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gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37613991 134 - 70235451 tacaaagaacagaaatttgtttctcacagttctggagaatgagcagttcaatat---ggcattggtaaggtc------actctctggtgacggcctggtctttgcatccaagatggcatcgtgatgctgcatccatcctccag-- i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38172656 134 + 75711847 tacaaagaacagaaatttgtttctcacagttctggagaatgagcagttcaatat---ggcattggtaaggtc------actctctggtgacggcctggtctttgcatccaagatggcatagtgatgctgcatccatcctccag-- i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3330873 140 - 15759493 tacaaagaacagaaatttgtttctcacagttctggagaatgagcagttcaatat---ggcattggtaaggtctggtgaggcctctggtgagggcctggtctttgcatccaagatggcatcgtgatgctgcatccatcctccag-- i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11022410 134 + 28679189 tacaaagaacagaaatttgtttctcacagttctggagaatgagcagttcaatat---ggcattggtaaggtc------actctctggtgagggcctggtctttgcatccaagatggcatcgggatgctgcatccatcctccag-- i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37103993 134 + 72318688 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colAng1.NW_012116254v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36418535 84 - 117903854 ----TCTGTTGCAGGC--------------AGATTCTACATTTAAACCA-GGCTTCTGTATTTTACATAATCATTTCTCAGAGCTTTTGATTTTTAATGGAAA i calJac3.chr13 C 0 C 0 s saiBol1.JH378116 3146835 84 + 39782659 ----tctgttgtaggc--------------agattcaacatttaaacca-ggcTTCTGTACTTTACATAACCATTTCTCAGAGCTTTTGAGTTTTAATTGAAA i saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7873866 84 + 12915033 ----TCTGTTGTAGGC--------------AGATTCAACATTTAAATCA-GGCTTCTGTACTTTACATAACCATTTCTTAGAGCTTTTGATTTTTAATTGAAA i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 6966797 84 - 14511534 ----tcTGTTGTAGGC--------------AGATTCAACATTTAATCCA-GCCTTCTGTACTTTACATAACCATTTCTCAGAGCTTTTGATTTTTAATTGAAA i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 s micMur3.chr19 75326121 84 - 83067054 ----TCTGTTGTAGGT--------------AGATGTAAACTTTAAACCA-GGCTCTTGTACTTTATGTAATTATTTTTCAGAGCTTTTGAATTTTAGTAGAAA i micMur3.chr19 I 91 I 194 s otoGar3.GL873531 8811752 98 + 32490354 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panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36676920 18 - 77229886 TC---ATTCATttttacattt i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3222112 18 - 4590901 TC---ATTCATttttacattt i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36659631 21 + 152096393 tcattattcatttttacattt i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37636610 21 - 70235451 CCATTATTCATttttacattt i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38195274 21 + 75711847 CCATTATTCATttttacattt i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3354439 21 - 15759493 CCATTATTCATttttacattt i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11044694 21 + 28679189 CCATTATTCATttttacattt i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37126306 21 + 72318688 CCATTATTCATttttacattt i chlSab2.chr18 C 0 C 0 s manLeu1.NW_012101909v1 3460567 21 + 4886165 CCATTATTCATttttacattt i manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s colAng1.NW_012116254v1 4586261 21 - 4977704 CCATTATTCATttttacattt i colAng1.NW_012116254v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36423458 18 - 117903854 ---ttattcatttttacattt i calJac3.chr13 I 3 C 0 s saiBol1.JH378116 3152039 18 + 39782659 ---TTATTCATttttacattg i saiBol1.JH378116 I 300 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7881580 18 + 12915033 ---TTATTCATTTTTACATTT i cebCap1.NW_016107375v1 I 3 C 0 s micMur3.chr19 75327886 18 - 83067054 ---tcattcacttttacattt i micMur3.chr19 C 0 I 138 e dasNov3.JH582515 1617624 0 + 1694703 C e aotNan1.NW_018491627v1 6970597 823 - 14511534 I e canFam3.chr7 47216850 1789 + 80974532 I e otoGar3.GL873531 8812184 6733 + 32490354 I a score=1167030.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 24502 132 + 111737 agatattgaagtcatttggagctttttattgtgtatgttatagagtatggatatattttcttgttctatatagttacatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatatttgccctaaagatttgag s panTro5.chr18 37259032 132 - 78221452 agatattaaagtcatttggagctttttattgtgtatgttatagagtatggatatattttcttgttctatatagttacatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatatttgccctaaagatttgag i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36676938 132 - 77229886 agatattgaagtcatttggagctttttattgtgtatgttatagagtatggatatattttcttgttctatatagttacatggttgttccatcattacttattcaaaagtgcatatttgccctaaagatttgag i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3222130 132 - 4590901 agatattgaagtcatttggagctttttattatgtatgttatagagtatggatatattttcttgttctatatagttacatggttgttccatcactacttattaaaaagtgcatatttgccctaaagatttgag i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36659652 132 + 152096393 agatattgaagttatttggaactttttattttgtatgttatagagtatggatatattttcttgttctatatagttatatggttgttccatcattacttatgaaaaagtgcatttttgccctaaagatttgag i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37636631 132 - 70235451 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaaagatttgag i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38195295 132 + 75711847 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaaagatttgag i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3354460 132 - 15759493 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaAAGATTTGAG i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11044715 132 + 28679189 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaAAGATTTGAG i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37126327 132 + 72318688 agacattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaaagatttgag i chlSab2.chr18 C 0 C 0 s manLeu1.NW_012101909v1 3460588 132 + 4886165 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttacagggtatggatatattttcttattctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaaagatttgag i manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s colAng1.NW_012116254v1 4586282 132 - 4977704 agatattgaagtcatttggagctttttactgtgtatgttatagggtatggatatattttcttgttctatatagttatatggttgttccatcattacttattaaaaagtgcatctttgccctaaagatttgag i colAng1.NW_012116254v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36423476 132 - 117903854 agatacaaaagtcatttggagcattttactgtgtatgttacaggttatggatatattttattgttctatatagttatatggttgttccatcactacttactaaaaagtacatctttgtcctaatgatttgaa i calJac3.chr13 C 0 C 0 s saiBol1.JH378116 3152057 132 + 39782659 agatacagaagtcatttggagcattttattgtgtatgttacagggtatggatatattttattgttctatatagttatatggttgttccatcattacttactaaaaagtacatctttgtcctaatgatttgaa i saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7881598 132 + 12915033 AGATACAGAAGTCATTTGGAGCATTTTATTGTGTATGTTACAAAGTATGGATATATTTTATTGTTCTATATAGTTATATGGTTGTTTCATCATTACTTACTAAAAATTACATCTTTGTTCTAATGATTTGAA i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 e micMur3.chr19 75327904 138 - 83067054 I e dasNov3.JH582515 1617624 0 + 1694703 C e aotNan1.NW_018491627v1 6970597 823 - 14511534 I e canFam3.chr7 47216850 1789 + 80974532 I e otoGar3.GL873531 8812184 6733 + 32490354 I a score=3893467.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 24634 447 + 111737 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panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36677070 447 - 77229886 atagatgtaat----------------gtgctaattttcatatatattagaatttatttctggaccttctagtctactcTTAACTCTTTCTGGCTATTTAAATTATGTAAAGACTGTATGGTATATTTAATACCTGATAGGGCTAATATACCATTGTAGCTTTTTT------ATGTTTTTCTACATATTTGTTTATA----ATTATTTTATGTCAAATTTACTATTAATTTGTCTAGCTTCATAAAAATATTATTTGTATTCCTTTTGAGAAGTTTTAAACTTTAAAAAGCAACTGACATGCTTATGATGTCTATGAATCATTTatccaagtaaaaagaaatatatttccatttaactatatctgtttttgtatctttcagggtgtttacaat-tttttcttatatagctttcccaattagttaagttcattttatgcatttttgtcttcatggttgttactatacataagttt i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3222262 441 - 4590901 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gacaccacatacacacaagcacagaagataggccatatgagaacacata-agaaggcagcagtctacaagccaaacagagtgacatcaggagaaaccaaacctgctgacaccttgatcttggagttcttagcttccagaagggtgaaagtataaattactaatatttaagccacccaatctgtggtactttattatggcagtgctagcag------aTAGTTACATCAACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGGATATATCTATTGCTTACTTGAAACAC i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37648333 281 - 70235451 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgacatcaggagcaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagagtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagtcggtggtactttattacggcagcgctagcag------aTAGTTACGTCGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAACACTGAGCTAAGGCATATATCTATTGCCTACTTGAAACAT i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38207036 281 + 75711847 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgacatcaggagcaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagagtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagtcggtggtactttattacggcagcgctagcag------aTAGTTACGTCGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATATATCTATTGCTTACTTGAAACAT i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3366125 281 - 15759493 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgacatcaggagcaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagggtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagtcggtggtactttattacggcagtgctagcag------aTAGTTACGTTGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATATATCTATTGCTTACTTGAAACAT i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11056357 281 + 28679189 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgacatcaggagaaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagggtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagttggtgatactttattacggcagggctagcag------aTAGTTACGTTGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATGTATCTATTGCTTACTTGAAACAT i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37137740 281 + 72318688 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgatatcaggagcaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagggtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagtcggtggtactttattatggtagcactagcag------aTAGTTACGTCGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATATATCCATTGCTTACTTGAAACAT i chlSab2.chr18 C 0 C 0 s manLeu1.NW_012101909v1 3474175 281 + 4886165 gataccacatatacacaagcacagaagataggccatatgagaacatgta-agaaggcagcagtctacaaaccaaac--agtgacatcaggagcaaccaaacctgctgacaccttgctcttagagttcttagcttccagaagggtgaaagtat-aattactattatttaagtcacccagtcggtggtactttattacggcagcgctagcag------aTAGTTATGTTGACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATATATCTATTGCTTACTTGAAACAT i manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36437883 284 - 117903854 gacaccacatatacacaaacacagaagataggccatatgagaacacata-agaaggcagcagtctgcaagccaaatagagtgacatcaggagaaaccaaacctactgacaccttgatcttggagttcttagcttccagaagagtgagagtgtaaatgactatccattaagccactcagtctgttgtactttattgtggcactgctagaag------acAGTTATATCAACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGACTGAGCTAAGGCATATATCTATTGCTTACTTGAAACAC i calJac3.chr13 C 0 C 0 s saiBol1.JH378116 3167665 283 + 39782659 gataccacgtatacacaagcacagaagataggccatattggaacacgta-agaaggcagcagtctgcaagccacatagagtgacatcaggagaaaccaaacctactgacaccttgatcttggagttcttagcttccagaagtg-gagagtataaatgactattaattaagccactttctctgttgtactttattgcggcactgctagaag------acAGTTACATCAACTATTTTCTATGCAGCTTTCAAGATTGAGCTAAGGCATATCTCTATTGCTTACTTGAAACAC i saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7896454 284 + 12915033 gacaccacgtatacataagcacagaagataggccatatgagaacaggta-agaaggtagcagtctgcaagccaaatagagtgacatcaggagaaaccaaacctactgacaccttgatcttggagttcttaattcccagaagtgtgagagtataaatgactattaattaagccactcagtctgttgtactttattgtggcactgctagaag------acAGTTACATCAACTAGTTTCTATGTAGCTTTCCAGACTGAACTAAGGCATATATCTATTGCTTACTTGAAACAC i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 6984427 284 - 14511534 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manLeu1.NW_012101909v1 3474456 52 + 4886165 AATCCTCATCCTGAAT-------------------GGGAACTTTTATCCTCAGCCTATCC-CTGGCTTC-----ATC i manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36438167 52 - 117903854 AAACCTCATCCTGAAT-------------------GGGTATTTTTATCCCCAAACTACCC-CTGGCTTC-----ATG i calJac3.chr13 C 0 C 0 s saiBol1.JH378116 3167948 52 + 39782659 AAATCTCATCCTGAAT-------------------GGGTATTTTTATCCCCAAACTACCC-CTGGCTTC-----ATG i saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7896738 52 + 12915033 AAACCTCATCCTGAAT-------------------GGGTATTTTTATTCCCAAACTACCC-CTGGCTTC-----ATG i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 6984711 51 - 14511534 AAACCTCATCCTGAAT-------------------GGGTATTTTTAT-CCCAAACTACCC-CTGGCTTC-----ATG i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 s micMur3.chr19 75332912 57 - 83067054 AACTCTCACCCTGGAT-------------------GGTCATTTTTAACCCCATCCCATCC-ATGGCCACATTAGATC i micMur3.chr19 I 273 C 0 s otoGar3.GL873531 8822861 76 + 32490354 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gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36674900 94 + 152096393 CCAGTATATCTTTTATTTTA----AT-CTTTTATCAAATGATGTTATAATAATTTATACTTTCTGTATCTGATATAGGTAATACCTTCCATAGACCAAT i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37648666 94 - 70235451 CCAGTATGTCTTTTATTTAA----AT-TTTTTATCAAACGATGTTATAATAATTTATACTTTTTGTATCTGGTATAGGTAATACATTCTATAGACCAAT i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38207369 94 + 75711847 CCAGTATATCTTTTATTTAA----AT-TTTTTATCAAACGATGTTATAATAATTTATACTTTTTGTATCTGGTATAGGTAATACATTCTATAGACCAAT i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3366458 94 - 15759493 CCAGTATATCTTTTATTTAA----AT-TTTTTATCAAACGATGTTATAATAATTTATACTTTTTGTATCTGGTATAGGTAATACATTCTATAGACCAAT i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11056690 94 + 28679189 CCAGTATATCTTTTATTTAA----AT-TTTTTATCAAACGATGTTATAATAATTTATACTTTTTGTATCTGGTATAGGTAATACATTCTATAGACCAAT i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37138073 94 + 72318688 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micMur3.chr19 75332969 93 - 83067054 TAAGTATATCTTTTATTTTA----AT--ATTTATCAAACAATTTTGTAATAACTTATACTTCCTCTATTTGGTATAGGTTATGAATTCTTTAGACTGAT i micMur3.chr19 C 0 I 1 s otoGar3.GL873531 8822937 90 + 32490354 CCAGTATATCTTTTATTTAA----AT--ACTTATCAAACAATTTC---ATAACTTATGCTTCCTCTATTTGATATAGGTTATGAAGTCTTTAGACCAAT i otoGar3.GL873531 C 0 I 1 s canFam3.chr7 47225857 83 + 80974532 TCAGTATATCTTGTATTATA----AT--GCTCATCAAACATTATCATACTGA----------ATATCCCTGGTACAGATACTGAATTTTTTAGACCAAT i canFam3.chr7 C 0 I 1 s dasNov3.JH582515 1630389 90 + 1694703 ccaATATATCTTTTATCATA----AC--ATTTATCAAACAATATCAAAATAACATGACTTTCCCAT---TGGCATAAATGAAGAATTCTTTAGACTAAT i dasNov3.JH582515 I 3498 I 1 e colAng1.NW_012116254v1 4587303 450 - 4977704 I a score=12021.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 38585 3 + 111737 CTA s panTro5.chr18 37273136 3 - 78221452 CTA i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36691037 3 - 77229886 CTA i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3236240 3 - 4590901 CCA i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s 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a--acacacacatatgtatacatacatatacacatatgcata----tgtgtgtgtgtgtatagtttcttttttttttttttttttttt------------gagacacagtttcgctcttgttgcccaggttggagtgcagtggtgcaatcttggctcactgcaacctctgccttctgggttcaagcaattcttctgcctcagcctccagagtagctgggattacaggcacctgccaccacgcctggctac--tttttttaacttttagtagagac-tggtttttaccaggttggccaagctggccttgaattcctgacctcaggtgatccacccatcttggcctcccaaagtgctgagattacaagcatgagtcaccacgcccacccatgtgtgtgtagtttttaacatactatacatactatacacactatacacacacagatacacacatacaaatatatgtatacatacatacatatata------------------------------------------------------------------------------------------------ i colAng1.NW_012116254v1 C 0 I 7 s calJac3.chr13 36456861 402 - 117903854 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panPan2.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36679739 12 + 152096393 tgtatatgtata i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38211527 4 + 75711847 --tata------ i macFas5.chr18 C 0 I 111 s macNem1.NW_012010601v1 3370649 12 - 15759493 tgtatatgtgtg i macNem1.NW_012010601v1 I 4 I 4 s cerAty1.NW_012001406v1 11060851 12 + 28679189 tgtatatgtgtg i cerAty1.NW_012001406v1 I 4 I 4 s chlSab2.chr18 37142215 10 + 72318688 tgtatatgtg-- i chlSab2.chr18 I 2 I 6 s manLeu1.NW_012101909v1 3478664 10 + 4886165 tgtatatgtg-- i manLeu1.NW_012101909v1 I 2 I 6 s colAng1.NW_012116254v1 4591757 6 - 4977704 tgtata------ i colAng1.NW_012116254v1 I 7 C 0 s saiBol1.JH378116 3172471 12 + 39782659 tatgtgtgtgta i saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7901324 12 + 12915033 tatatatatgta i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 6989495 12 - 14511534 tgtgagtgtgtg i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 e micMur3.chr19 75336415 658 - 83067054 I e dasNov3.JH582515 1634459 5 + 1694703 I e canFam3.chr7 47230083 16 + 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gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36683189 375 + 152096393 aaagccagac-tgaaccaaacacaattaccttatatgaggaaagagggaactgggag-agaatatagtaacagagatgagacttctaacaatacatt--tacttgtatagttttgatattga-------aaccaagaatattcag-ttaaaaagacacaagccatat------------aaatagaaagcgaactaaaattgatacgctaaaccctatatcaaggaagtactataaccgccaagagaagttaattgggtcctgtgactttaaacattatattttgac--tgagtatccttgtcagaaattattttaatgacag----------aaaaaaaa-tcttaaactTTGAAC-----------------------------------AATGT-AGCAGAAGTGTATAGGAATTAAAACGGGTAGAGGAACAAGATAGCCAACA i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37656220 371 - 70235451 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TTTTATTTCTTGGGAAAT--TATTATTTTTACTCTTCT-----ATGTAG-AAAAATT i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 e micMur3.chr19 75344182 1333 - 83067054 I e dasNov3.JH582515 1663062 12 + 1694703 I e canFam3.chr7 47235612 1545 + 80974532 I e otoGar3.GL873531 8833720 0 + 32490354 C a score=1580089.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 62661 188 + 111737 acatctttgtgatgtttagtatttctatccaagaagatggcatactttttcacttgttctattatttgtatatgtgttcgtgtgtcttaatataattttaaaaactttttatttaaatcatgcacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccatggtaaattaagtat s panTro5.chr18 37297510 188 - 78221452 acatctttgtgatgtttagtatttctatccaagaagatggcatactttttcacttgttctattatttgtatatgtgttcgtgtgtcttaatgtaattttaataactttttatttaaatcatgcacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccatggtaaattaagtat i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36715250 188 - 77229886 acatctttgtgatgtttagtatttctatccaagaagatggcatactttttcacttgttctattatttgtatatgtgttcgtgtgtcttaatgtaattttaataactttttatttaaatcatgcacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccatggtaaattaagtat i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3260305 188 - 4590901 acatctttgtgatgtttagtatttctatccaagaagaaggcatactttttcacttgttctattatttgtatatgtgttcgtgtgtcttaatgtaattttaataactttttatttaaatcatgcacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccacggtaaattaagtat i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36699861 188 + 152096393 acatctttgtgatgtttagtctttctatccaagaagatggcatactttttcactcgttctattatttgtatatgtgttcgtgtgtcttaatataattttaacaactttttatttaaatcatgcacctttctc-attaaatttaaaactgtatattttattcttttttgttgccatggtaaattaagtac i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37672405 188 - 70235451 acatctttgtgatgtttagttttcctgtccaagaagatggcatactttttcatttgttctgttatttgtatatgtgtttgtgtgtcttaatataattttaataactttttatataaatcatgtacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccttcgtaaattaagtac i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38231559 188 + 75711847 acatctttgtgatgtttagttttcctgtccaagaagatggcatactttttcatttgttctgttatttgtatatgtgtttgtgtgtcttaatataattttaataactttttatataaatcatgtacctttctc-attaaatttataactatatgttttattcttttttgttgccttggtaaattaagtac i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3402591 188 - 15759493 acatctttgtgatgtttagttttcctgtccaagaagatggcatactttttcatttgttctgttatttgtatatgtgtttgtgtgccttaatataattttaataactttttatataaatcatgtacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccttcgtaaattaagtac i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11087038 188 + 28679189 acatctttgtgatgtttagttttcctgtccaagaagatggcatactttttcatttgttctgttatttgtatatgtgtttgtgtgtcttaatataattttaataactttttatataaatcatgtacctttctc-attaaatttataactatatattttattcttttttgttgccttggtaaattaagtac i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37161782 186 + 72318688 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saiBol1.JH378116 C 0 C 0 s cebCap1.NW_016107375v1 7917251 186 + 12915033 ACATTTTATTGCTATTTTGTCTTCCTGTCCAAGAAGATGGCATACCTTTTCATTTGTTCTATTATTTG--TATGTGTACATATGTCTTAATATAATTATAATAACTTTTTATATAAATCATGCACCTTTCTC-ATTAAATTTTTAACTATATATTTTATTATTTTTTGTTGCTACAATAAATTAAGAAT i cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 7007869 185 - 14511534 ACGTCTTTTTGCTATTTAGTCTTCCTGTCCAAGAAGATGGCATACCTTTTCATTTGTTCTATTATTTG--TATGTGTACATAT-TCTTAATATAATTTTAATAACTTTTTATATAAATCATGCACCTTTCTC-ATTAAATTTTTAACTATATATTTTATTCTTTTTTGTTGACACAGTAAATTAAGTAT i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 e micMur3.chr19 75344182 1333 - 83067054 I e dasNov3.JH582515 1663062 12 + 1694703 I e canFam3.chr7 47235612 1545 + 80974532 I e otoGar3.GL873531 8833720 0 + 32490354 C e calJac3.chr13 36477081 355 - 117903854 I a score=3927287.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 62849 443 + 111737 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s panPan2.chr18 36715438 442 - 77229886 ttga-ttttttctattatattttcaaactCATAGTCTGTAATACATCTTTATTCCAATATCTGTAAT---TTTCAGTCA--TTTTTCTTATCTAA-TAGTATTTTTTACCCCTTCCACAAAATG-TTTCATAATGCA----ATATTGGTTATCCTTGAATTGCTTC-TACTTTCATGACCATCTTTCTAGAATTTCTCCATTGAGAAAGATTTTGGCATTTGGAATATGATAAAGCTGTCTACTTAtggctgccaagatttgtctgaatgagac-----tagataaaagcagaagcaggtatttggaacctactgcaaatatccaatcaagaggtaatggtgactt----aaagacagtgatcttggcagtgac-gagaggtgctcagttttgtaggcagaaccaacaagacttcccagatgacattggtccaagc-actgaaagaatggaattactatt-aattaa i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3260493 443 - 4590901 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rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38231747 444 + 75711847 ttgatttttttctattatattttcaaactCACAGTCTATAATACATCTTTATTCTAATATCTGTAAT---TTTCAGTCA--TTTTTCTTATCTAA-TAGTATTTTTCACCCCTTCCACAAAATG-TTTCATAATGCA----ATATTGGGTATCCTTGAATTGCTTCTTACTTTCATGACCATCTTTCTAGCATTTCCTCATTGAAAAAGATTTTGGCATTTGGCATATGATACATCTGTCTactcatggctgccgagatttgtctgaataagag-----tagataaaagcagaagcaggtgtttggaacctactgcaaagattcaaacaagaggtaatggtgactt----aaagacagtggtcttgggagtgat-gagaggtgctcagttttgtaggcagaaccaacaagacttcccagatgatgttggtccaaac-actgaaagaatggagttactatt-aattaa i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3402779 439 - 15759493 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0 s macFas5.chr18 38238790 190 + 75711847 ATTATTGCAAAAGG------------------------------------------Aaaaaagatt--ttcaa------------------------taagaaaagagagactattgcaccaggaagactacttaggtcataagatctgcaagcatctcaaaggtaaggcagaaa-agagcttttctttag----------tagggagaaatgaacaagtctagaaagaactgagcatggagaagtggggccaaa--------ccagagttaattag i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3409810 190 - 15759493 ATTATTGCAAAAGG------------------------------------------Aaaaaagatt--ttcaa------------------------taagaaaagagagactattgcaccaggaagactacttaggtcataagatctgcaagcatctcaaaggtaaggcagaaa-agagcttttctttag----------tagggagaaatgaacaagtctagaaagaactgagcatggagaagtggggccaaa--------ccagagttaattag i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11094274 190 + 28679189 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manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s colAng1.NW_012116254v1 4624662 190 - 4977704 ATTATTGCAAAAGG------------------------------------------Aaaaaagatt--ttcaa------------------------taaggaaagagagactattgcaccaggaacactacttaggtcataagatctgcaagcatctcaaaggtaaggcagaaa-agagcttttctttag----------tagggagaaatgaacaagtctagaaagaactgagcatggagaagtggggccaaa--------ccagagttaattag i colAng1.NW_012116254v1 C 0 C 0 s calJac3.chr13 36482693 232 - 117903854 ATTATTGCAAAAGGAAAAAAAAGATTTTAAATAAAAAGATTATTGCAAAAGGAAAAAaaaaagatt--ttaaa------------------------taaggggagagggactactgaaccaggaagactacttaggtagtaagctcctcaagcatctcaaaggtaaggcagaaa-agaacttttctttag----------taggaataaatgaatctgtctagaaagaactgagcatgaagaagtgggaccaaa--------ccagagttaattag i calJac3.chr13 C 0 C 0 s saiBol1.JH378116 3199699 193 + 39782659 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aotNan1.NW_018491627v1 C 0 I 928 s otoGar3.GL873531 8840720 187 + 32490354 cttattgcaagagc---------------------------------------aaagaaaacgatt--tgcag------------------------taagggcaaggggactatagcacctgggagaacacttcaaatgtgagatccacaagc------------ggaaagaaa-ggaacctttctttgg----------tagagaaaaaggaaca-gcctagaaagaactacgcatggaaaagtaggctggaagtgtgac-ccacagtttatcag i otoGar3.GL873531 I 38 C 0 s canFam3.chr7 47242011 226 + 80974532 attacagtaagagg---------------------------------------agagaaagggact--tgcaaagtgggggagagtactggtggtgctgtggagggag-gactattgcaagctgaagaatatttcaaccatgagatctgcaagcatttcaaaggtcaggcagaaagagagc--------agagagaaagaacagagagaagtgagcaagtctgttaagaactgaatgtgggaacgtgtgataaaacagtgat-ctacagttgatgaa i canFam3.chr7 I 37 C 0 s dasNov3.JH582515 1675406 200 + 1694703 attgttgcgagagg---------------------------------------agcaaaagggactactgcaa------------------------taggaa---agtgactattccagaaaggagagagctctgactatgaaatctgcaaatgttactaaggactggcagaaa-aggaattttctttta----------tagggaggggtgaacaagactagaatgaaacaggggtagagaagtggaatgagaagatgataagacagttgatcat i dasNov3.JH582515 C 0 C 0 e micMur3.chr19 75346514 6172 - 83067054 I a score=909013.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 70211 98 + 111737 gaaagattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctggttgaaga--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctgggagaagaagagaagctta--------------------- s panTro5.chr18 37305027 98 - 78221452 gaaagattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctggttcaaga--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctgggagaagaagagaagctta--------------------- i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36722745 98 - 77229886 gaaagattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctggttcaaga--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctgggagaagaagagaagctta--------------------- i panPan2.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3267818 98 - 4590901 gaaagattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctggttcaaga--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctgggagaagaagagaagctta--------------------- i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36707352 98 + 152096393 gaaagattattccctgaagttagacaattttca---------------------gctatatgctggttcaagg--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctgggagaagaagagaagctta--------------------- i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37679818 95 - 70235451 gaaatattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctagttcaagg--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctggg---agaagagaaggtta--------------------- i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38238980 95 + 75711847 gaaatattattccctgaagttagactatgttca---------------------gctgtatgctagttcaagg--------ttaatgtgggt-aaaattcaggggcctggg---agaagagaaggtta--------------------- i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3410000 95 - 15759493 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dasNov3.JH582515 C 0 C 0 e otoGar3.GL873531 8849822 1234 + 32490354 I e calJac3.chr13 81408167 0 + 117903854 I a score=1531444.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 82435 196 + 111737 tattatgtctaattaccttgaactctcagaaattctaatGTACTTTAAATTATCAGTCTTTACAGG-ATATAATTATAAGTGCGAGCCAAAATATATA-AGCATATTTGTACTATTA------------ATTTT----TTTTGTTATCT----TATTGCACCTACACTA------TGAATACAAATAGGATT---TT-TAAATTGGATTATATTGCCCTAAAGTTTAC s panTro5.chr18 37317195 197 - 78221452 TATTATGTCTAATTACCTTGAACTCTCGGGAATTCTAATGTACTTTAAATTATCAGTCTTTACAGG-ATATAATTATAAGTGCGAGCCAAAATATATA-AGCATATTTGTACTATTA------------ATTTT---ATTTTGTTATCT----TATTGCACCTACACTA------TGAATACAAATAGGATT---TT-TAAATTGGATTATATTGCCCTAAAGTTTAC i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chr18 36734906 197 - 77229886 TATTATGTCTAATTACCTTGAACTCTCGGGAATTCTAATGTACTTTAAATTATCAGTCTTTACAGG-ATATAATTATAAGTGCGAGCCAAAATATATA-AGCATATTTGTACTATTA------------ATTTT---ATTTTGTTATCT----TATTGCACCTACACTA------TGAATACAAATAGGATT---TT-TAAATTGGATTATATTGCCCTAAAGTTTAC i panPan2.chr18 C 0 C 0 s 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i panTro5.chr18 C 0 C 0 s panPan2.chrUn_NW_014018519v1 4130 1343 - 14466 ttgaaatgcctaaccttgtttttactctaactcgctacttggaattttatcctgcttgtctctttaatcacctagccttgcttcccatgtaaataagactctctctagctggaaaagccggacaaactccagttgaccccttaatttacaagacactaagggctccttacccaacccccttccgcgaggagttgacctgtgtaagcagatcctcagtatttcaaaggagcccagttaactgataaggtactagcaccaacaatgtatgaagttcccaggatttttcttaaagagataacaacataaagccttgagttcgggtcccgcatactccctatatctaattataatgaaagatttagagccttgcacctggtaccgttgctctttttgtaaccatttgtcttttaaattgtttatctctctgtaaccattttgcttcttttgattcttgcatgtttttacttctgtagaattattgcatttgagtccccctccccttcctaaacctaggtataaaagttaatcaagccccttcctccgggccgagagatttttgagcgttagccgtctctttggccgcctgcttaataaaggactcttaattcatctcaaagtgtggcgttctcactaacttgcttgggtacaacaccatgtggagaaacctgaccgccaccacctggctcactgaaggaaactgggtttttt-----------tcatttctttctttttcagtctttcagcagctgtttatagttgctctgccccaaaggggcaaggacttctttttgtttaatcttttctgcacatggtccctgatccttacatgcggagcagctcagggcaaatcacacatatttcaggggacttaaaccttgtcttcgtatgctaacttcttcccttatcagactcaacaggctagggatgaaaaacacccagctggcatctagttctcattacagttcatggctattcttataaagctcatagtatgctctggaggggaacacctgcatgtggtgcccacctaaggccagagacgtctgacaccctaagattggaccccacaggaggacgctctgtggatcctgcagacctcaacctgcccaagggtgacgctctcggtagaggttctgaggtctaggagtcaaccctccttggaattttctctcagttgcaatgatgtctggccccaacattgcttggaatctggagtttactgttgaatgggaaagaggaatggcattgcatgtatccaggcttttgtgctgcggtttctaagca-ggggcctggttaacatgtgaca-cctcctttggtactgtttggccgcagggctctatggagtctgggg i panPan2.chrUn_NW_014018519v1 C 0 I 4579 s gorGor5.CYUI01015370v1 3290296 1356 - 4590901 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i panTro5.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3292929 2316 - 4590901 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cebCap1.NW_016107375v1 C 0 C 0 s aotNan1.NW_018491627v1 7043352 67 - 14511534 tttcattctgctgataaaggcatacctgaggctgagcaatttaca----aaagaaagaggttgaatggaat i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 s otoGar3.GL873531 8862250 49 + 32490354 ctccatgctg-------ggtcatgagtataact----agtttgta----aaaaa-------ttaatgaact i otoGar3.GL873531 C 0 I 42 e canFam3.chr7 47259336 126 + 80974532 I a score=1861772.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 107263 232 + 111737 t-agacttccacatggctggggaagcctggcaatcatggaagaaggcaaggagcaacaagtctcatcttacatggatgacagcaggctaatagagcttgtgcagggaaattcccctcataaaaccatcataccttgtgagacttattcactgtcataagaatagcacaggaaagacctgcccccatgatttaatttcctccagctgggtccctctcactacacgtgggaattc s panTro5.chr18 37342024 232 - 78221452 t-agacttccacatggctggggaagcctcacaatcatggaagaaagcaaggagcaacaagtctcatcttacatggatgacagcaggctaatagagcttgtgcagggaaattcccctcataaaaccatcataccttgtgagacttattcactgtcataagaatagcacaggaaaggcctgcccccatgatttaatttcctccagctgggtccctctcactacatgtgggaattc i panTro5.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3301738 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t-acagttccacgtggctggggaagcctcacagtcatggaagaaggtaaggagcaacaagtctcgtcttacatggatgacggcaggctaagagagcttatgcagggaaactccccttatacaaccaccatttcttgtgagacttattcaatatcataagactagcatgggaaagacccactcccatgatttaattatctcccactggctccctcccactacatgtgggaatta i aotNan1.NW_018491627v1 C 0 C 0 e canFam3.chr7 47259336 126 + 80974532 I e otoGar3.GL873531 8862299 42 + 32490354 I a score=756598.000000 s hg38.chr18_KI270864v1_alt 107495 92 + 111737 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacccaggtaattagcctagtatccaataggt s panTro5.chr18 37342256 92 - 78221452 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcgttagtacacagattatttcatcacccagataattagcctagtatccaataggt i panTro5.chr18 C 0 C 0 s gorGor5.CYUI01015370v1 3301970 92 - 4590901 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacccagataattagcctagtatccaataggt i gorGor5.CYUI01015370v1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 36747450 92 + 152096393 aagataagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacatggattattttatcacctaggtaattagcctagtacccaataggt i nomLeu3.chr4 C 0 C 0 s rheMac8.chr18 37712565 92 - 70235451 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcgcagtacccattaggt i rheMac8.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr18 38271766 92 + 75711847 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcgtagtacccattaggt i macFas5.chr18 C 0 C 0 s macNem1.NW_012010601v1 3444112 92 - 15759493 aagatgagatttgggtgcagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcgtagtacccattaggt i macNem1.NW_012010601v1 C 0 C 0 s cerAty1.NW_012001406v1 11125628 92 + 28679189 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcatagtacccattaggt i cerAty1.NW_012001406v1 C 0 C 0 s chlSab2.chr18 37199426 92 + 72318688 aagatgagatttgggtggagacacagtcaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcgtagtagccattaggt i chlSab2.chr18 C 0 C 0 s manLeu1.NW_012101909v1 3537904 92 + 4886165 aagatgagatttgggtggagacacagccaaaccatatcattagtacacagattatttcatcacctacataattagcgtagtacccattaggt i manLeu1.NW_012101909v1 C 0 C 0 s 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