##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=8831.000000 s galGal6.chrUn_NW_020109941v1 3107 317 + 4685 tttccgGTTAGGCTCAGAGTAAGGTTAGGGTaagcgttagggttagggttaggtttgtGGTTCATTTaggttgggattggggttagaGTTTGGATT-TGAGTAGGATAGTGGTA-------------GGGTTATTCTTAGGGTTACGATTACCGTAAGGGCTAtagttaaggttaggattagggttacggcatgggttagggttaggtttagggttagagttaggg-------tagggttagggttagggtacggttagggttagctttagagttagggttagggttagggttagggtgagggttacggttactgttacgattacggttacggttacg s nanPar1.KN908513v1 18742 321 + 120202 ttactgttcgggttGGCGTTACTATTTGGGTTAGAGTTACTGTTAGGGTTAAGATTAT----CATTGAGTTTAGGGTTACTGTTAGAATTAGTGTTATCATTACAGCTATGGTAACCATTAGGATTAGGGTTACCCTTAGGGTTAGGATTGCCATTAGGGTTAGCGTTAGTTTTAGGATTACCATTAGGGCTAGAgttactgttaaggttaggtttatctttaggattattattaggattagggttacattagggttagggttactattaaagttagagttaccagtagggttag------------ggttaccattaggattagggttac-attaga i nanPar1.KN908513v1 N 0 C 0 a score=29.000000 s galGal6.chrUn_NW_020109941v1 3424 1 + 4685 g s pelSin1.JH212759 28513 1 - 29831 A i pelSin1.JH212759 N 0 I 113 s nanPar1.KN908513v1 19063 1 + 120202 a i nanPar1.KN908513v1 C 0 C 0 a score=2059.000000 s galGal6.chrUn_NW_020109941v1 3425 113 + 4685 tttgggatagggttagggttcgggttagggtaaagat-ttgttagggttaggcatacgttcagttttgtgtaagagttttgtttagcgttatagtaaggtttagggttattgtt s nanPar1.KN908513v1 19064 96 + 120202 ttagggttaccattaggattagggttaccattaagttaccattaggtttagggttacttta------------------caattagggttacaattagggttagggttaccatt i nanPar1.KN908513v1 C 0 C 0 e pelSin1.JH212759 28514 113 - 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