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AAATGAAAAGAAAAATGTAGAAGTTG-CCTTT-GAGTTTGATTCACATACTGTTGGAATTCAGTTGCACAAGAG--AA-GAAACCTCATTGTGTTAC----GAAAATGTTGCATACGTATTAGAAAGTGCTACAAATAAAACAAGGTAACAGGTCTGGCCGGTTTCACCC---TCTTATGCCACCTCTCTGGTCTCCTCAGCTGGTATCACTTATATAT-GGGTTCTCACTTAATCTAGGCTTGG-CCACTGCAGTGATACAGACAGA-CCCTAGTTTGGAGACTCAACCGTCTGCATC i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92711751 221 - 128036923 -----------------------------------------------------------------GCACAAGAG--AA-GAAACCTCATTGTGTTAC----GAAAATGTTGCATACGTATTAGAAAGTGTTACAAATAAATCAAGGTAACAGGTCTGGCCCGTTTAACCC---TCTTATGCCACCTCTCTGGTCTCCTCAGCTGGTATCACTTACATAT-GGGTTCTCACTTAATCTAGGCTTGG-CCACTGCAGTGATACAGACAGA-CCCTAGTTTGGAGGCTCAACCGTCTGCATC i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71071069 232 + 107702431 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aagacaaaacaaaaACGAAGACATTATCTTTT-GAGTAAGAT----GTATTATTAGAGTAGAGCGATACAAGGGACAA-AAAAATCTTTTGTCTTATAAAAAAAAATGTTGCATCCATATCACAGGAAGCCATGACGACAACA-----ACAGGAACGAATCCTTTTATCTGAGTCCT--CCCGTCTCCCTAAGCCC--TAGCAAGCTTTAC-TGTATAA-GGATGCTCACCAAGTCTAGGATCAGATAATTTCAGAGGTAGAGATAAAGTCCTAGATTGAAGGCTCACTCACCTACTT- i mm10.chr17 I 18 C 0 s canFam3.chr17 35435504 276 - 64289059 AAATGAAAAGAAAAACGTAGGAGTTG-CCTTTGGAGTCTGAAAAACATATTCTTAGAACTGAATTGCACCAGAGG-AA-AAAGTATCATTGTTTTCT----AAAGATGTTGCATACATGGTAGAAAGATCTATGAAGAAACCAGGACAAGAAACCTGTTCC-TTTCACCT---TCTCCAACC--CGCCCCACCCCCCTTGGCTCTGGTCTCCCTCAGCT-GGGCTCACA------TTGGGCTTGGGCCCTTTCAGTGGCAGGGA-AAT-CCCTGCTTTGGGGGCTCCGCCATCTGATC- i canFam3.chr17 C 0 C 0 a score=1284631.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 11648 402 + 143390 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panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75396554 434 + 113028656 TTGGGCTCTGAATCTGA-ACTTGAACTCTATTGTCACCACATAATATCTTATTTTTGCTAAGTGAGT-----TCTTATTTACTCTGCCTGTGAATGATAGCTGCTGCAGAACTACCACAAGAGTTACAAGACACCTGCACAGAACACAGGTTCTCTTTGAGGTTTGGCCTAGCATCCTG------------------------acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactctcactctctctctctctctctctctctctctGTGTGtgtacaagtttaaatgaggtatttatcctttctgaatctg---tcttctctgtaaaacagagacaa----gaataccaaccatacagggtatcgtgcggat-aaaatgaTTGTTCTCCTTTTCTATTGTTA--TTTTTAGAGTCCTTCTAATTGAGTATCTCCTCAAGTTTTATGCTTGAGCTGG i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 53985986 420 + 81552678 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canFam3.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr17 16790843 1365 - 94987271 I a score=1311161.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 12130 391 + 143390 CTTAGGATC-TTCTGTTGGCCTTGTTTTGACAGTCTGTCTCATCTTGGGGTTTTAGCCTCTGTGATATTTTCTCAGACTCATTTTGGTCTCTGACTTATTTTAAAGAGCAGT-------------------------------AAT--TGGTAATGATAATagtaatagctgacactaataaagatcttattaattgctagtcaacatgctaagtgcttcatataggttattttaagtaatctacggaagagcgctgtaagaccaatggtttctattatctctagtgcct-tacgttgtcttcattttttacaggtgaggaatctgagttataggaggttgtgtggc--------ttgtcaaggtctcagagctatgtgtatggatattaagcttagaactcagtcctattctgccttaagggcctgtgtgttt s panTro4.chr2A 76740471 391 - 113622374 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i canFam3.chr17 I 216 C 0 a score=2906.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 18630 2 + 143390 GG s panTro4.chr2A 76746979 2 - 113622374 GA i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75404000 2 + 113028656 GG i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 53992981 2 + 81552678 GG i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102620712 2 - 137160470 GC i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74369051 2 + 111193037 GC i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92718954 2 - 128036923 GC i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71078464 2 + 107702431 GC i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71969984 2 + 108792865 GG i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35442052 2 - 64289059 GC i canFam3.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr17 16801602 1860 - 94987271 I a score=94703.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 18632 45 + 143390 TGcctaccttaccttttccttctcccctcccctccctt---ctcccct s panTro4.chr2A 76746981 48 - 113622374 TGCCTACCTTACCTTTTCCTTctcccctccactcccttctcctcccct i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75404002 46 + 113028656 TGCCTACCTTACCTtttccttctcccctcc-ctccctc-tcctcccct i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 53992983 48 + 81552678 TGACTACCTTATCTTttccttctcccctctcctgccctctcctgccct i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102620714 43 - 137160470 TGCCTACCTCACCTTTTCCTTcttct-----ctcccctcccctctcct i rheMac3.chr13 C 0 I 5 s macFas5.chr13 74369053 48 + 111193037 TGCCTACCTCAcctttcccttcttctctcccctcccctcccctctcct i macFas5.chr13 C 0 I 5 s papAnu2.chr13 92718956 43 - 128036923 TGCCTACCtcacctttcccttcttct-----ctcccctctcctcccct i papAnu2.chr13 C 0 I 106 s chlSab2.chr14 71078466 48 + 107702431 TGCCTACCTCACCTTTCCCTTCTTCTctcccctcccctcccctctcct i chlSab2.chr14 C 0 I 5 s calJac3.chr14 71969986 44 + 108792865 TGCCTGccttgccttttcccttcccattcccttcccttcctttt---- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35442054 0 - 64289059 C e mm10.chr17 16801602 1860 - 94987271 I a score=93265.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 18677 74 + 143390 ccctcccctccgctcccctctcctttcctttccttttatccttcctttcattcttccttcctttcctctcttcc s panTro4.chr2A 76747029 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mm10.chr17 16801602 1860 - 94987271 I e papAnu2.chr13 92718999 106 - 128036923 I a score=1342.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 18751 5 + 143390 gtatt s panTro4.chr2A 76747103 5 - 113622374 ttatt i panTro4.chr2A C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 53993105 5 + 81552678 ttctt i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71970087 4 + 108792865 -tatt i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35442054 0 - 64289059 C e mm10.chr17 16801602 1860 - 94987271 I e chlSab2.chr14 71078587 0 + 107702431 C e papAnu2.chr13 92718999 106 - 128036923 I e macFas5.chr13 74369174 0 + 111193037 C e rheMac3.chr13 102620799 0 - 137160470 C e ponAbe2.chr2a 75404119 414 + 113028656 I a score=23801.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 18756 64 + 143390 ctttcttccttccttccttcctt------------------------------------------------cctccctccctccctccctc-t---ctcattccct-----ccttcccttc s panTro4.chr2A 76747108 117 - 113622374 ctttcttccttccttctttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttcctccctccctccctccctccctccctc-t---ctcattccctccttcccttcccttc i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75404533 72 + 113028656 cttttttccttccttccttcctt------------------------------------------------cctccttctctccctccctc-tctcctcattccctccttcccttcccttc i ponAbe2.chr2a I 414 C 0 s nomLeu3.chr19 53993110 101 + 81552678 cttccttccttccttccttcctt----------------ccttccttacttccttccttccttcctccctccctccctccctccctccctc-t---cttattccctcctttccttcccttc i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102620799 14 - 137160470 -----------------------------------------------------------------------------ttccttccttcctt------------------------------ i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74369174 47 + 111193037 cttccttccttccttccttcctt----------------cctt----------------------------ccttccttccttccttcctt------------------------------ i macFas5.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71078587 69 + 107702431 cttccttccttccttccttcctt----------------ccttcctGCCTNNNNNNNNNNCCTC-------CCTCCCTCccttccttccttc----------------------------- i chlSab2.chr14 C 0 I 3 s calJac3.chr14 71970091 49 + 108792865 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aaagaGCCTT-AAAGTACACTTGGTGTTCTAAATGTGAACAGATCATGAATCTAA--AATATTCCAATT-----Taatatttactgagcacttgaattgctcccaactcttttctacatactttatgtgcatcctctcatttaattccccaacaa-tctatgtgagagggactattattatcttaattttaaagatgaggaaacttaggcacagattagttaaata--atgtcttagataat---ctaggttatatgtgggaggctcaggatttgaagataggcaatttgattccaaagcacaagctcttgaTATAACCTAAAGAATGATAATGTTTTATTTAAACAGATATACAAGAATCAGATAAACAGATGAATGTTGCTTTTCAAAGCACTAG---CACTGTCACCTTGGAAAAATATACC--CTTTCTAAGAATGTTGATGTTTCTTAAAATGTTTTTGCAACTGA-TCTCTTATCTAC i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71972258 463 + 108792865 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chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71972721 110 + 108792865 TTACAGATCTGCACACAAATTAGACTTGTTAGGTTCATATC-TTGGTTTGATGAGAAACACTATTACCTTAGCATAAAGATAGTTTCTTAAGCCAGTAAAATTGATGAATA i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35443402 8136 - 64289059 I e mm10.chr17 16803973 345 - 94987271 I a score=479424.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 27683 196 + 143390 TTGCCCAACCCA----------TGGAAATATacaagaatagttaacttctcaaagaagaaatataattc-----------acccatgaacttataaaaagatgtttaaccaaatacagtcaaagacacacaagttaaaac-----aatgagaaaatgctttttatctatcaaatg-acaaatatttctaaagactagcaa----tatccaggattggcaagaatggg s panTro4.chr2A 76750717 196 - 113622374 TTGCCCAACCCA----------TGGAAATATacaagaacaggtaacttctcaaagaagaaatataattc-----------acccatgaacttataaaaagatgtttaaccaaatacagtcaaagacacacaagttaaaac-----aatgagaaaatgctttttatctatcaaatg-acaaatatttctaaagactagcaa----tatccaggattggcaagaatggg i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75407387 196 + 113028656 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aggcatgagaattgcttgaactagggaggcagagtctacagtgagccgagatcatgccactgcactccaacctgggccacggagggagaccctgcttcaaaaaataaaac-aaa-------aaaactgtacatATTAATTATTACATGTCAGCT--AAAGCTAAA-GGGAAGAAAGATGCCCCTAGTTTCTATTCAAATAGAAGTCAACACCCAttcatttg-----tatatatatatagtagtcCTCCTTTAGCTGTGAGTTCATTTCTTCGGTTTTAGTTACCTGCAGGCAACTGACATCTGaaagtattaagtgaaaaactccaaaaa i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71087328 313 + 107702431 aggcatgagaattacttgaactagggaggcagagtctacagtgagccgagatcatgccactgcactccaacctgggccacggagggagaccctgcttcaaaaaataaaataaaa-------aaaaCTGTACATATTAATTATTACATGTCAGCT--AAAGCTAAA-GGGAAAAAAGATGCCCCTAGTTTCTATTCAAATAAAAGTCAACACCCATTAATTTG-------TATATATATATT-gtctgcctttagctgtgagttcatttcttcagttttagttacctgcaggcaactgacatcagaaagtattaagtgaaaaattccaaaaa i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71980120 318 + 108792865 acacatgagaattgcttgaacccaggaggcagagtctgcagtgagccaagactgtgctgctgcactacagcctgggtgacagagagagaccctatgtcaaaaaacaaaac-aac---aaa-aaaaCTGTATATATTAATTATT--ATGTTAACTAAAAAGCTAAA---ATAAAAAGACACCCCTAGTTT---TTCAAATAAAAGTCAACACCCATTAACTTTATATATATATATATAcagtagtcctcccttatctgtgagttcatttcttcagttttagttacctgcaggcaactgacatctgaaagtattaagtgaaaaattccaaaaa i calJac3.chr14 I 1321 C 0 e canFam3.chr17 35455787 12 - 64289059 I e mm10.chr17 16807457 3603 - 94987271 I a score=1051367.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 34256 399 + 143390 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AAGAACTCTTGGTAaagttttaaagttaaaaaagaacaACCTTTTATTTACTGGATTGTTGCATTCCTGAAAAACTCAGTTTATATTAGGACTGTAAAACCACTTTG-----------------------TGTTTATATGTAAAA-AGCATTAGATTCTAGGCCAAGATAATTATAAACAACTCTTTTTGCTTTCATaaaaaaaGTTAgtagtacattaaaaaaaaa-ggtgcagG--ACATAGACAATTCTTTGTTTAAAGGACTGGTCCATAAAGTGTTGGAAGCATATTGTTCCGGTGGCctgcctactgtgtgtcaggaacACCACTCTCCTACAATCATTGTATCCGTAAAG-----------------CACTACCCCA------TAAA---------------------------------------------------------------AAA--------------------------------------------------------------------TCATTGGTATAGGTCATGTCCTACTAAGAGCTAGGAGAGAAATGTTTGTGATGAAGGAATgaccttttattttacattgaagTCGTCAAGCATCGTTGTGTAGG i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71088496 450 + 107702431 aagaactcttggtaaagttttaaagttaaaaaagaacaaccttttatttactggattgttgcattcctgaaaaactcagtttatattaggactgtaaaaccactttg-----------------------tgtttatatgtaaaa-agcattagattctaggttgagataattataaacaactctttttgctttcataaaaaaagttagtagtacatt-aaaaaaaa-ggtgcagg--acatagacaattctttgtttaaaggactagtccataaagtgttggaagcatattgttccggtggcctgcctactgtgtgtcaggaacaccactctcctacagtcattgtAGCCGTAAAG-----------------CACTACCCCA------TAAA---------------------------------------------------------------AAA--------------------------------------------------------------------TCATTGGTATAGGTCATGTCCCACTAAGAGCTAGGAGAGAACTGTTTGTGATGAAGGAATGACCTTTTATTTTACATTGAAGTCGTCAAGCATCgttgtgtagg i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71981599 449 + 108792865 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atgtatgtataggaaaaa--tagtc-tctatagggctt-ggtacta-tcttccatttcaga-tatccagtgggggtttgggaatatat-cccgcaaagataaa-gggtgactattg i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75416829 116 + 113028656 atgtatgtatagggaaaaattagtcttctatagggcttgggtagtattcttccatttcagattatccagtgggggtttgggaatatatccccgcaaagataaaggggttactattg i ponAbe2.chr2a M 464 C 0 s nomLeu3.chr19 54004420 108 + 81552678 atgtgtgtataggaaaaa--tagtc-tatatagggctt-ggtacta-tcttccatttcaga-tatccagtgggagtttgggaatgtat-cccgcaaagataaa-gggtgactattg i nomLeu3.chr19 I 1 C 0 s rheMac3.chr13 102632085 108 - 137160470 atgtatgtatgggaaaaa--tagtc-tatataggactt-ggtacta-tcttccatttcaga-tatccggtgggggtttgggaatgtat-cccacaaagataaa-gggtgactattg i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74380506 108 + 111193037 atgtatgtatgggaaaaa--tagtc-tatataggactt-ggtacta-tcttccatttcaga-tatccggtgggggtttgggaatgtat-cccgcaaagataaa-gggtgactattg i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92730386 108 - 128036923 ATGTATGTATGGGAAAAA--TAGTC-TATATAGGACTT-GGTACTA-TCTTCCATTTCAGA-TATCCAGTGGGGGTTTGGGAATGTAT-CCCGCAAAGATAAG-GGGTGACTATTG i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71089982 108 + 107702431 atgtatgtatgggaaaaa--tagtc-tatataggactt-ggtacta-tcttctatttcaga-tatcccgtgggggtttgggaatgtat-cccgcaaagataaa-gggtgactattg i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71983065 108 + 108792865 atgattgtataggaaaaa--tagtc-tacataaggctt-ggcactg-tcttccctttcaga-tatccagtgggggtttgggaatgtat-cccccaaaggtaag-cgatgacaactg i calJac3.chr14 I 1 C 0 e canFam3.chr17 35456349 303 - 64289059 I e mm10.chr17 16812635 202 - 94987271 I a score=1321064.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 36664 413 + 143390 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TATCATATGTGTATTATGGATGACTTGA-AA-TTTTCTTT-AAACAAC----TTTAATTCAGTAGTACTGAAAGTGATTTAGA---TTTTTCATAAAAACCTACAAAATTTCATAAAA-CCTACAAGATTT--TTTCATATATGAAAAATTAAGCttt-taaacatttttaaaaatttaaaattCCACATAC--------TCATAACTCACATAC-ATTCCTTGTCTTTTTCTAGGAAACCCTAGTCTATCAGAAGTTGGAATAAAACAAACCTTCAGGTACCCAGAA--TAAGCAAGGAACTTTCTGAATTAGAAAGCCATTATAAATTGTAGATATTCTTGAAAAAATGGTAGGTATGCTATTATATTAGGATA--GTAATAGATACGGAAATACTATACAGAGAAATCAGGGATTGACTATTTTATAT i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35456652 409 - 64289059 TATTATGTATATACTTTAGTTGACATGG-AATTTTTCCTT-GAACAACTTTCTTTAGCTGGGTACTATTTTAAATTATTTAGG--CTGTATC-------TCT------CTTCATAAAAGCCTACAAGATTTTATTGCATGtattaaaaattaagctttataaaga-tttttttaattaaaaatCCCACATACCTACAAAGTCACTACCCATATACTATCTCTTGTCTTTTCCCAAAACAGCCTGTTCTATCAGTGGCCATAATAAAATAATCC--CAAGGAACTGAAATTTTACCAAGGAACTTCCCGAATTAGAAAGACAGTAC-AATTTTAAATATTCTTGGAAAAATAATAGGCATATTACCCTGTTGGGATATGTGAACATATATATAAA-AATATATGGAGAAGATGGGGGttaattattttatat i canFam3.chr17 I 303 I 358 e mm10.chr17 16812635 202 - 94987271 I a 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i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75417363 339 + 113028656 CACAAAGCAATTTATTTCTTTACAAAATGGATCTCTGATTTACAAAGGGGTTTACCTCATGCACATTTATAAAGCAAGCTTCCTTATTGCAGCA-------------------------TTTCCTTGG-------------------------------------------------------------------GGCACACTTCTTAAGAATCTGAATattca-----------tttgacagtatttattgagtttctacaacatgcctct-caccacgttaggctctta--atttcaattaagacaagacactgtctctgtgcatgaacagtttccagtttgtgaagaagatatataaactgacaattcaagcacaatgtcacaagtgattagataaaaattgtcaaccgagtgcccaagggaaagtgcatgtaactcagcct i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54004941 405 + 81552678 TGCAAAGCAATTTATTTCTTTACAAAATGGATCTCTGATTTACAAAGGGGTTTACCTCATGCACATTTATAAAGCAAGC-TCCTAATTACAGCA-------------------------TTTCCTTGGGGCACACttctttttttttttgtttttgggacggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcacACTTCTTAAGAATCTGAATattca-----------tttgacagtatttattgagtttctacaacatgcccct-caccatgttaggctctta--atttcaattaagacaagacactctctctgtgcatgaacagtttccagtttgtgaagaagatatataaactgacaattcaagcacaatgtcacaagtgatgagataaaaattgtcaaccaagtgcccaggggagagtgcatgtaactcagcct i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102632607 339 - 137160470 CACAAAGCAATTTATTTCTTTACAAAATGGATCTCTGATTTACAAAGGGGTTTACCTCATGCACATTTATAAAGCAAGCTTCCTTCTTACGGCA-------------------------TTTCCTTGG-------------------------------------------------------------------GGCACACTTCTTAAGAATCTGAATattca-----------tttgacagtatttattgagtgtctacaatgtgcccct-cactatgttaggctgtta--atttcaattaagacaagacactctttctgtgcatgaacagtttccagtttgtgaagaaggtacataaactgacaattcaagcacaatgtcacaagtgatgaaataaaaattgtgaaccaagtgccaaggggagagtgcatgtaactcggcct i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 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ponAbe2.chr2a 75417702 297 + 113028656 gaaggaggcagaga----------------------gagcctta------------------------------------------------ctgaagg--gatg-----------------------gcatttgaattgagtcttaaaaaactagt-----------cactggtgaagtaagaagaagagcaaatcaggcagaggaaatagcaggtgcaaaggcactgatgcctgacaagtagattgtcagacatgtgaggctgacatgag-------agaggtgtagtgctgggggtgagagg-gacaatagcaatgaaattcaggatataaattagttataggctgtggagggttttggatatcacgctaaggaatttgaactttatcctgcagaaaattgtgcctgt---- i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54005346 304 + 81552678 gaaggaggtggtga----------------------gagcctta------------------------------------------------ctgaagg--gatt-----------------------gcatttgaattgagtcttaaaaaactagt-----------cactggcgaagtaagaagaagagcaaatcaggcagaggaaatagcaggtgcaaaggcactgaggccttacaagtagattgtcagacatgagaggctgacatgagaattggcagaggtgtagtgctgggggtaagagg-gacaatagcaatgaaattcaggatataaattagttataggctgtggagggttttggatatcacgctaaggaatttgaactttatcctgcagaaaattgcgcctgt---- i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102632946 304 - 137160470 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TAGGTAGAAGATTTTGTGCATATTTAAAAAGAAGTGAGCTGAGTGTTCTTTcagtcagcagagctggggatagggattaaactctctgaggaaagctgaagaacctgagaaggaaggacaaatgcccacaaagaaaggccactcttcccctgacacctttcctggaaacatgcacaaaaaggtgaggaatgggacccctggtttgggccaaaactctcctcaaga---agcagttttgtttttactcca---------------gttcattgaggaataatattcaagaccccaaaacttgggtacttaatcatgtccacaatgttgtcagtctaaaaatattttataagaaatataaccaaatgcccatattgggtataaaataatgtggtaaaacaccagtagaatgtattaccttggacaatctaaGAATTGCTTACAAATTGTCCACGTAATTTCTTGAATGAACTAC--TTTTCTATAGGTT-------------------------------------TTTTTTT------------------CTAATGTTTGACTGTAACTC-TTTGGTGtagaaagtagggctgactgtctattaagac---------catgacagtagaatgaagccatctgtatgtatgagaatgcttatctttattattttattttatt-----------ttttgagaatgg-------ggagtacatgcatccagGTTTTTGAaaacaaacaaacaaaaaagccaacCACCTTATGATGACATTGATTAA----AAGGACTGTCAAACCTATACTCATTTTACCCCATTTGAAATTATTTCTTCAAAAAGATCTTTAAAATAACATT-AAAAATGTTGCTAACAACCATACACCTAACCATATGGTAAGACACAGGTTCTGTATTCATTTTATCTTATTTTACTTATTGTTacttttaatattagattcagggggtacatgtgcaggtttattacaATGTATTCACTTAAAAATGGTAAATCTTTATTGAGCTAATGCAATGTAGGACAGAACTGATTGGTCATAGAGTCAACAGTGCTCT------------AAAGGGCAAAATTAAAGGTGACAAA-AACAT 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taggtggaagattttgtgcatatgttaaaagaaggcagctgagtattcttccaataagcagagctggggatagggattaaactctttgaggaaagctgaagaacctgagaaggcaggacacat-------aagaaaggccactcctcccc-gacacctttcctggaaacatgcacaaaacggtgaggagttgtactcccggtctgggccaaaac-ctcttcaagaagcagcagttttgttttcactccaaatttgatgattattattcatcaaagaataatattcaaa--cccagaacttgggtacttaatcatgtccac---gtcatcagtctagaaatattttataagaggtataaccaaatgcccatatagagcatacaataatgtggtaaaacaccagtagaatgtattacctcgggcaTTCTAAGAATTACCTATAAATTGTCTACCTAATTTCTTGAATGAACTAC--TTTTCTATAAATT-------------------------------------TTTTTTC------------------TTGATGTTTGACTGTAACTC-TCTGGTGTAAAAagtagggctaactgtctattaagaccactaaatgcatgacagtagaatgaagccatctatatgtatgagaatgcttatctttattattttattttata-----------ttttgagaatgg-------ggagtacatgtatccaggtctttgaaaacaa--aaatagaaca-ccaaccaccttatgatgacattgattaa----aaagaatgtcaaacctatgctcattttatcccatttgaaattatttcttcaaaaagatctttaaaataacatttaaaaatgttgctaacaaccataaacctaactatatggtaagacacaggttc-gtattcattctatcttattttacttattgctacttttaatattagattcagggggtacatgtgcaggtttgttacaatgtattcacttaaaaatggtgaatctttattgagcttatgcaatgtagggcataattgactcgccacagagtcaacagtgttct------------aaa-gacaaaattaaaagtgacaaa-AACAC 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catgtagaagtttttgtacattgtttaaaaagaa--agttgcatacccttccagtaagcagagttaggcatggggtttataccctttgaggaaagtgggggaacctgagaaagag----acgtgccccaaataaaagaccattcctcacctggtaccc--------atcacccccaaaaaggagag--ataaaaccctcagtctgggccaaagctctccttaaga---agaagttttgggttcactcca---------------gttcactaaggaagcatatt-gagaccttgaaactttggcccctaatcatggcctcaatactatcactctagaaatatttataaaaaggtgcaaccaaatgccca-gtgtggtataaagtaatttagtagaatatcaatagtttatattaccttggggaatgtaggagttacttacaaaatatatacctacgttgctgaataaattacgatgttctataggttttcagccttaagttaaggaatgttggtgctatggac-ctctttcaaaaaaagagtgtctgggcttctgtttgactataaattgtttgatgaagaaagtagaaccaatcatctatcaagaccactgaatgcatgacaataaagtgaagccatacacatatatgaagatgcttatctttattactttattttatttatatatattgttttgaaaataggagttaaggagtgcaagtacccaggt--------------cattaaaaaa-------actttattaagatattgattaaaaataaggaatattagatatgttcttagtttatgtcatttgtaattgttactcctcaa--------------------aaagattttgctaacaaccttatcctcaatcatttggcatgat-cagtttctgtattcatt-----------------------------------------------------------------------------ttaaaaatggggaatctttattgagctcatgcaccatagcccataactggctt----tactgtcaaaggtgctttctgatgtttttaagagattttactttaaggtgacaaagagcat 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ATTCTCTGGATCTTGTTTGTCATGagcttt-taaaatcaattata------aaacataatgaaTTGATACCAGGTCTCAGGTAAAAATTGACCTGTGACTTGCAAAGTTTAGGGCCAGTTAACCTTTAGTTTATAAAGCTGGGAAAACCAATTCTCCCAGGTTTCTACTAG i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71098131 164 + 107702431 attctctggatcctgtttgtcatgagcttt-taaaatcaattata------aaatgtaatgaattgataccaggactcaggtaaaaattggcctgggacttacaaagtttggggccagttaacctttagtttataaagctgggaaaaccaattctcccaggtttctactag i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 71991647 164 + 108792865 ATTCTCTGGATCCTATTTGGCATGAGCTTT-TAAAATCAACTATA------CAATATAACGAATTGATACAACGTATCCGGTAAAAATTGGCTTGGGACTTGCAACTTTTAGGGCCAGTTAACCTTTAGTTTATAAAGATGGGAAAACCAATTCTCCCAGGTTTCTGCTAG i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35465733 169 - 64289059 attctctgcatcctctttggcatgagctttaaaaaattgactatagcatatgaatataattaaatgctactaggtcccaggtaaaaa-tgacttgggaccttcaaagtttagggccagctaacctttagtttataaagttgggcaaaccagtgatctcaggttt-tgctag i canFam3.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr17 16822337 619 - 94987271 I a score=2296.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 45070 3 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s panTro4.chr2A 76768086 1087 - 113622374 GTCTATCAGGTGAAATTCACccccaatatttcatgtagattcttttctattttccctaagtgtcagccagtctgagaaataaagggaaagagcacaaaagagagaaattttaaagctgggtgtctggaggagacatcacatgtcggcaggttccgtgatgccccccgagccgtaaaaccagcaagtttttattagtgattttcaaaaggggagggagtgtacgaatagggtgtgggtcacagaaatcacatgcttcacaaggtaataagatatcataaggcaaatggaggcagggcaagatcacaggaccccaggactggggcgaaattagaattgctaatgaagtttcaggcatgcattgtcattggtaacatcttatcaggagacagggtttgagagcagacaaccagtctgaccaaaatttattaggtgagaatttcctcatcctaataagcctgggagctctacaggagaccagggcttatttcatccatcagctatgacaataaaagacagccatccccaaagtggccatttcagaggcctcccctcaggacacattctctttctcagggatgttccttgctgagaaaaagaattcagcaatatttctcccatttgcttttgaaaaaagagaaatatggctctgttcttcctggctcactggcagtcagaatttaaggttatctcccttgttccctgagcattgctgttatcctgttcttttttcaaggtgcccagatttcatattgttcaaacacacgtgctct----acaatttgtgcagttaacgcaatcatcacagggtcctgaggtgacatacatcctcctcagtttacgaagatgacgggattaagagattaaagtaaagacaggcataggaaatcacaagggtattgattggggaagtgataagtatccatgaaatcttcacagtttatgttcagagattgcagtaaagacaggcataagaaattataaaaatattaatttgcggaactaataaatgtccatgaaatcttcacaatttatgttcttctgccatggcttcagccagtccctccgttcggggtccctgacttcccgcaaca i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75425362 1088 + 113028656 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i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54013034 1087 + 81552678 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tattttagcttctcccacc--------aaattctttcctccag-tattattttccagcatccgctcttattacctgttttggtgaccaaactcagtcatatttattata-t------attttttgatcccccaaatggaattt---at-aagatttaagtctgataccttctagctgact-tccctccattttcattttgtgtgttacctAAAAAGAAGTTCTTGTCAACGTAGGCCCTTGGAAGCCAAATTC-AAAATTTTCTGGAGCCTTCTTTAGAAGATaatctattcgta---ggaggaagtacaaacacctctcttaatataccatggaggagtttttcagtggttcctggagagcaatagattaccaggataagttcaaatttcccaagtacattatacacttctcagccgcttaacttctctggtccaaccaggagtacagatgggctagtggaaaggttca-ccaggagAAGTGTTAAAGGCAGAGT--GGGATCTTGTAGAGATGAACTCTAGCGTAAACTCAGAAGAATCCAACTACAGAAGTCACTGATTCTTTGAATTCTGATGGGTTGGATACTTTGCTTTGTTGC-------TGCCTTTGCTATTCCATATTTGGACAAAATTATTTCTCTCACAAGTCAGAATCATTGTTCCTTTCTAGT-TGG-TGACATCTATGGGCTGCTCAGATATTAAATATTAA--------------------------------TGGCCAGAAAGTTGTGGTATTGGAATCAAGACGAATTAACAACTCAGTTTTTTCATAGTTTAGGAATCTGTAGGTCTGTAGGAAGAAGAAAGGA-TGCTTTGCGAAGGCTGAAAACACACACACATACAC--------------------------------------------------------GTTGTTCTTTACTCTTGCTACTAAAGGAGTTCTGGAGACCACTAGGTGTCAGTCTGCACAGATCCCTACATTTGTGGATGCAAAGG---CAAGA----AAGAACTC---TATTCCTTGGAAAAACTGTTCT-----TTAGGAGACAAAGGCACAATAC----GACACAAAATGAGTTTGATTTCCTCTTCCTTGCCAGAGAAAGTC-----------TTTTATTTAGATCAGAAAGAAAACCCTCTTGGGTCCCTT-TCCTCCCATCAAtcttcttcttcttcttctccttctccttctccttctccttctccttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttTTTTTTTTTTTTGAGTTTAGAG-CAAGGAAAAGCT---GTTTCTCCATGAAGAAACATATGTTGAAAGCTGAAGAGTCACGTGT---------------GGGGTCTTCCTCCAGGAATCACACCCAGTCAGGTGCAGCATTTTCTTAGATTCCTGAGCTCTTCTCAGCAGAGCAAACTTTAagagaaggcggccactttcatggtataatttgaaactatgactgcaagtattt-cccctgcctcaaatatccac------ccatTAGTGGGCTCTTCCTACTTGGAGTCA-------TGTTTGCACCGATGAACTCTTATCCCTGGGTTAGGTACATTATGTAAGTAAAAACATTCTTGCTTAGATGTA-----TATGTTACATGGTGCTCCTCAAGAGCACACTAACGTTAAATCCAGTTATGTAACCATATTGTGTTAAAGTTATATTATATATATAT--CCTTGAAAGACACAGAGAGTATAGAATTGAGGGTGTAT-GTTTCAATTAATAAAGATAATGGGAAGAGGGACAGGTCTT----------------------------------------------------GATCA-------------------------AGACAAT----CAAATTGGACAGGATTAGGCTATAGGAA-ACAGAGA-GGCCAATTTGATCAGGGAGCAAAGAGGGACACTATTCTCTATCCTTGTT-CAAAGTTACTTATCTC------ 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CTACCTGTCAGTGGGGTTCCTGTCAGCAGGCAATGTAGCCCATGCAGGGAACATTCTGGAACTTGCTTAGTGCCTTTTCCCTCTATACGTCATTCCTCGTACTAAGGATTTTAGGTTTAAATTGACTTGTATGGGAC--ACTTACTGAGATTTGTAGAGAGAAATCACTGGCTAGGAGGCAGGGATGATACTTGAACCCTGGGCCCTGCCCCTCCACACTCTACTTCCTCTCCCTCCCTTCACATCATCTCAGCCTGCATCTCCTGGTAATTCGATTCTTTCTGGAGGAACACCAACTATTTGGAATATCACGAACTGCCT--TTTTAATGGATGTTGTGATGTCCATCTATAATTGCGATGATAATTTCT------ i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74413248 367 + 111193037 CTACCTGTCAGTGGGGTTCCTGTCAGCAGGCAATGTAGCCCATGCAGGGAACATTCTGGAACTTGCTTAGTGCCTTTTCCCTCTATACGTTATTCCTCGTACTAAGGATTTTAGGTTTAAATTGACTTGTATGGGAC--ACTTACTGAGATTTGTAGAGAGAAATCACTGGCTAGGAGGCAGGGATGATACTTGAACCCTGGGCCCTGCCCCTCCACACTCTACTTCCTCTCCCTCCCTTCACATCATCTCAGCCTGCATCTCCTGGTAATTCGATTCTTTCTGGAGGAACACCAACTATTTGGAATATCACGAACTGCCT--TTTTAATGGATGTTGTGATGTCCATCTATAATTGCGATGATAATTTCT------ i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92762544 367 - 128036923 CTACCTGTCAGTGGGGTTCCTGTCAGCAGGCAATGTAGCCCATGCAGGGAACATTCTGGAACTTGCTTAGTGCCTTTTCCCTCTATACGTTATTCCTCGTACTAAGGATTTTAGGTTTAAATTGACTTGTATGGGAC--ACTTACTGAGATTTGTAGAGAGAAATCACTGGCTAGGAGGCAGGGATGATACTTGAACCCTGGGCCCTGCCCCTCCACACTctacttcctctccctcccttcacaTCATCTCAGCCTGCATCTCCTGGTAATTTGATTCTTTCTGGAGGAACACCAACTATTTGGAATATCACGAACTGCCT--TTTTAATGGATGTTGTGATGTCCATCTATAATTGCGATGATAATTTCT------ i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71120580 370 + 107702431 CTACCTGTCAGTGGGGTTCCTGTCAGCAGGCAATGTAGCCCATGCAGGGAACATTCTGGAACTTGCTTAGTGCCTTTTCCCTCTATACGTTATTTCTTGTACTAAGGATTTTAGGTTTAAATTGACTTGTATGGGAC--ACTTACTGAGATTTGTAGAGAGAAATCACTGGCTAGGAGGCAGGGACGATACTTGAACCCTGGGCCCTGCCCCTCCACACTCTACTTCCTCTCCCTCCCTTCACATCATCTCAGCCTGCATCTCCTGGTAATTTGATTCTTTCTGGAGGAACACCAACTATTTGGAATATCACGAACTGCCT--TTTTAATGGATGTTGGGATGTCCATCTATAATTGCGATGATAATTTCTGGA--- i chlSab2.chr14 I 175 I 178 s calJac3.chr14 72012961 351 + 108792865 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AGAATAAGGAATGTGTCGATCTCCTGCC--AAAATTGTAATGGTGTCATGCTGTCAACATGTTTTGTCAATGGGAATGACCATCTGGGCTGTATGC i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71121186 94 + 107702431 AGAATAAGGAATGTGTCGATCTCCTGCC--AAAATTGTAATGGTGTCATGCTGTCAACATGTTTTGTCAATGGGAATGACCATCTGGGCTGTATGC i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72013381 94 + 108792865 AGCATAAGGAATATGTCGATCTCCTGCC--AAAATTGTAATGGTGTCATGCTGCCAACATGTTTTGTCAATGGGAAAGACCATCTGGGCGGTATGC i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35479977 94 - 64289059 AGAACAAGAAATGTGTCTATCTCCTAGC--CTGATTGTAATGGCATCATGCTACCAACATGGTGGGTCAGTGGGAAGGACCATCTGGACTGTATGC i canFam3.chr17 I 173 I 235 e mm10.chr17 16838150 0 - 94987271 C a score=1154279.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 66240 351 + 143390 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TCCATGGGAATGCAGCACACACGGGCAGGCCTCCCAGAAGGAAAACACCATTAGG-GTTGCCTGAGATTCATTGATTAACT----GGAGGGAAGCTTTATCCTCTTCCTAG--ATGTTAGTATCCAGGCAGTGGTGCCA-CCTGAGTTATAGGTATTATACACTTACGCACTCTGAGCCAGGGCTGGGGCAAAGACTG-----TTTTTTGTCCTCAATGTCA-------------TAGATAAATTGAAAGCTCCCTGTTATTTTTTAGTTCTATTGATGTAAAATGTTTCAAATAAGAATACCAT-ATGTAATACTTTCCTTGACCAAGATGTGTAAATTAATCCAATGAATTGatgtattcagttgatgcatatttatt i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74413770 353 + 111193037 TCCATGGGAATGCAGCACACACGGGCAGGCCTCCCAGAAGGAAAACACCATTAGG-GTTGCCTGAGACTCATTGATTAACT----GGAGGGAAGCTTTATCCTCTTCCTAG--ATGTTAGTATCCAGGCAGTGGTGCCA-CCTGAGTTATAGGTATTATACACTTACGCACTCTGAGCCAGGGCTGGGGCAAAGACTG-----TTTTTTGTCCTCAATGTCA-------------TAGATAAATTGAAAGCTCCCTGTTATTTTTTAGTTCTATTGATGTAAAATGTTTCAAATAAGAATACCAT-ACGTAATACTTTCCTTGACCAAGATGTGTAAATTAATCCAATGAATTGatgtattcagttgatgcatatttatt i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92763066 353 - 128036923 TCCATGGGAATGCAGCACACACGGGCAGGCCTCCCAGAAGGAAAACACCATTAGG-GTTGCCTGAGACTCATTGAttaact----ggagggaagctttatCCTCTTCCTAG--ATGTTAGTATCCAGGCAGTGGTGCCA-CCTGAGTTATAGGTATTATACACTTACGCACTCTGagccagggctggggcaaagaCTG-----TTTTTTGTCCTCAATGTCA-------------TAGACAAATTGAAAGCTCCctgttattttttagttctattgatgtaaaatgtttcaaataagaATACCAT-ACGTAATGCTTTCCTTGACCAAGATGTGTAAATTAATCCAATGAATTGATGTATTCAGTTGatgcatatttatt i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71121280 357 + 107702431 TCCATGGGAATGGAGCACACACGGGCAGGCCTCCCAGAAGGAAAACACCATTAGG-GTTGCCTGAGACTCATTGATTAACTGGAGGGAGGGAAGCTTTATCCTCTTCCTAG--ATGTTAGTATCCAGGCAGTGGTGCCA-CCTGAGTTATAGGTATTATACACTTACGCACTCTGAGCCAGGGCTGGGGCAAAGACTG-----TTTTTTGTCCTCAATGTCA-------------TAGATAAATTGAAAGTTCCCTGTTATATTTTAGTTCTATTGATGTAAAATGTTTCAAATAAGAATACCAC-ACGTCATACTTTCCTTGACCAAGATGTGTAAATTAATCCAATGAATTGatgtattcagttgatgcatatttatt i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72013475 348 + 108792865 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i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35495249 80 - 64289059 I e mm10.chr17 16851404 1150 - 94987271 I e chlSab2.chr14 71144867 0 + 107702431 C e papAnu2.chr13 92786492 0 - 128036923 C e macFas5.chr13 74437824 0 + 111193037 C e rheMac3.chr13 102688193 10310 - 137160470 I e calJac3.chr14 72038182 0 + 108792865 C a score=166663.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 90213 52 + 143390 gaattcgattagttttgggagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat s panTro4.chr2A 76813944 52 - 113622374 gaattcaattagttttgagagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75473905 52 + 113028656 gaattcgattagttttgggagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccgt i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54061741 52 + 81552678 gaattcgattagttttgggggaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102698503 52 - 137160470 gaattcgattagttttgggagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat i rheMac3.chr13 I 10310 C 0 s macFas5.chr13 74437824 52 + 111193037 gaattcgattagttttgggagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92786492 52 - 128036923 GAATTCGATTAGTTTTGGGAGAAgccaccaaactgtcttccaaagtggccat i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71144867 52 + 107702431 gaatttgattagttttgggagaagccaccaaactgtcttccaaagtggccat i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72038182 52 + 108792865 gaattcgactagttttgcaagaagccaccaaactgtctgccaaagtggccgt i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35495249 80 - 64289059 I e mm10.chr17 16851404 1150 - 94987271 I a score=757012.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 90265 237 + 143390 atcattttctacttccatcagcaatgaatgagagtttctgttgttccacatcctcaacagcatttggtgttatcagtgttttgaattttggccattctaataggtgtatagggatatctc---gttgttttaatttgtgtctc---cctgatgacatatgctgtgaggcatgttttcataagcttatttgccatctgtacatcgtatttggtgaggtgtctgttca---------------------------------------ggatctttaacccattt s panTro4.chr2A 76813996 240 - 113622374 atcattttctacttccatcagcaatgaatgagagtttctgttgttccacatcctcaacagcatttggtgttatcagtgttgtgaattttggccattctaataggtgtatagggatatctcattgttgttttaatttgtgtctc---cctgatgacatatgctgtgaggcatgttttcatcagcttatttgccatctgtacatggtatttggtgaggtgtctgttca---------------------------------------ggatctttaacccattt i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75473957 237 + 113028656 atcattttctatttccgtcagcaatgaatgagagtttctgttgttccacatcctgaacagcatttggtgttgtcagtgtttcaaattttggccattctaataggtgtataggggtatctt---gttgttttaatttgtgtctc---cctgatgacatatgctgtgaggcatgttttcataagcttacttgccatctgtacatcgtatttggtgaggtgtctgttca---------------------------------------ggatatttaacccattt i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54061793 236 + 81552678 atcgttttctatttccatcagcaatgaatgagagtttctgttgttccacatcctcaacagcatttggtgttgtcagtgttttgaattttggccattctaataggtgtgtagtggtatctc---gttgttttaatttgtgtctt---cctgatgacatatgctgtgaggcatgttttcataagcttatttgccatctgtacatcgtatttggtgaggtgtctgttca----------------------------------------gatctttaacccattt i nomLeu3.chr19 C 0 C 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ATCATTTGCTATTTCCatcagcagtgaatgagagtttctgttgttccacatcctcaatagcatttagtgttgtcagtgttttgaattttggccattctaataggtgtgtagtggtatctcaatgttgttttaatttgtgtctC---CCTGATGACTTATGCTGTGAGGCATGTTTTCATAAGCTTATTTGCTATCTGTACATCATATTTGGTGAGGTGTCTGCTCA----------------------------------------GATCTTTAACcca-tt i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71144919 238 + 107702431 atcatttgctatttccatcagcagtgaacgagagtttctgttgttccacatcctcaacagcatttagtgttgtcagtgttttgaattttggccattctaataggtgtgtagtggtatctcattgttgttttaatttgtgtctc---cctgatgacatatgctgtgagacatgttttcataagcttatttgctatctgtacatcatatttggtgaggtgtctgttca----------------------------------------gatctttaaccca-tt i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72038234 238 + 108792865 atcattttctatttccgtcagcaatgagtgagagtttctgttgttccacatccttaataccatttggtattgtcagtgttttggattttggccattctaataggtgtgtagtgatatttcactattgttttaatttgtgtctt---cctgatgacatatgctgtggggcatgttttcataagc-tatttgccatctgtacatcatatttggtgaggtgtctgttca----------------------------------------gatctttaacccattt i calJac3.chr14 C 0 C 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ttaattgggttgtttgttttcttattgttga-gtttatgaattctttgtatattttggataatagttatttatcagatatgtgttttgcaaatatttt i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102698793 97 - 137160470 ttaattgggttatttgttttcttattgttga-gtttatgaattctctgtatattttggaaaatagttatttatcagatatgtgttttgcaaatatttt i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74438114 97 + 111193037 ttaattgggttatttgttttcttattgttga-gtttatgaattctctgtatattttggaaaatagttatttatcagatatgtgttttgcaaatatttt i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92786782 97 - 128036923 ttaattgggttatttgttttcttattgttga-gtttatgaattctctgtatattttggataatagttatttatcagatatgtgttttgcaaatatttt i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71145157 97 + 107702431 ttaattgggttatttgttttcttattgttga-gtttatgaattctctgtatattttggataatagttatttatcagatatgtgttttgcaaatatttt i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72038472 97 + 108792865 ttaattgggttggttgttttcttattgttga-gtttatgaattctttgtatattttagctaatagtcctttatcagatatgtcttttgcagatatttt i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16852958 93 - 94987271 ttaattgagttgtttgt----tggtgattgatttttatgagtgctttgtatattctagcgtgcgggccttta-cgaatgtgtcctttgaaggtatttt i mm10.chr17 I 132 C 0 e canFam3.chr17 35495249 80 - 64289059 I a score=781758.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 90599 248 + 143390 --------ctcccagctggtggc-tgttttctcattctctagatta-tgtgttttgcagagcagaagttttacattttaataagtcctgcttatcagttatttttttcatggattgtaccttt-gtgctgtatcta-aaaggtcattaccata-tccagggttacctaggttttctcctatgttatcttctaagcgttttatagttttgtgatttataattaggcctacct--tccattttgagttaat-gtttgtgaagg-atg s panTro4.chr2A 76814333 248 - 113622374 --------ctcccagctggtggc-tattttctcattctcttgatga-tgtgttttgcagagcagaagttttacattttaataagtcctgcttatcagttatttttttcatggattgtgccttt-gtgctgtatcta-aaaggtcattaccata-tccagggttacctaggttttctcctatgttatcttctaagcgttttatagttttgtgatttataattaggcctacct--tccattttgagttaat-ttttgtgaggg-atg i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75474860 246 + 113028656 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catatttctggtcacaaaaccatcaccaaacttccaaataaagaccaagacacttctaatattaagtattgagataaatatgagctatacatacattacagaaagattaataagacaagtaagataattatttacccacttattccagttgaggatcgctggtggctggatcctatcccagcagctccaggtgcaagatgggagcgaaacctggaca-gctgcccttccattgcagggcacactcaaacacacacacactcactcactcagacttgggaccatagagatacgccgattcacctg-ccatgcacatctttgggatgtaggtggcaactggagtacccagagaaaacccatgcagaaatggggagaacatgcaatctccacacacacagtggccctggctgggaatcacatttttttctcattaattttaaaatgaaacaacattggatgaaaagacatatttgaggacctgctgGATATACTTTT-TTCTCCCAGCTTTATTAAA--------GTCaaataaaaattatatctatatatatataaa-------------------------------------------------------------------------atcaacatctccccatttctctcacctcccagcccctggtaatgctgtttctataagtttaacttatataaatgttctattctgtttccataagttcaactttt-acgttacacatatgaaggagaacttgcaatatctatccttctgtgcttggcttatttcacttagcataatgtcctctaggttcacccattttgttgccagtggcagaatttccttctttcttgaggctgaataa i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75477986 812 + 113028656 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catatttctggtcacaaaaccatcaccaaacttccaaataaagaccaagacacttctaatattaagtattgagataaatatgagctatacatacattacagaaagattaataagacaagtaagataattatttacccacttattccagttgaggatcgctggtggctggatcctatcccagcagctccaggtgcaaggtgggagcaaaacctggaca-gctgcccttccattgcagggcacactcaaacacacacacactcactcactcagacttgggaccatagagatgcgccgattcaccta-ccatgcacatctttgggatgtaggtggcaaccggagtacccagagaaaactcatgcagaaatggggagaacatgcaatctccacacacacagtggccctggctgggagtcacatttttttctcattaattttagaatgaaacaacattggatgaaaagacgtatttgaggacctgctgGATATACTTTT-TTCTCCCAGCTTTATTAGA-----GTTGTCAAGTAAAAATtatatatatatatgtacacatatatatacatattttatatatattatatattatacacacacacacacacacacacacacacaTATATATAtgatcaacatctccccatttcccttacctcccagcccctggtaatgctgtttctataagtttaacttatgtaaatgttctattctgtttccatacgttcaactttttacgttacacatatgaataagaacttgcaatatctgtccctctgtgcttggcttatttcacttagcataatgtcctctaggtttacccattttgttgccagtggcaggatttccttctttcttgaggctgaataa i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72041505 749 + 108792865 catatttctggacacaagaccatgaccaaacttccaagtaaagaccaagacacttctcatgttaagtgttgagataagtatgagctatacatatattacaaaaagattaatgagacaagtaagataattatttacccacttattccaggtgagggttgctggtggctagagcctatcccagcagctccaggtgtgaggtggcagtgaaacctggacaggatgcccttccactgcagggcacactc------acacacactcactcactcagacttgggaccgtggagacatgctgatctacctgattatgcacatctttgggatgtaggtggaaactggagtacccaaagaaaacccatgcagacatggagagaacaggcaatctccacaca-------gacttggctggaaatcaca-ttttttctcattaattttaaaatgaaacaatattggttgaaaagaagtatttgaggacctgttgGATATACTTTTCttctcccagctttattaaagtgtagttgacaaataaaaattatacatatATATCTATATA-------------------------------------------------------------------CATAtgatcaacatctccccatttctcttacctcccagcccctggtaatgctgtttgtgtaa-------------------------------------gttcaactttttgtgttacatatatgaatgagaacttgcagtatctgtctctctgtgcttggcttagctcacttagcatagtgtcctctaggttgacccattttgttggcaatggcaggatttctttctttcttgaagctgaatga i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35496628 345 - 64289059 I e mm10.chr17 16855921 2295 - 94987271 I e chlSab2.chr14 71148270 0 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i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92797668 1815 - 128036923 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i papAnu2.chr13 I 913 C 0 s chlSab2.chr14 71155297 1809 + 107702431 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i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72049347 1814 + 108792865 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i calJac3.chr14 C 0 I 188 e canFam3.chr17 35504276 1726 - 64289059 I e mm10.chr17 16864501 5101 - 94987271 I a score=221016.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 103249 70 + 143390 aggagagggcggaaagaaagggaagaataggtcttggttgaaataaccgcgggctcttgctgttcttacc s panTro4.chr2A 76827313 70 - 113622374 aggagagggtggaaagaaagggaagaataggtcttggttgaaataaccacgggctcttgctattcttacc i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75487603 70 + 113028656 agaagaggatggaaagaatgggaagaataggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttacc i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54074754 70 + 81552678 atgagaggatggaaagaatgggaagaataggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttacc i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102710892 70 - 137160470 aggagagggtggaaagaatgggaagaataggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttacc i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74450067 70 + 111193037 aggagagggtggaaagaatgggaagaataggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttacc i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92799483 70 - 128036923 AGGAGAGGGTGGAAAGAATGGGAAGAATAGGTCTTGGTTGAAATAACCACAGGCTCTTGCTGTTCTTACC i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71157106 70 + 107702431 aggagagggtggaaagaatgggaagaataggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttacc i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72051349 70 + 108792865 aggagatgatgaaaagaatggaaagaacaggtcttggttgaaataaccacaggctcttgctgttcttatc i calJac3.chr14 I 188 C 0 e canFam3.chr17 35504276 1726 - 64289059 I e mm10.chr17 16864501 5101 - 94987271 I a score=968445.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 103319 305 + 143390 acattttagtagattttattgaacaaatatttcttcatttgatgtatgcccttaggatcctttccagagactttaaatggttgctctttttccataa----------atttttttttttttttaccaatttttctagca-ttaggga-ggggggactccatggagcttcttaggctgtcatgccagaaacagaacccATGTATTTACTTTTACATGATATAATAAATACATGTGATAGAAATGATATTATAAACACATGTGGAATGA--AAC---AACACATGTTCACCTATCTCTATGTGCTGTTTGTTTATACGATTCCC s panTro4.chr2A 76827383 314 - 113622374 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CTACATTCCCATCTCTCAGAGGGACCAAGTATTTTTTTTCCTTTTTAttttattttaattgacaaatagtaattgtatacatttatgaggtatagtgtgatgttttgatatgtgtatacattatgaaatgattaaatcaggataactaaca i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54075124 149 + 81552678 CTACATTCCCATCTCTCAGAGGGACCAAGTA--TTTTTTCCTTTTTGttttattttaattgacaaatagtaattgtatatatttatgaggtacaatgtgatgttttgatatgtgtatacattatggaatgattaaatcaggataactaaca i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102711258 150 - 137160470 CTACATTCCCATCTCTCAGAGAGACCAAGTA-TTTTTTTCCTTTTTAttttattttaattgacaaatagtaattgtatacatttatgagatacaatgtgatgttttgatatgtgtatacatcatggaatgattaaatcaggataactaaca i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74450433 150 + 111193037 CTACATTCCCATCTCTCAGAGAGACCAAGTA-TTTttttcctttttattttattttaattgacaaatagtaattgtatacatttatgagatacaatgtgatgttttgatatgtgtatacatcatggaatgattaaatcaggataactaaca i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92799849 150 - 128036923 CTACATTCCCATCTCTCAGAGAGaccaagta-tttttttcctttttattttattttaattgacaaatagtaattgtatacatttatgagatacaatgtgatgttttgatatgtgtatacatcatggaatgattaaatcaggatAACTAACA i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71157474 150 + 107702431 CTACATTCCCATCTCTCAGAGAGACCAAGTA-TTTttttcctttttattttattttaattgacaaatagtaattgtatacatttatgaggtacaatgtgatgttttgatatgtgtatacattatgaaatgattaaatcaggataactaaca i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72051716 145 + 108792865 CTGCGTTCTCATCTTTCAGAGGGAC--AGTA--TTTTTTTCTTTTTAttttattttaattgacaaatagtaatt-tatacatttatgagggacaatgtgatg-tttgatatgtgtatacatgatggaatgattaaatcaggttaactaaca i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35506292 0 - 64289059 C e mm10.chr17 16864501 5101 - 94987271 I a score=51853.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 103774 16 + 143390 tgtctatctctcaaat s panTro4.chr2A 76827847 16 - 113622374 tgtctatctctcaaat i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75488137 16 + 113028656 tatctatctctcaaat i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54075273 16 + 81552678 tatctatctctcaaat i 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gaccaaattttgaaattttata------gtgttctttaccttaaaaatttactttatcaaataatgatgtaggcctaaaatatgtaatattttgtattaattgttttggaaattacataaagactattacttaaatatagccttctggaactcagtgtttgactcacattatattattaagatttctccatattgcagtatgtagTTGTCATTTGTT--GTTTTACTTCTACACAACA-TTCCATAG----------------------GTCCTTTCTCTCTTTGATGGATG-------gttcccag-tttttctttttattcagcgtttggctcactc--tgctatgatttccaacccatgaacttgaatggaactggtgacagcagctcattaattacttctgtaatacccaaccaaatggacacct-------------------------------atcagtcctcatcctac----aagaccacacactgccattcaactgagctaacttctccctcaatg---aaaaacgt-gctctcttggttttcatgacacctctagggtcatgaggtcatgacacctcttgcttctctgatcccctctttgaaatttcctttgtcctttccatcttctttctataacttttaaattatattcctgatggcctgatcctgggaactcttgcctcactaggctctctctcttTCAATGTTGAAAagtatcacc-cgagctacttattacaatgcagatttgcaggggaggggttcc-----caatgagattctgt-tttagtaagtatagggtgagacacaagaa--tgcattattaacaagtATACATCTCTGAGGGGA-------------TTAAGGCAGTTCTCAGAATTTATGCTACTGTCTCTT---CTGTAAAAAATTCTTTTCTT-----AACTTGTGATGTGTTCTGGAGATTTTATGAAA-GTTAATTTATTTTTAAAGAAATTGCTGGCACTAATAACACTTTTAAAAAC-CTTGCATTTAGAATTGCCTTTAAACAGAGCACAGTAGCTGTCAAACAGAGTTATATAATATTTTCTATGCTTTGGAGATGGCACCAATGGAAGAGCTAGCTGTGTGGCAGAGCCAT-----TGGTTACTAGGACTGATAG------------AGTCATTGGTGTTGGTCAGGCTAAACAATTCTTTGAAGC---AAAGGGAACTGGAAAAACTCAAAAACCATAGCCACCTAATACGAAAAAGTTGATTGATGGAAAAGACTTTCCCTGCTATCTGTAGTTTTGGGCAGTGTGGTGTTGAT-gtgcaagaagatgctaatagataggcaggagtaaaaaaaaatagcattttgtaagccatattaaggatttttatcttcatcttgattggaataagataccattggagagttt 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i mm10.chr17 C 0 I 121 e canFam3.chr17 35514071 2015 - 64289059 I a score=28300.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 111817 11 + 143390 gcatggtgcgc s panTro4.chr2A 76835884 11 - 113622374 gcatggtgcgc i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75496192 11 + 113028656 gcatagtgcgc i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54083434 11 + 81552678 gcatggtgcgc i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102719372 11 - 137160470 acatggtgtgc i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74458548 11 + 111193037 acatggtgtgc i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92807966 11 - 128036923 ACATGGTGTGC i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71165595 11 + 107702431 acatggtgtgc i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72060033 11 + 108792865 gcatgctatac i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35514071 2015 - 64289059 I e mm10.chr17 16875890 121 - 94987271 I a score=1321742.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 111828 412 + 143390 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ttttaaataggatttttaggagagatttcattgagaaggtaacgtttgggcaaggatttcaaggaggagagagagttagctaagcaggtatctggagtgtgtaaggtcaat-gtgctggattgaagaatgagggaagaatgataggagacaaagttagatgaataatggaaagccagatcatatgggaatttgtagaacattccgagggctttggctcctgagtgagaaagggagccgttaaagactttgagcagaggaatgacacagtctgatttatgtgttaaatgggggctgtgtggaaaggagattgta-ggaggaaatccaattaggagcttcttgcagtcatttaggttagtgatggtggtagtttgaatgagtgtcatagtgaaggcagcgacaagtagGTAAGGTT i ponAbe2.chr2a C 0 I 1664 s nomLeu3.chr19 54083445 412 + 81552678 ctttaaataggatttttaggagagatttcattgagaaggtaacgtttgggcaaggatttcaaggaggagagagagttcgctaagcagatatctggagtgtgtaaggtcaat-gtgctggattgaggaatgagggaagaatgataggagacaaagttagatgaataatggaaagccagatcatatgggaatttgtagaacattccgagggctttcactcctgagtgagaaagggagccattaaagactttgagcagaggaatgacacagtctgatttatgtgttaagtgggggctgtgtggaaaggagattgta-ggaggaaatccagttaggagcttattgcagtcatttaggttagtgatggtggtaatttgaatgagtgtcatagcgaaggcagcgacaagtagataaggtt i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102719383 412 - 137160470 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atgtaaataggatt-ttaggatagatctcattgagaaggtaaagtttgggcaaagatttaaaggagaagagagagttagctaagcagatatctggagtgtataaactcaatggtgctgtactgaagaatgagagaggaatgttaagacacaaagtcagatgaataatggaaagccagatcatatggggatttgtagaacattccgagggttttggctcctgagtgagaaagggagccattgaagactctgagcaggagaatgacacaatctgatttatgtgttaaatgagagctgtgtggagagaagattgtatggaggaaatccaattaggagcttattgcagtcatttaggtcagtgatggtggtagtttgaatgagtatcatagtgaagggggtgacaagaagatacagtt i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16876011 351 - 94987271 TTTTAGCTAGGGGTTTTAGGGTATATTTCAT-------AAAACATTTGGGCAAAGACGTAAAAGAGAAGCCTGAGTTTGGTAAGATGGTAGATAAAGCATGTGTCGTCAGT-A----GGGCTGCAAAATAGGCAAAGAATCAGAGGACTCAAAGGCAGATGAAAAGTGGAAAT------------------------GCGTTCTAAGGACCTTAGCTCTTTTTTGAGCTGGGGATGAATGGAGATATTTGATCAGAGACAAGGTAGAATCTGGTTTATGAGAACAGGGGAAGGTGTGCTAACAG-AGATTGCA-GGA------------------------CAGAC-TGTAGGCCACAGACAGTGACAACTTAAATAATAGTGACAACGAAGGGTGTAGTAAGGTCATAAAGCC i mm10.chr17 I 121 C 0 e canFam3.chr17 35514071 2015 - 64289059 I a score=645573.000000 s 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AAGAGTAGTGTTGGAAGATTTTCCTAACA----GATTCAACGTTAAAGCAGAGTCAAAGATGATGGCccgtcagttcaagtaaggaaagctaaatggatcagattggaaagtgagattggatgttc-gttttgagataacttaaatgtaagaggtctagaagaattctcctcggctgttagacgtgtaaatctagaatacag-gacataggtatgatctataaa-ttaaatctgggagtcactggcatatagggaccatctaaag i mm10.chr17 C 0 I 275 e canFam3.chr17 35514071 2015 - 64289059 I a score=1648696.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 112436 540 + 143390 atagaagactgaatgaaatcatgaaatgagttggtgtgggtCTCCCAAAGTTGTGAGGTTGGGCAGGAGT-GTGGAGCTAGCAAGGAACATGAGTAGTAaatggggagaggac-ttcctattcagtagtgctgtaatagctagctagccacatgcaggagaatgaaacagtacccctgcctttcaacatatacaaacattaactcaagatggattaaagatttcagtgtaagatctcaaactataagaattttagaagaaaacctaaaaaacaccattctgcacatctgcctttagaaataatttatgactcagacctcaaaagcaattgcaacaaaaacaaaaattgacaagtgggagctaattaaactaaagagcttctgcacagcaaaagaaaccatcaacagagtaaacagacaatctacaggaggggagaaaatacaaactatgcatctgacaaaggtctagtatccagaatctataaggaaattaaaaaattcaacaagcaaaaaccatattaccgcatt-aaaaagta--------------------ggcaaaag s panTro4.chr2A 76836503 540 - 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s panTro4.chr2A 76837043 1329 - 113622374 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i papAnu2.chr13 I 175 C 0 s chlSab2.chr14 71169978 1349 + 107702431 tattatgtgcttattaccacttttctacatacttgggagcatcagtgaacagaataaatttctgctctcttgtagctGTGTAGCCACATGCATTAGTCCT--ATCTTTCAAGAAAAAAGTCTATTTGATTATTCTTCACATCATCTGAGGTTGAATTAAAGCAGAATGCCAACTTTTCCATCTTAATATTTTATGAAAAAAAAGGTGTTCAAAATCTTGTTCAACAACATCTATAATAAATCGCCTTTGATTTAGAATTGT--AGAGTATGAAGA----AAAGAAATAAGTGCTGGAGAAAAGTGAGACACCCAAGAGATATCTTGTTCTTCTACTTATCTTGGTTGAAATTAAGTGTCTACTTAGTATCATAAATTTACAGTGCAGTGACCACAGAAGCATTTCAGCCATTGACAAGGCTAAAAAATGATTGTTCCTGTACTATATCAAGCGTTTAAAAATTGACTCCTGAACTGTTAATAATAAAATTGTAGTAATAGTTTTTTGCTAAAATTTAAGATTTATTGTCAAATCCCAGAAGCTATGATGAATTTGATATTCGGCATCAGCTGCAGCTTTGCCTGAATATTGCTTTCAGCACTTGACCACTTAGAATGACATAAAATATACATATATTTTCTGAGTTCCTTCACCATCAATTA-TTTTTTCCAAAGACAGAAGCCAAAATGTGAAAATAATAGAGACATGGTGCCTG-CATGTCAGGAGCATATCAAGCTCATGACAACATTTTCAACAGTTAAAAGTTTTTTCGGCCCCAGATAAATTGTCCAGTGAGCAGAACTTATGTGGAGGCAACTTACTTGGACTTTGCCCTCCTGCCATATGTGATCAT--CTCATGTCCA--TAGCAATCGCCACACAACTAGAATAAATTGTTTTAGGGCTTGCAGTTACAAG-----CCCACCTTACTCAAGGATGTTATT--TAAAAAA---------ATCTCATTTAAGCAGTATACAGCAAACATTTAAACTTTATATGCAAAATAATTTCT-TACAGGTTTTTATTTATCCCATTGATTTTTGCCTGCAACTTCCTTCCCATGTCACCTGCCTCACTTTTCAAATCTCAATAATCACCTCTGAAA-------GTGTATGAACTAGTTCCCAAGGAGGAGTAAAGAACACATCATTAGTTATTCATGGTATGGTGACTGCCTTGAAGTACATGTGTTAATATGgtgattctcaaatttggtattcattaaaatcacctagggaatttgctaaaccacagattggtgggttctgctctgtgattgctaat------------tgagaatgtctgaggtagggtctcagagtttacatttttggcaagttccctgg----------tgatgctgatctgggatcactctataaggacca i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72065329 1331 + 108792865 tattatgtgcttattaccacctttctacatacttgggtgcatcagtgaacagaacaaatttctgctctcttgtagcttTGTTGCCATACGCATTAGTCCT--GTCTTTCAAGAAAAAAGTCTATTTGATTATTCGTCACATCATCTGAGGCTGAATTAAGGCAGAATGCCAACTTTTCCATTTTAATATTTTATGAAGAAAAAAGTGTTCAGAATCTTGTTCAACAACATCTATAATAAATCATCTTTGATTTAGAATTGTAAAGAGTATGAAGA----AAAGAAATAAGTGCTGGAGAAAAATGAGACACCCAAGAGATATCTTGTTCTTTTACTTATCTTGGTTGAAATTAAGTGTCTACTTAGTATCATAAATTTGCAGTACAGTGACCACAGAAGCATTTTAGTCATTGACAAGGCTAAGAAATGATTGTTCCTGTACTATATCAAGCATTTAAAAATTGACTCCTCAACTGTTAATAATAAAATTGTAGTAATAATTTTTTGTGAAAATTTAAGATTTATTGTCAAATCCCAGAAGCTGTGGTG----TGATATTCGGCATTAACTGCACCTTTGGCTGAATATTGCTTTCAGCA-TTGACCACTTAGAATGATATAAAATACACATATGTTTTCTGAGGTCCTTTACCATCAATTATTTTTTTCCAAAGACAGAAGCCAAAATGTGAGAATAATAGAGACACAGTGCCTG-CATGCCAGGAGCACATCAAACTCATGACAACATTTTCAACAGTTAAAAG-TTTTTGAGCCCCAGATAAATTGTCCAGTGAGCAGAACTTA-ATGGAGGCAACTTACCTGGACTTCGCTCTTTGGCCATGTGGAATTGT--CTCATGTCTGTTTAGCAACCATTGCACAACTAGAGTATATTGTTTTAGGGCTTGCAATTTCAAGAAAAACTTACTTTACTCAAGGACATTATT--T-AAACA---------ATCTCATTTAAACCGGATGCAACAAACATTTAAAACTTACATGCAAAATAATTTCT-TACAGGTTTTTATTCATCCCACTGATTTTTGACTGCAACTTCCTTCCCATGCCATCTGCCTCACTTTTCAGATCTCAATAATCACCTCAGGAA-------GTGGGTGAACTAGTTCCC---------------ACATTTCATTAGTTATTCATGGTATGGTGACTGCCTCAAAATACATGTGTTAATACTgtggttctcaaattgggcattcattagaatcacctagagaa---gctgaaccacagactggtggcttctactctgcaattgctgat------------tgagaatgtctgaggtagggtctc--aatttacatttttggcaagttccctgg----------tgatgctgatctgggatcactctataagcacca i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35516185 1361 - 64289059 tattatgtgcttagca----tttattacacatttaggaacatcagtgaacaaaacaaactgctgctctcttaaagcttTGTAGCCACCTACATTAGTCTTGAGTCTTTCAAGAAAAAGTTCTATTTGATTATTCCTTATATCATCTGA-ATTGAATTAAAACAGAATGTCAACTTTGCCATCTTAATATTTTATGAAGGAAAAAATATTAAAAATCTCAT---GCAACATCTATAATAAATCTTCCTTGATTCAGAATAGTAAAGAATATAAACAGTATGAAGAAGAAAGTGCTAGAGAAATATGAGATACCCAAGAGATACCTTGTTTTTCAACTTACCTCAGTTGAAATTAAGTGTCTCGTTAGTGTCATAAATTTGCAGTACAGTGACCATAGGAACAGTTCAGTAATTGACAAGACTAAGAAATGATCATTTATATACTATGTTAAGCATTTAAAATTTGACTTCTAAACTGTAAAT----AGATTGTAATAATAATTTTTTTGTTAAATTCAAGATTTATTCTCAAATTTCAAGAGTTATGACA----GGATATTTGACATCAGGATTGAATTTGGCTGAATATTGCTTTTGCCACTTGACCCCTTAGTATGACATAAAA-----ATATGTATTCTGGGGTTCTTTACTA-----TA--------CAAAGATAGAAGCCAAAAGATGAGAATTACAGGTAT---TTGCCTGCCATGTCAGTGGCATCTCAGACTCATGACAATCTTTTTGTCAGTTAGAAGTGTTCTTAGCCCCCGATAAACTGTCCAGGGAGCAAAAGTTACACAGAGGCAACTTACCTGGACTTTGCCCTTCTGCCAAATAGGATCATTCCTTAGTTCTT--TGGCAACTGCCACAC--TTGAAATAAATCATTTCAGGCCTTGTTATTACAAA-----ACCAACTTATTCAAGGGCATAAAA--AAAAAAACCCAAAAACACCTCATTCAAACAGTATACAACAAACATTTAGAACTGAGATGCAAAGTAATTTTTCTCTAGGTCTTTATTTATGTCACTGCTTATGCCTTAGAACCTCCTTCCCATCTCACCTGCCTTACTTTTCAAATTTCAACAATCACTTCCACAAATTCATTGTTTCTGAACCAGCTCCCAGGGACTTAAGAACAATACATCTTTAGATATTCATAGTATAGTGATTGCCTCATAGCAATGGGATTAATACTgtggttctcaaatttggcatccattagaatcacctggcgggattgttgaatcacagactagtgggttctaccatcagattgctgacggagtaggtctgggaggaggtctgggatgaggtccaagaatttacatttctgataagttcctcagaacttggtaatgctgctgatctgggacaatactttgaggacca i canFam3.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr17 16876620 275 - 94987271 I a score=634228.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 116287 177 + 143390 --------ctAATATAATAATGGTTTAACTTTTTGTTTCTCCC-CTTGTCTAGGAGTTTATTGGAGGCAAATAAAATTCAGTTTCA--TTGACAAGCCTAAGAAATGATTG--------------------tagtaaagtaccag--gcacagagtagatacttagtaaata--gctgttgactaaatgcatAGAGAGCTTTACTCAGTAGT s panTro4.chr2A 76840343 177 - 113622374 --------ctAATATAATAATGGTTTAACTTTTTGTTTCTCCT-CTTGTCTAGGAGTTTATTGGAGGCAAATAAAATTCAGTTTCA--TTGACAAGCCTAAGAAATGATTG--------------------tagtaaagtaccag--gcacagagtagatacttaataaata--gctgttgactaaatgCGTAGAGAGCTTTACTCAATAGT i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75503559 179 + 113028656 --------ctAATATAATAATGGTTTATTTTTTTGTTTCTCCT-CTTGTCTAGGAGTTTATTGGAGGCAAATAAAATTCAGTTTCA--TTGACAAGCCTAAGAAATGACTG--------------------tagtaaagtaccaggcgcacagggtagatgcttaataaata--gctgttgactaaatgCATAGAGAGCTTTACTCAATAGT i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54089001 177 + 81552678 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--------CTAATATAATAATGGTATAACTTTTTGTTTCTCCT-CTTGTCTAGGAGTTTATTGGAGGCAAATGCAATTCAGTTTCA--TTGACAAGCCTAAGAAGTGATTG--------------------TAGTAAACTACCAG--GCACagagtagatgcttaataaata--gcTGTTGACTAAATGCTTAGAGAGCTTTACTCAATAGT i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71171327 177 + 107702431 --------ctAATATAATAATGGTATAATTTTTTGTTTCTCCT-CTTGTCTAGGAGTTTATTGGAAGCAAATGCAATTCAGTTTCA--TTGACAAGACTAAGAAATGATTG--------------------tagtaaactaccag--gcacagagtagatgcttaataaata--gctgttgactaaatgCTTAGAGAGCTTTACTCAATAGT i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72066660 197 + 108792865 --------ctAATATAAGAATGGTTTAACTTTTTGTTTCTCCT-CTTGCTTAGGAGTTTATTGGAGGCAGATAAAATTCTGTTTCA--TTGACAAGGCCAAGAAATGATTGTTAGAATCatttctagaatctagaaaaataccaa--acacagaatagatgcttaataaata--gctgttgactaaaCACATAGAGAGCTTTACTCAATAGT i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16876895 173 - 94987271 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panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75503738 171 + 113028656 ACTAGGTTAGTTGCATAAACGTTCACAGCTTTTGTACTTGTAAGTTAC-TTTTTCCCCCAGTAGTCACCTA-TTGTCTTCTGGGAAACTAAACATTCGAAGATTATTGATAACTTTAAC-TAAAATCCAAAGCA-CCTATATGGGGAATTCTGAATTA-----TTTATTAATCACTAGCT i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54089178 167 + 81552678 ACTAGGTTAGTTGCATAAATGTTCACAGCTTTTGTACTTGTAAGTTAC-TTTTTCCTCCAGTAGTCACCCA-TTGTCTTCTGGGAAACTAAAAATTCAAAGATTATTGATAACTT-----TAAAATCCAAAGCA-CCTATATGGGGAATTTTGAATTA-----TTTATTAATCACTAGCT i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102725311 170 - 137160470 ACTAGGTTAGTTGCATAAACATTCACAGCTTTTGTACTTGTAAGTTAC-TTTTTCCCCCATTAGTCACCCA--TGTCTTCTGGGAAACTAAAAATTCAAAGATTATTGATAACTTTAGC-TAAAATCCAAAGTA-CCTATATGGGGAATTTTGAGTTA-----TTTATTAATCACTAGTT i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74464458 170 + 111193037 ACTAGGTTAGTTGCATAAACATTCACAGCTTTTGTACTTGTAAGTTAC-TTTTTCCCCCATTAGTCACCCA--TGTCTTCTGGGAAACTAAAAATTCAAAGATTATTGATAACTTTAGC-TAAAATCCAAAGTA-CCTATATGGGGAATTTTGAGTTA-----TTTATTAATCACTAGTT i macFas5.chr13 C 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mm10.chr17 16877068 1246 - 94987271 I a score=278282.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 116635 91 + 143390 AATATAAAATACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAATGTTTTACTTATAGAAAAATTGAAATAAATACTTC-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATACGTGCTCT s panTro4.chr2A 76840691 91 - 113622374 AATATAAAATACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAATGTTTTACTTATAGAAAAATTGAAGTAAATACTTA-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATACGTGCTCT i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75503909 91 + 113028656 TATATAAAATACAGGCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAATGTTTTACTTATAGAAAAACTGAAATAAATACTTA-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATACGTACTCT i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54089345 91 + 81552678 AATATAAAATACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATATGAATGTTTTACTTATAGAAAAATTGAAATAAATACTTA-TGACTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACTCT i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102725481 91 - 137160470 AATATAAAACACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAACATTTTACTTATAGAAAAATTGAAATAAATACCTG-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACTCT i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74464628 91 + 111193037 AATATAAAACACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAACATTTTACTTATAGAAAAATTGAAATAAATACCTG-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACTCT i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92814043 91 - 128036923 AATATAAAACACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------GAATGAACATTTTActtatagaaaaattgaaataaataccTA-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACTct i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71171660 91 + 107702431 AATATAAAACACAGCCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGAACATTTTACTTATAGAAAAATTGAAATAAATACCTA-TGAGTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACTCT i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72067027 91 + 108792865 AATACAAAAGACAGTCTT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGTGAATGTTTTACTTATAGAATAATAAAAATAAATTCCTG-TTAGTGTTTTGAGCTTATTTATATGTACACT i calJac3.chr14 C 0 I 155 s mm10.chr17 16878314 91 - 94987271 AAGGTTAAAGGCAGCTTA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATTAGTGTTTTCTTTTAAGAATAGTAGAAACAGATTCTTAGTTATTGTGCTTGAC-TATATATACATACCCT i mm10.chr17 I 1246 C 0 s canFam3.chr17 35517902 193 - 64289059 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gagatttctttatttaaTGAAGTTGATCTCAACTATCCCTGTGCCTCAGGGATAGATTTTTAAAAAAatctggagagt-ttttaaaaactaaaggtg-tt-cagcccaactttttgagattccatgtcaattggc--tgggtgggtaggtgacggg-------agaagtgagtatttttacaaatctctgagtagattctaatgtacagtaatagttgggaaccactgATTTATAACCAAAATGGTAAACTGTGGGTGCACATACGGGTCCAAGATCATCTTCAGGAAACTAGGCAAGCCATAACTTCTTA------------------TGTCTTTTGTATGGTATTTCTGTTGGAGTCCT--AAAATATGGCTTAAACTTGAGCTTCAC-AATGGGTAAGTTTGCCTCTGCCTATTCTTTTGCAAAGCTATT-----------------------ATATGAATGTCCAAGTTATTGATG-AATATCAGGGTGAGAGGATTAAAGAGAGGGAAAGACAGAGAGCATCGCTCACAATG-TGGAACAATGAAAGAAAGCACATGTGCTTTTGT-------TTC-------GGCAAAGTATGCCACTAATCTAGTCATATCCATCATGTCAAGCTTGCTTACAAATGTATTGTTGTCT-GTCTATAGAGATGTGACATTAAGTAGCTCATATACTGTGTTATTTATTTGTTTATAGGTTAATTGTTCAGAATATTGATCTCCTGGGCTGGTTTTCCCATTCTTTCTGAAATATCCTTTCAAATCAACAAACATAAAATAGAACAGATT---CTTTCACACAGGGGACTCTTAAATGATGCAGATTCTTTATACTTGGTGCCTTTTAAAAAA--TCACTTTTGCAAGAAGGCATAATCTGGTATACATATTGCTTCTACTCCAGA-----------------------------------------------------AGGATGCACT-AATTTTTGACCACTT 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i mm10.chr17 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35520065 967 - 64289059 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papAnu2.chr13 92820016 21 - 128036923 ATTTGTTATTACTCCTTCCTG------ i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71177661 21 + 107702431 ATTTGTTATTACTCCTTCCTG------ i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72072844 21 + 108792865 ATTTGTTATTGCTCATTCTTG------ i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16896847 21 - 94987271 GTTCCTTGCTACTGAATGCTG------ i mm10.chr17 C 0 I 3051 s canFam3.chr17 35527350 27 - 64289059 ATTGGTCATTCTTAATCTCTTGTTATG i canFam3.chr17 I 1825 C 0 a score=897106.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 122238 254 + 143390 GAGTCTCATCTTTGCAAGTGTATTGCAAGTGAATTATCTTTAATGTTTTCCGGAAGCATATTCACCTTGTGTGTCATTTTGGAAATACTGTTGTGAAATTAGCATGGCATTGTTAATTAGATAGAACTGATAGTTTGGTTATTTTCTGTTCAAAAGCAGGGAAGAATAAAAATACATTCTTA-TATTTTAGTTAGTATATTACAATTAGGCCTATGATATGGAAACAAAATACTAACATTTAGTTTGTAGAAGCC s panTro4.chr2A 76846293 254 - 113622374 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ponAbe2.chr2a 75516622 369 + 113028656 AAACAGCTAGtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgtccccacccaaatctcgtcttgaattgtagctcccataattcccttgtgttatgggagggacctggtgggagttgattgaatcatgggggcagtttcccccatactgttctcttggtagtgaataagtctcacgagatctgatggttttataaggggtttcccttttctctttgctctcattctgtcttgtctgccgccatgtaagatgtgccttttgccttccactatgattgcgaggcctccccagccacgtggaactatgagtccatgaaacctcttcttctttataaattacccagtgtcaggtatgtctttattagcaatgtgaagatggacta i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54102121 369 + 81552678 AAACAGCTAAtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgttcccacccaaatctcgtcttgaattgtagctcccataattcccttgtgttataggagggacctggtgggagatgattgaatcatgggggcactttcccccatactgttctcatggtagtgaataagtctcatgagatctgatggttttataaggggtttcccttttctctttgctctcattctgtcttgtctgccaccatgtaagatgtgcctgttgccttacactatgattgtgaggcctccccagccacatggaactttgagtccatgaaacctcttcttctgtataaattacccagtgtcaggtatgtctttattagcaacgtgaagatggacta i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102738147 368 - 137160470 -AGCAGCAAGtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgtccccacccaaatctcatcttgaattgtaactcccataatacccttgtgttatgggagggacctggtgggagataattgaatcatgggggcagtttcccccatactgttctcatggtagtgaataagtctcatgagatctgatggttttataaggggtttccatttttgctgtgctctcaatctctctgagctgcagccatgtaagatgtgccttttgccttccactatgattgtgaggcccccccagccacatggaactacgagtccatgaaacttcttcttctttatacattacccagtgtcaggtatgtctttattagcaacgtgaagatggacta i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74477381 368 + 111193037 -AGCAGCAAGtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgtccccacccaaatctcatcttgaattgtagctcccataatacccttgtgttatgggagggacctggtgggagataattgaatcatgggggcagtttcccccatactgttctcatggtagtgaataagtctcatgagatctgatggttttataaggggtttccctttttgctttgctctcattctctcttgtctgccgccatgtaagatgtgccttttgccttccactatgattgtgaggcctccccagccacatggaactacgagtccatgaaacttcttcttctttataaattacccagtgtcaggtatgtctttattagcaacgtgaagatggacta i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92827512 368 - 128036923 -AGCagcaagtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgtccccacccaaatctcatcttgaattgtagctcccataatacccttgtgttatgggagggacctggtgggagataattgaatcatgggggcagtttcccccatactgttctcatggtagtgaataagtctcatgagatctgaaggttttataaggggtttccctttttgctttgctctcattctctcttgtctgccgccatgtaagatgtgccttttgccttccactatgattgtgaggcctccccagccacatggaactacgAGTCCATGAAActtcttcttctttataaattacccagtgtcaggtatgtctttattagcaacgtgaagatggacta i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71184930 368 + 107702431 -AGCAGCAAGtgatatggt---------------------------------------------------------------------------------------------ttggctctgtgtccccacccaaatcttatcttgaattgtagctcccataatacccttgtgttatgggagggacctggtgggagataattgaatcatgggggcagtttcccccatactgttctcatggtagtgaataagtctcatgagatctgatggttttataaggggtttccctttttgctttgctctcattctctcttgtctgccgccatgtaagatgtgccttttgccttccactatgattgtgaggcctccccagccacgtggaactacaagtccacgaaacttcttcttctttataaattacccggtgtcaggtatgtctttattagcaacgtgaagatggacta i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72079969 460 + 108792865 AAACAGCTAGTGATATGGTTTGGTgccgggcgtggtggctcacgcctgtaatccaaacactttggaggccaagatgggcggatcacctgaggtcaggagttcaagatatggcttggctctgtattcccacccaaatctcatcttgaattgtaattcccataattcccttgtgttgtggaaaggacctggtgggatataattgaatcatgcgggcagtttcctccatactgttttcatggtagtgaataagtcttacgtgatctgatggttttataaggggtttccttttttgctttgctctcattatctcttatctgccaccatgtaagatgtgccttttgtctt-caccatgattgtgaggtctcccaagccatgtggaactatgagtccataaaacctctttttctttataaattactcagtctcaggtatgttttt-ctagcaatgtgaagatagacta i calJac3.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr17 35538550 0 - 64289059 C e mm10.chr17 16908909 874 - 94987271 I a score=336096.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 129775 101 + 143390 atacaGCTAGCCATagtggacatattacacaaacttcatactcaagagcttcatcccagtcctgtcttggtcatttaatagctttgtgactttgggcaact s panTro4.chr2A 76852295 101 - 113622374 atacaGCTAGCCATagtggacatattacacaaactttatactcaagagcttcatcccagtcctgtcttggtcatttaatagctttgtgactttgggcaact i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75516991 101 + 113028656 atacaGCTAGCCAcagtggacatattatacaaactttatactcaagagcttcatcccagtcctgtcttggtcatttaatagctttgtgactttgggcaacc i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54102490 101 + 81552678 atacaGCTAGCAgcagtggacatgttacacagactttatactcaagagcttcatccgagtcctgtcttggtcatttaatagctttgtgactttgggcaact i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102738515 100 - 137160470 atacaGCT-GCcatagtggacatgttacacaaactttatactcaagagcttcattccagtcctgtcttggtcatttaatggctttgtgactttgggcaact i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74477749 100 + 111193037 atacagct-gccatagtggacatgttacacaaactttatactcaagagcttcattccagtcctgtcttggtcatttaatggctttgtgactttgggcaact i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92827880 100 - 128036923 atacagct-gCCATAGTGGACATGTTACACAAACTTTATACTCAAGAGCTTCATTCCAGTCCTGTCTTGGTCATTTAAtggctttgtgactttgggcaact i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 71185298 100 + 107702431 atacagct-gccatagtggacatgttacacaaactttatactcaagagcttcatcccagtcctgtcttggtcatttaatggctttgtgactttgggcaact i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72080429 101 + 108792865 atacaGTTAGTCATAGTGGACATGTTgcacaaactctatactcaagaccttcatcccagtcttgtcttggtcatttaatagctttgtgaccttggacaact i calJac3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr17 35538550 88 - 64289059 ATACAGCTTGTcatagtgcatggggtagagaggctttatagtc-agacctacatcccagtcatgtctt------------gctgtgtgatcttgggcaata i canFam3.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr17 16908909 874 - 94987271 I a score=1521503.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 129876 453 + 143390 catttaactctttcgagtcccaacttccttatctgtaaagct-gtacaac----aatgaagcctatgtcctggtgttgctgcgagattagacatagtgtttaaaaaccaagctggcctacaggaagagtttaatttctggta---g--ttGACATTTTGGAGAGTGAATCTAATGATAAGTGCATGGGCATCGTCACATTTCCCGTGATGTGTAT----GGATGG-ATTTGGAGCTCTGAATAAGTACAAAGGAATT--GTTTTTGAAACGTGTCACTTCACATTGCCAGTTCTCTCTTCCTC----CTCATCTGTATTTTTTCCTGTTATTGAACCAATTCATGGAGCTAGCATGGAATTTCTATTAACTTACTCCACATAGATATG---------------------------------------------------------ACGCTATCTGGATAGGTTAGCCTGAACATAATTTCTCAATTAACTAAATTCTGCTTCTAAGCGAT-TTACAGCATAGTGGTCTTTTC s panTro4.chr2A 76852396 456 - 113622374 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catttaactcttttgagtcccaacttccttatctgtaaagct-gtacaac----aatgaagcctatgtcctggtgttgctgccagattagacatagtgtttaaaaacaaagctggcctacagtaagagtttaatttctggtggttG--TTGACATTTTGGAGAGTGAATCTAATGATATGTGCGTGGACATCGTCACATTTCCCATGATGTGTAT----GGATGG-ATTCGGAGCTCTGAATAAGTACAAAGGAATT--GTTTTTGAAACCTGTCACTTCACATTGCCAGTTCTCTCTTCCTC----CTCATCTGTATTTTTTCCTGTTATTGAACCAATTCATGGAGCTAGCATGGAATTCCTATTAACTTACCCCACATAGATATG---------------------------------------------------------ACGTTATCTGGATAGGTTAGCCTGAACATAATTTCTCAATTAACTAAATTCTGCTTCTAAGCGAT-TTACAGCATAGTGGTCTTTTC i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 54102591 456 + 81552678 cattcaactcttttgagtcccagcttccttatctgtaaagct-gtacaac----aatgaagcctatgtcctggtgttgctgccagattagacatagtgtttaaaaaccaagctggcctacagtaagagtttaatttctggtagttG--TTGACATTTTGGAGAGTGAATCTAATGATATGTGCGTGGACATCGTCACATTTCCCGTGATGTGTAT----GGATGG-ATTAGGAGCTCTGAATAAGTACAAAGGAATT--GTTTTTGAAACCTGTCACTTCACATTGTCAGTTCTCTCTTCCTC----CTCATCTGTATTTTTTCCTGTTGTTGAACCAATTCATGGAGCTAGCATGGAATTCCTATTAACTTACCCCACATAGATATG---------------------------------------------------------ATGTTATCTGGATAGGTTAGCCTGAACATAATTTCTCAATTAAGTAAATTCTGCTTCTAAGCGAT-TTACAGCGTAGTGGTCTTTTC i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr13 102738615 451 - 137160470 catttaacccttttgagtctcaacttctttatccgtaaagctggtacagc----aatgaagcctg------ggtgtagctgccagattagacatagtgtttaaaaaccaagctggcctacagtaagagtataatttctggtagttG--TTGACATTTTGGAGAGTGAATCTAATGATATGTGCGTGGACAGCATCACATTTCCCGTGACGTGTAT----GGATGG-ATTCAGGGCTCTGAATAAGTACAAAGGAATT--ATTTTTGAAACCTGTCACTTCACATTACCAGTTCTCTTTTCCTC----CTCATCTGTATTTTTTTCTGTTATTGAACCAATTTATGGAAGTAGCATGGGATTCCTATTAACTTACCCCACATAGATATG---------------------------------------------------------ACGTTATCTGGATAGGCTAGCTTGAACATAATTTCTCAATTAATTAAATTCTGCTTCTAGGCAAT-TTGCAGCATGGTGGTCTTTTC i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr13 74477849 451 + 111193037 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catttaactcttttgagtctcaacttccttatccgtaaagttggtacagc----aatgaagcctg------ggtgttgctgccagattagacatagtgtttaaaaaccaagctggcctacagtaagagtataatttctgatagttG--TTGACATTTTGGAGAGTGAATCTAATGATACGTGCGTGGACAGCATCACATTTCCCGTGACGTGTAT----GGAGGG-ATTCAGGGCTCTGAATAAGTACAAAGGAATT--ATTTTTGAAACCTGTCACTTCACATTACCAGTTCTGTCTTCCTC----CTCATCTGTATTTTTTTCTGTTACTGAACCAATTTATGGAAGTAGCATGGGATTCCTATTAACTTACCCCACATAGATATG---------------------------------------------------------ACGTTATCTGGATAGGCTAGCCTGAACATAATTTCTCAATTAATTAAATTCTGCTTCTAGGCAGT-TTGCAGCATAGTGGTCTTTTC i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72080530 456 + 108792865 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ATTAATTATCTTCAACTAGGGTGAGTTATGTTTGCACTTATTGCATTGATGT-------AGCTAATGGAGAAAGTTCCATATGGACATC-TTTTTCTATTAACAAATA---TGTCTTTAAGTATA-TGTTCT-TGGTGCATTTATGTATGTAATAATTTGAGTTGGTAATT---TGTTCATGTATACAAGGATCAACCATTGTAATGAAATTGAGGAACACTGTTACAGGTTAAATGATAATTATGTTTGATCC---TTCTGCTTAACTAGTTAG-TACTGGCTATGCTTATACTGGATACAGCTCAAGTAGAATGACTGATAGGTAAGATGAGGA-TTTTTTTA-TATCAATATT--TCACTAATCTCATAAGTCCTTGGGCCAGTTATCCATTACAGTCTCAGGAAGATGCTCCTATGG------TGTTTTTTTTTTTCTCTGAGCAGGAAAATGAGCTTTCTGAT---GTCCCCTTGGTTCTGTCCTTAGCTAGATAGCTAACAATTTCTTATACT--TGTAGCAGCATGTACTCTTCAAAGTCCTTTCAGTTGAACTCCATGATACTGACCCCATTTCTAGTTTCTATCTCCTTGCCTCCATATATGAAGAAAAATGCCAACTACCCAATGATGTGAGGGAAAAGTGGGAATAATTCTTTGGAATGTTAAGC--ATTTTTCCTTGAGAGTTTGAAGGTCCAGTGTACTGTGAAGGCATAGGGCCATTTTTGGAAGAATAG-AGGGAAGCTGGAATTCAGAGTTTTGGCATTCTTT----CA-CATTCC-AGAGGCTGGAGCCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg-- i canFam3.chr17 I 473 C 0 a score=1988807.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 131122 489 + 143390 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CACACATGTGGGAGGGACTTCTTGGTTACATTAATAATTTACTACATCC-TGTGTTATTTGCCATTTGATTTATGAGTTACTACAACACGATTATAAGCAACTTGAGGTCAAAGAATCTTTTTTAGAGCTTTAGAGGTCTCAAAATGCTTAGCATAGTTCAGGGAAATTGTAAGTATACTGTGGATTCTTGCTGAATGGAATTGAAAGGTACTTTCTGCTTCTCAC-GCCTACCTAACATTAGATTGCATGAA---GTCAGCACAAGGAGAATTGCTCATTATGCCTGCTCTGTGGATAGTAAGGCAAATGCTTACTAGAAGGAGGGTCAATAAGATACAAACAAATTCAGGTTGGAATAAATGGACCATGCCCTTTTTTGATACCT-AATGACTCCAAATTACTTTTAGCGATGAAAGCTCATTAACTTTTT-CACAAAGTGGTAATGTGAAACCTGTTCCAAAATATGTGAATTGCTTTAAAATAATGTCTCAT i rheMac3.chr13 I 24 C 0 s macFas5.chr13 74480802 489 + 111193037 CACACATGTGGGAGGGACTTCTTGGTTACATTAATAATTTACTACATCC-TGTGTTATTTGCCATTTGATTTATGAGTTACTACAACACGATTATAAGCAACTTGAGGTCAAAGAATCTTTTTTAGAGCTTTAGAGGTCTCAAAATGCTTAGCATAGTTCAGGGAAATTGTAAGTATGCTGTGGATTCTTGCTGAATGGAATTGAAAGGTACTTTCTGCTTCTCAC-GCCTACCTAACATTAGATTGCATGAA---GTCAGCACAAGGAGAATTGCTCATTATGCCTGCTCTGTGGATAGTAAGGCAAATGCTTACTAGAAGGAGGGTCAATAAGATACAAACAAATTCAGGTTGGAATAAATGGACCATGCCCTTTTTTGATACCT-AATGACTCCAAATTACTTTTAGCGATGAAAGCTCATTAACTTTTT-CACAAAGTGGTAATGTGAAACCTGTTCCAAAATATGTGAATTGCTTTAAAATAATGTCTCAT i macFas5.chr13 I 1707 C 0 s papAnu2.chr13 92829234 489 - 128036923 CACACATGTGGGAGGGACTTCTTGGTTACATTAATAATTTACTACATCT-TGTGTTATTTGCCATTTGATTTATGAGTTACTACAACAAGATTATAAGCAACTTGAGGTCAAAGAATCTTTTTTAGAGCTTTAGAGGTCTCAAAATGCTTAGCATAGTTCAGGGAAATTGTAAGTATACTGTGGATTCTTGCTGAATGGAATTGAAAGATACTTTCTGCTTCTCAC-GCCTACCTAACTTTAGATTGCATGAA---GTCAGCACAAGGGGAATTGCTCATTATGCCTGCTCTGTGGATAGTAAGGCAAATGCTTACTAGAAGGAGGGTCAATAAGATACAAACAAATTCAGGTTGGAATAAATGGACCATGCCCTTTTTTGATACCT-AATGACTCCAAATTACTTTTAGCGATGAAAGCTCATTAACTTTTT-CACAAAGTGGTAATGTGAAACCTGTTCCAAAATATGtgaattgctttaaaataatgtctCAT i papAnu2.chr13 I 8 C 0 s chlSab2.chr14 71186656 489 + 107702431 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CATACACACAGGGGTGATTCCTTGGCTAGAGGAACCACT--CTATATCCTTGTATTGTTTTCCAATTGATTTATGAGCTACTGTAACAAGATTGCAAGGAACTGGAAGCCAACAAATC--TTTTAGATCTTTATATGCTTCAAAATGTTTAGCATAGTTTAGAGAAGTTGTCAGTACTCAGTGGATTTTTGCTAATTGAAATTGACAGATACTTCCTGCTTTGCACTGCCTACCTAACTGTGGGTTGCATGAA---GCTGTCTCTCTAGAATTTGCTCATTATGCCTGCTGTATGGAT--------AAATGCTTACAAGAAGGAGGGTCAATGGGATACAAAT--ATCCAGACTGAAATAAATGCACCAGGTAC--TTTTGATACCTAAATAACCCTAAATTACATTCAGCAATGCAAACTTATTAGCTTTTTCCACAGAGTGG-------------GT---------TGTGAATTTCTTAAAAATAATGTGTCAT i mm10.chr17 I 22 I 6704 s canFam3.chr17 35540397 481 - 64289059 --CACGCTTAGGGGAGACTTCTTGCTTATATCAATCAT---AAACCTCC-TTTGTTGTTAGCTCATTGAAGTATGAGTTACTGAAACAAGATTGTGAGTAAATTGAAGTTAGAAAATCTTTTTCAGAAATGTATTTGTCTCAAAATGCTTAGCGTAGTGTAGGGAAATTTTAAGCACCCAGTGGGTTCTTGCTAAGTGAAATTGAGAGATACTTTTTGCTTCTTACTGCCTACCTAACATTGGGTTGCATAAA---ATCAGCTCATGGGAACTTGTTCATATTGT---CTTTGTGGATAGTAAGGCAAATGCTTACTGGAAGGAGGGTTAATGAGATACAAACAAATTCAGGTTGTAATAAATGGTCCATGCTCTTTTTTGATACCT-AATGATTCTAAATTACTTTTAGTGATAGATGCCCATTGACTTTTT-CACAAAGTGGCAATGTGAAATCAGCTCCAAGATATGGAAATTGCTTAAAAATAA-GTCTCCC i canFam3.chr17 C 0 C 0 a score=360125.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 131611 89 + 143390 AGAAGTTAAATTGAAAACAAGAAAAATTCCTGAGACAGAGCTG-ATGTCTATTGCATGGTAGTACAGAGCCATTTGGGAACTATTTTAAG s panTro4.chr2A 76854134 89 - 113622374 AGAAGTTAAATTGAAAACAAGAAAAATTCCTGAGACAGAGCTG-ATGTCTATTGCATGGTAGTACAGAGCCATTTGGGAACTATTTTAAG i panTro4.chr2A C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 75518811 89 + 113028656 AGAAGTTAAACTGAAAACAAGAAAAATTCCTAAGACAGAGATG-ATGTCTGTTGCATGGTAGTACAGAGCCATTTGGGAACTATTTTAAG i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s 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agaaGCTAATCTCAAAACAAGAAGGCTTCTTAAAACAGAGCCC-CTAGCTGTTGCATCGTAGCATGGTGCTGGTTAGGAATTATTCCAAA i mm10.chr17 I 6704 C 0 s canFam3.chr17 35540878 87 - 64289059 AGAAATTAAACTGAAAACAAGAA---TTACTGATACAGAGCTGAATGTCTGTTGTATGGTAGCTTGCTGCCAGTTGGGAGCTGTTTCAAG i canFam3.chr17 C 0 C 0 a score=601119.000000 s hg38.chr2_GL383521v1_alt 131700 221 + 143390 AATGGAGACCCTCCTAACCAAAGTCAGGG-TTGGGGATAAATGGAACTGGCAGTCACCCATG-ATATGCTCAAGAAACACACTGTGCAACTGAGATTTGAGAATTTTTGCTGCAGCCTTACCGCTGC---------------TGATGCTAG----------------------------------------------------CCCTTA-------------GTGACTAAAGGGTGCGG----------ATAAGCA----------AGGTGCTGT---AGAAGAAATGGA--------CCAAGAATTTGAAAATAAACACAATA----------------------------------GCTCATTAGT s panTro4.chr2A 76854223 221 - 113622374 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macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 92830103 134 - 128036923 TTCTGGTTTCT-----------------------------------------------------CTTGAGGTCAGGTGATTTGTTCATTTGGTGCTTCTTGAGTTTCTCTGAGGTTGTCTGGAATAAGCCTGATCACCTGGTAGGATTTTCTTGAAGCA---GTTGTC---------AT-GGAGTGAACAATGGACATAT i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72082659 136 + 108792865 TTTTGGTTTGT-----------------------------------------------------CTTTAGGTCAGGTGATTTGTTCATTTTGTGCTTCTTGAGTTTCTCTGAGATGGTCTGGGATAAGCCTGATCATCCGGT-GGATTTTCTTGAAGCAGTTGTTGTC---------AT-GGAGCCAATAATGGAAATAT i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16918721 185 - 94987271 ttgtgtcttctggaagagcaaatgaatgctcttaaccactgaaccatctctctagcccTTGTACTTGGAGTTCAAATAATTTGATCATTTT-TGGTTCTTCAGTTATTCTAAGGAGGTGTGTGGTTAATCTGGTTTCCTGG--GGTTTGCTTTGGGGTA---GTTGTT---------GTCAGAGTGGACAAGGGACAGAC i mm10.chr17 I 145 C 0 s canFam3.chr17 35541459 141 - 64289059 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i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s calJac3.chr14 72082795 335 + 108792865 GGATTAG------------------------------------------------------------------------TTGTCT-GTTTCAGTG-GCTTAGT-GAAAATGGCAACATCATGAACATTTGGTTCTCGGTTCCACCTCTCCTGATGCTTTTTTCCTAACTAAATAATGGAAGGCTTCCTTTTCTGACACTGTTTACCGGCACCTAACTGC---------------------------------CAGGCAGACAGATTCTGCTCTTGTATGAGGGAAGAGTGTGGTTTTGGAGACTGGTGTGAAACACTGAAATGTGACATGTTTATGGACTAAAAAACACATGCTGGCAATGCCATCTCCAGAGTGGGAAAGTTTTATTCTATAATTTCCATAATTCAAA-AGACTAGAGTTAATTTTTACTCTAAGTTTTAATT i calJac3.chr14 C 0 C 0 s mm10.chr17 16918906 256 - 94987271 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i ponAbe2.chr2a I 3 N 0 s nomLeu3.chr19 54115036 1049 + 81552678 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i nomLeu3.chr19 C 0 N 0 s rheMac3.chr13 102755183 1055 - 137160470 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i rheMac3.chr13 I 3 N 0 s macFas5.chr13 74497019 1055 + 111193037 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i macFas5.chr13 C 0 N 0 s papAnu2.chr13 92846857 1057 - 128036923 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i papAnu2.chr13 C 0 N 0 s chlSab2.chr14 71200599 1049 + 107702431 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i chlSab2.chr14 I 3 N 0 s calJac3.chr14 72101522 1050 + 108792865 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i calJac3.chr14 C 0 N 0