##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=5311.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 185 80 + 181496 atcattgaatggaatcgaatggaatcaTCATCAGATGGAAATGAATGGTATCATCATAGAATGGAATCAAATGGATTCAT s panTro4.chrUn_GL393522 315172 79 + 458469 atcattgaatggaaccgaatggaatcatcatcgaatggaa-ccaacggtttcatcatcgaatggaatcacatggaatcat i panTro4.chrUn_GL393522 N 0 I 31 a score=0.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 265 25 + 181496 TGAATGGAATCAGATGGAATCATCC e panTro4.chrUn_GL393522 315251 31 + 458469 I a score=27169.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 290 386 + 181496 AATGGACTTGAATGGAATCATTGAATGTACTGGAATGGAATCATTATTGAATAGAATTGAATGGAATCATGGAATGGTCTCGAATGGTATCATTATGAAATGGAATCGAATGGAATCACCGAATAGAATCGAATGGAACAATCATCGAATGGACTCAAATGGAATTATCCTCAAATGGAATCAAATGGAATTATCGAATGCAATCGAATGGAATTATCGAATGCAATCGAATAGAATCATCGAATGGGCTCGATTGGAATTATCGAATGGAATTTAATGGAATAATTGAACGGAATTGAATCGAATCGTCATCGAATG-AATTGAATGCAATCATCGAATGGTCTCGAATGGAATCATCTTCAAATGGAAAGGAATGGAGTCATCGC s panTro4.chrUn_GL393522 315282 385 + 458469 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-agggcaggagaagtaacactatttttagtaatgttctattttcatatatggttataagcaaataaatgtg-ttcaTTAATCAAGCT i rheMac3.chr3 C 0 I 298 s macFas5.chr3 125006344 85 - 192294377 -GGGGCAGGAGAAGTAACACTATTTTTAGTAATGTTCTATTTTCATATATGGTTATAAGCAAATAAATGTG-TTCATTAATCAAGCT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122270673 86 - 180432695 GGGGGCAGGAGAAGTAACACTATTTTTAGTAATGTTCTATTTTCATATATGGTTATAAGCAAATAAATGTG-TTCATTAATCAAGCT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121526592 85 - 127223203 -ggggcaggagaagtaacactatttttagtaatgttctattttcatatatggttataagcaaataaatatg-ttcattaatcaagtt i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C a score=583987.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 10732 379 + 181496 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atccatatttaatcattgtacttttctgcatgtatgatatatgtcaataaaatattttcaattatatacagc-aaaatagacaaaa-ccacaagaagacatacacaaatattaaacctagagagaaatttgaatctaagtaagtctctgaatgactggtagaacaaaccgaaaaataatgaggatggagaggtttggaacagcatgattagcaaaattgacataTCTGTCTTTTAATATAGGCAGAAACATAGTTAGATTAAAAAAAAGGACTTGTCTCAGAGTATGATTTCTAAAAATAGTGGAATCGAGTTTGAATCTAGTAAGTACATATAAATAAATGTCTTAAAACTCCTCTTATGTTAGCTGATTAAGaa-atatta i ponAbe2.chr16_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892853 374 - 94967081 gtccatatttaatcattgtactttcctgcatgtatg--gtatgtca--aaaaagtcttaaattatatacagcaaaaatagacaaaa-ccacaagaagacatacacaaatgttaaacctagagagaaattcgaatataagtaagtctctgaatgactggtagaacaaacagaaaaataatcaggatgtagaggtgtggaacagcatgattagcaaaattgacataTCTGTCTTTTAATACAGGCAGAAATATAGTTAGAT--CAAAAAAGGACTTGTCTTAGAGTATGATTTCTGAAAATGGTGGAATCGAGTTTGAATCTAGTAACTACATGTAAATAAATGTCTTAAAACTCCTCTTATGTTAGCTAATTAAGAATATAC-- i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr3 125006429 366 - 192294377 GTGTG----TAATGATTGTAATTTTCTGGATATATGATATAAGTCaataaaatatcttaaattatatacagcaaaaatagacatta-ccacaagcagacatacacaaatgataaacctagagagaaatgtgaata----taactctctgaatgactggtagaacaaacagaaaaataatcgggatatagaggtttggaacagcatgattagcaaaactgacataTCTATCTTTTACTATAGGCTGAAATATAGTTAGAT--AAAAAAAGGACTTCTCTCAGAGTGTGATATCTGAAAATAGTGGAATCAAGCTTGAATCTAGTAACTACATATAAATAAATATCTTAAAACTCCTCTTATGTTAGCTAATT----A-ATATG- i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122270759 368 - 180432695 GTGCA----TAATCATTGTAATTTTCTGGATATATGATATATGtcaataaaatatcttaaattataTACAGCAAAAATAGACATAA-CCACAAGAAGACATACACAAATGATAAACCTAGAGAGAAATGTGAATA----TAACTCTCTGAATGACTGgtagaacaaac--aaaaataatcgGGATGTAGAGGTTTGGAACAGCATGATTAGCAAAACTGACATATGTATCTTTTACTATAGGCTGAAATATAGTTAGAT--aaaaaaaGGACTTCTCTCAGAGTGTGATATCTGAAAATAGTGGAATCAAGCTTGAATCTAGTaactacatataaataaatatcttaaaactCCTCTTATGTTAGCTAATTAAGAA-ATATG- i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121526677 374 - 127223203 gtgcatacttaatcattgtaattttctggatatatgatatatgtcaataaaatatcttaaattatatacagcaaaaatagacttaa-ccacaagaaggcacacacaaatgataaacctagagagaaatgtgaata----taactctctgaatgactggtagaacaaacagaaaaataatcaagatgtagaggtttggaacagcatgattagcaaaactgacataaCTCTCTTTTACTATAGGCTGAAATATAGTTAGAT--AAAAAAAGGACTTCTCTCAGAGTATGATATCTGAAAATGGTGGAATCAAGTTTGAATCTAGTAACTACATATAAATAAATATCTTAAAACTCCTCTTATGATAGCTAATTAAGAA-ATATG- i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C e rheMac3.chr3 124555405 298 - 198365852 I a score=302.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 11111 2 + 181496 TT s panTro4.chrUn_GL393527 105192 2 - 341619 TC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr16_random 6064047 2 + 12312115 tt i ponAbe2.chr16_random C 0 C 0 e papAnu2.chr3 122271127 0 - 180432695 C e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C e chlSab2.chr21 121527051 0 - 127223203 C e rheMac3.chr3 124555405 298 - 198365852 I e nomLeu3.chr14 21893227 0 - 94967081 C e macFas5.chr3 125006795 0 - 192294377 C a score=175954.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 11113 106 + 181496 GTAATAGATATTAGAAAATATTTTAATAAATTGAGTGAATTTCACAAGCTAAGG-AAATGATCTTACTTGCATTTGATAGTTCAATTAGATACATATATACCTATAG s panTro4.chrUn_GL393527 105194 106 - 341619 GTAATAGATATTAGAAAATATTTTAATAAATTGAGTGGATTTCACACACTAAGG-AAATGATCTTACTTGCATTTGATAGTTCAATTACATACATATATACCTATAG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr16_random 6064049 102 + 12312115 gtaatagatattagaaaatattttaataaat----tGGATTTCACACGCTAAGG-AAATGATCTTACTTGCATTTGATAGTCCAATTACATACATATATACGTATAG i ponAbe2.chr16_random C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124555703 107 - 198365852 GTAATAGCTATTAGAAAATATTTTAATAAACGGAGTGGATTTCTCATTCTAAGGGAAATAATCTTACTTGCATTTGATAGTTCAATTACATACATATATACCTATAG i rheMac3.chr3 I 298 C 0 s macFas5.chr3 125006795 107 - 192294377 GTAATAGCTATTAGAAAATATTTTAATAAACGGAGTGGATTTCTCATTCTAAGGGAAATAATCTTACTTGCATTTGATAGTTCAATTACATACATATATACCTATAG i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122271127 107 - 180432695 GTAATagctattagaaaatattttaataaacggAGTGGATTTCTCATTCTAAGGGAAATAATCTTACTTGCATTTGATAGTtcaattacatacatatatacctatag i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121527051 107 - 127223203 GTAATAGCTATTAGAAAATATTTTCATAAACTGAGTGGATTTCTCATTCTAAGGAAAATAATCTTACTTGCATTTGATAGTTCAATTACATACATGTATACCTATAG i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C e nomLeu3.chr14 21893227 0 - 94967081 C a score=65573.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 11219 32 + 181496 GTATTTTAAAATATTTCTAATAACCTTATATA s panTro4.chrUn_GL393527 105300 32 - 341619 GTAGTTTAAAATATTTCTAATAACCTTATATA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 I 1 s ponAbe2.chr16_random 6064151 32 + 12312115 ATAGTTTAAAATATTTCTAATAACCTTATATA i ponAbe2.chr16_random C 0 I 1 s rheMac3.chr3 124555810 29 - 198365852 GTAGTTCAAAATATTTCTAATAAC---ATATA i rheMac3.chr3 C 0 I 1 s macFas5.chr3 125006902 29 - 192294377 GTAGTTTAAAATATTTCTAATAAC---ATATA i macFas5.chr3 C 0 I 1 s papAnu2.chr3 122271234 32 - 180432695 gtagtttaaaatatttctaataaccttatata i papAnu2.chr3 C 0 I 1 s chlSab2.chr21 121527158 32 - 127223203 GTAGTTTAAAATATTTCTAATAACCTTATATA i chlSab2.chr21 C 0 I 1 s calJac3.chr8 20069573 32 + 128169293 GTAATTGAAAATATTTCTAAGAACCTTGTATA i calJac3.chr8 C 0 C 0 e nomLeu3.chr14 21893227 0 - 94967081 C a score=852969.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 11251 334 + 181496 -TTTTAAAAAGCATTGATATCTGTTTGCACTGTCTGGTCTATAGAGTACACATACCAAACATGATTGTAGCTCTTCTGCTATAAACTTCAAATGTCCAATTAATACAAAAATCTAGAATGAGAACAGTTCTTTGCA---------------T-TTTTTTTT-ACCAAATAGAATATAGGAAGGATAGCTGCAAATATACCTGACACACTTATCTGTGAGTATGGTG-GTAGCAtttttatt-----------------------------------------------------------------------------------ttattttattttatttttgagagagggtctcactttgtcacccaagatggagtgcagtcatgtgattagagctcactgaagccttcacatactgtgctcaagcgattctccc s panTro4.chrUn_GL393527 105333 333 - 341619 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chlSab2.chr21 121527191 324 - 127223203 -TTTTAAAAAGCATTGATATCAGTTTGCACTGTCTGGTCTATACAGTACACATAGCACACATAATTATAGCTCACCTGCTATAAACATCAAATGTC----TAATACAAAAATCTAGAATGAGAACAGTTCTTTGCA---------------G--TTATTTTTAAAAAATAGAATATAGGAAAGATAGCTGCAAATATACCTGACACACTTATCTGTGAGTATGGTG-GTAGCCAt----tt-----------------------------------------------------------------------------------tttttttttttttctt--gagacagggtctgactttgtcacccaatatggagtgcagtgatgtgatcagagctcaccgcagccttcacatactgtgctcaagcgattctttc i chlSab2.chr21 I 1 C 0 s calJac3.chr8 20069605 420 + 128169293 TTTTTAAAAAGCATTGATACCTGTTTACACTATCTGGTCTATGGAGTACGCATATCACCCAGGATTATAGCTCTTCTGCTATAAACTTCAAATGTCTAATTAATACAAAAATCTAGAATGAGAACGGTTATTTGCAAT-------------T-TTTGTTTTTGCAAAATAGGATGTAGGAAAGATAGCTGTAACTATACCTGACACACTTATCTGTGAGTCTGGTGTGTAGCTTTttctttctttctttccttccttccttccttccttccttacttacttacttacttacttacttccttccttccttctttccttccttccCtttttttttttttttt--gagacagagtctcactttttcacccaagctggaggtgggtgatgtgatcacagcttactacagcctccacctaccgtgctcaagcgatcctccc i calJac3.chr8 C 0 C 0 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acctcagtctcctgagtagcagggactgcaagtgcgtgacaccaca-ctagctgatttttgtagaggtggggtttcaccatattgccctggctgatctccaactcctggactcaagagatctgtccactttggcctcccaaagtgctga i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122271601 148 - 180432695 acctcagtcttctgagtagcagggactgcaAGTGCATGACACCACa-ctagctgatttttgtagaggtggggtttcaccatattgccctggctgatctccaactcctggactcaagagatctggccactttggcctcccaaagtgctgg i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121527515 148 - 127223203 acctcagtctcctgagtagcagggactgcaagtgcgtgacaccaca-ctagctgatttttgtagaggtggggtttcaccatattgccctggctgatctccaactcctggactcaagagatctggccactttggcctcccaaagtgctgg i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20070025 148 + 128169293 acctcaacctcc-gagtagtggaaactgcaggtgcatcataccacacctagctaatttttgtaaagatggggtttcaccatgttgccctggctcatctctaactcctagactcaagtgatcctgccaccttggcctcccaaagtgctgg i calJac3.chr8 C 0 C 0 e ponAbe2.chr16_random 6064538 0 + 12312115 C a score=3489895.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 11733 1277 + 181496 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr16_random 6064538 1278 + 12312115 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i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20052792 1735 + 128169293 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i calJac3.chr8 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4078633 2140 + 55844845 I e papAnu2.chr3 122256635 679 - 180432695 I e chlSab2.chr21 121512404 0 - 127223203 C e rheMac3.chr3 124540552 455 - 198365852 M e macFas5.chr3 124991798 0 - 192294377 C a score=373127.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 23986 392 + 181496 CTTTTCTCTGGCTTTTCAAACCTAGTAAGACTAAGACACTAAAGTAAC-TTTGCCCGTGGTTTGGTAATGCCTTCTAAAG---CACATCCTAAGCTCTCGTGCATAGGGGGGCCTCCTTTGAG-CT-CTGTGCTTTTG--AGATCCCATATACCTAAATTCCAGTACTCCAAATCAGTACTGCTCAGTTTTAGTTACTAA-GTTTAAAAATGTAATTTAATAGCAAGTTAGTTTAGTGCACTCTTGCTTCTTTCTTGACTGCTTGTATACATGTATATTCCTTTAAATGAATCTTGGAACTTATTTAAAAATT-TTAAATTATACTAATGAAACTGTAT-----ATTGTTGTGAATTCATAAG-TGAATGTGGAAAGAATTTGTCTTTATGATAGTAAATCCTTTTTA------ s panTro4.chrUn_GL393527 118195 392 - 341619 CTTCTCTCTGGCTTTTCAAACCTAGTAAGACTAAGACACTAAAGTAAC-TTTGCCCGTGGTTTGGCAATGCCTTCTAAAG---CACATCCTAAGCTCTCGTGCATACGGGGGTTTCCTTTGAG-CT-CTGTGCTTTTG--AGATCCCATATACCTAAATTCCAGTACTCCAAATCAGTACTGCTCAGTTTTAGTTACTAA-GTTTAAAAATGTAATTTAATAGCAAGTTAGTTTAGTGAACTCTTGCTTCTTTCTAGACTGCTTGTATACATGTATATTCCTTTAAATGAATCTTGGaatttatttaaaaatt-ttaaattataCTAATGAAACTGTAT-----GTTGTTGTAAATTCATAAG-TGAATTTGGAAAGAATTTGTCTTTATGATAGTAAATCCTTTTTA------ i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5681369 392 + 72422247 CTTTTCTCTGGCTTTTCAAACCTAGTAAGACTAAGACACTAAAGTAAC-TTTGCCCGTGGTTTGGTAATGCCTTCTAAAG---CACATCCTAAGCTCTCATGCATACAGGGGTCTCCTTTGAG-CT-CTATGCTTTTG--AGATCCCATATACCTAAATTCCAGTACTCCAAATCAGTACTGCTCAGTTTTAGTTACTAA-GTTTAAAAATGTATTTTAATAGCAAGTTAGTTTAGTGCACTCTTGCTTCTTTCTTTACCGCTGATATACATGCATATTCCTTTAAATGAATCTTGGaatttatttaaaaatt-ttaaattataCTAATGAAACTGTAT-----ATTGTTGTGAATTCATAGG-TGAATTTGGAAAGAATTTGTCTTTATGATACTAAATCCTTTTTA------ i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41387575 388 + 81552678 CTTTTCTCTGGCTTTTAAAACCTAGTAAGACTAAGACACTAAAGTAAC-TTTGCCCGTGGTTTGGTAATGCCTTCTAAAG---CACATCCTAAGCTCTCGTGCATACAGGGGTCTCCTTTGAG-CT-CTATGCTTTTG--AGATCCCATATACCTAAATTCCAGCACTCCAAATCAGTACTGCTCAGTTTTAGTTACTAA-GTTTAATAATGTCTTCTAATAGCAAGTCGGTTTAGTGCGCTCTTGCTTCTTTCTTTACTGCTGATATACATGTATATTCCTTTAAGTGAATCTTGGA----ATTGGAAAAAT-TTAAATTATACTAATGAAACTGTAT-----ATTGTTGTGAATTGATAGG-TGAATTTGGAAAGAATTTGTCTTAATAATATTAAATCCTTTTAT------ i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20054527 397 + 128169293 CTTTTCTCTGGCTTTTCAAACCTAGTAAGACTAAGACACTAAAGTAACTTTTGACAGTGGTTTGGCAATGACTTCTAAAG---CACATCCTAAGCTCTCATGCATAGAAGGGTCTATTTTAAGCCT-TTATTCTATTG--GGATCCCATATACCTAAATTCCAGTACTCCAAATCAGGACTGGAAAGCTTTAGTTACTAA-GTTTACAAATTTATTTTAACAGCAAGTTAGTTTGGTGTACTCTTGCTTCTTTATTTACTGCTGGAATACATGTTTATTCCTTTAAATGAATCTTGGGAGt--tttaaaaatt-ttaaattatactaatgaaattgtatctggcattgttgtgaattgatagg-tgaatttggaaagaatttgtccttatgataccaaatccttttta------ i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4080773 402 + 55844845 CTCTCCTCTGATTCCTCAAGCC-AGTAAGACCATAAGAAAGACCTAACTTTTGTCCCTTGTTTGGCAATGTTATCTAAAAAGTTATGTCCTAAACTCACATGTACACAGAGGTCCATTTTTAG-CTATTATTCGATTGCAGGATCCAATATACTTA---------TCCTTAAATCAATGCTTCATAGCTTCAGTTACTAATGCCTAATAATTTATTTTAATAGTTATTGAGTTTGATGTATCCTTTAATTTCTCTTTATTGCTAATATACATATTTATTTTTTGAAATGAATCTTGGGGTT-ATTTAAAATTTGCTGAGCTATACTGATGAAATTGTCTTCTGGCTTGCAATAAATTGATAAGATGAATTTGGGAAGAATTTGTCCTTATGATACTAGATCttttttttttttt i canFam3.chr18 I 2140 C 0 e papAnu2.chr3 122256635 679 - 180432695 I e chlSab2.chr21 121512404 0 - 127223203 C e rheMac3.chr3 124540552 455 - 198365852 M e macFas5.chr3 124991798 0 - 192294377 C a score=541074.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 24378 322 + 181496 TCCAAGAATCatatgtgtctttatatttattccagtctatatttatatcactgagtaaatatatagaaatgtagatacatacagctgtagtt----ctag----atacaaatatagatataacatgttaaatctatatctatcccatataacatatatacatgttatatttg--------tgtgtgtatatatatatgtttatat---tatTAAAGAGCTCCCTTAAAATTTTTCTTTTATTTCCTATATAATTTTAGGTCGAGCTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAACAAGCAAATATTTATACTAGTTTTAATACTGATGTTTA---GGCATTCTATCTTATTTT s panTro4.chrUn_GL393527 118587 322 - 341619 TCCAAGAATCATATGTGTCTTCATATTTATTCCAGTCtatatttatatcactgagtaaatatatagaaatgtggatacatacagctgtagtt----atag----atacaaatacagatataacatgttaaatctatatctatcccatataacatatatacatgttatatttt--------tgtgtgtatatatatatgtttatat---TATTAAAGAGCTCCCTTAAAATTTTTCTTTTATTTCCTATATAATTTTAGGTCGAGCTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAACAAGCAAATATTTATACTAGTTTGAATACTGATGTTTA---GACATTCTATCTTATTTT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5681761 318 + 72422247 TCCAAGAATCatatgtgcctttatatttattc--gtctatatttatatcactgagtaaatatatagaaatgtagatacatacagctgtagtt----atag----atagaaatgtagatataacatattaaatctatatctatcccatataacatatatacattttata--tg--------tgtgtgtatatatatatgtTTGTGT---TATTAAAGAGCTCCCTTAAAATTTTTCTTTTATTTCCTATATAATTTTAGGTTGAGTTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAACAAGCAAATATTTATACTAGTTTTAATACTGAGGTTTA---GACATTCTATCTTATTTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41387963 324 + 81552678 TCCAGGAATCATATGTGCCTTTATATTTATTCCAGTCTATACTTATATCACTGAGTAAATATATAGAAATGTAGATACATACAGCTGTAGTTATAGatag----atacaaatatagatataacatgttaaatctatatctaTCCCATATAACATATATACATGTTATA--TG--------TGCGTGTATATACATATGTTTGTGT---TATTAAAGAGATCCCTTAAAATTTTTCTTTTATTTCCTATATAATTTTAGGTTGAGCTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAAAAAGCAAATGTTTATACTAGTTTTAATACTGATGCTTA---GACATTCTGTCTTATTTT i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124991798 326 - 192294377 TCCAAGAATCatatgtgtctttatatttattccagtctatatttacataactgagtaaacatatagaaatgtagatacatatagatatag------atag----atacaaatatagatataacatgttaaatctgtgtctatcccatgtaacatatatacatgttatatatgtgtgta--tgtgtgtgtatatatatgtttgtat---tatTAAAGAGCTCCCTTAAAATTTTTCTTTTGTTTCCTATATATTTTTAGGTTGAGCTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAACATGCAAATATTTATACTAGTTTTAATACTGATGTTTA---GATGTTCTATTTTATTTT i macFas5.chr3 C 0 I 23 s chlSab2.chr21 121512404 324 - 127223203 TCCAAGAATCatatgtgtctttatatttattccagtctatatttacataactgagtaaacatatagaaatgtagatacatatagat----------atag----atacaaatatagatataacatgttaaatctgtatctatcccatgtaacatatatacatgttatatatgtgtatatgtgtgtgtgtatatatatGTTTGTGT---TATTAAAGAGCTCCCTTAAAATTTTTCTTTTGTTTCCTATATATTTTTAGGTTGAGCTTGAATTTTCCTTGT--------------ATAAACATGCAAATATTTATACTAGTTTTAATACTGATGTTTA---GATGTTCTATTTTATTTT i chlSab2.chr21 C 0 I 47 s calJac3.chr8 20054924 323 + 128169293 accaagaataatatgtgcctttacatttattccaatctatctttaTATAACTGAGTAAATATATAGAAATGTAGATACATATGGATATAGTT----ATAGAGATATACAAATATCGATATAACATGTTAAAACTA----TATCCCATATAAAatatatgcatgttacatgtgtgta----tgtgtgtatatatatatgtgtgtgtgtGTATTAAAGAGCTCCCTTAAAATTCTT------TTTCTTATGTGTTTTTAGGTTGAGCTTGAATTTTCGTTGT--------------ATAAAAATGCAAATGTTTATACCAGTTTTAATACTGATGTTTA---GACCTTCTATTTTATTTT i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4081175 282 + 55844845 ttttttaatCATCTGTGCCTTTCTATTGATTTAGGTCTATTCTGATATGCCTGAGTAG----ATAGAAATATTGATAA------------------ACAG----ATAAAGATGAAGCTATAATAAGTTAAA-----------------------------ATATTCTCTTTC--------TCTCTTTCTATCTTTAAGGGGAAAT---AACTA---------CCTCAATTTTTGTTCGCATTTCCTATAAATATTTAGGTTAAGTTTGAATTTTCCTATTTTAGAATTATAATGATATAAACCCAAATATTTATACCAGCTTTAATACCAATGATTGTATGACTGTATTTTTTATTT- i canFam3.chr18 C 0 C 0 e papAnu2.chr3 122256635 679 - 180432695 I e rheMac3.chr3 124540552 455 - 198365852 M a score=11592.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 24700 9 + 181496 AACATTGAA s panTro4.chrUn_GL393527 118909 9 - 341619 AGCATTGAA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5682079 9 + 72422247 AGCATTGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41388287 9 + 81552678 AGCATTGAA i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124992147 9 - 192294377 AATATTAAT i macFas5.chr3 I 23 I 15 s calJac3.chr8 20055247 9 + 128169293 AGCATTGAC i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4081457 9 + 55844845 ACCATTGaa i canFam3.chr18 C 0 C 0 e papAnu2.chr3 122256635 679 - 180432695 I e chlSab2.chr21 121512728 47 - 127223203 I e rheMac3.chr3 124540552 455 - 198365852 M a score=391758.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 24709 266 + 181496 TATTTTCACAATTATTATAAATATT---ATCTAATAT-TAATAATGTACCTGTTAAAAATATTTAAAATTTTACCT-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTAAAATTCCTTT--------------AA-TATGATAGTAAATTTCTATTT-------------------------------------------CATGCTT-TCTCTTTGCATATGCAAATTAATCTATCCACTTCT----CTATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATCAGGCCTCTCTTCTTCTAATGGACATACAC-----------------ATGTTTGCATATAGAATATCAGACTCTTTATAGCATT s panTro4.chrUn_GL393527 118918 266 - 341619 TATTTTCACaattattataaatatt---atctaatat-taataatGTACCTGttaaaaatatttaaaattttaCCT-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTAAAATTCCTTT--------------AA-TATGATAGTAAATTTCTATTT-------------------------------------------TATGCTT-TCTCTATGCATATGCAAATTAATCTATCCACTTCT----CTATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATCAGGCCTCTCTTCCTCTAATGGACATACAC-----------------ATGTTTGCATATAGAATATCAGACTCTTTATAGCATT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5682088 260 + 72422247 TATTTTCACaattattataaatatt---atctaatat-taataatGGAACTGttaaaaatatttaaaattttaCCT-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTTAAATTCCTTT--------------AAGTATGATAGTAAATTTCTATTT-------------------------------------------TATGCTT-TCTCCATGC-------AATTAATCTATCCACTTCT----CTATCCCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATTAGGCCTCTCTTCTTCTAATGGACATACAC-----------------ATGTTTGCATATAGAATATCAGACTCTTTATAGCATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41388296 262 + 81552678 TATTTTCACAATTATTATAAATAAT---ATCTAATAT-TAATAATGTAAC--TTAAAAATATTTAAAATTTGACCT-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTTAAATTCCTTT--------------AAGTATGATAGTAAATTTCTATTT-------------------------------------------TCTGCTT-TCTCTATGCATATGCAAATTAATCTATACACTTCT----CTATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATCAGGCCTCTCT---TCTAATAGACACACAC-----------------ACGTTTGTATATAGAATATCAGACACTTCATAGCATT i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124992171 261 - 192294377 TATTTTCACAATTATTATA---ATT---ATCTAATAT-TAATAATGTAACTG-TAAAAATATTTAAAATTTTACCA-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTTAAATTCTTTT--------------ACATATGATAGTAAATTTGTATTT-------------------------------------------TATGCTT-TCTCTATGCATATGCAAATTAATCTATCCACTTCT----CTATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATGAGACCTCTTTTCTTCTAATAGACATACAC-------------------GTTTGTTTATAGAATATTGGACTCTTTATAGCATT i macFas5.chr3 I 15 C 0 s chlSab2.chr21 121512775 261 - 127223203 TATTTTCACAATTATTATA---AAT---ATTTAATAT-TAATAATATAACTG-TAAAAATATTTAAAATTTTACCA-----------TTGAAT----TATTTTATTGTTGAATTTAAATTCTTTT--------------ACATATGATAGTAAATTTATATTT-------------------------------------------TATGCTT-TATCTATGCATATGCAAATTAATCTATCCACTTCT----CTATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAAAATGAGACCTCTTTTCTTCTAATAGACATACAC-------------------ATTTGCTTATAGAACATTGGACTCTTTATAGCATT i chlSab2.chr21 I 47 C 0 s calJac3.chr8 20055256 280 + 128169293 -TTTTTCATAATTATTATAAATGTTACGATCTAATAT-TAATGATGCAACta-ttaaaatatttaaaattttaCCATTATTTAATCGTTGAAT----TATTTAATTCTTGAATTTAAATTCCTTT--------------AAGT---ATAATAAATTTGAATTT-------------------------------------------TATACTG-ACTCTGTGCATATGAAAATTAATCTATTCACTTCTTGAACAATCTCTATGTAGT-----------AACATATGAATATGAGAGCTCTCTTCTTCTAATAGGCATATAT-----------------ATGTTTGCATATGGAATATCAAACTCGTTATGGCATT i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4081466 344 + 55844845 tatttttat--ttattttaa--ttt---CCTTTATATATGATAAT----------AAACTATGTGATGTTTTCTCT-----------GTGCATATGCAAGCTAATATCTATATATGCATTTCTCTATCTCTGGTTAGTAAAATATGAAAATAAGAATGTGTCTCTCcccatgatcgaatcccacgtcggcctcccggtgcatggagcctgcttctccctctgcctgtgtctctgcctctctctctctct----ctctctctgtgtgactatcataaataaaaaaaaaaaaaaTGTGTCTCTCTCCCTCTCTTAGACATATATTTCTTAGACATAAATGTGTATATATGTATAAAATATCAGACTCTTTATAGCTTT i canFam3.chr18 C 0 C 0 e papAnu2.chr3 122256635 679 - 180432695 I e rheMac3.chr3 124540552 455 - 198365852 M a score=189571.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 24975 70 + 181496 TAAAATCTTTAAAGACATGAATATTGCCTTTTAACAAATATATTTT-AGCATGTACTGAGAATCCCCTATT s panTro4.chrUn_GL393527 119184 70 - 341619 TAAAATCTTTAAAGACATAAATATTGCCTTTTAACAAATATATTTT-AGCATGTACTGAGAATCCCCTATT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5682348 70 + 72422247 TAAAATCTTTAAAGACATGAATATTACCTTTCAACAAATATATTTT-AGCATGTACTGAGAATCCCCTATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41388558 70 + 81552678 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TATTTTTAATTTGGGCTAATCAATATGATTATTAATATTATTGGATTACCAAATTTGGAAACA-------------------CACTTTCATCCCCAAGGTGGATAtttgttttttttttt-tttttGCCAATTTCTTCTCTTACTGTTTCAAACATTGTTGGATATTA-TTTTTATTTTATTTGGCAT-----TTTAGTATCAACATTTCTAATTGATGT---ACTCT--ACATATTTTTTCTTCAATATCTGGTGGGTTTTATAATTACTGCTATGTTGGATTTGTAGTAGCCATTGACAAAA----ATTATTCCTGTATGTTTTATAGCTGTAtgaaggaaactaatatattttacc----cctaaatatatt s panTro4.chrUn_GL393527 119254 333 - 341619 TATTTTTAATTTGGGCTAATAAATATGATTATTAATATTATTGGATTACCAAATTTGTAAACA-------------------CACTTTCATCACCAAGCTGGATATTTG---TTTTATTT-TTTTTGCCAATTTCTTCTCTTACTGTTTCAAACATTGTTGGATATTA-TTTTTATTTTATTTGGCAT-----TTTAATATCAACATTTCTAATTGATGT---ACTCT--ACATATTTTTTCTTCAATATCTGATAGGTTTTATAATTACTGCTATATTGGATTTGTAGCAGACATTGATAAAA----ATTATTCCTGTATGTTTTATAGCTGTAtgaaggaaactaatatattttacc----cataaatatatt i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5682418 286 + 72422247 TATTTTTTATTTGGGCTAATCAATACGATTATTAATATTATTGGATTACCAAATTTAGAATCA-------------------CACTTTCATCCCCAAGGTGGATATTTG---TTTTA-TT-TTTTTGTCAATTTCTTGTCTTACTGTTTCAAATATTGTTGGATATTA-TTTTTATTTTATTTGGCAT-----TTTAGTGTCAATATTTGTAAGTGATGA---ACTCT--ACTTATTTTTTCTTCAGTATCTGGTGGGTTTTATAATTACTGCTTATTGGAATTTGAGGTGAAAATTGACAAAA----ATTATTCCCG---GTTTTGT----------------------------------------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41388628 334 + 81552678 TATTTTTTATTTGGGCTAATCAATATAATTATTAATTTTATTGGATTACCAAATTTGGTATCA-------------------CACTTTCATCCCCAAGGTGGATATTTG---TTTCATTTATTTTTGCTAATTTCTTGTCTTACTCTTTCAAATATTGTTGGATATTA-TTTTTATTTTCTTTGGCAT-----TTTAGTATAAATATTTGTAAGTGATGT---ACTCT--AGATATTTTTTCTTCAATATCTGGTGGGTTTTATAATTACTGCTATATTGGATTTGTAGAAGACATTGACAAAA----ATTATTCCTGTATGTTTTATACCTGTAtgaaggaaaccaatatattttacc----ccaaaatatatt i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124541077 332 - 198365852 tattttttatttggtctaatcaatatgattattaatattattggattaccaaatttggaatca-------------------cactttcatccccaaggtggatatttg---cttta-tt-gttttg-cagtttcttgtcttactgtttcaaatattgtcagagattatttttttttttatttggcat-----tttagtatcaatatttgtaagtgagat---actct--acatattttttcttcaatatctggtggattttataattactgctatattggATCTGTAGTAGATATTGACAAAA----ATTATTTCTTTATGTTTTATAGCTGTAtgaaggaaatcaacatattttacc----ccaaaatatgtt i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124992502 331 - 192294377 TATTTTTTATTTGGTCTAATCAATATGATTATTAATATTATTGGATTACCAAATTTGGAATCA-------------------CACTTTCATCCCCAAGGTGGATATTTG---CTTTA-TT-GTTTTG-CAGTTTCTTGTCTTACTGTTTCAAATATTGTCGGAGATTA-TTTTTATTTTATTTGGCAT-----TTTAGTATCAATATTTGTAAGTGAGAT---ACTCT--ACATATTTTTTCTTCAATATCTGGTGGATTTTATAATTACTGCTATATTGGATCTGTAGTAGATATTGACAAAA----ATTATTTCTTTATGTTTTATAGCTGTAtgaaggaaatcaacatattttacc----ccaaaatatgtt i macFas5.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121513106 327 - 127223203 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taagcttctgtacccaccgtgtgactgggtcctgggtcttcattctatgggctccagggtacacacattacagaagcctgtatgccttttctactatttatctgcctcctgttat-tgattttcagggaatcttcagaaggcaaaagggacattctcccttagcccatacCCAGGC-AAAATCCCCCAACATTTAACTGATTCCTGGTAGCTTAACATCACTTTGAAAGATCTATATATTTATAACCTTTTCTTCCCTCTATGATTTCTGGTCAGCTTGGGTTTTGTTTTTTACTGCATTTACTTCATCCTCAAAAAGATCTATTTTATGTCTATTTATTCTCATTTATTGACATtgagaaaataaaatatcttttatgtgagaaatgcaagtccttttaaataatcaggcccagagagatattaaaatgagacagcagtcgtgcctgactcctctttgagctgtgtattcatctaggctgcttgaggttgccacagtagctataaattaatcaataatgccaagccagacaccataatccacacccaataatagcataacagtgtatagccagtcactaatcaatgttatttccataagccaatgagaatttgtgacaaacctctttgcatcatcccactccttgtccctttttagcctttaagaaattgcttgttgcaaaacgccaaatggagttcatatccaagaatacttgggtctgtttcttccaggcag-ctgtccttattttggctcaagtaaactctttgaattacgttttgtgcttcaGCCTCTTCCACTTAGATTAACAACATGGATTTGTGTTACCATGTACAGCAATTAAAATGTTTACACTTTTCCCCTCAAGGGCATTGATGTGTTTTCCTGAGCACTTCGAGTAGCTACATTGTGTTTACTTTCTAGAATATggtttctcaaccttggtgctatttaccttt i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 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aggaccagaggattctttgttgtgggaggctgccctagcaatgctagatgtttcgtttgacctctaaatttcacacctccaccagtcttgacatccccacaataac-cccagacattgccaaatgtctcct-ggggaaaactctcctccagttgacagccaAACTTCTTGAAATATTGGAATTGTCAATTGAGTTTTTATGTTATCCAAAACAAATATTTTTCTTTGTTTTTAAACATCTACTTCCATCTACTTATCTATTTATTTTT-CTTTTATTTGTAACTTAATTCCATCAAGGAGAGAGAATGCATTTTCAGTTTTGCTAAATTTTGGAAGAATGTATCGATTTTTTATGACCTGATATATGGATGATATGTAGATATTACATGTTTATGTTATCAAATTTCGGGGCAGTAAT-----AAA i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124543048 414 - 198365852 agaaccagaggattatttgttgtgggaggctgccctagcaatgctagatgtttcatttgacctccaaatttcacacgcccaccagtcttgacattcccacagtaac-tctagacattgccaaatgtctcct-ggggaaaaatttccaccagttgagCGCCCAAGTTCTTGAAATATTGGAATTGTCAATTGAGTTTTTATGTTATCAAAAACAAATATTTTTCTTTGTTTTAAAACTTCTACTTCCATCTACTTATCTACTTATTTTTACTTTTATTTGTAACTTAATTCCATCAAGGATAG----TGCATTTTCTATTATGCTAATTTTTTCAAGAATGTTTTGA-TTTTTATGACCTAATATATGGATGATATGTAGGTATTACATGTTTGTATTATCAAATTTCAGGGCAATAAT-----AAA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124994469 414 - 192294377 agaaccagaggattatttgttgtgggaggctgccctagcaatgctagatgtttcatttgacctccaaatttcacacgcccaccagtcttgacattcccacagtaac-tctagacattgccaaatgtctcct-ggggaaaaatttccaccagttgagagccCAAGTTCTTGAAATATTGGAATTGTCAATTGAGTTTTTATGTTATCAAAAACAAATATTTTTCTTTGTTTTAAAACTTCTACTTCCATCTACTTATCTACTTATTTTTACTTTTATTTGTAACTTAATTCCATCAAGGATAG----TGCATTTTCTATTATGCTAATTTTTTCAAGAATGTTTTGA-TTTTTATGACCTAATATATGGATGATATGTAGGTATTACATGTTTGTATTATCAAATTTCAGGGCAATAAT-----AAA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122258827 414 - 180432695 agaaccagaggaTTATTTGTTGTGGGAGGCTGCCCTAGCAATGCTAGATGTTTCATTTGACCTCCAAATTTCACACGCCCACCAGTCTTGACATTCCCACAGTaac-tctagacattgccaaatgtctcct-agGGAAAAATTTCCACCAGTTGAGAGCCCAAGTTCTTGAAATATTGGAATTGTCAATTGAGTTTTTATGAtatcaaaaacaaatatttttctttgttttaaaacttctacttccatctacttatctacttatttttacttttatttgtaacTTGATTCCATCAAGGATAG----TGCATTTTCTATTATGCTAAATTTTTCAAGAATGTTTCGA-TTTTTATGACCTAATATATGGATGATACGTAGATATTACATGTTTGTATTATCAAATTTCAgggcaataat-----aaa i papAnu2.chr3 I 559 C 0 s chlSab2.chr21 121514730 415 - 127223203 aggaccacaggattatttgttgtgggaggctgccctagcaatgctagatgtttcatttgacctccaaatttcacatgctcaccagtcttgacatccccacaataacttctagacattgccaaatgtctcct-ggggaaaaatttccaccagttgagagccCAAGTTCTTGAAATATTGGAATTGTCAATTAAGTTTTTATGTTATCAAAAACAAATATTTTTCTTTGTTTTAAAACTCCTACTTCCATCTACTTATCTACTTATTTTTACTTCTATTTGTAACTTGATTCCATCAAGGATAG----TGCATTTTCTATTATGCTAAATTTTTCAAGAATGTTTTGA-TTTTTATGACCTAATATATGGATGATACGTAGACATTACATATTTGTATTATCAAATTTCAGGGCAATAAT-----AAA i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20057533 423 + 128169293 aggaccagaggattcttcgtggtgggaagttgccctgacaatgttagaagtttcgtttgacccctaaatttcacacccccaccattctcgacatccccaccataac-tctagacattgccaaatgtcacctgggggaagaatctccaccagttgagagccaAAGTGCTTGAAATATTGGAATTATCAATTGAGTATTTATGTTATCCAAAACAAATATTTTTCTTTATTTT-AAACATCTACTTCAATCTACTTCTGTACTTATTTTTACTTTTATTTGTAACTTCATTGCATCAAGGATAGAAAGTGCATTTTCTGTCATGCTAAATTTTTCAAGAATGTATTGT-TTTTTATGAGCTAATATATGGGTAATATGTATATATTACATGTGTGTATTGTCAAATTTCAGGGCAATAATAAAACAAA i calJac3.chr8 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4082200 1320 + 55844845 I a 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rheMac3.chr3 C 0 M 324 s macFas5.chr3 124994883 131 - 192294377 ATAAATACTTCTACTATTTATATTGTCACTGTATATTAGTTATTTTCTTTTTTC--ACTACAGGAGTTTTTCAACCTAGAGGC--AATTTTTCAATTCTAGGTTATCCAGTAGATTTTGAAATGTTATGATTAAA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122259241 131 - 180432695 ataaatacttctacTATTTATATTGTCACTGTAtattagttattttcttttttc--actacaGGAGTTTTTCAACCTAGAGGC--AATTTTTCAATTCTAGGTTATCCAGTAGATTTTGAAATGTTATGATTAAA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121515145 131 - 127223203 ATAAATACTTCTACTATTTATATTGTCACTGTATATTAGTTATTTTCTTTTTTC--ACTACAGGAGTTTTTCAACCTAGAGGC--AATTTTTCAATTCTAGGTTATCCAGTAGATTTTGAAATGTTATGATTAAA i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20057956 119 + 128169293 ATAAATACTTCTAATATTTATATTGTCACTACATATTAGTTATTTTCTTTTTTT--GCTACAGGAAATTTTCGGCCTATAGGC--TATTTTTCAATACTAGG------------TTTTGAAATGTTATGATTAAA i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4083520 131 + 55844845 ATAAATA-TTCTAATATTTACACG---ATTATATATTTAACATTTTCTTTTTTCTTACTATAGCGATTTTCTAACCCACAGCCTTTTTTTTTCAATTATAGGTTAACATGTAGGTTATTAAATATTATGAGTAAT i canFam3.chr18 I 1320 C 0 a score=8852.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 27223 3 + 181496 TAT s panTro4.chrUn_GL393527 121441 3 - 341619 TAT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5684550 3 + 72422247 TAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41390803 3 + 81552678 TAT i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124995014 3 - 192294377 TAT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122259372 3 - 180432695 TAT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121515276 3 - 127223203 TAT i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20058075 3 + 128169293 TAT i calJac3.chr8 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4083651 3 + 55844845 CAT i canFam3.chr18 C 0 I 161 e rheMac3.chr3 124543593 324 - 198365852 M a score=707206.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 27226 312 + 181496 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5684904 15 + 72422247 TTTAAAGCATAATAA---------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr19 41391157 15 + 81552678 TGTAAAGCATAATAA---------------- i nomLeu3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr3 124995368 6 - 192294377 -----AGCATC-------------------- i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122259726 11 - 180432695 TTTAAAGCATC-------------------- i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121515633 11 - 127223203 TTTAAAGCATC-------------------- i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s calJac3.chr8 20058427 31 + 128169293 ttagaaacaaattaattataatctataatca i calJac3.chr8 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4083654 161 + 55844845 I e rheMac3.chr3 124543960 6 - 198365852 I a score=71700.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 27592 30 + 181496 ----------------------------------------------CATG----GAGAAATATTGCAAAACATACATTTT s panTro4.chrUn_GL393527 121810 30 - 341619 ----------------------------------------------CATG----GAGAAATATTGCAAAACATACATTTT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s 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panTro4.chrUn_GL393527 I 4 C 0 s ponAbe2.chrUn 5684957 62 + 72422247 -AATTGTTAA------TATCTAATCATTAAGTGAGAACA---------------AAGGTAAAGAGTAGCTACAC--ACAAACACAC i ponAbe2.chrUn I 4 C 0 s nomLeu3.chr19 41391505 64 + 81552678 -AATTGTTAA------TATTTAATCATTACGTGAGAACA---------------AAGGTAAAGAGTAGCTacacacacacacacac i nomLeu3.chr19 I 299 C 0 s macFas5.chr3 124995413 71 - 192294377 -AATGGTTAATATTCTTATTTAATCATTAAGTGAGAACATCAATTCTTT----GCAGATAAAGAGTAGCTACAC------AC---- i macFas5.chr3 I 4 C 0 s papAnu2.chr3 122259776 71 - 180432695 -aatggttaatattcttatttaatcATTAAGTGAGAACATCAATTCTTT----GCAGATAAAGAgtagctacac------ac---- i papAnu2.chr3 I 4 C 0 s chlSab2.chr21 121515683 71 - 127223203 -AATGGTTAATATTCTTATTTAATCATTAAGTGAGAACATCAATTCTTT----GCAGGTAAGGAGTAGCTACAC------AC---- i chlSab2.chr21 I 4 C 0 s calJac3.chr8 20058542 73 + 128169293 TATTGGTTAATAT---TATTTAATCATTCAGTAAGAACATCAAGTCTTTACACGTAGGTAATGAGTAGCTATAC------AC---- i calJac3.chr8 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4083654 161 + 55844845 I e rheMac3.chr3 124543996 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 5685019 930 + 72422247 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tgttgcaggtagggcttactgggaggtgttgggtcatgggaatggaccctcaggaacggataatacccct-----------------------------------ccctcaggaatgagtgtcccattctTTATTCAACTGTAATTCCCCCACCCAccctttttgagataccagttacatgtatgttacactgctgcatattgtctcatgtatcagtgagtttctggcttttttattttagtttcccctttgtccttcagtttgtaaagcttcta-tttttgtctataaatcttctgatgttagggtaaaatccattacttattgtatctcatggaatttttatttcaaatatttatttttcatctatacatgtcacacttttcattttataacttctatttttctcctATGTTCAATTTTCATTTAAGTAATTTGACatata----tatttatcta----------tatatctttataaaatatatatTACTTTAAGGACCTTGAAAATTCCTTCTTCTCTGTCATTTATAAATGACCTA-TTTTTATCCTGTTAATATATATCTTAATAATATatatcttcctgcttctttgcatgtcagaa---------atttt---ggggt-attttgatgttatgctattcaatatctggattttattggctacctttgaacagtg----ttgtggcaggcagttcagtaactttaggatgagtattttcctgttgctgttttaaatcttctctttaaacattgttgagttattctagagccatctgtaatttagagctaactgagcactattactagggcatgaacctcccgtggtctt i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122262355 768 - 180432695 TGTTGCAGGTAGGGCTTACTGGGAGGTGTTGGGTCATGGGAATGGACCCTCACGAACGGATAATACCCCT-----------------------------------CCCTCAGGAATGAGTATCCCATTCTTTATTCAACTGTAATTCCCCCACCCACCCTTTTTGAGATACCAGTTACATGTATGTTACACTGCTGCATATTGTCTCGTGTATCAGTGAGTTtctggcttttttattttagtttcccCTTTGTCCTTCAGTTTGTAAAGCTTcta-tttttgtctataaatcttctgATGTTAGGGTAAAATCCATTACTTATTTTATCTCatggaatttttatttcaaatatttattttccatctatACATGTcacacttttcattttataacttCTATTTTTCTCCTATGTTCAACTTTCATTTAAGTAATTtgacatata----tatttatcta----------tatatctttataaaatatatattactttaagGACCTTGAAAATTCCTTCTTCTCTGTCATTTATAAATGACGTA-TTTTTATCCTGTTAATATATATCTTAATAATATATatcttcctgcttctttgcatgtcAGAA---------ATTTT---GGGGT-ATTTTGATGTTGTGCTATTTAATATCTGGATTTTATTGGCTACCTTTGAACAGTG----TTGTGGCAGGCAGTTCAGTAACTTTAGGATGAGTATTTTCCTGTTGCTGTTTTAAATCTTCTCTTTAAACTTTGTTGAGTTATTCTAGAACCATCTGTAAATTAGAGCTAAATGAGCACTATCACTAGGGCATGAACCTCCAGTGGTCTT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121518261 768 - 127223203 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892411 2 - 94967081 ac i nomLeu3.chr14 T 6294 C 0 s calJac3.chr8 20041267 2 + 128169293 GT i calJac3.chr8 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4090940 3995 + 55844845 I e papAnu2.chr3 122245559 25067 - 180432695 I e chlSab2.chr21 121519790 6454 - 127223203 I e rheMac3.chr3 124548386 6574 - 198365852 I e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I e macFas5.chr3 124981578 24403 - 192294377 I a score=13551.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 47869 8 + 181496 cagctaat s panTro4.chrUn_GL393527 144239 8 - 341619 cagctgat i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892413 8 - 94967081 cagctaat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124554960 8 - 198365852 cagctaat i rheMac3.chr3 I 6574 C 0 s macFas5.chr3 125005981 8 - 192294377 cagctaat i macFas5.chr3 I 24403 C 0 s chlSab2.chr21 121526244 8 - 127223203 cagctaat i chlSab2.chr21 I 6454 C 0 s calJac3.chr8 20041269 8 + 128169293 TAACTAAT i calJac3.chr8 C 0 I 28069 e canFam3.chr18 4090940 3995 + 55844845 I e papAnu2.chr3 122245559 25067 - 180432695 I e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I a score=136331.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 47877 119 + 181496 tttttgtattttagtagagaaggggttttaccacgttggccaggatggtctcaa-tctcctgaactcatgatccgcgcacctcagcctcccaaagtggtgggattagaggcatgaaccac s panTro4.chrUn_GL393527 144247 120 - 341619 tttttgtattttagtagagaaggggttttaccacgttagccaggatggtctcaaatctcctgacctcatgatccgcgcccctcagcctcctaaagtggtgggattagaggcatgaaccac i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892421 119 - 94967081 tttttgtattttagtagagaaggggttttaccacattggccaggatggtctcaa-tctcctgacctcatgatccatgcacctcagcctcccaaagtgatgggattagaggcatgagccac i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124554968 116 - 198365852 ttattgtattttagtagagaaggggtttcatcacatcg---aggatggtctcga-tctcctgacctcatgattcacgtgcctcagcttcccaaggtgatgggattagaggcatgagcgac i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 125005989 116 - 192294377 ttattgtattttagtagagaaggggtttcatcacatcg---aggatggtctcga-tctcctgacctcatgattcacgtgcctcagcttcccaaggtgatgggattagaggcatgagcgac i macFas5.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121526252 116 - 127223203 ttattgtattttagtagagaaggggtttcatcacatcg---aggatggtctcga-tctcctgtcctcatgactcacgttcctcagcctcccaaggtgatgggattagaggcatgagccac i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4090940 3995 + 55844845 I e papAnu2.chr3 122245559 25067 - 180432695 I e calJac3.chr8 20041277 28069 + 128169293 I e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I a score=286769.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 47996 173 + 181496 AAAGTGCTCAAAAAATCTATTAATTAAAAAATGTGTATGTAGCCATCTTTAATCTACCATGTCCATTAGCAGATAAGTACTATAAGCAAAATAACAACAATG----AAAGAAAC----------ATTGACTTagagtagatactctgatttatttaataaaaatttgaaaatagaccaaatta-----tgac s panTro4.chrUn_GL393527 144367 178 - 341619 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chlSab2.chr21 121526368 173 - 127223203 aaagtgctcaaaaagtctattgattAAAAAATGTGTGTGTAGCCATCTTTAATCTACCATGTCCATTAGCAGATAAATACTATAAGTAAAAT---AACAACG----AAATAAAC----------ATAGCCTTagagtatata--ctgatttctttaataaaaatttgaaaatagaccaaattattctatgat i chlSab2.chr21 C 0 I 4 s calJac3.chr8 20069346 188 + 128169293 aaagtgcttgaaaagtctattaattAAAAAATATGTATGTAGCCATCTTTAATCTACCATGTCCATTAGCAGATAAATACCATAAGTAAAATAACAGCAATG----AAATAAACAGAAAAAAATATAGCCTTATATTATATGCTCTAATTTATTCAATAACAATTTGAAAACAGACCAAATTACTCTATGAT i calJac3.chr8 I 28069 C 0 e canFam3.chr18 4090940 3995 + 55844845 I e papAnu2.chr3 122245559 25067 - 180432695 I e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I a score=96720.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 48169 47 + 181496 -aaaaaaaaaatctgttactattgaggatgagggttagtgtttggaaa s panTro4.chrUn_GL393527 144545 47 - 341619 -aaaaaaaaaatctgttactattgaggatgaaggttagtgtttggaaa i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892722 45 - 94967081 ---aaaaaaaatctgttactattgaggatgggggtttgtgtttggaaa i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 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-agggcaggagaaatatcactatttttagtaatgttctaatttcacacatgttcataag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124555320 58 - 198365852 -agggcaggagaagtaacactatttttagtaatgttctattttcatatatggttataag i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 125006344 58 - 192294377 -GGGGCAGGAGAAGTAACACTATTTTTAGTAATGTTCTATTTTCATATATGGTTATAAG i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122270673 59 - 180432695 GGGGGCAGGAGAAGTAACACTATTTTTAGTAATGTTCTATTTTCATATATGGTTATAAG i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121526592 58 - 127223203 -ggggcaggagaagtaacactatttttagtaatgttctattttcatatatggttataag i chlSab2.chr21 C 0 C 0 e canFam3.chr18 4090940 3995 + 55844845 I e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I a score=41685.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 48274 28 + 181496 caaatacatgtgtttcattaatcaagct s panTro4.chrUn_GL393527 144650 28 - 341619 caaatacatgtgtttcattaatgaagct i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 21892825 28 - 94967081 caaataattgtgtttcattaatcaagct i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 124555378 27 - 198365852 caaataaatgtg-ttcaTTAATCAAGCT i rheMac3.chr3 C 0 I 298 s macFas5.chr3 125006402 27 - 192294377 CAAATAAATGTG-TTCATTAATCAAGCT i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 122270732 27 - 180432695 CAAATAAATGTG-TTCATTAATCAAGCT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr21 121526650 27 - 127223203 caaataaatatg-ttcattaatcaagtt i chlSab2.chr21 C 0 C 0 s canFam3.chr18 4094935 24 + 55844845 CAGGTTCATTTGGTTCACTGAACA---- i canFam3.chr18 I 3995 C 0 e calJac3.chr8 20069573 0 + 128169293 C e ponAbe2.chrUn 5691023 4380 + 72422247 I a score=419917.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 48302 329 + 181496 atctatatttaatcattgtacttttctgcatgtatgatatatgtcaat-aaaTgtcttaaagtata-tacagcaaaaatagacaaaaccacaagaagacatacacaaatgttaaacctagagagaaatttgaatataagtaagtctctgaatgactggtagaac------aaaccgaaaaat----aggatggagaggtt--------------------tggaacagcatgattagcaaaattgacataTCTGTCTTTTAAT----ATAGGCAGAAACATAGTTAGAT--AAAAAAAGGACTTGTCTCGGAGCATGATTTCTGAAAACAGTGGAATCGAGTTTGAATCTAGTAAGTACATATAAAT s 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 I 47 e nomLeu3.chr14 21905515 0 - 94967081 I a score=0.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 64741 45 + 181496 actgaatggaatcattatcaaattgatttgaatggaatcatcatt e nomLeu3.chr14 21905515 0 - 94967081 I e panTro4.chrUn_GL393527 164712 47 - 341619 I a score=74936.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 64786 1264 + 181496 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hg38.chr10_KI270824v1_alt 75791 48 + 181496 TGCCCCCCCGCCGTCGCGGCTTTTTG-ACCCCTGCCGCAGCGGCTTTTT s panTro4.chrUn_GL393527 171967 42 - 341619 TG-------AGCGCCGCGGCTTTTTGCACCCCAACCGCCGCGGCTTTTT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 e nomLeu3.chr14 21905515 0 - 94967081 I a score=338.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 75839 2 + 181496 GT s panTro4.chrUn_GL393527 172009 2 - 341619 GC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22129282 2 - 94967081 GC i nomLeu3.chr14 n 0 C 0 a score=8358.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 75841 7 + 181496 CCCAAGG s panTro4.chrUn_GL393527 172011 7 - 341619 CCCATGG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70318875 7 - 72422247 CCCATGG i ponAbe2.chrUn N 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22129284 7 - 94967081 CCCACAG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 4944 7 + 44534 CCCACGG i rheMac3.chrUn_JH290316 N 0 C 0 s macFas5.chr13 18032200 7 + 111193037 CCCAGGC i macFas5.chr13 N 0 C 0 s papAnu2.chr13 104664545 7 + 128036923 CCCACGC i papAnu2.chr13 N 0 C 0 a 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tgaatttatttatgtatttatttTCGCTATCACAAGTAGAAAAAGCCTGTAAGTTGCTATGCC-AAAATCCTGCCTCTAGATGGCAAACAAACCCCACAATACACAAAAGAGAGCCAAATTCTTAGAAACCCTGGGAAAGGAAGAGGGCTACTGTCCCATTAACAACTTGGAGCCCTTAAGGCAAGAATGAGGTGGAACATCTGGAACATCTGGGAGGAGACAGCAGGGTGCAGAGTAGTGGGGAACCTGCTCTGTGCTCTGAGACTGAAAGCCCAGCCTTGCCTCTCACCGCTGCCTTGACTGTGTCCCCATCTGCTGTGAAGTGAATGGTGTCTTCTAAATTCATGCTG-AGC-CCTAATTGCTGAAAAGTGTAAGACATGCAATGGGGGGATTATGTGCATCTTC s panTro4.chrUn_GL393527 172448 405 - 341619 TGAATTTATTTATGTATTTATTTTCACTATCACAAGTAGAAAAAGCCTATAAGTTGCTATGCC-AACAACCTGCCTCTAGATGGCAAACAAACCCCACAATACACAAAAGAGAGCCAAATTCTTAGAAACCCTGGGAAAGGAAGAGGGCTACTGTCCCATTAACAACTTGGAGCCCTTAAGGCAAGAATGAGGTGGAACATCTGGAACATCTGGGAGGAGACACCAGTGTGCGGAGTAGTGAGGAACCTGCTCTGTGCTCTGAGACTGAAAGCCCAGCCTTGCCTCTCACCGCTGCCTTGACTGTGTCCCCATCTGCTGTGAAGTGAATGGTGTCTTCTAAATTCATGCTG-AGC-CCTAATTGCTGAAAAGTGTAAGACATGCAATGGGGGGATTATGTGCATCTTC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70319318 405 - 72422247 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papAnu2.chr13 T 50287 C 0 s chlSab2.chr14 16776697 15 + 107702431 CCCACACCAACATGA i chlSab2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr14 18151560 15 + 108792865 CCAACACCAACATGA i calJac3.chr14 C 0 I 558 a score=527464.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 76697 194 + 181496 TGCTGAGGAAGGAGACTTCTTGTTTTCTCTTAGGATTCTTTTACTAACCAAGATTTTGCCTCTACTGCGTATTTCCCTTTGCTGATTGTCCCTCCCTTTTGACAGAAGATGGCCCAGGGCATTCACTACTAAGTCTCAACCTCTTACCCAAAGTCGTCAGTCTAGGGTTGCTC-TTTCCTTCATGCTATTTTTGT s panTro4.chrUn_GL393527 172868 194 - 341619 TGCTCAGGAAGGAGACTTCTTGTTTTCTCTTAGGATTCTTTTACTAACCAAGATTTTGCCTCTACTGCATATTTCCCTTTGCTGATTGTCCCTCCCTTTTGACAGAAGATGGCCCAGGGCATTCACTACTAAGTCTCAACCTCTTACCCAAAGCCCTCAGTCTAGTGTTGCTC-TTTCCTTCATGCTATTTTTGT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70319738 194 - 72422247 TGCTCAGGAAGGAGACTTCTTGTTTTCTCTTAGGATTCTTTTACTAACCAAGATTTTGCCTCTACTGCATATTTCCCTTTGCTGATTGTCCCTCCCTTTTGACAGAAGATGGCCCAGGGGATTCACTACTAAGTCTCAACCTCTTACCCAAAGCCCTCAGTCTAGTGTTGCTC-TTTCCTTCATGCTATTTTTGT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22136878 194 - 94967081 TGCTCAGGAAGGAGGTTTCATGTTTTCCCTTAGGATTCTTTTACTAACCAAGATTTTCCCTCTACTGCACATTTCCCTTCCCTGATTGTCCCTCCCTTTTGACAGAAGATGGCCCAGGGGATTCACTACTGAGTCTCAACCTCGTACCCTAAGCCCTCAGTCTAGGGTTGCTC-TTTCCTTCATGCTATTTTTGT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 5800 194 + 44534 TGCTCAGGAAGCAGAC-TCTTGTTTTCTCTTAGGATTCTTTTACTAATGAAGATTTTGCCTCTACTGCACTTTTCCGTTTCCTGATTGTCCCTCTCTATTGACAGAAGATGGCCCAGGGGATTCACTACTGAGTCTCCACCTCTTACCCAAAGCCCTGAGTCTAGGGTTGCTCTTTTCCTTCTTGTTATTTTTGT i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18033048 193 + 111193037 TGCTCAGGAAGGAGAC-TCTTGTTTTCTCTTGGGATTCTTTTACTAACGAAGATTTTGCCTCTATTGCACTTTTCCCTTTCCTGATTGTCCCTCTCTATTGACAG-AGATGGCCCAGGGGATTCTCTACTGAGTCTCCACCTCTTACCCAAAGCCCTGAGTCTAGGGTTGCTCTTTTCCTTCTTGTTATTTTTGT i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104615129 193 + 128036923 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70320305 274 - 72422247 CCAGACTCACAGCTCATGACCGTCCTCTGCAGACACAGCTTCTCCCCGGATGGCTGAGGGTTGTCATTGGCTGTGTCCTGCCTTGTGCATGACAACAGGAGACACAGAAGGTCTGTAAGCAGCCCTGCAAGCCAGGTTCTGAGCAAGCCCTCCTGTGTGGGGCCCTCTTACCTGGACATAGGTGtgcaaaccaaaaatgaaactctaagctccctaaccaactgaatgaactcctcctctcagccaaggacacaccaaaatcaacctgaaatac-- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22137437 274 - 94967081 CTACACTCACAGCTCATGACTGTCCTCTGCAGACACAGCTTCTCCCCAGATGGCTGAGGGTTGTCATTGGCTGTGTCCTTCCTTGTGCATGACAACAGGAGACATAGAAGGTCTGTAAGGAGCCCTGCAAGCCAGGTTCTGAGCAAGCCCTCCTGTG-GGGGCCTTCTTACCTGGACACAGGTGtgtaaatcaaaaatgaaattctaagctccctaaccaactgagtgaactcctcctttcagccaaggacacaccaaaatcaacctgaaatac-a i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 6363 275 + 44534 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ag-a i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22145518 4 - 94967081 agtg i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 7454 4 + 44534 agct i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18035060 4 + 111193037 agct i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104667692 4 + 128036923 AGTg i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 16779048 4 + 107702431 agtg i chlSab2.chr14 C 0 C 0 e calJac3.chr14 18155737 926 + 108792865 I a score=203145.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 78732 71 + 181496 gaagccaccagaagctggaagagctaaatcagactgctccctagagcttcagaaggagccagaactgatga s panTro4.chrUn_GL393527 174901 71 - 341619 gaagccaccagaagctggaagagctaaatcagactgctccctagagcttcagaaggagccagaactgatga i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70321766 71 - 72422247 gaagccaccagaagctggaagagctaaatcagactgctccctagagcttcggaaggagccagaactgatga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22145522 71 - 94967081 gaagccaccggaagctggaagagcaaaatcagactcctctctagagcttctgaaggagctagacctgatgt i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 7458 71 + 44534 ggagccaccagaagctgaaagagctaaatcagactccttcctagagcttctgaaggggctagaaccgatgt i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18035064 71 + 111193037 ggagccaccagaagctgaaagagctaaatcagactccttcctagagcttctgaaggagctagaaccgatgt i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104667696 71 + 128036923 gaagccaccagaagctggaagagttAAATCAGACTGCTCCCTAGAGCTTCTGAAGGAGATAGACCTGACGA i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 16779052 71 + 107702431 gaagccaccagaagctggaagagttaaatcagactgctccctagagcttctgaaggagctagacctgacga i chlSab2.chr14 C 0 I 971 s calJac3.chr14 18156663 71 + 108792865 GAAgccactggaagttggaagaactaaatcagactcctccctagagcttctgaaggagccagacttgatga i calJac3.chr14 I 926 C 0 a score=564596.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 78803 196 + 181496 ctccaagatcttagcccagtgaaactga-tctggacttct--------gaactatgagagattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgagaacttgttacagtagcccaaggacactaaCAAAAATGGGGCTCCGGGAAAATCCAGACTAAAGGTGTTGTGTTGG-TTTGCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATACT s panTro4.chrUn_GL393527 174972 196 - 341619 ctccaagatcttagcccagtgaaactga-tctggacttct--------gaactatgaaagattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgagaacttgttacagtagcccgaggacagtaacacaAATGGGGCTCCGGGAAAATCCAGACTAAAGGTGCTGTGTTGG-TTTGCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATACT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70321837 197 - 72422247 ctccaagatcttagcccagtgaaactgattctggacttct--------gaactatgagagattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgacaacttgttacagtagcccgaggacactaacacaAATGGGGCTCTGGGAAAATCCAGACTAAAGGTGCTGTGTTGG-TTTGCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATACT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22145593 205 - 94967081 ctccgagatcttagcccattgaaactgattctggacttctggtttccagaactatgagagattccattcttgttgtttgaacctgccacatttttgagaacttgttacagtagcccgaggacactaacacaAATGGGGCTCCGGGAAAATCCAGACTAAAGGTGCTGTGGTGG-TTTGCAATCTCCTTGATTAACTTTCTGATACT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 7529 206 + 44534 ctccaagatcttagcccagtgaaactgattctggacttctggtctccagaactatgagtgattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgagaacttgttacagtagcccaaggacactaacacaAATGGGGCTCTGGGAAAATCCAGACTACAGGTGCTGTGGTGGTTTTTCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATATT i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18035135 206 + 111193037 ctccaagatcttagcccagtgaaactgattctggacttctggtctccagaactatgagagattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgagaacttgttacagtagcccaaggacactaacacaAATGGGGCTCTGGGAAAATCCAGACTACAGGTGCTGTGGTGGTTTTTCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATATC i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104667767 205 + 128036923 CTCCAAGACCTTATACCAGCGAAACTGATTctggacttctggtctccagaactatgagtgATTCCATTCCTGTTGCTTGAAGCTACCACATTTTTGAGAACTTGTTACAGTAACCCGAGGACACTAACACAAATGGGGCTCCAGGAAAATCCAGACGAAAGGTGCTGTGTTGG-TTTGCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATATT i papAnu2.chr13 C 0 I 1573 s chlSab2.chr14 16780094 205 + 107702431 ctccaagaccttagcccagtgaaactgattctggacttctggtctccagaactatgagtgattccattcctgttgtttgaagctaccacatttttgag-acttgttacagtaactcgaggacactaacacaAATGGGGCTCCGGGAAAATCCAGACTACAAGTGCTGTGGTGGTTTTTCAATCTCCTTGCTTAACTTTCTGATATT i chlSab2.chr14 I 971 C 0 s calJac3.chr14 18156734 202 + 108792865 ctccaagatctcagcccagtgaaactgattctggacttctggtctccagagctatgagagatgctattcctgttcttttaagctatca-gtttttgagaacttgttacagta-ccccaggacactaacacaAATGGGGCTTAGGGAAAAT-CACACTAAAGGTGCTTTGTTGA-TTTGCAATCTCCTTCCTTAAATTTCTAATACT i calJac3.chr14 C 0 C 0 a score=337914.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 78999 118 + 181496 AGACATAAATAGATCAGTGAAAAATTTTGTGATTGAAGCAATGTACATGAAACCTACAGTGTACAGAGAAGCATCTGTTAGTTATAAGATAAATATTGATAATTTTAGTTGAAAATGA s panTro4.chrUn_GL393527 175168 118 - 341619 AGACATAAATAGATCGGTGAAAAATTTTGTGATTGAAGAAAGGTACATGAAACCTACAGTGTACAGAGAAGCATCTGTTAGTTATAAGATAAATATTGATAATTTTAGTTGAAAATGA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70322034 118 - 72422247 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TATGTGACTAGTAATATCTCACACAACATTCTGAGTTATTCAAGGATGCATAAAATGTGCATTAGATTCTCTTCTC----AAGTATGTGAGTGTGTTCATCTATAGATGTATGTGCACCTCATGGtgcatcagctggtacaaccctcaggacaccc i calJac3.chr14 C 0 C 0 e nomLeu3.chr14 22145916 0 - 94967081 C a score=1243797.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 79269 446 + 181496 cttcacatccccagtgctccatttcacacatgaggaaactgttcatgacagcacatggctgatttgcataaaagtcacttggtcagcagttgttgaagctgaacttggaatctaggtctgtctgaccttaactatgttccttccacagagccacgttCATTCCATAGAGGAACCCACCACCTATAAAACCAGAAAAGAGACAAAGCCAGAAGTG----------------------------------------------------------------------------------------------------CAGGTTGGATTTCTTAACACAAGCTCACTGCGACCTCTAGTCCTCATCACGCTGACACTAAGCTTAAACCCAGACCCTTCTACAGTTTTGTCTACAAAGCACAATTTGCCCAAAGCCTTTACAAACACCAACAGCCTTTCTTTCAGATATGGCAGCAGGGTCACATCTTACACGGCCCTGATCACATTTTCTCTCCTCTGCCATCCCCATCTCTCTGACTCAGTCCTCGCTt s panTro4.chrUn_GL393527 175438 446 - 341619 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CTtcacatcctcagtgccccatttcacacatgaggaaactgttcatgacagcacatggctgatttgcgtaaaagtcacttggtcagcagttgttgaagctgaacttggaatctaggtctgtctgaccttaactatgttccttccacagagccacgttcattcCATAGAGGAACCCATCACCTATAAAACCAGAAAAGAGACAAAGCCACAAGTG----------------------------------------------------------------------------------------------------CAGGGTGGATATCTTAACACAAGCTCACTGCGACCTCTAGTCCTCATCACGCTGACACTAAGCTTAAACCCAGATCCTTCTACAGTTTTGTCTACAAAGCACAATTTGCCCAAAGCCTTTACAAACACCAAGAACCTTTCTTTCAGATATGGCAGCAGGGTCACATCTTACATGGCCCTGACGACATTTTATCTCCTCTGCCATCCCCATCTCTCTGACTCAGTCCTC---- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22145916 526 - 94967081 CTTCGTATCCTCGGTGTCACATTTCACACAGGAAGAAGGTGTTCATGAGAGCAGATG--------------------CTTGGTCAGCAGTTGTTGAAGCTGAATTTGGAATCTAGGTCTGTCTGACCTTAACTATGTTCCTCCCACAGAGCCACATTCATTCCATAGAGGAACCCACCACCTATAAAACCAGAGAAGAGACAAAGCCAGAAGTGCAGTGCAGGGTGGAGttctttttttttttttttttagacggagtctcgctctgtcacccgagctggagtgcactggtgcgatctcggctcactgcaagctcAGGGTGGAATTCTTAATGCAGGCTCACTATGGCCCTTTGTCCTCATCATGCTGACACTAAGTTTAAACCCAGACCCTTCTACAGTTTTGTCTACAAAGCACAACTTGCTCAAAGCCTTTACAAACACCAAGAACATTTCTTTCAGATATGGCAGCATGGTCACATCTTGCATGGCCCTGACGACATTTTGTCTCCTAGGCCGTCCCCATCACTCTGACTCAGTCCTTGCTT i nomLeu3.chr14 C 0 I 3 s rheMac3.chrUn_JH290316 8000 446 + 44534 tttcataccctcagtgccccattacacacaggaggaaactgttcatgagagcacatggctgatttgcataaaagtcacttggtcagcagttgttgaagctgaacttggaatctaggtctgtctgaccacaactatgttccttccacagagccacattCATTCCGTAGTGGAACCCACCACCTATAAAACCAGAGAAGAGACAAAGCCAGAAATG----------------------------------------------------------------------------------------------------CATGGTGGAGTTCTTAACACAAGCTCACTGCGAATTCTAGTTCCCATCACGCTGACACTAAGCTTGAACCCAGACCCTTCTACAGTTTTGTCTACAAAGCACAACTTGCTCAAAGCCTTTACAAACACCAAGAACCTTTCCTTCAGATATGGCAGCAGAGTCACATCTTGCATGGCCCTGACCACATTTAGTCTCCTCTGCCACCCCCATCTCTCTGACTCAGTCCTTGCTt i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18035613 446 + 111193037 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panTro4.chrUn_GL393527 175884 354 - 341619 gcagccataaaaatggatgagttcatgtcctttgtaggggcatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgcaaggacaaaaaaaccaatcactgcatgttctcactcacaggtgggaattgaacaatgagaacatatagacacaggaaggggaacatcacacaccagggcctgtcgtggggtggggggaggggggagggatagcattaagaagtatacctaatgtaaatgacgagttaatgggtgcagcacaccaacatggcacatgtatacatatgtaataaagctgcacattgtgcacatataccctagaacttaaagaacaataataCTAATAATAAAAA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70322746 346 - 72422247 gcagccataaaaaaggatgagttcatgtcctttgtagggacatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgcaagga-gagaaaaccaaacaccccatgttctcactcttaggttggaattgaacaatgagaacacttggacacaggaaggggaacatcacacaccagggcctgtcatggggtggggggaggggagagggatagcattaggaggtatacctaatgtaaatgacgagttaatgggtgcagcacacctacatggcacatgtatacatatgtaacaaacctgcacgttgcgcacatgtaccctagaacttaaagaacaataataa-------aaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 8446 343 + 44534 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-AAGATGTCTTCCAAGAATGAGGATTTTTTCAGtgttttaggttgggtccccccagtgagaaggatgacaaagatttccatgcaggcagtgtatttacagagtgcaggaaataagcaagtgagcaagggaggggagg------agggacagtgaaacaTCCCTCAGCAAGGAGCCACCTCTGAGGATAACAAGAGCCCAAGCCCACACAGAGAC-ACATGAAAACTGCCTCTgttt i calJac3.chr14 C 0 C 0 a score=421641.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 81400 154 + 181496 ttccacctgagaggtgagggagctgggggatgtgtacacctcccttgtcatcactgattgacagccgtcctaggggatgctaattccAGGCCATGAGGTCTGCCTCATTTGCAGCCTGAGCTG-CTTCCCCAGGTTCAGATAGAGCAGTGAAGGG s panTro4.chrUn_GL393527 177572 154 - 341619 ttccacctgagaggtgagggagctgggggatgtgtacacctcccttgtaatcactgattgacagccgtcctaggggatgctaattccAGGCCATGAGGTCTGCCTCATTTGCAGCCTGAGCTG-CTTCCCCAGGTTCAGATAGAGCAGTGAAGGG i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70324426 154 - 72422247 ttccacctgagaggtgagggagctgggggatgtgtacacctcccttgtcatcactgattgacagccatcctaggggatgctaattccAGGCCATGAGGTCTGCCTCATTTGCAGCCTGAGCTG-CTTCCCCAGGTTCAGATGGAGCAGTGAAGGG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22148147 155 - 94967081 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i chlSab2.chr14 C 0 T 60243 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e macFas5.chr13 18041357 62685 + 111193037 I a score=67331.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 87762 61 + 181496 aaatgggaaactaca----cccaatccaggtaggactacaaatggtccagatcctctccgggtca s panTro4.chrUn_GL393527 183943 61 - 341619 aaatgggaaactaca----cccaatccaggtaggactacaaatggtccagatcctctccgggtct i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70330870 61 - 72422247 caatgggaaactata----cccaatccagataggactacaaatggtccagatcctctccgggtca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22154095 65 - 94967081 caatgggaaactacaacagcctgatccaggtaagactgcaaatggtccagatccttccagggtca i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104624036 61 + 128036923 caatgggaaattATA----CCCCGTCCAGGTAGGACTACAAATAGTCCAGATCCTTTCTGGGTCA i papAnu2.chr13 T 54897 I 54836 s chlSab2.chr14 16728940 61 + 107702431 caatgggaaactata----cccaatccaagtaggactacaaatagtcaagatcctgtccaggcca i chlSab2.chr14 T 60243 I 60182 e calJac3.chr14 18162483 1 + 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cgacctgctgaggtgcttgctgaaggcaaagggaatacagaatgaatagtggaagaaagtagttatcaataccagctatgaccacctgaccagctgcagaaatgaggactggaactatcatgagtatttcctccttcttttgttaaaaacatgtttgtgcatgtatgcacttgtactaagaaaatatcttcatttcatttcccttttctttatcaggtgacat-agatttactgacctcatatcagcatttaagtattgtttactttatgtaatagtatttgggttggggattgg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22154160 291 - 94967081 tgacctgctgaggtgcttcctgaaggcaaagggaatacagaataaatagtggaagaaggtagtcatcaataccacctacgaccatgtaaccggctgcagaaatgaggactggaactgtcatgattattt----cttcctttcttaaaaacatgcttgtgcatgtatacacttgtactaagaaaatatcttgatttcatttcctttttctttatcagatgacataagagttattgacttcatatcagcatttaagcattgttcactttatgtagtagtatttgggttggggattgg i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 104678933 290 + 128036923 cgacctgctgaggtgcttgctgaaggcaaaagcAATACAGAATGAATAGTGGAAGAAGGTAGTGATCAATATCAGCTATGaccacgtgaccagctgcagaaaggaGGACTGGAACTATCATGagtatttccttcttcttttgttGAAAACgtatttgtgcatgtatacacttgtactaagaaattATC-----TTCATTTCCGGTTTCTCTATTaggtgacataagatttattgacctCATATGAGCATTTAAGTATTATTCATTTTGTGTAATAGtttttgggttggggattgg i papAnu2.chr13 I 54836 C 0 s chlSab2.chr14 16789183 290 + 107702431 cgacctgctgaggtgcttgctgaaggcaaaggcaatacagaatgaatagtggaagaaggtagtgatcaatatcagctatgaccatgtgaccagctgcagaaaggaggactggaactatcatgagtatttccttcttcttttgttaaaaacatatttgtgcatgtatacacttgtactaagaaattatc-----ttcatttccagtttctctatcaggtgacataagatttattgacctcatatgagcatttaggtattattcattttgtgtaatagtttttgggttggggattgg i chlSab2.chr14 I 60182 C 0 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e macFas5.chr13 18041357 62685 + 111193037 I a score=185438.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88117 127 + 181496 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C 0 s macFas5.chr13 18104171 438 + 111193037 ttgtgatggctaatactgagtgtcaacttgattggattgaaggatgtaaagtattcatcctgggtgtgtctgtgagggtgttgcc--aaaaaaggttaacacttgagtcagtgggctgggaaaggcagacccaccactgatctgtgtgtgaacaacccaatcagctgccaacacagccagactataagcaggcagaaaaatgtgaaa--agaga-----ctaccctcccagcctacatctttctcccatgctggatacttcctgccttcgaacatggactccaggttcttcagttttggaactctggctggctctttttgctcctgagtcaacagatggctgattgtgagacctggtgattgtataagttaatacttaataaactttctgtattagcaagtgac--ctagagggacagaactaacaggatatatatatatataaaCaca i macFas5.chr13 C 0 N 0 s papAnu2.chr13 104679352 444 + 128036923 tggtgatggttaatactgagtttcaatttgattggattgaaggatgtaaagtgttgatcctgggtgtgtctgtga-ggtgttgcc--aaaggagattaacatttgagttagtgggctgggaaaggcagattcACCCTTAATCTGCATAAGCACAATACAATCAGCTGCCAACACAGCTAGACTATAAGCgggcagaaaaatgtgaga--agagacgagcctagcctcccagcctacatctttctcccgtgctggatgcttcctgtcctcaaaCATGGACTCCAAggtcttcagttttggaactctgGTCGGCTCTTTTTGCTCCTCAGCCAGGAGATGGCCTATTGTGAGACCTGGTGATTgagtgagttaatacttaataaacttcctGTATTAGAGGGTGAcatctagagggacagaactaacaggagatagatagatagatagata i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 16789602 444 + 107702431 tGgtgatggttaatactgagtttcaatttgattggattgaaggatgtaaagtgttgatcctcggtgtgtctgtga-ggtgttgcc--aaaggagactaacatttgagtcagtgggctgggaaaggcagaatcacccttaatctgcgtgagcacaatacaatcagctgccaacacagctagactataagcgggcagaaaaatgtgaga--agagatgagcctagcttcccagcctacatctttctcctgtgctggatgcttcctgccctcaaacatggactccaaggtcttcagttttggaactctggtaggctctttttgctcttcacccaggagatggcctattgtgagacctggtgattgagtgagttaatacttaataaacttcctgtattagtgagtgacatctagaggcaaagaactaacaggagatagatagatagatagata i chlSab2.chr14 C 0 C 0 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e ponAbe2.chrUn 70331353 757 - 72422247 I a score=3948.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88691 13 + 181496 gatagatagatag s macFas5.chr13 18210387 13 + 111193037 tatatatGcacac i macFas5.chr13 N 0 C 0 s papAnu2.chr13 104679796 13 + 128036923 gatagatagatag i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 16790046 13 + 107702431 gatagatagatag i chlSab2.chr14 C 0 I 60 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e nomLeu3.chr14 22155006 0 - 94967081 C e ponAbe2.chrUn 70331353 757 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393527 184866 0 - 341619 C a score=-532.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88704 17 + 181496 atatagatatatatata-- s macFas5.chr13 18210400 17 + 111193037 --atatatgtacatacaca i macFas5.chr13 C 0 N 0 s papAnu2.chr13 104679809 5 + 128036923 --ataga------------ i papAnu2.chr13 C 0 C 0 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e chlSab2.chr14 16790059 60 + 107702431 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e nomLeu3.chr14 22155006 0 - 94967081 C e ponAbe2.chrUn 70331353 757 - 72422247 I e panTro4.chrUn_GL393527 184866 0 - 341619 C a score=5706.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88721 16 + 181496 tagatatatatatata s panTro4.chrUn_GL393527 184866 16 - 341619 tatatatatatatata i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18104609 16 + 111193037 tacatatatatatgca i macFas5.chr13 N 0 C 0 s papAnu2.chr13 104679814 16 + 128036923 tagatagatagataca i papAnu2.chr13 C 0 C 0 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e chlSab2.chr14 16790059 60 + 107702431 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I e nomLeu3.chr14 22155006 0 - 94967081 C e ponAbe2.chrUn 70331353 757 - 72422247 I a score=23024.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88737 66 + 181496 gatatatatatatatatacata----cacacatacatacatatatatatgcacacac--acacacatatata-- s panTro4.chrUn_GL393527 184882 68 - 341619 tatatatatatgcatatacata----cacatacacatacatatatatGCACACACACAGACACACATATATa-- i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70332110 64 - 72422247 gatatatacatatataTacata----cacacacacatacgtatacatatgcacac----acacacacacaTa-- i ponAbe2.chrUn I 757 C 0 s nomLeu3.chr14 22155006 50 - 94967081 gatatatatttacatataccta----aacacacaca--------------cacac----taaaacatatata-- i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18104625 70 + 111193037 cacatacatatgtatacacacaccctcacgcacacatacaCATATATAtgtgtgt----gtgtgtgtgtgtgtg i macFas5.chr13 C 0 T 61057 s papAnu2.chr13 104679830 50 + 128036923 cacaca--------------------cacacacacacacatatatataggtgtgt----gtgtgtgtgtatata i papAnu2.chr13 C 0 I 2 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e chlSab2.chr14 16790059 60 + 107702431 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I a score=7548.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88803 17 + 181496 tatatttatttataaag s panTro4.chrUn_GL393527 184950 17 - 341619 tatatttatttataaag i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70332174 17 - 72422247 tatatttatttataaag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 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papAnu2.chr13 104679889 57 + 128036923 ggatgttTACTAACTTAAAGGATCATAAGTTCCACAATGGGCTGTCTGCAAA-TCCAT i papAnu2.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr14 16790119 57 + 107702431 ggatgtttactaacttaaaggatcataagttccacaatgggctgtctgcaaa-tccat i chlSab2.chr14 I 60 C 0 e calJac3.chr14 18162483 1 + 108792865 I e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I a score=27508.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88877 13 + 181496 gagaaaggagagc s panTro4.chrUn_GL393527 185024 13 - 341619 gagaaaggagagc i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70332248 13 - 72422247 gagaaaggagagc i ponAbe2.chrUn C 0 I 24 s nomLeu3.chr14 22155124 13 - 94967081 gagcaaggagaga i nomLeu3.chr14 C 0 I 25 s macFas5.chr13 18043712 13 + 111193037 gagaaagaagcga i macFas5.chr13 C 0 I 24 s papAnu2.chr13 104679946 13 + 128036923 GAGAAAGGAGAGC i papAnu2.chr13 C 0 I 24 s chlSab2.chr14 16790176 13 + 107702431 gagaaaggagagc i chlSab2.chr14 C 0 I 24 s calJac3.chr14 18162484 13 + 108792865 gagcaaggagagc i calJac3.chr14 I 1 C 0 e rheMac3.chrUn_JH290316 13778 3934 + 44534 I a score=1164567.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 88890 463 + 181496 ------------------------catggagtccaatgtttgagggcaggaagaaaccagcatgggagaaagatgtaggctgggaggctaggccagtctctccttttcaaatttttctgcctgctttatatttgctggcagcagattagattttgcccaccagattaagggt-gggtctgccttccccagcccactgactcaaat---gttaatctctttcggcaacactctcacagacacaccctgggtcaatacttcatatccctcaatcctatcaagttgacactcattattaaccatctcactccccttcatatatatatatgtatatagt--------------------------------------cctttaattctgtcactctagagaaccctgactaatacaTCTACACTTCTGATGGTCTATTTCTTTTATTTTAGGTCATTTATTTCCCCTGGGTTGCCTACACTCGCTTCTTCCCACTCCCCTATGAAGGACAATATAAGCCTCTGGACCTCACTA s panTro4.chrUn_GL393527 185037 463 - 341619 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cagtcaagtccccaaatggaagaacttggagtctgatgtttgagggcaggaagtgtccagaattggagaaagatgtaggctgggaggctaggccagtctctccttttca---ctatctgcctgctttatatttgctggcagtggattagatcatgcccaacagattagaggt-ggatctgccttccccagcccactgactcaaat---gtttatctcttttggcgacaccctcacagacactcccatgatcaatacttggtatccttcaattctatcaagttgacactcaatattaaccatcacaCTTCCATTT--ATATGTATATATACATCAA-----------------------------------------------------------GGGACT-------ATATATATACTCACTTGATGACCCATTTCTTTTATTTTAGTtcatttatttgccctgggttccctatactcccctctttccactcccctgtgaaggac-atataaccatctggaccttacta i calJac3.chr14 C 0 N 0 a score=5313.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 89353 3 + 181496 AGT s panTro4.chrUn_GL393527 185500 3 - 341619 AGT i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 70332745 3 - 72422247 GGT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 22155661 3 - 94967081 tgt i nomLeu3.chr14 C 0 n 0 s rheMac3.chrUn_JH290316 18170 3 + 44534 ggt i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 C 0 s macFas5.chr13 18044211 3 + 111193037 ggt i macFas5.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.chr13 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ctactccgtaggctgaggttggagaactgtttgcatttgagaactcaaggttacaatgagccacgatcataccactgcacttcatgctgggcaaccgagtgagtgagaccctgtGATTTTTCCCCTGCTTTTTGCAGaatttt------ttgcctctttcttctattaatttgtgttttgtccattcattttctgcaaacctttagagggcaaataggaaatttcccttttt i rheMac3.chrUn_JH290316 C 0 N 0 s macFas5.chr13 18044393 227 + 111193037 ctactccataggctgaggtgggagaatcacttgtgcttgagaattcaaggttgccatgagccatgatcacaccactgtacttcatgctgggtaacc----gagtgagaccctgtGATTTTTCCCCTGC-TTTTACAGAATTTTTTtttgttgcctctttcttctattagtttgtgttttgtctattcattttctgcaaacctttagagggcaaataggaagtttccattttt i macFas5.chr13 C 0 N 0 s chlSab2.chr14 16790858 227 + 107702431 ctactccataggctgaggttggagaactgtttgcacttgagaactcaaggttaaaatgagccacgatcacaccactgcacttcatgctgggcaaccgagtgagtgagaccctgtGATGTTTCCCCTGCTTTTTACAGaattttt-----ttgcctctttcttctattaatttgtgttttgttcattcattttctgcaaacctttagagggcaaataggaaatttcccttttt i chlSab2.chr14 C 0 N 0 e nomLeu3.chr14 22155664 0 - 94967081 I a score=112859.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 89760 440 + 181496 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 I 4241 s ponAbe2.chrUn 70333896 1485 - 72422247 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caggaggatttcttaatcccaggagtttgaggttacagtgagctatgattatggtactgccctttagcttgggtgacaaagcaagaccttgcttctaaaaaaaTaatagttaaaa------atatataaataaatacaattt--aaaaatgggcaaaagatctgaacagatattttctcaaaagaagacatacaaatggccaataggaagatgaaaaaatattcaatatcactaatcatcaaagaaatgcaaatcaaaatcacaatgcaatatcatctcaccttggttgaaatgacttgtttcaaaaagacaggcaataacagatgctggcaaggatgtggagaaagggaaatactagtacactgttggtgggaatctacattaataaagccactatggagaacagtatggaggttccccaaaaaagtaaaaatagaactaccacgtggtccagcaatttctttactggatatatatccaaaataaaggaaattaatatatcaaagacatatctacatgccgatgtgtactgcagcactattcacaatagacaaaatatggaatcaacgta---------caacaaatgaatagattttaaaagtcatatatatacataatggaatactactcagatacaaagaagaatgaaattctgtcattcgcagcaacataggtggcactggccatttggcttaacgtaatgaacataggccattgtgttaagtggaatgagcc s panTro4.chrUn_GL393527 195765 729 - 341619 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caggaggatttcttaatcccaggagtttaaggttacagtgagctatgattatgccactgtcctttagcctggatgacagagcaagatcttgcttctaaaaaaa-aaTAGttaaaa------atatataaataaatacaattttaaaaaatgggcaaaagatctgaacagata-tttctcaaaagaagacctacaaatggccaataggaagatgaaaaaatgttcaatatcactaatcatcagagaaatgcaaatcaaaaccacaatgcagtatcatctcaccttggttgaaatgacttatatcaaaaagacaggcaataacagatgctggcaaggatgtggagaacggggaacactagtacaccattggtgggaatctacgttaataaagccactatggagaacagtatggaggttcctcaaagatgtaaaaatagaactaccatgtggtccagctatttcactactggatatatgtccaaaataaaggaaatcaatatataaaagacatctctacatgcccacgtttattgcagcactattcataatggccaaaatatggaatcaatataagtgctcatcaacaaatgaatatattttaaaagtcatatatatacataatggaatactactcagataaaaagaagaatgaaattctgtcatttgtagcaacataggtggcgctggccatttcgcttaatgtaatcaacatagcccattatgttacgtggaatgagcc i rheMac3.chr14 I 302 C 0 s papAnu2.AHZZ01138950 2499 735 - 13741 caggaggatttcttaatcccaggagtttaaggttacagtgagctacgattatgccactgccctttagcttgggtgacagagcaagatcttgcttctaaaaaaa-taatgttaaaaatatatatatataaataaatacaattttaaaaaatgggcaaaagatcggaacagata-tttctcaaaagaagacctacaaatggccaataggaa-atgaaaaaatgttcggtatcactaatcatcaaagaaatgcaaatcaaaaccacaatgcagtaTCATCTCACCTTGGTTGAAATGACTcatatcaaaaagacaggcaataacagatgctggcaaggatgtggagaacgGGGAACACTagtacaccgttggtgggaatcTACGTTAATaaagccactatggagaacagtatggaggttccttaaaaaagtaaaaatagaactaccatgtggtCCAGCTATTTCACTACTGAATAGATgtccaaaataaaggaaatcaatatataaaagaCATCTCTACAtgcccatgtttattgcagcactattcataatagccaaaatatggaatcaatgtaagtgctcatcaacaaatgaatatattttaaaagtcatatatatacataatgcaaTACTACTCAGatacaaagaagaatgaaattctgtcatttgtagcaacatagGTGGCGCTGGccatttcacttaatgtaatgaaCATAGGCCATTATGTTATGTGGAATGAGCc i papAnu2.AHZZ01138950 I 279 C 0 e chlSab2.chr1 44799776 1404 - 126035930 I e nomLeu3.chr14 22155664 0 - 94967081 I e ponAbe2.chrUn 70345219 266 - 72422247 I a score=435201.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 99502 528 + 181496 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aagcacagaaaggcaaatatcgcatgttgtcactcatatgtgggtggttaaaaagtggatctcatgaagatagaaaGTAAATTGGCGGTTGCTAGATGCCAGCAAGGGGAGTGGGAAGACGAGACGAAGAGAagcaaatttaaatgtatttatcacCACTAAACTGTCCTCTAAAAATGTACAgatggtaaattatatata--------tatatatatatatatatataatctcaataaaaaata---aaaaaattctgttcTGTGTTTATAGGGCACATGTATAAGACTTTCTCTAGGGTTGtatcagttttctattgctgctataacaattTACCACAAACTTATTGGcttaaaagaacacatttttttaagatttgagtctgttttaaaaaacacacacaaacttaCTATCTTAGAGTTGTTTTGGTTGGAAGTCTGGTATGGCTTTCACTGAACTAacatcaagatgttggcaggctGCATTTCTTTCTGAAGGCTCTAAGAGAGAATCtgggttgttggcagaattcagttccttgtggttgtag i papAnu2.AHZZ01138950 C 0 I 7 s chlSab2.chr1 44801180 547 - 126035930 aagcacagaaaggcaaatatcgcatgttgtcactcatatgtgggtggtaaaaaagtggatctcatgaagatagaaagtaaattggtggttgctagaggccagcaaggggagtgggaagacgagatgaagagaagCAAATTTAAATGTATTTATCACCACTAAGCTGTCCTCTAAAAATGTACAGAAGGTAAATtaaatatatgtgtgtgtatatatatatgtatataAAATCTCAATAAAAAATT---AAAAAATTCTGCTGTGTGTTTATAGGACACATGTACAAGACTTTCTCTAGGGTtgtatcagttttttattcctgctatagcaatttaccacaaacttattggcttaaaagaacacatttttttaagatttgagtctgttttaaaaaacacacacaaacttactatcttggagttgttttggttggaagtctggtacggctttcactgaactaacatcaagatgttggcaggctgcatttctttctgaaggctctaagagagaatctgggttgttggcagaattcagttccttgtggttgtag i chlSab2.chr1 I 1404 I 403 e nomLeu3.chr14 22155664 0 - 94967081 I e ponAbe2.chrUn 70345219 266 - 72422247 I a score=61449.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 100030 119 + 181496 atcctcag-tttcttcctggttgtaaactttgggtcattcccagcttctaaaggtcactggctttccttggcttgtggccccctaccactgttttaaaagccagtaatagcaggccacat s panTro4.chrUn_GL393527 197024 119 - 341619 atcctcag-tttcttcctggttgtaaactttgggtcattcccagcttctaaagttcactggctttccttggcttgtagccccctaccactgttttaaaagccagtaatagcaggccacat i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s rheMac3.chr14 45476562 120 - 135538710 atcctcggttttctttctggttgtaaacttcgggtcattcccagcttctaaaggtcactggctttccttggattgtggcccccttccactgttttaaaagccagtaatagcaggccacat i rheMac3.chr14 I 7 C 0 s papAnu2.AHZZ01138950 3780 120 - 13741 atccttgattttctttctggttgTAAACTTTGGGTCATTCCCAGCTTCTAAAGGTCACTGGCTTTCCTTGGATTGTGGCCCCCTTCCACTGTTTTAAAAGCCAGTAATAGCAGGCCACAT i papAnu2.AHZZ01138950 I 7 C 0 e chlSab2.chr1 44801727 403 - 126035930 I e nomLeu3.chr14 22155664 0 - 94967081 I e ponAbe2.chrUn 70345219 266 - 72422247 I a score=943853.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 100149 1130 + 181496 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s rheMac3.chr14 45476682 1129 - 135538710 ctttctcatactgccatctgtctgaatctctgcatccagaaaatattctctgctctcatggaattatgagattaaattggactcaccaagataattcaaggtaatttccccatttcaatgccgttgatggtaatcacatctgcaaagtcccttttagcatg------taagttagcatgttcaccgtatctgaagactgggatgtaactgtctttggt-gggggccaattattctgcctaacccaAAGATACACAACTTGCAGATATACAACTAGTTCATGGAGATTAAACATTTTCAAATCTACAAGAAAATGTTTTTTAAAATGAGCATCTCTTATTAGATTTTCACCAGCACTGTATCAGAATTATATTTACTTCATAATGTCATCAATACTGACATCAGATACTTAATTTTCTAGTCAGTTCAGGATAATGTGACATTGTGAATAATATA----TTTGttcattcattcaacaaacattttttatcagatatcaccaatatgctggacagtgtcatggatcctaaaaatataaccgttattattattttttaaacaaagtccctgctgtgataaagctttcattctttgggacaggcagacagtaatccagataaataaatgcaagggcaaattgggggaaaaattagattggagagttcaggatctggcaccagagaagggcagagagagTGGGGACCCAGTTCAGAATCTCGATGCGTGCACACCAAACAATTCCATGAGGGCTGAGGAGAAGGAGCTGAAAGGCTTGTCTGACATCACAAGAGACAGAAACCTGAGCCCCATTTTCATCTCTCTCCTGACAATGTTCCTGGCTTGATTTCCTCCTTCCAGCAGAGACAAGAATCAGGAAGTGCAACCTGATGGGTAACA-TTTCTTTTAAGGAGCCTATCTTGGGGCTCCTGGTGAGAACCTGAGTCCATTGCTGACCACGGTAGCCCAGCATGGTCCTCAGTGCGTGACCCAAGGCCGAGAGTCTGTGCCTCTATCCTGGAGGCAGAAGAAATGACTGGGGGAAAATGAGAGGTTTTAGGTGGTTGGCACTGGGTGAGACCAAGGAGAGCTTTTAAAGCTGTGTGTCCTGGggccgggcgcggtggctcacgcctgtaatccc 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s panTro4.chrUn_GL393527 226594 1340 - 341619 ccagagccaggccatagagatgggaggg-caacaccaaggcagagtcagggtagatccagagctgagcagagtcagggcaggtccagagttgaggcagagctagggcccaagcagggccatggcagCACcagggcaggggagggcagggcaat-gcaggactgggcCATGGCAGTGCCTGGTCAACTCTGgggcagagccagaagcaggacagggcaagagccaatgttcaggccagggacagggcatgacaggaagtgccagagcagggctgggccaatgtaggggcagggcaaatc-agaccaggacaCCCCCAAgtccagctctggccctgccttggccctggccccttcctgacctgaccttgtccctggccctgccctatccatgccctgTGTGTTTGACCAGTGTTTTATAACCAGAATCCTACAAGAAACTTA--------AATCAGCTCtttttgtgcatttttagtagagatggggtttcacaatgttgcccaggctggttccaaactcctgagctcaagccatctgcctgccttggcctctcaaagtgctgggattacaggagtaaTCt---------ggccaagtatttaacttctttatgcctgtttcctacatttggaaaatggggatgctttaagtacctagcacatagaattattgtgagaatcaatgcctcacatatttacatattgataaaattatactcatagaacagtactggaagcagagatagtattagttaaaatttagtgattatt---TACTGTAAATATTATTACTATTACAAACAACATAGTATAGACATTATTACCACTACTATAGTTATCTTAA------AAAATAAAAATTTTACGTAATAGCCTAATGTAATCTCCCCTGCTCTGccccggctctgccctagtgctggctctgcccctagtcctaccacatccctggccctgacccttccctggtcctgccgctgccctggcccttcccatcttcaggccttaccatggccctaccctggtcctgaccatggccctaccctggtcctgaccctggccctacc--------ccAGAGAAGGGGTATGGCAGAGCCAGGGAAGGGCCGGGGCAAATAAGGGATGGGACACATCCAAATCCAGGAAAGGGCCAGGGCCATGACAGAGCCAGGGCGAGTCCTTGGCAGGGCCAGGTTCCAGGCCAGGGCCAGGAAAGGGTCATGGCAGGGTCACTGTATGGCCAAGGTCCAGGCCAAAGCAAAGGC-GGGGTAGGGTCAGGCCTGCATAagggcaggaccagagccagtgatatggcagggccagggccagggccagggccagggctgtgccaggacagaacaagagcagagcagggcagga 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ataacaagaccctttatctacaaaaaatttttaaatatttgccaggtgtggcggcacgtgcctgtagtcttaaacaattat---atgacccagatagtgtattccttagggatatacccaagggaaatgaaaatatacatccacactaaaatttgtacacaaatgttcacagcagcattgtgcataatagccaaaaattgg-aaaaaaaactcaagtgcctatcaacagaggaactgataaaatatggtatatccattcaaaagattactcagcattaaaaaagaatgaagtgctgatatatgctacagcatggataaaccttgaaaacactgtgccaagtgaagtaagtcaatcacaaaagaccacatgtagtaagatttcattctgtgaagcctccagaagagctaaactcagagacagaaagtaggctagttattgccagggactaggggaaaagggaataaggatgactgctaatgggtatgggatttcttgtggactgatgaaaatggtctgaaagtatctagatacctgtcttgtttgtgcgattctgtgaacatattataaaccacaaaattctgcactcaaggggttgatttcatggtaggtgaatttatctcaTTTATCTTTATCTCAATAAAGCTTTTTAAAGACACTTAAAAAAGACAT--CTGTATAAGCTACAAATATAACACACTGAGAGACTAAAATGCTTAATTTTTCCATTTTTCTTCTTCAGCGCAATCTCAAGTCCAAAAGTCTTTCCTTCCTATATATGCATATTTTGTCCAGTGAAACAAGAAACTCTATTAACTTTTTTATTAGAAAT-----TTAAAAAAgccaggtgtgctggctcacagctgtgcttccagctactcagaaggctgagacagaaggatcacttgaggccaagactgggagttcaagaccagctgaggcaacatagctagatcctgtctttaaaaaTATTTTTCAggccaggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggagggcagatcatttgagatcaggagttcaaaaccagcctggacaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatataaaaattagccaggtgtggtggtgggcacctgtagtcccagctacttgggaggctaaggcaggagaattgcttgagccgggagggtggaggctgcagtgaggccaagatcatgccattgcactccagcctgggtgacagagcaagactccgtctcaggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatatatat----------------------------------------------------------------------------------------atatatatatatGTAAATAT----------TTTTAAGTTAAAACCCTACTGAAATGAAACTAATAAAATAAAATTCAAGTTAATTAAAAAATAGTTCCTGAAATATTAATTTTCAAACAATTCTATTTTAGCTTTGACTCTGAACaaaatataaacctcaatttcaaaatatcacaaagattggctgggggcagtggctcatgcctgtaagtccagcactttgggaggatgaggcaggtggatcactagaggccaggagttccagagcagcctggccaacatagggaaacccagtctctact--aaaaaaatacaac-aaaaattagctgggtctattaaccccagctactcaggaggctgaggcattagaatcgctggaatctgggaggtggaggttgcagtgagcggagatcatgccacagcactccaacctgggcgacagactgagactctgtctcaaaaaaataaaaaTAAggccaggtgccgtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggcagatcgcttgaggtcaaggagtttgggaccagcctgggcaacacagtgaaacctcctctctactaaaaatacataaattagctgcgcatggtggcacacacttgtaatgccagctacaccagaggctgaggcaggggaatcgcttgaattcgggaggtggaggttgtagtgacctgagattgtgctactgcactccagcctggacgacagagtgagactccatctcaaaaaaaaaac--aaaaaaaaagaaaatttaaatttaaaatttaaaaAAATCACAAAGACTACAAATACTCAGGTTTAAGCAAATTCCCACCTTTCTTGAATTAACAGTAATTCATATTTGCTTTGTCAAAAATGTAGATATTTACCTGCCCCAACGGAATGAAATCCTAAAAGCCTAGTGTTCTCAAATGATGAAGAGAAAGAAACATGAATATTTTAATTAATAATTTTGATTCAGAATTAATTTTAACCTAGCTGGAGTATACATAATCATTTATGTATTTA----CTTATTTAAgagactgggtttctctgtgttatccaggctggaatgcagtggcacaaccttggctcactgcaacttgtacttcctgagctcaagtgatcctcccacctcagcctccagagtagctgagactgcaagtgcatgctaccacacccagctaatttttgcggagacgagcctcactatgtttcccacactggcctt-taattccttggctcactacagcctcaagcccctgggatcaagcaatctgcctcccaaagtgctgagattacaggagtgagccaccgcaccccgccTATTGGATAGTATATACTAAGCAACATGTACCCTGCTTTTGCCTAGAACATACTGAAAACATGGCATTAAAAACAATCACAAAAGTTGGGAGCTGAGAAAAATCATATACTGTAAAACAAATCTGACAGATATTAATCTCAAGAAGCTCCTGAAAATGTCTCAAGAACTCCTATGCTGCACTCTCCCTAATAATTTAGACTttctacagatattttctgatcatctaccgtgtgccaggcaccatgccacgtaccaagatgccatggtgaggtatacacaaaaccggctcctgcttgtaggaagcctacTCTCTAAAACAGTGCTTGCCAAGCTCGACTGATC-CAACTTGGGAGCTTGTTTAAGTTCCAAATCGGCTTCCCTGCTTTGGTGAGCCACAATCCGTGGCATTTTTATCAGGTGCTCCCAGTGATTCCTACGCTCTAACGGGTTTGGGAGGCAAGGGTGGGGGTAAGCTGGAGAGCCCAGAGCCATCCCGTCCAGCGGGAGCCCCACCTCTAAAGTCCATGTCGCTCAGCATCCTTCCCCCTGACTAGTGGCCCAAACACAGCACGAAGCTGAGGTGGGTGGAACGCTTTCCAAAACAGCGCTCTATGATGAGCCACTGACAGACTTGCTCGCCTCCGGGAACGAAGAGCTCACTCCTCACAAAccccccccccccccccccccccccGGGAAAGGTAGCACCTGAGCCTCCCGGGCTGCGCCGACACCTGGACACCTGTCTCCCCGCGGGTGCCACCTACTGCTCCAGGGGACTCCAGTCCCCAGGTTCCGCCCCACGGGGACTGGGGGGAGGGGGGAGGCGCCCCGCGCATTAGGCGCCAACTGTATACCGA---CCCCCCCCTCCGGAGTGCGCAGGCCAGCACCCATACACACCCTCACACACCCACACACACTCCCGTGGAAACTGAGGCAGGCAGGCGGCGGACCAGGTCCCGCCGCCTGACGGCTCGCGGCTGGGATTGAAGCCGGA----------CCTTCCGCCTCACAGGCGCTCCTCAGCCGCTGAGGCCCGGCCCAGCTCCCACCGCCGGAGTCTCACAAACAAAGTCTCCTGGCCCGAGCCCCTCACGCACTCACCTGCGCCGACGCCGGCGGCGATTCGGGCTCCAGCCGCCTTCAGCTCCTTGCGGG----GGCCCTTGGGTCGGCTCGGGCGCCGGCGGCGGCGACTGCTCCATATCCACGGGGTCCGGGCGGCGTCCGCCTCGAGTTAAAGGTCCCGCCAGCTAGGCGCGCGCGCCAGTTCCGCTCGCCATGTTCCAGCCGTGCTGCGCGCCGCCGCGGCGACCCTCACTGCCCCCCAACcgcgcgcgcacccg--------------------------------- 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s macFas5.chr5 87180768 122 - 189454096 tagagatggggtttcaccatgttggccaggatggtctcaatctcttgaccttgtgatctgctcctctggatctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccacacccagccaagttt i macFas5.chr5 N 0 C 0 s papAnu2.chr5 84489684 122 - 178775436 tagagatggggtttcaccatgttggccaggatggtctcaatctcttgaccttgtgatctgctcctctgggtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccacacccagccaagttt i papAnu2.chr5 C 0 C 0 a score=27919.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 128448 42 + 181496 t--tttttttttaaagaatgctgaaggccgggcgtgttggctca s panTro4.chrUn_GL393527 271210 40 - 341619 t--tttttttt--aagaatgctgaaggccgggcgagggggctca i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s rheMac3.chr5 86893283 42 - 184069350 ttttttttttt--aagaatgctgaaggctgggcacggtggccta i rheMac3.chr5 N 0 C 0 s macFas5.chr5 87180890 39 - 189454096 ---tttttttt--aagaatgctgaaggctgggcacggtggccta i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 84489806 39 - 178775436 ---tttttttt--aagaatgctgaaggctgggcacagtggccca i papAnu2.chr5 C 0 C 0 a score=1675873.000000 s 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90930877 1305 - 198332218 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i ponAbe2.chr4 N 0 C 0 s rheMac3.chr5 86893325 1301 - 184069350 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macFas5.chr5 I 4 I 6 s papAnu2.chr5 84491164 7 - 178775436 TGTGGTG--- i papAnu2.chr5 I 4 I 6 e rheMac3.chr5 86894643 17 - 184069350 I a score=453725.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 129816 245 + 181496 ccagttcactggcaacaacactctgatggggtgtgccagccaaagtgcttcattgtagtgattgtaacaaggtccccactcacacatatgtgc---cagcagcagcagcacacagcaggtatgcatgtgttggcaggggtgcagtgccagcaggagtgggatgGGGGTGTTCTGCATACTTGCACGTGCCAGCCGGGGCAATGGTGCTGTGGGGTGCACTCATGTGCTGCTGGAGACAGAGTGGCAGC s panTro4.chrUn_GL393527 272580 245 - 341619 ccagcccactggcaacaacactctgatggggtgtgccagccaaagtgcttcattgtagtgattgtaacaaggtccccactcacacatatgtgc---cagcagcagcagcacacagcaggtatgcatgtgttggcaggggtgcagtgctggcaggagtgggatgGGGGTGTTCTACATACTTGCACATGCCAGCCGGGGCAATGGTGCTGTGGGGTGCACTCATGTGCCGCTGGAGACAGAGTGGCAGC i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90932209 245 - 198332218 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i macFas5.chr5 C 0 I 5 s papAnu2.chr5 84491425 1015 - 178775436 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cattttcttattactacttttccttttgaacttttaacatttattatgtgtaagg-tctatctatattcctttccacataaa----tagttatctcaacaccatttatgaaaga----tttctttctcccactgatttaaaataccaattgtataatgtaataaatcccatagattagtttccacactttgtattctcttttcttccaatctattttgtctatt--tatgtcactattattcagttttaactattttacctttacaaaaacagtatcttgttctcttaaatttacttgatctttcattctaagatcttattcttccaaatgaactttataattagcttgtcaagttcagtaaaaatccctgcaaatattttgattggtgtatc-----tctgattaatttatttggggtagagattacatctttacattattgaggctt i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 84492746 433 - 178775436 CATTTTCTTATTACTACTTTTCCTTTTGAACttataacatttattatgtgtAAGG-TCTATCTATATTCCTTTCCACATAAA----TAGttatctcaacaccatttatgaaAGA----TTTCTTTCTCCCACTGATTTAAAATACCAATTGTATAATGTAATAAATCCCATAGATTAGTTTCCACACtttgtattctcttttcttccaaTCTATTTTGTCTATT--TATGTCACTATTATTCAGTTTTAACTATTTTACCTTTACAAAAACAGTATCTTGTTCTCTTAAATTTACTCGATCTTTCATTCTAAGATCTTATTCTTCCAAATGAACTTTATAATTAGCTTGTCAAGTTCAGTAAAAATCCCTGCAAATATTTTGATTGGTGTATC-----TCTGATTAATTTATTTGGGGTAGAGATTACATCTTTACATTATTGAGgctt i papAnu2.chr5 C 0 C 0 s 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macFas5.chr5 C 0 I 3700 s papAnu2.chr5 84493179 289 - 178775436 tggccgggtgtggtggctcacacctataatcccagcactttggaaggtcaaggtgggcatatcacttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaaaatggtgaaacaccatatgtactaaaaacacaaaaactagctgagcgtggtgttgggcacctgtaaaaTTGAGGCTTTTTAGTTCACACTTGTGAAATGTCTCGCTAAGTATTCAGGTATTATCTTagttatattaattattatattcacaatttttataaaagtatagaCTATCTTCACAGTTTTGTTCT i papAnu2.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr32 14495687 8570 - 38810281 I a score=3822.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 132072 2 + 181496 TA s panTro4.chrUn_GL393527 274833 2 - 341619 TA i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90934469 2 - 198332218 TA i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 30421647 2 - 118206036 TA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr5 86896930 2 - 184069350 TA i rheMac3.chr5 C 0 I 433 s macFas5.chr5 87188248 2 - 189454096 TA i macFas5.chr5 I 3700 C 0 s papAnu2.chr5 84493468 2 - 178775436 ta i papAnu2.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr32 14495687 8570 - 38810281 I a score=38392.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 132074 21 + 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90941099 1423 - 198332218 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i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 30427424 1422 - 118206036 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i panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90953636 1802 - 198332218 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macFas5.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr32 14519244 0 - 38810281 C e papAnu2.chr5 84527712 651 - 178775436 I e calJac3.chr3 90747412 871 + 190850796 I e chlSab2.chr7 84768925 374 - 135778131 I e rheMac3.chr5 86931540 370 - 184069350 I e panTro4.chrUn_GL393527 300475 7687 - 341619 I a score=22730.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 161794 40 + 181496 aaataaaTACAAGATTGTTGTTTCTTATAAACTTTTTTTG-- s ponAbe2.chr4 90976786 37 - 198332218 -aataaaTACAAGATTGTTGTTTCTTATAAACTTTTT--G-- i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 30457274 39 - 118206036 -AATAAATACAAGATTGTTGTTTCTTATAAACTTTTTTTG-- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr5 87222637 37 - 189454096 -aataaatacaaTATTATTGTTTTTTATAAACTTTTT--G-- i macFas5.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr32 14519244 40 - 38810281 AAGTAATTACAAGTATATTGTTCCTTATAAATTTTTG--GAG i canFam3.chr32 C 0 C 0 e papAnu2.chr5 84527712 651 - 178775436 I e calJac3.chr3 90747412 871 + 190850796 I e chlSab2.chr7 84768925 374 - 135778131 I e rheMac3.chr5 86931540 370 - 184069350 I e 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 84534487 4056 - 178775436 TAAGTTCTTGCCCCAGGGATGTGACTTCTACTACACAGTTCCTTTTGGCCTGAGGGCAATTCCTAGGGAGTGAACTTAGTCATGTGCCCTCAACAGACAGCACTCTAAGGAAGCTGGGGAATGAGTGTCTCCATTCTGAAGGGAGTCCTGGACTACATACCACAGAACACACTACTCTGTCCATCCCTCGTGTCATTTGGATCCGTGACTTCATATAACTTCTCTCCATCTAGGAACAGCTCCTCCAGGATTTTGgttggtttcttttgctgaggAAACCTGAAAGTAACATTCATGGAGTGAACAATAGCTCCTTGGCTCTTCAACTGGTCTTTCACC-----CTAAACTGATCATCTCCCTTTCCTACTATGCAGGTACTATCGGGTTTACATTCTTACACTCAGCTAGCACCTCCACTGGTCTAGGTCATTTACCTGGTAATAGGAGAGGGGGGTCTAGTAGCCATGGCTACTAGACTTTTCCATTTAAATTGAGCAATCAAAATTTAGTAAGAGACTACTTAAACATCACTTGGCTGCCAAACACATTCCTGTCTCCTTCTATTGTGTAACAGCATTGAATTGCAGAGATAAGAAGCAAAAATTTCCCAAGTGAATCCCTGGGGGTGACGGTAAATAGTGCTACTCTTTCTTCAATCCATGGTCCTCTTTCTATTAGCGACGTGGGACCATATAATGATTATTGATCTAGGATATATGCTTGTATCGCATCCCTGCAGCTTCAAAGGGCTACTGGAGGCTGTTACATCACTGCATCAGTTTGACAGCTTCTAGTTTTTGTGATTTCATGATTTGTAATAGGATCACTAAATTGCATTTTCCTGTGTCCACCACTGCAACTACAGTGCTATAAAGTACATTCCCTTTATACAGTGCTATAAAGTACAATGCAAGGATGTGCAGGATTCCATATTAGAGGATTAAACATTCTGTCAGCCATTGGATAATGGTGCTGGTTGAGGCCGTGTAAGTAGGAAAGATAAATCCATACTCAGAATAAGTGTCGGTTCCAGCCAAGATGAATCACTACCCTTCCTGTGATGGAAAGAATTCAATGTATTCAGCTTGCCACCTTGTGGCTACTTGGTGTCCTTGAGGAATGATGCTATCTTGAGGCCTCAGTGTTGCTCTGTCTTGATGACAAGCTTGACATTCAGAA-CAACAGTAGCTAGATAAGACTTAGTCAGTGGAGAC-TCTGCTGTTTGGGCCTCTGCATAGCCTCCATCCTTGTCACTACATTTATTCACCAATTGTGCCAGTACTGAGCTGGCCAATGGAAGAGGTTGGCTAACATCATCCAGCTGAGTCGCTTTTCTCCTTGGTTGTTGATAGATACCTCCTGTAGGTGTTAACATGGGAAACAAAGATCTTCATACTTTTTGTACATTCCCGTAAGTCCATCCATATGCCCTTTTCTCAGATATCTTTTTCTCCAGTCTTCCAAATTTTCTCCTTCCATCCCCCTGACCTGTAGCCAAGCCATTTGACCATGAGTCAGTACATTCTTACTTTGAGTCTCTTCTGTTTCCATGCAAAGTGAATGACAAGGTGCATAGTGCAAAGTTCTGCcaactgaaataatttatatttttattttttatttttttattttttgagacagagtctcactcgctctgtcaccaggctggagtacagtggcacgatctcggctcactgcaagctctgcctcctggattcacaccattctcctgcctaagcctcccgagtagctggaactacaggcacccgccaccacacccggctaa-ttttttttgta-ttttttagtagagacggggtttcaccgtgttagccagaatgctgttaatctcctgaccttgtgatccgcccacctcggcctcccaaagtgctgggagtacaggtgtgagccactgtgcccagccaagaatttatttttgagttgaatttttaaatattaaaactttttaaatgtgcaaaCAAAAATCGTATATATTTGTAGTGTACAAcctgatgttttgaaatatggatacgttgtgaaatggctaaatcaagctaattaatacatgtattacctcacatacttatcatttcttttatgGTGAGAACACTAAAAATCTACTGTcctagcaattttcaagtatgcaatacattgttattaactgtagtcaccatgttgtacaataggtCTCTTGAACTTGTTCTTCCTGcttatcttaatttttgtatcctttgaccaacatctccccagttCTACCCTCCTCCCCTAGCCCCTAATaaccattattttgttttctgctactatgtgtttgacttttttagattccacatataagtgagatcacatggcatttgtctctctgtgcctggcttatttcacttaatataatgtcctccagtttcatccatgttattacaaaggacaggatttccttctttaaggttgaacagtatttcattgtgtatctatacaccacattttcttaaactaTTCATCTGTTAaaggatacttaggttgattccatatcttgtctattatgaataatgttgcaatgaacatgaggTACAGATTTTTCTTTGACATATTCAAtcattttctttgggtatataaaTAGTactaggattgctggatcatatggtagttttatttttaattttctgagaaacctccatattatttttcataatggctgtactaattaaCATTCCCGCCAACAGTATACAaaggctcccttttctccacatcctcgccaacacatgttatcttttgtctttttcatagtagccattctaaAAGGGAtgactcattgtggttttgatttgcctttccctgatgaCTGGTGATGTTGGTCATTTTTTCATAttcctgttggccatttgtatgtcttctttgg-aaaaatgtttattcgGGTACTTTG---CCCTTTTGTTAATCAGGTTATATGTTTTcatgctattgagttgtatgaattctttatatattctggatattaatcctttatcagatgtatggtttgcaaatattttctccctttttgtaGGCtatctctttactctgttgattgttccCTTTGCTCACCACAGCtctttagtttgatataatcccatttgtctagttttgcttttgttgcctgtgcttttggggtcatatccagaaaatcattgcccagaccagtCTCATGGAGCTTttcctgtatgttttcttctagtagttttatggtttcaggttttatatttaagtctttagtccatttgcattatattgttgtatatggtgtgagataagggtctaatttcatttctCTGCATGTGGAAttctcccaacaccatttattgaaaagattgtcctttccccattgtgtgttcttggcgtATTTActgaaaatcaattggccataaatGTGGATGTATTTtgaggctctctattctgttccattggtctattagTCTGTTTGTATGCCAATATCATGTTATATTTTTGATTACTATAGCatcatagtatattttgaaactggataatgtgatgcctcctactttgttcttttttctcaagatttgctatttgg-tttttttgtgtgtgtgtggtttcacATGAATTTGGAGGcttttttctgtttatga-aaaaaaatcatcagaattttgatagagattacactGAGTCTGTAAATCATTTTGGGTACtaagaacattttaacaatatgaattcttcaaatccatgaacatgggatatatttccatttatttgtgtcttcttcaatttctttcaccaatGGTTTATAGTTTTGAGTGtacaggtctttcacctccttggttaaattaattccttattatttttgtagctattataaatgaaattgttttcttgatttctttttcagatagttcattgttagtatatacaGACACTACTGggttttttatgttgattttgcatcctgcaactttactgaattaatttattaGTTCCAACAG-ttttttttAGTGgactctttagggttttctacatttaagatcatgttgtctgcagagacaatttcacttcttcctttctgactttaatgcctt 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i macFas5.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr5 84539494 955 - 178775436 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i chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 90758238 960 + 190850796 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chlSab2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr3 90759198 165 + 190850796 tttttgttattgatttctaat---agtgctattactaatttgttataccgatataaacatttaa---tactatctgtaggcctaatatctggtcaatttttataaatatttcaaatgtgctcaaaaaaggaatagag--------attctctaactgttgat---------------------tagccttactaatttta i calJac3.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr32 14527215 189 - 38810281 cttttgttattgatttctaataccagtgc---------tttgttatctatacatgaattttaaaatgtgatacctttaggtctaatacctggtcagtttttataagtatttcaagtttatttgaaaa--gaataaaagaatagggattatttaattgttgattatagttttatatcacttatatagccttactaagttta i canFam3.chr32 I 179 C 0 e ponAbe2.chr4 90978966 0 - 198332218 C a score=2651416.000000 s hg38.chr10_KI270824v1_alt 173892 813 + 181496 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panTro4.chrUn_GL393527 C 0 C 0 s ponAbe2.chr4 90980309 191 - 198332218 TCTCAA---TTT-----TTTACCACTGTTGCTTATTC----TTAATACAATTGTTTTTCTT-----AATTGA-TCaattccaatagttctatagtaggtgctgatatctggtgagaaaagttcctctcaatagtc--tttttttcgaacaattttctgactattcttctacatgaactttaacataatttaatccaattttaaaatgcttt i ponAbe2.chr4 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 30463057 195 - 118206036 tctcaa---ttt-----tttaccactcttgcttattcttaattaatacaattgtttttctt-----aattga-tcaattccaacagttctatagtagatgctgatatccggtgagaaaagttcctcttaatagtc--cttttttggtacaattttctgactattcttctacgtgaactttaagataatttaatccaattttaaaatgcttt i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr5 86945751 196 - 184069350 tctcga---gtt-----tttaccactcttgcttattcttaattaatacaattgtttttctt-----aattga-tcatttccagtagttctatagtaggtgctgatatctggtgacaaaatttcctctcaatagtc-ttttttttggtacaattttctgagtattcttctacatgaactttaagataatttaatccaattttaaaatgcttt i rheMac3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr5 87236876 196 - 189454096 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