##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=2713851.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 0 2236 + 137718 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i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s macFas5.chr2 192316353 1650 + 192460366 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i macFas5.chr2 C 0 N 0 s papAnu2.chr2 187287708 1649 - 187378091 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i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 e ponAbe2.chr21_random 868231 7030 - 4212913 I a score=407479.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 8405 1656 + 137718 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i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 875387 1737 - 4212913 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i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 e papAnu2.JH684932 176044 837 - 231459 I a score=1358432.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 13140 1743 + 137718 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i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 I 15645 s papAnu2.JH684932 188437 1996 - 231459 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otoGar3.GL873804 N 0 I 378 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 67988 475 - 206903 I e papAnu2.JH684932 190433 14772 - 231459 I e macFas5.chr5_KE145639_random 25400 15645 + 87690 I a score=68417.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 29682 85 + 137718 TAAAGTAAAATAGAGACATGA-TTTTTTTCATGCTTTCGAATGCATCTATAAAAA-TATACTTGAGggctgggagcagtggctcacg s panTro4.chrUn_GL393550 76298 86 - 115532 TAAAGTAAAATAGAGACATGA-TTTTTTTCATGCTTTCGAATGCATCTATAAAAAATAGACTTGAGggctgggcgcagtggctcacg i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 894071 86 - 4212913 TAAAGTAAAATAGAGACATGA-TTTTTTTCATGATTTCGAATGCATCTATAAAAAATAGACATGAGggctgggcgcggtggctcacg i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27493090 86 - 28733288 TAAAGTAAAATAGAGACATGA-TTTTTTTCATGCTTTCGAATGCATCTGTAAAAAATAGACTTGAGggctgggcgctgtggctcacg i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120463110 87 - 155834243 TAAAGTAAAATACAGACATGATTTTTTTTCATGCCTTCTAATGCATCTATAAAAAATAGACTTGGGggctgggcgtggtggctcatg i calJac3.chr7 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 67988 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macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 205321 8 - 231459 ccgggcgc i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120463312 8 - 155834243 ctgggcat i calJac3.chr7 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_67797.1-4931 619 8 + 4931 ACAAAAGT i tupBel1.scaffold_67797.1-4931 n 475 n 475 e otoGar3.GL873804 1035391 378 - 1077187 I a score=148886.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 29889 95 + 137718 ggtggtgcgcgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcgctt-----gaacccgggaagcggaggttgcagtgagctgagattgca s panTro4.chrUn_GL393550 76506 95 - 115532 ggtggtgcacgcctgtaatcccagctacttaggaggctgaggcaggagaatcgctt-----gaacccgggaagaggaggttgcagtgagccaagatcgca i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 894279 95 - 4212913 ggtggcgcgcgcctgtaatcccagctactcaggacgctgaggcaggagaatcgctt-----gaacccgggaggcggaggttgcagtgagccgagatcgcg i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27493298 95 - 28733288 ggtggagcgcgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaacagaatcactt-----gaacttgggaggcggaggttgcagtgagccgagatcgtg i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 41169 95 + 87690 ggtggcgcgcgcctgtagtcccagttcctctggaggctgaggcaggaggatcgcgt-----gaacccgggaggtggaggctgcagtgagctgagatcccg i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 205329 95 - 231459 ggtggcgcgcgcctgtagtcccagctcctctggaggctgaggcaggaggatcgcgt-----gaacccgggaggtggaggctgcagtgagctgagatcccg i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120463320 100 - 155834243 ggtgccgcgtgcctgtagtcccagctactcaggaggctgagacaggagaatcgcttgaaccgaaccagagagggggagtttgcagttagccaagatcacg i calJac3.chr7 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_67797.1-4931 627 475 + 4931 I e otoGar3.GL873804 1035391 378 - 1077187 I a score=36229.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 29984 21 + 137718 ccattgcact-ccag------cctgggc s panTro4.chrUn_GL393550 76601 21 - 115532 ccattgcact-ccag------cctgggc i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 894374 21 - 4212913 ccatcgcact-ccag------cctgggc i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27493393 21 - 28733288 ccactgcact-ccag------cctgggc i nomLeu3.chr24 C 0 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ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494033 1 - 28733288 G i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 41936 1 + 87690 G i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 206099 1 - 231459 G i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120464103 1 - 155834243 G i calJac3.chr7 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_108772.1-367680 308789 1 - 367680 G i tupBel1.scaffold_108772.1-367680 C 0 I 102 e otoGar3.GL873804 1036500 156 - 1077187 I a score=103783.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 30622 67 + 137718 AAGCGGGTTCTAGAGGCGCAGGAACGGGTAGGCGAGGCCGGTGGCCCTGGGCCCGGAGTCTGCAGGC s panTro4.chrUn_GL393550 77250 67 - 115532 AAGCGGGTTCTAGAGGCGCAGGAGTGGGTAGGCGAGGCCGGTGGCCCTGGGCCCGGAGTCTGCAGGC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895014 67 - 4212913 AAGCGGGTTCCAGAGGCGCAGGAGCGTGTAGGCGAGGCCGGTGGCTCTGGGCCCGGAGTCTGCAGGC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494034 67 - 28733288 AAGCGGGTTCTAGAGGCGCAGGAGCGGGTAGGCGAGGCCGGTGGCCCTGGGCCCGGAGTCTGCAGGC i nomLeu3.chr24 C 0 C 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155834243 TGG i calJac3.chr7 C 0 C 0 s otoGar3.GL873804 1036656 1 - 1077187 T-- i otoGar3.GL873804 I 156 I 266 s tupBel1.scaffold_108772.1-367680 308892 3 - 367680 cga i tupBel1.scaffold_108772.1-367680 I 102 C 0 a score=8576.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 30692 4 + 137718 GCTC s panTro4.chrUn_GL393550 77320 4 - 115532 GCTC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895084 4 - 4212913 GCTC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494104 4 - 28733288 GCTC i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 42004 4 + 87690 GCCC i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 206167 4 - 231459 GCCC i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120464174 4 - 155834243 GCTC i calJac3.chr7 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_108772.1-367680 308895 4 - 367680 gttc i tupBel1.scaffold_108772.1-367680 C 0 I 80 e otoGar3.GL873804 1036657 266 - 1077187 I a score=7393.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 30696 5 + 137718 CTGTC s panTro4.chrUn_GL393550 77324 5 - 115532 CTGTC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895088 5 - 4212913 CTGTC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494108 5 - 28733288 CTGCC i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 42008 5 + 87690 CTACC i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 I 78 s papAnu2.JH684932 206171 5 - 231459 CTACC i papAnu2.JH684932 C 0 I 82 s calJac3.chr7 120464178 5 - 155834243 CTGCC i calJac3.chr7 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_108772.1-367680 308899 80 - 367680 I e otoGar3.GL873804 1036657 266 - 1077187 I a score=41726.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 30701 57 + 137718 CTGCCGCTTAGGGACCCGGTTACCAACCCTCATGTCGCTC-AGTTTGCCCATGTGTCC s panTro4.chrUn_GL393550 77329 57 - 115532 CTGCCACTGAGGGACCCGGTTACCAACCCGCATGATGCTC-AATTTGCCCATCTGTCC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895093 57 - 4212913 CTGCCGCTGATGGGCCCGGTTATCAAGCCGCATGTCGCTC-AGTTTGCCCATCTGTCC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494113 57 - 28733288 CTGCCGCTGAGGGACCCGGTTACCAACCCCCATGACGCTC-AATTTGCCCATCTGTCC i 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macFas5.chr5_KE145639_random 42298 30 + 87690 I a score=1365.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 31052 1 + 137718 T s panTro4.chrUn_GL393550 77680 1 - 115532 T i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895444 1 - 4212913 T i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27494765 1 - 28733288 T i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 42328 1 + 87690 T i macFas5.chr5_KE145639_random I 30 C 0 s papAnu2.JH684932 206491 1 - 231459 t i papAnu2.JH684932 I 30 C 0 e tupBel1.scaffold_133938.1-150249 138347 80 - 150249 I e calJac3.chr7 120464534 302 - 155834243 I e otoGar3.GL873804 1036924 1586 - 1077187 I a score=523398.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 31053 414 + 137718 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panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895868 10 - 4212913 AAACTTAGCG i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495195 10 - 28733288 AAATTTAGCA i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44110 10 + 87690 AACTTCGACA i macFas5.chr5_KE145639_random I 1337 C 0 s papAnu2.JH684932 208084 10 - 231459 AACTTCGACA i papAnu2.JH684932 I 1148 C 0 s calJac3.chr7 120465267 10 - 155834243 AGATTTGGCA i calJac3.chr7 C 0 I 1274 s tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69360 10 - 206903 ATTTTTAAAA i tupBel1.scaffold_108778.1-206903 C 0 C 0 e otoGar3.GL873804 1036924 1586 - 1077187 I a score=378.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 31486 3 + 137718 -TTA s panTro4.chrUn_GL393550 78114 3 - 115532 -TTA i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895878 3 - 4212913 -TTA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495205 3 - 28733288 -TTA i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44120 3 + 87690 -TGA i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208094 3 - 231459 -TAA i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120466551 3 - 155834243 -TAA i calJac3.chr7 I 1274 C 0 s tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69370 3 - 206903 CTT- i tupBel1.scaffold_108778.1-206903 C 0 I 397 e otoGar3.GL873804 1036924 1586 - 1077187 I a score=57725.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 31489 39 + 137718 GATTGCGAAGTTCTATTGATTGTATTTGATTTGTAATTT s panTro4.chrUn_GL393550 78117 39 - 115532 GATTGCGAAGTTCTATTGATTGTATTTGATTTGTAATTT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 895881 39 - 4212913 GATTGTGAAGTTCTATTTATTGTATTTGATTTGTAATTT i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495208 39 - 28733288 GATTGTGAAGTTCTATTGATTGTATTTGATTTGTAATTT i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44123 39 + 87690 GGTTGTGATGTTCTAGTGATTGTACTTGACAAGTAATTT i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208097 39 - 231459 GGTTGTGATGTTCTAGTGATTGTACTTGACAAGTAATTT i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120466554 39 - 155834243 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115532 ggatctgcattttggtgtggtgggttcagctgggtagttgatatatttgtgttgcctggatcacagaagagcccttagtcacctggtgccttgactgagccttgttggtttaagatagtttccttcaca-atctggtggtttctggtgactcttggctaggccctgtgtct i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 896068 170 - 4212913 ggatctgcattttggtgtggtggattcagctgggtagttgatatatttgtgttgcctggatcacaaaagaggccttggtcacctggtgccttgactgagcctggttggttgaagatagtttccttcaca-atctggcggtttgTGGTGACTCTTGGCTAGGCCCTGTGTCT i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495392 170 - 28733288 ggatctgcattttcgtgtggtgggttcagctgggtagttgatatatttgtgttgcctggatcacaaaagaggccttggtcacctggtgacttgactgagcctggttggttgaagatagtttccttcaca-atctggcggtttCTGGTGACTCTTGGCTAGGCCCTGTGTCT i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44304 121 + 87690 tgattcacattttggc---gtgtgttcacctgggcatttcctttgctaatgttgtctggatcacagatgaggctttagtcatctggtgccttcac-----------------------------tcacatgtctgatggttcatgctgaccct------------------ i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208278 121 - 231459 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208399 16 - 231459 --------------------------------------TGTCCGAGAAGGCAAG i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120467016 53 - 155834243 CCAACAGGGTAGCT-CAAACTTCTTCACAATGTGACTATGTCCAAAAAGGCAAG i calJac3.chr7 I 278 C 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69373 397 - 206903 I e otoGar3.GL873804 1038511 344 - 1077187 I a score=4986.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 31897 6 + 137718 -AACCAA s panTro4.chrUn_GL393550 78531 6 - 115532 -aaccaa i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 896292 6 - 4212913 -AACCAA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495616 6 - 28733288 -AACCAA i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44441 6 + 87690 -caccag i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208415 6 - 231459 -CACCAG i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120467069 6 - 155834243 -AACCAG i calJac3.chr7 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69770 6 - 206903 tgggca- i tupBel1.scaffold_108778.1-206903 I 397 C 0 e otoGar3.GL873804 1038511 344 - 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hg38.chrUn_GL000214v1 31907 100 + 137718 TATTTGCATCACATTTTCCATTGTCCATTCACTGGA-CAAGTCAGATGGAAAAGCCCAATTTATTGTCAGAGCATA--ATATGAGGGCTTGGATAGAAGGAAA s panTro4.chrUn_GL393550 78541 100 - 115532 tatttgcatcacattttcccttgtccattcactgga-caagtcagatggaaaagcccaatttattgtcagagcata--atatgagggcttggatagaaggaaa i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 896302 100 - 4212913 TAGTTGCGTGACATTTTCCATTGTCCATTCACTGGA-CAAGTCAGATAGAAAAGCCCAATTTATTGTCAGACCATA--ATATGAGGGCTTGGATTCAGGGAAA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495626 100 - 28733288 tatttgcatcacgttttccattgtccattcactgga-caagtcagatggaaaagcccaatttattgtcagggtgta--atatgagggcttggatacagggaaa i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44470 103 + 87690 tattttcatcatattttccatgtcccattggcaaaagcaagtcaaatggcagagccctgttcgttatcagagcatactctatgaggtctgagatacagggaca i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208444 103 - 231459 tattttcatcatattttccATGTCCCATTGGCAAAAGCAAGTCAAATGGCAGAGCCCTGTTCGTTATCAGAGCGTACTCTATGAGGTCTGAGATACAGGGAGA i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120467108 99 - 155834243 TATTTG-ATCACATTTTTCATTGTCCATTCATTGGA-CATGTCAAATGGAAAAGCCCAATTCATTGTCAGAGCATA--ATATGAGGGCTTGGATACAGGGAAA i calJac3.chr7 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69780 106 - 206903 I e otoGar3.GL873804 1038857 3388 - 1077187 I a score=-3370.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 32007 1 + 137718 -G s panTro4.chrUn_GL393550 78641 1 - 115532 -g i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 896402 1 - 4212913 -G i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27495726 1 - 28733288 -g i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 44573 1 + 87690 -c i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 208547 1 - 231459 -C i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 s calJac3.chr7 120467207 1 - 155834243 -G i calJac3.chr7 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_108778.1-206903 69886 1 - 206903 T- i tupBel1.scaffold_108778.1-206903 I 106 I 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-AAGTCTGAACCAGCACCTTCTTTCGTGACACAGATTATGTGGTGGGGCATATTTC-ACCACCAACCTGGCAGTAAACACTT-TA------------------------------------------ATGTTGTGTAGTGGAAGTGGTC---------------- i calJac3.chr7 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 70174 1665 - 206903 I e otoGar3.GL873804 1042246 3509 - 1077187 I a score=187.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 33066 1 + 137718 T s panTro4.chrUn_GL393550 79705 1 - 115532 T i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 897504 1 - 4212913 T i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27496782 1 - 28733288 C i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s otoGar3.GL873804 1045755 1 - 1077187 C i otoGar3.GL873804 I 3509 N 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 70174 1665 - 206903 I e calJac3.chr7 120468987 0 - 155834243 C e papAnu2.JH684932 209661 0 - 231459 C e macFas5.chr5_KE145639_random 45687 0 + 87690 C a score=8569.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 33067 25 + 137718 GGCGTTTTGTGCAGTGGAAATGGTC s panTro4.chrUn_GL393550 79706 25 - 115532 GGCGTGTTGTGCAGTGGAAATGGTC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 897505 25 - 4212913 GGCGTGTTGTGCAGTGGAAATGGTC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27496783 25 - 28733288 AGCGTGTTGTGCAGTGGAAATGGTC i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 45687 4 + 87690 ------------agtg--------- i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 C 0 s papAnu2.JH684932 209661 4 - 231459 ------------AGTG--------- i papAnu2.JH684932 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_108778.1-206903 70174 1665 - 206903 I e calJac3.chr7 120468987 0 - 155834243 C a score=-6180.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 33092 2 + 137718 A------------------------------------------T s panTro4.chrUn_GL393550 79731 2 - 115532 A------------------------------------------T i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 897530 44 - 4212913 ATCTTCCGCTAAAGCATGGCGTGTTGTGCAGTGGAAAGGGTCCT i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27496808 2 - 28733288 A------------------------------------------T i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s nasLar1.chr9 3131249 2 - 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acctgagtgagttagagagaaacgccacactttgagacgaattcaggagtcctttattagccggtgactgagagacggctaacgcatgaaattctctcagccccaaggaagggaatagatttacttttatactttggtttagagaggggaggggggattccagctgcagcaactttacagaagaaaaaaacagacaaaaaagtgaaaaagacagatggatacaggaaaacaaactgttcccggtgcaggggctttaaattcaccacaaagtgataggtgagggggctctgggcgttatctgctggacaaatgtgggggctttatgatactatccctgagtaatttgctgggaactgcggacatcgcttgcctcagcactttatcagttaattgcactctttgatatgttgaaaatcagcttgcacaagttaaagtccttgaggaaaggtggtgggtagggagcccttgatgtcttgtaaatgaaggagccaaatggagtttgtctagttttctcagctaaaggagagtctattcatattaaaaacaaggttagctatcTAAGGAAGAGTCTTTTCATGTTAATAAAACGTTGG i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 897943 592 - 4212913 acccgagagagttagagagaaacgccacactttgagacgaattcaggagtcctttattagccggcgactgagagacggctaacgcacgaaattctctcagccccgaagaaggggcgagattttcttttatactttggtttagagaggggagggggaattctagctgcagcaactttacagaagaaaaaaca-gacaaaaacgttaaaaagacagatggttaaaggaaaacaaactgttccgagtgcaggggctttaaattcaccacaaaatggtaggtgagggggctctgggtgttatctgctggacaaacatgggggctttatgatactatctctgagtaaattgctgggaactgtggacatcgcttgcctcagcactttatcagttaattgcactctttgatatgttgaaagtcggcttgcacaagttaaagtccttgaggaaagggggtgggtaaggaacccttgatgtcttataaatgaaggagccaaatggagtttgtccggttttctctgctaagggagagtctattcatattaaaaacaaggttaggtatcTAAGGAAGAGTCTATTCATGTTAATACAACGTTGG i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27497473 591 - 28733288 acccgagcgagttagagagaaacaccacactttgagacaaattcaggagtcctttattagccggcaactgagagacagctaacgcacgaaattctctcagccctgaagaaggggctagattttcttttatactttgatttagagagaggaggggggattctagctgcagcaactttacagaagaaaaaaca-gacaaaaaagttaaaaagacagatggttacaggaaaacaaactgttccaggtgcaggggctttaaattcatcacaaagtgataggtgagggggctctgggcgttatctgctggacaaatgtgggggctttatggtactatctccgagtaaattgctgggaactgcggacatcgcttgcctcagcactgtatcagtt-attgcactctttgatgtgttgaaagtcagcttgcacaagttaaagtccttgaggaaagggggtgggtaaggagcccttgatgtcttgtaaatgaaggaggcaaatggagtttgtccggttttctcagctaagggagagtctattcgtattaaaaacaaggttaggtatctaaggaagagtctattaatgttaatacaaggttgg i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 e calJac3.chr7 120469349 0 - 155834243 C e papAnu2.JH684932 210018 363 - 231459 I e macFas5.chr5_KE145639_random 46044 363 + 87690 I a score=11241.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 34055 10 + 137718 gtattacaAA s panTro4.chrUn_GL393550 80690 10 - 115532 GTATTACAAA i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 898535 10 - 4212913 GTATTACAAA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27498064 10 - 28733288 gtattacaAA i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 46407 10 + 87690 gCATTTCAAA i macFas5.chr5_KE145639_random I 363 C 0 s papAnu2.JH684932 210381 10 - 231459 GCATTTCAAA i papAnu2.JH684932 I 363 C 0 e calJac3.chr7 120469349 0 - 155834243 C a score=44192.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 34065 38 + 137718 ACGTCTGTTCATGAC-------CTGGAAATTCTTCTGTGTTAGTT s panTro4.chrUn_GL393550 80700 38 - 115532 CCATCTGTTCATGAT-------CTGGAAATTCTTCTGTGTTAGTG i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 898545 38 - 4212913 ACATCTGTTCATGAT-------CCAGAAATTCTTCTGTGTTAGTT i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27498074 34 - 28733288 ACGTCTGTTCATGAT-------CTGGAAATTCTTGTATGTT---- i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 s macFas5.chr5_KE145639_random 46417 44 + 87690 TTATC-GTTCATGATTTTTCTCCTGGAAATTCTTCTGTGTTAGTT i macFas5.chr5_KE145639_random C 0 N 0 s papAnu2.JH684932 210391 44 - 231459 TTATC-ATTCATGATTTTTCTCCTGGAAATTCTTCTGTGTTAGTT i papAnu2.JH684932 C 0 N 0 s 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Ctgttaaaagaaaaactttaaaggggtttaattgagcaataaatgattcacaaatcggacagcccccagaatcacagcaga-tcagagagactccagtccagtcgtgtggtggagaaagatttatagacaaaaaaaaaaagg i calJac3.chr7 C 0 I 5348 a score=533866.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 34245 1120 + 137718 cataccgaaatcggaagtgaggtacagaaacaactcagcgtttgccttctttgaacacattttgaacatttggcagtgcctgagtggttgaagtttggccattgggattggccaagatgtagctgttgttccaggtgcatactctcaagttagtttttcattcttgtatacctattaaggtaggttgcagttcatccacaaggactcatatatagaattatggagtccttctcaggccatacttagttcactttaacaatgccttccctttggttattttctcaattttgagagattggccaaaacttcagtcactggtgtcactattaccattgcaaatgtacttacttggtttagaaacccactgggaaatagaccagtgagatttgaaaaggtggaacaaggacttgagtagaatatatcttcttatgctggaacatcctgtttacaggagaaaaacaaaacctggtttgttctaggatttatgtgtttccttaaagtcttagtttgattatgttacatttagcatgagtgactcgatttt-atttggtttggtctgttgggacctattgcatgagcttagttcaaaacaatggcctcccataattttgcttaaaaaattcctccttttggctgggtgaggtggcttacacctgtaatcccagcactttggggggctgaggtgggcagatcacgaggtcaggagattgagaccatccttgctaataaggtgaaaccccgtctctgctaaaaatacaaaaaattagccaagtgtggcagcgggtgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaattgcctgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgtgccactgcactccactctgggggacagaccaagactc-tgtcttag-------aaaaaaaaatcctctttttcagtcaagttctcacttagttgagagtgtgaccaaaatgtagggccttaacaccactcttagttaccattgttttgggttccgattttagcacatcattcCCATTGTTTTGGGTTTCTGGTTTAGCACGTCACTCCCATTGTTTTGGG-TTCCGGTTTTAGCACGTCATTCCCATTGTTTTGGGTTTC s panTro4.chrUn_GL393550 80880 1125 - 115532 cataccgaaatcagaagtgaggtacagaaacaactcagcgtttgccttgtttgaacacagtttgaacatttggcagtgcctgagtggttgaagtttggccattgggattggccaagatgtagctgttgttccaggtgcatactcttaagttagtttttcattcttgtatacttattaaggtaggttgcagttcatccacaaggactcatatatagaattatggagtccatctcaggccatacttagttcactttaacaatgccttccctttggttattttctcaattttgagagattggccaaaacttcagtcactggtgtcactattaccattgcaaatgtacttacttggcttagaaacccactgggaaatagaccagtgagatttgaaaaggtggaacaaggacttgagtagaagatatcttcttatgctggaacatcctgtttacaggagaaaaacaaaacctagtttgttctaggatttatgtgtttccttaaagtcttagtttgattatgttacatttagcatgagtgactccattttggtttggtttggtctgttgggacctattgcatgagcttagttcaaaacaatggcctcccataattttgcttaaaaaattcct-cttttggctgggcacggtggctcacacttgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcagatcacaaggtcaggagattgagaccatccttgttaatatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagccaagtgtggtggtgggtgcctgtagtcccagctactcagaaggctgaggcaggagaatggcctgaacccaggagatggagcttgcagtgagccaagatcatgccactgcactccactctgggggacagaccaagactc-tgtcttag---aaaaaaaaaaaaatcctccttttcagtcaagttctcacttagttgagagtgtgaccaaaatgtagggccttagcatccctcttagttaccattgttttgggttccggttttagcacgtcattcCCATTGTTTTGGGTTTCTGGTTTAGCAGGACGCTCCCATTGTTTTGGGTTTCTGGTTTTAGCACTTCACTCCCATTGTTTTGGGTTTC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 898722 1116 - 4212913 cataccgaaatcggaagtgaggtacagaaacagcacagcgtttgccttgtttgaacacagtttgaacacttggcagtgactgagtggttgaagtttggccactgggattggccaagacgcagctgttgttccaggtgcatactctcaggttaggttttcgttcttgtctacctattaaggtaggttgcagttcatccacaaggactcatatgtagaattatggagtccttctcaggccatactcagttcactttaacaattccttccctttggttattttctcaattttgagagattggccaaaacttcaggcactggtgtcactgttaccattgcaaatgtacttacttggtttagaaacccactgggaaatagaccagtgagttttgaaaaggtggaacaaggacttgagtagaaggtaccttcttatgctggaacgtcctgtttacaggagaaaaacaaaacctggtttgttctaggatttatgtgtttccttaaagtcttactttgattatgttacatttagcatgagtgactccatttttgtttgctttggtctgttgggacctattgcatgagcttagtttaaaacaatggtctcccataattttgcttaaaaaattcctccttttggctgggcacggtggctcacgcctgtattcccagcactttgggaggccagggtgggcggatcacaaggtcaggagattgagaccatcctgtctaatacggtgaaacctcatctctactaaaaatacaaaaaattagtcaggcatggtggtgggcgcctgtagtcccatctacttgggaggctgaggcaggagaatggcctgaacccaggaggcagagcttgcagtgagccgagattgtgccactgcactccactctggag-------tgagactc-tgtctcag-----aaaaaaaaaattcctcctttttagtcaagttctcacttagttgagagtgtgaccaaaatgtagggccttagcaccactcttagttaccatcgttttgggttccagatttagcacgtcactcCCATTGTTTTGGGTTTTGGGTTTAGCACATCACTCCCATTGTTTTGGG-TTCCGGTTTTAGCACGTCACTCCCGTTGTTTTGGGTTCC i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27498250 1076 - 28733288 cataccgaaatcggaagtgaggtacagaaacaactcagcgtttgccttgtttgaacacagtttgaacacttggcagtgcctgagtggttgaagtttggccactgggattggccaagacacagctgtagttccaggtgcatactcccaagttaggttttcattcttgtctacctattaagataggttgcagttcatccac-aggactcatatatagaattatggagtccttctcaggccatacttagttcactttaaGAattcgttccctttggttattttcccaattttgagagattggccaaaactttagtcactggtgtcactattaccattgcaaatgtacttacttggtttagaaacccactgggaaatagaccagtgagttttgaaaaggtggaacaaggacttgagtagaaggtaccttcttatgctggaacgtcctgtttacaggagaa----aaaacctggtttgttctaggatttatgtgtttccttaaagtcttagtttgaatatgttacatttagcgtgagtgactccattttggtttggtttggtctgttgggacctatggcatgaggttagttcaaaacaatggcctcccataattttgcttaaaaaattcctccttttggctgggcgtggtggctcatgcctgtaatctcagcactttgggaggccgaggtgggtggatcacaaggtcaggagattgagaccatcctggctaatg-----------cgtctctactaaaaatacaaaaaattagccaggtgtggtggcggacgcctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatggtgtgaacctgggaggcggaggttgcagtgagctgagatcgtgccactgcactccagtctgggggacagagtgagactcttgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaattcctcctttttagtcaagttctcacttggttgagagtgtgaccaaaacatagggccttagcaccacttttagtta-----------------------------------tcattgttttgggtttccagtttagcacgtcactcCCATTGTTTTGGG-TTCCAG-TTTAGCACGTCACTCCCATTATTTCGGGTTC- i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I a score=1419.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 35365 5 + 137718 TGGTT s panTro4.chrUn_GL393550 82005 5 - 115532 TGGTT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr24 27499326 5 - 28733288 TGGTT i nomLeu3.chr24 C 0 C 0 e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I e ponAbe2.chr21_random 899838 0 - 4212913 C a score=9119.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 35370 126 + 137718 TAGCACCTCACTCTCATTGTTTTGGGTTCCTGTTTTAGCACGTCACTCCCATTGTTTTGGGTTCTGGTTTAGCACTTCACTCTCATTGTTTTGGGTTCTGGTTTTAGCACGTCACTCCCATTGTTT s nomLeu3.chr24 27499331 125 - 28733288 TAGCACGTCACTCCCATTGTTTCGGGTTC-TGGTGTAGCACGTCACTCCCATTGTTTCGGGTTCTGGTTTAGCACATCACTCCCACTGTTTTCGGTTCCAGTTTTGGCACATCGCTCCCATTGTTT i nomLeu3.chr24 C 0 I 68 e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I e ponAbe2.chr21_random 899838 0 - 4212913 C e panTro4.chrUn_GL393550 82010 0 - 115532 C a score=3743.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 35496 121 + 137718 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899903 0 - 4212913 C e panTro4.chrUn_GL393550 82477 0 - 115532 C a score=1886.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 36202 94 + 137718 TGTCTGGTTTTATCACGTCACTCCCATCGTTTTGGGTTTCTGGTGTAGCAGGACGCTCCCATTGTTTTGGGTTTCTGGTTTTAGCATGTCACTC s nomLeu3.chr24 27500113 56 - 28733288 T-TCCggttttagcacatcactcccattgtttcggg-ttccag------------------------------------tttagcatgtcattc i nomLeu3.chr24 I 295 T 309 e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I e ponAbe2.chr21_random 899903 0 - 4212913 C e panTro4.chrUn_GL393550 82477 0 - 115532 C a score=2847.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 36296 48 + 137718 CCTTTGTTTTGGGTTTCTGGTTTTACACATCACTCCCATTGTTTTGGG s nomLeu3.chr24 27499860 48 - 28733288 CCGTTGTTTCGGGTTCCGGTTTCAGCATGTCACTCCCATTGTTTCGGG i nomLeu3.chr24 T 309 T 90 e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I e ponAbe2.chr21_random 899903 0 - 4212913 C e panTro4.chrUn_GL393550 82477 0 - 115532 C a score=0.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 36344 85 + 137718 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e calJac3.chr7 120469531 5348 - 155834243 I e nomLeu3.chr24 27501418 3105 - 28733288 I e panTro4.chrUn_GL393550 84328 436 - 115532 I a score=492402.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 39915 5734 + 137718 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s panTro4.chrUn_GL393550 84764 5741 - 115532 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CTCCatgtagaacaaagaagagaataagaaaataatcatctggcaaccatcaaagtaataattgttcaaacacaagtcatccatgaaatgctaaatctagtgggttctgaggagtaaccagatatttacagagcctcaaagtatctccatacaaaatacgg i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 I 6979 s nomLeu3.chr1a 82119903 161 - 122973662 CTCCatgtagaacaaagaagagaataagaaaataatcatctggcaaccatcatagtaataattgttcaaacacaagtcatccatgaaatgctaaatctagtgggttctgaggagtaaccagatatttacagagcctcaaagtatctccatacaaaatacgg i nomLeu3.chr1a C 0 I 4088 s rheMac3.chr10 62012284 161 + 95678458 CTCCatgtagaacaaagacgagaacaagaaaataatcatctggcaaccatcgtagtaataattgttaaaacacaagtcatccatgaaaggctaaatctagtgggttctgaggagtaaccagatatttacagggtctcaaagtatctccatacaaaatacgg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61908199 161 - 96509753 CTCCatgtagaacaaagacgagaacaagaaaataatcatctggcaaccatcgtagtaataattgttaaaacacaagtcatccatgaaaggctaaatctagtgggttctgaggagtaaccagatatttacagagcctcaaagtagctccatacaaaatacgg i macFas5.chr10 C 0 I 4409 s chlSab2.chr2 23889803 161 - 90373283 CTCCatgtagaacaaagaagagaacaagaaaataatcatctggcaaccatcatagtaataattgctaaaacacaagtcatccatgaaaggctaaatctagtgggttctgaggagtaaccagatatttacagagcctcaaagtagctccatacaaaatacgg i chlSab2.chr2 C 0 I 4092 s calJac3.chr1 79982491 161 + 210400635 TTCTatgtagaacaaacaagaaaataaggaaataatcatctggaaatcatcatagtaataattgttctaacacaagtcatcaatgaaatgctaaaactagcaggttttgagaagtaaccaggtattgacagagcctcaaagtatctccacacaaaatactg i calJac3.chr1 C 0 C 0 e papAnu2.JH684937 39113 3855 + 180295 I a score=1911.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 50137 1 + 137718 T s panTro4.chrUn_GL393525 249001 1 + 371432 T i panTro4.chrUn_GL393525 I 6979 C 0 s nomLeu3.chr1a 82124152 1 - 122973662 T i nomLeu3.chr1a I 4088 C 0 s rheMac3.chr10 62012445 1 + 95678458 t i rheMac3.chr10 C 0 I 4697 s macFas5.chr10 61912769 1 - 96509753 T i macFas5.chr10 I 4409 C 0 s chlSab2.chr2 23894056 1 - 90373283 T i chlSab2.chr2 I 4092 C 0 s calJac3.chr1 79982652 1 + 210400635 t i calJac3.chr1 C 0 I 3769 e papAnu2.JH684937 39113 3855 + 180295 I a score=141151.000000 s 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GAGATGGTGCAAATAAACTTTTTAAAAA-tttttttattttcaagat-ggagtctcgctctgtcacctaggctggagtgcagtggtgtgatctcggctcactgcaacctccacctcccgggttcaagcatttctctgcctcagcctccctagtagctgggattacaggtgcccaccacaacacccagctaa--tttt----- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23894057 195 - 90373283 GAGATGGTGCAAATAAACTTTTTAAAAA-tttttttattttcaagataagagtctcgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgtgatctcggctcactgcaacctccacctctccagttcaagcatttctctgcctcagccttcctcgtagctgggattacaggtgcccaccaccacacccagctaat-tttt----- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 62012446 4697 + 95678458 I e calJac3.chr1 79982653 3769 + 210400635 I e papAnu2.JH684937 39113 3855 + 180295 I a score=6590.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 50337 6 + 137718 ttttgt s panTro4.chrUn_GL393525 249201 6 + 371432 ttttgt i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr2A 92403849 6 + 111351968 ttttct i gorGor3.chr2A N 0 N 0 s nomLeu3.chr1a 82124348 6 - 122973662 ttttgc i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s macFas5.chr10 61912963 6 - 96509753 ttttgt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 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chlSab2.chr2 23894258 122 - 90373283 acttttagtagagacggagtttcaccatcttggccaggctggtc-tgaactcctgacctcatgacacacctgcctc-----------ggcctcccaaagtgctgggattacaagcatgagccaccgtgcctggc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 62012446 4697 + 95678458 I e calJac3.chr1 79982653 3769 + 210400635 I e papAnu2.JH684937 39113 3855 + 180295 I a score=478879.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 50466 333 + 137718 TGGTGCAAAGAAACTTTAAAAGTGACATGggccgggtgcggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgagaggctcaggcaggcagatcacaaggtcaggagttcaagaagagcctggccaatatggtgaaaccctgtctctactaaaaatgcaaacattagctgggtgtaatggtgggtgcttgtagtctcagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggtggagcttgcagtgagtggagatagatggcaccaagacactccagcctgggtgacagagtgagatactgcctcaaaaaaaagaaaaaaaaaaT s panTro4.chrUn_GL393525 249330 329 + 371432 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cGGTGCAAAGAAACTTTAAAAGTGACATGAgccaggcacggtggctcatacctgtaatcccagcactgtgggaggctgaggcaggcagatcacaaggtcaggagtttgagaacagtctgctcaagacggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaacattagctgggtgtaatggcaggcgcctgtagtctcagctatgcgggaggctgaggtgggagaattgcttgaacctgggaggtggaggttgcagtgagccaagat----ggcgccac-acactccagcctgggtgacagagtgagacactgcctccaaaaaaaaaaaaaaaaaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 42968 328 + 180295 TGGTGTAAAGAAACTTTAAAAGTggtatgggctgggcatggtggctcac-cctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggtggagcacaaggtcaggagcttgagatcagcctggccaatatggtgaaatcccatccttactaaaaatacaaaaattagctaggtgtggtggtgggcacctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcaggagagtcacttgaacccgggaggcggaggttgcaatgagctgagat----catgccactgcactctagcctaggcaacagagcaagattccttctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaag i papAnu2.JH684937 I 3855 C 0 s chlSab2.chr2 23894380 328 - 90373283 cGGTGCAAAGAAACTTTAAAAGTGACATGAgccaggcatggtagctcatgcctgtaatcccagcactgtgggaggctgaggcaggcagatcacaaggtcagaagtttgagaacagcctgctcaagatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaacattagctgggtgtaatggcgggcgcctgtagtctcagctacgtgggaggctgaggcgggagaattgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagccaagat----ggcaccat-acactccagcctgggtgacagagtgagacactgcctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79986422 298 + 210400635 TGGTGCAATGAAACTTTAAAAGTAGTATGAgccagggacagtggctcacggctgtaatctcagcactttgggatgccaaggcaggcagatcacaaggtcaggagctcgagaccagcctggccaatatggtaaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcatggtggcaggcacctgtagtctcagctactctggagactgagacaggagaatcacttgaacccaggaggcagggattgcagagagctgagac----tgcaccattgcactccagcct-ggtgacagagtgag------------------------------ i calJac3.chr1 I 3769 C 0 e rheMac3.chr10 62012446 4697 + 95678458 I a score=552.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 50799 2 + 137718 GT s panTro4.chrUn_GL393525 249659 2 + 371432 GT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82124803 2 - 122973662 GT i nomLeu3.chr1a 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hg38.chrUn_GL000214v1 50805 104 + 137718 TGAACCACAGCTAAACTATAATCAATTAGAGAGTAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCATCAGTTATCAGGCAATAACATGCAATTTCTAAAACCTAACTTAA s panTro4.chrUn_GL393525 249665 104 + 371432 TGAACCACAGCTAAACTACAATCAATTAGAGAGTAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCATCAGTTATCAGGCAATAACATGCAATTTCTAAAACCTAACCTAT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82124809 104 - 122973662 TGAACCACAGCTAAACTACAATCAATTAGAGAGAAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCGTCAGTTATCAGGCAATAACATGCAATTTCTAAAACCTAACTTAA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62017147 104 + 95678458 TGAACCACAGCTAAACTATGATCAGTTAGAAAGTAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCATCAGTTATCAGGCAATAACATGCAATTTCTGAAACCTAACTTAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61913443 104 - 96509753 TGAACCACAGCTAAACTATGATCAGTTAGAAAGTAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCATCAGTTATCAGGCAATAACATGCTATTTCTAAAACCTAACTTAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 43302 102 + 180295 tgAACCACAGACAAACTACAATCAAGTAG--AGTAAGA----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATACCGTCAGTTAGTAGGCAATAACATGCAATTTCTAAAACCTAACTTAA i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23894722 104 - 90373283 TGAACCACCGCTAAACTACAATCAGTTAGAAAGTAAGC----------------------------------------------------------------------------------CAAAGCATCTCAAAGTATATCATCAGTTATCAGGCAATAACATGCTATTTCTAAAACCTAACTTAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79986720 54 + 210400635 ---------gct--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTATACCTCCAGTTATTAGGTAA-AACATGCAATTTCTAAAACCTAACTTAA i calJac3.chr1 C 0 C 0 s micMur1.scaffold_78816 737 182 + 2310 TGAACCACAGCCAAACTAAAATCAATTAAAATTTAAGCCAGGGAGGAGTGGGGGCAAGGGCAATATATGCAACCTTAACATTTGTATCCCCATAATATGCGGAAATAAAAAAAAATTAAGCAAAGTATCTCAAAGTATACCTTTAGTTATTGAGCAACACTATTTCATTTCCAA----TAACTTAA i micMur1.scaffold_78816 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6266605 102 + 85426708 TGAACTTCTTATAAACTATTGCTAATCAGAAAATAAGT----------------------------------------------------------------------------------TAAAGCATCT--AAGTGTACTTCTGGTTAGTATGTAATAATATTTACTTTCCAAAATCCAATTTAA i canFam3.chr2 N 0 I 233 a score=20628.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 50909 6 + 137718 ATGCAG s panTro4.chrUn_GL393525 249769 6 + 371432 ATGCAG i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82124913 6 - 122973662 ATGCAG i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62017251 6 + 95678458 ATGCAG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61913547 6 - 96509753 ATGCAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 43404 6 + 180295 ATGcag i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23894826 6 - 90373283 ATGCAG i chlSab2.chr2 C 0 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CTTTTTTCATAGATAATAACTCCTGTTGAAGAACTTGATTGTCTTTAGCCAAATTGACACATTTTGAAGATACAGCTTCCTTCTCTGCTGTAAGATCATCAAACTGCATGAATAAAATAGTATAGCTTGATAATGAAGTAGGCTGAGAATAATCTAATACGAAACCAATAGCAA----ATTTTGAAA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 45779 183 + 180295 tttttctcATAGATAAAAACTCCTGTTGAAGAACTTGATTGTCTTTAGCCAAATTGACACATTTTGAAGACACAGCTTCCTTCTCGGCCGTAAGATCATCAAACTgcatgaataaaataatagagCTTGATAGTGAAGCAGGCTGCGAATAATCTAATACAAAACCAGTAACaa----attttgaaa i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79989612 183 + 210400635 CTTTTTTCATAGATAATAACTCCTGTTGAATAACTTGATTGTCTTTAGCCAAATTGATACATTTTGAAGACAGAGCTTCCTCCTCTGCTGTAAGATCATCAAGCTGCATGAATAAAATAATATAGCTTGATAATGAAGTAGTCTGAGAATGATTTAATACAAAACCAATAGCAA----ATTTAGAAA i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6270134 182 + 85426708 TTGCTTTCATAGATAATAACTCTTGTTGAAGAACTTGATTTTTTGCGTCCAGGTGTAGACACCTTGAAGATTCAGTTTCCAGTTTTGCTGTAAGATCATCAATCTGCATGAATAAAACAATACAGTTTG-----GAAGTGGAGTGAAAATAGTTTAATTAAAAACTATAACCAACATTATTTTTAAA i canFam3.chr2 C 0 I 157 e chlSab2.chr2 23897247 0 - 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panTro4.chrUn_GL393525 252862 205 + 371432 TCACTTGTAATAAAATGTTATCAGTAATGCATCAGATTCTTCAAATGTGATCCCTTAAATTACTCAGAATTTTAAGAACAAAGTTAAAGCTACCATGAGTCACAAAAATATATTCTTTAGTATCATCATCTTTGCCACAGAACTTTTGTACTTCATCTTA--CTTTTATTTTTCTGATAATTTATTT---TTGTTCCTCCTTAAATGGCA- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82127924 204 - 122973662 TTACTTGCAATAAAATGTTATCTGTAATGCAGTAGATTCTTCAAATGTGAACCCTTAAATTACTCAGAATTTTAAGAACAAAGTAAAAGCTACCATGAGTCACAAAAATATATTATATACTATCATCATCTTTGCCACAGAAC-TTTGCACTTCATCTTA--CTTTTATTTTTCTGATAATTTATTT---TTGTTCCTCCTTAAATGGCA- i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 45967 202 + 180295 ttaCTTGCAATAACATGTTATCAATAATGTAGCACAGTCTTCAAATGTGAACCCTTAAATTACTCAGAATTTTAAGAGCGAAGTTAAAGCTACCATGAGTCACAAAAATACACGCTCTACTATCATCATCTTTGCCACAGAACGCCTGCGcttgatct-----tttcatttttccgATGATTTGTTT---TTGTTCCTCCTGAAACGGCA- i papAnu2.JH684937 C 0 I 303 s calJac3.chr1 79989800 204 + 210400635 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papAnu2.JH684937 I 303 C 0 s calJac3.chr1 79990004 17 + 210400635 CTAAGTTAACTCTTAGT i calJac3.chr1 C 0 I 973 s canFam3.chr2 6270830 17 + 85426708 GTAAGTCACCTCTTAGT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=10924.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 54114 11 + 137718 AAAAAGTGTCT s panTro4.chrUn_GL393525 253084 11 + 371432 AAAAAATGTCT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82128145 11 - 122973662 AAAAAGTATCT i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 46489 11 + 180295 GAAAAGTGTCT i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79990994 11 + 210400635 AAAAAGTGTCT i calJac3.chr1 I 973 C 0 s canFam3.chr2 6270847 11 + 85426708 AGAAACTCTCT i canFam3.chr2 C 0 I 452 e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=17462.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 54125 39 + 137718 AACCCCCTTCCTTCATTATCATTCCCCACAGTATGTC---AA s panTro4.chrUn_GL393525 253095 39 + 371432 AACCCCCTTCCCTCATTATCATTCCCCACAATATTTC---AA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82128156 32 - 122973662 AACCCCCTTCCC----TATCATTCCCCA---TATGTC---AG i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 46500 38 + 180295 AA-CCCCTTCCCTCACAGCCACTCCCCAAAATTTGTC---aa i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79991005 42 + 210400635 AACACCCCTCCCTCATCATCATTCCCCATAATTTGTCAAAAA i calJac3.chr1 C 0 C 0 e canFam3.chr2 6270858 452 + 85426708 I e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=87715.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 54164 83 + 137718 AAAAAGTTTCAGAGATATCATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGGCCTAGGAATAAGACTTTGAAAATAATATT s panTro4.chrUn_GL393525 253134 83 + 371432 AAAAAGTTTCAGAGATATCATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTAGGAATAAGACTTTGAAAATAATATT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82128188 83 - 122973662 AAAAAGTTTCAGAGATATCATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTAGGAATAAGACTTTGAAAATAATATA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 46538 83 + 180295 aaaaaGTTTCAGAGCTATCACATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTCAGAATAagactttgaaaataatatg i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79991047 82 + 210400635 AAAAAGTTTCAGAGATATCATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTCAGAATAAGACTTTGAAATTAATAT- i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6271310 83 + 85426708 AAGAAGTTTTAGTAATATCATATTGACTTATGTAGGTCTGAGAAAATAAATGCTTCCTAAGAGAAGCCTTTGAAAATAAGACT i canFam3.chr2 I 452 I 2 e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=220337.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 54247 303 + 137718 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aaTAATGAATCCAGTAAATAAGGATTCTGATGCCATAAGCCTTTGCTTAAACTGCAAATGTTTCATGCTAATTTGAATTGCATTTTAAGAAGTAATGACTCTTGGGGTAAAGG i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 46926 113 + 180295 aataatgAATCCTGTAAATAAGGATTCTGATGCCATAAGCCTTTTCCTAAACTGCAAATATTTCATGCTAATTTGAATTGCATTTTAAGAGGTAATGATTCTTGGGGTAAAGG i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79991449 113 + 210400635 AATAATGAATCCTGTAAATAAAGATTGTGATGCCATAAGCCTTTCCCTAAACTGCAAATGTTTCCTGCTAATTTGAATTGCATTTTAAAAATTAATCATTCTCGGGGTAAAGG i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6271395 113 + 85426708 AATTATTGAATCTATAATTACTGATTCTAATGCCACAAGCTTTTTTCTGAATTACAAATGATTTACACTAATTTGAATTGCACTCCCAGGAGAAATGATTCTCAGGGTTAAGA i canFam3.chr2 I 2 I 6736 e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=240084.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 54663 343 + 137718 CCatagaatacggcacccagaaataaatccacatatttccagccaactgattttggacgaacatgccaagaacatacgctggggaaaggacagcctcttcaaatgaatgacactgggaaaactaaatatccatatggagaagaatgatattagcttcctatgtaacaccatataacaacataaactcagaatcgattgaagactgaaatataaggccc---------------------------------aaaattatcaaactactctaagtaaatatagggaaaatgtttgaggacattagtctgcacaaagatttttatgggtaagacatcagaagcataggcaaacaacaaatcatagacaaatgacacta s panTro4.chrUn_GL393525 253632 343 + 371432 CCataggatacagcacccagaaataaatccacatatttccagccaactgattttggatgaacatgccaagaacatatgctggggaaaggacagcctcttcaaatgaatggcactgggaaaactaaatatccatatggagaagaatgatactagcttcctatgcaacaccatataacaacataaactcagaattgattgaagactgaactgtaaggtcc---------------------------------aaaattatcaaactactataagtaaatatagggaaaatgcttgaggacattagtctgcacaaagatttttatgggtaagacatcagaagcataggcaaacaacaaatgatagacaaatggtacta i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82128689 342 - 122973662 CCatagaatacagcacccagaaataaatccacatatttccagccaactgattttgggtgaaggtgccaagaacaagcactggggaaaggacagcctcttcaag-gaatggcaataggaaaactaaatatccatatagagaagaatgatactagcttcctgtgtaacacaatataacaaaataaactcagaatcgattgaagactgaaatataaggccc---------------------------------aaaattatcaaactactgtaagtaaatatagggaaaatgcttgaggacattagtctgcacaaagatttttatgggtaagacatcagaagcataggcaaaaaacaaatgatagacaaatggtacta i nomLeu3.chr1a C 0 I 28 s papAnu2.JH684937 47039 362 + 180295 CCATAGAATACAgcacctagaaataaatccacatatttacagccaactgattttggACTAAGGCGCCACGAACATACattagggaaaggacaccctcttcaaaTGAAAGGCACTGGGAAAAC----TATCCATATGG---AGAATGACACTAGCTTCCTATCTAGCACCATATAGCAAAAT------AGAATCAATTGATGACTGAAGTGTAAGGCCCAAAATTATCAAACTACTATAAGTAAAGATAGGGAAAATTATCAAACTACTATAAGTAAAGATAGggaaaatgcttcaggacattagTCTGCACAAAGATTTCTATGGGTAAGACATCAGAAGCCCAGGCAAAAAACAAACGATAGACAAACAGTACT- i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79991562 326 + 210400635 CCatagaatacaatacccaaaaataaatccatatatttacagccaactgattttggactaaggtgccaagaatatacattaaggaaaggacgccctcttcaaatgaatggcactgggaaaacgaaatattcatataa----------------ctttctatctaacaccaaataacaaaataaactcagaattgattaaagacttaa-tgcaaggccc---------------------------------aaaattatcaagctactacaagtaaacatagggaaaatgctttaggacattcatctgcacaaagatttttatgggtaagacatcagaagcataggcaaaaaacaaatgataggcaagtggtacta i calJac3.chr1 C 0 C 0 e canFam3.chr2 6271508 6736 + 85426708 I e chlSab2.chr2 23897247 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62019646 0 + 95678458 C e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I e macFas5.chr10 61915952 0 - 96509753 C a score=37375.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 55006 100 + 137718 cattaagctaaagagcttctgtccagcaaacaactgagtgaagaaaaaacctgtagaataggagaaaatattgtcaagctattcacctaataagggacta s panTro4.chrUn_GL393525 253975 100 + 371432 cattaagctaaagagcttctgtcaggcaaacaactgagtgaagagaaaacctgtagaatgggagaaagtattgtcaagctattcatctaataagggacta i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 47401 71 + 180295 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atatccaaaatatacaaggaa-ctcaaacaccCTCACAGTATAAAAAATAATCTGAGTTCAAAACTGCGCAAAATATCtgattagcttttc-------tttttttaagaaaaaaagaaatacaaatggccaataaatacattttaaaatgttcagtatcactaatcatcagggaaatacaaatcaaacctAAAATGTGATATACTCTTGCTCCATTTCGAATAAATGGCTAtcatagaaaagacaaaaaata-------acaaatgctggtgaggtttcAGAGAACAGTAAACTCTTACATggtgttggtgggaaggtaaattagtgaAGCCACT-TAGAAAACAacatgaagatttctcaaaaaa-ctaataatGGAACTGTCGAgggatccagcaaccccactaccGGGTATTCAGGCAATAGaaaa-aaaCCAATAGATCACAAAGATACCTGTcctcatatgttcattgtagcactattcacaacaactGATGTAATAAATCAACCTGCATGtctatcaacaaatgaatggaccAAAAATcgtggtacacatacacaatggaacactattcaccatgtaaaaaaatgaaatcctcttATTTGTGGCCATTTGGATCAGTCTGGAGGATATTATATTAAgtgcagacacagaaagatacaTACCGTACATTCGCACTCATGTGTGGAAGCTAAAGaaa i papAnu2.JH684937 C 0 I 307 s calJac3.chr1 79991988 616 + 210400635 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s panTro4.chrUn_GL393525 254965 988 + 371432 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i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82129933 990 - 122973662 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i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79992812 1015 + 210400635 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i calJac3.chr1 C 0 C 0 e canFam3.chr2 6271508 6736 + 85426708 I e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I a score=412765.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 56957 185 + 137718 A-TTTTCCTAAAA--CTCCTTCAATTATGAACTCTGATAACAAGGCAAGGATGTCTCCTTACAATTTCCCCTCAAGTTAGGAAAT----AAGATTGGGAAGCAAGAAGATGTATGATTTGAAA------AAC--AACTAGAGATACTTGGTGACATAGGCAAAATCAGACA-TTTACCTGATTTCAATTAACTAAAATTCT s panTro4.chrUn_GL393525 255953 185 + 371432 A-TTTTCCTAAAA--CTCCTTCAATTATGAGCTCTGATAACAAGGCAAGGGTGTCTCTTTACAATTTCCCCTCAAGTTAGGGAAT----AAGACTGGGAAGCAAGAAGATGTATGATTTGAAA------AAC--AATTAGAAATGCTTGGTGACATAGCCAAAATCAGACA-TTTACCTGATTTCAATTAACTAAAATTCT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82130923 186 - 122973662 ACTTTTCCTAAAA--CTCCTTCGATTGTGAACTCTGATAACAAGGCAAGGGTGTCTCCTTACAATTTCCCCTCAAGTTAGGAAAT----AAGACTGGGAAGCAAGAAGACATATGATATGAAA------AAC--AACCAGAAATACTTGGTTACACAATCAAAATCAGACA-TTTACCTGATTTGAATTAACTAAAATTCT i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62020616 172 + 95678458 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ACTTTTCCTAAAA-CCCCCTTCAATTATGAACTCTAATAACAAGGCAAGGG--------------TTCCCCTCAAGTTAGGAAAT----AAGACTGGGAAGCAAGAAGACATATGATTTGAAA------AAC--AACTAGAAATACTTGGTTACATAATCAAAATCAGACA-TTGACCTAATTTCAATTAACTAAAATTCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79993827 187 + 210400635 ACTTTTCCTACAA-CCTCCTTCAATTATGAACTCTGATCACAAGGCCAGAACGTCTCCTTAGAATTTCCCCTCAGGTTAGGAAAT----AAGACTGGGAAGCAAGAAGACGTATGCTCTGAAA------AAC--AACTAGAAATATTTGGTTACATAACCAAAATCAGACA-GTTACCTGATTTCAATTAACTAAAATTCT i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6278244 196 + 85426708 -ATTTTTCTAAGATTCTCTTCAAATTACAAATTATTAAAACTAAGCAGGAACATTTCTTTTGAATTTCCCTTTAAGTTAAGGGAGAACAAAGACTGACAAGCAGAGAGACATATGATTTGAAGTGTAACAACTGAACTAGAAAGA----GTTTAATAAGCAAAATGGAACCTTTTACCTGATTTCAATTAACTGCAATTCT i canFam3.chr2 I 6736 C 0 e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I a score=287456.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 57142 145 + 137718 ----AAAAGAAGAAGCTTTGAGTGTTTATTAATCAACCTAGTATTCAATTTTCATTTT-CTTTTC----TAAATGAGCAAATAAGGAGA---TTATGGAATGATTTTTAGTCTTCACAGAAGTAAAATAAGCATAGTGTGTTTTG--AGTGTTAAGACA s panTro4.chrUn_GL393525 256138 148 + 371432 ----AAAAGAAGAAGCTTTGAGTGTTTACTAATCAACCTAGTATTCAATTTTCATTTT-CTTTTC----TAAATGAGGAAATAAGGAGAATATTATGGAATGATTTTTAGTCTTCACAGAAGTAAAATAAGCATAGTGTGTTTTG--AGTGTTAAGACA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82131109 141 - 122973662 ----AAAAG-ATAAGCTTTGAGTATTTATTAATCAACCTGGTATTTAATTTTTATTTTCCTTTTC----TCAATGAGGAAATAAGGAGAACATTATGAAATGATTTT--GTCTTCACAGAAGTAAA-----CATAGTGTGCTCTG--AGTGTTAAGAAA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62020788 146 + 95678458 -----AAAAGGTAAGCTTTGAGTGTTTATTAATCAATCTAGTATTTAATTTTTATTTTCCTTTTC----TCAATAAGGAAATAAGGAGAACATTATGGAGTGATTTTCTGTCCTCGCAGAAGTAAAATAAAC--AATGTACTTCG--AGTGTTAAGAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61917102 146 - 96509753 -----AAAAGGTAAGCTTTGAGTGTTTATTAATCAATCTAGTATTTAATTTTTATTTTCCTTTTC----TCAATAAGGAAATAAGGAGAACATTATGGAGTGATTTTCTGTCCTCGCAGAAGTAAAATAAAC--AATGTACTTTG--AGTGTTAAGAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 50157 153 + 180295 ----aagagaagaagctttgAGTATTTATTAATCAATCTAGtattcaattttcattttcctttttctcattgaGGAGGAAATAAGGAGAACATTATGGAATGATTTTTAGACTTCACAGAAGTAAAATAAACATAGTGAGGTTTG--AGTGTTAAGACA i papAnu2.JH684937 I 316 C 0 s chlSab2.chr2 23898400 146 - 90373283 -----AAAAGGTAAGCTTTGAGTGTTTATTAATCAATCTAGTATTTAATTTTTATTTTCCTTTTC----TCAATAAGGAAATAAGGAGAACATTATGGAATGATTTTCTGTCCTCGCAGAAGTAAAACAAAC--AATGTGCTTTG--AGTGTTAAGAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79994014 143 + 210400635 ----ACAAGAAGGGACTCAGAGTATTTATTAATCAGCCTAGCATTCAATTCTCATTTTTCTTTTT----TCAATGAGGAAATAA------CATTATGGAATTATTTGTAATCTTTACAGAAGTAAAACAAACATAGTGTGCTTTC--AGTGTTAAGAAA i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6278440 143 + 85426708 AAAAGAAATAGGCAGCTTTGAGGGTTTCTAAATCAA---------TAATCTTCATTCTACCTTCA----TCAGTGATGAAATAAAGAGAACATTAGGGAATAATTTATAATCTTTTCATTAACAAAACAAATATATTGTTCTTTGGCACATTTAAG--- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I a score=4095.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 57287 1 + 137718 T s panTro4.chrUn_GL393525 256286 1 + 371432 T i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr1 123765947 1 + 229507203 T i gorGor3.chr1 N 0 N 0 s nomLeu3.chr1a 82131250 1 - 122973662 T i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62020934 1 + 95678458 T i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61917248 1 - 96509753 T i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 50310 1 + 180295 T i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23898546 1 - 90373283 T i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79994157 1 + 210400635 T i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6278583 1 + 85426708 T i canFam3.chr2 C 0 C 0 e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I a score=417590.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 57288 157 + 137718 CAAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTGTATGGAGAAGTTAAGACCATCCCATCTCTATGTTATGCCACAATGCT----------------CCTCTATAGCACACAACTTGGCTCCGAAA---TTTTGAAAGTCAAAATACTAACCTACTATGTGTCTCTGATA s panTro4.chrUn_GL393525 256287 157 + 371432 TAAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTCTATGGAGAAGTAAAGACCATCCCATCTCTATGTTATGCCACAATGCT----------------TCTCTATAGCACACAACTTGGCTCTGAAA---TTTTGAAAGTCAAAATAATAATCTACTATGTGTCTCTGATA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82131251 173 - 122973662 CAAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTTCAAGCTTGTTTGTTTGGAGAAGTTAAGATCATCCCATCTCTATGTTATACCACAATGCTGTTATACCACAATGCATCTCTAGAGCACATAACTTGGCTCTGAAA---TTTTGAAAGTCAAAATACTAATCTACTATGTGTCTCTGATA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62020935 157 + 95678458 CCAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTGTATGGAGACATTAAGACCATCCCATCTCTATGTTATACCACAAGGCT----------------TCTCTATAGCACACAAGCTGGCTCTGAAA---TTTTGAAAGTCAAAATACTAATCTACTATGTGTCTCTGATA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61917249 157 - 96509753 CCAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTGTATGGAGACATTAAGACCATCCCATCTCTGTGTTATACCACAAGGCT----------------TCTCCATAGCACACAAGCTGGCTCTGAAA---TTTTGAAAGTCAAAATACTAATCTACTATGTGTCTCTGATA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 50311 157 + 180295 CAAATGCAATTTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTGTACGGAGAAGTTAAGACAATCCCATCTCTATGTTATACCACAATGCT----------------TCTCTATAGCACACAACTTGGCTCtgata---ttttgaaattcaaaataccAATCTACCATTTGTCTCTGATA i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23898547 157 - 90373283 CAAACGCAATCTCTCCTTTACCTTACTCCAAGCTTGTTTGTATGGAGACGTTAAGACTATCCCATCTCTGTGTTATACCACAAGGCT----------------TCTCTATAGAACACAACCTGGCTCTGAAA---TTTTGAAAGCCAAAATACTAATCTACTATGTGTCTCTGATA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 79994158 157 + 210400635 CAAATGCAATTTCTTCTTTGCCTTACTTCAAGCTTCTTTGTGTGGAGAAGTAAGGACCATCTCATCTCTATGTTATACCACAATGTT----------------TCTCTATAGCACACAACTTGACTCTGAAA---TTTTGAAATTCAAAATACAAATCTGCTATTTGTCTCTGATA i calJac3.chr1 C 0 I 11 s canFam3.chr2 6278584 159 + 85426708 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AATTGCCTGAACATTACCTGATTTTGAAGTGCTGCACTCCTAAGACCTTTTCTTGGAATGAGTTAAACTTTTTATTCCAGGAATCCTCTACTGAGCTAGAAAGCAGAGCTGTGCA----TCTCTGTTTCAGTAAAAGGAGGTCAATACAGGGAACTGTGGTTTCTGAGAATGCAAGATCTGCACTAAGAAAAGGATTAGC--CACAGTGC----TACCCAAGAGAAGCAGCTACCAGGAGGAAAGAGGGTC----TGTAAAC-TGCAAGATGATTACT---TCA-CTTGATTTCCACTGAGGAAAGCTGGTGGCTCAGACTTAAACTTCTCCTTCCTAGATGGTAAACATCTATGGAAGGTTCTATGGATTATAATGAGTTAGTAAAACATAATGCACTAAATATTAGA---CTATGTCAGCAGATCC i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82131424 406 - 122973662 AATTGCCTGAACATTACCTGATTTTGAAGTGCTGCAATCCTAAGACGCTTTCTTGGAATGAGTTAAACTTTATATTCCAAGAATCCTCTACTGAGCTAGAAAGCAGAGCTGTGCA----TCTCTGTTTCAGTAAAAGGAGGTCAATACAGGGAACTGTGGTTTCTGAGAATGCAAGATCTGCACCAAGAAAAGGATTAGC--CACAGTGC----TACCCAAGAGAACCAGCTGCTAGGTGGAAAGAGGATC----TGAGAAC-TGCAAGATGATGACT---TCA-CTTGATTTCCACTGAGGAAAGCTGGCAGCTGAGACTTAAACTTCTCCTTCCTGGATGGTAAACATCTATGGAAGATTCTATGAATTATAATGAGTTAGCAAAACATAATGCACTAAATATTAGA---CTATGTCAGCAGATCC i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62021092 408 + 95678458 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AATTG-CTGAATATTACCTGATTTTTAACTGCTGCGCTCCTAAAAC-TTTTCTTGGAATGAGTTAAACTTTTTATTCCAAGAATCCTCTAGTAAGCTAGAAAGCAGAGCTGTGCA----TCTCTGTTTCAGTCAAAGGAGGTCAATACA-GAAACTGTGGTTTCTGAGAATGCAAGATCTGCACCAAGAAAAGGATTAGC--CACAGTGC----TACTCAAGAGAACCAGCTACCACGTGGCAAGAGGATC----TGCGAAC-TGGAAGATGATGACT---TCA-CTTGGTTTCCACTGAGGAAAGCTGGCAGCTCAGACTTAAACTTCTCCTTCCTGGATGGTAAATATCTATGGATGATTCTATGAATTATAATGAATTAGTAAAACATAATGCACTAAACAGTAGA---CTATGTCTGCAGATCC i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23898704 402 - 90373283 AATTGCCTGAACATTACCTGATTTTTAAGTGCTGCACTCCT------TTTTCTTGGAATGAGTTAAACTTCATATTCCAAGAATCCTCTACTGAACTAGAAAGCAGACCTGTGCA----TCTCTGTTTCAGTGAAAGGAGCTCAACACAGGGAACTGTAGTTTCTGAGAATGCAAGATCTGCACCAAGAAAAGGATTAGCCACACAGTGC----TACACAAGAGAACCAGCTACCAGGTGGAAAGAGGATC----TGCGAAC-TGAAAGATGATGACT---TCA-CTTGATTTCCATTGAGGAAAGCTGGCGGCTCAGACTTAAACTTCTGCTTCCTGGATGGTAAACATCTATGGAAGATTCTATGAATTATAATGAGTTAGCAAAACATAATGCACTAAATATTAGA---CTATGTCAGCAGATCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6278743 379 + 85426708 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chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6279122 3 + 85426708 tat i canFam3.chr2 C 0 C 0 e calJac3.chr1 79994315 11 + 210400635 I e tarSyr2.KE941306v1 72517 7166 + 419730 I a score=55390.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 57854 38 + 137718 GACCAAAACTTACTGAAAATATAACTATAGCGGGAGGC-- s panTro4.chrUn_GL393525 256853 38 + 371432 GACCAAAACTTACTGAAAATATAACTATAGTGGGAGGC-- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82131833 38 - 122973662 GACCAAAACTTACTGAAAATAAAACTATAGTGGGAGGC-- i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62021634 38 + 95678458 GACCAAAACTTAATGAAAATAAAATGACAGCAGGAGGC-- i rheMac3.chr10 I 131 C 0 s macFas5.chr10 61918121 38 - 96509753 GACCAAAACTTAATGAAAATAAAATGACAGCAGGAGGC-- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 50874 38 + 180295 GACCAAAATTTACTGAAAACGAAACTATAGAGGGAGGC-- i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23899109 38 - 90373283 GACCAAAACTTAATGAAAATAAAACGACAGCAGGAGGC-- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6279125 38 + 85426708 atacaaaattaacacgaaatatta--agagctagaattat i 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calJac3.chr1 C 0 C 0 e canFam3.chr2 6284866 315 + 85426708 I e chlSab2.chr2 23905851 29 - 90373283 I e tarSyr2.KE950423v1 43681 7166 - 1054607 I e papAnu2.JH684937 57642 326 + 180295 I e panTro4.chrUn_GL393525 263324 0 + 371432 C a score=87573.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 65805 38 + 137718 ttgagatggagtctcccac-tgtcacccaggttggagtg s panTro4.chrUn_GL393525 263324 35 + 371432 ---agatggagtctcccac-tgtcacccaggctggagtg i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1285126 38 - 4212913 ctgagatggagtctcccac-tgtcacccaggctggagtg i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82138331 38 - 122973662 ttgagatggagtcccccac-tgtcacccaggctggagtg i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62028357 38 + 95678458 ttgagatggagtctcccac-tgtcacccaggctggaatg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61924856 38 - 96509753 ttgagatggagtctcccac-tgtcacccaggctggagtg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23905880 38 - 90373283 ttgagatggagtctcccac-tgtcacccaggctggagtg i chlSab2.chr2 I 29 C 0 s calJac3.chr1 80007499 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cagtggcacgatctccgctcaacacaacctccacctcctgggttcaagcaattctcctgcctcaccctcccaagaagataggatcacaggtatgtgctaccacgcccggctaatttttcatatctttagtagagacagggtttcactatgttggccagactgatcttgaactcctaacctcatgatctgcctgccttagcctcccaaagtgctgggattacaggactgagccaccacgctcag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 57968 241 + 180295 CAAcagcgcgatctccactcactgcaacctccacctctcgggttcacgtgattatcctgtctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgcccaccacctcacccagctaattgtt--tgtttttagtagagatggggtttcactatgttggccaggcaggtcttgaactcctgacctcatgatccgcccacctcggtctctcaaagtgctgggattacaggcatgagccaccatgcccgg i papAnu2.JH684937 I 326 C 0 s chlSab2.chr2 23905918 243 - 90373283 cagtggcaccatctcggctcaacacaacctccacctcctgggttcaagcaattctcctgcctcaccctcccaagaagataggatcacaggtatgtgctaccatgcccggcaaatttttcatatctttagtagagacaaggtttcactatgttggccagactgatcttgaactcctaacctcatgatctgcttgccttagcctcccaaagtgctgggattacaggactgagccaccacgcccag i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80007538 243 + 210400635 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panTro4.chrUn_GL393525 263742 77 + 371432 CCACACGCTCATACATTGCTACTTGGTGCAGATTACTTTTGTAGATAGTGAATCTTGTCTATTTTA-------------TGTTGGCTCTC--- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1285549 77 - 4212913 CCACACGCTCAGACATTGCTACTTGGTGCAGATTACTTTTGTAGACAGTGAATCTTGTCTATTTTA-------------TGTTGGTTCTT--- i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82138754 77 - 122973662 CCACACGCTCAGACATTGCTACTTGGTGCAGATTACTTTTGTAGATAGTGAATCTTGTCTATTTTA-------------CGTTGGTTCTT--- i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62028781 90 + 95678458 CCACACACTCATACATTGCTACTTTGTGCAGATTACTTTTGCAGATAGTGAATCTTGTATATTCTATTCTTGTCTATTCTGTTGGTTCTT--- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61925280 90 - 96509753 CCACACACTCATACATTGCTACTTTGTGCAGATTACTTTTGCAGATAGTGAATCTTGTATATTCTATTCTTGTCTATTCTGTTGGTTCTT--- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 58351 77 + 180295 CCACACACTCATACATTGCTACCTGGTGCAGATTACTTTTGTAGATAGTGAATCTTGTCTATTTTA-------------TGTTGATTCTT--- i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906304 90 - 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papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906394 4 - 90373283 ATTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80008042 4 + 210400635 ATTG i calJac3.chr1 C 0 C 0 s saiBol1.JH378298 1886773 4 + 2064692 ATTG i saiBol1.JH378298 n 2022 I 57714 s canFam3.chr2 6285408 4 + 85426708 attt i canFam3.chr2 C 0 C 0 e tarSyr2.KE950423v1 43681 7166 - 1054607 I a score=14007.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 66309 4 + 137718 ATGT s panTro4.chrUn_GL393525 263823 4 + 371432 ATGT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1285630 4 - 4212913 ATGT i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82138835 4 - 122973662 ATGT i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62028875 4 + 95678458 ATAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61925374 4 - 96509753 ATAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 58432 4 + 180295 ATGT i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906398 4 - 90373283 ATAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80008046 4 + 210400635 ATGT i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6285412 4 + 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panTro4.chrUn_GL393525 263914 53 + 371432 TCTTTTTTGGACCAGTATACTTTGTCCC-ttttttgttttaca-------tttttaatttt---- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1285730 42 - 4212913 TCTTTTTTGGACCAGTCTACTTTGTCCC-ttt------------------ttttctccttc---- i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82138935 41 - 122973662 tcttttttGGACCAGTATACTTTGTCCt-tt-------------------ttttctttttc---- i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62029010 41 + 95678458 TCTTTTTTGGACCAGTATACTTTGTCCC-tt-------------------ttttccctttt---- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61925474 41 - 96509753 tcttttttGGACCAGTATACTTTGTCCC-tt-------------------ttttccctttt---- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 58716 41 + 180295 tctttttttgaccactatactttgtcct-tt-------------------ttttctttttc---- i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906498 42 - 90373283 tcttttttGGACCAGTATACTTTGTCCCttt-------------------ttttccctttt---- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80008146 41 + 210400635 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ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82138985 177 - 122973662 gagatggagtcacactgtgtcattcaggctggagtgc-agtggcgccatcttggctcactgcaacttccacctcctgggttcaagtgattctcctgcctcggcctcccaagtagctagaactacaggtgcacaccaccatgcctggctaat-ttttgtattttcagtagagacagggtt i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62029053 170 + 95678458 gagatggagtcacactgtgtcatccaggctggagtgc-agtggtgccatcttggctttctgcaacttccacctcctgagtccaagtgattctcctgcctcagcctcccgaggagctgg-------ggtgcccaccaccaagcctggctaat-ttttatattttcagtagagacagggtt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61925517 177 - 96509753 gagatggagtcacactgtgtcatccaggctggagtgc-agtggtgccatctcagctcactgcaacttccacctcctcggttcaagtgattctcccgcctcggtctcccaagtagctgggactacaggtgcccaccaccaagcctggctaat-ttttatattttcagtagagacagggtt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 58770 177 + 180295 gagatagagtcACAGTctcttatccaggctggagtgc-agtggtgtcacgtcggctcactgcaacttccatctcctgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctaagtagctgggactacagttgcacaccactacaccaagctaat-ttttgtattttcagtagagacaggggt i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906542 177 - 90373283 gagatggagtcacactgtgtcatccaggctggagtgc-agtggtgccatctcagctcactgcaacttccacctcctgggttcaagtgattctcctgcctcggtctcccaagtagctgggactacaggtgcccaccaccaagcctggctaat-ttttatgttttcagtagagacagggtt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80008196 175 + 210400635 aag---gaatcacactctgtcatctaggctaaagtgtaagtggtgccatctcagctcactgcaacttgcacctcttgggttcaagtgattctgctgcctcagcctcccaaatagctggggctacaggtgcaccttaccatgcccagctaat-ttttgtatttttattagagacagggtt i calJac3.chr1 C 0 C 0 s tarSyr2.KE941306v1 79692 177 + 419730 gagttagagtctcactgtgttgcccagactggagggc-agtgacacgttcacggct-accacagccttgacctgctgggctcaggtgatccttctgcttcagccttcctagtagctggaattgcaggcgcatgccaccacccccagctaatgtttttgatttattgtagagacgaggtc i tarSyr2.KE941306v1 C 0 C 0 e saiBol1.JH378298 1886777 57714 + 2064692 I e canFam3.chr2 6285655 161 + 85426708 I a score=303182.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 66650 108 + 137718 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macFas5.chr10 61925694 95 - 96509753 tcaccatgttggccaggc------tgtttttgaacttctgacctcaggtaacccacccacctcagcttccccaaatattgggattaca-------------gCACCCAG----------------------------CCCTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 58947 108 + 180295 ttgccatgttggccaggt------tgttcttgtacttctggcctcaggcaatccacccacctcagtctcccaaagtgttggaattacaggcatgagccatggcacccag----------------------------ccctt i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23906719 95 - 90373283 tcaccatgttggccaggc------tgtttttgaacttctgacctcaggtaatccacccacttcagcctcccaaaatattgggattaca-------------gCACCCAG----------------------------CCCTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80008371 108 + 210400635 tcaccatgttggctaggc------tgtttgtgaactcctgaacttaggtgatccacccgcctcagcccctcaaagtgttgggattacagacgtgagccactgcacccgg----------------------------cTCTT i calJac3.chr1 C 0 C 0 s tarSyr2.KE941306v1 79869 136 + 419730 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s panTro4.chrUn_GL393525 265466 906 + 371432 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i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1287321 904 - 4212913 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i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82140523 895 - 122973662 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i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62030420 953 + 95678458 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i rheMac3.chr10 I 91 C 0 s macFas5.chr10 61926880 907 - 96509753 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i tarSyr2.KE941306v1 I 1 C 0 s canFam3.chr2 6290342 911 + 85426708 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i canFam3.chr2 C 0 I 120 e saiBol1.JH378298 1886777 57714 + 2064692 I a score=141316.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 68882 48 + 137718 gtggagggacatgg----aggaaggctgcagtcatgcctaggagatgtgggg s panTro4.chrUn_GL393525 266372 48 + 371432 gtggagggacatgg----aggaaggctgcagtcatgcctaggagatgtgggg i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1288225 48 - 4212913 gtggagggacatgg----aggaaggttgcagtcatgcctagcagatgtaggg i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82141418 48 - 122973662 gtggagggacatgg----aagaaggttgcagtcatgcctaggagatgtgggg i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62031373 48 + 95678458 gtgaagggacatgg----aggaaggctgcagtcatgcctaggagatgtgggg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61927787 48 - 96509753 gtgaagggacatgg----aggaaggctgcagtcatgcctaggagatgtgggg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 61454 48 + 180295 GTGGAGAGACGTGG----AGAGGGGTTGCAGTCATGGCTAAGAGATGTGGGG i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23908944 48 - 90373283 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tarSyr2.KE941306v1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6291373 78 + 85426708 tttcttttcagggtgataaa------aatgctctgatggcagtgagagtcgcacaactctataaatgtactcagagacaactac---- i canFam3.chr2 I 120 C 0 e saiBol1.JH378298 1886777 57714 + 2064692 I a score=312449.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 68984 107 + 137718 acattttaaatggttgaactctctcaaatgtgaatgatatctcagtgaaa--ctgttTTTAAAATCCAAAGGCAGGATCAAGAT-AATTTTCTCAACTCTCAATTTTTGA s panTro4.chrUn_GL393525 266474 107 + 371432 acattttaaatggttgaactctctgaaatgtgaatgatatctcagtgaaa--ctgttTTTAAAATCCCAAGGCAGGATCAAGAT-AATTTTCTCAACTCTCAATTTTTGA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1288327 104 - 4212913 acattttaaatggttgaactgtctgatacatgaattatatctcagtgaaa--ctgttTTTAAAATCCAATGGT--GATC-AGAT-AATTTTCTCAGCTCTCAAGTTTTGA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82141520 107 - 122973662 acattttaaatggttgaactgtctgatacatgaattatatctcagtgaaa--ctgttTTTAAAATCCAATGGCAGGATCGAGAT-AATTTTCTCAGCTCTCAATTTTTGA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62031475 108 + 95678458 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canFam3.chr2 C 0 C 0 e saiBol1.JH378298 1886777 57714 + 2064692 I e calJac3.chr1 80010960 0 + 210400635 C a score=151522.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 69091 68 + 137718 CTTACATGCTATATCAAATCTAAATATTTTTAGAGTTTTATAGTATATTTTAAATTA----AAG----ATAAAGAA s panTro4.chrUn_GL393525 266581 68 + 371432 TGTACATGCTATCTCAAATTTAAATATTTCTACAGTTTTATAGTATATTTTAAATAA----AAG----ACAAAGAA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1288431 72 - 4212913 TGTACATACTGTATCAGATCTAAATATTTCTATACTTTTATAGTATATTTTAAATAA----AAGGTAAATAAAGAA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82141627 72 - 122973662 TGTACATACTATATCAGATCTAAATATTTCTACACTTTTATAGTATATTTTAAATAA----AAAGTAAATAAAGAA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62031583 68 + 95678458 TGTACATACTATATCAAATCTAAATATTTCTACAGTTTTATAGTATATTTTAAATAA----AAG----ATAAAGAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61927996 68 - 96509753 TGTACATACTATATCAGATCTAAGTATTTCTACACTTTTATAGTATATTTTAAATAA----AAG----ATAAAGAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 61697 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AACTAGGTACAACATGTATCCAGAACCAAATG----TTTAAATTTTCTTTCTAGAAG-----------------TTTG-AAAGTATTTATCTTCCTTGGTACTTACTACTCTTTCTGTTT----TCTCTTTCTCATATTGAAAGAGACTTTCTTTTAAATAATTATATTCATTCATTCGCTTCTTATTTTTCTCTTCTAGCAGGAGGTCTTTCTTTCCACTCTCAAT----------------AAAGCCT--------CTTTGGATATTAATTACTATC---TCTTCATGATCCTCTTTCTGATGAACATCATCTAGTTGCTGTACAAGCCACAGATTTTCACGTTGGAGTTGACATATCCTCTCTTCTACACAGTTCCACTTTCCAGTGGATTTACTCACTTCAGCTTCTGCATTTTGATACATCTCTTTCATTTCCTTTATTTGCTGCTGTGTTTGGCTTAGGTCGTTTTGTACAGTTTCTAAAGCCAGTGACTTTTTTCTGAGAGTATCTCTTGTCTTA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62033769 469 + 95678458 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AACTGGGTTCGACATGTATCCAGAACCAAATG----TTTAAATTATCTTTCTAGAAG-----------------TTTG-AAAGTATTTATCTTCCTTGACACTTACTACTCTTTCTGTTT----TCTCTTTCTCATACTGAAAGACACTTTCTTTTAAATGATTATATTCATTCATTCGCTTCTTATTTTTCTCTTCTAGCAGGAGGTCTTTCTTTCCACTCTCAAT----------------AGAGCCT--------CTTTGGATATTAATTACTATC---TCTTGATGATCCTCTTTCTGATGAACATCGTCTAGTTGCTGTTCAAGCCGCAGATTTTCACGTTGGAGTTGACATATCCTCTCTTCTACACAGTTCCACTTTCCAGTGGATTTACTCACTTTTGCTTCTGCATTTTGATACATCTCTTTCATTTCCTTTATTTGCTGCTGTGTTTGGCTTAGGTCATTGTGTACAGTTTCTAAAGCCAATGACTTTTTTCTGAGAGTATCTCTTGTCTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684937 63951 459 + 180295 aactaGGTTCAACATACAGCCAAAATGAAATG----CTTaaatt-tctttccagaag-----------------gtTA-AAAAGtttt------cttcatacttacttctccttctgctt----cttctttttcatactgaaacagtttttcttttaaataattatattcattcattaattccatatttttttcttct---gtaagatCTTCCTTTCCATTCTCAAG----------------ACAGTCT--------TCTTGGATATTAATGACTATC---TCTTTATTATTGCCTTCCTTATAAGCATCCTTTACTTGTTGTTCAAGCAATAGATTTTCAAGTTCTTGTTGATGTATTCTCTCCTCTAAAGAGTTCTGCTTTCCAAAGGATTGACTTTCTTTAGCTTCCTCATTTGGATGCATCTGCTTCATTTCCTTTAATCGATACTGCGCTTGCTTTAGGTCCATCTGTACACTTTCTAAAGCCAGTGTCTTTTCCCTGAGAGCATCTCTTGTCTCA i papAnu2.JH684937 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23911353 484 - 90373283 AACTAGGTTCAACATGTATCCAGAACCAAATG----TTTAAATTATCTTTCTAGAAGTATTTCTAGAATATTTCTTTG-AAAGTATTTATCTTCCTTGACACTTACTACTCTT--TGTTT----TCTCTTTCTCATACTGAAAGACACTTTCTTTTAAATGATTATATTCTTTCATTCGCTTCTTATTTTTCTCTTCTAGCAGGAGGTCTTTCTTTCCACTCTCAAT----------------AGAGCCT--------CTTTCGATATTAATTACTATC---TCTTGATGATCCTCTTTCTGATGAACATCATCTAGTTGCTGTTCAAGCCTCAGATTTTCACGTTGGAGTTGACGTATCCTCTCTTCTACACAGTTTCACTTTCCAGTGGATTTACTCACTTCAGCTTCTGCATTTCGATACATCTCTTTCATTTCCTTTAATTGCTGCTGTGTTTGCCTTAGGTCGTTTTGTACAGTTTCTAAAGCCAATGACGTTTTTCTGAGAGTATCTCTTGTCTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80013123 469 + 210400635 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papAnu2.JH684937 64572 418 + 180295 aaaatttcaTTGTACTCATTTATAGCAGTGGCCAGGCTAGAATGGAGGGATTCAACTTCAGCTTCTAGTCTTTCTTTGCTGTGTTTTTCCTTCTCCAATTTTGAATTCAGCCTTGTATTCTCAGCTTTCAGTTCATTAAGCTGTTGCG--AATACTGGGCCGTTGTTTTTGTTATCATTTCGTCATTGAGTCTTACACTCTTTTCAAAGTTAGCATTCATTTCTgtaatacttttaatttcctgaatatattctttttcctttctgagactgtcattttttattgtgtataatTCCTGTTTGAGCATGGCAATGTCTCTCTTCAACATGTAATTTCCATACATCACATCCTTCTTTCTTCCATAACTTTGAGAatcctaaataaaacaaaac-aaatttttagcTAGCACTCAACAAAATA----- i papAnu2.JH684937 C 0 I 5 s chlSab2.chr2 23912002 421 - 90373283 ACACTTTCACCGTGTTTACTTACAGCAGCAGCCAGTCTAGACTGATAGGATTCAATTTCAGCTTCCAGTCTTGCCTTGCTTTCTTTTTCCCTCAACAGTCTGGAATTGAGCCCTGTATTCTCAGCCTTGAGATCATGAAGCTCTTGTATCAATACTGGAATGCTGTTTTTGTGATTGTTTCCTCATTGAGTTTTATACTCTTTTCAAGGTAAGCGTTTATTTCTTTAACAATTTTAATGTCCGTAAGACATTTAttttctttttccaggttgtcatttttcattgtgcatatttcCCGTCTGAGTATAGCAACATCTGTCTTCAAAATGCAATTTTCATCCATCAGATCTTTCATTTCTTCATGATTATGAAAATCCTAAATAAAACAAAAAGAAAGTTTTACCTAGTACTCAATAAAATA----- i chlSab2.chr2 C 0 I 4 s calJac3.chr1 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saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e rheMac3.chr10 62034820 171 + 95678458 I a score=83108.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 72371 34 + 137718 AAATTTATTTAAA-GTCAATGAATTTATAAAAGTA s panTro4.chrUn_GL393525 270283 35 + 371432 AAATTTATTTAAAAGTCAATGAATTTATAAAAGTA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1291820 34 - 4212913 AAATTTATTTAAA-GTCAATGAATTTATAAAAGTA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82145029 34 - 122973662 AAATGTATTTAAA-GTCAATGAATTTATAAAAGTA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s macFas5.chr10 61931387 34 - 96509753 AAATGTATTTAAA-GTCAATGAATTTATAAAAGTA i macFas5.chr10 C 0 I 2 s papAnu2.JH684937 65449 34 + 180295 aaatttatttgat-gTCAATGAAtccataaaacac i papAnu2.JH684937 I 323 I 11 s chlSab2.chr2 23912563 34 - 90373283 AAATGTATTTAAA-GTCAATGAATTTATAAAAGTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80014305 34 + 210400635 aaatttatctgaa-gttaatgaatccataaaagta i calJac3.chr1 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6295100 34 + 85426708 AAATGTAATTGAA-GACAATGAATGCATGAAAGGA i canFam3.chr2 C 0 C 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AACAC--ACACACACACGCACAC------------------CAGATAATTTTTAAGAATTTC--AGAAT------------------------------TGGAAAAGCCTTTCCCTGAATTACAACAAACTC-----------AAAAGTATAAATTAAAGCATCAACAAATTTGACTAAA---TTAAAATATATC----AAAAAATTGCATTTACACTTTGATATCTAACCCATACACCACCCTATAGTAAGAACCTTA-GTTC-ACACGTATTTGGACAGATAAAATTTCCCAGAGTTACTACAGTTCAGTTTCACTGATAACATTCTATTTCAATTTGACTCCTTTAACACTTTTATAGTCAGTTATAAGAATTACATTTAC---TAAATCATAAATCTAGACATTATAC--TAGTCACTCCTATACATATTCATTGGTGAACTCATCTAGTTACCACAAT----TTTGAGAAAGAAAGGTTAAAA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82145063 418 - 122973662 AacacacacacacacatacacacgcatgcacacacacacacCAGAGAATTTTTAAGAATATC--AGAAT------------------------------TGGAAAAGCCTTTCCCTGAATTACAACAAACCC-----------AAAAGCATAAATTAAAGCATTAACACATTTGACTAAA---TTAAAATATATA----AAAAAATTGCATTTACACTTTGCTATCTAACCCATACACCACCCTATAGTAAGAACCTTA-GTTC-ACACGTATTTGGACAGATAAAATTTCCCAAATTTGTTACAGTTCTGTTTCACTGATAATATTTTATTGCAGTTTGACTCTTTTAACACTTTTATTGTCAGTTATAAGAATTACATTTAC---TAAATCATAAATCTAG-----ATAC--TAGTCACTCCTATATATATTCATTGATGAACTCATCTAGTTACCACAAT----TTTGA----GAAAGGTTAAAA i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62034991 424 + 95678458 Aacacacacacacactcacacac----gcacacacgcacacCAGAGAATTTTTAAGAATATC--AGAAT------------------------------TGGAAGAGCCTTTCCCTGAATTACCACAAACCC-----------AAAAGCAGAAATTAATGCATTAACAAATTTGATTAAA---TTAAAATATATC---CAAAAAATTGCATTTATACTTTAATATCTAACCCATTCACCACCCTATAGTAAGAATCTTA-GTTC-ACATGTATTTGGACAGATAAAATTTCCCAAAGTTATTATACTTCTGTTTCACTGATAATATTCTATTGCAATTTGACTCTTTTAACAATTTTATAGTCAGTTGTAAGAATTACATTTAC---TAAATCATAAATCTAGACATTATAC--TAGTCACTCCTATATACATTCATTGATGAACTCATCTAGTTACCACAAT----TTTGAAAAAGAAAGGTTAGAA i rheMac3.chr10 I 171 I 335 s macFas5.chr10 61931423 424 - 96509753 cacacacacacacacacacacac----gcacacacgcacacCAGAGAATTTTTAAGAATATC--AGAAT------------------------------TGGAAGAGCCTTTCCCTGAATTACCACAAACCC-----------AAAAGCAGAAATTAATGCATTAACAAATTTGATTAAA---TTAAAATATATC---CAAAAAATTGCATTTATACTTTAATATCTAACCCATTCACCACCCTATAGTAAGAATCTTA-GTTC-ACATGTATTTGGACAGATAAAATTTCCCAAAGTTATTATAGTTCTGTTTCACTGATAATATTCTATTGCAATTTGACTCTTTTAACAATTTTATAGTCAGTTGTAAGAATTACATTTAC---TAAATCATAAATCTAGACATTATAC--TAGTCACTCCTATATACATTCATTGATGAACTCATCTAGTTACCACAAT----TTTGAAAAAGAAAGGTTAAAA i macFas5.chr10 I 2 I 340 s papAnu2.JH684937 65494 401 + 180295 cacacacacacacacacacacac----acacacacacactctagagaatttttaagaatatc--agaat------------------------------tggaaaaacctttCTCTGAATTACAACaaactc------------aaagcataaagttaaatgttaaaaattttgactaaaatcttgaaaaa--------agaaaattgcatttaTACTCTGATATCTAACCC-----------------AAGAGCTTTACCTCC-ACATCTATTTGGACAGATAAAATCtctcaaagttttaaaagttctgtTTCCCTGATCATATTGTATTGTGATTTGACTC----AAC-ATTTTTTAGTCAGTTGTAAGAATTACATTTAC---TAAACCATAAATCTAGACATTGTAC--TAAGCACTTCTACATACAAACATTGATGAacttatttaatcatcacaat---cCTTAAAGAAGAGAGGTTAAAA i papAnu2.JH684937 I 11 C 0 s chlSab2.chr2 23912597 454 - 90373283 --Aacacacacacacacacacac----acacacacacacacCAGAGAATTTTTAAGAATATCTTAAAATTAAGATATTCTTAATTTTATAGGCTCTTTATGGAAGAGCCTTTCCCTGAATTACCACAAACCC-----------AAAAGCAGAAATTAATGCATTAAGAAATTTGACTAAA---TTAAAAGATATC---AAAAAAATTGCATTTACACTTTGATATCTAACCCATTCATCACCCTATAGTAAGAACCTTA-CTTC-ACATGTATTTGGACAGATAAAATTTACCAAAGTTATTACAGTTCTGTTTCACTGATAATATTCTATTGCAATTTGACTCTTTTGACACTTTAAAAGTCAGTTATAAGAATTACATTTAC---TAAATCATAAATCTAGACATTATAC--TAGTCACTCCTATATACATTCATTGATGAACTCCTCTAGTTACCACAAT----TTTGAAAAAGAAAGGTTAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr1 80014339 397 + 210400635 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0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e canFam3.chr2 6295605 220 + 85426708 I a score=414.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 72924 2 + 137718 TG s panTro4.chrUn_GL393525 270821 2 + 371432 CG i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 1292357 2 - 4212913 CA i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82145577 2 - 122973662 CG i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e canFam3.chr2 6295605 220 + 85426708 I e chlSab2.chr2 23913147 0 - 90373283 C e rheMac3.chr10 62035846 0 + 95678458 C e calJac3.chr1 80014832 0 + 210400635 C e papAnu2.JH684937 65991 0 + 180295 C e macFas5.chr10 61932283 0 - 96509753 C a score=459690.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 72926 264 + 137718 GAAGAAAACTTTTATTTCAAAACACCAATGGTAAATAAGATAAAATTTATAGAGCTCTTCTTAGAATATCATGAGATTATTTGTGATTGCAATAA--TT--TGTTTCCTCTTTATAATATTAGGTACAGTAATCAATATGAAATAGGGGAAAGTACAAGGAACAATTTTACTGGGAACAGAATCTTTATCAATAGGTTATCACTAAGTATATACTATGGCATATTATTGTTTTCAAAAGCTCTTTGTTATAAAATAATATCTTATGTG s 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chlSab2.chr2 C 0 I 12 s calJac3.chr1 80017334 50 + 210400635 gccattgcactcc-a-cctttagtagcagagtaagaacctgtctctacaaac i calJac3.chr1 C 0 I 6 s canFam3.chr2 6322011 51 + 85426708 GTTCTTTTGCTCCTA-CACTGTATGGGACAATCTCAACCTCTCTgagagaag i canFam3.chr2 I 143 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I a score=41778.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 79999 21 + 137718 ag-----gaaaaaaaaaaggctcaga---- s panTro4.chrUn_GL393525 277899 20 + 371432 ag------aaaaataaaaggctcaga---- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr9 44823358 23 - 135191526 aa---aagaaaaaaaaaaGGCTCAGA---- i ponAbe2.chr9 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82152263 26 - 122973662 aggaaaagaaaaaaaaaaGGCTCAGA---- i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62042903 21 + 95678458 -----aaaaaaaaaaaaaGGCTCAGA---- i rheMac3.chr10 I 13 C 0 s macFas5.chr10 61960994 21 - 96509753 -----gaaaaaaaaaaaaGGCTCAGA---- i macFas5.chr10 I 21796 C 0 s papAnu2.JH684937 70817 21 + 180295 -----aaaaaggaaaaaaggctcAAA---- i papAnu2.JH684937 I 9 C 0 s chlSab2.chr2 23920119 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AGAAAATGCATTTGGGT-------------ttgttgtcgttgttgttgttgt---------tgttgttt-----gagatggaatatcactcttgctg-ccaggctgaagtgcaatagtgtgatctcagctcaccacaacctctgcctctcagattcaagctattctcctgcctcagcctcctgagtaactgggattacaggca i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62054478 183 + 95678458 AGAAAATGCATTTGGGTTTTGTGG------TGGTGGTGGTCATGGTTGTTGC---------TGTTGTTA-----gagatggagtttcactcttgctgccgaggctgaagtgcaatggtgcgatctcagctcaccgcaacctctgcctctcgagttcaagccattctcctgcctcagcctctggagtagctgggattacaggcA i rheMac3.chr10 C 0 I 173 s macFas5.chr10 61962272 183 - 96509753 AGAAAATGCATTTGGGTTTTGTGG------TGGTGGTGGTCATGGTTGTTGC---------TGTTGTTA-----gagatggagtttcactcttgctgcccaggctgaagtgcaatggtgcgatctcagctcaccgcaacctctgcctctcgagttcaagctattctcctgcctcagcctcccgagtaactgggattacaggca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23921390 188 - 90373283 AGAAAATGCATTTGGGTTTTgtgg------tggtggtggtcgtggtggttgt---------tgttgtTAGAGAtgagatggagtttcgctcttgctgcccaggctgaagtgcaatggtgccatctcagctcaccgcaacctctgcctctcgggttcaagctattctcctgcctcagcctcccaagttgctggaattacaggca i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e canFam3.chr2 6323006 0 + 85426708 C e tarSyr2.ABRT02249021v1 5113 983 - 15527 I a score=172798.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 81472 147 + 137718 tgtgccaccatgaacagctaattttgtgtttttagtagagatgggtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcccaacctcaagttatctgtccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacag----------------------gcactagccaccgcacc s panTro4.chrUn_GL393525 279338 147 + 371432 tgtgccaccatgaacagctaattttgtgtttttagtagagataggtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcccaaccccaggttatctgcccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacag----------------------gcacaagccaccgcacc i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr9 44824808 147 - 135191526 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90373283 C i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02249021v1 6096 1 - 15527 T i tarSyr2.ABRT02249021v1 I 983 N 0 s canFam3.chr2 6323937 1 + 85426708 C i canFam3.chr2 C 0 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e tupBel1.scaffold_128287.1-227454 115245 3948 + 227454 I a score=1545707.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 82339 809 + 137718 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chlSab2.chr2 C 0 C 0 s tarSyr2.KE946491v1 2261 78 - 17820 TTTTTTCATATGAAATGAATATGTCTAGACCTACTCTACATGCATAGGTTAGAGAGAACCATGAGATGAGAAGTAAAT i tarSyr2.KE946491v1 N 0 N 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e canFam3.chr2 6325229 334 + 85426708 I e tupBel1.scaffold_128287.1-227454 115245 3948 + 227454 I a score=683483.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 83396 408 + 137718 ggcacagtggctcccacctgtaatcccagcacattggcaagccgaggtgggcagatcacctgaggtcaggagttcaagagcagcctggccaacctggtgaaaccccatctctactagaaatagaaaaattagcagggtatggtagcacgtgcatgtagtatcagctactcgaggggctgaggcaggagaattgcttgaacctgagaggcagaggtggtaatgagccaagactgagccactgcactccagccttggtgacagaacaagactctgtctcaaaaacacaaacaaacaaaca---aaaaaCCTAATTGTTCCCATATAA------GTCTATGTTCATACAAGATCTGAAGAGTACACAACACCGTGAGACAGGACAGACATATATTTTAAAAGTTATATTCCTGATTTCTG s panTro4.chrUn_GL393525 281249 407 + 371432 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85426708 I e tupBel1.scaffold_128287.1-227454 115245 3948 + 227454 I a score=790169.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 83804 434 + 137718 TAAAAATAAAATAGTTGAATTTAAGCTTTCAAGACAAGTCAACGAAAAGAGC-AAAAAATGCAAAAGTGAAACTCGAAAGGTCATTTCCCCATCAAGGGCTCATGATCACTGGACATTCACAAAC-----TATACTGTTCAAAACATTAGATCTGAATTTTGATCCGAGTATCCCTTTAGTAGCAGTTTCATTCAAG----GATGTCCAAGAGGTAA-------------AATAAGAC--AATATCATTTGCTATTTTCAGTTTTCTTTTCTGAGAACAGCCCAGCATTCTTCTTCAGAGAAATGAATTGTCCTAACTTCATAGGCTAAAGGCTCA-TGAGTCATAGTTCTAAGGGCATTAATAAAATATGGTGGTGCATGCTTGTATTCTGAACTTTTCAGGTTTAAACTCTCATATAGTAAATGCTAATAGATACAAACTGATTAAAGAAAAGCCCTC s panTro4.chrUn_GL393525 281656 434 + 371432 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ponAbe2.chr9 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82156048 439 - 122973662 TATAAATAAAACTGTTGAATTTAAGCTTTTAAGACAAGTCAAGGAAAAGAGC-AAAAAACACAAAAGTGAAACTTGAAAGTTCATTTCACCAACAAGGCCTCACGATCACTGGACATTCACAAACTAATATATACTGTTCAAAACATTAGTTCAGAATTTTGATCTGAGTATCCCCAGAGTTTCAGTTTCATTTAAG----GATGTCCAAGAAGTCA-------------AATAAGAC--AATGTCATTTGCTCTTTTCAGTTTTCTTTTCTGAGAACAGCACAGCAAACTTCTTCAGAGAAATGAATTGTCCTAACTTCATAGGCTAAAGGCTCA-TGGGTTGTAGTTCTAAGGGCATTTATAAAATATGCTAATGCATGCTTGCATTCTGaactttttagctttaaattctcatatagtaaatactaatagatacaaactgattaaacaaaagccctt i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62057109 439 + 95678458 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macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23923915 439 - 90373283 TATAAATAAAACTATTGAATTTAAGCGTTTAAGACAAGTCAAGGAAAAGAGCAAAAAAATGTAAAAGTGAAACTTGAAAGTTCATTTCACCATCAAGGGCTCATGATCACTAGACATTCACAAACT-ATATATATTGTTCAAAACATTAGTTCTGAATTTTGATCTGAGTATCCCCGGAGTTTCAGTTTCATTCAAG----GATGTCCAAGAGGTCA-------------AATAAGAC--AATGCTGTTTGCTATTTTCAGTTTTCTTTTCTGAGAACAGCACAGCAAACTTCTTCAGAGAAATGAATTGTCCTAACTTCACAGGCTAAAGGCTCA-TGAATCACAGTTCTAAGGGCGTTTATAAACTATGGTGGTGCATGCTTCCATTCTGaacttttcagctttaaactctcatatagtaaacattaatagatacaaactgattaaacaaaagccttt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6325563 437 + 85426708 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96509753 tTAATCTGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23924354 9 - 90373283 tTAATCTGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_112877.1-131908 59707 9 + 131908 TGGAATAGG i tupBel1.scaffold_112877.1-131908 n 3948 n 3948 s canFam3.chr2 6326000 9 + 85426708 tggaattcc i canFam3.chr2 C 0 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I a score=59556.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 84247 39 + 137718 CATTATTTTTCTTTTTA-TTTCTTCA-------TTTATcagcaacag s panTro4.chrUn_GL393525 282099 39 + 371432 CATTATTTTTATTTTTA-TTTCTTCa-------tgtatcagcaacag i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr9 44827598 46 - 135191526 CAttatttttattttta-tttttTCATTCATCGTTTATCAGCAACAA i ponAbe2.chr9 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82156496 47 - 122973662 CATTATTTTTATTTTTATTTTTTTCATTCATCATTTATcagcaacag i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62057557 43 + 95678458 CATTATTTTTATTTTTC-TTTCTTTCTTCA---TTTATcagcaacag i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61965265 43 - 96509753 CATTATTTTTATTTTTC-TTTCTTTCTTCA---TTTATcagcaacag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23924363 43 - 90373283 CATTATTTTTATTTTTC-TTTCTTTCTTCA---TTTATcagcaacag i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 6326009 38 + 85426708 caataatttt-tttaaa-gattttta-------tttattcatgacag i canFam3.chr2 C 0 I 156 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e tupBel1.scaffold_112877.1-131908 59716 3948 + 131908 I a score=331218.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 84286 221 + 137718 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggtatgagggaatacaatgaacagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcacaccaatgtgggtacaagtggaaaatataatacaaaacacaccaaagaaagtggcagaaaggtatataaagtatataac-cactcacatactattttaggacac----aaaa-----------------------------------aattctgcatattatttctgggcatcaca--atgtag s panTro4.chrUn_GL393525 282138 221 + 371432 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggcatgagggaataccatgaacagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcacaccaatgtgggtacaagtgtaaaatataatacaaaacacaccaaagaaagtggcagaaaggtatataaagcgtataac-cactcacgtaccattttaggacac----aaaa-----------------------------------aattctgcatattatttctgagcatcaca--atgtag i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr9 44827644 225 - 135191526 GAGAGTCTAACTAAATGTGGTAAAGTGGTCTAAGGGAATACAATGAGAAGTCTAAAATGAATTAAACCAGAGATAATCATATCAATATGGATACATCTGGAAAATACAATACAAAATACACCAAAGAAAGTGGCAGAAAGGTATACAAAGTGCATAAC-CACTCGCATACCATTTTAGGACACAAATAAAA-----------------------------------AAATCTGCATATTATTTCTGAGCATCACA--ATATAG i ponAbe2.chr9 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82156543 225 - 122973662 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggtctaagggaatacaatgtaaagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcatatcaatgtggatacatctggaaaatataatacaacgtacaccaaagaaagtggcagaaaggtatataaagtgtataac-cactcgcataCCATTTTAGGACTCAAATAAAA-----------------------------------AAATCTGCATACTATTTCTGAGCATCACA--ATATAG i nomLeu3.chr1a C 0 C 0 s rheMac3.chr10 62057600 224 + 95678458 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggtttaagggaatacaatgaaaagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcatgtcaatgtggatgcatctggaaa--ataatacaaaacacaccaaagaaagtggcagaaaggtatgtaaagtgtataactcactcacataccattttaggacacaaataaAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------------------------------- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 61965308 226 - 96509753 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggtttaagggaatacaatgaaaagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcatgtcaatgtggatgcatctggaaa--ataatacaaaacacaccaaagaaagtggcagaaaggtatgtaaagtgtataactcactcacataccattttaggacacaaataaaa-----------------------------------aattctgcatattatttctgagcatcacacaatatag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 23924406 222 - 90373283 gagagtctaactaaatgtggtaaagtggtttaagggaatacaatgaaaagtgtaaaatgaattaaaccagagataatcatatcagtgtggatgcatctggaaaatataccacaaaatacaccaaagaaagtggcagaaaggtatgtaaagtgtataacccactcacataccattttaggacacaaataaaa-----------------------------------aattatgcatattatttctgagcatcaca------at i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e saiBol1.JH378105 7503254 57714 + 72162052 I e canFam3.chr2 6326047 156 + 85426708 I e tupBel1.scaffold_112877.1-131908 59716 3948 + 131908 I a score=2393448.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 84507 1369 + 137718 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AATCAATTCCTTTAAATAAACCTCAATATTGCCTAggcatggtggctcacacctgtaatcccagccctttgccaggccaaggtgggtggattgcttgagttcaggagtttgagaccagcctgggcaacataatgagaacacatctctacac-aaaaatacaaaaaggagtcaggctttatggtgtgtgcttgta-tcccagctgcttgggaggttgatgtgggaggatcacttgagatttagaggcggagactgtagtgagccaagatcatgccactacactccatcctgggcaacagaacaagaccctgactccacaaaaaTTTCAACTTAAAATGTGAGAACGAAGGGAGATACAAACAAAAAACAAGCCTAATTGGTCAATGAAATATGAGCTTACGCCAAGAAAGAAAATAAACAACATGAAGTACAATAAAGTAAATGGAGAAACAGATCTGTAACAGAGCCTTTTGGTCTTTCATATCCCTAATAATACTAATAAATATTTATGCTACAATTAG-TTTTTTGTAAGTACTTCTGTGATACAGTTTATTACTCTAAGACATTCAATTACTTAAATATGGTCATCTACCACTACCTGAAAGAACATTATTATAACAAAGAGAGAAACCTGGAACTT----TCAACTTTCCACCTAG-AAAAAGAATTGGTCACCAGAATTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=5076.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 89265 18 + 137718 TAAAGAGTAATGTATGGc s panTro4.chrUn_GL393525 287153 18 + 371432 TAAAGAGTAATGTATGGc i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s nomLeu3.chr1a 82161245 18 - 122973662 TAAAGAGTAATGTATGGC i nomLeu3.chr1a C 0 I 13526 e chlSab2.chr2 23929080 0 - 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aatggtgatcattaaaaagtcaggaaacaacaggtgctggagaggatgtggagaaataggaacacttttacactgttggtgggacagtaaactagttcaaccattgtggaagagagtgtggtgattcctcaaggatctagaattagaaataccatttgacccagccatcccattactgggtatatacccaaaggattataaatcatgctgctataaagacacatgcacgcgtatgtttattgtgccactattcacgatagcaaagacttggaaccaacccaaatgttcatcaatgatagactggattaagaaaatgtggcacttacacaccatggaatactatgcagccataaaaaggatgagttcatgtcctttgtagggacatggatgaagctggaaaccatcattctgagcaaactgtcgcaaggacagaaaaccaaacaccgcatgttctcactcataggtgggaactgaacaatgagaacacttggacacaggatggggaacatcacacaccagggcctgtcatggggtgggggg----aggggggacagcattaggagatatacctaatgtaaatgatgagttaatgggtgcagcacaccaacatggcacatgtatacatatgtaacaaacccgtacgttgtgcacatgtaccctagaacttaaagt------ataataataaTAA i nomLeu3.chr1a I 13526 I 3 e chlSab2.chr2 23929080 0 - 90373283 C e macFas5.chr10 61969994 0 - 96509753 C e ponAbe2.chr9 44834539 0 - 135191526 C a score=409358.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 90055 360 + 137718 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agaggagtttggctggcagtggttggagagatcagcctctggatggcaaagctccgggggaagatcatcttcccattccatcccctttccagctccccatccatcccattgagtgccacctccaccactcaataaaacccccacattcaccatcctcaagtctgtgtgcaacttaattctttctggatgctggacaaggaactgggtaccaagagggcactgaacaggttaacacttaagccgtctgtggatggcaaagctaaaagagtgcactgtaacacatgcccacttgggctgtgggagtcgcaggaacccacccctagacagtaccatggccacttgccctgcctattgcacctgcctgtctgcatgctcccctgcccagtaaggggtttgacagcacacacggtggccagacaagccacacccctgttgcacatcctgccaaggggagtcagggaagtctccagtttcatcaggaatgtaaatttgttcagccattgtggaaagcagtttggagatttctgaaataacttaaaacagaactaccattcaacccagcaatcccattattgggtatatacccaaaggaatataaatcattctgtcatagacatatgcacgcatattttcattataacactattcacaatagcaaagacacggaatcaacttagatgcctgttaacagaagactggattaaaaaaa-tgcagcgtacatacaccatggaatactacacacctataaaataggatgaaataatgtcttttgcagcaacatgaatggagctggagaccattattctaagtgaattaatgaaggaacagaaaaccaaacaaacactgcatgttctcacttataagtgggggctaaacattgagtccacatggacacagagaagggaacaatagacacaaggtctactgtgggtggagggttggtgg-agagtgaggatcaaaaaactccctattagatattacgttcactacctggatgactacctaatctgtacaccaaatcccattgacacacattttacccatataataaacctgcacatgtaccc-gctgaacctaaaataaatgttggaaggaaataaaGTTACAACCAACTCTTGTACTAt---gaggaaacaatcatatgtgttgac-aaaaaatcagctactaatagatttataatagtatatatgtagcagaaaaatatcagatataacttatatacccaaaagtatgacttaaaaacagcatgacaatctttatgatgggatattgtgaaactactagaagcacattttcagagattatttattaacatatgataatgactacattgagtggtttttagaagcatgaattgaaaccatgtataagcatgactttattgaacttatatataacattacacacacatttacataATTATAAAATAAGTATGCTCATGTTCATAATATGTATTTATTTATATTCATATGTAAGGCCAATAGGAAGTAATCTCTGTATCTGAGTTATTATTTCATAAATAATTTATGCTTGTTCTGTGAAAATAAAAGCACTGCTATGGATCTTCCAAGTATCCTGAAAGGATACCGTTTATAATTAAACAATAACAATTTTAGAAATAATTATTTTAAATAAGGCTATGATAAATCTGGTTTCATTGCACACTTTAACTTTGGAACATTTCATGAAGCGTCCCTTGATCACGACTCTCATATTCCGGAGTTTTTTGAGATCAAAATGGGACAATCAGTATGAATCTATTTTTTAGACATGCAAATGGATAACTTTAAATAGCAGTAGCGATATAATCAGAGTGCACAGTTGCTCTGGGACAAAACTTGGAAATCAGCATATTTTTAGATTCTTAATGTTTTACACACTTTAGCATGCCACAGCACCATTACATACTCATTTTTCTACTAGAATACCTTGGTAAAAATTCACAGTAGAGATCAGGCTTGTCCTTCATACATTAACTAATCAAGCAGGAAAGTGCAAATGAGAACACAGTGCCAAATATAGGCACCACATGGAAACAAGCATGGAACTGCCAGGAAGCCATTTTTGTAGCTTTGTAGCCCAATTATATTTTTCCTAATGTATTGCACACAAAACTT-GGGGGAAAAAAAAGAGGCAGAGAGAAAACAGGTTATATCAGCTCTATCTCACAATCCACAAGTTCATCCTATTAGAGGAGTAACTATGTAAAACAAATTTTATCTGTTGAATGTCCTATTTAGTTAATCGCAAAACTGTATGAGAACACACTTGTGACTTATTTAGCAGCTTGTTTGTTCGCTTTCCACTGGCTTCACAAATGTCCTTTGGAAATAGAATGTATATTTGGAACCCTGTACACCTTTTCTTTCTCCAGTAAcctgttgtcacttccatcactaaggtgacagaagcaactaggggcaatgcATTTGTAGCACACCTGGGTCAGAGGTATCCTCCAGGGGAAGGATCAGACCTGCTTGAAAGCATGTCGTTGGAATTGGGAGGCTTCTAGTAGCTATAACATAAGC-ACTGATGTTTACTGTTCCCTGCCCTCAACTTTGATCACTCTGGGAAAAGTTTTTTTTTT-TTAAATCCATTGTAttgaaacataatttacataaaataaatact---attttaaagtgcacagtttgctgagttttgccagatgtaaccatccaggtgaataaaattgattaaactgatctttcaaataataaattaactttgcaatcttgctagaaaattaatttgttcacagtttattatccattctatgtactgctacattcaattggttattatgttttaaggacttttgagtctatgtttatgagggataaacatcaaagttgtataatgcctttgtctcgatttggaatc--ggcaatactgggttcataaaataagataggaaatgtccctttaaattttcttttttttttttttttttttttgagacggagattcactcttgttgcccaggctggagtgcaatggcacaatttaggctctccacaatctctgcctcccagattcaagctattctcctgcctctgtctcccaaggagctgggattacaggtaagcgccaccacaccctgctaattatgtacttttagtagagacgggggtttctccttgctggtcaggttggtctcaaactcctgaccccaggtgatctgccagtcttggcctcccaaagtgctgggattacatgtgtgagccactgtgcctggcccttaaattctatttcttaaaaagagtccgttcaagattgatattatagatattccttaacttacaattgtcttatgtcttaatgaactcatcctaaattgaaaatattgtaagtctaaaacgcatttaatatatttaacctactgaatatcatgacttagcctcgcctaccttaaacttgctcagaacacttacattatcctacaattgggcaaaatcatctaccacaagacccattttaaaatattcagtatctcatgaaatttattgaaaactacactgatagtgaaaaactggtcatattgatgctcatcattaatgtacacagatgaaagcacCATTATCAAGTCAGAAGAGCACAAGTCAAACCACTGTAAGTTGAGGACTCTCTGTActttcttaaatgtttgatagaattcacctaagaaagcatgtagcctgtaa-----gtatagaaatctttttaaattaaaaaaaattcttcaatacatagagaagctattactttttctatttcattttgcatcagttttaagaattagttttacaaataatttcccatgttattttaattgtcaaatgtattggcctaaagttttcataattatattgatgtctgtaggttctgtagttacatcttctatttaattcccattatctacattatgtagcttctctaa-attttttcgagataaatcttgctagccattgttta-ttaaaaaaatttttttcaaagaaccaatttgtgggtatattaattagctccaccttttgttatttgctatgttgttggtttacatttttatctttatcatcttccttcttcttaatttggatatactttgctca---ttttttagcctcttaaaaaagaacctaaaggtcattgattgaagccttttattttcagta----tattacatctataaatgtacctttaagaaaagatttatctgcatcccacattttattaagtttttaaaaaattttctttcagtttaaactatttt-tttttttgtgtgtgaaacttttcttggccaatgggtttttctgaagtattttgtttaatgttcaaatgttggggtgttattgtacatatcctactgttgtccatctctggttcatgatacaatgcatgttctccattgcacttagataacatgcctccatgtctctggagaattcctcagtctttctaaaatgcttttgatgaatactggcagttattttgtagaatgtccctcctcaatttcagttagtctgatgttttctcacggttaggactaaagttatacattttgtctaagaataccatagaattgatgttttgtcctactcagtgcatcatataagaagttacatgaagttcatttatcttattattagtaacgttaactttgatcacttggctaagttgacatctccactttgaagttactattctataattatgttgtgggaagatactttcatattatgcaaatatgttctttcccaacatatattcaccactaatcttagcatccctccaaggttctttcttgcaacaattattactgtgatatttgcaaagtgatgattcttatattttatgtctcctacatttaatgaaattttactgtaat-aaatactacccattctcaatctttggtttat------tat-ttatgtcaatatgga---------ttttttttt-------agttggagtcttgttttgtcatccaggctgttgtgcaatg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i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 a score=182.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 102208 2 + 137718 ta s ponAbe2.chr2a 3123293 2 + 113028656 ta i ponAbe2.chr2a C 0 I 15408 e panTro4.chrUn_GL393525 345801 8127 + 371432 I a score=0.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 102210 840 + 137718 tgtatACtgcacagctccttgaatattctaaaaaccactcaattgtatactttctttttttctttagttatttaaagacagggtctccttttgtcacccatgctgtagtgcagtggtgccatctggtctcactgcaacctatggcttctgggctcaagtgatcttccagtctcatgtccccaagtagttgggactacaggcatgagccaccacatccagctaatttttgtatttttgctagagatgctgttttgccatgttgcccaggctagtcgcaaactcctgaacacaagcgatccacctgcctcagctgcccaaagtcttagcgttataggaattagccactgcacctggcctgaattgcgtactttgataaatgaattgcatgatacgttaaccatatttcaataacgttattattttaaaaaTGGCTGGGCATggcgtggtgactcacgcctctgatctcagcacactgggaggccaaggtgggtggattgcctgatttcaggagttcgagaccagtctggccaacatactgaaactctgtctctactaaaaatacaaaaatattagctgagagtggtgacatgggcctgtaattccagctagtctggaggctgaggcaggggagttgcttgaaccagggaggtggaggttgcagtcagctgagatcacaccactgcattccagcctgcatgacagagtaagagtccgtctccaaaagaaagaaagaaaaagaaaaTGGGCATTGAACACAggtggctcccacctacatataatccaagcactttgggaagctgaggcagaatgatcacttgaggccaggagtctgacaacatc e ponAbe2.chr2a 3123295 15408 + 113028656 I e panTro4.chrUn_GL393525 345801 8127 + 371432 I a score=755.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 103050 8 + 137718 ctgagATT s panTro4.chrUn_GL393525 353928 8 + 371432 ctgagatt i panTro4.chrUn_GL393525 I 8127 C 0 e ponAbe2.chr2a 3123295 15408 + 113028656 I a score=256097.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 103058 996 + 137718 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tagcctttaaaatgaaccagtaaaagaaagtaaattggtgagatgcagtggttcatgcccataatcccagcattttgtgaagttgaggtgggaggatcatgggagcccagaaatttgagaccagcctgggcaacataacaagaccccatctctacaaaaagtaaaagaacatagccagatatgctggtatgggcctat------aatctcagctatttggaaggctgagatgggaggatcacttgagcccaggagtcccatgctacagtgagctttgatcacaccactgcattccagcctggcaacagactgagaccctgtatctcagaaaaaaaaagaaaacaatctgtttttctgagttctgcaagctgtccaagcaaatgattccagccaccaatgggggtcatgaaaccctgttttctcgctggttggtcaaaactacatgtaacaacccaagacttgcaattggcatgtggagtgagggtagactcctggtactgagcccccatcctgcggggtctgcactaactccagggagtgtcaggatggaattgtgggatacccagttgggatccagattgtccgaaaatcagtgtacaaactccacatgcacatttggtcagaggtgttTGACCGTAACTGCTATTCACGAAAAAGGTCTACTCATTAGAACTAAAAATCACAAAATTGTAAGCTCTACAAAAACAAATCAACCTTATCTACCGCCCAGTCCTACCGAACTACAGAATGTGAGAACAGAAGGTCTGACCGTGGAGTCGAGAGCTGAC---AGGAATGTCACCACCATCCTGTTCTCCAAGGACTCCTCATCTTCAACAGACTCCTCATCTTCAATGGGCAGGGTGGAAACTGCAACTTGTGCCATGATCCTTGCACAAGAAAAGTAGTAAGAAAATGAGTGGTAGAAATCCAGTGCCGTAAACTCACATCCAGAGCTGTGAGAGTTTTTTACCGGCTGGATAATTCACAGTTTTCTTGAATCAGG i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3138703 998 + 113028656 tagcctttaaaatgaaccagta----gaagtaaattggtgagacgcagtggctcacgcccataatcctagcattttgtgaagttgaggtgggaggatcatgtgagcccagaaatttgagaccagcctgggcaacgtaacaagaccccatctctacaaaaaaggaaagaacatagccagatatgctggtacgagcctatagtctcagtctcagctatatgggaggctgaggtgggaggatcacttgagcctaggagtcccatgctacagtgagctttgatcacaccactgcattccagcctggcaacagactaagaccctgtatctcagaaaagaaaataaaacaatctgtttttctgagttctgcaagctgtccgagcaaatgattccacccaccaacg-gtgtcatgaaaccctgttttctaactggttggtcaaaactacatgtaacaactgaagacttgcaattggcatgtggagtgagggtagactcctgggactgagcccccatcctgcagggtctgcactaactccagggagtgtcaggatggaattgtgggatacccagttgggatccagattgtccgaaaatcagcgtagaaactccacatgcacatttggttacaggtgttTGACCATAACTACTATTCATGAAAAAGGTCTATTCATTAGAAATAAAAATCATAAAATTTTAACTTCTACAAAAACAAATCAACCTTATCTACCGCCCAGTCCTACTGAACTACAGAATGTGAGAACAGAAGGTCTGACCATGGACTCGAGAGCTGACATTAAGAATGTCACCACCATCCTGCTCTCCAAAGA---CTCATCTTCAACAGACTCCTCATCTTCAATGGGCAGGGTGGAAACTGCAACTTGTGCCATGATCCTTGCACAAGAAAAGTAGTAAGAAAGTGAGTGGTAGAAATCCAGTGTCCTAAACTCACATCCAGAGCTGTGAGAGTTTTTCACCGGCTGGATAATTCATAGTTTTCTTGAATCAGG i ponAbe2.chr2a I 15408 C 0 a score=207.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104054 1 + 137718 G s panTro4.chrUn_GL393525 354933 1 + 371432 G i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3139701 1 + 113028656 G i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nasLar1.chr3 132434241 1 - 179790006 A i nasLar1.chr3 N 0 I 35 a score=8608.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104055 35 + 137718 G-AAAAATAAGACTCAGAAACTAGGAATTCATTTTG s panTro4.chrUn_GL393525 354934 34 + 371432 --AAAAATAAGACTCAGAAACTAGGAATTTGTTTTG i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3139702 36 + 113028656 GAAAAAATAAGACTCAGAAACTAGGAATTCGTTTTG i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 e nasLar1.chr3 132434242 35 - 179790006 I a score=67.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104090 1 + 137718 T s panTro4.chrUn_GL393525 354968 1 + 371432 C i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3139738 1 + 113028656 C i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nasLar1.chr3 132434277 1 - 179790006 T i nasLar1.chr3 I 35 I 2207 a score=36736.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104091 152 + 137718 CCAAAACTCTCATCAGATACAGAATCCATCCGCTAA----CTATCTAGTGTTATTTCCATAAGTTAGATCAATTATCACTCCCAAAACAAATGCACATGGCACCCAGAATCTGTGCATTTCTCCCAAGTAAAAGAGGAGGTggacgggcgcagtgt s panTro4.chrUn_GL393525 354969 152 + 371432 CCAAAACTCTCATCAGATACAGAATCCATCTGCTAA----CTATCTAGTATTATTTCCATAAGTTAGATCAATTATCACTCCCAAAACAAATGCACATGGCACCCAGAATCTGTGAATTTCTCCCAAGTAAAAGAGGAGGTggacaggagcagtgt i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3139739 153 + 113028656 CCAAAACTCTCATCAGATAGAGAATCCATCTGCTAACTTTCTATCTAGTATTATTTCCATAAGTTAGATCAA-TATCACTCCCAAAATAAATGCACATGGCACCCAGAATC--TGCATTTCTCCCAAGTAAAAGGGGAGGCGGATAggcgcagtgt i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 e nasLar1.chr3 132434278 2207 - 179790006 I a score=123451.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104243 276 + 137718 ctcatgcctttaaccccagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaagtcaggagttcaagacaagcctggacaacatggtgataccctgtctctactaaaaataaaaaaa---gttagccaggtgtggtggcatgtgcctgtagtcccagcttcttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggctgaggttgcagtgagcagagatcgcaccactgcacctcagcctggacgacagagtgagactctgtctcaaaaaaaa s panTro4.chrUn_GL393525 355121 279 + 371432 ctcatgcctttaaccccagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaagtcgggagttcaagagcagcctggccaacatggtgataccctgtctctactaaaaataaaaaaaaaagttagccaggtgtggtggcatgtgcctgtagtcccagcttcttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggctgaggttgcagtgagcagagatcgcaccactgcacctgagcctgggtgacagagtgagactctgtctcaaaaaaaa i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 I 1 s ponAbe2.chr2a 3139892 277 + 113028656 ctcatgcctgtaaccccagcactttgggaggccaaggtgggcggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatagtgataccctgtctctactaaaaataaaaaaaaaaa--agtcaggtgtggtggcacgtgcctgtagtcccagcatcttgggaggctgaggcaagagaatcgcttgaacccaggaggctgaggttgcagtgagcagagatcgcaccactgcacccgagcctgggcgacagagtgagactctgtctcaataaaaa i ponAbe2.chr2a C 0 M 324 s nasLar1.chr3 132436485 273 - 179790006 ctcatgcctataatcccagcactttgggaagctgaggtgggtggatcaa--gagattaggagttcgagaccagcctggccaagatggtgaaactccatctttactaaaaatacaaaaa----ctagctgggtgcggtggcaggcgcctgtaatcccagctactcagaaggctgaggcaggagaatcgtgtgaacccaggaggcaaaggttgcagggagctgagatcttgccaccgctctctagcctgggcgacagagcaagactctgtctcaaaataaa i nasLar1.chr3 I 2207 C 0 a score=5067.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104519 81 + 137718 GGAGGGGAGGAAAGGAGGCAAGGCACTTTACAACCCAGTGATGGGCTACCACAACTCAACACAGCAAAGAGTTGCCAAGCT s panTro4.chrUn_GL393525 355401 81 + 371432 GGGGGGGAGGAAAGGAGGCAAGGCACTTTACAACCCAGTGATGGGCTACCACAACTCAACACAGCAAAGAGGTGCCAAGCT i panTro4.chrUn_GL393525 I 1 C 0 s nasLar1.chr3 132436758 22 - 179790006 ---------aaaaaaaagaaaaa--------------------------------------------------GCCAAACT i nasLar1.chr3 C 0 I 88 e ponAbe2.chr2a 3140169 324 + 113028656 M a score=8183.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104600 99 + 137718 CCCTTTCTCCCTTGCACAACACGACACAGAAGAGTTGGTGCAGTGGAATGAGGCTGGATGGAGAGAAGTTCCTCttctttctttccttttattttttt-----g s panTro4.chrUn_GL393525 355482 104 + 371432 CCCTTTCTCCCCTGCACAACCTGACACAGAAGAGTTGGTGCAGTGGAATGAGGCTGGATGGAGAGAAGTTCCTCttctttctttcctttttttttttttttttg i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 e nasLar1.chr3 132436780 88 - 179790006 I e ponAbe2.chr2a 3140169 324 + 113028656 M a score=3227.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104699 16 + 137718 agatggactctcgctc s panTro4.chrUn_GL393525 355586 16 + 371432 agatggactctcgctc i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59675788 16 + 201139530 agagggagtcttgctt i gorGor3.chr4 N 0 C 0 e nasLar1.chr3 132436780 88 - 179790006 I e ponAbe2.chr2a 3140169 324 + 113028656 M a score=123410.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 104715 292 + 137718 tgtcacacaggctgggctgcagtggtgcaatctcgg-ttactgtaacctctgccttatgggtttaatcaattct-cttcctcagccttccaaatacctggggttagaggcaccccccaccacacccagctaattttttttttttt-------tttttagtggagactgggtttcactatgttggccaggctggtcttgaactcctgaccttaggtgaactacccacctcggcctccaaaagtgctaggattacaggcatgagccgctgtgcccagccAAGAAGTTCCTCTTCTTACTTAGA s panTro4.chrUn_GL393525 355602 297 + 371432 tgtcacacaggctggggtgcagtggtgcaatctcgg-tcaccgtaacctctgccttacgggtttaatcaattct-ctgtctcagccttccgaatacctgggattagagacgccccccaccacacccagctaatttttgtttgtttgtttgtttttttagtggagactgggtttcactatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctt--gtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctaggattacaggcatgagtcgctgtgcccagccAAGAAGTTCCTCTTCTTACTTAGA i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59675804 287 + 201139530 tgtcgc-caggctgcagtgcagtggcacgatctcagctcactgcaacctctgactccctggatcaagtgattctcctgcctcagcctcccaagaagctaggactacaggcacatgccaccacacctggctaatttttttta-----------tttttagtagagacggggtatcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctt--gtgatacacctgtctcagcctcccaaagtgctaggattacaagcatgagccgctgtgcccagccAAGAAGTTCCTCTTCTTACTTAGA i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3140494 294 + 113028656 tgtcacacaggctggggtgcagtggctcgatctcag-tcactgcaacctctgtctcccgggttcaaccaattct-ctgcctcagccttctgaatacctgggattagaggcgcccgccaccacacccagttaattttttttttttttttt---tttttagtagagactgggtttcactatcttggccaggctggtcttgaactcctgacctt--gtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccgctgcgcccagctGAGAAGTTCCTCTTCTTACTGAGA i ponAbe2.chr2a M 324 C 0 e nasLar1.chr3 132436780 88 - 179790006 I a score=910.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105007 1 + 137718 A s panTro4.chrUn_GL393525 355899 1 + 371432 A i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676091 1 + 201139530 A i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3140788 1 + 113028656 A i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nasLar1.chr3 132436868 1 - 179790006 A i nasLar1.chr3 I 88 I 55 a score=27876.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105008 54 + 137718 AACAGATCACAGGGCATCAAGTAACACGTAAAATCCTTTATAATAAGCAGTATT s panTro4.chrUn_GL393525 355900 54 + 371432 AACAGATCACAGGGCATCAAGTAACACATAAAATCCTTTATAATAAGCAGTATT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676092 54 + 201139530 AACAGATCACAGGGCATCAAGTGACACGTAAAATCCTTTATAATAAGCAGTATT i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3140789 54 + 113028656 AATAGATCACAGAGCATCAAGTAACAAGTAAAATTCTTTATAATAAGCAGTATT i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 e nasLar1.chr3 132436869 55 - 179790006 I a score=128719.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105062 168 + 137718 --ATTTTTGGAAAACCTTTCCTAATATTTTGGTATCAGCAAAAAGCCTCAGATTAATTTCATACACTATAAAAATACAATACATaaacagaaaatattaa-ctgtcagcaatgctatagagaaattggaagctgtatgcattgctttttggaatgtaaaatggtacagccc s panTro4.chrUn_GL393525 355954 168 + 371432 --ATTTTTGGAAAACCTTTCCTAATATTTTGGTATCAGCAAAAAGCCTCAGATTAATTTCAAACACTATAAAAATACAATACATaaacagaaaatattaa-ctgtcagcaatactatagggaaattggaagctgtatgcattgctttttggaatgtaaaatggtacagccc i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676146 169 + 201139530 --ACTTTTGGAAAACCTTTCCTAATATTTTGGTATCAGCAAAAAGCCTCAGATTAATTTCAAACACTATAAAAATACAGTACATaaacagaaaatattaacctgtcagcaatgctatagagaaattggaagctgtatgcattgctttttggaatgtaaaatggtacagccc i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3140843 168 + 113028656 --ATTTTTGGAAAACCTTTCCTAATATTTTGGTATCAGCAAAAACCCTCAGATTAATTTCAAACACTATAAAAATACAATACATaaacagaaaatattac-ctgtcagcgatgctatagagaaattggaagctatatgcattgctttttggaatgtaaaatggtacagccc i ponAbe2.chr2a C 0 C 0 s nasLar1.chr3 132436924 170 - 179790006 GTTCTCTTTGAAAAAAACCTGTAACATTTTGTTAACAGCAAAGACCCTCAAATGAATTTCAAACACTATAAATAtataacacataaacagaaaatactaa-ctgtcagcaaggatatcaaaaacctggaacctttatgcattgctttttggaatgtaaaatggtgcagccC i nasLar1.chr3 I 55 N 0 a score=20961.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105230 39 + 137718 actgtggaaaatggtttagcagctccttaaaaatatgaa s panTro4.chrUn_GL393525 356122 39 + 371432 attgtggaaaatggtttagcagctccttaaaaatatgaa i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676315 39 + 201139530 actgtggaaaatggtttagcagctccttaaaaatatgaa i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3141011 39 + 113028656 actgtggaaaatggtttagcagctccttaaaaatattaa i ponAbe2.chr2a C 0 I 5 a score=-1324.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105269 13 + 137718 aaatcaaaaatat s panTro4.chrUn_GL393525 356161 5 + 371432 gca-ca------- i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676354 5 + 201139530 gca-ca------- i gorGor3.chr4 C 0 C 0 e ponAbe2.chr2a 3141050 5 + 113028656 I a score=437408.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 105282 861 + 137718 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gaattatatgatccatcaacaacctttaagcatatatacccaaaagaactgagagcagagactcaaacaggtatttgtacacccgattaacagcagcattattcacagtggccaaaaggtag-cccaaacctaatgcccatcagtaggtgaatagataaagaaaatgtaatatatgcatacatagagtattattcagccataaaaagaaaAATATCTggccagattcaggagcttacacctgtaatcccagtattttgggaggccaaggtgggcaggtctcttgagccccatattttgagaccaggctggacaacatggCACATTTGGTTAGAAGTGTTTGACCATAACTACTATTCCAGAAAAAGATCGACTCATTAGAACTACAAATCATAAAATTATAAGTTCTACAAAAACAAATCAACCTTATCTACCACCCAGTTCTACCCAATTATATCATGTTAGAACAGAAGGTCTCACCGTGGACTCGAGAGCTGATATGAGCAATGTCACCACCATCCTGCTCTCCACGGAATCATCTTCAACAGACTCCTCATCTTCAATGGACTC---------------CTCATCTTCCATGGACTCCTCGTCTTCCATGGGCAGGGTGGAAACTGCAACTTG-GCCATGATCCCTGTGC-AAAAAAGTAGTAAGAAATTGAATGGTAGAAATGCAGTGTCCTAAACTCACATCCAGAGCTGTGAGAGTTTCTCACCGGCTGCCAAATTG-TTTTTTGCGTCAGAGAAAAAAATAAAACTTGGTAACTTGGTATTCAATTTGCCCAAGACTCTCATCACATAGAGAATCCATCCACTAACTTTCTATCTAGTATTATTTCCATGAAGTTACATCAATATCACTCCCAAAATAAATCCAGGTGG i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59676359 862 + 201139530 gaattatatgatccatcaacaccctttaagcgtatatacccaaaagaactgacagcagggactcaaacaggtatttgtacactcgattaacagcagcattattcacagtggccaaaaggtag-cccaaacctaatgcccatcagtaggcgaatagataaagaaaatgtaatatatacatacacagagtattattcagccataaaaagaaaAATATCTggccagattcaggggcttacagctgtaatcccagtattttgggaggccaaggtgggcaggtctcttgagccccaaattttgagaccaggctggacaacatggCACATTTGGTTAGAAGTGTTTGACCATAACTACTATTCCAGAAAAAGATCTACTCATTAGAACTACAAATCATAAAATTGTAAGTTCTACAAAAACAAATCAACCTTATCTACCACCCGGTTCTACCCAATTATATCACGTTAGAACAGAAGGTCTCACTGTGGACTCGAGAGCTGATATGAGCAATGTCACCACCATCCTGCTCTCCACGGAACCATCTTCAACAGACTCCTCATCTTC---------------------------------CATGGACTCCTCATCTTCCATGGGCAGGGTGGAAACTGCAACTTGTGCCATGATCCCTGTGCAAAAAAAGTAGTAAGAAATTGAATGGTAGAAGTGCAGTGTCCTAAACTCACATCCAGAGCTGTGAGAGTTTCTCACCAGCTGCCAAATTG-TTTTTTGCGTCAGAGAAAAAAATAAAACTTGGTAACTTGGTATTCGATTTGCCCAAAACTCTCATCAGATAGAGAATCCATCCGCTAACTTTCTATCTACTATTATTTCCATGAAGTTACATCAATATCACTCCCAAAATAAATCCAGGTGG i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a 3141055 893 + 113028656 gaattatatgatccaccaacaccctttaagcatatatacccaaaagaactgagagcagggactcaaacaagtatttgtacacccatttaacagcagcattattcacagtggccaaaaggtagaaccaactctaatgcccatcagtaggtgaatggataaagaaaaagtaatatatacag--atagagtattattcagccataaaaagaaaAATATCTGGCCAGATTTAGGggcttacacctgtaatcccagtattttgggaggccaaggtgggcaggtctcttgagccccaaattttgagaccaggctggacaacatggCACATTTGGTTAGAAGTGTTTGACCACAACTACTATTCAAGAAAAAGATCTACTCATTAGAACTATAAATCATAAAATTATAAGCTCTACAAAAACAAATCAACCTTATCTACCACCCAGTCCTACCCAATTATAGAATGTTAGAACAGAAGGTCTCACCGTGGACTCGAGAGCTGATATGAGCAATGTCACCACCATCCTGCTCTCTGCGGACTCATCTTCAACAGACTCCTCATCTTCAACGGACTCCTCGTCTTAGACAGACTCATCTTCCATGGACTCCTCATCTTCAGTGGGCAGGGTGGAAACTGCAACTTGTGCCATGATCCCTGTGC-AAAAAAGTAGTAAGAAACTGAATAGTAGAAATCCAGTGTCCTAAACTCACATCCAGAGCTGTCAGAGTTTTTCACCGGCTGGCAAATTGTTTTTTTGCATCAGAGACAAAAATAAAACTTGGTAACCTGGTATTTGGTTTGCCCAAAACTCTCATCA-ATAGAGAATCCATCCACTAACTTTCTATCTAGTATTATTTTCATGAAGTTAGATCAATATCACTCCCAAAATAAATCCACGTGG i ponAbe2.chr2a I 5 N 0 a score=133647.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 106143 498 + 137718 Aagactaaatccaaagctagcagaaggaaagaaataataaagagcataattagagcataaatcaataaaatagaaggttggagagcagtagaatg-aaaaaatgtagattctttgaaagatcaagcctttcactatattgaatgagcaaaagatggaagactaattattaaaataataaatgaaagcagagccattactaccaactttacagaaatacaaaaggattataggagtatactgtgaacaactgtctagcaacaaattaggtgccctggatgaaatggatgaatcgctagaaagacacaaactaccaaagtggctcaagaagaaagagaaaatctgaatagacctataacctaggagattgaattagtaatcgaaagcgattaacaaagaaacatttatgaccaaatagctgcattaactggtgagtcaacctaacatttaaagaagaattaatatcatttcttctcaaactcttctgacaaaatatatgaa s panTro4.chrUn_GL393525 357044 498 + 371432 Aagattaaatccaaagctagcagaaggaaagaaaaaataaagaccataattggagcataaatcaataaaatagaaggttggagagcagtagaacg-aaaaaatgtagattctttgaaagatcaagcctttcactatattgactgagaaaaagatggaagactaattattaaaataataaatgaaagcagagccattactaccaactttacagaaatacaaaaggattacaggagtatactgtgaacaactgtctaacaacaaattaggtgccctggatgaaatggatgaatcactagaaagacacaaactaccaaagtggctcaagaagaaagagaaaatctgaatagacctataacctaggagattgaattagtaattgaaagcgattaacaaagaaacatttatgaccaaatagctgcattaactggtgagtcaacctaacatttaaagaagaattaataccatttcttctcaaactcttctgacaaaatatatgaa i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59677221 499 + 201139530 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s panTro4.chrUn_GL393525 357542 2140 + 371432 gaaggaatacttgctaattcattttttgataacagcattatccttataccaaagccaaagagagcacaaaagagagaaatacagcactagatcccttatgaatatataagcaaaaatctcagcaaaatactagcaatactagcaaaatactagcagcaatattgtataatcaaaggattgtaaactatcaccctttgagatttatcctcaaaatgcaagggtggttcaacatataaaatatcaatcagtgtaatatgctgtaacagtaaaatgaataagcacgtgattatttcaattgatgcagcgaaaacactgatgaaatacaacacccttctataataaaaatactcagtaaactaggcatagaagtgatcttctgcaacatgacaacgggatgtacaaaaaccgaacagttaatatcatgatcaatgatgaaacagtgaaagctgttttcctaacatctagaagaaaaggatggtgcatttgccacttgtattcaacgtagcactggcagttctagccagagcaattaggcaagacaaagaaataaaacgcatctacattagaaataaaaaataaaatgtaaaattatatctacacatgatcttatgggtataaagctccaaacaaaacacaaaaccgattataattaataaaagaggcaggatgcaaacaaacataggcaaatgagctatatttctatatagttgtaaaaaagtatgaaaacatttttaaaattccatttataatagcatcaaagaatacgttattcaggcataaatctaaccatggtggtatacacaaaactttgctgaaaaaaactaaagagagtggaaataactggaaagacattctgtgttcacgggttgtaagacaatattgttaagatgacaataccatctaaagtaatctacagactcaatgcaataccatcaaaatcccaaaggcatttttgcagaaacaaagaaattcattctaaaatcatgcaaaaattcaaaggatctgacagacaaaacagtcttgaaaaagaacattggaaaactcacatttttcagtttcacagcctactaccaatctacagtcatcaagagagtgtggtactggcataagaccaatagactttcagaccaatacaatagaacagatttgagatcctacaagttagtcctcacatatattgtcaatgactgttcaacaaggtggccaagtctagtcaagggaggaaagagcagtctcttcaacagctggatgtcagtgcacaagagagaagttagacccctaccttgcagtatacacaaaaaattaattctaaattaataaaagacttaaatgtaaggactaaaaatatgtaactcttagaagaaaacacatggtaaacctttatgacctttgagttttaagtgtattttgaaatatgacagaaaagcacagataacaaaagaaaatacacgaaaattagatttaatcaaaataaaaa-ccgtttatgcatcaaaggatactatcaaaggagtgaaaagacaacccatagtacgtgagaaaatatgtatctgataaaatcaaagtgtgtatctgataaaagcttaatatcccacaactcaacaacagaatttctaagatcccaattaaaaaaataggcaaaggacttgaatagacatttctccaaagaagatacacaaatgtctaagaaggacaagaaaagatgctaaacaccgttattcatcaataaaatgcaagacaaaacccaaatgagatgccactttgcatccactagtaaggctttcataacaacgacacagaaaatcagtgttgttaaggaggtggagaaactggagccctcatgaactggctgctaggaatagaaaatgatggacttgctgtggaaaacagtttggttgttcctcaaagaatcacacagagaaACAGCCGCCACTGGCTTGCGGGTTCTCCTGGGCTGGCGCGGGACTTCCCGGAATCGCAGGCGCGCATCCTTTCTCACCTGAGGGCCCGCCTGGCCGTGACTCCCGCCCCTCTTCTCCTCCGAAGAGAGATCGGGGCCGCCCCAGCGGCCGTCTGTAGCCACCGGGGATGGGGCTGAGGGTCGGTTCCTGCCCTGGTGCAGCCGCCCCCGGGCAGACCGCCT i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 e gorGor3.chr4 59677720 2289 + 201139530 I a score=28668.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 108779 148 + 137718 GGCTTGGTCGCAGCCACGGCGACATCTAGCCTCGGTTCTGCGAGGCTGGGCGTGGCAGCCAGCTTGGGAGTCGTCC------------------------GGCGCCTGTAGCT-GGGTGCACAGGTGGTGGAGCATGCCCTGGGCCGCCTCTGGATCACAGGTGCCCCTGGCC s panTro4.chrUn_GL393525 359682 148 + 371432 GGCTTGGTCGCAGCCACAGCGATATCTAGCCCCGGTTCTGCGAGGCTGGGCGCGCCAGGCAGCTTGGGAGTTGCCC------------------------GGCGCCTGTAGCT-GGGCGCCCAGGTGGTGGAGCATGCCCTGGGCGGCCTCTGGATCGTGGGTGCCCCTGGCC i panTro4.chrUn_GL393525 C 0 C 0 s rhiRox1.JABR01079880v1 0 173 + 943 GGCCTGGCCGCAGCCACGGCGACATCTGGCCCCGGTTCTGCGAGGACTGGAGCGCCAGCGAGCTTGGGAGTGGCCAGGCGGCTGCTACCAGCAGGCAGAGGGCGCCCGCAGTTAGAGCGCCCGGGCGGCGGAGCATGGCCTGGGGGGCCTCTGGATCGCGAGTGCACCTGTCC i rhiRox1.JABR01079880v1 N 0 C 0 e gorGor3.chr4 59677720 2289 + 201139530 I a score=370606.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 108927 806 + 137718 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e gorGor3.chr4 59681579 37398 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15035073 9636 + 72422247 I a score=2292.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 116705 8 + 137718 gAGGGTTT s gorGor3.chr4 59718977 8 + 201139530 gagggttt i gorGor3.chr4 I 37398 C 0 s nomLeu3.chr17 90738073 8 + 99891981 gagggttt i nomLeu3.chr17 N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 15035073 9636 + 72422247 I a score=101617.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 116713 316 + 137718 GAGACAgaatgaggagtgacaaatatctacagggtttttctctggccgggagtgataagacgttctacaatgaattgcgaattaaatttgaatgtgcacaaccacaggtatactaaaagccactcaattcatgacttttaatgggggaatcttatgTGGCGCACTCTCATGGAGACCACGGCAGACATAGTGAGAGAGAAAAAGGTGAGTAAATATCTGAAACGGAGGCAGTAACAGAGAGAATGAAAAGCCCTGTGAATGGAAGGGAGAGCGAAAAGGGAAAATGGTCCTATTTATAAATGACAGATGTGAAATT- s gorGor3.chr4 59718985 316 + 201139530 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gagacagaataagaaatgactaatgt-tacagggattttcttacggggtggatg--aaaatgtcataaatcatcttgcgatttaaaatggactgtgcacaattatgaatacactaaaggcgatacaattcatcaccttaattgggtgaatcttatCCACGGCATCCACATGGAGACAGCAGCAGACACAGGGAAAGAG-----GATGAGTAAATGTCTGAAATGGAGGCCGAAAGAGAGACAAGGAGAAGGCCTGTGAATGGAAGACACCGACTGCAGGGAAAACGGTCATATGTATACATCAGGGATCTGAGAACA i macFas5.chr19_KE145851_random N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 15035073 9636 + 72422247 I a score=5049.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 117029 7 + 137718 GGGGTTC s gorGor3.chr4 59719301 7 + 201139530 GGGGTTC i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90738394 7 + 99891981 GGGGCTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 914 7 - 18279 GGGGTTC i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38041392 7 + 51301725 gaggctt i papAnu2.chr19 N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 15035073 9636 + 72422247 I a score=213841.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 117036 211 + 137718 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2876 s nomLeu3.chr17 90739241 139 + 99891981 agctggaatctagacaagttttgagggtagctgaaagaggcacaagagtccctgtgggctgagggcaaagacctgagagagaccagggaggatctcagtgaggtctgtgggtgtgtaggtgattcctgagtgtcggagg i nomLeu3.chr17 C 0 I 147 s macFas5.chr19_KE145851_random 1761 139 - 18279 aagagaaatctgcggatgactggaggggagctgggagacacaggagagtccctgagggccgcaggtgaggaaatgggagacatgatggaggagggccctgagatttctgagtttgtcagtgacccccgggtgtgggggg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38042240 139 + 51301725 AGCTGGAATCTAGGGATGGTTTGAGAGTAGCTGAAAGAGACAGAAGATTCTCTGTAGGCTGAGGGCAAAGACCTGAGAGAGACTGGGGAGGATCTCAGTGAGGTCTGTGAGTCTGTAGGTGTTTCCTGGGTGTAGGAGG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37903615 139 + 50890351 agctggaatctagggatggtttgagagtagctgaaagagacagaagattccctgtaggctgagggcaaagacctgagagggactggggaggatctcagtgaggtctgtgagtctgtaggtgattcctggatgtaggagg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=57152.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118016 103 + 137718 ctgactcccgctgaaatctgggcgtggtgggag-------agtagctgggacagacaggagagtcccaggggtc---tgggggtgaagacatgagagagactggggagtaact s nomLeu3.chr17 90739527 103 + 99891981 ctgactcccgctgaaatctgggcgtggtcggag-------agcagctgggacagccaggagagtccctgagggc---tgggtgtgaagacatgagagagactggggagtaact i nomLeu3.chr17 I 147 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 1900 113 - 18279 ctgagtgtggcagaaatcttgggatgatttctgcatcccaagtagctgggacacacacaagagtagctgagggcCTACTAAACTAAAGAGTTGGAGGACATGGGGATGGAGCC i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38042379 103 + 51301725 CTGACTCCTGCTGAAATCTGGGTGTGTttggag-------agtagctgggacagacaGGAGAGTGCCTGAGGGC---TGGGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGTGGAGTAACT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37903754 103 + 50890351 ctgactcctgctgaaatctgggcatggttggag-------agtaactgggacaaacaggagagtgcctgaggtc---tgggtgtgaagacatgagagagactggggaggaact i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e gorGor3.chr4 59726618 2876 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=254842.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118119 291 + 137718 cagtgaaactgctgagtttggtggtgatacatgggtgcctggaactgactcccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctggaacagacaggagagtccctgagggct---ggtgaagacacgagagagactggagagtaattgagtgaaattggtgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactgacgcccgctgaagtgggggtgtgattggagagtagctgggacacacaggagagtccctgagggttggagataaagacgtgctagagactgaggagtaact s gorGor3.chr4 59729494 291 + 201139530 cagtgaaactggtgagtttggtggtgactgcggggtgcctggaacggactccagctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccaagagggct---ggtgaagacatgagagagactggagagtaattgagtgaaattggtgagtttggtggtgattcctgggtgccaggaactgacacccgctgaagtgtgggcgtggttggagagtagctgggacacacaggagagtccctgagggttggagataaagacgtgctagagactggggagtaact i gorGor3.chr4 I 2876 I 1614 s nomLeu3.chr17 90739630 288 + 99891981 cagtgaagctggtgagtttggtggtgaccccggggtgcccggaactgactccagccgaaatctgggcgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggct---ggtgaagacatgagagagactggggagtaagtgagaggaattggtgagtgtggtggtgattccggggtgcctggaactgactccagctgaaatctgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggctgggg---aagacatgagagagactggggagtaatt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 2013 294 - 18279 GTGTGAAGACCCTGAGTTTCCAGGTGTTTCCTGGGTGTGGGAGACTGACTGGTGGAGAAACGTGGGGAGTTCtggagagtaactgggagatgtgggagtgtccccgtgggcagggggtgaagagatgggacacacaggggaggagtgcagtgaggactctgaatttctgggtgttgcctgggtgtgggagtttgactgttgtagaaacctggggctggttggagtggagctgggagaaaccagagaatctctggggaatggggatgaagagatgggagacacgtgggaggagca i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38042482 294 + 51301725 CAGTGAAATTGGTGAGTTTGTAGCTGATTCCTGGGTGCCTGGAACTGAGTCCCGCTGAAATCTGGGCTTGGttggagagtagctgggacagacaGGAGAGTCCCTGAGGGCTGGGGGTGAAGACACGAGAGAGACTGGAGAGTAACTCAGTGAAACTGGTGAGTTTGTAGGTGATTTCTGGGTGCCTGGAACTGACTCCCGCTGAAATCTGGGCGTGTttggagagtagctgggacagacaGGACAGTCCTTATGGGCTGGGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGGGGAATATCT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37903857 294 + 50890351 cagtgaaattggtgagtttgtacctgattcctgggtgcctggaactgagtcccactgaaatctgggcgtggttggagagtaactgggagaggcaggagagtccctgagggatgggggtgaagacataagagagactggggagtaactcagtgaaattggtgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactgactcctgctgaaatctgggcatggctggagagtagctgggacagacaggagagttgctgaagcctgggggtgaagacatgagagagactggggagtaact i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=125491.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118410 245 + 137718 gagtgaaattggtgagtttggtggtgattccggggtgcctggaactgactccagctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagacgggagagtccctgagggatgg---tgaagacatgagagagactggggagtaacgcagtgaaattggtgagtttggtggtgacttctgggtgcctgcaacggactcccgctgaagtgtgggcgtgtttggagagtagctgggacagacaggcgagt s nomLeu3.chr17 90739918 245 + 99891981 gagtgaaataggtgagtgtggtggtgattccggggtgcctggaactgactccagctgaaatctgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggctgg---tgaagacatgagagagaccggggagtaagtgagaggaattggtgagtgtggtggtgattccggggtgcctggaactgactcccgctgaaatttgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 2307 228 - 18279 cagggaGGTCTCTGA--------------CCTGA------ggggctgaccccgatagaaatctggcgacggtgggagaggagctgggacacacaggagagtccccgagggttgcaggtgaagagatgggagacatgatggaagagaggcctgagatgtgtgagtctgtaggcgattcctagatttggggagttgagggttgcagtaagcttgggatgataggagagtagctgggagacacagaagcat i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38042776 248 + 51301725 CAGTGAGGTGTGTGAGTTTGTAGGGGATTCCTGGGTGTCTGGAACTGACTCCAGCTGAAATCTGGGCACGGTTGGAGAGTAGCTGAGAGACACAGGAGAGTCCCTGTGGCCTGGGGATAAAGACATGAGAGAGACTGGGGAGTAACTCAATGAAATTGGTGAGTTTGTAGGTGATTCCTGGGTACCTGGAACTGACTCCAGCTGAAATCTGGGTGTGGTTGGAGAGTAgctgagagagacagaagagt i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37904151 248 + 50890351 cagtgaaattggtgagtttggtggtgattcctgggtgcctagaactgattccagctgaaatttagaaatggttggagagcagctgagagagacagaagagtccctgtggcctggggatgaagacgtgaaagagattgtggagtaactcagtgaaatgggtgagtttgtaggtgatccctggctgcctggaactgactccagctgaaacctgggtgtggctggagagcaggtgagagagacagaagagt i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=3201.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118655 5 + 137718 ccctg s nomLeu3.chr17 90740163 5 + 99891981 ccctg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 2535 5 - 18279 acccg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043024 5 + 51301725 cCCTG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37904399 5 + 50890351 ccctg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 102052 5 - 3959310 gctca i rhiRox1.KN297800v1 N 0 I 1643 e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=28499.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118660 83 + 137718 agggttggagataaagacgtgctagagactggggagtaactcagtgaaagcggtgggcttggtggtgatccctgggttcctgg s nomLeu3.chr17 90740168 80 + 99891981 agggctgg---tgaagacatgggagagactggggagtaattgagtgaaatcggagagtgtggtggtgattccggggtgcccgg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 2540 64 - 18279 agggccgggagtaaAGAGTTAGGACACATGGGGCCAGAGCCCTGTGAGACCCCTGAGTTTCTGG------------------- i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 I 8977 s papAnu2.chr19 38043029 83 + 51301725 TGGCCTGGGGATAAAGACGTGAGAGAGATTGTGGAGTAACTGAGTGAAATTGGTGAGTTTGTAGGTGATCCCTGGCTGCCTGG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37904404 83 + 50890351 atggctgagggtgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaaactggtgaatttggtggtgagtcctgggtgcctgg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=379910.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 118743 543 + 137718 aactgacccgcgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagactggagggtccgtaagggctgggaatgaagacgtgagagagactggcgaggatctcactgaggtctgtgagtttgtaggtgtttctggggtgtggggtacagactcccgctgaaatctgggcgtagttggagagtagctgggacagacaggagagtcatgggtggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGAGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGTCACGGGAGAACACAATGACATGAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGGAAAGGGAAACGTAAAGTTGTGGAATTCTGTTGATGACGGATGTGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGAGATGATGTAGAGGACTTCCACATCTCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGTGCTGGGGGACCGCTCATA s nomLeu3.chr17 90740248 543 + 99891981 aactgactcccgctgaaatgtgggcgtgctcggagaggagctgggacagacaggagagtccctgagggttggggataaagacgtgctagagaccggggagtaactcagcgaaagtggtgagcttggtggtgatccctgggttcctggaactgacccccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtcactgatggctggggatgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGACTGAGGTGACTGTGAAGAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGATTGTCCTGCGTGGTAAGGAAAGGGAAATGTCGAGTTGTGAAATGCTGTTGATGATGGATATGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGGTGTAGAGTACCTCCACATCCTCGGTGAGGAGCTGCTCGTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTGGGGAGTCCGGGCTGGGGGACCTTTCATA i nomLeu3.chr17 C 0 I 5249 s macFas5.chr19_KE145851_random 11581 543 - 18279 aactgactccaactgaaatctagagagggttggagagtagctgacagagacagaagagtgcccgagcgctgtggaggaagacatgagagagactggggaggatctcactgagctctgtgactttgtaggtgattccggggtgtgggaggctgactccccctgaaatctgggtgtagttggagaggagctggaacagacaggagagtcgctgagggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGATGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGATGAAAGGTACTTCCACATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGAGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGCTCATA i macFas5.chr19_KE145851_random I 8977 C 0 s papAnu2.chr19 38043112 492 + 51301725 AACTGACTCCAGCTGAAATCTGGATGTGGCTGGCGAGGAgctgagagagacagaagagtcCCTGTGGTCTGGGGATAAAGACATGAGAGAGACTGGGGAGTAACTCAGTGAAACTGGTGAATTTGGTGGTGAGTCCTGAGTG---------------------------------------------------CAGACAGGAGAGTCACTGAGGGCTGGGGGTGAGCTGCTGGAGGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCAGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGTTGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGACGAAAGGTACTTCCGCATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGtttctgggaggggagagggagaagctgggagaggcaggcatGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGCTCATA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37904487 543 + 50890351 aactgactccaactgaaatctacagatggttggagagtagctgacagagaccgaagagtgcccgagcgctgtggaggaagacatgagagacacttgggaggatctcactgagctctgtgagtttgtaggtgattctggggtgtgggaggtggactcctcctgaaatctgggtgtagttggagaggagctggaacagacaggagagtcactgagggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTACTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAAAGCACAATGACATCAGTGATTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGTTGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGATGAAAGGTACTTCCGCATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGAGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGCTCATA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=2976.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 119286 7 + 137718 TTCTCCC s macFas5.chr19_KE145851_random 12124 7 - 18279 ATCTCCT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043604 7 + 51301725 ATCTCCT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37905030 7 + 50890351 ATCTCCT i chlSab2.chr6 C 0 I 5391 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e nomLeu3.chr17 90740791 5249 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=9948.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 119293 18 + 137718 GAGACCTgtgagtctctg s macFas5.chr19_KE145851_random 12131 18 - 18279 GAGACCTgtgagtttctg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043611 18 + 51301725 GAGACCTGTGAGTTTCTG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37910428 18 + 50890351 GAGACCTgtgagtttctg i chlSab2.chr6 I 5391 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e nomLeu3.chr17 90740791 5249 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=7169.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 119311 9 + 137718 ggggactcc s nomLeu3.chr17 90746040 9 + 99891981 ggtgattcc i nomLeu3.chr17 I 5249 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12149 9 - 18279 ggggactcc i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 T 9554 s papAnu2.chr19 38043629 9 + 51301725 GGGGACTCC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37910446 9 + 50890351 ggggattcc i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=417587.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 119320 700 + 137718 tggttgca-------tggggc-tgactcccgcaggaacctggggatggctggagagtaactgggagcgacaggagagtccctgaggcctgggggtgaagagatgaaagacacgggggtggagcaccgtgaggctcgtgagtttgtaggtgattcctgggtgtggggggctgactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacacaggagaccccccgagagctgggggtgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATGTGGTATATTATTGATGAACGTGGGGACTCTGAGGAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAAAGCCCAATGGCTTCATTGATTGCCCATCACGGTGAGGACAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGATTCTGATGATGACAGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGGGGATGGTGAATGGTAGCTCCGGATCCCTGGTGAGGAGCTTCCCCTTAAGCCTGAGTTTCTGAGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTCGCTTGGACCTTGGGGAGTCCGGGCTGGGGGACCGTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGACCCTACTGTTCTTAGGTGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGGGCCCCTACTAATGTTCTAACTCGCAGAAGGAAGGAgtgtgtgtgcgtgtgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgtgtgtg s nomLeu3.chr17 90746049 686 + 99891981 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TGGGTGCA-------TGGGGC-TGACTCCCGCAGAAAGCTGGGAATGGTTGGAGAGTAACTGGGACACACAGGGGAGTCCCTGAGGGCTGGGGGTGAAGAGATGAAAGACACAGGGgaggagcgccctgaggcttctGAGTCTGTATGTGATTCCTGGGTGTGGGGGGCTGACTCCAGCTGAAATCTGGGGTTGTTTGGAGAGTAGCTGGGAGACACAGGAGACTCCCCGAGAGCTGGGGATGAGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACGTGTGGTATATAATCGATGAACGTGGTGAAGCTAAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCAGTGGCTTCACTGATTGCCCATCACGGTTAGGAAAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGTTTCTGGTGATGACAGAGGTGAGTGGGGTGAATCCCTAGAGGATGGTGAATGGTAGCTCCAGATCCCTGGTGAGGAGCTTTCTCGTAGGTCTGAGTTTCTGGGAGCGGAGAGGGACAAGCCGGGCGAGGCTAGCGTGACTCTCGGGGAGTCCGGGCTGGGGGACCGCTCATAGGAAGAGCCAGACAAGACCCCACTGTTCTTAGATGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGGCCCCCTACCAATTTTCTGACCCCCAGAATAaaggagtgagtgtgtgtgtgtgt------------------------- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37910455 670 + 50890351 tggctgca-------tggggt-tgactcccgcagaaatctggggatggttggagagtaattgggacacacaggagagtccctgagggctgggggcgaagagatgaaagacataggggaggagcgcggtgaggcttctgagtctgtatgtgattcctgggtgtggggggctgactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacacaggagactcccctagagctggggatgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATGTGGTATATTATCGATGAACGTGTTGACTGTAAAGAATCCCCAGAGGAGGACACAGGAGAGTCCAGTGGCTTCACTGATTGCCCATCACGGTTAGGAAAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGTTTCTGGTGATGACGGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGAGGATGGTGAATGGTAGCTCCAGATCCTTGGTGAGGAGCTTTCTCCTAGGTCTGAGTTTCTAGGAGGGGAGAGGGGCAAGCCAGGCGAGGCTAGCATGGATCTCGGGGAGTCCCGGCTGGGGGACTGCTCATAGGAAGAGCCAGAAAAGACCCCACTGTTCTTAGATGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGACCCCCTACCAATTTTCTGACCCCCAGAATAAAGGAGAgtgtgtgtgtg------------------------------ i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59729785 1614 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=1019.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 120020 4 + 137718 cgtg s gorGor3.chr4 59731399 4 + 201139530 tgtg i gorGor3.chr4 I 1614 I 329 s nomLeu3.chr17 90746735 4 + 99891981 cgtg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38044313 3 + 51301725 -gtc i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e chlSab2.chr6 37911125 0 + 50890351 C e macFas5.chr19_KE145851_random 3264 0 - 18279 C e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=170858.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 120024 294 + 137718 tgtgtgtttgtgtgtgtgcgttgtgAGGTATGTGCCCCTTAAGAAAATGGAAATCAACCAACCAATGagaca---------gacagacagacagacagacagacagaGATTCACTTGCCCAAGTGTTCTG---TCCTGTCCTCTGAATCTGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTGAGCTCCAAGTCCACGCAGAGTCCGCCAAAAGCTCCGGCCGCTGATCCGCTCCGCGAAGATCTGAGTACAGGCCAGCCAGGGTGGGTTTAAATAGCCTCGGGCGCAGCCTAGCAGCGGAAAGGGCGGAGCTTC s nomLeu3.chr17 90746739 288 + 99891981 tgtctggt--------------gtgaggtatgtgCTACTAATGGAAATGGaaataaacaaatcaataa-acaaatcaatGagacagacagacagactgagagacagaGATTCACTTGCCCAACTGTTCTG---TCCTGTCCTCCGAATGCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTAAGCTCCAAGTCCACGCAGAGCCCGCAGAACGCTCCGGCCGCTGCTCTGCTGTGCGAAGATCTGAGTACAGGCCCGCCAGGGTGGGTTTAATTAGCCTCGGGCGCAGCCTAGCAGCGGAAAGGGCGTAGCTTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 3264 281 - 18279 TGTGGGTGGGGGGGGGCGTAACTTGATTTGTGTCTTCCTTAAGAAAATGGGAATAAACACACAAATCAGACA-------------------------GACAGACACAGATTCACTTAGCCAAGGGTTCTGTTCTTCTGTCCTCTGAATCTGCTTCTAGATCACAAGATGCTGTAAGCTTCAGGTGCTGGCAGAACCAGCGAAACTCTCCTGCCGCTGCTGTCCTCTGTGAGGATCTGAGCACAGGCCGGATAGGGTGGGTTTAAGTCGCCTCGGACAGGGCCTGAGAGTGGAAAGGGCTGAGCTTC i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 I 9561 s papAnu2.chr19 38044316 278 + 51301725 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgaggtatGTGCTccttaagaaaatggaaagaaacaaaccaatgagaca-------------------------gacagacagaggtTCACTTACCCAAGTGTTCTG---TCCTGTCGTCTGAATCCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGGAAGCTCCAAGTCCACGCAGAGACCGCAAAACGCTCCGGAGGCTGCTCTCTTCTGCGAAGATCTGAGCACAGGCCCGCCAGGGCGGGTTTAAATAGCCTTGGCCGCAGCCTGTCAGCGGAAAGGGCGGAGCTTC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37911125 268 + 50890351 tgtgtgtgtgt----------tgtgaggtatgtACTCCTTAAGAAAATGGAAATAAACAAACCAATGAGACA-------------------------GACAGACAGGGATTCACTTACTCAAGTGTTCTG---TCCTGTCGTCTGAATCCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTAAGCTCCAAGTCCACGCAGAGACCGCAAAACGCTCCGGACGCTGCTCTCCTCTGCGAAGATCTGAGCACAGGCCCGCCAGGGCGGGTTTAAGTAGCCTTGGGCGCAGCCTGTCAGCGGAAAGGGCGGAGCTTC i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 102057 1643 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731403 329 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=28556.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 120318 39 + 137718 ACTCCTCCTTTCCATCAGTCACTCCCAACTTTCCCAGGC s nomLeu3.chr17 90747027 39 + 99891981 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rhiRox1.KN297800v1 103700 8 - 3959310 TCCACCTG i rhiRox1.KN297800v1 I 1643 I 13952 e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=68421.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 120365 105 + 137718 GTAGGAAACTGTTCTCCTGCTTTGATTTCATGCGCCACCTTTGGGACAATCTAAGAACTTACAAGTTTTCTTGGCCAGATATATTAGGAATTGTATGCACTGAAA s nomLeu3.chr17 90747074 104 + 99891981 CTAGGAGACTGCTCTCCTG-TTTGATTTCATGTGCCACATTTGGGACAATCTAAGAACGTACAAGTGTTCTTGGCCAAATATATGACGAATTAAATGCGCTTCAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 13153 105 - 18279 GTAGGAAACTGCTATCCTGTTGTGATGTCATATCATGCATTTGGGACAATCTAAGAACCTACGCGTTTTATTGACCAAATAGAGTAGGAATTAAATGCACTTAAA i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 I 6 s papAnu2.chr19 38044641 105 + 51301725 GTAGGAAACTGCTCTCCTGATTTGATGTTATGTCACGCATTTGGGACAATCTAAGAACTTACAAGTTTTATTGGTGAAATATAGTATGAATTAAATGCACTTAAA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37911439 105 + 50890351 GTAGGAAACTGCTCTCCTGTTTTGATGTCGTGTCACGCATTTGGGACAATCTAAGAACTTACAAGTTTTATTGGCCAAATATAGTAGAAATTAAATGTACTTAAA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 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GTATTCATTTGATGAAGGTGATTGGGTTAGGAATATCAAGGTGTGGTTCCAGATAATTCAATCATCTAATTAAGTTTTCAGTTAAGCTAATCTGTTTTAAAATTCCGTTTGTGTAAATCCTATTACTCAGACTGAGAATGGCAGT----gccccaaccccaattcccagggagggttgagagcctgaggttgagttgatcaccaatagcctatggtttaacccatcatgcctatgtaatgaagcctccataaaaacccaaaaggactgggtttggagagcttctggataaaacttcctggaaagtagggtgcccctccccctgtgccaggcccca i macFas5.chr19_KE145851_random I 6 I 3 s papAnu2.chr19 38044992 331 + 51301725 GCATTCATCGGATGATGGTGAATGGGTTAAGAATATCAAGGTGTGGTTCCAGATAATTCAATCACCTAATTAAGTTTTCAGTTAtggtaatttgttttaaaattccttttgtgTAAATCCTATTACTCAGACTGAGAATGGCAAT----GCCCCAACCCCAATTTCCAGGGAGGGTTGAGAGCCTgaggttgagttgatcaccaataGCCTATGGTTTAACccatcatgcctatgtaatgaagcctccataaaaacccaaaaggactggGTTTAGAGAGCTTCTGGATAAAACTTCCTGGAAAGTAGGGTGCACCTCCCCCCTTGCCGGGCCCCA i papAnu2.chr19 C 0 I 3 s chlSab2.chr6 37911791 329 + 50890351 GCATTCATTGGATGAGGGTGATTGGGTTAGGAATATCAAGGTGTGGTTCCAGATAATTCAATCATCTAATTAAGTTTTCAGTTAAGCTAATCTGTTTTAAAATTCCA--TGTGTAAATCCTATTACTCAGACTGAGAATGGCAAT----GCCTCAAccccaatatccagggagggttgagagcctgaggttgagttgatcaccaatagcctatggtttaacccatcatgcctatgtattgaagcctccataaaaacccaaaaggactgcgtctcgagagcttctggataaaacttcctggaaagtagggtacccctccacccatgcggggcccca i chlSab2.chr6 C 0 I 3714 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=165352.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121054 242 + 137718 --catttatt-tctgaactttgtgcaatgtccgctaaaatacaaccgcaaatgtaagtgtttccctgcgtgctgtgagctcttccagcaaatgaatgcaactaaatctgggagtggtggcaacctgatttatagccagtggctgagaagcacaggtaaagcaacgtagggcttcccattgttattagtgtgggaggcctgtctggcgggaccgggccctttggaatctaatgctatgtcccggta s nomLeu3.chr17 90747766 239 + 99891981 --cattc--t-tctgaatttt-tgaaatatccgctatgataaaatggtaactgtaagtgtttccctgcgtgctgtgagctcttcgagcaaattcatgcaactaaaacagggagtagtggaaacctgatttatagacggtcgctaagaagcacaggtaaaacagcgaagggcttcccattgtgattagagtgggaggccagtcttgcgggactgagccctttggagtctaacgctatctccgggta i nomLeu3.chr17 I 3 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 13598 242 - 18279 atctttt--tatctgaattttttgcgatatcctctataataaaatggtaaatgtaagtgtttccctgcgcgctgtgagctgttctagcaaattaatgcaactaaaacagggagtggtggaaacctgatacgtagccagttggtcagaagcacaggt-aaacaacgtagggcttgccgttgttatgagagtgggaggccagtttggcggaactgagccctgtggaatctaatgctatgtccaggta i macFas5.chr19_KE145851_random I 3 C 0 s papAnu2.chr19 38045326 241 + 51301725 ATcgttt--t-tctgaattttttgcaATATCCTTTATAGTAAAATGGTAAATGTAATTGTTTCCCTGCGTACCGTGAGCTGTTCTAGCAAATTAATGCAACTAAAACAGGGAGTGATGGAATCCTGATATGTAGCCAGtcggtcagaagcacaggt-aaacAACGTAGGGCTTGCCATTGTTATGAGAGTGGGAGGCCAGTTTGGCGGAACTGAGCCCTGTGGAATCTAATGCTATGTCCAGGTA i papAnu2.chr19 I 3 C 0 s chlSab2.chr6 13032067 242 - 50890351 attgttt--t-tctgaattttttgcaatatcctttatagtaaaatggtaaatgtaagtgtttccctgcatgctgttagctgttctagcaaattaatgcaactaaaacagggagtggtggaaacctggtatgtagccagtcggtcagaagcacgggtaaaacaacgtaggatttgccattgttatgagagtgggagacgagtcttgcggaactgagccctgtgcaatctaatactatgtccaggta i chlSab2.chr6 n 3714 I 917 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=9913.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121296 28 + 137718 gatagcgtcaccattgaattagaagaca s nomLeu3.chr17 90748005 28 + 99891981 gacggcgccgtcattgaattagaagaca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 13840 28 - 18279 caaagtgtcataatcgaattagaagaca i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38045567 27 + 51301725 GACAGTGTCAT-ATTGAATTAgaagaca i papAnu2.chr19 C 0 I 908 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13032309 917 - 50890351 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=1131.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121324 3 + 137718 cac s nomLeu3.chr17 90748033 3 + 99891981 cac i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 13868 3 - 18279 ccc i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 I 1036 s papAnu2.chr19 38046502 3 + 51301725 CAC i papAnu2.chr19 I 908 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13032309 917 - 50890351 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=1299.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121327 3 + 137718 aTA s nomLeu3.chr17 90748036 3 + 99891981 aTG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 14907 3 - 18279 ATG i macFas5.chr19_KE145851_random I 1036 C 0 s papAnu2.chr19 38046505 3 + 51301725 ATG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13032309 917 - 50890351 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=169211.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121330 275 + 137718 TGTTGAGAATAATCATTCTGGTCATTTGCTGCATGTCTTATTGACAATATGTAATCACATCCTTTATCCTGACCTTATGGCACCTGGGTTAAGAACCATGATTTGAACCAGACGTTGGTCTGTCACTTTCTCAGTTTGAAAC----TTTAttttgcctttagcgttttgctgttgctttttcgttGTCttttgtttcgtttcgttcctaagtt-ctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttactaaggttaacgtgtgccatggtggtttgctg s nomLeu3.chr17 90748039 271 + 99891981 TGTTGAGAATAATT-TTTTAGTCATTTGTTGTATGTCCTATGTACAATATGTAATCAAATTCTTTATCCTGACTTTATGGCACCTGC-TTGAGAACCATGATTGGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTCTCAGCTTGAAAC----TTGATTT-ACCGCTAGCCTTTTGTTATTGTTCTTTTGTTTCCttttgtttcgttttgtt--taaattgatggggtataagtgcaggatgtgcagatttgttaggaaggtaaacgtgtaccatgctggtttgctg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 14910 274 - 18279 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTATATGTTTTAATTGCAATATGTAATCAAATTCTTTGTCTTTACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACAATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTTTCAGTTTGAGACTTTGTTTATTTTGCCACTAGTGTTTTGTTTTTGTTTTATT----TTGtttgttt-gttttgtttttatgtt-ctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttccataggtaaacgtgtgccatggaggtttgctg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38046508 263 + 51301725 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTGTATGTCTTAATTGCAATATGCAATCAAATTCTTTGTCTTTACCTTATGGCACCTGGGTTGAGAACCATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCCCtttttcactttgagac----tttattttgccgctagtgttttgtttttgttt-----------tttgttt-cgtttgttttgAAGTA-CTGGGGtgtatgtgcaggatgtgcagatttgttacacaggtaaacatgtgccatggtggtttgctg i papAnu2.chr19 C 0 I 10893 s chlSab2.chr6 13033226 269 - 50890351 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTTATTTGCTGTATGTCTTAATTGCAATATGTAATAAAATTCTTTGTCTTTACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACCAGAATTTGAACCAGAAATCGGTCTGTCACTTTTTCAGTTTGAGACTTTGTTTATTTTGCCACTATTGTTTCGTTTTTGGTTTTTTGTTGTTGtttgttt-gttttgtttttaagtt-ctggggtgt---------atgtgcagatttgttacacaggtaaatgtgtgccatggtggtttgctg i chlSab2.chr6 I 917 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=146880.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121605 206 + 137718 cacctctcaacccatcacctaggtattaggcccagcatgcagtaggcgtttttcttaacgctctgtctccc---------------ggaaggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgggatctcatttttcagctcccattataagtgagt---tgtggcgtttggttttcttttccctggataagtttgctgagggtaatgacCACACATCAC s nomLeu3.chr17 90748310 205 + 99891981 cacctgtgaacccatcacctag-tagtaagcccggcatgcattaactgcttttcttcgtgctgtccgtccc---------------gacaggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtgcatgtgttctcctttttcagctcccatcatcactgagaa--tgtggtgtttggttttctgttcccaggtta-gtgtgctgaggataacgacttcACATCAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15184 220 - 18279 cacctatcaacccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccccatgtcaggccccaatgtgtgttg---cccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactatgagtaagaacatgtggtgtttggttttctgttcccggatta-gtttgctgaggataatgacttcACATCAC i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 13307673 223 - 51301725 cacctatcaccccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccccatgtcaggccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactatgagtgagaatgtgtggtgtttggttttctgttcctgggtta-gtctgctgaggataatgacttcacatcac i papAnu2.chr19 n 10893 C 0 s chlSab2.chr6 13033495 223 - 50890351 cacctatcaacccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccacatgacaggccccaatgtatgtttttccccttcctgtgtccgtgtgttctcatttttcagctcccactatgcgtgagaatgtgtggtgtttggttttctgttcctgggtta-gtctgctgaggataatgacttcACATCAC i chlSab2.chr6 C 0 n 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=1604.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121811 10 + 137718 CACTATT--TTT s nomLeu3.chr17 90748515 12 + 99891981 TGGTGTTATTTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15404 10 - 18279 TAGTGTT--TTT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 13307896 10 - 51301725 taatctt--ttt i papAnu2.chr19 C 0 T 6762 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13033718 0 - 50890351 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=1356.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121821 12 + 137718 GTTTTTTAGTAT s nomLeu3.chr17 90748527 12 + 99891981 TTTTTTTATTTA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15414 12 - 18279 TTTTTTTAATGT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 T 7275 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13033718 0 - 50890351 I e papAnu2.chr19 13307906 6762 - 51301725 T e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=91.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121833 1 + 137718 A s nomLeu3.chr17 90748539 1 + 99891981 A i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59731740 1472 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13033718 0 - 50890351 I e papAnu2.chr19 13307906 6762 - 51301725 T e macFas5.chr19_KE145851_random 15426 7275 - 18279 T e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=546.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121834 2 + 137718 AA s gorGor3.chr4 59733212 2 + 201139530 AA i gorGor3.chr4 I 1472 I 1308 s nomLeu3.chr17 90748540 2 + 99891981 AA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e chlSab2.chr6 13033718 0 - 50890351 I e papAnu2.chr19 13307906 6762 - 51301725 T e macFas5.chr19_KE145851_random 15426 7275 - 18279 T e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=12225.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 121836 243 + 137718 GAGTAGTATTTTATTGAATAAGATTTGCTCACAGAAAAATAAGCTTACATCTACAATGAATGCCAGACCCTACAGCAGAAAGCCATTTTCTCACTTTTCCACACACAATGGTTCCTACTAAGTGAAAAAAAAGCCATAAAATTTCATTCACAAATGTACTACTCTGTCTCAAAACATCGCACATAATCATGCACTGTACTAAAGCCATTAGATCAGTTCCTCAGTCAGGTTAAAG--------------AAGTATCA s nomLeu3.chr17 90748542 252 + 99891981 AATTAGTGTTTTATTAAACAGGGTTTCTTCACAGCAAAATAAGTTTA-ATCTACAATGAATGCCAGATATTACAGCAGAACGCAATTTTCTC--TTGCCCACACACAAAAGTTCTTACTAAGTGAAAAAA--GCCATAAAATTACATTCACAAATATGGTTCCCAGTCTCCAAAGCTTTCACATAATTATTCACAGTAGTAATACAATCAGAGCAGTTATTCAGTCAGGTGAAAGTACCGTGAACCCTAAAGTATAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I e chlSab2.chr6 13033718 0 - 50890351 I e papAnu2.chr19 13307906 6762 - 51301725 T e macFas5.chr19_KE145851_random 15426 7275 - 18279 T e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=27914.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122079 45 + 137718 C-------------------------TCTAATAACTGACTTTTATAATGCTATCAATATCCACTCCCAAT s nomLeu3.chr17 90748794 70 + 99891981 CAATAAGATTAAAAAAGACGTATCCATCCAATAACTGATTTTTGAAATGCTGTGAACGTCCACACCCTAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 8151 45 - 18279 -------------------------CTCTAATAACTGATTTTTTAAATGCTATAAATACCCACTCCCTAT i macFas5.chr19_KE145851_random T 7275 C 0 s papAnu2.chr19 38057664 45 + 51301725 -------------------------CTCtaataactgatttttaaaatgctataaatatcCACTCCCTAT i papAnu2.chr19 I 10893 C 0 s chlSab2.chr6 37915834 45 + 50890351 -------------------------CTCTAATAACTGATTTTTAAAATGCTATAAATATCCACTCCCTAT i chlSab2.chr6 I 3714 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15044815 1312 + 72422247 T a score=229527.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122124 227 + 137718 CAGTCTGCCATTGTTAATGGT-GTACAGCAATACTGAATACAATGGAATTGATGACGCCCATATCCAcggacaaaccgtgacttatgatggtttgatttatgatttttcaacgttatgatgggtttactggaatatTAGATGCGTTTCTGAGTTACACTGGGTTTATGAGTATGCGACCCTATACTCC------AGAAACAGCTGTATAAGGAAAAACAGGTTTACCTAATGAA s ponAbe2.chrUn 15043503 227 + 72422247 CAGTTTGCCATTTTTAAAGGT-GTACAGCATTATTGAGTACAACGGTATAGATGAAACCCATAACCACGGACAAAGcctgacttatgatggtttgatttatgatttttcaacactactatgggtttattgggatatTAGATGCGTTTTTGACTGACACTGGGTTTATCAGTATGTAACCCTACACTCC------AGAAACAGCTGTATAAAGAAAAACAGGTGTAACTAATTAC i ponAbe2.chrUn T 1312 C 0 s nomLeu3.chr17 90748864 225 + 99891981 GAGTCTGCCATTGTTAATGCT-GTACAGCATCATTGAATAGAATGGTATTGATGAAGCCCACATCCACGGAGAAAccctgacttacgatggtttgatttatgattttccaattttatgatgggtgtattgagatattacATGCGTGTTTA--------TGGGTTCATCGGTAGGTGACCCCGTTCTCCCGGAATGGGAATGGCTATCTAAAGTGAAACAGGTGTACCTAATTAA i nomLeu3.chr17 C 0 T 11504 s macFas5.chr19_KE145851_random 8196 226 - 18279 CAGTTTGCCATTGTTAAAGGT-GTACAGCATTATGGAATACAACGGAATTGATGAAACCCATATCCAcggacaaaccgtgacttatgatggtttggtttatgattttttaactttatgatgggtttattgggatatTAAATATATTTTTGAGTG-CACTGGGTTTATCAGTATGTAACCCTATACTCC------AGAAATAGCTGTATAAAGAAAAACAGGTGTACTGAAGGGA i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057709 227 + 51301725 CAGTTTGCCATTGTTAAAGGCAGTACAGCATTATGGAATACAACGGAACTGATGAAACCCATATCCACGGGCAAACCGTGACTTATGATGGTTTGGtttatgattttttaactttatgatgggtttattgggatattaaatatatttttgagtg-cACTGGGTTTATCAGTATGTAATCCTATACTCC------AGAAATAGctgtataaagaaaaacaggtgtACTGAAGGGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37915879 226 + 50890351 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103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I a score=122004.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122387 153 + 137718 TCACAACTGATGGAGAGCCGTGTAAGAGAGATAACGTTAAATATTTA------CAATAACACAATTTTCCTGCACCTGTCGAGGATTTCCCCAAAAAAACGCAGGATGTGGGATGCACCTAAGGCATaggaaagagagagggcagaaggagtaagagag s ponAbe2.chrUn 15043766 152 + 72422247 TTACAATTGATGGAGAAACATGAAAGAGAGATACCGGTAAATAAAAA------CAATAACACAATTTTCCTGCAACTGTCTAGGACTTCCC-AAAACAACACAGAATGTAGGATGCACCCAAGGAATATAaaagagagaaggcagaaagagtaggagag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90749089 132 + 99891981 TTACAATTGATGCAGAACC----------TGTACCAGTAAATAAAAATTGATGCAGAACCTCAATTTTCCTGCATTTTCCTGCAATAACTC---AATTTTCCAGAATGTAGGATGCAGCCAAGGCATGTAAAAGTGAG--------------AAGAGAG i nomLeu3.chr17 I 11468 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 8458 151 - 18279 TTACAATTGATGGAGAACCATGAAAGACAGATACCACTAAATAAAAA------CAATAACACAA-TTTCCTGCAACTGTCGAGGATTTCCG-AACAAAACACAAGAAATAGGATGCACACAATGAATATAAAAGAGAGAGGGCAGAAGCagcaagagag i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057972 151 + 51301725 TTACAATTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGATAccaccaaataaaaa------caataacacaa-tttcCTGCAACTGTCGAGGATTTCCg-aacaaaacacaagaaatagGATGCACACAATGAATATAAaagagagagggcagaagcagcaagagag i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37916141 152 + 50890351 TTACAATTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGACACCACTAAATAAAAA------CAATAACACAATTTTCCTGCAACTGTCGAGGATTTCCG-AACAAAACACAAGAAGTAGGATGCACACAATGAATATAAAagagagagggcagaagcagcaagagag i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I a score=8467.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122540 22 + 137718 aaataggaggaaggagggaagg s ponAbe2.chrUn 15043918 15 + 72422247 aaataggaggaagga------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90749221 15 + 99891981 AAATAGGaggaagga------- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 13301144 22 - 51301725 aaatggaagaaaggaaggaagg i papAnu2.chr19 T 6762 C 0 s chlSab2.chr6 37916293 22 + 50890351 ggagggaaggaaggaaggaagg i chlSab2.chr6 C 0 I 1112 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I e macFas5.chr19_KE145851_random 8609 0 - 18279 C a score=778.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122562 14 + 137718 aaagaaggaagtca s papAnu2.chr19 13301166 14 - 51301725 aaggaaggaaggaa i papAnu2.chr19 C 0 I 4483 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59733214 1308 + 201139530 I e chlSab2.chr6 37916315 1112 + 50890351 I e macFas5.chr19_KE145851_random 8609 0 - 18279 C e nomLeu3.chr17 90749236 0 + 99891981 C e ponAbe2.chrUn 15043933 0 + 72422247 C a score=32854.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 122576 103 + 137718 ggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagg-aaggaaagaaggacgtaaggaaggaGAAAACAGC-GGTGTTACTAAAAGCCCCCAAAAAAA-TGGTTTCCC s ponAbe2.chrUn 15043933 62 + 72422247 ----------------------------------------aagaagga----aggcgggagaaaaCACCTGGTGTTACTAAAAAAaaaaaaaaaaaatggtttctc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90749236 97 + 99891981 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tgtcctgggtgcctggaactgactccagctggaatctagacaagttttgag-gtagctgaaagagacacaagagtccctgtgggctgagggcaaagacctgagagagaccagggaggatctcagtgaggtctgtgggtgtgtaggtgattcctgagtgtcggaggctgactcccgctgaaatctgagcgtggctggagaggagctgggacacgcaggagagtcccagggggctgtgggtgaagacgtgagagagactggagagtaactcagtgaaactgctgacttcgtaggtgattcctgggtgccgggaactgactcccgctgaaatctgggcgtggtcggagagcagctgggacagccaggagagtccctgagggctggg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 10548 371 - 18279 tgtcctgggtgtctggacctgactccagcaggaatctagagatggcttgagagtagctgaaactgatagaagagtccctgtgg------------gacctgagagagactggggaggatctcagtgaggtctgtgagtctgtaggtgattcctgggtgtaggaggccgactcctgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgagggctgggggtgaaggcatgagagggaccggggagtagctcagtgaaattggtgagtttgtagctgattcctgggtgcctggaactgactcccgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggacagtccttatgggctggg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38042214 383 + 51301725 TGTCCCGGGTGCCTGGAATGGACTCCAGCTGGAATCTAGGGATGGTTTGAGAGTAGCTGAAAGAGACAGAAGATTCTCTGTAGGCTGAGGGCAAAGACCTGAGAGAGACTGGGGAGGATCTCAGTGAGGTCTGTGAGTCTGTAGGTGTTTCCTGGGTGTAGGAGGCTGACTCCTGCTGAAATCTGGGTGTGTttggagagtagctgggacagacaGGAGAGTGCCTGAGGGCTGGGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGTGGAGTAACTCAGTGAAATTGGTGAGTTTGTAGCTGATTCCTGGGTGCCTGGAACTGAGTCCCGCTGAAATCTGGGCTTGGttggagagtagctgggacagacaGGAGAGTCCCTGAGGGCTGGG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37918242 371 + 50890351 tgtcctgggtgtctggaactgactccagctggaatctagagatggcttgagagtagctgaaacagatagaagagtccctgtgg------------gacctgagagggactggggaggatctcagggaggtctgtgagtctgtaggtgtttcctgggtgtaggaggctgactcctgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagacggcttgaggtctgggtgtgaagacatgagagagaccagggaatatctcagtgaggtgtgtgagtttgtaggtgattcctggatgcctggaactgactccagctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgtggtctggt i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a 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tgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaagctggtgagtttggtggtgaccccggggtgcctggaactgactccagccgaaatctgggcgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccc i nomLeu3.chr17 C 0 I 143 s macFas5.chr19_KE145851_random 10921 134 - 18279 tgaagacaagagagagactggggaatatctcagtgaggtgtgtgagtttgtaggggattcctgggtgtctggaactgagtcccgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccc i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050281 133 + 51301725 TAAAGAGTTGGAGGACATGGGGATGGAGCCGTGTGAAGACCCTGAGTTTCCAGGTGTTTCCTGGGTGTGGGAGACTGACTGGTGGAGAAACGTGGGGAGTTCTGGAGAGTAACTGGGAGATGT-GGAGTGTCCC i papAnu2.chr19 I 7682 C 0 s chlSab2.chr6 37918615 134 + 50890351 taaagacacgagagagactggggagtaactcaatgaaattggtgagtttggtggtgatttctgggtgcctgaaactgactcctgctgaaatctgggcgtggttggagagctgctgggacagacaggagagtccc i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=195247.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 124521 258 + 137718 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tgtggtctggtgataaagacatgagagagactggggagtaactcaatgaaattggtgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactgagtcccgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgtgggctgggggtgaagacaagagagagactggggagtatctcagtgaggtctgtgagtttgtaggggatccctggctgcctggaactgagtccagctgaaatctgggtgtgg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050414 239 + 51301725 CGTGG--CAGGGGTGAAGAGATGGGACACACAGGGGAGGAGTGCAGTGAGGACTCTGAATTTCTGGGTGTTGCCTGGGTGTGGGAGTTTGACTGTTGTAGAAACCTGGGGCTGGTTGGAGTGGAGCTGGGAGAAACCAGAGAATCTCTGGGGAATGGGGATGAAGAGATGGGAGACACGTGGGAGGAGCACAGGGAGGTCTCTGA--------------CCTGA------GGGGCTGACCCCGATAGAAATCTGGCGACGG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37918749 261 + 50890351 tacgggctgggggtgaagacatgagagagactggggaatatctcagtgaggtctgtgagtttgtaggggatccctggctacctggaactgagtccagctgaaacctgggtgtggttggagagcagctgagagagacagaagagtccctgtggcctggggataaagacgtgagagagattgtggagtaacacagtgaaatgggtgagtttgtaggtgatccctggctgcctggaactgactccagctgaaacctgggcgtgg i chlSab2.chr6 C 0 T 14600 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=27745.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 124779 38 + 137718 ttggagagttgctgggacagacgggagagtccctgagg s panTro4.chr4 111483519 38 - 193495092 ttggagagtagctgggacagacgggagagtccctgagg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90751569 38 + 99891981 ttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11316 38 - 18279 ttggagagtagctccgagagacaggagagtccctgtgg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 I 3 s papAnu2.chr19 38050653 38 + 51301725 TGGGAGAGGAGCTGAGAGACACAGGAGAGTCCCTGAGG i papAnu2.chr19 C 0 I 3 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e chlSab2.chr6 37919010 14600 + 50890351 T e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=64152.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 124817 87 + 137718 gatggtggagacatgagagagactggggagtaacgcagtgaaattggtgagtttggtggtgacttctgggtgcctgcaacggactcc s panTro4.chr4 111483557 87 - 193495092 gctggtgaagacatgagagagactggcgagtaattgagtgaaattggtgagtttggtggtgattccggggtgcaaggaactgcttcc i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90751607 87 + 99891981 gctggtgaagacatgagagagaccggggagtaagtgagaggaattgttgagtgtggtggtgattccggggtgcctggaactgactcc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11357 87 - 18279 ggggatgaagatgtgagagagattgtggagtaactcagtgaaatgggtgagtttgtaggggatccctggctgcctggaactgactcc i macFas5.chr19_KE145851_random I 3 C 0 s papAnu2.chr19 38050694 87 + 51301725 GCAGGTGAAGAGATAGGAGACATGATGGAAGAGGGCCCTGAGATGTGTGAGTCTGTAGGTGATTCCTAGATTTGGGGAGTTGAGGGT i papAnu2.chr19 I 3 C 0 s chlSab2.chr6 37904410 87 + 50890351 gagggtgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaaactggtgaatttggtggtgagtcctgggtgcctggaactgactcc i chlSab2.chr6 T 14600 I 14513 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=7838.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 124904 19 + 137718 cgctgaagtgtgggcgtgt s panTro4.chr4 111483644 19 - 193495092 agctgaaatgtgggcgtgg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90751694 19 + 99891981 agctgaaatttgggtgtag i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11444 19 - 18279 agctgaaacctgggcgtgg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050781 19 + 51301725 TGCAGGAAGCTTGGGATGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e chlSab2.chr6 37904497 14513 + 50890351 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=45167.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 124923 52 + 137718 ttggagagtagctgggacagacaggcgagtccctgagggttggagataaaga s panTro4.chr4 111483663 52 - 193495092 ttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgagggttggagataaaga i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90751713 49 + 99891981 ttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggctgg---tgaaga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11463 52 - 18279 ctggagagcaggtgagagagaaagaagagtccctgatggctgagggtgaaga i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 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17414 s chlSab2.chr6 37919062 60 + 50890351 cgtgagagagactggggagtaactcagtgaaactggtgaatttggtggtgagtcctgagt i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=195284.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125035 199 + 137718 tcctggaactgacccgcgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagactggagggtccgtaagggctgggggtgaagacgtgagagagactggcgaggatctcactgaggtctgtgagtttgtaggtgtttctggggtgtggggtacagactcccactgaaatctgggcgtagttggagagtatctggga s panTro4.chr4 111483775 199 - 193495092 tcctggatctgacccgcgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggagagactggagggtccgaaagggctgggggtgaagacgtgggagagactggcgaggatgtcactgaggtctgtgagtttgtaggtgtttctggggtgtgggataccgacgcccgctgaaatctgggcgtagttggagagtagctggga i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90751822 199 + 99891981 gcccggaactgactcccgctgaaatgtgggcgtgctcggagaggagctgggacagacaggagagtccctgagggttggggataaagacgtgctagagaccggggagtaactcagcgaaagtggtgagcttggtggtgatccctgggttcctggaactgacccccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctggga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11575 199 - 18279 gcctggaactgactccaactgaaatctagagagggttggagagtagctgacagagacagaagagtgcccgagcgctgtggaggaagacatgagagagactggggaggatctcactgagctctgtgactttgtaggtgattccggggtgtgggaggctgactccccctgaaatctgggtgtagttggagaggagctggaa i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060667 199 + 51301725 GCCTGGAACTGACTCCAGCTGAAATCTAGAGAGGGttggagagtagctgggacagacaGAAGAGTGCCTGAGCGCTGTGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGGGGAGGATCTCACTGAGCTCTGTGAGTCTGTAGGTGATTCTGGGATGTGGGAGGCTGACTCCCCCTGAAATCTGGGTGTAGTTGGAGAGGAGCTGGAA i papAnu2.chr19 I 17414 T 17612 s chlSab2.chr6 37919122 199 + 50890351 gcctggaactgactccagctgaaatctagagagggttggagagtagctgggacagagagaagagtgcctgagcactgtgggtgaagacatgagagagactggggaggatctcactgagctctgtgagtttgtaggtgattctggggtgtgggaggcggactcctcctgaaatctgggcgtagttggagaggagctggaa i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=350770.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125234 289 + 137718 cagacaggagagtcatgggtggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGAGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGTCACGGGAGAACACAATGACATGAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGGAATGGGAAACGTAAAGTTGTGGAATTCTGTTGATGACGGATGTGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGATGTAGAGGACTTCCACATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGA s panTro4.chr4 111483974 289 - 193495092 cagacaggagagtcattggtggctgggggtgaGCTGCTGGATGACGGCAGTAAGAACATATGGCACATTATTGATGAATGGGGTGACTGTGAGGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAACACAATGACATGAGTGATTGTCCTGCTTGGTTAGGAAAGGGAAATGTAAAGTTGTGGAATTCTGTCGATGACGGATGTGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGATGTAGAGTACTTCCACATCCCTTGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTCCTGGGAGGGGAGA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90752021 289 + 99891981 cagacaggagagtcactgatggctggggatgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGACTGAGGTGACTGTGAATAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGATTGTCCTGCGTGGTAAGGAAAGGGAAATGTCGAGTTGTGAAATGCTGTTGATGATGGATATGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGGTGTAGAGTACCTCCACATCCTCGGTGAGGAGCTGCTCGTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 11774 289 - 18279 cagacaggagagtcgctgagggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGATGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGATGAAAGGTACTTCCACATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGA i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043254 289 + 51301725 CAGACAGGAGAGTCACTGAGGGCTGGGGGTGAGCTGCTGGAGGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCAGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGTTGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGACGAAAGGTACTTCCGCATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGtttctgggaggggaga i papAnu2.chr19 T 17612 C 0 s chlSab2.chr6 37919321 289 + 50890351 cagacaggagagtcactgagggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGATACATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCGGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAAAGTTGTGAAATTCCGCTGATGTTGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGATGAAAGGTACTTCCGCATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGTTTCTGCGAGGGGAGA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15045313 158 + 72422247 I a score=96845.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125523 56 + 137718 GGGAGAAGCTGGGTGAGGCAGGCATGAATATTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGC s panTro4.chr4 111484263 56 - 193495092 GGTAGATGCTGGGTGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCTC i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045471 56 + 72422247 gggaGAAGCTGTGTGAGGCAGGCATGAATCTTGAAGAGTCAGGGCTGGGGGACTGC i ponAbe2.chrUn I 158 C 0 s nomLeu3.chr17 90752310 56 + 99891981 GGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTGGGGAGTCCGGGCTGGGGGACCTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12063 56 - 18279 GGGAGAAGCTGGGAGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGC i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043543 56 + 51301725 gggagaagctgggagaggcaggcatGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37919610 56 + 50890351 GGGAGAAGCTGGGAGAGGCAGGCATGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGGGGACCGC i chlSab2.chr6 C 0 T 14641 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I a score=10371.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125579 6 + 137718 TCATAA s panTro4.chr4 111484319 6 - 193495092 TCATAT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045527 6 + 72422247 TCATAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90752366 6 + 99891981 TCATAA i nomLeu3.chr17 C 0 I 5200 s macFas5.chr19_KE145851_random 12119 6 - 18279 TCATAA i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043599 6 + 51301725 TCATAA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37905025 6 + 50890351 TCATAA i chlSab2.chr6 T 14641 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I a score=5604.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125585 6 + 137718 TCTCCC s panTro4.chr4 111484325 6 - 193495092 TCTCCC i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045533 6 + 72422247 TCCTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12125 6 - 18279 TCTCCT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38043605 6 + 51301725 TCTCCT i papAnu2.chr19 C 0 I 7269 s chlSab2.chr6 37905031 6 + 50890351 TCTCCT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e nomLeu3.chr17 90752372 5200 + 99891981 I a score=19583.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125591 18 + 137718 GAGACCTgtgagtctctg s panTro4.chr4 111484331 18 - 193495092 GAGACCCgtgagtatctg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045539 18 + 72422247 GAGACCTGTGGGTCTCTA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12131 18 - 18279 GAGACCTgtgagtttctg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050880 18 + 51301725 GAGACCCCTGAGTTTCTG i papAnu2.chr19 I 7269 C 0 s chlSab2.chr6 37905037 18 + 50890351 GAGACATGTGAGTTTCTG i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I e nomLeu3.chr17 90752372 5200 + 99891981 I a score=35509.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125609 31 + 137718 ggggactcctggttgcatggggc-tgactccc s panTro4.chr4 111484349 31 - 193495092 ggggactcctgggtgcatggggc-tgactccc i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045557 31 + 72422247 ggggactcctgggtgcatggggc-tgactccc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90757572 31 + 99891981 ggtgattccggggtgcccggaac-tgactccc i nomLeu3.chr17 I 5200 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12149 31 - 18279 ggggactcctggctgcatggggc-tgactccc i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050898 31 + 51301725 GTTG-TTCCAGTCTGGTCGGGGTGTGACTGTT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37905055 31 + 50890351 GGGGATTCCTGGCTGCATGGGGT-TGACTCCC i chlSab2.chr6 C 0 I 4664 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I a score=708012.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 125640 504 + 137718 gcaggaacctggggatggctggagagtaactgggagccacaggagagtccctgaggcctgggggtgaagagatgaaagacgcaggggtggagcaaagtgaggctcgtgagactgtaggtgattcctgggtgtggggggctgactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacacaggagaccccccgagagctgggggtgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATGTGGTATATTATTGATGAACGTGGGGACTCTGAGGAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCAATGGCTTCATTGATTGCCCATCACGGTGAGGACAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGATTCTGGTGATGACAGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGGGGATGGTGAATGGTAGCTCCGGATCCCTGGTGAGGAGCTTCCCCTTAAGCCTGAGTTTCTGAGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTCGCATGGACCTTG s panTro4.chr4 111484380 504 - 193495092 gcaggaacctggggatggcttgagagtaactgggagccacaggagagtcccggaggcctgggggtgaagaggtgaaagacataggggaggagcaccgtgaggctcgtgagtttgtaggtgattcctgggtgtggggggctgactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacccaggagactccccgagagctgggggtgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAGGAACGTGTGGTATATGACTGATGAACGTGGTGACTCTGAAGAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCATTGGCTTCATTGATTGCCCATCACGGAGAGGACAGGGAAATGGGAGATTGTGGGATACTGGTGATGACAGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGCGGATGGTGAATGGTAGCTCCGGATCCCTGGTGAGGAGCTTCCTCTTAAGACTGAGTTTCTGAGAGGGGACAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15045588 504 + 72422247 gcagaaacctggggatggctggagagtaagtgggagacacaggagagtccctgaggcctggaggtgaagagatgaaagacataggggaggagcacagtaaggctcatgagtttgtaggtgattcctgggtgtgggggacagactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacacaggagtctccccgagagctgggggtaaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGTGGTGGTTCAAAAGAATCCCAAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCAAAGGCTTCATTGATTGCGCATCACGGTGAGGAAAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGATTCTGGTGACGACAGAGATGAGTGTGGTGAAGCCCTAGGGGATGGTTAATGGCAGCTCCGGATCCCTGGTGAGGAGCTTCCTCTTAAGTCTGAGTTTCTGAGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90757603 504 + 99891981 gctgaaatgtgggcgtgctcggagaggagctgggacagacaggagagtccctgagggttggggataaagacgtgctagagaccggggagtaactcagcgaaagtggtgagcttggtggtgatccctgggttcctggaactgacccccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtcactgatggctggggatgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGACTGAGGTGACTGTGAATAATCCTCAGAGGAGGACACGGGAGAGCACAATGACATCAGTGATTGTCCTGCGTGGTAAGGAAAGGGAAATGTCGAGTTGTGAAATGCTGTTGGTGATGGATATGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGGTGTAGAGTACCTCCACATCCTCGGTGAGGAGCTGCTCGTTGGGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12180 504 - 18279 gcagaaagctggggatggttggagagtaactgggagacacaggggagtccctgagggctgggggtgaagagatgaaagacataggggaggagcgccctgaggcttctgagtctgtatgtgattcctgggtgtggggggctgactccagctgaaatctggggttgtttggagagtagctgggagacacaggagactcccctagagctgggggtgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATGTGGTATATTATCGATGAACGTGGTGACTGTAAAGAATCCCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCAGTGGCTTCACTGATTGCCCATCACGGTTAGGAACGGGAAATGGGAGCTTGTGGGTTTCTGGTGATGACGGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGAGGATGGTGAATGGTAGCTCCAGATCCCTGGTGAGGAGCTTTCTGTTAAGTCTGAGTTTCTGGGAGGGGAGAGGGACAAGCCAGGCGAGGCTAGCGTGACTCTCG i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050929 503 + 51301725 GCAGGAATCTAGGGATGGTTGGAGAGTAACTGGGAGACATGGGAGAGTCCCTGGGGGCT-GGGGTGATGAGATGGGAGACATAGGGCAGGATCCCAGTGAGGTCTGTGAGTGTCTCTGTACTTCCTGGGTGTGGCAGGCTGACTGGGTCAGAAATCTGGGGTTGTCTGGGGAGTACCTGGGAGGCACACGAGACTCCCCATGAACTGGGGGTGAGCTGCTGGGCGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTCTTGATGAACGTGGCGACCCTGAAGAATCCCCAGGGGAGGACATGGGAGAGAACAATGGCTTCAGTGACTGTGCATCACGGTTAGGAAAGGGAAATGGGAAAGTGTGGCATTCTGGTGATGATGGAGGTGAGCTTGGTGAAGCCCCGCGGGATGATGAAAAGTGGCCCCGGGTTTTTGGTGAGGAGGCTGCTCTTGCGCCTACATTTctgagaggggagagggataaGCTGGGTGGGGCTGGCATGGATCTTG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37909750 504 + 50890351 gcaggaatctagggatggttggagagtaactgggagacatgggagagtccctgggggctgggggtgatgagatgggagacatagggcaggatcccagtgaggtctgtgagtgtctctgtacttcctgggtgtggcaggctgactgggtcagaaatctggggttgtctggggagtacctgggaggcacaggagactccccatgaactgggggtgaGCTGCTGGGCGATGGCAGTAAGAATATATGGTATATTATTGATGAACGTGGCGACCCTGAAGAATCCCCAGGGGAGGACATGGGAGAGCACAATGGCTTCAGTGACTGTGCATCACAGTTAGGAAAGGGAAATGGGAAAGTGTGGCATTCTGGTGATGATGGAGGTGAGCTTGGTGAAGCCCCGTGGGATGATGAAAAGTGGCCCCGGGTCTTTGGTGAGGAGGCCGCTCTTGGGCCTACATTTCTGAGAGGGGAGAGGGATAAGCTGGGTGGGGCTGGCATGGATCTTG i chlSab2.chr6 I 4664 I 727 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I a score=165312.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 126144 132 + 137718 GGGTGTCCGTGCTGGGGGACCGTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGACCCTACTGTTCTTAGGTGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGGGCCCCTACTAATGTTCTAACTCGCAGAAGG--AAGGAg s panTro4.chr4 111484884 132 - 193495092 GGGAGTCCGGGCTGGGGGAACGTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGACCCTAGTGCTCTCAGGTGCAGACATGATTAGGAAAACTGCAGCTCCCAGAGACCCCTACTAATTTCCTGACCCGCAGAATG--AAGGAG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15046092 132 + 72422247 GGGAGTCCGGGCTGGGGGACCTTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGACCCTACTTTTCTTAGGTGCAGACATGATTAGGAAACCTGTAGCTCCCAGGAACCCCTACCAATTTTCTAACCCGCAGAATG--AACCAg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90758107 114 + 99891981 GGGAGTCCGGGCTGGGGGACCTTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGA-CCTGCTGTTCTTAGATGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGC-----------------AATTTGCTATCCCGCAGAATG--AAGGAG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12684 132 - 18279 GGGAGTCCGGGCTGGGGGACCGCTCATAGGAAGAGCCAGAAGAGACGCCACTGTTCTTAGAAGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGGCCCCCTACCAATTTTCTGACCCCCAGAATA--AAGGAg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38051432 116 + 51301725 AGGAGGCCAGGCTTGGAGACCGCTCATAGGAGGAGCCA------------------TTAGAGGCAGACATGATTAGAAACCCCGCAGTTCCCGGTGTCACCTACCCCTTTCCTGACCCCCAGTATATGAAGggc i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37910981 132 + 50890351 GGGAGTCCCGGCTGGGGGACTGCTCATAGGAAGAGCCAGAAAAGACCCCACTGTTCTTAGATGCAGACATGATTAGGAAACCTGCAGCTCCCAGGACCCCCTACCAATTTTCTGACCCCCAGAATA--AAGGAG i chlSab2.chr6 I 727 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59734523 4706 + 201139530 I a score=7040.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 126276 6 + 137718 tgtgtg s panTro4.chr4 111485016 6 - 193495092 TCtgtg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59739229 6 + 201139530 Agtgtg i gorGor3.chr4 I 4706 I 5776 s ponAbe2.chrUn 15046224 6 + 72422247 tgtgtg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90758221 4 + 99891981 --TGCG i nomLeu3.chr17 C 0 I 2 s macFas5.chr19_KE145851_random 12816 6 - 18279 tgtgtg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38051548 6 + 51301725 actctg i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37911113 6 + 50890351 Agtgtg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I a score=29919.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 126282 31 + 137718 tgcgtgtgtgtgcgtgtgcgtgtgcgtgtgt s panTro4.chr4 111485022 31 - 193495092 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15046230 31 + 72422247 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i ponAbe2.chrUn C 0 M 793 s nomLeu3.chr17 90758227 31 + 99891981 TTtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i nomLeu3.chr17 I 2 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 12822 18 - 18279 ------tgtgtgtgtgtgtgtgtg------- i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38051554 18 + 51301725 ------tgtgtgtgtgtgtgtgtg------- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 37911119 18 + 50890351 ------tgtgtgtgtgtgtgtgtt------- i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=97765.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 126313 170 + 137718 gtgtgcgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgcggtgtgAGGTATGTGCCCCTTAAGAAAATGGAAATCAACCAACCAATGagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagaGATTCACTTGCCCAAGTGTTCTG---TCCTGTCCTCTGAACCCGCTTCCAAGTC s panTro4.chr4 111485053 146 - 193495092 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3 + 99891981 aTG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 14907 3 - 18279 ATG i macFas5.chr19_KE145851_random I 1036 C 0 s papAnu2.chr19 38046505 3 + 51301725 ATG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e chlSab2.chr6 37920583 2800 + 50890351 I a score=376656.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 127640 275 + 137718 TGTTGAGAATAATCATTCTGGTCATTTGCTGCATGTCTTATTGACAATATGTAATCACATCCTTTATCCTGACCTTATGGCTCCTGGGTTGAGAACAATGATTTGAACCAGACGTTGGTCTGTCACTTTCTCAGTTTGAAAC----TTTAttttgcctttagcgttttgctgttgctttttcgttGTCttttgtttcgtttcgttcctaagttctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttactaaggtaaacgtgtgccatggtggtttgctg s panTro4.chr4 111486358 275 - 193495092 TGTTGAGAACAATTTCTCTGGTCATCCGCTGCATGTCTTATTTACAATACGTAATCGAATTCTTTATCCTGACCTTATGGCAGCTGGGTTGAGAACCATGATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTCTGAGTTTGAAAC----TTTGTTTTGCCGTTAGCGTTTTGCTATTGCTTTCTCGttttctttgctttcgatttgtttctaagttctgggatatacgggcagggtgtgcagatttgttactaaggtaaacgtgtgccacggtggtttgcgg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15047598 275 + 72422247 TGTTGGGAATAAATTTTCTAGTCATTTGCTGTATGTCTTATTTACAATATGTAATCAAATTCTTTATCCTGACCTTATGGCACCTGGGTTGAGAACCATGCTTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTCTCTGTTTGAAAG----TTTATTTTGCTGCTACCGTTTTGTTATTGTTTTTTCGTTTTGttttgtttcattttgtttcaaagttctggggtgtatgcgcagggtgcccagatttgttacaaaggtagacgtgtgccatggtggtttgctg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90759568 274 + 99891981 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGTTGTATGTCCTATGTACAATATGTAATCAAATTCTTTATCCTGACTTTATGGCACCT-GCTTGAGAACCATGATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCATTTTCCCAGCTTGAAAC----TTGATTTTACCGCTAGCCTTTTGTTATTGTTCTTTTGTTTCCTTTTGTTTCGttttgttttaaattcatggggtataagtgcaggatgtgcagatttgttaggaaggtaaacgtgtgccatgctggtttgctg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 14910 274 - 18279 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTATATGTTTTAATTGCAATATGTAATCAAATTCTTTGTCTTTACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACAATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTTTCAGTTTGAGACTTTGTTTATTTTGCCACTAGTGTTTTGTTTTTGTTTT---ATTTTGtttg--tttgttttgtttttatgttctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttccataggtaaacgtgtgccatggaggtttgctg i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38046508 263 + 51301725 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTGTATGTCTTAATTGCAATATGCAATCAAATTCTTTGTCTTTACCTTATGGCACCTGGGTTGAGAACCATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCCCtttttcactttgagac----tttattttgccgctagtgttttgtttttgttt----------tttg--tttcgtttgttttgAAGTACTGGGGtgtatgtgcaggatgtgcagatttgttacacaggtaaacatgtgccatggtggtttgctg i papAnu2.chr19 C 0 I 17360 s chlSab2.chr6 37923383 265 + 50890351 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTATATGTTTTAATTGCAATATGTAATCAAATTCTTTGTCCTCACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACAATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTATCACTTTTTCAGTTTGAGACTTTGTTTATTTTGCCACTAGTGTTTTGTTTTTGTTTT---ATTTTGTTTG--CTTGttttgtttttaagttctggggtat---------atgtgcagatttgttacataggtaaacgtgtgccatggaggtttgctg i chlSab2.chr6 I 2800 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=332354.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 127915 221 + 137718 cacctgtcaacccatcacctaggtattaggcccagcatgcagtagctgtttttcttaacgctctgtctccc---------------ggaaggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgggatctcatttttcagctcccattataagtgagt---tgtggcgtttggttttcttttccctggataagtttgctgagggtaatgacCACACATCACCACTG---T--TTTTGTTTT s panTro4.chr4 111486633 221 - 193495092 cacctgtcaacccatcacctaggtattcagcccagcaggcagtagctgtttttcttaacgctctgcctccc---------------gaaaggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgatcccattgttcagctcccactataagtgaga--atgtggcgtttggttttctgttccc-ggattaggttgttgaggataacgacttcACATCACCAGTG---T--CTTTGTTTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15047873 223 + 72422247 cacctgtcaacccatcacctcggtattaagcccagcatgcattagctgtttttcttaatgctctgcctccc---------------gaaaggccccaatgtatgttgttccccttcctgtgtccatgtgatctcgtttttcagctcccattataagtgaga--atgtggtgtttggttttc-attccc-agactggtttgctgaggataatgacttcACATCACCAGTGTGTT--TTTTCTTCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90759842 223 + 99891981 cacctgtgaacccatcacctaggtagtaagcccggcatgcattaactgcttttcttcgtgctgtccgtccc---------------gacaggccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtgcatgtgttctcctttttcagctcccatcatcactgaga--atgtggtgtttggttttctgttccc-aggttagtgtgctgaggataatgacttcACATCACTGGTG---TTATTTTTTTTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15184 235 - 18279 cacctatcaacccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccccatgtcaggccccaatgtgtgttg---cccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactatgagtaagaacatgtggtgtttggttttctgttccc-ggattagtttgctgaggataatgacttcACATCACTAGTG---T--TTTTTTTTT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38064131 237 + 51301725 cacctatcaccccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccccatgtca-gccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactataagtgagaacatgtggtgtttggttttctgttccc-tgattagtttgctgaggataatgacttcacatcactagtg---t--ttttttttt i papAnu2.chr19 I 17360 C 0 s chlSab2.chr6 37923648 238 + 50890351 cacctatcaacccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctcccccaaccccaccccatgtcaggccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctaccactataagtgagaacatgtggtgtttggttttctgttccc-ggattagtttgctgaggataatgacttcACATCACTAGTG---T--TTTTTTTTT i chlSab2.chr6 C 0 N 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=2730.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128136 2 + 137718 TT s panTro4.chr4 111486854 2 - 193495092 TT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048096 2 + 72422247 TT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760065 2 + 99891981 TT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15419 2 - 18279 TT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38064368 2 + 51301725 tt i papAnu2.chr19 C 0 T 6710 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=-182.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128138 5 + 137718 AGTAT s panTro4.chr4 111486856 5 - 193495092 ATTAT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048098 5 + 72422247 TATTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760067 5 + 99891981 ATTTA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19_KE145851_random 15421 5 - 18279 AATGT i macFas5.chr19_KE145851_random C 0 N 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e papAnu2.chr19 38064370 6710 + 51301725 T a score=87609.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128143 239 + 137718 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99891981 AAAAAATAGTGTTTTATTAAACAGGGTTTCTTCACAGCAAAATAAGTTTTAATCTACGATGAATGCCAGATATTACAGCAGAACGCAATTTTCTC--TTGCCCACACACAAAAGTTCTTACTAAGTGAAAAAA--GCCATAAAATTACATTCACAAATATGGTTCCCAGTCTCCAAAGCTTTCACATAATTATTCACAGTAGTAATACAATCAGAGCAGTTATTCAGTCAGGTGAAAGTACCGTGAACCCTAAAGTATAACAATAAGATTAAAAAAGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e papAnu2.chr19 38064370 6710 + 51301725 T a score=-3224.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128382 3 + 137718 -AGT s panTro4.chr4 111487097 1 - 193495092 ---T i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048339 1 + 72422247 ---T i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760346 3 + 99891981 -CGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14138063 3 - 59248254 AGG- i macFas5.chr19 N 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e papAnu2.chr19 38064370 6710 + 51301725 T a score=463635.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128385 520 + 137718 ATCCCTCTAATAACTGACATTTATAATGCTATCAATATCCACTCCCAATCAGTCTGCCATTGTTAATGGT-GTACAGCATTACTGAATACAATGGAATTGATGACGCCCATATCCAcggacaaaccgtgacttatgatggtttgatttatgatttttcaacgttatgatgggtttactggaatatTAGATGCGTTTC-TGAGTTACACTGGGTTTATGAGTATGCGACCCTATACTCCAGAAACAGCTGTATAAGGAAAAACAGGTTTACCTAATGAAAATATGCTTAGTGACTTGGGATAAACCAATAGATGTTCACAACTGATGGAGAGCCGTGAAAGAGAGATAACGGTAAATAGTTACAATAACACAATTTTCCTGCACCTGTCGAGGATTTCCTCAAAAAAACGCAGAATGTGGGATGCACCTAAGGCATaggaaagagagagggcagaaggagtaagagagaaataggaggaaggagggaaggaaagaaggaagtcaggaaggaaggaaa----gaagga s panTro4.chr4 111487098 523 - 193495092 ATCCCTCTAATAACTGATTTTTATAATGTTATCCACATCCACGCCCACTCAGTCTGCCATTGTTAATGGT-GTACAGCATTATTGAACACAATGGAATTGATGGAGCCCATATCCACCGACAAACCGTGACTTAAGTTGGTTTGATTTATGAGTTTTCAACGTTATGATGGGTCTATTGGAATATTAGATGCCTTTC-TGAGATACACTGGGTTTATGGGTATGCGACCCTATACTCCAGAAACAGGTGTATAAAGAAAAACAGGTGTACCTAATTAAAATATACTTAGTGACCTGGGATAAATCAATAGATGCTTACAACTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGATAGCAGTAAATAATTACAATAACACAATTTTTCAGCACCTGTCGAGGATT-CCTCAAAAAGACGCAGGACGTAGGATGCACCTAAGGCATATGAAAGAGAGAGGGCAGAAGGAATAAGAGAGAAATAGGTggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagcagggaaaga i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048340 491 + 72422247 ATCCCTCTAATAACTGATTTTTAAAATGCTATCAATATCCACTCCCTATCAGTCTGCCGTTGTTAATGGT-GTTCAGTATTATTGAATAAAAGGGAATGGATGAAGCCCATATCCACGGGCACAccgtgactcgtgatggtttcattatcgatttttcaactttatgatggtttcattgggatattacATGCGTTTTATGAGTTACGCTGGGTTT-TGAGTATGTGAACACCTACTCCAGAAATAGCTATATAAAGAAAAACAGGTGCACCTAATTAAAATATACTTAGTGACTTGGGAGAAACCAGTAGATTTCTACAATTGATGCAGAACCATGAAAGAGACATAGCGGTAAAAAATAACAATAACACAATTTTCCTGCAACTGTCGAGGATT-TCCCAAAAAAACACAGAATGTAGGATGCACCTAAGGCATATGAAAGAGAGAGGGCAGAAGGAGTAAGAGAGAAATAgaaggaaggaaggaag--------------------------------gacaga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760349 510 + 99891981 ATCCATCCAATAACTGATTTTTGAAATGCTGTGAACGTCCACACCCTACGAGTCTGCCATTGTTAATGCT-GTACAGCATCATTGAATAGAATGGTATTGATGAAGCCCACATCCACGGAGAAAccctgacttacgatggtttgatttatgattttccaattttatgatgggtgtattgagatattacATGCGTGTT-TGAGTGACAATGGGTTCATCGGTAGGTGACCCCGTTCTCCCGGAATGGCTATCTAAAGTGAAACAGGTGTACCTAATTAAAATATACTTAGTAACATGGGAGAAAACAATAGATGTTTACAATTGATGCAGAACC-TGAAGGAGAGATACCAGTAAATAAAAACAATAACTCAATTTTCCTGCAACTCTCGAGGATT-TCCTAAAGAAACACAGAATGTAGGATGCAGCCTAGGCATGTAAAAGTGAGAGGGCAGAAGAAGTAAGAGAGAAATAGGaggaaggaaggcaggaaggaaggaaggaaggaag------------gaagga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14138066 496 - 59248254 ATCCCTCTAATAACGGATTTTTTAAATGCTATAAAT--------TGTATCAGTTTGCCATTGTTAAAGGT-GTACAGCATTATTGAATACAATGGAATTGATGAAACCCATATCCATGgacaaaccatgacttatgatggtttgatttatga---ttaaactttatgatgggtttattgggatatTAAATAGATTTT-CGAG-TACACTGGGTTTATCAGTATGTAACCCTATACTCCAGAAATAGCTGTAAAAAGAAAAACAGGTGTACCGAAGTAATAAATACTTAGTGACTTCAGAGAAAGCAATAGATGTTTACAAT---TCGAGAATCATGGAAGAGACATACCGGTAAATAAAAACAATAACACAATTTTCCTGCAACTGTCAAGGATT-TCTGAACAAAACAGAGGAAGTAGGATGCACACAATGAATATAAAAGAGAGAGGGCAGAAGAAGCAAGAGAGAAATAgaaggaaggaaggaaggaaagaaggaaggaagaaag------------gaaaga i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057660 494 + 51301725 ATGCCTCtaataactgatttttaaaatgctataaatatcCACTCCCTATCAGTTTGCCATTGTTAAAGGCAGTACAGCATTATGGAATACAACGGAACTGATGAAACCCATATCCACGGGCAAACCGTGACTTATGATGGTTTGGtttatgattttttaactttatgatgggtttattgggatattaaatatatttt-tgag-tgcACTGGGTTTATCAGTATGTAATCCTATACTCCAGAAATAGctgtataaagaaaaacaggtgtACTGAAGGGAAAAATACTTATTGACTTGGGGGAAACCAACAGATGTTTACAATTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGATAccaccaaataaaaacaataacacaa-tttcCTGCAACTGTCGAGGATT-TCCgaacaaaacacaagaaatagGATGCACACAATGAATATAAaagagagagggcagaagcagcaagagag----------------ggaaggaaggaaggaagcaagagag------------ggaggg i papAnu2.chr19 T 6710 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=1031.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128905 4 + 137718 cgta s panTro4.chr4 111487621 4 - 193495092 cgga i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048831 4 + 72422247 tgga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760859 4 + 99891981 agga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14138562 4 - 59248254 agga i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38058154 4 + 51301725 aggg i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s tarSyr2.KE947990v1 108440 4 + 295600 CTTA i tarSyr2.KE947990v1 N 0 N 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=7748.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128909 13 + 137718 aggaagg-agaaAA-------- s panTro4.chr4 111487625 13 - 193495092 aggaagg-aGAAAA-------- i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048835 13 + 72422247 aggaagg-aGAAAA-------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760863 14 + 99891981 aggaaggtaggaaA-------- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14138566 21 - 59248254 aggaagg-aagaaaggaaagaa i macFas5.chr19 C 0 I 1429 s papAnu2.chr19 38058158 14 + 51301725 agggaag-gggaaaa------- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=7904.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128922 15 + 137718 CACC-GGTGTTACTAA s panTro4.chr4 111487638 16 - 193495092 CACCCGGTGTTACTGA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 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ponAbe2.chrUn 15048888 9 + 72422247 tggttcccc i ponAbe2.chrUn I 24 C 0 s nomLeu3.chr17 90760906 9 + 99891981 TGTTTTCCC i nomLeu3.chr17 I 1 C 0 s papAnu2.chr19 38058198 9 + 51301725 tggtttctc i papAnu2.chr19 C 0 I 10848 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14138587 1429 - 59248254 I a score=15878.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 128961 69 + 137718 CCTGTGGGTAAGCctacaatgtggacgaatcttgaaaatattgtgctac--gtgttatgtcagtcataaca s panTro4.chr4 111487675 71 - 193495092 CCTGTGGGTAAGgctgcaatgtggatgaatcttgaaaatactgggctaaaagtgttatgtcagtcataaaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048897 69 + 72422247 actgtgggtaaggctacaatgtggatgaatcttgaaaattttgtgcaaa--gtgtaaagtcagtcacaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90760915 46 + 99891981 ACTGTGGGTAAAGCTACAATGTTCATGAACCTAAAG---------------CTACAATGT----------a i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e papAnu2.chr19 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gctcacgtattgtgcaattccattgataggaaatgtccacagtatggaaatctatgcatatggggttgatcgctctatgcagttgttacctagggctgagggtcagggagagggttt-------------gagacagaatgaggagcgactaatgtccacagggttttcctctgttcgggggtgataaaaccttctaaaatggattgcgaattaaaattgaacgtgcacaggcacaaatatactaaaatccactcaattcatgacttttaatggggcaattttatgTGGCACACTCTTATGGAGACCACGGCAGACATAGTGAGAGAGAAAAAGGTGAGTAAATCTCTGAAACGGAGGCAGAAACAGAGAGAATGAGAAGCCCTGTGAATGGGAGGGAGAGGGAAAAAGGAAAATGGTCCTATTTACAAATGTCAGCTGTGAAACT- i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15048966 432 + 72422247 gctcacatattgtgcaattgtgtttatatgaaatgcccacaatatggaaatctatgcatattgggttgatcgctctatgtagttgttacctagggatgagggtcagggagagggttt-------------gagggagaatgaggagtgaccaatgtttacagggtttttctctggtcgggggtgataaaatgttctaaaatggattgcgaattaaaatggaatgtgcacaaccacaaatagagtaaaggccactcaattcatggtttttaatgggggaatCTTCTGTGACACACTCTCTTCGAGACCGCGACAGACATAGTGAAAGAGGAAAA-TTGAGTAAATATATGAAACGGAGGCAGAAACAGAGAGAATGAAAAGCCCCGTGAACGGAAGAGAGAGAGAAAAGAGAAAAAAGACCTATTTACAAATGAAAGATCTGAAACT- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 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I 10848 T 10247 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14138587 1429 - 59248254 I a score=597820.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 129463 518 + 137718 GGGGTTCACATCAACAGTGTCACTGCCAGGAAGGAGGGTCACGCTAGACATGTCACCGGTAGTTTGGCCCGCAGGGACGCCGACCTGCTGGAGCGTCGTGCCAGCATGGGCTGTGGCAGCCACGTGGGCCAGCAGGGGGTTCCCGCTGCACAGCTGT--GGGGTGAGGATAGACTGGGTGGTGATATCGGCCATTACAGGGGCCTCTTCTGCTGGCAAGAGTGTGACAGTAGCAAGTAGATGGACAGGCCTGCGTGTGAGGACGGAATGCAGGAGGGGCTCTTGTGCGGCTGGGTGTGGGGCCCTCCCGGGAACCGTGGAGAAATGGCCAGGTAACTGCGTCATGTGGGCTAGTAGATTGGCCAGGGCTTCGAAGTGAAGGACAATAACGGGGAGTAGCTGTCAGGCCCTGGGAGTGCCTGAGTGTAAGTGGAGATGGGTTTGGGGTCACTGAGGGATGCGTGGGAGCCATCCCTGTATAGGTACAGGTCAtagggagatagtccggtgaggcctgtgag s panTro4.chr4 111488179 518 - 193495092 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GGGGCTCACATCAACAGTGTCACTGCCAGGGAGGAGGGTCATGCTATCCGTGTGACGGCTAGTGTCGCCCGCAGGGACGCCGACGTGCTGGAGGTTCGTGTCAGCATGGGCTCTGGCAGCCACGTGGGCAAGCAGGAGGGTCCCGCTGCACAGCTGT--GGGCTGACGAAAGTCTGGGGGGTGATATCGGCCATGAGAGGGGCCTCTTCTCCTGGCAAGAGTGTGACAGTAGCAAGTAGTTGGACAGGCCTGTGTGTGAGGACGGAACGCAGGAGGGGCCCTTCTGCGGCTGGGTGTGGGGCCCTCAGCAGAAATGTGGAGAAATGGCCAGGTAACTGCGTCATGTCGACCAGCAGATTGGCCAGGGCTTCGAACTGAAGGACAATAACGGGGAGTAGCTGTTAGGCAATGGGAGTGTGTGGGTGTAAGTGGAGATGGGTTTGGGGTGACTGAGGGATAGGTGGGAGCCATCCCTGTATAGATACAGGTCACAGGGAAATAGTCTCGTGAGGCCTGTGAG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14140016 518 - 59248254 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gaggctTACATCAACAGTGTCACTGCCAGGTAGGACGGTCATGCTAGCCATGTCAGCGGTATTGTCACCCGCAGGGACGCCGACATGCTGGAGGTTGTTGTCAGTACGGGCGCTGGCAGCCACGTCGGCAAGCAGGAGGGTCCCGCTGCACAGCTGC--GGGGCGATGATAGTCTGGGTGGTGCTATCGGCCGTTAGAGGAGCCTCTTCTGCTGGCAAGAGTGTGACAGTAGCAAGTAGATGGACAGGCCTGCGTGTGAGGACGGAATGCAGGAGGGGCTCTTCTGCGGCTGGGTgtggggccctcaccagaaatgTGGAGAAATGGCCAGGGAACCGCGTCATGTTGGCTAGTAGATTGGCCAGGCCTTTGAACTGAAGGACTGTAACAGGGAATAGCTGTCAGGCCCTGGGAGTGCCTGAGTGTAAATGGAGATGGGTTCGAGGTCACTGAGGGATACGTGGGAGCCATCGCTGTATAGACACAGGTCACAGGGAAATAATCTCGTGAGGCCTGTGAG i papAnu2.chr19 T 10247 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=136454.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 129981 177 + 137718 tgtctagggttgtcctgggtgcctggggctgactgtggcagaaatctggggaaggctggagagaagctgggagacccaggagagtccctgaaggcagggggtgaagaggtgaaagaaatgggggatggttgcagtaaggtccgtgagtttgcaggtgattccagggtgtgggaagct s ponAbe2.chrUn 15049915 177 + 72422247 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nasLar1.chrUn_JMHX01086195v1 851 267 + 1122 gaccccagctgaaatctggagatggttggagagtagctgagagagacagaagagtccctgagggctgggggtgaaaacatgagagagactggggaggaactcggtgaaatgggtgagtttggtggtgtgtcctgggtgcctggaactgactccagctggaatctagagatggcttgagagtagctgaaactgatagaagagtccctgtgg------------gacctgagagagaccggggaggatctcagtgaggtctgtgagtctgtaggtgattcc i nasLar1.chrUn_JMHX01086195v1 N 0 N 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=190141.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130437 291 + 137718 ggagtgtgggaggctgactcccgctgaaatctgggcgtggtgggagagtagctgggacagacaggagagtcccaggggtctgggggtgaagacctgagagagactggggagtaactcagtgaaactgctgagtttggtggtgatacatgggtgcctggaactgactcccgctgaaatctgggcatggttggatagtagctgggacgcacaggagagtccccgagggctgtgggtgaagacatgagagagaccggggagtaactgagtgaaactggtgagtttggtggtgac s ponAbe2.chrUn 15050371 288 + 72422247 gggctgtcaggaactgacagcagctgaaatctgggcttggttggagagaagctgggacacacaggagagtccctgagggct---ggtgaagacatgagagagactgaggagtaattgagtgaaattgttgagtttgctggagattccagcgtggctggaattaactccagctgaaatctggctgtggttggagagtacctgggacacacaggagagtctatgagtgccagaggtgaagacctaagagagaccgcggagtaactcagtgaacatggtgagtttggtggtgac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90762365 291 + 99891981 tgagtgtcggaggctgactcccgctgaaatctgagcgtggctggagaggagctgggacacgcaggagagtcccagggggctgtgggtgaagacgtgagagagactggagagtaactcagtgaaactgctgacttcgtaggtgattcctgggtgccgggaactgactcccgctgaaatctggacgtggtcggagagcagctgggacagccaggagagtccctgagggctgggtgtgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaagctggtgagtttggtggtgac i nomLeu3.chr17 C 0 I 144 s macFas5.chr19 14140990 291 - 59248254 tgggtgtctggaactgagtcccgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgtgggctgggggtgaagacaagagagagactggggagtaactcagtgaggtctgtgagtttgtaggggatccctggctgcctggaactgagtcccgctgaaatctgggtgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgtggcctggggatgaagatgtgagagagattgtggagtaactcagtgaaatgggtgagtttgtaggggat i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060221 291 + 51301725 TGGGTACCTGGAACTGACTCCCGCTGAAATCTGGGCATAGttggagagtagctgggacagacaGGAGAGTCCCTATGGGCTGGGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGGGGAATATCTCAGTGAGGTCTGTGAGTTTGTAGGTGATCCCTGGCTACCTGGAACTGAGTCCAGCTGAAATCTGGGTGTGGTTGGAGAGTAgctgagagagacagaagagtcCCTGTGGCCTGGGGATGAAGACGTGAGAGAGATTGTGGAGTAACTCAGTGAAATGGGTGAGTTTGTAGGTGAT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=57571.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130728 83 + 137718 tccggggtgcctggaactgactccagctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagacaggagagtccctgagggc s ponAbe2.chrUn 15050659 83 + 72422247 tccggggtgtcaggaaaggactgcagctgaaatctgagcctggttggagcgcagctgggacagacaagagagtcccagaggga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90762800 83 + 99891981 tccggggtgcctggaactgactccagctgaaatctgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggc i nomLeu3.chr17 I 144 C 0 s macFas5.chr19 14141281 83 - 59248254 ccctggctgcctggaactgactccagctgaaacctgggcgtggctggagagcagctgagagagacagaagagtccctgtggtc i macFas5.chr19 C 0 I 3 s papAnu2.chr19 38060512 83 + 51301725 CCCTGGCTGCCTGGAACTGACTCCAGCTGAAACCTGGGCGTGGCTGGAGAGCAgctgagagagacagaagagtcTCTGATGGC i papAnu2.chr19 C 0 T 9899 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=36384.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130811 70 + 137718 tggtgaagacacgagagagactggggagtaattcagtgaaatttgtgagtttggtggtgattcctgggtg s ponAbe2.chrUn 15050742 70 + 72422247 tgatgaagacatgagagagactggggagtaacgcagtgaaattggtgagtttgctgctgattccggggtg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90762883 70 + 99891981 tggggaagacatgagagagactggggagtaattgagtgaaataggtgagtgtggtggtgattccggggtg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14141367 70 - 59248254 ggataaagacatgagagagattgtggagtaactcagtgaaactggtgaatttggtggtgagtcctgagtg i macFas5.chr19 I 3 C 0 s papAnu2.chr19 38050696 70 + 51301725 AGGTGAAGAGATAGGAGACATGATGGAAGAGGGCCCTGAGATGTGTGAGTCTGTAGGTGATTCCTAGATT i papAnu2.chr19 T 9899 I 13 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=21815.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130881 74 + 137718 cctgcaatggactcccgctgaagtgtgggcgtgtttggagagtagctgggacagacaggcgagtccctgagggt s ponAbe2.chrUn 15050812 74 + 72422247 tctggaactgactcccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctaggacagacaggagagtccctgagggt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90762953 74 + 99891981 cctggaactgactccagctgaaatctgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38050779 61 + 51301725 -------------GTTGCAGGAAGCTTGGGATGATAGGGGAGTAGCTGGGAGACACAGGAGCATACCCGAGGGC i papAnu2.chr19 I 13 I 9755 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14141437 0 - 59248254 C e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=1353.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130955 3 + 137718 tgg s ponAbe2.chrUn 15050886 3 + 72422247 tgg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90763027 3 + 99891981 tgg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060595 3 + 51301725 TGA i papAnu2.chr19 I 9755 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 103708 13952 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14141437 0 - 59248254 C e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=-1617.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130958 3 + 137718 -aga s ponAbe2.chrUn 15050889 3 + 72422247 -gga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90763030 2 + 99891981 -gg- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060598 3 + 51301725 GGG- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 117660 3 - 3959310 gga- i rhiRox1.KN297800v1 I 13952 I 9530 e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14141437 0 - 59248254 C e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=101138.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 130961 265 + 137718 taaagacgtgctagagactggggagtaactcagtgaaagcggtgggcttggtggtgatccctgggttcctggaactgacccgcgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagactggagggtccgtaagggctgggggtgaagacgtgagagagactggcgaggatctcactgaggtctgtgagtttgtaggtgtttctggggtgtggggtacagactcccgctgaaatctgggcgtagttggagagtagctggga s ponAbe2.chrUn 15050892 265 + 72422247 taaagacgtgctagagactggggagtaactcagtgaaagtggtgagcttggtggtgatccctgggttcctggaactgactcccgctgaaatgtgggcgtggttggatagtagttgggacagacaggaaggtccgaaagggctgggggtgaagacgtgagaaagactggccagtatctcactgaagtctgcgagtttgtaggtgcttctgggttgtgggagaccgaatcccgctgaaatctgggcgtagttggagagtagcttttt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90763032 263 + 99891981 --aagacatgagagagactggggagtaattgagtgaaatcggtgagtttggtggtgattccggggtgcccggaagtgactcccgctgaaatgtgggcgtggttggagaggagctgggacagacaggagagtccctgagggttggggataaagacgtgctagagactggggagtaactcagcgaaagtggtgagcttggtggtgatccctgggttcctggaaatgacccccgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctggga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060601 265 + 51301725 TGAAGACATGAGAGAGACTGGGGAGTAACTCAGTGAAATTGGTGAATTTGGTGGTGAGTCCTGAGTGCCTGGAACTGACTCCAGCTGAAATCTAGAGAGGGttggagagtagctgggacagacaGAAGAGTGCCTGAGCGCTGTGGGTGAAGACATGAGAGAGACTGGGGAGGATCTCACTGAGCTCTGTGAGTCTGTAGGTGATTCTGGGATGTGGGAGGCTGACTCCCCCTGAAATCTGGGTGTAGTTGGAGAGGAGCTGGAA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e macFas5.chr19 14141437 0 - 59248254 C e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=88776.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 131226 113 + 137718 cag-acaggagagtcatgggtggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGAGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGTCAC s ponAbe2.chrUn 15051157 114 + 72422247 taattcaggagagtcattgatggctggggatgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAGGAATATATGGTATATTTTTTTAAGATGAGGTGACTGTGAAGAATCGCCAGAGGAGGACAC i ponAbe2.chrUn C 0 I 8 s nomLeu3.chr17 90763295 113 + 99891981 cag-acaggagagtcactgatggctgtgggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGAGGTGACTGTGAAGAATCCTCAGAGGAGGACAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14141437 113 - 59248254 cag-acaggagagtcgctgagggctgggggtgAGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACAC i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060866 113 + 51301725 CAG-ACAGGAGAGTCACTGAGGGCTGGGGGTGAGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGAGGAACGGGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGACAC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=3492.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 131339 6 + 137718 GGGAGA s nomLeu3.chr17 90763408 6 + 99891981 GGGAGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14141550 6 - 59248254 GGGAGA i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060979 6 + 51301725 GGGAGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15051271 8 + 72422247 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=36458.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 131345 50 + 137718 ACACAATGACATGAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGGAAAGGGAAACGTAA s ponAbe2.chrUn 15051279 50 + 72422247 GCACAATGACATGAGTGATTGTCCTGCTTGGTTACGAAAGGGAAATGTAA i ponAbe2.chrUn I 8 M 475 s nomLeu3.chr17 90763414 50 + 99891981 GCACAATGACATCAGTGATTGTCCTGCGTGGTTAGGAAAGGGAAATGTCG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14141556 50 - 59248254 GCACAATGACATCAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAA i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38060985 50 + 51301725 GCACAATGACATCAGGGACTGTCCTGCTTGGTTAGCCGGGGGAAATGTAA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=24622.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 131395 55 + 137718 AGTTGTGGAATTCTGTTGATGACGGATGTGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGA s nomLeu3.chr17 90763464 55 + 99891981 AGTTGTGAAATGCTGTTGATGATGGATGTGAGAGTGGTGAAGCCCTGCGGGATGG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14141606 55 - 59248254 AGTTGTGAAATTCCGCTGATGATGGATGTGCGCGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGA i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38061035 55 + 51301725 AGTTGTGAAATTGCGCTGATGTTGGATGTGCGAGTGGTGAAGTCCTGAGGGATGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15051329 475 + 72422247 M e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=587245.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 131450 747 + 137718 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TGTAGAGTACTTCCACATGC-TGGTGAGGAAGTGCTCCTTGGGTGTGAGCTTCTGGA--GGGAGAGGGGGAAGCTGGGTGAGGCGGGCATTA-TCTTGAGGATTCAGGGATGGGGGACCGCTCATAATCTCCCGAAAACTgtgagtctctgggggactgctgggtgcatggggctgactcccgcagaaaccgggggatggctggagagtaagtgggagacacgggagagtccctgaggcctggggttgaagagatgaaagacatagaggaggagcaccgtgcggctcgtgagtttgtaggtggttccttggtgtgggttggtaactcgagaaaaaatctggggttgtttggaaagtagctgggagacacaggagtctcccagagagctggttgtgaGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACATCAGGTACATTATTGATGAACGTGGTGATTCTAAAGAATCCCCAGAGGAGGACACGGGAGAGCCCAAAGGCTTCATTGATTGCCCATCACGGTGAGGAAAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGATTCTGGTGATGACAGAGGTGAGTGTGGTGAAGCCCTAGGGAATGGTAAATGGCAGTTCCGGATCCCTGGTGAGGAGCTTCCTCTTAAGTCTGAGTTTCTGAGATGGGAGAGGGAGAAGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTAGGGAGTCCGGGCTGGGGGAACGTTCATAAGAAGAGCCAGACAAGACCATACTGCTCTTAGG i ponAbe2.chrUn M 475 C 0 s nomLeu3.chr17 90763519 747 + 99891981 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TGAAAGGTACTTCCGCATCCCTGGTGAGGAGCTGCCCCTTGGGTCTGAGtttctgggaggggagagggagaagctgggagaggcaggcatGAATCTTGAGGAGTCAGGGCTGGAGGACCGCTCATAATCTCCTGAGACCTGTGAGTTTCTGGGGGACTCCTGGGTGCATGGGGCTGACTCCCGCAGAAAGCTGGGAATGGTTGGAGAGTAACTGGGACACACAGGAGAGTCCCTGAGGGCTGGGGGTGAAGAGATGAAAGACATAGGGgaggagcgccctgaggcttctGAGTCTGTATGTGATTCCTGGGTGTGGGGGGCTGACTCCAGCTGAAATCTGGGGTTGTTTGGAGAGTAGCTGGGAGACACAGGAGACTCCCCGAGAGCTGGGGATGAGCTGCTGGGTGATGGCAGTAAGAACGTGTGGTATATTATCGATGAACGTGGTGAAGCTAAAGAATCCCCAGAGGAAGACACGGGAGAGTCCAGTGGCTTCACTGATTGCCCATCACGGTTAGGAAAGGGAAATGGGAGCTTGTGGGTTTCTGGTGATGACGGAGGTGAGTGGGGTGAAGCCCTAGAGGATGGTGAATGGTAGCTCCAGATCCCTGGTGAGGAGCTTTCTCTTAAGTCTGAGTttctgggaggggagagagacaaGCTGGGTGAGGCTAGCATGGATCTTGGCGAGTCCGGGCTGGGGGACCGCTCATAGGAAGAGCCAGAAAAGACGCCACTGTTCTTAGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I e panTro4.chr4 111488697 5770 - 193495092 I a score=73034.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132197 104 + 137718 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gorGor3.chr4 59739235 5776 + 201139530 I a score=13964.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132301 10 + 137718 gtgtgtgtgc s panTro4.chr4 111494556 10 - 193495092 gtgtgtgtgt i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59745011 10 + 201139530 atgtgtgagt i gorGor3.chr4 I 5776 I 352 s ponAbe2.chrUn 15052651 10 + 72422247 gtgtgtgtgt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90764346 10 + 99891981 gtgtgtgtgc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14142486 10 - 59248254 gtatgtgtgt i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38061912 7 + 51301725 ---tgtgtgt i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=370205.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132311 348 + 137718 gtgtgtgtgtttgtgtgtgtgcggtgtgAGGTATGTGCCCCTTAAGAAAATGGAAATCAACCAACCAATG----agacagacagacagacagacagacagacagacagaGATTCACTTGCCCAAGTGTTCTGTCCTGTCCTCTGAACCCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTGAGCTCCAAATCCACGCAGAGTCCGCCAAACGCTCCGGCCGCTGATCCGCTCCGCGAAGATCTGAGTACAGGCCAGCCAGGGTGGGTTTAAATAGCCTCGGGCGCAGCCTAGCAGCGGAAAGGGCGGAGCTTCACTCCTCCTTTCCATCAGTCACCCCCAACTTTCCCAGGCTACACCTC s panTro4.chr4 111494566 336 - 193495092 gtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtggtgtgAGGTATGTGCTCCTTAAGAAAATGGAAATCAACCAACCAA----------------AGagacagacagacagacagacagaGATCCACTTGCCCAAGTGTTCTGTCCTGTCCTCTGAATCCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTGAGCTCCAAGTCCACGCAGAGTCCGCCAAACGCTCCGGCCGCTGCTCCGCTCTGCGAAGATCTGAGTGCAGGCCAGCCAGGGTGGGTTTAAATAGCCTCGGGTGCGGCCTCGCAGCGGAAAGGGTGGAGCTTCACTCCTCCTTTCCATCAGTCACCCGCAACTTTCCCAGGCTACACCTC i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15052661 332 + 72422247 --------------------gtgttgtgAGGTATGTGCTCCTCAAGAAAATGGAAATAAACCAACCAATGagacagacagacagacagacagacagacagacagacagaGATACACTTACCCAAGTGTTCTGTCCTGTCCTCTGAATCCGCTTAAAGGTCGCAAGACGCTGTAAGGTCCAAGTCCACGCAGAGCCCGCAAAACGCTCCGGCCGCTGCTCCGCTCTGCGAAGATCTGAGTACAGGCCCGCCAGGGTGGGTTTAAATAGCCTCGGGCGCAGCCTAGCAGCGGAAAGGGCGGACCTTCGCTCCTCCTTTCCATCAGTCACCCCCAACTTTCCCAGGCTACACCTC i ponAbe2.chrUn C 0 I 1 s nomLeu3.chr17 90764356 349 + 99891981 --gtgtgtgtgtgtgtgtgtCTGGTGTGAGGTATGTGCTACTAATGGAAATGGAAATAAacagacagaca-gacagagagacagactgacagacagaaagacaggcagaGATTCACTTGCCCAAGTGTTCTGTCCTGTCCTCCGAATGCGCTTCCAAGTCGCAAGACGCTGTAAGCTCCAAGTCCACGCAGAGCCCGCAGAACGCTCCGGCCGCTGCTCTGCTGTGCGAAGATCTGAGTACAGGCCCGCCAGGGTGGGTTTAAATAGCCTCGGGCGCAGCCTAGCAGCGGAAAGGGCGTAGCTTCACTCCTCCTTTCCGTTGGTCACCCCCACCTTTCCCACGCTTCACCGC i nomLeu3.chr17 C 0 I 1 s macFas5.chr19 14142496 328 - 59248254 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C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59745373 1 + 201139530 G i gorGor3.chr4 I 352 I 2203 s macFas5.chr19 14142824 1 - 59248254 A i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062247 1 + 51301725 G i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e nomLeu3.chr17 90764705 1 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 15052993 1 + 72422247 I a score=56306.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132660 56 + 137718 TAGGAAACTGTTCTCCTGCTTTGATTTCATGCGCCACCTTTGGGACAATCTAAGAA s panTro4.chr4 111494903 56 - 193495092 TAGGAAACTGTTCTCCTGATTTGATTTCGTGCGCCACCTTTGGGACAATCTAAGAA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15052994 56 + 72422247 TGGGAAACTCTTCTCCTGATTTGATTTCATGCGCCACGTTTGGGACCATCTAAGAA i ponAbe2.chrUn I 1 I 715 s nomLeu3.chr17 90764706 55 + 99891981 TAGGAGACTGCTCTCCTG-TTTGATTTCATGTGCCACATTTGGGACAATCTAAGAA i nomLeu3.chr17 I 1 C 0 s macFas5.chr19 14142825 56 - 59248254 TAGGAAATTGCTCTCCTGATTTGATGTCATGTCACGCATTTGAGACAATCTAAGAA i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062248 56 + 51301725 TAGGAAACTGCTCTCCTGTTGCGATGTCATATCACGCATTTGGGAGAATCTAAGAA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59745374 2203 + 201139530 I a score=24165.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132716 48 + 137718 CTTACAAGTTTTCTTGGCCAGAAATATTAGGAATTGTATGCACTGAAA s panTro4.chr4 111494959 48 - 193495092 CTTACAAGTTTTCTTGGCCAAAGGTATGATGAATGAAATGCACGGAAA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90764761 48 + 99891981 CGTACAAGTTTTCTTGGCCAAATATATGACGAATTAAATGCGCTTCAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14142881 47 - 59248254 CTT-CAAGTTTCATTGGCCAAATATAGTATGAATTAAATGTAATTAAA i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062304 48 + 51301725 CCTACGCGTTTTATTGATCAAATATAGTAGGAATTAAATGCACTTAAA i papAnu2.chr19 C 0 I 6 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59745374 2203 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=174088.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 132764 253 + 137718 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GCATTCATTGGATGAGGGTGATTGGGTTAAGAATATCAAGGTGTGGTTCCAGATAATTCAATCATCTAATTAAGTTTTCAGTTATGCTAATCTGTTTTAAAATTCCGTTTGTGTAAATCCTATTACTCAGACTGAGAATGG----CAATGCCCTAAccccaatttcca-ggaggattgagagtctgaggttgagttgatcaccaatagcctatggtttaacccatcatg i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062358 225 + 51301725 GTATTCATTGGATGAAGGTGATTGGGTTAGGAATATCAAGGTGTGGTTCCAGATAATTCAATCATCTAATTAAGCTTTCAGTTAAGCGAATCTGTTTTAAAATTCCGTTTGTGTAAATCCTGTTACTCAGACTGAGAATGG----CAGTGCCCCAACCCCAATTCCCAGGGAGGGTTGAGAGCCTGAGGATGAGCTGATCACCAATAGCCTATGGTTTAACccatcatg i papAnu2.chr19 I 6 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59745374 2203 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=1500.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133242 1 + 137718 c s panTro4.chr4 111495483 1 - 193495092 c i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59747577 1 + 201139530 c i gorGor3.chr4 I 2203 I 639 s nomLeu3.chr17 90765289 1 + 99891981 c i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14143398 1 - 59248254 c i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062583 1 + 51301725 c i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=244213.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133243 371 + 137718 ctatagaatgaggtctccatcaaaacccaaaaggactgggttcagagagcttctggataacacttcctggaaggtagtgcgcccctccccacgtgccgggcccca--catt-tatt-tctgaactttgtgcaatgtccgctaaaatac----aacggcagatgtaagtgtttccctgcgtgctgtgagctcttccagcaaatgaatgcaactaaatctgggagtggtggcaacctgatttatagccagtggctgagaagcacaggtaaagcaacgtagggcttcccattgttattagtgtgggaggcctgtctggcgggactcggccctttggaatctaatgctatgtcccggtagatagcgtcaccattgaattagaa s panTro4.chr4 111495484 375 - 193495092 ctatagaatgaggtctccataaaaacccaaaaggactgggtttagagagcttctggataacacttcctggaaggcagtgcgcccctccccacatgccgggcccaa--aagt-tttt-tctgaagtttttgcaatatccgctaacatacaaaaaatgggaaatgtcagtgtttccctgcgtgctgtgagctcttccagcaaatgaatgcaactaaaactgggagtggtggaaacctgatttatagccagttgctgagaagcacaggtaaaacaacgtagggcttcccattgttattagtgtgggaggccaatcttgcgggactcggccctttggaatctaatgctatgtcccggtagatagcgtcaccgttgaactcgaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90765290 372 + 99891981 ctatagaatgaagtctccataaaaatccaaaattactgggtttagagaacttgtggataaaacttcccggaaggtagtgcgcccctccccacatgcccggcccaa--aaccattct-tctgaattttttgaaatatccgctatgataa----aatggtaactgtaagtgtttccctgcgtgctgtgagctcttcgagcaaattcatgcaactaaaacagggagtagtggaaacctgatttatagacggtcgctaagaagcacaggtaaaacaacgaagggcttcccattgtgattagagtgggaggccagtcttgcgggactgagccctttggagtctaacgctatctccgggtagacggcgccgtcattgaattagaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14143399 370 - 59248254 ctatgtaatgaagcctccataaaaacccaaaaggactgggtttggagagcttctggataaaacttcctggaaagtagggtacccctccacccatgcggggccccatgaatcgttgt-tccaaattttttgcaatatcctttatagtaa----aatggtaaat----gtgtttccctgcgtactgttagctgttctagcaaattaatgcaactaaaacagggagtcgtggaaacctgatatgtagccagtcggtcagaagcacaggtaaaacaacgtaggatttgccattgttatgagagttggaggccagtcttgcggaacggagccctgtgtaatctaatactatgtccaggtacatagtgtcataaatgaattagaa i macFas5.chr19 C 0 I 889 s papAnu2.chr19 38062584 373 + 51301725 ctatgtaatgaagcctccataaaaacccaaaaggactgggtttggagagcttctggataAAACTTCCTGGAAAGTAGGGTGCCCCTCCCCCTGTGCCAGGCCCCATGTATCTTTTCATCTGAATTTTTTGCCATATCCTctataataa----aatggtaaatgtaaGTGTTTCCCCGCGCGCTGTGAGCTGTTCTAGCAAATTAATGCAACTAAAACAGGGAGTGGTGGAAACGTGATATGTAGCCAGtcggtcagaagcacaggt-aaacAACGTAGGGCTTGCCGTTGTTATGAGAGTGGGAGGCCAGTTTGGCGGAACTGAGCCCTGTGGAATCTAATGCTATGTCCAGGTAGACAGTGTCAT-ATTGAATTAgaa i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59747578 639 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=1677.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133614 4 + 137718 gaca s panTro4.chr4 111495859 4 - 193495092 gcca i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90765662 4 + 99891981 gaca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38062957 4 + 51301725 gaca i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59747578 639 + 201139530 I e macFas5.chr19 14143769 889 - 59248254 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=1340.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133618 4 + 137718 caca s panTro4.chr4 111495863 4 - 193495092 cACG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90765666 4 + 99891981 cATA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14144658 4 - 59248254 CGTA i macFas5.chr19 I 889 C 0 s papAnu2.chr19 38062961 4 + 51301725 ccca i papAnu2.chr19 C 0 I 901 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59747578 639 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=613.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133622 2 + 137718 TA s panTro4.chr4 111495867 2 - 193495092 TA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90765670 2 + 99891981 TG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14144662 2 - 59248254 TG i macFas5.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59747578 639 + 201139530 I e papAnu2.chr19 38062965 901 + 51301725 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=160348.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133624 254 + 137718 TGTGGAGAATAATCATTCTGGTCATTTGCTGCATGTCTTATTGACAATATGTAATCACATCCTTTATCCCGACCTTATGGCACCTGGGTTGAGAACCATGATTTGAACCAGACGTTGGTCTGTCACTTTCTCAGTTTGAAAC----TTTAttttgcctttagcgttttgctgttgctttttcgttGTCttttgtttcgtttcgttcctaagttctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttactaaggttaac s panTro4.chr4 111495869 254 - 193495092 TGTTGAGAACAATTTCTCTGGTCATCCGCTGCATGTCTTATTTACAATACGTAATCGAATTCTTTATCCTGACCTTATGGCAGCTGGGTTGAGAACCATGATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTCTGAGTTTGAAAC----TTTGTTTTGCCGTTAGCGTTTTGCTATTGCTTTCTCGttttctttgctttcgatttgtttctaagttctgggatatacgggcagggtgtgcagatttgttactaaggtaaac i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90765672 253 + 99891981 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGTTGTATGTCTTATGTACAATATGTAATCAAATTCTTTATCCTGACTTTATGGCACCT-GCTTGAGAACCATGATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTCTCAGCTTGAAAC----TTGATTTTACCGCTAGCCttttgttattgttcttgtgtttccttttgtttCGttttgttttaaattgatggggtataagtgcaggatgtgcagatttgttaggaaggtaaac i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14144664 253 - 59248254 TGTTGAGAATAATTTTTCTAGTCATTTGCTATATGTTTTAATTGCAATATGTAATCAAATTCTTTGTCTTTACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACAATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACTTTTTCAGTTTGAGACTTTGTTTATTTTGCCACTAGTGTTTTGTTTTTGTTTT---ATTTTGtttg--tttgttttgtttttatgttctggggtatatgtgcaggatgtgcagatttgttccataggtaaac i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38063866 244 + 51301725 TGTTGAGAATAGTTTTTCTAGTCATTTGCTATATGTTTTAATTGCAATATGTAATCAAATTCTTTGTCCTCACTTTATGGCACCTGGGTTGAGAACAATTATTTGAACCAAAAATTGGTCTGTCACtttttcagtttgagactttgtttattttgccactagtgttttgtttttgtttt---attttgtttg--tttgttttgtttttaagttctggggtat---------atgtgcagatttgttccacaggtaaac i papAnu2.chr19 I 901 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59747578 639 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=105630.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133878 92 + 137718 gtgtgccatggtggtttgctgcacctgtcaacccatcacctaggtattaggcccagcatgcagtagctgtttttcttaacgctctgtctccc s panTro4.chr4 111496123 92 - 193495092 gtgtgccacggtggtttgcggcacctgtcaacccatcacctaggtattcagcccagcaggcagtagctgtttttcttaacgctctgcctccc i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59748217 92 + 201139530 gtgtgccatggtggtttgctgcacctgtcaacccatcacctaggtattaagcccagcgtgcagtagctgtttttcttaacgctctgcctccc i gorGor3.chr4 I 639 C 0 s nomLeu3.chr17 90765925 92 + 99891981 gtgtgccatgctggtttgctgcacctgtgaacccatcacctaggtagtaagcccggcatgcattaactgcttttcttcgtgctgtccgtccc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14144917 92 - 59248254 gtgtgccatggaggtttgctgcacctatcaacccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctccc i macFas5.chr19 C 0 I 15 s papAnu2.chr19 38064110 92 + 51301725 gtgtgccatggaggtttgctgcacctatcaccccatcacctaggtattaagcccaggatgcattagctatttttcttaatgctctccctccc i papAnu2.chr19 C 0 I 15 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=-2193.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133970 3 + 137718 gga s panTro4.chr4 111496215 3 - 193495092 gaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59748309 3 + 201139530 gaa i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766017 3 + 99891981 gac i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr19 14145024 2 - 59248254 ga- i macFas5.chr19 I 15 I 1 s papAnu2.chr19 38064217 2 + 51301725 gt- i papAnu2.chr19 I 15 I 1 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=77739.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 133973 72 + 137718 aggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgggatctcatttttcagctcccattataagtgag-t-- s panTro4.chr4 111496218 73 - 193495092 aggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgatcccattgttcagctcccactataagtgagaa-- i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59748312 72 + 201139530 aggccccagtgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgatcccgtttttcagctcccattataagtgaga--- i gorGor3.chr4 C 0 I 5892 s nomLeu3.chr17 90766020 72 + 99891981 aggccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtgcatgtgttctcctttttcagctcccatcatcactgaga--- i nomLeu3.chr17 C 0 I 1 s macFas5.chr19 14145027 75 - 59248254 aggccccaatgtgtgtttttccccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactatgagtgagaatg i macFas5.chr19 I 1 C 0 s papAnu2.chr19 38064220 74 + 51301725 a-gccccaatgtgtgttgttccccttcctgtgtccatgtgttctcatttttcagctcccactataagtgagaaca i papAnu2.chr19 I 1 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=49347.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134045 70 + 137718 tgtggcgtttggttttcttttccctggataagtttgctgagggtaatgacCACACATCACCACTGT--TTTT s panTro4.chr4 111496291 69 - 193495092 tgtggcgtttggttttctgttccc-ggattaggttgttgaggataacgacttcACATCACCAGTGT--CTTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766093 71 + 99891981 tgtggtgtttggttttctgttccc-aggttagtgtgctgaggataatgacttcACATCACTGGTGTTATTTT i nomLeu3.chr17 I 1 C 0 s macFas5.chr19 14145102 69 - 59248254 tgtggtgtttggttttctgttccc-agattagtttgctgaggataatgacttcACATCACTAGTCT--TTTT i macFas5.chr19 C 0 N 0 s papAnu2.chr19 38064294 69 + 51301725 tgtggtgtttggttttctgttccc-tgattagtttgctgaggataatgacttcacatcactagtgt--tttt i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=2645.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134115 7 + 137718 GCTTTTT s panTro4.chr4 111496360 7 - 193495092 GTTTTTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766164 7 + 99891981 TTTTTTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38064363 7 + 51301725 ttttttt i papAnu2.chr19 C 0 T 6710 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=40811.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134122 247 + 137718 AGTATAAAGAGTAGTATTTTATTGAATAAGATTTGCTCACAGAAAAATAAGCTTACATCTACAATGAATGCCAGACCCTACAGCAGAAAGCCATTTTCTCACTTTTCCACACACAATGGTTCCTACTAAGTGAAAAAAAAGCCATAAAATTTCATTCACAAATGTACTACTCTGTCTCAAAACATCGCACATAATCATGCACTGTACTAAAGCCATTAGATCAGTTCTTCAGTCAGGTTA---------------------------------------AAGAAGT s panTro4.chr4 111496367 242 - 193495092 ATTATAAAGAGTAGTATTTTATTGAATAAGATTTACTTCCAGAAAAATAAGCTTTAATCTACAATGAATGCCAGACTCTACAGCACAAAGCAATTTTCTCAGTTTTCCACACACAAAGCTTCCTACTAAGTG--AAAAAAGCCACAGAATTTCATACACAAATGTACTACTCTGTCTGAAAACATCTCACAGAATCATGCACTGTACTAATACCATTAGATCAGCTCTTCAGTCAGGTTA------------------------------------------AAGT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766171 282 + 99891981 ATTTAAAAAAATAGTGTTTTATTAAACAGGGTTTCTTCACAGCAAAATAAGTTTTAATCTACAATGAATGCCAGATATTACAGCAGAACGCAATTTTCTC--TTGCCCACACACAAAAGTTCTTACTAAGTG--AAAAAAGCCATAAAATTACATTCACAAATATGGTTCCCAGTCTCCAAAGCTTTCACATAATTATTCACAGTAGTAATACAATCAGAGCAGTTATTCAGTCAGGTGAAAGTACCGTGAACCCTAAAGTATAACAATAAGATTAAAAAAGACGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e papAnu2.chr19 38064370 6710 + 51301725 T e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=35264.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134369 93 + 137718 ATCCCTCTAATAACTGACTTTCATAATGCTATCAATATCCACTCCCAATCAGTCTGCCATTGTTAATGGT-GTACAGCATTACTGAATACAATG s panTro4.chr4 111496609 93 - 193495092 ATCCCTCTAATAACTGATTTTTATAATGTTATCCACATCCATGCCCACTCAGTCTGCCATTGTTAATGGT-GTACAGCATTATTGAACACAATG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766453 93 + 99891981 ATGCATCCAATAACTGATTTTTGAAATGCTGTGAACGTCCACACCCTACGAGTCTGCCATTGTTAATGCT-GTACAGCATCATTGAATAGAacg i nomLeu3.chr17 C 0 T 17638 s papAnu2.chr19 38057660 94 + 51301725 ATGCCTCtaataactgatttttaaaatgctataaatatcCACTCCCTATCAGTTTGCCATTGTTAAAGGCAGTACAGCATTATGGAATACAACG i papAnu2.chr19 T 6710 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=17942.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134462 42 + 137718 GAATTGATGACGCCCATATCCAcggacaaaccgtgacttatg s panTro4.chr4 111496702 42 - 193495092 GAATTGATGGAGCCCATATCCACCGACAAACCGTGACTTAAG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90748908 42 + 99891981 GTATTGATGAAGCCCACATCCACGGAGAAAccctgacttacg i nomLeu3.chr17 T 17638 I 17596 s papAnu2.chr19 38057754 42 + 51301725 GAACTGATGAAACCCATATCCACGGGCAAACCGTGACTTATG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=-96.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134504 1 + 137718 a s panTro4.chr4 111496744 1 - 193495092 T i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766546 1 + 99891981 a i nomLeu3.chr17 I 17596 C 0 s papAnu2.chr19 38057796 1 + 51301725 A i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59748384 5892 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=20575.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134505 27 + 137718 tggtttgatttacgatttttcaacgtt s panTro4.chr4 111496745 27 - 193495092 TGGTTTGATTTATGAGTTTTCAACGTT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59754276 27 + 201139530 tggtttgatttatgatttttcaacgtt i gorGor3.chr4 I 5892 I 2700 s nomLeu3.chr17 90766547 27 + 99891981 tggtttgatttatgattttccaatttt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057797 27 + 51301725 TGGTTTGGtttatgattttttaacttt i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=35567.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134532 101 + 137718 atgatgggtttactggaatatTAGATGCGTTTCTGAGTTACACTGGGTTTATGAGTATGCGACCCTAT------ACTCCAGAAACAGCTGTATAAGGAAAAACAGGT s panTro4.chr4 111496772 101 - 193495092 ATGATGGGTCTATTGGAATATTAGATGCCTTTCTGAGATACACTGGGTTTATGGGTATGCGACCCTAT------ACTCCAGAAACAGGTGTATAAAGAAAAACAGGT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766574 107 + 99891981 atgatgggtgtattgagatattacATGCGTGTTTGAGTGACAATGGATTCATCGGTAGGTGACCCCGTTCCCCGTCTCCCGGAATGGCTATCTAAAGTGAAACAGGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057824 100 + 51301725 atgatgggtttattgggatattaaatatatttttgag-tgcACTGGGTTTATCAGTATGTAATCCTAT------ACTCCAGAAATAGctgtataaagaaaaacaggt i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59754303 2700 + 201139530 I e ponAbe2.chrUn 15053050 715 + 72422247 I a score=305.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134633 6 + 137718 TTACCT s panTro4.chr4 111496873 6 - 193495092 GTACCT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053765 6 + 72422247 TTACCT i ponAbe2.chrUn I 715 C 0 s nomLeu3.chr17 90766681 3 + 99891981 GTA--- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057924 6 + 51301725 gtACTG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59754303 2700 + 201139530 I a score=6643.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134639 11 + 137718 AATGAAAATAT s panTro4.chr4 111496879 11 - 193495092 AATGAAAATAT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59757003 11 + 201139530 AATTAAAATAT i gorGor3.chr4 I 2700 I 2437 s ponAbe2.chrUn 15053771 11 + 72422247 AATTAAAATAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057930 11 + 51301725 AAGGGAAAAAT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e nomLeu3.chr17 90766684 0 + 99891981 C a score=62839.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134650 124 + 137718 GCTTAGTGACTTGGGATAAA-CCAATAGATG-TTCACAACTGATGGAGAGCCGTGAAAGAGAGATAACGGTAAATAGTTACAATAACACAATTTTCCTGCACCTGTCGAGGAT----------------TTCCCCAAAAAAA s panTro4.chr4 111496890 123 - 193495092 ACTTAGTGACCTGGGATAAA-TCAATAGATG-CTTACAACTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGATAGCAGTAAATAATTACAATAACACAATTTTTCAGCACCTGTCGAGGA-----------------TTCCTCAAAAAGA i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053782 125 + 72422247 ACTTAGTGACTTGGGAAAAACCCAATAGAGGTTTTACAATTGATGGAGAATCATGAATGAGAGACAGCGGTAAATAGTAACAATAACACAATTTTCCGGAAACTGCCGAGGA-----------------TTTCCCAAAAGAA i ponAbe2.chrUn C 0 I 1 s nomLeu3.chr17 90766684 116 + 99891981 ------------------------ATAGATG-TTTACAATTGATGCAGAACC-TGAAGGAGAGATACCAGTAAATAAAAACAATAACTCAATTTTCCTGCAACTCTCGAGGATTTCCTAAAGACGAGGATTTCCTAAAGAAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38057941 122 + 51301725 ACTTATTGACTTGGGGGAAA-CCAACAGATG-TTTACAATTGATGGAGAACCATGAAAGAGAGATAccaccaaataaaaacaataacacaa-tttcCTGCAACTGTCGAGGA-----------------TTTCCgaacaaaa i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59757014 2437 + 201139530 I a score=53603.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134774 60 + 137718 CGCAGAATGTGGGATGCACCTAAGGCATaggaaagagagagggcagaaggagtaagagag s panTro4.chr4 111497013 60 - 193495092 CGCAGGACGTAGGATGCACCTAAGGCATATGAAAGAGAGAGGGCAGAAGGAATAAGAGAG i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59759451 60 + 201139530 CGCAGAATGTGGGATGCACCTAAGGCATATGAAAGAGAGAGGGAAGAAGGAGTAAGAGAG i gorGor3.chr4 I 2437 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053908 60 + 72422247 CGCAGAATGTAGGATGCAGCTAAGGCATATGAAGCAGAGAGGGCAGAAGGTGTAAGAGAG i ponAbe2.chrUn I 1 C 0 s nomLeu3.chr17 90766800 51 + 99891981 CACAGAATGTAGGATGCAGCCAAGGCATGTAAAAGTGAGTAGGaggaagga--------- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38058063 60 + 51301725 cacaagaaatagGATGCACACAATGAATATAAaagagagagggcagaagcagcaagagag i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=9678.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134834 36 + 137718 aaataggaggaaggagggaaggaaagaaggaagtca s panTro4.chr4 111497073 16 - 193495092 AAATAGGTggaagga--------------------a i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59759511 36 + 201139530 AAATAGGaggaaggaaggaaggaaggaaagaagtaa i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053968 16 + 72422247 AAATAGGaggaagga--------------------a i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766851 9 + 99891981 -------aggaaggc--------------------a i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 13301144 36 - 51301725 aaatggaagaaaggaaggaaggaaggaaggaaggaa i papAnu2.chr19 T 4766 n 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=3000.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134870 2 + 137718 gg s panTro4.chr4 111497089 2 - 193495092 gg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59759547 2 + 201139530 gg i gorGor3.chr4 C 0 I 1191 s ponAbe2.chrUn 15053984 2 + 72422247 gg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766860 2 + 99891981 gg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38058123 2 + 51301725 gg i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=10990.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134872 13 + 137718 aaggaaggaagga s panTro4.chr4 111497091 13 - 193495092 aaggaaggaagta i panTro4.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053986 13 + 72422247 aaagaaggaagga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766862 13 + 99891981 aaggaaggaagga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38058125 13 + 51301725 aaggaaggaagga i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59759549 1191 + 201139530 I a score=62801.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134885 96 + 137718 aggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaagaaggacgtaaggaaggaGAAAACA-CCGGTGTTACTAAAAGCCCCC--AAAAAAA--TGGTTTCCC s panTro4.chr4 111497104 90 - 193495092 aggaaggaaggaaggaaggaaggaagcagggaaa----gacggaaggaaggaGAAAACACCCGGTGTTACTGAAACCAC-----AAAAAG--TGGTTTCCC i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59760740 96 + 201139530 aggaaggaaggaaggaaggaaggaaagaaggaaagaaggacggaaggaaggaGAAAACACCCGGTGTTACTAAAACCCC-----AAAAAGACTGGTTTCCC i gorGor3.chr4 I 1191 C 0 s ponAbe2.chrUn 15053999 71 + 72422247 --------aggaaggaaggaagg--------------------aaggaaTGAGAAAACACCCGGTGTTACTAAAACCaaaaagaaaaaaa--tggtttccc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766875 95 + 99891981 aggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagTAGGAAACACCTGGTGTTACCAAAACCAA----AAAGAAA--TGTTTTCCC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38058138 69 + 51301725 --------agcaagagagggagg---------------gagggagggaaggggaaaactCCTGGTGttactgaaac-------aaaaaaa--tggtttctc i papAnu2.chr19 C 0 I 10848 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=42469.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 134981 69 + 137718 CCTGTGGGTAAG-Cctacaatgtggacgaatcttgaaaatattgtgct--acgtgttatgtcagtcataaca s panTro4.chr4 111497194 71 - 193495092 CCTGTGGGTAAG-gctgcaatgtggatgaatcttgaaaatactgggctaaaagtgttatgtcagtcataaaa i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59760836 69 + 201139530 CCTGTGGGTAAG-Cctacaatgtggatgaatcttgaaaatattgtgct--acgtgttatgtcagtcattaaa i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15054070 70 + 72422247 actgtgggtatgaaaaataatgtggatgaatcttgaaaatattgtgct--aagtgtaaagtcagtcacaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90766970 69 + 99891981 ACTGTGGGTAAA-gctacaatgttcatgaaccttgaaaatactgtgct--aagcgtaaagtccgtcatagaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I e papAnu2.chr19 38058207 10848 + 51301725 I a score=156691.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135050 171 + 137718 gctcacctattgtgcaattccgcttataggaaatgtccacaatatgataatctatgcatatgggattgatcgcactaggtagttgctacctagggctgagggtcagggagagggttt-------------gagacagaatgaggagtgactaatgtctacagggtttttctc------tggccgggagtg s panTro4.chr4 111497265 171 - 193495092 gctcacgtattgtgcaattccattgataggaaatgtccacagtatggaaatctatgcatatggggttgatcgctctatgcagttgttacctagggctgagggtcagggagagggttt-------------gagacagaatgaggagtgactaatgtccacagggttttcctc------tgttcgggggtg i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59760905 171 + 201139530 gctcacctgttgtgcaattccgtttataggaattgtccacaatatggaaatctatgcatatggggttgatcacactatgtagttgctacctagggctgagggtcagggagagggttt-------------gagacagaatgaggagtgactaatgtctacagggtttttctc------tggtcggaggtg i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15054140 171 + 72422247 gctcacatattgtgcaattatgtttatatgaaatgcccacaatatggaaatctatggatatggggttgatcgctctatgtagttgttacctagggctgagggtcagggagagggttt-------------gagagagaatgaggagtgaccaatgtttacagggtttttctc------tggttgggggtg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90767039 168 + 99891981 gctcacatattgtataattcctttggtaggaaatatccagaatatggaaatctatggatgtaggtttgagcgctctatgtagttgttacctagggctgagggtcggggagagggttt-------------gagacagaat---gagcgatgaaagtttacgggatttttctc------cggtagggggtg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069055 189 + 51301725 GCTCACATGTTCTACTATTCTGTTTATAAAAACTATCCAGACTGGGTAAATCTATGGAGATAGAGTGGAGATCTCTATGGAGCTGTGACCTAGGGCTGCGGTTGCGGTTGGGGGTTTGGGTTGTGGCCCGGAGACAGAATAAGAAATGACTAATGT-TACAGGGATTTTCTTACGGGGTGGATGAAAATG i papAnu2.chr19 I 10848 I 2 e rhiRox1.KN297800v1 117663 9530 - 3959310 I a score=8849.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135221 10 + 137718 at-aagacgtt s panTro4.chr4 111497436 10 - 193495092 at-aaaacctt i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59761076 10 + 201139530 at-aagacgtt i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15054311 10 + 72422247 at-aaaaagtt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90767207 10 + 99891981 at-aaaatgtt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069246 10 + 51301725 AT-AAATCATC i papAnu2.chr19 I 2 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 127193 11 - 3959310 atgaaaatgtc i rhiRox1.KN297800v1 I 9530 I 1505 a score=33319.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135231 40 + 137718 ctacaatgaattgcgaattaaattcgaatgtgcacaacca s panTro4.chr4 111497446 40 - 193495092 ctaaaatggattgcgaattaaaattgaatgcgcacaggca i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59761086 40 + 201139530 ctacaatggattgtgaattaaaatggaatgtgcacaacca i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 15054321 40 + 72422247 ctaaaatggattgcgaattgaaattgaatgtgcacaacca i ponAbe2.chrUn C 0 N 0 s nomLeu3.chr17 90767217 40 + 99891981 ctaaagtggactgcgaatgaaaattgaaggagcacaacta i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069256 30 + 51301725 ----------TTGCAATTTAAAATGGACTGTGCACAATTA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=289678.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135271 463 + 137718 caggtatactaaaagccactcaattcatgacttttaatgggggaatcttatgTGGCGCACTCTCATGGAGACCACGGCAGACATAGTGAGAGAGAAAAAGGTGAGTAAATATCTGAAACGGAGGCAGTAACAGAGAGAATGAAAAGCCCTGTGAATGGAAGGGAGAGCGAAAAGGGAAAATGGTCCTATTTACAAATGACAGATGTGA-AATTGGGGTTCACATCAACAGTGTCACTGCCAGGAAGGAGGGTCACGCTAGACATGTCACCGGTAGTTTGGCCCGCAGGGACGCCGACCTGCTGGAGCGTCGTGCCAGCATGGGCTGTGGCAGCCACGTGGGCCAGCAGGGGGTTCCCGCTGCGCAGCTGTGGGGTGAGGATAGACTGGGTGGTGATATCGGCCATTACAGGGGCCTCTTCTGCTGGCAAGAGTGTGACAGTAGCAAGTAGATGGACAGGCCTGC s panTro4.chr4 111497486 462 - 193495092 caaatatactaaaatccactcaattcatgacttttaatggggcaattttatgTGGCACACTCTTATGGAGACCACGGCAGACATAGTGAGAGAGAAAAAGGTGAGTAAATCTCTGAAACGGAGGCAGAAACAGAGAGAATGAGAAGCCCTGTGAATGG-GGGGAGAGGGAAAAAGGGAAATGGTCCTATTTACAAATGTCAGCTGTGA-AACTGTGGTTCACATCAGCAGTGTCACTGCCAGGAAGGAGGGTCATGCTAGCCATGTCACCGGTAGTGTGGCCCGCAGGGACACCAACATGCTGGAGCGTCGTGCCAGCATGGGCTCTGGCAGTCACCTGGGACAGCAGGAGGGTCCCGCTGCACAGCCGTGGGGTGAGGATAGACTGGTGGCTGATATCGGCCATTACAGGGGCCTCTTCTGCTGGCAAGAGTGTGAGAGTAGCAAGTGGATGGACAGGCCTGT i panTro4.chr4 C 0 C 0 s gorGor3.chr4 59761126 463 + 201139530 caggtatactaaaagccactcaattcatgacttttaatgggggaatcttatgTGGCGCACTCTCATCGAGACCACGGCAGACATAGTGAGAGAGAAAAAGGTGAGTAAATATCTGAAACGGAGGCAGAAACAGAGAGAATGAAAAGCCCTGTGAATGGAAGGGAGAGCGAAAAGGGCAAATGGTCCTATTTACAAATGACAGATGTGA-AACTGGGGTTCACATCAACAGTGTCACTGCCAGGAAGGAGGGTCATGCTAGCCATGTCACCGGTAGTGTGGCCCGCAGGGACGCCGACATGCTGGAGAATCGTGCAAGGATGGGCTCTGGCAGCCACGTGGGCCAGCAGGAGGGTCCCGCTGCACAGATGTGGGGTGAGGATAGACTGGGTGGTGATATTGGCCATTACAGGGGCCTCTTCTGCTGGCAAGAGCGTGACAGTAGCAACTAGATGGACAGGCCTGC i gorGor3.chr4 C 0 I 2074 s nomLeu3.chr17 90767257 463 + 99891981 caaataaagaaaaaggcactcaattcatgactcttaatggggaaatcttatgTGGCGCACTCTCATCGACACCACGGCAGACAGCGAAGAAGAGAAAAAGGTGGGTCAGTATCTGAAATGGAGGCAGACACAGAGAGAATGAAAAGCCCTGTGAAGGGAAGAAAGAGAGAAAAGGGAAAATGGTCCAATTTAGAAATCACAGATGTGA-AAGTGGGGCTCACATCAACAGTGTCACTGCCAGGGAGGAGGGTCATGCTATCCGTGTGACGGCTAGTGTCGCCCGCAGGGACGCCGACGTGCTGGAGGTTCGTGTCATCATGGGCTCTGGCAGCCACGTGGGCAAGCAGGAGGGTCCCGCTGCACAGCTGTGGGCTGACGAAAGTCTGGGGGGTGATATCGGCCATGAGAGGGGCCTCTTCTCCTGGCAAGAGTGTGACAGTAGCAAGTAGTTGGACAGGCCTGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069286 442 + 51301725 TGAATACACTAAAGGCGATACAATTCATCAGCTTAATTGGGTGAATCTTATCCACGGCATCCACATGGAGACAGCAGCAGACACAGGGAAAGAG-----GATGAGTAAATGTCTGAAATGGAGGCCGAAAGAGAGACAATGAGAAGGCCTGTGAACGGAAGACACCGACCGCAGGGAAAACGGTCATATGTATACATCAGGGATCTGAGAACAGGGGTTCACACCGACAGTGTCACTGCCAGGAAGACAGGTCAAGCTGGCGATGTCGCTGGTGGCGTTTCCCACAGGAACGCAGATAGGCTGGGGGTTCCCGCTGGCATGGGC----------------ACAGGCAGGAGCGTCCCGCTGCACAGCTGAGGGGTAA-GACAACCTGGCTGTTGATGTCGGCCATCAGAGTGGCCTCTCCTGCCAGCAAGTGTGTGATAGTAGCAAGTAGAAGGAGAGGTCTGT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=127113.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135734 192 + 137718 GTGTGAGGACGGAATGCAGGAGGGGCTCTTGTGCGGCTGGGTGTGGGGCCCTCCCGGGAACCGTGGAGAAATGGCCAGGTAACTGCGTCATGTGGGC--TAGTAGATTGGCCAGGGCTTCGAACTGAAGGACAATAACAGGGTGTAGCTGTCAGGCCCTGGGAGTGCCTGAGTGTAAGTGGAGATGGGTTTGGG s panTro4.chr4 111497948 192 - 193495092 GTGTGAGGACGGAATTGATTGCGTGCTCTTCTGCGGCTGGATGTGGGGCCCTCCCCAGATATGTGGAGATATGGCCAGGTAGCTGCACCATGTTGGCTATAGT-GATTGGCCAGGCTTTCCAACTGAAAGAC-ATAACGGGGAGTAGCTGTCACGCCTTGGGAGTGTCCGAATGTATTTGGAGATGGGTTTGGG i panTro4.chr4 C 0 N 0 s gorGor3.chr4 59763663 192 + 201139530 GTGTGAGGACGGAATGCAGGAGGGGCTCTTCTGCGGCTGGGTGTGGGTCCCTCCCCAGAAATGTGGAGACATGGCCAGGTAGCTGCATCATGTTGGC--TAGTAGATTGGCCAGGGCTTCGAACTGAAGGACAATAACGGGGAGTAGCTGTCAGGCCCTGGGAGTGTCTGAGTGTAAGTGGAGATGGGTTTGGG i gorGor3.chr4 I 2074 C 0 s nomLeu3.chr17 90767720 192 + 99891981 GTGTGAGGACGGAACGCAGGAGGGGCCCTTCTGCGGCTGGGTGTGGGGCCCTCAGCAGAAATGTGGAGAAATGGCCAGGTAACTGCGTCATGTCGAC--CAGTAGATTGGCCAGGGCTTCGAACTGAAGGACAATAACGGGGAGTAGCTGTTAGGCAATGGGAGTGTGTGGGTGTAAGTGGAGATGGGTTTGGG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069728 192 + 51301725 GTGTGAGGCCAGAACGCGGGAGGGGCTCTTctgtggctgggtgtggggcCCTGAGCAGGAATGTGGAGTAATGGCCGGATAACTGCATCACATTGGC--CAGGAGGCTGGCAAGGACTTCGAGCTGAATGATGATAACGGGGAGTGACTGTGAGGCTCTGAGAGGGTCTGAGTGTAAAAGAAGATGGGTGTGGG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=52587.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 135926 140 + 137718 GTCACTGAGGGATGCGTGGGAGCCATCACTGTATAGGTACAGGTCATAGGGAGATAGTCTGGTGAGGCCTGTGAGTGTCTAGGGTTGtcctgggtgcctgttgctgactgtggcagaaatctggggaaggctggagagaa s gorGor3.chr4 59763855 140 + 201139530 GTCCCTGAGGGAAGCGTGGGAGCCATCCCTGTATAGATACAGGTCATTGGGAGGTAGCCTGGTGAGGCCTGTGAGTGTCCAGGGTTCCCCTGGGTGCCTGGGGCTGACTGTGGCAGAAATCTGGGGAAGGCTGGAGAGAA i gorGor3.chr4 C 0 I 2462 s nomLeu3.chr17 90767912 140 + 99891981 GTGACTGAGGGATAGGTGGGAGCCATCCCTGTATAGATACAGGTCACAGGGAAATAGTCTCGTGAGGCCTGTGAGTGCCTGGGGTTCtcctgggtgcctggggctgactggggcagaaatgtggggaaggctggagagaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38069920 140 + 51301725 GCCCCTGGGGAGTATGTGGGAGCTGTTGCTGTGTAGATGGAAGTCGTTGGGGAAGAATCTGGTTAGCTCTGTGAATTTCTAGGGATCTCCTCAGTGCTGGGGGCTGACTCTTGCAGAAAACTGGGGATGGTTGGAGAGTA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=21504.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136066 128 + 137718 gctgggagacccaggagagtccctgaaggcagggggtgaagaggtgaaagaaatgggggatggttgcagtaaggtccgtgagtttgcaggtgattccagggtgtgggaagctgactccaggtgaaatc s nomLeu3.chr17 90768052 128 + 99891981 gctgggagacacaggagagaccctgaaggctgggggtgaagaggtgaaagaaatgggggagggtggcagtaaggtccgtgagtttgtgggtgatccctgcgtgggggaagctgactccggctgaaatc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070060 128 + 51301725 GCTGGGAGACATGGAAGAGACCCTAAGGAATGGCAGTACAAAGGTcagagaggtgggggaggggcacaGGGAGGTCTGTGAGTTTCTAGGAGACTCCTGTTTATTAGGGGCTGGCCCCAGGAGAAATC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I e gorGor3.chr4 59763995 2462 + 201139530 I a score=38277.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136194 113 + 137718 tggagatggttggagagtagctgagagagacagaagagtccctgagggctgggggtgagaacatgagggagacaggggagtaagtcagtgaaattcgtgagt---tcggtggtgta s gorGor3.chr4 141307919 113 - 201139530 tggagatgcctggagagtagctgagagagacagaagagtccctgagggctgggggtgagaacatgagggagactggggagtaagtcagtgaaattcgcgagt---tcggtggtgta i gorGor3.chr4 n 2462 n 2462 s nomLeu3.chr17 90768180 113 + 99891981 tggagatggtgggagagtggctgagagagacagaagaggccctgagggctgggggtgaaaacatgagcgagaccggggagtaactcagagaaattggtgagt---ttggtggtgtg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070188 113 + 51301725 TGGGGATGGTTGGAGAGGAGCTGGGGGACACTAGAGAACCTCTGAGGGATGGGGATGCAAAGATGGGAGATATGGCCGAGGAGCACAGGGAGGTCTGTGGGTTGCTAGGTGAT--- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=4539.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136307 24 + 137718 tcgtgggtgcctggaactgactcc s nomLeu3.chr17 90768293 24 + 99891981 tcctgggtgcctggaactgactcc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070301 24 + 51301725 TCCTGGGCATGTGAGGCTGACTCC i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I e gorGor3.chr4 141308032 2462 - 201139530 I a score=131813.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136331 411 + 137718 agctggaatctagagaagttttgagagtagctgaaagagacacaagagtccctgtgggatgagggcaaagacctgagagagaccagggaggagctcagtgaagtctg-tgagtctgtatctgattccggagtgtgggaggctgactcccgctgaaatctgggcgtggtgggagagtagctgggacagacaggagagtcccaggggtctgggggtgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaaa-tgctgagtttggtggtgatacatgggtgcctggaactgactcccgctgaaatctgggcatggttggagagtagctgggacgcacaggagagtccctgagggctgggggtgaagacatgagagagaccggggtgtaactgagtgaaactggtgagtttggtg s gorGor3.chr4 59766457 412 + 201139530 agctggaatctagagaagttttgagagtagctgaaagagacacaagagtccctgtgggctgagggcaaagacctgagagagaccagggaggacctccgtgaagtctg-tgagtctgtaggtgattccagagtgtgggaggctgactccctctgaaatctgggcgtggtggtagagtagctgggacagacatgagagtcccagggggctggggatgaagacatgagagagactggggagtaacgcagtgaaactgctgagtttgtatgtaattcctgggtgcctggaacggactcctgctgaactgtgggcgtggttggagagtagctgggacacacactagagtccctgagggctggaggtgaagacatgagacagaccggggagtaactcagtgaaactggtgagtttggtg i gorGor3.chr4 I 2462 C 0 s nomLeu3.chr17 90768317 412 + 99891981 agctggaatctagacaacttttgagggtagctgaaagagacacaagagtccctgtgggctgaggccaaagacctgagagagacctgggaggatctcagtgaggtctg-tgggtgtgtaggtgattcctgagtgtcggaggctgactcccgctgaaatctgagcgtggctggagaggagctgggacacgcaggagagtcccagggggctgtgggtgaagacgtgagagagactggagagtaactcagtgaaattgctgacttcgtaggtgattcctgggtgccgggaactgactcccgctgaaatctgggcgtggtcggagagcagctgggacagccaggagagtccctgagggctgggtgtgaagacatgagagagactggggagtaactcagtgaagctggtgagtttggtg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070325 402 + 51301725 AAGAGAAATCTGCGGATGGCTGGAGGG-AGCTGGGAGACACAGGAGAGTCCCTGAGGGCCGCAGGTGAGGAAATGGGAGACATGATTGAGGAAGGCACTGAGATCTGTTGAGTTTGTCGGTGACCCCCGGGTGTGGGGGGCTGAGTGTTGCAGAAATCTTGGAATGATGGGAGAGTAACCGGGACACACACGAGAGTAGCTGAGGGCCTGGAGTAAAGAGTTGGGAGACATGGGGAGGGAGCCCTCTGAGGACCCTGAGTTTCCAGGTGTTTCCTGGGTGTGGGCGGCTGACTGGTGGGGAAAGGTGGGGAGGTCTGGAGAG--ACTGGGAGACATGGGAGTGTCCCCGAGAGCTGGGGGTGAAGAGATGGGACACATAGGGGAGGAGTGCAGGGAG------GACTCTGG-- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 127204 1505 - 3959310 I a score=1910.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136742 2 + 137718 gt s gorGor3.chr4 59766869 2 + 201139530 gt i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90768729 2 + 99891981 gt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070727 2 + 51301725 GT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 128709 2 - 3959310 gt i rhiRox1.KN297800v1 I 1505 I 8 a score=2138.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136744 8 + 137718 gactccgg s gorGor3.chr4 59766871 8 + 201139530 gactccgg i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90768731 8 + 99891981 gaccccgg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070729 8 + 51301725 GTTACCTG i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 128711 8 - 3959310 I a score=4157.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136752 8 + 137718 ggtgcctg s gorGor3.chr4 59766879 8 + 201139530 ggtgcctg i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90768739 8 + 99891981 ggtgcctg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070737 8 + 51301725 GGTGTGCA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 128719 8 - 3959310 ggtgtgca i rhiRox1.KN297800v1 I 8 I 92 a score=17270.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136760 47 + 137718 gaactgactccagctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctggga s gorGor3.chr4 59766887 47 + 201139530 gaactgactccagctgaaatgtgggggtggttggagagtagctggga i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90768747 47 + 99891981 gaactgactccagccgaaatctgggcgtagttggagagtagctgcga i nomLeu3.chr17 C 0 I 144 s papAnu2.chr19 38070745 47 + 51301725 GGCATGAATGTTGTAGAAATCTGGGGCTGGTTGGAGAGGAGCTAGGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 128727 92 - 3959310 I a 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gactggggagtaattgagtgaaatcg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070839 23 + 51301725 GTGGGAGGAGCA---CAGGGAGGTCT i papAnu2.chr19 I 3 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 128819 23 - 3959310 gttgggggcgca---cagggaggtct i rhiRox1.KN297800v1 I 92 I 101 a score=-1080.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136874 1 + 137718 -g s gorGor3.chr4 59768614 1 + 201139530 -g i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90769005 1 + 99891981 -g i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070862 1 + 51301725 C- i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 128842 101 - 3959310 I a score=65685.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136875 100 + 137718 tgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactgacgcccgctgaagtgtgggcgtggttggagagtagctgggacacacaggagagtccctgagggtt s gorGor3.chr4 59768615 100 + 201139530 tgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactcactcccgctgaagtgtgggcgtggttggagagtagctgggacacacaggagagtccctgagggtt i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90769006 100 + 99891981 tgagtgtggtggtgattccggggtgcctggaactgactccagctgaaatctgggtgtagttggagagtagctgcgacagacaggagagtccctgagggct i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070863 100 + 51301725 TGAGTTTCTCAGTGATTCCTGCATGTGAGAGGCTGACTCTGATAGAAATCTGGAGACGGTGGGAGAGGAGCTGGGAGACACAGGAGAGTCCCTGGGGGTT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01063152v1 1 100 + 1167 tgagtttggtggtgattcctgggtgcctggaactgactgcagctgaaatctgggcntggttggagagnngctgggacaganaggagagtccctgagggct i nasLar1.chrUn_JMHX01063152v1 N 0 C 0 e rhiRox1.KN297800v1 128842 101 - 3959310 I a score=1163.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136975 3 + 137718 gga s gorGor3.chr4 59768715 3 + 201139530 gga i gorGor3.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 90769106 3 + 99891981 ggg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 38070963 1 + 51301725 --G i papAnu2.chr19 C 0 I 2 s nasLar1.chrUn_JMHX01063152v1 101 3 + 1167 ggg i nasLar1.chrUn_JMHX01063152v1 C 0 C 0 s rhiRox1.KN297800v1 128943 1 - 3959310 --g i rhiRox1.KN297800v1 I 101 N 0 a score=65053.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 136978 142 + 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ctggggataaagacgtgagagatattgtggagtaactgagtgaaattggtgcgtttgtaggtgatccctggctgcctggaactgactccagctgaaatctgggcgtggctgggagagcagctgagagagacagaagagtccctgtggcctggggataaagacatgagagagactgtggagtaattcagtgaaactgg i nasLar1.chrUn_JMHX01063152v1 C 0 N 0 a score=89407.000000 s hg38.chrUn_GL000214v1 137313 403 + 137718 tgggcttggtggtgatccctgggttcctggaactgacccgcgctgaaatgtgggcgtggttggagagtagctgggacagactggagggtccgtaagggctgggggtgaagacgtgagagagactggcgaggatctcactgaggtctgtgagtttgtaggtgtttctggggtgtggggtacagactcccgctgaaatctgggcgtagttggagagtagctgggacagacaggagagtcatgggtggctgggggtgaGCTGCTGGATGATGGCAGTAAGAACATATGGTATATTATTGATGAATGAGGTGACTGTGAAGAATCTCCAGAGGAGGTCACGGGAGAACACAATGACATGAGTGACTGTCCTGCTTGGTTAGGAAAGGGAAACGTAAAGTTGTGGAAT s gorGor3.chr4 59769053 403 + 201139530 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