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acctatcaaaaggaagaaaaatatttgccaactctGTATCTGATGAAAGGCTAATACCTAGAATTTACAAGTAATtaaaacaactcaacaagaaaaatacaaataaccccattgaaaagtgggcaaaggacatgagca-tttttcaaaataatacacaCAGGCAGCAACAAAcgtg-aaaaaatgttcagtattgctaatcatcagtgaaatgcaaattaaaaccacaatgagatagcacctttcaccagtcagaaaggctttcattaaaaagtcaagaaaacacagatattggtgaggatgaggagaaaagagaatgcttatatactgttggtgggaatgtaaattagtacaacctctatggaaaacactgTGACTATTTCTTAAATAGCTAAAAGTCAAACTACCGTTTGATACAGCagttccactactgggtatttgcccaaaggaaaag-aattagtatattaaaaagacacttgtgcttgtatgtttatcacagcactattcacaatagcaaagatatggaatcaatatGTGTCCATTAGCAGatgattggatgaagaaaatgtgtatacattcttggagaaatatatatatacacacaca--------------cacacacaca-----------cgcacg-gtattatacacatacact--cacacacaca--cca i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67469506 646 + 135778131 acctatcaaaatgaagaaaaatatttgccaactatgtatctgatgaaaggctaatatctagaatttacaagtaattaaaacaactcaacaagaaaaatacaaataaccccattaaaaagtgggcagaggacatgagca-tttttcaaaataatacacacaggcagcaacaaacgtg-aaaaaatgttcaatattgctaatcatcagcgaaatgcaaattaaaaccacaatgagatagcacctttcaccagtcagaaagactttcattaaaaagtcaagaaaacatagatattggtgaggatgaggagaaaagagaatgcttatacactgtaggtgggaatgtaaattagtaaaacctctgtggaaaacactgtgattatttcttgaatagctaaaaatcaaactaccatttgatccagcagttccactactgggtatttgcccaaaggaaaag-aattagtatattaaaaagacacttgtgcttgtatgtttatcacagcactattcacaatagcaaagatatggaatcaatatgtgtccattagcagatgattagataaagaaaatgtgtatacatTCTTGGAGAAatatatatat----atata--------------tacacacaca-----------cacaca-gtattatacacatacaCT--Cacacacaca--cca i chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83284585 0 - 149736546 C e canFam3.chr19 33965168 0 - 53741614 C e calJac3.chr3 116994012 1059 - 190850796 I a score=945546.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 2632 352 + 158965 tagaatactatccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacct----tttttttt-----taggttaaatcactcagaaagtcaagtactgcacattctcacctagtaggagcgcaacaatgtggacacatggacatacagagtagagtagtagacactggagactcgaaaa-ggtgggagggtgggaggtgggtgtggaatgagtaattacctgttgggtacaatgtaccctatttaggtgatggttccactaaaagccccgacctcactgttacacaatatatccatgtaacaaaaatgcacttgtactacctgactctataaaaatt-aaa---- s panTro4.chr4 122593157 351 + 193495092 tagaatactatccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacct----tttttttt------aggttaaatcactcagaaagtcaactactgcacattctcacctagtaggagcgcaacaatgtggacacatggacatacagagtagagtagtagacactggagactggaaaa-ggtgggagggtgggaggtgggtgttgaatgagaaattacctattgggtacaatgtaccctatttaggtgatggttccactaaaagccccgacctcactattacacaatatatccatgtaacaaaaatgcacttgtactacctgactctataaaaatt-aaa---- i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124730804 350 + 198332218 tagaatactacccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacga----ttttttt-------aggttaaatcactcagaaagtcaaatactgcacattctcacctagtaggagcgcaacaatgtggacacatggacatacagagtagaatagtagacactggagactcgaaaa-ggtgggagggtgggaggtgagtgtggaatgagaaattacctattgggtacaatgtacactctttaggtgatggttccactgaaagccccgacctcactattacacaatatatccatgtaacaaaaat-catttgtactgtctgaatctataaaaattaaaa---- i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78906284 337 - 115148730 -----------ccatttataaaaaataatgaaatc--gtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacca----ttttttt-------aggttaaatcagtcagaaagtcaaatactgcacattctcacctagcaggagcgcaacaatgtggacacatggacatacagagtggagtagtagacactggagactcgaaaa-ggtgggagtgtgggaggtgggtgtggaatgagaaattacctattgggtacaatgtacaccatttaggtgatggttccactaaaagccccgacctcactattacacaatatatccatgtaacaaaaatgcacttgtactacctgaatctataaaaatt-aag---- i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113937824 361 + 184069350 tataatactatccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaaccattttttttttttttttttaggttacatcactcagaaagtcaaatactgcacattctc----agtaggagtgtaacaatgtggacacgtggacatacagagtggagtagtggacgctggagacttgaaaa-gatgggagggtgggaggcaggtgtggaaagagaaacttcctattgggtacaatgtacactatttaggtgacagttccattaaaagccctgacctcactattacacaatatttccatgtaacacaaatgcacttatactaactgaatctataaaaata-aaaaTAT i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119160403 357 + 189454096 tataatactatccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacca----ttttttttttttttaggttacatcactcagaaagtcaaatactgcacattctc----agtaggagtgtaacaatgtggacacgtggacatacagagtggagtagtggacactggagacttgaaaa-gatgggagggtgggaggcaggtgtggaaagagaaacttcctattgggtacaatgtacactatttaggtgacagttccattaaaagccctgacctcactattacacaatatttccatgtaacaaaaatgcacttatactaactgaatctataaaaata-aaaaTAT i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110842128 357 + 178775436 tataatACTAtccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacca----ttttttttttttttaggttacaTCACTCAGGAAGtcaaatactgcacattctc----agTAGGAGTGTAACAGTGTGGACATGTGGACATACAGAGTGGAGTAGTGGACACTGGAGACTTGAAAa-gatgggagggtgggaggcaggtgTGGAAAGAGAAACttcctattgggtacaatgtacactatttagGTGACAGTTCCATTAAAAGCCCTGACCTCACTATTACACAATATTTCCATGTAACAAAAATGCACTTATACTAactgaatctataaaaata-aaaatat i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67470152 361 + 135778131 tataatactatccatttataaaaaataatgaaatcatgtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacca-----tttgtttttttttaggttacatcactcagaaagtcaaatactgcccattctcacttagtaggagtgtaacagtgtggacatgaggacatacagagtggagtagtggacactggagacttgaaaaggatgagagggtgggaggcaggtgtggaatgagaaacttcctattgggtacaatgtacactatttaggtgacggttccattaaaagccctgacctcactattacacaatatatccatgtaacaaaaatgcacttatactaactgaatgtataaaagta-aaaaTAT i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 116995071 340 - 190850796 tAAAATAATAT---------AATaataatgaaatcaagtcttttgcagtaacatggatgggactgggaacca----ttttatt-------aagttaaataactcagaaagtcaaatactacacattctcatttagtggaagcacaacaatgtggacaggtgaacataca-cgtggaggagtagacactggggacttgaaaa-ggtgggagggtgggaagcaggtgtggagtgagaaattgcctattgggtacagtgtacaccatttaggtgatggttccactaaaagccccaacctcactgttacaaaatatattgatgtaacaaaaatgcacgtgtacaacatgaatctgtaaaaatt-taa---- i calJac3.chr3 I 1059 C 0 e mm10.chr6 83284585 0 - 149736546 C e canFam3.chr19 33965168 0 - 53741614 C a score=12285.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 2984 3 + 158965 aaa s panTro4.chr4 122593508 3 + 193495092 aaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124731154 3 + 198332218 aaA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78906621 3 - 115148730 aaa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113938185 3 + 184069350 AAA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119160760 3 + 189454096 AAA i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110842485 3 + 178775436 aaa i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67470513 3 + 135778131 AAA i chlSab2.chr7 C 0 C 0 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AACACAATGAATTTAGAAAGGCAGTAATTTA-TTTTTTCCATTGCAG--TGATAGATTCAGAGGTTTTATGTGCTTAAGGTAAGGAA-TTGAGAATAGAGGCTCTTTGTCCCAGTCATTTAATAGTGTTCTCTGGCTA-ACTGTGCAGATTAGCACTATGCTTGCAAAGGAGAAATATTAGGCCAGGACAGCTCTAATTTTTAAAATAGTCTGTTGACAATCTAAAAAATAGCTCTGGGCTTCATTTT--GAGTATAGAATG-CAATTTTTTTTTTTTTTTTTacttaccatagttttggttaag-tagat i canFam3.chr19 C 0 C 0 a score=607819.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 3285 173 + 158965 taccaaatttgtatgcttcattttctacatccataaaatggg-attcacaatatgcaataaatgaaaggttgtgataattcaatgtattaaatcatgtaaatgcataggactcttcatagcatatggaaaggacacaataaacataattattatt----TTTGATCTTAGATAAATAA s panTro4.chr4 122593809 176 + 193495092 taccaaatttgtatgcttcattttctacatccataaaatggg-attcacaatatgcaataaatgaaaggttgtgataattcaatgtattaaaacatgtaaatgcataggactcttcatagcatatggaaaggacacaataaacataattattatt-ATTTTTGATCTTAGATAAATAA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124731453 176 + 198332218 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i calJac3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr6 83301342 406 - 149736546 I e canFam3.chr19 33979505 372 - 53741614 I a score=2226313.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 15393 1000 + 158965 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124743835 972 + 198332218 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macFas5.chr5 119175093 916 + 189454096 caagaatatgccatattttaggccactaaataacctaaaaaattcaaaaaccttgatatcatatcaagtatactctctgacctcaatggaataaaactggaaatcaataacaaaaggattttttgaaactgtacaaacacatggaaattaaacaatatgttcctgcatgaccagtgggccaataaaacaattaagaaggaaagc-aaaaaattccttgaaacaaatgataacggaaacataacatacccaaaccaatgggatacagggaaagcagtcctaaaaggaaagttagtagctataaaaacctacaagcaaaaagtggaaaaccttcagataaaaaacccaaggattcaacttaatgaactagaaaagcaagaacaaaccaaacccaaaataagcagaagaaaagaaatcat-agagagcagagcagaaataaattaaatggaaacaaagtaaacaatataacaggtgaatgaaatgaaaagctgtttttt--taaaaaagataaaatgaacaaacctttagccagagtaac---------taagaaaagagaagacccaagtaaataaaatcaaagatgaaaagatagacattataatctttatggcagaaatttgaaggatcattaaaggatactatgagcaactatatgccaataaatgggaaaacccag-aaaaaaatagacaaattcctagacacatataacctaccatgactgaaccatgaagaagtccaaaacctgaacctatcaatagcgagtaatgagagcaaaaccataataaaatgtctctcagcaaagaaaagtccaggacctgatggcttcactgctgaa---------ttttaccaaatatctatagaagaactaattctaactttactcaaaactattc-----aaataaaaaaatagaagaggagtgagtacttacaaTGTTA i macFas5.chr5 C 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papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67485118 919 + 135778131 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mm10.chr6 83301342 406 - 149736546 I e canFam3.chr19 33979505 372 - 53741614 I e chlSab2.chr7 67486841 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110858548 0 + 178775436 C e rheMac3.chr5 113952591 2207 + 184069350 I e nomLeu3.chr7b 78922703 3627 - 115148730 I e ponAbe2.chr4 124747340 135 + 198332218 I a score=1567542.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 19391 937 + 158965 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i macFas5.chr5 C 0 I 1662 s papAnu2.chr5 110871997 2691 + 178775436 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hg38.chr4_KI270788v1_alt 36236 15 + 158965 agaccagaacaataa s panTro4.chr4 122626894 15 + 193495092 agaccagaaaaataa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78942447 15 - 115148730 agaccaaagctataa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113971691 15 + 184069350 agaccaaaactataa i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110875480 15 + 178775436 agaccaAAACTATAA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67503603 15 + 135778131 agaccaaaactataa i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117027775 15 - 190850796 agaccaaaactataa i calJac3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e canFam3.chr19 33990680 964 - 53741614 I e macFas5.chr5 119193390 1662 + 189454096 I e ponAbe2.chr4 124763332 11 + 198332218 I a score=824616.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 36251 355 + 158965 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tatataaagtaggtcattatataattataaaggggtc--aattaagc-aaagggacataacaattttaaatatatatgcacccaacaattgagcacccagacatataaagcaaatatttttaaagctaaagagagaaataggtcccaatacaataatagttgcaga-ttcaatacccgactttaagtatcagacagatctctcagacagaaaatcaacaaagaaacataagac--aatctgcactataaaacagatgaacctaatagaaacttacagtacacttcatctaacagcttcacaatacacattttctccttagtacatggatcattgtcaaggatagatcacatgttaggtc i ponAbe2.chr4 I 11 C 0 s nomLeu3.chr7b 78942462 355 - 115148730 gagacaaagtaggtcattatataattataaaggggtc--aattaagc-aaagggacataacaattttaaatatatatgcacgcaacaattgagcacccagacatataaagcaaatatttttagagctaaagaaagaaatagatcccaatacaataatagtcgcaga-ttcaatacccaactttcagtatcagacaggtctcccagacagaaaatcaacaaagaaacatcagacttaatctgcactataaaacaaatgaacctaatagaaacttacagtacacttcatctaacagcttcacaatacacattttctccttagtacatggatcattgtcaacgatagatcacatgttaggtc i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113971706 358 + 184069350 gagacaaagtaggtctttatataatgataaaggggtcaaaattaagc-aaagggacataataattttaaatatatatgcacccaacaattgagcatccagacatataaaacaaatattgttagagctaaagagagaaatagattccagtacaataatagttggagacttcaatacccgactttcagtatcagacagatctcccagacagaaaatcaacaaagaaacatcagacttaatctgcactataaaacaaatgaacctaatagaaatgtacagtacacttcatctaacagcttcagaatacacattttctccttagtacatggatcattgtcaaggatagatcacatgttaggtc i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110875495 358 + 178775436 GAGACAAAgtaggtcattatataatgataaagggatcaaaaTTAAGC-AAAGGGACAtaacaattttaagtatatatgcacccaacaatTGAGCATCCagacatataaaacaaatattgttagagctaaagagagaaataggttccaatacaataatagttggagacttcaatactcgaCTTTCAGTATCAGGCAGAtctcccagacagaaaatcaacaaagaaacatcagacttaatctgtactataaaacaaatgaacctaatagaAATGTACAGTACACTTCATCTAACAgcttcagaatacacattttctcCTTAGTACATGGATCATTGTCAAGGACAGAtcacatgttaggtc i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67503618 358 + 135778131 gagacaaagtaagtcattatataatgataaaggggtcaaaattaagc-aaagggacataacaattttaaatatatatgcacccaacaattgagcatccagacatataaaacaaatattgttagagctaacgagagaaatagattccaatacaataatagttggagacttcaatacccgattttcagtatcagacagatctcccagacagaaaatcaacaaagaaacatcagacttaatctgcactataaaacaaatgaacctaatagaaatttacagtacacttcatctaacagctttagaatacacattttctccttagtacatggatcattgtcaaggacagatcacatgttaggtc i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117027790 355 - 190850796 gagacaaagtaggtcattatataatgataaaggggtc--aattaagcaaaaaggatgtaacaattttaaatatatattcacccaacaattgagcacccagacatataaagcaaatattgttagcgctaaagagagaaatagatcccaatacaataatagttggagacttcaatacccaactttcagtatcagacagatatcccagacagaaaatcaacaaagaaacatcagactcaatctgcactataaaacaaatgaacctaatatatatttacagaacacttcatctaacagcttcagaatacacattttctccttagtacatagatcattgtcaaggatagat--catgctaggtc i calJac3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e canFam3.chr19 33990680 964 - 53741614 I e macFas5.chr5 119193390 1662 + 189454096 I a score=1010.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 36606 2 + 158965 ac 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panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124763725 254 + 198332218 aatgtaaataacatcaaatatcttctctgaccacaagggaataaaactagaaatcaataac--gaggaactttggaaactatacaaacacacaaaaattaagcaattggctcatgaatgagcaaacagtaggtgaatgaagaaattaagaaggaaattgaaacattcttgaaacaaatgataatggaaatacaacataccaaaacctctcggatacagcaaaagcagtattaagaggaaagtttatagtgattgag i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78942846 254 - 115148730 aatgtaaataacatcaaatatcttctctgaccacaagggaataaaactagaaatcaataat--gaggaactttgaaaactatacaaacacacaaaaattaagcaatttgctcatgaatgagcaaacagtaggtgaatgaagaaattaagaaggaaattgaaacattcttgaaacaaatgataatggaaatacaacataccaaaacctctgggatacagcaaaagcagtattaagaggaaagtttacagtgattgag i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113972105 256 + 184069350 aatggaaataacatcaaatatcttttctgaccacaagagaataaaactagaaatcagtgacaagaggaactttggaaactatacaaacacacaaaaattaagcagtttgctcatgaatgagcaaacagtaggtgaatgaagaaattaagaaggaaattgaaacattcttgaaacaaataataatggaaatacaacataccaaaacctctgggatacagcaaaagcggtattaagaggaaagtttatagtgattgag i rheMac3.chr5 I 27 C 0 s macFas5.chr5 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canFam3.chr19 33990680 964 - 53741614 I e calJac3.chr3 117028159 806 - 190850796 I a score=881855.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 37335 348 + 158965 tggcttcatcCGGATTGGTTGTTGAAGAAACATTAACCACAGTAGATACTGCAGGGCCAAATGACATCTctaaaaatgggaattaagagccagtctgaaagtgggaacatcagcccttttttcttactaataaaatttcaaaatatcag--------gtggca-atagggtctatgtcccccaaggtaagaaagag-----------------------------------taggcatcttcttttaataatcaca-gaaaaaacagcctttaaatgctgacatagaaggacccctgaagtaaagaaag-gaaaaaaaatggcttc--acattaagatcttacagtgaagccccaagtg--aacaatcaccacctccaaatactccaaatacagtact s panTro4.chr4 122627547 348 + 193495092 tggcttcatcCGGATTGGTTGTTGAAGAAACATTAACCACAGTAGATCCTGCAGGGCCAAATGACATCTctaaaaatgggaattaagagccagtctgaaagtgggaacatcagcccttttttcttactaataaaatttcaaaatatcag--------ctggca-atagggtctatgtcccccaaggtaagaaagag-----------------------------------taggcatcttcttttaataatcaca-gaaaaaacagcctttaaatgctgacatagaaggacccctgaagtaaagaaag-gaaaaaaaatggcttc--acattaagatcttacagtgaagccccaagtg--aacaatcaccacctccaaatactccaaatacagaact i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124763979 348 + 198332218 tggcttcgtcCAGATTGGTTGGTGGAGAAACATTAACCATAGTAGATCCTGCAGGGCCAAATGACATCTctaaaaatgggaattaagagccagtctgaaagtgggaacatcagcccttttttcttactaataaaatttcaaaatatcag--------ctggca-atagggtctatgtcccccaaggtaagaaagag-----------------------------------taggcttcttcttttaataatcaca-gaaaaaacagcctttcaatactgacatagaaggacccctgaagtaaagaaag-gaaaaaaaatggcttc--acattaagatcttacagtgaagccccaagtg--aacaatcaccacctccaaatactccaaatacagaact i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78943100 344 - 115148730 tggcttcatcTAGATTGGTTGGTGAAGAAACATTAACCACAGTAGATCCTGCAGGGCCAAATGACATCTCTAAAAATGGGAATTAAGAGCCAGTCTGAAAGTGGGAACATCAGCCCTTTATTCTTACTAATAAAATTTCAAAATATCAg--------ctggaa-atagggtctatgtcccccaaggtaagaaagag-----------------------------------taggcttcttcttttagtaatcaca-gaaaaaacagcctttaaatgctgacatagaaggacccctgaagt----aaag-gaaaaaaaatggcttc--acattaagatcttacagtgaagccccaagtg--aacaatcaccacctccaagtactccaaatacagaact i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113972361 348 + 184069350 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TGGCTTCATCCAGAATGGTTGGTGCAGAAACATTAACCACAGTAGATCCTGCAGGGCCAAATGACATCTCTAAAAATGGGAATTAAGAGCCCGTCTGAAAGTGAGAACATCAGCCCTTTTTTCTTactaacaaaatttcaaaatatcag--------CTGTTG-ATAAGGTCTATGACCCCCAAGGAAAGAAAGAG-----------------------------------TAAGCTTCTTCTTTtaataatcacagaaaaaaacagcCTTTAAATGCTGACATATAAAGACccctgaaat----aaag-aaaaaaaaatggcttc--acATTAAGATCTTACAGTGAAGCCCCAAGTGAAAATAATCACCACCTCCAAATACTCCAAATACGGAACT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67504287 341 + 135778131 tggcttcatccagaaTGGTTGGTGAAGAAACATTAACCACAGTAGATCCTGCAGGGCCAAATGACATCTCTAAAAATGGGAATTAAGAGCCCATCTGAAAGTGGGAACATCAGTCCTTTCTTCTTACTAATAAAATTTCAAAATATCAg--------ctgtca-atagggtctatgtcccccaaggaaagaaagag-----------------------------------tagg---cttcttttaataatcaca-aaaaaaacagcctttaaatgctgacatataaggacccctgaaat----aaag-aaaaaaaaatggcttc--acattaagatcttacagtgaagccccaagtg--aacaatcaccacctccaaatactccaaatacggaact i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr19 33991644 356 - 53741614 TAGCTTCATC-ACATTGGCTGGTCAGGAAACATTAGCCACAGG------TGTGGG------TGACATATCT-AAAATGGAAGTTAGGAGCCCATCTGCAAG----------ATACTCTTTTTCCTATTATTCAAATTCCAGAATATCAACAGAATATCTGGAATATATGGTCTATCTTCTCTAGAGTaaaacaaaaataaaaacaaaacaaaacaaaaaaaaaaacGCTATTAGGCTTCTTCTTTAAAAGGTCACA--GATAAGCAACCTCTAGATGCTGACACAGAGCTATCCCCAAAGT----AAAA-GGAAAATATTGTTTGTCGGCATAAGGaccttatagggaaccctcaagtt--aacaattactacctccaaaca--------gaagagt- i canFam3.chr19 I 964 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e calJac3.chr3 117028159 806 - 190850796 I a score=865765.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 37683 282 + 158965 tccagtaggttcttaatgctttact-------------------tttaaatacgaatgagcaaacaaagataaccatatattctaggagagcctcc--------actgagacaaa--gagatcaaaacaaacaaatagaagagtagatctg---ggaTAAATAAGGAAAA-------------------------CTTGAATTACTATCCCC-----------ATAATGTAT---TTTATCCATAAATCAAGATCTGAAGCCATGAAAATAAAAAATAACCAGTAAAAACA--CTTTGAAAATTAAAA--TTGAGTGCCAGAAATTTTGGAAAATAATGGCAGATA-TTCCCCCagaa s panTro4.chr4 122627895 282 + 193495092 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tccagtaggttcttaatgctttact-------------------tttaaatatgaatgagcaaacaaagataaccatatattctaggagagcctcc--------actgagacaaa--gagatcaaaacaaacgaatagaagagtagatctg---ggataaataaggaaaa-------------------------cttgAATTACTATCCCC-----------ATAATGTAT---TTTATCCATAAATCAAGATCTGAAGCCATG-AAATAAAAAATAACCAATAAAAACA--CTTTTGAAAATAAAA--TTGAGTGCCAGAAATTTTGGAAAATAATGTCAGATA-TTCCCCCagaa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113972709 290 + 184069350 tccactaggttcttaatgctttactnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------------------gagctaaccatatattctaggagagcctcc--------actgatacaaa--gagatcaaaacaaatgaatagaagaggaaatctg---ggataaataaggaaaa-------------------------cttgaattactatccccgtgcacataaaataatgtat---tttatccataaatcaagatctgaagccatgaaaaTAAAAAATAACCAATAAAAACA--CTTTGAAAATTAAAA--TTGAGTCCCAGAAATTTTGGAAAATAATGTCAGATA-TTCCCCCAGAA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119195696 293 + 189454096 tccactaggttcttaatgctttact-------------------tttaaatatgaacgatcaaacagagctaaccatatattctaggagagcctcc--------actgatacaaa--gagatcaaaacaaatgaatagaagaggaaatctg---ggataaataaggaaaa-------------------------cttgaattactatccccgtgcacataaaataatgtat---tttatccataaatcaagatctgaagccatgaaaataaaaaataaccaataaaaaca--ctttgaaaattaaaa--ttgagtcccagaaattttggaaaataatgtcagata-ttcccccagaa i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110876505 290 + 178775436 T-CACTAGGGTCTTAAtgctttact-------------------tttaaatatgaaCGAGCAAACAGAGCTAA-CATATATTCTA-GAGAGCCTCC--------ATTGATACAAA--GAGATCAAAACAAACGAATAGAAGAGGAAATCTG---GGATAAATAAGGAAAA-------------------------CTTGAATTACTATCCCCGTgcacataaaataatgtat---tttatccaTAAATGAAGATCTGaagccatgaaaataaaaaataaccaataaaaaca--ctttgaaaattaGAA--TTGAGTCccagaaattttggaaaataatgtcaGATA-TTCCCccagaa i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67504628 293 + 135778131 tccagtaggttcttaatgctttact-------------------tttaaatatgaacgagcaaacagagctaaccatatattttaggagagcctcc--------actgagacaaa--gagatcaaaacaaacgaatagaagactagatctg---ggataaataaggaaaa-------------------------cttgaattactatccccgtgcacataaaataatgtat---tttatccataaatcaagatctgaagccatgaaaataaaaaataaccaataaaaaca--ctttgaaaattaaaa--ttgagtcccaaaaattttgtaaaataatgtcagata-ttcccccagaa i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117028965 284 - 190850796 tccagcagcttcttaatgcttttct-------------------tttaaatatgaataagcaaacaaagataacc--atattctaggagagcctcc--------actgagac------agatcaaaataaacaaatagaagagtagatcta---ggataaacaagaaaaG-------------------------CTTAAATTAATAATCTCCTACACATAAAGTAATGTAT---TTTATACATAAATCAAGATCTGAAGCCATGAAAATAAAAAATAACCAATAAAAAAA--CTTTGAAAATTAAAG--TTGA----CAGAATTTTTGGAAAATAATATCAAATATTTTCCCCAAAA i calJac3.chr3 I 806 C 0 s canFam3.chr19 33992000 325 - 53741614 tcctgtcagct-ttagtgctttact-------------------tttaaacatgaatggacaatcaaggatagctagatatcctagaggcacttcagaagccagatcaaaacaaatggaaaactaaaaaaggaagtaaaaaaggaagtcaggcagcaggaaaaaggaaaacttaaaaaaaaatccttaaaaaatccttgaattaatatcccc------------caatatacatgtttttccataaatcaaaacctgaatccatgaacacgaaacatggttaggaaaaataacatttggaaattaaaaatataagtgccagaaatTTTGAAAAATAGTGTCAGATA-TTTCCCCAGGA i canFam3.chr19 C 0 I 2013 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I a score=642745.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 37965 258 + 158965 agagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagaTGAGAGAATATCAGAATATTAAAAGATCAGACC-AGGTatagatagacagatagatagagagagaga---------------gtacatata---------tatatatatTTTTT-------TTTTCTATATTATATTTTGACATCTTAAAAAAAACCCTCCCCCC-CCTCCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa s panTro4.chr4 122628177 255 + 193495092 agagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagatgagagaatatcagaacattaaaagatcagacc-aggTatagatagatagatagatagatagaG-------------------TACatata---------tatatatatatatt-------ttttctatattatattttGACATCTTAAAAAAAACCCTCCCCCCGCCTCCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124764609 262 + 198332218 agagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagatgagagaatatcagaacattaaaagatcagacc-aggTatagatagatagatagatagatagataga----------------tagataTAGAGAG----TACACatatatata-------ttttttatattatattttGACATCTTAAGAAAAACTCTCCCCAC-CCCGCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggatatactgcctttcccggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78943725 278 - 115148730 aaagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagaTGAGAGAATATCAGAACATTAAAAGATCAGACC-AGGTatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataTAGAGAGtacatatatatatatata-------ttttctatattatatTTTGACATCTTAAAAAAAACCCTCCCCCC-CC----AAGAAAACCCCAAcctttctgcttgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113972999 266 + 184069350 AGAGAAATGGAAAAGAAAAAGAGGCAGAAAACAGATGAGAGAATGTAAGAACACTAAAAGATCAGACC-ATGTatagatagatagataggtaggtaggtaca----------------tagatagatagaC----tatatatatatata-ttttttttttctatattatattttGACATCTTAAAAAAA--CCTTGCCCC-CCTCCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119195989 267 + 189454096 agagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagatgagagaatgtaagaacactaaaagatcagacc-aTGTatagatagatagataggtaggtaggtaca----------------tagatagatagat----tatatatatatatatttttttttttctatattatatTTTGACATCTTAAAAAAA--CCTTGCCCC-CCTCCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaagggctcaaccaggaa i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110876795 270 + 178775436 agagaaatggaaaacaaaaagaggcagaaaacagatgagagaatgtaagaacactaaaagaTCAGACC-ATgtatagatagatag-taggtaggtaggtaca----------------tagatagatagattttatatatatatatatatatttttttttctatattatattttGACATCTTaaaaaaa--CATTGCCCC-CCTCCAAAGAAAACCCCAACCTTTCTGCCTGGGAGATACTGCCTTTCCTAGGGCTAGCCAATTAGAGACAGCAAAGGGCTCAACCAGGAA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67504921 260 + 135778131 agagaaatggaaaagaaaaagaggcagaaaacagatgagcgaatgtaagaacactaaaagatcagacc-GTGTatagatagataggtaggtaggtagg--------------------ttgatagatagat----tatatatatatatatatTTTTCTTTT--TTCTATATTTTGACATCTTAAAAAAA--CCTTGCCCC-CCTCCAAAGAAAACCCCAAcctttctgcctgggagatactgcctttcctggggctagccaattagagacagcaaa-ggctcaaccaggaa i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117029249 229 - 190850796 ATTGAAATGGAAAAGAAAAAGAGGCAGAAAACAGATGAGAGAATATAAGAACATTAAAAGATCAGACCTAGGTATAGCTAGATAGATAAATAA------------------------------------------CATGt-tttatata--------tttttatattatattttGACACCTTAGAAAAC--CCTCCACCC-GCC---AAGAAAACTCCAAcctttctgcctaggagata----ctttcctggtgctagctaattagagagagcaaa-ggctcagccagcaa i calJac3.chr3 C 0 I 1883 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e canFam3.chr19 33992325 2013 - 53741614 I a score=515316.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 38223 217 + 158965 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catgtctttgttatgcagactaaccaatccagagtcatacctcctctatttggcctgaggccctcagaagtcaatattcctctgcttctgtaagtcaatatcccaggaacagataccaggcaactagggaccacctctatagtttagagtccacagaaattatccacgctaTAGGTATGgaactgaactgggattcatccgcccagtgcagtaagaccagatag i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113973265 216 + 184069350 catgtctttgttatgcagactaaccaatccagagccacacctcctctatttggcctgagaccctcagaagtcaatattcctcccctttaata-------atcccaggaacagataccaggcaacta-ggaccacctctatagtttagagatcacagaaatgattcatactaTAGGTATGgaactgaactgggattcattcgcccagcacagtaagaccagatag i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119196256 216 + 189454096 catgtctttgttatgcagactaaccaatccagagccacacctcctctatttggcctgagaccctcagaagtcaatattcctcccctttaata-------atcccaggaacagataccaggcaacta-ggaccacctctatagtttagagatcacagaaatgattcatactaTAGGTATGgaactgaactgggattcattcgcccagcgcagtaagaccagatag i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110877065 216 + 178775436 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s panTro4.chr4 122628649 1015 + 193495092 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124765088 1015 + 198332218 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i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78944227 1016 - 115148730 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i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113973481 1004 + 184069350 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i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119196472 1004 + 189454096 tcacactgaggtttgcagccagataaaggaaaatgcttctttgtagggtgcctaacaaggaggatctagcagctaatggttaagtcctggcttctctgatggcttaaggtaagggtttttaaaggcaagggtaagtttcagaaagcagaagttacaagcacaattgtaaatcaaaacatggaagttacacattggttttggcctaaaagagtggaatatcttgaagctggggcttacaggtcgtaggtagattcaaatattttctgattttcaatttgttaaggaagaaaagctttgtttaaaaatttagggtcaacagaaatggatgttagcctggctcatgggtgtgactttctctaggcacctcaggaggaaatttaaaataaagaatgttgatcagagttcagtcccccattcccccttaact-aggaccatgtgccattagatctgtttaacggaggttggggtttctgaaaacaactcagagacatactt-gaagatgttatctttactctatatagggaaaccaaacatctgctgattttgttagcagtggcgaatccttacaggtatgcagcatcctgatttcttgcctcctcagaagaaagaattcaaccaaggggcataaggcagaatgagagaccgaggcaagttttagagcaggagtaaacatttattaaaaagttttag---tggaacgaaaggaagggaagtatacttggaagtgggtcaagcaggcgacttaagagattcaagtgcgctgtttgaccttt-------ggctttatgcattggtgtgcttctggggtcttgcattacttcttccctgattcttcccttgaggtgggctgtcgcatgaacagtggcctaccagcacttgggaggggctgtatgcacagtgtgtttactggacttttacgcatgctcacttgagttgtttttcctttaccagtcaagtattcctggaggaaggccacataccagataaactctgccattttacatcttagtgtg i macFas5.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67505397 1000 + 135778131 tcacactgaggtttgcagcaagataaaggaaaatgcttctttgtagggtgcctaacaaggaggatctagcagctaatgcttaagtcctggcctctctgatggcttaaggtaagggtttttaaagggaagggtaagtttcagaaagcagaagttacaagcacaattgtaaatcaaaacatggaagttgcacattggttttggcctaaaagagtggaatatcttgaagctggggcttacaggtcataggtagattcaaatattttctgattttcaatttgttaaggaagaaaagctttgtttaaaaatttagggtcagcagaaacggatgttagcctggctcatgggtgtgactttctctaggcacctcaggaggaaatttaaaataaagaatgttgatcagagttcagtcccccattcccccttaactgaggaccatgtaccattggatctgtttaacggaggttggggtttctgaaaacaactcagagacatactt-gaagatgttatctt-----tatatagggaaaccaaacatctgctgattttgttagcagtggcgaatccttacaggtatgcagcatcctgatttcttgcctcctcagaagaaagaattcaaccaaggggcataaggcagaatgagagactgaggcaagttttagagcaggagtaaacatttattaaaaagttttag---tggaacgaaaggaagggaagtatacttggaagtgggtcaagcaggcgacttaagagattcaagtgcactgtttgaccttt-------ggctttatgcattggcgtgcttctggggtcttgcattacttcttccctgattcttcccttgaggtgggctgtcgaatgaacagtggcctaccagcacttgggaggggctgtatgcacagtgtgtttactggacttttacgcatgctcacttgagttgtttttcctttaccagtcaagtattcctggaggaaggtcatataccagataaactctgccattttacatcttagtgtg 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124767116 1112 + 198332218 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67506951 1114 + 135778131 ttcttccatctggctgcactagtgtaattctcatgttgcgcctcttgTATTTAAGACCTCTAGGTATAATAAACTTTGTTTTCCTGAACCTCTTC-TCTGTCTTCTCTTGACTGACCATCTCATAAAACAACACAAAACAccaagaaatctaatggtgtgataaaaatattagtaaggaagatcaaagaaaatagatgagaagaaattattcaaacaggaaatagaaaaatactttcagaaatgaagggcttgacttttcagattaaagggtcgatggaaagccttattatgtaaataa---------attaataataaacgacaccaaagcacataattgtgaaattttagaatacagactaaagtatctactgaacatttccaaagtaaacagtcaggtaagcatacaaagaatagggaattataatgtcattaatggcgttattgagaagacagaagagagtgagttatgatgtcataatttggagagaaaagtgttttcgtcttgtaattctttacccagcccaactcttgatcaagtataagaatagaacaattgcatgcaaggattaaacctcccattgaatgttagcataggaaattattgaaggattgactccag-caaaatgataaagttaacaaagatggaagaagataggttatcaggataacaggagattccaaaccacaaagtggtaaactaaaaccaagatgaagactgtaggcaattctagaatgacagctgaacaacaggctcaggaaatattctgttcaaattggagcaggaagataagactttggggagcagatattagggaagtgaaaaagaaaaaaagcaatggtagattatcgatttatgtgagcattcagatgatgatgtggataggtgcttgacagatacattggagaagttaacaaattggtagaagt---aagtatatttttataagtaagaaaatggaaaaagcaataagtaatttactccagcaaaaattcaaatattgaacaaaaaggtaaacacagtcagagtgcactgcttgtctctgtagtgaatggtcttaagatagtcacaataatgttagtaataattatttagttaaTGATATGCTTAATATTACTCAGTTGG i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117031886 1109 - 190850796 ttctttcatttggctgcactggtgtatttctcatgTTGTGTTTCCTGTGTTGAAGACCTGTCAGTGTAAAAACTTTTGTTTTCCTGGACTTCTTC-TCTGTCTTCTCTTGACTGACTATCTCATAAAAGAATACAAAACAccaagaaatctaatggtgttatagaaatttcaggaaggaagatcaaagaaaacagatgagaagaaattactcaaacaggaaac--aaaaatattttcagacatgaaggacttgacttttcagattaaagggcctatgaaaagcctcattatataaataaaataataataataataataaatgacact-aagcacataattgtgaaattttagaatacagactgagttatctactgaacacttccaaagtaaacagtcaggtaagcatacaaagaataggaaattataatgtcattaacagcatcactgagaagatagaaaagagtgaactatcatgtcataatttggagagaaaagta-tttcatcttgtaattctttgcctggccaaactctagattaaatataagaatagaacaatcgcatgcaaggattaaacctctcattgtattttagcataggaaactattgaaggatgaactccagaaaaaatgataaagttaacaaagatgaaagaaggtaagttatcaggaaaacaggagattccaaaccaaaaagtggtaaactaaaaccaagatgaagactgcaggcaattctaggatgacaactgagcaataggctcaggaaatattctgttcaaattggagcaagaagataagacttt-gggagcagatcttaggggaatgaaaaagaaacaaa-----aatagatcactgatctatgtgagcattcagatgacaatatggataggtgcttaaaagatgcattggagaagttaataaattggtattcattactagaatatgttgaaaagtaagcaagttgaaaaaacaataagttatttactccaggagaaattcaaatattgaacccaacaagaa--acagtcatagtgcactatttgactc--tagtgaacggttttaagatggtcacaataatgttagcaatgattattTA----ATGATGTGCTTAATATTACTCAATGGG i calJac3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e canFam3.chr19 33992325 2013 - 53741614 I e papAnu2.chr5 110877281 1620 + 178775436 I a score=1494427.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 41132 600 + 158965 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aagcaggttgtttctgttgtggttttgttggtggtggtagggaacaa-ctagactcagtattttacatattaaatttcagatgcc-t-ttagatatatccaagcctggatatatacatttaagtgc-------aaaggtctaagcttgagatgtgaattcggaagagaatatagtatgcaaagccatgagactggttataatgactagggtgtagataaagagatctaaggactgagaagaatctcaaagatgccttaatattaagataccaaaaagcaaaagtggaacaagtagactaaaaaa-gTGGAGGATCATGATTTGCAATGGTCCGATGATCTCCTGTACCACCCAGAAGCCAAATAAATTATAAATCAACATCTTGGAGGAATTGCTGAGTAGCACAGTTGGAGTCAACACGTTAGGAAGGAGAGGAGCTGTCCT---GGATGCAACTAAAACATGAAAATAGGAGTCGTTTTGCTCA-CATCACCCTCAGTGACTCACTGGGGAGGAA i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110879201 502 + 178775436 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aagcaggttatttctgttgtggttttgttggtggtggtagggaacat-ctagactcagttttttacatattaaatttcagatgcc-t-ttagatatatccaagcctggatatatacatttaagtgc-------aaaggtctaagcttgagatgtgaatttggaagcgaatatagtatgcaaagccatgagactggttataatgactagggtgtagacaaagagatctaaggactgagaagaatctcaaagatgccttaatattaagataccaaaaagcagaagtggaataagtagactgaaaaa-gTGGAGGATCATGATTTGTAATGGTCCGATGAACTCCTGTACCACCTAGAAGCCAAATAAATTATAGATCAACATCTTGGAGGAATTGCTGAGTAGCACAGTTGGAGTCAACACGTTAGGAAGGAGAGGAGCTGTCCT---GGATGCAACTAAAACATGAAAATAGGAGTTGTTTTGCTCA-TATCACCCTCAGTGACTCACTGGGGAGGAA i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117033900 503 - 190850796 aagcagattgtttctgttgctgttttgctggtggtggtagggaatag-ctaaactcagatttttatacattaaatttcagatgcc-tgttacatatatccaagcccaggtatataaatttaagtgc-------aaaggtctaagcttgagacatgaatttggaagagaatatagtccgtaaagctatgagactggtaataacgactagggtatagataaagagatctccagactgagaagaatctcaaagatgccttgatattaagatatcagaaa-cagaagaggaacatgtagactaaaaaaagtggATGATCATAATTTGCTATGGTCCTATGACCTCCTGGACCACCCAGAAGCCAAATAAATTATGGATCAACATCTTGGAGGAATTGCTGAGTAGCACAGTTGGAGTCAACACCTTAGGAAGGAGAGGAGCTGTCCT---GGATgggaccaaaaaatgaaaataggagccattctgttta-catcgccctcagtgactcacttgggaagaa i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 33995382 489 - 53741614 aggcaggtcatttctattgt--ttttgttggaaggagtatagaagatactggactcagttttgaacatactaaatttgagatgtcat-atatatatatatatgtctat-tatatgaatatgaatgtgaaggtaaaaggttaaagctagagacatgattttggaagagaatgtggtatctaaagccatgagactggatgtatttatcagga-gtagataa----atttaaggactgagaagtgtttcaagggcattttaatattaagaggtcaggga---gaagaggaaaaagtagattgagaaa-gaggagggccaTGGCTTGcatcgttcctatcaccttctgcatcatccataagtctgagaagttgtggcatagcctcttgaaggccttgctgaggggccagctcagagctgacatctgaggagggagaggagctgttcttcaggatgcagtCAA-------------GGGTC--TCTGCTCATCATCACTCCCACTGACTCACTTAGGGGGAA i canFam3.chr19 I 8 I 8 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I a score=21906.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 42520 8 + 158965 TTTGTATA s panTro4.chr4 122632731 8 + 193495092 TTTATATA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124769631 8 + 198332218 TTTATATA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78948302 8 - 115148730 TTTATATA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113977856 8 + 184069350 TTTATGTA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119200862 8 + 189454096 TTTATGTA i 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TCCATCTGTACAACTTTAAGCTCCATGGGTTTAGAAGTTTTTGTTCCC---------TACTCTTACCAGGAGGCAAAATAAAAGTCCCAAT i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119200870 82 + 189454096 TCCATCTGTACAACTTTAAGCTCCATGGGTTTAGAAGTTTTTGTTCCC---------TACTCTTACCAGGAGGCAAAATAAAAGTCCCaat i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110879711 82 + 178775436 TCCATCTGTACAACTTTAAGCTCCATGGGTTTACAAGTTTTTGTTTCC---------TACTCTTACCAGGAGGCAAAATAAAAGTACCAAT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67509795 82 + 135778131 TCCATCTGTACAACTTTAAGCTCCATGGGTTTAGAAGTTTTTGTTCCC---------TGCTCTTACCAGGAGGCACAATAAAAGTCCCAAT i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117034411 82 - 190850796 tccacttctgcaactttaggttccgtgggtttagacgtttttgttccc---------tacttttgccaggggacaaaatacaagtcccaat i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 33995879 90 - 53741614 TCCATCTCTACTACTTTAGGCTTCAT-GGTCCAGCAGTCTTGTTTCCTAAGAGAACATAATTCTAATAGAAGATAAAATAAAAGTCTCGAT i canFam3.chr19 I 8 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I a score=48046.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 42610 16 + 158965 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rheMac3.chr5 113977999 260 + 184069350 tttgggaggccgagatgggtggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctggcacagtgaaaccctgtctctactaaacaaaatacaaaaattagccgggtgtggtggcaggcacctgtagtcccagctgctcaggaaactgaggcaggagaatggcatgaacccgggagacagagcttgcagtgagcccagatcacgctactgcactccagcctgggttacagagcgaga--ctgtctcaaaaaaaa-------------------------aaaaaaaa i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119201005 285 + 189454096 tttgggaggccgagatgggtggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctggcacagtgaaaccctgtctctactaaacaaaatacaaaaattagccgggtgtggtggcaggcacctgtagtcccagctgctcaggaaactgaggcaggagaatggcatgaacccgggagacagagcttgcagtgagcccagatcacgctactgcactccagcctgggttacagagcgaga--ctgtctcaaaaaaaacccaaaaaaacaaacaaaaaaaaacaaaaaaaa i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110879846 262 + 178775436 tttgggaggccgagatgggtggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctggcacagtgaaaccctgtctctactaaactaaatacaaaaattagccgggtgtggtggcaggcacctgtagtcccagctactcaggagactgaggcaggagaatggcatgaacccgggagacagagcttgcagtgagcccagatcacgctactgcactccagcctgggttacagagcgagactctgtctcaaaacaaa-------------------------caaacaaa i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67509930 261 + 135778131 tttgggaagccaagacgggtggatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggctagcatggtgaaaccctatctctactaaataaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcaggcacctgtagtcccagctactcgggagactgaggcaggagaatggcatgaacccgggaggcagagcttgcagtgagcctacatcatgctactgcactccagcctgggttacagagcgagactccgtctcaaaaaaaa--------------------------aaacaaa i chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83310816 1745 - 149736546 I e canFam3.chr19 33995969 0 - 53741614 C e calJac3.chr3 117034508 9 - 190850796 I e panTro4.chr4 122632874 802 + 193495092 M a score=-5604.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 42925 2 + 158965 -----------------------------aa s nomLeu3.chr7b 78948707 2 - 115148730 -----------------------------aa i 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panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124773693 274 + 198332218 TGCCAGTGACATCATTTTTCCATTATAAAACCAACCCAGT-GAGAGACTT-CTTTCTTTTA-TTCTTTT--------AATCAAGAGAGGAATATTAGTAACAATATTCCTGCACTAAACAGTACACTTC-AAA-AAGAATACATAGAAATAACATACT-----AAAGAAAAAC-----ACAAATCTTAGAAAAAGTTTATGTTAGAAGAA----ATGCCTTTAG-TCTGACATTGCCTTTTTATATGAATACAAGTTGAATAGTTGCCCTCAGGTAGTAGTTTTCCATATTCAAATATGTGa i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78952114 274 - 115148730 TGCCAGTGACATCATTTTTCCGTTATAAAACCAACCCAGT-GAGGGACTT-CTTTCTTTTA-TTTTTTT--------AATCAAGAGAGGATTATTAGTAACAATATTCCTGCACTAAACAGTACACTTC-AAA-AAGAATTCATAGAAATAACATACT-----AAAAAAAAAC-----ACAAATCTTACAAAAAGTTTATGTTAGAAGAA----ATGCCTTTAG-TGTGACATTGCCTTTTTATATGAATACAAGTTGAGTAGTTGCCCTCAGGTAGTAGTTTTCCATATTCAAATATGTGa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113981696 269 + 184069350 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gaatcatctggattgttcatgagatgtggaggttcttggaccattccagtggagattaggattcaatgggtatgggatagagcacaggaatctgcattttcacagatattccagataatcctcatcgaagtgatctgtgattgagaaacat--ttttaaattataaatttttttttCTTATTCTCTTCAGCCCAGCTAA---GTGTAATTATCTTCACCTTCTTAGCCTGAGGTTGACTAG-----------AAATTTTTCAATGAATAATGAGGAGCAGAAACAA----ATACTTCAAACAAAAACATACAACATCAAAAACAAAAATAACTTCTTCCTTTT i panTro4.chr4 C 0 I 155 s ponAbe2.chr4 124773967 322 + 198332218 gaatcatctggattgttcatgagatgtggaggttcttggaccattccagtggaaattaggattcagtgggtatgggatagagcacaggaatctgcattttcacagatattccagataatcctcatCGAAGTGATCTGTGATTGAGAAACAC--ttttaaattataaaatttttttCCTTATTCTCTTCAGCCCAGCTAA---GTGTAATTATCTTCACCTTCTTAGCCTGAGGTTGACTAG-----------AAGTTTTTCAATGAATGATGAGGAGCAGAAACAA----ATACTTCAAACAAAAACATACAACATCAAAAACAAAAATAACTTCCTCC-TTT i ponAbe2.chr4 C 0 I 1 s nomLeu3.chr7b 78952388 324 - 115148730 gaatcatctggattgttcatgagatgtggaggttcttggaccattccaatggagattaggattcagtgggtatgggatagagcacaggaatccgcattttcacagatattccagataatcctcatcaaagtgatctgtgattgagaaacactgTTTTAAATTATAAATTTTTTTTTCTTATTCTCTTCAGCCCAGTTAA---GTGTAATTATCTTCACCTTCTTAGCCTGAGGTTGACTCG-----------AAGTTTTTCAGTGAATGATGAGGAGcagaaacaa----atacttcaaacaaaaacatacaacatcaaaaacaaaaaaaaCTTCTTCC-TTT i nomLeu3.chr7b C 0 I 1 s calJac3.chr3 117038317 323 - 190850796 gaatcatctggattgctcatgagatgtggaggttcttcgaccattccaatggagatgaggttttagtgggtatgggatagagcacaggaatctgcattttcacaaatattccagataattctcattgaagtgatctgtgattgagaaacagtgTCCTAAATTATAAAAATTTTGT--TTATTCTCTTCAGCCCAGCTAA---GTGTAATTATCCTCACCTTCTTAGCCTGAGATTGACT--------------ACTTTTTCAATGAATGATGAGGAGCGGAAACAAACAGATACTTCAAACAAAACCATACAACAACAAAAACAAAAACAACGACTTCC-TCT i calJac3.chr3 C 0 I 1 s mm10.chr6 83313575 301 - 149736546 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rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119205420 28 + 189454096 A-TTTTAATGAATTAATATATTTTTACAT i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110884583 28 + 178775436 a-ttttaatgaattaatatatttttacat i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67514330 28 + 135778131 A-TTTTAATGAATTAATATATTTTTACAT i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117040023 29 - 190850796 atttttaatgatttaatataCCTTTACAT i calJac3.chr3 C 0 I 3 s canFam3.chr19 34001783 23 - 53741614 A-TCTTAAGATCTGTGTATAACCT----- i canFam3.chr19 I 493 C 0 e mm10.chr6 83314126 188 - 149736546 I a score=-184.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 48380 3 + 158965 --TGT s panTro4.chr4 122638948 3 + 193495092 --TGT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124775743 3 + 198332218 --TGT i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78954164 1 - 115148730 ----T i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113982417 3 + 184069350 --tgt i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119205448 3 + 189454096 --TGT i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110884611 3 + 178775436 --tgt i papAnu2.chr5 C 0 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s panTro4.chr4 122648609 1406 + 193495092 catcaaaataacataaaatGAATAAGTAAAGTTTTTAACTACAAGGCATTTTGTACCTGTCTACCAACCTATCCCAACTATGAGTCCTAAGAACATAGTTAAACCCCTTGTTTTTATGAATAacaagctttatgctcttgtgcaggctacttagcatgtctgcactttaattttcttgactacaaaatatgaatTAGGTACTAAGATAAAGCAATTTATGGCTTTGAAGTAAATAATTCTTTAGGAACTTTCCATTTCTAGAAAGTACATAAGTCTTAATTTGATCTCATAATCATTGGTTCTTTTTTAAAATAAtttcaacttttattttagattcaaggggtacatgtgcaggtttgttacatgggtaacatgggaatatcatgtgatgctgaggttttgggtatgattgattccatcaaccaggtagtgagcatagtacccaagaatttttccacctttacccccttgcattcctccccgcccctagtagtcctcagtt---------------------tctatgagtagtcagtgtttagctgccacttagaaatgagaacatgtggtatttgtttttctgttcctatggttcccttaagataacagcctccaacggcatccatgttgctgcaaaggacataa------tttttttatgggtatgtggtattccatggggtatatgtaccacattttctttatctagtacattctcgacgggcacctaggttgattccatgtctttgctattgtgaatagtgctgcaaagaacatatgagtgcatgtgtcttttttatagaatgatttattttgttttggatatatacttagtaatgaaattgctcagttgaacagtcattctgttttaagttatttgagaaatcttc-------------------------------------catgaacagtgtataaacattccattttctccacagcttcaccaatatct--------------ttttttttttttttgacattttaacaataaccattctgactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatg--taatgatgttgacattttcttatatatttatagtcttctcctatgccttcttttgagaatgcctattcatgtcttttgcccactttctaatgggata-ttactttttgcttcttgaattaaagttccctatagattctggatattagacttttgttggatgcatagtttgaaaatattttctcccattctgtaggttgtctgcttacgctgttggtagtttcttttgctaagcagaagctctgtagtttcattaggtctcacttgtcaatttttgtttctgttgcaattgcttttgaggtcttagtcatatattgttttccaatgtcaatgtccaaaattatgtttcctagattttcctctaggattcttatagtttgaggtcttacattgaaatcttcaat- i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124790101 1401 + 198332218 CATCAAAATAACATAAAATGAATAAGTAAAGTTTTTAACTACAAGGCATTTTGTACCTGTCTACCAACCTATCCCAACTATGAGTCCTAAGAACATAGTTAAACCCCTTATTTTTATGAATAacaagctttatgctcctatgcaggctacttagcatgtctgcactttaattttcttgactacaaaatatgaatTAGGTACTAAGATAAAGCAATTTATGGCTTTGAAGTAAATAATTCTTTAGGAACTTTCCATTTCTAGAAAGTACATAAGTCTTAATTTGATTTCATAATCATTGGTTCTTTTTTAAAATAAtttcaacttttattttagattcaaggggtacatgtgcaggtttgttacatgggtaacatgggaatatcatgtgatgccaaggttttgggtataattgattccatcaaccaggtagtgagcatagtacccaataatttttccacctttgcccccttgcgttcctccctgcccctagtagtcctcagtg---------------------tctatgagtagtcagtgtttagctgccacttagaaatgagaacatgtggtatttgtttttctgttcctgtggttcccttaagataacggcctccaactgcatccatgttgctgcaaaggacgtaat----ttttttttatgggtatgtggtattacatggggtatatgtaccacgttttctttatccagtacattcttgatgggcacctaggttgattccatgtctttgctattgtgaatagtgctgcaaagaacatatgagtgca--tgtcttttttatagaatgatttattttgttttggatatatacttagtaatgaaattgcccagttgaacagtcattctgttttaagttatttgagaaatctcc-------------------------------------catgaatggtgtataaacattccattttctccacagcttcaccagcatc--------------------tttttttttgacattttaacaatagccattctgactggtgtgagacggtatctcattgtggttttgatttacatttctctgatgattaatgatgttgacattttcttatatatttatagtcttctcctatgccttcttttgagaatgcctattcatgtcttttgcacactttctaatgggatatttgttttttgcttcttgaatt-aagttccctatagattctggatattagacttttgttggatgcagagtttgaaaatattttctcccattctgtaggttgtctgtttacgctgttggtagtttcttttgctaagcagaagctctttagtttcattaggtctcacttgtcaatttttg-ttctgttgcaattgcttttgaggtcttagtcatatattgttttccaatgtcaatgtccaaaattatgtttcctagattttcctctaggattcttatagtttgaggtcttacatttaaatcttcaat- i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78963226 1404 - 115148730 catcaaaataacataaaatgaataaGTATAGTTTTTAACTACAAGGCATTTTGTACCTGTCTACCAACCTATCCCAACTATgagtcctaagaacatggttaaaccccttgtttttatgaataacaagctttatgctcctatgcaggccacttagcatgtctgcactttaattttcttgactgcaaaatatgaatTAGGTACTAAGATAAAGCAATTTATGGCTTTGAAGTAAATAATTCTTAAGGAACTTTCCATTTCTAGAAAGTACATAAGGCTTAATTTGATCTCATAATCATTGGTTTTTTTAAAAAATAttttcaacttttattttaaattcaaggggtgcatgtgcaggtttgttacataggtaacatgggaatattatgtgatgctgaggttttgggtatgattgatttcgtcaaccaggtagtgagcatagtacccaataatttttccacctttgcccccttgcattcctcctcgcccctagtagtcctcagtt---------------------tctatgagtagtcaatgtttagctgccacttagaaatgagaacatgtggtatttgtttttctgttcctatggttccctgaagataacggcctccaactgcatccatgttgctgcaaaggacataa-----ttttttttatgggtatgtggtattccatggggtatatgtaccacattttctttatccagtacattcttgacaggcacctaggttgattccatgtctttgctattgtgaatcgtgctgcaaagaacatatgagtgcatgtgtcttttttatataatgacttattttgttttggatatatgcttagtaatgaaattgctcagttgaacagtcattctgttttaagttatttgagaaatctcc-------------------------------------catgaatggtgtataaacattccattttctccacagcttcaccagcatc-------------------ttttttttttgacattttaataatagccattctgactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttatctgatgattaatgctgttgacattttcttatatatttataggcttctcctatgccttcttttgagaatgcctattcatgtcttttgcccactttctaatgggatatttgttttttgcttcttgaatt-aggttccctatagattctggatattagacttttgttggatgcatagtttgaaaatattttctcccattctgtaggttgtctgtttacattgttggtagtttcttttgctaagcagaagctctttagtttaattaggtctcacttgtcaatttttgtttctgttgcaattgcttttgaggtcttagtcatatattgttttccaatgtcaatgtccaaaatgatgtttcctagattttcctctaggattcttatagtttgaggtcttatatttaaaacttcaat- i nomLeu3.chr7b C 0 I 2666 s calJac3.chr3 117051822 1479 - 190850796 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ccattttttgttagtttttgtatatggtgaaatgcaggggacgagtttcattcttctgcatatggctagccagctatcctagca-------------ccatttattgaatagggagtcctttctccattgcttgtttttgtcaactttgttgaagattagataactgtggatgtgcagctttatttctgggttctctattgtgttccattggcctgtgtgtcagtttttgtaccagtacaatgctgttttagttattatagcctaataggatagtttcaagtcagatagggtgatgcctccagctttttctttttgctcaggattgctttggctatttctgctc--tccttttttagttccatatgaagtttagaatagctttttttctaacgctgtgaaaaatgatgttggtagtttcataggaatagcgttgtatctgtagattactttgggcaatatggccattttaatgatattgattcttctaatccattagcatggaatgtttttccttttatttgttatattggtctgttctcatgctgctaatgaaaagcatacccaaagactgggtaatttctaaaggaaagagatttaatggacttaacggttccacatggttggggaggcctcacaatcgtggcagaaggtgaaggagaagcaaagccatgtcttacatggcagcaggcaagagagcatgtgcaggggaactgcccttttataaaaccatcagatcttgtgagacttatgcactattaaaagaacagcataggaaaaaattgcccccatgattcaactgcctcccaccaggtccctcccacagtacatggggatgattattata i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124791502 825 + 198332218 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ccatttttagttaatttttg--tatgatgaaatgtaggggaccagttttactcttctgcatatggctagccagctatcctagcaataaatatcctccctatttattgaatagggagtcctttctccattgcttatttttgtcaactttgttgaagattacatgactgtagaggtgcagctttatttctggattctctattgtgttccattggcttggatgtcattttttgtaccagtaccatgctgttgttgttattatagtcttacagggtagtttcaagtcagatagggtgatgcctccagctttttcattttgctcaagatgactttggctatttctgctctttcttttttttgttacatataaagtttggagtag-ttttttgcagatgctgtgaaaaatgatattgatagtttcataggaatagcattgtatctgtagattatttggggcaatatggccattttaacaatattgattcttctaatccattagcatggaatatttttcttttcatttCTtgtattagtctattctcacgttgctaataaaaaatataccc-aaggctgggtaatttctaaaggaaagagatttaatggactt-acagttccacatggctggggaggcctcacaatcatggtagaaggcaaaggagaagcaaacccatgtcttacacaacagcaggcaagagagcatgtgcagg-gtaccacccttttataaaaccatcagatcttgtgagacttatgcactattacaagaacagcacaggaaaaactcacctgcatgattcaacttcctcccaccagatccttcccacaacatgtgggaatgacgatcata i calJac3.chr3 C 0 I 4692 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34010618 849 - 53741614 I e chlSab2.chr7 67523049 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110893661 0 + 178775436 C e macFas5.chr5 119214213 0 + 189454096 C e rheMac3.chr5 113991068 0 + 184069350 C e nomLeu3.chr7b 78964630 2666 - 115148730 I a score=142301.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 59864 542 + 158965 ttatttatttatttatttatttttgagacagagtcttgctctgtcacccaggctggaatgcagtggctttatctccactcactgcgagctcctccttccgggttcgtgccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggaccacaggtgcccgccaccacgcccagctaattttttgtatttttagtagagaccgggtttcaccctgttagccagcatggtcttgctctcctgacctcgtgatctgcccagctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacgcccagcc-----aattattataaattcaaggtgagatttgggcgaggacacagagccaaacaatatcatttgtatcaccttgatttctttgagcagtgttttgcagttctccttgtggagatcttttaccttgatgtagtttggatatttgtctccactcaaatctgatgttgaattgtaatccccagtgttggaggtgggggaattggtgggaggtgattggatcatgggggcagattctctcatggg s panTro4.chr4 122650845 534 + 193495092 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i panTro4.chr4 I 276 C 0 s ponAbe2.chr4 124792874 1480 + 198332218 ttggtgctgtcctcgaaatagtgaatcacaagatctgattgtttgaaagtgtgtggcacctccccctcctcttgctcttgctctcactatgcaaagtgcctgctcctgctttgccttctgtcatgagaaaaagctgcctgaggcctccccagaagctgagcagaggctggtgtcatgcttcctggacaacctgcagaaccatgagccaattaaacctcttttccttttaaattacccagtatcagggtttttttt---------------gttttgtttttgtttttttaatagcaatgcaagaatgacctaataacatacctccatggttagatgtattcctgagtattttatttattttgtggctactgtaaatatgattgtgttcttgatttggctttcagcttgaatgttattagtctcgaaatgctcctgatttttgtacattgattttgtatcctaaaacttaactgaagtcatttaccagtttcaggagccttttggcagagtctttacgattttataggtcacgatcatattgtcagtgaagagagacaatttgccttcttcctttctatttggatgccttttatttctttctcttgcctcattgctctggctaggacttccagtactatgttgaataggagtgttgagaatgggcatccttgttttgttctagttctcagaaggaatgctccagcttttgctcattcagtattatgtcagctgtgggtttgtcatagttgtcttcttttattttgaggtttatttctactatgcctagtctgttaagaatttttatcatgaaggaatgttggatttttatctaaaaccttttccatgtctattgagatgatcatatggtttttgcttttaattctttttattttgaggtatgtttcttctgtgcctagtctgttaggagtttttatcatgaaggaatgttggatttttatcaaaaaccttttccatatctattgagatgatcatatggtttttgcttgtaattctgtttatgtgatgaagcacactgatttgtgtgtgttcagctaaccttacatcccaggaatgaagcctaccagattgtagtgaattcactttttgatgttgtgatggttaatactgagtgtaaacttgattagattgaggggtacaaagtattaatcctgggtgtgtctgtgtgggtgttgcccaaaagaaattaacatttgagtcagtgggctggggaaagcagatccacccttaatctggtgggcacaatctaatcagcttccaccgaatataatgcaggcagaaaaacatgaaaagccaagatgggcctagtctcccagacaacatctttctcccatgctggatgcttcctgccctggaacattggcctccaagttcttcagttttgagacttggactgtctctcctttctcctcagcttgcagacagcctattgcgggaccttgtgatcacgtaagttaatatttaataaactctgata 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124794354 1316 + 198332218 tatatatcaagagatatatatatctatatatatcctattagttctaggttccagggttctctaagagtactctgactaatacagatgtgtgctactggatttgatttgctagcaatttttgaggattttttcatctttgtttatcagggacattggcctgcaatttcttttcctttcttgtttttttttttt------ttt---------------tttgacacaggatctcactttgttgcctaggctggagtacagtggcctaatcatggctcacttcagcttggacctcccaggctcaagcaatcctcccacttcagcctcccaagtagctgggactacaggcatgtgccaccacacctggttaattttttattttttgtagtgatagggtctctctatcttgccagattggtttcaaactcctgggctcaaggaattcttctacctcggcctctaaaattgctgagattacatttgtgagccaccatacccagcctaattttcttttctttgtgtctttgccaggttttggtatcaggattatgctggctttgtagaatgagttaggaag-tcctcagcgttgaatttttttaatagtttcagtagaattggtactagctcttcctttgtaaatctattagaattcagctgtgaatcagtctggtctagagctgtttttggttggtaggttttttatcactgattcaattttgggacccaatctcggtctgttcagagtttcaatttc-tcttgattcagtattgggaggttgtgtgtttccaggaatttatccatttcctctagattttctagtttttgtgaatagaagtgttcataatagcctctgaggatcttttgtatttcagtaggatcaattgtaatgtcacctttatcatttctggttgtgcttatttggatcgtctctctttttt-ttttgttaatctagctactgatctaaccattttgtttgtgctttcacaaaaccaacttttgattttatcaattctttgtaaggattttggagtcttaatttcatgcatttcttctccgattttcgttattccttttcttctgctagttttgagggtagtttgttgttgcttttcttgttcctctaggtgtgattttcttgttcctctagatcattaatttgagatattttcaactttttaggtaggtgtttagtgctataaactttcctcttaacactgcttttgctgcatccccgatattttggtatgttgtgtctctgttttcctttatttcaaagattgtttttaaaaaaattctgccttaattttgttggttacccaaaagttattcagaagtcagtt 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TATATATCAAGAGATAtatatatctatatgtatcctattagttctaggttccagggttctctaagagtattgtgactaatacaGATGtgtgctactggatttgatttgctagcaatttttgaggattttttcatctttgtttatcagggacattggcctgcagtttttttt-ctttcttgt-----------------ttt---------------tttgacacaggatctcactttgttgcctaggctggagtacagtggcctaatcatggctcacttcagcttggacctcccaggctcaagcaatcctcccacttcagcctcccaagtagctgggactacaggcatgtgccaccaaacctggttaattttttattttttgtagtgatagggtctctctatcttgccagattggtttcaaactcctgggctcaaggaattcttctaccttggcctctgaaattgctgagattacatttgtgagccaccatacccagcctaattttcttttctttgtgtctttgccaggttttgttatcaggattatgctggctttgtagaatgagttaggaagttcctcagccttgaa-tttttgaatagtttcagtagaattggtactagctcttcctttgtacatctagtagaattcagctgtgaatcagtctggtctagggctgcttttggttggtaggttttttatcactgattcaattttgggaaccaatctcgatctcttcagagtttcagtttcttcttgattcaatattgggaggttgtgtgtttccaggaatttatccatttcctctagattttctagtttttgtgaataggagtgttcatagtagcctctgaggatcttttgtatttcagtaggatcaattgtaatgtcacctttatcatttctgattgtgcttatttggatcgtctctctttttttctttgttaatctagctactgatctaaccattttgtttgtgcttttacaaaaccaacttttgattttatcaattctttgtaaggattttggagtcttaatttcatgcatttcttctccaattttcattattccttttcttctgctagttttgagggtagtttgttgttgcttttcttgttcctctaggtgtgattttcttgttcctctagatcattaatttgagatattttcaactttttgggtaggtgtttagtgctataaactttcctcttaacactgcttttgctgcatcccagatattttggtatgttgtgtctctgttttcctttatttcaaagattgttttttaaaaaattctgccttaattttgttggttacccaaaagttattcagaagccagtt i nomLeu3.chr7b I 2666 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34010618 849 - 53741614 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I e chlSab2.chr7 67523049 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110893661 0 + 178775436 C e macFas5.chr5 119214213 0 + 189454096 C e rheMac3.chr5 113991068 0 + 184069350 C a score=236458.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 63214 345 + 158965 tattttccatgCAGTCCAATGATAATGTGATTAGGTAAATTATTAGGTGATTGAGTACCAAACCTCAGGAATTCTAGGAGCACATTTTGTCTCAATACTCATTTACCATATCTTGAAGCAATCGAACAAGAAACAGCTGTTTGCTGAGTATCATATTGGTGTCTTTAAATTGATTGTGTGTTGTATGCACAAGTATGGATATGCCTTCATATCTGTCATGAGGAACTCATGGTTTGTAAGCTTTAGCTTTTTGATCTGGTACTCCGAATCTACATATCACCTTGGTCCTTGAAGCCAGGATCCACTTATTTCACTGGATCTCTGTGCATTCGTTT-----------ATTTTTTTTT s panTro4.chr4 122654469 345 + 193495092 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gaagatctt---ctccagttggaggaattatggttccaaaaaggttgagtaaacccctttccattggccttatgctca-tggccctatgcaggccccaatagggcctatacccattggccctatacaggcatagagtcataga-agcgtgcagcagaatgggggc-aact-gaacctctgcttttgaccaaggctcaaaaatg---gaaggggcttagaaaagaga-actgtaaagttatttataaacacctggggtcagtcctgagctc-aaattcatgaatcagatctgatcataaacacac-gccaaagacattgagaatgaagtaacagataaatcaccaatgatcatccacgtaccagactgaccactgagtggcttacacaggggagagagatgagtaatcatcggaaaggttagaaaacagaactgacact i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78969587 427 - 115148730 gaagatctt---ctccagttagaggaattatggttccaagaaggttgagtaaacccctttccactggccttatgctcattggccctatgcaggccccgatagggcctatacccattagccctgtacaggcatagagtcataga-agcgtgcaatagaatgggggc-aact-gaacctctgcttttgaccaaggctaaaaaatg---ggaggggcttggaaaagaga-actataaagttatttataaacacttatggtcactcctgagctctaaattcataaatcagatctgatcataaacacat-gccaaagacattgagaatgaagtaacagataaatcaccaatgatcatccaggtaccagactgaccactgagtggcttacacaggggagagatacgagtaatcttcggaaacgttagaaaacagaactgacact i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s canFam3.chr19 34012724 394 - 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ttcatgtcattacaatcacagacgaa--gagaaaaaatatgttgtctaaaacatatttgaagacatgatggctgaaag-ccagtaaaacttgactaaagatataaatctacagattccaggagttcaacaattcttaaacatgataaacctaagg------aaacgtagaca i canFam3.chr19 I 10 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I e chlSab2.chr7 67523049 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110893661 0 + 178775436 C e macFas5.chr5 119214213 0 + 189454096 C e rheMac3.chr5 113991068 0 + 184069350 C a score=61140.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 65342 212 + 158965 catagtaattaaattcttgaactaaataataattaaattcttgaaataaatatatatatatatttagttatatatatagaaccttattaagttatacttatatatatat------------aaccttaatggtactgaggaacagtgacccactacttatagggaacaataattcaagtgattttgttttgtctttagaaactatggaggcaagaaaaaagtag s panTro4.chr4 122656592 212 + 193495092 cataataattaaattctcgaactaaataataattaaattcttgaaataaatatatgtatatatttagttatatatatagaaccttattaagttatacttatatatatat------------aaccttaatggtactgaggaacagtgacccactacttatagggaacaataattcaaatgattttgttttgtctttagaaactatggaggcaagaaaaaagtag i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78970732 222 - 115148730 cataataattaaattcttgaaCTAAATAATAATTACATTCTTGAAataa--atatgtatatatttagttatatatatagaaccttattaagttatacatatatatatatatatatgtataaaaccttaatggtactgaggaatagtgacccactacttatagggaacaatgattcaaatgattttgttttgtctttagaaactatggaggcaagaaaaaagtag i nomLeu3.chr7b C 0 I 6145 s canFam3.chr19 34013291 131 - 53741614 catcataatcaaactgcttaa---------aaccaaatacagagaaaaa------------------------------------------------------------------------aatcttgatggcacccaggaggcatgacccattacttttagggaacaatga--caaatgatt----------ttcagagactatggcactcagaagaaagtgg i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I e chlSab2.chr7 67523049 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110893661 0 + 178775436 C e 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ggcaaaaattttaatgtacttcaggaaaagaaccactaatgcaggattctatattcagcagaaatatccttcaagaatggaagtgaaataaaaacgtttttagatgaaggaaaagtaagataagttgttga-tagcaaaatcattataaaataattgctaaaactaaattcttcag--agaaggaacatga i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I e chlSab2.chr7 67523049 0 + 135778131 C e papAnu2.chr5 110893661 0 + 178775436 C e macFas5.chr5 119214213 0 + 189454096 C e rheMac3.chr5 113991068 0 + 184069350 C e ponAbe2.chr4 124797792 443 + 198332218 I a score=436740.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 65741 240 + 158965 taccagaagaaaatttagaccatcaagatgaaggaagagcagaaatggtaattgtctgtgtaaatataatagattggttctcttctttaaaatatgtctgatggttgaaataaaaaa-tataacaacttagtcaaatctcaaaggctgcatgcagggtgaaagaagccagcctcatattgtatgacattc--ttttttcttcttcttcttctttttcttctttttgagacagagtctcagtct s panTro4.chr4 122656991 234 + 193495092 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chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34013765 33 - 53741614 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I e ponAbe2.chr4 124797792 443 + 198332218 I a score=600293.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 66006 241 + 158965 gtgaccttggttcactgcaacctctgcctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctctaagtagctgggattacaggcatgtgccattgcacctggctaattttggtatttttagtagagatggggttttgccatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaattgctgggattacaggcatgagccaccatgcccggccacg s panTro4.chr4 122657250 241 + 193495092 gtgacctcagctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctctaagtagctgggattacaggcatgtgccattgcacctggctaattttggtatttttagtagagatggggttttgccatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaactgctgggattacaggcatgaaccaccatgcccggccatg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124798235 241 + 198332218 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gtgacctcggctgactgcaacctctgcctcctgggttcaagcgattctcctgtctcagcctctaagtagctgggattacaggcatgtgccactgcacctggctaattttggtatttttagtagagatggggttttgccatgttggccaggctggtcttgaactgctgacctcaggtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcccggccatg i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110893922 241 + 178775436 gtgacctcggctgactgcaacctctgcctcctgggttcaagcgattctcctgtctcagcctctaagtagctgggattacaggcatgtgccactgcacctggctaattttggtgtttttagtagagatggggttttgccatgttggccaggctggtcttgaactgctgacctcaggtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcccggccatg i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67523310 241 + 135778131 gtgacctcggctgactgcaacctctgcctcctgggttcaagcgattctcctgtctcagcctctaagtagctgggattacaggcatgtgccactgcacctggttaattttggtatttttagtagggacggggttttgccatgttggccaggctagtcttgaactgctgacctaaggtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctgggattataggtgtgagccaccatgcctggccatg i chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34013765 33 - 53741614 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I 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taTCACATTCTTAAAAAGACACTTGTAATCTCTTCTGTGA---TTCCTTCTACC-CCCAATCTAATGTAACCATCACCTTCATGCCTGTCATGTCACCTGGTTTTATCTGACTCATAGTGTCATAGCAATTATTACAATATAAGTCATCTTGTTTATAGACTTGTT---TTACTTGttgtctgtctcctcctctgC--CCACATCTGTTTATCCAGTGAATTTGCTGATTTTACTTGTCACTGTATTCTTAGTGG i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67523551 243 + 135778131 tatcacattcttaaaaagacaCTtgtaatctcttctgtga---ttccttctacc-cccaatctaatgtaaccatcaccttcatgcctgtcatgtcacctggttttatctgactcatagtgtcatagcaattattacaatataagtcatcttgtttatagacttgtt---ttac---ttgtctgtctcctcctctgc--ccacatctgtttgtctagtgagtttgctgattttacttgtcactgtattcttagtgg i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34013798 247 - 53741614 tgtgatattaatgaaaagacaCACATCACCTCTTTTATGACGTTTACTTTAACCTCCTAGTCTAAAGTAGCCATGACTTCCACGTCCATCA---CATCTGGTTTTATCTTAATCATAAAATCATACCCATTATCACAATTTAAACTAT-TTGTTCATATATTTGTTTTCTTATTTAGTATCCCTGTCTCCCCCTAC--CCTCATCTGTTTG-CTGGTGAATTTGTTGATTTTATTTACCTACA-ATGCTTATTGT i canFam3.chr19 I 33 I 221 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I a score=153348.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 66494 113 + 158965 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGctctctttctctctctctctctctctctctctctctctctctatatatatatatatatatatatatattatttttta s panTro4.chr4 122657738 82 + 193495092 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGctctctttctctctctctctctct------------------------------atatatatatatttt-tttttta i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124798724 97 + 198332218 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGctctctctctctctctctctctct----------------ctAAGtatatatatatatatatatatatTAtttttta i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78978035 93 - 115148730 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGctctctttctctctctctctctct--------------------atatatatatgtgtatatatatataatttttta i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113991816 95 + 184069350 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGCTTTATCTCTCTCTCtacatatat------------------atatatatttatatatatttatatattatatattt i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119214961 91 + 189454096 ttagaataacagctaatacatatagacattcaatTGCTTTATCTCTCTCTCTACatatat------------------atata----tatatatatttatatattatatattt i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110894409 91 + 178775436 TTAGAATAACAGCTAATACATATAGACATTCaattgc----tctctctctctacatatat------------------atatatatatttatatatttatatattatatattt i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67523794 85 + 135778131 ttagaataacagctaatacatataggcattcaatTGctctctctctctctctctacatat------------------acata----------tatttatatattatatattt i chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34014045 221 - 53741614 I e calJac3.chr3 117054140 4692 - 190850796 I a score=673848.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 66607 233 + 158965 a---tttttttttttagatggagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggcacgatctcagctcacggcaacctccgtctcttgggctcaagcagttctcctgcctcagcctcccgaatagctgcgactaaaggcatgcaccaccaagcctggctaatttttatattttttgtagaaatggagtctcactgtgttggccaggctggtctcaaactcctgacctccagtga s panTro4.chr4 122657820 233 + 193495092 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atTGTAtttattttcagatagagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagtggcacgatctcagcttactgcaaactccatctcttggcctcaagcagttctcctgcctcagcctcccgaatagctgcgactaatggcatgcaccaccatgcctggctaatttttataatatttgtaaaaatggagtctcactgtgttggccaggctggtctcaaacgcctgacctccagtga i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119215052 236 + 189454096 atTGTAtttatttttagatagagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagtggcacgatctcagcttactgcaaactccatctcttggcctcaagcagttctcctgcctcagcctcccgaataggtgcgactaatggcatgcaccaccatgcctggctaatttttataatatttgtaaaaatggagtctcactgtgttggccaggctggtctcaaacgcctgacctccagtga i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110894500 234 + 178775436 attgtatttatttttagatggagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagtggcatgatctcagcttactgcaaactccgtctcttggcctcaagcagttctcctgcctcagcctcccgaatagctgcgactaaaggcatgcaccaccatgcctggctaa-ttttataatatttgt-aaaatggagtctcactgtgttggccaggctggtctcaaatgcctgacctccagtga i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67523879 236 + 135778131 attgtatttatttttagatggagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagtggcacgatctcagctcactgcaaactccgtctcttggccccaagcaattctcctgcctcagcctcccgaatagctgcgactaaaggcatgcaccaccatgcctggctaatttttataatatttgtaaaaatggagtctcaatgtgttggccaggctggtctcaaaagcctgacctccagtga i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117058832 227 - 190850796 ---attattatttttaaatagagtctcactctgttacccaggctggagt------gcatgatctcagcacactgcaacctctgtcttttgggctcaagcaattctcctgcttcagcctcccaaatagctgggactaaaggcatgcattaccatgtctggttaatttttacattttttatagaaatggggtctcactgtgttggccatgctgggctcaaactcctgacctccagtga i calJac3.chr3 I 4692 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I e canFam3.chr19 34014045 221 - 53741614 I a score=493716.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 66840 152 + 158965 tctgcctgtttctgcttcccaaagtgctgggattacagtcatgagccacctcactcagctaaatatatatT--TTTAATGGCTTAATTAATTAATATTTTAGGAAGCCTGATACTAATACATTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA s panTro4.chr4 122658053 152 + 193495092 tctgcctgtttctgcttcccaaagttctgggattacagtcatgagccacctcactcagctaaatatatatt--tttaatggcttaattaattaatattttaGGAAGCCTGATACTAATACATTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124799053 151 + 198332218 tctgcctgtttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccacctcactcagctAAATATATA-T--TTTAATGGCTTAATTAATTAATATTTTAGGAAGCCTGATACTAATACATTCATACTGAGT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78978363 152 - 115148730 tctgcctgtttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccacctcactcagctaaatatatatT--TTTAATGGCTTAGTTAATTAATATTTTAGGAAGGCTGATACTAATACATTAATACTGAAT------------------GAATTGAAATGTAGTGTCTTA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113992147 152 + 184069350 tctgcctgcttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccacctcactcagcTAAGTATATATT--TTTAATGGCTGAATTAGTTAATATTTTAGGAAACCCAATACTAATACATTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119215288 152 + 189454096 tctgcctgcttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccacctcactcagcTAAGTATATATT--TTTAATGGCTGAATTAGTTAATATTTTAGGAAACCCAATACTAATACATTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110894734 152 + 178775436 tctgcctgcttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcctgagccacctcactcagctaagtatatatt--tttaatggctgaattagttaatattttaggAAACCCAATACTAATACATTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTAA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67524115 152 + 135778131 tctgcctgcttctgcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccacctcactcagctaagtatatatT--TTTAATGGCTGAATTAGTTAATATTTTAGGAAACCCAATACTAATACACTCATACTGAAT------------------GAATTGGAATGTAGTGTCTTA i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117059059 170 - 190850796 tctgcctacctctgcttcccaaagagctgggattataggcatgagtcacctcacccagctaaatatttatt--tataatGGCTGAATTAGTTGATATTTTAGGAAGCCTGAAACTAATACTTTCATACTGAATATATTGGAATATATATTGGAATTGGAATATAGTGTCTTA i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34014266 137 - 53741614 tCtttttttttttttttttttaaGCAC--------CAGACA--------CTCATTT-GCTAAGTACATTTCTGTTTAGTGGCTGAATTAACTGATATTTTAGTAAGGCTGATGCTAACACATTTGTATCAAGT------------------GGATTGGAATGTGATGCCTta i canFam3.chr19 I 221 C 0 e mm10.chr6 83317978 2758 - 149736546 I a score=2386238.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 66992 802 + 158965 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ATAGCtgtattagttttctaggactgccataacaaaatcctatagataaggtggtttgagcaaaagaaatgtattttctcaccatcctgcaggttgaaagtctgagactgatgtatcagtagatttcatttctctgagacctctctcc--ttcttgatggtggccaccttcttgctgtcgtggttgtttcccattgcatatgcactcctagtgtctctctgtgtgttcaatttcttcttcatataaggacacaatcagatttgattatgcctactctaaaggcttcattttgacttaatcgcctctttaaatgtatgcctactctaaaggcttcattttgacttaatcgcctctttaaatgctctgtctccaaatatagtcaca-ttttgagctactaggggttaagacttcaacataaaaattctgtggagacataatccagcccataacaATAGCtgtcttagtttgttttgtactgctataacaaaa----aatacctgagagtaggcaatttataaagaacagaaatttatt------tatcacagttcaggagaccgggaagtccaagatcagggcaccagcaggctcaactgtctggacaggactgctttctgtttccaagatggagttttggcatcctttgcatgggaggaacactgcgtgctcacagagcagagggacagaagggtgaaaagggacaaactccctcagtcaagcccttcataaaagttgcctaatcccattcatgagggctctgactcaatcagctttcaaagtccacaactcccaatactgttgcattggggattaaattttaacatgaattttggagggaacaaaagcaatcaaaccataTTC i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124799204 797 + 198332218 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ATAgctatattagttttctaggactgccataacaaaatcctATAGATAAGGTGGTTTGAGCAAacgaaatgtattttctcactgtCCTGGAGGTTGAAAGGCTAAGACTGATGTATCAGTAGGTTTCATTTCTCTGAGACGTCTCTCC--TTCTTGATGGTGGCCACCTTCTTGCTTTCATGGTTACTTCCCATTGCATATGCACACCTGGCGTCTCTCTGTGTGTTCAATTTCTTCTTCATATAAGGACACAATCAGATTTGATTATGCCTACCCTAAAGGCTTCATtttgacttaatcacctctttaaatg------------------------------------------------ctctatctccaaatatagtcaca-ttttgAGCTACTAGGAATTAAGACTTCAACACAGAAATTCTGTGGAGacataattcagcccataacaataACCGTCTTAGcttgttttgtgctgctataacaaaa----aataCCAGAGAgtaggcaatttataaagaacagaaatttatt------tatcacagttcaggagactgggaagtccaagatcagggcacCAGCAGGCTCAACTGTCTGGACAGGACTGCTTTCTGTTTCCAAGATGGAGCTTTGGTATCCTTTGCATGGGAGGAACACTGCATGCTCACATAGCAGAGGCACAGAAGGGCCAAAAGGGACAAACTCTCTCAATCAAGCCCTTTATAAAAGTTGcataatcccattcatgagggctctgactTAATCAGCTTTCAAAGTCCACACCTcccaatactgttgcattggggattaaatttcaacatgaattttggagggaacaaaaATAATCAAACCATATTC i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67524267 798 + 135778131 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nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 113994702 918 + 184069350 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panTro4.chr4 122667192 446 + 193495092 tctgttagtcagttctcacactactgtaaagaactacctgaaactg---------ggtaatgtatgaagaaaaaaagtttaattgactcacagttccacaggctatacaggcagcatgactgtggaggcctcaggaaacttacaaccatgacagaaggcaaaggggaagcaaggcatgtcttcatatggccagcaagagaaaga-ggggggtgggaagagatgctacacacttttaaacaaccagatctcttgagaactctatcagaagaacagcaagggggatgtccaccttcgtgattcaatcacctcccaccaggccccacctccaacacttgggatcacaattcaacatgagacttggctggggacacggatccaaaccatatcattgacagacaataaactgcacat-attaaattgtacagtttgatatattttgacataggtgacctgtg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124807436 442 + 198332218 TCTATT----Agttctcacactgctgtaaagaactacctgagactg---------ggtaatgtacaaagaaaaaaagtttaattgacccacagtaccacaggctgtacgggaagcgtggctgtggaggcctcaggaaacttacaatcatggcagaaggtgaaggggaagcaaggcatgtcttcatatggccagcaagagaaaga-ggagtgtgggaagtggtgctacacacttttaaaccaccagatctcttgagaactctatcagaataacagcaaaggggaagtccacctttgtgattcaatcatctcccaccaggccccacctccaacactcgagattacaattcaacatgagatttggctgtggacacagatccaaaccacatcattgacagacaataaactgcacat-gttaaattgtatagttcgatatattttgacataggtgacctgtg i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78986724 456 - 115148730 tctattagtcagttctcacactgctgtaaagaactacctgagactgcgtaatgcatgtaatgcatgaagaaaaaaagtttaattgactcacagttccacaggctgtacaggaagcatggctgtggaggcctcaggaaacttacaatcatggcagaaggtgaaggggaagcaaggcatgtcttcatatggccagcaagagaaatagggggggtgggaagaggtgccacacacttttaaaccaccagatctcttgagaactctatcagaagaacagcaagggggaagtccatctttgtgattcaatcatctcccaccaggccccacctccaacactcgggatcacaattcaacatgagatttggctggggacacagatccaaaccacatcattgacagacaataaactgcacat-attaaattatacagtttgatatattttgacataggtgacctgtg i nomLeu3.chr7b C 0 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110903548 7 + 178775436 GA------ACCAC i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67532944 7 + 135778131 ga------accac i chlSab2.chr7 C 0 I 9 s calJac3.chr3 117068096 13 - 190850796 gaaccatcaccac i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34024045 6 - 53741614 AA------acca- i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83323507 1592 - 149736546 I a score=9438.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 75624 10 + 158965 aattaagaca s panTro4.chr4 122667645 10 + 193495092 aatcgagaca i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124807891 10 + 198332218 aatcgagaca i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 78987193 10 - 115148730 aatcgagaca i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr5 119224139 5 + 189454096 ---cgaga-- i macFas5.chr5 C 0 I 3 s papAnu2.chr5 110903555 5 + 178775436 ---CGAGA-- i papAnu2.chr5 C 0 I 1 s calJac3.chr3 117068109 10 - 190850796 aatcaaggca i calJac3.chr3 C 0 I 2 s canFam3.chr19 34024051 10 - 53741614 aatcaagata i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83323507 1592 - 149736546 I 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124815324 1141 + 198332218 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i ponAbe2.chr4 I 4506 C 0 s nomLeu3.chr7b 78990126 1138 - 115148730 tatctttgggtctcacctaatcaggtgagcccttaaaaagagaggggattctttcttgtaaaaaagatttcaagctccagaaagattcagtgtcctactgctagcttcgaagatggagggagccacgtagccaggaactgctgga--gcctgaaagaattaatagcattctctgcctgacagccagaaaggaaatgaggaccgcaatcgtatgacttcaagacacggaattctgacagaatcaggtgagcaga--aaagaggactccaagctcctgaagagaataaagcccagcggacatcccgattttagccttggggtaccctgagcagggaacccagtctcactatggccagacttctgatctacataatcgtaagataataaaggggtattacgttactccgctaaattcatggtgatgtgctgactcatcattagagaa-caacacaCCTTGGCCAGGCCCAGCCTCAGTGTATTGT-GTGAAATTTATCCTACATATTATGGCAGTTCTTTGATTGAATTCAGGAGTCTAAAG--GACAATTATGAAGA---AAAATATTGATAATAATCTAATATATGACATAAACTTCTGGAAAATATTCTTTAAGAGATCCAGAGAAAAGATAGTTAGGATTTTCAAAAATAGACTTGTCCATGGATATTCACTTCATGAGAAATGGAAAA--TTCTGTCCATATGAAAGCCAATAACACCAATTATTTTA--AAAGAGAGGCATCGAAACCAA--ATGTTAACTTTCTGAAACATTGGTCTTGTAAAAAGAATGTTTACAaacaatgataaa-------------ataat-aatataaaaagaag-tattaatct----a-aaataCAAAAAGAAAGTTAAGTACCAGAATAATTTTAGGTTAATCAAAATTAAAAAATA--------------------------------------------AGAGAGGTAAACTTGTGACCCACATTCAGGC-------TATTTATTTA----TTTATTC-----AAAAG-----CACTTCTCTAATTCT---GT-GCACGATG-TATCTATAAGCCATAGAACTTTATACTTTGTTTCATCAACCAATGCTGATACATAAGTCATCCAACTGGCTAAATGAGAGGCAAAGTAGCCTTACTTCAAATTACAGTGAAAAACTAATTTGCATCCCCCCA-----CTTG-TTTCTGGATCTTCCTTTTTGTAGGCCAGATTTTTTtctgtc 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i papAnu2.chr5 I 2 C 0 s chlSab2.chr7 67535974 1146 + 135778131 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tatttttgggtctcacctaatcagaaaagcccttaaaaagggg--------------------------ttaagctccagaaagttgcagtgtcctactgctaactttgaagatggaggaacccacatagccaggaactcctgga--gcctgaaagaactgatagcattctctggctgacagccagaaaggaaatgaggatctcaatcatacgacttcaaaacactgaattctgacagaaccaggtgagcaga--aaagaggactccaagattctgcagaaaacaaagcccagtggacacctcaattttagccttggagaatcgtgatcagagaactcagtgtcattatggccagactaatgatctacataattttgagataataaaggggtattgcattagtctgtt-aattcatggcaa-ATGCTAATTCATCATCAGCGAA-CAACACACCTTGGCCAGGCTCAGGCTCAGCGTTTTGTAGTAAAATGTATCCTATGCATTGTGGCAGTTCTTTGATTGAACTCAGTACTCTAAAG--GACAATTATGAAGA---AAAATATTGAGGATAATCTACTATATAATATAAACTTCTGAGAAATATTCTTTAAGAGATCCAGAGAAAAGATAGCTAGGATTTGCAAGAAAAGACTTGTCTATGGATATTCTCTTCATGAGAGATGGAAAA--TTCTGTTCATATCAAACCCAATAGCACCAATTATTTTA--AAAGAGAAGCATCTAAACCAAACATGTTAACTTTCTGAGGCATTCATCTTTTAAAAAGAATGTTTACAAACAATGTTAAA-TAAT--------AAAAT-AACATAAAAGAGAG-TATTCATCT----A-AAATAGAAAAATAAAGTTAAGTATCAGAATAATTTTAGGTTAATAAAAATTAAAAAATG--------------------------------------------A-AGAGGTAATCTTGTGATCCACGTTCAGGCTATT---TATTTATTTA----TCTATCTATCCAAAAAG-----CACTTCTCTAATTCT---GT-GCACAATC-TATCTATAACCCATAAAACTTTATACTTTGTTCCATCAGCCTATGCTGA----TAAATCATCCAACCGCCTAAATGAGAGACAAAGTAGGCTTACTTCAAATCACAGTGAAAAACTAATTTGGATTCTCCCACCCTACTTGTTTTCTGGATCTTCC-TTTTGTAGGCCAGATTTTTTtctgtc 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gcccaggctggagtgcagtggcactgtgtcagctcactgcaacctctgctcccgggttcaagtaatcctcctaaatcag i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67537120 79 + 135778131 gcccaggctggagtgcagtggcgcaatgtcagctcactgcaacctctgctcccgggttcaagtaatcctcctatatcag i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117072058 79 - 190850796 atccacgctggagtgcagtggcacaatatcagctcactgtaacctctgctctcagattcaagcagtcctcctacctcag i calJac3.chr3 C 0 C 0 s mm10.chr6 83326314 26 - 149736546 GCAAAGGCTAATGT-----------------------------------------------------CTCCTATATCAG i mm10.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr19 34033243 0 - 53741614 C a score=347559.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 79818 141 + 158965 cctactgagtagctgggactacaggcatgtatcaccaggcctggctgtt----------ttttcgt-ggg--------------------------------------------ttttttttttttctcctgtaaagacggtttctccatgttgctcaggctggtcttgaact-----------------------------cctcacaaagtgctgggattaca s panTro4.chr4 122671829 142 + 193495092 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papAnu2.chr5 110908398 20 + 178775436 TGTGGCTGTGACATCAGGAG i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67537827 20 + 135778131 TGTGGCTGTGACATCAGGAG i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s mm10.chr6 83326686 17 - 149736546 -ATTGAGGTTAATTTGGG-- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34034651 20 - 53741614 CTTGGCTGTTATGACTGGAG i canFam3.chr19 C 0 C 0 e calJac3.chr3 117072754 73 - 190850796 I a score=5083784.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 80390 1387 + 158965 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AAAAAGGGTTTCCCAAGgacaacat--tattttttaaatgcatattttctcCCTGGGTTTTAAGGgctactttctgtcttttttttctttag-cctgtAAGTTCTTTATCCATCTGGAATTAATG----TTAAGAGAGTGAGGTAATGATTCAACTTATTTTTCTCC-CAAAGATTAGCCAATTATcacaacactatttattgaataatctattttttttctactgtttgaAATATTACCAATTTTT-------------------------------ATAagacaaattttatatatatataaaattctattctgaatatctttattttgttccacTTTTTGGTCCACTTGTTTCCAAATCAATAC---AC-CTTCATTGCACTGgctttaaattatgttttaatattcagtagttcaaaatttttcttaacacatttattttagaattctcCTAATTCTAAATATGTAGTATTTCACATAAATTTCCagagaaatttttctttctttc-tttctttcttttttttttttttttttgaga---- i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67542908 483 + 135778131 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i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124825774 1001 + 198332218 tcgggggaatctgcccccaacatttcaatgtaggttctttctgtttttccataagtgttggctggctgagaaataaagagaaagagtacaaagagaggaattttatagctgggctgccgggggtgacatcacatatcagtgggtccatgatgcccacctgaggctcaaagcagcaagttttttattaagggtttcaaaaggggaaggggtgtaaaacagggagtaggtacaaagatcacatgcttcaaagggcaaaaagtggaacaaaggtcacatgcttctgaggaaataggacaaaggcaaagcagaactactgataagggtcaatgttcaaccgtgcacgtattgtcttgataaacatcttaaacaacagaaaacagcgttcaagagcagagacccggtctgaccacaaatttaccagggtggagtttttccccaccctaataagcctgagggtactgtaggagaccagggcgtatctcagtcctcatctcaatcgcgtaagacagacactctcagaatggccatttatagacctctctccaggaatgcattcctttcccagggtattaatagtaatattccttgctaggaaaagaatttagtgatatctctcctacttgcacatccatttataggctttctgcaagaagaaaaatatgactctttttgcccgaccccacaggcagtcagaccttatggttgtcttcccttgttccctaaaagtcgctgttattctgttgtttttcaaggtgcactgatttcatattgttcaaacacac--gttttacaatcaatttgtacagttaacacaattatcacagtggtcctgacctgacgtacatcctcagcttacgaagataacaggattaggaaattaaagtaaagacagtcataagaaattataaaagtattatttgggaactgataaatgtccatgaaatcttcacaatttatgttcctctgccgcgactccagccagtccctccatttggggtccctg i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79000536 992 - 115148730 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calJac3.chr3 117079219 434 - 190850796 T e papAnu2.chr5 110917161 445 + 178775436 T e macFas5.chr5 119237748 445 + 189454096 T a score=60285.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 87736 35 + 158965 ACATGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGG s panTro4.chr4 122682146 35 + 193495092 ACATGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124826866 35 + 198332218 ACATGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGC i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79001619 35 - 115148730 ACATGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGC i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114014285 35 + 184069350 ACATGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGC i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67546365 35 + 135778131 ACTTGAATTTGGGGATGGGAGAAAATAACAAAGGC i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34042850 35 - 53741614 ATAGAAATTGGGGGATGGGAGAAAATAACACAGGG i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83335925 19 - 149736546 I e calJac3.chr3 117079219 434 - 190850796 T e papAnu2.chr5 110917161 445 + 178775436 T e macFas5.chr5 119237748 445 + 189454096 T a score=47754.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 87771 12 + 158965 AGACTTTTATTT s panTro4.chr4 122682181 12 + 193495092 AGACTTTTATTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124826901 12 + 198332218 AGACTTTTATTT i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79001654 12 - 115148730 AGACTTTTATTT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114014320 12 + 184069350 AGACTTTTATTT i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119237303 12 + 189454096 AGACTTTTATTT i macFas5.chr5 T 445 C 0 s papAnu2.chr5 110916716 12 + 178775436 agACTTTTATTT i papAnu2.chr5 T 445 C 0 s chlSab2.chr7 67546400 12 + 135778131 AGACTTTTATTT i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117078785 12 - 190850796 AGACTTTTATTT i calJac3.chr3 T 434 C 0 s canFam3.chr19 34042885 12 - 53741614 AGACCTTTACTT i canFam3.chr19 C 0 C 0 e mm10.chr6 83335925 19 - 149736546 I a score=322290.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 87783 82 + 158965 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATGTTTAAAATGTTTCACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT s panTro4.chr4 122682193 82 + 193495092 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATGTTTAAAATGTTTCACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124826913 78 + 198332218 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATGTTTAAAATGTTTCACATTCTTC----CTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79001666 82 - 115148730 GGAGTGCATTCTATGTTTTTAAAAGAATGTTTAAAATGTTTCACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTAGAAGAT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114014332 82 + 184069350 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATATTTAAAATGTTTCACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119237315 82 + 189454096 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATATTTAAAATGTTTCACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110916728 82 + 178775436 GGAGTGCAtcctatatttttaaaggaatatttaaaatgtttcacattgttcctttctttcttt---aaaataattagtaCAAGAT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67546412 82 + 135778131 GGAGTGCATTCTATATTTTTAAAAGAATATTTAAAATGTTTTACATTCTTCCTTTCTTTCTTT---AAAATAATTAGTACAAGAT i chlSab2.chr7 C 0 C 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AAACAGTTCAtgtgtggttgttcattttgttatgtggacttgtagtttgtttattttcattgctgtatataatttcacgtatgcatataccagaaattgttatgtattctactttgataaatggttgtttccagttttttagctaccacaaatggtactgctatgaacgttcttatatatgtcatttggttcatttgtctatgcatttctgtcaaatatatacttagaagtggaattactgaatcataaggaatgcacatattta i macFas5.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67550804 265 + 135778131 AAACAGTTCAtgtgtggttgttcattttgttatgtggacttgtagtttgtttattttcattgctgtatgtaatttcatatatgcatataccagaaattgttatgtattctactttgataaatggttgtttccagttttttagctaccacaaatggtactgctatgaacgttcttatatatgtcatttggttcatttgtctatgcatttctgtcaaatatatacttagaagtggaattactgaatcataaggaatgcacatattta i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117083821 259 - 190850796 aatcagttcatgtgtgtttcttcattttgttatgtgaacttgtagtttgtttaatttcattgttgtatataatttcacatatgcatacaccagaaattattttgtattctactttgataaatagttgtttccagttttttagctactgtaaatggtatttctatgtac-----taaaaatgtcatttggttcatttatttatgcatttctgttgaatatatacttggaagtggagttactgaataataaaggatgc-TTTATTTA i calJac3.chr3 C 0 I 337 e mm10.chr6 83339701 10056 - 149736546 I e 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s panTro4.chr4 122687070 2838 + 193495092 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i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114020469 1277 + 184069350 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i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119243459 1277 + 189454096 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tat-tttttgtatTTGGTTTAGTTTCATTATTATGtataaatttagcatcaacctgttgatttccatgaaacaaactgctgagatttgattagaattatattgagtctatatttcaactggcacataattgacacatttacattattaagactttcgactcacatacatgatatacccttccagttactttggtcaccttttatatctttgatgttttcaatttttggtagaaagttctggtacatacttcatttagatgtatgttgttttgatgtcatactaaattatatcttttaatataattcattctgtttttt---a-tttgagatgtatataaacatagttcattttagtttattgatgtcatattcagaaatattattaaacttacttttt-acctttagttttctgaagaccctt--gaatttctgcacaaaaag-cacataaaaa---tatataataattacagatttatttctccctttttatccatataaccattattttcttttcttgccttcttgaactatttaagacctcacttgaatgttgaacataaattgttataaactgatttcacaggatttcaccaataaggat--tatttacagtaggattttctaggtactctgtcagatgaaggaacc-accttctgttcctCCGT----ATTAGTGTTGGAGTATTGGAAATTGTG----------------ACTGTTTTTAATTGTACCTTATAAAATTTCTATGAGAAAAAATTAGTCAGATGTTGCTAGTGAAAATATCTGGAAAGCCTGTTCCCTCTCACTCTAATTTCCAGCAAACAA---TTTCCTATATTTTCAGAGCATCTCTTCTTCCTCTAC-ACACTGGTTTATTCCCTTAAAGTAAGCCTGTAATGGCAGCAGTTTTTGTTTCCATACA--CATCAATTTATCACTAAGAATTGGGGTTCTTTTTTTTTTTAAGAATTGGGGTTC--TTAGTAGAGTTTT--ACTAAAAGAGACAGAT-------------ATAGATGCAGAGACTATAGTTATGAAAATTTTTGCAGTCCCTCTTCTCATTTGAGCCCATGGAGGTGGGGCTCTT--AGGGAAAAGGCTAGT---TTTAAAGGAAGAACTGGTTTGAGagtataaagcatggtggttaaaagcttgagctctggagcctaacttcttgagttt-aaatcccagctctgccatttacaaactatatcttcttaataatttaattttcagttaatttcacacttcttgttggtaagggggctaacacagta----------tataaggttgtagtatataatgcactgagtttgtatataacgtactgatgacagtgtttg 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rheMac3.chr5 114022631 24 + 184069350 tttattttgtttatgtatttattt i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119245621 24 + 189454096 tttattttgtttatgtatttattt i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110925349 24 + 178775436 tttattttgtttatgtatttattt i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67554697 24 + 135778131 tttattttatttatgtatttattt i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34047980 24 - 53741614 Ttttttttatttatttatttattt i canFam3.chr19 C 0 I 589 e mm10.chr6 83339701 10056 - 149736546 I e calJac3.chr3 117087645 0 - 190850796 C a score=695896.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 102253 300 + 158965 -------gagttttcgctcttgttgcccaggctagagtgcaatggtgcaatctcggctcaccacaacctccacctccctggttcaagccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtatgtgccaccacgcccgcctaattttgtatttttagtagagatggggtttctcactgttggtcaggctggtcttgaactcccgacctcaggtgatccacctgcctcggcctccaaaagtgccgggattacaggcgtgaaccacggtgcctggccAAAATGAACCATTTTTTTTT----ACC s panTro4.chr4 122696688 299 + 193495092 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ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79019493 434 - 115148730 ac------ttaatctagtctaatttacagatttttttatgtatgatttttatattgtgccatgtttaagaaattttctttaccccgtagttagaacaatcttctcctatattctgttttaaaagttttaAATCCTTAGTCTATCTGAAAAGAG-CTTTGTGTGAGTTGCTTTTTAGGTATCCAATCTCCCAGTGCAGAACCCGTTGTCCAAGTATGAATTTATTGAATAAt------------------tctgctttgccagtcccattgtatgcctaatttctcattttaccctgttggataggataacacatgcaaagtttaataaaagtgttgatagcagcatcattaacatgttcatggtatcaaaaag-gagttttcaataattcatcatgtacattt-actgtagctta-ttttagacaacccatatattcagaaagttcccttttattttcagtt i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114032545 440 + 184069350 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calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34057924 450 - 53741614 tcttaaaattggtgaaatcaaatttatcaatatttttatacatgattcttatattgtgccatgtttaagaaattttctttacctaa-agttataatagtattctcctatgttttcttccataagatctaaatccttagtctatctagaaagagtttttgtgtgaattgctttgcagggatcaaatctccctatatagaactgattgtggaactaccaatatactgaatggtcagttttttccccagtgatatgtaatgccagtgctgtcatatacctagtttctcctttgctccatttggagagaaccactgatgagatattaactcaaactgatgacagtggcatctttgtcatg-taatgattcaaaagga-aagctttcagtatttcaccatGCACCTTT-ACTGTGGTTTATTTTTACACAACTCACACATTTAGAAG--------TTCTTTtcagtt i canFam3.chr19 C 0 I 239 e mm10.chr6 83354370 7770 - 149736546 I a score=455864.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 112256 160 + 158965 tggcaaaagtt---ttttttaaccaacctctttttctatgtttattttatatatattcgtagattttacaatgttcaacttattctgtagtcctgagataaagtgattcatggttttatt---cat-------------------------------tttatatatatagcaaaattcagtttattagtaattggtt s panTro4.chr4 122706684 160 + 193495092 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aaatGTCACAGAGAATGCTAATTTTCATGTGACTTTCTGCACTCCCAATCAATTTT-GTGTCCTTTCTGCAGGTAAACCTGGTGTAAATGTAAATTCAGAGTTta----tgcaagt---------------------------------g--------tgtgtgtgtgtgtgtataattgtacgtatctttagatgtagtattgtatgtgtgtTTCCTGTGTAAGGTAGTTTATTCAGTGGTGGGGAGAGCAGGCTTGAactacctgtgtaacctcaggcaagttacctaa---ctttatgacccatctattacttggggataataatagggccAATAAAATCAGTGTTTttctttgaaaagattaat i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34058759 306 - 53741614 AAACATTACAGGGAATGTTAATTTATGTTTTACTCTCTACAGTACCAATCAATTCTAATGTCCTTTCTGCAAGTATACCTA-------TGTAAGTTCATGGTTTATCTTTACACAA------------------------------------------TTTGTGTGTGTGTGTTATATTTTA------TTTAGAAATA------TGTGTGTGTTCActgagtaaggcagtatgttggacagttaggagagcagtctcagactacctctgtaacttcaggcaagtcaa-taacctctctaggactcatcttttaattggggatgataccctggccAATGAAACTAATGCTAttctttgaaaagtttaat i canFam3.chr19 C 0 I 627 e mm10.chr6 83354370 7770 - 149736546 I a score=521978.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 114587 151 + 158965 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rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119259023 150 + 189454096 aaagcaga-aaagttattttaagagcaagaaagaaatagaaagtccaaatatgaggaaagaaaacagggaatatttatacatacggtc-agatttaaacataataagataatgttgtaaatataattttatgccattaaattggagaattta i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110938487 150 + 178775436 aaagcaga-aaagttattttaagagcaagaaagaaatagaaagtccaaatatgaggaaagaaaacagggaaTATTTATAGATACGGTC-AGATTTAAACATAATAAGATAAtgttgtaaatataattttatgccaTTAAATTGGAGAATTTA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67567443 150 + 135778131 agagcagc-aaagttattttaagagcaagaaagaaatagaaagtccaaatatgaggaaagaaaacagggaatatttatagatatggtc-agatttaaacataataagataatgttgtaaatgtaattttatgccattaaattggagaattta i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117102614 150 - 190850796 a-agtaga-aaagttattttaagagcaagaaagaaatagaaagtccaaacatgaggaaagacaacaggaaatatttatagatatggtcaagatttaaacataataagataatgttgtaaatataattgtatgccattaaattggagaattta i calJac3.chr3 C 0 I 334 s canFam3.chr19 34059692 149 - 53741614 aaagtagataaatttcttttaagag-aaggaaaaaggggaaagcctaaataataggaaagttgaaaaggaatatttatagatacagtcaagatttaaacataatacaataatgttggaaa--taattttagatcattaaattagaaaattta i canFam3.chr19 I 627 C 0 e mm10.chr6 83354370 7770 - 149736546 I a score=1465246.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 114738 575 + 158965 tgtgaaatgacaatttttccagaaaagtagaaatgacaaaaaatgactgagaaggaaatacaagaggtaaattgaAAAT-AAAAAAATAAGttttcaattatatttaatacatatactggaaagtacctaaattataaaagaaatgcttacttaatttttacaaaatgaatatacccatgaaatacag-------tgactgaagagtatgaacaacctggaaa--------ccttcgctcttcctttcaatcaccaattccccaaga-ta-atttatatcctggctttttatgccaaagataagttttgcctgtttttgaactttacataaatggactcatacagtctgttctcatttttgcccggcttctttggctcaacat--tgtttgtgagactcatctctggtgttggctgtagtttggtttgcccatgctcattactctaaaatgttctattctatgcatacactacaatttatttattcaactgtctatgaacattttgctgatttttgctatatttttcaatgcttctctacacattcttgtgcatgttttttaagg--aaaaatttgtgcaattttgtAGATTTATAA s panTro4.chr4 122709161 575 + 193495092 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tgtgaaatgacaatttttccagaaaagtagaaataacaaaaaatgactgaaaaggaaataaaaGAGGTAAATTGAAAATAAAAAAAATAAGTTATCAATTATATTtaacacatatactgaaaagtacctaaattataaaaaaaa-gtttacttaatttttacaaaatgaatatacccatgaaatacag-------tgactgaagagtatgaacaacctggaaa--------ccctcgctcttcctttcaatcaccaattctccaaga-ta-atttatattctggctttttatgccaaagagaagttttgcctgtttttgaactttacataaatggactcatacagtcagttcttatttttgcttgacttcttttgctcaacat--tttttgtgagactcttctctggtgttggctgtagtttggtttgcccatgctcattactctaaaatgttctattctatgaatacactacaatttatttattcaa----ctatgaacattttgctgatttttgctatatttttcaatgcttctctacacattcttgtgcata-tttttAAGG--AAAAATTTATGCGATTTTGTAGATTTATAA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79022368 573 - 115148730 tgtgaaatgacagtttttccggaaaagtagaaatgacaaaaaatgactgagaaggaaataaaaGAGGTAAATTGAAAAT-AAAAAAAT--GTTTTCAATTATATTtaacacatatactgaaaagtacctaaattataaaagaaatgcttacttaatttttacaacatgaatatacccatgaaatacag-------tgactgaagagtatgaacaacctggaaa--------acctcgctcttcctttcaatcaccaatcccccaaga-ta-atttatatcctggctttttatgccaaagttaagttttgcctgtttttgaactttacataaatggactcatacagtcagttctcgtttttgcccggtttcttttgctcaacat--tgtttgtgagactcatctctggtgttggctgtagtttggactgcccatgctcattactctaaaatgttctattctatgaatacactaaaatttatttattcaactgtctgtgaacattttgatgatttttgctatatttttcaatgcttctctacacattcttgtgcatgttttttaagg--aaaaatttgtgcaattttgtcgATTTATAA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114035773 572 + 184069350 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papAnu2.chr5 110939893 425 + 178775436 GCAAAATCAGTTCCAGCCTCTGTCCTCATGGGGTTTATGTTTGGTGACATAGActgatattttacaaataatcagggaaataaatGCAATGCC-----AAATCACAAATGGGACAAGTCCCACA-AAGTAGAGGAATTTAGATCcatgaggaaaaaatgaaaatattttctcagtcaagaaagtcataaaataattttcagagaaGTGGCAAGTGAACAGAGGTTT-GAAAGTTAAGCACatggagagaaacaggaaaagtaTTTCAGGTCTAGGGAAACAC---AAGTACAAAATCCTGTGAAAAGAGAAGATGACCGAAACCAGCAACTGTAAGAAAACCAGGGTAATTGACCTGGAGAAATCC-AGGGAACACAGGAACAAAC--AGCCTGAACAAGAAAttaaat--tttgccttttt--taaaaagtatatctttat i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67568838 425 + 135778131 gcaaaatcatttccagcctctgtcctcatggggtttatgtttgatgacatagactgatattttacaaataatcagggaaataaatgcaatgca-----aaatcacaaatgggacaagtcccaca-aagtagaggaatttagatccatgaggaaaaaatgaaaatattttctcagtcaagaaagtcataaaataattttcagagaagtggcaagtgaacagaagttt-gaaagttaagcacatggagagaaacaggaaaagtatttcaggtctagggaaacac---aagtacaaaatcctgtgaaaagagaagatgaccgaaaccagcaactgtaagaaaacctggataattgacctggagaaagcc-agggAACACAGGAACAAAC--AGCCTGAACAAGAAATTAAAT--TTTGCCTTTTT--AAAAAAGTATATCTTTAT i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117103914 433 - 190850796 GCAAAATCAGTTCCAGCCTCTGTCCTTGTAGGGATTATGTTTGATGATAGGTACTGATATATTACAAATAATCAGAGAAATAAATGCAATGCAAATGCAAATCACAAATGAGACAAGTCCCACA-AAGC-GAGGAATTTAGATCCATGAGGAAAAAATGAAAATATTTTCTTAGTCAAGAAAGTCAT-AAATAATTTTCAGAGAAGTGGCAAGTGAACTGAGGTTTAAAAAGTTAAGTGCATGGAGAAAAATGCGAAAAGTATTTCAGGTCTGGGGAATCCTGTGAAGTACAAAATCCTGTAAAGAGAGAAGATGATCAAAACCAGCAACTGTAAGAAAACCAGAGTT-TGGGCCTGGACAAAGCC-AGGGAACACAGGAACAAAC--AGGCTGAGCAAGAAATTAAATTGTTTGCCTTTTT--AAAAAAGTGTATCTTTAT i calJac3.chr3 I 123 C 0 s canFam3.chr19 34061025 409 - 53741614 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panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124849358 183 + 198332218 TCattagctgagtgtgggggcacacactttgtagtcctagctactcaggagcctgaagcaggaagatcacttcaagcctagcagttcaaggttgcagtgaggtatgatggtgccactctacttcaacctgggtgacagagtgaga-ccctgttt----aaaaaaaaa-aaTAGTAAATCTTTATTCTAT i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79024026 188 - 115148730 TCCttagctgggtgtgggggcacacactttgtagtcctagctactcaggagcctgaagcaggaagatcgcttcgagcctaggaattcaaggttgcagtgagctatggtggtgccactctacttcaacctgggtgacagagtgaga-ccctgtttcaaaaaaaaaaaacaaaaGTAAATCTTTATTCTAT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114037397 183 + 184069350 gccttagctgggtgtgggggcacacaccttatagtcctagctactcgggagcctgaagcaggaagattgcttcgagcctaggagttcaaggttgcagggagctatgatggtgccactctacttcaacctgggtgacagagtgaaa-ccccgtttc----aaaaaaaa-aaaagtaaatctttattctat i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119260854 181 + 189454096 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GTGCAACTAGAAGACACGGAATGTT-TTAAAAATGTGTGCTGTTGGGCAGGCCAACATGATGTGgtgcatgatcagatttgcatttagaaaagatcactttggctgaaaggttgagag--tttggaagcaagagacaa-ggtggaagcaggaagacagacttaggggcttatagcagtggtctatgaacgaggggcagtgggttatatttggg---tggtggtgatggtgatgaagatatgcaaaaaacgctcaagggagatttgtgggatgatgttggtaagcctgatgatgggttgttaaagtgggaaagaatggagaggggtcaaagagagtatctggatttctggcaatgatgactagttggatgctcacgccattcattggga-gaaaaat-ggtagaggaagatcctgaggTCTGGTTTAATCAGGTAGCCATGGGAAACAG-GAGGCTGTTCTAGGCAGAGGGAATGACAT------GACTAAGACAGTGAAGGGTCATATGTCTTTAGTGATGATT-AGCAAGTAACAAACTTGATCCAAGTGTAAGA-TTTGTACAGCCTAATGC-----TGAAATTTAAGGAGCAATGTTAAAGCACATCCCTCACTCCATTAAAAAGTACAAATTGGTTAGGAAATAGAGGAATCAGACAGA--GAACCACATTTACTGTATTAGTGCAAGGGCTGGGTAAAAGTGTTTGGCTTAGAAAAAGCAACCA---------AAGGGTCATCC------TAATAATTCACCTACAAATTGAATTTGCCCCTTGTTAAAACTGCAGCCTGTCTGGTGTATGGAAGCCGAGCCTGTTTCGTCAATTTACTGTCAGCAAGAAAACACAGGATATTTCATGCACCTTGCAGGTATGCAAATTCCAAGGTTTCCAGCTAGGTAAGTCATCTTGCATCTTCAGAAAGG----AGTGAGAGTATGAAGGAGAGCATCAGAGACTGCCACTCTCAAACTTTTTCTCTTACTTAATTCATATGCCCCCAGGAAACATGGGAGAGGAAGAGGGTATTTTCCTTACAAATGAT-ACTGGCAATGACGTCG----GCATGTGAATGTTGTAGAGCTAGAA 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i mm10.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr19 34067193 2002 - 53741614 I a score=210840.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 122269 81 + 158965 tccgtttt-tagggaatccagattaatgataattagacatacatttttaggctggaaataatctttcctcagaactttaaaa s panTro4.chr4 122716972 81 + 193495092 tccgtttt-cagggaatccagattaatgataattagacatacatttttaggctggaaataatctttcctcagaactttaaaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124855201 81 + 198332218 tccgtttt-tagggaatccagattaatgataattagacatacatttttaggctggaaataatctttcctcagaactttaaaa i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79029856 81 - 115148730 tccgtttt-tagggaatccagattaaTGATAATTAGACATACATTTTTAGGCTGGAAGTAATCTTTCCTCAGAACTTTAAAA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114043290 80 + 184069350 tctgtttt--agggaatccacattaatgacaATTAGACATACATTTTTATGCTGGAAATAATCTGTCCTCAGAACTTTAAAA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119266726 80 + 189454096 tctgtttt--agggaatccacattaatgacaATTAGACATACATTTTTATGCTGGAAATAATCTGTCCTCAGAACTTTAAAA i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110946198 80 + 178775436 TCTGTTTT--AGGGAATCCACATTAATGACAATTAGACATACATTTTTATGCTGGAAATAATCTGTCCTCAGAACTTGAAAA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67575134 80 + 135778131 tctgtttt--agggaatccagattaatgacaATTAGACATACATTTTAATGCTGGAAATAATCTGTCCTCAGAACTTTAAAA i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s mm10.chr6 83365377 81 - 149736546 -CCATTTTCTGGAGGAGTTAGGTTAATGATAGCTGGACACCAATCTTTATACTGAAAACAATCTTTTCTCAGAAAGTTTAAA i mm10.chr6 C 0 I 1 e canFam3.chr19 34067193 2002 - 53741614 I e calJac3.chr3 117110141 0 - 190850796 C a score=427895.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 122350 187 + 158965 tgattgcttcgccgggtgcggttgctcacacctgtaatcctagcactttgggaggctgaggcgggcagatcgcgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacgatgaaaccccgtctccactaaaaatacaaaaaattagccaggcgtggtggcgggcgcctgtagtcccagctactcggga s panTro4.chr4 122717053 187 + 193495092 tgattgcttcgctgggtgcggttgctcacacctgtaatcctagcactttgggtggctgaggcgggcagatcgcgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacgatgaaacccagtctccactaaaaatacaaaatattagccaggcatgatggcgggtgcctgtagtcccagctactcagga i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 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chlSab2.chr7 C 0 C 0 s mm10.chr6 83365459 2 - 149736546 CA i mm10.chr6 I 1 C 0 e canFam3.chr19 34067193 2002 - 53741614 I e calJac3.chr3 117110141 0 - 190850796 C e ponAbe2.chr4 124855469 1 + 198332218 I a score=154308.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 122693 57 + 158965 tccactgAGATGTGTAAGATTTAGAGAAGAAGGAAAAGCAAATACAAGATGTTTCTT s panTro4.chr4 122717398 57 + 193495092 tccactgAGATGTGTAAGATTTAGAGAAGAAGGAAAAGCAAATACAAGATGTTTCTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79030276 57 - 115148730 TACACTGAGATGTGTAAGATTTAGAGAAGAAGGAAAAGCAAATACAAGATGTTTCTT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114043712 57 + 184069350 TCCACTGAGATGTGTAAGATTTAGAGAAGAAGGAAAAGCAAATACAAGATGTTTCTT i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119267148 57 + 189454096 TCCACTGAGATGTGTAAGATTTAGAGAAGAAGGAAAAGCAAATACAAGATGTTTCTT i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110946620 57 + 178775436 TCCACTGAGATGTGTAAGATttagagaagaaggaaaagcaaatacAAGATGTTTCTT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67575555 57 + 135778131 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TAAGCAATTGTTTGGATGAGAAGTGACTACAAATTCAGCTGTCATTTACCTTCCTTTGTAATGTAGGTACAATGAGTCATGCATTTTACATTTTGTGGATTACTTCCATGATAGTCATTTCTGTGTATTAGGTACCAATTTAGAGTATC------------ATCTGGAAAAAT-AAACTATTACTGCAAAAATAAACTGTTATTGCACTCTATTCTTAAATTAAATACTCTTAGGAAAGAGAAGTATACAGGGAAAGAAGAGACTCAGATAGAAATAAAAGAATAGAGAAAATGGGACATGGATATACTGAGGGAAATGGTCCAACAGAAAGAATACCTGTGAGAAGTACTGAACTACATAGTTCGTATTACACATACCTCCAGGAAATTACAATTACTAATACAAGAGCAAATCATTAAAATAATCTTTTCTAATACTGAGAATTTTC--------TAAATCAGAAGCGGGATTGGTAGGGA-------------------AGGCCACAACTTGCTTATCTATTTCTCTTTTGATGACTTTTGGGGTATTAATGGAGGTGATTAATATAGGCTAATGGGCACTTTAGGCAATCATCATTGATTTTTCCCTTTGGTCTGAAGAAACTTATGCCTCCTCTTTTTTCTTTTT-----GGTGAAGGCTTTCCTTTTTTT-TCCTATTCAATTCTATGGTTTATTAAATGAGTAAATGCCTATTTCTAGATTCTCAAGGGTTTTCTAAAATTCATTTGATAAATATTCTGAAAGCTGAGAATTTTTCCAAGGAATCTTTGTTTAAAGATTTAAAg------------------tagccactagcaacatgtgactcctgagtatttgaaatggggccggacccaactgagatgcactgtcagtgtaaaatctacaccagattttgaagacttagcatgaaataaaattcaaaatagctcattaataacttttaaattgattatacatttaaataatattttgcatatatgttacatatgaatatattTACATATATAGAGATAATT 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i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119272455 938 + 189454096 AACTTGGAAATAACAAAAGAAAATCTGTA-TTTTTAAGTAGTCTTT-CCACTTAggattaagtaccttccaaagaaatgtgcctgcatggaatttggaaggtagacgtgagatggaggctcttctttctgTGATAGTGACAGTTGATGGACAGGTTCTCACAGATGCCAGTTTTTCAGAGGCCAGACCAGGCTGCACGTGCCACTCTCTGGTGAAATGGGTAGC--TGTGATAACAGTGCCAGTTTCCAGATGTTTCCTGACCTCAGAATGTTTCAAAAGTAATGAAGACCTAAACAGTTTTC---TATTTGGATAGCAGTTGCATGGCACGGGCTTGCCGCCTGGTGGCAGTCCCATGACATTCACTCTTTGATTAATTAGAGTAAAA-TTTAAGTGCCCAATTCATTTTTT---------GTGTGAAATACCTAGGGTGATTTCTAGTTCCTGCACTGAAACTCAGTCCTATAAaatagactcacaaggattgcaacctggagttattatctcaccaggttg---ggcttgaaggtaataataatctcattgccagtagaaaaagaaaca----tggtcaactgaaaaaatagaagaactatctctta-atgattacctgaggctgcctggaagaaatgggatgtttaaggca----------------------------------------------------------------agagact------------------------------------------------------------------------------------ggcagataatgtagctgctgtcataaactactgtgatgggactaaggaacacctacctgcactgtgagtaagttggccacttccaaaactaatgaggagc-taaagaaagataatgaagtgctccagaatttaagttttcatctcatggtatgatctgaggacctgagaccttctatggccactcgaagaatctcttatcttgtatacccagagttgatataattaaaaacatgacagagtctaatcttgcaacttactttactcccacacaggttgaattcacagcttcaccagatctctt i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110951934 935 + 178775436 AACTtggaaataacaaaagaaaatctgta-tttttaagtagTCTTT-CCACTTAGGATTAAGTACCTTCCAAAGAAATGTGCCTGCATGGAATTTGGAAGGTAGACGTGAGATGGAGGTTCTTCTTTCTGTGATAGTGACAGTTGATGGACAGGTTCTCACAGATGCCAGTTTTTCAGAGGCCAGACCAGGCTGCACGTGCTACTCTCTGGTGAAATGGGTAGC--TGTGATAACAGTGCCAGTTTCCAGATGTTTCCTGACCTCAGAATGTTTCAAAAGTAATGAAGACCTAAACAGTTTTC---TATTTGGATAGCAGTTGCATGGCACGGGCTTGCCGCCTGGTGGCAGTCCCATGACATTCACTCTTTCATTAATTAGAGTAAAA-TTTAAGTGCCCAATTCATTTTTT---------GTGTGAAATACCTAGGGTGATTTCTAGGTCCTGCACTGAAACTTAGTCCTATAAAATAGACTCACAAGGATTGCAACCTGGAGTTATTATCTCACCAGGTTG---GGCTTGAAGGTAATAATAATCTCATTGCcagtagaaaaagaaaca----tgGTCAACTGAAAAAAT---AGAACTATCTCTTA-ATGATTACCTGAGGCTGCCTGGAAGAAATGGGATGTTTAAGGCA----------------------------------------------------------------AGAGACT------------------------------------------------------------------------------------GGCAGATAATGTAGCTGCTGTCATAAACTACTGTGATGGGACTAAGGAACACCTACCTGCACTGTGAGTAAGTTGGCCACTTCCAAAACTAATGAGGAGC-TAAAGAAAGATAATGAAGTGCTCCAGAATTTAAGTTTTCATCTCATGGTATGATCTGAGGACCTGAGACCTTCTATGGCCACTCGAAGAATCTCTTATCTTGTATACCCAGAGTTGATATAATTAAAAACATGACAGAGTCTAATCTTGCAACTTACTTTACTCCCACACAGGTTGAATTCACAGCTTCACCAGATCTCTT 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ATGTGAAACTTGGGGAATTAATTAGGATAAAGTGTGACTTTAAGAATGAGATAGGGACAATTGGTAGATTTGGATGACTCTGTGTTCTAGAAATGATCAAGTCCCAATGAGCTTCTTTGTCATCAGTCGTCCTTTCTCACAAATGAAGCTAGTACTGTTTCACATGAAGATCCTGCAAGGTCTTTACC---------------TGAGAGAGTCACCTACAAAGTGATGTTAATTCTCTTCATGTGCACCTCTCATTGCCATCAGACCCTTATTAGAGTCAGAATCCAACGTATCCCAGAAGAACAATTACACAGTTGGAGACATAAGAAAGTAGCTTCACACCAAAAGGAATTTTAAGGTCTTGCTAATTTACTTTGAtagaaatttgagaaatatatatGTGAGTGAATTCTAAGAGAACTgatgaagaaggaagaaacttACTAGTGTGAGACTAATGTATGTATATGGGTATACTTACCAAAGGTGTGGATTTAGTTTGTGAGCTTGAGCATCTGAGACTGGCATTGAAAATCTAATTGATTGCATAACAGAAATATTTATGATGGACTTCATTAAATTAAATGGGGGTGTTGGACTTGTCTGGTATAATAGAAAGTGTAGTAGCCCCTATTTGTTGAC-AAATATTTCATCTTCTCCTGGGAGCACTGCAGAATTGCACTTCCAGGCTCCCTTTTTAGTTA--------------------------------------------GTGGGGGGTATGTGGCTATTTCAGTTCAATGAGCTGTAATAGTACCTGACACACATTATTAAATGCCAGGGCATTTAATTGTTTACACTGCACTCATAGAGCATTGCTTCCCTCTGATAC--AGTGACAGGCAATATCCAGGATAGTGGCTATTTCATCAGCTTGGTTTATTGAAAGACTCCAGTAGTAGAAACCCCTTCCTGACCTGCAGTGGACAAGTGGTGTGAGTGAAACAGAAACTTATAATGTTTTTAACTACTGGGACTATGGAATGGTTATTGTATAATGACCTATTGTGACTTACACCTAGAGGAAGTAAAACATTCAAAGTTTATCATATGTTATCCATAAATCCACCCACATCACTCTACACCCCAGGAAGTTTCCAAAAATACTTCATCACCAAagcattaagaaataaatatattggtGAGAGAGGCATGAAATACCTTGGGAAG-TCTATTGTGGCTGCCCTCTGAAAGCTGGAGATGACAGTGGAAGACCTCATGATTGAAGTAGGCTGCCTAATTTCAATGGGATGATGGAATTCCAGGGATTCGGAATTATATTTCAGGACTTAAGCACCAGGTGCAAAATGCACATAGATGCCATAATGAGCAATAGGGCCAAAGCATTAATTGGAATGATTTGACCCTCGAGAATCACAGTCTCCCTAGGACTCACATACATCTACATAAGCAGCCTACTGAACcttatctaatatatatttttcaaaaatgaaactcTAAATGTGGGAAATAGAAACCTGAGTAAGTCGCAATAATGAAGAATCATAGTTCCTCATCCAATTCCCTGACCTGAGTTTGTTCCCAGACTCAAAATCCCTAAAAATATTAGAGATGTTGGGTTATATAAAGAAAAGGCACTGCAATACAGTC i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67581849 1584 + 135778131 atgtgaaacttggggaattaattaggataaagtgtgactttaagaatgagatagggacaattggtagatttggatgactctgtgttctagaaatgatcaagtcccaatgagcttctttgtcatcagtagtcctttctcacaaatgaagctagtactgtttcacatgaagatcctgcaaggtctttacc---------------tgagagagtcacctacaaagtgatgttaattctcttcatgtgcacctctcattgccatcagacccttattagagtcagaatccaacatatcccagaagaacaattacacagttggagacataagaaagtagcttcacaccaaaaggaattttaaggtcttgctaatttactttgatagaaatttgagaaatatatatgtgagtgaattctaagagaactgatgaagaaggaagaaacttactagtgtgagactaatgtatgtatatgggtatacttaccaaaggtgtggatttagtttgtgagcttgagcatctgagactggcattgaaaatctaattgattgcataacagaaatatttatgatggacttcattaaattaaatgggggtgttggacttgtctggtataATAGAAAGtgtagtagcccctatttgttgac-aaatatttcatcttctcctgggagcactgcagaattgcacttccaggctccctttttagtta--------------------------------------------gtggggggtatgtggctatttcagttcaatgagctataatagtacctgacacacattattaaatgccagggcatttaattgtttacattgcactcacagagcattgcttccctctgatac--agtgacaggcaatatccaggattgtggctgtttcatcagtttggtttactgaaagactccagtagtagaaaccccttcctgacctgcagtggacaagtggtgtgagtgaaacagaaacttataatgtttttaactactgggactatggaatggttattgtataataacctaTTGTGACTTACACCTAGAGGAAGTAAAACATTCAGAGTTTATCATATGTTATCCATAAATCcacccacatcactctacaccccaggaagtttccaaaaatacttcatcaccaaagcattaagaaataaatatattggtgagagaggcatgaaatcccttgggaag-tctcttgtagctgccctctgaaagctggagatgacagtggaagacctcatgattgaagtaggctgcctaatttcaatgggatgatggaattccagggatacagaattatatttcaggacttaagcaccaggtgcaaaatgcacatacatgccataatgagcagtagggccaaa-cattaattggaatgatttgaccctcgagaatcacagtctccctaggactcacatacatctacataagcagcctactgaatcttatctaatatata-tttccaaaaatgaaacgctaaatgtgggaaatagaaacctgagtaagtcgcaataatgaagaatcatagttcctcatccaattccctgacctgagtttgttcccagactcaaaatccctaaaAATATTAGAGATGTTGGGTTATATAAAGAAAAGGCACTGCAATACAGTC 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atgtgaaacttggggcattaattagcataaagtgtgaccttaagaatgagataggtacaattggtgtatttggatgaatctgttttctagaaatgatctagtcccaatgagcttcgttgccatctgtaattctttctcacagatgaagctagttctgttttacttgaagatccttcaaggtctttacctctcacctttgtaggtgagatagtcgcctacca---gatgttaattctctttatgtgcacctctcattgccatcagacccacattagggtcagaatccaacatgtcccagaagaatgattaccaagttggaggcctaagaaagtagcctcacactaaaaagaattttaaggtcttgctcatttac-----------------------atATGTGA---------AAGAAAAGTGATGAAGAAGGAAGAAACTTACTAATGTGGGACTAATGGATGTATATGTGTATACTTGCCAAAGGTGTGGTTTCAATGTGTGAGCTTGAGCATCTGAGATTGGCATTAAAAATCTGATTGATTGCATAATAGAAATATTTATGATGGCCTTCATTAAATCAAAGTGGGGTGCTGAACTTATCTAGCATAATAGAAAGtgtggtagccattgtttgttgataaaatat------ttcttctgggagcactgcagaattgcacttccaggctccctttttagtta--------------------------------------------gtg--gggtgtgtgcatacttcagttcaatgtgctatgatagtatttgacacacattattaaatgccaggacattt-atcgttaacactgcactcaccaggcattgcttccctctgacactgtgtgacaggccatatccaggatagtggctgtttcatcagcttggtttattgaacgactccagtagtggaaacacctttctcatgtgcagtggacaagtggtgtgagcaaaacacaaacctataatgtttaaaactaccgagaGTACAGAATGGTTATTGTATAATAATCTATTATGACTCACACCTAGAGGAAGTAAAACATTCAGAGTTTATCATATGTTATCCATAAATtcacccacatcactctacaccccaggaagcttccaaaaatacgtcttcatcaaagcactagggaataaatatattggtgagagaagcatgaatttccttgggaaggtctattgtggctgccctctgaaagctggagatgacagtggaagacctcatgattgaaatgggctgtctaatttcaataggatgatagaattccagagatgtggaattacatttcaggacttaagcaccaggtgcaaaatgcatatggataccataatgagcaataaggccaaagcattaattggaatgatttgacccttgggaatcacagtctccctgggactcacatacatctacatgagcagcctactgattattatctgatatata-tttccaaaaatgaaactctaaatgtgggaaacaaaaccc--agtaagtcacaataatgaaggatcatagttcttcatccaattcactgacctgagttttttcccagattcaaagtccctaaaAATATTAGAGATGATGGGTTGTATAAAAGAAAGTCACTGCAATGCAGTC 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mm10.chr6 I 1270 C 0 s canFam3.chr19 34081025 195 - 53741614 aatattcaaatagttttattttattttttaaattttatCTGACTTCACCGAGAAGATTGGCTTTGGAAAGTGAATCTTAGATTTGTCAGCAATATATGCTAGAATT----AAAGCTCAGCAGTTGTAGTAAGTGTATTTTCTTATGGAGTTAGAC-ACTTCCACTTTTGAATAATTGTTTTAGGTTACTTGAtgtgatgg i canFam3.chr19 C 0 I 502 a score=68595.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 132783 20 + 158965 TTATTTTATATGAATAAAGA s panTro4.chr4 122727491 20 + 193495092 TTATTTTATATGAATGAAGA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124864950 20 + 198332218 TTATTTTATATGAATGAAGA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79046087 20 - 115148730 TTATTTTACATGACTGAAGA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114053062 20 + 184069350 TTATTTTATATGACTGAAGA i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 119276496 20 + 189454096 TTATTTTATATGACTGAAGA i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110955971 20 + 178775436 ttattttatatGACTGAAGA i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67584954 20 + 135778131 TTATTTTATATGACTGAAGA i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117122535 20 - 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i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79046120 434 - 115148730 TCTGCACTTAGTGATTGGAAATCAGGAAGGTACATAAACACATTCTCTAGGATAGGG-----AAAGA------ATTTTTAATCTGCTTTAGACTGAATTATGGCAGGTAAAATTAGTAAAATACTCTCTAGGTCTGGAGTATTGGGTGTGTTCCTGTCCGCTGGTCACAGTAGGT----TTGAATACGTGAAGGTCAGTGGTTAACAACAAAGATCAACAGAGAACATGTGAAAGATTGG----AGGATAGC-ATATGAGAAACTGGATGATACAATAGGGCTTGAACAGACTCAGCAAGTATTACAAATTTTAGCAACTAAGGCACACTGATACCTCCATTTTCAATAAACAGTCTTGGTGACTATAAAG------At-atgtatgctattatttatttgtttattatgttgtttatgtatgtaATTTACATTTGTAACAAGATCATTGAATC------TGCACAT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114053095 439 + 184069350 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110956004 440 + 178775436 CCTGAACTTAGTGATTGCAAATCAGGAATGTACATAAACCTA-TCTCTAGGATAGGG-----AAAGA------ATTTTTAATCTACTTTAGACCGAATTATGGAAGGTACGGTTAGTAAAATACTCTCTAGGTCTGGAGTATTGGGTGTGTTCCTGTCCACTTGTCACAGTAGGT----TTGAATACATGAAGGTCAGTGGTTAACAACAAAGATCAACAGAGAACATGTGAAAGATTGG----AGGATAGCAATATGAGAAACTGGATGATAAAATAGGGCTTGAACAGACTCAGCAAGTATTACAAATTTTAGCAACTAAGGCACATTGATACCTCCATTTTCAATAAACAAGCTTCGTGACtataaagatatttat-atttatactattatttatttgtttattatgttgtttatgtatgtaatttacatttgtAACAAGATCATTGAATC------TGCACAT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67584987 436 + 135778131 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i calJac3.chr3 M 243 C 0 s mm10.chr6 83372012 325 - 149736546 TCTACAAATTGTTATTTAAAATCAGG-ATGTGCATGAAAATGTGTTTTAGGACAGGGAGGCAAAGGT------AGTTTTACTTTTCCTT-GACTGAGTCATGGAGGGTACAATAAGATGAACTCTCTATAGGTCCTAGCGCTTGGG-----ACCTGGATGTTGCCCAGAGAGGAT----TCAAA-----------------------------------------------AAAAGTT------------------------------------------GTTTGTGCAGATCCAGAAGCCAGCA-----TTTAGCATCAAAGGGACAGTGATATATCTTGCTGAGATGAGCAAGCTTGGTGAGTATAGAG------AG-CCTTCTGTTACTGTTTA-----------TGTAGCTCACATAC-------CCGTCTATGTTAAGAGCATGAAGTC------TGCACAG i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr19 34081751 438 - 53741614 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papAnu2.chr5 110956603 413 + 178775436 GGAGTATCTCccttttttaatgaaatgtaagCACAAAAGTTTGAGATGGTCTGGGACAAAGGTAACAGTCAATGGGAGAGTATTCTAGACTTGTTTTCCATGTTGAGAACAagtcctattaaaaaaaaaa-------------aaaaaaggagaaagagcttA-GTTTCCTTAAGCTTTTCCATGCAAACC----CAAACCCAGTATGACATGAAAGCCAAGCAATCTCCTGTTGACTTATTG--ACGGGAAGCATTTCAGGACCAGTTACCCCGTTTTCAGACTGAGTCATCTGCT--CTGTAGTAATCCATGGTATTAGCTCCACATGTGTACACAGGATGCTGCCACTGC-------GTCATTGTGAGGACACAGATGGCAGCACCAGTCATATACTTCCTGGGGGCA-CTTCAAAATGTCAAAGACAATTTCGATTGCC i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr7 67585583 426 + 135778131 GGAGTATCTCCCTTTTTTAATGAAATATAAGCACAAAAGTTTGAGATGGTCTGGGACAAAGGTAACAGTCCATGGGAGAGTCTTCTAGACTTGTTTTCCATGTTGAGAACAAGTCCTATTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTGGAGAAAAAGCTTA-GTTTCCTTAAGCTTTTCCATGCAAACC----CAAACCCAGTATGACATGAAAGCCAAGCAATCTTCTGTTGACTTATTG--ACGGGAAGCATTTCAGGACCAGTTACTCGGTTTTCAGACTGAGTCATCTGCT--CTGTAGTAATCCATAGTATTAGCTCCACATGTGTACACAGGATGCTGCCACTGC-------ATCATTGTGAGGACACAGATGGCAGCACCAGTCATATACTTCCTGGGGGCA-CTTCAAAATGTCAAAGACAATTTCGATTGCC i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117123401 381 - 190850796 GGAGCATCTGCCTTTTTAAATAAAATGTAAGAAGGAAAGTTTGAGATGGTCTGGGACAAAGGTAACAGTCAGT-GGAGAGTCTTCTAGACTTGTTTTCTACATTCAGAACAAGTTCTACAAGAAAGTAGA-------------------------GGAGCTTA-CTTTCTTTAAGCTTTTCTATGCAAACC----CAAACCTAGCAAGACGTGAAAGCCAAACAATCTCCAGTGGACTTAATG--ATGGGAAGCATTTCAGGACCA--------GATTTCAAACTGAATCATCCACT--CTGTAGTAATCCA-----------CTACATGCGTACACAGGATACTGCCACTGC-------ATCACTGTGAGGACACAGATGGCAGCACCAGTCACATACCTCCTGGGGGCT-CTCCAAAATGTCATAGACAATTTCAATTGTC i calJac3.chr3 C 0 C 0 s mm10.chr6 83372519 310 - 149736546 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GAtttgtc--------ttttttttttttttttttgaaggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggtgcgatcttggctcactgcttcctccacccc-ccgggttgaagcagttctcctgcttcagcctcccaagtagctgggattacgggcatgcaccaccatgcctggctaatttttgcatttttagtagagacagcgtttcactgtgttggtcaggctggtctcgaactcctgacctcatgatctacctgcttcggcctcccaaagtg----gattacaggcatgagccactgtgtccggcc i chlSab2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr6 83372829 350 - 149736546 I e canFam3.chr19 34083340 160 - 53741614 I e calJac3.chr3 117123788 7 - 190850796 I a score=132033.000000 s hg38.chr4_KI270788v1_alt 134133 44 + 158965 CATGGTTGTTTTTAGTAGTTGCTAATAGGTTTCTGATAGACTGA s panTro4.chr4 122728842 44 + 193495092 CATGGTTGTTTTTAGTAGTTGCTAATAGGTTTCTGATAGACTGA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 124866294 44 + 198332218 CATGGTTGTTTTTAGTAGTTGCTAATAGGTTTCTGATAGATTGA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 79047391 44 - 115148730 CATGGTTGTTTTTAGTAGTTGCTAATAGGTTTCTGATAGACTGA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s rheMac3.chr5 114054421 44 + 184069350 CATGGTTGTTTTTAGTAGTTGCTAATAGATTTCTGATAGACTGA i rheMac3.chr5 C 0 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 110966397 1970 + 178775436 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i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 117132733 1929 - 190850796 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