##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=17675.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 0 7 + 158759 gaattcc s panTro4.chrUn_GL393505 889570 7 - 1195001 gaattcc i panTro4.chrUn_GL393505 N 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66593331 7 - 72422247 gaattcc i ponAbe2.chrUn N 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67491161 7 - 121039945 gaattct i nomLeu3.chr6 N 0 C 0 s macFas5.chr7 24002975 7 + 171882078 gaattcc i macFas5.chr7 N 0 C 0 s papAnu2.chr7 21350630 7 + 162156779 GAATTCC i papAnu2.chr7 N 0 C 0 s chlSab2.chr26 21937391 7 - 58131712 gaattcc i chlSab2.chr26 N 0 C 0 s calJac3.chr10 24177447 7 + 132174527 gaattcc i calJac3.chr10 N 0 C 0 a score=31705.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 7 15 + 158759 aa-ttgttgtctatgc s panTro4.chrUn_GL393505 889577 15 - 1195001 aa-tttttgtctatgc i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66593338 15 - 72422247 aa-tttttgtctatgc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67491168 15 - 121039945 aa-tttttgtctatgc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24002982 12 + 171882078 ca-tttttgtcta--- i 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s panTro4.chrUn_GL393505 890991 958 - 1195001 ATTATATTGTCTTTGTTGC-TTTTCTCTAACATGAAACATATGTTACACAGGCACAGTGCTGGTATCTTTTCTATTATTATCTTTGAATGAGACTCATTATTGTCTGAGC-TATTTATT-AAAGTGGTGAAGGAAAAGATCAGTAAAGTAAATTATGTCATTAGGCAGTATCAATTTAGGTGTATTTTCCATGAATATTTTCTCAGCAACtgtggtgttatgatatat--------------------------------------------attggttttcatccacagttcctggcttataactcgcctagcacttattacagtcttttgttataatattgggtgtgttaggcctcaggagcaggcctctcacctcctcatggctttttttcatttttatgttcctgcctttctggttgtgggtcttaagaccatctcagcagagagtcccaccctataccctggagggaggaatgctgatatcatgaaacttccatgaaaatccaggaggacagggttcaatgagtttctgggtagttgaacacatggatgttcctggagggtggccaacccagggatggcatggaagctcagctcccttccccca-tgcattgctctaagtgtctcttcatctatatcctttgcaatatcctttataatacaccaggaaatgtaagtgtttccctgagttctgtgagccactccaacaaattaatcaaacccaaagaaggggtcatgagaa-cccaacttgaagccaataggtcagaagttcagagtcctggacttgtggctggtagattgagggtgggcagtcttggggactg--------acctgtgagatctgacactatctccaggtacacagtgtagtgtcagaactgaattagaggacactcagctggtgtctgctccttggtgtatgtatggag-gaataaaccgacacatttagtcacagaagtcttctgtgttgctgattgatatttgtggtgtgagactaaaggaaaaacag-- i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66594749 958 - 72422247 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171882078 ATGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21353443 4 + 162156779 atga i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21940205 4 - 58131712 ATGA i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24180323 4 + 132174527 ATGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e panPan1.JH650621 3540872 2134 + 12672142 I e otoGar3.GL873530 122063 2029 + 36342412 I e canFam3.chr30 13401743 400 + 40214260 I a score=8460.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 3657 3 + 158759 GGG- s panTro4.chrUn_GL393505 892376 3 - 1195001 GGG- i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66596134 3 - 72422247 GGG- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67493975 3 - 121039945 GGG- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24238709 3 + 170124641 GGG- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24005789 3 + 171882078 GGG- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21353447 3 + 162156779 ggg- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21940209 3 - 58131712 GGG- i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24180327 3 + 132174527 GGG- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s 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hg38.chrUn_KI270749v1 3662 147 + 158759 AAACAATTACCCTGAG-TATCTGAAGCTCCAAATCTCATTTTCCAGTCAAAATCTCTGATAGGTAAACAACCTGAAAAAGTTG-----------CCACAACTCAC-TGAGGTGATAACCTCATTTGCTTAAGAGAATGTAATTGTTTTTATG--ATtttttt------------ s panTro4.chrUn_GL393505 892385 147 - 1195001 AAACAATTACCCTGAG-TATCTGAGGCTCCAGATCTCATTTTCCAGTCAAAATCTCTGATAGGTAAACAACCTGAAAAAGTAG-----------CCACAACTCAC-TGAGGTGATAACCCCATTTGCTTAAGAGAATGTAATTGTTTTTATG--ATTTTTTT------------ i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 I 284 s ponAbe2.chrUn 66596143 147 - 72422247 CAACAATTACCCTGAG-TATCTGAAGCTCCAGATCTCATTTTCCAATCAAAATCTCTGACAGCTAAACAACCTGAAAAAGTAG-----------CCACAACTCAC-TGAGGTGATAACCCCATTTGCTTAAGAGGATGTAATTGTTTTTATG--ATTTTTTT------------ i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67493984 146 - 121039945 AAACAATTACCCTGAG-TATCTGAAGCTCCAGATCTCATTTTCCAGTCAAAGTCTCTGATAGGTAAACAACCTGAAAAAGTAG-----------CCACAACTCAC-TGAGCTGATAACCCCATTTGCTTAAGAGAATGTAATTGCTTTTATG--ATTATTT------------- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24238718 157 + 170124641 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AAACAATTACCCTGAG-TATCTGAAGCTCCTGATCTCATTTTCCAATCAAAATCTCCGATAGGTAAACAACCTGAAAATGTAA-----------CCACAACTTAC-TGGGGTGATAACC-CATTTGCGTAAGAGAACGTAATTGTTTTTATG--AGGTTT-------------- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13402143 161 + 40214260 AAAAAATCACCCTGAA-TACCTGTGGATCTAGAGCTCCTCTTCCAACCAAAATGTATGTCAAGTAAAAAA-CTGAGAAAGTAG-----------CTACAGTTCACTTGGACTGATAACCTCATTTGCTTAAGAGAGCACAATCATTTTCAAGGCATCTTTTTTTTCCTTCTTTT i canFam3.chr30 I 400 C 0 e panPan1.JH650621 3540872 2134 + 12672142 I e otoGar3.GL873530 122063 2029 + 36342412 I a score=254324.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 3809 77 + 158759 tatcccaggaaaaca-----ttgaaaaaaagtttagagatgatg------aagtatatgaaaactataacatttatactttagagatg s panTro4.chrUn_GL393505 892816 77 - 1195001 tatcccaggaaaaca-----ttgaaaaaaagtttagagatgatg------aagtataggaaaactataatatttatactttagagacg i panTro4.chrUn_GL393505 I 284 C 0 s ponAbe2.chrUn 66596290 77 - 72422247 AATCCCAGGAAAACA-----TTGAAAAAAAGTTTAGAGATGATG------AAGTATATAAAAGCTATAATATTTATACTTTAGAGATG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67494130 77 - 121039945 TATCCCAGGGAAACA-----TTGAAAAAAAGTTTAGAGATGATG------AAGTATATGAAAACTATAATATTTATACTTTAGAGATG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24238876 77 + 170124641 tatcccaggaaaacc-----ttgaaaaaaagtttagagatgatg------aagtatatgaaaactataacatttatactttagagatg i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 24005945 77 + 171882078 tatcccaggaaaacc-----ttgaaaaaaagtttagagatgatg------aagtatatgaaaactataacatttatactttagagatg i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 21353603 77 + 162156779 tatcccaggaaaacc-----ttgaaaaaaagtttAGAGATGATG------AAGTATATGAAAACTATAACATTTATACTTTAGAGATG i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s chlSab2.chr26 21940366 77 - 58131712 aatcccaggaaaacc-----ttgaaaaaaagtttagagatgatg------aagtctatgaaaactataacatttatactttagagatg i chlSab2.chr26 I 1 C 0 s calJac3.chr10 24180480 77 + 132174527 TATCCCAAGAAAATA-----TTAAAAAAAAGGTTAGAAATCATG------AAGTATATGAAAACTATAATATTTACACTTTAGAGATA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13402304 88 + 40214260 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tgatatttatttataattgtattagtatttaaa----tatagattagcattttacattccaattttaaatgtgtaacagaatattttagatattggggttttttt--agttgaaattataagtggttttaccgag------------------------------ttgccagtagtggttt-aacattgaagataatttaagattcatgattttgtgagtttaatttatt------------------------------------------------------------agctctataagggttgtttaagtactct-gaaggctttatttgttagtctgataactaaaatcttcacaaagataattcaacatattaaatttataaatgtagttta i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66596367 295 - 72422247 TGatatttatttataattgtattagtatttaaa----tataGATTAGCATTTTACATTCCAATTTTAAATGTGTAACAGAATATTTTAGATATTGGATTTTTTTT-TAGTTGAAATTATAAGCAGTTTTACCGAG------------------------------TTGCCAATAGTGGTTT-AACATTGAAGATAATTTAAGATTCATGATTTTGTGAGTTTAATTTATT------------------------------------------------------------AGCTCTATAAGGGTTGTTTAAGTACTCC-GAAGGCTTTAATTGTTAGTCTGATAATGAAAATGTTCACAAAGATCATTGAACAT-----ATTTATAAATGTAGTTTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67494207 301 - 121039945 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tgatatttattcataattgtatttgtatttaac----tatagatttgcattttacattccaattttaaatgtataacagaatattttagatactggttttctttt--agttgaaattataagcggttttaccgag------------------------------ttgccagcagtggttt-aaccttcaagataatttaagattcatgattttgtaagtttaatttatt------------------------------------------------------------agctctataagggttgtttaagtactctggaaggttttatttgttagtccggtaattaaaatgttcacaaagataattgaacatattaaatttataaatgtag-tta i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21353680 303 + 162156779 TgatatttattcataattgtatttgtatttaactatttatagatttgcattttacattccaattttaaatgtataacagAATATTTTAGATACTGGTTTTCTTTT--AGTTGAAATTATAAGCGGTTTTACCGAG------------------------------TTGCCAGCAGTGGTTT-AACCTCCAAGATAATTTAAGATTCATGATTCTGTAAGTTTAATTTATT------------------------------------------------------------AGCTCTATAAGGGTTGTTTAAGTACTCTGGAAGGTTTTATTTGTTAGTCCGATAATTAAAATGTTCACAAAGATAATTGaacatattaaatttataaatgtag-tTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21940443 301 - 58131712 tgatatttattcataattgtatttgtatttaaatatttatagattagcattttacattccaactttaaatgcataacagaatattttaaatactggttttctttt--agttgaaattataagcggttttaccgag------------------------------ttgccagcagtagtttaaacctgtgagataatttaagattcatgattttgtaagtttaatttatt------------------------------------------------------------agctctataagggttgtttaagtactttggaaggt----tttgttagtctgataattaaaatgttcacaaagataattgaacatattaaatttataaatgtagttta i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24180557 295 + 132174527 TTATATTTATGCATAATTGCATAAGTATTTAAATATTTATAGATTAGCATTTTACATTCTAATTTGAAATGTGTAACAGAATATTTTAGAT-----TTTTTTTTT--AGTTGAAATTTTAAGTGGTTTTACTGAG------------------------------TTGCCAGTAGTGGTTT-AACATTTAAGATAATGTAAGATTCATGGTTTTGTGAGTTCAATTTATT------------------------------------------------------------AGCTCTATAAGGG----TTAAGTACTCTGGAAGGTTTTGTTTGTTAGTCTGATAATTAAAATGTTCACAAAGATAATTGAACATATTAAATTTATAAATGTAGTTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e panPan1.JH650621 3540872 2134 + 12672142 I e otoGar3.GL873530 122063 2029 + 36342412 I e canFam3.chr30 13402392 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AAATCTTTAAGGGAGTTTAATTAACTAAGTTGTAAATGGAAGCAAACATTAATCAAAGTTCCCCTTAAAAA-TAATTTTAAATGTACTAGATTTATAAATAGAACAATAAGATTTCTAATTTAAACACAAAACTTTGAATGGTTGGTTAAAAA-GTTAACATAATGTGCTTCACATTAATTTAAAATA-TGAAACC-TTATACATAGTCCTTTTTACATTCAAGAATCACACTGA--AAAAATCACAAAATGCCCACTGGTAACTGCCATGAAACTCTGTAAGCAATTGATCTTGTATGAATTTTACTCCTCTAATGATTTGAAGATCATGTATCAATTCTTTCTTCTTCTTATTTTGTTTTCA---- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13403761 350 + 40214260 AAAGCtttaagtgatttttattaactaaattggaaacggaaccaaacatttacaaaaatcccccttaaaaattatttttaaatatatgaattttataactag---aataaGTTTTCATTTTTAAACTCCAAATTT-----AAGTGTTTTAAGTTCTTATTTTAATATGCTGCACATTAATGTAAAATATTGAAATCATTGTCAATAATCCTTTTTATACTAAAAAGAAATAGTAAGAAAACACCCCAAAATGCCCATTTACAGTTGCTATAAAACACTTTGAGCCATAGGTCCTGTAGAAATTTTACTCTCT--ATAATCTGAAGATCATGCATCATTTCTTTCTTCTTGCtattttttt-------- i canFam3.chr30 I 1369 C 0 e panPan1.JH650621 3540872 2134 + 12672142 I e otoGar3.GL873530 122063 2029 + 36342412 I a score=155186.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 4547 79 + 158759 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ponAbe2.chrUn C 0 I 1 s nomLeu3.chr6 67494942 285 - 121039945 tgttcctt--cgcttgctttctgaggacgccctactctgaaaggcagtagctttcaataaactatgtcttcttctcattgtactctgtgactcacgctgaattctttgctgtgtgaggcccaagaaccctctcttaaagtctggatcaggactcctttttccagtaacaCTAGTGCtgttataattaggtaaatgttactcacacctgaaacatgcagcataaatgattgaatttcatttctacacaacattttttccccttaaactgacaatttttaa---aaattttt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24239674 281 + 170124641 cgttcctt--tgcttgctttctgaggacaccctactctaaaaggcagcagctttctataaactatgtcttcttctcattgtactctgtgactcaccttgaattctttcctgcttgaggcccaagaaccctttcttgaagtctggatcaggacccctttttccagtaacaCTAGTactgttatagttaggtaaatgttactcacacctgaaatatggggcataaatgattgaatttcatttctacaca----tttttccccttaaactgacaattttttt---aaattttt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24006748 281 + 171882078 cgttcctt--tgcttgctttctgaggacatcctactctaaaaggcagcagctttctataaactatgtcttcttctcattgtactctgtgactcaccttgaattctttcctgcttgaggcccaagaaccctttcttgaagtctggatcaggacccctttttccagtaacaCTAGTactgttatagttaggtaaatgttactcacacctgaaacatggggcataaatgattgaatttcatttctacaca----tttttccccttaaactgacaattttttt---aaattttt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21354449 281 + 162156779 CGTTCCTT--CGCTTGCTTTCTGAGGACACCCTACTCTAAAAGGCAGCAGCTTTCTATAAACTATGTCTTCTTCTCATTGTACTCTGTGACtcaccttgaattctttcctgcttGAGGCCCAAGAACCCTTTCTTGaagtctggatcaggacccctttttCCAGTAACACTAGTACTGTTATAGTTAGGTAAATGTTACTCGCACCTGAAACATGGGGCATAAATGACTGAatttcatttctacaca----ttttttcccttaaactgacaatttttta---aaattttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21941173 281 - 58131712 cattcctt--cgcttgctttctgaggacaccctactctaaaaggcagcagctttctataaactatatcttcttctcattgtactatgtgactcaccttgaattctttcctgcttgaggcccaagaaccctctcttgaagtctggatcgggacccctttttccagtaacaCTAGTactgttatagttaggtaaatgttactcacacctgaaatatggagcataaatgattgaatttcatttctacaca----ttttttcccttaaactgacaatttttta---aaattttt i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24181262 275 + 132174527 ggctcctt--cac-tgctttctgaggatgccctactctagacggcaatagctttcaataaactat---ctcttctcattgtactctgagactcaccttgaattctttcctgtgtgaggcctaagaaccctctcttgaagtctggatcaggacccctttatccagtaacaCTAatactgttttaattaggtaaatgttacttacacctgatacatggaggataaatgattaaatttcatttctacacaacgttttt-----ttaaactggcaattttt-a---aaattttt i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13404149 152 + 40214260 ccttcctcaatgcttgttatataa---------------aatggcaata---tccaa-----------ttccttccattgca-tttgt--------------------------------------ccctcctctgaag---aaat---------ttctttcaattaatttagcaatgcttt----------------------------------------------tgaattttacttctata------tct------ctaaaataatagtctaatactgaaactatt i canFam3.chr30 C 0 C 0 e panPan1.JH650621 3540872 2134 + 12672142 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I a score=908529.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 4910 241 + 158759 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otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=242387.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 5259 111 + 158759 gtttggttggagat-actattctgcattagaaataa-tttgtttttcaatttataaggctttg----cttgttttctagtgaccatttatat--ttctcttctctggaaattttaagtg s panTro4.chrUn_GL393505 894229 111 - 1195001 gtttggttggagat-actattctgcattagaaataa-tttgttttgcaatttataaggctttg----cttgtcttctagtgaccatttttat--ttctcttctctgaaaatttgaagtg i panTro4.chrUn_GL393505 I 2 C 0 s ponAbe2.chrUn 66597734 111 - 72422247 gtttggttggagat-actattctgcattagaaataa-tttgttttgcaatttataaggctttg----cttgtcttccagtgaccatttttat--ttctcttctctggaaatttgaagtg i ponAbe2.chrUn I 2 C 0 s nomLeu3.chr6 67495578 111 - 121039945 gtttggttgggcat-accattctgcattagaaataa-tttgttttgcaatttataaggctttg----cttgtcttctagTGACCATTTTTAT--TTCTCTTCTCTGGAAATTTGAAGTA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24240307 105 + 170124641 gtttggttgcgcat-act-------attagaaataattttgttttgcaatgtataaggcttta----tttatcttccagtgaggatttttat--ttctcctctctggaagtttgaagta i 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i papAnu2.chr7 I 295 C 0 s chlSab2.chr26 21943044 2107 - 58131712 atttccccgccacttgcaattttgcactttttggtaagctaagtcagttaccagccatttatggacttcctattttcaaaaatgttgctgttTTATTTTTTTATCACTTCAAT-AGCCATTTGCCATCACGTTATAGTTTGAG-TGGGAAAATAAGTCTCTATATGTGTTTAACATGCCATATTTGCTCAGGTGTCTGCATCTACTCTCACCATTTTTTGAAGAGAGGTTAACTTGTTATGGCACTAACAACTAGtgctcaaaatttggtttagaatttttaatggtgtttattttcaacaaaattggtagagttctttt--ctttgtacattgatttttcttttggttttcagttgttttaagaaataaatggagggagagatatgcttcctttgctcccattaaccaaaagaatagtttgaacaacacaggaattaacttttccattaagtttaagaggatctgcttgagacacaactgggccttgagcttttaaaggtgctacaactttatacctgttacatttttttctattgttggtatcttcaaatgttctcatttacctagatttatttttatagttaaattttccctaaaacattaacctcttcatatatattttcaaatataatgaccaaaagttacatattgcattcttttgaaaattttcaattatccagtttttcatttttcttgttgtattttaatatgctctctcttttttgtcatctaatttatttgtcttttcaaagaaacaattttttggatttattgaAAAATTCCATTGTGGTTGGGATGGGAGAAAAGTAAATCCTTTAAATAATAggccaggcatggtggctcatgcctgtaatgccagcactttgggaggccgaggtgggcggatcacttgaggccaggggttcaaggccagcctggctgatatggtgaaaccccttctctactaaaaatacaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggtacgtgcctgtaatctcagctacttgggaaactgaggcacaagaaatcactcaaacccaagaggcggaggttgtagtgagctaagattgtgccactgccctccagcctgggtgacagagcaagactctgtct--------caaa-------------------------------aaaaaaaaaaTCTTTAAATAATAGCATATTGT---TTTGCAGATTATAAGATCAATAGATATTTATTGTAAAATGCACAAATAGTGCAACATTTCTTAAAGTAGACAGTGAAGTACTTCATGTCGCCATCTTTCTCCAAGAGGTACTATTGGGCCTTCATACTAAGCAATTCTTCCTTATATAGGACTGTTTGGCTCAATGCACTGTCTGGCCCAATGCATGCTGCATGTGATCTGTACCCTCTACTTGGTAAGTGCTTGTCATGTCTCCATCATTGATACAACCAAAAATAACCTACATTTCCAAAATCACTTCAAAGGAATAGTCCTGAGAAAGAGTTGAAAATTCTCAACTCCTCAGAGTGGATCTCTATTAAATAATTGAACAAGTATGCTAACTAATATTTGCAAAGCTGTTCACTATACAAGTTTATAAAAAAATGCAAAGATGGTAATGTCTTAAATTTTCAATAGATATGTTTTATAAAAA-TACTGGTAAAAATGAACATTTTACAGTCATTTTAAATGATGGCAAGATGTGCAATGTATTTTTGAATGAAATGTCAGGTCACTACAAATCATAATTAGCCTAATCTCATTTTTTAAAAAAGGTACACATATGCCTTTTATGAGTGAAAGTATTTGAGTTCTAATTAAATTTTTGTTGGTGGATTTCTAAGGAATAGAGGAATTGGTGAGGCAAGTGGGATTGTAGAGAGAGGGAGATTCCAATTTACATTTAATTCACTCCCAGACTGTTTGAGTTTTTCTAATAAAACATTATAAAATGTTATATAATTTAGACTATGATCACTTAAAAAC-----TTTCAATTAAAAGGAAATTTTTAAAAAGAGAACTATCAAATGACTACTACAGCTATCATAGTTTCATAAATGACTTTTTCCTTCCTTCATGTTGTGTTAATGGGTGCCCACTAGGTCA----------AGACCCA----GATTTGACACTGGGTACAGTCAGGATATAAGTATCAAAACAGGAGATT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 e gorGor3.chr7 99320580 23650 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e canFam3.chr30 13405216 4140 + 40214260 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=690948.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 8605 257 + 158759 ACCTATCTGGATACCCTAGCTTCTCC--ATTCCTGAGCAAGTTGGGAGGCCATGGGGTACAACTCTCTCAATATGTACTAAGGAAACAGAGATACTTTTGCCAAAGGATATTCTTCTTGATGGTAAAA-------ATATTAGCTAACATTTGTTAGCTGACAAAAATGAAGTAtattaaatatgctaagggaaactgtggttcaagtgatagagatttttaattctttttgagatcatgtaattatacccatg--acaaggtaagttt s panTro4.chrUn_GL393505 897559 257 - 1195001 ACCTATCTGGGTACCCTAGCTTCCCC--ATTTCTGAGCAAGTTGGGAAGCCATAGGGTCCAACTCTCTCAATATGTACAAATGAAACAGAGATACTTTTGCCAAAGGATATTCTTCTTGATGGTAAAA-------ATATTAGCTAACATTTGTTAGCTGACAAAAATGAAGTATATTAAATATGCTAAGGGAAACTGTGGTTCAAGTGATAGAGATTTTTAATTCTTTTTGAGATCATGTAATTATACCCATG--ACAAGGTATGTTT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66601132 257 - 72422247 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TTGTTTTAAAGTGTGAAAATTAATATTGAATTATTGTGTTTA---TATAATATGGTGTCCTATAATTTCTGTTTGGAATATAAAATCAGCAACTAATATGTAT-TTTCAAAACATTATAAATAAAGAGTGCTAAGTAAGTGACTTCAGTGTGAAATGTAGTCATAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246297 151 + 170124641 TTGTTTTAAAGTGTGAAAATTAATACCGAATTCTTGTGTTTA---TATAATATAGTGTCCTATAATTTCTGTTTGGAATATAAAATCAGCAACTAATATGTAG-TTTCAAAACATT----ATAAAGAGTGC----TAAGAGACTTCAGTGTGAAAT---ATCATAT i rheMac3.chr7 I 289 C 0 s macFas5.chr7 24013377 155 + 171882078 TTGTTTTAAAGTGTGAAAATTAATACCGAATTCTTGTGTTTA---TATAATATAGTGTCCTATAATTTCTGTTTGGAATATAAAATCAGCAACTAATATGTAG-TTTCAAAACATTATAAATAAAGAGTGC----TAAGAGACTTCAGTGTGAAAT---ATCATAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21361050 155 + 162156779 ttgttttaaagtgtgaAAATTAATACTGAATTCTTGTGTTTG---TATAACATGGTGTCCTATAATTTCTGTTTGGAATATAAAATCAGCAACTAATATGTAG-TttcaaaacattataaataaagaGTGC----TAAGTGACTTCAGTGTGAAAT---ATCATAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21947488 155 - 58131712 TTGTTTTAAAGTGTGAAAATTAATACTGAATTCTTTTCTTTA---TATAATATGGTGTCCTATAATTTCTGTTTGGAATATAAAATCAGCAACTAATATGTAG-TTTCAAAACATTATAAATAAAGAGTGC----TAAGTGACTTCAGTGTGAAAT---GTCATAT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13411245 161 + 40214260 TTGCTGTAAAATATGAAAATAAATATTGAATTATCATGTTTAATTGATACTACAGTGCCTTATCTATTCTG-TTAGCATATAAAATCATTAACCAATATAGATATTTTAAAATACTGCAAATGAGTGGTAC----TAAGTAAATTTAATGTAAAATGCTGTCATAT i canFam3.chr30 C 0 C 0 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=212442.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 11098 95 + 158759 AAAGAATATAATAATTATACTGGATTATT----TTTAAATGGGCTGTCTAACATTATATTAAAAGGTTTCATCAGTAATTAATTATATCAAAATGCTCC s panTro4.chrUn_GL393505 901689 95 - 1195001 AAAGAATATAATAATTATACTGGATTCTT----TTTAAATGGGCTGTCTAAGATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTATATCAAAAAGCTCC i panTro4.chrUn_GL393505 I 1616 C 0 s ponAbe2.chrUn 66603634 91 - 72422247 AAAGAATATAATAATTATACTGGATTCTT----TTTAAATGGG----CTCACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTATATCAAAATGCTCC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67501373 95 - 121039945 AAAGACTATAATAATTCTACTGGATTCTT----TTTAAATGGACTGTCTAACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATCATATCAAAATGGTCC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246448 90 + 170124641 AAAGAATATACTAATT-TACTGGATTCTT----TTTAAATGGT----CTAACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTAAATCTAAAAGCTCC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24013532 90 + 171882078 AAAGAATATACTAATT-TACTGGATTCTT----TTTAAATGGT----CTAACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTAAATCTAAAAGCTCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21361205 90 + 162156779 AAAGAATATACTAATT-TACTGGATTCTT----TTTAAATGGT----CTAACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTAAATCTAAAAgctcc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21947643 90 - 58131712 AAAGAATATACTAATT-TACTGGATTCTT----TTTAAATCAT----CTAACATTATATTAAAAGGTTTCCCCAGTAATTCATTAAATCAAAATGCTCC i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13411406 97 + 40214260 AAAGAATGCAATAATTTTGGCAGATTCTCTTTATTTAAATAGAATCACTAACAT--TTTTAAAAAACTTTCTCCGTTATTCATTATCTAAAAATGTTCC i canFam3.chr30 C 0 I 11 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=712164.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 11193 315 + 158759 Aggccgggcgtggtggcttatgcctgtaatcccagcactttgggaggtcgaagtgggcggatcacttgaggtcaggagttggagactagcctgaccaacacgatgaaaccccgtctctaataata--aaaaa-aaaaaattagctgggtgtggcggtgggcaactgtaatctcagctaatcaggaggctgaggcagaagaattgcttgaacttggaaggcagagtttgcagtgtgccaagatcacaccacccca-ctccaacctgggtgatagagcaagactcagtctcaaggaaaaagaaaa----------GCTCGAAAAATGTTTG s panTro4.chrUn_GL393505 901784 316 - 1195001 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Aggccaggtgtggtggcttatacctgtaatcccaacactttgggaggccaaggcaggcggatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctaataaa---aatac-aaaaaattagctgggtgtgatggtgggcaactgtaatctcagctaatcaggaggctgaggcaggagaattgcttgaacttggaaggcagaggttgcagtgtgccaagatcatgccaccccatctccggcctgggtgatagagcaagactcagtctcaaggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGCTCGAAAAATGTTTG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246538 314 + 170124641 Aggccaggcgtggtggctcacgcctgtaatcccagcacttcgggaggctgaggcaggcggatcacttgaggtcgggaatttgagaccagcctggccaacatggtgaaacctcgtctctaataaa---aatac-aaaaaattagctgggtgtggtggtgggcacctgtaatctcagctaatcaggaggccgaggcaggagaatttcttgaacttggaaggcagatgttgcagtgtgccaaaatcatgccacccca-ctctggcctgggtgatagagcaagactca-tctcaagggaaaaaaGGA---------AGCTCGAAAAATGTTTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24013622 314 + 171882078 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Aggccaggcatggtggctgacgcctgtaatcccagcacttcaggaggctgaggcaggcggatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccgtctctaataaa---aatacaaaaaaattagctgggtgtggtggtgggcacctgtaatctcagctaatcaggaggctgaggcaggagaatttcttgaacttggaaggcagaggttgcagtgtgccaaaatcatgccacccta-ctcgggcctgggtgatagagcaagactcagtctcaaggaaaaaaaaga---------aGCTCGAAAAATGTTTG i chlSab2.chr26 C 0 C 0 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e canFam3.chr30 13411503 11 + 40214260 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=226476.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 11508 93 + 158759 CTTATTTTGGTAAAATTATTCAATGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCATATTTCATTTTTAGAAATTACATATTAAAGATCTAAAA s panTro4.chrUn_GL393505 902100 88 - 1195001 CT-ATTTTGGTAAAATTACTCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCATATTTCATTTTTAGAAATTACATATTAAAGAT----AA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66604041 93 - 72422247 CTTATTTTGGTAAAATTATTCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGGAAACTGTCCATATTTCATTTTTAGAAACTACACATTAAAGATCTAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67501793 93 - 121039945 CTTATTTTGGTAAAATTATTCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCATATTTCATTTTTGGAAATTACATATTAAAGATCTAAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246852 90 + 170124641 CTTATTTTTGTAAAATTATTCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCACATTTTATTTTTAGAAATTACATATTAAAGATCTA--- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24013936 90 + 171882078 CTTATTTTTGTAAAATTATTCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCACATTTTATTTTTAGAAATTACATATTAAAGATCTA--- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21361610 90 + 162156779 cttatttttgtaaaattattcatTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAActgtccatattttatttttagaaattacatATTAAAGATcta--- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21948049 90 - 58131712 CTTATTTTTGTAAAATTATCCATTGACTATGCTCAGAAATCAAGCAAACTGTCCATATTTTATTTTTAGAAATTACATATTAAAGATCTA--- i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13411514 78 + 40214260 CTTTCTTTGGTAAAATTAT-------------TCAGGAGTCAAGAAAATTGCCCGAACTTA--TTTTAGAATTTATAGATTAGAGTTCTAAAA i canFam3.chr30 I 11 C 0 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e calJac3.chr10 24181774 1302 + 132174527 I a score=100087.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 11601 35 + 158759 CAAAGGATAAA----ATATCTGCAAAAATATTTGCATTT s panTro4.chrUn_GL393505 902188 35 - 1195001 AAAAGGATAAA----ATATATGCAAAAATACTTGTATTT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66604134 35 - 72422247 CAAAGGATAAA----ATATATGCAAAAATATTTGTATTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67501886 35 - 121039945 CAAAAGATAAA----ATATATGCAAAAATATTTGTATTT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246942 34 + 170124641 -AAAGGATAAA----ATATATGCAAAAATATTTGTATTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24014026 34 + 171882078 -AAAGGATAAA----ATATATGCAAAAATATTTGTATTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21361700 34 + 162156779 -aaaggataaa----atatatgcaaaaatatttgtattt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21948139 34 - 58131712 -AAAGGATAAA----ATATATGCAAAAATATTTGTATTT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24183076 39 + 132174527 CAAAGGATAAATTATATTTATGCAAAAACATTTGTATTT i calJac3.chr10 I 1302 C 0 s canFam3.chr30 13411592 19 + 40214260 -------CAAA----GTGTA---------ACTTACATTT i canFam3.chr30 C 0 I 21 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I a score=321771.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 11636 103 + 158759 CTGGATAAATTAGTTTCCTGATTTAACTCCTTG----TTGACACTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGACAAAGAAAGAAATTCAAAAT s panTro4.chrUn_GL393505 902223 107 - 1195001 GTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGACAAAGAAGGAAATTCAAAGT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66604169 103 - 72422247 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGACAAA----GAAATTCAAAAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67501921 107 - 121039945 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCAATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGAGAAAGAAAGAAATTCAAAAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24246976 103 + 170124641 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGAC----AAAGAAATTCAAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24014060 107 + 171882078 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGACAAATAAAGAAATTCAAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21361734 107 + 162156779 ctggatAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTGTTTtaaattaaacaaggcgctgataaaacaaaagacaaataaagaaattcaaaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21948173 107 - 58131712 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTTAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAGGTGCTGATAAAACAAAAGACAAATAAAGAAATTCAAAAT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24183115 107 + 132174527 CTGGATAAATTAGTTTCCTGAGTAAACTCCTTGACTGTTGACATTGAATCTATTTTAAATTAAACAAAGTGCTGATAAAACAAAAGACAAAGAAAGAAATTCAAAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e gorGor3.chr7 99344236 3265 - 158137892 I e otoGar3.GL873530 124174 14031 + 36342412 I e canFam3.chr30 13411611 21 + 40214260 I a score=245877.000000 s 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s panTro4.chrUn_GL393505 904867 1046 - 1195001 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i panTro4.chrUn_GL393505 I 3 C 0 s ponAbe2.chrUn 66606668 1050 - 72422247 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i ponAbe2.chrUn I 3 C 0 s nomLeu3.chr6 67504442 1048 - 121039945 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i nomLeu3.chr6 I 3 C 0 s rheMac3.chr7 24249818 1040 + 170124641 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i rheMac3.chr7 I 3 C 0 s macFas5.chr7 24016897 1041 + 171882078 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i macFas5.chr7 I 3 C 0 s chlSab2.chr26 21950720 1050 - 58131712 aaccaatccaagtgaatagattaaaaaaaaaaactgtggtattactatacaatggaatatggcaattaaaaagagaaaagactgagtc-----aaattaaaactgaaaaagtagacattgcgattgatgccacagaaataaac-aagactgtaagagactgctgtgaatgattatagtagtaactgggtaacctagaaacaaatcagagattactggaaatacacaacctataacaccgaatcaagaagaaatacaaaatatgaacaaatctctagctagtaaggtgtttaaatcagtaatcaaaaatcttcctgcaaagaaaaatctcaggcgcagatgactttgctagagaattctgctaacatttaaggaagaattaatgccaatatttctcagacattcctaaaaaactaaagaagaaagaacaattctaaactctttttgtgaatctagcgtaaccccaatatcaaagccagacaatggcactacaagaaaaaaaa----aaatt-aaatattcctaatgaatgtagatgc-aagatccacaacaaataccagcaaattgaattcaacagcactttaaagtatcatccgctataattatgatggatt-tagtc--------caagaagggtt---catgtgaaa----atcaatataataaaccacattaacaaaacaaataattaaaatcacatgttcacctccatagatggagaaagagtatttgaggaaattcaacattctttcatgagaaaaacacttgaaaaaacaggaatagaag-gaaattattccaacagaataaagggcatatgtaaaaagcccacagctcacgtaatattaatgaagaaaaactgaaatatcttcttctaagat--ggatcaggaacaaggcaaggatgcctttatgaagtacataaagtcccagctaaaataattaagcaagaaaaagatataaaaggcatccaaattggaaaggaagaagtaa----aattttctctattcacagaaaacatcatcttatatatataaaaaaaaaaacgctaaagattcaacaaaaaatttcttagaactaataaaat i chlSab2.chr26 I 3 C 0 s calJac3.chr10 24185771 1046 + 132174527 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i calJac3.chr10 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17095508 1115 - 38611459 I e canFam3.chr30 13414194 3028 + 40214260 I e papAnu2.chr7 21363980 3502 + 162156779 I a score=-1155.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 15195 1 + 158759 t s panTro4.chrUn_GL393505 905913 1 - 1195001 g i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66607718 1 - 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67505490 1 - 121039945 g i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24250858 1 + 170124641 g i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24017938 1 + 171882078 g i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21951770 1 - 58131712 c i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24186817 1 + 132174527 t i calJac3.chr10 C 0 C 0 s otoGar3.GL873529 17096623 1 - 38611459 T i otoGar3.GL873529 I 1115 n 1115 e canFam3.chr30 13414194 3028 + 40214260 I e papAnu2.chr7 21363980 3502 + 162156779 I a score=1111885.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 15196 538 + 158759 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I e papAnu2.chr7 21363980 3502 + 162156779 I e ponAbe2.chrUn 66608506 49 - 72422247 I a score=257.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 16091 5 + 158759 ggaag s canFam3.chr30 13417222 5 + 40214260 ggaac i canFam3.chr30 I 3028 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24251620 0 + 170124641 C e calJac3.chr10 24187364 0 + 132174527 C e chlSab2.chr26 21952540 991 - 58131712 I e papAnu2.chr7 21363980 3502 + 162156779 I e macFas5.chr7 24018703 0 + 171882078 C e nomLeu3.chr6 67506313 0 - 121039945 C e ponAbe2.chrUn 66608506 49 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 906758 0 - 1195001 C a score=-1621.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 16096 6 + 158759 -gaaagc s panTro4.chrUn_GL393505 906758 3 - 1195001 ----agc i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66608555 6 - 72422247 -taaagc i ponAbe2.chrUn I 49 C 0 s canFam3.chr30 13417227 6 + 40214260 tgaata- i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24251620 0 + 170124641 C e calJac3.chr10 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cataca--atgaaaaattattcagacttaggaaaggaaatattttta------------------------------tgtgcta---------------------------------catgattcaacttacaagaaatatctaaattagtcaaactcatagacacaaagagtaaaatgttgtttgccaggggctggcaggagagagaaa---------tgttgttcaatggttacagagtttcaattaag-aagataaataagttctagagatctactgtacaacaacatgcatatagttgacaataatgtcatttacacttaa-ataattttaagagggtaga-tttcatgctgtgtt-tcttaccataataaaaaaaaaatctgtccatattgagcttatattttagtgggaaaagatgaagtagta----aataatagtgacaaatgctgcaaggatgttaggagcaagagaagaaactaaggatatgt--gtgcaagtttagtgagtaaatatttctgtgttaaactggcatatgagcaaagaacttgagggcagtaaggaagtaagccatgtggaacgcccaaggcatccagcaaggcatgcagagaaaacagcaaggataaagaccctgaattggaatcatgcttcacttatttcaaaacaacagcaatgacaccagagtgactga-caggagtgagcaatggggaggttgaagattttttcagagaggcagttgagggacaggatcctgtacaggcttgtaagcttggcaagaactttgaattttaatctggataggataggaagccactgatagcagaacaatgtgtttcagcagaagagtcaaattatctgctttatatttcaacaaggtcactgtac---ctactctacggagtagaga--ctatagtgcaaagctagcagcagagagaccagttaggtgcttat-----tactcttaggtgagaaatAGTACAAATGATACGAGGTCATC---AGCCTCCAACTGCCATTTCTTCTGGACATTAGAGCTCA------------------AAGGCTTCCTCACAGTTTCCACATTCACTTCTTAGGTGCAAACATGAACCCTTCACT-TGTGTGACACCTTAGATCTGGATTCTGGTTAGGGAGATAGCAGTCCACTCCAGTTTGTTATCCTGCCAGAATTTATACTGCAAATGTTTCGATATT-ACTAATATGATAATACAGA--GGTTAGAGGAATGGTGAAGAGGG-----CCAAATCCTCT--CTGTACCAAGACCAGAAGAATAGGAGTACATCTATATAGTTTCCCTATTGGCATAGGTCCTTATATTTTGTCAGGAAACAA--TAATAGGGCTATATAAAGGGCTTCTCTACTTATTTTCAGGATGTCTTTTCTTTGTCATAAAAAGAAGCCACAGCATTT-TTGCTTCTAATTGTTACTTTTCATGAAGCCACCACAA--ACTCACTAAATTATTGATG-Gtctcctcaaattgcagcatgatgttgacttacattctaa 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chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24191052 271 + 132174527 ACTTATTTTGAACTGATTATAGTGTGCCCACTGAAAATCCCTCAGATTTATACATTGAAATCCTAACTCTTAATGTGTTGGTA---------------ttgggaggtaatcaggttgtgaagatgaagccctcatcaaaggaaagtagtgcccttctaagaagagacaca--agggatttttttctccatcatgtaagaatacagtaagacagccagctgtaaaccaggaagacagctttcaccaagaacccaaccatgttgactccctagtctcagatttctactct i calJac3.chr10 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e canFam3.chr30 13420836 37 + 40214260 I a score=1834944.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 20001 584 + 158759 acggatctgtgaaaaacaaatgtttattgtttt----actcaatctgtgttttccgttatagcagcccacattgactaagaAAATACTAAACCCTTTATTTGATAGATAAAGATAGTATCAGACAAGGTAT---CATATGAGTAAAAACCTAAGATTTATGTGTGATCATTTTACATTGGAGCAGCTACTGAAACTTGAGACCAAAACCACTAGCTAACATCAGTATGTCAACCCAAAACATTTGGGACAGTAATGAAGATACAGCAAATGAATTGTTTTAATATATAATCAAGTCAAAGTTATCCTCAGAATT-ATAGG-AAAAAATCCACTAAATTTGGTTTATGAGAAATTCATGGTTCATTGTATACCTTGATACTGGGCTTAAAGCAGCAATCCTAATTCCAGATCTACCTTCAAGTCTGGGTCAGTGTTCTCAAATGCTGCCAGTTTCATGTCAGGACCGGCTTAATATTGAAGGTAAC--TGAGCATTGCTAATGTCTGACTGGAGCTGAAAGAGGCC---AAAAGCAGGGTTATAACTTTGGGAAAACTGACCTGGTGTTAACTTCCATGCCTTCCATTTCAAACGGGAA s panTro4.chrUn_GL393505 910583 587 - 1195001 acagatctgtgaaaaacaaatgtttattgttttagtcactcaatctgtgttttctgttatagcagcccacattgactaagaAAATACTAAACCCTTTATTTGATAGATGAAGACAGTATCAAGCAAGGTAT---CATGTGAGTAAAAACCTAAGATTTATGTGTGATCATTTTACATTAGAGCAGCTACTGAAACTTGAGACCAAAACCACTAGCTAACATCAGTATGTCAACCCAAAACATTTGGGACAGTAATGAAGATACAGCAAAGGAATTGTTTTAATATATAATCAAGGCAAAGTTATCATCAGAATT-ATAGG-AAAAAATCCACTAAATTTGGTTTATGAGAAATTCGTGATTCATTGTATACCTTGATACTGGGCTTAAAGCAGCAAACCTAATTCCAGATCTACCTTCAAGTCTGGGTCAGTGTTCTCAAATGCTGCCAGTTTCATGTAAGGACTGGCTTAATATTGAAGGTAAC--TGAGCATTGC-AATGTCTGACTGGAGCTGAAAGAGGCC---AAAAGCAGGGTTATAACTTTGGGAAAACTGACCTGGTGTTAACTTCCTTACCTTCCATTTCAAATGGGAA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66613727 589 - 72422247 acagagctgtgaaaaacaaatgtttgttgttttagccactcaatctgtgttttctgttatagctgcccacattgaccaagaAAATACTAAACCCTTTATTTGATAGATGAAGATAGTATCAGACAAGGTAT---CATATGAGTAAAAACCTAAGATTTATGTGTGATCATTTTACATTGGAGCAGCTACTGAAAGTTGAGACCAAAACCACTAGCTAACATCGGTATGTCAACCCAAAACATTTGGGACAGTAACGAAGATACAGCAAATGAATTGTTTTAATATATAATCAAGGCAAAGTTATCATCAGAATT-ATAGGAAAAAAATCCACTGAATTTGGTTTATGACAAATTCATGATTCATTATATACCTTGATACTGGGCTTAAAGCAGCAATCCTAATTCCAGATCTACCTTCAAGTCTGGGTCAGCGTTCTGCAATTCTGCCAGTTTCATGTCAGGACTGGCTTAATATTGAAGGTAAC--TGAGCATTGCTAATGTCTGACTGGAGCTGAAAGAGGCC---AAAAGCAGGGTTATAACTTTGGGAAAACTGACCTGGTGTCAACTTCCATCCCTTCCATTTCAAACGTGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67510085 589 - 121039945 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acagatcgttgaaaaacaaatgtttcttgttttagccacggaatctattttttctgttatagcagcccacattgactaagaAAATACTCAACCCTTTATTTGATAGATGAAGATAGTATCAGACAAGGTAT---CATATGAGCAAAAACCTAAGATTTATGTGTGATCATTTTACATTGGAGCAGCTACTGAAACTTGAGACCAAAACCACTAGCTAACATCAGCATGTCAACCCAAAACATTTGGGACAGTAATGAAGATACCGCAAATGAGTTGTTTTAATATATAATCAAGACAAAGTTATCATCAGAATT-ATAGGAAAAAAATCCACTAAATTTAGTTTATGAGAAATTCATGATTCATTGTATACCTTGATACTGGGCTTAAAGCAGCAATCCTAATTCTAGATCTACCTTCAAGTCTGGGTCAGAGTTCTCAAATGCTGCCAGTTTCATGTCAGGACTGGCTTAATATTGAAGGTAAC--TGAGCATTGCTAATATCTGACTGAAGCTGAAAGAGGTA---AAAATCAGGGTTATGACTTTGGGAAAACTGACCTGGTGTCAACCTCCATCCCTTTCATTTCAAATGGGAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24022564 589 + 171882078 acagattggtgaaaaacaaatgtttcttgttttagccacggaatctattttttctgttatagcagcccacattgactaagaAAATACTCAACCCTTTATTTGATAGATGAAGATAGTATCAGACAAGGTAT---CATATGAGCAAAAACCTAAGATTTATGTGTGATCATTTTACATTGGAGCAGCTACTGAAACTTGAGACCAAAACCACTAGCTAACATCAGCATGTCAACCCAAAACATTTGGGACAGTAATGAAGATACCGCAAATGAGTTGTTTTAATATATAATCAAGACAAAGTTATCATCAGAATT-ATAGGAAAAAAATCCACTAAATTTAGTTTATGAGAAATTCATGATTCATTGTATACCTTGATACTGGGCTTAAAGCAGCAATCCTAATTCTAGATCTACCTTCAAGTCTGGGTCAGAGTTCTCAAATGCTGCCAGTTTCATGTCAGGACTGGCTTAATATTGAAGGTAAC--TGAGCATTGCTAATATCTGACTGAAGCTGAAAGAGGTA---AAAATCAGGGTTATGACTTTGGGAAAACTGACCTGGTGTCAACCTCCATCCCTTTCATTTCAAATGGGAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21370413 589 + 162156779 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40214260 C a score=786.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 21455 6 + 158759 cagcag s panTro4.chrUn_GL393505 912038 6 - 1195001 cagcac i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66615180 6 - 72422247 cagcac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67511543 6 - 121039945 catcac i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24024019 3 + 171882078 CAG--- i macFas5.chr7 I 3 C 0 s papAnu2.chr7 21371865 3 + 162156779 cag--- i papAnu2.chr7 C 0 I 3 s chlSab2.chr26 21957853 3 - 58131712 cag--- i chlSab2.chr26 C 0 I 3 s calJac3.chr10 24192782 6 + 132174527 cagtac i calJac3.chr10 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24256933 6 + 170124641 I e canFam3.chr30 13421319 0 + 40214260 C a score=1116588.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 21461 716 + 158759 tgcttccaatttgtgcacacctggctgggcagtgacagcaccctgctgggtcccaaccccactctatgatcagagcacagagccaggaggtgggagagaccaggcagcaggaagaggtgcctccaagcctgcaaggggc---aaggggggcgttcccaggctccccaagagtgcagggatgcctgagtctgcagcattggtttgggtggctgggtggtgggctggggtggggacagagtaggggagttggataaactcccgtctgctccatggagtgggaggtccaggtctacagctacagctgcagtttgggcagctgcagcagcacccagggagctcccattccaactcggaa-gggcagggctcccacttgtcctcatcctgccaaatccagggagcatacaaccccggccacacctctcccctgcagctggcatgatggcagcagccactGCCATcacaatcacagcctattgtagcctcaaactcctgggcccaagtgatctttttacctcagtctccccaatggctggggccacaggcatgt-gccataatgcccatctaa---ttgttttttt-atttttgtagagaaggtggtctggctatattgcccaggttaatctctaattcctggatttaagcagtcttcctgcctcatcctcct-acatggctgggattacaggcaagagcgactgtgcccagcTCCTGATAAATCCTTTCTT s panTro4.chrUn_GL393505 912044 714 - 1195001 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tgcTCCCAATGTGTGCACACCTGGCTGGGCTGTGACAGTGCCCTGCTGGATCCCAACCCCACTCTGACATCAGAGCACAgagccaggagctgggagaggccaggcagaaGGAGGAGGCATCTCCAAGCCTGCAAGGGGCTGGGTggggggggTTCCCAGACTCCCCAAGAGTGCAAGGGTGCCTGAGTCTGCAGCATTGGTTTGGGTGGCTGGGTGGTGGACTGGGGCAGGGGCAGAGTAGGAAAGTTGGATAAATTCCTGTCTGCTCTGTGGAGTGGGAGGCCCAGGTCTACAGCTACAGCTGCAGTttgggcagctgcagcagcaCCCAGGAAGCTCCCATTCCAACTCGGAAGGGGCAGGGCTCCCACTTGTCCCTGTCCTTCCAACTCCAGGGAGCATATAACCCCGGccacacctccccacacctccccaca------cAGCAGCCGCTGCCAtcgcgatcatagctcattgtagcctcaaactcctgaacctAAGTAATCTTTTTACCTCGGTCTCCCCAATAGCTGGGGACACaagcatgt-gccacaatgcccatctaa--tttttttttta-ctttttgtagagaatgTGGTCTGGCTATATTTCCCAGGTTCATCTCTAATTCCTGcccttaagcaatcttcctgcctcatcctcct-aaatggctgggattacaggcatgagcgactatGCCCAGCTCCTGGTAAATCCTTCCTT i papAnu2.chr7 I 3 C 0 s chlSab2.chr26 21957859 722 - 58131712 tgctcccaatgtgtgcacacctggctgggctgtgacagtaccctgctggatcccaaccccactctgacatcagagcacagagccaggagctgggagaggccaggcagcaggaggaggcatctccaagcctgcaaggggctgggtgggggcggttcccagactccccaagagtgcaaggatgcctgagtctgcagcattggtttgggtggctgggtggtggactggggcaggggcagagtaggagagttggataaattcctgtctgctctgtggagtgggaggcccaggtctacagctacagctgcagtttgggcagctgcagcagcacccagtaagctcccgttccaactcagaaggggcagggctcccacttgtccccatccttccaactctagggagcatataaccccggccacacctccccactgcagctggcatgatggcagtagccgctGCCATcacaattatagctcattgtagtctcaaactcctggacctaagtaat-tttttacctcagtctccccaatagctggggacacaagcatgt-gccacaatgcccatctaattttttttttttt-ttttttgtagagaatgtggtctggctatatttcccaggttcatctctaattcctgcccttaagcaatcatcctgcctcatcctcct-aagtggctgggattacaggcatgagcgactatgcccagcTCCTGGTAAATCCTTCCTT i chlSab2.chr26 I 3 C 0 s calJac3.chr10 24192788 703 + 132174527 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panTro4.chrUn_GL393505 912758 7 - 1195001 AATCAAA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66615903 7 - 72422247 AATCAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512266 7 - 121039945 AATCAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21372586 7 + 162156779 AATCAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21958581 7 - 58131712 AATCAAA i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24193491 7 + 132174527 TTTTAAA i calJac3.chr10 C 0 I 1958 s canFam3.chr30 13421319 7 + 40214260 AACCAAA i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24256933 6 + 170124641 I e macFas5.chr7 24024022 0 + 171882078 C a score=8022.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 22184 4 + 158759 GTCT s panTro4.chrUn_GL393505 912765 4 - 1195001 GTCT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66615910 4 - 72422247 GTCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512273 4 - 121039945 GTCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21372593 4 + 162156779 GTCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21958588 4 - 58131712 GTCT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13421326 4 + 40214260 GTCT i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24256933 6 + 170124641 I e calJac3.chr10 24193498 1958 + 132174527 I e macFas5.chr7 24024022 0 + 171882078 C a score=448651.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 22188 236 + 158759 TCATCAGCAGCCTTACTTACCA------CAATCTTCCCAGATGATCTCAAG-TATCCAAGGAAACTAAAAGTAGCTACTGCTGACAAAACTGTTGGGTTCCCTGATACTGTGCAAGAATAAAATGATGCTAGGTCTTCTGTTAGCTAGCTCTTCTTCT-GTAACAGTCTCTTTCT----ATGTATTAATCAAAACTGATGCAACTTTTTAAAGAACTATTCCTAGAAACTTTCTCCCTTCCCAGTCAC----- s panTro4.chrUn_GL393505 912769 236 - 1195001 TCATCAGCAGCCTTACTTACTA------CATTCTTCCCAGATGATCTCAAGTTATCCAAGGAAATTAAAAGTAGCTACTGCTGACAAAACTGTTGGGTTCCCTGATATTATGCAAGAATAAAATTATGCTAGGTCTCCCATTAGCTAGCTCTTCTTCT-GTGACAGTCTCTTTCT----ATGTATTAATCAAAACTGATGCAACTTTTTTAAGAACTATTCCCAGAAACTTT-TCCCTTCCCAGTCAG----- i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66615914 236 - 72422247 TCATCATCAGCCTTACTTACCA------CAATCTTCCCAGATGATCTCAAG-TATCCAAAGAAATTAAAAGTAGCTACTGCTGACAAAACTGTTGGGTTCCCTGATATTGTGCAAGAATAAAATTATGCTAGGTCTTCCGTTAGCTAGCTCTTCTTCT-GTAACAGTCTCTTTCT----ATGTATTAATCAAAACTGATGCAACTTTTTAAAGAACTATTCCTAGAAACTTCCTCCCTTCCCAGTCAG----- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512277 233 - 121039945 TCATCAGCAGCCTTACTTACCA------CAATCTTCCCAGATGATCTCAAG-TATCCAAAGAAGTTAAAAGTAGCTTCTGCTGACAAAACTGTTGGGTTCCCTGATATTGTGCAAGAATAAAATTATGTGAGGTCTTCCTTTAGCTAGC---TCTTCT-GTAGCAGTCTCTTTCT----ATGTATGAATCAAAACTGATGCAACTTTTTAAAGAACTATTCCTAGAAACTTTCTCCCTTCCCAGTCAG----- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21372597 235 + 162156779 TCACCAGCAGCCTTACTTACCA------CCATCTTCCCAGATGATCTCAAG-TatccaaagaaattaaaagtagcTTCTGCTGACAAAGCTGTTGGGTTCCCTGATATTGTTCAAGAATAAAATTATGCTAGGTCTTC-ATTAGCTAGCTCTTCTTCT-GTAACAGTCTCTTTCT----ATGTATGAATCAAAACTCATGCAACTTTTTAAAGAACTATTCCTAGAAACTTTCTCCCTTCCCAGTCAg----- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21958592 232 - 58131712 TCACCAGCAGCCTTACTTACCA------CCATCTTCCCAGATGATCTCAAG-TATCCAAAGAAATTAAAAGTAACTTCTGCTGACAAAGCTGTTGGGTTCCCTAATATTGTTCAAGAATAAAATTATGCTGCGTCTTC-ATTAGCTAG---TTCTTCT-GTAACAGTCTCTTTCT----ATGTATGAATCAAAACTCATGCAACTTTTTAAAGAACTATTCCTAGAAACTTTCTCCCTTCCCAGTCAG----- i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24195456 231 + 132174527 ttatCAGCTGCCTTACCTACTA------CCATCTTCCCAGAGGATCTCAAG-TATCCAAAGAAATTAAAAGTAGCT-CTGCTGACACAACAGTTGGGTTCCCTGATATAGTGCAAGAAGAAAATTATGCTAGGTCCTTCTTTAGCTAGTTCTTTTTCT-GGAACAATC----TCT----GTGTATGAATCAAAACTGATGCAACTTTTTTGAGAACTATTCCTAGAAACATTCTCCCTTCTCAGTCAG----- i calJac3.chr10 I 1958 C 0 s canFam3.chr30 13421330 251 + 40214260 TCATTAGCAGCCTTACTTACCACCACCGCCACCCTCCCAGATGACCTCAAA-GATCCAAGGAAATAAAAAGTAGCTTCTGCTACTAAAACTATTGGATTCTCTGAGATTGTGTAAGAAGAAAATTACTCTATGCCTTGCTTCAGCTATCTCATCTTTTCAGAATAACCTTTGTCTCCCGAAGTAGCAATCAAAATTAATACAATTTTCT-GAGAAAGCTTCCTAGATGATTTTTCCCATCTCAACCAGAAACT i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24256933 6 + 170124641 I e macFas5.chr7 24024022 0 + 171882078 C a score=473136.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 22424 158 + 158759 AATTAATGTATT-------ATTTATACATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGCTTTGGGTATATAACAGCACTTACGGCCATTTACTTTGTGGTTCAGTGATTTCTGTGTGCTTCTGACTTGTATATACTTTCAGCCCTTGTAGATGTAG----TGGTGGTAGTTT s panTro4.chrUn_GL393505 913005 126 - 1195001 AATTAATGTATT-------ATTTATCCATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGGT--------------------------------TTTGTGGTTCAGTGATCTCTGTGTGCTTCTGACTTGTATATACTTTCAGCTCTTGTAGATGTAG----TGGTGGTAGTTT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66616150 158 - 72422247 AATTAATGTATT-------ATTTATCCATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATAACAGCACTTATGGCCATTTACTTTGTGGTTCAGTGATTTCTGTGTGCTTCTGACCTGTATATACTTTCAGCCCTTGTAGACGTAG----TGGTGGTAGTTT i ponAbe2.chrUn C 0 I 253 s nomLeu3.chr6 67512510 158 - 121039945 AATTAATGTATT-------ATTTATCCATTTAAAGG----ACTATGTAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATCACAGCACTTATGGCCATTTACTTTGTGGTTCAGTGATTTCTGTGTGCTTCTGACTCGTATATACTTTCAGCCCTTGTAGATATAG----TGGTTGTAGTTT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24256939 158 + 170124641 AATTAATGTATT-------ATTTATGCATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATCACAGCACTTATGGCCATTTACTTCATGGTTCAGTGATTTCTGTGCGCTTCTGACTTGTATATACTTTCAGCCCTTGTCAATGTAG----TGGTTGTAGCTT i rheMac3.chr7 I 6 C 0 s macFas5.chr7 24024022 158 + 171882078 AATTAATGTATT-------ATTTATGCATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATCACAGCACTTATGGCCATTTACTTCGTGGTTCAGTGATTTCTGTGCGCTTCTGACTTGTATATACTTTCAGCCCTTGTCAATGTAG----TGGTTGTAGCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21372832 158 + 162156779 aattaatgtatt-------atttatgcatttaaagG----ACTATATAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATCACAGCACTTATGGCCATTTACTTCATGGTTCAGTGATTTCTGTGCGCTTCTGACTTGCATATACTTTCAGCCCTTGTCAATGTAG----TGGTTGTAGCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21958824 158 - 58131712 AATTAATGGATT-------ATTTATGCATTTAAAGG----ACTATATAAGTAGGACATGGTTTGGGTATATCACAGCACTTATGGCCATTGACTTCGTGGTTCAGTGATTTCTGTGCACTTCTGACTTGTATATACTTTCAGCCCTTGTCAATGTAG----TGGTTGTAGCTT i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24195687 141 + 132174527 AATTAAGGTATT-------ATTTATCCATTTAAAGG----ACTATTTAAGTAGGACATGGTTTGGGTATGTCATAGCACTCATGGCCATTTAATTAATGGTTCAGTGATTTCTGTATGCTTCTGA-----------------CCCTTGTAGATTTAG----TGGTTGTAGTTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13421581 167 + 40214260 AACTACCTTTTTAAAAAAAATTCATCCATTCAAAGGACTAACTATATAAATAGGAATTGATTTGGGTATACTGTAACACCTATAGCTATCTTCCCTGCATTTCAGTGATTTTTATGTGTTCCTGACTTGTATGTATTGTCAGCCCTTATAGAATTAGCACTTGGCCG------ i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I a score=35456.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 22582 12 + 158759 TCCCAACTTAAA s panTro4.chrUn_GL393505 913131 12 - 1195001 TGCCAACTTAAA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512668 12 - 121039945 TCCCAACTTAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 24257097 12 + 170124641 TCCCAACTTAAA i rheMac3.chr7 C 0 I 369 s macFas5.chr7 24024180 12 + 171882078 TCCCAACtgaaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 21372990 12 + 162156779 TCCCAACTTAaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21958982 12 - 58131712 TCCCAACTTAAA i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24195828 12 + 132174527 TCCCAACTTAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13421748 12 + 40214260 TCCAAACTTAAA i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e ponAbe2.chrUn 66616308 253 - 72422247 I a score=15787.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 22594 13 + 158759 TTTGTCTTTATCA-- s panTro4.chrUn_GL393505 913143 13 - 1195001 TTTATCTTTATCA-- i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512680 13 - 121039945 TCTATCTTTATCA-- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr7 24024192 13 + 171882078 cctatctgtacta-- i macFas5.chr7 C 0 I 361 s papAnu2.chr7 21373002 13 + 162156779 cctatctgtacta-- i papAnu2.chr7 C 0 I 687 s chlSab2.chr26 21958994 13 - 58131712 TCTATCTTTATCA-- i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s calJac3.chr10 24195840 13 + 132174527 TCTATCTTTATCA-- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13421760 13 + 40214260 --TCTCTCTCTCGCC i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24257109 369 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panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 67512756 278 - 121039945 -----------ACCGCAAGTTTTTATTATGCATAAATACTAAGATGTCCATGTCCATGGTCTTGCAGGACAGCAGAAGATAA--TTTTTTTACCAGTGTATCTATTGCTAACAATTGCTTCAAGGTCAGGACCCAACTCATGTATTAGACATGTAAATCTTGTGAAAATATTCATACTGGAAACAGCATGTAGCAAGTGCAAACAGAACTAAATAAAT------------------------------------CCTTTAATTTATCAC-----------------------AGTCCC--------TTCAAAGTATGAA------TTCTTCTTCTAGCATTACATC------------------------CAAATTTGATAAAATCCA----------------- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr26 21959070 277 - 58131712 -----------ACTGAAAGTTTTTATTATGCATAAATACTAAGATGTCCATGTCCATGGTTATGCAGGACAGCAGAAGGTAA---TTTTTTACCATTGTATCTATTGCTAACAATTGCTTCAAGGTCAGGAGTAAGCTCATGTATTAGACAGGTAAATCTTGTGAAAATATTCACATTGGAAACAGCATATAGCAAGTGCAAACAGAACTAAATAAAT------------------------------------ACTTTAATTTATGAC-----------------------AGTCCC--------TTCAAAGTATGAA------TTCTTCTCCTAGCATTACATA------------------------CAAATTTGATAAAATCCA----------------- i chlSab2.chr26 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01226723v1 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AAAATATTTTATCTCAGTGTTTTAAAAGTGTTGATGCT----GTA-TACATTGAGT--------------------------------------------TATTGCACAACTGAATGGAACCCACATTCAAAGTTTTTCCTCAATGTTAAAATTAAATGGTTGTCTCTGTGATTC i nasLar1.chrUn_JMHX01226723v1 C 0 N 0 s calJac3.chr10 24196189 126 + 132174527 AAAATATTTTATCTCAATATTTTAAAAGTGTTGATGCT----ATA-TACATCGAGC--------------------------------------------TATTGTACAATTGAATGGAACCCACATTCAAAGATTTTCCTCAATGTTAAAATTAAGTGTTTCTCTCTGTGATTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr30 13422233 171 + 40214260 TAAATATTTTATTACAATTTCTCCAAAATATTAATCCTTCTGGCATTACATCAAATGAAAGTGATTGTATCACGACTGGAAAAAAAATAAAAGTTTGTACTATTGCACAACTGAA-AGAACCCATGTTT-CAGTTTTTCATCAGTGCTAAAATTAAATGTTCCTCTC--TGATTC i canFam3.chr30 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24257109 369 + 170124641 I e papAnu2.chr7 21373015 687 + 162156779 I e macFas5.chr7 24024205 361 + 171882078 I a score=176907.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 23074 127 + 158759 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chlSab2.chr26 C 0 I 192 s calJac3.chr10 24196517 285 + 132174527 taagaggtgaggccaggctgaccacggtggctcccacctgtaatcccagcactttgggagtctgacatggttggatcacatggtcaggagttctagaccagcctggccaacatgg-agaatgccatctctattaaaaatacaaacattagccaggtgttgtggcacactcctgtaatccaagctacttggaaggctgaggcaggagaattgcttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagccgagatcatgccactacactccagcctgggtgacatagcaaga i calJac3.chr10 C 0 C 0 e otoGar3.GL873529 17096624 1115 - 38611459 I e rheMac3.chr7 24257109 369 + 170124641 I e canFam3.chr30 13422532 10 + 40214260 I e papAnu2.chr7 21373015 687 + 162156779 I e macFas5.chr7 24024205 361 + 171882078 I a score=16181.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 23563 41 + 158759 ctccatctc--------------------aataaataaataaataaataaataaataaata s panTro4.chrUn_GL393505 914112 49 - 1195001 ctctatctc------------aataaataaataaataaataaataaataaataaataaata i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66617195 61 - 72422247 ctccgtctcaaaaattaaataaataaataaataaataaataaataaataaataaataaaga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 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s rheMac3.chr3 73788730 1 + 198365852 t i rheMac3.chr3 I 3 C 0 s macFas5.chr3 67265642 1 + 192294377 t i macFas5.chr3 I 3 C 0 s papAnu2.chr3 58141499 1 + 180432695 t i papAnu2.chr3 I 3 C 0 s chlSab2.chr21 5675955 1 + 127223203 t i chlSab2.chr21 I 3 C 0 s calJac3.chr8 108074730 1 - 128169293 t i calJac3.chr8 C 0 I 3 e saiBol1.JH378145 696862 1072 - 18371965 I e tarSyr2.KE946558v1 981451 916 - 1121937 I e canFam3.chr18 51725632 0 - 55844845 C e nomLeu3.chr17 55735513 0 + 99891981 C e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=424432.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 33090 193 + 158759 aagaatacagtatataagacatataa--catattaaatatgggttaattgactg------ttatttgtaaggcttagagtagtctattagtagttaagttttgggggagtcaaagttatagtggattttctactgtgc-aggggggccagcacccc-aacctccgtgttgcttaagggtcaactgTACATGTTATTTCCTTTC s ponAbe2.chrUn 66719830 199 - 72422247 aagaatacagtatataagacatataa--catattaaatatgtgttaactgactgcttgtgttatttgtaaggcttaaagtaggctattagtagttaagttttgggggagtcaaagttatagtggattttctactgtgc-aggggggccagcacccc-aacctccgtgttgcttaagggtcaactgTACATGTTATTTCCTTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55735513 201 + 99891981 aagaatacagtatataagagatatag--catattaaatatgtgttaattgactgcttgtgttatttgtaaggcttccagtaggctattaatagttaagttttgggggagtcaaagttatagtggattttctactgtgcggggggggccagcacccctaacctccgtgttgcttaagtgtcaactgTACCTGTTATTTCCTTTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73788731 202 + 198365852 aagaatacagtatataagacatataactcatattaaatgtgtgttaattgactgcttgtgttatttgcaaggcttacagtgggctattggtagttacattttggaggagtcaaagttgtagtggattttctatggtgc-aagggggccagcacccctaacctccgtgttgcttaaggttcaactgTACATGTTATTTCCTTTC i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67265643 202 + 192294377 aagaatacagtatataagacatataactcatattaaatgtgtgttaattgactgcgtgtgttatttgcaaggcttacagtgggctattggtagttacattttggaggagtcaaagttgtagtggattttctatggtgc-aagggggccagcacccctaacctccgtgttgcttaaggttcaactgTACATGTTATTTCCTTTC i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58141500 202 + 180432695 aagaatacagtacataAGACATATAACTCATattaaatatgtgttaattgactgctTGTGTTATTTGTAAGGCTTACAGTGGGCTATTGGTAGTTACATTTTGGAGGAGTCAAAGTTATAGTGGATTTTCTATGGTGC-AAGGGGGCCAGCACCCCTAACCTCCGTGTTGCTTAAGGTTCAACTGTACATGTTATTTCCTTTC i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5675956 202 + 127223203 aagaatacagtacataagacatataactcatattaaatatgtgttcattgactgcttgtgttatttgtaaggcttacagtgggctatcggtagttacattttggaagagtcaaagttatagtggattttctatggtgc-aagggggccagcacccctaacctccgtgttgcttaaggttcaactgTACATGTTATTTCCTTTC i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108074734 199 - 128169293 aagaatacagtataggatacatatag--cgtattaaatatgtgctaattgactgcctatgttatttgtaaggcttacagtaggctgttagtagttaagttttgtgcgagtggaagatatagtagattttctactgagt-gggagggctgg-acccttaacctcttagttgcttaagggtcaactgTACATGATATCTCCTTTC i calJac3.chr8 I 3 C 0 e saiBol1.JH378145 696862 1072 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103781204 2406 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 981451 916 - 1121937 I e canFam3.chr18 51725632 0 - 55844845 C e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=266099.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 33283 103 + 158759 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGAAGGTCTTTTCTCCAATAAGTGTATTCAAAATGTAGCAGATTTGAAATGTGTTGGCGCCACCATTTTGCGTCTCACTTTGAA s ponAbe2.chrUn 66720029 103 - 72422247 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGACGGTCTTTTCTCCAATAAGTGTATTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATGTGTTGGCGCCACCATTTTGCGTCTCACTTTGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55735714 103 + 99891981 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGAAGGTCTTTTCTCCAATAAGTGTGTTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATGTGTTGGCGCCACCATTTTGTGTCTCACTTTGCA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73788933 103 + 198365852 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGAAGTTCTTTTCTCCAGTAAGTGTACTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATATGTTGGCTCCACCATTGTGTGTCTCACTTTAAA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67265845 103 + 192294377 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGAAGTTCTTTTCTCCAGTAAGTGTACTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATATGTTGGCTCCACCATTGTGTGTCTCACTTTAAA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58141702 103 + 180432695 CTGTAAGAGAAAAATGATGAGAAGTTCTTTTCTCCAGTAAGTGTGTTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATATGTTGGCTCCACCATTTTGTGTCTCACTTTGAA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5676158 103 + 127223203 CTGTAAGAGAAAAATGGTGAGAAGTTCTTTTCTCCAGTAAGTGTATTCAAAATGTAGCAGACTTGAAATATGTTCGCTCCACCATTTTGTGTCTCACTTTGAA i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108074933 103 - 128169293 CTACAAGAGAAAAATGATGAGAATATATTTTCTTTAGGACGTGTGTTCAAAATGTAGCAGACTTCAAATATGTTGGTGCCACTATTTTGTGCCTCACTTTGAA i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 51725632 98 - 55844845 CTATAAAAATAAAGTGATTCAAAGACATGTT----AATAAGTGTATTCAAAGTGTAGCAGAATTTAAATGCATTAGTACT-CCATTTTGTATCTCACTTTAAA i canFam3.chr18 C 0 I 201 e saiBol1.JH378145 696862 1072 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103781204 2406 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 981451 916 - 1121937 I e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=1385585.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 33386 652 + 158759 AACTTATTATTTAAAATCGTACTAAAGCCTACCTTAC-TTTTCCAACATTAGAAAAAATGTTACAAAGAAAAGGGGTGAAACCATGCTAGTTTGCCCTGAAATTTGAACTTATCTTTTAAAA---ATATATTTTTACATTAATGACTTCCAAAAT------A---GAGATCAGTTGCATACAAATGGCAGGTCACCGTAATCCACCCTATGGCTGCACTTAGATTCATGAGGAATTGTGCCAACTAGAAAGGGCAGAGAAGAGGAATAGGGTGCTCTGCGTCTTGAAATATAAACAGGCACATAGCCACATGC-TTTGATTCTCT------TGTCACTTTGTACTTACAGCTAGGAAGAGGGCATGTTTGTGTATTTTTATGCTAATTATTATCCAAATTGTTAGTGATTTACGCTTTCAGAACCATATAAAGA-TTTTTT--CCTTTCAGATATAAACTATCTTGCATTGTTCTTCTGATCATATGAGGAATAAATTTGCCTAAATATTCTTCAGACCATAATATTATGT-CCATATAAATGCCAGTAGCAAGAGTAGAATCAACCACAACTGCCTTTGTAATTATTTAAAGCACGTGTGCCTATAA----TTGGCATTTTATATAATCAAGAATCTTTGATATAATAATCTCTCAACTATTTGAAACATGGCTCACAT s ponAbe2.chrUn 66720132 617 - 72422247 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AACTTATTATTAAAAATCATACTAAAGCCTACCTTAC-TTTCCCAACCTTAGAAAAACTGGTACAAAGAAAAGGGATGGAAACATGCTAGTTTGCACTGAAATTTGAAATTATCTCTCAAAA---ATATATTTTCACTTT----ACTTCCAAAAT------G---GAGATCAATT-TATACAGATGGCAGGTCACCCTAATCCACCCTATGACTGCACTTAGATTCCTGAGGAATTGTGCCATCTAGAAAGGACAGAGAAGAGGAATAGAATGCTCCGCATCTTGGAATATAAACATGTGCATTGCCACGTGC-TTTGATTCTGTTGTCACTGTCACTGTGTACTTACTGCTAGGAAGAGGGCAGATTTGTGTATTTTTATTCTAATTATTATATAAGTTGTTAATGATTTAGGCTTTCAGAACCATATAAAGA-TTTTTTTTCCTTTCAGATATAAACTATCTTGCATTGTTCTTCTGATCATATGAGGGATAAATTTACGCAAATATTCTTCAGACCATAATATTATGT-CCACATAAATGCCAGTAGCAAGAGTAGAATCAACCACAACTGCCTTTGTAATTATTTAAAGCATGTGTGCCTAAAAGCAACTGGCATTTTA-ATAATCAAGAATCTTTGATATAGTAAGTTCTCAACTATTTGAAACATGGCTC---- i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67265948 658 + 192294377 AACTTATTATTAAAAATCATACTAAAGCCTACCTTAC-TTTCCCAACCTTAGAAAAACTGGTACAAAGAAAAGGGATGGAAACATGCTAGTTTGCACTGAAATTTGAAATTATCTCTCAAAA---ATATATTTTCACTTT----ACTTCCAAAAT------G---GAGATCAATT-TATGCAGATGGCAGGTCACCCTAATCCACCCTATGACTGCACTTAGATTCCTGAGGAATTGTGCCATCTAGAAAGGACAGAGAAGAGGAATAGAATGCTCCGCATCTTGGAATATAAACATGCGCATTGCCACGTGC-TTTGATTCTGTTGTCACTGTCACTGTGTACTTACTGCTAGGAAGAGGGCAGATTTGTGTATTTTTATTCTAATTATTATATAAGTTGTTAATGATTTAGGCTTTCAGAACCATATAAAGA-TTTTTTTTCCTTTCAGATATAAACTATCTTGCATTGTTCTTCTGATCATATGAGGGATAAATTTACGCAAATATTCTTCAGACCATAATATTATGT-CCACATAAATGCCAGTAGCAAGAGTAGAATCAACCACAACTGCCTTTGTAATTATTTAAAGCATGTGTGCCTAAAAGCAACTGGCATTTTA-ATAATCAAGAATCTTTGATATAGTAAGTTCTCAACTATTTGAAACATGGCTCATGT i macFas5.chr3 C 0 I 4 s papAnu2.chr3 58141805 650 + 180432695 AACTTATTATT-AAAATTGTACTAAAGCCTACCTTAC-TTTCCCAACCTTAGaaaaactggaac-aagaaaagggATGGAAACATGCTAGTTTgcactgaaatttgaaattatctctcaaaa---atatattttcacttt----acTTCCAAAAT------G---GAGATCAATT-TATACAGATGGCAGGTCACCCTAATCCACCCTATGACTGCACTTAGATTCATGAGGAATTGTGCCATCTAGAAAGGACAGAGAAGAGGAATAGAGTGCTCCGCATCTTGGAATATAAACATGCACATTGCCACATGC-TTTGATTCTGT------TGTCACTGTGTACTTACTGCTAGGAAGAGggcatatttgtgtatttttattctaattattatACAAGTTGTTAATGATTTAGGCTTTCAGAAccatataaagatttttttttcctttcagatatAAACTATCTTGCATTGTTCTTCTGATCATATGAGGGATAAATTTACGCAAATATTCTTCAGACCATAATGTTATGT-CCACATAAATGCCAGTAGCAAGAGTAGAATCAACCACAACTGCCTTTGTAATTATTT-AAGCATGTGTGCCTAAAAGCAATTGGCATTTTA-ATAATCAAGAATCTTTGATATAATAAGTTCTCCACTATTTGAAACATGGCTCATGT i papAnu2.chr3 C 0 I 4 s chlSab2.chr21 5676261 653 + 127223203 AACTTATTATTAAAAATTGTACTAAAGCCTACCTTAC-TTTCCCAACCTTAGAAAAACTGGAACAAAGAAAAGGGATGGAAACATGCTAGTTTGCACTGAAATTTGAAATTATCTCTCAAAA---ATATATTTTCACTTT----ACTTCCAAAAT------G---GAGATCAATT-TATACAGATGGCAGGTCACCCTAATCCACCCTATGACTGCACTTAGATTCATGAGGAATTGTGCCATCTAGAAAGGACAGAGAGGAGGAATAGAGTGCTCCGCATCTTGGAATATAAACATGCACATTGCCACATGC-TTTGATTCTGT------TGTCACTGTGTACTTACTGCTAGGAAGAGGGCATATTTGTGTATTTTTATTCTAATTATTATACAAGTTGTTAATGATTTAGGCTTTCAGAACCATACAAAGATTTTTTTTTCCTTTCAGATATAAACTATCTTGCACTGTTCTTCTGATCATATGAGGGATAAATTTACACAAATATTCTTCAGACCATAATGTTATGT-CCACATAAATGCCAGTAGCAAGAGTAGAATCAACCACAACTGCCTTTGTAATTATTTAAAGCATGTGTGCCTAAAAGCAATTGGCATTTTA-ATAATCAAGAATCCTTGATACAATAAGTTCTCCACTATTTGAAACATGGCTCATGT i chlSab2.chr21 C 0 I 4 s calJac3.chr8 108075036 658 - 128169293 AACTTATAATCAAAAATCATACTAAAGCCTACCTTAT-TTTTCCAACATTAGAAAATCTGTTACAGGGACAAG---TAAAAACATGCTAATTTGCACTGCAATTGGAAATCGTGTTTCTAAA---ATATATTTTTGTTTTAATTACCTCCAGAGT------GAAAGAGAACAATTGCACAGAAATGACAGGAGATCCTAATCCACCCTATGACTGCACTTAGATTCACAAGGAATTGTG-CATCTAGAAAGAGCAGAGGAGAGGAATAGAGTACCCTGCATCTTGGAATGTAAACGTGCACATAGTCACATGCTTTTGAATGTGT------TGTCACTGTGTATTTACTGCTAGGAAGAGCGCATATTTGTGTATTTTTATTCTAATTATTATTTCATTTGTTAATCATTTGGGCTTTCAAAACCATGTATAGA-TTTTTTTTCCTTTGAGATATAAACTATCTTATTTTCATCTTCTGATCATATGCAGGATAAGTTTACCTGCATACTCTGAAGATCATAATATTATGT-CCATATAAATGTCAACTGTTAGAGTAGAATCAACCACACCTATCTTTGTAATTATTTTAAACATGTGTGCCTAAAAATAATTGGTATTTCATATAATCAAGTATCTTTGATATAGTAAGTTCTCAACTATTAGAAACATTACTCATAT i calJac3.chr8 C 0 I 2 s canFam3.chr18 51725931 409 - 55844845 AAGTTATTATCAAAAATCACACTAAAGGCTATTTCATATTTTTTTGTGTTAGAGAAGCTGGGACAACCAGAATGGGTGAAAACATACTAGTTTGCATTGTAATCTAAAATTTTATGCTTAAATTTTTTTTTTTTTGCCTTCATTACCTCAAAAGCTAAAGAG---AAGAGCAGTTCCATACAAATATCAAAAC-CCCTGCTTTATCCTATGATTGTACTTTGATTTATGAAAAACTGTATCATCTAGAGTGAGCAGAGAAAAGGAATAGAGTGTGCTGCTTCTTGGAACATAAAAATGGATGCAGGCATATGC-TTTG----TAT------TATCATCCTATTTTTACAGCTTAAAAGAGGG-------------------------------------------------------------------------TATTTG-----------------------------------------ATACAATAGATAAACATAC-------------------TGATTTTATATGCCatatatatattaaaa----------------------------ttataata----------------------------------------------------------------------------------------------- i canFam3.chr18 I 201 C 0 e saiBol1.JH378145 696862 1072 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103781204 2406 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 981451 916 - 1121937 I e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=1911.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 34038 1 + 158759 T s ponAbe2.chrUn 66720753 1 - 72422247 T i ponAbe2.chrUn I 4 C 0 s nomLeu3.chr17 55736478 1 + 99891981 T i nomLeu3.chr17 I 4 C 0 s macFas5.chr3 67266610 1 + 192294377 T i macFas5.chr3 I 4 C 0 s papAnu2.chr3 58142459 1 + 180432695 t i papAnu2.chr3 I 4 C 0 s chlSab2.chr21 5676918 1 + 127223203 T i chlSab2.chr21 I 4 C 0 s tarSyr2.KE946558v1 982367 1 - 1121937 T i tarSyr2.KE946558v1 I 916 I 625 e saiBol1.JH378145 696862 1072 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103781204 2406 - 158137892 I e rheMac3.chr3 73789690 0 + 198365852 C e canFam3.chr18 51726340 0 - 55844845 C e calJac3.chr8 108075694 2 - 128169293 I e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=184083.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 34039 110 + 158759 AATTTTTTATGCAAA--CATA------------------------------------------------------TATATAATATCATTGTATATGAAACTAAATTTTCGACTTTAGGA---CAGCTTCTTAGAATCCTGACTTAAAT--GTCTACAGTAATATTTGACTT s ponAbe2.chrUn 66720754 110 - 72422247 AATTTTGTATGCAAA--TATA------------------------------------------------------TATATAATATCATTGTATATGAAACTAAATTTTGGACTTTAGAA---CAGCTTCTTAGAATCTTGACTTAAAT--GTCCACAGTAATATTTGACTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55736479 110 + 99891981 AATTTTATGAGCAAA--TATA------------------------------------------------------TATATAATATCATTGTATATGAAACCAAATTTTGGACTTTAGAA---CAACTTCCTAGAATTTTGACTTAAAT--GTCTACAGTAATATTTGACTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73789690 108 + 198365852 ---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------------------------TTTAGAA---CAACTTCCTAGAATCTTGACTTAAAT--GTCTACAGTAATATTTGACTT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67266611 111 + 192294377 AATTTTATATGCATAT-TATA------------------------------------------------------TATATAATGTAATTGTTTATGAAACTAAATTTTGGACTTTAGAA---CAACTTCCTAGAATCTTGACTTAAAT--GTCTACAGTAATATTTGACTT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58142460 110 + 180432695 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canFam3.chr18 51732624 18 - 55844845 ----------------------CCAATGCATGGTATTTGA------------ i canFam3.chr18 C 0 C 0 e gorGor3.chr1 101673154 988 - 229507203 I e tarSyr2.KE946558v1 990057 5968 - 1121937 I e rheMac3.chr3 73791101 483 + 198365852 I e chlSab2.chr21 5678321 474 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58143860 457 + 180432695 I e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=385173.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 36158 289 + 158759 gtctagaaaatgttaatttttgtaagtattctgtatgaacaataaaataacatgaattataatattcatgttccttatataatatttgccctttttaaaatccactagcttcttttaaaacttactcttttaattttttcttttatctattattgaaagatgtgtgtttgaaatgtctataat-atttgggggcttatccatttctactt-----tctgatatttttgctttatataatttgactctctctCTAAATAtgtgtgtgtctctgtgtgtgagagagtgtgtggtttg s ponAbe2.chrUn 66722859 291 - 72422247 gtctagaaaatgttaatttttgtaagtattctgtatgaacatgaaaatgacatgaattataatattcatgttccttatataacatttgcc-tttttaaaatccactagcttcttttaaaacttactcttttaattttttcttgtatctattactgaaagatgtgtgtttgaaatgtctatattgatttgggggcttatccatttctactta-ctttctgatatttttgctttatataatttgactctctctCTAAATACgtgtgtgtgt--gtgtgagagagagtgtgtagtgtg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55738601 273 + 99891981 gtctagaaaatgttaatttttgtaagtattctgtatgaacatgaaaataacattaattataatattcgtgctccatatataacatttgccctttttaaaatccactagcttcttttaaaacttactctttaaattttttcatttatctattactgaaagatgtgtgtttgagatgtctataatgatttgggggcttatccatttctactta-ctttctgatatttttgc--tatataatttga--ctctctctAAATAtgtgtgtgtgt--gtgtgtgtg--------------- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124574366 265 - 198365852 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aatatcaactt-tcaaaatattgcatttgcgtagcatg----------------------------ttcctattatttgaatttcaatctttctgtaatcttatatcttggtag--tcatttgtaaccatcatagaaatgga------tTAAAAACAAAACAAAGCAACACCTCTTCTGTCAATCTTGGTATCTTAAGGAAACTTATTGTCTATTTATATGTAAG------GTGATCTTTGATACTTTAT---------------------------------- i canFam3.chr18 C 0 C 0 e gorGor3.chr1 101673154 988 - 229507203 I e tarSyr2.KE946558v1 990057 5968 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2466230 960 - 4227291 I e rheMac3.chr3 124574748 12271 - 198365852 T e chlSab2.chr21 5678321 474 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58143860 457 + 180432695 I e macFas5.chr3 125026376 12546 - 192294377 T e panTro4.chrUn_GL393505 916973 55599 - 1195001 I a score=476.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 36833 1 + 158759 G s gorGor3.chr1 101674142 1 - 229507203 g i gorGor3.chr1 I 988 C 0 s calJac3.chr8 108078844 1 - 128169293 a i calJac3.chr8 C 0 I 156 s saiBol1.JH378145 700786 1 - 18371965 g i saiBol1.JH378145 C 0 I 5 s canFam3.chr18 51733132 1 - 55844845 G i canFam3.chr18 C 0 C 0 e 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nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67268469 4 + 192294377 ctct i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58144331 4 + 180432695 CTCT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5678799 4 + 127223203 ctct i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108079619 4 - 128169293 atct i calJac3.chr8 C 0 C 0 s tarSyr2.KE946558v1 996281 4 - 1121937 ctct i tarSyr2.KE946558v1 I 255 I 1111 s canFam3.chr18 51733718 4 - 55844845 cact i canFam3.chr18 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e panPan1.JH650444 2467194 1157 - 4227291 I e rheMac3.chr3 124574748 12271 - 198365852 T a score=38532.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 37786 15 + 158759 aggagatatgtagag s panTro4.chrUn_GL393505 973073 15 - 1195001 aggagatacataggt i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66724466 15 - 72422247 aggagatacgtaggt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55741994 15 + 99891981 aggagatacataggt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67268473 15 + 192294377 aggagatacttaggt i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58144335 15 + 180432695 AGGAGATACTTAGGT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5678803 15 + 127223203 aggagatacttaggt i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108079623 15 - 128169293 aggagatacttaggt i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 51733722 15 - 55844845 atgagatactgagat i canFam3.chr18 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 996285 1111 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2467194 1157 - 4227291 I e rheMac3.chr3 124574748 12271 - 198365852 T a score=2348828.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 37801 793 + 158759 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gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 998308 679 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I e canFam3.chr18 51737522 239 - 55844845 I e chlSab2.chr21 5681438 19 + 127223203 I a score=166838.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 40431 55 + 158759 CTTAATTAGACATTGTGAGTTCACCATCTTCCTGTCAGTATTGCATCCAAGCTGA s panTro4.chrUn_GL393505 975728 55 - 1195001 CTTAATTAGACATTGTGAGTTCACTATCTTCCTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66727238 55 - 72422247 cttaattaGACATTGTGAGTTCACCATCTTCCTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55744633 55 + 99891981 CTTAATTAGACATTGTGAGTTCACCATCTTACTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73794066 55 + 198365852 CTTAATTAGATGTTGTGAGTTCACCATCTTACTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i rheMac3.chr3 I 5 C 0 s macFas5.chr3 67271122 55 + 192294377 CTTAATTAGATGTTGTGAGTTCACCATCTTACTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i macFas5.chr3 I 5 C 0 s papAnu2.chr3 58146987 55 + 180432695 cTTAATTAGATGTTGTGAGTTCACCATCTTACTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i papAnu2.chr3 I 5 C 0 s chlSab2.chr21 5681457 55 + 127223203 CTTAATTAGCTATTGTGAGTTCACCATCTTACTGTCAGTATAGCATCCAAGCTGA i chlSab2.chr21 I 19 C 0 s calJac3.chr8 108083058 54 - 128169293 CTTAATT-GACATCATGAGTTCACCATCTTACTGTTAGTATAGCATCCAAGCTGA i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 666641 4517 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 998308 679 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I e canFam3.chr18 51737522 239 - 55844845 I a score=133484.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 40486 50 + 158759 TTATCATAGATTAGAAGTTCAACTATCA---ACTGTGTTCTGAGAGTC--TAAAA s panTro4.chrUn_GL393505 975783 50 - 1195001 TTATCATAGATTACAAGTTCAACTATCA---ACTGTGTTCTGAGACTC--TAAAA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66727293 50 - 72422247 TTATCATAGATTACAAGTTCAACTATCA---ACTGTGTTCTGAGAGTC--TAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55744688 49 + 99891981 TTATCACAGACTACAAGTTCAACTGTCA---ACT-TGTTCTGAGAGTT--TAAAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73794121 50 + 198365852 TTATCATAAATTACAACGTCAACTGTCA---ACTGTGTTCTGAGAGTT--AAAAA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67271177 50 + 192294377 TTATCATAAATTACAACGTCAACTGTCA---ACTGTGTTCTGAGAGTT--AAAAA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58147042 50 + 180432695 TTATCATAAATTACAATGTCAACTGTCA---ACTGTGTtctgagagtt--aaaaa i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5681512 52 + 127223203 TTATCATAAATTACAATGTCAACTGTCA---ACTGCGTTCTGAGAGTTTAAAAAA i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108083112 50 - 128169293 TTATCATAGATTACGACTTCAACTGACA---ACTGTGTTCTGGGAAGT--ATAAA i calJac3.chr8 C 0 I 337 s canFam3.chr18 51737761 52 - 55844845 ctgcccAAGATTATGGTTTCAAGTGCTATGTACT-TGTTCTGTGAAAT--CAAAA i canFam3.chr18 I 239 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 666641 4517 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 998308 679 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I a score=25142.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 40536 13 + 158759 AAATAAATGAACG s panTro4.chrUn_GL393505 975833 13 - 1195001 AAATAAATGAATG i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66727343 13 - 72422247 AAATAAATGAATG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55744737 13 + 99891981 AACTAAATGAATG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73794171 13 + 198365852 AAAGAAATGAATA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67271227 13 + 192294377 AAAGAAATGAATA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58147092 10 + 180432695 a---aaatgaatg i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5681564 13 + 127223203 AAAGAAATGAATG i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s canFam3.chr18 51737813 12 - 55844845 -GAGAAGTTAATG i canFam3.chr18 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 666641 4517 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 998308 679 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I e calJac3.chr8 108083162 337 - 128169293 I a 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58 + 127223203 TATTTGTTTGGGTATTCTTAAAGCAGGAGTGAGG-----------ACACA-GTGA-AAGTGAGAC---GAGGAA i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108083499 49 - 128169293 ----TGTTTGGGTGTTCTTAAAGCAGGAGTGAGG-----------ACATA-GTAA-AATTGAGAC--------A i calJac3.chr8 I 337 C 0 s canFam3.chr18 51737825 58 - 55844845 --------TGGGGTTTTTTG----GGGGGTGGGGAATAATCTTCAAAACATGTGA-AAGGGAGAC---AAGGAA i canFam3.chr18 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 666641 4517 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 998308 679 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I a score=11524.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 40603 3 + 158759 AAG s panTro4.chrUn_GL393505 975904 3 - 1195001 GAG i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66727412 3 - 72422247 GAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55744811 3 + 99891981 gag i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73794242 3 + 198365852 gag i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67271298 3 + 192294377 gag i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58147161 3 + 180432695 gag i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5681635 3 + 127223203 GAG i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108083548 3 - 128169293 AAG i calJac3.chr8 C 0 C 0 s tarSyr2.KE946558v1 998987 3 - 1121937 aaa i tarSyr2.KE946558v1 I 679 I 904 s canFam3.chr18 51737883 3 - 55844845 GAG i canFam3.chr18 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 666641 4517 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 700878 7521 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103785534 4130 - 158137892 I e panPan1.JH650444 2469490 1827 - 4227291 I a score=909331.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 40606 343 + 158759 AGA---------ACAAAATAAAACAGGAAAGAGAGACAAGCCAATACCAC--ACGTGTTAAGAGGTAAGTTCCTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTTTATGGGAAGCTATGTGGAGCAT-GCCTCAGAATTACATCACTGAATCCAGGGAGA-------------TTCTTCCTAGT-------TACCCTCA-------------GCTTTTCTTCCCACTTCATGCCCAGTCACAAGCTCCCGTGCTGCTAGAGAAAGTCCTCAGCTAGAAAC--AGGTGCAAATTC-TGGAGATGAGACCTT-GTAGAGTGTT-AAGAATGGTTTTCTTCCCAGCAGCTACAGGTAAGGAATAGGGGCTGGGCTATTAATACATCTGCTACAAACCAATGAA---- s panTro4.chrUn_GL393505 975907 343 - 1195001 AGA---------ACAAAATAAAACAGGAAAGTTAGAAAAGCCAGTACCAC--ACGTGTTAAGAGGCAAGTTCCTCTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTATGTGGAACAT-GCCTCAGAATTACATTACTGAATCCAGGGAGA-------------TTCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTTTTCTTCCCACTTCATGCCCAGTATCAAACTGCCGTGCTGCTAGAGAAAGTCCTCAGTTAGAGAC--AGCTGCAAATTC-TGGAGATGAGACCCT-GTAGAGTGTT-AAGAATGGTTTTCTTCCAGGCAGCTACAGGTAAGGAATAGGGTCTGGGCTATTAATACATCTGCTACAAATCAATATA---- i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66727415 343 - 72422247 AGA---------ATAAAATAAAACAGGAAAGACAGAAAAGCCAATACCAC--ACATGTTAAGAGGCAAGTTCCTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTATGTGGAACAT-GCCTGAGAATTACGTCACTGAATCCAGGGAGA-------------TTCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTTTTCTTCCCAGTTCATGCCCAGTAACGAGCTCCCGTGCTGCTGGAGAAAGTCCTCAGCTAGAAAC--AGGTGCAAATTC-TGGAGATGAGACCTT-GTAGAGTGTT-AAGAATGGTTTTCTTCCCAGCAGCTACAGGTAAGGAATAGGGGCTGGGCTATTAATACATCTGCTACAAATCAATAAA---- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55744814 344 + 99891981 aga---------gaaaaataaaacaggaaaaatagaaaAGCCAATACCAC--ATGTGTTAAGAGGCAAGTTCTTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTGTGGGAAGCTATGTGGAACAT-GCCTCAGAATTACATCACTGAATCCAGGGAGA-------------ATCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTTTTCTTCCCACTTCATGCCCAGTAACAAGCTCCGGTGCTGCAAGAGAAAGTCCTCGGCTAGAAAC--AGGTGCAAATTC-TGGAGATGAGACCTTGGTAGAGAGTT-AAAAATGGTTTTCTTCCCAGCAGCTACAGGTAAGGGATAGGGGCTGGGCTATTAATACATCTGCTACAAATCAATATA---- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73794245 343 + 198365852 agagagagaaaaaaaaaaaaaaacaggaaagatagaaaAGCCGATACCAT--ATGTGTTAAGAGGCAAGTTCTTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTACGCGGAACAT-GCCTCAGAATTACATCACTGAATCTAGGGAGA-------------ATCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTCTTCTTCCCACTCCATGCCCAGTAATAAGCTCCCATGCTGCTAGAGAAAGTCCTCAGGTAGAAAC--AGGTGCAAATAC-TGGAGATGAGACCTT-GTAGAGTGTT-AACAATGGTTTTCTTCCGAGCAGCTACAGGTAAGGGAAAGGGGCTGGG---------CATCCGGTACAAATCAATATA---- i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67271301 343 + 192294377 agagagagaaaaaaaaaaaaaaaaccgaaagatagaaaAGCCGATACCAT--ATGTGTTAAGAGGCAAGTTCTTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTACGCGGAACAT-GCCTCAGAATTACATCACTGAATCTAGGGAGA-------------ATCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTCTTCTTCCCACTCCATGCCCAGTAATAAGCTCCCATGCTGCTAGAGAAAGTCCTCAGGTAGAAAC--AGGTGCAAATAC-TGGAGATGAGACCTT-GTAGAGTGTT-AACAATGGTTTTCTTCCGAGCAGCTACAGGTAAAGCAAAGGGGCTGGG---------CATCCGGTACAAATCAATATA---- i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58147164 338 + 180432695 aga-----aaaaaaaaaaaaaaacaggaaagatagAAAAGCCAATAGCAC--ATGTGTTAAGAGGCAAGTTCCTGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTACGTGGAACAT-GCCTCAGAATTACATCACTGAATCTAGGGAAA-------------ATCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTCTTCTTCCCACTCCATGCCCAGTAATAAGCTCCCATGCTGCTAGAAAAAGTCCTCAGGTAGAAAT--AGGTGCAAATAC-TGGAGATGAGACCTC-GTAGAGTGTT-AAAAATGGTTTTCTTCCCAGCAGCTACAGGTAAAGGAAAGGGGCTGGG---------CATCTGGTACAAATCAATATA---- i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5681638 340 + 127223203 AGA----GAAAAAAAAAAAAACACAGGAAAGATAGAAAAGCCAATAGCAC--ATGTGTTAAGAGGCAAGTTCCCGTGTTAGATATCTGGGC----TTAATTCTATGGGAAGCTACGTGGAACAT-GCCTCAGAATCACATCACTGAATCCAGGGAAA-------------ATCTTCTTAGT-------TACCCTCA-------------CCTCTTCTTCCCACTCCATGCCCAGTAATAAGCTCCTATGCTGCTAGAGAAAGTCCTCAGGTAGAAAT--AGGTGCAAATACTTAGAGATGAGACCTC-GTAGGGTGTT-AAAAATGGTTTTCTTCCCAGCAGCTACAGGTAAGGGAAAGGGGCTGGG---------CATCTGGTACAAATCAATATA---- i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108083551 269 - 128169293 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tarSyr2.KE946558v1 1001656 239 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2472146 1356 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73795463 1659 + 198365852 M e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=164484.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 43551 89 + 158759 AGGCATTTGAAACTGTACTAAAATATAAGCTGTGAACATTTTGTGATCA------------TTACAAATTCTTACACTGAATAAATATTTTTA-TTTTTACA s panTro4.chrUn_GL393505 978866 78 - 1195001 AGGCATTTGAAACTGTACTTAAATATAAGC-----------TGTGATCA------------TTACAAATTCTTACACTGaataaatattttta-tttttata i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55747785 85 + 99891981 AGGCATATGAAACTCTACTAAAATATAAGCTGTGAACATTTTGTGATCA------------TTATAAATTCTTATGCTG----AATATTTTTA-TTTTTATA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73797135 85 + 198365852 AGGCATTTAAAACCCTACTAAAATATAAGTTGTGAACATTTTGTGATCA------------TTATAAGTTCTTACACTG----aatatttata-tttttata i rheMac3.chr3 M 1659 C 0 s macFas5.chr3 67274295 89 + 192294377 AGGCATTTAAAACCCTACTAAAATATAAGTTGTGAACATTTTGTGATCA------------TTATAAGTTCTTACACTGAATAAATATTTATA-TTTTTATA i 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calJac3.chr8 C 0 I 2 s saiBol1.JH378145 708682 1 - 18371965 t i saiBol1.JH378145 C 0 I 2110 e rhiRox1.KN300005v1 671671 912 - 4311341 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2472146 1356 - 4227291 I e canFam3.chr18 51741770 0 - 55844845 C e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=956020.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 43926 398 + 158759 ggtaggctgtacaatctaggtgtttgtaatattccctgtgatgtttgcaaaatgatgaaattgcctatggatgcatctgttagaacgtatccctatcattcagtgatgtgtggctgTACTAAAATGCTCAATGTAAGTTTCAATGCCCTCCATAAAACTGTTGTACTG------TGAAATACAAATCTCTCACCCATGGCCTGAATATGTTTGCAAACTAAGCAGATCATGGGAAGGAGAATGTGCTGGCATCGCTGGGATGATTTTCTCACACTACATGAATAATATCTACAGACTTAGTGCATATGAGCCACTTGCATAGAGTTAAAGTAGGCATCTCTTTGCTGGGAAATTTATCAAATGGGAGTATGAAGTGTTTTTAAAAGATA----CTTGTTTGTTTGTAG s panTro4.chrUn_GL393505 979222 398 - 1195001 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papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5686828 29 + 127223203 aaatgttaaggaatctcctgaataagtga i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108089787 23 - 128169293 aaagtttaaggagttcactgaat------ i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 708683 2110 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2473503 1300 - 4227291 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=745.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 45771 1 + 158759 c s panTro4.chrUn_GL393505 981086 1 - 1195001 t i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55750038 1 + 99891981 t i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73799368 1 + 198365852 t i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67276531 1 + 192294377 t i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58152383 1 + 180432695 T i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5686857 1 + 127223203 c i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s saiBol1.JH378145 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panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55750039 256 + 99891981 agaactagtaaattatttcagcaatattacagcatacaagataaatatacaaaaatcagttgcacacatctacaatgaaaaccccaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttacaatagcatcaaaaaatgaaa-taattaataattaatctgga-aaatgtaatacaata-ttttactctgaaaattaaaaattattgtttaaagaagatctaaataattagcaaacatcttacagccatta--attggaagatttaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73799369 251 + 198365852 agaactagtaaattatttcagcaatattacagcatacaaaataaatatacaaaaatcaattgcacgcatctacaatgaaaacgtcaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttacaatagcatcaaaaaaatgaa-------ataattaatttggaaaaatgtaatacaata-ttttactctgaaaattaaaaagaattgtttaaagaagatctaaataattagcaaacatcttacagccatta--attggaagatttaa i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67276532 251 + 192294377 agaactagtaaattatttcagcaatattacagcatacaaaataaatatacaaaaatcaattgcacgcatctacaaggaaaacgtcaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttacaatagcatcaataaaatgaa-------ataattaatttggaaaaatgtaatacaata-ttttactctgaaaattaaaaagaattgtttaaagaagatctaaataattagcaaacatcttacagccatta--attggaagatttaa i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58152384 251 + 180432695 AGAACTAGTAAATTATTTCAGCAATATTACagcatacaaaataaatatacaaaaatcaattgcacaCATCTACAATGAAAACgtcaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttacaatagcatcaaaaaaatgaa-------ataattaatttggagaaatgtaatacaata-ttttactctgaaaattaaaaagaattgtttaaagaagatctaaataattaGCAAACATCTTACAGCCATTa--attggaagatttaa i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5686858 251 + 127223203 agaactaggaaattatttcagcaatattacagcatacaaaataaatatacaaaaatcaattgcacacatctacaatgaaaacatcaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttacaatagcatcaaaaaaatgaa-------ataattaatttggaaaaatgtaatacaata-ttttactctgaaaattaaaaagaattgtttaaagaagatctaaataattagcaaacatcttatagccatta--attggaagatttaa i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108089810 257 - 128169293 ataactagtaaattatttcagtaatattacagcatacaagataaatatataaaactcaattatacacatctacaatgaacaccccaaaatgaaattaagaaaacacttcaatttataatagcatcaaaaaaataaaatgattaataatcaatttgga-atatataatacaatatttttactctgaaaattaaaa---attgtttagagaagatctaaataaacagcaaaaatcttacagccaagaacattgatattgttaa i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 710794 249 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2473503 1300 - 4227291 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=14025.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 46024 6 + 158759 tactgt s panTro4.chrUn_GL393505 981338 6 - 1195001 tattgt i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55750295 6 + 99891981 tattgt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73799620 6 + 198365852 tattgt i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67276783 6 + 192294377 tattgt i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58152635 6 + 180432695 tattgt i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5687109 6 + 127223203 tattgt i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108090067 6 - 128169293 gatggc i calJac3.chr8 C 0 C 0 s saiBol1.JH378145 711043 6 - 18371965 tactgt i saiBol1.JH378145 I 249 I 1250 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2473503 1300 - 4227291 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=2263241.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 46030 1014 + 158759 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s panTro4.chrUn_GL393505 981344 1014 - 1195001 agtactttacaagttgaactacagatttcacgtaatccctgcaagtatcccaacagacttctgtctagaaactgacaagctgattctaaaatacacatgggattgtaagggactcaaaatagccaaaatagtcttgataaaagaaaacatgttaggataattcacacccccgtgctccaaaccttacggca-aagcatcagtaatcaagacaacacaatagtgatgaaggaaaaatacatagattgat-gaagtgaattgagagtccatatataaaactatgtatctacagtcaatggattcttaaagtggtgccatgtgcaattcaatgaggaagagacagtctttgaacaaac--tgggtcaacaacgtacacgtggaacgccacttgcaaaatagtaaattggaagccttacccccaaagcatac-aaaaatattaactcaaatgaattaaagacatacatgcaagagctagaataaagcatatgcgaaaatcttcaggattttggatctagcaaagaaatagctgtaacaccaaaaacatgagcaacaaaataaaaattagatatttaaaatttcttaaaaattaaagacattggtgtttcaaaggaca-accaagcaagtcaaaaggcagctcaaaaattgtgagaaaatatttgagaagcacatatctatatgtc------tgcatatatatgtatcttgaatatagaaaaattgttttaactcagtaacaaa----aatcccaactcaaaactgataaatgataggaatagatgtatatcccaagaaggtacacgaacggtcaataatcccat-aaaaagatactcaacagcatcactcatcaggcaactacaaatcaaatccatagttagatacTCTATGGCTAGAACTGgccactttggaaaataggttgatggcttctaaa-tatattaaacatagtatagtcatatgacccagaaatatattcctaggtatacccccagagtattggaaagaggtgttcaaacgcagattgtgcacaagta i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55750301 1015 + 99891981 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i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73799626 1018 + 198365852 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agtacttgacaatttgaactacagatttgatgaaatccctgcaagtatcctatcagacttctgtctagaaactaacaaactgattctaaaatacacatggaattgtaagggactcaaaatagccaaaataatcttgaaaaaagaaaacatattagaataattcacacccccatactccaaaccttactgca-aagcatcaataatcaagacaacacgatattgatgaaggaaaaatatatggattgatggaagagaattgagagttcatatataaaactacgtatctatagtcaatggattcttacagtggtgccatgtgcaattcaatgaggaagagatagtctttgaacaaactttgggtcaacaacctacatgtggatcaccactcgcaaaataataaatttgaaccctta-ccccaaagcatac-aaaaatattaactcaaatgaattaaaggcatacatgcaagagctagaagaaagcatgtgggaaaatcttcatgattttggatctagcaaagaaatagctataacaccaaaaacatgagcaacaaaataaaaattagatatttaaaatttcttaaaaattaaagacattggtgcttcaaaggaca-accaaagaagtcaaaaggcagctcaaaaattgtgagaagatatttgaaaaacacatatctatatgtcgacatatatatatatatgtatcttgaatatagaaaaattgttttaacttagtaacaaa----tatcccaacttaaaactgataaacgatatgaatagatatgtttcccaagaagatacacgaacagtcaataatcccat-aaaaaaatgctcagtagcattactcatcaagcaactacaaatcagtaccacaattagatactcaatggttagaactggccactttggaaaatagtttgatagcttctaaa-tatattaaacatagaattgtcatatgacctagaaatgtattcctcggtatatacccagattatcggaaacaggtgttcaaacacaaattgcacacaagta i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58152641 1018 + 180432695 agTACTTGACAATTTGAACTACAGATTTGATGAAATCCCTGCAAGTATCCTATCAGACTTCTGTCTAGAAActaacaaactgattctaaaatacaCAAGGAATTGTAAGGGactcaaaatagccaaaataatcttgaaaaaagaaaacatattaggATAATTCACACCCCCATACTCCAAACCTTACTGCA-AAGCATCAATAATCAAGACAACACGATATTGATGAAGGAAAGATATATGGGTTGATGGAAGAGAATTGAGATTCCATATATAAAACTACGTATCTATAGTCAATGGATTCTCACAGTGGTGCCATGTGCAATTCAATGAGGAAGAGATAGTCTTTGAACAAACTTTGGGTCAACAACCTACATGTGGATCACCACTcgcaaaataataaatttgaaccCTTG-CCccaaagcatac-aaaaatattaactcaaaTGAATTAAAGGCATACATGCAAGAGCTTGAAGAAAGCATGTGGGAAAATCTTCATGATTTTGGATCTAGCAAAGAAATAGCTATAACACCaaaaacatgagcaacaaaataaaaattagatatttaaaatttcttaaaaattaaagacattggTGCTTCAAAGGACA-ACCAAACAAGTCAAAAGGCAGCTCAAAAATTATGAGAAGAGATTTGAAAAACACATATCTAtatgtc----tacatatatatatgtatcttgaatatagaaaaattgttttaacttaGTAACAAA----TATCCCAACTTAAAACTGATAAACGATAGGAACAGATATGTTTCCCAAGAAGATACACAAACAGTCAATAATACCAT-AGAAAAATGCTCAATAGCATTACTCATCAGGCaactacaaatcaaaaccacagttagATACTCAATGGCTAGAActggccactttggaaaatagtttgatagcttctaaa-tatattaaacatagaATTGTCATATGAACTAGAAATGTATTCCTCGGTATATACCCAGATTATCGGAAACAGGTGTTCAAACACAAATTGTACACAAGTA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5687115 1019 + 127223203 aatacttgacaatttgaactacagatttgatgaaatccctgcaagtatcctatcagacttctgtctagaaactaacaaactgattctaaaatacacatggaattgtaagggactcaaaatatccaaaataatcttgaaaaaagaaaacatattaggataattcacacccccatactccaaaccttactgca-aagcgtcattaatcaagataacacgatattgatgaaggaaaaatatatggattgattgaagagaattgagagtccatatataaaactatgtatctatagtcaatggattcttacagtggtgccatgtgcaattcaatgaggaagagatagtcttttaacaaactttgggtcaacaacctacatgtggatcaccactcgcaaaataataaatttgaaccctta-ccccaaagcatac-aaaaatattaactcaaatgaattaaaggcatacatgcaagagctagaagaaagcatgtgggaaaatcttcatgattttggatctagcaaagaaatagctataacaccaaaaacatgagcaacaaaataaaaattagatatttaaaatttcttaaaaattaaagacattggtgcttcaaaggaca-accaaacaagtcaaaaggcagctcaaaaattgtgagaagatatttgaaaaacacatatctatatgtc----tacatatatatatgtatcttgaatatagaaaagttgttttaacttagtaacaaa----tatcccaacttaaaactgataaacgataggaatagatatgtttcccaagaagatacacgaacagtcaataatcccataaaaaaaatgctcaatagcattactcatcaggcaactacaaatcaaaaccacaattagatacTCAATGGCTAGAACTGgccactttggaaaatagtttgatagcttctaaa-tatattaaacatggaattgtcatatgatctagaaatgtattcctcggtatatacccagattatcggaaacaggtgttcaaacacaaattgtacacaagta i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108090073 1006 - 128169293 agtactttacaatttgaactacagattttatgaaatccctgcaagaatcc------acttctatctgaaaactgacaagctgattctaaagtacacatggacttctcagggactcaaaatcaacaacatagtcttgaaaaagaaaaacttagtaggataaatcatacctctgtacttcaaaccttactgcatcattatcagtaatcaagacaacatgatactgatgaaggaaatatatatacattgatggaagagaatttagagcccatatataaaactatgtgtctataggcaatagattcttacagtgatgccatgtgcaattcaatgaggaaaagatagtctctgaataaatgttgggtcaacaacgtacatgtggatcaccacctgcaaaataataaatttgaactctta-ccccaatgcatacaaaaaatattgactcaaatgaattaaagatgcacatgcacgagctagaagaaagcatgtgggaaaattttcatgactttggatctagcaaagatacagctatagccccaaagacatgagcaacaaaataaaaatcagatatttaaattttcttaataattaaagacat----------aaggacacatcaagcaagtcaaaaggcaactcaaaaattgtgaaaaaatatttgaaaaacacatactcata--tc------tatatctgtatgtatcttgaatataaaaaaattgttttaacacagtaacaaaaagtcatcctaacttaaaactgaaaaaggatataaataaatacgtttcccaagaagatacacaaatggtcagtaaccccat-gaaaagatgctcaatagcattactcatcatgcaactacaaatcaaatccacaGTTGTATATTCAATGGCTATAATTGTccactttggaaaatagtttgatggattctaccttatattaaacatagaattgtcatatgatctagaaatttattcctaggtatatacccagattattggaaacacatgttcaaacacaaattgtacacaagta 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tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 982358 0 - 1195001 C a score=498953.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 47045 221 + 158759 ttttagcagcagtatttaaaatagccaaaggctgaacacaactcaaatgtcaataaaaatattattggataaacaaaatgttatatccatgaaattgaatgttatacggttataaaaagaaataaagtaccaatacgtacatgaaccttgatagcattatgccaactgaaagaa------gccaggcacaaaa--ggccacctattgtatga-ttctatttagatgaaaa s panTro4.chrUn_GL393505 982358 224 - 1195001 ttttaacagcagtatttaaaatagccaaaggctgaacacaactcaaatgtcaataaaaatattattggataaacaaaatgttatatccatgaaattgaatgttatacagttataaaaagaaataaagtaccaatacgcatatgaaccttgatagcattatgccaactgaaagaa------gccaggcacaaaaagggccacctattgtatgatttctatttagatgaaaA i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 I 186 s nomLeu3.chr17 55751317 219 + 99891981 ttttagcagcagtatttaaaatagccaaaggctgaacacaactcaaacgtcaataaaaatattactggataaacaaaatgttatatccatgaaactgaatgttata--gttataaaaagaaataaagtaccaatacatatatgaaccttgatagcattatgctaactgaaagaa------gccaggaacaaaa--ggccacctattatatga-ttctatttacatgaaaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73800645 226 + 198365852 ttttagcagcagtatttaaaatagccaaagactgaacacaactcaaatgtcaataaaaatattattggataaacaacatgttgtatccatgaaattgaatgttatacaattataaaaataaacaaagtaccaatacatatatgaaccttgatagcattatgctaactgaaggaaggcca-cctaggcacaaaa--ggccacctattatatga-ttctatttacatgaaaa i rheMac3.chr3 C 0 I 4 s macFas5.chr3 67277812 226 + 192294377 ttttagcagcagtatttaaaatagccaaagactgaacacaactcaaatgttaataaaaatattattggataaacaacatgttgtatccatgaaattgaatgttatacaattataaaaagaaacaaagtaccaatacatatatgaaccttgatagcattatgctaactgaaggaaggcca-cctaggcacaaaa--ggccacctattatatga-ttctatttacatgaaaa i macFas5.chr3 C 0 I 4 s papAnu2.chr3 58153660 227 + 180432695 TTTTAGCAGCAGTATTTAAAATAGCCAAAGACTGAACACAACTCaaatgtcaataaaaatattattggaTAAACAACATGTTGTGTCCATGAAATTGAATGTTATacaattataaaaagaaacaaagtaccaATACATATATGAACCTTGATAGCATTATGCTAACTGAAGGAAGGCCACCCTAGGCACAAAA--GGCCACCTATTATATGA-ATctatttacatgaaaa i papAnu2.chr3 C 0 I 4 s chlSab2.chr21 5688135 226 + 127223203 ttttagcagcagtatttaaaatagccaaagactgaacacaactcaaatgtcaataaaaatattattggatgaacaacatattgtatccatgaaattgaatgttatacaattataaaaagaaacaaagtaccaatacatatatgaactttgataacattatgctaactgaaggaaggcca-cctaggcacaaaa--ggccacctattatatga-ttctatttacatgaaaa i chlSab2.chr21 C 0 I 4 s calJac3.chr8 108091080 217 - 128169293 ttttagcagcagtactgaaaatagccaaagggtgaacacaactcaaatgtcaatcgaaatatgattggataaacaaaatgttatatccatgaaattgaatattatatagttataaaaag----aaagtaccaatacatatataaacctagataatattatgctaattgaaagaa------gccaggcacaaaa--ggccacctattatatga-ttctatttacatgaaaa i calJac3.chr8 C 0 I 4 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 711049 1250 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 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papAnu2.chr3 58153893 275 + 180432695 gaataggaaAATCTATAGAGAATGGAAAACAGAGTTGGGGTTGCTTAGGATTGAGTAGGGGATGGGTGCATAGGAGTTTAACAGTTAAAGAAGGTGGAGTTTCtttttgaagtgatgaaaatgctctaaaattcaTTGTGATGATGGCTTCACTTATCTGTGcatatactaaaagccattgaCTTGTACACATTAATGTGTGCACTCCAtgctatgtaaattatatctcaataaatcctTTCAAAAATATACAGAAGAGTAAG------TGGAGTGTTGCA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5688367 275 + 127223203 gaataggaaaatctatagagaatggaaaacagagttggggttgcttaggattgagcaggggatgggtgcataggagtttaacagtcaaagaaggtggagtttctttttgaagtgatgaaaatgctctaaaattcgttgtgatgatggcttcacttatctgtgcatatactaaaagccattgacttgtacacattaatgtgtgcactctatgctatgtaaattatatctcaataaaTCCTTTCaaaaatatacagaagagtaag------tggagtgttgca i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108091303 273 - 128169293 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papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5688642 1 + 127223203 -g i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108091576 1 - 128169293 -c i calJac3.chr8 C 0 C 0 s otoGar3.GL873564 12709510 1 + 14340318 t- i otoGar3.GL873564 N 0 I 46758 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712301 431 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=351899.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 47549 154 + 158759 ctgggaggcagtttgaaatactgaataggcctcatcgagaatgtgaagtttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcaatggatatatggagggctatctttccaagccaagaaattaactagagtcttggtcataaggcagcagc s panTro4.chrUn_GL393505 983051 154 - 1195001 CTGGGAGGCAGTTTGAAATACTGAATaggtctcatcgagaatgtgaggtttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcaatggatatatggaaggttatctttcaaagccaagaaattaactagagtcttgatcataagacagcagc i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55751819 154 + 99891981 gtgggaggcagtttgaaatactgaataggtctcattgagtatgtgaggtttcagtaaagacttgaggaagttgaataagctgatcaatggatatatggagggctatctttccaagccaagaaattaactagagccttggtcataaggcagcagc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73801153 154 + 198365852 ctgggaggcagtttgaaatactgaataggtctccttaagaatgtgagatttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcgatggatatatggagggctatctttccagaccaagaaattaacaagagtctgggtcataaggcagcagc i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67278320 154 + 192294377 ctgggaggcagtttgaaatactgaataggtctccttaagaatgtgagatttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcgatggatatatggagggctatctttccagaccaagaaattaacaagagtctgggtcataaggcagcagc i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58154169 153 + 180432695 CTGGGAGGCAGTTTGAAATACTGAATAGGTCT-CTTGAGAATGTGAAATTTCAGTAAAGACTTGAGGAAGTTGAATGAGCTGATCGATTGATATACGGAAGGCTGTCTTTCCACACCAAGAAATTAACAAGAGTCTAGGTCATAAGGCAGCAGC i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5688643 153 + 127223203 ctgggaggcagtttgaaatactgaataggtct-cttgagaatgtgaactttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcgatggatatacggagggctgtctttccagaccaagaaattaacaagagtctgggtcataaggcagcagc i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108091577 154 - 128169293 ctgggaggcagtttgaaatactgaataggtctcactgagaatgtgaggtttcagtaaagacttgaggaagttgaatgagctgatcaatggatatatgaaggcctatcattccaagccaagaaattaactaaagtctggatcataaggcagcaag i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712301 431 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51742470 1236 - 55844845 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I a score=8453.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 47703 3 + 158759 gtg s panTro4.chrUn_GL393505 983205 3 - 1195001 atg i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55751973 3 + 99891981 atg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73801307 3 + 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TAAGCCCTTAGTTTTCAAAGCCAGCTTGTGAGGCAGTGACATCTTACGCAAGTTTGCTGCTTTCTGGCACAGTGGTCCTTGGTCAGCTGGCACAAATTGTTTTAAAAACACCACTAGGTCGAAAAAAAAGTTTGGATCACAATGAACACAGACACACCCTCATCCTTTCAGAAATACCTATCTCATCCTTTCATAAATACCTATCTCATCCTTTCAGAAATACCTATCAATTACTTCCAATACAGAATG---AAAACTGACAAAGGAAATACGTTGATTGTAAAAATGTCAG-TTAGCTTGCATCTACACGAAAG-AAAATGCTATTTTTATTACATTAGATCATTGTTTTACATGA-GTTTTGGTATAGAACAACGTTGAACCAAGGGTAAAGACAGATGAATTAATTAAGTCTT----ACGATATCAAGAATTTAAAAGAAAAGGAAGGTCATCTTTAAAGTTTAGTGACATAGCATTCATCTTCTGTTGTCACCTTTTCCATCATTCCCTGTATGCCTGATGGACAGCTTTCACTCAAGTTCAGAGAACAGCTTGCAAAGATTAGCTACCAATTAATCTTTATGAATGGAACTTAATTTCTAACCAGACTGAGCTTACATTTTAGCAGGAAGCATTTTTAGGAAATGTTTATGTTACAGTTTGCCCTTCTTGACAAGGTGAGACATAAATGTCTACTTTATAGACATGAATTAAGATG-------GGAAGATATTTGGGGGAAATATTTACTCAAACGCTAAATAATAAAGGTACACAAAGGGCAAATTATATTAGATTTCTTTC----CCATTTGTTTTCTGTATCTCGTGCAATTCACCTTGATTCCCTTCAGTTTCTGTTTAATGGAGAAAGTGGTATTTTCATTATTTTAAGCTTCTAGGACAATGAAAGAATTTCTCTTTTTCATGAACTGAATCATAAATGAAAGGTAGGAAGAGTGTCCTATATCATATTTATTGTTCAACAAAACACTGCTCCACGGCTTAAATTCAGTTTGAA-AAAGAGAATTTATTGAAAGTCTAACACATACATAAAAGGCAGTAAAGACAAATGAAAAGAGGGCAGGATATTGAAGTATACAGACTTTAATGCTGAGTTCTGTA----AGTAAGTTACTCCACCTTACAGAGACTCAATTCCCTCTGATTTAGGAAGGCGATGCTAATGGGTATTGCATAGCTG-----TAAGTATAAAAATGTTATATTTAAGATAACCCCACAAGCTTCATATAAGG i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108092185 1178 - 128169293 TAGACCTCTAGTTTTCAAAGCCATCTTATGAGACAGTGACATCTCATGCAAG-TTGCTGCTTTCTGGCACAGTGGTCCTTGGTCAGCTGGCACAAATTATTTTAAAAACATCACTAGGTCC---AAAAATTTTGGATCACAATGGATGCAGATACACC----------------------------------------------TACATCCCTTTATAAATACCTATCAATTACATCCAATACAACATG--AAAAACTGACAAAAGAACGATGTTGATTGTAATAATGCCAG-TTAGCTTGCATC-----------TAAATGCCATTTTTATTATAGTAGATAATTATTTTACATGA-GTTTTGGTATAGCATAACTTTGAACCAAGGGCAGAGAGAGATGAAATAATTAAGTCTT----AACATATCAGGAATTGAAAAGTAAAGGGAGGTCATCTCTGAAGGTTAGTGACATAGCATTCATCTTCTTTTGTCATCTTTTCCATCATTCCCTGTATGCCTTATGGACAGCTCTCACTCAAGTTCAGAGAATAGCATGCAAAGATTAGCTACCAATTAATCTTTATGAAGGGAACTTAATTTCTAGCATGACTCAGCTTTCGTTTCTGCAGGAAGCATTTTTAGGAAAAATTTATTGTAGAGTTTGCCCTTCTTGACAAGGTGAGACATAAATGTCTACTTTATAGACATGAATTAAGATG-------GGAAGATATTTGTGGGAAATATTTACTCAAAAGCTAAATAATAAAGGTACACAAAGGGCAAATTATATTCGACTTCTTTC----CCACTCGTTTTCTATAGCTCAGGCAATTCACCTTGATTCCCTTCAGTTTCCGTTTAATGTAGAAAGTGGCATTTTCATTATTTTAAGCTTCTAGCACAATAAAAGAATTTCTTTGTTTTATGAACTGGATCATAAATGAAAGGTTGGAAGAGTTTCCTATATCATATTTATTGTTCAACAAAACACCACTCCATGGCTTAAATTCATTTTTAA-AAAAAGAATGTATTGAACATTAAACACACACATGAAAGGCAGTAAAGACAAATGAAAAGAGGGCAGGATATTGAAGTATACAGACTTTAGTGTGGAGTTCTGTATCACAGTCAGTTACTCCACCTTACAGAGGCTGGATTTCCTCTGATTCAGGAAGGCGATGCTAA-GGGGACTGCAAAGGTA-----TAAGTATAAAAATGTTATAGTTAAGATAACCCTGCAAGCTCTGTACAAGG i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 51743706 1133 - 55844845 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panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e papAnu2.chr3 58156078 13448 + 180432695 I e nomLeu3.chr17 55753728 11875 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 984962 17964 - 1195001 I a score=15555.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 49578 29 + 158759 gtagggacggctgcacaatgttatgactc s rheMac3.chr3 124562585 29 - 198365852 gtagggatggctgcacaatgttatgacta i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 125013944 29 - 192294377 gtagggatggctgcacaatgttatgacta i macFas5.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121532385 29 - 127223203 gtagggatggctgcacaatgttatgacta i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075583 38 + 128169293 I e papAnu2.chr3 58156078 13448 + 180432695 I e nomLeu3.chr17 55753728 11875 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 984962 17964 - 1195001 I a score=127827.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 49607 175 + 158759 tatttagtaccactgaactgtacacttaaaatggttaacagagtacattttatgttatgtgtattttaccacagtaaaaaaaTAAAATACCTTAGGAACATTTTCATGGAAAA-----------GCCCACATAAAATTCATTTTAATGCACGTGTTTATGCATAGCTTTGTATTTTTCTCTTTTCT s rheMac3.chr3 124562614 170 - 198365852 tatttagtaccactgaactatatacttaaaatggtaaacagagtacatt-----ttatgtgtattttacgacaataaaaaaaTAAAATACCTTAGGAACATTTTCATGAAAGA-----------GTTCACATAAAATTCATTTTAATGCATATGTTTATGCATAGCTTTCTATTTTTCTCTTTTCT i rheMac3.chr3 C 0 n 0 s macFas5.chr3 125013973 170 - 192294377 tatttagtaccactgaactatatacttaaaatggtaaacagagtacatt-----ttatgtgtattttacgacaataaaaaaaTAAAATACCTTAGGAACATTTTCATGAAAGA-----------GTTCACATAAAATTCATTTTAATGCATATGTTTATGCATAGCTTTCTATTTTTCTCTTTTCT i macFas5.chr3 C 0 I 1 s chlSab2.chr21 121532414 170 - 127223203 tatttagtaccactgaactatatacttaaaatggtaaacagagtacatt-----ttatgtgcattttatgacaataaaaaaaTAAAACACCTTAGGAACATTTTCATGAAAGA-----------GTTCACATAAAATTCATTTTAATGCATATGTTTATGCATAGCTTTCTATTTTTCTCTTTTCT i chlSab2.chr21 C 0 n 0 s calJac3.chr8 20075621 182 + 128169293 tatttagtacctctgaactgtacac-taaaatgattaac--agtacattttatgttatgtgtattttaccacaat-aaaaaaTAAAACACCTTAGAAACATTTTCACCAAAGAGACACAGGACTGACCACATAAAATTTATTTTAATGCTTATGTTTATGCATAAATTTCTATTTTTCTCTTTTAT i calJac3.chr8 I 38 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e papAnu2.chr3 58156078 13448 + 180432695 I e nomLeu3.chr17 55753728 11875 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 984962 17964 - 1195001 I a score=3611.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 49782 16 + 158759 CTTTATCTTCCAAAtt s macFas5.chr3 125014144 16 - 192294377 ATTTATATTCCAAATT i macFas5.chr3 I 1 n 1 s calJac3.chr8 20075803 16 + 128169293 ATTTATCTTCCAAATT i calJac3.chr8 C 0 n 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e rheMac3.chr3 124562784 0 - 198365852 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e chlSab2.chr21 121532584 0 - 127223203 I e papAnu2.chr3 58156078 13448 + 180432695 I e nomLeu3.chr17 55753728 11875 + 99891981 I e ponAbe2.chrUn 66728662 5219 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393505 984962 17964 - 1195001 I a score=1627.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 49798 5 + 158759 ctaat s nomLeu3.chr17 55765603 5 + 99891981 ctagc i nomLeu3.chr17 I 11875 C 0 s macFas5.chr3 67295574 5 + 192294377 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1195001 cagagaagggaatcccctctgtacctccaggatattcagtaaagaccactggaggttcatgccctagtgacagtgctcatttagctcaaaattactgatggctctagacttactcaacaaagtttaaagagaagatttaaaacaacaacagaaaaatactcatcctgaaggtactgaactgccttccacaacattgttcaaaggttgccaatcaaatctagatattcaatagcataacaccaaaa---taccc- i panTro4.chrUn_GL393505 I 17964 C 0 s ponAbe2.chrUn 66733881 250 - 72422247 cagagaagggaatcccctctgtacctccaggatatccagtaaagaccactggaggttcatgccctagtgacagtgctcatttagctccaaattacagatggctctagactaactcaacaaagtttaaagagaagatttaaaacaacaacagaaaaatactcatcctgaagttactgaactgcctgccacaacattgttcaaaggtagccaataaaatctagatattcaatagcataacatcaaag---taccc- i ponAbe2.chrUn I 5219 I 3 s nomLeu3.chr17 55765608 251 + 99891981 aagagaagggaatcctctctgtacatccaggatattcagtaaaggccactggag-ttcatgccctagtgatagtgctcatttagctgcaaattacagatggctctagactaactcaacaaagtttaaagagaagatttaaaacaacaacagaaaaatactcatcttgaagttactgaactgcctgccacaacattgttcaaaggtagccaataaaatctacatattcaataccataacatcaaaata-tgccc- i nomLeu3.chr17 C 0 I 1 s rheMac3.chr3 73818182 251 + 198365852 cagagaaggaaatcccctctgaacatccaagatattcagtaaagaccactggaggttcatgccctagtaatagtgctcagttagctctaaattacagatggctctagaataactcaacaatgtttaaagagaagatttaaaacagcaacaggaaaatactcatcctaaagttactgaactgcctgccacaacactgttcaaaggtagccaataaaatccagatattggatagcataacatcaaaa---tacccc i rheMac3.chr3 I 15233 C 0 s macFas5.chr3 67295579 251 + 192294377 cagagaaggaaatcccctctgaacatccaagatattcagtaaagaccacgggaggttcatgccctagtaatagtgctcagttagctctaaattacagatggctctagaataactcaacaatgtttaaagagaagatttaaaacagcaacaggaaaatactcatcctaaagttactgaactgcctgccacaacactgttcaaaggtagccaataaaatccagatattgaatagcataacatcaaaa---tacccc i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169531 251 + 180432695 CAGAGAAGGGAATCCCCTCTGAACATCCAAGATATTCAGTAAAGACCACTGGAGGTTCATGCCCTAGTGATAGTGCTCATTTAGCTCTAATTTACAGATGGTTCTAGAATAACTCAACAAAGTTTAAAGAGAAGATTTAAAACAGCAACAGGAAAATACTCATCCTAAAGTTACTGAACTGCCTGCCACAACACTGTTCAAAGGTAGCCAATAAAATCCAGATATTAAATAGCACAACATCAAAA---TACCCC i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704133 251 + 127223203 cagagaagggaatcccctctgaacatccaagatattcagtaaagaccactggaggttcatgccctagggatagtgctcatttagctctaaattacagatggctctagaataactcaagaaagtttaaagagaagatttaaaacagcaacaggaaaatattcatcctaaagttactgaactgcctgccacgacactgttcaaaggtagccaataaaatccagatattgaatagcataacatcaaaa---tacccc i chlSab2.chr21 I 13537 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103790498 16649 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=1870.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50056 3 + 158759 cca s panTro4.chrUn_GL393505 1003176 3 - 1195001 cca i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s gorGor3.chr7 103807147 3 - 158137892 cca i gorGor3.chr7 I 16649 I 218 s ponAbe2.chrUn 66734134 1 - 72422247 --a i ponAbe2.chrUn I 3 I 3 s nomLeu3.chr17 55765860 3 + 99891981 cca i nomLeu3.chr17 I 1 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e rheMac3.chr3 73818433 0 + 198365852 C e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I e chlSab2.chr21 5704384 0 + 127223203 C e papAnu2.chr3 58169782 0 + 180432695 C e macFas5.chr3 67295830 0 + 192294377 C a score=276621.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50059 140 + 158759 aaaaaaactctgacatgcaaagaagccgtaagatatatatacttaagacatatattaacaagataaaaataagtcatttataaatgacagaaaagaaggaaatttcaaggtccttaaagtaa-acatattttataaataca s panTro4.chrUn_GL393505 1003179 136 - 1195001 aaagaaactctgacatgcaaagaagccgtaagatata----attaagacatatattaacaggataaaaataagtcatttataaatgacagagaagaaagaaatttcaaggtcctaaaagtaa-atatattttataaataca i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734138 139 - 72422247 aaaaaacctctgacatgcaaagaagccggaaga-atatattattaagatatacattaacatgataaaaataagtcatttataaatgacagagaagaaggaattttcaaggtccttaaagtaa-atatattgtataagtaca i ponAbe2.chrUn I 3 C 0 s nomLeu3.chr17 55765863 141 + 99891981 aagaaacctctgacatgcaaagaagctggaagatatacattattaagatatatattaacaggataaaaataagtcacttataaatgacagagaagaaggaattttcaaggtccttaaagtaatatatattttataaataca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818433 109 + 198365852 --aaaatttctgacatgcaaagaagcaggaagatatATATTATTAAGATATATATTAACAGGATAAAAATAGGTCATTTATAAATGACAGAG------------------------------tatatattttataaagata i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67295830 139 + 192294377 --aaaatttctgacatgcaaagaagcaggaagatatATATTATTAAGATATATATTAACAGGATAAAAATAGGTCATTTATAAATGACAGAGAAGAAGGAATTTTCAAGGTCCTTAAAGTAatatatattttataaagata i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169782 139 + 180432695 --AAAATTTCTgacatgcaaagaagcaggaagatATATATTATTAAGATATATATTAACAGGATAAAAATACGTCATTTATAAATGACAGAGAAGAAGGAATTTTCAAGGTCcttaaagtaatatatattttataaagata i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704384 139 + 127223203 --aaaatttctgacatgcaaagaagcaggaagatatatattattaagatatatattaacaggataaaaataggtcatttataaatgacagagaagaaggaattttcaaggtccttaaagtaatatatattttataaagata i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 712735 12286 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103807150 218 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=20828.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50199 8 + 158759 tataggta s panTro4.chrUn_GL393505 1003315 8 - 1195001 tatagata i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734277 8 - 72422247 tatagata i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766004 8 + 99891981 tatagata i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818542 8 + 198365852 tatagata i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67295969 8 + 192294377 tatagata i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169921 8 + 180432695 tatagata i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704523 8 + 127223203 tatagata i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s saiBol1.JH378145 725021 8 - 18371965 cacacaca i saiBol1.JH378145 I 12286 I 62 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e gorGor3.chr7 103807150 218 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=30037.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50207 20 + 158759 aatacatatatatgtcaagg s panTro4.chrUn_GL393505 1003323 20 - 1195001 aatacatatatatgtcaggg i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734285 20 - 72422247 aatacatatatatgtcaaat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766012 20 + 99891981 aatatatatatatgtcaaat i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818550 16 + 198365852 a----atatatatGTCAAAT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67295977 16 + 192294377 a----atatatatGTCAAAT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169929 16 + 180432695 a----atatatatgtcaAAT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704531 16 + 127223203 a----atatatatgtcaaat i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725029 62 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103807150 218 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=7405.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50227 3 + 158759 cac s panTro4.chrUn_GL393505 1003343 3 - 1195001 tac i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734305 3 - 72422247 tac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766032 3 + 99891981 tac i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818566 3 + 198365852 TAC i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67295993 3 + 192294377 TAC i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169945 3 + 180432695 TAC i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704547 3 + 127223203 tac i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s saiBol1.JH378145 725091 3 - 18371965 CAT i saiBol1.JH378145 I 62 I 11832 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e gorGor3.chr7 103807150 218 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=117641.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50230 46 + 158759 ttaaatgaaaattgaatatag---aaaaatagaagttataaaatgaaaa s panTro4.chrUn_GL393505 1003346 49 - 1195001 ttaaatgaaaattgaacataggagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734308 49 - 72422247 ttaaatgaaaattgaacataggagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766035 49 + 99891981 ttaaatgaaaattgaacacagaagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818569 49 + 198365852 TTAAATGAAAATTGAACATaggagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67295996 49 + 192294377 TTAAATGAAAATTGAACATaggagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58169948 49 + 180432695 TTAAATGAAAGTTGAACATAGGAGAAAAATAGaagttataaaatgaaaa i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704550 49 + 127223203 ttaaatgaaagttgaacataggagaaaaatagaagttataaaatgaaaa i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103807150 218 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2474804 14753 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=501.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50276 1 + 158759 a s gorGor3.chr7 103807368 1 - 158137892 a i gorGor3.chr7 I 218 I 2221 s ponAbe2.chrUn 66734357 1 - 72422247 a i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818618 1 + 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I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=570501.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50373 281 + 158759 aaaaaatagaagctttacaaactaaaggacaaagggtaaaccaaaataagaaagccagaaactcactgataagtcagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaattaatatctcaaaaaggatgggtgggggaattataggtgaataaagaatGGTACACTCATTCCTGAGGGCACCGAGGAGGGAAGATAGCTTTAGATTTctaagggagggtattatccattcatgaaggtccaaccccatgaccaaacaccttccagtaagccccacctgcaaca s panTro4.chrUn_GL393505 1003491 281 - 1195001 acaaaatagaagctttacaaactaaaggacaaagggtaaactaaaataagaaagccagaaactcactgatatgtcagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaatcaatatctcaaaaaggatgggtggggaaattataggtgaataaagaatggTACACTCATTCCTGAGGGCAGCGAGGAGGGAGGATAGCTTTAGATTcctaagggcgggtattatccattcatgaaggtccaaccccatgaccaaacacctcccagtgagccccacctgcaaca i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734454 281 - 72422247 aaaaaatagaagctttacaaactaaaggacaaagggtaaactaaaataagaaagccagaaactcactgatacgtgagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaattaatatctcaaaaagGATGGGTGGGGGAATTATAGTTGAATAAAGAATGGTACACTCATTCCTGAGGGCACCGAAGAGGGAGGATAGCTTGAGATTcctaagggagggtattatccattcatgaaggtccaaccccatgacccaacacctcccagtaatccccacctgcaaca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766180 279 + 99891981 -aaaaatagaagctttacaaactgaaggacaaagggtaaactaaaataagaaagccagaaactcactgatatgtgagccaatatgcagcagtgtaacatacatgtaactgatatctcaaaaagGATGGGTGGGGGAATTATAGTTGAATAAAGAATGGTACTCTCATTCCTAAGGGCACCGAGGAGGGAAGATGGTTTGAGTTTcctaagggagggtattatccattcatgaaggtccatccccatgacccaacacct-ccagtaagccccacctgcaaca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818715 246 + 198365852 caaaaatagaagctttacaaactgaaggacaaaggggaaactaaaataaaaaagccagaaactcactgatacatgagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaactggtatctcaaaaagggTGGGTGGGGGAATTACAGTTGAATAAagaatgggacactcattcctgag-----------------------------------ggaggggtattatccgttcctgagggtccattcccatgacccaacacctcccagtaagccctacctgcaaca i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67296142 246 + 192294377 caaaaatagaagctttacaaactgaaggacaaaggggaaactaaaataaaaaagccagaaactcactgatacatgagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaactggtatctcaaaaagggTGGGTGGGGGAATTACAGTTGAATAAagaatgggacactcattcctgag-----------------------------------ggaggggtattatccgttcctgagggtccattcccatgacccaacacctcccagtaagccctacctgcaaca i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58170094 246 + 180432695 caaaaatagAAGCTTTACAAACTGAAGGACAAAGgggaaactaaaataaaaaagccagaAACTCACTGATACACGAGACAATATGCAGCAGTGTAACATACATGTAACTGGTATCTCAAAAAGGGTGGGTGGGGGAATTACAGTTGAATAAAGAATGGGATACTCATTCCTGAG-----------------------------------GGAGGGGTATTATCCGTTCGTGAGGGTCCATTCCCATGACCCAACACCTCCCAGTAAGCCCTACCTGCAACA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704696 246 + 127223203 caaaaatagaagctttacaaactgaaggacaaaggggaaactaaaataagaaagccagaaactcactgatacatgagacaatatgcagcagtgtaacatacatgtaattggtatctcaaaaagggtggGTGGGGGAATTACAGTTGAATAAagaatgggacactcattcctgag-----------------------------------ggaggggtattatcccttcgtgagggtccattcccatgacccaacacctcccagtaagccctgcctgcaaca i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103807369 2221 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2489558 2002 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I e calJac3.chr8 20075819 0 + 128169293 I a score=157796.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50654 57 + 158759 ttggggatcaaattttaacatgaga-ttggaaggggcaagcattcaaaccatagcaAG s panTro4.chrUn_GL393505 1003772 57 - 1195001 ttggggatcaaattttaacatgaga-ttggaagggtcaagcattcaaaccatagcaAG i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66734735 58 - 72422247 ttggggatcaaattttaacatgagatttggaaggggcaagcattcaaaccatagcaAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55766459 58 + 99891981 ctggggatcaaattttaacatgagatttggaaggggcaagcattcaaaccgtagcaAG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73818961 58 + 198365852 cttggtatcaaatttcagcatgagatttggaaggggcaagctttcaaaccatagcaAG i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67296388 58 + 192294377 cttggtatcaaatttcagcatgagatttggaaggggcaagctttcaaaccatagcaAG i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58170340 58 + 180432695 CTTGGTgtcaaatttcagcatgagatttggaaggggcaaGCTTTCAAACCATAGTAAG i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5704942 58 + 127223203 cttggtatcagatttcagcatgagatttggaaggggcaagctttcaaaccatagcaAG i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108108119 58 - 128169293 ttggggatcaaattttaacatgagatttggagaggacaagcattcaaacggtagcaAA i calJac3.chr8 I 14649 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103807369 2221 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2489558 2002 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51744948 14651 - 55844845 I a score=4450278.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 50711 1367 + 158759 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gorGor3.chr7 103809611 2207 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2492399 3 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51760998 193 - 55844845 I a score=15165.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 53104 4 + 158759 CACT s panTro4.chrUn_GL393505 1006229 4 - 1195001 CAGT i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s panPan1.JH650444 2492402 4 - 4227291 cact i panPan1.JH650444 I 3 I 322 s ponAbe2.chrUn 66737211 4 - 72422247 CACT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55768935 4 + 99891981 CACT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73821765 4 + 198365852 CACT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67298882 4 + 192294377 CACT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58172837 4 + 180432695 cact i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5707438 4 + 127223203 CACT i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108110667 4 - 128169293 CACT i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e 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rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67300215 2 + 192294377 gg i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58174734 2 + 180432695 GG i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5708780 2 + 127223203 gg i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108112068 2 - 128169293 ag i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103811820 700 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1002039 26432 - 1121937 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e canFam3.chr18 51761325 1320 - 55844845 I a score=1833906.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 54444 637 + 158759 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gorGor3.chr7 103813639 1473 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1028475 2761 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2495611 1391 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 14340318 I e rheMac3.chr3 73824845 455 + 198365852 M e chlSab2.chr21 5710798 0 + 127223203 C e papAnu2.chr3 58175381 679 + 180432695 I e macFas5.chr3 67302578 0 + 192294377 C e panTro4.chrUn_GL393505 1009397 534 - 1195001 M a score=-282.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 56663 1 + 158759 C s ponAbe2.chrUn 66740716 1 - 72422247 G i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55772418 1 + 99891981 G i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108114602 1 - 128169293 G i calJac3.chr8 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_70142.1-11303 3499 1 - 11303 A i tupBel1.scaffold_70142.1-11303 N 0 N 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103813639 1473 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1028475 2761 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2495611 1391 - 4227291 I e otoGar3.GL873564 12709511 46758 + 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panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s panPan1.JH650444 2497003 1 - 4227291 t i panPan1.JH650444 C 0 I 1762 s gorGor3.chr7 103815112 1 - 158137892 t i gorGor3.chr7 I 1473 C 0 s ponAbe2.chrUn 66741917 1 - 72422247 t i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55773620 1 + 99891981 t i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108115838 1 - 128169293 t i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e rheMac3.chr3 73824845 455 + 198365852 M e canFam3.chr18 51764072 2140 - 55844845 I e chlSab2.chr21 5710798 0 + 127223203 C e papAnu2.chr3 58175381 679 + 180432695 I e macFas5.chr3 67302578 0 + 192294377 C a score=1365.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 57857 1 + 158759 t s panTro4.chrUn_GL393505 1011041 1 - 1195001 t i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s gorGor3.chr7 103815113 1 - 158137892 t i gorGor3.chr7 C 0 I 1761 s ponAbe2.chrUn 66741918 1 - 72422247 t i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55773621 1 + 99891981 t i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108115839 1 - 128169293 t i calJac3.chr8 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2497004 1762 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73824845 455 + 198365852 M e canFam3.chr18 51764072 2140 - 55844845 I e chlSab2.chr21 5710798 0 + 127223203 C e papAnu2.chr3 58175381 679 + 180432695 I e macFas5.chr3 67302578 0 + 192294377 C a score=503537.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 57858 673 + 158759 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nomLeu3.chr17 55774289 406 + 99891981 TTGAATTTATCTTACTATTCCAATGATCCAGTAAAGACATTCTATGCTTGTACACCACATATTTTCTTCGATTATTGATATATTTTAGATAGAATTTTATGTCTGGCTTTCACTTTGGCCTGGTCCCTACCTCAAGCATAAGGTCAAGATTTTCCATGGGTTCTTTTCTGGTGCTACTACCTGCCGATGTGGGGTCATGTCCTAGTCTATCT---------------------------TGAGGGAACCCC------------CCTGTTCATTATT-GTCAGAGTGAGACTGCTAAGTCTTGATTTCCCTGGACAACTTCATTGCATGACTTTTAATGTGATTTTTA--AATATACTCTTTACTGGACAATAAATTATATAGTTAGCTGAGTAAGAGATATGGTCAGGAAGAGGCATTGCCTCATTCAGCTTTTCTGTTTGGTGAACT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108116501 409 - 128169293 CTGAATTTATCATACTATTTCATTGATCTATTAGAGATATTCCACACCTGTAAACCACATATTTTCTTCGATTGTTAATATAGTTTAGATAGAATTTCATATCT-GCTTTCACTTTGGTCTGGTCTCTACCTCAACTATATAGTAAAGACTTCTGGTGGGTTCTTTTCTTGTACTACTGCCTACCAGTGTGGGGTCATGTCCTCATCTGTCTTGGACTAGGGACACCTAGTCCAATGAATGAGGGAACACC------------CCTGTTCATTATTGGGCAGAGTGA------------------------GACAACTTCATTGCATGACTTCTAATATGATTTTTA--AATATACCCTTTACTGGACAATAAATTATATGGTTACCTGAGTAAGAGATATGTCCAGCAAGAGGCATTGCCTCATAGAGCTTTTCTATCTGGTGAACT 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panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s panPan1.JH650444 2501083 2 - 4227291 aa i panPan1.JH650444 I 530 C 0 s rheMac3.chr3 73828237 2 + 198365852 aa i rheMac3.chr3 C 0 I 577 s papAnu2.chr3 58179067 2 + 180432695 aa i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5713763 2 + 127223203 aa i chlSab2.chr21 C 0 I 18 s canFam3.chr18 51769005 2 - 55844845 ga i canFam3.chr18 C 0 C 0 e rhiRox1.KN300005v1 672584 28899 - 4311341 I e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103818525 1549 - 158137892 M e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e macFas5.chr3 67305550 0 + 192294377 C e nomLeu3.chr17 55776972 0 + 99891981 C e ponAbe2.chrUn 66745958 0 - 72422247 C a score=2621.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 61934 15 + 158759 ---aagaaggaaggaaat s panTro4.chrUn_GL393505 1015112 15 - 1195001 ---gaaaaagaaggaagg i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s panPan1.JH650444 2501085 15 - 4227291 ---aagaaggaaggaaag i panPan1.JH650444 C 0 I 395 s ponAbe2.chrUn 66745958 6 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saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103818525 1549 - 158137892 M e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I a score=600.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 62403 1 + 158759 g s panTro4.chrUn_GL393505 1015563 1 - 1195001 g i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66746443 1 - 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55777106 1 + 99891981 g i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103818525 1549 - 158137892 M e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58179521 1 + 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aaagcaaga---------------aaa------aaagaaagaaagaaagaagggaggaa------ggaaggaaggaaaggaggaagagagaatggaaaa----aggaagggaaagaaagaaagtaaagagaaggaaggaaggaaagaaggaaagaag i macFas5.chr3 I 1 I 5 s papAnu2.chr3 58179522 136 + 180432695 aaagcaaga---------------aaaaaaaagaaagaaagaaagaaagaagggaggaa------ggaaggaaggaaaggaggaagagagaatggaaaaagagaggaagggaaagaaagaaagtaaagagaaggaaggaaggaaagaaggaagaagg i papAnu2.chr3 I 1 C 0 e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103818525 1549 - 158137892 M e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I a score=910.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 62532 1 + 158759 A s panTro4.chrUn_GL393505 1015690 1 - 1195001 a i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66746569 1 - 72422247 A i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55777256 1 + 99891981 A i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58179658 1 + 180432695 a i papAnu2.chr3 C 0 I 1398 e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103818525 1549 - 158137892 M e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I e macFas5.chr3 67306146 5 + 192294377 I a score=146182.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 62533 297 + 158759 CCGCAAATATTAGAAATTCTGGGTTTGTTAGAGAATATGTCAAACTG----TTTTTTTTTTTCACTTGAAAGGAAAGAGTATCTGCCATTGAAgattggatgtcttgttggtgatattgttgttcttatcttccacatgattactgagtttgtgcctagtctttccattactaagacaaaagtgttgaagtctgcaaatataattttggatttttctagttcacctttgatttctttcatgtttttcctcatgtatttggaggttctgttgttagctgcataccctaattagtaggatgtt s panTro4.chrUn_GL393505 1015691 290 - 1195001 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panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66746872 465 - 72422247 acatcttcttgataactgattattatattatctattatctctcatctctgatactatttcttgctctgaactctgttgtgtctaatatcaatgtagtccttccacagctttatttcagtgtttccatgatatggctttctccatatcttgatgataacctatttatatctctatatatttggagcaagATATAAAATTTAGAGTTGATTttttaaagat-ttttcaagatgtaattcttatttatttttgttctatttgacattctctgagtttcctatatctgaagtttgattttctgtcac-ttcttttagaatgtttttggcagttattttgaaaaatatttctttt-ctccattattttttcctcttttctttttgggatttcaattataactagggtaggtaatttcatcTCAGTCTTATGCAGGTGCTTTTTCTCAGAGTCCCAGGAATGTAGCCTTCTCAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55777554 466 + 99891981 acatcttcttgagaattgattattatattatatattatctctcatctctgataatatttcttgttctgaactctgttgtgtctaatatcaatgtagtctttccacagctttatttcagtgtttccatgatatggctttctccataccttgattataacctatttatatctctatatatttggagcaagATATAACATTTAGAGTTGATtttttaaagatattttcaagatgtaattcttatctatttttgttctatttgacattctctgagtttcctgtatctgaagtttgattttctgtcacttttttttataatatttttgacagttattttaaaaaatatttcttctgctccattattttttcctc--ttctttttgggatttcagttgtaactagggtaggtaatttcatctcagtctcatGCGGGTACTTTTTCTCAGGGTCTCAGGAATGTAGCCTTCTCAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103820077 698 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108119180 215 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58179659 1398 + 180432695 I e macFas5.chr3 67306146 5 + 192294377 I a score=116398.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 63296 189 + 158759 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tupBel1.scaffold_124140.1-170013 63480 135 - 170013 ----acacagccttgaaatctgggaagtctaagatcaagtcactggcagattcagtgtctg-gccagagataattctctaa-tcatagatggccccttttggctgtgtccccacatggccaaagggatgaaggaactcaca i tupBel1.scaffold_124140.1-170013 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 725094 11832 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103820776 6504 - 158137892 I e tarSyr2.KE946558v1 1031322 4664 - 1121937 I e panPan1.JH650444 2501496 2037 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58179659 1398 + 180432695 I e macFas5.chr3 67306146 5 + 192294377 I a score=11387.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 63663 14 + 158759 ttgagc-tattttat s panTro4.chrUn_GL393505 1016815 15 - 1195001 ttgagcttcttttat i panTro4.chrUn_GL393505 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66747705 15 - 72422247 ctgagcttcttttat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55778393 15 + 99891981 ctgagcttcttttat i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108119573 14 - 128169293 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calJac3.chr8 108119623 303 - 128169293 aaagacactaatctcattcataagggcttgcgcccccaagacccagtcattt---------cccC-------------------------------------------------------------------------------AGTGTTC----------------------------------TGCTGTCCCTGATCTGTATCATATACAG-ACTCTCTTGGAGTACTTATCAATTGTTTGAGAGATCCCAATGGGTATGTGGGGAAAAAG-TTTTCAAGATGGTAGATCTTTCCCAATTTCTGCAGCTGTCAG-------------TGACCAGCACCACCTTGCCTTTAGGAATTAATTGATTATTTCGGCTTTA-TTGTAATAGTGGTATCTGTTTGCATCTGTCCTATGTAA----AGGCATTCATCCTTTTACTCTTTG i calJac3.chr8 I 36 C 0 s tupBel1.scaffold_124140.1-170013 63629 419 - 170013 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i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66749687 133 - 72422247 cactgcactccagcctgggcgacagagggagactccacctcaatgataataataataatatgtgcataatgtattgctgagtatttgacatgtagaaatgtaatatgtctataacatattttccagtaacatc- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 55780646 128 + 99891981 cactgcactccagcctgggcgacagagcaagactccatctc------aataataataatatgtgcataatgtattgctgagtatttgacatgtagaaatgtaatatgtctataacatattttccaataacatca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 736940 4040 - 18371965 I e gorGor3.chr7 103820776 6504 - 158137892 I e panPan1.JH650444 2504757 3515 - 4227291 I e rheMac3.chr3 73828239 577 + 198365852 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108121369 2840 - 128169293 I e chlSab2.chr21 5713952 382 + 127223203 I e papAnu2.chr3 58179659 1398 + 180432695 I e macFas5.chr3 67306146 5 + 192294377 I a score=1754.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 65769 3 + 158759 aaa s panTro4.chr15 18342991 3 + 99548318 aaa i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66749820 3 - 72422247 aaa i ponAbe2.chrUn C 0 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aaaaatatttgagaaatacaccaaacaaacagtaaaatgacagacataaatagaataataccaattataatattatatgtgagcagattaaataatccaatcaagaggtagagatggtcagactggattaaaacaagtgatcccaatatacgctgtctagagaaggcacatttgagatgcaaggatactaatggattgaaagtaaaaagatgacaaaaaatatcatacaaagagcaaccataagaacactgaactcattatactcctaatacacaatacagactattaaaaatgtgaataggattttaaaaatttatattgtagtaataagggggtcaactcttcaggaagacatagctattacaatcatatatgcactggtatgagctaaattgtttcctctatatagatgctgaaatcctaacctctgaatatgacctcattaggaaataggttctttgcaggtgatcaagttaagataaaatcagatgagccttaatccaatatggctgatgtccttatacaaagaagaaatttgagtagagggagacacacacacagggagagtaccatgtgattatgagggcagagattagccaaggaatgccaaagactgccattaaaccaccagaaactag-aaacaaggcatagaacagactttctctcatagcccttgaagggaccatccctgctgatgcctcaatctcaaacttttagcttccaagactat i macFas5.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5714686 725 + 127223203 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i papAnu2.chr3 I 1398 C 0 s chlSab2.chr21 5715411 445 + 127223203 aagataataaatttatgttattcaaggcacccagtttgtg-tacttggttaaggcagccctagaaagctaatacatgaactaataacagaatataataacatgaagcaaaaaatgacaaaaGAGGAGCatcagcaaaatggcagtggagacagctgcaatctttcatttccccacagaaacatcaaacaactaaaagaaactaccagaatgaactttaccaaaactctggaaaatggtgaaaagattacaacaaccaagtgaaagtagactcaagtaaaagacaacttgaaaactttatgacatttttaacttgcctgtgccccagcaaattggcagttttgaagtgtcagaagcccacgttcccagtgtggaacactggtccatggctccaaaggaacaggagaagatcttacctgcaaattattatgtatgtctgttctgactg i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 736940 4040 - 18371965 I e gorGor3.chr2A 19483061 6504 - 111351968 I e panPan1.JH650444 2504757 3515 - 4227291 I e canFam3.chr18 51769239 2841 - 55844845 I e calJac3.chr8 108121369 2840 - 128169293 I a score=1627896.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 67274 700 + 158759 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tcattaggccatggatgtatgtcataggactggccaag-agaactgcagctaaattggagtgtagggagt----gaaat-ggagaactcaaagatgactctcagCACTGGAAGGTGACAGCTGTCACTG-AAGC-ATGCTGATGCCTCTT-TTAAGAGAGTTACTC-GG-GAATGGC------------AAGATCAAAACTTC-----------TCAAATTTATGAAAAATATTGTTTTCAGAACGAATGACTTTGGGATCAGAAAGCCATCATTCTAATTGATGGTTCCATGACTACACAGGCTCAC-------TCACAAGAGCAAAATTAAATAATCACAAAGGTGCTTC-----------CTGACAATTCTAGAGAATAGGGATTTACTGTAAcatctttctga-ttttaggagaggta-gcagttccctttttagcctaaatgtta-ttttttttaaagctcagccaagagactccattataattttcaaaaattgtgta---acttaacttctcatattaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 73832737 475 + 198365852 tcgttaggtcatggatgtatttcgtaggactggccaag-agaactgcagctaaattggagtgtagggagt----gaaat-ggagaactcaaggatgactctcagcactggaaggtgacagctgtcactg-aagc-atgctgatgcctcttattaggagaattactt-gg-gaatggc------------aagatcaaaacttc-----TCACTTTCAAATTTATGAAAAATATTGTTTTCAGAATGAATGACTTTGGGATCAGAAAGCCATCATTCTAATTGATGGTTCCATGACTACACAGGCTCAG-----ACTCACAAAAGCAAAATTAAATCATCATAAAAGTGCTTC-----------GATGCAATTCTAGAGAACAGAGAATTATTGTAACATCATTCTGA-TTTTAGGAGAGGTA-GCAGTTCCCTTTTTAGCTTAAACACTA-TTTTTTTTAAAGCTCAGTCAAGAGACTCCATTATAATTTTCAAAAATTGTGTA---AC--AACTTCTCATATTAA i rheMac3.chr3 C 0 I 3 s macFas5.chr3 67310078 475 + 192294377 tcgttaggtcatggatgtatttcgtaggactggccaag-agaactgcagctaaattggagtgtagggagt----gaaat-ggagaactcaaggatgactctcagCACTGGAAGGTGACAGCTGTCACTG-AAGC-ATGCTGATGCCTCTTATTAGGAGAATTACTT-GG-GAATGGC------------AAGATCAAAACTTC-----TCACTTTCAAATTTATGAAAAATATTGTTTTCAGAATGAATGACTTTGGGATCAGAAAGCCATCATTCTAATTGATGGTTCCATGACTACACAGGCTCAG-----ACTCACAAAAGCAAAATTAAATCATCATAAAAGTGCTTC-----------GATGCAATTCTAGAGAACAGAGAATTATTGTAACATCATTCTGA-TTTTAGGAGAGGTA-GCAGTTCCCTTTTTAGCTTAAACACTA-TTTTTTTTAAAGCTCAGTCAAGAGACTCCATTATAATTTTCAAAAATTGTGTA---AC--AACTTCTCATATTAA i macFas5.chr3 C 0 I 3 s papAnu2.chr3 58184151 469 + 180432695 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ttgttaggtcatggatgtatttcataggactggccgag-agaactgcagctaaattggagtgtagggagt----gaaat-ggagaactcagggatgactctcagCACTGGAAGGTGACAGCTGTCACTG-AAGC-ATGCTGATGCCTCTTATTAGGAGAATTACTT-GG-GAATGGC------------AAGATCAAAACTTC-----TCACTTTCAAATTTATGAAAAATAATGTTTTCAGAACGAAAGACTTTGGGATCAGAAAGCCATCATTCTAATTGATGGTTCCATGACTACACAGGCTCAG-----ACTCACAAAAGCAAAATTAAATCATCATAAAAGTGCTTC-----------AGTGCAATTCTAGAGAACAGAGAATTATTGTAACATCATTCTGA-TTTTAGGAGAGGTA-GCAGCTCCCTTTTTAGCTTAAACGCTA--TTATTTGAAAGCTCAGTCAAGAGACTCCATTATAATTTTCAAAAATTGTGTA---ACTTAACTTCTCATATTAA i chlSab2.chr21 C 0 I 3 s calJac3.chr8 108125674 478 - 128169293 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tggtcagtacatggatacgttttaaaggaagtgcaaagaagagctatggataaattgca-tgaagggagtaagagaaatgggagaattcaaggatgactccaagctctagaagatgagcccattcagtgaaaga-atgatgatgacttttactataaga--tgctt-ggagaataactggttcaaaaggaaaataataaattc-----taatttggagattcatggcaagtGTTGTCTCCAGAACCAATGATTTTGCAGTCAGGAAGCGAGCATTCCATTGTGTAGCT-CATGACTGTACAGGCTCAGATATAATCCATGAGAGC-AAATTAAATTACCATGAAAGTAATTAAATTACTCCAGAAGGTAATTCTGGAG-ATAGA-AATTAGTGCAA-----TTCTGG-TTTGGACAGAGGTAGGTAACTTCCTTTCTAGCCGGAGATTCA----TATTTAAAGGTCAGCCAAGAGATTGCACCATCATCTCCAACAATTATGTACATGTTTAATTACTCGCATTCA i canFam3.chr18 C 0 C 0 e saiBol1.JH378145 741843 1754 - 18371965 I a score=242760.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 70122 99 + 158759 AT-ACCACTATGCTTAAATTAGTCAAAACATTTTCCCCATCTACAACTC-TATCTTGTCATTGCAATCATTTTCACAAAAGTGACTGCAGCTCACAGACCC s panTro4.chr15 18347343 99 + 99548318 AT-ACCACTATGCTTAAATTAGTCAAAACATTTTCCCCATCTACAACTC-TATCTTGTCATTGCAATCATTTTCACAAAAGTGACTGCAGCTCACAGATCC i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66754158 100 - 72422247 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rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 67310988 2 + 192294377 AT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 58185007 2 + 180432695 AT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 5719158 2 + 127223203 AT i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 108126584 2 - 128169293 AT i calJac3.chr8 C 0 C 0 s saiBol1.JH378145 743597 2 - 18371965 AT i saiBol1.JH378145 I 1754 N 0 s canFam3.chr18 51775573 2 - 55844845 AT i canFam3.chr18 C 0 C 0 a score=332535.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 70560 96 + 158759 CAGAGAGATAATTTTATCTTGAAGATTGTTAAATTATAATggtgattcactaccttgccacgtctctgagtc-aaaaattaggtctttgtttaggaa s panTro4.chr15 18347781 94 + 99548318 C--AGAGATAATTTTATCTTGAAGATTGTTAAATTATAATGGTGATTCACTACCTCGCCACGTCTCTGAGTC-AAAAATTAGGTCTTTGTTTAGGAA i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 66754597 96 - 72422247 CAGAGAGATAATTTTATCTTGAAGATTGTTAAATTATAATGGTGATTCACTACCTTGCCACGTCTCTGAGTC-AAAAATTAGATCTTTGTTTAGGAA i ponAbe2.chrUn C 0 I 244 s nomLeu3.chr17 55785573 96 + 99891981 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TGCTCTGTGCTCTGAGACTGAAAGCCCAGCCTTGCCTCTCACCGCTGCCTTGACTGTGTCCCC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66988675 63 - 115148730 TGCTCTGTGCTCTGAGACTGAAAGCCCAGCCTTGCCTCTCACCGCTGCCTGGACTGTGTCCCC i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34745677 63 + 96509753 TGCTCTGTGCTCTGAGACTGAAAGCCCAGCCTTGCCTCTCACCGCTGCCTTGACTGTGTGCCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 e tarSyr2.ABRT02443347v1 1517 69 - 17224 I a score=-1486.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 74292 3 + 158759 ATG- s panTro4.chrUn_GL393527 172758 3 - 341619 ATC- i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66988738 3 - 115148730 AGC- i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34745740 3 + 96509753 ATC- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 1586 3 - 17224 -TTG i tarSyr2.ABRT02443347v1 I 69 I 2924 a score=53831.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 74295 106 + 158759 TGCTGTGAAGTGAATGATGTCTTCTAAATTCATGCTGAGCCCTAATTGCTGAAAAGTGTAAGACATGCAATGGGGGGATTATGTGCATCTTCCCGACACCAACATG s panTro4.chrUn_GL393527 172761 106 - 341619 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TCACATT---TTCCTTCCTAGTTATTACATAAGTTATCATAGTTAATTACAATGGCTGCCTTCTGAATAATAAATAGTCCTTCAAAATGATGTTAAGA----GATCCGAATCCGTGTGCTTCAGAAGTTGCAAGAAG-------CTCTGTCTAGCCCAGGTGCCAGTGACTCTCCTGGAGTGCTCCATGCATCTGGCCCCACAGAGTCCCTCTGTGCTGTCG------TATCACCCACCGCCTTCTGTGAATGAGATATTCTGATAAGAATCCCGGTGGATGCTCTTTGAGCCAGTTTCCACACAAAT--CC i macFas5.chr10 I 309 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 5272 293 - 17224 TAAATTTACCTTTGGTTCTGAGTTTTCCAAATGCTATTTTAATCAAC-----TGATCATCTTCAGAATAATCAACAGACTTGCAAAATTGTGTTAAAATTATGATTCAAATCCATGTGCTCAGGAAGTGGCATGATGAGCCACACCTTGTCTAGCAGAGGCACCAGTGCCTCTCTCAGAAT--------CTACTGGCCCAGCAGAATCACTCTCTGTTGGAA------TATTACCTATTGCCTTTTGTGAATCAGATTTTCTGATTAAATTCCTAGTGGTGTATATTTGAGTCAAGGGACACTCATTCTGTC i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 a score=1710.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 74924 4 + 158759 TATG s panTro4.chrUn_GL393527 173390 4 - 341619 TATG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66989374 4 - 115148730 CATG i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34746677 4 + 96509753 CATG i macFas5.chr10 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GACAATCACAGGTCTCTAGACTCACAGCTCATGACCGTCCTCTGCAGACACAGCTTCTCCCCGGATGGCTGAGGGTTGTCATTGTCTGTGTCCTTCCTTGTGCATGACAACAGGAGACATAGAAGGTC--T i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66989403 129 - 115148730 GACAATCACAGGTCTCTAGACTCACAGCTCATGACTGTCCTCTGCAGACACAGCTTCTCCCCAGATGGCTGAGGGTTGTCATTGGCTGTGTCCTTCCTTGTGCATGACAGCAGGAGACATAGAAGGTC--T i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34746707 131 + 96509753 GACAATCACAGTTAGCCTGACCCATAGCTCATGATAGCCCTCTGCAGACACAGGTTCTCCCCAGATGGCTGAAGGTAGTCATTGGCTGTGTCCTTCCTTGTGCATGACAACAGGAGACAGAGCAGGTCTGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 5918 123 - 17224 GACAGTAAGAGATCTGAAGGATTATA------AATCTCCCTCCGTAAGGATAGCTTCTCTCTACATGGTTAAGTGCTGTCTTTGGCTATGTCATTTCTTGGGCATCATAATTGGGGACAGAGAAGATC--T i tarSyr2.ABRT02443347v1 I 323 I 38 e otoGar3.GL873598 58494 319 + 9074155 I a score=350469.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 75083 728 + 158759 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GTAAGCAGCCCTGCAAGCCAGGTTCTGAGCAAGCCCTCCTGTGTGGGGCCCTCTTACCTGGACATAGGTGtgtaaaccaaaaatgaaactctaagctccctaaccaactgaatgaactcctcctctcagccaaggacacaccaaaatcaacctgaaatacaa-tgcagtccatgatcggaacggatgattggatatgccttaacttaccctcttccctttaaaattcaggcacaactgaccag-ttttaatatgaagacagagaccttgagactgacaaagaaaactctttatagcaataagataccaatgtgacagataccacgtcctaagagaaatcaaagtattttccccaagatattgttatttaatg-tatttaaaaatgcctctgcaaagctggttcttgtgggaaaaatctacattccgtaaagatt------cctttttaagtctctttcctgacccagagagatttaactaagagtttggcaccttttaagtctactaagaaacaattacaatctattctctctgaagcctgctacctggaggcttcatctgcatgatgcaaccttggctccaaaaccctttttctaaacccagaaactcccttgtgttgattacaggtcattagataaactctttcaaccacctatgaaatctttgaatccacctatgacctggaagtccccaacatccccccctccttcaggctgtcctgcctttccatatcaaa i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66989532 731 - 115148730 GTAAGCAGCCCTGCAATCCAGGTTCTGAGCAAGCCCTCCTGTGTGGGGCCTTCTTACCTGGACATAGGTGtgtacaccaaaaatgaaactctaagctcccaaaccaactaaatgaactcctcctctcagccaaggacacaacaaaatcaacctgaaatacaa-tgcagtccatgatcagaaaggatgattgcatatgccttaacttaccctcttccctttaaaattcaggcaaaactgaccagcttttaatatgaagacagacaccttgagactgacaaagcaaactctttatggcaataagataccaacgtgacagataccatgtcctaagagaaatcaaagtattttctccaagatattgttatttaatg-tacttgaaaatgcctctgcaaagccggttcttgtggg-aaaatctacattctgtagagattcctacccctttttaagtctctttcctgacccagagagatttaactaagagtttggcaccttttaagtcagctaagaagcaattacagtctattctctctgaagcctgctacctggaggcttcatctgcatgatgcaaccttggctccaaaaccctttttctaaacccagaaactcccttgtgttgattacaggtcattagataaactctttcaaccccttatggaatctttgaatccacc-atgacctggaagtccccaacat-cccccctccttcgggctgtcctgcctttctgtatcaaa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34746838 730 + 96509753 GTAAGCAGCCCTGCAAGCCAGGTTCTGTGCAAGCCCTCCTGTGTGAGTCCCTCTTACCTGGACACAGGTGtgtaaaccaaaaatgacactatatgctctctagccaactgcataaactcctcctctcagccaagaacacaccaaaatcaacctgaaatacaagtacaggccatgatgggaatggatgattgaatatgccttaatttacctaccaccctttacaattcagacacaactgaccagtttttgatattaagacagagaccttgagactgacaaaggaaactctttatagtagtaagataccaacatgacagataccaggctcgaggagaaatcaaggtattttctccaagatattgttatttgatg-tatttgaaaatgtctctgcaaagctgtttcttgtgggaaaaatccatattctgtagagattcctacccctttttaagtctctttccggacccagagagatttaacta--agtatggcacctttt-agtctgctaagaaacaattacaatctattctctctgaagcctgctacctgggggcttcatcttcatgatgaaaccttggctccacgaccctttttctaaacctagaaactcccttctgttgattacaggtcattagataaactctttc-ctcttttatgaaatctttgaatccacctatgacccggaagtccccaacac-gccccctccttcgggctgttcagcctttccatagcaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 e tarSyr2.ABRT02443347v1 6041 38 - 17224 I e otoGar3.GL873598 58494 319 + 9074155 I a score=135869.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 75811 168 + 158759 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gcaatgtacagcttacacatattgattgatatcttatgtctccctaagacatgtaaaaccaagctgtagcccgaccatcttgggcacacattcttaagaccttctgaggctatttcactgatatgtctttaactttgaccaaataaatttctaaaatgaatgtgactt i macFas5.chr10 C 0 C 0 e tarSyr2.ABRT02443347v1 6041 38 - 17224 I e otoGar3.GL873598 58494 319 + 9074155 I a score=29108.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 75979 32 + 158759 ttctcagatacttatttgttcataGGTATCAC s panTro4.chrUn_GL393527 174444 32 - 341619 ttctcagatacttatttgtttataGGTATCAC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 514 32 + 1032 TTCTCAGATACTTATTTGTTTATAGGTATCAC i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66990431 32 - 115148730 ttctcagggacttatttgtttataGGTGTCAC i nomLeu3.chr7b C 0 I 5598 s macFas5.chr10 34747736 32 + 96509753 gtctcagatacttGTTTATTTGTGGGTATCAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6079 32 - 17224 TCCTCTGAGTCTTACCTGGACATGGATGGCAC i tarSyr2.ABRT02443347v1 I 38 C 0 e otoGar3.GL873598 58494 319 + 9074155 I a score=116226.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76011 120 + 158759 TGGATACACTTAAGGAATTGAAGAGATTTATGACATTGAGAAAAGGAGGAAGCCAGGGTGTATG--------------------gagagagagagagagagagagaTTGTGATGTATGTACAGGACTAACACTGAGACCT s panTro4.chrUn_GL393527 174476 140 - 341619 TGGATACACTTAAGGAATTGAAGAGATTTATGACATTGAGAAAAGGAGGAAGCCAGGGTGTGTGGGgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaTTCTGATGTATGTACAGGACTAACACTGAGACCT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 546 120 + 1032 TGGATACACTTAAGGAGGTGAAGAGATTTATGACATTGAAAAAAGGAGGAAGCCAGGGGGTgtg--------------------gcgagagagagagagagagagattgtgatGTATGTACAGGACTAACACTGAGACCT i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996061 134 - 115148730 TGGATTCACTTAAGGAAGTGAAGAGATTTATGACATTGAGAAAAGGAGGAAGCCAGGGTGTGTG------gagagagaaagagagaaagagaaagagagagagagaTTGTGATGTATGTACAGGAGTAACACTGAGACCT i nomLeu3.chr7b I 5598 C 0 s macFas5.chr10 34747768 140 + 96509753 TGGACACACTTAAGGATGTGAAGAGATTTATGACAATGAGAAAAGGAGGAAGCCAAGATGTGTGgagagagagagagacagagtgagagagagagagagagagagagagagaTGTTTGTACAGGACTAACCCTGAGAAGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6111 118 - 17224 TGAACATACTTAGGAAATTGAAGTGATTTACATTATTGAGAAAAGGAGGGAGTGAAGG---------------------AGAAAGACAGA-AAAGACAGAGAAAGAATGTGATGTGAGTACAATACCGACATTGAGACTT i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 e otoGar3.GL873598 58494 319 + 9074155 I a score=2252.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76131 2 + 158759 GG s panTro4.chrUn_GL393527 174616 2 - 341619 GG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 666 2 + 1032 GG i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996195 2 - 115148730 GG i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34747908 2 + 96509753 GT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6229 2 - 17224 GA i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 s otoGar3.GL873598 58813 2 + 9074155 GG i otoGar3.GL873598 I 319 I 135 a score=128095.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76133 131 + 158759 TTATGTAATGGTGCAGTACTGAGTATCATCCCCAAATAGTGAGGTTTCATTCCAAGAAGACTATGCATGTATCTCATTTGGGGAAACAGCTTTTGCAGGTGTAAATTAAGGAGCTTGAAACAGGGAGATAT s panTro4.chrUn_GL393527 174618 131 - 341619 TTATGTAATGGTGTACTACTGAGTATCATCCCCAAATAGTGAGGTTTCATTCCAAGAAGACTATGCATGtatctcatttgggaaaacagcttttgcaggtgtaaattaaggagcttgaatcagggagatgg i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 668 131 + 1032 TTATGTAATGGTGTAGTACTGAGTATCATCCCCAAATAGTGAGGTTTCATTCCAAGAAGACTATGCATGTATCTCCTTTGGGAAAACGGCCTTTGCAGGTGTAAATTAAGGAGCTTGAAACAGGGAGATGG i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996197 131 - 115148730 TTATGTAATGGTGTAGTACTGAGTATCATCCCCAAATAGTGAGGTTTCACTCCAAGAAGACTATGCATGTATCTTATTTGGGAAAACGGCTTTTGCAGGTGTAAATTAAGAAGCTTGAAACAGGGAGATGG i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34747910 131 + 96509753 TTCTGTAATCATGTAGTACTGAGTATCATCCCCAAAGAGTGAGGTTTCATTCCAAGAAgaatatgcatgtattttatttgggaaaagggcttttgcaggtgtaaattaaggagcttgaaacaaggagatga i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6231 130 - 17224 ATCTGTAATGGTTTAGTATTGagaatggctctcacgttatcatattttatttcattaaatctgtgaatgtacctttcaggaaaaaagagccttcccaggaataaattaag-atctggcaacaaggatatta i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 e otoGar3.GL873598 58815 135 + 9074155 I a score=2727.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76264 2 + 158759 TC s panTro4.chrUn_GL393527 174749 2 - 341619 tc i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 799 2 + 1032 TC i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996328 2 - 115148730 TC i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748041 2 + 96509753 tc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6361 2 - 17224 tc i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 s otoGar3.GL873598 58950 2 + 9074155 ta i otoGar3.GL873598 I 135 I 202 a score=198839.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76266 208 + 158759 TTAGATTAATCAACTGGGACTTAAATGCAAACTCAAGTGTCCT--AAAAAAACCAAGAGGTAGAGAGACATTTAGCATAGACTGAAGTggagaaggcaatgtgaacacagagacagagattgcagtgatgtgtccacatcccgggagag--agaagccaccagaagctggaagagctaaatcagactgccccc-tagagcttcagaaggagcc s panTro4.chrUn_GL393527 174751 210 - 341619 ttagattaatcaacttggacttaaatgcaaactcaagtgtcctaaaaaaaaaacaagaggtagagacacatttagcatagactgaagtggagaaggcaatgtgaacacagagacagagattgcagtgatgtgtccacatcccgggagag--agaagccaccagaagctggaagagctaaatcagactgctccc-tagagcttcagaaggagcc i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 801 207 + 1032 TTAGATTAATCAACTGGCACTTAAATGCGAACTCAAGTGTCCT---aaaaaaaCAAGAGGTAGAGAAACATTTAGCATAGACTGAAGTGGAGAAGGCAATGTgaacacagagacagagattgcagtgatgtGTCCACATCCCAGGAGAG--AGAagccaccagaaactggaagagctAAATCAGACTGCTCCC-TAGAGCTTCTGAAGGAGCC i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996330 208 - 115148730 TTAGATTAATCAACTGAGACTTAAATGCATACTCAAGTGTCTT--AAAAAAAACAAGAGGTAGAGAGACATTTAGCATAGACTGAAGTggagaaggcaatgtgaacacagagacagagattgcagtgatgtgtccacatcctaggagag--agaagtcaccagaagctggaagagctaaatcagactgctctc-tagagcttctgaaggagcc i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748043 209 + 96509753 ttagattaatcaactgggccttaaatgcgaacacaagtgtcct--gagaaaaacaagaggtagagagacacttaccatagactgaagaggagaaggcaatgtgaacacagagacagagatcgcagtgatgtgtccacagccaaggagag-tggaagccaccagaagctggaagagttaaatcagactgctccc-tagagcttctgaaggagat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 6363 188 - 17224 ctggattaaacaggttggtcttaaatgcaatcacaagtgtcca--tagaaga--gagagacagagagagacttaacacagattgtagaggagaagacaat-------------------ttggagtgatgtgtccacagccaaggaatcctgtaacctgccagagaatttagaaggtagg--agaagactcccatagagtcCCTGGAAGACCC i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 I 1360 e otoGar3.GL873598 58952 202 + 9074155 I a score=2910.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76474 4 + 158759 agaa s panTro4.chrUn_GL393527 174961 4 - 341619 agaa i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s panPan1.AJFE01000138 1008 4 + 1032 AGAA i panPan1.AJFE01000138 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996538 4 - 115148730 agaa i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748252 4 + 96509753 agac i macFas5.chr10 C 0 C 0 e tarSyr2.ABRT02443347v1 6551 1360 - 17224 I e otoGar3.GL873598 58952 202 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aactatgagtgattccattcctgttgcttgaagctaccacattgttgagaacttgttacagtagcccgaggacactaacacaAATGGGGCTCCAGGAAAATCCAGACGAAAGGTGCTGTGTTGGTTTGCAATCTCCTTGCTTAACTTTC-----------------TGATATTAGACATAAATAGATTGGTGAAAAATTTTGTGATTGAAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 7958 193 - 17224 aactgtgagagaatacatttctgttgttttaaactggcacatttctggaagtttgtcatagtagcccaaagaCAATTATGCAAACAGGGCTGAGGGAAAA-CCAGACTAAATGTGTGATGATCAGTTGTAATCTCCACATTCACCTGTC-----------------TAATGCTACACATAAATTAATTGGTGACAAATTTTTTGGTTTAGA i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 e otoGar3.GL873598 59181 214 + 9074155 I a score=1365.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76719 1 + 158759 A s panTro4.chrUn_GL393527 175206 1 - 341619 A i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996809 1 - 115148730 A i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748506 1 + 96509753 A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 8151 1 - 17224 A i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 s otoGar3.GL873598 59395 1 + 9074155 A i otoGar3.GL873598 I 214 I 84 a score=57193.000000 s 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nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748592 1 + 96509753 -A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s tarSyr2.ABRT02443347v1 8242 1 - 17224 -T i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 s otoGar3.GL873598 59480 1 + 9074155 C- i otoGar3.GL873598 I 84 I 149 a score=4317.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76806 7 + 158759 CTGTCAA s panTro4.chrUn_GL393527 175293 7 - 341619 CTGTTAA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996896 7 - 115148730 CTGTTAA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s macFas5.chr10 34748593 7 + 96509753 CTGGTaa i macFas5.chr10 C 0 I 971 s tarSyr2.ABRT02443347v1 8243 7 - 17224 CTAGTAA i tarSyr2.ABRT02443347v1 C 0 C 0 e otoGar3.GL873598 59481 149 + 9074155 I a score=25680.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 76813 44 + 158759 TATCTCACATAAC------ATTCTGAGTTACTCAAGAATGCATAAAAGGG s panTro4.chrUn_GL393527 175300 44 - 341619 TATCTCACATAAC------ATTCTGAGTTACTCCAGAATGCATAAAAGGG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 66996903 44 - 115148730 TATCTCACACAAC------ATTCTGAGTTACTCAAGAATTCATAAAAGGG i nomLeu3.chr7b 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nomLeu3.chr7b C 0 N 0 s macFas5.chr10 34750495 108 + 96509753 TGATTGGGTCTTGTACATCTAATTTTCCCTATGAATGTTAAAACAACAAACCTACAGCCCTCTCCTCTGCTCATGTGCTGTGAGAGATGACTTCCAGGCTCCCAGATA i macFas5.chr10 C 0 N 0 s tarSyr2.ABRT02220930v1 3462 92 - 4434 AGATTGTGTCTTACAAATCTATTTTGCCCTCCTATTATGAAA---------------TCCCATATTCTTCTCA-GTGTTGTGAGAGCTGACTCTGAAGCTCTCAGACA i tarSyr2.ABRT02220930v1 N 0 C 0 a score=273.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 77857 1 + 158759 T s panTro4.chrUn_GL393527 176346 1 - 341619 T i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 N 0 s tarSyr2.ABRT02220930v1 3554 1 - 4434 T i tarSyr2.ABRT02220930v1 C 0 C 0 a score=403.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 77858 11 + 158759 TTCTGAGATAT s tarSyr2.ABRT02220930v1 3555 8 - 4434 ---CAAGATAT i tarSyr2.ABRT02220930v1 C 0 N 0 a score=16820.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 77874 6 + 158759 AGTTGC s panTro4.chr3 201643789 6 - 202329955 AGTTGC i panTro4.chr3 N 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69623397 6 + 202140232 AGTTGC i ponAbe2.chr3 N 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67552216 6 + 86207423 AGTTGC i 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TATTCTCAAGGGCCAGGAGAAAACATCTTTT---------GTGAGGCTAGC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59521265 42 + 187378091 TATTCTCAAGGGCCAGGAGAAAACATCTTTT---------GTGAAGCTAGC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64458652 42 - 101219884 TATTCTCAAGGGCCAGGAGAAAACATCTTTT---------GTGAGGCTAGC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46008319 42 - 98464013 TATTCTCATGGGCCAGGAGAAAACATCTTTT---------GTGATGCTAGC i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16569030 51 + 58134056 AATCCCCGTGGATCAACAGAACACTTTTTTTTTTTTTCTGGTGGGTTAAAC i canFam3.chr20 C 0 C 0 a score=5005.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 77922 1 + 158759 T s panTro4.chr3 201643837 1 - 202329955 T i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69623445 1 + 202140232 T i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67552264 1 + 86207423 T i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61802592 1 + 192599291 T i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60960908 1 - 192460366 T i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59521307 1 + 187378091 T i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 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papAnu2.chr2 59521572 719 + 187378091 M e nomLeu3.chr21 67552670 125 + 86207423 I e ponAbe2.chr3 69623678 140 + 202140232 I e panTro4.chr3 201644316 292 - 202329955 I a score=-2762.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 79299 1 + 158759 -a s macFas5.chr2 60961257 1 - 192460366 -a i macFas5.chr2 C 0 I 1 s rhiRox1.KN296641v1 1342349 1 - 1467263 -g i rhiRox1.KN296641v1 N 0 I 11816 s calJac3.chr15 46008870 1 - 98464013 t- i calJac3.chr15 C 0 C 0 s saiBol1.JH378125 27694599 1 + 27742158 c- i saiBol1.JH378125 C 0 C 0 e gorGor3.chr10 53996802 632 + 147764049 I e tarSyr2.KE940204v1 2530304 0 - 2706325 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873527 24251435 11 + 39804640 I e rheMac3.chr2 61802799 178 + 192599291 I e canFam3.chr20 16569236 0 + 58134056 C e chlSab2.chr22 64458907 202 - 101219884 I e papAnu2.chr2 59521572 719 + 187378091 M e nomLeu3.chr21 67552670 125 + 86207423 I e ponAbe2.chr3 69623678 140 + 202140232 I e panTro4.chr3 201644316 292 - 202329955 I a score=-69.000000 s 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tattaagtagtattaactcagacgatcacagggtcccacagtaggctgtctacaagctgaggagcaaggaaaccagtcccaggcccaaagctgaagaacctggagtccgatttt-----------------cagcatgggagacagatgtagaatgggaggctaagccagtctagccttttcacatttttctgcctgctttatattctggccacactggccgctgataagattgtgcccacccacactgagggtgggtctgcctttcccagcctactgactcaaatgttaatct-ctttggcaacaccctcacagacacacccaggatcaatactttgcatccttcaatccaatcaggttgacactcagtgttaaacatcccaATGAATATATATGGCAAGAAGAAAT i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69623894 387 + 202140232 tattaagtagtattaactcagacgatcacagggtcccacagtaggctgtctacaagctgaggagcaaggaaaccagtccgagtcccaaagctgaagaacttggagtccgatttt-----------------cagcatgggagacagatgtagaatgggaggctaagccagtctagccttttcacgtatttctgcctgctttatattctggccacactggcagctgattagattgtgcccacccacattgagggtgggtctgcctttcccagcccactgactcaaatgttaatct-ctttggcaacaccctcacagacacacccaggatcaatactttgcatccttcaatccaatcaggttgacactcagtgttaaacatcccaATGAATATATAT---AAGAAGAAAT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61802983 387 + 192599291 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ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67561865 257 + 86207423 tataaaatgtgactctgtctct--gggacagg-gacatg--------------------------------tattccagagacatcatgtctgcattctatatTCCACGTTCTTCCCCAAACATAAATAC-AGAGAA-AAAAATGAAAG-ATGTG-AAAAATCACATACAGAAATAACAAATGTGCATTTTAAAACATAGTGAATTGATGCTTGAAGGATTATGATAACTAAAAATGATTTATAAAGAAATTCAAAAATCTTATTTACTTTTCAGTATACTATTAATAATGCAATA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61818155 290 + 192599291 TATAAAATGTGACTATGTCTCT--GGGAGAGGAAACATGTATTTCAGAGACATAATGTCTACATTCTATATTATTTCAGAGACATCCTGTCTGCATTCTATATTCCATGTTTTTCTCAAAACATAAATAT-AGAGAA-AAAAATGAAAG-ATGTG-AAAAATCACATACAGAGATAATAAATGTGCATTTTAAAACATAGTGAATTGATCCTTGAAGGATTGTGATAACTAAACATGATTTATAAAGAAATTCAAAAATCTTATTTACTTTTCAGTATACTATTAATAATGCAATA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60976781 290 - 192460366 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tupBel1.scaffold_127380.1-196860 77448 5219 + 196860 I a score=1560081.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 90737 367 + 158759 TCTTTCAGTTAATAAATATGAGACAGAATCTTATAAAA-GGAAATGCAATCAGGATTTTCACAGAAGATTTTTCCTGAAGGATAAAAATAATAATGGTGTTTGACTCACTTTTATACCTGGGAGCAGAAGATGTCCTTGCCAAATATCTTTTTGGAAGAGCTCTAGTTGGACAGACACTTCCAAAAGATAAGCAAAGCAT-GAAAGATATGAAC---ATCGGACAAAACGAAAGGAAATGAAAGCATTTCCTAAAGCATTTAAAATGATGACAT--AAAAAAGTTTGTTTATATTTATCAAACATAAGTTGGGTGACTTTTTAAAAATGGAAAGATGAACTTCAGGATATTTATTACCAAGCTGGTCCAGACAG s panTro4.chr3 201655621 367 - 202329955 CCTTTCAGTTAATAAATATGAGACAGAATCTTATAAAA-GGAAATGCAATCAGGATTTTCACAGAAGGTTTTTCCTGAAGGATAAAAATAATAATGGTGTTTGACTCACTTTTATACCTGGGAGCAGAAGATGTCCTTGCCAAATATCTTTTTGGAAGAGCTCTAGTTGGACAGACACTTCCAAAAGATAAGCAAAGCAT-GAAAGATATGAAC---ATCGGACAAAACGAAAGGAAATGAAAGCATTTCCTAAAGCATTTAAAATGATGACAT--AAAAAAGTTTGTTTATACTTATCAAACATAAGTTGGGTGACTTTTTAAAAATGGAAAGATGAACTTCAGAATATTTATTACCAAGCTGGTCCAGACAG i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69634845 367 + 202140232 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91305 262 + 158759 --TGgaa-----------catgggagtatgatgtaaaatgggctatatccttgttatctcatgagcaccactctggcacagg---cttctaccagcaagggtatcccagtagcagcagacaggcatgaagtttttcatgatgtgcatctgacagtgataccatgtgatattgataagcaatggcaTTGGCA---TCTGGAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-TTTTCCCAAAAGAGAAAATGGGGTT--TTCCAAT s panTro4.chr3 201656189 272 - 202329955 --TGGAATAAGGATGgaacatgggagta-gatgtaaaatgggctatatccttgatacctcatgagcaccactctggcacagg---cttctaccagcaagggtatcccagtagcagcagacaggcatgaagtttttcatgatgtgcatctgacagtgataccatgtgatattgataagcaatggcaTTGGCA---TCTGGAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-TTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTT--TTCCAAT i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69635413 273 + 202140232 --TGGAGTAAGGATGGAACATGGGAGTATGATGTAAAATGGGCTATATCCTTGATACTTCATGagcaccactctggcacagg---cttctaccagcaagggtatcccagtagcagcagacaggcatgaagtttttcatgatgtgcatctgaaagtgatatcatgtgatattgataagcaatggcaTTGGCA---TCTGGAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-TTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTT--TTCCAAT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67563044 273 + 86207423 --TGGAATAAGGATGgaacatgggagtatgatgtaaaaagggctatatccttgatacctcatgagcaccactctggcacagg---cttccaacagcaagggtatcccagtagcgacagacaggcatGAAGTTTTTCATGATGTGCATCTGACAATGATACCATGTGATATTGATAAGCTATGGCATTGGCA---TCCGGAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-TTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTG--TTCCCAT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61819372 273 + 192599291 --TGGAATAAGGATGgaacatgggagtatgatgtaaaatgggctatatcctcgatatctcatgagcaccactctggcacagg---cttccaccagcaagggtatcctagtagcagcaaacaggcatgaagtttttcattatgcacatctgacagtgataccatgtgatatcaataagcaatggcaCTGGCA---TCCAAAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-GTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTG--TTCCAAT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60977998 273 - 192460366 --TGGAATAAGGATGGAACATGGGAGTATGATGTAAAATGGGCTATATCCTCGATATCTCATGAGCACCACTCTGGCACAGG---CTTCCACCAGCAAGGGTATCCTAGTAGCAGCAAACAGGCATGAAGTTTTTCATTATGCACATCTGACAGTGATACCATGTGATATCAATAAGCAATGGCACTGGCA---TCCGAAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-GTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTG--TTCCAAT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59537678 273 + 187378091 --TGGAATAAGGATGGAACATGGGAGTATGATGTAAAATGGGCTATATCCTCGATATCTCATGAGCACCACTCTGGCACAGG---GTTCCACCAGCAAGGGTATCCTAGTAGCAGCAAATAGGCATGAAGTTTTTCATTATGCACATCTGACAGTGATACCATGTGATGTCAATAAGCAATGGCACTGGCA---TCCGAAATCT---GTCTCACTGGGTTTGGCAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT-GTTTCCCAGAAGAGAAAATGGGGTG--TTCCAAT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64475845 273 - 101219884 --TGGAATAAGGATGgaacatgggagtatgatgtaaaatgggctatatcctcggcatctcatgagcaccactctggcacagg---cttccaccagcaagggtatcctagtagcagcagacaggcatGAAGTTTTTCATTATGCACATCTGACAGTGATACCATGTGATATCAATAAGCAATGGCATTGGCA---TCTGAAATCT---GTCTCACTGGGTTCGGCAGAAGGACCTAGAGATAGTATTAGATTT-GTCTCCCAGAAGAGAAAATGAAGTG--TTCCAAT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46024134 275 - 98464013 --TGAAATAAGGATGGAACATGGTAGTATGAGCTAAAATGGGCTATATCTGCAATATCTTATGAGCATCACTCTGACATGGGCTTCTTCCaccagcaagggtaatccagcagcagcagacaggcatgaagtttttcatcatgaacatctgacagtgataccatgtgatattgataaggaatggcaTTGGCA---TCTGGAATCT---GTCTCACTGGGTTTGACAGAAGGACCTAGAGACAGTATTAGATTT--TTTCCCAAAAGAAAAAATGGGGTG--TTCCAGT i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45736518 251 - 149736546 ------AGAAGGATGGGCAATGGG-GAGTGCCCTAAAATAAACTGACTACCTGAGATCCTATAAACAGCATTCTGGCAGGAG---TTTTAATTTGCCA-GATATCCCTTTCCTAATATTCATTT------TTTTTAAAACCGTTAACCTTAAGGCAATGCCATTCAATA---AGGAACAATAACATTGATC---TCCAGAGAAT---AATAAACTGCGCTGTTCAGA-------ACACACGTTACTAGATTTCGTTTCCTGGCAAAGCATATTAAATGACTTTT--- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16582968 262 + 58134056 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nomLeu3.chr21 67563317 1 + 86207423 G i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61819645 1 + 192599291 G i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60978271 1 - 192460366 G i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59537951 1 + 187378091 G i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64476118 1 - 101219884 G i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s nasLar1.chr2 57709280 1 + 181502896 G i nasLar1.chr2 I 442 I 107 s rhiRox1.KN296641v1 1359309 1 - 1467263 G i rhiRox1.KN296641v1 I 449 I 113 s calJac3.chr15 46024409 1 - 98464013 G i calJac3.chr15 C 0 C 0 s saiBol1.JH378125 27706934 1 + 27742158 G i saiBol1.JH378125 I 3212 I 2650 s mm10.chr6 45736769 1 - 149736546 G i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16583230 1 + 58134056 G i canFam3.chr20 C 0 C 0 e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e tarSyr2.KE939134v1 136237 602 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11037804 1029 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=42682.000000 s 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gorGor3.chr3 199327788 2666 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 136237 602 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11037804 1029 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=9658.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 91581 2 + 158759 AA s panTro4.chr3 201656475 2 - 202329955 AA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69635700 2 + 202140232 aa i ponAbe2.chr3 C 0 I 3 s nomLeu3.chr21 67563331 2 + 86207423 at i nomLeu3.chr21 C 0 I 8 s rheMac3.chr2 61819659 2 + 192599291 AA i rheMac3.chr2 C 0 I 136 s macFas5.chr2 60978475 2 - 192460366 aa i macFas5.chr2 I 190 C 0 s papAnu2.chr2 59537962 2 + 187378091 AA i papAnu2.chr2 C 0 I 108 s chlSab2.chr22 64476132 2 - 101219884 AA i chlSab2.chr22 C 0 I 187 s rhiRox1.KN296641v1 1359423 2 - 1467263 aa i rhiRox1.KN296641v1 I 113 C 0 s calJac3.chr15 46024423 2 - 98464013 AA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45736783 2 - 149736546 AA i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16583244 2 + 58134056 AA i canFam3.chr20 C 0 C 0 e saiBol1.JH378125 27706935 2650 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709281 107 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199327788 2666 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 136237 602 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11037804 1029 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=8387.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 91583 11 + 158759 AAATATATATA s panTro4.chr3 201656477 11 - 202329955 ATACATATATA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69635705 11 + 202140232 atatatatata i ponAbe2.chr3 I 3 C 0 s nomLeu3.chr21 67563341 11 + 86207423 atatatatata i nomLeu3.chr21 I 8 C 0 s macFas5.chr2 60978477 11 - 192460366 aaatatatata i macFas5.chr2 C 0 I 1 s papAnu2.chr2 59538072 11 + 187378091 aaatatatata i papAnu2.chr2 I 108 I 1 s nasLar1.chr2 57709388 11 + 181502896 atatataaata i nasLar1.chr2 I 107 I 8926 s rhiRox1.KN296641v1 1359425 11 - 1467263 atatatatata i rhiRox1.KN296641v1 C 0 C 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papAnu2.chr2 I 1 C 0 s rhiRox1.KN296641v1 1359436 1 - 1467263 t- i rhiRox1.KN296641v1 C 0 I 2179 s calJac3.chr15 46024430 2 - 98464013 TA i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45736786 0 - 149736546 C e saiBol1.JH378125 27706935 2650 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199327788 2666 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 136237 602 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11037804 1029 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I e rheMac3.chr2 61819661 136 + 192599291 I e canFam3.chr20 16583252 0 + 58134056 C e chlSab2.chr22 64476134 187 - 101219884 I a score=-4254.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 91596 9 + 158759 -CAATGAAAC s panTro4.chr3 201656490 9 - 202329955 -CAATAAAAC i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69635718 9 + 202140232 -CAATAAAAC i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67563354 9 + 86207423 -tattaaAAC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s macFas5.chr2 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rhiRox1.KN296641v1 1359437 2179 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27706935 2650 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199327788 2666 - 199944510 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=393188.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 92291 97 + 158759 aaaaggctcagaaagtgaaatcagttccaatgctatcatctttcctcaagctgagctacagtgttcaattctccaAATGTGAGGTAGCTGGCAAAGA s panTro4.chr3 201657179 97 - 202329955 AAAAGGCTCAGAAAGTGAAATCAGTTCCAATGCTATCATCTTTCCTCAAGCTGAGCTACGGTGTTCAATTCTCCAAATGTGAGGTAGCTGGCAAAGA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69636410 97 + 202140232 AAAAGGCTCAGAAAGTGAAATCAGTTCTAATGCTATAATCTTTCCTCAAGCTGAGATACAGTGTTCAATTCTCCAAATGTGAGGTAGCTGGCAAAGA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67564049 97 + 86207423 AAAAGGCTCAGAAAGTGAAATCAGTTCCAATGCTATCATCTTTCCTCAAGCTGAGCTACAGTGTTCAATTCTCCAAATGTGAGGTAGCTGGCAAAAA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61820488 97 + 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macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59540880 457 + 187378091 ACAAAGATGGAATCATACAAAATGCTCAATTaaagccacaaaaggcagtaaaatagtggaagacaaactaaaaacaaagaaaaagtgaaacaaatatgaaactaacaaaTATGGTAGGCATTAATTCAACTAAATCATTAGTTACTTCAAACATCAATAGTCTAAATATAtcagt---taaaagacaaagattgtcaaaatggattaaaaaaaaaacccttccccCATGTATGTTGCCTTACAAGAAACATGCATTAACTACCAAAGCACATACAGAAAGATATACTATGCtgatgctaatttttaaaatgggaatagctatattaattttaaacagactagacttcagagcaaagaaagttATCAGGGCTAAAGATGGGCATTTCATAATGATTAAGGGGTCAATTCCTTAAAAAGACATGACAATCCTTA----ATGTATATATGTCTGATAATGGAGCATC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46027233 453 - 98464013 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i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67566612 1228 + 86207423 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i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60981746 1258 - 192460366 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CGTGAGGCAACATCTAATAGAACTGCAAGAAGTAAAACATGAGTCCACTATCATAGTTGTTGACTTCAACATCCCTCTATCAAAAATGGACATatcaagcagg-cag-aaaaaagaataaacacagcACCATCAATTAACtggatataattgacatataTTGACTGTTTTATGATTAAACAACACACTATTAAAGTAGACgtgaattaaagaagaaatcccaaaaacaacaaaataagtattttgaactaaatgaaaatt-aaatacaacttacaaagtTTGTGGGATGTGTCGAAAACAGTGCTTAGAGAGAAATTCATAGCATTGAATacatttattagaaaagaaaaattttaaattgattacCTTATCTataacaaactcacagccaacattatacttaatgaggaaaagttgaaagcattccccatgagaactggaataagacaaggacgcccactttcaccacttgtatttaacatagtactggaagtcctagccagagcagtcagacaaaagaaag-aataaagggaatccaaatcagtaaaaaggaagtcaaagtattcctgtttgctgatgatatgatc---tcatacttagaaaaccttaaagactcatccaaaatgCTTC-taaaactgg-taaatgaattcagtaaagtttcaggatacaaaatt-aatgtacacaaataagTAGCACTgatatacaccaacagcaaccaagctgagaatcaaatcaagaactcaacccctttaacaatagctgcaaaaccccacaaaaatataacaacaa-aaaaacttactaatatacttaaccaagaaggtgaaagacctctataaggaaaactacaaaacactgctgacagAAATTAtcgacaacacaaacaaatggaaacatataccatgctcatggatgggtagaatcaatattgtgaaaatgactctACTGCC-AAAGCAATccacaaatttaatgcaattttcatcaaaataccaccatcattcttcacagaattagaaaaaacaatcctaaaattcatatggaacc-aaaaaaaaaaaaagaggcccaCATGGCcaaagc------aaggaaaaagaaaaaatctggaggcattacattacct----------------aaGTTCAGATGATACTATCAGGCCatagtcaacaacaacaaaaaaaaatggcatggtactggtataaaaacaggcatatagaccaacggaacagaatagagaacccagaaatgaaaccaaatacttacagtcaactgatctttg i papAnu2.chr2 I 1 C 0 s calJac3.chr15 46027692 1231 - 98464013 catgaggcaacatcttatataacatcaaggagaaagacatgagtccactatcatagttggagacttcagcacacctctgtcaacaatgtacatataaagcaag-aag-aaaaaagagtaaacacagcaccatcaattacctggatataattgacatctattgactgtttcatgattaaacaacacattattaaacaagacatggattaaaaaagaaatctcaacaacaacaaaataagtattttgaactaaatgaaaatgaaaatacaacttacaaagtttgtgggatgtgtcgaaagcagtgcttagagagaaatttacagcattgaatacatttatta-cagagaaaaatttaaaattaatcaCTTTatctataacaaactcacagccaacattatacttaatgggtaaaagttgaaagcattccctgtgagacctggaactggacaaagacgcccactttcaccacttctattcaacatagtactggaagtcctagtcaaagcaattaggcaagagaaagaaataaagggcatctaaatcagtaaaaaggaagtcaaagtgttgctgtttgctggtgatttgaaa-------acctaaaaaaccctaaagaattatccaaaaagcttc-taaaactgg-tgaatgaattcagtaaagtttcagaatacaaaatt-catgtatgcaaattagtagtgctgctatatgccaacagcaaacaagctgagaatc-aatcaagaactcaaccccttttataatagctgcaaaaaac--aaaaaatacaacaacagcaaaagctaagtaaaatacttaaccaaggaggtgaaagacctctatagggaaaactacgacatgctactgacagaaatcataaacaacacaaacaaatggaaacacatgccattctcatggatggatagagtcattattgtgaaaacaaccatactgccaaaagcaatccacaaatttaatgtaattcagatcaaaataccactatcattcttcacagaactagaaaaaacaattctaaaactcatacggaacc-aaaaag--------gagcccacatgaccaaagcaagtctaagg-aaaagaacaaatctggaggcattacattaccc----------------aacttcaaactatactataaggccatagtcac-----------caaaatggcatggtactggtataaaaacaggcatatagacaaatggaactgaatagagaacccagaaataaagccaaatacttataatcaactgatccttg i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1362265 2676 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27710216 1835 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199331087 5383 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11038940 9934 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I e rheMac3.chr2 61821870 5091 + 192599291 I e canFam3.chr20 16585240 4188 + 58134056 I e chlSab2.chr22 64479100 788 - 101219884 I a score=736089.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 96074 343 + 158759 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acaaagcaaacaaaaacataaagtggggaaaggacacccttttcaacaattggtg-ctgggataattggctagctacatgtaagagaatgaaactggagcctcatctctcaccttatacaaaaatcaattcaagatggatcgaggacttaaatctgagacctgaagccataaaaattttagaagataacattggaaaaactcttatagatattggcttaagcaaagacttcatgaacaagaatccaaaaggaaacacaacaaaaacaaagatgaatagatgggacttgattaaactaaaaagcttctgcacagccaaataaatgattagcagagtaaaca---- i rheMac3.chr2 I 5091 C 0 s macFas5.chr2 60983004 338 - 192460366 acaaagcaaacagaaacataaaatggggaaggga-acactattcaacaaatggtt-ctggggtagttgacaagccacatgtagaagaatgaaactgaatcctcacctctcaccttatccaaaaataaaattaagatggatcaaagacttaaatctaagacttgaaaccataaaaattctagaagataacattggaaaaactcttatagatattggcttaagcaaagacttcatgaacaagaatccaaaaggaaacacaacaaaaacaaagatgaatagatgggacttgattaaactaaaaagcttctgcacagccaaataaatgattagcagagtaaaca---- i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59542592 338 + 187378091 acaaagcaaacagaaacataaaatggggaaggga-acactattcaacaaatggtt-ctggggtagttgacaagccacatgtagaagaatgaaactgaatcctcacctctcaccttatccaaaactaaaattaagatggatcaaagacttaaatctaagacttgaaaccataaaaattctagaagataacattggaaaaactcttacAGATATTGGCttaagcaaagacttcatgaccaagaacccaaaagtaaacacaacaaaaacaaagatgagtAGATGGGACttgattaaactaaaaagcttctgcacagccaaagaaatgaTTAGCAGAGTAAACA---- i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46028923 334 - 98464013 acaaagcaaacaaaaatgtaaaatggtaaaagaa-aacttattcaacaaatggtg-ctgggataattggcaagtcacatgtagaagaa--aaactgaat-ctcatctctcactttatacaaaaatcaaatcaagattaattaaagacttaaatctaatacctgaaactataaacattctagaacaaaacattgggaaaatccttctagacattgacttgggcaaagactttatgaccaagaaccc-aaagcaaacacaacaaaaaccaagataaatagatgggacttaattaaactgaaaagcttctgcacagcagaagaaatgatcagtagagtaaata---- i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1362265 2676 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27710216 1835 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I 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actcataggatcagagaaaatattcacaacctgtacatcagtcataggactaatattcagaatctacaaggaactcaagca i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60983342 81 - 192460366 actcataggatcagagaaaatattcacaacctgtacatcagtcataggactaatattcagaatctacaaggaactcaagca i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59542930 81 + 187378091 ACTCATAGGgtcagagaaaatattcacaacctGTACATCAGTCataggactaatattcagaatctacaaggaactcaagaa i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s rhiRox1.KN296641v1 1364941 81 - 1467263 actcatagggtcggagaaaatattcacaacctgtacatcagtcaaaggactaatattcagaatctacaaggaattcaagca i rhiRox1.KN296641v1 I 2676 C 0 s calJac3.chr15 46029257 78 - 98464013 acccacagattaggagaaaatatttataacctgtacatcagtcaaagg---aatattcagaatctacaaggaactcatgca i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e saiBol1.JH378125 27710216 1835 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199331087 5383 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 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ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67568283 84 + 86207423 aaacgattgcatcaataagtgggctaaggacatgaatagataattctcaaaagaagatatacaaatggtcaacaaacacatgaa i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61827401 84 + 192599291 aaacaatttcatcaaaaagtgggataaggacattaatagataattctcaaaagatgatatacaaatggccaataaacatatgaa i rheMac3.chr2 I 1 C 0 s macFas5.chr2 60983443 84 - 192460366 aaacaatttcatcaaaaagtgggataaggacattaatagataattctcaaaagatgatatacaaatggccaataaacatatgaa i macFas5.chr2 I 1 C 0 s papAnu2.chr2 59543031 84 + 187378091 aaacaatttcatcaaaaagtgggataAGGACATTAATAGATaattctcagaagaagatatacaaatggccaataaacatatgaa i papAnu2.chr2 I 1 C 0 s calJac3.chr15 46029353 83 - 98464013 aaacaatttcatcaaaaagtgggctaaggacatgaatatataattctcaaaagtagatttacaaatggccaacaaacatg-aaa i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1365041 163 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27710216 1835 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 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aaatgctcaacatcactg---attatcaggtaaatgcgaatcaaaatcacaatgtgatacca-tctcacctctgcaagaa i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60983527 76 - 192460366 aaatgctcaacatcactg---attatcaggtaaatgcgaatcaaaatcacaatgtgatacca-tctcacctctgcaagaa i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59543115 76 + 187378091 aaatgctcaacatcactg---attatcaggtaaatgcaaatcaaaatcacaatgtgatacca-tctcacttCTGCAAGAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46029436 76 - 98464013 aaatgctcaacatcaaag---attatcaggaaaatgcaaatcaaaaccacaatatgatacaa-actcactacagcatgaa i calJac3.chr15 C 0 C 0 s otoGar3.GL873534 11048980 78 + 30473821 atagactacagatcaaaggaagttatcaagg--ttaaaaaggaatattacataatgataaaagagtcagttctcatagaa i otoGar3.GL873534 I 94 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1365041 163 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27710216 1835 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199331087 5383 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e 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micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199336471 714 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11049291 134 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I e canFam3.chr20 16585240 4188 + 58134056 I e chlSab2.chr22 64479100 788 - 101219884 I a score=8082.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 97018 7 + 158759 atatata s panTro4.chr3 201661903 7 - 202329955 atatata i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69641132 7 + 202140232 ataaata i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67568791 7 + 86207423 atatata i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60983958 7 - 192460366 gtgtgta i macFas5.chr2 I 15 C 0 s papAnu2.chr2 59543528 6 + 187378091 -tatata i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46029867 7 - 98464013 atgtatg i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1365205 338 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27712052 368 + 27742158 I e nasLar1.chr2 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agaaaggaacaa-aataatgacattttg-----------agcaacctggatggaattggagaccattattctaagtgaagccactcaagaatggaaaaccaaacatcacatattctcactcataagtgggagctaagctatga---ggatgcaaagacataagaatgatataataaactttgggga----tttgggggaaagagtggaaggagggtgaggacGAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s otoGar3.GL873534 11049425 183 + 30473821 ataacagaacgataactagaaaacccta-----------aaacactt---tgtgattcaatacta-----cacaatgaaataacacatgggtcaaaaataaa------------tttttttaaaagaaagaaata--ttttgaattaaatgaaaaga---aagtacaacttacaaaatgtgtgggatgccttgaaagcagtgtttacagggagatttat------ i otoGar3.GL873534 I 134 I 35 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1365552 3267 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27712441 742 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199336471 714 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I e canFam3.chr20 16585240 4188 + 58134056 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AACACTACATagacattgggtacagtgtacacttcttgggtgatgagtgcaccaaaatctcagaaatcacaatTAAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 e mm10.chr6 45740732 10290 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1365552 3267 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27712441 742 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57709399 8926 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199336471 714 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 137317 11259 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11049608 35 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I e canFam3.chr20 16585240 4188 + 58134056 I e calJac3.chr15 46029927 10983 - 98464013 I e chlSab2.chr22 64479100 788 - 101219884 I a score=9705.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 97356 6 + 158759 gaattt s panTro4.chr3 201662234 6 - 202329955 gaattt i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69641453 6 + 202140232 gaattt i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67569129 6 + 86207423 gaattt i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61828273 6 + 192599291 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panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11050040 1925 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=1835093.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 98083 437 + 158759 TCTTTCAAATATTGGAAGAGGAAAGGATGGTTTTAATTCCCCAGGTCGTTAAATGAGTAATGAAGCAAGTTTTACATTCTAACCGTGAGACAT----ATTAGCTGTTAATTTGAAAAGGAAACATTTAGTTTC-----CAGTCTTTGGGGACCTCACTGCAAACTTTTATTTACAAAGCTAGTTG-CA---CGTGTCTATTATTGTGCATCGTTTTTG-AGCTTTTGCATTATATTT-----TGCATCACCA--CAGTTAAGGG---TAAAATAACAGGACTATGGCATCTGTGTTTAGATTT-AGATAGACAAATGGGGAAATAGTGCAGAGAAAAGCCAACTAAAGAAATTT-TAATTGTTCCTTGTATAAAGCCCCAGTTTACAGAAAGGTTGAACCAATTCATTTCTGCAGCTTACATATCTAAATCTGTGACCA--TGTAGCATATGAAACAAATAGGGT s panTro4.chr3 201662960 437 - 202329955 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acttatatggtagttggttttctctagagggaggaaacaaagaaaacagtggaagttgtatg-ttttttattaactagccttagaggtcgtgtagcatcatttctaccatagtacatgtgtaaaagaagtcataagtccagccaaaatgaaggcaagatgtagagacacctctca i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59546849 174 + 187378091 ACTTATATGGTAGTTGGTTTTCTCTAGAGGGAGGATACAAAGAAAACAGTGGAAGTTGTATG-TTTTTTATTAACTAGCCTTAGAGGTCACGTAGCATCATTTCTACCATAGTACATGTGTAAAAGAAGTCATAAGTCCAGCCAAAATGAAGGCAAGATGTAGAGACACCTCTCA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64482839 174 - 101219884 acttatatggtagttgattttctctagagggaggatacaaagaaaacggtagaagttgtatg-ttttttattaactagcctcagaggtcacatagcatcatttctaccatagtacatgtgtaaaagaagtcataagtccagccaaaatgaaggcaagatgtagagacacctctca i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46045052 161 - 98464013 acttatatggttgctgaatttctctaaagggaagataccaagcaaacagtggaagttgtctgcctttttg--aactagcct-----------tagcatcatttctaccatattacatgtgtcaga-aagtcataagacaagccaaaatgaaggcaagatgtacagccacctctca i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16591405 174 + 58134056 tcttacatggcagttggctttctctaccatgtagttcccaagagaatggtggaagttgcatg-acttttgtgacttagtttcagaagtgacacagcatcattcccaccaaattgcattgatcgaagaagacagaagtccggccaagttcagagtgagatggagcgccatccctcA i canFam3.chr20 C 0 I 13 e mm10.chr6 45754834 2272 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1368820 1387 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27716687 755 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57718326 1387 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e tarSyr2.KE939134v1 164863 1325 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11052089 351 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=652166.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 100489 182 + 158759 atgggaagaaatctaaagaatatgccacagtttttt-aaaactaccCTACACTTcatctcaattaaagcaaaagccaaaattttctcaatggtctgcaaTGGGAAA-TTGTAGcaaatttgaccactgcttgct-ttttaaaatcaagttggattagaacagtcacatgtattggtttacataca s panTro4.chr3 201665361 183 - 202329955 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macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59547227 145 + 187378091 GCCAAAGGTGAGTCGTTGTGA-GAGAGACAGTGTGGCC-TACAAAGCTGAACGTGTTTATAATCTGGCTCTTTAGGAGACAAGTTTACTAACCCCTGGT-CTGCAGTCTTGCACACACACATCCTGCTCCCCTATTTGCTCTCTGAAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64483217 144 - 101219884 gccaacggtgagtccttgtga-cagagacagtgtggcc-tgcaaagctgaatctgtttataatctggctctttaggagacaagtttactaacccctgGT-CTGCAGTCTTGCACAcacacatcctgctcccctatttgctctctg-aa i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46045419 140 - 98464013 accaaagttgagtagttgtga-cagagagagtctggcc-tgcaaagctgaacctgtttataacctgaccttttagaagataagtttactaatccctgCT-CTGCAGTGTTGA----ACACATCctgctcctccatttgctctgtg-aa i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45757112 147 - 149736546 TCTAGAGTTAAGTATACAGGAGTGGAAAAAATATGGCTGTTAAAAATTCAATTTTTTAAAAATATGTCTCTTAGGTACACAACTGTAATGCTCTTCAATCCTCCAATATCTGACATCTGTTTCTTCACAATCTATTTTCTTTCAG-AG i mm10.chr6 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1368820 1387 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27716687 755 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57718326 1387 + 181502896 I 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0 s nomLeu3.chr21 67573128 1 + 86207423 a i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61831984 1 + 192599291 a i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60988010 1 - 192460366 a i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59547607 1 + 187378091 A i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64483596 1 - 101219884 a i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46045798 1 - 98464013 a i calJac3.chr15 I 6 C 0 s saiBol1.JH378125 27717442 1 + 27742158 a i saiBol1.JH378125 I 755 I 3900 s mm10.chr6 45757493 1 - 149736546 a i mm10.chr6 C 0 I 5 s canFam3.chr20 16591861 1 + 58134056 a i canFam3.chr20 C 0 I 5 e rhiRox1.KN296641v1 1368820 1387 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57718326 1387 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e tarSyr2.KE939134v1 164863 1325 + 958716 I e panPan1.JH650619 8733645 21854 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11052442 1335 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 82671 7428 + 196860 I a score=2037328.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 101072 435 + 158759 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gorGor3.chr3 199340835 435 - 199944510 ctaataatattctcatatgctattgatttaacttatttattttatttatagtctattttc--ctcattaaaatgcaagctccattacatcagggattgttgtttgttttgttctctgatgcatcccagagcctacaacagtgctgacatgtaataggtcctcaataaaca-------------------tttgttgaatggaCAGAGGCATGCATGCAGTGACTAATGAAATAACACAAAATAAAT-----ATGTAAAATGCATAGGCAATATTATAAAATGAAATGTATTGGCTGTTTGGGGTTATATAAGTGGAACATAGAAGTGAATTAAAGCTTTAAGTAAGAGGGAAGATCCTGATGTTAGTATTGATTCCCTTTTCCCCACGATGAATGATGTTTTGAAGATCTTGATGCTAACATTAGTTTAAGCTCATTCAATACTGTCATAGGAGAGAGAAA i gorGor3.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69645415 430 + 202140232 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cttaaaatattctcatgcgctatagatttaacttatttattttatttatagtctgttttc--ctcattaaaatataagctccattacatcgcacactgtggtctgttttgttctctgatgcatcccagagcctacaacagtgctggcacttaacaggtcctcaataaaca-------------------tttgttgagtgaaCAGAGGCACGCATGCGGGGACTAATAAAATAACACAAAATAAAT-----TTGTAAAATTCATATTCAATATTATAAAATGAAATGTATTAGCTGTTTGGGGTTATATAAGTTGAACACAGAAGTGAATTAAAGCTTTAAGTAAGAGGGAAGATCCCGATGTTAGTATTGATTCCTTTTTCCCCACGATGAATGATGTTTTGAAGATCTTGATGCTAACATTAGTTTAAGCTCATTCAGTACTGTCATAGGAGAGAGAAA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45757499 397 - 149736546 tttgtatcattctctcatggtataaaatga----gtttatcttatttttggcaggtctca--ccaaccaaa---------tcatattgttatggatttttggctcttatgtccactggtatgtccTAGAAACTCCAACAG----------------------AAAAGACA--------------------CTGTAAAGTGGACAAAGGTGTGGTCATAAGACCCAATGGAGAAGTATATGATAAATCTAAAAAAGAAAAATTATAGGTGAAGTCATAAG--GAAATTTATTAGTTGATCAGGATTACACTACTTGTATATAGAAGTGAATTAAAGTTCTAAGAAA----GAAGATATTGATGTTCATATTGATTCTC-TTTCTTCAGGATGAATTATGTTTTGAAGATTCTGATGCTAACATTAGTTTGAGCTCATTCAATATTGTCAGAGTAGGAAGAAA i mm10.chr6 I 5 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ac---aTTAAACATCAATTTGTGGAGACAGTTTTGT--AAACAAAGGAATCTGAGCAG-ATACCT--GACTCAATATTaataaatgaagttgaaataaGACCTGTGATTGGTCTGTGATGACAGAAAGCAAATAGCTTTTCCTCCTGATACAACTA-AAAGATTACATTGCTAAGCATTTATTTCAAGGATTGGCAAAGAA-TGTG-TTATAACACAGGT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64487192 209 - 101219884 AC---ATTAAACATCAATTTGTGGAGACAGTTTTGT--AAACAAAGGAATCTGAGCAG-ATACCT--GACTCAATATTAATAAATGAAGTTGAAATAAGACCTGTGATTGGTCTGTCATGACAGAAAGCAAATAGTTTTTCCTCCTGATACAACTA-AAAGATTACCTTGCTAAGCATTTATTTCAAGGATTGGCAAAGAA-TGTG-TTATAACACAGGT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46049415 206 - 98464013 AC------AAACACCAATTTGTGGGGTCAGTTTTGC--ATACAGAGGAATCTGAGCAGCATACCT--GACTCAA-ATTAATAAATGAAGTTAAAATAGGATCTGTGACTGGTCTGTGATGACAGAAAGCAAATAGTTTTTCCTCCCAATACAACTA-AAAGATTACCTTGCTAAGCAGTTATTTCAAGGATTGGGAAAAAA-TGTG-TTATAATACAGGT i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45763049 211 - 149736546 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otoGar3.GL873534 11056929 505 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I a score=203780.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 104876 77 + 158759 TGTAGGCATAATGGAAGA--AATGCCTTGAGCGTCATTC---A---AAGGAAGGATA----GAGAAA--AAATATATATAGAAT------------------------------CAATGTA s panTro4.chr3 201669743 77 - 202329955 TGTAGGCATAATGGAAGA--AATGCCTTGAGCGTCATTC---A---AAGGAAGGATA----GAGAAA--AAAAATATATAGAAT------------------------------CAATGTA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69649285 79 + 202140232 TGTAGGCATAATGGAAGA--AATGCCTTGAGCGTCATTC---A---AAGGAAGGATA----GAGaaaatatatatatatagaat------------------------------caatata i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67576932 77 + 86207423 TTTAGGCATAATGGAAGA--AATGCCTTGAGCATCATTC---A---AAGGAAGGATA----GAGAAA--ACATATATATAGAAC------------------------------CAATACA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61835780 98 + 192599291 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rheMac3.chr2 61835878 74 + 192599291 M e canFam3.chr20 16595933 0 + 58134056 C a score=4216.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 104965 14 + 158759 CAG---------------TCTTTTAATGT s panTro4.chr3 201669832 14 - 202329955 CAG---------------TCttttaatat i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69649399 14 + 202140232 aag---------------tcttttaatat i ponAbe2.chr3 I 23 C 0 s nomLeu3.chr21 67577040 14 + 86207423 ata---------------tcttttaatat i nomLeu3.chr21 I 19 C 0 s macFas5.chr2 60991918 12 - 192460366 CAA-----------------TCTTAATTT i macFas5.chr2 I 25 C 0 s papAnu2.chr2 59551518 12 + 187378091 caa-----------------tgttaattt i papAnu2.chr2 I 25 C 0 s chlSab2.chr22 64487515 14 - 101219884 CAA---------------TCTGTTAATTT i chlSab2.chr22 I 25 C 0 s calJac3.chr15 46049711 29 - 98464013 aaatatatttttatattttatcttaattt i calJac3.chr15 I 2 C 0 s mm10.chr6 45763358 14 - 149736546 CAA---------------ACTTGtactgt i mm10.chr6 I 5 I 4676 s canFam3.chr20 16595933 5 + 58134056 ------------------------AATGC i canFam3.chr20 C 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chlSab2.chr22 C 0 I 1 s calJac3.chr15 46050722 69 - 98464013 aATGAAAGCAGAAGAAACATTGAAAGGAGTC-AGCAAATTTTCTTATTCTTCTATCTCTTAGCCTACAAA- i calJac3.chr15 C 0 I 1 s canFam3.chr20 16596637 66 + 58134056 AATGAAAGCAGAGGAGATATTGGACAAAGCCAAGT--ATTTACTTA---TTCTATTCCTTAGCCTGTGAGG i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1373718 849 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I a score=5500.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106030 1 + 158759 G s panTro4.chr3 201670892 1 - 202329955 G i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650458 1 + 202140232 G i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578103 1 + 86207423 G i nomLeu3.chr21 C 0 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TAGGCTTGATTTTAAATACCAGAAAGCAACCAA-CTATTTATGCTTCAAAGTTATTTATAGTTTCAGGTACGTG s panTro4.chr3 201670893 73 - 202329955 TAGGCTTGATTTTAAATACCAGAAAGCAACCAA-CTATTTATGCTTCAAAGTTATTTATAGTTTCAGGTACGTG i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650459 63 + 202140232 TAGGCTTGATTTTAAATACCAGAAAGCAACCAA-CTATTTATGCTTCAAAGTTATTTATAGTTT---------- i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578104 73 + 86207423 TAGGCTTGATTTTAAATACCAGAAAACAACGAA-CTATTTATGCTTCAAAGTTATTTATAGTTTCAGGTACGTG i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61836949 74 + 192599291 TAGGATTGACTTTAAATACCAGAAAGCAACCACTCTATTTATACTTCACATTTATTTATAGCTGCAGGTATGTC i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60992963 74 - 192460366 TAGGATTGACTTTAAATACCAGAAAGCAACCACTCTATTTATACTTCACATTTATTTATAGCTGCAGGTATGTC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59552579 74 + 187378091 TAGGCTTGACTTTAAATACCAGAAAGCAACCACTCTATTTATACTTCACAGTTATTTATAGCTGCAGGTATGTC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64488580 70 - 101219884 TAGGATTGACTTTAAATACCAGAAAGCAACCACTC----TATACTTCAAAGTTATTTATAGCTGCAGGTATGTC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46050793 74 - 98464013 TAAAATTGTTTTTAAATACCAGAAAGCAACCACTCTATTTATACTTCAAAGTTATTTATAGTTTCAGATATGAA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16596704 67 + 58134056 TGAGACTAAT----AGTAACAGAAAACAAACA--CTATTTATA-TGCAAAGTTATTAATAGTTTCAAGTATGTA i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1374568 186 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I a score=298486.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106104 112 + 158759 TGTagtcatgcatcacttaatgacagggaaatgttctgagaaatgagtccttaggtgatttgttgtgtcaacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgat s panTro4.chr3 201670966 112 - 202329955 TGTagtcacgcatcacttaatgacagggaaatgttctgagaaatgagtccttaggtgatttgttgtgtgagcatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgat i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650522 73 + 202140232 ---------------------------------------gaaatgagtccttaagtgatttgttgtgtgaacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatggt i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578177 112 + 86207423 TATagtcatgcatcacttaacgacagggaaatgttctgagaaacgagtccttaggtgatttgttgtgtgaacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgat i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61837023 111 + 192599291 TGTagtcacgcatcccttaacgacaggaaaatgttctgagaaatgagt-cttaggtgatttgttgtgtggacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgat i rheMac3.chr2 C 0 I 1 s macFas5.chr2 60993037 111 - 192460366 TGTagtcacgcatcccttaacgacaggaaaatgttctgagaaatgagt-cttaggtgatttgttgtgtggacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgat i macFas5.chr2 C 0 I 1 s papAnu2.chr2 59552653 111 + 187378091 TgtagtcatgcatcacttaacgaCAGGAAAATGTTCTGAGAAATGAGT-CTTAGGTGATTTGTTGTGTGgacatcatagaatgtacttatgCTCTATGTATACCTGCATGAT i papAnu2.chr2 C 0 I 1 s chlSab2.chr22 64488650 111 - 101219884 TGTagtcatgcatcacttaacaacaggaaaatgttctgagaaatgagt-cttaggtgatttgttgtgtggacatcatagaatgtacttatgctctatgtatacctgcatgac i chlSab2.chr22 C 0 I 1 s calJac3.chr15 46050867 112 - 98464013 TGTagtcttgcattacttagcaacagggaaatgttctgagaaatgaatccttgggtgatttgttgtgggaacatcatagaatgtacttacactctctgtataccagcatgat i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1374568 186 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I e canFam3.chr20 16596771 0 + 58134056 C a score=4095.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106216 1 + 158759 a s panTro4.chr3 201671078 1 - 202329955 a i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650595 1 + 202140232 a i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578289 1 + 86207423 a i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61837135 1 + 192599291 a i rheMac3.chr2 I 1 C 0 s macFas5.chr2 60993149 1 - 192460366 a i macFas5.chr2 I 1 C 0 s papAnu2.chr2 59552765 1 + 187378091 A i papAnu2.chr2 I 1 C 0 s chlSab2.chr22 64488762 1 - 101219884 a i chlSab2.chr22 I 1 C 0 s rhiRox1.KN296641v1 1374754 1 - 1467263 a i rhiRox1.KN296641v1 I 186 I 151 s calJac3.chr15 46050979 1 - 98464013 a i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I e canFam3.chr20 16596771 0 + 58134056 C a score=419492.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106217 151 + 158759 tagcctactacacacctaggctatgtggtatagagcctattgctcttcacttttaagcctgtatagcttgtgattgttcca-aatgctgcaggcaattgtaacacaacggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaataaaaaatgtac s panTro4.chr3 201671079 152 - 202329955 tagcctactacacacctaggctatgtggtatagagcctattgctcttcgcttttaagcctgtatagctcgtgattgctccccaatactgcaggcaattgtaacacaatggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaataaaaaatgtat i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650596 146 + 202140232 tagcctactacacacctaggctatgtggtatagagcctattgctcttggc-tttaagcctgtatagcttgtgattgttcca-aatactgcaggcaattgtaacacaatg----gtatttatgtatataaacatgtcaaaataaaaaatgtac i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578290 150 + 86207423 tagcctactacacacctaggctatgtggtatagagcctattgctcttggc-tttaagcctgtatggcttgtgattgttcca-aatactgcaggcaattgtaacacaacggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaataaaaaatgtac i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61837136 149 + 192599291 cagcctaccacacacctaggttatatggtatagagcctattgctcttggc-tttaagcctgtatagcttgtgattgttcca-aatacggcagccaattgtaacacaatggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaat-aaaaatgtac i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60993150 149 - 192460366 cagcctaccacacacctaggttatatggtatagagcctattgctcttggc-tttaagcctgtatagcttgtgattgttcca-aatacggcagccaattgtaacacaatggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaat-aaaaatgtac i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59552766 149 + 187378091 cagcctaccacacacctaggttatatggtataGAGCCTATTGCTATTGGC-TTTAAGCCTGTATAGCTTGTGATTGTTCCA-AATACggcaggcaattgtaacacaatggtaagtatttatgtatgtaaacatgtcaaaat-aaaaatgtac i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64488763 150 - 101219884 cagcctaccacacacctaggctatatggtatagagcctattgctcttggc-tttaagcctgtatagcttgtgattgttcca-aatacggcagccaattgtaatacaacggtaagtatttatgtatataaacatgtcaaaataaaaaatgtac i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46050980 146 - 98464013 taatctattacacacctaggctatatggtatagagtctattgctcttggc-tgcaaacctgtacagcttgtgattgttcca-aatactgtaggcaattgtaacacaacagtaagcatttg-gtatctaaacatgttaaaat-aaaaatac-- i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1374755 151 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I e canFam3.chr20 16596771 0 + 58134056 C a score=21045.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106368 6 + 158759 agcagt s panTro4.chr3 201671231 6 - 202329955 aggaat i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69650742 6 + 202140232 agtaat i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67578440 6 + 86207423 agtaat i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61837285 6 + 192599291 agtaat i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60993299 6 - 192460366 agtaat i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59552915 6 + 187378091 agtaAT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64488913 6 - 101219884 agtaat i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s rhiRox1.KN296641v1 1374906 6 - 1467263 agtaat i rhiRox1.KN296641v1 I 151 I 606 s calJac3.chr15 46051126 6 - 98464013 agtaat i calJac3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr6 45763372 4676 - 149736546 I e saiBol1.JH378125 27721348 2395 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57723051 2409 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 19649 15065 - 329962 I e gorGor3.chr3 199357462 2386 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 171907 2391 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11057995 1642 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I e canFam3.chr20 16596771 0 + 58134056 C a score=242494.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 106374 79 + 158759 aatatgatattacatccttatggaaccaccatggtatatgcagaccactattgaactaa--attattatataatgaatgac s panTro4.chr3 201671237 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saiBol1.JH378125 27723955 752 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57725658 1066 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 34715 9017 - 329962 I e gorGor3.chr3 199359852 2664 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 174830 347 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11060489 1632 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 90100 8450 + 196860 I a score=11165.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 107950 2 + 158759 TC s panTro4.chr3 201672810 2 - 202329955 TC i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69652324 2 + 202140232 TC i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67580291 2 + 86207423 TC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61838892 2 + 192599291 TC i rheMac3.chr2 C 0 I 2 s macFas5.chr2 60994905 2 - 192460366 TC i macFas5.chr2 C 0 I 2 s papAnu2.chr2 59554523 2 + 187378091 tc i papAnu2.chr2 C 0 I 2 s chlSab2.chr22 64490520 2 - 101219884 TC i chlSab2.chr22 C 0 I 2 s rhiRox1.KN296641v1 1376519 2 - 1467263 TC i rhiRox1.KN296641v1 I 314 I 13 s calJac3.chr15 46052706 2 - 98464013 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ponAbe2.chr3 69652356 95 + 202140232 ------------AGTTACTGTTATTTTCTCACTAATTTATCACTCTTCTTCTTCTTCCT---TTCTTTATTATCCGTGTAAATTTTAACCTTTCTAAGACAGA-TGA----------TTTG i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67580325 91 + 86207423 ------------ACTTACTGTTATTTTCTCACTAATTTATCACTCTTCTTCTTC---CT---TTCTTTATTATCCATGGAAATTTTAACCTTTCTAAGATAGACTGA----------TT-- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61838942 96 + 192599291 ------------ACTTACTGTTATTTTCTCACTAATTTATCACTCACCTTCTTCTTCCT---TTCTTTATTATCCGTGTAAATTTTAACCTTTCTAAGACAGACTGA----------TTTG i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60994955 96 - 192460366 ------------ACTTACTGTTATTTTCTCACTAATTTATCACTCACCTTCTTCTTCCT---TTCTTTATTATCCGTGTAAATTTTAACCTTTCTAAGACAGACTGA----------TTTG i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59554573 96 + 187378091 ------------GCTTACCGTTACTTTCTCACTAATTTATCACtcaccttcttcttcct---ttctttattatcCGTGTAAATTTTAACCTTTCTAAGACAGACTGA----------TTTG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64490570 106 - 101219884 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----GGTGGTAAAAG-CCTTCTTATTCCTACTTGAGttttcttttcttttttttttttttcttttttttttttttttttttttttttttttCACAGCATCAACCAGAGAGCA---G-TACTAGGTAAGGGCTCTATAAATATTTGCAGGTTTGCGCTGTGGTTGACCTACCATAAAGAACAATGATTTCCTAAGGAAATTCACTGCTCCCAGTGCATGAGGCAAGAGCT-AGATTTTAGCAACTGTGTACCTAAAACTAAAGAGCAAACAACTTCATGGGAAGCTGAACAATAAAACTGAAAGGCATTTTTATTGAGATCTTATTTGTTCAGCTAAGCTGAGGTCCTGGTTTAACTGGGCCCCAGAATCCAAATATAGTTT-- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16599328 304 + 58134056 -CCCGGGAATAAAGGACCC---TACTCATATTTGAATTCTC--------------------------------------------------CATAGCTTCTATCAGAGTATA---T-TATTAAACAAAGACTCAGTAAATATTTGCAGCTTTGTGCTGTGGCTGCTTTGCCATAAGAAACAACGGTTTCCTAGTGACATTCACTGCTCCTACTGCCTGAGGTAAGAAAC-ACATTTTAGCAATTGTGGACCTAAAAAGGAGAGGTAAACGACTTCATCAGAAACCTAACAACAAAATTGAATGCCACTTAGTCACGGTC-TTACTTTTTCAGCTA-----------------ATCCAGGTCTTAGGAGTCACAGGCAGTTT-- i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1376672 580 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27723955 752 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57725658 1066 + 181502896 I e 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otoGar3.GL873534 11062124 5456 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 98551 2515 + 196860 I a score=170410.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 108653 47 + 158759 CATGCTCACACATCACTTTAGGAAAAGTTAAAAGAGTTATAACAAAA---- s panTro4.chr3 201673514 47 - 202329955 CATGCTCACACATCACTTTAGGAAAAGTTAAAAGAGTTATAACAAAA---- i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69653025 47 + 202140232 CATGCTCACACATCACTTTAGGAAAAGTTAAAAGAGTTACAACAAAA---- i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67580990 46 + 86207423 CATGCTCACACATCACTTT-GGGAAAGTTAAAAGAGTTATAACAGAA---- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61839614 47 + 192599291 CATGCTCACACATCTCTTTAGGAAAGGTTAAAGGAGTTATAACAAAA---- i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60995627 47 - 192460366 CATGCTCACACATCTCTTTAGGAAAGGTTAAAGGAGTTATAACAAAA---- i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59555245 47 + 187378091 CATGCTCACACATCTCTTTAGGAAAGGTTAAAAGAGTTATAGCaaaa---- i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64491252 47 - 101219884 CATGCTCACACATCTCTTTAGGAAAAGTTAAAAGAGTTATAACAAAA---- i 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macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59556692 1 + 187378091 T i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64492699 1 - 101219884 t i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s nasLar1.chr2 57728168 1 + 181502896 t i nasLar1.chr2 I 1442 I 1066 s calJac3.chr15 46054811 1 - 98464013 t i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16601415 1 + 58134056 t i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45770078 2487 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1378695 1065 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27726401 1057 + 27742158 I e micMur1.scaffold_1480 34715 9017 - 329962 I e gorGor3.chr3 199362517 2543 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 177326 1087 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11067581 1082 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 101075 10911 + 196860 I a score=210291.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 110087 62 + 158759 gttggaagaacaagaag---gccaataagtctggggtgtactacataaaaggaggatatacaatg s panTro4.chr3 201674948 65 - 202329955 gtcggaggaacaagaagaaggccaataagtctggggtgtactacataaaaggagggtatacaatg i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69654453 65 + 202140232 gttggaggaacaagaagaaggccaataagtctggggtgtactacataaaaggaggatatacaatg i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67584272 65 + 86207423 gttgaaggaaaaagaagaaggccaataagtctggggtgtactacataaaaggaggatatacaatg i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61841076 65 + 192599291 gttggaggaataggaagaaggccaataagtctggggtgtactacataaaaggaggatatacaatg i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 60997076 65 - 192460366 gttggaggaataggaagaaggccaataagtctggggtgtactacataaaaggaggatatacaatg i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59556693 65 + 187378091 GTTGGAGGAATAGGAAGAAGGCCAATAAGTCTGGGGTGTACTACATAAAAGGAGGATATACAATG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64492700 65 - 101219884 gttggaggaataggaagaaagccaataagtctggggtgtactacgtaaaaggaggatatacaatg i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46054812 62 - 98464013 gttggagaaacagcaag---gccagtaagtctggactatactacacaataagaggatataaaatg i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16601416 64 + 58134056 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hg38.chrUn_KI270749v1 114512 394 + 158759 GAGAAACAGGACATTCCAGCAATGAAAGAACCATCATTAAGGAAACAATTGAGGACAAACATCCTGACT-AATGAAAAGCCCAATTCTTTGATATCGCACACAGCTCAATTCAGGAATGATATTCC---AAAAAATAATCA--AAGTGCCTTTAGAACTATT-ACCCATGCTTTTACTTTCAGAAGGCATT-------TTGTAGTTACAAAAGAAAGAACAGAGATATTTGTAATTGTATCTATAAGGATGCAAACTGCCCTCTGCCCTAAAATCTTTAATGACAGTACCACTGCTGTAAATATAT-GTAAACATACTTTAGACACATGCAAGTTTTTTGAGGTTATATCAATAACAGGTTT-CATATAACAAACTAAAAATAAGC------------AAAAAAAAA--TGGAAAAAGGGTATG s panTro4.chr3 201679376 395 - 202329955 GAGAAACAGGACATTCCAGCAATGAAAGAACCATCATTAAGGAAACAATTGAGGACAAACATCCTGACT-AATGAAAAGCCCAATTCTTTGATATCGCACACAGCTCAATTCAGGAATGATATTCC---AAAAAATAATCA--AAGTGCCTTTAGAACTATT-ACCCATGCTTTTACTTTCAGAAGGCATT-------TTGTAGTTACAAAAGAAAGAACAGAGATATTTGTAATTGTATCTATAAGGATGCAAACTGCCCTCTGCCCTAAAATCTTTAATGACAGTACCACTGCTGTAAATATAT-GTAAACATACTTTAGACACACGCAAGTTTTTTGAGGTTATATCAATAACAGGTTT-CATATAACAAACTAAAAATAAGC------------AAAAAAAAA-ATGGAAAAAGGGTATG i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69658876 395 + 202140232 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ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67590752 119 + 86207423 GAGATTAATAGAAAAA-AATATGAAAAGAAAATGACAGCAGC-TAGGAAGAAA-CAAAAAGG-TGGGTGGAAATAAGGGAGGTTGGCCTCCAAAGGGCAAGTAAAGTAGAACTGAAATAAAAC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61847600 120 + 192599291 GAGATTAATAGAAAAA-AATATGAAAAGAAAATGACAGCAGC-TAGGAAGAAA-CAAAAAGGATGGGTGGAAGCAAGGGAAGTTGGCCTCCAAAGGGCAAGTAAAGTAGAACTGAAATAAAAC i rheMac3.chr2 I 23 C 0 s macFas5.chr2 61003596 120 - 192460366 GAGATTAATAGAAAAA-AATATGAAAAGAAAATGACAGCAGC-TAGGAAGAAA-CAAAAAGGATGGGTGGAAGCAAGGGAAGTTGGCCTCCAAAGGGCAAGTAAAGTAGAACTGAAATAAAAC i macFas5.chr2 I 11 C 0 s papAnu2.chr2 59563493 120 + 187378091 gagattaatagaaaaa-aatatgaaaagaaaatgacagcagc-taggaagaaa-caaaaaggatgGGTGGAAGCAAGGGAAGTTGGCCTCCAAAGGGCAAGTAAAGTAGAACTGAAATAAAAC i papAnu2.chr2 I 11 C 0 s chlSab2.chr22 64499309 120 - 101219884 GAGATTAATAGAAAAA-AATATGAAAAGAAAATGACAGCAGC-TAGGAAGAAA-CAAAAAGGATGGGTGGAAACCAGGGAAGTTGGCCTCCAAAGGGCAAGTAAAGTAGAACCGAAATAAAAC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46061236 116 - 98464013 GAGATTAATGGGAAAA--ATATGGGAGGAAAA----AGCAGCTTAGGAAGAAA-CCAAAAGGATGGGTTGAAATAAGGGAAGTTAGCCTTCAATGAGCAAGTAAAGTAGAACTGAAATAAAAT i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16607044 120 + 58134056 GAGCTTAATAGAAAAAAAAAATGAGAATGAAATAGCAGAAGC-CTGGAAGAAGCCAAAAAGGACGGATAGGAAGAAAGAAAGT--ATCTGCAAAGGTCAAGTAAAGTAGAATTGGAATAAAAC i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45780879 404 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1384494 1306 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27732135 1287 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57733963 1307 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199368274 1297 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 182580 943 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11071907 1205 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=392970.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 116679 119 + 158759 CTGGTGATTTTGATCTGCATGTGTAATTAATAT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTGATGGGAGAAATGGGGATAAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTGTGAAGGCAACAC---- s panTro4.chr3 201681559 119 - 202329955 CTGGTGATTTTGATCTGCGTGTGTAATTAATAT-------AGTTTCTGGTCGGGGGTGATGGGAGAAATGGGGATAAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTGTGAAGGCAACAC---- i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69661054 119 + 202140232 CTGGTGATTTTGATCTGTGTGTGTAATCAATAT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTGATGGGAGAAATGGGGATAAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTGTGAAGGCAACAC---- i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67590871 118 + 86207423 CTGGTGATTTTGATCTGTGTGTGTAATTAATAT-------AGTTTCTGATGGAGGGTGATGGGAGAAATGGGGATAAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTG-CTGAATTGTGAAGGCAACAT---- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61847720 119 + 192599291 CTGGTGATTTTAATATATGTGTGTAATTAATGT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTAATGGAAGAAATGGGGATGAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTATGAAGGCAACAC---- i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61003716 119 - 192460366 CTGGTGATTTTAATATATGTGTGTAATTAATGT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTGATGGAAGAAATGGGGATGAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTATGAAGGCAACAC---- i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59563613 119 + 187378091 CTGGTgattttaatatatgtgtgtaattAACGT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTGATGGAAGAAATGGGGATGAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTATGAAGGCAACAC---- i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64499429 119 - 101219884 CCGGTGATTTTAATATATGTGTGTAATTAATGT-------AGTTTCTGGTGGGGGGTGATGGAAGAAATGGGGATGAAGAAAAGCCCTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTGAATTATGAAGGCAACAC---- i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46061352 119 - 98464013 CTGGCAGTTTTAATCTGTGGGCGTAATTAATAC-------AGTTTCTGGTGAGGGGTGATGGGAGAAATGGTGATAAAGAACATCACTGAGTAGCAACCTTCTTGCCTAAAGTGTAAAGGCAACAC---- i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45781283 100 - 149736546 CTGGTAGTTT--------GTATACAATTAAAATATTCATGAATTTCTGTCAAGATGTGATGACAGA---GGAGATGACGTAAAAC--------ACAACCT-------TGAATTGTAAATACAGCAA---- i mm10.chr6 I 404 I 4 s canFam3.chr20 16607164 120 + 58134056 TTGGTGATCTTAATCAACATGTATAACTAATAGAGCA---AGTTTCCAGGGGGATATATTGGAGGA---GTAGATAGAGCATAGCCC----TATCAATCTTCTTGCCCAAATTGTACAAGGAACATGCAT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1384494 1306 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27732135 1287 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57733963 1307 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199368274 1297 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 182580 943 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11071907 1205 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=15983.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 116798 3 + 158759 GAA s panTro4.chr3 201681678 3 - 202329955 GAA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69661173 3 + 202140232 GAA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67590989 3 + 86207423 GAA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61847839 3 + 192599291 GAA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61003835 3 - 192460366 GAA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59563732 3 + 187378091 GAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64499548 3 - 101219884 GAA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46061471 3 - 98464013 AAA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s tarSyr2.KE939134v1 183523 3 + 958716 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ACATAGATCAGGTATTGGGAAAAATA--AATGCAACCCCTTAAAATTTGCACCATATTATTCAAATCTCTTTGACATGAGTAACCACAG------AAGACACAGGTAACATCCGGGTTGCTCTTTATGTAGGGCTTTAGCAATCTAATCTATTCA-----------GTCTTTTAC---------CATGTGACTA--CTTTAT------------------- i chlSab2.chr22 C 0 I 166 s calJac3.chr15 46061475 169 - 98464013 ACATGGATCAGATCTTGAGAAAAAGA--GATGCAATCCCTTAAAATTTGCACCATATTATTCAGATCTCTTTGAGGTGGGTAAGCATAG------AAGATACAGGTAACAT-CGGATGGCTCTTAATGTAGGGCTAAAGTAGT--ATTCTATTCA-----------GTCTCTTAC---------CATATGACTA--CTTTAT------------------- i calJac3.chr15 C 0 I 156 s mm10.chr6 45781391 182 - 149736546 ACATACATGGGCGTTTAGGAAAGAGA------TGTTCTTTTAAAAATTGTTCTGAGTTATTCTAG-CTTTTGGAGGCAGATAAGCAGAG--CAATAAAAGGCAGATAATATAAGATAT----TTTTTGGAAGGATTCAGC-----AAACTGtttatatatatattttttttttaCTTGACCACATATGTGACTG--TGATGT------------------- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16607288 192 + 58134056 ATATAGATCAGTTCTCAAGAAAAAAAGAAATGCGACTCCATAAAATTTGTTCCATATTATTCAAATTCCTTTTA--TGAGTAAGTATAAGGCTATAAAACACAGGTAATATCAAAGCTGTTCTTCATGTAGGACTCT-GT-----AAACTACTT------------GTTTTTTCC---------CATGTGACTAGTCTTTGTTTCTGAATATTATTTTCGT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1384494 1306 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27732135 1287 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57733963 1307 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199368274 1297 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 183845 334 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11071907 1205 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=17416.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 116969 2 + 158759 AT s panTro4.chr3 201681849 2 - 202329955 AT i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69661344 2 + 202140232 AT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67591159 2 + 86207423 AT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61848180 2 + 192599291 at i rheMac3.chr2 I 165 C 0 s macFas5.chr2 61004177 2 - 192460366 at i macFas5.chr2 I 166 C 0 s papAnu2.chr2 59564074 2 + 187378091 AT i papAnu2.chr2 I 166 C 0 s chlSab2.chr22 64499890 2 - 101219884 at i chlSab2.chr22 I 166 C 0 s nasLar1.chr2 57735270 2 + 181502896 at i nasLar1.chr2 I 1307 I 170 s rhiRox1.KN296641v1 1385800 2 - 1467263 at i rhiRox1.KN296641v1 I 1306 I 170 s calJac3.chr15 46061800 2 - 98464013 at i calJac3.chr15 I 156 C 0 s saiBol1.JH378125 27733422 2 + 27742158 at i saiBol1.JH378125 I 1287 I 171 s tarSyr2.KE939134v1 184179 2 + 958716 at i tarSyr2.KE939134v1 I 334 I 172 s mm10.chr6 45781573 1 - 149736546 -T i mm10.chr6 C 0 I 8 s canFam3.chr20 16607480 2 + 58134056 AT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199368274 1297 - 199944510 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11071907 1205 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=62185.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 116971 36 + 158759 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9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 184354 861 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=751752.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 117414 236 + 158759 TTATGGTACTTTCATTCTATGAAATATTACGTAGTTCTCAATCAAAATGAGAGGGATAGCTGTATA-AAACCTAAGCTATTGTTAACA-G--------------AAAAAAAGCATGTAAAC-A-AAATTATTAAATTATGGTTTTAATAAAATCCATATATATGAATTTGGAC----------------ACGTGTATACACAAGTAAAGTCAGAGAAAATGACAGAATATAATG-----TATGTTGAAATTATAGCAATGAC-TACCACTAAAAAA s panTro4.chr3 201682287 236 - 202329955 TTATGGTACTTTCATTCTATGAAATATTACGTAGTTCTTAATCAAAATGAGAGGGATATCTGTATA-AAACCTAAACTATTGTTAACA-G--------------AAAAAAAGCATGTAAAC-A-AAATTATTAAATTATGGTTTTAATAAAATCCATATATATGAATTTGGAC----------------ACGTGTATACACAAGTAAAGTCAGAGAAAATGACAGAATATAATA-----TATGTTGAAATGATAGCAATGAC-TACCACTAAAAAA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69661788 236 + 202140232 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rhiRox1.KN296641v1 I 237 I 372 s calJac3.chr15 46062492 1 - 98464013 A i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16608345 1 + 58134056 A i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45782303 2 - 149736546 I e saiBol1.JH378125 27733598 1358 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57735445 891 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 184354 861 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=2997.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 117651 1 + 158759 A s panTro4.chr3 201682524 1 - 202329955 A i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69662025 1 + 202140232 A i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67591858 1 + 86207423 A i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61848879 1 + 192599291 A i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61004875 1 - 192460366 A i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59564773 1 + 187378091 a i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64500586 1 - 101219884 A i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46062493 1 - 98464013 A i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16608346 1 + 58134056 G i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45782303 2 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1386496 372 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27733598 1358 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57735445 891 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 184354 861 + 958716 I e panPan1.JH650619 8758554 13098 + 9346047 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=6006.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 117652 1 + 158759 A s panTro4.chr3 201682525 1 - 202329955 A i panTro4.chr3 C 0 C 0 s panPan1.JH650619 8771652 1 + 9346047 a i panPan1.JH650619 I 13098 I 450 s ponAbe2.chr3 69662026 1 + 202140232 A i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67591859 1 + 86207423 A i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s 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TGAACTTAGTTGGGTACCAGTTGAGATATTTGAAGTTTAT-CTACCCTGTAGTCCTCACACCTAAAATTTTTC---TCAATCGTTGAATGTAAGTTATTTACTTCTGGATTGAACAATAAAATGTAAATGGAGGTT------TCCAGGAAGATGAATT-GAGTGTGCC i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61005292 157 - 192460366 TGAACTTAGTTGGGTACCAGTTGAGATATTTGAAGTTTAT-CTACCCTGTAGTCCTCACACCTAAAATTTTTC---TCAATCGTTGAATGTAAGTTATTTACTTCTGGATTGAAAAATAAAATGTAAATGGAGGTT------TCCAGGAAGATGAATT-GAGTGTGCC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59565194 157 + 187378091 TGAACTTAGTTGGGTACCAGTTGAGATATTTGAAGTTTAT-CTACCCTGTAGTCCTCACACCTAAAATTTTTC---TCAATCGTTGAATGTAAGTTATTTACTTCTGGATTgaacaataaaatgtaaatggagGTT------TCCAGGAAGATGAATT-GAGTGTGCC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64501019 157 - 101219884 TGAACTTAGTTGGGTACCAGTTGAGATATTTGAAGTTTAT-CTACCCTGTAGTCCTCACACCTAAAATTTTTC---TCAATAGTTGAATGTAAGTTATTTACTTCTGGATTGAACAATAAAATGTAAATGGAGGTT------TCCAGGAAGATGAATT-GAGTGTGCC i chlSab2.chr22 C 0 I 14 s calJac3.chr15 46062826 147 - 98464013 ----------TGGGTACCattttaaatatttaaattttat-CTACCCTGTAGTCTTCCCAGTTAAAATTTTTC---TTAATCTTTGAATATAAGTTATTTATTTCTGGATTAAACAATAAAATGTAAATGGAGGTT------TCCAGGAAGATGAATT-AAGTGTGCC i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45782658 167 - 149736546 TTAATTTACTTGAGTGCTGGCTGAAATGTTTGTACTCTGTGGTATTTTGTTGTCATCAGAGTTGGAACCTTCCATTTCAACAACTTACTTTAAATAATGGACTTGCTGATGGAATGGTAGAATATACATGAAATATATATTATATATAAAGATAAAGT-GAGGATGCC i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16608718 161 + 58134056 TTAATTTAGTTGTGTACACTTTGCAATATTTGTATTTTAT-CTGCCCTATCATCCTCACATTTAAAATGTTCCTCCTCAACAGTTTAGTGTTAGGTATATATTTACTGTTGGAACAAGGAAATGCAAATGGAGGTT------TCCAGGAAGATGAAATGGAGTGTGCC i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1386874 823 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27733598 1358 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=10342.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 118236 3 + 158759 ATA s panTro4.chr3 201683122 3 - 202329955 ata i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69662621 3 + 202140232 ATA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67592450 3 + 86207423 ATA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61849453 3 + 192599291 ATA i rheMac3.chr2 C 0 I 11 s macFas5.chr2 61005449 3 - 192460366 ATA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59565351 3 + 187378091 ATA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46062973 3 - 98464013 ACA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45782825 3 - 149736546 ATA i mm10.chr6 C 0 I 3 s canFam3.chr20 16608879 3 + 58134056 ACA i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1386874 823 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27733598 1358 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e chlSab2.chr22 64501176 14 - 101219884 I a score=3293.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 118239 2 + 158759 ct s panTro4.chr3 201683125 2 - 202329955 ct i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69662624 2 + 202140232 ct i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67592453 2 + 86207423 TT i nomLeu3.chr21 C 0 I 9 s macFas5.chr2 61005452 2 - 192460366 TT i macFas5.chr2 C 0 I 9 s papAnu2.chr2 59565354 2 + 187378091 TT i papAnu2.chr2 C 0 I 9 s calJac3.chr15 46062976 2 - 98464013 TT i calJac3.chr15 C 0 I 9 s canFam3.chr20 16608882 2 + 58134056 TT i canFam3.chr20 C 0 I 7 e mm10.chr6 45782828 3 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1386874 823 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27733598 1358 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199369574 1622 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11073114 1350 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 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1189 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=926745.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121066 215 + 158759 ---------AGATGCACAAATAGATGTTTGAATGGCATTTGTATAATTCTGGGTCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAAGAAATTTTTAAGGTTAAATAAAAAGCAAACTTTTAGTGTATCAGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAGCACTGTGACAAACATAAAAAGCAGAAACATTAAAAGCAGAAAACTCTTTATTTTCTCTGCTTCCCTGGGAGAAAAACACC s panTro4.chr3 201685953 215 - 202329955 ---------AGATGCACAAATAGATGTTTGAATGGCATTTGTATAATTCTGGGTCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAAGAAATTTTTAAGGTTAAATAAAAAGCAAACTTTTAGTGTATCAGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAGCACTGTGACAAACATAAAAAGCGGAAACATTAAAAGCACAGAACTCTTTATTTTCTCTGCTTCCCTGGGAGAAAAACACC i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69665466 214 + 202140232 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---------AGATGCACAAATAGATGTTTGAATGGCATTTGTATAATTCTGGGGCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAAGAAATTTTTAAGGTTAAATATAAAGCAAACTTTTAGTGTATCAGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAGCACTGCGATAAACATAAAAAGCTGAAACATTAAAAGCAGAAAACTCTTTATTGTCTCTGCTTCCCTGGGAGAAAAACACC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59565974 215 + 187378091 ---------agatgcacaAATAGATGTTTGAATGGCATTTGTATAATTCTGGGGCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAAGAAATTTTTAAGGTTAAATATAAAGCAAACTTTTAGTGTATCAGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAGCACTGCGATAAACATAAAAAGCTGaaacattaaaagcagaaaattcttTATTGTCTCTGCTTCCCTGGGAGAAAAACACC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64501800 215 - 101219884 ---------AGATGCACAAATAGATGTTTGAATGGCATTTGTGTAATTCTGGGGCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAAGAAATTTTTAAGGTTAAATATAAAGCAAACTTTTAGTGTATCAGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAGCACTGCGATAAACATAAAAAGCTGAAACATTAAAAGGAGAAAACTCTTTATTGTCTCTGCTTCCCTGGGAGAAAAACACC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46063596 215 - 98464013 ---------AGAAGCACAAATAGGTGTTTGAATGGCATTTGTATAATTCCAGGGCAAGTTTTTAGGACAAGCTTACC-AAGGAAATTTTTAAGGTTAAATATAAAGCAATCTTCTAGTATATCAGGATGTCTGCTAAAAGCAGAGCACTATGATAAGCATAGAAAGCAGAAACATTAAAAGCAGCAAACTCTTTATTGTCTCTGCTTCCTTGGGAGAAAAACACC i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45783442 213 - 149736546 ---------GAAAGCACAAATAGATGTTTTAATGGAACTTGTACAATTCTGGAACAACTTTTTAGGACAGGCTTATC-AAAGAAATTTCTGAGGTTAAATAGGAAGCAGACTTTTAATGTTTGAGGGTGTTTGCTGAAAGCAGAATGCTGTGATGAACTTGAAAAGGAGAAACATTAAAAGCAGTGAGCGCTTTAT--TTTCTGTTTCCCCAAGAGCAAAGCTCC i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16609505 225 + 58134056 AGAGAAAAGAAAAGCACAAATAGATGTTTCAACAGCATTTGTATAATGCTGGGGCAAGTTTTTAGGACCAGCTTACCGAAGGAAATTCCTAAGGTTAAATATGAAGCAAACTTTTAATGTGTGGGGGTGTTTGCTAAAAGCAGAACACTATGATGGACGTAAAAAGCTGAAACATTAAAGGCAGTCAGCTCTTTATTTTCTCTGCTTCCCTAGGAGCAAAACACC i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27734957 5107 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199376561 1189 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=74413.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121281 15 + 158759 AACAGAAGAATTCGG s panTro4.chr3 201686168 15 - 202329955 AACAGAAGAATTCGG i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69665680 15 + 202140232 AACAGAAGAATTCGG i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67593289 15 + 86207423 AACAGAAGAATTCGG i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850292 15 + 192599291 AACAGAAGAATTCAG i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006287 15 - 192460366 AACAGAAGAATTCAG i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566189 15 + 187378091 AACAGAAGAATTCAG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502015 15 - 101219884 AACAGAAGAATTCAG i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46063811 15 - 98464013 AACAAAAGAATTCGG i calJac3.chr15 C 0 C 0 s saiBol1.JH378125 27740064 15 + 27742158 AACAGAAGAATTCGG i saiBol1.JH378125 I 5107 I 2047 s mm10.chr6 45783655 14 - 149736546 -AAGAGAGAGTTCTG i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16609730 15 + 58134056 AGCAGAAGAATTCTG i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199376561 1189 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 185216 1715 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=976945.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121296 250 + 158759 TAGAT-AAATGATGTTTCCAACTGTGTTGGGAACTTGGAGTTGTGAGATTACAATTGGGACCACAGATTCAGACACCATCATCACCAACTATTTTTGTTCACATTTAAAAATAAAAAGTCAAAAGAAATTTACTAAA-----------------------------ATCTGTATATGTCTGGTTACATGTTTATATGGTTAAAATTTAATATATATACTT-----TTATATAACTGCATTA----TCTATCAATGTATTTATACATCTGTAACTTTTATCTACAAATAT-- s panTro4.chr3 201686183 250 - 202329955 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otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e rheMac3.chr2 61850561 204 + 192599291 M e panTro4.chr3 201686596 0 - 202329955 C a score=16438.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121721 9 + 158759 aaggtagat s panTro4.chr3 201686596 9 - 202329955 AAGGTAGAT i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666104 9 + 202140232 agggtagat i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67593728 9 + 86207423 tagatagat i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006753 8 - 192460366 TA-GTAAAT i macFas5.chr2 I 1 C 0 s papAnu2.chr2 59566639 9 + 187378091 taggtaaat i papAnu2.chr2 I 1 C 0 s chlSab2.chr22 64502454 9 - 101219884 TAGGTAAAT i chlSab2.chr22 I 1 C 0 s calJac3.chr15 46064238 9 - 98464013 taggaagat i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45784063 9 - 149736546 TGGGTAGAT i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610322 9 + 58134056 AAAATTGAT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377795 59 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 186934 14 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e rheMac3.chr2 61850561 204 + 192599291 M a score=53491.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121730 29 + 158759 -aggctagatagTTCAACACAAAAT---GTTAA s panTro4.chr3 201686605 29 - 202329955 -AGGCTAGATAGTTCAACACAAAAT---GTTAA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666113 29 + 202140232 -agactagataATTCAACACAAAAT---GTTAA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67593737 16 + 86207423 -agGCTGCATAGTTCAA---------------- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850768 29 + 192599291 -AGGCTAGATAGCTCAACACAAAAT---GTTAA i rheMac3.chr2 M 204 C 0 s macFas5.chr2 61006761 29 - 192460366 -AGGCTAGATAGCTCAACACAAAAT---GTTAA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566648 29 + 187378091 -aggctagatagCTCAACACAAAAT---GTTAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502463 29 - 101219884 -AGGCTAGATAGCTCAACACAAAAT---GTTAA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46064247 29 - 98464013 -aggctaggtaggtagacaCAAAAA---GTTAC i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45784072 13 - 149736546 ---------TTGTC--------AGT---GGTAA i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610331 30 + 58134056 AGGGAGAAAGAG---AACACAAAATCGAGATAA i canFam3.chr20 C 0 I 8 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377795 59 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 186934 14 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=6918.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121759 2 + 158759 CA s panTro4.chr3 201686634 2 - 202329955 CA i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666142 2 + 202140232 CA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850797 2 + 192599291 CA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006790 2 - 192460366 CA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566677 2 + 187378091 CA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502492 2 - 101219884 CA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46064276 2 - 98464013 CA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s tarSyr2.KE939134v1 186948 2 + 958716 ta i tarSyr2.KE939134v1 I 14 I 588 s mm10.chr6 45784085 2 - 149736546 TG i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610369 2 + 58134056 CA i canFam3.chr20 I 8 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377795 59 - 199944510 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e nomLeu3.chr21 67593753 0 + 86207423 C a score=47379.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121761 19 + 158759 TAAAATATGACAAAGGCAT s panTro4.chr3 201686636 19 - 202329955 TAAAATATGACAAAGGCAT i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666144 19 + 202140232 TAAAATATGACAAAGGCAT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850799 19 + 192599291 TAAAATATGACAATGGCAT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006792 19 - 192460366 TAAAATATGACAATGGCAT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566679 19 + 187378091 TAAAATATGACAAAGGCAT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502494 19 - 101219884 TAAAATATGACAAAGGCAT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46064278 19 - 98464013 TAAAACATGACAAAGGCAT i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45784087 6 - 149736546 --TACTAT----------- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610371 19 + 58134056 CAAAATATGAAAAAGTTGT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1387698 719 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57736337 1549 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377795 59 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 186950 588 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e nomLeu3.chr21 67593753 0 + 86207423 C a score=5634.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121780 1 + 158759 T s panTro4.chr3 201686655 1 - 202329955 T i panTro4.chr3 C 0 C 0 s gorGor3.chr3 199377854 1 - 199944510 T i gorGor3.chr3 I 59 I 1534 s ponAbe2.chr3 69666163 1 + 202140232 T i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850818 1 + 192599291 T i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006811 1 - 192460366 T i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566698 1 + 187378091 T i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502513 1 - 101219884 T i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s nasLar1.chr2 57737886 1 + 181502896 t i nasLar1.chr2 I 1549 I 1568 s rhiRox1.KN296641v1 1388417 1 - 1467263 t i rhiRox1.KN296641v1 I 719 I 1568 s calJac3.chr15 46064297 1 - 98464013 T i calJac3.chr15 C 0 C 0 s mm10.chr6 45784093 1 - 149736546 T i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610390 1 + 58134056 C i canFam3.chr20 C 0 C 0 e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e tarSyr2.KE939134v1 186950 588 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e nomLeu3.chr21 67593753 0 + 86207423 C a score=4500.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121781 1 + 158759 G s panTro4.chr3 201686656 1 - 202329955 G i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666164 1 + 202140232 G i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850819 1 + 192599291 G i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006812 1 - 192460366 G i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566699 1 + 187378091 G i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502514 1 - 101219884 G i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46064298 1 - 98464013 G i calJac3.chr15 C 0 I 1 s mm10.chr6 45784094 1 - 149736546 G i mm10.chr6 C 0 I 1 s canFam3.chr20 16610391 1 + 58134056 G i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1388418 1568 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57737887 1568 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377855 1534 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 186950 588 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11074489 1844 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I e nomLeu3.chr21 67593753 0 + 86207423 C a score=-1120.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 121782 1 + 158759 -G s panTro4.chr3 201686657 1 - 202329955 -G i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666165 1 + 202140232 -G i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850820 1 + 192599291 -G i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61006813 1 - 192460366 -G i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59566700 1 + 187378091 -G i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502515 1 - 101219884 -G i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16610392 1 + 58134056 C- i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784095 1 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1388418 1568 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57737887 1568 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377855 1534 - 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s nomLeu3.chr21 67593753 316 + 86207423 ------------GCAAATATGT-TAAACATAACCGTAGCTTTGAGAAAGCATAAAGCAAGCCTGAATAAAAACTTCT-ACTATCCCAGATAA--AGATAATTTTACGAAACATAAAAGGATATGT--CTATTGCTT-GGAAAGGATTGTAGTTTTTCTTAGCATTCATGTCTAAGTGAAAT-TTCTTACACAGAGTTGTACACAGATAAGCAATATTATTGTTTTCTCCAGTAAGAACACGTACTAGTGACTCT---------------------------------TGATTGATCATCCACAGCGCATTACACTAAGCCA----TTTTACAGATGAGCTCTCAAATTTTGACATTA--GGGAAGTAAGTCAATT--------------------------------------------------------------------------------- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61850821 364 + 192599291 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s papAnu2.chr2 59566701 331 + 187378091 aatagaaataaagcaaatatgt-tAAACATAACCATAGCTTTCAGAAAGCATAAAGCAAGCCTGAATAAAAACTTCCTACTATCCCAGATAGAGAGATAATTTTATGAAACATAAAAGGATATGT--CTATTGCTT-GGAAAGGACTGTAGTTTTTCTTAGCGTTCATGTGTAAGTGAAAT-TTCTTACACAGAGTTGTACACAGATAAGCAATATTATTGTTTTCTCCAGTAAGAGCATAGACTAATGACTCT---------------------------------TGATTGATCATCTACAGTGCATTACACTaagcca----ttttacaaatgggCTCTCAAATTTTGATATTA--GCGAAGTAAGTCAATT--------------------------------------------------------------------------------- i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64502516 330 - 101219884 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rhiRox1.KN296641v1 1388418 1568 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57737887 1568 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377855 1534 - 199944510 I e otoGar3.GL873534 11076448 1837 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=3319438.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 122338 977 + 158759 -TGGTCCAAGACCAATCTACCCTCCATCCTCTTGTTGCCTGGATCCCTTTTCTTTGTGGGTATGACCATTGGAGCACTGAAAAGATGATATAAGTGTCAGGTGAGTTGCATGTTATACATTTGATT---------------------------------TATGAGGGAATGCAGGCTGCTTTGGGAATTTCCTCTGGCACCTTAGCCCTTTTTCTCCTTTCCTTTTCTCCATATTCCAGGACCATCTGTAAAAGGCAGGGATGAGAGAGAGTTCAATGCCTTTCTCCTCCTCTTGATAAGA--AGGGGTAGGATTATGGATAACTACAACTTTGAGAATTCTCCCTCTTACCTTCTGTAGTCCTCTAGATGTGGTCCAGGGGATTGGGGTTTTCAGAAGTGGTGTTTTTGCTGTGCCCTGTCCTAGAAGGCCCTGCAGAAGCTGACT------AAAATGGGTAATTTTCTGAACTTAGAAAT-TGGAGCACTTAGTTTACTCTGCTTGTCAGCATTCTCACGGAAGCAAGAAACAGTCCTCAAAGGCACTTTATAACTGATACCATATAAAAA-CAATTTTTGCTACATTTGACATGACATACTCTTACAGTGATGTCTCTGGCAGAACAATGCACACTCAGTGAGTTGAGGAACAAGTTGCTGCAAAGAAGTGATAAGGCTTCATGTAAAGGCATGCTAGTGTTAAAGAAAGATGCCCTATATGCCAGAAATTGTAAGAAATTTGCATTATGAC-TGT-ATCAGAGAATATGGTCAGGACAGTAAAGAGTTTTTTGG-TTCTCCTCAAATTAAAAACAACTAATTCAATAAGTATGGAAATATGTTTTCAATATTCTA-----TAACTTTTTTATACTTTAA---TTCCTTCAAGAGTGTCATTAAATAATCCAG--------TTTTTTTAA---GTATCCTGCAAACACCAA--AGGTTGACAATCAAAGTTTTAAGT---------------------CAACATGTGAAGTTGCCATTGCTACTTATCAGGGCAATAAAGTCAATGACTGATATATTTTTTCA s panTro4.chr3 201687217 977 - 202329955 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i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69666725 999 + 202140232 -TAGTCCAAGACCAATCTACCCTCCATCCTCTTGTTGCCTGGATCCCTTTTCTTTGTGGGTATGACCATTGGAGCACTGAAAAGATGATATAAGTGTCAGGTGAGTTCCATGTTATACATTTGATT---------------------------------TATGAGGGAATGCACGCTGCTTTGGGAATTTCCTCTGGCACCTTAGCCCTTTTTCTCCTTTCCTTTTCTCCATATTCCAGGACCATCTGTAAAAGGCAGGGATGAGAGAGAGTTCAATGCCTTTCTCCTCCTCTTGATAAGA--AGGGGTAGGATTATGGATAACTACAACTTTGAGAATTCTCTCTCTTACCTTCTGTAGTCCTCTAGATGTGGTCCAGGGGATTGGGGTTTTCAGAAGTGGTGTTTTTGCTGTGTCCTTTCCTAGAAGGCCCTGCAGAAGCTGACT------AAAATGGGTAATTTTCTGAACCTAGAAAT-TGGAGCACTTAGTTTACTCTGCTTGTCAGCATTCTCAGGGAAGCAAAAAACAGTCCTCAAAAGCACTTTATAAGTGATAGCATATAAAAA-CAATTTTTGCTACATTTGACACGACATACTCCTACAGTGATGTCTCTGGCAGAACACTGCACACTCAGTGAGTTGAGGAACAAGTTGCTGCAAAGAAGTGATAAGGCTTCATGTAAAGGCATGCTAGTGTTAAAGAAAGATGCCCTATATGCCAGAAATTGTAAGAAATTTGCATTATGAC-TGT-ATCAGAGAATATGGTCAGGACTGTAAGGAGTTTTTTGG-TTCTCCTCAAATAAAAAACAACTAATTCAATAAGTATGGAAATATATTTTCAATATTCTA-----CAACTTTTTTATACTTTAA---TTCCATCAAGAATGTCATTAAATAATCCAG-------TTTTTTTTAA---GTATCCTGCAAACACCAA--AGGTTGACAATCAAAGTTTTAAGTTGAAGGTCTGTAGCCATTTCCCAACATGTGAAGTTGCCATTGCTACGTATCAGGGCAATAAAGTCAATGACTGATATATTTTTTCA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67594299 996 + 86207423 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i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61851423 999 + 192599291 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i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61007383 999 - 192460366 -TGGTCCAAGACCAATCTACCCTCTATCCTCTTGTTACCTGGGTCCCTTTTCTTTGTGAGTATGACTGTTGGACCACTGACAAGATGATATACGCGTCAGGTGAATTCCATGTTATACATTTGATT---------------------------------TATGAGGGAATGCAGGCTGCTTTGGGAATTTCCTCTGGCACCTTAGCCCTTTTTCTCCTTTCCTTTTCTCCATACTCCAGGACCATCTGTAAAAGGCAGGGATGAGAGAGAGTTCAATGCCTTTCTCCTCCTCTTGATAAGA--AGGGGTAGGATTATGGATAACTACAACTTTGAGAATTCTCCCTCTTACCTTCTGTAGTCCTCTAGATGTGGTCCAGGGGATTGAGGTTTTCAGAAGTGGTGTTTTTGCTGTGCCCTCTCCTAGAAGGCCCTGAAGAAACTGACT------AAAATGGGTAATTTTCTGAACCTAGAAAC-TGGAACACTTAGTTTACTCTGCTTGTCAGCATTCTCAGGGAAGCAAGAAACAGTCCGCAAAAACACTTTATAACTGATAACATATAAAAA-CAATTTTTGCTACCTTTGACACTACATACTCTTACAGTGACGTCTCTGGCAGAACATTGTA-ACTCGGTGGGTTGAGGAATAAGTTTCTGCAATGAAGTGATAAGGTTTCATGTAAAGTCATGCCAGTGTTAAAGAAAGATGCCCTATATGCCAGAAATTGTAAGAAATTTGCATTATGGC-TGTGGTCAGAGAATATAGTCAGGACAGTAAAGAGTTTTTTGGATTCTCCTCAAATAACAAACAACTAATTCAATAAGTATGGAAATATGTTTTCAATATTCTA-----TAACTTTTTTATACTTTAA---TTCCATCAAGAGTGTCATTAAATAATCCAG--------TTTTTTTAA---GTATCCTTCAAACACCAA--AGGCTGACAATCAAAGTTTTAAATCGAAGCTCTGTAGCCATTTCATAACATGCGAAGTTGCCATTGCTACATATTAGGGCAATAAAGTCAATGACTGATATATATTTTCA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59567270 1000 + 187378091 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i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64503084 1007 - 101219884 -TGGTCCAAGACCAATCTACCCTCTATCCTCTTGTTACCTGGGTCCCTTTTCTTTGTGAGTATGACTGTTGGACCACTGACAAGATGATATAAACATCAGGTGAATTCCATGTTATACATTTGATT---------------------------------TATGAGGGAATGCAGGCTG-TTTGGGAATTTCCTCTAGCACCTTAGCCCTTTTTCTCCTTTCCTTTTCTCCATACTCCAGGACCATCTGTAAAAGGCAGGGATGAGAGAGAGTTCAATGCCTTTCTCCTCCTCTTGATAAGA--AGGGGTAGGATTATGGATAACTACAACTTTGAGAATTCTCCCTCTTACCTTCTGTAGTCCTCTAGATGTGGTCCAGGGGATTGAGGTTTTCAGAAGTGGTGTTTTTGCTGTGCCCTCTCCTAGAAGGCCCTGCAGAAGCTGACT------AAAATGGGTAATTTTCTGAAGCTAGAAAC-TGGAGCACTTAGTTTACTCTGCTTGTCAGTATTCATAGGGAAGCAAGAAACAGTCTGCAAAAACACTTTATAAATGATAACATATAAAAA-CAATTTTTGCTACCTTTGACACTACATACTCTTACAGTGATGTCTCTGGCAGAACAATGTACACTCAGTGGGTTGAGGAGTAAGTTTCTGCAATGAAGTGATAAGGCTTCATGTAAAGGCATGCCAGTGTTAAAGAAAGATGCCCTATATGCCAGAAATTGTAAGAAATTTGCATTATGGC-TGTGATCAGAGAATATGCTTAGGACAGTAAAGAGTTTTTTGGGTTCTCCTCAAATAACAAACAACTAATTCAATAAGTATGGAAATATGTTTTCAATATTCTA-----TAACTTTTTTATACTTCAA---TTCCATCAAGAGTGTCATTAAATAATCCAGTTTTTTTTTTTTTTTAA---GTATCCTGCAAACACCAA--AGGTTGACAATCAAAGTTTTAAATTGAAGGTCTGTAGCCATTTCACAACATGGGAAGTTGCCATTGCTATATATCAGGGCAATAAAGTCAACGACTGATATATATTTTCA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46064839 996 - 98464013 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i calJac3.chr15 C 0 I 1 s canFam3.chr20 16611145 1016 + 58134056 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i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1388418 1568 - 1467263 I e saiBol1.JH378125 27740079 2047 + 27742158 I e nasLar1.chr2 57737887 1568 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199377855 1534 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 187539 1319 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11076448 1837 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=9100.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 123315 1 + 158759 G s panTro4.chr3 201688194 1 - 202329955 G i panTro4.chr3 C 0 I 2 s gorGor3.chr3 199379389 1 - 199944510 G i gorGor3.chr3 I 1534 I 230 s ponAbe2.chr3 69667724 1 + 202140232 G i ponAbe2.chr3 C 0 I 1 s nomLeu3.chr21 67595295 1 + 86207423 G i nomLeu3.chr21 C 0 I 1 s rheMac3.chr2 61852422 1 + 192599291 G i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61008382 1 - 192460366 G i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59568270 1 + 187378091 g i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64504091 1 - 101219884 G i 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ttttttaaatttatttttaaattaaattt-----------------taGTGtttattttagatatgggggg---ataca----ggtgcaggtttgttacat--aggtatattgc----ataatcctgagtctggg------------------------------------------ggtatggatcctgtcatccaggtagttagcataggat i panTro4.chr3 I 2 C 0 s ponAbe2.chr3 69667726 145 + 202140232 ttttttaaatttatttttaaattaaattt-----------------tagcgtttattttagatatgggggatacataca----tgtgcaggtttgttacat--aggtatactgc----ataatcctgagtttggg------------------------------------------ggtatggatcctgtcatccaggtagttagcacaggat i ponAbe2.chr3 I 1 C 0 s nomLeu3.chr21 67595297 142 + 86207423 GTTTTTTAATTTATTTTTAAATTAAAttt-----------------tagcatttattttagatatgggggg---ataaa----tgtgcaggtttgttacgt--aggtatattgc----ataatcctgagtttggg------------------------------------------ggtatggatcctgtcatccaggtagttagcataggat i nomLeu3.chr21 I 1 C 0 s rheMac3.chr2 61852423 141 + 192599291 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TTTTTAAAATTTATTTTTTAATTAAAttt-----------------tagcttttattttagatacgggggg---ataca----tgtgaaggttttttacat--aggtatattgt----ataatgctgaatttggg------------------------------------------ggtatggatcctgtcatccaggaagttagcataggac i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46065837 138 - 98464013 TTTTCAAAATTTATTTTTTAAATAAGTTT-----------------TAGCTCTTG----AGATATGGgagg---atacc----tgtgcaggactgttacat--agatacatggc----ataatgctgagttttca------------------------------------------ggtatggatcctgtcatccagatagttagcataggac i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16612162 198 + 58134056 ------ACAACTACCTAACAATTCCATTTTGACTGTCCTCACTGTGTAGCTTCTTCTCTGGAT-------G---ATACAGTGCTGTGCCAATTTTTTAAACTGTGttttattgtagcaagaacactgaacatgggctctaacctcttaaatttttaaaaatgtacattactgttgaccataggtactgtgtcatacagtggatttatagagcgt i canFam3.chr20 C 0 I 41 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1389987 837 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57739456 837 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199379390 230 - 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0 C 0 s nomLeu3.chr21 67595503 285 + 86207423 tgcttccatctacatgtccatgtaaactcaatg--tccagctcttactcattagtgagaacatgtggtatttggttttctgtttctgcattaattcac-----ttaggattatggccttcagcttaatccatgttgcttaaaaggacagaatttgattctttattacaactgcatagtgttccctggtacctatatgtaccacattttctttatctaatccaccaataatggatacctaggttgagttcatgtctttgttatcgtgaatagcacagcaaagaacatatgagt i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61852628 280 + 192599291 tgcttccatctacatgtccatgtatactcaatg--ttcagctcttactcattagtgagaacattttgtatttgattttctgtttctgcattaattcac-----ttaggattatggccttcagcttaatccatgttgcttaaaaggacataatttgattctttattatgact-----atgttccttggtacctatatgtaccacattttctttatccaatccaccactaatggacacctaggttgagttcatgtctttgatatcatgtatagcacaccaaagaacacatgagt i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61008588 280 - 192460366 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ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67596118 1 + 86207423 c i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61853238 1 + 192599291 c i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61009198 1 - 192460366 c i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59569086 1 + 187378091 C i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64504908 1 - 101219884 c i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s nasLar1.chr2 57740293 1 + 181502896 c i nasLar1.chr2 I 837 C 0 s rhiRox1.KN296641v1 1390824 1 - 1467263 c i rhiRox1.KN296641v1 I 837 C 0 s calJac3.chr15 46066664 1 - 98464013 c i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16613014 1 + 58134056 c i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e tarSyr2.KE939134v1 188860 477 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11078287 665 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=12012.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 124138 2 + 158759 tt s panTro4.chr3 201689019 2 - 202329955 tt i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69668549 2 + 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atttgtcaaagagagataataacagtagttttt--cataaggttgttgcgaagattgaatgagttcatacagataaagcactcaaactatgtaaatgtcttattgcactcagagctatg i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59569089 117 + 187378091 ATTTGTCAAAGAGAGATAATAACAGTAGTTTTT--CATAAGGTTGTTGCGAAGATTGAATGAGTTCATACAGATAAAGCACTCAAACTATGTAAATGTCTTATTGCACTCAGAGCTATG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64504911 117 - 101219884 atttgtcaaagagagataataacagtagctttt--cataaggttgttgcaaagattgaatgagttaatacagataaagcactcaaaccatgtaaatgtcttattgcgctcagagctatg i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46066667 117 - 98464013 atttgtcaaatagacgtaataacagtagctttt--cataaggtggttgagaagattgaatgagttaacacagacaaagcactcaaactatataaatgtcttattgtgctcacaactatg i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16613017 115 + 58134056 tattgtaaaatagggataatattaatactttttaaaatagggttgctggaaaaactaaatgagttaatacaggaaaaacat----actacataaatgctacattgcatttagagctatg i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1390827 401 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57740296 4158 + 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TAAGTATTAGGTATTACTACATTTATTATCGGTATTCACACTTTATTATTGTTGTAGTGGTGGGAATACAGGCTGTTTTGGGATAC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64505028 86 - 101219884 taagtgttaggtattattACATTTATTATCGGTATTCACACTTTATTATTGTTGTAGTGGTGGGAATACAGGCTGCTTTGGGATAC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46066784 83 - 98464013 taagtgttaggtattattACATTTATTACTGGTATTCACATTTTATTATGGTTG---TGGTGGGAATTCAGGCTGCTTTGTGATAT i calJac3.chr15 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16613132 85 + 58134056 taaatgttaactattaGTAAGTTCAGTATTGATATTGGTATGCTATTATTACTGTGGTGGTGGGAATACAGATTGTTTTGGGATG- i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1390827 401 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57740296 4158 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199380364 281 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 188860 477 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11078287 665 + 30473821 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 111995 7957 + 196860 I a score=12315.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 124339 5 + 158759 --CCTTg s panTro4.chr3 201689223 5 - 202329955 --CCTGg i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69668753 5 + 202140232 --CCTGg i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67596323 5 + 86207423 --CCTGg i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61853444 5 + 192599291 --cctgg i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61009404 5 - 192460366 --CCTGG i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59569292 5 + 187378091 --CCTGG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64505114 5 - 101219884 --CCTGG i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46066867 5 - 98464013 --TCTGg i calJac3.chr15 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_127380.1-196860 119952 5 + 196860 --TCTAG i tupBel1.scaffold_127380.1-196860 I 7957 I 4846 s canFam3.chr20 16613217 5 + 58134056 AGCCA-- i canFam3.chr20 C 0 C 0 e mm10.chr6 45784614 373 - 149736546 I e rhiRox1.KN296641v1 1390827 401 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57740296 4158 + 181502896 I e micMur1.scaffold_1480 43734 9030 - 329962 I e gorGor3.chr3 199380364 281 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 188860 477 + 958716 I e otoGar3.GL873534 11078287 665 + 30473821 I a score=586243.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 124344 174 + 158759 gaatcatgttaatctttctctacctttttattctc-agcatctagttcaatgccacacacacacaaacat--gcttcacaaatgtctgttgaCAAATCAGGTAAATGGCATGGCTTACTGATGTCTAACTGTGGAGATAGTTATCATTCATGG-------------------------------------GCCCACT---------------------GAGAGCAAAAAGAAAGC s panTro4.chr3 201689228 173 - 202329955 gaatcatgttaatctttctctacctttttattctc-agcatctagttcaatgccacacacacacaaacat--gcttcacaaatgtctgttgaCAAATCAGGTAAATGGCATGGCTTACTGATGTCTAACTG-GGAGATAGTTATCACTCATGG-------------------------------------GCCCACT---------------------GAGAGCAAAAAGAAAGC i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 69668758 174 + 202140232 gaatcatgttaatctttctctacctttttattctc-agcatctagttcaatgccatacacacacaaacat--gcttcacaaatgtctgttgaCAAATCAGGTAAATGGCATGGCTTACTGATGTCTAACTGTGGAGATAGTTATCACTCATGG-------------------------------------GCCCACT---------------------GAGAGCAAAAAGAAAGC i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 67596328 174 + 86207423 gaatcatgttaatctttctctacctttttattctc-agcatctagttcaatgccacacacacaaagacat--gcttcacaaatgtctattgaCAAATCACGTAAATGGCATGGCTTACTGATGTCTAACTGTGGAAATAGTTATCACTCATGG-------------------------------------ACCCACT---------------------GAGAGCAAAAAGAAAGC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 61853449 174 + 192599291 gaataatgttaatctttctctacctttttattctc-agcatctagttcaatgtcacacacacacaaagat--gctttacaaatgtctgttgaCAAATCAGCTAAATGGCATGGTTTGCTGATGTCTAACTGTTGAGATAGTTATCACTCATGG-------------------------------------GCCCATT---------------------GAGAGCAAAAAGTAAGC i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61009409 174 - 192460366 GAATAATGTTAATCTTTCTCTACCTTTTTATTCTC-AGCATCTAGTTCAATGTCACACACACACAAAGAT--GCTTTACAAATGTCTGTTGACAAATCAGCTAAATGGCATGGCTTACTGATGTCTAACTGTTGAGATAGTTATCACTCATGG-------------------------------------GCCCATT---------------------GAGAGCAAAAAGTAAGC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 59569297 174 + 187378091 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aataatgaagaca i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64506415 13 - 101219884 AATAATGAAGACA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s calJac3.chr15 46068146 13 - 98464013 AATAATGAAGACA i calJac3.chr15 C 0 C 0 s otoGar3.GL873534 11080377 13 + 30473821 aataaCAGTGGCA i otoGar3.GL873534 I 604 I 1886 s mm10.chr6 45787758 11 - 149736546 AACAATGCACT-- i mm10.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr20 16614494 13 + 58134056 TATAATGGAGACT i canFam3.chr20 C 0 C 0 e rhiRox1.KN296641v1 1391239 2585 - 1467263 I e nasLar1.chr2 57740296 4158 + 181502896 I e gorGor3.chr3 199381540 2913 - 199944510 I e tarSyr2.KE939134v1 190231 1905 + 958716 I e tupBel1.scaffold_127380.1-196860 119957 4846 + 196860 I a score=4705687.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 125702 1222 + 158759 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i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 61010719 1222 - 192460366 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papAnu2.JH685018 78572 6 - 139415 TGCGGT i papAnu2.JH685018 N 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20209136 1121 - 111351968 I a score=77189.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 130852 192 + 158759 tggtggcagcgatggacactgcagccagccagagcgtagaaaggcatcggggtaagtgcactattc-aggctgcactgcgggtggcctgggacgggttgggagccctatctcaggtgtcactgcccgtcttgggtggctggttgggtgtgctatctggggctgtgctgcctgcacc----gg-ggggtggtttggggg s ponAbe2.chr2a_random 8994153 192 + 13868332 tggtggcagcgatggacactgcggccagccagagcatagaaaggcgt-gtggtaagtgcgctatcc-gggctgcactgcgggtggcctgagacgggttgggggccctatctcaggcgtcactgcccgccttgggtggctggttgggtgtgctatctggggctgtgctgcctgcacc----ggaggggtggtttggggg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78578 197 - 139415 TGGTGGCAGGGACCGAAACTGCAGCTGTCCAGAGTGTAGAAAGGCATTGGAGTAACTGTGCTCTCCAGGGCTGCATCGCCCACGGCCTGGGGTGGGTTGGGGGTCCTATCTCAGGCATGACTGCCTGCCTTGGGTGACTGGTTGGGTGCACCATCTGGGGCTGTGTTGCCTGCACTGGAggg-ggggTGGGTTGGGAG i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285672 190 - 75399963 tggtggcagggaacgacactgcagctgtccagagcatagaaaggcatcg--gtaagcgcattttccagggctgcaccgcccgcggcctggggtgggttgggagccctatctcaggcgtcactgcccatcttgggtggctggttgggtgtgccatct-gtgctgtgttgcctgcacc----gg-ggggtgggttggggg i chlSab2.chr5 N 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20209136 1121 - 111351968 I a score=476.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131044 1 + 158759 c s gorGor3.chr2A 20210257 1 - 111351968 c i gorGor3.chr2A I 1121 I 120 s ponAbe2.chr2a_random 8994345 1 + 13868332 c i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78775 1 - 139415 T i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285862 1 - 75399963 c i chlSab2.chr5 C 0 C 0 a score=6568.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131045 17 + 158759 ccaaaccggggctgcac s ponAbe2.chr2a_random 8994346 17 + 13868332 ccaaaccggggctgcac i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78776 17 - 139415 CCTATCTGGGGCTGCCC i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285863 17 - 75399963 cctatcctgggctgcac i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210258 120 - 111351968 I a score=69467.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131062 104 + 158759 tgcctttggcggggagccggttgggggcactatcccagactgtattgctggcaacagtgaggtgggctaagtgtgctatccagggctgcactgtgcggctgtgg s ponAbe2.chr2a_random 8994363 104 + 13868332 tgcccttggcggggagccggttgggggcactatcccggactgtattgctggcagcagtgaggtgggccaagtatgctatccggggctgcactgcgaggctgtgg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 682726 104 - 115148730 TGCCCTtggcggggagccggttgggggcactattccagacagtattgctggcaacagtgaggtgggctaagtgtgctatccggggctgcactgcgtggctgcat i nomLeu3.chr7b N 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78793 103 - 139415 TGCCCTCCGCAGCGAGCGGGTTGGGGGCACTATCCGCGACTGTATTGACAGCAGCAGTGAGGTGGGTTAAGGGTGCTATCTGGGCCTGCACTACCCTT-TGTGG i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285880 103 - 75399963 tgccctcggtggggagcgggttgggggcgctatccgagactgtattgacggcagcagtgaggtgggttaaggcttctatctgggcctgcactacccgg-tgtgg i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210258 120 - 111351968 I a score=430.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131166 1 + 158759 g s gorGor3.chr2A 20210378 1 - 111351968 t i gorGor3.chr2A I 120 I 11059 s ponAbe2.chr2a_random 8994467 1 + 13868332 g i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 682830 1 - 115148730 g i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78896 1 - 139415 G i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285983 1 - 75399963 g i chlSab2.chr5 C 0 C 0 a score=177601.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131167 268 + 158759 g--ggtggggtggcggtttcgg-ttgagggcgctatggggtgctgtaatgcccatggtccagggaggcggggcggtttgggtatgttgggtgtgctattg-gggggggcgacactgctggt----ggtagggggcagggtgggttgggggccatatcaggggctgcactgattgctttagctaggatttcaggtgctatgttaaacaacagtggtgacaaggggcatccttatcatgttcca--gatcttagaggaaaagctttcca-tttttccccat s ponAbe2.chr2a_random 8994468 271 + 13868332 gtggggggggtggcggtttcgggttgagggcgctgtggggtgctgcaatgcccatggtgcggggaggcgaggcggtttgggtgtgttggatgtgctattg-gggggagcgacactgctggt----ggtagggggcagggtgggttgggggccatatcaggggctgcactgattgctttagctaggatttctggtactgtgttaaacaacagtggtgacagggggcatccttatcatgttcca--gatcttagaggaaaagctttcca-tttttccccat i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 682831 267 - 115148730 -----gggggtggcagttttgggttcagggccct-tgaggtgctgcaatgcccatggtgcggggaggcagggcggtttgggtgtcttgcgtgtgctgttgcggggggtctacactgctggt----ggcagggggcagggtgggttgggggccatatcaggttctgcactgattgctttagctgggatttccagtactatgttaaacaacagtggtgacagtgggtatccttatcatgttcaa--gatcttagaggaaaagctttccattttttccccat i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 78897 249 - 139415 ---TGGGGGG--------TTGGGTTGAGGGCGCTATGGAGTGCTGTAGTGCCCACAGTGcgggggggcggggcggtttgggtgtgttggg-gtgctat--------------actgctggtggcgggca-ggggtggggtgggttgggggccatatcaggggcTGCACTGATTGCTTTAGCTAGGATTTCCGGTACTATGTTAAATagcagtggtgacagtgggcatccttgtcatgttcca--aatgttagaggaaaagctttcca-tTTTTCCCCGT i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43285984 260 - 75399963 ---cgggggg-------tttgggttgagggcgctatggggtgctgcagtgcccacggtgcagggagg-ggggcggtttgcgtgtgttgggtgcgctatt--tgggggtctacactgctgtt----ggca-ggggcggggtgggttgagggccgtatcaggggctgcagtgattgctttagctaggatttccagtactgtgttaaatgtcagtggtgacagtgggcatccttatcatgttccaagaatgttagaggaaaagctttcca-tttttccccat i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=1353013.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 131435 1200 + 158759 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s panTro4.chr15 18733720 1234 + 99548318 TCCAtatgattctagctctgggtgtctttcctgtagtttttattatgttgtggtatgtttcttctgtacccgtttctttgaggattaatagcatgaagg-atgttgaatttcatcaaatgctttttcagtttcagttgacatgatcatactgtttttgtcatttatttggtagatatgatgtatcacattgt--gttgagtgacccttgcatcccagggatacatcgcacttgatcatgatgaattatcttttcaatgtattactgaatttgattcactggtattttgttgaggatttttgcatcaatatttgaaatactggcctatagtttccttctttgatgcctttgtctgattttggtatcacagtaataatggtctcacagaataagtttggaagtattccctcctgtttttcaaaatagtttgagtaggattcatactaggtctttaaattgtttgttgtgaagccatcagcagtgaagacatcagttcccgggcttttctttactgggagaacttttctgatggcttcaatctcattacttgttaccaatctgttttggtcttggatgttttcattattcaacctaagtaggtgtatacaacctaagtaggtgtattcctagatgtatgcatctaggaacttgccaatttctactaggctttccaatttattggcatataatagccagttatgatcctttgaatttct-gaagtattagttgtaatgtctccttttttttaatctgttgattttatttatttgaattttgtctc-ttttttcttagttagcctggtta---aaagtttgtcaattttgtttagctttccagaaaaccaacttttcatttaatcatgtgtg--ttttttatttcaattttatttctgctacgatctt----atttattttcttattttcagtttagtttgttcttacttcaatagttctttaagatgtatggtttatttaaagtttttcttttgtttggatggtaggcacttata-------------gctgt----------------aaatctctgcctttgtactgctttctgcata--acaagttttggtatactgtgttttcattgccctttgtttcatgaaatttttgaatttctgtcttagtatcttcattgacccgctagtcatttattcagaagggtagtgtttaacttccatgtgattgtattgtttccaaaattactcttcttattgatacctagttttattcctttgtagtcaaagaagatggccacggag i panTro4.chr15 N 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8994739 1207 + 13868332 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tccatctgattctagctgtgggtgtctttcttgtagtttttattatattgcagtgtgtttcttctgtacccatttttttgaggatttatagcatgaagggatattgaatttcatcaaatgctttttcagtttcagttgacatgatcatactgcttttgtcgtttatttggttgatgtgatgtatcacattgtatgctgagtgacccctgcatcccagccatacatcccacttgatcatgatgaattatcttttttatgtattactgaatttgattcactggtattttgttgaggatttttgcatcagtattagagatactagcctgtagtttccttctttgatgcctttgtctgattttggtatcacagtaataatggtctcatagaataagtttggaagtattccctcctgtttttccaaatagtttgagtagggttggtactaggtctttaaattgtttggtgtgaagccatcagcagtgaagacatcagttgctgggcttttctttaccaggagactttttctaatggcttcaatctcattacttattaccagtctgttctggtcttggatgctttcattgttcaacgtaggtaggt------------------------------tgtatgcatctaggaatttgccaatttctactaggctttccaatttattggcatgtaatagccagttatgatcctttgaatttct-gaaatatcagttgtaatgtctccttttttt--atctgttgattttatttatttgagtcttgtctcatttttttttagttagccttgtta---aaagtttgtcaattttgtttagctttccagaaaaccaacttttcgtttaatcttgtgtg---attttatttcaattttatttctgctacgatctt----atttattttcttatttttggtttagtttgttcttactatactagttctttaagatgtattgtttatttgaagtttttcttttgtttggatggtagactcttata-------------gcttt----------------aaatctctgcctttgtcctgctttctgtgta--acaa-ttttggtatattgtgttttcattaccctttgtttcatgaaatctttgaatttccatcttagtatcttcattgacccaccagtcatttattcaggagagtagtgtttaacttccctgtgattgtattctttccaaagttactcttcttattgatacctagtttcattcctttgtagtcaaagaagaCggccacggag i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 79146 1200 - 139415 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i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43286244 1231 - 75399963 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i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=3354.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 132635 3 + 158759 aca s panTro4.chr15 18734954 3 + 99548318 aca i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8995946 3 + 13868332 aca i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 684302 3 - 115148730 aca i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 80346 3 - 139415 ACA i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43287475 3 - 75399963 aca i chlSab2.chr5 C 0 C 0 s saiBol1.JH378298 305806 3 - 2064692 tct i saiBol1.JH378298 N 0 N 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=763722.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 132638 651 + 158759 gacagcagcgtggttagagtggtaggagccggccatcagcgagagctgctccatgcctggctgctgggtgctagagcctgcggccc-actggcttgcctcactgtggttggtggtggcagtaacagagactgcagcacaaccagagtggtaggacaggggctatccagggctgcacctttcgcagtgtggggtgggttgggggcgctatccagggtgtcattgcctgcattaggggtactggttggtagcactccacagggctgcactacccacggcagggagggtgggttatgggtgctttctggggctgcagtgcccatggaggaggacaggttagggcactatcgggtatacgctactggcagcattgggggacggaggtggggggcgctattgagggcaggactagccgtggagggcgggcgagttcggtgctatcaggggctgcactgctggcggcggTCAACAGA---------------GTTGGCATCCAAGGAAGGAGTGGTTCTCCTCTCCCT-GACTCCACACTCCAGAGGGCAACCCACTCTTGGTCATACTGGAGTGTGGCAGGGCACGCAGCGTTTGCATGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCACCGTGGTTCCTGGGCCTGTGCACTCTCGGTCTGTGCCTCAG s panTro4.chr15 18734957 646 + 99548318 g----cagcgtggtcagagtggtaggagccggccatcagcgagagctgctccgtgcctggctgctgggtgctacagcctgtggccc-actggcttgcctcactgtggttggtggtggcggtgacagagactgcagcacgaccagagtggtaggacaggggctatccagggctgcacctttcgcagtgtggggtgggttgggggcgctatccagggtgtcattgcctgcattaggggtactggttggtagcactgtacagggctgcactgcccatggcagggagggtgggttatgggcgctttctgggactgcaatgcccatggagaaggacaggttagggcactatcaggtatacgctactggcggcattgggggatggaggtggggggagctattgagggcaggactagccgtggagtgggggtgagttcagtgctatcaggggctgcactgctggcggcagTCAGCAGA---------------GTTGGCATCCAAGGAAGGAGTGGTTCTCCTGTCCCT-GACTCCACACTCCAGAGGGTGACCCACTCTTGGTCATACTGGAGTGCGGCAGG-CATGCAGCGTTTGCATGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCACCGTGGTTCCTGGGCCTGTGCACTCTGGGTCTGTGCCTCAG i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8995949 646 + 13868332 g----cagcgtggtcagagtggtaggagccgcccatcggcgagagctgctctgtgcctggctgctgggtgctagagcctgtggccc-actggcttgcctcactgtggttggtggtggcggtgacagagactgcagcacgaccagagtggtaggacaggggctatccagggctgcacctttcacagtgtggggtgggttgggggcgctatccagggtgtcattgcctgcattaggggtactggttggtagcactgtacagggctgcactgcccacggcagggagggtgggttatgggcactttctggggctgcaatgcccatggaggaggacaggttagggcactatcgggtatacgctactggcggcattgggggacggaggtggggggcgctgttgagggcaggactagccgtggagggggggcgagtttggtgatatcaggggctacactgctggcggcggTCAGCAGA---------------GTTGGCGTCCAAGGAAGGAGTGGTTCTCCTCTCCCT-GACTCCACACTCCAGAGGGCGACCTACTCTTGGTCATACTGGAGTGCGGCAGG-CACGCAGCATTTGCGTGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCACCGTGGTTCCTGGGCCTGTGCACTCTGGGTCTGTGCCTCAG i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 684305 646 - 115148730 g----cagcgtggtgggagtggtaggagcgggccatcagcgagagctgctccctgcctggctgctgggtgctagagcctatgtccc-actggcttgcctcactgtggttggtggtggcggtgacagagactgcagcacgaccagagtggtaggacaggggctatccagggctgcacctttcgcagtgtggggtgggttgggggcgctatccagggtgtcattgtctgcattaggggtactggttggtagcactgtacagggctgcactgcccacggcagggagggtggattatgggcgctttctggggctgcaatgcccatggaggaggacaggttagggcactatcgggtatatgctactggcagcattcggggatggaggtggggggcactatttagggcaggagtagctgtggatagggggcgagttcattgctatcagtgactgcactgctggtggcagTCAGCAGA---------------GTTGGCATCCAAGGAAGGAGTGGTTCTCCTCTCCCT-GACTCCACACTCCAGAGGCCGATCTACTCTTGGTCATACTGGAGTGCGGCAGG-TGCACAGCGTTTGCGTGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCACCGTGGTTCCTGGGCCTGTGCACTCTGAGTCTGTGCCTCAG i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 80349 658 - 139415 G----CATCATGATCAGAGTGGTAGGAGGCAGCCATCAGCAAGAGCTGCTCTGTGCCCAGCTGCTGGGTGCTAGAGCCTGCAGCCC-AGTGGCTTGCCTCATTGCGGTTGATGGCAGTGACGACAGAGACTGCAGCACAACCAAAGTGGTAGGACAGGGGCTATCTGGGGCAGCACTTTTCGCAGTGTGGGGTGGGTTGGGGGTGCTATCCGGGGTGTCACTACCTGCGTTGGGGGTACTGGCTGGTAGCACTATACAGGGCTGCACTGCCCACGGC--GGTGGGTGGGTCATGGGCACTCTTTGGGGCTGCAATGCCCATGGTGGGGGACAGGTTAGGGCACTATCAGATATACGCTGCTGTCAGCAttgtggggtggaggtggggg-tgctATTGAGGGCAGGACTACCTGTGGAGAG-GGGCGAATTGGGTGCCATCAGGAACTGCACTATTGGCAACAGTCGGCAGAGGTGGCAGCAACAGTGGTGGCATCCAAGGAAGGAGCGGTTCTCCTCTCCCTGGACTCCACACTTCAGAAGGCGACCTACTCTTACTCATACTGGAGTGTGGCAGG-CGCACAGTGTTTCCGTGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCACCATGGTTCCTGAGCCCATGCACTCTGGGTCTGTGCCGCAG i papAnu2.JH685018 C 0 M 562 s chlSab2.chr5 43287478 660 - 75399963 g----catcatggtcagagtggtaggagggagccatcagcaagagctgctccaggccaggctgctgggtgctagagcctgcagccctggcggcttgcctcactgtggtttgtggtgatggcgacagagactgcagcacgaccagagtggtaggacagggactatccggggctgcactttttacagtagggggggggttaggggcactatccggggtgtcactgcctgcgttgggggtactggttggtagcactatacagggctgcgctgcccatggt--tgggggtgggttatgggccctctctggggctgcattgcccatggagggggacaggttagggcactatcggatatacgctgctgtcagcattgtggggtggaggtgggggatgctattaagggcaggactacctgtggagag-gggcgagttgggtgctatcaggggctgcgctgctggtggcagTCGGCAGAGGTGGCAGCAACAGTGGTGGCATCCAAGGAAGGAGTGGTTCTCCTCTCCCTGGACTCCACACTCCAGAGGGCGACCTATTCTTACTCATACTGGAGTGCGGCAGG-TGCACAGTGTTTCCGTGGGAATCCTGAGCATGGCAGAGCCCCCACACCCGCCATGGTTCCTGGGCCCATGCACTCTGGGTCTGTGCCGCAG i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=165027.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133289 211 + 158759 AGGCTGCCAGGCACCCC------------TGGGGACACCACGGGGGACAGGGCCCTGTGCGTGGAGGCGTCCAGAACAGGAATTGGCACCTGGGTGTGGAGGGCTGGCTGGGTCTGAATTTTTCTGCTTCTCCTGTTCCCCGAGGAGTGCAGCCCCGGTGGGCCCAATGGTTCCTGTGGAGTGGGGAGCTGGAATCTGTGGTGTCTCCAGCACCCACCCCAGA s panTro4.chr15 18735603 211 + 99548318 AGGCTGCCAGGCACCCC------------TGGGGACACCACGGGGGACAGGGCCCTGTGTGTGGAGGCGTCTGGAACAGGAATTGGCACCTGGGTGCGGAGGGCTGACTGGGTCTGAATTTTTCTGCTTCTCCTGCTCCCTGAGGAGTGCAGCCCCAGTGGGCCCAATGGTTCCTGTGGAGTGGGGAGCTGGGTGCTGTGGTGTCTCCAGCACCCACCCCAGA i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8996595 211 + 13868332 AGGCTGCCAGGCACCCC------------TGGGGACACCACGGGGGACAGGGCCCTGTGTGTGGAGGCGTCCGGAACAGGAATTGGCACCTGGGTGCGGACGGCTGGCTGGGTCTGAATTTTTCTGCTTCTCCTGCTCCCCGAGGAGTGTGGCCCTGGTGGGCCCAATGGTTCCTGTGGAGTGGGGAGCTGGGTGCTGTGGTGTCTCCAGCACCCACCCCAAA i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 684951 210 - 115148730 AGGCTGTCAGGCACCCC------------TGGGGACACCACGGGGGACAGGGCCCTGTGCGTGGAGACGTCTGGAACAGGAATTGGCACCTGGGTGTGGAGGGCTGGCTGGGTCTGAATTTGTCTGCTTCTCCTGCTCCCCGAGGAGTGCAGCCCGGGTGGGCCCAATGGTTCCTGTGGAGTGGGGAGCAGGGTGCTGTGGTGTCTCCA-CACCCACCCCAGA i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43288138 220 - 75399963 ACACTGCCTGGCACCCCCAGGTATGGAGTTGCGGACACCATAGGGGACAGGGCCCTGTGTGTGGAGGCATTGGGAACAGGATATGGCACCTGGGTGGGGAGGGTTGGCTGGGTCTGAGTT--TCTGCTGCTCCTGCTCCCCGAGGAGTGCAACCC-AGTTGGCCCAGCAGTTCCTGTGGAGTGGGGAGCTGGGGGCTGTGGCGTCTCCAACACCCACACCATG i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e papAnu2.JH685018 81007 562 - 139415 M a score=388075.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133500 326 + 158759 CCCCAGTTCCCAGACAGCTTGGGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGGGTGGGTGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCTGGCATGACAAGTTGAGGCTCTAACCCTTCCACTCCTCACAACTTCCtctaggcttttctggctttgcccgcccagctgctccgtgccaggaagaggaggagacacctagagcctgcaacaccacggctcgcctcgctgcaggtggatggcagtgacggagactgcagtgcgccagagcggtaggagagcggccgcgctaggagggcaggcggctgcaggcagggttgg s panTro4.chr15 18735814 326 + 99548318 TCCCAGTTCCCGGCCAGCTTGGGCCAAAAGGAGAGGTTGGACTTTGGAGGGTGGGTGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCGGCATGACAAGTTGAGGCTCTAACCCTTCCACCCCTCACATCTTCCtctaggcttttctggctttgcccgcccagctgctccatgccaggaggaggaggagacacctagagcctgcaacaccacggctcgcctcactgcaggagggtggcatcgacggagactgcagtgcgccagagcggtaggagagcggccatgctaggagggcaggcggcTGCAGCCAGGGTTGG i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8996806 326 + 13868332 CCCCAGTTCCCGGCCAGCTTGGGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGTGTGGATGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGCATTACAAGTTGAGGCTCTAACCCTTCCACCCCTCACATCTTCCtctaggcttttctggctttgcccacccagctgctctgtgccaggaggaggaggagacacctagagcctgcgacaccacggctcacctcgctgtgggtgggtggcagcaacggagagtgcagtgcgctggagcagtaggagagcggccgcgctaggagggcaggcggctgcagccatggttag i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 685161 326 - 115148730 CCCCAGTTCCTAGCTAGGTTGGGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGGGTGGGTGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCGGCATGACATGTTGAGGCTCTAACCCCTCCACCCCTCACATCTTCCtctaggcttttctggctttgcccgcccagctgctccatgccaggaggaggaggagacacctatagcctgcaacaccatggctcgcctcattgcaggtgggtggcagcgacagagaccgcagtgcaccggagcagtaggagagTGGCCATGCTAGGAGGGCAGGTGGCTGCAGCCAGGGTTGG i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 81569 326 - 139415 CTCCAGTTCCTGGCCAGCTTGGGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGGATGGGTGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGCCCCTTGCCACCCAGTGGCTGGCATGACAAGGTGAGGCTCTAACGCTACCACCCCTTGCATCTTCCTCTAGGCGTTTCTGGCTTTGCCCACCCAACTGCTCCatgccaggaggaggaggaaacaccTGGAGCTTGTGACACTGTGGCTCACTTCACTGCAGCTTGGTGGTGGTAACGGAGACTGCAGCACGCCGGAGCAGTAGAAGGGCAGCCATGCTAGGAGGGCAGGTGTCTGTGGCCAGGGCTGA i papAnu2.JH685018 M 562 I 62 s chlSab2.chr5 43288358 325 - 75399963 CCCCAGTTCCTGGCCAGTGTGGGTCAAAAGGAGAGGCTGAACTTTGGAGGGTGGGTGTGAGTGCCTTTGCTGAAACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCTGGCATGACAAGGTGAGGCTCTAACGCTACCACCCC-TGCATCTTCCtctaggcttttctggttttgcccacccaactgctccatgccaggaggaggtggaaacacctggagcctgcgacaccatggctcgcctcactgtggcttggtggtggcgacagagactgcagtgtgctggagtggtaggagggcagccacgctaggagggcaggtggctgtggccagggctga i chlSab2.chr5 C 0 I 68 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=16141.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133826 23 + 158759 gagTCAGGCTTACAGCGATGGAC s panTro4.chr15 18736140 23 + 99548318 GGGTCAGGCTTACAGCAATGGAC i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997132 23 + 13868332 gggtcaggttTACAGCGATGGAC i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 685487 23 - 115148730 GGGTCAGGTTTACAGTGATGGAT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 81957 23 - 139415 GAGGCAGGCCTACAGTGGTGGCC i papAnu2.JH685018 I 62 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e chlSab2.chr5 43288683 68 - 75399963 I a score=166277.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133849 144 + 158759 GGGCTGCAGCAGTGGCCAGGTGGTAGGAGCCTTGTAGGGAGGGCTGGTGCATTGGCAATGGGCCTGGCTTTGCCCTGCGCCTGCCATGGATCTGGCCCTGTACTGCCCTG--CCTTGCCCTGTACCTGCCCTACTGTTACCTGGAT s panTro4.chr15 18736163 144 + 99548318 GGGCTGCAGCAGTGGCCAGGTGGTAGGAGCCTTGTAGGGAGGGCTGGTGCATTGGCAGTGGGCCTGGCTTTGCCCTGCCCGTGCCGTGGATCTGgccctgtactgccctg--ccttgccctgtacctgccctactgttacctggac i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997155 144 + 13868332 GGGCTGCAGCAGTGGCCAGGTGGTAGGAGCCTTGTAAGGAGGGCTGGTGCATTGGCAATGGGCCTGGCTTTTCCCTGCCCCTGCCGTGGATCTGgccctgtactgccctg--ccttgccctgtacctgccctactgttatctggac i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 685510 144 - 115148730 GGGCTGCAGCAGTGGCCACGTGGTAGGAACCTTGTAGGGAGGGCCGGTGCATTGGCAATGGGACTGGCTTTCccctgcccctgctgtggatctggccctgtactgccctg--ccttgccctgtacctgccctactgttacctggac i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 81980 139 - 139415 AGGCTGCAGCAGTCGCCAGGTGGTAGGAGCCTTATAGGGAGAACCGGTGAATTGGCAATGGACCTGGCTCTGCCTTGCCCCTGCCATGGACCTGGCCATGTACTGCCCTG-------CCCTGGACCTGCCCTACCGTTATGTTGAC i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43288751 146 - 75399963 GGCCTACAGCAGTGGCCAGGAGGTAGGAGCCTTGTAGGGAGGGTCAGTGAATtggcaatgggcctgactctgccttgcacctgccatggacctggccctgtactgccccgcccctgcccctggacctgccctaccgttacctggac i chlSab2.chr5 I 68 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=4011.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133993 2 + 158759 TG s panTro4.chr15 18736307 2 + 99548318 tg i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997299 2 + 13868332 tg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 685654 2 - 115148730 tg i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82119 2 - 139415 TG i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43288897 2 - 75399963 tg i chlSab2.chr5 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2569 2 + 2907 tg i nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 N 0 I 186 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=112248.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 133995 93 + 158759 TCTCGGCCCTGTCCTGCTCTGGTCCCATCCTGACCCTGTCTTGGCCCTGTGCTACCCTGTCCCTGCCCTGGTCTTGCCCTGACACTGGCCCTG s panTro4.chr15 18736309 93 + 99548318 tctcggccctgtcctgctctggtcccatcctgaccctgtcttggccctgtgctaccctgtcccttccctggtcttgccctggcactggccctg i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997301 93 + 13868332 tctcggccctgtcctgctctggtcccatcctgaccctgtcttggtcctgtgctaccctgtccctgccctgctcttgccctggcgctggccctg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 685656 93 - 115148730 tctcggccctgtcctgctctggtcccattctgaccctgtcttggccctgtgctaccctatccctgccctggtcttgccctggcactggccatg i nomLeu3.chr7b C 0 I 272 s papAnu2.JH685018 82121 93 - 139415 TCTCAGCCCTGCACTGCTCTGACCCCATCCTGGCCTGGTCTTGGCCCTGTGCTACTCTGTCCTtgccctggtcctgcccttgtactggccctt i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43288899 93 - 75399963 tctcaaccctgccctgctctggccccaccctggccctgtcttggccctgtgctaccctgtccctgccctgattctgcccttgtactggccctt i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2571 186 + 2907 I e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=5991.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134088 9 + 158759 CCCTGAACC s panTro4.chr15 18736402 9 + 99548318 ccctgAAcc i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997394 9 + 13868332 ccctgaacc i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82214 9 - 139415 ccctggctc i papAnu2.JH685018 C 0 I 18 s chlSab2.chr5 43288992 9 - 75399963 ccctggctc i chlSab2.chr5 C 0 I 51 e nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2571 186 + 2907 I e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=3331.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134097 23 + 158759 TGCACTGGCCTGACCTtggctct---------- s panTro4.chr15 18736411 23 + 99548318 tgtactggcctgaccttggctct---------- i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997403 16 + 13868332 tgcactggcctgacct----------------- i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82241 33 - 139415 tgccctggaCCTTCCCTGATCCTATGCTTGCCT i papAnu2.JH685018 I 18 C 0 e nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2571 186 + 2907 I e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e chlSab2.chr5 43289001 51 - 75399963 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=60750.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134120 110 + 158759 ggccctggctctggccctgCCCCTTGTCCTGACCCTGGTCCTGTCATGGCACTGGCCCTGCCAATGGTCATGGTCCTGCCCCTGTTCTGGCCCTGACCTGGCCTTGGAAA s panTro4.chr15 18736434 79 + 99548318 ggccctggctctggccctgccccttgtcctgaccctggtgctgtcatggcactggccctgccaatggtcatggtcctgc------------------------------- i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997419 74 + 13868332 -----tggctctggccctgcccCTTGTCCTGACCCTGGTTCTGTCATGGCACTGACCCTGCCAATGGTCATGgtcctgc------------------------------- i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82274 110 - 139415 GGCCTTGGCTCTGGCTCTGCCTCTTGTCCTGACCCTGGTCCTGCAATGGCACTGGCCCTGCCAATGCTCATGGTCATGGTCCTGTTCTGGCTCTGACCTGGACATGGACA i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289052 109 - 75399963 ggccttggctctggccctgcc-cttgtcctgaccctggtcgtgtcatggccctggccttgccaatggtcatggtcctggtcctgttctggctctgacctgtacttggaca i chlSab2.chr5 I 51 C 0 e nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2571 186 + 2907 I e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=3321.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134230 8 + 158759 TGTCCTGG s papAnu2.JH685018 82384 8 - 139415 TGTGCTGG i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289161 8 - 75399963 tgtcctgg i chlSab2.chr5 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2757 8 + 2907 tttcctgg i nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 I 186 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I e ponAbe2.chr2a_random 8997493 0 + 13868332 C e panTro4.chr15 18736513 0 + 99548318 C a score=3993.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134238 8 + 158759 ACCTGCTT s papAnu2.JH685018 82392 8 - 139415 CCCTGATT i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289169 8 - 75399963 cccggatt i chlSab2.chr5 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 2765 8 + 2907 cccagatt i nasLar1.chrUn_JMHX01048499v1 C 0 N 0 s saiBol1.JH378296 154471 8 - 2409723 GCCTGATT i saiBol1.JH378296 N 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I e ponAbe2.chr2a_random 8997493 0 + 13868332 C e panTro4.chr15 18736513 0 + 99548318 C a score=1146.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134246 2 + 158759 TG s papAnu2.JH685018 82400 2 - 139415 TG i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289177 2 - 75399963 tg i chlSab2.chr5 C 0 I 5 s saiBol1.JH378296 154479 2 - 2409723 TG i saiBol1.JH378296 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I e ponAbe2.chr2a_random 8997493 0 + 13868332 C e panTro4.chr15 18736513 0 + 99548318 C a score=2532.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134248 12 + 158759 GCCCATCCCTGT s panTro4.chr15 18736513 6 + 99548318 ------tcctgt i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997493 6 + 13868332 ------tcctgt i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s saiBol1.JH378296 154481 6 - 2409723 ------TCCTGT i saiBol1.JH378296 C 0 N 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e chlSab2.chr5 43289179 5 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 82402 0 - 139415 C e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=7105.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134260 32 + 158759 TCTGGCCCTGACCTGGCCTTGGAAATGTCCTG s panTro4.chr15 18736519 32 + 99548318 tctggccctgacctggccttggacatgtcctg i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997499 32 + 13868332 tctggccctgacctggccttggacatgtcctg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82402 5 - 139415 ---------------------------TCCCA i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e chlSab2.chr5 43289179 5 - 75399963 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=193798.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134292 269 + 158759 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gccctgctttggcccatccctgccctgacaccaccatgggcctgcctgtgctgccctctcctggcactgaccttgtgctgtcatggcccagtggtgccattgccctgccttaccctgcgctgGTTGTGCCTTGGCCCCGCTTGGTGCTGGCCGCT-----------CCCTGGGCCTGCCCTGACCCTGCCTTGGCTTTTGCCCTGCCCTCACTATGGcct----------------------------ggccctggccctagccctggtcctgccatatccctggtcctgcctttat------------------ i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82407 278 - 139415 GCCCTGCCTTGGCccatccctgccctggccccaccaTGGTCCTGTCTGTTCTGCCCTCTCCTGGCACTAACCTTGCCCTGTCATGGCCCAGTGA-GCCATTGCCCTGCCTTACCCTGCTCTGGTTTTGCCCTGGCCCCACCTGGCACTGGCCACT-----------CCCTGGACCTGACCTGACCCTACCTTGGCTTTTGCCCT-CCCTCACTATGGCCTGGCTCTGGCCTTGTCCTGTCCCAgcccgggccctggccctgaccctggtcctgccatatccctggccctgg------------------------ i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289184 294 - 75399963 gccctgccttggcccatccttgccctggccccaccatggtgctgcctgttctgccctctcctgacactgactttgccctgtcatggctcagtggtgccattg----------ccctgctctggttgtgccctgatcccacttggcactggccgct-----------ccctggatctgccctgaccctgccttggtttttgccctgctctcacgatggcctggctctggccctgtcctggcccagcccgggccctggccctgaccctggtcctgccatatccctggccctggccctggccctggccctgctcttat i chlSab2.chr5 I 5 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=458256.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134561 436 + 158759 CCAGGCCTTGCCCCTGCTGCTGCCCTGGCCCTGGCCTGGAACCTGGTCCTGTCAAGGATCTGCCCTGACTCTGCCATGGCCCTGGCCCTGCTCTGCCTTGTTCCTGGCCCTGACCCAGACCCAGACCCATTCCTGGCTCTGCACT------GGCCTTTCCCTGGCCCTGAGCTGGCAGTGGTCTGCCCCTGGTCTTGCCATCACCCTGCCCTGCTGTGCTCTGGATGTGTCATCACCCTGCCCTGC-----------CCCTACTCTGCCTTTGACCCTGCCCTGGCCTTACCTTGGCCCTCACCCTAGTCTTCGCTAGGCCCAGCACAGACCTGGCTCTG------ACCCTGGCCGAGCACAGACCTGGCTCTGACCCTGGCCCTGGTCTTTGTCCTGCCATAGCCTTGG-----------------CCCTGAAGTGGACTTGGAGGTGTCCTGGCCCCGGTGTAACATGGCTCTT s panTro4.chr15 18736809 426 + 99548318 CCAGGCCCTGCCCCTGCTGCTGCCCTGGCCCTGGCCTGGAACCTGGTCCTGTCAAGGAcctgccctgactctgccatggccctggccttgctctgccttgttcccggccctgacccagacccagaccctttcctggctctgcact------ggcctttccctggccctgagctggcagtggtctgcccctggtcttgccatcactctgccctgctgtgctctggatgtgtcatcaccctgccctgg-----------ccctactctgcctttgaccctgccctggccttaccttggcccttactctagtctttgctaggccctgc-----tctggagctg------gccct-----agcacagacctggacctgaccctagccgtggtctttgtcctgccatagtcctgg-----------------ccctGAAGTGAACTTGGAGGTGTCCTGGCCCCGGCGTAACATAGCTCTG i panTro4.chr15 C 0 C 0 s panPan1.JH649737 27801 426 + 66344 CCAGGCCCTGCCCCTGCTGCTGCCATAGCCCTGGCCTGGAACCTGGTCCTGTCAAGGACCTGCCCTGACTCAGCCATGGCACTGGCCCTGCTCTGCCTTGTTCCTGGCCCTGACCCAGACCCAGACCCTTTCCTGGCTCTGCACT------GGCCTTTCCCTGGCCCTGAGTTGGCAGTGGTCTGCCCCTGGTCTTGCCATCACCCTGCCCTGCTGTGCTCTGGATGTGTCATCACCCTGCCCTGG-----------CCCTACTCTGCCTTTGACCCTGTCCTGGCCTTACCTTGGCCCTCACCCTAGTCTTCATTAGGCCCTGC-----TCTGGAGCTG------GCCCT-----TGCACAGACCTGGCCCTGATCCTGGCTCTGGTCTTTGTCCTGCCATAGCCCTGG-----------------CCCTGAAGTGGACTTGGAGGTGTCCTGGCCCTGGCATGACATGGCTCTG i panPan1.JH649737 N 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8997789 426 + 13868332 ccaggccctgcccctgctgctgccctggccctggcctggaacctggtcctgtcaaggacctgccctgactctgccatggccctggccctgctctgccttgttcctggccctgacccAGGCCCAGACCCTTTCGTGgctctgcact------ggcctttccctggccctgagctggcagtggtctgcccctggtcttgccatcaccctgccctgctgtgctctggatgtgtcatcaccctgccctgg-----------ccctactctgcctttgaccctgccctggccttaccttggccctcaccctagtctttgctaggccctgc-----tctgGAGCTG------Accct-----agcacagacctagccctgaccctggccctggtctttgccctgccatagccctgg-----------------ccctGAAGTGGACGTGGAGGTGTCCTGGCCCGGGCGTAACATGgctctg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 82685 427 - 139415 -----------ccctgctgctgccctggccctggcatggaacctgggcctgccgaggacctgcACTGACTCTGCCGTGGCCCTACCCCTGCTCTGCCTTGGTCCTGGCCCTGA------CTCAGAGCATTTCCTGTCTCTGCCCTTGCCCCAGCCTTCACGCGG-CCTGAGCTGGCAGTGGTCTGCCCCTGGTCTTGGCACCACCCTGCCCTGCCGTGCTCTGGCTGTGTCATCACCCTGCCCTGGTTCTGCTTTCTCCCTACTCTGGCTTTCACTCTGCCCTAACCCTACTTTGGCCCTCACCCTA---TTGGTTAGGCCCTGC-----TCTGGACCTGGCCCTAGCCCT-----AGCCCAGACCTGACCCTGGCTCT-------CCCTTTGTCCTGCCAAAGCCCTGGCCCTGG-----------TCCTGAACTAGACTTGGAGGTGTcctggccctgaagtgaccctggcctg i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289478 447 - 75399963 ccaggccctgcccctgctgctgccctggccctggcctggaacctggctctgccagggacctaaccggactctgccatggccctggccctgctctgccttggtcctagccctga------cccagagcatttcctggctctgccctcaccctggcctttccctgg-cctgagctggcagtggtctgcccctggtcttggcaccaccctgccctgccatgcgctggctgtgtcatcaccctgccctggttctgccttctccctactctggctttgaccctgccctagccctaccttggccctcaccctagccttggctaggcactgc-----tctggacctg------cccct-----agcccagacctggccctggctct------ggcttttgtcctgccactgccctggccctggccctgccctcaccctgaactagacttggaggtgtcctggccctgaggtgacctggccctg i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I e nomLeu3.chr7b 685749 272 - 115148730 I a score=347414.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 134997 215 + 158759 CTTTGGCCTGTCTC-----AGCCCTGCCCCTACCATCGCCTTGCCCTGCTCTGCCCTGCCCCAGTACTGACCCGGCCACGCTATTTCCCTGCCCTACCCTGCCTTGGCTGTGCCCTGGCTCGGTTCTGGCCCTG------GCCCCGGCCCTGCCCTGGACATGCTCTGACACTGCCTCAGCCTTGGCACTAGCCTGGCTCTTTCTTGGCATCAGCCCTGCTCTCTC s panTro4.chr15 18737235 215 + 99548318 TATTGGCCTGTccc-----tgccctgccgctaccatcgccttgccctgctctgccctgtcccagtactgacctggccatgctatttccctgccctaccctgccttgGCTGTGCCCTGGCTCGGTTCTGgccctg------gccctggccctgccccagacatgctctgacactgcctcagccttggcactagcctggctctttcttggcatcagccctgctctctc i panTro4.chr15 C 0 C 0 s panPan1.JH649737 28227 215 + 66344 CATTGGCCTGTCCC-----TGCCCTGCCACTACCATTGCCTTTCCCTGCTCTGCCCTGTCCCAGTACTGACCCAGCCATGCTATTTCCCTGCCATACCCTGCCTTGGCTGTGCCCTGGCTCGGTTCTGGCCCTG------GCCCCGGCCCTGCCCTGGACATGCTCTGACACTGCCTCAGCCTTGGCACTAGCCTGGCTCTTTCTTGGCATCAGCCCTGCTCTCTC i panPan1.JH649737 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8998215 221 + 13868332 cattggcctgtccc-----ttccctgcccctaccattgccttgccctgctctgccctatcccagtactgacccggccatgctatttccctgccctaccctgccttggctgtgccctggcttggttctggccctggccccagccccggccctgccctggacatgctctgacactgcctgagccttggcactagccTGGCTCTTTCTTGGCATCAGCCCTTCTCTCTC i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686021 215 - 115148730 CCTTGGCCTGTCCC-----TCCCCTGCCCCTACCATCACCTTGCCCTTCTCTGCCCTGTCCCAGTACTGACCTGGCCGTGCCATTTCCCTGCCCTACCCTGCCTTGGCTGTGCCCTGGCTCGGTTCTGGCCCTG------GCCCCGGCCCTGCCCTGGACATGCTCTGACACTGCCTCAGCCTTGGCACTAGCCTTGCTCTTTCTTGGCATCAGTGCTGCTCTCTC i nomLeu3.chr7b I 272 C 0 s papAnu2.JH685018 83112 209 - 139415 cctaagcctgtccc-----tgccctgcccctgccatcgccttgccctgttctgcctTGTCCCAGCACGGACCTGGCCATGCCATTGTCCTGCCCTACCCTGCCTTGGCCATGCCGTGGCTTGGTTCTGGCCCTG------GCCCC------ACCCTGGACATACCCTGACACTGCTTCAGCCTTTGCACTATTGTGGCTCTGCCTTGGCATTGGCCCTGCTCTCTC i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43289925 214 - 75399963 cctaggcctgtccctgccttgccccgcccccgtcatcgccttgccctgttctgccctgtcctggcactgacctggacataccattgccctgccctaccctgccttggccatgccctgactcggttctggccctg------gcccc------gccctggacatgccctgacactgcctcagccttggcactagcctggctcggccttggcattggccctgccctctc i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=6125.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135212 3 + 158759 TGT s panTro4.chr15 18737450 3 + 99548318 tgt i panTro4.chr15 C 0 C 0 s panPan1.JH649737 28442 3 + 66344 TGT i panPan1.JH649737 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8998436 3 + 13868332 TGT i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686236 3 - 115148730 TGT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 83321 3 - 139415 TGT i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43290139 3 - 75399963 tgt i chlSab2.chr5 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01104421v1 981 3 - 1182 TAC i nasLar1.chrUn_JMHX01104421v1 N 0 I 29 e gorGor3.chr2A 20210379 11059 - 111351968 I a score=58986.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135215 43 + 158759 GGACTGGCTCTTGTCCTTTCCTGCCCTGGCCATACCATGCCCT s panTro4.chr15 18737453 43 + 99548318 ggaccggctcttgtcctgtcctgtactggccataccatgccct i panTro4.chr15 C 0 C 0 s panPan1.JH649737 28445 43 + 66344 GGACTGGCTCTTGTCCTGTCCTGCACTGGACATAccatgccct i panPan1.JH649737 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8998439 43 + 13868332 AGACCGGCTCTtgtcctgtcctgcactggccataccatgccct i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686239 43 - 115148730 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nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 83549 47 - 139415 GATCTTACCCTGGTTCTGCCCTGGCCCTGACCCTGTCCTGACACTGA i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43290372 42 - 75399963 gaccttaccctggttctgccctggccctgac-----cctgacactga i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20221439 36 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I a score=1365.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135497 1 + 158759 A s panTro4.chr15 18737736 1 + 99548318 a i panTro4.chr15 C 0 C 0 s gorGor3.chr2A 20221475 1 - 111351968 a i gorGor3.chr2A I 36 I 383 s ponAbe2.chr2a_random 8998737 1 + 13868332 a i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 83596 1 - 139415 A i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43290414 1 - 75399963 a i chlSab2.chr5 C 0 C 0 e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e nomLeu3.chr7b 686522 0 - 115148730 C a score=116431.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135498 104 + 158759 ATGCCTGGCCCTACCCTGGCCTTGCACTGCTCTGGCCCTTGCCCTGACTCTGGTCCTGTCACTGACCTAGCCCCAGCCCTGTTGCTGGTCTTACCATGGCCCAG s panTro4.chr15 18737737 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hg38.chrUn_KI270749v1 135715 3 + 158759 gcc s ponAbe2.chr2a_random 8998955 3 + 13868332 gcc i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686707 3 - 115148730 gcc i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s chlSab2.chr5 43290632 3 - 75399963 gcc i chlSab2.chr5 C 0 I 3383 e gorGor3.chr2A 20221476 383 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=35784.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135718 143 + 158759 gtggccctgg---------------------------------------ccctggccctgcccaggtcttggcactggcctggccctgccctgccctggccctATGCTTT--------------------CCTGGCCCTGCCTTGGCCCTAGCCTGGCTTTGACCCTGCCCTGGCCCTACCTTGGCCTTCACCCTAGCCTTA s ponAbe2.chr2a_random 8998958 202 + 13868332 atggccctggccctggccctggccctgccctggctctgccctggctgttccctggccctgcccaggtcttggcactggcctggccctgacctgccttggtcctatgctttcctggccctgccttgccggccctggccctgccttggccctagcctggctttgaccctgccctggccctaccttggcctTCACCCTAGCCTTA i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686710 185 - 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hg38.chrUn_KI270749v1 135882 68 + 158759 GGCTATAGCACAGACCTGGTTGTGG------CCCTGGCCCTGCCGTGGCCCTGTCCCAGA--CCCTAGCCCTGCCA s ponAbe2.chr2a_random 8999181 70 + 13868332 GGCCATAGCACAGACCTTGTTGTGG------ccctggccctgccatggccctgtcccagaccccctagccctgcca i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686916 74 - 115148730 ggccatagcacagacctggttgtggccctgaccctggccctgccatggccctgtcccaga--ctgtagccctgcca i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20221880 68 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=11573.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135950 22 + 158759 GGTACCTGTCCTGGCCCAGCTC s gorGor3.chr2A 20221948 22 - 111351968 ggtacctgtcctggcccagctc i gorGor3.chr2A I 68 I 25 s ponAbe2.chr2a_random 8999251 22 + 13868332 ggtacttgtcctggccctgctc i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 686990 22 - 115148730 ggtacctgtcctggccctgctc i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=6986.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135972 25 + 158759 TGGGCCTGGCTTTGTCCCTGGTTCT s ponAbe2.chr2a_random 8999273 25 + 13868332 tgggcctggctttgtccctggttct i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 687012 25 - 115148730 tgggcctggccttgtccctggttct i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20221970 25 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=1092.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 135997 2 + 158759 TA s gorGor3.chr2A 20221995 2 - 111351968 ta i gorGor3.chr2A I 25 I 40 s ponAbe2.chr2a_random 8999298 2 + 13868332 ta i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 687037 2 - 115148730 ta i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 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99548318 C a score=2892.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 136040 10 + 158759 ACTGGCCTTG s ponAbe2.chr2a_random 8999341 10 + 13868332 actggccttg i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 687080 10 - 115148730 actggccttg i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20222038 10 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=5427.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 136050 13 + 158759 GACATGTCCGTGG s gorGor3.chr2A 20222048 13 - 111351968 gacatgtctgtgg i gorGor3.chr2A I 10 I 89 s ponAbe2.chr2a_random 8999351 13 + 13868332 gagatgtccatgt i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 687090 13 - 115148730 gacatgtccgtgg i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=10112.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 136063 71 + 158759 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hg38.chrUn_KI270749v1 136152 2 + 158759 AG s gorGor3.chr2A 20222150 2 - 111351968 gg i gorGor3.chr2A I 89 I 24 s nomLeu3.chr7b 687158 2 - 115148730 ag i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e ponAbe2.chr2a_random 8999435 0 + 13868332 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=4284.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 136154 62 + 158759 CCATAGACCTGCCCTGGTTGGTCGTTCCCTACCTTAACCCTGTGCTA-CCCTGGGCCTGCTCC s nomLeu3.chr7b 687160 63 - 115148730 caatagacctgccctggttggtcatgccctgacttaaccctgtgctacccccagacctgctcc i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20222152 24 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I e papAnu2.JH685018 83814 0 - 139415 C e ponAbe2.chr2a_random 8999435 0 + 13868332 C e panTro4.chr15 18737841 0 + 99548318 C a score=39056.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 136216 187 + 158759 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atggccctgcctctgccctggaccagtgctggcactggcatggaccctggccctg------gcTGTTCGCTACTTAAGGCCATAccctggcccagccctggtcctgaccctgtcctggccctaatttggcc------------------------------tggct------------------------------ctaccctggcatgctattctggccctggccctgacccggtccctgtccctgtcctggccctagccccgttgctggtcctgccatg---------------------gcccttgtcctGACATTGCCCTTTcc------tggtcctggccctggccctgtc-----------------------------------------ccagccctgctctggccctggtctgaaccctggccctacaatggacctgccttggtcctgcccagaccctggctcgggccctacctctgccctggccatacccttgccctggcttggaccccggtcctggtccttgtcctggcccagccatggtcctggccctgccctgcctgtgccctgttctatcctgaggtggccctgccatggcctggtgttgctattgccctgccttagcctgccctgcttg-tgccctagatctgtcccg----------------------gcctttgcccc-gtcttgtttctagcct i panTro4.chr15 C 0 C 0 s ponAbe2.chr2a_random 8999579 557 + 13868332 atggccctgcctctgccctggaccggtgctggcactggcatggaccctggccctg------gcccttagctacttaaggccataccctggcccagccctggtcctgaccctgtcctggccctaATTTGGCC------------------------------TGGCT------------------------------CTACCCTGGCATGCTATTctggccctagccctgaccctgttcctgtccctgtcctggccctagccccattgctggtcctgccatg---------------------gcccttgtcctgacattgccccttcc------tggtcctggccctggccctgtc-----------------------------------------ccagccctgctctggccctggtctgaaccctggccctGCAATGGACCTgccttggtcctccccagaccctggctctggccctacctctgccctggccacacacttcccctggcctggaccccggtcctggtccttgtcctgccccagccgtggccctGgccctgccctgcctgtgccctgttctatcctgggctggccctgccatagcctggtcttgccattgccctgccctagcctgccctgcTTGTTTCCCTAGATCTGCCCCG----------------------GCCTTTGCCCCTGTCTTGGTTCTAGCCT i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 687466 543 - 115148730 -----------------ctggacaggtgctggcactggcatggaccctggccctg------gcccttcactacttaaggccataccctggcccagccctgatcctgaccctgtcctggccctaatttggcc------------------------------tggctctaccctggcatgctattgtggccctagccct------------------------------gaccctgtctctgtccctgtcctggccctagccccattgctgatcttgacatg---------------------gcccttgtcctgacattgccctttcctggtaatggtcctggccctggccctgtc-----------------------------------------tgagccctgctctggccctggtctgaaccctggccctgcaatggacctgccttggccctgcccagaccctggctctggccctacctctgccctggccatacacttgccctggcctgcaccctggtcctggtcctag-cctgccccagccatggccctggccctgccctgcctgtgccctgtTCTATCCTGGGCTGGCCCTGCCATGGCCTGGTCTTGCCATTGCCGTGCCCTAGCCTGCCCTGCTTG-TGCCCTAGATCTGCCCCG----------------------GCCTTTGCCCT-GTATTGGTTGTAGCCT i nomLeu3.chr7b C 0 C 0 s papAnu2.JH685018 83817 612 - 139415 ctgcccctccccctgccctggattgaccctggcactggcatggaccctggccctggcccttgccctTCACTGCTTAAGGCCATAACCTGGCCCAGTCCTGGGCCCCACCCCGTCCTGGCCATGATTTGTCCTGGCCCTAACCTGACATGCTATTCTGACCATAGTC------------------------------------------------------------------CTGACCCTGTCGCTGTCCTGGCCCTAGCCATGTTGCTGGTCCTGCCTTGGGCTTGGTCTTGCTGGGCTTTgccctggtcctgaaattgcccttccc------tggtcctggccctggccctggcccggccccggccccagccctggccccggccctggccctgcgccagccctaatctggccctgatctgaatcctggccctgCAATGGACCTGCTTTATCCCTGCCCAGACCCTGGCTCTGGTCCTACCTCTGCCTTGGCCATACCCTTGCCCTGGCCTGGAC------CCTGGTCCTTATCCTTCCCCAGCCACGGCCCTGGCCCCACCCTGCCTGTGCCCTGTTCTGTCTTGGGCTGGCCCTGCCATGGCCTGGTCTTGTTATTGCCCTGCCCTAGCCTGCCCTGCTTG-TGCCCTAGATCTGCCCTG----------------------GCCTTTGCTCCTGTCTTGGTTCTAGCCA i papAnu2.JH685018 C 0 C 0 e gorGor3.chr2A 20222229 3952 - 111351968 I e panPan1.JH649737 28684 1793 + 66344 I e chlSab2.chr5 43290635 3383 - 75399963 I a score=126313.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 137051 107 + 158759 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i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 691297 1547 - 115148730 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i nomLeu3.chr7b M 100 C 0 e gorGor3.chr2A 20230991 2509 - 111351968 I e panTro4.chr15 18742985 7214 + 99548318 I a score=1421.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 143473 6 + 158759 tgatac s gorGor3.chr2A 20233500 6 - 111351968 tgatat i gorGor3.chr2A I 2509 I 380 s ponAbe2.chr2a_random 9006371 6 + 13868332 tgatat i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 e nomLeu3.chr7b 692844 0 - 115148730 C e panTro4.chr15 18742985 7214 + 99548318 I a score=21562.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 143479 147 + 158759 tgaaatgaaattgaaagatgagatgaaat--gatgagatgaaatg-------ttgaaatgaaatgatgaa-----gagatatgacatgaaatgatgagctgaaatga---tgagatgaaat---gaaatgaaatgagattaaatgatgagatga------aaaatgatgagat s ponAbe2.chr2a_random 9006377 149 + 13868332 tgaaatgaaattgaaagatgagatgagat--gaaatcatgaaatg-------ttgaaatgaaatgatgaaatgaagagatgtgagatgaaatgatgagctgaaatga---tgagatgatag---gaaacgaaatgagattaaatga---gatga------aaaatgatgagat i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 692844 167 - 115148730 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s ponAbe2.chr2a_random 9008012 794 + 13868332 accctgcaactttattaatttcatttatcaccctgagaagcttttggtagcgtcttatttttttccgtgtataagatcacattatctttaaactgtgacaattcgactgtctcctttccaattcagatgtcctttatttctttctctcgcctaattgtcctggctaagactttcactatgtgaaatatgattggtgaaaataggcatccttttcttgttacagtaaaatctttttcttgttcacagtaaaatctttcaccttttccacattcagtgtgatcttagctatagatttgtcctttatgtccttctgtgttaaggcatatattttctatactaaattgttgagagattttttgtcatgtaagaatatttaattttgccaaacgcttttattgtgtttattaatttaatcatatggttttCAgtatatatctaaaggaaagaaaagcagtatatcaaagagttacctgcacccccatgtttattacagcactattcacaatagccaagatatggaatcaacaaaagtgtccatcaacagatgaatggataaagaaatgtgacatacatatataatggaatattacttagtcataataaagaacaaaatcgtgttatttgtggcaacaagaatgcaagtggagggcattatgttaggtgaaataagcctggcatagaaacataaacaccacataactacatgttctcacttatgtatggaagttaaaatttttaatctcatagaagtagata---gtagagttttggttaccatatgctggaaagagtaggag i ponAbe2.chr2a_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b 694808 790 - 115148730 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6602127 1 - 72422247 t i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26470045 1 - 34552619 T i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 27966647 1 + 137757926 T i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 26708655 1 + 132286798 t i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s micMur1.scaffold_30619 6456 1 + 11642 T i micMur1.scaffold_30619 I 1666 I 39 a score=50907.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 156435 39 + 158759 AAAATGGTTTGGTTGAAATGTTTAGAAAACAGCTAGAAA s panTro4.chrUn_GL393527 132175 39 + 341619 aaaatggtttggttgaaatgtttagaaaacagctagaaa i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6602128 39 - 72422247 aaaatggtttggttgaaatgtttagaaaacagctagaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26470046 39 - 34552619 AAAATGGTTTGGTTGAAATGTTTAGAAAACAGCTAGAAA i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 27966648 39 + 137757926 AAAATGTTTTGGTTGAAGTGTTTAGAAAACAGGTAGAAA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 26708656 39 + 132286798 aaaatgttttGGTTGAAGTGTTTAGAAAACAGCTAGAAA i papAnu2.chr11 C 0 C 0 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ATataaaggga i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s otoGar3.GL873576 6763735 11 + 12054995 gtagagatggg i otoGar3.GL873576 I 23 N 0 e micMur1.scaffold_30619 6500 453 + 11642 I a score=5627.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 156844 11 + 158759 TAGGAAAtatg s panTro4.chrUn_GL393527 132584 7 + 341619 taggaaa---- i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6602536 9 - 72422247 TAGGAAATA-- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26470452 7 - 34552619 taggaaa---- i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 27967054 7 + 137757926 taggaaa---- i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 26709063 7 + 132286798 taggaaa---- i papAnu2.chr11 C 0 C 0 e micMur1.scaffold_30619 6500 453 + 11642 I a score=-3199.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 156855 32 + 158759 tatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatg s panTro4.chrUn_GL393527 132591 4 + 341619 ----------------------------tata i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6602545 17 - 72422247 ---------------gtatgtatgtatgtatg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26470459 4 - 34552619 ----------------------------tatg i nomLeu3.chr23 C 0 C 0 s macFas5.chr11 27967061 4 + 137757926 ----------------------------tatg i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 26709070 4 + 132286798 ----------------------------tatg i papAnu2.chr11 C 0 C 0 s micMur1.scaffold_30619 6953 6 + 11642 --------------------------tacata i micMur1.scaffold_30619 I 453 N 0 a score=772417.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 156887 621 + 158759 tatgt-atgtatgtatgtGTAtaggatcatgcactatatatagcttgcttctttttccactatgataattttcccatgtcatgaattacggcttgcaagtgcttattcttaacaggctgcattatttttcattatttggatttattgttatttaattggagctctattattgaacatttagattgcttccaaaattttttgctcttgttaatatattgtaataaacttcTGTGAAACACATACTCTTCACCTGCTACTTACATATGACTTCTGTAAGCCGAGACCTctgtatccccaggacctagaaggttacctggacatagtagtttcttaatt-aaaaaaaattattgattgaatgaaAGAAGACTATTAAATGTTCAGTTCTTctttttttattctgattccctgtgtatccagaggcctcttatttgtctgcatgtatgagtttggctgtaatgaaagtattggccatatatgaccataaacaggcattcctatttctgtcacagttat-----------------------------atttgtcattctgtattaatacatctataccctgatttctattgaagcatggttatttttgtttgcttctaagcaatgtagctaccctattgatgccgataaaaataaa s panTro4.chrUn_GL393527 132595 622 + 341619 tatgt-atgtatgtgtgtgtataggatcacgcactatatatagcttgcttctttttccatgatgataattttcccatgtcatgaattacggcttacaagtgcttattcttaaagggctgcattatttttcattatttggatttattgttatttaattggagctctattattgaacattttgattgcttccaaaattttttgctcttgttaatatattgtaataaacttcTGTGAAACACATACTCTTCACCTGCTACTTATATATGACTTCTGTAAGCAGAGACCTctgtatccccaggacctagaaggttacctggacatagtagttgcttaattaaaaaaaaattattgattgaatgaaAGAAGACTATTAAATGTTCAGTTCTTctttttttattctgattccccgtgtatccaggggcctcttatttggctgcatgtatgagtttggctgtaatgaaagtattggccgtatatgaccataaacaggcattcctatttctgtcacatttat-----------------------------atttgtcattctgtattaatacatctatatcctgatttctattgaagcatagttatttttgttttcttctaagcaatgtagctaccatattgatgatgataaaaataaa i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6602562 620 - 72422247 tatgt-atgtgtgtgtatgtatAggatcatgcactatatatagcttgcttctttttccatcatgataattttcccatgtcatgaattacagcttgcaagtgc-tattcttaaagggctgcattatttttcattatttggatttattgttatttaattggagctctattattgaacatttagagtgcttccaaaattttttgctcttattaataTAGTGTCATAAACTTCTGTGAAACACATGCTCTTCACCTGCTACTTACATATGACTTCTGTAAGCAGAGACCTctgtatccccaggacctagaaggttacctggacatagtagttgtttaatt-aaaaaaaattattgattgaatgaGAGAAAActattaaatattcagttcttctttttttattctgattccctgtgtatccaggggcctcttatttggctgcatgtatgagtttggctttaatgaaagtattggccgtatatgaccataaacagtcattcctatttctgtcacagttat-----------------------------atttgtcattctgtattaatacatatatatcctgatttctattgaagcatggttaattttgtctgcttctaagcaatgtagctaccctactgatgctgataaaaataaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26470463 619 - 34552619 tatgt-atgtatgtgtgtgtataggatcatgcactatatatagcttgcttctttttccatcatgataattttcccatgtcatgaattatggcttgcaagtgc-tattcttaaagggctgcattatttttcattatttggatttattgttatttaattggagctctattattgaacattttgattgcttccaaaatttcttgctcttattaatatattgtaataaacttcTGTGAAACACATACTCTTCACCTGCTACTTACATATGACTTCTGTAAGCAGAGacttctgtatacccaggacccagaaggttacctggacatagtagttgcttaatt--aaaaaaattactgattgaatgaaAGAAGACTATTAAATGTTCAGTTCTTctttttttattctcattccctgtgtatccaggggcctcttatttggctgcatgtatgagtttggctgtaatgaaagtattggccgtatatgaccataaacaggcattcctatttctgtcacagttat-----------------------------atttgtcattctgtattaatacatttatatcctgatttctgttgaagcatgtttaattttgtttgcttctaagcaatgtagctaccctgttgatgctgataaaaataaa i nomLeu3.chr23 C 0 I 308 s macFas5.chr11 27967065 649 + 137757926 tgtgt-atgtatgtgtgtgtataggatcatgcactatatatagcttgctttttttcccatcatgataattttcccatgtcatgaattatggcttgcaagtgc-tattcttaaagggctgcattatttttcgttatttggatttatcattatttaattggagttctattattgaacatttagattgctcccaaaagtttttactcttattaatatattataataaacttcTGTGAAACACATACTCTT-GCCTGCTACTCAGATATGACTTCTGTAAGCAGAGACCTctgtatcctcagaacctagaaggttacctggacatagtagttgcttaattaaaaaaaaattattgattgaatgaaAGAAGACTATTAAATGTTCAGATCCTCTTTTTTTATTCTGATTCCCTGTGTATCCAGGGGCCTCTTATTTGGCTGCATATATGAGTTTGGCTGTAATGAAAGTATTGGCCACGTATGACCATAAACAGGCATTCCTATTTCTATCACATGTATGACCGTAAACAGGCAATCCTATTTCTATCATTTGTCATTCTGTATTAATGCATCTATATCCTGATTTCTATTGAAGCATGGTTAATTTTGTTTGCTTCTAAGCAATGCAGCTACCCTATTGATGCTGATAAAAATAAA i macFas5.chr11 C 0 C 0 s papAnu2.chr11 26709074 649 + 132286798 tgtgtaatgtatgtatgtgtgtaggaTCATGCACTATATATAGCTTGCtttttttCCCATCATGATAATTTTCCCATGTCATGAATTATGACTTGCAAGTGC-TATTCTCAAAGGGCTacattatttttcagtatttggatttatcattatttaattggAGTTCTATTATTGAACATTTAGATTGCTCCCAAAAGTTTTTActcttattaatatattataataaacttCTGTGAAACACATACTCTT-GCCTGCTACTCAGATATGACTTCTGTAAGCAGAGACCTCTGTATCCTCAGAACCTAGAAGGTTACCTGGACATAGTAGttgcttaatt-aaaaaaattaattgattgaATGAAAGAAGACTATTAAATGTTCAGATCCTCtttttttATTCTGATTCCCTGTGTATCCAGGGGCCTCTTATTTGGCTGCATATATGAGTTTGGCTGTAATGAAAGTATTGGCCACGTATGACCATAAACAGGCATTCCTATTTCTATCACAGGTATGACCGTAAACAGGCAATCCTATTTCTATCATTTGTCATTCTGTATTAATGCATCTATATCCTGATTTCTATTGAAGCACGGTTAATTTTGTTTGCTTCTAAGCAATGCAGCTACCCTATTGatgctgataaaaataaa i papAnu2.chr11 C 0 C 0 a score=1173879.000000 s hg38.chrUn_KI270749v1 157508 954 + 158759 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s panTro4.chrUn_GL393527 133217 938 + 341619 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 6603182 952 - 72422247 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i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr23 26471390 943 - 34552619 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