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ttaggtacagcagtggcctacagttaacaatgaggtattgtgtatatactattccctaagg-----gatcttaagtgcttccccacgaaaaaagaagaggtaactgtgtgaagagatggatgtgttattccactaattcacatatagtcatgctagatgat i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 126414005 1253 - 136387465 M e mm10.chr6 128541655 770 + 149736546 I e canFam3.chr27 9421447 0 - 45876710 C a score=241509.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 2525 116 + 238139 aacaatcag------ctcac-tatatatatcaaaacatcacaccacatacctt--caatacacaatt---gtaatttCAAAAAATTATGGCAAACTTTGTAAGACTTT-AGTCAAATT-ATAAAATAATT s panTro4.chr12 76910472 114 - 134246214 aa---tcag------ctcac-tatatatatcaaaacgtcacaccacatacctt--cgatacacaatt---gtaatttCAAAAAATTATGGCAAACTTTGTAAGAGTTT-AGTCAAATTTATAAAATAATT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9024148 116 - 34552619 aacaatcag------ctcac-tatatatatcaaaatgtcacaccgcacacctt--caatacacaatt---gtaatttAAAAAAATTATGGCAAACTTTGTAAGAGTTT-AGTCAAATT-ATAAAATAATT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9666368 111 + 134985053 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nomLeu3.chr23_JH996205_1_random C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9668259 23 + 134985053 aaaaaaaacaaaGGGTTCCCCAG i rheMac3.chr11 I 3 C 0 s macFas5.chr11 9862403 20 + 137757926 ---aaaaaaaaaGGGTTCCCCAG i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9434296 23 + 132286798 aaaaaaaaaaaagagttccccAA i papAnu2.chr11 I 3 C 0 s chlSab2.chr11 9403654 16 + 128539186 -------aaaaaGGGTTCCCCAG i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104476626 11 - 124281992 -------aaaaaGAGTTC----- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr6 128543681 113 + 149736546 I e canFam3.chr27 9423075 0 - 45876710 C a score=1480801.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 4277 455 + 238139 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s panTro4.chr12 76918651 1001 - 134246214 AGCACCCCCCAAGAGGCGGGGACTGAGAGCCAGCCCCTCTCCCCCCCCCCCGGCTATAGGGACCCCCATCGCAGGAGGAGGAGACACACCCCAGGAGGCCGGGAATGAGAGCCAGCCCCTCTCCCGCCGGTGGNTATTAAGACACCCATCGCAGGGGGTGAGGCACCCCCTACGAGGCGGGGACTCAGAGCCAGCCCCTTTTTCCCCctggctcttaggatacccatcgcaggagtgggaggcatttccagcgaggcggggactgagagccagcccctcttccctacc-tggctcttaggacccccatcgcaggcgcgaagcaaccgcccgcgactcggggactgagagccagcgccctccccccccccaggctcttaggacccccatcgcaggcggggaggcactccccagcgaggcggggactgagagccagcccctctccccccgctggctgttaggacccccatcgcagtggggggaggcacc-cccgagaggcggggactgagagccagcccctcttccccacctggctcttaggacccccatcgcaacggggggaggcaccccccgagaggcggggatcgagagcctgcccctcttccccccc-ttggctcttaggaccctcatcgcagg-ggcggaggcaccccccgcgagttggggactgagagccagccgctctttccccctggctcttaggatacccatcgcaggagtgggaggcacttccagcgaggcggggactgagagccagcccctcttccctacctggctcttaggatccccatcgcaagggggggaggcaccgcCCGCGACTCGGGGACTGAGAGCCAGCCGCCTCTCCCCATCCCCCCCCTGGCTCTTAGGACCCCCATCGCAGGGGTGGGAGGCACTTCCAGCGAGGCGGGGACTGAGAGCCAGCCCCTCTTCCCCCCCACTGGCTTTTAGGATCCCCATCGCAAGGGGGGAAGACACAGCCCGCGAGTTGGGGACTGAGAGCCAGC 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TGCGAATCG--ATGATATATA------TTTTA------------CAAATATGGCACTATTTTATACATCCAGGAATAAAAGTGAAGA----AAG------AAAAAGAAAACAGAAAT----ACACATAGGAGGGAAAATGGC--------------------------------TAAAACTCACTCAACACTGACAAGGTCCCACATCCATGTCTCTGGGAAGTTGGTTCTTACTGTTTGAATTATAGCCTGTTCCACATAGTCAGTATTTTCCTCTCCAATTTTATTAGCT----------AAA-AAAAAAGGAAGA i calJac3.chr9 C 0 C 0 s mm10.chr6 128558818 297 + 149736546 GACAAATGA--ACAATGTTTTGTTTTGTTTTAAAAAAGAAAAACCAAAAGCTTCACTAATTTAT-TGCCCAGGAATAAAAGTTAACAAATCAAA------AGAAAAAAAATAGAGACAGAGCTACAAAAGGGAGAAGTCTGTTTAAGGAAAAAACACTAAGAAGCATAGAAAAATAAAACTCACTCTACACTGACAAGGTTCCATATCCATGTCCTGGGGAAGTTTGTCCTCACTGTCTCTTTGATGGCCACTTTTGCATGGCTGATGCTGTCCAC---AGAGTCATGAACT--------AAAAT-gagagagagaga i mm10.chr6 I 6 I 1288 s canFam3.chr27 9437859 247 - 45876710 TACAAATGAATATATTACATA------TTTTA------------CAAATATGGTATTGATTTATATATCCAGAAATAAATTTGAAGA----AATAACCACAAAAAGAAAATAGAAATAAAGACAC--AGGAGAGAAAACT-C--------------------------------AAAAACTCACTCGACACTGACAAGGTCCCATATCCATGTCTCTGGAAAGTTTGTCCTTACTGTTTCTATTATAGCCTGTCCTACATAGTCAAAATTCTCCTTCAAGCTTTCATGAGCT--------AAAAG-AAAAGAG----- i canFam3.chr27 C 0 C 0 a score=54824.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 27537 15 + 238139 AGTACCTTATTCAGA s panTro4.chr12 76927194 15 - 134246214 AGTACCTTATTCAGA i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126405711 15 - 136387465 AGTACCTTATTCAGA i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9070616 15 - 34552619 AGTACCTTATTCAGA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9683006 15 + 134985053 AGTACCTTATTCAGA i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9876974 15 + 137757926 AGTACCTTATTCAGA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9449145 15 + 132286798 agtaccTTATTCAGA i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9417882 15 + 128539186 AGTACCTTATTCAGA i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 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i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126405854 977 - 136387465 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i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9070759 976 - 34552619 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i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9683149 1076 + 134985053 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i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9449288 1013 + 132286798 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aactagatattaaggttaagcaagaaaaaatgagattaggatattaggatattataaaatatgtaaatataaaaataaccactaaaataaaaattcaacctagcctgaatactcaaagaagctttaagcaaga---taacaaa----aaacaaaca-------taaaagctaaagaaataaagttgctttaaataaaatacagaatcataagaaaaatagtatgatagagctgaggcctaacacatacatcatatcaatagagtgaacagattttattctcctttaaaagacaaagatatgtatatttaaaacaaaacccaatgctgtacttgatacaaaagacaagtgaagtgcatatttcaaaaggtgaaatccaaaggaaaagtaaaggaaaataacaagaatgcaaaggctgcaatcctcctgttatcggaaatcatagaagtcaggccaaaagacatcaaacaagacagagaagaatacttactgctaaaagctgcaattcataataaaggcacaacagttatgattatctatgcaGAAACTACAGCCGATGCAAGAAGAAACAGAGCACTATTCATAGGGTATTTTAACACACCACTCAGCAGAAGAAGGTTAAATAAATTTTACAAAATAAGTAAGAATACAAAGGATCAAAATAATCCAACCTCGTGGATAGAAAACAAACTG------ATCATAGAG i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9688934 673 + 134985053 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gactagatattaaggttaagcaagaaaaaa-------atgagattgcgatattataaaatatgtaaatataaaaatagccactataataaaaattcaacctggcctgactactcaaagaagctttaagcaaga---taacaaa----aaacaaaca-------aaaaagctaaagaaataaagtagtttaaaataaaatatagaatcataagaaaaataatatgatagagctgaggcctaacacatacatcatatcaatagagtgaatagactttattctcctttaaaagacaaagatatgtatatttaaaacaaaacccaaggctgtacttgatacgaaagacaagtggagtgtgtatttcaaaatgtgaaatccaaagggtaggtaaaggaaaataataagaatgcaaaggctgcaatcctcctgttatcggaaatagcagaagtaaggccaaaagacatcaaacaagacagagaagaatacttactgctaaaagctacaattcataataaagccataacagttatgattacctgtgcaGAAACTacagaagatgcaagaagaaacagagcgctattagtagggtattttaacatatcactcagcagaagaaggttaaataaattttacaaaacaagtaagaatgcaaaggatcaaaataatccaacctcgtggatggaaaacaaactg------acaatagag i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104497834 695 - 124281992 gattagatattaaggctaagcaaaaaaaaa-------atgagattaggatattataaaacatggaaatacaaaaataaccactaaaataaaaattcaacccagcctaaatactcaaagaagctttaagcaagattgtaacaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaaagctaaagaaataaagtgaccttaaatagaatatagaattataagaaaaacagtatgatagagctgaggcctaacatatacatcatagcaatgaagtgaatagactgtattcacctttaaaagacaaagacatgtatatttaaaacaaaacccaatgctgtacttgatacaaaagccaagtgaagtacacgtttcacaaggtgaaatccaaagggcaaataaaggaaaataataagaatgcgagggctgcaatcctcctgatattggaaatagtaaaagtaaggtcaaacgacatcaaacaagatagaaaagaatactcactgctaaaaattgcaattcataataaaggcacaacagttacga----ctatgcaGAAACTACGGGATATGCAAGAAGAAGCAGAGCACTATTAGTAGAGTATGTTAAGACACTATTCAGCAGAAGAAGGTTAAGTAAATTTTAAAAACTTAGTAAGAATACAAAGGATCAAAATAATGCAATCTTGTGGATAGAAAACAAactatttgcaatagcaaag i calJac3.chr9 C 0 I 451 e mm10.chr6 128563354 2242 + 149736546 I e canFam3.chr27 9444216 15 - 45876710 I a score=472662.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 33228 165 + 238139 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ACTATGTCCTCTCAATATATGTGATATATTCACAAAAACTCACTGTATATTTGGGCTCAAAAGTGTATCAGTAGAAATACTGCCAACCATCA------AGAACTTGAAATTTaaaagaaaactctaaaataaattcctttttatataaaaattaaaaaatactcc i calJac3.chr9 I 451 C 0 e mm10.chr6 128563354 2242 + 149736546 I e canFam3.chr27 9444216 15 - 45876710 I a score=404670.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 33393 112 + 238139 AGTAAGTAAATTTTCAGTGAAAGGGTTAATACAAACAGAAATTACGGAATTTCTGAAAAATAAAAATGGTGCAATTGCTATGTATCAGGATCTATGAGATACTTCAAAAGTA s panTro4.chr12 76933356 112 - 134246214 agtaagtaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacggaatttctgaaaaataaaaatggtgcaattgctatgtatcaggatctatgagatacttcaaaagta i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126430807 112 - 136387465 agtaagtaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatgatgcaattgctatgtatcaggatctatgagatacttcaaaagta i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9076439 112 - 34552619 agtaactaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcaattgctttgtatcaggatctatgagatacttcaaaagta i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9689766 112 + 134985053 agtaagcaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcgattgctacatatcaggatctatgagatacttcaaaagta i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9883983 112 + 137757926 agtaagcaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcgattgttacatatcaggatctatgagatacttcaaaagta i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9454712 112 + 132286798 AGTAAGCAAATTTTCAGTGAAAGGGTTAATACAAACAGAAATTacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcgATTGCTACATATCAGGATCTATGAGATACTTCAAAAGTA i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9423452 112 + 128539186 agtaagcaaattttcagtgaaagggttaatacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcgattgctgtgtatcaggatctatgagatacttcaaaagta i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104499139 112 - 124281992 agtaagcaaattttcagtgaaaagattaacacaaacagaaattacagaatttctgaaaaataaaaatggtgcaattgctgtgtatcaggatatatgagatacttcaaaagta i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 9444231 105 - 45876710 aataaatgagttTTCAGTGAAATGCTAAATACAAAT----ATTATAGAATTTCTAAAAAAT---GATGATGCAATTGCTATAGATCAGAATCTAAGGGATACATTAAAAGTA i canFam3.chr27 I 15 I 1850 e mm10.chr6 128563354 2242 + 149736546 I a score=1626487.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 33505 604 + 238139 GAAATCATGGAAAAACTTATAGGCTTAAAAACACCTAGCCCAATAAAATAAATTAATGAAaatgaagtaaatttctaagtgaaaaagctaaaaataacaacaaaatacagcaccagtaaggaaataataaagataaaaatagaaattaatgtgatggagtagcaaaaaacctcacatcatattacatcacattaataaattaaaattatatgtttttggaaaactcggcaaaataggtaaacca---ccaactaatctaacaaggaagaaaaagtagctatctgcttaggaacaaaagaaaaacaacttcttccatgactcagttttcagcctcat--tttttgtccttttagcatcgtgaattggggtccggagttgtttgtatttttctttcacaATAGACTGatgtatgtaacctagtctcaaatgattcag-aaaaaactgaaatggcataaac--------tctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgt----atgtgtgtgtgtgtaggggtggagagagtgagaaagagaaaacaagtacggtgaaatgttcacaaactggtg-aatcaggccaagggtctac-gggagttctctgtgtaattcttgcactt s panTro4.chr12 76933468 602 - 134246214 gaaatcatggaaaaacttataggcttaaaaacacctagcccaataaaataaattaatgaaaatgaagtaaatttctaagtgaaaaagctaaaaataacaacaaaatacagcaccagtaaggaaataataaagataaaaatagaaattaatgtgatggagtagcaaaaaacctcacatcatattacatcacattaataaattaaaattatatgtttttggaaaacttggcaaaataggtaaacca---ctaactaatctaacaaggaagaaaaagtagctatctgcttaggaacaaaagaaaaacaacttcttccatgactcagttttcagcctcat--tttttgtccttttagcatcgtgaattggggtccggagttgtttgtatttttctttcacaATAGACTGatgtatgtaacctagtctcaaatgattcag-aaaaaactgaaatgccataaac--------tctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt------gtgtgtgtgtgtaggggtggagagagtgagaaagagaaaacaagtacggcgaaatgttcacaaactggtg-aatcaggccaagggtacat-gggagttctctgtgtaattcttgcactt i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126430919 589 - 136387465 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gaaatcatggaaaaacttacaggcttaaaaacacctagcccaataaaataaatcaatgaaaatgaagtaaatttctaagtgaaaaagctaaaaataacaacaaaatacagcaccagtaaggaaataataaagataaaaatagaaattaatgtggtggagtagcaaaaaaCCTCATATCATATTACATCACATTAATAAATTAAAATTATATGtttttggaaaactcagcaaaataggtaaatca---ctaactaatctaacaaggaagaaaaAgtagctatctgcttaggaacaaaagaaaaacaacttcttccatgactcagttttcagcctcat--tttttgtccttttagcatcgtgaattggggtcctgagttgtttgtatttttctttcacaATAGACTGatgcatgtaacctagtctcaaacgattcag-aaaaaattgaaatgccataaac--------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt------------------aggggtagagagagtgagaaagagaaaacaagtatggcaaaatgttcacaaactggtg-aatcacgtcaagggtacatggggagttctctgtgtaattcttgcactt i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9689878 580 + 134985053 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GGAATCATGgaaaaacttaaaggcttaaaaacaccgaacccaataaaataaattaatgaaaatgaagtaaatttctaagtgaaaaagctaaaaataacaactaaataaagcaccagtaaggaaataataaagataaaaacagaaattaatgtgGTGGAGTAGCAAAAAACCTCATATCATATGACATcacattaatacattaaaattacaTGTTTTTGGAAAACTCGGCAAAATAGGTAAACCA---CTAACTAATCTAACAAGGAAG-TAAAttagctatctgcttaggaacaaaagaaaaacaa---cttccaTGACTCAGTTTTCAGCcttat--tttttgtccttttagcATTGTGAATTGGGGTCTTGAGTtgtttgtattttcctttcacaatagaCTGATGTATGTAACCTAGtctcaaatgattcag-aaaaaattgaaatgccataaac----------------tgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgt------------------aggggtggagagagtgagaaagagaaaacaagtatGGCAAAATGTTCACAAACTGGTG-AAACAGGTCAATGGTATAT-GGGAGTTCTCTGTGCTATTcttgcactt i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9423564 596 + 128539186 ggaatcatagaaaaacttataggcttaaaaacaccgaacccaataaaat-aattaatgaaaatgaagtaaacttctaagtgaaaaagttaaaaataacgacaaaataaagcaccagtaaggaaataatcaatataaaaatagaaattaatgtggtggagtagcaaaaaacctcatatcatatgacatcacgttaataaattaaaattacatgtttttggaaaactcggcaaaataggtaaacca---ctaactaatctaacaagGCAG-TAAATtagctatctgcttaggaacaaaagaaaaacaacttcttccatgactcagttttcagcctcat--tttttgtccttttagcatcgtgaattggagtcttgagttgtttgtattttcctttcacGATAGACTGatgtatgtaacctagtctcaaatgattcag-aaaaaattgaaatgccataaactctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt------------------aggggtggagagagtgagaaagagaaaacaagtatggcaaaatgttcacaaactggtg-aatcaggtcaatggtatat-gggagttctctgtgctatccttgcactt i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104499251 564 - 124281992 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taaaaaattatttaaaactaaaagctaagcttacataatat------aaaaaataacataaacgtatagaatataaatTGGAATTCACTCATTTATAGAACTTCACTTGATTTATACTATT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9424160 121 + 128539186 taaaaaattatttaaaactaaaaGCTAAGCTTacataacataatataaaaaaataacttaaACGTATAGAATGTAAATTGGAATTCACTCATTTATAGAACTTCACTTGATTTATACTAAT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104499815 120 - 124281992 ttaaaaattatttaaaactaaaaaCTAAGCTTACATAAGataatat-aaaaaataacataaatttatagaatataaattGGAATTCACTCATTTATAGAACTTTACTTGATTTATACTATT i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 9446186 101 - 45876710 tttaaaaTTATTTAAAACTAAA----AAACTTACAAAACACAATAT-TAAAAGTACTACAAAC------AATATGAATTGGAACTCATTTATATA---------ACATGACTTACAGTGTT i canFam3.chr27 I 1850 C 0 e mm10.chr6 128563354 2242 + 149736546 I a score=325376.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 34228 124 + 238139 AATATAGCTATCAATAATAAACAAGGGCAACCTCTTTTGGCTC--TGATATATTCTGAGACCCCTGAA---------------TAATGCCT-CTAGAATTTTCTTTTTGAGGTCCCTTGATGGTCTTTTCTTGAGGCAGTTT s panTro4.chr12 76934190 124 - 134246214 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canFam3.chr27 C 0 I 223 e mm10.chr6 128563354 2242 + 149736546 I a score=277828.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 35356 82 + 238139 AAGAAAATACAATATCCATTTATAGATAATAACTTTACACTGAATCCAAGCATATCCTTGAACATAGAGATTTCATTTT--ATT s panTro4.chr12 76935346 82 - 134246214 AAGAAAATACAATATCCATTTATAGATAATAACTTTACACTGAATCCAAGCATATCCTTGAACATAGAGATTTCATTTT--ATT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126433037 82 - 136387465 AAGAAAATACAATATCCATTTATAGATAATAACTTTACACTCAATCCAAGCGTATCCTTGAACATAGAGATTTCATTTT--ATT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9078395 82 - 34552619 AAGAAAATACAATATCCATTTATAGATAATAACTTTACACTGAATCCAAGCATATCCTTGAACATAGAGATTTCATTTC--ATT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9691666 82 + 134985053 ACGAAAATAAAAGATGCATTTATAGAAAATAACTTTACACTGAATCCAAGCAGATCCTTGAACACAGAGATTTCATTTT--ATT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9886373 82 + 137757926 ACGAAAATAAAAGATGCATTTATAGAAAATAACTTTACACTGAATCCAAGCAGATCCTTGAACACAGAGATTTCATTTT--ATT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9456668 82 + 132286798 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i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9459337 823 + 132286798 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i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104503991 829 - 124281992 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ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 9081923 342 - 34552619 CTTTAATTGAAGCCACAGAATTGGGCTTCAGTTCTGTTTCTTTCAGCTACATGTGAACACTGACAAATTATTTAACTGCAAAATTCTGTTTAAGCAGCAGAAAATAAAG--AGAAAGTATAAGATCTCCCCTATCTATGCAC---GAAATGATCTGAAGAA----GAAAGTCAAATCATCCTCATGAGCTACTTCTTGTTTCCTAGAGGAAAATATTAGTTGTTAGCAAATTTATAACAATCG---TGATAGACTTTTAGCTTCTCATCCTCT------------------------------CGAACAAGTATTCTC-ATATA-------------------TTATTTAGTGAACAAG--------CAAATTATATAAA---------------------------------------ATAAGCTA--------CATTTTAAATTTTCTTTAAAATAT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9695306 343 + 134985053 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--ttgtttctt----tttgcttgtttgagacggagtctcagtctgctgcccaggctggagtacagtggtgcaatcttggctcactgcaacctctgcctacagggttcaagccattctcattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatgtatgaccatgctaggctaatttttatatttttagtagagactggatttcaccatgttgggcagtctggtcccgaactcctgacctc--atgatccacccgcctcaatctctcaaagtgctgggattacaggtgtgagccactatacccagccTCACATTTTGTT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104514189 315 - 124281992 TGTTGTTGCTGTT--GTTGtttgtttgagacggagtctcgctctgt--cccaggctgaagtg-aatggcacaatctcagctcactgcaatctctgcctccagggtgcaagc------cattctcctgcctcagcctcctgagtacctgggattacaggcatacaccaccatgccgagctaatttttgtacgtttagtagagatgggatttcaccatgttggccaggctggtttcgaattcctgacctcgggtgatctgcctgcctcagtctcccacagtgctggaattacaggtgtgaaccactgtgcctggGCTCACATTTTGTT i calJac3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr6 128575806 75 + 149736546 I e canFam3.chr27 9459462 14 - 45876710 I a score=5164.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49396 2 + 238139 TC s panTro4.chr12 76949719 2 - 134246214 TC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126446849 2 - 136387465 TC i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9706364 2 + 134985053 TC i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9900960 2 + 137757926 TC i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9471213 2 + 132286798 TC i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9439910 2 + 128539186 TC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 104514504 2 - 124281992 TC i calJac3.chr9 C 0 C 0 s mm10.chr6 128575881 2 + 149736546 TA i mm10.chr6 I 75 C 0 e canFam3.chr27 9459462 14 - 45876710 I a score=1490103.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49398 511 + 238139 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TATGGTAATCTTTTACGT--TGTGTAGACAATTGCCTGGATTCTAGAAGAGGAGAT----TTTCCTAGG---TAGAAGA----GTCAGAGGTTAGAATCACAATACTCGGC--AAGGAGTGAGTAACAAGAAAGGAGAGATTATAAAACAAAAAACCCCAAGAA---------AGGGAAATGACAGAAAACCAAATCAGGTCTCATAGACTTTT--GCCTAAATCTAACATA-AAAACTGTTTTGTTCAGTCATTTGAGCTCCACATTTACACGGAACAAACATAAATAG---TTAGTTACCATATCTATCAACAGTAAATTGGTGTGTCAACGTCTTTCCTGATTTTCTTTTCACAAAAATAGAGTAATCTCCAAACATTGGTTCTGAAATCAGTTGGAATGAGAGTTGGGTAATATTTTTAAAAGAGGTCACATTTTGCCACTGAAAAATCCTATTGTTTTGAGGATCCTGG-AAATAAAG---AAGAAATAAAAGCAA----AGGTCATA-AAGAGTATTATGCTTTCCT i canFam3.chr27 I 14 C 0 a score=43181.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49909 20 + 238139 GCCATATTTCGGATAGTTTC s panTro4.chr12 76950232 20 - 134246214 GCCATATTTCGGATAGTTTC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126447362 20 - 136387465 GCTATATTTTGGATAGTTTC i ponAbe2.chr12 C 0 I 37142 s rheMac3.chr11 9706888 20 + 134985053 GAGATATTTTGGATCGTTTC i rheMac3.chr11 C 0 I 23544 s macFas5.chr11 9901486 20 + 137757926 GAGATATTTTGGATCGTTTC i macFas5.chr11 C 0 I 23496 s papAnu2.chr11 9471735 20 + 132286798 GATATATTTTGGATCGTTTC i papAnu2.chr11 C 0 I 15775 s chlSab2.chr11 9440434 20 + 128539186 GATATATTTTGGATCGTTTC i chlSab2.chr11 C 0 I 23464 s calJac3.chr9 104515009 20 - 124281992 GCTATATTTTGGATAGTTTC i calJac3.chr9 C 0 I 37188 s canFam3.chr27 9459970 20 - 45876710 TCTTTACCTTGGGTATTTCT i canFam3.chr27 C 0 C 0 a score=205.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49929 1 + 238139 G s panTro4.chr12 76950252 1 - 134246214 G i panTro4.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9925002 1 + 137757926 A i macFas5.chr11 I 23496 C 0 s papAnu2.chr11 9487530 1 + 132286798 A i papAnu2.chr11 I 15775 C 0 s canFam3.chr27 9459990 1 - 45876710 G i canFam3.chr27 C 0 I 23199 e ponAbe2.chr12 126447382 37142 - 136387465 I e chlSab2.chr11 9440454 23464 + 128539186 I e calJac3.chr9 104515029 37188 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9706908 23544 + 134985053 I a score=6939.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49930 15 + 238139 GATAGTTTCACAAGG s panTro4.chr12 76950253 15 - 134246214 GATACTTTCACAAGG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9925003 15 + 137757926 CATACTTTCACAAGG i macFas5.chr11 C 0 I 25 s papAnu2.chr11 9487531 15 + 132286798 CATACTTTCACAAGG i papAnu2.chr11 C 0 I 25 e ponAbe2.chr12 126447382 37142 - 136387465 I e chlSab2.chr11 9440454 23464 + 128539186 I e calJac3.chr9 104515029 37188 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9706908 23544 + 134985053 I e canFam3.chr27 9459991 23199 - 45876710 I a score=23688.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49945 12 + 238139 GTTATTTTAGGC s panTro4.chr12 76950268 12 - 134246214 GTTATTTTAGGC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126484524 12 - 136387465 GTTATTTTAGGC i ponAbe2.chr12 I 37142 C 0 s rheMac3.chr11 9730452 12 + 134985053 GTTATTTTAGGC i rheMac3.chr11 I 23544 C 0 s macFas5.chr11 9925043 12 + 137757926 GTTATTTTAGGC i macFas5.chr11 I 25 C 0 s papAnu2.chr11 9487571 12 + 132286798 GTTATTTTAGGC i papAnu2.chr11 I 25 C 0 s chlSab2.chr11 9463918 12 + 128539186 GTTATTTTAGGC i chlSab2.chr11 I 23464 C 0 e calJac3.chr9 104515029 37188 - 124281992 I e canFam3.chr27 9459991 23199 - 45876710 I a score=952901.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 49957 425 + 238139 CAATATTTTCTCTTATGAAACAAACAAGTAGCTTTTGGTAGAGCCTGTGAGGGCTTAAGAACCCTAATGTCTATAAATCTTAGAGGATTATACACTATGCTTTGGTCATACAAACTTGTACTGCCTTTATTCTTTTTTCTTTTTTT-AAAGTATTGTAATTGTACATACTTAAAGGATACAA-TTggcggggcacagt-ggctcacacctgtaatcctagcactttgggatgccaaggtgggcagatcactagagccaaggagttcaagaccagcttgggtaatattgtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagttgggtatggtggcgtgtgcctctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcgcttcaacgtgggaggtgaaggttgcagtgaaccgagatcata s panTro4.chr12 76950280 425 - 134246214 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CAATATTTTCTCTTATGAAACAAATAAGTAGCTTTTGTTAGAGCTTGCGAGCGCTTAAGAACTCTAATGTCTATAAATCATAAAGGATTATACACTCTGCTTTGGTCATAAGAACTTGTACTGCCTATATTCTTTTTTTT-------AAATCATTATAATCATACATACTTAAAGGATACAATTTggccgcacacagtgggctcacacctgtattcctaccatgttgggaggccaagatgggcaggtcacttgagcccaaaagttcaagaccagcctgggcaatattgcgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagttgggtgt-ggtgtgcatgc--ttataatcccagctactcgggaggctgaggcaggcgaattgcttcagcctaggaggtgatggttgcagtgaaccatgatggta i calJac3.chr9 I 37188 C 0 e canFam3.chr27 9459991 23199 - 45876710 I a score=72804.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 50382 41 + 238139 ccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactttgtct s panTro4.chr12 76950705 41 - 134246214 ccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactttgtct i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 126484961 41 - 136387465 ccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactttgtct i ponAbe2.chr12 I 1 C 0 s rheMac3.chr11 9730888 41 + 134985053 ccaccgcactccagcctgggtgacagagtgagactttaccc i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9925479 41 + 137757926 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atgacatgtaccattaatatactaatgagcctaaactctgtttctcctgcccacgaagatctctgaaaact-aggcccatataattaactaccctgaatatattttataataaaaatgctacagaaaccctcaaattggaatgatttattactgtgcccaaccttccttttttttctctttctcttatttatctcagtgaatacctcaaccattcacttagtcactgaagtcaaatatctagagacatcctagactttttattttctttctcctataattttcaattgttgat-aaatactttcaaatgtatctttttaacattttctgtttccaacagatcacatttgttcctgttgctattccttatatcaatttcttatcttttttccctcatatgtcttctatttttttctatccagtctctctctcctgtattgcttttgcttgttctttctctatactggcatcaaaccaaattttctaaaatgcaaaatttagcattatcctccctaaaacattgtagtgactgctcTGATAGGCCATGGTTATTCGCTAGAAATCTCTTTCTCATTCTCTTACTAGTATAGGCAATGATTGCTTTAAAAAGTCCCTTCTGAAATTGTATTATTTGTAGTAGATACAATGCCTGCATCAGTATCTA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9436110 658 + 134985053 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atgacatgcaccattaatacactaaagagcctaaactctgtttctcctgcccacaaagatctctgaaaactcaggcccatatcattaactaccctgaatattttttataataaaaatgctacagaaaccctcaaattggaatgatttattactgtgcccacacttcc-cttttttctctttctcttatttatctcagtgaatacctcaaccattcacttagttactaaagtcaaatatctagagacatcctagac---ttattttctttttcCTATGATTTTCAATTGTTGATAAAATATTTTCAATTGTATCTTTTTAACATTTTCTGTTTCCAACTGATCACATTCGTTCCTGTTGCTATTCCTTATATCAATTTCTTATCTTTTATCCCTCATACATCTTCTA-TTTTTTCTATCTAGTCTCTCTCTCCTGTATTGCTTTTGCTTGTTCTTTCTCTATACTGGCATCAAACCAAATTTTCTAAAATGCAAAATTTAGCATCATCCTCCCTAAAACATTGTAGTGACTGCTCTGATAGGCCATGGTTATTCACTAGAAATCTCTTTTTAATTCTCGTACTAGTACAGGCAATGATTGCTTTAAAAAGTCCCTTCTGAAATTGTATTATATATAGTAGATACAATGCCTGCATCAGTATCTA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9201145 657 + 132286798 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124281992 I e rheMac3.chr11 9448571 6120 + 134985053 I e canFam3.chr27 9400002 155 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 8846137 3838 - 34552619 I a score=1332.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 81455 2 + 238139 aa s panTro4.chr12 76986270 2 - 134246214 aa i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9453045 2 + 136387465 ga i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9215193 2 + 132286798 aa i papAnu2.chr11 C 0 I 5244 s chlSab2.chr11 9166189 2 + 128539186 aa i chlSab2.chr11 C 0 I 1313 e calJac3.chr9 104759737 274 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9448571 6120 + 134985053 I e macFas5.chr11 9644366 5340 + 137757926 I e canFam3.chr27 9400002 155 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 8846137 3838 - 34552619 I a score=399280.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 81457 1528 + 238139 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atcattttttaaaatttttactttaagttctggtatacatgtgcagaacgtgcaggtttattgcatagatatacatgtgccatggtggtttgctgcacctatcaacccgtcacataggttttaagccctgcacctaaaatatatttccttgacatattttgaaatggatcTGCACAGCTGActtttgtggggaaaatctacattctacAGAGAATCGTCTTCCTTTTCCAAGTCATTTACCTGATCCAGGAGAGACTTtactaagagtctggcacctttttaagtctgataagagaCGTTTACaatctgttctctctgaagcctgctacccagaggcttcatctgcataataagaatCTTGGTCTCCaaaaccccttatcttaacccacaCACTTCCTTctattgattccaagtctt i papAnu2.chr11 C 0 I 138 s chlSab2.chr11 9189810 417 + 128539186 ATCAttttttaaaatttttactttaagttctggtatacatgtgcagaacgtgcaggtttattgcataggtatatatgtgccatggtggtttgctgcacccatcaacccgtcacataggttttaagccctgcacctaaaatatatttctttgacatatcttgaaatggatctgcacagctgtcttttgcggggaaaatctacattctacagagaatcgtcttccttttccaagtcatttacctgatccaggagagacttaactaagagtctggcacctttttaagtctgataagagacgtttacaatctgttctctctgaagcctgctacccagaggcttcatctgcataataagaatcttggtctccaaaaccccttatcttaacccagacacttccttctattgattccaggtctt i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I e canFam3.chr27 9414238 0 - 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atgcctttgcccaaatgtcactgcctcaatgatatcaaccctaa----gccttgtgttt--agctttccagtct-------tcccagagtgttctatatcctcctgcccttctctacattttatattttcc-atagcacttataacctcttaatttcctcgactttgcttatccattatgttcattattatgtttgtacatttcgtttgattgtattatacgtattgtttgtctcccccattagaatgcaagcaccacaagggcagctgttt-ttgctattttcattcattgatatttcccaaacaccaagaaga-gtatttggcaactatcagcattcaaGACTGGTGGTCTGAACTAAAGCAGCATGGCAGTGCTGGATAAAAGCATGTGGATCTATGAGTCATTCAGGAGGTAGATCAACAATTGTCAATTATCAACACTGATAGAAAAGAAGATGAGAGAGAGAAGGAGGTAAAGTTGATCCTTAGGTGA----TGGATGATAATATTGCCACACACTGAGGCAGGG-ATCTAAGTTGGAGAAACTGGTTT-GGAGTAGATTATGGACCCTACTGAGGTGCCTGTGGGACATTCAATTAAACAAGCACCTTAGGCAGTGGGATATATGCA-ACTGAAATGTGACTATAGAGGCATATATTTGGGATACACAAAAATACAGATAGTAACTGAAATGCAGGATATTTAACGTGTATAGTGAGAAGAGAAGAGGGTTTGCAATAGAATCATG----AAAGAATTATTTAA----TAGTAAGAGAAAAGTGGAG-C--AAAATGAAGATCAGTAAATATCCAGAAAGTGAGAAGGAAAATGTGATTGTTATGTGATTATTATGGGAA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9247402 839 + 132286798 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atacctttgcccaaatgtcactgcctcaatgatatcaaccctaa----gccttgtgttt--agctttccagtcttctcacctcccagagtgttctatatcctcctgcccttctctacattttatattttcc-atagcacttataacctcttaatttcctcgactttgcttatccattatgttcattattatgtttgtacatttcgtttgattgtatcatacgtattg----tctcccccattaaaatgcaagcaccacaagggcagctgttt-ttgctattttcattcactgatatttcccaaacaccaagaaga-gtatttggcaactatcagcattcaaGACTGGTGGTCTGAACTAAAGCAGCATGGCAGTGCTGGATAAAAGCATGTAGATCTATGAGTCATTCAGGAGGTAGATCAACAATTGTTAATTATCAACACTGATAGAAAAGAAGATGAGAGAGAGAAGGAGGTAAAGTTGATCCTTAGGCGA----TGGATGATGATATTGCCACACACTGAGGCAGGG-ATCTAAGTTGGAGAAACTGGTTT-GGAGTAGATTATGGATCCTACTAAGGTGCCTGTGAGACATTCAATTAAAGAAGCACCTTAGGCAGTGGGATATATGCA-ACTGAAATGTGAATATAGAAGCATATATTTGGGATACACAAAAATACAGATAGTAACTGAAATGCAGGATATTTAATGTGTATAGTGAGAAGAGAAGAGGGTTTGCAATAGAATCATG----AAAGAATTATTTGA----TAGTAAGAGAAAAGTGGAGTC--AAAATGAAGATCAGTAAATATCCAGAAAGTGAGAAGGAAAATGTGATTGTTATGTGATTATTATGGGAA i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr27 9416408 831 - 45876710 aaatctttgctcaaatgtcactgcttcaatgaggttgaacgtaaatctacctagtatttcaatccttctcctcgtcccatctccctggacattctggatcctcttacccatctctacagtttttattttccaacaacacttaccaccttccaatttcttaaattttgcttatctatgttgctgatt-ttatgCTTACATttattgtttgattatattacatgtattgtatatctctcccattgaaatgtaagctccacaaggatagccatttcttactattttcatttaccgatatagcctgactgtccagaagaggtttttggtgcatataggcactcaaGACTGATGGTCTGAACTAAAACAGCATGGCAGTA-TGGATAAAAGGAAACGGATCAATGAGTTATTCATTTGGTAGGTGAACACTGGTCCATTATCAACAGTGAATGAGTAGAATGTGAG-----GGACGAGGTGA----GATACTTAGATAATTCTTTAGTGATGATATTGTCACACACTGAGATAGGGTATCTCAGTAAAAGAACCTGGTTTAGGGGTAAATGATGGATATTATTGAGGTGTCTGTGGGACATTTGACTA---ATGTACAATAGACAGTGGGATTCATGGAGGCTGGAAAGTAGATAGAGAAGCATATATGTGGGAATC----AGACATAAATTTTAATTT---TGTAGGATTTTTAGTGTGTATAGTGAGAAGAGAAAAAGACTTGC--TAGAATCATGATGAAAAATATTATTTAATGTTTGGTAAGAGAAAGTGGAGC-TGAGAAAAGAAGATCAATAAGTATCTGGATAGTGAGAAGGAA------------ATGTACATACTGTGGAGA i canFam3.chr27 I 687 I 17 e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I a score=127080.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 103217 53 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hg38.chr12_KI270835v1_alt 103270 142 + 238139 TATGTGATGGTGgaaggaaaagaaaacaataaa--cagaaagaggctgaggataaagaagagaaagaca----aTAAAATTGATGGAATGAGAAGGTGGCGAAACAGGATGAGATTTCTAGAACATAGCAAAGGAGATGTTAGTGTTA s panTro4.chr12 77016870 142 - 134246214 TATGTGATGGTGGAAGGAAAAGAAAACAATAAA--CAGAAAGAGGCTGAGGATAAAGAAGAGAAATACA----ATAAAATTGATGGAATGAGAAGGTGGCGAAACAGGATGAGATTTCTAGAACATAGCAAAGGAGATGTTAGTGTTA i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9479545 142 + 136387465 TATGTAATGTTGGAAGGAAAAGAAAACAATAAA--GAGAAACAGGCTGCGGATAAAGAAGAGAAAGACA----ACAAAATTGATGGAATGAGAAGGTGGCAAAAGAGGATGAGATTTCTAGAACATAGCAAAGGAGATGTTAGTGTTA i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 8877477 142 - 34552619 CATGTGATGTTGgaaggaaaagaaaacaataaa--gagaaagaggctgaggatgaagaagagaaagaca----aCAAAATTGATGGAATGAGAAGGTGGCAAAAGAGGATGAAATTTCTAGAACATAGCAAAGGAGATGTTAGTGTTA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9482445 137 + 134985053 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TAAGTGATGATGGAAGAAAAATAAAACAATAAAAGGAAAAAGAGCATGAGACCTAAGAAAAGAGATAAAAGGGAAAAAGCTGATAGAAAGAGGAGGAGGATAAAAAGGATGAGATTTCTAGGAGACAGTAAAGAGGATGTTAGGGCTT i canFam3.chr27 I 17 C 0 e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I a score=11817.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 103412 7 + 238139 AGGGTTT s panTro4.chr12 77017012 7 - 134246214 AGGGTTT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9479687 7 + 136387465 AGGGTTT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 8877619 7 - 34552619 AGCATTT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9677410 7 + 137757926 AGCATTT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 9248431 7 + 132286798 AGCATTT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 9195281 7 + 128539186 AGCATTT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr27 9417404 7 - 45876710 GGTATTT i canFam3.chr27 C 0 C 0 e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9482582 759 + 134985053 I a score=199164.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 103419 161 + 238139 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catatactatatgtgtgtatgtgcatgtataca--tacatatacacatatatacacccatgtgtatatgtatatacatacacatattgtaggtatatatgtgtatacatgtatgtatgtatatacat--atatataCACACAAA s panTro4.chr12 77017220 140 - 134246214 catatactatacatgtgtatgtgcatgtataca--tacatatacacatatatacacccacgtatatatgtatatacatacacatattgtatgtatatatgtgtatacatgtatgtatgtatatacat--atatataCACACAAA i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9479895 138 + 136387465 catatactttacatgtgtatgtgaatgtataca--tacatacacacttaaatacacccatgtatatacgtatatacatacacatattgtatgtatatacgtatatacatgtatgtatgtatatac----atatacacacacata i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 8877843 137 - 34552619 tgtgta---tacatgtgtatgtgtgtgtgagcatgtatacatatacatatatacacccatgtatatatgtatatacatacacatgttccatgcatatatgtatatgtatgtatgtatatacgtac----atataCACACACATA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9677613 130 + 137757926 gatg-----tacgtgtgtatgtgtacgtacaca--tacatatacac--acatacacccatgtatatatgtatatacattcac-----gtatgtatatacgtatatacatatatgtatgtatatacatacatatgcactcacata i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 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panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9480559 211 + 136387465 atacaaaaaattagccaggcatggcggcgggcgcctgtagtcccagctactcgggagactga-ggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcctgggagacagagcgaga--gtgtctcaaaaaaaaaaaaagaaaaaagaaaaaaaaaGAGAAAAGGGCAAGTAAGAGAGCT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s canFam3.chr27 9417791 47 - 45876710 atataaa-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ccagaaagagg-----tttcaa-----------------------------tgcaaggggcaagtaacagagct i canFam3.chr27 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 9196024 16 + 128539186 I e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9482582 759 + 134985053 I e papAnu2.chr11 9248867 284 + 132286798 I e macFas5.chr11 9677818 430 + 137757926 I e nomLeu3.chr23 8878384 66058 - 34552619 I a score=292525.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 104480 429 + 238139 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chlSab2.chr11 9198565 330 + 128539186 I e calJac3.chr9 104785680 62969 - 124281992 I e rheMac3.chr11 9484815 389 + 134985053 I e papAnu2.chr11 9250094 6 + 132286798 I e macFas5.chr11 9680146 7 + 137757926 I e nomLeu3.chr23 8878384 66058 - 34552619 I a score=253975.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 108067 203 + 238139 GTCCTTCACTTTCTTCCTTTCCTCCCCACCCCTCACTGTTCAACAGATAACCTGAGTGCATTCAGTTTGTAAAGCACAGTGCTGGGGCCGTGAAAGCCAGAGACGAATCAGACAACACACAACCACTCTCAAAGAGATTCAGGGATCCCAGGAGGGAAGAAAGGAACATCAGTAAGCACAACGCCCCgcaagcctgggtttca s panTro4.chr12 77021579 203 - 134246214 GTCCTTCACTTTCTTCCTTTCCTCCCCACCCCTCACTGTTCAACAGATAACCTGAGTGCATTCAGTTTGTAAAGCACAGTGCTGGGGTCGTGAAAGCCAGAGACGAATCAGACAACACACAACCACTCTCAAAGAGATTCAGGGATCCCGGGAGGGAAGAAAGGAACATCAGTAAGCACAACGCCCCgcaagcctgggtttca i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9484597 203 + 136387465 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catctgtttagcagcagcatgaccttaaggaggtcactaacaggtcaacgcctcagcttcttccactgaaaaacaggaatggtcacttctgcgtcactgaattacctc---------------gaaggtgaaaaggagctggtgatgtctggtgctcctgtcctggctgacacagctaggtcctcaGCATTTGCTATTATTGCCTGCAAGACGGGGAGCAGTGAGGGGCTTCAGGCACTCAGGAAACCCAGAACTCCCACAAGTGGGCAGGGCAAAGTAGGCGAAATTTCAGGGAGGAGGCGGTCTAGAGCAGATCACGGAGAGGGAAGCTCCAGGCTTAGGAGACAGACACTCTGCAAGAGAACGCCACGGAGGACGAAACAGCAGAGCAACAGCAAGCAGCGCCTCTGGTTGGAGCTGTGCCTTTC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 9484800 413 + 136387465 catctgtttagcagcagcatgaccttaaggaggtcactaacaggtcaacacctcagcttcttccactgaaaaactggaatggtcacttctacatcacggaattacctc---------------gaaggtgaaaaggagctgatgatgtCTGGTGCTCCTGTCCCGGCTGACACAGCCAGGTCCTCAGCATTTGCTATTATTGCCTGTAAGATGGGGAGCAGTGAGGGGCTCCAGGCACTCAGGAAACCCAGAACTCCCACAAGTGGGCAGGGCAAGGTAGGCAAAATTTCAGGGAGGAGGCAGTCTAGAGCAGATCACGGAGAGGGAAGCTCCAGGCTTAGGAGACAGACACTCTGCAAGACAACACCACGGAGAACGAAACAGCAGAGCAACAGCAAGCAGCGCCTCTGGCTGGAGCTGTGCCCTTC i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 9485407 413 + 134985053 catctgtttagcagcagcatgaccttaaggaggtcactaacaggtcaatgcctcagcttcttccactgaaaaacaggaatggtcacttctacatcacggaattacctt---------------gaaggtgaaaaggagctggtgatgtccggtgctcctgtcctggctgacacagctaggtcctcaGCATTTGCTATTACTGCCTGTAAGATGGGGAGCAGTGAGGGGCTCCAGGCACTCAGGAAACCCAGAACTCCCACAAGCGGGCAGGGTGGGGTAGGCGAAATTTCAGGGAGAAGGCAGTCTAGAGCAGATCACGGAGAGGGACGCTCCAGGCTTGGGAGACAGACACTCCGCAAGAGAACGCCATGGAGGACGAAGCACCAGAGCAACAGCAAGCAGCACCTCTGGCTGGAGCTGTGCCTTTA i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 9680356 413 + 137757926 catctgtttagcagcagcatgaccttaaggaggtcactaacaggtcaatgcctcagcttcttccactgaaaaacaggaatggtcacttctacatcacggaattacctt---------------gaaggtgaaaaggagctggtgatgtccggtgctcctgtcctggctgacacagctaggtcctcaGCATTTGCTATTACTGCCTGTAAGATGGGGAGCAGTGAGGGGCTCCAGGCACTCAGGAAACCCAGAACTCCCACAAGCGGGCAGGGTGGGGTAGGCGAAATTTCAGGGAGAAGGCAGTCTAGAGCAGATCACGGAGAGGGACGCTCCAGGCTTGGGAGACAGACACTCCGCAAGAGAACGCCATGGAGGACGAAGCACCAGAGCAACAGCAAGCAGCACTTCTGGCTGGAGCTGTGCCTTTA i macFas5.chr11 C 0 I 314 s papAnu2.chr11 9250100 413 + 132286798 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ggccaggtgcggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtggatggatcacgtggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatccctactaaaaatacaaaaattagctgggcatgctttcatgcacatgtaatcctagctactcaagaggctgagacaggagaattgcttgaacctgggaggcagag-gttgcagtgagctgagatcacaccattgcactttagcctgggcaacatagtgagactctgtcccaaaaaataaaaaGTAACTGAATAAATA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30436694 307 + 132286798 ggccaggtgcggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtggatggatcacatggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatccctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtgctttcatgcacatgtaatcctagctactcaagaggctgagacaggagaattgcttgaacctgggaggcagag-gttgcagtgagctgagatcacaccattgcactttagcctgggcaacatagtgagactctgtcccaaaaaataaaaagtaaatgaataaata i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30702601 307 + 128539186 ggccaggtgcggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtggatggatcacgtggtcaggagttcaagaccagcccggccaacatggtgaaaccccatccctactaaaaatacaaaaattagctgggcatgctttcatgcacatgtaatcctagctactcaagaggctgagacaggagaattgcttgaacctgggaggcagag-gttgcagtgagctgagataacaccattgcactttagcctgggcaacatagtgagactgtgtcccaaaaaataaaaagtaaatgaataaata i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88087105 299 - 124281992 GGTGgggcgcggtggctcacacctataatcccagcactttgggaggccaaggcgcactaatcacgaggtcaggatctcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccgtccctactaaaaacaca-aaattgactgggtgtggtggtgtgcacatgtaatcccagctattcaggaggctggggcaggagaatcacttgaacccgggggggggggagttgcaatgagctgagatcacgccattgcactccagcctgagcagtgtagtgagactctgtcccaaaaaattaaa--------aataaata i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 41567435 101 + 45876710 I a score=976289.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 121677 312 + 238139 aaatgttcccataatgtaagaaatttaaattgtttttgattttcctttattataaattgctctttaatgagcactctaacacataagatatttgatagcttttcttattattttcttaatatggagttttagaagtgcagttactggtccaaagatatgccttt-----------------agtgcccttagccttagttcttaaggcttgtagtac-cctttgcaaagaggcttttctcaaaggttttgacacgctatactccac-cagtgctggagtagagggctgcatcatgttagcagttatcagcttaaaaatctgtgcacatttg s panTro4.chr12 77035163 312 - 134246214 aaatgttcccataatgtaagaaatttaaattgtttttgattttcctttattataaattgctctttaatgagcactctaacacataagatatttgatagcttttcttattattttcttaatatggagttttagaagtgcagttactggtccaaagatatgccttt-----------------agtacccttagccttagttcttaaggcttttagtac-cctttgcaaagaggcttttctcaaaggttttgacacgctatactccac-cagtgctggagtagagggctgcatcatgttagcagttatcagcttaaaaatctgtgcacatttg i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32219827 312 + 136387465 aaatgttcccctaatgtaagatatttaaattgtttttaattttcctttattataaattgctccttaatgaacattctaacacataagatatttgatagcttttcttattattttcttaatatggagttttagaattgtagttactggtctgaggatataccttt-----------------agcacccttagccttagttcttaaggattttagtac-cctttgcaaagaggttttcctcaaaggttttgacacgctatactccat-cagtgctggagtagagggcTGCAGCATATTAGCAGTTATCAGCTTAAAAATCTGTGCACATTTG i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 156738 312 + 34552619 aaatgttcccctaatgtaagatatttaaattgtttttagttttcctttattataaattgctccttaatgagcactctaacacataagatattggatagcttttcttattattttcttaatatggagttttagaagtgcagttactggtctgaggatatgccttt-----------------agtacccttagccttagttcttaaggcttttagtac-cctttgcaaagaggttttcctcaaaggttttgacacgctatactccat-cagtgctggagtagagggccgcataatattagcagttatcagcttaaaaatctgtgcacatttg i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31278978 324 + 134985053 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aaatgttcccCTAATGtaagatat-----ttgtttttaattttcctttattataaatTCCTCCTTAATGAGCACTCTAACACATAAGATATTTGATagcttttcttattattttcttaatatggaGTTTTAGAAGTGCAGTTACTGGTCCGAGGATAGGCCTTT-----------------AGTACCCTTAGCCTTAGTTCTTTAGGCTTTTAGTAC-CCTCTGCAAAGAGGTTTTCCTGAAAGCTTTTGACAAGCTATACTCCAC-CAGTGCTGCAGTAGAGGGCTGCATCATATAAGCAGTTATCAGCTTAAAAATCCGTGCGCATTTG i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30702908 307 + 128539186 aaatgttcccctaatgtaagatat-----ttgtttttaattttcctttattataaattcctccttaatgagcactctaacacataagatatttgatagcttttcttattattttcttaatatggagttttagaagtgcagttactgatctgaggataggccttt-----------------agtaccctgagccttagttctttaggcttttagtac-cctctgcaaagaggttttcctgaaaccttttgacaagctatactccac-cagtgctggagtagagggcTGCATCATATTAGCAGTTATCAGCTTAAAAATCCGTGCGCATTTG i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88087404 295 - 124281992 aaaTGTtctcctaatgtaagatatttaaat---------------tttattataaattgctccttaatgagcactttcatgcataaaatatttgataccttttcttattgttttcttagcacggagttttagaagtgcagttactggtctgaggataGACCTTT-----------------AGTACCTTTAGCCTTAGTTCTTAAGGCTTTTCATAG-TCTCTGCAAAGCAGTTTTTCTCAAAGGTTTTGACATGTTATCCTCTAC-CAGTGCTGGAGTAAAGGGCTGTATCATATTAGCAATTATCAGCTTAAAAATCTGTG--CTGTTG i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 41567536 295 + 45876710 aaccattcccctgctgtaagacgctcaagttgtttctaattctccttgactacaaatcgctctctaatgaatacactcacgcataatatatctgacagcatttctgatcattttctcagagtggattctcagaagcacagttactggtcaggggacgggccgat------------------------------------tttaaggctctccatacttctctgtgaagttgtctagtgcaaagagtgcagcaccttacgctccctgcagctctgagttgtagggctgcatcacactggcaatgatcggtttgaaaatcaaggcacattgg i canFam3.chr27 I 101 C 0 a score=409345.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 121989 131 + 238139 gaaggcaagatggcatgcacctg--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccagaaatttgagcctgcagtagctatgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt s panTro4.chr12 77035475 131 - 134246214 gaaggcaagatggcatgcacctg--tagtcccagctactagggaggctaaggcagaagaatcacttgaggccagaaatttgagcctgcagtagctatgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32220139 131 + 136387465 GAAggcaagatggcatgcacctg--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccagaaatttgagcctgcagtagctatgattgcaccactgcactacagcctgagcaacaaggt i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 157050 131 + 34552619 gaaggcaagatggcacgcacctg--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttcgggccagaaatttgagcctgcagtagctatgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31279302 131 + 134985053 GAAggcgagatggcgtgcagcta--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccaggaatttgagcctgcagtaggtgtgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i rheMac3.chr11 C 0 I 1047 s macFas5.chr11 31745185 131 + 137757926 GAAggcgagatggcgtgcagcta--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccaggaatttgagcctgcagtagctgtgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i macFas5.chr11 C 0 I 1042 s papAnu2.chr11 30437308 131 + 132286798 GAAGGCGAGATGGCGTgcagcta--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccaggaatttgagccTGCagtagctgtgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i papAnu2.chr11 C 0 I 1043 s chlSab2.chr11 30703215 131 + 128539186 GAAAgcgagatggcgtgcaccta--tagtcccagctactagggaggctgaggcagaagaatcacttgaggccaggaatttgagcctgcagtagctgtgattgcaccactgcactccagcctgagcaacaaggt i chlSab2.chr11 C 0 I 1082 s calJac3.chr9 88087699 133 - 124281992 GAAACcgagatggtgtgcacctgtatagtcccagctagtagggagggtgagacagaagaatcacctgaggccaggaatttgagcctacagtagctgtgattgcaccacagcactccagcctgggcaacaaggt i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 41567831 0 + 45876710 C a score=10419.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 122120 16 + 238139 gagatcctatctctat------- s panTro4.chr12 77035606 16 - 134246214 gagatcctatctctat------- i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32220270 16 + 136387465 gagatcctatctctat------- i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 157181 23 + 34552619 gagatcctgtctctattaaaaaa i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88087832 15 - 124281992 -agattctctctctat------- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30703346 1082 + 128539186 I e rheMac3.chr11 31279433 1047 + 134985053 I e papAnu2.chr11 30437439 1043 + 132286798 I e macFas5.chr11 31745316 1042 + 137757926 I e canFam3.chr27 41567831 0 + 45876710 C a score=697417.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 122136 691 + 238139 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gaaagaaagaataataataaagaaaaaagaaaggcaaaaagtagtatactattattgccataatttgga--tttctttgattactagtgatgttctgcattccttctcatgttt----attgattgctagta---tttcATGTACAAACCTAGTTACAGCAACAACCAGCAAGCCACAACTCTCAAACATCCTTGCCATCTTAGTGCCATTGCTGTAATATATAAAACACACATTAAATCACAGCAGTTAA-TATTGTGCTCGTGGTTAATACCACAGTGCAGTagagacaggc-tgacatagcgtgagaagca-gaggttccaagccagacagccctgggtttaaatgtctcctccctcatggaccagccatgtgaccttggcaaagtaacttaaccgctcttaccttgggtgtcatctgccgtggagctataaaatgaaacagtcatcacttccttccaggg-ccccatgagaatcaggtgaggatgacacaggggaggcaggtacacacggccacacacCTGAGGGGACTCAGCAGGGGGCAGTAATGACCACAGGGGACACTACTAAAGGGCCGAGTATGCAGAGCTCCCATCCC-GGAGAGAAGGAGGGAAGAGGATGATGCCAGTGATACTGGGCTGTATTGTTAGGTCACTAAAGTCCAGTGTGGCATCCAAAAGTGTGCCTGTCAGACCGAGTCTTC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32220286 695 + 136387465 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a-aaaTTACCCAAACTGCCTTCTCAACACCACGGCTAATGAAAAAGGCTGCCTTGGTCTCTCCTTCCCTGATCTTAgcttttctttctatctct i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 163202 94 + 34552619 gaaaaTTACCCAAACTGCCTTCTCAACACCATTGCCAATGAAAAAGCCTGCCTTGGTCTCTCCTTCCCTGATCTTAGCCTTTCTTTCTATCTCT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s canFam3.chr27 41575013 93 + 45876710 G-AAATTACCCAAACTACCTTTTCAACACCACGGCTAATGCAAAAGACTGCCTTGATCCTTCCCTCCCCGATCTTAGCTAAATATTTCATCTTT i canFam3.chr27 C 0 N 0 e chlSab2.chr11 30709252 1 + 128539186 I e calJac3.chr9 88096742 3857 - 124281992 I e rheMac3.chr11 31285383 1 + 134985053 I e papAnu2.chr11 30443332 0 + 132286798 C e macFas5.chr11 31751186 0 + 137757926 C a score=379135.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 129618 737 + 238139 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s panTro4.chr12 77045868 1526 - 134246214 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i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31287081 1487 + 134985053 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i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30445052 1505 + 132286798 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i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30710942 1495 + 128539186 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i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88100977 3325 - 124281992 I e nomLeu3.chr23 165728 1255 + 34552619 I a score=652285.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 133885 285 + 238139 ctctttggttcaggtaaatccaagat-gaaattagatgtctggacaacatg-ccgaaaagaag-----aaaaaaaagaaaagagaaattagatattgaggtggaaatgccaagtgggcagatggatacacccatcctgagttctgaggagaagtctgccctagaggctatggacaaatctacgcaaagatgacacttagcatccaagaattgcagaagattagccacggagggagtgcaggtgggaaagacgacccaggcctgagcccAGATGGAGGGGCCTG---------------------GCAGAAGCA s panTro4.chr12 77047394 285 - 134246214 ctcttttgttcaggtaaatccaagat-gaaattagatgtctggacaacatg-ccgaaaagaag-----aaaaaaaagaaaagagaaattagatattgaggtggaaatgccaagtgggcagatggatacacccatcctgagttctgaggagaagtctgccctagaggctatggacaaatctacgcaaagatgacacttagcatccaagaattgcagaagattagccagggagggagtgcaggtgggaaagaggacccaggcctgagcccAGATGGAGGGGCCTG---------------------GCAGAAGCG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32231748 306 + 136387465 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gaggagcagttgccaccagggcagTTCTGCAGAACTAGCTgaacttgacaaaaccccagaggcagcagtagagagccatagatatgactgagattaagcttcatacctgggctgaatgaaggctta-gagtcagaaatgttccctgttacagaaaaATTTTAAACTTGTACTTCTTggccaagtgtggtggctcaggcctatgattccaacactttgagaggccaaagtaggagaattgcctgagcccagaagttcaagaccagcctaggcaacatagggagttccatgactctacaaaaaatttaaaaattagctgggtgtgccttgtaacgt---c-------ctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtgggaggatcacctgag i ponAbe2.chr12 C 0 I 523 s nomLeu3.chr23 167267 386 + 34552619 GAGGAGCAGTTGCCACCAGGGCAGCTCTGCAGAACTATCTGAACTTGACAAAACCCCAGAGGCAGCAGTAGAGAGCCATAGATATGACTGGGATTAAGCTTCATACCTGGGCTGAATGAAGGCTTA-GAGCCAGAAATGTTCCCTATTACAGAAAAATTTTAAACTTGTACTTCTTggccaggtgtggtggcccaggcctatgattccaacactttgagaggccaaagtaggagaattgcctgagcccagaagttcaagaccagcctaggcaacatagggagaccc-tgactctacaaaaaatttaaaaattagctgggtgtg----gtggtgcacacccagcagctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtgggaggatcacttgag i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31288857 378 + 134985053 GAGGAGCAGTTGCCACCGCGGCAGCTTAACAGAACTGTCTAAACTTGATGAaaccccaaaggcagcagtagagaaccatagatatgactgggattaagcttcatgcctgggctgaatgaaggctta-gagtcagaaatgttccctgttacagaaaaATGTTAAATTTGTACTTCTTggctaggtgtggtggctcaggcctaggattcc-acactttgagaggccacagtaggagaaatgcctgagcccagaagttcaagaacagcctaggcaacatagggagaccc-tgactctacaaaaaatttaaaaattagctggctgtg----gtggtgcacac-------ctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtcggaggatcgcttgtg i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31754660 378 + 137757926 GAGGAGCAGTTGCCACCGCGGCAGCTTAACAGAACTGTCTAAACTTGATGAaaccccagaggcagcagtagagaaccatagatatgactgggattaagcttcatgcctgggctgaatgaaggctta-gagtcagaaatgttccctgttacagaaaaATGTTAAATTTGTACTTCTTggctaggtgtggtggctcaggcctaggattcc-acactttgagaggccacagtaggagaaatgcctgagcccagaagttcaagaacagcctaggcaacatagggagaccc-tgactctacaaaaaatttaaaaattagctggctgtg----gtggtgcacac-------ctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtcggaggatcgcttgtg i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30446827 378 + 132286798 GAGGAGCAGTTGCCACCGCGGCAGCTCTACAGAACTGTCTTAACTTGATGAAACCCCAGAGGCAGCAGTAGAGAACCATAGATATGACTGGGATTAAGCTTCATGCCTGGGCTGAATGAAGGCTTA-GAGTCAGAAATGTTCCCTGttacagaaaaatgttaaatttgtacttcttggctaggtgtggtggctcaggcctaggattcc-acactttgagaggccaaagtaggagaaatgcctgagcccagaagttcaagaacagcctaggcaacatagggagaccc-tgactctacaaaaaatttaaaaattagctggctgtg----gtggtgcacac-------ctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtcggaggatcgcttgtg i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30712726 378 + 128539186 GAGGAGCAGTTGCCACCGTGGCAGCTCTACAAAACTGTCTTAACTTGATGAaaccgcagaggcagcagtagagaaccacagatatgactgggattaagcttcatgcctgggctgaacgaaggctta-gagtcagaaatgttccctgttacagaaaaatgttaaatttgtacTTCTTggctaggtgtggtggctcaggcctatgattcc-acactttgagaggccaaagtaggagaaatgcctgagcccagaagttcaagaactgcctaggcaacatagggagaccc-tgactctacaaaaaattttaaaattagctggctgtg----gtggtgcacac-------ctgtggtc----ccagctgctcaggaggctgaggtcggaggatcgcttgtg i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88104302 383 - 124281992 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cccagaaggtcaaggctgcattaagatgtgatcattccactgcactcgagcctgggcaacagaacaaggccctgtttaaa--aaTAATAATAAATTTCTTAAAAATATAtttgttttgagacagagtctcactctgtcacccaagctggagtgcagtgacatgatc i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31289235 164 + 134985053 cccggaaggtcaaggcttcattaagatgtgatcatgccactgcactccagcctgggcaacagatcaaggccctgtttcga--aaaaataataaaTTTtttaaaaaaatatttgttttgagacagagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcgatc i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31755038 164 + 137757926 cccggaaggtcaaggcttcattaagatgtgatcatgccactgcactccagcctgggcaacagatcaaggccctgtttcga--aaaaataataaaTTTTTTAAAAATATAtttgttttgagacagagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcgatc i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30447205 164 + 132286798 cccgGAAGGTCAAGGCTTCGTTAagatgtgatcatgccactgcactccagcctgggcaacagatcaaggcCCTGTTtcga--aaaaataataaattttttaaaaaaatatttgttttgagacagagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggtgtgatc i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30713104 164 + 128539186 cccggaaagtcaaagcttcattaagatgtgatcatgccactgcactccagcctgggcaacagatcaaggccctgtttcga--aaaaataataaattttttaaaaaaatatttgttttgagacggagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggcatgatc i chlSab2.chr11 C 0 I 47 s calJac3.chr9 88104685 164 - 124281992 ccgagaaggtcaaggctgcattaagatgtcatcatgccactgcactccagcctgggcaacagggcaaggccctgtttcaaagaaaaataataaatttt--aaaaaaaaattttttttgagacagagactcactctgttacccaagctggagtgcagtgacacaatc i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32232435 523 + 136387465 I a score=232697.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 134713 142 + 238139 -tctgctcacggcaacctccacctcccaggttcaagcctttctcctgcctcagccccccaa-gtagctgggcccacaggcacctgccaccacacccagctgatttctgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggcc s panTro4.chr12 77048222 142 - 134246214 -tctgctcacggcaacctccacctcccaggttcaagcctttctcctgcctcagccccccaa-gtagctgggcccacaggcacctgccaccaaacccagctgatttttgtatttttagtagagatggggtttcaacatgttggcc i panTro4.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 167817 142 + 34552619 -tctgctcacggcaacctccacctcccaggttcaagccattctcctgcctcagccccccaa-gtagctgggcccacaggcgtctgccaccacacccagctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatattggcc i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31289399 142 + 134985053 -tcagctcactgcaagttccacctcccgggttcacgccattctcctgactcagcctcccga-gtagctggcaccacaaacacccgccaccatgcccagctaatttttgtatttttggtagagatggggtttcaccatgttggcc i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31755202 142 + 137757926 -tcagctcactgcaagctccacctcccgggttcacgccattctcctgactcagcctcccga-gtagctgggaccacaaacacccgccaccatgcccagctaatttttgtatttttggtagagatggggtttcaccatgttggcc i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30447369 142 + 132286798 -tcggctcactgcaagctccacctcccgggttcacgccattctcctgattcagcctcccaa-gtagctgggaccacaagcgcccgccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggcc i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88104849 144 - 124281992 actcactcacggcaatctctgcctcccaggttcaagccattctcccgcatcagcctcctgaggtagctgggactacaggcacctgccaccacacccagctaaattttgtatttttagcagagatggggtttcaccatgttggcc i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32232435 523 + 136387465 I e chlSab2.chr11 30713268 47 + 128539186 I a score=230572.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 134855 98 + 238139 aggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacccgcctcagcttcccaaagtgctgggattacaggtgtaagccaccgcgcctggccTaaaata s panTro4.chr12 77048364 98 - 134246214 aggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtaagccaccgcacctggcctaaaata i panTro4.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 167959 98 + 34552619 aggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtaagccaccgcgccgggccTAAAGTA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31289541 98 + 134985053 aggctggtctcgaactcctgacctcagatgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggctttaaaaa i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31755344 98 + 137757926 aggctggtctcgaactcctgacctcagatgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggatttaaaaa i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30447511 98 + 132286798 aggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggctttaaaaa i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30713315 98 + 128539186 aggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggccTTAAAAA i chlSab2.chr11 I 47 C 0 s calJac3.chr9 88104993 98 - 124281992 aggttggtctagaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaagcatgagtcactgcgcccagccTAAACAA i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32232435 523 + 136387465 I a score=910.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 134953 1 + 238139 a s panTro4.chr12 77048462 1 - 134246214 a i panTro4.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 168057 1 + 34552619 A i nomLeu3.chr23 C 0 M 100 s calJac3.chr9 88105091 1 - 124281992 A i calJac3.chr9 C 0 I 6 s canFam3.chr27 28382390 1 - 45876710 a i canFam3.chr27 N 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32232435 523 + 136387465 I e chlSab2.chr11 30713413 0 + 128539186 C e rheMac3.chr11 31289639 0 + 134985053 C e papAnu2.chr11 30447609 0 + 132286798 C e macFas5.chr11 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cactacTCataaaaataattacataaaattttat-atatGCATAATTAACCG---GGTTATGTATATGTCATTATATGAGTGTTAC-AAAATAATCAGTGCCCTGAAGGCAAAGAAAGAACTAGGAAAGAGAATGGGAAGGGGCTCAGTCGAGATACAGCCTTC----AAGGAAAGCGTCTCTTAAG i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31755496 178 + 137757926 cactacTCATAAAAATAATTACATAAAATTTTAT-ATATGCATAATTAACCG---GGTTATGTATATGTCATTATATGAGTGTTAC-AAAATAATCAGTGCCCTGAAGGCAAAGAAAGAACTAGGAAAGAGAATGGGAAGGGGCTCAGTCGAGATACAGCCTTC----AAGGAAAGCGTCTCTTAAG i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30447663 178 + 132286798 CACTactcataaaaataattacataaaattttat-atatgcataattaACCA---GGTTATGTATATGTCATTATATGAGTGTTAC-AAAATAATCAGTGCcctgaaggcaaagaaagaacTAGGAAAGAGAATGGGAAGGGGCTCAGTCGAGATACAGCCTTC----AAGGAAAGCGTCTCTTAAG i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30713467 178 + 128539186 cactacTCATAAAAATAATTACATAAAATTTTAT-ATAGGCATAATTAACCA---GGTTATGTATATGTCATTATATGAGTGTTAC-AAAATAATCAGTGCCCTGAAGGCAAAGAAAGAACTAGGAAAGAGAATGGGAAGGGGCTCAGTCGAGATACAGCCTTC----AAGGAAAGCGTCTCTTAAG i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88105152 178 - 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papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30713655 188 + 128539186 AGCATTTCTCCTTTCCAGTCAGACCTCTGCTGCAAACATGCT-CCACCAGATCCTCGGCCAGGCC---AAGAAGCTTCCAAGCGTGATCCTCCTCTTAATATTTATTGGAGCTGGAGGTCCTGGAGCAGCACTGTATGTCTTGCATCTGGCACTGTTCAATCAGATGTTAGTAGGGGCAGAAAGAATAACCC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88105340 189 - 124281992 AGCATTTCTCCTTTCCAATCAAACCCCTGCTGCAAACGTGCTCCCCCCAGATCCTCAGCCAGGCC---AAGAAGCATCCAAGCTTGATCCTCCTCTTAATATTTATTGGAGCTGGAGTTCCTCGAGCAGCACTGTATGTCTTGCATCTGGCACTGTTCAATCAGATGTTAGTAGGTAAAGAAAGAATAACTC i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28382628 3 - 45876710 I a score=892883.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 135384 304 + 238139 AAAAACCCTGAGACAAACTGGGTGCCAATGATCAGTACAAGTTCAACTCGGTGAATG--TGGATTACAGCAAACTGAAGCAAGAAGGCCCAGATTTCTAAATGAAATGTTTCACTCTAAAGCTGCTTAGAATGAAGCTCTTCCAGGAGCCATCCGCACAATTTCCCACTTAACCAGGAAACATTTCTCCTCTAAAATACATGAAATCATCTTGACGTATTATTTTGGAGATTACACTAATTAATACATATCCGAGACTCGAAAAAAACTAAAAAAGAAGGTTTCATAAACAGAAGACAATTCAAGG s panTro4.chr12 77048893 303 - 134246214 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i papAnu2.chr11 I 4 C 0 s chlSab2.chr11 30715733 1258 + 128539186 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ttaatttttatttattttttatttttTGAGGAATTAACAGTCTTTATTGGGCTCAGATCAGGAGGCCGTGGGTCTTGAGGACCTCTGTGTATTTGTCAATTTTCTTCTCCACGTTCTTCTCGGCCTGTTTCCGTAGCCTCGTGAGCTGTTTCTTCTTCCCGTAGTGGATCTTGGCTTTCTCCTTCCTCTTCTCCTCCAGGGTGGCTGTCCCTGCCTGGTACTTCCAGCCAAACTCGTGAGCCAGGCGCCCCAGATACGCAAACTTTCTTGTAGGCTTCAGACGCACAACCTTGAGCGCAGCAGGAACCACCATCCGCTTTTTCTTGTCGTAGGGCGGTGGGATGCCGTCAAACACCTTGAGACGGTCCAGAGCGGCCTGGCCTCGCTTGGTCTTGTGGGTCAGCATACCTCGCACGGTCC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32240600 413 + 136387465 tttattttta-----ttttta-tttttGAGGAATTAACAGTCTGTATTGGGCTAAGACCAGGAGTCCGTGGGTCTTGAGGACCTCTGTGTATTTGTCAATTTTCTTCTCCACGTTCTTCTCGGCCTGTTTCCGTAGCCTCTTGAGCTGTTTCTTCTTCCGGTAGTGGATCTTGGCTTTCTCTTTCCTCTTCTCCTCCAGGGTGGCTGTCACTGCCTGGTACTTCCAGCCAACCTCGTGAGCCAGGCGCCCCAGATAGGCAAACTTTCTTGTAGGCTTCAGACGCACAACCCTGAGGGCAGCAGGAACCACCATCCGCTTTTTCTTGTCGTAGGGCGATGGGATGCCGTCAAACACCTTGAGGC-GTCCAGAGCGGCCTGGCCTCGCTTGGTCTTGTGGGTCAGCGTACCTCGCACGGTCC i ponAbe2.chr12 C 0 I 294 e chlSab2.chr11 30720747 16 + 128539186 I e calJac3.chr9 88113098 0 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macFas5.chr11 C 0 I 1 s papAnu2.chr11 30457120 175 + 132286798 CAGAGTTAAATGGCATAAAACTCAGAT-TTTCAAAGCCGGTTGATTTAATCCGGGACACATAAGACTAGGATCAAATAAGTGAAGTAAATGATTCAAATGCAATGACTTCTGTTGTTT--TTC-------------------CTAAAACTATTCTATGGCCTAATTTTCAGAAACTA--TTTTAGgacaaaaaagaacc i papAnu2.chr11 C 0 I 1 s chlSab2.chr11 30722576 175 + 128539186 CAGAGTTAAATGGCATAAAACTCAGAT-TTTCAAAGCCGGTTGATTTAATCTGGGACACATAAGACTAGGATCAAATAAGTGAAGTAAATGATTCAAATGCAATGACTTCTGTTGTTT--TTC-------------------CTAAAATTATTCTATGGCCTAATTTTCAGAAACTA--TTTTAGGACAAAAAAGAACC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88118193 173 - 124281992 C--AGTTAAATGGCATAGAACTCAGAT-TTTCAAAGCCAGTTGATTTAATCTGGGACACGGAAAAGTAGGATCAAATAAGTGAAGTAAATGATTCAAATGCAATGACTTCTGTTGTTT--TTC-------------------CTAAAATTCTTCTGTGGCCTAATTTTCAGAAACTA--TTTTAGGATAAAAAAGAACC i calJac3.chr9 C 0 I 181 s canFam3.chr27 28391629 173 - 45876710 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CAGAGCTTCTTTTTAAAAAAATAAA-TAATATTAAGTCAAAGAGGAAAACAAATATAACATCAAACTATTTGCAAAATAATGAAAAT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31299318 87 + 134985053 CAGAGCTTCttttttaaaaaataaaataatattaaGTCAAAGAGGAAAACAAATACAACATCAAACTATTTGCAAAATAATGAAAAT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31765198 87 + 137757926 CAGAGCTTCTTTTTAAAAAAATAAAATAATATTAAGTCAAAGAGGAAAACAAATATAACATCAAACTATTTGCAAAATAATGAAAAT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30457349 87 + 132286798 Cagagcttcttttttaaaaaataaaataatattaagccaaagaggaaaataaatataacatcaaactatttgcaaaataatgaaaat i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30722804 87 + 128539186 CAGAGCTTCTTTTTTAAAAAATAAAATAATATTAAGTCAAAGAGGAAAATAAATATAACATCAAACTATTTGCAAAATAATGAAAAT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88118595 85 - 124281992 CAGAGTTTCTTTTCTAAAAAATAAAATAATATTGAGTCAAAGAAGAAAACAAATATAACATCAAACTA--TGCAAAATAATGAAAAT i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28392144 87 - 45876710 cGGGACTTCATTTTTTTTAAGTAAAATAATATTGAGTCAAAGAAAAGGATAAATATAATATTAAGCTATTTGCAAAATAATAAAAGT i canFam3.chr27 I 290 I 350 a score=1200690.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 145611 425 + 238139 TGGCTGGGGGCAGTGGCTTactttgggaggctgaggcaggtgaatcacctgag-acaagagttcaagaccggcctaggcaacatag---tagg----acc-tcatctc---------tacaaaaaatac-aaaaaattcatgggacatggtggtacacacctgtagtcccagctactaaagaggctgaggtggaaagaccacttgagcctgggaagttgaggctgcagtgagcaatgagtatgccactgcagtccagccATGTCTC-AAAAACATCACaataataatgaaaatgagaacaatgcatagaaaacttagtttaggggttgta--caagctacagcgtaactcataaccttaaatgtttttcttctt----agaaa-aaatctaactcttcaactcaaaaaa--ttagaatagctaaaacgaatctaagaaaagagaaaaggaaaat s panTro4.chr12 77060757 432 - 134246214 TGGCTGGGGGCAGTGGCTTactttgggaggctgaggcaggtgaatcacctgag-acaagagttcaagaccggcctaggcaacataggcctaggca--acc-tcatctc---------tacaaaaaatac-aaaaaattcatgggacatggtggtacacacctgtagtcccagctactaaagaggctgaggtggaaagaccacttgagcctgggaagttgaggctgcagtgagccatgagtatgccactgcagtccagccATGTCTC-AAAAACATCACaataataatgaaaatgagaacaatgcatagaaaacttagtttaggggttgtagccaagctacagcgtaactcataaccttaaatgtttttcttctt----agaaa-aaatctaactcttcaactcaaaaaa--ttagaatagctaaaacgaatctaagaaaagagaaaaggaaaat i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32243747 435 + 136387465 TGGCTGGGGGCAGTGGCTcactttgggaggctgaggcaggtgaatcacctgag-acaagagttcaagaccggcctaggcaacatag---taggtaggacc-tcatctc---------tacaaaaaatac-aaaaaattcatgggacatggtggtacacacctgtagtcccagctactaaagaggctgagatggaaagaccacttgagcctggaaagttgaggctgcactgagccatgagcatgccactgcagtccagccATGTCTC-AAAAACATCATAATAATAATGAAAATGAGAACAATGCATAGAAAACTTAGTTTAGGGGTTGTAGCCAAGCTACAGCGTAACTCATAACCTTAAATGTTTTTCTTCTTAAAAAAAAA-AAATCTAACTCTTCAACTCAAAAAA--TTAGACTAGCTAAAACAAATCTAAGAAAAGAGAAAATGAAAAT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 178041 437 + 34552619 TGGCTGGGGGCAGTGGCTcactttgggaggctgaggcaggtgaatcacctgag-acaagagttcaagaccggcctaggcaacatag---tagg----acc-tcatctctacaaaaaatacaaaaaatac-aaaaaattcatgggacatggtggtacacacctgtagtcccagctactaaagaggctgaggtggaaagaccatttgagcctgggatgttgaggctgcagtgagctatgagcgtgcctctgcagtccagccATGTCTC-AAAAATATCACAATAATAATGAAAATGAGAACAATGCATAGAAAACTTAGTTTCAGGGTTGTAGCCAAGCTACAGCGTAACTCATAACCTTAAATGTTTTTCTTCTT----AAAAATAAATCTAACTCTTCAACTCAAAAAA--TTAGAATAGCTAAAACAAATCTaagaaaagagagaatgaaaat i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31299405 416 + 134985053 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papAnu2.chr11 30457436 422 + 132286798 tggttgggcacagtggctcactttgggaggctgtggcaggtgaatcacctgagcccaagagttcaggaCCGGCCTAGACAACATAG---Aggg----atc-tcatctc------------------tac-aaaaaatttgtgggacatggtggtacacacctgtagtcccagctagtaaagaggctgaggtggaaagatctcttgagcctgggaagttgaggctgcagtgagccatgagcatgccactgcagtccagccctgtctc-aagaaaatcacaataataatgaaaatgagaaCAATGCATAGAAAACTTAG-TTAGGGGTTATAGTCAAGCTACAGTGTAACTCATAAccttaaatgtttttcttctt--taaaaaa-aaatctaactcttcaactcaaaaaattttagaatagctaaaacaaatctaagaaaagagaaaatgaaaat i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30722891 420 + 128539186 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tGCAAATCGCTGT--TGTTCCTTGACA-ACGAGAAGAAACTGAATAtgctttgtga--------tggttaattttgtatgtCAGATTGGCGAAGTCATAGTACCCAATTTATTCAATTAAACACAAATCTAGGTGAAGGTATTCTGTAGATATGGTTAACAGCTACACTTAATTGACTTTAAATAAAGGAGATAATCTTTTATAACCTAGGTGGGCTTCATGCAACcaggtttaaattttttctcaaagtaaaaaa----atttttaaaggaaggtaaatggctgggcacagtggctcacacctgtaatcctagcactttgggaggcgaaggcgggagACTTGCTTGTGTCctggtgttcaagaccagcctgggcaacataatgagaccctgtctctacaaaaaattaaaatatcagccaggtgtggtggcatgtgcctgtagtcccagctactggagaggctgaagcaggaggatcgtttgagccttgGAGTTTAGGGGTGAAACAAGCCAgaatcgcaccattgcacaccagcctgggtgacacagcaagaccttgtctctaaaa i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30730156 552 + 128539186 TGCAAATGGCTGT--TGTTCCTTGACA-ACGAGAAGAAACTGAATATGCTTtgtga--------tggttaattttgtatgtcagattggcgaagtcatagtacccaatttattcacttaaacaccaatctaggtgaaggtattctgtcgatatggttaacagctacacttaattgactttaaataaaggagataatcttttataacctaggtgggcttcatccaaccagGTTTAAATTTTTTCTCAAAGTAAAAAA----ATTTTTAAAGGAAGGTACATgactgggcacagtggctcacacctgtaatcctagcactttgggaggccaaggcaggagacttgcttgtgtcctggtgttcaggaccagcctgggcaacataatgagaccctgtctctacaaaaaattaaaataccagccaggtgtggtggcatgtgcctgtagtcccagctactggagaggctgaagcaggaggatcgtttgagccttggagtttaagggtgaaacaagccagagttgcaacattgcacaccagcctgggtgacacagcaagaccttgtctctaaaa i chlSab2.chr11 C 0 I 1 s calJac3.chr9 88126457 557 - 124281992 T-CAAATGACTGTTATGTTCCCTGATAGACAAGAAGAAACTGAATATGCTTCgtga--------tggttacttttataagtcagattggtgaaatcattgtacccagtttattcaattaaacacaaatctaggtgaaggtattctctagatatggttaatagctacacgtaattgactttaagtaaaggagattatcttttataacctaggtgggcttcatccaaccagGTTTACATTTTTTCTCAAAGTAAAAAAAAAAACATTTAAAGGCTGGTAAATggctgggcacagtgattcacacctgtaatcctagcactttgggaggctaaggcaggaggcttgcttgtgtcctggtgttcaagaccagcctgggccacataatgaga-catgtctctacaaaaaattaaaatatcagccaggtgtggtagcacgtgcctgtagttccagatactcttgaggctgaggcaggagaatcatttgagccttggagtgtaagggtgaagcaagccagaattgcaccattgcactccagcctgggtgatacagcaagaccttgtctccaaaa i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28398112 1116 - 45876710 I a score=164367.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 152769 73 + 238139 aGGTTTTTT-aaaagaaggagggtaaatggagtgaaagtgtttaaagccctcacattgtccagaaactggtgac s panTro4.chr12 77067907 73 - 134246214 aGGTTTTTT-aaaagaaggagggtaaatggagtgaaagtgtttaaagccctcacattgtccagaaactggtgac i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32250879 74 + 136387465 aGGTTTTTTaaaaagaaggagggtaaatggagtgaaagtgtttaaagcccccacattgtccagaaactggtgac i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 185825 74 + 34552619 aGGTTTTTTaaaaagaaggagggtaaatggagttaaagtgtttaaagccctcacgttgtccagaaactggtgac i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31307332 73 + 134985053 aaGTTTTTTaaaaagaacgagggtaaatggagtgaaagtgtttaaagccctcacattgtccagaaactggtga- i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31772786 73 + 137757926 aCGTTTTTTaaaaagaacgagggtaaatggagtgaaagtgtttaaagccctcacattgtccagaaactggtga- i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30465250 73 + 132286798 aagttttttaaaaagaaggagggTAAATGGAGTGAAAGTGTTTAAAGCCCTCACATTGTCCAGAAACTGGTGA- i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88127014 74 - 124281992 aaGCTTTTTaaaaagaaggagggcaaatggagtgaaagggtttaaagctctaatactgtccagaaactggtgat i calJac3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30730708 1 + 128539186 I e canFam3.chr27 28398112 1116 - 45876710 I a score=315168.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 152842 140 + 238139 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chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88128917 275 - 124281992 Tggccaggcgtggtggctcatgcctgtaatcccagaactttgggaggccaaggtgggtggatcaccagaggtcgggagttcaagaccagcctgaccaatatggagaaaccctgtctctactaaaaatacaaaactggcccagtgtggtggcaaatacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcggagcttgcagtgaactggaatggccccactgcactccagtctgggcaac-agatcgagaat i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28400524 184 - 45876710 I a score=33724.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 154343 28 + 238139 ccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa s panTro4.chr12 77069494 27 - 134246214 ccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa- i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32252466 24 + 136387465 ccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaa---- i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 186327 22 + 34552619 ccatctcaaaaaaaaaaaaaaa------ i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31309221 15 + 134985053 ccatctccaaaaaaa------------- i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31774366 15 + 137757926 ccatctccaaaaaaa------------- i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30466834 15 + 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AATCTAATGTATATGTCACTAATGCTAAGAATCACGGGAAATACAATTAGACATACAACAATTACCTT i canFam3.chr27 I 182 I 306 e calJac3.chr9 88129220 0 - 124281992 C a score=713135.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 154623 304 + 238139 TGAGAAGCTTAGAGAGAGTGTTGTGCCTTTCCCGTACACTAAGAACTTTTGCTCTGTGACTAAGAAGGAAACTGAATAAGAATATGCCTCATCCTCTTTGCTTTTCTAGCCAAGATGCCTGGTGGCAAGGAAGAACCAGCATGTTATAGAAAAAGAGGAgccgggagtggtggctcactcctgtaatccaaagcactttggtaggccgaggcagtgggccccatgtctactaaaaatacaaaaattatctaggcggggtggcaggcac------------ctactcgggaggctgaggcaggagaatcacctgaac s panTro4.chr12 77069768 304 - 134246214 TGAGAAGCTTAGAGAGAGTGTTGTGCCTTTCCCGTACACTAAGAACTTTTGCTCTGTGACTAAGAAGGAAACTGAATAAGAATATGCCTCATCCTCTTTGCTTTTCTAGCCAAGATGCCTGGTGGCAAGGAAGAACCAGCATGTTATAGAAAAAGAGGAgccaggagtggtggctcactcctgtaatccaaagcactttggtaggccgaggcagtgggccccatgtctactaaaaatacaaaaattatctaggcggggtggcaggcac------------ctactcgggaggctgaggcaggagaatcacctgaac i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32252734 314 + 136387465 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gggattataggtataagccaccgtgcccagccctttgcccaatttttaattgggttgtttgtcttttcattgttgacatgtaaaagttatttatatattctggatagtatgcccttatcagataaatgacttacaaatatttttctccca----ttctataagttgtgttttcact-------------------------------- i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88135027 188 - 124281992 gggattacaggcatgagccaccgtgcccggtcctttgcccaatttttaatttgg-tgtttgtctttttattgttgacattaaaaagttatttatatattctggatagtatgcccttatcagataaatgattcacaaata-ttttctccca----ttctgtaagttgtgttatcactttttaaaaaaaatttttt-------------- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30734063 2569 + 128539186 I e canFam3.chr27 28405867 435 - 45876710 I a score=2380476.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 159262 818 + 238139 tttttttttttttaccttttcttaaatagagttggggtcttactatgttacctaggctagtctcaaactctcaaactcctggactccagcaatcctcctaccttggcctcccaaaatgttgggatttcagctgtgagccaccaggcccggcccttcactttcttgatagtgtcctttatacacaaaagtttttaattttgatgaagcccaatttatc-tttttttcttttgttatttgtacttttggtgtcatatttaagaaactgttacctaatccaaggtcataaatatttatacctatgttcccttcaagagttttatgagctcttacatttaggtctttgatccattttgagtaaattttttttatatcatgtgaTACTTCAAGTATCTACTTTGGATAGATTCCTAAAAAGTGGGCATATAATGCTTCAGGA---GTGGTTTTGATTTGGGtttttt---------tttttttaagagacaaagtctcaagtcttgctgcatctccaaggctggagtgcagtggcacgatcatagttcactgcagcctagaaatcctgaactcaagcaatcctcccacctcaacctcccaagtagctagaactacaggtgcatgccactatgttcaactacgtttttttattttttgtagagacagggtcttgctatgttgtccaggctggtctcaaactcctggcctcaagaaatcctcccactttagcctcccaaagtgct------gggattacaggtgtgagccaccacaccaggccCAGTTTTAAACACAGAAGCTGAATTTCTAATTCCAGTCACAGTTCCATCATCAATGAGGAC s panTro4.chr12 77075493 812 - 134246214 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attttttttttttactttttcttaaatagagatggggtcttactatgttacctaggctagtctcaaactctcaaactcctggactccagcaatcctcctgcctcggcctcccaaagtgttgggatttcagctgtgagccatcagacctggcccttcactttcttcatagtgtcctttatacacaaaagtttttaattttgatgaaacccaatttatcttttttttcttttgttatttgtacttttggtgtcatatttaagaaactgttaactaatccaaggtcataaatatttatacctgtg-----ttcaagagttttatgagctcttacatttagatctttgatccattttgagtaaattttttt-atatcgtgtgaTACTTTAAGTATCTACTTTGGATAGATTCCTAGAAAGTGGGCATACAATGCTGCAGGG---GTTGTTTTGGTTTGGGtttttt---------tttt---aagagacaaagtctcatgtcttgctctgtctccaagactggagtgcagtggcacgatcatagttcactacagcccagaaatcctgaactcaagcaatcctcccacctcagtctcccaagtagctagaactacaggtgcatgccactatgttcagctacgtttttttattttttgtagagacagggtcttgctatgttgcccaggctggtctcaaactcctggcctcaagaaatcctcccactttggcctcccaaagtgct------gggattacagatgtgagccaccacaccaggccCAGTTTTAAACACAGAAGCTGAATTTCTAATTCCAGTCACAGTTCCATCATCAATGAGGAC i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31315336 805 + 134985053 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ttttttttttcttactttttcttaaatagagacggggtctttctatgttccctaggctagtctcaaactctcaaactcctggactccagcaatcctcctgccttggcctctcagagtgttgggatttcagctgtgagccaccaggcctgccccttcactttcttgatagtgtcctttatacacaaaagtttttaattttgatgaagcccaatttatc-tttttttcttttgttatttgtacttttggtggcatatttaagaaactgttacctaatccaaggtcataaatatttatacctatgttcccttca--agttctatgagctcttacatttaggtctttgatccattttgagtaaattttttt-atatcgtgtgaTATTTTAAGTATCTACTTTGAATAGATTCCCAGAAAGTGAGCATACAATGCTTCAGGG---GTTGTTTTGGTTTAGGtttttt---------tttt---tag----aaagtctcatgtcttgctctctctcccaggctggagtacagtggcacaatcatggctcactgcagcctagaaatcctgaactcaggcaatcctcccacctcaacctcccaagtagctagaactacaggtgcatgccattatgttcagctac-tttttttattttttgtagagacagggtcttgctgtgttgcccaggctggtctcaaaatcctggcctcaagtaatcctcccactttggcctcccagactgct------gggattacaggtgtgagccaccacaccaggccCAGTTTTAAACACAGAAGCTGAATTTCTAATTCTAGTCACAGTTCCATCATCAATGAGGAC i macFas5.chr11 C 0 I 292 s papAnu2.chr11 30474077 810 + 132286798 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-----------------------aaatagagctagggtcttactg-gttacccaggttagtctcgaactcccaaattcctggactccaggaatcctcctgccttggcctcccaaagtgttgggattgcaggtgtgagccactaggccagg-ccttcactttcttgatggcgttctttatacacaaaagtttctaattttgatgaagcccaatttatc-ttttttacttttgttatttatccttttgatgtaatatttaagaaact---------------gtcatgaagatttatatctatgttcccttcaagagttttatgagctcttacatttaggtctttgatccattttgagttaattcttgt-atacggtatgaCATTTTAAGTATCTACTTTGGATAGATTCCTAGAAGGTGGACATACAATGCTTCAGGGTtttttgtttttgtttttgttttttggtttgtgtttttttaaagagacaaagtctcatgtcttgctctgtctcaaaggctggagtgcagtggcactatcatagctcgctgcagcctagaaatcttgaactcaagcaatcctcccacctcagcctcccaagtagctaggactacaggtgcataccaccatgttcagctaatttttaaaattttttgtagagagagggtcttgctatgttgcctgggcaggtctcaaactcctggcctcaagcaatcctcccaccttggcctcccaaaatcctcccaaagggattacaggtgtgagccaccacaccaggccCAGTTTTAAGTACAGAAGCTGAATTTCTAATTCCAGTTACAGTT---TTATCAATGAAGGC i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28405867 435 - 45876710 I a score=48219.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 160080 16 + 238139 AAAAGAAGTAAGAGTG s 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papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30746131 88 + 128539186 ttgaacccgggaggcagaggttgcagtgagccaagatcgtgccattgcactccagcctggacgacagactctgtctcaaaaaaaaT--GT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28413429 6 - 45876710 TTTAAC------------------------------------------------------------------------------------ i canFam3.chr27 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88140794 0 - 124281992 C a score=492494.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 163337 153 + 238139 AACTGCATTATGACAGACTTTTTTCCTTTTAGCAATTGAAACTGGCATCCCAAGGATGCTCTAGATACAGTCATAAAGATAATGCTTACTGCA----TCTCTCATCACTGGCTTACTTGGAAAAGAAC--AAAAAAAAAAA--AGTTATAAAGAAAATCTG s panTro4.chr12 77079571 152 - 134246214 AACTGCATTATGACAGACTCTTTTCCTTTTAACAATTGAAACTGGCATCCCAAGGATGCTGTAGATACAGTCATAAAGATAATGCTTACTGCA----ACTCTCATCACTGGCTTACTTGGAAAAGAAC--AAAAAAAAAAA---GTTATAAAGAAAATCTG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32269268 153 + 136387465 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aactGCATTATGACAGACTTTTTTCGTTTTAGCAATTGAAACTGGCATCCCAAGGATGCTCTAGATACAGTCATAAAGATAATGCTTACTGCA----TCTCTCATCACTGGCTTACTTGgaaaagaactacaaaaaaaaaa---gttataaagaaaatctG i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30746219 152 + 128539186 AACTGCATTATGACAGACTTTTTTCCTTTTAGCAATTGAAACTGGCATCCCAAGGATGCTGTAGATACAGTCATAAAGATAATGCTTACTGCA----TCTCTCATCACTGGCTTACTTGGAAAAGAAC--AAAAAAAAAAA---GTTATAAAGAAAATCTG i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88140794 149 - 124281992 AACTACATTATGACAGAC--TTTTCCTTTTAACAATTGAAACTGGCATCCCAAAGAT-CTCTAGAAAAAGTCATAAAGATAATGCGTATTGCA----TCTCTCATCACTGGCTTACTTGGAAAAGAAC--AAAAAAAAAAA---GTTATAAAGAAAATCTG i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28413435 120 - 45876710 ----------TGACAGATTTCTTTAAT-----------AGACTGACATCCCCAGGATGCTC-AAAAACAAACAT-------ATGCCTACTGCACTCCCCCCTCGTCACTGGCTTATTTGGAAAAGAAA--------AAAAA---ATTACAAAG-AAATCTG i canFam3.chr27 C 0 C 0 a score=403759.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 163490 146 + 238139 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CCTGGATCACAAgcgatgactcacatctgtaatctctgcactttgggaggccaagaca-gaggagtgcctgaggccaggagtttgaggacagcctggccaatatagtgagaccccagctctattagaaaaaaaaaaaa-------aagaagaagaa-- i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31790445 155 + 137757926 CCTGGATCACGAgcgatgactcacatctgtaatttctgcactttgggaggccaagaca-gaggagtgcctgaggccaggagtttgaggtcagcctggccaatatagtgagaccccagctctattagaaaaaaaaaaaAAaagaagaagaagaagaa-- i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30482272 145 + 132286798 CCTGGATCACaagtgatggctcacatctgtaatctctgcactttgggaggccaagacaggaggactgcctgaggccaggagtttgaggtcagcctggccaatatagcgagaccccagctctattagaaaaaaaaaaaa-----------agaagaa-- i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30746371 144 + 128539186 CCTGGATCACGAgcgatggctcacatctgtaatctccgcactttgggaggccaagacaggaggactgcctgaggccaggagtttgaggtcagcctggccaatatagcgagaccccagctctattagaaaaaaaaagaa------------gaagaa-- i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88140943 139 - 124281992 TCTGTAccaggagcggtggctcacatctgtaatctcagcactttgggaggccaagacagaaggactgcctgaggccaggagtttgagaccagcctggccaatatagtgagaccctatctctattag-----agaaaaa------------aaagaa-- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28413555 0 - 45876710 C a score=1139511.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 163636 328 + 238139 AAATC----------TGCCTGATAAAGAGCTAAAGAAGC--AGCCTCAAGCTGCTAGAGCCACAAGCGCCCCTGGAACTGTGCACTTAAATAGCATTGTCTTTAGCACTAGCATAACTGGGCAAAAGGAGCACCATCTCTGTAACCTATAACTTGAATGGTGCTTGCCCCCTTGGAGTTGTTCAAGGAGTCTAGACTGGCCAAAGCAGGCAACCGGCCTGGCTTCAA-TAAC--TATGCTTGGAACTTTGGGCCTTGAGGCTAAGAGGTGTGTTGTACTATTTCAGCATGTTTTATGAATTGGTTCCACAGAGCTGTTACAGCACAGCCAAATTTTACTCTTC s panTro4.chr12 77079867 327 - 134246214 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i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88144079 943 - 124281992 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nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31798840 159 + 137757926 AAATACTCAGCATCTTAAATATTATGTACAACTCTTTTTTT-----AGTAAGCTAGACACTGGCTTCAGAGTTTGTGGGACTGGG-----GGA-AATCAACCCATTCAAAACTACTCTAGAAATTGTGTTTTGGCAGAATAGCAGATATCCAAGTTAAAAATAGGAGGGT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30754747 158 + 128539186 AAATACTCAGCATCTTAAATATTATGTACAACTC-TTTTTT-----AGTAAGCTAGACACTGGCTTCAGAGTTTGTGGGACTGAG-----GGA-AATCAACCCATTCAAAACTACTCTAGAAATTGTCTTTTGGCAGAATAGCAGATATCCAAGTTAAAAATAGGAGGGT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88149584 159 - 124281992 AAATACTCAGCATCTTAAATATTATGTACAACTCTTTTTTT-----AGTAAGCTAGACACTGGCTTCAGAGTTTGTGAAACTGAG-----GAA-AATCAACCCATTCAAAACTACTCTAGAAGTTGTCTTTTGGCAGAATAGCAGGTATCCAAATTAAAAATAAGAaggt i calJac3.chr9 C 0 C 0 s mm10.chr6 148922639 167 + 149736546 AAATACTCAGCATCTTAAATATTATGTACACTTCTTTTTCT--TGCAGTAAGCTAGAGACTGGCTTCAGAGTTTGTTGGATGAAGGGTAAGGA-CAGTAACCCATTAAAAACTATTCTAGAAAATGTCTTTTGGCAGAATAGCAGGTATCCAAGTTAAAAATAGGAGGGT i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28421796 165 - 45876710 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panTro4.chr12 77089933 259 - 134246214 ATAAGGAAGAAAAATAGGAATACAA------------------AAGAAATCTACTCACTATTATAACTAGTCCAATATAACCAAAGAGTTGTGCTTCTACAATCTTG-CACATTCCAAGTGAAAGGGCTCCTAGAGTAA-CCCCAATTAGCTAGAGAAGGGGAATTACCCAGTTGCCTTAAAGGCCACACTGGAATCTTCTCAAATATTGAGGAAGACAG----CATTTTGAAAGACAGCAGTCAGTTTCAAAGGCTGCCCCTGATGTTGTTAACTATTTCCT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32278466 259 + 136387465 ATAAGGAAGAAAAATAGGAATACAA------------------AAGAAATCTACTCACTATAATAACTAGTCCAATATAACTAAAGAGTTGTGCTTCTACAATCTTG-CACATTCCAAGTGAAAGGGCTCCTAGAGTAA-CCCCAATTAGCTAGAGAAGGGGAATTACCCAGTTGCCTTAAAGGCCACACTGGAATCTTCTCAAATATTGAGGAAGATGG----CATTTTGAAAGACAGCAGTCAGTTTCAAAGGCTGCCCCTGATGTTGTTAACTATTTCCT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 212754 249 + 34552619 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GTAAGGAAGAAAAACAGTCAT------------------------------------CTATTATAACCAGTCCAATATAACCAAACAATTATGCTTCTACAATCTTC-CACATTCCAAGTGAAAGTGCTCCTAGAGTAA-CACCAATTAGCTAGGAAAGAGAAATTACCCAAGTCCCTTAAAGTTCACATTGGAATCTTCTCAAATATT---AAAGATGG----CATTTTGAGAGACAGCAGTCGGTTTCAAAGGCTGCCCCTCATGTTGTTAATTATTTCCT i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28422223 271 - 45876710 ATAAGGTAGAAAACTAGTAATACAAGAAAACAAAAAAAGGGGGGAGAAATCTAT--AACACTGTAAC-AATACAACATGATCAAAGGGTT-CACTTCTCTGGTCTCATCACATTTCAAATGAA--GGCTCCTAGAAAGGCCCCCAATTAGCTAAGTTATAGGAATTACCCAGGTCCCTTAAATCCCACACTGGAATCTTACCAAGTATTAAAGGGGACAGGGGTCATTCTGAGATAA------CAGTTTCAGAAACGGCTCCTAAAGTTATAAACTGTTTCCT i canFam3.chr27 C 0 I 210 e mm10.chr6 148923070 2744 + 149736546 I a score=233236.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 173956 75 + 238139 CCAAAATCACCAACTCTT-------------G-AAAAAAAAATCAGCCACCATAAACAGGCTGATGCAGCTAGCAATTTTTTATATATA s panTro4.chr12 77090192 75 - 134246214 CCAAAATCACCAACTCTT-------------G-AAAAAAAAATCAGCCACCATAAACAGGCTGATGCAGCTAGCaattttttatatata i 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panTro4.chr12 77094060 438 - 134246214 aatagcttactgcaaacctaacctcctaggctcaaacaatcccctcaccttggcctctcaaaatgctaggattacaggtgtgagccatcacgcctggcctgaatcaatttattatgagattatctcggtttttcactttttcttgagacagctttagcaacatgtcttttttctagtactgtacctgcttcacctgtatgttcaaatttattggcataaaattgtctataatatcctattattttttaaatgtctgctttatctatacctaagtctcttttctctttcctaaaattgcttatgtgt---attatctccttttcctgatccactttatctctagtatatttttggtcacg---tctttttgaaggaccaactcttagttttactgattctctccactgcatattgtctttctactccacttatctAGCAATAGGC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32282549 428 + 136387465 aatagcttactgcaaccctaacctcctaggctcaaacagtcccctcaccttggcctcccaaaatgctaggattacaggtgtgagccatcacgtctggcCTGAATCAATTTATtatgagattatctcggtttttcactttttcttgagacagctttagcaagatgtcttttttctagtactgtacctgcttcacctgtatgttcaaatttattggcataaagttgtctataatatcctattat----------tctgctttatctatacctaagtctcttttctctttcctaaaattgcttatgtgt---attatctccttttcctgatccactttatctccagtatttttttggtcacg---tctttttgaaggaccaactcttagttttactgattctctccactgcatattgtctttctactccatttatctAGCAATAGGC i 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ttttttttttttaatcaagatagggtttcactgcattgcccaggctggtctcaaactcctagcctcaagcagtcttcccaccttggcctcccaagtgctaggattgagtgtgagccactgcacctgaccTATAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACGTAAGTTGGTTATAAATACCATGAGTAATTTAAGTGATAGTAAGAGAAGTAGGATAGAG------ACTATATCAAGGTTTGAgatccttttgtcatttgtaagtgtgatgattgggcattcacac--gtgtgagatgtgcctccctcaaaccttgttatgacgtcggcactttacc-------catGAAAAAGGGGTTGAACTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGGAAGCCAATTAAATAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGTGCCTCTtgtaaccatttagcttgcttggaaattctttctatgcaagtctctacttcacccaaggtgttgatgtaagtgcaacaggcactgtgagctactgcacagactcctTgtcccagctactcgggaggctgaggtaggaggatcacctgagcccagggaggtcaaggctgtagtgagccgtgatca---caccaccacactccaacctaggcgacagagcaagactctccctc-----aaaaaaaaaaaaaa---------------aaaaaaaaaGTGCCCTTCAATTTGCCAGCGATTTTGCCAGCTATTTACACTATGTGCCCATCCTTGAGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACATACCAAAATGTATCTCTTAACTATTCATTCATAATAGTTTGAATAGGTAAGTTGTTTAAAACATGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGCCTTACAAAGGCCTGCATAAGCATGATATAT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32299447 848 + 136387465 tgtttttttt---atcaagatagggtttcactgcattgcccaggctggtctcaaactcctagcctcaagcagtcttcccaccttggcctcccaagtgccaggattgagtgtgagccactgcacctgATCTATAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACATAAGTTGGTTATAAATACCATGAGTAATTTAAGTGATAGTAAGAGAAGTATGATAGAA------ACTATATCAAGGTTTGAgatccttttgtcatttataagtgtgatgattgggcattcacac--gtgtgagatgtgcctccctcaaaccttgttatgacatcggcactttacc-------catGAAAAAGGGGTTGAATTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGGAAGCCAATTAAATAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGCGCCTCTtgtaaccatttagcttgcttggaaattctttctatgcaagtctctacttcacctgaggtgttgatgtaagtgcagcaggcagtgggagctactgcacagactcctTgtcccagctactcgggaggctgaggtaggagg-------gagcccagcgaggtcaaggctgtagtgagctgtgatca---caccaccacactccagcccaggcgacagagcaagaccctccctc-----------------ca---------------aaaaaaaaaGCGCCCTTCAAtttgccagctattttgccagctatttACACTATGTGCCCATCCTTGAGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACATACCAAAATGTATCTCTTAACTATTCATTCATAATAGTTTGAATAGGTAAGTTGTTTAAAACATGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGCCTTACAAAAGCCTGCACAAGCACGATATAT i ponAbe2.chr12 C 0 I 316 s nomLeu3.chr23 233267 847 + 34552619 tttttttgtt---atcaagataggatttcactgcattgcccaggctggtctcaaactcctagcctcaagcagtcttcccaccttggcctcccaagtgctaggatcgagtgtgagccactgcacctggccTATAATTCTGGTTTTTAGCAATAGACTTAGGTAAGTTGGTTATAAATACCGTGAGTAATTTAAGTGATAGTAAGAGAAGTAGGATAGAGACT---ACTATATCAAGGTTTGAgatacttttgtcatttataagtgcgatgattgggcattcacat--gtgtgaaatgtgcctccctcaaaccttgttatgacatcggcaatttacc-------catGAAAAAGGGGTTGAATTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGAAAGCCAATTAAATAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGTGCCTCTtgtaaccatttagtttgcttggaaattctttctatgcaagtctctacttcacctgaggtgttgatgtaagtgcagcaggcagtgtgagctactgcacagactcctTgtcccagctactcgggaggctgaagtaggagaatcacctgagcccagggaggtcaaggctgtagtgagccgtgatca---caccaccacactccagcctaggcgacagagcaagaccctccctc-------------aaaaaa---------------aaaaaaaaaGCACCCTTCAAtttgccagctattttgccagctatttACACTATGTGCCCATCCTTGAGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACATACCAAAATGTATCTCTTAACCATTC----------------ACGGGTAAGTTGTTTCAAACCTGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGCCTTACAAAAGCCTGCATAAGCACGATATGT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31354106 852 + 134985053 ttttttttttta-attaagacagggtttcactacattgcccaggctggtcccaaactcctagcctcaagcagtctttccaccttggcctcccaagtgctagt-----gtgtgggccactgcaactggccTATAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACGTAGGTTGATTATAAATACCATGAGTAATTTAACTGATAGTAAGAGAAATAGGATAGACACTACGATTATATCAAGGTTTGAgatccttctgtcatttataagtgtgatgactggacattcacacatgtgtgagatgcacctccctc-aaccctgttatgacattggtactttacc-------catGAAAAAGGGTTTGAATTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGGAAGCCAATTAAACAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGTGCCCCTtgtaaccatttagcttgcttgaaaattctttctatgcaagtctctacttcacctgaggtgttgatgtaagtgcagcaggcagtgtgagctactgcacagactcctTgtctcagctactcgacaggctaaggtaggaggatcacctgagcccagggaggtcaaggttgtagtaagccatgatca---caccaccacactccagcctaggcgacagagcgagaccctccctc------------aaaaaaa---------------aaaaaaaaGGCTCCTTTCAATTTGCCAGCTATTTTGCCAGTTATTTACACTATGTGCCCATCCTTGGGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACCTACCAAAATGTATCTATTAACTATTCATTC------------ATGGGTAAGTTGTTTAAAACATGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGTCTTACAAAAGCCTGCATAAGCATGATACAT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31820211 860 + 137757926 tttttttttttt-attaagacagggtttcactacattgcccaggctggtcccaaactcctagcctcaagcagtctttccaccttggcctcccaagtgctagt-----gtgtgggccactgcaactggccTATAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACGTAGGTTGATTATAAATACCATGAGTAATTTAACTGATAGTAAGAGAAATAGGATAGACACTACGATTATATCAAGGTTTGAgatccttctgtcatttataagtgtgatgactggacattcacacatgtgtgagatgcacctccctc-aaccctgttatgacattggtactttacc-------catGAAAAAGGGTTTGAATTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGGAAGCCAATTAAACAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGTGCCCCTtgtaaccatttagcttgcttgaaaattctttctatgcaagtctctacttcacctgaggtgttgatgtaagtgcagcaggcagtgtgagctactgcacagactcctTgtcccagctactcgacaggctaaggtaggaggatcacctgagcccagggaggtcaaggctgtagtaagccatgatca---caccaccacactccagcctaggcgacagagcgagaccctccctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaa---------------aaaaaaaaGGCTCCTTTCAATTTGCCAGCTATTTTGCCAGTTATTTACACTATGTGCCCATCCTTGGGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACCTACCAAAATGTATCTATTAAC----CATTC------------ATGGGTAAGTTGTTTAAAACATGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGTCTTACAAAAGCCTGCATAAGCATGATACAT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30512329 860 + 132286798 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ttttttttttaa-attaagacagggtttcactacattgcccaggctggtcccacactcctagcctcaagcagtctttccaccttggcctcccaagtgctagt-----gtgtgggccactgcaactggccTATAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACGTAGGTTGATTATAAATAGCATGAGTAATTTAACTGATAGTAAGAGAAATAGGATAGACACTACGATTATATCAAGGTTTGAgatccttctgtcatttataagtgtgatgattggacattcacacatgtgtgagatgcacctccctc-aaccctgttatgacattggtactttacc-------catGAAAAAGGGTTTGAATTGCAGACTGGAAGAAAT-------------AGGAAGCCAATTAAACAGATCATTGAGAAGATCGGTAGTTTGTGCCCCTtgtaaccacttagcttgcttgaaaattctttccatgcaagtctctacttcacctgaggtgttgatgtaagtgaagcaggcagtgtgagctactgcacagactcctTgtcccagctactcgacaggctaaggtaggaggatcacctgagcccagggaggtcaaggctgtagtaagccatgatca---caccaccacactccagcctaggtgacagagcgagaccctccctc------aaaaaaaaaaaaa---------------aaaaaaaaaGCTCCTTTCAATTTGCCAGCTATTTTGCCAGTTATTTACACTATGTGCCCATCCTTGGGTTGGTGGGTGTGGCCCAATGCCACCTACCAAAATGTATCTATTAACTATTCATTC------------ATGGGTAAGTTGTTTAAAACATGAGTGAGCCATGGATTGGTTTTACTGCAGGTCTTACAAAAGCCTGCATAAGCATGATACAT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88171684 887 - 124281992 TTATTTttttta-atcaagacagggtctcactatattgaccaggctggtctcaaactcctagcctcaagcaatcctctcaccttggcctcccaagtgctaggattgcatgtagaccactgcacctggccCGTAATTCTGG-TTTTAGCAATAGACTTACAGCAGTTGGCTATAAATACTCTGAGTAATTTAACTGATAGTAACAGTAGTAGGATAGAGACTATGATTATATCAAGGTTTGAgatcttttcgtcatttttaagt--gatgactgggcattcacacatgtgtgagatgtgcctccctgaaaccttgttatgacatcagcactttaaccatctgacatgaAAAAGGGTTCCAGCTGCAGACTGGAAGAAATGCTCCAGTTCCAAAGGAAGCCAATTAAGTGGGTCATTGAGAAGATGGGTAGTTTGTGCCTCTtgtaatcatttagcttgcctggaagtcctttctgtgcaagtctctacttcacctgaggtattgatataagtgcagcaggcagtgtgagctactgcacagactcctTgtcccagctactcaggaggctgaggtgggaggatcatctgagcctagggaggtcaaggctgtagagagccctgatcacaccaccaccacactccagcctgggcaacagaataagaccctctctc----aaataaacaaaaaaaGGCAATGtaatggccaagaagacaaagcccttcaatttgccagc------------tatttacactatgtccccatccttgggttggtgggtgtggccCAATGCCACATACCAAAATGTATCCCCTAACTATTCATTC------------ATGGGTAAGGTGTTTAAAACATAAGTGAGCCACAGATTGGTTTTACTGCAGGCCTTAGAAAAGCCTGCATAAGCATATTC--- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr6 148936027 1647 + 149736546 I e canFam3.chr27 28444848 322 - 45876710 I a score=3557556.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 195140 1158 + 238139 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s panTro4.chr12 77112461 1164 - 134246214 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i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32300611 1163 + 136387465 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i ponAbe2.chr12 I 316 C 0 s nomLeu3.chr23 234114 1167 + 34552619 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i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31354958 1173 + 134985053 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i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30513189 1167 + 132286798 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i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30777559 1167 + 128539186 AACAAACAAGACGTGCTGGTACAATTTGCTTTTGCTTTTTCTCCTTTGGACATTCAGTTGCCAGTTATGACAGTAACGGTGGGAAGCCAGGAATGTGCAGGGACAGCGGCCTGGAAAAGATGAGGAATTAAGTTTGTGTTCCAGATAAGTTAGAGAATTTGTCCCTGATTGGCTTCCTGATAGACAGGCCTGGGGGCGGTGGGAAGGGGTGAGACTTAGGGAATATAATTAAGCACAGAATGAAAATATGGCCTGGCTTTAGAAGCTGAATTTGAATTTGGAAAGGGACACTTGGAGAGAACTGGTGCAAGTATATGGTAACATTTGGAGTGTCAGAAAAATCAATCACAGGTGCAACAAGTAGCATGTAATGATATTGAATGGCCCTAGGAAGCTGGTGAC-AAATCCAGCAATCTGAGAGACTGCCTCTATCTGCCACACTTTGGAAAAGTTTAGCTCATGAACTATTTTT-CCATCACCAGCAGAGACCCTGAAAAGTCAAGTA----------TATATATATATTGGTGGCCATCA-TGTGTATGGAAACATTAACCAGGTTATATATCCTATAATCTGAGTCAAAGCAGACAAGGCCAATAGTCCCCAAAGTAAATATAATACTCTAAGAATGTTTAGACAGGAGATCatacaggcctgctctgaagtcttgggtcaattagctgtccattcagatgttgtcaacttctcgtcctggtttcagggttgaagctgtttggtgaatcagagacagggatctctggtgggagtcatggtccattcaggaagttgtgcctttttaaggtgagagatatggatccgtgagtctacaccctttaactctgctgtgcatggattactcaacggtacctggcaagggcccct---ccaccaaggctggagggagtcctttatgagatgtcttttccaacagacaaaacttccaggttggaggtcatgaccagaatcttcatctcccaggagtacactgtgggacgtgtcttgcactaaggtctgccttttcatgagttggtgaatgagtcccttaaaatagtgcaagatgtccccattcagtaaatttggatcagtcatcttgattcccacgtgcctgggtcttccagttacaatttcatgagaagggagttgataaagggatggatcaaaggttgaacaatacca i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88172571 1158 - 124281992 AACAAACGAGACGTGCGGGCACAATTTGC-TTTGCTTTTTCTCCTTTGGACTTTCAGTTGCCAGATATGACAGAAATGTTGGGAGGCCAGGAATGTGCAGGGACAGAGGCCTAGAAAAGGTGAAGACTTAAGTATGTGTTCTAGATAAGTTAGAGAATTTGTCCCTGATTGGTTTAGTGATAGACAGGCATGAGGGCGGTGGGGAGGGGTAAGACTGGGGGGAAATTATTAAGCAGAGAATGAAAATATGGCTTGGCTTTAGAAGCTGAATTTGAATTTGGAAAGTGACATTTGGAGGTAACTCATGCAAGTATACGGTAACATTTGGAGTGTCAGAAAAATCAATCATTGGCGCAGTAAGTAGCATGTAATGGTCTTGAATGGCCCTTGGAAGGTGGTGAC-AAATCCAACCATCTGAGAGAATGCCTCCATCTGCCACACTTTGGGAGAGTTTAACTAATGAACTATTTTTCCCATCCCCAGCAGAGACCCTGAAAAGTCAAGTGTGTATATATATGTATGTGTGTGTGTGGCCATCATTGTGTATAGAAATGTTAACCAGATTATATATCCTATGAACTGAGTCAAAGCAGACAAGGCCAATAGTCCCCAAAGTAAATATATTACTCTAAGAATGTTTAGACAGGAGATCatacaggcctggtctgaagtcttaggtcaattagctgtccactcagatgttgtcaacctctcgtcttggtttcaggattgaagctgtttggtgaatcagagacagggatctttggtgggagtcacggttcattcaggaagttgtgcctttttaaggtgagagatatggatccgtgagtctacaccctataactctgctgccaagggattagtcaacagtacctggca-----------------------ggagggagtcctttacgagaggtcttttccaacagacaaaatctccagcttggaggacatgaccagaatcttcacctcccaggagtgcactgtgggacgtgtcttgcactaaggcctggcttttcatgagttggtgaacaagtcccttacgatcatgcaagatgtccccgttcagtaaatgtggatcagtcatcttgattcccatgtgcctgggtcttccagttacaattttatgagaagagagttgataaagggatggatcaaaggttgagcaatatca i calJac3.chr9 C 0 I 6221 e mm10.chr6 148936027 1647 + 149736546 I e canFam3.chr27 28444848 322 - 45876710 I a score=1770705.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 196298 758 + 238139 aggggagtgccttcagcctagcagaggtgaaaagcctccataaatttagccagttgtgtttttattattccattggtccattctaccaatccggggacttagccaattgtgttattattccattgttccattctaccaatccagaggaactaagggtggtaggcacaatcaaaatacggaaatataggccaa--tttttttttttttttttttttgagactaagtctcgctctgtcacctaggctggagtgcagtggcatgattttggcttactgcaacctccgcctgccaggtttaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgtgcgccacgatgcccggctaatttttgtattgttagtggagacaggatttcaccatgttagccaggctggtcttaaactcctgacctcaggtgatccgcccgcctcggcctccc-aagtgctgggattacaggcatgagccactgcgcccagccccaaattttacaaatgctcaatgacctgggcagtaaaataagttcccctattgctgtgaagttcaaaaggggactccccataatggggtaatcc---cttaataagattttacccactaccattgcccatcagcaggatgggcaattgcattacccaatgcaaaaacatgcatatcattaccaatacatatttatatgcttaagatggtggcagctagataaaatcaagctgccacatctcaaaaggtctaggtagaaaaagaaaat s panTro4.chr12 77113625 760 - 134246214 aggggagtgccttcagcc-agcagaggtgaaaagcctccataaatttagccagttgtgtttttattattccattggtccattctaccaatccggggacttagccaattgtgttattattccattgttccattctaccaatccagaggaactaagggtggtaggcacaatcaaaatactgaaatataggccaa--tttttttttttttttttttttgagactaagtctcgctctgtcacctaggctggagtgcagtggcgtgattttggcttactgcaacctccgcctgccaggtttaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgtgcgccacgatgcccggctaatttttgtattgttagtggagacaggatttcaccatgttagccaggctggtcttaaactcctgacctcaggtgatccgcccgcctcggcctccc-aagtgctgggattacaggcatgagccactgcacccagccccaaattttacaaatgctcaatgacctgggcagtaaaataagttcccctattgctgtgaagttcaaaaggggactccccataatggggtaatcccttcttaataagattttacccactaccattgcccatcagcaggatgggcaattgcattacccaatgcaaaaacatgcatatcattaccaatacatgtttatatgcttaagatggtggcagctagataaaatcaagctgccacatctcaaaaggtctaggtagaaaaagaaaat i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32301774 711 + 136387465 aggggagtgccttcggcc-agcagaggtgaaaagcctccataaatttagccaattgtgtttttattattccgttgg--------------------------------------------------tccattctacccacccagaggaactaagagtggtaggcacaatcaaaatactgaaatataggccaatttttttttttttttttttttttgagaccaagtctcactctgtcacctaggctggagtgtagtggcgtgattttggcttactgcaacctccgcctgccaggtttaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtggctgggactacaggcgtgcgccacgatgcccggctaatttttgtattgttagtggagacagga-ttcaccatgttagccaggctggtcttaaactcctgacctcaggtgatccgcccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcgcccagccccaaattttacaaatgctcaatgacctgggcagtaaaataagttcccctattgctgtgaagttcaaaaggggactccccataatggggtaatccct-tctaataagattttacccactaccattgcccatcagcaggatgggcaattgcattacccaatgcaaaaacatgcatatcattaccaatacatgtttatatgtttaagatggtggcagctggataaaatcaagatgccacatctcaaaagatctaggtagaaaaagaaaat i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 235281 758 + 34552619 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agggaagtgccttcggcc-agcagaggcgaaaagcctccataaatttagccaat--tttttctattattccattggtccattgcaccaatccagggacttagccaattgtgttattattccattgctccattctaccaatccagagg-actaagggtagtaggcacaatcaaaatactgaaatacaggccaa-----ttttttttttttttttttgagatcaagtctcgctctgtcacctagggtggagtgcagtggtgcgatcttggctcactgcaacctccgcctgccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtggctgggactacaggcatgcgccacgatgaccggctaatttttgtattgttaggggagacaggatttcatcatgttagccaggctggtcttaaactcctggcctcaggtgatccgcccacctcagcttcacaaagtgctgggattacagacgtgagccactgcgcccagccccaaattttacaaatgctcaatgacctgggcagtaaaataagttcccctactgctgtgaagttcaaaaggggactccccacaatggggtaatcctt-tctaataagattttacccactaccattgaccatcagcaggatgggcaattgcattacccaatgcaaagacatgcatgtcattaccaatgcatgtttatatgcttaagatggtggcagctggataaaatcaagctgtcacatctcaaaaggtctaggtagaaaaagaaaat i macFas5.chr11 C 0 I 2547 s papAnu2.chr11 30514356 757 + 132286798 AGGGAAGTGCCTTCGGCC-AGCAGAGGCGAAAAGCCTCCATAAATTTAGccaat--tttttctattattccaTTGGTCCATTGCACCAATCCAGGGACTTAGCCAATTGTGTTATTATTCCATTGCTCCATTCTACCAATCCAGAGG-ACTAAGGGTAGTAGGCACAatcaaaatactgaaatataggccaa--tttttttttttttttttttttgagatcaagtcttgctctgtcacctagggtggagtgcagtggtgcgatcttggcttactgcaacctccgcctgccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtggctgggactacaggcatgcaccacgatgaccggctaatttttgtattgttaggggagacaggatttcatcatgttagccaggctggtcttaaactcctggcctcaggtgatccgctcacctcagtttcacaaagtgctgggattacagacgtgagccactgcacccagccccaaatttTACAAATACTCAATGACCTGGGCAGTAAAATAAGTTCCCCTACTGCTGTGAAGGTCAAAAGGGGACTCCCCACAATGGGGTAATCCTT-TCTAATAAGATTTTACCCACTACCATTGACCATCAGCAGGATGGGCAATTGCATTACCCAATGCAAAGACATGCATGTCATTACCAATGCATGTTTATATGCTTAAGATGGTGGCAGCTGGATAAAATCAAGCTGCCACATCTCAAAAGGtctaggtagaaaaaaaaaat i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30778726 748 + 128539186 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s panTro4.chr12 77114385 1705 - 134246214 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i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32302485 1734 + 136387465 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i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 236039 1722 + 34552619 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i rheMac3.chr11 I 2330 C 0 s macFas5.chr11 31825542 2410 + 137757926 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i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88179950 2348 - 124281992 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aaggtgtaggggtggtgaaggaggcaccaaagagtaaagaaggtaccttttttactcttcgaaga---ttct-ttttttagtaggagagacagtatatttcagagctctctgttaacacctttaagttgtttattagcatcctgtaagaaacaaag-----gtcatcctacccacttttgctactttcaagataccactagaagcagcttccccattctagttgcttaatttttgcactagcaccttccatcctggtctgcatatatatggcaattttggcaaatcagaagatctgcatttaggccattgtgattt--agtcatccttaagtcatcatggtccatttggttaagtaattacacaatgagggactgatcctaaatactgtatattaacccagttggggtttctaaagatggaatctgatgttctacagttgcaggggatttagtcaattgagaggctttgttctccacaatttttaacaccttctcattagattgactaagtcaggaggtgttctgaatccagacatgctacttgcaaacACAAAGGTTGAGGATGCACACCCCAGAAGCACGAGTTCCAGGAGCTTAAAACCTGCGCtctgaagtaggctatatgaggcacagtctttatacatt-ttttaaacaggaaaatatgtgcagtatggtaaagcagtaattgataatttggttcatactcagtgatgttatgcctaaagtaaagtaaatacgtggttgagtgagtaggagagaaaagttaacaatcgtgtaggcaccttagggtgtggtagaaggatgattgattccatcctgcctttgttctatatctgataaacaagtttacaaccagtatctgccagtaaaatatttaacagactccagttACAAACCCAAGGGGTCAGCTTTAGTCTGTAGGCAGTGGTTTTATTACGCGTATGTCCAAACTGCAGCCATCTTGGGCCAGATTTCTCTTTTCTTCTGACACTATCTATCATTATCTG----TCTGTCTACAGTATGCTGCCTGAAGTTTCTTCAAATGGGACAAACATTTTCAGATGTTTCTCAGGATCTGAGAGGTTACAGTTAAAACATACTTATTGATAGGAGTTTGTAACGCTTATCTCTGACATAGCTGCCTTTGC-ACATACACACATTCCTGGGTAAG--AGAAATTTAGAAGAGGTCTGTGTTGATCAG-ATTTTTCTTTTATTTGTTTTCACAGGTGC-TTAGATGTGTTGCTTAAATTTT--AAGTTGacatttatatagcaatttacatattataaagcacttttgctggcattctttctttgGCTAGTATTAGCCAAAAACCCAAAAACATTTTTAATACTATAAACAGTTAAAAACAATTG-----ggctgggagcggtggctcaagcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcgggtggatcac--gaggtcaagagatcgagaccatcctggtcaacacagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggc---atggtggcgcgtgcctgt-aatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaattgcctgaacccaggaggcggaggttgcggtgagctgagatcgcgccattggactccagcctgggtaagaagagcaaaactccgtctcaaaa--aaaa 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ATCTAAAAAAGCACAGAGAGCTTAAATAAACTTCCTCAAAGACATACAAATGGAGAGA------TACAGATTAGAAAACACACTCCATGGGAGAGACTACGAAATAGAGTGGTAAGATCAAAAT--ATACAGAGCAGAATGGGAAGGAAATGGCAGAAAGGAGACAAGCAAAAGATTTATAAAGTGG-GAAGGAAGCAGCGGTGAACAAAGACAAAAAGACCTAAGCAA---CCAAAGACAACTTTGAAGTGAAGGAGAT-GCATTTCTTTACAGCCAAACTTGAAATGACAGGATGATGGGAAAGGAAAA---GAAGTAAACATGAAAAAACACTTGCTATCACAAGCTGT--GGGGATCCTTGAGTTCCCGTAATTGGTAATGCCACCAATGACACCA-TTTTAGTCAATTGTA---TGCTATCGTTAACCACATTTAAGTACAGAATCCAGTAAACACTAACAGTGTAACTGGAGCAACACTTTTCACAAAGGGTCAACAGGACTACATGCTTTGTAT-TCTCCCGCTGCTAGGCCACTTGGCTGCAGTATTCCCCAACAATGAGACATGTT---TCATCTGCAGTTAAGGAAAGCTATGGAGTAATAAAAC---GTTATTTCCTCTTACCTGCTTCTAGATACCAGCATACATCT--CAG---CGAAATTCCCGAATTTAGCTAAC---------TTT-AGGAACAAATTTAAATCTGTCCGGAAGAAAACTGAGAAAGGAGTAGGGG------ACTCCACTTGTTTGCCAACAGCCTCTCCAAACATGTGCCCTGCCCCTGAGAAAT---AT--------------------------------------------G-------GTAAAGCATTTATAACTGTGGCTGTCTATGGAATCCACACTTGGGAGAAGAGACTAAAACTTATCCTATGTAGGAAAGAGGTC-AAGCTCAGAAATAAGCAAATCCTCAACTAAAGTGGCATAAGTTAAAAATAAAATT 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tataa------------------atat-----------taaataattatttaattttttttaata-tttggcgcagacctgtaattccagctactggtgaggctgaagcaggagaatggcgtgaatccgggaggcggagcttggagtgagccaagattgcaccactgcactccagcctggatgactgagcaaga-tcccgtctcaaaa i papAnu2.chr11 I 1338 I 23 s chlSab2.chr11 97737385 189 - 128539186 tatat------------------atatgtgtatatatataAaaaaatatataaattagctgggcattttggcgcagacctgtaattccagctactcgggagactgaagcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttggagtgagccgagatcgccccactgcactctagcctgggcgactgagcaaga-ttccatctcaaaa i chlSab2.chr11 I 4 n 4 e mm10.chr6 148947861 128 + 149736546 I e calJac3.chr9 88196286 0 - 124281992 C e rheMac3.chr11 31379176 1379 + 134985053 I e canFam3.chr27 28457200 333 - 45876710 I a score=345638.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 219381 194 + 238139 aataataataatggccaggcgaagtgcctcacgcctgtaatcacagcactttgggaggccaatgtgggtgaattacctgaggtagggagtttgagagcagcctgaccaacatggagaaaccccgtctctaccaaaaatgcaaaattagccgggcgtggtggcacatgcctataatcc---tagctacttgggaggct s panTro4.chr12 77136751 194 - 134246214 aaTAATAATAATggccaggcgaagtgcctcatgcctgtaatcgcagcactttgggaggccaatgtgggtgaattacctgaggtagggagtttgagagcagcctgaccaacatggagaaaccccgtctctaccaaaaatgcaaaattagccgggcgtggtggcacatgcctgtaatcc---tagctacttgggaggct i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32324699 197 + 136387465 aaTAATGATAATggccaggcgaagtgcctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaatgtgggtgaattacctgaggtagggagtttgagggcagcctgaccaacatggagaaaccccgtctctaccaaaaatgcaaaattagctgggcgtggtggcacatgcctgtaatcctattagctactcgggaggct i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 258736 191 + 34552619 aaTA---ATAATggccgggccaagtgcctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgatgtgggtgaattacctgaggtagggagttcgagaccagtctgaccaacatggagaaaccccatctctaccaaaaatgcaaaattagccgggcgtggtggcacatgcctgtaatcc---cagctactcaggaggct i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31846945 194 + 137757926 aataataataatagccaggcaaagtggctcatgcctgtaatcccagcactttgagaggccaaggtgggtgaattacctgaggtagggagttcgagaccagcctgaccaacatgaagaaaccccgtctctaccaaaaatgcaaaattagctgggcgtggtggcacatgcctgtaatcc---tagctactcaggaggct i macFas5.chr11 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macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30538484 144 + 132286798 gaggcaggagaatcccttgaacccaggagacggaggttgtggtgagcc--aaaatcaagccattgcactctagcctgggcaacaagagctaaactctgtctcaaaataataataataataataataataaatatgtaaatataatt i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30802634 135 + 128539186 gaggcaggagaatcccttgaatccaggagacggaggttgtggtgagcc--gaaatcaagccattgcaccctagcctgggcaacaagagctaaactctgtctcaa---------aataataataataataaatatgtaaatataatt i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e mm10.chr6 148947861 128 + 149736546 I e calJac3.chr9 88196286 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28457200 333 - 45876710 I a score=216102.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 219715 82 + 238139 ttaaaaaat-taatGGACATTTTCAAGGTTCTTACAGGTTTATCGCTAATCAGAACTTTAGTTTACAATTTTTGCATTTGACC s panTro4.chr12 77137086 82 - 134246214 ttaaaaaat-taatGGACATTTTCAAGGTTCTTATAGGTTTATCGCTAATCAAAACTTTAGTTTACAATTTTTGCATTTGACC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32325034 82 + 136387465 ttaaaaaat-taatGAACATTTTTAAGGTTCTTATAGGTTTATCACTAATCAAAACTTTAGTTTAAAATTTTTGCATTTGACC i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 259065 82 + 34552619 ttaaaAAAT-TAATGGACATTTTCAAGGTTCTTATAGGTTTATCGCTAATCAAAACTTTAGTTTACAATTTTTGCATTTGAGC i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31380690 82 + 134985053 TAAAGAAAT-TAATGGACATTTTCAAGGTTATTATAGGTTTATCGCTAATCAAAACTTTAGTTTATAATCTTTGCATTTGACC i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31847277 82 + 137757926 TAAAGAAAT-TAATGGACATTTTCAAGGTTATTATAGGTTTATCGCTAATCAAAACTTTAGTTTATAATCTTTGCATTTGACC i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30538628 82 + 132286798 taaagaaat-taatggaCATTTTCAAGGTTATTATAGGTTTATCACTAATCAAAActttagtttataatttttgcatttgacc i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30802769 82 + 128539186 ttaaaaaat-taatGGACATTTTCAAGGTTATTATAGGTTTATCCCTAATCAAAACTTTAGTTTACAATTTTTGCATTTGACC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s mm10.chr6 148947989 80 + 149736546 TTATAAAATATACTTGAATTTTTAAATTTTCCTATTGGTTTATTGCAAGTTAAAA---TACCTTACAGTTTTTGCATTTGACC i mm10.chr6 I 128 C 0 e calJac3.chr9 88196286 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28457200 333 - 45876710 I a 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TAAAATGAGTTTGGAAG-TTATAGTGGTCACATTGGTTGATATGATGCC----ATCC-----CTGTCCTTATGACAATAAACA----TGAATAAGCTTAATAGCTGTTTCTGTG-TTCCACT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30538710 107 + 132286798 taaaatgagtttggaag-ttaTAGTGGTCACATTGGTTGATATGATGCC----ATCC-----CTGTCCTTATGACAATAAACA----TGAATAAGCTTAATAGCTGTTTCTGTG-TTCCACT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30802851 107 + 128539186 TAAAATGAGTTTGGAAG-TTACAGTGGTCACATTGGTTGATATGATGCC----ATCC-----CTGTCCTTATGACAATAAACA----TGAATAAGCTTAATAGCTGTTTCTGTG-TTCCACT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s mm10.chr6 148948069 97 + 149736546 TAAAAGGAGTTTGGGGGCTTATAGTGA--ACTTTAATTGA--------C----ATCT-----TTGTCCTTA-GGTAATAAAAT----TTTACAGCTTTAAGAATTTTTTTTCCg-ggctggt i mm10.chr6 C 0 I 235 s canFam3.chr27 28457533 113 - 45876710 taaaatGAGCTTGGAAG-TT--------CACCTTGATTAATATGATGCCTATGATGCTGGAACTGTTCTTATCATAATAAATAAAGTGGAGTAGGCTTACCCACTCTTTCTGGGCTTTCACT i canFam3.chr27 I 333 C 0 e calJac3.chr9 88196286 0 - 124281992 C a score=462690.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 219901 158 + 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C 0 s macFas5.chr11 31852782 44 + 137757926 aaaggaggagaaggaggggaaggggaaggggaaggggaagg-----------------------------------------------aga i macFas5.chr11 I 1059 I 2 e chlSab2.chr11 30806934 570 + 128539186 I e calJac3.chr9 88201034 0 - 124281992 C e rheMac3.chr11 31384570 616 + 134985053 I e papAnu2.chr11 30543352 381 + 132286798 I e canFam3.chr27 28460912 0 - 45876710 C a score=91399.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 224141 44 + 238139 agaagaagaagaaagaaaaaaagaagCTGATCCCCCAGACATAG s panTro4.chr12 77141504 44 - 134246214 agaagaagaagaaagaaaaaaagaagCTGATCCCCCAGACATAG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32329474 44 + 136387465 agaagaagaagaaagaaaaaaagaagTTGATCCCCCAGACATAG i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 263660 44 + 34552619 agaagaagaaaaaagaaaaaaagaagTTGATCCCCCACACATAG i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31385186 44 + 134985053 agaagaagaagaaagaaaaaaagaagTTGATCACCCAGACATAG i rheMac3.chr11 I 616 C 0 s macFas5.chr11 31852828 44 + 137757926 agaagaagaagaaagaaaaaaagaagTTGATCACCCAGACATAG i macFas5.chr11 I 2 C 0 s chlSab2.chr11 30807504 44 + 128539186 agaagaagaagTAAGAAAAAAAGAAGTTGATCACCCAGACATAG i chlSab2.chr11 I 570 C 0 s calJac3.chr9 88201034 25 - 124281992 -------------------aaagaaGTTGATCCCCCAGACATAG i calJac3.chr9 C 0 C 0 e papAnu2.chr11 30543352 381 + 132286798 I e canFam3.chr27 28460912 0 - 45876710 C a score=548346.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 224185 208 + 238139 AGTTCACTTCCTGGAAAACCCACTGTTCTAACTATTCAAGGCATCACTAAAGGCAAGCATGCTAC-ATCATCAACAGATGATGAACAAGTGAATGAGTGGACAC-----ATAATAGTCAAAGAGACATGCTGCATTGCCATTTCTAAAAGCTTTGGTGATAAAATATTGAGGAATCTGGAAGAACT---TACTTATTGATTTAAttt------tttttagtga s panTro4.chr12 77141548 208 - 134246214 AGTCCACTTCCTGGAAAACCCACTGTTCTAACTATTCAAGGCATCACTAAAGGCAAGCATGCTAC-ATCATCAACAGATGATGAACAAGTGAACAAGTGGACAC-----ATAATAGTCAAAGAGACATGCTGCATTGCCATTTCTAAAAGCTTTGGTGATAAAATATTGAGGAATCTGGAAGAACT---TATTTATTGATTTAAttt------tttttagtga i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32329518 209 + 136387465 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tcttaatgcattattttaATGTAAATTGAATTGACCACTTTTtaaatgatggaacacctataaaatggaattctatactgctgttacaaagaataagtccgctttatatatgctgacatagaaagatagtcccaatatagtaagtggataaaaagcaatttgcaggccaggcgcagtggctcacacctgtaatcccagcactttgg i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30544924 206 + 132286798 tcttaatgcattattttaatgaaaattgaaTTGACCACTTTTTAAATGATGGAACACCTATAAAATGGAATTCTATACTGCTGTTACAAAGAATAAGTCTGCTTTATATATGCTGACATAGAAAGATAGTCCCAATATAGTAAGTGGATAAAAAGCAAtttgcaggccaggcgcagtggctcaagcctgtaatcccagcactttgg i papAnu2.chr11 C 0 M 1163 s chlSab2.chr11 30809629 206 + 128539186 TCTTAATGCATTATTTTAATGTAAATTGAATTGACCACTTTTtaaatgatggaacacctataaaatggaattctatactgctgttacaaagaataagtctgctttatatatgctgacatagaaagatagtcccaatatagtaagtggataaaaagcaacttgcaggccaggcgcagtggctcacgcctgtaatcccagcactttgg i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88202803 205 - 124281992 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31389282 0 + 134985053 C e papAnu2.chr11 30547682 0 + 132286798 C e macFas5.chr11 31857642 0 + 137757926 C e canFam3.chr27 28464167 1478 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=19866.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 228581 10 + 238139 GTACCTACTT s panTro4.chr12 77146634 10 - 134246214 GTACCTACTT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31389282 10 + 134985053 GTACCTACTT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31857642 10 + 137757926 GTACCTACTT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30547682 10 + 132286798 GTACCtactt i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30811626 10 + 128539186 GTACCTACTT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88204505 10 - 124281992 GTACCTACTT i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32333903 0 + 136387465 C e canFam3.chr27 28464167 1478 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=315644.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 228591 132 + 238139 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atataaataaatatgcaacCAAGAAGTCCATAAAAGCTCTTCTTTCCTCTACCCATAACTCTCTTCCCCCTCATCTTTGAATGTTTAAATCCCACCCATCCTTCGAGGCCTGACTCGAATGCCAGCTCACGTC i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30811636 133 + 128539186 ATATAAATAAATATGCAACCAAGAAGTCCATAAAAGCTCTTCtttcctctacccagaactctcttccccctcatctttgaatgtttaaatcccacccatccttcgaggcctgactcgaatgccagctcTCATC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88204515 132 - 124281992 ATATAAATAAATTTACAGCCAAGGAGTCCATAAATGATCTTCtttcctccacctggaactcttttccccctcatctttgaatgttt-aatcctacccatccttcaaggcccgactcaaataccagctcacgtc i calJac3.chr9 C 0 I 1 e canFam3.chr27 28464167 1478 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=95418.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 228723 56 + 238139 AGTAATGGTCATGGATTGATTTCCAGCTCTGGATCCAGCATCGCTCTGCACACCCA s panTro4.chr12 77146776 56 - 134246214 agtaaTGGTcatggattgatttccagctctggatccagcatcgctctgcacaccca i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31389425 56 + 134985053 agtaatggtcttGGattgattgccagctctggatccagtattactctgcacgccca i rheMac3.chr11 C 0 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catagtttttcttccttcacaat----aatcttcacaagaatcc--tgacatagatgctggtctttcctatttacatagg-aaaaaaatgggcctttacagttatgaagcttattcagtgtcacatgtgtcataaattagtgatg-----gagctaagaaacctcacctcctgacccGGTTC--ATTCTGAATTCATCCCGCTTTACTCC---ATGGACTTCGCCTTAATCTCTCAAACAGGAAACAATACTTTCTTCCTCTCAAGTCTTCTAACATTTGGTGAGTGCCTCTTAAAGCACATATTAGTTTCTGCTTTATGT--------TTCGTTTATCTGTGTATAGCCTCACATCTCTATATGAGAATAAGAGCTGACTCTAATCATTTCAATCCACAGATGGcataaaaatcacctgtgaacgtt i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31857841 403 + 137757926 CATAGTTTTTCTTCCTTCACAAt----aatcttcacaagaatcc--tgacatagatgctggtctttcctatttacatagg-aaaaaaatgggcctttacagttatgaagcttattcagtgtcacatgtgtcataaattagtgatg-----gagctaagaAACCTCACCTCCTGACCCGGTTC--ATTCTGAATTCATCCCACTTTACTCC---ATGGACTTCGCCTTAATCTCTCAAACAGGAAACAATACTTTCTTCCTCTCAAGTCTTCTAACATTTGGTGAGTGCCTCTTAAAGCACATATTAGTTTCTGCTTTATGT--------TTCGTTTATCTGTGTATAGCCTCACATCTCTATATGAGAATAAGAGCTGACTCTAATCATTTCAATCCACAGATGGcataaaaatcacctgtgaacgtt i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30547881 404 + 132286798 CATAGTTTTTCCTCCTTCACAAT----AATCTTCACAAGAATCT--TGACATAGATGCTGGTCTTTCCTatttacataggaaaaaaaatgggcCTTTACAGTTATGAAGCTTATTCAGTGTCACATGTGTCATAAATTAGTGATG-----GAGCTAAGAAACCTCACCTCCTGACCCGGTTC--ATTCTGAATTCATCCCGCTTTACTCC---ATGGACTTCGCCTTAATCTCTCAAACAGGAAACAATACTTTCTTCCTTTCAAGTCTTCTAACATTTGGTGAGTGCCTCTTAAAGCACATATTAGTTTCTGCTTTATGT--------TTCGTTTATCTGTGTATAGCCTCACATCTCTATATGAGAATAAGAGCTGACTCTAATCATTTCAATCCACAGATGGCATAAAAATCACCTGTGAACGTT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30811825 403 + 128539186 CATAGTTTTTCTTCCTTCACAAT----AATCTTCACAAGAATCC--TGACATAGATGCTGGTCTTTCCTATTTACATAGG-AAAAAAATGGGCCTTTACAGTTATGAAGCTTATTCAGTGTCACATGTGTCATCAATTAGTGATG-----GAGCTAAGAAACCTCACCTCCTGACCCGGTTC--ATTCTGAATTCATCCCGCTTTACTCC---ATGGACTTCGCCTTAATCTCTCAAACAGGAAACAATACTTTCTTCCTCTCAAGTCTTCTAACATTTGGTGAGTGCCTCTTAAAGCACATATTAGTTTCTGCTTTATGT--------TTCGTTTATCTGTGTATAGCCTCACATCTCTATATGAGAATAAGAGCTGACTCTAATCATTTCAATCCACAGATGGcataaaaatcacctgtgaacgtt i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88204703 389 - 124281992 CATATCTTATCTTCCTTTACAAT----AATCTTCACAATAATCC--TGACACAGATGCCGGTctttctcatttacatatg--aaaaaatgggccttcacagttgtgaagcttattcaatatcacatgtgtcacagattactgatggaggtgagataagaaacttcacctcctgacctggttc--attctGAATTTATTCTACTTTACTCC---ATGGACTTTGCCCTAATCTCTC------------------TCTTCCTCTCAACTCTTCTAACATTTGGTCAGTGCCTCTAAAAGCACATATTAGTTCCTACTTTATGT--------TTCATTTATCTGTGTGTAGTCTCACATCTCTATATGAGAATGAGAGCTGATTCTAACCATTGCAGTCCATAGATGgcataaaaatcacctgtgaacttt i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28465645 411 - 45876710 CATGTTTTATATCTCTTCATTGTTTAAgatcttgatgataatcctgtggcatagatgggagtccttctcatttatgtatg--aaaaaatgggccttaacaattatgaggcttaatcagtgttcca--tgtcat-aataagtggtggag--gtgcaaggaaaccaggtctcttga----gttcgaattccagattcatgctcctgtacTCCTCTATGGACTTTGCCCTGACTTCTCAAACAGAAAGTACTATTTTCCTCCTCTCAATCCTTCTAACATGTTGTCAGTGCATTGTAAGCCACACATCAGTTTCTGCTTTATTTCAACTTACTTGAGTCATTCATGTGCAGCCTTGTAACTCTATATG---ACAAGATCTAAATCTAATAGTTTCAATCCTTAGAGGGCATGAATAT---CTGTGAACTTC i canFam3.chr27 I 1478 I 2491 e ponAbe2.chr12 32334036 2108 + 136387465 I e 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panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32336259 440 + 136387465 CAAATAGCAAATGCCAGGTGgggcacggtggctcacgtctgtaatcccaacactttaggaggctgaggcaggtggatcccttgagctcaggagttccagaccagcctgggcaacatggtgaaacctcgtctctacaaaaagcacaaaaattagccgggcatggtggtgcacacctgtagtcccagctgcttgtggggctgaagcggaaggattgcttgagcccaggggatcgagactgcaatgagctgtgatggcattactgcactccaatgtgggtgacaaagcaataccctgtctcaaa------aaaaaaaaaa-aagctgggcgcggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggcggatcac--------gagatcaagaccatcccggctaacacagtgaaacccccgtctctacaaca--aaatac----------------aaaaaaaa- i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31390046 460 + 134985053 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CAAATTGCAAATGCCGGGTGgggcacggtggttcatgtctgtaatcccaacactttgggaggccgaggcaggtggatccattgagctcaggagttccagaccagcctgggcaacacggtgaaacctcatctctacaaaaagtacaaaaattagccgggtatggtggtgcacacctatagtcccagctacttgaggggctgaggcagaaggattgcttgagcccaggggatccagactgcaatgagctgtgatggcattactgcactccaacgtgggtgccagagcaataccctgtctcaaa------aaaataaaaa-aGAGcaggcatggtggctcatgcctgtaattccagcacttcaggaggctgatgtgggcggatcacaaagtcgggagatcgagaccatcctggctaacacagtgaaacccccatctctacaaca--aaatac------aaaaaaaaaaaaaaaaaa- i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30548450 466 + 132286798 CAAATAGCAAATGCCGGGtggggcacggtggttcacgtctgtaatcccaacactttgggaggccgaggcaggtggatccattgagctcaggagttccagaccagcctgggcaacacggtgaagcctcatctctacaaaaagtacaaaaattagccgggtatggtggtgcacacctatagtcccagctacttggggggctgaggcagaaggattgcttgagcccaggggatccagactgcaatgagctgtgatggcattactgcactccaacgtgggtgccagagcaataccctgtctcaaa------aaaataaaaa-agagcaggcatggtggctcacgcctgtaattccagcacttcaggaggctgatgtgggcggatcacaaggtcgggagatcaagaccatcctggctaacacagtgaaacccccatctctacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaaaaa- i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30812393 448 + 128539186 CAAATAGCAAATGCCGGGTGgggcacggtggttcacgtctgtaatcccaacactttgggaggctgaggcaggtggatccattgagctcaggagttccagaccagcctgggcaacacggtgaaacctcatcgctacaaaaagtacaaaaattagccgggtatggtggtgcacacctatagtcccagctacttg-ggggctgaggcagaaggattgcttgagcccaggggatccagactgcaatgagctgtgatggcattactgcactccaacgtgggtgccagagcaataccctgtctcaaa------aaaataaaaa-aGAGcaggcatggtggctcacgcctgtaattccagcactttaggaggctgatgtgggcagatcacaaggtcgggagatcgagaccatcctggctaacacagtgaaacccccatctctacaaca--aaatac---------------aaaaaaaaa- i chlSab2.chr11 C 0 I 179 s calJac3.chr9 88205256 461 - 124281992 CAAATAGCAAATGCCAGGTAGCgcacagtggctcacgtctgtaatcccaacactttgggaggccaaagcaggtggatcccttgagctcaggagttccaaaccagcctgggcaacatggtgaaacctcatctccac-aaaagtacaaaaattagccaggtgtggtggtgcacacctgtagttccagctacttgggggactgaggcagaaatattgcttgaacccaaggggtcgaagctgcagtgagctgtgatggcattactgcactccagcatgggtgacagagcaataccctgtctcaaaaaaaataaaaaagaaa-aggccaggcgctgtggcttatgcctgaaatcccagcattttggaaggccatggtgggtagatcacgaggtcaggatattaagactatcctgggcaacattgtgaaa-ccccatctctac--ta--aaatac-----aaaaaaaaaaaaaaaaaaa- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28468712 5 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=224969.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 229801 183 + 238139 ttagctgggcatggtggcgtgcacctgtagtc------------------------------------------------------ccaggtactcgagaggctgaggcaggagaattgcttgaacccgggaggcggaggttgcagtgagccgagatcgtgccactgcactccggcctgggtg--agagtaagactctgtctcaaaaaataataataataaattaaa------------------------------------------------aagaaaGAAAAG s panTro4.chr12 77147852 183 - 134246214 ttagctgggcgtggtggcgtgcacctgtagtc------------------------------------------------------ccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacctgggaggcggaggttgcagtgagccgagatcatgccactgcactccggcctgggtg--agagtaagactctgtctcaaaaaataataataataaattaaa------------------------------------------------aagaaaGAAAAG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32336699 183 + 136387465 ttagctgggcgtggtggcatgcacctgtagtc------------------------------------------------------ccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccgggaggcagaggttgcagtgaaccaggatcgagccactgcactccaggctgggtg--aaagtaagactctgtctcaaaaaataataataaaaaattaaa------------------------------------------------aagaaaGAAAAG i ponAbe2.chr12 C 0 M 754 s rheMac3.chr11 31390506 183 + 134985053 atagatgg------------------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------------------------gcttgaacccgggaggcagagcttgcagtgagccaagatcatgccactgcactccagcctgggcgacagagtaagactccgtctcaaaaaaaaataataaaaaataaaa------------------------------------------------aagaaaGGAAAG i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31858864 185 + 137757926 ttagctgggcgtggtggcgtgcacttgtagtc------------------------------------------------------ccagatactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggcagagcttgcagtgagccaagatcatgccactgcactccagcctgggcgacagagtaagactccgtctcaaaaaataataataaaaaataaaa------------------------------------------------aagaaaGAAAAG i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30548916 185 + 132286798 ttagctgggcgtggtggcgtgcacttgtagtc------------------------------------------------------ccagatactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggcggagcttgcagtgagccaagatcatgccactgcactccagtctgggcgacagagtaagactccgtctcaaaaaataataataaaaaataaaa------------------------------------------------aataaagaaaag i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88205717 232 - 124281992 tcagccaggtgtggtggcacatgcctatagtc------------------------------------------------------ccatctacttgggaggctgaggcaggggaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgagcctagatcaagccactgcactccaacct-agcgacagagtgataatgcatctaaaaaagaagaaagaaggaaggaaagaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagaaggaaggaaggaaggaaggaagg i calJac3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e canFam3.chr27 28468712 5 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=9315.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 229984 8 + 238139 AAAAGAGA s panTro4.chr12 77148035 8 - 134246214 AAAAGAGA i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31390689 8 + 134985053 AAAAGAGA i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859049 8 + 137757926 AAAAAAGA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549101 8 + 132286798 aaaagaga i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88205949 8 - 124281992 aagggaga i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32336882 754 + 136387465 M e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e canFam3.chr27 28468712 5 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=212294.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 229992 143 + 238139 AAAAGCAGATACCTTATAAGTATTTGTTGACTTATCCATAATCATTAATTATTTTTATAAATCCAAATATGGAATCAGAGCTGCCTTTACTGGAAGAAAAGTCTAAGTGTTTGGGTAAT---AGAGACACTATGAGGATCAGGTAG s panTro4.chr12 77148043 143 - 134246214 AAAAGCAGATACCTTGTAAGTATTTGTTGACTTATCCATAATCATTAATTATTTTTATAAATCCAAATATGGAATCAGAGCTGCCTTTACTGGAAGAAAAGTCTAAGTGTTTGGGTAAT---AGAAACACTATGAGGATCAGGTAG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31390697 143 + 134985053 AAAAGCAGATACCTTGTAAGTATTTGTTGAATTACCCATAATCATTAATTATTTTTGTAAATCCAAATATGGAATCAGAGCTGCCTTTACTGGAAGAAAAGTCTAAGTGTTTGGGTAAT---GGAGACACTATGAGGATCAGGTAG i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859057 143 + 137757926 AAAAGCAGATACCTTGTAAGTATTTGTTGAATTACCCATAATCATTAATTATTTTTGTAAATCCAAATATGGAATCAGAGCTGCCTTTACTGGAAGAAAAGTCTAAGTGTTTGGGTAAT---GGAGACACTATGAGGATCAGGTAG i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549109 143 + 132286798 aaaagcagataccttgtaagtatttgttgaattacccataatcattaattatttttgtaaatccAAATATGGAATCAGAGCTGCCTTTACTGGAAGAAAAGTCTAAGTGTTTGGGTAAT---GGAGACACTATGAGGATCAGGTAG i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88205957 129 - 124281992 aaAAGCAGATACCTAATAAGTATTTGTTTTATGACCCATAATC----ATTACTTTTGTAAATCCAAATATGAAATCAGAGCTTTCTTTACTGGAAGAAAGGTCTGTGTGTTTGGGTAAT---GGAGATGCTATG----------AG i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28468717 145 - 45876710 AAAAACAGATGTCCAATAAATATTTGTCAAAGTACGAATAATCATCAATGATTTTT-TAAACGCAAATGTAGAATCAGGGCTCCCTTTACAGGAAGAAAAGTCCAAGAGGTTGGGTGATGGGGGGGACCCTGTAAGGATCAGCTGG i canFam3.chr27 I 5 I 41 e ponAbe2.chr12 32336882 754 + 136387465 M e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=46575.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230135 43 + 238139 TTTAAGCAATGT----GGGGGTGGCTAGTGGGTGAACTATGAGGATT s panTro4.chr12 77148186 43 - 134246214 TTTAAGCAATGT----GGGGGTGGCTAGTGGGTGAACTATGAGGATT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31390840 43 + 134985053 TTTAAGCAACTG----CGGGGTGGCTAGTGGGTAAACTATATGGATT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859200 43 + 137757926 TTTAAGCAACTG----CGGGGTGGCTAGTGGGTAAACTATATGGATT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549252 43 + 132286798 TTTAAGCAACTG----GGGGGTGGCTAGTGGGTAAACTATATGGATT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88206086 47 - 124281992 TTTAAGCAATGGTGGAGGGGGGGGCTAGTGGATAAACTATAAGGATT i calJac3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32336882 754 + 136387465 M e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e canFam3.chr27 28468862 41 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=8640.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230178 9 + 238139 AAAGGTGCC s panTro4.chr12 77148229 9 - 134246214 AAAGGTGCC i panTro4.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31390883 9 + 134985053 AAAGGTGCC i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859243 9 + 137757926 AAAGGTGCC i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549295 9 + 132286798 AAAGGTGcc i papAnu2.chr11 C 0 C 0 e ponAbe2.chr12 32336882 754 + 136387465 M e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e calJac3.chr9 88206133 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28468862 41 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=145927.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230187 108 + 238139 ggctgggcactgtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggagggtaaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaatgtggtgaaac s panTro4.chr12 77148238 108 - 134246214 ggctgggcactgtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggagggtgaggcgggtggatcacctgtggtcaggagttcgagaccagcctggccaatgtggtgaaac i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32337636 108 + 136387465 ggctgggcactgtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggagggtgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaatgtagtgaaac i ponAbe2.chr12 M 754 C 0 s rheMac3.chr11 31390892 108 + 134985053 Agccgggcactgtggctcatgcctgcaatcccagcactttgggagggtgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaatatggtgaaac i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859252 108 + 137757926 Agccgggcactgtggctcatgcctgcaatcccagcactttgggagggtgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagactagcctggccaatatggtgaaac i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549304 108 + 132286798 agccgggcactgtggctcatgcctgcaatcccagcactttgggagggtgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagtttaagaccagcctggccaatatggtgaaac i papAnu2.chr11 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e calJac3.chr9 88206133 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28468862 41 - 45876710 I e nomLeu3.chr23 265360 306 + 34552619 I a score=311839.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230295 190 + 238139 cctgcctctactaaaaatacaaaaataagccaggcgtggtggcaagcgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaagcaggagaatcgcttgaacccaggaggcagaggctgcagtgagccaagatc-cgccactgcgttccagcctgggtgacagagcaagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaa s panTro4.chr12 77148346 190 - 134246214 cccacctctactaaaaatacaaaaataagccaggcgtggtggcaagcacctgtagtcccagctactcaggaggctgaagcaggagaatcgcttgaactcaggaggcagaggctgcagtgagccaagatc-cgccactgcgttccagcctgggtgacagagcaagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32337744 190 + 136387465 cccgcctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtagcaagcgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaagcaggagcatcgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgagatc-caccactgcgttccagcctgggtgacagagcaagactctgtcttcaaaaaaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 265666 190 + 34552619 cctgtctctgttaaaaatacaaaaataagctgggcgtggtggc-ggcacctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcagaagaatcgcttgaacccggcaggtggaggttgcaatgagctgagatcgcaccactgcactctagcctgggcgacagagtaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaag i nomLeu3.chr23 I 306 C 0 s rheMac3.chr11 31391000 188 + 134985053 ccaccctccactaaaaatgcaaaaattggccaggcgtggtggcgagcgcctgtagtcccagctacttgggagcctgaagcaacagaatcacttgaacccagaaggcagaggttgcagcgagcgaagatc-caccgctgcgttccagcctgggtaacagagcaagtctccgtctc--aaaaaaaaaaaaaaG i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31859360 190 + 137757926 cctacctccactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgagcgcctgtagtcccagctacttgggaggctgaagcaacagaatcacttgaacccagaaggcagaggttgcagtgagccaagatc-caccactgcgttccagcctgggtaacagagcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaG i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30549412 187 + 132286798 cctacctccactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgagcgcctgtagtcccagctacttgggagactgaagcaacagaatcacttgaacccagaaggcagaggttgcagtgagccaagatc-caccactgcgttccagcctgggtaacagagcaagactccgtctc---aaaaaaaaaaaaag i papAnu2.chr11 C 0 C 0 e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e calJac3.chr9 88206133 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28468862 41 - 45876710 I a score=151.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230485 3 + 238139 aaa s canFam3.chr27 28468903 3 - 45876710 AGA i canFam3.chr27 I 41 C 0 e ponAbe2.chr12 32337934 0 + 136387465 C e chlSab2.chr11 30812841 179 + 128539186 I e calJac3.chr9 88206133 0 - 124281992 C e rheMac3.chr11 31391188 0 + 134985053 C e papAnu2.chr11 30549599 0 + 132286798 C e macFas5.chr11 31859550 0 + 137757926 C e nomLeu3.chr23 265856 0 + 34552619 C e panTro4.chr12 77148536 0 - 134246214 C a score=44713.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 230488 35 + 238139 aaaGGTGCCACAAAGGTGTGCT-----------------------CAGAAACAGCCGT s panTro4.chr12 77148536 31 - 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GATCAGGccg------------------ggtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatgtcgaaaccttgtctctactaaaaatacgaaaattagcagggtgtggttgcgggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggggaatcgcttgaacctccgcagaaggtggaagttgcagtgagccgagactgtgccattgcactccagcctgggtgaccaagcgagactccatctc--------------------tgaataaataa-ataaataaata i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30813945 333 + 128539186 GATCAggccgggtgcagtggctcacgctggtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatgtcaaaaccctgtctctactaaaaatacgaaaattagtagggtgtggttgcgggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggggaatcacttgaacctctgcagatggtggaagttgcagtgagccgagactgtgccattgcactccagcctgggtggccaagcgagactccatctctaaataaataaataaataaataaataaataa-ataaataaata i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88207101 0 - 124281992 C e canFam3.chr27 28469394 835 - 45876710 I a score=513474.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 231739 191 + 238139 GATCAGTTAATAGGGTTgaaacaaacaaaaatggaaatatataaaaagaaacaaaaacgaaagaaaagaaaTCTCATTGGAAATCTCACTGGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAATGGActgctcttattacataaggattatagagctgacccatgattagtaaagtatatgcttgagttgttttt s panTro4.chr12 77149770 191 - 134246214 GATCAGTTAATAGGGTTgaaacaaacaaaaatggaaataaataaaaagaaacaaaaacgaaagaaaagaaaTCTCATTGGAAATCTCACTGGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAAtggactgctcttattacataaggattatagagctgacccacgattagtaaagtatatgcttgagttgttttt i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339185 186 + 136387465 GATCAGTTAATAGGGTTGAAACAAACAAAAATGGAAATAAATAAAAAGAAACAAAAAC-----AAAAGAAATCTCATTGGAAATCTCACTGGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAAtggactgctcttattacataaggattatagagctgacccacgattagtaaagtatatgcttgagttgttttt i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267066 173 + 34552619 GATCAGTTAATAGGGTTgaaacaaacaaaaatggaaataaataaaaagaaacaaaaac-----gaaagaaagCTCATT-------------GAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAATGGACTGTTCTTATTAAATAAGGATTATAGAGCTGGCCCACGATTAGTGAAGTATATGCTTGAGTTGTTTTT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31392769 179 + 134985053 gatCAGTTAACAGGGTTgaaacaaacaaaaacgtaaataaataaaaagaaacaaaaatgaaagaaaagaaaTCTCACT------------GGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAAtggactgctcttattacataaggattacagagctgagccacaattagtaaagtatatgcttgagttgttttt i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31861146 179 + 137757926 GATCAGTTAACAGGGTTGaaacaaacaaaaacgtaaataaataaaaagaaacaaaaatgaaagaaaagaaaTCTCACT------------GGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAAtggactgctcttattacataaggattacagagctgagccacaattagtaaagtatatgcttgagttgttttt i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30551546 179 + 132286798 gatcagttaacagggttgaaacaaacaaaaatgtaaataaatgaaaagaaacaaaaatgaaagaaaagaaatctcacT------------GGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAATGGACTGTTCTTATTACATAAGGATTACAGAGCTGAGCCACAATTAGTAAAGTATATGCTTGAGTTGTTTTT i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814278 179 + 128539186 GATCAGTTAACAGGGTTGaaacaaacaaaaatgtaaataaataaaaagaaacaaaaatgaaagaaaagaaaTCTCACT------------GGAGATTTTTGCATAAATTTGATCCAAAATGGActgctcttattacataaggattacagagctgagccacaattagtaaagtatatgctcgagttgttttt i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88207101 187 - 124281992 AATCACTTAATAGGGTTGAAACAAACAAAAATATAAGTAAATAAAAAGAAACAAAAAC-AAAGAAAATAAATCTCATTGGAAATATCACTGGAGATTTTTGCATAGATATGATCTGTAATGGACTGTTCTTATTACATACGGATTATAGAGCTGACCCATAGTTAGTAAAGTATATGCtt---ttattttt i calJac3.chr9 C 0 I 285 e canFam3.chr27 28469394 835 - 45876710 I a score=40123.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 231930 17 + 238139 cGTAATAATATTATTTC s panTro4.chr12 77149961 17 - 134246214 cGtaataatattatttc i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339371 17 + 136387465 cataataatattatttc i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267239 17 + 34552619 CGTAATAATATTATTTC i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31392948 17 + 134985053 cctaataatattatttc i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31861325 17 + 137757926 ccTAATAATATTATTTC i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30551725 17 + 132286798 CCtaataatattatttc i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814457 17 + 128539186 ccTAATAATATTATTTC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88207288 285 - 124281992 I e canFam3.chr27 28469394 835 - 45876710 I a score=5576.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 231947 2 + 238139 AT s panTro4.chr12 77149978 2 - 134246214 at i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339388 2 + 136387465 at i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267256 2 + 34552619 AT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31392965 2 + 134985053 at i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31861342 2 + 137757926 AT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30551742 2 + 132286798 at i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814474 2 + 128539186 GT i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28470229 2 - 45876710 at i canFam3.chr27 I 835 C 0 e calJac3.chr9 88207288 285 - 124281992 I a score=267885.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 231949 78 + 238139 AATA-TCATTAATTAATATATTTGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGGATATACAATATTATAAAATATACTTCCCA s panTro4.chr12 77149980 78 - 134246214 aata-tcattaattaatatatttGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGGATATACAATATTATAAAATATACTTCCTA i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339390 78 + 136387465 aata-tcattaattaatatatttGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGGTTATACAATATTATAAAATATACTTCCTA i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267258 78 + 34552619 AATA-TCATTAATTAATATATTCGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGCATATACAATATTATAAAATATACTTCCTA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31392967 78 + 134985053 aata-acattaattaatatatttGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGGACATACAATGTTATGAAATATGCTGCCTA i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31861344 78 + 137757926 AATA-tcattaattaatatatttgtgcacatactctgctatatgataaggacatacaatgttatgaaatatgctgccta i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30551744 78 + 132286798 aata-tcattaattaatatatttgtgCACATACTCTGCTATATGATAAGGACATACAATGTTATGAAATATGCTGCCTA i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814476 78 + 128539186 AATA-TCATTAATTAATATATTTGTGCACATACTCTGCTATATGATAAGGACATACAATGTTATGAAATATGCTGCCTA i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88207573 78 - 124281992 AGTA-TCATTAATTAATATCTTTGTGCACATACTCTGCTATACGATAAGGATATACAATATTATAAAATATACTTCCTA i calJac3.chr9 I 285 C 0 s canFam3.chr27 28470231 75 - 45876710 aatagtaataaATAAATATCTTTAAGTACATTATCTGCTATATGATAAGGATGT----TGTTATAAAACATACTTCCTA i canFam3.chr27 C 0 I 1009 a score=1133505.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 232027 379 + 238139 gactgggtgtgttggctcacacctataatcccagcactttgggaggccacggcaggaggccgtgtttgagagcagcctgggcaacatagagagactgtgtctctacaaaaactttaaaaaattgtcagggcatgatggcatgggcttttagtcccagatactcaggaggctgagcggggaggacctccccgcttgagcccacaatgcagaggttgtagtgagctgtgatagtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagaccttgtct---aaaaaaCAATAgagtaaaatatacttcctatccttaatgggcttccagccccaagagggagacataacagttatgtaaaaagtaaataccagctgggcacagtgg s panTro4.chr12 77150058 379 - 134246214 gactgggtgtgttggctcacacctataatcccagcactttgggaggccacggcaggaggccgtgtttgagagcagcctgggcaacatagagagactgtgtctctacaaaaactttaaaaaattgtcagggcatgatggcatgggcttttagtcccagatactcaggaggctgaggggggaggacctccccgcttgagcccacaatgcagaggttgtagtgagctgtgatagtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagaccttgtct---aaaaaacaaTAgagtaaaatatacttcctatccttaatgggcttccagccccaagagggagacataacagttatgtaaaaagtaaataccagctgggcacagtgg i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339468 379 + 136387465 gactgggtgtgttggctcacacctataatcccagcactttgggaggccacggcaggaggccgtgtttgagagcagcctgggcaacacagagagactgtgtatctacaaaaactttaaaaaattatcagggcatgatggcatgggcttttagtcccagctactcaggaagctgaggggggaagacccccctgcttgagcccacaatgcagaggttgtagtgagctgtgatcgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagaccttgtct---aaaaaaTAATAgagtaaaatatacttcctacccttaatgggcttccagccccaagagggagacataacagttacataaaaagtaaataccagctgggcacagtgg i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267336 379 + 34552619 gactgggtgtgttggctcacatctataatcccagcactttgggaggccacggcaggaggccgtgtttgagagcagcctgggcaacatagagagactgtgtctccacaaaaacgttaaaaaattatcagggcatgatggcatgggcttttagtcccagctactcaggaggctgaggggggaggacccccccgcttgagcccataatgcagaggttgtagtgagctgtgatcttgccactgcattccagcctgggtggcagagcaagaccttgtct---aaaaaaTAATAgagtaaaatatacttcctatccttaatgggcttccagccccaagagggagacataacagttatgtaaaaagtaaataccagctgggcacagtgg i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31393045 376 + 134985053 gactgggtgtgttggctcacacctgtaatcccagcacttt-ggaggccacggcaggaggctgtgttcgagagcagcctgggcaacacagagagactatgtctctacaaaaactttaaaaaattatcagggcatgatgtcacgggcttttagtcccagctactcaggaggctgagtggggaggaccctcc-gcttgagcccacaacgaagaggttgtagtgagctgtgattgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagacc-tgtct---aaaaaaTAATAGAGCAAAATATACTTCCTATCCTTAATGGGCTTCCAGCCCCAAGAGGGAGACATAACAGTTACATAAAAAGTAAACACCAGCTGAGCACAGTGG i rheMac3.chr11 C 0 I 1271 s macFas5.chr11 31861422 376 + 137757926 gactgggtgtgttggctcacacctgtaatcccagcacttt-ggaggccacggcaggaggctgtgttcgagagcagcctgggcaacacagagagactatgtctctacaaaaactttaaaaaattattagggcatgatggcacgggcttttagtcccagctactcaggaggctgagtggggaggaccctcc-gcttgagcccacaacgaagaggttgtagtgagctgtgattgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagacc-tgtct---aaaaaataatagagcaaaatatacttcctatccttaatgggcttccagccccaagagggagacataacagttacataaaaagtaaacaccagctgagcacagtgg i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30551822 375 + 132286798 gactgggtgtgttggctcacacctgtaatcccagcacttt-ggaggccacggcaggaggccatgttcgagagcagcctgggcaacacagagagactgtgtctctac-aaaactttaaaaaattatcagggcatgatggcacaggcttttagtcccagctactcaggaggctgagtggggaggaccCTCC-GCTTGAGCCCACAAcgaagaggttgtagtgagctgtgattgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagacc-tgtct---aaaaaataatagagCAAAATATACTTCCTATCCTTAATGGGCTTCCAGCCCCAAGAGGGAGACATAACAGTTACATAAAAAGTAAACaccagctgagcacagtgg i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814554 377 + 128539186 gactgggtgtgttggctcacacctgtaatcccagcacttt-ggaggccacggcaggaggccgtgttcgagagcagcctgggcaacacagagagactgtgtctctacaaaaactttaaaaaattatcagggcatgatggcacgggcttttagtcccagctactcaggaggctgagtggggaggacccccctgcttgagcccacaacgaagaggttgtagtgagctgtgattgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagacc-tgtct---aaaaaaTAATAgagcaaaatatacttcctatccttaataggcttccagccccaagagggagacataacagttacataaaaagtaaacaccagctgagcacagtgg i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88207651 375 - 124281992 gactgggtttggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggccatagcagaaggccatgtttgagagcagcctgggcaacataga------ctgtctctacaaaaaatttttaaaattatcagggcatagtggcacaggtctttagtcctagctacttaggaggctgagatgagaggacccccg-ccttgagcccacaacacagaagttgtagtgagctgtgattgtgccactgcattccagcctgggtgacagagccagaccttgtatctcaaaaaaTGTTAGAGTAAAATATACTTCCTATCCTTAATGGGCTTCCAGGCCCAAGAGGGAGACATAACAGTTACATAAAAAGTAAATACCAgccagcagcggtga i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28470306 1009 - 45876710 I a score=582305.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 232406 279 + 238139 ctcacgcctgtaatcccagctctttgggaggctgaggcaggcagatcac--gaggtcaggagttcaagaccagcctgaccaacacggtgaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcatggtggtgaccacctgtaatcccagctactcaagaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcaga-gttgcagtgagctgagatcgcgccattgcactctagcctggccagcagagcgagagtccatctcaatt----aaaaaaaaaaaa s panTro4.chr12 77150437 283 - 134246214 ctcacgcctgtaatcccagctctttgggaggctgaggcaggcagatcac--gaggtcaggagttcaagaccagcctgaccaacacggtgaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcatggtggtgaccacctgtaatcccagctactcaagaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcaga-gttgcagtgagccgagatcgcgccattgcactctagcctggccagcagagcgagagtccatctcaattaaaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32339847 253 + 136387465 ctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggcagatcac--gaggtcaggagttcaagaccagcctgaccaacatggtgaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcatggtggcgaccacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatc------------------------------agccgagatcgcgccattgcactctagcctgggcagcagagcaagagtccatctcaatt-taaaaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 267715 280 + 34552619 ctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggcagatcac--gaggtcaggagttcaagaccagcctgaccaacacggtgaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagccacacatggtggcgaccacctataatcccagctactcaagaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccggtaggcaga-gttgcagcgaacccagatcgcgccattgcactctagcctgggcagcagagctagagtccatctcaatt---aaacaaaaaaaaa i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31861798 277 + 137757926 ctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggcagattat--gaggtcaggagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaatccatctctactaaaaatacaaaaattaaccaggtgtggtggcgaccgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacctgggaggcaga-gttgcactgagccgagatcgtgccattgcactctagcctgggcaacagagcaagagtccatctcaatt------taaaaaaaaa i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30552197 278 + 132286798 ctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggcagattat--gaggtcacgagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaatccatctctactaaaaatacaaaaattaaccaggtgtggtggcgaccGCCTGTAATcgcacctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacctgggaggcaga-gttgcactgagccgagatcgtgccattgcactctagcctgggcaacagagcaagagtccatctcaatt-----aaaaaaaaaaa i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30814931 278 + 128539186 ctcatgcctgtaatcccagcactttgggagactgaggcaggcagattat--gaggtcaggagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaatccatctctactaaaaatacaaaaattaaccaggtgtggtggtgaccgcctgtaatctcagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacctgggaggcaga-gttgcagtgagccgagatcgtgccattgcactctagcctgggcaacagagcaagagtccatctcaatt-----taaaaaaaaaa i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88208026 279 - 124281992 ctcatgcttgtaatcccagaactttggaaggttgaggagggcagatcacctgaggctgagagttcaagaccagcctggccagcgtggagaaccccatctttactaaaaatacaaaaattagccaggtgtggtggtacatgcctgtaattccagctactcaggagggtgaggcaggagaatcacttgtacct-ggaggcagaggttgcagtgagctgagattacaccactgcactccagcctaggtgacagag--agagactgttttaaaa----aaaaaaaaaaaa i calJac3.chr9 C 0 I 1040 e rheMac3.chr11 31393421 1271 + 134985053 I e canFam3.chr27 28470306 1009 - 45876710 I a score=520155.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 232685 303 + 238139 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chlSab2.chr11 30816573 87 + 128539186 AGGCTGATGTTttttat-----gtacagacggggtctcactatgttgcgcaggcctgtccctaactcctggcttcaagtgatcctcccattt----------------------------------------------- i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88210054 87 - 124281992 gggctaatgttttctat-----ttagagacaggatctcactatgttgcccaggccacttcctaactgctagcttcaagtgatccttccactt----------------------------------------------- i calJac3.chr9 C 0 C 0 e canFam3.chr27 28470306 1009 - 45876710 I a score=584164.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 234100 170 + 238139 cCCATGTTTCTAATCTTGATGGTGGTCACGTGAACTAAGTTTGAG-AAGCTAGGAAATGAACA-GGTTTTGGGAGGAGGATGATCAGATCTGATTTGGGGAAGGGAATGAGAGAGAAGAGAAGCTAGAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG------TTTTTTGTTAGTGTG-TTTGTT s panTro4.chr12 77152141 170 - 134246214 cCCATGGTTCTAATCTTgatggtggtctcatgaactaagtttgag-aagctaggaaatgaaca-ggttttgggaggaggatgatcagatctgatttggGGAAGGGAATGAGAGAGAAGAGAAGCTAGAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG------TTTTTTGTTAGTGTA-TTTGTT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32341516 170 + 136387465 cCCGTGTTTCGAATCTTgatggtggtcacatgaactaagtttgag-aagctaggaaatgagca-ggtttcgggaggaggatgatcagatctgatttggGGAAGGGAATGAGAGAGAAGAGAAGCTAGAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG------TTTTTTGTTAGTGTG-TTTGTT i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 269617 170 + 34552619 ccCATGTTTCTAATCTTGGTGGTGGTCACATGAGCTAAGTTTGAG-AAGCTAGAAAATGAACAGGGTTTCAGAAGGAGGATGATCAGATCTGATCTGGGGAAGGGAATGAGAGAGAAGAGAAGCTAAAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG-------TTTTTGTTAGTGTG-TTTGTT i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31395457 170 + 134985053 cCCATGTTTCTAATTTTGATGGTGGTCACATGAACTAAGTTTGAG-AAGCTAGGAAATGAACA-GGTTTAGGGAGGAAGATGATCAGATCTGATCTGGGGGAGGGAATGAGAAAGAAGAGAAGCTAAAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG------TTTTTTGTTTGTGTG-TTTGTT i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31863849 170 + 137757926 cCCATGTTTCTAATTTTGATGGTGGTCACATGAACTAAGTTTGAG-AAGCTAGGAAATGAACA-GGTTTAGGGAGGAAGATGATCAGATCTGATCTGGGGGAGGGAATGAGAAAGAAGAGAAGCTAAAGAGGAATGAAAGATCAAGGAAAG------TTTTTTGTTTGTGTG-TTTGTT i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30554326 170 + 132286798 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canFam3.chr27 C 0 I 159 e calJac3.chr9 88210316 3782 - 124281992 I a score=716539.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 234324 287 + 238139 TATTCTATTCTGCATGATAGGAACTCAGTAAATATTTTTTGAAAAAATGAAAAGAttgcgaagccgatgcaggtagatcatttgaggtcaggttttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccgtccctactaaaaatacaaaaatt----aggcggtagtggcacgcacctgtaatcccagctactcggtaggctgaggcaggagaatcacttgaactcggaaggcagaggttgtggtgagctgagatcacgccactgcactccagcctggatgacaaagtgaga s panTro4.chr12 77152365 287 - 134246214 TATTCTATTCTGcatggtaggaactcagtaaatattttttgaaaaaatgaaAAGAttgggaagccgacgcaggtagatcatttgaggtcaggttttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccgtccctactaaaaatacaaaaatt----aggcagtagtggcacgcacctgtaatcccagctactcggtaggctgaggcaggagaatcacttaaactcggaaggcagaggttgtggtgagctgagatcacgccactgcactccagcctggatgacaaagtgaga i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32341740 287 + 136387465 TATTCTATTCTGcatggtaggaactcagtaaatattttttgaaaaaatgaaAAGAttgggaagctgatgcaggtagatcatttgaggtcaggtgttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaatt----aggcagtagtggcacgcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaactcggaaggcagaggttgtggtgagctgagatcacgccactgcactccagcctggatgacaaagtgaga i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 269841 287 + 34552619 TATTCTATTCTGcatggtaggaactcagtaaatatttcttgaaaaaatgaaAATAttgggaagccgatgcaggtagatcatttgaggtcaggtgttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaatt----aggcggtagtggcacacacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaactcggggggcagagattgtggtgagctgagatcacgccactgcactccagcctggatgacaaagtgaga i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31395681 291 + 134985053 TATTCTATTCTGcatggtaggaactcagtaaatattttttgaaaaaatgaaAAGAttgggaggccgatacaggtagatcatttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagtcaggcggtagtggcacacacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaactcgggaggaagaggttgtggtgagccgagatcacgccactgcactccagcctgggtgacaaagtgaga i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31864073 291 + 137757926 TATTCTATTCTGcatggtaggaactcagtaaatattttttgaaaaaatgaaAAGAttgggaggccgatacaggtagatcatttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagtcaggcggtagtggcacacacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaactcgggaggcagaggttgtggtgagccgagatcacgccactgcactccagcctgggtgacaaagcgaga i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30554550 291 + 132286798 TATTCTATTCTGCATGGtaggaactcagtaaatattttttgaaaaaatgaaaagattgggAGGCCGAtacaggtagatcatttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagtcaggcggtagtggcacacacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaactcgggaggcagaggttgtggtgagccgagatcacgccactgcactccagcctgggtgacaaagtgaga i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30816884 291 + 128539186 TATTTTATTCTGCATGGTAGGAACTCAGTAAATATTTTTTGAAAACATGAAAAGAttgggaggccgatacaggtagatcatttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacataatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagtcaggcggtagtggcacacacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaactcgggaggcagaggttgtggtgagccgagatcacaccactgcactccagcctgggtgacaaagtgaga i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88210316 3782 - 124281992 I e canFam3.chr27 28471541 159 - 45876710 I a score=301620.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 234611 124 + 238139 ccctgtctcaaa----------aaaataaaataaaataaaataaa-----------aataaaaataaaaaATGGAAAGCGTTGAGAGGAAGAAACTAGAGATAAAGAG--AATATGACTGAAAAAGCAAGGTCCCCAGGAAAACCAT s panTro4.chr12 77152652 124 - 134246214 ccctgtctcaaa----------aaaataaaagaaaagaaaagaaa-----------aagaaaaagaaaaaATGGAAAGGGTTGAGCGGAAGAAACTAGAGATAAAGAG--AATATGACTGAAAAAGCAAGGTCCCCAGGAAAACCAT i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32342027 112 + 136387465 ccctgtctcaaa----------aaaataaaag------------a-----------aagaaaaagaaaaaaTGGAAAGGGTTGGGAGGAAGAAATTAGAGATAAAGAG--AATATGACTGAAAAAGCAAGATCCTCAGGAAAACCAC i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 270128 135 + 34552619 ccctgtctcaaa----------aaaataaaataaaatataataaaataaaataaataagaaaaagaaaaaaTGGAAAGGGTTGAGAGGAAGAAATTAGAGATACAGAG--AATATGACTGAAAAAGCAAGGTCCTCAGGAAAACCAC i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31395972 126 + 134985053 ccttgtctcaaa----------aaaataaaataaaataaataaga---------aTAAGAAAAAGAAAAAATGGAAAGGGTTGAGAGGAAGAAATCAGAGATAAAGAG--AGTATGACTGAGAAAGCAAGGTCCTCAGGAAAACCAC i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31864364 126 + 137757926 ccttgtctcaaa----------aaaataaaataaaataaataaga---------aTAAGAAAAAGAAAAAATGGAAAGGGTTGAGAGGAAGAAATCAGAGATAAAGAG--AGTATGACTGAGAAAGCAAGGTCCTCAGGAAAACCAC i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30554841 126 + 132286798 ccttgtctcaaa----------aaaataaaataaaataaataaga---------ataagaaaaagaaaaaatggaaagggttgagaggaagaaatcagagataaagag--agTATGACTGAGAAAGCAAGGTCCTCAGGAAAACCAC i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30817175 136 + 128539186 ccttgtctcaaaaaaataaaataaaataaaataaaataaataaga---------ataagaaaaagaaaaaaTGGAAAGGGTTGAGAGGAAGAAATCAGAGATAAAGAG--AGTATGACTGAGAAAGCAAGGTCCTCAGGAAAACCAC i chlSab2.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28471700 127 - 45876710 ctctgtctctca----------tgaat-aaataaataaaatctta---------aaaaaaaaAAAAAAAGGATGAGTGAGTTGAGAAGAAAAAATTGGAGATAAAGAGAAAACATATCTGATAAAGTAAGGTCCTGGGGAAAACAAT i canFam3.chr27 I 159 I 7 e calJac3.chr9 88210316 3782 - 124281992 I a score=122847.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 234735 55 + 238139 ATGCGGTCGtgtcttagtctgtttgggctgctataacataataccataaaatact s panTro4.chr12 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cattaTCACAAACTTTCTTATCTCCTG-TTTGTTCTCCTGAAAacccatttatttttccaaaatggtCATTTGTTCTCGCACAAGtgcctttctctccttctccttcaccAATTAAGATGGCATATAAGCCCCAAATTCTAGCCACCCCTTTGAATTACTCATCACAGAATTCTCCCGTCTGTATACACCTTGCACGTGTGAGTGtgaactgttttttat----------------ttttctcctgttaagGTATCTTTTGTGAGTTTAATTTGCAGGCCCTAGCTACTGAATCTAAGAA i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88214236 299 - 124281992 CATTATCACAAGCTTTTTTATCTCCTGTTTTGTTCTCCTGAAAAACCCATTAATTTTCCAAAATTGACATTTGTTTTCCCACAGGTGCC-TCCTCTCCTTCCCCTTCACCAAttaagatggcatataagccccaaattctagccagccctttaaattattcatcacagaattctcacatttgtgtataccttgcacatgtgagtatgaacggttttttgttgttgtttgtattttattTTCTCCTATTGAAGTACCTTTTGTGAGTTTAATGTACGGGCTTTAGCTATTGAATCTAAGAA i calJac3.chr9 C 0 C 0 s canFam3.chr27 28474504 274 - 45876710 cattatcacaaactttcttatctcttg-ttttctctcctgaacacccatttacctttccaaaa--gtc-tttggtttcccataaatgcctttcttcccttccccttcactcattaagatggtatataagccccaaattctaaccactgctatg-gttactcatcactgaggtctcctg-ctatacacacagtgtgta-ataaataagtaccattttc-------------------ccccttcctgttaatctgccttttgtcagtttaatttgcagctcccatgcactcaacctaagag i canFam3.chr27 I 2617 I 242 e chlSab2.chr11 30818878 2226 + 128539186 I e nomLeu3.chr23 271556 1749 + 34552619 I a score=10515.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 236717 6 + 238139 actgag s panTro4.chr12 77154757 6 - 134246214 ACTGAG i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32344123 6 + 136387465 ACTGAG i ponAbe2.chr12 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31397914 6 + 134985053 ACTGAG i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31866465 6 + 137757926 actgag i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 30556932 6 + 132286798 ACTGAG i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr9 88214535 6 - 124281992 GTTGag i calJac3.chr9 C 0 I 1156 e chlSab2.chr11 30818878 2226 + 128539186 I e canFam3.chr27 28474778 242 - 45876710 I e 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papAnu2.chr11 I 1470 C 0 s chlSab2.chr11 30821104 34 + 128539186 ggctcacgcctataatcccagcactttgggaggc i chlSab2.chr11 I 2226 C 0 e calJac3.chr9 88214541 1156 - 124281992 I e canFam3.chr27 28474778 242 - 45876710 I a score=4683.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 236773 2 + 238139 cg s panTro4.chr12 77154813 2 - 134246214 cg i panTro4.chr12 C 0 C 0 s ponAbe2.chr12 32344180 2 + 136387465 cg i ponAbe2.chr12 C 0 I 791 s nomLeu3.chr23 273356 2 + 34552619 ca i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s rheMac3.chr11 31399027 2 + 134985053 cg i rheMac3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr11 31867905 2 + 137757926 cg i macFas5.chr11 I 1383 C 0 s papAnu2.chr11 30558457 2 + 132286798 cg i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s chlSab2.chr11 30821138 2 + 128539186 cg i chlSab2.chr11 C 0 C 0 e calJac3.chr9 88214541 1156 - 124281992 I e canFam3.chr27 28474778 242 - 45876710 I a score=138964.000000 s hg38.chr12_KI270835v1_alt 236775 55 + 238139 aggcgggcggatcgcctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggcg s panTro4.chr12 77154815 55 - 134246214 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