##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=411465.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 0 781 + 82728 GAAttccttaaattactaacttgctagaagattttttaatgaatcattgttgaatttcattaagttttttctgcaATTTCTCCCtttttttttttttttttttttttgaaatggagtttcactctttctcacaggctggaatgcaattgcgccacctcggctcactgcaacctctgcctccagggttcaagtaattatcctgcctcagcctcctgagtagctgggattataggtgcctgccactgcacccaatttttgtatttttgtagagacgcggtttcgccacgttggccaggctgatctcgaacccctgactttgtgatccacccacctcggtctgccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcccggccTCTCCCTTTTTGTTAATTATATtcattcattttgtttatgctcagtttgtactagatttgggcagtgagagccctgtcaaactattttctgagtttttgtttgttcgtatcgttttCAAAAACCTATTTAcatcatttttagagcatttgctttctttccaacgtaatgttttccacttattatgtacctgatgtctaggattcatgtgcctcagtcttggattcacctattccttcaagaagccttgggtcccttgacccaaataatttggacccaaggaatttggaatttggagagcaagctatggaccctctgttgcacctattgcttaaaggcgtcaatctgcctggctttccctgtggacagacctaggggtatggaggtatgcataATCACAT s panTro4.chr5 169760287 773 - 182651097 gaattccttaaattactaacttgctagaagattttttaatgaatcattgttgaatttcattaagttttttctgcaATTTCTCCCtttttttttttttttt-------gaaacggagtttcactctttctcacaggctggaatgcaattgcgccacctcggctcactgcaacctctgcctccagggttcaagtaattatcctgcctcagcctcctgagtagctgggattataggtgcccaccactgcacctaatttttgtatttttgtagagacgcggtttcgccacgttggccaggctgatctcgaactcctgactttgtgatccacccacctcggtctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccgtgcccggccTCTCCCTTTTTGTTAATTATATtcattcattttgtttatgctcagttggtactagatttgggcagtgagagccctgtcaaactattttctgagtttttgtttgttcgtatcgttttcaaaaacctatttacatcatttttagagcatttgctttctttccaacgtaatgttttacacttattatgtacctgatgtctaggattcatgtgcctcagtcttggattcacctattccttcaagaagccttgggtcccttgacccaaataatttggacccaaggaatttggaatttggagagcaagctatggaccctctgt-gcacctattgcttaaaggtgtcaatctgcctggctttccctgtggacagacctaggggtatggaggtatgcataatcacat i panTro4.chr5 N 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170430813 772 - 183952662 gaattccttaaattactaacttgctaaaagattttttaatcaatcaatgttgaatttcattaagttttttctgcaATTTCTCCCttttttttttttttt--------gaaacagagtttcactctttctcacaggctggaatgcaattgcgccatctcggctcactgcaacctttgcctccacggttcaagtaattatcctgcctcagcctcctgagtagctgggattataggtgcccgccactgcacccaatttttgtatttttgtagagacgcggtttcgccacgttggccaggctgatcttgaactcctgaccttgtgatccacccacctcagtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgtgcctggccTCTCCCTTTTTGTTAATTATATtcattcattttgtttatgctcagtttgtactagatttgggcagtgagagccctgtcaaactattttctgagtttttgtttgttcgtatcgttttCAAAAACCTATTTACCtcatttttagagcatttactttctttccaacataatgttttacactttttatgtacctgatgtctaggattcatgtgcctcagtcttggattcacctattccttcaagaagccttgggtcccttgacccaaataatttggacccaaggaatttggaatttctagagcaagctatggaccctctgt-gcacctattgcttaaaggtgtcaatttgcctggctttccctgtggacagacctaggggtatggaggtatgcataatcacat i ponAbe2.chr5 N 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109150358 769 - 121039945 gaattccttaaattactaacttgctaaaagattttttaatgaatcaatgttgaatttcattaagttttttctgcaATTTCTCCCttttttttttttt----------gaaacggagtttcactctttctcacaggctggaatgcaactgtgccatctcggctcactgcaacctctgcctccagagttcaagtaattatcctgcctcagcctcctgagtagctgggattataggtgcccgccactgcatccaatttttgtatttttgtagagacgcagtttcgccatgttggccaggctggtctcgaactcttgaccttgtgatccacccacctaggtctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgtgcccggccTCTCCCTTTTTGTTAATTATATtcattcattttgtttatgctcagtttgtactaggtttgggcagtgagagccctgtcaaactattttctgagtttttgtttgttcatattgttttcaaaaacctatttacatcatttttagagcatttgctttctttccaacataatgttttacacttattatgtacctgatgtctaggattcatgtgcctcagtcttggattcacctattccttcaagaagccttgggtcccttgacccaaataatttggacccaaggaatttggaatttggagagcaagctatggatcctctgt-gcacctattgcttaaaggtgtcaatttgcctgggtttccctgtggacagacct-ggggtatggaggtatgcataatcacat i nomLeu3.chr6 N 0 C 0 a score=34626.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 781 49 + 82728 AGAAATGAAAATACACAGAGACGAAGATGTATAACTATTATGTATTTTA s panTro4.chr5 169761060 49 - 182651097 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tatgtatgtattttatatgcataaatattTCTGCATCTTTAT----ATACAATTATTTAAATACCTAACAGTTATTACTGATACATTTGTAAAGATAATACCTACTGCAGTTCTAACAGAACATCTGAGAGTACTTTCCAGGCTTTGGACTTTTCATGTGTAAACGCTTTCTCTGAAAGGACTGTGGGAAAatagatagat i panTro4.chr5 C 0 I 2546 s ponAbe2.chr5 170431620 201 - 183952662 tatgtatgtattttatatgcataaatattTCTGCATCTTTATTTATATACAATTATTTAAATACCTAACAGTTATTACTGATACATTTGTAAAGATAATACCTACTGCAGTTCTAACAGAACACCTGAGAGTACTTTCTAGTCTTTGGACTTTTCATGTGTAAACCCTTTCTCTGAAAGGACTGTGGGAaaatagatagat i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109151162 201 - 121039945 tatgtatgtattttatatGCATAAATATTTCTGCATCTTTATTTATATACAATTATTTAAATACCTAACAGTTATTACTGATACGTTTGTAAAGATAATACCTACTGCAGTTCTAACAGAACACCTGAGAGTACTTTCCGGCCTTTGGACTTTTCATGTGTAAACCCTTTCTCTGAAAGGACTGTGGGAAAACACatagat i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168596619 199 - 181584905 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AGTACATAGGT---ggat----agagaaagagaggagattGCTTGATTGATAGATAATCATCTTAAATCACATAGCTTGTTTGCTCACTCCAATGGAGCCTTCAATTACTCAGATACCTCCTTTATCTGAGATAACTGTGCTGCCTCCCGCCCCCACTCTGTGTCCTAGGCACCCAGGCATGCTAATGCCTATACATGGCACCCTCACCTACTCACTGCTCTGCCTCCTTGAACA-------TCTGGCAGGTAAgatgaagagaaagggaagatgaGCATGGGTAGGGGAAGAGGAAAATGGTAAGGAAATgatgataaataaataagccaaaaattggta-tttttattaCTAATACTACTCTTATAGTAATGACTTTTTCTAGCACCATAGTTtgaatttgcttttattattccAATGTTTTTAAATGGAAGAT----TAATTggctttgtacttttatttttttcttacctatttgtccaaaataaatttgttt------tttatatatatgtaagattCTATGTATTACGGCTATGAATTTCTCTACAAGCATAACTTAACAGATTTTAATATGCCCTACACATTTTAATATATggttgtattttcacttttatagGCAAACCTTGGAAATATTGCAGGTTTAGTTCCAGACTACCATGACAAAGCAAATATTGAAATAAAGccagtcacacaaattttttttatttctccattcatATGAAAGGTAAGTTTAGACTACGCTGTAGTCTA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78710523 728 - 91010382 agtagataggt---ggatagagagagaaagagaggggattgcttgatt----gataATCATCTTAAATCAGGTAACTTGTTTGTTCACTCCAATGGAGCCTCCAATTACTCAGATACCTCCTTTGTCTGAGATAACTGTGCTGCCTCCCGCCCCCACTCTGTGTCCTAGGCACCCAGGCATGCTAATGCCTATACATGGCACCCTCACCTACTCACTGCTCTGCCGCCTTGAACA-------TCTGGCAGGTAAGATGaagagaaagggaagatgagcatgggtaggggaagaggaaaacggtaaggaaaTGATGATAAATAAATAAGCCAAAAattgtta-tttttattaataatattactcttatAGTAATGACTTTTTCTAGCACCATAGTTTGAATTTGCTTTTATTATTCCAATGTTTTTAAATGGAAGATTAGATAATTGGATTTGTACTTTTATTTTTTTCTTACCTATTTGTCCAAAATAAATTTGTTT----------TATATATATTAGATTCTATATATTACGGCTATGAATTTCTCTACAAGCATAACTTAACAGATTTTAATATATCCTACACATTTTAATATATGGTTGTATTTTCACTTTTATaggcaaatcttggaaatattgcaggtttagttccagactaccatgacaaagc-aatattgaaataaagccggtcacacaaattttttttatttctccactcatatgaaaggtaagtttagattatactgtagtcta i chlSab2.chr4 C 0 C 0 a score=233380.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 1769 196 + 82728 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i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168597771 1131 - 181584905 tctttttttttggggggatggagtttcactctgtcacccacgctggagtgcagtgttgcaatcttggctcactgcaactgtcacctcctgggttcaagggattcttgtgcctcaggctctggagtagctgggactataggtgcacaccaccatgcccggctaattttttgaatttttagtagatagggagtttca--------------------------------------------------------ccatgttggccaggctggtctcaaacccctgatctcaggtgatcctcctgcctcggcctcccaaaattctgtgattacaggcatgagccatggtacccggcctgttgtgtctatttcttaaaataagatgacaataaaacttgccacattgactgactcttttcatgaaaggtttctctgtagcatatattgttgtttgatagcattttactcacagtggaacctcatttaaagttggagtcgatactctcaaatcctgctggtttatcaaataaggttatgtaatattccaattcatttgttgtcatttcaaaaacatacaaagcatcttcagcaggagtggactttacctcagaaaatc----tcttttctcatccatgagaaacaactcgtcatccatacaatttttatcatgagactgaagcaattcagttacatccttaggcttcccttttaattctagttctcttgc--tattttcaccacatctg-aagttattttctctactaaagtcttaaacccctcaaaatcattcatgagggttggagtgaacttttcgcaaactcctgttaatgttgaaatttaacctcccatgaatcatgaatgctcttagtgacatctagaatggtgaatcttttacagaagattttcaatttgctttgcacagatccatcagaagaatcactatacatagcacctatagccttacaaaatgtatatcttaaataatgagatttgaaagttgaaatggcaccttgatccatggtctgcggaatggatgttgtgttagcagacatgaaaatacattattctcttcgtacatctccatcagaactcttggatgactagatacgttttcagtgagaagtaatatagcgaaagaaatgtttt-----tctgagcagtagctctcaacagagggcttgaaatattcagtaagcattgc i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161818843 1187 - 174439528 ttttttttttttttgagatggagtttcactctgtcacccacgctggagtgcagtgtcacaatcttggctcactgcaactgtcacctcctgggttcaagggattcttgtgcctcaggctctggagtagctgggactacaggtgcacaccaccatgcccggctaattttttgaatttttagtagataccgagtttcaccatgttggccaggctggtctcaaacccctgatctcaggtgatcctcctgcctgggccatgttggccaggctggtctcaaacccctgatctcaggtgatcctcctgcctcggcctcccaaaattctgtgattacaggcatgagccatggtaccCGGCCTGTTGTgtctatttcttaaaataagatgacAATAAAACTTGCCACATTGACTGACTCTTTTCATGAAAGGTTTCTCTGTAGCATATATtgttgtttgatagcattttactcacagtgGAACCTCATTTAAAGTTGGAGTCGATACTCTCAAATCCTGCTGGTTTATCAAATAAGGTTATGTAATATTCCAAttcatttgttgtcatttcaaaaacATACAAAGCATCTTCAGCAGGAGTGGACTTTACCTCAGAAAATC----TCTTTTCTCATCCATGAGAAACAACTCGTCATCCATACAATTTTTATCATGAGACTgaagcaattcagtcacatcctTAGGCTTCCcttttaattctagttctcttgc--tattttcaccacATCTG-AAGTTATTTTCTCTACTAAAGTCTTAAACCCCTCAAAATCATTCATGAGGGTAGGAGTGAACTTTTcgcaaactcctgttaatgttgaaatttaacctcccatgaatcatgaatgttcttagtgacatctagaatggtgaatcttttacagaagattttcaatttgctttgcacagatccatcagaagaatcactataCATAGCacctatagccttacaaaatgtatatcTTAAATAATGAGATTTGAAAGTTGAAATGGCACCTTGATCCATGATCTGcggaatggatgttgtgttagcagacatgaaaatacattattctcttcgtacatctccatcagaactCTTGGATGACTAGGTGCGTTTTCAATGAGAAGTAATATAGCgaaagaaatgtttt-----tctgagCAGTAGCTCTCAACAgagggcttaaaatattcagtaagcatTGC 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ttttttttttttttgagatggaatttcactctgtcacccatgctggagtgcagtgtcgcaatcttggctcactgcaactgtcacctcctgggttcaagggattctcatgcctcaggctctggagtagctgggactacaggtgcacaccaccatgcccggctaattttttgaatttttagtagatagggagattca--------------------------------------------------------ccatgttggccaggctggtctggaacccctgatctcaggtgatcctcccgcctcggcctcccaaaattctgtgattacaggcatgagccacggcacccggcctgttgtgtctatttcttaaaataaaatgacaataaaacttgccacattgactgactcttttcatgaaaagtttctctgtagcatatattgttgtttgatagcatttaactcacagtggaacttcatttaaaattggagtcaatactctcaaatcctgctggtttatcaaataaggttatgtaatattccaattcatttgttgtcatttcaaaaacatacaaagcatcttcagcaggagtggactttacctcagaaaatc----tcttttctcatccatgagaaacaactcgtcatccgtacaatttttatcatgagactgaagcaattcagtcacatccttaggctccccttttaattccagttctcttgc--tatttttaccacatctg-aaattattttctctactaaagtcttaaacccctcaaaatcattcatgagggttggagtgaacttttcgcaaattcctgttaatgttgaaatttaacctcccatgaatcatgaatgttcttagtgacatctagaatggtgaatcttttacagaagattttcaatttgctttgcacagatccatcagaagaatcactatacattgcacctatagccttacaaaatgtatatcttaaataacgagatttgaaagttgaaatggcaccttgatccatggtctgcggaatggatgttgtgttagcagacatgaaaatacattattctcttcgtacatctccatcagaactcttggataactacgtgcgttttcaatgagaagtaatatagcaaaagaaatgtttt-----tctgagcagtagctctcaacagagggcctaaaatattcagtaagcattgc 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TGTacagatgtcttctcattcagactttgttgttccatttataaatcagaggcagataa---ctagtatacttgttaagggtcctagaattttcagaatgataaatgagatttggcttcaacttaaagtcaccagctgcattagcccctaacaagagaattagcctgtcctttgaagccaggcattcatttcttctctcaagctatgaaatttctagatggtatcttctcccaatagaaggctgttgtgtctatatt i ponAbe2.chr5 M 818 C 0 s nomLeu3.chr6 109153442 254 - 121039945 tgtacagatgtcctctcattcagactttgttgttccatttataaatcacaggcagataa---ctagcatacttgttaagggtcctagaattttcagaatgataaatgagatttggcttcaacttaaagtcaccagctgcattagcccctaacaagagaattagcctgtcctttgaagccaggcattcatttcttctctcaagctatgaaatttctagatggtatcttctcccaatagaaggctgttgtgtctacatt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168598902 257 - 181584905 tgtacagatgtactctcattcagactttgttgttccatttataaatcacaggcagaggagatctagcatactcgttaagggtcctagaattttcagaatgataaatgagatctggcttcaacttaaagtcaccagctgcattagcccctaacaagagaattcgcctgtcctttgaagccaggcattcatttcttctctcaagctatgaaatttctagatggcatcttctcccagtagaaggctgttgtgtctgcact i macFas5.chr6 C 0 I 287 s papAnu2.chr6 161820030 256 - 174439528 TGTACAGATGTACTCTCATTCagactttgttgttccatttataaatCACAGGCAGAGGAGATCTAGCATACTCGTTAAGGGTCCTAGAATTTTCA-AATGATAAATGAGatctggcttcaacttaaagtcaccagctgcattagcccctaacaagagaattcgcctgtcctttgaagccaggcattcaTTTCTTCTCTCAAGCTATGAAAtttctagatggcatcttctcccAGTAGAAGGCTGTTGTGTCTGCACT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78712617 257 - 91010382 tgtacagatgtactctcattcagactttgttgttccatttataaatcccaggcagaggagatctagcatatttattaatggtcctagaattttcagaatgataaatgagatttggcttcaatttaaagtaaccagctacattagcccctaacaagagaattagcctgtcctttgaacccaggtattcatttcttctctcaagctataaaatttctagatggcatcttctctcaatggaaggctgttgtgtctacatt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191024350 255 + 204313951 tgtacagatgtactctcattcagacttgcttgttccttttataaatcacatgcagagtagatctagcatacttcttcagggtcctagaactttcagaatgatacataatagttggtttcaacttaaatttgc--actgcattagcccctaaccagagaattagcctgtcctttgaagccaggcattcagttcttctctcaagctatgaaatttctagatggcatcttcttccaatagaaggttgttgtgtctatatt i calJac3.chr2 C 0 C 0 a score=25536.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 3356 12 + 82728 gaaaatctgctt 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calJac3.chr2 191024617 3 + 204313951 ttt i calJac3.chr2 C 0 C 0 a score=662780.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 3371 425 + 82728 agtgtagctaccttcacaggctgttg------aaaaaaaaatggcactgatagacttgcttgatgcaggattgccacaaactttgaatttgtaaaaaatgtaatatctgtgaagcatagtaaagtgaaacacaataaaatgtgg-tatgTTTttattcattttgaaatattttctttctcttttgcattcttttaagacatatagattatttataaatatattataatgtctatgtaatgatgc-ttttagttaaacctgtgttattaatgtacagcttaattcaatgtggct-ggggaacattgaattatgatcatcctttgcaatttgtattcaacatggttctcaatctcaatttttataagtgtttaatgtgcaattgtaaagaaCAGTTTGTTAATTATTTTATTTGGATCTTTAGTGTTCATAGTAAT s panTro4.chr5 169766185 423 - 182651097 agtgtagctaccttcacaggctgttg------aaaaaaaaatggcactgatagacttgcttgatgcaggattgccacaaactttgaatttgtaaaaaatgtaatatctgtgaagcatagtaaagtgaaaca--ataaaatgtgg-tatgTTTttattcattttgaaatattttctttctcttttgcattcttttaagacatatagattatttataaatatattataatgtctatgtaatgatgc-ttttagttaaacctgtgttattaatgtacagcttaattcaatgtggct-ggggaacattgaattatgatcatcctttgcaatttgtattcatcatggttctcaatctcaatttttataagtgtttaatgtgcaactgtaaagaatAGTTTGTTAATTATTTTATTTGGATCTTTAGTGTTCATAGTAAT i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170433666 426 - 183952662 agtgtagctaccttcacaggctgttg-----aaaaaaaaaatggcactgatagacttgcttgatgcaggattgccacaaactttgaatttgtaaaaaatgtaatatctgtgaagcatagtaaagtgaaacacaataaaatgtgg-tatgTTTttattcattttgaaatattttctttctcttttgcattcttttaagacatatagattatttataaatatattataatgtctatgtaatgatgc-ttttagttaaacctgtgttattaatgtgcagcttaattcaatgtggct-ggggaatattgaattatgatcatcctttgcaatttgtattcatcatggttctcaatctcaatttttataagtgtttaatgtgcaattgtaaagaaCAGTTTGTTAATTATTTTATTTGGATCTTTAGTGTTCATAGTAAT i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109153711 422 - 121039945 agtgtagctaccttcacaggctgttg-----aaaaaaaaaatggcactgatagacttgcttgatgcaggattgccacaaactttgaatttgtaaaaaatgtaatatctgtgaagcatagtaaagtgaaacacaataaaatgtgg-tatgTTTttattcattttgaaatattttctttctcttttgcgttcttttaagacataca----atttataaatatattataatgtctatgtaatgatgc-ttttagttaaacctgtgttattaatgtacagcttaattcaatgtggct-ggggaacattgaattatgatcatcgtttgcaatttgtattcatcatggttctcaatctcaatttttataagtgtttaatgtgcaattgtaaagaaCAGTTTGTTAATTATTTTATTTGGATCTTTAGTGTTCATAGTAAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168599461 429 - 181584905 agtgtagctaccttcacatgcttttgaaaaaaaaaaaaaaatggcaccgatagacctgcttgatgcaggattgccacaaagtttcaatttgtaaaaaatggagtatctgtgaagcatagtaaagtgaaac---acaaaatgtgg-catgttgttattccatttgaaatattttctttctcttttgcattcttttgagacatatagattatttataaatatattataatgtctatgtaatgatgctttttagttaaatctgtgttattaatgtacagcttaattcagcgtggct-gggaaacattgaattatgatcaacctttgcaacttgtattcatcatggttctcaatctcaatttttgtaaatgtttaatgtgcaattataaagaaCAGTTTGTTAATTATTTTATTCAGATATTTAGTGTTCATAGCAAT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78713170 429 - 91010382 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tttcattctacttttattattgaaaggtgtttttagtggatatagaattctctatcagtaattatttttcttttcactttttaaaaatattggtcaatagcattactgtttatgattagaagttattagttattcaatttcttgttcttcagaaatgtgctcttttaatctggccactttcaaaattttatctctatctttgttttttatcatcttgcctatcttgat----- i macFas5.chr6 C 0 I 5 s papAnu2.chr6 161821489 228 - 174439528 tttcattctacTTTTATTATTGAAAGGTGTTTTTAGTGGATATAGAATTCTCtatcagtaattatttttcttttcactttttaaaaatattggtcaATAGCATTACTGTTTATGATTAGAAGTTATTAGTTATTCAATTTCTTGTTCTTCAGAAATGTGCTCTTTTAATCTGGCTACTTTCAAAattttatctctatctttgttttttatcatcttgcctatcttgat----- i papAnu2.chr6 C 0 I 5 s chlSab2.chr4 78713712 228 - 91010382 tttcattctacttttattattgaaaggtgtttttagtggatatagaattctgtatcagtaattatttttcttttcactttttaaaaatattggtcaatagcattactgtctatgattagaagttattagttattcaatttcttgttcttcagaaatgtgctcttttaatctggctactttcaaaattttatctctatctttgttttttatcatcttgcctatcttgat----- i chlSab2.chr4 C 0 I 5 e calJac3.chr2 191025096 0 + 204313951 C a score=515040.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 4125 225 + 82728 ttgactttatttttcttgtggtgcactcttattcataaaaccgtaaattcttgccccacaccatttttgtgaaattatcagtcacgatttcttcaaatcctttgtttaaagccacatttgctttttctcttctctcc-tgtggattcttgttacattcttgttagatctttgaatactccccaaagatttcatgaggggatgttcttttgtgtattcttt--ttttaa s panTro4.chr5 169766942 225 - 182651097 ttgactttatttttcttgtggtacgcttttattcataaacccgtaaattcttgcctcacaccatttttgtgaaattatcagtcacgatttcttcaaatcctttgtttaaagccacatttgatttttctcttctctcc-tgtggattcttgttacattcttgttagatctttgaatactctccaaagatttcatgaggagatgttattttgtgtattcttt--ttttaa i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170434425 225 - 183952662 ttgactttatttttcttgtggtacgctcttattcataaacccgtaaattcttgcctcacatcatttttgtgaaattatcagtcacgatttcttcaaatcctttgtttaaagccacatttgctttttgtctcgtctcc-tgtggattcttgttacattcttggtagatctttgaatactgcccaaagatttcatgaggagatgttcttttgtgtattcttt--ttttaa i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109154471 227 - 121039945 ttgactttatttttcttgtggtatgctcttattcataaacccgtaaattctcccctcacaccatttttgtgaaattgtcagtcacgatttcttcaaatcctttgtttaaggccacatttgctttttctcttctctcc-tgtggattcttgttacattcttgttagatctttgaatactgcccaaaggtttcatgaggagaagttcttttgtgtattcttttattttaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 10 226 - 153562 ttgactttatttttcttgtggtacgctcatattcatgaacctgtaatttcctgcctcacaccatttttgtgaaattatcagtcatgatttcttcaaatcctttgtttaaggccacatttgctttttctcttctctccttgtggattcttgctacattcttgttagatctttggatactgcccaaaggttttgtgaggagatgttcttttatgtattcttt--taaaaa i rheMac3.chrUn_JH290906 N 0 C 0 s macFas5.chr6 168600233 226 - 181584905 ttgactttatttttcttgtggtacgctcatattcatgaacctgtaatttcctgcctcacaccatttttgtgaaattatcagtcatgatttcttcaaatcctttgtttaaggccacatttgctttttctcttctctccttgtggattcttgctacattcttgttagatctttggatactgcccaaaggttttgtgaggagatgttcttttatgtattcttt--ttaaaa i macFas5.chr6 I 5 C 0 s papAnu2.chr6 161821722 225 - 174439528 ttgactttatttttcttgtggtaCGCTCATATTCATGAACCTGTAATTTCCTGCCTCACACCATTTTTGTGAAATTATCAGTCATGATTTCTTCAAATCCTTTGTTTAAGGccacatttgctttttctcttctctccttgtgGATTCTTGCTACATTCTTGTTAGATCTTTGGATACTGCCCAAAGGTTTTGTGAGGAGATGTtcttttatgtattcttt--tt-taa i papAnu2.chr6 I 5 C 0 s chlSab2.chr4 78713945 226 - 91010382 ttgactttatttgtcttgtggtatgctcatattcttgaacctgtaatttcttgcctcacaccatttttgtgaaattatcagtcatgatttcttcaaatcctttgtttaaggccacatttgctttttctcttctctccttgtggattcttgctacattcttgttagatctttggatactgcccaaaggttttgtgaggagatgttcttttatgtattcttt--ttacaa i chlSab2.chr4 I 5 C 0 e calJac3.chr2 191025096 0 + 204313951 C a score=2556336.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 4350 887 + 82728 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i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170444070 2226 - 183952662 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i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109162364 2221 - 121039945 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i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191036459 2242 + 204313951 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i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1894083 3625 + 42124431 I a score=-21114.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 16926 47 + 82728 agaaagaactcaagttatcacttgagctatatcacttgacctatatc s panTro4.chr5 169779674 47 - 182651097 agaaagaactcaagttatcacttgagctatatcacttgacctatatc i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170446296 1 - 183952662 a---------------------------------------------- i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109164585 5 - 121039945 t------------------------------------------tcta i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168617078 1 - 181584905 a---------------------------------------------- i macFas5.chr6 I 4 C 0 s papAnu2.chr6 161835789 1 - 174439528 A---------------------------------------------- i papAnu2.chr6 I 6 C 0 s chlSab2.chr4 78727571 1 - 91010382 a---------------------------------------------- i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191038701 11 + 204313951 ---------------------------------acttttccaat--- i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1894083 3625 + 42124431 I e 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calJac3.chr2 191038712 235 + 204313951 --ttcttgatataggtgcttagcgctataaacgttgtccttaaccctgccttagctgtatcctggagattctgagatgctgtatctgctttattagtttcaaagatcatattaatttctgctttaatttcattctttatctaaaagtcattcaga---------------------------------aacaggttgtttaataactgtgaaattgtatcattttgTCAAACTCAATTTTGATATAAATGCAAACAGTGCTATTACTTGT i calJac3.chr2 C 0 I 323 e canFam3.chr34 1894083 3625 + 42124431 I a score=723051.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 17204 257 + 82728 ACAGATTACTTTTCTTTTATAATTTTATCATACCCTGGGTGAagagaataccaattagtttcctaattccatttccccttcttc-attttaatgggatccccaacttgtagctatcacttagttttccagaataaGTAATAATAATAGTATTGCTAAAGATTTCATAGTGT------------ATAACcactgttctaagtctgctaaatatattactaaatttaatgctcacaaaaataggagatgagactattattatatttccattt s panTro4.chr5 169779953 252 - 182651097 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aaaagaaGAAGATTGAGAGTAGT i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168620652 23 - 181584905 agaagaagaaGATTGAGAGTAGT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161839673 23 - 174439528 aaaagaagaagattgaGAGTAGT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78731178 13 - 91010382 aaaa----------aaGAGTAGC i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1897708 16 + 42124431 AAAC-------TTTTGGATGAGC i canFam3.chr34 I 3625 C 0 e calJac3.chr2 191042300 0 + 204313951 C e ponAbe2.chr5 170449820 7077 - 183952662 I a score=1296532.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 20585 520 + 82728 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rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168621197 19 - 181584905 TGTCTTGTCTCCTATCAGG i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161840218 19 - 174439528 TGTCTTGTCTCCTATCAGG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78731713 19 - 91010382 TGTCTTGTCTCCTATCAGG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191042856 19 + 204313951 TATTTTGTCTCCTATTAGG i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1898246 125 + 42124431 I e ponAbe2.chr5 170449820 7077 - 183952662 I a score=383778.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 21124 149 + 82728 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAACAACCATAAACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGCATTCAGGAGTGTGTGTTAGAAAGAGACTCAATCATGAACTATTTGTTGAGGTTATACAGAGAGTAAAGCAAGTGAGttatgacact s panTro4.chr5 169783851 145 - 182651097 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAACAACTATAAACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGCATTCAGGAGTGTGTGTT----AGAGACTCAATCATAAACTATTTGTTGAGGTTATATGTAGAGTAAAGCAAGTGAGttatgacact i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109168722 149 - 121039945 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rheMac3.chrUn_JH290906 18401 409 - 153562 I e ponAbe2.chr5 170449820 7077 - 183952662 I a score=46869.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 21674 70 + 82728 tttta--ttattattttatttattattattattGtt--------------------------ttgagacagagtctcgctctgtcaccca--agct--------ggag s panTro4.chr5 169784397 70 - 182651097 tttta--ttattattttatttattattattattGtt--------------------------ttgagacagagtctcgctctgtcaccca--agct--------ggag i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109169582 76 - 121039945 --tta--ttattttatttgttattattattattatt--------------------------ttgagacagagtctcgctccatcgctca--agctgggggcgggggg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168621774 90 - 181584905 ttttattttattctatttattattactattattatttatttatttttattttatttttttttttgagacagagtctcgctctgttgcaca------------------ i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161840798 87 - 174439528 ttttattttattctatttattattactattattatttatttatttttatt---attttttttttgagacagagtctcgctctgttgcaca------------------ i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78732320 75 - 91010382 ttttattttattctatttattattattattattAtt-----------------tttttttttttgagacggagtctcgctctgttgcacaga---------------- i chlSab2.chr4 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1898561 2300 + 42124431 I e rheMac3.chrUn_JH290906 18401 409 - 153562 I e calJac3.chr2 191043396 0 + 204313951 C e ponAbe2.chr5 170449820 7077 - 183952662 I a score=459209.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 21744 264 + 82728 tgcagtggtgcgatctcggctcactgcaaactctgcctcccgggttcatgccattctcctatctcagcctccctagtagctgggactataggcgcccgccaccacgccctgctaattttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttagccaggatggtctctatctcctgacttcgtgatccacctgcctcggcctcccaaagtactgggattacaggggtgagccaccacacccggccACTTCTGTTTTTCTTAG s panTro4.chr5 169784467 264 - 182651097 tgcagtggtgcgatctcggctcactgcaaactctgcctcccgggttcatgccattctcctatctcagcctccctagtagctgggactataggcgcccgccaccacgccctgctaattttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttagccaggatggtctctatctcctgacctcgtgatccacctgcctcggcctcccaaagtactgggattacaagggtgagccaccgcacccggccACTTCTGTTTTTCTTAG i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109169658 264 - 121039945 tgcagtggcgcgatctcggctcactgcaagctctgcctcccagattcatgccattctcctgcctcagcctccctagtagctgggactacaggcacccgccaccacgccctgctaattttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggggtgagccactgcacccggccACTTCTGTTTTTCTTAC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 18810 264 - 153562 tgcagtggtgcgatcttggctcactgcaagctctaccccccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcgcccgtcaccacacctggctaattttttgtatttttagtagagatgggctttcaccgtgttagccagaatggtctcgatctcctgacctcatgatctgcctgcctcagcctcccaacgtgctgggattacaggcgtgagtcaccgcgcccggccACTTCTGTTTTTCTTAC i rheMac3.chrUn_JH290906 I 409 C 0 s macFas5.chr6 168621864 264 - 181584905 tgcagtggtgcgatcttggctcactgcaagctctaccccccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggactacaggcgcccgtcaccacacccggctaattttttgtatttttagtagagatgggctttcaccgtgttagccagaatggtctcgatctcctgacctcatgatccgcctgcctcggcctcccaacgtgctgggattacaggcgtgagtcaccgcgcccggccACTTCTGTTTTTCTTAC i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161840885 264 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nomLeu3.chr6 109180027 440 - 121039945 AGTACtgaaaccaacccactagtccc-atagatagttttt----attttttttaaataaacatataaattaacccttctggtcttaaagcttgaaatttatgtttgttttaacatagttctttccttcaggcctctcaaaaatactaccaaag-actgaaactcaacagatcaccatatccagaaaatgagatgctagaccactcattcatcatgat---ttgtttgcccctccctagctcctgttttcttacacattgttacatttcttccctattatat-aaacccctagctttagtcagtcagggagatggatttgagactgagttcccctcttggctatagcactcaattaaagcctttttccttggcaacactcatcatctcagtcattgggtttctgtgaagtgaacagcaggacccagatcaaacccctggtgttttggtaac i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 36860 442 - 153562 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papAnu2.chr6 161860235 442 - 174439528 AGTACTAAAACCAGCCCACTAGTCcc-atagattattttttcttttttttttttagtaaacatATAAATTAACCCTTCCGGTCTTCAAGCTTGAAACTTATA-TTGTTTTAACATAGTTCCTTCCTTCAGGCCTCTCAAAAATACTACCAAAG-ACTGAAACTCAACAGATCACCATATCCAGAAAATGAGATGTGAGACTACTGAGTCATCATGAT---TTGTTTGCCCCTctctagttcctgttttcttacacattgttatATTTCTTCCCTACTATAT-AAACCCCTAACtttagtcagtcagggagatggatttgagactgagctcccacCTTGGCTGCAGCACTCAGTTAAAGTCTTGTTCCTTGGCAATATTCATCATCTCAGTCA-TGAGCTTCTGTGTAGTGAACAGCAGGACCCAGATcaaacccctggtgttttggtaac i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78751909 440 - 91010382 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rheMac3.chrUn_JH290906 38958 122 - 153562 AATCATTCTAACATTCAACTTCCATG-CCACATTATTCAACTGAAAGTTTCAGTTTAACTTTATTTAAGCTTTGATGAAAAGGCATAATGAATTGGGTAAGGACAATGAAATAGTAATATAAC i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168642793 122 - 181584905 AATCATTCTAACATTCAACTTCCATG-CCACATTATTCAACTGAAAGTTTCAGTTTAACTTTATTTAAGCTTTGATGAAAAGGCATAATGAATTGGGTAAGGACAATGAAATAGTAATATAAC i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161862330 122 - 174439528 aatcattctaaCATTCAACTTCCATG-CCACATTATTCAACTGAAAGTTTCAGTTTAACTTTATTTAAGCTTTGATGAAAAGGCATAATGAATTGGGTAAGGACAATGAAATAGTAATGTAAC i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78754004 122 - 91010382 AATCATTCTAACATTCAACTTCCATG-CCACATTATTCAACTGAAAGTTTCAGTTTAACTTTATTTAAGCTTTGATGAAAAGGCATAATGAATTGGGTAAGGACAATGAAATAGTAATATAAC i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191060204 122 + 204313951 AATCATTCTAACATTCAACTTCTATACCCACATTATTCAACTGAAAGTGTCAGTTTTACTTCA-TTAAGCATTGATGAAAAGGCATAATGAATTGGGTAAGTACAATGAAATAGTAATATAAC i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1908904 31 + 42124431 I a 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acacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcagg-aaaaaaaaaatgcttaccgggcttaatacctaggtaatgggttaatagatgcagcaaaccaccatggcacatatttacccatgtagcaaacttgcacatcctgcacatgtatcctggaaataaaaacaaaataaaataaaAGTCACACAGGTGTAAAATGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaaTATACAATTGATAAACACCCTCCAACTAGAAGTTAAAACGTTCATTCAAAAATAACTGTTgtcactatttattgtgtgtttatttttatcacatactttgccaagttcttgatatac-----attttttc-----------------------------actttttacaattatgccc-tttttataatggaaaacctcaatatacataaatgcaaatgacttacttaaatttgcagttctac i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170468514 430 - 183952662 acacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcagg--aaaaaaaaatgcttaccgggcttaatacctaggtaatgggttaatagatgcagcaaaccaccgtggcacatgtttacccatgtagcaaacttgcacatcctgcacatgtatcctgcaactaaaaataaaataaaataaaAGTCACACAGGTGTAAAATGCAAAAAAAAAAG------------AAGAATATACAGTTGATAAACACCCTCCAACTAGAAGTTAAAACATACATTCAAAAATAACTGTTgtcactatttattgcgtgtttatttttaccacatactttgccaagttcttgataaac-----attttttc-----------------------------aatttttacaaTTATGCCC-TTTTTATAACGGAAAACCTCA--ATACATAAATGCAAATAACTTACTTAAATTTGCAGTTGTAC i ponAbe2.chr5 I 379 C 0 s nomLeu3.chr6 109185269 439 - 121039945 acacactggggtctgtcagtgttggggatggggagggagagcatcagg---aaaaacaatgcttaccgggcttaatacctaggtaatgggtgaatagatgcagcaaaccaccatggcacatgtttactcatgtagcaaacttgcacatcctgcacatgtatcctggaactaaaaataaaataaaataaaAGTCACACAAGTGTAAAATGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaag--aagaaTATACTATTGATAAACACCCTCCAACTAGAAGTTAAAACATTCATTCAGAAATAACTGTTgtcactatttattgagtgtttatttttaccacatactttgccaagttcttgatatac-----attttttc-----------------------------aatttttacaaTTATGCCC-TTTTTATAATGGAAAACCTCA--ATACATAAATGCAAATGACTTACTTAAATTTGCAGTTCTAC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 42633 429 - 153562 atacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcagg-aaaaaaaaaatgcttactgtgcttaataccta-gtaatgggttaatagatgcagcaaaccaccatggcacgtgtttacccatgtggcaagcttgcacatcctgcacatgtatcctggaactaaaaataaaataaaataaaAATCATACTGGTGTAAAATGC-AAAAAAAAAG------------ATGAATATACAATTGATAAACACCCTCTAACTAGAAGTTAAAACATTCATTCAAAAATAACTGTTGTCACTATTTAC----TGTTCATTTTTACCACATAGTCTGCCAAGTTCTCGACATAC-----ATTTTTTC-------------------------AATTAATTTTTACAATAATGCCC-TCTATATAATGGAAAATCTCA--ATATATAAATGCAAATGACTTACTTAAATTTGCAGTTCTAC i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168646405 428 - 181584905 atacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcagg--aaaaaaaaatgcttactgtgcttaataccta-gtaatgggttaatagatgcagcaaaccaccatggcacatgtttacccatgtggcaagctggcacatcctgcacatgtatcctggaactaaaaataaaataaaataaaAATCATACTGGTGTAAAATGC-AAAAAAAAAG------------ATGAATATACAATTGATAAACACCCTCTAACTAGAAGTTAAAACATTCATTCAAAAATAACTGTTGTCACTATTTAC----TGTTCATTTTTACCACATACTTTGCCAAGTTCTCGACATAC-----ATTTTTTC-------------------------AATTAATTTTTACAATAATGCCC-TCTATATAATGGAAAATCTCA--ATATATAAATGCAAATGACTTACTTAAATTTGCAGTTCTAC i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161865956 429 - 174439528 atacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcagg--aaaaaaaaatgcttactgTGCTTAATACCTA-GCAATGGGttaatagatgcagcaaaccaccatggcacatgtttacccaTGTGGCAAgcttgcacatcctgcacatgtatcctggaactaaaaataaaataaaataaaaatcatactggtgtaaaatgcaaaaaaaaaag------------atgaatatacAATTGATAAACACCCTCTAACTAGAAGTTAaaacattcattcaaaaataactGTTGTCACTATTTAC----TGTTCATTTTTACCACATACTTTGCCAAGTTCTTGACATac-----attttttc-------------------------aattaatttttacaataatgCCC-TCTATATAATGGAAAATCTCA--ATATATAAATGCAAATGACTTACTTAAATTTGCAGTTCTAC i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78757174 431 - 91010382 atacactggggtctgtcagtggtggggatggggagggagagcatcaggaaaagaaaaaatgcttactgtgcttaataccta-gtaatgggttaatagatgcagcaaaccaccatggcacatgtttacccatgtagcaaacttgcacatcctgcacatgtatcctggacctaaaaataaaataaaataaaAATCACACTGGTGTAAAATGCAAAAAAAAAAG------------ATGAATATACAATTGATAAACACCCTCTAACTAGAAGTTAAAACATTCATTCAAAAATCACTGTTGTCACTATTTAC----TGTTCGTTTTTACCACATACTTTGCCAAGTTCTCGACATAC-----ATTTTTTC-------------------------AATTAATTTTTACAATAATGCCC-TCTATATAATGGAAAATCTCA--ATATATAAATGCAAATGACTTACTTAAATTTGCAGTTCTAC i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1911629 254 + 42124431 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TGTTTTTAATCAGGATACTCTAATAGTTTTG---AATACATTTat---gtagtaatcaaaacaataattttaagcTATTAGACTAATTAAAACTCTGTAGCTTTTAAGC-TAAATTATCACAAAATCACAATGCAAAGTTATGCTTGAGCAAAATGGCAAATCACTACTTTTCTACAAAGGAAGATGCCACATCA-TTCGGTaaataaacactcaataaataatgaCAATGGTTATTTTTGAACGAATGTTTTAACTTTGCCTATGTATAACCAACAATATGTCAGCAAAATTTGGAGATAGCATAAACTGGAAGCTCTCTGAATTATGCTCACTTTCCTAGGCTTTTAAAATGGCAGCAACTGGTCATCATAGTTtcataaaacccagaaaaatcaGTACTATTAGTAACATATCTGTAACATAACATCCCTAAATACATCGAATGCTATGCTTCA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78758248 449 - 91010382 TGTTTTTAATCAGGATACTCTAATAGTTTTG---CATACATTTAT---GTAGTAATCAAAACAATAATTTTAAGCTATTAGCCTAATTAAAACTCAGTAGCTTTTAAGC-TAAATTGTCACAAAATCACAATGCAAAGTTATGCTTGAGCAAAATGGCCAATCACTGCTTTTCTACAAAGGAAGATGCCACATCA-TTCGGTAAATAAACACTCAATAAATAATGACAATGGTTATTTTTGAACGAATGTTTTAACTTTGCCTATGTATAACCAACAATATGTCAGCAAAATTTGGAGACAGCATAAATTGGAAGCTCTCTGAATTATGCTCACTTTCCTAGGCTTTTAAAATGGCAGCAACTGGTCATCATGGTTTCATAAAACCCAGAAAAATCAGTACTATTAGTAACATATCTGTAACATAACATCCCTAAATACATCGAATGCTATGCTTCA i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191064099 423 + 204313951 TCTCTCTAATGAGGATTTTCTAGTAGTTTTG---AATACATTTAT---GTAGTAATCAAAATAATAATTTTAAGCTATTAACCTAATTAAAACTCAGTAGCTTTTAAGC-TAAATTTTCACAAAATCACAAAGCAAAGCTATGCTC-AGCAAGA-------------CTTTTCTGTGAAGGAAGATGCCAGACCATTTCAGTAAACAAA----CAATAAATAATGACAACGGTTATTTTTAGATGAATGTTTTAACTTTGCCTCTACATTACCAACATTATATTGGCAAAATTTGGAGATAACATAAATTGGAAGCTCTCTGAATTATGCTCACTCTCCTAGGCTTTTCAGGTGGCAGCAACTGATCCTCATAGTTTGATAAGACCCAGAAAAATC---------AGTAACATATCTGTAACATGACATCCCTAAATACATCAAATTCCATGCTTCA i calJac3.chr2 I 325 C 0 s canFam3.chr34 1912395 359 + 42124431 TCTTTTTAATTAGGATACTCTTTTAGATGTACGTAAAAAACCtatataataataattaaaattctaattttaagctatta----atttaaaa--CAGTA-TTTTAAAGCATAGATTGCCACAAAAT-----AGCAAAGCCATATTTGTACAAGATGCCAAATATATTTTTTTCAATAAAGGAAGATGCTAGGGTA------------------------------------------------------TTTTA-------------GTAGCCAAGAATAGATAGGC-AAATTTGGAGAAAACATATTT----AATTCTTTG----------ACTATTTTAAGCTTTGAAAATAGTGGAAACTAGTTCTCATGTCTTCAAAAACCCCAAAAAAGTCAG----ATTAACAATAAATCCGTGAAATCAGGTTCCTAAGTTCATCTAATTCTGTGCTCCA i canFam3.chr34 C 0 I 222 a score=822984.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 34188 278 + 82728 TGTAAGGtgaaaaccaaaaataaaaaccgaaagccccctgcagccatctgaatggac------ctcagccagggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggtcatgtcaggaagtgagggtcagacatgcctcattacacccagacagcattaacatcaacacagaccttaagtctgataagaaacatgacagtcttttctctctaaagcctgctag-tgggggcttcatctgcatggcaaaacctaagtgcccccaacacctcattataacccagac s panTro4.chr5 169799972 278 - 182651097 TGTAAGGtgaaaaccaaaaataaaaaccgaaagccccctgcagccatctgaatggac------ctcagccagggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggtcatgtcaggaagtgagggtcagacatgcctcattacacccagacagcattaacatcaacatagaccttaagtctgataagaaacatgacagtcttttctctctaaagcctgctag-tgggggcttcatctgcatggcaaaacctaagtgcccccaacacctcattataacccagac i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170470027 279 - 183952662 TGTAAAGtgaaaaccaaaaataaaaaccgaaagccacctgcagccatctgaatggac-----tttcagccagggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggccatgtcaggaagtgagggtcagacatgcctcattacacccagacagcattaacatcaacacagaccttaaggctgataagaaacatgacagtcttttctctctaaagcctgctag-tggaggcttcatctgcatggcaaaacctaagtgcccccaacacctcattataacccagac i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109186805 270 - 121039945 TGTAAGGtgaaaaccaaaaataaaaaccgaaggacccctgcagccatctgaatggac------ctcagccagggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggccatgtcaggaagtgagggtcagacatgcttcattacacccagacaacattaacatcaacacagaccttaagtctgataagaaacatgacag-----tctctctaaagcctgctag-tggaggcttcatctgcatggcaaaacctaagtgcccccaacacctc---ataacccagac i nomLeu3.chr6 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TGTAGGGtgataatcaaaaataaaaatcgaAAGCCCCCTGCAGCCATCTGGCTGGAC------CTCAGCCGTGGTActctaaaatttaacctgaaagactggttcaggccatgtCAGGAAGTGAGTGTCAGACGTGCCTCATTACACCCTGAcggcattaacatcaacacagaccttaagtctgataagaaacattacAGTCTTTCCTCTCTAAAGCCTGCTAG-TGGGGGCTTCATCTGCATGGCAAAACCTAAGTGCCCCCAACATCTCATCATaacccagac i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78758697 278 - 91010382 TGTAGGGtgaaaatcaaaaataaaaatcgaaagccccctgtagccatctgaatggac------ctcagccgtggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggccatgtcaggaagtgagtgtcagacatgcctcattacaccctgacagcattaacatcaacacagaccttaagtctgataagaaacattacagtcttttctctctaaagcctgctag-tgggggcttcatctgcatggcaaaacctaagtgcccccaacatctcatcatcacccagac i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191064522 285 + 204313951 TGTAGGGtgaaaaccaaaaacaaaatttgacggcctcctgcagccatctgagtgaacaaaccctttcctcagggtactctaaaatttaacctgaaagactggttcaggccatgtcaggaagtgggggtcagacgtgcttcattataccctgacagcattaacatcaacacagaccttaggtctgataagaaacattacagtctttcctctctaaagcctgctagttggaggcctcatctgtgtggtaaaatctcagtgcccctaaaacctcagaataacccaaac i calJac3.chr2 C 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attt--------------------ctgataataactctttcaaccagttgctaatcagaaaacgtttaaatgtacctatgacctggaagccaccctccttcaatctctcttccagatcaaaccaatgtaaatgttacatgtattgattgatgtattatttctccccgaaatgtataaaagcaagctgtaccctgactgcctt-gggcacatgccatcaggac--tctcacgggtgcatctttaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 44665 226 - 153562 atttctttct-------------actgatgataactcttccaaccaggtgctaatcagaaaatgtttaaatgtacctatgacctggaagccaccctccttcagtctctcttccagatcaaaccaatgtaaatgttacatgtattgattgatgtattatgtgt--ccaaaatgtataaaagcaggctgtaccctgactgcctc-gggcacatgccatcaggac--tgttacgggtgcatctttaa i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 I 32 s macFas5.chr6 168648441 226 - 181584905 atttctttct-------------actgatgataactcttccaacaaggtgctaatcagaaaatgtttaaatgtacctatgacctggaagccaccctccttcagtctctcttccagatcaaaccaatgtaaatgttacatgtattgattgatgtattatgtgt--ccaaaatgtataaaagcaggctgtaccctgactgcctc-gggcacatgccatcaggac--tgttacgggtgcatctttaa i macFas5.chr6 C 0 I 32 s papAnu2.chr6 161867999 226 - 174439528 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ponAbe2.chr5 170470811 5 - 183952662 GAAAA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109187566 5 - 121039945 GAAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 44961 5 - 153562 GAAAA i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168648737 5 - 181584905 GAAAA i macFas5.chr6 C 0 I 1 s papAnu2.chr6 161868295 5 - 174439528 GAAAA i papAnu2.chr6 C 0 I 314 s chlSab2.chr4 78759876 5 - 91010382 gaaaa i chlSab2.chr4 I 419 C 0 s calJac3.chr2 191065121 5 + 204313951 GAGAA i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1912754 222 + 42124431 I a score=105900.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 34963 33 + 82728 TTTTGCAGACTATAGATATGAATTACAATGATT s panTro4.chr5 169800760 33 - 182651097 TTTTGCAGACTATAGATATGAATTACAATGATT i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170470816 33 - 183952662 TTTTGCAGACTATAGATATGAATTACAGTGATT i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109187571 33 - 121039945 TTTTGCAGACTATAGATATGAATTACAATGATT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 44966 33 - 153562 TTTTGCACACTATAGATATGAATTACAATGATT i 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papAnu2.chr6 161873061 439 - 174439528 CAGTGAGGAGTGAGAGCCAAGTGTCTGTGCTGTCCTATGCGGCTCTCCAGCCATATTCAGGACTGAGGGCACAAGCATGGAACAGGCATATAATTGAATTCAACCAGAGATACAGTGTAGCAATACACAAGGTAGGGCAGGGAAGTTGGTATAGGTAGGGGAATAATTATAAGATTAACCACATAGTTAAtgttatat-aaagaaatatgagACTGTGAAACATTAAATAGGTGATAAAACTAATGGCTTATGAGTCCTAGTATCATTGAAGGAAAGTTAAATTGGGATAATAGAAGCAATAAGGTGGAAACTGAGAAGTTGGCATGAAAAAggaagataataaaaatgtagataattGAAGGATTTCTGTATTGTTAATGACAAGGCTACGGTATGACCATGGAAGTGAGCAGCTGAAATCAGAAGTAGGAGAATGTCA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78764326 439 - 91010382 cagtgaggagtgacagccaagtgtctgtgctgtcctatgcggctctccagccatgttcaggactgagggcacaagcatggaacaggcatatagttgaattcaaccagagatacagtgtagcaatacacaaggtagggcagggaagttggtatcggtaggggaataattataagattaaccacataattaatgttatat-aaaggaatatgagactgtgaaacattaaataggtgataaaactaatggcttatgagtcctagtatcattgaaggaaagttaaattgggataatagaagcaataaggtggaaactgagaagttggcatgaaaaaggaagataataaaaatgtagataattgaaggatttctgtattgttaatgacaaggctacggtatgaccatggaagtgagcagctgaaatcagaagtaggagaatgtcg i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 191066682 435 + 204313951 CAGTGAGGagtgagatccaagtgtctgtgctgtcatatgcacctctccagccatgttcagcactgagggcacaagcatggaactggcatatagtttaattcaaccagagatac-----agcagtacacaaggtagagcagggaagttggtattggtaggggaataattataagattaaccacaaaattaatgctgcataaaaggaatatgagactgtgatacactaaataggtgataaaactaatggcttatgagtcctggtatcattgaaggaaagttaagctgggataatagaagcaataaggtggaaactgagaagttggcatgaaaaagggagataatagaaatttagataatttaagggtttccatatggttaatgacaaggctaaggtatgaccatggaagtgagcagctgaaatcagaagtaggagaaggtcc i calJac3.chr2 I 171 C 0 e canFam3.chr34 1915463 654 + 42124431 I a score=1592425.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 40141 504 + 82728 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tatttgactcttcaatgtcatttaataccgtt-gatttttctcttctaaattaatgtttcatttacatagcagcagaactcactctcctttgcttttctccaaatta--taaccacccttgttagtcttcttttccatttt-ctccccaac-ttttaccctcataggaccttctctaatgattcttctcttctttatctatacttactttctcagttgtctaatctagtctcagaattttcagtatcacataattgctaatgatttcaaaatgtgtagacca-----accagatgtttctcctgaattccagttccataa----aaatcacttacttgagatctcttgaacattttataaaattattaaacAACCCTCTATGAAG-----TATTTTCATTCTATCTCTAGTAGACA--------TGAAAAAGTATTTTTCT----TTATGAAAGATGACATCATTA-TTATACATAtcctgttcttcccaattcctaaatt--gttcttcttgcattatttttgtgtttaaagact i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161873500 502 - 174439528 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panTro4.chr5 169807252 215 - 182651097 TAGTTATTAAAT-AAATTTAACTCAATTTAACTTAAAATTTAAGTACAAGAcaggtgtggaggcacatgcctgtag-----tcccatctacttgggaggctgaggtgggaggaatgcttgagcccaggagtctgaggctgaagtgagctatgattgtggcactgtactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccatgtctaaaaaaaaaaaaaaaaaaaA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170477303 205 - 183952662 TAGTTATTAAGTAAAATTTAACGCAATTTAACTTAAAATTTAATTACAAGAcgggtgtggaggcacatgcctgtag-----tcccatctacttgggaggctgaggtgggaggattgcttgagcccaggagtctgaggctgaagtgagctacgattgtggcactgcactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccatgtctaaaaaaaaa----------- i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 109193653 205 - 121039945 TAGCTATTAAGTAAAATTTAACTCAATTTAACTTAAAATTTAAGTACAAGATgggtgtggaggcacatgcctgtag-----tcccatctacttgggaggctgaggtgggaggattgcttgagcccaggagtctgagactgaagtgagctatgattgtggcactgcactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccatgtctaaaaaaaaa----------- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 51350 208 - 153562 TAGTTATTAAGTAAAATTTAACTC-----AACTTAAAATTTAAGTACAAGACTggtgtggtggcacattcctatagtcccatcccatctacttgggaggctgaggtgggaggattacttgagcccaggagtctgaggctgaagtgagctatgattgtggcactgcactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccgtgtc---aaaaaaaaaaCAA----- i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168654810 211 - 181584905 TAGTTATTAAGTAAAATTTAACTC-----AACTTAAAATTTAAGTACAAGACTggtgtggtggcacattcctatagtcccatcccatctacttgggaggctgaggtgggaggattacttgagcccaggagtctgaggctgaagtgagctatgattgtggcactgcactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccgtgtcaaaaaaaaaaaaaCAA----- i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161874692 209 - 174439528 tagttattaagtaaaatttaattc-----AACTTAAAATTTAAGTACAagactggtgtggtggcacattcctatagtcccatcccatctacttgggaggctgaggtgggaggattacttgagcccaggagtctgaggctgaagtgagctatgattgtggcactgcactccagcctgagcaacagagcaa-gaccccatgtc--aaaaaaaaaaacaa----- i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78766022 211 - 91010382 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atcctatcaatattcattaggtaattta------atcacag----------------------ttaatattatttttgttctttacagaggaggaacatgaagcttaaatcattaaatagctttcctaaggtgataATAAATCTTTT-TTGATTCCTGATTCCTTAAGCAATTTTCACAAAATTCTAATGAATGTATGATTTACTAAACTACACTTTATCAAAAGTCATCATTAAGTAACTATCATCTTTTATGGAAGGCAAAGAATTGGTACTGGCTTTGAAAAAAAA-GTAAATAAAATAAA i panTro4.chr5 I 4 C 0 s nomLeu3.chr6 109194313 273 - 121039945 AACCTATCAATATTCATTAGGTAATTTA------ATCAcag----------------------ttaatattatttttgttctttacagaggaggaacatgaagcttaaatcattaaatagcttttctaagatgataATAAATCTTTT-TTGATTCCTGATTCCTTAAGCTCTTTTCACATAATTCTCATAAATGTATGATTTGCTAAACAACAATTTATCAAAAGTTATCATTAAGTAATTACCATCTTTTATGGAAGTC-AAGAATTGGTACTGTGTTTGAAAAAAAA-GTAAATAAAATAAA i nomLeu3.chr6 I 4 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 52016 274 - 153562 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rheMac3.chrUn_JH290906 I 8 C 0 s macFas5.chr6 168675475 197 - 181584905 agcttatttattacagagtatacaacaattttgtataaaaatgagaagacaaggaggcaatatatttaaactgttgtgctaaattgactgccagctgagaagtctgttcataggaaaa-atat--ttttatgttgaagacaacataaagataaattaggataaataataacgtaatttgtcaaagtagagctaaaaaaat i macFas5.chr6 I 1 I 313 s papAnu2.chr6 161895393 197 - 174439528 AGCTTATTTATTACAGAGTATAcaacaattttatataaaaatgagaagacaaggaGGCAATATATTTAAACTGTTGTGCTAAATTGACTGCCAGCTGAGAAGTCTGttcataggaaaa-atat--ttttatgttgaagACAACATAAAGATAAATTAGGATAAATAATAGCGTAATTTGTCAAAGTAGAGCTaaaaaaaT i papAnu2.chr6 I 1 C 0 s chlSab2.chr4 78787194 197 - 91010382 agcttatttattacagagtatataacgattttatataaaaatcagaagacaaggaggcaatatatgtaaactgtcatgctaaattgactgccagctgagaagtctgttcataggaaaa-atat--ttttatgttgaagacaacataaagataaattaggataaataataacgtaatttgtcaaagtagagctaaaaaaat i chlSab2.chr4 I 8 C 0 s calJac3.chr2 191081920 192 + 204313951 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s panTro4.chr5 169826150 1474 - 182651097 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acatcagatgaa-tccacaagagagataatctgtaaaatatatgaccatcacttcacataaatgtcaatagcatcaaaaatgtgaatgtctaagaaactgtcacactgtagaggagcctcacgagacatgacaattaaatgtaatgtggtatcttggatggaatcccggaacagaaggagaacattaggtaaaaactaaacaaatcttcgtaaagtacggactttattttaaagcaatgtgacaataaaacttcatgacttataacaaatgtaccatcgtaatacaagatgttaataataagagaaaatgggcataaggggcatgaaaactcaatgtaccatctttgtgatttttactgcaaatttctaaagttattttttaaattaaaaGAATAATTGCTTCAAAGCGCTGACAAATATTTATACTTGCCTGTGAAAGGGAATTAAAATATTTATATGATTTATTTCTCATCATTCAGACTTTTCTAACAAATAGAGAAACAATCACAGTTTCTTAGAAGCAGACCAAGTTCCAAAAGCAATGCTTCATATGTAGCAAGCAGAAACATTGTTCAGGAATATAGGCAGGATGGAGAGCCAGAAAGGGAAGATGCAAGGGAGGGAGGCGAAAGAGAAGGTAGGAAGAAGAGAAGAAAGGAAGGAAGAAGGGGAGGAAGGGA--GGAAGAGAGATCATTGTATTAATGCC------ATTTTCTTACtatatatatggtaataaagtatatacata------tgtacttcattttatatatactt-----ta i macFas5.chr6 C 0 I 5 s papAnu2.chr6 12538834 770 + 174439528 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acgtcagatgaattccaaaagagagataatctgtaaaatatatgaccatcacttcacaaaaatgtcaactgcatcaaaaacatgaatgtctaagaaactgtcacactgtagaggagcctcatgagacatgacaattaaacgtaatgtggtatcttggatggaatcccggaacagaaggaggacattaggtaaaaactcaacaaatcttcgtaaagtacggactttattttcaagcaatgtgacgataaaacttcatgacttgtaacaaatgtgccatcgtaatacaagatgttaataataagagaaaatgggcataaggggcttgataactcaatgtaccatctttgtgatttttactgtaaatttctaaagttattttttaaattaaaaGAATAATTGCTTCAAAGTGCTGACAAATATTTATACTTGCCTGTGAAGGGGAATTAAAATATTTATATGATTTATTTCTCATCATTCAGACTTTTCTAACAAATAGAGAAACAGTCACAGTTTCTTAGAAGCAGACCAAGTTCCGAAAGCAATGCTTCGTATGTAGCAAGAAGAAACACTGTTCAGGAATATAGGCAGGATGGAGAGCCAGAAAGGGAAGATGCAAGGGAGGGAGGCGAAAGAGAAGGTAGGAAGAAGAGAAGAAAGGAAGGAAGAAGGGGAGGAAGGGA--GGAAGAGAGACCATTGTGTTAATGCC------ATTTTCTTACTC----TATGGTAATAAAGtatatacata------tgtactttattttatatatactt-----ta i chlSab2.chr4 C 0 I 5 s calJac3.chr2 13227089 749 - 204313951 acatgagatgaatttcaaaagactgatactctataaaatatatgagcatcacttcacataaatgtcaagggcatcaaacctgc---tatctaagaaactatcacactgtagaggagcctcatgagacatgaaagttaaatgtaatgtggtattctggatggaatcctgcaacagaaggagtacattagttaaaaactaaacaaatcttcgtaaagtatggac----ttttaaagcaatgtgacaatgaaagttcatgacttgttacaaatgtactacagtgaaataacatgttagtaatagtagaaaatgggcatgaggggcatgagaactcggtgtaccatc--tgtgattttt-ctgtaaatttctaaaattattttttaaattaaaa-aatAGTTGCTTCAAAATGCTGACAAATATTTATACATGCCTGTAAAGGAGGATTAAAATGTTTATATAATTTATTTCTCATCATCCAGATTTTTCTAACAAATAGAGAAACAATCATAGTTTCTTAAAAGCAAACCAAGTTCCAAAAGCAGTGCTTCATAT-----------------TGTTCaggaagataggcaggaagaaaagccagaaaggcaagatgcaagggagggaggcaaaagagaaagtaggagggagagaagaaaggaagaaagggagaaagagaggaagTGGGAGAGAGATCATTGCATTAATGAT------ATTTTCTTACtatatatatagtaagaacgtagatacatattttattatattacagtatatacatacat-----t- i calJac3.chr2 T 8225 C 0 e canFam3.chr34 1929055 2823 + 42124431 I a score=40318.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 62808 35 + 82728 ttaaagtatatatacctacattgtatatataCTAC s panTro4.chr5 169828649 35 - 182651097 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rheMac3.chrUn_JH290906 77491 0 + 153562 I e chlSab2.chr4 12219274 0 + 91010382 I a score=1774264.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 63445 614 + 82728 agcaaaagcataaacccctgataaacccatcagatctcgtgagactttttca-cgtcacaagaatagcacggaaaagactggctcccatgattcaattacctccccctaggttcctcccacaacacatgggaatgctgggagatacaattcaagttgagatttaggt-ggggacacagccaaaccatatcaTCCACCATCAACACTTTTAAAATACAACTGTCCCACTAACTACCAATTTCTACATACCAATGTGGCGTTTTACtttaccctg-tttttcacctaatggatccaaaaacagtcactgatttttcatttgtacagc--tttttttgtaagaatggaagttatgacttccaagctatttacatgttggagctgaaaatggaagtATAAACAATTCTTTTTACATAAATACTT---CTATATAAGCTAAGCCTTTTAAAATTAAAAATGACTCTTAGCCCTTCAActcatttttaatatcaggtcacatgcatccagaaaagatacaaaactttccccaaaatatacagctaattagtagcaaaacacaatt-aaatccagcctccagattcaaagtttagtgctctc--gttattgtttacaacaaattacctGCAA s panTro4.chr5 169829285 616 - 182651097 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s panTro4.chr5 169830461 1720 - 182651097 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gctgaggtggaaggattgcttgaggccagaatttcaaggctacagtgaactatgacctcaccactgcacaccagtatgggtgacatagcaagaccttgtctGGAaaggaaggaaggaaggaaggaag i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 95619 122 - 153562 gctgaggtgggaggattgcttgaggctggaatttcaaggctgcagtgagctataacctcaccactgcacatcagtatgggtgacattgcaagagcttgtct-----ggaaagatggaaggaaggaag i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 I 248 s macFas5.chr6 168699448 122 - 181584905 gctgaggtgggaggattgcttgaggctggaatttcaaggctgcagtgagctataacctcaccactgcacatcagtatgggtgacattgcaagagcttgtct-----GGAAAGATggaaggaaggaag i macFas5.chr6 C 0 I 311 s papAnu2.chr6 161919064 122 - 174439528 gctgaggtggaaggattgcttgaggctggaatttcaaggctgcagtgagctatgacctcACCACTGCATATCAGTATGGGTGACGTTGGAAGACGTTGTct-----ggaaagatggaaggaaggaag i papAnu2.chr6 C 0 I 344 s chlSab2.chr4 78810986 122 - 91010382 gctgaggtgggaggattgcttgaggctggaatttcaaggctgcagtgagctataacctcaccactgcacatcagtatgggtgacattgcaagaccttgtct-----GGAAAGATggaaggaaggaag i chlSab2.chr4 C 0 I 351 e canFam3.chr34 1935726 0 + 42124431 C e calJac3.chr2 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AAAGATATAGAGAAAATCAAAACT----CAAGCAACTGAATTTTAACTGT-GTATTAAAAATGGAGAATCTACAAGTGGGAAATGGAAGCAGATATGAAAGACCATTTCCAGAATACTG----TATTCTTTTTTGACTAGTCTGACTAAAGAAATGTTCTGTGTTCCTTTATGAGTTTTCTAACAAGCTTGGCAGAATTTTACTCCTGGATAACTTTTTTAAATGGTACTATGCTAAAGAAATTTATAATGTTCCATAA-----AAGACATATTTTTCATTTT-CAAATATAGATGATCCTAGACA-----------------------------------------------TTTGTTTTTTGTTTTGCTT------------------------------TTATTTTAAAAAAATAATAAAGCAGAACAAAGTTCCTTGGGTTGTACTTTGACAAATTATGGTCTATAAAAATATGTTTGAATGAACTTTGGTGGTAACTATAGACTGTATAACT-----TGATATTTTAATAATTTACAAGAAAAAAATTAGCAACTCAGAAAGGATCTTATTTATCAAAATAACATAAATGCTGAAATG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1935726 507 + 42124431 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i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161920257 1056 - 174439528 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i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78812187 1058 - 91010382 TCCTTCATTGCCTTACCTATCATATTGTTAGCAAAATTAACAAACATTTAAACTT-AATTTACATAAAATATATAAATATGTAAACAGAATTGAATTCATAATTTATCAAAAGCAATAACAAATAGCTTTTCATGTGATCACACTTTTTCACTTCATCAACATGAGATATTTTTCTCTCTGCCTAC---ATTTATTCTTTCTTCTAATGAGTACAGAAAATTATTCTTAGGTTAATCAAATTTTTTTAATGCGCAAAAATTTCTA--TTTCATTTTCTGAGGGAGCCATTTTTCAAAACCAGGTT-TCTGAAAAA-----TTAATCTCTAATAATAGTGATAAAATGACATTTTTTCTATGGTTACATACACA---TATTATATTTTAAACAATATTTTTATATTAATTATACTTATTGACTCTTTCAATGACTTAGAAAATCTTGAATATTCAGTTGTTAATCACTTCCCAAAAAGAAACAGGAGAGGTTGAAA--GTTCTATGTTTTAACTAATAACAAAATTACCTTTTTCATTTCAAAAGCTTCAGTTTTATTTCTGTAGCAAA--AGAGAGTATATTTAGCAACATGCTCCCAAACAGTGATTACTGTTCAATCATTACCATTTTGCGGGATGGTGAGGGATGCTGTGTGGCCACGGCAGGGTTTCCTCCATATGTGCTCAGctttgcagcctgactggctgtgat-ctgtgacgcaggtgagggctttgccacctgtgagctgta--ggtgttatgtaattacttaacctctatgagtttacttagcagtaaatgggtaaaagagtaatgcagatggcatcgggtggtataaagattaaaa-gacaccatgcaaaggcagaatttaccacagagattagcTTCATGGAAGGTTCTGGTATTTACAAGCTGTAA-AAACGGTCATCTACTAATCTACACTTAAAAAGCTATTAAGATAATCTGTTCATCAAGTATAACTTTTATACCAGATGATAATTTTATGACACCTGGTAATATACctttagataaagggaaaata------gtaaaataagaaagggcttggaaaataattatttcatt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1938035 1048 + 42124431 TCTTACAATGTATTGCCtaatatatt--ta--aaaattaataaatgttttaatttaaatctaaataaaatatGACAAAA-GAACATATGAATGTATTCAGAATTTATTAAAAGCAGATACAAATAACTTTTTATGCA---ACACTGTTTCACTTCATCAACATAGAATATTTATTTTTCTGTCTACCTGAGTCATTCTTCCCTTGAGTAAGTACTGAAAACCATTCTCTCTTTAATCACA-TTTTTGAACCTGCAACAATTTCTATTTTTCATTATGTGA---AGCTGCTTTATAAAAATTGCTTATCTAGAAAGTTAATTTAATCTCTAATAGAAGTGATAAGCTGACAGTTTTTACATGATTACATTTGaatattattatattttaaacaatattcttatataaatGATACTTGTAGATTCTTTCAAAGCCTTAAGAACACTTGAATATTCAGCAGTTA-------CCATAAACAAAATTGTAGTCTTGGAAAGTGTTCCTTGTTTTAACAAGCAACCAAATTACT-TTTTCATTTCAAAAGCTT--GTCTTATTTCTGTAGCGAAAAAAAGAGTGTATTTAGCAACATGATTAAAAGCAGTGATTATTGTTTAATCGTTACTATTTTACAGGATGGTAAGTGATG-TGGGAAGCCA--GCAGGTTTTCCTCCATATATACTAAGCTTGCCAG-CTAATGGGCTGGGATactgtggattgaatgaaagcttcgccccctgggacctatacttatatgaacaaatcactgaacctctgtg---------agcagtaaaatggtaaaatggcagtgcatatgtcatagcatggtctaaggattaaaatgacacaatgcaAA-ACAGCATTTTCTCCTGAGATTGGCCTAGTGAAAGTCTTTGATATTTAGATGCTCTAATAAATAGTCATCTAGTAACTTACATTTAATAA---ATCAAGATTATATATGGATCATGTATAACCTTTATATTAGGAAATAATTTTATTATATCCGGTAATCCTCTTTTGGTTAAAGGGaaaataaaaaataaaaaataa-aaaGGGTGTGGAAAATAAATATATCATT i canFam3.chr34 I 1802 I 488 e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=14071.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77320 9 + 82728 AAAACATAT s panTro4.chr5 169843297 9 - 182651097 AAAACATAT i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170525995 9 - 183952662 AGAACAAAT i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 97778 8 - 153562 -AAACATAT i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168701665 8 - 181584905 -AAACATAT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161921313 9 - 174439528 aaaacatAT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 78813245 9 - 91010382 aaaacatat i chlSab2.chr4 C 0 N 0 e canFam3.chr34 1939083 488 + 42124431 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=98639.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77329 75 + 82728 TTAggccaggcatagtggctcaggtctgtaatcccagtgttttggaaggctgaggcaggaggattgcttgaggcc s panTro4.chr5 169843306 75 - 182651097 TTAggccaggcataatggctcaggtctgtaatcccagtgttttggaaggctgagggaggaggattgcttgaggcc i panTro4.chr5 C 0 I 976 s ponAbe2.chr5 170526004 75 - 183952662 TTAggccaggcatggtggctcaagtctgtaatcccagtgttttggaaggctaaggcaggaggattgcttgaggcc i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 97786 75 - 153562 TTAggccaggcatggaagcttaggtctgtaatcccagtgttttggaaggctgaggcaggaggattgcttgaggcc i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168701673 75 - 181584905 TTAggccaggcatggaagcttaggtctgtaatcccagtgttttggaaggctgaggcaggaggattgcttgaggcc i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161921322 75 - 174439528 TTAGGCCTGGCATGGAGGcttaggtctgtaatcccagtgttttggaaggctgaggcaggaggattgcttgaggcc i papAnu2.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1939083 488 + 42124431 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=52138.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77404 65 + 82728 agaagttggagatcagcctgagcaacatagcgagaccacatctctacagataattgattttaaaa s ponAbe2.chr5 170526079 65 - 183952662 agaagttggagatcagcctgagaaacatagcgagaccacatctctacagataattgttttcaaaa i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 97861 65 - 153562 agaagtcggacatcagcctgagcaacatagcaaaaccacatctctacaaataattgtattttaaa i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 I 293 s macFas5.chr6 168701748 65 - 181584905 agaagtcggacatcagcctgagcaacatagcaaaaccacatctctacaaataattgtattttaaa i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161921397 65 - 174439528 agaagtcggacatcagcctgagcaacatagcaaaaccacatctctacaaataattgtatttaaaa i papAnu2.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1939083 488 + 42124431 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I e panTro4.chr5 169843381 976 - 182651097 I a score=1874.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77469 5 + 82728 attat s ponAbe2.chr5 170526144 5 - 183952662 attat i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168701813 5 - 181584905 attaa i macFas5.chr6 C 0 I 288 s papAnu2.chr6 161921462 5 - 174439528 attaa i papAnu2.chr6 C 0 I 286 e canFam3.chr34 1939083 488 + 42124431 I e rheMac3.chrUn_JH290906 97926 293 - 153562 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I e panTro4.chr5 169843381 976 - 182651097 I a score=29915.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77474 40 + 82728 ccaggcatggtggcataggcctgtggttctagccacttga s ponAbe2.chr5 170526149 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gaggctgaggcaggggcatcacttgagcccaggtgtttgaggc---------agcagtgagctatggtcacgccattgcactctagcctgggtggcagagggagaccatgtccctaaagataaaagaaaaataaaTTTAAA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 98259 141 - 153562 gaggctgaggcagggggatcatttgagcccaggtgtttgaggctcaaatgtgagcagtgagctatggtcacaccattgcactctagcctgggtgacagaggtagaccctgtctctaaagataaaaggaaaataaaTGTTGA i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168702146 141 - 181584905 gaggctgaggcagggggatcatttgagcccaggtgtttgaggctcaaatgtgagcagtgagctatggtcacaccattgcactctagcctgggtgacagaggtagaccctgtctctaaagataaaaggaaaataaaTGTTGA i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161921793 141 - 174439528 gaggctgaggcagggggatcatttgagcccaggtgtttgaggctcaAATGTGAGCAGTGAGCTacggtcacaccattgcactctagcctgggtgacagaggtagaccctgtctctaaagataaaaggaaaataaatgttga i papAnu2.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr34 1939083 488 + 42124431 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=321290.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77646 250 + 82728 AGAAACATATTTAATTCAGACACTTAAAA--ATGTATTGGAGAACAAGTCTAGTCAGTTTGTTCACCAACACCTTAGGAACTGACATTTTCCTGTTCACAAACAA-CAAACATAGATGTC----------CTATGGC---AATTTTTCAT-----ATGAA------------AGAGGTAAGATTCAATAGAAGAGATTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAAT-------ATAATTATAGGTTATTTATCTTTGTCAATTGCTTCGCAATAtgt s panTro4.chr5 169844489 250 - 182651097 agaaaCATATTTAATTCAGACACTTAAAA--AGGTATTTGAGAACAAGTCTAGTCAGTTTGTTCACCAACACCTTAGGAACTGACATTTTCCTGTTCACAAACAA-CAAACATAGATGTC----------CTATGGC---AATTTTTCAT-----ATGAA------------AGAGGAAAGATTCAATAGAAGAGATTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAAT-------ATAATTATAGGTTATTTATCTTTGTCAATTGCTTCACAATAtgt i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170526321 252 - 183952662 AGAAACATATTTAATTCAGACAGTTAAAA--ATGTATTTGAGAACAAGTCTAGTCAGTTTGTTCACCAACACCTTAGGAACTGATATTTTCCTGTTCACAAACAA-CAAACATAGATGTC----------CTATGGC---AATTTTTCAT-----ATGAA----------AGAGAGGTAAGATTCAATAGAAGAGATTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAAT-------ATAATTATAGGTTATGTATCTTTGTCAATTGCTTCGCAATAtgt i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 98400 254 - 153562 AAAAATATATTTAATTCAGACAGTTAAAA--AGGTATATGAGAACAAATCTAGTTAGTTGGTTCACCAGCATCTGAGGAACTGACA-TTTCCTG-TCATAAACAA-CTAACGTAGATGTC----------ATATGGC---AATTTGTCAT-----ATGAAACATCTTGGAAGAGGGGTAAGATTCAATAGAAAAGTCTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAA-------------TATAGGTTATTTATCTTTGTCAACTGCTTCGCAATACAT i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168702287 254 - 181584905 AAAAATATATTTAATTCAGACAGTTAAAA--AGGTATATGAGAACAAATCTAGTTAGTTGGTTCACCAGCATCTGAGGAACTGACA-TTTCCTG-TCATAAACAA-CTAACGTAGATGTC----------ATATGGC---AATTTGTCAT-----ATGAAACATCTTGGAAGAGGGGTAAGATTCAATAGAAAAGTCTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAA-------------TATAGGTTATTTATCTTTGTCAACTGCTTCGCAATACAT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 161921934 254 - 174439528 aaaaatatatttaattcagaCAGTTAAAA--AGGTATATGAGAACAAGTCTAGTTAGTTGGTTCACCAGCATCTGAGGAACTGACA-TTTCCTG-TCATAAACAA-CTAACGTAGATGTC----------ATATGGC---AATTTGTCAT-----ATGAAACATCTTGGAAGAGGGGTAAGATTCAATAGAAAAGTCTTCCAAATTAATGGCACATCAAAACCATCACCAAAAACAAA-------------TATAGGTTATTTATCTTTGTCAACTGCTTTGCAATACAT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1939571 276 + 42124431 AAATACATGTTTAACATAGACATGTAAAAGTGTGTGTCTTAGAACAATTCTGGT------------CCATGTTTGAGAAGCTTGCACAGTTCTG-TCATAAACAACCTGGCATCCATGTCCCCCCCAGCACTCTGGCAGGAAACTGTCATCCTCCGTCACACATCTGGGAAGAAAGATAAGAGTCAATAGGAGAGACAAGCCAATCAATGGTGTGTCAAAACCATCACCAACCACAATCACATCTGATGACTGTAGTTTATCT-TTTTTGTCAACTGCTTTACAATATAT i canFam3.chr34 I 488 I 28 e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=179615.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 77896 148 + 82728 attaaggttctttaaagaaatag----aataggatatatatagagagatttattatgcaaattgactcaacaattatgaaggctgagaagtgccatgatttgcttcctgcaagctggagaagcaggtaagccagtgctgtaattcagtttaa s panTro4.chr5 169844739 148 - 182651097 attaaggttctttaaagaaatag----aataggatatatagagagagatttattatgcaaattgactcaacaattatgaaggctgagaagtgccatgatttgcttcctgcaagctggagaagcagctaagccagtgctgtaattcagtttaa i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170526573 152 - 183952662 attaacgttctttaaagaaatagaactaataggatatagagagagagatttattatgcaaattggctcaacaattatgaaggctgagaagtcccatgatttgcttcctgcaagctggagaagcagctaagccagtgctgtaattcagtttaa i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290906 98654 152 - 153562 Attaaggttctttaaagaaatagagctaataggatatatagagagaggtttattatggaaatcggctcaacagttatgaagactgagaaatcccatgatttgctttctggaagctggagaagcagctaagccagtgttgtacttcggtacag i rheMac3.chrUn_JH290906 C 0 I 34 s macFas5.chr6 168702541 152 - 181584905 Attaaggttctttaaagaaatagagctaataggatatatagagagaggtttattatggaaatcggctcaacagttatgaagactgagaaatcccatgatttgctttctggaagctggagaagcagctaagccagtgttgtacttcggtacag i macFas5.chr6 C 0 I 22 s papAnu2.chr6 161922188 152 - 174439528 ATTAAGGTTCTTTAAAGAAATAGagctaataggatatatatagagAGGTTTATTATGGAAATTGGCTCAACAGTTATGaagactgagaagtcccatgatttGCTTTCTGGAAGCTGGAGAAGCAGCTAAGCCAGTGTTATACTTCGGTACAG i papAnu2.chr6 C 0 I 22 e canFam3.chr34 1939847 28 + 42124431 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=5104.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 78044 7 + 82728 cttcaaa s panTro4.chr5 169844887 7 - 182651097 cttcaaa i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170526725 7 - 183952662 cttcaaa i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr6 168702715 7 - 181584905 cctcaga i macFas5.chr6 I 22 I 5 s papAnu2.chr6 161922362 7 - 174439528 CCTCAGA i papAnu2.chr6 I 22 I 5 e canFam3.chr34 1939847 28 + 42124431 I e rheMac3.chrUn_JH290906 98806 34 - 153562 I e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=715642.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 78051 581 + 82728 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papAnu2.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr34 1939875 141 + 42124431 AAAAAAATGTTGTTAAGCCAATCTGGGCTTTGAGAATATAAGGCGCAGTCAAGAGCTCCCTGTGTCCACATGGGACCAACTGC-AGGAGGCAG--GACACTCCC-AGGGAATGTAAGTTGTTTGGAAACCAGAATTAGGCCAATC i canFam3.chr34 I 28 I 47 e calJac3.chr2 191105002 2661 + 204313951 I a score=225630.000000 s hg38.chr5_GL383532v1_alt 78776 204 + 82728 -----------------TAtttttttttttttttttttt--------------------GCTTGACTGGTTATTGGCATAATGCCCTTAACAAAGATGACTTTAACAAAGGTAACAGTCTATTTTTTGCTTAACCAGTTATTCACATAATGCTTTTAACAAAGGGTGACCAGTTATTCACATAATGCCTTTAACAAAGATGTTTATTGAATAACTGCTTAGTAATCAGTTGCCTAACATAA s panTro4.chr5 169845616 223 - 182651097 -----------------TGttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttGCTTAACTGGTTATTGGCATAATGCCCTTAACAAAGATGACTTTAACAAAGGTAACAGCCTATTTTTTGCTTAACCAGTTATTCACATAATGCTTTTAACAAAGG-TGACCAGTTATTCACATAATGCCTTTAACAAAGATGTTTATTGAATAACTGCTTAGTAATGAGTTGCCTAACATAA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 170527457 195 - 183952662 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