##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=1023.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 0 8 + 478999 GAATTCTT s nomLeu3.chr9 4317848 8 + 118206036 GAATTATG i nomLeu3.chr9 N 0 C 0 s calJac3.chr5 10881268 8 - 159171411 GAACTGTG i calJac3.chr5 N 0 C 0 a score=330639.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8 132 + 478999 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAG-CCTACAAAATTCAAAGCAAACCTTAG------------------------------------TACATAATTTTCACTGAAAATTTTATGAAAGA-TGGTGGAAATTGATCTAAATAAATAGCTGAGTTA s panTro4.chr13 80367731 134 - 115123233 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTACTACATAAGCAATAG-CCTACAAAATTCAAACCAAACCTTAG------------------------------------TACATAATTTTCAATGAAAATTTTACAGAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAATAGCTGAGTTA i panTro4.chr13 N 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4317856 131 + 118206036 TATCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAG-CCTACAAAATTCAAACCAAATCTTAG------------------------------------TACATAATTTTCAATGAAAATTTTACAAAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAATAGCTGACTTA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80143228 167 - 94676912 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAA-CCTACAAAATTCAAATCAAGACTTAGTACATAATTTTCAATGAAATTCAAATCAAAATTTAGTACATAATTTTCAATGAAAATTTTACAAAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAATAGCTGAGTTA i rheMac3.chr17 N 0 M 898 s macFas5.chr17 82291791 167 - 96864807 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAA-CCTACAAAATTCAAATCAAGACTTAGTACATAATTTTCAATGAAATTCAAATCAAAATTTAGTACATAATTTTCAATGAAAATTTTACAAAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAATAGCTGAGTTA i macFas5.chr17 N 0 C 0 s papAnu2.chr17 76964889 167 - 90913898 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAA-CCTACAAAATTCAAATCAAGACTTAGTACATAATTTTCaatgaaattcaaatcaaaatttaGTACataattttcaatgaaaattttacAAAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAACAGCTGAGTTA i papAnu2.chr17 N 0 C 0 s chlSab2.chr3 78433417 163 - 92142175 TGTCTGACAAAATTACCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAATAA-CCTACAAAATTCAAATCAAGACTTAG----TAATTTTCAATGAAATTCAAATCAAAATTTAGTACATAATTTTCAATGAAAATTTTACAAAAGA-TGGTGGAAAT-GATCTAAATAAACAGCTGAGTTA i chlSab2.chr3 N 0 C 0 s calJac3.chr5 10881276 131 - 159171411 TATCTGACAAAAATATCAATGGTGCTTAC---ATAAGCAGTAA-CCTACAAAATTCAAACCAAACCGTAG------------------------------------TATACAATTTTCCATGAAAATTTTACAGAAGA-TCGTAAAAAT-AATCTAAATAAATAGCTGAGTTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5389248 132 + 51628933 TGTTTGATGAAA-CACCAGTGGCTAGTAG---ATAAGCAAGAGTCCTACAAAATTCAAACCAAGCCTAGG------------------------------------AATATAACTTTATGTGAAAATTTCATTAAAAACTGGAAAAAAT-GATCCTAACAAGTAGTATAATTA i canFam3.chr25 N 0 C 0 a score=1239.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 140 2 + 478999 AT- s panTro4.chr13 80367865 2 - 115123233 AT- i panTro4.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4317987 2 + 118206036 AT- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82291958 2 - 96864807 AT- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76965056 2 - 90913898 AT- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78433580 2 - 92142175 AT- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10881407 2 - 159171411 AT- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5389380 2 + 51628933 -TT i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80143395 898 - 94676912 M a score=2161598.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 142 912 + 478999 AAAGGAGGGGAA-------CCAAAACAAACATTTGAGTTT----------AAAAAGTAAAGATTGAGTATTCATATTTAAAGGAGTATCAGTGAAAATAATATAGTACTTTAAATT-AAAAATATTTTATTT----GTAAAGGAATAAAATTAAAATAAGAGATCAATAGTTATTTAAAACTTCAGCCAGCTCCTTCACTAAATATAATTTCACATAGCTTATCTTATACATTCTATTTTTATTCAGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATAACATTGTACTCTCACACTTAAAACTCTAAAATAAAATACAGTCAGATCCTGTTAATAGATAAACATACTATGTGACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAATTATTCATCATGTCCTTATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTGACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAGAAACAAGTTTGGAACTTGGACCATGATATT-AAAAGGTATACTAAAAGCATCACAAGG------CCTTCCACATTAC-TTA-------AAAAAAAATGGG--------GGGGCCTGCTGTTTTCACATAACAATTAATGCTGTTGGGTGGCAGATTTTCATTCTAAAATTATTCTTTAGAAAATATTTT------AT--T---GTCTTTTTATTGATCTCCTCA-AAATCCTACTATTCTGGATTATAAATAGTGTATAAATGTAT-AAATGAATATTCTCTTCAACAGCATGTTACCTTTACCTCTTAGAAGTACTTATTCCTCCTTCCTTGTATTATTGTTAGTAA---AAAAAAAATC------TCTCTTTCGTAATATAAGAAAGAATATTATCTTATTCATCTTTTGTCTTCCTGATCCCTACCCTAATTTCTCAGGGAACATTTAACTGAATTAATGTCAAATTCAAAAATGGAGTAAGAATAGAATAGGTAGGAAAAAACAAAGCC s panTro4.chr13 80367867 910 - 115123233 AAAGGGGGGGAA-------CCAAAACAAGTATTTGAGTTT----------AAAAAGTAAAGATCGGGTAATCATATTTAAAGGACTATCAATGAAAATAATATAGTACTTTAAA-----AAATATTT---------GTAAAGGGATGAAATTAAAATAAGAGATCACTAGTTATTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTCACTAATTATAATTTCACATAGCTTATCTTATACATTCTATTTTTATTCAGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACTTAAAACTCTAAAATAGAATACAGTCAGATCCTGTTACTAGATAAACATGCTAGGTGACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAATTATTCATCATGTCCTCATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTGACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAGAAACAAGTTTGGAACTTGGACCATGATATT-AAAAGGTATACTAGAAGCATCACAAGG------CCTTCTACATTAC-TTT-------AAAAAAAAAAGGC----AGAGGGGGCCATTGTTTTCGCATACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGGTTTGCATTCTAAAATTATTCTTTGGAAAATATTTTTCTAAAATTGT---GTCTTTTTATTGACCTACTCA-AAATCCTACAATTTTGGATTGTAAATAGTATATAAATGCAT-AAATGAATATTCTCTTCAACAGCATGTTACCTTTACCTCTTAGTAGTACTTA-TCTTTCCTCCTTGTATTATTGTTAGTGT---AAAAAAAA-A------TCTCTTTCCTAATATAAGAAAGGATATTATCTTATTCATCTTTTATCCTCCTGATCCCTACCCTAATTTCTCAGGAAATGTTTAACTGAATTAATGTCAAATTCAAAAAC--AGTAAGCATAGAATAGGTAGGAAAAAACACAGCC i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82306858 926 - 117095149 AAAGGGGGGGAA-------CCAAAACAAGTATTTGAGTTTTAAAAGTAAAAAAAAGTAAAGATTGGGTAATCATATTTAAAGGAGTATCAACGAAAATAATATAGTACTTTAAATTAAAAAATATTT---------GTAAAGGAATGAAATTAAAATAAGAGATCACTAGTTATTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTCACTAATTATAATTTCACATAGCTTATCCTATACATTCTATTTTTATTCGGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACTTAAAACTCTAAAATAGAAT--AGTCAGATCCTGTTACTAGATAAACATGCTATGTGACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAATTATTCATCCTGTCCTTATAAAGAACATTAACTTGTATTATAAAATCAAGCTGACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAGAAACAAGTTTGGAACTTGGACCATGACATT--AAAGGTATACTAGAAGCATCACAAGA------CCTTCTACATTACTTTT-------AAAAAAAAAAGGCGGGGGGAGGGGGGCGTTGTTTTCACATACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGATTTGCATTCTAAAATTATTCTTTAGAAAATATTTTTCTAAAATTGT---GTCTTTTTACTGACCTACTCA-AAATCCTACTATTCTGGATTGTAAATAGTATATAAATGTAT-AAATGAATATTCTCTTCAACAGCATGTTACCTTTACCTCTTAGTAGTACTTATCCCTTCTTCCTTGTATTAT--GTAGGGT---AAAAAAAA-A------TCTCTTTCCTAATATAAGAAAGGATGTTATCTTATTCATCTTTTATCCTCCTGATCCCTACCCTAATTTCTCAGGAAATGTTTAACTGAATTAACGTCAAATTCAAAAAC--AGTAAGAAAAGAATAGGTAGGAAAAAACACAGCC i ponAbe2.chr13 N 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4317989 909 + 118206036 AAAGGGGGGGAA-------CCAAAACAAGTATTTGAGTTT----------AAAAAGTAAAGATCGGGTAATCATATTTAAAGGAATATCAATGAAAATAATATAGCACTTTAAATTTAAAAATGTTT---------GTCAATGAATGAAATTAAAATAAGAGATCACTAGTTATTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTTACTAATTATAATTTCACATAGCTTATCTTATACATTCTATTTTTATTCAGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACTTAAAACTCTAAAATAGAATATAGTCAGATCCTGTTACTAGATAACCATGCTATGTGACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAATTATTCATCATGTCCTTATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTGACCATTATAAGCATATCCACTCGATG----AATTCATAATATAGAATCAAGTTTGGAACTTGGACCATGATATT-AAAAGGTATACTAGAAGCATCACAAGG------CCTTCTACATTAC-TTT-------AAAAAAAAAGG------CAGGGGGGCCATTGTTTTTGCCTACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGATTTGCATTCTAAAATTATTCTTTAGAAAATATTTTTCTAAAATTGT---GTCTTTTTATTGACCTACTCA-AAATCCT---ATTCTGGATTGTAAATAGTATATAAATGTAT-AAATGAATATTCTCTTCAACAGCATGTTACCTTTACCTCCTAGTAGTACTTATTCCTTCTTCCTTGTATTATTGTTAGTGT---AAAAAAAA---------CTCTTTCCTAATATAAGAAAGGATATTATCTTATTCATCTTTTATCCTCCTGATCCCTACCCTAATTTCTCAGGAAATGTTTAACTGAATTAATGTCAAATTCAAAAAC--AATAAGAATAGAATAGGTAGGAAAAAACACAGCC i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82291960 904 - 96864807 AAAGGAGGGGAA-------CCAAAACAAACATTTGAGTTT----------AAAAAGTAAAGAGCAGGTAATCATATTTAAAGGAATATCAATGAAAATAATATAGTACTTT-------------------------GTAAGGGAATGAAATTAAAATAAGAGATCACTAGTTACTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTCACTAATTACAATTTCACATAGCTTATCTTATACATTCTATTTTTATTCAGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACGTAAAACTCTAAAATAGAATACAGTCATATCCTGTTAC----TAAACATGCTATGTGACCAGACTGTAGCTCATAAAAAATTATTCATCATGTCCTTATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTGACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATACAAAAACAAGTTTGGAACTTGGACCATGATATT-AAAAGATATACTAGAAGCAACACAAGG------CCTTCCACATTAC-TTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-----aaaaaaGCCTGTTGTTTTTGCATACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGATTTGCATTCTAAAATTATTCTTCAGAAAATATTTTTCTAAAATTGT---GTCTTTTAATTTCCCTACTCA-AAATCCTACTATTCTGGATTGTAAATAGTATATAAATGTAT-AAATGAATATTCTCTTCAACTGCATGTTACCTTTACCTCTTAGTAGTACTTATTTCTTCTTCCTTGTATTACTGTTAGTGT---AAAAAAAA-A------TCTCTTTCCTAATATAAGAAAG-ATATTATCTTATTCATCTTTTTTCCTCCTGATCCCTATCCTAATTTCCCAGGAAACATTTAACTGAATTAATGTCATATTCAAAAACAGAGTAAGAACAGAATAGGTAGGAAAAAACACAGCC i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76965058 896 - 90913898 AAAGGAGGGGAA-------CCAAAACAAACATTtgagttt----------aaaaagtaaagagcAGGTAATCATATTTAAAGGAAtatcaatgaaaataatatagtaCTTT-------------------------GTAAgggaatgaaattaaaataagagaTCACTAGTTACTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTCACTAATTACAATTTCACAGAGCTTATCTtatacattctatttttattcagtAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACGTAAAACTCTAAAATAGAATACAGTCATATCTTGTTAC----TAAACATGCTATGTGACCAGACTGTAGCTcat-aaaaattattcatcatGTCCTTATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTGACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAAAAACAAGTTTGGAACTTGGACCATGATATT-AAAAGATATACTAGAAGCAACACAAGG------CCTTccacattac-ttt-------aaaaaaaaaaaa-----aaaaaagcctgttgtTTTTGCATACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGATTTGCATTCTAAAATTattcttcagaaaatatttttctaaaattgt---gtcttttaatttccCTACTCA-AAATCCTACTATTCTGGATTGTAAatagtatataaatgtat-aaatgaatatTCTCTTCAACCGCATGTTACCTTCACCTCTTAGTAGtacttatttcttcttccttttattactgttagtgt---aaaaaaaa-a------tctctttcctaATATAAGAAAG-ATattatcttattcatcttttttcctcCTGATCCCTACCCTAATTTCTCAGGAAACATTTAACTGAATTAATGTCATATTCAAAAACAGAGTAAGAACAGAATAGGTAGGAAAAAACACAGcc i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78433582 904 - 92142175 AAAGGAGGGGAA-------CCAAAACAAACATTTGAGTTT----------AAAAAGTAAAGAGCGGGTAATCATATTTAAAGGAATATCAATGAAAATAATATAGTACTTT-------------------------GTAAGGGAATAAAATTAAAATAAGAGATCACTAGTTACTTAAAACTGTAGCCAGCTCCTTCA-TAATTACAATTTCACATAGCTTATCTTATACATTCTATCTTTATTCAGTAGTAATGATTTCAAGAACATGATCTGATA-CATTCTACTCTTACACGTAAAACTCTAAAATAGAATACAGTCATATCCTGTTAC----TAAACATGCTATGTGACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAACTATTCATCATGTCCTTATAAAGAACATTAACCTGTATTATAAAATCAGGCTAACCATTATAAACATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAAAAACAAGTTTGGAATTTGGACCATGATATT-AAAAGATATACTAGAAGCAACACAAGG------CCTTCCACATTAC-TTT-aaaaaaaaaaaaaaaaaa-----aaaaaaGCCTGTTGTTTTTGCATACCAATTAATGCTGTTGGGTAGCAGATTTGCATTCTAAAATTATTCTTCAGAAAATATTTTTCTAAAATTGT---GTCTTTTAATTTCCCTACTCA-AAATCCTACTATTCTGGATTGTAAATAGTATATAAATGTAT-AAATGAATATTCTCTTCAACCGCATGTTACCTTTACCTGTTAGTAGTACTTATTTCTTCTTCCTTGTATTATTGTTAGTGTAAAAAAAAAAA-A------TCTCTTTCCTAATATAAGAAAG-ATATTATCTTATTCATCTTTTATCCTCCTGATCCCTATCCTAATTTCTCAGGAAACATTTAACTGAATTAATGTCATATTCAAAAACAGAGTAAGAACAGAATAGGAAGGAAAAAACACAGCC i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10881409 921 - 159171411 AAAGGAAGAGAA-------CCAAAACAAATATTTGAGTTA----------AAAAAGTAAAGATTGGGTAATCATATTTAAAGAAATATCAATGAAAATAATACAGTACttt------aaaaatattttattc----ataaagaaataaaatttaaa-aaGAGATCAATAG-TATTTAAAACTTCAGCCAGCTCCTTCACTAATTATAATTTCACATAGCT--TCTTATACATTCTATTTTTATTCAATAGTAATGATTTCAAGAGCATGATCTGACA-CATTCTACTCTTACACTTAACACTCTAAAATAGAATACAGTCAGATCATGTTAT----TAAACATGCTATGCAACCAGACTGTAGCTCAT-AAAAATTACTCATCATGTGTTTATAAAGAGTATTAACCTGTATTATAAAATCAAGCTGACTATTACAAATATATCCACTTGATG----AATTCATAATATAGAAACAAGTTTGGAACATGGACCATGATATT-AAAACATATACCAGAAGCATCACAAGG------ACTTCCATATTAC-TAA-TAAAATAGAATAAACTAA-----AAATGGACTTGTTGTTTTCACATGTCAATTAATCCTACTGAGTAGTAGCTTTTCACTCTAAAATTATTCTTTAGAAAATACTTTTCTAAAATTGT---GTCATTTTATTGACCTACTCA-AAATCCTGCTTTTCTGGATTATAAATAGTAGGTAAATGTATAAAATGAACATTCTCTTCGACAGCATGTTACCTTTACCTCTTAGTAGTACTTCTTCCTTCTTCCTTGTGTTACTGTTAGTTT---AAAAAAAA-AAAAATCTTTCTTTCCTAAGATAAGAAAGGATATTATTTTATTCATCTTTTATCTTCCTTATCATTACCCTAATTTCTCAGGAAATGTTTAACTAAATTAATGTCAAATTCAAAAATAGTGTTAGAATAGAAGAGGTAGAAAAAAACACAGAC i calJac3.chr5 C 0 I 4 s canFam3.chr25 5389382 890 + 51628933 AAGGTGGGGGAAATGGGAGACAAAGCAAA---TTATCTTTAAGGAAAGAGAAAAACCAAAGCTTGAGC-CTCAC-TTTAAAGAAACTTTTATAGAAAGAAC------TTTTAAATTCTAAAACATTTTATTCATAGATAGGTGAATAAAATTAAAACAAGAGATCAGTGGTTATATAAAGCTTTAGCCC-CTTCTTCAGTAGCTATAATTTCACACAGCTTATCATA-------TATTTTTATCCAGTAATAATGATTCCGAGAACATCATCTGGTA-AATTCCACTTTTATGCTTAAAACTATGAAATAGAGC--AGTCACATCCTCTTCCTAGATAAACATTTTCAGAGATCAGATTTTACTCTAT-AAAA-----TTGTCATGTGTTTATAAAGAACACTAAA--GCAATATAAAATCAGATTGGCCATTATTAACATATTCATTTGATGAAAAAATTCATAATTTGGAAACAAGTTTTTAACTTTG-CTCTGTTATAAAAAAGACATGCTGGAAGTACCACATGAAGCCTTCCATCCACATTAC-TTA-------AAAAAAAAAATGTC---AGGTTTTTTTTTTTTTTTTTCATAGCACT---------CGGTTAATAG-TTTTTATTCTAAAATTTATCTTTAGGAAATATCTTTCTAAATGTGTGGGGTTTTTTTATTGGCCTATTCAGAAATCCTGCCAGGCAGA-------------------------AAATGAAAGCTCCCTTCAACAGCATGTTACCTTTACT-----GTATTACTTCTTCCTTCCGCTTTGCATTACTGTTAAT-T---ATTCACAT-A------TCTTTCTTTCAATATAAAGAAG-ATACTATCTTATTCATCTTTTTTTCTCTCTGGTCCTGCCATAATTCCTTAGCAGATGTTGAACTGAATTTATGGCAAATTCAAGAACAGAATAAGAATAGAACAGATAAGACAAATCACAGAT i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80143395 898 - 94676912 M a score=227668.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 1054 73 + 478999 TGGGAAGAGAAGAAAGAAGAT-TCTAACTCTGCTTTTAAATGTATTTCATTTGATTAACAGTTTCAAAATATTT s panTro4.chr13 80368777 74 - 115123233 TGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTGACTCTGCTTTTAAATGTATTTCCTTTGATTAATGGttttaaaatattt i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82307784 74 - 117095149 CGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTGACTCTGCTTTTAAATGTATTTCCTTTGATTAACGGTTTTAAAATATTT i ponAbe2.chr13 C 0 I 353 s nomLeu3.chr9 4318898 73 + 118206036 TGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTGACTCTGCTTTTAAATGTA-TTCCTTTGATTAATGGTTTTAAAATATTT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80144293 74 - 94676912 TGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTAACTCTGCTTTTAGATGTATTTCCTTTGATTAACAGttttaaaatattt i rheMac3.chr17 M 898 C 0 s macFas5.chr17 82292864 74 - 96864807 TGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTAACTCTGCTTTTAGATGTATTTCCTTTGATTAACAGTTTTAAAATATTT i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76965954 74 - 90913898 tgggaaaagaagaaagaagatctCTAACTctgcttttaaatgtatttcctttgattaacagttttaaaatattt i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78434486 74 - 92142175 TGGGAAAAGAAGAAAGAAGATCTCTAACTCCGCTTTTAAATGTATTTCCTTTGATTAACAGTTTTAAAATATTT i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10882334 74 - 159171411 TAGGAAAAAAAGAAAAAATATCTATAATTCGGTTTTTAACTGAGTTTCCTTTGATTAACGGTTTTAAAATATTT i calJac3.chr5 I 4 C 0 s canFam3.chr25 5390272 66 + 51628933 -----TAAGAGAAAAGAAGATAGCCAACTCTGTTTT--AGGGTGTTTAGTTTGAATGACTGCTTTAAAATCCT- i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=345898.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 1127 136 + 478999 TTATATTTTGGTATTTGTTTTCATTTTCTCAAGTAAAACTACTTTAAAAACAGATCTACACTTGGATAATTTATAGTTATAAATCTGTAACCTTTAGATGGA---ACAATTTAAATCTCATAGAAAATGTAAGCCCTGG s panTro4.chr13 80368851 139 - 115123233 ttatattttGGTATTTGTTTTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAGAAAGAGATCTATACTTGGATAACTTATAGTTATAAATCTGTAACCTTTAGATGGAAATACAATTTAAATCTTACAGAAAATGTAAGCTCTGG i panTro4.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4318971 139 + 118206036 TTATATTTTGGTATTTGTTTTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAAAAAGAGATCTATACTTGGATAGTTTATAGTTATAAATCTGTAACCTTTAGATGGAAATACAATTTAAATCTTATAAAAAATGTAAGCTCTGG i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80144367 139 - 94676912 ttatattttGGTATTTGTATTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAAAAGGAGATCTATACTTGGATAATTTATAGTTATAAATCTGTAACTTTTAGATGGAAATACAATTTAAATCTCATAGAAAATGTAAGCTCTGG i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82292938 139 - 96864807 TTATATTTTGGTATTTGTATTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAAAAGGAGATCTATACTTGGATAATTTATAGTTATAAATCTGTAACTTTTAGATGGAAATACAATTTAAATCTCATAGAAAATGTAAGCTCTGG i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76966028 139 - 90913898 ttatattttggtatttgtattcattttctcaagtaaagctattttaaaaggaGATCTATACTTGGATAATTTATAGTTATAAATCTGTAACTTTTAGatggaaatacaatttaaatCTCATAGAAAATGTAAGCTCTGG i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78434560 139 - 92142175 TTATATTTTGGTATTTGTATTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAAAAGGAGATCTATACTTGGATAATTTATAGTTATAAATCTGTAACTTTTAGATGGAAATACAATTTAAATCTCATGGAAAATGTAAGCTCTGG i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10882408 139 - 159171411 TTCTATTTTGGTATTTGTTTTCATTTTCTCAAGTAAAGCTATTTTAAAAAGTGATCTATACTTGGACAATTTATAATTATAAATCTGTAACCATTAGATGAAAATACAATTTAAATCTCTTAGAAAACATGAGCTTTGG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5390338 85 + 51628933 ---TATTTTGATATTTG------CTTTCTCCAGTAAAGCTATTTTAAAAAGTGTTC---------------------------TCTGTAATTGTTAG---------------AAATCT---ATAAAATGCATGCTCTGA i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82307858 353 - 117095149 I a score=4511254.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 1263 1426 + 478999 AATTTGATCTATAT---ATTAATTTTATGTGGT-GAC---AGAATACATAA-TTTTTAAGA--AGTACTATAATGTGACATGGCTAA-CCATATTTGGAAATAATACCTGAGAAGTTATA--AAAATAGTTGCATTATAGCATCCAATCCAGAATTaactaaaccaaataggagcactggcggttacaaagagaaacttctgttcaataaag--agagattgttccaac-atttagattagcctataatggaacaggttatcAGAAATGTTCATTTTTATTGTAGAAAGCATtatacatacacacacatatacccata-----acatGTATGATTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTTTAATT-GTAGAGGTACACCA-----TAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTCCAAGGTTGTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTAATCATTTGTTGTTGTT-TTGGT--GGAGTGA-TGGGGAGGGTGGCAGGCAATG---ATTAGTTCAGAGACTCAGTATCAAAGTGTAG------CATAGCAACAATTGATTCAAAAGAAGGCCAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAATCTTGCTCAGTAATTGACAGAAAGGAGCTTGCTTTCTT-------CACCTGGATGTGAAGGTCTATAGCACTAATTCTCTCTGgcagccttgtgacctcaaacagtatcagctttagc-----ataaaatcaacactgtagctggtacagcagagatatagataaaacctgggtctctgatgacattattgagactcagataacccagccctgaaacACAACTTA--TGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACC-TCCCTGTCCTGTTTTAATGCTTGAGACgctcccttgcctactggtttccagttgagtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattagcaagaaattaagggacagaaagaaaatgaagttgggtatacattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactatactcctttct-------tgaagaccacagtcccatcaggcac-ccttcttct-atagctacaataactttctctttgggttatgctaaacacttattcccctcatctcttcaaatcttcccaagct--ccc-------tgctttcaactttttgaatacccttgcattaaactcttctcaaaaacctaggttgagtacgccatctgtttcctgccaagaatataactgataTGCCATCTAACACTAGACTTT--GTTACA----TTAGTATATTTTCTTAATGTTTAAGATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAATCAAAAATATCCTATTGA-------ATATACTGGATAACCTCTAAGTTTTCCACAAGATCATATTTTGGCAAAACAAAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTTTCATGGAACAGTAAAATTGTTATTAAT-AAAAGGCCTCGCA----------------------------------------------------TAT------------------------------- s panTro4.chr13 80368990 1444 - 115123233 AATTTGATCTATAT---ATTACTTTCATGTGGT-GGC---AGAATACATAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTGACATGGCTAA-CCATATTTGGAAATAATATCTGAGAAGTTATA--CAAATAGTTGCGTTATAGCATCCActccagaattaactaaaccaaataggagcactagcggttacaaagagaaacttctattcaataaag--agagattgttccaac-atttagattagcccataatagaacaggttatcAGAAATGTTCATTTTTATTGTAGAAAGCATAATATACACACACACATATACATATA-----ATGTGTATGAGTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATTA-----TAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTCCAAGGTTGTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAT-CAGATTAATCATGTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGG-AGGGGAGGGTGGCAGGCAATG---ATCAGCTCAGAGATTCAGTATCAAAGTTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGGTTCAAAGGTAGGCTAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAATCTTGCTCAGTAATTGACAGAAATGAGCTCGCTTTCTT-------CACCTGGATGTGAAGGTCTATAGCGCCAATTCTCTCTGgcagccttgtgacctcaaagagtatcagctttagc-----ataaaatcaacactgtagctggtacagcagagatatagataaaacctgggtctctgatgacattattgagacttagataacccagccctgaaacACAACTTA-CTGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACCTTCCCTGTCCTATTTTTATGCTTGGGATgctcccttgcctactggtttccagttgggtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattagcaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaagttgggtatatattttccagattttaccccttcag-----tacacttaacactatactcctttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttctcctaatagctacaataactttctctttgggttatgctaaacacttatttccctcatctcttcaaatcttgccaagct--ccc-------ttcttacaactttttaaatacccttgcattaaagtcttctcaaaaacctaggttgagtatgccatctgttccctgccaagaatataactgataTGCCATCTAACACTAGACTTTCAGTTACATCAGTTAGTATATTTTCCTAATGTTTAAGATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAATCAAAAATATCCTATTGA-------ATATGCTGGATAACCTCTAAGTTTCCCACAAGATCACATTTTGGCAAAACAGAACAAAAACAC----------CTAAAAATTTTTTCGTGGAACAGTAAAATTGTTATTAATAAAAAGGCCTCTCA----------------------------------------------------TAT------------------------------- i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82308211 1424 - 117095149 AATTTGATCTATAT---ATTACTTTCATGTGGTGGGC---AGAATACATAATTTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTGACATGGCTAACCCATATTTGAAAATAATATCTGAGAAGTTATA--AAAATAGTTGCATTATA----------TAGAATTAACTAAAACAAACAGGAGCACTAGCGGTTACAAAGAGAAACTTCTATTCAATAAAG--AGAGATTGTTCCAAT-ATTTAGATTAGCCCATAACAGAACAGGTTATCAGAAATGTTCATTTTTATTGTAGAAAGCATTATACACACACACACATATA--TATA-----ATGTGTATGAGTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATTA-----TAGTATAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTCCAAGGTTGTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTAATCATGTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGG-AGGGGACGGTGGCAGGCAATG---ATCAGCTCAGAGACTCAGTATCAAAGTTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGGTTCAAAGGTAGGCTAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAATCTTGCTCAGTAATTGACAGAAAGGAGCTCGCTTTCTT-------CACCTGGATGTGAAGGTCTATAGCACCAGTTCTCTCTGGCAG--------CCTCAAACAGTATCAGCTTTAGC-----ATaaaatcaacactgtagctggtacagcagagatatagataaaacctgggtctctgatgacattattgagactcagataacccaacgctgaaacACAACTTAACTGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACCTTACCTGTCCTATTTTCATTCTTGGGATgctctcttgcctactggtttccagttgggtttgactaa--------------------------------------tt---gacattagcaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaagttgggtatgtattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactatactcctttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttttcctaatagctacaataactttctctttgggttatgctaaacacttatttccttcatctcttcaaatcttgccaagct--ccc-------tgcttacaactttttaaatacccttgcattaaagtcttctcaaaaacctaggttgagtatgccatctgtttcctgccaaaaatataactgataTGCCATCTAACACTAGACTTTCAGTTACATTAGTTAGTATATTTTCCTAATGTTTAAGATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAGTCAAAAATATCCTATTGA-------ATATGCTGGATAACCTCTAAGTTTTCCACAAGATCATATTTTGGCAAAACAGAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTTTCGTGGAACAGTAGAATTGTTTTTAATAAAAAGGCCTCTCA----------------------------------------------------TAT------------------------------- i ponAbe2.chr13 I 353 C 0 s nomLeu3.chr9 4319110 1442 + 118206036 AATTTGATCTATGT---ATTACTTTCATGTGGT-GGC---AGAATACATAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTGACATGGCTAA-CCATATTTGGAAATAATATCTGAGAAGTTATA--AAAATAGTTGCGTTATAGCATCCActccagaattaactaaaccaaataggagcactagcggttacaaagagaaacttctattcaataaag--agagattgttccaac-atttagattagcccataatggaacaggttatcAGAAATGTTCATTTTTATTGTAGAAGGCATTATATATACACACACATATACATATA-----ATGTGTATGAGTATCT----------------ATTCAATAAATTGTATAAAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATCA-----TAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTCCAAGGTTGTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTAATCATGTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGACAGGGGAGGGTGGCAGGCAATG---ATTAGCTCAGAGACTCAGTATCAAAGTTTAGCATTCTCATTGCAACAACTGGTTCAAAGGTAGGCTAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAATCTTGCTCAGTAATTGACAGAAAGGAGCTCGCTTTCTT-------CACCTGGATGTGAAGGTCTATAGCGCCAATTCTCTCTGgcagccttgtgacctcaaacagtatcagctttagc-----ataaaatcaacactgtagctggtacagcagagatatagataaaatctgggtctctgatgacattattgagacccagataacccagccctgaaacACAACTTA-CTGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTCCGCTGCC----TTTCCAACCTTCCCTGTCCTATTTTCATGCTTGGGATgctcccttgcctactggtttccagttgggtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattagcaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaagttgaccatatattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactatactcctttct-------tgaagaccacact----tcaggtac-ccttttcctaatagctacagtaactttctctttgggttatgctaaacacttatttccctcatctcttcaaatcttgccaagctccccc-------tgcttacaactttttaaatgcccttgcattaaagtcttctcaaaaacctaggttgagtatgccatctgtttcctgccaagaatataactgataGGCCATCTAACACTAGACTTTCAGTTACATTAGTTAGTATATTTTCTTAATGTTTAAGACACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAATCAAAAATATCCTATTGA-------ATATGCTGGATAATCTCTAAGTTTTCCACAAGATCATATTTTGGCAAAACAGAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTCTCGTGGAACAGTAAAATTGTTATTAATAAAAAGGCTTCTCA----------------------------------------------------TAT------------------------------- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80144506 1451 - 94676912 AATTTGATCCATAT---ATTACTTTTATGTGGT-GGC---AGAACACACAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTAATATGGCAAA-TCATATTTAGAAATAATATCTGAGAAGTTATA---AAATTGCTGCATTATAGCATCCActccagaattaactaaaccaaataggagcactggaggttacaaagagaaacttctattcaataaag--agagattgttccaac-atttagattagcccataacggaacaggttatcAGAAACGTTCATTTTTATTGTAGAAACCATTATACATACACACACATATACATATA-----ATGTGAATGAGTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-GTAAAGGTACATCATAAAGTAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTTCAAGGTTTTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTATTCATTTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGATAAGGGAGGGTAGCAAGCAATG---ATTAGCTCAGAGACTCGGTATCAAA-TTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGGTTCAATGGTAGGCCAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAAACTTGCTCAGCAATTGACAGGAAGGAGCGCACTTTCTT-------TACCTGGATGTGAAGGCATACAGCACCAATTCT-TCTGGCAGCATTGTGACCTCAAACAGTATCGGCTTTAGC-----ATaaaatcaacactgtagctggtacagtagagatacagacaaaacctgggtctctgatgacattattgagacccagataacccagccctgaaaGACAGCTTA-CTGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACATTCCCTGTCCTATTCTCATGCTTGGGATgctctattgcctactggtttctagttgggtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattaccaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaatttgggtatatattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactgtactcctttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttctcctaacagctacaacaactttctctttgggttatactaaacacttatttccctcatctcttcaaatcttgccaagct--ccc-------tgtttacaactttttaaatacccttgcattaaactcttctcaaaaacgtaggttgagtatgccatctgtttcttgccaagaatataactaacaAGCCATCTAATACTAGACTTTCAGTTACATTAGTTAGTATATTTTCTTAATGTTTAAGATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAATCAAAAATATCCTATTGAATCACTGAT-CACTGGATAACCTCTAAGTTTTCCGTAAGATCATATTTTGGCAAAACAAAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTTT-GTGGAACAGtaaaatttttattaataaaaaGGCCTCTCA----------------------------------------------------CAT------------------------------- i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82293077 1444 - 96864807 AATTTGATCCATAT---ATTACTTTTATGTGGT-GGC---AGAACACACAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTAATATGGCAAA-TCATATTTAGAAATAATATCTGAGAAGTTATA---AAATTGCTGCATTATAGCATCCACTCCAGAATTaactaaaccaaataggagcactggaggttacaaagagaaacttctattcaataaag--agagattgttccaac-atttagattagcccataacggaacaggttatcAGAAACGTTCATTTTTATTGTAGAAACCATTATACATACACACACATATACATATA-----ATGTGAATGAGTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATCATAAAGTAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTTCAAGGTTTTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTATTCATTTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGATAAGGGAGGGTAGCAAGCAATG---ATTAGCTCAGAGACTCGGTATCAAA-TTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGGTTCAATGGTAGGCCAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAAACTTGCTCAGCAATTGACAGGAAGGAGCGCACTTTCTT-------TACCTGGATGTGAAGGCATACAGCACCAATTCT-TCTGGCAGCATTGTGACCTCAAACAGTATCGGCTTTAGC-----ATaaaatcaacactgtagctggtacagtagagatacagacaaaacctgggtctctgatgacattattgagacccagataacccagccctgaaaGACAGCTTA-CTGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACATTCCCTGTCCTATTCTCATGCTTGGGATgctctattgcctactggtttctagttgggtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattaccaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaatttgggtatatattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactatactcctttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttctcctaatagctacaacaactttctctttgggttatactaaacacttatttccctcatctcttcaaatcttgccaagct--ccc-------tgtttacaactttttaaatacccttgcattaaactcttctcaaaaacgtaggttgagtatgccatctgtttcttgccaagaatataactaacaAGCCATCTAATActagactttcagttacattagttagtatattttcttaatgtttaagatactttgaatcaaattttc-tactaaccacaatcaaaaatatcctaTTGA-------AT-CACTGGATAACCTCTAAGTTTTCCGTAAGATCATATTTTGGCAAAACAAAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTTT-GTGGAACAGTAAAATTTTTATTAATAAAAAGGCCTCTCA----------------------------------------------------CAT------------------------------- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76966167 1442 - 90913898 AATTTGATCCATAT---ATTACTTTTATGTGGT-GGC---AGAACACACAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTAATATGGCAAA-CCATATTTAGAAACAATATCTGAGAAGTTATA---AAATTGCTGCATTATAGTATCCACTCCAGAATTAACTAAACCAAATAGGAGCACTGGAGGTTACAAAGAGAAACTTCTATTCAATAAAG--AGAGATTGTTCCAAC-ATTTAGATTAGCCCATAACGGAACAGGTTATCAGAAACgttcatttttattgtagaaaccattatacatacacacacatatacatata-----atgtgaatgagtatat----------------attcaataaattgtgtaaAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATCATAAAGTAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTTCAAGGTTTTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATtattcatttgttgttgtt-ttggtaggGAGTGATAAGGGAGGGTAGTAAGTAATG---ATTAGCTCAGAGACTCGGTATCAAAGTTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGATTCAATGGTAGGCCAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAAACTTGCT---CAATTGACAGAAAGGAGCTCACTTTCTT-------TACCTGGATGTGAAGGCATACAGCACCAATTCTCTCTGGCAGCATTGTGACCTCAAACAGTATCGGCTTTAGC-----ATAAAATCAACACTGTAGCTGGTACAGTAGAGATACAGACAAAACCTGGGTCTCTGATGACATTATTGAGACCCAGATAACCCAGCCCTGAAAGACAGTTTA-CTG-TTGCCGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACATTCCCTGTCCTATTCTCATGCTTGGGATGCTCTATTGCCTACTGGTTTCTAGTTGGGTTTGACTAA--------------------------------------TTGAAGACATTACCAAGAAAttaaaggacagaaagaaaatgaatttgggtatatattttccagattttACCCCTTCAG-----TACACTT-ACACTATACTCCTTTCT-------TGAAGACCACACTCCCATCAAGTAC-CCTTCTCCTAATAGCCACAACAACTTTCTCTTTGGGTTATACTAAACACTTATTTCCCTCATCTCTTCAAATCTTGCCAAGCT--CCC-------TGTTTACAACTTTTTAAATACCCTTGCATTAAACTCTTCTCAAAAACGTAGGTTGAGTATGCCATCTGTTTCTTGCCAAGAATATAACTGACAAGCCATCTAATACTAGACTTTCAGTTACATTCGttagtatattttcttaatgtttaagATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACAATCAAAAATATCCTATTGA-------AT-CACTGGATAACCTCTAAGTTTTCCATAAGATCATAttttggcaaaacaaaacaaaaacac----------cttaaaatttttt-gtggaacagtaaaatttttattaataaaaaggcCTCTCA----------------------------------------------------CAT------------------------------- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78434699 1446 - 92142175 AATTTGATCCATAT---ATTACTTTTATGTGGT-GGC---AGAACACACAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTAATATGGCAAA-CCATATTTAGAAATAATATCTGAGAAGTTATA---AAATTGCTGCATTATAGCATCCACTCCAGAATTAACTAAACCAAATAGGAGCACTGGAGGTTACAAAGAGAAACTTTTATTTAATAAAG--AGAGATTGTTCCAAT-ATTTAGATTAGCCCATAACGGAACAGGTTAACAGAAACGTTCATTTTTATTGTAGAAACCATTATACATACACACACATATACATATA-----ATGTGAATGAGTATAT----------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-GTAGAGGTACATCATAAAGTAGTCTAT------TATCCATTCTGCTCCTCCCAGGACTTCAAGGTTTTGCTCCAAATAGCCTAATCCAAC-CAGATTAATCATTTGTTGTTGTT-TTGGTAGGGAGTGATAAGGGAGGGTAGCAAGCAATG---ATTAGCTCAGAGACTTGGTATCAAAATTTAGCATTCTCATAGCAACAACTGGTTCAATGGTAGGCCAGCCAAGCTCTAAGCTAACCAATCAAATTGGAGAGAAGAAACTTGCTCAGTAATTGACAGAAAGGAGCTCACTTTCTT-------TACCTGGATGTGAAGGCATACAGCACCAATTCTCTCTGGCAGCATTGTGACCTCAAACAGTATCAGCTTTAGC-----ATaaaatcaacactgtagctggtacagtagagacacagacaaaacctgggtgtctgatgacattattgagacccagataacccagccctgaaaGACAGCTTA-CCGTTTGCTGCTTTTCCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAACATTCCCTGTCCTATTCTCATGCTTGGGATgctctattgcctactggtttctagttgggtttgactaa--------------------------------------ttgaagacattaccaagaaattaaaggacagaaagaaaatgaatttgggtatatattttccagattttaccccttcag-----tacactt-acactatactcctttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttctcctaatagctacaataactttctctttgggttatactaaacacttatttccctcatctcttcaaatcttgccaagct--ccc-------tgtttacaattttttaaatacccttgcgttaaactcttctcaaaaacgtaggttgagtatgccatctgtttcttgccaagaatataactgacaAGCCAGCTAATActagactttcagttacattagttagtatattttcttaatgtttaagatactttgaatcaaattttc-tactaaccacaatcaaaaatatcctaTTGA-------AT-CACTGGATAACCTCTAAGCTTTCCATAAGATCATATTTTGGCAAAACAAAACAAAAACAC----------CTTAAAATTTTTT-GTGGAACAGTAAAATTTTTATTAATAAAAAGGCCTCTCA----------------------------------------------------CAT------------------------------- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10882547 1473 - 159171411 AATTTAATCTATAT---ACTACTTTTCTGTGGT-GAC---AGGCTACATAA-TTTTTAAGA--AGTACTAT-ATGTGATATGACTAA-CCATATTTGGAAATAATATCTGAGAAGTTACA-AAAAACAGTTACATTATAGCATACACTCCAGAATTAACTCAACCAAATAGGAGCACTGGAAATTACAAAAAGAAAC-----TTCAGTAAAG--ACAGATTCTTCCAACAATTTAGATTAGCCCATAATGGAACAGGTTATCACAAATATTCATTTTTATTGCAGAAACCATTATACATACACACACATATACATATA-----ACATGTATGATTATATA---------------ATTCAATAAATTGTGTAAAACTATTGTAATT-ATAGAGGTACATTATAAAGTTGTCCAT------TATCCATTCTGCTCCTCTCAGGACTCTTAGGTTGTACTCCAAATAGCCTAATCCAAC-AATATTAATCATTTGTTGTTGTT-TTGGT--GGAGTGATAAGGGA-GGTGGCAGACAATGATTATTATTTCAGAGACTCAGTATCAAAGTTTAGGATCCTCACAGAAACAGTTGGTTCAAAGGTAGGCCAGCTGAGACCTAAGCTAACCAATCAAAATGGAGAGAAGAATCTTGTTCAGTAATTGACAGAAAGGAGCTCTCTTTCTT-------CACCTGGATATGAAGGTCTACAGCACCACTTCTCCCTGGAAGCCTTGTGACCTCAAACAGTATCAACTTTCGC-----ATAAAATCAACACTGTAGCTGGTACGGCAGAGATAGGAATAAAACCTGGATCTCTGATGACATTACTGAGACCCAGATAACCCAA---------ACAATTTA-CTGTTTGCTGCCTTACCAACCTTTTGCTGCC----TTTCCAAACCTCCCTGTTCTATTTCCATGCTTGGGATGTTCCCTTGCTTCCTAGTTTCCAG-TGGGTTTGACTAACCCACTGGAAATGGGGTTAGTCCAATTCCAGGAGTAACCTggagacattagctagaaattaaaggacagaaagaaaatgaagttgggtatatatttcccagattttacccctccag-----taaactt-acactatactcttttct-------tgaagaccacactcccatcaggtac-ccttcccct-atagctacaataactttcccttaaggttacgttaaacacttattcccttcatctcttcaaatcttgccaggct--ctc-------tgcttacaacttttcaaatacccttgcattaaactattctcaataaactaggttcagagtgccatctgtttcctgccaagaatataactgataTGCCATCTAACACTAGACTTTCAGATACATTTGTTAGTACATTTTCTTAAGGTTTAAGATACTTTGAATCAAATTTTC-TACTAACCACA-CAAAAAATATCCTATTGA-------ATACACTGGATAACCACTCAGTTTTCCAGAATATCATATTTTGGCAAAACAAAAC-AAAACAC----------CTTAAAATTTTTCCATAGAACAGTGAAATTGTTATTATTTAAAAGGCCTCTCA---------------------------------------------------TTAT------------------------------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5390423 1566 + 51628933 AATTTAAACTTTATGACATTACTTTTATGTAAT-GACTATATAAGATATAA-TCTGTACGATGAATGCTAT-ATGAATTGTGATGGA-ACATATTTGGAAACAGAATTTCAGAAGCTAGGAAAAAACAATTATATTTTAATGTCCACTCCAGAAGTAACTAAATCAAACTCGAGCAATTGATGTTATA---AGAAGTTGCTATTCAGTAAAAACAGAGGTCTTTCCCAC-ATTTAGAACAGGCCACAATGGAATAGACCACCAGTAATGTTCTTTTTTATTGCAGAAACCATTCtatctatatctatatctatatctatatctatatctatatctatatctataGATAACATATTATTAAGTAAATTATGGGAAATTAATTTAATTAGTAGAGGTGCATTGTAAAGTAGTTGATCATCAACATCCATTTCACTCCTTCCAAGATACCAAAACTGAGCAACAAATGGCCTAATCCAATATGAATCACTTATGTGTTGCTACTGTTGCTGTTGCTTGG---GTGAGACAGGTACACAGTG---ATT---------------CATCAAA-------ATATTCATGGCAATAAATAATTCAAA-GTAG----GTCAAGACTTAACCGGAGCAATCAAATTGGAGGGAAGGATGTTTTTCAA-AAGTGGGAGAAAGAAGTTTTTCTGCCTACGCCCCCACCTGGATGTGAAAGTCTAATGCACTAAGGTGACCTGGCAATCTTCT--TCTGAAAAGACAGTAGCTATAGCAGCAAATAAAATCATGAA-ATATGtggcagaggaggcatacagaaaaaccctgggtccttgatgacataattgagacccagacaaccaaaccctaaagcccaacttt-atggacA-TGTTTTATCAGCC--ACACTgatctagtccccagccttccccatcctatttctgagcttgggaggctcctttggctactagcttaccactgggtttggctag---------------------------------------tgaagacaccagtaggaaattaaaggacaggaagaaaacgaagttggggAGG-----CCCTGGCTTTACCCCTTCAGGCCAACAGACtt-ttttttttttttttttttttttACTAAAGATAACTCT-CTATCAGGTACAACTTCTCCT-AGAACTACAATAACTTTCTTTTTGAGTTATGATAAACACTCACTTCTCTCACCTCTGCAAActttgctgattt--cccttaaaaatgctcacaactctttaaagaactttgcgttaaactctttacaataaccaggtttgggcatgatgtctgtttcccgccaggaatatgactgataAGCCACCTGTCACTAGACTTCCAGTTACATTAGTAAGCATATTTCCTAAATGTTTGAACCACTTTGACTCAATTTTTTAAAATAACAACACCCAAAAA-----TACTGA-------ATACCCGAGAAAACCTCCATATCCTTC--AAACTCATATTTTGGCAAAATAAAACAAACAAACAAAAAAGGATCTCAAAAGTTGTTCATAAAATAGTTTAAATGACATGAATAAAGAAACCTCTTACTAggggtgcctcggtggttcagttggttgggtgattgcctttggctcaggtcatgatctcaggatcctgggatcgagccccatgt i canFam3.chr25 C 0 I 130 a score=932904.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 2689 310 + 478999 ACTATCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATATAAAAGCTAAGTGGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATTAAGTTAA----GAAATTAAAAAATCAAACTTCTATTACCTATACTATTAATACTAACCTGGCCACTGATTATTTAAAAATAACACAATATGAGCATTCCTCTGAGAAAGGT-AAAAAAGTTACTGTTTCTTAGGTAATCAGACAAGCATGCAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactatttactgagcccagca--ctgtgctaggtgctgaagatataac-aataaggggagacaaaa s panTro4.chr13 80370434 308 - 115123233 ACTATCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATATAAAAGCTAAGTGGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATT-AGTTAA----GAAATTAAAAAATGAAACTTCTATTACCTATACTATTAATACTAACCTTGCCAGTGATTATTTAAAAATAACAAAATGTGAGCACTCCTCCAAGAAAGGT-AAAAAAGTTACTCTTTG-CAGGTAATCAGACAAGCATACAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaaccatttactgagctaagca--ctgttctaggtgctgaagatacagc-aataaggggagacaaaa i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82309635 308 - 117095149 ACTATCTTCCTAAG----------ATATCTTACATGACAAGGAGATACAAAAGCTAAGTGGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATT-AGTTAA----GAAATTAAAAAATGAAACTTCTATTACCTATACTATTAATACTAACCTTGCCAGTGATTATTTAAAAATAACACAACGTGAGCATTCCTCCAAGAAAGGT-AAAAAAGTTACTCTTTG-TAGGTAATCAGACAAGCATGCAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactatttaccgagctaagca--ctgttctaggtgctgaagatatagc-aatacggggagacaaaa i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4320552 307 + 118206036 ACTATCTTCCTAAG----------ATATCTTCTGTGACGAGGAGATATACAAGCTAAGTGGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATT-AGTTAA----GAAATTAAAAAATGAAACTTCTATTACCTATACTATTAATACCACCCTTGCCAGTGATTATTTAAAAATAACACAATGTGAGCATTCCTCCAAGAAAGGT-AAAAAAGTTACTCTTTT-TAGGTAATCAGACAAGCATGTAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactatttactgaactaagca--ctgttctaggtgctgaagatatagc-aataaggggagacaaa- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80145957 303 - 94676912 ACTCTCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATACAAAAGCTAAGTTGCAGTTAACCAGTAACCTGT------ATTAA----GCAATTAAAAAATGAAAATTCTATTA-CTATACTATTAATACTAACCTTGCCACTGATTATTTAAAAACAACACAATGTGAGCATTTCTCTAAGAAAGGT-AAAAGAGTTACTCTTTCTTAGGTAATCAGACAAGCATGCAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactatttactgagccaagca--ctgttctaggtgctgaagatatcac-aataaggggagacaaaa i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82294521 308 - 96864807 ACTCTCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATACAAAAGCTAAGTTGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATC-AGTTAA----GCAATTAAAAAATGAAAATTCTATTA-CTATACTATTAATACTAACCTTGCCACTGATTATTTAAAAACAACACAATGTGAGCATTTCTCTAAGAAAGGT-AAAAGAGTTACTCTTTCTTAGGTAATCAGACAAGCATGCAAGGACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactatttactgagccaagca--ctgttctaggtgctgaagatatcac-aataaggggagacaaaa i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76967609 308 - 90913898 ACTCTCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATACAAAAGCTAAGTTGCAGTTAACCAGGAACCTGTTATC-AGTtaa----gcaattaaaaaatgaaaattctatta-CTATACTATTAATACTAACCTTGCCactgattatttaaaaacaatacaatgtGAGCATTTCTCTAAGAAAGGT-AAAAGAGTTACTCTTTCTTAGGTAATCAGACAAGCATGCAAGGACTTTTCATA----TACTcaattcaacaactatttactgagccaagca--ctgttctaggtgctgaagATATAAC-AATAAGGGgagacaaaa i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78436145 306 - 92142175 ACTCTCTTCCTAAG----------ATATCTTCTATGACAAGGAGATACAAAAGCTAAGTTGCAGTTAACCAGTAACCTGTTATC-AGTTAA----GCAATTAAAAAATGAAAATCCTATTA-CTATACTATTAATACTAACCTTGCGACTGATTATTTAAAAACACCACAATGTGAGCATTTCTCTAAGAAAGGT-AAAAGAGTTACTCTTTCTTAGGTAATCAGACAACCATGCAAGGACTTTTCATA----Tattcaattcaacaactatttactgagccaagca--ctgttctaggtgctgaagatataac-aataaggggagaaaa-- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10884020 305 - 159171411 ACTATCTTCCTTAA----------ATATCTTCTATGACAAGAAGAT--AAAAGCTAAGTGACAGTTAACCAGTAACCTGTTATT-AGTTAA----TAAATT-AAAAATGAAACTTCTATTGCCTATACTATTAATACTAACGTGGC-ACTGATTATTTCAAAATAACACAATGTGAGTATTCCTCTGAGAAAGACAAAAAAAGTTACTCTTTC-TTGGTAATCAGACAAGCATGCAAGTACTTTTCATA----TACTCAattcaacaactactttctgagtcaaatg--ccattctaggtgctgaagacataag-aataaggggagagaaaa i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5392119 293 + 51628933 ACTACCTTCCTTGATAACTAAGTTATACCTTCTAAAACAAGGAGAT---AAAGTTAAGTAACACTTAACCATTAACTTGTTATT-AGTTGATGATAAAAT--AAAAATGGAACCTTTAATATCTATCCTGTTTA------CCCAGCAACTGA-TATTCAAAAATAAAACAGTGTTAAAATTCATCTGAGAAGGTG-AAAA-------------------------ACAAGCATGCAAATGCTTTCACTAATTCAATTAAatccaacaaatatttattgaggtgggcattcttttttgggtgctgaagatacagcaaataagtgagaacaaaa i canFam3.chr25 I 130 C 0 a score=1365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 2999 1 + 478999 a s ponAbe2.chr13 82309943 1 - 117095149 a i ponAbe2.chr13 C 0 I 3347 s nomLeu3.chr9 4320859 1 + 118206036 a i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80146260 1 - 94676912 a i rheMac3.chr17 C 0 I 5 s chlSab2.chr3 78436451 1 - 92142175 a i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10884325 1 - 159171411 a i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e papAnu2.chr17 76967917 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82294829 0 - 96864807 C e panTro4.chr13 80370742 0 - 115123233 C a score=592.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3000 10 + 478999 aaatatatac s nomLeu3.chr9 4320860 10 + 118206036 atatatatac i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78436452 10 - 92142175 atatatatac i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10884326 1 - 159171411 --------a- i calJac3.chr5 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e papAnu2.chr17 76967917 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82294829 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80146261 5 - 94676912 I e panTro4.chr13 80370742 0 - 115123233 C a score=91.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3010 1 + 478999 a s nomLeu3.chr9 4320870 1 + 118206036 a i nomLeu3.chr9 C 0 I 3279 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78436462 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76967917 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82294829 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80146261 5 - 94676912 I e panTro4.chr13 80370742 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10884327 0 - 159171411 C a score=3211.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3011 47 + 478999 tacatatacacatacatatatatatatatacacatacatatatatat s calJac3.chr5 10884327 42 - 159171411 -----acacacatacatatatatatatatatatatatatatatatat i calJac3.chr5 C 0 I 3299 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78436462 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76967917 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82294829 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80146261 5 - 94676912 I e panTro4.chr13 80370742 0 - 115123233 C e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3058 90 + 478999 atatatacacatacatatatatatatatacacacatacatatatatatatatatatatatatatatatatacacacacacatacatatat e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78436462 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76967917 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82294829 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80146261 5 - 94676912 I e panTro4.chr13 80370742 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=2431.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3148 6 + 478999 atatgt s panTro4.chr13 80370742 6 - 115123233 atatat i panTro4.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82294829 6 - 96864807 atatac i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76967917 6 - 90913898 atatac i papAnu2.chr17 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392412 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78436462 0 - 92142175 C e rheMac3.chr17 80146261 5 - 94676912 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=4389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3154 4 + 478999 atat s panTro4.chr13 80370748 4 - 115123233 atac i panTro4.chr13 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80146266 4 - 94676912 atac i rheMac3.chr17 I 5 C 0 s macFas5.chr17 82294835 4 - 96864807 atac i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76967923 4 - 90913898 atat i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5392412 4 + 51628933 atat i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e chlSab2.chr3 78436462 0 - 92142175 C e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=684023.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3158 485 + 478999 atTgcccctgctttca------tgaagcctacattctagcaggaggaggcagaaaattggtaaaaaatataaaacacgccagaatggtgctgtaaaattagcagagtaggt--aaacactgatggttatggaagggatactaatttatttagaatgattggagaatatttctgtgataaggcatcatacaagcaaaatcctgaatgaagcatagaatcaaattc--tgtgagtatctgaagaaaaagtgatggaaacaatgggggaagtaaatgcaaaagtcct----tgggtaaattcttatcatt---ttagttcttaagggaaaggcaaaaagacctttgcctaa-------------aacagagaaagcaagag-agtgg----ggagagatgatgt--gaggtgtaaGGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGATGAAGACTTGAATAAGATTTGGCACATTTTAGGACAACTAGTCTAACTGCAAGTGAAAAACGGACTGTAGgtaaccaatggtga s panTro4.chr13 80370752 469 - 115123233 attgcccctgctttca------taaagcctacattctagcagaaggaggcagaaaattagtaaaaaatataaaacatgccagaatggtgctgcaaaattagcagcataggt--aaacactgatggttatggaaggaatactaatttatttagaatgatcggagaatatttctgtgataaggcatcatataagcaaaatcctgaatgaagcatagaatcaaagtc--tgtgagtatctgaagaaagagtgatggaaacaattggggaagtaaatgcaaaagtcct----tgggtaaatgtttaccatt---ttagttcttaaggaaaaggcaaaaagacctttgcctaa-------------aatagagaaagcaagaa---------------------gt--gagGTATAAGGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGACGAAGACTTGAATAAGATTTGGCACATTTTAGGATAACTAGTCTAACTGCAAGTGAAAAATGGattgtaggtaaccaatggtga i panTro4.chr13 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80146270 488 - 94676912 attgcccctgctttca------tgaatcctacattctagcaggaggaggcagaaaattagtaaaaaatataaaacatgccagaatggtgctacacaattagcagggtacat--aaacactgatggttatggaaggaatactaatttatttagaatgatcagagaatatttctgtgataaggcatcatataagcaaaatcctgaatgaagcatacaaccatattc--tgtgagcatctgaagaaagggtgatggaaacaatgggggaagtaaatgcaaaagtcct----tgggtaaatgcttaccattttattagtttctaaggaaaaggcaaaaagacc-ttgcctaa-------------aaccgagaaagcaagaagagtgg----gaagagatgatgt--gaggtaTAAAGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGATGAAGACTTGAATAAGATTGGGCACATTTTAGGACAACTAGTCTAACTGCAAGTGAAAAACTGACTGTAGgtaaccaatggtaa i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82294839 488 - 96864807 attgcccctgctttca------tgaatcctacattctagcaggaggaggcagaaaattagtaaaaaatataaaacatgccagaatggtgctacacaattagcagggtacat--aaacactgatggttatggaaggaatactaatttatttagaatgatcagagaatatttctgtgataaggcatcatataagcaaaatcctgaatgaagcatacaaccatattc--tgtgagcatctgaagaaagggtgatggaaacaatgggggaagtaaatgcaaaagtcct----tgggtaaatgcttaccattttattagtttctaaggaaaaggcaaaaagacc-ttgcctaa-------------aaccgagaaagcaagaagagtgg----gaagagatgatgt--gaggtaTAAAGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGATGAAGACTTGAATAAGATTGGGCACATTTTAGGACAACTAGTCTAACTGCAAGTGAAAAACTGACTGTAGgtaaccaatggtaa i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76967927 470 - 90913898 attgccCCTGCTTTCA------TGAATCCTACATTCTAGCAGAAGGAGGCAGAAaattagtaaaaaatataaaacatgccAGAATGGTGCTACACAATTAGCAGGGTACAT--AAACACTGATGGTTATGGAAGGAATACTAATTTAGTTAGAATGATCAGAGAATATTTCTGTGATAAGGCATCATATAAGCAAAATCCTGAATGAAGCATACAACCAAATTC--TGTGAGTATCTGAAGAAAGAGTGACGGAAACAATGGGGGAAGTAAATGCAAAAGTCCT----TGGGTAAATGCTTACCATTTTATTAGTTTCtaaggaaaaggcaaaaatacC-TTGCCTAA-------------AACCGAGAAAGCAAGAAGAGTCG----GAAGAGATGATGT--GAGGTATAAAGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGATGAAGACTTGAATAAGATTGGGCACATTTTAGGACAACTAGTCTAACTGCAAGTGAAA------------------AATGGTAA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78436462 488 - 92142175 attgcccctgctttca------tgaatcctacattctagcagaaggaggcagaaaattagtcaaaaatataaaacatgccagaatggtgctacacaattagcagggtacgt--aaacactgatggttatggaaggaatactaatttatttagaatgatcagagaatatttctgtgataaggcatcatataagcaaaatcctgaatgaagcatacaaccaaattc--tgtgggtatctgaagaaagagtgatggaaacaatgggggaagtaaatgcaaaagtcct----tgggtaaatgcttaccattttattagtttctaaggaaaaggcaaaaagacc-ttgcctaa-------------aaccgagaaagcaagaagagtgg----gaagagatgatgt--gaggtaTAAAGCTTATGACTTCATTATGAGAAGGATGAAGACTTGAATAAGATTGGGCACATTTTAGGACAACTAGTCTAACTTCAAGTGAAAAATTGactgtaggaaaccaatggtaa i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5392416 475 + 51628933 actgtccctgctttcatgaagctgaagcttatattctagtgaaaagaggcagaaaaataagtaaaaaaagaa-----gtcaaaattatgctgtaaaa----aatggtagattgagatagtgatggttatagaaggggtact-ttgtattcagagtgatacgtaaagacttctctgataaggtatc--acaagtgaaatcctaagtgaagtgtagaatttcaatccatatggatatct------------------acaa----------aaatgcaaaagtcctcagatggattcatacttgccact---ttagtttttaggaaaaaggcaaagaggcctttacatgggcagtgtatgtccaacagagaaagtaagaaggaggatgataaagagatgaaatcagaggtaagagaattgggaatttactctgcaaatgatgtagc----agtaaggtctgatacattttaggaagactagtgtgactccaagtgggaAACAGATTGTGGATAACCAATAGTTA i canFam3.chr25 C 0 I 318 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=620807.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 3643 489 + 478999 aggatgatcatggtttgaactaaaatggtatcaacggacatagtaaggagttgagaaataatgaggaagtagtaattgattctggatatgttctgagagtaaaacaacataatttcctgagagtttggatctagagtgcaacaaaagtagagtcaaaaacaattaactttttggtttcaactacttgttgaatggtaatgccactaaataagacaaacaactctgaaggatgaaaaatttgagagaaaaatcagtttggataatttagtcaagaagattactagaaatccaagtggaactaaaaataggagaaacaattgagggtaattagtatttacaggatcacgggagctgtagaagtggataatctcaattagagtaaggtactgtgtagatggaaaagtgaaatgctttccaggattaatcactgggaaagaagagtcatcagagtttataaagatgaaggagaactaatgagagagaataagt s panTro4.chr13 80371221 486 - 115123233 aggatgatcatggtttgaactaagatgatatcaactgacatggtaaggagttgagaagtaaagaggaagtagtaattgattctggatacattttgacagtaagacaacataatttcct--gagtttggatctagagtgcaaaaaaagtagagtcaaaaagaattaactttttggtttcaactacttgttgaatggtaatgccactaaataagataaagaactctgaaggatgaaaaa-ttaagagaaaaatcagtttggataatttagtcaagaagattaccagaaatccaagtggaactaaaaataggagatacaattgagagtaattagtatttacaagatcatggaagctgtagaagtggataatctcaattagagtaaggtactgtgtagatggaaaagtgaaacgctttccaggattaatcactgggacagaacagtcatcagaatttagaaagatgaagcagaactaatgagagagaataagt i panTro4.chr13 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80146758 480 - 94676912 aggatgatcatggtttgaactaagatgatatcaacggacatggtaaggaattgagaagta---aggaagtagtaattgattctggatatgttttgacagtaagacaacataatttcctgagagtttggatctagagtgcaaaaaaagtagagtcaaaaagaattaactttttggtttcaactacttgttgaatggtaatgccactaaataagataaagaactctgaaggatgaaacg--tgtgagaaaaataagtttggataatttagtc---aagattactagaaatccaagtggaactaaaagtaggagaaacaactgag-gcaattagtatttacaggatcatggaagctgcagaagtagataatctcaattagagtaaggtactgtgtagatggaaaagtgaaacgctttccaggattaatcactgggacagaacagtcatcagaacttagaaagatgaagcagaactaatgagagagaataagt i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82295327 483 - 96864807 aggatgatcatggtttgaactaagatgatatcaacggacatggtaaggaattgagaagta---aggaagtagtaattgattctggatatgttttgacagtaagacaacataatttcctgagagtttggatctagagtgcaaaaaaagtagagtcaaaaagaattaactttttggtttcaactacttgttgaatggtaatgccactaaataagataaagaactctgaaggatgaaacg--tgtgagaaaaataagtttggataatttagtcaagaagattactagaaatccaagtggaactaaaagtaggAGAAACAACTGAG-GCAATTAGTATTTACAGGATCATGGAAGCTGCAGAAGTAGATAATCTCAATTAGAGTAAGGTACTgtgtagatggaaaagtgaaacgctttccaggattaatcactgggacagaacagtcatcagaacttagaaagatgaagcagaactaatgagagagaataagt i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76968397 483 - 90913898 AGGATGATCATGGTTTGAACTAAGATGATATCAACGGACATGGTAAGGAATTGAGAAGTA---AGGAAGTAGTAATTGATTCTGGATATGTTTTGACAGTAAGACAACATAATTTCCTGAGAGTTTGGATCTAGAGTGCaaaaaaaGTAGAGTCAAAAAGAATTAACTTTTTGGTTTCAACTACTTGTTGAATGGTAATGCCACTAAATAAGATAAAGAACTCTGAAGGATGAAACG--TGTGAGAAAAATAAGTTTGGATAATTTAGTCAAGAAGATTACTAGAAATCCAAGTGGAACCAAAAGTAGGAGAAACAACTGAG-GCAATTAGTATTTACAGGATCATGGAAGCTGCAGAAGTAGATAATCTCAATTAGAGTAAGGTACTGTGTAGATGGAAAAGTGAAACGCTTTCCAGGATTAATCACTGGGACAGAACAGTCATCAGAATTTAGAAAGATGAAGCAGAACTAATGAGACAgaataagt i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78436950 479 - 92142175 aggatgatcatggtttgaactaagatgatatcaacggacatggtaaggaattgagaagta---aggaagtagtaattgattctggatatgttttgacagtaagataacataatttcctgagagtttggatctagagtgcaaaaaaagtagagtcaaaaagaattaactttttggtttcaactacttgttgaatggtaatgccactaaataagataaagaactctgaaggatgaaacg--tgtgagaaaaataagtttggataatttagtcaagaagattactagaaatccaagtggaactaaaagtaggAGAAACAAGTGAG-GCAATTAGTATTTACAGGATCATGGAAGCTGCAGAAGTAGATAATCTCAATTAGAGTAAGGTACTgtgtagatggaaaagtgaaacgctttccaggattaatcactgggacagaacagtcatcagaatttagaaagatgaagcagaactaacg----agaataagt i chlSab2.chr3 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e canFam3.chr25 5392891 318 + 51628933 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=624742.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 4132 416 + 478999 aagagaaaaacaaagcaaaccatggc-aaaacacaatgcaagaaagcatttcaagaaggaaagactgttc-aaccgaaatattcacaggtcgaataagataaggactgagaaataatcacaggacagactgtgaaggccactggtgacaaagacatgagccatctgaaaggacatggaagaacgaaagacaggttggaataggaatagatttaggagtaagtgagTGtccaggaatataaggaaggtttaaaatctgaaaaataatcaatgtaattcac-----taagaaaaatg-agaaacatcatactcatctcaaatactgcagaaaagatgtttgataaaat------cctgtttataataaagaaaactcttagaaaaatagaaatagataa-ttccttaatttaactaaaaaatctacaaaaact s panTro4.chr13 80371707 421 - 115123233 aagaaaaaaa-aaagcaagccatcac-aaaacacaatgcaagaaagcatttcaagaaggaaagaatgttc-aactgaaatattcacaggtcaaataagataagaactgagaaataatcacaggacagattatgaaggccactggtgacaaagacatgagccatcttaaaggacatgtaagaatgaaaaccaggttggaataggagtagatttaggagtaaacgagagtccaggaatataaggaaggtttaaaatctggaaaataatccatgtaattgactaaattaagaaaaatgaagaaacatcttaatcatctcaaatactgcagaaaagatgttatataaaat------cctgtttataataaagaaaactcttaggaaaccagaaatagataa-ttccttaatttaactaaaaaatccacacaaagt i panTro4.chr13 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80147238 422 - 94676912 aagaaaaaaagaaagaaagccatcac-aaaacacaaaacaataaagtatttcaagaaggaaagaatgttc-aactgaaatattcacaggccaaataagataaggactgagaaataatcacaggacagattatgaaggccactggtgataaagacatgagccatcttaaagggcatgtaagaatgaaagccaggttggaatacgagtagattcaggagtaaacgagagtccaggaatacaaggaaggtttaaaatctgaaaaataatcaatgtaattcactaaactaagaaaaatgaagagaaattataatcatctcaaatactgcagaaaaggtgtttgataaaat------cctgtttataataaagaaaactcttagcaaactagaaataggtaa-ttccttaatttaactaaaaaatctacaaaaagt i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82295810 422 - 96864807 aagaaaaaaagaaagaaagccatcac-aaaacacaatacaataaagtatttcaagaaggaaagaatgttc-aactgaaatattcacaggccaaataagataaggactgagaaataatcacaggacagattatgaaggccactggtgataaagacatgagccatcttaaagggcatgtaagaatgaaagccaggttggaatacgagtagatttaggagtaaacgagagtccaggaatacaaggaaggtttaaaatctgaaaaataatcaatgtaattcactaaactaagaaaaatgaagagaaattataatcatctcaaatactgcagaaaaggtgtttgataaaat------cctgtttataataaagaaaactcttagcaaactagaaataggtaa-ttccttaatttaactaaaaaatctacaaaaagt i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76968880 422 - 90913898 aagaaaaaaagaaagaaagccatcaa-aaaacacaatacaataaagtatttcaagaaggaaagaatgttC-AACTGAAATATTCACAGGCCAAATAAGATAAGGACTGAGAAATAATCACAGGACAGATTATGAAGGCCACTGGTGATAAAGACATGAGCCATCTTAAAGGGCATGTAAGAATGAAAGCCAGGTTGGAATACGAGTAGATTTAGGAGTAAACGAGAGTCCAGGAATACAAGGAAggtttaaaatctgaaaaataatcaatgtaattcactaaactaagaaaaatgaagagaaatcatAATCATCTCAAATACTGCAGAAAAGGTGTTTGATAAAAT------CCTGTTTATAATCAAgaaaactcttagcaaactagaaataggTAA-TTCCTTAATTTAActaaaaaatctacaaaaagt i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78437429 422 - 92142175 aagaaaaaaagaaagaaagccatcac-aaaacacaatacaataaagtatttcaagaaggaaagaatgttc-aactgaaatattcacaggccaaataagataaggactgagaaataatcacaggacagattatgaaggccactggtgataaagacataagccatcttaaagggcatgtaagaatgaaagccaggttggaagacgagaagatttaggagtaaacgagagtccaggaatacaaggaaggtttaaaatctgaaaaataatcaatgtaattcactaaactaagaaaaatgaagagaaatcataatcatctcaaatactgcagaaaaggtgtttgataaaat------cctgtttataataaagaaaactcttagcaaactagaaataggtaa-ttccttaatttaactaaaaattctacaaaaagt i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5393209 414 + 51628933 aaattaaaaaaaaagaatgctgtcacaaaaatacaactgaagaaagcatttcaacaaggaaggactttgagaactgaaatgttaataggtcgaataagatgaaaactgagaacc--ttaagatgtagaatatgaagactactggtgacattggcatgagccattttaaggaa-----------aaaagactgactgtaataggAACGGATCTAAAactaaataggattccaggaatatgaggatggtttaacatatgaaaatcaattaatgtagttcagtaag--aaaaaaactgaagaaac-tcgtaattatcacaaataatgcaaaaaag-catttgatcaaattcagcacccgtttatgataaagaaaactctaagcaaacttatagtagacagtttttttaatatgatttaaaaatctaatgaaagt i canFam3.chr25 I 318 I 167 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=365228.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 4548 253 + 478999 -------------aat-tattaaaa--------------atatcatacttagtggctaattattaacagcattgcccatgagatcaggaataagacagggatggccactatcacaacttttatt-caacactgtactggcagtctttaggtggcataacaaggcaaggaaaaaaataaaaaaataaatattagaaagg-aaaaaacaaaact-atcattctccgatgttattattgtctacaa--aattttttttg-aaaaaatctacaaatgactagatttaatag s panTro4.chr13 80372128 248 - 115123233 -------------aatctattaaaa--------------atatcatacttagtg--taattattaaaagcattgcccatgagatcaggaataagacagggatggccactatcacaacttttattccaacactgtactggcactttttaggtggcataacaaggcaaggaaa-----aaaaacctaaa-attagaaaggaaaaaaacaaaact-atcattctccaatgttattattgtctacaa--aaatttttcca-aaaaaatctacaaatgactagatttaatag i panTro4.chr13 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80147660 254 - 94676912 -------------aatctattaaaa--------------atatcatacttactggctaattattaaaagcattgcccatgagatcaggaataagacagggatggccactatgacaacttttatt-caacactgtgctggcagtttttaggtggcataacaagggaaggaaaaaaataaaaaactaaacattagaaag--aaaaaacaaaactaatcattctccaatgttgttattgtctacaa--aaatttttctg-aaaaaatctacaaatgactagatttaatag i rheMac3.chr17 C 0 I 1699 s macFas5.chr17 82296232 254 - 96864807 -------------aatctattaaaa--------------atatcatacttactggctaattattaaaagcattgcccatgagatcaggaataagacagggatggccactatgacaacttttatt-caacactgtgctggcagtttttaggtggcataacaagggaaggaaaaaaataaaaaactaaacattagaaag--aaaaaacaaaactaatcattctccaatgttgttattgtctacaa--aaatttttctg-aaaaaatctacaaatgactagatttaatag i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76969302 254 - 90913898 -------------aatctattaaaa--------------atatcatACTTACTGGCTAATTATTAAAAGCATTGCCCAtgagatcaggaataagacaggGATGGCCACTATGACAACTTTTATT-CAACACTGCGCTGGCAGTTTTTAGGTGGCATaacaagggaaggaaaaaaat-aaaaactaaacattagaaag-aaaaaaacaaaactaatcatTCTCCAATGTTGTTATTGTCTAcaa--aaatttttctg-aaaaaatctACAAATGACTAGATTTAATAG i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78437851 256 - 92142175 -------------aatctattaaaa--------------atatcatacttactggctaattattaaaagcattgcccatgagatcaggaataagacagggatggccactatgacaacttttatt-caacattgtgctggcagtttttaggtggcataacaagggaaggaaaaaaataaaaaactaaacattagaaagaaaaaaaacaaaact-atcattctccaatgttgttattgtctacaa--aaatttttctgaaaaaaatctacaaatgactagatttaatag i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5393790 277 + 51628933 aatcgttaaaaaaaatctactgaaagtaatctacagcatataccatacacagtggctaattattgaaagctttgcacatgagatctggaataagacagggatgctcactattacaacttttgtt-cagcaccattctggaagtctt--agtgcaatatcaagg---ggaaaagacataaaaaataaatactggaaagg-aaaaaataaaatt-gcatttcttagatgatgagattttctacaaagaaatgtatctg--aaaaattaacaaactactagaaataacag i canFam3.chr25 I 167 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=402409.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 4801 405 + 478999 aggaatagaaagattggtatataaaagttcaacataaatatcaattataattctatgtaccagtaacaaattaaaaatcaaaacttttaattgcttcttggccttttgggtaagatcaagtgcaaagaattaaaattttaagggcatcaaataatatcaaatatctgcaaataaatccatcaaaaagacagaaactgttctatacagaaaactacagaagaaaatctaaattaataaaagaatataccaagtatatgacttgaaagattcaatataggaaagatgtcaatataatacaataaaaatcctcatgttttttggtggaagttgataagctg----acatatatggaaatgcaaagactcagaaatggccaaggcaatcgtcaagaacaacagtaaagctaga s panTro4.chr13 80372376 404 - 115123233 aggaacagaaagactggtatataaaagttcaacataaatatcaattataattctatgtaccagtaac-----aaaaatcaaaacttttaattgcttcttggccttttgggtaagatcaagtgtaaaatattaaaattttaagggcatcaaataatatcaaatacctgtaaataaatccatcaaaaagacagaaactgttccatacagaaaagtacaaaagaaaatctcaattaataaaagaatataccaagtatataacctgaaagattcaatataggaaagatgtcaatataatacgataaaaatcctcatgttttttggtggaagttgataagctgatatatatatatggaaatgcaaagacccaaaaacagccaaggcaatcttcaagaacaacagtaaagctaga i panTro4.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82296486 405 - 96864807 aggaatagaaagactggtatataaaagttcaaagtaaacatcaattataattctatgtaccactaacaaattaaaaatcaaaaattttaattgcttcttggccttttgggtaagatcaagtgtaaaaaattaaaattttaagggcatcaaataatattaagtatctggaaataaatccatcaaaaagacagaaactgttccatagagaaaagtacaaaagaaaatctcaattaataaaagaacatatcaagtatatgacctgaaagattcaatataggaaagatgtcaatataatacaataaaaatcctcatgttttttggtggaagttagtaagctg----atatatatggaaatgcaaagacccaaaaacagtcaaggcagtcttcaagaacaacagtaaagctaga i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76969556 400 - 90913898 AGGAATAGAAAGACTGGTATATAAAAGTTCAATGTAAACATCAATTATAATTCTATGTACCactaac-----aaaaatcaaaaattttaattgcttcttggccttttgggtaagatcaagtgtaaaaaattaaaattttaagggCATCAAATAATATTAAGTATCTGGAAATAAATCCATCAAAAAGACATAAACTGTTTCATAGAGAGAAGTACAAAAGAAAATCTCAATTAATAAAAGAACATATCAAGTATATGACCTGAAAGATTCAATATAGGAAAGATGtcaatataatacaataaaaatcctCATGTTTTTTGGTGGAAGTTAGTAAGCTG----atatatatggaaatgcaaagaccCAAAAACAGTCAAGGCAGTCTTCAAGAACAACAGTAAAGTTAGA i papAnu2.chr17 C 0 I 1460 s chlSab2.chr3 78438107 405 - 92142175 aggaatagaaagactggtatataaaagttcaatgtaatcatcaattataattctatgtaccagtaacaaatcaaaaatcaaaaattttaattgcttcttggccttttgggtaagatcaagtgtaaaaaattaaaattttaagggcatcaaataatattaagtatctggaaataaatccatcaaaaagacagaaactgttccatagagaaaagtacaaaagaaaatctcaattaataaaagaacatatcaagtatatgacctgaaagtttcaatataggaaagatgtcaatataatacaataaaaatcctcatgtttcttggtggaagttggtaagctg----atatatacggaaatggaaagaaccaaaaacagtcaaggcagtcttcaagaacaacagtaaagctaga i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5394067 317 + 51628933 aagaatagcaatgctggtacataaaaggtcaaaataaatgccaattatatttctatgt-----------------------------------------------------------------aaaaaactaacatttgaaa----------aacctcaagtatctagaaataaatctagcaa------agaaagttttctacatagaaaattaccaaag-agacctaagtaaatagagggatacactaaatgcatgaattggagggttcaatat---aaagatatcaatataacacaatgaaaatccttgcattttctggtggaaattgacaagctg----atagatatactaatgcaaaaactcaaagatagccaaagcaatctt---gaaaaacaataaacctaga i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e rheMac3.chr17 80147914 1699 - 94676912 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=23904.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5206 39 + 478999 tgacatactcttaaatatcaggctgcactaaaaagctat s panTro4.chr13 80372780 39 - 115123233 tgacatactcttaaatatcaggccgtactaaaaagctat i panTro4.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82296891 39 - 96864807 tgacatactcttaaatatcaggccatactaaaaagctat i macFas5.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78438512 39 - 92142175 tgacatactcttaaatatcaggccatactaaaaagctat i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5394384 29 + 51628933 tgac----------atatcaaaatatactaaaaatgcat i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e papAnu2.chr17 76969956 1460 - 90913898 I e rheMac3.chr17 80147914 1699 - 94676912 I e calJac3.chr5 10884369 3299 - 159171411 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=14066.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5245 13 + 478999 acaaattaaaata s panTro4.chr13 80372819 13 - 115123233 acaaattaaaatc i panTro4.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82296930 13 - 96864807 acaaattaaaata i macFas5.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78438551 13 - 92142175 acaaattaaaata i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10887668 13 - 159171411 acaaacaaaaatg i calJac3.chr5 I 3299 I 9 s canFam3.chr25 5394413 13 + 51628933 acaaattaagata i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e papAnu2.chr17 76969956 1460 - 90913898 I e rheMac3.chr17 80147914 1699 - 94676912 I e nomLeu3.chr9 4320871 3279 + 118206036 I a score=3705.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5258 4 + 478999 ctgt s panTro4.chr13 80372832 4 - 115123233 ctgt i panTro4.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4324150 4 + 118206036 ctaa i nomLeu3.chr9 I 3279 C 0 s macFas5.chr17 82296943 4 - 96864807 ctgt i macFas5.chr17 C 0 I 1146 s papAnu2.chr17 76971416 4 - 90913898 ctaa i papAnu2.chr17 I 1460 C 0 s chlSab2.chr3 78438564 4 - 92142175 ctgt i chlSab2.chr3 C 0 I 1165 s calJac3.chr5 10887690 4 - 159171411 ctaa i calJac3.chr5 I 9 C 0 s canFam3.chr25 5394426 4 + 51628933 gtga i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82309944 3347 - 117095149 I e rheMac3.chr17 80147914 1699 - 94676912 I a score=8595.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5262 2 + 478999 tg s panTro4.chr13 80372836 2 - 115123233 tg i panTro4.chr13 C 0 I 1268 s ponAbe2.chr13 82313291 2 - 117095149 tg i ponAbe2.chr13 I 3347 C 0 s nomLeu3.chr9 4324154 2 + 118206036 tg i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80149613 2 - 94676912 tg i rheMac3.chr17 I 1699 C 0 s macFas5.chr17 82298093 2 - 96864807 tg i macFas5.chr17 I 1146 C 0 s papAnu2.chr17 76971420 2 - 90913898 tg i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78439733 2 - 92142175 tg i chlSab2.chr3 I 1165 C 0 s calJac3.chr5 10887694 2 - 159171411 tg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5394430 2 + 51628933 tg i canFam3.chr25 C 0 I 1397 a score=81263.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5264 31 + 478999 gaatattacttagcaataaaaaggaatgaaa s ponAbe2.chr13 82313293 31 - 117095149 gaatattatttagctataaaaaagaacgaag i ponAbe2.chr13 C 0 I 4 s nomLeu3.chr9 4324156 31 + 118206036 gaatattatttagctataaaaaagaacgaaa i nomLeu3.chr9 C 0 I 4 s rheMac3.chr17 80149615 31 - 94676912 gaatattatttagctataaaaaagaatgaag i rheMac3.chr17 C 0 I 4 s macFas5.chr17 82298095 31 - 96864807 gaatattatttagctataaaaaagaatgaag i macFas5.chr17 C 0 I 4 s papAnu2.chr17 76971422 31 - 90913898 gaatattatttagctataaaaaagaatgaag i papAnu2.chr17 C 0 I 4 s chlSab2.chr3 78439735 31 - 92142175 gaatattatttagctataaaaaagaatgaag i chlSab2.chr3 C 0 I 4 s calJac3.chr5 10887696 31 - 159171411 aaatattatttcgcctaaaaaaagaacaaaa i calJac3.chr5 C 0 I 4 s canFam3.chr25 5395829 31 + 51628933 gaatactatccagccatgaaaaggaataaag i canFam3.chr25 I 1397 I 4 e panTro4.chr13 80372838 1268 - 115123233 I a score=1230415.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5295 387 + 478999 aaaatatgctataacatggatgcacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccacttacatgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaagtgaattatggattgactaggggtgggaatcatgaagagatatagggaaaattggtaaaggaaatgaataacaa--------agaagataaaatattcattttccataattatatatgaaaatgtctaatcttattcaaaatctaggaaaagtgcaaattaaaaccacaatgaaataatattttgcatccactaaattgacaTTATAATAT--GAAATATTAA------------------------CATACATTTTT-ATTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTAATTAT s panTro4.chr13 80374106 384 - 115123233 aaaatatgctataacatggatgcacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatctcacttatgtgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaagtgaattatgggttgactaggggtgggaatcatgaagagacatagggaatactggtaaaggaaatgaataacaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaatcttattagaaatctaggaaaagtgcaaattaaaaccacaatgaaata---ttttgcatccactaaattgacattataatatttgaaatattaa------------------------catg--ttTTT-ATTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTACTTAT i panTro4.chr13 I 1268 C 0 s ponAbe2.chr13 82313328 389 - 117095149 aaaatatgctataacatggatgcacac-tgaaaacattatgctaagcaaaagggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccacttatgtgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaagtgaattatgggttgactaggggtgggAATCATGAAGAGACATAGGGAATATTGGTAAAGCAAATGAATAACAA--------AGAAGATAAAAGATTAATTTTCTACAATTatatatgaaaatgtctaatcttattcgaaatctaggaaaagttcaaattaaaactacaatgaaataatattttgcatccactaaattgacattataatatttgaaatattaa------------------------caTACGTTTTT-ATTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTAATTAT i ponAbe2.chr13 I 4 C 0 s nomLeu3.chr9 4324191 386 + 118206036 aaaatatgctataacatggatgcacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatctcacttacatgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaagtgaattacgggttgactaggggtgggAATCATGAAGAGACATAGggaaaattggtaaaggaaatgaataacaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaatcttacttgaaatctaggaaaagtgcaaattaaaaccacaatgaaataatattttgcatccagtaaattgacatt---atatttgaaatattaa------------------------caTACATTTTT-ATTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTAATTAT i nomLeu3.chr9 I 4 C 0 s rheMac3.chr17 80149650 387 - 94676912 aaaatatgctataacatggatacacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccacttccgtgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaaatgaattatgggttgactcagggCGGGAATCATGA--TGACAGAGggaaaattggtaaaggaaatgaataccaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaattttattcaaaatctaggaaaactgcaaattaaaaccacaatgaaagagtattttgcatccactaaattgacattataagatttgaaatattaa------------------------CATACATTTTT-ACTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTAACTAT i rheMac3.chr17 I 4 C 0 s macFas5.chr17 82298130 387 - 96864807 aaaatatgctataacatggatacacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccacttccgtgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaaatgaattatgggttgactcagggCGGGAATCATGA--TGACAGAGggaaaattggtaaaggaaatgaataccaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaattttattcaaaatctaggaaaactgcaaattaaaaccacaatgaaagagtattttgcatccactaaattgacattataagatttgaaatattaa------------------------CATACATTTTT-ACTTGA-----AGGCTTTTACAAATATTTCTAACTAT i macFas5.chr17 I 4 C 0 s papAnu2.chr17 76971457 387 - 90913898 aaaatatgctataacatggatacacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccACTTCCgtgaaatatttagaataagCAATTCATAAAGCCA-----AAAAATGAATTATGGGTTGACTCAGGGCGGGAATCATGA--TGACAGAGGGAAAATCGGTAAAGGAAATGAAtaccaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaattttattcaaaatctaggaaaactgcaaattaaaaccacaatgaaagaGTATTTTGCATCCACTAAATTGACATTATAAGATTTGAAATATTAA------------------------CATACATTTTT-ACTTGA-----AggcttttacaaatatttctaaCTAT i papAnu2.chr17 I 4 C 0 s chlSab2.chr3 78439770 387 - 92142175 aaaatatgctataacatggatacacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccaaatacaaaaagacaaatattgtatgatcccacttccatgaaatatttagaataagcaattcataaagcca-----aaaaatgaattatgggttgactcagggTGGCAATCATGA--TGACAGAGggaaaattggtaaaggaaatgaataccaa--------agaagataaaagattaattttctataattatatatgaaaatgtctaattttattcaaaatctaggaaaactgcaaattaaaaccacaatgaaacagtattttgcatccactaaattgacattataagatttgaaatattaa------------------------catacattttt-atttga-----aggctTTTACAAATATTTCTAACTAT i chlSab2.chr3 I 4 C 0 s calJac3.chr5 10887731 387 - 159171411 aaactatgctataacatgaatacacac-tgaaaacattatgctaagcaaaatggaccagaaacagaaagacaaatattatataattccatttacatgaaatattcagaataagcaattcataaag-ca-----aaaactgaattatggcttgactaggggTGGAAATCATGAAAAGACATAGggaaaattgataaagaaaatgaataacaa--------agaagataaaagattaattttcaataattatatatgaaaatgtctaatctgattcaaaatctaggaaaagtgcaaattaaaactacaatgaaatat--ttttgcatccactaaattgacaTTATAATATTTGAATTCTTAA------------------------TGTATATTTTCAATTTGA-----AGGCTTGTATAAATATTTCTAATTAT i calJac3.chr5 I 4 C 0 s canFam3.chr25 5395864 415 + 51628933 gatagatgctacagcatggatgaaatcttgtaaatattatggtacgtgaa----acaagatacaaaaaaacaaatattatatgatctcacttatatgaaatacctagaata-------cataaaatcagagtcaaaagtagattatagattgcctaggagtaggggTCTTGAAAGGAAATCGGGCaaactggctaaggacatggataattactccgttcaaaagagaaagtgtggatgtgctatgaatacatatg--tatgtccaatgttattcaaattttccaaaaa-tgcaaatgaaagccaaaatgatatctcattttatgcc---taAGGTGACAATAGAATTTTAAGGATATTAATTCTGAGTGAAAGGAAAAACTGAGTATGTCTTTTT-ATTTGACTTACAATCTTTTCAATGAATTTCTAATTCT i canFam3.chr25 I 4 I 136 a score=1169072.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 5682 376 + 478999 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATGTTTAATTTAGGATT-TTCTGATACATTCTCAAGTAAACAAATG-AAAGCA---CATTTAAAGGGGTAAGTCCTCACAGAAATCCTGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATAAAATTCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTCTT-AATACTCTAGATACAGAAAAAGAGTATT--------------------CTCTTATTTTAAAAAATAAACCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAATAATGTTAT-GGAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGCTACCAATGATCAAT---CTTAACAATCTACCACTCTTCAATGCTTAATCCTTAAGGAAAGGTCAGCACTAGTTTCAAAG s panTro4.chr13 80374490 380 - 115123233 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATATTTACTTTAGAATT-TTCTGATACATTCTCA-TCAAACAAATG-AAAGCAAATTATTTAATGGGGTAAGTCCTCACAGAAATCCTGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATCAAATTCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAAATATT--ATACTCTAGATACAGAAAAAGAGTATT--------------------CTGTCATTTAAAAAAATAAGCCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAATAATGTTAT-GGAAAAAATCATCTTAATAAAGAAATGCTACCAATGATCAATCTACTTAACAATCTACCACTTTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTGTTTCAAAG i panTro4.chr13 C 0 I 25 s ponAbe2.chr13 82313717 377 - 117095149 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATATTTACTTTAGAATT-TTCTGATACATTCTCA-TTAAACAAATG-AAAAAT---TATTTAACGGGGTAAGTCCTCACAGAAATCCTGTC-ACACAGA---GTAACCTCACAAAGGCATTTCATATGTTATCAAATTCAAGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATACGCTAGATACAGAAAAAGAGTATT--------------------CTATCATTTAAAAAAATAAGCCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAATAATCTTAT-GGAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGCTACCAATGATCAATTTACTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTAATTCAAAG i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4324577 379 + 118206036 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATGTTTACTTTAGAATT-TTCTGATACATTCTCA-GTAAACAAATG-AAAGCA---TATTGAAAGGGGTAAGTCCTCACAGAAATCCTGTC-ACATCTGCCTGTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATCAAATGCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATACTCTAGATACAGAAAAAGAGTATT--------------------CTATCATTTAAAAAAA-AAGCCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAATAACGTTAT-GGAAAAAATCATCTGAATAAAGAAATGCTACCAATGATCAATCTGCTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTGTTTCAAAG i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80150037 376 - 94676912 AAGCTAAGTTTGAA--GTAAAAGAATGTTTACTTTATAATT-TTCTGATACATTCTCA-GTAAACAAACG-AAAGCA---TATTTAAAGGGGTAAGTCTTCACAGAAATCCTGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATGTGTTATCAAAATCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATAAACTTTTTATAGAAAAAGAGTAT---------------------CTATCATTTAAAAAAATAAGTCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAGTAACGTTAC-GGAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGTTGCCAGTGATCAATCTACTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTGTTTCAAAG i rheMac3.chr17 C 0 I 23 s macFas5.chr17 82298517 377 - 96864807 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATGTTTACTTTATAATT-TTCTGATACATTCTCA-GTAAACAAACG-AAAGCA---TATTTAAAGGGGTAAGTCTTCACAGAAATCCTGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATCAAAATCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATAAACTAGATATAGAAAAAGAGTATC--------------------CTATCATTTAAAAAAATAAGTCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAGTAACGTTAC-GGAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGCTGCCAGTGATCAATCTACTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTGTTTCAAAG i macFas5.chr17 C 0 I 5 s papAnu2.chr17 76971844 376 - 90913898 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAatgtttactttataatt-ttctgaTACATTctca-gtaaacaaaca-aaagca---tatTTAAAGGGGTAAGTCTTCACAGAAATCCTGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATC-AAATCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATAAACTAGATATAGAAAAAGAGcatt--------------------ctatcatttaaaaaagtaagtCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAGTAACGTTAT-GGAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGCTGCCAGTGATCGATCTACTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACacttgttttaaag i papAnu2.chr17 C 0 I 5 s chlSab2.chr3 78440157 378 - 92142175 AAGCTAAGTTTTAA--GTAAAAGAATGTTTACTTTATACTT-TTCTGATACATTCTCA-GTAAACAAACG-AAAGCA---TATTTATAGGGGTAAGTCTTCACAGAAATCCCGTC-ACACACA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCATATGTTATCAAAATCATGTTAAATGTAGCTTATCATACATCTTCTAAACAATTATT--ATAAACTAGATATAGAAAAAGAGTATT--------------------CTATCATTTAAAAAAATAAGTCAAAGAGCCTTAAGTTCTTAATAACGTTACAGAAAAAAATCATCTCAATAAAGAAATGCTGCCAATGATCAATCTACTTAACAATCTACCACTCTTCAATCATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAACACTTGTTTCAAAG i chlSab2.chr3 C 0 I 25 s calJac3.chr5 10888118 393 - 159171411 TTGCTAAGTTTTAA----AAACAAAAGCTTACTTTAGAATT-TTCTGATATATTCTCA-GTAAACAGATG-ATAGCA---TATTTAAA-GGGTGAGTCCTCACAAAAATCCTGTC-ACACCCA---GTAATCTTACAAAGGCATTTCA--TGTTATCAAATTCATGTTAACTATAGTTCATTATACATTTTCTAAACGATTCTT-AATACTCTAGATACAGAAAAAGAGtatttattattttaaaaagagtaactattatttaaaaaaataaGCCAAACAGCCTTAAGTTTTTAATAATGTTAC-TGAAAAAATTATCTCGATAAAGAAATGCTACCAATGATCAATCTACTTAACGATTTACCATTCTTCAATTATTAATCCTTAAAGAAAGGTCAGCACTTGTTTCAAAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5396415 364 + 51628933 AAGTTAAGCTTTAAGTGTAAAAGAATGCTCACTTTAGAATTATGCTGATCAAATCTCA-GCAAATAGATGAAAAGTA---TATTCAA-GGGGTAGTTCTTGTTAGTGATCTTATTAATACATA---GTAATAACACAAA-GCATTTCG--TAATATCTAATTCATGTAAAATGTAATTTCACATAAATCTTCTAAATGATACTTAAGTACTCTAGACATA-AAAAAAAGTTTT--------------------CCATGA---AACCAAACACATGAATGA------------TAATCTTGTTAC-TGAAAAAATTATTTCAATACAGAAATGCTGCCAATGATCAATCTATGTAATAACCTACCAGTCCTCAATCACCAATCCTTCAAAAAAGAAGAATCCTTGTTTCAAAG i canFam3.chr25 I 136 C 0 a score=2277.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6058 3 + 478999 ACa s ponAbe2.chr13 82314094 3 - 117095149 AAA i ponAbe2.chr13 C 0 I 16 s nomLeu3.chr9 4324956 3 + 118206036 AAA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82298899 3 - 96864807 ACA i macFas5.chr17 I 5 C 0 s papAnu2.chr17 76972225 3 - 90913898 aca i papAnu2.chr17 I 5 C 0 s calJac3.chr5 10888511 3 - 159171411 AAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5396779 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78440535 25 - 92142175 I e rheMac3.chr17 80150413 23 - 94676912 I e panTro4.chr13 80374870 25 - 115123233 I a score=3962.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6061 21 + 478999 t-attttttatatatataacat s nomLeu3.chr9 4324959 22 + 118206036 AGACATGTTATATACATAATAT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82298902 15 - 96864807 -----TGTTATATACAAAAT-- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972228 15 - 90913898 -----tgttgtatacaaaat-- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888514 22 - 159171411 AGACATGatatatatatagtat i calJac3.chr5 C 0 I 4 e ponAbe2.chr13 82314097 16 - 117095149 I e canFam3.chr25 5396779 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78440535 25 - 92142175 I e rheMac3.chr17 80150413 23 - 94676912 I e panTro4.chr13 80374870 25 - 115123233 I a score=-2423.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6082 6 + 478999 atatag s rheMac3.chr17 80150436 2 - 94676912 AC---- i rheMac3.chr17 I 23 C 0 s macFas5.chr17 82298917 2 - 96864807 AC---- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972243 2 - 90913898 at---- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888540 1 - 159171411 a----- i calJac3.chr5 I 4 C 0 e ponAbe2.chr13 82314097 16 - 117095149 I e canFam3.chr25 5396779 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78440535 25 - 92142175 I e panTro4.chr13 80374870 25 - 115123233 I e nomLeu3.chr9 4324981 0 + 118206036 C a score=28758.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6088 13 + 478999 gtataaagacatg s panTro4.chr13 80374895 13 - 115123233 GTATAAAGACATG i panTro4.chr13 I 25 C 0 s nomLeu3.chr9 4324981 13 + 118206036 GTATAAAGACATA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80150438 13 - 94676912 GTATAAAGACATG i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82298919 13 - 96864807 GTATAAAGACATG i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972245 13 - 90913898 gtataaagacatg i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440560 13 - 92142175 GTATAAAGACATG i chlSab2.chr3 I 25 C 0 s calJac3.chr5 10888541 8 - 159171411 -----aatacatg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5396779 10 + 51628933 ---CAAAAATAAG i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82314097 16 - 117095149 I a score=972821.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6101 319 + 478999 taatatataAAAtatagcatattttagaacttgactctttttgtgactaaataatattcaattgcatgtatatactacat-tttgtttgtccattaatcaactgataacatttCAAATGTAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTGCTTCAAAGTATCTTCTCAATTTTTTTCCAGAGG----AAATGTATGTTTATCC--CTTAGTTGAGATCTCACTTCTATTACTTTTCAAATAGTCTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATAGAGTTAACTAACTGATAAG---AGGTTTGAGAGTGCTAATAAAGGGCACAGGTATTTGTT- s panTro4.chr13 80374908 315 - 115123233 TAATATATAAAATATCgtatattttagaacttgattatttttgtgactaaac----ttcaattg-atgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaattgataatatttCAAATGTAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATTTTTTTCCAAAGG----AAA--TATGTTTATCC--CTTAGTTGAGATCTCACTTCTATTACTTCTCCAACAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATAGAGTTAACTAACTGATAAGAAAAGGTCAGAGAGTGCTAATAAAAGACATAGGTATTTGTT- i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82314113 320 - 117095149 TAATATGTAAAAtatagcatattttagaacttgattatttttgtgactaagtaatattcaattgcatgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaattgataacatttCAAATGTAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATTTTTTTCCAAAGG----AAA--TATGTTTATCC--CTTAGTTGAGATCTCACTTCTATTACTTCTCAAACAATTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATAGAGTTAACTAACTGATAAGAAAAGGTCAGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTGTT- i ponAbe2.chr13 I 16 C 0 s nomLeu3.chr9 4324994 316 + 118206036 ----TTATAAAAtatagcatattttagaacttgattatttttgtgactaaataatattcaattgcatgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaattgataacatttCAAATGTAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATCTTTTTCCAAAGG----AAA--TATCTTTATCC--CTTAGTTGAGGTCTCACTTCTATTACTTCTCAAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATAGAGTTAACTAACTGATAAGAAAAGGTATGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTGTT- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80150451 320 - 94676912 TAATATATAAAAtatagcatattttagaacttgattctttttgtgactgaataatattcaattgcatgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaactgataacatttCAAATGCAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATTTTTTTCCAAAGG----AAA--TATGTTTATCC--CTTAGTTAAGATCTCACTTCTATTACTTCTCAAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATGGAGTTAACTAACAGATAAGAAGAGGTCTGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTGTT- i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82298932 320 - 96864807 TAATATATAAAAtatagcatattttagaacttgattctttttgtgactaaataatattcaattgcatgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaattgataacatttCAAATGCAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATTTTTTTCCAAAGG----AAA--TATGTTTATCC--CTTAGTTAAGATCTCACTTCTATTACTTCTCAAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATGGAGTTAACTAACAGATAAGAAGAGGTCTGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTGTT- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972258 320 - 90913898 taatatataaaatatagcataTTTTAGAACTTGATTCTTTTTGTGactaaataatattcaattgcatgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaATTGATAACATTTCAAATGCAAAACAATTGGAGGTAAAATTAAAACTACTTCAAAatatcttctcaatttttttccaaagg----aaa--tatgtttatCC--CTTAGTTAAGATCTCACTTCTATTACTTCTCAAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATGGAGTTAACTAACAGATAAGAAGAGGTCTGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTgtt- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440573 320 - 92142175 TAATATATAAAAtatagcatattttagaacttgattctttttgtgactaagtaatattgaattgcacgtatataccacat-tttgtttatccattaatcaattgataacatttCAAATGCAAAACAATTGGAAGTAAAGTTAAAACTACTTCAAAATATCTTCTCAATTTTTTTCCAAAGG----AAA--TATGTTTATCC--CTTAGTTAAGATCTCACTTCTATTACTTCTCCAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTATGGAGTTAACTAACAGGTAAGAAGAGGTCTGAGAGTGCTAATAAAGGGCATAGGTATTTGTT- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888549 320 - 159171411 taatatataaaataaagcatattttgaaacttgattctttttgtaactaaat---gttcaattgcatatatataccacacatttgtttatccattaatcaattgattacacttCAAATGTAAAACAATTGGAGGTGAAATTAAGACTACCTCAAAATATCCTCTTAATTTTTTTCCAAAGG----GAATATATGTCTATAC--CTTAGTTGAGATTTCACCTCTACTACTTCTCAAATAGTTTCATTTTCAGAGCAGCTGAATATTAAAGATTTAACTAACTGATAAAAAGAGGTCTGAGAGTACTATTGAAGTGCATAGGTATCTGTT- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5396789 216 + 51628933 -----------------------------------------------------------------------------------------------------TTACAAGGATTTCAGAGGT-GAACAATCTGAGTTGAA---AAAACTGTTTCTAAAAGTCCCCTCAAAATTATTTCGAAAGGGAAAAA--TAAGTTTATTCCTCTTATTCGTGGACTCACCTCTATTATTTCTCATAGAGTTCTA-TTTCAGAGTAGCTGAATGTTA--GAGTTAACT----GATAAGAATAGGCTTGAGAGAGCTAATGAGGGTAACAGATACTTCCTT i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6420 1 + 478999 A s ponAbe2.chr13 82314433 1 - 117095149 A i ponAbe2.chr13 C 0 I 1 s rheMac3.chr17 80150771 1 - 94676912 A i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888869 1 - 159171411 A i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397005 1 + 51628933 A i canFam3.chr25 C 0 C 0 e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=-1107.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6421 1 + 478999 -T s rheMac3.chr17 80150772 1 - 94676912 -T i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888870 1 - 159171411 -T i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397006 1 + 51628933 G- i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=1126.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6422 7 + 478999 TAAAAAA s rheMac3.chr17 80150773 7 - 94676912 AAAAAAA i rheMac3.chr17 C 0 I 1 s canFam3.chr25 5397007 7 + 51628933 GAAAGAA i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10888871 0 - 159171411 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=336.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6429 8 + 478999 AACAGCAA s canFam3.chr25 5397014 8 + 51628933 AAAAGCCA i canFam3.chr25 C 0 I 94 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10888871 0 - 159171411 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6437 289 + 478999 CATGCTggctggacgcagtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggcggatcacgaggtccggagatcgagactatcctggctaacacggtgaaaccctgtttctactaaaaacacaaaaaaattagctgggcgtggtggcaggcgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccggaaggcggaggttgcatgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcccaggcgacagcgagactctgtct e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e canFam3.chr25 5397022 94 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10888871 0 - 159171411 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=399.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6726 33 + 478999 caaaaaaataaataaataaataaaaaataaaaa s canFam3.chr25 5397116 33 + 51628933 CAGAATTGTACAGCTATGACTAAAGCAAAGAAG i canFam3.chr25 I 94 C 0 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e chlSab2.chr3 78440893 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 76972578 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82299252 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I e panTro4.chr13 80375223 0 - 115123233 C e calJac3.chr5 10888871 0 - 159171411 C e nomLeu3.chr9 4325310 0 + 118206036 C a score=1179.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6759 1 + 478999 a s panTro4.chr13 80375223 1 - 115123233 A i panTro4.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4325310 1 + 118206036 A i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299252 1 - 96864807 A i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972578 1 - 90913898 a i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440893 1 - 92142175 A i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397149 1 + 51628933 G i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I e calJac3.chr5 10888871 0 - 159171411 C a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6760 1 + 478999 t s panTro4.chr13 80375224 1 - 115123233 T i panTro4.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4325311 1 + 118206036 T i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299253 1 - 96864807 T i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972579 1 - 90913898 t i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440894 1 - 92142175 T i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888871 1 - 159171411 T i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397150 1 + 51628933 T i canFam3.chr25 C 0 C 0 e ponAbe2.chr13 82314434 1 - 117095149 I e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I a score=9025.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6761 10 + 478999 aaaaaaAC--GC s panTro4.chr13 80375225 10 - 115123233 AAAAAAAC--GC i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82314435 10 - 117095149 AAAAAAAC--AC i ponAbe2.chr13 I 1 C 0 s nomLeu3.chr9 4325312 10 + 118206036 AAAAAAAT--GC i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299254 8 - 96864807 AAAAAAAT---- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972580 8 - 90913898 aaaaaaat---- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440895 10 - 92142175 AAAAAAACAT-- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888872 10 - 159171411 AAAAAAAC--AC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397151 7 + 51628933 aaaaaaa----- i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80150780 1 - 94676912 I a score=1035495.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 6771 350 + 478999 TTATTCATGAAATCTCACT--AATTTT-AAAGGAAATCACATGATACAACTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCAT------AAAAGCACAGCTGTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAAAACAACATAAATGACACAAAATAGGAAAATGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATACTATGTATAGATGAG--AAAAACTACTTTAAATAGTCATATATATTAAGAGTAGGG-AAAAAGAGCACAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAATAAAA--ATTTTGACCGCATAATTAAAAAATAACACAAAACCTAACAGGTAAATCCATGTATACTAAATATA----AAGATT s panTro4.chr13 80375235 357 - 115123233 TTATTCATGAAATCCCACTTTAATTTTCAAAGGAAATCACATAATACAACTAAACTCCTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCAT---CATAAAAGCACAGCTTTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAAAACAACATAAATGACACAAAATGGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGCGTAGATCAG--AAAAACTACTTTAAATA---ATATATATTAAGAGCAGGG-AAAAAGAGCACAAAATAATGTTTCTATTACCACAAAATAAAA--ATTTTGACTGCATAATTAAAAAATAACACAAAACTTAACAGGTAAATTCATGTATACTAAATATAGATTAAGATT i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82314445 352 - 117095149 TTATTCATGAAATCTCACTCTAATTTTCAAAGGAAATCACATGATACAACTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCAT---CGTAAAAGCACAGTTTTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAA---AACATAAATGACACAAAATGGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGTATAGATCAG--AAAAACTACTTTAAATA---ATACAAAATAAGAGCAGGG-AAAAAGAGCACAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAATGAAA--ATTTTGACCGCATGATTAAAAAATAACACAAAAC--AACAGGTAAATTCATGTATACCAAATATAGATTAAGATT i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4325322 360 + 118206036 TTATTCATGAAATCCCACTTTAATTTTTAAAGGAAATCACATGATACAACTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCATTATCATAAAAGCAGAGCTTTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAAAACAACATAGATGAAACAAAATGGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGTATAGATCAG--AAAAACTACTTTAAATA---ATACATATTAAGAGCAGGG-AAAAAGAGCATAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAATAAAA--ATTTTGACCGCATAATTAAAAAATAACACAAAACCTAACAGGTAAATCCATGTATACTAAACATAGATTAAGATT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80150781 356 - 94676912 TTATTCATGAAATCCCACTTTAACTTTTAAAGGAAATCAC--GATACAATTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCATTATCATAAAAGCACAGCTGTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAA---AACATAAATGACACAAAATAGGAAAAAGTAAACTCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGTATAGATCAG-AAAAAACTACTTTAAATA---ATATGTAATAAGAGCAGGG-AAAAAGAACACAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAATAAAT--ATTTTGACTGCATAATTAAAAAATAACACAAAACCTAACAGGTAAATCCATTTATACTAAATATAAATTAAGATT i rheMac3.chr17 I 1 C 0 s macFas5.chr17 82299262 356 - 96864807 TTATTCATGAAATCCCACTTTAACTTTTAAAGGAAATCAC--GATACAATTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCATTATCATAAAAGCACAGCTGTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAA---AACATAAATGACACAAAATAGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGTATAGATCAG-AAAAAACTACTTTAAATA---ATATGTAATAAGAGCAGGG-AAAAAGAACACAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAATAAAT--ATTTTGACTGCATAATTAAAAAATAACACAAAACCTAACAGGTAAATCCATTTATACTAAATATAAATTAAGATT i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972588 359 - 90913898 ttattcatgaAATCCCACTTTAACTTTTAAAGGAAATCACATGATACAATTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCATTATCATAAAAGCACAGCTGTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAA---AACATAAATGacacaaaataggaaaaagtaaacccatctaatttttattgtttatattatgtatagatcagaaaaaaactactttaaata---atatgtaataagAGCAggg-aaaaagaacacaaaataatgtttctattactacaaaataaaa--attttgaccgcataattaaaaaataacacaaaacctAACAGGTAAATCCATTTATACTAAATATAAATTAAGATT i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78440905 359 - 92142175 TTATTCATGAAATCCCACTTTAATTTTTAAAGGAAATCACATGATACAATTAAACTCTTGTGAGATCATAATCAGAAATTCAGCACTCATTATCATAAAAGCACAGCTGTGACTAAAGCAAAAGAGGTCATAA---AACATAAATGACACAAAATAGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGTTTATATTATGTATAGATCAGAAAAAAACTACTTTAAATA---ATATATAATAAGAGCAGGG-AAAAAGAACACAAAATAATGTTTCTATTACTACAAAACAAAA--ATTTTGACCGCATAATTAAAAAATAACACAAAACCTAACAGGTAAATCCATGTATACTAAATATAAATTAAGATT i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10888882 347 - 159171411 TTATTCATGAAATTCCACTTTAATTTTAAAAAGAAATCACATGATAC-----AACTCTTATAAGACCATAATCAGAAATTCAGCATTCATTATCATAAAAGTACAGCTGTAACTAAAGCAAAAGAAGTCATAAAACAACATAAATGACACAAAATGGGAAAAAGTAAACCCATCTAATTTTTATTGCTTATACTACATATAGATCAG--AAAAACTACTTGAAATAGTCATATATATTAAGAACAGGGAAAAAAGGGCACAAAATAATGTTTCTATTACTATAAAATAAAA--ACTTTGACCATATAATTTAAAAATCATACAAAAC-TAACAAGTAAATCCATGTAAACT-----------GAGACT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397158 236 + 51628933 -------------------------------------------------------------------------agaaa------------------------------------aaagaaaaaaa------aa---GAGACAAATGACACAAGATGGGAAAAT-TAAACCCATCTAATTTCTATTATTTATATTACGTAGTGATTTGAGAAAAGCTACCTTAAATATTCAAATATATTAAAAGCAGAG-ACAAAT--CACAA---ATTGTTTTGCTTATTACAAAACAAAGATATTTTTAGCTTAAAATTGGAAAATTAAGCAAAAA-TAA-----AAATCCACTTAAAATAAA-ATTGACAAAGGTT i canFam3.chr25 C 0 I 20 a score=490996.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 7121 167 + 478999 TTTATCTTAATAAAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAggccaggcgcagtggttcatgcttgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggcagatcacttgagatcaggagttcaagaccagcctggccaacgtggggaaaaccctgtttctactaaaaatac s panTro4.chr13 80375592 166 - 115123233 TTTATCTTAATAAAAAAGACTTTCAAGATAC-AGTCTAAggccaggcgcggtggttcatgcctgtaatcccagcacgttgagagtccaaggcgggcagatcacttgaggccaggagttcaagaccatcctggctaatacggtg-aaaccctgtctctactaaaaatac i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82314797 166 - 117095149 TTTATCTTAATAAAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAggccaggcgtggtggttcatgcctgtaatcccagcactttgggagtccaaggcgggcagatcacttgaggccaggagttcaagaccatcctggctaatacggtg-aaaccctgtctctactaaaaatac i ponAbe2.chr13 C 0 I 168 s nomLeu3.chr9 4325682 166 + 118206036 TTTATCTTAATAAAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAggccaggtgcggtggttcatgcctgtaatcccagcactttgggagtccaaggcaggcagatcacttgaggccaggagatcaagaccatcctggctaatacggtg-aaaccctgtctctactaaaaatac i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80151137 166 - 94676912 TTTATCTTAATACAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAggtcagacgcagtggttcatgcctgtaatcccagcactttgcgaggccaaggcgggcagatcacttgaggccaggagttcaagatcagcctggccaacatgggg-aaaccctgtctctactaaaaatac i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299618 166 - 96864807 TTTATCTTAATACAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAggtcagacgcagtggttcatgcctgtaatcccagcactttgcgaggccaaggcgggcagatcacttgaggccaggagttcaagatcagcctggccaacatgggg-aaaccctgtctctactaaaaatac i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76972947 166 - 90913898 TTTATCTTAATACAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCTAAGGTCagacgcagtggttcatgcctgtaatcccagcactttgcgaggccaaggcgggcagatcacttgaggccaggagttcaagatcagcctggccaacatgggg-aaaccctgtctctactaaaaatac i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78441264 166 - 92142175 TTTATCTTAATACAAAAGACTTTCAAGAAAC-AGTCGAAggtcaggcgcagtggttcatgcctgtaatcccagcactttgcgaggccaaggcgggcagatcacttgaggccaggaattcaagatcagcctggccaacatgggg-aaaccctgtctctactaaaaatac i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10889229 167 - 159171411 TTTATCTTAATAAAAAAGACTTTAAAGAAACAAGTCTATggccaggtgtggtggttcatgcctataatcccagcactttgggaggctgaggcgggtgaatcacttgaggtcaagagttcaagaccaggctggccaacatggtg-aaatcctgtctctactaaaaatac i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5397394 20 + 51628933 I a score=13104.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 7288 4 + 478999 aaaa s panTro4.chr13 80375758 4 - 115123233 aaaa i panTro4.chr13 C 0 I 163 s ponAbe2.chr13 82315131 4 - 117095149 aaaa i ponAbe2.chr13 I 168 C 0 s nomLeu3.chr9 4325848 4 + 118206036 aaaa i nomLeu3.chr9 C 0 I 169 s rheMac3.chr17 80151303 4 - 94676912 aaaa i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299784 4 - 96864807 aaaa i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76973113 4 - 90913898 aaaa i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78441430 4 - 92142175 aaaa i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10889396 4 - 159171411 aaaa i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5397394 20 + 51628933 I a score=1373385.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 7292 499 + 478999 ctttagctaggcatggtggtacgcacctgtgatcccagatactagggaggcttaggcaggagaattgcttgattgaactcgggaggtgggggttgcagtgagccaagatcgcaccactgcactctagtgtgggagacagagtgagacactgtctc-aaaaaaaataa-aaaataaaaaaaaaGTCTAAGTGAAAAGATAGCAAAGAAACAACTAcagtactcacttcttatccggaggcgatgcttccaagacccctagtggatgATATATACGA-TTTtcagtctgagaactgagatagctactaaatgactaataggaagacagtgtatactgcatgaaaaagctgagcaaaaggaggattcatgtcc-ggacttgatgaagagggacagtacgagatttcatcactctactcagaacagcacacaattta-aaagttataaattgtttattccatttaatatttttgaactgcagttgtccatgggtaagtgacaccttag s panTro4.chr13 80375925 487 - 115123233 CTttagccaggcatggtggtgcgcgcctgtgatcccagccactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgatcaaactcaggagatgggggttgcagtgagccaagatcgtgccactgcactccactgtgggagacagagtgagacactgtctc-aaaaaaaa-------------aaaaaGTCTAAGTGAAAAGATAGCAAAGAAACAACTAcagtactccctccttatcctgacgcgatagttccaagacccctagtggatAATAAATACGA-TTTtcagtccgagaactgagatagctactaaataactaatggagagacagtgtatacagcatgaaaaagcggaacaaaaggaggattcatgtccagggcttgatgaagagggacagcatgagatttcatcactctcctcagaacagcacacaatttagaaagttataaatggtttatttcatgc--tatttttgaactgcagttgaccacgggtaagtgacaccttag i panTro4.chr13 I 163 C 0 s ponAbe2.chr13 82315135 488 - 117095149 CTttagccaggcatggtggtgcacgcctgtgatcccagacactcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgatcgaactcaagaggtgggggttgcagtgagccaagatcgtgccactgcactcccgtgtgggagacagagtgagacactgtctc-aaaaaaaa------------aaaaaaGTCTAAGTGAAAAGATAGCAAAGAAACAACTAcagtactccctccttatcctgaggcaatagttctaagacccctagtggatAATATATACGATTTTtcagtccgagaactgagatagctactaaataactaatggagagacagtgtatacagcatgaaaaagctgaacaaaaggaggattcacgtccaaggcttgatgaagaaggacagcatgagatttcatcactctactcagaatagcatacaactta-aaagttataaattgtttattccatga--tatttttgaactgcagttgaccatgggtaagtgacaccttag i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4326021 488 + 118206036 CTttagtcaggcatggcggtgtgcgcctgtgatcccagacactagggaggctgaggcaggagaatcgcttgatcgaactcggaaggtgggggttgcagtgagccaagatcgtgccactgcactccagtgtgggagacagagtgagacactgtctc-aaaaaaaa-----aaaaaaaaaaaaaGTCT-------AAGATAGCAAAGAAACAACTATagtactccctccttaccccaaggtgatagttccaagacccctagtagatAATATATACGA-TTTtcagtccaagaactgagatagctactaaataactaatggggagacagtgtatacagcatgaaaaagctgaacaaagtgaggattcatgttt-gggcttgatgaagagggacagcatgagatttcatcactctactcagaataacacacaattta-aaagttacaaattgtttattccatttgatatttttgaacagcagttgaccatgggtaagtaacaccttag i nomLeu3.chr9 I 169 C 0 s rheMac3.chr17 80151307 501 - 94676912 ctttagccaggcatggtggtgtgcgcctgtgatcccagataatcaggaggctgaggcaggagaatcgcttaatcaaactcaggaggaggaagttgcagtgagtcaagatcgtgccactgcactccagtgtgggagacagagtgagacaccgtctc-aaaaataaaaataaaaaatgaaaaTAATCTAAGTGAAAAGAAAGCAAAGAAACAACTAcagtactccctccttatcccgaggcgatagttccaagacccctagtggatgATGTAcacga-ttttcggtctgagaactgagatagctactaaatgactaatagggagacagtgtatacagcatgaaaaagctgaacaaaaggaagattcatgtccagggcttgttaaagagggacagcatgagacttcatcactctactcagaacagcacacaattta-aaagttataaattgtttattccatttgatatttttgaaccacagttgaccatgggtaagtgacaccttag i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82299788 501 - 96864807 ctttagccaggcatggtggtgtgcgcctgtgatcccagatactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttaatcaaactcaggaggaggaagttgcagtgagtcaagatcgtgccactgcactccagtgtgggagacagagtgagacaccgtctc-aaaaataaaaataaaaaatgaaaaTAATCTAAGTGAAAAGAAAGCAAAGAAACAACTAcagtactccctccttatcccgaggcgatagttccaagacccctagtggatgATGTAcacga-ttttcggtctgagaactgagatagctactaaatgactaatagggagacagtgtatacagcatgaaaaagctgaacaaaaggaagattcatgtccagggcttgttaaagagggacagcatgagatttcatcactctactcagaacagcacacaattta-aaagttataaattgtttattccatttgatatttttgaaccacagttgaccatgggtaagtgacaccttag i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76973117 501 - 90913898 ctttagccaggcatggtggtgcgcgcctgtgatcccagatactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttaatcAAACtcaggaggaggaagttgcagtgagtcaagatcgtgccactgcactccagtgtgggagacagagtgagacaccgtctc-aaaaataaaaataaaaaatgaaaataatctaagtgaaaagaaagcaaagaaacaacTACAGTACTCCCTCCTTATCCCGAGGCGATAGTTCCAAGACCTCTAGTGGATGATGTACACGA-TTTTCGGTCTGAGAACTGAGATAGCTACTAAATGACTAATAGGGAGACAGTGTATACAGCATGAAAAAGCTGAACAAAAGGAAGATTCATGTCCAGGGCTTGTTAAAGAGGGacagcatgagatttcatcactcTACTCAGAACAGCAcacaattta-aaagttataaattgtttattccatttgatatttttgaaCCCCAGTTGACCATGGGTAAGTGACACCTTAG i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78441434 502 - 92142175 ctttagccaggcatggtggtgcgcgcctgtgattccagatactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttaatcaaactcaggaggaggaagttgcagtgagtcaagatcgcgccactgcactccagtatgggagacagagtgagacgccgtctcaaaaaataaaaataaaaaatgaaaaTAATCTAAGTGAAAAGAAAGCAAAGAAACAACTAcagtactccctccttatcccaaggcgatagttccaagacccctagtggatgATGTATACGA-TTTtcggtctgagaactgagatagccactaaatgactaatagggagacagtgtatacagcatgaaaaagctgaacaaaaggaagattcatgtccagggcttgttaaagagggacagcatgagatttcatcactctactcagaacagcacacaattta-aaagttataaattgtttattccatttgatatttttgaaccacagttgaccatgggtaagtgacaccttag i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10889400 479 - 159171411 ccttagccaggcatggtggtgcatgcctgtgattctagatactagggaagctgaggcaggagaattgcttcatagaactggggaggtaggagttgcagcaagccaagatggagccactgtactccagtctgggagacagagtgaggcactgtcac-aaaaaaaa-----------------aGGCTAAGTGAGAAGACAGCCAAGAAACAACTAcagtagttccttcttatcccaaggcaatagtttcaagaccgctggtggatgATGTATTCTA-CTTtcagtctgagaaccgagatggctactaaatgactaatagggagatagtgtgcacagcatgaaaaagct-atcaaagggaggattcatgtcttgggcttgatgaggagagatggcatgatacttcatcactctactcagtacagcgcacaattta-aaagttataaattgtttattccatttaatatctttggactgcagttgaccatgg----gtgacactttag i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5397394 20 + 51628933 I a score=646281.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 7791 240 + 478999 aaagagagagtagaaataaaggggcactactATAGAAAAACTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGAATAGATATAGATGAAATTTTTTTCTTTAG-TTT--TTTAA----TTCAAAATTT---AATTATGC-----TTCCAATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTTAAATCTA------------------AGGTGTTTGTGAATTAGCAAATAGTATAATCTCTACACAGTCAATGGAAAGTGAAATTATAGAAAAAATATAATTAG s panTro4.chr13 80376412 241 - 115123233 aaagtgagagtggaaataagggggtactact-TAGAAAA-CTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGAATAGATATAGATGtaaattttttatttagattt--tttta----ttcaaaatttcttaattaCAC-----TTCCGATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTTAAATCTA------------------AGACGTTTGTGAATTAGCAAATAGTATAATCTCTACACAGTCAATGGAAAGTGAAATTACAGAAAAAAAA-AATTAG i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82315623 244 - 117095149 aaagtgagagtagaaataagggggcactactATAGAAAAACTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGAATAGATATAGATGTAAATTTTTTCTTTAGTTTT--TTTTA----TTCAAAATTTCTTAATTACAC-----TTCCGATATCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTTAAATCTA------------------AGACGTTTGTGAAGTAGCAAATATTATAATCTCTATACAGTCAATGGAAAGTGAAATTACAAAAAAAAAATAATTAG i ponAbe2.chr13 C 0 I 105 s nomLeu3.chr9 4326509 240 + 118206036 aaagtgagagtagaaataa-ggggtactactATAGAAAAACTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGAATAGATATAGATGTAAATTTTTTCTTTAGTTTT--TTTTA----TTCAAAATTTCTTAATTACAC-----TTCCAATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTTAAATCTA------------------AGACATTTGTGAATTAGCAAA---TATAATCTCTACACAGTCAATGGAAAGTGAAATTATAGAAAAAATATAATTAG i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80151808 230 - 94676912 aaagcgagagtagaaataagggtgtactactATAGAAAACCTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGA----ATATAGATGTACATTTTTTCTTTACTTTT--TTTAA----TTTAAATTTTCTTAATTACAC-----TTCCGATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTGAAATCTC------------------AGACGTTTGGGAATTAGCAAATAGTATA----------AGTCAATGGAAAGTGAAATTATAGAAAAAATATAATTAG i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82300289 230 - 96864807 aaagcgagagtagaaataagggtgtactactATAGAAAACCTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGA----ATATAGATGTACATTTTTTCTTTACTTTT--TTTAA----TTTAAATTTTCTTAATTACAC-----TTCCGATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTGAAATCTC------------------AGACGTTTGGGAATTAGCAAATAGTATA----------AGTCAATGGAAAGTGAAATTATAGAAAAAATATAATTAG i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76973618 230 - 90913898 AAAGCGAGAGTAGAAATAAGGGTGTACTACTATAGAAAACCTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTtga----atatagatgtaaattttttctttactttt--tttaa----tttaaattttcttaattacac-----TTCCGATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTGAAATCTC------------------AGACGTTTGGGAATTAGCAAATAGTATA----------AGTCAATGGAAAgtgaaattatagaaaaaatataattag i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78441936 228 - 92142175 aaagcgagagtagaaataagggtgtactactATAGAAAAACTTAAGAGAAATGATACTTATTGCTTGA----ATACAGATGTAAATTTTTTCTTTACTTTT--TTTAA----TTTAAATTTTCTTAATTACAC-----TTCTGATACCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTGAAATCTC------------------AGACGTTTGTGAATTAGCAAATGGTATA----------AGTCAATGGAAAGTG--ATTATAAAAAAAATATAATTAG i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10889879 244 - 159171411 taagtcaaagtagaaacaaggaggtactactgTAGAAAAACTTAAGAGAAATGTTACTTATTGCTATTATAGATATATATGAAAACTTTACTTTC---TTT--TTTAATTTCTTTCAAATTTCTTAATTACAC-----TTCCAATATCCAGTTAATTCC-ATGTCTACACTTAAATCTA------------------AGATGTTTGTGAATTAGCAAACAGTATAATCTCTACACAGTTAACGGAAAGGGaaattata-aaaaaatataattaG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397414 249 + 51628933 AAAGATAGCGAAGAAACAATAAGA---------AAAAAGTATTAAGGGGAA--ATACTTTTAACTTTAA---ATGTAGAGGAAAAAAGTTTCTTTATTTTCTATCTTA----CTCAAAATTCCT-AAAAACACAGATTTCCCTGCACTCAATTTATTTCAATGTTTACACTTAAATCTAAAAGCAATATATAAAAGTAAATATGTGTGGATTAGC--CTACTATA----ATGAACAGTCTATGAAAAGAAAAACTATAGAAAAAATATAATTAG i canFam3.chr25 I 20 C 0 a score=1668858.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8031 469 + 478999 TGATTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAG-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT----CACCTACCTTTTCAAGTAATTAGCCAATAACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCACCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCGAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGATA---TCATTATGTAATCATCAC--GTTTATTCTAAACACAGTGTTCCAATTTCAGTATTTTATTATGCCAAGAG---ATAACCATATTCAAATCTAATCTCTATTTTATTGACAATGACTATTATGCCTTATATTATGAAAGAATATATTTCCTGATAAGCATGAGAAAACTA---TTGTCCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGTTT----TTTTACATTCCAAAGTAAAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATAGGTCTGGCTTCAAGTAAA s panTro4.chr13 80376653 473 - 115123233 TGATTATC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAACA--GTGTCCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAG---ATAACCATATTCAAATCTCATCTCTATTTTACTGACAATGACTATTATGCCTTATATTATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTCCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGTTT----TTTTACATTCCAAAGTAAAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATATGTCTGGCTTCAAGTAAA i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82315972 473 - 117095149 TGATTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGCAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAACA--GTGTTCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAG---ATAACCATATTCTAATCTAATCTCTATTTTACTGACAATGACTATTATGCCTTATATTATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTCCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGTTT----TTTTACATTCCAAAGTAAAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATATGTCTGGCTTCAGGTAAA i ponAbe2.chr13 I 105 C 0 s nomLeu3.chr9 4326749 475 + 118206036 TGGTTGTC-AGTTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---CCATTATGTAATCGTCACATGTTTATTATAATCACAGTGTCCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAG---ATAACCATATTCAAATCTAATCTCTATTTCACTGACAATGACTATTATGTCTTATATTATGAAAGAATATATTTCATCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTCCTTTTCAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGTTT----TTTTACATTCCAAAGTAAAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATATGTCTGGCTTCAAGTAAA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80152038 460 - 94676912 TGGTTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAATATAGCATTCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAGATAATAACCATATTCAAATCTAATTTCTATTTTACTGACAATGACTATTATGCCTTATA-TATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTTCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGATT---------------------AAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATACGTCTGGCTTCAAGTAAA i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82300519 460 - 96864807 TGGTTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAATACAGCATTCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAGATAATAACCATATTCAAATCTAATTTCTATTTTACTGACAATGACTATTATGCCTTATA-TATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTTCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTGTGTAGATT---------------------AAACATCAAAGTTTATCTCTACATATATTTATACGTCTGGCTTCAAGTAAA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76973848 461 - 90913898 tgGTTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACATA-ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAATACAGCATTcca-tttcagtattttattatgCCAAAAGATAATAACCATATTCAAATCTAATTTCTATTTTACTGACAATGACTATTATGCCTTATA-TATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTtctttacaaattaaatataataaactgAATCATAACTGTGTAGATT---------------------AAACATCAAAGTTTAtctctacatatatttatatgtctgGCTTCAAGTAAA i papAnu2.chr17 C 0 M 50 s chlSab2.chr3 78442164 477 - 92142175 TGGTTGTC-AGCTGTCCAACTGTGAA-GCTACACAATAAAACCATCAACACGT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTATTATAAATACAGCATTCCA-TTTCAGTATTTTATTATGCCAAAAGATAATAACCATATTCAAATCTAATTTCTATTTTACTAACAATGACTATTATGCCTTATA-TATGAAAGAATATATTTCCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGTTGTTCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAATCATAACTATGTAGATT----TTTTACATTCCAAAGTAAAACATCAAAGTTTATCTCCACATATATTTATATGTCTGGCTTCAAGTAAA i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10890123 474 - 159171411 TGATTGTC-AGCTGTTCAACTGTGAG-GCTACACAAT-AAACCATCAACACATATATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGATA---TCATTATGTAATCATCACATGTTTGTTATAAACATAGTGTTCCA-TTTCAGTATTTTATTATACCAAAAGATAATAACTATATTCAAATCTAATCTCTATTTTACTGATAATGACTAGTATGCCTTATATTATGCAATAATATATTTTCTCATAAGCATGAGAAAACTAGTGGTGTCCTTTACAAATTAAATATAATAAACTGAAACATAACTGTGTAGTTT----TTTTACATTCCAAAGTAAAA---CAAAGTTTATCTCTACATATA--TGTACGTCTGGCTTCAAGTAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5397663 485 + 51628933 GGGTTGTCGAGTTGTTCAGCTATGAATACTACACAATAAAACCATCAATACAT--ATCACTTACCTTTTCAAGTAAGTAGCCAATGACTAAAAAGCCTTTTCCACCCAGCATCTGTTCTTGCATGGCTACTGAACTTTTAAGTAGTTCAACCAGGAATGCCAAAAGAGTAGCACTGCATGTAAAGTACAGACAATTTCATTATGTAATCATCAAATGTTGATTATAAACATAGTGTTCCG-TTTCAGAATTTTATATTGCGAAAAGATAAAAACCAAATTCAAAACTAATCTCTATTTTGCTGACAATGATTACTATATTTTATATTGTACATGACTATATTTTCTCACAAGCATGAGAAAACTAGTCTCATCTCTTTAGAATTAAATATCAAAAATCAAAACATAAATGCATAGCTTTTTTTTTTATATCCCAAAGCCAAACACTGGAGTTCACCT--ACACATATGTACATTACCTGTTTTAAGTAAA i canFam3.chr25 C 0 I 5 a score=208672.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8500 90 + 478999 CCTAAGAAACATAC------ACACATC-ATTTTCCATA--------ATAAAGAC-TGTATCATACTATTATTTTGAATAACAAGCTATTGTAGAGAATTTTAAATA s panTro4.chr13 80377126 90 - 115123233 CCTAAGAAACATAT------ACACATC-ATTTTCCATA--------ATAAAGAC-TGTATCATACTATTCTTTTGAATAACAAGCTATTGTAGAGAATTTTAAATA i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82316445 90 - 117095149 CCCAAGAAACATAC------ACATATC-ATTTTCCATA--------ATAAAGAC-TGTATCATACTATTCTTCTGAATAACAAGCTATTGTAGAGAATTTTAAATA i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4327224 90 + 118206036 CCTAAGAAACATAC------ACATATC-GTTTTCCATA--------ATAAAGAC-TGTATCATACTATTCTTTTGAATAACAGGCTATTGTAGAGAATTTTAAATA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80152498 80 - 94676912 CCTAAGAAACATAC------ACATATC-ATTTTCCATA--------ATAAAG-----------ACTATTCTTTTGAATAACAAGCTATTGTAGaaaattttaaatg i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82300979 80 - 96864807 CCTAAGAAACATAC------ACATATC-ATTTTCCATA--------ATAAAG-----------ACTATTCTTTTGAATAACAAGCTATTGTAGaaaattttaaatg i macFas5.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78442641 80 - 92142175 CCTAAGAAATATAC------ACATATC-ATTTTCCATA--------ATAAAG-----------ACTATTCTTTTGAATAACAAGCTATTGTAGaaaattttaaatg i chlSab2.chr3 C 0 I 20 s calJac3.chr5 10890597 90 - 159171411 CCTAAGAAACATAC------ACATATC-ATTTTCCATG--------ATAAAGAC-TGTATCGTAATATTCTTTTGAATAACAAGCTATTGTAGAGAATTTTAAATA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5398153 105 + 51628933 CATAAGAAACACATCTACAAATACATCAATTCTCCACAGTATTTCCATAAAGACTTTTACCATAACATTCTTTTGAAGAACATACTATCTTAGAAAA-TTTAAATA i canFam3.chr25 I 5 C 0 e papAnu2.chr17 76974309 50 - 90913898 M a score=34416.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8590 13 + 478999 TAGATGC-AATATT s panTro4.chr13 80377216 13 - 115123233 TAGATGC-AATATT i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82316535 13 - 117095149 TAGATGC-AATATT i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4327314 13 + 118206036 TAGATGC-AATATT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80152578 13 - 94676912 tatattt-aaaatt i rheMac3.chr17 C 0 I 16 s macFas5.chr17 82301059 13 - 96864807 tatattt-aaaatt i macFas5.chr17 C 0 I 20 s papAnu2.chr17 76974359 13 - 90913898 tAGATGC-ACTATT i papAnu2.chr17 M 50 C 0 s chlSab2.chr3 78442741 13 - 92142175 taGATGC-AATATT i chlSab2.chr3 I 20 C 0 s calJac3.chr5 10890687 14 - 159171411 TAGATGCAAATATT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5398258 13 + 51628933 TATATGC-AACATT i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=10476.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8603 3 + 478999 GCT s panTro4.chr13 80377229 3 - 115123233 GCT i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82316548 3 - 117095149 GCT i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4327327 3 + 118206036 GCT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82301092 3 - 96864807 GCT i macFas5.chr17 I 20 C 0 s papAnu2.chr17 76974372 3 - 90913898 GCT i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78442754 3 - 92142175 GCT i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10890701 3 - 159171411 GCT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5398271 3 + 51628933 GCT i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80152591 16 - 94676912 I a score=2608831.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 8606 866 + 478999 TTGTAAGAACAAGCCCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGAACTATTCTTCAAAAA-------CACTTTGTT-AAAAAAAATCCAGAGGAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----AAA-GAAATGATTTATGTAATATTGAAATGAAAAGTGAC----AATTACACAGTATATAAACAAATACATAAAGGCAGACA--G--AGGCGT----CAAAGATTTAGCACTTG--GT-ATGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAGAAA---ATGACTGCATTGAATTAAGCTTTGATAATATATTACTTCAT--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATATATGAATATAGTATTCTGAATAATGGAAATACATATTCCTTCACTGTATATGCTTAATGTAGCTCAT---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCAACAATTAAAAGAATATCAATTTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACAAATTTCTAAACATATTTTAAATGCA-GAAGTACTCATTCTTACAAGTAATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCGAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TGTA-TTTTTCTCAT-AATGTGGCTACTTTTGTTCAAATCAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATTATCATTGTCATTATTATAAAAATT------------------------------------------GATAGTTTAATGAATTAC---ATATCAGCTAGACAAAATATAGTA--TCCAGAAATAAAGCACTTCATTATAGGAAATTAAA s panTro4.chr13 80377232 871 - 115123233 TTGTAACAACAAACTCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGAACTATTCTTCAAAAA-------CCTTTCATT-AAAAAAAATCCAGAGAAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAACTCATGAGAGC----AAATAAAATGATTTATGTAATATTGAAATGAAAAGTGAT----AATTACACAATATATAAACAAATACATAAAAGCAGACAAAG--AGGTGT----CAAAG-TTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAAAAAGAAATGATTGCATTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTAAATAATGGAAATACATATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAGCTCAA---AATAAATTGTTATAGACCAGATTTTATCATGAATTAAAATAGTATCAATTTACAATGTTTTATAATATACCATAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACAAATTTCTAAACATATTTTAAATGCA-GAAGTACTCATTCTTACAAGTGATTCAGACAATCTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCAT-AATGTGGCTACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATTATCATTATCATTATTATAAAAATT------------------------------------------CATAGTTTAATGAATTAC---ATACCAGCTAGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTCATTACAGGAAATTAAA i panTro4.chr13 C 0 I 389 s ponAbe2.chr13 82316551 872 - 117095149 TTGTAAGAACAAACCCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGGACTATTCTTCAAAAA-------CCCTTCGTT-AAAAAAAATCCAGAGAAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----AAA-GAAATGATTTATGTAATATTGAAATGAAAAGTGAC----AATTACACAATATATAAACAAATACATAAAAGCAGACAAAG--AGGTGT----CAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAAAAAGAAATGATTGCATTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTAAATAATGGAAATACACATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAGCTCAA---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCATGAATTAAAATAGTATCAATTTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGTAAAAACCACAAATTTCTAAACATATTTTAAATGCA-GAAGTACTCATTCTTACAAGTGATTCAGACAATCTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGTTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCAC-AGTGTGGCTACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATTATCATTATCATTATCATAAAAATT------------------------------------------CACAGTTTAATGAATTAC---ATACCAGCTGGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTCATTACAGGAAATTAAA i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4327330 869 + 118206036 TTGTAAGAACAAACCCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGAACTATTCTTCAAAAA-------CACTTTGTTAAAAAAAAATCCAGAGAAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----AAA-GAAATGATTTATGTAATATTGAAATGAAAAGTGAC----AATTACACAATATATAAACAAATACATAAAAGCAGACAAAG--AGGTGT----CAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAAAAAGAAATGATTGCACTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACTTATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTGAATAATGGAAATACATTTTCCTTCATTGCATATGCTTAATGTAGCTCAT---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCATGAATTAAAATAGTATCAATTTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCAT----AAGGGT-AGAACCACAAATTTCTAAACATATTTTAAATGCA-GAAGTACTCATTCTTACAAGTGATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTTTAGCTCTTCCAGTTTCAAATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCATAAATGTGG-TACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATTATCATTATCATTATTATAAAAATT------------------------------------------CATAGTTCAATGAATTAC---ACACCAACTAGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTCATTACAGGAAATTAAA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80152607 873 - 94676912 -------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----aaa-taaattatttatataatattGAAATGAAAAGTGAC----AATTATGCAATACATAAACAAATACATAAAAGCAGATGAAG--AGGTGTCAGACAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGTAATGAATGAAGAAATAAAACAAAAAGAAATGATTGCATTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGCTTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTGAATAATGGAAATACATATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAGCTCAT---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCAAGAATTAAAATAGTATCAA-TTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACACATTTCTAAACATATTTTAAATGCAGGAAATACTCATTTTTACAAGTGATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------------------------AAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTTGTTACAGGAAATTAAA i rheMac3.chr17 I 16 C 0 s macFas5.chr17 82301095 875 - 96864807 TTGTAAGAACAAGTCCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGAACTATTCTTCAAAAA-------CACTTGGCT-AAAAAAAATCCAGAGAAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----AAA-TAAATTATTTATATAATATTGAAATGAAAAGTGAC----AATTATGCAATACATAAACAAATACATAAAAGCAGATGAAG--AGGTGTCAGACAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGGAATGAATGAAGAAATAAAACAAAAAGAAATGATTGCATTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTGAATAATGGAAATACATATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAGCTCAT---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCAAGAATTAAAATAGTATCAA-TTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACACATTTCTAAACATATTTTAAATGCAGGAAGTACTCATTTTTACAAGTGATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCCT-AATGTGGCTACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATTACCATTATCATTATTATAAAAATT------------------------------------------GATAGTTTAATGAATTAC---ATATCAGCTAGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTTGTTACAGGAAATTAAA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76974375 875 - 90913898 TTGTAAGAACAagtcctatttttaaataaac-------------------------------------------------------------ttttcatttagAACTATTCTTCAAAAA-------CACTTGGct-aaaaaaaatccagagaaatATGTA------------------------------ACATATCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGagagc----aaa-taaattatttatataatattgaaATGAAAAGTGAC----AATTAtgcaatacataaacaaatacataaaagcaGATGAAG--AGGTGTCAGACAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTttggaatgaatgaagaaataaaacaaaaagaaatgattgcATTGAATTAAGCTTTGATAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTGAATAATGGAAATACATATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAGCTCAT---AATAAATTGTTATATACCAGATTTTATCAAGAATTAAAACAGTATCAA-TtacaatgttttataatatacCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACACAtttctaaacatattttaaaggcaGGAAGTACTCATTTTTACAAGTGATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTAttctaatttttgaattattctAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCCT-AATGTGGCTACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAAATtaccattatcattattataaaaatt------------------------------------------gataGTTTAATGAATTAC---ATATCAGCTAGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTTGTTACAGGAAATTAAA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78442757 876 - 92142175 TTGTAAGAACAAGTCCTATTTTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGAACTATTCTTCAAAAA-------CACTTGGCTAAAAAAAAATCCAGAGAAATATGTA------------------------------ACATGTCACTTATGTCCAGGTATGCCCTAAGAAAAGCTCATGAGAGC----AAA-TAAATTATTTATATAATATTGAAATGAAAAGTGAC----AATTATGCAATACATAAACAAATACATAAAAGCAGATGAAG--AGGTGTCAGACAAAGATTAAGCACTTG--AT-TTGTCTTTGGAATGAATGAAGAAATAAAACAAAAAGAAATGATTGCATTGAATTAAGCTTTGAAAATGCATTACTTCAC--AGTTACATATAATGATTTT-AACCAGCAACACTGATACATGAATATAGTATTCTGAATAGTGGAAATACATATTCCTTCATTGTATATGCTTAATGTAACTCAT---AATAAATAGTTATATACCAGATTTTATCAAGAATTAAAATAGTATCAA-TTACAATGTTTTATAATATACCCTAAATTACCTATTTATATTCATAAGAAAGGGT-AAAACCACACATTTTTAAACATATTTTAAATGCAGGAAGTACTCATTTTTACAAGTGATTCAGACAATTTGGTAATAAGGAAAACTTGAAAATTATTAAAGCCCAAAAGGAATCTGAAGTTATTCTAATTTTTGAATTATTCTAGCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATAA---TACA-TTTTTCTCCT-AATGTGGCTACTTTTGTTCAAATTAGAAATGTTCTCATAATA------------------------------------------------------------AGAACCAACAGCAAACTTATCATTATCATTATTATAAAAATT------------------------------------------GATAGTTTAATGAATTAC---ATATCAGCTAGACAAAATATAGTA--TCTAGAAATAAAGTACTTTGTTACAGGAAATTAAA i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10890704 866 - 159171411 TTGTAAGAACAAG-CCTATTCTTAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTAGACCTATTCTTCAAAAA-------CACTTTGTTAAAAAACAATCCAGAGAAATACGTA------------------------------ACATGTCACATACGTCCAGGTATGCCCTCAGAAAAGTTCATGAGAGC----AAA-GAAATGATTTATGTATTATTGAAATGAAAACTGAC----AATTACATAATGTATAAACAAACACATAAAAGCAAACGAAG--AGGTGTCAGACAAAGATTAAGCACTTGATAT-ATGTCTTT----TGAATTAAGAAACAAAATAAAAAGAAGTGACTGCATTGAATTCAGCTTTGATAATG--TTACTTCAC--AGTTACACATAATGATTTT-AACCAACAACACAGACACATGAATACAGTATTCTGAATAACGGAAATACATATTCCTTTATTGTACATGCTTAATGTAGCTCAT---AAT-AATTACTATATACCAGATTTTATCAAGAATTAAAATAGTATCAATTTACAATG-TTTGTAATATACCCT--GTTACCTGTTTATATCCAGAAGAAAGGGT-AAAACCACAAATTTCTAAATATATTTTAAATGCA-GAAGTACTAATTCTTA-AAATAATTCAGACAATTTGGTAACATGGAAAACTTGAAAATTATTAGAGCCCAAAAGGAATCTGAAATTATTCTAATTTCTGAATTATTCTACCTCTTCCAGTTTC-AATAGG--G------------------------------ATGACATTATA-TTTTTCTCAT-AATGCGGCTACTTTTGTTTAAATCCAAAGTGTTCTCATAACA------------------------------------------------------------AGAACCAATAGAAAA------ATTAACATTATTATAAAAATT------------------------------------------GATAGTTTAATGAACTACATGATATCAGCTGGAAAAAATATAATA--TCTAGAAATATAGTACTTCATTACAGGAAATTAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5398274 872 + 51628933 TTGGAAGAACACACCTGTTTTTGAAATAAAC-------------------------------------------------------------TTTTCATTTATACCTATTTTTTTAAAAAGACTTTCTATTTTTT-AGAAAATATCCAGAGAAATAT---------------------------------ACATGTTATTTGTGTCCATATATTCACTCAGGAAAGCTCATGAGAGCAGAAAAA-CAAATGATCTGTATAATATTGAAATG-GAAGTGGCAATTAATTACACAATGTATACACAAACACATAAAAGCACACAAAGATAAGTGCCAGACAAAGATAAAGCACTTG--ATAATGTCTGT----TGAATGAAGAAACAAAAGAAAAATAAATGACTGCATTGGATTAAGTTTTGATAATATACTACTTCACAAAGTTACATTGAACAATTTTCAACTAACAGCATTAATACATG---ATGGCATTCCTAATTAAGAAAATATATATTCCTTCACTGTACATGCTTACTATAGTTTATTACAATAA------ACAAGCCAAACTTCATCAGCAATTAA---ATTATCTATTTACTGTGCCTTATAATGTACTCTAAATTGCCTATTTATATTCATAAGAAAGTAT-AAAACCACAAATTTCCAAATATATTTTAAATTCA-TAAGTACTCGTTTCTTCAAGGAATTAAGAAAATTCGTTAATGAGGAAAACTTGAAAATCACTAAGGTCCAAAAG-----TGATTCTATTC----TTTCAAGTTATTCTAAATTTTCTGGTTTC-AATAGAATG------------------------------ACAA---CACATTTTTTCTGAT-AATGTGGCTATTCTAGTTCAAATCAGAAATATTCTCATTAAA------------------------------------------------------------AGAATCAATAGCaaa------attattattattataaaaatt------------------------------------------GATAGTTTAATGGGTTATATGACATCAGGTAGAAAAAATATAGTATTTCTGGAAATAAAGTACTTCATTACAGGAAATTAAA i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=896621.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 9472 317 + 478999 ATTCAATTATATTAACTGACCCTATATCCTTAAACCACAAAAAAT--GTAAAC---TATCACATATCAATGAT-TTTTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTACAAGAAAACTACAACTACCAATGAGTCTCTTGGGATTTTAAAAAACGTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAGCAATCTAGTCCATTTTAAATGAATTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACAAATAATTGC-TAAGTACTATATTACACATAACACATCTGCCTAGATGTGTAAAAAGAATAAAGAAAACCATGCATAGAGATTACACAATTT s ponAbe2.chr13 82317423 319 - 117095149 ATTCAATTATATTAACTGATCCTATATCCTTAAACCACAAAAAAAA-GTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTACAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTCTTGGGATTTTAAAAAATGTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAGCAATCTAGTCCATTTTAAATGAATTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACGAATAATTGC-TAAGTACTATATTACACCTAACACATCTGCCTAGATATTTAAAAAGAATAAAGAAAACTATGCATAGAGATTACACAATTT i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4328199 317 + 118206036 ATTCAATCATATTAACTGATCCTACATCCTTAAACCACAAAAAAA--GTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTACAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTC-TGAGATTTTAAAAAATGTTTCTATAAAGAAGCACAGCTATTAAGCAATCTAGTCCATTTTAAATGAATTA----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACGAATAATTGC-TAAGTACTATATTACACCTAACACATCTGCCTAAATATTTAAAAAGAATAAAGAAAACTATGCATACAGATTGCACAATTT i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80153480 320 - 94676912 AGTCAATTATATTAACTGACCCTATATCCTTAAACCACAAAAAAAATGTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTGCAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTCTTGGGATTTTAAAAAATGTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAACAATCTAGTCCATTTTAAATGAACTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACAAATAATTGC-TAAGTACTGTATTACACATAACACATCTGCCTAGATGTTTAAAAAGAATAAAGAAAACTATGCATAGAGATTACAAAATTT i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82301970 320 - 96864807 AGTCAATTATATTAACTGACCCTATATCCTTAAACCACAAAAAAAATGTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTGCAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTCTTGGGATTTTAAAAAATGTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAACAATCTAGTCCATTTTAAATGAACTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACAAATAATTGC-TAAGTACTGTATTACACATAACACATCTGCCTAGATGTTTAAAaagaataaagaaaactatgcatagagattacaaaattt i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76975250 320 - 90913898 AGTCAATTATATTAACTGACCCTATATCCTTAAaccacaaaaaaaatgtaaac---tatcaCAAATCAATGATATCCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTGCAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCtcttgggattttaaaaaatgtttctgtaaagAAGCACAGCTATTAAACAATCTAGTCCATTTTAAATGAACTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCACAAATAATTGC-TAAGTACTGTATTACACATAACACATCTGCCTAgatgtttaaaaagaataaagaaaactatgCATAGAGATTACAAAATTT i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78443633 321 - 92142175 AGTCAATTATATTAACTGACCCTATATCCTTAAACCACAAAAAAAATGTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGATAGACACTTGCAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTCTTGGGATTTTAAAAAATGTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAACAATCTAGTCCATTTTAAATGAACTG----AATTAGTCAAGGCCACTTCACAAATAATTGC-TAAGTACTGTATTACACATAACACATCTGCCTAGATGTTTAAAaagaataaagaaaactatgcatagagattacaaaattt i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10891570 313 - 159171411 ATTCAATTATATTAACTGACCATGTATCCTTAAACCACAAAAAAT--GTAAAC---TATCACAAATCAATGATATTCTTTTACTTTGTCCTTAAGCCAAAGACAGACACTTACAAGAAAAATACAACTACCAAGGAATCTCTTGGGAATTTAAAAAATCTTTCTGTAAAGAAGCACAGCTATTAAGCAATCTGGTCCATGTTAAATGAATTG----AA-TAGTCAAGGCCACTTCA-----AATTGC-TAAGTACTATATTACACATAACACATCTGCCTAGATGTTTAAAAAGAATAAAGAAAACTATGCATACATATTACACAATTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5399146 319 + 51628933 ATTCAGTTACATTAATTGGCCCTATTTCTTTAAACCACACAAAAAA-GTAAACTAGTATTACAAGTCAACGATGTTCTTTTACTTTGTCCT------AAAGTTAGATATTTACAAATTAAACACAACTACCAAAGAATCCTTTGGGATTTTTTAAAATATTTCTGTATAGAAGAACAGCTATTAGACAATCTAGTCCATTTTTAATGAATTGTGTCAA-CAGTAAAAGCCACTTCACAAATAATTGCATAGGTAC--TACTACACAAAATACTTCTGCCTAAATGTTTGAGAAGAATAAAGAATCTACTGCATAGAGATTACACAATGT i canFam3.chr25 C 0 C 0 e panTro4.chr13 80378103 389 - 115123233 I a score=4070181.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 9789 1106 + 478999 CCTAATCTGTTCATAGAATTCTTACATACACCAAAGTTAGTGATT--GAGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-ACAGACTAGAAATGCCTCACAGTGGTCCTTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTT--TACAGTAAATCACCCTACTATATAGAACCATATACAATTGCAAGGATGACACAGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAATATCTAATGAGTTAACTCAGACCTCTAAACACAGTGGAGCTCTATTATAAAAACTGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATCTTAACA--AGACTCTGCTATCCATGAAGTATTAATTTCACTTCAACATTAACTAGGACACCAATTGAAATGTCAAATGCATTCACTAACAAAGGTAGTTTCAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGCAAA--AAAAAAA--AAA--------ATCTTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTTGAAGAGGTACATTTTCAAACATAATTCAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAAGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTTCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAAGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACAACTTCCTCTCTAGAACGCATCAGTTCATCTGCAGAGGATCTAAATATATACTCTAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCGTTGTCAGCCAAAACTAAT----ACAACATAGAACACTCTCTTGAAAACTATATCAATACCTAGGAAAAGATTTTCAGAGGAGTATTTTATTTTATAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTCAACTTTTCAACAGACAGTACTATAACA---CATGTTCTATAAGTAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATGAGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTAAGGAAAATGATGCTAATAATCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA s panTro4.chr13 80378492 1112 - 115123233 CCTAATCTGTTCATAGAATTCTTACATACACCAAAGTTAGTGATTTAGGGGGAAAATG---GATTCCTAAGCATGAGCACTGCCAAAAAG-AACGACTAGAAATGCCTCACAACGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCGCCCTACTATATAGAACCATGTAAAACTGCAAGGATGACATGGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTAACTCAGACCTCTAAACACAGTGGAGTTCCATTACAAAAACAGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATCTTAACACAGGACTCTGCTATCCATAAAGTGTTAATTTCACTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAAATGCATTCACTAACAAAAGTCGTTTTAATTTATACCTAAAACCCAATCCAATAGCAATACCACATCTTTGCAAA--AAAAAAA-CAAA--------AACTTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACATTTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGCAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGTGTCAGCCAAAACTAAT----ACAACATAGAAAATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTAGGAACAGATTTTCATAGGAGTATTTTACTTCATAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAATA---CATGTTCTATAAGTAGCAATTCTACTTCAAGAATGGATAAGAGTTT---TT-ATCCTGTATCTTTTTAAGGAAAATGATGTTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i panTro4.chr13 I 389 C 0 s ponAbe2.chr13 82317742 1113 - 117095149 CTTAATCTGTTCATAGAATTCTTACATACACCAAAGTTAGTGATTTAGGGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AACGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCACCCTACTATATAGAACCATGTAAAATTGCATGGATGACATGGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTAACTCAGACCTCTAAACACAGTGGAGTTCCATTACAAAAACAGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATCTTAACACAGGACTCTGCTATCCATAAAGTGTTAATTTCAGTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAAGGTCAAATGCATTCACTAACAAAAGTCGTTTTAATTTATACCTGAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGCAAA--AAAAAAAAAAAA--------ATCTTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGGGGTACATTTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGCAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGTGTCAGCCAAAACTAAT----ACAACACAGAAAATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTAGGAACAGATTTTCATAGGAGTATTTTACTTCATAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATCATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAATA---CATGTTCTGTAAGTAGCAATTCTACTTCAAGAATGGATAAGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTAA-GAAAATGATGTTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4328516 1112 + 118206036 CCTAATCTGTTCATAGAATTCTTACATACACCAAAGTTAGTGATTTAGGGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AACGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCGCCCGACTATATAGAACGATGTAAAATTGCAAGGATGACATGGATTTTCT--TTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTAACTCAGACCTCTAAACACAGTGGAGTTCCATTACAAGAACGGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATATTAACACAGGACTCTGCTATCCATAAAGTGTTAATTTCACTTCAGTATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAAATGCATTCACTAACAAAAGTAGTTTTAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGCAAA--AAAAAAAAAAAA--------ATCTTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACATTTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCACACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGCAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGTGTCAGCCAAAACTAAT----AAAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTAGGAACAGATTTTCATCGGAGTATTTTACTTCATAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAATA---CATGTTCTGTAAGTAGCAATTCTACTTCAAGAATGGATAAGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTAAGGAAAATGATGTTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80153800 1112 - 94676912 CCTAATCTGTTCGTAGAATTCTTACATACACCGAAGTTAGTGATTTAGTGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AAAGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCGCCCTACTATATAGAACCATATAAAATTGCAAGGATGACAT-GATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTACCTCAGACCTCTAAACACAGTGTAGTTCCATTACAAAAACAGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATATTAACACAGAACTCTGCTATCCATAAAGTGTTAATTTCACTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAATTGCATTCACTAACAAAAGTAGTTTCAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGC-AA--AAAAAAAAAAAA--------ATCGTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACAATTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGTAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGAGTCAGCCAGAACTAAT----ACAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCAGGGAACAGATTTTCAGAGGAGTATTTTACTTCACAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAACA---CATGTTCTATAAGTAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATATGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTGAGGAAAATGATGCTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i rheMac3.chr17 C 0 M 627 s macFas5.chr17 82302290 1114 - 96864807 cctaatctgttcgtAGAATTCTTACATACACCGAAGTTAGTGATTTAGTGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AAAGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCGCCCTACTATATAGAACCATATAAAATTGCAAGGATGACATGGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTACCTCAGACCTCTAAACACAGTGTAGTTCCATTACAAAAACAGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATATTAACACAGAACTCTGCTATCCATAAAGTGTTAATTTCACTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAATTGCATTCACTAACAAAAGTAGTTTCAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGCAAA--AAAAAAAAAAAA--------ATCGTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACAATTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGTAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGAGTCAGCCAGAACTAAT----ACAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTGGGAACAGATTTTCAGAGGAGTATTTTACTTCACAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAACA---CATGTTCTATAAGTAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATATGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTGAGGAAAATGATGCTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76975570 1121 - 90913898 CCTAATCTGTTCGTAGAATTCTTACATACACCAAAGTTAGTGATTTAGTGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AAAGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCcatgaaa-------aaaggcaaaaaagtatTTCTTACAGTAAATCGCCCTACTATATAGAACCATATAAAATTGCAAGGATGACAtggattttctcattcttttatgtCAGAATAAGTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTACCTCAGACCTCTAAACACAGTGTAGTTCcattacaaaaacagaaatattaatattattattccaaAATATTAACACAGGACTCTGCTATCCGTAAAGTGTTAATTTCACTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAATTGCATTCACTAACAAAAGTAGTTTCAATTTATACCTAAAACCCAATGC-ATAGCAATACCacatctttgcaaa--aaaaaaaaaaaaaaaaagagatcgtTACAataaggtataattgacatggTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACAATTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGTAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGAGTCAGCCAGAACTAAT----ACAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTGGGAACAGATTTTcagaggagtattttacttcacAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAACA---CATGTTCTATAAGTAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATATGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTGAGGAAAATGATGCTAATAACCTAGTGggtgttttttctt-aaaaataattacca i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78443954 1117 - 92142175 cctaatctgttcgtAGAATTCTTACATACACCGAAGTTAGTGATTTAGTGGGAAAATG---GATTCCTAAACATGAGCACTGCCAAAAAG-AAAGACTAGAAATGCCTCACAATGGTCCCTATGATCCATGAAA-------AAAGGCAAAAAAGTATTTCTTACAGTAAATCGCCCTACTATATAGAACCATATAAAATTGCAAGGATGACATGGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCATTCTCAAACATCTAATGAGTTACCTCAGACCTCTAAACACAGTGTAGTTCCATTACAAAAACAGAAATATTAATATTATTATTCCAAAATATTAACACAGGACTCTGCTATCCATAAAGTGTTCATTTCACTTCAATATTAACCAGGACACCAATTGAAATGTCAATTGCATTCACTAACAAAAGTAGTTTCAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACATCTTTGCaaa--aaaaaaaaaaaaaaa-----aTCGTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACAATTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGTAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGAGTCAGCCAGAACTAAT----ACAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTGGGAACAGATTTTCAGAGGAGTATTTTACTTCATAGACCAAAAGTATGCTGATTATTATGTCATGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGACAGTACCATAACA---CACGTTCTGTAAGTAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATATGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTAAGGAAAATGATGCTAATAACCTAGTGGGTGTTTTTTCTT-AAAAATAATTACCA i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10891883 1117 - 159171411 CCTAATCTGTTCGGAGAATTCTTGCATACACCAAAGTTAGTGATTTAGGGAGAAGATG---GATTCCTAAACATAAGCACTGCC-AAAAG-AAAGACTAGAAGTGCCTCACAAGGGTCCCTATGGTACATGAAA-------AAAGGC-TAAAAGTATTTCTTAAAGTAAATCACCGTCCTACATAGAACCAAATAAAATTGCAAGCATGAC--GGATTTTCTCATTCTTTTATGTCAGAATAACTACTCACTCTCAAACATCTAACGAGTTAACTCAGACCTCTAAATACAGTGGAGTTCCATTACAAAAACAGATATATTAACATTATTATTCCAAAATCTTAACACGGTACTCTGCTATCCATAAAGTGTGAATTTCACTTCAATATTAACCATGACACCAATTGAAATGTCAAATGCATTCACTAACAAAATTAGTTTTAATTTATACCTAAAACCCAATGCAATAGCAATACCACAACTTTGCAAAACAAAACAAAAAAA--------ATCTTTACAATAAGGTATAATTGACATGGTGGACGTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACATTTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGTTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACA-TACCACTTCCTGTCTAGAACACATCAGTTCATCTGCAGAGGATCTAAATATATACTATAGGATAAACCAAAAAGCAAGTATCTGTGTCAGCCAAAACTAATACACACAACATAGAACATTCTCTTGAAAAGTATAGCAATACCTAGGAACAGATTTTCAGAGGAGTATTTTACTTCATAGACAAAATGTATGCTGATGATTATGTCGTGATATATAATTGCTAAACTTTTCAACAGAGAGTACCGTAACA---CATGTTCTATAAGCAGCAATTCTACTTCAGGAATGGATGAGAGTTT---GTAATCCTGTATCTTTTTAAGGAAAATGATGCTAATAACCTACTGTGTGTTTTTTCTTAAAAAATAATTACCA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5399465 1098 + 51628933 CCTAATCTTTTCATGGAATTCTTACCTACACCTGAATTAGTGACTACGGGGAAAGATGACTAATTCCTAAACATCAACACTGCTAAAAAGAAAAGACTGGAAATGCCT----ATGGTCCCCATGGTCCATGaaaaaaatgcaaaaaaaaaaaaaaaaaaattaaaataaaTCACCCTCCTATGTAGAACTATATAAAATTACAAGGATGCCATGGATATGCTTACTCTTTTATGTCAGAAGGGCTACTCTTTCTCAAACATCTAAGTAATTACC-CAGACTTCTAATCACATTGGAGTTCCATTACAAAATCAAAAATATGAA---TTTTATTCCAAAATCTTAACACATGACTATGCTACCCACATAAAGTTAATTTCACTTCAGTTTTAACTATGACAACAATTGAAAAGTCAAATGCATTCACTAACAAAAGTA-TTTTAAATTATTCCTAAAACTGAATGCAATAGCAATACCATATCTTTTCAAA-----------AAA--------ATCTTTAAAAT-AGGTATATTTGACATGGTGGA-GTAATAGTAAATAGATGGCCATCTTCGAAGAGGTACATTTTCAAACATAATTTAACAAACTTACCAGTAACTAAAATGCATCGGATTGCTGCAGGGCTCACAATAAACTTGCAAAATTCTGTGTACTGCCATACAAAATTTCTCTCCATTCTTGCCTATTTCCAACTCCCCTAGATACAAAGGCAAATATAAAGGATACTTCAGCCCATTCCTATATCTCCTACATTACCACTTCCTGTCTAG-ACACAACAGTTCATCTGTAGAGGATCTAAGTACA-----TAGGAT-AACCAAAAACCAAGTATCTGTGTTGGCCAAAGCTAGTATATACAACATAGAAGATTCTCTTGAAAAGTATAG------CTAGAAACAGATTTTCATAGGAATATTTTACTTGATAGACAAAAAGTATACTGAC--TTCACTCATAAAGTAAAATTGCTAAACTTTTCAATAGACAGTACTATAACATATCATGTTCTATATGTAGCAATTCTACTTCAGGAATAGTTAGGAGTGTTTAATAATCCTGTCTCCTTTTAAGGAAAATGACACTAACAATCTATAGGG---TTAATCTT-AAAAATAATTACCA i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=1874148.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 10895 727 + 478999 TCTTGTAATTCTTAATAAGCTTAATTTAAGTTAGAAAATAATGTTTATTTCAAGTATCAGATCGTAAAGGGTTAGACCATGGGAAAAAAATGAAAGAAATAGCATAATAATACCTCTTATAAATTAGCATATTTATTATTTCTCCAGAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATGCCACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGAATATTTATTAACTATGTATAAAAACATAACTAACC--TGtttataat------ataca---tatatttatatgccattaaaatttaaatatagattttgactt-attttactataactttatccatttcaatttg-----tatttaatttTTTAAAATAACTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCATGAAGTTTTATTATTTTTGAGGTACTTTTATTATTTAGAATTCAATATATCATAAAGATACACCTAATTCATAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGTAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTTTTTACTGAAA-AAGCAAAGTACCACAGCTAGATTGGCTTTTTAAATAAAGATCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATAACTTACGTAAAAAGTAAAGATTCCCCCCCTAAAATCCAATACCTCCTCCACTTTTAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTA-------------ATC---AAGTAGATTAAGTTTCAAATCGGATTTACGGT s panTro4.chr13 80379604 728 - 115123233 CCTTGTAATTCTTAATAAGCTTCATTTAAGTTAGAAACTAATATTTATTTCAAGTATCATATTTTAAAGGGCTAGACCATGGGAAAAAAATGAAAGAAATAGTATAATAATATCTCTTATAAATTAGCATATTTATTACTTCTCCAGAACTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATACCACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGaatatttattaactatgtat--aaacataactaatt--tgtttataat---aaaatata---tatatttatattccattaaaatttaaatataGATTTTGACTT-ATTTTACTGTAACTTTATCCATTTCAATTTG-----TATTTAATTTTTT-TAATAACTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCATAAAGTTTTATTATCTTTGAGGTACTTATATTATTTAGAATTCAATATATCATAAAGATACAACTAATTCATAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGTAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTTTTTACTGAAA-AAGCTAAGTACCACAGCTAGATTGGCTTTTTAAATAAACACCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATACCTTACATAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCCAATACCTCCACCCCTTTTAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTTCCAAATCAGATTTACAG- i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82318855 717 - 117095149 TCTTGTAATTCTTAATAAGCTTCATTTAAGTTAGAAAATAATATTTATTTCAAGTATCAGATTTTAAAGGGCTAGACCATGGG-AAAAAATGAAAGAAATAGTATAATAATACCTCTTATAAATTAGCATATTTATTACTTCTCCAGAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATACCACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTCAGAATATTTATTAACCATGTAT--AAACataattaatt--tgtttataat----aaaaata---tatagttatattccattaaaatttaaatataGATTTTGACTT-ATTTTACTATAACTTTATCCATTTCAATTTG-----TAT----TTTTTT-TAATAACTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCATAAAGTTTTATTATCTTTGAGGTAC-----TTATTTAGAATTCAATATATCATAAAGATACAACTAATTCATAATTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTATGTTCAAAGGTAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTTTTTATTGAGA-AAGCTAAGTACCACAGCTAAATTGGCTTTTTAAATAAACATCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATACCTTACATAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCCAATACCTCCTCCCCTTTTAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTTCCAAATCAGATTTATGG- i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4329628 722 + 118206036 ACTTGTAATTCTTAATAAGCTTCATTTAAGTTAGAAAAT-ATATTTATTTCAAGTATCAGATTTTAAAGGGCTAGACCATGGG-AAAAAATGAAAGAAATAGTATAATAATACCTC--ATAAATTAGCATATTTATTATTTCTCCAGAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATGCCACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGAATATTTATTAACTATGTAT--AAACATAACTAATT--TGTTTATAAT----AAATATA---TATATTTATATTCCATTAAAATTTAAATATAGATTTTGACTT-ATTTTACTATAACTTTATCCATTTCAATTTG-----TATTTAATTTTTT--AATAACTGATGTAGATAACTCACGTAACGTGATCCATAAAGTTTTATTATCTTTGAGGTACTTATGTTATTTAGAATTCAACATATCATAAAGATACAACTAATTCTTAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGTAGCTCTCTGACGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTTTTTACTGAAA-AATCTAAGTACCACAGCTAGATTGCCTTTTTAAATAAACATCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATACCTTACATAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCCAATACCTCCTCCCCTTTTAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTTCCAAATCAGATTTATGG- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82303404 728 - 96864807 TCTTGTAATTCTTAATAAGCTTCATTTAAGTTAGAAAATAATATTTATTTCAAGTATCAGATTCTAAAGGGCTAGACCATGGG-AAAAAATGAAAGAAATAGTATAATAATACCTCTTATAAATTAGCATATTTATTATTTCTCCAGAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATACAACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGAATATTTATTAACTATGTAT--AAACATAACTAATT--TGTTTATAAT-A-AAAATATA---TATATTTCTATTTCATTAAAATTTAAATATGAATTTTGACTT-ATTTTACTATAACTTTATCCATTTCAATTTG-----TATTTAACTTTTT-TAATAACTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCATAAAGTTTCATTATATTTCAGGTACTTATATTATTTAGAACTCAATATATCATAAAGATACACCTAATTCATAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGTAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTCTTTACTGAAA-AAACTAAGTACCACAACTAGATTGGCTTTTTAAATAACCATCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATACCTTCCATAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCTAATACGTCCTCCCCTTATAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTCCCAAATCAGATTTACAG- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76976691 728 - 90913898 tCTTGTAATTCTTAATAAGCTTCATTTaagttagaaaataatatttatttcaagtaTCAGATTCTAAAGGGCTAGAccatggg-aaaaaatgaaagaaatagtatAATAATACCTCTTATAAATtagcatatttattatttctccagAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATACAACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGaatatttattaactatgtat--aaacataactaatt--tgtttataat-a-aaaatata---tatatttctatttcattaaaatttaaatatgaattttgactt-attttaCTATAACTTTATCCATTTCaatttg-----tatttaacttttt-taataaCTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCataaagttttattatatttcaggTACTTATATTATTTAGAATTCAATATATCATAAAGATACACCTAATTCATAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGTAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTCTTTACTGAAA-AAACTAAGTACCACAACTAGATTGGCTTTTTAAATAACCATCTTTTTATTAAGAAGACTGGAA---ATACCTTCCATAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCTAATACGTCCTCCCCTTATAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTCCCAAATCAGATTTACAG- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78445071 724 - 92142175 TCTTGTAAATCTTAATAAGCTTCATTTAAGTTAGAAAATAATATTTATTTCAAGTATCAGATTCTAAAGGGCTAGACCATGGG-AAAAAAT----GAAATAGTATAATAATACCTCTTATAAATTAGCATATTTATTATTTCTCCAGAGCTTTTTGGCCTTTATTGATAAAGAATGCAACAACAGTCTTGGCCCACAAATACCTGAGAATATTTATTAACTATGTAT--AAACATAACTAATT--TGTTTATAAT-A-AAAATATA---TATATTTCTATTTAATTAAAATTTAAATATGAATTTTGACTT-ATTTTACTATAACTTTATCCATTTCAATTTG-----TATTTAACTTTTT-TAATAACTAATGTAGATAACTCATGTAATGTGATCCATAAAGTTTTATTATATTTCAGGTACTTATATTATTTAGAATTCAATATATCATAAAGATACACCTAATTCATAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAAACCTAAGTTCTGTTCAAAGGCAGCTCTCTGAAGACATAAACTGGCTATTCAATTTGGTCTTTACTGAAA-AAACTAAGTACCACAACTAGATTGGCTTTTTAAATAAACATCTTTTTATTAAGAAGACTAGAA---ATACCTTCCACAAAAAGTAAAGATT--CCCCCTAAAATCTAATACGTCCTCCCCTCATAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTG---------ATT---AAGTAGATTAAGTCCCAAATCAGATTTACGG- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10893000 723 - 159171411 TGTTGTAATTCTT-ATAGGCTCGATTTAAGTTAGAAAATAATATTTATTTCAAGTATTATATTTTAAAGAGCTAGACCATGGG-AAAAAATGAAAGAAATAGTATAATAATACCTCTAATGACTTAGCATATTTATTATTTCTCCAGAGCTTTTTGGTCTTTATCAATCAAGAATACCACAACAGTCGTGGCCCACAAATACCTGAGaatatttattaactatgtat--aaaca----taatt--tgtttataatca-gaattatt---tatatttatattccattaaaatttaaaCATAGATTTTGACTT-ATATTACTATAACTTTATCCATTTCAATTTA-----TATTTAGTTTTTAAAAATAACTAATATAGATAACTCATGTAATCTGATCCATAAAGTTTTATTATCTTTGAGGTATTTTCATTATTTTGAATTCAATGTATCAT--AGATACACCTAATTCAAAACTAAAATGATTAAGAGTGAATATATAATCCTAAATTCTGTTCAAAGGTAGCTCTATGAAGACATAAACTGACTATTCAATTTGGCTTTTACTGAAA-AAGCAAAGTACCACAGATAGATTGGCTTTTTAAATAAACATATTTTTATTAAGAAGTCTGAAA---CTACCTCACATAAAAAGTAAAGATT--CCCCTTAAAATCCAATATATCTTCCCCTTTTAAAAGAATGTT-------------------------GCAAAGTAATTC---------ATT---AAGTAGATTAAGTTCCAAATCAGATTTATGG- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5400563 755 + 51628933 TCTTCCAGTTCTTAATAAGCTTCTATTAAATTAGAAAGTAATATTTATTTTAAGAACATACTCATAAAGGGCTAGACCTTAGA-AAAAAATGAAGAAAATAGTATAATAATATCTCTAATGACTCAGCATACTTATTATCTCTCTAGAACTTTCTCATCCATATTATTAAAGAATACCAC-ATAATCTTGGCCCACAATCACCTGAGAATATATAATAACTATATAT--GAACATGACTAATTTCTATTTCTAAT-ATAAAATATGTACTATATTTAGGTTCCATTAAAATTTCTATATAAAATTTGACTTGATTTTAATATAATTTTATTCATTTGAAATTGTCCattatttattttttttaaataaCTAATGTAAATAACTCATGCCATGTGATCCTAAAAGTTTTATTATTTTTGAGGTATTTG-ATTATTTAAA----CATATATCA-AAAGACAGACCTAATGTATAACTGAAATGATTAA-ATTGAATACATAA-CCAAAGTTCAGTTC-AAGACAGTTCCTAGGATTCAGAAACTGGCTTTTCAATCTGCTTTGTACTGAAACAAGCCATGTATCTCAGCTAGATGAACTGCTTAAGTA----------TATTGAGAAGAATGGCATTCATAAGTTA---AAAAATTAAAGACT--GCCC--AAGATCCAACACTCCCTCCCCTCTTAAAAGGATATTTTTAATATCTTAAGAAACACTACAGACAAAATAATTGCCAGAATAAATTCAAAAGGAGATTAAGTTTC--ATTAAGATTAAGG- i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80154912 627 - 94676912 M a score=1060331.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11622 329 + 478999 TATCAGTAAGGGGGAAAAAATCTTTTGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTCTTA---AGCCTAATTTAGGACTGAATTACAGTGAAATATTTTAAAAGATGATTAAAATTACGTAAAATATTTAATATCATAGTTTCTATAGTATTTCTCTCACTACAAAACTCTTCCTAAATA-AGAGTGATCATAGCAGA---AATTGACTTCACTGT-ACATTAATCAATTCAATTC-CACACCCAAAACAATTTTGCATC--CAAGA-TAATTTTCAGTGACAC----------A-AAAAAACTCACAGTAAGTTCTAAGAGTT-AATTTCCTTCACAGTTCAACATTAGAAAGGGCTAA s panTro4.chr13 80380332 332 - 115123233 TATCAGTAAGGGGG-AAAAATCTTTTGACATTTTTAAAAGGTTTCATCTCTTA---AGCCTAATTTAGGACTGAATTACAGTGaaatattttaaaagatgattaaaattatgtaaaatatttaatatCATA-TTTCTATAGTATTTCTCTCACTACAAAACTCTTCCTAAATG-AGAGTGATCATAGCAGAAATAATTGATTTCACTGT-ACGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCGGTGACAC----------ACAAAAAACTCACAATAAGTTGTAAGAGTTAAATTTCCTTCACAGGTCAACATTAGAAAGGGCTAA i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82319572 331 - 117095149 TATCAGTAAGGGGG-AAAAATCTTCTGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTCTTA---AGCCTAATTTAGGACTGAATTACAGTGaaatattttaaaagatgattaaaattatgtaaaatatttaatatCATA-TTTCTACAGTATTTGTCTCACTACAAAACTCTTCCTAAATG-AGAGTGATCATAGCAGAAATAATTGATTTCACTGT-ACATTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCGGTGACAC----------ACAAAAAACTCACAATAAGTTGTAAGAGTT-AAATTTCTTCACAGTTCAACATTAGAAAGGGCTAA i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4330350 330 + 118206036 TATCATTAAGGGGG-AAAAATCTTTTGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTCTTA---AGCCTAATTTAGGACTGAATTACAGTGAAATATTTTAAAAGATGATTAAAATTATGTAAAATATTTAATATCATA-TTTCTATAGTATTTCTCTCACTACAAAACTCTTCCTAAAT---GAGTGATCATAGCAGAAATAATTGATTTCACTGT-ACGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCAGTGACAT----------ACAAAAAACTCACAATAAGTTGTAGGAGTTAAATTTCCTTCACAGTTCAACATTAGAAAGGGCTAA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80155547 332 - 94676912 TATCAATAAGGGGGAAAAAATCTTTGGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTTTTA---AGCCGACTTTAGGACTGAATTACAGTGaaatattttaaaagatgattacaattatgtaaaatatttaatattata-tttCTATAGTATTTCTCTCACTACATAACTCCTCCTAAATG-AGAGTGATCACAGCAGAAATAATTGATTTCATTGT-ATGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCGGTGACAC----------AAAAAAAACTCACAGTAACTTGTAAGAGCT-AATTTCCTTCATAGTTCAGCATTAGAAGGGGCAAA i rheMac3.chr17 M 627 C 0 s macFas5.chr17 82304132 332 - 96864807 TATCAATAAGGGGGAAAAAATCTTTGGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTTTTA---AGCCGACTTTAGGACTGAATTACAGTGAAATATTTTAAAAGATGATTACAATTATGTAAAATATTTAATATTATA-TTTCTATAGTATTTCTCTCACTACATAACTCCTCCTAAATG-AGAGTGATCACAGCAGAAATAATTGATTTCATTGT-ATGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCGGTGACAC----------AAAAAAAACTCACAGTAACTTGTAAGAGCT-AATTTCCTTCATAGTTCAACATTAGAAGGGGCAAA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76977419 332 - 90913898 TATcaataagggggaaaaaatcttTGGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTTTTA---AGCCGACTTTAGGACTGAAttacagtgaaatattttaaaagatgattacaattatgtaaaatatttaatattata-tttctatagTATTTCTCTCACTATATAACTCCTCCTAAATG-AGAGTGATCACAGCAGAAATAATTGATTTCACTGT-ATGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCGGTGACAC----------aaaaaaaaCTCACAGTAAGTTGTAAGAGCT-AATTTCCTTCGTAGTTCAACATTAGAAGGGGCAAA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78445795 332 - 92142175 TATCAATAAGGGGGAAAAAATCTTTGGACATTTTCAAAAGGTTTCATCTCTTA---AGCCGACTTTAGGACTGAATTACAGTGAAATATTTTAAAAGATGATTACAATTATGTAAAATATTTAATATTATA-TTTCTATAGTATTTCTCTCACTACATAACTCCTCCTAAATG-AGAGTGATCACAGCAGAAATAATTGATTTCACTGT-ATGTTAATCAATTCAAGTC-CACACCCAAGACAATTTCGCATC--CAAGA-TAATTTTCAGTGACAC----------AAAAAAAACTCACAGTAAGTTGTAAGAGCT-AATTTCCTTCATAGTTCAACATTAGAAGGGGCTAA i chlSab2.chr3 C 0 I 29167 s calJac3.chr5 10893723 313 - 159171411 TATCAGTAAAGGGGAAAAAACCTTTCAACATTTTCAAAAGGTTTCATTGCTTA---AGCCTAATTTAG----------CACTTAAATACTTTAAAAGATGATTAATATTATGTAAAATATTTAACATCATAGTTTCTATAGTATTTCTCTCACTATAAAACT--TCCTAAATG-ACAGTGATCATAGCAGAAATAATTAATTTCACTGT-ACATTAATCAATTAAAGTC-CACACCCAAGACAATTTTGCATC--CAAGA-CAATTTTC------------------AAAAAAAACTCACAATAAGTTACAAGACTT-AACTTCCTTCACAGTTCAACAGTAGAAAAGGCTAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5401318 342 + 51628933 TACCAGGAAAGGGA-GAAAATCTTTTGACTTTTTCATAAGGTTTCTTCTTTTATATAGCCTAATTTGGTACGGAAATACATTGAAATCTTGCAAAGGATGATTAAAATTATATAAAATATCTAATACCATTGTTTCTATGCTATTTCTTTGACTAGAAAACTTTTCTGAGATGAAGAGTGATCG-AGCAGGAACAA-------AACTGTAAAAGAAATCAACTCAAGTCTCATACCCAAGGTAATTTCTCATCAACAAAATTAATTTCTAGTGACACACATGCAAAAAAAAAAATCTCACAG-AAGTTAGAAGAGTT-AAGTTCCTTCACAGTTCAAAATTAGAAAGGTCTAA i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=10089.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11951 4 + 478999 ACCA s panTro4.chr13 80380664 4 - 115123233 ACCA i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82319903 4 - 117095149 ACCA i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4330680 4 + 118206036 ACCA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80155879 4 - 94676912 CCCA i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82304464 4 - 96864807 CCCA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 76977751 4 - 90913898 CCCA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10894036 4 - 159171411 ACCA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5401660 4 + 51628933 ACCA i canFam3.chr25 C 0 I 30080 e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I a score=5423.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11955 3 + 478999 TAT s panTro4.chr13 80380668 3 - 115123233 CAT i panTro4.chr13 C 0 C 0 s ponAbe2.chr13 82319907 3 - 117095149 TAT i ponAbe2.chr13 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4330684 3 + 118206036 TAT i nomLeu3.chr9 C 0 I 33592 s rheMac3.chr17 80155883 3 - 94676912 TAT i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82304468 3 - 96864807 TAT i macFas5.chr17 C 0 I 29201 s papAnu2.chr17 76977755 3 - 90913898 TAT i papAnu2.chr17 C 0 I 29319 s calJac3.chr5 10894040 3 - 159171411 AAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I a score=2800.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11958 1 + 478999 G s panTro4.chr13 80380671 1 - 115123233 G i panTro4.chr13 C 0 I 33405 s ponAbe2.chr13 82319910 1 - 117095149 G i ponAbe2.chr13 C 0 N 0 s nomLeu3.chr9 4364279 1 + 118206036 g i nomLeu3.chr9 I 33592 C 0 s rheMac3.chr17 80155886 1 - 94676912 G i rheMac3.chr17 C 0 I 30103 s macFas5.chr17 82333672 1 - 96864807 g i macFas5.chr17 I 29201 C 0 s papAnu2.chr17 77007077 1 - 90913898 G i papAnu2.chr17 I 29319 C 0 s calJac3.chr5 10894043 1 - 159171411 G i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I a score=422.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11959 1 + 478999 C s nomLeu3.chr9 4364280 1 + 118206036 t i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82333673 1 - 96864807 t i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007078 1 - 90913898 T i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10894044 1 - 159171411 T i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I e rheMac3.chr17 80155887 30103 - 94676912 I e panTro4.chr13 80380672 33405 - 115123233 I a score=1365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11960 1 + 478999 T s ponAbe2.chr14 90185712 1 - 108868599 t i ponAbe2.chr14 N 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4364281 1 + 118206036 t i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82333674 1 - 96864807 t i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007079 1 - 90913898 T i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10894045 1 - 159171411 T i calJac3.chr5 C 0 I 29543 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I e rheMac3.chr17 80155887 30103 - 94676912 I e panTro4.chr13 80380672 33405 - 115123233 I a score=1097.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11961 2 + 478999 AC s ponAbe2.chr14 90185713 2 - 108868599 ac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4364282 2 + 118206036 at i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82333675 2 - 96864807 at i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007080 2 - 90913898 AT i papAnu2.chr17 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e chlSab2.chr3 78446127 29167 - 92142175 I e rheMac3.chr17 80155887 30103 - 94676912 I e panTro4.chr13 80380672 33405 - 115123233 I e calJac3.chr5 10894046 29543 - 159171411 I a score=7644.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11963 3 + 478999 AAT s panTro4.chr13 80414077 3 - 115123233 aat i panTro4.chr13 I 33405 N 0 s ponAbe2.chr14 90185715 3 - 108868599 aat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4364284 3 + 118206036 aat i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80185990 3 - 94676912 aat i rheMac3.chr17 I 30103 C 0 s macFas5.chr17 82333677 3 - 96864807 aat i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007082 3 - 90913898 AAT i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78475294 3 - 92142175 aat i chlSab2.chr3 I 29167 C 0 e canFam3.chr25 5401664 30080 + 51628933 I e calJac3.chr5 10894046 29543 - 159171411 I a score=404389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 11966 165 + 478999 AGACCTCATGtgatatttccaacatg-tgggttatctt-agagttggtctatgatgattttctcttcccttgagaataagtcacattttcctgaccatttttagaataagtac-------------------ttttggattatatgctaaatagtgtgactattaCTCTGT----ACAATACTGTAGAGA--------------------------------------------- s panTro4.chr2B 115163713 165 - 247518478 agacctcatgtgatatttgcaacatg-tgggttatctt-agagttggtatatgaggattttctcttcccttgagaataagtcacatttttctgaccatttttagaataagtac-------------------ttttggattatatgctaaatagtgtgactattaCTCTGT----ACAATATTATGGAGA--------------------------------------------- i panTro4.chr2B N 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90185718 164 - 108868599 agacctcatgtgatatttccaacatg-tgggttatcttaagagttggtatatgatgattttctcttcccttgagaac--gtcacattttcctgaccatttttagaataagtac-------------------ttttggattacatgctaaatagtgtgactattaCTCTGT----ACAATATTATGGAGA--------------------------------------------- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4364287 178 + 118206036 agacctcatgtgatatttccaacacg-tgggttatctt-ggtgttggtatatgatgattttctcttccctt--gaataagtcacattttcct----atttttagaaaaaatacttttggattatatgctaaattttggattatatgctaaattgtgtgactattactccgt----acaatattgtagaga--------------------------------------------- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80185993 161 - 94676912 agacttcatgtggtatttccaacatg-tgggttatctt-ggagttggtatatgatgattttctcttcccttgagaataagtcacattttc----ctatttttagaataagtac-------------------ttttggattatatgctaaattttgtgactattGCTCTGT----ACAATATTGTAGAGA--------------------------------------------- i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82333680 165 - 96864807 agacttcatgtggtatttccaacatg-tgggttatctt-ggagttggtatatgatgattttctcttcccttgagaataagtcacattttcctgactatttttagaataagtac-------------------ttttggattatatgctaaattttgtgactattGCTCTGT----ACAATATTGTAGAGA--------------------------------------------- i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007085 165 - 90913898 AGACTTCATGTGGTATTTCCAACATG-TGGGTTATCTT-GGAGTTGGTATATGATGATTTTCTCTTCCCTTGAGAATAAGTCACATTTTCCTGACTATTTTTAGAATAAGTAC-------------------TTTTGGATTATATGCTAAATTTTGTGACTATTGCTCTGT----ACAATATTATAGAGA--------------------------------------------- i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78475297 161 - 92142175 agacttcatgtggtatttccaacatg-tgggttatctt-ggagttggtatatgatgattttctcttcccttgagaataagtcacattttc----ctatttttagaataagtac-------------------ttttggattatatgctaaattttgtgactattGCTCTGT----ACAACATTGTAGAGA--------------------------------------------- i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5431744 215 + 51628933 agtcctcatgtgataattcaatgattctggtttatcct-gaagttgctgtgtgctgattttccctttccttgagaataagtcacattttcctggcttttcaaaggatgagcaa-------------------ttttggattatatgctggacatggtgaaaattattctgtagagaccatatttttctgaaaagtatttatgtttttgtttcatggactcattttcctgtttaga i canFam3.chr25 I 30080 C 0 e calJac3.chr5 10894046 29543 - 159171411 I a score=3044801.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 12131 959 + 478999 ---------------------------------------------------------------------------AACTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAT------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggggatatcagtccatgcagactgactgttccatattttgactaccctc--------gcctgcttttattcaatcttcacaatcctcagatagatgttatctatattatgtgcagagtttacaaatggttatttttgagaagatcagtttgttaggagctcacccctctatacaagtatcagaaatcCTCTGAAGTGATCTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTCTTTATGATATAGCAAATTATA-AAAACTATTATACTATCATATTCATAAATGAAGGAGAGAACTCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCCATGAAGACTAACTGCTTGCCACACGGGATTAACAGAACAATGAGAAAATGTCTAGTAATAATTATAAAATATAAAAA---CTTTGTTAAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCACC--------TCATACACAAT------------CTTGAAGACATTAAATAACCC---CAAATAG----CCACTGTAAACTTACCTGGCAGTAAATTTTACTATACTAGACAAATCTACAGTGAGATTTTCTGTTATTTTAAATATTTTCTGTATTTCTG-----TATTTTCCAAAATGAACGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCCTAACTTATTTACTGTTTCCAGAAAATAACCAAGTACAGAATATATACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATA-TCAACAG-AAAAAAATTTACCTAGCACTACAGTGA----------CCAACAGGTCAAAATCATTTGTGACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGATGGCATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTTGAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAGCTCAGAATCATA---AATATTGTCTGACCATTACAAT----GAAAGTTCCATATAACTG---------AAGGCA s panTro4.chr2B 115163878 975 - 247518478 ---------------------------------------------------------------------------AACTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAT------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggggatatcagtccatgtagacagactgttctatattttgactaccctccgaagcttgcctgcttttattcaatctccacaaccctcagatagatattatctatattatgtgcagagtttacaaatggttatttgtgagaagatcagtttgttaggagctcacccctccacacaagtactggaaatcCTCTGAAGTGATTTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTTT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AAAACCATTATGCTATCATATTCATAAATGAAAGAGAGAACTCAAAACTAAATTTTCAAATATCTGGCCATGAAGACTAACTGCTTGCTACACGGGATTAACAAAACAATGAGAAAATGTCTAGtaataattataaaatataaaaa---CTTTGTTAAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCACC--------TCATACAGAAT------------CTTGAAGACATTAAATAACCC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTATGTGGTAGTAAATTTTACTATACTAGACAAATCTACAGTGAGATTTTCTG-TATTTTAAATATTTTCTGTATTTCTG-----TATTTTCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCCTAACTTATTTACCATTTCCAGAAAATAACCAAGTACAGAATACTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATATTCAACAG-AAAAAAATTTACCTAGCACTACAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTGACAGGTTCTATTGAATATATAGTTTGATGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAACTTTGAAGCCCA--TATGTTAACATGCTACCTACACTAAACTCAGAATCATA---AATTTTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTT---------AAGACA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90185882 968 - 108868599 ---------------------------------------------------------------------------AACTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAT------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggggatatcagtccatgtagactgactgttccatattttgactaccctccaaagcttgcctgcttttattcaatctccacaaccctcagatagatgttatctatattatgtgcagagtttgcaaatggttatttgtgagaagatcagtttgttaggagctcac--------acaagtattggaaATCCTCTGAAGTGATTTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AAAACCATTATGCTATCATATTCATAAATGAAAGAGAGAACTCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCCATGTAGACTAACTGCTTGCTACACGGGATTAACAGAACAATGAGAAAATGTCTAGtaataattataaaatataaaaa---CTTTGTTAAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCACC--------TCATACAGAAT------------CTTGAAGACATTAACTAACCC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTATCTGGTAGTAAATTTTACTATACTAGACAAATCTATAGTGAGATTTTCTG-TGTTTTAAATATTTTCTGTATTTCTG-----TATTTTCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAGGTGATACCCTAACTTATTTACCGTTTCCAGAAAATAACCAAGTACAGAATATTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATATTAGACAGAAAAAAAATTTACCTAGCACTACAGTAA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTGAGAGGCTCTATTGAATATATAGTTTGATGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAACTTTGAAGTCCA--TATGTTGACATGCTATCCACACTAAGCTCAGAATCATA---AATTTTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTT---------AAGGCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4364465 984 + 118206036 ---------------------------------------------------------------------------aACTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAT------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggggatatcagtccatgcagaccaactcttccatattttgactaccctccaaagcctgcctgcttttattcaatctccataaccct---atagatgttatctatattatgtgcagagtttacaaatggttatttgtgagaagatcagtttgttagaagctcacccctccatacaagtattggaaatcCTCTGAAGTGAATTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCACTTAGAACTTTATTATGATATAGCGATTCAT--AAAACCATTGT--TATCATATTCATAAATGAAGGAGAGAACTCAAAGCTACATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCACACAGGGTTAACATAACACTGAGAAAATATCTAGTAATAATTATAAAATATAAAAA---CTTTGTTAAAATCTGATTCGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCACC--------TGATACACAAGA--TTTTATAAACTCGAAGACATTAAATAACCC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTGTCTGATAGTAAATTTTACCATACTAGACAAATCTACAGTGAGATtttctg-tattttaaatgttttctgaatttctgtattctattttcCAAACTGAATGGTATATTCAGTTAATAAGTGACACCCTAACTTACTTACTCTTTCCAGAAAATAACCAAGTACAGAATATTTACTGATAAACTGCAATGCTTAAAACCAAACATTCGACAG-AATAAAAATTACCTAGCACTCCAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTGACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGATGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTCAAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAGCTCAGAATCATA---AATATTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTT---------AAGGCA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80186154 985 - 94676912 ---------------------------------------------------------------------------AATTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAt------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggagatatcaagccatgtagactgactgttccatatattgactaccctccaaagcctgcctgcttttattcaatctccataaccctcaaatagatgttatctacattatgtgcagagtttgcaaatggttatttgtgagaatatcagtttgttaggagctcacccctccatacaagtattggaaatcCTCTGAAGTGAATTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AATACCATTATGTTACGATATTCATAAATGAAGGAGAGAACTCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCACA-AGGGTTAACGTAACACTGATAAAATATCTAGtaataattataaaatataaaaC---TTTTGTTTAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCATT--------TGATACACAAGA--TTTTATAATCTCGAAGACATTAAATAACTC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTACCTGGTAGTAAATTTTACCATACTAGACAAATCTACAGTGAGATTTTCTG-TATTTTAAATATTTTCTGAATTTCTGTATTTTACTTTCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCCTAACTTAT----TACTGCCAGAAAATAACCAAGTACTGAATTTTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATGTTCGACAG-AACAAAAATTACCTGGCACTCCAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTAACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGACGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTCGAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAACTCAGAATCATA---AATATTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTC---------AAGGCA i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82333845 985 - 96864807 ---------------------------------------------------------------------------AATTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAt------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggagatatcaagccatgtagactgactgttccatatattgactaccctccaaagcctgcctgcttttattcaatctccataaccctcaaatagatgttatctacattatgtgcagagtttgcaaatggttatttgtgagaatatcagtttgttaggagctcacccctccatacaagtattggaaatcCTCTGAAGTGAATTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AATACCATTATGTTACGATATTCATAAATGAAGGAGAGAACTCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCACA-AGGGTTAACGTAACACTGATAAAATATCTAGTAATAATTATAAAATATAAAAC---TTTTGTTTAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCATC--------TGATACACAAGA--TTTTATAATCTCGAAGACATTAAATAACTC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTACCTGGTAGTAAATTTTACCATACTAGACAAATCTACAGTGAGATTTTCTG-TATTTTAAATATTTTCTGAATTTCTGTATTTTACTTTCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCCTAACTTAT----TACTGCCAGAAAATAACCAAGTACTGAATTTTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATGTTCGACAG-AACAAAAATTACCTGGCACTCCAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTAACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGACGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTCGAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAACTCAGAATCATA---AATATTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTC---------AAGGCA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77007250 985 - 90913898 ---------------------------------------------------------------------------AATTTTC---------------------TGGCCAGAAA-----------------------------------------------GTTtcctat------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatgggGATATCAAGCCATGTAGACTGACTGTTCCATATATTGACTACCCTCCAAAGCCTGCCTGCTTTTATTCAATCTCCATAACCCTCAAATAGATGTTATCTACATTATGTGCAGAGTTTGCAAATGGTTATTTGTGAGAATATCAGTTTGTTAGGAGCTCACCCCTCCGTACAAGTATTGGAAATCCTCTGAAGTGAATTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AATACCATTATGTTACGatattcataaatgaaggagagaacTGAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCACA-AGGGTTAATGTAACACTGATAAAATATctagtaataattataaaatataaaac---ctttGCTTAAATCTGATTTGCAAGCTTATGTCAAAGGGCCATC--------TGATACACAAGA--TGTTATAATCTCGAAGACATTAAATAACTC---CAAATAGAGATCCACAGTGAACTTACCTGGTAGTAAATTTTACCATACTAGACAAATCTACAGtgagattttctg-tattttaaatattttctgaatttctgtattttactttCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCCTAACTTAT----TACTGCCAGAATATAACCAAGTACAGAATTTTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATGTTCGACAG-AACAAAAATTACCTGGCACTCCAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTAACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGATGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTACTAATTTCGAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAACTCAGAATCATA---AATATTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTCCATATAACTC---------AAGGCA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78475458 984 - 92142175 ---------------------------------------------------------------------------AATTTTC---------------------TGGCC-GAAA-----------------------------------------------GTTTCCTAt------------------------------------------------------------------aaaag-caaaaaatggggatatcaagccatgtagactgactgttccatatattgactaccctccaaagcctccctgcttttattcaatctccataaccctcaaatagatgctatctacataatgtgcagagtttgcaaatggttatttgtgagaatatcagtttgttaggagctcacccctccatacaagtattggaaatcCTCTGAAGTGAATTTTAATTTTGGAGGTTGTGTTATACTTTTTCTCT-TATCAGTTAGAACTTTATTATGATATAGCAAATTATA-AATACCATTATGTTACGATATTCATAAATGAAGGAGAGAACGCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCACA-AGGGTTAACGTAACACTGAGAAAATATCTAGTAATAATTATAAAATATAAAAC---CTTTGTTTAAAACTGATTTGCAAGGTTATGTCAAAGGGCCATC--------TGATACACAAGA--TTTTATAATCTCGAAGACATTAAATAACTC---CAAATAGAGATCCACAGTAAACTTACCTGGTAGTAAATTTTACCATACTAGACAAATCTACAGTGAGATTTTCTG-TATTTTAAATATTTTCTGAATTTCTGTATTTTACTTTCCAAACTGAATGGTTTATTTAGTTAATAAGTGATACCATAACTTATTTACTATTTCCAGAAAATAACCAAGTACAGAATTTTTACTGATAAGCTGCAATGCTCAAAACCAAATGTTCGACAG-AACAAAAATTACCTGGCACTCCAGTGA----------CCAACAAGTCAAAATCATTTGTAACAGGCTCCATTGAATATATAGTTTGATGACATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTCGAAGCCCA--TATGTTGACATGCTATCTACACTAAACTCAGAATC-------ATATTGTCTGACCATTACAATGAAAGAAAGTTACATATAACTC---------AAGGCA i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10923589 980 - 159171411 ---------------------------------------------------------------------------acttctc---------------------tggacagaaa-----------------------------------------------gTTTCCTAT------------------------------------------------------------------AAAAGAAAaaaaatggggatatcagtccatgcagactaactgtttcacattttgactaccttctaaagactgcctgc--------------cataaccctcagatagatgttacctgtattatgtgcagagtttacaaatggttatttgtaagaagatcagtttgttaggaactcacccctccatACAACTATTGGAAATCCGCTAAAGTGATTCTTAATTTTGGGAGTTGTGTTATGCTTTTTCTCT-TATCaattaaaattttattatgatatagtaaattata-aaaaCCATTATGCTATCATTTTCATAAATGAAGGAGAGAACTCAAAGCTAAATTTTCAAATATCTGGCAATGAAGACTAACTGCTTGCCATATAGGGTAAACATAACAATAAGAAAATGTCTAGTAATAATTATAAAATACAAAACTTTTTTTGTTAAAATCTGATTTGCAAGCTTATATCAAAGGACCATC--------TGATACACAAGG--TTTTATAATCTTGAAGATATTAAAGAATCC---CAAATAGATATCCAT-GTAAACTTATCTGATAGTAAATTTTACTATACTAGACAAATCTACAGTGAGACTTCCTG-TATTTTAAATTTTTTTCTGTATTCTGTATTTTATTTTCCAAACTGAATGGTTTATTAAGTTAATAAGGGATACCCTAAGTTATTTACTGTTTCCAGAAAATAATCAGGTACAGAATATTTATTGATAAGCTGCAATGTTCAAAACCAAACATTCCACAG-AAGAAAAATTACCTAACACTCCAGTGA----------CCAACA-GTCAAAATCATCTGTGACAGGCTACACTGAATACATAGTTTGGTTATATTATTTGAAGGTAGAATTAACTTATTTTATTAATTTAGAACCCCCATTATGTTGACATGCCATCTATACTAAGTTCAGAATCATA---AATATTGTCTGATGATTACAATGAAAGAAAGTTCCATGTAACTT---------AAGGCA i calJac3.chr5 I 29543 C 0 s canFam3.chr25 5431959 1182 + 51628933 tacaactacagactgtcatgtgtggtgtcttggatctcagttcagttcttgaacccgtatttacaatctattatcagttttccatgatcatggtttcaggggttggccagagattcaagctgagtatttttaaaatacagattcagattctttccttgctgtctcttatccacggctgcccattaatctccatggtgttgattggccAAGTGTTTTTTATCTTAATTTTTATGGCCAGAG-TGaaaaatggggaactcaatccatgctgaccacttgtttcatgttttggtacctctctaaaacctgactgcaattattcagtct-taaagccctcacatacctgttttctgtattatgtgcagagttt-taagtggtta-ctgtgggaatatcactctcttaggagcttgcctatccaagcaagtatcagaaacCCTCCAAAGTGATTTTTAATTTTGGAGACTGTTCTATACATTTTCTCTGTATCAGTTAGGCCTTTATCATATTATAAT-ACTGATACAGAATCATTATGTTATCGTTTTCTTGAATGGAAGACAAAACACAAAGCTTAATATTGAAATATTTAGCAATGGAGATGAATTGCTTGCCACAAAGGGTT------------AGGAAATGTCCAATAACAATTAAAAAATATCAAAA---CTT---TAAAATCTGTTTTGCAAGCTTATGTCAAAAAACCACTATATATAACTATATATAAGACTTTTTATAATCTTGTAGAGACTGAATTACCCCATCAAATGCAGCTCTCCAATACACTAACCTCATAGTAAATTTTTCTGTACTAGACAAAGTTACAGTGAGAAATTCCG-TGTTTTACCAAT-------------------TAC-TTCCAAATCTAATGATTTATTTAATTGATTAGTAATATACTCCTTTATTTACAGTTTACCTAAAATAGCTAAATACAAAATATTCACTGACAAGCCATATTGCTCAAAACCAGACATTTCATAG-AAAAA----TACCTAATATTCTAATTCTAATTCTATTTCAACAAATCACAATTACACAGAATAGGCTGCATAGTATATATAGTTTGAGGACATTATTTTGGGG-GGAATTAATTTATTTCA---------GGGCCCA--GATGTTGACATGCCATCTACATTAAGCCCAGAATCACAGAGAATACCATCTGACCACTCTACTTATTG-AAGTTCCATATAACATGCATCAACAAAggca i canFam3.chr25 C 0 I 202 a score=948558.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 13090 324 + 478999 ATAAATATAAATAC--TGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCATTTTGTGATTT-ATCCAAATGTCCATTAGTTAATTATATTCTCTACACCTTAAAAGTTCCGCTGTAGCCCTCTACCCCGCTTC-ACTCAC-AGAGAGTGACTTT-------------AGCAAGATAATTTTGACT---ATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TGTCAAAACACAATCTGATC---ATTTGCA----TTCCTCCTTCTCTATGTTCTCTGAATTTCT-----------AAAAAAAAAAAAAAAGGTTTTTAATAT-AAAAAATTTTTGCTGATGCCTGTCATGGT-GCAATTGTACTTATACTA s panTro4.chr2B 115164853 328 - 247518478 ATAAATATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAAT-----CTCCA-TTTGTGATTT-ATCCAAATGTCCATTAGTT-ATTATATTCTCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-TCTCAC-AGAGAGTGACTTT-------------ACTAAGATAATTGTGACTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTT---TTC-TGTCAAAACACAACCCGATC---ATTTGCA----TTCCTCCTTCTCTATGTTCTCTGAATTTCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGCtttttaatat-aaaaaaattttGCTGATGCCTGTCATGGT-GCAATTGTACTTATAATA i panTro4.chr2B C 0 I 1473 s ponAbe2.chr14 90186850 319 - 108868599 ATAAATATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCA-TTTTTGATTT-ATCCAAATGTCCATTAGTC-ATTATATTCTCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-TCTCAC-AGAGAGTGACTTT-------------ACCAAGATAATTGTGACTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTT---TTC-TGTCAAAACACAATCTGATC---ATTTGCA----TTCCTCCTTCACTATGTTCTCTGAATTTCT-------------AAAAAAAAAAAAAGctttttaatat-aaaaaaa-tttgctgatgcctgtcatgat-gcaattgtacttataata i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4365449 322 + 118206036 AAAAATATAAATACTATTTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCA-TTTGTGATTT-ATCCAAATGTCCACTAGTT-ATTATATTCTCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGGAAGTGACTTT-------------ACCAAGATAATTGTGACTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TGTCAAAACACAATCTGATC---ATATGGA----TCCCTCCTTCCCTATATTCTCTGAATTTCT---------------GAAAACAAAAAGctttttaatat-aaaaaatttttgctgatgtctgtcatggtagcaattgtacttataata i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80187139 321 - 94676912 AAACCTATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCG-TTTGGGATTT-ATCCAAATGTCCACTAGTT-ATTATATTCCCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGGAAGTGACTTT-------------ACCAAGATAATTGTGAGTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TATCAAAACACAATCTGATC---ATATGCA----TTCTTCCTTCCCTATATTTTCTGAATTCCT-------------AC---AAAAAAAAGTtttttaatat-gaaaaatttttgctgatgcctgtcacggtagcaattgtacttataata i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82334830 321 - 96864807 AAACCTATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCG-TTTGGGATTT-ATCCAAATGTCCACTAGTT-ATTATATTCCCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGGAAGTGACTTT-------------ACCAAGATAATTGTGAGTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TATCAAAACACAATCTGATC---ATATGCA----TTCTTCCTTCCCTATATTTTCTGAATTCCT-------------AC---AAAAAAAAGTtttttaatat-gaaaaatttttgctgatgcctgtcacggtagcaattgtacttataata i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77008235 324 - 90913898 AAACATATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCA-TTTGGGATTT-ATCCAAATGTCCACTAGTT-ATTATATTCCCTATACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGGAAGTGACTTT-------------ACCAAGATAATTGTGAGTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TATCAAAACACAATCTGATC---ATATGCA----TTCTTCCTTCCCTACATTTTCTGaattcct-------------acaaaaaaaaaaagttttttaatat-gaaaaatttttGCTGATGCCTGTCACGGTAGCAATTGTACttataata i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78476442 320 - 92142175 AAACATATAAATACTATGTTATTATACAACACTAAGTAATTTAAACTCCA-TTTGGGATTT-ATCCAAATGTCCACTAGTT-ATTATATTCCCTACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGGAAGTGACTTT-------------ACCAAGATAAT--TGAGTATAATGTGTGAACTAC-TCAGCTTTTCTTC-TATCAAAACACAATCTGATC---ATATGCA----TTCTTCCTTCCCTATATTTTCTGAATTCCT-------------AC--AAAAAAAAAGTtttttaatat-gaaaaatttttgctgatgcctgtcacggtagcaattgtacttataata i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10924569 309 - 159171411 ATAAATATAAATACTATGTTATGATACAACACAAAGTGATTTAAATTCCA-TTTGTGATTT-ATCCAAATATCCACTACTT-ATTATATTCTCCACACCTTAAAAATTCCACTGTAGCCCTCTACCC--CTTC-ACTCAC-AGAAAGTAACTTT-------------ACCAAGATAATTGAGACTATAATGTGTGAACAAC-TCAGCTTTTCTTC---TCAGAACACAAT----------TTTGCA----TTCCTCCTTCCCTATAGTCTCTGAATTTCT-------------------AAAGaaaattttttattat-aaaaattttttGCTGAAGCCAGTCATGGTAGCAATTATACTTACAATA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5433343 329 + 51628933 ATGaatataaata------tattatataatatttaaCAATT----CTAGA-TTTGTAATTTAAGCTAAATGGCAACT-----ATTACATCCAAAACATTATAAAAATTCCACTGTAACTCGCTACCC--CTTCAACTCATAAGAAAGTGACTTTACTTCCTACTTTAACCAAGAAAATTGAGACTATTATATGTGAACCACTTCAGCTTTTTTCCTTGTCATAACACAATCTGATCTTTATTTGCATCCTTTCTTCTTTCTCTTCATTCTCTGAATTTCT------------------AGAAAACAAC--TTCAATGTCAAAAAAATTTTACAGATGCATTTCCTAATAGCATTTCTACTATTAATA i canFam3.chr25 I 202 C 0 a score=200241.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 13414 66 + 478999 TTTACAAATTGAGGAAATGCATGT--ACCTTTGGCTTTATCA---ACCCCCACTAACAACAAGGGGTG-CAG s panTro4.chr2B 115166654 68 - 247518478 TTTACAAATTGAGAAAATGCATGT--ACCTGTGGATTTATCATCAACCCCCACTAACAACAAGGG-TG-CAG i panTro4.chr2B I 1473 C 0 s ponAbe2.chr14 90187169 68 - 108868599 tttacaaattgagaaaatgcatGT--ACCTGTGGATTTATCATCAACCCCCACTAACAACAAGGG-TG-CAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4365771 69 + 118206036 tttacaaattgagaaaatgcatTT--ACGCTTGGATTTCTCATCAACCCCCACTAACAACAATGGGTG-CAG i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80187460 69 - 94676912 tttacaaattgagaaaatgcatGT--ATCCGTGGATTTATCATCAACCCCCACTAACAACAATGGGTG-CAG i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82335151 69 - 96864807 tttacaaattgagaaaatgcatGT--ATCCGTGGATTTATCATCAACCCCCACTAACAACAATGGGTG-CAG i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77008559 69 - 90913898 tttacaaattgAGAAAATGCATGT--ATCCATGGATTTATCATCAACCCCCACTAACAACAATGGGTG-CGG i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78476762 68 - 92142175 tttacaaattgcgaaaatgcatGT--ATCCGTGGATTTATCACCAACCCCCACTAACAACAAT-GGTG-CGG i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10924878 70 - 159171411 TTTACAAATTAAGAAAATGCATGT--ACCTGTGGAATTATCATCAACCCCCACTAAGAAGGAAAGTTGTTAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5433672 71 + 51628933 CTTACAAACTGAGAAAATACATATACACTCACAGATTTACAGTCTATTTTCATTAACAACAAAGGGCT-CAG i canFam3.chr25 C 0 I 251 a score=2463308.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 13480 787 + 478999 T--------GAGCTGAGAACTTTCAAAACTTAAAAAAATACTCTCTG-ATGTAATGCCC-AAATTTACAGGTA-TCTCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGTACTCTACACTGTGTGTT-AGGATATTAAGGATACA--CTACGTCACATGAG---CTGTGCAC---GTATGATG--ACCGGGGTTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAT----GACGAGAAAGACGTGTGAAAAGAATACTACAAACTACAGAGATTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAGTTTGCTTCTCTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATTGCTTATATTCAGCCCTTTTCCTTGATGTTGCCAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAGATTTCACATTAGCAATCATATTGG---------------ATTTGTA------------------TCTTCTTGATACTCTACCTT-TTTATATTTCATTTGTTTGCTTGTCACTCTATTTAATATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGATACTGCAAGCATTTTATGAAACAACTCAAAGAAGTAGAAAAGAAAAGCAGGCAGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAGCA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACTCGACAAAAAGACCCATGAAAGAAAAAGTAGCTGGACAAGCACAAATTCATTTCTAGAGCTAGTAGGACAAAAACAAAAATGATATGGAAAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTG-ACATAAAAATAATAGCATTATTATCCTTCAATATTATCATGGTTATTAAAGTCACTGAGAA-A-AAAAGATCTTTTAATATG s panTro4.chr2B 115166722 781 - 247518478 T--------AAGCTGAGAACTTTCAAAACTTAATAAAATACTATCTG-ATGTAATGCCC-AAACTTACAGGTA-TATCTCTTAAAAGTTCTGGCTTT-----AGGTACTCTAT--TGTGTGTT-AGGATACTAAGAATACT--CTACGCCACATGAG---CTGTGCAC---ACATGATG--ACCAGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAT----GACGAGAAAGGCGTGTGAAAAGAATACTACAAACTACAGAGTTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAGTTTGCTTCTTTGTGAATAGAA---TTACA-AAATCGCTTATATTCAGCCTTTTTCCTTGATGTTGCCAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAAATTTCACATTAGCAATCATATCGG---------------ATTTGTA------------------TTTTCTTGATATTCTACCTT-TTTATATTTTATTTGTTTGCTTGTCACTCTATTTAATATCATTCTATTAGGGCTT--AAAAAGACACTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAAGTAGGAAAGAAAAGCAAGCAGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACACAAAGACCCATGAAAGAAGAAATAGCTGGACAAGCACAAATTCATTTCTAGAGCTAGTAAGACAAAAACAAAAACGATACGGAAAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTG-ACATAAAAATCATAGCATTATTATTCTTCAATATTATTATGGTTATTAAAGTCACTGAGAA-A-AAAAGATCTTTTAATATG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90187237 781 - 108868599 T--------AAGCTAAGGACTTTCAAAACTTAATAAAATACTATCTG-ATGTAATGCCC-AAATTTACAGGTA-TATCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGTGCTCTAC--TGTGTGTT-AGGATACTAAGGATACT--CTATGTCACATGAG---CTGTGCAC---ACATGATG--ACCAGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAT----GACAAGAAAGATGTGTGAAAAGAATGCTACAAACTACAGAGTTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAgtttgcttctttgtgaatagaa---ttaca-aaattgcttatattcagccttcttccttgatgttgccaggaagctcccatcaattctgaaatttcacattagcaatcatattgg---------------atttgta------------------ttttcttgatattctacctt-tttatatttcatttgtttgcttgtcactccatttaatATCATTCTACTAGAGCTT--AAAAAGACACTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAAGTAGGAAAGAAAAGCAGGCAGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAAAGAACCATGAAAGAAGAAGTAGCTGGACAAGAACAAATTCATTTCTAGAGCTAGTAAGACAAAAACAAAAATGATATGGAAAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTG-ACATAAAAATAATAGCATTATTATTCTTCAATATTATTATGGTTATTAAAGTCACTTAGAA-A-AAAAgatcttttaatata i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4365840 784 + 118206036 T--------GAGCTGAGAACTTTCAAAACTTAATAAAATACTCCCTG-ATGTAATGCCC-AAATTGACAGGTA-TATCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGTACTCTAC--TGTGTGTT-AGGATACTAAGGATACA--CTATGTCACATGAG---CTGTGTAC---ACATGATG--ACAGGG-TTACTGCTCATTATCACTGCTGTTA---AAAAGAAT----GACAAGGAAGACATGTGAAAAGAATACTACAAATTACAGAGTTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAGTTTGCTTCTTTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATT-CTTATATTCAGCCCTTTTCCTTGATGTTGCCAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAAATTTAACATTAGCAATCATATTGG---------------ATTTGTA------------------TTTTCTTGATATTCTACCTT-TTTATATTTCATATATTTACTTGTCACTCTATTTAATATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGACACTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAACTAGGAAAGAAAAGCATGCAGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAAAGACCCATGAAAGAAAAAGTAACTGTACAAGCACAAATTCATTTCTAGAGCTAGTAAGACAAAAGCAAAAATGATATGGAAAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTG-ACATAAAAATAATAGCattattattcttcaatattattatggttattCAAGTCACTGAGAACA-AAAAGATCTTTTAATATG i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80187529 782 - 94676912 T--------GAGCTGAGAACGTTCAAAACTTAATAAAATACTCTCTG-ATGTAACGCCC-AAATTTACAGGTT-TCTCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGCACTCTAC--TGTGTGTT-AGGAAAACAAGGATACA--CTATGTCGCGTGAG---CTGTGCAC---ACATGATG--ACAGGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAC----AACAAGAAAGACTTGTGAAAAGAATACTACAAATTACAAAATTTGCAAAGCTGTTTAGGACAAAATTTGCTTCTTTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATTGCTTATATTCAG-CCTTTTCCTTGATGTTGCAAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAAATTTTGCATTAGCAATCGTATTGG---------------ATTTGTA------------------TTTTCTTGATATTCTACCTT-TTTATATTTCATTTGTTTGCTTGTCACTCTATTCAATATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGACACTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAATAAGTAGGAAAGAAAAGCAGGCCGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAACGACCCATGAAAGAAAAAGCAGCTGTACAAGCACAAATGCATTTCTAGAGCTAGTAAGAC--AAAAAAAAATGATATGGAGAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTGTTTTTTAAAATAATAGCATTATTATTCTTCAATATTATTATGGTTATTAAAGTCATTGAGAA-C-AAAAGGTATTTTAATATG i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82335220 782 - 96864807 T--------GAGCTGAGAACGTTCAAAACTTAATAAAATACTCTCTG-ATGTAACGCCC-AAATTTACAGGTT-TCTCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGCACTCTAC--TGTGTGTT-AGGAAAACAAGGATACA--CTATGTCACGTGAG---CTGTGCAC---ACATGATG--ACAGGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAC----AACAAGAAAGACTTGTGAAAAGAATACTACAAATTACAAAATTTGCAAAGCTGTTTAGGACAAAATTTGCTTCTTTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATTGCTTATATTCAG-CCTTTTCCTTGATGTTGCAAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAAATTTTGCATTAGCAATCGTATTGG---------------ATTTGTA------------------TTTTCTTGATATTCTACCTT-TTTATATTTCATTTGTTTGCTTGTCACTCTATTCAATATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGACACTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAATAAGTAGGAAAGAAAAGCAGGCCGCATATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAACGACCCATGAAAGAAAAAGCAGCTGTACAAGCACAAATGCATTTCTAGAGCTAGTAAGAC-AAAAAAAAAATGATATGGAGAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTTG-ACATAAAAATAATAGCattattattcttcaatattattatggttattaAAGTCATTGAGAA-C-AAAAGGTATTTTAATATG i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77008628 783 - 90913898 T--------GAGCTGAGAACGTTCAAAACTTAATAAAATACTCTCTG-ATGTAATGCCC-AAATTTACAGGTT-TCTCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGTACTCTAC--TGTGTGTT-AGGAAAACAAGGATACA--CTATGTCACATGAG---CTGTGCAC---ACATGTTG--ACAGGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAC----GACAAGAAAGACTTGTGAAAAGAATACTACAAATTACAAAATTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAATTTGCTTCTTTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATTGCTTATATTCAGCCCTTTTCCTTGATGTTGCAAGGAAGCGCCCATCAATTCTGCAATTTTGCATTAGCAATCATATTgg---------------atttgta------------------ttttcttgatattctacctt-tttatatttcatttgtttgcttgtcACTCTATTCAGTATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGACATTGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAAGTAGGAAAGAAAAGCAGGCCgcatattaataaaaaatgtgaattaCA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAACGACCCATGAAAG-AAAAGCAGCTGTACAAGCACAAATGCATTTCTAGAGCTagtaagac-aaaacaaaaatgatatggAGAATATATGATAGCAAGTATTGTTACCTtg-acataaaaataatagcattATTATTCTTCAATATTATTACGGTTATTAAAGTCATTGAGAA-CAAAAAGGTATTTTAATATG i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78476830 785 - 92142175 T--------GAGCTGAGAACGTTCAAAACTTAATAAAATACTCTCTG-ATGTAATGCCC-AAATTTACAGGTT-TCTCTCTTAAAAGTTCTGACTTT-----AGGTACTCTAC--TGTGTGTT-AGGAAAACAAGGATATA--CTATGTCACATGAG---CTGTGCAC---ACATGATG--ACAGGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTA---AAAAGAAT----GACAAGAAAGTCTTGTGAAAAGAATACTACAAATTACAAAATTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAATTTGCTTCTTTGTGAATAGAAGAATTACA-AAATTGCTTATATTCAGCCCTTTTCCTTGATGTTGCAAGGAAGCTCCCATCAATTCTGAAATTTTGCATTAGCAATCGTATTGG---------------ATTTGTA------------------TTTTCTTGATATTCTACCTT-TTTATATTTCATTTGTTTGCTTCTCACTCTATTCAATATCATTCTATTAGAGCTT--AAAAAGACAATGCAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAAGTAGGAAAGAAAAGCAGGTCGCCTATTAATAAAAAATGTGAATTACA-----AAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAACCCAACAAAACGACCCATGAAAGAAAAAGCAGCTGTACAAGCACAAATGCATTTCTAGAGCTAGTAAGACAAAAACAAAAATGATATGGAGAATATATGATAGCAAGCATTGTTACCTTG-ACATAAAAAtaatagtattattattcttcaatattattatggttattaAAGTCATTGAGAG-CAAAAAGGTATTTTAATATG i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10924948 787 - 159171411 TTCTCAACGAAGCTGAGAACTTTCAAAACTTAACAAAATACTCTCTG-ATGCAATGCCC-AAATTGACAGGTG-TATCTCTTAAAAGTTCTGAGTTT-----AGGTACTCTAC--TGTGTGTTAAGAATACTAAAGATACA--CTATGTCATATGAG---TTATTTGT----TATCGTG--ACAAGG-TTACTGCTCATTATCACTGTTGTTATACAAGAATGT----GACAAGGAAGAC--GTGAAAAGAATAC-------TACAGAGTTTGCAAAGCTGTTCAGGACAAAgtttgctcctttatgaatagaagaattaca-aaattgctga---atagcccttttccttgatgcttccaggaaactcccatcaattctgaaatttcacattagcaatcatattgtatttatgatttacacatttgta------------------ttttcttgatattctacctt-ttcatatttcatttgtt--------actctgtttAATATAATTCTATTAGAGCCT-AAAAAAGATACTTTAAGTATTTTATGAAACAACTCAAAGAAATAGGAAAGAAAAGCAGGCAGCATATTAATGAAAAATGTGAATTACAAAAATAAAATATTCCTATGCAAGATCAACA-ATGGCAGAACCAGGATGCAAAGCCAACAAAAACAACCATGAAAGAAAAAGTAGCTATACGAGCACAA---CATTTCCAGAACTAGT-------AAAGAAAAACGGAATGGAAAATTTATGACAGCAAGTATGGTTACCTTG-ACATAAAAATAATAGCATTATTATTATTTAGTATTATTATGGTTATTAAAGTCACTGAGAA-CAAAAAGATCTTGCAATATG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5433994 784 + 51628933 --------CAGGCTGGGAACTTTCAAAACTTAATAAAATATTTTTTTCGTGAAATGCCTAAAATTTAGAGGTATTTTCTTTTAAAAGTTCCAACTTTGATAGAGGTATTCTAT--TGTCTATG-A------TAGGAATACATTCTGTATCACATGAGTATCTGCGTATAGAACATGGTGACACAGGG-TTACTACTCATTTTCACTTTTGTTA---TGAAAGATTATGGATGAGAAAGAGCT---------ATATGACAAGTCACTAAGTTTGCAAAGTGACTCAAGACAatgtttgctcctttccaaataggagaattacataacctgtttatatttagtccttttcctttttcttgccagaaagctgccatcaattctaaaatttcactatagcaatcatattgg---------------atttacactttgcatatctgtggggtttttttaattttctatcttaatTGTGGATCACTGATT------TTGATTCACTTAATAACATTCTGGCAGTGCTTGAAGAAAGCCACTTCAAATATTTTAGG--CCAAACTGAGGAAAT-----ATAAAAGGAGGCAG------AATCCAAAAATCTAATTACA-----GAAATATTCCCACACAAAGCCAACACATGGCAGAACTAGAACCCAAACCCAACAAAAGGACTCATGAAAGAAAAAAT-GCTGTATAAGCACAAATTCATTTCTAGCAATGGTAAAAT-------AAAGTGTTAGGGACAAAAGATGGTAGCAAGTATTTTCACCTTG-ACATAAAAATGACAGCATTATTGTCATTTAATATCATTGTGAC--TTAAAATCGCTAAGGA-C--AGAAATATTTTAGTACA i canFam3.chr25 I 251 C 0 a score=84394.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14267 33 + 478999 GGTAAATTCAAACTTTCCTCTCTCGCTCTCTCt s panTro4.chr2B 115167503 33 - 247518478 GGTAAATTCAAACTTTCctctctctgtctctct i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188018 27 - 108868599 ggtaaattcaaactttcctc------tctctct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366624 32 + 118206036 GGTAAATTCAAACTTTCCTCTCTCTCTCTCTC- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80188311 33 - 94676912 GGTAAATTCAAACTTTCCTCTCTCTCTGTGTCT i rheMac3.chr17 C 0 I 29 s macFas5.chr17 82336002 33 - 96864807 GGTAAATTCAAACTTTCctctctctctgtgtct i macFas5.chr17 C 0 I 17 s papAnu2.chr17 77009411 33 - 90913898 GGTAAATTCaaactttcctctctctctctgtct i papAnu2.chr17 C 0 I 5 s chlSab2.chr3 78477615 33 - 92142175 GGTAAATTCAAACTTTCctctctctctctctct i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10925735 33 - 159171411 GGTAAAATCAATCTTTCCTCTCTCTCTGTCTCT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C a score=1701.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14300 6 + 478999 atatat s panTro4.chr2B 115167536 6 - 247518478 ctcttt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188045 6 - 108868599 ctatat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78477648 6 - 92142175 ctctct i chlSab2.chr3 C 0 I 13 s calJac3.chr5 10925768 6 - 159171411 CTTTTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e papAnu2.chr17 77009444 5 - 90913898 I e macFas5.chr17 82336035 17 - 96864807 I e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I e nomLeu3.chr9 4366656 0 + 118206036 C a score=617.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14306 25 + 478999 atatccgtgtgtgtgtgtgtgtgtg s panTro4.chr2B 115167542 25 - 247518478 cactctctctATAtgtgtgtgtgtg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188051 25 - 108868599 atatatgtgtgtgtgtgtgtgtatg i ponAbe2.chr14 C 0 I 4 s calJac3.chr5 10925774 5 - 159171411 ----CTTTC---------------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78477654 13 - 92142175 I e papAnu2.chr17 77009444 5 - 90913898 I e macFas5.chr17 82336035 17 - 96864807 I e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I e nomLeu3.chr9 4366656 0 + 118206036 C a score=884.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14331 4 + 478999 tgtg s panTro4.chr2B 115167567 4 - 247518478 tgtg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366656 4 + 118206036 TGTA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90188076 4 - 108868599 I e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78477654 13 - 92142175 I e papAnu2.chr17 77009444 5 - 90913898 I e macFas5.chr17 82336035 17 - 96864807 I e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I e calJac3.chr5 10925779 0 - 159171411 C a score=442.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14335 4 + 478999 tgta s panTro4.chr2B 115167571 4 - 247518478 tgtg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366660 4 + 118206036 TATA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77009449 4 - 90913898 tctc i papAnu2.chr17 I 5 I 8 e ponAbe2.chr14 90188076 4 - 108868599 I e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78477654 13 - 92142175 I e macFas5.chr17 82336035 17 - 96864807 I e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I e calJac3.chr5 10925779 0 - 159171411 C a score=7224.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14339 20 + 478999 ----tatatatatatatatatGAC s panTro4.chr2B 115167575 14 - 247518478 ----tgtgtgtatg-ACAT----- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366664 12 + 118206036 ----TATATATATG-AC------- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82336052 12 - 96864807 ----TATATAAATG-AC------- i macFas5.chr17 I 17 C 0 s papAnu2.chr17 77009461 12 - 90913898 ----tatataaatg-ac------- i papAnu2.chr17 I 8 C 0 s chlSab2.chr3 78477667 12 - 92142175 ----TATATAAATG-AC------- i chlSab2.chr3 I 13 C 0 s calJac3.chr5 10925779 16 - 159171411 TTTATATATATACG-AC------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90188076 4 - 108868599 I e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I a score=2004.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14359 4 + 478999 --AAAA s panTro4.chr2B 115167589 4 - 247518478 --AAAA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188080 4 - 108868599 --AAAA i ponAbe2.chr14 I 4 C 0 s calJac3.chr5 10925795 6 - 159171411 ATAAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C e chlSab2.chr3 78477679 0 - 92142175 C e papAnu2.chr17 77009473 0 - 90913898 C e macFas5.chr17 82336064 0 - 96864807 C e rheMac3.chr17 80188344 29 - 94676912 I e nomLeu3.chr9 4366676 0 + 118206036 C a score=161302.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14363 61 + 478999 ATAAAAACAGAAATACCAATGCAAAAATACAGAGGCCAAAGAGGGAATTTTT--TTATGTTT----T s panTro4.chr2B 115167593 63 - 247518478 ACAAAAAGAGAAATACCAATGCAAAAATACAAAGGCCAAAGAGGGAATTTTTAAAAATATTT----T i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188084 61 - 108868599 ATAAAAAGAGAAATACCAATGCAAAAATACAAAGTCCAAAGAGGGAATTTTT--TAATGTTT----T i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366676 67 + 118206036 ATAAAAAGAGAAATACTAATGCAAAAATACAAACGCCAAAGAGGGAATATTTTTTAATATTTACTAC i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80188373 66 - 94676912 ATAAAAAGAGAAATACCAATGCAAAAATACAAAGGCCAAAGAAGGAATATTT-TTAATATTTACTAC i rheMac3.chr17 I 29 C 0 s macFas5.chr17 82336064 66 - 96864807 ATAAAAAGAGAAATACCAATGCAAAAATACAAAGGCCAAAGAAGGAATATTT-TTAATATTTACTAC i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77009473 66 - 90913898 ataaaaagagaaataccaATGCAAAAATACAAAGGCCAAAGagggaatattt-ttaatatttactac i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78477679 66 - 92142175 ATAAAAAGAGAAATACCAATGCAAAAATACAAAGGCCAAAGAGGGAATATTT-TTAATATTTACTAC i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10925801 65 - 159171411 ATAAGAAGAGAAATATCAACGCAAAAATACAAAGGCAAAAGAGGGAATTTTT--TAATGTTGACTAC i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5434778 0 + 51628933 C a score=1094643.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14424 347 + 478999 T-CCTTTCCATTACACAATCTTCACATTAA----TTAA--ATTGAG--TTCAATAAAAAAACCACACTTCCGTACAAGACAAGTACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-TATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCTAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCCAGTGTGATTTAAACAGAACCCTAATATGTTCCCCTAGCCAGGTGTACCGCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTATATCTTACCT-----AGTCTTTGTTCTTAAAGTTTAAAAAACAGAAAGAATG--ATAAATTACAT----TAATTAGTTTTGCTAAATTAGTTTACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC s panTro4.chr2B 115167656 355 - 247518478 T-CCTTTCCATAACACAATCTTCACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAATAAACCACACTTCCATAAAAGACAAGTACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-TATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCCAATGTGATTTAGACAGAACCTTTATATATTCCCCTATCCAGGTGTACTGCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTATATCTTACCTA---GAGTCTTTGTTCTTAAAGTTTAAAAAACAGAAAGAATATTATAAATTACAT----TAAATAGTTTTGCTAAATTAGTTTACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188145 359 - 108868599 T-CCTTTCCATAACACAATCTTCACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAATAAACCACGCTTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAAAATTATAAACACTTTGAC-TATAATGTGTAATTCTCTTTCAGTTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCCAATGTGATTTAAACAGAACATTTATATATTTCCCTAGCCAGGTGTACTGCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTATATCTTACCTA---GAGTCTTTGTTCTTAAAGCTTAAAAAACAGAAAGAATATGATAAATTACATTAAATAATTAGTTTTGCTAAATTAGTTTACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4366743 349 + 118206036 T-CCTTTCCATAACACAATCTTCACATTAATTAT-------TTGAG--TTCAATAAA-AAACCACACTTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-TATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCAAATGTGATTTAAATAGAACCCTAATATACTCCCCTAGGCAGATGTACTACACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTCTATCTTACCTA---GAGTCTTTGTTTTTAAAGTTTAAAAAACAATAAGAATATGATAAATTACAT----TAATTAGTTTTGCTAAATTAATATACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i nomLeu3.chr9 C 0 I 4 s rheMac3.chr17 80188439 349 - 94676912 T-CCTTTCCATAACACAATGTTAACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAA-AAACCACACTTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAGAAATATAAACACTTTGAC-GATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCTAATGTGATTTAAATAGAACCCCTATACACTCCCCTAGCCAGGTATACTTCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTCTATCTTACCGA---GAGTCTTTGTTTTGAACGTTTAAAAAAC-AAAAAAATATGATAAATTACAT--------TAGTTTTGCTAAATTAGTATACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i rheMac3.chr17 C 0 I 4 s macFas5.chr17 82336130 349 - 96864807 T-CCTTTCCATAACACAATGTTCACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAA-AAACCACACTTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAGAAATATAAACACTTTGAC-GATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCTAATGTGATTTAAATAGAACCCCTATACACTCCCCTAGCCAGGTATACTTCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTCTATCTTACCGA---GAGTCTTTGTTTTGAACGTTTAAAAAAC-AAAAAAATATGATAAATTACAT--------TAGTTTTGCTAAATTAGTATACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i macFas5.chr17 C 0 I 4 s papAnu2.chr17 77009539 346 - 90913898 T-CCTTTCCATAACACAACGTTCAC----ATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAA-AAACCACACCTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-GATAATGTGTAATTCTCTTTCAGctcccagtagtttgagacttCACAATTCCTAATGTGATTTAAATAGAACCCCTATACACTCCCCTAGCCAGGTATACTTCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTCTATCTTACCGA---GAGTCTTTgctttgaaagtttaaaaaacaaaaaaaaaatgataaattacat--------tAGTTTTGCTAAATTAGTATACTCACTACTGTACCTACTTCCTCAC i papAnu2.chr17 C 0 I 4 s chlSab2.chr3 78477745 348 - 92142175 T-CCTTTCCATAACACAATGTTCACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTCAATAAA-AAACCACACTTCCATACAAGACAAGTACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-GATAATGTGTAATTCTCTTTCAGCTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCTAATGTGATTTAAATAGAACCCTTATACACTCCCCTAGCCAGGTATACTTCACATTTAAAACTAACTCATATATGTGCATGCTCTATCTTACTGA---GAGTCTTTGCTTTGAAAGTTTAAAAAA--AAAAAAAAATGATAAATTACAT--------TAGTTTTGCTAAATTAGTATACTCACTACTGTATCTACTTCCTCAC i chlSab2.chr3 C 0 I 7 s calJac3.chr5 10925866 348 - 159171411 TCCCTTTCCATAACACAATCTTCACATTAATTATTTAA--ATTGAG--TTTAATAAA-AAACAGCACTTCCATACAAG------ACTCCTTCAGAATTATAAACACTTTGAC-TATAATATGTAATTCTCTTTCAGTTCCAAGTAGTTTGAGACTTCACAATTCCCAGTGTGATTTAAATAAAACCCTTATGTATTCCCCTAGCCAGGTGTCCTCCCCATTTAAAACTAACTCACATATGTGCCTGCTATACCTTACCTA---AAGTCTTTGTTTGTAAAG-TTAAAAAACAGAAATAATATGATAAATTATAT----TAAATAGTTTTGTTAAATGCGTATACTCACTACTGTACCTACTTCCTCCC i calJac3.chr5 C 0 I 4 s canFam3.chr25 5434778 361 + 51628933 -CCTTTTTCATAATATAATCTTCGCACTGATTATTTAAACACTAAGTTTTTTTTAAA-AAATAGCTGTTCGATGGAAGATATGAACTTCTTCAAAATTAAAAATACTTTGACTTACACTGCATAATTCTC--TCAGCTCCAAAGAGTTTGGGATATCACAGCTCCTTATGTGATTTAAATAATACTC--ATATATTTCCCTAGCCAGGTATACTGCATATTAAAAACTCTTTCATATATGTGAATACAGTATTTTGCCTAAATAAGTCTTCATTTTAAATG-TTAAAAAACAGGAAGAATATGATAAATCATATTAAATACTTGATTTTGCAAAATTCATATGGTCAGTATTGTACTAACTTCCTTAT i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=38205.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14771 15 + 478999 TGCaatta--------aagcaaa s panTro4.chr2B 115168011 15 - 247518478 TGCAATTA--------AAGCaaa i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188504 15 - 108868599 TGCAATTA--------AAGCaaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4367096 15 + 118206036 TGCAATTA--------AAGCAAA i nomLeu3.chr9 I 4 C 0 s rheMac3.chr17 80188792 15 - 94676912 TGCAATTA--------AAGCAAA i rheMac3.chr17 I 4 C 0 s macFas5.chr17 82336483 15 - 96864807 TGCAATTA--------AAGCAAA i macFas5.chr17 I 4 C 0 s papAnu2.chr17 77009889 15 - 90913898 Agcaatta--------aagcaaa i papAnu2.chr17 I 4 C 0 s calJac3.chr5 10926218 15 - 159171411 TACAATTA--------AAGCAAA i calJac3.chr5 I 4 C 0 s canFam3.chr25 5435139 21 + 51628933 --CTATTGTAAAGGACAAGCAAA i canFam3.chr25 C 0 C 0 e chlSab2.chr3 78478093 7 - 92142175 I a score=4808016.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 14786 1565 + 478999 aatataaactaaaattaaataaTTTCAGGCCCATGAAATATATTATCTTAGATTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTCTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTATGTTCATTATGTA--ATATATATTTCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAACAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTT---------------------------------------AAAAGGCATGCTATCAATATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATA-----AAAAAAGTTGAG----AAAAAAGCACCTTTGAACCGAAAAGAAACATATAATAAAAACTGACTACATTCC--AAAAAATAGAAATGACTCTTAAACTGTATTAAAGAAAGATTTTCACTAAAAGTTATATTACATCACATTTTACATCTAAAACGCTCTCTAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCTAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGA--------ATGGCAACAGGTTTAGCACAGAATACGCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGAACCACGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATT--AA-----AAATGCATTATTTT-TAATGATGAAAAGGTTTA-AATCCTTAAATCGGCCT------TTAGGAATATTTTAAAATATAACAATAATAATAGAAGAAAGCATCAATTAAGACTTTAT----TATTTAAATAAT--AAATGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGACCAATTACATGTTTTACACTTACATTTAAGCAAACA-AAACAATAGCCACCTACTCAGTCTTCCGACTT----ACTTTTCAAATATTATAGTTAAAGGCAAAAGAGCTTATATTTATTTATTTACAAACGTTAAAATAA-TTTAAAACTGTCATGATGT-ATAATGATCCATATATAGAGAGATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCCAAAATGTAATCATGAAAACATAGGGTCTAATTTTTTAAATTCAACTTTATTTTTGAAATTATGAATCTATTCCTCTATTCCTCCATATTTAGTAAAACACACAAAGAAAATAAATCCCCGCTCGTGTGTGAGTAGGAACTACACAGAACGAAACACACAATAAGACTATAATCTGCTGCTTAAAGCAGATGGTACAGTGCTCTCCACATTGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTT---AAGATCTTTCCAGCCTCTACATCTTACACCCCACCCACCCAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCTCAAAGGCTATTTCACACCTTAGAATGAATAAGCAAGA-ATCATATATGTAAGAAGTACTTTTGGTCCTTCAATAAAGTAACAA-AAAGAATTGTGAATGC-ATACAAAGGC--AAAAAGAACTGTCGTCATTAAATACCCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAACTTAAACTTTA------ACTGCATAAAG----------TATGTGTCATTATCTAGAATTCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAAAAAA-CGAAGTCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTCTCATTGAATGAGTC s panTro4.chr2B 115168026 1591 - 247518478 aatataaactaaaattaaataattttaGGCCCATGAAGTATATTATCTTAGATTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTCTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTATGTTTACTATGtaatatatatatttcaaatttttgtattataaataCTACATTAAGCAAAATAGTTTTATAAGATTTATTATTTCAGAACTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCTATCAATATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAACAGTTGAG----AAAAAAGCATCTTTGAACCAAAAAGAAACACATAATAAAAACTGACTACAATCC--AAAAAATAGAAATGACTCTTAAACTGTATTAAAGAAAGATTTTCACTAAAAATTATATTACATCACATTTTACATCTGAAATGCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---GCAGTTATTACTACCTTATATCTAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCACCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTAT-AAAAGTCATT--AA-----AAAAGCATCATTTT-TAATGATGAAAAGGTTTA-AATCCTTAAATCAACCT------TTATGaatattttaaaatataacaataataataGAGGAGAGCATCAATTAAGGCtttat----tatttaaataat--aaatGCCAGCCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAATTACATTTTTTACACTTATGTTTAAGC------AAACAGTAGCCATCTACTCAATCTTCTGACTT-ACCACTTTTCAAATATTATAGTTAAAGACAAAAGAGCtta----taattatttacaaacattaaaataa-tttaaaaCTGTAATGATGT-ATAATTATCCATATAGAGAGAGATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCCAAAATGTAATCGTGAACACATAGGGTCTAATTTTTT-TATTCTACTTCATTTTTGAAATTATGAATCTATTCCTCTATTCCTCCGTATTTAGTAAAAGACACAAAGAAAATAAATCCCCTCTCATATATGAGTAGGAACTACACAGAATCAAATAAACAATAAGACTAAAATCTGCTGCTTAAAGCAGATGGTACAGTGCCCTCCACATTGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTTAACAAGATCTTTCCAGCCTCTACTTCTTACACCCCACTCACCCAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCAAAGGCTATTTCACACCTTAGAATGAATAAGCAAGA-ATTATATATGTAAGAAGTACTTTTGGTACTTCAATAAAGTAACAA-AAAAAATTGTGAATGC-GTACAAAGGC--AAAAAGAACTGTCGTCATTAAATACCCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAACTTAAACTTTA------ACTGCATAAAGTA--TGTATATATGTGTTATTATCTAGAATTCCCCACTTCTTAGGGCACTATT-ATAAATAACCAAAAAA-CTAAGTCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTATCATTGAATGAGTC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90188519 1552 - 108868599 aatataaactaaaattaaataatttCAGACCCATGAAGTATATTATCTT-----------------------------------TTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTATGTTCATTATGTAATATATATATTCCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAATAGTTTTATAAGATTTATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCTATCAATATTAGGAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAACAGTTGAG----AAAAAAGCATCTTTGAACCGAAAAGAAACACATAATAAAAACTGGCTACATTCC---AAAAATAGAAATGACTC--AAACTGTATTAAAGAAAGATTTTCACTAAAAATTATATTACATCACATTTTACATCTAAAACACTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCTAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCAGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCACCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCTTTAAAA-----AAATGCATCATTTT-TAATGATGAAAAGGTTAA-AATCCTTAAATCATCCT------TTATGAATATTTTAAAATATAACAGTAATAACAGAAGAAAGCATCAATTAAGACtttat----tatttaaataat--aaatGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAATTACATGTTTTACACTTATGTTTAAGCAAAC--AAACAATAGCCACCTACTCAATCTTCTGACTT-ACCACTTTTCAAATATTATAGTTAAAGGCAAAAGAGCTTACaattatttatttacaaatattaaaataa-tttaaaaCTGTAATGATGT-ATAATTATCCATATATAGAGAGATTGATCTGAATCAAGGGAATGGTTGTTCCAAAATGTAATCATGAACACATAGGGTCTATTTTTTT--ATTCTACTTTATGTTTGAAATTATGAATCTATTCCTCTATTCCTCCATATTTAGTAAAAGACAC----AAAATAAATCCCTTCTCATATATGAGTAGGAACTACACAGAATCAAATAAACAATAAGATTAAAATCTGCTGGTTAATGCGGATGGTACAGTGCTCTCTACATTGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTTAACAAGATCTTTCCAGCCTCTACTTCTTACACCCCACCCACCCAAACCAGGGAAACCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCAAAGGCTATTTCACACCTTAGAATGAGTAAGCAAGA-ATTATATATGTAAGAAATACTTTTGGTACTTCAATAAAGTAACAA-AAAGAATTGTGAATGC-ATACAAAGGC--AAAAAGAACTGTCATCATTAAATACCCAATCTTTAATTGGAAGTATAGGAACTTAAGCTTTA------ACTGCATAAACTA--TGTATATATGTGTTATTATCTACAACTCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAAAAAT-CTAAGTCTTTTCTTTCCAAGATGCTTTC------TTGAATGAGTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4367111 1593 + 118206036 AATATAAGCTATAATTGAATAATTTCAGGCCCATGAAATATATTATCTTAGTTTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTCTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----ATTCTTTATTATGTTCATTATGTAATATGTATATTTCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAACAGTTTTATAAGATTTATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCCATCAATATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATA-----AAAACAGTTGAG----AAAAAAGCATCTTTGAACCAAAAATAAACACATAATAAACATTGACTACATTTC--AAAAAATAGAAATGACTCTTAAACCGTATTAAAGAAAGATTTTCACTAAAAATTATATTACACCACATTTTACATCTAAAACTCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCACCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATA-AAA-----AAATGCATTATTTT-TAATGACAAAAAGGTTTA-AATCCTTAAATCGGCTTTCATTATCATGAATATTTTAAAATATAACAATAATAATAGAAGAAAGCATCAATTAAGACTTTAC----TATTTTAATAAT--AAATGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAGTTACATGTTTCACACTTACATATAAGCAAAC--AAACAATAGCCACCTATTAAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATATTATAGTTAAAGGCAAAAGAGCTTATAATTATTTATTTACAAAAGTTAAACTAA-TTTAAAACTGTAATGATGT-ACAACGATCCATATATAGAGAGATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCCAAAATTTAATCATGAACACATAGGGTCTAATTTTTTTTATTCTACTTTATTTTTGAAATTACGAATCTATTCCTCTATTCCTCCATATTAAGTAAAAGACACAAAGAAAATCAATCCCTTCCCATATATGAGTAGGAATTACACAGAATCAAATAAACAAGAAGACTAAGATCTGCTGCTTAAAGCTGATGGTACAGTGCTCTCCACA-TAAGGAATTCAACACTGAAGAAGCCAAAACCTT-----GATCTTTCCGGCCTCTACTTCTTACACCCAGCCCACCCAAACCAGGGAAGGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCTTTCTCCTATCCCAACAGGCTATTTCACACCTTAAAACGAATAAGCAAAA-ATTATATATGTAAGAAGTACTTTTGGTACTTCAATAAAGTAACAA-AAAACAATGTGAATGAGGTACAAAAGCA-AAAAAAAATTGTCGTCATTAAATATGCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAA------CTTTA------ACTGCATCAAGTA--TGTATATATGTGTTATTATCTAGAATTCTCCACTTCTTAGGGCACTATTAACAAGTAACCAAAAAA-CTAAGTCTTTTCTTTCCAAGATACTCTCTTATCATTTAATGAGTC i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80188807 1589 - 94676912 AATATAAGCTAAAATTGAATAATTTCAGGTCCATGAAGTATATTATCTTACTTTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTGTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTATGTTCACTCTGTAATATGTATATTTCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAATAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAA-GCATGCCACCAGTATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAACAGGTGAG---AAAAAAAGCATCTTTGAACCAAAAAGAAACATATAATAAAAACTGACTACATCCTAAAAAAAATAGAAATGACTCTTAAACCATATTAGAGAAAGATTTTCACTAAAAATTATATTACACCACATTTTACATCTAAAACTCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCTCCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATAAAAAAAATCAAATGCATTATTTT-TAATGACAAAAAGGTTTC-AATCCTTAAATTGGCCTCCATTATCAAGCATATTTTAAAATATAACAAAAATAATAGCAGAAAGCATCAATTAAGACtttat----tatttaaataat--aaatGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAGTTACATG---CACACTTATGTTTAAGCAAAC--AAACAGTAGCCACCTACTCAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATATTACAGTTAAAGGCAAAAGAGattataattatttattttaaaaaGTTAAACTAA-TATACAACTGTAATGATGT-ATAATGATCCATATATAGAGACATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCCAACATTTAATCATGAACACATAGGGTATAATTTTTT-TATTCTACTTTATTTTTGAAATTACGAATCTATTCCTCTACTCCTCCATATTAAGTAAAAGACACAAAG---------CCATTCCCATATATGAGTAGGAATTACACAGAATCAAATAAACAATAAGACTAAGATCTGCTTCTTAAAGCCAATGATACAGTGCTCTCCACA-TGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGACAAAAGCTTAACAAGATCCTTCCAGGCTCTACTTCTTACACCCCACCCACCGAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCACAGGCTATTTCACACCTTAGTACGAATAAGCAAGA-ATTATATATGTAAGAAGTACTTTTGGTACTTCAATAAAGT----A-AAAAAATTGTGAATGGGGTACAAAGGCA-AAAAAAAATTGTTGTCATTAAATACCCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAA------TTTTA------ACTGCCTAAAGTA--TGTATATATGTGTTATTATCTAGAATTCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAATAAA-GTAAGCCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTATCATTTAACGAGTC i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82336498 1590 - 96864807 AATATAAGCTAAAATTGAATAATTTCAGGTCCATGAAGTATATTATCTTACTTTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTGTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTATGTTCACTCTGTAATATGTATATTTCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAATAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCCACCAGTATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAACAGGTGAG---AAAAAAAGCATCTTTGAACCAAAAAGAAACATATAATAAAAACTGACTACATCCTAAAAAAAATAGAAATGACTCTTAAACCATATTAGAGAAAGATTTTCACTAAAAATTATATTACACCACATTTTACATCTAAAACTCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCTCCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATAAAAAAAATCAAATGCATTATTTT-TAATGACAAAAAGGTTTC-AATCCTTAAATTGGCCTCCATTATCAAGAATATTTTAAAATATAACAAAAATAATAGCAGAAAGCATCAATTAAGACTTTAT----TATTTAAATAAT--AAATGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAGTTACATG---CACACTTATGTTTAAGCAAAC--AAACAGTAGCCACCTACTCAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATACTACAGTTAAAGGCAAAAGAGATTATAATTATTTATTTTAAAAAGTTAAACTAA-TATACAACTGTAATGATGT-ATAATGATCCATATATAGAGACATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCCAACATTTAATCATGAACACATAGGGTATAATTTTTT-TATTCTACTTTATTTTTGAAATTACGAATCTATTCCTCTATTCCTCCATATTAAGTAAAAGACACAAAG---------CCATTCCCATATATGAGTAGGAATTACACAGAATCAAATAAACAATAAGACTAAGATCTGCTTCTTAAAGCCAATGATACAGTGCTCTCCACA-TGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTTAACAAGATCCTTCCAGCCTCTACTTCTTACACCCCACCCACCGAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCACAGGCTATTTCACACCTTAGTACGAATAAGCAAGA-ATTATATATGTAAGAAGTACTTTTGGTACTTCAATAAAGT----A-AAAAAATTGTGAATGGGGTACAAAGGCA-AAAAAAAATTGTTGTCATTAAATACCCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAA------TTTTA------ACTGCCTAAAGTA--TGTATATATGTGTTATTATCTAGAATTCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAATAAA-GTAAGCCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTATCATTTAACGAGTC i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77009904 1591 - 90913898 aatataagcTAAAATTGAATAATTTCAGGTCCCTGAAGTATATTATCTTACTTTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTCTTTCTAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----GTTCTTTATTGTGTTCACTCTgtaatatgtatatttcaaatttttgtattttaaatactaCATTAAGCAAAATAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCCACCAGtattagaaaatattctgaagaat--aaaaagtttataaagagaaaacagttgag----aaaaaagcatctttgaaccaaaaagaaacatataataaaaactgactacattct-aaaaaaatagaaatgactcTTAAACCATATTAGAGAAAGATTTTCACTAAAA-----ATTACACCACATTTTACATCTAAAACTCTCCatagaa-tttataaaatt---acaGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCTCCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGtcatagctctattttt-aaaagtcataaaaaaaatcaaatgcattatttt-taatgacaaaaaggTTTA-AATCCTTAAATCAGCCTCCATtatcaagaatattttaaaacataacaaaaataatagcagaaaGCATCAATTAagactttat----tatttaaataat--aaatgccaGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAGttacatg---cacacttatgtttaagCAAAC--AAACAGTAGCCACCTACTCAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATATTACAGTTAAAGGCAAAAGAgcttataattatttatttacaaaagttAAACTAA-TATACAACTGTAATGATGT-ATAATGATCCATATATAGAGAGATTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTCTAACATTTAATCATGAACACATAgggtataatttttt-tattctactttatttttgaaattacgAATCTATTCCTCTATTCCTCTATATTAagtaaaagacacaaagaaaatcaATCCCTTCTCATATATGAGTAGGAATTACACAGAATCAAATAAACAATAAGACTAAGATCTGCTTCTTAAAGCCGATGATACAGTGCTCTCCACA-TGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTTAACAAGATCCTTCCAGCCTCTACTTCTTATACCCCACCCACCGAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCACAGGCTATTTCACACCTTAGTACGAATAAGCAAGA-AttatatatgtaagaagtacttTTGGTActtcaataaagt----a-aaaaaattgtgaatggggtacaaaggca-aaaaaaaattgtCGCCATTAAATATCCAATCTCTAATTAGAAGTATAGGAA------TTTTA------ACTGCCtaaagta--tgtatatatgtgttattATCTAGAATTCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAAAAAA-GTAAGCCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTATCATTTAACGAGTC i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78478100 1591 - 92142175 AATTTAAGCTAAAATTGAATAATTTCAGGTCCCTGAAGTATATTATCTTACTTTCCTTCTAAATCTTTAACTCTTCTTTCCAAGTTACCAG-TAATATTAACAA-----A-TCTTTATTATGTTTACTCTGTAATATGTATATTTCAAATTTTTGTATTTTAAATACTACATTAAGCAAAATAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTTAAC------------------------------------AAAAGGCATGCCACCGGTATTAGAAAATATTCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAACAGTTGAG----AAAAAAGCATCTTTGAACCAAAAAGAAACATATAATAAAAACTGACTACATTCT-AAAAAAATAGAAATGACTCTTAAACCATATTAAAGAAAGATTTTCACTAAAACTTATATTACACCACATTTTACATCTAAAACTCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ACAGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCTCCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCATTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATAAAAAAAATCAAATGCATTATTTT-TAATGACAAAAAGGTTTA-AATCCTTAAATCAGCTTCCATTATCAAGAAGATTTTAAAATATAACAAAAATAATAGCAGAAAGCATCAATTAAGACTTTAT----TATTTAAATAAT--AAATGCCAGTCA-AGTTTTTTGGGAAAAA-TGATCAGTTACATG---CACACTTATGTTTAAG----C--AAACAGTAGCCACCTACTCAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATATTACAGTTAAAGGCAAAAGAGCTTATAATTATTTATTTACAAAAGTTAAACTAA-TATACAACTGTAATGATGT-ATAATGATCCATATATAGAGAGACTGATCTGAATCAAGGGAATGACTATTTCAACATTTAATCATGAACACATAGGGTATAATTTTTT-TATTCTACTTTATTTTTGAAATTACGAATCTATTCCTCTATTCCTCCATATTAAGTAAAAGACACAAAGAAAATCAATCCCTTCTCATATATGAGTAGGAATTACACAGAATCAAATAAACAATAAGACTAAGACCTGCTTCTTAAAGCCAATGATACAGTGCTCTCCACA-TGAGGAATTCAGCACTGAAGAAGCCAAAAGCTTAACAAAATCCTTCCAGCCTCTACTTCTTACACCCCACCCACCGAAACCAGGGAAAGCAGTCATGG-----CTCAGTTCCCTTCCCCTATCCCCACAGGCTATTTCACACCTTAGTATGAATAAGCAAGA-ACTATATAGGTAAGAAGTACTATTGGTACTTCAATAAAGT----A-AAAAAATTGTGAATGGGGTACAAAGGCA-AAAAAAAATTGTTGTCATTAAATATCCAATCTTTAATTAGAAGTATAGGAA------TTTTA------ACTGCCTAAAGTA--TGTATATATGTGTTATTATCTAGAA-TCTCCACTTCTTAGGGCACTATT-ACAAATAACCAAAAAA-GTAAGCCTTTTCTTTCCAAGATACTGTCTTATCATTTAACGAGTC i chlSab2.chr3 I 7 C 0 s calJac3.chr5 10926233 1505 - 159171411 AATACAAGCTAAAATTGAATAATTTCAGCCCCATGCAATATATTATCTTAGTTTCCCTCTAAATCTTTAACTCTTCTCTCCAAGTCACCAATTAATATTAACAT-----GTT-TTTATTACGTTCACTATGTA--ATATATATTTCAAAATTTTGTATTTCAAA---TACATTATGCAAAATAGTTTTATAAG----ATTATTTCAGAATTGTTAAC-------------------------------------AAAGGCATGCCATCA-TATTAGAAAATATGCTGAAGAAT-AAAAAAGTTTATAAAGAGAAAATAATTGAG----AAAAAAGCATCTTTAAATCAAAAAGAAACAAACAATAAAAACTGACTACATTCC--GAAAAATAGAAATGATTCTGAAACCATACTGAAGAAATATTTTCACTAAAAATTATATTATACCATGTTTTACATCGCAGACTCTCCATAGAA-TTTATAAAATT---ATAGTTATTACTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGTGCTGGGTTGAGTGCTTCACTGAACACATACACGGCACCGAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGATGATCCAAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTT-AAAAGTCATAAAAA-CATCAAATGCATTATTTT-TAATGACAAAAAGGTTGA-AATCCTTAAATCAGCCTTCATTATCATGAATAACTTAAAATATAACAATAATAACAGAAGAAAGCATCAATTAAGACTTTAT----TATTTAAATAGC--AAATGCCAGTCA-AG-TTTTTGTGAAAAA-TGATCAGTTACATGTTTTACATTTATGTTTAAGCTAATATAAACAATAACCACCTATCCAATCTTCAGACTT-ACCACTTTTCAAATATTATAGTTAAAGGCAAAAGAGCttataattatttatttacaaaagttaaattaattttaaaaCTCT---------------------------AGAGATTGATCTGAATCAAGGAAATGACTGTTCTACA--TCAATTATGAACACAAATGGTCTAATTTTTT-CATCCTACTTTATTTTTGAAATTATGAATCTATTCCTCTATTTCTTCACATTAAGTAAAAGACACAAAGAAAATCAATCCCTTCTCATATATCAGTAGAAATTATACAAAATCAAATAAACAATAACACTAAAATCTA-------------------------------------------------------------------AACAAGATCTCTCCTACCTCTATTTCTCATAGCCCAC-AACCCACACCAGGGAAAGCAATCATGG-----TTCAGTTCCCTTGCCCTATCCCCACAGGCTATTTTGCACCTTAGAATGAATGAGCAAGA-ATTATATCTGTAAGAAATGCCTTTGGTACTTCAATAAAGTAACAACAAAAAATTGTGAATAGAGTAAAAAAACAGAAAAAAAATTATCGTCACTAAATACACAATATTTAATTAAAAGTATAGAAA------CTTTA------ACTGTATAAAGTA--TGCATATATATGTTATTATCTAGGATTCTCCACTTCTTAGAGCACTATT-ACAAAAAGTTGAAAAATCTACGTCTTTTCTTTTCAAGATACTGTCTTATCATTTAACAAGTC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5435160 1573 + 51628933 AGTAAAAACTAAAACTGAGTAATTTCAGCCACATGTA--ATTTTATACTATTTTCCTTTTAAACCTTTA----TTCTTTCCAAACTACTTC-TAATTTGAACAATAATGGTCATTTCATTTGTTCATTATGTA---------TTTCAAAATCTGAGATTTCAAATACCACATTAAGCAATATGGTTTCATAAAATTTATTATTTCAGAA-TGTCAACAAAAGCCATGACTCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGCCATGACTCTAACATTAGGAAATATTCTAAAGAATTTTCAAAGTTTGTGAATGGAAAATAGTTAAAAAGAAAAAAAGCACCTTTAAAACAAAATGAAACCTGTAAGAACAACTGA----GCTCC--AAAAAATAGAGACAACTTTTAAACCACACTGAAGAAAGATTATCCCTATACATTATATTGTATCACATTTCACAT---AAAATCCATATAAAACTTTCCAGAATTATAACAGTT-TTATTACCTTATATCCAGGTCCTAACTGATGAATTGCAAATATCTGCGCAGGGTTGAGTGCTTCACTGAATACATACACGGCACCAAGTTGACCACAGAATACCCTATTTGCATCAGCAGTTTCTGAAGATCCGAGAAAGCACTTGTCATAGCTCTATTTTTAAAAAGTCATA-AAA-----AAATGTATTATTTTGTAATGACAAAATATTTAAGGATACTT------GCCTTCACTGTCATGAAGACCTTACAGTATAACAATAATGATAGAAGAAAGCATCACTTAAGACTTTATGGAGTATTTAAATAATAAAAAGGCCAGCTATAGATTTTTAGAAAAAGTTAATCAGTTAAATATTTTGTATCTATAGAAAAGC------AAA-AATAACCAATTATTCAATAATC--ACTTAACCACTTTCCAAATGTCATACTTAAAGACAAAAGGGCTTATAATT--CTATTTATAAAAGTAAAACTAA-TTTGAAATTCTAATGATTTAATAACTGTCTATAT----AGAGATTCATATGAATC-AGAGAACGACTATTCCAATTTTTAACCATAAACACATAGG--------------------CCTAATTTCTGAAACT----ATCTA-------ATTTCTCCACACTAAGTCAAGGACAGAATGAAAACCAATTCCCTCTCTTCCATGAGTAGGCATTATGCAGAACCAAATAAACAA-ATCACTAAAGTCTGCAACCTAAAGCAGACGGTACAGTGCTCTCCATC-TGGAGACTTCAAGACCTAAGAAGCCATA--TTTAACAAGCCCTTTCTCATCTCTACTTCTTAAAATCTCCCC--------------------TAATGGTAGGTTCCAGTTTCCCTCCCTCATCCTTATAAGTTATTCCACACCTTAGTACTGATCATCAATACATTAAATATGTATGGAATTCCTTTGGTGCCTCAACAGAATAAC-A-AAATATTTGTGAATGAATTACAAAGACA-GAAAC------TCCTTGTCAAATACCCAATCTGTAATTAAAACTGTAAGAGC-----CTTTAGAATTTACTGCATAATGTATGTGTATATATGTGTTATTGCCCATGCCTCTCTATTTTTTGGTGTACTATT-GCAAATAATTCAAAAA--TAAGTCTTCTTTCTTTATTCT-CTTCCTTCTTTTCAAATATAAC i canFam3.chr25 C 0 I 254 a score=451736.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 16351 149 + 478999 AAGACGACCACTGGGATTTCTTCCACTCTATAATAAAAAGACTCtgcag---agatctcctctggagagaagat-aaaaagcagaatttcatctgtctATTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTAATTGGTTGTGGCACAACCA s panTro4.chr2B 115169617 152 - 247518478 AAGAAGACCACTGGGATTTCTTCCACTCTATAATAAAAAGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGGAGAGAAGAT-AAAAAGCAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAACATTCCATTAAATATTAATTGGTTGTGGCACAACCA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90190071 152 - 108868599 AAGAAGACCACTGGGATTTCTTCTACTCTATAATAAAAAGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGGAGAGAAGAT-AAAAAGCAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAACATTCCATTACATATTTATTGGTTGTAGCACAACCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4368704 149 + 118206036 AAGAAGACCACTGGGGTTTCTTCCACTCTATAATAAAAAGACTGTGGAG---AGATCTCCTCTGGAGAGAAGAT-AAAAAGCAGAATTTCATCTGTGCATTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTTATTGGTTGTGGCTCAACTA i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80190396 152 - 94676912 AAGAAGACCACTGGGGTTTCTTCCACTCTATAATAAAATGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGCAGAGAAGAT-AAAAAGGAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTTATTGGTTGTGGCTCAACCA i rheMac3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82338088 152 - 96864807 AAGAAGACCACTGGGGTTTCTTCCACTCTATAATAAAATGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGCAGAGAAGAT-AAAAAGGAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTTATTGGTTGTGGCTCAACCA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77011495 152 - 90913898 AAGAAGACCACTGGGGTTTCTTCCACTCTATAATAAAATGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGCAGAGAAGAT-AAAAAGGAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAacattctattaaatatttattggttgTGGCTCAACCA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78479691 152 - 92142175 AAGAAGACCACTGGGGTTTCTTCCACTCTATAATAAAATGACTCTGGAGAGAAGATCTCCTCTGCAGAGAAGAT-AAAAAGGAGAATTTCATCTGTGTATTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTTATTGGTTGTGGCTCAACCA i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10927738 150 - 159171411 AAGAATACCACTGGGATTTCTTTCACTCTATAATAAAAAGACTCTGGAG---AGATCTCTTCTGGAGAGAAGATAAAAAAGCAGAATTTCACCTGTCTGTTCTAATTCTGAAAACAACATTCTATTAAATATTTATTGGTTGTGGCTCAACTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr25 5436733 254 + 51628933 I a score=368312.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 16500 119 + 478999 TGAGTTTCTACGGcagggaaaagcaactttttctataaagggacagacagaaaatattttaaactttgcttgccacacctggtttctgtcccat--tcttct-ttgattttgtttgtgtctc-- s panTro4.chr2B 115169769 119 - 247518478 TGAGTTTCTATGGCAGGGAAAAGCaactttttctacaaagggacagacagaaagtattttaaactttgcttgccacacctggttgctgtcccat--tcttct-ttgattttgtttgtgtctc-- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90190223 119 - 108868599 TGAGTTTCTGTGAcagggaaaagcaaatttttctataaagggacagacagaaagcattttaaactttgcttgccacacctggttgctgtcccat--tcttct-ttgattttgtttgtgtctc-- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4368853 119 + 118206036 TGAGTTTCTACGGCAGAGAAAAGCaactttttctataaagggacagacagaagatattttaaactttgcctgccacacctggtttctgtcccat--tcttct-ttgattttgtttgtgtctc-- i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80190548 119 - 94676912 TGAGTTTCTATGGCAGAGAAAAGCaactttttctataaagggacagacagaaaatattttaaaccttgcctgccacacctggtttctgtcccat--tctgct-ttgatttggtttgtgtctc-- i rheMac3.chr17 C 0 I 170 s macFas5.chr17 82338240 119 - 96864807 TGAGTTTCTATGGCAGAGAAAAGCaactttttctataaagggacagacagaaaatattttaaaccttgcctgccacacctggtttctgtcccat--tctgct-ttgatttggtttgtgtctc-- i macFas5.chr17 C 0 I 7 s papAnu2.chr17 77011647 119 - 90913898 TGAGTTTCTATGGCAGAGAAAAgcaactttttctataaagggacagacagaaaatattttaaactttgccTGCCACACCTGGTTTCTGTCCCAT--TCTGCT-TTGATTTGGTttgtgtctc-- i papAnu2.chr17 C 0 I 4 s chlSab2.chr3 78479843 119 - 92142175 TGAGTTTCTATGGCAGAGAAAAGCaactttttctataaagggacagacagaaaatattttaaactttgcctgccacacctggtttctgtcccat--tctgct-ttgatttggtttgtgtctc-- i chlSab2.chr3 C 0 I 4 s calJac3.chr5 10927888 119 - 159171411 CGAGTTTCCAGGGCAGAAAAAAACaacttttcctgtaaagggacagacagaaaatattttaaactttgccagccccacctggttactgtaccat--tcctct-ttgattttatttgtgtctt-- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5436987 124 + 51628933 TAGGTTTCTTCCACTGTATAATAAAAATCCTCTTTGGAAGGTAGACATGAAGCAGAATTTCATCTTTGCAACCTACATGTGCTTTCTGTCATATAATCTTCTATTTTCTTTGTTTGGATGTTTA i canFam3.chr25 I 254 C 0 a score=23339.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 16619 26 + 478999 aag-------------aaacaaacaaacaaaaaaccttt s panTro4.chr2B 115169888 30 - 247518478 aagaaaa---------aaacaaacaaacaaaaaaccttt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90190342 31 - 108868599 aagaaaa--------caaacaaacaaacaaaaaaccctt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4368972 24 + 118206036 t---------------taaaaaagaaaaaaaaaatcttt i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82338366 26 - 96864807 ----aaa---------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaatta i macFas5.chr17 I 7 C 0 s papAnu2.chr17 77011770 26 - 90913898 ----aaa---------aaaaaaaaaaaaaaaaaaactta i papAnu2.chr17 I 4 C 0 s chlSab2.chr3 78479966 23 - 92142175 ----------------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaatta i chlSab2.chr3 I 4 C 0 s calJac3.chr5 10928007 20 - 159171411 -------------------taaaaaaaaaaaaaaccttt i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5437111 38 + 51628933 -AAAAAATGATCCTTTAAAAAAACAtcttaaaaaccttt i canFam3.chr25 C 0 C 0 e rheMac3.chr17 80190667 170 - 94676912 I a score=5667065.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 16645 1782 + 478999 aaaaattaaaagccaagattcttaggccccagcttacacaaaaccagaaacagggggagggtcagatttggctcatagggtgtagtctgccaagccccgATCTAGGGGACAAACTGTGGACCATACACACAGTGCTAGTTAAACGAATACAAGACACGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAAATTAAAGCCTAGAGAGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTATTGAGCTTGGAAGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTTACTTTGACTCTGACAGGCCAGAATGTAGACAATGGAAAGCCCCAAGTAGAGAAACCGTAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCAAGTTGTTCTCtacctagaatccaactgtgtcacttcttccactgctaacatactggtagaaactcatataatctctttatt-ttattgcaataagccatttaagtgatcttcctgcttctgtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatgtttttaaaatataagca-----cacatcacttgtctgctgaaaaccttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcgaaagcccaggccttacgtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctcatctct---tattattctgcctctacctccctctgctccagacaaac----tgccttttccttgaactttcctattccgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactgaatagaaga--------agttccccacatacctcgcttg-ctcaactcttcctactaaaatcatctctggaccatccggctcctcccttccctacaactacactttctgta-----tcccca---atttattttctccatagcatttatcac----gatgtaattaataatagtgactatatgttatcctt-------ctgtttagggtcttctttcTGTATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAATAAATAGAATACAGGATTCACGGTTTTTTTAATCTA------AAAAACTTAAAACTTTGGCCAAATGTTCCTGTTTTTGTATCACTAATCATGTCTTTTAACAATTTTCTTATACTAAATTTAACAATGAAAGATTCG-TTTAATAAAAAA---AAACTTTCAAAGTTTTA--AGTTTCTACCAAACTATTTTATTATTCAATTCATATTGT----AATGATAGCTCATACTCT----CAA----ATTAAACCACAGACAGAAAAAT--AGACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACGTAACACTGAATTTCATTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTACAT---AAAA---------AATTATATCAATATGTAATGTTTGGTTATTACGGTCT--AAAATGCAATTATAACATTCATAAAACCCTAGAAG----AATATGCTGACAGAACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGCTCCCCC---TCCCATCCCTCATTTCACAGATGGTAGAAGCGGCACATAAAGA--ATATTCATGGAGAAGACAAGAACTACAGCCCCTTGACCTCCAGAGTGATATTCTTTCCACTATACCAAGATTCAAA-ATTGTGGAAATACAATT-TATTTATGTTCATTCATTT---AAAATTTACATTGTGCCAGGCACTGCAGATACCCAAGGCTGACTA-------------------GTTCTCCTAGAAATTATGAGCTA-TAAAAGAAATA---C s panTro4.chr2B 115169918 1791 - 247518478 aaaaattaaaagccaagagtctttgcccccagcttacacaaaaccagaaacagcgggagggtcagatttggttcatagggtgtagtctgccaagccccgATCTAGGGGACAACCTATGGACCATACACACAGTGCTGGTTAAAAGAATACAAGACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATTAAAGCCT--ATAGACATGCAAACAAAACTGAAAAATGAATTGTATTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTAAGCGTGAAGGGTTGTATATTATTGAGCTTGCAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTTACTTTGGCTCTGACAGGCCAGAATGTAGACAATAGAAAGCCCAAAGTAGAGAAACCGTAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCGAGTTTTTCACtatctagaatccaactgtgtcacttcttccactgctaacatactggtagaaactaatataatctctttgtt-ttattgcaataagccatttaagtgattttcctgcttctgtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatgcttttaaaatataagca-----cacatcacttgtctgctgaaaaccttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcaaaagcccaggccttatgtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaaccttatctcttaatattattctgcttctacctacctctgctccagataaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactggatagaaga--------agttccccacataccttgcttg-ttcaactcttcctactaaaatcatctctggaccatccagctcctcccttccctacaactacactttctgta-----tcccca---atttattttctccatagcatttatcac----tatgtaattaataatagtgactatatgttacactt-------ctgtttagggtcttctttcTATATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAATAAATAGAATACAGGATTCGCGGTTTTTT--ATCTA------AAAAACTTAAAACTTTGGCCAAATGTTCCTGTTTTTGTATCACTAATCATGTCTTTTAGCAATTTTCTTATATTAAATTTAACAGTGAAAGATTTG-TTTAATAAAAAGAATAAACTTCCAAAGTTTTA--AGTTTCTACCAAACTATTTTATTATTCAATTCATTTTGT----AATGATAGATCATACTCT----CAA----ATTAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACGTCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACTGAATTTCACTGTTTCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACttaaat---aaaaaaa----ttaaatatatCAATATGTAATGTTTGGTTATTATGATCT--AAAATGCAATTATAATATTCATAAAACCCTACAAT----AATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGTTCCCCC---TCCCATCCCTCATTTCACAGATGGTAGAAGTGGCACATAAAGA--ATATTCATGGAGAAGACAAGAAGTACAGCCCCTTGACCTCCAGAGTAATATTCTTTCCACTATACCAAGATTCAAA-ATTGTGGAAATACAATT-CATTTGTGTTCATTCATTT---AAAATTTACATTGTGCCAGGCACTGCAGATACCCAAGGCTAACCA-------------------GTTCTCCTAGAAGTTATGAGCTA-TAAAAGAAATA---T i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90190373 1794 - 108868599 aaaaattaaaagccaagagtcttagcccctagcttacacaaaaccagaaacagggagagggtcagatttggctcatggggtgtagtctgccaagccccgATCTAGGGGACAACCTATGGACCATACACACAGTGCTAGTTAAAAGAATACAAGACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATTAAAGCCT--ATAGACATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACGAGGTACGCTTGAAGGGTTGTATATTATTGAGCTTGGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTTACTTTGGCTCTGACAGGCCAGAATGTTGACAATGGAAAGCCCAAAGTAGAGAAACCGT-AGGACCCTTGAGGTTTTAATTCGAGTTGTTCTCtacctagaatccaactgtgtcacttcttcccctgctaacatactggtagaaactaatataatctctttgtt-ttattgcaataagccatttaagtgatcttcctg-gtctgtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgaggcttttaaaatataagca-----cacatcacttgtctgctgaaaaccttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcaaaagcccaggccttatgtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctcatctcttaatattattctgcttctacctacctctgctccagacaaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactgaat---gga--------agttccccacataccttgcttg-ctgaactcttcctactaaaatcatctctggaccatccggctcctcccttccctgcaactactctttctgta-----gcccca---atttattttctccatagcatttatcac----tatgtaattaataatagtgactatatgttacactt-------ctgtttagggtcttctttcTATATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAATAAATAGAATACAGGATTCATGGTTTTTT--ACCTA------AAAAACTTAAAACTTTGGCCAAATGTTCCTGTTTTTGTATCAGTAATCATATCTTTTAGCAATTTTCTTATACTAAGTTTAACAATGAAAGATTTG-TTTAATAAAAAGAATAAACTTTCAAAGTTTTA--AGTTTCTACCAAACTATTTTATTATTCAATTCATTTTGT----AATGATAGATCATACTCTCAAACAA----ATTAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAACCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAATATAACACTGAATTTCACTGTTCATCCATTGATTGTAAATGTGGATAATGCTGATCATGTACCACttaaat---aaaaaaa----ttaaatatatCAATATGTAATGTTTGGTTATTATGGTCT--AAAATGCAATTATAACATTCATAAAACCCTACAAGAATAAATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGTTCCCCC---TCCCATCTCTCATTTCACAGATGGTAGAAGTGACACATAAAGA--ATATTCATGGAGAAGACAAGAACTACAGCCCCTTGACCTCCAGAGTGATATTCTTTCCACTATACCAAGATTCAAA-ATTGCAGAAATACAATT-CATTTGTGTTCATTCCTTT---AAAATTTACATTGTGCCAGGCACTGCAGATACCCAAGGCTAACCA-------------------GTTCTCCTAGAATTTATGAGCTA-AAAAAGAAATA---T i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr9 4368996 1784 + 118206036 aaaaattaaaagccaagattcttagcccccagcttacacaaaaccagaaacagggggagggtcagatttggctcatagggtgtagtctgcccagccccgATCTAGGGGACAAACTGTGGACCATATGCACAGTGCTAGTTAAAAGAATACAAGACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATGAAAGCCT--AGAGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTATTGAGCTTAGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTCATTTTGGCTCTGACAGGCCGGAATGTAGACAATGGAAAGCCCAAAGTAGAGAAACCATAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCTAGTTATTCTCtacctagaatccaactgtgttacttcttccactgctaacatactggtagaaactaatatagtctctttgtt-ttattgcaataagcgatttaagtgatcttcctgcttctgtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatggttttaaaatagaagca-----cacatcacttgtctgctgaaaaccttccaagga-tttttaagctgagtaagatgtgaaaacccaggactt--gtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctcatctcttaatattattttgcctcttcctccctctgctccagacaaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcatttgcactcactgttcccactgaatagaaga--------agtttcccacataccttgctcg-ctcaactcttcctactaaaatcacctctggaccatctggcttctcccttccctataccta--ctttctgta-----tcctca---atttattttctccatagcatttatcac----tatgtaattaataatagtgactatctgttatactt-------ctgtttaaggtcttctttccatatctaaatgAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAAAAGACAGAACACAGGATTCATGGTTTTTG--ATCCA------AAAAACTTAAAACTTTGGCTAAATGTT--TGTTTTT-TATCACTAATTATGTCTTTTAGAAATTTTCTTATACTAAATTTAACAATGAAAGATTCA-TTTAATAAAAAGAATAAACTTTCAAAGTTTTA--AGTTTCTACCAAACTATTTTATTATTCAATTCTTATTGT----AATGATAGATCATACTCT----CAA----ATTAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTAAAT---AAAAAAA----TTAAATATATCAATATGTAATGTTTGGTTGTTACAGTCT--AAAATGCAATTACAACGTTCATAAAACCCTACAAG----AATATGCTGACAGGACTATTAAGGATCATCTAATAGCACTTCATCAAGCTCCTCC---TCCCATTTCTCATTTCACAGATGATAGAAGTTGCACATAAAGA--ATATTCCTGGAGAAGACAAGAACTACAACCCCTTGATCTCCAGTGTGACGTTCCTTCCACTATACCAAGATTCGAA-ATTGTGGAAATACAATT-TATTTGTGTTCATTCATTT---AAAATTTAcattgtgccaggcactgcagatacccaagactgacca-------------------gttct-ctagaatttacgagctagtaagcgaaata---t i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80190837 1762 - 94676912 aaaaattaaaagccaagattcttagcccccagcttatacaaaaccagaaacagggggaaggtctgatttggctcatagggtgtagtctgccaagtccccATCTACAGGACAAACTATGGACCATATGCACA-TGCTAGCTAAAAGAATACAAAACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATGAAAGCCT--AGAGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTACTGAGCTTGGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTCACTTTGGCTCTGACAGGCCAGAATGTAGACAACAGAAAGTCCAAAGTAGAGAAATCATAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCTAGTTATCCTCtacctagaatcctactgtgtcacttcttccactgctaacatactggtagaaactaatatagtctctttgtt-ttattgcaataagcgatttaagtgatcttcctgcttcagtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatggttctaaaatagaagca-----cacatcacttctctgctgaaaactttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcgaaagcccaggcctt--gtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctca----------------tgccgcctcctccctctgcttcagacaaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactgaatagaaca--------agttccccacacaccttgcttg-ctcaactctttctgctaaaatcatctctgcaatatctggcttctcccttccctacacctacactttctgta-----tgccca---atttattttccccatagcatttatcac----tatgtaatgaataatagtgactatatgttatactt-------ttgtttagggtctTCTT---ATATCTAAATAAGGGGTAAACCACAGTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAAA---------ATAAGATTCAAGGTTTTTT--ATCTA------AAAAACTTAAAACTTTGGCCAAATGTT--TGTTTTT-TATCATTAATCATGTCTTTTAGCAATTTTCTTATACTAAATTTAACAATGGAAGATTCATTTTAATAAAAAGAATAAATTTTCTAAGTTTTA--AGTTGCTACCAAACTATTTTATAATTCAATTCATATTGT----AATGATAGATCATTCTCT----CAA----ATGAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTAAATAAAAAAAAAA----GCAAATATATCAATATGTAATGTTTGGTTATTATGGTCT--AAAATGCAGTTATAACATTCATAAAACCCTACAAG----AATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGCTCCCCC---TCCAATCTCTCATTTCACAGATGGTACAAGTAGCACATAAAGA--ATATTCTTGGAGAAGACAAGAACTACAACCCCTTGACCTCCAGAGTGATATTCCTTCCACTATACCAAGATGTGAA-ATTGTGGAAATATAATT-TATTTGTGTTCATTCATTT---AAAATTTAcattgtgccaggcactgcagacacccaaggctgacca-------------------gttctcccagaatttatgagctagtaaaagaaata---t i rheMac3.chr17 I 170 C 0 s macFas5.chr17 82338392 1762 - 96864807 aaaaattaaaagccaagattcttagcccccagcttatacaaaaccagaaacggggggaaggtctgatttggctcatagggtgtagtctgccaagtccctATCTACAGGACAAACTATGGACCATATGCACA-TGCTAGCTAAAAGAATACAAAACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATGAAAGCCT--AGAGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTACTGAGCTTGGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTCACTTTGGCTCTGACAGGCCAGAATGTAGACAACAGAAAGTCCAAAGTAGAGAAATCATAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCTAGTTATCCTCtacctagaatcctactgtgtcacttcttccactgctaacatactggtagaaactaatatagtctctttgtt-ttattgcaataagcgatttaagtgatcttcctgcttcagtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatggttctaaaatagaagca-----cacatcacttctctgctgaaaactttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcgaaagcccaggcctt--gtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctca----------------tgccgcctcctccctctgcttcagacaaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactgaatagaaca--------agttccccacacaccttgcttg-ctcaactctttctgctaaaatcatctctgcaatatctggcttctcccttccctacacctacactttctgta-----tgccca---atttattttccccatagcatttatcac----tatgtaatgaataatagtgactatatgttatactt-------ttgtttagggtctTCTT---ATATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAAA---------ATAAGATTCAAGGTTTTTT--ATCTA------AAAAACTTAAAACTTTGGCCAAATGTT--TGTTTTT-TATCATTAATCATGTCTTTTAGCAATTTTCTTATACTAAATTTAACAATGGAAGATTCATTTTAATAAAAAGAATAAATTTTCTAAGTTTTA--AGTTGCTACCAAACTATTTTATAATTCAATTCATATTGT----AATGATAGATCATTCTCT----CAA----ATGAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTAAATAAAAAAAAAA----GCAAATATATCAATATGTAATGTTTGGTTATTATGGTCT--AAAATGCAGTTATAACATTCATAAAACCCTACAAG----AATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGCTCCCCC---TCCAATCTCTCATTTCACAGATGGTAGAAGTAGCACATAAAGA--ATATTCTTGGAGAAGACAAGAACTACAACCCCTTGACCTCCAGAGTGATATTCCTTCCACTATACCAAGATGTGAA-ATTGTGGAAATATAATT-TATTTGTGTTCATTCATTT---AAAATTTACATTGTGCCAGGCACTGCAGACACCCAAGGCTGACCA-------------------GTTCTCCCAGAATTTATGAGCTAGTAAAAGAAATA---T i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77011796 1769 - 90913898 aaaaattaaaagccaagaTTCTTAGCCCCCAGCTTATACAAAACCAGAAACAGGGGGAAGGTCTGATTTGGCTCATAGGGTGTAGTCTGCCAAGTCCCTATCTACGGGACAAACTATTGACCATACGCACA-TGCTagctaaaagaatacaaaacaggATAAGCA-AATCCCTGCCCTTTGGGAGATGAAAGCCT--AGAGAGATGCAAACAAAACTCAGAAATGAATTGTGTTT--AACAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTACTGAGCTTGGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACC-TTCACTTTGGCTCTGACAGGCCAGAATGTAGACAACAGAAAGTCCAAAGTAGAGAAATCATAAGGACCCTTGAGGTTTTAATTCTAGTTATCCTCTACCTAGAATCCTACTGTGTCACTTCTTCCACTGCTAACATACTGATAGAAACTAATATAGTCTCTTTGTT-TTATTGCAATAAGCGatttaagtgatcttcctgcttcagtaa---TTTCCCTTCAAAATATTCTCAATACTGCAGGCAGACTGATGGTTCTAAAATAGAAGCA-----CACATCACTTCTCTGCTGAAAACCTTCCAAGGA-TTTTTAAGCTGAGTAAGATGCGAAAGCCCAGGCCTT--GTTTGCTTATGAAGGCCAAAATGATT-------------TCTGCCTAACCTca----------------tgcctcctcctccctctgcttcaGACAAAT----TGCCTTTTCCTTGAACTTTCCTATTCTGCCTCAAAGCCTTTGCACTCACTGTTCCCACGGAATAGAACA--------AGTTCCCCACACACCTTGCTTG-CTCAACTCTTTCTGCTAAAATCATCTCTGCAATATCTGGCTTCTCCCTTCCCTACACCTACACTTTCTGTA-----TGCCCA---ATTTATTTTCCCCATAGCATTTATCAC----TATGTAATGAATAATAGTGACTATATGTTATACTT-------TTGTTTAGGGTCTTCTT---ATATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGctggaaaaaacagaatataagaTTCAAGGTTTTTG--Atcta------aaaaacttaaaactttggccaaatgtttctgttttt-tatcatTAATCATGTCTTTTAGCAATTTTCTTATACTAAATTTAACAATGAAAGattca-tttaataaaaagaataaattttcaaagtttta--agTTGCTACCaaactattttataattcaaTTCATATTGT----AATGATAGATCATTCTCT----CAA----ATGAAAacacagacagaaaaataaagacttacaTCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTAccacttaaat--aaaaaaaa----gcaaatatatcaaTATGTAATGTTTGGTTATTATGGTCT--ACAATGCAATTATAACATTCATAAAACCCTACAAG----AATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGCTCCCCC---TCCAatctctcatttcacagatggtaGAAGTAGCACATAAAGA--ATATTCTTGGAGAAGACAAGAACTACAACCCCTTGACCTCCACAGTGATATTCCTTCCACTATACCAAGATGTGAA-ATTgtggaaatataatt-tatttgtgttcattcattt---aaaatttacattgtgccaggcactgcagatACCCAAGGCTGACCA-------------------GTTCTCCTAGAATTTATGAGCtagtaaaagaaata---t i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78479989 1772 - 92142175 aaaaattaaaagccaagattcttagcccccagcttatacaaaaccagaaacagggggaaggtctgatttggctcatagggtgtagtctgccaagtccctATCTACGGGACAAACTATGGACCATACGCACA-TGCTAGCTAAAAGAATACAAAACAGGATAAGCA-AATCCCTGCCCTTCGGGAGATGAAAGCCT--AGAGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTGTTT--AAGAGGTAAGTTCTTATAAAACCAGGTATGCTTGAAGGGTTGTATATTACTGAGCTTGGAGGTACTTTCAGCATTAAAACAAACCTTTCACTTTGGCTCTGACAAGCCAGAATGCAGACAACAGAAAGTCCAAAGTAGAGAAATCATAAGGACCCCTGAGGTTTTAATTCTAGTCATCCTCtacctagaatcctactgtgtcacttcttccactgctaacatactggtagaaactaatatagtctccttgtt-ttattgcaataagcgatttaagtgatcttcctgcttcagtaa---tttcccttcaaaatattctcaatactgcaggcagactgatggttttaaaatagcagca-----cgcatcacttctctgctgaaaaccttccaagga-tttttaagctgagtaagatgcgaaagcccagacctt--gtttgcttatgaaggccaaaatgatt-------------tctgcctaacctca----------------tgcctcctcctccctctgctcgagaaaaat----tgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttgcactcactgttcccactgaatagaaca--------agttccccacataccttgcttg-ctccactctttctgctaaaatcatctctgcaatatctggcttctcccttccctacacctacactttctgta-----tgccca---atttattttccccatagcatttatcac----tatgtaatgaataatagtgactgtatgttatactt-------ttgtttagggtctTCTT---ATATCTAAATAAGGGGTAAACCACATTTTTTAGTGCTTG--ATGCTGGAAAAAACAGAATATAAGATTCAAGGTTTTTG--ATCAA------AAAAATTTAAAACTTTGGCCAAATGTTTCTGTTTTT-TATCACTAATCATGTCTTTTAGCAATTTTCTTATACGACATTTAACAATGAAAGATTCA-TTTAATAAAAAGAATAAATTTTCAAAGTTTTA--AGTTGCTACCAAACTATTTTATAATTCAATTCATATTGT----AATGATGGATCATTCTCT----C-A----ATTAAAACACAGACAGAAAAATAAAGACTTACATCATTTGTATTAACATGCCAAGCCATATCACCGTAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTAAAT--AAAAAAAA----GCAAATATATCAATATGTAATGTTTGGTTACTATGGTCT--AAAATGCAATTATAACATTCATAAAACCCTACAAG----AATATGCTGACAGGACTATTAATGATCATCTAATACCGCTTCCTCAAGCTCCCCC---TCCAATCTCTCATTTCACAGATGGTAGAAGTAGCACATAAAGA--ATATTCTTGGAGAAGACAAGAACTACAACCCCTTGACCTCCAGAGTGATATTCCTTCCACTATAACAAGATGTGAA-ATTGTAGAAATACAATT-TATTTGTGTTCATTCATTT---AAAATTTACATTGTGCCAGGCACTGCAGATACCCAAGGCTGACCA-------------------GTTCTCCTAGAATTTATGAGCTAGTAAAAGAAATATATT i chlSab2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10928027 1768 - 159171411 aaaaattaaaagccaatacaattagcccccagcttacacaaaatcagcaac-gggggagggtcagatttggtt----agctgtaggctgccaagcccCAGTCCAGGGAATAAATTATGAACCAGACACACTGTGCTAGCTAAAAGAAAATAAGGCAAGATAAGT--AATACCTACCCTTTGGGAGATGAAAGCCT--AGCGAGATGCAAACAAAACTGAGAAATGAATTGTATTT--AAGAGGTAAATTCTAATAAAATCCGGTATGCTTAAAGAGTTGTATCTTACTGAGCTTGGAGGTAGTTT-AGCATTAAAACCAACCTTTCACTTTGGCTCTGATGGGCCGAGATGTAGACAATGAAAAGTCCAAAGTAGAGAAACC-TAAGGACCCTTGAGGCTTTAATTCTAGAGTTCCTCtacctagaatccaactaattcacctgttccactgctaacatactggtagaaactaatataatctctttgtt-ttatggcagtaagccatttaagtgatcttcctgattctgtaa---tttcccttcataatattc----tactgcaggcagactgatacttttaaaatataagca-----cacatcaattgtctgctcaaaatcttccaaggattttttaagctgagtaagatgtgaaagcccaagcttt------gcttacaaaggccagaatgatt-------------tctgcctaacctcatctctgaatattattcggcctcttcctccctctgctccagaccaattgactgccttttccttgaactttcctattctgcctcaaagcctttacactcactgttcccactgaatagaata--------agttacccacataccttgctttccttaactc---ctactgaaatcatctctggaccatctggcctctcccttccttacacctacattttctgta-----accccacttatttttttcctccatagtatgtatcac----tatgtaattaataatagtgactatatgttatattt-------ctgtttagggtcttctttccATATCTAAATAAGTGGTAAACCACACTTTTTAG----CG--ATGCTGGAAAAAACAGAATACTGGATTCATGGTTTTTG--ATCTA------AAAAATTGAAAACTCTGGACAAATGTTCCTATTTTTCTACCACTAATCATGTCTTTTAGCAACTTTCTTATACAAACTTTAACAATAAAAGACTCA-TTTAATAAAAAGAATAAACTTTCCAAGTTTTA--AGTTTCTACCA---------ATTATTCAATTCATATTGT----AATGATAGATCACACTCT----CAAACACATTAAAACACAGACAGAAAAAT----ACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAAGATACCAGTTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCATCGATTGTAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACttaaat-aaaaaaaaa----ttaaatacattaatatGT-ATGTTTGGTTCTTATGGTCT--AAAATGCAATTATAACTTTCATAAAACCCTACCAG----AATATGCTGGCAAGACTAATAATGATCATCTAATACCACTTCCTCAAGGTCCCCCCCTTCCCATCTCTCATTTCACAGATGGTAGAAGTGG--CATAAAGA--ATATTCATGGAGAAGAGAA-AATTACAACCCCTTGACCTCCAGAGTGATAGTCCTTCCACTATACCAAGATCCAAA-ATTGCGGAAATACAACT-TATTTGTGTTCCTTCATTT---AAAATTTACATTGTGACAGGCACTGCAGATAGCCGAGGCTGACCA-------------------GTTCTCCTACAATTTATGAGCTAGTAAAAGAAATT---C i calJac3.chr5 C 0 I 204 s canFam3.chr25 5437149 1814 + 51628933 aaaatgaagaaaccaagattcttagctctcaggttatgcaaa------aacagatcaaggttcagacatggtctgcagggtatattcttccaacctatgACTCAGGGAAAAAGCTACGGACTTTGTACACAGTACTATTTAGAAGAATACCAGAGAGAACAAGAAGAGATCCCGCTCTTGAGTAAATTATAGTCT--GGAGAGATACGGACAATACTGAGATGTGAATTTTGTTTAAAAGAGGCAAGTTTTTATAAAACCAGGTACCCTGGAATAATTATCTATTATTG-GTTTGGAAATATTTT-GGCATTAGAAAATATCTTTTATTCTGGGTCTGACAGGCCAGGATAATGACAAGGGAAAGTCCAGAACAGAGA------------TCTTGAGGTTTTAACTCTAGATATTTTCtatccagaattcaactgtgtaacctctctcactactaacaggacagtcaaaactagtat--tgtgtttgttattatcacagtaagtcatttaattgatctccttgcttctgtcatttttttccttcaaaatattctcaattct----acagcctgatatttttaaaatatgaatcagtatcatatcacctgtctgctcaaaactttccaaag--tttttatgctgggtaagatagaaaagcccaggtattatgttaacacatgagactctgcatgatttcaccacttactatctgcctaaccttatctcttaacattattctg------------tccactcctggctgct----tttttgtttaattaactttttcagttcacctcataggcttcggactcactgcttccagcaaatgggatatttctcccaaatatccacatgactttttcc-ctcaactctt----ctaagatcatttctataccatatagcttc-cccttccctacacctatagcctctatactatttccact---aaattttttttccacagcatttatcactacttatctagtaaacaacaatgactacatgttatacttattcacattgtttagagtcttcctttcacATTCAGATAAGATGCAAGACACAGTTTTTACCGCTTGAAATTCTGGAAAGAATAGAATACTGCATGGATG--TTTTG--ATCTAATCCTTAATAATTTA----TTTGAAC-AATTTTCCTTTTTTTGTATCACTATTTATAACTTATA---------TTAAACGAGACCTA-------AAAATTCA-CTTAACAGAAAAAA-AAACTTTCAAAGTACAACTATTTTCTACAAAACAATTCTATTACAAAATTCATGTTATGAACAATGATAGATTACATATT----TAAATACATTAAAGCACAGGTTAAAGAA--AAAACTTACATCATTTGTGTTAACATGCCAAGCCATATCACCATAGGATACCAGCTGTCCATTAACATAACACCGAATTTCACTGTTCCTCCACCGATTATAAATGTGGACAATGCTGATCATGTACCACTTAAATAAAAAAAAAAAGATTTAAAGATCTTAATATGTCATGTTTAGT---TATGGTCTAAAAAAAGCAATCATAACATTCATAGCACACTACAAG----AA-ATGCTTGAAAGA--ATTAACAATTACACATTACCATT---TCAAGTTGCACC---TCTTATTTCTCATTTTGGAGATGAAAGAATTGATTCATAAAGATTAAATCTGTGATGGAGAC-AGACCTAGAACACTCTGAACTCAGGAATGATATTCCTTCCACTATACTAAGATCTAAATATTATGGAAATACAATTATATTTGTGCtcattcatttaacaacatgtatattctgccaggcaccacaaatactcaagtttgaccagacagagcacacagatccggctatcctaaaattcatgatgtaatgaaaaagaca---c i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=191517.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 18427 59 + 478999 ATATGACACAATTAAACAAGTGTAGAATTATAAA-TCATGGTGATTACAGGGAGGAGAAA s panTro4.chr2B 115171709 59 - 247518478 ATATGACACAATTAAACAAATGTAGAATTATAAA-TCATGGTGGTTACAGTGAAGAGAAA i panTro4.chr2B C 0 N 0 s ponAbe2.chr14 90192167 60 - 108868599 ATATGACACAATTAAACAAATGTAGAATTATAAATTCATGGTGATTACAGTGAGGAGAAA i ponAbe2.chr14 C 0 I 11776 s nomLeu3.chr9 4370780 59 + 118206036 atatgacacaattaaacaaatgtagaattataaa-tcatggtgattacagtgaagagaaa i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s rheMac3.chr17 80192599 59 - 94676912 atatgacacaattaaacaaatgtagaattataaa-tcatggtgattacagtgaggagaaa i rheMac3.chr17 C 0 N 0 s macFas5.chr17 82340154 59 - 96864807 ATATGACACAATTAAACAAATGTAGAATTATAAA-TCATGGTGATTACAGTGAGGAGAAA i macFas5.chr17 C 0 C 0 s papAnu2.chr17 77013565 59 - 90913898 atatgacACAATTAAACAAATGtagaattataaa-tcatggtgATTACAGTGAGGAGAAA i papAnu2.chr17 C 0 C 0 s chlSab2.chr3 78481761 59 - 92142175 ATATGACGCAATTAAACAAATGTAGAATTATAAA-TCATGGTGATTACAGTGAGGAGAAA i chlSab2.chr3 C 0 N 0 s calJac3.chr5 10929999 57 - 159171411 ACGTGACACAATTAAACAAACAT--AATTATAAA-TCGTGGCAATTATAGTGAGCAGAAA i calJac3.chr5 I 204 C 0 s canFam3.chr25 5438963 59 + 51628933 agattagacaagtaaaaaaatataagatgatgaa-taaccaagattactctgaggggaaa i canFam3.chr25 C 0 C 0 a score=14693.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 18486 22 + 478999 -GAaaacaa---aaacaggagaag---aa s nomLeu3.chr9 4370839 28 + 118206036 -aagaacagtataaactgaaaaagaacaa i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s macFas5.chr17 82340213 25 - 96864807 -AAGAACAGTATAAACTGAAAAAG---AA i macFas5.chr17 C 0 N 0 s papAnu2.chr17 77013624 25 - 90913898 -AAGAACAGTAtaaactgaaaaag---aa i papAnu2.chr17 C 0 N 0 s calJac3.chr5 10930056 23 - 159171411 --AAAACAGTATAAAGGGAAAAAG---A- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr25 5439022 26 + 51628933 taaaaaaagtgtaaactgaggaag---aa i canFam3.chr25 C 0 N 0 e ponAbe2.chr14 90192227 11776 - 108868599 I a score=857.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 18508 4 + 478999 acaa s nomLeu3.chr9 4370867 4 + 118206036 acaa i nomLeu3.chr9 C 0 C 0 s calJac3.chr5 10930079 4 - 159171411 ATAA i calJac3.chr5 C 0 N 0 e ponAbe2.chr14 90192227 11776 - 108868599 I a score=251.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 18512 4 + 478999 gaat s nomLeu3.chr9 4370871 4 + 118206036 ggat i nomLeu3.chr9 C 0 N 0 e ponAbe2.chr14 90192227 11776 - 108868599 I a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 18516 1636 + 478999 acaaacatgaaatagaagcagtagcaaaagaaaatgaagaggaacaagaaaatgagaagaaaacacacagcggaagAAAGGAAAAAGAACAGGTATGGGAATTAGAAGGCCTATAATACCTCTTATCCCCTTCTCGATTCATAAAATTTGAGTAACTCAAAGACTATCACAACAAAAAACAAGCAAAAGGATACACAAATAGTCATCCCCTAAATTTTGTTAAGAATGAGACAATGCTGCCACTCACGCCTAGCTCAGGCACCAGCAGGAGGGCACCCTCCAGAGATTGCAGGAGAAAGGGGGAGAACTCTTCTTTgccctaggtatatcaccaccactgccaccgaagcctgtgttacagcacccacaggttcctccccaccccagagtgggatgggccctgcagtgctcctattcccccttcccggcccccagacttcctactgctaccaccactagcgccaatgccaatacaaccactgtcgccctcaatgtaccagcccaccctaccagctcctaccacctggcccccgtgggtgccctcctcccgctccggtcgatctgtggtctccatcgccaccaccaaccgcatgaggcaagctgcagaaccacgtcatctgcaggctcgaccctaccacaggcgactcctcgccttctcctccttcagcctggcttggagtagctgggcaggcaaagccagaaaagccCAAATCAGGATTCAGACAGTGGAACCGTTAGAGCCTCACCTTGTCACGCTGGTGACTGGGTGGCAGGCATCAGTTTCATTGAAGGCACTCACATCCACCTTCCAAAGTCCAGCCTCTCCTTCTGGCAAAAGCTGGCCAGGAACTGGGGTCTGGGGTGGGAGTGAATGCCTTCACTGAAACCGGCCCCTGGCCAACTCCAGCTGACCAGGAATTGCTGGGCCCACCAGGGCTGCCCTCCTCAGGGAGCCCGAGTAGGAGAAACTCAGAACCAGCCAGCCCTCCCCACCCAAGGGCTGGTTCCCATTCCTGACGCCTCCACCCACAGTGCCCTGTCCCCTGCTTCCCCCGTGGGTGCCTATTACTCCCTGCCTGGTAGTCCCAGGTGGTCTCCGCAACACAGAGCATGAGGGCGTGCCGGGAAACCACAGTGGGTGTGGGAGCCCTGCCGTGCAATCTAGCACGAGCAGGAGAAGATCGCCTTCTAGAGTCTGGAGTCCGGGAATAGAAGAACGATCCCTTACCTGGAGACCACCAGAAGGAAAGAGGCGGCCACTACTGTCGCTGCCGCTgccgccacctcagctcgccaacaccgctggcagtgtagcccccacagcacccctaatctgacccctgccactagcagtgtagcccccggatagcacatccaacacaccctagtttcaggcaatgtaaccccaatacctcccccaaagcactccccccacactgcagggagtgtaccacccaacagtgccccaaatctgacccagccacgggagttgctgcactagataccatcccaaacccacctcctcccaccccgccacggacagttcagctcttgatggcgcaccaccccgagtcagcacccaacaacgccccaggcagtgcagcatccaacaacgtccctaaaccacccccgactg e ponAbe2.chr14 90192227 11776 - 108868599 I a score=190019.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 20152 2314 + 478999 ccagcattgtagccctggataactccacccaacccaccccctgccgctggcagtgcagcagaagatagcgcccctaatccttccccagccaccggcagtatacgctagtgtacacaatctgctttccccgaccacccctgccaccgcaggcagtatagccccagatagccagccaacctgccccaccaccagcaatgccaccccggagagtgcccccaaccagaccactgccacaggcagggtagcctctagcagtgagccccagtaggacacccaacccttgcccccagaggcgtgcagggcagccccgggaaactcacctaccccatcacatttctaccactgtgaccgagctgcagtctccgacgtcaccaccaaccacagcgaggcgaaccaaccagagccaggccagccacggtggcacaggttccagcctccagcatgtggcagtgcctcttccttctcctagtcctccagcccagcaggagaagctcccgctgccgggcgctctcctactgctctgtcgccaccaccaaccacagcgaaacagtgtcccacgctccagggctccagactccatccatcctccagcttcaagcaggagaaaggttgcggcctcttccagttctctaagccggtcacggggtagctcttcctctagacacagaagagcttgaaatgacctgatacgacctcagcatgctttatataccgaggttatgcaaatgcgtttcctggactacatgttctgattggatgagagaaaaaacctctaggcctactctgattggactttgttttcatgctgtgattggttgtgttaagacttactctcaaccaatcagaacatgataataaagtccaatcagagtaagcctggaggtttttt--ctcatccaatcaaaacatgcagtccaggaacctccgtgggcataaccgcagtatataaatgatgctgaagacaggtcaggtttattcaggttcctgtattttcctgtcgagttgctagctgcccgtcgtagaggaCTAAAAAAAATTAATGAAAATTGCTAAATCAATGACGCTTTCAGAAGTTCCCTGTTTTTGACATCAGAGTCATATTATAATGCTCTATTTTCTGTTTCCTCACCTAAATAGAATTTTGCTTGAGGTAATTTTTTATCTGAACTTCTGTTTGTAGAAACCAGGGACATTTATTGAATTGTTTCTGGCTGGCTATTTGATCTTAACAAAGCATTTAAATGATACTGATGCCCTGGCTTGAGCAACGGAGCATCCCAGACTTTCAGTTAGTTGCACATAGCACACATACAACTCATTTGAGTTACAGCTAAATGCAATTACAGGCCTCAGAGCTAATATATAGATCACTTCTTATTTAAGGCAATTCACCTTTGAATTGGTTAACCTTTAATTGTTGATAAAATAATAAGATGGGAAACAAAGTTGCTACCCAATATGTTAGTTTCCCCAAATAAACACTTATTTAAAGGTTCATTTGTTAATCAAGTATCTGGAAGTTGAAATACATTTTTATGAAAGGAAATAAATTTTAGGTGATGATTAGGTTTTTATCAAGAGCTGAAGTTTTTAATAACGAACAGGGAGAGATACTATGGCAAAACAGTAATTGAATAAAACATAAATTCAATAAAATGATATGAAAAATCAATGACATTTATCCTGAGTCAAATATAAAGAGAATTAAATTGAGGATGATAAAAT---GTTTCTAATCATTGTTCCACCAGTATTTGACCTTGAGCAAACTGCCTGGGGGCCATATTTGGTAGACAGATGAGGATGTACACTTTCTTTTAAATACTTGAGAATTAGCTTAAGTGCTATCATTTGATAACTTGCTCGGTATTTCATAAATGCCAGGAAATTAACTCAAATCCTTTGATGAGCTGCATTTTCTGTATTCAATTTGTGTAAGttcaacaaatatttattgagggtcttccatatgctgggtaTGTGTCTTCGCAAAATAAAGTACATTATGAAAGATGTgatgctcaatagtatatcatcagtgaattgcaaattaaaatctaaatgagatatcactatatatccactggattgtctaatattttaaagttgtcagtattaaatattgggaaaaatgtggagcagctggaacactcatacattgccagtgggagattaaaatggtgcagcactttgtaaagctaaacatatatttaccatactacccaataataccactaagtatttaccaagagaaaacaattgtctacacaaagacttgtacatgaatgttcaccgtagccttattcatcatagctaaaa s ponAbe2.chr15 18445016 2290 + 99152023 ccagcattgtagccccggataacttcacccaacccaccctctgccgctggcattgcagcagaagacaccacccctaatccttctccagccaccgacggtacacgtcagtgtacacaacctgcctcccctgatcacccctgccaccgcgggcagcagagccccagatagccagccaacctgccccaccaccagcaatgccaccctggagaatgcccccagccagaccactgccacaggcagggtagcctctagcagtgagccccaataggacacccaacccttgctcccagaggcgtacagg-cagccccaggaaactcacctaccccatcacatttccaccactgtggccgagctgcagtctccgacgtcaccaccaaccacagcgaggcgagccaacca---cgaggcgagccacggtggcacaggctccagcctccagcacgtggcggtgcctcttccttctcctagttctccagcccagcaggagaagctccccctgccggccactctactactgttctgcagccacca---accacagccagatagtgtcccacgcgccagggttccaggctccatccatcctccagc-------aggcgaaatgttgcggccttttccagttttctaagcccgtcacagggtagctcctcctctcgacacagaagagcttgaaatgacctgatgcgacctcagcatattttatatagctaggttatgcaaatgtggttcctggactacatgttctgattggacaagagaaaaa-cctctaggtctactctgattggactttattttcatgctgtgattgattgtgttaagacttgctctcaaccaatcagaacatgataataaagtccaatcagagtaagcctggaggttttttttctcatccaatcaaaacatgcagtccaggaacctccgtgggcataaccgcagtatataaatgatgctgaagcgaggtcaagttttttcaggttcctct-tttttttgtggagttgctcgctgcccagcgtagaggaCTAAAAAAA-TTAATGAAAATCGCTGAATCAATGACGCTTTCGGAAGTTTCCTGTTTT-GACATCAGAGTCATATTATAATGCTCTATTTCCTGTTTCCTCACCTAAATAGAATTTTGCTTCAGGCAATTTTTTATCTGAACTTCTGTTTGTAGAAACCAGGGACATTTATTGAATTGTTTCTAGCTGGCTATTTGATCTTAACAAAGCATTTAAATGGTACTGATGCCCTGGCTTGAGCAACGGAGCATCCCAGACTTTCAGTTAGTTGCACACAGCACACATACAACTCATTTGAGTTACAGCTAAATGCAATTACAGGCCTCAGAGCTAATATACAGATCACTTCTTATTTAAGGCAATTCACCTTTGAATTGGTTAACCC----TTGTTTATAAAATAATAAGATGGGAAACAAAGTTGCTACCTAATATGTGAGTTTCCCCACATAAACACTTATTTAAAGGTTCATTTGTTAATCAAGTATCTGGAACTTGAAATACATTTTTATGAAAGGAAATAAATTTTAGGTGATGATTAGGTTTTTATCAAGAGCTGAAGTTTTTAATAATGAACAGG--GAGATACTATGGCAAAACAGTAATTAAATAAAAC--AAATTCAATAGAATGATATGAAAAATCAATGACATTTATCCTGAGTCAAATATAAAGAGAATTAAATTGAGGATGACAAAATGTGGTTTCTAATCGTTGTTCCACCACTATTTGACCTTAAGCAAACTGCGTGGGGTCCATATTTGGTAGACAGATTAGGATGTACACTTTCTTTTAAATACTTGAGAATTAGCTTAAGTGCTATCATTTGATAACTTGCTCAGTATTTGATAAATGCCAGGAAATTAACTCAAATCCTTTGATGAGCTCCATTTTCTGTATTCAATTTGTATAAGttcaacaaatatttcttgagggtcttccatatgctgggtatgtgtcttagCAAAATAAAGTACATTATGAAAGATCTgatggtcaatagtatatcatcagtgaattgcaaattaaaatctaaatgagatatcactatatatccactggattgtctaatattttaaagttgttagtattaaatattgggaaaaatgtggagcagctggaacactcatacattgctagtgggagattaaaatggtgcagcactttgtaaagctaaacatatatttactatactacccaataataccactaagtatttaccaagagaaaacaattgtctacacaaagacttgtacatgaatgttcacagca--ctttatcatcata-ctaaaa i ponAbe2.chr15 n 11776 I 36 a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 22466 10 + 478999 actggaaaca e ponAbe2.chr15 18447306 36 + 99152023 I a score=35488.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 22476 398 + 478999 actcaaaaacagaaaagtaaattgatgagcaaattgtggtatatcaatttaatgggataccatccaacaatgaaataaataatgaacgataacactgattgacatcaataatctcaaaatcattatcctatgttaatgaagccagacacaaataagtattttgtatattattttatttgcataaaaatttataacaggaaaatctaatctataatggcaaaaagtagattcatggttgtctgagctaaggggtagaggaagattgatggactgcaaaatgcaaaagggaactccttgagggtgatggaaatagtctatatcctgattagcaaggtggttacatgcatgtatacctttctcaaaactcatagaacatacacttaaaaTGTGCAGTGCTG s ponAbe2.chr15 18447342 397 + 99152023 nctcaaaaacataaaagtaaattgatgagcaaattgtggtatatcaatttaatgggataccatccaacaatgaaataaataatgaatgataacactgattgacatcaataatctcaaaatcattatcttatgttaatgaagccagacataaataagtattttgtatattattttatttgcataaaaatttataacaggaaaatctaatctataatggcaaaaagtagattcgtggttgtctgagctaaggggtagaggaagattgatggactgcaaaatgcaaaagggaactccttgggggtgatggaaatagtctatatcctgattagcaaggtggttacatgcatgtatacctttctcaaaacgcatagaacatacac-taaaaTGTGCCGTGCTG i ponAbe2.chr15 I 36 T 969 a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 22874 33 + 478999 GCTGGGTGCAGTGATATGGCTCATACCAATAAT e ponAbe2.chr15 18447739 969 + 99152023 T a score=7534.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 22907 88 + 478999 GAACAGGGAGAGATACTATGGCAAAACAGTAATTGAATAAAACATAAATTCAATAAAATGATATGAAAAATCAATGTTTGACATTTAT s ponAbe2.chr15 80703628 88 - 99152023 GAACAGGGAGAGATACTACGGCAAAACAGTAATAGAATAAAACATAATTTCAACAAAATGATATGAAAAATCAATGTTTGACATTTAT i ponAbe2.chr15 n 969 n 969 a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 22995 95 + 478999 CCTGAGTCAAATATAAAGAGAATTAAATTGAGGATGATAAAATGTTTCTAATTATTGTTCCACCAGTATGTGACCTTGAGCAAACTGCCTGGGGG e ponAbe2.chr15 80703716 969 - 99152023 n a score=2724.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 23090 31 + 478999 CCATATTTGGTAGACAGATGAGGATGTACAC s ponAbe2.chr15 18446770 31 + 99152023 CCATATTTGGTAGACAGATTAGGATGTACAC i ponAbe2.chr15 T 969 I 1506 a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 23121 42 + 478999 AGTGGTATGGCTCATACCACTGCACCCAGCCAGCACTGCACA e ponAbe2.chr15 18446801 1506 + 99152023 I a score=2696580.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 23163 824 + 478999 ATAAATGTCAAACATTGATTTTTCATATCATTTTATTGAATTTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCATAGTATCTCTCCCTGTTCGTTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCATCACCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAACTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAACTAACATATTGGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATGAACAATTAAAGGTTAACCAATTCAAAGGTGAATTGCCTTAAATAAGAAGTGATCTATATATTAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTGTGCAACTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTATCATTT-AAATGCTTTGTTACGATCAAATAGCCAGCCAGAAACAATTCAATAAATGTCCCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTGAGATAAAAA-A-TTGCCTGAAGCAAAATTCTGTTTAGGTGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGGAACTTCTGAAAGCGTCATTGATTTAGCAATTTTCATTAATTCTTTTAACCAAAAAAACTG----------------CTCTTTTGTAGTCCTTTTTAAAAGAGAAAAAAA----GGGAAAAATGCCTTACTTAGCCCTTGGCACACATT----TTATT-ATTCATTTCTAACATGGCATGTCACATTGACAACTCGTTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA-----TTTTGTATAT s panTro4.chr2B 169274952 820 + 247518478 ATAAATGTGAAACATTGATTTTTCATATCATTTTATTGAATGTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCA---CCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAACTAACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATAAACAATTAAAGGTTAACCAATTCAAAGGTGAATTGCCTTAAATAAGAAGTGATCTATGTATTAACTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTTTGTGTGTGCTGTGTGCAACTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAACAGCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCCCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAA-A-TTGCCTGAAGCAAAATTCTATTTAGATGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCATTCATTTAGCAATTTTGATTAATTTTTTTAACCAAAAAAACCG----------------CTCTTTTGTAGTACTTTTTAAAAGAGAAAAAAG----GGGAAAA-TGCCTTACTTAGCCCTTCGCACACATT----TTATT-ATTCATTTCTAACATGGCACATCACATTGACAACTCATTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA-----TTTTGTATAT i panTro4.chr2B N 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18448307 821 + 99152023 ATAAATGTCAAACATTGATTTTTCATATCATTTTGTTGAAATTATGTTTTATTCTATTACTGTTTTGCCGTAGTATCTCTCCCTGTTCGTTATTAAAAAATTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCATCACCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAACTCACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATAAAC----AAAGGTTAACCAATTCAAAGGTGAATTGCCTTAAATAAGAAGTGATCTATATATTAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTGTGCAACTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAGCCCAGGGCATCAGTACCATTTAAAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCAGCTAGAAACAATTCAATAAATGTCCCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAA-A-TTGCCTGAAGCAAAATTCTATTT-GGTGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCGTCATTGATTTAGCAATTTTGATTAATTTTTTTAACCAAAAAAACTG----------------CTCTTTTGTAGTACTTTTTAAAGGAGAAAAAAA----GGGAAAAATGCCTTACTTAGCCCTTGGCACTCATT----TTATT-ATTCATTTGTAACATGGCACGTCACATTGACAACTCATTTTAAGTCTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA-----TTTTGTGTAT i ponAbe2.chr15 I 1506 C 0 s nomLeu3.chr17 86752864 822 - 99891981 ATAAATGTGAAACATCGATTTTTCATATCATTTTATTGAATGTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTGTTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCATCACCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAGACTAACATGTTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATAAACAATTAAAGGTTAACCAATTCAAAAGTGAATTGCCTTAAATAAGAGGTGATCTGTGTATTAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTGTGTGTACTGTGTGCAACTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCATTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATACCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCCCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAA-A-TTACCTGAAGCAAAATTCTATTTAGATGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCACTGATTTAGCAATTTTGATTAATTTTTTTAACCCAAAAAACTG----------------CTCTTTTGTAGTACTTTTTAAAAGAGAAAAA------GGGAAAAATGCCTTACTTAGCCCTTCGCACACATT----TTACT-ATTCATTTCTAACATGGGACATCACATTGACAACTCATTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA-----TTTTGTATAT i nomLeu3.chr17 N 0 C 0 s rheMac3.chr12 28269027 817 + 106825570 ATAAATGTGAAACATTGATTTTTCATATCATTTTATTGAATTTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCA---CCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAATTAACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCttattattttataaacaattaaaaattaaCCAATTCAAAGGTGAATTGCTTTAAATAAGAAGTGATCTATGTATCAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTGTGCAATTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCTCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAT-A-TTGCCCGAAGCAAAATTCTATTTAGGCGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCACTGATTTAGCAATTTTGATTAATT-TTTTAACCAAAAAAACTG----------------CTCTTTTGTGGTAATTTTTAAAAGAG-AAAAAA----GGGAAAAATGCATCAC-TAGCCCTTGGCACACATT----TTATT-TTTCATTTCTATCATGGCACATCACATTGACAACTCGTTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA------TTTGTATAC i rheMac3.chr12 N 0 C 0 s macFas5.chr12 53825355 818 + 132586672 ATAAATGTGAAACATTGATTTTTCATATCATTTTATTGAATTTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCA---CCTAAAATTTATTTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAATTAACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATAAACAATTAAAAATTAACCAATTCAAAGGTGAATTGCTTTAAATAAGAAGTGATCTATGTATCAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTTAAATGAGTTGTTTGTGTGCTGTGTGCAATTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCTCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAT-A-TTGCCCGAAGCAAAATTCTATTTAGGCAAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCACTGATTTAGCAATTTTGATTAATT-TTTTAACCAAAAAAACTG----------------CTCTTTTGTGGTAATTTTTAAAAGAGAAAAAAA----GGGAAAAATGCATCAC-TAGCCCTTGGCACACATT----TTATT-TTTCATTTCTATCATGGCACATCACATTGACAACTCGTTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA------TTTGTATAC i macFas5.chr12 N 0 C 0 s papAnu2.chr12 26908269 818 + 104110932 ATAAATGTGAAACATTGatttttcatatcattttattgaatttatgttttattcaatTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCA---cctaaaatttatttcctttcat-aaaa------------------------------------------------------atgtattt------------------------------------------------------caagttCCA--------------------------GATACTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTTAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAATTAACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCca---tcttattattttataaacaattaaaaattaaccaattCAAAGGTGAATTGCTTTAAATAAGAAGTGATCTATGTATCAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTGTGCAATTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCGTTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCTCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAT-A-TTGCCCGAAGCAAAATTCTATTTAGGCGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCACTGATTTAgcaattttgattaatt-ttttaaccaaaaaaactg----------------ctcttttgtggtactttttaaaagagaaaaaaa----gggaaaaatgcctCAC-TAGCCCTTggcacacatt----ttatt-tttcatttctatcatgGCACATCACATTGACAACTCGTTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA------TTTGTATAC i papAnu2.chr12 N 0 C 0 s chlSab2.chr10 50448929 818 + 128595539 ATAAATGTGAAACATTGATTTTTCATATCATTTTATTGAATTTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCACAGTATCTCTCCCTGTTCATTATTAAAAACTTC-AGCTCT----------TGATAAAAACCTAATCA---CCTAAAATTTATTTCCTTTCATAAAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CAAGTTCCA--------------------------GATTCTTGATTAACA------------------------------------------------------------AATGAACCTTCAAATAAGTGTTTATTTGGGGAAATTAACATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TCTTATTATTTTATAAACAATTAAAGATTAACCAATTCAAAGGTGAATTGCTTTAAATAAGAAGTGATCTATGTATCAGCTCTGAGGCCTGTAATTGCATTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTTTGCAATTAACTGAAAGTCTGGGATGCTCCATTGCTCAAG-CCAGGGCATCAGTACCATTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCAGCAAGAAACAATTCAATAAATGTCTCTGGTTTCTACAAACAGAAGTTCAGATAAAAT-A-TTGCCCGAAGCAAAAATCTATTTAGGCGAGGAA--ACAGGAAATAGAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGGAAACTTCTGAAAGCATCACTGATTTAGCAATTTTGATTAATT-TTTTAACCAAAAAACCTG----------------CTCTTTTGTAGTACTTTTTAAAAGAG-AAAAAA----GGGAAAAATGCCTCAC-TAGCCCTTGGCACACATT----TTATT-TTTCATTTCTAACATGGCACATCATATTGACAACTCGTTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTACTAAGTAATCA------TTTGTATAT i chlSab2.chr10 N 0 I 178 s calJac3.chr6 104659419 814 - 158406734 ATAAATGTAAAACATTGATTTTTAATATCATTTTATTGAATTTATGTTTTATTCAATTACTGTTTTGCCATGGTATCTCTCCCTGTTCATTATCAAAAACTTC-AGCTCA----------TAATAAAAACCTAACCATTACCTAAAATTTATGTCCTTTCAT-AAAA------------------------------------------------------ATGTATTT------------------------------------------------------CACGTTCCA--------------------------GATACTTGGTTAATC------------------------------------------------------------ACTAAACTTTTAGATAAGTGTTTATTTGGGGAAACTACCATATTAGGTAGCAACTTTGTTTCCCA---TTTTATTATTGTATCAACAATTAAGGGTTAACCAATTCAAAGGTGAATTACCTTAAATAAGAAGCAATGTATGTATTAGCTCTGAGGTCTATAATTGCACTTAGCTGTAACTCAAATGAGTTGTATGTGTGCTGTGTGCAACTAACTGACAGGCTGGGATGCTCCATTGCTCAAG-CCAGGGCTTTGGTATCGTTT-AAATGCTTTGTTAAGATCAAATAGCCACTGAGAATCAATTCAATAAAAGTCCC------------ACAGAAGCTCAGATAAAAACA-TTGCCTGAAGCAAAATTCTATTTAGGAGAGGAA--ACAGGAAATAAAGCATTATAATATGACTCTGATGTCAAAAACAGAAATTTCCTGAAAGCATCATTGATTTAACAATTTTGATTAATT-TTTTAATCCAAACAACTG----------------CTCCTCTGTAGTATTTTTTAAAAGAGAAAAAAA---GGGGGAAAACGCCTTACTTGGCCCTTGGGACACATT----TTAATAATTCATTTTTAACATGGCACACCACATTGACAACTCATTTTAAGTTTGAATTT-TTCTTATTAAGGAATCA-----TTTTGTATAT i calJac3.chr6 N 0 C 0 s canFam3.chr36 10203925 1038 + 30810995 ATACATTTAAAACACTGAATTTTC-TGTCATTTTAGTGAGTTTATGTTTCACTCAGTTGCTGTTTTGTTA-GTTACTTCTTTCTGTTTATTATTGTAAACTTCAAGCTTTGTTGAATCTGTGATAAGAG--TAACCATCCCTCAACATTTATTTCCCTTCAT-GAGAAAGTCCCAGGTAACTTACTGAAAACAATGAACCTTttttttttttttaatttttatttatttatgatagtcacagagagagagagagagaggcagagacacaggcagagggagaagcaggctccatgcaccgggagcccgacgtgggattcgatcctgggtctccaggatcgcgccctgcgccaaatgcaggcgccaaaccgctgtgccacccagggatcccCAACAATGAACCTTTAAACAAGTATCTATTTTGGGAGACCTGCAGATTAGGTCATATCTTTGTTTCCTACTTTGTTATTATTTTATAAAGAGC-AAAGGGTAACCAATTCAGAGGTGAATTGCTTAGAAGAGAAGGT--TCTGTGTGTTAGCTCTGTGTCCTCTAATTGCATTTAGCCCTGAC-CAGATGAG-TGTATGGGGGGGGCTTGCAGCTAAC----AGGCTGGGTCACCCCACTGTACAAC-CCAGGGTGTCAGCACCATTT-CAGTTCTTTGTTAAGATCAAGTAGCCAGTGAGAAACAATTCAATAAGAATCTCTGGTTTCTACACACTGAAGTTCAGATAAAAA-AGTTGCCTGAAGCAAGATTCTATTTAAGCAAAGAAATACAGGAAATAAAACATTATAATAAGCCTTAGATGTCAAGAACAGGAAACTCCTGTAAGCATCATTGATTTGGCCATTTTGATTGAAT-TGTTTATTAAAAAAAAAGTAAAAAGAAAAAAAAACTCCTCTGTAGTA-TTTTTAACAGAAAAAAAAAGAGGGGGAAAA----------GAGCCCTTGAGGCACATTTTAATTATT-ATTAATCTCTAACACAGCACATTACATTGACAGCCTGTTTGAAGCCTGATTTTCTTCTTCCCAAGTACTTGTTTTATTTTGTAC-- i canFam3.chr36 N 0 C 0 a score=1271879.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 23987 360 + 478999 GCTA-TTTTTTC-ATTGAATTACAGTG---TATGAGAAGCAGTCTCTCAAATCACCACATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTATGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAGTCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATTTAGAGATAAAAATAATGTCTAATTTTAGTATCTTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTATAGACTAGGAAGACAGAAGGATGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACATTCCTGTTTCTCCCTACATTTATTCAGGAATT--GGTTGAGGGAAAAGGAGAGTAGAGAGAAATTC s panTro4.chr2B 169275772 361 + 247518478 GCTA-TTTTTTCCATTGAATTACAGTG---TATGAGAAGCAGTCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCCATTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATTTAGAGATAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCTTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGGAAGACAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACATTTATTCAGGAATT--GGTTGAGGGAAAAGGAAAGTAGAGAGAAATTC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449128 360 + 99152023 GCTA-TTTTTTC-ATTGAATTACAGTG---TATGAGAAGCAGTCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATTATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATTTAGAGATAAAAGTAATGTTTAATTTTGGTATCTTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTATAGATTAGGAAGACAGAAGAGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACATTCCTGTTTCTCCCTACATTTATTCAGGAATT--GGTTGAGAGAAAAGGAGAGTAGAGAGAAATTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86753686 361 - 99891981 GGTA-TTTTTTCCATTGAATTACAGTG---CGTGAGAAGCAGTCTCTCAAACCACCAGATAGAATATGTGACAATCCATTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATTTAGAGATAAAACTAATGTCTAATTTTGGTATCTTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGAAAGACAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACATTTATTCAGGAATT--GGTTGAGGGAAAAGGAAAGTAGAGAGAAGTTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28269844 358 + 106825570 GCTA-TTTTTTC-ATTGAATTATAGTG---TATGAGAAGGAGCCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATGTAGAGGTAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCCTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGGAAGATAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACAATTATTCAGGAATT--GGTTGGGGGAAAAGGAAAGT--AGAGAAATTC i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826173 358 + 132586672 GCTA-TTTTTTC-ATTGAATTATAGTG---TATGAGAAGGAGCCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATGTAGAGGTAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCCTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGGAAGATAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACAATTATTCAGGAATT--GGTTGGGGGAAAAGGAAAGT--AGAGAAATTC i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909087 358 + 104110932 GCTA-TTTTTTC-ATTGAATTATAGTG---TATGAGATGGAGCCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTACGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATGTAGAGGTAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCCTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGGAAGATAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAAGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACAATTATTCAGGGATT--GGTTGGGGGAAAAGGAAAGT--AGAGAAATTC i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50449925 359 + 128595539 GCTATTTTTTTC-ACTGAATTACAGTG---TATGAGAAGCAGTCTCTCAAATCACCAGATAGAGTATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAATGTTCATTATTCCTCTATGTTTCTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATGTAGAGATAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCTTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAGACTAGGAAGATAGAAGGGTGAGTCTTCAGATATCCTATTTCATATTAGTTGAAGAGGATTTCTTAAAACGTTCCTGTTTCTCCCTACACTTATTCAGGAATT--GGTTGGGGGAAAAGGAAAGT--AGAGAAATTC i chlSab2.chr10 I 178 C 0 s calJac3.chr6 104660233 361 - 158406734 GCTATTTTTTTC-ATTGAATTACAGTG---TATGATAAGTAGTCTCTCAAATCACCAGATAGAATATGTGACAATCAGTTTAGTTTGTAGTCAGTGTTCATTATTCCTCTAAGTTTTTTTATTTTGGTAGTTTAATCATAGTTCTTAACAACTGCCTTGAAATTTAGAGATAAAAGTAATGTCTAATTTTGGTATCCTTAGTCAC--AAAAATAGCTGTGGAACAAACTGTAAACTAGGAAGATAGAAGGGTGAGTCTTCAGATGTCCTGTTTCATATTAGTCAAAGAAGATTTCTTAAAATGTTCCTGTTTCTCTCTGCATTGATTCAGGAATT--GGTTGGGGGAAAAGGAAAGTAGAAAGAAATGC i calJac3.chr6 C 0 I 352 s canFam3.chr36 10204963 357 + 30810995 CCTA-TCTTTTC-ATTGAATTATAGTGTACTATGAGAAGTGGACTCTCAAATCACCAGATAGGATATTTGATAATCGATTTAATTTATAGTCAGTGTTTATTATTCCTCCAAGATTCTTGA-----GTAGCTTAATCACCACTCTTAACAACTGACAGGAAATTTAGAGATACAAGCAATGTCTACTTTTGGTATCGTTAGTCACAAAAAAAAAGTTGTGCAACAAGCTCTAGACT---AAGATAAATGAGCAAATCCTCAAATATTCTGTTTTATATTAATTGAAGACAATTTCTTTAAATGTGCCTGTTTCTCCTTACATTTACT-AGAAATTCGAGTTGAGGAAAGGGAGAAGTAAGGATTAATT- i canFam3.chr36 C 0 C 0 a score=185957.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24347 53 + 478999 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACCGTGCTGTTG s panTro4.chr2B 169276133 53 + 247518478 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTACTGTTG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449488 53 + 99152023 AACAGATACTTAACTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATGTATTACTGTACTGTTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754047 53 - 99891981 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTACTCTTG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270202 53 + 106825570 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTTGTGTTG i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826531 53 + 132586672 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTTGTGTTG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909445 53 + 104110932 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTTGTGTTG i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450284 53 + 128595539 AACAGATACTTAATTTCTGGTTGGTGCTTTGCCTATATATTACTGTACTGTTG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104660946 53 - 158406734 aACAGATGCTTAATTTCTGGTTGGCACTTTGCCTATATATTACTGTACTGTTG i calJac3.chr6 I 352 C 0 s canFam3.chr36 10205320 51 + 30810995 AACAGGTTTTTGATTTCTGGTAGGTGCTTTACCTTTATA--ACTTGACTGTTG i canFam3.chr36 C 0 I 549 a score=318907.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24400 101 + 478999 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGTTGCTAGTTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTTTATAACACGCATAAtttagaaatgttgaagat s panTro4.chr2B 169276186 101 + 247518478 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGGTGCTAGTTATTAAATGTAAAGGAATAACCTGATTTATTGTttataacacccataatttagaaatgttgaggat i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449541 99 + 99152023 CATTACTGACAC--ATCACAGTGTGGGTTGCTAGTTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTttataacacccataatttagaaatgttgaagat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754100 101 - 99891981 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGGTGCTAGTTATTAAATGTAAAGGAATAACCTGATTTATTGTttataacacccataatttagaaatgttgaagat i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270255 101 + 106825570 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGTTGCTAGTTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTttataacacccataatttagaaatgttgaagat i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826584 101 + 132586672 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGTTGCTAGTTACTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTTTATAACACCCATAATTTAGAAATGTTGAAGAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909498 101 + 104110932 CATTACTGACACTTATCACAGGGTGGGTTGCTAGTTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTTTATAACACCCATAATTTAgaaatgttgaagat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450337 101 + 128595539 CATTACTGACACTTATCACAGTGTGGGTTGCTAGTTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTTTATAACACCCATAATTTAGAAATGTTGAAGAT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104660999 101 - 158406734 CATTACTGACACTTATCACAGTGGGGGTTGCTAGCTATTAAATGTAATGGAATAACCTGATTTATTGTTTATAACACCTATAATTTAGAAATGGTGAAGAT i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10205371 549 + 30810995 I a score=310121.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24501 93 + 478999 aaagctcttcagtttaaattgataaattatccaagattatatatt-----aata---tgtgcttgattaagtcggtg---aactcagatttgggcaattctgag s panTro4.chr2B 169276287 96 + 247518478 gaagctcttcagtttaaattgataaattatccaaggttatatatt-----aataatatgtgcttgattaagtcagtg---aactcagatttgggcaattctgag i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449640 96 + 99152023 aaagctcttcagtttaaattgataaattatccaaggttatatatt-----aataatatgtgcttgattaagtcggtg---aactcagatttggacaattctgag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754201 96 - 99891981 gaagctcttcagtttaaatttataaattattcaaggttatatttt-----aataatatgtgcttgattaagtcggtg---aactcagatttgggcaattctgag i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270356 96 + 106825570 gaagctcttcagtttaaattgataaattatccaaggttatatatt-----aatagtatgtgcttgattaagtcagtg---aactcagatttgggcaattctgag i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826685 96 + 132586672 GAAGCTCTTCAGTTTAAATTGATAAATTATCCAAGGTTATATATT-----AATAGTATGTGCTTGATTAAGTCAGTG---AACTCAGATTTGGGCAATTCTGAG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909599 96 + 104110932 gaagctcttcagtttaaatTGATAAATTATCCAAGGTTATATATT-----AATAGTATGTGCTTGATTAAGTCAGTG---AACTCAAATTTGGGCAATTCTGAG i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450438 96 + 128595539 AAAGCTCTTCAGTTTAAATTGATAAATTATCCAAGGTTATATATT-----AATAGTATGTGCTTGATTAAGTCAGTG---AACTCAGATTTGGGCAATTCTGTG i chlSab2.chr10 C 0 I 23 s calJac3.chr6 104661100 96 - 158406734 GAAGCTCTTCAGTTTAAACTGATAAATTATTCAAGGTAATGTATT-----AATAATATGTGCTTGGTTAAGTTGGCG---AACTCAGATTTGGGCACTTCTGAG i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10205920 104 + 30810995 aaaatccttcagtttaagatattcaatatgccaagatgccatcttttgggcacagtgtgtcctgaaccccatcaTTGATAagctcaggcttggctaattctgaa i canFam3.chr36 I 549 C 0 a score=37507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24594 13 + 478999 gttcatgctctgt s panTro4.chr2B 169276383 13 + 247518478 gttcatgctctgt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449736 13 + 99152023 gttcatgctctgt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754297 13 - 99891981 gttcatgctctgt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270452 13 + 106825570 gttcatgttctgt i rheMac3.chr12 C 0 I 66 s macFas5.chr12 53826781 13 + 132586672 GTTCATGTTCTGT i macFas5.chr12 C 0 I 8 s papAnu2.chr12 26909695 13 + 104110932 GTTCATGTTCTGT i papAnu2.chr12 C 0 I 8 s calJac3.chr6 104661196 13 - 158406734 GTTCATGCTCTGT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10206024 13 + 30810995 gcccctgctctat i canFam3.chr36 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50450534 23 + 128595539 I a score=13032.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24607 14 + 478999 ccaatacCATAGT---------------------A----- s panTro4.chr2B 169276396 14 + 247518478 ccaATATCATAGT---------------------A----- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449749 14 + 99152023 ccaatacCATAGT---------------------A----- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754310 14 - 99891981 ccaatacCATAGT---------------------A----- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826802 35 + 132586672 TCAATACTACAGTTTTGTAGTATTGTTTACTACAA----- i macFas5.chr12 I 8 C 0 s papAnu2.chr12 26909716 14 + 104110932 GCAATACTACAGT---------------------A----- i papAnu2.chr12 I 8 C 0 s calJac3.chr6 104661209 14 - 158406734 CCAATAGCATAGT---------------------A----- i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10206037 19 + 30810995 ccaatacaATTTT---------------------GTGGTC i canFam3.chr36 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50450534 23 + 128595539 I e rheMac3.chr12 28270465 66 + 106825570 I a score=8043.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24621 3 + 478999 AAA s panTro4.chr2B 169276410 3 + 247518478 AAA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449763 3 + 99152023 AAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754324 3 - 99891981 AAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826837 2 + 132586672 -Aa i macFas5.chr12 C 0 I 21 s papAnu2.chr12 26909730 2 + 104110932 -AA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450557 3 + 128595539 aaa i chlSab2.chr10 I 23 C 0 s calJac3.chr6 104661223 3 - 158406734 AAA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10206056 3 + 30810995 AAA i canFam3.chr36 C 0 C 0 e rheMac3.chr12 28270465 66 + 106825570 I a score=166483.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24624 51 + 478999 ATTTACAAAATATTTCATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA s panTro4.chr2B 169276413 49 + 247518478 ATTTACAAAATATTTCATGAAAGAAGAC--GTGACAATTGGGAAAGCCACA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449766 51 + 99152023 ATTTACAAAATATTTTATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754327 49 - 99891981 ATTTACAAAATATTTCGTGAAAGAAGAC--GTGACAATTGGGAAAGCCACA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270531 51 + 106825570 atttacaccatatttCATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA i rheMac3.chr12 I 66 C 0 s macFas5.chr12 53826860 51 + 132586672 atttacaccatatttCATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA i macFas5.chr12 I 21 C 0 s papAnu2.chr12 26909732 51 + 104110932 ATTTACACCATATTTCATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450560 51 + 128595539 atTTACACAATATTTCATGAAAGGAGACATGTGACAATTGGGAAAGCCACA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104661226 51 - 158406734 ATTTATTAAATCGCTTATGAAAGGAGACATGTGACAATTGAGAAAGTCACA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10206059 51 + 30810995 ATTTACAAAAGACCTCATGGAAGGAAACATTTAACAATTGGGAATTCCATA i canFam3.chr36 C 0 I 867 a score=511032.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24675 148 + 478999 AGAATTTATGAGTTAATACTTATGAAGACCTCTGAAAATCCA-TAAGTATAATAGATTTTTATTTAGTA--------------TGTGTTTTTCAGAAGAAATAATTTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGCTCTTAAAATTTATTTGG s panTro4.chr2B 169276462 148 + 247518478 AGAATTTATGAGTTTATATTTATGAAGACCTCTGAAAATCCA-TAAGTATAGTAGATTTTTATTTAGCA--------------TGTGTTTTTCAGAAGAAATAATTTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAAGCTGTTAAAATTTATTTGG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449817 148 + 99152023 AGAATTTATGAGTTAATATTTATGAAGACCTCTGAAAATCCA-TAAGTATAGTAGATTTTTATTTAGTA--------------TGTGTTTTTCAGAAGAAATAATTTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGCTTTTAAAATTTATTTGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754376 148 - 99891981 AGAATTTATGAGTTAATATTTATGAAGACCTCTGAAAATCCT-TAAGTATAGTAGATTTTTATTTAGTA--------------TGTGTTTTTCAGAAGAAATAATTTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAAGCTGTTAAAATTTATTTGG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270582 148 + 106825570 AGAATTTATGAGTTAATATTTACGAAGACCTCTGAAAATCCG-TAAATATAGTAGATTTTTATTCAGTA--------------CGTGTTTTTCAGAAGAAATAAATTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGCAGTTAAAATTTATTTGG i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53826911 148 + 132586672 AGAATTTATGAGTTAATATTTACGAAGACCTCTGAAAATCCG-TAAATATAGTAGATTTTTATTCAGTA--------------CTTGTTTTTCAGAAGAAATAAATTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGCAGTTAAAATTTATTTGG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909783 148 + 104110932 AGAATTTATGAGTTAATATTTACGAAGACCTCTGAAAATCCG-TAAATATAGTAGATTTTTATTCAGTA--------------TGtgtttttcagaagaaataaatttcaggtATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGcagttaaaatttatttgg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450611 148 + 128595539 AGAATTTATGAGTTAATATTTATGAAGACCTCTGAAAATCCA-TAAGTATAGTAGATTTTTATTTAGTA--------------TGTGTTTTTCAGAAGAAATACATTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGAATAGTTAAAATTAGGCAGTTAAAATTTATTTGG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104661277 134 - 158406734 AGAATTTATGATTTAATATTTATGAAGACCTTTGAAAATTCATTAAGTATAGTAGATTTTTATTTAGTA--------------TGTATTTTTCAAAAG-AATAATTTTCAGGTATTTGCTTAGTTTTTGCATAG--------------TTAAAATTTATCTGG i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10206977 162 + 30810995 AGAATTTATGATTTAATATTTATGAGGATCTCTGAAAATCCG-TAAGTATAAAAGATTTTTAGTTAGCAACACCCTGTAAAATTGTATTTTACAAAAAGCATAATTTTCAAGTATTTACCTAGTTTTTGAAGAGTTAAAATTAGGGGGTTAAAATGTATTTGG i canFam3.chr36 I 867 C 0 a score=585028.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 24823 212 + 478999 aacctggacaacatagtgagattttgtccttactt-aaaaaaaaaaattatctgggtgtggtggtgtgtatctgtgatctcagctgcctgg--------gaggctgagatgggaggagagtttgagcccaggaggtcaatgctgcagtgagctgtgtttgcactactgcttaccacctctgatgacaca----gaccttgtctcaaTTTTTTTTTT--TAAATTTGG s panTro4.chr2B 169276610 214 + 247518478 aacctggacaacatagtgagattttgtccttactt-aaaaaaaaaaattacctgggtgtggtggtgtgtatctgtgatctcagctacctgg--------gaggctgagatgggaggagagtttgagcccaggacgtcaatgctgcagtgagctgtgtttgcactactgcttaccaccttgggtgacagaatgagaccttgtctcaaTTTTTTTTTT--TA--TTTGG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18449965 210 + 99152023 aacctggacaacatagtgagattttgtccttactt-aaaaaaaaaaattatctgggtgtggtgctgtgtatctgtgatctcagctgcctgg--------gaggctgagatgggaggagagtttgagcccaggaggtcaatgctgcagtgagctatgtttgcactactgcttactacctctggtgacaga----gaccttgtctcaaTTTTTTTTAA--AA--TTTGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754524 212 - 99891981 aacctggacaacatagtgagattttgtccttactt---aaaaaaaaattacctgggtgtgatggtgtgtatctgtgatctcagctacccgg--------gaggctgagatgggaggagagtttgagcccaggaggtcagtgctgcagtgagctgtgtttgcactactgcttaccaccttgggtgacagagtgagaccttgtctcaaTTTTTTTTTT--AA--TTTGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270730 223 + 106825570 AAActggacaacatagtgagattttgtccctact--aaaaaaaaaaatgatctgggtgtggtggtgtgtatctgtgatctcagctacctgggaggctgagaggctgagaggagaggagagtttgagcccacgaggtcaatgctgcagcaagctgtgtttgcactactgctaaccaccttgggtgacagagtgagaccttgtctcaaTTTTTTTTTTCCAA--TTTGG i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53827059 223 + 132586672 AAActggacaacatagtgaaattttgtccctact--aaaaaaaaaaatgatctgggtgtggtggtgtgtatctgtgatctcagctacctgggaggctgagaggctgagaggggaggagagtttgagcccacgaggtcaatgctgcagcaagctgtgtttgcactactgctaaccaccttgggtgacagagtgagaccttgtctcaaTTTTTTTTTTCCAA--TTTGG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26909931 215 + 104110932 aaactggacaacatagtgagattttgtccctact--aaaaaaaaaaatgatctgggtgtggtggtgtgtatctgtgatcacagctacctgg--------gaggctgagaggggaggagagtTTGAGCCCACGAGGTCAATGCTGCAGCAAGCTGTGTTTGCACTACTGCTTaccaccttgggtgacagagtgagaccttgtctcaattttttttttccaa--tttgg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450759 215 + 128595539 aacctggacaacatagtgagattttgtccctactaaaaaaaaaaaaatgatctgggtgtggtggtgtgtatctgtgacctcagctacctgg--------gaggctgatatgggaggagagtttgagcccacgaggtcaatgctgcagcaagctgtgtttgcactact-cttaccaccttgggtgacagagtgagaccttgtctcaaTATTTTTTTT-CAA--TTTGG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104661411 214 - 158406734 aacctggacaacatagtgagatttttgtctcaat--taaaaaaataattatctgggtgtagtgatgtgtatctgtgatattggctacctgg--------gaggctgagatgggaggagagtttgagcccaggaggtcagtgctgtagtgagctgtgtttgcaccactgttcaccatcttgggtgacagagcgggaccttgtctcaaTTTTTTTTTT-TAA--CTTGA i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10207139 0 + 30810995 C a score=3005236.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 25035 932 + 478999 CTTAAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTTGATATTTTAGATTACATA------TCATGGAAGATTAAAATCATCACATTATTTTGAATTTTTTTCTACTAGTTGGTGAAAAAGATAT---TT-TTTTATGCATGCTC--TAAATCTAAAATATGTATAATCAAGTCATAATCCTTAATTTACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATTTTAT-TTGGGGTATATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCAGAAACTCAA---ACAAGAGCTTCCTCTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCCGAACGTGTTACTATGCTTTCTAAGCATTATGAGGTTCCAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAGTTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTGTGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGTTAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATGGG----TTT---------TTTTTAATGTGTTAATAAAATAATAATATGCCATCTACTTAAAATCC--TTTTTGCAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAGTCCAAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGCAAAAGCTCTGACAAGACTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTAGGTCTGAAATAATCTTATCCGCACATG---AAAAACATTCAAAGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTGCACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTCATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATGAATAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCGCAAAACAGAACTTTTTCTTTCCCTTTCATGATACTGTATTTATGTGTTCTCATAACAAATCTTTCCTCTTTCAGTCGCTCAGAACAGATA s panTro4.chr2B 169276824 938 + 247518478 CTTAAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAGAGTCAGTGATGTTTTGATATTTTAGATTACATAC--ATATCATGGAAGATTAAAATCATAACATTATCTTGAATTTTTTTCTACTAGTTGGTGAAAAAGATATCA-TT-TTTTATGCATGCTC--TAAATCTAAAATACATATAATCAAGTCATAATCCTTAATTTACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATTTTAT-CTGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCAGAAACTCAA---AGAAGAGCTTCCTCTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAACGTGTTACTATGCTTTCTAAGCATTATGAAGTTCTAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAGTTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATGGG---GTTT---------TTTTTAACGTGTTAATAAAATAATAATACGCCATCTACTTAAAATCC--TTTTTGAAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAATCCAAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGCAAAAGGTCTGACAAGACTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAAATAATCTTATCTGCGCATG---AAAAACATTCAAAGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAAAGTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCAC--GTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATAAATAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCACAAAACAGAGCTTTTTCTTTTCCTTTCATGATACTATATTTATGTGTTCTCATAGCAAATCTTTCCTCTTTCAGTTGCTCAGAACAGATA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18450175 930 + 99152023 CTTAAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTAGGTATTTTAGATTACATA------TCATGGAAGATTAAAATCATAACATT---TTGAATTTTTTTCTACTAGTTGGTGAAAAAGATATCATTT-TTTTATGCATGCTC--TAAATCTAAAATACATATAACCAAGTCATAATCCTTAATTTACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATTTTAT-CTGGGGTATATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCGTTGTGGCAGAAACTCAA---ACCAGAGCTTCCTCTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAACGGGCTACTATGCTTTCTAAGCATTATGAGGTTCTAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAGTTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTGTGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATAGG----TTT---------TTTTTAATGTGTTAATAAAATAATAATATGCCATctacttaaaatcc--tttttgaaacaaggtgcagggataaataaataaCCCAAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGTAAAAGGTCTGACAAGACTTTGATCCTTCTTCAAGTCCTGGTAGGTCTGAAATAATCTTATCCGCGCATG---AAAAACATTCAAAGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTGCACAGTTCACGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACGTGTCATCCATTAGTTTAGCAGTCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATAAATAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCGCAAAAC--AACTTTTTCTTTCCCTTTCATGATACTATATTTACGTGTCCTCATAGCAAATCTTTCCTCTTTCAGTTGCTCAGAACAGATA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86754736 951 - 99891981 ATTTAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTTGATATTTTAGATTACATAC--ATATCGTGGAAGATTAAAATCATAACATTATTTTGAATTTTTTTCTACTAGTTGGTGAAAAAGATATCA-TT-TTTTGTGCATGCTC--TGAATCTAAGATACATATAATCAAGTCATAAT-CTTAATATACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATTTTAT-CTGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAATGGGAAACTCATTGTGGGGGAAACTCATTGTGGCAGAAACTCAA---ACAAGAGCTTCCTCTAAATTTGATTTTCCTCTTTCTCTGAACGTGTTACTGTGCTTTCTATGCATTATGAGGTTCTAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAGTTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACA--CTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATGGA-----TT---------TTTTTAACATGTTAATAAAATAATAATATGCCATTTACTTAAAATCT--TTTTTGAAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAATCCAAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGCAAAAGGTCTGACAAGACTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAAATAATCTTATCCACACATG---AAAAACATTCAAAGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAAAGTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATAAATAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCACAAAACAGAGCTTTTTCTTTTCTTTTCATGATACTATATTTACATGTTCTCATAGCAAATCTTTCCTCTTTCAGTTGCTCAGAACAGATA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28270953 967 + 106825570 CTCAAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTTGAAATTTTAGATTACATAC--ATACCATGGAAGAGTAAAATCATAACATTATTTTGAATTTTTTTCTACTAGGTG--AAAAAGGATATCT-TT-TTTTATGCATGCTC--TAAATCTAAAATGCATATAATCAAGTCACaatcc-------acagaaattccacagaaaatccacagTATGTTATCTGGGGTACATACTATTATTCTTGAGTATGTTAT-CTGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCGGAAACTCA-------AGAGCTTCCTTTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAACGTGTTACGATGCTTTCTAAGCATTATGAGGTTCTACAGAAGAGA-TTTTCACTTTAATTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATGGG---TTTT---------TTAAAAATGTGTTAATAAAATAATAATATGCCATCTACTTAAAATCC--TTTTTGAAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAATCCGAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGC-AAAGGACTGGTAAGAGTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAAGTAATCTTATCCACACATG---AAAAACATGCAAGGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTTAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATGAACAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCACAGAACAGAGCTTTTTCTTTTCCTTTCATGATACTATATTTACGTGTTCTCATAGCAAATCTTTCATCTTCCAGTTGCTCAGAAT----- i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53827282 920 + 132586672 CTCAAGTCAGTCACCTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTTGAAATTTTAGATTACATAC--ATACCATGGAAGAGTAAAATCATAACATTATTTTGAATTTTTTTCTACTAGGTG--AAAAAGGATATCT-TT-TTTTATGCATGCTC--TAAATCTAAAATGCATATAATCAAGTCACAATCC-------ACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATGTTAT-CTGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCGGAAACTCA-------AGAGCTTCCTTTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAACGTGTTACGATGCTTTCTAAGCATTATGAGGTTCTACAGAAGAGA-TTTTCACTTTAATTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTACAATCCTCTTATGGG---TTTT---------TTTTAAATGTGTTAATAAAATAATAATATGCCATCTACTTAAAATCC--TTTTTGAAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAATCCGAGTAACATGAT-ATTTTCAATTTTAGGC-AAAGGACTGGTAAGAGTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAAGTAATCTTATCCACACATG---AAAAACATTCAAGGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATGAACAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCACAGAACAGAGCTTTTTCTTTTCCTTTCATGATACTATATTTACGTGTTCTCATAGCAAATCTTTCATCTTCCAGTTGCTCAGAAT----- i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26910146 923 + 104110932 ctCAAGTCAGtcatcttttatatttaattataatgcAAAGTcagtaatgttttgaaattttagattacatac--ataccatggaagaGTAAAATCataacattattttgaatttttttctactagGTG--AAAAAGGATATCt-tt-ttttATGCATGCTC--TAAATCTAAAATGCATATAATCAAGTCACAATCC-------ACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATGTTAT-CTGGGGTAcatactattattttaatatctagaAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCGGAAATTCA-------AGAGCTTCCTTTAAATTTgatcttcctctttctctgaacGTGTTACGATGCTTTCTAAGCATTATGAGGTTCTACAGAAGAGA-TTTTCACTTTAATTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCtcttatgggttttttt---------ttttaaatgtgttaataaaataataatatgccaTCTACTTAAAATCC--TTTTTGAAACAAGGTGCAgggataaataaataatccaagtAACACGAT-ATTTTCAATTTTAGGC-AAAGGACTGATAAGAGTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAAGTAATCTTATCCACACATG---AAAAACATTCAAGGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATGAACAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGCCTTCCACAGAACAgagctttctcttttcctttcatgaTACTATATTTACGTGTTCTCATAGCAAATCTTTCATCTTCCAGTTGCTCAGAAT----- i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50450974 925 + 128595539 CTCAAGTCAGTCACTTTTTATATTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGATGTTTTGAAATTTTAGATTACATAC--CTATCATGGAAGATTAAAATCATAACATTATTCTGAATTTTTTTCTACTAGGTG--AAAAAGGATATCT-TT-TTTTATACATGCTC--TAAATCTAAAATACATATAATTAAGTCATAATCC-------ACAGAAA-----------------------------------------------CTTGAGTATGTTAT-CTGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAACTCATTGTGGCGGAAACTCA-------AGAGCTTCCTTTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAACGTGTTACGATGCTTTCTAAGCATCATGAGGTTCTAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAATTTGTATCAAATTCATGAGTGAATAAATTCTACAGTATGCTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATAGGGAAAAACTCTATAATCCTCTTATGGG---TTTT---------TTTTTAATGTGTTAATAAAATAATAATATGCCATCTACTTAAAATCC--TTTTTGAAACAAGGTGCAGGGATAAATAAATAATCCAAGTAACAAGAT-ATTTTCAATTTTAGGC-AAAGGACTGATAAGAGTTTGATCCTTCTTCAAGGCCTGGTGGGTCTGAATTAATCTTATCCACACATG---AAAAACATTCAAGGCATTTAAAGGACCTGGCTATAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCATAGAATAAA-GTTCAACTAATTCATTCCTTAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGTATAATGAATAGTCTCTCTTCATTTGACTAACAAAGGGGACTAATGTCTTCCACAGAACAGAGCTTTTTCTTTTCCTTTCATGATACTATATTTACGTGTTCTCATAGCAAATCTTTCACCTTCCAGTTGCTCAGAGTAGATA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104661625 933 - 158406734 CTTAAGTCACTCACTTGTTATGTTTAATTATAATGCAAAGTCAGTGAAGTTTTGATATTTTAGCTTATATAC--ATATAATGGAAGATTAAAATCATAACATTATTTTGAA-CTTTTTCTATTAGTTGGTAAAAAAGATACCA-TTAATTTCTGTATACTC--TAAATCTAAAATACATATAATGAAGTCATAATCCTTAATTTACAGAAA-----------------------------------------------C--GAGTATTTT-T-TGGGGGTACATACTATTATTTTAATATCTAGAAT----------------GGGAAATTTATTGTGGCAGAAACTCAA---ACAAGAGCTTTCTCTAAATTTGATCTTCCTCTTTCTCTGAAAGTGTTGCTATGCTTTCTAAGTATTATGAGATTCTAGAGAAGAGA-TTTTCACTTTAGTTTGTATCAAATTCATGAATGAATAAATTCTACAATATGTTTAAAACACTCTGAGAAGTAGGATATAGAAAAACTCTATAATCCTCTTACGGG---TTTT---------TTTTTAATGTGTTAATAAAATAATAATAtgcaatctactttaaatcc--tttttgaaacaaggtgcagggataaattaataaTCCAAGTAACATGGT-ATTTTCAATTTTAGGCAAAATTACTGACAAGAGTTTGA---TTCTTCAAGGTCTGGTGGGTCTGAAGTAATCTTATCTACACATG---AAAAATATTCAAAGCATTTAAAAGACCTGTATGTAATTACACAGTTCATGGTGGCAACTCGTAAAATCAA-GTTCAGCTAATTCGTTCTTCAGTCACATGTTATCCATTAGTTTAGCAATCTTGGATTCCTTAAGATTAAAGCATAATGAATAGTCTATCTTCATTTGACTAACAAAGTGGACTAATGCCTTCCACAAAATAGAGCTTTTTCTTTTCCTTTCATGATACTATATACATGTGTTCTCAGAGCGAATCTTTCCTCTTCCAGTTGCTCAGAACAGATA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10207139 908 + 30810995 CTAAAACTAATCACCTTTTATATTTAATTATAGTGTA-AGTTAGTGATGGTTTTATATTTTAGATCACATACATATACATTGGAAGGCTAAAACCATGACA-GATATTAAA-TGTTTTCTGGTAGTTGGTTAAAAAGATATCA-TTAATTTACACATACTCTATAATTCAAAGATACATACAATAAAATCATAATCTTTAATTTACAGAGA------------------------------------------------TTGAATATTTTATATTTGAATAAATG-GATTATTTTGATATTTGGAGCAGAGCATC--------AGAAAACTTGTTTTGTCAGAAGTCAAACACACCCTTACTTCTTATAGTTATGATCTTCCTCTTTTTTT-----TGTTGCTATGCTTTCTAAGTATTATGAGATTCTAGAGAAGAGATTTTTCACTTCCGTTTGTATAAA----ATGATAGAATAAATTCTAAAATATGCTTAGAATACTTTGAGAAGTATACTAGGGGAAAA--CTATAATCCTC--ATGGA----TTTACTCAGGGATTTTTAATGTGTTAATAAAATAGTAATATGGAATCTACTTTAAATCCTTTTTTTGATACAAGGTGGGAGTATAAATAAATAATCCAAGCAACATGATAATTTTGCACTGTGAGTAAAAAGACT-ACAAGGGTCTGATACTTCTTTTAGGCCTGGTTGTCCCAAAGTAATCTTATCCACATATGAAAAAAAAAAATCAAAACATTTAGATGAACGGCTTAAAATTACACAGTTCTTGGTGGCAACTCTTGGAATA---GTT---------------------ACACATTGTCCATTAGCTTCTGGCTCTTGGATTCCTTAAGATTTAATTCTAATGAATAATTTATCTTCATTTGATTGAGAAAG-GGACTAATACCTTCTATAAAATAGAACTTTT-------CTTTTGAGATACTATATCCAT-------------AAATAGTATATCTTCTATTTGCTCAGAACTGATA i canFam3.chr36 C 0 I 454 a score=912215.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 25967 297 + 478999 AAGATAAATGAAGAATAATCTATC-GATATTAGCATAATTCTGTGAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAAATGTTATGCATAATGCACTCAGGAATTCATTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTT--------ATAAGTACTAGACAACAGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTACATCTGA-----Ttatcagtcagga----taaggtaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgcttatataggcactatt s panTro4.chr2B 169277762 306 + 247518478 AAGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAGCATAATTCTGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-GAAAGCCAATTATACAAATATTATGCATAATGCACTCAGGAGTTCATTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATATAAGTACTAGGCAACAGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGA-----Ttatcggtcagga----taaggaaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgcttatataggcactatt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18451105 297 + 99152023 AAGATAAATGAAGAATAATCTATC-AATATTAGCATAATTCTGTGAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAAATATTATGCATAATGCACTCAGGAGTTCATTTAAACCAGGAGTTTTGAGTTACATGTT--------ATAAGTACTAGACAACAGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGATATATTATTAAATCTGA-----Ttatcagtcagga----taaggtaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgcttatataggcactatt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86755687 306 - 99891981 AAGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAGCGTAATTATGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAAATATTATGCATAATGCACTCAGGAGTTCATTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATATAAATACTAGACAACAGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGA-----TGatcagtcagga----taaggtaggcaattctgtggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgcttatacaggcactatt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28271920 309 + 106825570 -AGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAACATAATTCTGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAATTATTATGCATAATGCACTTAGGAGTCCACTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATATAAGTACCAGACAATGGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTACATCTGATTAATTtatcagtcagga----taaggtaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgc-tatataggcactatt i rheMac3.chr12 C 0 I 192 s macFas5.chr12 53828202 309 + 132586672 -AGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAACATAATTCTGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAATTATTATGCATAATGCACTTAGGAGTCCACTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATATAAGTACCAGACAATGGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGATTAATTtatcagtcagga----taaggtaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgc-tatataggcactatt i macFas5.chr12 C 0 I 192 s papAnu2.chr12 26911069 309 + 104110932 -AGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAACATAATTCTGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATACAATTATTATGCATAATGCACTTAGGAGTCCACTTAAACCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATATAAGTACCAGACAATGGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGATTAATTTATCAGTCAGGA----TAAGGTAGGCAATTCTCTGGTAACAAACCATCCTCAAATCTCAGTGC-TATATAGGCActatt i papAnu2.chr12 C 0 I 193 s chlSab2.chr10 50451899 311 + 128595539 AAGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAACATAATTCTGTAAAGAACTATAGCAATGTCTTGTTTAC-AAAAGCCAATTATGCAATTATTATGCATAATGCACTTGGCAGTCCATTTAAAGCAGGGGTTTTGAGTTACATGTTTAAGCAATACAAGTACCAGACAATGGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACCAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGATTAATTtatcagtcagga----taaggtaggcaattctctggtaacaaaccatcctcaaatctcagtgcttatataggcactatt i chlSab2.chr10 C 0 I 195 s calJac3.chr6 104662558 316 - 158406734 AAGATAAATGAAGAATAATCTATCTAATATTAGCATGACCCTGTAAAGAACTATAGAAATGTCTTATTTACAAAAAGCCAATTATACAAATATTATTCATAATGCACTCAGGAGTTCATTTAAACCGGAGGTTTTGTGTTACATGTTTAAGTAATATAAATACTAGACAACAGCTGTTTCCCTGGTGTATGATGGAGCCAACACAAGTCAGAGGTATATTATTAAATCTGCTTAATTtaccagtcaggacaagtaaggtaggcaattctctggtaacaaaccatccccaaatctcagtgcttacataggcactatt i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10208047 454 + 30810995 I a score=2756611.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 26264 906 + 478999 tcttgctccactagatggttcatacttgctcacactacccatcatgggtcgttaggagatctctgcttat-----ggtcactcaggaattcatctgacaaaggagccaccaccttgaatatcatgggtcactgtgctggaagcaaaagagagaaatgtggtgggtttaccatcaacatttaagtactctggcccagaagtggattgtcacttctactcatcacttacgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggaccagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaatatctgtgaaacagTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAG--TATATGTATTATTGCAGCAGTGCTGGTCAAAAATAACTGCTGGATGGAGTAGTAGGTTACAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTGCAAGTAAGAGATGAGCTGCATAGTGCTAAATAAAGATGGCATACTTTCTGGAACATATGAGAAATTTGTCCTTTTAAGTATAAAGAAATGAGGTCAAGACAATAATCATTTTCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGATGAGTTGTTATGGATGCTTTTCAGACACTCTGGGACAGAATTTTACGGTggaagtatg--cactgtaatgattcaggacttgactggcgatattttgggtatcttaa-cctcctccttaaataggctaccaaaaatttgaaaccaaaagggCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGTTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCATCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggacgcagcggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatggatg s panTro4.chr2B 169278068 907 + 247518478 tcttgcttcactagatggctcatacttgctcacactaaccatcatgggtcgttaggagatctctgcttgt-----ggtcactccggaattcatctgacaaagcagccaccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctggaag--aaaaagagaaatgtggtgggtttgccatcaacatgtaaatactctggcccagaagtggtttgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacataaccccaccacaaggggaccagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaatatctgtgaaacagTGGTATTGTCAAAACCAACGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAG--TATATGTATTATTGCAGCAATGCTGGTCAAAAATAACTGCCGGATGGAGTAGTAGGTTATAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAGATGAGCTGCATAGTGCTAAGTAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATGAGAAATTTGTCTTTTTAAGTATAAAGGAAGGAGGTCAAGACAATAATCATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGACCAGTTGTTATGGATACTTTTCAGACACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTATGTGCACTGTAATGATTCAAGACTTGACTGGTGGTATTTTGGGTATCTTAAACCTCCTCTTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAGGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGCTATGATTGGAAGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAAAAATCAGAAGTCCTggctggacgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatggatg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18451402 908 + 99152023 tcttgctccactagatggctcatacttgctcacactatccatcatgtgtcgttaggagatctctgcttat-----ggtcactcaggaattcatctgacaaagcagccaccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctgaaagataaagagagaaatgtggtgggtttgccatcaacatttaagtactctggcccagaagtggattgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccgcaagaggaccagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaatatctgtgaaacagTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAG--TATATGTATTATTGCAGCAGTGCTGGTCAAAAATAACTGCTGGTTGGAGTAGTAGGTTATAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGATGCAAGTAAGAGATGAGCTGCATAGTGTTAAATAAAGATGGCATGTTTTCTGGAACATACGAGAAATTTGTCTTTTTAAGTATAAAGGAATGAGGTCAAGACAATAATCATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGACCAGATGTTATGGATACTTTTCAGACACTCTGGGACAGAATTTTACGGTGGAAGTATGTGCAGTAT-ATGATTCAGGACTTGATTGGTGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCCTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAGGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGTTATGATTGGAGGGAATAGGGTCTACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggacgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatggatg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86755993 906 - 99891981 tcttgctccactagatggctcatacttcctcacactacccatcatgggtcattaggagatctctgcttat-----ggtcgctcaggaattcatctaacaaagcagccaccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctggaagcaaaagagagaaatgtggtgggtttgccatcaacatttaaatactctggcccagaagtggtttgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggaccagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaatatctgtgaaacagTGGTATTGTCAAAAACAATGTGTAAGATTAACTTTTGCTTAAACAAG--TATATGTATTATTGCAGCAATGCTGGTCAAAAATAACTGCTGGATGGAGTAGTAGGTTATAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAGATGAGCTGCATAGTGCTAAATAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATGAGAAATCTGTTTTTTTAAGTGTAAAGGAATGAGGTCAAGACAATA---ATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGACCAGTTGTTATGGATACATTTCAGACACTCTGGGACAGAATTATACAGTGGAAGTATGTGCACTGTAATGATCCAAGACCTGATTAGCGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAGGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGTTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggacgcagtggcccacatctataatcccagcattttgtaaggcccaggtggatagatg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28272421 909 + 106825570 tcttgctccgctagatggctcatacttgctcacactacccatcatgggtcgttaggagatctctgcttat-----ggtcgctcaggaattcatctgacaaatcagccgccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctggaagcaaaagagagaaatgtggtgggtttgccctcaacatttaaatactctggcccagaagtggtttgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggacgagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaataCCCATGAAACAGTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAGTATATATATATAACTGCAGCAATGCTGGTC-AAAATAACTGCTGGATGAAGTAGTAGGTTACAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAGATGAGCTGCATGGTACCAAATAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATGAGCAATTTGTCTTTTTAAGTATAAAGGAATGAGGTCAAGACAATAATGATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATAGAGCTGACCAGTTGTT-TGGATACTTTTCAGATACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTATGAGCACTGTAATGGTACAAGACTTGATTGGCGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAAGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGGTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggatgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatgggtg i rheMac3.chr12 I 192 C 0 s macFas5.chr12 53828703 909 + 132586672 tcttgctccactagatggctcatacttgctcacactacccatcatgggtcgttaggagatctctgcttat-----ggtcgctcaggaattcatctgacaaatcagccgccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctggaagcaaaagagagaaatgtggtgggtttgccctcaacatttaaatactctggcccagaagtggtttgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggacgagcatgtacaatcttaccatatggatgtaaggagacagaacaggaaataCCCATGAAACAGTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAGTATATATATATTACTGCAGCAATGCTGGTC-AAAATAACTGCTGGATGAAGTAGTAGGTTACAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAGATGAGCTGCATGGTACCAAATAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATGAGCAATTTGTCTTTTTAAGTATAAAGGAATGAGGTCAAGACAATAATGATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATAGAGCTGACCAGTTGTT-TGGATACTTTTCAGATACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTATGAGCACTGTAATGGTACAAGACTTGATTGGCGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAAGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGGTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggatgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatgggtg i macFas5.chr12 I 192 C 0 s papAnu2.chr12 26911571 909 + 104110932 tcttGCTCCACTAGATGGCTCATACTTGCTCACACTACCCATCATGGGTCGTTAGGAGATCTCTGCTTAT-----GGTCGCTCAGGAATTCATCTGACAAATCAGCCACCACCTTGAAAATCATGGGTCACTGTGCTggaagcaaaagagagaaatgtgGTGGGTTTGCCCTCAACATTTAAATACTTTGGCCCAGAAGTGGTTTGTCACTTCTACTCATCACTTATGGGTGACAAGTGCTACAACTGGTCACCTAACCCCACCACAAGGGGACGAGCATGTACAATCTTACCATATGGATGTAAGGAGACAGAACAGGAAATACCTGTGAAACAGTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTtaaacaagtatatatatattactgcAGCAATGCTGGTC-AAAATAACTGCTGGATGAAGTAGTAGGTTACAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAGATGAGCTGCATGGTACCAAATAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATgagaaatttgtctttttaagtATAAAGGAATGAGGTCAAGACAATAATGATTTCCACTAAAGCAGTTAGTTACATAGAGCTGACCAGTTGTT-TGGATACTTTTCAGATACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTATGAGCACTGTAATGGTTCAAGACTTGATTGGCGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATAGGCTACCAAAAATTTGAAACCAAAAAGGctgagaatcactgctttaaaAAGTGAGGTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGtcctggctggatgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccAGGTGGatgggtg i papAnu2.chr12 I 193 C 0 s chlSab2.chr10 50452405 908 + 128595539 tcttgctccactagatggctcatacttgctcacactacccatcatgggtcgttcggagatctctgcttat-----ggtcgctcaggaattcatctgacaaatcagccgccaccttgaaaatcatgggtcactgtgctggaagcaaaagagagaaatgtggtgggtttgccctcaacatttaaatactctggcccagaagtggtttgtcacttctactcatcacttatgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggacgaggtagtacaatcttatcatatggatgtaaggagacagaacaggaaatatctgtgaaacagTGGTATTGTCAAAACCAATGTGTAAGATTAACTTCTGCTTAAACAAG--TATATATATTACTGCAGCAATGCTGGTCAAAAATAACTGCTGGATGGAGTAGTAGGTTATAGAAATTATGTAGACTGGGTACAACTTGCTACAAGTAAGAAATGAGCTGCATGGTACCAAATAAAGATGGCATATTTTCTGGAACATATGAGCAATTTGTCTTTTTAAGTATAGAGGAATGAGGTCAAGACAATAATGATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGACCAGTTGTT-TGGATACTTTTCAGACACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTATGTGCACTGTAATGGCTCAAGACTTGATTGGCGATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATCGGCTACCAAAAATTTGAAATCAAAAAGGCTGAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGGTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACCCTCTAATAAACAGTAAAGAAATCAGAAGTCCTggctggatgcagtggctcacacctataatcccagcactttgtaaggcccaggtggatgggtg i chlSab2.chr10 I 195 C 0 s calJac3.chr6 104662874 902 - 158406734 tcttgctccactagatggcttatagttgctcacactatgcatcatgggtaattaggagatctccgcttatcctaacgttgctcaggaattcatctggcaaggcagctgccacctagaaaatcatgaatcactgtgctggaagc-aaagagagaaatgtggtgggtttgccgtcaacatttacatactctggcccaggagtgatttgtcacttctacccatcacttacgggtgacaagtgctagaactggtcacctaaccccaccacaaggggaccagcatgtac--------catatggatgtaaggag-cagaacaggaaatatctgtgaaacagcCACATTGTCAAAACCAGTGTGTAAGATTAATTTCTGCTTAAACAAG--TATATGTATTATTGCAGCAATGCTGGTCAAAAACAACTGCTGGATGGAGTAGTAGGTTATAGAAACTATGTAGGCTGGGTACAACTTGCTGCAAGTAAGAGATGAGCTGCATGGTGCTAAATAAAGAGGGCATATTTTCTGGAACACATGAGAAATTTGTCTCTTTAAGTACAAAGGAATGAGGTTAAGACAATAATCATTTCCACTGAAGCAGTTAGTTACATGGAGCTGATCAGTTGTTATGGATACTTTTCAGACACTCTGGGACAGAATTATATGGTGGAAGTGTGTGCACCGTAATGATTCAAGACTTGATTGGCAATATTTTGGGTATCTTAAACCTCTTCTTTAAATATGTCACAGAAAAATTGAAACCAAAAGGGCTAAGAATCACTGCTTTAAAAAGTGAGTTATGATTGGAGGGAATAGGGTCCACTCGATAATGAACAGCAAAGAAATCAGAAGTCCTGG-Tggacacagtggctcacacctataaactcagca-tttgcaaggcccaggtggatgaaag i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10208047 454 + 30810995 I a score=362582.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 27170 156 + 478999 gcttgagcccaggagttcgagactagattcggcaacctggcaaaaccctgtctctacacaaaatacaaaaattaaccaggttgggtggcgcacctgtggtcccagctacttgg-aggccgaaatgagaggatcacttgagctccagaggtcaaggct s panTro4.chr2B 169278975 157 + 247518478 gcttgaacccaggagttcgagactagattgggcaacctagcaaaaccctgtctctacaaaaaatacaaaaattaaccaggtcgggtggcccacctgtggtcccagctacttgggaggctgaaatcagaggatcacttgagctctggaggtaaaggct i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18452310 156 + 99152023 gcttgagcccaggagttcgagactagattgggcaacctggaaaaaccctgtctctacacaaaatacaaaaattaaccaggtgggatggcgctcctgtggtcccagctacttgg-aggctgaaatgggaggatcacttgagctccagaggtcaaggct i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86756899 157 - 99891981 gcttgagcccaggagttcgagactagattgggcaacctggcaaaaccctgtctctacacaaaatacaaaaattaaccaggtggggtggcgcgcctgtggtcccagctacttgggaggctgaaatgagaggatcacttgagctccggaggtaaaggct i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28273330 152 + 106825570 gcttgagcccaggagtttgagactagattgggcaacctggcaaaaccctgtctctacacaaaatgcaaaaattaatcagg-----tggcgcccctgtggtcccagccacttgggaggctgaaatgggaggatcacttgagctccggaggtcaaggct i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53829612 152 + 132586672 gcttgagcccaggagtttgagactagattgggcaacctggcaaaaccctgtctctacacaaaatgcaaaaattaatcagg-----tggcgcccctgtggtcccagccacttgggaggctgaaatgggaggatcacttgagctccggaggtcaaggct i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26912480 152 + 104110932 gcttgagcccaggagtttgagactagattgggcaacctggcaaaaccctgtctctacacaaaatgcaaaaattaatcagg-----tggcgcccctgtggtcccagccacttgggaggctgaaatgggaggatcacttgagctccggaggtcaaggct i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50453313 152 + 128595539 gcttgagcccaggagtttgagactagattgggcaacctggcaaaaccccgtctctacacaaaatgcaaaaattaatcagg-----tggtgcccctgtggtcccagccacttgggaggctgaaatgggaggatcacttgagctccggaggtcaaggct i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10208047 454 + 30810995 I e calJac3.chr6 104663776 0 - 158406734 C a score=4287959.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 27326 1549 + 478999 gcagtgagccaagatggcgccagtgcactccagcatgggctgcagaaagagacgctgtctc----------------a------aaa----taattaaataaataaataaaat------------aaataaataaGTCCT----------GTTGT---CAAGAAGTCAGTAGACAATTTTTCCTAACACAATGATCTTAAGGACTTTA-TTTTTCCCATTTTTATTTCATTTTATTTACACCAAA-TTTCTTACTGGGTTTTCAATGCAGCTTAATGCAATATGCAATGATTTTAtgtttttatcc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctaccctatcTCAAAAA-AATAAATAAATAGC-TATATAAGAGTTTATATAAGCAATTTACTTATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCATTGaggctggagtgcagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgacctctcaggctcaagcga-ccctcccacctcagcctcctgtgtagctgggactacagcttaccatgccaagctaatttttaaattttctgtagcgacaggtttcactatgttatcagggctggtctcaaatccctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagtactgggattacaggcatgaaccaccgcacctggTTTGATCTTAAACACAACTTTTCTTGAAAAAAAGTTACCATGACAAGTGCTAATTTTTTTCTCCTACTAtttgttttgaaaaattttaaacttacaggttaaaataatagtacaataaatatctatatatctttttacttagagtcaccatttgtttacatttttccatattttcctctattttagtctgtctacaaacat--atacataAACATACTAAATGTATATGTATACACGTATGTG--------TGTATATACATTCATATACTCACACATACACATCAATATTACttttcttttgtgaggctattagagaataaatttagacacagcatttttgtcctaaatacttcagtatgtatcttataagtacatggatattcttccacataagcgtgacataattatcacactcaaaatttaacaacaataaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgtggtccaagtaataaccttcatagcCACCTGCCCTTCCCCCATCCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCTTCTGTTTAGTTACAGCCGAGACTG--CTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTTTCATAGGGAATAACCTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGATTGCATGAAGTGCAAGGATGAGCTGAAAGTGTGGCTCTGAAGCAGC--AACTGAtgggacaactctgaggtcatctacttaccctcgagggactgaggcagctctctctgtgagattgctgat-atgcaactggg-------------------------------------------------------------------------------cttggcctctttattcttcttggaccgacttgacttctcactttcctgtttctcctgggaacactcgtaaggaatggctcag------------------------------------------------------------------tgaatttccttctcaaggtcggctttggggaTATATATTTACATATAT-------GTATACATGTAACAA s panTro4.chr2B 169279132 1565 + 247518478 gcagtgagccaagatcacgccagtgcactccagcatgggctgcagagagagacgctgtctc----------------a------aaa--aataaataaataaataagtaaaatgaatgaataaataaataaataaGTCCT----------GTTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGACAGTTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCATTTTTATTTCATTTTATTTACAACAAT-TTTCTTACTGGGTTTTCAATGCAACTTAATGCAATATGCAATGATTTTAtgtttttattc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctatcccatcTCAAAAA-AAAAAAAA----GC-TATATAA-ATCTTATATAAGCAATTTACTTATTCCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCACTGaggctggagtgcagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgacctctcaggc-----------------------------------------------------------------------------ctgtagtgacaggtttcactatgttatcagggctggtctcaaattcctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccaccgcacttggTTTGATCTTAAATACAACTTTTCTTGAAAAAAAGTTAGCATGACAAATGCTAATTTTTTTCTCCTACTAtttgttttgaaaaatttttaacttacaggttaaaataatagtacaataaatatctatatatctttttacttagagtcaccatttgtttacatttttccatattttcctctattttaatctgtctacatacatgtatacatatacatactaaatgtat--gtatacatgtatgtg--------cgtatatacattcatatactcacacatacacatcaatattactttt--tttgtgaagctatttgagaacaagtttagacacggcatttttgtcctaaatacttcagtatgtatcttataagtacatggatattcttctacataagcatgacataattatcacattcaaaatttaacaacaataaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgttgtctgactaataaccttcatagcCACCTGCCCTTCCCCC-----TAATCCAATCATGAATGAAGGCTTCTATTTAGTTACAGCAGAGACTGTGCTGTAGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCATAGGGAATAACCTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTTATAGATTGCATGAAGTGCAAGGATGAGCTGAAAGTGTGGCTCCCAAGCAGC--AACTGATGGGACAACTCTGAGGTCATCTACTTGCCCTCGAGGGACTGAGGCAGCTCTCTCTGTGAGATTGCTGAT-ATGCAACTGAGGGGACAACTCTGAGGTCATCTACTTGCCCTCGAGGGACTGAGGCAGCTCTCTCTGTGAGATTGCTGATATGCAACTGAgcttggcttctttattcttcttggaccgacttgacttctcactttcctatttctcctgggaacactcgtaaggaatggctcac------------------------------------------------------------------tgaatttctttctcaaggtcggctttggg-aTATATATTTACATATATAGTATATGTATATATGTAACAA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18452466 1567 + 99152023 gcagtgagccaagatcatgccagtgcactccagcatgggctgcagagaaagacactgtctc----------------a------aaataaataagtaaataaataaataaagt-------taaataaataaataaGTCCT----------GCTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGACAATTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCATTTTTATTTCATTTTATTTACACCAAA-TTTCTTACTGGGTTTTCAATGCAACTTAATGCAATATGCAATGATTTTAtgtttttatcc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctatcctatcTCAAAAA-AATAAATAAATAGC-TATATAAGAATTTATATGAGCAATTTACTTATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCATTGaggctggagtgcagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgacctctcaggctcaagcga-ccctcccacctcagcctcctgtgtagctgggactacagcttaccatgccaagctaatttttaaattttctgtagcgacaggtttcactgtattatcagggctggtctcaaattcctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccaccgcacctggTTTGGTCTTAAACACAACTTTTCTTGAGAAAAAGTTACCATGACAAGTGCTAATTTTTTTCTCCTACTAttttttttgaaaaattttaaacttacaggttaaaataatagtacaataaatatctatatatctttttacttagagtcaccatttgtttacatttttccatattttcctctattttaatctgtctacatacatgtatacataaacatactaaatgtatatgtatacatgtatgtg--------tgtatatacattcatataCTCACACAtacacatcaatattactttt--tttgtgaggctattaaagaataagtttagacacgacatttttgtcctaaatacttcagtatgtatcttataagtacatggatattcttctacataagcgtgacataattatcacattcaaaattt---aacaataaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgtggtccaagtaataaccttcatagcCACCTGCCCTTCCCCTATCCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCTTCTGTTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCATAGGGAATAACCTCAGGTAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGATTGCATGAAGTGCAAGGATGAGCTGAAAGTGTGGCTCCGAAGCAGC--AACTGATGGGAGAACTCTGAGGTCATCTACTTACCCTCGAGGGACTGAGGCAGCTCTCTCTGTGAGACTGCTGAT-ATGCAACTGGG-------------------------------------------------------------------------------CTTGGCCTCTTTATTCTTCTTGGACCGACTTGACTTCTCACTTTCCTATTTCTCCTGGGAACACTCATAAGGAATGGCTCAG------------------------------------------------------------------TGAATTTCCTTCTCGAGGTCGGCTTTGGGGatatatatttacatatatagtatatgtatatatgtaACAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86757056 1517 - 99891981 gcagtgagccaagatcacaccagtgcactccagcatgggctgcagagagagacgctgtctc----------------a------aca------aataaataaaTAAGTAGAAT--------GAATAAATAAATAAGTCCT----------GTTGTTGTCAAGAAGTCAATAGACAATTTTTCCTGATATA---ATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCATTTTTATTCC-TTTTATTTACAACAAT-TTTCTTACTGGGTTTTCAATGCAACTTAATGCAATATGCAAGGATTTTAtgtttttattc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctaccctatcTCAAAAA-AA-----AAATAGC-TATATAA-ATCTTATATAAGCAAT----TAATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCACTGaggctggagtgcagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgacctctcaggctcaagcga-ccctcccacctcatcctcctgtgtagctggggctacaggttaccatgccaagctaatttttaaattttctgtagcgacaggtttcactatgttatcagggctggtctcaaattcctgaggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccacctcacctggTTTGATCTTAAATACAACTTTTCTTGAAAAACGGTTACCATGACAAGGGCTATTTTTTTTCTCCTACTAtttgttttgaaaaattttaaacttacaggttaaaataatagtgcaataaatatctatatatctttttacttagagtcaccatttgtttacattttttcatattttcctctgttttaatctgtctacatacatgtat------acatactaaatgtgt--------------------------gtatatacattcatatactcacacctacacatcaatattactttt--tttgtgaagatatttgagaacaagtttagacatggcatttttgtcctaaatacttcagtatgtatcttataagtacatggatattcttctacataagcatgacataattatcacattcaaaattt---aacaataaaattaaatatttaatgtactgctcatttaaaaactgtagttgttgtctgagtaataacctttatagcCACCTGCCCTTCCCCC-----TAATCCAATCATGAATGAAGGCTTCTATGTAGTTGCAGCAGAGACTGTGTTGTGGGAACCCAGATCTGCTTCTCTCATAGGGAATAACCTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACGGATTGCATGAAGTGCAAGGATGAGCCgaaagtgtggctcccaagcagc--aactgatgggacaactctgaggtcatctacttgccctcgagggactgaggcagctctctctgtgagattgctgat-atgcagctggg-------------------------------------------------------------------------------cttggcctctttattcttcttggactgacttgacctctcactttcctgtttctcctgggaacacttgtaaggaatggctcag------------------------------------------------------------------tgaatttccttctcaaggtcggctttggggatatatatttacatatatagtatatgtatatatgtaACAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28273482 1557 + 106825570 gcagtgagccaagattgcgccagcgcactccagcttgggctgcagagagagacactatctc----------------aataaataaataaataagtaagtaagtaagtaaaat----gaataaataaataaataaGTCCT----------GTTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGACGATTTTTCCTAATACAATGATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCGTTTTTATTTCATTTTATTTACACCACA-TTCCTTATTGGGTTTTCAGTGCAAT---------AATGCAATGATTTTAAgtttttattc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctaccctatcTCAAAAA-AATAAATAAATAGC-TATATAAGAGTTTATATAAGCAATTTACTTATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCACTGaggctggagtacagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgcccacagacgctcaagcga-ccctcccacctcagcctcctgtgtagctgggactacaggttaccatgccaagctgatttttaaattttctgtagcgacaggtttcacta-gttatcagggctgggctcatattcctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccaccgcacctggTTTAATCTTAAACACAACTTTTCTTGAAAAACAGTTACCATGACAAGTGCTAACTTTTTTCTCCTACTAtttgttttgaaaaattttaaacatataggttaaaataatagtataacaaatatctatatatctttttacttagagtcaccatttgtttacatttttt---------ctctattttaatctgtctacataaatgtatacatatacatactAAatgtat--gtatacatgtatgtt--------tgtatatatattcatatactcacacatacacatTAatattactttt--tttgtgaaactatttgagaataagtttagacatggcatttttgttctagatacttcagtatgtatcctataagtacatggatattcttctacataaacatgacataattatcacattcaaaatttaacaacaatgaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgttgtccgagtaataaccttcatagcCACCTGCCCTTCCCCCATCCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCTTCTATTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCCTAGGGAATAACTTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGATTGCATGAAGTACAAGGATGAGCtgaaagtgtggctcccaagcacc--aactgatgggacaactctgaggtcatctacttg-ccttgagggactgaggcagctctctctgtgagattgctgat-atgcaactggg-------------------------------------------------------------------------------cttggcctctttattcttcttagactgacttgacttctccctttcctatttctcctgggaacactcgtaaggaatggctcag------------------------------------------------------------------tgaatttccttctcaaggtcagctttggggaTATATATTTACACATATAACATATGTATATATGTAACCA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53829764 1553 + 132586672 gcagtgagccaagatcgcgccagcgcactccagcttgggctgcagagagagacactatctc----------------aataaataaataaataaataagtaagtaagtaaaat----gaataactaaataaataaGTCCT----------GTTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGACGATTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCGTTTTTATTTCATTTTATTTACACCACA-TTCCTTATTGGGTTTTCAGTGCAAT---------AATGCAATGATTTTAAgtttttattc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctaccctatcTCAAAAA-AATAAATAAATAGC-TATATAAGAGTTTATATAAGCAATTTACTTATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAAGCACTGaggctggagtacagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgcccacagacgctcaagcgacccctcccacctcagcctcctgtgtagctgggactacaggttaccatgccaagctgatttttaaattttctgtagcgacaggtttcactacgttatcagggctgggctcatattcctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccaccgcacctggTTTGATCTTAAACACAACTTTTCTTGAAAAACAGTTACCATGACAAGTGCTAACTTTTTTCTC---CTATTTGTTTTGAAAAATTTTAAACATATAGGTTAAAATAATAGTGTAACAAATATCTATATATCTTTTTACTTAGAGTCACCATTTGTTTACATTTTTT--------CCTCTATTTTAATCTGTCtacataaatgtatacatatacatactaaatgtat--gtatacatgta------------tgtatatatattcatatactcacacatacacatTAatattactttt--tttgtgaaactatttgagaataagtttagacatggcatttttgttctagatacttcagtatgtatcctataagtacatggatattcttctacataaacatgacataattatcacattcaaaatttaacaacaatgaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgttgtccgagtaataaccttcatagcCACCTGCCCTTCCCCCATCCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCTTCTATTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCCTAGGGAATAACTTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGATTGCATGAAGTACAAGGATGAGCtgaaagtgtggctcccaagcacc--aactgatgggacaactctgaggtcatctacttg-ccttgagggactgaggcagctctctctgtgagattgctgat-atgcaactggg-------------------------------------------------------------------------------cttggcctctttattcttcttagactgacttgactcctccctttcctatttctcctgggaacactcgtaaggaatggctcag------------------------------------------------------------------tgaatttccttctcaaggtcagctttggggatatatatttacacatataacatatgtatatatgtaACCA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26912632 1575 + 104110932 gcagtgagccaagatcacgccagcgcactccagcttgggcttcAGAGAGAGAcgctatctcaataaataaataaataaataaataaataaataaataaataaataagtaaaat----gaataaataaataaataagtcct----------gTTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGACGATTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCa-tttttcccgtttttatttcattttatttacaccACA-TTCCTTATTGGGTTTTCAGTGCAAT---------AATGCaatgattttaagtttttattc--------acTGAGATTTGTGGATGGTTTGTTACCAGAGTATTGCctaccctatctcaaaaa-aataaataaatagc-tatatAAGAGTTTATATAAGCAATTTACTTATTGCTTATATAAGAACACTTATAAAagcactgaggctggagtacaatggcatgaccatggctcactgcagcctcgcccACGgaggctcaagcga-ccctcccacctcagcctcctgtgtagctgggactacaggttacCATgccaagctgatttttaaattttctgtaccGACAGGTTTCACTACGTTATCAGGGCTGGGCTCAtattcctggggtcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaaccaccgcacctggtttGATCTTAAACACAACTTTTCTTGAAAAACAGTTACCATGACAAATGCTAACTTTTTTCTCCTAcgatttgttttgaaaaattttaaacatataggTTAAAATAATAGTACAACaaatatctatatatctttttaCTTAGAGTCaccatttgtttacatttttt--------cctctattttaatCTGTctacataaatgtatacatatacatactaaatgtat--gtatacatgtatgtt--------tgtatatatattcatatactcacacatacacattaatattactttt--tttgtgAAACTATTTGAGAATAAGTTTAGACATGGCATTTTTGTTCTAGATACTTCAGTATGTGTCCTATAAGTACATGGATATTCTTCTACATAAACATGACATAATTATCACATTCAAAATTTaacaacaatgaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtcCTTGTTGTCCGAGTAATAACCTTCATAGccacctgcccttcccccatCCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCTTCTATTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCCTAGGGAATAACTTCAGGCAGCCAGGACCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGATTGCATGAAGTACAAGGATGAGCTGAAAGTGTGGCTCCCAAGCACC--AACTGATGGGACAACTCTGAGGTCATCTACTTG-CCTTGAGGGACTGAGGCAGCTCTCTCTGTGAGATTGCTGAT-ATGCAACTGGG-------------------------------------------------------------------------------CTTGGCCTCTTTATTCTTCTTAGACTGACTTGACTTCTCCCTTTCCTATTTCTCCTGGGAACACTCGTAAGGAATGGCTCAG------------------------------------------------------------------TGAATTTCCTTCTCAAGTTCAGCTTTGGggatatatatttacacatataacatatgtatatatgtaaccA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50453465 1569 + 128595539 gcagtgagccaagatcgcgccagcgcactccagcttgggctgcagagagagacgctatctc-----------------------aaaaaaataaataaataaataagtaaaat----ggataaataaataaataaGTCCTTGTCAAATAAGTTGTTGTCAAGAAGTCAGTAGATGATTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCA-TTTTTCCCATTTTTATTTCATTTTATTTACACCACA-TTTCTTATTGGGTTTTCAATGCAAT---------AATGCAATGGTTTTAAgtttttattc--------actgagatttgtggatggtttgttaccagagtattgcctaccctatcTCAAAAA-AATAAATAAATAGC-TATATAAGAGTTTATATGAACAATTTACTTATTGCCTATATGAGAACACTTATGAAAGCACTGaggctggagtacagtggcatgaccatggctcactgcagcctcgcccgcgtaggctcaagcga-ccctcccacctcagccttctgtgtagctgggactacaggttaccatgccaagctgatttttaaattttctgtagcgacaggtttcactatgttatcagggctgggctcatattcctggggtcaagcgatcctcctgtcgtggcctctcaaatcactgggattacaggcatgaaccaccacacctggTTTGATCTTAAATACAACTTTTTTTGGAAAAAAGTTACCATGACAAGTGCTAACTTTTTTCTCCTACTATTTGTTTTGAAAAATTTTAAACATACAGGTTAAAATAATAGTGCAACAAATATCTATCTATCTTTTTACTTAGCGTCACCGTTTGTTTACATTTTTTCATATTTTCCTCTATTTTAATCTGTCtacataaatgtatacatatacatactaaacgtat--gtatacatgtatgtg--------tgtatataca-tcatatactcacacatacacatTAatattactttt--tttgtgaaactatttgagaataaatttaggcatggcatttttgttctaaatacttcagtatgtatcttataagtacatggatattcttctacataagtatgacataattatcacattcaaaatttaacaacaataaaattaaatatttaatgtacagctcatttaaaaattgtccttgttgtccgagtaataaccttcatagcCACCTGTCCTTCCCCCATCCTTAATCCAATCATGAATGCAGCCTTCTATTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGGAACCTAGATCTGCTTCTCTCCTAGGGAATAACTTCAGGCAGCCAGGAGCTGCTCTGCCTGTGGGGCTCACAGACTGCATGAAGTACAAGGATGAGCTGAAAGTGTGGCTCCTAAGCACC--AACTGATGGGACAATTCTGAGGTCATCTACTTG-CCTTGAGGGACGGAGGCAGCTCTCTCTGTGAGATTGTTGAT-ATGCAACTGGG-------------------------------------------------------------------------------CTTGGCGTCTTTATTCTTCTTAGACTGACTTGACTTCTCCCTTTCCTATTTCTCCTGGGAACACTCGTAAGGAACGGCTCAG------------------------------------------------------------------TGAATTTCCTTCTCAAGGTCAGCTTTGGGGatatatatttacacatatagtatatgtatataCGTAACCA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104663776 1616 - 158406734 gcagtgacctgagatcatgccagtgcactccagcatgggctgcagagagagacactatctc----------------a------aaa----------aataaataagtaaaaT------------AAATAAATAAGTCCT----------GTTGT---CAGAAAGTCAGTAGACAATTTTTCCTAATATAATGATCTTAAGGACTTCATTTTTTCCCATTTTTATTTCATTATATTTACACCAAATTTTTTTATTGGGTTTTCACCACAACTTAAT----AATGTAATGATTTTATGTTTTTATTTATGCAGTAACTGAGATTTGGGAATGGTTCATTACCAGAGAATTACCTACCCTACCttaaaaataataaataaatagcttatataagagtttatataattaatttatttGTTGCTTACATAAGAGCATTTATGTAAGCAGTGaggctggagtgcaatggcatgactgtggctcaatgcagcctcgacctcccaggctcaagtaa-tcctcccgcctcagcctcctgtgtagctgggactacaggtta------caagctaatttttaatttttttgtaatgacaggttttactatgttatcaagattggtctcaaattcctgggctcaagtgatcctcctgtcttggcctcccaaagcactgggataacaggtgtgagccaccccacctggTTTGATCTTAAATACAACTTTGCTTGAAAAA-AGTTACCATGATAAATGCTAATTTTTTTCTCCTACTAtttgttttgaaaaactttaaacttacaggttaaaataatagtacaataaatatctatatatc-atttacttagagtcaccatttg---atgttttcctatattttcctctattttaatttctctaattacatacgtaaatatacacactaaatgtat--gtatacatgtatgtgtgtatgtatgtatatactttcatgtgctcacacatacacatcaacattacttct--tttgtgaagctatttgagaataagtttagacatggcacttttgtcctaaattcttcagtatgtatcttattagtac-tggatattcttctacataagcatgacataattatcacagtcaaaatttaacaacaataaaattgaatgtttaatgtatagctcatttaaaaattgtcctcattgtctgagtaatacctctcacagcTACCTGCCCTTCCCCCATTCTTAATCCAATCATGAATGAAGCCT----TTTAGTTACAGCAGAGACTCTGCTGTGGAAACCTAGGTCTGCTTCTCTCACAGGAAATAACCTCAGGCAGCCAGAACCTGCTCTGCCTGTGAGGCTCACAGATTGTAGGAAGTGCAGGGATGAGCTGAAAGTGTGACTCCCAAGCAGCAAAACTGATGGGACAACTCTGAAGTCATGTACTTGCCCTCGAGGGACTGAGGTAGCTCCCT---GGAGATTGCTGATAATGCACTTGGC-------------------------------------------------------------------------------CTTGGCCTTTTTATTCTTCTTAGACTGACTTAACTTTTCACTTTCCTGTTTCTCCTGGGAACACTCCTAAGGAATGGCTCAGTAGCATCTTCTTCACATGTACCCCAAAACCTAAAATGCAATTAAAAAAAAAAAAAGGAATGGTTCATGAATTTCTTTCTCAAGGTCAGCTTCGGGGATATATATTTGCATATGTAGTATATGTATATATGTAACAA i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10208047 454 + 30810995 I a score=2319768.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 28875 771 + 478999 AACAAaga-------ccattccttttacagattattctcaatttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagacaaaatattgttgacaagaatactacatactacataagtga---tgtgtcttcctAATACAGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCTTCCAAGAAATGCCATTATCTTTTGGCCAGCACTCAAATGAAATACAGACATTC-TTTTAAAATCGAATGTATTCTATTTTAT-TATGTTTTGCATTTCCCCTCTTGAGTTTCTCCTAGTTTACTAACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAACTATATTATATTTTTATTCATAAGAAAAAGAAAAAAAA-----CCTCATGCAACTGAAATTGCCTTAAATTATTCATCTCTCACACTATTCTTACTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCTGCTTAATCCCATAACATATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCAGACACCTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTACAAAACC-------------AAGAAAAAAAAAAAAGGGGGGGATTTTTCTTGGACTCTGT-TCGAAGTTTCAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATAGTTTCACTGAAACAAAAAAGTGACAGCTGCTtc-----cccttccttcccttcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttccctct-cccccaccctcc-tcctccttctcctcttcct s panTro4.chr2B 169280697 771 + 247518478 AACAAaga-------ccattccttttacagattgttctcagtttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagataaaatattgttgacaagaatactacatactacataagtgacgatgtgtcttcctAAAACAGGTTTTTGAAATGTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCTTCCAAGAAATGCCATTATCTTTTGGCCAGCACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCGAATGTATTCTATTTTAT-TATGTTTTGCATTTCCGCTCTTGAGTTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAA-----TTATATTCTTATTCATAAGAAAAAGAAAAAAAA-----CCTGATGCAACTGAAATTGCCTTAAATTATTCATCTCTCACACTATTAATACTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCCGTTTAATCCTATAATATATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AACTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCAGCCACCTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTACAAAACC-------------AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG--ATTTTTCTTGGACTCTGT-TTGAAGTTTCAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTTGCTGAAACCAAAAAGCGACAGCAGCTTC-----CCCTtccttcccttcccttcc-------------------------------------------------------------------------------tc-ttccttct-tccccacc-tcc-tccttcttctcctcttcct i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18454033 815 + 99152023 AACAAAGA-------GCATTCCttttacagattgttctcaatttggatt-------tttc-tgattgttacatcatgattagatttagacaaaatattgttgacaagaatactgcatactacataagtga---tgtgtcttcctAATATGGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCTTCCAAGAAATGCCGTTATCTTTTAGCCAGCACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCGAATGTATTCTA-TTTAT-TATGTTTTGCATTTCCCCTCTTGAGTTTCTCCTAGTTTACTTACCTTTC---------------TACAGAGtaataaaa-----ttatatttttattCATAAGAAAAAG-AAAAAAA-----CCTCATGCAACTGAAATTGCCTTAAATTATTCA--TCTCACACTATTCTTACTTTGCTGTTTAATATTACTATTTTATCTGCTTAATCCCATAATATATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAA-----ATTTTATTTCAGCCACCTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTACAAAACC-------------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG-GATTTTTCTT-AACTCTGT-CCGAAGTTTCAAGCCTACC----ATCGGATCTGTCACAGACATAACT--TCTCAGAAGCTCCTGGATGGGATTTTGCCCTGTATAGTTTCACTGAAACAAAAAAGCGACAGCTG------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC-TTCCCTCT-CCCCCACCctcc-tccttcttctcctcttcct i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86758573 766 - 99891981 AACAAaga-------ccattccttttacagattgttctcaatttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagataaaatattgttgacaagaatactagatagtacataagtgatgatgtgtcttcctAAAACAGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCTTCCAAGAAATGCCATTATCTTTTGGCCAGCACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCGAATGTATTCTATTTTAT-TATGTTTCGCATTTCCCCTCTTGAGTTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAA-----TTATATTCATATTCATAAGAAAAAGAAAAAAAA-----TCTGATGCAACCGAAATTGCC-----TTATTCATCTCTCACACTATTCTTACTTTGATGTTTAATATTGTTATTTTATCTGTTTAATCCCATAATATATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTCGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCAGCCACCTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTACAAAACC-------------AAAACAAAACAACAACAAAG-GATTTTTCTTGGGCTCTGT-TCGAAATTTCAAGCCTACCATCAATCAGATCTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTTGCTGAGACAAAAAAGCGACAGctgcttc-----cccttcctttccttcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttccctct-cccccacc-tcc-tccttcttctcctcttcct i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28275039 764 + 106825570 AACAAaga-------ccattccttttacagattgttctcaatttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagacaaaatattggtgacaagaatactacctactacatacatgatgatgtgtcttcctAATACAGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCATCCAAGAAATGTCATTATATTTTGGCCAGTACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCCAATGTATTCCCTTTTAT-TATGCTTTGCATTTCTCCTCTTGAATTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAG--------CATTCTTATTCATAAGAAAAAG-AAAAAAC-----CCTGATGCAACTGAAATTGCCTTAAATTATTCACCTCTCACACTATTCTTATTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCTGCTTAATCCCATAATACATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCCGCCA-CTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTATAAAACC-----------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaG-GATTTTTCTTGGACTCTGT-CAGAAGTTTGAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTCGCTGAAACAAAAAAGCGACAGCTGctcc-----tctttccttcccttcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttccttct-cccccacc-tcc-tccttctcctcctcttcct i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53831317 763 + 132586672 AACAAaga-------ccattccttttacagattgttctcaatttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagacaaaatattggtgacaagaatactacctactacatacgtgatgatgtgtcttcctAATACAGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCATCCAAGAAATGTCATTATATTTTGGCCAGTACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCCAATGTATTCCATTTTAT-TATGCTTTGCATTTCTCCTCTTGAATTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAG--------CATTCTTATTCATAAGAAAAAG-AAAAAAC-----CCTGATGCAACTGAAATTGCCTTAAATTATTCACCTCTCACACTATTCTTACTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCTGCTTAATCCCATAATACATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCCGCCA-CTAGAAAAATAGTTCTAAATTCTATaaaacc------------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaG-GATTTTTCTTGGACTCTGT-CAGAAGTTTGAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTCGCTGAAACAAAAAAGCGACAGctgctcc-----tctttccttcccttcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttccttct-cccccacc-tcc-tccttctcctcctcttcct i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26914207 767 + 104110932 AACAAAGA-------CCATTCCTTTTACAGATTGTTTTCAATTTGGATT-------TTTC-TGATTGTTTCATCATGATTAGATTTAGACAAAATATTGGTGACAAGAATACTACATACTACATACGTGATGATGTGTCTTCCTAATAcaggtttttgaaattttaaattctgataaCTGCTTTTCATCCAAGAAATGTCATTATATTTTGGCCAGTACTCAAATGAAATAGAgacattc-ttttaaaatccaATGTATTCCATTTTAT-TATGCTTTGCATTTCTCCTCTTGAATTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAG--------CATTCTTattcataagaaaaagaaaaaaac-----cctgatgCAACTGAAACTGCCTTAAATTATTCACCTCTCACACTATTCTTACTTTGatgtttaatattattattttatctgctTAATCCCATAATACATA---TTCTGACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAActacttataattttattttatttccgcCA-CTAGAAAAATAGTTCTAAATtctataaaaac-----------caaaaaaaaaaaaaaaaaaaag-gatttttcttGGACTCTGT-CAGAAGTTTGAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGACAtaact--tctcagaaagctct-aATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTCGCTGAAACAAAAAAGCGACAGCtgctcc-----tctttccttcccttcc------------------------------------------------------------------------------------tctttccttctacccccacc-tcc-tccttctcctcctcttcct i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50455034 772 + 128595539 AACAAaga-------ccattccttttacagattgttctcaatttggatt-------tttc-tgattgtttcatcatgattagatttagacaaaatattgttgacaagaatactacatactacatacgtgatgatgtgtcttcctAATACAGGTTTTTGAAATTTTAAATTCTGATAACTGCTTTTCTTCCAAGAAATGTCATTATATTTTGGCCAGTACTCAAATGAAATAGAGACATTC-TTTTAAAATCCAATGTATTCCATTTTAT-TATGCTTTGCATTTCCCCTCTTGAATTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTC---------------TACAGAGTAATAAAA--------CATTCTTATTCATAAGAAAAAGAAAAAAAA-----CCTGATGCAACTGAAACTGCCTTAAATTATTCACCTCTCACACTATTCTTACTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCTGCTTAATCCCATAATACATA---TTCTTACATAAATCTGC------AAATTGTTGAAAAC-AATTTACTTAACATTTCAACTACTTAAAATTTTATTTTATTTCCGCCA-CTAGAAAAACAGTTCTAAATTCTATaaaaccaa---------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaG-GATTTTTCTTGGACTCTGT-CAGAAGTTTGAAGCCTACC----ATCAGATTTGTCCCAGACATAACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCCTGTATGGTTTTGCTGAAACAAAAAAGTGACAGctgctccttttttcttcccttcccttcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttccttct-ctcccacc-tcc-tccttctcctcctcttcct i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104665392 773 - 158406734 AACAAAGA-------CTATTCCTTTCACAaatttttctcaatttggact-------tttcttgattatttcttcataattagatttagacaacatatttttcacaagaat-ctacatatttcataagtgattatgtgtgttcctAATACACGTTTTTGAAATTTGAAATTCTGATAACTGCCTTTCTTTGAAGAAATGCCATTATCTTTTGGCCAGCACTCAAATGAAATAGAGACCTTC-TTTTAAAATTGAATGTATTCCATTTTAT-TATGTTTTGCATTTCCCCTCTTGCCTTTCTCCTAGTTTACTTACCTCTCAAAGTATTTATTTATTGCAAAGGAATAATA--------TGTTCTTAT----------AAGAAAAAAAA-----TCTGTTGCAACTGATCTTGCCTTAAATTATTCGTCTCCCACACTGTTGTTACTTTGATGTTTAATATTATTATTTTATCTGCTTAATC-----ACATATA---TTCTGACATAAATCTGT------AAATTGTTGAAACCAAATTTACTTAGTATTTCAACTATTTAA---TTTTTTTTATTTCAGCCACCTAGAAAAATAGTTCTAAATTCaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaagaaagaaaaagaaaaaaaG-GACTTTTCTTGGACTCTG---AGACATTTCAAGCCTACC----ATCAGATCTGTCCCAGAAATGACT--TCTCAGAAAGCTCT-AATGGGATTTTGCCTTGCATGGTTTCACTGAAACAGAAAAGCAGCAGCTGCTCC-----TCCTTCCTTTCATtcc------------------------------------------------------------------------------------tc-ttcctcct-cacccacc-tcc-tccttctccttctctttct i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10208501 758 + 30810995 aacaaagagtctgggttattcctttcatagataattcttaatttggatttaaattatatc-tgattatatcttaaagattacatttagacaaaatattttgggtaagaat-------actacataaatgatgatgtatcatcctAATATAAACTTCTACAATTTAAAATTTTAAT-ATTGCCTTTCCTCTAAGAAATGCCATTATCTTTTGGCCAGCACTCTAATGAAATATGAATATGCTTTTTTTACTTGAATTTATTCTATTTTATGCAAATTTTGAGTGTTCTCTCCTG--TTTTTTTTAGTTTGTTTACCTGTG---------------TACAGGattataaat------tatatttttattCATAAGAGAAGAAAGGGAAAGTCTTTCTGATGTAGCTGAAATTACCCTAAGTTACTCATCTCCTGTACTA----TACCTTGAGGTCTAATATTAAT-TTCCTTCTGTTTAATTCTATTATGTATATTTTTCTGACACAAGTCCACTGACATAAAATGTTAAAAATTAGCTTACTTAAGATGTAAACTACTTAAAATTTCATTTTATTTTAGACACCTAGAAAAATAATCTTCAGTTT---------------------------------AAAAAATAG-TGTTTTTCTTGGATTCTTTATAGAAGATTCAAACCTGCC----ATCACATCTTCCCCCAACGTGACTTCTCTCAGCAAGTTCT-AATGGAATTTTACCTTGCACAGTGTGGTTGAAACA--------ATAGTTTCTCC-----ACCTCCTTCTCTTCTT------------------------------------------------------------------------------------TC-TTCTTTTT-TACACAAT-TCTATCTTTCTTTTCCACTCACT i canFam3.chr36 I 454 I 66 a score=97698.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 29646 44 + 478999 tcttcttctt----------------------ccttctTGCACATGTCTGATCTCTTTTTCC-------------------------------TGGC s panTro4.chr2B 169281468 44 + 247518478 tcttcttctt----------------------ccttctTGCACATGTTTGATCTCTTTTTCC-------------------------------TGGC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18454848 44 + 99152023 tcttcttctt----------------------ccttctTGCACATGTCTGATCTCTTTTCCC-------------------------------CGGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86759339 44 - 99891981 tcttcttctt----------------------ccttcttGTACGTGTTTGATCTCTTTTTCC-------------------------------TGGC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28275803 97 + 106825570 tcttcttctTTCTTCTTGCACATGTTTTGATCTCTTCTTGCACATGTTTGATCTTTTTTTCCTCTTTTTGATCTCTTTCTTCTTGCATATGTTTGAT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53832080 97 + 132586672 tcttcttctttcttcttgcacatgttttgatctcttcttgcacatgtttgatctttttttcctctttttgatctctttcttcttGCATATGTTTGAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26914974 96 + 104110932 tcttcttctttcttcttgcacatgttttgatctcttcttgcacatgtttgatc-ttttttcctctttttgatctctttcttcttgcacatgtttgat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50455806 44 + 128595539 tcttcttctt----------------------tcttcttTCACATGTTTGATCTCTTTTTCC-------------------------------TGGC i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104666165 44 - 158406734 tcttcctctt----------------------ccttctTTCACATGTTTGATCTCTTTTTCC-------------------------------TGAC i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10209259 66 + 30810995 I a score=600730.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 29690 183 + 478999 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGATGAATGACTAATCTGAGGGTCGGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGAAAAAAATCCCCCAGTAATTATAGGTTGC--AAAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTTGC----TCTTTTAGGTTCTTTTCATTTA-TTTCAAATTAAATGATACTTTCTTT s panTro4.chr2B 169281512 183 + 247518478 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGATGAATGACTAATCTGAGGGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGTAAAAAATCCCCCAGTAATTATAGGTTGC--AAAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTCGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTA-TTTCATATTAAATGATACTTTCTTT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18454892 183 + 99152023 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGGGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGAAACAAATCCCTCAGTAACCACAGGTTGC--AAAAAACCTCTTCTACTTATTTGGCCATTCGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTA-TTTCAAATTAAATTATACTTTCTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86759383 183 - 99891981 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATGGGGTGATGAATAACTAATCCGAGGGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GATGCTTCCTGAAAAAAATCCCCCCGTAATTATAGGTTGC--AAAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTGGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTG-TTTCAAATTAAATGATACTTTCTTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28275900 182 + 106825570 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGTGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGAAAAAAATCCCCCAGTAATTACAGGTTGC---AAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTCGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTA-TTTCAGATTAAATGATACTTTCTTT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53832177 182 + 132586672 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGTGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGAAAAAAATCCCCCAGTAATTACAGGTTGC---AAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTCGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTA-TTTCAGATTAAATGATACTTTCTTT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26915070 183 + 104110932 ctctAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGTGTCAGAG-CTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGaaaaaaaCCCCCCAGTAATTACAGGTTGC---AAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTCGC----TCTTTTAggttctcttcatttattttcagattaaaTGATACTTTCTTT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50455850 182 + 128595539 CTCTAATTTAGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGTGTCAGAG-TTTCTTTCCT------GAAGCTTCCTGAAAAAAATCCCCCAGTAATTACAGGTTGC---AAAAACCTCTTCTACTTATTTAGCCATTCGC----TCTTTTAGGTTCTCTTCATTTA-TTTCAGATTAAATGATACTTTCTTT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104666209 184 - 158406734 CCCTAATTTCGCAGCCAGTGATTGGGTGACGAATGACTAATCTGAGAGTCAGAGTCTCCTCTCCT------GAAGCTTCCTGAAAAAAGCCTCCCAATAATTATAGGTTGC--CAAAAACCTCCTCTACTTATTTAGCTATTTGC----TCTTTTAAGGCTTCTTCATTCA-TTTCAAATCATATGATACTTTCTTT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10209325 185 + 30810995 cgaggagtctgcAGCCATTGGTTGGGTGGCCAATGACT-----GGCGGTCAGAG-CTTTTCTCATCCCTAAAAAGCTTCCTGAAAAATATTCCCCAATAATTGTAAATTTCTAAGGAAACTCTTCCAATTTATTTAGCCATTCTCTCTATCTTTCAGGTTCTCTTCATTCA------AATTGTCTGATATTTTTCCC i canFam3.chr36 I 66 I 174 a score=538813.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 29873 159 + 478999 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAGGTGCTGCTACATTAATTCAATGCATGTTGCA-TTTTTAATGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTATCAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCACCGTAATGAA s panTro4.chr2B 169281695 159 + 247518478 CCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAGGTACTGCTACATTAATTCAATGCATGTTGCA-TTTTTAATGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTATGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCACCAAAATGAA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18455075 159 + 99152023 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAGGTGCTGCTACATTAATTCAATGCATGTTGCA-TTTTTAATGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTATGAATTGCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCACCAAAATGAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86759566 160 - 99891981 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGATTCCCTTCAGGTGGTGCTACATTAATTCAATGCTTGTTGCA-TTTTTAATGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAATTTCCACTTAAGTTGAGTTCCCACCAAAATGAA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28276082 159 + 106825570 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAGGTGCTGCTAAATTAATTCAATGCATGTTACA-TTTTTAAAGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCACCAAAATGAA i rheMac3.chr12 C 0 I 302 s macFas5.chr12 53832359 159 + 132586672 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAGGTGCCGCTAAATTAATTCAATGCATGTTACA-TTTTTAAAGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCACCAAAATGAA i macFas5.chr12 C 0 I 303 s papAnu2.chr12 26915253 159 + 104110932 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTCAAGTGCTGCTAAATTAATTCAATGCatgttaca-tttttaatgaaTCATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTTCCCAccaaaatgaa i papAnu2.chr12 C 0 I 304 s chlSab2.chr10 50456032 160 + 128595539 TCTCCCAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGACTTCCTTTAGGTGCTGCTAAATTAATTCAATGCATGTTACATTTTTTAATGAATAATTTTAGGTAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGAGTTCCCACCAAAATGAA i chlSab2.chr10 C 0 I 305 s calJac3.chr6 104666393 159 - 158406734 TCTCCTAAAATTCAAACTGGAGTTTCTTTGCCTTCCTTCAGGTGTTGCTACATCAATTCAATGCATGTTAAG-TTTTTAATTAATAATTTTAGGAAG---------TGAATTTCAAGTTCTGTAGGAATTTCATTAA-TTCTACTTAAGTTGGGTGCCCACCAAAATTAA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10209684 166 + 30810995 tccCCTAAATTTTGAACTGTAGTTTCTTTGACCTCCATCAGACGTTATTACATTAGTTCAAAGCATGTTAAG-TTTTT-ATGGATAA-GGTAGGTAAACTAATGTTCAGATTTTAAGTAATGTAGAAGTCTCATTAA-TTTTGCTTACATTGGGTTGCTTTCTAAATGAG i canFam3.chr36 I 174 C 0 a score=1800700.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 30032 507 + 478999 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAAGCACCAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGActtcccttccttccttcctcgctc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttccttccttcttt----------------------------ccttccttcctcctttccAGCATCAGCTTTAGCAAGGAGCCCTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCACTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCACTCCATAGTCAGGGATGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACACGGCCACATAAATATTTATTAGCTTTTTATTTGTATCAATCTGTTCTGTACAACCTGTACAGCTTTTCATTGCTGACATCCTTTTT-----ATTATTTCAAATAATAGTTTAGTATGAGAGTTAAA--AGAAACATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT s panTro4.chr2B 169281854 507 + 247518478 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAAGCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGACTTCccttccttccttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttccttccatcttt----------------------------ccttccttcctgctttccAGCATCAGCTTTAGCAAGGAGCCCTAGAAGAAGACACCGGAAGGTTTCCAACTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCACTCCATAGTCAGGGATGTGGGGGAAACACTCTAGGCAACACCTCCCACACATGGCCACATAAATATTTATTAGCTTTTTATTTGTATCCATCTGTTCTGTACAACCTGTACAGCTTTTCATTGCTGACATCCCTTTT-----ATTATTTCAAATGATAGTTTAGCATGATAGTTAAA--AGGAACATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18455234 507 + 99152023 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAAGCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGACTTCccttccttccttcctcgctc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttctttccttcttt----------------------------ccttcctccctcctttccAGCATCAGCTTTAGCAAGGAGCCCTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCACTGTCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCACTCCATAGTCAGGGATGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACATGGCCACATAAATATTTATTAGTTTTTTATTTGTATCAATCTGTTCTGTACAACCTGTACAGCTTTTCATTGCTGACATCCTTCTT-----ATTATTTCAAATAACAGTTTAGTATGAGAGTTAAA--AGGAACATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86759726 506 - 99891981 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAATCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGActtcccttccttccttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttccttccatcttt----------------------------ccttccttcctcctttccAGCACCAGCTTTAGCAAGGAGCCCTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTT-GGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCACTCCATAGTCAGGGATGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACATGGCCACATAAATATTTATTAGCTTTTTAATTGTATCAATCTGTTCTGTACAACCTGTACAGCTTTTCATTGCTGACATCCTTTTT-----ATTATTTCAAATGATAGTTTAGTATGATAGTTAAA--AGGAACATACC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28276543 507 + 106825570 CTTTTAAACGTGTGTATTATTGTTTGGCCGAAAGCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGACTTCccttccttctttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctctctcttttccttccttcttt----------------------------ccttccttccttctttccAGCATCAGCTCTAGCAAGGAGCCTTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCATTCCGTAGTCAGGGCTGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACATGTGGCCACATAAATATTTATTAGTTTTTTATTTGTATCAATCTGTTCTGTACAACTTGTACAGCTTTGCATTGCTGACATCCTTTTT-----ATTATTTCAAATGATAGTTTAGTATGATAGTTAAA--AGGAATATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i rheMac3.chr12 I 302 C 0 s macFas5.chr12 53832821 507 + 132586672 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCGAAAGCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGActtcccttccttctttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctctctcttttccttccttcttt----------------------------ccttccttcctcctttccAGCATCAGCTCTAGCAAGGAGCCTTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCATTCCGTAGTCAGGGCTGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACATGTGGCCACATAAATATTTATTAGTTTTTTATTTGTATCAATCTGTTCTGTACAACTTGTACAGCTTTGCATTGCTGACATCCTTTTT-----ATTATTTCAAATGATAGTTTAGTATGATAGTTAAA--AGGAATATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i macFas5.chr12 I 303 C 0 s papAnu2.chr12 26915716 507 + 104110932 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAAGCACAAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATgacttcccttccttctttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttccttccttcttt----------------------------ccttccttcctcctttccagcATCAGCTCTAGCAAGGAGCCTTAGCAGAAGACGCCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACCACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTGTATTTTTTCCtaagtttcctttttcattccGTAGTCAGGGCTGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACGTGgccacataaatatttattagttttttatttgtatcaatCTGTTCTGTACAACTTGTACAGCTTTGCATTGCTGAcatccttttt-----attatttcaaatgatAGTTTAGTATGATAGTTAAA--AGGAATAtatc-------------------------------------tttgttcttgt i papAnu2.chr12 I 304 C 0 s chlSab2.chr10 50456497 507 + 128595539 CTTTTAAACATGTGTATTATTGTTTGGCCAAAAGCACGAAATGGGTGTTCAGCTTACAT----TCTAATGActtcccttccttctttcctcactc--------------------------------------------------------------cctctctccctcttttccttccttcttt----------------------------ccttccttcctcctttccAGCATCAGCTCTAGCAAGGAGCCTTAGCAGAAGACACCAGAAGGTTTCCAGCTGACTTGTCTCTTTTGTTCCTAAACTACTACTAACAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCGCTGCCCACTGTGCTATTTAAATCTCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCATTCCGTAGTCAGGGCTGTGGGGGAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACGTGGTCACATAAATATTTATTAGTTTTTTATTTGTATCAATCTGTTCTGTACAACTTGTACAGCTTTGCATTGCTGACATCCTTTTT-----ATTATTTCAAATGATAGTTTAGTATGATAGTTAAA--AGGAATATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i chlSab2.chr10 I 305 C 0 s calJac3.chr6 104666552 597 - 158406734 CTTCTAAACATGTGTGTTATTATTTGGCCAAAAGCAAGAAATAGGTGTTCAGCTTGCAT----TCTAATGACTtcccttccttcttccctccctctctccctttcttattttcctcctcctctccctccctctctccctttctttttttctttccttcctccctccctctttccctttcttctttccttccttcctccctctctccctctttcccttccttcctcctttccAGCATCAGCTCTAGCAAGGAGCCCTAGCAGAAGACAGCAGAAGGTTTCCAGCCAACTTGCCCCTTTTGTTTCTAAACCACTACTAATAGCAATATTAGTCATCACTTCCCCCACTGCCCACTGTGCTATTTAAATATCCCTCTTTGGGTATGTTTTTTCCTAAGTTTCCTTTTTCACTCCATACTCAGGGCTGTGGGGTAAACACTCCAGGCAACACCTCCCACACATGGCCACATAAATATTTATTAGATTTTTATTTGTATCAATTTGTTCTGTACAGCCTGTACAGTTTTTCATTGCTGACGTCCTTTTT-----ATTACTTCAAATGATAGTTTAGTGTGATAGTTAAA--AGGAAGATATC-------------------------------------TTTGTTCTTGT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10209850 539 + 30810995 CTTTTAATCGTGTATATT-CTGCTTAG-CAAAGTCAAGACATGGGTTTTTGTCTTGTGTTCTCTCTAATGCCTACCCTCCCCTGATTTCTCCCCC--------------------------------------------------------------GCCATCTCTCT--------------TTC----------------------------CCCTACTCCCTCCCTTCTAGCATTGGCTTTAAAGAGGAATGGTAACAGAAGAAAACAGAAGATCTCTAGCCAACTTGTGTCTTTTGTTTCTAAACCACTACTAGCAGCAGTATTAGTCATCACTCCCCCAGCTGCCCACCATGCTATTTAAATATCCCTCTTTGGGTATATTTTTTCCTGTGTTTCCTCTTCTGGTCCATAGTCATGACTGTGGAGGAAATGCTCTAGGCAACGCCTCCCACCCATGACCACATAAATATTTATTAGTTTTTTATTTGTATATCTCTGTTCTATACAACCTGTACAGCCTTGCATTGCCGTAAGCCTTGTTTATCAATTATTTCAAATGAAAGAACAGTCTGACAGTTAAAAGAGAAACATATCAggggtgtctgggtggctcagttggttaagtgtctgtcttgggcttgt i canFam3.chr36 C 0 I 179 a score=235155.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 30539 73 + 478999 TCTGAATCATAGAAAATTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTATGATTCCCTTTTGAAACATTTAAGAGG s panTro4.chr2B 169282361 72 + 247518478 TTTGAATCGTAGAAAACTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATATATGATTCC-TTTTAAAACATTTAAGAGG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18455741 71 + 99152023 TCTGAATCATAGAAAATTTAAACTGTCA-GAGGCCAGTGAGAATG--TGATTCCCTTTTGAAACATTTAAGAGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86760232 72 - 99891981 TTTGAATTGTAGAAAACTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTAAGATTCC-TTTTAAAACATTTAAGAGG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28277050 72 + 106825570 TTTGAATCGTATAAAACTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTATGATTCC-TTTTAAAACTTTTAAGAGA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53833328 72 + 132586672 TTTGAATCGTATAAAACTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTATGATTCC-TTTTAAAACTTTTAAGAGA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26916223 72 + 104110932 tttgaatCGTATAAAACTTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTATGattcc-ttttaaaacttttaagaga i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50457004 72 + 128595539 TTTGAATCATATAAAACCTAAACCGTCA-CAGGCCAGTGAGAATGTATGATTCC-TTTTAAAACTTTTAAGAGG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104667149 73 - 158406734 TTTGAATTAAAGAAAACTTAAACTGTCAGCCGGCCAGTGAGAATGTATGATTCT-TTTTAAAATATTGAAGAGG i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10210568 72 + 30810995 TTTGAATGATAGAGAACAtaaaccatca-caggccaatgagaatgtgtgctttc-ttttaaaacacttaagaga i canFam3.chr36 I 179 I 199 a score=66417.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 30612 39 + 478999 CATAATTTTGACAGTC---TTTGTTTAACAAAGACTTTGCTT s panTro4.chr2B 169282433 26 + 247518478 CATAATTTTGGCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18455812 23 + 99152023 CATAATTTTGACAGTC---TTTGTTT---------------- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86760304 26 - 99891981 CATAATTTTGGCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28277122 26 + 106825570 CATAATTTTGGCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53833400 26 + 132586672 CATAATTTTGGCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26916295 26 + 104110932 CATGATTTTGGCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50457076 26 + 128595539 CATAATTTTGTCAGTC---TTTGTTTAAC------------- i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104667222 29 - 158406734 CATAATTTTGGCAGTTTTATTTGTTTAAC------------- i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10210640 199 + 30810995 I a score=3184427.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 30651 970 + 478999 TGTTTTGACAGTCT------------TTGCTCAGTAACTCTTATATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCAGTTGATAGGCTATGTTTTCTCTTTCAATCTGTATGAATTCAATAAATGTTTTAATGAGAG-TTTTC--TAAGCACCAGATGCTGTATC----------------------AGGTACTAGGGATGACTATGAAATGA-CTCAGCTCCCAACAACTTTATAATAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAATACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGcttgctgtgtgtgtgcatttaggtaaacagtttcatctctctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaggagttgaattcaatgatATATTCTATTATATAACACCATAAAAACACTTTACCATATGGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagatccatccttct----------gctctgccttgttctggggtgaagaagttgatcctcggcagggtgactttttcaggctctagagaatttctgaaaggactgagtcaacgggcagcaggaatatatcaaccatggaaaattagagagcagggtgaggagcggtttttgggggagggagctatcaagacactccctcctgttttcagcctaaggtggcctctccagtggctttatcttctctg-tgactccagcccccattgtatcaaggc-caccagagatcc-agtctcc-cagagtggt-----cctcttggtgccagtaattcc-atgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgctatcgtcaatctcccaggattattttagagccctctgtttaattctcagcctctccactcttcatggacccaccactgctttccattccttctgctgtgaacatttgagatgatttctgctttcttggttaatctatggctaaCCACAGTGTTCACCTCTACTTTA--------------------TTTTATAATTGAGGAAGGA s panTro4.chr2B 169282459 953 + 247518478 --------------------------TTGCTCAGTCACTCTTATATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCGGTTGATAGGCTATGTTT-CTCTTTCAATCTGTATGAATTCAATAAATGTTTTATTTAGAG-TTTTC--TAAGCACCAGATGCTGTATC----------------------AGGTACTAGGGATGACTATGAAATGA-CTCAGCTCCCAAGCACTTTATAATAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAATACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTTAGACCTAAAAGcttgctgtgtgtgtgcatttaggtaaacagtttaatctctctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaagagttgaattaaatgatATATTCTATTATATAACACCATAAAAACACTTTACCATACAGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagatctatccttct----------actctgctttgttctggggggaagcagttgatccttggcaggatgactttctcaggctccagagaatttctgaaaagattgagtcaacgggcagcaggattatatcaaccacgggaaattagagagcagggtgaggagtggtttttgggggagggag--atcaagacactccctcctgttttcagcctaaggtggcctctccaggggctttatcttctctg-tgactccagcccccattgtatcgaggc-caccagagattc-agtctcc-tagagtggt-----cctcttggtgctagtaattgc-atgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgccatcttcaatctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcagcctctccactcttcatggacccacctctgctttccattccttccactgtgaacatttgagatgatttctgctttcttggttaatctatggctaaCCACAGTGTTCACCTCTGATTTA--------------------TTTTATAACTGAGGAAGGA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18455835 966 + 99152023 -----TGACAGTCT------------TTGCTCAGTAACTCTTATATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCTGCTGATAGGCTATGTTTTCTCTTTCAATCTGTATGAattcaataaatgttttattgagag-ttttc--taagcaccagatgctgtatc----------------------aggtactagggatgactatgaaatga-ctcagcttccaagaactttataatAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAATACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTATTCAGACCTAAAAGCTTGCTCTGtgtgtgcatttaggtaaacagtttcatctctctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaggagttgaattcaatgatATATTCTATTATAAAACACCATAAAAACACTTTACCATATGGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagatctatccttct----------gctctgctttgttctggggggaagaagttgatcctcggcagcgtgactttttcaggcttcagagaatttctgaaaggattgagtcaacgggcagcaggaatatatcaaccatggaaaatcagagagcagggtgaggaatggtttttgggggagggagctatcaagacactccctccttttttcagcctaaggtggcctctccagcggctttatcttctctg-taactccagcccccattgtatcgaggc-caccacagatcc-agtctcc-cagagtggt-----cctcttggtgccagtaattgcaatgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgctatcatcaatctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcagcctctccactcttcatggacccacctctgctttccattccttccgctgtgaacatttgagatgatttctgctttcttggttaatctatggctaaCCACAGTGTTCACCTCTAATTTA--------------------TTTTATAATTGAGGAAGGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86760330 953 - 99891981 --------------------------TTGCTCAGTCACTCTTATGTGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCAGTTGATAGGCTATGTTTTCTCTTTCAATCTGTATGAattcaataaatgttttattgagag-ttttc--taagcaccagatgctgtatc----------------------aggtactagggatgactatgaaatga-ctcagctcccaagcactttataatAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAATACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGCTTTCTCTGtgtgtgcatttaggtaaacagtttaatctctctggagcctagctcctctctgtaaaatgaaagagttgaattaaatgatATATTCTATTATATAACACCATGAAAACACTTTACCGTGTGGtgtgctgggcctggacctgtttgcactcagatctatccttct----------actctgcttcattctgggaggaagcagttgatcctcggcagggggactttttcaggctccagagaatttctgaaaggattgagtcaacgggcagcaggattatatcaaccatgggaaattagagagcagggtgacgagtggtttttggtggggggagctatcaagacactccctcctgttttcagcctaaggtggcctctccaggggctttatcttctctg-tgactccagcccccattgtattgaggc-caccagagatcc-agtctcc-tagagtggt-----catcttggtgccagtaattgc-atgttttccttttgtctctccagcccaagagtgat--agacttcctgccatcatc-atctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcaacctctccactcttcatggaaccacctctgctttccattccttccgctgtgaacatttgagatgatttctgctttcttggttaatctatggctaaCCACAGTGTTCACCTCTGATTTA--------------------TTTTATAATTGAGGAAGGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28277148 951 + 106825570 --------------------------TGGCTTAATAACTCTTGTATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCAGTTGATAGGCTATGCTTTCTCTTTCAATCTGTATGAattcaataaatgttttattgaggg-ttttc--taagcaccagatgctgtagc----------------------aggtactagggatgactatgaaatga-ctcagctcccaagcactttataatAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAACACAATCGTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGcttgctctgtgtgtgcatttaggtaaacagtttaatctccctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaatagttgaattaaatgatATATTCTATTATATAACACCATGAAAACACTGTAACATACAGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagacccatccttct----------gttctgctttgttctggggggaagcagttgatccttggcagggtgactttttcaggctccagagaatttctggtaggattgagtcaatggtcagcaggattatatcaaccatgggaaattagagggcagggtgaggagtggtttttaagataggaagacatcaagacactccctcctgttttcaacctaaggtgg-----ccagtggcttcatcttctctg-tgactccagcccccattgtatcaaggc-caccagagagcc-agtctcc-cagagtggt-----cctcttggtaccagtaattgc-atgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgctatcatcaatctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcaacctctccactcttcatggacccacctctgctttccattccttctactgtgaacatttgagatgatttctgctgtcttggttACTCTATGGCTAACTACAGTGTTCACCTCTCATTTA--------------------TTCTATAATTGAGGAAGGA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53833426 956 + 132586672 --------------------------TGGCTTAATAACTCTTGTATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCAGTTGATAGGCTATGCTTTCTCTTTCAATCTGTATGAattcaataaatgttttattgaggg-ttttc--taagcaccagatgctgtagc----------------------aggtactagggatgactatgaaatga-ctcagctcccaagcactttataatAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAACACAATCGTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGcttgctctgtgtgtgcatttaggtaaacagtttaatctccctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaatagttgaattaaatgatATATTCTATTATATAACACCATGAAAACACTGTAACATACAGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagacccatccttct----------gttctgctttgttctggggggaagcagttgatccttggcagagtgactttttcaggctccagagaatttctggtaggattgagtcaatggtcagcaggattatatcaaccatgggaaattagagggcagggtgaggagtggtttttaagataggaagacatcaagacactccctcctgttttcaacctaaggtggcctctccaatggcttcatcttctctg-tgactccagcccccattgtatcaaggc-caccagagagcc-agtctcc-cagagtggt-----cctcttggtaccagtaattgc-atgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgctatcatcaatctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcaacctctccactcttcatggacccacctctgctttccattccttctactgtgaacatttgagatgatttctgctgtcttggttACTCTATGGCTAACTACAGTGTTCACCTCTCATTTA--------------------TTCTATAATTGAGGAAGGA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26916321 956 + 104110932 --------------------------TGGCTTAGTAACTCTTGTATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCAGTTGATAGGCTATGCTTTCTCTTTCAATCTGTatgaattcaataaatgttttattgagGG-TTTTC--TAAGCACCAGATGCTGTAGC----------------------AGGTACTAGGGATGACTATGAAATGA-CTCAGCTCCCAAGCACTTTATAATAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAACACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGCTTGCTCTGTGTGTGCGTTTAGGTAAACAGTTTAATCTCCCTGGACCCTAGctcctctctgtaaaatgaaatagttgaattaaatgatatattctattatataacACCATGAAAACACTGTAACATACAGTGTGCTGGTCCTGGACCTGTTTGCACTTAGACCCATCCTTCT----------GTTCTGCTTTGTTCTGGGGGGAAGCAGTTGATCCTTGGCAGGGTGACTTTTTCAGGCTCCAGAGAATTTCTGGTAGGATTGAGTCAATGGTCAGCAGGATTATATCAACCATGGGAAATTAGAGGGCAGGGTGAGGAGTGGTTTTTAAGAGAGGAAGACATCAAGACACTCCCTCCTGTTTTCAACCTAAGGTGGCCTCTCCAGTGGCTTCATCTTCTCTG-TGACTCCAGCCCCCATTGTATCAAGGC-CACCAGAGAGCC-AGTCTCC-CAGAGTGGT-----CCTCTTGGTACCAGTAATTGc-atgttttccttttgtctctccAGCCCAAGAATGATAAAGACTTCCTGCTATCATCAATCTCCCAGGATTATTTTAGAGCCCGCTGTTTAAATCTCAACCTCTCCACTCTTCATGGACCCACCTCTGCTTTCCATTCCTTCTACTGTGAACATTTGAGATGATTTCTGCTGTCTTGGTTACTCTATGGCTAACTACAGTGTTCACCTCTCATTTA--------------------TTCTATAATTGAGGAAGGA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50457102 957 + 128595539 --------------------------TGGCTTAGTAACTCTTGTATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTACCTTAGATCCGTTGATAGGCTATGTGTTCTCTTTCAATCTGTATGAattcaataaatgttttattgagggtttttc--taagcaccagatgctgtatc----------------------aggtactagggatGACTATGAAATGA-CTCAGCTCCCAAGCACTTTATAACAGGGCTTAAGCAG---------------TGTCATAACTAACACAATCCTAATAAAAGCATGCTGTGTGTTCAGACCTAAAAGcttgctctgtgtgtgcgtttaggtaaacagtttaatctccctggaccctagctcctctctgtaaaatgaaatagttgaattaaatgatATATTCTATTATATAACACCATGAGAACACTGTACCATACAGtgtgctggtcctggacctgtttgcactcagacccatccttct----------gctctgctttgttctggggggaaggagttgatccttggcagggtgattttttcaggttccagagaatttctggtaggattgagtcaacggtcagcaggattatatcaaccatgggaaattagagggcagggtgaggagtggtttttaagagaggaagacatcaagacactccctcctgttttcaacctaaggtggcctctccagtggcttcatcttctctc-tgactccagcccccattgtatcaaggc-caccagagatcc-agtctcc-tagagtggt-----cctcttagtaccagtaattgc-atgttttccttttgtctctccagcccaagaatgataaagacttcctgctatcatcaatctcccaggattattttagagcccactgtttaattctcaacctctccactcttcgtggacccacctctgctttccattccttctactgtgaacatttgagatgatttctgctgtcttggttACTCTATGGCTAACTACAGTGTTCACCTCTCATTTA--------------------TTCTATAATTGAGGAAGGA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104667251 974 - 158406734 --------------------------TTGCTCAGTGACTCTTCTATGACTGGAAATTTTCTAAAGCTGCCTTAGATCAGTTGATATG--ATGTTTTCTCTTTCAATCTGTATCAGttcaataaatgttttattgaggg-ttttc--tatgcaccaggttctgtatcgggtaatagggatGACTATACTAGGTACTAGGGGTGACTATGAAATGA-CTCAGCTCCCATGCACTTCATAATGGGGTTTAAGCAG---------------TGTCATAATTAACAC-ATCCTAATAAAAACATGCTGTGTGttccgacttaaaagcttgctctgtgtgtgcatttaggtaaacagtttaatctctctgtaccctagctcctctctgtaaaatgaaatagttgaattaaatgatATATTCTATTACATAACACCATAAAATCACTTTACCATATGGtgtgctagtcctggacctgtttgctctcagatccatcattct----------gttctgatttgttctcgggagaagcagttgattctcagcagggtgacttttttaggttccagagaacttctggcagaattgagtcaatgggcagcaggatcgtatcaacaatgggagattagagggcagggtgaggactgg-ctttgggggagggagatatcaagacattcccacctg-tttcagcctagggtggcctcttcagtggctttatcttctctgttgagtccagcccccattgtatcgagac-caccacagctcc-aatctcc-tggagtggt-----tctcttggtgccagtaattgc-atgttttccttttgtctcgccagcccaagaatggtgaagacttcctgctattgtcaatctcccaggattatgttagagcccaccgtttaattctcaacgtctccactcttcgtggacccatctgtgctttccattttttctgctgtgaacatttgagatgatttctgctttcttggttaatctatggctaaCCAGAGTGTTTGCCTCTCATTTA--------------------TTCTACAATTGAGGAAGGA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10210839 973 + 30810995 TGTTTTAGCAGTCTCCTTTGTTTCACATGTTTAGTGACCCGTATTTGACTGGAAATTATTTAAAGCTCCTTTAAATCAGTT-ATGGGCCATGTTTTCTCTTTCAGTTCATATCAGTTCAATGTACATTTTCCTGAGTG-TTTTCTTTAGGCATCAAATACTGAATT----------------------GTATACTAGGAATGAATATGAAATGAGCCCAGCTACCATGCGCTTCATAATGTGGCTTAAATTGAACAGAGAATGGTTTTGCAATAAATAGTA-GATCCTAAGGAAAGCACGCTGTGTGCCGGGACCTAAAaacttgctgtgtgtgtgcatttagataaatggtttaatctccctggaccccattttctctgtgtaaaatggaaagtttgaatgaaaagatatttCACATTATCTTACACTATAAAATCATTTTATCAGAGAGtgtgctggtcctggtcctggctgccctcatattcattcttcgctcctccccagctctgctctgtaggatgagggtgcagatgatcccctgcagattgacttttccaggctt----------------------agtc-----tcagcaggattaagtcactttggggagattggagggcacaaggagg------------gagagggggaaatcaagacactttcttctcccctcagcctaggatgg------------------cttctctg-tggctccagcctccactacacccggatgcatggtagtttctagtttccatagggctgtcctggcctcttagttccagtaattgc-atgttttcccattgtccctccagcttcaggatgataaagacttcctgctattgtcagtgt-ccagagttattttacatttccctgtgcaaatcttggcctctccattctccatgga-ccacctgtgctttccattctt----ctgtgaacactggagatgatttctgttttcctagccagactatgacAATCCACAGTGCTTACTTCCTATTTGCCTAAGAGCCATGAAAGGGCTTTAAAAATTGAGGAAGAA i canFam3.chr36 I 199 I 284 a score=978449.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 31621 346 + 478999 AAATATGAGCATAGATACATTAAAGGAGCAGACCCAAACTAGCTCCTTGTATCCAAACAAAATGAAAGAAGGTTGTATCCAAACCTTCTTTTGATGCTGGTATCTATTTTTTGGTACTTAGATACCAGCATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcatggcccaataatgagatgcagatgaactgg-atagaagggagtttatttatataactaggtacagagagaaggctgggaaatattgccagaccaactcaaaattataaagttttccagagcttata--caccttctaagctatatgtctatgtgtaagtatgtaagtgtgcattcatctaaagacat s panTro4.chr2B 169283412 347 + 247518478 AAATATGAGCATAGATATATTAACTGAGCAGACCCAAACTAGCTCCTTGTATCCAGACAAAACGAAAGAAGATTGTATCCAAACCTTCTTTTGATGCTCGTATCTATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGCGTCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcatggcccaataacaagatgcagatgaactgggatagaagagagtttatttctataactaggtacagggagaaggctgggaaatattgccagaccaactcaaaattacaaagctttccagagcttata--caccttctaagctatatgtctatgtgtaagtgtgtaagtgtgcattcatctaaagacat i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18456801 343 + 99152023 AAATATGAGCATAGATACATTAAAGGAGCAGACCCAAACTAGCTCCTTGTATCCAAACAAAATGAAAGAAGGTTGTATCCAAAC---ATTTTGATGCTGGTATCGATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGCATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcatggcccaataatgagatgaagatgaactgg-atagaagagagtttatttctataactaggtacagagagaaggctgggaaatattgccagaccaactcaaaattataaagttttccggagcttata--taccttctaagctgtatgtctacgtgtaagtgtgtaagtgtgcattcatctaaagacat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86761283 347 - 99891981 AAATAGGAGCATAGATACATTAACGGAGCAGACCCAAACTAGCTCCTTGTATCCAAACAAAACAAAAGAAGGTTGTATCCAAACCTTCTTTTGATGCTGGTATCTGTTGTTTGGTGCTTAGATACCAGCATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcatggcccaataacgagatgcagatgaactgggatagaagagagtttatttctataagtaggtacagagagaagactgggaaatattgccagaccaactcaaaattataaagttttccagagcttata--tactttctaagttatatgtctacatgtaagtgtgtaagcgtgcattcatctaaatacat i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28278099 339 + 106825570 AAATATGAGCATAGATACATTAACTGAGCAGACCCAAACTAGTTCGTTATGTCCAAACAAAATGAAAGAAGGTTGTATGCAAACCTTCTTTTGATGCTGGCATCTATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGTATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcacggcccaataatgagatgcagatgaactggaatagaagagagcttatttctataactaggtacagagagaaggctgggaaatgttgccagaccaactcaaaattacaaagttttccagagcttata--taccttctaagctatatgtctacatgtaaat--------gtgcattcatctaaagacat i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53834382 339 + 132586672 AAATATGAGCATAGATACATTAACTGAGCAGACCCAAACTAGTTCGTTATGTCCAAACAAAACGAAAGAAGGTTGTATGCAAACCTTCTTTTGATGCTGGCATCTATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGTATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------tgcttattctcacggcccaataatgagatgcagatgaactgggatagaagagagcttatttctataactaggtacagagagaaggctgggaaatgttgccagaccaactcaaaattacaaagttttccagagcttata--taccttctaagctatatgtctacgtgtaaat--------gtgcattcatctaaagacat i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26917277 339 + 104110932 AAATATGAGCATAGATACATTAACTGAGCAGACCCAAACTAGTTCGTTACGTCCAAACAAAACGAAAGAAGGTTGTATGCAAACCTTCTTTTGATGCTGGCATCTATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGTATCAAAGGAAGGTTTGTTTTA--------------------TGCTTATTCTCACGGCccaataatgagatgcagatgaactgggatAGAAGAGAGTTTATTTCTATAACTAGGTACAGAGAGAAGGCTGGGAAATGttgccagaccaactcaaaattacaaagttttccagagcttata--taccttctaagctatatgtctacatgtaaat--------gtgcattcatctaaagacat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50458059 339 + 128595539 AAATATGAGCATAGATACATTAACTGAGCAGACCCAAACTAGTTCCTTATGTCCAAACAAAACAAAAGAAGGTTGTATCCAAACCTTCTTTTGATGCTGGCATCTATTGTTTGGTGCTTAGATACCAGCATCAAAGGAAGGCTTCTTTTA--------------------tgcttattctcatggcccaataatgagatgcagatgaactgggatagaagagagtttatttctataactaggtacagagagaagactggtaaatgttgccagaccaactcaaaattacaaagtttcctagagcttata--taccttctaagctatatgtctacatgtaaat--------gtgcattcatctaaagatgt i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104668225 349 - 158406734 AAATATGAGCATAGATACATTAACTGAGCAGACCCAGGCTAGCTCCTTGTATCCAAACAAAACAAAAGAAG-----------ACCTTCTTTTGATGCTTGTAGCCCTTGTTTGATGCTTGTATACCAGCATCAAAGGAAGGTTTGTTTTACGTTCCTTTTaggatcgggctgcttattctcacagcccaataactagatgcagatgaactgggacagaaaagagtttatttttataaccagatacagagagaaggctgggaaataatgccagaccaacttaaaattacaaagttttccaaagcttatatgtatcgtctaagctatatgt-tacgtgtaagt--------gtgcatttatctaaagacgt i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10211812 284 + 30810995 I a score=701723.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 31967 311 + 478999 aagtaataaactt----tt--tttttttt-tttcttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgatctcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagtgattctcttgcctcagccttccaagtagctgggattacaggtgtgcaccaccatgccaggctaattttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcccgacctcaggtgatccacctgcctcggccttccaaagtgttgggattataggtgtgagccaccccatccggcc s panTro4.chr2B 169283759 312 + 247518478 aagtaatcaattt----cc--ttttttttctttcttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggcaccatctcagctcactgtaatctctgcctcctgtgttcaagtgattctcttgcctcagccttccaagtagctgggattacaggtatgcaccaccatgccaggctaattttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcccgacctcaggtgatccgcccgcctcagcctcccaaagtgttgggattacaggtgtgagccaccgcgtccggcc i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18457144 316 + 99152023 aagtaatcaacttcttcct--ttttttttttttcttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggcatgatctcggctcactgtaacctctgcctcctgggttcaagtgattctcttgcctcagccttccaagtagctgggattacaggtgtgcaccaccatgccaggctaattttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcccgacctcaggtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgttgggattacaggcatgagccaccgcatccggcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86761630 309 - 99891981 aagtaatcaactt----ct--tttttt---tttcttgagacagagttttgctcttgttgcccaggctggactgcaatggtgcaatctcagctcactgtaacctctgcctcccgggttcaagtgaccctcttgcctcacccttccaagtagctgggattacaggtgtgcaccaccacgccagtctaattttgtatttttagtagagatgaagtttctccatgttggtcaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacccgccttggcctcccaaagtgttaggattacaggtgtgagccaccgcgtccggcc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28278438 295 + 106825570 aagtaatcaactt----tc--tttttttt-ttttttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgatctcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagagatcctcttgcctcagccttccaactagctgggattacaggt--------------caggctaattttgtattttcagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctgatctcaaactctcgacctcaggggatccacctgccttggcctccc--agtgttgggattacaggcatgagccactgcgttcagcc i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53834721 308 + 132586672 aagtaatcaactt----tc---ttttttt-ttttttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgatctcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagagatcctcttgcctcagccttccaactagctgggattacaggtgtgcaccaccatgccaggctaattttgtattttcagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctgatctcaaactctcgacctcaggggatccacctgccttggcctccc--agtgttgggattacaggcatgagccactgcgttcagcc i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26917616 311 + 104110932 aagtaatcaactt----tctttttttttt-ttttttgagacggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgatctcggctcactgcagcctctgcctcccgggttcaagagatcctcttgcctcagccttccaactagctgggattacaggtgtgctccaccacgccaggctaattttgtattttcagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctgatctcaaactctcgacctcaggggatccaactgccttggcctccc--agtgttgggattacaggcatgagccactgcgttcagCC i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50458398 310 + 128595539 aagtaatcaactt----cc---ttttttt-tttttgtagatggagttttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtacgatcttggctcactgcaacctctgcctccagggttcaagagatcctcttgcctcagccttccaactagctgggattacaggtgtgcaccaccatgccaggctaattttgtattttcagtagagacggggtttctccatgttggtcaggctgatctcaaactctcgacctcaggggatccacctgccttggcctcccaaagtgttgggattacaggcatgagccaccgcgttcagcc i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10211812 284 + 30810995 I e calJac3.chr6 104668574 0 - 158406734 C a score=1251608.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 32278 437 + 478999 aagtaatcaacttctaacctataactaaaatctgagtactgaagaccttcctctggagccttagtaaattttcttaatctaaatgggtccaggtgccagggt------------------------gattacccttatcttgtctcctgctaaatcatggag---------gttcctttagtccccagtaaagcttgtttgtggaggtctagggagttcctttagacccccaataaaacttgtttaatcctaaatgggtcctgttaggaattcctttgttatcttgtcatacttcaaggcccagggaagacctaggcaaaactcttggtgg-gttttgttacattccagcctttgtatgaggacattggccccatcag-tttttaatatttatcttaaccactcagtcagtgctgaaacagttgtcatggaggcctgcttattcagctgttagtgagacctggcctgccaca s panTro4.chr2B 169284071 435 + 247518478 aagtaatcaacttctaatctatcactaaaatctgagtactgaagaccttcctctggagcctcagtacattttcttaatctaaatgggtccaggtgccatggt------------------------gattacc--tatcttgtctcctgctaaatcatggag---------gttcctttagtccccaataaagcttacttgtggaggtctagggagttcctttagacccccaataaaacttgtttaatcctaaatgggtcctgttaagaattcctttgttatcttgtcatgcttcaaggcccagggaagacctaggcaaaactcttggtga-gctatgttacattccagcctttgtatgaggacactggccccatcag-tttttaatatttatcttaaccactcagtcagtgctgaaacagttgtcgcagaggcctgcctattcagctgttagtgagacctggcctgccaca i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18457460 437 + 99152023 aagtaatcaacttctaatctataacaaaaatctgagtactgaagaccttcctctggagcctcaataaattttcttaatctaaatgggtccaggtgccagggt------------------------gattacccttatcttgtctcctgctaaatcatggag---------gttcctttagtccccaataaagcttgtttgtggaggtctagggagttcctttagacccccaataaaacttgtttaatcctaaatgggtcctgttaggaattccttcgttatctcgtcatgcttcaaggcccagggaagacctaggcaaaactcttggtgg-gctttgttgcattccagcctttgtatgaggacactggccccatcag-tttttaatatttatcttaaccactcagtcagtgctgaaacagttgtcacggaggcctgcctattcagctgttagtgagacctggcctgccaca i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86761939 437 - 99891981 aagtaatcaacttctaatctataacgaaaatctgaatactgaagaccttcttctggagcctcagtaaattttcttaatctaaattggtccagatgctggggt------------------------gtttatccttatcttgtctcctgctaaatcatggag---------gttcctttagtccccagtaaagcttgtttgtggatgtcaaaggagttcctttagacccccaataaaacttgtttaatcctaaatgggtcccgttaagaattccttcgttatcttgtcatgcttcaaggcccagggaagacctaggcaaaactcttggtgg-gcattgttacattccagcctttgtatgaggacactggccccatcag-tttttaatgtttatctgaaccactcagtcaatgttgaaacggttgtcccagaggcctgcctattcagctgttagtgagacctggcctgacaca i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28278733 444 + 106825570 aagtaatcaacttctaatctataactaagatctgagtactgaagaccttcctctggagcctcagtaaattttcttaatctaaatgggtccaggtgctggggg------------------------tattacc-ttatcttgtctcctgctaaatcatggaggtttggggagttcctttagtccccaataaaacttgtttgtggaggtctatggagttcctttagacccctaataaaacttgtttaatcccaaatgggtcctgttaagaattccttcattatcttgccatgcttcaaggcccaggaaagacctaggcaaaa-tcttggtgg-gctttgttacattccagtctttgtatgaggacactggtcccatcag-tgtttaatatttaacttcaccactcagtcagtgctcaaacagttgtcagggaggcctgcctgttcagctgttagtgagacctggcctgcAATA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53835029 444 + 132586672 aagtaatcaacttctaatctataactaagatctgagtactgaagaccttcctctggagcctcagtaaattttcttaatctaaatgggtccaggtgctggggg------------------------tattacc-ttatcttgtctcctgctaaatcatggaggtttggggagttcctttagtccccaataaaacttgtttgtggaggtctatggagttcctttagacccctaataaaacttgtttaatcccaaatgggtcctgttaagaattccttcattatcttgccatgcttcaaggcccaggaaagacctaggcaaaa-tcttggtgg-gctttgttacattccagtctttgtatgaggacactggtcccatcag-tgtttaatatttaacttcaccactcagtcagtgctcaaacagttgtcagggaggcctgcctgttcagctgttagtgagacctggcctgcAATA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26917927 444 + 104110932 AAGTAATCAACTTCTAATCTATAACTAAGATCTGAGtactgaagaccttcctctggagcctcagtaaattttcttaatctaaatgggtccaggtgccaGGGT------------------------GATtacc-ttatcttgtctcctgctaaatcatggaggtttggggagttcctttagtccccaataaaacttgtttgtggaggtctATGGAGTTCCTTTAGACCCctaataaaacttgtttaatcccaaatgggtcctgttaagaattccttcattatcttgccatgcttcaaggcccaggaaagACCTAGGCAAAA-TCTTGGTGG-GCTTTGTTACATTCCAGTCTTTGTATGAGGACACTGGTCCCATCAG-TGTTTAATATTTAACTTCACCACTCAGTCAGTGCTCAAACAGTTGTCAGGGAGGCCTGCCTGTTCAGctgttagtgagacctggcctgcaaTA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50458708 444 + 128595539 aagtaatcaacttctaatctataactaagatctgagtactgaagactttcctctagagcctcagtaaattttcttaatctaaatgggtccaggtgccagggt------------------------gattacc-ttatcttgtctcctgctaaatcatggaggtttggggagttcctttagtccccagtaaaacttgtttgtggaggtctacggagttcctttagacccccaataaaacttgtttaatcccaaatgggtcctgttaagaattccttcattatcttgccctgcttcaaggcccaggaaagacctaggcaaaa-tcttggtgg-gctttgttacattccagtctttgtatgaggacactggtcccgtcag-tgtttaatatttaacttcaccactcagtcagtgctcaaacagttgtcagggaggcctgcctgttcagctgttagtgagacctggcctgccata i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104668574 460 - 158406734 aagtaatcaacttctaatctataactgagatct-agtcctaaagaccttcctctggagtgtcaacaaatatacttaatctaaatgggtcccggtgtgggggcgggtgtgggtggggggagggaagggattacccttatcttgtctcctgctaaattatggaggt-------tttccttttgttcccagtaaagtttgtttgtggtggtctagggagttccttcagaccccccaaaaaacttgtttaatcccaacttggtcctgttaagaattccttcattatcttgtcatgcttcaaggcccaggaaagacctaggcaaatctcttggtggaattttgtcacattccagcctttgcatcccaacagtggctctatcagttttttaatatttaacttaaccactcag----tgctgaaacagttatcacggaggcctgcctattcagctgctagtgacacctggcctgccaca i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10211812 284 + 30810995 I a score=945784.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 32715 321 + 478999 CTTTCAGTCAACTATTGAAGGACACACAAGATTCTCTTttattattattattattattattattattattattattattattaAAGCTGCCATGTTGAATCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAACCTTTAGTGAACTACATCACTCTGTGTGCTTCCTGGTTCTTAGGACAGATGACTTTATTACAGCCTCTGAATCTATCAAATGTGTCCA-TTTTTCACCAGGAATGTTAATTAAAAATAAAATTATAGTGATAAATGTATTAGCAACCTAAAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAACC- s panTro4.chr2B 169284506 296 + 247518478 CTTTCAATCAACTATTGAAGGACACAAAAGATCCTCTTttattattattattattatta------------------------AAGCTGCCATGTTGAATCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATTGAGGTGGGGGAAACCTTTAGTGAACTACATCACTCTGTGTACTTCTTAGTTCTTAGGACAGATGACTTTATTACAGCCTCTGAATCTATCAAATGTATCAA-TTTTTCACCAGGAATATCAATTAAAAATCAAATTATAGTGATAAATGTATTAGCAACCTAAAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAC-- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18457897 300 + 99152023 CTTTCAGTCAACTATTGAAGGACACACAAGATTCTCTTttattattattattattatta---------------------ttaAAGCTGCCATGTTGAATCTCTTG----AAAGTTAAGGCCAATGTAAATCGAGGTGGGGGAAACCTTTAGTGAACTACATCACTCTGTGTACTTCTTGGTTCTTAGGACAGATGATTTTATTACAGCCTCTGAATCTATCAGATGTGTCCATTTTTTCACCAGGaatattaattaaaaataaaattatagtgataaatatattaGCAACCTAAAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAC-- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86762376 287 - 99891981 CTTTCAATCAACTATTGAAGGACACATAAGATCCTCTTATGTTATTATTA---------------------------------CAGCTGCCATGTTGAATCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAACCTTTAGTGAACTACATCACTCCGTGTACTTCTTAGTTCTTAGGACAGATGACTTTATTACAGTCTCTGAATCCATCAAATGTATCAA-TTTTTCACCAGGAATATTAATTAAAAATCAAATTATAGTGATAAATGTATTAGCAACCTAAAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAC-- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28279177 301 + 106825570 CATTCAGTCAACTATTGAAGAACACACAAGATCCTCTTttattactattattattatta------------------ttattaAAGCTGCCATGTTGATTCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAATCTTTAGTAAACTACATCACTGTGTGTACTTCTTGGTTCTTAGGATAGATGACTTTATTACAGTCT-TGAATCTATCAAATGTGTCAT-TTTTTCTCCAGGaatattaattaaaaataaaattaCAGTGATAAATGTATTAGCAACCTATAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAC-- i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53835473 301 + 132586672 CATTCAGTCAACTATTGAAGAACACACAAGATCCTCTTttattactattattattatta------------------ttattaAAGCTGCCATGTTGATTCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAATCTTTAGTAAACTACATCACTGTGTGTACTTCTTGGTTCTTAGGATAGATGACTTTATTACAGTCT-TGAATCTATCAAATGTGTCAT-TTTTTCTCCAGGAATATTAATTAAAAATAAAATTACAGTGATAAATGTATTAGCAACCTATAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAC-- i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26918371 301 + 104110932 CATTCAGTCAACTATTGAAGAACACACAAGATCctcttttattactattattattatta------------------ttattaaagctGCCATGTTGATTCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAATCTTTAGTAAACTACATCACTGTGTGTACTTCTTGGTTCTTAGGATAGATGACTTTATTACAGTCT-TGAATCTATCAAATGTGTCAT-TTTTTCTCCaggaatattaattaaaaataaaattacagtgaTAAATGTATTAGCAACCTATAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGt-aaaaaac-- i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50459152 295 + 128595539 CTTTCAGTCAACTATTGAAGGACACACAAGATCCTCTTttattac------tattatta------------------ttattaAAGCTGCCATGTTGATTCTCTTG----AAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTGGGGGAAATCTTTAGTAAACTACATCACTGTGTGTACTTCTTGGTTCTTAGGATAGATGACTTTATTACAGTCT-TGAATCTATCAAATGTGTCAT-TTTTTCTCCAGGAATATTAATTAAAAATAAAATTACAGTGATAAATGTATTAGCAACCTAAAG-TTTGGTAAGAGAAAGATATGT-AAAAAAG-- i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104669034 302 - 158406734 CTTCCAGTCAATGATTGAAGGACACACAAGATCCTCTTTTCttattatttttattttt-------------------taattaaaGCTGCCATGTTGAATTTCTTGAAACAAAGTTAAGGCCCATGTAAATCGAGGTACGGGAAAGCTTTAACGA---ACATCATGCTGTGTACTTCTTGCTTCTTAGGACAGATGGCTTTATTACAGCCTCTACATCTATCAAATGTGCCAA--TTTTCACCAGGaatattaattaaaaataaaattataGTGATACATGTATTAGCAACCTAAAG-TTTGGCAAGAGAAAGATATGTAAAAAAAC-- i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10212096 271 + 30810995 CTTCAGGTCAAATATTCAGGGACTTACAGGATCTCCTTTT-------------------------------------TTATTGAAGCTACCGTGTTGAATCTTCTG----AAAGCTAGGGTCCCTGGAAATCAAGGTGGGAGAAATCTTTGATGAA--------------GAACTGCATGGTTCTTAGGACAAATGGCTTCATTATAGCCTCTACATCTATCAAATGCATTGC-TTTTCCACCAAGAGtattaattaaaaataaaattatGGTGAAAAATATATTAGCAACTTAAAGCTTTGGTAAGAGAAGAAGATGT-ACAGAAC-T i canFam3.chr36 I 284 I 126 a score=3423746.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 33036 1022 + 478999 TCTTTTTTAAAGACGAGGCTTAGGCATCCTGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTTATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAACTTACGGTGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATA----CTCTTTTATTTAATTTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAAAATCCACCC-ATTCCCACTACCCCT--TACTTTGGGTATGGGTGCGAGAGAGGA-GAAGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTGATAGTACCATTGCTGATACAGGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAGAgtattact-------ttcctgtggtaggtggcttaaaacagacatttagtggat-aaaacaacacacatttatttactcacagttccagaggcc-agagtctgaaatcaacatcactggcttaaaatcaaggtgacagcagggctgtctcccctctggaggttccgggggagaatctgttcctgacctcttccgggtgtctggtggctgccagcattccttgccttgtgaccacatcgcttcaatctctgcttctatggtcacactgattt-tttcctgttctttgatgaagtttccttctcaatccctcttataaagagacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggaaaatctccctgtctcaagattcttagtca-------catctgcatagtcccttttgctatgtaaagtaacattcacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACACAG-----AAAAGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGTT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTTTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTAAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGAGCTATACAATTAGTGTAGAAAGAATACGCCCTTTTGGGGTGGATGAGTCAAAATA---CTCACACTTTATT s panTro4.chr2B 169284802 1024 + 247518478 TCTTTTTTAAAGACTTGCCTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-TTAAAGTGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATA----CTGTTTTATTTAATGTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAACATCCACCC-ATTCCCACTACCCTT--TACTTTGGGTATGGGTATGAGAGGGGAAGAAGTTCATAGTGATTGGGTGACAAGGAAAAGTGATAGTACCATTGCTGATACAGGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACCAGCTGGA---GATTAGAgtattagt-------ttcctgtagtaggtggcttaaaacacacatttagtggattaaaacaacacacatttatttactcacagttctggaggcc-agagtctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtgacagtagggctgtcttccctctggagattccgggggagaatctgttcctcacctcttccgg-tgtctggtggctgccagcattccttgccttgtgaccacatcacttcaatctctgcttccatggtcacactgatttatttcctgctctgtggtgaagtttccttctcaatctctcttataaggacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatctccctatctcaagattcttagtca-------catctgcatagtcccttttgctatgtaaagtaacattcacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACACAG-----AGAGGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGTT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTAAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATTTGCCCTTTTGGGGTGGATGAGTCAAAATG---CTCACACTTTATT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18458197 1023 + 99152023 TCTTTTTTAAAGACTGGGCTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTTATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAACTTATGATGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATA----CTCTTTTATTTAATTTATTCATTAAAAAAAGAAGTGGGATGAAAATCCACCC-ATTCCTGCTACCCCT--TACTTTGGATATGGGTGTGAGAGGGGAAGACGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATAGTACCATTGCTGACACAGGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAGAgtattagt-------ttcctgtggcaggtggcttaaaacacacatttagtggattaaaacaacacacatttatttactcacagttccagaggcc-agagtctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtgacagcagggctgtctcccctctggaggttccggggcagaatctgttcctgatctcttctgg-tgtctagtggctgccagcgttccttgccttgtgaccacatcgcttcaatttctgcttctatggtcacattgattt-tttcctgttctttggtgaagtttccttctcaatccctcttataaagacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggaaaatctccctatctcaagattcttagtca-------tatctgcatagtcccttttgctatgtaaagtaacattcacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACACAG-----AGAGGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGTT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTTTTCAAGGTTAAGATCTTTCGAGGACTAAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATACCCTTTTGGGGTGGATGAGTCAAAATG---CTCACACTTTATT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86762663 1022 - 99891981 TCTTTTTTAAAGAGTTGCCTTAGGCGTCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-CTAAAGTGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATA----CTCTTTTATTTAATGTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAACATCCACCC-ATTCCCACTACCCCT--TACTTTGCATATGGGTGTGAGAGGGGAAGAAGTTCATAGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTGATAGTACCATTGCTGATACAGGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACCAGCTGGA---GGTTAGAAtattagt-------ttcctgtagtacgtggcttaaaacacacatttagtggattaaaacaacacacatttatttgctcacagttctggaggcc-agagtctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtgacagcagggctgtctcccctctggaggttccgagggagaatctgttcctcacctcttccag-tgtctggtggctgccagcattccgtgccttgtgatcacatcacttcaatctctgcttccgtggtcacattgattt-tttcctgttctgtggtgaagtttccttctcaatccctcttataaggacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatatccctatctcaagattcttagtca-------catctgcatagtccattttgctatgtaaagtaacattcacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACACGG-----AGAGGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGTT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATGCCCTTTGGGGGTGGATGAGTCAAAATG---CTCACATTTTATT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28279478 1034 + 106825570 TCTTTTTTAAAGACTTGACTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCACTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-CTAAAGTGGTTTTACTTTAAAATGATACGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATAGATGCTCTTTTATTTAACTTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAAAATCCACCCTATTGCCACCACCCCT--TACTTTGGGTATGGGTGTGAGAGGGGAAGAAGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATGGTACCATTGCTGATACAAGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAGAgtattagt-------ttcctgtggtaggcggcttaaaacacacatttaatggattaaaacaacacacatttatttactcacagttttggaggcc-agaatctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtggcagcagggctatctcccctctggcagttccagtggggaatctggtcctcacctcttcggg-tgtctggtggctgccagcattccttgccttgtgaccacatcgcttcaatctctgcttccatggtcacattgattt-tttcctgttctgtggtgaagttaccttctcaatccctctcataaggacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatctccctagctcaagactcttagtcacatctgccatctgcatagtcccttttcctacataaagtaacattgacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACATAG-----AGAGGCTGGTGTGAGTTTTATTTATATGCT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATGCCCTTTTGAGGTGGATGAGACAAAATG---CTCACACTTTATT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53835774 1034 + 132586672 TCTTTTTTAAAGACTTGACTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCACTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-CTAAAGTGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATAGATGCTCTTTTATTTAACTTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAAAATCCACCCTATTGCCACCACCCCT--TACTTTGGGTATGGGTGTGAGAGGGGAAGAAGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATGGTACCATTGCTGATACAAGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAGAgtattagt-------ttcctgtggtaggcggcttaaaacacacatttaatggattaaaacaacacacatttatttactcacagttttggaggcc-agaatctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtggcagcagggctatctcccctctggcagttccagtggggaatctggtcctcacctctttggg-tgtctggtggctgccagcattccttgccttgtgaccacatcgcttcaatctctgcttccatggtcacattgattt-tttcctgttctgtggtgaagttaccttctcaatccctctcataaggacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatctccctagctcaagactcttagtcacatctgccatctgcatagtcccttttcctacataaagtaacattgacaggttccagggcttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACATAG-----AGAGGCTGGTGTGAGTTTTATTTATATGCT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATGCCCTTTTGAGGTGGATGAGACAAAATG---CTCACACTTTATT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26918672 1034 + 104110932 tcttttttaaaGACTTGACTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-CTAAAGtggttttactttaaaatgatagGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATAGATGctcttttatttaacttattcattaaaaaaagaggTGGGATGAAAATCCACCATATTGCCACCACCCCT--TACTTTGGGTATGGGTGTGAGAGGGGAAGAAGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATGGTACCATTGCTGATACAAGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAcagtattagt-------ttcctgtggtaggcagcttaaaacacacatttaatggattaaaacaacacacatttatttactcacagttttggaggcc-agaatCTGAAATCAACAtcactggactaaaatcaaggtggCAGCAGGACTATCTCCCCTCTGGCAGTTCCAGTGGGGAATCTGGTCCTCATCTCTTTGGG-CGtctggtggctgccagcattccttgCCTTGTGACCACATCGCTTCAATCTCTGCTTCCATGGTCACATTGATTT-TTTCCTGTTCTGTGGTGAAGTTACCTTCTCAAtccttctcataaggacacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatctccctagcTCAAGACTCTTAGTCACATCTGCCATCTGCATAGTCCCTTTTCCTACATAAAGTAACATTGACAGGTTCCAGGGCTTAGAATGGGGACATCTTTGGAGGCCTTTATTCAGCCTACTACAGTCAGATAAAGCACATAG-----AGAGGCTGGTGTGGGTTTTATTTATATGCT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATGCCCTTTTGAGGTGGATGAGACAAAATG---CTCACACTTTATT i papAnu2.chr12 C 0 I 6166 s chlSab2.chr10 50459447 1034 + 128595539 TCTTTTTTAAAGACTTGACTTAGGCATCATGCTTCTTCTCCAACTC-TTTTATCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCATTTCTAGCAATTTCACCA-GAGAGGTCAACAAT-CAAA-CTAAAGTGGTTTTACTTTAAAATGATAGGTAGGCAAA-----CTTGTGGAGATAGATGTTATTTTATTTAACTTATTCATTAAAAAAAGAGGTGGGATGAAAATCCACCCTATTGCCACCACCCCT--TACTTTGGGTATGGGTGTGAGAGGGGAAGAAGTTCATGGTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATGGTACCATTGCTGATACAAGGAGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGCTGGA---GGTTAGAgtattagt-------ttcctgtggtaggcggcttaaaacacacatttaatggattaaaacaacacacatttatttactcacagttttggaggcc-agaatctgaaatcaacatcactggactaaaatcaaggtggcagcagggctgtctcccctctggcggttccaggggggaatttggtcctcacctcttcggg-cgtctggtggctgccagcattccttgccttgtgaccacatcacttcaatctctgcttccatggtcacattgattt-tttcctgttctgtggtgaagtttccttctccatccctctcataaggatacttgaaattgcatttagggcccacctggataatccccaggataatctccctagctcaagattcttagtcacatctgccatctgcatagtcccttttcctatataaagtaacattgacaggttccaggacttagaatggggacatctttggaggcctttattcagcctactacaGTCAGATAAAGCACATAG-----AGAGGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGCT--------GTCTCTGAG--------------------------TGTCTTCAAGGTTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATATTGGTTAATTCCTAACATCCTGGGCTATACAATGAGTGTGGAAAGAATATGCCCTTTTGAGGTGGATGAGACAAAATG---CTTACACTTTATT i chlSab2.chr10 C 0 I 2092 s calJac3.chr6 104669336 1014 - 158406734 TCGTTTTTAAAGACTTGGCTTAGGGATCATGCTTCCCCTCCATCTC-TTTTTTCTCCATTTCCTTTAGGTTGGTAAGATACTTTCTTCATTTCTAGCAGTTTCCCCA-GAGAGGTCAACCAT-CAAG-CTACGGTGGCTTTACTTTAAAATGATGCGTAGGCAAA-----CCTGTGTTCATA----CTCTTTTATTTAATTTATTCATTAAAAAAAGACGTGGGATGAAAATCCATGCTATTCACACCACCGGT--TACATTAGGTATGGTTGTAAAAGGGGA-GAAGTTCATGCTGATTGGGTGACAAGGAAA-GTAATGGTACTGTTGCTGACACAATGGGAGTCCCAGAGAGAGAAACTAGGTGGA---GGTCAGAgtattagt-------tttctgtgataggtggcttaaaacacacatttagtggattgaagcaacacacatttatctacttacagttttggaggcc-agagtctgaaatcaacatcactggatt--gatcaaggtgtaagcagggctatct-ccctctggagggtcccggggagaatctcttcctcacctcttccag--------tggctgccagcgttccttgtcttgtgaccacttcatttcaacctctgcttctatggat-ccttgatt--cctcctgttctgtggtgaagtctccttctcaatgcttcttataaggacacttgaaattgcatttaaggtccacctaaataatccccaggataatctccctatctcaagattctcagtca-------catctgcatagtctcttttgctatgtaaagtaacattcataggttccagggcttagaaccaggacgtctttggaggcctttatttagcctactacaGTCAGATAAAGCACATAGTCAGATAAAGCTGGTGTGGGTTTTATTTGTATGTT--------GTTTCTGAA--------------------------TATCTTCAAGATTAAGATCTTTCAAGGACTGAAGAATGTTGGGTAATTCCTAACATCCTG-GCTACATGATGGAAGTGGAAAGAATATGCCCTTTTGGGGTGGATGACTCAAAATG---CTCACACTTTATT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10212493 1060 + 30810995 TTTTTTTTAAAGACTTGCCTTAGGCATTGTGGCCTTCTGACACCTCTTTTTATCTCCATTGCCTGTAGGTTGCTGAGATACTTTCTTCCTTTCTAGTGGTTTCATCAGGAGAGGACAAGAATACAAA-CTCAGGTAATTTTACTTTAAAATGGTATGTGGTTATACTTCTCTTCTGGAGATA----TTCTT-------ATTTATTTCCCTAAAAAGGAGGT-GGATAAAAATGGACTCTGCTTCCTTCCTTTCTGCCATTTTGGGTATAGTTGTAAGAAGGGGAGAAATTCATGGTGATTGGCTGACAAGGAAA-ATAATGGTACCATTGCTGATACATTGAGAGTCCCAGAGAGAGGAACTATGTGGGCTTACTTAGAATGTCAGTGTCCTAGTTCCCACGGTAGGTGG-TTAAAacacac--ttgatggctt-aaacaacaggaatttattcactcacaattctggaggccaaaagtctgaaatcattatcactggactgaaatcaaggtgtcagcagtgccatgcttctcctggaggctctaggatagaacttattccttggcttttctgg-cttctgagggccg-tgtcattctttggcttgtggccacgccacttcagtctctgcctccatgggcacattgctt--tctgctcttttgtggtgaaatttccttctgccttcctcttataagagcacttgtgattgcatttctggcctaccagaacaat--ccaggataatctcctcaagtcaagatccttgatct-------taactgcatagtcccttttgccatatagggtaatacttacaggtt-caggaattaggattggaatatatttggaag-ctttactcaacctagtacaATGAGGTAAAGTGTGTAG-----AGAGGCTGATGTGGGTTTTATTTGTATGTTTCTAACGCTTTTATGAGACAATGACTAAATGAGGGCTAACTCCTATCTTTAGGGCCAATAATTTTTAAGGATTAGAGAATATTGATTACTTCTTAACA-CCAGGATTACACACT-AATATGGAAAGAATATACCCTTT-GGGGTAGTTGAATAACACTGCCACTTTGACTTTATC i canFam3.chr36 I 126 C 0 a score=8190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 34058 2 + 478999 AA s panTro4.chr2B 169285826 2 + 247518478 AA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18459220 2 + 99152023 AA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86763685 2 - 99891981 AA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28280512 2 + 106825570 AA i rheMac3.chr12 C 0 I 4870 s macFas5.chr12 53836808 2 + 132586672 AA i macFas5.chr12 C 0 I 6257 s papAnu2.chr12 26925872 2 + 104110932 aa i papAnu2.chr12 I 6166 C 0 s chlSab2.chr10 50462573 2 + 128595539 AA i chlSab2.chr10 I 2092 C 0 s calJac3.chr6 104670350 2 - 158406734 AA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10213553 2 + 30810995 AA i canFam3.chr36 C 0 C 0 a score=439014.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 34060 138 + 478999 AACCATTATAGTGAATTTTACTGTTTGTTCTGTGGATGTTACAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGTGTAAAGCTTAGTCATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------CGGAAATTCTGTTTTATCTCCTAGATGTAT--------------------------------------- s panTro4.chr2B 169285828 136 + 247518478 AACCATTATAGTGAATTTTACTGTTTGTTCCGTGGATGTTCCAGAAAAAGGCATATTCTCTGCATAGTGTAAAGCTTATTCATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATT--GTTTTATCTCCTCGATGTAT--------------------------------------- i panTro4.chr2B C 0 I 2 s ponAbe2.chr15 18459222 137 + 99152023 AACCATTTTAGTGAATTTTACTGTTTGTTCT-TGGATGTTCCAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGTGTAAAGCTTAGTCATACCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATTCTGTTTTATCTCCTAGATGTAT--------------------------------------- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86763687 138 - 99891981 AACCATTATAGTGAATTTTATTGTTTGTTCTGTGGATGTTCCAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGCGTAAAGCTTAGTCATGCCTATTAAAGATATTTTGTTGTTC--------------------TTGAAATTCTGTTTTATCTCCTCGATATAT--------------------------------------- i nomLeu3.chr17 C 0 I 2 s rheMac3.chr12 28285384 138 + 106825570 AACCATTATAGTGAATTTTACTGTTTGTTCTGTGAATGTTACAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGCGTAAAGTTTAGCTATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATTCTGTTATATCTCCTCGATGTAT--------------------------------------- i rheMac3.chr12 I 4870 I 2 s macFas5.chr12 53843067 138 + 132586672 AACCATTATAGTGAATTTTACTGTTTGTTCTGTGAATGTTACAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGCGTAAAGCTTAGCTATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATTCTGTTATATCTCCTCGATGTAT--------------------------------------- i macFas5.chr12 I 6257 I 2 s papAnu2.chr12 26925874 138 + 104110932 aaccattaTAGTGAATTTTACTGTTTGTTCTGTGAATGTTACAGAAAAAGGCATATTCTCTGTATAGTATAAAGCTTAGCTATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATTCTGTTATATCTCCTCGATGTAT--------------------------------------- i papAnu2.chr12 C 0 I 2 s chlSab2.chr10 50462575 138 + 128595539 AACCATTATAGTGAATTTTACTGTTTGTTCTGTGAATGTTACAGAAAAAGGTATATTCTTTGTATAGTGTAAAGCTTAGTTATGCCTATTAAAGATATTTTGTCATTC--------------------TTGAAATTCTGTTATAGCTCCTCGATGTAT--------------------------------------- i chlSab2.chr10 C 0 I 2 s calJac3.chr6 104670352 138 - 158406734 AACCATTTTAGTGAATTTTATTGTTTGTATTGTGGATTTTACAGAAAAAGGTGTATTGTCTGTATAGCATAAAACTTAGACATGCCTATTAAAGATATTTTGCCATTC--------------------TTGAAATTCTGttttatctccttgatgtat--------------------------------------- i calJac3.chr6 C 0 I 2 s canFam3.chr36 10213555 197 + 30810995 AACTGATAGAGTCAATTTTAATATTTGTTTTACGGATGTTGTAGAAAAGTGTGTATTCTCTATACAATGTACAGTTTAATCATGCTTATGAATGATATTTTATAGTTCTTACAATTTTTATAATTCTTTTGAAATTCTGTTTCATCGCATTCATATACTGGTTAAAGAGTTATATTCGAATTTTTTTAAAGATTTAT i canFam3.chr36 C 0 I 167 a score=906135.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 34198 311 + 478999 GTTAC--------------AGTTATGTTAAAGTTTTATGTAAAGtttcctttccttcctaacagtttttattttatgtatttcctcagtg------------------------------tatggattgtttgtgatgcttatgtttgcactgtgcattgtaacttttacaggtgtataataatcattttatcc-atttcata--ttttttgccatgatacatgatgctgtgtctgattctaatatttctacctgtctattcctctaaattttcta------tgttccttttgaccagggaaac-ttt-tgaatccctttattttcaacatttctttgtcaattcgtt--tatacatgtgcttc-ttat s panTro4.chr2B 169285966 311 + 247518478 GTTAC--------------AGTTATGTTAAAGTTTTATGTAAAGTTTCCtttccttcctaacagtttttattttatgtatttcctcagtg------------------------------tatggattgtttgtgatgcttatgtttgcactgtgcattgtaacttttacaggtgtataataataattttatcc-atttcata--ttttttgccatgatacatgatgctgtgtctgattctaatatttctacctctctattcctctaacttttcta------tattccttttgactagggaaga-ttt-tgaacccctttattttcaacAtttctttgtcaatttgtt--tatatatgtgtttc-ttat i panTro4.chr2B I 2 C 0 s ponAbe2.chr15 18459359 311 + 99152023 GTTAC--------------AGTTATGTTAAAGTTTTATGTAAAGTTTCCtttccttcctaacagtttttattttatgtatttcctcagtg------------------------------tatggattgtttgtgatgcttatgtttgcactgcgcattgtaacttttacaggtgtataataatcattttatcc-atttcata--ttttttgccatgatacatgatgctgtgtctgattctaatatttctacctgtctattcctctaacttttcta------tgttccttttgaccagcgaaac-ttt-taaacccctttattttcaacatttcttagtcaatttgtt--tatacatgtgcttc-ttat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86763827 307 - 99891981 GTTCC--------------AGTTATGTTAAAGTTTTATGTAAAGTTTCCTTTCCTTCCT----GTTTTTATTTTATGTATttcttcagta------------------------------tatggattgtttgtgatgcttgtgtttgcactgtccattataacttttacaggtgtataataatcattttatcc-attgcata--ttttttgccatgatacatgatgctgtgtctgattctaatatttctacctctctattcctgtaacttttcta------tattccttttgaccagggaaac-ttt-tgaacccctttattttcaacatttctttgtcaatttgtt--tatgtatgtgcttc-ttat i nomLeu3.chr17 I 2 C 0 s rheMac3.chr12 28285524 296 + 106825570 GTTAC--------------AGTTATGTTTAAGTTTTATGTAAAGTTTCCTTTCCTTGCTAACAGTTTTTATTTTATGTATTTCCTCAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------------------------NNNNNNNNNNCTTTTACAGGTATATAATAAtca--ttatcc-gtttcata--ttttttgccatgatacatgatgctatgtctgattctaatatttctacccctctattcctctaa-------------------cttttgactagggaaac-ttt-tgaacccctttattttcaacgtttctttgtgaacttgtttatatatatgtgcttctttat i rheMac3.chr12 I 2 C 0 s macFas5.chr12 53843207 296 + 132586672 GTTAC--------------AGTTATGTTTAAGTTTTATGTAAAGTTTCCTTTCCTTGCTAACAGTTTTTATTTTATGTATTTCCTCAgtg------------------------------tatggattatttgtgatgcttatgtttgcattgtgcattgtaacttttacaggtatataataatca--ttatcc-gtttcata--ttttttgccatgatacatgatgctatgtctgattctaatatttctacccctctattcctctaa-------------------cttttgactagggaaac-ttt-tgaacccctttattttcaacgtttctttgtgaacttgtt--tatatatgtgcttc-ttat i macFas5.chr12 I 2 C 0 s papAnu2.chr12 26926014 296 + 104110932 GTTAC--------------AGTTATGTTTAAGTTTTATGTAAAGTTTCCTTTCCTTgctaacagtttttattttatgtatttcctcAGTG------------------------------TATGGATTATTTGTGATGCTTATGTTTGCATTGTGCATTGTAACTTTTACAGGTATATAATAATCA--TTATCC-GTTTCATA--TTTTTTGCCATGATACATGATGCTATGTCTGATTCTAATATTTCTACCCCTCTATTCCTCTAA-------------------CTTTTGACTAGGGAAAC-TTT-TGAACCcctttattttcaacatttctttgTGAACTTGTT--TATATATGTGCTTC-TTAT i papAnu2.chr12 I 2 C 0 s chlSab2.chr10 50462715 296 + 128595539 GTTAC--------------AGTTTTGTTTAAGTTTTATGTAAAGTTTCCTTTCCTTGCTAACAGTTTTTATTTTATGTATTTCCTCAgtg------------------------------tatggattatttgtgatgcttatgtttgcattgtgcattgtaacttttacaggtatataataatca--ttatcc-atttcata--ttttttgccatgatacatgatgctatgtctgattctaatatttctacccctctattcctctaa-------------------cttttgaccagggaaac-ttt-tgaacccctttattttcaacatttctttgtgaacttgtt--tatatatgtgattc-ttat i chlSab2.chr10 I 2 C 0 s calJac3.chr6 104670492 314 - 158406734 gttac--------------agttatgttaaagttttacgtaaagtttcctttccttcctaacagtttttattttatgtatttcctcagta------------------------------tgtggattgtttgtgatgcttatgtttccattgcacattgtaacttttacaggtatgtaatagtcatttcatcc-atttcacattttttttaccaggatacatgatgctgtgtctgattctagtatttccacctctttgttcctctgacttttgta------tattcctttggaccagaggaactttt-tgaacccctttattttcaacattcttttgtcaatttgtt--tatagatgtgcttc-ttat i calJac3.chr6 I 2 C 0 s canFam3.chr36 10213919 326 + 30810995 gtcacccaggtgccccAAGAGTTATGTTAAATTTTAAGTGAATTTTTCCTTTTTTTCCCAATAGTTTATATTTTATATATTTCTCCTCTA------------------------------TATGGATTTTCATAATTGTTAACATTTGCATTCTGCATTGTAACTTTTATAGATGTATACTAATCATTTTATCCTGTCATATA--TTTTTTGCCAC-ATACATGATTC----TTTGGTTCTA--ATTTCTACCTTTCTCCTCCTCTGATTTTTTTAAAAATGGATACATTTTGACTGGAGAAAT-TTTCTGAACCCCTTTACTTCCAACTTTTATTTCTTGATTTGTT--TATGTGTATGCTTC-TTTT i canFam3.chr36 I 167 I 629 a score=626975.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 34509 188 + 478999 aattagtaaatttagatttttaccttttgatataagctgattttatttgcctttttttgttatcttttaagccatttatattcactatgccaagtcaggtatagtcttattttgcca--ttttattttattctttgtggtttatacttactgttttctTCTTCCCTATACATTATATGTCATTGTAGCTC s panTro4.chr2B 169286277 188 + 247518478 aattagtaaatttagatttttaccttttgatataatctgattgtatttgccttttattgttaccttttaagccatttatattcactatgctaagtcaggtatggtcttattttgcca--ttttattttattctttgtggtttatacttactgttttcttcttcCGTATACATTATATGTCATTGTAGCTC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18459670 188 + 99152023 aattagtaaatttagatttttaccttttgatataatctagttgtatttgccttttattgttatcttttaagccatttatattcactatgctaagtcaggtatggtcttattttgcca--ttttattttattctttgtggtttatacttactgttttcttcttccctatatattatgtgtcattgtagctc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86764134 188 - 99891981 aattagtaaatttagatttttaccttttgatataatctgattgtatttgccatttattgttaccttttaaaccatttatattcactatgctaagtcaggtatagtcttattttgcca--ttttattttattctttgtagtttatacttactgttttcttcttccctATACATTATATGTCATTGTAGCTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28285820 187 + 106825570 aattagtaaatttagatttttaccttttgatataatctgattgtatttgccttttattgttaccttttaagtcatttatattcactatgctaagtcaggtatggtc-tattttgcca--ttttattttactctttgtggtttatacttactgttttctTCTTCCCTATACATTATATGTCATTATAGCTC i rheMac3.chr12 C 0 M 509 s macFas5.chr12 53843503 187 + 132586672 aATTAGTAAATTTAGATTTTTACCTTTTGATATAATCTGATTGTATTTGCCTTTTATTGTTACCTTTTAAGTCATTTATATTCACTATGCTAAGTCAGGTATGGTC-TATTTTGCCA--TTTTATTTTACTCTTTGTGGTTTATACTTACTGTTTTCTTCTTCCCTATACATTATATGTCATTATAGCTC i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26926310 187 + 104110932 AATTAGTAAATTTAGATTTTTACCTTTTGATATAATCTGATTGTATTTGCCTTTTATTGTTACCTTTTAAGTCATTTATATTCACTATGCTAAGTCAGGTATGGtc-tattttgcca--ttttattttactctttgtgGTTTATACttactgttttcttcttccctgtACATTATATGTCATTATAgctc i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50463011 187 + 128595539 aATTAGTAAATTTAGATTTTTACCTTTTGATATAATCTGATTGTATTTACCTTTTATTGTTACCTTTTAAGTCATTTATATTCACTATGCTAAGTCAGGTATGGTC-TATTTTGCCA--TTTTATTTTACTCTTTGTGGTTTATACTTACCGTTTACTTCTTCCCTATACATTATATGTCATTATAGCTC i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104670806 189 - 158406734 aattagtaaatttagatttttacctcttgatataatctgattttatttgccttttactgttacctttgaagccatctatatttactgtgctaagtcaggtatggtcttagtttgccattttttattttattctttgta-tttatacttactattttcctcttccctatacattatatgtcactgtagctc i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10214874 171 + 30810995 AAGCAGTAACTTTGA---TTCCCCTCAtgatccaatctgatggcattttc-------------cttttaagtcatttacatttaccataaaaagtgacatatgaacttatttta-ta--ttttattttataatttatggtgtataattattgtttttttctcccctatgcattatatatcatagaagatt i canFam3.chr36 I 629 C 0 a score=966104.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 34697 446 + 478999 CTCTTTCTTCCTATTA-----TTTTTTCTACAAATTTTATTCTATATTCCCATTTGTAGAA--------TG-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCTACAGTtat----------atata------------------------tattcaca---tatgcacattatatgtatataaaa------------------atata---catat------------------------acacagagattagcat-------atatatgtaATTTTCAACCAATTATAAGAATGGAAGACTATTACTGGTTCTCCTATATAA---GAGACTTATCACACTTTTACTTTCCTCTTCTCTACTCCTGCTCAACATGTATTAATTAATTA----GTTT---TTTAGGTCAAATTCCTGGTATTAAAAATATTATTTTTT-ATTTT----ATTTTCTTTCCCAAGAAATATATTTGATACAAGAATTATGTAACATATTGATGTTAAAAACTAGTAA-TTATTTATTAATGTGAATTTTAATGGATGCAGTACACATAATCAATTTTT-AATATCATATTACCTCT s panTro4.chr2B 169286465 469 + 247518478 TTCTTTTTTCCTATTAGTTATTTTTTCCTACAAATTTTATTCTATATTCCCATTTGTAGAA--------TG-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCTACAGTtat----------atatacata---------------tattatattcaca---tatgcatattatatgtatataaaa------------------atata---catat------------------------aCACAGAGATTAGCAT-------ATATATGTAATTTTCAACCAATTATAAGAATGGAAGACTGTTACTGATTCTCCTATATAA---GAGACTTATCACACTTTTACTTTCCTCTTCTCTACTCCTGCTCAACATGTATTAATTAATTAATTAGTTT---TTTAGGTCAAATTCCTGGtataaaaaatattatttttttattttGTGTATTTTCTTTCCCAAGAAATATATTTGATACAAGAATTATGTAACATATTTCTGttaaaaattagtaa-ttatttattaatgttaattttaatGGGTGCAGTACACATAATCAATTTTT-AATATCATATTACCTCT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18459858 451 + 99152023 ttctttcttcctgttagttg-ttttttctacaaattttattctatattcccattTGTAGAA--------TG-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCTACAGTtat----------atatacata--------------------tattcaca---tatgcatattatatgtatataaaa------------------atata---catat------------------------aCACAGAGATTAGCAT-------ATATATGTAATTTTCAACCAATTATAAGAATGGAAGACTATTACTGATTCTCCTATGTAA---GAGACTTATTACACTTTTACTTTCCTCTTCTCTACTCCTGCTCAACATGTATTAATTAATTA----GTTT---TTTAGGTGAAATTCCTGTTATTAAAA----TTTTTTTT-ATCTTGTGTATTTTCTTTCCCAAGAAATACATTTGATACAAGAATTATGTAACATATTGATGTTAAAAACTAGTA----ATTTATTAATGAGAATTTTAACGGGTGCAGTACACATAAACAATTTTT-AATATCATATTACCTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86764322 483 - 99891981 TTCTTTTTTCCAATTAGTTATTTTTTTCTACAAATTTTATTCTATATTCCCATTTGTAGAA--------TGGAatatagttcta--------------tatttatatatatagttctacagtact----------atatacata---------------tattatattcaca---tatgcatgttatatgtatataaaa------------------atcta---catat------------------------acccacagattagcat-------atatatgtaATTTTCAACCAATTATAAGAATAGAAGACTATTACTGATTCTCCTATATAA---GAGACTTATCACACTTTTACTTTCTTCTTCTCTACTCCTGCTCAACGTGTATTAATTAATTA----GGTT---TTTATGTCAAATTCCTGGTATTAAAAATATTATTTTTTTATTTTGTGTATTTTGTTTCCCAAGAGATATATTTGATATAAGAATTATGTAACATATTTATGTTAAAAACTAGTAA-TGATTTATTAATGTGAATTTTAATGGGTGCAGTACACataatcaattttt-aatttcatattatctct i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53843690 467 + 132586672 TTCTTTTTTCCTATTACTTA-TTTTTTCTACAAATTTTATTCTATATTCACATTTGTAGAA--------TA-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCTACAGTtat----------atatacata--------------------tattcaca---tatgcatattatatgtatataaaata-------------tacatacacaccatat------------------------acacacagattaacat-------atatatgtaATTTTCAACCAATTATAAGAATAGACGACTGTTACTGGTTCTCCTTTATAA---CAGACTTATCACACTCTTACCTGCCTCCTCTCTACTCCTGCTCGATAGGTATTAGTTAATTA----GTTT---TTTAGGCCAAATTCTTGGTATTACAAATATTATGTTTTAATTTTGTGTATTTTCTTTTCCAAGGAATGTATTTGATACAAGAATTATGTAACATATTTATGTTAAAAACTAGTAA-TTATTTATTAATGTGAATTTTAATGGGTGCAGTACACATAATCAATTTTT-AATAGCCTATTACCTCT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26926497 440 + 104110932 ttcttttttcctattactta-ttttttctacaaattttattctatattcacatttGtagaa--------ta-----------ca--------------cattt-------ttgttctacagttat----------atatacata--------------------tattcaca---tatgcatattatatgtatataaaata-------------tacatacacaccatat------------------------acacacagattaacat-------atatatgtaattttcaaCCCATTATAAGAATAGACGACTGCTACTGGTTCTCCTTTATAA---CAGACTTATCACACTCTTACCTGCCTCCTCTCTACTCCTGCTCGATATGTATTAGTTAATTA----GTTT---TTTAGGCCAAATTCTTGGTATTAcaaatattatgttttaattttgtgtattttcttttccaaggAATGTATTTGATACAAGAATTATGTAACA----------------------------TATTAATGTGAAttttaatgggtgcagtacacatAATCAATTTTT-AATAGCCTATTACCTCT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50463198 472 + 128595539 TTCTTTTTTCCTATTACTTA-TTTTTTCTACAAATTTTATTCTATATTCACATTTGTAGAA--------TA-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCTACAGTtat----------atatacata---------------tattttattcaca---tatgcatattatatgtatataaaata-------------tacatatacaccatat------------------------acacaccgattaacat-------atatatgtaATTTTCAACCAATTATAAGAATAGACGACTGTTACTGGTTCTCCTTTATAA---CAGACTTATCACACTCTTAGCTTCCTCCTCTCTACTCCTGCTCGACACGTATTAGTTAATTA----GTTT---TTTAGGCCAAATTCTTGGTATTACAAATATTATGTTTTAATTTTGTGTATTTTCTTTTCCAAGGAATGTATTTGATACAAGAATTATGTAACATATTTATGTTAAAAACCAGTAA-TTATTTATTAATGTGAATTTTAATGGGTGCAGTACACATAATCAATTTTT-AATAGCCTATTACCTCT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104670995 460 - 158406734 ttcttttttcgtattatt---ttttgcctacaaattttattctatatttctatATGCTATATTCCTATCTG-----------CA--------------CATTT-------TTGTTCtatagttat----------atatacata---------------tactatattcaca---tgtgcatattatatatgtatataa------------------a-ata---tacat------------------------acacacagattggtat-------gtatatgtaATTTTTAACCAATGATAAAAATAGAAGACTATTACTGATTCTCTTATAGAA---GGGACTTATCACACTCTTACTTTCTTTATCTCTA--------CAATATATATTAATTAATTA----GTTT---TTTAGGTCAAATTCTTGGTATTGaaaatattatttttt-attttatGTATTTTCTTTCCCAAGAAATATTTTTGATGTAAGAGCTATGTAATACAACTATGTTAAAAACTAGTAATTTTTTTAGTAATGTGAATTTTAATGGGTACAGTACACAGAGT-AATTTTT-AATATTATATTACCTCT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10215045 545 + 30810995 ttcttttttcattttagttttcttttcctacaggt----------------atttgtagaa--------ta-----------tacagtacatttgtctcattt-------gtgttctacaatgtttagctttaagatatgcataattATAAATTAGATGTACCGTATACACATTTTATACATATTATATACATGTATAACAATACATCCACAGGTAAATATACAAAATATGTAATTTTTATTGAAGTATAATTGATACACAATATTGTATTTGTTTCATATATATATATTTAAACTAATGACAAAAAT--ATGATTACAACTGATTCTTCTGTATCAGGTGACACTCATAATGTGTACTCTTTCTTCTTTTTT-CTCCCTTCCAACAGGTATTAATTAACTA----CTTTAGATTTGTTTAAATTCTTTGATGTTAAGA--CTTCCTTTTTTATATTGTGTATTTTCTTTCCCAAGAAATATTTTTGACAGATTAATTGTATAACGTTGCTGTGTTAAAAACTACTGA-TAAAAATTTAATGCTAGTTTTAATGGGTGCATTACGCATCACCAATTTTTAAATATCACATCACCTCT i canFam3.chr36 C 0 C 0 e rheMac3.chr12 28286007 509 + 106825570 M a score=546029.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 35143 162 + 478999 TGAGATGTAACAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAAGAATTATTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATACTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGACTAAAAGTTTGGTTGCCTGcagaa-ttttttaatctgaattc s panTro4.chr2B 169286934 162 + 247518478 TGAGATTTAATAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTTAAGTATCAAAGAATTATTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATACTTGCATTTTctgatttcctctcacttgaataaaagtttggttgcctgcagaa-ttttttaatccgaattc i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18460309 162 + 99152023 TGAGATTTAATAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAATAATTATTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATACTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGAGTAGAAGTTTGGTTGCCTGcagaa-ttttttaatctgaattc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86764805 162 - 99891981 taagatttaatag-ttttatttattctttTAGTCAGCTGTGGTA---TTCGCTCAAGTATCAAAGAATTATTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATCCTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGAATAAAAGTTTGGTTGTCTGcagaa-ttttttattctgaattc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28286517 162 + 106825570 TGAGATTTAATAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAAGAATTGTTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATCCTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGAATAAAAGTTTGGTTGCCTGCGGAA-ttttttattcctaattc i rheMac3.chr12 M 509 C 0 s macFas5.chr12 53844157 162 + 132586672 TGAGATTTAATAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAAGAATTGTTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATCCTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGAATAAAAGTTTGGTTGCCTGCGGaa-ttttttattcctaattc i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26926937 162 + 104110932 TGagatttaatag-ttttatttattcttttagtcAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAAGAATTGTTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATCCTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCACTTGAATAAAAGTTTGGTTGCCTACAGAA-TTTTTTATTCCTAATTC i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50463670 162 + 128595539 TGAGATTTAATAG-TTTTATTTATTCTTTTAGTCAGCTGTGGTA---TTTTCTCAAGTATCAAAGAATTGTTTCCCCCATGAATGGTAAATGGATCCTTGCATTTTCTGATTTCCTCTCCCTTGAATAAAAGTTTGGTTGCCTGcagaa-ttttttattcctaattc i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104671455 163 - 158406734 TGAGATTTAATAA-TTTTATTTTTTCTTTTAGTCAGTTGCAGTA---TTTTCTCAAGTATAAAGAAATTATTTCCCCCATGAATGCTAAATGTGTCCTTGCATTTTCTAATTTTCTCTCATTTTAATAAAAGTTTGGTCACCTGCAGAatttttttattcctaattt i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10215590 166 + 30810995 TGAGATTTTATAATTTTTACTTATTCTTTTCATCAGTTGTGGTATTTTTTTTTCAGATATCAGGTACTTTTTTTCCCCAAAGAGAGTCAGTGGAGCTTTACACTTTCTAATTCCTTCTCATTTTAATAAGAGTTTGGCTAGGTTAAGGT-TTTTTTCACCATAAATC i canFam3.chr36 C 0 I 2195 a score=4193243.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 35305 1438 + 478999 gctgatggatacctgggttgcttctactttttaactattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaatA--TAAAAAAAATTAAGCATTTTTTTGGGGACTGAGATATGCTTAAGATAAATTAACCATCATAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACTAGAACCCAAAGGCCTAGT--------------------CTGGGTCATAGGATATTATGGAATG-AAAGAATAACCCATACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGCAATTGTTTAGCTACAAAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAATAAGACTGGTAAAGTCTCCCAGAAACTTTCAGGATTCCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCATCTTCATAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAGTTCTTAAGAGCATACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAC-GGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCAAGGAAGATATTCACAAATAGAACATACAATGGGGGATGAAATGATTTTAAGGAGAAATGACAATGACAATGACAGTG-GTATGTAGTATGTAGGGGGGCCATTGCTTTCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGTCACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCATACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAAAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGTCTTGCCTCCTTTTTTTCTCTGATCTTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACATTTTACCACCACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGGGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGCATTAGTTAGTTCAGTATCGTATGAGTGAATTTGGGGGAGAAGTAACCAGTGTCTGTATCTGCTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTACTGCAATATTTTAGGCATCTGCCTTGACTTCGAATGAACGTTCCTGTCCATACCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATA------TTATTAAATATCCTCTAGATTTTAGCGAATATATGGACTACTTTTTTTAAGCAAATCTGTAAGGGCAGTTGTCATTGTGGAGAACTGTGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACATTGTTGAATTTTTAGTGGTCCAGCGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATTAAATCTCCATTAGATAAACTCACATTTTTATAGGAGTGTTAAGAGAAAATCTCTCCAAGTGTTTAAGCCTGGGAAAATGAGAGAGAGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACCGTCAATTGTGAATAAGAGGAAAAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCCTTAGTGTGCAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT s panTro4.chr2B 169287096 1433 + 247518478 actgatggatacttgggttgcttctactttttaactattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaata--tttAAAAATTAGAGCATTTTTTGGGGGACTGAGATATGCTCAAGATAAATTAACCGTCACAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACCAGAACCCGAAGGCCTAGT--------------------CTGGGTCATAGGATATTATGGAATG-AAAGAATAACCCATACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGCAATTGTTTAGCTACAAAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAATAAGACTGGTAAAGTCTCCCGGAAACTTTCAGGATTCCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCATCTTCATAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAGTTCTTAAGAGCATACTATCTAGGTCTGAAGAGGAATAC-GGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCAAGGAAGGTACTCATAAATAGAACATACAATGGGGTATGAAATGATTTTAAGGGGAAATGACATTGACAATGACAGCC-ATATGTAGTATGTAGGGGGACTATTGCTTTCAATCTTGGAAAATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCCACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCATACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGTCTTGCCTCCTTTTTTTCTCTGATCTTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCCTCACATTATACCACCACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGT----GTTAGTTCAGTATC-TAAGAGTGAATTAAGGGGAGAAGTAAGCAGTGTCTGTATATGCTACAGACAATGAGAAGACTGTCTTACTGCAATATTTTAGGCATGTGCCTTGACTTTGAATGAAAGTTCCTGTCCATATCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATA------TTATTAAATATCCCCTAGATTTTAGTGAATATATGGACTACTTTTTTAAAGCAAATCTGTAAGGGCAGTTGTCATTGTGGAGAACTGTGGGTTTAATTAGTCTGTCTTAATAATATAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACAGTGTTGAATTTTTAGCAGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATTAAATCTCCATGAGATAAACTCACATTTTTAGGGGAGTGTTAAGAGAAAATCTCTCCAAGTGTTTAAGCCTGGGAAAATGAGAGAGGGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTATCAATTGTGAATAAGAGGAAAAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCCTTAGTGTGTAGAAGAGGTACAGACTGAAAAT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18460471 1438 + 99152023 gctaatggatacctgggttgcttctactttttaactattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaatatttTAAAAAATTAGAGCATATTTTTGGGGACTGAGATATGCTCAAGATAAATTAACCATCACAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACTAGAACCCGAAGGCCTAGT--------------------CTGGGTCATAGGATATTATGGAATG-AAAGAATAACCCATATTGATGAAAATGTCACTTACCAAAATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGCAATTGTTTAGCTACAAAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAATAAGACTGGTAAAGTCTCCCAGAAATGTTCAGGATTCCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCATCTTCGTAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAGTTCTTAAAAGCATACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAC-AGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCAAGGAAGGTATTCACAAATAGAACATACAATGCGGGATGAAATGATTTTAAGGGGAAACGACAATGACAATGACAGCG-GTATGTAGTATGTAGGGGGACTATTGCTTTCAATCTTGGAAGATGAATTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCCACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCATACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAAAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGTCTTGCCTCCTTTTTTTCTCTGATCTTGTTTACTGCCTGAGTTACCCTTCACATTTTACTACCACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGCATTA--TAGTTCAGTATCGTATGAGTGAATTTGGGGGAGAAGTAACCAGTGTCTGTATCTGCTACAGACAATGAGAAGACTGTCTTACTGCAATATTTTAGGCATCTGCCATGACTTTGAATGAAAGTTCTTGTCCATATCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATA------TTATTAAATATCCTATAGATTTTAGCGAATATAAGGACTACTTTTTTAAAGCAAATCTGTAAGGGCAGTTGTCATTGTGGAGAACTGTGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACATTGTTGAATTTTTAGCAGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATTAAATCTCCATGAGATAAACTCACATTTTTAGAGGAGTGTTAAGAGAAAATCTCTCCAAGTGTTTAAGCCTCGGAAAATGAGAGAGAGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTGTCAATCGTGAATAAGAGGAAAAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCCTTAGTGTGCAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86764967 1453 - 99891981 gctgatggatacttgggttgcttctactttttagctattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaatA--TAAAAAAA--AGAGCATTTTTGGGGGGACTAAGATATGCTCAAGATAAATTAACCGTCATAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACCAGAATCTGAAGGCCTAGTCTTAGTCTATTAATAAAATCCTGGGTCCTAGGAAATCATGGAATG-AAAGAATAACCCATATTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGCAATTGTTTAGCTACAAAATGTGTGACAATCATGACTTGCAGAAATAAGACTGGTAAAGTCTCCTAGAAACTTTCAGCATTCCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCATCTTCATAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTTCTCAGTTCTTAAGAGCATACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATACGGGAGAATGAAGGC--AGATTCATGGACCAAGGAAGGTATTCACAAATAGAACATACAATAGGGGATGAAATGATTTTAAGGGGAAATGACAATGACAATGACAGCT-GTATGTCGTATGTAGGGGGACTATTGCTTTCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCATACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACAGACCTATTGTCAGCTATGATTGTCTTGCCTTCTTTATTTCTCTGATCTTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACACTATACCACCACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTGCATTCTTGTATATTTCTGCTTTAACATAGC----ATTAGTTCAGTATCATAAGAGTGAATTTGGGGGAGAAGTAAGCAGTGTCTGTATATGCTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTATTGCAGTATTTTAGGCATCTGCCTTGACTTTGAATGAAAGTTCGTGTCCATATCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCGTA------TTATTAAATATCCCCTAGATTTTAGCGAATATATGGACTACTTTTTTTAAGCAAATCTGTAAGGGCAGTTGTCATTGTGGAGAACTGTGGGTTTAATTAGTCTCCCTTAATAATATAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACAGTGTTGAATTTTTAGCAGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATTAAATCTCCATGAGATCAACTCACATTTTTAGGGGAGTGTTAAGAGAAAATCTCTCCAAGTGTTTAAGCCTGGGAAAATGAGAGAGGGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTGTCAATTGTGAATAAGAGGAAAAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCCTTAGTGTGTAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28286679 1450 + 106825570 actgatggatacttgggttgcatctacattttagctattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaata-tttTAAAAATTGGAGCATTTTTTT-GGGACTGAGACATGCTCAAGATAAATTAACCATCAAAGGAGAACATAAAACATAAATTTCTAAGGGTGAACCAGAACTTGAAGGCCTAGT------CTATTAATAAAATCCTGGGTCATAGGATATCACGGAATGAAAAGAATAACCCATACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGTAATTGTTTAGCTACACAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAAGAAGACTGGTAAAGTCTGCTGGAAACTTTCAGGATTCCTAAAACCATTCCTTTGTCCAAAAGTCA--TTCGTAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAATTCTTAAGAGCCTACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAT-CGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCGAGCAAGGTCTTCACAAATAGAACATACAATGGGGGATGAAATGATTTTAAGGGGAAATGACACTGACAATGACAGCC-GTATGTAGTATGTAGGGGGACTATTGCTTCCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCACACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGCCTTGCCTCCTTTTTCTCTCTGATCCTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACGTTATACCACTACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGC----ATTAGTTCAGTATCATATGAGTGAATTTTGGGAAAAAGTCAGCAGTGTCTGCATCTACTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTACTGCAATGTTTTAGGCATCTGCCTTGACTTTGAATGACAGTTCCTGTCCATACCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATATTTGTATTATTAAATATCCCCTAGATTTTAGCAAATATATGGACCACTTTTTTAAAGCAAATCTGTAAGGCCAGTTGTCATTATGGAGAATTCGGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAGCAGTGTTGAATTTTTGGAGGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATCAAATCTCCGTTAGATAAACTCACATTTTTAGGGGAGTGGTAAGAGAAAATGTCTCCAAGTGCTTAAGCCC-GGAAAATGAGAGAAGGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTGTCAACTGTGGATAAGAGGAAAAGTCAGAACCGAAGAAAAGCCCTTA--GTGTAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53844319 1450 + 132586672 actgatggatacttgggttgcatctacattttagctattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaata-tttTAAAAATTGGAGCATTTTTTT-GGGACTGAGACATGCTCAAGATAAATTAACCATCAAAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACCAGAACTTGAAGGCCTAGT------CTATTAATAAAATCCTGGGTCATAGGATATCACAGAATGAAAAGAATAACCCATACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGTAATTGTTTAGCTACACAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAAGAAGACTGGTAAAGTCTGCTGGAAACTTTCAGGATTCCTAAAACCATTCCTTTGTCCAAAAGTCA--TTCGTAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAATTCTTAAGAGCCTACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAT-CGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCGAGCAAGGTCTTCACAAATAGAACATACAATGGGGGATGAAATGATTTTAAGGGGAAATGACACTGACAATGACAGCC-GTATGTAGTATGTAGGGGGACTATTGCTTCCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCACACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGCCTTGCCTCCTTTTTCTCTCTGATCCTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACGTTATACCACTACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGC----ATTAGTTCAGTATCATATGAGTGAATTTTGGGAAAAAGTCAGCAGTGTCTGCATCTACTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTACTGCAATGTTTTAGGCATCTGCCTTGACTTTGAATGACAGTTCCTGTCCATACCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATATTTGTATTATTAAATATCCCCTAGATTTTAGCAAATATATGGACCACTTTTTTAAAGCAAATCTGTAAGGCCAGTTGTCATTATGGAGAATTCGGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAGCAGTGTTGAATTTTTGGAGGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTACCAAATCTCCGTTAGATAAACTCACATTTTTAGGGGAGTGGTAAGAGAAAATGTCTCCAAGTGCTTAAGCCC-GGAAAATGAGAGAAGGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTGTCAACTGTGGATAAGAGGAAAAGTCAGAACCGAAGAAAAGCCCTTA--GTGTAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26927099 1450 + 104110932 ACTGATGGATACTTGGGTTGCATCTACATTTTAGCTATTCTGAATAATGCTGCCGtgat--agtcatttaaaaata-ttttaaaaattggagcaTTTTTTG-GGGACTGAGATATGCTCAAGATAAATTAACCATCAAAGGagaacataaaacataaatatctaAGGGTGAACCAGAACTTGAAGGCCTAGT------CTATTAATAAAATCCTGGGTCATAGGATATCATGGAATGAAAAGAATAACCTATACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGTAATTGTTTAGCTACACAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAAGAAGACTGGTAAAGTCTGCTGGAAACTTTCAGGATTCCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCA--TTCGTAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAATTCTTAAGAGCCTACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAT-CGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACTGAGCAAGGTCTTCACaaatagaacatacaatgggGGATGAAATGATTTTAAGGGGAAATGACACTGACAATGACAGCC-GTATGTAGTATGTAGGGGGACTATTGCTTCCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGAAGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCACACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACATATCTATTGTCAACTATGATTGCCttgcctcctttttctctctgatcTTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACGTTATACCACTACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGC----ATTAGTTCAGCATCATATGAGTGAATTTTGGGAAAAAGTCAGCAGTGTCTGCATCTACTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTACTGCAATGTTTTAGGCATCTGCCTTGACTTTGAATGACAGTTCCTGTCCATACCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTcatatttgtattattaaataTCCCCTAGATTTTAGCAAATATATGGACcacttttttaaagcaaatctgtAAGGCCAGTTGTCATTATGGAGAATTCGGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAGCAGTGTTGAATTTTTGGAGGTCCAACGATATCTCTTTGTGGAGAGAGCATTTGCTTTATCAAATCTCCGTTAGATAAACTCACATTTTTAGGGGAGTGGTaagagaaaatgtctccaagtgTTTAAGCCC-GGAAAATGAGAGAAGGGAAATACAGAACGAGGTCATGTGAACTGTCAACTGTGGATAAGAGGAAAAGTCAGAACCGAAGAAAAGCCCTTA--GTGCAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50463832 1448 + 128595539 actgacggatatttgggttgcatctacattttagctattctgaataatgctgctgtgac--agtcatttaaaaata-tttTTAAAATTGGAGCATTTTTT--GGGACTGAGATATACTCAAGATAAATTAACCATCATAGGAGAACATAAAACATAAATATCTAAGGGTGAACCAGAACTTGAAGGCCTAGT------CTATTAATAAAATCCTGGGTCATAGGATATCATGGACTGAAAAGAATAACCCACACTGATGAAAATGTCACTTACCAAGATGATGATCTTACAGTGTAGGAACAGTAATTGTTTAGCTACACAATGTGTGGTAATCATGACTTGCAGAAAGAAAACTGGTAAAGTCTGCCGGAAACTTTCAGGATTTCTAAAACCAGTCCTTTGTCCAAAAGTCA--TTCGTAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAGTTCTTAAGAGCCTACTGTCTAGGTCTGAAGAAGAATAT-AGAGAGTGAAGGC--AGATTCATGGACCGAGCAAGGTCTTCACAAATAGAACATACAATGGGGGATGAAATGATTTTAA-GGGAAATGACAATGACAATGACAGCC-GTATGTAGTATGTGAGGGCACTATTGCTTCCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGTTTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGATGTTCTCA-GGTAGAATTAGCCATACATCCTTTGCTTCTGGGTTTCTGAGATATTGGTGACAGAACTGAAACTAAGAACAGATCTATTGTCAACTATGATTGCCTTGCCCCCTTTTTTTCTCTGATCTTGTTTACTGCCTGAGTTTCCCTTCACGTTATACCACCACAACTAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGC----ATTAGTTCAGTATCATATGAGTGAATTTTGGAAAAAAGTAAGCAGTGTCTGTATCTACTACAGACAATGAGAAGATTGTCTTACTGCAATGTTTTAGGCATCTGCCTTGACTTTGAATGACAGCTCCTGTCCATACCCTAAAGGAGAAAAGAGTTGCACTCATATTTGTGTTATTAAATATCCCCTAGATTTTAGCGAATATATGGACCACTTTTTTAAAGCAAATCTGTAAGGCCAGTTGTCATTGTGGAGAATTCAGGGTTTAGTTAGTCTCCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACAGTGTTGAATTTTTAGAGGTCCAACGATATCTCTTTGTAGAGAGAGCATTTGCTTTATCAAATCTCCATTAGATAAACTCACATTTTTAGGGGAGTGGTAAGAGAAAATGTCTCCAAGTGTTTAAGCCT-GGAAAATGAGAG--GGGAAATACAGAATGAGGTCATGTGAACTGTCAATTGTGGATAAGAGGAAAAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCCTTAGTGTGTAGAAGAGGTAGAGATTGAAAAT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104671618 1438 - 158406734 gctgatggatatttgggttacttctactttttagctattctgaataatgctgctgtaacaGAGTCATTTAAAAATG--TGAAAAAATTAGAGGTTTTCTGGGGGGACTGAGATATGCTCAAGATAAATTAACCATCCCAGGAGAACATAAAACATAAGCATCTAAGAGTGAACCAGAGCCTGAAGGCCTAGT------CTATTAATAAAATTCTGAGTCAAGGGATATCATGGAACG-AAAGAATAACCCATATTGATGAAAATTCCACTTGCCAAGGTGATGATATTACAGTGTAGGAACAGCAGTTGTTTAGCTACAAAATGTGTGGTAATCATGACTTTCAGAAATAA------------------GAAACATTCAGGATTCCCAGAACCAGTATTTTGTCTAAAAGTCATTTTTATAGTAGTGGCCATATCCTGAATGAAGTTACTCAGTTTTTAAAAGCATCTTTTCTAGGTTTGAAGAAAAATAC-GATGAGTGAAGATAGAGATTCATGAACCAAGCAAGGTTTTCACAAATAGAACATATGATGGATGATGAAATGACTTTAAGGGGAAATGACAATGACAATGACAGCCTGTGTGTAGAATGTAGGGGGACTATTGCTTCCAATCTTGGAAGATGAGTTCAAGATTTGATTGCATCAAAATGGAGCTACACTGAAGTTCTCAGGGTAGAATTAGCCATACAT-CTTTGCTTCCGGGTTTCTGGGATACTGGGGACAGAACTGACACTAAGGACAGACCTGTTGTCAAAATTGATTGTCTTGCCTCCTTTTTC-CTTTGGTCTTGCTTATTGCCTGAGTTTCCCTTCACATTAAACTACTATAACCAAGCAGGGACCTTATTTATTAAGAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACACAGT----ATTAGTTTAGTATCATATGAATGAATTTAGGGAAGAAGTAAGCAGTGCCTGTATCTGCTCCAGACAATGAGAAGATTGTCTTGCTGCAATGTTTTAGGCATCTGCCTTGACTTCGAATGCAAGTTCCTGTATATATCCTAAAGGAGAAAACAGTTGCACTCATATTTGTGTTATTAAATATCCCTTAAATTTTAGGGAATAGATGAGCTAATTTTCTTAAGCAAATCTCTAAGCACAGTTGTCATTGTGGAGAATTGTGAGTTTAGTTAGTCTTCCTTAATAATACAAATGGAGAAAATTTAGTTGAGAACATTTTTGAATTTTTAGAGGTCCAACAATATCTCTTTGTGGAGAGAACATTTGCTTTATTAAATCTACATTAGATATACTCACATTTTCAGGGGTGTGGTAAGAGTAAATTTCTCCAAGTGTTTAAGCCTGGGAAAATGAGAG--GGAAGATACCGAACGAGGTCAGGTGAACTGCCAGTTGTGGATAAGAGGAAGAGTCAGAACCAAAGAAAAGCCTTTAGTGTGTACAAGAGGTAGAGATAGAAAAT i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10215756 2195 + 30810995 I a score=3387019.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 36743 1098 + 478999 GAGCTGTCAAAA-AGAAATGCGGGGGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCTAAAT-TTGATTAAACTTGACTGAGATAAAGGGAGAGAGAAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTTATTAGTGACAATCTTCATAAGCAGGTTTCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGAACTGTAGTAATTTAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGAATAA-ATGATAACTTAATGGGGTGTCACAAAATCACCTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAACAGATTATATTAATATTAAAAATAGGAAA--AAA----GAGCAAAG--AAATATATTAGGACTTCTAGCTACATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTTACTAAATATATTTGACACAT----ATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTACAAATTATATGA--------TATTTCCTCTTTTCCAATTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCACCTAATCTTTATTATGATATATTTGT-AAGGGGAATTGAATTATAAGCTTTCTCAGGTTAAAATAAGGACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATTTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAGTCAGCCATTGTAGCCTTTTCTGTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAGATATCTATTGTGCAA------------ACTAAAATTTAGTTCTAATTCCATT----------CATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCCGCTTAATACAGACTTTATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCATTTAAAAATGAATAGTTTACAAATAACTTAGCTTTAGTCTTTAAGTATTTACATACATTTATTTATGATTTGTCACACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTTAATTTTAAAGT-----TTTTTTTTGTTTTAATTACA---CAACTGGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTATGGTATATTTGTTCAGGTGCCTTGAGAAATACC s panTro4.chr2B 169288529 1090 + 247518478 GAGCTGTCAAAA-AGAAATGTGGGGGATAAGCTAGA-ATAAAATACCTAAAGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAATATTGATTAAACTTGACTGAGATAAAGGGAGAGAGAAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTTATTAGTAACAATCTTCATAAGCAAGTTTCCAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGAACTATGATAATTTAGGAAGGACAGATAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGGATAA-ATGATAACTTAATGGGGTGTCACGGAATCACCTTGCGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAACAGATTATATTAATATTAAAAACAGGAAA--AAA-----AGCAAAGAAAAATATATTAGGACTTCTAGCTGCATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCATATATTAATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTACAAATTATATGA--------TATTTCCTCTTTTCCAATTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCACCTAATCTTTATTATGATATATTTGT-AAGAGGAATTGAATTATAAACTTTCTTAGGTTAAAATAAGGACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATTTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTGTAGCCTTTTCGGCAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTGTTGTCCAA------------ACTAAAATTTAGTTCTAATTCCATT----------CATATTAGATATATTTATTTACTACAGCATTCTGTTTAATACAGACTTTATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCATTTAAAAATGAATAGTTTAAAAA-----TAGCTTTAGTCTTTAAGTATTTACATGC---------TGATTTGTCATACATAAAAGGATATTCTCCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTGAATTTTAAAGT-----TTTTTTTTGTTTTAATTACA---CAACTGGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTATGGTATATTTGTTCAGGTGCATTGAGAAATACC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18461909 1093 + 99152023 GAGCTGTCAAAA-AGAAATGCGGGGTATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAGGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACACTAATAGGACCAAAT-TTGATTAAACTTGACGGAGATAAAGGGAGAGAGAAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTTATTAGTAGCAATCTTCATAAGCAAGTTTCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGAACTGCAGTAATTTAGAAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATAAGGATAA-ATGATAACTTAATGGGGTGTCACGAAATCACCTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAACAGattatattaatattaaaaataGGAAA--AAA----GAGCAAAGAAAAATATATTAGGACTTCTAGCTACATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATACATTTGGCATATATTAATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTACAAATTATATGA--------TATTTCCTCTTTTCCAATTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCATCTAATCTTTATTATGATATATTTGT-AAGGGGAATTGAATTATAAGCTTTCTCAGGTTAAAATAAGGACGAAAC--AAATTTTCGGATAAAATTTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTATAGCCCTTTCTGTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAGATATCTATTGTGCAA------------ACTAAAATTTAGTTCTAATTCCATT----------CATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCTGTTTAATACAGACTTTATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCATTTAAAAATGAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTTTAGTCTTGAAGTATTTACATAC---------TGATTTGTCATACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTTAATTTTAAAGT-----TTTTTTTTGTTTTAATTACA---CAACTGGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTATGGTATATTTGTTCAGGTGCCTTGAGAAATATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86766420 1095 - 99891981 GAGCTGTCAAAA-AGAAATGTGGGGGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAATATTGATTAAACTTGACTGAGACAAAGGGAGAGAGAAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTTATTAGTAACAATCTTCATAAGCGAGTTTTGAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGAACTATGGTAATTTAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGACGATAA-ATGATAATTTAATGGGGTGTCACGGAATCACCTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAACAGATTATATTAATATTAAAAATGGGAAA--AAA---AGAGCAAAG--AGAAATATTAGGACTTCTAGCTGCATGGTGAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCTTATATTAATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTAAAAATTATATGA--------TATTTCCTCTTTTCCAATTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCACCTAATCTTTATTATGATATATTTGT-AAGGGGAATTGAATTATAAGCTTTCTCAGGTTAAAATAAAGACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATTTTCATCCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTGTAGCCTTTTCTGTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTATTGTCCAA------------ACTAAAATTTAGTTCTAATTCTATT----------CATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCTGTTTAATACAGACTTCATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCATTTAAAAATGAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTTTAGTCTTTAAGTATTTACATAC---------TGATTTGTCATAGATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGCTACTGAATTTTAAAGT-----TTTTTTTTGTTTTAATTACA---CAACTGGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTATGGTATATTTGCTCAGGTGCCTTGAGAAATACC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28288129 1095 + 106825570 GAGCTGTCAAGA-AGAAATGTAAGGGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAACTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAAT-T------AACTTGACTGAGATAAAGAGAGAGAGAAAGGTGGTTCAATTTGGGGATTAGGTTATTAGTAACAATCTTCCTAAGTAAGTTTCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGGACTATGGTAATTCAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGGATAA-GTGGCAATTTAATGGGGTGTCACGAAACCAACTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAATAGattatattaatattaaaaataGCAAA--AAA------GCAAAGAAAGATGTATTAGGACTTTTAGCTTCATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCATATATTCATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTATAAATTACATGATATTGAGTTATTTCCTCTTTTCCAAGTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCGCCTAATCTTTAT-----TATATCTGT-AAGGGGAATTGAATTACAAGTTTTCTCAGGTTAAAATAAGGACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATGTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTATAGCCTTTTCTCTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTATTGTCCAA-----------AACTAAAATTTAGTTCCAATTCCATT----------CATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCTGTTTAATACAGACTTTATAAATATAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCGTTTAAAAATAAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTATAGTCTTTAAGTATTTACATAC---------TGATTTGTCATACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTTAATTTTAAAGG-TTTTTTTTGTTTGTTTTAATTACA---CAACTAGTGGTGACAATATAACCCTAGCTGGCTCTAGTATATTTGTTCAGGGGCCTTGAGAAATACC i rheMac3.chr12 C 0 I 15 s macFas5.chr12 53845769 1095 + 132586672 GAGCTGTCAAGA-AGAAATGTAAGGGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAACTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAAT-T------AACTTGACTGAGATAAAGAGAGAGAGAAAGGTGGTTCAATTTGGGGATTAGGTTATTAGTAACAATCTTCCTAAGTAAGTTTCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGGACTATGGTAATTCAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGGATAA-GTGGCAATTTAATGGGGTGTCACGAAACCAACTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAATAGATTATATTAATATTAAAAATAGCAAA--AAA------GCAAAGAAAGATGTATTAGGACTTTTAGCTTCATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCATATATTCATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTATAAATTACATGATATTGAGTTATTTCCTCTTTTCCAAGTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCGCCTAATCTTTAT-----TATATCTGT-AAGGGGAATTGAATTACAAGTTTTCTCAGGTTAAAATAAGGACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATGTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTATAGCCTTTTCTCTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTATTGTCCAA-----------AACTAAAATTTAGTTCCAATTCCATT----------CATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCTGTTTAATACAGACTTTATAAATATAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCGTTTAAAAATAAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTATAGTCTTTAAGTATTTACATAC---------TGATTTGTCATACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTTAATTTTAAAGG-TTTTTTTTGTTTGTTTTAATTACA---CAACTAGTGGTGACAATATAACCCTAGCTGGCTCTAGTATATTTGTTCAGGGGCCTTGAGAAATACC i macFas5.chr12 C 0 I 4 s papAnu2.chr12 26928549 1095 + 104110932 GAGCTGTCAAGA-AGAAATGTAAGGGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAAT-T------AACTTGactgagataaagagagagagaaaggtggtTCGATCTGGGGATTAGGTTATTAGTAACAATCTTCCTAAGCAAGTTGCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-GGATGAAGGGGACTATGGTAATTCAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGGATAA-GTGGCAATTTAATGGGGTGTCACGAAACCAACTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAAtagattatattaatattaaaaatagcaaa--aaa------gcaaagaaagatatATTAGGACTTTTAGCTTCAT-GTAAACAACAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCATATATTCATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTATAAATTACATGATATTGAgttatttcctcttttccaagTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCGCCTAATCTTTAT-----TATATCTGT-AAGGGGAATTGAATTACAAGTTTTCTCAGGTTAAAATaaggacaaaacaaaaattttctgaTAAAATGTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTATAGCCTTTTCTCTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTATTGTCCAA-----------AACTAAAATTTAGTTCCAATTCCATT----------CatattagatatatttatttaatacagtATTCTGTTTAATACAGACTTTATAAAtagaatcacattttatttttaaatgtcatatccTAGAGGAATGTTTGtacaaattgtttaaaaataaatagtttaaaaataacttagcTATAGTCTTTAAGTATTTACATGC---------TGATTTGTCATACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACttaattttaaaggtttttttttgtttgttttaattaca---cAACTAGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTCTAGTATATTTGTTCAGGGGCCTtgagaaatacc i papAnu2.chr12 C 0 I 4 s chlSab2.chr10 50465280 1029 + 128595539 GAGCTGTCAAGA-AGAAATGTAAGAGATAAGCTAGA-ATAAAACACCTAAAGAATAAATTTCAAG----GAAAAAGAGGAACATTAATAGGGCCAAAT-T------AACTTGACTGTGATAAAGAGAGAGAGAAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTTGTTAGTAACAATCTTCCTAAGCAAGTTTCAAACGA-CTTGTAGTAGTAGAAACTG-AGATGAAGGGGACTATGGTAATTCAGGAAGGACAGGTAGAGTATCAGTATCTCTG-AAAGGTTTGCAGGTGATGAGATCAATGAGGATAA-GTGGCAGTTTAATGGGGTGTCATGAAACCAACTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGAATAGATTATATTAATATTGAAAATAGCAAAATAAA------GCAAAGAAAGATATTTTAGGATTTTTAGCTTCATGGTAAACAATAAACTCTGGTTTCACTAAATATATTTGGCATATATTAATTATAGAATTTTCCTTGCAAATGTT--GTTACAAATTACATGATATTGGGTTATTTCCTCTTTTTCAAGTTTCCTCTTACAAGGTAAATTCACCTAATCTTTAT-----TATATTTGT-AAGGGGAATTGAATTACAAGTTTTCTCAGGTTAAAATAAGGAC-AAACAAAAATTTTCTGATAAAATGTTCTTGCAGTATGCCACCATTTGCCAAAGGAAATCAGCCATTATAGTCTTTTCTCTAATCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATCTATTGTCCAA-----------------------------------------------------------------------------------------AGACTTTATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCATATCCTAGAGGAATGTTTGTACAAATCATTTAAAAATAAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTATAGTCTTTAAGTATTTACATAC---------TGATTTGTCATACATCAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTGCTGATACTTAATTTTAAAGTTTGTTTTTTGTTTGTTTTAATTACA---CAACTAGTGGTGACAATATAACCCTAGATGGCTATAGTATATTTGTTCAGGTGCCTTGAGAAATACC i chlSab2.chr10 C 0 I 3 s calJac3.chr6 104673056 1105 - 158406734 GAGCT-TTAGAA-AGAAATGTGGAGGATAAGCTAGGTATAAAACACCTAAAAAATAAATTTCAAA----GAAAAGGAGGAACATTAATAGGATCTAATATTGATT-AAATTGACCGAGATAAAGAGAGA---AAAGGTGGTTTGATTTGGGGATTAGGTGATTAGTAATAATCTTCATAAGCAACTTTCAAGCGAGTTTGTAGTGGTGGAAAGCG-GGATGAAGGGAACTATGGTAATTTAGGAAGGAGAGGTGGAACATCGGTATCTTTG-AAAAGTTTGCAGGTGATCAGATCAAGGAGGTTAG-ATGATAACTTAATGGGGTGGCAAGAAATCACCTTAAGTTGGCTGGTGAAGACTTGGGCA-GTTTTTAGGGATAGATTATATTAATG-TAAAAATAGGAAA--AAAAGAAAAGCAAAGAAAAAGGTGTTTGGACTTCTAGCTGCATGGTAAGCAATAAACTCTGTTTTCACTAAATATATTTGGCATATGTTAATTGCAGAATTTTCCTGGCAAATGTT--GTTACACATTATATGATATTGAGCTACTTCCTATTTTTCAATTTTCCTTTTACAAGGTAAATTTACCTAATCTTTATTACGATACATTTGTAAAAAGGAATTGAATTATAACTTTTCTCAGGTTAAA-----GACAAAACAAAAATTTTCTGATAAAATTTTCTTGCAATGTGGCACCATTTGCCAAAGAAAATCAGCTATTATAGCCTTTTCTGTAACCT---TAAGTTTTTTGGACAAATATTTGTTGTTCAAAACTAATTCAAAACTAGAATTTAGTTCTAGTTCCATT----------TATATTAGATATATTTATTTAATACAGTATTCTATTTAATACAGACTTTATAAATAGAATCACATTTTATTTTTAAATGTCCTTTCCTAGAGGAATATTTCTACAAAGGATTTAACAATGAATAGTTTAAAAATAACTTAGCTTTAGACTTGAAGTATACACATAT---------TGATTTGTCATACATAAAAGGACATTCTTCTTCTTAATTATATCTTACTCATAC------TTCAAGT------TCGTTTTGTTTTAATTACA---CAACTGGTGGTGACAATATAACCCTAGATGACTATGGTATGTTTGTCCAGGTGCCTTGAGAAATACC i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10217951 1037 + 30810995 gggttgcCAAAAGAAAGATGGAAGAGGTTGGCCAGA-ATAACACTGCCAAAAAAAAAAAAAAGAGACATGGAAAAGGAGAACATTAATAGGGTCGAATATTGATGGAAATCAACTGAGATGAAAATGGAG-GAAAGGTTGTCAGACT-----------------------------CTGCACAAATTTCAAATGA-ATTGTAAGAGTGGAAACCATGGATTAAGGGAACTGTAGAAATTGAGGAAGGACATGTGAAGTGTCAGTATCTTTGCAAAAGTCTGTGTGTGATGAAATCAATGAGGATAACATTGCATTTTAAGATAGTGTCAAGAAACCATCTTAAGTTGGCTGGTGGAGATTTGGGCATGTTTGTAGGAATAGGTTATAT------TAAGAATAGAAAA--AAG----TAGTAAAGAAAAAGATATTAGAGCTG--------ATAATATATAATA--------------TAGATGAAAATGA--------ATTTACAGAGTTTTCCTGGCAAATGTTAAATTATGCATTAAATAATAC-----TATTTTCTTTTTACTAGTTTTCTTCTTACAAGGTAAATCCACCAAAGTGTCCT----GCTGGTTTGT-GATGGAAACTCAGTTACAAATTTGCTAAGGTTAGAATAAGGACAAAATAAAAATTCCTTGATACAATTTTGTTACTAGAGAACACCATTTTGTAGAAGAATTCAGTCATC-TAACCTTCTCTGTAATCCTGATAAGTCTCTTGGAAAAATATCTATTGTCTAA-----------AAGTGAAATTTGATTTTCATTCAGTTCACATTCCTGCATATTAAATATA--TGTTTAA-ATAGTAGTTTATTT---------TTTGTAAATATAATTGATGCTTTTTAAAAAATATTCTATATTACAGGAAGCTTTATGCAGAGCATTaaaaaatgggcagtttaaaaataaattatctttagtgttgaaataga-acatac---------taatttgccatatacaaaaggaaattctccttcataattatatcttgctcatac------ttacagt-----ttgttgtgcttttaattatacagcaactggtgatgatgatgcagctctcaatggctagggaacatcagtccaggTGCCCtaggaaatgcc i canFam3.chr36 I 2195 C 0 a score=9582.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 37841 16 + 478999 AAAA--TTTTTGACAATG s panTro4.chr2B 169289619 14 + 247518478 AAAA--TTTTTGACAA-- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18463002 16 + 99152023 AAAA--TTTTTGACAATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86767515 14 - 99891981 AAAA--TTTTTGAAAA-- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53846868 11 + 132586672 AAAA-----GTGACAA-- i macFas5.chr12 I 4 C 0 s papAnu2.chr12 26929648 12 + 104110932 aaaa-----gtgacaat- i papAnu2.chr12 I 4 C 0 s chlSab2.chr10 50466312 17 + 128595539 AAAATATTTTTGACAAT- i chlSab2.chr10 I 3 C 0 s calJac3.chr6 104674161 14 - 158406734 AAAA--TTTTTGACAA-- i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10218988 15 + 30810995 caca--tttgggatgac- i canFam3.chr36 C 0 C 0 e rheMac3.chr12 28289224 15 + 106825570 I a score=2164308.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 37857 698 + 478999 TTTTTTTTCCTTTGGGTCAgatc-ttttttattacaatgaa------------agataaatttcagtaaactaagagacagagactctacacagagtttcagtttccccttagctcctataaaatggaatgtcatgcta--ctgagatatctcatgcactgctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcatgaattacctgaatcatctggatccctagaattggattagtggctcagacaactccatctttt-gggacagatgatagaaggtatctatttcctacagctaggttttt-gcagtaagattacataactctta--------------tttgatctttctcatta-tttttttcaggacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagtagatactcattaggactctaaggagcatatttttctacttagtgcaaacgtcagaaagtaagtaatc---atgtttaaactgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtggtagtgtgcatggagt--cttccacaaagagacagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaaagataacc-----------------atcaataccactggttgatttcatctgc-tcctatg---agaaggacagattgtacatggtgct-gtcagatgatctcagaacataaagagatttcctgagagATC s panTro4.chr2B 169289633 697 + 247518478 TTTTTTTTCctttgggccagatc-tttcttattacaatgaa------------agagaaatttcagtacactaagagacagagactctacacagagtttcaatttcccctgagctcctataaaatggaatatcatgcta--ctgagatatctcatgcactgctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcatgaattacctgaatcatctggatccctagaattggattagtggctcagaccactccatctttt-ggggcagatgatagagggtgtctatttcctacagctaggttgtt-gcagtaagattatgtaactctta--------------tttgatctttctcatt--tttttttcaggacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattaggactctaagtaccatatttttctacttagtgcaaatgtcagaaagtaagtaatc---atgtttaaactgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtggtaatgtgcatggagt--cttccacaaagagacagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaaagataacc-----------------atcaataccactggttgatttcatctgc-tcctatg---agaaggacagattgtacatggtgct-gtcggatgatctcagaccataaagagatttcctgagagATC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18463018 699 + 99152023 TTTTTTTTCctttgggccagatc-ttttttattacaatgaa------------agagaaatttcagtacactaagagacagagactctacacagagtttcagtttccccttagctcctataaaatggaatatcacgcta--ctgagatagctcatgcactgctcttgccttctgtatgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcatgaattacctgaatcatctggatccctagaattggattagtggctcagacaactccatctttt-gggacagatgatagaaggtgtctatttcctacagttaggttttt-gcagtaagattacataactctta--------------tttgatctttctcattattttttttcagaacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattaggactctaaggagcatatttttctacttagtgcaaacgtcagaaagtaagtaatc---atgtttaaactgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtggtaatgtgcatggagt--cttccacaaagagacagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaaagatagcc-----------------atcaataccactggttgatttcatctgc-tcctatg---agaaggacagattgtacatggtgct-gtcggatgatctcagaacataaagagatttcctgagagATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86767529 681 - 99891981 TTATTTTTCctttgggccagatc-ttttttattacaattaa------------agagaaatttcagttcactaagagacagagagtctacacagagtttcagtttccccttagctcctataaaatggaatatcatgcta--ctgagacatctcatgcacttctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggactcatgaattacctgaatcatctggatccctagaactggattagtggctcagaccactccatctttc-gcgactgatgttagagggtgtctatttcctatggctaggttttt-gcagtaagattacagaactctta--------------tttgatctttctcatt--attttttcaggacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattaggac-----------------tctacttagtgcaaacgtcagaaagtaaataatc---atgtttaaactgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtgctaatgtgcatggaat--cttccacaaagagacagac--agatgtccgcaataaccagcttaagaaaagataacc-----------------atcaataccactggttgatttcatctgc-tcctatg---agaaggacagattgtacatggtgctggccggatgatctcagaccataaagagatttcttgagagATT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28289239 697 + 106825570 TTTTTTTTCctttgggccagatctttttttattacagtgaa------------agagaaatttcagtacactaagagacagaga-tctacacagagtttcagttttcccttaggtcctataaagtggaatatcatgctatcctgagatatgtcatgcactgctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcacgaattacctgaatcatctggagccctagaattggattagtggcttagaccactccatctttt-ggggcagatgatagagggtgtctatttcctacagctaggttttt-gcagtaagattacatgactctta--------------ttcgatctttctcatta-ttttcttcaggacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattaggactctaaggagcatatttttctacttagtgcaaatgtcagaaagtaagtaatg---atgtttaaaccgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtggtaatgtgcatggagt--cttccacaaacagtcagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaaagataacc-----------------atcaataccactggttgatttcat---c-ttttatg---agaaggacagattgcacatggtgct-gtcagatgatctcagaccataaagagatttcctgagagATC i rheMac3.chr12 I 15 C 0 s macFas5.chr12 53846879 697 + 132586672 TTTTTTTTCctttgggccagatctttttttattacagtgaa------------agagaaatttcagtacactaagagacagaga-tctacacagagtttcagttttcccttaggtcctataaagtggaatatcatgctatcctgagatatgtcatgcactgctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcacgaattacctgaatcatctggagccctagaattggattagtggcttagaccactccatctttt-ggggcagatgatagagggtgtctatttcctacagctaggttttt-gcagtaagattacatgactctta--------------ttcgatctttctcatta-ttttcttcaggacataaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattaggactctaaggagcatatttttctacttagtgcaaacgtcagaaagtaagtaatg---atgtttaaaccgacaagag-ctttaaccaggaagttgcctacatcacaagatctccttcctgtggtaatgtgcatggagt--cttccacaaacagtcagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaaagataacc-----------------atcaataccactggttgatttcat---c-ttttatg---agaaggacagattgcacatggtgct-gtcagatgatctcagaccataaagagatttcctgagagATC i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26929660 697 + 104110932 ttttttttcctttgggccAGATCtttttttattacagtgaa------------agagaAATTTCAGTACACTAAGAGACAGAGA-TCtacacagagtttcagttttcccTTAGGTcctataaaatggaatatcatGCTATCCTGAGAGATGTCATGCACTGCTCTTGCCTTCTGTCTGAAG---------------------------------------------------------------------------------------ATGGGATTCACGAATTACCTTAATCATCTGGAGCCCTAGAATTGGATTAGTGGCTTAGACCACTCCATCTTTT-GGGGCAGATGATAGAGGGTGTCTATTTCCTACAGCTAGGTTTTT-GCAGTAAGATTACATGACTCTTA--------------TTCGatctttctcatta-ttttcttcagGACATAAATTGTGTTCCAATTCTGATATCCAA------TGATCTTACCTCATTTGGGGTAGGTTAAAGTTGATACTCATTAGGACTCTAAGGAGCATATTTTTCTACTTAGTGCAAACGTCAGAAAGTAAGTAATG---ATGTTTAAACCGACAAGAG-CTTTAACCAGGAAGTTGCCTACATCACAAGATCTCCTTTCTGTGGTAATGTGCATGGAGT--CTTCCacaaacagacagac--agatgcCTGCAATAACCGGCTTAAGAAAAGATAACC-----------------ATCAATACCACTGGTTGATTTCAT---C-TTTTATG---AGAAGGACAGATTGCACATGGTGCT-GTCAGATGATCTCAGACCATAAAGAGATTTCCTGAGAGATC i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50466329 660 + 128595539 TTTTTTTTCCTTTGGGCCAAatc-ttttttattacagtgaa------------agagaaatttcagtacacgaagatacagaga-tctacacagagtttccgtttccccttaggtcctataaaatggaatatcatgctatcctgagatatgtcatgcactgctcttgccttctgtctgaag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcatgaattacctgaatcatctggagccctagaattggattagtggcttagaccactccatctttt-ggggcagatgatagacggtgtctatttcctacagctaggttttt-gcagtaagattacatgactctta--------------ttggatctttctcatta-ttttcttcaggacacaaattgtgttccaattctgatatccaa------tgatcttacctcatttggggtaggttaaagttgatactcattagaactgtaaggatcatatttttctacttagtgaaaatgtcagaaagtaagtaatg---atgtttaaaccaacaagag-ttttaaccagcaagttgcctatatcacaagatctccttcctgtggtaatgtgcatggagt--cttccacaaacagacagac--agatgcctgcaataaccggcttaagaaAAGATAACT-----------------ATCAATACCACTG-------------------------------------------ATGGTGCT-GTCAGATGATCTCAGACCATAAAGAGATTTCCTGAGAGATC i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104674175 703 - 158406734 -CTTATTTCTTTTGGGCCATatc-ttttttattacaatgca------------agagaaatttcagtacactaagagacagagattctatgcagagtttcagtttcctcttagctcctataaaatggaatatcatgctgtactgagatatttcatgtactgctcttgccttctgtctttag---------------------------------------------------------------------------------------atgggattcattcattacctgaatcatctggatcccaagaattggattagtggctcacaacactccatctttt-gggacag--gagagagggtgtctatttcctgtggctacatt-tt-gcagtaagattacatgactctta--------------tttgatctttctcattattttttttcagggcgtaaattgtgtcccaattctgatacccaataatggtgatcttacctcatttggggtaggttgaagttgatattcattaggacttgaaggagcatatttttctacttagtggaaacctcagaaagtaagtaatt---gtgtttaacctgacaagag-ctttaacaaggaagatgcctacatcacaagatctccttcctgtggtaatatgcatagagt--cttccacgaagagatagacagagatgcctgcgataagtggcttaagaaaggataacc-----------------aggaataccactggtagatttcatctgcaccttatg------aggacagattgtacacggtgct-gttggatgatctcagaccataaaaagatttcctgagagatt i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10219003 787 + 30810995 ---tcttttatctggttcagatc-tattttattacaatggagatttcttttccaaagaaattccagcccactgagagataaagactttacaaagggtttcagttgccctttatctcc---aaaatgcaacatcatgtcctactcagacatttcaggcactgcttctgcctcctgtatgaagTCACCAGTTATCTAAGTAGTCTGTCACCAGTTATCTAAGTAGTAGTCTGTCACCAGTTATCTAAGTAGTCTGTCACCAGTTATCTAAGTAGTAGTCACCAATTATCTAAGTAGTCTGGATTCTT---ATCTCATCAGTGGCTTAGTTAACTCTATCTTttgggggcagattacaaagaacgtctacttcgtacagctgcgtttctaacagtaagactgggtgactcttctaaaatggggaagttctgacctgtctcatta-cttttcttaggacataaaatgtggcccaatggtgatatctaatcatgattatcttacttcatttgggg--------------tactcattaggactttaaggagca------------caatgcaagccttggaatgcaagtgatcataatgtctaaactaaggagggattttcacagggaagttgccaaattatcataatttcctttc--ttgtAATGTGTATGGCATGCCTTTCATGAAGACACTCAG--GGGTAGCTTC---------CTTAAGTAAAGCTATCTACTGGTTGGATCAATGGATCAATACCATTGATC-ATACCAGTTGA-TACCATGTATAGAAGGACGGATTGTATATGGTGCT--TTGGATAATCTTAGAACATAAAGAGATC------------ i canFam3.chr36 C 0 C 0 a score=347322.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 38555 130 + 478999 GTTATAATATTGGGATAAAACTTTACTGC---AAAAAT---CTCATAGAGTGAATGAATGATAGAGGTAAACAAAAGTTTATTCTATTAAAACTTACATTTTGCAGCTTATTACAACATAtgttatgatttgaatg s panTro4.chr2B 169290330 131 + 247518478 GTTATAATATTGGGATAAAAATTTACTAC--AAAAAAA---CTCATAGAGTGAATAAATGATAGAGGTAAACAAAAGTTTATTCTATTAAAACTTACATTTTGCAGCTTATTACAACATAtgttatgatttgaatg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18463717 130 + 99152023 GGTATAATATTGGGATAAAACTTTACTAC---AAAAAA---CTCATAGAGTGAATAAATGATAGAGGTAAACAAAAGTGTATTCTATTAAAACTTACATTTTGCAGCTTATTACAACGTAtgttatgatttgaatg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86768210 129 - 99891981 GTTACAATATTGAGATAAAAATTTACTAC---AAAAAA---CTCATAGAGTAAATAAATGAGAGAGGTAAACGAAAGTTTATTCTATTAAAACTTATATTTTGCA-CTTATTACAACATAtgttatgatttgaatg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28289936 132 + 106825570 ATTATAATATTGGGGTAAAAATTTACTAC---AAAAAAAACCTCATAGAGTGAACAAATCATAGAGGTAAA-AAATGTTTATTCTATTAAAACTTATATTTTGCAGCTTATTACAACATACgttatgatttgaatg i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53847576 132 + 132586672 ATTATAATATTGGGGTAAAAATTTACTAC---AAAAAAAACCTCATAGAGTGAACAAATCATAGAGGTAAA-AAAAGTTTATTCTATTAAAACTTATATTTTGCAGCTTATTACAACATACgttatgatttgaatg i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26930357 132 + 104110932 ATTATAATATTGGGGTAAAAATTTACTAC---aaaaaaaCCCTCATAGAGTGAACAAATCATAGAGgtaaa-aaaagtttattctatTAAAACTTATATTTTGCAGCTTATTACAACATATgttatgatttgaatg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50466989 132 + 128595539 ATTATAATATTGGGATAAAAATTTACTAC---AAAAAAA-CTTCATAGAATGAACAAATCATAGAGGTAAACAAAAGTTTATTCTATTAAAACTTATATTCTGCAGCTTATTACAACATAtgttatgatttgaatg i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104674878 136 - 158406734 gttataataTTGGGATAAAAACTTACTACCAAAAAAAAAACCTCACAGAGTGAATAATTTATAGCGGTAAACAGAAGTTTAATATTTTAAAACTTATATTTTGCAGCTTTTTACAAAATGTTTtataatttgaatg i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10219790 0 + 30810995 C a score=2499634.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 38685 811 + 478999 tgtcccctccaaagttcaatcattgccaatatgatggtattaagaagtgattaagat--------aggtattaagatggtctttaagaggtgattaggccttacagtctcttcctggctaatggagttaaaaagcccttacaaaagaggcgtcccgcaatgcttggctagttgcccttccaccttatgccatgtgaggatgcagcaagaaggccctcactagatcaaatgcctagagccttgaccttgtattttccagccactgaaactgtgagaaagtaatttttttttctttataaaat----agtctgtggtattttgttataggagcacgaatggactaagacaACATGCATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTTCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGACATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCCATAACCATTGCACCGGTTTCTATATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTCGAGAACTTCTTTTCTGGGAAGGTCTAACAGCTTACTATCCAACCCATTATAACTAGCTATAATATTCTGTCAAATTCCTTCAAATTG----------ATTTCTCTGTCTCAGACCACCATA--ACCCATCACAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCCTATATGGAACCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCTAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTGCAAATGGTAAGATTTAGATGTTCTGTAGACAACTAGAAGTATTGG s panTro4.chr2B 169290461 817 + 247518478 tgtcccctccaaagttcagttgttgccaatgtgatggtattaggaagtgattaagattggtattaaggtattaagatggtctttaaaaggtgattaggccttacagtctcttcctggctaatggagttaaaaggcccttataaaagaggcgtcacgcagtgcttggctagttgcccttccaccttacgccatgtgaggatgcagcaagaaggccctcactagatcaaatgcctagagcctt-accttgtattttccagccactgaaactgtgagaaagtaaattttttttctttataaaat----agtctgtggtattttgttacaggagcacaaatggactaagacaACATGCATGTAATTAACAAATGGGTCTTCAG---TATAAGCCTGAAGGAGATAGCTTTCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGACATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCTATAACCATTGCACCAGTTTCTATATAAAAGGTCAGAGCTCTGCCTTTTACTTCGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAGCTATAATATTCTGTCAAATTCCTTCAAATTG----------ATTTCTCTGTCTCAGACCACCAT---ACCCATCATAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCCTATATGGAACCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCTAGTTTGCCAGCCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTGCAAATGGTAAGATTTAGATGTTCTGTAGACAACTAGAGGTATTGG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18463847 812 + 99152023 tgtcccctccaaagttcaatcgttgccaatatgatggtattaagaagtgattaagat--------aggcattaggatggtctttaagaggtgattaggccttacagtctcttcctgcctaatggagttaaaaggcctttataaaagaggcgtcacgcagtgcttggctagttgcccttccaccttatgccatgtgacgatgcagcaagaaggccctcactagatcaaaagcctagagccttgaccttgtattgtccagccactgaaactgtgagaaagtaa-ttttttttctttataaaat----agtctgtggtattttgttataggagcacaaatggactaagacaACATGCATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGACATCCTTAACAGCTGCCCCTCCAGCCATAACCATTGCACCAGTTTCTGTATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTTGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAACTATAATATTCTGTCAAATTCCTTCAAATTG----------ATTTCTCTGTCTCAGACCACCACCATACCCATCACAATTCTGAAAGCTGGAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCCTATATGGAACCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTtgagataggagaaagagaaaagctagtttgccaaccagagggaggatgatgtgttcagtttgcaaatggtaagatttagatgttctgtagacaactagaggtattgg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86768339 809 - 99891981 tgtcctctccaaagttcagttgttgctaatatgatggtattaagaagtgattaagat--------aggtattaagatggtctttaagaggtgattaggccttacagcctcttcctggctaatggagttaaaaggcccttataatagaggcgtcatgcagtgcttggctagttgcccttacaccttatgccgtgtgaggatgcagcaagaaggcctttactagatcaaatgcctagagccttgaccttgtatgttccagccactgaaactgtgagaaagtac-atttttttctttataaaat----agtctgtggtattttgttataggagcacaaatggactaagacaACATGCATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---CATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCTAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGACATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCCGTAACCACTGCACCAGTTTTTGTATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTCGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAGCTAGCTATAATATTCTGTCAAATTCCTTCAAATTG----------ATTTCTCTGTCTCAGACCACCAT---ACCCATCCTAATTCTGAAAGCTGAAAGAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCTTATATGGAACCCTTGGTTTCTGCTGAGGTAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCCAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGGTGATGTGTTCAGTTTGCAAATGGTAAGATTTAGATGTCCTGTAGACAACTAGAGGTATTGG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28290068 818 + 106825570 tgtcacctccaaagttcagttgttgccaatgtgatggtattaagaagtgattaagat--------aggcattaagatggtctttaagaagtgattaggccttacagtctcgtcctggctaatggagttaaaaggcccttataaaagaggcatcacgcagtgcttggctagttgcccttccaccttatgccatgtgaggatgcagcaagaaggccctcactaaatcaaatgcctagagctttgaccttgtactttccagtcactgaaactgtgagaaagtaa-a-ttttttctttataaaag----agtctgtggtattttgttataggagcacaaagggcctaaggcaACGTACATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGGCATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCCATAACCATTGCACCAGTTTCTGTATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTTGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAGCTGTAATATTCTGTCAAACTCCTTCAAATTGATTTAAATTAATTTCTCTGTCTCAGACCACCGT---GCCCATCATAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCTTGTATGGATCCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCTAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTCCAAACGGTAAGATTTAGATGTTCTGCAGACAACTAGTGGTATTGG i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53847708 818 + 132586672 tgtcacctccaaagttcagttgttgccaatgtgatggtattaagaagtgattaagat--------aggcattaagatggtctttaagaagtgattaggccttacagtctcgtcctggctaatggagttaaaaggcccttataaaagaggcatcacgcagtgcttggctagttgcccttccaccttatgccatgtgaggatgcagcaagaaggccctcactaaatcaaatgcctagagctttgaccttgtactttccagtcactgaaactgtgagaaagtaa-a-ttttttctttataaaag----agtctgtggtattttgttataggagcacaaagggcctaaggcaACGTACATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGGCATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCCATAACCATTGCACCAGTTTCTGTATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTTGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAGCTGTAATATTCTGTCAAACTCCTTCAAATTGATTTAAATTAATTTCTCTGTCTCAGACCACCGT---GCCCATCATAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCTTGTATGGATCCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCTAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTCCAAACGGTAAGATTTAGATGTTCTGCAGACAACTAGTGGTATTGG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26930489 819 + 104110932 tgtcACCTCCAAAGTTCAGTTGTtgtcaatgtgatggtattaagaagtgATTAAGAT--------AGGCATTAAGATGGTCTTTGAGAAGTGATTAGGCCTTACAGTCTCGTCCTGGCTAATGGAGTTAAAAGGCCCTTATAAAAAAGGCATCACGCAGTGCTTGGCTAGTTGCCCTTCCACCTTATGCCATgcgaggatgcagcaagaaggccctcactagaTCAAATGCCTAGAGCTTTGACCTTGTACTTTCCAGTCACTGaaactgtgagaaagtaa-atttttttctttataaaag----agtctgtggtatttttttaTAGGAGCACAAAGGGCCTAAGGCAACGTACATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGGACATCCTTAACAGCTGCCCCTCCACCCATAACCATTGCACCAGTTTCTATATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTTGAGAACTTCTTTTCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAGCTGTAATATTCTGTCAAACTCCTTCAAAttgatttaaattaatttctctgTCTCAGACCACTGT---GCCCATCATAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCTCATATGGATCCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAgataggagaaagagaaaagctagTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTCCAAACGGTAAGATTTAGATGTTCTGCAGACAACTAGTGGTATTGG i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50467121 819 + 128595539 tgtcacctccaaagttcagttgttgccaatgtgatggtattaagaagtgattaagat--------aggcattaagatggtgtttaagaggtgattaggccttacagtctcctcctggctaatggagttaaaaggcccttataaaagaggtatcacacagtgcttggctagttgcccttccaccttatgccatgtgaagatgcagcaagaaggcccccactagatcaaatgcctagagctttgaccttgtactttccagtcactgaaactgtgagaaagtaa-ttttttttctttataaaat----agtctgtggtattttgttataggagcacaactggcctaaggcaACGTGCATGTAATTAACAAATGGGTCTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCCCAGTTTGCTAAGAGATGTCTAAAC----TGAATATCCTTAACAACTGCCCCTCCACCCATAACCATTGCACCAGTTTCTGTATAAAAGGTCAGAACTCTGCCTTTTACTTTGAGAACTTCTTTTCCGGAAAGATCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTAGCTGTAATATTCTGTCAAACTCCTTCAAATCGATTTAAATTGATTTCTCTGTCTCAGACCACCGT---GCGCATCATAATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCTACAGATAGCCTTATATGGATCCCTTGGCTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAGAGAAAAGCTAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCAGTTTCTAAACGGTAAGATTTAGATGTTCTGTAGACAACTAGAGGTATTGG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104675014 765 - 158406734 tgtcctcttcaaagttcagttgttgccaaaatgatagtattaagaggtgataatgat--------aggta---------tctttaagaggtgattaggccttaccgtctcttcctggtgaatggggttaaaagacccttataaaagaggcgtcacgcagtgcttggctagttgcccctctaccttatgccatgtgaggatgcagcaagaaggccctcac--------atgcctgaagccttgatcttgtacttcccagccactgaaactttgagatagtaaatttttgttttttataaaatgctcagtctgtggtatttcgttacaggagcacaaatggactaaggcaACAAGCATGTAATTAACAAATAGGATTTGGG---TATAGGCATGAAGGAGATAGCTTCC-------------------------------ACAGCCTTAACAATTCCCTCTCCACCCATAACTATTTCACCAGTTTCTGTGTAAAAGACCAGAGCTCTGCCTTTTACTTCAAGAACTTCTTTCCTGGAAAGGTCTAACAGCTTACTATCCATCCCATTATAACTATCTATAATATTCTGTCAAACTTCTTCATATTG----------ATTTCTTTGTCTCAGACCATCAT---ACCC-----AATTCTGAAAGCTGAAATAGGATGAGCACCCTCTTCTCAACAGACAGCCTTATATGGAACCCTTGTTTTCTGCTGAGATAAGATTTGAGATAGGAGAAAAAGAAAAGCTAGTTTGCCAACCAGAGGGAGGATGATGTGTTCCGTTTACAAATGGTAAGATTTACATGTTTTGTAGGCAACTAGAGGTACTGG i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10219790 537 + 30810995 TGTC------------------------------------TGAGAGGTCATTATAAT--------------------------------------------------------------Actgggattaaaaattgcccataaaa--------atccactaggtgaataatt-----------------tatggaaggata-aacaaaagtG-------------------------------------------------------------AAATGtaa-----------tattaaaat----tatattttttaGCTTATTACATG--------------------ATATGCATGTAACTAGTGAATAAGACTTGGGATCTAT-GGCATGAAGGAGAT-----------------------GTCTAAACTATTTGAACAACCTTAAAAACTTCCTGTCTACCCATGACATATACCCCAGTGTCTGTGT-AAAGCTCAGAG-TCTGCC-------------------------------CATAACAGCTTATTATCCATCACATT-TAACTAGCTTTA----TCTGCCGAACTTTTTCAGATTA----------A--CCTCTGTGTCAAGCCATTAT---ACCC-----AGTTCTGAAAGCTCAACTAGGATGGACAC---CTTCTCTGCAGCTAGTCCTATAAGGAACTCTCAGCTTCTGCTGAAACGAGATTTAAGACAGGAGAAATGGGAAAGCTAGTTTGCTACCCAGAAAGAGGATGATGTGCTCAGTTTGCAGATGGAAAAGTTTAGATGTTTTGTAGGACACTGGAGGTATTGG i canFam3.chr36 C 0 C 0 a score=191742.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39496 63 + 478999 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGCTTGGTACATCAATTGAGTAGTCATTAGTATAAAAAT s panTro4.chr2B 169291278 63 + 247518478 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACATCAATTGAGTAGTCATTAGTATAAAAAT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18464659 63 + 99152023 aatccaggcttggatgagaagtttggtttggtacatcaattgagtagtcattagtataaaaat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769148 63 - 99891981 AATTCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACGTCAATTGACTAGTCATTAGTATAAAAGT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28290886 63 + 106825570 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACACCAATTGAGCAGTCATTAGTATAAAAAT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848526 63 + 132586672 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACACCAATTGAGCAGTCATTAGTATAAAAAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931308 63 + 104110932 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACACCAATTGAGCAGTCATTAGTATAAAAAT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50467940 63 + 128595539 AATCCAGGCTTGGATGAGAGGTTTGGTTTGGTACACCAATTGAGCAGTCATTAGTATAAAAAT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104675779 63 - 158406734 AGTCCAGGCTTGGATGAGAGATTTGGTTTCGTAAATCTATTAAATAGTCATTAGTATAAAAAC i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220327 0 + 30810995 C a score=90420.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39559 39 + 478999 TACAACTGggccgggcgcggtggctcatgcttgtaatcc s panTro4.chr2B 169291341 39 + 247518478 GACAACTGggctgggcatggtggctcatgctcataatcc i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18464722 39 + 99152023 gacaactgggctgggtgtggtggctcatgcttgtaatcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769211 39 - 99891981 GACAACTGggccaggtgtggtggctcatgcttgtaatcc i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28290949 39 + 106825570 GACAACTGggccaggtgcagtggcttatgcttgtaatcc i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848589 39 + 132586672 GACAACTGggccaggtgcagtggcttatgcttgtaatcc i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931371 39 + 104110932 GAcaactgggccaggtgcagtggctcatgcttgtaatcc i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468003 39 + 128595539 GACAACTGggccaggtgcagtggctcatgcttgtaatcc i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220327 0 + 30810995 C e calJac3.chr6 104675842 0 - 158406734 C a score=374382.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39598 166 + 478999 tagcactttgggaggccaaggcaggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagctgggcttggtggtgggtgcctgtaatcccagctaatcgggggaatgaggcaggagaat s panTro4.chr2B 169291380 166 + 247518478 tagcactttgggaggccgaggagggtggataacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatgatgaaaccctatctctactaaaaacacaaaaaattagctgggtgtggcggtgggcgcctgtaatcccagctaatcgggggactgaggcaggagaat i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18464761 166 + 99152023 tagcactttgggaggccgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaagttagctgggcatggtggtgggcgcctgtaatcctagctaatcaggggactgaggcaggagaat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769250 166 - 99891981 tagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctaaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagctgggcgtggtggtgggctcctgtaatcccagctaatcgggggactgaggcaggagaat i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28290988 166 + 106825570 tagcactttgggaggtcaaggggggtggatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaatatgatgaaactccatctctactaaaaatacaaaaaattagatgggtgtcgtagtgggggcctgtaatcccagctaatcgggggactgaggcaggagaat i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848628 166 + 132586672 tagcactttgggaggtcaaggcgggtggatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaatatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagatgggtgtcgtagtgggtgcctgtaatcccagctaatcgggggactgaggcaggagaat i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931410 166 + 104110932 tagcactttgggaggtcaaggtgggtggatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaatatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagatgggtgtcgtagtgggtgcctgtaatcccagctaattgggggactgaggcaggagaat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468042 166 + 128595539 tagcactttgggaggccaaggcgggtggattgcttgaggtcaggagttcgagaccagtctggccaacatgatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattcaatggatgtcttggtgagtgcctgtaatcccagctaatcgggggactgaggcaggagaat i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10220327 49 + 30810995 TAGCA--------------------------------------GAGTTGGAG--------------------------------------TAGGTTTAGGAAATCAGTTGGG-----------------------------------------GAGTCATTAGTAT i canFam3.chr36 C 0 C 0 e calJac3.chr6 104675842 0 - 158406734 C a score=180210.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39764 101 + 478999 tgcttgaacccggggggtggaggttgcagtgagctgagatcgcaccacttcacttcagcctgggcaaaagagtgaaacaccatctcaaa--------------aaaaaaaaaaaa s panTro4.chr2B 169291546 115 + 247518478 tgcttgaacctggcgggtggaggttgcagtgagctgagatcgcaccacttcactccagcctgggcaaaagagtgaagctctatcttaaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaa i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18464927 110 + 99152023 tgcttggacccggggggtggaggttgcaatgagctgagatcataccacttcactccagcctgggcaaaagagtgaaactccatctcaaaaaaaaaaaa-----aaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769416 96 - 99891981 tgcttgaacctgaggggtggaggttgcagtgagctgagatcac-ccacttcactccagcctgggcaaaagagtgaaactctgtct------------------aaaaaaaaaaaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28291154 109 + 106825570 tgcttgaattcggagggcgggggttgcagtgagccgagatcacaccacttcattccagcctggacaaaattgtgaaactccattcccccccaaaaaa------agaaaaaaacca i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848794 109 + 132586672 tgcttgaattcggcgggcggaggttgcagtgagccgagatcacaccacttcattccagcctggacaaaattgtgaaactccatccccccaccaaaaa------agaaaaaaacca i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931576 109 + 104110932 tgcttgaattcgacgggcggaggttgcagtgagccgagatcacaccacttcattccagcctggacaaaattgtgaaactccatcccccccccaaaaa------agaaaaaaacca i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468208 99 + 128595539 tgcttgaattcggcgggcagaggttgcagtgagccgagatcacaccacttcattccagcctggg-aaaattgtgaaactccatccccccc--------------aaaaaaaaCC- i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220376 0 + 30810995 C e calJac3.chr6 104675842 0 - 158406734 C a score=4665.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39865 5 + 478999 aaaaa s panTro4.chr2B 169291661 5 + 247518478 caaaA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18465037 5 + 99152023 aaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769512 4 - 99891981 aaaa- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28291263 5 + 106825570 aaaaC i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848903 5 + 132586672 aaaaC i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931685 5 + 104110932 aaaat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10220376 5 + 30810995 AAAAT i canFam3.chr36 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50468307 0 + 128595539 C e calJac3.chr6 104675842 0 - 158406734 C a score=1044596.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 39870 338 + 478999 GACAACTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGA------GATGGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCAGCAAGAAGAGGAAGA-GAGTTACTGAAGGAGATGTGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAACGGCCCCATCACAGGGGGCCTTCACAGTCACACA-GGCTTCACATTTGGA------------TCTCTAAATGAGATCATGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACGTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATACTGAAATGTTGGGACACTGTAAAAGAAATGggctgtgtg---tagtggtc--acacctgt s panTro4.chr2B 169291666 338 + 247518478 ACCATCTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGA------GATTGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCAGCAAGAAGAGGAAGC-AAGTTATTGAAGGAGATGTGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAATGGCCCCATCACAGCGGGCCTTCACAGTCACACA-GGCTTCACATTTGGA------------TCTCTAAATGAGATCATGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATATGGAAATGTTGGGATGCTTTAAAAGAAATGggctgtgtg---tggtggtc--acacctgt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18465042 323 + 99152023 gacaacgggagctagaaggcaggattggtaggc---aaaggggaagtaaatggagaga------gattgggtttgaggacccagtcttgcagcaAGAAGAGGAAGA-GAGTTATTGAAGGATATGTGAAAGCCAGGT--AGAGGTAAGAGAAACCTATTACACTGGCCCCA-------------TCACAGTCACACA-GGCTTCGCATTTGGA------------TCTCTAAATGAGATCATGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGTAATAAATATTTAAAACATACTGAATTGTTGGGACGCTGTAAAAGAAATGggctgtgtg---tagtggtc--actcctgt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769516 339 - 99891981 ---aTCTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGCAAAAAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGA------GATTGGGATTGAGGACCCAGTCTTTCAGCAAGAAGAGGAAGA-CAGTTATTGAAGGATATGTGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGGGAAACCTATTACGATGGCCCCATCACAATGGGCCTTCACAGTCACACA-GGCTTCACATTTGGA------------TCTCTAAATGAGATCATGTCTCTATTATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATACTGAAATGTTGGGACACTTTAAAAGAAATGggctgtgtg---tagtggtc--ccacctgt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28291268 338 + 106825570 GGCAACTGGAGGTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGAGGTTGGGATTGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCCGCAAGAAGAGGAAGA-GAGTTATTGAAGGAGATATGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAATGGCCCCATCATAGTGGGCCT------TCACCTA-GGCTTCACATTTGGA------------TCTCTAAATGAAATCATGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATACTGAAATGTTGGGATGTTTTAAAAGAAATGggctgggtg---tagtggtc--acacctgt i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53848908 338 + 132586672 GGCAACTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGAGATTGGGATTGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCCGCAAGAAGAGGAAGA-GAGTTATTGAAGGAGATATGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAATGGCCCCATCATAGTGGGCCT------TCACCTA-GGCTTCACATTTGGA------------TCTCTAAATGAAATCATGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATACTGAAATGTTGGGATGTTTTAAAAGAAATGggctgggtg---tagtggtc--acacctgt i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26931690 338 + 104110932 ggcAACTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGAGATTGGGATTGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCcgcaagaagaggaaga-gagttaTTGAAGGAGATATGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAATGGCCCCATCATAGTGGGCCT------TCACCTA-GGCTTCACATTTGGA------------TCtctaaatgaaatcatgtctcta-tattttgtgaatatgtattaaacttttaatttagaagcaataaatatttaaaacatactgaAATGTTGggatgttttaaaagaaatgggctgggtg---tagtggtc--acatctgt i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468307 338 + 128595539 GGCAACTGGAGCTAGAAGGCAGGATTGGTAGGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGAGATTGGGACTGGGATTGAGGACCCAGTCTTGCTGCAAGAAGAGGAAGA-GAGTTATTGAAGGAGATGTGAAAGCCAGGTAGAGAGGTAAGAGAAACCTATTACAATGGCCCCATCATAGTAGGCCT------TCACCTA-GGCTTCATATTTGGA------------TCTCTAAATAAAATCAAGTCTCTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTAGAAGCAATAAATATTTAAAACATACTGAAATGTTGGGACGCTTTAAAAGAAATGggctgggtg---tagtggtc--acacctgt i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104675842 325 - 158406734 GGTAACTGGAACTAGAAGGCAGTATTAGTAAGC---AAAGGGGAAGTAAGTGGAGAGA------GATTGGAACTGAGGACCCAGTCTTGCAGCCAGAAGAGGAAGA-GAGTTATCGAAGGAGCTACAAAAGCCAGGTAGAGAAGTAAGAGAAACCTATTACAGTGATCTGAACACAG-------------TCACACA-GGCTTCATGTTTGGA------------TCTCTAAATGAGATCATGTCACTA-TATTTTGTGAATATGTATTAAACTTTTAATTTACCAGCAATAAACATTTAAAAAGTACTGAAATGTTGGGATACTTTAAAAGAAATAAgctgggcg---tagcggtc--acagctgt i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10220381 327 + 30810995 GACAATTGGC-CTAGGAGGCAGGATCAGGAGGC---CAAAGAAAAGTAAGTGGAGAGG------TACTGGGTCGGAAGA--CAGTCTTGCAGCAAGAAGAGGAAGAGGAGTTAGTGAA--AGATTTAGAAGCCAGATGGAGAGGCAGGAAGGGCCTATCCCTGTGCTACCAGCA---TGAGCTCTCACGATCATCTATAGCTTCAAGTTTAGATTTTTGATGTGCTCTCAAAGTGAAATCATATCCTTA-TATTTTGTT----TGTATTAAAATTTTAATTTAGTAATGGTACACATTTAAAACATACCAGAA---Tgggacgc---------------ctgggtggctcagtggttgagcacctgc i canFam3.chr36 C 0 I 179 a score=285955.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 40208 93 + 478999 aatcccagtgctttgggaggatgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattaagaccctgcctttac s panTro4.chr2B 169292004 93 + 247518478 aatcccagtgctttgggaagctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccaacctaggcaacatattaagaccctgcctctac i panTro4.chr2B C 0 I 11 s ponAbe2.chr15 18465365 93 + 99152023 aatcccagtgctttggggggctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattaagaccctgcctttcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769855 93 - 99891981 aatcccagtgctttgggaggccgacgtggcaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaatatattaagactctgcctttac i nomLeu3.chr17 C 0 I 7 s rheMac3.chr12 28291606 93 + 106825570 aatcccagtgctttgggaggctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattaagaccctgtttctac i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53849246 93 + 132586672 aatcccagtgctttgggaggctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattaagaccctgtttctac i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26932028 93 + 104110932 aatcctagtgctttgggaggctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattaagaccctgtttctac i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468645 93 + 128595539 aaacccagtgctttgggaggctgaggtgggaggactgattgagcccaggagtttgagaccagcctaggcaacatattcagactctatctctac i chlSab2.chr10 C 0 I 127 s calJac3.chr6 104676167 93 - 158406734 aatcccagtgctttcggaggctgaggtgggaggactgatggaacccaggagtttgagatcagcctaggtaacatattaagaccctgtttctcc i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220708 179 + 30810995 I a score=2188.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 40301 4 + 478999 aaaa s panTro4.chr2B 169292108 4 + 247518478 aaaa i panTro4.chr2B I 11 C 0 s ponAbe2.chr15 18465458 1 + 99152023 ---a i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769955 4 - 99891981 aaaa i nomLeu3.chr17 I 7 C 0 s calJac3.chr6 104676260 4 - 158406734 aaaa i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220708 179 + 30810995 I e chlSab2.chr10 50468738 127 + 128595539 I e papAnu2.chr12 26932121 0 + 104110932 C e macFas5.chr12 53849339 0 + 132586672 C e rheMac3.chr12 28291699 0 + 106825570 C a score=459462.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 40305 153 + 478999 aaaaaaaaaaagttgggtatggtggcgcatacccatagtcccagctacttgggaggctgagatgggaggattgctggagctcagggatttgaggctgcagtgagtcatgatcacaccactgcactgcagcctgagcaacagagcaagactctg s panTro4.chr2B 169292112 153 + 247518478 gaaaaaaaaaagttgggtatggtggcacatacccatagtcccagctacttgggaggctgagatggcaggattgctggagcccaggaatttgaggctgcagtgagtcatgatcacaccattgcactgcagcctgagcaacagagcaagactctg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18465459 153 + 99152023 aaaaaaaaaaagttgggtatggtggcacatatccacagtcccagctacttgggaggctgagatgagaggattgctggagcccaggaatttgaggctgcagtgagtcatgatcacaccactgcactgcagcctgagcaacagagcaagactctg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86769959 153 - 99891981 agaacaaaaaagttgggtatggtggcacataaccttagtcccagctacttgggaggctgagatgggaggattgctggagcccaggaatttgaggctgcagtgagtcatgatcacaccactgcactgcagcctgagcaacagagcaagactctg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28291699 151 + 106825570 --aaaaaaaaagttgggtttggtggcacatgcccatagtcccagctacttggaaggctgagatgggaggattgctggagcccaggagtttgaggctgtagtgagtcatgatcacaccactgcactgcaacctgagcaacagagcaagactctg i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53849339 151 + 132586672 --aaaaaaaaagttgggtttggtggcacatgcccatagtcccagctacttggaaggctgagatgggaggattgctggagcccaggagtttgaggctgtagtgagtcatgatcacaccactgcactgcaacctgagcaacagagcaagactctg i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26932121 151 + 104110932 --aaaaaaaaagttgggtttggtggcacatgcccatagtcccagctacttgggaggctgagatgggaggattgctggagcccgggagtttgaggctgtagtgagtcatgatcacaccactgcactgcaacctgagcaacaaagcaagactctg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50468865 153 + 128595539 aaaaaagaaaagttgggtgtggtggcacatgcccatagtcccagctacttgggaggccgagatgggaggattgctggagcccaggagtttgaggctgcagtgagtcatgatcacaccactgcactgcaacctgagcaacagagcaagactctg i chlSab2.chr10 I 127 C 0 s calJac3.chr6 104676264 140 - 158406734 ------aaaaagttgg-------ggcacatgcccataatcccagctacttgggaggctgagatgggagtattgctagagcccaggagtttgaggctgccgtgagtcatggtctcaccactgcactgcagcctgagtgacagagcaagagtctg i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10220708 179 + 30810995 I a score=4399880.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 40458 1426 + 478999 cctc--------------------aaaaaataaataa--aTGAATGAAAGAAAT----------GAAAGTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAGGAAAATT---AGAAGACTGTTCCAGGAACAGGCAATTGAGGTTGTCAGAAAAGTGAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAATAAGAACTGAGAGAAGACCATGATGTTCAGCAA-GGGGGCCACTAGAACTCCATAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGCATCCTTTAGAG--AAGTTTGGCAATTAGAAgtgtg------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgtgC----------GCGCGCA-CGCCAGTGTTCATT-----------TTTACCTCTCATCTCCTATCTCATCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAATGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCGCACAGCAGGGAGTC------------TTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTACGCTGTGGTGCTGGGAGCCAGAGACAGAGAC-AAAAAAAGCTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAGTTATCTATAAAAGGACTC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCT--TAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACTGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTCTGGCGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TT--ACAGCCTGAACCTAATAGGCATCTAATATTGTTATGTGTTGTCATATCTCAaccaccaccatcaccaccacTCCCAGCTAGCACTCACAGAGCACCTGACCTGGGATCAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTGGTGCTTACATAGGCTATTGTTTACTACATCTGCACCCACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGTTTCTCAGGTATTCTTCTCCCCTGCTTTTATGTGTCAGAACCTGTATAATCATTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGCCAGAGTGCCCATTCCTGATGTCCACAAAGTACGGTAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTCGCATGGCCTCTGAGCCAGTGCAACAAGCCTTGCAG--GCATTGGTATTTGCACAACAAATAGTA------------------------------TTTTTTTTTTTTGGCTTAAATAAGGGAAATAG--GGAATATTTATCACAGCT--ATACatttattcatcatttaattccc----atttatttattcattaatttattCAAAC-ACTTCTTAA s panTro4.chr2B 169292265 1419 + 247518478 tctc--------------------aaaaaataaataa--ataaatgaaagaaaT----------AAAATTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCCTGGGAGGAAAATC---AGAAGACTGTTCCAGGAACAGGCAATTGAGGATGTCAGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAATAAGAACTGAGAGAAGACCATTATGTTCAGCAAGGGGGGCCACTAGAGCTCCATAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGCATCCTTTAGAG--AAGTTTGGCAATTAAAAGCAtg------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgt---------------------gCCACTGTTCATT-----------TTTACCTCTCATCTCCTATCTCATCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAATGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGTGCACAGAAGGGAGTC----------ttttttttttttttttt-aaatttatGCTGTGGTTCTGGGAGCCAGAGATAGAGAC-AAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAGTTATCCATAAAAGGACTC-----AAAAGAGGAGTCTGGGTTCACAGCT--TAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACTGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TC--AGAGCCTGAACTTAATAGGCATCTGATATTGCTATGTGTTGTTATATCTCAACCACCACCAACACCACCACTCCCAGCTAGCACTCACAGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTGGTGCTTACATAGGCTATTGTTTACTACATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTTCTCCCTTGCTTTTATGTGTCAGAATCTGTATAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGCCAGAGTGCCCATTCCTGATGTCCACAAAGTACAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCATGGCCTCTGAGCCAGTGCAACAAGACTTGCAG--GCATTGGTATTTGCACAACAAATAGTA---------------------------TTTTTTTTTTTTTTTTGCTTAAATAAGGGAAATAG--GGAATATTTATCATAGCT--ATACATTTAT---TCATTTAATTCCT----ATTTATTTattcattcatttattcaaac-atttcttaa i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18465612 1363 + 99152023 tctc--------------------aaaaaataaataa--aTGAATGAAAGAAAT----------AAAAGTTGCTTGGATTCTTATTAACTtgtgattagtcttgggaggaaaatt---agaagactgttccaggaacaggcaattgaggaagtcagaaaagtcagatgttggcaagatgtcaaagagaataagaactaagagaagaccatgatgttcagcaa--GGGCCCACTAGAGCTCCGTAAGAGAGA-GCCTGGGTATTGTGGTCA---------------------------------------------------------------------TTGGCAATTAGAGGGgtg------------tgtgcatgtgtgtg--------tgcgcgcgcgc------atgtgtgtgtg-tgCCAGTGTTTGTT-----------TTTACCTCTCACCTCCTATCTCGTCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAATGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCGCATAGCAAGGAGTC-------------ttttattttttttt-aaatttaaGCTGTGATGCTGGGAGCCAGAGACAGAGAC-AAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAATTATCCATAAAAGGACTC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCT--TAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACTGGTGGAGGGGAACAAGAAAGAACTTGTCCGGAGAAGTTTGGAGCCAAGCGTAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAAGGCAAGCAGCAGTCAT-TT--AGAGCTTGAACCTAATAGGCATCTAATATTGTTACCTGTTGTTATATCTCAACCACCACCATCACCACCACTCCCAGCTAGCACTCACAGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTGGTGCTTAC-------ATTGTTTACTACATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTTTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGTTTCTCAGGTATTCTTCTCCCCTGCTTTTATGTGTCAGAACCTGTATAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGGAGAGCCAGAATGCCCATTCCTGATGTCCACAAAGTACAGCAATGAACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCATGGCCTCTGAGCCAGTGCAACAAGACTTGCAG--GCATTGGTATTTGCACAACAAATAGTA-------------------------TTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTAAATAAGGCAAATAG--GGAATATTTATCATAGCT--ATACCTTTATTCATCGTTTAATTCCCatttatttatttattcattcatttattCAAACAACTTCTTAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86770112 1440 - 99891981 tctc--------------------aaaaaataaataa--aTAAGTGAAATAAAT----------AAAAGTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAGGAAAATT---AGAAGACTGTTCCAGGAACAGGCAGTTGAGGATGTCTGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATATCAAAGAGAATAAGAACTGAGAGAAGACCATGATGTTCAGCAA-GGGGGCCACTAGAGCTCCATAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGCATCCTTTAGAG--AAGTTTGGCAATTAGAAGCGTT------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg-tgCCACTGCTCATT-----------TTTACCTCTCATCTCCTATCTCGTCCAATACCTAATACTCTCTAGGGAAATGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCTCACAGCAGGGGACt---------tttttttttttttttttt-AAATTTACGCTGTGGTGCTGGGAGCCAGAGATAGAGACGAAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACCCAATCAAGTTATCCATAAAAGGACTC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCT--TAAAGGAATGAGGCTAAATAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACTGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCTGGCTTTCTTGTCCAAGGGCAAGCAGAAGTCAT-TT--AGAGCCTGAACCTAATAGGCATCTAATATTATTATGTGTTGTTATATCTCAaccaccaccatcaccaccacTCCCAGCTAGCACTCACAGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTGATGCTTACATAGGCTATTGTTTACTACATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCTTGTGGGCAGT-GGAGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTTCTCCCCTGCTTTTATGTGTCAGAACCTGTATAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGCCAGAGCCAGAGTGCCCATTCCTGATGTTGACAAAGTACAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGGCACTCTTGCCTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATATTGCATGGCCTCTGAGCCAGTGCAACAAGACTTGCAG--GCATTGGTATTTGCGCAACAAATAGTA------------------------------TTTTTTTTTTTTTGCTTAAATAAAGGAAATAG--GGAATATTTATCATAGCT--ATAcatttattcatcatttaattcct----atttatttattcattcatttattcaaac-atttcttaa i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28291850 1441 + 106825570 tctc------------aataaataaataaataaataa--ataaataaaagaaat----------aaaaGTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAGGAAGATT---AGAAGACTATTCCAGGAATAGGCAATTGAGGATGTCAGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAATAAGAGCTGAGAGAGGACCATGATGTGCAGCAA-GGGGGCCGCTAGAGCTCCACAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGTATCCTTTAGCG--AAGTTTGGCAATTACAATCCtg------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgtgt--------gtgtgtgtg-CGCCACTGATCATT-----------TTTACCTCTCATCTCATATCTCGTCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAGTGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCACGCAGCAGGGAGTCttttttttctttttctttctttttttt-AAATGTATGCTGTGGTGCTGGGAGCCAGAGATAGAGAC-AAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAGTTACCCACAAAAGGACCC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCTTATAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAACAACCACCGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TT--AGAGCCTGAACCTAATAGGCATCTGATATTGTTACGTGTTGTTACATCTCAACCACCACCAT---CATCACTCCCAGTTAGCACTCATGCAGCACCTGACCTGGGAACGGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGG------AGTGGTTCAGTGGTGCTTACATAGGCTATTATTTACTTCATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTACTTCCCTGCTTTTACGTGTCAGAACCTGTAAAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGCCAGAGTACCCATTCCTGATTTCCACAAAGTATAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCCGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCATGACCTCTGAGCCAGTGCAACAAGGCTTGCAG--GCATTGGTGTTTGCACAACAAATAG-----------------------------------TTTTTTTTTTTCTTAAATAAGGGAAATAG--GGAATATTTATCATAGAT--ATACATTTATTCATCATTTAATTCCC----ATTTATTTA-TCattcatttattcagac-atttcttaa i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53849490 1446 + 132586672 tctc--------aataaataaataaataaataaataa--ataaataaaAGAAAT----------AAAAGTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAGGAAGATT---AGAAGACTATTCCAGGAATAGGCAATTGAGGATGTCAGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAATAAGAGCTGAGAGAAGACCATGATGTGCAGCAA-GGGGGCCGCTAGAGCTCCACAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGTATCCTTTAGCG--AAGTTTGGCAATTACAATCCTC------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgtgt--------gtgtgtgCG-CGCCACTGATCATT-----------TTTACCTCTCATCTCATATCTCGTCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAGTGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCACGCAGCAGGGAGTCttttttttctttttctttctttttttt-AAATGTATGCTGTGGTGCTGGGAGCCAGAGATAGAGAC-AAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAGTTACCCACAAAAGGACCC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCTTATAAAGGAATGAGGCTAAACACCAGAAAGGCTCAAACAACCACCGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TT--AGAGCCTGAACCTAATAGGCAGCTGATATTGTTACGTGTTGTTACATCTCAACCACCACCAT---CATCACTCCCAGTTAGCACTCATGGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGG------TGTGGTTCAGTGGTGCTTACATAGGCTATTATTTACTTCATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGTCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTACTTCCCTGCTTTTACGTGTCAGAACCTGTAAAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGCCAGAGTACCCATTCCTGATTTCCACAAAGTATAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCCGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCATGACCTCTGAGCCAGTGCAACAAGGCTTGCAG--GCATTGGTGTTTGCACAACAAATAG----------------------------------TTTTTTTTTTTTCTTAAATAAGGGAAATAG--GGAATATTTATCATAGAT--ATACATTTATTCATCATTTAATTCCC----ATTTATTTA-TCattcatttattcagac-atttcttaa i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26932272 1455 + 104110932 tctcaataaataaataaataaataaataaataaataa--ataaataaaagaaat----------aaaagttgctTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAGGAAGATT---AGAAGACTATTCCAGGAATAGGCAATTGAGGATGTCAGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAATAACAGCTGAGAGAAGACCATGATGTGCAGCAA-GGGGGCCACTAGAGCTCCACAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGTGGGACAGGTCTCAAGTATCCTTTAGCG--AAGTTTGGCAATTAcaatcctg------------tgtgtgtgtgtgtg--------tgtgtgtgtgc--------gcgcgcgcg-tgccaCTGATCATT-----------TTTACCTCTCATCTCATATCTCGTCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAGTGGAATCCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAGCTGTCACAGTGCCCAAGAAGCACGCAGCAgggagtcttttttttctttttctttctttttttt-aaatgtatgctgTGGTGCTGGGAGccagagatagagac-aaaaaaagtTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATcaagttacccacaaaaggaCCC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCTTATAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAACAACCACCGGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGTTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TT--AGAGCCTGAACCTAATAGGCATCTGATATTGTTACGTGTTGTTACATCtcaaccaccaccat---catcactccCAGTTAGCACTCATGGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTGGTGCTTACATAGGCTATTATTTACTTCATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGCTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATCTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGTCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTACTTCCCTGCTTTTACGTGTCAGAACCTGTAAAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGCCAGAGTACCCATTCCTGATTTCCACAAAGTATAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCCGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCATGACTTCTGAGCCAGTGCAACAAGGCTTGCAG--GCATTGGTGTTTGCac-acaaatag--------------------------------ttttttttttttttcttaaataagggAAATAG--GGAatatttatcatagat--atacatttattcatcatttaattccc----atttattta-tcattcatttattcagac-atttcTTAA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50469018 1485 + 128595539 tctc----------------aataaataaataaataa--ataaataaaAGAAAT----------AAAAGGTGCTCAGATTCTTGCTAACTTGTGATTAGTTTTGGGAGGAAGATT---AGAAGACTATTCCAGGAATAGGCAATTGAGGGTGTCAGAAAAGTCAGATGTTGGCAAGATGTCAAAGAGAGTAAGAGCTGAGAGAAGACCATGATGTTCAGCAA-GGGTGCCACTAGAGCTCCACAAGAGAGAGGCCTGGGTATTGTGGTCAGAGGAAGTCAAGGAATTAGTAAATGCTAAAGAAAGAGGGACAGGTCTCAAGCATCCTTTAGAG--AAGTTTGGCAATTAGAACCCtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtg--------tatgtgtgtgt--------gtgtgtgtg-tgCCACTGATCATT-----------TTTACCTCTCATCTCATATCTCGTCCAATACCTAATATTCTCTAGGGAAGTGGAATTCTGGCTGAAAGGCAGGCTTGTCCTTCAACTGTCACAGTGCCCAAGAAGCACGCAGCAGGGAGTCttttttttctttttctttcttttttttAAAATTTATGCTGTGGTGCTGGGAGCCAGAGATAGAGAC-AAAAAAAGTTGTCCTGGAGTCTGTTGCATTGTGACTGAATCAAGTTATCCACAAAAGGACCC-----AAAATAGGAGTCTGGGTTCACAGCTTATAAAGGAATGAGGCTAAACAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACCAGTGGAGGGGAACAAGTAAGAACTTGTCTGGAGAAGGTTGGAGCCAAGTATAAATACCCACTGCTGACATTCACACATTCCCAGCTTGCTTGTCCAAGGGCAAGCAGGAGTCAT-TC--AGAGCCTGAACCTAATAGGCATCTGATATTGTTACGTGTTGTTACATCTTAACCACCACCAT---CACCACTCCCAGTTAGCACTCGTGGAGAACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACAGAAACTTCTAGACTGA------TGTGGTTCAGTAGTGCTTACATAGGCTATTATTTACTTCATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGGTTTGTACATTTAGCTCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTGGGCAGT-GGGGTGAGGAACCCTGTCTTAATCTGCTTCTCAGGTATTCTACTCCCCTGCTTTTATGTGTCAGAACCTGTAAAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCAGGAGTAGGCAGAGTCAGAGTGCCCATTCCTGATTTCCACAAAATATAGCAATGCACCCAGGCTTGATTTGGAGCCACTCTTGCCTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGTATGACCTCTGAGCCAGTGCAACAAGGGTTGCAG--GCATTGGTGTTTGCACAACAAATAGttgttttttttgtttttttgtttttgtttttgtttttgtttttTTGCTTAAATAAGGGAAATAG--GGAAtatttatcatagtt--atacatttattcatcatttaattccc----atttattta-tCGttcatttattcaaac-atttcttaa i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104676404 1386 - 158406734 tttc--------------------aaaatataaataaatataaatgaaataaataaaacataaaaaaaGTTGCTTGGATTCTTACTAACTTGTGATTAGTCTTGGGAAGAAAATTAGAAGAAGACTGTTTCAGGAGTAGGCAATTGAGGATGTCAGAAAAATCAGATGTTGACAAGATGTCAAAGAGAATAAGAACTGAGAGAAGACCATGATGTTCAGCAA-GGGGACAACTAGAGCTCCAGAAGAGAGAACCCTGGGGGTTGTGGTCAGAGGAAGTCCAGGAATTAGTAAACACTAAAGAAAATGGGGCAGGTCTCAAGCACCCTTTAGAG--AAGTTTGGCAATTAGAAGCCTA------------CATGTGTGTGTATG--------TGTGTGTAGGC---------------------CACTGTCCATC-----------TTTACCTCTCATCTCCTATTTCATCCAATACATAATATTCTCTAGGTAA-TGGAATACTGGCTGAAAGTCAGGCTTGTCCTTCGGTTGTCACAGTACCCAAGAAGTGCACAGCAGGGAGTC---TTTTTAttatttatttatttattt---atttatGCTGTAGTGCTGGGGGTCCGAGACAGAGAC-AGAAAAAGTTGTCCTGGAGTCT-TTGCGTTGTAACTGAATCAAGTTATCCATAAA--TATAA-----AAAATAGGAGTCCGGGTACACAGTT--TGAAGTCATGAGCCTAAGGAGCAGAAAGGCTCAAGCAACCACCTGTGGAGGGGAACAGGTAGGAAACTGCTTGGAGAAGTTTGAAGCCAAGTGTAAATACCCACTGCTGACATTCACAGCTCCCCAGCTTGCTCTTCCAAGGGCGAGCAGGAGTCATAGT--AGAGCCCGAACCTAGTAGGCATCAGATATTGTTACGT----------------------TATCACTGCCACTCCCAGCTAGCACTCACAGAGCACCTGACCTGGGAACAGTGCCTGAATCAGAAACTGAAACTCCGAGACCGAGACCGGTGTTGTTCAGTGGTGCT----------GTTGTTTACAACATCTGCACCAACCTTTCAGGAAGCATTTGACTTGTACATTTAGCGCTGTGGC----CCACTGAAGAGAATTTCCTGTAGGTAGT-GGGGTGAGGAACCCTGCCTTAATCTGCTTCTCAGGTATT---CTCCCCTGCTTCTATGTTTCAGAACCTGTGTAATCCTTGTAGGGCCTAT-CCGGGAGTAGGCAGAGTCAGAGCGCCCA----GGATGTCCACAAAGTGTAGCAGTGCACCCAGGCTTGATCTGGAGCCACTCTTGATTTCCTGAC-----------TGTTTTCAAAGATATGTTGCGTGGCCTCTGAGTCAGTGCAACGAGCCTTGCAG--GCATTTGTATTTGCACAACAAATAGTA----------------------------------TTTTTTTCTGCTTAAATAAGAGAAATAG--GGAATATTTATCATAGCT--ATCCATTTATTCACCATTCAATTTGC----attcactca------------ttcaaac-atttcttaa i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10220887 1408 + 30810995 --------------------------------------CCTTTAAAAAAAAAAT----------GGAAGTGGCTTGGATTTCCCCCAAATAATGA-TAATCTCTGGAGGAAAAGC---AGGAGACCGTTCTAGGAACAGATAATCAAAAATATCAGAAATGTCAGAAGTTAAAGAAAGGCCAGAGAGAATAAGCACTGAGAAAAGATCCTGGTATTCACTGA----GACCACTGGAGTTCTTTGAG-GAGAGATCTGAGTATTGTGGTAAAGTGAGGTCAGGGACGTGGTACATGGT-AAGAAAATGCTGCTGGTCCCAAGCATCCTGCAGAGGAGAGTGTGGCAATTAGAACCACA------------CACG-GGGCATGTGCTGCTTGTTTTCTATGTGT-------TGTGTGTGTGAGGCCACTTTCTCTTAGTTTCTTTCCTTTCCCTCTTATTTCCTACCTCTTTCACTACCTCCTATTCTCTAGGGAAATGGAATCCTGGCTAAAAGGCAAGCCTGTCCTCTAATTGTCAGGGTACCCAAACAG-ACACCACAG-----------------------TTTCTTAGTG-ACACTTA-----TGGTCCCGGAAGGCAGAAGTAGACTT----------TGTTC-AAAGTATATCATGTTATGACTGAGTCAAGTTATGTGTAAAAGAGCTCTTCAGAAAACAGGAGTCGAGGTACACAGCT--TAGAGAAATAGGAACGGAGAGCAGAAAGCTTTGGGCAATTCACCTTGGAGCGG-GCAAGTGGGAGCTTGTCTGGAGAAGTCCCTAGGCAACTACAAATACCTACTGCATACGTTTACACTTTCTCAGCTTGCTTCTTCAAGGGCAGGCAGGGAGCAT-TTAAAGAGTCTGAACC-AGCAGGCATCTAATA-----AAGCATTATTACGTCTCCACCACTATCAC--TGACCGTTCCCAGCCAGTACTCACAGAGCACCTAAAGCAGAAAGAGCTACTGAACC--------AAACTCAAGGACTGA------T-TGATTCTGTGGTGCCCACAGGAGCCATTGTTTATGACATTTCTATCCAGCTCCAAGGAAGCA-TTGACTTGTATGTTTAGTTCTACAACCCATCCATTGAAGGACATTTCCCAAGGGTAGTGGGGGTGAGGAACCTCCTCCAACTC----TCTCAGGTTTTCCTCTCTCCTGCTTTTGTGCTCAGGCATCTGTGTAATCCTTATAGGGCTTACACAAAAAGCAGGCAGAGCCAAAGTGTCCATTTTTGAGGTCAACAGAATATAGTAGTGCTCTCAGGCTTGATTTGGAGCCATTCTTGCCTTCCTGatatatatatatattttttattaGTTGCCTGTTGTGGCTTCTGAGCCAGGGCAGTGAGCTTTGGGGGTGTATTTGTATTTGCACAATAGATAGCA------------------------------TTTTTTACCTCTGCTTTAAATAAGGGTGATTATCTTACCACCTATCATATATCCATCTGTCTATTCATTATTCAATTCCA----atttattcattcattcatgcattcacac-atttattAA i canFam3.chr36 I 179 I 108 a score=43515.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 41884 12 + 478999 GCATGCACCATG s panTro4.chr2B 169293684 12 + 247518478 gcatgcaccatg i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18466975 12 + 99152023 GCATGCACCATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86771552 12 - 99891981 gcatgcaccatg i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28293291 12 + 106825570 gcatgcaccatg i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53850936 12 + 132586672 gcatgcaccatg i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26933727 12 + 104110932 GCATGCACCATG i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50470503 12 + 128595539 gcatgcaccatg i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104677790 11 - 158406734 gcatgca-catg i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10222403 12 + 30810995 gcaggccccatg i canFam3.chr36 I 108 I 110 a score=2770982.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 41896 804 + 478999 TGTCATGCCCATCTTAGAGGCCACAAAGGTTCTAAAACTATTACTTGTGGACAGAAAAAGAGACCCATATACATGTAGCATTATGTCTTATTGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCTGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATAAATTTTCTATTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAGCTCCTT-GGGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAGTATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTGATCTGATCTGATTCAAAATTTTATTTCCTGAAAGGTTTGCTCATGTCATATTAAGGTACTCTTGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATACTGCTGCTCTCTGCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAATAACAGGAAGGAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGTACATGGGCCACGAGAAGGCAGCATTTTACTTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGC----TGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAATGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCTTTAAAGAGGAGAAAAAATTATTCTATGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCACAGAACCAAATAATTCGGCCAGGCTCTCAGTCTTCATGGTTGAAAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTTAAATTCATAGTTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT s panTro4.chr2B 169293696 794 + 247518478 tgtcatccctatcttagaggcCACAAAGGTTCTAAAACTATTACGTGCCGACAGAAAAAGAGACCCATATACATGTAGCATTATGTCTTATTGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCCGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATAAATTTTCTATTGAACAATTACTC----TAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT-GGGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAGTATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTGCTCTGATCTGATTTAAAATTTTATTTCCTGAAAGGTTTACTCAGGTCATATTAAGGTACTCTAGTATTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATA---CTGCTCTCTGCTTTGGACTTCGCTGCTTTTCAATAACAGGAAGG---AATACTGTTTTCATCAGTTTTGTATATCCGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACTTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGC----TGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GATGTGGAAAATCTTCAGAAATGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCTTTAAAGAGGAGAAAAAAATATTCTACGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAGGCTTTCGGTCTTTGTGGTTGAAAAGTTATCAGGAAATTTAAAATGTAAATTCATAGTTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18466987 802 + 99152023 TGTCATGCCCATCTTAGAGGCCACAAAGGTTCTAAAACTATTACTTGCGGACAGAAAAAGACACCCACATACACGTAGCGTTGTGTCTTATTCGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCCAGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATAAATTTTCTATTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTATTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT-GGGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTTACAGTGGTAATTACAGTATTAAGCCCCATTTTGGAACACTT--ATCTGATCTGATTCAAAATTTTATTTCCTGAAAGGTTTACTCATGTCATATTAAGGTACTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATACTGCTGCTCTCTGCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAATAACAGGAAGGAACGATACTGTTTTCATCAGTTTTGCGCATGGGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACTTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGC----TGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAATGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCTTTAAAGGGGAGAAAAAATTATCCTATGTGACTCTATTACGAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAAGCTCTCAGTCTTCATGGTTGAAAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTTAAATTCATAGTTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86771564 801 - 99891981 tgtcatgcccatcttagaggccacaaagatTCTAAAACTATTACTTGCCGACAGAAAAAGAGACCCATATACATGCAGCATTTTGTCTTATTGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACACCCGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATAAATTTTCTATTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT-GGGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAGTATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTGATCTGATCTGATTTAAAATTTTATTTCCTGAAAGGTTTACTTATGTCATTTTAAGGTACTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTGAAATCTAAATA---CTGCTCTCTGCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAATAACAGGAAGGAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGCATATGGGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACTTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGC----TGTGTCTGGAGGGCTTTGA-GAGGTGGAAAATCTTCAGAAATGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCTTTAAAGAGGAGAAAAAATTATTCTACGTGACTCTATTACCAATCGTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAGGCTCTCAGTCTTCGTGGTTGAAAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTGAAATTCATAGTTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTCTTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28293303 803 + 106825570 tgtcatgcccATCTTAGAGGTCACAAAGGTTCTAAAACTATTACTTGCCAGCAGAAACAGAGACCCATATACATGTAGCATGATGTCTTATGGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCTGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATGAATTTTCTCTTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT--GGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAATATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTAATCTGATCTGATTCAAAATTTTACTTCCTGAAAGGTTTACTCACGTCATATTAAGGTACTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATA---CTGCTCTCTTCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAGTAACAGGAA-GAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGTACATGGGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACCTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGCTGTGTGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAACGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATTGTTAAAGAGGAGAAAAAATCATTCTACGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAAGCTCTTAGTCTTCATGGTTGAGAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTTAAATTCAAAGCTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53850948 803 + 132586672 tgtcatgcccATCTTAGAGGTCACAAAGGTTCTAAAACTATTACTTGCCAGCAGAAACAGAGACCCATATACATGTAGCATGATGTCTTATGGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCTGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATGAATTTTCTCTTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTAGACCAGGATTTAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT--GGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAATATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTAATCTGATCTGATTCAAAATTTTACTTCCTGAAAGGTTTACTCACGTCATATTAAGGTACTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATA---CTGCTCTCTTCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAGTAACAGGAA-GAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGTACATGGGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACCTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAATGCTGAGCTGTGTGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAACGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCGTTAAAGAGGAGAAAAAATCATTCTACGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAAGCTCTTAGTCTTCATGGTTGAGAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTTAAATTCAAAGCTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26933739 803 + 104110932 TGTCATGCCCATCTTAGAGGTCACAAAGGTTCTAAAGCTATTACTTGCCAGCAGAAACAGAGACCCATATACATGTAGCATGATGTCTTATGGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCTGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATGAATTTTCTCTTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGGTGGTAAGGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT--GGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAATATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTAATCCGATCTGATTCAAAATTTTACTTCCTGAAAGGTTTACTCACGTCATATTAAAGTACTCTAGTCTTTTCATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATA---CTGCTCTCTTCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAGTAACAGGAAGGAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGTACATGGGCCACGAGAGGGCagcattttacttcttttaagatttaatgCTGGTCTACAAAATGCTGAGCTGTGTGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAACGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCgttaaagaggagaaaaaattatt-tacGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAAGCTCTTAGTCTTCATGGTTGAGAAGTtatcaggaaatttaaaatttaaattcatagCTACAGAGCCACTAgtgaaaatttgcttttt i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50470515 794 + 128595539 tgtcatgcccATCTTAGAGGTCACAAAGGTTCTAAAACTATTACTTGCCAGGAGAAAAAGAGACCCATATACATGTAGCATTATGTCTTATGGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACACATCTGGCTGGGGGCAGGATGAGGAAGGACCTGATGAATTTTCTCTTGAACAATTACTCTAAATAAGTGTGC-TTTCTTTAGATGGTAAAGATTAGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTCCTT--GGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAATATTAAGCCCCATTTTGGAACACTTTA----------ATTCAAAATTTTACTTCCTGAAAGGTTTACTCACGTCATATTAAGGTACTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAATC---CTGCTCTCTTCTTTGGACTTGGCTGCTTTTCAGTAACAGGAAGGAACAATACTGTTTTCATCAGTTTTGTACATGGGCCACGAGAGGGCAGCATTTTACTTCTTTTAAGATTTAATGCTGGTCTACAAAACGCTGAGCTGTGTGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAACGTTCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATTCATCTTTAAAGAGGAGAAAAAATTATTCTACGTGACTCTATTACCAATCTTTGGGCAGAGAACCAAATAATTTGGCCAAGCTCTTAGTCTTCATGGTTGAGAAGTTATCAGGAAATTTAAAATTTAAATTCATAGCTACAGAGCCACTAGTGAAAATTTGCTTTTT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104677801 802 - 158406734 tgtcatgcccatattagaggctacaaaggtTCTAAAACTATTACTTGCATACAGAAAAAGAGACCCATATACATGTAACATTATCTCTTATTGGAATTCAGAGCAGGAAGAGAACATATCTGGCTGGGGGCAGGATAAGGAAGGAGCTGATAAATTTTCTATTGAACGATTATTCTAAATGAGTGTGCTTTTCTGTAGATGGTAAGGATTGGACCAGGATTCAAGATTACTGGATTTTGAGTCAAAGTTAGAACTCCTT-GGGGGAAAATCTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTACAATCTTAGGCCCTATTTTGGAACATTTTAATATGATCTGATTCAGAATTTTACTTTCTGAAATGTTTACTTATGTCACATCAAGATATTCTAGTCTTTTTATTTGCAAACTCATTTAAAATCTAAAAA---CTGCTCTCTGCTTTGGACTCGGCTGCTTTTCAGTAACACGAAGGAACAATACTGTTTCCATTAGTTTTGTACATGGACCACTAGAGGGCAGCATTTTACTTCTTTTAGGATTTAATGCTGGTCTACAGAATGCTGAGT----TGTGCCTGGAGGGCTTTGT-GGTGTGGAAAATCTTCAGAAATATGCAGTGAAACCCAGCATCCTCTGATGTAGCTTTAAAGAGGAGAAGAAATTATTCCTCGTGACTCTCTTACCAATCTTTGGGGAAAGAACCAAATAATTTGCCCAAGCTGTTAGTCTTCGTGGTTGAGAAGTTATCCGGACATTTAAAATTTAAATTCAGAGTTACAGGGTCACTGGTGAAAATTTGTTTTTT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10222525 773 + 30810995 TGCCATGCCCATCCCAAGGACCACGAAGGGACTAAAAATGTTGCTTACCAACAGGAGGCAAGACCTGAAGAAACGTGGAATCAACTCTTACTGGAATTTGGAGCAGGAAAAGAACCTATGTGACTGCAGGCAAGAAGAAGTGGATTCTAATAAATTTCCTACTAAACAGCTAGTCTAAATGAATATGC-TTTCTTTAGATGGTAAGGATTGGACCAGAAATCAAGAGTTCTGGATTTCAAGTCAAATTTTGAACTCCTTGGAGGAAAAATTTGCATATATGCAGAGTCATGGTGGTAATTAGAGTATTAGGCCCCATTTTGAAACACTGTAATCGGGTCTGATTCTAAATTTCATTTCCTGAAGGATTTGCTCGTATCATTTCAAGAGGCTTTAGTCCTTTTAATTGCAAACCCATTTAAAGCCTGAATA---CTGGATACTGTTCTCCGCCTGGCTGCTGTTGAATAACATGAAGGAA---------TTTCCACAGTTGTGTACATTGGACACTAGAGGGCAGTGTTTTACTTTTTTAAAGATTTACT-----TGTACAAAATGCTGAGC----TGTAGCTGGAGGGCTTTGTGGGCGTGGAAAAGCTTCAGATATTTGCAGTGAAACCCA----CCCCTGACTGATCTTCAAAGAGCAGAAGAAATGATTCCATGTGACTC----ACCGATCCTTAGGCAGAG--------AATTTGACTAAGCTGTTTGTCTTAATGGTTGAGAAGCTTTCAGGATACTTAGATTTAAACATGTCACTTACAGAGCCCCTCATGAAGATTTGCTTTTT i canFam3.chr36 I 110 I 228 a score=-3229.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 42700 8 + 478999 AATGA----------AAA s panTro4.chr2B 169294490 6 + 247518478 AATG------------AA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18467789 8 + 99152023 AATGA----------ACT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772365 6 - 99891981 AATG------------AA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294106 6 + 106825570 AATT------------AA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53851751 6 + 132586672 AATT------------AA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934542 6 + 104110932 aatt------------aa i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471309 6 + 128595539 AATG------------AA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104678603 18 - 158406734 AATGACCTCTTTAATGAA i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10223298 228 + 30810995 I a score=425783.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 42708 140 + 478999 ATTTTTTT--TT---------GGTCTACATTTTCACCCTCTGCGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTGTTTAACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACACCAAGGCAAGCTCCGTTTCCTTTCCC-- s panTro4.chr2B 169294496 139 + 247518478 CTTTTTTT--TT---------GGTCTATATTTTCACCCTCTG-GGTGGGGGCTCTTTTAAATGCGCCTGTTTAACCATACCGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACATCAATGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCA-- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18467797 140 + 99152023 TTTTTTTT--TT---------GGCCTATATTTTCACCCTCTGGGGTGGAGGCTCTTTTAAATGCCCCTGTTTAAACATACTGCGTCCAGAAATGTATACGTATCAC-AAGCCTGTTGGTAATGACACCAACGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772371 140 - 99891981 CTTTTTTT--TT---------GGTCTATATTTTCACCCTCTGGGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTGTTTAACCATACCGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACACCGATGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294112 144 + 106825570 CTTTTTTT-------GGGGGGGGGCTATATTTTCATCCTCTATGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTATTTAACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACATGTTGGTAATGACACCATTGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i rheMac3.chr12 C 0 I 1 s macFas5.chr12 53851757 149 + 132586672 CTTTTTTT--TTTGGGGGGGGGGGCTATATTTTCATCCTCTGGGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTATTTAACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACACCATTGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i macFas5.chr12 C 0 I 1 s papAnu2.chr12 26934548 151 + 104110932 cttttctttttttgggggggggggctaTATTTTCATCCTCTGGGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTATTTAACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACACCATTGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i papAnu2.chr12 C 0 I 1 s chlSab2.chr10 50471315 142 + 128595539 CTTTTTTTTTTT---------GGTCTATATTTTCACCCTCTGGGGTGGGGGCTCTTTTAAATGCCCCTATTTAACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCAC-AAACCTGTTGGTAATGACACCATTGCAAGCTCCGTTTCCCTTCCC-- i chlSab2.chr10 C 0 I 249 s calJac3.chr6 104678621 140 - 158406734 CCTTTTAT--CT---------GGTCTATATTTTCACCCTCTTGGGGGGAGGCTCTTTTAAATGCCCCTATTCGACCATACTGCATCCAGAAATGTATACATATCGC-AAAACTGTTGGTGATGACACCAATGCAGGCTCTGTCTCCCTTCGC-- i calJac3.chr6 C 0 I 4 s canFam3.chr36 10223526 120 + 30810995 ACTTTTCT--CT---------GGCCTATGTTATCACCTTCTGGGGTAGAGGCACTTCGAA---------------CATGCTGCACACACAAATGTGTATATATCACAAAATCTTTTGGCAACAA--------TAGGTCCCATTTCCCTTTCACC i canFam3.chr36 I 228 C 0 a score=203744.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 42848 66 + 478999 ----ATCATCGGTGGACCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATGGCACCCGTCTACTTTC s panTro4.chr2B 169294635 66 + 247518478 ----GTCATCTGTGGACCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATGGCACCTGTCTACTTCC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18467937 66 + 99152023 ----ATCGTCTGTGGACCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATAGCACCCGTCTACTTTc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772511 66 - 99891981 ----GTCACCTGTGGACCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATGGCACCCGTCTACTTTC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294257 66 + 106825570 ----GTTATCTGTGGATCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATGGCACCCGTCTACTTTC i rheMac3.chr12 I 1 C 0 s macFas5.chr12 53851907 66 + 132586672 ----GTTATCTGTGGATCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATCCTATGGCACCCGTCTACTTTC i macFas5.chr12 I 1 C 0 s papAnu2.chr12 26934700 66 + 104110932 ----ATTATCTGTGGATCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTACGCATCCTATGGCTCCCGTCTACTTTC i papAnu2.chr12 I 1 C 0 s chlSab2.chr10 50471706 66 + 128595539 ----GTTATCTGCGGATCACACCTACACCAGCGCTTCCTTCTGCGCATTCTATGGCACCCGTCTACTTTC i chlSab2.chr10 I 249 C 0 s calJac3.chr6 104678765 61 - 158406734 ----TCTGTCTGTGGACCACACCTACACCCGCGCTGCCTTCTGTGCATCCCATGCCACCCG-----TTTC i calJac3.chr6 I 4 C 0 s canFam3.chr36 10223646 64 + 30810995 AGGACTTGCCTATGGACC---CCTACTCCAGC-CTTC--TCTGTCCATCTTAGTGTGTTTGCCTACTTTC i canFam3.chr36 C 0 I 1933 a score=271928.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 42914 76 + 478999 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAACGTACACAATAAACGTTCTATTTCTTGA s panTro4.chr2B 169294701 76 + 247518478 TGTTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAAGTACACAATAAATGATCCTCTTCCTGA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468003 76 + 99152023 tgctttgggaatccccacagaggctagcacagtgctgaacttgtaaaaggtacacaataaacgttctacttcttga i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772577 76 - 99891981 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAGGTACACAATAAACGTTCTGCTTCTTGA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294323 76 + 106825570 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAGGTACACAATAAACGGTCTGCTTCTTGA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53851973 76 + 132586672 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAGGTACACAATAAACGGTCTGCTTCTTGA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934766 76 + 104110932 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAGGTACACAATAAACGGTCTGCTTCTTGA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471772 76 + 128595539 TGCTTTGGGAATCCCCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACTTGTAAAAGGTACACAATAAACGTTCTGCTTCTTGA i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104678826 76 - 158406734 TGCTTTGGGCATCCTCACAGAGGCTAGCACAGTGCTGAACCTGTGAAAGGTACACAGTAAGTGTTCTGCATGTTGA i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10225643 76 + 30810995 TGCTTTGGGATTCCCCACAGAGCCAGGTACAGTGTTAAGCATGTGGGACGTACACAATGGATGTTCTACTTGTTGA i canFam3.chr36 I 1933 C 0 a score=69320.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 42990 29 + 478999 ACGACATTGGATGATAATGCAATCTCTCT s panTro4.chr2B 169294777 25 + 247518478 ACGACATTGGATGATAATAAAA----TCT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468079 29 + 99152023 acgaCATTGGATGATTATGCAATCTCTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772653 25 - 99891981 ACGACATTGGATGATAATGCAA----TCT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294399 29 + 106825570 ACGGCATTGGATGATATTGCAATCTCTCT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852049 29 + 132586672 ACGGCATTGGATGATATTGCAATCTCTCT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934842 29 + 104110932 ACGACATTGGATAATATTGCAATCTCTCT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471848 29 + 128595539 ACGACATTGGATAATATTGCAATCTCTCT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104678902 29 - 158406734 ACTGCATTGGATGGTAATGCAATCTTTCT i calJac3.chr6 C 0 I 155 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C a score=9842.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43019 4 + 478999 CTTG s panTro4.chr2B 169294802 4 + 247518478 CTTG i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468108 4 + 99152023 CTTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772678 4 - 99891981 CTTG i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294428 4 + 106825570 CTTG i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852078 4 + 132586672 CTTG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934871 4 + 104110932 Cttg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471877 4 + 128595539 CTCG i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C e calJac3.chr6 104678931 155 - 158406734 I a score=46867.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43023 36 + 478999 Taagagagaggagaaagagagagaga---------gaagtgagag s panTro4.chr2B 169294806 32 + 247518478 TGAGAGAGAGGAGAGaga---agaga---------gaggtgaga- i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468112 36 + 99152023 Tgagagagaggagagagagagagaga---------agagagagga i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772682 23 - 99891981 Tgagagag-------------agaga---------agagagagga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294432 39 + 106825570 Tgagagagaggagagag----agagaagagagagcagagagag-- i rheMac3.chr12 C 0 I 60 s macFas5.chr12 53852082 33 + 132586672 Tgagagagaggagagag----agaggaga------agagagag-- i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934875 30 + 104110932 tgagagagaggagagag----agaga---------agagagag-- i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471881 30 + 128595539 Tgagagagaggagagag----agaga---------agagagag-- i chlSab2.chr10 C 0 I 6 s calJac3.chr6 104679086 39 - 158406734 TGAGAGAGAGGCGAGAA----AGAGGAGAGAGGAAGaagagag-- i calJac3.chr6 I 155 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C a score=25885.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43059 20 + 478999 ---------gagagagagacagaagagaa s ponAbe2.chr15 18468148 20 + 99152023 ---------gagacagagacagaagagag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772705 20 - 99891981 ---------gagagagagacagaagagag i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852115 16 + 132586672 -------------gagagacagaagagag i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934905 20 + 104110932 ---------gagagagagacagaagagag i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471917 20 + 128595539 ---------gagagacagacaggagagag i chlSab2.chr10 I 6 C 0 s calJac3.chr6 104679125 29 - 158406734 gaggggtggcagacagagagagaagagag i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C e rheMac3.chr12 28294471 60 + 106825570 I e panTro4.chr2B 169294838 0 + 247518478 C a score=843144.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43079 297 + 478999 agGTGAG-GGgggaggggagagagacacagagacagagtc----------agagacagagagagaccaaaagggaacagctggcagcagca-----gggaggcaggcttgaggagttggtgtctgatttacgtgggggccacagattggtttgatcaggtgtgaagtttacagggcgctgggaaggctggttgccccaccctaatcttatgcaaatgggctttccacttgctcagcgccatctcgtctactctttactgtacacgtggctggcaaagagaagggaagatagagctctcgttttgaacatg--taa s panTro4.chr2B 169294838 284 + 247518478 --------gggggaggggagagagac------agagagtc----------agagccagagagagatcaaaagggaaaagccggcagcagca-----gggaggcaggcttgaggagtccctgtctgatttacgtgggggccacaaattggtttgatcaggtgtgaagtttacacggcgccgggaaggctggttgccccaccctaatcttatgcaaattggctttccacttgctcagcgccatcttgtctactccttactgtacatgtggctggcaaagagaaaggaagatagagctctcgttttgaacacg--tag i panTro4.chr2B C 0 I 1389 s ponAbe2.chr15 18468168 307 + 99152023 aggtgagacggggaggggagagagacacagagacagagtcagagacagagagagacagagagagaccaaaagggaaaagcccgcagcagca-----gggaggcaggcctgagaagtaggtgtctgatttacgtgggggccacagactggttt-atcaggtgtgaagtttacagggcactgggaaggctggttgccccaccctgatcttatgcaaatgggctttctacttgctcagcgccatctcgtctactctttactgtacacgtggctggcaaagagaagggaagatagagctctcgttttgaacatg--tag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86772725 308 - 99891981 aggtgagagggggaggggagagagacacagagacagagtcagagacagagagagacagagagtgaccaaaagggaaaagccggcagcagca-----gggaggcaggcttgaggagtcagtgtctgatttacgtgggggccacagattggtttgatcaggtgtgaagtttacacagctcggggaaggctggttgccccatcctaatcttttgcaaatggactttccacttgctcagcgccatcttgtctattccttactgtacacgtggctggcaaagagaagggaagatagagctctcgttttgaacacg--tag i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294531 307 + 106825570 AGGTGAG-GGGGGAGGGgagagagacacagagacagagtcagagacaaagagagacagagagagaccaaaagggagaaggcggcagcagca-----gggaggcaggcttgaggagttggtgtctgatttacgtgggggccacagattggtttgatcaggtgtgaagtttacacggtgtggggaacgctggttgccccaccctaatcttacgcaaatgggctttccacttgctcagcgccatcttgtctactccttactgtacacgcggctggcaaagagaagggaagatagagctctcattttgaacatg--taa i rheMac3.chr12 I 60 C 0 s macFas5.chr12 53852131 307 + 132586672 aggtgag-gggggaggggagagagacacagagacagagtcagagacaaagagagacagagagagaCCAAAAGGGAGAAGGCGGCAGCAGCA-----GGGaggcaggcttgaggagttggtgtctgatttacgtgggggccacagattggtttgatcaggtgtgaagtttacacggtgtggggaacgctggttgccccaccctaatcttacgcaaatgggctttccacttgctcagcgccatcttgtctactccttactgtacacgcggctggcaaagagaagggaagatagagctctcattttgaacatg--taa i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26934925 306 + 104110932 aggtga--gggggaggggagagagacacagagacagagtcagagacaaagagagacagagagagaccaaaAGGGAGAAGGCGGCAGCAGCA-----GGGAGGCAGGCTTGAGGAGTTGGTGTCTGATTTACGTGGGGGCCACAGATTGGTTTGATCAGGTGTGAAGTTTACACGGTGTGGGGAAGGCTGgttgccccaccctaatcttacgCAAATGAGCTTTCCACTTGCTCAGCGCCATCTTGTCTACTCCTTACTGTACACGCggctggcaaagagaagggaagatagaGCTCTCATTTTGAACATG--TAA i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50471937 304 + 128595539 aggtgag-gggggaggggagagagacacagagacagagtcagagacaaagagagacagagagagaCCAAAAGGGAAAAGCCGGCAGCAGCA-----GGGaggcaggcttgaggagttggtgtctgatttaggtgggggccacagattggtttgatcaggtgtgaagtttacacggtgtggggaaggctggttgccccaccctaatcttacgcaaatgggctttccacttgctcagcgccatcttgtcta---cttactgtacacgcggctggcaaagagaagggaagatagagctctcattttgaacatg--taa i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104679154 308 - 158406734 --gagagagaaagagagaaaagagagagagagaaagag----agcgagagagagagagaatgcgcacaaaagggaaaagtcagcagcagcacattttataggcaggcttgaggaagtggtgtctgatttacgcgggggccatagattggtttgatcaggtgtgacgtttacacagcgcagacaaggctggttgccccaccctaatcttatgcaag-aagctttctacttgctcagtgccatcttttctacttctcactgtacacgcggctgccaaagagaagaaaagatagagctgtcattttgaacatgcctag i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C a score=763302.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43376 270 + 478999 ttccaggtagtattttcctattggca------caacttcacgcatttgcctgtgcaggcttccacttcgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttagg-a------------aaacaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggtaaaacttaccaaggactcctgtaccctcactatctgcctaactaatttcttcttaactcctatatcaACAAAACCCCACGATAATTTTTT--TCCTATGAAAAAATATTTT-ATTTGAAGAAATTA s panTro4.chr2B 169296511 266 + 247518478 ttccaggtagtattttcctattggca------caacttcaggcatttgcctgtgcaggcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttagg-a------------aaagaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttaccaaggactcctgtaccctcactatctgcctaa----tttcttcttaactcttatatcaATAAAACCCCACGATAATTTTTT---CCTATAAAAATGTGTTTTTATTTGAAGAAATTA i panTro4.chr2B I 1389 C 0 s ponAbe2.chr15 18468475 270 + 99152023 ttccaggtagtattttcctattggca------caacttcaggcatttgcctgtgcaggcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttagg-a------------aaataaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaagcttaccaaggactcctgtcccttcactatctgcctaactaatttcttcttaactcctatatcaATAAAACCCCACGATAATTTTTT--TCCTATGAAAAAATGTTTT-ATTTGAAGAAATTA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86773033 268 - 99891981 ttccaggtagtattttcctattggca------caacttcaggcatttgcctgtgcaggcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctgtttgttagg-a------------aaagaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttaccaaggactcctgtaccctcactatctgcctaa----tttcttcttaactcctatatcaATAAAACCCCACGATAATTTTTT-TTCCTATAAAAGTGTGTTTTTATTTGAAGAAATTA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28294838 270 + 106825570 ttccagatagtattttcctattggca------taatttcaggcatttgcctgtgcatgcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttagg-a------------aaaaaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttacctaggactcctctaccctcactatctgcttaactaatttcttcgtaactcctatatcaATAAAACCCATTGATAATTTTTT---CCTATGAAAATACGTTTTTATTTGAAGAAATTA i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852438 271 + 132586672 ttccagatagtattttcctattggca------taatttcaggcatttgactgtgcatgcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttaggaa------------aaaaaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttacctaggactcctctaccctcactatctgcttaactaatttcttcgtaactcctatatcaATAAAACCCATTGATAATTTTTT---CCTATGAAAATATGTTTTTATTTGAAGAAATTA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26935231 270 + 104110932 TTCCAGGTAGTATTTTCCTATTGGCA------TAATTTCAGGCATTTGCCTGTGCATGCTTCCACCTTGCTTGCCTATGTCTGCAACTTCATTTTACAGTCTGCtctttgttagg-a------------aaaaaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttacctaGGACTCCTCTACCCTCACTATCTGCGTAACTAATTTCTTCGTAACTCCTATATCAATAAAACCCCATGATAATTTTTT---cctatgaaaatatgtttttatttgaagaaatta i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50472241 270 + 128595539 ttccaggtagtattttcctattggca------taatttcaggcatttgcctgtgcatgcttccaccttgcttgcctatgtctgcaacttcattttacagtctgctctttgttagg-a------------aaagaaatgatttgagggctgcttttaattaaaaggaaaaccttatctaggactcctctaccctcactatctgcttaactaatttctttgtaactcctatatcaATAAAACCCCATGATAATTTTTT---CCTATGAAAATATGTTTTTATTTGaagaaatta i chlSab2.chr10 C 0 I 341 s calJac3.chr6 104679462 290 - 158406734 ttccaggtagtattttcctactggcacaacttcaacttcaggaattcgcctgtggaaggttccagcttgcttgcctacatctggagcttcattctacaggctgctctttgttagg-aaaataaataaataaataaatgatttgagggctgctttttgttaaaaggaaaaccctaccaaggactcctgtaccctcgttatctgcctaattaattcctcc-taactgctgtatcaATAAAATGCCACGATAATTTTTTTTCCCTATGAAAATAGATTTTTATTTGAAGAAATTA i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C a score=150218.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43646 62 + 478999 ACGTAAgctgtgtgtggtggctcacacctgtaatcccagtgctttgggaggtcaagatggga s panTro4.chr2B 169296777 62 + 247518478 ATGTAAgctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagtgctttgggagtccaaggtggga i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468745 62 + 99152023 ATGTAagctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagtgctttgggaggccaagatggga i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86773301 62 - 99891981 ATGTAAgctgggtgtggtagctcacacctgtaatcccagtgctttgggagtccaaggtggga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28295108 62 + 106825570 ATGTAAgctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagcgctttgtgaggccaaggtggga i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852709 62 + 132586672 ATGTAAgctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagcgctttgtgaggccaaggtggga i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26935501 62 + 104110932 atgtaagctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagtgctttgtgaggccaaggtggga i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104679752 62 - 158406734 ATGTAAgctgggtgtggtggctcacacctgtgatcccagtgctttgggaggctgaggtgaga i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C e chlSab2.chr10 50472511 341 + 128595539 I a score=834223.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 43708 293 + 478999 ggacccctcgaggcgagaagtttgagaccagcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagaaaattagccgggcatggtagtgtgcacctgtagtcccaactccttgggaggctgagataggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgattgtaccactgcactccagactgggtgacaaaacaagaccctgtctcc-----aaaaaaaaaaaa------------aaTTAATATAAAATGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGA-------ATATACTGT s panTro4.chr2B 169296839 291 + 247518478 ggatccctcgaggcgagaagtttgagaccagcctgggcaacaaaggaagaccctgtctctataaaaagttagaaaattagccgggcatgttagtgtgcacctgtagtcccaactccttgggaggctaaggtgggaggatgatttctggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgattgtaccactgcactccagactgggtgacaaaacaagaccctatctct-----aaaaaaaaaaaa--------------TTAATATAAAATGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGA-------ATATAGTCT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18468807 294 + 99152023 ggatccctcaaggtgagaagtttgagaccagcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagaaaattagccgggcgtggtagtgtgcacctgtagtcccaactccttgggaggctgagatgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttgcagtgagctgtgattgtaccactgcactccagactgagtgacaaaacaagaccctgtctct-----aaaaaaaaaaaa-----------aaaaaaaaacaaaaTGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGGTGAATGA-------ATATAGTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86773363 296 - 99891981 ggatcccttgaggcgagaagtttgagacctgcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagaaaattagccgggcatgttagtgtgcacctgcagtcccaattccttgggaggctgaggtgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgattgtaccactgcactccagactgggtgacaaaacaagaccctatctct-----aaaaaaaaaaaa---------aaaaaTTAATATAAAATGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGA-------ATATAGTCT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28295170 301 + 106825570 ggatcccttgaggggagaagtttgagaccagcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagcaaattaggcgagcatggtagtgtgcaccggtagtcccaactcctcgggaggctaaggtgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgactgtaccactgcactccagactaggtgacaaaacaagaccctatctct-----aaaaaaaaaaaa-----------aTATTAATATAAACTGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGAATAGAATATATAGTCT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53852771 301 + 132586672 ggatccctcgaggggagaagtttgagaccagcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagcaaattaggcgagcatggtagtgtgcacctgtagtcccaactcctcgggaggctaaggtgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgactgtaccactgcactccagactaggtgacaaaacaagaccctatctct-----aaaaaaaaaaaa-----------aaaTTAATATAAACTGTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGAATAGAATATATAGTCT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26935563 302 + 104110932 ggatccctcgaggtgagaagtttgagaccagcctgggcaacataggaagaccctgtctctataaaaagttagCAAATTAGGCgagcatggtagtgtgcacctgtagtcccaactcctcgggaggctaaggtgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgactgtaccactgcactccagactaggtgacaaaacaaaaccctatctct----aaaaaaaaaaaaa-----------aaattaatataaactgTGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGAATAGAATATATAGTCT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50472852 283 + 128595539 ggatccctcgaggcgagaagtttgagacaagcctgggcaacataggaagactctgtctctataaaaagttagcaaattaggcgagcatggtag---------------------cctcgggaggctaaggtgggaggatcatttttggccccaggagtttgaggttacagtgagctgtgactgtaccactgcactccagactaggtgacaaaacaagaccctatctctaaaaaaagaaaaaaaaa-----------aaaTTAATATAAAC--TGGAACTTTTCGCTAGTGGAGATGAATGAATAGAATATATAGTCT i chlSab2.chr10 I 341 C 0 s calJac3.chr6 104679814 309 - 158406734 ggatccctccaggcgagaagcttgaggccagcctgggca--ataggaagaccctgtctctataataagttagaaaattagttggacatggtagtatgcacctatagtcccaactgcttgggaggctgaggtgggaggatcatttctggccccaggagtttgaggttatagtgagttgtgattgtaccactgcactccagcatgagtggcagagcaagactctagctct-----aaaaaaaacaaaaagtaaaataaaaaTTAATATAAAA-ATGGAACTTTTTGCTAGTGGAGATACATGAATAGAATATACAGTCT i calJac3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr36 10225719 0 + 30810995 C a score=3684151.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 44001 1118 + 478999 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAGTTCCTAAGTGAAAAGCG---GAAGGATATG--CCCTAGAAGAGGGCATAACT----GAATGTGTGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTTCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCCCTTCCTCTGGATGGGTATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATTGTAAACATTTTCAGAGGTGGGAGGAGAAAAGATGGAAACCATAAAGACACAGCTATATAAAAGGTTAATTGCATATATA-TTTGGTTATGGTAATTTCTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAG---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATACGTAGAACTTAC-TTCAAAATATTTTGTTGTTTCTTAAAGTGCCTAATTGTACCATAGTCCAACACGAAGCCCTTTTATAAGAGAGATGG--AAGAGCATGCAGAATCTAATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACCAACTAAACATTATGATTCATTTTGATAAAACAAGCCAGTCAC----ATTAGTAAGAAACAgctcactctggctggagaacttgttccctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatgtcatgttcaccagaaaggccatttctgatcatctaatttatagactgaacacccctcaccctgtcattctactttacagcaccttgttctgttcacaatttataattgtattatcac------ttgtttacttgattaatgtctgtctcactcatagatcgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcactcccagcatttagggaaatacct-----gaagtagaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatATA-TTCTTGCTCTATATGTG--AAAACACCATTTATTCATA-----CAGTTAAACTATGATGTCAGTATTA----TGTCAGAT---TATTATAATGTCATATTCATTAACAACGAGACCCATAGTAAAAACAAAAATGTATTTGACAAA---------------------CTGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTATAG-------------ATGAAATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TTATCTTTTTGAAGAT s panTro4.chr2B 169297130 1117 + 247518478 GCAGATTTATGGAAATATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAGGATATG--CCCTAGAATAGGGCATAACT----GAATGTCTGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCCCTTCCTCCGGATGGGTATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATTGTAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTATATAAAAGGTTAATTGCATATATA-TTTGGTTATGTTAATTTTTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAG---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTTTGTTGTTTCTTAAAGTGCCTAATTGT-----------ACGCGAAGCCCTTTTATAAGAGAGGTGG--AATAGCATGCAGAATCTGATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACCAATTAAACATTATGATTCATTTTGATAAAACAAGCCAGTCGC----ATTAGTAAGAAACAGCTTGctctggctggaaaacttgttccctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatgtcatgttcagcagagaggccatttctgaccatctaatttatagattgaacacccctcaccccgtgattctactttatagcaccttgttctcttcgcaatttataattgtattatcac------ctgtttacttgattaatgtctgtctcactcatagattgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttaaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaggtagaaggcattcagtaaacacttgtggagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTATGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAACGAGGCCCATAGTAAAAATGAAAGTGTATTTGTCAAA---------------------CAGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTATAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18469101 1124 + 99152023 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAAAGGG---GAAGGATATT--CCCTAGAAGAGGGCATAACT----GAATGTCTGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCCCTTCCTCCGGATGGGTATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATTGTAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTATATAACAGGTTAATTGCATATATA-TTTGGTTATGTTAATTTCTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAG---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATACGTGGAACTTACTTTCAAAACATTTTGTTGTTCCTTAAAGTGCCTAATTGTACCATAGTCCAACATGAAGCCCTTTTATAAGAGAGACGG--AATAGCATGCAGAATCTAATCATTGGATTCAATAAGCAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACCAATTAAACATTATGATTCATTTTGATAAAACAAGCCAGTCGC----ATTAGCAGGAAACAGGtcgctctggctggagaacttgttccctactttcacaaggctgacttcttcatccgatcaaatgaaaatgtcatgttcaccagaaaggccatttctgaccatctaatttatagactgaacacccctcaccccatgattctactttatagtaccttgttctgttcacaatttataattgtattatcac------ctgtttacttgattaatgtctgtctcactcacagat-atgaactccgtgaaagcaagaatcaattctgttttgaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaagtagaaggccttcagtaaatacttgtggagtgaatgtatGTATTTCTTGTTCTGTATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTATGATGTCAGTATTA----TGTCAGAT---TATTATAATGTCATATTCATTAACAACGAGGCCCATAGTAAAAACAAAAATGTATTTGACAAA---------------------CAGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTACAGT------------ATGAAATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TTATCTTTTTGAAGAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86773659 1107 - 99891981 GCAGGTTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAAGATATG--CCCTAGAATAGGGCATAACT----GAATGTCTGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCCCTTCCTCCGGATGGGTATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATTGTAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTCTATAAAAGGTTAATTGCATATATA-TTTGGTTATGTTAATTTTTGTATATATGCTTCATATCTTTAACAG---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTTTGTTGTTTCTTAAAGTGCTTAATTGT-----------ACCCGAAGCCGTTTTATAAGAGAGATAG--AATAGCATGCAGAGTCTGATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTAATGAAGTACCAATCAAACATTATGATTCATTTTGATAAAACAAGCCAGTCGC----ATTAGTAAGAAACAGCTTGctctggctggagaacttgttccctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatgtcgtgttcaccagagaggccatttctgaccatctaatttatagaccgaacacccctcacgccgtgattctactttatagcaccttgttctgttcacaacttata-----attatcac------ctgtttacttgattaatgtctgtctcactcatagatcatgaactccgtgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaggtagaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTGTGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAACGAGGCCCATAGTAAAGATGAAAATGTATTTGTCAAA---------------------CAGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGT-----------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28295471 1126 + 106825570 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAGGATATG--CCCTAGAAGAGGGTGTAACT----GAACGTCGGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCTCCCCTTCCTGATGGATATCATTCCATATCATTACAGGCAGTCCTGAGAGGGAGATTACAAATCATAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTATAAAAAAGGTTGATTGCATATATA-TTTGGCTATG-TAATTTTTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAT---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTCTGCTGTTTCTTAAAGTGCCCAATTGTACCATAGTCCAACACGAAGCCCTTTCATAAGAGAGATGG--AATAGCATGCAGAATCTAATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACTAATTAAACATTGTGATTCATTTTGATTAAACAAGCCAGTCGC----ATTAATAAGAAACAGCTTGctctggctggagaacttgttcgctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatatcatgttcaccagaaaggccatttctgaccatctaatttatagactgaacacccctcatcctgtgattctactttacagaaccttgttctgttcacaatttataattgtattatcac------ctgtttacttgattaatgtctatctcactcacagattgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaagtagaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTCTGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAATGAGG-CCATAGTAAAAACGAAAATGTATTTTTCAAA---------------------CAGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTGTAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53853072 1126 + 132586672 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAGGATATG--CCCTAGAAGGGGGTGTAACT----GAACGTCGGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCTCCCCTTCCTGATGGATATCATTCCATATCATTACAGGCAGTCCTGAGAGGGAGATTACAAATCATAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTATAAAAAAGGTTGATTGCATATATA-TTTGGCTATG-TAATTTTTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAT---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTCTGCTGTTTCTTAAAGTGCCCAATTGTACCATAGTCCAACACGAAGCCCTTTCATAAGAGAGATGG--AATAGCATGCAGAATCTAATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACTAATTAAACATTGTGATTCATTTTGATTAAACAAGCCAGTCGC----ATTAATAAGAAACAGCTTGctctggctggagaacttgttcgctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatatcatgttcaccagaaaggccatttctgaccatctaatttatagactgaacacccctcatcctgtgattctactttacagaaccttgttctgttcacaatttataattgtattatcac------ctgtttacttgattaatgtctatctcactcacagattgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaagtagaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTCTGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAATGAGG-CCATAGTAAAAACGAAAATGTATTTTTCAAA---------------------CAGTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTGTAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26935865 1123 + 104110932 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAGGATATG--CCCTAGAAGAGGGTATAACC----GAATGTTGGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTC---CTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCTCCCCTTCCTGATGGGTATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATCATAAACATTTTcagaggtggggagagaaaagATGGAAACCACAAAgacacagctataaaaaaggttggttgcatatata-tttggttatg-taatttttgtatatatgctTCATATCTTTTACAT---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAacttactttcaaaatattctgcTGTTTCTTAAAGTGCCCAATTGTACCATAGTCCAACACGAAGCCCTTTCATAAGAGAGATGG--AATACCATGCAGAATCTAATCATTAGATTCAATaagtaaatatgtattgagtactGATGAAGTACTAATTAAACATTGTGATTCGTTTTGACTAAACAAGCCAGTCGC----ATTAATAAGAAACAGCTTGCTCTGGCTGGAGAACTTGTTCGCTACTTTCACAAGGTTGACTTCTTAATCCGATCAAATGAAAATATCATGTTCACCAGAAAGGCCATTTCTGACCATCTAATTTATAGACTGAACACCCCTCATCCTGTGATTCTACTTTACAGAACCTTGTTCTGTTCCcaatttataattgtattatCAC------CTGTTTACTTGATTAATGTCTATCTCACTCACAGATTGTGAACTCCATGAAAGCAAGAATCAAATCTGTTTTGAAGCACACCCAGCATTTAGGGAAATACCT-----GAAGTAgaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatatatttcttgTTCTATATGTG--AAAAAACcatttatt-atacaaatcagtTAAACTCTGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAATGAGG-CCATAGTAAAAacgaaaatgtatttttcaaa---------------------cagTTCATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTGTAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50473135 1126 + 128595539 GCAGATTTATGGAAGTATGACATCTAAAAAGACCAGAATAATTCCTAAATGAAGAGGG---GAAGGATATG--CCCTAGAAGAGGGTGTAACT----GAATGTTGGGGGAAGGTTTTCAAACTTTACTCCTTCTAATGCAAACCTCTGTGACCCCTTACAACCTCCCCTTCCTGATGGATATCATTCCATATCATTACAGGCAGTACTGAGAGGGAGATTACAAATCATAAACATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAACCACAAAGACACAGCTATAAAAAAGGTTGATTGCATATATA-TTTGGTTATG-TAATTTTTGTATATATGCTTCATATCTTTTACAT---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTCTGCTGTTTCTTAAAGTGCCCAATTGTACCATAGTCCAACACGAAGCCCTTTTATAAGAGAGATGG--AATAGCATGCAGAATCTAATCATTAGATTCAATAAGTAAATATGTATTGAGTACTGATGAAGTACTAATTAAACATTGTGATTCATTTTGATTAAACAAGCCAGTCGC----ATTAATAAGAAACAGCTTGctctggctagagaacttgttcgctactttcacaaggttgacttcttaatccgatcaaatgaaaatatcatgttcaccagaaaggccatttctgaccatctaatttatagactgaacacccctcatcctgtgattctactttacagaaccttgttctgttcacaatttgtaattgtattatcac------ctgtttacttgattaatgtctatctcactcatagattgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcacacccagcatttagggaaatacct-----gaagtagaaggcattcagtaaatacttgtggagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATATGTG--AAAAAACCATTTATT-ATACAAATCAGTTAAACTCTGATGTCAGTATTA----TGTCAGATTAATATTATAATGTCATATTCATTAACAACGAGG-CCATAGTAAAAACGAAAATGTATTTTTCAAA---------------------CAGTTTATTAGTAGGAAATTGAGTTTAGTGTAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TAATCTTTTTGAAGAT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104680123 1120 - 158406734 GAAGATTAATAAAAGCATGACATCTAAAAAGACCGGAATAATTCTTAAATGAAGAGGG---AAAGGGGGTG--CCCTAGAACAGGACATCACT----GAATGTCC-GGGAAGTTTTTCAAACTTTACTCCTCCTAATGTAAACCTCTGTGACCCCTTACAACTCCTTCCTCTGGATGGGTATCGTTCCATATAATTAGAGGCAATACTGAGAGGGAGATTACAAACTGTAACCATTTTCAGAGGTGGGGGGAGAAAAGATGGAAATCACAAAG--AGAGCTACGTAAAAGGTTAATTATATATATA-TTTGGTTATGTTAATTTTTGTATATATGCTTCAGATCTTTTACAA---TCAGTGTGTTAGTGGCAAATAATTATGTGGAACTTACTTTCAAAATATTTTGTTGATTCTTGAAATGCTCAATTGCATGATAGTCCAACACGAAGCCCTTTTATCAGAGAGATGG--AATAGCATGCAGAATCTAATCGTTAGATTCAGTAAGTCAATTTGTATTGAGTACTGATGAAGTATCAGTTAAAGATTGTGATTTATTTTGGTAAAACAAGCTAGTCAC----ATTAATGAGAAACAGCTTGCTCTGGCAGGggaactcgttccctacttttacaaggatgacttctcaatctgatcaaatg-aaatgtcatgttcaccagagaggccattcctgaccatctggtctatagactgaacaccccttaccc-atgattctactttatagcaccttgttctgttcacaatttataattgtattctcac------ct-cttacttctttaatgtctgtctcactcatagatcgtgaactccatgaaagcaagaatcaaatctgttttgaagcacacccagcatttaggggaatatct---gggaagtagaaggcattcagtaaatattagcgaagtgaatgtatATATTTCTTGTTCTATTTGTGAAAAAAAACCATTTATT-ATAAAGA--AGTTAAATTCTGAT----GTATTA----TGTCAGATTAATACTATAATGTCATATTCATTAATAATGAGGCCCTTAGCAAAAACCAAAATGTGTCTGTCGAA---------------------CAGTTCATTAGTGGGAAATCGAGTTTAGTGTAGT------------ATGAGATTTTCAGGTAAGATATTC-----------TGATCTTTTTCATGAT i calJac3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr36 10225719 1155 + 30810995 GCTGAGTTTTGCAAGAGTGAC--CATAAAACACCTTACTTATTCTTAAATAAGGAGGGGAAGAAGGATATGCTCCCCAGAATGGGGGAATACTTTTCAAACTTCAGAGAA----TCCGGATCCTCACTCCTTCTGATTCAGACTTCTACAAACCCCCATAATTCCTTCTCTCAGTTGATAATCATTTCATGTAGTTAGAGATGATATGGAGGGGGAGGTTTTGAACTGTGACTATTACC-GACATGGGGAAAGATGAGATGGGAACCACAAGGACATGGCTATATAAAGGGTTAATTGTATATATGTTTTAATCATGTCAATTTTTGCGTGTATGCCTTAGGTCTTTTATATAAATTAGTGTGTTAGTGGCAAATAAATATGTGGTACTCACTTTCAAAATAGTTTGGTGTTTCTT-ATGTGCCCCATTGTACCATAATTCAACACATAGATCTTTGCTAAGAGAGATGGAAAATAGCATGCA----TCCATGGTTGGATTCATTA----AATACATATTGAGCACTAATGAAGTACCAATTAGACATTGTGATTCATTTAAAAAAAATAAGCCAGTCTCATAAATAAATAAGAGACTACTTGGCTtgcctggaagacttgttccctccttttataaggctgacttctcaaccctagtagatg-aaatgtcgttttc-ccagagaggcctttcctgactactta--------aatgaaccccct---cctcattattctatttcattgcatc-----ctgctcacagtttctaattgtgtacacacacctatttctttacttgattggtgtctatc-------------atgaactctttgaaagctagcatcaaatcggttttgcaacatgttcagaaggtaggggagtacctactgagaagtaagaggcatttaataaatatttgtggagtagatgtatATGTTTCTTGTTCTATATGTA--AAAACAGAGTGTTTT-GTA--AATATGTTCAATTCTACTCTTAATATTATTTTTGTTAAATAAATATCATGATGCCATATCCATTAGCAGCTAGACCCCTAGTGACAACCAAA--TCATTTGTCAAAACTGATTAATAAAAAAAAAAGTGATTCATTAATGAGATATTGGATTTAGTAAGGTTAGATTTAGTAGGTAAGATTTTCAGGTAAAATGTTTGAATATTTGAATTAttttttttaagat i canFam3.chr36 C 0 N 0 a score=92414.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 45119 34 + 478999 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCAAGGCAGAC s panTro4.chr2B 169298247 34 + 247518478 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCAGGGCTGAC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18470225 34 + 99152023 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGACAGGGCAGAC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86774766 34 - 99891981 ATGACAGCATATTTAAGCTTTAGGCAGGGCTGAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28296597 33 + 106825570 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCAAGG-TGAC i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53854198 33 + 132586672 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCAAGG-TGAC i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26936988 33 + 104110932 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCaagg-tgac i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50474261 33 + 128595539 ATGACAGCATATTTAAGCTTTGGGCAAGG-TGAC i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104681243 34 - 158406734 ATGTCAGCATATTGAAGGTTTGGGCAGGGCTGAC i calJac3.chr6 C 0 C 0 a score=5614.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 45153 7 + 478999 ------------------------------------ttttttt s panTro4.chr2B 169298281 43 + 247518478 TTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTGttcttgttttttttttttttt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18470259 13 + 99152023 ------------------------------ttttttttttttt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86774800 8 - 99891981 -----------------------------------tttttttt i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28296630 7 + 106825570 ------------------------------------ttttttt i rheMac3.chr12 C 0 I 4 s macFas5.chr12 53854231 7 + 132586672 ------------------------------------ttttttt i macFas5.chr12 C 0 I 5 s papAnu2.chr12 26937021 7 + 104110932 ------------------------------------ttttttt i papAnu2.chr12 C 0 I 5 s chlSab2.chr10 50474294 7 + 128595539 ------------------------------------ttttttt i chlSab2.chr10 C 0 I 145 e calJac3.chr6 104681277 0 - 158406734 C a score=671973.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 45160 294 + 478999 ttttttttgagacag-attttcactc--gttgcccaggctggagggcaacggtacgatctcggctttccgcaacctccgcctcccgggatcaagcaattcttctgactcagcctcccgagtagctgggattacaggcatgcggcaccacgcccggctaattttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctggtctcagactcccaatctcaggtgatctgcccgccttggacttccaaagtactgggatgacaggcgtgagccactgcgcccggccTGGGCT--- s panTro4.chr2B 169298324 299 + 247518478 ttttttttgagacag-agtttcactcttgttgcccaggctggagtgcaatggtacgatctcggctctccacaacctctgcctcccgagatcaagcaattcttctgactcagcctcccgagtacctgggattacaggcatgcggcaccacgcccggctaattttgtatttttagtagagacagggtttctccatgttggtcaggctggtcttggactcccaatctcaggtgatccgcccgccttggactcccaaagtgctgggattacaggcctgagccatcaagcccagccTAAGCTGAC i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18470272 291 + 99152023 ttttttttg---cag-attttcactc--attgcccaggctggagtgcaacggtacgatctcggctttccacaacctccgcctcccgggatcaagcaattcttctgactcagcctcccgagtagctgggattacaggcatacggcaccatgcccggctaattttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcaggctggtctcagactcccaatctcaggtgatctgcccgcctcagactcccaaagtgctgggatgacaggcaagagccactgagcccggccTGGGCT--- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86774808 299 - 99891981 ttttttttgagacag-agtttcactcctgttgcccaggctggagtgcaatggtacgatctcagctctccacaacctctgcctcctgggatcaagcaattcttctgactcagcctcccgagtagctgggattacaggcatgcggcaccacgcccagctaattttgtatttttagtagagacggggtttctccatgttggtcaggctggtcttggactcccaatctcaggtgatctgcccgcctcggactcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccatcaagcccggccTAAGCTGAC i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28296641 296 + 106825570 ttttttttgagacag-agtttcactcttgttgcccaggctggagtgcaatggtaggatcttggctctccgccacctctgcctcccgggatcaatcaattcttctgactcagcctcccaaatagctgggattacaggcatgcagcaccatgcccagctaattttgtatttttagta---atggggtttctgcatgttggtcaggctggtctcgaactcgtgatctcaggtgatctgcccgtctcagactcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccagtgcgcccggccTGGGCTGAC i rheMac3.chr12 I 4 C 0 s macFas5.chr12 53854243 296 + 132586672 ttttttttgagacag-agtttcactcttgttgcccaggctggagtgcaatggtaggatcttggctctccgcaacctctgcctcccgggatcaatcaattcttctgactcagcctcccaaatagctgggattacaggcatgcggcaccatgcccagctaattttgtatttttagta---atggggtttctgcatgttggtcaggctggtctcgaactcgtgatctcaggtgatctgcccgtctcagactcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccagtgcgcccggccTGGGCTGAC i macFas5.chr12 I 5 C 0 s papAnu2.chr12 26937033 296 + 104110932 ttttttttgagacag-agtttcactcttgttgcccaggctggagtgcaatggtaggaTCTTGGCTctccgcaacctctgcctcccgggatcaatcaattcttctgactcagcctcccaaatagctgggattacaggcatgcggcaccatgcccagctaattttgtgtttttagta---atggggtttctgcatgttggtcaggctggtctcgaactcatgatctcaggtgatctgcccgtctcagactcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccagtgcgcccggccTGGGCTGAC i papAnu2.chr12 I 5 C 0 s chlSab2.chr10 50474446 297 + 128595539 ttttttttgagacagaagtttcactcttgttgcccaggctggagtacaatggtagggtcttggctctccgcaacctctgcctcccgggatcaatcaattcttctgactcagcctcccaaatagctgggattacaggcatgcggcaccacgcccagctaattttgtatttttagta---atggggtttctgcatgtttgtcaggctggtctcgaactcgtgatctcaggtgatctgcctgtctcagactcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccagtgcgcctggccTGGGCTGAC i chlSab2.chr10 I 145 C 0 e calJac3.chr6 104681277 0 - 158406734 C a score=4180038.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 45454 1398 + 478999 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcccggtttgattgcgccagtgtctgacagc----tgtgtggtgcctgtatcataacagttgttaaataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGCTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGGGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACAGCATATGCTAGACAAAACTCTTAGGGAAAGAATATGTATATACGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGAGAAGCATTCAGTACATAAATTATTAGGCTCAAGTAGGAGGTTACTATAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTATATTTtgaattggaagaatgccgatctgggagtcaaaaactcttaattttgagccatgggtgcataaccttgggtattttaatattgggcttagtttactggtttgcaaaa-gagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattctGCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGACATTACCAGGATAAATATAGGAAAAACTAGTAGTATCCCCTTA-CCCCCTC-ACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACAGAACATCCTTCTATCATCC-TTTTTGGTACACACAAACATATATAAACAAAAATAAATGTATGTAAGCTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATAAAATATACATTATTCAGATGTGtttccctgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaataatatttcagtaaacaccattgtagaagtatcactatatgctgatgcttttgttttttttctgtcagatacatttttgaaaataggatttttgggtcaaaggtatatgcagttttcattttaatagataattgctaatttatttctaaaatatttgtggtgatttaGAATG-GTAACAGTGCCAA-------------TTGCCAGCACTGAGTTAATATTTTGTTTTCTATTGCTGCTCACCTGAAGGCTAAAAATGATGCCATTTTAGTTTAATTTGAATTATCTAGATTTTGTTGGAACAAGAAAAAAGAATTCTACTTGCATCTCTTCAAATGATGGGTCTGCATACCGTCTACTATGAATTGGCAATTCGTAGCCTTTGCATATGTCCATTTTAATATGATCAACTTTTAGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTTTGTCTTTCTGC-TATGGTTTACATAGCGAGATATACTT--GTTTTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCGTTCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT s panTro4.chr2B 169298623 1415 + 247518478 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcctattttgattgggccagtgtctgagggctgattgtttggtgcctgtatcataatagttgtt-aataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGGGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATATGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGAGAAGCATTCAGTACATAAATTATTAGGCTCAAGTAGGAGTTTACTATAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTATGTTTtgaattggaagaatgctgatctgagagtcaaaaactcttaattttgagccatggatgcataaccttgggtatgttaatattgggcttagtttactggtttgcaaaatgagatgagtggacaaaatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattctGCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGACATTACCAGGACAAATATAGGAAAAACTGGTAGTATCCCCTTA-CCCCCTC-ACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACTGAACATCCTTCTATCATCC-TTTTTGGCACACACAAACATATATAAACAAAAATAAATGTATGTAAGTTTTCTTGCCTGAAAAAAAGTA----AAAATATACATTATTCAGATGTGtttctttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaatagtatttcagtaaacatcattgtagaagtatcactatatgctgatgcttttgttttttttctgccagatacatttttgaaaatggaatttctggatcaaaagtatatgcagttttcattttaatagataattgctaatttctttctaaaatatttatggtgatttagaatg-ataacagtgccaatttccctgtattcttgccagcactgagttaatattttgttttctattgctgctcatctgaaggctaaaaatgatgccatttttgtttaatttgaattatctagattttgttggaagaagaaaaaagaattctacttgcatcttttcaaatgatgggtctgcataccatctactatgaattggcaatttgtagcctttgcatatgtccattttAAAATCATCAACTTTTGGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTTTGTCTTTCTGCTTATGGTTTACATAGCCAGATATACTTCCATTTTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCTTTCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGtttattt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18470563 1417 + 99152023 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcccgttttgattgggccagtgtctgagggctgactgtgtggtgcctgtatcataacagttgttaaataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGCGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATATGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGACAAGCATTCAGTACATAAATTATTAGGCTCAAGTAGGAGGTTACTATAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTATATTTTGAATTAGAagaatgctgatctgagagtcaaaaactcttaattttgagccatggatgcataaccttgggtatcttaatatggggcttagtttactggtttgcaaaa-gagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctgggcatgaattttcatgattctGCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGACATTACCAGGATAAATATAGGAAAAACTAGTAGTATCCCCTTA-CCCCCTC-ACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCATGGAACATCCTTCTATCATCC-TTTTTGGTACACACAAACATATATAAACAAAAATAAATGTATGTAAGTTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATAAAATATACATTATGCAGATGTgtttccttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcgctataaataatatttcagtaaacatcattgtagaagtatcactatatgctgatgcttttgtttttcttctgtcagatacatttttgaaaataggatttttgggtcaaaggtatatgcagttttcattttaatagataattgctaatttctttctaaaatattcatggtgatttagaatg-ataacagtgccaatatccctgtactcttgccagcactgagttcatgttttgttttctattgctgctcatctgaaggctaaaaatgatGCCATATTTGTTTTATTTGAATTATCTAGATTTTATTGGAACAAGAAAAAAGAATTCTACTTGCATCTTTTCAAATGATGGGTCTGCATACCGTCTACTATGAATTGGCAATTCGCAGCCTTTGCATATGTCCATTTTAATATGATCAACTTTTAGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTGGTTTGTCTTTCTGC-TGTGGTTTACATAGCAAGATATACTTCCGTTTTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCATTCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCTTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86775107 1408 - 99891981 ATTTTTATTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcctattttgattgggccagtgtctgagggctgattgtttggtgcctgtgtcataacagttgtt-aataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGCTAGCTTCATTTACCTAAAGAGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTACATATGTGCATGCAAACCACACAGACTGAAAGAGAAGCATTCAGTACATAAATTATTAGGCTCAAGTAGGAGTTTACTATAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTATATTTTGAATTGGAAGAATGCTGATCTGAGAGTTGAAAACTCTTAATTTTGAGCCATGGAtgcataaccttgggtatcttaatattgggcttagtttactggtttgcaaaatgagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattctGCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGACATTACCAGGATAAATATAGGAAAAACTAGTAGTATCCCCTTA-CCCCCTC-ACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACTGAACATCCTTCTATCATCC-TTTTTGGCACACACAAACATATATAAACAAAAGTAAATGTATGTAAGTTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATAAAATATGCATTATTCAGATGTGtttctttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaatagtatttcagtaaacatcatcgtagaagtatcattatatgctgatgcttttgttttttttctgtcagatacattttttaaaatagaatttctggatcaaaagtatatgcagttttcattttaatagataactgctaatttctttctaaaatatttatggtgatttagaatg-ataacagtgcctatttccctgtattcttgccagcactgaattaatattttgttttctattgttgatcatctgaaggctaaaaatgatgccatttttgcttaatttggattatctagattttgttggaagaagaaaaaagaattctacttgcatcttttcaaatgatgagtctgcataccctctactatgaattggcaattcttagcctttgcatatgtccattttAAAATGATGAACTTTTGGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTTTGTCTTTCTGCTTATGGTTTACATAGCCAGATATACTTCCAT----------ATCCATGGTTTGTTTTCTGTCTTTCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28296937 1419 + 106825570 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcctattttgattgggccagtgtctgagggctggttgtttggtgcctgtatcataacagttgttaaataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACGTAGATAGCTTCATTTACCTAAAGGGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATTTGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGAAAAGCATTCAGTACATAAATTACTAGGCTCAAGTAGGAGTTCACTCTAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTGTATTTtgaattggaagaaggctgatctgagagtcaaaaactcttaattttgagccatggatgcataaccttgggtatcttaatatt-ggcttagtttactggtttgcaaaatgagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattccaCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGATATTACCAGGATAAATATAAGAAAAACTAGTAGCATCCCCTTA-GCCCCTCAACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACCAAACACCCTTCTATCATCC-TTTCTGGCACACACAAACATATATAAACAAAAATAAACATATGTAAGTTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATGAAATATACATTATTCATA-GCGTttccttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaatagtatttcagtaaacaacattgtagaaatatcactatatgctgatgcttttgttttttttctgtcagatacatttttgaaaataggatttctgggtcaaaggtatatgcagttttaattttaataggtaattgctaatttatttataaaatatttatggtgatttagaatg-ataagagtgcaaatttccctgtattcttgccagcactgagttaatattttgttttctgttgctgctcatctgaaggctaaaaatgaagccatttttgtttaatttgaa-tatctagattttgttggaacaagaaaaaggaattctacttgcatcttttcaaatgatgggtctgcatgccatctactatgaattggcaattcgtagcctttgcatatgtccattttAAAATGATCAACTTTTGGATATTGTATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTTTGTCTTTCTGCTTATGGATTACATAGCCAGATATACTTCTCTTGTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCTTGCTTAAGTGAGAAGATCTTCACCAGAAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53854539 1417 + 132586672 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcctattttgattgggccagtgtctgagggctggttgtttggtgcctgtatcataacagttgttaaataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACGGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGGGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATTTGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGAAAAGCATTCAGTACATAAATTACTAGGCTCAAGTAGGAGTTCACTCTAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTGTATTTTGAATTGGAAGAAGGCTGATCTGAGAGTCAAAAACTCTTAATTTTGAGCCATGGAtgcataaccttgggtatcttaatatt-ggcttagtttactggtttgcaaaatgagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattccaCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGATATTACCAGGATAAATATAAGAAAAACTAGTAGCATCCCCTTA-CCCCCTCAACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACCAAACACCCTTCTATCATCC-TTTCTGGCACacacaaacatacataaacaaaaataaacataTGTAAGTTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATGAAATATACAttattcata-gcgtttccttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaatagtatttcagtaaacaacattgtagaaatatcactatatgctgatgcttttgttttttttctgtcagatacatttttgaaaataggatttctgggtcaaaggtatatgcagttttaattttaataggtaattgctaatttatttataaaatatttatggtgatttagaatg-ataagagtgcaaatttccctgtattcttgccagcactgagttaatattttgttttctgttgctgctcatctgaaggctaaaaatgaagccatttttgtttaatttgaa-tatctagattttgttggaacaagaaaaaggaattctacttgcatcttttcaaatgatgggtctgcatgccatctactatgaattggcaattcgtagcctttgcatatgtccattttAAAATGATCAACTTTTGGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTTTGTCTTTCTGCTTATGGATTACATAGCCAGATATACTTCTCTTGTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCTTGCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26937329 1417 + 104110932 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTACACCAGAATGGCTGTTGCCTATTTTGATTGGGCCAGTGTCTGAGGGCTGGTTGTTTGGTGCCTGTATCATAACAGTtgttaaataatttgaatatataatgTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGGggtactgattttaaaaattaattcatttgaaTTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGaaagaatatgtatatttgtgcatgtAAACCACACAGACTGAAAGAAAAGCATTCAGTACATAAATTACTAGGCTCAAGTAGGAGTTCACTCTAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAgaatttgattttgtattttgaattggAAGAAGGCTGATCTGAGAGTCAAAAACTCTTAATTTTGAGCCATGGATGCATAACCTTGGGTATCTTAATATT-GGCTTAGTTTACTGGTTTGCAAAATGAGATGAGTGGACAAGATATCTTTAAAGTCCATTCTAGGCATGAATTTTCATGATTCCACAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGATATTACCAggataaatataagaaaaactaGTAGCATCCCCTTA-CCCCCTCAACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACCAAACTCCCTTCTATCATCC-TTTCTggcacacacaaacatatataaacaaaaataaacatatgtaagttttcttgcctg-aaaaaagtaaaataaaatatacattattcatA-GTGTTTCCTTGCTAATAGACATCTGAAtgtcttcagtttttatttttgtcactatAAATAGTATTTCAGTAAACAACATTGTAGAAATATCACTATATGCcgatacttttgttttttttctgtcagatacatttttgaaaataggatttctgggtcaaaggtatatgcagttttaattttaataggtaattgctaatttatttataaaatatttatggtgaTTTAGAATG-ATAAGAGTGCAAATTTCCCTGTATTCTTGCCAGCACTgagttaatattttgttttctgttgctgctcaTCTGAAGGCTAAAAATGAAGCCATTTGTGTTTAATTTGAA-TATCTAGATTTTGTTGGAACAAGAAAAAGGAATTCTACTTGCATCTTTTCAAATGATGGGTCTGCATGCCATCTACTATGAATTGGCAATTCGTAGCCTTTGCATATGTCCATTTTAAAATGATCAACTTTTGGATATTATatatactgtaaatattttttccagtctttAGTTTGTCTTTCTGCTTATGGATTACATAGCCAGATATACTTCTCTTGTTTATAAAATAGgtggtttgttttctgtcttgcttAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCttccttctggaatttttataggtttattt i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50474743 1418 + 128595539 ATTTTTGTTTCCCACAGATGTTTAcaccagaatggctgttgcctattttgattgggccagtgtctgagggctgattgtttggtgcctgtatcataacagttgttaaataatttgaatatATAATGTTTAAATATGTAGTTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACGTAAAGGGGTACTGATTTTAAAAATTAATTCATTTGAATTTAAACACATCATATGCTAGACAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATTTGTGCATGTAAACCACACAGACTGAAAGAAAAGCATTCAGTACATAAATTACTAGGCTCAAGTAGGAGTTCACTCTAGAGTTAGCTGCTACTTATTTTCAGAATTTGATTTTATATTTTGAATTGGAAGAAGGCTGATCTGAGAGTCAAAAACTCTTAATTTTGAGCCATGGATGCATAACCTTGAGTATCTTAATATT-GGcttagtttactggtttgcaaaatgagatgagtggacaagatatctttaaagtctattctaggcatgaattttcatgattccaCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGATATTACCAGGATAAATATAAGAAAAACTAGTAGCATCCCCTTACCCCCCCCAACCCTCCTGAGTAACCAATTTAATATGCACCAAACACCCTTCTATCATCC-TTTCTGGCACACACAAACATATATAAACAAAAATAAATGTATGTAAGTTTTCTTGCCTG-AAAAAAGTAAAATAAAATATACATTATTTATA-GTGTttccttgctaatagacatctgaatgtcttcagtttttatttttgtcactataaatagtatttcaggaaacaacattgtagaaatatcactatatgctgatgcttttgttttttttctgtcagatacatttttgaaaataggatttctgggtcaaaggtatatgcagttttaattttaataggtaattgctaatttatttataaaatatttatggtgatttagaatg-ataagagtgccaatttccctgtattcttgccagcactgagctaatattttgttttctgttgctgctcatctgaaggctaaaaatgaagccatttttgtttaatttgaa-tatctagattttgttggaacaagaaaaaggaattctacttgcatcttttcaaatgacgggtctgcatgccatctactatgaattggcaattcatagcctttgcatatgtccattttAAAATGATCAACTTTTGGATATTATATATACTGTAAATATTTTTTCCAGTCTTTAGTGTGTCTTTCTGCTTATGGATTACATAGCCAGATATACTTCTCTTGTTTATAAAATAGGTGGTTTGTTTTCTGTCTTGCTTAAGTGAGAAGATCTTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTATAGGTTTATTT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104681277 1372 - 158406734 ATTTTTGTTTCCCAcagatgtttacgccag-atggttgttgcctattttgac---------------------------tggtgcctgtattataacagttgttaaataatttgaatatATAATATTTAAATATGTAGCTTGTCTTTGATCTTTTGACAACAGAGATAGCTTCATTTACCTAAAGAGGAACTGattttaaaaattaatttatttgaatttaaaCACATCATATGCTAGTCAAAACTTTTAGGGAAAGAATATGTATATGTGTGCATGTAAACCACAC------------AAGCATTCGGTGCACAAGTTATTAGGCTCAAGTAGGAATTTACTATACAGTTAGATGCTCCTTATTTTCAGAGTTGGATTTTATATTTtgaattggaagaatgctgacctgagagtcaaaaactcttcattttgagccatggttgcataaccttaggtatcttaatattgggcttagtttactcgtttgcaaaatgagatgaatggacaaggtatctctaaagtctattctagacatgaattgtcatgattttGCAGTATATGTTCCTTTTAACAAGTGAGACATTACCAGGATAAATACAGGAAAAACTAGCAACATCCCCTTC-CCCCCTC-ACCCTCCTGAGTAACCAATGCAATATGCAGTGAACATCCTTCTATCATCCTTTTTTGGCACACACAAACATAGATAAACAAAA-TAAGTGTATGTACGTTTTCTTGCCTG-CAAAAAGTAAAACaaaatac-cattattcagattggtttccttgctaatagacatctgaatgtcttcaggttttatttttgtcactgtaaatagtatttcagtaaacatcattgtagaagtatcactacgtgctgatgttttttttttttttctgtcagatacatttttgaaaatagaatttctgggtcaaaggtatatgacactgtaa-tttaatagataattgctgatttatttctaaaatatttatggtgatttaggatgcaaaggagtgtcaatttccctgtattcttgccagcactaggttaatattttgttttctattgc---tcatttgaaagctaaaaatgatgtcatttttgtttaatttgaattctcttga--ctgttagaacaataaaaaatagttctacttacatctcttcaagtgatgagtctgcatactctctactatgaattggaaattcatagactttgcatatgtccatttttAAATTATTAACTTTTAGATATTATATATACTGTAAATATTTTTCCCAGTATTTAGTTTGTCCTTCTGTTTATGGTATATGTAGCCAGAGATGCCTGTCATTTTT-TAAAATAGGTGATTTGTTTTCTGTCTTGCTTAAGTGAGAAGATCCTCACC--AAGGGCTTCCTTCTGGAATTTTTCTTGCTTTATTT i calJac3.chr6 C 0 C 0 a score=15288.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 46852 8 + 478999 AAAAATAT s panTro4.chr2B 169300038 8 + 247518478 aaaaatat i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18471980 8 + 99152023 AAAAATAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28298356 8 + 106825570 AAAAATAT i rheMac3.chr12 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53855956 8 + 132586672 AAAAATAT i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26938746 8 + 104110932 aaaaatat i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50476161 8 + 128595539 AAAAATAT i chlSab2.chr10 C 0 C 0 e calJac3.chr6 104682649 0 - 158406734 C e nomLeu3.chr17 86776515 0 - 99891981 C a score=2865.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 46860 2 + 478999 Tg s ponAbe2.chr15 18471988 2 + 99152023 Tg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28298364 2 + 106825570 TG i rheMac3.chr12 C 0 I 33 s macFas5.chr12 53855964 2 + 132586672 TG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.chr12 26938754 2 + 104110932 tg i papAnu2.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr10 50476169 2 + 128595539 TG i chlSab2.chr10 C 0 I 33 e panTro4.chr2B 169300046 0 + 247518478 C e calJac3.chr6 104682649 0 - 158406734 C e nomLeu3.chr17 86776515 0 - 99891981 C a score=25671.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 46862 295 + 478999 gccgggcgcagtagctcacgcctgtaatcccaacactttgggaggccgaggcgggcgaatcacgaggtcaggagattgagaccgtcctggctaacacggtgaaaacccatctctactaaaaatacaaaaaattagccaggcgtggtggcgggcgcctgtagtcctagcttctcgagaggctgaggcaggagaatggcgtgaaccccagagatggaggttgcagtgagccgagatcgtgccactgcactccagcctgggcaa--gagtgagactctgtctcaaaaaacaaaacaaaac s ponAbe2.chr15 18471990 297 + 99152023 gctgggcgcagtggctcacgcctgtaatcccaacactttgggaggccgaggtgggcggatcacgaggtcaggagatcgagaaaatcctggctaacacggtgaaaacccatctctactaaaaatacaaaaaattagccgggcgtggtggcgggcgcctgtagtcccagcttctcgggaggctgaggcaggagaatggcgtgaaccccggaggtggaggttgcagtgagctgagatcgtgccactgcactccagcctgggcaacagagcaagactctgtctcaaaaaacaaaacaaaac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50476171 33 + 128595539 I e papAnu2.chr12 26938756 0 + 104110932 C e macFas5.chr12 53855966 0 + 132586672 C e rheMac3.chr12 28298366 33 + 106825570 I e panTro4.chr2B 169300046 0 + 247518478 C e calJac3.chr6 104682649 0 - 158406734 C e nomLeu3.chr17 86776515 0 - 99891981 C a score=3753.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47157 8 + 478999 aaaaaTAT s ponAbe2.chr15 18472287 8 + 99152023 aaaaaTAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86776515 8 - 99891981 AAAAATAT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104682649 8 - 158406734 AAAAATAG i calJac3.chr6 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50476171 33 + 128595539 I e papAnu2.chr12 26938756 0 + 104110932 C e macFas5.chr12 53855966 0 + 132586672 C e rheMac3.chr12 28298366 33 + 106825570 I e panTro4.chr2B 169300046 0 + 247518478 C a score=1820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47165 2 + 478999 TT s panTro4.chr2B 169300046 2 + 247518478 tt i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18472295 2 + 99152023 TT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86776523 2 - 99891981 TT i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104682657 2 - 158406734 TT i calJac3.chr6 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50476171 33 + 128595539 I e papAnu2.chr12 26938756 0 + 104110932 C e macFas5.chr12 53855966 0 + 132586672 C e rheMac3.chr12 28298366 33 + 106825570 I a score=36249.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47167 28 + 478999 AATTCACCTGAACTTTAAAAAA--TATATA s panTro4.chr2B 169300048 30 + 247518478 aattCACCTGGACTTTAAAAAAAATGTATA i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18472297 29 + 99152023 AATTCACCTGGACTTTAAAAAA-ATGTATA i ponAbe2.chr15 C 0 I 4 s nomLeu3.chr17 86776525 30 - 99891981 AATTCACCTGGACTTTAAAAAAAATGTATA i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s macFas5.chr12 53855966 28 + 132586672 AATTCACCTGGACTTAAAAAAAAATGTA-- i macFas5.chr12 C 0 I 6 s papAnu2.chr12 26938756 28 + 104110932 aattcacctggacttaaaaaaaaatgta-- i papAnu2.chr12 C 0 I 6 s calJac3.chr6 104682659 28 - 158406734 AATTCACCAGGACTTTAAAAAGTGTATA-- i calJac3.chr6 C 0 C 0 e chlSab2.chr10 50476171 33 + 128595539 I e rheMac3.chr12 28298366 33 + 106825570 I a score=281565.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47195 110 + 478999 ----AATAGTCTAAATTTGTATTTTTACATGGGGTTTTTAATGGAGATGTACTGAATTAAAAGCTCATTTTGTCATATATAAGGCTCTTATGTGTACTTGGATGTAATTCTAGA s panTro4.chr2B 169300078 110 + 247518478 ----AATAGTCTAAATTTGTATTTTTACATGGGGTTTTTAATGGAGACGTactgaattaaaagctcattttgtcatatataaagctctcatgtgtacttggatgtaattctaga i panTro4.chr2B C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18472330 110 + 99152023 ----AATAGTCTAAATTTGTATTTTTACATGGGGTTTTTAATGGAGATGTactgaattaaaagctcattttgtcatatataaagctctcatgtgtacttggatgtaattctaga i ponAbe2.chr15 I 4 C 0 s nomLeu3.chr17 86776555 110 - 99891981 ----AATAGTCTAAATTTGTATTTTTACAGGGGGTTTTTAATGGAGACGTactgaattaaaagctcattttgtcatatataaagctctcatgtgtacttggatgtaattctgga i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr12 28298399 96 + 106825570 ----AATAGTCTACATTTGCATTTTTACATGGGGTTTTTAAAGGAGACGTA--------------CATTTTGTCTTATATAAAGCTCTCATGTGTACTTGGATGTAATTCTAGA i rheMac3.chr12 I 33 N 0 s macFas5.chr12 53856000 96 + 132586672 ----AATAGTCTACATTTGCATTTTTACATGGGGTTTTTAAAGGAGACGTA--------------CATTTTGTCTTATATAAAGCTCTCATGTGTACTTGGATGTAATTCTAGA i macFas5.chr12 I 6 C 0 s papAnu2.chr12 26938790 96 + 104110932 ----aatagtctacatttgcatttttacatgGGGTTTTTAAAGGAGACGTA--------------CATTTTGTCTTATATAAAGCTCTCATGTGTACTTGGATGTAATTCTAGA i papAnu2.chr12 I 6 C 0 s chlSab2.chr10 50476204 96 + 128595539 ----AATAGTCTACATTTGCATTTTTACATGGGGTTTTGAAAGGAGACGTA--------------CATTTTGTCTTATATAAAGCTCTCATGTGTACTTGGATGTAATTCTAGA i chlSab2.chr10 I 33 C 0 s calJac3.chr6 104682687 113 - 158406734 AAGTAATAGTCTAAATTTGTATTTTTACATGGGGTTTTTAGTGGAAAAATACTGAATTAAAAGCTTATTTTGTCACATA-AAAGGTCTCATGTGTATTTGGATATAATTCTAGA i calJac3.chr6 C 0 C 0 a score=118815.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47305 55 + 478999 TTCCGTGCTCTATTCTCTAGATTTGCTTATTCATGTGCCAGTGCTATACTATTCT s panTro4.chr2B 169300188 55 + 247518478 taccctgctctgttctctagatttgcttattcatgtgccagtgctatactattct i panTro4.chr2B C 0 N 0 s ponAbe2.chr15 18472440 55 + 99152023 ttccctgctctgttctctagatttgcttattcatgtgccagtgctatactatTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 86776665 55 - 99891981 ttccctgctctgttctctagatttgcttattcatgtgccagtgctatggtattct i nomLeu3.chr17 C 0 N 0 s macFas5.chr12 53856096 55 + 132586672 TTCCCCGCTCTCTTCTCTAGATTTTCTTATTCATGTGCCAGTGCTATACTATTCT i macFas5.chr12 C 0 N 0 s papAnu2.chr12 26938886 55 + 104110932 TTCCCCGCTCTCTTCTCTAGATTTTCTTATTCATGTGCCAGTGCTATACTATTCT i papAnu2.chr12 C 0 N 0 s chlSab2.chr10 50476300 54 + 128595539 TTCCCCGCTCTC-TCTCTAGATTTTATTATTCATGTGCCAGTGCTATACTATTCT i chlSab2.chr10 C 0 N 0 s calJac3.chr6 104682800 55 - 158406734 TTCCCCACTCTGCTCTCTAGATTTGCTTATTCACGTGCCACTGCTGTACCCTTCT i calJac3.chr6 C 0 C 0 a score=-155.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47360 1 + 478999 A s ponAbe2.chr15 18472495 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr6 104682855 1 - 158406734 A i calJac3.chr6 C 0 N 0 a score=455.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47361 5 + 478999 TTTTT s ponAbe2.chr15 18472496 5 + 99152023 TTTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 a score=1731.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47366 3 + 478999 TTT s ponAbe2.chr15 18472501 3 + 99152023 TTT i ponAbe2.chr15 C 0 I 2 s nomLeu3.chr11 1688037 2 - 123690457 -TT i nomLeu3.chr11 N 0 I 1 s macFas5.chr2 191326624 2 - 192460366 -TT i macFas5.chr2 N 0 I 1 s papAnu2.chr2 186318607 2 + 187378091 -tt i papAnu2.chr2 N 0 I 1 a score=20888.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47369 8 + 478999 AAAGGTTT s panTro4.chr3 1470543 8 - 202329955 AAAGGTTT i panTro4.chr3 N 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18472506 8 + 99152023 AAAGGTTT i ponAbe2.chr15 I 2 C 0 s nomLeu3.chr11 1688040 8 - 123690457 AAAGGTTT i nomLeu3.chr11 I 1 C 0 s rheMac3.chr2 191543948 8 + 192599291 AAAGGTTT i rheMac3.chr2 N 0 C 0 s macFas5.chr2 191326627 8 - 192460366 AAAGGTTT i macFas5.chr2 I 1 C 0 s papAnu2.chr2 186318610 8 + 187378091 aaaggttt i papAnu2.chr2 I 1 C 0 s chlSab2.chr15 90398613 8 + 91754291 AAAGGTTT i chlSab2.chr15 N 0 C 0 a score=12217403.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 47377 4251 + 478999 AAAACATTTATCACTAAAGATACTAGAATGTTCTTTGAAAACCTATTAAGACATTTAACTATTCTTTTATGCTATT--------------------------CTGATCAAAAGAAAGAATAAAAGTTTAGGAAAGG-GAAAAATGCACA-TTTCTTAAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCATAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAATGGGATTAAATTAAAAATAAAAGACATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAACTATAATTTTACTTAATTCCATTTCTATCACAACAAGAAAAAAAA-GCCAATGCGTTCCAACCAAAGATGCTGAATTCCAAACA-TAATTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGACAGAATTATCATCCATTTCTTTCTGCCTCTGTCTTGGCAGCATTCTAGAGAAGTGAATGGGAAAGACTTCCGTTCTTTCAAGGCCAGGCCAGTGTTTGCTTCTTCTTTCTAACTCCAACCTCGTCTACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAGTGTGTTGACTGAGAAAAAAGAATGTGTGTATATATTTTTTCTTATATACAC--------ACACTATCAAAAAACTGATTTCACCAGTTTCAATACCTACTGTGGGA---GCAGCAGAGACAGGAAGACAATCTGCTTCTTGTATTACTATGAAGTTCCACTAT-AAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAGCTATAATCTATAA---TATTTTGACACTGACATTTCACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTAAAAAGATTTAGACTCAAAAATGGATGCAAATTCTTTAAGCATC---------TATTTTG----TTTTTTTCTAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCTAGAATACAGTATATACAAAC--GTATTTAAGTGAGCCCTATAAAGAAATACTCATAGGTAGTTTAAAATTTCTTGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAGTTGGTGGTTAC----TAGACTCTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATTAGTACTATGTGCCAGGCACTCGACACATGAAGACAGAGTTGTATTAGCCTCGGTGTCTTACGCTTCACAATTACTCATTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCTAAAAGCAGCAGAAGAAAAAAGAAAAAG----------------------------TCTAAAATATAATAAATAAGTACTATAGTAACACTGTCCTAATAACACAAGAGGACTATTAAAGTAACTTTTAGATTTAAATGGGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGTAAATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACATGAggccaggtgtagtggctcgtgcctgtaattgtagcactttgggaggccaaggtgggcagattgcctgagctcaggagttggagacaagcctgggcaacatggtgagactctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcacgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcatgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcatgccactgcgctccagcctaagtgacagagtgagactctgtatcaaaaaaaaaaaaaaataaaataaaaaataaaaaaCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTCAATGTTTTAATTTAAAATT---------------------------------------AATAAATCACAATTCTGTATTGCTTTTAAGATT---TTGTTTAAAAATGACACATCTCAAAATTAACCAAACTATATTTCTGCTAGAGGTTAGTTTATCCATGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGCTGCCAGCAATGGACATGCAGGTAACTATTGAAGAAGTTGTAGCTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAGTGAGGCCTTGGCACAT--------------------------------------AGTCAGTGAGAATGGTCTTTGACTTAGAAGGGAAGTGCCTCTGAGTGCATGAGGATCACAGTCTTCTCATCTCGTTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCATAATCCATCCA----TTTACAAAGAATGTTAAAATTTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGACAGAAATAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAAT---CTTGCCTTATCAATAAAAAACAGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTATCATAGATATAGTGGGAATAAAATAACGGAAATAAAACCCTGCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAACAGCAAAATTATTTTTTATTCATGATTTATACTACTGCAGGATGGCAAGCAGGGGGGAAGTTAATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCA--AATACTTGAACAAC--CTATTCCAAA-GCAAAACAATgaataaaggagaaggagaggagatgaa-----agaagagaagagaaa-gggaggggaggggagaagggaGGGCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGATCTTTCAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTCTCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTT--GTGTTTTTACATTAATAGTCTCTACCTATTTGA----AAA-----------CAAAACAAAAGTAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCATCAAGAAATACTCTGTCGCTCAAGTTCTCATAGATAATACCACACTGATGATGACCTGGAGCAATGCCGCCGCCTCCAAGTCTCTACAGTTGATTTCCTATCGGCT-GCTTCTCTGTAACACTAACA-TTCTCTTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGATCACCAAGGTTCACGTCTCTCACT---CTGCGCCTGCTAGTCCCAAATATTGTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAAGCTAATTTT-AAATTCCCGAAAATTCACTGGTTATTATATTATTTGCCATGGGAGGGGGGTATCTGTGAGGTGAAAGAGGATTAATGAAAAACAAAAAGAACAAAAATAAACCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAAAGGAGGGAAGA---AGGTAGTGGCACTAACCAAAGTCACAAAGCCCAGGTTGGAACAA-GAACAAATCACTTTGGTTCCTAGAGCCAAGCCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACGAAATGGGAAGAAATACACGGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACAAAATTTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTATT-AAAAAAGGTAAAAATCAAATA-CTTTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATAAAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTACCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGAAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGATGAAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACATATGATAAATGGCCCTGATAGGCGGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCATTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCCAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAATATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATTGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAACAGTTTGGCTAGTTTCAGGAAAAGATG s panTro4.chr3 1470551 4321 - 202329955 AAAACATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTTTGAAAACCTATTAAGACATTTAAATATTCTTTTATGCTATCAAAAGACATTAAAATATTCTTTTACGCTGATCAAAAGGAAGAATAAAAGTTTAGGAAAGG-GAAAAATGCACACTTTTTTAAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCA--AAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAATGGGATTAAATTAAAAATAAAAGGCAT---AAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAAACTACTTTTGCTTAATTCCATTTCTATCAAAACAAGAAAAAAAAAGCCAATGCGTTCCAACCAAAGATGTTGAATTCCACACG-TAACTGTTTCTCTTATTACTTCTGTTCTCTTAGAAACACTTCTAAGTTCTAAGAGAACAGAAGTGTGCTTGACAGAACTATCATCCATTTCTTTCTGCCTCTGTCTTGGCAGCTTTCTAGAGAAGTGAATGGGAAAGACTTCGGTTCTTTCAAGGCCAAGCCAGTGCTTGCTTCTTCTTTCGAACTCCAACCTCATCTACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAATGTGTTGACTGAGAAAAAAGAATGTGTGTATCTATTTTTTCTTATATACAC--------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTGTGAGA---GCAGCGGAGACAGGAAGACAATCTGCTTTTTGTATTACTATGAAGTTCCACTAT-AAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAGCTATAATCTATAA---TATTTTGACACTGACATTTCACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTTAAAAGATTTAGACTCAAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCATC---------TATTTTG----TTTTTTTCTAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCTAGAATACAGTATATACAAACATGTATTTAAGTGAGCCCTA-AAAGAAATACTCATAGGTGGTTTAGAATCGCTTGTTAGAGGCACAGGTTCGTTTACAGTTGCTGGTTAC----TAGACTGTACGCAGCTGGACACTTCTATGTTAAAGGGAAGGGAATGAATACTATGTGCCAGGCAGTCAACACATGAAGACAGAGTTGTATTAGCCTCAGTGTCTTACGCTTCACAATTACTCATTTACTATTTCAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAATTGTCCCTAAAAGCAGAAGAAGAAAAAACAAAAAGAGAAGATAACTTTA------------AATCTAAAATAAAATAAATAAGTACTATAGTAATACTGTCCTAATAACACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTCAGATTTAAATGGGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGTAAATATAAAAGGCAGTTATTTAAAAAACATGAggccaggtgcagtggctcatgcctgtaattgtagcactttgggaggccaaggtgggcagattgcctgagctcaggagttggagaccagcctgggcaatgtggtgagactctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcaggcgcctgtggtctcagctactcgggaggctgaggcatgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcgcgccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactctgtatcaaaaaaaataaaaa-------------taaaaaaCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTGAATGTTTTAA-----AATT---------------------------------------AATAAATCACAATTCTGTATTACTTTTAAGATT-----GTTTAAAAATGACATATTTCAAAATTAACCAAAGTATATTTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCACGTAACTTAAGAATAAACCACAGCGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGAC--AAGTCAGTTGCCAGCAATGGACGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGTCGCAACTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAACGAGGCCTTGGCACAC--------------------------------------AGTCAGTGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCTCTGAGTGCATGAGGATCACAGTCTTCTCATCTCGTTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCATAATCCATCCAACTGTTTACAAAGAATGGTAAGATTTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAATAAACCAGTTTCTATAATTCACTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAAC---CTTGCCTTATCAATAAAAAA--GTCACTTCTCTCCTTATAATTGCATCTTATCATAGATATAGTGGAAATAAAATAATGGAAATAAAACC-TGCCAGTTTCTCCAATGTATACTACAACAGCAAAATTATTTTTTATTCATGATTTATACTACTGCAGGACGGCAAGCAGGGGGGAAGTTAATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCACAGATACTTGAACAACACCTACTCCAAAAGCAAAACAATGAATAAaggagaaggagaggagaggaa-----aaaagagaagagaaaagggaggggaggggagaagggaggGCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTATCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTC--GT-TTTTTACA---ATAGTCTCTACCTATTTGA----AAAACAAAACAAAGCAAAACTAAAGTAACTCAACATCTCAAATGATCTACAAATTCATCAAGAAATACTCTGTCGCTCAAGTTCTCATAGATAATACCACACTGCTGACGACCTGGGGCAATGCTGCCGCCGCCAAGTCTCTACGGTTGATTTGCTATCGGCT-GCTTCTCTGTAACACTAACA-TTCTCTTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGCTCACCAAGGTTCACATCTCTCACT--GCCTCTGCTGCTAGTCCCAAATATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAGAAAGCTAATTTTTAAATTCCCAAAAATTTACTGGTTATTATATTATTTGCCATGGGAGGGGG-TATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAATGAAAAAGAAAAAGACCAAACCTAAACCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAAAGGAGGGAAGAGGAAGGTAGTGGCACTAACCAAAGTCATAAAGCCCAGGTTGGAACAA-CAACAAATCACTTTGGTTCCTAGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAATGGGAAGAAGTTTACGGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAAATTTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACATA-CTTTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACGCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGAAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGATGAAACACATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGGCCCTGACAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCATTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAGTATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATTGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAACGGTTTGGCCAGTTTCAGGAAAGGATG i panTro4.chr3 C 0 I 738 s ponAbe2.chr15 18472514 4242 + 99152023 AAAACATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTTTGAAAACCTATTAAGACATTTAACTATTCTTTTATGCTATT--------------------------CTGATCAAAAGAAAGAATAAAAGTTTAGGAAAGG-GAAAAATGCACA-TTTCTTTAAAAAGTTTATTTCCAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGCCATAAAATATAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACAGGATT-AATTAAAAATAAAAGACATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAACTATAATTTCACTTAATTCCATTTCTATC---ACAAGAAAAAAAAAGCCAATGCGTTCCAACCAAAGATGTTGAATTCCAAACA-TAATTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGACAGAATTATCATCCATTTCTTTCTGCCTCTATCTCAGCAGCATTCTAGAGAAGTGAATGGGAAAGACTTCCGTTCTTTCAAGGCCAGGCCAGTGCTTGCTGCTTCTTTTGAACTCCAACCTCCTCTACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAGTGTGTTGACTGAGAAAACAGAATGTGTGTATATATTTTTTCTTATATACAC--------GCACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTGTGGGA---GCAGCGGAGACAGGAGGACAATCTGCTTCTTTTATTACTATGAAGTTCCACTAT-AAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAGCTATAATCTATAA---TATTTTGACACTGACATTTCACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTAAAAAGATTTACACTCGAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCACC---------TATTTTG----TTTTTTTCTAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCTAGAATACAGTATATACAAACATGTATTTAAGTGAGCCCTATAAAGAAATACTCATAGGTGGTTTAAAATTGCTGGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAGTTGGTGGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATTAATACTATGTGCCAGGCACTTAACACATGAAGATAGAGTTGTATTAGCCTTGGTGTCTTACGCTTCACAATTACTCATTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATATTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTCTCCCTAAAAGCAGCAGAAGAAAA---AAAAAGAGAAGATAACTTTA------------AGTCTAAAATATAATAAATAAGTACTATAGTAACACTGTCCTAATAACAC--GAGGACTATTAAAGTAACTTTTAGATTTAAATGGGAATTTTCATTCTAAAGTGATGAAATATAGGGTAAATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACATGAggccaggtttagtggctcatgcctgtaattgtagcactttgggaggccaaggtgggcagattgcctgagctcaggagttggagacaagcctgggcaacatggtgagactctgtttctacaaaaaatacaaaaaattagctgggtgt-gtggcacgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcatgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcatgccactgcgctccagcctaagtgacagagtgagactctgtatcaaaaaaaaataaaa------------ataaaaaaCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTCAATGttttaatttaaaatt---------------------------------------aataaatCACAATTCTGTATTGCTTTTAAGATT---TTGTTTAAAAATGACACATTTCAAAATTAACCAAACTATATTTCTGCTAGAGGTTAGTTTATCCATGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGGAATGGACGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGTTGTAGCTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAAAGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAGTGAGGCCTTGGCACAT--------------------------------------AGTCAATGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCTCTGAGTGCATGAGGATCACAGTCTTCTCATCTCATTGGTTTTCTGTTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCATAATCCATCCAACTGTTTACAAAGAATGTTAAAATTTTGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGACAGAAATAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATGTTCCAGAG-AAAATGAAATTAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAAT---CTTGCCTTATCAATAAAAAACAGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTATCATAGATATAGTAGGAATAAAATAATGGAAATAAAACCCTGCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAACAGCAAAATTATTTTTTATTCATGATTTATACTACTGCAGGATGTCAAGC-GGGGGGAAGTTAATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCA--GATACTTGAACAACACCTACTCCAAAAGCAAAACAATGAATaaaggagaaggagaggagatgaa-----agaagagaagagaaa------------------gggagggCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTCAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTCTCAACACACACATTTCATTTTCCTTTCTT--GT-TTTTTACATTAATAGTCTCTACCTATCTGa----aaa-caaaacaaaacaaaacaaaaGTAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCATCAAGAAATACTCTGTCGCTCAAGTTCTCATAGATAATACCACACTGATGATGACCTGGGGCAATGCCGCTGCCGCCAAGTCTCTGTGGTTGATTTGCTATCGGCT-GCTTCTCTGTAACACTAACA-TTCTCTTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGATCACCAAGGTTCACGTCTCTCACT---CTGCGTCTGCTAGTCCCAAATATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAAGCTAATTTT-AAATTCCCGAAAATTTACTGGTTATTATATTATTTTCCATGGGAGGGGGGTATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAATGAAAAACAAAAAGAACAAAAA------TAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAGTTGAAGGGGG-GAAAGGAGGGAAGAAGAAGGTACTGGCACTAACCAAAGTCACAAAGCCCAGGTTGGAACAA-GAACAAATCACTTTGGTTCCTAGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACGAAATGGGAAGAATTCTACGGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAGATGTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTGTTAAAAAAAGGTAAAAATCAAATA-CTTTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACTACAGCTGGTCCTAACTTTTATAAAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTACCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAAGAGCAAGTCCAGGAAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGATGAAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGACCCTGATAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTACACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGATTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGA--AGTCATTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCCAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAATATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAGTGGTTACTCTTCATTGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGCGTCAAGCTAGATAACAGTTTGGCTAGTTTCAGGAAAAGATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1688048 4318 - 123690457 AAAACATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTTTGAAAACCTATTAAGACATTTAAATATTCTTTTATGCTATCAAAAGACATTTAAATATTCTTTTATGCTGATCAAAAGAAAGAATAAAAGTTTAGGAAGGG-GAAAAATGCACA-TTTTTTTAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCA--AAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACGGGATTAAATTAAAAATAAAAGGCATTATAAAATTTGAGGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTTTTGCTTAATTCCATTTCTATCAAAACAAGAAAAA----GCCAACGCGTTCCAACCAAAGATGCTGAACTCCACACG-TAACTGTTTCTCTTCATA----------------------------------AAGAACAGAAGTGTGCTCGACAGAGTGATCACCCGTTTCCTTCTGCCTCTGTCTTGGCAGCGTTCTAGAGAAGTGAATGGGAAAGACTTCCGTTCTTTCAAGGCCAGGCCAGCGCTTGCTTCTTCTTTCGAACTCCAACCTCGTCCACCACAGCATCTTTGCCAGGGTGTTCAATCGACGTGTTGACTGAGAAAA-AGAATGTGTGTATATATTTCTTCTTATATACAC--------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCGGTTTCAATACCTACTG---GA---GCAGCGGAGACAGGAAGACAATCTGCTTTTTGTACTACTGTGAAGTTCCACTAT-AAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAGCTATAATCTGTAA---TATTTTGACACTGACATTTCACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTTAAAAGATTTAGACTCAAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCACC---------TATTTTGTTTTTTTTTTTCTAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCTAGAATACAGTATATACAAACACGTATTTAAGTGAGCCCTA-AAAGAAATACTCATAGGTAGTTTAAAATTGCTTGTTAAAGGCACAGGCTCGTTTACAATTGGTGGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTTACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATTAATACTATATGCCAGGCACTCAACGCATGAAGACAGAGTTGTATTGGCCTTGGTGTCTTATGCTTCACAATTACTCATTTACTATTCTAGGTAGGATAGAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCTAAAAGCAGCAGAAGA------AAAAAGAGAAGACAACTTTA------------AGTCTAAAATATAATAAATAAGTACTATAGTAATACTGTCCTAATAACACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTCAGATTTAAATGGGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGTAAATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACACGAggccaggcgcagtggctcacgcctgtaattgtagcactttgggaggccgaggtgggcagactgtctgagctcaggagttggagaccagcctgggcaacatggtgagactctgtctctactaaaaatacaaacaattagctgagtgtggtggcacacacctgtggtctcagctactcaagaggctgaggcatgagaattgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgagccgagatcacgccactgcactccagcctaggtgacagagttagactctgtatcaaaaaaaataaaaa------taacaaataaaaaaCATGAATCTTGATTCAGATATAA-TTTTCTTTCAACAAGTTCTGAATGTTTTAATTTAAAATT---------------------------------------AATAAATCACAATTCTGTA------TTAAGATT---TTGTTTGAAAATGACACATTTCAAAATTAACCAAAGTATA-TTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCACATAACTTAAGAATAAACCACAGCGTAGCTCAAGGGAGCT--ACCGAAGAGCCAGGTTCTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGCAACGGATGTGCAGGTGACTATCGAAGAAGT--TAACTACAAATCCCAGACTGCTTCTATCAATGGAACCGCCCTCTGTTGAGTCACAAGCCTGAAGCGCGGCCTTGGCACACAGCCAGTGAGGATGGTCTGAAGCGCGGCCTTGGCACAGAGCCAGTGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCCCTGGGTACATGAGGGTCACAGTCGTCTCATCGCGCTGGTTTCCTATGTCATTGGTAGCATCTTCCTT---ATAATCCATCCAACTGTTTACAAACAATGGTAAAATTTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAATAAACCAGTTTCTATAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAA--AGAGACCACTAAGTGCTCTAAATACGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAAC---CTTGCCTTATCAATAAAAAACAGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTATCATAGATATAGTGGAAATAAAATAATGGAAATAAAACC-TGCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAACAGCAAAATTATTTTTTATTCATGATTTATATTACTGCAGGATGGCAAGCAGGGGGGAAGTTAATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCACAGATACTTGAACAACACCTACTCCTAAAGCAAAACAATgaagaaaggagaaggagaggagaggaa-----agaagagaagagaaa-gggaggggaggggagaagggaggGCACTCCAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTCTCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTC--GT-TTTTTACATTAATAGTCTCTACTTATTTGA----AAA----AAAGAAACAAAACTAAAGTAACTCAACATCTCAAATGATCTCTAAATTCACCAAGAAATACTCTGTTGCTCAAGTTCTCATAGATAACACCACACTGCTGACGACCTGGGGCAATGCCGCCGCCGCCGCGTCTCCACGGTTGATTTGCTATCAGCT-GCTTCTCTGTAACACTAACA-TTCTCTTTCATGAGTATAGTCTCTTCTCACTATATCAGAGCTCACCAAGGTTCACGTCTCTCACTCTGCCTCTGCTGCTAGTCCAAAATATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAAGCTAATTTT-AAATTCGCGAAAATTCACCGGTTATTGTATTATTTGCCATGGGAGGGGGGTATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAATGAAAAACAAAAAGAACAAACCTAAACCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAGAGGAGGGAAGAGGAAGGTAGTGGCACTAACCAAAGTCATAAAGCCCAGGCTGGAACAA-GAACAAATCACTTTGGTTCCTAGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAACGGGAAGAAGTGTACGGTCAATGGGAATCTTCTTCTATCTCAATGATTTAGCTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTATCACGAAATTTCTAAAATTGACTTTTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACATATTTTTTCTTCCCTTCCTTCACGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTGCATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGGAAAGGAAAGCTACGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGATGAAACGAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCGTTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGAGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGC-AAGTAAAATGCAAATCTCACACACGATAAATGGCCCTGATAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCT----AAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCATTTGCTTCTTTCATTCATGTCATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAGTATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATTGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAACGGTTTGGCCAGTTTCAGGAAAGGATG i nomLeu3.chr11 C 0 I 1036 s rheMac3.chr2 191543956 4246 + 192599291 AAAATATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTCTGAAAACCTATTAAAACATTTAAATATTCTTTTATGCTATT--------------------------CTGATCAAAAGAAAGAAT--AAGTTTAGGAAAGGTTAAAAATGCAAA-TTTTTTTAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCGTAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACGGGATTAAATTAAAAATAAAAGGCATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTTTTACTTAATTCCACTTCTATCAAAACAAGGGAAAAAAAGCCAATGTGTTCCAAC-------ATTGAATTCCAAACA-TAACTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGGCAGAATCATCACCCATTCCTTTCTGCCTC--TCTCGGCAGCACTCTAGAGGAGTGAATGGGAGAGACTTCCATTCCTTCAAAGGC-GGCCAGTGCCTG---CTTCTTTCTAACTCCAACCTCACCCACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAATGTGTTGGGGGAGAAAAAAGAAGGCGTGTATATATTTTTTCTTATATACACA-------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTG---GG---GGAGTGGAGACAGGAAGATAATCTGCTTTTTGTATTACAATGAAGTTCTACTATAAAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAACTATAATCTGTAA---TATTTTGACACTGCCATTTTACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTTAAAAGATTTAGACTCAAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCACCtttttttttttttttt----tttttttttAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCCAGAATACAGTGTATACAAACATGTATTTAAGTGAGCCCTATAAAGAAATACTCATAGGTAGTTTAAAATTGCTTGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAATTGGTGGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATTAATACTATGTGCCAGGCACTCAATACATGAAGATAGAGTTGTATTAGCCTTGGTGTCTTATGCTGCACAATTACTCGTTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCTAAAAGCAGCAGAAGAAAAAAGAAAAAGAGAAGATAACTTTA------------AGTCTAAAATAAAATAAATAAGTACTATAATAATACTGTCCTAATAACACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTTAGATTTAAATGAGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGGGGATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACATGAggccaggcgcagtggctcacgcttgtaattgcagcactttgggaggtcaaggtgggcagactgcatgagatgaggagttggagatcagcctggacaacatggtgagactctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgtgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcacgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcactccagcctgggtgacagagtgaga--ctgtatcaaaaaataaaaata--aaaataaaaaataaaaatCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTGAATGTTTTAATTTAAAATT-------------------------------------------AATCACAATTCTGTATTGCTTTTAAGATT---TTGTTTAAAAATGACACATTTCAAAATTAACCAAAGTATATTTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCACGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGCAATGGATGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGCTGTAACTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAACGAGGCATTGGCACAC--------------------------------------AGTCAATGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCTCTGAGGGCACGAGGATCACAGTCTTCTCATCTAGGTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCACAATCCATCCAGCTGTTTACACAGAAAGTTAAAATGTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAGTAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAACCTTCTTGCCTAATCAATGAAAA--AGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTAACATAGATATAGCGGGAATAAAATAATGGAAATAAAACCCTTCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAACAGCAAAATTATTTTTTATTCATGATTTA---TACTGCAGGATGGGAAGCAGGGGGGAAGTTCATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCACTGATACTTGAACAACACCTACTCCAAAAGCAAAACTACGAAT--aggagaaggagaggagaggaaagcagagaagagaggagaaa-gggaggggaggggagaAAGGAGGGCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTATCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTC--GT-TTTTTATA---ATAGTCTCTACTTATTTGG----AAA-----------AAAAAAAAAAGTAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCA-CAAGAAATACTCTGTCACTCAAGTTCTCACAGACAATGCCACACTGATGATGACCCCGGGCAATGCG--------------CCCACGGCCGATTTGCTATCAGCT-GCTTCTCTGTAACACAAACA-TTCTCCTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGCTCACCAAGGTCCACATCTCTCACT---CTGCCTCTGCTAGTCCCAAATATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAACCTAATTTT-AAGTTC-CGAAAATTCACTGGTTATTATGTTATTTGCCATGGGAGGGAG-TATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAAGGAAAAACAAAAAGAACAAACCTAAATCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAAAGGAGAGAAGAGGAAGGTAG-GGCACTAACCAAAGTCATAAAGTCCAGGTTGGAACAAGGAACAAATCACTTTGGTTCCTGGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAATGGGAAGAAGTCTACAGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAAATTTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACACA-CTCTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACAGAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGGAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGAT-AAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGGCCCTGATAGGCTGTTTGCTGAAAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCACTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAATATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATCGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAATGGTTTGGCCAGTTTCAAGAAAGGATG i rheMac3.chr2 C 0 I 816 s macFas5.chr2 191326635 4243 - 192460366 AAAATATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTCTGAAAACCTATTAAAACATTTAAATATTCTTTTATGCTATT--------------------------CTGATCAAAAGAAAGAAT--AAGTTTAGGAAAGGTTAAAAATGCAAA-TTTTTTTAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCGTAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACGGGATTAAATTAAAAATAAAAGGCATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTTTTACTTAATTCCACTTCTATCAAAACAAGGGAAAAAAAGCCAATGTGTTCCAAC-------ATTGAATTCCAAACA-TAACTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGACAGAATCATCACCCATTCCTTTCTGCCTC--TCTGGGCAGCACTCTAGAGGAGTGAATGGGAGAGACTTCCATTCCTTCAAAGGC-GGCCAGTGCCTG---CTTCTTTCTAACTCCAACCTCACCCACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGT----TCAATGTGTTGGGGGAGAAAAAAGAAGGCGTGTATATATTTTTTCTTATATACACA-------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTG---GG---GGAGTGGAGACAGGAAGATAATCTGCTTTTTGTATTACAATGAAGTTCTACTATAAAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAACTATAATCTGTAA---TATTTTGACACTGCCATTTTACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTTAAAAGATTTAGACTCAAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCACC-----ttttttttttt----ttttttattaattttAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCCAGAATACAGTATATACAAACATGTATTTAAGTGAGCCCTATAAAGAAATACTCATAGGTAGTTTAAAATTGCTTGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAATTGGTAGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGAGAAGAGAATTAATACTATGTGCCAGGCACTCAATACATGAAGATAGAGTTGTATTAGCCTTGGTGTCTTATGCTGCACAATTACTCGTTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCTAAAAGCAGCAGAAGAAAAAAGAAAAAGAGAAGATAACTTTA------------AGTCTAAAATAAAATAAATAAGTACTATAATAATACTGTCCTAATAACACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTTAGATTTAAATGAGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGGGGATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACATGAggccaggcgcagtggctcacgcctgtaattgcagcactttgggaggtcaaggtgggcagactgcctgagctgaggagttggagatcagcctggacaacatggtgagactctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgtgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcacgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcactccagcctgggtgacagagtgaga--ctGTATCAaaaaataaaaata--aaaataaaaaataaaaatCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTGAATGTTTTAATTTAAAATT-------------------------------------------AATCACAATTCTGTATTGCTTTTAAGATT---TTGTTTAAAAATGACACATTTCAAAATTAACCAAAGTATATTTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCACGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGCAATGGACGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGCTGTAACTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAACGAGGCATTGGCACAC--------------------------------------AGTCAATGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCTCTGAGGGCACGAGGATCACAGTCTTCTCATCTAGGTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCACAATCCATCCAGCTGTTTACACAGAAAGTTAAAATGTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAGTAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAACCTTCTTGCCTAATCAATGAAAA--AGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTAACATAGATATAGCGGGAATAAAATAATGGAAATAAAACCCTTCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAACAGCAAAATGATTTTTTATTCATGATTTA---TACTGCAGGATGGGAAGCAGGGGGGAAGTTCATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCACTGATACTTGAACAACACCTACTCCAAAAGCAAAACTACGAATAaagaagaaggagaggagaggaaagcagagaagagaggagaaa-gggaggggaggggagaaaggagGGCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTATCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTC--GT-TTTTTATA---ATAGTCTCTACTTATTTGGaaaaaaa-----------aaaaaaaaaaGTAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCA-CAAGAAATACTCTGTCACTCAAGTTCTCACAGACAATGCCACACTGATGATGACCCCGGGCAATGCG--------------CCCACGGCCGATTTGCTATCAGCT-GCTTCTCTGTAACACAAACA-TTCTCCTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGCTCACCAAGGTCCACATCTCTCACT---CTGCCTCTGCTAGTCCCAAATATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAACCTAATTTT-AAGTTC-CGAAAATTCACTGGTTATTATGTTATTTGCCATGGGAGGGAG-TATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAAGGAAAAACAAAAAGAACAAACCTAAATCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAAAGGAGAGAAGAGGAAGGTAG-GGCACTAACCAAAGTCGTAAAGTCCAGGTTGGAACAAGGAACAAATCACTTTGGTTCCTGGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAATGGGAAGAAGTCTACAGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAAATTTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACACA-CTCTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACAGAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGGAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGAT-AAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGGCCCTGATAGGCTGTTTGCTGAAAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCACTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAATATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATCGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAATGGTTTGGCCAGTTTCAAGAAAGGATG i macFas5.chr2 C 0 I 823 s papAnu2.chr2 186318618 4250 + 187378091 aaaatatttatcactaAAAATACTAGAATGTTCTCTGAAAAcctattaaaacatttaaatattcttttatgcTATT--------------------------CTgatcaaaagaaagaat--aagtttAGGAAaggttaaaaatgcaaa-tttttaaaaaaagtttatttctagcCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCGTAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACgggattaaattaaaaataaaaggcattataAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTTTTACTTAATTCCACTTCTATcaaaacaaggggaaaaaagcCAATGCATTCCAAC-------ATTGAATTCCAAACA-TAACTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGACAGAATTATCACCCATTCCTTTCTGCCTC--TCTCGGCAGCACTCTAGAGGAGTGAATGGGAGAGACTTCCATTCCTTCAAAGGC-GGCCAGTGCCTG---CTTCTTTCTAACTCCAACCTCACCCACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAATGTGttgggggagaaaaaagaaggcatgtatatattttttcttatatacacA-------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTG---GG---GGAGTGGAGACAGGAAGATAATCTGCTTTTTGTATTACAATGAAGTTCTActataaaaaaaacccaaatgagTATTAATCTGGATTTTAACTATAATCTGTAA---TATTTTGACACTGCCATTTTACTAGATGTGGAtctcagtatattttaaaagatttagacTCAAAAATTGATGCAAATTCTttaagcacctttttttttttttttt----tttttttttaattttagctactACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCCAGAATACAGTATATACAAACATGTATTTAAGTGAGCcctataaagaaatactcatAGGTAGTTTAAAATTGCTTGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAATTGGTGGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATtaatactatgtgccaggcactcaacACATGAAGATAGAGTTGTATTAGCCTTGGTGTCTTATGCTGCACAATTACTCGTTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCtaaaagcagcagaaggaaaaagaaaaagagaagataacttta------------agtctaaaataaaataaataagtactataataatactgtcctaataaCACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTTAGATTTAAATGAGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGGGGATATAAaaggcaattatttaaaaaacatgaggccaggcgcagtggctcacgcctgtaattgcagcactttgggaggtcaaggtaggcagactgcctgagttgaggagttggagatcagcctgggcaacatggtgagactctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgtgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcacgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcactccagcctgggtgacagagtgaga--ctgtatcaaaaaataaaaata--aaaataaaaaataaaaatcatgaatcTTGATTcagatataatttttctttcaacaagttctgaatgttttaatttaaaatt-------------------------------------------aatcacaattctgtattgcttttaagatt---ttgtttaaaaatgacaCATTTCAAAATTAACCAAAGTATATTTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCATGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGCAATGGACGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGTTGTAACTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGCTGAGTCACAAGCCTGAAACGAGGCATTGGCACAC--------------------------------------AGTCAGTGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAGTGCCTCTGAGGGCACGAGGATCACAGTCTTCTCATCTAGgtggttttctatttcattggtaGCATCTTCTTTATCACAATCCATCCAGCTGTTTACACAGAAAGTTAAAATGTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAGTAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATAttccagagaaaaatgaaatcaagaattaTATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATAtgtttcattaattatttttactcatttttctgaAAACCTTCTTGCCTAATCAATGAAAA--AGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTAACATAGATATAGCgggaataaaataatggaaataaaacccTTCTAGTTTCCCCAATGTATACTACAAcagcaaaatgattttttattcaTGATTTA---TACTGCAGGATGGTAAGCAGGGGGGAAGTTCATGGGGGAAGGGGATGGTGGGAACAAAATGCCAGAACCAAACCACTGATACTTTAACAACACCTACTCCAAAAGCAAAACTACGAataaaggagaaggagaggagaggaaagcagagaagagaggagaaa-ggcaggggaggggagaacggagggCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAgaatctttaaaagaaacaaattattgcTATCAACACGcacatttcattttcctttctc--gt-tttttata---atagtctctacttatttag--gaaaa-----------aaaaaaaaaagtaactcaaCATCTCAAATGATCTATAAATTCA-CAAGAAATACTCTGTCACTCAAGTTCTCACAGACAATGCCACACTGATGATGACCCCAGGCAATGCG--------------CCCACGGCCGATTTGCTATCAGCT-GCTTCTCTGTAACACAAACA-TTCTCCTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTATATCAGAGCTCACCAAGGTCCATATCTCTCACT---CTGCCTCTGCTAGtcccaaatatttttctcctttaagtg-------GAAAAAACCTAATTTT-AAGTTC-CGAAAATTCACTGGTTATTATGTTATTTGCCATGGGAGGGAG-TATCTGTGAGGTGAGAGAGgattaaggaaaaacaaaaagaacaaacctaaaTCTAAAATTGCAACatatacagaaatttatttccaaattgaa-gggg-gaaaggagagaagaggaaggtaGTGGCACTAACCAAAGTCATAAAGTCCCGGTTGGAACAAGGAACAAATCACTTTGGTTCGTGGAGCCAAACCtgaaggggaaacaggcagaAGGGAAGACAAAATGGGAAGAAGTCTACAGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAAATTTCTAAAACTGAC-TTTTCACATTtgtt-aaaaaaggtaaaaatcacaca-ctcttcttcccttccttcaggTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACAGAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGGAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGATTAGCAGAT-AAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTATAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGGCCCTGATAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGtcatacttttctttttgcaattttCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCACTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCttgtagaaaatggaaaaaagaatatgAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATCGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAATGGTTTGGCCAGTTTCAAGAAAGGATG i papAnu2.chr2 C 0 I 938 s chlSab2.chr15 90398621 4236 + 91754291 AAAATATTTATCACTAAAAATACTAGAATGTTCTCTGAAAACCTATTAAAACATTTAAATATTCTTTTATGCTATT--------------------------CTGATCAAAAGAAAGAATAAAAGTTTAGGAAAGGTTAAAAATGCAAA-TTTTTTAAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAAAGTCGTAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACGGGATTAAGTTAAAAATAAAAGGCATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTTTTACTTAATTCCACTTCTATCAAAACAAGGGAAAAAAAGCCACTGTGTTCCAAC-------GTTGAATTCCAAACA-TAATTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATAGAAGTGTGCTTGACAGAATAATCACCCATTTCTTTCTGCTTC--TC--AGCAGCACTCTAGAGGAGTGAATGGGAGAGACTTCCATTCCTTCAAAGGC-GGCCAGTGCTTG---CTTCTTTCTAACTCCAACCTCACCCACCACAGCATCTTTGCCAGAGTGTTCAATCAATGTGTTGGGGGAGAAAAAAGAAGGCGTGTCTATATTTTTTCTTATATACACA-------ACACTATCAAAAAACTGATTTTACCAGTTTCAATACCTACTG---GGGGAGGAGTAGAGACAGGAAGATAATCTGCTTTTTGTATTACAAAGAAGTTCTACTAT-AAAAAACCCCAAATGAGTATTAATCTGGATTTTAACCATAATCTATAA---TATTTTGACACTGCCATTTCACTAGATGTGGATCTCAGTATATTTTAAAAGATTTAGACTCAAAAATTGATGCAAATTCTTTAAGCACC--------TTTTTTTT----TTTTTTTTAAATTTTAGCTACTACCTGATGAGATCTAAAATTATTCTGGCCAGAATACAGTACACATAAACATGCATTGAAGTGAGCCCTATGAAGAAACACTCATAGGTAGTTT-AAACTGCCTGTTAAAGGCACAGGCTCATTTACAATTGGTGGTTAC----TAGACTGTAAGCAGCTTAACATTGATATGTTAAAGGGAAGAGAATTAATACTACGTGCCAGGCACTCAACACATGAAGATAGAGTTGTATTAGCCTTGGTGTCTTACGCTGCACAATTACTCGTTTACTATTCTAGGTAGGATAAAATGTTCCATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGCCCCTAAAAGCAGCAGAAGAAAACAGAAAAAGAGAAGATAACTTTA------------AGTCTAAAATAAAATAAATAAGTACTATAATAATCCTGTCCTAACAACACAAGAGGACTATTAAGGTAACTTTTAGATTCAAATGAGAATTTTCATTCTAAAGTGATGACAAAAAGGGGGGATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACACGAggccaggcgcagtggctcacgcctgtaattgcagcactttgggaggtcaaggtgggcagattgcctgagctgaggagttggagatcagcctgggcaacatggtgagactctgtctcgactaaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgtgcacctgtggtctcagctactcaggaggctgaggcacgagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagctgagatcataccactgcactccagcctgggtgacagagtgaga--ctgtatcaaaaaataaaaata--aaaataaaaaataaaaatCATGAATCTTGATTCAGATATAATTTTTCTTTCAACAAGTTCTGAATGTTTTAATTTAAAATT-------------------------------------------AATCACAATTCTGTATTGCTTTTAAGATT---TTGTTTAAAAATGACACATTTCAAAATTAACCAAAGTATATTTCTGTTAGAGGTTAGTTTATCCACGTAACTTAAGAATAAACCACAGTGTAGCTCC------CTTAACCAAAGAGCCAGGTTTTAATGACTGAAGTCAGTTGCCAGCAATGGACGTGCAGGTAACTATCGAAGAAGTTGTAACTACAAATCCCAAACTGCTTCTATCAATGGAAAAGCCCTTTGTTGAGTCACAAGCCTGAAACGAGGCATTGGCACAC--------------------------------------AGTCAATGAGGATGGTCTTTGACTTAGGAGGGAAATGCCTCTGAGGGCACGAGGATCACAGTCTTCTCATCTAGGTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTACCACAATCCATCCAGCTGTTTACACAGAAAGTTAAAATGTGGAACTCAGGTGGCACTGCAGCTTTCTGCCAGAAGTAAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTAGAAGGCCAATATATTCCAGAGAAAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAACCTTCTTGCCTAATCAATAAAAAACAGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATCTTAACATAGATATAGCGGGAATAAAATAATGGAAATAAAACCCTTCTAGTTTCTCCAATGTATACTACAACAGCAAAATGATTTTTTATTCATGATTCA---TACGGCAGGATGGTAAGCA-GGGGGAAGTTCATGGGGG-AGGGGATGGTGGGAACAGAATACCAGAACCAAACCACAGATACCTGAACAACACCGACTCCAAAGGCAGAACTGCGGATAAaggagaaggagaggagaggaaagcagagaagagaggagaaa-gggagggcaggggagaagggaggGCACTCAGATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTTAGAATCTTTAAAAGAAACAAATTATTGCTATCAACACGCACATTTCATTTTCCTTTCTC--GT-TTTTTATA---ATAGTCTCTACTTATTTGG-----AA-----------AAAAAAAAAAGTAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCA-CAAGAAATACTCTGTCACTCAAGTTCTCACAGACAATGCCACACTGATGATGACCCCGGGCAATGTG--------------CCCACAGCCGATTTGCTATCAGCT-GCTTCTCTGTAACACAAACA-TTCTCCTTCATGAGTATAATCTCTTCTCACTGTATCAGAGCTCACCAAGGTCCACATCTCTCACG---CTGCCTCTGCTAGTCCCAACTATTTTTCTCCTTTAAGTG-------GAAAAAACCTAATTTT-AAGTTC-CGAAAATTCACTGG---TTATGTTATTTGCCATGGGAGGGAG-TATCTGTGAGGTGAGAGAGGATTAAGGAAAAACAAAAAGAACAAACCTAAATCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAATTGAA-GGGG-GAAAGGAGAGAAGAGGAAGGTAGTGGCACTAACCAAAGTCATAAAGTCCAGGTTGGAACAA-GAACAAATCACTTTGGTTCCTGGAGCCAAACCTGAAGGGGAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAATGGGAAGAAGTCTACAGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATAGAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTACTACCACGAAATTTCTAAAACTGACTTTTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACATA-CTCTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTATACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGCAACTCAAAAGGAGCAAGTCCAGGGAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGACTAGCAGAT-AAACAAATACTCTGAAAAACTCCAATCTGCCATTCAAGTATTGGAAATACCCCAAAGGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAATGCAAATCTCACACATGATAAATGGCCCTGATAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTTTGGACCCTAAAGAAGGGGTTCATATAAAAGTCATACTTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAAAGAATAGTCACTTGCTTCTTTCATTCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAAAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTGTAGAAAATGGAAAAAAGAATATGAGGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATCGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAGTGGTGTCAAGCTAGATAATGGTTTGGCCAGTTTCAAGAAAGGATG i chlSab2.chr15 C 0 I 801 s calJac3.chr15 18142749 4262 + 98464013 AAAAAAATTATCACTATAAATACTAGAATGCTCTCTGAAAACCTATTAAGACATTTAAATATTCTATT----TATT--------------------------CTGATCCAAAGAAAGAATAAAAGTTTAGGAAAGG-GAAAGATGCATA-TTTTTTTAAAAAGTTTATTTCTAGCCCTGAAAGAACAAAATTATTGAACAA--TCATAAAATACAGCAGTTAATGTCAATGTATAACAATTAAATAATTGAACGGGATTAAATTAAAAATAAAAGGCATTATAAAATTTGAAGACAACAGAAAAGACAAAC--TACTGTCACTTAATTCAATTTCTATCAAAACTAGAAAAAAAAAGCCAATGTGTTCCAACCGAAGATGCTGAATTCCAAACATTAACTGTTTCTCTTAATA----------------------------------AAGAATCAAAGTATGCTTGACAGAATTATCATACATTTCTTTCTGC-TCTGTCTCGGCAGCATTCTAGAAGAGTGA----GAAAGACTTCAGTTCTTTCAAGGCCAAGCCAGTGCTTGCTGCTTCTTTTTAATTCCAGCCTCGTCTACCACAGCATCTTTGCCAGAGAGTTCAATAAATGTGCT----GAGAAAAAAGAATGTGTATATATATTTTTTCTTATATACACACATACATACACTATCAAAAAACTGATTTTACCTGTTTAAATGCCTACTGTGGGA---GCAGCGGAGACAGGAAGACAATCTGCTTTTTATATTACTATCAAGTTCCACCAT-AAAAAACCCC----GAGTATGAATCAGGATTTTAGCTATAATCTACAATGTTACTTTGACACTGACATTTCACTGAATACGGATCTCAGTATATTTAAAAAGATTTAGATTCAAAAATGGATGCAAATTCTTTAAGCACC---------TATTTT-----TTTTTTCCTAATTTTAGCTACTACCTGATCAGATCTAAAATTATTCTGGCTAGAATACAGTATATACAAACATGTATTTAAGTGAGCCCTATAAAGAAATACTCATAGGTAGTTTAAAACTGCTTGTTAAAGGCACAGGCTCGTTTAAAACTGGTGGTTACTAAATAAATTGTAAGCAGCTTAACATTTATATGTTAAAGGGAAGAGAATGAATACTATGTGCCAGGCACTCA-------AAGATAGAGTTGTATTAGTCTTGGTGTCTTATGCTACACAATTACTCATTTATTATTCTAGGTAGGATACAATGTTCAATGTTTCATAGTTTCCCAGTTTTAACTGTCCCTAAAAGTAGAAG------------AAAGAAAAGATAACTTTAAGACTACCAGAGAGTCTAAAATATAATAAA----TACTATAGTTATACTGTGCTAATAACACAAGAGGACTATTAAAGCAACTTTTAGATTTAAATGGGAACTTTCATTCTAGAGTGATAACAAAATGGGTGAATATAAAAGGCAATTATTTAAAAAACATGAggccaggcgcagtggctcacacctgtaattgcagcactttgggaggctgaggtgggcagattgcctgagctcaggagttggagaccagcctgggcaacgtggtgagaccccgactctactgaaa--acaaaaaatcagctcaatatggtggtgaacacctgtgatctcagctactcagga-gtggaggcacaagaatcgcttgaacccaggaagtagaagttgcagtgagctgagatcatgccagtgcactgcagcctgggtgacagagtaagactctgtctcaaacaaataaaaaa--------------aaaaaaaaaaaaTCTTGATTCA-----AATTGTTCTTCCAACAAGTTCTTAACGTTTTAAGTTAAAATTAATAAATCACAATTCTGTGCTCGCTTTGGCAGCACATCTAATAAATCACAATTCTGTTTTGGTTTTACAATTATTTTGTTTAAAAATGACACATTTCAAAATTAACCGAAGTATATTTCTATTGGAGGTTAGTTTATCCAGGTAACTTAAGAATAAACCAAAGTGTATCTCC------CTTAATCTAAGAGCCAGGTTGTAATGACAAAAGTCAGTTACCAGCAATGCACGTGCAGGTAACTATCAAAGAAGTTGTAACTATAAATCCCAAACTGCTTCTACCAATTAAAAAGCCCTTTGCTGAGTCACAAGCCTAAAACAAGGCATTGGCAC----------------------------------------AGTCAACGAATATGGTCTTTGACTTAGGATGGAAGTGTATTTGAGTGCATGACGGTCACAGTCTTATCATCTAGGTGGTTTTCTATTTCATTGGTAGCATCTTCTTTATCATAATCCATCCAACCATTTATGAAGAATGTTAAAATGTGAAACTCCAGTGGCACTGCAGCTTTCTACCAGAA--AAACCAGTTTCTGTAATTCAGTAATAGCTGTTGAAGGCCAATATAGTCCAGAGAGAAATGAAATCAAGAATTATATTGAAAACAGAGACCATTAAGTGCTCTAAATATGTTTCATTAATTA-TTTTACTCATTTTTCTGAAAACTTTCCTGCTTTATCAATATAAAACAGTCACTTCTCTCCTTATAATTGTATATTAACATAG----AGTGGGAATAAAATAATGGAAATAAAACCCTGCTGGTTTCCCCAATGTACAC-ACAACAGCAAAATTA-TTTTTATTCATGATTTGTACGACTGCAGGGTGGCAAGCAAGGGTGAAGTCAATGGGGG-------------GAACAAAATGCCAGAACCAAACCACAGATACTTGAACAATACCTGCTCCAAAAGCAAAACAACAAATAAaggag-aggagagg------------agagagggaggggat-gggaggggaggagagaagagAGGGCACTCAAATAATTAATGCTACAGGTCTCAGACCTTTCAGAATCTTTAAAAGAAAAAAATTATTGCTATTAACACGCACATATCATTTTTCTTTCTCCAGT-TTTTTACATTAATATTCTCTACTTATTTGA----AAA----GAAAAAACAAAACTAAAATAACTCAACATCTCAAATGATCTATAAATTCACCAAGAAATACTCTGTCACAGAAGCTCTCAAAGATAGTAAAACACTGATAATGATCTGGGACAATGAGACTTCCACAAGAG-TCTGTGGTTGATTGGTTATCAGCTGGCTCCTCTGCAACACTAACATTTCTCTTTCATGAATATAATCTTGTCTCACTATATCAAAGCTCACCGAGGTTCCCGTCTGTCACT---CTGCCTCTGCTAGTCCCAAATATTTTTCTCCTTTGAATGGGGGGGAGGGGAAAGCTAATTTT-AAATTC-TGAAAATTCACTGGTTATTGTATTATTTGCCCTGGGAGGGGGGTATGTGTGAGGCGAGAGAGGATTAATGAAAAACAGAAAGAACAAACCTAAACCTAAAATTGCAACATATACAGAAATTTATTTCCAAAATGAA-GGGGAAAAAGGAGAGAAGAGGAAGGTAGTGGCACTAACCAAAGTCATAAAGCCCAGGTTGGAACAA-GAACAAATCACTTTGGCTCCTAGAGCCAAACCTGAAGAGAAAACAGGCAGAAGGGAAGACAAAATTGGAAGAATTCTATAGTCAATGGGAATCTTTTTCTATCTCAATGATTTAGTTATAAATATAGATTATTAGTCTTCTCTCTATACATGTAACAAATGCCAAACTTAATACCACAAAATTTCTAAAACTGGCTTCTTCACATTTGTT-AAAAAAGGTAAAAATCACATA-CTTTTCTTCCCTTCCTTCAGGTCAAGTTCTGAACTAAAATATTACATGTAACAACAGCTGGTCCTAACTTTTACACAAAGTGAAACTATATAGAGCTCCTTTGCCAACATAAGGAGCTACATAATTTCTATTACACTTGCCTAGGCATGAGAAACTCAAAAGC-----------AGGAAATTAAGGAAAAGGAAAGCTATGAAGGAGAGAAAGAGTAGCAGATGAAACAAATACTCTGAAAAACTCGAATCTGCCATTCAAGTATTAGAAATACCCCAAATGGGACAATGAATGGGATCTATTACAACAAAGTCAGCAAAGTAAAACGCAAATCTCACTCATGATAAATGGCTCTGATAGGCTGTTTGCTG-AAAGACCTAAGGCTAGTGATTCAGTCCACAATTCCTTCTGGACCCTCAAGAAGGGGTTCACATGGAAGTCATAATTTTCTTTTTGCAATTTTCTCTTGGTTGTCTTCAGAGAATAGTCATTTGCTTCTTTCATCCAGGTTATGCAGACCATTTCTTTAAACCCCAGAAAGAGTAATAATTTTCATATACTAAAAGGCTTCTTTTAGAAAAGGGAAAAAAGAATATGCAGCCACAGCAGTGATGTTAACGGTTACTCTTCATTGCTTCTTTAGCTGCCATGATCAATGGTGTCAAGCTAGACAGTGGTTTGGCCAGTTTCAGGAAAGGATG i calJac3.chr15 N 0 I 434 a score=447149.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 51628 137 + 478999 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCTGTTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCCCGAAATATTGGGGAAAGTGTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGATTCCATTAGTTGCTATTAGGCACAAGG s panTro4.chr3 1475610 137 - 202329955 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCCCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i panTro4.chr3 I 738 I 6605 s ponAbe2.chr15 18476756 137 + 99152023 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAGCCCCTTCTTTCCACATCCGTTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCCCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGATTCCATTAGTTGCTATTAGGCACAAGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1693402 137 - 123690457 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACACCGATTTAAGAAATCCCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGGTCCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i nomLeu3.chr11 I 1036 I 5904 s rheMac3.chr2 191549018 137 + 192599291 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCTCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGCTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i rheMac3.chr2 I 816 I 6508 s macFas5.chr2 191331701 137 - 192460366 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCTCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGCTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i macFas5.chr2 I 823 I 4926 s papAnu2.chr2 186323806 137 + 187378091 ctgTAATAATTCTTTGGCTGAaccccttttttccacatccatTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCTCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAgg i papAnu2.chr2 I 938 I 6500 s chlSab2.chr15 90403658 137 + 91754291 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACAACGATTTAAGAAATCTCGAAATATTGGGGAAAGTTTCTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i chlSab2.chr15 I 801 I 6602 s calJac3.chr15 18147445 137 + 98464013 CTGTAATAATTCTTTGGCTGAACCCCTTTTTTCCACATCCATTTCCAAACATCGATTTAAGAAATCCCGAAATATTGGGGAAAGTTTTTCTGGATTCTGAAGTTCTGGGGTTCCATTAGTTGCTATTAGGTACAAGG i calJac3.chr15 I 434 I 4731 a score=650391.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 51765 198 + 478999 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAGTAGCCATGATACCCAGAGACCATACATTGACTTTAGGGCCATAAGCCTTCCGTGTAACCACTTCTGGTGCCATCCAGTATGGCGTTCTGACCACGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCAGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG s panTro4.chr3 1482352 198 - 202329955 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCGACTTTAGGGCCATACGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGCGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCAGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i panTro4.chr3 I 6605 I 2217 s ponAbe2.chr15 18476893 198 + 99152023 CCCTCAAGGGATTTTCATCGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAGTAGCCATGATACCCAGAGACCATACGTTGACTTTAGGGCCATAAGCCTTCCATGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGCGTTCTGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCAGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1699443 198 - 123690457 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCAACTTTAGGGCCATAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGCGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCAGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i nomLeu3.chr11 I 5904 I 2243 s rheMac3.chr2 191555663 198 + 192599291 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCGACTTTGGGGCCATAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGGGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCGGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i rheMac3.chr2 I 6508 I 3252 s macFas5.chr2 191336764 198 - 192460366 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCGACTTTGGGGCCATAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGGGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCGGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i macFas5.chr2 I 4926 I 3244 s papAnu2.chr2 186330443 198 + 187378091 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCGACTTTGGGGCCATAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGGGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCGGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTcag i papAnu2.chr2 I 6500 I 2735 s chlSab2.chr15 90410397 198 + 91754291 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATGTCGACTTTGGGGCCATAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAGTATGGGGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCGGGGGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i chlSab2.chr15 I 6602 I 2559 s calJac3.chr15 18152313 198 + 98464013 CCCTCAAGGGATTTTCATTGAGGTATGGAGGCTCTCCTTCTACCATCTCAATAGCCATGATACCCAGAGACCATATATCAACTTTAGGGCCGTAAGCTTTCCGTGTAACCACCTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTTCCGACCATGGTACTGCGTTTGCTCTGCTCAGGAGTGATCTGGGCACAGAAACCAAAGTCAG i calJac3.chr15 I 4731 I 3751 a score=306299.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 51963 94 + 478999 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACACTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG s panTro4.chr3 1484767 94 - 202329955 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACATTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG i panTro4.chr3 I 2217 C 0 s ponAbe2.chr15 18477091 94 + 99152023 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACACTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1701884 94 - 123690457 TGAGCTTAACTGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACATTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAACGCCTG i nomLeu3.chr11 I 2243 C 0 s rheMac3.chr2 191559113 94 + 192599291 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGGACATTGTCGCTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAACGCCTG i rheMac3.chr2 I 3252 I 3421 s macFas5.chr2 191340206 94 - 192460366 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGGACATTGTCGCTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAACGCCTG i macFas5.chr2 I 3244 C 0 s papAnu2.chr2 186333376 94 + 187378091 TGAGCTTAACTGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACATTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG i papAnu2.chr2 I 2735 C 0 s chlSab2.chr15 90413154 94 + 91754291 TGAGCTTAACCGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACATTGTCACTTTTGATGTCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG i chlSab2.chr15 I 2559 C 0 s calJac3.chr15 18156262 94 + 98464013 TAAGTTTAACTGATCCTTCCATTCCCAAAAGTACATTGTCACTTTTGATATCTCTGTGGATCACTTGATTAGCATGTAAAAACTCCAATGCCTG i calJac3.chr15 I 3751 C 0 a score=12138.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52057 5 + 478999 TAAAC s panTro4.chr3 1484861 5 - 202329955 TAAAC i panTro4.chr3 C 0 I 3494 s ponAbe2.chr15 18477185 5 + 99152023 TAAAC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1701978 5 - 123690457 TAAAC i nomLeu3.chr11 C 0 I 3552 s macFas5.chr2 191340300 5 - 192460366 CAAAC i macFas5.chr2 C 0 I 5967 s papAnu2.chr2 186333470 5 + 187378091 TAAAC i papAnu2.chr2 C 0 I 3467 s chlSab2.chr15 90413248 5 + 91754291 TAAAC i chlSab2.chr15 C 0 I 3148 s calJac3.chr15 18156356 5 + 98464013 TAAAC i calJac3.chr15 C 0 C 0 e rheMac3.chr2 191559207 3421 + 192599291 I a score=-829.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52062 1 + 478999 -T s ponAbe2.chr15 18477190 1 + 99152023 -T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18156361 1 + 98464013 A- i calJac3.chr15 C 0 I 3912 e chlSab2.chr15 90413253 3148 + 91754291 I e papAnu2.chr2 186333475 3467 + 187378091 I e macFas5.chr2 191340305 5967 - 192460366 I e rheMac3.chr2 191559207 3421 + 192599291 I e panTro4.chr3 1484866 3494 - 202329955 I e nomLeu3.chr11 1701983 3552 - 123690457 I a score=384882.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52063 118 + 478999 CTCTCTGCATACAGCGGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGTGACCCCCTAGCAAGGTATTCCACGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA s panTro4.chr3 1488360 118 - 202329955 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGTGACCCCCCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i panTro4.chr3 I 3494 C 0 s ponAbe2.chr15 18477191 118 + 99152023 CTCTCTGCATACAGCAGCGATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGTGACCCCCCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1705535 118 - 123690457 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCGTCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGTGACCCCCCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i nomLeu3.chr11 I 3552 I 1623 s rheMac3.chr2 191562628 118 + 192599291 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGCGATCCACCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i rheMac3.chr2 I 3421 I 1631 s macFas5.chr2 191346272 118 - 192460366 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGCGATCCACCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i macFas5.chr2 I 5967 I 1598 s papAnu2.chr2 186336942 118 + 187378091 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGCGATCCACCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i papAnu2.chr2 I 3467 I 1596 s chlSab2.chr15 90416401 118 + 91754291 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACCACATCAGTGAGCGATCCACCAGCAAGGTATTCCATGACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i chlSab2.chr15 I 3148 I 1605 s calJac3.chr15 18160274 118 + 98464013 CTCTCTGCATACAGCAGCAATCTGTGCTTCATCCATGCAGGTTTCTGTTACAACATCAGTAAGTGACCCACCAGCAAGGTACTCCATTACCACAAACAATTCATCTCCTACCAGGTAA i calJac3.chr15 I 3912 I 1290 a score=6876.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52181 2 + 478999 CT s panTro4.chr3 1488478 2 - 202329955 CT i panTro4.chr3 C 0 I 1902 s ponAbe2.chr15 18477309 2 + 99152023 CT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707276 2 - 123690457 CT i nomLeu3.chr11 I 1623 C 0 s rheMac3.chr2 191564377 2 + 192599291 CT i rheMac3.chr2 I 1631 C 0 s macFas5.chr2 191347988 2 - 192460366 CT i macFas5.chr2 I 1598 C 0 s papAnu2.chr2 186338656 2 + 187378091 CT i papAnu2.chr2 I 1596 C 0 s chlSab2.chr15 90418124 2 + 91754291 CT i chlSab2.chr15 I 1605 C 0 s calJac3.chr15 18161682 2 + 98464013 CT i calJac3.chr15 I 1290 C 0 a score=26740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52183 10 + 478999 GTCCAAGAAG s ponAbe2.chr15 18477311 10 + 99152023 GTCCAAGAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707278 10 - 123690457 GTCCAAGAAG i nomLeu3.chr11 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 191564379 10 + 192599291 GTCCAAGAAG i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 191347990 10 - 192460366 GTCCAAGAAG i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 186338658 10 + 187378091 GTCCAAGAAG i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr15 90418126 10 + 91754291 GTCCAAGAAG i chlSab2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18161684 10 + 98464013 GTCCAAGAAG i calJac3.chr15 C 0 C 0 e panTro4.chr3 1488480 1902 - 202329955 I a score=321043.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52193 99 + 478999 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATTACCAGAATCTCATTAATGATCAAGTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATTTGTTTGATAGCA s panTro4.chr3 1490382 99 - 202329955 TTAACGATGTTGGGATTTTTCAATTCTTTCATCACCAGAATCTCGTTAATGATCAGTTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATTTGTTTGATAGCA i panTro4.chr3 I 1902 C 0 s ponAbe2.chr15 18477321 99 + 99152023 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCATTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATTTGTTTGATAGCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707288 99 - 123690457 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCGTTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATTTGTTTGATAGCG i nomLeu3.chr11 C 0 I 476 s rheMac3.chr2 191564389 99 + 192599291 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCATTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATCTGTTTGATAGCA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 191348000 99 - 192460366 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCATTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATCTGTTTGATAGCA i macFas5.chr2 C 0 I 649 s papAnu2.chr2 186338668 99 + 187378091 TTAACTATGTTGggattttttaattctttcatcaCCAGAATCTCATTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATCTGTTTGATAGCA i papAnu2.chr2 C 0 I 479 s chlSab2.chr15 90418136 99 + 91754291 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCATTAATAATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATCTGTTTGATAGCA i chlSab2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18161694 99 + 98464013 TTAACTATGTTGGGATTTTTTAATTCTTTCATCACCAGAATCTCATTAATGATCAATTCCTTCTTTGGCTGTTTCTGTAAATTAATCTGTTTGATAGCA i calJac3.chr15 C 0 I 475 a score=13752.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52292 4 + 478999 ACCT s panTro4.chr3 1490481 4 - 202329955 ACCT i panTro4.chr3 C 0 I 472 s ponAbe2.chr15 18477420 4 + 99152023 ACCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707863 4 - 123690457 ACCT i nomLeu3.chr11 I 476 C 0 s rheMac3.chr2 191564488 4 + 192599291 ACCT i rheMac3.chr2 C 0 I 538 s macFas5.chr2 191348748 4 - 192460366 ACCT i macFas5.chr2 I 649 C 0 s papAnu2.chr2 186339246 4 + 187378091 ACCT i papAnu2.chr2 I 479 C 0 s chlSab2.chr15 90418235 4 + 91754291 ACCT i chlSab2.chr15 C 0 I 478 s calJac3.chr15 18162268 4 + 98464013 ACCT i calJac3.chr15 I 475 C 0 a score=443.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52296 1 + 478999 T s ponAbe2.chr15 18477424 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707867 1 - 123690457 C i nomLeu3.chr11 C 0 C 0 s macFas5.chr2 191348752 1 - 192460366 C i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 186339250 1 + 187378091 C i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18162272 1 + 98464013 C i calJac3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr15 90418239 478 + 91754291 I e rheMac3.chr2 191564492 538 + 192599291 I e panTro4.chr3 1490485 472 - 202329955 I a score=150825.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52297 45 + 478999 CTGTCCCAGTGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC s panTro4.chr3 1490957 45 - 202329955 CTGTCCCAATGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i panTro4.chr3 I 472 I 3681 s ponAbe2.chr15 18477425 45 + 99152023 CTGTCCCAGTGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1707868 45 - 123690457 CTGTCCCAATGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i nomLeu3.chr11 C 0 I 1429 s rheMac3.chr2 191565030 45 + 192599291 CTGTCCCAATGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i rheMac3.chr2 I 538 I 2009 s macFas5.chr2 191348753 45 - 192460366 CTGTCCCAATGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i macFas5.chr2 C 0 I 2012 s papAnu2.chr2 186339251 45 + 187378091 CTGTCCCAATGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr15 90418717 45 + 91754291 CTGTCCCAACGCAACGTCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i chlSab2.chr15 I 478 C 0 s calJac3.chr15 18162273 45 + 98464013 CTGTCCCAATGCAACATCAGTAGCAGTGAAAACTGTACCAGAAGC i calJac3.chr15 C 0 I 1351 a score=3600.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52342 1 + 478999 C s panTro4.chr3 1494683 1 - 202329955 C i panTro4.chr3 I 3681 C 0 s ponAbe2.chr15 18477470 1 + 99152023 C i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1709342 1 - 123690457 C i nomLeu3.chr11 I 1429 C 0 s rheMac3.chr2 191567084 1 + 192599291 C i rheMac3.chr2 I 2009 C 0 s macFas5.chr2 191350810 1 - 192460366 C i macFas5.chr2 I 2012 C 0 s papAnu2.chr2 186339296 1 + 187378091 C i papAnu2.chr2 C 0 I 2013 s chlSab2.chr15 90418762 1 + 91754291 C i chlSab2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18163669 1 + 98464013 C i calJac3.chr15 I 1351 C 0 a score=3600.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52343 1 + 478999 C s panTro4.chr3 1494684 1 - 202329955 C i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18477471 1 + 99152023 C i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1709343 1 - 123690457 C i nomLeu3.chr11 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 191567085 1 + 192599291 C i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 191350811 1 - 192460366 C i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 186341310 1 + 187378091 C i papAnu2.chr2 I 2013 C 0 s chlSab2.chr15 90418763 1 + 91754291 C i chlSab2.chr15 C 0 I 4252 s calJac3.chr15 18163670 1 + 98464013 C i calJac3.chr15 C 0 C 0 a score=154338.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52344 63 + 478999 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATATTTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT s panTro4.chr3 1494685 62 - 202329955 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATA-TTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACGATAGTT i panTro4.chr3 C 0 I 2470 s ponAbe2.chr15 18477472 63 + 99152023 CTTGTCCAGTTTTTTCATATCTTGTATAATTTTTTCTTCGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1709344 62 - 123690457 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATA-TTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT i nomLeu3.chr11 C 0 I 2433 s rheMac3.chr2 191567086 62 + 192599291 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATA-TTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT i rheMac3.chr2 C 0 I 3096 s macFas5.chr2 191350812 62 - 192460366 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATA-TTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT i macFas5.chr2 C 0 I 3040 s papAnu2.chr2 186341311 62 + 187378091 CTTGTCCAATTTTTTCATatcttgtata-ttttttcttaggGTCACCTATGCTCACAATAGTT i papAnu2.chr2 C 0 I 3025 s calJac3.chr15 18163671 62 + 98464013 CTTGTCCAATTTTTTCATATCTTGTATA-TTTTTTCTTAGGGTCACCTATGCTCACAATAGTT i calJac3.chr15 C 0 I 2697 e chlSab2.chr15 90418764 4252 + 91754291 I a score=439820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52407 134 + 478999 CTTAGTTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATCTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTAAAGACTTGGCACCACCATCAACATTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACAGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT s panTro4.chr3 1497217 134 - 202329955 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATCTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTAAAGACTTGGCAGCACCATCAACATGTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACAGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i panTro4.chr3 I 2470 I 1096 s ponAbe2.chr15 18477535 134 + 99152023 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATCTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTAAAGACTTGCCACCACCATCAACATTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACAGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1711839 134 - 123690457 CTTAATTtctccataatctcttcatctgtcatcttagtcttctttttcTGTTTGTCTAAAGACTTGGCACCACCATCAACATTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACGGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i nomLeu3.chr11 I 2433 I 1098 s rheMac3.chr2 191570244 134 + 192599291 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATTTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTGAAGACTTGGCACCACCATCAACACTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACGGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i rheMac3.chr2 I 3096 I 1392 s macFas5.chr2 191353914 134 - 192460366 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATTTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTGAAGACTTGGCACCACCATCAACACTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACGGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i macFas5.chr2 I 3040 I 1391 s papAnu2.chr2 186344398 134 + 187378091 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATTTtagtcttctttttctgtttgtctgaaGACTTGGCACCACCATCAACACTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACGGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i papAnu2.chr2 I 3025 I 1393 s chlSab2.chr15 90423016 134 + 91754291 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATTTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTGAAGACTTGGCACCACCATCAACACTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACAGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i chlSab2.chr15 I 4252 I 1417 s calJac3.chr15 18166430 134 + 98464013 CTTAATTTCTCCATAATCTCTTCATCTGTCATCTTAGTCTTCTTTTTCTGTTTGTCTGAAGACTTGGCACCACCATCAACATTTGAATCACCAACTGGTGCAGGAACAGGGTCAATTACAGACCGTGTGTAAAT i calJac3.chr15 I 2697 I 1549 a score=324067.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52541 106 + 478999 TGATTTCATATGATCCGGTGGTGGGGCAATAACGGGAGGGGCAGTCTCTTCATCATCGTCCTCCTCCTCTGTCACTACTGCAGGTGCTTCTGTTCCCTCGGCATTC s panTro4.chr3 1498447 106 - 202329955 TGATTTCGTATGATCCGGTCGCGGGGCAATAACGGGAGGAGCAGTCTCTTCATCATCATCCTCCTCCTCTGTCACTACTGCGGGTGCTTCTGTTCCCTTGGCATTC i panTro4.chr3 I 1096 C 0 s ponAbe2.chr15 18477669 106 + 99152023 TGATTTGGTATGATCCAGTGGTGGGGCAATAACGGGAGGGGCAGTCTCTTCATCGTCATCCTCCTCCTTTGTCACTACTTCGGGTGCTTCTGTTCCCTTGGCATTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1713071 106 - 123690457 TGATTTCGTATGATCCGGTCGTGGGGCAATAACGGGAGGAGCAGTCTCTTCATCATCATCCTCCTCCTCTGTCACTACTGCGGGTGCTTCTGTTCCCTTGGCATTC i nomLeu3.chr11 I 1098 C 0 s rheMac3.chr2 191571770 106 + 192599291 TGATTTCGTATGATCTGGTCGTGGGGCAATAACAGGAGGAGCAGTCTCTTCATCATCATCATCTTCCTCTGTCACTACTGCGGGTGTTTCTGTTCCCTTGGCGTTC i rheMac3.chr2 I 1392 C 0 s macFas5.chr2 191355439 106 - 192460366 TGATTTCGTATGATCTGGTCGTGGGGCAATAACAGGAGGAGCAGTCTCTTCATCATCATCATCTTCCTCTGTCACTACTGCGGGTGTTTCTGTTCCCTTGGCGTTC i macFas5.chr2 I 1391 C 0 s papAnu2.chr2 186345925 106 + 187378091 TGATTTCGTATGATCTGGTCGTGGGGCAATAACAGGAGGAGCAGtctcttcatcatcatcatcttcctctGTCACTACTGCGGGTGTTTCTGTTCCCTTGGCGTTC i papAnu2.chr2 I 1393 C 0 s chlSab2.chr15 90424567 106 + 91754291 TGATTTCGTATGATCTGGTCGTGGGGCAATAACAGGAGGAGCAGTCTCTTCATCATCATCATCTTCCTCTGTCACTACTGCGGGTGTTTCTGTTCCCTTGGCGTTC i chlSab2.chr15 I 1417 C 0 s calJac3.chr15 18168113 106 + 98464013 TGATTTTGTATGATCTGGTCGTGGGGCAATAACAGGAGGAGCAGTTTCTTCGTCATCATCATCTTCCTCTGTCACTACTGCTGATGTTTCTGATCCCTTGGCATTC i calJac3.chr15 I 1549 I 1141 a score=5076.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52647 2 + 478999 AG s panTro4.chr3 1498553 2 - 202329955 AG i panTro4.chr3 C 0 I 1193 s ponAbe2.chr15 18477775 2 + 99152023 AG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1713177 2 - 123690457 AG i nomLeu3.chr11 C 0 I 1220 s rheMac3.chr2 191571876 2 + 192599291 AG i rheMac3.chr2 C 0 I 855 s macFas5.chr2 191355545 2 - 192460366 AG i macFas5.chr2 C 0 I 854 s papAnu2.chr2 186346031 2 + 187378091 AG i papAnu2.chr2 C 0 I 866 s chlSab2.chr15 90424673 2 + 91754291 AG i chlSab2.chr15 C 0 I 990 s calJac3.chr15 18169360 2 + 98464013 AC i calJac3.chr15 I 1141 C 0 a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52649 1 + 478999 T s panTro4.chr3 1499748 1 - 202329955 T i panTro4.chr3 I 1193 C 0 s ponAbe2.chr15 18477777 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 191572733 1 + 192599291 T i rheMac3.chr2 I 855 C 0 s macFas5.chr2 191356401 1 - 192460366 T i macFas5.chr2 I 854 C 0 s papAnu2.chr2 186346899 1 + 187378091 T i papAnu2.chr2 I 866 C 0 s chlSab2.chr15 90425665 1 + 91754291 T i chlSab2.chr15 I 990 C 0 s calJac3.chr15 18169362 1 + 98464013 T i calJac3.chr15 C 0 C 0 e nomLeu3.chr11 1713179 1220 - 123690457 I a score=103993.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52650 31 + 478999 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT s panTro4.chr3 1499749 31 - 202329955 GCTGGTGTTCCAGAAGGAAAGCCATCTTTCT i panTro4.chr3 C 0 I 2174 s ponAbe2.chr15 18477778 31 + 99152023 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1714399 31 - 123690457 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCGTCTTTCT i nomLeu3.chr11 I 1220 I 2186 s rheMac3.chr2 191572734 31 + 192599291 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 191356402 31 - 192460366 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 186346900 31 + 187378091 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr15 90425666 31 + 91754291 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCGTCTTTCT i chlSab2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18169363 31 + 98464013 GCTGGTGTTCCAGAAGGGAAGCCATCTTTCT i calJac3.chr15 C 0 I 1879 a score=3600.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52681 1 + 478999 C s panTro4.chr3 1501954 1 - 202329955 C i panTro4.chr3 I 2174 C 0 s ponAbe2.chr15 18477809 1 + 99152023 C i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1716616 1 - 123690457 C i nomLeu3.chr11 I 2186 C 0 s rheMac3.chr2 191572765 1 + 192599291 C i rheMac3.chr2 C 0 I 2637 s macFas5.chr2 191356433 1 - 192460366 C i macFas5.chr2 C 0 I 2456 s papAnu2.chr2 186346931 1 + 187378091 C i papAnu2.chr2 C 0 I 2143 s chlSab2.chr15 90425697 1 + 91754291 C i chlSab2.chr15 C 0 I 2103 s calJac3.chr15 18171273 1 + 98464013 C i calJac3.chr15 I 1879 C 0 a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52682 1 + 478999 A s panTro4.chr3 1501955 1 - 202329955 A i panTro4.chr3 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18477810 1 + 99152023 A i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1716617 1 - 123690457 A i nomLeu3.chr11 C 0 C 0 s calJac3.chr15 18171274 1 + 98464013 A i calJac3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr15 90425698 2103 + 91754291 I e papAnu2.chr2 186346932 2143 + 187378091 I e macFas5.chr2 191356434 2456 - 192460366 I e rheMac3.chr2 191572766 2637 + 192599291 I a score=462323.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52683 136 + 478999 GGAGGAGTAAAACTCAGATACTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGA---------CATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATATTTGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCAGTGTTCTGGCATGC s panTro4.chr3 1501956 145 - 202329955 GGAGGAGTAAAGCTCAGATATTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTTAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATATTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i panTro4.chr3 C 0 I 976 s ponAbe2.chr15 18477811 145 + 99152023 GGAGGAGTAAAGCTCAGATATTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTTAAGATACCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATATTTGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1716618 145 - 123690457 GGAGGAGTGAAGCTCAGATATTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTTAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATGTTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i nomLeu3.chr11 C 0 I 988 s rheMac3.chr2 191575403 145 + 192599291 GGAGGAGTAAAGCTCAGATACTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTGAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATGTTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i rheMac3.chr2 I 2637 I 976 s macFas5.chr2 191358890 145 - 192460366 GGAGGAGTAAAGCTCAGATACTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTGAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATGTTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i macFas5.chr2 I 2456 I 976 s papAnu2.chr2 186349075 145 + 187378091 GGAGGAGTAAAGCTCAGATACTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTGAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATGTTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i papAnu2.chr2 I 2143 I 976 s chlSab2.chr15 90427801 145 + 91754291 GGAGGAGTAAAGCTCAGATACTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAATTTGAGGACATCCAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTCTGCTCTAGTTTGGTGATGTTGGAGGTCTGTAGCAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i chlSab2.chr15 I 2103 I 961 s calJac3.chr15 18171275 145 + 98464013 GGAGGAGTAAAGCTCAGATATTTCTGCTTCACTGTGTTGGAGTCGTAGAACTTTAAGACATCTAGCACAGCCTGAGGATTCTTCTTTTGCTCTAGTTTGGTGATATTGGAGGTCTGTAGTAATCGAGCCCACTGTTCTGGCATGC i calJac3.chr15 C 0 I 984 a score=351240.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52819 104 + 478999 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTtttctttctttttacttcct s panTro4.chr3 1503077 104 - 202329955 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGCTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i panTro4.chr3 I 976 N 0 s ponAbe2.chr15 18477956 104 + 99152023 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAAATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr11 1717751 104 - 123690457 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i nomLeu3.chr11 I 988 N 0 s rheMac3.chr2 191576524 104 + 192599291 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i rheMac3.chr2 I 976 N 0 s macFas5.chr2 191360011 104 - 192460366 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i macFas5.chr2 I 976 N 0 s papAnu2.chr2 186350196 104 + 187378091 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGccgttccttttctttctttttacttcct i papAnu2.chr2 I 976 N 0 s chlSab2.chr15 90428907 104 + 91754291 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATGGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i chlSab2.chr15 I 961 N 0 s calJac3.chr15 18172404 104 + 98464013 CAGTGAATTCTCCAGTAACAGCATCAAAGCCAACATGGATAGTGTGTTCAAAATCAGATGGAGGAGAAATTTCTGGCCGTTCCTTTTCTTTCTTTTTACTTCCT i calJac3.chr15 I 984 N 0 a score=263838.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 52923 3002 + 478999 ttctCTGTGCCTGAGAATATGGAGATGATTTTATGCCTGGGCTTTTTCTCCTCTGGAACAGAAGGCAAAGGTTTCAAACTGTGATTGGCTGACAAAGGGTCTTTGCCTCCAGTGCTAAAGATGGTCCCGCTCATTCGCACGGGAGGTGCTGGAGGCTTGTCTTCCAGTTCTCCGTTATCACACATGATTCAGAATTATGAAATGGCCCCAGGTGAGGCAAGTTCCCCACCCCAGTGAGGCGCCTTGGTCAGAGCTCCTGGGAGGTTGCGGAGGCGCctggtaccaaaacagagatatagaccaatggaacagaacagagccctcagaaataataccacacatctataaccatctgatctttgacaaacctgacaaaaacaagaaatgaggaaaggattcccgatttaataaatggtgctgggaaaactggctagccatatgtagaaagctgaaactggaccccttccttacaccttatacaaaaattaattcaagatggattaaagacttacatgttagacctaaaaccataaaaaccctagaagaaaacctaggcaataccattcaggacataggcatgggcaagggctgcatgtctaaaacaccaaaagcaatggcaacaaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaaactaaagagcttctgcacagcaaaagaaactaccatcagagtgaacaggcaacatacagaatgag-aaaaatttttgcaatctactcatctgacaaagggctaatacccagaatctataatgaactcaaacaaatttacaagaaaaa----aacaaccccatcaaaaagtgggtgaaggacatgaacagacacttctcaaaagaagacatttatgcagccaaaagacacatgaaaaaatgctcatcatcactggccatcagagaaatgcaaatcaaaaccgcaatgagataccatctcacaccagttagaatggtgatcattaaaaagtcaggaaacaacaagtactagagaggatgtggagaaataggaacacttttacactgttggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaataccatttgacccagccatcccattgctgggtatgtacccaaaggattataaatcatgctgctataaagacacatgcacacgtatgtttattgcggcactattcacagtagcaaagacttggaactaacccaaatgtccaacaatgataaactggattaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcccttgcagggacatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgaaaggacaaaaaaaccaaacaccacatgttctcactcataggtgggaactgaacaatgagaacacatggacccaggaaggggaacatcacacactggggcctgttgtggggtggggggaggggggagggatagcattaggagatatgcctaatgttaaatgatgagttaatgggtggagcacaccaacatggcacatgtatacacatgtaacaaacctgcacgttgtgcacatgtaccctaaaacttaaagtataataaaaaataaaaaCATACAACCAAACAAAAAAAAGAATGCTGGAAAAGCACAAATGTAACGTTTTATGTGGTGGGACAGCCCTTTCAAAAGTGTTTTCCACTGCTTATACTGATGAAGGTAGAAAAAAATTTCACTTATTTTAACTCTTCCTTTAAAAACTTCTTTTTGGTGGCTCATGTCATGCATACTCCACAAGTCCTGGAAGTTAAATGCTCTTAAATATTTGATGGTCTGGTCTTAGCAAAACGGCAGGTTTTTACTTTTACATTTTTAGCTATGTTTTAAATTATTTGTAATCCAGACACTGAAGTTTTATTTTGTTGTGAATTgaatctgggcagagtgtacaagggatctctctgtatta-tttttacaactacatgtgaatctataattatctcatcaaaaattcaCTGAAAAAGGTATCACGGAGCCCATGTTTGCTGTTACCGTCTTTGCTCCTCCCAGGTTACAATGCCCCGTGCCTCTCAGTGCACAGTGAAAATGCAGCAGACGTTTTTGATGTGAGCTCCACGGAATGGATCCAGACTGTCCCCTTCAACAAGGTAATTTGACCTTAAGATTATGCAACTAATGAGTTAATGACTGAAACGCGGAAACAGAAATAATCCATTGTACATTTACTGTAATGGGTACTTGCTAGTTTGGAGGCTTAACAAAGAGTATAAAAAACAAAACCCTACAAAACATTATATTGATTAATTGCATTACTAGTACTAGAGCCATTTGTGACATCTAGTTCCATTATATAAAGTAGTATTGTTATAGATAAATATATTATTTATTTATACCATACAGCACAGCAGTTATTTCCCATATTCAGTTTAAAGTTAC----TTTATCAGTAATTTTTACTTACCAGTATAATTTGTTCCTTTTATACTTACCAGTATAAAAAGGAACACTTTACAGGGTAAAAGGAACATTTTTACAGGGTAAAAAAAGAAAAAAGCATATAACCAAGGCTGTGTTTCAGATTCTCAATAGGATCTCACAATGGTGATGTTTTGcaaaacaaggacattgacagtaactccatctacttaccttaggcagattttcctagttttactttcactgtgtgtgtattaatgtctgtataattctaccacctgtgtgaattcatgtatccaccactagtcaatatactgaatggctccagcaccacagtgggtccctcaagagcccttttataatcactccccctccctcacacctccttccgctttcctaacccctggcaatcagtaacctccatttctaaaattttatcatttcaaaaatgtctaacaaatggcgttatatagtatTCATGAT---TTTTATCTGCTAAGTCCAAATTTATTTT s ponAbe2.chr15 18478060 3011 + 99152023 TTCTCTGTGCCTGAGAATATGGAGATGATTTTATGCCTGGGCTTTTTCTCCTCTGGAACAGAAAGCAAAAGTTTCAAATTGTGATTGGCTGACAAAGGGTCTTTGCCTCCAGTGCTAAAGATGGTGCTGCTCATTCGCACGGGAGGTGCTGGAGGCTTGACTTCCAGTTCTCCGTTATCACACATGATTCAGAATTATGAAATGGCCCCAGGCGAGGCAAGGTCCCCGCCCCAGTGAGGCGCCTCGGTCAGAGCTCCCGGCAGGCTGTGGAGGTGCctggtatcaaaacagagatatagaccaatggaacagaacagagccctcagaaatcataccacacatctacaaccatctgatctttgacaaacctgacaaaaacaagaaatggggaaaggattccctatttaataaatggtgctgggaaaactggctagccatatgtggaaagctgaaactgaatcccttccttacaccttatacaaaaattaattcaagatggattaaagacttaaatgttagacctaaaaccataaaaaccctagaagaaaacctaggcaataccattcaggacataggtatgggcaaggacttcaggtctaaaacaccaaaagcaatggcaacaaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaaactaaagagcttctgcacagcaaaagaaactaccatcagagtgaacaggcaatctacagaatgggaaaaaatttttgcaatctactcatctgacaaagggctaatacccagaatctataatgaactcaaacaaattcacaagaaaaaaacgaacaaccccatcaaaaagtgggcaaaggatatgaatagacacttctcaaaagaagacatttatgcagccaaaaaacacatgaaaaaatgctcatcatcactggctatcagagaaatgcaaatcaaaaccgcaatgagataccatctcacaccagttagaatggtgatcattaaaaagtcaggaaacagcaggtgctggagaggatgtggagaaataggaacacttttacactgttggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaataccgtttgaaccagccatcccattactgggtatatacccaaaggattataaatcatgctgctataaaggcacatgcacacgtatgtttattgcggcactattcgcaatagcaaagacttggaactaacccaaatgtccaacaatgataaactggattaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcccttgcagggacatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgaaaggac-aaaaaaccaaacactgcatgttctcactcataggtgggaattgaacaatgagaacacatggacacaggaaggggaacatcacacaccggggcctgttgtggggtggggagagcggggagggatagcattaggagatatacctaatgttaaatgacgagttaatgggtgcagcacaccaacatggcacatgtatacatatgtaacaaacctgcacgttgtgcacatgtactctaaaacttaaaatataataaaaaataaaaaCAAACAACTAAAC-AAAAAAAGAATGCTTGAAAAGCACAAATGTAACGTTTTATGTGGTGGGACAGCCCTTTCAAAAGTGTTTTCCACTGCTTATACTGATGAAGGTAGAAAAAAATTTCACTTATTTTAACTCTTCTTTTAAAAATTTCTTTTTGGTGGCTCATGCCATGCACACTCCACAAGTCCTGGAAGTTAACTGCTCTTAAATATTCGATGGTCTGGTCTTAGCAAAGCGGCAGGTTTTTACTTTTACGTTTTTAGCTATGTTTTAAATTATTTGTAATCCAGACACTAAAGTTTTATTTTGTTGTGAATTgaatctgggcagagtgtacaagggatctctctgtattattttttacaactacatgtgaatctataattatctcatcaaaaattcactgaaaaaGGTATCAAGGAGCCCATGTTTGCTGTTACCTCCTTTGCTACTCCCAGGTTACAATGCCGCGTGCCTCTCAGTGCACAGTGAAAATGCAGTAGACATTTTTGATGTGAGCTCCATGGAATGGATCCAGACTGTCCCCTTCAACAAGATAATTTGATCTTAAGATCATGCAACTAATGAGTTAACGACTGAAACGCGGAAACAGAAATAATCCATTGTACATTTACTGTAATGTGTACTTGCTAATTTGGAGGCTTAACAAAGAGTATAAAAAA-AAAACCCTACAAAACATTATATTGATTAATTGTATTACTAGTACTAGAGCCATTTGTGACATCTAGTTCCATTATATAAAGTAGTATTGTTATAAATAAATATGCTATTTATTTATACCATACAGCACAGCAGTTATTTCCCATGTTCAGTTTAAAGTTACTTTGTTTATCAGTAATTTTTACTTACCAGTATAATTTGTTCCTTTTATACTTACCAGTATAAAAAGGAACACTTTACAGGGTAAAAGGAACATTTTTACAGGGTAAAAAAAGAAAAAAGCATATAACCAAGGCTGTGTTTCAGATTCTCAACAGGATTTCACAATGGTGATGTTTTGcaaaacaaggacattgacagtaactccatctacttaccttaggcagattttcctagttttactttcactgtgtgtgtattaatgtctgtataattctaacacctgtgtgagttcatgtatccaccactagtcaatatactgaatggctccagcaccacggtggttccctcaagagcccttttataatcac-acccctccctcccacctccttctgctttcctaacccctggcaatcagtaacctccatttctaaaattttatcatttcaaaaatgtctaacaaatggcgttatatagtatTCATGATTAATTTTATCTACTAAGTCCAAATTTATTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 a score=80764.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 55925 298 + 478999 TCTAAAAAAAACAAACTTTGGATTAGAAACCCAGGAGAATCCCATTACAATATTCTTATCATATAGCAGCTACATCAAAAAATTTTTGGAATATATACAGTTCAAATAAATAGACAAAAACAAGTGATGCCCATCAGTCAGATGATAGAGTAACTTCAATTCATATGGTCCAAGTCTGACAAAAATGCATTCTAACACCTGCATCTAACACCAGCTTTATTGAATAATTTCATCACGTTTCAAAATCTGTGTCTCCTAGACCAGTTGAGCTCACAACAAAAAGCAATTGTAGAGAGTT s ponAbe2.chr15 18481071 298 + 99152023 TCTAAAAAAAACAAACTTTGGATTAGAAACCCAGGAGAATCCCATTACAATATTCTTATCATATAGCAGCTACATCAAAAAATTTTTGGAATATGTACAGTTCAAATAAATAGACAAAAACAAGTGATGCCCATCAGTCAGATGACAGAGTAACTTCAATTCATATGTTCCAAGTCTGACAAAAATGCAATCTAACACCCGCATCTAACACCAGCTTTACTGAATAATTTCATCATGTTTCAAAATCTGTGTCTCCTAGACCAGTTGAGCTCACAACAAAAAACAATGGTAGAGAGTT i ponAbe2.chr15 C 0 I 243 s nomLeu3.chr6 45173126 298 - 121039945 tctaaaaAAAGCAAACTTTGGATTAGAAACCCAGGAGAATCCCATTACAATATTCTTATCATATAGCAGCTACATCAAAAAATTTTTGGAATATATACAGTTCAAATAAATAGACAAAAACAAGTGATGCCCATCAGTCAGATGACAGAGTAACTTCAATTCATATGGTCCAAGTCTGACAAAAATGCATTCTAACACCCGCATCTAACACCAGCTTTATCGAATAATTTCATCACGTTTCAAAATCTGTGTCTCCTAGACCAGTTGAGCTCACAACAAAAAACAATGGTAGAGAGTT i nomLeu3.chr6 N 0 C 0 a score=1007263.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 56223 3875 + 478999 AGAAAAATATATGAAATTAGTGAACAAAACAGTGAAACCTTCCAACCAGGAATGTTTTTGGAACTTTCTTTGTTAGTAATAGTTCCTTATGGTTCCTAAATATTCAACCTCCCAGCATGAATGTGTCTCCCATCAAAAGAGCCACAGAATAAACACAACCTCTTTTTTCAACATCCCTCTTCCTATGCTCACGTCTCCCATCTTTTTCCCTTGTCTTACAGCCAAATTCCTGAAATTGTTATTGATATTCCTTGCCCTCCACTTCCCACCCCTATTCACACCTCCATCACAGGGCAATCTGACTTACACCTTAATCACTCCATTAAAGCTGCTCTCATACAAGTTATCAGCCATCAGTTGTGAAAACCATCTGACCTGTTTGTCTCTTCTTGGCTGCCCAGCGACACCTGACCCTTCTTTCTTCAGTCCCCACGCTGCTGCTCCCTCGATTTTCCCCACTTCCCTGAATTCTCCTTCCCTGTTTTCTCTGCTCCTCTTCCTCTGGTCGAAGCCCTCTTCCTTTCTCGCTCTGCTTACTCAGCATGTCCAAAGAGtcaggctgacactaccagaagcgagtcatcgattttagcgtgacaagtgggatggctagagattgtgtgccATGCACAGTACTGTTCATGAAGTGTTCCTACAACCAGGCTTTAGAGCTCCTTCCCCATTATAGGAAATTCAGGGCATAGAAG---TGAAGCAGTATCATGAGGGAGAACAAAGACAGGTGCAGATTGTGGGACATTATGAAGGACAACAAATCAGTGGCAGGGAGGACTGCTCAGGATGAGAGGACCTTTGTGAGAAAGTGGTGTGCAGGgtggaccttgtcaggattctgattccaatagacagactgcaaaaagagaaatacttgtgataatcaagtatgtatgactgtggactatgtatgggatgataatcagaatcattgagtacatcttcaggagcgatcacagcaatgtgattatgggagaaagtgtccctacttttagtgatacatgttcaaatgtgtagagatggaacaacatgatgtcagggatttgacttgaaatattccaACAACACAACAACAAAGAAAATACTTCAATGGTCACATCTCTTCCTCCATACCCGCCTAGATCTGCTCCACCTTGTGTTTTATGACCTCAGAGTCTATCAGTGGCCTCCGCCCCTTTGCTCAAGTTGGAAACCTGAGAATCATTGCTGATTCTCTTACATGTCAGCTTCCACTTCCAACCAAGTGTGAAGCTTTTGCAATTTTATCTCCTCAATATTCCTCATATCCTCTCCTCTCCATCCCCACCGCTACTATCATACATAATTTTAATTCACAATTTCTCCCGTAACCCCCTAACTGGTCTCTTAGCCTCCAGTAAGTAGTAAttgaattcccttaattactagtggtgtggagcattcatttgtgcgcttatttgccacatgtatcttctttgttgaggaacctgttcaaatactccgcccattttaaaaatttgggttgagttggggagcggtggctcacacctgttatttcaccacttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaacctcgtctctacaaaaatacaaaaattagccaggcatgatggcgggtgcctgtaatcccagctactcgcaggggt-gggggtgggggattgggaggctgaggggggagaatcgcttgaatctgggaagctgaggtcacagtgagccgagattgtgccattccacaccagcctaggcagcagagcaagactccatctgaaa-----aaaataaaatttgggttatttattttcttattattgagtttttaaaattcttcatacattctggatacaaggttttttt--gtcatatctgatttgcaaatattttctccaaatctgtggcttgtttacttctcttagcagtaaatttcaaataacagaaatttttaattttatcaattttttatttttatttttattttgagacagagtctcactctgtcgccaggctggagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcaacctccgcctcccaggttcgagggattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggtcccagctcgtatagccagcacgcccagctaattttagtatttttagtagagaaggggtttcaccatgttggtcaggatggtctcaatctcttgaccttgtgatccacctgcttctgccttccaaagtgtggggattacaggcatgaatcaacgtggctggccccaaacttttatcacatttttaaaagttttatacattgtgctttgatgttgtatcaaagaattgtttgccttatccaaaatcagaaagattttcttcattgtttacttttaggcacttcctagttttaggtttacatttagttacatgacctattttgaattaactctcatatatgctaagaaatatagataaaagttgatttttttgcatatggttatctgaggttctagcacaatttgttgacagcttttgcagcttgttggaaatactgtatatattaaagcaacagaatagaggatcctgcaatatatatcagcaaatgtataaacagacacatagatatagagatggatatacacaaaatatttttgtatctgtatatacagttctgaatttcatatcatatatattatagttttattgttgaaatcaggtaaagttaatttatcaaatttgttcttttttcagttattttggctcttctagatcgtttgcattttcttatgaatttcagaatcagcttgtcaatatctaccaaaaaatattaaaatcctgctagaattttgactaggattgtgttgaaactatctatcaatttggggaacatttatgttctaaatattggtttccagggcatgaagacagtgtatctctccatgtatttgggttatctttaatgtttctcagtattccacagttttcagtgtacaggtcatgcacatcttttgtcagatttattcctaagagtttaatatattttgatgctactttaaatggcattgcttttaaaattccaatttctggttatttgttgctagtataaaatgcaattggtttttgtatattgttcatgtatcctgcaaccttgctaaacgcatttattagttctaatagc-tttttttgtattttatattgaattttctacatagatgttcattttgtctgtgtgcagttttgcttctttctttctatcctggacgtattctatctcagcttcttgtctggctaggatttccacaacaatgttaaatgtaagcgtggtgagagcaaacatcccatcttgttcctgataagacaaacaagaaagcattgagtgtttcgttactaacaatgatgttagctgtaggatttttcacagatgccttttatcaggatgaggaagctcccttctaaatgttccaaatgtaaatatatgacttcatcagatgtatttactgcatctattgacatgatcatttattaatatggtgcaatacattgattgatttgaggatgttcaaccaaccaacctttctgagatacattatatttgtccacggtacaatataatttttatgtattgttggaactgatttgctaacattttgtaaagaacttttatatctaaattcaaaaagaatatttgtttatag-tttttttgtaatatcttagtctagctttggtatcaaggtgatactagccttataaaataagttggtaactagttcctactcttcaattttctgaaagagtttaagtataattggtaatatttcttccttagaggtttgaacaaaaaacttcagagaa s ponAbe2.chr15 18481612 3878 + 99152023 AGAAAAATATATGAAATGAATGAACAAAACAGTGAAACCTTCCAACCAGGAATGTTTCTGGAACTTTCTTTGTTAGTAATAGTTCCTTATGGTTCCTAAATATTCAACCTCCCAGCATGAATGTCTCTCCCATCAAAACAGCCACAGAATAAACACAACCTCTTTTTTCAACATCCGTCTTCCCATGCTCACGTCTCCCATCTCTTTCCCCCGTCTTACAGCCAAATTCCTGAAATTGTTATTGATATTCCTTCCCCTCCACTTCCCACCCCTATTCACACTGCCATC-CAGGGCAATCTGACTTACACCTTAATCCCTCCATTAAAGCTGCTCTCATACAAGTTATCAGCCATCAATTGTGAAAACCATCTGACCCGTTTGTCTCTTCTTGGCTGCCCAGCGACACTCGACCCTTCTTTCTTCAGCCCCCATGCTGCTGCTCCCTCAATTTTCCACAATTCCCTGAATTCTCCTTCCCTGTTTTCTCTGCTCCTCTTCCTCTGGTTGAAGCCCTCTTCCTTTCTCACTCTGGTTACTCAGCATGTCCAAAGAGTCAGGCTGACACCACCAGAAGCGAGTCATCGATTTTAGCGTGACAAGTGGGATGGCTAGAGATCGTGTGCCATGCACAGTACTGTTCATGAAGTGTTCCTATGACCAGGCTTTAGAGCTCCTTCCCCATTATAGGAAATTCAGGGCATAGAAGAAGTTAAGAAGCACCACGAAGGAGAACAAAGACAGGCGCAGATTGTGGGACATTGTGAAGGACAACAAATCAGTGGCAGGGAGGACTGCTCAGGACGAGAGGACCTTTGTGAGAATGTGGTGTGCAGGGtggaccttgtcaggattttgattccaataagtagactgcaaaaagagagatactcgtgataatcaagtatatatgactgtggactatgtatgggatgataatcagaatcattgagcatatcctcaggagggatcacagcactgtgattatgggagaaagtgtccctacttttagtgatacatgttaaagtgtgtagagatggaacaacatgatgtcagggatttgacttacaatattccaACAACACAACAACAAAGGAAATACTTCAATGATCACATCTCTTCCTCCATACCCGCCTAGATCTGCTCCACCTTGTGTTTCATTACCTCAGAGTCTATCAGTGGCCTCCACTCCTTTGCTCAAATTGGAAAACTGAGAATCATTGCTGATTCTCTTACACGTCAGCTTCCACTTCCAACCAAGTGTGAAGTTTTTGCAATTTTATCTCCTCGATATTCCTCATATCCTCTCCTCTCCATCCCAACCACTTCTATCATATATAATTTTAATCCACAATTTCTCTCATAACCCCCTAACTGGTCTCTTAGCCTCCAGTAAGTAGTAAttgaattcccttaattactagtggtgttgagcattcatttgtgcgcttatttgccatgtgtatcttctttgttggggaacctgttcaaatactctgcccattttaaaaatttgggttgagttggggagcggtggctcacacctgttatttcaccacttgggaggcgaaggtgggtggatcacctgaggtcagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccttgtctctacaaaaatacaaaaattagccaggcacgatggcgggtgcctgtaatcccagctactcgcaggggtggggggtgggggattgggaggctgaggggggagaatcgtttgaatctgggaagctgaggtcacagtgagctgagattgtgccattgcacaccagcctgggcagcagagcaagactccatctgaaa-----aaaataaaatttgggttattcattttcttattattgagtttttaaaattcttcgtacattctggatacaagtttttttttggtcatatttgatttgcaaatattttctccaaatctgtggcttgtttacttctctt---agtaaatttcaaagaacagaaattttaaattttatcaa-tttttatttttatttttattttgagacagagtctcactctgtcgccagactggagtgcagtggtgcgatctcagctcactgcaacctccgcttcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggtcccagctcctatagccagcacgcccagctaattttagtatttttagtagagaaggggtttcaccatgttggccaggacggtctcaatctcttgacctcgtgatccacctgcttctgccttctaaagtgcggggattacaggcatgaatcactgtggctggccccaaacttttatcacattttaaaaaattttatacattgtgctttgatgttgtatcaaagaattgtttgccttatccaaaatcagaaagattttcttcattgtttacttttaggcacttcctagttttaggtttacatttagttatatgacctattttgaattaactctcatatatgctaagaaacatagataaaagttgatttttttgcatatggttatctgaggttctagcacaatttgttgacagcttttgcagcttgttggaaataccatatatattaaagcagcagaatacaggatcctgcaatatatatcagcaaatgtataaacagacacatagatatagagacagatatacacaaaatatttttgtatctgtatatacagttctgaatttcatatcatatatattatagttttattgttgaaatcaggtaaagttaatttatcaaatttgttcttttttcagttattttgcctcttctagatcatttacattttcttatgaatttcagaatcagcttgtcaatatctaccaaaaaatattaaaatcctgctagaattttgactaggattgtgttgaaactatgtatcaatttggggaacatttatgttttaaatattggtttccaatgcatgaacacagtgtatctctccaagtatttgggttttctttaatttttctcagtattccacagttttcagtgtacaggtcatgcacatcttttgtcagatttattcctaagagtttaatatattttgatgctactttaaatggccttgcttttaaaattccaatttctggttatttgttgctagtataaaatgcaattggtttttgtatattgttcatgtatcctgcaaccttgctaaactcatttattagttctaataccttttttttgtattttatattgaattttctacatagatgttcattttgtctatgtgcagttttgcttctttctttctatcctggccgtattccatttcagcttcttgtctggctaggatttccacaacaatgttaaatgtaagcgtggtgagagcaaacatcccatcttgttcctgataagacaaacgagaaagcattgagtgtttcgttactaataatgatgttagctgtaggatttttcacagatgccttttatcaggatgaggaagctcccttctaaatgttccaaatgtaaatatatgacttcatcaaatgtgtttactgcatctattgacatgatcatttataaatatggtgcaatacattgattgatttgaggatgttcaaccaaccaacctttctgagatacattatatttgtccacggtacaatataatttttatgtattgttggaactgatttgctaacatattgtaaagaacttttatatctaaattcaaaaagaatattcatttatagttttttttgtaatgttttagtctagctttggtatcagggtgatactagccttataaaataagttggtagctggttcctactcttcaattttctgaaagagtttaagtagaattggtaatatttcttccttagaggtttgAACAAAAAACTCCAAAGAa i ponAbe2.chr15 I 243 I 16469 s nomLeu3.chr6 45173424 3847 - 121039945 AGAAAAATATATGAAATTAATGAACAAAACAGTGAAACCTTCCAACCAGGAATGTTTTTGGAACTTTCTTTGTTAGTAATAGTTCCTTATGGTTCCTAAATATTCAACCTCCCAGCATGAATATGGCTTCCATCAAAATAGCCACAGaataaacacagcctcttttttcaacatccctcttcctatgctcacgtctcccatctctttcccttgtcttacagccaaattcctgaaattgttattgatattccttgccctccacttcccacccctattcacacctccatc-cagggcaatctgacttacaccttaatccttccattaaagctgctctcatacaagttatcagccatcaattgtgaaaaccatctgacccgtttgtctcttcttggctgcccagcgacactcgacccttctttcttcagctcccacgctgctgctccctcgattttccccacttccctgaattctccttccctgttttctctgctcctcttcctctggtcgaagccctctTCCCTTCTCACTCTGCTTACTCAGCATGTCCAAAGAGTCAGGCTGACACCACCAGA-----------------AGCGTGACAAGTGGGATGGCTAGAGATTGTGTGCCACGCACAGTACTGTTCATGAAGTGTTCCTACGACCAGGCTTTAGAGCTCCTTCCCCATTATAGGAAATTCAGGGCATAGAAG---TGAAGCAGCATCATGAGGGAGAACAAAGACAGGTGCAGATTGTGGGACACTGTGAAGGACAACAAATCAGTGGCAGGGAGGACTGCTCAGGACGAGAGGACCTTTGTGAGAAAGTGGTGTGCAGGgtggaccttgtcaggattctgattccaataaatagactgcaaaaagagaaatacttgtgataatcaagtatatatgactgtgggctctgtatatgatgataatcagaatcattgagcacatcttcaggagcgatcacagcaatgtgattatgggagaaagtgtccctacttttagtgatacatgttaaagtgtgtagagatggaacaacatgatgtcagggatttgacttgaaatattccaACAACACAACAACAAAGAAAATAATCCAATGATCACATCTCTTCCTCCATAcccgcttagatctgctccaccttgtgtttcatgatctcagagtctatccgtggcctccactcctttgttcaagttggaaacctgagaatcattgccgattctcttataagtcagcttccacttccaaccaagtgtgaagtttttgcaattttatctcctcaatattcctcgtatcctctcctctccatccccac----gctatcacacataattttaatccacaatttctcccgtaaccccttaactggtctcttagcctccaGTAAGTAGTAAttgaattcccttaattactagtggtgtggagcattcatttgtgtgcttctttgccacatgtatcttctctgttgaggaacctgttcaaatactctgcccatttaaaaaatttgggttgagttcgggagcggtggctcacacctgttatttcaccacttgggaggccaaggtgggtggatcacctggggtcagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaacctcatctctacaaaaatacaaaaattagccaggcatgatggcgggtgcctgtaatcccagctactcacaggggt-gagggtgggggattgggaggctgaggggagagaatcgcttgaatctgggaagctgaagtcacagtgagccaagattgtgccattgcacaccagcctggacagcagagcaagactccatctgaaaaaaataaaataaaatttgggttatttattttcttattattgagtttttaaaattcttcatacattctggatacaaatttttttt--gtcatatttgatttgcaaatattttctccaaatctgtggcttgttttcttctcttagcagtaaatttcaaagaacagaaattttaagttttatcaattttttattgttatttttattttgagacagagtctcactctgtcgccaggctggagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcaagctccgcctccccggttcaagcgattctcctgcctcagcct-ccgagtatctgggactacaggtcccagctcatacagccagcacacccagctaattttagtatttttagtagagaaggggtttcaccatgttggccaggatggtctcaatctcttaatctcgtgatccacctgcttctgccttccaaagtgcggggattacaggcatgaatcaccgtggctggccccaaacttttatcaaatttttaaaaattttatacattgtgctttgatgttgtatcaaagaattgtttgccttatccaaaaccagaaagattttcttcattgtttacttttaggcacttcctagttttaggtttacatttagttatatgatctattttgaattaactctcatataggctaagaaatatagataaaagttgatttttttgcatatggttagctgaggttctagcacaatttgttgacagcttttgcagcttgttggaaatactgtatatattaaagcaatagaatagaggatcctgcaatatatatcagcaaatgtataaacagacacatagatatagagacagatatacacaaaatatttttgtatctgtagatacagttctgaatt-----tcatatatattatagttttattgttgaaatcaggtaaagttaatttattaaatttgttcttttttcagttattttggctcttctagatcatttgcattttcttatgaatttcagaatcagcttgtcaatatctaccaaaaaatattaaaatcccgctagaattttgactaggattgtgttgaaactatctatcaatttggggagcacttatgttttaaatattggtttccaatgcatgaacacagtgtatctctccatgtatttgggttttctttaatttttctcagtattccacagttttcagtgtacagatcatgcacatcttttgtcagatttattcctaagagtttaatatattttgatgctactttaaatggcactgcttttaaaattccaatttctggttatttgttgctagtataaaatgcaattggtttttgtatattgttcacgtatcctgcgaccttgctaaactcatttattagttctaatagc--ttttttgtattttatattgaattttctacatagatgttcattttgtctatgtgcagttttgcttctttctttctatcctggacgtattctatttcagcttcttgtctggctaggatttccacaacaatgttaaatttaagcgtggtgagagcaaacatcccgtcttgttcctgataagacaaacgagaaagcatggagtgtttcattactaataatgatgttagctgtaggatttttcacaaatgccttttatcaggatgaggaacctcccttctaaatgttccaaatgtaaatatatgacttcatcaaatgtgtttactgcatctattgacatgatcatt----aatatggtgcaatacattgattgatttgaggatgttcaaccaaccaacttttctgagatacattatatttgtccacggtacagtataatttttatgtattgttggaactgatttgctaacattttgtaaagaacttttatatctaaattcaaaaagaatattcgtttataa-tttttttgtaatgtcttagtctagctttggtatcaaggtgatactaaccttataaaataagttggtaactggttcctactctttaattttctgaaagagtttaagtagaattgataatatttcttccttagaggtttgaacaaaaaacttcagagaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 a score=154953.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 60098 1826 + 478999 gcaatctggggttagagtttcctttgtaggatgagcatttaattaaaattcaattacttcaataaatatagagttattcaattatctgattcttcttgagtgagctatagcaatttgtatctttcaaaaaaattctcatttcatctcagttacaaaatttattaggtaatgctgtacacagtattcccttactccatttttaatttttacaaaatctgtgctgatatagtttctttcatacctgatattaggaatttgtctcttttttgttttgatgatcagcctgctggaagtttataaatatttggtttcatagatttttctctatttttttttgttttattgatgttcactctgatctctagtatttccaaaattgttttttgtgtttaatttgctcttgtttttccaattattaaggcagaagctggggtagttaattaatctaaaatctattctcttttctactatagtgtttaatcccataattttacacataaatattgccttatcagcattccacacattttgaaatattgttttcactctcacttagctgaaaatgcat--tggtttctcttttgaaatcttctttagcccttgcaatatgtagacatgtgtaatttatcatcttaatacttgacgtttttccagaaaagttattattattaacttctaatttatttccaatgtg---------------------------------------gtccaagaacatacttcataggacttaaatcactccaaatattctgagacttgctttctggcacagaatgtattctatcttgataaatattctgtgtttgcttgagaagagtttatattatgtgactgtcaggtggactgatttataaatatcaataaaatcaagttatttgatagttttatttttttaagtctgctgtatcttcactgattttttttctacttgttctactaattattgatagtgagtattgtaatccccaactataactgtggagaaatagacaactatttctcttttgagttctattggtgtttgtttcgtttgtgttgaagctctgtgatgacatacgtagtgcttgttattcttagaattatcacgtcctcctgagaagcggaccctgttctccttataaaacgacattcttcatccctg---atattctcttatctgatgtctactttatctgatatgaatatagccactccagctttcatttgattcatggtaactctttttcaatcttttacttttaatatgtttgtatctttacatttaaaatgtctttctcacaggcagcatgtacttgggtcttcatttttttcatcaaagctgacaatctct-ccttttaattgggatgcttagaacatttaacaagatttttgaaatggttatgttacacctgtgatcttgttattcatcttttactcaatccatctgttctttgctcccctttcctgtttagtgccctgttttggattttgttgttgttgttgttattccatctcatcttctttgttggcttatatgataacaaaactttttgttttgttatttcagtggttgctttacaactctaagttactgcagcctactttcacatgttatcttacttcatgtgtggtgtaagaaccttccagtaacatgctttcatttttcctttcctggcctttcgctattgttgtcctgcatttcacttacacataaattacaaactacacaaaacactgttgttatttctgtataaaattcaattattatttcaagattttttaatggaggggtcttatacatcttcctatacagttactttccagagctcttcatcctttattacagatcaatatttccatctga s nomLeu3.chr6 45177271 1863 - 121039945 gcaatttggggttagagtttcctttgtaggatgagcatttaattaaaattcaattacttcaataaatataaagttattcaatgatctgattcttcttgagtgaactatagcaatttgtatctttc-aaagaattgtcatttcatctcaattacaaaatttattgggtaatgctgtacatggtattcccttactccatttttaatttttacaaattctgtgctgatacagtttctttcatacctgatattaggaatttgtctctttttcattttgatgatcatcctgctggaagtttataaatatttggtttcatagatttttctcta-ttttttttgttttattgatgttcactctgatctttagtatttccaaaatttttttttgtgtttaatttgctcttctttttctaattattaaggcagaagctggggtagttaattgatctaaaatctattgtcttttctactatagtgtttaatcccataattttacacataaatattgccttatcagcattccacacattttgaaatattgttttcactctcacttagctgaaaatgtattctgatttctcttttgaaatcttctttagccctcgtaatatgtagacttgtgtaatttatcatcctaatacttgatgtttttctagaaaagtttttattattaacttctaatttatttccaatgtggaaatatgtccaatgtgaaatatttccaatgtgaagtatgtccaagaacatacttcatatgacttaaatcactccaaatattctgagacttgctttctggcacagaatgtgttctatcttgataagtattctgtgtttgcttgagaagagtttatattatgtgactgtcaggtggactgatttataaaaatcaataaaatcaagttgtttgatagttttatttttttaagtctgctgtatcttcactgattttttttctacttgttctaccaattattgagagtgagtattgtaatccccaattataattgtggaattgt------ctatttctcttttgagttctatcggtgtttgtttcatttgtgttgaagctctgtgatgacatatatagtgcttgttattcttagaattattatgtcctcctgagaagcagaccctgttctccttataaaatgacattcttcatgcctgataatattcttttatctggtgtctactttatctgatatgaatatagccactccagctttcatttgattcatggtaactctttttcaatcttttacttttaatatgtttgtacctttatatttaaaatgtctttcttacaggcagcatgtacttgggtcttcatttttttcatcagagctgacaatctctaccttttaattgggatgcttagaacatttaacgagatttttgaaatggttatgttatacctgtcatcttgttattcatcttttactcaatccatctgttctttgctcccctttcctctttagtgccctattttggattttgttgttgttgttgttattccatctcatcttctttgttggcttatatgataacaaaactttttgttttgttatttcagtggttgctttacaactgtaagttactgcagcctactttcacatgttatcttacttcatgtgtggtgtaagaaccttccagtaacatgctttcatttttcctttcctggcgtttcgctattgttgtcctgcatttcactcacacataaattacaaactacacgaaacactgttgttatttttgtataaaattcaattgttatttcaagattttttaagggaggggtcttatacatcttcctgtacagttactttccagagctcttcatgctttattacagatcaatatttccatctgg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18485490 16469 + 99152023 I a score=168160.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 61924 646 + 478999 tatcatctttcttctgcctgaggagttcctattttatttcctgtgcagcaggtctgctggtgatacgttcttacagtttttttctgcctggatatatctttatttccccttcattttggaaagttatttacactggttacagaattcagagttaacagtatgtcctcttttagaatttaaaata-ttttttctatatcctcccagattctgg-tatctgtgatgagaactctggcagcatcctttgttaatctttatgtatggtgtgtcccatccctctatgtctgtatcactagggttcaatactttgattactatgaacctttgtggagttcttcatatttcttataggtgggctttactgagtttcttggataagagatttatagtttatatcaaatttgaaaacattttggccatttttttgtatta-ttttttctgtccctcctcttttcagtccttctaggactcaaattacatgtattattggctgcttgaaggtgttctacagtttagtttcttaaaatccttttactctatttccttttggatagtttttattgctatgtcttgtatttggcaatgtttaatctgctattaatcatgttccgtgtatttttcatctcaaatttataAG----AGTTTTTGGGTg s ponAbe2.chr15 18501959 646 + 99152023 tatcatctttcttctgtctgaggagttcctattttatttcctgtagagcaggtctgctggtgatacattcttacagtttttttctgcctggatatatctttatttccccttcattttggaaagttatttatactggttacagaattcagagttaacagtatatcctcttttagaatttaaaata-ttttttctgtatcctcccagattctgg-tatctgtgatgagaactctggcagcatccttttttaatgtctatgtctggtgtgtcccatccctctatgtctgtatcactagggttcaacactttgattactatgaacctttgtggagttcttcatatttcttataggtgggctttactgagtttcttggatacgagatttatagtttatatcaaatttgaaaacattttggccatttttt-gtatta-ttttttctgtccctcctcttttcagtccttctaggactcaaattacatgtattattggct---tgaaggtgttctacagtttagtttcttaaaatccttttaatctatttccttttggatagtttttattgctgtgtcttgtatttggcaatgtttaatctgctattaatcatgttctgtgtatttttcatctcaaaTTTATAAGTAAGAGTTTTTgggtg i ponAbe2.chr15 I 16469 C 0 s nomLeu3.chr6 45179134 653 - 121039945 tatcatctttcttctgcctgaggagttcctattttatttcctgtagagcaggtctgctggtgatacattcttacggtttttttctgcttggatatatctttatttcaccttcattttggaaagttatttacactggctacaggattcagagttaacagtatatcctcttttagaatttaaaatatttttttctatatcctcccagattctggttatctgtgatgagaactctggcagcatcctttgttaatctctatgtatggtgtgtcccattcctctatgtctgtatcactagggttcaatactttgattactatgaacctttgtggagttcttcatatttcttataggtgggctttactgggtttcttggataagagatttatagtttatatcaaatttgaaaacattttggccatttttttgtattatttttttctgtccctcctcttttcagtcctcctaggactcaaattacatgtattattggctgcttgaaggtgttctacagtttagtttcttaaaatccttttactctatttccttttggatagtttttattgctatgtcttgtatttggcaatgtttaatctgctattaatcatgttctgtgtatttttcatctcAAATTAATAAGTAAGAGTTTATGGGTg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 a score=124602.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 62570 216 + 478999 ggcatggtggctcacacctgtaatcccagccttttgggagactgaagtgggctgatcatttgagctcaggagtttgagaccagcctgggcaacaagataaaaccccgtgtttac-----------aaaaattagccaggtgtggtggcacatgcctgtagtcccacctactcaggaggctgaagttgaggatagcttaagcccagaaggcagaggttacagtgagcc s ponAbe2.chr15 18502605 216 + 99152023 ggcacggtggctcacacctgtaatcccagccttttgggagacagaagtgggctgatcatttgagctcaggagctcaagaccagcctggacaacatgacaaaaccccgtgtttac-----------aaaaattagccaggtgtggtggcacatgcctgtagtcccacctactcaggaggctgaagttgaggatagcttaagcccagaaggcagaggttacagggagcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45179787 216 - 121039945 ggcatggtggctcacatctgtaatcccagccttctgggagactgaagtgggctgatcatttgagctcaggagttcgagaccagcctgggcaacatggcaaaaccccgtgtttac-----------aaaaattagccaggtgtggtggcacatgcctgtagtcccacctactcaggaggctgaagttgaggatagcttaagcccagaaggcagaggttacagtgagcc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21553870 185 + 96509753 ggcacggtggctcacgcctgaaaacccagcactttgggaggccgagatgggcggatca--caaggtcaggagttcaagatcagcctagccaatatcatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaaattagccgggcgtggtggtgggcacctgtagtcccagctactcaggaggctg-------------------------aggcag--------------- i macFas5.chr10 N 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478041 185 - 90941950 ggcacggtggctcacgcctgaaaacccagcactttgggaggccgagatgggtggatca--caaggtcaggagttcaagatcagcctggccaatatcatgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaaattagccgggcgtggtggtgggcacctgtagtcccagctactcaggaggctg-------------------------aggcag--------------- i papAnu2.chr10 N 0 C 0 a score=118048.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 62786 61 + 478999 gagatcacgccactgcactccagcctggacgacatagccagaccctgtc-------aaaaaaaaaaca s panTro4.chr22 21153944 68 - 49737984 gagatcgcgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chr22 N 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18502821 58 + 99152023 aagatcacgccactgcacaccagcctggatgacgaagccagaccctgtc----------aaaaaacaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180003 60 - 121039945 gagatcacgccattgcactccagcctggatgacaaagtcagaccctgtc--------aaaaaaaaCCA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21062234 63 - 95678458 gagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctc-----aaaaaaaaaaaa i rheMac3.chr10 N 0 C 0 s macFas5.chr10 21554055 63 + 96509753 gagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctc-----aaaaaaaaaaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478226 64 - 90941950 gagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctca----aaaaaaaaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20471829 63 - 33263144 gagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctc-----aaaaacaaaaaa i chlSab2.chr19 N 0 C 0 a score=-1504.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 62847 2 + 478999 aa s panTro4.chr22 21154012 2 - 49737984 aa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18502879 2 + 99152023 aa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180063 2 - 121039945 CA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21062297 2 - 95678458 CC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21554118 2 + 96509753 CC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478290 2 - 90941950 cc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20471892 2 - 33263144 CC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15898019 2 - 38964690 AA i canFam3.chr26 N 0 C 0 a score=1108233.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 62849 340 + 478999 aaCTTTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAGGAACAAA------AAAGTCAATAATTCACGATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATAAAACTATGCACTAAGGAGTTTTATATATAAATTT---------------ACCCATTAAATAAATA--TGTGTATGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA----------------------------------------------TTCTAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CCACAAGATTATTTATACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTGGGGGATGAAGTTTACTAAGCAATTTACAATGTTCTGTGAAAATCATCAGCTTTTTCAGGTTCTGTAGTAAAGTTATAAAAGTTCTAGGCACC s panTro4.chr22 21154014 337 - 49737984 aaCTTTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAGGAACAAA------AAAGTCAATGATTGACAATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATGAAATTATGCACTAAGGAGTTTTATATATAAATTT---------------ACCCATTTAACAAGTA--TGTGTGTGTACTT----AA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCTAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-TTATAAGATTATTTATACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTTAGGGATGAAGTTTACCAAGCAATTTATAATGTTCTGTGAAAATCACCAGCTTTTTCAGGTTCTCTAATAAAGTTATAAAAGTTCTAGGCACC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18502881 341 + 99152023 aaCTTTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAGGAACAAA------AAAGTCAACAATTCACGATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATAAAATTATGCACTAAGGAGTTTTACATATAAATTT---------------ACCCATTAAATAAATA--TGTGTATGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCTAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CCACAAGATTATTTATACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTGGGGGATGAAGTTTACTAAGCAATTTACAATGTTCTGTGAAAATCATCAGCTTTTTCAGGTTCTGTAGTTAAGTTATAAAAGTTCTAGGCACC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180065 341 - 121039945 AACTTTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAGGAACAAT------AAAGTCAATAATTCACGATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATGAAATTATGCACTAAGGAGTTTTATATATAAATTT---------------ACCCATTAAATAAATA--TGTGTATGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCTAATGACT---------------------------------TACAGTTTTTA-CCACAAGATTATTTATACAAACAGATTATTTTCATTCCAGAGTGGGCTTTTGTGGGGATGAAGTTTACTAAGCAATTTACAATGTTCTGTGAAAATGATCAGCTTTTTCAGGTTCTGTAGTAAAGTTATAAAAGTTTTAGGCACC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21062299 343 - 95678458 AACTGTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAAGAACAAA------AAAGTCAATGATTTACAATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATGAAGTTATGCACTAAGGAGTTCTATATTTAAATTT---------------ACCCATTAAACAAGTATGTGTGTGTGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCGAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CTGTAAGATTATTTACACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTTGGGGATGAAGTTTCCTAAGCAATTTATAATGCTCTGTGAAAATCACCAGCCTTTTCAGGTTCTGTAATAAAGTTTTAAAAGGTCTAGGCACC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21554120 343 + 96509753 AACTGTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAAGAACAAA------AAAGTCAATGATTTACAATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATGAAGTTATGCACTAAGGAGTTCTATATTTAAATTT---------------ACCCATTAAACAAGTATGTGTGTGTGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCGAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CTGTAAGATTATTTACACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTTGGGGATGAAGTTTCCTAAGCAATTTATAATGCTCTGTGAAAATCACCAGCCTTTTCAGGTTCTGTAATAAAGTTTTAAAAGGTCTAGGCACC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478292 343 - 90941950 aactgtcATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAAGAACAAA------AAAGTCAATGATTCACAATTTAAAagctactaaaaacataaaatatgaaattatgcaCTAAGGAgttctatatttaaattt---------------accCATTAaacaagtatgtgtgtgtgtacttctttaa-------tttaaaaaa---------------------------------------------attcgaATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CTGTAAGATTATTTACACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTTGGGGATGAAGTTTCCTAAGCAATTTATAATGTTCTGTGAAAATCACCAGCCTTTTCAGGTTctgtaataaagttttaaaaggtcTAGGcacc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20471894 340 - 33263144 AACTGTCATAACCAATTATATAACCATTCTACTACTTAGAAGAACAAA------AAAGTCAATGATTCACAATTTAAAAGCTACTAAAAACATAAAATATGAAATTATGCACTA---AGTTCTATATTTAAATTT---------------ACCCATTAAACAAGTATGTGTGTGTGTACTTCTTTAA-------TTTAAAAAA---------------------------------------------ATTCAAATGACT---------------------------------TACAGTTTATA-CTGTAAGATTATTTACACAAACAGATTATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTTTTGGGGATGAAGTTTCCTAAGCAATTTATAATGTTCTGTGACAATCACCAGTCTTTTCAGGTTTTGTAATAAAGTTTTAAAAGTTCTAGGCACC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 50036 341 - 112050 AAATTTCATAACCAATTATATAACCATTCTATTACTTGGAGGAATAAA------AAAGTCAATGATTGTCAATTTAAAAGCTACTAAAAACATAACATATAAAATTATACACTAAGGAGTTTTATATATAAATTT---------------GCCCATTAAATAAGTA--TGTGTGCATACTTCTTTAA-------TTTAAGAAA---------------------------------------------ATTCTAATGACT---------------------------------TATAGTTTATA-CTACAAGATTATTTATACAAACAGATTGGTCTCATTCCAGAGTAGGCTTTTCTGGGGATGAAGTTTACTAAGCAATTTACAACGTTCTGTGAAAATCATCAGCTTTTTCAGGTTCTGTAGTAAAGTTATAAAACTTCTAGGCACC i calJac3.chrUn_GL286438 N 0 I 1055 s canFam3.chr26 15898021 427 - 38964690 ACTTTTCATAACCAATT-CATAACCATTCTGCTACTTAGAGGAACAAAAAAAACAAAGTCAAGGATTCACAATT----------CAAGACCACAAAATATGAAATAATGCAATAAGGAGTTTTATAAGTAAATTTATAATATAGAAGTAAATTTACCCACTAAGTA--TGTCTGCCTACTTCCTTAAAGAAAATTTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaTCTAATGATTTTTTACAAGattatttatataacaatataaatatataatatatatttacaagattatttatata-----aCAATTCTCATTCCAGAGTGGGCTTTCTTGGGGATGAAGTTT----AGCAATTTACAATGTTCTGCAAAAATTATAAGCTTCTTCAGGTTCCAGGGTAAAGTTACAAAAGTTCTGGCAAT- i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=47468.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 63189 17 + 478999 ATATCTTTTTAAACCAT s panTro4.chr22 21154351 17 - 49737984 ATATTTTTTTAAACCAT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18503222 17 + 99152023 ATATTTTTTTAAACCAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180406 17 - 121039945 ATATTTTTTTAAACCAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21062642 17 - 95678458 ATATTTTTTTAAaccat i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21554463 17 + 96509753 ATATTTTTTTAAaccat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478635 17 - 90941950 atatttttttaaatcat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20472234 16 - 33263144 ATA-TTTTTTAAaccat i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15898448 16 - 38964690 -TTTTTTTTTAAACCAT i canFam3.chr26 C 0 I 298 e calJac3.chrUn_GL286438 50377 1055 - 112050 I a score=1134654.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 63206 474 + 478999 Aagaaaa--tacgagggcacatgtgtgtatgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttatttgtaattaccaaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaatacagaacctgttgtatatccatacaacgcaatgctactaagcaacagaaagtaattactgatacataaaaacatggatgaatctcaaaatacattaggttaaataaaagacgtccgtctcaagaagccacatactg-AGTCaagcagg--------------gggatccctt---------------------------------------------gagaccaggagcttgaggcca-gcataggcaatataaca---aggcctcccatt-----------------------tctatt---aaacaaacaaaaattaaaacaa--------aaaggctaaatactgcgtgattt------------t-gt--ttacacggaa-ttctgaaaa--gaaaaaaaaaaaaagacaagacagagaaaaaaacagatcagtggtggccagagactagaggtaaggaaatgggctgactatg s panTro4.chr22 21154368 467 - 49737984 AAAAAAAAATacatgggcacatgtgt--atgtatgcatgcatcaatggttttatggcacttttatttgtaattaccaaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaacacagaagttgttgtacatccatacaatggaatgctcctaaacaacagaaagtaattactgatacataaaaacatggatgaatctcaaaatacattaggttaaataaaagatgtcagtctcaagaagtcacatactg-AGTCaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gagaccaggagcttgcggcca-gcataggcaatataaca---agacctcccatt-----------------------tctatc---aaacaaacaaaaaTTAAAACAa--------aaaggctaaatactgcatgattt------------ttgt--ttacatggaaattctgaaaa--------aaagacaatacaa--cagagaaaaaa-cagatcagtggttgccagagactagaggtgaggaaatgggctgactata i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18503239 472 + 99152023 aagaaaa--tacatgggcacatgtgtgtatgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttattcgtaattaccaaaaactggaaacaacccaaacgaactggggaatgaatacagaacctgttgtacatccatacaatggaatgctactaagcaacagaaagtaattactgacacataaaaacgtggatgaatctctaaatacattaggttaaataaaagacgtccatctctagaagccacatactg-AGTCaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gagaccaggagtttgaggcca-gcataggcaatataaca---agacctcccatt-----------------------tctatt---aaacaaacaaaaattGaaacaa--------aaaggctaaatactgcgttattt------------t-gt--ttacatggaa-ttcagaaaa--aaaaaaaaagacaaaacaa--cagagaaaaaaacagatcagtggtggccagagactagaggtaaggaaatgggctgactatg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180423 474 - 121039945 Aagaaaa--tacatgggcatatttgtgtatgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttattcgtaattaccaaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaatacagaacctgttgtacatccatacaatggaatgctactaagcaacagaaagtaattactgatacataaaaacatggatgaatctcaaaatacattaggttaaataagagacatccgtctcaagaagccacatactg-AGTCAAGCAGG--------------GGGATCCCTT---------------------------------------------GAGACCAGGAGCTTGAGGCCA-GCATAGGCAATATAACA---AGACTTCTCATT-----------------------TCTATT---AAACAAACAAAAATGAaaacaa--------aaagactaaatactgcatgattt------------t-gt--ttacatggga-ttctgaaaaaaaaaaaaaaagacaaaacaa--cagagaaaaaaacagatcagtagtgggcagagactagaggtaaggaaataggctgactgtg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21062659 460 - 95678458 aaaaaaa-atacatgggcacatgtgt--atgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttatttgtaattactgaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaatacagaaactgttgtacatccatacaatggaatgctactaagcaacagaaagtaattactgatacataaaaacatagatgaatctcaaaacacattaggttaaataaaagacatcagtctcaagaagccacatactg-AGTCaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gaggccaggagtttgcagcca-gcataggcaacataaca---agacctcccatt-----------------------tctatt-------aaaCAAAAATTAAAACAa--------aaaggctaaataccacatgattt------------t-gt--ttacatggaa-ttctcaaaa--------aaagacaatacaa--cagagaaaaaa-cagatcagtggttgccagagactagaggtgaggaaatgggctgactata i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21554480 460 + 96509753 aaaaaaa-atacatgggcacatgtgt--atgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttatttgtaattactgaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaatacagaaactgttgtacatccatacaatggaatgctactaagcaacagaaagtaattactgatacataaaaacatagatgaatctcaaaacacattaggttaaataaaagacatcagtctcaagaagccacatactg-AGTCaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gaggccaggagtttgcagcca-gcataggcaacataaca---agacctcccatt-----------------------tctatt-------aaaCAAAAATTAAAACAa--------aaaggctaaataccacatgattt------------t-gt--ttacatggaa-ttctcaaaa--------aaagacaatacaa--cagagaaaaaa-cagatcagtggttgccagagactagaggtgaggaaatgggctgactata i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20478652 460 - 90941950 aaaaaaa-atacatgcgcacatgtgt--atgtatgtatgcatgaaTGCTTTTAtggcagttttatttgtaattaccgaaaactggaaacaacccaaatgaacTGGGGAATGAATACAGAAACTGttgtacatccatacaatggaatgctactAAGCAACAGAAAGTAATTACTGATACATaaaaacatagatgaatctcaaaacacATTAGGTTAAATAAAAGACATCAGTCTCAAGAAGCCACATACTG-AGtcaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gaggacaggagtttgcaGCCA-GCATAGGGAACATAACA---AGACCTCCCATt-----------------------tctatt-------aaacaaaaattaaaacaa--------aaaggctaAATACCACATGATTT------------T-GT--TTACACGgaa-ttctcaaaa--------aaagacaatacaa--cagagaaaaaa-cagatcagtggttgccagagactAGAGGTGAGGAAATGGGCTGACTATA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20472250 464 - 33263144 aaaaaaa-atacatgggcacatgtgt--atgtatgtatgcatgaatgcttttatggcagttttatttgtaattaccgaaaactggaaacaacccaaatgaactggggaatgaatacagaaactgttgtacatccatacaatggaatgctactaagcaacagaaagtaattactgatacataaaaacatagatgaatctcaaaacacattagggtaaataaaagatatcagtctcaagaagccacatactg-AGTCaagcagg--------------aggatccctt---------------------------------------------gaggccaggagtttgcagcca-gcataggcaacataaca---agacctcccatt-----------------------tctatt---aaacaaacaaaaaTTAaaacaa--------aaaggctaaatactgcatgattt------------t-gt--ttacatggaa-ttctggaaa--------aaagacaatacaa--cagagaaaaaa-cagatcagtggttgccagagactagaggtgaggaaatgggctgactata i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15898762 549 - 38964690 aaaaaaa--AAAATGGGcatatatgtgtgcatgtgtatgcat--atgcttttatagcagttt--tttgtggtcaccaaaaactggtaacaatccaaatga-----gtaatgaat----aaactttggtacacccatacaatgaaatgcagctcagcaataaa----aattactcatacac-aaaatacgaat--atgtcaaagtgccctgtattaaa----agaagccagtctcaaaaagctacatactgcattccagtatggattccatttatacagaattctttttttagatttttaatttattcatttgagagagagagacagacagagaaaccacaagcagagagagaggcaaagggagaaggagaaacagactccccattgagcagggagcccaatgcagggctcaatcccaggacggggaaatctgaaggcaacctgagccaaaggc-aaacactaaatcatctgagccactcaggt-gccgctatatggaa-ttctttgaa---------aagacaaaacta--taatgacaaaa-cagatcagtacttgtcagagactggaagtaggggaacagatggacta-- i canFam3.chr26 I 298 C 0 e calJac3.chrUn_GL286438 50377 1055 - 112050 I a score=1001063.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 63680 321 + 478999 gaaaggggcatgaggaaa-ttttt------tgagaaactaactctatatcttgatcatcatggtggttgcacaactagatgtgtttCCCAGTCTTACAGAACCATATTCAAA------------------------------TACACCTTAAT--AAAGATAATTTTCAACCATACATATGATAGAATCATAATTATTACTCTTATACTAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACTGAGGCAAGAACACTAAACCTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTTTGAAAACTCCCTTCCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAATATTTGTAAATTAGTCACAAAATCCTTTAAGATTAAA s panTro4.chr22 21154835 317 - 49737984 gaaagggtcatgaggaaa-ttttt------tgaggaacta-ctttgtatcttgatcat---ggtggttgcaaaactacatgtgtttcccaacctcacagaaccatacTCAAA------------------------------CATACCTTAAT--AAAAATAATTTTCAACCATACATATGAAAGAATCTTAATTATTGCTCTAATACCAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACCGAAGCAAGAACACTAAACTTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTTTGAAAACTCCCTTCCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAATATTTGTAAATTAGTCACAAAATCCtttaatattaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18503711 320 + 99152023 gaaagggtcatgaggaca-ttttt------tgagaaacta-ctctatatcttgatcatcatggtggttgcacaactagatgtgtttcccaaTCTTACGGAACCATATTCAAA------------------------------TATACCTTAAT--AAAGATAATTTTCAACCATACATATGATAGAATCATAATTATTGCTCTCATGCTAAGACCACATAGATGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAACACTAAACCTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTTTGAAAACTCCCTTCCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAATATTTGTAAATTAGTCACAAAATCCTTTAAGATGAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45180897 320 - 121039945 gaaagggtcatggggaaa-ttttt------tgagaaacta-ctctatatcttgatcatcacgatggttgcacaactAGATGTGTTCCCCAATCTTACAGAACCATATTCAAA------------------------------TATACCTTAAT--AAAGATAATTTTCAACCATACATATGACAGAATCATAATTATTGCTCTCATACTAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAATACTAAACCTTGGTCTGGTCTGCCTCCAAGTTTGAAAACTCCCTTCCATTAACA-TTTTGCTTAAAAATT-AAACAATATTTGTAAATTAGTCACAAAATCCTTTAAGATTAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21063119 313 - 95678458 gaaagggtcatgaggaaa-ttttt------tgaggaacta-ctctatatcttggtcat---ggtggttgcaaaactagatgtgtttcccaacctcacagaaccatacTCAAA------------------------------CATACCTTAAT--AAAAATAATTTTCAACCATATATATGATAGAATT----TTATTGCTCTAATACCAAGACCAAATAGTTGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAACACTAAACTTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTCTGAAAACTCCCTTTCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAATATTCGTAAATTGGTCAAAAAATCCTTTAAGATTAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21554940 313 + 96509753 gaaagggtcatgaggaaa-ttttt------tgaggaacta-ctctatatcttgatcat---ggtggttgcaaaactagatgtgtttcccaaCCTCACAGAACCATACTCAAA------------------------------CATACCTTAAT--AAAAATAATTTTCAACCATATATATGATAGAATT----TTATTGCTCTAATACCAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAACACTAAACTTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTCTGAAAACTCCCTTTCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAATATTCGTAAATTGGTCAAAAAATCCTTTAAGATTAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20479112 313 - 90941950 GAAAGGGTCATGAggaaa-ttttt------tgaggaacta-ctcTATATCTTGATCAT---GGTGGTTGCAAAACTAGATGTGTTTCCCAACCTCACAGAACCATACTCAAA------------------------------CAtaccttaat--aaaaataattttcaaccatATATATGATAGAATT----TTATTGCTCTAATACCAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAACATTAAACTTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTCTGAAAACTCCCTTTCATTAACA-TTTTgcctaaaaatt-aaacaatattcgTAAATTAGTCACAAAATCCtttaagattaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20472714 313 - 33263144 gaaagggtcatgaggaaa-ttttt------tgaggaacta-ctctatatcttgatcat---ggtggttgcaaaactagatgtgtttcccaacctcacagaaccatacTCAAA------------------------------TATACCTTAAT--AAAAATAATTTTCAACCATATATATGATAGAATT----TTATTGCTCTAATACCAAGACCAAATAGATGCTGCTTAAACCACTGAAGCAAGAACACTAAACTTTGGTCTGATCTGCCTCCAAGTCTGAAAACTCCCTTTCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAACATTCGTAAATTAGTCACAAAATCCTTTAAGATTAAA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 51432 301 - 112050 gaaagggtcatgaggaaacttttt------tgaggaacta-ctctatatcttgatcctcatggtggttgcacaactAGAAGTGTTTCCCAACCTCACAGAACCATATTC-AA------------------------------TATACCTTAAC--AAAAATAATTTTCAACCATAC--ATGATAGAACCT---TTATTGCTCTAATAGCAAGACCAAAGAGATGTTGCTTAAACCACTGATG-------------CCTTGGTCCGATCTGCCTCCAACTTTGAAAACTCCCTTCCATTAACA-TTTTGCCTAAAAATT-AAACAGCATTTGTAAGTTAGTCAC-AAATCCTTTGAGATCAAA i calJac3.chrUn_GL286438 I 1055 C 0 s canFam3.chr26 15899311 338 - 38964690 gaaatggccacaagaaaa-tttttttgaggtgatggacta-ttctgtatctccatcac---tgtg--------atcatatgtgtttacaaaacttgcagaactgtactcaaagggcatgttttcgttttattctatgtaaattacaccttaGTTGTAAAATTTTTCTAAAACATAGAGATGATAGAATCTTAATTACTCCTTTGAAAACAGGACC----AGATGCTGCTTAAACAACCAAAGCAAGTACACTAAACCTTGCTAT-ATCTGCTTCC-AGTTTGAAAAATCCCTTCCATCAATATTTTTGCCTAGAAATTGAAACAATATCTGTA-----GCTATAAACTCCCTTAGaattaaa i canFam3.chr26 C 0 I 169 a score=997892.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 64001 313 + 478999 ATA----TACATATATTCTTAAAGAAAACTACCTAGTGCTTGCAACCAAGTCATTTTAGGAGAAAATTAGCTTTGTTAAGAAGGGAATAAAGCCCAAGTAATAAATATTAAC-----------------ATCCATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAA-TGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTATTTTCACATAACTAGGCAGTATAAC--AAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggctggatgc---agtggctca s panTro4.chr22 21155152 306 - 49737984 atacatatatatatattCTTAAAGAAAACTACCTAGTGCTTACATCCTAGTCATTTTAGGAGAAAATTA------------AGGGAATAAAGCCCAAGTAATAAATACTAAC-----------------ATCAATCTTTTCCAGAATCATCATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGATTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTACGTATTTTCACATAACTAGGCAGTATAGC--AAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggccggacgc---agtggctca i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18504031 312 + 99152023 ATA----TACATATATTCTTAAAGAAAACTACCTAGTGCTTACATCCAAGTCATTTTAGGAGAAAATTAGCTTTGTTAAGAAGGGAATAAAGCCCAAGGAATAAATATTAAC-----------------ATAAATCTTTTCCAGAATCACGATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTCTTAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTT----TATTTTCACATAACTAGGCAGTATAAC-AAAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggccggatgc---agtggctca i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45181217 316 - 121039945 ATA--TATATATATATTCTTAAAGAAAACTACCTAGTGCTTACATCCAAGTCATTTCAGGAGAAAATTAGCTTTGTTAAGAAGGGAATAAAGCCCAAGTAATAAATATTAAC-----------------ATCCATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTGAAAATACCAGAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTCTTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTATTTTCACATAACTAGGCAGTATAAC--AAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggctggatgc---agtggctga i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21063432 303 - 95678458 ATA----TATATATATACTTAAAGAAAACTACATAGTGCTTATATCCTAGTCATTTTAGGAGAGAATTA------------AGGGAATAAAGCCCAAGTAATATATATTAAC-----------------ATCAATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTGTTTTCACACAACTAGGCAGTATAAC-AAAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggccggacgc---agtggctca i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21555253 303 + 96509753 ATA----TATATATATACTTAAAGAAAACTACATAGTGCTTATATCCTAGTCATTTTAGGAGAGAATTA------------AGGGAATAAAGCCCAAGTAATATATATTAAC-----------------ATCAATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTGTTTTCACACAACTAGGCAGTATAAC-AAAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggccggacgc---agtggctca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20479425 304 - 90941950 ata----tatatatatacttaaagaaAACTACATAGTGCTTATATCTTAGTCATTTTAGGAGAGAATTA------------AGGGAATAAAGCCCaagtaataaatattaac-----------------atCAATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGttcaaaataccaaaatttttACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTGTTTTCACACAACTAGGcagtataacaaaaaa----aaagagcacaggctta--ggccggacgc---agtggctca i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20473027 304 - 33263144 ATA----CATATATATACTTAAAGAAAACTACATAGTGCTTATATCCTAGTCATTTTAGGAGAGAATTA------------AGGGAATAAAGCCCAAGTAATAAATATTAAC-----------------ATCAATCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAATAAATGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTTCAAAATACCAAAATTTTTACTTCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTGTTTTCACACAACTAGGCAATATAACAAAAAA----AAAGAGCACAGGCTTA--ggccggacgc---agtggctca i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 51733 312 - 112050 ATA----CACACATATTTTTAAAGAAAACTACCTAGTGCTTGCATCCATGTCATTTTTGGAGAAAATAACCTTTGTTAAGAAGGGAATAAAATCCAAGTAATAAATACTGAC-----------------ATCAGTCTTTTCCAGAATCATGATGGTCAAAACAA-TGAGACTCTTCTCCTAATTTTGGTCC-AAATACCAAAATTTTTACTGCAAAAACTCTC-TAACAGATTATTATAAAATCTTAACATTTGCCTAAAAGTCTTTAAGTGCTTTCACTTAACTAGGCAGTATAAA--CAAA----AAAGAGCACAAGCTTA--ggcagaacac---aatggctca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15899818 328 - 38964690 ATA----CACACACACTCTT-AAGAAAACTACCTACCATTTACATCCTAGTAGTGTTA----AAGCTTT--TTTGTCAAGGAGGGAATAAAACCCAAGCAATAAATATTAACATCAAAGATACACACATATCAATCTTTTCCAGAAT---GATGGTCACAACAAATGAGTTTCCTCTCCTAATTTTGGTTCAAAAAAACAAAA-TTTCGTTTCAAATTACCTG-CAAGAGATTACTGTAAGATCTTAACATTTGCCTAAAA-TATTTAAGTGCTTTCACCTAACTAGGcagtacaac--aaaatggctaagaactcaggctcaacaatgggatgcctgggtggctca i canFam3.chr26 I 169 I 130 a score=209105.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 64314 111 + 478999 cacctgtaatcctagcattttggga---ggccaaggc----agatcgcttgagtccagcagtttgagaccagtctgggaaatgtggcaaaaccccgtctctataaaatacattaaaa--------------c s panTro4.chr22 21155458 100 - 49737984 cacctgtaatcccagcattttcgga---agccaaggc----aaaccacttgagtccag-------------------------tggcaaaaccccatctctataaaatacacaaaaaaattagccaggtgtg i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18504343 111 + 99152023 cacctgtaatcctagcattttggga---ggccaaggt----agactgcttgagtccagcagtttgagaccagtctgggaaacgtggcgaaacctcatctctataaaatacattaaaa--------------c i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45181533 111 - 121039945 cacctgtaatcctaacattttggga---ggccagggc----agatcgactgagtccagcagtttgagacctgtctgggaaatgtggcgaaaccctgtctctataaaatacatcaaaa--------------t i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21063735 103 - 95678458 cagccgtaatcccagcattttgggatttggccaaggc----acaccacttgagtccag-------------------------tggcgaaaccccgtctctataaaatacacaaaaaaattagccgggtgtg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21555556 103 + 96509753 cagccgtaatcccagcattttgggatttggccaaggc----acaccacttgagtccag-------------------------tggcgaaaccccgtctctataaaatacacaaaaaaattagccgggtgtg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20479729 103 - 90941950 caaccgtaatcccagcattttgggatttGGCCAAGGC----ACACCACTTGAGTCcag-------------------------tggcgaaaccccgtctctataaaatacacaaaaaaattagccgggtgtg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20473331 103 - 33263144 cagccgtaatcccagcattttgggatttgaccaaggc----acaccacttgagtccag-------------------------tggcgaaaccccgtctctataaaacacacaaaaaaattagccgggtgtg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 52045 115 - 112050 cacttgtaatcccagcatttctgga---ggccaaggcggggaaatcacttgagtccagcagtttgagaccagtctgggcaatgcagcaaaactccatctcttcaaaatacacaaaaaa-------------- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 317 e canFam3.chr26 15900146 130 - 38964690 I a score=387342.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 64425 131 + 478999 gtggcccatacctgtagtcccagctacttcaggggatgaggcaggaggatggcttgagccttagagacagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccactctgggtgat---agagtgggaccctt s panTro4.chr22 21155558 131 - 49737984 gtggcacacacctgtagtcccagctacttagggggatgaggcaggagtatgacttgagccttgaaggcagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccaccctgggtgac---agagtgagaccctt i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18504454 131 + 99152023 gtggcccacacctgtagtcccagctacttcagcggatgaggcaggaggatggcttgagcctcagagacagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccactctgggtgat---agagtgggaccctt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45181644 131 - 121039945 gtggcccatacctgtagtcccagctacttcaggggatgaggcagaaggatggcttgagtcttagagacagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccactctgggtgat---agagtgggaccctt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21063838 129 - 95678458 gtggcacacacctgtagtcccagctacttaggaggatgaggcaggaggatgacttgagccttggaggcagaggctgcagtgagccaagatcacaccactcactccgctctgggtgac-----agtgagaccctt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21555659 129 + 96509753 gtggcacacacctgtagtcccagctacttaggaggatgaggcaggaggatgacttgagccttggaggcagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccaccctgggtgac-----agtgagaccctt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20479832 129 - 90941950 gtggcacacacctgtagtcccagctacttaggaggatgaggcaggaggatgacttgagccttggaggcagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccaccctgggtgac-----agtgagaccctt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20473434 129 - 33263144 gtggcacacacctgtagtcccagctacttaggaggatgaggcaggaggatgacttgagccttggaggcagaggctgcagtgagccaagatcacgccactcactccaccctgggtgac-----agtgagaccctt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 52477 134 - 112050 gtggcacacacctgcagttccagctacttgggggaatgaagcaggaggatgatttgagccttggaagcagaggctgcagtgtgccaagatcacgccactcactccagcttgggtgagatcagagtgagaccctt i calJac3.chrUn_GL286438 I 317 C 0 e canFam3.chr26 15900146 130 - 38964690 I a score=1339276.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 64556 418 + 478999 tctcaaaaaaaaaTTTTTTTTTAAAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAcctaggcaagttatttaacctaattttccatcgattgtatcatcagtaaaattgggataattttacctacctctaggaataatcctagactattacatgagttaatacatgtattataataaatcacagggtaatgcctggcatagttaactaagtctcaata----CCAACCTAAC-ATAAATGAATGACACCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTTTGCATACCACAATTCTGCCCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATCTAGTAATACTACTCTATATTCCTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAAGAAAGGTta-------------------agtattttacctctt s panTro4.chr22 21155689 417 - 49737984 tctcaaaaaaaaaTTTTTTTT-AAAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAcctaggcaaattatttaacttaattttgcctcaattgtctcatcagtaaaattgggataattttacctacctctgggaataatcctagactattaaatgagttaatacatgtattataataaatcacagggtagtgcctggcatagttaactaagcctcaata----CTAACCTAAT-ATAAATGAATGATATCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTTTGTATCCCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCCAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATTTAGTAACAGTACTCTATATTCCTATTATTTTACGTGAATTTCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAAGAAACGTTA-------------------AGtattatacctctt i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18504585 417 + 99152023 tctcaaaaaaaaTTTTTTTCT-AAAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAcctaggcaagttatttaacctaattttccctcgattgtatcatcagtaaaattgggataattttacctacctctaggaataatcctagactattacatgagttaatacatgtattataataaatcacagggtagtgcctggcatagttaactaagtctcaata----CTAACCTAAC-ATAAATGAATGACACCAATAATCCCTAGCTGTGTA-------------------GTCTTTGTGTACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAACTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATCTAGTAATACTACTCTATATTCCTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAagaaaggtta-------------------agtattatacctctt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45181775 418 - 121039945 tctcaaaaaaaaaTTTATTTTTAAAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAcctaggcaagttatttaacctaattttccctcaattgtatcatcagtaaaactgggataattttacctacctctaggaatattcctagactattacatgagttaatacatgtattataataaatcacagggtaatgcctggcatagttaactaagtctcaata----CCAACCTAAC-GTAAATGAATGACACCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTTTGTATACCACAAGTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATACAGACCTACCTAGTGATACTACTCTACGTTCCTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAagaaaggtta-------------------agtattatacctctt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21063967 419 - 95678458 tctc-aaaaaaaaTTTTTTTT--AAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAGCtaggcaagttatttaacttaattttgcctcaactgtctccccagtaaaattgggataattttacctacctctgggaataatcctagactattaaacgagttaatacatgtattacaataaatcacagggtagtacct-gcatagtcaactaagcctcaata----CTAACCTAATAATAAATGAATGATATCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTGTGTATACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATTTAGTAACAGTACTCTATATTCTTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAAGAAAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21555788 415 + 96509753 tctc-aaaaaaaaTTTTTTTT--AAGCACAGGCTCAAGAACTCAACCCAGCtaggcaagttatttaacttaattttgcctcaactgtctccccagtaaaattgggataattttacctacctctgggaataatcctagactattaaacgagttaatacatgtattacaataaatcacagggtagtacct-gcatagtcaactaagcctcaata----CTAACCTAATAATAAATGAATGATATCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTGTGTATACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATTTAGTAACAGTACTCTATATTCTTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAAGAAAGGTTA-------------------AGtattatacctttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20479961 415 - 90941950 tctc-aaaaaaaatttttttt--aagcacaGGCTCTAGAACTCAACCCAgctaggcaagttatttaacttaatTTTGCCTCAACTGTCTCCCCAGTAAAATTGGGATAATTTTACCTACCTCTGGGAATAATCCTAGACTATTCAACGAGTTAATACATGTATTACAATAAATCACAGGGTAGTGCCT-GCATAGTTAACTAAGCCTCAATA----CTAAcctaataataaatgaatgatatcAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTGTGTATACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATTTAGTAACAGTACTCTATATTCCTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAAGAAAGGTTA-------------------AGTATTATacctttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20473563 416 - 33263144 tctcaaaaaaaaaCTTTTTTT--CAGCACAGACTCAAGAACTCAACCCAGCtaggcaagttatttaacttaattttgcctcaactgtctcaccagtaaaattgggataattttacctacctctgggaataatcctagactattaagtgagttaatacatgtattacaataaatcacagggtagtgcct-gcatagttaactaagcctcaata----CTAACCTAATAATAAATGAATGATATCAATAATCACCAGCTGTGTA-------------------GTCTGTGTATACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAGTGGCCTAAATTCAATGGCCTAAATAAAGACCTATTTAGTAACAGTACTCTATATTCCTATTATTTTACCTGAATTGCACCTACCTAATTCAGTTTGCAAAagaaaggtta-------------------agtattacacctctt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 52611 416 - 112050 tctc-aaaaaaaaTTTTTTTT-AAAGCACAGGCTCAAGATCTCAACTCAcctaggcaagttatttaacctaattttgcctcaattgtctcatcagtaaaattggaataatttcaccaccctctgtgaatagtcctagactatcaaatgagttaatatatgtaTTATAATAAATCACAGGGTGATAACTGGCATAGTTAATTAAGCCTCAGTA----TTAACCTAAT-ATAAATAAATGATATCAATAATCACCAGCTATGTA-------------------GTCTTTGTATACCACAATTCTGCTCTGTAAGGTAAATGGCCTAAATTCAATGGTCTAAATAAAGAGCTATCTAGTAATACTATTCTATATTCCTATTATTTTACCTGAATtgcacctacctagttcagttttcaaaagaaaaatta-------------------agtattatacttctt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15900276 405 - 38964690 tcttaaaaaaaaa---------aaaactcaggcttaacaactcaact-actcgggcaagttatttaacctaatcttgcctcaattttctcatcagtaaaataagaataattatacctgcatctgggaataattctagacaattaaatgaattgatatacatgtaaccat-----ttagaacagtgcct----aagatacttaagcctcagcaagtTTCAAGCTAAC-ATAAATGAATG------ATAATCacctgctgtgtgtccttagataagtcattttacctttgtatatcacaattctgccttgtaaggtaacaaacctaaatacaatgccccaaac----atctgtgtagttatactattctatgttcctataattTTGCCTGAACTGCACC-----AAGTCAACTTGCAAA--TAATGTTA-------------------AGTATTATGCCTGTT i canFam3.chr26 I 130 I 387 a score=910385.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 64974 276 + 478999 atat-ataaaaaagtgaactataaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacagtaacttgaaggcagagccaagatgaggatttggtatt--gagactccttaaaactttgtcctctcCAAAATTTTTAGCCCTCCATGAATTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACGGGTATAATGCACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAATTtaaaaatttcattaagctatacatttgatttgtgcactcttctgtatgttt----tatatcataat--agaaaggttaaG s panTro4.chr22 21156106 282 - 49737984 atac-aaaaaaaagtgaagtctaaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacaataatgtgaaggcagagccaagatgaggttttggtgttctgagattccttaaaactttgtcctctcCAGAATTTTTAGCCCTCCATCAACTCCTTCCCTCCTAACAAAGACACAGGTATAACGTACCCCAAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAAttttaaaatttcattaagctatacatttgatttgtgcactcttctgtatgtttgttttatatcataac--aaaaaggttaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18505002 280 + 99152023 atat-ataaaaaagtgaactataaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacagtaacgtgaaggcagagccaagatgacgatttggtatt--gagactccttaaaactttgtcctctccaAAATTTTTAGCCTTCCATGAATTCCTTCCCTCCTAACAAAGATATGGGTATAATGCACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAATTTAAaaatttcattaagctatacatttgatttgtgcactcttctgtatgtttgttttatatcataat--ggaaaggttaaG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182193 276 - 121039945 atat-ataaaaaagtgaactataaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacggtaatgtgaaggcagagccaagatgaggatttggtatt--gagactccttaaaactttgtcctctccaaaatttttagccctccatcagTTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACGGGTATAATGCACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAATTtaaaaatttcattaagctatatatttgatttgtgcactcttctgtatgttc----tgtatcataat--agaaaggttaaG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21064386 273 - 95678458 ----------aaagtgaggtctaaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacagtaatgtgaaggcagagccaaggcgaggttctggtattctgagattccttaaaactttgtcctctcCAAAATTTTTACCCCTCCATCAACTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACAGGTATAATGTACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAAttttaaaatttcattaagctatacattcgatttgtgcactcttctgaatgtttgttttatatcataat--aaacaggttaaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21556203 282 + 96509753 atat-aaaaaaaagtgaggtctaaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacagtaatgtgaaggcagagccaaggcgaggttctggtattctgagattccttaaaactttgtcctctcCAAAATTTTTACCCCTCCATCAACTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACAGGTATAATGCACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAAttttaaaatttcattaagctatacattcgatttgtgcactcttctgaatgtctgttttatatcataat--aaacaggttaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20480376 283 - 90941950 atataaaaaaaaagtgaggtcTAAATAAGTTAAATGACTTACCC-AAAGAAACAGTAATGTGAAGGCAGAGCCAAGGCGAGGTTCTGGTATTCTGAGATTCCTTAAAActttgtcctctccaaaatttTTACCCCTCCATCAATTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACAGGTATAATGCACCCCCAAAAACCtccaatttaa---------------------taattttaaaatttcattaagcTATACATTCTATTTGTGCACTCTTctgaatgtttgttttatatcatAAT--AAACAGGTTAAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20473979 282 - 33263144 atat-aaaaaaaagtgagatctaaataagttaaatgacttaccc-aaagaaacagtaatgtgaaggcagagccaaggcgaggttccggtattctgagattccttaaaactttgtcctctcCAAAATTTTTAGCCCTCCATCAACTCCTTCCCTCCTAACAAAGATACAGGTATAATGCACCCCCAAAAACCTCCAATTTAA---------------------TAATTTTAAATTttcattaagctatacattcgatttgtgcactcttctgaatgtttgttttatatcataat--aaacaggttaaa i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 53027 281 - 112050 atat-aaaaaaatgtgaggtctaaataagttaaatgacttattc-aaagaaacagtaatgtgaaggcagagccaagatgaggattcggtattctgagattccttaaaactttgtcctctccaaaacttttagccctccaccaACTCCTTCCCTCCTAACAAAGACACAGGTATAATGCA-CCCAAAACAACTCCAAttcaa---------------------taattttaaaatttcgttaagctatacatttgatttgtgcactattctgtatatttgttttatatcataat--agaaaggctaaa i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15901068 297 - 38964690 atac-agaaaaatctgaggcccaaataaattaaatgagttgcccaaaagagacagtaagatgaaggcagaaccaagacaaggatctgctgctgtgaaatttctcaaaactttgttctctccaAATATTTTAGCCCTCCATCAACTCCTTCCCTTCTGATAA--ATATAAATATGA--CATCaaaaaaaaaaaacattttaaattcattttaaacattttaattcattttaaaaatCCATTAAGCTATACACTTG-TTTGTTCACTCCTCTGTGTGTTT----TATACCATAACTGAAAAAGGTAAAG i canFam3.chr26 I 387 I 3852 a score=27180.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65250 8 + 478999 TGGCTTAT s panTro4.chr22 21156388 8 - 49737984 TGGCTTAT i panTro4.chr22 C 0 I 7 s ponAbe2.chr15 18505282 8 + 99152023 TGGCTTAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182469 8 - 121039945 TGGCTTAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21064659 8 - 95678458 TGGCTTAT i rheMac3.chr10 C 0 I 7 s macFas5.chr10 21556485 8 + 96509753 TGGCTTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20480659 8 - 90941950 TGGCTTAT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20474261 8 - 33263144 TGGCTTAT i chlSab2.chr19 C 0 I 7 s calJac3.chrUn_GL286438 53308 8 - 112050 TGGCTTAT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=1140.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65258 48 + 478999 TACCTAATACACTAGTATTCACTTGTATTCACATATGAATACATACAC s ponAbe2.chr15 18505290 48 + 99152023 TACTTAATACACTAGTATTCACTTGTATTCACATATGAATACATACAC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182477 48 - 121039945 TACTTAATACACTAGTATTCACTTGTATTCACATATGAATACATACAC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21556493 7 + 96509753 ---------CATTAAG-------------------------------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20480667 7 - 90941950 ---------CATTAAG-------------------------------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 53316 8 - 112050 ---------CATTAAGT------------------------------- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20474269 7 - 33263144 I e rheMac3.chr10 21064667 7 - 95678458 I e panTro4.chr22 21156396 7 - 49737984 I a score=273.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65306 1 + 478999 T s ponAbe2.chr15 18505338 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182525 1 - 121039945 T i nomLeu3.chr6 C 0 I 26 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20474269 7 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20480674 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21556500 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21064667 7 - 95678458 I e panTro4.chr22 21156396 7 - 49737984 I e calJac3.chrUn_GL286438 53324 0 - 112050 C a score=919626.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65307 324 + 478999 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTACATTAAAAGCTAAAAGGTGACAAACTAAGCAGATTATGTTCTTTAAAATTTTGTGAGAGGCAAAAGtttttaactgaggtatataatacatgtacaaagaagtgcacacttcctaagtctactattcaatgattctcataaactgaacacatccatgaaatcatgacccagatcaagacagagaacattaccagcacacctacaatctcccttgtcctcatcaccaaagataaccattattctgatt-ccattcccatctgttagttttgtctgtttttt-aagctttac s panTro4.chr22 21156403 322 - 49737984 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGACGACGAACTCAGCAGATTACGTTCTTTAAAATTTTGCGAG--GCAaaagtttttaactgaggtataatatacat--acaaagaagtgcacctttcctaagtctactactcgatgattctcataaactgaacacaaccatgaaatcaagatccagatcaagacacagaacattagcagcatacctacaatctcccctgtcctcaccaccaaagataaccattattctgatttccattcccatctgttagttttgtccatttttttaagctttac i panTro4.chr22 I 7 C 0 s ponAbe2.chr15 18505339 324 + 99152023 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGATGACAAACTCAGCAGATTATGTTCTTTAAAATTTTGTGAGAGGCAAaagtttttaactgaggtatataatacatgtacaaagaagtgcacacttcctaagtctactattcaatgattctcataaactgaacacaaccatgaaatcatgacccagatcaagacagagaacattaccagcacacctacaatctcccttgtcctcgccaccaaagataaccattattctgatt-ccattcccatctgttagttttatctgtttttt-aagctttac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182552 324 - 121039945 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTATAGCAAAAGCTAAAAGGCAACAAACTCAGCAGATTCTGTTCTTTAAAATTTTGTGAGAGGCAaaagtttttaactgaggtatataatacatgtacaaagaagtgcacacttcctatgtctactactcaatgattctcaaaaactgaacacaaccatgaaatcatgacccagatcaagacagagaacattaccagcacacctacaatctcccttgtcctcaccaccaaagataaccattattctgatt-ccattcccatctgttagttttgtctgtttttt-aagctttac i nomLeu3.chr6 I 26 C 0 s rheMac3.chr10 21064674 321 - 95678458 TGTATTCACATATGAAGAAAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGAAGACAAACTCAGCAGATTATGTTCTTTAAAATTTTGTGAGAGGCAaaagtttttaactgaggtataatatacat--acaaagaagggcacatttcctaagtctactactcaatgattctcataaactgaacacaaccacaaaatcacgacctatatcaagacacagaacattaccagcacacctacaatctcct--gtcctcacaaccaaagataaccattattctgatttccattctcatctgttagttttgtccgtttttc-aagctttac i rheMac3.chr10 I 7 C 0 s macFas5.chr10 21556500 303 + 96509753 TGTATTCACATATGAAGAAAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGAAGACAAACTCAGCAGATTATGTTCTTTAAAATTCTGTGAGAGGCAaaagtttttaactgaggtataatatacat--acaaagaagggc------------------actcaatgattctcataaactgaacacaaccacaaaatcacgacctatatcaagacacagaacattaccagcacacctacaatctcct--gtcctcacaaccaaagataaccattattctgatttccattctcatctgttagttttgtccgtttttc-aagctttac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20480674 321 - 90941950 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGAAGACAAACTCAGCAGattatgttctttaaaattttgtgagAGGCAAAAGTTTTTAACTGAGGTATAATATACAT--ACAAAGAAGGGCACATTTCCTAAGTCTACTACTCAATGATTCTCATAAACTGAACACAACCACGAAATCACGACCCATATCAAGACACAGAACATTACCAGCACACCTACAATCTCCC--GTCCTCACAACCAAAGACAACCATTATTCTGATTTCCATTCTCATCTGTTAGTTTTGTCCGTTTTTC-AAGCTTTAC i papAnu2.chr10 C 0 I 319 s chlSab2.chr19 20474276 321 - 33263144 TGTATTCACATATGAAGAGAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTAAAAGAAGACAAACTCAGAAGATTATGTTCTTTAAAATTTTGTGAGAGGCAAaagtttttaactgaggtataatatacat--acaaagaagtgcacatttcctaagtctactattcaatgattctcagaaactgaacacaaccacgaaatcacgacccatatcaagacacagaacattaccagcacacctacaatctccc--gtcctcacaaccaaagataaccattattctgatttccattctcatctgttagttttgtccgtttttc-aagctttac i chlSab2.chr19 I 7 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 53324 322 - 112050 -GTATTCATATACGAAGCAAAGTAGTGGAAAAGTTACATCAAAAGCTACAAGGAGACAAACTCAGCAGATTATGTTCTCTAAACTTCTGTGAGAGGCAGaactttttaactgaggtataacatacat--acaaagaagtgcacacttccaaagtctactactcaatgagtctcataaacagaacacaaccataaaatcatgacccagatagagacacagaacattactagcacacctagaatctcccttgtcctcaccaccaaagataaccattattctgatttccattcccatctgttagttttgtctgtttttg-aagctttac i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=724105.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65631 246 + 478999 agaaatggagtgctcgcttcggcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaacattagcgtggtccctgcacaaggatgacatgcaaattggtgaggctttccatcttttt--attattacagtagtctgtattatttcatatcCAAAAA--AATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATTAATACTGTGATTGAAGACAATAGCATTATTTGCCTGGGAAACTAAAGACAAAACAACTGG s panTro4.chr22 21156725 245 - 49737984 agaaatggagtgctcgcttcagcagcacatatactaaaattggaacaatacagagaagattagcgtggtccctgcacaagaatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttcttaattattacagtagt----attatttaatatcCAAAAA-CAATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAACAGCACTATTTGCCTGGGAAACTAAAGACAAAACAACTAG i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18505663 247 + 99152023 agaaatggagtgctcgcttcggcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaacattagcatggtccctgcacaaggatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttttt-attattacagtagtctgtattatttcatatcCAAAAA--AATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAATAGCATTATTTGCCTGGGAAACTAAAGACAAAACAACAGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45182876 247 - 121039945 agaaatggagtgcttgcttcggcagcaaatataccaaaattggaacaacacagagaacattagcatggtccctgcacaaggatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttttt-attattacagtagtctgtattatttcatatcCAAAAA--AATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAATAGCATTATTTGCCTGGGAAACTAAAGACAAAGCAACTGG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21064995 246 - 95678458 agaaatggagtgctcgcttcagcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaagattagcgtggtccctgcacaagaatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttcttaattattacagtagt----attatttaatatcCAAAAAACAATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAACAGCATTATTTGTCTGGGAAACTAAAGACAAAATAACTAG i rheMac3.chr10 C 0 I 305 s macFas5.chr10 21556803 246 + 96509753 agaaatggagtgctcgcttcagcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaagattagcgtggtccctgcacaagaatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttcttaattattacagtagt----attatttaatatcCAAAAAACAATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAACAGCATTATTTGTCTGGGAAACTAAAGACAAAATAACTAG i macFas5.chr10 C 0 I 305 s papAnu2.chr10 20481314 246 - 90941950 agaaatggagtgcttgcttcagcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaagattagcgtGGTCCCTGCACAAGAATGACATGCAAATTGGTGAGGCTTTCCATCTTTCTTAATTATTACAGCAGT----ATTATTTAATATCCAAAAAACAATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAACAGCATTATTTGTCTGGGAAACTAAAgacaaaataactag i papAnu2.chr10 I 319 C 0 s chlSab2.chr19 20474597 246 - 33263144 agaaatggagtgctcatttcagcagcaaatatactaaaattggaacaatacagagaagattagcgtggtccctgcataagaatgacatgcaaattggtgaggctttccatctttCTTAATTATTAGAGTAGT----ATTATTTAATATCCAAAAAACAATGATCAATATGAAGAATGGGATGAACTAATCAATACTGTGATTGAAGACAACAGCATTATTTGTCTGGGAAACTAAAGACAAAATAACTAG i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 53646 245 - 112050 agaaacagagtgctcgcttcagcagcaaatacactaaaactggaacaacaca-agaagattagcatggtcccagcacaaggatggcatgcaaattggtgaggcgtcccatctttttttattattacagtagtctgtattatttAACAT--AAAAA--AAAGATCAATATGAAAAATGGGATGAACTAATCAACAATGTAATTAAAGACAACAGCATTATTTGCCTGGGAAACTAAAGACAAAACAACTGA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=1552504.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 65877 552 + 478999 AAAACTACTAAAACTGTTAAAGGAGTCAATTTGCTACTTATGGAATAAACATATACTGTATTCACAGTAACATATATTAT-------GGAATTAAAATCACATTTCTggctgggcacagtggctcacatctataaccccagcactctgggaggccaaggtgggaggatcactggagctcaggagttcaagaccagtgtgggcaacatagtgaaacttccaaagaataGGACTAACTCCACGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGCAGGAGTGTTTCCTGATTAAATAACCTAAGTGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGATTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAATGCTATAAAAGTAAGTAATTCAAGAAAGTTTCATCCAAATTAACTCATGT-AAAACAAAAACAAAACAAGAAAAATTTGCCACATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAATGTAACTACTGTCTTTATTTGTGTCTCACTTACAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTACTTACTTTGATTAAAAAAA s panTro4.chr22 21156970 537 - 49737984 AAAACTATTAAAACTGTTGAAGGAGTCAATTTGCTACTTACAGAATAAACATAT--TCTACTCACAATAACATATACTATATACTATGGAATTAAAATCATATTTCTggctgggcacaatggctcacgtctataatcccagcactctgggaggccaaggtgggaggatcactggagctcaggagttcaagaccagcaggggcaacatagcgaaaTTTCCAAAGAATAGGACTA---------------TCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCCTGATTAAATAGCCTAAATGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGATTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAACGCTATAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTCTCATCCAAATTAACTCAAGT-AAAACAAAAACAAAACAAGAAAAATTTGTCCCATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTCTATCAGTGACTCACTTATAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTACTTACTTTCATTAAAAAAA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18505910 547 + 99152023 AAAACTACTAAAACTGTTAGAGGAGTCAATTTGCTACTTATGTAATAAACATATACTGTATTCAAAGTAACATATATTAT-------GGAAGTAAAATCACATTTCTggctgggcacagtggctcacatctataaccccagcactctgggaggccaaggtgggaggatcactggaactcaggaattcaagaccagtgtgggcaacatagtgaaacttcCAAAGAATAGGACTAACTCCACGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGCAGGAGTGTTTCCTGATTAAATAACCTAAGTGTCATCTCCGTGAATGCATATATACAACTTTGTTGGATTGAAGGCTCCTCATCTCAACCTCACTGGAGGTAAATGCTATAAAAGTAAGTAATTCAAGAAAGTTTCATCCAAATTAACTCATGT-AAAACAAAAACAAAACAAGAAAAATTTGCCACATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCTGTGTCTCACTTACAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTACTTACTTTGATTAAAAAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45183123 542 - 121039945 AAAACTACTAAAACGGTTAAAGGAGTCAATTTGCTACTTATGGAATAAACATATATTGTATTCACAGTAACATATATTAT-------GGAATTAAAATCACATTTCCggctgggcacagtggctcacatctataaccccagcactctgggaggccaaggtgggaggatcactggagctcaggagttcaagaccagtgtgggcaacatagtgaaacctccaaagaataGGACTAACTCCACGTATAGCACCTACATGTGGACAAGCAGGAGTGTTTCCTGATTAAATAACCTAAGTGTCACCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTG-----TTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAATGCTGTAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTTTCATCCAAATTAACTCATGT-AAAACAAAAACAAAACAAGAAAAATCTGCCACATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCTGTGTCTCACTTACAAAGTAGATCTGAACTATGGATTGCTACTACTTACTTTGATTAAAAAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21065546 547 - 95678458 aaaaCTATTAAAACTGTTAAAGGAGTCAATTTGCTACTTAAGGAATAAACACATACTCTATTCACAATAAAATATACTATATACTATGGAATTAAAATTACATTTCTggctgggcacaatggctcacgtctataatcccagcactctgtgaggccaaggcgggaggatcactggggctcaggagttcaagaccagcatgggcaacatagcaaaaTTTCC--AGAATAGGACTAACTCCATGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCTTGATTTAATAACCCAAGTGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGACTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAACGCTATAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTCTCATCCAAATTAACTCATGT-AAAACA-----AAAACAAGAAACATTTGCCCCATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCAGTGACTCACTTATAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTACTTACTTTCATTAAAAAAA i rheMac3.chr10 I 305 I 7 s macFas5.chr10 21557354 542 + 96509753 aaaaCTATTAAAACTGTTAAAGGAGTCAATTTGCTACTTAAGG-ataaacacatactctattcacaataaaatatactatatactatGGAATTAAAATTACATTTCTggctgggcacaatggctcacgtctataatcccagcactctgtgaggccaaggtgggaggatcactggggctcaggagttcaagaccagcatgggcaacatagcaaaaTTTCC--AGAATAGGACTAACTCCATGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCTTGATTTAATAACCCAAGTGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGACTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAACGCTATAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTCTCATCCAAATTAACTCATGT-AAAACA-----AAAACAAGAAACATTTGCCCCATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCAGTGACTCACTTATAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTACTTACTTTCATT----AAA i macFas5.chr10 I 305 I 7 s papAnu2.chr10 20481560 547 - 90941950 aaaactattaaaactgtTAAAGGAGTCAATTTGCTACTTAAGGAATAAACACATACTCTATTCacaataaaatatactatatactatggaattaaaattacatttctggctgggcacaatggctcacgtctataatcccagcactctgggaggccaaggtgggaggatcactggggctcaggagttcaagaccagcatgggcaacatagcaaaatttCC--AGAATAGGACTAACTCCATGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCTTGATTTAATAACCCAAGTGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGACTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAACGCTATAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTCTCATCCAAATTAActcatgtaaaaaca-----aaaacaagaaacatttgCCCCATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCAGTGACTCACTTATAAAGTAGATCTGAACTATGGATTACTACTActtac-ttcattaaaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 I 7 s chlSab2.chr19 20474843 539 - 33263144 AAAACTATTAAAACTGTTACAGGAGTCAATTTGCTACTTAAGGAataaacacatactctattcacaataaaatatactatatactatGGAATTAAAATTACATTTCTggctgggcacaatggctcacgtctataatcccagcactctgggagaccaaggtggaaggatcactggggctcaggagttcaagaccagcatgggcaacatagcaaaaTTTCC--AGAATAGGA------CCATGTGTAGCATCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCTT-ATTTAATAACCCAAGTGTCATCTCCATGAATGCATGTATACAACTTTGTTGGACTGAAGGCTCCTCATCTCAACCCCACTGGAGGTAAACGCTATAAATGTAAGTAATTCAAGAAAGTCTCATCCAAATTAATTCATGT-AAAAC------AAAATAAGAAACATTTGCCCCATCAAGGTAATGTTATAAAATGTGTAA-----CTACTGTCTTTATCAGTGACTCACTTATAAAGTAGATCTGAACTACGGATTACTACTACTTACTTTCATTTAAAAAA i chlSab2.chr19 C 0 I 318 s calJac3.chrUn_GL286438 53891 550 - 112050 AAAATTATTAAAACTGTGGAAGGAGTCAATTTGCTGCTTATGGAATAAACATATACTGTAATCACAATGACATATACTATATACTATAGAATTAAAATAACATTTCTggctgggcacagtggctcacgcctgtaatcccagcactctgggaggccaaagtgggaggatcacttgagctcaggagttcaagagcagcgagggcaacatggtgaaaTTTCCAAAGAATAGGACTAACTCCACATGTAGCAGCTACATGTGGACAAGTATGAGTGTTTCCTGATTAAATAACCTAAGTGTCATCCCCATGAATGTATGTATACAAGTTTGTTGAATTGAAGGCTCCTC----CAACTCCACTGGAGATAAATGCTATAAATGTAAGTAATACAAGAAACTCTCATCCAAATTAACTCACGT-AAAACAAAAACAAAACAAGAAAAATTTGCCACATCAAGGAAATGTTATAAAGTGTGTAA-----CTATTGTCTTTACCAGTGACGCATTTATAAAGTGGATCTGAACTATAAATTACTACTACTTACTTGCATTTAAAAAA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=-278.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 66429 8 + 478999 CA-CT---GATG s panTro4.chr22 21157507 11 - 49737984 AA-AAAAAGATG i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18506457 8 + 99152023 CA-CT---GATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45183665 8 - 121039945 CA-CC---GATG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21066100 8 - 95678458 AA-CC---AGTA i rheMac3.chr10 I 7 C 0 s macFas5.chr10 21557903 8 + 96509753 AA-CC---AGTA i macFas5.chr10 I 7 C 0 s papAnu2.chr10 20482114 9 - 90941950 aaccc---agta i papAnu2.chr10 I 7 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 54441 8 - 112050 AA-AG---GATG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20475382 318 - 33263144 I a score=71106.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 66437 25 + 478999 TGAGATATTTTTGTAAATTTTCTTT s panTro4.chr22 21157518 25 - 49737984 TGAGAAATTTTTGTAAATTTTCTTT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18506465 25 + 99152023 TGAGATATTTTTGTAAATTTTCTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45183673 25 - 121039945 TGAGATGTTTTTCTAAATTTTCTTT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21066108 25 - 95678458 TGAGATACTTTTGTAAATTTTCTTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21557911 25 + 96509753 TGAGATACTTTTGTAAATTTTCTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20482123 25 - 90941950 tgAGAtacttttgtaaattttcttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20475700 24 - 33263144 TGAGATACTTTTGT-AATTTTCTTT i chlSab2.chr19 I 318 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 54449 25 - 112050 TGAAATATTTTTGTAAAttttcttt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 593 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=432082.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 66462 191 + 478999 ACCCAAAGGTTCACTgcagccat-aaaaaagaacaaaatcatatcctttgcagcaacatgatgcagctggagatcatcatcctaagctaaacattgggtaaacatggacataaacatgggaacaatagatacagggaactaacagagaggagaggatgggaaggggcgaaagctcaaaactgcctactggcg s panTro4.chr22 21157543 183 - 49737984 ACCCAAAGGTTCGCTgcagccat-aaaaaagaacaaaatcatgtcctttgcagcaacatgatgcagctggagatcatcattctaaactaaacattgggtaaacatggacataaacatggga--------ttcagggaactaacagagaggagaggatgggaaggcgtgaaggttcaaaactacctactagga i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18506490 191 + 99152023 ACCCAGAGGTTCACTgcagccat-aaaaaagaacaaaatcatatcctttgcagcaacatgatgcagctggagatcatcatcctaagctaaacattgggtaaacatggatgtaaacatgggaacaatagatacagggaactaacagagaggagaggatgggaaggagggaaggctcaaaactacatactgggg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45183698 191 - 121039945 ACCCAAAGGTTCACcgcagccat-aaaaaggaacaaaatcatatcctttgcggcaacgtgatgcagctggagatcatcatcctaagctaaacattgggtaaacatggacataaacatgggaacaatagatacagggaactaacagagaggagaggatgggaaggagtgaaagctcaaaactacctactgggg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21066133 190 - 95678458 ACCCAAAGGTTTGCTgcagccat-aaaaaaaaaaaaaatcatgtcctttgcagcaacatgatgcagctggagatcatcattctaaattaaacaatgggtaaacatggacataaacatgggaaaaacagatacagggaactaacagagaggagaggatgggaaggcatg-aggttcaaaactacctactaggg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21557936 191 + 96509753 ACCCAAAGGTTTGCTgcagccataaaaaaaaaaaaaaatcatgtcctttgcagcaacatgatgcagctggagatcatcattctaaattaaacaatgggtaaacatggacataaacatgggaaaaacagatacagggaactaacagagaggagaggatgggaaggcatg-aggttcaaaactacctactaggg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20482148 190 - 90941950 accCAAAGGTTcgctgcagccat-aaaaaagaacaaaatcatgtcctttgcagcaacatgatgcAGCTGGAGATCATCATTCTAAATTAAACAATGGGtaaacatggacataaacatgggaaaaaCAGATACAGGGAACTAACAGAGAGGAGAGGATGGGAAGGCATG-AGGTTCAAAACTACCTACTaggg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20475724 190 - 33263144 ACCCAAATATTCGCTgcagccat-aaaaaagaacaaaatcatgtcctttgcagcaacatgatgcagctagagatcatcattctaaattaaacaatgggtaaacatggacataaacatgggaaaaacaaatacagggaactaacagagaggagaagatgggaaggcatg-aggttcaaaactacctactaggg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 54474 593 - 112050 I a score=2027874.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 66653 717 + 478999 gctgggtacagtagctcacgcctataatcccagcactttgggaggccaaggtgggtggattgcttgagtccaggagttcgagac-------------------------------cagcctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaaatacaaaaaatagcagggtatggtggcccaccactgtagtcccagctaccccggaggctgagctgggaggatcggctgagcccaagaggtcaaaactgcagtgaccagtgattgcaatattgcaatccagcctggggg-acagagacctaccttgtctcaaaaaacttaaacaaaactacgtgctgggtgctatgcttactacctgggtgatgggatcaattgtaccccaaacctcatgcaatatacccatgtaacaaacctgcacaCTATTATTATTGCGAGAAACAGA---------------GCTAATTTAGAACAATATATATAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAATTTTACATTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGAACTAAAATTGCATACTATTCATTCATATGACTGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaggtgcagtggctcacacttgtaatcccagctactcgggaggctgaggctcgagaatcacttgaaactgggagatggaggttgccgtgagccaagattgtgccactgctctacaacctgggtgacagagtaagactctgtttcaaaa s panTro4.chr22 21157726 711 - 49737984 gctgggtacggtggctcacgcctataataccagcactttgggaggctgaggtgggtggattgcttgagtccaggagttcgaggc--------------------------------agcctgggtaacagggcaaaacccagtctctacaaaaaa-tacaaaaattagcagggaatggtggcccaacactgtagtctcggctacccagaaggctgagctgggaggatggactgagcccaagcggtcaaaactgcagtgaccagtgatcgcaacattgcactccagcctgaggg-acagagacctaccctgtctcaaaaaacttata----actatctagtgggtgctatgcttaccacctgggtgatgtgatcaattgtaccccaaacctcatgcaatatacccatgtaacaaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAAAAGA---------------GCTAATTTAGAACAATATATATAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAAGTTTACCTTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGGACTAAAATTGTGAACTATTCATTCATATGACTGAATACTATACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaagtgcagtggctcacacttgtaatcccagctactcgagaggctgaggctcgagaatcacttgaacctgggagacggaagttgcagtgagccaagattgtgccactgtactacagcctgggtgacagagcaagattctgtttcaaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18506681 717 + 99152023 gctgggcacagtggctcacgcctataatcccagcactttgggaggccaaggtggttggattgcttgagtccaggagttagagac-------------------------------cagcctgggtaacagggcaaaacccagtctctacaaaaaaatacaaaaattagcagggcatggtggcacaccactgtagtcccagctacccaggaggctaagctggacggaccggctgagcccaagaggtcaaaactgcagtgaccagtgatcgcaacattgcactccagcctggggg-acagagacctgccctgtctcaaaaaacataaacaaaactacctactgggtgctatgcttactacctgggtgatgggatcaattctatcccaaacctcatgcaatatacccatgtaataaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAACAGA---------------GCTAATTTATAACAATACATATGGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAATTTTAAATTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGGACTAAAATTGTGTACTATTCATTCATATGACTGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaggtgcagtggctcacacttgtaatcccagctactcgggaggctgaggcttggtaatcacttgaacctgggagatggaggttgcagtgagccaagattgtgcctctgcactacagcctgggtgacagagtaagactctgtttcaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45183889 717 - 121039945 gctgggtacagtggctcacgcctataatcccagcactttgggaggccgaggtgggtggattgcttgagtccaggagttcgagac-------------------------------cagcctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaaatacaaaaaacagtagggtgtggtggcccaccactgtagtcccagctacccaggaggctgagctgggaggattggctgagcccaagaggtcaaaactgcagtgaccagtgattgcaaaattgcactccagcctgggga-acagagacctaccttgtgtcaaaaaacttaaacaaaactacgtactgggtgctatgcttactacctgggtgatgggatcaattataccccaaacctcatgcaatatacccatgtaacaaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAACAGA---------------GCTAATTTAGAACAATATATGTAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAATTTTACATTTGTATATTTGTTGAAAAGAACTATCAATAAAGAACTAAAATTGCGTACTATTCATTCATATGACTGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaggtgcagtggctcacacttgtaatccctgctactcgggaggctgaggctcaagaatcacttgaacctggaagacagaggttgcagtgagccaagattgtgccactgctctacaacctgggtgacagagtaagactctgtttgaaaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21066323 707 - 95678458 gctgggtatggtggctcacacctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggtggatcgcttgagtccaggagctcgaggc--------------------------------aacctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaa-tacaaaaattagcagggcatggtggcgcaccactgtagtctcagctacccaggaggctgagctgggaggatggactgagcccgagaggtcaaaactgcagtgaccagtgatcataacactgcactccagcctgaggg-acagagacctaccctgtctcagaaaacttaaa----actatctagcgggtgctatgcttactacctgggtgatggggtcaattgtaccccaaacttcatgcaatatacccatggaacaaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAAAAGA---------------GCTAATTTAGAACAACATATGTAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAAGTTTACCTTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGGACTAAAATTGTGTACTATTCATTCATA----TGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaagtgcagtggctcacacttataatctcagctactcaagaggctgaggctcgagaatcacttgaacctgggagacggaagttgcagtgagccaagattgcgccactgcactacagcctgggtgacagagcaagattctgtttcaaaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21558127 707 + 96509753 gctgggtatggtggctcacacctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggtggatcgcttgagtccaggaactcgaggc--------------------------------aacctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaa-tacaaaaattagcagggcatggtggcgcaccactgtagtctcagctacccaggaggctgagctgggaggatggactgagcccgagaggtcaaaactgcagtgaccagtgatcgtaacactgcactccagcctgaggg-acagagacctaccctgtctcagaaaacttaaa----actatctagcgggtgctatgcttactacctgggtgatggggtcaattgtaccccaaacttcatgcaatatacccatggaacaaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAAAAGA---------------GCTAATTTAGAACAACATATGTAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAAGTTTACCTTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGGACTAAAATTGTGTACTATTCATTCATA----TGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaagtgcagtggctcacacttataatctcagctactcaagaggctgaggctcgagaatcacttgaacctgggagacggaagttgcagtgagccaagattgcgccactgcactacagcctgggtgacagagcaagattctgtttcaaaa i macFas5.chr10 C 0 I 905 s papAnu2.chr10 20482338 707 - 90941950 gctgggtatggtggctcacacctataatcccagcacttcgggaggctgaagtgggtggatcgcttgagtccaggagcttgaggc--------------------------------aacctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaa-tacaaaaattagcagggcatcgTGGCGCAccactgtagtctcagctaccccggaggctgagatgggaggatggacTGAGCCCGAGAGGTCAAAACTGCAGTGACCAgtgatcgcaacactgcactccagcctgaggg-acagagacctaccctgtctcagaaaacttaaa----actatCTAGCGGGtgctatgcttactacctgggtgatggggtcAATTGTCCCCCAAActtcatgcaatatacccatggaacaaacctgcacactatTATTATTGGGAGAAAAAGA---------------GCTAATTTAGAACAACATATGTAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAAGTTTACCTTTgtatatttgttgaaaacaaCTATCAATAAAGGATTAAAATTGTGTACTATTCATTCATa----tgaatactacacagctattaaaattaatgaagtaaggcaagtgcagtggctcacacttataatctcagctactcaagaggctcaggctcgagaatcacttgaacctgggagacggaagttgcagtgagccaagattgcgccactgcactacagcctgggtgacagagtaagattctgtttcaaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20475914 707 - 33263144 gctgggtatggtggctcacacctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggtggatcgcttgagtccaggagctcgaggc--------------------------------cacctgggtaacagggcgaaacccagtctctacaaaaaa-tacaaaaattagcagggcatggtggtgcaccactgtagtctcagctacccaggaggctgagctgggaggatggactgagcccgagaggtcaaaactgcagtgaccagtgatcgcaacactgcactccagcctgaggg-acagagacctaccctgtctcagaaaacttaaa----actatctagtgggtgctatgcttactacctgggtgatggggtcaattgtaccccaaacttcatgcaatatacccatggaacaaacctgcacaCTATTATTATTGGGAGAAAAAGA---------------GCTAATTTATAACAACATATGTAGCTTGACCCAATTTGAGGAAAAAGTTTACCTTTGTATATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAGGACTAAAATTGTGTACTATTCATTCATA----TGAATACTACACAGctattaaaattaatgaagtaaggcaagtgcagtggctcacacttacaatctcagctactcgagaggctgaggctcgagaatcacttgaacctgggagacggaagttgcagagagccaagattgcgccactgcactagagcctgggtgacagagcaagattctgtttcaaaa i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 55067 758 - 112050 gcagggcatggtggtgcatgcttgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaagagaactgcttgaaaccagaagacggaagttgcagttagctgagattgcaccactgcactccagcct-ggtgatagagcaagactctgtctcaaattaaaa-aaaaaaTattagcaaggcatggtggcccaccactatagtcccagctacccaggagactgagctgggaggataagctgagcccaagagatcaaaactacagtgaccagtgatcataacactatactccagcctgggggaacagagacataccctgtctcaaaaaaattaaacaaaactacctactgggtgctatgcttactacctgggtggtgggatcaattgtaccctaaacctcatgcaatatagccgtgtaacaaacctgtacaCTATTATCATTGGGAGAAAAAGAGAGAAAATACATGGTGCTAATTTAGAACCATACAAATAGTTTGACCCCATTTGAGGAAACATTTTGCATTTGTGTATTTGTTGAAAACAACTATCAATAAAAGACTATAATTGTGTCCTGTTCATTCATATGACTGACTACTACACAGCTATTAAAATAAATG----Aaggcaggtgcagtggctcatacctgtaatcccagccatttgggaggctgaggcttgagaatcacttgcacctgggaggcagaggttgcagtgaggcaagactgtgcccctgcacttcggcctgggtgacagaacaagactctgtttcaaaa i calJac3.chrUn_GL286438 I 593 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=-220.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67370 7 + 478999 taatcat s ponAbe2.chr15 18507398 7 + 99152023 taatcat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45184606 4 - 121039945 taat--- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 55825 2 - 112050 --aT--- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20476621 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20483045 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21558834 905 + 96509753 I e rheMac3.chr10 21067030 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21158437 0 - 49737984 C a score=613071.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67377 256 + 478999 aataataatactactaataataCACATATATCAGCATAAATAAATGTAACTTTCCaa-ttacagaatgtatgta---------ccaaaatatcacataaatttgaaacacaatagtactacatgttaaatatatgtagatatttgtaggaagaatataagtgcatgagctaaaaagataaa-taacttctgcataagaaaataggatctaagaggatgaca--aaagggactccaaccgtatgcatatttta-------tttttaaaaacaaattt s panTro4.chr22 21158437 239 - 49737984 aaTAATAATA------ATAATACACATATATCAACAT--------GTCATTTTTCAAATTATAGAAAGTATGTA---------CTAAAATATCACATAAATTTGAAACCCAATA---CTACATA--AAATATATATAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAAAAGATAAA-TAACTTCTGCATACGAAAATACGATCTAAGAGGATGACA--AAAGGGACTCCAACCGTATGCATATTTTAA------TTTTTAAAAGCAAATAC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18507405 257 + 99152023 aataataatactactaataataCACATATATCAGCATAAATAAATGTAATTTTCCAA-TTATAGAATGTATATA---------CTAAAATATCACATAAATTTGAAACACAATAGTACTACATGTTAAATATATATGGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAAAAGATAAA-TAACTTCTGCATAAGAAAATAGGATCTAAGAGGATGACA--AAATGGACTCCAACCATATGCATATTTTGA------TTTTTAAAAACAAATAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45184610 256 - 121039945 agtaataatactactaataataCACATATATCAGCATAAATAAATGTAACTTTCCAA-TTATAGAATGTATGTA---------CCAAAATATCACATAAATTTGAAATACAATAGTAGTACATGTTAAATACATATAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAATAGATAAA-TAACTTCTGCATAAGAAAATAGGATCTAAGAGGATTACA--AAAGGGACTCCAACCGCATGCATATTTTA-------TTTTTAAAAACAAATAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21067030 239 - 95678458 aaCAATAATA------ATAATACACATATATCGACAT--------GTCATTTTTCAAATTATAGAAAGTATGTA---------CTAAAATATCACATAAATTTGAAACACAATA---CTACATA--AAATGTATGTAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAAAACATAAA-TAACTTCTGCATAAGAAAACAGGATCTAAGAGGATGACA--AAACGGACTGCAAGTGTATGCATATTTTAA------TTTTTAAAAACAAATAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21559739 239 + 96509753 aaCAATAATA------ATAATACACATATATCGACAT--------GTCATTTTTCAAATTATAGAAAGTATGTA---------CTAAAATATCACATAAATTTGAAACACAATA---CTACATA--AAATGTATGTAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAAAACATAAA-TAACTTCTGCATAAGAAAACAGGATCTAAGAGGATGACA--AAACGGACTGCAAGTGTATGCATATTTTAA------TTTTTAAaaacaaatat i macFas5.chr10 I 905 C 0 s papAnu2.chr10 20483045 240 - 90941950 aacaataata------ataatacacatatatCGACAT--------GTCATTTTTCACATTATAGAAAGTATGTA---------CTAAAATATCACATAAATTGGAAACACAATA---CTACATA--AAATGTATGTAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGagctaaaaacataaattaacttCTGCATAAGAAAATAGGATCTAAGAGGATGACA--AAACGGACTGCAagtgtatgcatattttaa------tttttaaaaacaaatat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20476621 239 - 33263144 aaCAGTAATA------ATAATACACATATATCGACAT--------GTCATTTTTCAAATTATAGAAAGTATGTA---------CTAAAATATCACATAAATTTGAAACACAATA---CTACATA--AAATGTATGTAGATATTTGTAGGAAGAATATAAGTGCATGAGCTAAAAACATAAA-TAACTTCTGCATAAGAAAATAGGATCTAAGAGGATGACA--AAACGGACTGCAACTGTATGCATATTTTAA------TTTTTAAAAACAAATAT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 55827 261 - 112050 ATTGATAATA------ATAATACACATATATCAACATAAATAAATGTCATTTTTCAAATTATAGAATACATATCATACACATTCTAAAATAT---ATGTATTTGAAACATAATAATACTACATGTTAAATATATAGAGATATTCGTAGGAAGAATACAAGTACATGGGCTAAAAAGATAAA-TAACTTCTGCAT-----AATAGGATCTAAGAGGACTCCATTAAAGGGACTCCAACTGTATACGTAttttaattatttttttttgagacaaaatt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 405 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I a score=305507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67633 140 + 478999 aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagtattttagggggccaagacgggcagatcacttgaggtcggttggagaccagcctggacaacatagtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaattagccggg s panTro4.chr22 21158676 140 - 49737984 Aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagccctttggggggccaagatgggcagatcacttgaggccagttcaaaaccagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaataagaaaattagccggg i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18507662 139 + 99152023 Aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagcactttagggggccaagacgggcagatcagttgaggtcagttggagaccagcctggacaacatagtgaaaccc-gtctctactaaaaatacaaaaattaaccggg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45184866 140 - 121039945 Tggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagcactttagggggccaagatgggcagatcactagaggtcggttggagaccagcctggacaacatagtgaaaccccgtctctattaaaaatacaaaaattagccagg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21067269 132 - 95678458 Aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcctagcactttgaggggcca--------agatcacccgaggtcagttcaagaccagcctggccagcatagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctggg i rheMac3.chr10 C 0 I 285 s macFas5.chr10 21559978 132 + 96509753 aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcctagcactttgaggggcca--------agatcacccgaggtcagttcaagaccagcctggccagcatagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctggg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483285 132 - 90941950 aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagcactttgaggggcca--------agatcacccgaggtcagttcaagaccagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctggg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20476860 132 - 33263144 Aggccaggcacagtggctcacccctgtaatcccagcactttggggggcca--------agatcacccgaggtcagttcaagaccagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctggg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=148487.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67773 90 + 478999 agtagtgacaagctcctataatcccagctactcaaaaggccaaggcacgagaattgcttgaacttgggaggtggcggttgcagtgagcag s panTro4.chr22 21158816 90 - 49737984 catggtgacgagctcctgtaatcccagctactcaaaaggccgaggcacaagaatcacttgaacctgggagatggagggtgcagtgagcag i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18507801 90 + 99152023 agtggtgacaagctcctataatcccaactactcaaaaggccaaggcaggaaaattgcttgaacctgggaagtggtggttgcagtgagcag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185006 90 - 121039945 agtagtgacaagctcctataatcccagctactcaaaaggccaaggcacaagaattgcttgaacctgggaggtggcggttgcagtgagcag i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560110 90 + 96509753 cgtggtgaggagctcctgtaatcccagctactcaaaaggcggaggcacaagaatcacttgaacctgagagatggagggtgcagtgagcag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483417 90 - 90941950 tgtggtgaggagctcctgtaatcccagctactcaaaaggcggaggcacaagaatcacttgaacctgagagatggagggtgcagtgagcag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20476992 90 - 33263144 cgtggtgaggagctcctgtaatcccagctactcaaaaggcggaggcacaaaaatcacttgaacctgagagatggagggtgcagtgagcag i chlSab2.chr19 C 0 I 285 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e rheMac3.chr10 21067401 285 - 95678458 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=38515.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67863 46 + 478999 ggattttaccactatacaccaggctgggcaacagagtgagacccca s panTro4.chr22 21158906 46 - 49737984 agattgtgccactgcacatcagtatgggcaacagagtgagagcccg i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18507891 46 + 99152023 gaattttaccactgtacaccaccctgggcaacagagtgagaccttg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185096 46 - 121039945 ggattttaccactttacaccagcctgggcaacagaatgagacccca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560200 45 + 96509753 tgactgtgccactgcactctagcct-ggcaacagagcaagactcca i macFas5.chr10 C 0 I 172 s papAnu2.chr10 20483507 45 - 90941950 tgactgtgccactgcactctagcct-ggcaacagagcgagactcca i papAnu2.chr10 C 0 I 204 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20477082 285 - 33263144 I e rheMac3.chr10 21067401 285 - 95678458 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=163136.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 67909 368 + 478999 tctcaaaaataa---------taaataaaaacatatataaatacacttttgaagcaaatctgataagatgtcagcatctatgaaatctactgaatgggctgggtgcggtgg-ctcacgcctgtaataccaacactttgggaggccaaggtgggcagatcacgaagtgaagagataagagaccatcctggccaacatggtgaaacccagtctctactaaaaatacaaaaattagctgggtgtggtggcgtgtgcctgtaatcccagctactcaggaggctgagacaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgaaattgcaccagtgcactccagcctgagcgacagagcgagactccatctc s panTro4.chr22 21158952 372 - 49737984 tctcaaaaataaataaataaataaataaaAACATACTTAAATACACCtttgaagcaaatctgacaagatgtcagcatctattaaatctactgaatgggctggacatggtgg-ctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggccaatcacaaggtcaagagatca-agaccatcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtggtggcgtgcacctgtagtcccagctactcgggaagctgaggtag-agaatcgcttgaacccaggaggcagaggttacagtgagccga--ttccaccactgcactccagcctg-gcgacagagcgacactccaactc i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18507937 367 + 99152023 tctcaaaataaa---------taaataaaaaCATATATAAATACACCTTTGAAGCAAATCTGACAAGGTATCAGCATCTATGAAATCTACTGAATGggccgggcatggtgg-ctcacacctgtaataccaacactttgggaagccaaggtgggcagatcacgaggtgaagagatag-agaccatcctgactaacatagtgaaaccctgtctctgctacagatacaaaaattagctgggtgtggtggcatgtgcctgtagtcccagctattccggagcctgaagcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagattgcaccactgcattccagcctgggcaacagagcgagactccatctc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185142 366 - 121039945 tctcaaaaataa---------taaataaaaaCATATATAAATACACCtttgaagcaaatctgacaaggtgtcagcatttatgaaatttactgaa--gctccaatgtggtggaattacgcctgtaataccaacactttgggaggccaaggtgggcagatcacgaagtgaagagataagagaccaccctggccaacatggtgaaactccgtctctaccaaaaata-aaaaattagctgggtgcggtggcgtgtgcctgtagtcccagctactcaggaggctgagacaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagattgtaccactgcactccagcctgagcaacagagcgagactccatctc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20477082 285 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20483552 204 - 90941950 I e macFas5.chr10 21560245 172 + 96509753 I e rheMac3.chr10 21067401 285 - 95678458 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=5328.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 68277 8 + 478999 aaaaaaaa s panTro4.chr22 21159324 8 - 49737984 aaaaaaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18508304 8 + 99152023 aaaaaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185508 8 - 121039945 aaaaaaaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560417 8 + 96509753 aaggaagg i macFas5.chr10 I 172 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20477082 285 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20483552 204 - 90941950 I e rheMac3.chr10 21067401 285 - 95678458 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=10915.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 68285 23 + 478999 aaaaaaaaaaggaa---------------------aggaaaaaa s panTro4.chr22 21159332 23 - 49737984 aagaaaaaaaagaa---------------------aaagaaaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18508312 41 + 99152023 aaaaaaaagaaaaa---cagaaaaGAAAGAAAAGCAAAGAAAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185516 42 - 121039945 aaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaagaaaggaaa--ggaaaaaag i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560425 23 + 96509753 aaggaaggaaagaa---------------------ggaaggaag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483756 23 - 90941950 aaggaaggaaggaa---------------------ggaaggaag i papAnu2.chr10 I 204 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20477082 285 - 33263144 I e rheMac3.chr10 21067401 285 - 95678458 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=10557.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 68308 5 + 478999 gaaaa s panTro4.chr22 21159355 5 - 49737984 gaaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18508353 5 + 99152023 AGAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185558 5 - 121039945 aaaaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21067686 5 - 95678458 gaaAA i rheMac3.chr10 I 285 C 0 s macFas5.chr10 21560448 5 + 96509753 gaaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483779 5 - 90941950 gaaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20477367 5 - 33263144 gaaAA i chlSab2.chr19 I 285 C 0 e canFam3.chr26 15901365 3852 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=431696.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 68313 192 + 478999 aaaatctactgaattagtacctggtgtttgttaaattattctccatatttttctaaatttttgaaatatttAAACTTTGCTCTAAAAAA----GTCGAGATTTTGGAATTCAG----AGACA---GGCTTTGTAGA-TTCAGTACAGGAtg--tgtgtgt--------g------------tgtgtgt----------------gATAAGCCTGT--TATTCTGTACTATAAAATTTCTAACT-A s panTro4.chr22 21159360 204 - 49737984 aaaatctactgaattagtacatggtgtttgttaaattattctccatatttttctaaattttttaaatatttaaattttaCTTTAAAAAAATAAGCCAAGGTTGTGGAATTCAG----AGACA---GGCTTTGTAGA-TTCTATAGGGGATC--tgtgtgtctgtgtgtg------------tgtgtgt----------------gACAAGCCTGT--TATTCTGTACtataaaatttttaact-a i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18508358 199 + 99152023 AAAATCTACTGAATTAGTACATGGTGTTTGTTAAATTATTCT--Gtattatttttaatgtttgaaatatttaaattttactttaaaaaa----GCTGAGATTTTGGAATTCAG----AGACA---GGCTTTCTAGA-TTCTATATGGGATT--TGTG-GTGTGTGTGTG------------TGTGAGA----------------GACAAGCCTGTTATATTCTGTACTATAAAATTTCTAACT-A i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185563 211 - 121039945 aaaatctactgaattagtacatggtgtttgttaaattactctccatatttttctaaatttttgaaatatttaaa-----ctttaaaaaA----GTCGAGATTTTGGAATTCAG----AGACA---GGCTTTGTAGA-TTCAATATAGGAtg--tgtgtgtgtgtgtgtg------------tgtgtgtgtgtgtgtgtgCATGAGACAAGCCTCT--TATTCTGTACTATAAAATTTCTAACT-A i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21067691 205 - 95678458 GAAACCTACTGAATTAATACATGGTGTTTGTTAAATTATTCTCCatatttttctaaattttttaaatatttaaattttactttaataa-----GCCAAGGTTGTGGAATTCAGAGACAGACA---GGCTTCGTAGA-TTCTATATGGGATTtgtgtgtgtgtgtgtgtg------------tgtgtgt----------------gtCAAGCCTGT--TATTCTGTACCATAAAATTTCTAACT-C i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560453 199 + 96509753 gaaaCCTACTGAATTAATACATGGTGTTTGTTAAATTATTCTCCATATTTTTCTACATTTTTTAAATATTTAAATTTTACTTTAATAA-----GCCAAGGTTGTGGAATTCAGAGACAGACA---GGCTTCGTAGA-TTCTATATGGGATT------tgtgggtgtgtg------------tgtgtgt----------------gtCAAGCCTGT--TATTCTGTACCATAAAATTTCTAACT-T i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483784 195 - 90941950 gaaacctACTGAATTAATACATGGTGtttgttaaattattctccatatttttctaaattttttaaatatttaaattttactttaataa-----gCCAAGGTTGTGGAATTCAGAGACAGACA---GGCTTTGTAGA-TTCTATAtgggatt----------tgtgtgtg------------tgtgtgt----------------gtcaagccTGT--TATTCTGTACCATAAAATTtctaact-c i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20477372 218 - 33263144 GAAACCTACTGAATTAATACATGGTGTTTGTTAAATTATTCTCCATATTTTTCTAAATTTTTTAAATATTTAAATTTTACTTTAATAA-----GCCAAGGTTGTGGAATTCAGAGACAGACA---GGCTTTGTAGA-TTCTCTATGGGATTtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcacgcgcatgtgtgt----------------gtCAAGCCTGT--TATTCTGTACTATAAAATTTCTAACTAA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15905217 191 - 38964690 aacatctatta----agtacatgacatttgttaaattattctctatatttttctgaatttttgaaatatctaaattttacttttaaaaaAGGAAACATGG-TATGGAATTTAGGAAAAGAGAAGGGGCTTTGTAGACTTCTATAGGGTATT------------------------------TTCTTTT----------------CACAAGCTTGA--TATTCTTTACTATAAAACTTCTAAGT-A i canFam3.chr26 I 3852 C 0 e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=1737377.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 68505 817 + 478999 AAAAAAAA--TTATAtta---ggttggtgcaaatgtagttgcagttttcgtattgttgaaacttgctatttgatactggaatacattcttaaatatatgtggttat-ttatataccattttaatgcacatttctcacctttt-ttgctaataacatattatttgctg----ttttattctgttagacagtggaaattatattataaaaaaaagcaaattcaagcgattttcttgagttcaaaatgggtcgcaaagcagtggagacaactcgcaacatcaactacacacttggcccaggaactgtgcaatggtggttcaagaagtgttgcaaaggagacgagagccttgaagatgaggagtgtagtagccggccagaagaagttggcactgaccaattgagagcaatcatcgaagctgatcctcttacaactacacgagaaattaccgaagaactcaatgtcaaccattctacgcttgtttggca----atttaagcaagttggaaaggtgcaaaagcttcttttttttttttt----------ttttttttttttttttgagatggagtctcactctatcacctaggctggaatgcagtggcaccatctgggctcactgtaacctctacttcccgggttaaagtgattctcgtgcctcagcctccctagttgctgggattacaggcacccaccaccacacccgattactttttgtatttttagtagagctggggtttcaccatgttggccaggctggtcgtgaactcctggcctcaagtgatctgcccgcctcagcctccgaaagtactgggattacaggcgtgagccaccacgccctgcca s panTro4.chr22 21159564 809 - 49737984 aaaaaaaaaattatattattagtttggtgcaaatgtaattgcagtttttgcactgttgaaatttgccacttaatactggaatacactcttaaataaatgtggttatgttatacatcattttaatgcacatttcttgccttttcttgctaataacgtattttttgctt----tttt----ttttagactatggaaattatgtta-gacaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagttcaaaatgggtcgtgaagcagtggagacaactcacaacatcaactacacatctggcccagaaactgtgcagtggtggttcaagaagtgttgcaaaggagacgagagtcttgaagatgaggagtgtagtggccagccagaag---ttggcaatgaccaactgagagcaatcatcgaagctgatcctcttacaactacacgagaaattgccgaagaactcaatgtcgaccattctacccttgtttggcaggcaattgaagccaactggaaaggtgaaaaag-----------tttttt----------ttgtttgtttgtttttgagatggagtctcactctatcacctaggctggagtgcagtggtgtaatgtgggctcactgcaacctctacttcctgtgttcaagcgattctcgtgcctcagcctccctagttgctgggattacacatgcccgccaccatgcccaactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttggccaggctggtcttgaactcctggcctcaagggatctgcccacctctgcctcccaaagtgctgggaatacaggcgtgggctaccacgcccagcca i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18508557 802 + 99152023 AAAAAAAAAATTATGTTAttaggttggtgcaaacgtagttgcagtttttgtattgttgaaatttgccgtttgatactggaatacattcttaaataaatgtggttat-gtatacatcattttaatgcacatttcttgccttt--ttgctaataacttattatttgctgtttattttatttttttagacaatggaaattatatta-caaaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagttcaaaatgggttgcaaaccagtggagacaactcgtaacatcaactacacatttggcccaggaactgtgcagtggtggttcaaaaagtgttgcaaaggagacgagagccttgaagatgaggagtgtagtggccagccagaagaagttggcattgaccaattgagagcaatcatcgaagctgatgctcttataactacatgagaaattgccgaagaactcaatgtcaaccattctatgcttgtttggca----attgaagcaagttggaaaggtgcaaaag-----------cttttt---------------------tttctgcaatggagtctcactctatcacctaggctggaatgcagtggcacaatctgggctcactgcaacctctgcttcccaggttcaagtgattctcatgcctcagcctccctagttgctgggattacaggcacccaccaccacacctgactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtcttgaactcctggcctcaagtgatctgcctgcctcagcctcccaaagtactgggattacaggcatgggccaccatgccccacca i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45185774 798 - 121039945 AAAAAAAA--TTATAtta---ggttggtgcaaatgtagttgcagttttcgtattgttgaaatttaccatttgatactgg-atacattcttaaataaatgtggttat-ttatgcatcattttaatgcacatttctcacctttt-ttgctaataatgtattatttgctg-----tttattcttttagacaatggaaattatattattaaaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagttcaaaatgggtcgcaaagcagtgaagacaacttgcaaaatcaactacacatttggcccaggaactgtgcagtggtggttcaagaaatgttgcaaaggagacgagagccttgaagatgaggagtgtagtggccggccagaagaagttggcattgaccaattgagagcaatcatcgaagctgatactcttacaactacacgagaaattgccgaagaactcaatgtcaaccattctatacttgtttggca----attgaagcaagctggaaaggtgcaaaag-----------cttttt----------ctttt------tttttgagatggagtctcactctatcacctaggttggaatgcagtggcaccttctgggctcactgcaacctctacttcctgggttcaagtgattctagtgcctcagcctccctagttgatgggattacaggcacccaccaccacacctgactaatttttgtatttttagtagagttgggatttcaccatgttggacaggctggttgtgaactcctggcctcaagtgatctgcccgcctcagcctccgaaagtactgggattacaggcgtgagccaccaagccctgcca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21067896 813 - 95678458 AAAAAAAA--TTATATTAttaggttggtgcaaacgtaattgcagtttttgcactgttgaaatttgccatttggtactggaatacactcttaaataaatgtggttatgttatacaccatttgaatgcacatttcgtgccttttcttgctaataacgtattttttgc------ttttttttttttagactacagaaattatgtta-gacaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagtttaaaatgggtcataaagcagtggagacaactcacaacatcaactacacatttggcccagaaactgtgcactggtggttcaagaagtgttgcaaaggagatgagagccttg-agatgagcagtgttgtggctggccagaag---ttggcaacgaccagttgagagcaatcatcaaagctgatcctcttacaactacatgagaaattgccaaagaacccaatgttgacc-ttctacgcttgtttggca----attgaatccaattggaaaggtgaaaaag-----------tttttttgtttgtttgttttttggttttttttgagatgaagtcttactctgtcgcctaggctggagtgcagtggtgcaatctgggctcactgcaacctctacttcctgggttcaagtgattctcctgcctcagcctccctagtcgctgggattacaggagctcgccaccatgcccaactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcacctcgttttccaggctggtcttgaactcccggcctcaagtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctggggttataggcatgagctaccacgcccggcca i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21560652 813 + 96509753 AAAAAAAA--TTATATTAttaggttggtgcaaacgtaattgcagtttttgcactgttgaaatttgccatttggtactggaatacactcttaaataaatgtggttatgttatacaccatttgaatgcacatttcgtgccttttcttgctaataacgtattttttgc------ttttttttttttagactacagaaattatgtta-gacaaaaagcgaattcaagtgattttcttgagtttaaaatgggtcataaagcagtggagacaactcacaacatcaactacacatttggcccagaaactgtgcactggtggttcaagaagtgttgcaaaggagatgagagccttg-agatgagcagtgttgtggctggccagaag---ttggcaacgaccagttgagagcaatcatcaaagctgatcctcttacaactacatgagaaattgccaaagaacccaatgttgacc-ttctacgcttgtttggca----attgaatccaattggaaaggtgaaaaag-----------tttttttgtttgtttgttttttggttttttttgagatgaagtcttactctgtcgcctaggctggagtgcagtggtgcaatctgggctcactgcaaactctacttcctgggttcaagtgattctcctgcctcagcctccctagtcgctgggattacaggcgctcgccaccatgcccaactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttttccaggctggtcttgaactcccggcctcaagtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctggggttataggcatgagctaccacgcccggcca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20483979 814 - 90941950 aaaaaaaa--ttatattattaggttggtgcaaacgtaattgcagtttttgcactGTTGAAATTTGCCATTTGGTACTGGAATACactcttaaataaatgtggttatgttatacacCATTTGAATGCACATTTCGTGCCTTTTCTTGCTAATAAcgtattttttgc------ttttttttttttagactacAGAAAttatgtta-gacaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagTTTAAAATGGGTCATAAAGCAGTGGAGACAACTCACAACATCAACTACACATTTGGCCCAGAAACTGTGCACTGGTGGTTCAAGAAGTGTTGCAAAGGAGatgagagccttgaagatgaggagtgtTGTGGCCGGCCAGAAG---TTGGCAATGACCAGTTGAAAGCAATCATcaaagctgatcctcttacaactacatGAGAAATTGCCAAAGAACTCAATGTTGACC-TTCTACGCTTGTTTGGCA----ATTGAATccaattggaaaggtgaaaaag-----------tttttttgtttgtttgttttttgtttttttttgagatgaagtcttactctgtcgcctaggctggagtgcagtgatgtaatctgggctcactgcaacctctacttcctgggttcaagtgattctcctgcctcagcctccctagttgctgggattacaggcgctcgccaccatgcccaactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttttccaggctggtcttgaactcccggcctcaagtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctggggttataggcatgagctaccacgcccggcca i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20477590 811 - 33263144 AAAAAAAA--TTATATTAttaggttggtgcaaacgtaattgcagtttttgcactgttgaaatttgccatttggtactggaatacactcttaaataaatgtggttatgttatacaccatttgaaggcacatttcgtgccttttcttgctaataacgtattttttgctt----ttttttttttttagactacagaaattatgtta-gacaaaaagcaaattcaagtgattttcttgagtttaaaatggatcataaagcagtggagacgactcacaacatcaactacacatttggcccagaaactgtgcactggtggttcaagaagtgttgcaaaggagatgagagccttgaagatgaggagtgttgtggccggccagaag---ttggcaacgaccagttgagagcaatcatcaaagctgatcctcttacaactacacgagaaattgccaaagaactcaatgtcgacc-ttctacgcttgtttggca----attgaagccaattggaaagatgaaaaag-----------tttt----tttgtttgttttttgg-tttttttgagatgaagtcttactctgtcgcctaggctggagtgcagtggtgcaatctgggctcactgcaacctctacttcccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctccctagttgctgggattagaggcgctcgccaccatgcccaactaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttttccaggctggtcttgaactcctggcctcaagtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctggggttataggcgtgagctaccacgcctggcca i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15905408 0 - 38964690 C e calJac3.chrUn_GL286438 56088 405 - 112050 I a score=2085041.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 69322 746 + 478999 aaaggtgaaaaagcttgataagtgggtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcgtcgttttgaagtgttgtcttctcttattctacataacgacgacgaaccatttcttagttggattgtgacgtttgacaaaaagtgtattttatacaacaacagtgatgaccagctcagtggttggaccgagaagatgctccaaagcacttcctgaagccaaactttcatcaaaaagaggtcagggtcactgtttggtggtctgctcctggtctgatccgctacagctttctgaatcatagtaaaaccaatacatctgagaagtatgctcagcaaatcgatgagatgcaccgaaaactgcgaggcctgcagctggcactggtccacagaaagggtccagttcttctccacgacaacacccgacaacatgttgcacaaccaacatttcaaaagttgaatgaattgggctacaaagttttgcctcatccaccatattgaactgacctctcaccaaccgactaccacttttccaagcatctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccatcaggatgcagaaaatgctttccaagagttcatcgaatcccgaagcatggatttttacgctacaggaataaacaaacttatttctcattggcaaaaaatgtgttgattgtaatgtttcctattttgataaa----gatgtgtttgggcctagttataataatttaaaattcgtaatcc s panTro4.chr22 21160373 743 - 49737984 aaaggtgaaaaagcttgataagtgggtgcctcatgagctgaccgaaaattttaaaaattgtcgttttgaaatgttgtcttctcttattctacgtaacgacgacgaaccatttcttggttggattgtgatgtgcgacaaaaagtggattttatacaacaacagtgatgaccagctaagtggctggaccgagaagacactccaaagcacttcccaaagccgaacttacaccaaaaagtggtcatggtcactgtttggcggtctgctcctggtctgatccactacagctttctgaatcccagtaaaaccaatacatctgagaagtatgctcagcaaatcgatgagatgcactgaaaactgcaatgcctgcagccagcactggtccacagaaagggtccaattcttctccacaat--cacccgacaacacgttgcacaaccaacatttcaaaagttgaat----tgggctacgaagttttgcctcatccaccatattcaactgaccactcgccaaccgactaccacttttccaaatatctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccagcaggatgcagaaaatgctttccaagagttcatcgaatctcaaagcatggatttttatactacaggtataaacaaacttatttctcatcggcaaaaa-tgtgttgattgtaacagttcctattttgataaatgaagatctgtttgggcctagttacaatgatttaaaattcacaatcc i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18509359 745 + 99152023 aaaggtgaaaaaacttgataagtgggtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcgtcgttttgaagtgttgtcttctcttattctacataacaacaatgaaccatttcttggttggattgtgatgtgtgacaaaaagtggattttatacaacaacagtgatgaccagctcagtggttggactgagaagacgctccaaagcacttcctgaagccaaactttcatcaaaaagagatcagggtcactgtttggtggtctgctcccggtctgatccactatagctttctgaatcccagtaaaaccaatacatctgagaagtatgctcagcaaatcgatgagatgtaccaaaaactgcgaggcctgcagccgacactggtccacagaaagggtccagttcttct-catgaaaacacccgacagcacattgcacaaccaatatttcaaaagttgaatgaattgggctacaaagttttgcctcatccaccatattgaactgacctctcaccaaccgactaccacttttccaagcttctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccatcaagatgcagaaaatgctttccaagagtttatcgaatcctgaagcatggatttttacactacaggaataaacaaacttatttctcattggcaaaaaatgtgttgattgtaatggttcctattttgataaa----gatgtgtttgggcctagttataataatttaaaattcgcaatac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45186572 739 - 121039945 aaaggtgaaaatgcttgataagtgggtggcccatgagctgaccaaaaattttaaaaatcgtcattttgaagtgttg-----tcttattctacataacgacgatgaaccatttcttagttggattgtgacgtttgacaaaaagtgtattttatacaacaaaagtgatgaccagctcagtggttggactgagaagacgctccaaagcacttcctgaagccaaactttcatcaaaaagaggtcagggtcactgtttggtggtctgctcccggtctgatccactatagc-tactgaatcccagtaaaaccaatacatctgagaagtatgctcagcaaatctacgagatgcaccgaaaactgcaaggcctgcagctggcactggtccacagaaagggtccagttcttctccatgacaacacccgacaacacgttgcacaaccaatatttcaaaagttgaatgaattgggctacaaagttttgcctcatccaccatattgaactgacctctcaccaactgactgccacttttccaagcatctagaaaatttttttgcagggaaaatacttccacaaccatcaggatgcagaaaatgctttccaagagttcatcgaatcccaaagcatggatttttacactacaggaataaacaaac--atttctcattggcaaaaaatgtgttgattgtaatggttcctattttgataaa----gatgtgtttgggcctagttacaataatttaaaattcgcaatcc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21068709 729 - 95678458 aaaggtgaaaaagattgataagtgggtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcatcattttgaaatgttgtcttctcttagtctatgtaacaacgacgaaccatttcttggttggattgtg-----caacaaaaagtggattttatacgacaacagtgatgaccagctaagtggctggactgagaagatgctccaaagcacttcccaaagccgaacttgcaccaaatagacgtcatggtcactgtttggtggtctgctcctggtctgatccactatagctttctgaatcccggtaaaaccaacacatctgagaagtacgctcagcaaattgatgagatgcaccaagaacttcaatgcctgcagccaacactggtccacagaaagggttcaattcttctc----------cccgacaacacgctgcacaaccaacatttcaaaagttgaa-----tgggttaccaagttttgcctcatccactatattcaactgaccacttgccaaccgactaccatttttccaagcatctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccagcaggatacagaaaatgctttccaaaagttcctcaaatcccaaagcacggatttttacactacaagaataaacaaacttgtttctcatcggcaaaaa-tgtgttgattgtaatggttcctattttgataaataaagatctgtttgggcctagttataatgatttaaaattcacaatcc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21561465 729 + 96509753 aaaggtgaaaaagattgataagtgagtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcatcattttgaaatgttgtcttctcttagtctatgtaacaacgacgaaccatttcttggttggattgtg-----caacaaaaagtggattttatacgacaacagtgatgaccagctaagtggctggactgagaagatgctccaaagcacttcccaaagccgaacttgcaccaaatagacgtcatggtcactgtttggtggtctgctcctggtctgatccactatagctttctgaatcccggtaaaaccaacacatctgagaagtacgctcagcaaattgatgagatgcaccaagaacttcaatgcctgcagccaacactggtccacagaaagggttcaattcttctc----------cccgacaacacgctgcacaaccaacatttcaaaagttgaa-----tgggttaccaagttttgcctcatccactatattcaactgaccacttgccaaccgactaccatttttccaagcatctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccagcaggatacagaaaatgctttccaaaagttcatcaaatcccaaagcacagatttttacactacaagaataaacaaacttgtttctcatcggcaaaaa-tgtgttgattgtaatggttcctattttgataaataaagatctgtttgggcctagttataatgatttaaaattcacaatcc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20484793 730 - 90941950 aaaggtgaaaaagattgataagtgggtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcgtCATTTTGAAATGTTGTCTTCTCTTAGTCTACGTAACAACGACGAACCATTTCTTGGTTGGATTGTG-----CaacaaaaagtggattttatacgaCAACAGTGATGACCAGCTAAGTGGTTGGACTGAGAAGatgctccaaagcacttcccaaagccgaACTTGCACCAAATAGAcgtcatggtcactgtttggtggtctgctcctggtctgatccactacagctttctgaatcccggTAAAACCAACACATCTGAGAAGTACGCTCAGCAAATTGATGAGATGCACCAAGAACTTCAATGCCTGCAGCCAACACTGGTCCACAGAAAGGGTTCAATTCTTCTC----------CCCGACAACACGCTGCACAACCAACATTTCAAAAGTTGAAT----TGGGCTACCAAGTTTTGCCTCATCCACTATATTCAACTGACCACTTGCCAACCGACTACCATTTTTCCAAGCATCTAGAAAA-TtttttgcagggaaaatgcttccacaaccagcaggatacagaaaatgctttccaaaagtTCATCAAATCCCAAAGCACGGATTTTTACACTACAAGAATAAACAAACTTGTTTCTCAtcggcaaaaa-tgtgttgattgtaatggttcctattttgataAATAAAGATCTGTTTGggcctagttataatgatttaaaattcacaatCC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20478401 730 - 33263144 aaaggtgaaaaagattgataagtgggtgcctcatgagctgaccaaaaattttaaaaatcgtcattttgaaatgttgtcttctcttagtctatgtaacaacgatgaaccatttcttggttggattgtg-----caacaaaaagtggattttatacgacaacagtgatgaccagctaagtggttggactgagaagatgctccaaagcacttcccaaagtcgaacttgcaccaaatagacgtcatggtcactgtttggtggtctgctcctggtctgatccactacagctttctgaatcccagtaaaaccaacacatctgagaggtacgctcagcaaattgatgagatgcaccaagaacttcaatgcctgcagccaacactggtccacagaaagggttcaattcttctc----------cccgacaacacgctgcacaaccaacatttcaaaagttgaat----tgggctaccaagttttgcctcatccactatattcaactgaccacttgccaaccgactaccatttttccaagcatctagaaaa-ttttttgcagggaaaatgcttccacaaccagcaggatacagaaaatgctttccaaaagttcatcaaatcccaaagcacggatttttacactacaagaataaacaaacttgtttctcatcggcaaaaa-tgtattgattgtaatggttcctattttgataaatagagatctgtttgggcctagttataatgatttaaaattcacaatcc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 56493 746 - 112050 aaaggtgaaaaagcttgatatgtgggtgcctcatgagctcacagaaaatttaaaaagttgttgttttgaagtgttgtcttctc--attctttgtaatgatgacaaaccagtttttgatcagattgtgacgtgagac-aaaagtggattttacacgaaaacagtgaagatcagctcagtggttggaccacgaagacactccgaagcacttctcaaagccaaacttgcaacaaaaagaggtcatggtcactgtttggtggtctgctgccggtctgatccactacagctttctgaatcctggcaaaatcaacacatctgggaaggatgctcagcaaatcgatgagatgcaccgaaaactgcaacacctgcagccggcactggtccacagaaagggcccaattcttctccacaacaacacccgaccccacattgcacaaccaacacttcaaaagttgaatgaactgggctacgaagttttgcctcatccatcatattcaactgatctctcgccaactgactaccacttttccaagcatctagaaaa-atttttgcagggaaaatgcttccacaaccagctatatgcataaaacgctttccaagagttcatcaaattccaaagcacagatttttacaccacaagaataaacaaacttatttctcgttggcaaaaa-tgtgttgattggaatggttcctattttgattaataaagatgtgtttgggcctagttgaaataatttagaatttgcaatct i calJac3.chrUn_GL286438 I 405 C 0 e canFam3.chr26 15905408 0 - 38964690 C a score=179445.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 70068 68 + 478999 aaaaccaccattaattttgtaccaacctaaCAGTACCTACATTTATTACCTCAACTGCTCTTC-AAC-------------tt s panTro4.chr22 21161116 68 - 49737984 aaaaccacaattaattttgcaccaacctaaCAGTACCTACATTTATTATTTCAACTGCTCTTC-AAC-------------tt i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18510104 68 + 99152023 aaaaccatgattaattttgcaccaacctaaCAGTATCTACATTTATTACCTCAACTGCTCTTC-AAC-------------tt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45187311 68 - 121039945 aaaaccatgataaattttgcaccaacctaaCAGTACCTACATTTATTACCTCAACTGCTCTTC-AAC-------------tt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21069438 76 - 95678458 aaaaccacgattgattttacaccaacctaaCAGTACCTACATTTATTATCTCAACTGCTCAACtttt------ttttttttt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21562194 75 + 96509753 aaaaccacgattgattttacaccaacctaaCAGTACCTACATTTATTATCTCAACTGCTCAAC-ttt------ttttttttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20485523 75 - 90941950 AAAACCACGATTGATTTTACACCAACCTAACAGTACGTACATTTATTATCTCAACTgctcttc-aac------ttttttttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20479131 73 - 33263144 aaaaccacgattgattttacaccaacctaaCAGTACCTACGTTTATTATCTTAACTGCTCTTC-AAC--------Atttttt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 57239 71 - 112050 gaaatcatgattaattttgcacc----------tacctaCATTTATTACCTCAACTGATCCTC-AAAttttttttttttttt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15905408 56 - 38964690 AAAATCCCCATAAACTT------------ATAGTACTTACATTTATTACCTTGATTGCTCTTC-AAC-------------TT i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=285257.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 70136 101 + 478999 tcttttttt-gagacagagtatccctctgtcacccaggctggagggcagtggcacaaatctcggctcactgcaacctccacctccaggggtcaagtgattct s panTro4.chr22 21161184 101 - 49737984 ttttttttttgagatggagtctccctctgtcaaccaggctggagtgcagtggcacga-tctcggctcactgcaacctccacctcccaggttcaagtgattct i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18510172 100 + 99152023 tcttttttt-gagacagagtatccctctgtcacccaggctggagtgcagtggcacaa-tctcggctcactgcaacctccacctccaggggtcaagtgattct i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45187379 100 - 121039945 tcttttttt-gagacagagtatccctctgtcacccaggctgaagtgcagtggcacaa-tctcggctcactgcaacctccacctctagggatcaagtgattct i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21069514 100 - 95678458 ttttttttt-gagacagagtctccctctgtcactcaggctggagtgcagtggcacta-ccttggctcactgcaacctccaactcccaggttcaagtgattct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21562269 100 + 96509753 ttttttttt-gagacagagtctccctctgtcactcaggctggagtgcagtggcacta-ccttggctcactgcaacctccaactcccaggttcaagtgattct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20485598 100 - 90941950 ttttttttt-gagacagagtctccctctgtcactcaggctggagtgcagtggcacta-ccttggctcactgcaacctccaactcccaggttcaagtgattct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20479204 100 - 33263144 ttttttttt-gagacagagtctccctctgtcactcaggctggagtgcagtgacactc-tcttggctcaccgcaacctccacctcccaggttccagtgattct i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 57310 100 - 112050 ttttttttt-gagatggagtctccctctgtcacccaggctggagtacagtggcacaa-tcttggctcactgcaacctccgcctcctaagttcaagcaattct i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 137 e canFam3.chr26 15905464 0 - 38964690 C a score=487422.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 70237 186 + 478999 cctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagacgtccaccaccacgcccggctaatttttgtatttttaat------agagacggggttttgccatgttggccacgctgg-tctcaaactcctgatctc---atctgtccaccttggcctcccaaagtgctgggattatagacatgagccacggcgttcagcc s panTro4.chr22 21161285 186 - 49737984 cctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagatgcccaccaccgcaccccgttaatttttgtatttttagt------agagatggggttttgccatgttggccaggctgg-tctcaaactcctgacctc---acctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggattataggcacgagccactgcatccagcc i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18510272 186 + 99152023 cctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagatgtccaccaccacgcccggctaatttttgtatttttagt------agagacggggttttcccatgttggccacgctgg-tctcaaaatcctgatctc---atctgtccactttggcctcccaaagtgctgggattatagacataagccaccgcgtccagcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45187479 186 - 121039945 cctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagacgtccaccaccacgcctggctaatttgtgtatttttagt------agagacgggattttgccgtgttggccacactgg-tctcaaactcctgatctc---atctgtccaccttggcctcccagagtgctgggattatagacatgagccaccgcatccagcc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21069614 186 - 95678458 cctgcctcagtctcctgagtagctgggattacagatgcccaccacaaccccctgttaatttttttatttttagt------agagatggggtttcgccatgttggccaggctgg-tctcaaactcctgacctc---atctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggattataggcacgagccaccgtgtccagcc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21562369 186 + 96509753 cctgcctcagtctcctgagtagctgggattacagatgcccaccacaacaccctgttaatttttttatttttagt------agagatggggtttcgccatgttggccaggctgg-tctcaaactcctgacctc---atctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggattataggcacgagccaccgtgtccagcc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20485698 187 - 90941950 cttgcctcagtctcctgagtagctgggattacagatgcccaccacaacaccctgttaatttttttatttttagt------agagatggggtttcgccatgttggccaggctggttctcaaactcctgacctc---atctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggattataggcacgagccaccgtgtccagcc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20479304 173 - 33263144 cctgcctcagtctcctgagtagctgggattacagatgtccaccacaacaccctgttaatttttttatttttagt------agagatggggtttcgccatgttggccaggctgg-tctcaaactcctg----------------accttggcctcccaaagtgctgggattataggcacgagccaccgtgtccagcc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 57547 194 - 112050 cccatcctggcctcccaaagtgctgagattataggcgtgagctaccacgtctggccTAATCTTACATTTCCTGTtctttaagagatggggttttaccatcttggccaggctga-tctcaaaatcctgaccttgagatctgctcgcctcagcctcccaaagtactgggattacaggtgtgagccacctcacccag-c i calJac3.chrUn_GL286438 I 137 C 0 e canFam3.chr26 15905464 0 - 38964690 C a score=1550429.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 70423 509 + 478999 TAATCTTACTCTTTAAAAGAATAA--AGTAAGGGCAGACAATAACGAATGTCTTAACCCAGAAATCTCACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAAC----AGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGAATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGGGTATATAAACGTAGAACGGCTTAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAATCTCCAATAAGCCTATACTGTCATAATAAAAATCATTTGCCTAAATCTCTTCCAATTCATATTAGATGTATTAATATAAACCATATCCTACCTGAGTTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAacacac-cac----------aac------acacaagcacacaaacacacatacac------------GGATACAGAACTTGGGAGTTCAGGCTGAG-TTCTGCATTTACAGAGTTCATAGAAACCAATTTTTCTT---AAGGTATCTTTCATAATTCTCAATC s panTro4.chr22 21161471 525 - 49737984 TAATCTTACTCTTTAAAAGAATAA--AGTAAGGGCCGATAATAACAAATGTCTTAACCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATTATGTTATCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAACTAACAGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATGTGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGGCTATATAAACTTAGAACGGCTCAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCCAATAAGCCTATACTGTCATAATAAAAATCGTTTGCCTAAGTATCTTCCAATTCATATTAGATGTATTAAGATAAACCATATCCCATCTGAGTTGCCACAACTCCATTTGATATTTAAAACATAC-cac----------aac------acacacacacacacacacacacacacacacacacacacGGATACAGAACTTGGGAGTTCGGGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTGCATAGAAACTGGTTTTTCTT---AAGGTGTCTTTTATAATTCTCAATC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18510458 518 + 99152023 TAATCTTACTCTTTAAAAGAATAA--AGTAAAGGCAGACAATAACAAATGTTTTAACCCAGAAATCTCACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAGACACTACAAGTGTGCAGTAAAC----AGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAAGGAATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCGCCAGATGGGTATATAAATGTAGAATGGCTTAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCCAATAAGCCTATACTGTCATAATAAAAATCGTTCACCTAAATATCTTCCAATTCATATTAGATGTATTAATATAAACCATATCCCATCTGAGTTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAACACAC-CAT----------Aac------acacacacacacacacacacacacacacacacacG---GGATACAGAACTTGGGAGTTCAGGCTGAG-TTCTGCATTTACAGAGTTCATAGAAACCGATTTTTCTT---AAGGTGTCTTTCATAATTCTCAATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45187665 506 - 121039945 TAATCTTATTCTTTAAAAGAATAA--AGTAAGGGCAGACAATAACGAATGTCTTAACCCAGAAATCTCACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAAC----AGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGAATATGTGACACGGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGAGTATATAAACGTAGAACGGCTTAACTCCCAGCTGCATATTAACACCAAATCTCCAATAAGCCTATACTGTGTTAAT-AAAATCATTTGCCTAAATCTCTTCC-ATTCATATTAGATGTATT-ATATAAACCATATCCTATCTGAGTTGCTACAACTCCATTTGATATTTAAAacacac-cac----------tac------acacacgcacagaaacacacacacGC------------GGATACAGAACTTGGGAGTTCATGCTGAG-TTCTGCATTTACAGAGTTCATAGAAACGGATTTTTCTT---AAGGTGTCTTTCATAATTCTCAATC i nomLeu3.chr6 C 0 M 100 s rheMac3.chr10 21069800 500 - 95678458 TAATCTTACTCTTTAAA---------------GGCAGATAATAACAAATGTCTTAATCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAAAGGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAACTAACAGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGACTATATAAACCTAGAACGGCTCAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCCAATAAGTCTATACTGTCATAATAAAAATCATTTGCCTAAATATCTTCCAACTCATATCAGATGTATTAATATACACCACATCCCATCTGAATTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAAAACAC-CAC----------cac------acacacacacacacacacacacacac------------GGATACAGAACCCGGCAGTTTGGGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTTCATAGAAACTGATTTTTCTT---AAAGTGTCTTTCATAATTCTCAATC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21562555 500 + 96509753 TAATCTTACTCTTTAAA---------------GGCAGATAATAACAAATGTCTTAACCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAACTAACAGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGACTATATAAACCTAGAACGGCTCAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCCAATAAGTCTATACTGTCATAATAAAAATCATTTGCCTAAATATCTTCCAACTCATATCAGATGTATTAATATACACCACATCCCATCTGAATTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAacacac-cac----------cac------acacacacacacacacacacacacac------------GGATACAGAACCCGGCAGTTTGGGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTTCATAGAAACTGATTTTTCTT---AAAGTGTCTTTCATAATTCTCAATC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20485885 509 - 90941950 taaTCTTACTCTTTAAA---------------GGCAAATAATAACAAATGTCTTAACCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAACTAACAGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATAACTATATAAACTTAGAACGGCTCAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCCAATAAGTCTATACTGTCATAATAAAAACCATTTGCCTAAATATCTTCCAACTCATATCAGATGTATTAA-ATACACCACATCCCATCTGAATTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAacacaa-caccacacacacacac------acacacacacacacacacacacacac------------ggatacaGAACCCGGCAGTCTGGGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTTCATAGAAACTGATTTTTCTT---AAAGCGTCTTTCATAATTCTCAATC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20479477 510 - 33263144 TAATCTTACTCTTTAAA---------------GGCAGATAATAACAAATGTCTTAACCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATTCACAGAAGCATTTAAAACACTACAAGTGTGCAGTAAACTAACAGCAAAAGCCAACAAGC----TCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATATGACACAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGACTATATAAACTTAGAACGGCTCAACTCCCAGCTATATATTAACACCAAAACTCCAATAAGTCTATACTGTCATAATAAAAATCATTTGCCTAAATATCTTCCAACTCATATCAGATGTATTAATATAAACCACATCCCATCTGAATTGCTACAACTCCACTTGATATTTAAAacacaa-caccacacacatacac------acacacacatacacacacacacacac------------GGACACAGAACTCGGCAGTTTGGGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTTCAAAGAAACTGATTTTTCTT---AAAGTGTCTTTCATAATTCTCAATC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 57741 493 - 112050 TATTCTTAGTCTTTAAAAGAATAA--AGTAAACCCAGATAATAACAAATGTCTTAACCCAGAAATCTAACCTTTTTGAATGATGTTCTCCATCCACAGAAGCACTTAATGCACTATAAGTGTGCAGTAAAC----AGCAAAAGCCAACAGGC----GCTAATCACTTAAACTCTAGAGGATATATGGCATAGCTCTTCCTAAAATATCACCAGATGGGTATACAAACTTAGACTGGCTCAACTCCCAGCTGTATATTAACACCAAAACTCTAATGAGTCTTTACTGTCATAATAAAAATCATTTGCCTAAATATCTTCCAATCCGTATTAGATGTATTAATATAAACCATAGCCCATCTGAATTGCTACAACTCCACTTGATAGTTAAAACACAC-CGC--------------------------------AACACACACAAGC------------AGTTACAGAACTTGGGAGTTCGAGCTGAG-TTCTGTGTTTACAGAGTCCATACAAACTGATATTTCTT---AAGGTGTCTTTCATCATTCTCAATC i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15905464 471 - 38964690 TAAACTTATTCTTAAAATATATACATATAAAGGGTAGATAATTACAAATGCCTTACCCTAGAAAT-----------------------------ACAAA---ATTTAATGTGC----AGGGGGGAAAAAAC------CACAAACTGACAGGCTCTATCTAATCACTTAAACTCTAAAAGATACATTGCATAGATCTTCCTAAAATATCACCAGATTAGTACATAAA-TTACAGTGGCTCAACTCCCAGCCGTAATTTAACACCAAA-CCCCAATGAGACTATACTGTCATAAT-------TTTTATCTAAATATCCTCCAATTCAAATTACATGTATAAA-----AGCCTATCACCTCTGAA-TGCTGTAATCCCACTTGATATTTAAAATACACACAC----------AGCTATAGAACTTACTCAAGTCCACATGGCAAGTC------------AGCAGGAGAATTGGGAAATTCAGGCCGAGAAAAAGTGTTT--AGAGTTCACAGAATCTGATTTTTCTTTTCAAGGCATCAGTCATAATTCTCAATC i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=391764.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 70932 142 + 478999 AGCTTATTAAAAAGAGAAAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGTGTTTAACTGTGATCAAATCCCACAATGTCTTCAGTCATAGTAGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATAAGCTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT s panTro4.chr22 21161996 142 - 49737984 AGCTTATTAAGAAAAAAAAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGGGTTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGTGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGCTTACCTGCCCCACTCCTCCCATACTACT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18510976 142 + 99152023 AGCTTATTAAGAAGAGAAAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGTGTTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGTGGATTTCACAATGATAAAGTCCAAATCAGCTTACCTGCCCCGTTCCTCCCACACTACT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21070300 142 - 95678458 AGCTTATTAAGAAGAAAGAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGTGTTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGGGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGTTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563055 142 + 96509753 AGCTTATTAAGAAGAAAGAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGTGTTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGCCATAGGGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGTTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486394 142 - 90941950 AGCTtattaagaagaaagaaactagatgGCTCAGTCCTCTTGTGTTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGTGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGTTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20479987 142 - 33263144 AGCTTATTCAGAAGAAAGAAACTAGATGGCTCAGTCCTCTTGTATTTAATTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGTGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGTTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58234 139 - 112050 AGCTTAT---AAACAGAAAAACTGGATGGCTAAGTCCTCTTGTGTTTAACTGTGATCAAATCCCAGAATGTCTTTAGTCATAGTGGAGTTCACAATGATAAAGTTCAAATCAGCTTACCTGCCCCATTCCTCCCATACTACT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15905935 129 - 38964690 AGCTCATCAGGAAGAAGAAAATTAGATGG--AGGTCTTCTGGTGTTTAAATATGATCAAAGC-----------TCAGTCTCAGTGGAGTTTACAATGAGAAAGTTCAAATTACCTTGCTTGCACCATTTCTCCCCTACCACT i canFam3.chr26 C 0 C 0 e nomLeu3.chr6 45188171 100 - 121039945 M a score=390314.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 71074 116 + 478999 TCCTACAGCTGCCACTCGTCTTAGGAACTGGAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGACTGTGACCTAAACCTTCACAAGACATCCAGTGAAAAATAAAGACTTTAAAATA s panTro4.chr22 21162138 116 - 49737984 TCCTACTGCTGCCACTCCTCTTAGGAACTGGAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGAGTGCGACATAAACCTTCAGAAGACATCCAATGAATAATAAAGACTTTAAAATA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18511118 116 + 99152023 TCCTACAGCTGCCACTCCTCGTAGGAACTGCAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGAGTGTGACTTAAACCTTCGGAAGACATCCAGTGAAAAATAAAGACTTTAAAATA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45188271 115 - 121039945 TTCTACAGCTGCCACTCCTCTTAAGAACTGGAGCCAGTTAACCA-CCACTTTCTCAATGGTGACTGTGACTAAACCTTTCACAAGACATCCAATGAAAAATAAAGACTTTAAAATA i nomLeu3.chr6 M 100 C 0 s rheMac3.chr10 21070442 116 - 95678458 TCCTACAGCTGCCACTCCTCTTAGGAACTGGAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGACTGTGACATAAACCTTCACAAAACATCCAGTGAAAAATAAAGACTTTAAAATA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563197 116 + 96509753 TCCTACAACTGCCACTCCTCTTAGGAACTGGAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGACTGTGACATAAACCTTCACAAAACATCCAATGAAAAATAAAGACTTTAAAATA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486536 116 - 90941950 TCCTACAACTGACACTCCTCTTAGGAACTGGAGCCACTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGACTGCGACATAAACCTTCACAAAACATCCagtgaaaaataaagactttaaaata i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20480129 116 - 33263144 TCCTACAACTGCCACTCCTCTTAGGAACTGGAGCCAGTTAACCACCCACTTTCTCAATGGTGACTGCGACATAAACCTTCACAAGACATCCAATGAAACATAAAGACTTTAAAGTA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58373 116 - 112050 TCCTACAGCTGCCATTCCTCTTGAGAACTGGAGCCAGTTAACCAACCACTTTCTCAATGGTGACTGTGACTTAAACCTTCACAAGACATCCACTGAAATATAAAGACTTTAAAATA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906064 107 - 38964690 TCCTACAACTGCCACTCTGCTTA-GAACGGGAGCCACTTAACTATC--------CAGTGATGACTATGACTTAAACGCTCCTAAGACACCCAATGAAAACTAAAGACATCAAAATG i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=346935.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 71190 122 + 478999 GCAGTTTTTggctgagcgtggtggctcagacctgt-aatcccagcactttggaaggcc---atgggcggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaatcccatctc s panTro4.chr22 21162254 124 - 49737984 GCAGTTTTTggctgagcgtggtggctcacacctgt-aatcccagcactttggaaggccaagatgggcggatcacctgcggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggcgaaatcccatct- i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18511234 125 + 99152023 GCAGTTTTGggctgagcgtggtggctcagacctgt-aatcctagcactttggaaggctgagatgggcggatcacctgaggtcaggagttcaagaccggcctggccaacgtggtgaaatcccatctc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45188386 122 - 121039945 GCAGGTTTTggctgagcgtggtggctcagacctgt-aatcccagcactttggaaggcc---atgggtggatcacctgaggtcaggagttcaagatcagcctggccaacatggcgaaatcccatctc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21070558 125 - 95678458 GCAGTTTTTggctgagcgtggtggctcacacctgc-agtcccaacactttggaaggccaagacgggcggatcacctgaggtcaggaattcacgaccagcctggccaacatggcaaaatcccacctc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563313 125 + 96509753 GCAGTTTTTggctgagcgtggtggctcacacctgc-agtcccaacactttggaaggccaagacgggcggatcacctgaggtcaggaattcacgaccagcctggccaacatggcaaaatcccacctc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486652 125 - 90941950 gcagtttttggctgagcgtggtggctcacacctgt-agtcccaacactttggaaggccaagacgggcggatcacctgaggtcaggaattcacgaccagcctggccaacatgctaaaatcccacctc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20480245 125 - 33263144 GCAGTTTTTggctgagtgtggtggctcacacctgt-agtcccaacactttggaaggccaagacgggcggatcacctgaggtcaggaattcaagaccagcctggccaacatggcaaaatcccacctc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58489 120 - 112050 TCAGGTTTTggctgagcatggtggctcacacctgtaaatttcagcactttgggaggtaaag------tgatcacctgaggtcaggggttcatgaccagcctggccaacaaggtgaaaccccatctc i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15906171 0 - 38964690 C a score=36012.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 71312 12 + 478999 tactaa-aaaata s panTro4.chr22 21162378 10 - 49737984 --ctaa-aaaaca i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18511359 12 + 99152023 tactaa-aaaata i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45188508 12 - 121039945 tactaa-aaaaca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21070683 12 - 95678458 tactaa-aaaata i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563438 12 + 96509753 tactaa-aaaata i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486777 12 - 90941950 tactaa-aaaata i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20480370 12 - 33263144 tactaa-aaaata i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58609 13 - 112050 tattaacaaaaca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906171 12 - 38964690 TACTCT-AAAATA i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=456115.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 71324 175 + 478999 c--aaaaattagctggctgtggccagcttgtgcctgtagtctcatctgcttgggaggttgagacatgagaatcgcttgaacttgggaggcagaggttatagtgagctgagatcgcaccatttcactccagcctgggtgacagagtgagactctgtcttaaaaaata------aaaataaaaTA s panTro4.chr22 21162388 181 - 49737984 c-aaaaaatcagctggctgtgg-tggcttctgcctgtagtctcagctacttaggaggctgagacacgagaatggcttgaacccaagaggtggaggttgcagtgagctgagatcacgccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactccatcttaaaaaataaaaaataaaataaaaTA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18511371 181 + 99152023 g-aaaaaattagctggctgtggccagcttgtgcctgtagtctcagccacttgcgaggctgagacacgagaatggcttgaacccgggaggcagaggttgcagtaagctgagatcgcaccacttcactccagcctgggtgacagagtgagactccatcttaaaaacaaacaaacaaaa-aaaaTA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45188520 166 - 121039945 g--aaaaattagctggctgtggccagcttgtgcctgtagtctcagccgcttgggaggtggagacatgagaatcacttgaacctggcaggcagaggttatagtgagctgagatcgcaccatttcactccagcctgggtgacagagtgacactctgtcttaaaa---------------aaaaTA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21070695 182 - 95678458 caaaaaaatcagctggctgtgc-tggcttgtgcctgcagtctcagctactcgggaggctgagacacgagaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgaactgagatcacgccactgcacttcagcctgggtgacagaatgagactccgccttaaaaaataaaaaataaaataaaaCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563450 182 + 96509753 caaaaaaatcagctggctgtgc-tggcttgtgcctgcagtctcagctactcgggaggctgagacacgagaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgaactgagatcacgccactgcacttcagcctgggtgacagaatgagactccgccttaaaaaataaaaaataaaataaaaCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486789 182 - 90941950 caaaaaaatcagctggctgtGC-TGGCttgtgcctgcagtctcagctactcgggaggctgagacacgagaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgaactgagatcacgccactgcacttcagcctgggtgacagaatgagactccgccttaaaaaataaaaaataaaataaaaca i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20480382 182 - 33263144 caaaaaaatcagctggctgtgc-tggcttgtgcctgcagtctcagctacttgggaggctgagacacgggaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgaactgagatcacgccactgcacttcagcctgggtgacagaatgagactccaccttaaaacataaaaaataaaataaaaCA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58622 180 - 112050 c-acaaaattagtcagctgcag-tagcttgtgcctgcaatcccagctacttggaaggctga-atacaagaatcacttgaacctaggaggcagaggctgcaatgagctgagatcacaccactgcactccggcctgggtcacagagtgagactccatcttaaacaataaaaaataaaataaaaTA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15906183 0 - 38964690 C a score=1720389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 71499 540 + 478999 GCAAtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactatagaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccgagacagaaattaatcactactaatatttCCATTCATGGCAATCCAGGATCTCTTCTGTATATCAAAGTGTATTAGTTCATTTACCAAACAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAGCATACTAATTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCAGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACTGCTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGAAATCATGCCTGCTTTTT-CTTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAAAGACCAACTAATGAGTATGTTTCCTTTATA---AATAGCAGCCTACtaaat---------------aaacaaatacatacataca-------------------------------tatataCGAATATACAGTCTTGCCA-CAGGAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAt s panTro4.chr22 21162569 529 - 49737984 GCAGtttttcctacgtat-------------------------------------------------------------------------aaaactaatacatgctcgttgtagaaaaatgggaaactctaaaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccaagacagaaattaatcactactaatatttccattcatggccatccagggtctcttctatatat--aagtgtCTTAGTTCATTTACCAAACAGGATTTTAAATACTGCAGAACAAGCGGGAAGTAGCATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCATTG-----TAAAGAAGTTACACTTACTGCTGAGTAAGTCAACCATATGTACAAGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGGAATCATACCTGCTCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAAAGACCAACTAATGAGTATGTTTCCTTTATA---AATAGCAGCCTACTAAAT---------------AAAGAAATACATACATACA---------------------------------------AATATACAGTCTTGCCA-CAAGAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18511552 535 + 99152023 GCAGtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactatggaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccaagacagaaatgaatcactactaatatttccattcatggccatccagggtctcttctgtatataaaagtgtaTTAGTTCATTTACCAAACAGGATTGTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAGCATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTTTTCAGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACTGCTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGAAATCATGCCTGCTTTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGAAACCATTATGTATGCAAAGACCAACTAATGAGTATGTTTCCTTTATA---AACAGTAGCCTACTAAat---------------aaatacatacatacatata-----------------------------------tacaaatatacaGTCTTGCCA-CAGGAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45188686 537 - 121039945 GCAAtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactatagaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccaagacagaaattaatcactactaatatttCCATTCGTGGCAATTCAGGGTCTCTTCTGTATATAAAAGTGTCTTAGTTCATTTACCAAACAGGATTTTAAGCACTGCAGAACAAGGCGGAAGTAGCACACTAGTTCTTTGGAAGACTGATTTTCTTCAGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACTGCTGAGTAAGTCAACCATATATATAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGAAATCATGCCTGCTTTTTTTTTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTCTGGGAACCATTATGTACACAAAGACCAACTAATGAGTATGTTTCCTTTATA---AATAGCAGCCtactaaat---------------aaacacatacatacatata-----------------------------------tagaaatatacaGTCTTGCCA-CAGGAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21070877 535 - 95678458 GCAGtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactctaaaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccaagacagaaattaatcactactaatatttccattcatggccatccagggtatcttctgtatataAAAGTGTCTTAGTTCATTTACCAAACAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAACATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCGGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACAGTTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGGAATCATACCTGCCCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAACGGCCAACTAATGAGTATGTTTCCTTCATA---AATAGCAGCCTACTAAAT---------------AAACAAATACATACATACA-----------------------------------TACAAATATACAGTCTTGCCA-CAGAAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21563632 535 + 96509753 GCAGtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactctaaaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccatgacagaaattaatcactactaatatttccattcatggccatccagggtatcttctgtatataAAAGTGTCTTAGTTCATTTACCAAACAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAACATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCGGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACAGTTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGGAATCATACCTGCCCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAACGGCCAACTAATGAGTATGTTTCCTTcata---aatagcagcctactaaat---------------aaacaaatacatacataca-----------------------------------tacaaatatacaGTCTTGCCA-CAGAAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20486971 535 - 90941950 gcagtTTTTTCCacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcatCGTAGAAAAATGGGAAACTCTAAAAGAATAAGAAGCAAAAAAGCCACATTATCCCACCAAGACAGAAATTAATCACTACTAATATTTCCATTCATGGCCATCCAGGGTATCTTCTGTATATAAaagtgtcttagttcatttacCAAATAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAACATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCGGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACAGTTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGAGAGAATGACAAAGGTGAGGGGAATCATACCTGCTCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAACGGCCAACTAATGAgtatgtttcctttata---aatagcagcctactaaat---------------aaacaaatacatacataca-----------------------------------tacaaatatacagtCTTGCCA-CAGAAGTTACACACACAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20480564 535 - 33263144 GCAGtttttcctacttat-------------------------------------------------------------------------aaaagtaatacatgctcattgtagaaaaatgggaaactctaaaagaataagaagcaaaaaagccacattatcccaccaagacagaaattaattactactaatctttccattcatggccatccagggtatcttctgtatataAAAGTGTCTTAGTTCACTTACCAAACAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAACATACTAGTTCTTTGGAAGACTAATTTTCTTCAGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACAGTTGAGTAAGTCAACCATATGTACAGGAAACTGGACAGAATGACAAAGGTGAGGGGAATCATACCTGCTCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACCATTATGTATGCAAAGGCCAACTAATGAGTATGTTTCCTTTATA---AATAGCAGCCtactaaat---------------aaacaaatacatacataca-----------------------------------tacaattatacaGTCTTGCCA-CAGAAGTTACACACATAGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 58802 620 - 112050 CCAG-TTTTCCTTCTTATAAAATACGTagctttgtgcagtggcagtatcatagccaatgaggtttatccaaggcgtgattattgctaattgaaaagtaaaacatgctcattttagaaacctgagaaactataaaagaataagaatcaaaaaagtcacattatcgcaccaagagagaaattaatcagtactattatttccatttctggacatccaaggtctcctctatatgtaaaagtatattcattcatttaCCAGACAGGATTTTAAGTACTGCAGAACAAGGGGGAAGTAGCCTACTAGTTTTTTGGAAGACTAATTTTCTTCAGTG-----TAAAGAAGTTACACTTACTGCTGAGTAAGTCAACCACATGTACAGGAAACTGAAGAGAGTGACAAAGATGAAGGGAATCATACTTGCTCTTT--TTCATTCACTCACAGCAAACCATGGAGTCCATGTTTTGGGAACATTTTTG-------AGACCAAT-----------ATTTCTTTATA---AATAGCAGCCCACTTAat---------------aaacaaatacgtatatacaaatatgcatagacatataatacatacaaatatatacacaaatatacaGTCTTGCCA-CAGGCGTTACAC----AGTGAAAGGAATGACATTAAGAGTAT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906183 505 - 38964690 GCAAtttttccta---at-------------------------------------------------------------------------aagagtaatgcatgctca---tacaaaattggaaaactacagaagaatacgaagcagaaaagttacactattccacca-gccagaaatcaatcattattaatatttctattcctgtctttctagggtctcttt----CATAAAAGTCTATTAGTTCACTTACTAAACAGGATTTTAAGTACAGCAGAA-------AAAGAACAATACTAGTTCTTTTGAAGACTAATTTTCCTCAGTGTTTTCTAAGGCA-------------------AAACCATGTATGTACACATGGAACTGGAGAGAAGGAGACAAATGAGAGAACTCTTACGTGCTCCTT--TTCATTCACCCCATGGCAACCA--GAGTCTGTATTTCAAGAACCATTGTATACCCAAAAACTAA----------TGTTTCCTTCTTAAGTAGTAGCAGCCTACTACATCTCTCTCTCTCTCTcacacacacacacacacaca-----------------------------------cacacCTA-----TCTTGGCAGTAGGAGAAACATATGTAGTAAAAGGAATTAAATCAAGACTGA i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 72039 1 + 478999 t s panTro4.chr22 21163098 1 - 49737984 T i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18512087 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45189223 1 - 121039945 t i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906688 1 - 38964690 T i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20481099 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20487506 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564167 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071412 0 - 95678458 C e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=546.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 72040 1 + 478999 t s ponAbe2.chr15 18512088 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45189224 1 - 121039945 t i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906689 1 - 38964690 T i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20481099 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20487506 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564167 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071412 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163099 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=546.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 72041 2 + 478999 tt s nomLeu3.chr6 45189225 2 - 121039945 tt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906690 2 - 38964690 TT i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18512089 0 + 99152023 C e chlSab2.chr19 20481099 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20487506 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564167 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071412 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163099 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=45796.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 72043 575 + 478999 aaaattattatactttaagttttagggtacatgtacacaacgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgttggtgtgctgcacccattaactcgtcatttaacattaggtatatctcctaatactatccctccccgctccccccaccccacaacaggccctggtgtgtgtgatgttctccttcctgtgtccatgtgttctctttgttcaattcccacctatgagtgagaacatgcggtgtttg---tttttgtccttgcgatagtttgctgagaatgatggtttccggcctcatccatgtccgtacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtctatcattgttggacatttggattggttccaagtctttgctattgtgaatagtgccgcaataaacatacgtgtgcatgtgt-------ctttatagcagcatgatttataatcctttgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaataaatgggatctaattaaactaaagagcttctgcacagcaaaa s nomLeu3.chr6 45189227 574 - 121039945 tttattattatactttaagttttagggtacatgtgcataacgtgcaggttagttacatatgtaa--------cctgttggtgtgctgcacccattaactcatcatttaacatta-gtatatctcctaatgctatccctcccccctccccccaccacacaacaggccctg--gtgtgtgatgttccccttcctgtgtccatgtgttttcactgttcaattcccacctatgagtgagaacatgcggtgtttgttttttttgtccttgtgatagtttgctgagaatgatggtttccagcttcatccatgtccatacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtctatcatttttggatatttggcttggttcccagtctttgctattgtgaatagtgccgcaataaagacatgtgtgcatgtgtatacatgatttatagcagcatgatttataatcctttgggtatatatccagtaatgggattgctgggtcaaataaatgggatctaattaaactgaagagcttctgcatagcaaaa i nomLeu3.chr6 C 0 I 173 e ponAbe2.chr15 18512089 0 + 99152023 C e canFam3.chr26 15906692 0 - 38964690 C e chlSab2.chr19 20481099 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20487506 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564167 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071412 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163099 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=37628.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 72618 436 + 478999 gaaactaccatcagagtgaacaggcaacatacagaatgggagaaaatttttgcaatctactcatctgacaaagggctaatatccagaatctacaatgaactcaaacagatttacaagaaaaagacaaacaaccccatcaaaaagtgggcgaaggatatggacagacacttctcagaagaagacatttatgcagccaaaagacacatgagaaaatgctcatcatcactggccatcagagaaatgcaaatcaaaaccgcaataagataccatctcacaccagttagaatggcgatcattaaaaagtcaggaaacaacaggtgctggagaggatgtggagaaacaggaacacttttacactggtggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggtaattcctcagggatctagaacaagaGTAT-G s nomLeu3.chr6 45189974 435 - 121039945 gaaactaccatcagagtgaacaggcaac-tacagaatgggagaaaattttt-caatctactcatctgacaaagggctaatatccagaatctacaatgaactccaacaaatttacaagaaaaagacaaacaaccccatcaaaaagtgggcaaaggatatgaacagacacttctcaaaagaagacatttatgcagccaaaagacacatgaaaaaatgctcgtcatcactggccatcagagaaatgcaaatcaaaaccactatgagataccatctcacaccagttagaacggcgatcattaaaaagtcaggaaacaacaggtgctggagaggatgtggagaaataggaacacttttacactgttggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggcgattcctcagggatctagaacaagaGTATTG i nomLeu3.chr6 I 173 C 0 e ponAbe2.chr15 18512089 0 + 99152023 C e canFam3.chr26 15906692 0 - 38964690 C e chlSab2.chr19 20481099 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20487506 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564167 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071412 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163099 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=3276.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73054 1 + 478999 T s panTro4.chr22 21163099 1 - 49737984 T i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18512089 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45190409 1 - 121039945 T i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21071412 1 - 95678458 T i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21564167 1 + 96509753 T i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20487506 1 - 90941950 t i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20481099 1 - 33263144 T i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906692 1 - 38964690 T i canFam3.chr26 C 0 C 0 e calJac3.chrUn_GL286438 59422 0 - 112050 C a score=1271255.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73055 389 + 478999 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGACAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAAGGTTGATCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATAGTTTCTGTGCACATAAGATGAAGGAACAATCTAACTACGG--AAAACGTAACTGTTGATTTTATAATGCTATAACTTAT---TTACACGTATAAATAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttagtccacaaatatcgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctagggagtaagggagagaacagccaccagtcccta-tttctgcagaactttcaatctGTCTCTTGAAGTATGATGTCAAACACTAGGC--ATGTGGCCTCAAGC------AAGTCACAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA s panTro4.chr22 21163100 385 - 49737984 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAAGGTTGATCTAAAATTCAAGACCTCTTCCAC-GAAAATATTTTCTGTGCACATAAGATGAAGGAACAATCTCACTACGG--AAAATATACCTGTTGGTTTTACAATGCTATAACTTAT---TTACATGCGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAA----TAGTCCTCAAAtattgacagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctagggagtaagggagagaacagccaccagtcccta-tttctgcagaactttcagtctaCCTCTTGAAATATGATGTCAAACACTAGGC--ATGGGGTCTCAAGC------AAGTCACAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18512090 389 + 99152023 TTTTTGTCACCATGAACGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAAGGTTGGTCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATAGTTTCTGTGCACACAAGATGAAAGAACAATCTCACTATGG--AAAATGTAACTGTTAGTTTTACAATGCTATAACTTAT---TTACATGTGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttagtccacaaatattgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctagggagcaagggagagaacagccatcagtcccta-tttctgcagaactttcaatctaCCTCTTAAAATATGATGTCAAATACTAGGC--ATGTGGCCTCAAGC------AAGTCACAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45190410 385 - 121039945 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGACAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAAGGTTGATCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATAGTTTTTGTGCACAGAAGATGAAGGAACAATCTAACTACGG--AAAACGTAACCGTTGATTTTACAATGCTATAACTTAT---TTACATGTGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAA----cagtccacaaatattgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctagggagtaagggagagaagagccaccagtcgcta-tttctgcagaactttcaatctaTCTCTTGAAGTATGATGTCAAACACTAGGC--ATGTGGCCTCAAGC------AAGTCACAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21071413 385 - 95678458 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAACATTGATCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATATTTTCTGTGCACGTAAGATGAAGGAACAATCTCACTATGG--AAAACTTAACTGCTGGTTTTACAATACTATAACTTAC---TTACATGTG----TAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttagtccacaaatattgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctaggaagtaaaggagagaacagccaccaatcccta-tttctgcacaactttcagtctaCCTCTTGAAATATGATGTCGAACACTAAGC--ATGTGGCCTCCAGC------AAGTCCCAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21564168 385 + 96509753 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAACATTGATCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATATTTTCTGTGCACGTAAGATGAAGGAACAATCTCACTATGG--AAAACTTAACTGCTGGTTTTACAATACTATAACTTAC---TTACATGTG----TAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttagtccacaaatattgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctaggaagtaaaggagagaacagccaccaatcccta-tttctgcacaactttcagtctaCCTCTTGAAATATGATGTTGAACACTAAGC--ATGTGGCCTCCAGC------AAGTCCCAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20487507 391 - 90941950 tttttGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAACATTGATCTAAAATTCATGACCTcttccac-aaaaatattttctgtgcatGTAAGATGAAGGAACAATCTCACTATGG--AAAACTTAACTGCTGGTTTTACAATACTATAACTTAT---TTACATGTGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAACAGTTAGTCCACAAATATTGATAGCTTACTCTGTACCAGGCAATGTATTAACTGCTAGGAAGTAAAGGAGAGAACAGCCACCAATCCCTA-TTTCTGCACAACTTTCAGTCTACCTCTTGAAATATGATGTCAAACACTAAGCATATGTGGCCTCCAGC------AAGTCCCAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20481100 389 - 33263144 TTTTTGTCACCATGAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGAT-----------------------------ATGTGAAACATTGATCTAAAATTCATGACCTCTTCCAC-AAAAATATTTTCTGTGCACGTAAGATGAAGGAACAATCTCACTATGG--AAAACTTAACTGTTGGTTTTACAATACTATAACTTAT---TTACATGTGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttagtccacaaatattgatagcttactctgtaccaggcaatgtattaactgctaggaagtaaaggagagaacagccaccaatcccta-tttctgcacaactttcagtctaCCTCTTGAAATATGATGTCAAACACTAAGC--ATGTGGCCTCCAGC------AAGTCCCAACAGTCCTGATTAAATGATGATCTCAAA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 59422 375 - 112050 TTTTTGTCACCATTAAAGTA-TCTTAAGAGAAAGTAAAGGGGT-----------------------------ATGTGAAAGGTTCATCTAAAATTCATGACTTCTTCCAC-AAAAATATTTTCTGTGCACATCAGCTGAAGGAACGATCTAACTATGG--AAAAAGTAAGTGTTGGTTTTATAATGCTATAATTTAT---TTACATGTGTAAATAAATATGCAGGAGTTTAAAcagttattctataaacagtaatagcttactctgtaccagacactgtatgaagtgctagggagtaagggagggaacagccaccagtcccta-cttttgcacaaccttcagtctaTCTCTTTAAATATGATGTCAAACACTAGGC--ATGTGGCCTCAAG--------------------GCTGATTAAATGATGATCTCAAA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15906693 420 - 38964690 TGTTTGTTTCCTTAAAATTACCCTTAGGAGAAGGTAAAATAACTGAAAGCATGaaaaaaaatttttttttaaatCTGAAAGGCTGATGTAAAATTAATGATCTCTCCCACAAAAAATATTCTCTGTGCACATCAGATGAAAGAACAATGTAACTACAGAAAAAATGTAACTATTAGTTTTACAACACTATAACTTATTTATTATATGCTTAAATAAATATGTAAGAGTTTTAAA---CAGTCCAGGGATATTGATACCTTACTCTGTACCAGGTAGTACAT-AAGTGCTGGGAAGTAAGGGA--GAACAGCCATCAGTACCTACCTTCTGCAGGGCTT---AGGCACCTCTCTAAATATGGTATCTAACACTAGAC--ATGTAGCCTCAAAAGAACAGAAATCACACCA---CTCATTAAATTATGCTCTCAAg i canFam3.chr26 C 0 I 61 a score=363583.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73444 126 + 478999 TCCTTGTGATGATCTAAGAAGATATATGTGAAAGTAGCTTATAAATCATGTTACCTAAAGTAAAAAGAGATATGTAGCCATTTGTG-CAAAGCACTGTTTATAGCAATCATCTTCAATAGAAATTAT s panTro4.chr22 21163485 126 - 49737984 TCCTTGTGATGACCTAAGAAGATATATGTGAAAGTAGCTTATACATCATGTTACCTAAGGTAAAAAGAGATATGTGGCCTTTTGTG-CAAAGCACTGTATATAGCAATCACCTTCAATATAAATTAT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18512479 123 + 99152023 TCTTTGTGATGATCT---AAGATATATGTGAAAGTAGTTTATAAATCATGTTACCTAAGGTAAAAAGAGATATGTAGCCATTTGTG-CAAAGCACTGTATGTAGCAATCATCTTCAATATAAATAAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45190795 127 - 121039945 TCCTTGTGATGATCTAAGAAGATATATGTGAAAGTAGCTTATAAATCATGTTACCTAATGTAAAAAGAGATATGTAGCCATTTGTGTCAAAGCACTGTTTATAGCAATCATTTTCAATATAAATTAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21071798 126 - 95678458 TCCTTATGATGATCTAAGAAGACATATGTAAAAGTAGCTTATCAATCATGTTACCTAAAGTAAAAAGAGATATGTAGCCTTTTGTG-CAAAGCACTGCATATAGCAATCATCTTCCATATAAATTAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21564553 126 + 96509753 TCCTTATGATGATCTAAGAAGACATATGTAAAAGTAGCTTATCAATCATGTTACCTAAAGTAAAAAGAGATATGTAGCCTTTTGTG-CAAAGCACTGCATATAGCAATCATCTTCCATATAAATTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20487898 126 - 90941950 TCCTTATGATGATCTAAGAAGACATATGTGAAAGTAGCTTATCAATCATGTTACCTAAAGTAAAAAGAGATATGTAGCCTTTTGTG-CAAAGCACTGCATATAGCAATCATCTTCcatataaattat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20481489 126 - 33263144 TCCTTATGATGATCTAAGAATACATATGTAAAAGTAGCTTATAAATCATGTTACCTAAAGTAAAAAGAGATATGTAGCCTTTTGTG-CAAAGCACTGCATATAGCAATCATCTTCCATATAAATTAT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 59797 123 - 112050 TCCTTGTGATGATCT---AAGATATATGTGAAAGTAGCTTATAAATCATGTTACCTAAGGTAAAAAGGGATATGTGGCCTTTTATG-CAAAGCACTGTATACAGCAATCATCTTCAATATAAACTAT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15907113 61 - 38964690 I a score=1067.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73570 20 + 478999 ---------------Ctttatttatttatttattt s ponAbe2.chr15 18512602 15 + 99152023 ---------------CTC-----Atttcttttttt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45190922 35 - 121039945 tttatttatttatttatttatttatttatttattt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15907113 61 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20481615 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20488024 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564679 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071924 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163611 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59920 0 - 112050 C a score=19462.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73590 78 + 478999 tttgagatggagactcgc-tctgtcacccaggctggagtgcagtggcgtgatctcggctc-------actgccacctctgcctctg s ponAbe2.chr15 18512617 85 + 99152023 tttgagacggagtctcgc-tctgtcacccaggctggagtgcagtggcatgatctcggctctcggctcactgcaagctccacctctg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45190957 78 - 121039945 attgagatggagactcgc-tctgtcacccaggctggagtgcagtggcatgatctcggctc-------actgcaacctctgcctctg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15907174 60 - 38964690 cccgggatcgagtcccacatcgggctccctgcatgga-------------------gctt-------gcttctctctctgcctgtg i canFam3.chr26 I 61 I 169 e chlSab2.chr19 20481615 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20488024 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564679 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071924 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163611 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59920 0 - 112050 C a score=47618.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73668 208 + 478999 gggtttaggccattctcctgcctcagcctcctaagtagctgggactacaggcacccaccaccacgactggctaattttttgtatttttagtagagatggggtttcaactgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatccgcccaccttggcctcccaaagtgctgggatggcaggtgtgagccaccgcgcccggccC s ponAbe2.chr15 18512702 206 + 99152023 gggttcaagccattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggactacaggagaacaccaccacgcctggctaattttt-gtatttttagtagagataaggtttca-ccgtgttagccaggaagttctcaatctcctgacctcatgatccacccgcctcggcctccaaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcacccagccT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45191035 208 - 121039945 gggttcaggccattctcctgcctcagcctcccacgtagctgggactacaggcacccgccaccacgactggctaattttttgtatttttagtagagatggagtttcaactgtgttagctaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggattgcaggggtgagccaccacgcctggccT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15907234 169 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20481615 0 - 33263144 C e papAnu2.chr10 20488024 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 21564679 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21071924 0 - 95678458 C e panTro4.chr22 21163611 0 - 49737984 C e calJac3.chrUn_GL286438 59920 0 - 112050 C a score=2034861.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 73876 638 + 478999 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAAAA-A-TAATCACTCAAGTTGCTTAATATAATCTCTTTTGACAGTCTCTAAGATTTTGATATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCATATGAAGTAACTGAAATTAATTTTCCCATGATGGGGGAGAAAAGATTCACTTTTTTCTAATACAAAAAGCTTTATTTCCTGATTTCATAATTTATAGGGGTTAGGGGGCAGGCAGCCACAGATCAAAAGCAACTTATTCAAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCACCATGGAAAGTTT-------------------------GTTATAGGCTCAGGCTAATCCAAAT--AGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCTTCCCTTCACTCAGTCTCTAACACCTAACCTCTTAAAAAACAGGGAGATATATATTATAGCCAAATTGCTTTCCAAAAAACATA-ATTTTAAAAAATATGCTCTACACAGTATC--------------------AACTGTTTGTATCTAAAAGAAATAGACTATTTACAT--------------------TGCTTTTTATCCTACGA-TTTATCCTTTTCAAATTCAGCCACCTCAACGATGCAAAAAAGTATCAAACTGATGCTTTAAA-------TTTATTTTTGCCCT---------TATTGCAGATACGACTC s panTro4.chr22 21163611 618 - 49737984 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAAAA-AGTAATCACTCAAGTTGCTTAATATAATCTCTTTTCACAGTCTCTAAGATTTTAGTATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCACATGAAATAACTGAAATTAATTTCCCCAT---------------------TTTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTGATGTCATAATTTATAGGGGTTGGGGGGCAGGCAGCCACAGATCAAAAGCAACTTATTCTAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------GTTATAGGCTCAGGCTAATCCAAACAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCATCCCTTCACTCAGTCTCTAGGACCTAA-CTCTTAAAAAACAGGGAGACACATATTATAGCCAAACGGCTTTCCAAAAAACATA-ATTTTTTAAAATATGTTCTACAAAATATT--------------------AATTCTTCATATCTAGAAGAAATAGAGTACTTACAT--------------------TGCTTCTTATCCTACGA-TTTGTGCTTTTCAAATTCAGCCACCTCAACAATGC-AAAAAGTATTGAACTGATGTTTTAAA-------TTTATTTTTACCCT---------TATTGCAGATACAACTC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18512908 641 + 99152023 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAGAA-AAGAATCACTCAAGTTGCTTAATATAATCTCTTTTGACAGTCTCTAAGATTTTAAAATTATCTTTCTCTGCCAATGGCCCATATGAAATAACTGAAATTAATTTCCCCGTGATGGGGGAGAAAAGATTTGTTTTTTTCTAATACAAAAACCCTTATTTCCTGATTTCATAATTTATAGGGGTTAGGGGGCAGACAGCCACACATCAAAAGCAACTTATTCAAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------GTTATAGGCTCAGGCTAATCCAAACAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGCACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAACTATTCATCCCTTCACTGAGTCTCTAAGACCTAACCTCTTAAAAAACAGGGAGATATATATTATAGCCAAACTGCATTCCAAAAAACATA-ATTTTTAAAAATAAGCTCTACACAATATT--------------------AATTCTTCATATCTAAAAGAAATAGACTATTTATAT--------------------TGCCTCTTATCTTACGA-TTTGTCCTTTTCAACTTCAGTCACCTCAACAATGCAAAAAAGTATCAAACTGATGCTTTAAA-------TTTATTTTTGCTCT---------TATTGCAGATGTGACTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45191243 634 - 121039945 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAAAA-AATAATCACTCAAGTTGCTTAATATAATCTCTTTTGACAGTCTCTAAGATTTTAATATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCATATGAAATAACTGAAATTAGTTTCCCCATGATGGGGGAGAAAAGATTTGTTTTTTTCTAATACAAAAAGCTTTATTTCCTGATTTCATAATTTATAGGGGTT-GGGGGCAGGCAGCCACAGATCAAAAGCAACTTATTCAAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCACCATGGAAAGTTT-------------------------GTTATAGGCTCAGGCTAGTCCATAT------AG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCTTCCCTTCACTCAGTCTGTAACACCTAACCTCTTAAAAAACAGGGAGATATGTATTATAGCCAAATTGCTTTCCAAAAAACATA-ATTTTTAAAAATACGCTCTACACAATATC--------------------AACTGTTTGTATCTAAAAGAAATAGACTATTTACAT--------------------TGCTTCTTATCCTACTA-TTTATCCTTTTCAAAGTCAGCCACCTCAATAATGCAAAAAAGTATCAAACTGATGCTTTAAA-------TTTATTTTTGCCCT---------CACTGCAGATATGACTC i nomLeu3.chr6 C 0 I 1843 s rheMac3.chr10 21071924 619 - 95678458 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAAAA-AATAATCACTCAAGTTGCTTAATACAATCTCTTTTCACAGTCTCTAAGATTTTAATATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCATATGAAATAACTGAAATTAATTTCCCCAC---------------------TGTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTGATTTCACAACTTATAGGGGCTGGGGGGCAGGCAGCCACAGATGAAAAGCAACTTATTCTAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------TTTATAGGCTCGGGCTAATCCAAATAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCATGCCTTCACTCAGTCTCTAGGACCTAACCTCTTATAAAACAGGGAGATATATATTATAGCCAAACTGCTTTCCAAAAAACATA-ATTTTTTAAAATATGTTCTACACAATATT--------------------AATTCTTCATATCTAAAAGAGATAGATTACTTACAT--------------------TGCTTCTTATCCTACTA-TTTGTCCTTTCCAAATTCAGCCACCTCAACAATGC-AAAAAGTATCGAACTGATGCTTTAAA-------TGTATTTTTGCCCT---------TATTGCAGATATGACTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21564679 619 + 96509753 CTCATTTCTTTTAACTGGCAAAAA-AATAATCACTCAAGTTGCTTAATACAATCTCTTTTCACAGTCTCTAAGATTTTAATATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCATATGAAATAACTGAAATTAATTTCCCCAC---------------------TGTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTGATTTCACAACTTATAGGGGCTGGGGGGCAGGCAGCCACAGATGAAAAGCAACTTATTCTAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------TTTATAGGCTCGGGCTAATCCAAATAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCATGCCTTCACTCAGTCTCTAGGACCTAACCTCTTATAAAACAGGGAGATATATATTATAGCCAAACTGCTTTCCAAAAAACATA-ATTTTTTAAAATATGTTCTACACAATATT--------------------AATTCTTCATATCTAAAAGAGATAGATTACTTACAT--------------------TGCTTCTTATCCTACTA-TTTGTCCTTTCCAAATTCGGCCACCTCAACAATGC-AAAAAGTATCGAACTGATGCTTTAAA-------TGTATTTTTGCCCT---------TATTGCAGATATGACTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20488024 619 - 90941950 ctcatttcttttaacTGGCaaaaa-aaTAATCACTCAAGTTGCTTAATACAATCTCTTTTCACAGtctctaaaattttaatattatctttCTCTGCCAATGACCCAtatgaaataactgaaattaatttCCCCAC---------------------TGTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTGATTTCACAACTTATAGGGGCTGGGGGGCAGGCAGCCACAGATGAAAAGCAACTTATTctaactcaag-aaaaaaattatcttttaatctaAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------TTTATAGGCTCGGGCTAATCCAAAGAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCATCCCTTCACTCAGTCTCTAGGACCTAACCTCTTATAAAACAGGGAGATATATATTAtagccaaactgctttccaaaaaacata-attttttaaaatatgttctacacaatatt--------------------aattcttcataTCTAAAAGAGATAGATTACTTACAT--------------------TGCTTCTTATCCTACTA-TTTGTCCTTTCCAAATTCAGCCACCTCAACAATGC-AAAAAGTATCGAACTGatgctttaaa-------tttatttttgcccT---------TATTGCAGATATGACTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20481615 619 - 33263144 CTCACTTCTTTTAACTGGCAAAAA-AATAATCACTCAAGTTGCTTAATACAATCTCTTTTCACAGTCTCTAAGATTTTAACATTATCTTTCTCTGCCAATGACCCACATGAAATAACTGAAATTAATTTCCCCAC---------------------TGTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTGATTTCACAACTTATAGGGGCTGGGGGGCAGGCAGCCACAGATGAAAAGCAACTTATTCTAACTCAAG-AAAAAAATTATCTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------TTTATAGGCTCGGGCTAATCCAAATAGAGTTAG--TGACAGGTTAATTGTGGTACTTTGAAAGCAAAGGAGAGCAAGTAGCAATTATTCATCCCTTCACTCAGTCTCTAGGACCTAACCTCTTATAAAACAGGGAGATATATATTATAGCCAAACTGCTTTCCAAAAAACGTA-ATTTTTAAAAATATGTTCTACACAATATT--------------------AATTCTTCATATCTAAAAGAGATAGATTACTTACAT--------------------TGTTTCTTATCCTACTA-TTTGTCCTTTCCAAATTCAGCCACCTCAACAATGC-AAAAAGTATCGAACTGATGTTTTAAA-------TTTATTTTTGCCCT---------TATTGCAGATATGACTC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 59920 641 - 112050 CTCATTTCTTTTAAATGGCAAAAA-A--AATCATTCAAGTTGCTTAACATAATCTCTTTTCACAGTCTCTAAGATTTTAATATCATCTTTCTCTGCCAATGACCCGTATGACATAACTGAAATTAATTTCCCCATAACGGGGATGAAAAGACTCAATTTTTTCTAATACAAAAAGCCTTGTTTCCTAATTTCATAACTTATGGGGGTTGAGAAGCAGGCAGCCACAAATCAAAAGCAACTTATTCAAATTCAAG--AAAAAATTATGTTTTAATCTAAGAATCATCATGGAAAGTTT-------------------------GTTATAGGCTCAGGTTATTCCAAATAGAGTTAG--TGAAAGGTTAATTGTGTTACTTTGAGAGCAAAGGAGAGCAAGCAGCAATTATTCATCCCTTCACTCAGTCTCTAAGACCTAATCTCTTTAAAAGCAGAGAGATACATATTACTTCCAAACTGCTTTCC-AAAAACGTA-CTTTTAAAAAATATGCTCTACACAATATC--------------------AATTATTCATATTGAAAAGGAATAGAC----TACAT--------------------TGCCTCTTACCCTATGA-TTCACCCTATTCAAATTCAGCCACCTCAACAATAC-AAAAATTATCAAACTGATGCTTTAAA-------TTTATTTTTGCCCTTATTGCAGATATTGCAGATATGACTC i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15907403 688 - 38964690 CTCATTTCTTTTAACTGACAAAAATAATAATCA--CAAATAGAT------------CTTTCATAATCTCGAAGACCTCAGTATTATCTGTCTCTGACAATGAACCATATGAAATAACTGAAATTAAGTTCCCCAGGATGGGAAGAGAAAGAGACCCATCTTTCTAATACAAAAAGCACCATTTCCTGATTTCATAATTTACGGTGA--GGGGTGGGGGCAGGAATAAATCAAAAGCAATGTATTCAAACTTAATTTAAAAAGTTACTTTTTAATCTAAGATTCATCATGGAAAGTTTCAGCCCAATAAAGCATTTTTTAAAAGTTAGAGATTCAGGCTCTTCCAAATGGAGTTAGAATGACAGGTTAATTGTGGTACTCTGCAAGCAAAGGAAAGTAAGTAGCAATTATTCATCCCTTCCCTCAGTCTCCAGG-------CTCTTAGAAAGCAGGGA------TGTTATAACCAAACCACTTTCCATAAAGCACAGACTTATTAAAATATATTCTACACAGTATCATATCTAAGCAAGAACAGAGAAATCTCTAT-TTTAGGAGAAATAGATTACTTACATAGTTTCTAAGAGAAACAGACTGTTTCCTATCCCATAATTTTTTCCTTTTCAAATTCAGCCACCTCAATGATAACAAACGGTATCAAACTGACACTTTGAACAAGGTTTATATGTTTGCCTT---------T-TTGCAGATAGGACTC i canFam3.chr26 I 169 C 0 a score=17082.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74514 5 + 478999 TAAAG s panTro4.chr22 21164229 5 - 49737984 TCAAG i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18513549 5 + 99152023 TCAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45193720 5 - 121039945 TCAAG i nomLeu3.chr6 I 1843 C 0 s rheMac3.chr10 21072543 5 - 95678458 TCAAG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21565298 5 + 96509753 TCAAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20488643 5 - 90941950 TCAAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20482234 5 - 33263144 TCAAG i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 60561 5 - 112050 TCAAG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15908091 5 - 38964690 CCAAA i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=402451.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74519 152 + 478999 AGCATGGGGA---Gtttctttt-tttttttttttttgagatggagtctcgctctgtcacagacgttggagtgccgtggtgcaatctcggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagagattatcctgcctcagcctcccgcgtagctggaac s panTro4.chr22 21164234 144 - 49737984 AGCATGGGA-----------Ct-tttttttttttttgagatggagtctcgctctgtcacccaggctgcagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaacctccgcctcctgggttcaagagattatccttcctcagcctcccaagtagctggaac i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18513554 155 + 99152023 AGCATGAGCATGGGACCttttt-tttttttttttttgagacagagtctcgctctgtcacagaggctagagtgcagtggtgcaatctcagctcactgcaacctccacctcctggattcaagagattatcctgcctcagcctcccgagtagctggaac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45193725 152 - 121039945 AGCATGGGAG---TGTGttttt-tttttttttttttgagatggagtctcgctctgtcacagaggttgcagtgcagtggtacaatctcggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagagattatcctgcctcagcctcccaagtagctggaat i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21072548 152 - 95678458 AGCATGAGAC---ttttttttc-tttttttttttttgagacaaagtctcactctgtcacccaggctgaagtgcagtggcgcaatctcggctcaatgcaacctccgcctcccaggttcaagagattatcctgcctcagcctcccaagtagctggaac i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21565303 151 + 96509753 AGCATGAGAC---ttttttttc--ttttttttttttgagacagagtctcactctgtcacccaggctgaagtgcagtggcgcaatctcggctcaatgcaacctccgcctcccaggttcaagagattatcctgcctcagcctcccaagtagctggaac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20488648 150 - 90941950 AGcatgagac---ttttttttc---tttttttttttgagacagagtctcactctgtcacccaggctgaagtgcagtggcgcaatctcggctcaatgcaacctccgcctcccaggttcaagagattatcctgcctcagcctcccaagtagctggaac i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20482239 153 - 33263144 AGCATGAGAC---ttttttttcttttttttttttttgagacagtgtctcactctgtcacccaggctgaagtgcagtggcgcaatctcggctcaatgcaacctccgcctcccaggttcaagagattatcctgcctcagcctcccaagtagctggaac i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 60566 153 - 112050 AGCATGGAAC---ttgttttttttttttttttttttgagatggaatctcactctgtcaaccaggctggaatgcagtggcacaatcttggctcactgcaacctctgtctcccgggttcaagcaattatcctgcctcagcctcccaagcagctgggac i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 133 e canFam3.chr26 15908096 0 - 38964690 C a score=115401.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74671 43 + 478999 tacaggcgtgtgccaccacgcccagctagctttttgtagtttt s panTro4.chr22 21164378 43 - 49737984 tacaggcgcgtgccaccacgctgggctaattttttgtattttt i panTro4.chr22 C 0 I 1 s ponAbe2.chr15 18513709 43 + 99152023 tacagccgcatgccaccacacctggctagttttttgtagtttt i ponAbe2.chr15 C 0 I 1 s nomLeu3.chr6 45193877 43 - 121039945 tacaggcacgtgccaccacacccagctagttttttgcagtttt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21072700 43 - 95678458 tacaggcacgtgccaccacgcctggctaattttttgtattttt i rheMac3.chr10 C 0 I 1 s macFas5.chr10 21565454 43 + 96509753 tacaggcacgtgccaccacgcctggctaattttttgtattttt i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.chr10 20488798 43 - 90941950 tacaggcacgtgccaccacgcccggctaattttttgtattttt i papAnu2.chr10 C 0 I 1 s chlSab2.chr19 20482392 43 - 33263144 tacaggcacgtgccaccacgcccggctaattttttgtattttt i chlSab2.chr19 C 0 I 174 s calJac3.chrUn_GL286438 60852 42 - 112050 tacaggtgtgagccaccacacctggccaattttttgtatttt- i calJac3.chrUn_GL286438 I 133 C 0 e canFam3.chr26 15908096 0 - 38964690 C a score=56630.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74714 31 + 478999 gtagagatggggtttcaccgtgttagccagg s panTro4.chr22 21164422 30 - 49737984 gtagagac-gggtttcacggtgttagccagg i panTro4.chr22 I 1 C 0 s ponAbe2.chr15 18513753 31 + 99152023 gtagagatcgggtttcaccattttagcgagg i ponAbe2.chr15 I 1 C 0 s nomLeu3.chr6 45193920 31 - 121039945 gtagagatggggtttcaccatgttagccagg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21072744 30 - 95678458 gtagagac-gggtttcaccgtgttagccagg i rheMac3.chr10 I 1 C 0 s macFas5.chr10 21565498 30 + 96509753 gtagagac-gggtttcaccgtgttagccagg i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.chr10 20488842 30 - 90941950 gtagagac-gggtttcaccgtgttagccagg i papAnu2.chr10 I 1 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 60894 21 - 112050 ----------agtttcaccatgttagccagg i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908096 0 - 38964690 C e chlSab2.chr19 20482435 174 - 33263144 I a score=169765.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74745 87 + 478999 atggtctcaatctcctgacttcatgatccacccgcctcggtctcccaaagtgctgggattactggcgtgagccaccatgcccggccT s panTro4.chr22 21164452 87 - 49737984 atggtctcgatctcctgacctcatgatccgtctgccttggcctcccaaagtgctaggattacaggcctgagccaccgcgcccagccT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18513784 35 + 99152023 aaggtctcgatctcctgacctcagg----------------------------------------------------tgCCTGGCCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45193951 87 - 121039945 ctggtctcgatctcctgacctcatgatccacccgcctcggcctcctgaagtgctgggattacaggcatgagccactgcgcccggccT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21072774 86 - 95678458 atggtc-cgatctcctgacctcatgatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagctaccatgcccagccT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21565528 86 + 96509753 atggtc-cgatctcctgacctcatgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagctaccatgcccggccT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20488872 84 - 90941950 atggtc-cgatctcctgacctcatgatctgcccac--tggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagctaccatgcccggcct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20482609 87 - 33263144 atggtctcgatctcctgaccttgtgatccgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggattataggcaagagctaccatgcccggccT i chlSab2.chr19 I 174 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 60915 73 - 112050 atagtctcgatctcctgaccttgtgatccg-ccacctcagcctcccaaagt-------------gcatgagtcaccgcacccagccT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908096 0 - 38964690 C a score=502603.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74832 157 + 478999 AGCATGGGACATTTTAAAGGCATTCATAATCCAACTAAACAGGACCACCTGCAAAACTA-GTGAAATGCCCAAAAACAAACATCTATAAATGCCCAATATTAAACCTCAAGGGTCTAAAGCAGTAGTATCCAAAGCAAGTATAACATACCTCCAGGAG s panTro4.chr22 21164539 145 - 49737984 AGCATGGGACATTTTAAAGGTATTCATGATCCAACTAAACTGGACCA---GCAAAACTA-GTGAAATGCCCAAAAACAAGCATCTATAAATGCTCAATATTAAACCTTAAGAGTCTAAAGCAGTAGTATCCAAAGCAAGTATAACATAT--------- i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18513819 155 + 99152023 AGCATGGGACATTTTAAAGGCACTCATAATCCAACTAAACTGGACCATCTGTAAAACTT-GTAAAATGCCCAAAAACAAACATCTATAAATACCCAATATTAAACCTCAAGAGTCTAAAGCAGTAGTACCCAAAGCA--TATAACATACCTCCAGGAg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194038 157 - 121039945 AGCATGGGACATTTTAAAGGCATTCATAATCCAACTAAACTGGACCACCTGCAAAACTA-GTGAAATGCCCAAAAACAAACATCTATAAATGCTCAATATTAAACCTCAAGGGTCTAAAGCGGTAGTATCCAAAGCAAGTATAACATACCTCCAGGAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21072860 157 - 95678458 AGCATAGGACATTTTAAAGGCATTCAAGATCCAACTAAACTGGACCATCTGCAAAACTA-GTGAAATACCCAAAAACAAGCATCTGTAAATGCCCAATATTAAACCTTAAGAGTCTAAAGCAGTAGTACACAAAGCAAATATAACATATCTCCAGGAg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21565614 157 + 96509753 AGCATAGGACATTTTAAAGGCATTCAAGATCCAACTAAACTGGACCATCTGCAAAACTA-GTGAAATACCCAAAAACAAGCATCTGTAAATGCCCAATATTAAACCTTAAGAGTCTAAAGCAGTAGTACACAAAGCAAATATAACATATCTCCAGGAg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20488956 157 - 90941950 agcaTAGGACATTTTAAAGGCATTCAAGATCCAACTAAACTGCACCATCTGCAAAACTA-GTGAAATACCCAAAAACAAGCATCTGTAAATGCCCAATATTAAACCTTAAGAGTCTGAAGCAGTAGTACACAAAGCAAATATAACATATCTCCAGGag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20482696 157 - 33263144 AGCATGAGACATTTTAAAGGCATTCAAGATCCAACTAAACTGGACCATCTGCAAAACTA-GTGAAATACCCAAACACGAGCATCCGTAAATGCCCAATACTAAACCTTAAGAGTCTAAAGCAGTAGCACACAAAGCAAATATAACATATCTCCAGGAg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 60988 157 - 112050 CACATGAACCAGTTTAAAGGCATTCATAATCCAACTAAACTGGGCCACCTGCAAAACTA-GTGAAATGCCTAAAAACAAGCATCTATAAATGCCCAATATTAAACCTTAAGAGTCTAAAGCATTAGCAGCCAAAGCAAGTATAACATACCTCTAGGAg i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15908096 154 - 38964690 AGCATGGCACACTTTATAGACCATCATAATCCAACTAGACTGGACCATTTACAGAACCAGGGGAAATGCCCCAAAATAATTATAAATAATGGCCCAACATTAAATCTTACAAGTCTAAAGcagagatatccaaagtaa----aatatacctcaggaag i canFam3.chr26 C 0 I 145 a score=739374.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 74989 301 + 478999 ATcgggcatggtggctcacacctggaatcccagcactttgggaggctgaggctggcggatcacttgagcccaggagttcaagaccagcctgaccaacatggtgaaaacccatctctaccaaagaa---------------tacaaaaattaaccaggcatggtggcagacacctgtaatcccaactgctcaagtggctgaggcacaagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgtagtgagccaagattacaccactgcacaccagtctgggtaacagagcaagactcttgtctcaaaaatatgt-----------------------------------------atatagat s panTro4.chr22 21164684 336 - 49737984 -----gcacggtggctcacacctgtaataccagcactttgggaggccaaggcaggcaattcacttgaagccaggagttccagatcagcctggccaacatggcaaaatcccgtctctactaaaaaa---------------tacaaaaattagccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactactcaagtggctgaggcgcaataatcacttcaacccaggaggcagaggttgcagtgagccaagatcgcaccactgcacaccagcctcggtaacagaaaaagactcttgtctcaaaaatatatacatattatacatacacgtatatatatgtta-tatatacacatatatat i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18513974 280 + 99152023 actgggcacggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaagcaggtagatcacttgaggccaggagttccagaccagcctggccaacatggcaaaatcccatctctactaaaaaa---------------tacaaaaattaaccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactgctcgagtggctgaggcacaagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgcagtaagccaagatcgcaccactgcacaccagcctgggtaatagagtgagactcTTGT-------------------------------------------------------------- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194195 324 - 121039945 ATTgggcacggtggctcacacctggaatcccagcactttgggaggccaaggcaggcggatcacttgagcccaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctaccaaagaa---------------tacaaaaactaaccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactgctcgagtggctgaggcacaagaatcacttgaactcaggaggcggaggttgcagtgagccaagatcacaccactgcacaccagtctgggtaacagagcaagactcttgtctcaaatatatatata------------------aaatatattattatatatacatatatat i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21073017 274 - 95678458 actgggcacggtggctcacacttgtaatcccagcattttgggaggccaaggcaggca----------------gagttccagaccagcctggccaacttggcaaaatcccatctctattaaaaaannnnnnnnnnnnnn--------------------------cactcacctgtaatcccaactactcaagtggctgaggcacaagaatcacttcaccccagcaggcagaggttgcagtgagccaaggtcgcaccactgcacaccagcctgggtaacggagaaaaactcttgtctcaaaaaaatat-----------------------------------------atatatat i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21565771 285 + 96509753 actgggcacggtggctcacacttgtaatcccagcattttgggaggccaaggcaggca----------------gagttccagaccagcctggccaacttggcaaaatcccatctctattaaaaaa---------------tacaaaaattagccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactactcaagtggctgaggcacaagaatcacttcaccccagcaggcagaggttgcagtgagccaaggtcgcaccactgcacaccagcctgggtaacggagaaaaactcttgtctcaaaaaaatat-----------------------------------------atatatat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20489113 285 - 90941950 actggacacggtggctcacacttgtaatcccagcattttgggaggccaaggcaggca----------------gagttccagaccagcctggccaacttggcaaaatcccatctctattaaaaaa---------------tacaaaaattagccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactactcaagtggctgaggcacaagaatcacttcaccccagcaggcggaggttgcagtgagccaaggtcgcaccactgcacaccagcctgggtaacggagaaagactcttgtctcaaaaatatat-----------------------------------------atatatat i papAnu2.chr10 C 0 I 173 s chlSab2.chr19 20482853 285 - 33263144 actgggcacggtggctcacacctgtaatcccagcattttgggaggccaaggcaggca----------------gagttccagatcagcctggccaacttggcaaaatcccgtctctattaaaaaa---------------tacaaaaattagccaggcatggtggcacacacctgtaatcccaactactcaagtggctgaggcacaagaatcacttcaccccagcaggcggaggttgcagtgagccaaggtcgcaccactgcacaccagcctgggtaacggagaaaggctcttgtctcaaaaatatat-----------------------------------------atatatac i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61145 299 - 112050 accaggcacgatggcttacaactataatcccagcactttgggaggccaatgcgggcagatcacttgaggccaggagttccagactagcctggctaacatggcaaaatcctgtatctactaaaaaa--------------atacaaaaattagccaggtatggtggcacacacctgtaatcccaactacttgagtggctgaggcacaaaaatcacatgaacccaggagatggaggttgcagtgagccaagattgcaccactgcacttcagcccgggtaacagagcaagactctagcctcaaaaaTATAT-----------------------------------------ATGCA--- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=4110.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75290 10 + 478999 catatattat s panTro4.chr22 21165020 10 - 49737984 tatatattat i panTro4.chr22 C 0 I 16 s nomLeu3.chr6 45194519 8 - 121039945 tatacata-- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21073291 10 - 95678458 tatatattat i rheMac3.chr10 C 0 N 0 s macFas5.chr10 21566056 10 + 96509753 tatatattat i macFas5.chr10 C 0 I 96 s papAnu2.chr10 20489571 10 - 90941950 catatattaa i papAnu2.chr10 I 173 C 0 s chlSab2.chr19 20483138 9 - 33263144 tatatatca- i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61444 3 - 112050 ----TTT--- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18514254 0 + 99152023 C e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=19044.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75300 19 + 478999 tatatatacatatatat-ta----- s panTro4.chr22 21165046 19 - 49737984 tgtatacacatatatat-ta----- i panTro4.chr22 I 16 C 0 s nomLeu3.chr6 45194527 20 - 121039945 tacacacacacatacatata----- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566162 19 + 96509753 tttatacacatatatat-ta----- i macFas5.chr10 I 96 I 14 s papAnu2.chr10 20489581 19 - 90941950 tatatacacatatatat-ta----- i papAnu2.chr10 C 0 I 14 s chlSab2.chr19 20483147 19 - 33263144 tatatacacatacatat-ta----- i chlSab2.chr19 C 0 I 154 s calJac3.chrUn_GL286438 61447 24 - 112050 TCTacacacacacacac-ggagaca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18514254 0 + 99152023 C e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=29692.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75319 34 + 478999 tacatatacacacacaca-catatacacatgcctg s panTro4.chr22 21165065 34 - 49737984 aatatatatacacacaca-catacatacataCACA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514254 34 + 99152023 AGTATATATATTcacaca-tacatacacacgcatg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194547 34 - 121039945 cacatgtgcacacacaca-catatacacatgtgca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566195 35 + 96509753 aatatatacacatatatattatatatacacaccca i macFas5.chr10 I 14 C 0 s papAnu2.chr10 20489614 35 - 90941950 aatatatacacatatatattatatatacacaccca i papAnu2.chr10 I 14 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61471 34 - 112050 cacacagacacacacagg-cgcacacacacacgca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20483166 154 - 33263144 I a score=91650.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75353 43 + 478999 ca--cac--acacacacctccaggagtacccaagaagccccagggta- s panTro4.chr22 21165099 45 - 49737984 CACGCAC--ACGCACACCTCCAGGAGTAACCAAGACACCCCAGGGTA- i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514288 43 + 99152023 ca--cac--acacaGACCTCCAGGAGTACCCAAGATGCCCCAGGGTA- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194581 43 - 121039945 ca--cac--acacacacCTCCAGGAGTACTCGAGAAGCCCCAGGGTA- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566230 43 + 96509753 ca--cac--acacacacctccaggagtaaccaagacgccccagggta- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20489649 45 - 90941950 ca--cacatacacacacctccaGGAGTAACCAAGACGCCCCagggta- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20483320 43 - 33263144 CA--CAT--ACACAcacctccaggagtaaccaagacgccccagggta- i chlSab2.chr19 I 154 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61505 44 - 112050 ca--cac--acacacacCTCCAGGAGTACCCAAGATGCCTCAAGGTAA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=358833.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75396 127 + 478999 aaaaaggaaaatatttgaactttatttttaattatcatccttgttaattttttgtttgtattt--taaagtccacaataatcagttactatatgtttattacttgtaaattaaatatctaaggattaag s panTro4.chr22 21165144 129 - 49737984 AAAAAGGAAAATATCTGAACTTTATTTTTAATTATCATCCTTGTTGATTTTTTGTTCGTATTTTATAAAGTCCACAATAATCAGTTACTATACATATATTATTTGTAAATCAAATATCTAAGGATTAAG i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514331 129 + 99152023 AAAAAGGAAAATATCTGAACTTTAACTTTAATTATCATCGTTGTTGACTTTTTGTTTGTATTTTATAAAATCTACAGTAATCAGTTACTATATGTCTATTATTTGTAAATGAAACATCTAAGGATTAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194624 123 - 121039945 AAAAAGGAAAATATCTGAACTTTATTTTTAATTATCATCCTTGTTAATTTTTTGTTTGTATTT--TAAAGTCCACAATGATCAGTTACTATATGTCTATTATTTGTTAATTAAA----TAAGGATTAAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21355095 129 - 95678458 AAAAAGGAAAATATCTGAACTTTATTTTTAATTATCAACCTTGTTAATTTTTTGTTTGTATTTTATAAAGTCCACAATAATCAGTTACTATACATATATTATTTGTAAATTAAATATCTAAGGATTAAG i rheMac3.chr10 N 0 C 0 s macFas5.chr10 21566273 129 + 96509753 aaaaaggaaaatatctgaactttatttttaattatcaaccttgttaattttttgtttgtattttataaagtccacaataatcagttactatacatatattatttgtaaattaaatatctaaggattaag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20489694 129 - 90941950 aaaaaggaaaatatctgaactttatttttaattatcaaccttgttaattttttgtttgtattttataaagtCCACAATAATCAGTaactatacatatattatttgtaaattaaatatcTAAGGATTAAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20483363 129 - 33263144 aaaaaggaaaatatctgaactttatttttaattatcaaccttgttaattttttgtttgtattttataaagtccacaataatcagttactatacatatattatttgtaaattaaatatctaaggattaag i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61549 127 - 112050 AAAAAAAAAAACAACTTAACTTCATTTTTAATTATCATCCTTGTTAATTTTTTGTTTGCATTTTATAAAGTTCACAATAATCAGTTACTAT--GTTTACTCTCTGCAAATTAAATATCTAAGGATGAAG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 302 e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=727913.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75523 274 + 478999 aactgatgctcaatattt-ttctTTTTCTCTTTTTTCAAAGCAACAACATGAAGTTGTATCA--A----TTTTTTTTCCTGACTTCATTCTTCCCATCCCATCAGttttttgttttttttttaaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggagtacagcggcggtattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactcctgacctcaa-atatcctcctgcctaagccaactacgtagctgggaccacaggaccacgtaccacacctgc s panTro4.chr22 21165273 269 - 49737984 AATTGATGCTCAATTTTT-TTCTTTTTCTCTTTTCTCAAAGCAACAACACGAAGTCCTATCA--AT---TTTTTTTTTCTGACTTCATTCTTCCCATCTCATCTGttt----ttttttttctaaagagat--ggtctcgctatgttgtccaggctagagtacagtggctatattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactcctggcctcaa-acattctcctgcctcagccaactaagtagctgggaccacagaaccatgtaccgcacctgc i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514460 267 + 99152023 AACTGATGCTCAATATTT-TTCTTTTTCTCTTTTTTCAAAGCAACAACATGAAGTTGTATCA--AT---TATTTTTTTCTGACTTCATTCTTCCCATCCCTTC---------AttttttttttaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggagcacagtggctatattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactcctggtctcaatatatcctcctgcctcagccaactacatggctgggaccacaggaccatgtaccgcacctgC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45194747 270 - 121039945 AACTGATGCTCAATATTT----TTTTTCTCTTTTTTCAAAGCAACAACATGAAGTTGTATCA--A----TTTTTTTTTCTGACTTCATTCTTCCCATCCCATCAGtttttt-gtttctttttaaagagacagggtctcattatgttgcccaggctggagtacagtggctgtattcataagcacaatcacactgaactttagccttgaactcctgacctcga-atatcctcctgcctcagccaactacgtagctgggaccacaggaccatgtgccacACCTGC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21355224 265 - 95678458 AATTGATGCTCAATTT------TTCTTCTCTTTTCTCAAAGCAACAACATGAAGTCGTATCA--TTTTCTTTTTTTTTCTGACTTCATTCTTCCCATCTCATCA--------ttttttttttaaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggaatacagtggctatattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactccttgcctcaa-acattctccggcctcagccaactaagtagctgggaccacaggaccatgtaccgcacctgc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566402 265 + 96509753 aattgatgctcaattt------ttCTTCTCTTTTCTCAAAGCAACAACATGAAGTCGTATCA--TTTTTTTTTTTTTTCTGACTTCATTCTTCCCATCTCATCA--------ttttttttttaaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggaatacagtggctatattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactccttgcctcaa-acattctccggcctcagccaactaagtagctgggaccacaggaccatgtaccgcacctgc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20489823 267 - 90941950 AATTGATGctcaattt------ttcttctcttttctcaaaGCAACAACATGAAgtcatatcattttttttttttttttctgacttcattCTTCCCatcccatca--------ttttttttttaaagagacaaggtctcactatgttgcccaggctggaatacagtggctatATTCATAAGCACAATCACAGTGAACTttagccttgaactccttgcctcaa-acattctccggcctcagccaactaagtagctgggaccacaggaccATGTACCGCACCTGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20483492 265 - 33263144 aattgatgctcaaTTT------TTCTTCTCTTTTCTCAAAGCAACAACATGAAGTCGTATCA--TTTTTTTTTTTTTTCTGACTTCACTCTTCCCATCCCATCA--------ttttttttttaaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggaatacagtggctatattcataagcacaatcacagtgaactttagccttgaactccttgcctcaa-acattctccggcctcagccaactaagtagctgggaccacaggaccatgtaccacacctgc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 61978 275 - 112050 aaTTGATGCTCAATTTTTTTTCTTTTTCTCTTTTTTCAAAGCGGCAACATAAAGCGGTAACA--A----TTTTTTTTCCTAACTTCATTCTTCCCATCCCATCAGttttgttttgcttttttaaagaaacagtgtctcactatgttgcccaggctggagtacagtgactatattcataagcacaatcacagtgaaccgtagccttgaattcttggcctcaa-aaatcctcctgcctcagccaaccaagtaactgggaccataggaccatgtactgaacctgc i calJac3.chrUn_GL286438 I 302 C 0 e canFam3.chr26 15908250 145 - 38964690 I a score=831413.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 75797 260 + 478999 ttaatgctcaaaagtttttggtgatggggtaagcaac--gaaagtttggagaccactgGTCTACACGACT-CATTGTCAC--TGAACTTTCATTTTTATCAGCTCCCTCCCAAGAGTTAAGCTATGGAAG-TAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAAAACTGTT-TCAAACTATTTTGAACTCC---CAACAAGCTAAAGATGACAAATCACtagcaag-aatatatggaattgaatactaatatgctgttgacgggaatttca s panTro4.chr22 21165542 259 - 49737984 ttaatgctcaaaattttttagtgatggggtAAGCAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTACACCACTCCCTTGTCAC--TGATCTTTCATTTTTATCAGCTCCCTCCGAAGAGTTAAGCTATGGAAT-TAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAG----AAAACTGTT-TCAAACTACTTTAAACTCC---CAACAAGCTAAAGATGACAAATCACTAGCAAG-AATATATGGAATTGAATActaatacgctgttgatgggaatttga i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514727 263 + 99152023 TTAatgctcaaaattttttggtgatggggtaagcaac--caaagtttggagaccattgGTCTACATTACT-CATTGTCGC--TGAACTTTCTTTTTTATCAGCTCCCTCCCAAGAGTTAAGCTATGGAAG-TAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAAAACTGTT-TCAAACTATTTTGAACTCCCAACAACAAGCTAAAGATGACAAATCACtagcaag-aatatatggaattgaatactaatatgttgttgatgggaatttca i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45195017 260 - 121039945 TTAatgctcaaaagtttttggtgatggggtaagcaac--caaagtttgaagaccactgGTCTACACTACT-GATTGTCAC--TGAACTTTCTTTTTTATCAGCTCCTTCCCAAGAGTTAAGCTATGGAAG-TAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAAAACTGTT-TCAAACTATTTTGAACTCC---CAACAAGCTAAAGATGACAAATCACtagcaag-aatatatggaattgaatactaatatgctgttgatgggaatttca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21355489 267 - 95678458 ttaatgctcaaaattttttagtgatggggtAAGCAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTACACCACT-CCCTTGCACTGTGAACTTTCATTTTTATCAGCTCTCTCCCAAAAGTTAAGCTATGGAAG-GAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAACGCTGTT-TCAAACTACTTTAAACTCCCAACAACAAGCTAAAGATGACAAATCACTAGCAAG-AATATATGAAATTGAATActaatatgctgttgatgggaatttcg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566667 267 + 96509753 ttaatgctcaaaattttttagtgatggggtAAGCAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTACACCACT-CCCTTGCACTGTGAACTTTCATTTTTATCAGCTCTCTCCCAAAAGTTAAGCTATGGAAG-GAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAACGCTGTT-TCAAACTACTTTAAACTCCCAACAACAAGCTAAAGATGACAAATCACTAGCAAG-AATATATGAAATTGAATActaatatgctgttgatgggaatttcg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490090 265 - 90941950 TTAATGCTCAAAATTTTTTAGTGATGGGGTAAGCAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTACACCACT-CCCTTGCAC--TGAACTTTCATTTTTATCAGCTCTCTCCCAAAAGTTAAGCTATGGAAG-GAAGTCctgatgctgaaaaagaaacagaagaaaagctgTT-TCAAACTACTTTAAACTCCCAACAACAAGCTACAGATGACAAATCACTAGCAAG-AATATATGAAATTGAATACTAATATGCTGTTGATGGGAATTTCG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20483757 265 - 33263144 ttaatgctcaaaattttttagtgatgggCTAAGCAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTATACCACT-CCCTTGCAC--TGAACTTTCATTTTTATCAGCTCTCTCCCAAAAGTTAAGCTATGGAAG-GAAGTCCTGATGCTGAAAAAGAAACAGAAGAAAAGCTGTT-TCAAATTACTTTAAACTCCCAACAACAAGCTAAAGATGACAAATCACtagcaag-aatatatggaattgaatactaatatgctgttgatgggaatttcg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62253 267 - 112050 ttaatgctcaaaattttttagtgatggggtAAGAAACCAAAAAGTTTGAAGACCACTGGTCTACCCTACTCCCTTGTCAC--TGAACTTTCATTTTTGTCCGCTCCCTCCCCAGAGTTAAGCTATGGAGG-TAAGTCCTGATGCTGAAAAGGAAACAGAAGAAAAGCTGTT-TCAAACTATTTTAAACTCCCAACAACAAGCTAAACATGAAAAATCACTAGCAAGAAATACATGGAATTGAATACTACTATGCTGTTAATGGGAATTTCA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15908395 242 - 38964690 ttaatgctaaaacttttttaccactgagatgatca----aaaattttagaaaccactAGCTTA----ATG-TATTATCAC--CGCACTCTCATTTTTACCGCCACTTCC-----AGTTAAACTGTAGAAGCTAAGACCTGATGCTGAAAAA--------AGGAAAACTATTCCCAAATTATTTTAAAGTCCCATCAACA----AAAAATAATAAATCACTAGCAAG-ACCATGCAGACCTGAACACTAATATGTTGTTTGTGGGACttttt i canFam3.chr26 I 145 I 732 a score=225488.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76057 94 + 478999 aatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccacatttaaaacacacataccctttgacctaataagccctt------t---ttttttttttttttt s panTro4.chr22 21165801 87 - 49737984 aatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccaaatttaaaacacacgtaccatttgacctaataatccc----------------acttttttttt i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18514990 94 + 99152023 aatagacaacctatctaaagggcatcttgagtatatccaaatttaaaacacacataccctttgacctaataTGCCttt------t---ttttttttttttttt i ponAbe2.chr15 C 0 I 313 s nomLeu3.chr6 45195277 97 - 121039945 aatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccaaatttaaaacacacatatcctttgacctaataagccttt------taaaaatttttatttattt i nomLeu3.chr6 C 0 I 1 s rheMac3.chr10 21355756 98 - 95678458 tatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccaaatttaaaacacacataccctttaacctaataaccccac--ttttt---ttttttttttttttt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21566934 96 + 96509753 tatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccaaatttaaaacacacataccctttaacctaataaccccac----ttt---ttttttttttttttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490355 100 - 90941950 TATAGACATCCTATCTAAAGGGCATCTTGAGTATAtccaaatttaaaacacacataccCTTTAACCTAAtaaccccacttttttt---ttttttttttttttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484022 94 - 33263144 tatagacatcctatctaaagggcatcttgagtatatccaaagttaaaacatacataccctgtaacctaataatcccac------t---ttttttttttttttt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62520 85 - 112050 AATAGACATTCTATCTATAGGGCACCTTGAGTATGTTCAGATTTAAAACACATATACCCTCTGATCCAATAAGCCCAC------t---tttttt--------- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I a score=368734.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76151 173 + 478999 tttttttt--AGAATgagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagtagcttaatctcggctcactgcagcctccgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcatcagcctt-ccaagtagct-ggaattatagaccct-cgccaccacaccagactaa-tttttgta-ttttagta s panTro4.chr22 21165888 174 - 49737984 ttcttttg--agactgagtctcactctgtcgcccaggctggagtgcagcagcttaatctcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcctcagcctt-ccaagtagct-ggaattacagaggcc-cgccaccacacccgactga-tttttgtatttttagta i panTro4.chr22 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45195375 178 - 121039945 tttttttg--agaatgagtctcactctcttgcccaggctggagtgcagtagcttaatctcagctcactgcagcctccgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcgtcagccttcccaagtagctgggaattacagaccccttgccaccacacccgactaattttttgaatttttagta i nomLeu3.chr6 I 1 M 1528 s rheMac3.chr10 21355854 174 - 95678458 tttttttg--agacggagtcttgctctgtcactcaggttggactgcagtggcataatctcggctcactgaaacctccgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcctcagcctt-ccaagtagct-agaattaaagatgcc-tgccgccacacccaactaa-tttttgtatttttagtt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567030 174 + 96509753 tttttttg--agactgagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtagcttaatctcggctcactgaaacgtctgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcctcagcctt-ccaagtagct-agaattaaagatgcc-tgccgccacacccaactaa-tttttgtatttttagtt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490455 176 - 90941950 tttttttggtagatggagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagcagcttaatctcggctcactgaaacctccgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcctcagcctt-ccaagtagct-ggaattaaagatgcc-tgccgccacacccaactaa-tttttgtatttttagtt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484116 174 - 33263144 tttttttg--agactgagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtagcttaatctcggctcactgaaacctccgcctcctgggttcaagtgattctctgtgcctcagcctt-ccaagtagct-ggaattaaagatgcc-tgccgccacatccaactaa-tttttgtatttttagta i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62605 174 - 112050 ttcttttg--agactgagtctcactctgttacccaggctggagtgcagtggcttgatcttacctcactgcaacctccatctcccaggctcaaatgattctccatacctcagtctt-ccaagtagct-ggaattacagacccc-caccaccacatccaactaa-tttttatatttttagta i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18515084 313 + 99152023 I e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I a score=192712.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76324 115 + 478999 gagatggggtttcaccattttggccaggctggtcttgaactgctgacctcaggtgatccacccacccgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccatgcc s panTro4.chr22 21166062 111 - 49737984 gagacggggttttaccatgttggccagcctggtcttgaactgctgacctcaggtgat----ccacccgccttggcctcccaaagtgctgggattacatgcatgagccaccacgcc i panTro4.chr22 C 0 M 417 s rheMac3.chr10 21356028 111 - 95678458 gagacggggtttcaccatgttggccggcctggtcttgaactgctgacctcaggtgat----ccacccgctctggcctcccaaaatgctggaattacatgcatgagccaccacacc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567204 111 + 96509753 gagacggggtttcaccatgttggccggcctggtcttgaactgctgacctcaggtgat----ccacccgctctggcctcccaaaatgctggaattacatgcatgagccaccacacc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490631 111 - 90941950 gagacggggtttcaccatgttggccggcctGGTCTTGAAcggctgacctcaggtgat----ccacccgccctggcctcccaaaatgctggaattacatgcatgagccaccacacc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484290 111 - 33263144 gagacggggtttcaccatgttggctggcctggtcttgaactgctgacctcaggtgac----ccacccgccctggcctcccaaaatgctggaattacatgcatgagccaccacacc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62779 111 - 112050 gagatggagtttcaccatgttagccaggctggtcttgaacacctgatctcaggtgat----ccgcccaccttggcctcccaacctgctggaattacaggcatgagccaccatgcc i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18515084 313 + 99152023 I e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45195553 1528 - 121039945 M a score=61865.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76439 49 + 478999 tggctaataaatccgcttttaagaatttatcctgggccaggcgcggtgg s rheMac3.chr10 21356139 49 - 95678458 tggctaataaacccacttttaagaatttatcctGGCccaggcgcagtgg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567315 49 + 96509753 tggctaataaacccacttttaagaatttatcctggcccaggcgcagtgg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490742 49 - 90941950 tggctaataaaCCCACTTTTAAGAATTCATCCtggcccaggcgcagtgg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484401 49 - 33263144 tggctaataaacccacttttaagaatttatcctggcccaggcgcagtgg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62890 49 - 112050 cagcTAATAAACCTACTCTTAAGAATTTATTCTGggccaggtgcagtgg i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18515084 313 + 99152023 I e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e panTro4.chr22 21166173 417 - 49737984 M e nomLeu3.chr6 45195553 1528 - 121039945 M a score=34466.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76488 19 + 478999 ctcaggcctgtaattctag s ponAbe2.chr15 18515397 19 + 99152023 ctcaggcctgtaattctag i ponAbe2.chr15 I 313 C 0 s rheMac3.chr10 21356188 19 - 95678458 ctcaggcctgtaatcccag i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567364 19 + 96509753 ctcaggcctgtaatcccag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490791 19 - 90941950 ctcaggcctgtaatcccag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484450 19 - 33263144 ctcaggcctgtaatcccag i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62939 19 - 112050 ctcatgcctgtaatcccag i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e panTro4.chr22 21166173 417 - 49737984 M e nomLeu3.chr6 45195553 1528 - 121039945 M a score=32563.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76507 13 + 478999 cactttgggaggc s panTro4.chr22 21166594 13 - 49737984 cactttgggaggc i panTro4.chr22 M 417 C 0 s ponAbe2.chr15 18515416 13 + 99152023 cactttgggaggc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21356207 13 - 95678458 aactttgggaggc i rheMac3.chr10 C 0 I 345 s macFas5.chr10 21567383 13 + 96509753 aactttgggaggc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490810 13 - 90941950 cactttgggaggc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484469 13 - 33263144 cactttgggaggc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62958 13 - 112050 cactttgggaggc i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45195553 1528 - 121039945 M a score=65920.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76520 55 + 478999 caagacggccggatcacgaggtcaggagatcgagaccagcctggccaacatggta s panTro4.chr22 21166607 55 - 49737984 ggaggcaggcggatcatgaggtcacgttatcgaggccatcctggccaacatggtg i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18515429 55 + 99152023 caagacgggtggaacacgaggtcaggagatcgagaccatcctggccaagatggag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567396 55 + 96509753 agaggcaggcagatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggccaacatggtg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490823 55 - 90941950 agaggcgggcagatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggccaacatggtg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484482 55 - 33263144 agaggcgggcagatcatgaggtcaggagatcgagatcatcctggccaacatggtg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62971 28 - 112050 cgaggcgggtggatcatgaggtcaggag--------------------------- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e rheMac3.chr10 21356220 345 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45195553 1528 - 121039945 M a score=105499.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76575 54 + 478999 aaaccccatctctact-gaaaatgcaaaaaattagctgggcgtggcggtgcacgg s panTro4.chr22 21166662 54 - 49737984 aaaccctgtctctact-aaaaatacaaaaaattagccaggcgtggtggcatgcgc i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18515484 54 + 99152023 aaaccccatctctact-gaaaatgcaaaaaaatagctgggcatggtggcacacag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45197081 54 - 121039945 aaaccccatctctact-gaaaatgcaaaaaattagccgggcatggcagcgcacgg i nomLeu3.chr6 M 1528 C 0 s macFas5.chr10 21567451 54 + 96509753 aaaccctatctctact-aaaaatacaaaaaattagccaggcgtggtggcgcgtgc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490878 54 - 90941950 aaacactatctctact-aaaaatacaaaaaattagccaggcgtggtggcgcgtgc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484537 54 - 33263144 aaaccctatctctact-aaaaatacaaaaaattagccaggcgtagtggcgcgtgc i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 62999 55 - 112050 aaatcctgtctctactaaaaaataaaaaatattagccaggcatggtggctcgcgc i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I e rheMac3.chr10 21356220 345 - 95678458 I a score=274895.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76629 96 + 478999 ctgtactcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggctgcagtgagccaagatcataccactgcactcca s panTro4.chr22 21166716 96 - 49737984 ctgtacgcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggcagaggctgcagtgagcctagatcgcaccaccgcactcca i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18515538 96 + 99152023 ctgtactcctagctactcaggaggctgaggaaggagaatcacttgaacctgagaggcagaggccgcagtgagccaagatcacaccactgcactcca i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45197135 96 - 121039945 ctgtactcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaatctgggaggcagaggctgcagtgagccaagatcacaccactgcactcca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21356565 96 - 95678458 ctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatggcgggaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactcca i rheMac3.chr10 I 345 C 0 s macFas5.chr10 21567505 96 + 96509753 ctgtatgcccagcttctcaggaggctaaggcaggaaaatcacttgaacctgggaggcagagactgcagtgggccaagatcacaccactccactcca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20490932 96 - 90941950 ctgtatgcccagcttctcaggaggctgaggcaggaaaatcacttgaacctgggaggcagaggctgcagtgggccaagatcacaccactccactcca i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20484591 96 - 33263144 ctgtacgcccagcttctcaggaggctgaggcaggaaaatcacttgaacctgggaggcagaggctgcagtgggccaagatcacaccactccactcca i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 63054 96 - 112050 ctgtagtcccaagtacttaggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacttggaaggcagaggctgcagggagccaagatcatgccactgcactcca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15908637 732 - 38964690 I a score=115940.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76725 40 + 478999 gcctgggtgacagagtga--ctctgtctcaaaaaaaaaaaaa-- s panTro4.chr22 21166812 42 - 49737984 gcctgggcgacaaagtgaggctctgtctcaaaaaaaaaaaaa-- i panTro4.chr22 C 0 I 6 s ponAbe2.chr15 18515634 42 + 99152023 gcctgggtgacagagtgagactctgtctcaaaaaaaacgaaa-- i ponAbe2.chr15 C 0 I 3 s nomLeu3.chr6 45197231 42 - 121039945 gcctgggcgacagagtgagactctgtctcaaaaaaagaaaaa-- i nomLeu3.chr6 C 0 I 2 s rheMac3.chr10 21356661 42 - 95678458 gcctgggcaacagagtgagaccctttctcaaaaaaaaaaaaa-- i rheMac3.chr10 C 0 I 3 s macFas5.chr10 21567601 42 + 96509753 gcctgggcaacagagtgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaa-- i macFas5.chr10 C 0 I 10 s papAnu2.chr10 20491028 42 - 90941950 gcctgggcaacagggtgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaa-- i papAnu2.chr10 C 0 I 4 s chlSab2.chr19 20484687 42 - 33263144 gcctgggcaacagagtaagacactgtctcaaaaaaaaaaaaa-- i chlSab2.chr19 C 0 I 8 s calJac3.chrUn_GL286438 63150 42 - 112050 gcctgggctacggagcaagactctgtttcaaaaaaaaaaaaa-- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 8 s canFam3.chr26 15909369 40 - 38964690 gcctatgtctctgcct----ctctgtctctcatgaatgaaaaaa i canFam3.chr26 I 732 C 0 a score=649919.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 76765 282 + 478999 ttatcctaaggaaataata--------ggacaatt-caatgc----------ccaaacaagttcatcacagtactactttaagagaaaaattggcaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgatgcatccatattatagaacactaaatactcattTACTCATTGAGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTGTTCTTTTTTAAGGTATTTCAATAGGT-ATGCATAAGAAAAAAA-ATGAAAACACCAAACATCACATCCAGATGGGATTACAGGTTATCTCTACTTTTTT s panTro4.chr22 21166860 290 - 49737984 ttatcctaaggaaataataaaataatagaacaatt-caatgcaattcaatgtccaaacgagttcatcacagtactgctttaagagaaaaattgacaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgatgcatccatattata-aacactaaatgctcatt--------aaGGGAATATCAATTTTACAGGGAAAGTTGTTCTTTTTAAAATTATTTCAATAGAT-ATGTATAAGAAAAAAA--CAAAAATACCAAACATTACATCCAGATGGGATTACAGGTCATCTCTACTTTTTT i panTro4.chr22 I 6 C 0 s ponAbe2.chr15 18515679 281 + 99152023 ttatcctaaggaaataata--------ggacaatt-caatgc----------ccaaatgagttcatcacagtactactttaagagaaaaattggcaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgacgcatccttattatagaacactaAATACTCATTTACTCATTAAGCGAATATCAATTTTACATTGAAAGTTGTTCTTTTTTTGAGTATTTCAATAGGT-ATGTATAAGAAAAAAA--TAAAAACACCAAACCTCACATCCAGATGGGATTACAGGTAATCTTTACTTaaaa i ponAbe2.chr15 I 3 C 0 s nomLeu3.chr6 45197275 277 - 121039945 ttatcctaaggaaataata--------ggacaatt-caatgc----------ccaaacgagttcatcacagtactactttaagagaaaaactggcaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgatgcatccatactatagaacactaAATCCTCATTTACTCATTAAGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTGTTCTT-----AAGTATTTCAATAGGT-ATGTATAAGAAAAAAA-ATGAAAACACCAAACATCACATCCAGATGGGATTACAGGTCATCTCTACATTTTT i nomLeu3.chr6 I 2 C 0 s rheMac3.chr10 21356706 270 - 95678458 ttttcctaaggaaataatg--------ggacaatt-caatgt----------ccaaacaagttcatcacagtattgttttaagagaaaaactgacaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgacacatccatattata-aaaactacatgttcatt--------aaGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTGTTCTTT----AATTATTTCAATAGGT-ATGTATAACAAAAAAAAATAAAAATACCAAACATTACATCCAGATGGGATTACAGGTCATCTCTACTTTTTT i rheMac3.chr10 I 3 C 0 s macFas5.chr10 21567653 270 + 96509753 ttatcctaaggaaataata--------ggacaatt-caatgt----------ccaaacaagttcatcacagtattgttttaagagaaaaactgacaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgacacatccatattata-aaaactacatgttcatt--------aaGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTGTTCTTT----AATTATTTCAATAGGT-ATGTATAACAAAAAAAAATAAAAATACCAAACATTACATCCAGATGGGATTACAGGTCATCTCTACTTTTTT i macFas5.chr10 I 10 C 0 s papAnu2.chr10 20491074 270 - 90941950 ttatcctaaggaaataata--------gGACAATT-CAATGT----------CCAAACAAGTTCATCACAGTATTGTTTTAAGAGAAAAACTGACAATATCCATTAACAACACAGAACTGCTATAAACTATGACGCATCCATATTATA-AAAACTACATGTTCATT--------AAGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTgttcttt----aattatttcaataggt-atgtataacaaataaaaataaaaataccaaacatTACATccagatgggattacaggtaatctctactttttt i papAnu2.chr10 I 4 C 0 s chlSab2.chr19 20484737 267 - 33263144 ttatcctaaggaaataata--------ggacaatt-caatgt----------ccaaacaagttcatcacagtattgctttaagagaaaaactgacaatatccattaacaacacagaactgctataaactatgacgcatccataTTGTA-AAAACTACATGTTCATT--------AAGGGAATATCAATTTTACATGGAAAGTTGTTCTTT----AATTATTTCAACAGGT-ATGTTTAACA---AAAAATAAAAATACCAAACATTACATCCAGATGGGATTACAGGTCATCTCTACTTTTTT i chlSab2.chr19 I 8 C 0 s canFam3.chr26 15909409 247 - 38964690 -----------------ta--------aaatctttaaaaaGT----------CCAAAGGAGTTCAGGACAGCACTGTTTTAAGAGAAAAATTGAAAATGTCAATTAATAG---AGAATTGTTGTAAATT---ACGTATCCACATCAC--AACACTAAATAACCATT--------AACGGTACATCAATTTGACATGGAAAGTTGTTCTTTTTG-AAGTATTT-GGTAGATAATATATAAGAAAAAAG---GATAATACCAAAAATCACATCTAAGTAGGACCATGCGTTATCTCTATTCTGCT i canFam3.chr26 C 0 I 268 e calJac3.chrUn_GL286438 63192 8 - 112050 I a score=698494.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77047 310 + 478999 TAAAAAAGAAA------------------AACATTAAAACTGTTCTGggccagatgcattggctcacgcctgtaatcctagcactttaggaggccaaggcaggtgaatcacctgaggtcaggagttagaaaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggtatggtggtgggtacctgt-aatcccagctactcgggaggctgaggcagcagaattgctggaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagaaaacgccactgcactccagcctgggtgacacaatgagactccatct s panTro4.chr22 21167150 306 - 49737984 TTTT---TAAA------------------AACACTAAAACTGTTCTGggccaggtgcagtggctcacgcctgtaatcccaccactttgggaggccaaggcaggcggatcacctgaggtcaggagttcgaaaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcaggtacctgt-aatcccaactactcaggaggctaaggcagcagaattgctagaacc-aggaggctgaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcattccagcctgagtgacagagcgagacgccatct i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18515960 328 + 99152023 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaCAACACTAAAACTGTTCTGggcaaggtgcagtggctcacgcctgtaatcctagcactataggaggccaaggcaggtggatcacctgaggtaaggagttagaaaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccgagtgtggtcgcgggtacctgt-aatcccagctactcgggaggctgaggcggcagaattgctggaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagatcacgccactgcactccagcctgggcgacacagtgagactccgtct i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45197552 311 - 121039945 AAAAAAAGAAA------------------AACATTAAAACTGTTCTGggccaggtgcattggctcacgcctgtaatcctagcactttaggaggccaaggcaggtggatcacctgaggtcaggagttagaaaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtccctactaaaaatacaaaaattagccgggtgtgatggcgggtacctgtaaatcccagctactcaggaggctgaggcagcagaattgctggaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagatcacgccactgcactacagcctgggcgacacagtgagactccatct i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21356976 305 - 95678458 TT-----TAAA------------------AACACTAAAACTGTTCTGggccaggcacagtggctcacgcctgtaatcccaccactttgggaggccaaggcaggccgatcacctgaggtcagaagttggaaatcagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgggtacctgt-aatcccagctactcgggaggcggaggcagcagaattgctggaacccaggaggctgaggttacagtgagctgagatcatgtcactgcattccagcctgggtgacagagcaagacttcgtct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21567923 305 + 96509753 TT-----TAAA------------------AACACTAAAACTGTTCTGggccaggcacagtggctcacgcctgtaatcccaccactttgggaggccaaggcaggccgatcacctgaggtcagaagttggaaatcagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgggtacctgt-aatcccaactactcgggaggcggaggcagcagaattgctggaacccaggaggttgaggttacagtgagctgagatcatgtcactgcattccagcctgggtgacagagcgagacttcgtct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20491344 305 - 90941950 tt-----ttaa------------------aacactaaaactgttctgggccaggcgcagtggctcacgcctgtaatcccaccactttgggaggccaaggcaggcggatcacctgaggtcagaagttggaaatcagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgggtacctgt-aatcccagctacttgggaggcggaggcagcagaattgctggaacccaggaggctgaggttacagtgagctgagatcatgccactgcattccagcctgggtgacagagcgagacttcatct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20485004 305 - 33263144 TT-----TAAA------------------AACACTAAAACTGTTCTGggccaggcacagtggctcacgcctgtaatcccaccactttgggaggccaaggcaggcggatcacctgaggtcagaagttggaaatcagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgggtacctgt-aatcccagctactcgggaggcggaggcagcagaattgctggaacccaggaggctgaggttacagtgagctgagatcatgccactgcattccagcctgggtgacagagcaagacttcgtct i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15909656 268 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 63192 8 - 112050 I a score=18155.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77357 8 + 478999 aaaaaaaa s panTro4.chr22 21167456 8 - 49737984 aaaaaaaa i panTro4.chr22 C 0 I 10 s ponAbe2.chr15 18516288 8 + 99152023 gaaaaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45197863 7 - 121039945 aaaaaaa- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21357281 7 - 95678458 -aaaaaaa i rheMac3.chr10 C 0 I 8 s macFas5.chr10 21568228 6 + 96509753 --aaaaaa i macFas5.chr10 C 0 I 8 s papAnu2.chr10 20491649 8 - 90941950 aaaaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 I 8 s chlSab2.chr19 20485309 8 - 33263144 aaaaaaaa i chlSab2.chr19 C 0 I 8 s canFam3.chr26 15909924 8 - 38964690 aaaaaaaa i canFam3.chr26 I 268 C 0 e calJac3.chrUn_GL286438 63192 8 - 112050 I a score=1172810.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77365 372 + 478999 GTTCTGTAGCTTTCATAATCAGAAAT---AATTTCACTTTGAAATTT--AAAATGAGATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTGTATCACTTCTAAAACTC-TTTGTAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTGGA-TCAGTCTAAATACTTAATCTAATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGCATATAATAAACAACAA-------------CCCTGTTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATATACTTATAACTTCCTTATATTCTGCCAGATTATAAATCTATGAATAATTCTGAAAATTATTCAGAAATTTCTAT--CTCTCTTCTGCAACTAAGTTACAAAA-- s panTro4.chr22 21167474 369 - 49737984 GTTCCGTAGCTTTCATAACCAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT--AAAATAAGATTAAGTTAAAACTCCAAATTACTGTCCGATATCACTTCCAAAACTC-TTTATAAACACTCTGCCTTCCCATGTCATTTGTGGAATCAGTCTAAACAATTAA----ATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGCATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTATAACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATATACTTATAATTTCCTTATATTTTGCCAGATTATAAATCTATGAATAATTCTGAAAACTA--AATAAATTTATAT--TTCTCTTCTGCAACTAAGTTATAAAA-- i panTro4.chr22 I 10 C 0 s ponAbe2.chr15 18516296 368 + 99152023 GTTCTGTAGCTTTCATAATTAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT--AAAATGAGATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTGTATCACTTCCAAAA--C-TTTATAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTGGA-TCAGTCTAAATACTTAATTAAATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGCATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATATACTTATAATTTCCTTATATTTTGCCAGATTATAAATCTATGAATAATTCTGAAAACTA--AATAAATTTCTAT--CTCTCTTCTGCAACTAAGTTACAAAA-- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45197870 372 - 121039945 TTTCTGTAGCTTTCATAATCAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT--AAAATGAGATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTGTATCACTTCCAAAACTC-CTTGTAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTGGA-TCAGTCTAAATACTTAATCTAATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGCATATAATAAATAACAA-------------TCCCATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGCCATGATTTATCAATATACTTATAACTTCCTTATATTTTGCCAGATTATAAATCTATGAATAATTCTGAAAATTATTCAGAAATTTCTAT--CTCTCTTCTGCAACTAAGTTACAAAA-- i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21357296 366 - 95678458 GTTCTGTAGCTTTCATAA-CAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT---AAATGATATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTATATCACTTCCAAAACTCTTTTATAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTAGAATCAGTCTAAACAATTAA----ATATTTGGTTTATCTCATAGAAAAATGATAGGCATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATACACTTCTAATTTCTTTATATTTTGCCAGAGTATAAATTTATGAATAATTCTGAAAACTA--AATAAATTTCTAT--TTCTCTTCCGCAACTAAGTTACAAAA-- i rheMac3.chr10 I 8 C 0 s macFas5.chr10 21568242 366 + 96509753 GTTCTGTAGCTTTCATAA-CAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT---AAATGATATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTATATCACTTCCAAAACTCTTTTATAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTAGAATCAGTCTAAACAATTAA----ATATTTGGTTTATCTCATAGAAAAATGATAGGCATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATACACTTCTAATTTCTTTATATTTTGCCAGAGTATAAATTTATGAATAATTCTGAAAACTA--AATAAATTTCTAT--TTCTCTTCCGCAACTAAGTTACAAAA-- i macFas5.chr10 I 8 C 0 s papAnu2.chr10 20491665 366 - 90941950 gttctgtagCTTTCATaa-cagaaat---aatttcattttgaaattt---aaatgataTTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTATATCACTTCCAAAACTCTTTTATAAACACTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTAGAATCAGTCTAAACAATTAA----ATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGCATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATACActtctaatttctttgtattttgccAGAGTATAAATTTATGAATAATtctgaaaacta--aataaatttctat--ttctcttccgCAACTAAGTTACAAAA-- i papAnu2.chr10 I 8 C 0 s chlSab2.chr19 20485325 366 - 33263144 GTTCTGTAGCTTTCATAA-CAGAAAT---AATTTCATTTTGAAATTT---AAATGATATTAAGTTAAAACTCCAAATTATTGTCCTATATCACTTCCAAAACTCTTTTATAAACGCTCTGTCTTCCCATGTCATTTGTAGAATCAGTCTAAACAATTAC----ATATTTGGTTTATCTCATGGAAAAATGATAGGAATAGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCATCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTATGTCATGATTTATCAATACACTTCTAATTTCTTTATATTTTGCCAGAGTATAAATTTATGAATAATTCTGAAAACTA--AATAAATTTATAT--TTCTCTTCCGCAACTAAGTTACAAAA-- i chlSab2.chr19 I 8 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 63200 371 - 112050 GTTCTATAGCTTTCATAATCAGATAG---AGTTTCATTTTGaaatttaaaaaatgagattaagttaaaattttaaattattgttttatatCCCTTCTAAAACTT-GTTATAAACA--GTGTCTTCTCGTGTCATTTGTAGAATAAATCTAAATACTTAATTACATATTTGGTTTATCTCATGTAAAAATGATAGGCATCGAATAAATAACAA-------------CCCTATTTCAAGTTA--ACCACCTTGTCTTTATACCAATTCTTGCCAGTTACGTCATGATTTATCAATATACTTATAATTTCCTTACGCTTTTCCAGATTATAAATCTATGAATAATTCTGAAAACAA--AACAAGTTTCTAT--TCCTTTTCTGCAACTAAGTTACAAAA-- i calJac3.chrUn_GL286438 I 8 C 0 s canFam3.chr26 15909932 381 - 38964690 ggtttataaaaaaaaaaA--AGAAATAACAATTTCATTTTGAAATTA--AAAATCAGACTAAGTTAAAATTCTTTCTTATTGCCCTGTAGTACTTCAGGAACTTCTTTATAAACACTACTTTGCCCCATGTGATTTATGGAGTCAGTCTACATAATTTA----CAATTAGATTTATCTTCTAGAGAAATGATAGGTATAGAACAAAAAAAAAAAAAAACAATTACCTTAATTTTAAATTA--GCCATTTTATTTTTATACCAATTCTTGCCAAATATGTTAGGATTTATCAATATACCAATAA-TTCCTTATAGTTTGCCAGCTTATCA----ATGAATAATTTAAAGAACTA--AATGAGTTTATATAGTTCTCTTCTGGAACTAAGCTCCATAAAG i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=290467.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77737 139 + 478999 GTATTaactacttcggga---ggctgaggcagggagaatcacttg-aacctgggaggcggagg-ttgcagtgaggcgagatcatgccattgcactccagtctgggtgacagag-------caagactctgtctc----aaaaaaTATATATATAT- s panTro4.chr22 21167843 139 - 49737984 GTATTAACGACTTGggga---ggctgaggcagggagaatcacttg-aaccccggaggcggagg-ttacagtgagccgagatcgcgccattgcactccagcctgggcaacagag-------cgagactctgtctc----aaaaaaaaaaaaaaaaa- i panTro4.chr22 C 0 I 4 s ponAbe2.chr15 18516664 138 + 99152023 GTATTaactacttcggga---ggctgaggcagggagaatcgcttg-aacctgggaggcggagg-ttgcagtgaggcgagatcatgccattgcactccagcctgggcgatagag-------caagactctgtctc----aaaaaaaaaaaaaaaa-- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45198242 139 - 121039945 GTATTaactacttcggca---ggctgaggcagggagaatcacttg-aacctgggaggcagagg-ttgcagtgaggcgagatcatgccattgcactccagcctgggtgatagag-------caagactctgtatc----aaaaaaaaaaaaaaata- i nomLeu3.chr6 C 0 I 19 s rheMac3.chr10 21357662 143 - 95678458 GTATTAACGACTtcggga---ggctgagggagggagtatcgcttg-aacccaggaggcggaag-ttacagtgagccgagactgcaccattgcactccagcctgggcaacagag-------tgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaagaa- i rheMac3.chr10 C 0 I 10 s macFas5.chr10 21568608 142 + 96509753 GTATTAACGACTtcggga---ggctgagggagggagtatcgcttg-aacccaggaggcggaag-ttacagtgagccgagactgcgccattgcactccagcctgggcaacagag-------tgagactctgtctc-aaaaaaaaaaaaagaaagaa- i macFas5.chr10 C 0 I 10 s papAnu2.chr10 20492031 140 - 90941950 GTATTAAcgacttcggga---ggctgaggcagggagtatcgcttg-aacccaggaggcagagg-ttacagtgagccgagactgcaccattgcactccagcctgggcaacagag-------cgagactctgtctc---aaaaaaaaaaaaaaaaaa- i papAnu2.chr10 C 0 I 10 s chlSab2.chr19 20485691 140 - 33263144 GTATTAACGACTtcggga---ggctgaggcagggagtatcacttg-aacccaggaggcggaggtttacagtgagccgagactgcgccattgcactccagcctgggcaacagag-------cgagactctgtctc----aaaaaaaaaaaaaagaa- i chlSab2.chr19 C 0 I 10 s canFam3.chr26 15910313 134 - 38964690 GCATTAGCTACTGGGGTgcctggctggctcagtcagtaaagcatgcaactcttgatctccagg-ttg--------tgagttcaagcc--------ccacattaggtg-tagagattacttcaaaataaaatctt----aaaagaaaAAAATTAAAA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e calJac3.chrUn_GL286438 63571 0 - 112050 C a score=311811.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77876 106 + 478999 GTATTAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATAAC-------AGAATCATTCTGAATATCTATAGTTATCAG s panTro4.chr22 21167986 102 - 49737984 GTATTAACTAATAAA----TTAGATTTCGACCCCAGGTAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTATCATCTG---TCATAAC-------AGAATCATTCTGAATATCCGTAGTTATCAG i panTro4.chr22 I 4 I 1 s ponAbe2.chr15 18516802 113 + 99152023 GTATTAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATAACAGAATCAAGAATCATTCTGAATATCTATAATTATCAG i ponAbe2.chr15 C 0 I 1 s nomLeu3.chr6 45198400 106 - 121039945 atataAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCTAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATAAC-------AGAATCATTCTGAATATCTATAGTTATCAG i nomLeu3.chr6 I 19 C 0 s rheMac3.chr10 21357815 106 - 95678458 GTCTTAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATACC-------AGAATCATTCTGAGTATCTGTAGTTATCAG i rheMac3.chr10 I 10 I 1 s macFas5.chr10 21568760 106 + 96509753 GTCTTAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATACC-------AGAATCATTCTGAGTATCTGTAGTTATCAG i macFas5.chr10 I 10 I 1 s papAnu2.chr10 20492181 106 - 90941950 gtcttaactACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATACC-------AGAATCATTCTGAGTATCTGTAGTTATCAG i papAnu2.chr10 I 10 I 4 s chlSab2.chr19 20485841 106 - 33263144 GTCTTAACTACTAAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAA-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCATCTG---TCATACC-------GAAATCATTCTGAGTATCTGTAGTTATCAG i chlSab2.chr19 I 10 I 1 s calJac3.chrUn_GL286438 63571 103 - 112050 GTATTAACTACCGAAGAAATTAGATTTAGACCCCAGATAG-------------------GTGAAATCAGAAAAGCTTGCTACCAACTG---TCATAAC-------AGAATCATTCTGAATAT---GAGTTATCAG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 1 s canFam3.chr26 15910447 121 - 38964690 GCATTAGCTACTGAAGAAG-TAAACTCAGAACCCAGAGAATAATCATTCTAAGTACTGTGTGAAGACACAAA---TCGGCACAAAACAGATTCAGGCC-------TGGACAAATCCAAGT---TGGGGTTTTCAA i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=56806.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 77982 20 + 478999 ---------ATCAAGACAATACCTGTGTG s panTro4.chr22 21168089 20 - 49737984 ---------ATCAAGACAATACCTCTGTG i panTro4.chr22 I 1 C 0 s ponAbe2.chr15 18516916 20 + 99152023 ---------ATCAAGACAATACCTGTGTG i ponAbe2.chr15 I 1 C 0 s nomLeu3.chr6 45198506 20 - 121039945 ---------ATCAAGACAACACCTGTGTG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21357922 20 - 95678458 ---------ATCAAGACAATACCTCTGTG i rheMac3.chr10 I 1 I 3 s macFas5.chr10 21568867 20 + 96509753 ---------ATCAAGACAATACCTCTGTG i macFas5.chr10 I 1 C 0 s chlSab2.chr19 20485948 20 - 33263144 ---------ATCAAGACAATACCTCTGTG i chlSab2.chr19 I 1 I 3 s calJac3.chrUn_GL286438 63675 20 - 112050 ---------ATCAAAACAATATCTCTGTG i calJac3.chrUn_GL286438 I 1 C 0 s canFam3.chr26 15910568 29 - 38964690 GTAGTGAGCACCAAGACAATACCTCTGTA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 20492287 4 - 90941950 I a score=232310.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78002 288 + 478999 GTTAACAAGTACTCCACACTCCATCTTAAGGGAAAAGAGTACTTAAGAAGATTATTATAG-------------------------------------------------------------------------------------CATAAG----------------------------------------------------TTTATGTG------------------------------------------------------------CTTTGTTCATTAATTCAACAATTTAGAACAAAGCTATGAGGTATTTCACCGCTAACAG-AATAGCTTTAAGGTAACCCATCTTCACAATTTTCTCTTTGTTTTCATTTGTTTCATGCCTTATTATTTTATAGACAGTCTTTCTATCGGCATTGCACAAGTACTATGTCCCTAAACAACTACGACCAAGTTTTATCACGACCCAAAAGAAAAAATA s panTro4.chr22 21168109 286 - 49737984 GTTAA--AGTACTCCATACTCCATGTTAAGGGAAAAGAGTACTTAAGAATATTATTACAG-------------------------------------------------------------------------------------CATAAG----------------------------------------------------TTCATGTG------------------------------------------------------------CTTTGTTCATTAAATCAACAGTTCAGAACATAGCTATGAGGTATTTCACCACTAACAG-AATAGCTTTAAGGTAACCCATCTTCACAATTTTCTTTTTGTTTTCGTTTGTTTCATGCCTTACTATTTTATAGACAGTCATTCTATCCACATTGCCCAAGTACTATGTCCCCAAACAACGACAACAAAGTTTTATCAAAACCCAAAAGAAAAAACA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18516936 288 + 99152023 GTTACCAAGTACTCCACACTCCATATTAAGGGAAAAGAGTACTTAAAAAGATTATTATAG-------------------------------------------------------------------------------------CATAAG----------------------------------------------------TTTATGTG------------------------------------------------------------CTTTGTTCATTAATTCAACAATTTAGAACAAAGCTATAAGGTATTTCACTGCTAACAG-AATAGCTTTAAGGTAACCCATCTTCACAATTTTCTCTTTGTTTTCATTTGTTTCATGCCTTACTATTTTATAGACAGTCATTCTATCTGCATTGCACAAGTACTCTGTCCCTAAACAACCATGACAAAGTTTTATCACAACCCAAAAGAAAAAATA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45198526 276 - 121039945 GTTAACAAGTGCTCCACACTCCATCTTAAGGGAAAAG----------AAGATTATTATAG-------------------------------------------------------------------------------------CATAAG----------------------------------------------------TTTATGTG------------------------------------------------------------CTTTGTTCATTAAATCAACAATTTAGAACAAAGCTATGAGGCATTTCACCGCTAACAG-AGCAGCTTTAAGGTAACCCATCTTCACAATTTTCTC--TGTTTTCATTTGTTTCATGCCTTACTATTTTATAGACGGTCATTCTATCCACATTGCGCAAGTACTATGTCCCTAAACAACTACGACAAAGTTTTATCACAACCCAAAAGAAAAAATA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 63695 282 - 112050 GTTACCAAGCACTCCATACTCAACCTTAAGGGAAAAGGATACTTCAGAATATTATTATAG-------------------------------------------------------------------------------------CATAAG----------------------------------------------------CTTATGTG------------------------------------------------------------CTTC-TTCATTTAATCAACAATTTAGAACTAA-CTATGAGGTATCTCACCACTAACAG-AATAGCTTTAAGGAAACCCATCTTGGCAGTTTTCTTCTTTTTTTCATTTGTTTCATACC----TGTCTTATAGTCAGTCATTCTACCCACACTGCACAAGCACTATGTACCTAAACAACTGCAACAAAGTTTTATCACAACCCAACAGAAAAAACA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15910597 464 - 38964690 GCTACCAAGTAGTCCAT--------TTAAGGGAAAAAAGTGCTTAAGAATATTAGCATATTTATGTCTTGCTgggatgcctgggtggttcagcgattgagcatcttcggctcaggtcgtgatcccagagtcctgggatcgagtcccacaaggggctcccctcagggagtctgctttctccctctgcctgtgtctctgcctctctctgtgtgtctctcataaataaataaattaaatattttttaaaaaGTTAAAAAAAAATTATCTCTTACCTTGGTTCATCAAATCAACAATTTATAACAGAGCAATGAGGTATTTTACCCTTAACAGAAATAACTTTAATTTAACCCAACTTCACAATTTCCTTGTAGTTT---TTCGTTTTATACCTTACTATCTTA------GTCATCCTAACTACAAAGCCCAGATATCATATCCCTAATCAATTACTTCAAAGTTTT---ACAACGCA--AGAAAAAATA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20492287 4 - 90941950 I e macFas5.chr10 21568887 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I a score=123660.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78290 159 + 478999 ACTTTCTAggccaggt----------gcagtggctcatgtctataatcccagcactttgggagaccaaggc---aggactac--tcaagcccaggagttcaagaccagcctgggcaatgtagcaaaaccctgtctctacaaaaaatGAAAATAATAATTTTTAAAAAGaaaaaa s panTro4.chr22 21168395 164 - 49737984 ACCTTTTAggccaggc----------acagtggctcatgtctacaatcccagcactttgggaggccaaagcaggaggactacctttgagcccaggagttcaagaccagcctgggcaacgtagcaaaaccctgtctctacaaaaaatgaaaattataatttttaaaaagaaaaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18517224 161 + 99152023 ACCTTTTAggccgggc----------gcagtggctcatgtctataatccaagcactttggaagaccaaggcaggaggactac--tcaagcccaggagttcaagaccagcctgggcaatgtagcaaaaccctgtctctacaaaaaatGAAAATAATAATTTTTAAAAA-Caaaag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45198802 162 - 121039945 ACCTTTTAggacaggt----------gcagtggctcatgtctataatcctagcactttgggagaccaaggcagtaggactac--tcaagcccaggagttcaagaccagcctgggcaatgtagcaaaaccttgtctctacaaaaaatGAAAATAAGAATTTTTAAAAAGaaaaca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 63977 172 - 112050 ACCTTTTAGGCCAGCCAACCTTATAGAcagtggctcatgtctataatcccagcactttgggaggccgaggcaggaggactac--ttgagcccaggagttcaaaaccagcgtgggcaaagtagcaaaaacccgtctctacaaaaaatgaaaaTAATAATTTTTATAAAGaaaaaa i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15911061 0 - 38964690 C e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20492287 4 - 90941950 I e macFas5.chr10 21568887 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I a score=43001.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78449 49 + 478999 tacattttacacggcaaccaagtatacatacataaacatatcttttaaa s panTro4.chr22 21168559 49 - 49737984 tacattttacacggcaaccaagtatacatacataaaaatatcttttaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18517385 49 + 99152023 tacattttacacagcaaccaaatatatacacataaacctatcttttaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45198964 49 - 121039945 tacattttacacggcaaccaagtatacatacataaacatatcttttaaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64149 49 - 112050 tacattttacactgcaaccaagtatacacacacaaacatatcttttaca i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911061 35 - 38964690 TATATTTTATGTTATAACCCAGT------ACATAAGCATAT-------- i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20492287 4 - 90941950 I e macFas5.chr10 21568887 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I a score=11295.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78498 21 + 478999 aagaaagaaaagtttcccaaa s panTro4.chr22 21168608 20 - 49737984 aag-aacaaaagtttcccaaa i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18517434 21 + 99152023 aagaaacaaaagtttcccaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199013 21 - 121039945 aagaaacaaaagtttcccaaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20492291 17 - 90941950 AAG--ACAATACCTCTGTG-- i papAnu2.chr10 I 4 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64198 19 - 112050 aggaaaca--agtttcccaaa i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911096 17 - 38964690 ----AAAAGAGACTTCTCAAA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e macFas5.chr10 21568887 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I a score=5348.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78519 2 + 478999 tc s panTro4.chr22 21168628 2 - 49737984 tc i panTro4.chr22 C 0 I 237 s ponAbe2.chr15 18517455 2 + 99152023 tc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199034 2 - 121039945 tc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21568887 2 + 96509753 TC i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.chr10 20492308 2 - 90941950 tc i papAnu2.chr10 C 0 I 1 s calJac3.chrUn_GL286438 64217 2 - 112050 tc i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911113 2 - 38964690 TC i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78521 1 + 478999 a s ponAbe2.chr15 18517457 1 + 99152023 a i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199036 1 - 121039945 a i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64219 1 - 112050 a i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911115 1 - 38964690 A i canFam3.chr26 C 0 C 0 e chlSab2.chr19 20485968 3 - 33263144 I e papAnu2.chr10 20492310 1 - 90941950 I e macFas5.chr10 21568889 1 + 96509753 I e rheMac3.chr10 21357942 3 - 95678458 I e panTro4.chr22 21168630 237 - 49737984 I a score=395762.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78522 129 + 478999 atatttacttttactttacacaatgtactgatatattc---ttttttaAAATGCTTTTTAAAATAAGTACATTGATTTCATTACCCTATGACACTGCCACCTGCTACTTA-AAAATGTAGCCTTAAAACTTTA s panTro4.chr22 21168867 129 - 49737984 ATATTTACTTTTACTTTATGCAATGTACTGATACATTC---TTTCTGAAAATACTTTTTTAAATAAGTACATCGATTTCATTACCCTATGACACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAGAACTTTA i panTro4.chr22 I 237 C 0 s ponAbe2.chr15 18517458 131 + 99152023 atatttacttttactttatgcaatgtactgatatattctctttttttaaaatgcttttttaaataagtacattgatttcattaccctatgacactgccacctgctgctta-aaaacacA-CCTTAAAACTTTA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199037 129 - 121039945 atatttacttttactttacgcaatgtattgatatattc---ttttttaAAATGTTTTTTAAAATAAGTACATTGATTTCATTACCCTATGACACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACGTAGCCTTAAAACttta i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21357945 128 - 95678458 ATATTTACTTTTACTTTATGCAACGTACTGATACATTCTC-CTTCTGAAAATGCTTT---AAATAAGTACACTGATTTCATTACCCTATGATACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAAAACTTTA i rheMac3.chr10 I 3 C 0 s macFas5.chr10 21568890 128 + 96509753 ATATTTACTTTTACTTTATGCAACGTACTGATACATTCTC-CTTCTGAAAATGCTTT---AAATAAGTACACTGATTTCATTACCCTATGATACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAAAACTTTA i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.chr10 20492311 128 - 90941950 atatttacttttactttatgCAACGTACCGATACATTCTC-CTTCTGAAAATGCTTT---AAATAAGTACACTGATTTCATTACCCTATGATACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAAAACTTTA i papAnu2.chr10 I 1 C 0 s chlSab2.chr19 20485971 128 - 33263144 ATATTTACTTCTACTTTATGCAACGTACTGATACATTCTC-CTTCTGAAAATGCTTT---AAATAAGTACACTGATTTCATTACCCTATGACACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAAAACTTTA i chlSab2.chr19 I 3 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64220 131 - 112050 atatttacttttactttatgcaatgcaccgatatattctg-ttttTCAAAATACTTTTTAAAGTAAGAACATTGATTTCATTACCCTATCACACTGCCACCTGCTACTTA-AAAACACAGCCTTAAAACTTTA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911116 125 - 38964690 ----ATACTTTTACCATTTGCAATATACTGATATTATTTA-TCTCTTTTAATGTTTT--AAAATCACCACACTGTTAACTTTGCCCTATGATGTTGCCACTTGGCATTTAGAAAACTTAGCCCTA-AACTTCA i canFam3.chr26 C 0 C 0 a score=404332.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78651 153 + 478999 TGCAGAGTGTGCTAAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTCCCACGACTCCAACATAAGAAAATGGGTAAAATCTAGC-AAGTCTATTCTAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGTTC--CTCTGAAGTCCCTGCAACATTGTGAT s panTro4.chr22 21168996 154 - 49737984 CACAGAATGTGCTGAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTACCACTGCTCCAACATAAGAAAATGGGTGAAATCTAGCCAAGTCTATTCCAAGTAGAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGTTC--CTCTGAAGTCCCTGCAACATTGTGAC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18517589 153 + 99152023 CGCAGAATGTGCTAAACTCCTTGCTCC---TGCCACCTTCTACCACTGCTCCAACATAAGAAAATGGGTGAAATCTAGC-AAGCCTATTCCAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGTTC--CTCTGAAGTCCCTGCAACATTGTGAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358073 154 - 95678458 CACAGAATGTACTAAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTACTACTGCTCCAACATAAGAAAATAGGTGAAAGTCAGCCAAGTCTATTCCAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGCTC--CTCTGAAGTCCCAGTAACATTGTGAC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569018 154 + 96509753 CACAGAATGTACTAAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTACTACTGCTCCAACATAAGAAAATAGGTGAAAGTCAGCCAAGTCTATTCCAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGCTC--CTCTGAAGTCCCAGTAACATTGTGAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20492439 154 - 90941950 CACAGAATGTACTAAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTACTACTGCTCCAACATAAGAAAATAGGTGAAAGTCAGCCAAGTCTACTCCAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTGAGACACCCCAGGCTC--CTCTGAAGTCCCAGTAACATTGTGAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486099 154 - 33263144 CACAGAATGTACTAAACTCCTTGCTCC---TACCACCTTCTACTACTGCTCCAACATAAGAAAATAGGTGAAAGCCAGCCAAGTCTATTCCAAGTACAGACCTTGGCATAAATGTCAGACACCCCAGGTTC--CTCTGAAGTCCCAGCAACATTGTGAC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64351 152 - 112050 CACAGAACATGCTAAACTCCTTGCACC---TACCACCTTCCACCACTGCTCCAACAGAAGAAAATGGGTGAA--TCTACCAAGTCTATTCCAAGTACAGATATTGGCATAAATGTGAGACATCCCAGGTTC--CTCTGAAGTTCCTGAAACATTGTGAG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911241 147 - 38964690 CACATAATGTACTAACCTCCTTCCACCACATTCCACCTTCTACCACCACTCCAACATGATAAAATGGGTAAAATCTAGC-AAATCTATTTCAAGTGCA-----------AAATGTGAGACATCCCTGACACCTCTCTGAAGTTCCTGCTGCATTGTGAC i canFam3.chr26 C 0 I 123 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=611359.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 78804 238 + 478999 TATTCCAACTGGCAGACAGGATACATTTGCTGAAAGGTTTCTCCAGCCAGACTACAGAAGCAGAAACCTTTTCTGTTGCCTTATCAGTGATATTGCTAAATTCTGCACTTGACAATGTGGACCAGGTTTACTACTGCTCCACAAGCCAATTCTTCCAAG-AAATAAAACAGGATTCCAGTATAATAGGATTCTAATACCAGACccttacattttttgaatacttttcaaacacattatt s panTro4.chr22 21169150 238 - 49737984 TATTCCGACTAGCAGACAGGATACATGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGCCAGAGTACAGAGGCAGAAACCTTCTCTGTTGCCATATCAGTGATATTGGTAAATTCTGCACTTGACAATACAGACTAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTTCAAAG-ACATAAAATAGGATTCTAATACAATACGATTCTAATACCagccccttacatttttagaatgcttttcatatacactatt i panTro4.chr22 C 0 I 9 s ponAbe2.chr15 18517742 238 + 99152023 TATTCCAACTGGCAGACAGGATACATGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGTCACAGGACAGAAGCAGAAAACTTTTCTGTTGCAGTTTCAGTGATATTGCTAAATTCTGCATTTGACAATGGGGACCAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTTCCAAG-AAATAAAACAGGATTCTAATACAATAGGATTCTAATACCagccccttacattttttgaatacttttcatatactctatt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358227 238 - 95678458 TATTCCGACTGGCAGACAGGATACATGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGCCAGAGTACAGAAGCAGAAACCTTTTCTGTTGCCATATCAGTGATATTGGTAAATTCTGAACTTGACAATACGGACTAGGCTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTGCCAAG-GCATAAAATAGGATTCTAATACAATATGATTCtaataccagccccttacatttttagaatacttttcatatacgctatt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569172 238 + 96509753 TATTCCGACTGGCAGACAGGATACACGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGCCAGAGTACAGAAGCAGAAACCTTTTCTGTTGCCATATCAGTGATATTGGTAAATTCTGAACTTGACAATACGGACTAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTGCCAAG-GCATAAAATAGGATTCTAATACAATATGATTCTAATACCagccccttacatttttagaatacttttcatatacgctatt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20492593 237 - 90941950 TATTCCGACTGGCAGACAGGATACATGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGCCAGAGTACAGAAGCAGAAACCTTTTCTGTTGCCATATCAGTGATATTGGTAAATTCTGAACTTGACAATACGGACTAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTGCCAAG-GCATAAAATAGGATTCTAATACAATATGATTCTAATACCAGCCCCTTACATTTTTAGAATACTTTTCATATACGCTAT- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486253 238 - 33263144 TATTCCGACTGGCAGACAGGATACATGTGCTGAAAGGTTtctccagccagagtacagaagcagaaaccttttctgttgccATATCAGTGATACTGGTAAATCCTGAACTTGACAATACGGACTAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAATTCTGCCAAG-GCATAAAATAGGATTCTAATACAATATGATTCTAATACCagccccttacatttttagaatacttttcatatacgctatt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64503 212 - 112050 TATTCCTA----CAAAGAGGATACATGTGCTGAAAGATTTCTCCAGGCAGAGTACAGAGGCAGAA----TTTCTGTTGCCTTATCAGTGACACTGGCAAATTCTGCACTTGAAAACATGTACCAG--TGGTCACTGCTTCACAAGCCAATTCTTCCAAG-ACATAAAATAG----------------AGTTCtaataccaaccccttacatttttagaatacttttcatatacactatt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911511 225 - 38964690 TATTCCTATTGGCAGACAGGATGTAAGTGCTGAAAGGTTTCTCCAGACGGAGTATGGAAGTAGTAATCTTTTTTGTTGCCTTATTAGTGACATTAGTAAATTCTGCACTTGACAACATGAAGTAGGTTTACCACTGCTCCACAAGCCAACTCTTCTAAGAAAATAAAATAGGATTCTAATACAGTCATATTCttaca--------------ttttagattgcttttcatacataccatt i canFam3.chr26 I 123 C 0 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=21704.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79042 19 + 478999 ccgttgcattctccccctg s ponAbe2.chr15 18517980 18 + 99152023 ccgtttgattctccccc-g i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358465 17 - 95678458 ctgtttgatcctcccca-- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569410 17 + 96509753 ctgtttgatactcccca-- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20492830 16 - 90941950 -TGTTTGATCCTCCCCA-- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486491 17 - 33263144 ctgtttgatcctcccca-- i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64715 17 - 112050 ccatttgatcctccctg-- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911736 17 - 38964690 ccatttgagccaccctg-- i canFam3.chr26 C 0 C 0 e panTro4.chr22 21169388 9 - 49737984 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=540978.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79061 198 + 478999 gcagtctgttagaaaagtagagaagctgctcttcttcctttcactaatgaaggaattggagctcagaggggttacgtggcttgccagaaacaacacggctaatgaagaata-caacgcaggcttgaacccaagatttactCATCTATCCACTTTTATGCTACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAGTATGAACTT s panTro4.chr22 21169397 198 - 49737984 acagtctgttagaaaagtagaaaagttgctcttcttcctttcactaatgagggaactggagctcaggggggttatgtagcttgccagaaacaacatgggtaatgaagaataacaacccaggcttgaacccaagatttact-atctacccactttcatgctACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAATATGAACTT i panTro4.chr22 I 9 C 0 s ponAbe2.chr15 18517998 198 + 99152023 gcagtctgttagaaaagtagagaagctgcccttcttcctttcactaaggagcggattggagctcagagggcttatgtggcttgccagaaacaacatggctaatgaagaata-aaacccaagcttgaacccaagatttactgatctatccactttcatgctACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAGTATGCACTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358482 197 - 95678458 gtagtctgttagaaaagtagagaagttgctcttcttcctttcactaatgagggaattggagctcaga-gggttatgtagcttgccagaaacaacacggctaatgaagaataacaacccaggcttgaacccaagatttact-ATCTACCCACTTTCACGCTACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAATATGAACTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569427 197 + 96509753 gtagtctgttagaaaagtagagaagttgctcttcttcctttcactaatgagggaattggagctcaga-gggttatgtagcttgccagaaacaacacggctaatgaagaataacaacccaggcttgaacccaagatttact-ATCTACCCACTTTCACGCTACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAATATGAACTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20492846 198 - 90941950 GTAGTCTGTTAGAAAAGTAGAGAAGTTGCTCTTCTTCCTTTCACTAATGAGGGAATTGGAGCTCAGAGGGGTTATGTAGCTTGCCAGAAACAACACGGCTAATGAAGAATAACAACCCAGGCTTGAACCCAAGATTTACT-ATCTATCCACTTTCATGctacaattttcatttttaatatctgaTACAAATATGAACTT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486508 198 - 33263144 gtagtctgttagaaaagtagagaagttgctcttcttcctttcactaatgagggaattggagctcagaggggttatgtagcttgccagaaacaacacggctaatgaagaataacaacccaggcttgaacccaagatttact-atctacccactttcatgctACAATTTTCATTTTTAATATCTGATACAAACATAAACTT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64732 198 - 112050 gcactctgttagaaaagtagagaagttgcttgtcttcctttcactaatgagggaattggagctcagaggggttatgtggcttgccaaaaacaacacagctaatgaagaata-caacccaggctcgaacccaggatttactgTTCTACCCACTTTCATGCTACAATTTTCATTTCTAATATCTGATACAAATGTGAGCTT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15911753 190 - 38964690 acaaactgaaataaaaata--------gttattcttccttttattaatgagagaattgaagctcagaaggattatgtggcttgccagaaataacacaactaacaaggaaca-caacttaagcttgaacccaggacttccctgtctacccattctcatgctACAATTTTCATTTTGAACATCTGAGATAAATATGAACAT i canFam3.chr26 C 0 I 582 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=182922.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79259 85 + 478999 AAAAAGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAAAGGTGAAAGCATGATATCAATATTGATGATACCAAAAAATTAAGATTAAATAT s panTro4.chr22 21169595 79 - 49737984 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAAAGATGAAAGCAT---ATCAGTATTGAT---ATCACAAAATTAAGATTAAAAAT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518196 85 + 99152023 AAAAGGTATATTGTTTCTGGATTCAAAGGCAAAGATGAAAGCATGATATCAGTATTGAGGATATCATAAAATTAAGATTAAAAAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358679 79 - 95678458 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAATGATGAAAGCAT---ATCAGTATTGAT---ATCACAAAATTAAGATTAAAAAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569624 79 + 96509753 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAATGATGAAAGCAT---ATCAGTATTGAT---ATCACAAAATTAAGATTAAAAAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493044 79 - 90941950 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAATGATGAAAGCAT---ATCAGTATTGAT---ATCacaaaattaagattaaaaat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486706 79 - 33263144 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGCAATGATAAAAGCAT---ATCAGTATTGAT---ATCACAAAATTAAGATTAAAAAT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 64930 81 - 112050 AAAAGGTATATTGTTTCTAGATACAAAAGTACAGATGAAAGCATG--AT--GTATGGATGATGTCATAAAATTAAGATTAAAAAT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 301 s canFam3.chr26 15912525 80 - 38964690 aataaataaaatattttaaaaaaTTAAAATTAAAATTAAAGCATTCTATCAATATTGGT---ATC--AAAATAAAAATTAAAAAC i canFam3.chr26 I 582 C 0 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=399869.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79344 155 + 478999 AGCAATGACATGTTAATAATTTTGGAGGCCTCTAAAGTTACTGGCAGTCCTAGTTCAATCCAATATGAATCTGATATCATCTTATATCTTCAATCAATGTTACA-TGATTATAAATTTATGTATATATTCACCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG s panTro4.chr22 21169674 155 - 49737984 AGCAATGACATGTTAATAATTT-GGTAGCCTCTAAAGTTACTGGGAGTTCTAGTTCAATCCAGTATGAATCTGATATCATCTTATAACTTAAATCAATGTTACACTGATTATAAATTTATCTATATATTCATCATAGAAAATTACAGAATTAGGTG i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518281 155 + 99152023 AACAATGACATGTTAATAATTTTGGTAGCCTCTAAAGTTACTGG-AGTCCTAGATCAATCCAATATGAATCTGATATGATCTTATATCTTAAATCAATGTTACATGGATTATAAATTTATGTATATATTCATCATAGAAAATTACAGAATTGGTTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358758 156 - 95678458 AGCAATGACAAGTTAATAACTTTGGTAGCCTCTAAAGTTACTGGGAGTCCTAGTTCAACCCAGTATGAATCTGATACCATCTTATATCTTAAATCAATGTTACACTGATTATAAATTTATGTATATATTCTCCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569703 156 + 96509753 AGCAATGACAAGTTAATAACTTTGGTAGCCTCTAAAGTTACTGGGAGTCCTAGTTCAACCCAGTATGAATCTGATACCATCTTATATCTTAAATCAATGTTACACTGATTATAAATTTATGTATATATTCTCCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493123 156 - 90941950 agcaataacaaGTTAATAACTTTGGTAGCCTCTAAAGTTACTGGGAGTCCTAGTTCAACCCAGTATGAATCTGGTATCATCTTATATCTTAAATCAATGTTACACTgattataaatttatgtatatattctcCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486785 154 - 33263144 AGCAATGACAAGTTAATAACCTTGGTAGCCTCTAAAGTTACTGGGAGTCCTAGTTCAACCCAGTATGAATCTGATATCATCTTATATCTTAAATCA--GTTACACTCATTATAAATTTATGTATATATTCACCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65312 151 - 112050 AGCAATGAC--GTTAGTAATTTTGGTAGCTTCTAAAATAACCTGGAGTCCTAGTTCAATCCAATGTGAATCTGAT---ATCTTATATGATAAATCAATGTTTCACTGATGATTAATTTATGTATATATTCACCATAGAAAATTACAGAATTGGGTG i calJac3.chrUn_GL286438 I 301 C 0 s canFam3.chr26 15912605 147 - 38964690 AGCAATG--------TTAATTTTGGTAGCCTCTAAAATTATTAGGAATTCTAGTTCAACCCAGTATGGATTTGATCTCATACTATGTCTTAAGTGAATGTTTCACTGATTATAAAATTAC-TATAAATTCACCATAGAAAATTACAGAATTGGggg i canFam3.chr26 C 0 I 181 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=723499.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79499 252 + 478999 GTAAGAAACAACTAGCTATATAAATTGCACATACTCCCCC-AAATCATTCTCAAGTCTTGTGGCTTCACACTAAATTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCTGATTTGATTTCAACACTAAGCGAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTACTACATAATACTTGCAACATACATTCAATTTCCGAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT s panTro4.chr22 21169829 253 - 49737984 GTAAGAAACAGCTAGCTATATAAATTGCACAAACTCCCCCCAAACCATTCTCAAGTCTCATGACTTCACACTAAATTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCAATTTGATTTCAACACTAAGCCAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTTCTACATAACACTTGCAACATACATTCAACATCGGAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518436 249 + 99152023 GTAAGAAACAACTAGCTCTATAAATTGCACAAACTCCCAC-AAACCATTCTCAAGTCTTTTGGCTTCACACTAAATTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGATTTCAACACTAAGCGAATTACAACAG-ATAAGCATGTTCTTTCTATATAATACTTGCAACATACATTCAATTTCC--AGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAATGCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21358914 253 - 95678458 GTAAGAAACAGCTAGCTATATAAATTGCACAAACTCCCCCCAAACCATTCTCAAGTCTTGTGACTTCACACTAACTTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGATTTCAACACTAAGCAAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTTCTACATAACACTTGCAACATACATTCAATTTCCGAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21569859 253 + 96509753 GTAAGAAACAGCTAGCTATATAAATTGCACAAACTCCCCCCAAACCATTCTCAAGTCTTGTGACTTCACACTAACTTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGATTTCAACACTAAGCAAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTTCTACATAACACTTGCAACATACATTCAATTTCCGAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493279 253 - 90941950 GTAAGAAACAGCTAGCTATATAAATTGCACAAACTCCCCCCAAACCATTCTCAAGTCTTGTGACTTCACACTAACTTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGATTTCAACACTAAGCGAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTTCTACATAACACTTGCAACATACATTCAATTTCCGAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCCATAAGCTAAAAGCAGAATCCAACA-----CAGaatcttgtttctttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20486939 253 - 33263144 GTAAGAAACAGCTAGCTATATAAATTGCACAAACTCCCCCCAAACCATTCTCAAGTCTTGTGACTTCACACTAACTTATGAAGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGATTTCAACACTAAGCGAATTACAACAGCATAAGCATGTTCTTTCTACATAACACTTGCAACATACATTCAATTTCCAAAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCTATAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCTTGTTTCTTTT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65463 252 - 112050 GAAAGAAATAACTAACTATATAAATTACACAAACTCCCCC-AAACCATTCTCAAGTCTCGTGGCTTCACACTAAATTATGACGTTCCCAATGTAAAACCCGATTTGGTTTCAACACTAAGTGAATTACAACAGCCTAAGCATGTTCTTTCTACATAATACTTGCAACATACATTCAATTTCTGGAGCACTTTTGTACAATGTCTACAATGCTCAAGCTAAAAGCAGAACCCAACA-----CAGAATCATGTTTCTTTT i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15912933 254 - 38964690 GTAAGAAACAACTAGGCACATAAATTACACAAACTTCCCT-AAACCATTCTTAA-TCTTGTGGCTTCACACTAAATTATGAAGTTCCTTATGTGAAATTC-ATTTGATTTCAACACTAAGTGAATTACAACAGTGTAAGCATGTG-TTTCTGCATAATACTTGCAACATGCACTCAATTTCCAGAGCACTTTTGGACAATGTCTAAAATCTATAAGCTACGAGTAGAACCCAAAAATGTTCAGGGCTTTTTTTTtttt i canFam3.chr26 I 181 I 196 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79751 1 + 478999 A s panTro4.chr22 21170082 1 - 49737984 A i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518685 1 + 99152023 A i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359167 1 - 95678458 A i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570112 1 + 96509753 A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493532 1 - 90941950 a i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20487192 1 - 33263144 A i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65715 1 - 112050 A i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15913187 196 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=3276.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79752 1 + 478999 A s panTro4.chr22 21170083 1 - 49737984 A i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518686 1 + 99152023 A i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359168 1 - 95678458 A i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570113 1 + 96509753 A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493533 1 - 90941950 a i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20487193 1 - 33263144 A i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65716 1 - 112050 A i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 35 s canFam3.chr26 15913383 1 - 38964690 A i canFam3.chr26 I 196 C 0 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=154654.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79753 73 + 478999 ATGGCAAAGGTTAGTCTACCTATATGAGATGAATACCAAATAACATAATTAGAACTTattaaaaatttacaga s panTro4.chr22 21170084 73 - 49737984 ATAATAAAGGTTCATCTACCTATATGAGATGAATACCAAATAACATAATTAGAAATGATTAAAAATTTGCaga i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518687 72 + 99152023 ATGACAGA-TTTCATCTATCTATATGAGATGAATGCCAAATAAGATAATTAGAACTTATTAAAAATTTCCaga i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359169 73 - 95678458 ATAAGAAAGGTTCGTCTACCTATATGAGATGAATACCAAATAACATAATTAGAAATTATTAAAAATTTGCAGA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570114 73 + 96509753 ATAAGAAAGGTTCGTCTACCTATATGAGATGAATACCAAATAACATAATTAGAAATTATTAAAAATTTGCAGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493534 73 - 90941950 ataagaaaggtTCGTCTAcctatatgagatgaataccaAATAACataattagaaattattaaaaatttgcaGA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20487194 73 - 33263144 ATAAGAAAGGTTCGTCTACCTATATGAGATGAATACCAAATAACATAATTAGAAATTATTAAAAATTTGCAGA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15913384 73 - 38964690 ATTAAAAAGGTGCATCTACCTACATAAGATGAATACTGAATAACATAATTACAAATTGTTGAAGATTTGCAGA i canFam3.chr26 C 0 I 1027 e calJac3.chrUn_GL286438 65717 35 - 112050 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=474790.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 79826 276 + 478999 atcaggctagagaaactacttgaggtcaaagactataggcccttaattgtatagatgagaaaattgatgcccagagaagttaagtgacattcccaacagcaattaatgacacagatggaatcagaatatatgtctatctgtcaatccagaacttcccattattctatattacctcTGCATTTAATGTGCTCTTAAAAAAGTCACTAACATCTAAAACACTTAAGACACATTAAGACTCAAAAACCAGGGGACACAACAATGTTCACGACAGTCTTT s panTro4.chr22 21170157 272 - 49737984 atcaggctagagaaactacttgaggtcaaagactataggcccttaactgtatatatgagaaaactgacgcccagagaagttaagtgacattcccaacagcaataaatgacacagatggaatcagaatatatg----tctgtcaatccagaacttcccactattctatactacctttGCATTTACTGGGCTCTTAAAAAAGTCACTAACATCTGAAACACTTAAGATTCATTAAGACTCAAAAACTAGGGGACTCGATAATGTTCATGACAGTCTTT i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18518759 258 + 99152023 atcaggctagagaaactacttgaggtcaaagactataggcccttaattgtatagatgagaaaactgatgcccagagaagttaagtaacattcccaacaacaattaatgacacagatggaatcagaa----------tctgtcaatccagaacttc--------cTATAACACCTCTGCATTTAATGTGTTCTTTAAAAAGTCACTAACATCTGAAACACTTAAGATACATTAAGACTCAAAAACTAGGGGACACAATAATGTTCATGACAGCCTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359242 272 - 95678458 ATCAGGTTACAGAAACTACTTGAGGTCAAAGACTATAGGcccttaatcgtatagatgggaaaactgatgcccagagaagttaagtgacattgccaacagcaataaatgacacagatggaatcagaatatatg----tctgtcagtccagaagttcccattattctatactacctctGCATTTACTGTGCTCTTAAAAAAGTCACTAATATCTAAAACACTTAAGACCCACTAAGACTCAAAAACTAGGGGACACAATAATGTTCACAACAGTCTTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570187 272 + 96509753 ATCAGGTTACAGAAACTACTTGAGGTCAAAGACTATAGGcccttaatcgtatagatgggaaaactgatgcccagagaagttaagtgacattcccaacagcaataaatgacacagatggaatcagaatatatg----tctgtcagtccagaagttcccattattctatactacctctGCATTTACTGTGCTCTTAAAAAAGTCACTAATATCTAAAACACTTAAGACCCACTAAGACTCAAAAACTAGGGGACACAATAATGTTCACAACAGTCTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20493607 272 - 90941950 ATCAGGTTACAGAAACTACTTGAGGTCAAAGACTATAGGCCCTTAATCgtatagatgggaaaactgatgcccagagaagttaagtgacatTCCCAACAGCAATAAATGACACAGATGGAATCAGAATATATG----TCTGTCAGTCCAGAAGTTCCCATTATTCTATACTACCTCTGCATTTACTGTGCTCTTAAAAAAGTCACTAATATCTAAAACACTTAAGACCCACTAAGACTCAAAAACTAGGGGACACAATAATGTTCACGACAGTCTTT i papAnu2.chr10 C 0 I 315 s chlSab2.chr19 20487267 272 - 33263144 ATCAGGttacagaaactacttgaggtcaaagactataggctcttaatcgtatagatgggaaaactgatgcccagagaagttaagtgacattcccaacagcaataaatgacacagatggaatcagaatatatg----tctgtcagtccagaagttcccattattctatactacctctGCATTTACTGTGCTCTTAAAAAAGTCACTAATATCTAAAACACTTAAGACCCACTAAGATTCAAAAACTAGGGGACACAATAATGTTCACGACAGTCTTT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15913457 1027 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 65717 35 - 112050 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=136397.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 80102 79 + 478999 AGAAAACAATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATTCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTTATTT-TTTTTATTTTC s panTro4.chr22 21170429 76 - 49737984 AGAAAACAATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATTCCAAACAATAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTCA----TTTTCATTTTC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18519017 80 + 99152023 AGAAAACAATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATCCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTTATTTCGTTTTATTTTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359514 76 - 95678458 AGAAAACAATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATTCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTTA----TTTTCATTTTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570459 76 + 96509753 AGAAAACAATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATTCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTTA----TTTTCATTTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20494194 76 - 90941950 agaaaacaatttcttaaaGGAATCTCAAAAATTCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTggctcttta----ttttcattttc i papAnu2.chr10 I 315 C 0 s chlSab2.chr19 20487539 75 - 33263144 AGAAAA-AATTTCTTAAAGGAATCTCAAAAATTCCAAACAACAAGCACTGAAAGCTGGCTCTTTA----TTTTCATTTTC i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr26 15913457 1027 - 38964690 I e calJac3.chrUn_GL286438 65717 35 - 112050 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=129701.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 80181 59 + 478999 TTTCCTATCCAGAGCCCTACTTGATCAAAAACTGGCTCTTTAATCCATTGCAAATTATC s panTro4.chr22 21170505 59 - 49737984 TTTCCTACCCAGAGCCCTATTTGATCAAAAATTGGCTCTTTAATCCATTGCAAAATATC i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18519097 58 + 99152023 TGT-CTATCCAGAGTCCTACTGGATCAAAACCTGGCTCTTTAATCCATTGCAAAATATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359590 59 - 95678458 TTTCCTATCCAGAGCCCTACTTGATCAAAAACTGACTCTTTAATCCATTGCAAAATATT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570535 59 + 96509753 TTTCCTATCCAGAGCCCTACTTGATCAAAAACTGACTCTTTAATCCATTGCAAAATATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20494270 59 - 90941950 tttcctatcCAGAGCCCTACTTGATCAAAAACTGACTCTTTAATCCATTGCAAAATATT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20487614 59 - 33263144 TTTCCTATCCAGAACCCTACTTGATCAAAAACTGACTCTTTAATCCATTGCAAAATATT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65752 59 - 112050 TTTCTTATCCAGAGCCCTACTTGATCAAAAACTTGCTGTTTAAACCAATGCAAAACATC i calJac3.chrUn_GL286438 I 35 C 0 e canFam3.chr26 15913457 1027 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=2080023.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 80240 793 + 478999 AAGTAGCTTTTAATAAC----------------------------TAACATGGCTATAAACCACCATAACTGTTCTTTTTTCCATATCAATACTATTCACTTACTAAAAAAAAAAATCTGAGGGTATAGAATATGC--TGATAActgtgctgggtattggcgacaccagggaac-------------aaaacagacgaggcctctgGCTCTTCTAATGGACAGCTGGGTGCAACTCTCTAAAAATACTACTTCATGATTTGACAGGATATTTGCCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAACTATAACAACATTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTATAATAACCTTCACCACA-CCCCCTCTAAAACGTGAATACGTCCTTTGGTAACTCAGCATTCTACTTCACTAAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTACAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGTAAATTTCAAGAACTTTTCACAATCTGTAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGATCTCAAATGACTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGATGGTTTAGGAGCAACC---ATGTTAG---GGAGCATCTTCAGTGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCTGACTTACTTCCTCTCCTTCTCTGTTTATTTCCTCTGGATTCTT--GTGTATCTCTGGATACAATGTATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAGTGTGTTCCTGATAACTTGTGCACAAATTAACTTTTGGCAGCAAATCTGTTTCACCTACACAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA s panTro4.chr22 21170564 793 - 49737984 AGGTAGCTTTTAATAAC----------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTTCTTTTTCCCATATCAATACTattcacttaat--taaaaaatatctgagggcacagaatatgc--tgataactgcgctgggtactggggacaccagggaac-------------aaaacagacaaggcctctggctcttctaatggaCAGCTGGGTGCAA--CTCTAAAAATACTACTCTATGATTTGACAGGATATTTACCAAAGCCCTTCACTACTCTACACAACTGTAACAACATTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTGTAAGAACCTTCACCACATCCCCCTCTAAAACACGAATACTTCCTTTGGTAA--CAGCATTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTACAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGCAAATTTCAAGAACTTTTCACAATACATAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCGGGTCTCAAATGATTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGATGGTTTAGGAGCAACCATGATGGTGG---GAAGCATCTTCAGTGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCCGACTTACTCCCTCTCCTTCTCTGTTTATTTCCTCTGGATCCTTCAATATATCTCTGGATACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAGTGTGTTCCTAATAACTTGTTTGCAAATTAACTTTTGGCAACAAATCTGTTTCCCCTACATAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18519155 796 + 99152023 AAGTAGCTTTTATTAAC----------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTTCTTTTTTCCACATCAACACTattcacttact--aaaaaagtatctgagggcatagaatatgc--tgataactgcactgggaactggagacaccagggaaa-------------aaaacagacaaggcctctggctcttctaatggaCAGCTGGGTGCAACTCTCTTAAAATACTATGCTACGATTTGACAGGATCTTTACCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAATTATAACAACATTTTCTTCCACCTTTTCCAAACTTATAACAACCTTCACCACA-CCCCCTCTAAAACATGAATACTTCCTTTGGTAACTCAGCGTTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACATATTAACTAGAACTACAGCAGATATTTAAACTGACTTTACCATTCCTCATGGCCTGTGGCAAATTTCAAGAACTTTGCACAATCCATAGTAACACTTCCTGGTTCACAATCCTGGTCTTAAATGACTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGATGGTTTAGGAGCAACAATGATGGTGG---GAAGCAACTTCAGTGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCCGAATTACTCCCTCTCCTTATCTATTTATTTCCTCTGGAATCTTCAATATATCTCTGGATACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAGTGTGTTCCTAATAACTTGTACACAAATTAACTTTTGGCAACAAACCTGTTTTCCCTACATAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21359649 778 - 95678458 AAGTAGCTTTTAA--------------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTT---------GTATCAATACTattcacttact-aaaaaaaatatctgagggcgcaaaatatgc--tgataactgcactgggtactggggacaccagggaac-------------aaaacagacaaggcctctgGCTCTTCTAATGGACAGCTGGGTGCAA--CTCTAAAAATACTACTCTATGATTTGACAGGATATTTACCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAACTAT---AACATTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTGTAAGAACCTTCACCACACTCCCCTCTAAAACATGAATACTTCCTTTGGTAA--CAGCATTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTATAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGCAAATTTCAAGAAGTTTTCACAATCCATAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGGTCTCAAATGGCTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGACGGTTTAGGAGCAACCATGATGGTGG---GAAGCATCTTCAGGGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCTGACTTACTTCCTCTCCTTCCCTGTTTATTTCTTCTGAATTCTTCAATATATCTTTGGGTACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAATGTGTTCCTAATAACCTGTGCACAAATTAACTTTTGCCAACAAATCTGTTTCCCCGACATAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21570594 778 + 96509753 AAGTAGCTTTTAA--------------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTT---------GTATCAATACTattcacttact-aaaaaaaatatctgagggcgcagaatatgc--tgataactgcactgggtactggggacaccagggaac-------------aaaacagacaaggcctctgGCTCTTCTAATGGACAGCTGGGTGCAA--CTCTAAAAATACTACTCTATGATTTGACAGGATATTTACCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAACTAT---AACATTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTGTAAGAACCTTCACCACACTCCCCTCTAAAACATGAATACTTCCTTTGGTAA--CAGCATTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTATAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGCAAATTTCAAGAAGTTTTCACAATCCATAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGGTCTCAAATGGCTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGACGGTTTAGGAGCAACCATGATGGTGG---GAAGCATCTTCAGGGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCTGACTTACTTCCTCTCCTTCCCTGTTTATTTCTTCTGAATTCTTCAATATATCTTTGGGTACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAATGTGTTCCTAATAACCTGTGCACAAATTAACTTTTGCCAACAAATCTGTTTCCCCGACATAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20494329 777 - 90941950 AAGTAGCTTTTAA--------------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTT---------GTATCAATACTATTcacttact-aaaaaaaatatCTGAGGGCACAGAATATGC--TGATAACTGCACTGGGTACTGGGGACACCagggaac-------------aaaacagacaaggcCTCTGGCTCTTCTAATGGACAGCTGGGTGCAA--CTCTAAAAATACTACTCTATGATTTGACAGGATATTTACCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAACTAT---aacattttcttccacctcttccAAACTTGTAAGAACCTTCACCACACTCCCCTCTAAAACATGAATACTTCCTTTGGTAA--CAGCATTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTATAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGCAAATTTCAAGAAGTTTTCACAATCCATAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGGTCTCAAATGGCTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGACGGTTTAGGAGCAACCATGATGGTGG---GAAGCATCTTCAGGGGACCCCTTTATGAGCCAGAAGCTGACTTACTTCCTCTCCTTCCGTGTTTATTTCCTCTGAATTCTTCAATATATCTTTGGGTACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATctaattttatcaaatgtgttCCTAATAACCTGTGCACAAATTAACTTTTGCCAACAAATCT-TTTCCCCGACATAAATCCATTATATTTTAAGAGATGCTCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20487673 777 - 33263144 AAGTAGCTTTTAA--------------------------------TAACACTGCTATAAACCACCATAACTGTT---------GTATCAATACTattcacttact--aaaaaaatatctgagggcgcagaatatgc--tgataactgcactgggtactggggacacctgggaac-------------aaaacagacaaggcctctggctcttctaatggaCAGCTGGGTGCAA--CTCTAAAAATACTACTCTATGATTTGACAGGATATTTACCAAAGTCCTTCACTACTCTACACAACTAT---AACATTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTGTAAGAACCTTCACCACACCCCCCTCTAAAACATGAATACTTCCTTTGGAAA--CAGCATTCCACTTTACTGAAGAAGGTGTGAACGTGGTAACTAGAACTATAGCAGATTTTTAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGCGGCAAATTTCAAGAAGTTTTCACAATCCGTAGTAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGGTCTCAAATGACTGCTAACACACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGACGGTTTAGGAGCAACCACGATGGTGG---GAAGCATCTTCAGGGGATCCCTTTATGAGCCAGAAGCTGACTTACTTCCTCTCCTTCCCTATTTATTTCCTCTGAATTCTTCAATATATCTTTGGGTACAGTATATCTCCAATTAATCAGCATCTAATTTTATCAAATGTGTTCCTAATAACCTGTGCACAAATTAACTTTTGCCAACAAATCTGTTTCCCCGACATAAATCCATTGTATTTTAAGAGATGCTCA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 65811 765 - 112050 AATTAGCTTTTAATAAC----------------------------TAACACTGCTAT-------CATATCTGTTCTTTTTTCCATATCAATACGGttcacttact--aaaaaaatatctgagggcatagaatatgc--tgataactgcactgggtactggggacctcagggaac-------------aaaacagacaaggcctctggctcttctaatggaCAGCTGGGTACAACTCTCTAAAAATACTACTC--TGATTTGACAGGATATTTA-CAAAGTCCTTCACTGCTCTACACAACTATAACAACCTTTTCTTCCACCTCTTCCAAACTTATGACGACCTTCACCACA-CCTCCCCTAAAACACGAATACTTCCTTTGGTAACACAGCATTCCACTTTACTAAAGAAGGTGTGAACGTGTTAACTAGAACTACAGCAGATCTTTAAGCTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGTGGCAAATTTCAAGAACTTTTCACAATCCATGATAACCCTTCCTGGTTCACAACCCTGGTCTCAGATGACTGCTAACAAACCCATCCTACCCTC----CACTAGAAATCTGAGTCAGATGCTGTAGGAGCAACCATGATGTTGA---GAAGCATCTTCAGCGGACCCCTTTATG-------AGCTTACTTGCTCCCTCTCCTTCTCTGTTTATTTCCTCTGGATTCTTCAATATATCTCTGGATACAGTATATCTCCAATAATTCAGCATCGAATTTTATCAGGTGTGTTTCT-------TGTGCATAAATTAACTTTTGGCAACAAATCTGTTTCCCCTACATAAA-------TATTTTAAGAGTTGCTCA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 305 s canFam3.chr26 15914484 816 - 38964690 AAGTAGCTTTTAATAACTTCtataatatcttttattaataatttttaataaaGTTATCAACCAC-------ATTTTTCTTCACATCTCAATACTACCcatttgct--caaaaaatacctgagagcacagtatatgctgtggaaactgtgctagacactggagatacCAAGAAAACTGGAGATCCAAGAAAACAAA-ACAGCCTCTGGCTCTCAAACTGGACAACTGGATACATTTTTCT-AAAATACTACTTCATGGTTTGACAGGGTATTTACCAAACTCCTTCACTACTCTACATAACTAT---AATATTTTCTGCCAATTCTTCTAAACTTGCAACAAACCTTACCACA-CTCCCGGTGCAACATGAGTA-TTTCTTGGGTAATTCACCATTCCACTTTACCACAGAAGGTGT--------TAACCAGAACTACAACAGATTTAAAAACTGACTTTACCACTCCTCATGGCCTGGGGCAAATTTCAAGAACTTTTCACAATCCACAATAAC-CTTCCTGGTGCACAACCCTCATTTCAAATGACTGCTAACCCACCCACCCTACCCTCACTTTACTAGAAATCTGAGTCAGATGGTTTAGGAGCAAGCATAATGTTGATATGAAGCACCTACCATGGACCCCTTTGTGAGCCAGAAGTAGACTTTTTGCCTCTCCCTCTCTTTTTCTTTCCTCTAGATCCTCTTATATATCTCTAG-----GTATACGTCCAGTCAAGCAGCATCTAATTTTATCAAATGTGTTCCCAAAGACTTG--CACAAA-TAACTTCTAACAACAAATCTAATTCCTCTACCTAAATCCATTATTTTCTAAGAGATGCTCA i canFam3.chr26 I 1027 C 0 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=546313.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 81033 208 + 478999 ATTTGCATC-CTTTAAGTTTCTCATGCTTCCC---CTTCTCCACTTCTTAAATTCTTAAAAAGCTATAAA----CAAAAGCACCCTGGGAAGCCATAATTAATGG--------GAATTCTTTGGAATAC---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAGTTCACATGCCTTGCTGACCACaatcaatc-agggagctttgtaaggatggattcccaggccctatcctcagagatttta s panTro4.chr22 21171357 208 - 49737984 ATTTGCATCTCTTTAAGTTTCTCATGCTTCCC---CTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACCCTGAGAAGTCATAATTAATGG--------GACTTCTTTGGAATAC---CCA-----ATCTAAAG--------CAAAAgttcacatgccttgctgaccagaatcattc-acggagctttgtaaggatagatccccgggctctatcctcagagatttt- i panTro4.chr22 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18519951 212 + 99152023 ATTTGCATCTCTTTAAGTTTCTCATGCTTCCCCTTCTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATATATAAA----GAAAAGCACCCTGAGAAGTCATAATTAATGG--------GAATTCTTTGGAATAT---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAgttcacatgccttgctgaccagaatcattc-agggagatttgtaaggatggattcccaggtccgatcctcagagatttta i ponAbe2.chr15 C 0 I 37155 s rheMac3.chr10 21360427 207 - 95678458 ATTTGCATCTCTT----TTTTTCATGCTTCCC-TTCTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACTCTGAGAAGTCGTAATTAATGG--------GAGGTCTTTGGAATAC---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAGTTCACATGCCTTACTGACCAgaatcattc-acggagttttataaggatagattcccaggctctatcctcagagattttt i rheMac3.chr10 C 0 I 1 s macFas5.chr10 21571372 207 + 96509753 ATTTGCATCTCTT----TTTTTCATGCTTCCC-TTCTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACTCTGAGAAGTCGTAATTAATGG--------GAGGTCTTTGGAATAC---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAGTTCACATGCCTTACTGaccagaatcattc-acggagttttataaggatagattcccaggctctatcctcagagattttt i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.chr10 20495106 207 - 90941950 ATTTGCATCTCtt----tttttCATGCTTCCC-TTCTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACTCTGAGAAGTCGTAATTAATGG--------GACGTCTTTGGAATAC---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAGTTCACATGCCTTACTGACCAGAATCATTC-ACGGAGCTTTGTAAGGATAGATTCCCAGGCTCTATTCTCAGAGATTTTT i papAnu2.chr10 C 0 I 1 s chlSab2.chr19 20488450 215 - 33263144 ATTTGCATCTCTT----TTTTTCATGCTTCCC-TTCTTCTCCACCTCTTAAATTCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACCCTGAGAAGTCATAATTAATGGGACGTCTTGACGTCTTTGGAATAC---CCA-----ACCTAAAG--------CAAAAGTTCACATGCCTTACTGACCAgaatcattc-acggagctttgtaaggatagattcccaggctctatcctcagagattttt i chlSab2.chr19 C 0 I 1 s calJac3.chrUn_GL286438 66881 216 - 112050 ATTTGCATCTCTTTAAGTTTCTCATGCGTCCCCTTCTTCCCCACCTCTTAAATCCTTAAAGATCTATAAA----CAAAAGCACCCTGAGAAGTCATAATTAATGG--------GACTTCTTTGGAATACCCACCA-----ATCTAAAG--------CAAAAgttcacatgccttgctgaccagaatcattcaagggagctttgtaaggatgtattcccaggccctatcctcagagatctta i calJac3.chrUn_GL286438 I 305 C 0 s canFam3.chr26 15915300 227 - 38964690 ATTTTCAG--TTTTAAATTTCTCAGGCTTCCCCTTCTTCTCTACCTCTCAAATTCTTAAAGCTCTATAAAGAATTAAAAGCATTCTCAGAAGTCATAATTAATGG--------GAACCTTATGGAATAC---CAAGGGTGACCTAAAGCTGACTTTCACAggttcacagacctggctgaccagaatcattc-agggaacttcgtaagaatggattcccaggccccacccttagagatttta i canFam3.chr26 C 0 C 0 e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=678646.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 81241 320 + 478999 attcattaggtc---CTGCATAAGTTCGAGGAA-------CTTAGGTAGTCCATAATATTGCTAATGACCAGCCTTAAACTAGACAACCACTG-----AAGAACCTGGCCTATGAGCTGAGAAACTTGGGTTCTTTTATGGCAGGCCATTAACGACAAGTGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAACTGAGGG-----AGTAATTGCAGCCAAAAGAGGTCTGTCGTCATAGGCAGCCAATCTAGAATTCTAGAATCCTCCAAATTTAGTTTAATATCACATACTATACTGGG-TTACTCAAAACAGTGTCATTCTg s panTro4.chr22 21171565 317 - 49737984 attcaccaggtc---ctgcatgagttcgaggaa-------tttaggtagtccataatatttctaatgaccagccttaaactagacaaccactg-----AAGAACCTGGCCTATGAGCTGAGAAACTCAGGGTTTTTTATGGCTGGTCATTAATGACAAGCGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAAATGAGGG-----AGTAATTGGAGCCAAAAGAGGTAT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATTCTAGAATCCTCCAAATTTAATTTAATATCACATACTATACTGGGTTTACTCAAAACAGTGTCATTCTg i panTro4.chr22 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21360635 311 - 95678458 attcaccaggtc---ctgcatgagttcgaggaa-------tttaggtagtccataatatttctaatgaccagccttaaactagacaaccactg-----AAGAACCTGGCCTATGAGCTGAGAAACTCAGGTTCTTTTATGGCTGGCCATTAATGACAAGCGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAAATGAGGG-----AGTAATTGGAGCCAACAGAGGTCT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATTCTAGAATCCTCCAAA-----TTTAATATCACAT-CTATACTGAGTTTACTCAAAACAGTGTCATTCTg i rheMac3.chr10 I 1 C 0 s macFas5.chr10 21571580 312 + 96509753 attcaccaggtc---ctgcatgagttcgaggaa-------tttaggtagtccataatatttctaatgaccagccttaaactagacaaccactg-----AAGAACCTGGCCTATGAGCTGAGAAACTCAGGTTCTTTTATGGCTGGCCATTAATGACAAGCGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAAATGAGGG-----AGTAATTGGAGCCAACAGAGGTCT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATTCTAGAATCCTCCAAA-----TTTAATATCACATACTATACTGAGTTTACTCAAAACAGTGTCATTCTg i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.chr10 20495314 312 - 90941950 ATTCACCAGGTC---CTGCATGAGTTCGAGGAA-------TTTAGGTAGTCCATAATATTTCTAATGACCAGCCTTAAACTAGACAACCACTG-----AAGAACCTGGCCTATGAGCTGAGAAACTCAGGTTCTTTTATGGCTGGCCATTAATGACAAGCGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAAATGAGGG-----AGTAATTGGAGCCAACAGAGGTCT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATTCTAGAATCCTCCAAA-----TTTAATATCACATACTATACTGGGTTTACTCAAAACAGTGTCATTCTG i papAnu2.chr10 I 1 C 0 s chlSab2.chr19 20488666 312 - 33263144 attcaccaggtc---ctgcatgagtttgaggaa-------tttaggtagtccataatatttctaatgaccagccttaaattagacaaccactg-----AAGAACCTGGCCTATAAGCTGAGAAACTCAGATTCTTTCATGGCTGGCCATTAATGACAAGCGGGGCTGTACCACTGTGCTGGTCACTTGAAGTTCTCTGAGTCACCTGAAAATGAGGG-----AGTAATTGGAGCCAACAGAGGTCT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATTCTAGAATCCTCCAAA-----TTTAATATCACATACTATACTGGGTTTACTCAAAACAGTGTCATTCTg i chlSab2.chr19 I 1 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 67097 314 - 112050 attcaccaggtc---ctgcataagttcgaggaa-------tttcggtagtccatactatttctaatgatcagccttaaactagacaaccactg-----Aagaacctgggctgcgagctgaaaaagttgggttcttttatggctggccattaactacaagcagggctgtaccactgtgctggtcacttgaagttctctgagtcacttgaaaatgaggg-----agtaattggagccaaaagaggtct----tcataggcagccaatctaaaattctagaatcctCCAAATTTAGTTTAATATCACATACTATACTGGGT---CTCAAAACAGCCTCATTCTG i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15915527 327 - 38964690 attcaccagatccttctacatgaagctcaggaatcagcatttAAGGCAGTCCATACTATTTCTCATGA-----CTGTATTTAGGTAACCACTGAATTaaagaacttggcctacaagttgagaaacatgggttctcctatgacttgctattaactacaaatggggctgcaccactctgctggtcacttgaactgctctgggtcacctgaaaatgagggagttAAGTAATTAGAGCTGAAAGAGGCCT----TCATAGGCAGCCAATCTAAAATCCTAGAACTCTCCAAA-----TTCAGTTTAGTATACTACACTGGGCTTACACAAAACTGTATCACTCTG i canFam3.chr26 C 0 I 110 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=556527.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 81561 337 + 478999 gctgggggtggtggctcacgcctgtaatcccaacactttggaaggccgaggcaggtggatcacttgaggtcaggagttccagaccagcctagccaacacggagaaatccctgtctctactgaaaatacaaaaattagccagccgtggtggcgcacacttgcaatcccaactacttgggaggctaaggtgggagtattgctagaatccgagaggcggaggttgcagtgagcagacatcacactactgcactccggcctgggcggcagag-cgagataacgtctc---------aaaaaaaaaaaaa-------------------aaaGTGTCATTCTGTAAACTCTTCTAGCCTGCCCAAGTCATA s panTro4.chr22 21171882 343 - 49737984 gctggcggcagtggctcacgcctataatcccaacactttcgaaggccaacgcaagcggatcacttgaggtcaagagttccaggccagcctggccaacatggtgaaatccccgtctctactaaaaatacaaaaattagccagccgtggtggcgcacacttgtaatcccagctacttgggaggctaaggtgggaggattgctagaacctggcaggcggaggttgcagtgagcagagatcgcactactgcactttggcctgggcgggagag-cgagattctgtctt---------aaaaaaaaaaaaaaaaaag-------------aaaGTGTCATTCTGTAAGCTCTTCTAGCCTACCCAAGTCATA i panTro4.chr22 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21360946 363 - 95678458 gctcggggcagtggctcacacctttaattccaacactttggaa-gccaaggcaagcgaatcacttgaggtcaggagttccagaccaggctggccaacatggtgaaatccccatctctaccaaaaatacaaaaattaaccagccgtggtggcacaaacttgtaatcccagctacttgggaggctgaggtgggaggattgctagaacccgggaggcggaggttgcagtgagcagagatcgcactactgcactccggcctgggcgggagagccaagattccgtctt--aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaGAAATGAAAAAAGGTGTCATTCTGTAAACTCTTCTAGCCTACCCAAGTCATG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21571892 360 + 96509753 gctcggggcagtggctcacacctttaattccaacactttggaaggccaaggcaagcgaatcacttgaggtcaggagttccagaccaggctggccaacatggtgaaatccccatctctaccaaaaatacaaaaattaaccagccgtggtggcacaaacttgtaatcccagctacttgggaggctgaggtgggaggattgctagaacccgggaggcggaggttgcagtgagcagagatcgcactactgcactccggcctgggcgggagagccaagattccgtctt------aaaaaaaaaaaaaaaaagaaagaaagaaaTGAAAAAAGGTGTCATTCTGTAAACTCTTCTAGCCTACCCAAGTCATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20495626 366 - 90941950 GctcggggcagtggctcacacctttacttccaacactttggaaggccaaggcaagcgaatcacttgaggtcaggagttccagaccagcctggccaacatggtgaaatccccatctctactaaaaatacaaaaattaaccagccgtggtggtacacacttgtaatcccagctacttgggaggctgaggtgggaggattgctagaacccgggaggcggaggttgcagtgagcagagatcgcactactgcactccggcctgggcgggAGAGCCaagattccgtcttaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaagaaagaaagaaagaaaaaaaggtgtcATTCTGTAAACTCTTCTAGCCTACCCAAGTCATG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20488978 357 - 33263144 gctcggggcagtgcctcacacctttaattccaacactttggaaggccaaggcaagcgaatcacttgaggtcaggagttccagaccagcctggccaacatggtgaaatccccatctctactaaagatacaaaaattaaccagccgtggtggcacacacttgtaatcccagctacttgggaggctgaggtgggaggattgctagaacccgggaggcggaggttgcagtgagcagagatcgcactactgcactccggcctgggcgggagagccaagattccgtctt---------aaaaaaaaaaaaaagaaagaaagaaagaaaAGAAGGTGTCATTCTGTAAACTCTTCTAGCCTACCCAAGTCATA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 67411 331 - 112050 GCTggggg------ctcatgtctgttctttcaacactttggaaggccaaggcaggcaaatcacttgaggtcaggaattccagaccagcaaggccaacatggtgaaactccggtctctactaaaaatacaaaaattagccggccgtggtatcccacacttgtaatcccatctgcttgggaggctgaggtgggaagattgctagaaccggggaggcggaggttgcagtgatcagagatcacactactgcacttcagactgggcagcagag-caagactctgtctc---------aaaaaaaTATATA-------------------TATATATCATTCTGTAAGCTCTTCTAGCCTACCCAAGTCACA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15915854 110 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=335610.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 81898 184 + 478999 GGCCCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAGGGGGATGGTCCCCCACCACCTCTCCACGGACAAATCATAAACATCTAACATTT----TAAAAA-----AATCATCTCCTGTAATTCAACCCAGGCCTCTCATGGCATTACCATTCACATAA----- s panTro4.chr22 21172225 188 - 49737984 GGCCCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAAGGGGAAGGT-CCCCACCACCTCTCCATGGACAAATCACAAACATTTGACATTG----AAAAAAATAATAATAATCTCCTGTAATTCAACCCAGGCCTCTTATGGCATTACCATTCACATAT----- i panTro4.chr22 C 0 N 0 s rheMac3.chr10 21361309 191 - 95678458 GGCCCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAAGGGGAAGGT-CTCCACCACCCCTCCATGGACAAATCACAAACATTTGACatttaaaaaaaaaaaaaa-aatCATCTCCTGTAATTCAACCCAGGCCTCTCATGGCATTACCATTCACATAT----- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21572252 190 + 96509753 GGCCCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAAGGGGAAGGT-CTCCACCACCTCTCCATGGACAAATCACAAACATTTGACATTT-AAAAAAAAAAAAA-AATCATCTCCTGTAATTCAACCCAGGCCTCTCATGGCATTACCATTCACATAT----- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20495992 186 - 90941950 GG-CCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATTAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAAGGGGAAGGT-CTCCACCACCTCTCCATGGACAAATCACAAAcatctgacattt----aaaaaaaaaa-aatcatctcctgTAATTCAACCCAGGCCTCTCATGGCATTACCATTCACATAT----- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20489335 187 - 33263144 GGCCCTATAAAGGGAAGACTTTCTGCATGCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-GAAAGGGGAAGGT-CTCCACCACCTCTCCATGGACCAATCACAAACATTTGACATTA----AAAAAAAAAA-AATCATCTCCTGTAATTCAACCCAGGCCTCTCATGGCATTACCATTCACATAT----- i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 67742 169 - 112050 GGCCCTATAGAGGGAAAACTTTCTGCATCCCATCAATGTCTCCTGTCCTACTGAACAGCCCTGAATCT-TAAAGGGTATGGT-CCCCACCACCTCTCCGTGG-----------ACATTTGACATTA----AAGAAA-----AATCATCTCCTATAATTCAACCCAGGCCTCTCATGG---TATCATCCACATAT----- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15915964 143 - 38964690 GGCTCTACAGA------------------------------------------AACAGCCTTTAATCTAAAAAGGAGAAAGT-CCCGGTCACCTCTCCAGGTACAAATCACAAACGTCTTACATAA----AA---------AATCATCTCGTGTAATTCAACCCAAGCCTTCGATAGCATCACTGTCCACACTGTGAGA i canFam3.chr26 I 110 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=127429.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 82082 74 + 478999 GAGAAAGTTGAACCTCAACTGCAAAAGTATATGGTTTGGGGGTGTTGTTTTGTTTGTTTGGGTTGTGGAAAAAC s panTro4.chr18 74564971 69 - 76611499 GAGAAAGTTGAACCTCAACTGGAAAAGTATATGGTTTTGGGGT-----TTTGTTTGTTTGGGTTGTGGAAAAAT i panTro4.chr18 N 0 C 0 s rheMac3.chr10 21361500 74 - 95678458 GAGAAAGCTGAACCTCAACTAGAAAAGTACATGGTTTTGGGGTTTTGTTTTGTTTGTCTAGGTTGTGGAAAAGT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21572442 74 + 96509753 GAGAAAGCTGAACCTCAACTAGAAAAGTACATGGTTTTGGGGTTTTGTTTTGTTTGTCTAGGTTGTGGAAAAGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20496178 74 - 90941950 GAGAAAGCTGAACCTCAACTAGAAAAGTACatggttttggggttttgttttgtttgtctaggTTGTGGAAAAGT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20489522 70 - 33263144 GAGAAAGCTGAACCTCAACTAGAAAAGTACATGGTTTTGGGGTTTTGT----TTTGTCTAGGTTGTGGAAAAGT i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 67911 74 - 112050 GAGAAAGTTGAACCTCAACTAGGAAAGTATATGGTTTTGGggtttggtttggtttggtttggttGTGAAAAAAC i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 304 s canFam3.chr26 15916107 56 - 38964690 AAAGAAGTTGAACCTCAACTACAAGAGTGCACACATTT------------------TTTTCGTTGTGAAAAATT i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=1782628.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 82156 870 + 478999 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATATCAAGATACTAGAACAGT-AAGAATTTAGGCCTCGGTCTGGAAACGAC------ATTTGAACATCAATATGTAATAGTAGTTCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTGACA-TAACTTTTCCAGCCCAAAATACGACTGAC---ATCATCTTATGGGTCCGGAAATACCATACATCAAGGAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCGTTTGGGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTACGCCAACCGCCCC-CAACCATCCTTCCCACCTA----TTACCAGGTCAGGAGGATGTCCTGCTGCACGCTCAGGCGGTCGCTCCTCCTTTCCACAAGACCCAGGCCCGCACCGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATGGCCCCCGACCTCCAGTCTCCAGCAACGATGGATCCCCACAGACCAGGCAGGGGGCGAAGGGC---------GCACACCCACCTCCCGGGAGTCAGTGGGAATAACCC-GGGCGCTCC-CAGGGTACGTCCCACACCCGGAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CTGGGCAGGCAGCCGGAGCCCGGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGGGTCCCGGCCGAGCTCGACCGCTGAGGTCCCGTTCCCACTCCCACTCCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGGCGGCCGCCC---GGGACGCCCCTCCCC-------------------------------GGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCCTGGCCGGGGCC---ATAGAGGCCGGCCCCTCCTCCAGCTCCTCCTCACCCCGGGAGGAGACAGGGGACGGGGATGGGGTTCTTACCAGGCAGCAGGACATGG s panTro4.chr18 74565040 876 - 76611499 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATATCAAGATACTAGAACAGT-AAGAATTTAGGTCTGGGTCTGGAAACGAC------ATTCGAACATCAATATGTAATAGTAGTTCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTGACA-TAATTTTTCCAGCCCAAAATACAACTGAC---ATCATCTTATGAGTCCGGAAGTGCCATACATCAAGCAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCGTTTGGGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTACGCCGACCGCCCC-CAACCATCCTTCTCACCTAATTATTACCAGGTCAGGAAGATGTCCTGCTGCACGCTCAGGCGGTCACTCCTCCTTTCCACAAGGCCCATGTCCGCACCGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATAGCCCCCGACCTCCAGTCTCCGGCAACGATGGACCCTCACAGACACGGCAGAGAGCGAAGGGC---------GCACACTCACCTCCCTGGAGTCAGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCT-GAGGGTACGTCCCACACCCGTAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CCGGGCAGGCAGCCCGAGCCCGGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGAGTCCGGGCCGAGCTTGGCAGCTGAGGTCCCGTTCCCACTCCCACTCCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGGCGGCCGCCT---GGGAGGCCCCTCCCC-------------------------------GGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACTGCCGCCTGGCCGGGCCG--GACAGAGGCCGGCCCCTCTTCCAGCATATCGTCACCCCAGGAGGAGACGGGGGACGGGGATGGGGTTCTAACCAGGCAGCAGGACACAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21361574 895 - 95678458 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATGTCAAGATACTATAACAGT-AAGAATTTAGGCCTGGGTCTGGAAAGGAC------ATTTGAACATCAATATGTAATAGTAATCCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTGACA-TAAGTTTTCCAGCCCAAAATACAACCGACAATATCATCTTACGGGTCCGGAAATGCCATCCATAAAGCAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCATTTGCGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTAGGCCAACCGCCCC-CAACCATCCTTCCCACCTAAGTACTACCAGGTCAGGAGGATGCCCTGTTGCATGATCAGGCGGTCA---CTCCCTTCCACAAGGCCCAGGCCCGTACAGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATGGCCCCCGACCTCCAGTATCCGGCA-------------ACAGACCCGGCAGGGGGCGAAGGGC---------GCACATCCATCTCCCAGGAGTCCGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCC-GAAGCTACGTCCCACACCCAGAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CTGGGAAGGCAGCCCGAGCCCAGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGGGTCCGGGCCGAGCTCGGCCGCTGAGCTCCCATTCCCACTCCCACACCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGACGGCCGCTG---GGGACGCCCCTCCCCGGGCCCCGCACGCAGTCCCCAGCCCTCC-CAGGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCCTggccggggccggggccgaggccggccccTCCTCCAGCTCTTCCTCACCCCCCGAGGAGACGGAGGACGGGGATGGGGTTCTTACCGGGCAGCAGGACATGG i rheMac3.chr10 C 0 M 142 s macFas5.chr10 21572516 908 + 96509753 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATGTCAAGATACTATAACAGT-AAGAATTTAGGCCTGGGTCTGGAAAGGAC------ATTTGAACATCAATATGTAATAGTAATCCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTGACA-TAAGTTTTCCAGCCCAAAATACAACCGACAATATCATCTTACGGGTCCGGAAATGCCATCCATAAAGCAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCATTTGCGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTAGGCCAACCGCCCC-CAACCATCCTTCCCACCTAAGTACTACCAGGTCAGGAGGATGCCCTGTTGCATGATCAGGCGGTCA---CTCCCTTCCACAAGGCCCAGGCCCGTACAGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATGGCCCCCGACCTCCAGTATCCGGCAACGATGGACCGCCACAGACCCGGCAGGGGGCGAAGGGC---------GCACATCCATCTCCCAGGAGTCCGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCC-GAGGCTACGTCCCACACCCAGAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CTGGGAAGGCAGCCCGAGCCCAGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGGGTCCGGGCCGAGCTCGGCCGCTGAGCTCCCATTCCCACTCCCACACCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGACGGCCGCTG---GGGACGCCCCTCCCCGGGCCCCGCACGCAGTCCCCAGCCCTCC-CAGGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCCTGGCCGGGGCCGGGGCCGAGGCCGGCCCCTCCTCCAGCTCTTCCTCACCCCCCGAGGAGACGGAGGACGGGGATGGGGTTCTTACCGGGCAGCAGGACATGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20496252 908 - 90941950 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATGTCAAGATACTATAACAGT-AAGAATTTAGGCCTGGGTCTGGAAAGGAC------ATTTGAACATCAATATGTAATAGTAATCCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTGACA-TAAGTTTTCCAGCCCAAAATACAACCGACAATATCATCTTACGGGTCCGGAAATGCCATACATAAAGCAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCATTTGCGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTAGGCCAACCGCCCC-CAACCATCCTTCCCACCTAAGTATTACCAGGTCAGGAGGATGCCCTGTTGCATGATCAGGCGGTCA---CTCCCTTCCACAAGGCCCAGGCCCGTACAGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATGGCCCCCGACCTCCAGTATCCGGCAACGATGGACCGCCACAGACCCGGCAGGGGGCGAAGGGC---------GCACATCCACCTCCCAGGAGTCCGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCC-GAGGCTACGTCCCACACCCAGAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CTGGGAAGGCAGCCCGAGCCCAGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGGGTCCGGGCCGAGCTCGGCCGCTGAGCTGCCATTCCCACTCCCACACCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGACGGCCGCTG---GGGACGCCCCTCCCCGGGCCCCGCACGCAGTCCCCAGCCCTCC-CAGGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCctggccggggccggggccgagGCCGGCCCCTCCTCCAGCTCTTCCTCACCCCCCGAGTAGACGGAGGACGGAGATGGGGTTCTTACCGGGCAGCAGGACATGG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20489592 908 - 33263144 AGA---TGTCAGA-AAACAAAGTGGATGTCAAGATACTATAACAGT-AAGAATTTAGGCCTGGGTCTGGAAAGGAC------ATTTGAACATCAATATGTAATAGTAATCCATGTCCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAACGTGGCCATAAAATCTACCCCATAATTTTAACA-TAAGTTTTCCAGCCCAAAATACAACCGACAATATCATCTTATGGGTCTGGAAATGCCATACATAAAGCAAAATTTCTACCGGAGAAATAACACTGTAATCATTTGCGGAGCAGTCTGACCAGTGTTCCCTGAGTTAGGCCAACCGCCCC-CAACCATCCTTCCCACCTAAGTACTACCAGGTCAGGAGGATGCCCTGTTGCAGGATCAGGCGGTCA---CTCCCTTCCACAAGGCCCAGGCCCGTACAGTTCGCCCCGG-GGCTCCCATGGCCCCCGACCTCCAGTATCCGGCAACGATGGACCGCCACAGACCCGGCAGGGGGCGAAGGGC---------GCACATCCACCTCCCAGGAGTCCGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCC-GAGGCTACGTCCCACACCCAGAGCCGCACGGGCCCATCCCCGCCAGGT--CTGGGAAGGCAGCCCGAGCCCAGGACCCCGCCTCCCCCGCACCTAGGGTCCGGGCCGAGCTCGGCCGCTGAGCTCCCATTCCCACTCCCACACCCAGCGCCTCCCCCTGGCGGCGACGGCCGCTG---GGGACGCCCCTCCCCGGGCCCCGCACGCAGTCCCCAGCCCTCC-CAGGGCGCTGCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCCTGGCCGGGGCCGGGGCCGAGGCCGGCCCCTCCTCCAGCTCTTCCTCACCCCCCGAGGAGACGGAGGACGGGGATGGGGTTCTTACCGGGCAGCAGGACATGG i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 68289 911 - 112050 aGA---TGTCAGA-AAACAGAGTGGATATCAAGATACTAGAACAGT-AAGAATTTAGGCCTGGGTCTGGAAAGGACATTTGAATTTGAATATCAATACCTAAAAGTAATCCATGTGCAAAACTCACAAGTGAGATTATCAAACTCCAGGGGAGTCTATTAATGTGACCATAAACTCTGCCCCTTAATTTCGACATTAAGTTTTCCAGTCCCAACTACTACCGACAATATAATCTTATGGGTCCGGAAATGCCATACAACAAGCAAAATGTCTCCCCGAGAAATAACACTGTAAACGATTGCGGAGCAGTCCGGCCAGTGTTCCCTGAGCTGCGCAAACTGTCCC---AGCATCCTTCCCACCTAAGTACTACCAGGTCAGGAGGAGGTCCTGCTGCACCATCAGGCGGTCACTCCTCCTTTCCACAAGGCCCAGGCCTGCGCCATGCGCCCCGG-GGCTCCCGTGACCCCCGACCTCCAGTCTCTGGCAACGACGGAGCCCCACAGACCCGGCAGGGGGTGAAGGGC---------ACACACTCACCTCCCGGGAGTCCGTGGGAATAACCCCGGGCGCTCC-TGGGGCACGTCCCACACCCGGAGCCGCACGGGCCCATCTCCGACAGGT--CCGGGAGGGCAGCCAGAGCCCGAGACCCCGCCTTCCCCGCACCTAGGGTCC-GGCCGAGCT-GGCCGCTGAGCTCCCATTTCCACTCCCTCTCCCAGCGCCACCCCCTGGCGGCGGCGATGGCCC---GGGACGCCCCTCCCCGGGCCCCGCACGCGGTCCCCAGCCCTTC-CAGGCCACTGCCTCCTCCGAGGGTGACAGCCGCCTGGCCCGGGCCAAGGCCGAGGCCGGCCCCTCCTCCAGC--CTCTTCACCTCCCGAGGAGACAGGGGACGGGG-TGGGCTTCTTACCGGGCAGCGCGACACGG i calJac3.chrUn_GL286438 I 304 C 0 s canFam3.chr26 15916163 852 - 38964690 AGACTCTGTCAGATAAACAAAGCGGGTGTCAAGATATTAAATCAGTCGAAAATTTAGGCCTCTGACTGGAGAAGAC------ACTTGAACATCAACAGCTAACTGAACATCAAGTACAAAACT--CAAACGAGATTATCAGGCCCCAAAGAAGTTTATTAAAGTGCCCATAAAATTGACCCCATTTTTTCGAGG-TAAGTTTTCCAGCCCAAAGTACAAGCAACAAAATTATCGCAGGGGTCCTGAG------------CGGCACAATTTCCACCTAGGAAA--------TCCTTTTTCGCGGAGCTGTTTGACCAGCGTCCCCTGCTCT----TAACCGCCTCGGAACCATCCTTCCCACCCAAGTACTACCAGGTCAGGAGGATGCCCTGCTGCAG----AGTCGGCCACTCCTCCTTCCCACAAGTCCCGGGCCCGCACCGCTCGCCCCGGAGGCTCTGCTGGCCCCCGACCTCCGGCCTCT-------------CGCCACAGACCCGGTCGGGAGCGAGGGGCGGGGGGGGTGCTCACTCACCTCCCGGG-GTGCGCGGGCACTTCTCCGGACGCTCCAGGGGCGGCACTTCACACCCCTCTCCCCACGGGCCCATCCCTGCCAGGTCCCCGGGATGGCCGCCCG------GGACCCCGCCTCCCCCGCGCCGAGGGTCGGGGCCGAGCCCAGCCGCTG------------CGCTCCCACTCCCCACGCCTCCCCCTGGCGGCCGCGGCCGCCGCCCAGGACACCCTTCCCCAGGC----CACGCCGTCCCCAGCCCCCCGCGGGCCGCCTCCTCCTCAGAGGGTGACAGCCGCTGCGCCGCGGCC------GAGGccggcccctcctccggcccctcctcACCCCGGGAGGAGG-GGGGGACG---------TTCTTACCGGGCGGCAGGACATGG i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=248222.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83026 154 + 478999 CAAGGCCCGCCACGGCACAGCCTCCTCCTCCACCATCTCACCAGGCTCCCTGCCAGGCCCGGCGCAGGGCAGCGACTGAGCTACTAGGGCGTCTGGTCCGGCTG---CTACT---------ccgccgccgccgccgccTTCTCACAACCACAACAACACTGCAGCA s panTro4.chr18 74565916 154 - 76611499 CAAGGCCAGCCACGGCACAGCCTCCTCCTCCACCATCTCATCAGGCTCCCTGCCAGGGCCGGCGCAGGGCAGCGCCTGAGCTACTAGGGAGTCTGGTCCGGCTG---CTGCT---------CCGGCGCCACCGCCGCCTTCTCACAGCCACAACAACACTGCAGCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21573424 157 + 96509753 CGAGGCCCGCCACGGCACAGTCTCCTCCTCCGCCACCCCACCAGGCTGCCTGCCAGGGCCGGCGCGGGGTAGCGCCTGAGCCGCTGGGACGTCTAGTCCTGCTGCTACTACT---------ccgccgccgccgccgccTTCTCACAACCACAACAACATGGCGGCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20497160 157 - 90941950 CGAGGCCCGCCACGGCACAGTCTCCTCCTCCGCCACCCCACCAGGCTGCCTGCCAGGGCCGGCGCGGGGTAGCGCCTGAGCCGCTGGGACGTCTAGTCCTGCTGCTACtact---------ccgccgccgccgccgccttctCACAACCACAACAACATGGCGGCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20490500 157 - 33263144 CGAGGCCCGCCACGGCACAGTCTCCTCCTCCGCCACCCCACCAGGCTGCCTGCCAGGGCCGGCGCGGGGTAGCGCCTGAGCCGCTGGGACGTCTAGTCCTGCTGCTACTACT---------ccgccgccgccgccgccTTCTCACAACCACAACAACATGGCGGCA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 69200 163 - 112050 CGAGGTCCGCCACGGCACGGCCTCCTCCTCCGCCACCCCACCAGGCTCCCTGCCAGAGCCGGCGCGGAGCAGCACCTGAGCCGCTGGGGCGTCTCATCCCGCAG---CTACTccgcagccgccgccgccgccgccgccTTCTCACAACCACAACAACCTGGCGGCC i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15917015 151 - 38964690 CGAGGCTCGCCACGGCACGG---CCTCCTCCGCCACCCCACTAGGCTCCCAGCCAGGGCCGGCGGGGGGCAGCGCCTGAGCCGCTGGAGCGTCTCGTCCGGCTG---CTCCT---------CCGCTGCCACCGCCGCCTTCTCACAACCACAACAACATGGCGGCA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 21362469 142 - 95678458 M e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=410682.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83180 225 + 478999 GCGGCCACACAGAGTGCACTCCCGACGCCGAGCcgggcgacgagcggagacgcgcgcgcaggctcgggcgcTGAAC--CGGGTGTCCGGGA---------AAGGGGGCGGGTCTCCGGGAAAGGGGGCGGGTCTCCGCCTGGTGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATAGGCGGGGCTGCAGCCCAGACGAATACCAGCGTTTGGGGAGAGGCTCGCG s panTro4.chr18 74566070 205 - 76611499 GCGACCACACAGAGCGCGCTCCCGACGCCGAGCCGGGCGACAAGCGGGGACGCGCTCGCACGCTCGGGAGCTGAAC--CCGGTGTCCGGGG---------AAGGGGGCGGGTCTCCG----------CGGGT----------TGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGCGGTCACGCCCCAGGAGATGGGAGGGGCTGCAGCCCAGACGAATACCGGCGGCTGGGGAGAGGCTCGCG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21362615 205 - 95678458 GCGGCCACACAGAGCGCGCTCCCGACGCCGAGCCGGGCGACGACCGGGGACGCGCGCGCACGCTCGGGCGCTGAGC--CGGGTGTCCGGGA---------AAGGGGGCGGATCTCCG----------CCGGT----------TGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATGGGCGAGGCTGCAGCCCAGACTAATACCCGCGGCTGGGGAGAGGCTCGCG i rheMac3.chr10 M 142 C 0 s macFas5.chr10 21573581 205 + 96509753 GCGGCCACACAGAGCGCGCTCCCGACGCCGAGCCGGGCGACGACCGGGGACGCGCGCGCACGCTCGGGCGCTGAGC--CCGGTGTCCGGGA---------AAGGGGGCGGATCTCCG----------CCGGT----------TGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATGGGCGAGGCTGCAGCCCAGACTAATACCCGCGGCTGGGGAGAGGCTCGCG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20497317 205 - 90941950 GCGGCCACACAGAGCGCGCTCCCGACGCCGAGCCGGGCGACGACCGGGGACGCGCGCGCACGCTCGGGCGCTGAGC--CCGGTGTCCGGGA---------AAGGGGGCGGATCTCCG----------CCGGT----------TGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATGGGCGAGGCTGCAGCCCAGACTAATACCCGCGGCTGGGGAGAGGCTCGCG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20490657 205 - 33263144 GCGGCCACACAGAGCGCGCTCCCGACGCCGAGCCGGGCGACGACCGGGGACGCGCGCGCACGCTTGGGCGCTGAGC--CCGGTGTCCGGGA---------AAGGGGGCGGGTCTCCG----------CCGGT----------TGGACGGGGGCGGGGCCTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATGGGCGAGGCTGCAGCCCAAGCTAGTACCCGCGGCTGGGGAGAGGCTCGCG i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 69363 206 - 112050 GCAGCCGCACAGAGCGCGCTCTCGACGCGGAGCCCGGCGACAAGCGGGGACGCGCGCGCACGCTAGGGCGCTGAGCGGGGGGTGTCCGGGA---------AAGGAGGCGGGTCTCC-----------CCTGT----------TGGACGGGGGCGGGGACTGGACAGGTGGTCACGCCCCAGGAGATGGGCGGGACTGCAGTCCAGACTAATACCCGCGGCTAGGCAGAGGCTAGCA i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 I 342 s canFam3.chr26 15917166 209 - 38964690 GCGGCCACACAGAGCGCGCCCCCGACGCCGAGCCGGGCCGCGAGCGGGAGCGCGCGCGCACGCTCGGGCCCTCAGT--CCGCGGTCGCGGAGCAGGAGGCAGGCGGGCAGGCAGGCG----------CTGGC----------GGGGC-AAGGCGGGGCC-GGGCCGACGGCCACGCCCCAGCTGGTGGGCGGGGCCGCGCGGCGGCTGAACGCCCTCCGC--GGGAAAGGCTGGC- i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=466732.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83405 265 + 478999 AAAAAGCCCAGC---GGAGGCAGAAGGGCTAGAC---AGATGGGAATTGGGCGCAGGAAAAGCGATGACAAAAATAAA--TCTGGAAGAAAACCAAAGGTGGTCCTACAAATT--TTTAGGAGGCGTCTTT--------------CCCTGGGCAAGACATGGCTCACTCTACTTACCAGAAAAATAGAACAACAGTGGTTATCTTTCACCTGCAATTGTGGTCAGGATAAAAGCAGTTTAATATAGTGCAAGTAAATGTAGTGTTTTAGAAGATGTATTCAGGATACAA s panTro4.chr18 74566275 266 - 76611499 AAAAAGCCCAGC---GGAGGCAGAAGGGCTAGGC---AGATGGGAATTGTGCGCAGGAAAAGCGATGACAAAAAAAAAAATCTGGAAGAAAACCAAAGGTGGTCCTACAAATT--TTTAGGAGGCGTCTTT--------------CCCTGGGCAAGACAtggctcactctacttaccagaaaaatagaacaacagtggt-atctttcacctgcaattgtggtcaggactaaaccagtttaatatagtgcaaGTAAATGTAGTGTTTTAGAAGATGTATTCAGGATACAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21362820 277 - 95678458 AAAAAGCCCAGC---GGAGGAAGAATGGCTCGAC---AGATGGGAAATGGGTGGAGAAAAAGAGATGACAAAAAAAA---TCTGGAAGAAAACCAAAGGTGGTCCTACAGATT--TTTAGGAGGCGTCTTTTCCAagctctgtaaccctgggcaagacatggctcactctacttaccagaaaaatagaacaatagtgat-atcttccacctgcaattgtgggcaggataaaatcagtttaatataATGCAAGTAAATATAGTGTTTTAGAAGTTGTATTCAGAATACAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21573786 277 + 96509753 AAAAAGCCCAGC---GGAGGAAGAATGGCTCGAC---AGATGGGAAATGGGTGGAGAAAAAGAGATGACAAAAAAAA---TCTGGAAGAAAACCAAAGGTGGTCCTACAGATT--TTTAGGAGGCGTCTTTTCCAAGCTCTGTAACCCTGGGCAAGACATGGCTCACTCTACTTACCAGAAAAATAGAACAATAGTGGT-ATCTTCCACCTGCAATTGTGGGCAGGATAAAATCAGTTTAATATAATGCAAGTAAATATAGTGTTTTAGAAGTTGTATTCAGAATACAA i macFas5.chr10 C 0 I 5304 s papAnu2.chr10 20497522 277 - 90941950 AAAAAGCCCAGC---GGAGGAAGAATGGCTCGAC---AGATGGGAAATGGGTGGAGAAAAAGAGATGAcaaaaaaaa---tctggaagaaaaccAAAGGTGGTCCTACAGATT--TTTAGGAGGCGTCTTTTCCAAGCTCTGTAACCCTGGGCAAGACATGGCTCACTCTACTTACCAGAAAAATAGAACAATAGTGGT-ATCTTCCACCTGCAATTGTGGGCAGGATAAAATCAGTTTAATATAATGCAAGTAAATATAGTGTTTTAGAAGTTGTATTCagaatacaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20490862 277 - 33263144 AAAAAACCCAGC---GGAGGAAGAATGGCTCGAC---AGATGGGAAATGGGTGGAGAAAAAGAGATGACAAAAAAAA---TCTGGAAGAAAACCAAAGGTGGTCCTACAGATT--TTTAGGAGGCGTCTTTTCCAagctctgtaaccctgggcaagacatggctcactctacttaccagaaaaatagaacaatagtggt-atcttccacctgcaattgtggtcaggataaaatcagtttaatataatgcaagtaaaTATAGTGTTTTAGAAGTTGTATTCAGAATATAA i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 69911 275 - 112050 AAAAAGCCCAGC---GGAGAAAGATGGGCTAGAC---AGATGGGAAATGGGCGGAGGTAAAGCGATGACCAAAAAAA---GCTGGAAGAAAGCCAAAGGTGATCCTACAGGTTTATTTAGGAGGGATCTTTTCCAAGCTCTCTAACCCTGGGCAAGACATGGCTTACTCTACTTACCTG----ATAGAAAAGTTCTGGC-ATCTTTCACCTACCATTTTGATCATGGTAAAACAAGTTTAATATAATGTAAGTAAATATAGTGTTTTAGAAGTTGTATTCAGAATACTA i calJac3.chrUn_GL286438 I 342 I 7 s canFam3.chr26 15917375 214 - 38964690 ------CCCAGCTCAGGTGGAGAAGGGATTCGGCGCTGGGTGGGAAGTGGG-----------------------------CC---GAGAAAACCAACGGCGGTCCTA-AGATC--AGGGGGAGGCAACTTTTCCCTTCCCTATAGCCCTGGGCAAGACAAAGC---CTCACACAACCAGTAAAATA------------C----------------TTATGGTGAGCATGAAACTAATCTAATATAACGCATAGAGGTATGGTGAGCTCGAGGCT---CTCGGAATACAA i canFam3.chr26 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=7644.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83670 3 + 478999 ttt s panTro4.chr18 74566541 3 - 76611499 TTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21363097 3 - 95678458 ttt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21579367 3 + 96509753 ttt i macFas5.chr10 I 5304 C 0 s papAnu2.chr10 20497799 3 - 90941950 ttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20491139 3 - 33263144 ttt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 70193 3 - 112050 ttt i calJac3.chrUn_GL286438 I 7 C 0 s canFam3.chr26 15917589 3 - 38964690 TTT i canFam3.chr26 C 0 I 90 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=11515.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83673 7 + 478999 ctttttt s panTro4.chr18 74566544 7 - 76611499 CTTtttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21363100 7 - 95678458 ttttttt i rheMac3.chr10 C 0 I 29 s macFas5.chr10 21579370 7 + 96509753 ttttttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20497802 7 - 90941950 ctttttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20491142 7 - 33263144 ctttttt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 70196 7 - 112050 ctttctt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15917592 90 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=3529.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83680 12 + 478999 tcattt-------------cttttt s panTro4.chr18 74566551 25 - 76611499 tctttttctttttctttttcttttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21579377 9 + 96509753 ---ttt-------------tttttt i macFas5.chr10 C 0 I 2 s papAnu2.chr10 20497809 5 - 90941950 --------------------ttttt i papAnu2.chr10 C 0 I 2 s chlSab2.chr19 20491149 12 - 33263144 tttttt-------------tttttt i chlSab2.chr19 C 0 I 25 s calJac3.chrUn_GL286438 70203 12 - 112050 tctttt-------------tttttt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15917592 90 - 38964690 I e rheMac3.chr10 21363107 29 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=11454.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83692 27 + 478999 ttttttt----------------ctgtcgcccaggctggaatg s panTro4.chr18 74566576 43 - 76611499 ttcttttgagacagagtctggctctgtctcccaggctggaatg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21579388 25 + 96509753 tttttttgagacagagtctggctct------------------ i macFas5.chr10 I 2 I 9 s papAnu2.chr10 20497816 25 - 90941950 tttttttgagacagagtctggctct------------------ i papAnu2.chr10 I 2 I 6 s calJac3.chrUn_GL286438 70215 43 - 112050 ttttttttagacagagtctggctctgtcacccaggctggattg i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15917592 90 - 38964690 I e chlSab2.chr19 20491161 25 - 33263144 I e rheMac3.chr10 21363107 29 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=394763.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83719 243 + 478999 cagtgacatctcagctcactgcaaactccgcctcccgggctcaagtgatcctcccacctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgcagaacatcatgccccgccaatttttgtattttttgtagacacggagtttctgccattttgtccaggctggtctcgaactcctgggctcaagcaatccacccacctcggcctcccaaagcgctgggattaaaggcatggaccgccgcacccggt s panTro4.chr18 74566619 243 - 76611499 cagtgacatctcagctcactgcaaactccgcctcctgggctcaagcgatcctcccacctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgcagaacatcatgcccggctaatttttgtattttttgtagacatggagtttctgccattttgtccaggctggtctcgaactcctgggctcaagcaatccacccacctcggcctcccaaagcactgggattacaggcatgaagcaccgcactcgAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21363136 240 - 95678458 cagtcgcatctctgctcactgcaccctctgtctcccgggctcaagcgatcctcccacctcagactcctgagtagctgggacgacagactg---acatcatgctcggctaatttttgtattttttgtagagacgagggttctaccattttgtccagactggtctcaaactcctgggctcaagcaatccacctacctcagcgtcccaaagcgctgggattacaggcatgaaccaccgcacccTGT i rheMac3.chr10 I 29 C 0 s macFas5.chr10 21579422 237 + 96509753 ---tggcatctctgctcactgcaacctctgtctcccgggctcaagcgatcctcccacctcagcctcctgagtagctgggactacagactg---acatcatgcccggctaatttttgtattttttgtagagacgaggtttctaccattttgtccagactggtctcaaactcctgggctcaagcaatccacctacctcagcctcccaaagcgctgggattacaggcatgaaccaccgcacccTGT i macFas5.chr10 I 9 C 0 s papAnu2.chr10 20497847 240 - 90941950 cagtggcatctctgctcactgcaacctctgtctcccgggctcaagcgatcctcccacctcagcctcctgagtaactgggactacagactc---acatcatgcccggctaatttttgtattttttgtagagacgaggtttctgccattttgtccagactggtctcaaactcctgggctcaagcaatccacctacctcagcctcccaaagcgctgggattacaggcatgaaccaccgcactcTGT i papAnu2.chr10 I 6 C 0 s chlSab2.chr19 20491186 240 - 33263144 cagtggcatctcggctcactgcaacctctgtctcccgggctcaagcgatccttccacctcagcctcctgagtagctgggactacagactc---acatcatgcccggctaatttttgtattttttgtagagacgaggtttctgccattttgtccagactggtctcaaactcctgggctcaagcaatccaccttcctcagcctcccaaagcgctgggattacaggcatgaaccaccgcacccTGT i chlSab2.chr19 I 25 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 70258 240 - 112050 cagtggcacct-ggttcgctgcaaccccc-tctcctgggctcaatcgatcctcccacctcagcctcctgagtagcagggactacaggcacacaacatcatgcccaggtaacttttgtattttttgtagagatgcagtttctgccattttgtccaggctggtctggaactcctgggctcaagcaattc-cccacttcggcctccaaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgtgctcagt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15917592 90 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=1216207.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 83962 721 + 478999 cCAGAATACAATTTCAAGCTGATTCAACTTCAGCTCCTAATCAAAAGCTTAGCGGGAAGAAGTGAATTTTCAAACAAAATAA-----ACCCCTCCCCCGCAAATTGTAACCTACCCACATTAGCCTGcagaattccacaaaccaggattgcattaccgcaggccctaacagattcacctcctctgagttgccttttaacattctacccttgacttttctggaaactgtctgggagagctagtcaaatgaaatctattcctgcatc---tgttgtaaaG-TTTTTCCACAGCACTTTCTGAAatt-------tattttcaatgtttattgttttttcactccacttagaatgtaaaagctacttgaagataaggatcttgtttgtcttgttcatcactatttccccagcacctagaactgtgcaggctaagtagtaggc-AGTATAATTTCTTGAT--------AGCTggctgggcgcggtggctcacggctgtaatcccagcactttgagaggctgaggcgggtggaacacctgaggtcaggtgttcgagaccagcctggccagcatggtgaaaacgcggatctactaaaaatgcaaaaattagccgtgcatggtggcgggtgcctgtaatcgcagctaattgggaggctgaggcaggagaatagcttgaacctgggaggcagaggttgccatgagccaagattgcgtcactgcactccagcctgggtgacagagcgagactccat s panTro4.chr18 74566862 716 - 76611499 CCAGAATACAATTTCAAACGGATTCAACTTCAGATCCTAATCAAAAGCCTAGCGGGAAGAAGTGAATTTTCAAACAAAATAA-----AGCCCTCCCCCCAAAATTGTAACCTACCCACACTAGCCTGCGGAATTCCACAAACCAggattgcattaccgtaggccctaacagattcacctcctctgagttgccttttaacattctaccgttgatttttctggaaactg----ggagaactagtcaaatgaaatctattcctgcatc---tgttgtaaaG-tttttccacagcactttctgaaatt-------tattttcaatgtttattgtgttttcactccacttagaatgtaaaagctacttgaagatgaggatcttgtttgtcttgttcatcactatttccccagcacctgaaactgtgcaggctaagtagtaggc-agtcGGATTTCTTGAT--------AGCTggctgggcgcagtagctcacggctgtaatcccagcactttcagaggctgaggcgggtggatcacctgaggtcaggtgtttgagaccagcctggccaatatggtgaaaacccggatctactaaaaatgcaaaaattagccgggcatgatggcaggcgcctgtaatcccagctaattgggaggctgagacaggagaatagcttgaacccgggaggcggaggttgccatgagccaagattgcgtcactgcactccagcctgggcg-cagagcgagactctgt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21363376 728 - 95678458 CCagaatacaatttcaaactgattcaacttcagctcctaatcaaaagctcagcgggaagaagtaagttttcaaacaaaataaaaaacaacccccccaaaaaaattgtaacctacccacactagcctgcagaattccacaaaccaggattgca-taccgtaggccctaacagattcacctcctctgagttgccttttaacattctacccttgacttttctgtaaattgtctgggaagactagtcaaatgaaatttattcctgcgtc---tgttgtaaaC-tttttccacagcactttctgaaatc-------tattttcaatgttcattgtctttttactccac-tagaatgtaaaagctacttgaagacaaggatc----ttgtcgtgttcgtcactgtttccctagcacctagaactgtgcagtgtaagtagtaggc-agtccaatTTCTTGATTAACTAACAGCTgactgggtgcgggggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggtggatcacctgagctcaggtgttcgataccagcctgggcaacatggtaaaaccctggatctactaaaaatacaaaagttagccgggcatggtggcaggcgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaataacttgaacccaggaggcggaggttgcggtgagtccagattgtgccactgcactccagcctgggcaacagagcaagactctgt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21579659 728 + 96509753 CCagaatacaatttcaaactgattcaacttcagctcctaatcaaaagctcagcgggaagaagtaagttttcaaacaaaataaaaaacaacccccccaaaaaaattgtaacctacccacactagcctgcagaattccacaaaccaggattgca-taccgtaggccctaacagattcacctcctctgagttgccttttaacattctacccttgacttttctgtaaactgtctgggaagactagtcaaatgaaatctattcctgcgtc---tgttgtaaaC-TTTTTCCACAGCACTTTCTGAAATC-------TATTTTCAAtgttcattgtctttttactccac-tagaatgtaaaagctacttgaagacaaggatc----ttgtcgtgttcgtcactgtttccctagcacctagaactgtgcagtgtaagtagtaggc-agtccaatTTCTTGATTAACTAACAGCTgactgggtgcgggggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggtggatcacctgagctcaggtgttcgataccagcctgggcaacatggtaaaaccctggatctactaaaaatacaaaagttagccgggcatggtggcaggcgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaataacttgaacccaggaggcggaggttgcggtgagtccagattgtgccactgcactccagcctgggcaacagagcaagactctgt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20498087 729 - 90941950 CCAGAATACAATTTCAAACTGATTCAATTTCAGCTCCTAATCAAAAGCTCAGCGGGAAGAAGTaagttttcaaacaaaataaaaaacaacccccccccAAAAATTGTAACCTACCCACACTAGCCTGCAGAATTCCACAAACCAGGATTGCATTACCGTAGGCCCTAACAGATTCACCTCCTCTGAGTTGCCTTTTAACATTCTACCCTTGACTTTTCTGTAAACTGTCTAGGAAGACTAGTCAAATGAAATCTATTCCTGCGTC---TGTTGTAAAC-TTTTTCCACAGCACTTTCTGAAATC-------TATTTTCAATGTTCATTGTCTTTTTactccac-tagaatgtaaaagCTACTTGAAGACAAGGATC----TTGTCGTGTTCGTCACTgtttccccagcacctagaactgTGCAGTGTAAGTAGTAGGC-AGTCCAATTTCTTGATTAACTAACAGCTGactgggtgcgggggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgcgtggatcacctgagctcaggtgttcgataccagcctgggcaacatggtaaaaccctggatctactaaaaatacaaaagttagccgggcatggtggcaggcgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaataacttgaacccaggaggcggaggttgcggtgagtccagatggcgccactgcactccagcccgggcaacagagcaagactccgt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20491426 728 - 33263144 CCagaatacaatttcaaactgattcaacttcagctcctaatcaaaagctcagcgggaagaagtaagttttcaaacaaaataaaaaacaaccccccc-aaaaaattgtaacctacccacactagcctgcagaattccacaaaccaggattgcattaccgtaggccctaacacattcacctcctctaagttgccttttaacattctacccttgacttttctgtaaactgtctgggaggactagtcaaatgaaatctattcctgcgtc---tgttgtaaaC-TTTTTCCacagcactttctgaaatt-------tattttcaatgttcattgtctttttactccac-tagaatgtaaaagctacttgaagacaaggatc----ttgtcctgttcgtcactgtttccccagcacctagaactgtgcagtgtaagtagtaggc-agtccaatttcttgattaactaaCAGCTgactgggtgccggggctcacgcctgtaatcccagcattttgggaggccgaggtgggtggatcacctgagctcaggtgttcgataccagcctgggcaacatggtaaaaccctagatctactaaaaacacaaaagttagccaggcatggtggcaggcgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaataacttgaacccaggaggcggaggttgctgtgagtccagattgtgccaccgcactccagcctgggcaacagagcaagcctccgt i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 70498 720 - 112050 cCagaatacaatttcaaactgattcaacttcagctcctaatcaaaagctcagcaggaagaagtgacttttcaaacaaaattaaaaacaaaaacaaa-aaaaaattgtaaactacccacactagcctgcagaattccacaaaccaggattgcattaccttaggccctaacagatcttcctcctctgagttgaattttaacattctagccttgacttttctggcaactg----gaagaactagtcaaatgaaatctattcctgcatt---tgttataaagttttttccattgcactttctgaaatt-------tattttcaacctttattgtctttttcctcccc-tagaatgttaaagctacttgaagataaggatcttgtttgtcttgttcatcactatttccccagcacct--aactgtgcag-gtaagtagtaggc-agtcgaATTTCTCTAT----TAACAGCTggctgggtgctgtggctcacacctggaatcccagcactttgaaaggccaggacaggtggatcagctgaggtcaggttttagagaccagcctggccaacttggtgaaaccctgtctctactaaatatacaaaaattagcgggatgtggtgtcaggagcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaattgcctgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgaggttgcaccacagcactccagcttgggcaacagagcaagact--gt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15917682 466 - 38964690 CCAGAATGGAatt-------------attttagg--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ccctaacagattaacctcttcagagttgcatttcaacattataccctttacttttctggaaaatggctaagagacccagtcaaatgaaatctgtttatttgttgtGTGtggttttt-tttttccacagtactccctgcaattatttatccatctttcatgtttatcgtctttctattccat-tacaacgtaaaagctactttaagataaaattc----atgttttgttcatcactttatccccagcacccggaactgtgcatggtgagtagtggacAAATTTGGttttttaag---------------------------------------attttatttatttgagagagagagagaga----------gagagcaggag-------------------------------------------ggaagggcagaggagaagcagac--------------------tccctgctgaacagggagcccagatggga------ctggatcctaggaccctgagatcatcgtgacctcagcagatggca---------------gataactgactgagccaccct i canFam3.chr26 I 90 I 27 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=14716.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 84683 26 + 478999 ctcaaaaaaa-----------------------------aaaaaaaaaaaaaaaG s panTro4.chr18 74567578 24 - 76611499 ctcaaaaaaa-----------------------------taaataaaaTAACA-- i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364104 20 - 95678458 ctcaaaaaac-----------------------------aaaaC----TAACA-- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21580387 20 + 96509753 ctcaaaaaac-----------------------------aaaaC----TAACA-- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20498816 20 - 90941950 ctcaaaaaac-----------------------------aaaac----taaca-- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20492154 20 - 33263144 ctcaaaaaac-----------------------------aaaaC----taaca-- i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 71218 49 - 112050 cacaaaaaacaacaaaaacaaaaacaaaaCAGAAACAAAAAAAC----TAACA-- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15918148 27 - 38964690 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=479480.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 84709 266 + 478999 gctaacatttattcatacaactcatctaattgaatcttcacaactttaataggtagacgccgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaATAAATTGCATGTATTAAAACAAAATTCAAACCCAAAC-----CCAGCAGACaacaaacaaacaaacaaacaaacacacaaaaaacCACTGTACTCTCACTCACCAGGCTGTACTGCCCAGTGCATGACACAGTGGCCTGAAATAAAATCTCAAGTAAGAAATTACTTTAg s panTro4.chr18 74567602 255 - 76611499 gctaacacttatgcatacaactcatctaattgaatcttcacaactttaataggtagacgccgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaATAAATTGCACGTATTAAAA-----TTCAAACCCAAAC-----CCAGCAGACaa---acaaa---acaaaacaaaacaaaaAAACCCACTGTGCTCTCACCCACCAGGCTGTactgcccagtgcatgacacagtagcctgaaataaaatctcaagtaagaaattactttag i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364124 244 - 95678458 gctaacatttattcatacaactcatctaatggaatcttcacaactttaataggtagatgccgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaataagttGCACGTATTGAAA------CAAAATTCAAAC-----CCAGCAGACAA---AAAAA-------------AAAAGAAAAACCACTATGCTCTCACCCACCCGGCTGTACTGCCCAGTGCATGACACAGTAGCCTGAAATAAAATCTCAAGTAAGAAATTACTTTAg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21580407 244 + 96509753 gctaacatttattcatacaactcatctaatggaatcttcacaactttaataggtagatgccgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaataagttGCACGTATTGAAA------CAAAATTCAAAC-----CCAGCAGACAA---AAAAA-------------AAAAGAAAAACCACTATGCTCTCACCCACCCGGCTGTACTGCCCAGTGCATGACACAGTAGCCTGAAATAAAATCTCAAGTAAGAAATTACTTTAg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20498836 243 - 90941950 gctaacatttattcatACAACTCATCTAATGGAATCTTCACAACTTTAATAGGTAGATGCCGTTAtctccatgttacagatgaagaaagtgaagcaCAGAATAAGTTGCACATATTGAAA------CAAAATTCAAAC-----ccagcagacaa---aaaaa-------------aaaagaaaaaccactatGCTCTCACCCACCCGACTGTACTGCCCAGTGCATGACACAGTAGCCTGAAATAAAATCTCAAGT-AGAAATTACtttag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20492174 244 - 33263144 gctaacatttattcatacaactcatctaattgaatcttcacaactttaataggtagatgccgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaataagttgcatgtattgaaa------caaaattcaaac-----ccagcagacAA---AAAAA-------------AAGAGAAAAACCACTATGCTCTCACCCACCCGGCTATACTGCCCAGTGTATGACACAGTAGCCTGAAATAAAATCTCAAGTAAGAAATTACTTTAg i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 71267 246 - 112050 GCTACCATTTATTTCTACAACtcaactagttgaatcttcacaactctaataggtagacatcgttatctccatgttacagatgaagaaagtgaagcacagaataaattgctcaTATTAAAA------CAAAATCCAAACCCAAACCAGCAGACAA---AAAAA----------------TAAAAAAACACTGTGTTCTCACCCACCAGGCTGTCCtgcccagttcatgacacagtagcctgaaataaaatctcaagtaagaaattactttag i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15918175 233 - 38964690 GCTAATATTTAGTTACACAATTCCtctaattgaatcttcacggctttaataggcagatactattatctccacttttcaaattaagaaactgcagcccagaTTACAATGCACTAAATCAAA----ATTCAAACTCAAAC-----CCAAGTGACAA---CAAAA-------------------------ATTATGCTGTCAGCCATTGGACTGTactgcccacttcatg-cattgtcacctgaaatagaatcccaaataaaaagttacattag i canFam3.chr26 I 27 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=288528.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 84975 172 + 478999 gccgggcacagtgtctcatgccggaaatcccagcactttaggaggccaaggcaggtggattgcttgagctcaggagttccagaccagcctaggcaacatggtgaaatcccacctttac--aaaaaataccaaaaaactggccaggcatggtggtgcgtgcctgtagtcccagct s panTro4.chr18 74567857 172 - 76611499 gctgggtgcagtgtctcatgcctgaaatcccagcactttaggaggccaaggcaggtggattgcttgaactcaggagttccagaccagcctacgcaacatggcaaaatcccacctctac--aaaaaataccaaaaaactggccaggcatggtggtgcgtgcctgtagtcccagct i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364368 173 - 95678458 accagacacagtggctcatgcctgaaatcccagcacttcaggaggccaaggtaggtggattgcttgagctcaggagtttgagaccagtctaggcaacgtggcaaaatcccatctctac-aaaaaaataccaaaaaactggcgaggtgtggtggtgcgcgcctgtagtcccagct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21580651 173 + 96509753 accagacacagtggctcatgcctgaaatcccagcacttcaggaggccaaggtaggtggattgcttgagctcaggagtttgagaccagtctaggcaacgtggcaaaatcccatctctac-aaaaaaataccaaaaaactggcgaggtgtggtggtgcgcgcctgtagtcccagct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20499079 173 - 90941950 gccagacacagtggctcatgcctgaaatcccagcacttcaggaggccaaggcaggtggattgcttgagctcaggagtttgagaccagtctaggcaacgtggcaaaatcccatctctac-aaaaaaataccaaaaaactggcgaggtgtggtggtgcgcgcctgtagtcccagct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20492418 174 - 33263144 gccagacacagtggctcatgcctgaaatcccagcactttaggaggccaaggcaggtggattgcttgagctcaggagtttgagaccagtctaggcaatgtggcaaaatcccatctctacaaaaaaaatatcaaaaaactggcgaggtgtggtggtgcgcgcctgtagtcccagct i chlSab2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 71513 172 - 112050 tccaggcacagtggctcatgcctgaaatcccagaactataggaggccgaggcgggcagattgctggagctctggagttcgagactagcctaggcaacatgacaaaatcccgtctctac--aaatcatgccaaacaactggccaggcgtagtggtgcacgcctgtagttccagct i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e canFam3.chr26 15918408 0 - 38964690 C e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=782895.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85147 432 + 478999 atttgagaggctgaggtgggaggatggcttgagcctgggaggcagacgttgtagtgagccctgattgtgccactgca-ctccaa-ctgggtgtcagagcgagaAAAAAGAAAGAATGAAagaaattactttagaggtaaattcttggaaagcccttgctttactaccagaaaaaccagtgcgcttcctgctttttgataac-------tcttatgcagctggttgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagggctaaatgtgaag--ctcagcaatgacccctgcttggcccctaagg-----------------------tccactcttgcctcgactttgcacctttatttatatgtggctgtcctgattt-tcCCTTTGTGTTATATGACTGTAGGCTTTATGGAATGGGAGAAGAAATAGTAAACACATAAAATTGATGAATGACTTAAAGAC s panTro4.chr18 74568029 434 - 76611499 atttgagaggctgaggtgggaggatggcttgagcctgggaggcagacgttgtagtgagccctgattgtgccaccgca-ctccaa-ctgggtgtcagagcgagaaaaaagaaagaacaaaagaaattactttagaggtaaattcttggaaagcccttgctttactaccaggaaaaccagcacgcttcctgctttttgataac-------tcttatgcagctgattgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagggctaaatgaccagggctcagcaatgacctctgcttggcccttaagg-----------------------tccattcctgcctcaactttgcacctttatttatatgtggctgtcctgattt-tcttttTCTGTTGTATGACTGTAGGCTTTATGGAATGGGAGAAGAAATAGTAAATACATAAAATTGATGAATGACTTAAAGTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364541 432 - 95678458 atttgagaggctgagg-gggagaatggcttgagcctgggaggcagaggttgtggcgagccctgattgtgccactgca-ctccaacctgggtgtcagaacaagaAAAAAGAATGAacgaaataaattactttagaattaaaagcttggaaagcccttgctttactaccagaaaaaccggtatgcttcctgcttttcgataac-------tgttatgcagctgattgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagggctaaatgtgaag--ctcagcaatgacctcttcttagcccttccgg-----------------------tccacttctgccttaactttgcacctttatttatatgtggctctcctgattt-tcCCTTACTGTTATATGACAGTAGGCTTTATGGAATGGGAGAAGAAACAGTAAATACATAAAATTGATGAATGACTTAAAGtt i rheMac3.chr10 C 0 I 5 s macFas5.chr10 21580824 432 + 96509753 atttgagaggctgagg-gggagaatggcttgagcctgggaggcagaggttgcggcgagccctgattgtgccactgca-ctccaacctgggtgtcagaacaagaAAAAAGAATGAacgaaataaattactttagaattaaaagcttggaaagcccttgctttactaccagaaaaaccggtatgcttcctgcttttcgataac-------tgttatgcagctgattgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagggctaaatgtgaag--ctcagcaatgacctcttcttagcccttccgg-----------------------tccacttctgccttaactttgcacctttatttatatgtggctctcctgattt-tcCCTTACTGTTATATGACAGTAGGCTTTATGGAATGGGAGAAGAAACAGTAAATACATAAAATTGATGAATGACTTAAAGtt i macFas5.chr10 C 0 I 5 s papAnu2.chr10 20499252 432 - 90941950 atttgagaggctgagg-gggagaatggcttgagcctgggaggcagaggttgcggcgagccctgattgtgccactgca-ctccaacctgggtgtcagaacaagaaaaaagaatgaacgaAATAAATTACTTTAGAATTAAAAGCTTGGAAAGCCCTTGCTTTACTACCAGAAAAACCGGTATGCTTCCTGCTTTTCGATAAC-------TGTTATGCAGCTGATTGTGTCTCTCTTTTCACTCTGGCTTCCAGAAAGCCCAGGGCTAAATGTGAAG--CTCAGCAATGACCTCTTCTTAGCCCTTACAG-----------------------TCCACTCCTGCCTTAACTTTGCACCTTTATTTATATGTGGCTCTCCTGATTT-TCCCTTACTGTTATATGACAGTAGGCTTTATGGAATGGGAGAAGaaacagtaaatacataaaattgatgAATGacttaaagtt i papAnu2.chr10 C 0 I 5 s chlSab2.chr19 20492592 432 - 33263144 atttgagagcctgagg-gggacaatggcttgagcctgggaggcagaggttgcggcgagccctgattgtgccactgca-ctccaacctgggtgtcagaacgagaAAAAAGAATGAACAAAATaaattactttagcattaaaagcttggaaagcccttgctttactaccagaaaaaccggtatgcttcctgcttttcgataac-------tgttatgcagctgattgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagggctaaatgagaag--ctcagcaatgacctcttcttagcccttaagg-----------------------tccactcctgccttaactttgcatctttatttatatgtggctctcctgattt-tcCCTTACTGTTATATGACAGTAGGCTTTATGGAATGAGAGAAGAAACAGTAAATACATGAAATTGATGAATGACTTAAAGtt i chlSab2.chr19 C 0 I 5 s calJac3.chrUn_GL286438 71685 431 - 112050 atttgggaggctgagg-gagaggatggcttgagcttgggaggcagagtttgcagtgagccctgattgtgccactgcatctccaacctaagcatgagagcaagaaaaaagaaagaacaaaagaaattactttagaattcaaagcttggaaagcccttgctttagtatgagaaaaaacggtgtgcttcctattttctgataac-------tgttatgcagctgattgtgtctctcttttcactctggcttccagaaagcccagctctatatgagaag--ctcagcgatgaactcctcttgccccttaagg-----------------------tccactcttgcctcgactttgcacctttatttatatgtggctgtcttgattt-tccttt-ctgttgtatGACTGCAGACTTTATGGAATGGGAAAAGAAATAGTAAATACACAAAATTGATGAATGACTTAAAGt- i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 C 0 s canFam3.chr26 15918408 327 - 38964690 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------agttgaaagttaggaaagacttggctgtactcccacagaatcaggtatgctttc---tttctgataattacttcgtgttatgcagctaattgtg--tatcttttcaccttggcttcccaaaagcccaaggctaaatctaaag--ctcagtggtagcctactgttgggccttcaggtgcgcatattaagaagcatggttttctctcccacctcaactttctacttttatttatattttactgtcctgatttCCCCCTTTTCATTATAGGATTGTAGCCTATACCGAATGAGAGAGGAAACAGTAAGTACATAGAATAGATGAATGACCAACAAAC i canFam3.chr26 C 0 N 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45199166 0 - 121039945 C a score=37366.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85579 15 + 478999 ttttattttattttt s panTro4.chr18 74568463 15 - 76611499 ttttattttattttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199166 15 - 121039945 ttttattttattttt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364978 15 - 95678458 ttttattttattttt i rheMac3.chr10 I 5 C 0 s macFas5.chr10 21581261 15 + 96509753 ttttattttattttt i macFas5.chr10 I 5 C 0 s papAnu2.chr10 20499689 15 - 90941950 ttttattttattttt i papAnu2.chr10 I 5 C 0 s chlSab2.chr19 20493029 15 - 33263144 ttttattttattttt i chlSab2.chr19 I 5 C 0 s calJac3.chrUn_GL286438 72116 15 - 112050 tttcattttattttt i calJac3.chrUn_GL286438 C 0 N 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=153095.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85594 84 + 478999 -gagacagagtttcgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggcaggaacttggctcactgcaacgcctgcctcctgggttcaa s panTro4.chr18 74568478 85 - 76611499 tgagatggagttttgcttttgttgcccaggctggagtgtaatggcgggaacttggctcactgcaacctccacctcctgggttcaa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199181 84 - 121039945 -gagatagagtttcgctcttgttgcccaggctggagtgtaatggcgggaacttggctcaccgcaacctccgcctcctgggttcaa i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 21364993 84 - 95678458 -gagacagagtttcactcttgttgcccaggctggagtataatggcgggaactcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaa i rheMac3.chr10 C 0 N 0 s macFas5.chr10 21581276 84 + 96509753 -gagacagagtttcactcttgttgcccaggctggagtataatggcgggaactcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20499704 84 - 90941950 -gagacagagtttcactcttgttgcccaggctggagtataatggcgggaactcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20493044 84 - 33263144 -gagacagagtttcactcttgttgcccaggctggagtataatggcgggaactcggctcactgcaacctctgcctcccaggttcaa i chlSab2.chr19 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=328551.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85678 272 + 478999 gtgactctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatgagccacaacacccggttaattttttgtatttttagtagagacagcgtttctccatgttgatcaggctagtctcgaactcccgaccacatgtgatccgcccgtctcggcttcccaaagtgctgggattacagctgtgagccgccattcccggcTTATTTTTAttttta-----tattttattttatttt-----cacacaaggtctcactctgttgcccaggctggagtggagtgg s panTro4.chr18 74568563 277 - 76611499 gcgactctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatgagccacaacaccaggttaattttttgtatttttagtagagacagcgtttctccatgttgatcaggctagtctccaactcctgaccacatgtgatccgcctgtctcggcttcccaaagtgctgggattacagctgtgagccaccattcctggcTCATTTTTATTTTTA-----TAttttattttattttattttcacacaaggcctcactctgttgcccaggctggagtgcagtgg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199265 272 - 121039945 gtgactttcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatgagccacaacacccggttaattttttgtatttttagtagagatggcgtttctccatgttggtcaggctagtctcgaactcccaaccacatgtgatctgcctgtctcggcttcccaaagtgctgggattacagccgtgagccaccattcccggcTCAtttttatttttg-----tattttattttatttt-----cacacaaggtctcactctgttgcccaggctggagtgcagtgg i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21581360 272 + 96509753 ccgactctcctgcctcagcctcccgagtagctaggattacaggcatgtgccaccacacccggctaattttttgtatttttagtagggacggggtttctccatgttggtcaggctggtctcgaactcccgacctcaggtgatcctcccatctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgaactacagcgcccggccTAtttttattttta-----tattttattttatttt-----cagacaaggtctcactctgttgcccaggctggagtgtagtgg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 20499788 272 - 90941950 ccgactctcctgcctcagcctcccgagtagctaggattacaggcatgtgccaccacacccggctaattttttgtatttttagtagggacggggtttctccatgttggtcaggctggtctcgaactcccgacctcaggtgatcctcccatctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagctacagcgcctggcctatttttattttta-----tattttattttatttt-----cagacaaggtctcactctgttgcccaggctggagtgtagtgg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr19 20493128 277 - 33263144 ccgactctcctgcctcagcctcccgagtaactaggattacaggcatgcgccaccacacccggctaattttttgtatttttagtagggacggggtttctccatgttgttcaggctggtctcgaactcccgacctcaggtgatcctcccatctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagctacagcacctggccTAtttttatttttatattttattttattttatttt-----cagacaaggtcttactctgttgcccaggctggagtgtagtgg i chlSab2.chr19 C 0 N 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=4365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85950 3 + 478999 ctc s panTro4.chr18 74568840 3 - 76611499 ctc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199537 3 - 121039945 ctc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 21581632 3 + 96509753 ctc i macFas5.chr10 C 0 N 0 s papAnu2.chr10 20500060 3 - 90941950 ctc i papAnu2.chr10 C 0 N 0 s chlSab2.chr2 37883268 3 - 90373283 CTC i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=7874.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85953 9 + 478999 acagcCACC s panTro4.chr18 74568843 9 - 76611499 acagcCACC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199540 9 - 121039945 acagccacC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60235336 9 - 96509753 ACAGCCACC i macFas5.chr10 N 0 C 0 s chlSab2.chr2 37883271 9 - 90373283 ACTGCCACC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=415393.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 85962 380 + 478999 AGGTGATTTGGGCTCACAA--GTCACCCTTGCTAAGAGGCAGAGTCCAGAGCAGAACCTGGGTAGATGCCAAAGGCAGCACTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTGTCAAGTAAATCACCAGCCAGGTG-----AGGTGCATACAGCATCTAGGGAGATGGGACACCGTGTTGTCCCCTCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACTGAGCGCCACTGTCTCCACTGTCCGATGCTACAGGAGAAACGTTTCCTGCTGGTTAAGGAAGTAGAAACTGCAGATCACTTTTCATCTTATTGGAAATCACTCTTTGACACTCTTGCCTCATCTTCACTCAGTACACATTGACTCTACCAGCAATAGCGTAAAAATAAACACAGCTTAAGGAAAT s panTro4.chr18 74568852 380 - 76611499 AGGTGAGTTGGGCCCACAA--GTCACACTTGCTAAGAGGCAGAGTCCAGAGCAGGACATGGGTAGATGCCAAAGGCAGCACTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTGTCAAGTAAATCACCAGCCAGGTG-----AGGTGCATACAGCATCTCGGGAGATGGGACACCGTATTGTCCCCTCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACTGAGCGCCACTGCCTCCACTGTCCGATGCTACAGGAGAGACATTTCCTGCTGGTTAAGGAAGTAGAAACTGCAGATCACTTTTCATCTTATTGGAAATCACTCTTTGACACTTTTGCCTCATCTTCACTCAGTACACATTGACTCTACCAGCAATAGTGTAAAAATAAACACAGCTTAAGGAAAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45199549 380 - 121039945 AGGTGAGTTGGACCCACAA--GTCACCCTTGCTAAGAGGCAGAGTCCAGAGCAGAACCTGGGTAGATGCCAAAGGCAGCATTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTCTCAAGTAAATCACCAGCCAGGTG-----AGGTGCATACAGCATCTAGGGAGATGGGACGCTGTGTTGTCCCCTCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACTGAGCGCCACTGCCTCCACTGTCCGATGCTACAGGAGAGACGTTTCCTGCTGGCTGAGGAAGTAGAAACTGCAGATCACTTTTCATCTTATTGGAAATCACTCTTTGACACTTTTGCCTCATCTTCACTCAGTACACACTGACTCTACCAGCAATAGTGTAAAAAGAAACACAGCTTAAAGAAAT i nomLeu3.chr6 C 0 I 302 s macFas5.chr10 60235345 379 - 96509753 AGGTGAGTTAGGCCTAGAA--GTCACCCTTGGTAAGAGGCAGAGTCCAGAGCTGGACCTGGGTAGGTGCCAAAGGCAGCACTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTCTCAAGTAAATCACCACCCAGGTG-----AGGTGCATACAGCATCTAGGGAGACGGAACACGGTGTTGTCCCCTCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACTGAGCGCCACTGTCTCCACTGTCTGATGCCACAGGAGAGACATCGCCTGCTGGGTAAGGAAGTAGAAACTGCAGAT-ATTTTCCATCTTCTTGGAAATCACTCTTTGACACTTTTGCTTCATCTTCACTGAGTGCACACTGACTCTACCAGCAATAGTGTAAAAATAAACACAGCCTAAAGAAAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37883280 379 - 90373283 AGGTGAGTTATGCCCACAG--GTCACCCTTGGTAAGAGGCAGAGTCCAGAGCAGGACCTGGGTAGATGCC-AAGGCAGCATTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTCTCAAGTAAATCACCAGCCAGGTG-----AGGTGCATACAGCATCTAGGGAGACGGAACACCGTGTTGTCCCCTCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACTGAGCGCCACTGTCTCCGCTGTCTGATGCCACAGGAGAGACATCGCCTGCTGGGTAAGGAAGTAGAAACTGCAGATCATTTTCCATCTTCTTGGCAATCACTCTTTGACACTTTTGCTTCATCTTCACTCAGTACACACTGACTCTACCAGCAATAGTGTAAAAATAAACACAGTCTAAAGAAAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108152597 342 + 108792865 AAGTGGTCCTGGCTCACACATGTCACCCCTGGTAAGAGGCAGAGTCCAGAGTGCGACCTCAGTAGACACCAAAGGCAGCACTCCCTACTCCACACATGGGTTTCTGTCAAGTAAATCACCAGTGGGGTGGGGCAGGGTGCACACAGAGTCTAGGAAGACAGTATACTCTTTTGT--CATCCTTCAGCCAGGAGGCCCCACACGGAGCACCACTGCCTCCACTGTCCAATGTCACAGGACAGACATTGTGTGCTGGTTAAGGGAGTAGAAACTGGGGATCAT------------------------------------------TATTCACTCAGTACTCACTGAGTATATCAGCAATAGTGT-AAAATAAACACAGCTTAAAGAAGT i calJac3.chr14 N 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=97050.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 86342 88 + 478999 AGGAACCCTTTATTCCTGGGACTTAAAAGCTTGACTTTCTCCAGTAAGTCAATTACCAGTGCCCACGGCAGGAAGAGCTCTGATGCCA s panTro4.chr18 74569232 88 - 76611499 AGGAACCCTTTATTCCTGGCACTTAAAAGCTTGACTTTCTCCAGTAAGTCAATTACCAGTGTCCATGGCAGGAACAGCTCTGATGCCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45200231 85 - 121039945 aGGAACTCTTTATTCT--GGACTT-AAAGCTTGACTTTCTCCAGTAAGTCAATTACCAGTGCCCATGGCAGGAACAGCTCTGATGCCA i nomLeu3.chr6 I 302 C 0 s macFas5.chr10 60235724 88 - 96509753 AGGAACCCTGTATTCCTGGGACTTAAAAGCTTGACTTTCTCCAGTAAGACAATTACCAGTGCCCACGGCGGAAAGAGCTCTGATGCCG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37883659 88 - 90373283 AGGAACCCTGTATTCCTGGGACTTAAAAGCTTGACTTTCTCCAGTAAGTCAATTACCAGTGCCCACGGCAGGAAGAGCTCTGATGCTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108152939 88 + 108792865 AGGAACCCTTTATTCCTGGGACGTAAAAGCTTGACTTTCCACAGTAAGCCAGTGACCAATGCCCCTGGTGTGAACAGCTCTGACAGCA i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=205632.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 86430 297 + 478999 GGGTTGACAGCACGCTGGAAAAACGGAGGAGTGTTTGCATTTCTGGGGCCTCAAGTAATGAGAAGTTCTTCCAAGAACA-CTGACAGGGATA-TTGTTGCCCTATTTTAGAATTATTACTCTGAAGATCAGGGAATT----TCAGGCGGTTGAACTCATGCCACAGCACCTGTGCTTTTCTGGTAGGGGAGGGATGGAGTCCAGCTCAGGAGTCCCCCGTCATGGGGGAAAGCACTGTGATGGGATGTCTGTGGGGGGATTAGAACCCTATAGCAGATGGGATAGGGTGGGGAGTCTACATAT s panTro4.chr18 74569320 297 - 76611499 GGGTTGACAGCACACTGGAAAACAGGAGG-GTGTTTGCATTTCTGGGGCCTCAAGTAATGAGAAGTTCTTCCAAGTACAACTGACAGGGGTA-TTGTTGCCCTATTTTAGAATTATTACTCTGAAGATCAGGGAATT----TCAGGCGGTTGAACTCATGCCACAGCACCTGTGCTTTTCTGGTAGGGGAGGGATGGAGTCCAGCTCAGGAGTCCCCCGTCATGGGGGAAAGCACTGTGATGGGATGTCTGTGGGGGAATTAGAACCCTATAGCAGATGGGATAGGGTGGGGAGTCTACATAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60235812 297 - 96509753 GGGTTGACAGCACACTGGAAAACGGGAGGGGTGCCTACATTTCCGGGGCCTCAAGTAATGAGAGTTTCTTCCAAGTACA-CTGACAAGGGTATTTGTGGCCCTGTTTTAGAATTATTACTCTGAAGATCAGGGAATT----TCAGTCGGTTAAACTCATGCCACAGCACCTGTGCTTTTCCAGTAGGGGAGGGATGGAGTCCAGTGCAGGAGTCCCCCGTCACGGGGGAAAGCTCCCTGATGGGATGTCTGTGGAGGAATTAGAACCCGACGGCAGACAGGATA-GGTGGGGAGTCTGTATAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37883747 297 - 90373283 GAGTTGACAGCACACTGGAAAACGGGAGGGGTGTCTGCATTTCTGGGGCCTCAAGTAATGAGAGGTTCTTCCAAGTACA-CTGACAGGGGTATTTGTGGCCCTGTTTTAGAATTATTACTCTGAAGATCAGGGAATT----TCAGTCGGTTGAACTCATGCCACAGCACCTGTGCTTTTCCAGTAGGGGAGGGATGGAGTCCAGTGCAGGAGTCCCCCGTCACGATGGAAAGCTCCGTGATGGGATGTCTGTGGAGGAATTAGAACCGGACAGCAGACGGGATA-GGTGGGGAGTCTGTATAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108153027 291 + 108792865 GGGCTGACAGT------GGAAACGGAAGGGGTGTTTGCATTTCTAGGGCCTCAAGAAATGGGAGGTTCTCCCACATACA-CTGACA-GGGTA-TTGTTGCCCTATTTTATAATTATTACCTGGAAGATCAGCAAATTGAAGTAGGTCTGTTTATCTCACACCACAGC-CCTGTACTTTTCCAGT-GGGGAGGGATGGAGTCCAGTGCAGGAGT-CACTGCCATGGAGAAAAGCACTGTGATGGGACGTCTGACTGCAGATTAGGACCCAATGGCAGATGGGACAGGGTGGGGAGTCTGCGTAT i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=1124362.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 86727 1030 + 478999 TTTTATTTGGATGCTTTGATGGAGTAAAGTTCCAAA-CCAAGCAAGTATCAGGCAGGGGGCAGTCCAGGCTGTGGTGCTGTGCTGTGAGGCTGGGAGTCCGGGCAGGTCCTGTGTTCACTG-GTCACTTCCACAGCCTGAAGCCCCTCGAAAGGACATCTGCACAGAGGCCCGCTAGTGACTTCAGGATGCTGATGATGCCCTCAAGGTGAGAGCCAGAG-AAAATCCCGTCAACTCTGCCAACCAAGGGCGTCAATGGCCACGTGTGTGGTTTTCTCCTGCAAAGAACAAGCCAGTTTGCAAACCATGCTTTTGAGGCTAGAAAAA-TGGCTGTATTC-CTTCAGTGTCTCCTGAAGTCTGGGTCCCCTGAGAGTTGATTCAAATACTGTATTCTCGTA--AAATATGGTAACATTTAGACCTGAAAAATGGCCTGGGGGATAATCTTATCAAACCTCTGATGTGGTTATTTTGTAACTGAGTATATTGAAGGCTGGGGAACAAAGCCATCTGGTGCCAGCATCCTAGCTGCTCTCTCTCCTCCAGGGGCTTGCCTTGGTTGGGGGCCTTTCCAGCAAAATTAGGCTGAAGAGATGAGATTTTAGTTAAACAAGGCCCACTGTTGCTTTAAGACAAAATGTCAAAGTTTTAAAAAATGTATTAACTTGTTCTTTTGGCCAAGAAATCAATAGATGCACTTCCTTTCCACTGTGCAGGCACTGAGCTGACAGAGGAGTAAGAGCTTGAACCATCTACGTGGTCTGAGTGACCACATCCTTCACT------TGGAGCCCTGTTCTACAGCAGATAATTCTGAGTCACCCCAGCTAATGGCTGTGCACAG------CATCCTGATGCTCTGATTA-GGCTGAG--------GGGCATGTGGCGTGGTGGCTAGGCTGTCTCAGAGAGCACCTCAGGCTGGGTGGACCAGGCTGACCCAGAAGAGGGCAATGGGCCTTTGACAGGGACTAGCTGGCTACTATCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACACTTAGGGTCATGGGTGAAAGTGTTTTTCCACATAT s panTro4.chr18 74569617 1039 - 76611499 TTTTATTTGGATGCTTTGATGGAGTAAAGTTCCAAA-CCAAGCAAGTATCAGGCAGAGGGCAGTCCAGGCTGTGGTGCTGTGCTGTGAGGCTGGGAGTCCAGGCAGGTCCTGTGTTCACTG-GTCACTTCCACAGCCTGAAGCCCCTCGAAAGGACATCTGCACAGAGGCCTGCTAGTGACTTCAGGATGCTGATGATGCCCTCAAGGTGAGAGCCAGAG-AAAATCCCGTCAACTCTGCCAACCAAGGGCATCAATGGCCACGTGTGTGGTTTTCTCCGGCAAAGAACAAGCCAGTTTGCAAACCATGCTTTTGAAGCTAGAAAAAATGTCTGTATTC-CTTCAGTGTCTCCTGAAGGCTGGGTCCCCTGAGAGTTGATTCAAATACCGTATTCTCGTATAAAATATGGTAACATTTAGACCTGAAAAATGGCCTGGGGGATAATCTTATCAAACCTCTGATGTGGTTATTTTGTAACTGAGTATATTGAAGGCTGGGGAACAAAGCCATCTGGTGCCAGCATCCTAGCTGCTCTCTCTCCTCCAGGGGCTTGCCTTGGTTTGGGGCCTTTCCAGCAAAATTAGGCTGGAGAAATGAGATTTTAGTTAAACAAGGCCCACTGTTGCTTTAAAACAAAATGTCAACGTTTTAAAAAATGTATTAACTAGTTCTTTTGGCCAAGAAATCAATAGATGCACTTCCTTTCCACTGTGCAGGCTCTGAGCTGACAGAGGAGTAAGAGCTTGAACCATCTACATGGTCTGAGTGACCACATCCTTCACTCAGGGCTGTAGCCCTGTTCTACAGCAGATAATTCTGAGTCACCCCAGCTAATGGCCGTGCACAG------CATCCTGATGCTCTGATTA-GGCTGAA--------GGGCATGTGGCGTGGTGGCTAGGCTGTCTCAGAGAGCACCTCAGGCTGGGTGGACCAGGCTGACCCAGAAAAGGGCAATGGGCCTTTGACAGGGACTAGCTGGCTACTATCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACACTTAGGGTGATGGGTGAAAGTGTTTTTCCACATAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60236109 1029 - 96509753 TTTTATTTGGATGCTTTCATGGAGTAAAGTTCCCAA-C----CAAGTATCAGGCTGAGTGCAATCCAGGCTGTGGTGCTGTGCTGTGAGGCAGGAAGTCTAGGCAGGTCCTGTGTTCACTGTTTCACTTCCACAGACTGAAGCCCCTCGAGGGGACATCTGCACAGAGGCTGGCAAGTGACTTCAGGATGCTGACGATGACCTCAAGGTGAGAGCCAGAT-AAAATCCCCTCAACTCTGCTAACCAAGGGCCTCAATGGCCACGCGTGTGGTTTTCTCCTGCAAAGAACAAACCAGTTTGCAAACCATGCTTTTGAGGCTAGAAAAA-TGGCTGTATTCACCAGAGTGTCTGCTGAAGGCTGGGGCCCCTGAAAGTTGATTCAAATACTGTATTCTGGTAGAAAATATGGTAGCATATAAACCTGAAAAATGGCCTGGGGG-TAATCTTATCAAACCTCTGCTGTGGTTATTTTGTAACTGAGTATATTGAAGGCTGGGGAACAAAGCCATCTGGTGCCAGCATCCTAGGTGCTCTCTCTCCTCCAGGGGCTTGCCTGGGTTGGGGGCCTTTCCAGCAAAATTAGGCTGGAGAAATGAGATTCTAGTTGAACAAGGCCCACTGTTGCTTTAAGACAAAATGTCAAAGCTTTAAAAAATGTATCAACTTGCTCTTTTGGCCAAGAAATCAATAGATGTGCTTCCTTTCCACTGTGCAGGCACTGAGCTGACAGAGGAGTAAGAGCTTGAATCATTTCCATGGCCTGAGTGACCACATGCTTCACT------CGGAGCCCTGCTCCACAGCACACAATTCTGAGTCATCCCAGCTAACGGCCATGCACAG------CATGCTGATGCTCTGGTCA-GGCTGAG--------GGGCGTGTGGCGTGGTGGCTAGGCTGTCTCAGAGAACACCTCAGGCTGGGTGGACAAGGCTGACCCAGAAGAGGGCAACAGGCCGTTGACAGGGACTAGCTGGCTACAATCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACAGTTAGGGTCATGGGTGAAAGTGTTTTTCCACATAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 30637 1028 + 80412 TTTTATTTTGATGCTTTCATGGAGTAAAGTTCCCAACC----CAAGTATCAGGCAGAGAGCAGGCCAGGCTGTGGTGCTGTGCTGTGAGGCAGGAAGTCCAGGCAGGTCCTGTGTTCACTATTTCACTTCCAGAGACTGAAGCCCCTCGAGGGGACATCTGCACAGAGGCCGGCAAGTGACTTCAGGATGCTGACGATGACCTCAAGGTGAGAGCCAGAT-AAAATCCCCTCAACTCTGCTAACCAAGGGCCTCAATGGCCACGCGTGTGGTTTTCTCCTGCAAAGAACAAACCAGTTTGCAAACCATGCTTTTGAGGCTAGAAAAA-TGGCTGTATTCACCAGAGTGTTTGCTGAGGGCTGGGGCCCCTGAAAGTTGATTCAAATACTGTATTCTGGTAGAAAATATGGTGGCATTTAGACCTGAAAAAAGGCCTGGGGG-TAATCTTATCAAACCTCTGCTGTGGTTATTTTGTAAGTGAGTATATTGAAGGCTGGGGAACAAAGCCATCTGGTGCCAGCATCCTAGCTGCTCTCTCTCCTCCAGGGGCTTGCCTGGGTTGGGGGCCTTTCCAGCAAAATTAGGCTGGAGAAATGAGATTCTAGTTGAACAAGGCCCACTGTTGCTTTAAGACAAAATgtcaaagctttaaaaaatgtatcaactTGCTCTTTTGGCCAAGAAATCAATAGATGTGCTTCCTTTCCACTGTGCAGGCACTGAGCTGACAGAGGAGTAAGAGCTTGAATCATTTCCATGGCCTCAGTGACCACATGCTTCACT------CGGAACCCTGCTCCACAGCACACAATTCTGAGTCACCCCAGCTAATGGCCATGCACAG------CATGCTGATGCTGTGGTCA-GGCTGAG--------GGGCGTGTGGCGTGGTGGCTAGGCTGTCTCAGAGAACACCTCACGCTGGGTGGACAAGGCTGACCCAGAAGAGGGCAACAGGCCGTTGACAGGGACTAGCTGGCTAC-ATCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACACTTAGGGTCATGGGTGAAAGCG-TTTTCCACATAT i papAnu2.JH684867 N 0 I 2810 s chlSab2.chr2 37884044 1028 - 90373283 TTTTATTTGGATGCTTTCATGGAGTAAAGTTCCCAA-C----CAAGTATCAGGCAGAGGGCAGGCCAGGCTGTGGTGCTGTGCTGTGAGGCAGGAAGTCCAGGCAGGTCCTGTGTTCACTGTTTCACTTCGAGAGACTGAAGCCCCTCTAGGGGACATCTGCACAGAGGCCGGCAAGTGACTTCAGGATGCTGACGATGACCTCAAGGTGAGAGCCAGAC-AAAATCCCCTCAACTCTGCTAACCAAGGGCCTCAATGGTCACGCGTGTGGTTTTCTCCTGCAAAGAACAAACCAGTTTGCAAACCATGCTTTTGAGTCTAGAAAAA-TGGCTGTATTCACCAGAGTGTCTGCTGAAGTCTGGGGCCCCTAAGAGTTGATTCAAATACTGTATTCTGGTAGAAAATATGATAGCATTTAGACCTGAAAAA-GGCCTGGAGA-TAATCTTATCAAACCTCTGCTGTGGTTATTTTGTAACTGAGTATATTGAAGGCTGGGAAAGAAAGCCACCTGGTGCCAGCATCCTAGCTGCTCTCTCTCCTCCAGGGGCTTGCCTGGGTTGGGGGTCTTTCCAGCAAAATTAGGCTGGAGAAATGAGATTCTAGTTGAACAAGGCCCACTGTTGCTTTCAGACAAAATGTGAAAGCTTTAAAAAATGTATCAACTTGCTCTTTTGGCCAAGAAATCAGTAGATGTGCTTCCTTTGCACTGTGCAGGCACTGAGCTGACAGAGGAGTAAGAGCTTGAATCATTTCCACGGCCTGAGTGTCCACATGCTTCACT------CGGAGCCCTGCTCCACAGCACACAATTCTGAGTCACCCCAGCTAACGGCCATGCACAG------CATGCTGATGCTCTGGTCA-GGCTGAG--------GGGCGTGTGGCGTGGTGGCTAGGCTGTCTCAGAGAGCACCTCCGGCTGGGTAGACAAGGCTGACCCAGAAGAGGGCAACAGGCCTTTGACAGGGACTAGCTGGCTACAATCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACAGTTAGGGTCATGGGTGAAAGTGTTTTTCCACATAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108153318 1015 + 108792865 TTCTGTTTGGATGCTTTGAGGAATTAAAGTTCCAAA-ACGAGAATGTACTTGGCAGAGGGCAGT-TGGGCTGTGGTTCCACGCTATGAGGCTGGGAGTCCAGGCAGGTCCTGTGTTCGCTGGTTCACTGTCACCGGCCAAAGGCCCTCCAGAGGACATCTGGACAGAGGCCT-CGGGTGGCTTCAGGATGCGGATGATGCCCACCTGGCGAGGGCCAGAGAAAAATCCTATCGACCCTGCTGACCAAGCGCATCCGTGGCCACGTGTGTGGCTTCTT---------------CCAGTCTGCAAACCACGC-TTTGAAGCTGGAAGCC-TGGCTGTACT--CTCCAGTGTCCTCTAAAGGCCGTGGACCCCGAGGGTTGATTCAAA-ACTGTGTTTTCTTATAAAATGTAGTAACATTCAGACCTGAAAAAAGGCTGGAGGA-------TATCTAACTTCTGAT---GTCATTTTGTAACCGAGTGGGTTGAAGGCTAGG-AACAAAGGTGTCTGGCGCCAGCGACCCCGCTGGTCTCCATCCTCCTGGGCCTTGCCTAGGTTGGGAATCTCTCCAGCAAAATCAGGCTGGAGAAACGAGATTCTAGTTTAACAAGGTCCACTGTTGCTTTAAGATGAAATGTCAAAGTTTTTAAAAATGTATTAACTTGCCCTTTTGGCCAAGAAATAAATAGATGTACTTCCTTT-CATGCTGCAGTCACTGAGTGGAACGAGAAGGAAGAGCTTGAATCATCAGTGTGGCGTGAGTGACCACATCCCGCACT------CTGAGCCCCACTCTGCAGCAGAGGATTCTGAGTCACCCCGGCTAATGGCC-TGCCCAGCGTCCTCATCCTGATGCTCTGATTACTCCTGAGTCAGCCAAGGGCGGATGGGGTGGTCGCTGGACTGTCTCAGAGGGCACCCTGGGCTGGGT-GACAAGGCTGGCCCACAAGAGGGCGAGGAGCCTTTGACGGGGACTGGCAGGCTACCGTCTGCCTCTTCTGCAGTTTGGGACACTTAGGGTCATGGGTGGGAGTGTGTTTCCACATAT i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=362411.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 87757 524 + 478999 GGTGGCCC-GAAAGGAAAGG-----AAACTCATGCCAGTGTTCAGAAAGCGTGCGGGTTTCTCAGGTAACGTTACTGCAGCCACTGATGTCTAATCCAAAGAGCTCTGAATGCTTGCCATAGAGATTTGTAGTTTTAATACTGAAGCCCCGAATATTCTGATTTCCTCATTAAGACCGACCTAACATGAGCTATGCAGTCAGCTAAGGTATCAACGGGAGGAAATTGCCAGTGTTTCCCTCTTATTTTCCTCTGAGGTCATCTGAAAACAACCGCAGTGAGGACGGAGTTCGTGCGGCCCTGATGGCTGTGTGTTCCCAGCTCCAAGCATGCACGaaatatttaattcatttgaatataaataagttaatgaatatgaatacattaataaattaattGGCATCGTTTTAGTCCTGTTGCAGTTTCAAACTCACCGATTTATCCAACTTCTTTGCACTGAGTTCTTATTCAAGTGAAGTATTCTGGTCTTGTGACTTGTACTTCTGACATAGTA---------------ATAG-AACA--ACTAATATT s panTro4.chr18 74570656 523 - 76611499 AGTGGCCC-GAAAGGAAAGG-----AAACTCATGCCAGTGTTCAGAAAGTGTGTGGGTTTCTCAGGTAACATTACTGCAGCCACTGATCTCTAATCCAAAGAGCTCTGAATGCTTGCTATAGA--TTTGTAATTTTAATACTGAAGCCCCGAATATTCTGATTTCCTCATTAAGACCGACCTAACATGAGCTATGTAGTCAGCTAAGGTATCAACGGAAGGAAATTGCCAGTGTTTCCCTCTTATTTTCCTCTGAGGTCATCTGAAAACAACTGCAGTGAGGACAGAGTTCGTGTGGCCCTGATGGCTGTGTGTTCCCAGGTCCAAGCATGCACtaaatatttaattcatttgaatataaataagttaataaatatgaatacattaataaattaattGGCATATTTTTAGTCCTGTTGCAGTTTCAAACTCACCAATTTATCCAACTTCTTTGCACTGAGTTCTTATTCAAGTGAAGTATTCCAGTCTTGTGACTAGTACTTCTGACATAGTA---------------ATAGTAACA--ACTAATATT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60237138 525 - 96509753 AGTGGCCC-GAAAGGAAAGG-----AAACTCATGCAAGTGTTCAGAACGTGTGCGGGTTTCTCAGGGGACGCTACTGCAGCGGCTGATGTCTAATCCAAGGAGCTCTGAAGGCTTGCCATAGAGATCTGTAGTTTTAATACCAAAGCCCCAAACATTCTGAGTTCCTCATGAAGACTGACTTAACATGAGCTATGCAGCCAGCTAAGGTATCCACTGAAGGAAATTGCCGGTGTTTCCTTCTCATTTTCCTCTGAGGTCATCTGAAAACAATCACTTTGAGGACAGAGTTTGTGCAGCCCTTATGGTGGTGTGTTCCCAGCTCTGAGCATGCACTAAATATTTAATTCATTTGAATataaataagttaatgaacatgaatacattaataaattaatTGGCATATATTTAGTCCTATTGCAGTTTCAAACTCACGAATTTATCCAACTTCTTTCCAATGAGTTCTCATTCAAGGGAACTATTTCAGTCTTATGACTAGTACTTCTGACATaata---------------atagtaaca--accaatatt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37885072 525 - 90373283 AGTGGCCC-AAAAGGAAAGG-----AAACTCATGCAACTATTCAGAATGTGTGCGGGTTTCTCAGGGAACGCTACTGCAGCGGCTGATGTTTAATCGAAGGAGCTCTGAAGGCTTGCCATAGAGATCTGTAGTTTTAATACCGAAGCCCCAAACATTCTGAGTTCCTCATGAAGACTGACTTAACATGAGCTATGCAGTCAGCTAAGGTATCCACTGAAGGAAATTGCCGGTGTTTCCTTCTCATTTTCCTCTGAGGTCATCTGGAAACAATCGCTTTGAGGACAGAGTTTGTGCAGCCCTGATGGTGGTGTGTTCCCAGCTCTGAGCATGCACTAAATATTTAATTCATTTGAATataaataagttaatgaacatgaatacattaataaattaatTTGCATTTTTAAATTTCTATTGCAGTTTCAAACTCACAAATTTATCCAACTTCTTTCCACTGAGTTCTTATTAAACTGAAGTATTTCAGTCTTATGACTAGTACTTCTGACATAATA---------------ATagtaata--accaatatt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108154333 535 + 108792865 GGTGGCCCTGAAAGGAAAGGAAACTAAACTCCTGC-AGTGTTCACAAGGTGCACGGGTTTCTCAGGTAACACCTCTGCCGCCACCCACGGCTGACCCAAAGAGCTCTGAATGCTTGCCAGAGAGATGTGTATTTTTAATCCCAAAGCCCTGAGTGCTCTGATTTCCTCGTTAAGACTGACTTAACATGAGCTAC----TTAGCTAAGTTATCAACTGAATAAAATAACCAGTGTTTCCCGCTTATTTTCTTCTGTGGTCATTTGAAAACAATGGTCGTGAGGACAGAGTTCCTGTGGCCTTGATGGTGGCGTGTCCCTGGCTCTGAGCATGCACCAAATCTTTAATTCCTTTGAGCACAAATAAGTTAATGAGTATGCAGACATTCATAAA-TAACTTGCATATTTTTAGTCCTATCGAAGTTTCAGACTCACCAATTTATCCAACTTCTCTGCGGTGAGTTCTTATTCAAGTGAACTATTCCAGTCTT-------GTACTTCTGATAGaataattattattattaatataataatatgattaatatt i calJac3.chr14 C 0 I 206 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e papAnu2.JH684867 31665 2810 + 80412 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=24404.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88281 28 + 478999 TATTTAGAACTTTAGTTTACCAAGCACT s panTro4.chr18 74571179 28 - 76611499 TATTTAGAACTTTAGTTTACCAAGCACT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60237663 28 - 96509753 tatttagacctttagtttaccaagcact i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37885597 28 - 90373283 tatttagaactttagtttaccaagcact i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108155074 28 + 108792865 TATTTAGAACTCTAGTTtgccaagcact i calJac3.chr14 I 206 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e papAnu2.JH684867 31665 2810 + 80412 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=1797.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88309 5 + 478999 CTACA s panTro4.chr18 74571207 5 - 76611499 CTACa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60237691 5 - 96509753 ctaga i macFas5.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108155102 5 + 108792865 ccaca i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37885625 0 - 90373283 C e papAnu2.JH684867 31665 2810 + 80412 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=2383.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88314 15 + 478999 Ttttattttattatt s panTro4.chr18 74571212 15 - 76611499 ttttattttataatt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60237696 15 - 96509753 ttttttttttttttt i macFas5.chr10 C 0 I 149 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37885625 0 - 90373283 C e papAnu2.JH684867 31665 2810 + 80412 I e calJac3.chr14 108155107 0 + 108792865 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=29683.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88329 135 + 478999 tatt---tgtttattt-tttttagtagagacagggtttcaccgagttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacgctcctcggcctcctaaagtgctgggattacaggcttgagccaccgcgcccagc s panTro4.chr18 74571227 139 - 76611499 tattatttatttatttatttttagtagagacagggtttcaccatgttagccaagacggtctcgatctcctgatctcgtgatccgtgctcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccatcgcacccagc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60237860 135 - 96509753 tagt---tttttgtat-tttttagtagagacggggtttcaccgtgttcgccaggatggtctcgatctcctgacctagtgatccgcccgtctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcttgagccaccgcgcccggc i macFas5.chr10 I 149 I 7 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37885625 0 - 90373283 C e papAnu2.JH684867 31665 2810 + 80412 I e calJac3.chr14 108155107 0 + 108792865 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=4740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88464 6 + 478999 cTACAT s panTro4.chr18 74571366 6 - 76611499 ctacat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60238002 6 - 96509753 ctagat i macFas5.chr10 I 7 C 0 s papAnu2.JH684867 34475 6 + 80412 ctacat i papAnu2.JH684867 I 2810 C 0 s chlSab2.chr2 37885625 6 - 90373283 ctacat i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e calJac3.chr14 108155107 0 + 108792865 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=880763.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 88470 777 + 478999 TTTATTTTTACATTTTGTCTTTACAAACCCCCACGGGGCAGGCATTCTCCTTACACGCAGTGTTAATTGGTGACACAGAGGCTCAGGGGTTTAAATGGTTTCACTGTAAACAATGTAATCTAGTAGGATGTTGCTTTCCTATTTTTCCTAATACTACCATGTTTAGATGTGGGTGGCTGAGTGGGAGTATATGATTTCCTGTGTATGTATAGACGTAACCCACACTCACAGGCGGGAAGTTCTGCAGGCTGAGAAGCGAAGCCCTTTGCTGAACAACCACCACCAACATTCTAGGGCCCCCACACCCTTGGTTCTGCAGGCTACACCCCTCCCATCTGCTTAGAAGCAGAAAGAAAACTCTGC------GGTTACTTTTCCCTTTGACAATAAGCCGCGGTTCTCTTCAACGTTCTCCTGGGGACTTGGGTCAATGTTCTCACATGCAAATGTTAGCCAGGCCCAGGGTTATTGTTTCCCCTACCCCTGCGGATTGATCATGGCATGCAACTGCCCCATATTGTATTTTGGTCACCCCCATCGGCATCCCATCTGCTGCTAGTGCCTCTGGCC-AGCTTCTCGCATGGTCCTGACACGGTGCTGTCACTCTCACATTATTTGCACACATTGTTTACCTATAGCTGGACACATTGTTCATAGGAGCCCAGCTGGTAAAGTAAAAATATTCCAAGACTGTGCTGATAAGCTACTTCTTCCCTGCATCCTGGGCTGGTGAGAAGCTAAAGAGGAATGAATGCTCTGCCTGTGAAGAGGCCGCACTGC s panTro4.chr18 74571372 783 - 76611499 tttatttttacattttgtctttacaaacccccacggggcaggcattctccttacacacagtgttaattggtgacacagaggctcaggggtttaaatggtttCACTGCAAGCAATGTAGTCTAGTAGGATGTTGCTTTCCTATTTTTCCTAATACTACCATGTTTAGATGCGGGCGGCTGAGTGAGAGTATATGATTTCCTGTGTATGTATAGATGTAACCCACACTCACAGGCAGAAAGTTCTGCAGGCTGAGGAGTGAAGCCCTTTGCTGAACAACCACCAACAACATTCTAGGACCCCCACACCCTTGGTTCTGCAGGCTACACCCCTCCCATCTGCTTAGAATCAGAAAGAAAACTCTGCCTCTGCGGTTACTTTTCCCTTTCACAATAAACCGTGGTTCTCTTCAACGTTCTCCTGGGGACTTGGGTCACTGTTCCCCCATGCAAATGTTAGCCAGGCCGAGAATTATTTTTTCCCCTACCCCTGCAGATTGATCATGGCACGCAGCTGCCCCATACTGTATTCTGGTCACCCCCATCAGCATCCCATCTGCTGCTTGTGCCTCTGGCC-AGCTTCTTGCATGGTCCTGACACGGTGCTGTCACTCTCACATTATTTGCACACATTGTTTACCTATAGCTGGACACATTGTTCATAGGAGCCCAGCTGGTAAAGTAAAAATATTCCAAGACTGTGCTGATAAGCTACTTCTTCCCTGCATCCTGGGCTGGTGAGAAGCTAAAGAGGAATGAATGCTCTGCCTGTGAAGAGGCCGCACTGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60238008 776 - 96509753 tttatttttacattctgtctttacaaacccccacaaggcaggcattctccttacacgcagtgttaattggtgacacggaggctcaggggtttaaatggtttCACTGCAAGCAATGTAATCTAGTAGGATGTTGCTTTCCTATGTTTCCTAATACTCCCATATTTAGATATGGGTGGCTGAGTGAGAGTATATGATCTCCTGTATATGTGTAGGTGTAACCCACACTCATAGACGGAAAGTTCTGCAGGTTGAGAAGTGAAGCCCTTTACTGAACAACCACCAACAACATTCTAGGACCCCCACACCCTTGGTTCTGCAGGCTACACCCCTCCCATCTGCTTAGAACCAGAAAGAAAACTCTGC------GGTTACTTTTGCCTTTGACAATGACCTGCGGTTCTCTTCCACGTTCTCCTGGGGACTTGGGTCAATGTTCTCCCACGCAAATGTTAGCCAGGCCCAGGGTTATTGTTTTCCCTACCCCTGCAGATTGATCACAGCACACAGCTGCCCCACACTGGATTTCAGTCACCCCCATCAGCATCCCATCTGCTGCTTGTGCCTCTGGCC-AGCTTCTTGCATGGTCCTGACACGGTGCTGTCACTCTCACATTATCTGCACACATTGTTTACCTATAGTTGGACACATTGTTCATAGGAGCCCAGCTGGAAAAGC-AAAATATTCGAAGACTGTGCTGATAAGCTACTTCTTCCCTGCATCCTGGGCTGGTGAGAAGCTAGAGAGGAACGAATGCTCTGCCTGTGAAGAGACCGCACTGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 34481 776 + 80412 tttatttttacattctgtCTTTACAAACCCCCACGAGGCAGGCATTCTCCTTACACGCAGTGTTAATTGGTGACACCGAGGCTCAGGGGTTTAAATGGTTTCACTGCAAGCAATGTTATCTAGTAGGATGTTGCTTTCCTAGTTTTCCTAATACTCCCATGTTTAGATGTGGGTGGCTGAGTGAGAGTATATGATCTCGTGTGTATGTGTAGATGTAACCCACACTCATAGACGGAAAGTTCTGCAGGTTGAGAAGTGAAGCCCTTTACTGAACAACCACCAACAACATTCTAGGACCCCCACACCCTTGGTTTTGCAGGCTACACCCCTCCCATCTGCTTAGAACCAGAAAGAAAACTCTGC------GGTTACTTTTGCCTTTGACAATGACACACGGTACTCTTCCACATTCTCCTGGGGACTTGGGTCAATGTTCTCCCACGCAAATGTTAGCCAGGCCCAGGGTTATTGTTTTCCCTACCCCTGCAGATTGATCATGGCACACAGCTGCCCCACACTGGATTTTGGTCACCCCCATCAGCATCCCATCTGCTACTTGTGCCTCTGGCC-AGCTTCTTGCATGGTCCTGACACGGTGCTGTCACTCTCACATTATCTGCACACATTGTTTACCTATAGCTGGACACATTGTTCATAGGAGCCCAGCTGGAAAAGC-AAAATATTCGAAGACTGTGCTGATAAGCTACTTCTTCCCTGCATCCTGGGCTGGTGAGAAGCTAGAGAGGAGTGAATGCTCTGCCTGTGAAGAGACCGCACtgc i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37885631 776 - 90373283 tttatttttacattctgtctttacaaacccccacgaggcaggtattctccttacacgcagtgttaattggtgacaccgaggctcaggggtttaaatggtttCACTGCAAGCAATGTTATCTAGTAGGATGTTGCTTTCCTAGTTTTCCTAATACTCCCATGTTTAGATGTGGGTGGCTGAGTGAGAGTATATGATCTCGTGTGTATGTGTAGATGTAACCCACACTCATAGACAGAAAGTTCTGCAGGTTGAGAAGTGAAGCCCTTTACTGAACAACCACCAACAACATTCTAGGACCCCCACACCCTTGGTTCTGCAGGCTACACCCCTCCCATCTGCTTAGAACCAGAAAGAAAACTCTGC------AGTTACTTTTGCCTTTGACAATGACCTGCGGTTCTCTTCCACGTTCTCCTGGGGACTTGGGTCAATGTTCTCCCATGCAAATGTTAGCGAGGCCCAGGGTTATTGTTTTCCCTACTCCTGCAGATTGATCACGGCACACAGCTGCCCCACACTGGATTTCGGTCACCCCCATCAGCATCCCATCTGCTACTTGTGCCTCTGGCC-AGCTTCTTGCATGATCCTGACAGGGTGCTGTCACTCTCACATTATCTGCACACATTGTTTACCTAGAGCTGGACACATTGTTCATAGGAGCCCAGCTGGAAAAGC-AAAATATTCAAAGACTGTGCTGATAAGCTATTTCTTCCCTGCATCCTGGGCTGGTGAGAAGCTAGAGAGGTGCGAATGCTCTGCCTGTGAAGTGACCACACTGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108155107 746 + 108792865 tttatttttaccttttgtctttacaaatccccacgagacaggcattctcgttactcacagtgttgactggc-aggcagaggctcgggggtataaatgctttCACTGCAAGCCCTGGGATCTAGAAGGGTGCTGCTTTCCTGTTTTTCCTAATGCTGCCATGTTTAGATATGGACGGCCGAGTGAGAGCAGATCATTTC-TGTGTGTGTGTAGATGTAACCCACACTCACAGACAGAGAGCTGTGCAGGCTGAGAAGTGGAGCCCTTTGCTGAATGGCCAACAAGAGCGTTCTAGGACCCCT-CATCCTTGGTACCTCAGGCTACGCCCCTCACATCGCCTTAGAACCATAAAGAACATTCCGA------GGTTACTTCTCCCATTTACAGTAAGCCATGGTTGTCTTCAACCTTCTCCAGGGGACTT-GGTCAATGTCCTCCCAGGCAAATGTTAGCCAGGCCCAAGGTAA-------CTCTGCCC---CAGATCTGTCTCGGCACATGACTGCCCCACACTGTATTCTG--CCACGCCGTCAGTGTCCCATCTGCCACCTGTGCCTCTGGCTGGGCTTCTCGCGAGATCCTGACGT-GTGCTGTTGCTCT-------------CACCTTGCTTGCTTGTAGCTGGACACACTG-TCATAGGAGCCCAGCTGGCAAAGCAAAAATA-CCTGAGACTGCTCTGATAAGCTACATATTCCCTGCATCCTGGGCCAGTGAGAAGCAGAAGAGGAATGAAAGCTCTGCTTGTGAAGAGGCAGCACTGC i calJac3.chr14 C 0 I 485 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=624704.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 89247 571 + 478999 AGAGAAGAGGAGGCAGAGATGCAGTCGTCACGGCCCTAAGACCCTGCCTGGACCCGGTTTTGCAAGTCGAGGGAAGAGTTTTGCACAAATTCTCACTGGGAGCATTGTCAGGGCTGCAGCCACATCACTTTTTTTTGATCTGAGTCCTTTTAACATTAGCTATGATGTCAAAAAAGATGAAATTGAAGTTGTCAACATCTGGTGGAAGGCAAAAACCAGTGAA-------TTTCTACCCAGGGAGAGTTCCTCTGCAGGGTCCCCG----------CTTCTGGTGGCCTGGAGTTGGGGAGGCCTCTGGAGCAAGTCAGGGGATTAAATTCTGGG--TTTTCTTCCATTTTATTATTTTCCTATTTTGACATCTTTG--AAAAATGGCTCAGCCTCATAGTGTATGGGTCTTCTGATTGCTTTTGTCTTGATTTTATTCTGACTGAGGGGCAATGGCCACTGTGGGCTCCTCATCCAGGATGAAGAGGGCCCCTCTGTGGCCTGGGTGCATCCATGCTCTTCACGGTGGCCTCATGGATCGTCATACAAAGGATGATCTCAGTGATGAGCTTGAGCCTACCCAAAATTAAAT s panTro4.chr18 74572155 570 - 76611499 AGAGAGGAGGAGGCAGAGATGCAGTTGTCACAGCCCCAACACCCTGCCTGGACCTGGTTTTGTAGATCCAGGGAAGAGTTTTGCACAAATTCTCACTGGGAGCATTGTCAGGGCTGCAGC-ACATCACTCTTTTTTGACCTGAGTCATTTTAACATTAGCTCTAATGCCAAAAAAGATGAAATTGAAGTTGCCAACATCTGGTGGAAGGCAAAAACCAGCGAA-------TTTCTAGCCAGGGAGAGTTCCTCTGCAGGGCCCCTG----------CTCCTGGTGGCCTGGAGTTGGGGAGGCCTCTGGAGCAAGTCAGGGGATGGGATTCTGGG--TTTTCTTCCATTTTATTATTTTCCTATTTTGACATCTTTG--AAAAATGGCTCAGCCTCATGGTGTATGGGTCTTCTGATTGCTTTTGTCTTGATTTTATTCTGACTTAGGGGCAATGGCCACTGTGGGCTCCTCATCCAGGATAAAGAGGGCCCCTCCATGGCCTGGGTCCATCCATGCTGTTCACGGTGGCCGCATGGATCATCATACAAAGGATGATCTCAGTGATGAGCTTGAGCCTACACAAAATTAAAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60238784 573 - 96509753 AGAGAGGAGGAGGCAGAGATGCAGTCATCACAGCCCCAAGACCCTGCCTGGACCTGGTTTTGCAGGTCAAGGGAAGAGTTTTGCACAAATTCTCACTGGGAGCATTGTCAGGGCTGCAGC-GCATCACTCTTTTTTGACCTGCGTCCTTTTAATGTTAGCTATGATGTCGAAAAAGATGAAATTGAAGTTGCCAACATTGGGTGGAAGGCAAAAACCAGAGGA------GTTTCTACCCAGGGAGAATTCCTCGGCAGGCCCCTTG----------CACCTGGTGGCCTGGAGTTGGGGAGGCCTCTGAAGCAACTCAGGGGATGGAATTCTGGG--CTTTTTTCCATTTTATTATTTTCCTATTCTGACATCTTTGGAAAAAAACCCTCAGTCTCATGGTGTATGGGTCTTCTGATTGCTTTTGTCTTGATTTTATTCTGACTGAGGGACAATGGCAACTGTGGGCTCCTCATCCAGGATGAAGAGGGCCCATCCGTGGCCTGGGTCCATCCATGCTGTTCATGGTGGCCTCATGGATCATCATACAGAGGATGATCTCAGTGACGAGCTTGAGCTTACACAAAATTAAAT i macFas5.chr10 C 0 I 489 s papAnu2.JH684867 35257 573 + 80412 agagaggaggaggcagagatgcAGTCATCACAGCCCCAAGACCCTGCCTGGACCTGGTTTTGCAGGTCAAGGGAAGAGTTTTGCACAAATTCTCACTGGGAGCATTGTCAGGGCTGCAGC-ACATCACTCTTTTTTGACCTGTGTCCTTTTAATGTTAGCTCTGATGTCGAAAAAGATGAAATTGAAGTTGCCAACATTGGGTGGAAGGCAAAAACCAGAGGA------GTTTCTACCCAGGGAGAGTTCCTCAGCAGGCCCCCTG----------CACCTGGTGGCCTGGAGTTGGGGAGGCCTCTGAAGCAACTCAAGGGATGgaattctgggtttttttttccattttattattttcctattctgaCATCTTTG--AAAAAAGCCTCAGTCTCATGGTGTATGGGTCTTCTGATTGCTTTTGTCTTGATTTTATTCTGACTGAGGGACAATGGCAACTGTGGGCTCCTCATCCAGGATGAAGAGGGCCCATCCGTGGCCTGGGTCCATCCATGCTGTTCATGGCGGCCTCATGGATCATCATACAGAGGATGATCTCAGTGATGAGCTTGAGCTTacacaaaattaaat i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37886407 570 - 90373283 AGAGAGGAGGAGGCAGAGATGCAGTCATCACAGCCCCAAGACCCCGCCTGGACCTGGTTTTGCAGGTCAAGGGAAGAGTTTTGCACAAATTCTCACTGGGAGCATTGTCAGGGCTGCAGC-ACATCACTCTTTTTTGACCTGCATCCTTTTAATGTTAGCTATGATGTCAAAAAAGATGAAATTGAAGTTGCCAACATTGGGTGGAAGGCAAAAACCAGAGAA------GTTTCTACCCAGGGAGAGTTCCTCGGCAGGCCCCCTG----------CACCTGGTGGCCTGGAGTTGGGGAGGCCTCTGAAGCAACTCAGGGGATGGAATTCTGC---TTTTTTTCCATTTTATTATTTTCCTATTCTGACATCTTTG--AAAAAAGGCTCAACCTCATGGTGTATGGGTCTTCTGATTGCTTTTGTCTTGATTTTATTCTGACTGAGGGACAATGGCGACTGTGGGCTCCTCGTCCAGGATGAAGAGGGCCCATCCGTGGCCTCGGTCCATCCATGCTGTTCATGGTGGCCTCATGGATCATCATACAGAGGATGATCTCAGTGATGAGCTTGAGCTTACACAAAATTAAAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108156338 572 + 108792865 AGAGGGGAAGAGGTGGTGATTCTGTCCTCA--GCCCCCAGGCCCCACCTGGATCTGGTTTTGCAGCTCCAGGGAAAAGTTTTGCACAAATTCTTGCTGGGAGCGTTATCAGGGCTGT-GC-ACATCAGTCTTTCCTGACCTGAGTCCTTTTAA--TTAGTTATGATGCTGAGAAAGATGAAATCGATGTTACCGACATCTGGTGGAAGACGAAAAGGAGCAGGATTCAGATTTCTACCCAGGCAGAGCCCCTTCGCAGGCTCTCTGGAGGCCTCCCCACTTGGTGGCCTGGAGTTGGAGAGGCCTCTGGGGCAGGCCAGGGGATGGAATTCTCAG--TTTTCTTTCATTTGATTATTTTCGTATTTTGGCATATTTG--GAAAATGGCTCAGCCTCATGGTGCATGTGTTTTCTGATTGCTTTTGTCTTTGTTTTATTCTGAGTCAGGGATGGTGGCCACTGTGGGCTCCTCATCCAGGACTCGGTGGCCC---TCGGGGCCTCCGTCCATCTAGGCT----ACGGCG--CATGGGGGTTCCCATGCACAGGGTGGTCTCGGGGATCAGTCTGAGCTGGCA-GGAATTAAAT i calJac3.chr14 I 485 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=318721.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 89818 211 + 478999 TATATGGGTTTATAAGATTCCT-CCTCAGGATCAGTATCATCAGGCCTGTCCCTGCTGGTAGCAAGGCCATCTTTATAATGTGCTGTCATGGTGGTAAAGGCATCACTCACTTGATGGAGATCCCAAAGACCAGCTCTACTCGAGAGAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCCTTGGTGCTTTTTCGAGGTTCTACTGAAGACAATGCCA s panTro4.chr18 74572725 212 - 76611499 TATATGGGTTTATAAGATGCTTGCCTCAGGATCAGTGACATCAGGCCTGTCCCTGCTGCTAGCAAGGCCAACTTTATAATGTGCTATCATGGTGGTAAAAGCATCACCCACTTGATGGAGATCCCAAAGACCAGCTCTACTCAAGATAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCCCTGGTGCTTTTTCAAGGTTCTACTGAAGACAATGCCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35457107 211 - 95678458 TATATGGGTTTACAAGATTCCTGCCTCAGGATCAGTGACATCAGGCCTGTCCCTGCTGCTAACAAGGCCGACTTTATTATGTGCTGTCATGGTGGTGAAGGC-TCCTCCACTTGATGAAGATCTTAAAGACTAGCTCTACTCAAGAGAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCTCTGGTGCTTTTTCAGGGTTCTAATGAAGACAATGCCA i rheMac3.chr10 N 0 C 0 s macFas5.chr10 36396122 211 + 96509753 TATATGGGTTTACAAGATTCCTGCCTCAGGATCAGTGACATCAGGCCTGTCCCTGCTGCTAACAAGGCCGACTTTATTATGTGCTGTCATGGTGGTGAAGGC-TCCTCCACTTGATGAAGATCTCAAAGACTAGCTCTACTCAAGAGAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCTCTGGTGCTTTTTCAGGGTTCTAATGAAGACAATGCCA i macFas5.chr10 n 489 C 0 s papAnu2.JH684867 35830 211 + 80412 tatatgggTTTACAAGATTCCTGCCTCGGGATCAGTGACATCAGGCCTGTCCCTGCTGCTAACAAGGCCGACTTTATTGTGTGCTGTCATGGTGGCGAAGGC-TCACCCACTTGATGGAGATCTCAAAGACTATCTCTACTCAAGAGAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCCCTGGTGCTTTTTAAGGGTTCTACTGAAGACAATGCCA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37886977 202 - 90373283 TATATGGGTTTACAAGATTCCTGCCTCAGG---------ATCAGGCCTGTCCCTGCTGCTAACAAGGCCGACTTTATTATGTGCTGTCATGGTGATGAAGGC-TCACCCACTTGATGGAGATCTCAAAGAGTAGCTCTACTCAAGAGAGATTTAAGCTAAGTTGCCTGGGAGTCCCTGGTGCTTTTTCAGGGTTCTACTGAAGACAATGCCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108156910 198 + 108792865 TAT-TTGGTTTATAAGATTCCTGCCTC------------ATCAGGCCTGCCTCTGCTGCTGGCAAGGCCGACTTTCCCATGTGCTCTCATGGTGGGAAAGGCCTTGCCCACGTGTTGAAGATCCC-AGGACTGGCTCCACTTGAAAGAGATTTCAGCTGCCTTGCATGGGAGTCTCCGGCGCTTCTTCAAGGGGCTACGGAAGACAATGACA i calJac3.chr14 C 0 I 588 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=90064.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 90029 57 + 478999 TCATCCAAGTATCTCTGAATGCCAACGTAGCTCTTGCCTCAGGAGCTCTGAGACCC-A- s panTro4.chr18 74572937 58 - 76611499 TCATCCAGGTATCTCTGAATGCCTACGTAGCTCTTGCCTCAGGAGCTCTGAGACCCCA- i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35457318 57 - 95678458 TCATCCAAGTATCTCTGAATGCCTAAGTAGCTCTTGCCTCAGGAGCTCTGAGACCTT-- i rheMac3.chr10 C 0 I 1 s macFas5.chr10 36396333 57 + 96509753 TCATCCAAGTATCTCTGAATGCCTAAGTAGCTCTTGCCTCAGGAGCTCTGAGACCTT-- i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.JH684867 36041 57 + 80412 TCATCCAAGTATCTCTGAATGCCTAAGTAGCTCTTGCCTCAGGAGCTCTGAGACCTT-- i papAnu2.JH684867 C 0 I 335 s chlSab2.chr2 37887179 57 - 90373283 TCATCCAAGTATCTCTGAATGCCCAAGTAGCTCTTGCCTCTGGAGCTCTGAGACCTT-- i chlSab2.chr2 C 0 I 1 s calJac3.chr14 108157696 58 + 108792865 TCATCCAAACACCTCAGAATGCCTAAGCAGCTCTTGCCCCCGGAGCTCTGAGACCTC-C i calJac3.chr14 I 588 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=300786.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 90086 195 + 478999 TGTTATCTATTTTTGAACTGGCCAAGGCCCCC------CACAGCAAGG-AAAGGGATGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCCCTCGTGTCTTGTATTCCACCCCACAGCCTCCTAGCAAGCATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCA----TGGCTGAGTTCAGTCTTGCTTACTGCAACTGTAGACATGAGGTCTGTGGAAGTAAGAATCC s panTro4.chr18 74572995 192 - 76611499 TGTTATCTATTTTTGAATTGGCCAAGGCCCCT---------AGCCAGG-AAAGGGATGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCCCTCGTGTCTTGTATTCCACCCCACAGCCTCCTAGCAAGCATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCA----TGGCTGAGTTCAGTCTTGCTTACTGCAACTATAGACATGAGGCCTGTGGAACTAAGAATCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35457376 205 - 95678458 TGTTATCTATTTTTGAATTGGCCAAGTCTCCTCCTCCCCCCAGCCAGG-AAAGGGAGGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCATTCGTGTCTTGTATTTCACTCCACAGCCTCCTGGCAAGCATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCGTGGCTGGCTGAGTTCAGTCTTGCTTACCGCAACTGTAGACATGAGGTCTGTGGAACTAAGAATCC i rheMac3.chr10 I 1 I 551 s macFas5.chr10 36396391 205 + 96509753 TGTTATCTATTTTTGAATTGGCCAAGTCTCCCCCTCCCCCCAGCCAGG-AAAGGGAGGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCATTCGTGTCTTGTATTTCACTCCACAGCCTCCTGGCAAGCATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCGTGGCTGGCTGAGTTCAGTCTTGCTTACCGCAACTGTAGACACGAGGTCTGTGGAACTAAGAATCC i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.JH684867 36433 202 + 80412 TGTTATGTATTTTTGGATTGGCCAagtctccccctccccccagccaGGAAAAGGGAGGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCATTCGTGTCTTGTATTCCACTCCACAGCCTCCTGGCAAGAATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCG----TGGCTGAGTTCAGTCTTGTTTACCGCAACTGTAGACACGAGGTCTGTGGAACTAAGAATCC i papAnu2.JH684867 I 335 C 0 s chlSab2.chr2 37887237 201 - 90373283 TGTTATCTATTTTTGAATTGGCCAAGTCTCCCCCTCCCCCCAGCCAGG-AAGGGGAGGCTCTTCCCATCCTTGTCAGCATTCGTGTCTTGTATTCCACTCCACAGCCTCCTGGCAAGCATCTCAGTGTCTGCA-GGTGAGCG----TGGCTGAGTTCAGTCTTGTTTACTGCAACTGTAGACACGAGGTCTGTGGAACTAAGAATCC i chlSab2.chr2 I 1 C 0 s calJac3.chr14 108157754 191 + 108792865 TGTTATCTATTTTCGAATTGCCCAAGACCCCC---------AGCCAGG-CAGGGGATGCTCTGCCCATCCCGGTCAGCCCTCACATCTTGCGATCCTCCCC-CAGCCTCCTGGCCAGCATCCCGAGCTTTCCGTGGTGAACG----TGGCTGAGCTCAGTCTGGCTAACTGCAACTGC-GGCCCGAGGCCTGCAGAACCGAGGAGCC i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=23162.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 90281 19 + 478999 TCTCATTTGCTGACTGGCA s panTro4.chr18 74573187 19 - 76611499 TCTCATTTGCTGACTGGCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 60339959 19 + 95678458 TTCTATTTGCGAACTGGCA i rheMac3.chr10 n 551 C 0 s macFas5.chr10 36396596 19 + 96509753 GTCCATTTGTgaactggca i macFas5.chr10 C 0 I 532 s papAnu2.JH684867 36635 19 + 80412 TTCCATTTGTGAACTGGCA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37887438 19 - 90373283 GTCCATTTGTGAACTGGCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108157945 19 + 108792865 GCCCCTTTGCTCACTGGCC i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=552486.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 90300 354 + 478999 TTTTGTTTAAGTCCCATGTCACTAATCTCTGGTGAGACAATCCTCTTTGTGTTTCCTGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATGTAAACAGTGGCTCCACCTGGGAGTGTATCCCCTTCCCACGGGGAGGGGGTGCATAGCCCCTGCCAGGTTTCTGCTGTCCTCTCATCCTCCCACTGGGCTTTTCCCCTGCAGATGGCCTGGTGCCCACACTGCCTGCAAATGGTCACTCTT-GCTTGTCCCAACACCACCTCCACTGCAGCTTCCAAGAGCCCTAGAAGGGCCGGGCCCTGGCTGAGCACTATTCCTAGGCCCTGGATGGCGGGTGTGGAACTATGTTCTCATCAAGGTCATT s panTro4.chr18 74573206 354 - 76611499 TTTTGTTTAAGTCCCAGATCACTAATCTCTGGCAAGACAATCCTCTTTGTGTTTCCTGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATGTAAACAGTGGCTCCACCTGGGAGGGTATCCCCTTCCCACGGGGAGGGGGTGCATAGCCCCTGCGAGGTTTTTGCTGTCGTCTCATCCTCCCACTGGGCTTTTCCCCTGCAGATGGCCTGGTGCCCACACTGCCTGCAAATGGCCACTCTT-GCTTGTCCCAACCCCACCTCCACTGCAGCTTCCCAGAGCCCTAGAAGGGCCGGGCCCTGGCTGAGCACTATTCCTAGGCTCTGGATGGTGGGTGTGGAACTATGTACTTGTCAAGGTCATT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 60339978 354 + 95678458 TTTTGTTTAAGTCTCAGGTCACTGATCTCTGGCAAGACAATCCTCTTTGTGTTTTCTGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATTTAAACAGTGGCCCCACCTGGGAGTGTATCCCCTTCCCACGGTGAGGGTGTGCATAGCCCCTGCCAGGTTTCTGCTGTCCTCTCATCCTGCCACTGGGCTTTTCCCCTGCAGAGGGCCTGGTGCCCACACTACCTGCAAATGGCCACTCTT-CCTTGTTCCAACCCCAACTCCACTGCAGCTTCCCAGAGCCCTAGAAGTGCTGGGCCCTGGCTGAGCACTATTCCTAGGCCTTGGATGGCGGGTGTGGAACTATGTCCTTATCAAGGTTATT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60239846 354 - 96509753 TTTTGTTTAAGTCTCAGGTCACTGATCTCTGGCAAGACAATCCTCTTTGTGTTTTCTGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATTTAAACAGTGGCCCCACCTGGGAGTGTATCCCCTTCCCACGGTGAGGGTGTGCATAGCCCCTGCCAGGTTTCTGCTGTCCTCTCATCCTGCCACTGGGCTTTTCCCCTGCAGAGGGCCTGGTGCCCACACTGCCTGCAAATGGCCACTCTT-CCTTGTTCCAACCCCAACTCCACTGCAGCTTCCCAGAGCCCTAGAAGTGCTGGGCCCTGGCTGAGCACTATTCCTAGGCCTTGGATGGCGGGTGTGGAACTATGTCCTTGTCAAGGTTATT i macFas5.chr10 I 489 C 0 s papAnu2.JH684867 36654 354 + 80412 TTTTGTTTAAGTCTCAGGTCACTAATCTCTGGCAAGACAATCCTCTTTGTGTTTTCTGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATTTAAACAGTGGCTCCACCTGGGAGTGTATCCCCTTCCCACGGTGAGGGCGTGCATAGCCCCTGCCAGGTTTCTGCAGTCCTCTCATCCTGCCACTGGGCTTTTCCCCTGCAGAGGGCCTGGTGCCCACACTGCCTGCAAATGGCCACTCTT-CCTTGTTCCAACCCCAACTCCACTGCAGCTTCCCAGAGCCCTAGAAGTGCTGGACCCTAGCTGAGCACTATTCCTAGGCCTTGGATGGCGGGTGTGGAACTATGTCCTTATCAAGGttatt i papAnu2.JH684867 C 0 I 268 s chlSab2.chr2 37887457 354 - 90373283 TTTTGTTTAAGTCCCAGGTCACTAATCTCTGGCAAGACAATCCTCTTTGTGTTTTCCGGTGATGGACTTGAGTGATTTCAATTTAAACAGTGGCTCCACCTGGGAGTGTATCCCCTTCCCACGGTGAGGGCGTGCATAGCCCCTGCCAGGTTTCTGCTGTCCTCTCATCCTGCCACTGGGCTTTTCCCCTGCACCGGGCCTGGTGCCCACACTGCCTGCAAATGGCCGCTCTT-CCTTGTTCCAACCCCAACTCCACTGCAGCTTCCCAGAGCCCTAGAAGTGCTGGGCCCTGGCTGAGCACTATTCCTAGGTCTTGGATGGCGGGTGTGGAACTATGTCCTTATCAAGGTTATT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108157964 345 + 108792865 TTTCCTGCAAGTCCC-CATCACTAATGTCGGGCAACGCAAGCCTC-CTGTGCTTCCTGGCGATGGACTTGAGTGATTACGATGTGAAGGGTGGCTCCTCCTGGGGGCACATCCAGGTTCCACCGTGGTGGGGGAGGTCACCCCTGCCAGGCTGCTGCCGTCCTCTCGT-CTGCTGCCGGGCCCTCCCCC--AAGATGGCCTGGAGCCCACAGTGCCTGGGAACGGCCACTCGGAGCTTGTCCCAGACTCACCTCCATTGCAGCTGCCCAGAGCTCTGGAGGGCCAGG--CCTGGCTGAGCACTGCCCCCA-GCCCTGGGTGTC-AGTGTGGACCTCTGTCCTTGCCAGGGTAAT- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=558387.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 90654 354 + 478999 TCCTCTTCTATTTTCATCATGTTAAGTAAATCCCTCTCTCATCATGAAATGCCCTGGAGAGAACAGATGCATAGCTGTGGAGTCTTGTTCTGGGATATGTCAGGTACCGGCTCAGGTGTGTGGAGGCTACAGGGGGTGGACATGAGTGGTCTTTCTCTCGCTGTGAATCACATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTATGAAGGAGAATCAGCCGTTTACCTGGCTGAGTCTAACCCTGGGATGGCGACAGCCGAAACCCCAGCTCCATTCCCTGACCTTCCCTAGGCTGCCGCATGGGTTCCCTGGCA-CTGTCACTGGGCTAATGCCTTCTGTCTCCTCCTGGGGTGAGGCCA s panTro4.chr18 74573560 354 - 76611499 TCCTCTTCTATTTTCATCATATTAAGTAAATCCCTTTCTCATCATAAAATGCCCTGGAGAGAACAGATGCATGGCTGTGGAGTCTTGTTCTGGGATATGTCAGGTATGGGCTCAGGTGTGTGGAGGCTACAGGGGGTGGACAGGAGTGGTCTTTCTCTCACTGTGAATCGCATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTGTGGAGGAGAATCAGCTGTTCACCTGGCTGAGTCTAACCCTGGGATGGCGACAGCCGAAACCCCAGCTCCATTCCATGACCTTCCCTAGGCTGCTGCGTGGGTTCCCTGGCA-CTGTCACTGGGCTAATGCATTCTATCTCCTCCTGGGATGAGGCCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 60340332 352 + 95678458 TCCTCTTCTATTTTCATCATGTTAAGTAAATCCCTTTCTCACCATAAAATGCCCTGGAGAGAACAGATGCATGGCTGTGGAGTCTTGTTCTGCGATATATCAGGTACAGGCTCAGGTATGTGGAGGCCACAGGGGGTGGACATGACTGGTCTTTCTCT--GTGTGAATTGCATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTGTGGAGGAGAATCAGCTGTTCACCTGGCTGAGTCTAACTCTGGGATGGTGACAACCGAAACCCCAGCTCCATTCCCTGACCTTCCCTAGGCTGCTGCGTGGGTTCCCTGGCA-CCCTCACTTGGCTAATGCATTCTGTCTCCTCCTGGGGTGAGGCCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60240200 352 - 96509753 TCCTCTTCTATTTTCATCATGTTAAGTAAATCCCTTTCTCACCATAAAATGCCCTGGAGAGAACAGATGCATGGCTGTGGAGTCTTGTTCTGCGATATATCAGGTACAGGCTCAGGTATGTGGAGGCCACAGGGGGTGGACATGACTGGTCTTTCTCT--GTGTGAATTGCATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTGTGGAGGAGAATCAGCTGTTCACCTGGCTGAGTCTAACTCTGGGATGGTGACAACCGAAACCCCAGCTCCATTCCCTGACCTTCGCTAGGCTGCTGCGTGGGTTCCCTGGCA-CTCTCACTTGGCTAATGCATTCTGTCTCCTCCTGGGGTGAGGCCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 37276 352 + 80412 tcctcttctattttcatCATGTGAAGTAAATCCCTTTCTCATCATAAAATGGCCTGGAGAGAACAGATGCATGGCTGTGGAGTCTTGTTCTGCGATATATCAGGTACGGGCTCAGGTATGTGGAGGCCGCAGGGGGTGGACATGACTGGTCTTTCTCT--GTGTGAATCGCATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTGTGGAGGAGAATCAGCTGTTCACCTGGCTGAGTCTAACTCTGGGCTGGTGACAACCGAAACCCCAGCTCCATTGCCTGACCTTCCCTAGGCTGCTGCATGGGTTCCCTGGCA-CTCTCACTGGGCTAATGCATTCTATCTCCTCCTGGGGTGAGGCCA i papAnu2.JH684867 I 268 C 0 s chlSab2.chr2 37887811 332 - 90373283 TCCTCTTCTATTTTCATCATGTTAAGTAAATCCCTTTCTCATCATAAAATGCCCTGGAGAGAACAGATGCATGGCTGTGGAGTCTTGTTCTGCGATATATCAGGTACGGGCTCAGGTATGTGGAGGCCACAGGGGGTGGATATGACTGGTCTTTCTCT--GTGTGAATCGCATGTTTTGTGCCAGCCCAAGGGTTCTGTGGAGGAGAATCATCTGTTCACCTGGCTGAGTCTAACTCTGGGATGGTGACAACTGAAACCCCAGCTCCATTCCCTGACCTTCCCTAGGCTGCTGTGTGGGTTCCCTGGCA-CTCTCACTGGGCTAATGCATTCTAT-------------------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108158309 340 + 108792865 TCCTCTTCTGTTTCCAGCATGTTGAGTAAATTCCTTTCTCTTCATAAAGTGCCCTAGAGTGTTCAGACATGT-GCTGTGGAGTCTTGCTCTGGGATATGTCAGGCACAGGCTC-GGTTCGGGGAGGCTCCGGGAGGTGGACACGAATGCTCTTTCTCTTGCTTTGAGTCGCCTGTTGTGGGCCAGCCCAGGGGCTCTGCAGAGG-------GCTGTCCACCTGGCTGAGTCTAGCCCTGGGGTGGCGATGGCTGAAC------GTCCGTTCCCGGACCTTCCCCAGGCTGCTGAGTGGGCTCCCCAGCCTCTGTCACTGGGCTAATGCGTTATATCTCCTCCTGGGGTGGGGCCA i calJac3.chr14 C 0 I 4190 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=242348.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 91008 169 + 478999 GCCTTTACTCATAGTTTCTGCCCATTCCACATCATTCTGCCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAAATCTGAGCCAAGCGTGTGCA-AGGGGTTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACTAAAATACACTGAGATGAGAAACCA--GCAGCACCTGCTTTGGAGCTGTCACAC---CT s panTro4.chr18 74573914 173 - 76611499 GCCTTTAGTCATAGTTTCTGCCCATTCCACATCATTCTGCCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAAATCTGATCCAAGCGTGTGCATGGGGGCTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACTAAAATACACTAAGTTGAGAAACCA--GCAGCACGTGCTTTGGAGCTCTCACACCTTCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 60340684 170 + 95678458 GCCTTTACTCATAGTTTCTGCCCATTCCACATCATTCTGTCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAGATCTGAGCCAAGCATGTGCCAGGGGGTTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACAAAAATACACGGAGATGAGAAACCA--GCAGCACATGCTTTGGAGCTGTCACAC---CT i rheMac3.chr10 C 0 I 3 s macFas5.chr10 60240552 170 - 96509753 GCCTTTACTCATAGTTTCTGCCCATTCCACATCATTCTGTCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAGATCTGAGCCAAGCATGTGCCAGGGGGTTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACAAAAATACACGGAGATGAGAAACCA--GCAGCACATGCTTTGGAGCTGTCACAC---CT i macFas5.chr10 C 0 I 3 s papAnu2.JH684867 37628 170 + 80412 GCCTTTACTCATAGTTTCTGCCCATTCCACATCATTCTGCCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAGATCTGAGCCAAGCATGTGAAAGGGGGTTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACAAAAATACACGGAGATGAGAAACCA--GCAGCACATGCTTTGGAGCTGTCACAC---CT i papAnu2.JH684867 C 0 I 412 s chlSab2.chr2 37888143 150 - 90373283 --------------------TCTAATGCACATCATTCTGCCTCCCACCCTTGGCTTTTTCAAAGATCTGAGCCAAGCATGTGCCAGGAGTTTAGAAACATGCTGTCCACAGGGAACAAAAATACACGGAGATGAGAAACCA--GCAGCACATGCTTTGGAGCTGTCACTC---CT i chlSab2.chr2 C 0 I 3 s calJac3.chr14 108162839 166 + 108792865 GCCTTTACTAAAGGTTTCTGCCCTTCCCGCATCTCTCTGCCTCCCACCCCTGGCATTTACAAA-CTCTGAGACAAGCATGCGGA-GGGGGTTAGAAACACCCGGTCCACGGGGAACGAA---GCGTGGAGATGAGACGCCAGCGCAGCGAACG-TTTAGGGCCCCCGCAC---CC i calJac3.chr14 I 4190 I 2 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=232892.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 91177 164 + 478999 GGGAACTGAGAAGCAAACTCTCAGAGATGCCTGGAAACCTTGGGAGCACATGAGTTCTCTGCATATATTTCAGTTGCAGATGAGTTTCTAGTCAAAGTAAAAAACACATGAAGGGCATTCATGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTCTGATTTTTCAGAGGTG s panTro4.chr18 74574087 164 - 76611499 GGGAACTGAAAAGCAAACTCTCAGAGATGCCTGGAAACCTTGGGAGCACACGAGGTCTCTGCATATATTTCAGTTGCAGATGAGTTTCTAGTCAAAGTAAAAAACACACGAAGGGCATTCACGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTTTGGTTTTTCAGAGGTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 60340857 163 + 95678458 GGGAACTGAGAATC-AACTCTCAGAGATGCCTGGAAACCTTGGGAACACACAAGGCCTCTGCATATATTTCGGTTGCAGAAGAGTTTATAGCCAAAGTAAAAAGCACATGAAGGGCATTCACGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTCTGGTTTTTCAGAGGTG i rheMac3.chr10 I 3 n 3 s macFas5.chr10 60240725 163 - 96509753 GGGAACTGAGAATC-AACTCTCAGAGATGCCTGGAAACCTTGGGAACACACAAGGCCTCTGCATATATTTCGGTTGCAGAAGAGTTTATAGCCAAAGTAAAAAGCACACGAAGGGCATTCACGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTCTGGTTTTTCAGAGGTG i macFas5.chr10 I 3 C 0 s papAnu2.JH684867 38210 164 + 80412 GGGAACTGAGAATCAAACTCTCAGAAATGCCTGGAAACCTTGGGAACACACAAGGCCTCTGTATATATTTCGGTTGCAGAAGAGTTTATAGCCAAAGTAAAAAGCACACGAAGGGCATTCACGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTCTGGTTTTTCAGAGGTG i papAnu2.JH684867 I 412 C 0 s chlSab2.chr2 37888296 164 - 90373283 GGGAACTGAGAAGCAAACTCTCAGAGATGCCTGGAAACCTTGGGAACACACAAGGCCTCTGTATATATTTCGGTTGCAGAAGAGTTTATAGCCAAAGTAAAAAGCACATGAAGGGCATTCACGTTTCCAGGAACAGAAGCATCCTGTCTGGTTTTTCAGAGGTG i chlSab2.chr2 I 3 C 0 s calJac3.chr14 108163007 152 + 108792865 GGGAACCCAGGCGCAAACAGTCG-------CCGCAgcccccgggcgcccgcggggccTCTGCACACACGTTTGCTGCC-ATGAGTTAATACCCGAAGTGAAAA-CGCACGAAGAGCGTCCGCATTTCCATGGACA-CTGTGCCTTGTCCAGTTTCTCAGGCG-- i calJac3.chr14 I 2 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=7864.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 91341 7 + 478999 AAGGGAG s panTro4.chr18 74574251 7 - 76611499 AAGGGAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 60240888 7 - 96509753 AAAGGAG i macFas5.chr10 C 0 n 0 s papAnu2.JH684867 38374 7 + 80412 AAAGGAG i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37888460 7 - 90373283 AAAGGAG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108163159 7 + 108792865 CAGGGAG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 60341020 3 + 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=905970.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 91348 590 + 478999 CAGTCTGAAGGGGCCGTGGCATAAGTATGTCTACAATCAAAGCTCACAGCCAAGGCCCTGGGGGAGGTTCAGGTGTACCCCAGGGGGTGCGCCCCATCCAGCACTCCACTGACAGGGGCCTCGTCTTTATTAAATTCTAGGCCTTTTCCTGGGCACTAGTTACAAAAGGTGGGTTCAATGAACCCTAGGTTCTGTGGCTGCCACCCATCTCAGGGTCGCACAGGTAATGATTGCCACCCCCTCCACCTtctgctgagggtcctggtgaccccctggtggtgtaacccaggccctcacccctaaggggtcctgagc--cttgctcaccacagagtccttggtctagggctcccgcacttgtccaCATGCCATCAAATGCTGTGTACCGGGAGGTACTTGCGTGGAGCCCCTCCTTCCCCAGGCAGCACAGCCCTGCTTCTGCTAACACCACGGTCCAGGTGGTACCCATTTTTCTGCCTGCAGGTCCCATGGAGGAGTAGCCTGAGGACAAAGCAGCACCCGGAGCTTG--TTTTTTCAGAGAACCTGGCCCAGCCCTGGCTAGAAGCCCCACAACTGTGGAAACCAGGGCCTCC s panTro4.chr18 74574258 592 - 76611499 CAGTCTGAAGGGGCCGTGGCATAGGTGTGTCTACAATCAAAGCTCACATCCAAGGCCCTGGGGGAGGTTCAGGTGTGCCCCAGGGGGTGCGCCCCATCCAGCACTCCACTGACAGGGGCCTTGTCTTTATTAAATTCTAGGCCTTTTCCTGGGCACTAGTTACAAAAGGGGGGTTCAATGAACCCTAGGTTCTGTGGCTGCCACCCATCTCAGGGTCACACAGGTAATGATCACCACCCCCTCCACCTtctgctgagggtcctggtgaccccctggtggtgtaacccaggccctcacccctaaggggccctcagc--cttgcccaccacagagtccttggtctagggctcccgcacttgtccaCGTGCCATCAAATGCTGTGTACCAGGAGGTACTTGCGTGGAGCCCTTTCTTCCCCAGGCAGTGCAGCCCTGCTCCTGCTGACACCATGGTCCAGGTGGTACCCATTTTTCTGCCCACAGGTCCCATGGAGGAGCAGCCTGAAGACAAAGCAGCACCCAGAGCTTGTTTTTTTTCAGAGAACCTGGCCCTGccctggctagaagccccacagctgtggaaaccaggacctcc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35458132 590 - 95678458 CAGTCTGAAGGGGCCGTGGCATAAGTGTGTCTACAATCAAAGCTCACAGCTGAGGCCCTGGGGGAGGATCAGGTGTGCACCAGGGGGTGCACCCCAGCCAGCACTGCACTGACAGGGGCCTCGTCTTTATTAAATTCTGGGCTTTTTCCTGGGTGCTAGTTACAAAATGTGGGTTCAATGAACCCTCTGTCTTGTGGCTGCCACCCATCTCAAGGTCGCACAGGTAATGATCACCACCCCCTCCACCTtctgctgagggtccgggtgaccccctggtggtgtaacccaggccctcactcctaaggggccctgagc--cttgctcaccacagagtctttggtctagagctcccgcacttgtccacatgccatcaaatgctgtgtaccgagaggcacttgcgtggagcccctCCTTCCCCAGGCAGCACAGTCCTGCTCCAGCTGACaccacggtccaggtggtactcatttttctgcccgcaggtcccatggaggagcagcctgaggacaaagcagcacccagagcttg--ttttttcagagaacctggacctgccctggctagaagccccacagctgtggaaaccaggacctcc i rheMac3.chr10 I 551 C 0 s macFas5.chr10 36397147 590 + 96509753 CAGTCTGAAGGGGCCGTGGCATAAGTGTGTCTACAATCAAAGCTCACAGCTGAGGCCCTGGGGGAGGATCAGGTGTGCACCAGGGGGTGCACCCCAGCCAGCACTGCACTGACAGGGGCCTCGTCTTTATTAAATTCTGGGCTTTTTCCTGGGTGCTAGTTACAAAATGTGGGTTCAATGAACCCTCTGTCTTGTGGCTGCCACCCATCTCAAGGTCGCACAGGTAATGATCACCACCCCCTCCACCTtctgctgagggtccgggtgaccccctggtggtgtaacccaggccctcactcctaaggggccctgagc--cttgctcaccacagagtctttggtctagagctcccgcacttgtccacatgccatcaaatgctgtgtaccgagaggcacttgtgtggagcccctccttccccaggcagcacagtcctgctccagctgacaccacggtccaggtggtactcatttttctgcccgcaggtcccatggaggagcagcctgaggacaaagcagcacccagagcttg--ttttttcagagaacctggacctgccctggctagaagccccacagctgtggaaaccaggacctcc i macFas5.chr10 I 532 C 0 s papAnu2.JH684867 38381 589 + 80412 CAGTCTGAAGGGGCCGTGGCATAAGTGTGTCTACAATCAAAGCTCACAGCTGAGGCCCTGGGGGAGGATCGGGTGTGCAACAGGGGGTGCGCCCCAGCCAGCACTGCACTGACAGGGGCCTCGTCTTTATTAAATTCTGGGCTTTTTCCTGGGTGCTAGTTACAAAATGTGGGTTCAATGAACCCTTTGTCTTGTGGCTGCCACCCATCTCAAGGTCGCACAGGTAATGATCACCACCCCCTCCACCTTCTGCTGAGGGTCCGGGTGATCCCCTGGTGGTGTAACCCAGGCCCTCACTCCTAAGGTGCCCTGAGC--CTTGCTCACCACAGAGTCCTTGGTCTAGAGCTCCCGCACTTGTCCACATGTCATCAAATGCTGTGTACCAAGAGGCACTTGCGTGGAGCCCCTCCTTCCCCAGGCAGCACAGTCCTGCTCCAGCTGACACCACGGTCCAGGTGGTACTCATTTTTCTGCCCGCAGGTCCCATGGAGGAGCAGCCTGAGGACAAAGCAGCACCCAGAGCTTG--TTTTTTCAGAGAACCT-GACCTGCCCTGGCTAGAAGCCCCACAGCTGTGGAAACCAGGACCTCC i papAnu2.JH684867 C 0 I 317 s chlSab2.chr2 37888467 590 - 90373283 CAGTCTGAAGGGGCCATGGCATAAGTGTGTCTACAATCAAAGCTCACAGCCAAGGCCCTGGGGGAGGATTGGGTGTGCACCAGGGGGTGCGCCCCAGCCAGCACTGCACTGACAGGGGCCTTGTCTTTATTAAATTCTGGGCTTTTTCCTGGGTGCTAGTTACAAAATGTGGGTTCAATGAACCCTTTGTCTTGTGGCTGCCACCCATCTCAAGGTCGCATAGGTAATGAtcaccaccccctccagcttctgctgagggtctgggtgaccccctggtggtgtaacccaggccctcactcctaaggggccctgagc--cttgctcaccacagagtccttggtctagagctcccgcacttgtccaCATGTCATCAAATGCTGTGTACTGAGAGGCACTTGCGTGGAGCCCCTCCTTCCCCAGGCAGCACAGTCCTGCTCCAGCTGACACCACGGTCCAGGTGGTACTCATTTTTCTGCCCGCAGGTCCCATGGAGGAGCAGCCTGAGGACAAAGCAGCACCCAGAGCTTG--TTTTTTCAGAGAACCTGGACCTGCCCTGGCTAGAAGCCCCACAGCTGTGGAAACCAGGACCTCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108163166 462 + 108792865 GAGTC----GGGGCCGTGG-GTGACCGTGTCT-------------GCAGCCGAGGCCCTGGAGGTGG-------------------------CTCGTCCTGCGCTGCGCTGCCAAGGGCCTCGCCTTCCTTACACTCCGGGCCTTTCCTTGAGTGCCGGTTACAAAAGGCGGGTTCCGTGAACCCTA-ACCCCGTG---GCCACCTA----------------------------------------------------------------CCTGGTGGTGCAGCCCAGGCCCTCGCCC--AGGACACCCTGAGCCTCTTGCTCACCACGGAGTCCTTGGCTT--GGCTCCTGCGCACGACCACGTACCGTCCAATGCTGGGCACCGAGAGGCCCCTGTGTGGAGCCC--CCTGCCCCGGGCAGCACAGCGCTGCTCCTGCTGACA-CAGGGTCCAGGCGGTGCCCGTTTTCCTGCCCGCGGGTCCTATGGAAGAGCAGCCTGAGGACACAGCAGCACCCAGAGCTTG--TCCTTCCAGGAAACCTGTCCCTGCCCCTGCTGGAAGCCCCACA------------AAGGCCGCC i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=131117.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 91938 88 + 478999 TGCTTTTCAGAGCCTAGATATGCAGGATATAGATGCCCCTCAGAGGTCCTGGCTGTGAGGTGGAAGGTTG--GGGGACACTGGGCTTCCT s panTro4.chr18 74574850 88 - 76611499 tgcttttcagagcctagatgtgcaggatatagatgcacctcagaggtcctgggtatgatgtggaaggttg--ggggacactgggcttcct i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35458722 88 - 95678458 tgcttttcagagcctagatgtgcaggatatagatgcacctcagaggtcctgggtgtgatgtggaaggttg--gggGACACTGGACTTCCT i rheMac3.chr10 C 0 I 5210 s macFas5.chr10 36397737 88 + 96509753 tgcttttcagagcctagatgtgcaggatatagatgcacctcagaggtcctgggtgtgatgtggaaggttg--ggggacactggacttcct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 39287 88 + 80412 TGCTTTTCAGAGCCTAGATGTGCAGGATATAGATGCACCTCAGAGGTCCTGGGTGTGATGTGGAAGGTTG--GGGGACACTGCACTTCCT i papAnu2.JH684867 I 317 C 0 s chlSab2.chr2 37889057 88 - 90373283 TGCTTTTTGGAGCCTAGATGTGCAGGATATAGATGCACCTCAGAGGTCCTGGGTGTGATGTGGAAGGTTG--GGGGACACTGGACTTCCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108163628 79 + 108792865 AGCCTTTCAGGGCC--GATGTGCAGGATGGAGAGGCACCT-GGTGGTCCTGGGCGGGAAACAGGGCTTGGGTGGGGACACTG-------- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=714374.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 92026 711 + 478999 ACTGCTGTGCTCCCATTGCCACATCTTCTACCTGGTGGGACAAGGCAGCTAGCAAAGGTGACAGATTCACCCAGACACTGTGTCCTCCCACATCCTGACCTGGCACCTGAGCCACCACTGCTGGGTCTGAAGCTCCCAGGAGTGTGTGTGTGCTGTGACCAGCAGACCTATGGCATGTGCCCTCTTCCTCCCTCTGTGGTGTGAAATCAGTTCCTCTGATGGTGTCATGTGAGGTCTTGTCCTGATGGGTAGAACTTTCTATAAACCATCCCATGGCCCCGGGGAAAGGCAAGCTCATCCCTTCAGGTTTAGCTGTTTCTGTTAAATGCAACCCTGTCCTTCCCAGGGCATCAGGGCCCCGTGCAGTTGTCCCAGCCTGGCAGGAAGTCCCCTTGAGGATTGTGTGGAGGGCGCAGCCTGGGTCTGACTCGTGACCCTGGCAAAGAGCAGGTGAGCCCTGGGGCTGACCACCTGCACTTTCTGTTTGGTGGTGGGAGATGTGGGGCAATATTTCTTGCGTTTCCTTTAGAGAGCATCTCCCAGCCTGCCCAGACAACCAGACCCCTAAACA-TGTGACTTGTAGGCAGGGCCTGGCTCTCTGTGGTGCTTTTCTGTCTCCTCCAAGCACCTGTGACTCACAGGCTTCCAGCCCTGCCAGCTTC-CCCCATCTGAGCTCCTGATGCAGGGTGAGGACTGTATTGTGGCAGACAG s panTro4.chr18 74574938 711 - 76611499 actgctgtgctccaattgccacatcttctacctggtgggacaaggcagctagcaaaggtgacagattcatgcagacactgtgtcctcccacatcctgacctggcacctgagcca-cactgctgggtctgaagctcccaggagcatgtgtgtgctgtgaccagtggacctatggcatgtgccctcttcctccctctgtggcgtgaaatcagttcctctgatggtgtcatgtgaggtcttgtcctgatgggtagaactttctataaaccatcccatggccccagggaaaggcaaactcatcccttcaggtttagctgtttctgttaaatgcaaccctgtccttcccagggcagcaggtcccagtgcagttgtcccagcctggcaggaactctccttgaggaTTGTGTGGAGGGCGCAGCCTGGGCCTGACTCATGACCCTGGCAAAGGGCAGGTGAGCCCTGGGGCTGACCACCTGCActttctatttggtggtgggagacgtggggcaatatttcttgcctttcctttagagagcatctcccagcctgcccagaccagtagacccctagaaattgtgacttgtaggcagggcctggctctccgtggtgcttttctctcccctccaagcacctgtgactctcaggcgtccagCCCTGCTGGCTTC-CCCCATCTGAGCTCCTGATGCAGGGTGAGGACTGTATTGTGGCAGACAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36397825 710 + 96509753 gctACAATGCTCTCATTGCCACATCTTCTACCTGGTGAAACAAGGCAGCTAGCAAAGGTGATAGATTCACCTGGACACGGTGTCCTCCCACATCCGGACCTGGCACCTGAGCCA-CACTGCTGGGTCTGAAGCTCTCAGGAGCGTGTGTGTGCTGTGACCAGCAGACCTATGGCATGTGCCCTCTTCCTCCCTCTGTGGCGTGAAATCAGTTCATCTGATGGTGTCATGTGAAGTCTTGTCCTGATGGGTAGAACTTTCTATAAATCATCCCATGGCCCCGGGGAAAGGCAAGTTCATCCCGGCAGGTTTAGCTCTTTCTGTCAAACACAACCCTGTCCTTCCCAGGGCATCAGGGCCTGGTGCAGTTGTCCCAGCCTGGCAGGAAGTCCCCTTGAGGGTAGCGTGGAGGGCACAGCCTGGGCCTGACTTGTGACCCTGGCAAACGGCAGCTGAGCCCTGGGGCTGACCACCTGCActttctgtttggtggtgggagatgtggggcaatatttattgcctttcctgtagagagcatctcccagcctgcccagaccactagacccctacaaa-tgtgacttgtaggcaagtcctggctctctgtggTGCTTTTCTCTCCTGTCCAAGCACCTGTGACTCCCAGGCCTCCAACCTTGCCGGCTTC-CCCCATCTAAGCCCCTGATGCAGGGTGAGGACTGTATTGTGGCAGACAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 39375 709 + 80412 GCTGCTATGCTCCCATTGCCATATCTTCTACCTGGTGAAACAAGGCAGCTAGCAAAGGTGAGAGATTCACCCAGACACGGTGTCCTCCCACATCCTGACCTGGCACCTGAGCCA-CACTGCTGGGTCTGAAGCTCTCAGGAGCGTGTGTGTGCTGTGACCAGCAGACCTATGGCATgtgccctcttcctccctctgtgGCATGAAATCAGTTCATCTGATGGTGTCATGTGAAGTCTTGTCCTGATGGGTAGAACTTTCTATAAATCATCCCATGGCCCCGGGGAAAGGCAAGTTCATCCCTGCAGGTTTAGCTCTTTCTGTTAAACACAACCCTGTCCTTCCCAGGGCATCAGGGCCTGGTGCAGTTGTCCCAGCCTAGCAGGAAGTCCCCTTGAGGGTAGCGTGGAGGGCACAGCCTGGGCCTGACTCGTGACCCTGGTAAAGGGCAGCTGAGCCCTGGGGCTGACCACCTGCACTTTCTGTTTGGTGGTGGGAGATGTGGGGCAATATTTATTGCCTTTCCTGTAGAGAGCATCTCCCAGCCTGCCCAGACCACTAGACCCCTACAAG-TGTGACTTGTAGGCAAGTCCTGGCTCTCTGTGGTGCTTTTCTCTCCTGTCCAAGCACCTGTGACTCCCAGGCCTCCAGTC-TGCCAGCTTC-CCCCATCTAAGCTCCTGATGCAGGGTGAGGACTGTATTGTGGCAGACAG i papAnu2.JH684867 C 0 I 556 s chlSab2.chr2 37889145 709 - 90373283 GCTGCTATGCTCCCATTGCCACATCTTCTACCTGGTGAAACAAGGCAGCTAGCAAAGGTGAGAGATTCACCCAGACACGGTGTCCTCCCACATCCTGACCTGGCACCTGAGCCA-CACTGCTGGGTCTGAAGCTCTCAGGAGCATGTGTGTGCTGTGACCAGCAGACCTATGGCATGTGCCCTCTTCCTCCGTCTGTGGCATGAAATCAGTTCATCTGATGGTGTCATGTGAAGTCTTGTCCTGATGGGTAGAACTTTCTATAAATCATCCCATGGCCCCGGTGAAAGGCAAGTTCATCCCGGCAGGTTTAGCTCTTTCTGTCAAACACAACCCTGTCCTTCCCAGGGCATCAGGGCTTGGTGCAGTTGTCCCAGGCTGGCAGGAAGTCCCCTTGAAGGTAGCGTGGAGGGCACAGTCTGGGCCTGACTCATGACCCTGGTAAAGGGCAGGTGAGCCCTGGGGCTGACCACCTGCACTTTCTGTTTGGTGGTGGGAGATGTGGGGCAATATTTATTGTCTTTCTTGTAGAGAGCATCTCCCAGCCTGCCCAGACCACTAGACCCCTACAAA-TGTGACTTGTAGGCAAGTCCTGGCTCTCTGTGGTGCTTTTCTCTCCTGTCCGAGCACCTGTGACTCCCAGGCCTCCAGCC-CGCCGGCTTC-CCCCATCTAAGCCCCTGATGCAGGGCGAGGACTGGATTGTGGCAGACAG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108163707 570 + 108792865 -----------------GCCGCAT------------------------CGGGCAAAGCTGAGGGACTCCCCTGGATGCTGTGTCCT--------CTGGGCTCAGCCCTGACCCA-CACGGCTGGGTCTGCAGCTCC---AGGTGAGCAGGTTCGGGGACCAGCAGACCCACGGC-TGGGCCCTCTTCCTCCCTCCTTGTGGCGAAATTGGCC--------------------AGTCTGGTCCTGGATGATAGCACTTTCTATCAACTGTCCTGTGGCCCTGAGGAAAGGCCCGCT-AGTCCTGCAGGGTTAGCTGTTTCTGTCAAATGCATCCCTGCCCCTCCCAGGGTGTCTGGGCCTGGTGCAG---------------------TCCCCTGGAGGGTGGTG--------------TGGGCCCAGCTCTCCACCCTGGCAGGGGTTAGCCGAGTCTTGGGGCTG---ACCTGTGTGTCCTGCTCAGTG-------------------------TGCCTGTGCTTTAGAGAGTGTCCCCCAGCCCTACCAGGACACTAGACTCCTAAAAA-CGTTA-GTGTAGGCAGGGCCTGGCTCTCTACGGTGGTTTT---TCCCATCTGAGCACCTGTGTCTTCCAGGCCTCCAGCCATGCCAGCTTCTCCCTATCTGAGCTCCTGGGTCAGGGGGAGGACTGTATCATGGCAGACGG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=147373.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 92737 134 + 478999 CATGCCGGTTTACACAGTTCTGGGACGAAACTGTAGGTATACATTATTTTATGTCCCGAGTAAATGAATCCCATTTATGGATACTTTTTTTGACACAGAGGGAAGAAAGGCATTGGTGAGATCCACGGGCCAGA s panTro4.chr18 74575649 134 - 76611499 CATGCCGGTTTACACAGTTCTGGGAGAAAACTATAGGTATACATTATTTTATGTCCCAAGTAAATGAATCCCATTTATCGATACTTTGTTTGGCACAGAGGGAAGAAATGCATTGGTGAGATCCATGGGCCAGA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36398535 134 + 96509753 CAGGCCGGTTTACACAGTTCTGGGACAAAATTATAGGTATACATTATTTTATGTCCCAAGTAAACGAATCCCATGTATGGATACATTTTTTGACACAGAGGGAAGAAATGCATTGGTGAGATCCACGGGCCAGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 40640 134 + 80412 CAGGCCGGTTTACACAGTTCTGGGACAAAATTAGAggtatacattattttatgtcCCAAGTAAACGAATCCCATTTATGGATACATTTTTTGACACAGAGGGAAGAAATGCATTGGTGAGATCCATGGGCCAGA i papAnu2.JH684867 I 556 C 0 s chlSab2.chr2 37889854 134 - 90373283 CAGGCCGGTTTACACAGTTCTGGGACGAAATTAGAGGTATATATTATTTTATGTCCCAAGTAAACGAATCCCATGTATAGATACATTTTTTGACACAGAGGGAAGAAATGCATTGGTGAGATCCATGGACCAGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108164277 125 + 108792865 ------GG--TGCACAGCTCAGGGACAAAACTGTAGGTGGCTGTTATTGTATGTCACAAGTAAACGAACCCCGTTTCTGGATGC-TTTTTTGACATGGGGGGAAGAAATGCACTGGTGAAATCCACAGGCCAGA i calJac3.chr14 C 0 I 4 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=66963.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 92871 78 + 478999 GCTCA-GCCTGTGCTCAGGCTCTGGC-AGCAGCTGTGCAGCTCTGGAGCTGTTGT-GGAGTGGGGAGGTGCTGTGTCTTTG s panTro4.chr18 74575783 80 - 76611499 GCTCAGGCCTGTGCTCAGGCTCTGGCAAGCGGCTGTGCAGCTCTGGAGCTGTTGT-GGAGTAGGGAGGTGCTGTGTCTTTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36398669 80 + 96509753 GCTCAGGCCTGTGCTCAGGCTCTGGC-AGCAGCTGTGTGGCTCTGGAGCTGTTGTGGGGGTGGGGAGGTGCTGTGTCTTTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 40774 80 + 80412 GCTCAGGCCTGTGCTCAGGCTCTGGC-AGCAGCTGTGCGGCTCTGGAGctgttgtgggggtggggaggtgctgTGTCTTTG i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37889988 80 - 90373283 GCTCAGGCCTGTGCTCAGGCTCTGGC-AGCAGCTGTGTGGCTCTGGAGCTGTTGTGGGGGTGGGGAGGTGCTGTGTCTTTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e calJac3.chr14 108164402 4 + 108792865 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=1179547.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 92949 1167 + 478999 CTCCCTGTGTTAAAGGCTTCATTTGTGTCTTTGTTCAGTTTGTTTTCTTTGACCCCTGTTCAGCAATACTGAAAATCAAGCATTCCTAAGAGGTGGAGACTTTGCTTTGGAGCAGGGGC------GGGGGCATTGGGTGGAAATGGGGAATAGGTTGATAGTGGGAATTTCATTTTCTGGAGCTCACGTGCAGCCTCTTGATGGCCTCGTCACAAGTTCACCTGATGACCTGAGTGGCCACTGTCCTTCTCCTGAGTGAGTTACGTGCTTGCCAGGCACATGAGCAGTGCATGCTCACATTTTTCAAA-TGAAGGAACTGAGAAGGGTTTGTCAGCAGATTGTAAGCCTGAAGC-TGCCAGTGTTTGGTCCACAGTAAACCACATGTGGAGAGCTTAAAAAAATTGCCCTCAAATCTGGCAAGAAAA---TGACAGTAATAAATTAAATTATTACTGTGATACACATGTTTCTTTCATTACAATTAGATATATTA----CACATA----TCACAATTTTGCAGAAGTTGCTCATCTATCAGTATTT----ATTTATTTATTTTTTGCATAA---GTTTCCAAGGAATCCTAATGATGGGGACTGTCTCTTTTAAAATTGAATTGTGTAAATAACTCCCAGAGCCATGCTGGTAAGaaacaaaacaaaacaaaaagaactagaaacatga-acaaaCATTGGATTTCTGCTGT-AAAGAGGATGCAAAGCAGGCCTGCCTGCTGCACCTCCCCAGAGCTAATCCTTGAGCCAAAAGAGCTTCCT-GGTGAAGCCTCGCACTCTCTGTAACAGGGCGT-GGGGGG-ACCAAGACATGCGGGCTCCAGATTAGACCATCTTTACCTAGTTATGGGATTTCAGTCACGTCTTTTAAATTCTTTGAGCTGCAGTTTTCACATATGTAAAGTGAAAGTATTTTTAAAATTTTAATTTG--------------------------------------------------------------------------------TGT-TATGACCTTGTATAAAGTTAAAAT-----AGTACATTTGAAAGCATTGTAGCTGAAGTCAAACGTTCACGTGTGTGCATG--------CAATGGCTTCTTAATTA-TTTTAGGGCTTAAC---CTGGTTTTACTGGTACTGTTACTAGCACTGCTACTTCTCCATGTCTCTGAAGACTATGAAATACTTAGAACTTAAGCAACAAGAAGCACCTGTCAAAGCGTTCTATGGCCGATGACAGATTTGACACAGCTGGATAT s panTro4.chr18 74575863 1164 - 76611499 CTCCC-GGGTTAAAGGCTTTATTTGTTTCTTTGTTCTGTTTGTTTTCTTTGACCCCTGTTCAGCAATACTGAAAATCAAGCATTCCTAAGAAGTGGAGACACGGCTTTGGAGCAGGGGT-------GGGCCATTGGGTGGAAATGGAAAATAGGTTGATAGTGGGAATTTCGTTTTCTGGAGCACACGTGCAGCCTCTTGATGGCCTCGTCACAAGTTCACCTGATGACCTGAGTGGCCACTGTCCTTCTCCTGAGCAGGTTGCATGCTTGCCACGCACATGATCAGTGCATGCTCACATTCTTCAAAGTGAACGAACTAAGAAGGATTTGTCAGCAGATTGTAAGCCTGAAGC-TGCCAGTGTTTGGTCCACAGTAAACCACATGTGGAGAGCCTAAAAAAA-TGCCCTCAAATCCGGCAAGAAAA---TGACAATAATAAATTAAATTATTACCATAATATACA--TTTCTTTAGTTACAATTAGATGTATTA----CATCTATAACTAACAATTTTGCAGAAGTTTCTCATCTACCAGtattt----atttattttttt-----ataa---GTTTCTAAGGAACCCTAATGATGGGGAGTGTCTTTTTTAAAATTAAATTTTGTAAATAACTCCCAGAACCATACTGGTAAGAAACAAAACAAAACTAAAAGAACTAGAAACGTGA-ACAGACATTGGATTTCTGCTGGAAAAAAGGTTGCAAAGCAGGCCTGCCTGCTGCACTTCCCCAGAGCTAATCCGTGAGCTGAAAGAGCTTTCT-GGTGAAGCCTCGCACTCTCTGTAACAGGGCGT-Ggggggcaccaagacatgcgggctccagacttgaccatctttacctactcatgggatttcaatcttgtcttttaaattctttgagctgcagctttcacatatgtaaagtgaaagtatttttaaaattttaatttg--------------------------------------------------------------------------------tgt-tatggccttgtataaagataaaat-----agtacatttgaaagcattttagctgaagtcaaacgttcacgtgtgtgcatg--------caatggcttcttaatta-ttTTAGGGCTTAAC---CTGGTTTTACTAGTACTGTTACTAGCACTGCTACTTCTCCATGTCTCTGAAGACTATGAAATACTTAGAACTGAAGCAACAAGAAGCACCTGTCAAAGGGTTCTATGGCCGATGACAGATTTGACACAACTGGATAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36398749 1165 + 96509753 CTCACTGAGTTAAAGGCTTCATTTGTTTCTTTGTTCAGTTTGTTTTCTATGACCCCTGTTCAGCAATATTGAAAATCAAGCATTCCTAGGAGGTGGAGACCTTGCTTTGGAGCAGGGTC-------GGGGCATTGGTTGGAAATGGGGAATAGGTAGACAGTGGGAATTTCATTTTCTGGAGCTCATGTGCAGCCTCTTGATGGCCTCGTCACAAGTTCACCTGATGACCTGAGTGGCCACTGTCCTTCTCCTGAGTGGGTTACGAGCTTGCCAGGCACATGAACAGGGCACGCTCACATTTTTCAAG-TGAAGAAACTAAGAAGGGGTTGTCAGCAGATTGTCAGCCTGAAGTATGCCAGTGTTTGGTCCACAGTAAACCACATGTGGAGAGCTT-AAAAAATTGCCCTCAAATCTGGCCAAAAAA---TGACAGTAATAAATTCAATTATTACTGTGATATACA--TTTCTTTAGTTACAATTATATATG-TATATCTATGTATAACTAACAATTTTGCATAAGTTTCTCATCTACCAGTATTT----TTTCGTTTTTGC-----ATAA---GTTTGCAAGGAACCCTAATGAT-GGGACTGTCTCTTTTAAAACTAAATTTTATAAATAACTCTCAGAGCCATACTGGTAAGAAACAGAACAAAACAAAAAGAACTAGAAACTTGA-ACAAACATTGGATTTCTGCTGG-AAAAAGGGTGCAAAGCGGGCCTGCCTGCTGCACTTCCCCAGAGCTAATCCTTGAGCTGAAAGAGCTTCCT-GGTGAAGCCTCACACTCTCTGTACCAGGGCGT-GGGGgg-acccagacacgtgggctccagatctgaccatctttacctagttatggggtttcaatcatgtcttttaaattctttgagctgcagttttcacatatgtaaagtgaaaatatttttaaatttttaatttg--------------------------------------------------------------------------------tgt-tataaccttgtataaagataaaat-----agtacatttgaaagcgttttagctgaagttaaacattcatgtgtgtgcatg--------caatggcttcttaattattTTTAGGGCTTAAC---CTGGTTTTGCTAGTACTGCTACTAGCACTGCTACTTCTCCATGTCTCTGAAGACTATGAAATG-TTAGAACTTAAGCAACAAGAAGCACCTGTCAAAGGGTTCTATGACCGATGACGGATTTGACACAACTGGCTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 40854 1237 + 80412 CTCACTGAGTTAAAGGCTTCATTTGTGTCTTTGTTCAGTTTGTTTTCTGTGACCCCTGTTCAGCAATATTGAAAATCAAG----CCTAGGAGGTGTAGACCTTGCTTTGGAGCAGGGGC-------GGGGTGTTGGGTGGAAATGGGGAATAGGTAGACAGTGGGAATTTCATTTTCTGGAGCTCACGTGCAGCCTCTTGATGGCCTCGTCACAAGTTCACCTGATGACCTGAGTGGCCACTGTCCTTCTCCTGAGTGGGTTACGAGCTTGCCAGGCACATGAACAGGGCATGCTCACATTTTTCAAG-TGAAGGAACTAAGAAGGGGTTGTCAGCAGATTGTCAGCCTGAAGTATGCCAGTGTTTGGTCCACAGTAAACCACATGTGGAGAGCTTaaaaaaaTTGCCCTCAAATCtggcaaaaaaaaagagacagtaataaattaaattattactgTGATACACA--TTTCTTTagttacaattata-----------tatatataactaacaATTTTGCAGAAGTTTCTCATCTaccagtattt----ttttgttttt-c-----ataa---gttTGCAAGGAACCCTAATGATAGGGactgtctcttttaaaattaaattttataaataactcCCAGAGCCATGCTGgtaaggaacaaaacaaaacaaaaagaactagaaacttga-acaaacaTTGGATTTCTGCTGG-AAAAAGGGTGCAAAGCCGGCCTGCCTGCTGCACTTCCCCAGAGCTAATCCTTGAGCTGAAAGAACTTCCT-GGTGAAGCCTCACATGCTCTGTACCAGGGCATggggggg-ACCCAGACATGCGGGCTCCAGATCTGACCGTCTTTACCTAGTTATGGGGTTTCAATCAtgtcttttaaattctttgagcTGCAGTTTTCACATatgtaaagtgaaaatatttttaaatttttaatttgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtaaagtgaatatatttttaaatttttaatttgtgtataaccttttataaagataaaat-----agtaCCTTTGAAAGCATTTTAGCTGAAGTTAAACATTCATATGTATGCATG--------CAATggcatcttaattatttttagggCTTAAC---CTGCTTTTGCTAGTACTGCTACTAGCACTGCTACTTCTCCATGTCTCTGAAGACTATGAAATG-TTAGAACTTAAGCAACAAGAAGCACCTGTCAAAGGATTCTATGACTGATGACGGATTTGACACAACTGGCTAT i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37890068 1161 - 90373283 CTCACTGAGTTAAAGGCTTCATTTGTGTCTTTGTTCAGTTTGTTTTCTACGACCCCTGTTCAGCAATATTGAAAATCAAGCATTCCTAGGAGGTGGAGA-CTTGCTTTGGAGCAGGGGC-------GGGGCATTGGTTGGAAATGGGAAATAGGTAGACAGTGGGAATTTCGTTTTCTGGAGCTCAGGTGCAGCCTCTTGATGGCCTCGTCACAAGTTCACCTGATGACCTGAGTGGCCACTGTCCTTCTCCTGAGTGGGTTACGAGCTTGCCAGGCACATGAACAGGGCACCCTCACATTTTTCAAG-TGAAGGAACTAAGAAGGGGTTGTCAGCAGATTGTCAGCCTGAAGTATGCCAGTGTTTGGTCCACAGTAAACCACATGTGGAGAACTT-AAAAAATTGCCCTCAAATCTGGCAAAAAAAAA-TGACAGTAATA-----AATTATTACTGTGGTACACA--TTTCTTTAGTTACAATtatatatattata--tatatataACTAACAATTTTGCAGAAGTTTCTCATCTACCAGGATTT----TTTTGTTTTTGC-----ATAA---GTTTCCAAGGAACCCTAATGATGGGGACTGTCTCTTTTAAAATTAAATTTTATAAATAACTCCCAGAGCCATGATGGTAAGaaacaaaacaaaacaaaaagaactagaaacttga-acaaaCATTGGATTTCTGCTGG-AAAAAGGGTGCAAAGCCGGCCTGCCTGCTGCACTTCCCCAGAGCTAAACCTTGAGCTGAAAGAGCTTCCT-GGTGAAACCTCACACGCTCTGTACCAGGGCGT-Gggggg-acccagacatgcgggctccagatctgaccatctttacctagttatggggtttcaatcatgtcttttaaattctttgagctgcagttttcacatatgtaaagtgaaaataTTTTTAAAATTTTAATTTG--------------------------------------------------------------------------------TGT-TATAACCTTGTATAGAGATAAAGT-----AGTACCTTTGAAAGCGTTTTAGCTGAAGTTAAATGTTCATGTGCGTGCATG--------CAATGGCTTCTTAATTATTTTTAGGGCTTAAC---CTGGTTTTGCTAGTACTGCTACTAGCACTTCTACTTCTCCATGTCTCTGAAGACTATGAAATG-TTAGAACTTAAGCAACAAGAAGCACCTGTCAAAGGGTTCTATGACCGATGACGGATTTGACACAACTGGCTAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108164406 1128 + 108792865 CTCACTGTGTTCGAGGCTTTCTCTGTTTCTTTGTTCAGTCTGTTTTCTCTGACCCCTGTTTAGCAGTACTGAAAATCAAGCATTCCTGAGAGGTGGAGACATTGCTTtggggcaggggcaggggcaggggcatggggTGGAAATGGGGAACCGGCTTATGGTGGGAATTTCATTTTCCCGAGCACACACGTGACCTCTTAGTGG-CTCGTCACACGTTCACCTGAGACCCTGAGTGGCCG-TGTCCTCCTCCTGAGTGGGTTACGTGCCTGCCGGCCACAGGAGCAGCGCTCGCTAACATTTTCCAAG-TG-AGGGACTCAGAAGGGGCTGCCAGCAGATTGCAAGCCTGCA-----------TTCATTCCACAGCAGACCAC--GTCGGGAGCTT-AAAAAATTGGCTTCAAATTTGGCAAGAAAA---TGACAGTAACGAGTTAAATTATTAGGGTAATATGCAGTGTTCTTACGTTATGATTCTA-----------CAT---TAACTAACAATTTCGCAGAAGTTTCTCCTCCACCAGTATTTAATCTTTTCTTTTTGT-----ATAATCGGTTTCCTAAGAACCCTAGTAAC--AGACTGTCTCTTTTAAAATTAAATTTTGTGATTAACTCCCAGAGCCATGGTAGTAAGAAACAAAACA-----CAAACAACTAGAAACTGGAGAGGAACATTGGATTTTTGCTGG-AAAGGAGG----------------CTGCTGTGC-TGTCCAGAGTTGATTCTCTGGCGGCAAGAGCCTCCTGGGTGAAGC--CACACTCCCTGCCAAGGGCTGC-GGGGGG-ACCAGGGCATGCCGGCTCCGGATTTGACCATCTTCACCCAGTTATGGGAGTTAGAACATGtctcttagattct------------ttttgcatgtgtaaagtggaaatatttttaaatttttgttctg--------------------------------------------------------------------------------tgt-tataagcttgtgtaaagataagatgaaagagtacatttgaaagcattttAGCTGCAGTC-AACGTCCGTGTGCATGTGTGTGTGCTCACAGTGGCTTCTTGCTTATTTTTAGGGCTTAACTAACTGCTTTTACTAGGACTCTTACTAACACTGCTGCTTCTCTGCGCCTCTGAAGACCGTGAAATACTTAGAATTAA---AACAAGAGGCACCTCTCAGAGTGTTCTGTGCCCAATGAT--ATTTGAAATAACTGGGTAT i calJac3.chr14 I 4 I 20867 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=91683.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 94116 125 + 478999 AGTAATATGTTCGATGGTGCCCAGATCATTGCTAAGCAGAGACTTCATGCTATTCTAAGTCGaaagtgtccctagaattctgaacctgctgaagcagccttcagaactgaagttgagaaaagtac s panTro4.chr18 74577027 105 - 76611499 AATAATATGTTAGGTGGTACCCAGA--------------------GATGCTGTTCAAAGTCGaaagtgtccatagaattctgaacctgctgaagcagccttcagaactgaagttgagaaaagtac i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36399914 125 + 96509753 GATAATGTGTTAGATGGTGCCTAGAGCACTGCTGAGCAGAGACTTCATGCTGTTCAAAGTCGAAAGAGTCcctagaattatgaacctgctgaagcagccttcagaactgaagttgagaaaagtac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 42091 125 + 80412 GATAATGTGTTAGATGGTGCCTAGAGCACTGCTGAGCAGAGACTTCATGCTGTTCAAAGTCGAAAGAGTCCCTAGAATTATGAACCTGCTGAAGCAGCCTTTAGAACTGAAGTTGAGAAAAACGC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37891229 125 - 90373283 GATAATGTGTTAGATGGTGCCTAGAGCACTGCTGAGCAGAGACTTCATGCTGTTCAAAGTCGAAAGAGTCcctagaattatgaacttgctgaagcagcctttagaactgaagtggagaaaagtac i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e calJac3.chr14 108165534 20867 + 108792865 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=555.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 94241 6 + 478999 attttc s papAnu2.JH684867 42216 6 + 80412 ATTTTC i papAnu2.JH684867 C 0 I 640 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37891354 0 - 90373283 C e macFas5.chr10 36400039 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e panTro4.chr18 74577132 0 - 76611499 C e calJac3.chr14 108165534 20867 + 108792865 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 94247 520 + 478999 tttttttttttattattattatactttaagttttagggtacatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgcgctgcacccactaacccgtcatctagcattaggtatatctcccaatgctaaccctccaccctccccccaccccacaacagtccccagagtgtgatgttccccttcctgtgtccatgtgttctcattgttcaattcccacctatgagtgagaatatgcggtgtttgattttttgttcttgcgatagtttgctgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagcattccatggtgtatatgtgccacattttcttaattcagtctatcattgttggacattgttggttccaagtctttgctatcgtgaatagtgccgcaataaacatacgtgtgcatgtgtctttatagcagcatgatttatagtcctttgggtatatacccagt e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37891354 0 - 90373283 C e papAnu2.JH684867 42222 640 + 80412 I e macFas5.chr10 36400039 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e panTro4.chr18 74577132 0 - 76611499 C e calJac3.chr14 108165534 20867 + 108792865 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=231472.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 94767 317 + 478999 attttcagttaaagaaagtct--gagagaccgtgttgccatcacacccaaaccccaataaat-------aaacttgttcaggatgaagaaaa---ataacagttggaaattctacttcacagaaaagatgaaagtgtgccaaaaatagtaaatatgtggaggggaaattactgttttaatgacatcctccaggaattacaacatgtacaaaagaaaaatctatgacaacatggcacaaaagatgagaggatggtaaggtaaggtttttatattttatatacagtgttatg-atatttaat---atacattaagtatttatattttaatttctg s panTro4.chr18 74577132 324 - 76611499 attttcagttaaagaaagtct--gtgagactgtgttaccatcacacccaaaccacgataaatgcaaaagaaacttgttcaggatgaagaaaa---ataataattggaaattctagttcacagaaaagatgaaaatgtgccaaaaatagtaaatatgtggaggagaaattactgttttgatgacatcctccaggaattacaacacatacagaagaaaaatctatgacaacatggcacaaaagatgagaggatggtaaggtaaggtttttatattttatatacagtgttatg-atatttaat---atacattaagtatttatattttaatttctg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36400039 326 + 96509753 attttcagttaaagaaagtct--gagagactgtgttgtcatcacacccaaaccacaataaatgcaaaagaaacttgttcagggtgaagaaaaatgataataattggaaattgtagttcacagaaaagatgaaagtgtgtcaaaaatactaaatatgtgaaggggaaattactattttaatgacatcctccaggaattacatcatgtgcagaagaaaaatccaagacaacatggcacaaaagatgagaggagggtaaggtaaggtttttgtgttttatata-agtgttatg-gtatttaat---atatgttaagtatttatattttaatttcca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37891354 326 - 90373283 attttcagttaaagaaagtct--gagagactgtgtagccatcacacccaaaccacaataaatgcaaaagaaacttgttcagggtgaagaaaaatgataataattggaaattctagttcacagaaaagattaaagtgtgccaaaaatagtaaatatgtgaaggggaaattactattttaatgacatcctccaggaattacaacatgtgcagaagaaaaatccaacacaacatggcacaaaagatgagaggagggtaaGGTAAGGTTTTTGTATTTTATATA-AGTGTTATG-ATATTTAAT---ATATGTTAAGTATTTATATTTTAATTTCTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108186401 331 + 108792865 attttcacttaaatgaaggctgagagagaatgtgtggccatcatacccaaatcacaataaatgcaaaataaagttgttcaggacaaagaaaaatgataacaattggaaattctagctcacaccaaagattaaagagtgccaaaaatggtaaatg-gtggaggggaaagaactgttttaatgacatcatctgggaactacaacatatgcagaagaataatcactgacaacacggcacaaaagccgagaggagggtgaggtaaggattttata-gttgcataaagtgttatatttatttaatctaatactttaagtatttatattttaatttcca i calJac3.chr14 I 20867 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e papAnu2.JH684867 42222 640 + 80412 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=684666.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 95084 715 + 478999 aacaactcaccaaaaataaataaatgaaacaaagagtcatagtta--aaaaaaaaa-------caaggtacaaaatccatac-taaaaaaaaacaaaaagaaaaccccataaaacaaacaaaca------------aaccaaaaCTACCATAATCCAGAAGAAGATGAGGAAGGCGGAAc------------------------------------------------------------------------------------agagactgtcaaaataagtaaaaaggaaacctcaataaccacttttaaaacgaaatacacttatgagataaagatataaatagatttgaactgaaaagatggacaaatatacactatgcaaatctttgttatcaa-aaactgcagccagtgtattaatggcagataagacagactacaagaaagacaagcttcaccagggataaagaaggatgttttatactaataagtccatttgcttagaaaacctaataagcataagcatgcatacacctaaga-aaaataacaaaatacatgaagcaaaagttattgaattaaaatgataaatgcataaatccacaatttgacaattctaattcttatatctcagaaattaatagaaaaaa-aactacaacaataagactacaaggtattaataggagaGATTATAACCAGAGCACTGGGAGAAAAACAGCAATATCCAATATGCTTACAACTATTGGTTGACAACTCAAAAGTTCCCAAAAGAATTTTTGACACCAAATAAAGGTAAATAGCCTGGAAaacctacaagccagcat s panTro4.chr18 74577456 704 - 76611499 aacaactcaccaaaaataaataaatgaaacaaag--tcatagtta--aaaaAAAAA------ACAGGGTACAAAATCCATAC-TAAAAAAAAA-----AGAAAACCCCATAAAACAAACAAACA------------AACCAAAACTGCAATAATCCAGAAGAAGATCAGGAAGGTGGAac------------------------------------------------------------------------------------agagactgtcaaagtaggtaaaaaggaaacctcaatatccacttttaaaaagaaatacacttatgagataaagatataaatagattcgaactgaaaagatggacaaatatacactatgcaa-tctttgttatcaa-aaactgcagccagtgtattaatggcagataagacacactgcaagaaagacaagcatcaccagggataaagaaggatgttttataccaataagcccatttgcttagaaaacctaataagcataagcatgca----cctaaga-aaaacagcaaaatacatgaagcaaaagttattgaattaaaaggataaatgcataaatccacaatttgacaattctaattattatatctcagaaatcaatagaaaaaataactacaacaataagactaca-gaTATTAATAGGAGAGATTATAACCAGAGCACCAGGAGAAAAACAGCAATATCCAATATGCTTACAACTATTGGTTGACAACTCAAAAGTTCCCAAAAGAATTTTTGACACTAAATAAAGGTAAATAGCCTGGAAagcctgcaagccagcat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36400365 723 + 96509753 aagaactcaccaaacataaataaatgaaacaaggagtgatagttt--aaaaaaaaa------tcaaagtacaaaatccatacaaaaaaaaaagaaagaaagaaaCCCCATAaaacaaacaaacaaactaaca----aaccaaAACTACAATAATCCAGAAGAAGACCAGGAAGGTGGAac------------------------------------------------------------------------------------agagactgtcaaagtaggtaaaaaggaaacctcaatatctgcttttaaaaagaaatacacttatgatataaagatacaaatagattcgaactgaaaagatggacaaatatacaccatgcaaatctttgttatcaa-aaactgcagccagtgtgttaatggcagatatgacagactacaagaaagacaagcatcaccagggataaagaaggatgttttatactaatgagtccatttgcttagaacacctaataatcataagcatgcacgcacccaaga-aaaataacaagatacattaagcaaaagttattgaattaaaaggataaatgcataaatccacaatatgacaattctaattcttatatctcagaaattaatagaaaa---aAATACAACAATAAGACTACAAGGTATTAATAGGGGAGATTATAACCAGAGCACCGGGAGATAAACAGCAATATCCAATATACTTACAACTACTGGGTGACAACTCAAAAGTGCCCAAAAGAATTTTTGACACTAGATAAAGGTAAATAGCCTGGAAAACCTACACGCCAGCAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 42862 723 + 80412 aagaagtcaccaaacataaataaatgaaatgaggagtcatagttt--aaaaaaaaa------tcaaagtacaaaatccatac-aaaaaaaaagaaagaaagaaaacccataaaacaaacaaacaaacaaacaaacgaaccaaaacTACAATAATCCAGAAGAAGACCAGGAAAGTGGAAC------------------------------------------------------------------------------------AGAGACTGTCAAAGTA-GTAAAAAGGAAACCTCAATAtctgctttt-aaaagaaatacactcATGAGataaagatacaaatatattCGCACTG-AAAGATAGACAAATATACACCATGCAAATCTTTGTTATCAA-AAACTGCGGCCAGTGTATTAATGGCAGATATGACAGACTACAAGAAAGACAAGCATCACCAGGGATAAAGAAGGATGTTTTATACTAATAAGTCCATTTGCTTAGAACACCTAATAATCATAAGCATGCATgcaccaaaga-aaaataaaaagatacatgaagcaaaaattattgaattaaaaggataaatgcataaatCCACAATTTGACAATTTTAATTCT--TATCtcagaaattaatagaaaaat-aactacaacaatAAGACTACAAGGTATTAATAGGGTAGATTATAACCAGAGCACCGGGAGATAAACAGCCATATCCAATATACTTACAACTATTGGTTGACAAGTCAAAAGTTCCCAAAAGAATTTTTGACACTAGATAAAGGTAAATAGCCTGGAAAACCTACAAGCCAGCAT i papAnu2.JH684867 I 640 C 0 s chlSab2.chr2 37891680 726 - 90373283 AAGAAGTCACCAAACATAAATAAATGAAACGAGGAGTCATAGTTTAAAAAAAAAAA------TCAAAGTGCAAAATCCATAC-AAaaacaaagaaagaaagaaaacccataaaacaaagaaacaaacaaaca----aactaaAACTACAATAACCCAGAAGAAGACCAGGAAGGTGGAac------------------------------------------------------------------------------------agagactgtcaaagtaggtaaaaaggaaacctcaatatctgcttttaaaaagaaatacacttatgagataaagatacaaatagattcgaactgaaaagatggacaaatatacaccatgtaaatctttgttatcaa-aaactgcaaccagtgtgttaatggcagatatgacagactacaagaaagacaagcatcaccagggataaagaaggatgttttatactaatgagtccatttgcttagaacacctaataatcataagcatgcacgcacccaaga-aaaataacaagatacatgaagcaaaagttattgaattaaaaggataaatgcataaatccacagtatgacaattctaattcttatatctcagaaattaatagaaaaaA-ATCTACAACAATAAGACTACAAAGTATTAATAGGGGAGATTATAACCAGAGCACCGGGAGATAAACAGCAATATCCAATATACTTACAACTACTGGGTGACAACTCAAAAGTTCCCAAAAGAATTTTTGACACTAGATAAAGGTAAATAGCCTGGAAAACCTACACGccagcat i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108186732 746 + 108792865 gatgactccctgaaaataaata---------aggagtcatagttt--aaaacacacacacacacaaggtacataatccatac-taaaataaacat---caaaaaaccctta----------------------------caaaacaatgacaatcc---agaagatcaggaaggcggaacagaggaaataagagtttcagacgtcgacttcaacccagccacatcactagctccgatgtgcatggactaaacactgccactgagagagactgtccgagcagggcaaaggcaagcctccatatacgcttttacaaagaaacactcttttgcgacaaagatgcaaatagattcaaactgaaaagacaaacaaatgtacaccaca-aaatgcttgttatcaagaagctgca-caggtgtacctattgcaggtgagacagatggtgagaaggaccagcatcaccagggacagagaaggatgttttctaggaatgagtccacttgcttaggaaacctaatgatgataagcacgtatgtacctgatataaaataacaaagtacgtgaagcaaaaataatcacagttaaaggataaatgcttaaattcacagtttgacaattctgataactatatatcaggaattaagagaaaaac---------cagtcaaatgaccag------atagaagaGATTATAACTAGAGCACTGGGAGAAAACCACAAA-------------TGCAATGATGAGCTAATACTTTAGAAATATTTAAA--AATGTGGGACACTAAGGAAAAGTATATAGGCTGGAAACCCTAAAAACCAGCAT i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=275488.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 95799 328 + 478999 aggaaggaagtggaaaatgaaacattgattgaaaataaatctggaagtccgggcgcagtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaagatgggtggatcacctgaggttgggagttcgagaccagcctgaccaacatggagaaactctgtctgtactaaaaatacaaaattagctgggtatggtggtgcatgcctgtaaccccagctacttggaggctgtcgtagaagaattgcttgaacccgagaggcagaggttgtcgtgagccaagatctccccattgcactccagccttggcaacaggagcgaaactctgtcccc s panTro4.chr18 74578160 328 - 76611499 aggaaggaagtggaaaatgaaatgttgattgaaaataaatctggaagtccgggcgtggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcgggagttcgagaccatcctgaccaacatggagaaactctgtctgtactaaaaatacaaaattagccgggtatggtggtccattcctgtaatcccagttactcggaggctgtggcagaagaatcgcttgaacccgagaggcggaggttgtggtgagccgagatctccccattgcactccagcctgggcaataagagcaaaactctgtcccc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36401088 328 + 96509753 AGGAAGGAAGTGGAAAATGAAACGTTGATTGAAAATAAATCTGAAAGTccgggcacagtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcgggagattgagaccagcctgaccaacatggagaaactctgtctgtactaaaaatacaaaattagctgggtgtggtggcgcatgcctgcaatcccagctgctcagaggctgtggcagaagaatcacttgaacccgagaggtggaggttgtagtgagccgagatctccccattgcactccagcctggccaacaagagcaaaattctgtcccc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 43585 328 + 80412 AGGAAGGAAGTGGAAAACGAAATGTTGATTGAAAATAAATCTggaagtctgggcacagtggttcatgcctgtaatcccagcactttaggaggccaaggtcggtggaacacctgaggtcgggagtttgagaccagcctgaccaacatggagtaactctgtctgtactaaaattacaaaattagccgggtgtggtggtgcatgcctgtaatcccagctacttggaggttgtggcagaagaatcacttgaacctgagaggcagagattgtggtgagccaagatctccccattgcactccagcctggccaacaagagcaaaactctgtcccc i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37892406 328 - 90373283 aggaaggaagtggaaaatgaaatgttgattgaaaataaatctgaaagtccgggcacagtggctcatgcctctaatcctagcactttgggaggccaatgggggtggatcacctgaggtcgggagattgagaccagcctgaccaacatggagaaactctgtctgtactaaaaatacaaaattagccgggtgtggtggcgcatgcctgcaatcccagctgctcagaggctatggcagaagaattgtttgaacctgagaggcagaggttgtagtgagccgagatctccccattgcactccagcctggccaacaagagcaaaattctgtcccc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e calJac3.chr14 108187478 0 + 108792865 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=676114.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96127 648 + 478999 caaaaaaaagaagaaaagaaa-----agaa----atctgaaaaaaggaaaagagaattgaggataaagctttgcaaatacaaaatccaaaaatcaaatgatagaaataagttcaaatatatcactttttcctaccaaacatagagggattaacctcatatattaaaatacaaaattatcaATAACTAAGCAGCACTTTCAAATTAAAGAAAT-TAA----AAATTAAATATTTTATAAAAATTTTAAGTAAATATTCACAG-AAAGCAAGCTGCTATCACAAAATTAATTTTAGTTTAAATAAAATTTAAGGAAGAAATAATAAACAACAAGATTGACACTGCACATGGAGGGACCATAGAACCGGGTAGGTGAACCAACGTCAAGTCCAATGCTGGCCTCACCTCCAGGACATACAAAGAAACTAACAGGATAGAGCAGGTCTAGAGAGGGACACTGGAACTCATACTTCTGAATTTAAATGGGAAATAGACAAAGATGTTATGTGTTTATAAAAGGTTTT-AAATCACAACAAATGCTGAATGTACATCACTTTCTAGTATATGTAATACTTACCAAATGGGACCCATATTAGGTTGCAAAAGAAATTACAAAAAC----CCGGAGATAGGGACCAAAGGACTAAAAGAAGTCAGAACAAAAAACA s panTro4.chr18 74578488 647 - 76611499 cccaaaaaaga-gaaaagaaa-----agaa----atctgaaaaaaggaaaagagaattgaggataaagctttgcaaatacaaaatccaaaa-tcaaatgatagaaataagttcaaatatatcactttttcctaccaaacatagagggattaacctcatatattaaaatacaaaattatcaATAACAAAGCAGCACTTTCaaattaaagaaat-aaa----aaaataaaaattttataaaaattttaagtaaatattCACAG-AAAGCAAGCTGCTATCACAAAATTAATTTTAGTTCAAATAAAATTTAAGGAAGAAATAATAAACAACAGGATAGACACTGCACATGGATGGACAATAGAACGGAGTAGGTGAAGCAACGTCAAGTCCAATGCTGGCCTCGCCTCCAGGACATACAAAGAAACTAACAGGATAGAGCAGGTCTAGAGAGGGACGCTGGAACCCATATTTCTGAATTTAAACGGGAAATAGACAAAGATGTTACGTGTTTATAAAAGGTTTTAAAATCACAACAAATGCTGAATATACGTCACTTTCTAGTATATGTAATACTTACCAAATGGGACACATATTAGGTTGCAAAAGAAGTTACAAAAAA----CTGGAGCTAGCGACCAAAGGACTAAGATAACTCAGAACAAAAAACA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36401416 651 + 96509753 ccaaaaaaataagaaaagaaa-----agaa----aTCTgaaggaaggaaaagagaattgaggataaaactttgcaaatacaaaattcaaaaatgaaatgatagaaataagttcaaatatatcactgtttcctaccaaacatagagggattaacctcatatattaaaatacaaaagtatcaATAATAAAGCAGCACTTTCaaattaaagaaag-aaaaaataaaataaatactgtataaaa-atttaagtaaataTTCACAG-AAAGCAAGCTGCTATCACAAAATCAATTTTAGTTCAAATAAAATGTAAGGAAGAAATCATAAACAACAGGAGAGACACTGCACATGGACGGACAATAGAACCGTGTAGGTGAAGCAACGTCAAGTCCAATGCTGGCCTCACCT-CCAGGCATACAAAGAAACTAACAGGATAGAGCAGGTCTAGAGAGGGACGCTGGAACCCATACTTCTGAATTTAAATGGGAAATAGACAAAGATGCTATGTGTTTATAAAAGGTTTTAAAATCACAACAAATGCTGAACATACATCATTTTCTAGTATATGTAATACTTACCAAATGAGACCCATATTCGGTTGCAAAAGAAATTACAAAAAA----CCAGAGCAGGGAACCAAAGGACTAACAGAAGTCAGAACAAAAAACA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 43913 651 + 80412 ccaaaaaaataaggaaaggaa-----agaa----atctgaaacaaggaaaagagaattgaggataaaaCTTTGCAAATACAAAATCCAAAAATCAAATCATGGAAATACGTTCAAATATATCACTTTTTCCTACCAAACATAGAGGGATTAAcctcatatattaaaataaaaaattatcaataataaagcaacactttcaaattaaagaaagaaaaaaataaaataaatattgtataaaatttttaagtaaatattcgcagaaaagCAAGTTGCtatcacaaaattaattttacttcaaataaaatgtaaggaagaaattataaa-aacaggagagacaCTGCACATGGACGGACAAGAGAATCATGTAGGTGAAGCAACATCAAGTCCAATGCTGGCCTCACC--CAGGACATACAAAGAAACTAACAGGATAGAGCAGGTCTAGAGAGGGACGCTGGAACCCATACTTCTGAATTTAAATGGGAAATAGACAAAGATGTTATGTGtttataaaaggttttaaaatcacAACAAATGCTGAACATACATCATTTTCTAGTATATGCAATACTTACCAAATGGGACCCATATTTGGCtgcaaaagaaattacaaaaaa-----tggAGCTAGGGACCAAAGGACTAACAGAAGTCAGAACAAAAAACA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37892734 652 - 90373283 ccaaaaaaataagaaaagaaa-----agaa----atctgaagaaaggaaaagagaattgaggataaaactttgcaaatacaaaattcaaaaatcaaatgatagaaataagttcaaatatatccctgtttcctaccaaacatagagggattaacctcatatattaaaatacaaaagtatcaATAATAAAGCAGCACTTTCaaattaaagaaag-aaaaaataaaataaatagtgtataaac-atttaagtaaataTTCACAG-AAAGCAAGCTGCTATCACAAAATCAATTTTAGTTCAAATAAAATATAAGGAAGAAATCATAAACAACAGGATAGACACTGCACATGGACAGACAATAGAACCGTGTAGGTGAAGCAACGTCAAGTCCAATGCTGGCCTCCCCTCCAGGACATACAAAGAAACTAACAGGATAGAGCAAGTCTAGAGAGGGATGCTGGAACCCATACTTCTGAATTTAAATGGGAAATAGACAAAGATGTTATGTGTTTATAAAAGGTTTTAAAATCACAACAAATGCTGAACATACATCATTTGCTAGTATATGTAATACTTACCAAATGGGACCCATATTCGGTTGCAAAAGAAATTACAAAAAA----CCGGAGTAGGGAACCAAAGGACTAACAGAAAGCAGAACAAAAAACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108187478 632 + 108792865 CAGAAGGAAGTGGGAAAGGAAATGTCAGAAATACATCTGGAGGAAGGAAAACACAATCAAGGATAAAGTTTTGCAAATCCAAAA--------TCACATGATAGAAATAAGTTCAAATATATCACTTTTTCCTACCAAACACAGAGAGGTTAACCTCACATATTAGAATACAAGATTATCAGTAGCAAAGGAGAACTTACAAATCAAGGGCAA-A------AAAATAAGGAA---ATGAAA----CCACTAAGTATTCACAG-AAAGAAAGTTTCTATGGCAAAATTAATCTTAGCTCAAATAAAATTTAAGGAAGAAATAATAAACAGCAGGATGGACACTGCACGTG----AGCCATAGGACCAAGGAGGTGA-------TGAAGTTCAGTGCTGGCCTCACCTCCAGGACATACAGGCAGACTGACGAGA-GGAGCAGATCCAGAGAGGAACGCTGGGATCCGTACTTCTCAATTTAAATGGAAAATAGACAGAAACGTTA-GGGTTTATTAAAGGTTTAAAAGCCACAACACATACTGAATACACATTATTTTCTAGTACAGGTGATACTTACCAAATAGGATCTGTATTAAGTTGAAAACAAAATTACAAAAAAAAAAAAAGACGTGGGGACCAAACAATTAATAGAAGTCAAAACAAAAATCA i calJac3.chr14 C 0 I 311 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=2187.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96775 3 + 478999 CGC s panTro4.chr18 74579135 3 - 76611499 CGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402067 3 + 96509753 CAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44564 3 + 80412 CAC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893386 3 - 90373283 CAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e calJac3.chr14 108188110 311 + 108792865 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=183387.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96778 186 + 478999 CCCATATAT----TTTAGG-GAAAAACAGCACAGTGATTTAATGGTAAATCAC---------TATAAACATGAAGGCATTCACCTAGAATAGAGATGAGATGCCAGAGTTCAAGACGACAACATGTGTCAGCCTGACTTTCTGAATGACTGCACAGGCAAGGCTGCCATCCATGGAAGCGCAGAAAAGGACACCCCTTAG s panTro4.chr18 74579138 167 - 76611499 CCCATATAT----TTTAGG-AAAAAACGGCACAGTGATTTCATGGTAAATCAC---------TATAAACATGAAGGGATTCAC-------------------CCAGAGTTCAAGACGACAACATGTGTCAGCCTGACTTTCTGAATGACTGCACAGGAAAGGCTGCCATCCAAGGAAGCACAGAAAAGGACACCCCTTAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402070 186 + 96509753 CCCAGATAT----TTTAGG-AAAAAATGGCACAGTGATTTAATGATAAATCAC---------TATAAACATAAAGGGATTCACCCAGAATAGAGATGAGATGCCAGAGTTCAAGATGACAACATGTGTCAGCCTGACTTTCTGAATGACTGCACAGGAAAGGCTGCCATCCAAAGAAGTGCAGAAAAGGACACCCTTTAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44567 187 + 80412 CCCATAGAT----ATTAGGaaaaaaaCGGCACAGTGATTTAATGATAAATCAC---------TATAAACATGAAGGGATTCACCCAGAATAGAGATGAGGTGCCAGAGTTCAAGATGACAACATGTGTCAGCCTGACTTTCTGAATGACTGTACAGGAAAGGCTGCCATCCAAGGAAGTGCAGAAAAGGACACTCCTTAG i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893389 186 - 90373283 CCCATATAT----TTAAGG-AAAAAATGGTACAGTGATTTAATGATAAATCAC---------TGTAAACATGAAGGGATTCACCCAGAATAGAGATGAGATGCCAGAGTTCAAGAGGACAACATGTGTCAGCCTGACTTTCTGAATGACTGCACAGGAAAGGCTGCCATCCAAAGAAGTGCAGAAAAGGACACCCCTTAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188421 189 + 108792865 CCCACATATTATATTTTGG-GGGAAATGGCACAGTGATTAAATGGTAAATCACTATAAATGTTATAAATGTGAAGGAATTCACTTAGAATAAAGATAAAATGCTAGAGTTCAATCC-ACAATATATGACAGCCTGGCATTCTGTAGGATGGCACAGGAAAGGGTGCTGTCC---------CAAGTAAGGGTGGCCCTCAG i calJac3.chr14 I 311 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35458810 5210 - 95678458 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=21006.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96964 14 + 478999 GTCCTGGATGGAGG s panTro4.chr18 74579305 14 - 76611499 GTCCTGGATGGAGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464020 14 - 95678458 GTCCTGGATGGAGA i rheMac3.chr10 I 5210 C 0 s macFas5.chr10 36402256 14 + 96509753 GTCCTGGATGGAGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44754 11 + 80412 ---GTGGATAGAGG i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893575 14 - 90373283 GTCCTGGATGGAGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188610 14 + 108792865 GTCATGGATGGGGA i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=9263.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96978 11 + 478999 AGGATGACCCC s rheMac3.chr10 35464034 11 - 95678458 AGGATGACCCC i rheMac3.chr10 C 0 I 2 s macFas5.chr10 36402270 11 + 96509753 AGGAAGACTCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44765 11 + 80412 AGGAAGACCCC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893589 11 - 90373283 AGGAAGACCCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188624 10 + 108792865 AGGAAACCCC- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=1000.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96989 1 + 478999 C s macFas5.chr10 36402281 1 + 96509753 C i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44776 1 + 80412 C i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893600 1 - 90373283 C i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188634 1 + 108792865 C i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e nomLeu3.chr6 45200316 0 - 121039945 C a score=2457.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96990 4 + 478999 AATA s nomLeu3.chr6 45200316 4 - 121039945 AGTC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402282 4 + 96509753 AATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44777 4 + 80412 AATG i papAnu2.JH684867 C 0 I 112 s chlSab2.chr2 37893601 4 - 90373283 AATG i chlSab2.chr2 C 0 I 112 s calJac3.chr14 108188635 4 + 108792865 AGTC i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=24889.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 96994 23 + 478999 CTGGATAGAGAAAGATGCCCTCC s nomLeu3.chr6 45200320 23 - 121039945 CTGGATGGAGAAGGATGCCCCCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402286 23 + 96509753 CTGGATGGAGAAGGGTGCCCCCC i macFas5.chr10 C 0 I 140 s papAnu2.JH684867 44893 23 + 80412 CTGAATGGAGAAGGATGCCCCCC i papAnu2.JH684867 I 112 C 0 s chlSab2.chr2 37893717 23 - 90373283 CTGGATGGAGAAGGATGCCCCCC i chlSab2.chr2 I 112 I 28 s calJac3.chr14 108188639 22 + 108792865 CTGGATAGAGAAGGAAACCCCC- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=37635.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97017 36 + 478999 AATTCTGGGATGGAGAAGGATGCCCCCCAGTCCTGG s nomLeu3.chr6 45200343 36 - 121039945 AATTCCAGGATGGAGAAGGATGACCCCTAATTCTGG i nomLeu3.chr6 C 0 I 1 s macFas5.chr10 36402449 36 + 96509753 AATTCTGGGATGGAGAAGGATGCCCCCCAGTCCTGG i macFas5.chr10 I 140 I 140 s papAnu2.JH684867 44916 36 + 80412 AATTCCAGGGTGGAGAAGGACGCCCTCCAGTTCTGG i papAnu2.JH684867 C 0 I 1 s chlSab2.chr2 37893768 36 - 90373283 AATTCTGGGATGGAGAAGGATGCCCCCCAGTCCTGG i chlSab2.chr2 I 28 C 0 s calJac3.chr14 108188661 34 + 108792865 -AGTCCTGGATAGAGAAGGA-AACCCCCAGTCCTGG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=10503.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97053 9 + 478999 ATGGAAAAG s nomLeu3.chr6 45200380 9 - 121039945 ATGGGGAAG i nomLeu3.chr6 I 1 C 0 s macFas5.chr10 36402625 9 + 96509753 ATGGAGAAG i macFas5.chr10 I 140 C 0 s papAnu2.JH684867 44953 9 + 80412 ATGGAGAAG i papAnu2.JH684867 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 37893804 9 - 90373283 ATGGAAAAG i chlSab2.chr2 C 0 I 113 s calJac3.chr14 108188695 9 + 108792865 ATAGAGAAG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=76162.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97062 83 + 478999 GATGCCCCCTAGTCCTTGATGGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTAGATGGAGAATGATGTCCCCTGAGTCCTGGATGGAGAAG s nomLeu3.chr6 45200389 83 - 121039945 GATGCCCCCCAGTCCTGGGTGGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTGGACGGAGAATGATGTCCCCTGAGTCCTGGATGGAGAAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402634 83 + 96509753 GATGCCCCCTAGTCCCGGATGGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTGGATGGAAAATGATGTCTCCTGAGTCCTGGATGGAGAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 44962 83 + 80412 GATTCCCCCTAGTCCTGGATGGAGAAGGATGTCCCCTAGTTACTGGCTGGAAAATGATATCCCCTGAGTCCTGGATGGAGTAA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37893926 83 - 90373283 GATGCCCCCTAGTCCCGGATGGAGAAGGTTGCCCCCTAGTTACTAGATGGAAAATGATGTCCCCTGAGTCCTGGATGGAGAAA i chlSab2.chr2 I 113 C 0 s calJac3.chr14 108188704 49 + 108792865 GAAACCCCC-AGTCCTGGGTAGAGAAGGACACCCCC------------------------------AGTCCTGGATAGAG--- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=46507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97145 115 + 478999 GATGGTCCCCCAAGTCCTCGATAGAGAAAGATGGTCGTCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGC---------------------------CCCCCTCAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTGGATGGAAAAA s macFas5.chr10 36402717 142 + 96509753 GATGGTCCCCTAAGTCCTGGATGGAGAAAGACAGTCCTCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCCAGTTCCTGAGTGGAAAAGGATGCCCCCCAAGTCCTGGATAGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTGGATGGAGAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45045 57 + 80412 GATGGTCCCCCATGTCCTGGATGGAGAAA-------------------------------------------------------------------------------------GATGCTCCCTAGTTGTTGGATGGAAAAA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894009 142 - 90373283 GATGGTCCCCCAAGTCCTAGATGGAGAAAGACAGTCCTCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCCAATTCCTGAGTGGAAAAGGATGCCCCCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCTAGTTACTGGATAGAGAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188753 101 + 108792865 ---GGCACCCCCAGTCCTGGATAGAGAAAGACA---CCCCCAGTCCTGGATAGAGAAGGAAAC------------------------------CCCCAGTCCTGGATAGAG---GACACCCCC-AGTC-CTGGATAGAGAAG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e nomLeu3.chr6 45200472 0 - 121039945 C a score=43907.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97260 50 + 478999 GATGTCCCCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCTCCCCAATTCCTGAATG s nomLeu3.chr6 45200472 50 - 121039945 GATGCCCCCCAATTCCTGAGTGGAGAAGGATGCCCCCCAATTCCTGAGTG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36402859 50 + 96509753 GATGTCCCCAAAGTCATGGATGGAGAAGGATGCTCCCCAATTCCTGAATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45102 50 + 80412 GATGTCCCCGAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCTCCACAATTTCTGAATG i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894151 50 - 90373283 GATGTCCCTGAAGTCATGGATAGAGAAGGATGCTCCCCAAATCCTGAATG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188854 43 + 108792865 --GACTCCCTCAGTCCTGGATAG---AGGATACCCCC--AGTCCTGGATA i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=77000.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97310 152 + 478999 GAGAAGGATGCCCCCTAGTTCTACATGGAGAAGGACAAAC-CCAGTCCTGAATGGAGAAGGATAACCCCCCAGTCCTGGATAGAGAAGGATGCCCCCCAAGTCCTATATGGAGAAGGACAAACCCCAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCC s macFas5.chr10 36402909 152 + 96509753 GAGAAAGATGCCCCCTAGTTCTACATGGAGAAAGACAACCTCCAGTCCTGGATGGAGAAAGATAA-CCTCCAGTACTGGATGAAGCAGGATGTCCCCCAAGTCCTATATGGAGAAGGACAAACCCCAGTCCTGGATGGAGAAGGATGACCCCT i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.JH684867 45152 151 + 80412 GAAAAAGATGTCCCCTAGTTCTACATGGAGAAGGACAACCTCCAGTCCTGGATGGAGAAAGATAA-CCTCCAGTACTGGATGAAGCAGGATGT-CCCCAAGTCCTATATGGAGAAGGACAAACCCCAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCCCCC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894201 97 - 90373283 GAAAAAGATGTCCCCTAGTTCTACATGGAGAAGGACAACCTCCAGTCCTGGATGGAGAAAGATAA-GCTCCAGTACTGGATGA-------------------------------------------------------AGCAGGATGTCCCCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108188897 144 + 108792865 AAGAAGGATGCCCCCAAAACCTGTATGGAGAAGGACACCCCCCAGTCCTGGATAGAGAAGGA-AA-CCCCTAGTCCTGGATAGAGAAGGACA--CCCCCAGTCCTGGATAGAGGAT----ACCCCCAGTCCTGGATAAAGAAGGATGCCCCC- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e nomLeu3.chr6 45200522 0 - 121039945 C a score=9144.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97462 39 + 478999 AAGTCCTATATGGAGAAGGACAAACCCCAGTCCTGGATA s chlSab2.chr2 37894298 39 - 90373283 AAGTCCTATATGGAGAAGGACAAACCCCAGTCCTGGATG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189041 39 + 108792865 AAAACCTGTATGGAGAAGGACACCCCCCAGTCCTGGATG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e papAnu2.JH684867 45303 0 + 80412 C e macFas5.chr10 36403061 1 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e nomLeu3.chr6 45200522 0 - 121039945 C a score=4497.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97501 41 + 478999 GAGAAGGATGCCCCCCAAGTCCTAAATGGAGAAGGATGCCT s nomLeu3.chr6 45200522 41 - 121039945 GAGAAGGATGCCCCCCAAGTCCTGGATGGAGAAGGATGCCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45303 6 + 80412 ----------------ATGTCC------------------- i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894337 22 - 90373283 GAGAAGGATGCGCCCCATGTCC------------------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189080 41 + 108792865 GAAAATGCTGTCCCTCAGTTTCCTAATGGAGACAAATACCT i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e macFas5.chr10 36403061 1 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C a score=220.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97542 5 + 478999 CCAAA s nomLeu3.chr6 45200563 5 - 121039945 CTGAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e chlSab2.chr2 37894359 0 - 90373283 C e papAnu2.JH684867 45309 0 + 80412 C e macFas5.chr10 36403061 1 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35464045 2 - 95678458 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e calJac3.chr14 108189121 0 + 108792865 C a score=194150.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97547 152 + 478999 GTCCAGATGAAGAAGAATTTCCCCCACTCCTGAATGGAATAGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCCCAAGTCCTGGGTGGAGAAGGACACCCCTCAGGTCCTGGATGGAGAAAAGATGCCCCCTAGGTCCTGGATGGAGA s nomLeu3.chr6 45200568 152 - 121039945 GTCCAGATGAAGAAGAATTTCCCCCACTCCTGAATGGAATAGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCCCAAATCCTGGGTGGAGAAGGACATCCTTCAGGTCCTGAATGGAGAAAGGATGCTCCCTAGGTCCTGGATGGAGA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464047 152 - 95678458 GTCCAGATGAAGAACAATTTCCCCCACTCCTGAATGGAATCGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCCCAAGTCCAGTGTGGAGAAGGACATCCCTCAGGTGCTGGGTGGAGAAAGGATGCCCCCTAGGTCCTGGATGGAGA i rheMac3.chr10 I 2 C 0 s macFas5.chr10 36403062 152 + 96509753 GTCCAGATGAAGAAGAATTTCCCCCACTTCTGAATGGAATCGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCCCAAGTCCAGGGTGGAGAAGGACATCCCTCAGGTGCTGGGTGGAGAAAGGATGCCCCCTAGGTCCTGGATGGAGA i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.JH684867 45309 148 + 80412 ----AGATGAAGAAGAATTTCCCCCACTCATGAATGGAATCGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCTCAAGTCCAGGGTGGAGAAGGACATCCCTCAGGTCCTGGATGGAGAAAGGATGCCCCCTAGGTCCTGGATGGAGA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894359 147 - 90373283 ----AGATGAAGAAGAATTTCCCCCACTCCTGAATGGAATCGGATCCCCTTCAAGTCCTGGGTGGATAAGACACCTCCCAAGTCCAGTGTGGAGAAGGACATCCCTCAGGTCCTGGATGGAGAAAGGATG-CCCCGATGTCCTGGATGGAGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e panTro4.chr18 74579319 0 - 76611499 C e calJac3.chr14 108189121 0 + 108792865 C a score=57620.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97699 37 + 478999 AGGATGTTCCCC--AAGTTCTGCTTGGAGAAGGTGGCTC s panTro4.chr18 74579319 37 - 76611499 AGGATGTTCCCC--AAGTCCTGCTTGGAGAAGGTGGCTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45200720 37 - 121039945 AGGAAGTTCCCC--AAGTCCTGCTTGGAGAAGATGGCTC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464199 39 - 95678458 AAGATGTTCCCCAAAAATCCCGATTGGAGAATATGGCTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36403214 37 + 96509753 AAGATGTTCCCC--AAATCCCGATTGGAGAATATGGCTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45457 37 + 80412 AAGACGTTCCCC--AAGTCCCGCTTGGAGAAGATGGCTC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894506 37 - 90373283 AAGATATTCCCC--AAGTCCCACTTGGAGAAGATGGCTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I e calJac3.chr14 108189121 0 + 108792865 C a score=154561.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97736 78 + 478999 TGGGGACCTCATGGGGAAGGATGCCCC-TTTTCCAGCCTCCCCATCCATACTTATCCTGACTTGTTAGTGTAGAACAAA s panTro4.chr18 74579356 78 - 76611499 TGGGGACCGCATGGGGAAGGATGCCCC-TTTTCCAGCCTCCCCATCCATACTTCTCCTGACCTGTTAATGTGGAACAAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45200757 78 - 121039945 TGGGGACCGCATGGGGAAGGATGCCCC-TTTTGCAGCCTCCCCATCCATACTAATCCTGACCTGTTAATGTAGAACAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464238 78 - 95678458 TGGGGACCACGTGGGCAAGGATACCCC-TTTTTCAGCCTCCCCATTCATACTTATCCTGACCTGTTAATGTAGAACAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36403251 79 + 96509753 TGGGGACCACGTGGGCAAGGATACCCCTTTTTTCAGCCTCCCCATTCATACTTATCCTGACCTGTTAATGTAGAACAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45494 78 + 80412 TGAGGACCACATGGGCAAGGATGCCCC-TTTTTCAGCCTCCCCATTCATACCTATCCTGACCTGTTAATGTAGAACAAA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37894543 78 - 90373283 TGGGGACCACATGCGCAAGGATGTCCC-TTTTTCAGCCTCCCCATTCATACTTATCCTGACCTGTTAATGTAGAACAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189121 69 + 108792865 TTGGGACCTCATGGGGAAGGATG-----GGAAGGAGCCTTCCCATCCATAGTTGTCCTGACCTGTTAATGTAGA----- i calJac3.chr14 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18520163 37155 + 99152023 I a score=1156441.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 97814 440 + 478999 GAGATTTGGAGGAAGAAACACAGGACTAAACTTTAGTCAGAATGTTTTCCTTTTAATCGACATTTTATAAATTCTAATTTTTATTTGATAAAAATAAGTGAAATGTATGACATAAACACAGTGTAACAACCGATTAGACCTATTTTTCC-GATCTGAGTCCTGGCTACCGGCTCTATTAGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGCAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAGTAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATGTGGCTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAAGGTTATGGTGTACTAAAATTACTGGTGGATCTTTATTACAAGCTCACTGGTAAAAATAGTCAATATGGGAATATTCTAATTTGTTAGAAATTAGTGTTGAGTGAGTATTAATCAAAACTTTAAA s panTro4.chr18 74579434 434 - 76611499 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACTAAACTTTACT------GTTTTCCTTTTAATCAACattttataaattctaatttttatttgataaaaataaGTGAAATCTATGACATAAACTCAGTGTAACAACCGATTAGACCTATTTTTCC-AATCTGAGTCCTGGCTACCGGCTCTATTAGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGTAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAGTAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATGTGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAAGGTTATGATGTACTAAAATTACTAGCGGATCTTTATTACAAGCTCACTGGTAAAAATAGACAACGTGGAAATATTCTAATTTGTTAGAAATTGGTGTTGAATGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90204003 425 - 108868599 GAGATTTGGAGGA--GAACACAGGACTAAA-TTTACTCAGAATGTTTTCCTTTTAATTAACATTTTATAAATTCTGATTTTTATTTGATAAAAATAAGTGAAATGTATGACATAAACACAGTGTAACAACCAGTTAGACCTATTTTTCCAAATCTGTGTCCTGGCTACCGGCTCTATTAGTCATTCTGCTTTTATGTATTTGTAAAACTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAGTAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATGTGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTATATGGGCTTC-------------TGGTATACTAAGATTACTAGTGGATCTTTATTACAAGCTCACTGGTAAAAATAGACAATGTGAAAATATTCTAATTTGTTAGAAGTTAGTGTTGAGTGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i ponAbe2.chr14 I 11776 C 0 s nomLeu3.chr6 45200835 440 - 121039945 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACTAAACTTTAATCAGAATGTTTTCCTTTTAATCAACATTTTATAAATTCTAATTTTTATTTGATAAAAATAAGTGAAATGTATGACATAAACACAGTGTAACAACCGATTAGAACTATTTTTCC-AATTTGAGTCCTGGCTACTGGCTCTATTAGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGTAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTAGTGCTAGTAACAGGTATAAATAGCCATTGAATAAAATGTGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAAGGTTACGGTGTACTAAAATTACCAGTGGATCTTTATTACAAGCTCAGTGGTAAAAACAGACAATGTGGAAATATTCTAATTTGTTAGAAATTAGTGTTGAGTGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464316 441 - 95678458 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACTAAACTTTACTCAGAATGTTTTCCTTTTCATCAACATTTTATAGATTCTAATTTTTATTTGATAAAAATAAGTGAAATGTATGACATAAACACAATGTAACAACCGATTAGACCTATTTTTCCAGATCTGAGTCCTGGCTATGGGCACTACTGGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGTAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAATAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATATGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAGGGTTATGGTGTACTAAAATTACTGGTGGATCTTTATTACAAACTCACTAGTAAAAATAGACAATGGGAAAATATACGAATTTGGTATAAATTAGTGTTGCATGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36403330 441 + 96509753 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACTAAACTTTACTCAGAATGTTTTCCTTTTCATCAACATTTTATAAATTCTAATTTTTATTTGATAAAAATAAGTGAAATGTATGATATAAACACAGTATAACAACCGATTAGACCTATTTTTCCAGATCTGAGTCCTGGCTATGGGCACTATTGGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGTAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAATAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATGTGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAGGGTTATGGTGTACTAAAATTACTGGTGGATCTTTATTACAAACTCACTAGTAAAAATAGACAATGGGAAAATATTTGAATTTGTTATAAATTAGTGTTGCGTGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 45572 441 + 80412 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACGAAACTTCACTcagaatgttttccttttcatcaacattttatagattctaatttttatttgaaaaacataagTGAAATGTATGACATAAACACAATGTAACAACTGATTAGACCTATTTTTCTAGATCTGAGTTCTGGCTGTGGGCACTACTGGTCattctacttttctgtatttgtaaAGCTTctcaaaattaaagataaaagagTTTATTGCTAATAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATGTGactctttaaaaattagtttattccATGGGCTTCTTTTGAAGGGTTACGGTGTACTAAAATTACTGGTGGATCTTTATTACAAACTCATTAGTAAAAATTGACAATGAGAAAATATACGAATTTGTTATAAATTAGTGTTGCATGAGtattaatcaaaactttaaa i papAnu2.JH684867 C 0 I 3762 s chlSab2.chr2 37894621 441 - 90373283 GAGATTTGGAGGAAGAAACATGGGACTAAACTTTACTCAGAATGTTTTCCTTTTCATCAACATTTTATAGATTCTAATTTTTATTTGTTAAACATAAGTGAAATGTATGACATAAACACAATGTAACAACCGAGTAGACCTATTTTTCCAGATCTGAGTCCTGGCTGCAGGCACTACTGGTCATTCTACTTTTCTGTATTTGTAAAGCTTCTCAAAATTAAAGATAAAAGAGTTTATTGCTAATAACATGTATAAATAGACATTGAATAAAATATGACTCTTTAAAAATTAGTTTATTCTATGGGCTTCTTTTGAAGGGTTACGGTGTACTAAAATTACTAGTGGATGTTTATTACAAACTCACTAGTAAAAATAGACAATGGGAAAATAAACGAATTTGTTATAAATTAGTGTTGCGTGAGTATTAATCAAAACTTTAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189190 389 + 108792865 ----TTTGGGGAAATAAACATGAGGTTAAACTTTACTTCTAA-----CCCTTTCAGTCAACATTTTATAAATACTAGATTTCATTTTATAAAGATAAATCAAATGTGTAACACAAATAGGGTATAACAACAGATTAAACCTATTTTTCTAAATCTGAGTCCTGGCAATGGGCTCTATTA------------TTCTGTATTTGTAAAACTTTTCAAACTTGAAAATAAGA---------GCT-------------------CATTGAAGAAAACGTGACCGTTCAAAAATTAGTTTATTCTATGGACTCCCTTGGAGGGGTTATGAT---CTACAATTCCTAGTGGATATATATTACGAGCTCAGTGGTGAAAACACACAATAAGAAAATATTCTATTTTGTTAGAAATTAATGTTGAGTGAATACTAATCAAAACTTTAAA i calJac3.chr14 C 0 C 0 a score=669309.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 98254 317 + 478999 ACCAAAATACATGGACATAAGAATAAATTATTCGACTTAATTATCCACTGACTTTAAATTCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGTAACTCTTCATTTTTCTCTCCTGTCAATATTTTATTCTCCCTTATT--TTTTTTTCTATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACTCCAAGGGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTT-GAATGACGTCATTACACCAACCCGTTAGGCAACTAGAACGTCACCAAGGTGAGCACTAGGAGACTTCAGAC----CACGGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG s panTro4.chr18 74579868 313 - 76611499 ACCAAAGTACATGGACATAAGAATAAATTATTCGACTTAATTATCCACTGACTTTAAATTCTAGTTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGTAACTCTTCATTTTTCTCTCCTGTCAATATTTTATTCCCCCTT------TTTTTTCTATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACTCCAAGGGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTT-GAATGACATCATTACACCAACCCGTTAGGCAACTAGACCCTCATCAAGGTGAGCAATAGGAGACTTCAGAC----CACAGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90204428 317 - 108868599 ACCAAAATACAGGGACATAAGAATAAATTATTCGACTTAATTATCCACTGACTTTAAATTCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGTCCATTTCACCTCCTTCACATCTCCAAGTAACTCTTCA-TTTTCTCTCCTGTCAATATTTTATTCTCCTTTATTTATTTTTTTCTATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACT--AATGGAGTCATGTTTTGCTTGTGTTAGAATGACTTCATTACACCAACCCATTAGGCAACTAGACCCTCACCAAGGTGAGCACTAGGAGACTTCAGAC----CACGGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45201275 317 - 121039945 ACCAAAATACACGGACATAAGAATAAATTATTCGACTTAATTATCCACTGACTTTAAATTCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGTAACTCTTCATTTTTTCCTCCTGTCAATATTTTATTCTCCCTTATT--TTTTTTTCTATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACTCCAAGGGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTT-GAATGATGTCATTACACCAACCCGTTAGGCAACTAGACCGTCACCAAGGTGAGCACTAGGAGACTTCAGAC----CACGGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35464757 318 - 95678458 ACCAAAATACATGGACATAAGAATAAATTATTCAACTTAATTATCCACTGACTTTAAAATCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGGAACTCTTCTTTTTTCTCTCCTGTCAGTACTTTATTCTCCCTTATT--TTTTTTTCTATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACTCTAAGGGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTTAGAATGACGTCATTACGCCAACCCATTAGGCAACTAGACCCTCACCAAGGTGAGCACTAGGAAACTTCAGAC----CATGGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG i rheMac3.chr10 C 0 M 12928 s macFas5.chr10 36403771 317 + 96509753 ACCAAAATATATGGACATAAGAATAAATTATTTGACTTAATTATCCATTGACTTTAAAATCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGGAACTCTTC-TTTTTCTCTCCTGTCAGTACTTTATTCTCCCTTATT--TTTTTTTCAATTTCCTGA-TTTTTTGAACAACTCTAAGAGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTTAGAATGACGTCATTACGCCAACCCATTAGGCAACTAGACCCTCACCAAGGTGAGCACTAGGTGACTTCAGAC----CACAGAGCCTCTCCTGATTTTTGACTCAGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37895062 315 - 90373283 ACCAAAATACATGGACATAAGAATAAATTATTCGACTTAATTATCCACTGACTTTAAAATCTAATTGCTAAATTTACTTTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCAAGGAACTCTTCTTTTTTCTCTCCTGTCAGTACTTTATTCTCCCTTA-T--TTTTTTTCTATTTTCTGATTTTTTTTAACAACTCTAAGGGAGTTGTGTTTTGCTTGTGTTAGAATGACGTCATTACACCAACCCATTAGGCAACTAGACCCTCACCAAGGTGAGCACTAGGAGACTTCA-------TATGGAGCCTCTCCTGATTTTTGAGTCAGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189579 319 + 108792865 ACCCAAAT---TGGGCATAAGAATAGATTATTCCATTTAATTCTCTACTGACTTTAAA-TGTAATTGCTAAATTTACCCTTTGCCCATTTCACCTCCTTCAAATCTCCCAGTAATTCTTTGTTTTCCTCTCCTGTCAATATTCTGTTCTCATTTATTTATTTTTTCCTATTTCCTGATTTTTTTGAACAACTCCGAGGGACTCGTGTTTTGTTTGCATTAGGATGAGTTCATTACACAAACCCCTGAAGCAACTACACCCTCACCACAGAGAGCACC-TGAGACTCCAGACGGAGCATGGGGCCTCTCCTGG-CATCGACTCAGG i calJac3.chr14 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 46013 3762 + 80412 I a score=450621.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 98571 297 + 478999 TTACCTGGCAACTGTGTTTAAATTATGAGTTGTTTAATTTTTTTAGATCCCCTATAGATAAAGAAGGATTTTAATAACCATCAATTTAAAATGCACTGGGACACTTCATGACTGACATTTCTTGCAGTTTCTGTGCTGTGGCCTCATGAGTAACTGTCTGTAAGGAACATCATGTTCCTCATTCTGCCCTTGCTCCTTGGGCTCCAAAGGGAAAGACCAGAAATTCTGTGGATATAAAACATGGAAACATTCATTCTTTAAAGGAAAAGGCGGTAAAGCAGAGATGAG------GAAAGGATG s panTro4.chr18 74580181 302 - 76611499 CTACCTGGCAACCGTGTTTAAATTATGAGTTGTTTAATTTTTT-AGATCCCCTATAGATAAAGAAGGATTTTAATAATCATCAATTTAAAATGCACTGGGACACTTTACGACTGACATTTCTTGCAGTTTCTGTGCTGCGGCCTCATGAGTAACTGTCTGTAAGAAACATCCTGTTCCTCATTCTGCCTTTGCCCCTTGGACTCCAAAGGGAAAAGCCAGAAATTCTGTGGATATAAAACATGGAAACATTCATTCTTTAAAGAAAAAGGCAGTAAAGCAGAGACGAGAACAGGGAAAGGATG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90204745 298 - 108868599 CTACCTGGCAACTGTGTTTAAATTATGAATTGTTTAATTTTTT-AGATCCCCTATAGATAAAGAAGGATTTTAATAACCATCAATTTAAAATGCACTTGGACATTTTA----TGACATTTCTTGCAATTTCTGTGCTGCAGCCTCATGAGTAACTGTCTGTAAGGAACATCATGTTCCTCATTCTGCCCTTGCTCCTTGGGCTCCAACGGGAAAAACCAGAAATTCTGTGGATATAAAACATGGAAACATTCATTCTTTAAAGAAAAAGGCTGCAAAGCAGAGACAAGAACAGGGAAAGGATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45201592 296 - 121039945 CTACCTGGCAACTGTGTTTAAATTATGAGTTGTTTAATTTTTT-AGATCCCCTATAGATAAAGAAGGATTTTAATAACCATCAATTTAAAATGCACTGGGACACTTCATGACTGACATTTCTTGCAGTTTCTGTGCTGTGGCCTCATGAGTAACTGTCTGTAAGGAACATCATGTTCCTAATTCTGCCCTTGCTCCTTGGGCTCCAAAGGGAAAAACCAGAAATTCTGTGGATATAAAACCTGGAAGCATTCATTCTTTAAAGAAAAAGGTGGTAAAGCAGAGATGAT------GAAAGGATG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36404088 301 + 96509753 CTACCTGGCAACTGTGTTTAAAGGATGAATTGTTTAATTTTTT-AGATCCCCTAGAGATAAAGAAGGATTTTAATAACCATCAATTTAAAACGCACTGGGACACTTTATGACTGACATTTCTTGCAGTTTCTGTGCTGCGGCCTTATGAGTAACTGTCTGTAAGGTACAGCATGTTCCTCATTCTGGCGTTGCTCCTTGGGCTCCAAAAGGAAAAACCAGAAATTCTGTGGCT-TTAAACACGGAAACATTCATTCTTTAAAGAAAAAGGCTGTAAAGTAGAGATAAGAACAGAGAAAGGATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37895377 301 - 90373283 CTA-CGGGCAACTATGTTTAAATTGTGAACTGTCTAATTTTTT-AGATCCCTTAGAGATAAAGAAGGATTTTAATAACCATCAATTTAAAATGTACTGGGACACTTTATGACTGACATTTCTTGCAGTTTCTGTGCTGCGGCCTTATGAGTAACTGTCTGTAAGGAACGTCATGTTCCTCATTCTGCCATTGCTCCTTGGGCTCCAAAGGGAAAAACAAGAAAATCTGTGGATATAAAACACAGAATCATTCATTCTTTAAAGAAAAAGGCTGTAAATTAGAGACAAGAGCAGAGAAAGGATG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr14 108189898 295 + 108792865 CTACCTGACAAGTG-------AGTACAAATTGTTTAATTTTTT-AGGTCCCTTATGGAAAAAGAAGGATTTTAATAACCATTCATTTAAAATGCACATGGACATTTTATAACTGACATTTCTTGCCCTTTCTGCACTATGGCCTCGTGAGTAACTGCCTCTGAAGAAGGTCATGTTCCTCGGTCTCCTCATGCTCCCCAGGCTCCAAAAGGCAAAGGCAGAAATTGCGTGGATATAAAACACTGAAATGTTCCGTTTCTGAAGGAAAAGGCTATAGAGCAAAGAGAAGAATGGGGACAGAATG i calJac3.chr14 C 0 N 0 e papAnu2.JH684867 46013 3762 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=145408.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 98868 119 + 478999 GTATTGAATACATGCAAATGGATAAAATATGAATGATCATGTTCTCATGTTCAACTCAATTTTTAAAAGTGGATGTATGAGCAGTGCGAGCATTTAGTCAGGGCATGGTGGGCCTGTGG s panTro4.chr18 74580483 119 - 76611499 TTATTCAATACATGCAAATGGATAAAATATGAATGATCATGTTCTCATGTTCAACTCAAGTTTTAAAAGTGGATGTATGAGCAGTGCCAGCATTTAGTCAGACCATGGTGGGCCTGTGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205043 119 - 108868599 TTATTGAATACATGCAAATGGATAAAATATGAATGATTATGTTCTCATGTTCAGCCCAATTTTTAAAAGTGGATGTATGAGCAGTGCGAGCATTTAGTCAGGCCATGGTGAGCCTGTGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45201888 119 - 121039945 GTATTGAATACATGCAAATGGATCAAATATGAATGATCATGTTCTCATGTTCAACTCAATTTTTAAAAGTGGATATATGAGCAGTGCGAGAATTTAGTCAGGCCATGGTGGGCCTGTGG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36404389 119 + 96509753 TTATCAAATACATGCAAATGGACAAAATATGAATGATTATGTTCTCATATTCAACCCAACTTTTAAAAGTGGATGTATGAGCAGTGCCAGCATTTAGTCAGGCCATGGCGAGCCCATGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37895678 119 - 90373283 TTATGGAATACATGCAAATGGACAAAATATGAATGATTATGTTCTCATGTTCAACCCAACTTTTACAAGTGGATGTATGAGCAGTGCCAGCATTTAGTCAGGCCATGGCGAGTCCGTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 46013 3762 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=363696.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 98987 448 + 478999 GCTAGAACAAGAGGCCACACTCAAGGAGAGATGGCACTCACGACGGGGGGCCTCTGCTCCTTTATGACTCCCCTTCCTCAGTGACCCAGAGCACCCTCCTATCACAGCCTGTAGGGGAGAGGAAGGTGTTAGGGCACTTTGAATCACAGCGGAGTGTGTGTCTACATGCTCTCCTCACATGCCACAAATCTGCATCGCTTTACAATATTTCAATAGATTATGAGTAAGGAAGATCGCTGCAGAACCAGTAAAAGCTGCCCTCCCAGACAATGCGCTAAATTGGGTTTTACAAAGTATTGTGAGAGATCTCGGGAGAGGGGGAGCAACCTGCTCATAGA-TTTTGCCAAAATCAACATTTAAACACCTCCGTTAGGCAGAAGAGCAGTGCTACTGGAATTAGTTAGCAGTTCTTTCCTGCTGGACATCTCTCAGCCTCCAGACCCTACAG s panTro4.chr18 74580602 441 - 76611499 GCTAGAACAAGAGGCCACATTCAAGGTCAGATGGCACTCACGACGCGGGGCCTCTGCTCCTTTATGACTCCCCTTCCTCAGTGACCCAGAGCACCCTCCTATCACAACCTGTAGGGAAG-------TGTTAGGGCACTTTGAATCACAGCGGAGTGTGTGTCTACATGCTCTCCTCACATGCCACAAATCTGCATCGCTTTACAATATTTCAATAGATTATGAGTAAGGAAGATCGCTGCAGAACCAGCAAAAGCTGCTCTCACAGACGATGCGCTAAATTGGGTTTTACAAAGTATTGTGAGAGATCTCGGGAGATAGGGAGCAACCTGCTCATAGA-TTTTGCCAAAATCAACATTTAAACACCTCCGTTAGGCAGAAGAGCAGTGCTACTGGAATTAGTTAGCAGCTCTTTCCTGCTGGACATCTCTCAGCCTCCAGACCCTACAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45202007 430 - 121039945 GCTAGAACAAGAGGCCACACTCAAGGTCAGATGGCATTCACGACGCGGGGCCTCTGCTCCTTTATCAGTCCCCTTCTTCAGTGACCCAGAGCACCCTCCTATCACAGCCTGTAGGGGAGAGGAAGGTTTTAGGGCACTTTGAATCACAGTGGAGTGTGTGTCTGCATGCTCTCCTCACATGCCACAAATCTGCATCGCTTTACAATATTTCAATAGATTATGAGTAACGAAGATCGCTGCAGAACCAGTAAAAGCTGCCCTCACAGACAATGCACTAAATTGGGTTTTACAAAGTATTGTGAGAGATCTCGGGAGAGGGAGAGCAACCTGCTCATAGA-TTTTGCCAAAATCAACATTTAAACACCTCTGTTAGGCAGAAGAGCAGCGCTACTGGAA----TTAGCAGCTCTTTCCTGCTGGA--------------CAGACCCTACAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36404508 447 + 96509753 GCTAGAACAAGAGGCCACACTCAAGGTCAGACAGCACTCACGACGCAGGGCCTCTGCTCCTTTATGACTCCCTCTCTTCAGTGACCCGGAGCACCCTCCTATCACAACTTGCAGGGGAGAGGAAGGTGTTAGGGCACTTTGAATGACAGCGGAGCGTGGGTCTACATGCTCTCCTCACATGCCACAAATCCGCATCGCTTTCCAATATTCCAAAGGATTCTGAGTAAGGAACATTGCTGCAGAACCAGTAAAAGCTGCCCTCACAGATGATG--CTAAATTGGGTTTTACAAAGTATTGTGAGAGATCTCGGGAGAGGGGGAGCAACCTGCTCATAGATTTTTTTCATAATCAACATTTAAACACCTCCGTTAGGCAGAAAAGCAGCGCTACCGGAATTAGTTAGCAGCTCTTGCCTGCTGGACATCTCTCGGCCTCCAGACCCTACAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37895797 446 - 90373283 GCTAGAACAAGAGGCCACACTCAAGGTCAGATGGCACTCACGACGCAGGGCCTCTGCTCCTTTATGACTCCCTCTCTTCAGTGACCCAGAGCACCCTCCTATCACAACCTGCAGGGGAGAGGAAGGTGTTAGGGCACGTTGAATGACAGCGGAGCGTGTGTCTACATGCTCTCTTCACATGCCACAAATCCGCATCGCTTTCCAATATTCCAAAAGATTCTGAGTAAGGAACATTGCTGCAGAACCAGTAAAAGCTGCCCTCACAGATGATG--CTAAATTGGGTTTTACAAAGTATTGTGAGAGATCTCGGGAGAGGGGGAGCAACCTGCTCATAGA-TTTTTTCAAAATCAACATTTAAACACCTCCGTTAGGCAGAAAAGCAGCGCTACCGGAATTAGTTAGCAGCTCTTTCCTGCTGGACATCTCTCGGCCTCCAGACCCTACAG i chlSab2.chr2 C 0 I 31 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e papAnu2.JH684867 46013 3762 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=278430.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 99435 546 + 478999 AGAAGAGGCCATGACCTAAAAGCAGTTTAAAAGCTTGAAAAAATAGAAGCTAAGGATTAAGCaaatatcgaaatttagaaaaggagagaagactttatttcttgtagagggttacagcctgcaaggtggccaccccacaggctgggaagaacagcctcctgccgagaccagagatgggcacttccaggaggaggggttggggcaggagctttggggtgaaaaggttggctaaagatacacagtcatcaggagacaggCATAACAACATAAAACCAGTTGTAGGTAACACAGAATGATTCTGATATTGATGTTCAATTCCACACACTAACAGACGTGAGAACCTCATTCACCGCACGTGGAGAAGGCACTGTATCTGCTCCGTGGTGGTCCCGATGACTTGTGTTTATCGTTGCCTGGGTCTGCATTTTCTCTTCTCTAGATTTTGCTTATCCTGCAAAGTTTGTGCTGGGACATCATTTCTAGGATTGAGTTTAAGCTGAGCCTCAGAGTTTTTATTGCAGCTACGGTGGATATGGCTTGGTTCCC s panTro4.chr18 74581043 545 - 76611499 AGAAGAGGCCATGACCTAAAAGCAGTTTAAAATCTTGAAAAA-TAGAAGCTAAGGATTAAGTGAATATCGaaatttggaaaaggagagaagactttatttcttgtagagggttacagcctgcaaggtggccaccccacaggctgggaagaacagcctcctgccgagaccagcgatgggcacttccaggaggaggggttggggcaggagctttggggtgaaagggttggctaaagatacacattcatcaggtgacaggCATAACAACATAAAACCAGCTGTAGGTAACACAGAATGATTCTGATATTGATGTTCAATTCCACACACTAACAGACGTGAGAACCTCATTCACTGCATGTGGAGAAGGCACTGTATCTGCTCTGTGCTGGTCCAGATGACTTATATTTATCATTGCCTGGGTCTGCATTTTCTCTTCTCTAGATTTTGCTTATCCTGCAAAGCTTGTGCTGGAACATCATTTCTAGGATTGAGTTTAAGCTGAGCCTCAGAGGCTTTATTGCAGCTATGGTGGATATGGCTTGGTTCCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45202437 546 - 121039945 AGAAGAGGCCATGACCTAAAAGCAGTTTAAAAGCTTGAAAAAATAGAAGCTAAGGATTCAGCGAATATTGaaatttggaaaaggagagaagactttatttcttgtagagggttacagcctgcaaggtggccaccccacaggctgggaagaacagcctcctgctgagaccagagatgggcacttccaggaggaggggttggggcaggagctttggggtgaaagggttggctaaagatacatgttcatcaggtgacaggCATAACAACATGAAACCAGCTGTAGGTAACACAGAATGATTCTGATATTGATGTTCAATTCCACACACTAACAGACATGAGAACCTCATTCACTGCACGTGGAGAAGGCACTGTATCTGCTCCGCGCTGGTCCAGATGACTTATGTTTATCATTGCCTGGGTCTGCATTTTCTCTTCTCTAGATTTTGCTTATCCTGCAAAGCTTGTGCTGGAACATCATTTCTAGGATTGAGTTTCAGCTGAGCCTCAGAGGTTTCATTGCAGCCACGGTGGATATGGCTTGGTTCCC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36404955 533 + 96509753 AGAAGAGGCCACGACCTAAAAGCAGCTTAAAAGCTTGAAAAAATAGAAGCTAAGGATTCAGCGAATATCGaaatttggaaaaggagagaagactttattccttgtagagggttgcagactgcaaggtggccaccccacgggctgggaagaacagcctcctgccgagaccagagatgggcacttccaggaggaggggttggggcaggagctttggggtg-------------aagatacacattcatcaagtgacaggCATAGCAACATAAAATCAGCTGTAGGTAACACAGAATGATTCTGATATTGATGTTCAATTCCACACACTAACAGATGTGAGAACATCATTCACTGCACCTGGAGAAGGCGCTGTATCTGCTCTGTGCTGGTCCAGATGACTTATGTTTATTGTTGCCTGGGTCTGCATTTTCTCTTCTCTAAATTTTGCTTCTCCTGTAAAGCTTGTGCTGGGACATCATTTCTAGGGTCAAGGTTAAGCTGAGCCTCAGAGGTTTCACTGCAGCTATGGTGGATATGGCTTGGTCCCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 46013 3762 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=1087761.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 99981 1345 + 478999 TGCAGTACTCTCTGGAAAGTACCTTCCTCCATTTGAAATCCCTGACGTGGTACCTCCTACAGCCTGCACAGCTCTGGCCTCT-GCCATGGGTCTCATGGCCTCTTCTGCTAAAACTAGAGAGGAGGTTCATCCCCTGCCTCTTTATAGAGAAGAGCCACTTGCTGACTGAGCTGAAAAGGGACTCCCCACTGAGCAGGCTCACCAGTGTCCCGACAGCCGGGCAGATCATGGGGACGGGGAATTCTGAGCAGACCCTCTTCAGAAGTTGAGTCTCAAGGGGCCTTGGGGAACTTGGTCAGCAGATGGCAAGACTTCATCTGTCAGTGGGCGGGTCAGCTCAGCGGGACTCCTGTCTTTGGAACTGAGACTCAAGTCTCTACTCTGTACCAAGACAGAGATGGAGGCCAGGAAACAAGACACACAACCATTTTCCATCATCGAGGGGCAAGGCAGGGCTTGGCATGAGGCAGAACCGGGCTCCATCAATGCCACATGTCAGGAGGAACCCCTTTTCTGTTTCAATCCCTCCTGCCCATTTGTGGGAGGCATTAGAGAGGCCTGACATAG-TTTTTTTTCTCCACGGCCTGAGGACGTGATAGGATTTCATTCCCGCCCCACCTTGTGGTTGGATGGAATCATGTGCCCAATTCTGGTCAAGATCAAGAAACTGAGGTATCATTTTTGTTTGTGTGGGACCAGGAAAATGGCTCTAATTTGGCTT--------TGTGTTTGTGCATGTGTGTGAGAACGGACAGGTAAATGTGTGTAATGGAGAGTGGGTAGGTGAGTGTGTACGTGTGTGAGAGTGTGTATGTGAGTT---GTGTGAATGTTTGTGAAGAAATGTGTGATAGTGGTGTTTGAACTTGGCAGTATGAGTGTGTATGTGGAATATAACTGTGTGCGGATGTGTAAATATGAGTGCATATGTGTG--TTAATGT--GTGTAAGTGTGTGAATAAGCCATGTGAGTGTGGTGTGTGAGCTTGGGTCCATGAGTGTGTGTG--------CGTGTCTGTGTGAGCATGACAGAGTGTGTGAGTTTGGGGTGTGTGCAGGCCACAGCCAGTCCCTCCTGGGGTACTAGATCTTTCCAACCCAAGCACCTCAAGTCGTTCTCCTTCCTCACTCCATCCTGAGCTTCCCAGCCAACTGCCTCTCATCCAAACTCCCACAGGGAAACAG--TCCCTGGGACTAGGGGCTCTGAGCATGGCACAGTGCCAAGTCTCCTCCCTGGCCACCTCCTGAGAACCTGGGTGTAGCACAAAACAGTCAAATATGTTCCTCTTCTGTCATCACTAACTAGAGCTCCACAGCTTCCCAGATTGCCCTGTTAGCTCTTCACCATAATTAGCTA s panTro4.chr18 74581588 1346 - 76611499 TGCAGTACTCTCTGGAAAGTACCTTCCTCCATTTGAAATCCCTGAAGTGGTACCTCCTACAGCCTGCACAGCTCTGGCCTCT-GTCATGGGTCTCATGGCCTCTGCTGCTAAAACTAGAGAGGAGGTTTATCCCCTGCCTCTTTATAGAGAAGAGCCACTTGCTGACTGAGCTGAAAAGGGACTCCCCACAGAGCAGGCTCACCAGTGTCCCGACAGCTGGGCAGATCATGGGAACGGGGAATTCTGAGCAGACCCTCTTCAGAAATTGAGTCTCAAGGGGCCTTGGGGAACTTGGTCAGCAGATGGCAAGACTTCATCTGTCAGTGGGTGGGTCAGCTTAGTGGGACTCCTGTCTTTGAAACTGAGACTCAAATCTCTACTCTATACCAAGACAGAGATGGGGGCCAGGAAACAAGACACACAACCATTTTCCATCATCGAGGGGCAAGGCAGGGCTTGGCATGAGGCAGAACCGGGCTCCATCAATGCCACATGTCAGGAGGAACCCCTTTTCTGTTTCAATCCCTCCTGCTCATTTGTGGGAGGCATTAGAGAGGCCTGACATAG-TTTTTTTTCTCCACGGCCTGAGGACGTGATAGGATTTCATTCCCGCCCCACCTTGTGGTTGGATGGAATCATGCACCCAGTTCTGGTCAAGACCAAGAAACTGAGGTATCAGTTTTCTTTGTGTGGGACCAGGAAAATGGCTCTAATTTGGCTT--------tgtgtttgtgcatgtgtgtgagaacggacaggtaaatgtgtgtaatggagagtgtgtgggtgagtgtgtacatgtgtgagagtgtgtatgtgagttattgtgtgaatgtttgtgAAGAAAT-------AATGGTGTTTGAACTTGGGAgtatgagtgtgtatgtggaatataactgcgtgtggatgtgtaaatatgagtgtgtatgtgtg--ttaatgt--gtgtaagtgtgtgaataagccatgtaagtgtggtgtgtgagcttgggcctatgagtgtgtgtg--agtgtgtgtgtctgtgtgagcatgacagagtgtgtgagtttgGGGTGGGCGCAGGCCACATCCAGCCCCTCCTGGGGTACTAGATCTTTCCAACCTAAGAACCTCAAGTTGTTCT---TCCTCACTCCACCCTGAGCTTCCCAGCCAACTGCCTCTCATCCAAACTCCCACAGGGAAACAGAGTCCCTGGGACCAGGGGCTCTGAGCATGGCACAGTGCCAAGTCTCCTCCCTTGCCACATCCTGAGAACCTGGGTGTAGCACAAAACAGTCAAATATGTTCCTCTTCTGTCATCACTAACCAGAGCTCCACAACTTCCCAGATCGCCCTGTTAGCTCTTCACCATAATTAGCTA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45202983 1355 - 121039945 TGCAGTACTCTCTGGAAAGTACCTTCCTCCATTTGAAATCCCTGACGTGGTACCTCCTACAGCCTGCACCGCTCTGGCCTCT-GCCATGGATCTCATGGCCTCTGCTGCTAAAACTAGAGAGGAGGTTCATCCCCTGCCTCTTTGTAGAGAAGAGCCACCTGCTGACTGAGCTGAAAAGGGACTGACCACAGAGCAGGCTCACAAGTGTCCTGAGAGCTGGGCAGAGCATGGGGACAGGGAATTCTGAACAGACTCTCTTCAGAAATCGAGTCTCAAGGGGCCTTGGGGAACTTGGTCAGCAGATGGCAAGACTTCATCTGTCAGTGGGCGGGTCAGCTCAGCGGGACTCCTGTCTTTGGAACTGAGACTCAAGTCTCTACTCTGTACCAAGACAGAGATGGAGGCCAGGAAACAAGACACACAACCATTTTCCATCATCGAGGGGCAAGGCAGGGCTTGGAATGAGGCAGAACTGGGCTCCGTCAACGCCACATGCCAGGAGGAACCCCTTTTGTGTTTCAATCCCTCCTGCTCATTTGTGGGAGGCATTAGAGAGGCCTGACATAGTTTTTTTTTCTCCATGGCCTGAGGACGTGATAGGATTTCATTCCCGCCCCACCTTGTGGTTGGATGGAATCATGCGCCCAATTCTGGTCAAGACCAAGAAACTGAGCTATCATTTTTGTTTGTGTGGGACCAGGAAAATGGCTCTAATTTGGCTT--------TGTGTTTGTGCATGTGCGTGAGAACGGACAGGTAAATGTGTGTAATGGAGAGTGGGTAGGTGACTGTGTACATGTGTGAGAGTGTGTATGTGAGTTATTGTGTGAA----TGTGAAGAAATGTGTGATAGTGGTGTTTGAACTTGGGAGTATGAGTGTGTATGTGGAATATAACTGCGTGTGGATGTGTAAATATGAATGCGTATGTGTG--TTAATGT--GTGTAAGTGTGTGAATAAGCCATGTGAGTGTGGTGTGTGAGCTTGGGCCTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTCTGTGTGAGCATGACAGAGTGTGTGAGTTTGGGGTGGGTGCAGGCCACAGCCAGTCCCTCCTGGGGTACTACATCTTTCCAACCCAAGCACCTCAAGTCGTTCTCCTTCCTCACTCCATCCTGAGCTTCCCAGCCAACTGCCTGTCATCCAAACTCCCACAGGGAAACAGAGTCCCTGGGACCAGGGGCTCTGAGCATGACACAGTGCCAAGTCTCCTCCCTGGCCACCTCCTGAGAACCTGGGTGTGGCACAAAACAGTCAAATACGTTCCTCTTCTGTCATCACTAACTAGAGCTCCACAACTTCCCAGATTGCCCTGTTAGCTCTTCACCATAATTAGCTA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36405488 1351 + 96509753 TGCAGTACTCTCTGGAAAGTACCTTCCTCCATTTGAAATCCCTGAAGTGGTACCTCCTACAGCCTGCACAGCTGTGGCCTCTCGCCATGGATCTCATGGCCTCTGCTGCCAAAACTAGACAGGAGGTTCATCCTCTGCTTCTTTGTAGAGAAGAGCCACCTGCTGACTGAGCTGAAAAGGGACTCCCCACAGACCAGGCTCACAAGTGTCCTGACAGCTGGGCAGAGCATGGGGACAGGGAATTCTGGGCAGACCCTCTTCAGAAATTGTGTCTCAAGGGGCCTTGGGGAACTTGGTCAACAGATGGCAAGACTTCATCTGTGGGCTGGCAGGTCAGCTCAGCGGGACTCCTGGCTTTGGAGCCGAGACTCAAGTCTCTACTCTGTACCAAGACAGAGACGGGGGCCGGGAAACAAG--ACACAACCATTTTCCATCATCGAGGGGCAAGGCGGTGCTTGGCATGAGGCAGAACCGGGCTCCGTCAATGCCACACGTCAGGAGGAACCTCTTTTCTGTTTCAACCCCTCCTGCTCATTTGTGGTAGACATTAGAGCGGCCTGACATAG--TGTTGTTCTCCACGATCTGAGGACGTGATAGGATTTCATTCCTGCTCCACCTTGTGGATGGATGGAATCACGCGCCCAGCTCTGGTCAAGACCAAGAAACTGAGGTATCATTTTTGTTTCTGTGGGACCAGGAAAGGGGCTCTAATTTGGCTTGAAgtgtgtgtgtttgtgcatgtgtgtgagagcggacaggtgaatgtgtgcaatggagagtgtgtaggtgagtgtgtacatgtgtgagagtgtgtatgtgagttattgagtgaatgtttgtggagaaatgt---------gtgtttgaacatgggagtatgagggtgtatgtggaatataactgtgtgtgaaagtgtgaatatgagtgtgtgtgtgtgtattagtgcgtgtgtgtgtgtgtgaataagccatgtgagtgtggtgtgtgagcttgaggctatgagtgtgtgtg--------tgcttgtgtgtgAGCATGACAGAATATGTGAGTTTGGGGTGAGTGCAGGCCACAGCCAGTCCCGCCTGGGGCACTAGAACTCTCCAACCCAAGCACCTCAAGTCGTTCTCTTTCCTCACTCCATCCTGAGTTTCTCAGCCCACCACCTTTCCTCTAAACTCCCACAGGGAAACAGAGTCCCCAGGACGAGGGGCTCTGAGCATGGCACACTGCCATGCCTCCTCCCTCGCCGCCTCCTGAGAACCTGGGTGGAGCACAAAACAGTCAAATATATTCGTCTTCTGTCATCACTAACTAGAGCTCCACAAGTTCCCAGATCGTCCCGTTAGCTCTTTGCCATAATTATCTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 49775 1341 + 80412 TGCAGTACTCTCTGGAAAGTACCTTCCTCCATTTGAAAT-CCTGAAGTGGTACCT-CTACAGCCTGCACAGCTCTGGCCTCTCGCCATGGATCTCATGGCCTCTGCTGCTAAAACTAGACAGGAGGTTCATCCCATGCTTCTTTGCAGAGAAGAGCCACCTGCTGACTGAGCTGAAAAGGGACTCCCCACAGACCAGGCTCACAAGTGTCCTGACAGCTGGGCAGAGCATGGGGACAGGGAATTCTGGGCAGACCCTCTTCAGAAATTGTGTCTCAAGGGGCCTTGGGGAACTTGGTCAACAGATGGCAAGACTTTGTCTGTGAGCCGGCGGGCCAGCTCAGAGGGACTCCTGGCTTTGGAGCCAAGACTCAAGTCTCTACTCTGTACCAAGACAGAGACGGGGGCCGGGAAACAAG--ACACAACCATTTTCCATCATCGAGGGGCAAGGCAGTGCTTGGCATGAGGCAGAACCGGGCTCCGTCAATGCCACACGTCAGGAGGaatctcttttctgttttaaccCCTCCTGCTCATTTGTGGTAGACATTAGAGCGGCCTGACATAG--TGTTGTTCTCCACCATCTGAGGACGTGATAGGATTTCATTCCTGCCCCACCTTGTGGATGGATGGAATCACGTGCCCAGCTCTGGTCAAGACCAAGAAACTGAGgtatcatttttgtttctgtgggaCCAGGAAAGAGGCTCTAATTTGGCttgaagtgtgtgtgtttgtgcatgtgtgtgagagcgggtaggtgaatgtgtgtaatggagagtgtgtaggtgagtgtgtacatgtgtgagagtgcgtatgtgagatattgagtgaatgtttgtgGAGAAATGT---------GTGTTTGAACATGGGAGTATGAGGgtgtatgtggaatataactatgtgtgaaagtgtgaatatgagtgtgtgtg------ttagtgc--gtgtgtgtgtgtgaataagccatgtgagtgtggtgtgtgagcttgagcctatgagtgtgtgtg--------tgcttgtgtgtgagCATGACAGAATATGTGAGTTTGGGGTGAGTGCAGGCCACAGCCAGTCCTGCCTGGGGCACTAGAACTCTCCAACCCAAGCACCTCAATTCGTTCTCTTTCCTCACTCCATCCTGAGTTTCTCAGCCCACCACCTTTCCTCTAAACTCCCACAGGGAAACAGAGTCCCCAGGACCAGGGGCTCTGAGCATGGCACACTGCCATGCCTCCTCCCTCGCCGCCTCCTGAGAACCTGGGTGGAGCACAAAACAGTCAAATATGTCCGTCTTCTGTCATCACTAACTAGAGCTCCACAAGTTCCCAGATCGTCCTGTTAGCTCTTTGCCATAATTATCTa i papAnu2.JH684867 I 3762 I 2166 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=290607.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 101326 575 + 478999 TTTTCTGATATCATACTAACATTCCTTAATTATTCCCTCAGAAACAAAGCAAATCCGTGGGATGCAGAGGGTACGCTGATGACTTCTGCTGGGGAGAGAAGCCCAAACACACGTCCTGGGCAGAGCCCAGAGACCTGGAGTGTGGCTGCCAGTGGGCACCCGGCTGAGGGACAAGCAGGTGGGCCTCAGTGGTGGCTGCCAGGTCCCTGGACGCCGGGGGCCACCGGCTTTGCCTCTCCTCTGCCTCGGAAGCACCGGAGGCTTTGGGGATCTGGTGGTCCTCCGGCCCTGAACGTGGACCTGGTGTGACAAAGGGAAGTTTGCCATCTCCATCCTCCTCAAGCTGCCTGTGCACCCCAGTAGCACTCACCCTCTCTGTGCTCCCGTCTGCACCGCATGTCCTGGGGTCCTTCTTTGTGCTGCACCCAGTGACAGGAACCAGTGTCCCGACTGTGACTTACTTCCCCCCTCAGGGACACACAAGGACTTTCACATCGAGGCTACTTTTCACCCCTTCTGCCTCCTGCAGGGACGCTGCATGCAGAG---GCAGGAGGACAGAGGGGCTGGTCTCAGGT s panTro4.chr18 74582934 568 - 76611499 TTTTCTGATGTCATACTAACATTCCTTAATTATTCCCTCAGAAACAAAGCAAATCCGTGGGATGCAGAGGGTACGCAGATGACTTCTGCTCGGGAGAGAAGCCCAAACACACGTCCTAGGCAGAGCCCAGAGACCTGGAGTGTGGCCGCCAGTGGGC-------TGAGGGACAAGCAGATAGGCCTCAGTGGTGGCTGCCAGGTCCCTGGACACCGGTAGCCACTGGCCTTGCCTCTCCTCTGCCTCAGAAGCACCGGAGGCTTTGGGGATCTGGTGGTCCTCCGGCCCTAAACATGCACCTGGCGTGACAAAGGGAAGTTTGCCATCTGCATCCTCCTCAAGCTGCCTGTGCACCCCAGTAGAACCCACCCTCTCTGTGCTCCCTTCTGCACCCCATGTCCTGGGGTCCTTCTTTGTGCTACACCCGATGACAGGAACCAGTGTCCCGACTGTGACTTGCTTCCCCCCTCAGGGACACACAAGCACTTTAATATCGAGGCTACTTTTCACCCCTTCTGCCTCCTGCAGGGACGCTCGATGCAGAG---GCAGGAGGACAGAGGGGCTGGTCTCAGGT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45204338 575 - 121039945 TTTTCTGATATCATACTAACATTCCTTAATTATTCCCTCAGAAACAAAGCAAATCCGTGGGATGCAGAGGGTACGCAGATGACTTCTGCTCGGGAGAGAAGCCCAAACACTCGTCCTAGGCAGAGCCCAGAGACCTAGAATGTGGCCGCCAGTGGGCACCCGGCTGAGGGACAAGCAGGTGGGCCTCAGTGGTGGCCGCCAGGTCCCTGGATGCCGGGGGCCACCGGCCTTGCCTCTCCTCTACCTCGGAAGCACAGGAGGCTTTGGGGATCTGGTGGTCCTCTGGCCCTAAACGTGGACCTGGTGTGACAAAGGGAAGTTTGCCATCTCCATCCTCCTCAAGCTGCCTGTGCACCCCAGTAGCACCCACCCTCTCTGTGCTCCCGTCTGCACCCCATGTCCTGGGGTCCTTCTTTGTGCTGCACCCAATGACAGGAACCAGTGTCCCGACTGTGACTTGCTTCCCCCCTCAGGGACACACAAGCACCTTCACATCGAGGCTACTTTTCACCCCTTCTGCCTCCTGCAGGGACGCTGGATGCAGAG---GCAGGAGGACAGAGGGGCCGGTCTCAGGT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36406839 577 + 96509753 ATTTTTGATATCATACTAAGACTCCATAATTATTCCCTCAGAAACAAAGCAAATCCGTGGGATGCAGAGGGTACGCAGATGACTTCTGCTCGGGAGAGAAGCCCCAACACAAGTCCTAGGCAGAGCCCAGAGACCTGGACTGTGGCCGCCAGTGGGCATCCAGCTGAGGAACAAGCAGGTGGGCCTCAGTGGTGGCTGCCAGGTCCCTGGAtgcctatggccaccggccttgcctctcctctgcctcAGAAGCACTGGGGGCTTTGGGGATTTGGTGGTCCTCCGGCCCTAAACGTGAACCTGGTGTGACAAAATGAAGTTTGCCATCTCCATCCTCCTCAAGCTGCCTGTGCACCCCAGTAGCAGCCACCCTCTCTGTGCTCCCGTCTGCACCCCATGTCCTGGGGTCCTTCTTTGTGCTGTACCTGATGATAGCAATCAGTGTCTCGACTGTGACTTCCTT-TCCCCTCAGGGACACACAAGCACCTTCACATCGAGGCTACTTTTCATCCCTTCTGCCTCCTGCAGGGATGCTGGATGCAGAGCCAGGAGGAGGACAGAGGGGCTGGTCTCAGGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 51116 2166 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=1048914.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 101901 1408 + 478999 GTGGCTTCTCTCATACCTGGCGCAGGTGGCCACTCCCCTTCCCCCCCCCACTCCCCCACC---CCACCTCAGCTCCCGGGTGTGAATGAGAAAGGGGAACCAAGAGATCATCATTACATGGGACATGCCACAAACCCCAAAAAGACCCATTTGGTGAAAAGAAGTAAAACAACCACAAGGCTA-TTTTGGCCTGAGGTGGTCTCATGGCTGAAGCAG-CCGCTGGTCTCTTGCCTGGGCTACTCAAATAGTAACCCGGTGTGTCCTCCCATGTGCATTTTCCTTCGGGTTGAGCAAAAACACTTTGTCATCCTCCCACTCCTCAATAGAGCAGAAGGGAATGAAAGGCAACTACAGGGCCTTACAGAGCTGCTCCGGGGGCCGCGGGAAACTTATCAGCATCCTAGAAAAGACAAAACCAGTGGGTTGCATGTGGCCTCTGACACCTGCCACCCTGACTGCAGGGAGTGGCCTCCCCCACCTTTCACCTTCCCATCATTAGTAAGCAAAGTGACCCCCTACGCCTGGACAAAGCGCTCAAAAGCCCAGGCCCGCGGGTTAGCTCCAGCCGCTCGGCTTGACAGGGGCCAGGGAGGCGGGCCAGCCCCACAGCCAAGTCACAGCTCCAGGGCCTGGTCGCACCTGAGCAGCGCGGCCTCGGGCTGCTGCTGGCGCTGCAGGATCCGCGCCTGACCCTCCAGCCTGCGCAGCAGGCACTCGGCCGGGAAGCACCTCTCCAGCAGGCGGCTCAGCACCACGTTCACGCGCCCGCGCCTGTGGCC---GCGCGGGCCCCAGCTCCACTTAGCGCTCACAGACCGTGAGC-CCGCAGGGCAGCGTCACAGGCTTGTGCAGCAGCCGTGGGCAGCCAAGCAGGTCGCGGGGCGCGCCGGGCGCCAGGGCCGGCCCTCCCTAGCCCTG-------AGCTCGCCGCCAGGCTTCCCCGCCAACAGTGGCCGTTCGCGCAGGCCGGGACACACCAGGCCGCCCGCCAGCTCC---------CCCAGCTCCTCC---------------GGACTCAGCGCCTCCAACCTCCCGGCTACATGGAACGCGCCCAGGGCCACCGGGAGGCGGCCGGCGCGGGCCAGCGCGTCCCCCAGCCTCAGGCACCGGCCGCGGTCGGGCTGCGCCAGCAGGGCCAGCATGGAGCGGAAGAGCCCGGC-GCTTTCTGGTACTTGCTCGCGCGGAAGGCCTCGTCGCCCTCCTCCAGGCGGTGGGCGATTGGCTTCCCGCAGCAGCAGCCCG-ACACTGGGGCGGCGGCGGCGGGACCGGCTCAGTGCTGATTCTCGCGGGGCTGCGACCGTGCGGGCCTGGAGCGAAGGCGCGGAGCAGGGGCGATGAGCTGCTGCTGGGAACTGGCCGGCGGGAGCGCGGCCACAGCCTTCGCCTGCAGAACCAAAAAAACGGTTTTAAAAATCTTTTT s panTro4.chr18 74583502 1392 - 76611499 GTGGCTTCTCTCACACCTGGCGCAGGTGGCCACTCCCCTTC--------ACCCCCCCACC---CCACCTCAGCTCCCGGGTGTGAATGAGAAAGGGGAACCAAGAGATCATCGTTACATGGGACACACCACAAACCCCAAAAAGACCCATTTGGTGAAAAGAAGTAAAACAACCACAAGGCTA-TTTTGGCCTGAGGTGGTCTCACGGCTGAAGCAG-CCGCTGGTCTCCTGTCTGGGCTACTCAAATAGTAACCCGGTGCGTCCTCC-ATGTGCATTTTCCTTCGGGTTGAGCAAAAACACTTTGTCATCCTCCCACTCCTCAATAGAGCAGAAGGGAACGAAAGGCAACTACAGGGCCTTACAGAGCTGCTCCGGGGGCCGCGGGAAACTTATCAGCATCCTGGAAAAGACAAAACCGGTGGGTTGCGTGTGGCCTCTGACACCTGCCACCCTGACTGCAGGGTGTGGCCACCCCCACCTTTCACCTTCCCATCATTAG-------------------CGCCTGGACAAAGCGCTCGAAAGCCCAGGCCCGTGGGTCAGCTCCAGCTGCTCCGCCTGACAGGGGTCAGGGAGGCGGGCCAGCCCCACAGCCAAGTCACAGCTACAGGGCCTGGTCGCACCTGAGCAGCGCGGCCTCGG-CTGCTGCTGGCGCTGCAGGCTCCGCGCCTGACCCTCCAGCCTGAGCAGCGGGCACTTGGCCGGGAAGCACCTCTCCAGCTTGCGGCTCAGCACCACGTTCACGCGCA-GCGCCTGTGGCC---GCTCGG-CCCCGGCTCCACGCAGCGCTTGCAGACCGTGAGC-CCGCAGGGCAGTGTCACCGGCTTGTGCAGCAGCCGCGGGCAGCCGAGCAGGTCGCGGGGCGCGCCGGGCTCCAGGGCCGGCCCTCCCTAGCCTGGCGCCTCAAGCTCGCCGCCCGGCTTCCCCGTGAACAGTGGCCGTTCGCGCAGGCCGGGGCACACCAGGCCGCCCGCCAGCTCTGCCAGCTCTCCCAGCTCCTCC---------------GGCCGCAGCGCCTCGAGCCGCAGGGCGACACAGAACGCGCCCAGGGCCACCGGGAGGCGACCGGCGCGGGCCAGCGCGTTCCCCAGCCTCAGGCACTGACCGCGGTCGGGCTGCGCCAGCCGGGCCAGCGTCGAGCGGAAGAGCCCGGCTGCTTTCTGGTACTCGCTCTGGCGGAAGGCCTCGTCGCCCACCTCCAAGCGCTGGGCGATCGGCTCCCCGCAGTCGCAGCCCGGACACTGGGGCGGCGGCGG---GACCGGCTCAGTGCTGATTCCCGCGGGGCTGCGACCCTGCGGGCCTGGAGCGAAGGCGTGGAGCAGGGGCAATGCGCTGCTGCTGGGAACTGGCCGGCGGGAGCGCGGCCACAGCCTTCGCCTGCAGAACGAAAAAAGCGCTTTTAAAAATCCTTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45204913 1375 - 121039945 GTGGCTTCTCTCACACCTGGCGCAGGTGGCCACTCCCCGTC--CCCCCCACTCTCCC-CG---CCACCTC----------------------AGGGGAACCAAGAGATCATCGCTACATAGGACACGCCACAAATCCC-AAAAGACCCATTTGGTGAAAAGAAGTAAAACAACCACAAGGCTATTTTTGGCCTGAGGTGGTCTCATGGCTGAAGCAGACTGCTGGTCTCTTGCCTGGGCTACTCAA----TAACCAGGCGTGTCCTTCCATGTGCATTTTCCTTCGGGTTGAGCAAAAACACTTTGTCATCCTCCCATTCCTCAATAGAGCAGAAGGGAACGAAAGTCAATTACACGGCCTTACAGAGCTGCTCCGGGGGCCGCGGGAAACTTATCAGCATCCTAGAAAAGACAAAACCAGTGGGTTGCATGTGGCCTCTGACACCTGCCATTCTGACTGCAGAGAGTGGCCTCCCCCACCTTTCACCTTCCCATCAGTAGTAAGCGAAGTGACCCCCTACGCCTGGACAAAGCGCTCGAAAGCCCAGGCCCGCGGGTCAGCTGCAGCCGCTCGGCCTGACAGGGGTCAGGGAGGCGGGCCAGCCCCACAGCCAAGTCACAGCTCCAGGGCCTGGTCGCACCTGAGCAGCGCGGCCTCGGGCTGCTGCTGACTCTGCAGGATCCGCGCCTGACCCTCCAGCCTGCGCAGCGGGCACTCGGCCGGGAAGCAGCTCTCCAGCAGGCGGCTCAGCACCACGTTCCCGCGCC-GCGCCTGTGGCC---GCGAGGGCCCCAGCTCCACGCAGCGCTCGCAGACCGTGAGC-CCGCAGGGCAGTGTCACCGGCTTGTGCAGCAGCCTCGGGCAGCCGAGCAAGTAGCCGGGCGCGCCGGGCGCCAGGGCCGGCCCTCCCTAGCCTTG-------AGTTCGCCGCCCGGCTTCCCCGTGAACAGTGGCCGTCCGCGCAGGCCGGGACACACCAGGCCGCCCGCCAGCTCC---------CCCAGCTCCTCC---------------TGCCGCAGCGCCTCAAGACTCCCGGCGACACGGAACGCGCCCAGGGCCACAGGGAGGCGGCCGGCGTGAGCCAGCGCGTCCCCCAGCCTCAGGCACCGGCCGCGGTCGGGCTGCGCCAGCCAGGCCAGCGTGGAGCGGAAGAGCCCGGCTGCTTTCTGCTACTCGCTCGCGCCGAAGGCCTCGTCGCCCTCCTCCAAGCGCTGGGCTATCGGCTTCCCGCAGCAGCAGCCGGGACACTGGGGCGGCGG------GGCCGGCTCAGTGGTGATCCCCGCGGGGCTGCGACCCTGCGGGCCTGGAGCGAAGGCGCGGAGCAGGGGCGATGAGCTGCTGCTGGGAACTGGCCGGCGGGAGCGCGGCCACAGCCTTCGCCTGCAGAACAAAAAAATCGGTTTTAAAAATCTTTTT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36407416 1408 + 96509753 GCGGCTTCTCTCACACCTGGCACAGGTGGCCACTCA-------CCTCCCCGCCCCGCACCCATCCACCTCAGCTCCCGGGTGTGAATGAGAAAGGAGAACCAAGAGATCATCCTTACGTGGGACACGCCACAAACCCCAAAAAGACCCATTTGGTAAAAAGAAGTAAAACAACCACAAGGCTA-CTTTCGCCTGAGGTGGTCTCATGGCTGGAGCAGACCACGGGTCTTCTGCTTGGGCTAGTCAAATACTAACC-GGTGTGTCCTTCCATGGCAATTTTCCTTCGGGGTGAGCAAAAACACTTTGTCATCCTCCCACCCCTCAATAGAGCAGAAGGGAACCACAGGCAACTACAGGGCCTTACAGAGCTGCTCT-GGGGCCGCGGGAAACTTATCAGCATCCTGGAAAAGACAAAACCAGTGAGTTGCATGTGGCCTCTGACACCTGCCACCCTGACTGCAGGATGTGGCCGCCCACACCTTTCACCTTCCCATCCTTAGCAAGCGAAGTGACCCCCTACGCCTGGACAAAGCGCTGGAAAGCCCGGGCCCACCGGTCAGCTCCAGTCACTCGGCCTGACAGGGGTCAGGGAGGCGGGCCAGCCCCACAGCCAAGTCACAACTCCAGGGCCTGGTCTCACTTGAGCAGTGCGGCCTGGGGCTGCTGCTGG-GCTGCAGGCTCCACGCCTGACTCTCCAGCCTGCACAGCGGGCACTAGGCCAGGAAACACCTCCCCAGCAGGCGGCTCAGCACCACATTCACGCGCC-GCGCCTGTGGTTGGAGGGGGGGGCCCAGTTCCATGCAATGCTTGCAGACCATCAGTCCCGCAGGGCAGCATCACCGGCTTGTGCAGCAGCCTtgggcagcagagccggtggccgggcgcgctgggcgctggggcgggccctgCCTAGCCTGGCGTCTCCAGCTCGCCGCC-GGCTTCCCAGGGAACAGTGGCCGCTGGCTCAGTCCAGGGCGCTCCAGGCCGCCCGCCAGCTCC---------ACCAGCTCCTCC----------------GCCGCAGCGCCTCCAGCCGCACGGCGACAGCAAACGCTCCCAGGGCCACCGGGAGGCGGCCGGCGCGGGCCAGCGCGTCCCCCAGCCTCAGGCACCGGCCGCGGTCGGGCTGCGCCAGCGGGGCCAGCCTGGAGAGGAAGAGCCCGACTGCTATGTGGCACTC-CCCGTGCGGAAGGCCTCGTCGCCCTCCTCCAAGCGCTGGGCTATCGGGTCCCCGCAGTCGCAGCCTGAACACTGGGGCTGCGGCGA---GACCGGCTCAGTGCGGATCCCCGCGGGGCTGTGACCTTGCGGGCCTAGAGCCAAGGCGCGGAGCAGGGGCGATGCGCTGCTGCTGGGAACTGGCCGCCAGGAGAGCAGCCACAGCCTTCGTCTCAAGAACGAAAAAAACGGTTTTAAAAATCTTTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32563376 1422 - 90941950 GCGGCTTCTCTCACACCTGGTGCAGGTGGCCactcaccccccccccccccgccctgCACCCATCCACCTCAGCTCCTGGGTGTGAATGAGAAAGGAGAACCAAGAGATCATCCTTACATGGGACACACCACAAACCCCAAAAAGACCCATTTGgtgaaaagaagtaaaacaaccACAAGGCTA-CTTTCGCCTGAGGTGGTCTCAAGGCTGGAGCAGACCACAGGTCTCCTGCCTGGGCTAGTCAAATACTAACC-GGTGTGTCCTTCCATGGCAATTTTCCTTCGGGGTGAGCAAAAACACTTTGTCATCCTCCCACCCCTCAATAGAGCAGAAGGGAATCAAAGGCAACTACAGGGCCTTACAGAGCTGCTCT-GGGGCCGCGGGAAACTTAACAGCatcctggaaaagacaaaaccagTGGGTTGCATGTGGCCTCTGACACCTGCCACCCTGACTGCAGGATGTGGCCGCCCCCACCTTTCACCTTCCCATCCTTAGCAAGCGAAGTGACCCCCTACGCCTGGACAAAGCGCTGGAAAGCCCGGGCCCACAGGTCAGCTCCAGTCACTCGGCCTGACAGGGGTCAGGGAGGCGGGCCAGCCCCACAGCCAAGTCACAGCT------CCTGGTCTCACTTGAGCAGTGCGGCCTGGGGCTGCTGCTGG-GCTGCAGGCTCCACGCCTGACCCTCCAGCCTGCACAGCGGGCACTAGGCCAGGAAGCACCTCCCCAGCAGGCGGCTCAGCACCAGGTTCACACGCC-GCGCCTGTGGCT---GGGCGGGCCCCAGTTCCAGGCAATGTTTGCAGACCATCAGCACCGCAGGGCAGCATCACCGGCTTGTGCAGCAGCCTTGGGCAGCAGAGCCGGTGGCGGGGCGCGCTGGGCGCTGGGGCGGGTCCTGCCTAGCCAGGCGTCTGCAGCCCGCCGCC-GGCTTCCCAGGGAACAGTGACCGCTGGCTCAGGCCAGGGCGCTCCAGgccgcccgccagctcc---------cccagctcctccggccgcagctcctccggccgcagcgcctccagccgcACGGCGACAGCAAACGCTCCCAGGGCCACCGGGAGGCGGCCGGCGCGGGCCAGTGCGTCTCCCAGCCTCAGGCACCGGCCGCGGTCGGGCTGTGCCAACGGGGCCAGCCTAGAGAGGAAGAGCCCGGCTGCTAGGTGGCACTC-CCCGCGCGGTAGGCCTCGTCGCCCTCCTCCAAGCGCTGGGCTATCGGCTCCCCGCAGTCGCAGCCTGAACACTGGGGCTGCGGCGA---GACCAGCTCAGTGCTGATCCCCGCGGGGCTGTGACTTTGCGGACCTGGAGCCAAGGCGCAGAGCAGGGGCGATGCACTGCTGCTGGGAACTGGCCGGCGGGAGCGCAGCCACAGCCTTGGTCTCAAGAACGaaaaaaacggttttaaaaatcttttt i papAnu2.chr10 n 2166 I 457 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=461879.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 103309 620 + 478999 AACATCCGCAGAACg--------------------------tgaagaattacattggaaattggttagagattgtattggacctatagattgatttgagtatgatggtcattttaacagtattaacacttctaattca-aaaaatgggataaccttgtctttacttgtatctttt-caattgatttttatcaatgttttatagttttcattttagacgtctttattt------------tgccaggcat----tttttttatagctattttcaatggg-----------gattcctttttcagatagtatgctgttgggtatagaaatgcatctgatttttctatgctgattttgtattctaaaactttactgtattcatttactgtttctgttttt-cagta-------tagggtctttt--atacatatgacatgatctatgtcatctgcaaacagggacaatttgactttctttttgtttttcaatttggatgtcttttctttctcttttctaattgctctagctaggacttccagtgctatgttgaagagaagttattaaagtgaacatccttgtcttgttcttgatcttagagacacagttttcaatttttccttattcagtatcatgtt-ggctgtgggttatcacatat------ggtctttattttattgagttatactctttt s panTro4.chr18 74584894 678 - 76611499 AACATCCGCAGAacgatttttaaaaccatttttaacatctctgaagaattacattggaaatttgttagagattgtattggacctatagattgatttgagtatgatggtcattttaacagtattaatacttctaattcataaaaatgggaaaactttccctttatttgtatctttttcaattgatttttatcaatgttttatagttttcattttagacatatttatttggcttagtttattcccaggcat----tttttt-atagctattttaaatgggattggtttcttgattcctttttcagatggtatgctgttgggtatagaaatgcgactgatttttctatgctgattttgtattctaaaactttactgtattcatttactatttctgttttttcagtagagtatttagggtttttt--atacataaga-----tc-atgtcatctgcaaacagggacaatttgactttatttttgtttttcaatttggatgtcttttcttttgctggcctaattgctctggctaggacttccagtactatgttgaagagaagtttttaaagtgaacatccttgtcttgttctagacgttagagacacagttttcaatttttccttattcagtatcatgtt-ggctgtgggttatcatttttttttggagcctttattttttggagctatgttctttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45206288 657 - 121039945 AACATTCGCAGAacgatttttaaaatcttttttaacatctgtgaagaattacattggaaattggttagagattgtattggacctatagattgatttgagtatgatggtcattttaacagtattaacacttctaattca-aaaaatgggataaccttctctttatttgtatctttttcaattgatttttatcaatgttttatagttttcattttagacgtctttatttggcttagtttattgccaggcattttatttttttatagctattttcaatggg-----------gattcctttttcagatagtatgctgttgggtatagaaatgcaactgatttttctatgctgattttgtattctaaaactttactgtattcatttactatttctgttttt-cagta-------tagggtttttt--atacataaaa-----gc-gtgtcatctgcaaacagggacaatttgactttctttttgtttttcaatttggatgtcttttctttctcttttctaattgctctagctaggacttccagtactatgttgaagagaagttattaaagtgaacatctttgtcttgttctagaccttagagacacagttttcaatttttccttattcagtatcatgtt-ggcggtgggttatcatatat------ggcctttattttattgagttatattctttt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36408824 641 + 96509753 AACAT-CGCAGAACGATCTTTAAAATCTATTTTAACCtctgtgaagaattacattggaaatttgttagagattgtattggacctataga-----ttgagtatgatggtcattttaacagtattaatactcctaattcatagaaatgggataactt----tatgtctatgtt-----taattgatttttatgaatgttttatagttttcattttagacatctttcttt-gcttagtttattcccagccat----tttttt-atagctgttttaaatgcgattgttttcttgattcctttttcagatagtttgctgttgggtgtagaaatgcgactgatttttctatgctgattttgttttctaaaac--tactgtattcatttactatttctgttt---------------tagggttttttaaatacataaga-----tc-atgtcatctgcagacagggacaatttggctttctttttgtttttcaatttggatgtcttttctttctcttgcctaattgttctggctaggacttccagtactgtgttgaagagaagttagtaaagtgaacatccgtgtctccttccagatcttagagacacggttttcaacttctctttattcagtatcatgtt-ggttgtgggttatcatatat------ggccttcattttattgagttatgttctttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 53282 643 + 80412 aacAT-CGCAGAACGatctttaaaatctattttaacatCTGTGAAGAATTACATTGGAAATTTGTTAGAGATTGTATTGGACCTATAGA-----TTGAGTATGATggtcattttaacagtattaatacTCCTAATTCATAGAAATGGGATAACTTTCTCTATGTCtatgtt-----taattgatttttatgaatgttttatagttttcattttagacATCTTTCTTT-GCTTAGTTTATTCCCAGCCAt----tttttt-ATAGCTGTTTTAAATGCGATTGTTTTCTTGATtcctttttcagatagtttgctgTTGGGTGTAGAAATGCGACTGATTtttctatgctgattttgttttctaaaac--taCTGTATTCATTTACTGTTtctgttt---------------taggttttttt--atacataaga-----tc-atgtcatctgcagacagggacaatttggctttctttttgtttttcaatttggatgtcttttctttctcttgcctaattgttctggctaggacttccagtactgtgttgaagagAAGTTAGTAAAGTGAACATCCGTGTCTCCTTCCAGATCTTAGAGACACGGTTTTC-ACTTTTCCTTATTCAGTATCATGTTGGGCTGTGGGTTATCATATAT------GACCTTCATTTTATTGAGTTATGTTCTTTT i papAnu2.JH684867 I 2166 I 4770 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=1257006.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 103929 2679 + 478999 tataactgatttgttaagagatcttatgtttacaaaaaacattgaattttgtcaaatgctttttctgtatctatttaaatgattatatgatttttatcttaccttatcgaatgtggtgtatcacatttattgatttatatatcataagccctccttgcctccctggaacaaatacagcctgattatggtgaatcatctttttaatgtgctttcaaattatgattgctagcattgctggttttgaatttttgcatttatgttcatcactgatattggcctgtagtttagtttttcactgttcttgtcgcattttggaataaggtaattctgtcttcatagaatgagtttggaagagtttcctccttttcactttttttggaacagtttgtaaataattagtatatgttcctctttaaatgttttgaagaattcagcagtataagcattggatcctcgatttttattttct-tctccttccctcccttc-cttccttcctccctccctccctccctctgtctctcttttctt---cctctttctttctttctttct----------------ttctttctttcttt----------------------------------------------ttcttcttcttcttaaatatttttggtttagagacatggtctttctttgtcactcaggctggagtacagtggtgcaatcatagctcactgcagcctcaaattcctggtcttaagtgatcctcctgcctcagcctcccaagttgttaggactgcaagtgcacaccactaaacctggataatttttatttttatttttgtaaagactgggtctcactatgttccccaggctaatctggaaattctggcttcaagtaatcctcctgccttggcctcc-aaagtgtgagatgacatgtgtgagacactgtgccag-ccctccagattttcttgtattgagagacaatgcttcaatctctttatttgttattggtctgttcgcattttgtatttcttaattcttcaattttgataggttatatgtgttcagaaacgtatttatttcttctaggttttctaatttattggcatataattttagtactttctcatgattctttgtatttctgtagtaaccattttaatgtcttttttcatctctcattttatttatgtgaatcttctctc-ttttttcttaatctgactaaagatatatcaattgcgtttatcttttcaaaaaataactttttatttcattgatctttcatatttttgtctccattttgtttatttgtgctctggtcttcattatctatattctttt--accaatttggggctaagtttgttcacgtttctataattccttgaaatgcattcttaaattattaatgagagttttctttctttcatatagaaatttatttctacaaacttccctctgaggactttttctgctgtatttcgtaagtttttatatgttctgatttcattttcatttgtcttaagaatttttaaaatgaaacaaaatttattttttaacccattgtttgtttaggggcacgttgtttaattttgtatgtatttgcacaatttctgaagttcttgttgtttatttctagttttattctatattgtcagaaaag--atgtgatataattttgatttttttttgaatttgctaaggctcattttgt-gcctagtatatgatctatcatggaaaatgttccatgcgcagtagagaagactgtgaattatgcaattgttggataacatgttctgtaaatgactgctaagttatt-tggtctagagttcactttaaatatgatgtttctttgttgattttatgtcttgataatctgtttattgctgaaagtagaatgtta----------ctattattttattgcttgctgtttctcctgttagatctattaacatttgttttatatatttaggtccttcaatatagagggcatatatatttacaatt---atattatcttgtgatattgatccctttatcattatataatggctgtatttgtctgtttttataggattttgtttgaagtatatgttatctgatataaatatatctata-ctggctttctttcggtttccatatttataaaatatatttttccatctgatcactttc---------------------------------------aatttatgtgtgtatttacagatgaagtgaatttcctgtagaaagtttatagttaggtcttgtttttaatcagtgtagccattatatgtcttaaatgggataatccatttacatacaagataattattgataggcaaggacttggttctgccatattattacttgttttcatgtttttttt--aatttgtact--------ttgattgattgatt----tctctatcttcctttgtgattaagtgctttactctatcagtgtgtttcggttt----ttttttttttttaatttttagagtatcttttaaaagtttttgctttgtggttaccacaaggcatgcaaagaacattttgtggttacaataagttattttaaagagatagcaacttaattttgattcaaaaagaggggaaaagaaaccactctactctttaactccatcactccctcacattttgcatttttgatgtcttaatttacatctttgtatattgc-tattccttaacaaattattgtaattattattattttatttgtattgttttttaaccttcctactaaggatatataagtgctttacatccaattattaccatattagagcattccaaattt s panTro4.chr18 74585572 2723 - 76611499 tataactaatttgttaagagatcttatgtttacaaaaaacattgaattttgtcaaatactttttctgtatctatttaaatgactat----ttttaatcttcccttatcaaatgtggtgtatcacatttattgattgacatatcataagccctccttgcctccctggaacaaatacaacctgattatggtgaatcatctttttaatgcacttccaaattatgattgctagcattgctggttttgaattgttgcattcatgttcatcagtgatattggcctgtagtttagttttttactgttcttgtctcattttggaataaggtaattgtgtcttcatagaatgagtttggaagagtttcctccttttcactttttttgtaataatttgtaaataattactataagttcctctttaaatgttttgaagaattcagcagtgtaagcatcggatcctgaacttttcttttct-tttcttttcttttcttttctttctttctttctttcttactttctttctttctttcttctt---tctctttctttctttctttct--ctttctttcttttgttctttctttcttt----------------------------------------------ttcttcttcttattaaatatttttggtttagagacagggtcttcctctgtcactcaggctggagtgcagtggtgcaatcatagctcactgcagcctcaaattcctggacttcagtgatcctcctgcctcagcctcccaagttgttaggactgcaagtgcacaccactacacctggctaatttttatttttatttttgtaaagactgggtctcactatgttccccaggctaatctggaacttctggcttcaagtaatcctcttgccgtggcctcc-aaagtgtgagtttacatgtgtgagatactgtgccaggccctccagattttcttgtattgagagacaatgcttcaatctcattatttgttattggtctgtttgcattttgtgtttcttcattcttcaattttgataggttatatgtgttcagaaacttatttatttcttctaggttttctaatttattggcatataattgtagtactttctcatgattctttgtatttctgtagtaaccatttcaatgtcttttttcatctg--attttatttatgtgaatcttctct----ttttcttaatctgactaaatacatatcaattgtgtttatcttttcaaaaaataacttttcatttcattgatctttcatatttttgtctccattttgtttatttgtgctctgttctttattatttgtattcttttttaccaatttggggcttagtttgttcacgtttctatgattccttgaaatacattcttaagttattaatgagagttttctttttttcatatagaaatgtatttctgcaaacttccctctgaggcctttttttgctgtatttcttaagtttttatatgttctgatttcattttcatttgtcttaagaaattttaaaatgaaacaaaatttattttttaacccattgttt----aaggacacattgtttaatttt-tatgtatttgcacaatttctgaagttcttgttgtttatttctagttttattctatattgtcagaaaag--acgtgatataattttgatttttttt-gaatttgctaaggctcattttgt-gcctaatatatgatccatcatggaaaatgttccatgtgcagtagaaaagactgtgaattatgcaattgttggataaaatgttctgtaaatgactgctaagttatt-tggtctagagttcattttaaatatgatgtttctttgttgatcttctgtcttgataatctgtttattgctgaaagtggaatgttaagatttcttactattattttattgcttgctgtttctcctgttagatctattaatgtttgttttatatatttaggggcttcaatatagagggcatatatatttacaatt---atattatcttgtgatattgacccctttatcattatataatggccatatttgtctgtttttataggattttgcttgaagtatatgttatctgatataaatatatctata-tcggctttcttttggtttccatatttatgaaatatatttttccatctgatcactttccatctgatcactttcatatttttccatctgatcactttcaatttatgtgtgtattcacagatgaagtgaatttcctgtagaaagtttatagttaagtc------------agtgtagccattatatgtcttaaatgggataatccatttacatacatgataattattcataggcaaggacttggtcctgccatattattacttgttttcatgtttttttttaaatttatact--------ttgattgattgattgatttcactatcttcctttgtgattaagtgatttactctatcagtgtgtttcggtttc---ttttttttttttaatttttaaagtatctattaaaagtttttgctttgtggttaccacaaggcatgcaaagaacattttatggttacagtaagttattttaaagagatagcaacttaattttgattcaaaaaaaggggaaaagaaaccactctactctttaacttcatcactccctcacattttgcatttttgatgtcttaatttacatctttgtatatttc-tattccttaacaaattattgtaattattatt---ttatttgtattgtattttaaccttcctactaaggatatataagtggtttacatccaattattaccgtattagagcattccaaattt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45206945 2666 - 121039945 tataactaatttgttaagagatcttatgtttacaaaaaacattgaattttgtcaaatgctttttctgtatctatttaaatgattatatgatttttatcttcccttatcgaatgtggtgtatcacatttattgatttatatatcataagccctccttgcctccttggaacaaatacaagctgattatggtgaatcatctttttaatgtgctttcaaattatgattgctagcattgctagttttgaatttttgcatttatgttcatcactgatattggcctgtagtttagtttttcactgttcttgttgcattttggaataaggtaattctgtctttatagaatgcacttgggagagtttcctcctttttacttttttgggaacagtttgtaaataattagtataagttcctctttaaatgttttgaagaattcaccagtataagcattggatcctcaatttttattttct-tctccttccctcccttc-cttctttccttcctccctccctccctccctctctctctctct---ctccttccttccttccttcct--------------------------------------------------------------------------------------tctcaaatatttttggtttacagacagggtctttctctgtcactcaggctggagtacagtggtgcaatcatagctcactgcagcttcaaattcctggtcttaagtgatcctcctgccccagcctcccttgttgttaggactacaagtgcacaccactacacctggataatttttatttttatttttgtaaagattgggtctcactctgttccccaggctaatctggaacttctggcttcaagtaatcctcctgctttggcctcctaaactgtgagtttacatgtgtgagatactgtgccaggccctccagattttcttgtattgagagacagtgcttcaatctcagtatttgttattggtctgtttgcattttgtatttcttaattcttcaattttgataggttatatgtgttcagaaacgtatttatttcttctaggttttctaatttattggcatataattttggtactttctcatgattctttgtatttccgtagtaaccattttaatgtcttttttcatctctgat----tttatgtgaatcttttctc-ttttttcttaatctgactaaagatatatcaattgtgtttatcttttcaaaaaataactttttatttcattgatctttcatatttttgtctccatcttgtttatttgtgctctggtcttcattatctatattctttt--accaatttggggcttagtttgttcacatttctataattccttgaaatacattcttaaattattaatgagagttttctttttttcatatagaaatttatttatacaaacttccctctgaggactttttttgctgtatttcataagtttttctatgttctgatttcattttcatttgtcttaagaatttttaaaatgaaacaaaatttattttttaacccattgtttgtttagggacacgttgtttaatttg-tacgtatttgcacaatttctgaagttc---ttgtttatttctagttttattctatattgtcagaaaag--atgtgatataattttgatttttttttgaatttgctaaggctcattttgt-gcctaatatatgatccatcatggaaaatgttccacgcacagtagacaagactgtgaattatgcaattgttggatgacatgttctgtaaatgactgctaagttatt-tggtctatagttcagtttaaatatgatgtttctttgttgattttctgtcttgataatctgtttattgctgaaagtggaatgttaaggtttcttactattattttattgcttgctgtttctcctgttagatctattaacttttgttttatatatttaggtgctttaatatagagggcatatatatttacaattatcatattatcttgtgatattgacccctttatcattatataatggctgtatttgtctgtttttataggattttgcttgaagtatatgttatctgatataaatatatctata-ctgactttcttttggtttccatatttataaaatatgtttttccatctgatcactttc---------------------------------------aatttatgtgtgtatttacagatgaggtgaatttcctgtagaaagtttatagttaggtcttgtttttaatgagtgtagccattatatgtcttaaatgggataatccatttacatacaagataattattgataggcaaggacttggtcctgccatattattacttattttcatttttttaaa--aatttatact--------ttgattgattggttgatttcactatcttccttggtggttaagtgatttactctattggtgtgtttcggttt----ctttttttttttaatttttagagtatcttttaaaagtttttgctttgtggttaccacaaggcatgcaaagaacatttcatggttacaataagttattttaaagagacagcaacttaattttgattcaaaaaaaggtgaaaataaaccactctactctttaactccatcactccctcacattttacatttttgatgtcttaatttacatctttgtatatcgc-tattccttaacaaattattgtaattattattattttatttgtattgtattttaaccttcctactaaggatatgtaaatggtttacatccaattattgccatattagagcattccaaattt i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36409465 2759 + 96509753 tatgactaatttgttaagagatctcatgtttacaaaaagcattgaatattgtcaaaggcttcttctgtatctatttaaatgattatattatttttatcttcccttatcaaatgtggtgtatcacatttattgactgacatatcataagccctccttgcctccctggaacaaatacaacctgattatagtgaatgatctttttaatgtgctttcaaattatgattgctagcattgctggttttgaatttttgcattcatgttcatcagtgacattggcctgtggtttagtttttcactgttcatgtctcattttggaataaggtaattgtgtcttcatagaatgagtttggaagagtttcctccttttcactttttttggaagagtttgtaaataattagtataagatcctctttaaatgttttgaagaattcagcagtataagcttcgggtcctgaacttttattttttctttcttttcttttcttt-ctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttccttctttcttttttttctttctctccttccttccttccttctttcttcttcttcttattaaatattttt-gtttagagacagggtctttctctgtcactcaggctggagtacagtggtgcagtcatatctcactacagcctcaaattcctggtcttaagtggtcctcctgccccagcctcccaagttgttaagactacaagtgcacaccactacacctggctaatttttatttttatttttgtaaagactgggtctcactatgttccccaggctaatctggaacttctggcttcaagtaatcctcctgccttggcctcc-aaagtgtgagtttacatgtgtcagatactgtgccaagccctcctgattttcttgtattgacaaacaatgcttcaatctcatcgtttgttactggtctgttcgcattttgtatttcttcattcttcaattttgatacgttacatgtgttcaggaaattgtttatttcttctaggttttctaatttattggcatataattgcagtactttctcatgattctttgtatttctgtagtaaccattttagtgtcttttttcatctctgactttatttatgtgactcttctctctttttttcttaatctgactaaagatatatcaattgtgtttatcttttcaaaaaataactttttatttcattgatctttcatatttttgtctccattttgtttatttgtgctctggtcttcattatttatattctttc--accaatttggggcttagtttgttcacgtttctataattccttgaaatacattcttaaattgttaatgagagtgttctgtttttcatgtagaaatttatttctacaaacttccctctgaggacttttt-tgctgtatttcatacgtttttatatgttctgatttcattttcatttgtcttaagaatttttaaaatgaaac--aatttattttttaacccattggttgtttagggaca---tgtttaatttg-tatttatttgcacaatatctgaacttcttgttgtttctttctggttttattctatattgtcagaatagacatgtgatataattttgatttttta--aaattt------gctcattttgtggcctaatatatgacccatcatggaaaacgttccatgcacagttgggaagactgtgagttatgcaattgttggatagaatgttccataaatgactgctaagttattctggtccagagttcagtttcaatatgccgtttctttgttgattttctggcttgataatctgtttattgctgaaagtggaatgttaaggtttcttactattattttcttgcttgctatttctcctgttagatctattaacatttgctttatgtatttaggtgcttcaatatagagtgcatatacagttacaattatcatattatcttgtgatattgacccctttatagttatataatggctatatttgtctgtttttatagatttttgcttgaagtatatgttatctgatataaatatatctatacccagctttctttcggtttccatacttataaaacatatttttccatctgatcactttc---------------------------------------aatttatgtatatatttacaaatgaagtgaattttctgtagaaagtttatagctaggtcttgtttttaatcagtgtagccattatatgtcttaaatgggataatctatttacatacaaggcaattattgatagacaaggacttggtactgccacattattacttgttttcatgtttttcttaaaatttatactttcattgattgattgattgattgatttcactatcttcctttgtggttaag---ttttctctatcagtgtgttttggtttcttgttttatttttttaatttttagagtatctactaaaagtttttgctttgtggttaccgcaaggcatgcaaagaacatcttatgcttacaataagttattttaaagagatagcaacttaattttgattcaaaca-aggggaaaagaaaccactctactcttcaactccatcaatccctcacattttgcatttctgatgtcttaatttacatctttgtatattgcttattccttaacaaattattgtaattgtta-----ttatttgtattgtattttaaccttcctactaaggatatataagtggtttacattcaattattaccatattagtgcattccaaattt i macFas5.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 53925 4770 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=1481122.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 106608 1856 + 478999 gtctgaatcctcacttctacctgtgggtttataccttcagattttttgtgttacatattgctgccattttctttcagtttggagaacaatatttagcgtttcttgtaaggctggtttgattacaatgaattcctttgctttttgtttgtctgagaatgtttcaatctctcctttatttctaaatgatagctatgctggatactttattcatggttgacagtttttttaattcagcacttgaatctattatcctactctctcctggcctgtagtgcttctgctgagaagtctgctgccaggcatattggaattctcttatgtg----ttgtttcccttttcttagtcctttcagggtcttctctttgtgtttgacatttgagagtttaattataaaatgtctttggttgtcttattcagattaaatatgattgggcactttgaccatcctaaacattttaatctttctccaggtttaaaaagttttctgttatttctttgaataaactatctccttttcattcttagttcccctttaacaccaatgatatgtagatttgctcttttgttggtgtcccacaaatctcataaactttctttgtttcttttcattctttt---ttt-cattctactctgaccatgtattttcaaagagcctgtctttgagctcactgtttctttcttctgcttgatcagttcttctgttgatgccttccgttggattttcaatgtgttaattgaactttcctgcttcaggatttacatgtga-tttttcccattattttgatttctttgttgaatttctctggtaaatttctgaattatgtctctgctttctcagtgtt--caggctcttcttaaaacagccattttgaattctttgcctgccggatcattcatctgtatgtctttaagttcagttgctgacaccttgttttgtccatttggagaggcaacttttcctaagctatcattattatatgtagatatacatctctgtctaaacattgatgaattagatatttatttgtgtcttctcagtctgggtttgtttgtGACTACTTTTAAGTGGGCTTATTAGGAAATGTTGAGCGGACTTACCATCGTATTCCATTTTAGCATTAGAGAGAGTCCAAATCCCACGTTAGACATAAGTCTTCCAATGGCTCCACCACTGCTGCAACATTTGCTGGATGGGCCCATGGGTGATCCACAGGGAG--CCCCTGGCTATGGGGGAGAACAAGTCAGGCC-GTCAAGCGTGTAG--TCTGTGTATTATGTTTCACATGGTGGCTGTtgctggccccacctcctcttatgtccttaacatgcctcaggtggttcatcccttttggcactcatggtgccacttgtgggctgatacaggagtgagtctactgtgaaggcactcagtatagtggaaaaaacaaatatcaacctcctgctgacttttttcagtgtaaaaactataagccctatgggagtttctgcagatggtaccataatggcctgagggaggagtatcacagtcacagagtattggttctctcactctgtaagccatggttttacccatcttcacaggccaaaggtgcttcataaccttgttcatgtattgaggttctgttggctcttgtaatggtaatttcacatgtggacagttgttcatattgatgtttctataggggtatgatagctggagaggtctgcaccactgtcttgctCTGCCTCGATCATTATTTTTTTCTAACAAGAATTTGTCTCCTCCTAGTTTTTCTTTTTCTCTTAACCGACCTAGGTATAGCCTTTTAATCCTTCTCCCTCCTCTGCTTCTAATGTCATTGCTTCTTTGTATGCCTATC----ATATCTAC s panTro4.chr18 74588295 1854 - 76611499 gtctgaatcctcacttctatctgtgggtttataccttcagattttttgtgttacatattgctgccatttcctttcagttcgaagaacaatatttagcatttcttgtaaggcttgtttgattacaatgaatttctttgctttttgtatgtctgagaatgtttcaatctctcctttatttctaaatgatagctatgctggatactttattcatggttgacagtttttttaattcagcacttgaatctattatcctactctctcctggcctgtagtgcttctgctgagaagtctgctgccaggcataatggaattctcttatgtg----ttgttttctttttcttagtcctttcagggtcttctctttgtctttgacctttgagagtttaattataatatgtctttggttgtcttattcagattaaatatgattgggcactttgaccatcctaaacattttaatctttctccaggtttaaaaagttttctgttatttctttgaataaactatctctttttcattcttagttccactttaacaccaatgatatgtagatttcctcttttgttggtgtcccacaaatctcataaactttctttgtttcttttaattctttt---ttttcattctactctgaccatgtattttcaaagagcctgtgtttgagcgcaatgtttctttcttctgcttgatcagttcttctgttgatgccttccgttggattttcaatgtgttcattgaactttcctgctccaggatttacatgtga-tttttcccattattttgatttctttgttgaatttctctggtaaatttctgaattgtgtctctgctt-ctcagtgtt--caggctcttcttaagacagccattttgaattatttgcctgccagatcgttcatctgtatgtctttaagttcagttgctgacaccttgttttgtgcatttggagagggaacttttcctaagctatcattattatatgtagatatacatctctgtctacacattgatgaattagatgtttatttgagccttctcagtctgggtttgcttgtGACTACTTTTAAGTGGGCCTATTAAGAAATTTTGAGTGGACTTATCATCGTATTCCAGTTTAACGTTAGAGAGAGCCCAAATCCCATGTTAGACATAAGTCTTCCAATGGCTCCAC---TGATGCAACATTTGCTGGCTGGGCCCATGGGTGATCCACAGGGAG--CCCCTGGCTATGGGGGAGAACAAGTCAGGCC-GTCAAGCCTGTAGAGTCTGTGTGTTATGTTTCACATGATGGCTGTtgctggccccacctcctcttatgtcattaacatgcctcaggtggttcatcccttttggcactcatggtgccacttgtgggctgatacaggagtgaggctactgtgaaagaactcaatatagtggaaaaaacaaatatcaaactcctgctcactttcttcagtgtaaaaactataagccctgtgggagtttctgcagatggtaccataacggcctgagggaagagtatcacagtcacagagtattggttctctcactgCATAAGCCATGGTTTTACCCATCTTCACAGGCTAAAGGTGCTTCATAACCTTGTTCATGTATTGAggttctgttggctcttgtaatggtaatttcacatgtggactgttgttcatattgatgtttctataggggtacgatagctggagaggtctgcaccactgtcttgctCTGCCTCAATCATT-TTTTTTTCTAACAAGAATTTGTCTTCTCCTAGATTTTCTTTTTCTCTTAACTGACCTAGGTTTAGCCTTGTAATCCTTCTCCCTCCTCTGCTTCTAATGTCATTGTTTCTTTGTATGCCTATC----ATATCTAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45209611 1853 - 121039945 gtctgaatcctcacttctatctgtggatttataccttcagattttttgtgttacatattgctgccatttcctttcatttagaagatcaatatttagcatttcttgtaaggctggtttgattacaatgaattcctttacgttttgtttgtctgagaatgtttcaatctctcctttatttctaaatgatagctatgctggatactttattcatggctgacagtttttttaattcagcacttgaatctattatcctactctctcctggcctgtagtgtttctgctgagaagtctgctgccaggcatattggaattctcttatgtg----ttgtttcctttttcttagtcctttcagggtcttctctttgtctttgacctttgagagtttaattataatatgtctttggttgtcttattcagatgaaatatgactgggcactttgaccatcctaaacattttaatctttctccaggtttaaaaagttttctgttatttctttgaatgaaccatctctttttcattcttagttcccctttaacaccaatgatatatagatttgctcttttgttggtgtcccacaaatctcataaactttctttgtttctttt----------------cattctactctgaccatgtattttcaaagggcctgtctttgagctcactgtttctttcttctgcttgatcagttcttctgttgatgccttccgttggattttcaatgtgttcattgaactttgctgctccaggatttacatgtgattttttcccattattttgatttctttgttgaatgtctctggtaaatttctgaactgtgtatctgctttctcagtgtt--caggctcttcttaaaacagctattttgaattctttgcctgcgagatcattcatctgtatgtctttaagttcagttgctgacaccttgttttgtccatttggagaggcaacttttcctaagctatcatgattatatgtagatatacatgtctgtctacacattgatgaattagatatttatttgagtcttcttagtctgggtttgtttgtgactacttttaagtgggcttattaagaaattttGAGTGGACTTATCATTGTATTCCATTTTAGCATTAGAGAGAGCCCAAATCCCACGTTAGATGTAAGTCTTCCAATGGCTCCACCACTGATGCAACATTTGCTGGATGGGCCCATGGGTGATCCACAGGGAGGCCCCCTGGCTATGGGGGAGAACAAGTAAAGCC-ATCAAGCCTGTAGAGTCTGTATATTATGTTTCACATGGTGGCTGTtgctggccccacctcctcgtatgtccttaacatgcctcaggtagttcaaaccttttggcactcatggtgccacttgtgggctgatacaggagttagtctactgtgaaggcactcagtatagtggaaaaaacaaatatcaaactcctgctcacttttttcagtgtgaaaactataagccctgtgggagtttctgcagatggtaccataatggcctgagggaggagtatcacagtcacagagtattggttctctcactgCATAAGCCATGGTTTTACCCATCTTCACAGTCCAAAGGTGCTTCATAACCTTGTTCATGTATTGAggttctgttggctcttataatggtaatttcacatgtggacagttgttcatattgatgtttctataggggtatgatagctggagaggtctgtgccactgtcttgctCTGCCTCGATCATTTTTTTTTTCTAACAAGAATTTGTCTTCTCCTAGTTTTTCTTTTTCTCTTAACTGACCTAGGTTTAGCCTTTTAATCCTTCTCCCTCTTCTGCTTCTAATGTCATTGTTTCTTTGTATGCCTATCATATATATCTAC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36412224 1842 + 96509753 gtctgaatcctcacttctacctgtggatttataccttcagatattttatgttacatattgctgccgttttctttcagtttgaagaacaatatttagcatttcttgtaaggctggtttgagtacaatgaattcattcactttttgtttgtctgagaatgtttcaatctctcctttatttctaaatgatagctatgctggatactgtattcatggttgacag-attttttattcagcactcgaatctattatcctactctctcctggcctgtagtgtttctgctgataagtctgctgccaggcatatgggaattctcttatgtgttatttgtttcccttttcttagtcctttcagggtcttctctttgtcttttacctttgagagtttaattgtaatatgtccttggttgccttattcagattaaatacgattggtgactttgaccatcctaaacattttaatctttcaccaggtttaaaaagttttctgttatctatttgaataaactatcactttttcattcttagttcccctttaatgtcaatgatatgtagatttgctcttttgttgttgtcccccaaatctcataaactttctttgtttcttctcattctcttttattttcattctactctgaatatgtattttcaaagagcctgtctttgagctcactg----tttcttctgcttgatcagttctactattaatgccttccattggattttcaatgtgttcaatgaactttccagctccatgatttccatttgattttttcccattattttgatttatttgttgaatttctctggtagatttctgaattgtgtttctactttctcagtgttcacaggttcttcttaaaacagccattttgaattctttgcctgccagatcattcatctgtatgtctttaaggtcggttgctggcaccttgctttttccatttggtgaggcaac-tttcctaagctattattaatatttttagatatacatctccgtctacacattgatgaattaga----tatttgagtcttctcagtttgggtttctttgtgactacttttcagtggacttattaagaaattttgagtggacTCACAATTGTATTCCATTGCAGCATTAGAGATAGCCCAGATCCCGCATTAGACGTAAGTCTTGCGATGGCTGCACCACTGATGCACCATTTGCTGAATGGGCCCACGGGTGATCCACAGAGT---CCCCTGGCTATGGGGT-GAACACGTAAGGCC-ATCAAGCCTGTAGAGTCTGTGTGT--TGTTTCACATGA-GGCTGTTGCTAGCCTCACCTCCTCTTATGTCCTTAGCAT-CCTCACATGGTTCATCCCTTTTGGCCCTCATGATGCCACTTGTGGGCTGATACAGGAGTGAGTCTACTGTGAAGGCACTCAGTATAGTGAAAAAACCAAATATCAACCTCTTGCTGACTTTTTTCAATGT-AAAACTATAAGCCCTGTGGGAGTTTCTGCAGATGGTACCATAATGGCCTGAGGGAGGAGTATCACAGTCACAGAG--TTGGTTCGCTCACTGTCTAAGCCATGGTTTTACTCATCTTCACAGTCCAAACATGCTTCATAACCTTGTTCATGCATTGAGGTTCTgt----tctcgtaatggtaatttcacatgtagacagttgctcatattgatgtttctataggggtgtgatagcaggagaggtctgcaccactgtcttgctCGGCCTCGATCA---TTTTTTTCTAACAAGAATTTGTCTCCTCCTCATTTTTCTTTTTCTCTTAACCGACC-AAGTTTAATCTTTTAATCCTTCTCCCTCCTCTGCTTCTAATGTCATTGTTTCTTTGTACACCTATC----ATatctac i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.JH684867 58695 1845 + 80412 gcctgaatccTCACTTCTACCTGTGGGTTTATACCTTCAgatattttatgttacatattgCTGCCgttttctttcagtttgaagaacaatatttagcatttcttgtaaggctggtTTGATTACAATGAATTCATTcactttttgtttgtctgagaatgtTTCAATCTCTCCTTTATTTCTAAATGATAGCTATGCTGGATACTGTATTCatggttgacagttttttttattCAGCACTTGAATCTATTATcctactctctcctggcctgtagtGTTTCTGCTGATAAGTCTGCTGCCAGGCATATGGGAATTCTCTTATGTGttatttgtttcccttttcttagTCCTTTCAGggtcttctctttgtcttttaccTTTGAGAGTTTAATTGTAATATGTCCTTGGTTGCCTTATTCAGATTAAATACGATTGGTGACTTTGACCATCCTAAACATTTTAATCTTTCACCAGGtttaaaaagttttctgttaTCTATTTGAATAAACTATCACTTTTTCATTCTTAGTTCCCCTTTAATGTCAATGATATGTAGATTTGCTCTTTTGTTGTTGTCCCACAAATCTCATaaactttctttgtttcttctcattctcttttattttcattctactctgactatgtattttcaaagagcctgtctttgagctcactg----tttcttctgcttgatcagttctacTATTAATGCCTTCCATTGGATTTTCAATGTGTTCAATGAACTTTCCAGCTCCAtgatttccatttgattttttcccattattttgatttatttgttgaatttctctgatagatttctgaattgtatttctACTTTCTCAGTGTTCACAGGTTCTTCTTAAAACAGCCATTTTGAATTCTTTGCCTGCCAGATCATTCATCTGTATGTCTTTAAGGTCAGTTGCTGGCACCTTGCTTTTTCCATTTGGTGAGGCAAC-TTTCCTaagctattattaatatttttagatatacATCTCTGTCTACACATTGATGAATTAGA----TATTTGAGTCTTCTCAGTCTGGGTTTCTTTGTGACTACTTTTCAGTGGACTTATTAAGAAATTTTGAGTGGACTCACAATTGTATTCCATTGTAGCATTAGAGATAGCCCAGATCCCGCATTAGACGTAAGTCTTGCGATGGCTCCACCACTGATGCACCATTTGCTGAATGGGCCCACGGGTGATCCACAGAGT---CCCCTGGCTATGGGGT-GAACACGTAAGGCCGATCAAGCCTGTAGAGTCTGTGTGT--TGTTTCACATGA-GGCTGTTGCTAGCCTCACCTCCTCTTATGTCCTTAGCAT-CCTCACATGGTTCATCCCTTTTGGCACTCATGATGCCACTTGTGGGCTGATACAGGAGTGAGTCTACTGTGAAGGCACTCAGTatagtgaaaaaaacaaatatcaaccTCTTGCTGACTTTTTTCAATGT-AAAACTATAAGCCCTGTGGGAGTTTCTGCAGATGGTACCATAATGGCCTGAGGGAGGAGTATCACAGTCACAGAG--TTGGTTCGCTCACTGTCTAAGCCATGGTTTTACTCATCTTCACAGTCCAAACGTGCTTCAAAACCTTGTTCATGCATTGAGGTTCTGT----TCTTGTAATGGTAATTTCACATGTAGACAGTTGCTCATATTGATGTTTCTATAGGGATGTGATAGCAGGAGAGGTCTGCACCACTGTCTTGCTCGGCCTcgatca---tttttttctaacaagaATTTGTCTCCTCctcgtttttctttttctcttaactgACCTAGGTTTAATCTTTTAATCATTCTCCCTCCTCTGCTTCTAATGTCATTGTTTCTTTGTACACCTATC----ATATCTAC i papAnu2.JH684867 I 4770 I 2734 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=1098799.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 108464 1353 + 478999 ATgctacatgaccttcagctggttatgtataatatataagacttaatatcctataaaatagaggtaataatagcatctacttgataggaaagttaagaatattaaatgaCACCATTGATGTTAAATGGAGGTAACTTTCTGAAATGTATTAATGAGACATGATTCTTTGTTCTAGTC--CACTTCATAGACTAGACTACTTTGTTTGAGTTTTCTCTTTTCAGTCAGAGAAAGCAATAAAATTGTAATAGTAAAAATTAAATAAAATTTAACTTAAAATTGTGTTCTGGTCTTCTCATTGTTCAGCCGTGGAAAGCAATAAAATTGTGATAGCAGAAATTAAAAGTGAGCAGAGACTTATTTAAAAATTGGTATTCTCCTTTTCAATGCCAAAATAAGAACTAGAAACTTTTAATAAGGCAACAGTCTGAAGAAACAATTTATTGAAGAGAATATGGGTTTCTAAATCCTAACAAGTTTTTTTACGTATGTGAGTCAAGTTTGGCTGCCTTGAATCCTATTATGACTTTAATGGAAGTTCTAGTTAGGGTGGAAAGtgtcaaagaaaacagttgcaccagacaaagttaaacacataaaaaagctgttattgaagactattgcaaaagggcaaagaggccagaacttagtctgaactcagctccactgaaacaaacagcagtagagattttaagagccaggatgagggggagatcatagaccacttgtctttgatagttgtctttttccaaaggaatattaaactatctt-ttatctttatgacagaaggtgattttacaaattagaggaatatgcccaccaaaatttggctcttactctctcatggagtctgggagataatggtgttatcttttttgagaattacatttcaaagggatggctctgaggtccttgaaatggacatttctgaagtgtaaaactggcacgtgggctcttagaaagatttat----caaagaggcagagaaagaatttacaatgataacatttctaaaatatgctaaa-----gaaaaaaagaggtgaggagccaagaatcagaaataatcctgtctaaaattttatcaaactgaggggaTGGCTTTAGTCAAAGGTTTAGTGTAAGGGGAATTTCTATGAAGAAGAGGAAGAGAAGAGCTTTTAACTACACAGGAAGAAGAAAGTTCCCAGGAGAT-------------GTGACTATGGCTCTGCCTGTGTCTCTGATCAGGTATTCAGCCCCAACATCCTCCTGGGACTCGCTCAAACAGATGGATAGGAAAAAATAGACAGTTAAAGAAAGATGAGAAAATATGCAGGCTGGTGTCTTACttctctagtgcacatagggtgtcccaggaatgacagag s panTro4.chr18 74590149 1353 - 76611499 ATgctacatgaccttcagctggttatgtataatatataagacttaatatcctataaaatagaggtaataatagcatctacttgataggaaagttaagaatattaagtgacaccattgatgttaaatgGAGGTAACTTTCTGAAATGTATTAATAAGACATTATTCTTTGTTCTAGTCTTCACTTTATACACTAGACTACTTTATTCGAGTTTTCTTCTTTCAGTCAGAGAAAGCaataaaattgtaatagtaaaaattaaataaaatttaatttaaaattGTGTTCTGGTCTTCTCGTTGTTCAGCCATGGAAAGCAATAAAATTGTTATAGCAGAAATTAAAAGTGAGCAGAGACTTATTTAAAAATTGGTGTTCTCCTTTTCAATGCCAAAATAAGAACTAGAAACTTTTAATAAGGCAATGGTCTGAAGAAACAATTTATTGAAGAGAATATGTGTTTCTACATCCTAAGAAGTTTTTTTACGTATGTGAGTCGAGTTTGGCTGCCTTGAATCCTACTATGACTTTAATGGAAGTTCTAGTTAGGGTGGAAAGtgtcaaagaaaacaattgcaccagacaaagttaaacacattaaaaagctgttattgaaggctattgcaaaaggacaaagaggccagaacttagtctgaactcagctctactgaaacaaacagcagtagagattttaagagctgggatgagggggtgatcataggccacttgtttttgacagttgtctttttccaaaggaatattaaactatctt---atctttatgacagaaggtaattttacaaatcagagcaatatgcccaccataatttggctcttactctcttatggagtctgggagataatggtgttatcgttcttgaggattacatttcaaagggatggctctgaggtccttgaaatggacatttctgaagtgtaaaactggcaaatgggctcttaaaaagatttatatatcaaagaggcagagaaagaatttacaatgataacatttctaaaatatgctaat---------aaaagaggtcaggagccaagaatcagaaataatcctgtctaaaattttatcaagctgaggggaTGGTTTTAGTCAAAGGTTTAGTGTAAGGGGAATTTCTATGAACAAGAGGAAGAGAAGAGCTTTTCATTACACAGGAAGAAGAAAGTTCCCAGGAGAT-------------GTGACTATGGCTCTGCCTGTGTCTCTGATCAGGTATTCAGCCCCAACATCTTCCTGGGACTCACTCATACAGATAGATAGGAAAAAATAGACAGTTAAAGAAAGATGAGAAAATATGCAGGCTGGTGTCTTACTTCTCTAGTGCACATAGGGTGTCCCAGGAATGACAGAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45211464 1351 - 121039945 ATgctacatgaccttcagctggttatgtatagtatataagacttaatatcctataaaatagaggtaataatagcatctacttgataggaaagttaagaatattaaatgaCACCATTGATGTTAAATGGAGGTAACTTTCTGAAATGTATTAATGAGACATGATTCTTTGTTCTAGTCTTCACTTTAGAGACTAGACTACTTT----GAGTTTTCTCTTTTCAGTCAGAGAAAGCAATAAAATTGTAATAGTAAAAATTAAATAAAATTTAACTTAAAATTGTGTTCTGGTCTTCTCATTGTTCAGCCATGGAAAGCAATAAAATTGTGATAGCAGAAATTAAAAGTGAGCAGAGAC--ATTTAAAAATTGGTATTCTCCTTTTCAATGCCAAAATAAGAACTAGAAACTTTTAATAAGGCAATAGTCTGAAGAAACAATTTATTGAAGAGAATATGGGTTTCTTAATCCTAACGACTTTTTTTATGTATGTGAGTCAAGTCTGGCTGCCTTGAATCTTACTATGACTTTAATGGAAGTTCTAGTTAGGGTGGAAAGTGTCCaagaaaacaattgcaccagacaaagttaaacacataaaaaagctgtcattgaaggctattgcaaaagggcaaagaggccagaacttagtctgaactcagctccactgaaacaaatagcagtagagagtttaagagctgggatgagggggagatcatagaccacttgtctttgctagttgtctttttccaaaggaatattaaactatctc-ttatctttatgacagaaggtaattttacaaattagagcaatatgctcaccaaaatttggctcttactctctcatggagtctgggagataatggtgttatctttcttgaggattacatttcaaagagatggctctgaagtccttgaaatggatgtttctgaagtgtaaaactggtaagtgggcttttaaaaagatttatatatcaaagaggcagagaaagaatttacaatgacaacatttctaaaatatgctaaa-------aaacaagaggccaggaaccaagaatcagaaataatcctgtctaaaattttatcaagctgaggggaTGGTTTTAGTCAAAGGTTTAGTGTAAGGGGAATTTCTATGAACAAGAGGAAGAGAAGGGCTTTTAACTACACAGGAAGAAGAAAGTTCCCAGGAGAT-------------GTGACTACGGCTCTGCCTGTGTCTCTGATCAGGTATTCAGCCCCAACATCCTCCTGGGACTCGCTCAAACAGATAGATAAGAAAAAATAGACAGTTAAAGAAAGATCAGAAAATATGCAGGCTGGTGTCTTACTTCTCTAGTGCACATAGGGTGTCCCAGGAATGAGAGAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36414067 1359 + 96509753 atgctacatgaccttcagttgattagatatgatatataagacttaatgtcctataaaatagaggtaataatagtgtctagttgataggaaggttaagaatattaaatgaCACCATTGATGTTAAATGGAAGTAACTTTCTGAAATGTATTAA--------GATTCTTTGTTCTAGTCT---CTTTATAGACTAGACTGCTTTGTTCGAGTTTTCTCTTTTCAGTCACAGAAAGCAAAACCATTGTAATAGTAAAAATTAAATAAAATTTAATTTAAAATTGTGTTCTACTCTTCTCCTTGTTCAGCCATGGAAAGCAATAAAATTGTGATAGCAGAAATTAAAAGTGAGCAGAGACTTATTTAAAAATTGGCATTCTCCTTTTCAATGCCAAAATAAGACCTAGACAGTTTGAATAAGGCAATAGTCTCAAGAAACAATTTATTGAAGAGAATGTGGGTTTCTAAATCCTAAAGAGATTTTTTACGTATGTGAGTCAAGTTTGGCTGCCTTGAATCCTACTATGACTTTAATGGAAGTTCTAGTTAGCGTGGAAATTGTCAaagaaaaaaattgcaccagacaaagttaaacacataaaaaagctattattgaaggttattgcaaaagggtaaagaggccagtacttagtctgaactcagctccactgaaacaaacagcagtagggattttaagagttgggatgagGGGGAGATCATAgaccacctttctttgctagttgtctttttccaaaggaatgctaaactatctttttatctttatgacagaaggtaattttacaaattagatcaatatgcccaccaaaattttgctcttactctctcatggagtctgggagataatggtgttatctttcttgagaagtatatttcaaagggatggcactgaggttcttgaaatggacatttctgaagtgtaaaactggcaagtgagctcttacaaagatgtctatgtcaaagaggcagagaaagaatttacaatgataacatttctagaatattagaaagaaaagaaaagaaaagaaaaggagcctagaatcagaaataatcctgtctaaaattttatcaagctgaagggattgttTTAGTCAAAGGTTTAATGTAAGGGGAATTTCTATGAACAAGAGGAAGAGAAGAGCTTTGAACTACACAGGAAGGAGAAAGTTCCCAGGAGATGTGAACTTTCTCAGTGACTATGGCTCTGCCTGTGTCTCTGATCAGGTATTCAGCCCCAGCATCCTCCTGGGACTCGCTCAAAGAGATAGATAAGAAAAAATAGAC----CAAGAAAGATGAGAAAATATGCAGGCTGGTGT----CTTCTCTAGTGCACATAGGGTGGCCCAGGAATGACAGAG i macFas5.chr10 I 1 I 4 s papAnu2.JH684867 63274 1365 + 80412 ATGCTACATGACCTTCAGTTGATTAGATATGATATATAAGACTTAATGTCCTATAAAATAGAGGTAATAATAGTGTCTAGTTGATAGGAAGGTTAAGACTATTAAATGACACCATTGATGTTAAATGGAAGTAACTTTCTGAAATGTATTAATGAGATGTGATTCTTTGTTCTAGTCT---CTTTATAGACTAGACTGCTTTGTTCGAGTTTTCTCTTTTCAgtcacagaaagcaaaaccattgtaatagtaaaaattaaataaaatttaatttaaaattgtgttcTACTCTTCTCCTTGTTCAGCCATGGAAAGTAATAAAATTGTGATAGCAGAAATTAAAAGTGAGCAGagacttatttaaaaattggcattCTCCTTTTCAATGCCAAAATAAGACCTAGACAGTTTTAATAAGGCAATGGTCTCAAGAagcaatttattgaagagaatgtGGGTTTCTAAATCCTAAAGAGATTTTTTACGTATGTGAGTCAAGTTTGGCTGCCTTGAATCCTACTATGACTTTAATGGAAGTTCTAGTTAGGGTGGAAATTGTCAA--GAAAAAATTGCACCAGACAAAGTTAAACACATAAAAAAGCTATTATTGAAGGTTATCGCAAAAGGGTAAAGAGGCCAGTACTTAGTCTGAACTCAGCTCCACTGAAACAAACAGCAGTAGAGATTTTAAGAGTTGGGATGAGGGGGAGATCATAGACCACCTTTCTTTGCTAGTTGTCTTTTTCCAAAGGAATGCTAAactatctttttatctttatgaCAGAAGGTAATTTTACAAATTAGATCAATATGCCCACCAAAATTTTGCTCTTACTCTCTCATGGAGTCTGGGAGATAATGGTGTTATCTTTCTTGAGAATTATATTTCAAAGGGATGGCACTGAGGTTCTTGAAATGGACATTTCTGAAGTGTAAAACTGGCAAGTGAGCTCTTACAAAGATGTCTATgtcaaagaggcagagaaagaatttacaatgataacatttctagaatattagaaaaaaaagaaaagaaaggaaaaggagccTAGAATCAGAAATAATCCTGTCTAAAATTTTATCAAGCTGAAGGGATTGTTTTAGTCAAAGGTTTAATGTAAGGGGAATTTCTATGAACAAGAGGAAGAGCAGAGCTTTGAACTACACAGGAAGGAGAAAGTTCTCAGGAGATGTGAACTTTCTCAGTGACTATGGATCTGCCTGTGTCTCTGATCAGGTATTCAGCCCCAGCATCCTCCTGGGACTCGCTCaaagagatagataagaaaaaatagac----aaagaaagatgagaaaatatgGAGGCTGGTGT----CTTCTCTAGTGCACATAGGGTGGCCCAGGAATGACAGAG i papAnu2.JH684867 I 2734 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=16830.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 109817 35 + 478999 tggcaggaca-gggggaagtgcctgagagatcagct s panTro4.chr18 74591502 35 - 76611499 TGGCAGGACA-GGGGGAAGTGCCTGAGAGATCAATT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45212815 35 - 121039945 TGGCAGGACA-GGGGGAAGTGCCTGAGAGATCAATT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 64639 36 + 80412 TGGCAGGACATGTGGGAAGTGCCTTAGAGATCAATT i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36415426 4 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=970013.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 109852 1189 + 478999 cccttactctcagcctgtgagtgctgtctgaaaagccagtctctccaagcttggtggaagggggactcacacctggtttgacaggaccagtggaggcccctggtgggacatgctggcctcagaatgtgaggtcttggaggctagaggaaaatggcagtgggttaccagaaacttcatcactgagtgccaatacatgc-aaaatcaaagagaagatgagccatgtcagcagatatcagtgaagaatgcccagagaagactccactgaccatacacagcacagaccagcctgttccagaggacagtgcAAATGGCACGCCACAGCAACAGAGGCGACTTCGACCCCGCCCACGCCATCAGCAGCTCGGACCCTAGGGTCAGATACCACCACAGAGGCTAATTCCAGTGGTCGCCCCGCATATCAGGAAGACGGGAACCTGCACTCAGCACCATCCCCGTGGCTGCACAGGGCCCAGGACTCGTAACCCGGCGCTCTGGTTGCGGGCCAAGAAAGAGCGTAACCTAGGGTGGCATGTCGGTGAACTCGGCGACCCTCTGACAACCTGGGAGCAGCCCCAACAGCCTCAGTTGTGGGCTCAGCTGCAACTGCCACCTGCCGATGGTGCACGGGAGCAGCAGCGGCAACCCTCGACCCTGTCCCCGCCACCAGCAGCACGGACAGCAGGGCCAGATAGCACCGCGGCGCCTAAGACCTTAGGCCACGCAGCTGCAGGAGGACGTGAAACGGGCGCTGAC-CGCCCCCCAGAAGCTATGCAATCCCCAGCGCAGGCGAGTCCTCACTCTGGGCGCGGGCCAAAGATCAGACACTACGATGAAAGGAC----GGTGAACTTGGTGACCCTGAGGCTCGCAATGGGTTTAGCAGCAGCTGCCAACTGCAACCAACCCTGACCCTGCCCGCGTCACCAGCAGCAGTAA-CCCAGGGCCAGATGCCGCCTCAGCGGCTAATTCAGGTAATCGTCCTCCAGCTGCAGCAGGGCGGAAATCCGCTGCTCAGCCCCACCTCGGCGGCTGCACAGAGCCCAGCGCC------------------CGCACAACCCGCTCTTGGTAAGGGCAAAGGAAGAGCGGACCTAGGGTGGGAGGACCCTGCACTCCCTGACCCTCAGGCCGTCTGGGGCCAGCCCTGCCAGCCTCTGTCTAAAGCTACGCTGCAACTGCTACCTGCTCATGGCGC s panTro4.chr18 74591537 1200 - 76611499 CTCTTACTCTCAGCTTGTGAGCGCTGTCTGAAAAGCCAGTCTCTCCAAGCTTGGTGGGAGGGGGACTCACAACCGGTTtgacagggccagtggaggcccctggtgggacatgctggcctcagaatgtgaggtcttggtggctagaggaaaatggcag---gtgaccagaaacttcatcagtgggtgacaatacatgc-aaaatcaaagagaagatgagccatgccagcaaatatgtgtgaagaatgcccagagaagactccattgaccatgcacagcacagaccagcctgttccagaggacGGTGCAAATGGCACGCCGCAGCAACAGAGGCGACTTCGACCCCGCCCACGCCACCAGCAGCTCGGACCCTAGGATCAGATACCACCACAGAGGCTAATTCCAGTGGTCGCCCCGCATCTCAGGAAGACGGGAACCTGCACTCAGCACCATCCCCATGGCTGCACAGGGCGCAGGATCCGTAACCCGGCGCTCTGGGTGCGGGCCAAGA----GCGTAACCTAGGGTGGCATGTCGGTGAACTCGGCGACCCTCTAACAACCTGGGAGCAGCCCCAACAGCCTCAGTTGTGGGCTCATCTGCAACTGCCACCTGCCGATGGCGCACGGGAGCAGCAGTGGCAACCCTTGACCCTGTCCCCACCACCAGCAGCGTGGACAGCAGGGCCAGATAGCGCCGCGGCGCCTAAGACCTTGGGCCACGCAGCTGCAGGAGGACGTGAAACTGGCGCTGAC-CGCCCCCCAGAAGCTATGCAGTCCCCAGGGCAGGCGAGTCCGCACTCTGGGCGCGGGCCAAAGATCAGATACTATGATGAAAGGAC----GGTGAACTTGGTGACCCCGAGGCTCGTAATGGGTTTAGCAGCAGCTGCCACCTGCAACCAACCCTGACCCTGCCCGCGTCACCAGCAGCAGTAA-CCCAGGGCCAGATGCCGCCTCAGCGGCTAATGCAGGTAATCGTCCTCCAGCTGCAGCAGGGAGGAAATCCGCTGCTCAGCCCCATCTCGGCGGCTGCACAGAGCCCAGCGCCGGCACAGAGTCCAGAGCCCGCACAACCCGCTCTGGGTAAGGGCAAAGGAAGAGCGGACCTAGGGTGGGAGGACCCTGCACTCCCTGACCCTCAGGCCGTCTGGGGCCAGCCCTGCCAGCCTCGGTCTAAAGCTCCGCTGCAGCTGCTACCTGCTCATGGCGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45212850 1190 - 121039945 CCCTTACTCTCAGCCTGTGAGTGCTGTCTGAAAAGCCAGTCTCTCCAAGCTTGGTGGAAGGGGGACTCACAACTGGTTTGACAggaccagtggaggcccctggtgggacatgctggcctcagaatgtgaggtcttggaggctagaggaaaatggcagtgggtgaccagaaacttcatcagtgggtgccaatacatgcaaaaatcgaagagaagatgagccatgtcagcagatatcagtgaagaatgcccagagaagactccactgaccatacacagcacagaccagcctgttccagaggacagtgcAAATGGCACGCCGCAGCAACAGAGGCGACTTCGACCCCGCCCACGCCACCAGCAGCTCGGACCCTAGGGTCAGATACCACCACAAAGGCTAATTCCAGTGGTCGCCCCACATCTCAGGAAGACGGAAACCTGCACTCAGCACCATCCCCGTGGCTGCACAGGGCCCAGGACTCGTAACCCGGCGCTCTGGGTGCGGGCCAAGAAAGAGCGTAACCTAGGGTGGCATGTCGGTGAAATCCGCGACCCTCTGACAACCTGGGAGCAGCCCCAACAGCCTCAATTGTGGGCTCAGCTGCAACTGCCACCTGCTGATGGCGCACGGGAGCAGCAGTGACAACCCTTGACCCTGTCCCCGCCACCAGCAGCGTGGACAGCAGGGCCAGATAGCGGCGTGGCGCCTAAGACCTTAGGCCACGCAGCTGCAGGAGGACGTGCAACTGGCGCTGAC-CGCCCCCCAGAAGCTATGCAATCCCCAGCGCAGGCGAGCCCGCACTCTGGGCGCGGGCCAAAGATCAGATACTATGATGAAAGGAC----GGTGAGCTTGGTGACCCTGAGGCTCGCAATGGGTTTAGTAGCAGCTGCCACCTGCAACCAACCCTGACCCTGCCCGCGTCACCAGCAGCAGTAA-CCCGGGGCCAGATGCCGCCTCAACGGCTAATTCAGGTTATCGTCCTCCAGCTGCAGTAGGGCGGAAATCCGCTGCTCGGCCTTATCTCGGCGGCTGCACAGAGCCCAGCGCC------------------CGCACAACCCGCTCTGGGTAAGGGCAAAGGAAGAGCGGACCTAGGGTGGGAGGATCCTGCACTCCCTGACCCTCAGGCCGTCTGGGGCCAGCCCTGCCAGCCTCGGTCTAAAGCTCCGCTGCAGCTGCTACCTGCTCAGGACGC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36415430 1193 + 96509753 CTCTTACTCTCAGCTTGTGAGTGCTGCCTGAAAATCCAGTCTCTCCAAGCTTAGTGGGAGGGGGACTCATAAATGGGTTGACtggaccagtggaggcccccggtgggacatgctggcctcagaatgtgaggtctaggaggctagagggaaatggcattgggtgaccagaaactgcatcagtgggtgccaatacatgc-aaaatcaaagagaagatgagccacgtcagcagatatcagtgaagaatgtccagagaagactccactgaccatacacagcacagaccagcctgttccggaggacagtgcAAATGGCGCCCAGCAGCAAGGGAGGCTACTTCGACCCTGCCCACGCCACCAGCAGCTCGGACCCTAGAGTCAGATGCCACCACAGGGCCTAATTCCAGTAGTCGGTTCACTTCTCAGGAAGACGGGAGCCTGCACTCAGCACCATCCCCGTGGCTGCACAGAGCCAAGTACCCGTGACCGGGCGCTCTGGGTGCAAGCCAAGAAACAGCGGAACCTAGGGTGGCTTTTCGGTGAACTCGGCGACACTCTGACCATCTAGGAACAGCCTCAACAGCTTCAGCTGTGGGCTCAGCTGCAACTGCCACCTGCCGACAGCACATGGGAGCAGTAGTGGCAACCCTTGACCCTGTCCCCGCCACCAGCAGCATGGACAGCAGGGCCAGAGTATGCCTTGGCACCTAAGACCTTAGGCCACGCAGCTGCAGGAGGACGTGAAACTGCCGCTGACACGGCTCCCAGAGGCTATGCAATGCCCAGCG-AGGCGACCCTGCACTCTGGACGCGGGCCAAAGATCAGATAGTACCATG-AAGGTCACCAAGTGAACTTGGTGACCCTAAGGCTCGCAATGGGTTTAGCAGCAGCTGCCACCTGGAACCAACCCTGACCCTGACCGCATCACCAGCAGCAGGAACCCCAGGGCCAGATGCCGCCTCAGCGGCTAATTCAGGTGTTCCTCCTCCAGCTGCAGCAGGGCGGAAATCCGCTGCTGAGCCCCATCTTGGCGGCTGCACAGAGCCCAGCGCC------------------CGCACAACGTGCTCTGGATAAGAGCAAAGGAAGAGCGGACCTAGGGTGGGAAGATCCTGCACTCTCAGATCCTCAGGCCATCTGGGGTCAGCCCTGCCAGCCTTGGTCTAATGCTCCGCTGCAGCTGCTACCTGCTCGTGGCGC i macFas5.chr10 I 4 C 0 s papAnu2.JH684867 64675 1190 + 80412 CCCTCACTCTCAGCTTGTGAGTGCTGCCTGAAAATCCAGTCTCTCCAAGCTTAGTGGGAGGGGGACTCATAAATGGGTTGACTGGACCAGTGGAGGCCCCCGGTGGGACATGCTGGCCTCAGAATGTGAGGTCTAGGAGGCTAGAGGAAAATGGCATTGGGTGACCAGAAACTGCATCAGTGGGTGCTAATACATGC-AAAATCAAAGAGAAGATGAGCCACGTCAGCAGATATCAGTGAAGAATGTCCAGAGAAGACTCCACTGACCATACACAGCACAGACCAGCCTGTTCCGGAGGACAGTGCAAATGGCGCCCAGCAGCAAGGGAGGCTACTTCGACCCTGCCCACGCCACCAGCAGCTCAGACCCTAGGGTCAGATGCCACCACAGGGCCTAATTCCAGTAGTCGGTTCACTTCTCAGGAAGACGGGAGCCTGCACTCAGCACCATCCCCATGGCTGCACAGGGCCAAGTACCGGTGACCGGGCGCTCTGGGTGCAAGCCAAGAAACAGCAGAACCTAGGGTGGCTTGTCGGTGAACTCGGCGACACTCTGACCATCTAGGAACAGCCTCAACAGCCTCAGCTGTGGGCTCAGCTGCAACTGCCACCTGCTGACAGCGCATGGGAGCAGTAGTGGCAACCCTTGACCCTGTCCCCGCCACCAGCAGCATGGACAACAGGGCCAGAGTGTGTCTCGGCACCTAAGACCTTAGGCCACGCAGCTGCAGGAGGACGTGAAACTGCCGCTGACACAGCTCCCAGAGGCTATGCAATGCCCAGCG-AAGCGACCCTGCACTCTGGGCGCAGGCCAAAGATCAGATACTACCATGTAAGGAC----GGTGAACTTGGTGACCCTAAGACTCGCAATGGGTTTAGCAGCAGCTGCCACCTGGAACCAACCCTGACCCTGACCGCATCACCAGCAGCAGGAACCCCAGGGCCAGATGCCGCCTCAGCGGCTAATTCAGGTGCTCCTCCTCCAGCTGCAGCAGGGCGGAAATCCGCTGCTGAGCCCCATCTTGGCGGCTGCACAGAGCCCAGCGCC------------------CGCACAACGCGCTCTGGATAAGAGCAAAGGAAGAGCGGACCTAGGGTGGGAAGACCCTGCACTGTCAGATCCTCAGGCCATCTGGGGTCAGCCCTGCCAGCCTCCGTCTAATGCTCCGCTGCAGCTGCTACCTGCTCGTGGCGC i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90205162 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=410660.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111041 342 + 478999 GCAGCGGTGGCAAACCCGGACTCCGCCCGCCGACACCAGCGGCCTCGAAACCCTAGAGACAGACTCCACCTAGTGGCCAAAATCAGGCAGTCGGCCCACAGCTGTAGGAGAGCGGGAACCTGCCCTTCAGCGGATTCCTGGAGGCTGCACAGTGCCCAGCGCCAGCCACCCG--GATCTGGGCGCGGGCAAATGACCCTCAGGCCGTCTGAGACCGGACCAGCCCTGCAGCCTCAGCGGTGGGCTCAGGGGCGACTGCCACGTGCACATGGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCCCCGACCCTGTGCAAGCCACCGGCAGTGCGGACCCCATGACCAAAAGCC s panTro4.chr18 74592737 341 - 76611499 GCAGCGGTGGCAAACCCGGACTCCGCCCACCAACAGCAGCGGCCTCGAAACCCTAGAGCCAGACTCCACCTAGTGGCCAAAATCAGGCAGTCGGCCCACAGCTGTAGGAGAGCGGGAACTTGCCCTTCAGCGGATTCCGGGAGGCTGCACAGTGCCCAGCGC-AGCCACCCG--GATCTGGGCGCGGGCAAATGGCCCTCAGGCCGTCTGGGACCGGACCAGCCCTGCAGCCTCAGCGGTGGGTTCAGGGGCGGCTGCCACGTGCACACGGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCCCCGACCCTGTGCAAGCCACCGGCAGTGCGGATCCCATGACCAAAAGCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205162 344 - 108868599 GCAGCGGTGGCAAACCCGCACTCCGCCCGCCGACACCAGCGGCCCCGAAACCATAGAGCCAGAGGCCACCTAGTGGCCAAAGTCAGGCAGTCGGCCCACAGCTGCAGGAGAGCTGCAAACCGCCCTTCAGCGGATTCCTGGAGGCTGCACAGTGCCCAGCTCCCGCCACCCGGTGCTCTGGGCGCGGGCAAATGACCCTCAGGCCGTCTGGGACCGGACCAGCCCCGCAGCCTCAGCAGTGGGCTCAGGGGCGGCTGCCACGTGCACACGGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCCCCGACCCTGTGCAAGCCAGCGGCAGTGCAGACCCCATGACCAAAAGCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214040 342 - 121039945 GCAGCGGTGGCAAACCCGGACTCCTCCTGCCGACACCAGCTGCCTCGAAACCCTAGAGCGAGACTCCGCCTAGTGCCCAAAATCAGGCAGTCGTCCCACAGCTGTAGCAGAGCTGGAACGTGCCCTTCAGCGGATTCCTGGAGGCTGCCCAGCGCCCAGCGCCCGCCACCCG--GATCTGGGCGCGGGCAAATGACCCTCAGGCCGTCTGGGACCAGACCAGCCCTGCAGCCTCAGTGACGGGCTCAGGGGCGGCTGCCACGTGCACACGGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCCCTGACCCTGTGCAAGCCACCGGCGGTGCGGACCCCATGACCAAAAGCC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36416623 342 + 96509753 CCAGCAGTGGCAAACCCGGCCTCTGCCCGCC-ACACCAGCAGCCCCGAAACCCTAGAGCCAGATGTCACGTAGTGG-CAAAGTCAGGCAGTCAGCCCACAGCTGCAGGAGAGTGGGAACCTGCCCTTCGGCGGATTCTTGGAGGCTGCATAGTGCCCAGCGCCCGCCACCCAGTGCTCTGGGTGCGGGCAAATGACCCTCAGGCCATCTGGGACCAGACCAGCCCTGCAGCCTCAGCGGTGGGGTCAGGGGCGGCTGCCAAGTGCACACAGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCGCGGACCCTGTGCAAGCCACCCGCAGTGCAGACCCCATGACCAAAAGCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 65865 342 + 80412 CCAGCAGTGGCAAACCCGGCCTCTGCCCGCC-ACACCAGCGGCCCCGAAATCCTAGAGCCAGATGCCACGTAGTGG-CAAAGTCAGGCAGTCAGCCCACAGCTGCAGGAGAGCGGGAACCTGCCCTTCGGCGGATTCTTGGAGGCTGCACAGTGCCCAGCGCCCGCCACCCGGTGCTCTGGGTGCGGGCAAATGACCCTCAGGCCATCTGGGACCGGACCAGCCCTGCAGCCTCAGTGGTGGGGTCAGGGGCGGCTGCCAAGTGCACACAGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCGCGGACCCCCTGCAAGCCACCGGCAGTGCAGACCCCATGACCAAAAGCC i papAnu2.JH684867 C 0 I 536 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=30963.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111383 44 + 478999 GCCGCGGCGCATAACTCAGGCGGTCGGCCCCCCAGCAG-------------CCAGAG s panTro4.chr18 74593078 44 - 76611499 GCCGCGGCGCATAACTCAGGCTGTCGGCCCCGCAGCAG-------------CCAGAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205506 44 - 108868599 GCCGCGTCCCCTAACTCAGGCGGTCGGCCCCCCAGTAG-------------CCAGAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214382 44 - 121039945 GCCGCGGCGCATAACTCAGGTGGTCGGCCCCCCAGCAG-------------CCAGAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36416965 57 + 96509753 TCTGAGGCACCTGACTCAGGCGGTCGGCCCCCCAGCAGCGGAAACCTTCCCCCAGAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 66207 536 + 80412 I e rheMac3.chr10 35465075 12928 - 95678458 M a score=61783.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111427 53 + 478999 GGCGGAAACTTGCAGCTTAGCCC-ATCCCAGCGCCTGCACTGTGCTCAGCGCCT s panTro4.chr18 74593122 54 - 76611499 GGCGGAAACTTTCAGCTTAGCCCCATCCCAGCACCTGCCCTGTGCTCAGCGCCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205550 54 - 108868599 GGAGGAAACCTGCAGCTCAGCCCCAACCCAGCGCCTGCACTGTGCTCAGCGCCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214426 53 - 121039945 GGCGGAAACTGGCAGCTTAGCCC-GTCCCAGCGCCTGCACTGTACTCAGCACCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35478004 54 - 95678458 GGCGGAAACCTGCAGCTCAGCCCCATCCCAGCGCCTGCACTGTGCTCAGCGCCT i rheMac3.chr10 M 12928 C 0 s macFas5.chr10 36417022 54 + 96509753 GGCAGAAACCTGCAGCTCAGCCCCATCCCATCGCCTGCACTGTGCTCAGCGCCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 66207 536 + 80412 I a score=71663.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111480 118 + 478999 -----------------------------------------------------------------------------------------------GCAATCCCACTCTCTGGGAGCGGG-CAAGGAAGACTGGACCTTAGGGTGGGAGGGCGGTGCATTCGGGGACCCTCAAGGCTTCTGGAATAAGCCCTTCCAGCCTCCGCTGCGGGTTCAG s panTro4.chr18 74593176 118 - 76611499 -----------------------------------------------------------------------------------------------GCAATCCCACTCTCTGGGCGCGGG-CAAGGAAGACTGGACCTTAGGGTGGGAGGGAGGTGCATTCGGGGACCCTCAAGGCTTCTGGAATAAGGCCTTCCAGCCTCCGCCACGGGCTCAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205604 118 - 108868599 -----------------------------------------------------------------------------------------------GTAATCCCACTCTCTGGGCGCGGG-CAAGGAAGACTGGACCTTAGGGTGGGAGGGCGGTGCACTCGGGGACCTTCAAGCCTTCTGGAACAAGCCCTGCCATCCTCCGCCGCGGGCTCAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214479 118 - 121039945 -----------------------------------------------------------------------------------------------GCAATCCCACTCTCTGGGAGCGGG-CAAGGAAGGCTGGACCTTAGGGTAGGAGGGCGGTGCATTCGGGGACCCTCAAGACTTCTGGAATAAGCCCTTCCAGCCTCCGCCGCGGGCTTAG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 66743 214 + 80412 GCCAACAGCAGTGAGGATTCCATGGCTGGAGGCCTTGCCGGGGCAGGAACCTGCCGCTCTGCCTATTCTAGGCAGCCGAACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGAGCTCTGGGCGCGGGCCAAGGAAGAGTAGACCCTAGGCTGGGACAGCGGTGCACTGGGCGATCCTCACGCTTTCTGGGACCAACTCTGCCGGCCTCTCCTGAGAGCTCAG i papAnu2.JH684867 I 536 T 694 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=143823.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111598 227 + 478999 CTGCAGCTGCCAGCTGCACACTCCTGGAAGCAGCAGCGGTGGCAGCTCTGGTCTCTGCCAGCTCCAGCAGCAGCGCGG--ACCGCCGAGCCAGAGGTCACTGCGGCGCC--TGTTAGGAGGTTGGCCTCTCAGCTGCAGGAGGGCGGGAATCTGCACCCAACCAGATCCTCAT-GGCTGCACAGTGTCCAACGCCCACGACCCTGCAATTTGGGCGCCGGCCTAGGAATAAC s panTro4.chr18 74593294 227 - 76611499 CTGCAGCTGCCAGCTGCACACTCCTGGAAGCAGCAGCGGTGGCAGCTCTGGTCTCTGCCAGCTCCAGCAGCAGCGCGG--ACCGCCGAGCCAGAGGTCGCTGCGGCGCC--TGTTAGGAGGTTGGCCTCTCAGCTGCAGGAGGGCGGGAATCTGCACCCAACCAGATCCTCAT-GGCTGCACAGTGTCCAACGCCCACAACCCTGCAATGTGGGAGCCGGCCTAGGAATAAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205722 227 - 108868599 CGGCAGCTGCCACCTGCACACTCCTGGAAGCAGCAGCGGTGGCAGCTCTGGTCTCTGCCAGCTCCAGCAGGAGCGCGG--ACCGCAGAGCCAGAGGTCACTGCAGCGCG--TGTTAGGAGGTTGGCCTCTCAGCCGCAGGAGGGCAGGAATCTCCGCCCAACCAGATCCTCAT-GGCTGCACAGTGTCCTACGCCCACGACCCCGCAATCTGGGCGCTGGTCTAAGAATAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214597 227 - 121039945 CTGCAGCTGCCAGCTGCACACTCCTAGAAGCAGCAGCGGTGGCAGCTCTGGTCTCTGCCAGCTCCAGCAGCAGCGCGG--ACCGCAGAGCCAGAGGTCACTGCAGCGCC--TGTTAGGAGGTTGGCCTCTCAGCTGCAGGAGGGCGGGAATCGGCACCCAACCAGATACTCAT-GGCTGCACGGTGTCCAACGTCCACGACCCTGCAATGTGGGCCCCGGCCTAGGAATAAC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 66263 220 + 80412 CTGCAGCTGCTACCTG----CTCGTGGCGCC--CAGCAGTGGCAAACCCGGCCTCTGCCCACCACACCAGCGGCCCCGAAATCCTAGAGCCAGATGCCAC-GTAGTGGCAAAGTCAGGCAGTCAGCC-CACAGCTGCAGGAGAGCGGGAACCTGCCCTTCGGCGGATTCTTGGAGGCTGCACAGTGCCCAGCGCCCGCCACCCGGTGCTCTGGGTGCGGGC----AAATGAC i papAnu2.JH684867 T 694 T 1294 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=25769.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111825 35 + 478999 GGACCCTGGGGTGGAAGGGCGGTGCACTCAGCCAC s panTro4.chr18 74593521 35 - 76611499 GGACCCTGGGGTGGAAGGGCGGTGCACTCAGCCAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205949 35 - 108868599 GGACCCTAGGGTGGAAGGGCGGTGCACTCAGCCAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214824 35 - 121039945 GGACCCTGGGGTGGAAGGGCGGTGCACTCAGCCAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 65189 35 + 80412 AGAACCTAGGGTGGCTTGTCGGTGAACTCGGCGAC i papAnu2.JH684867 T 1294 I 1259 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=142168.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 111860 237 + 478999 CCTTAGGCAACCT-----CAGACCAGCCCTGACAGCATCTGCCTGGGACTCAGCTGCAGCTGGCACCTGCGCATGGCGCACGGCAGTAGTAGTGGCAGCCCTGACCCTGCCCTCAGACACCAGCAGCAAAGACCCTAGGGCCGGATGCCTCCAAGGCATCTAAGTCAGGTGGTCGGTCCCATAGCGCTGGGGATTGCAGCGGTCGCCCGCTGCAGCGGGGCGGAAATCGGCTGCTCAGCCCC s panTro4.chr18 74593556 236 - 76611499 CCTTAGGCAACCT-----CAGACCAGCCCTGACAGCATCTGCCTCGGACTCAGCTGCAGCTGGCACCTGCCCATGGCGCACAGCAGTAGTAGTGGCAGCCGTGACCCTGCCCGCAGACACCAGCAGCAA-GACCCCAGGGCCGGATGCCTCCAAGGCATCTAAGTCAGGTGGTCGGTCCCATAGCGCTGGGAATTGCAGCGGTCGCCCGCTGCAGCAGGGCGAGAATCGGCTGCTCAGCCCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90205984 212 - 108868599 CCTTGGGCAGCCT-----CAGACCAGCCCTGCCAGCATCTGCCTTGGGCTCAGCTGCAGCTGGCGCCTGCGCATGGCGCACGGCAGTAGCAGTGGCAGCCCTGACCCTGCCCTCAGACACCAGCAGCAAAGACCCCAGGGCCGGACGCCCCCAAGGCACCTAAGTCAGGTGGTCGGCCCCATA-------------------------GCTGCAAGAGGGCGGGAATCGGCTGCTCAGCCCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45214859 237 - 121039945 ACTTAGGCAACCT-----CAGACCAGCCCTGACAGCATCTGCCTCGGACTCAGCTGCAGCTGGCACCTGCGCATGGCGCACAGCAGTAGTAGTGGCAGCCCTGACTCTGCCCTCAGACACCAGCAGCAAAGATCCCAGGGCCGGATGCCTCCAAGGCATCTAAGTCAGGTGGTCGGTCCCATAGCCCTGGGGATTGCAGTGGTCGCCTGCTGCAGCAGGGCAGGAATCGGCTGCTCAGCCCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 66483 229 + 80412 CCTCAGGCCATCTGGGACCGGACCAGCCCTG-CAGCCTCAGTGGTGGGGTCAGGGGCGGCTGCCAAGTGCACACAGTGAACTATAGCAGCTGTGGCAGCCGCGGACCCCCTGCAAGCCACCGGCAGTGCAGACCCCATGACCAAAAGCCTCTGAGGCACCTGACTCAGGCGGTCGGCCCCCCA------------GCAGCGGAAACCTTCCCCCAGAGGGCGGAAACCTGCAGCTCAGCCCC i papAnu2.JH684867 I 1259 I 29 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=167564.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 112097 337 + 478999 ATAGCAGCTGTGGCAGCCCTCATCTCTGTCCATGCCACC-AGTAGCACGTACCCCAGGGTCAGATACTGCGGTGGCGCCTAATTCAGACTGTAGCTGCAGCAGGGCAGGACTCCGCCGCTCAGCCCCATCCTGGAGGCTGCTCAGAGTCTAGCGCTCGTACACCGCGTCCTGGGAGCAGGCTAAGGAAGAGCAGAC-CCTAGGGTGGTAGGGCGATGCACCCAGAGACCCTCAGGGTGTCTGGGACCAGCCCTGCCGGTCTCTGCCACGCGCTCAGCTGCAGCTACCACCGCCAGGTGGCTCCCGGCAGCAGCGGTGGAAACC----------CCGCTGACCTTGCCCG s panTro4.chr18 74593792 338 - 76611499 ATAGCAGCTGTGGCGGCCCCCATCTCTGTCCATGCCACCCAGTAGCACGTACCCCAGGGCCAGATACTGCGGTGGCGCCTAATTCAGACTGTAGCTGCAGCAGGGCAGGAATCCGCTGCTCAGCCCCATCCTGGAGGCTTCTCAGAGTCTAGCGCTCGTACACCGCATCCTGGGAGCAGGCTAAGGAAGAGCAGAC-CCTAGGGTGGTAGGGCGATGCACTCAGAGACCCTCAGGGTGTCTGGGACCAGCCCTGCCAGTCTCTGCCACGCGCTCACTTGCAGCTACCACCGCCAGGTGGCTCCCAGCAGCAGCGATGGAAACC----------CCGCTGACCTTGCCCG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90206196 348 - 108868599 ATAGCAGCTGTGGCAGCCCCCATCTCTGTCCATGCCACC-AGTAGGACGAACCCCAGGGCCAGATACTGCGGTGGCGCCTAATTCAGACTGTAGCTGCAGCAAGGCGGGAATCGGCCGCTCAGCCCCATCCTGGAGGCTGCTCAGTGTCTAGCGCTCGCACACCACGTCCTGGGAGCAGTCTAAGGAACAGCAGACACCTAGGGTGGTAGGGCGGTGCACTCAGCGACCCTCAGGGTGTCTGGGACCAGCCCTGCCAGCCTCTGCCATGCTCCCAGCTGCAGCTACCACCGCCAGGTGGCGCCCGTTAGCAATGGTGGAAACCACACCCCCATCCCCCGACCTTGCCTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45215096 337 - 121039945 ATAGGAGCTGTGGTAGCCCTCATCTCTGTCCATGCCACC-AGTAGCACGTACCCCAAGGCCAGATACTGCGGTGGCGCCTAATTCAGACCGTAGCTGCAGCAGGGCAGGAATCCGCCGCTCAGCTCCATCCTGGAGGCTGCTCAGAGTCTAGCGCTCGTACACCGCGTCCTGGGAGCAGGCTAAGGAAGAGCACAG-CCTAGGTTAGTAGGGCGATGCACCCAGAGACCCTCAGGGTGTCTGGGACCAGCCCTGCCAGTCTCTGCCACGTGCTCAGCTGCAGCTACCACCGCCAGGTGGCTCCCAACAGCAGCGGTGGAAACC----------CCGCTGACCTTGCCCG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 66712 29 + 80412 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=742.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 112434 2 + 478999 CC s panTro4.chr18 74594130 2 - 76611499 CA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90206544 2 - 108868599 CC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45215433 2 - 121039945 CC i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 66741 2 + 80412 CT i papAnu2.JH684867 I 29 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36417076 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35478058 0 - 95678458 C a score=1713712.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 112436 1071 + 478999 GCCAACAGCAGTGAGGATACCACGGCTGGATCCCTTGCCAGGGCGGGAACCTGCCGCTCAGCATATT---CTGGGCAGCTGCACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGGGCTCTGGGCTCGGGCCAAGGAAGAGTGGACCCTAGGCTGGGAGGGCGGTGCACTCGGCGATCCTCACGCTTTCTAGGACCAACCCTGCCGGCGTCTACTGAGAACTCAGCTACAGCTGCCACCTGTACAAGGGCGCCGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCACCACTAAGAGCCAGGACACCGGGGACAACGCCGCCTCAGCGCCTAATTCAGGCACTCAGCCCAGCAGCTGCAGCAGGGCAGCAACCTTTGCCCTCGGCCGAAGCACCTTGGCTGCACAGTTCCCGGTGCCCGCGACCCGGAACTCTGGGCGCAGGCAAAAGAAGAGCGTACACTAGGCTGGGACAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTGTCTGGGCAACTCCTTGTCAG-----GTGATGGGCCCAGCTGCAGCAGCCAGCTGCACATGGCGCGCGCAGCAGCCTTGGAGGCAACCCCAGACCAGGCTCCTACACCAGCCAGGCGGATCCCAGGGCCAGACGCCGCCCACCGGCTAATTCAGCTGGTCAGACCCCAGCTGCAGGAGGGCGGGAGCCGGCCGCTCAGCCATT-TCCTGGCTGCTGCCCTGTACCCAGCGCTTGCACACCCCGCTGTGGGCTCCGGCAAGAAAGAGCTGACTCTAGGGTGAAAGGGCCCTGCACTCA-GAGACCCCCAGGCTGTCTGGGACCAGCCCTGCCTGCCTCTGATGTAGGTTCAGCTGCAGTGGTAACCTGCACAAGGCGCGCAGCAGCAGCTGTGGCAAACTCCGACCCTGCCAGTGCCACCAGCAGTGCGGACCCTTGGGCCAGAAGCCTCCACAGCGCCTAAGTCAGGGTGTTGGTCCCCAGCTGCAGGAGGGCAGGAACTGGCACTCAGCCCCACCTCAGAGGCTGCATGATGCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCGCAGGTTGTGGAGGGGCCAGGGGCcacccag s panTro4.chr18 74594132 1042 - 76611499 GCCAACAGCAGTGAGGATTCCACTGCTGGATCCCTTGCCAGGGCGGGAACCTGCCGCTCAGCCTATT---CTGGGCAGCTGCACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGAGCTCTGGGCTCGGGCCAAGGAAGAGTGGACCCTAGGCTGGGAGGGCGGTGCACTCGGCGATCCTCACGCTTTCTAGGACCAACCCTGCCGGCCCCTACTGAGAACTCAGCTACAGCTGCCACCTGTACAAGGGCGCCGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCACCACCAAGAGCCAGGACACCGGGGACAACGCCGCCTCAGCGCCTAATTCAGGCAGTCAGCCCCGCAGCTGCAGCAGGGCAGAAACCTCTGCCCTCGGCGCAGTCCCCTTGGCGGCACAGTTCCCAGTGCCCGCGACCCGGAACTCTGGGAGCAGGCAAAGGAAGAGCGGACTCCAGGGTGGGACAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTGTCTGGGAAAC-CCTTGCC----------------------------------TGCACATGGCGCGCGCAGCAGCCTTGGAGGCAAACCCAGACCGTGCTCCTACACCAGCCAGGCGGATCCCAGGGCCAGACGTCGCCCAGCGGCTAATTCAGGTGGTCAGGCCCCAGCTACAGGAGGGCGGGAACAGGCCGCTCAGCCATT-TCCTGGCTGCTGCCCTGTACCCAGCGCCTGCACACTCCGCTATGGGTGCCGGCAAGAAAGAGCTGACTCTAGGGTGAAAGGGCCCTGCACTTAAGAGACCCCCAGGCTGTCTGGGACCAGCCCTGCCTGCTTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGTAACCTGCACAAGGCGCGCAGCAGCAGCTGTGGCAAACTCTGACCCTGCCAGTGCCACCAGCAGTGCGGACCCTTGGGTCAGAAGCCTCCACAGCGCCTAAGTCAGGGTATTGGTCCCCAGCTGCAGGAGGGCAGGAACTGGCGCTCAGCCCCACCTTAGAGGCTGCATGGTGCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCGCAGGTTGTGGAGGGGCCAGGGGCcacccag i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90206546 1071 - 108868599 CCCAACAGCAGAGCAGATTCCACGGCTGGATGCCTTGCCAGGGCGGAAACCAGCCGCACAGCCTATT---CTGGGCAGCTGCACAGGGCCCAGCGCCCGAAACCCCGAGCTCTGGGGGCGGTCCAAGGAAGAGTGCACCCTAGGCTGGGAGGGTGCTGCACACCGCGATCCTCAGGCTTTCTGGGACCAAAGCTGCCGGCCTCTACTGAGAGCTCAGCTGAAGCTGCCACCTGTACAAGGGCGTGACAGCAGCAGAGCAACCTGGCACTTTGCCTGCACC----AGAGCCCTGACACCGGAGACAACACAGCCTCAGCGGCTAATTCAGGCAGTCAGCCCCGCATCTGCAGCAGGGCAGAAACCTTTGCCCTCGGCCCAGTCTCCTTGGCTGCACAGTTCCCAGTGCCCGCGACCCGGAACTCTGGGCTCAGGCAAAGGAACAGCGGACCCTAGGGTGGGATAGTGGTCCACTCAATGACCCTGAGGCTGCCTGGGAAACGCCTTGCCAGCCTCCGTCATGGGCTCAGCTGCAGCAGCCTCCTGCACTTGGCGCGCAGAGCAGCCTTGATGACAACCCCAGACCATGCTTTTACACCAGCCAGGCGGACTCCAGGGCCAGACGCCGCCTAGCGGCTAATTCAGGTGGTCCGGCCCCAGCTGCAGGAGGGCGGGAACCGGCAGCTCAGCCATT-TCCTGGCGGCTGCCCTGTGCCCAGCGCCTGCACACCCTGATCTGGGCGCCTACAAGAAAGAGCTGACTCTAGGGTGAAAGGGCCGTCCACTCA-GCGACCGCCAGGCTGTCTGGGACCAGCCCTGCCTGCCTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGTAACCTGCACAAGGCGCGCAGAAGCAACTGTGACAAACTCCGACCCTGCCAGCGCCACCAGCAGCGCGGACCCTTGGGCCAGAAGCCT-CACGAAGCCTAAATCAGGGTGTTGGTCCCCAGCTGCAGGAGGGCAGGAACTGGCGCTCAGCCTCACCTCAGAGGCTGCATGGTGCCCAGAGCCAGGACCCAGCTCTTCCAGCGCGGGTTATGGAGGGGCCAGGGGCCCcccag i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45215435 1043 - 121039945 GCCAATAGCAGTGAGGATTCCACGGCTGGATCCCTTGCCAGGGCGGCAACCTGCCGCTCAGCCTATCCTGCTGGGCAGCTGCACAGGGCCCAGCACTTGAAACCCCGAGCTCTGGGCTTGGGCCAAGGA--------------------AGGGCGGTGCACTCGGCGATCCTCACGCTTTCTAGGACCAACCCTGCCGGCCTCTACTGAGAACTCAGCTACAGCTGCCACCTGTACAAGGGCGCCGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCATCACCAAGAGCCAGGACACCGGGGACAACGCCGCCTCAGCGCCTAATTCAGGCACTCAGCCCCGCAGCTGCAGCAGGGCAGAAACCTTTGCCCTGGGCCCAGGCCCCTTGGCTGCACAGTTCCCAGAGCCCGCGACCCGGAACTCTGGGCGCAGGCAAAGGAAGAGCGGACCCAAGGCTGGGATAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTGTCTGGGAAACGCCTTGTCAG-----GTGATGGGCTCAGCTGCAGCAGCCACCTGCAC-----------AGCAGCCTTGGAGGCAACCCCAGACCATGCTCCTACACCAGCCAGGCGGATCCCAGGGCCAGACGCCGCCCAGCGGCTAATTCAGGTGGTCAGACCCCAGCTGCA-GAGGGCAGGAACCGGCCGCTCGGCCATTATCCTGGCTGCTGCCCTGTACCCAGCACCTGCACACCCCGCTATGGACGCCGGCAAGAAAGAGCTGACTCTAGGGTGAAAAGGCCCTGCACTCA-GAGACCCCCAGGCTGTCTGGGACCAGCCCTGCCTGCCTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGTAACCTGCACAAGGCGCACAGCAGCAGCTGTGGTAAACTCCTATCCTGCCAGTGCCACCAGCAGTGCGGACCCTTGGGCCAGAAGCCTCCACAGCGCCTAAGTCAGGGTGTTGGTCGCCAGCTGCAGGAGGGCAGGAACTGGCGCTCAGCCCCACCTCGGAGGCTGCATGGTGCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCGCAGGTTGTGGAGGGGCCAGGGGCcacccag i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35478058 1056 - 95678458 GCCAACAGCAGTGAGGATTCCATGGCTGGAGGCCTTTCCAGGGCAGGAACCTGCCGCTCTGCCTATT---CTAGGCAGCCGCACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGAGCTCTGGGCGCCGGCCAAGGAAGAATGGACCCTAGGCTGGGACAGCGGTGCACTGGGCGATCCTCACGCTTTATGGGACCAACCCTGCCGGCCTCTCCTGAGAGCTCAGCTGCAGCTGCCACCTGTACAAGGGCACGGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCACCACCAAGAGCCCAGACACCGGGGCCAACGCCATCTCAGCACCGAATTCAGGAAGTCAGCCCTGCAGCAGCCGCAGGGCAGAAACCTTTGCCCTTGGCCCAGTCCCGCTGGCTGCACAGTTCCCAGTGCCTGCGACCCGGAACTCTGGGCGCAGGCAAAGGAACCGCAGACCCTAGGCTGGGATAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTGTCTGGGAAACGCCTTGCCAGCCTCCATCATGGGCTCAGCTGCAGCAGCCAC-TGCACATGG---GTGCAGCAGCCTTGGTGGCGACCCAAGACCATGCTCTTACAGCAGCCAGGCGGACCCCAGGGCCAGAAGCCGCCCAGCGGCTAATTCGGGTGGTCAGGCCT-AGCTGCAGGAGGATGGGAACCGGCTACTCAACCATT-TCCTGGAGGCTGCCCTATGCCCAGCGCATGAACACCCTGCTCTGGGTGCCTGCAAGAAAGAGCTGACTCTATGGTGAAAGGGCCGTGCCCTCA-GCGATCCCCAGGCGGTCTGGGAACA-CCCTGCGTGCCTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGCAACCTGC--------------AGCAGCTGTGGCAAACTCCGACCCTGCCAGCGCCACCAGCAGTGCGGTCCCTTGGGCCAGAAGCCTCCAGGGCACCTAAGTCAGGGTGTTGGTCCTCAGCTGCAGGAGGACGGGAACTGGCGCTCAGCCCCACCTCAGAGGCTGCATGGTTCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCGCAGGTTGTGGAGGGGCCAGGGGCAACCCAG i rheMac3.chr10 C 0 M 6711 s macFas5.chr10 36417076 1056 + 96509753 GCCAACAGCAGTGAGGATTCCATGGCTGGAGGCCTTTCCAGGGCAGGAACTTGCCGCTCTGCCTATT---CTAGGCAGCCGCACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGAGCTCTGGGCGCGGGCCAAGGAAGAATGGACCCTAGGCTGGGACAGCGGTGCACTGGGCGATCCTCATCCCTTATGGGACAAACCCTGCCGGCCTCTCCTGAGAGCTGAGCTGCAGCTGCCACCTGTACAAGGGCACGGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCACCACCAAGAGCCCTGACACCGGGGCCAACGCCATCTCAGCACCGAATTCAGGAAGTCAGCCCTGCAGCTGCCGAAGGGCAGAAACCTTTGCCCTCGGCCCAGTCCCCCTGGCTGCACAGTTCCCAGTGCCCGCGACCCGGAACTCTGGGCGCAGGCAAAGGAACCGCGGACCCTAGGCTGGGATAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTTTCTGGGAAACGCCTTGCCAGCCTCCATCATGGGCTCAGCTGCAGCAGCCAC-TGCACATGG---GTGCAGCAGCCTTGGTGGCGACCCAAGACCATGCTCTTACAGCAGCCACGCGGACCCCAGGGCCAGATGCCGCCCAGCGGCTAATTCGGGTGGTCAGGCCTCAGCTGCAGGAGGGTGGAAACCGGCTGCTCAACCATT-TCCTGGAGGCTGCCCTATGCCCAGCGCATGAACACCATGCTCTGGGTGCCTGCAAGAAAGAGCTGACTCTATGGTGAAAGGGCCGTGCCCTCA-GCGATCCCCAGGCGGTCTGGGAACA-CCCTGCGTGCCTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGCAACCTGC--------------AGCAGCTGTGGCAAACTCCGACCCTGCCAGCGCCACCAGCAGTG-GGTCCCTTGGGCCAGAAGCCTCCAGGGCACCGAAGTCAGGGTGTTGGTCCTCAGCTGCAGGAGGACGGGAACTGGCGCTCAGCCCCACCTCAGAGGCTGCATGGTTCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCACAGGTTGTGGAGGGGCCAGGGGCAAcccag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 66743 1056 + 80412 GCCAACAGCAGTGAGGATTCCATGGCTGGAGGCCTTGCCGGGGCAGGAACCTGCCGCTCTGCCTATT---CTAGGCAGCCGAACAGGGCCCAGCGCCTGAAACCCCGAGCTCTGGGCGCGGGCCAAGGAAGAGTAGACCCTAGGCTGGGACAGCGGTGCACTGGGCGATCCTCACGCTTTCTGGGACCAACTCTGCCGGCCTCTCCTGAGAGCTCAGCTGCAGCTGCCACCTGTACAAGGGCACGGCAGCAGCAGAGCAACCGGGCACTTTGCCTGCACCACCAAGAGCCCTGACACCGGGGCCAACGCCACCTCAGCGCCGAATTCAGGAAGTCAGCCCTGCAGCTGCCACGGGGCAGAAACCTTTGCCCTCGGCCCAGTCCCCCTGGCTGCACAGTTCCCAGTGCCTGT-ACCCGGAACTCTGGGTGCAGGCAAAGGAACCGCGGACCCTAGGCTGGGATAGTGGTCCACTCCATGACCCTGAGGCTGTCTGGGAAACGCCTTGCCAGCCTCCCTCATGGGCTCAGCTGCAGCAGCCAC-TGCACATGG---GTGCGGCAGCCTTGGTGGCGACGCAAGACCATGCTCTTACAGCAGCCAGGCGGACCCCAGGGCCAGACGCCGCCCAGCGGCTAATTCGGGTGGTCAGGCCTCAGCTGCAGGAGGATGGGAACCGGCTGCTCAACCATT-TCCTGGAGGCTGCCCTATGCCCAGCGCATGAACACCCTGCTCTGGGTGCCTGCAAGAAAGAGCTGACTCTATGGTGAAAGGGCCCTGCCCTCA-GCGATCCCCAGGCGGTCTGGGAACA-CCCTGCGTACCTCTGCTGTAGGTTCAGCTGCAGTGGCAACCTGC--------------AGCAGCTGTGGCAAACTCCGACCCTGCCAGCGCCACCAGCAGTGCGGTCCCTTGGGCCAGAAGCCTCCAGGGCACCTAAGTCAGGGTGTTGGTCCTCAGCTGCAGGAGGACGGGAACTGGCGCTCAGCCCCACCTCAGAGGCTGCATGGTTCCCAGAGCCAGGGCCCAGCTCTTCTAGCGCAGGTTGTGGAGGAGACAGGGgcaacccag i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I a score=1132923.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 113507 956 + 478999 actggagggcagtgtcatgatcacagctcactgaagcctcaacctcccagtttcaagctatcgtctcacctcagcctcctgagtagctggtagctgggactgcaggcgggtgccatcatgtctggctattatattttatatacattttggagagacagtgtctcaccatgttgcccag-caggtcttgaacgcctggagttcaagcgatcctcccaacttgaccttcctcagtggtggtggtgggattatatgtgtgagccactgtgcccTAcctgccgcttttcttataaggatacttgtcattggatttagggcccatcttaatccaagatgagatgccctcatctcgaggtgctggatttaattacatctgcagattgttttccaaataaaggtacattcacatgttccaggTAGACATATCTTTTGATAGACCACCATGCAATCCACTCTAGGAGTATTAAAGTGCCAGTGTGGACCGAGGCACCAAAGAATCACATTATTATGTCATATAACTTGCCTTATTTGTAGTGACCCGTGGGCTTGGAAACAGAACCATTTGCAGCTGTCAGGGAAGT----GCACAGTGCCTGACCTTTCCCGCAGCCTCCTCCCCACTGGGCTTCCATGAGAGGATCACCCC-TTG-GAGTGTCCAGAGATTCCTGTTAAATGCTAAAGACCACAGGAGAGTTTGGGCGGGGGAAGATGTTTGGGGAGCAACTTAGTTGTCCTGAGGTGCCCATCACCCTTCACCGTTTCAGCAATATGGATCTTCCAAGGATCTGGGAATGGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTGAGTGAGAAGAGGCCAGAGTCTTTCTCTGTGTAGGCACCATCCAGCCCAAGATGAGCATTGTTCCAGAAACACATGCACTCATGATGCTAAACCCAATCTATTGAGGACTTAATACAAACTGTGATTTTTTTAA-Gcattta s panTro4.chr18 74595174 957 - 76611499 gctggagggcagtgtcatgatcacagctcactgaagcctcaatctcccagattcaaggtatgctgtcacctcagcctcctgattagctggtcgctgggactacaggcaggtgccatcatgcctggctgttatattttacatatattttggagagacagggtcttaccatgttgcccaggcaggtcttgaacgcctggagttcaagcgatcctcccaacttgaccttcctcagtggtgg------gattatatgtgtgagccactgtgcccTAcctgccgcttttcttataaggatacttgtcattggatttagggcccatcctaatccaagatgagatgccctcatctcaaggtgctggatttaattacatctgcagattgttttccaaataaaggcacattcacaagttccaggtagacatatcttttgagagaccaccatgcaatccacTCTAGGAGTATTAAAGTGCCAGTGTGGACTGAGGCACCAAAGAATCACATTATTATGTCATATAACTTGCCTTATTCATAGTGACCCATGGGCTTGGAAACAGAACCACTTGCAGCTGTCAGGGAAGTAAGTGCACAGTGCCTGACCTTTCCTGCAGCCTCCTCCCCACTGGTCTTCCATGAGAGGATCACCCC-TTGAGAGTGTCAAGAGATTCCTATTAAATGCTAAAGACCACAGGAGAGTTTGAGAGGGGGAAGATGTTTGGGGAGCAGCTTAGTTGTCCTGAGGTGTCCATCACCCTTCACCATTTCAGCAATATGGATCTTCCAAGGATCTGGGAATGGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTGGGTGAGAAGAGGCCAGAGTCTTTCTCTGTGTAGGCACCATCCAGCCCAAGATGAGCATTGCTGCAGAAACACATGCACTCATGATGCTAaacccaatctattgaggacttaatacaaactgcgatttttttaaagcattta i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90207617 932 - 108868599 gctggagagcagtgtcatgaacacagcttactgaagcctcaacctctcagattcaagctaccctctcacctcagcctcctgagtagttggtagctgggactacaggcgggtgccatcgtgcctggctattatattttatatacattttggagagacaggatctcaccatgttgcccaggcaggtcttgaaagcctggagttcaagggatcctctcaccttgacctccctcagtggtgg------gattatatgtgtgagccactgtgcccTAcctgccgcttttcttataaggatacttgtcactggatttagggcgcatcctaa-----------------tcatctcaaggtgctggatttaattacatctgcagattgttttccaaataaaggcacattcacatgttccaggtagacatatcttttgatagaccaccatgcaatccaCTCTAGGAGTATTAAAGTGCCAGTGTGGACTGAGGCACTGAAGAATCACATTATTCTGTCATATAACTTGCCTTATTTGTAGTGACCTGTGGGCTTGGAAACAGAACCATTTGCAGCTGTCAAGGAAGT----TCACAGTGCCTGACCTTTCCCGCAGCCTCCTCCCCACTGGTCTTCCATGAGTGGATCACCCC-TTGTGAGTGTCCAGATATTCCTGTTAAATGCTAAAGACCACAGGAGCTTTTGGGAGGGGGAAGATGTTTGGGGAGCAACTTTGTTGTCCTGAGTTGCCTATCACCCTTCACTGTTTCAGCAATATGGATCTTCCAAGGATCCGGGAATGGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTAGATGAGAAGAGGCCAGAGTCTTTCTCTGTGTAGTTA----CCAGCCCAAGATGAGCATTGCTCCAGAAACACATGCACTCATGATGCTAAACCCAATCTATTGAGGACTTAATACGAACTACGATTTTTTAAAAGcattta i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45216478 952 - 121039945 gctggagggctgtgtcatgatcacagctcactgaagcctcaatctcccagattcaagctatgctgtcacctcagcctcctgattaggtggtacctgggactacaagcaggtgccatcatgcctggctattatattttatatatattttggagagacaggttctcaccatgttgcccaggcaggtcttgaatgcctggagttcacgtgatcctcccaagttgacattcctcagtggtgg------gattatatgtgtgagccactgtgcccTAcctgccgcttttcttataaggatacttgtcatcggatttagggcccatcctaatccaagatgagatgccctcatctcaaggtgctggatttaattacatctgcagattgttttccaaataaaggcacattcacaagttccaggtagacatatcctttgatagaccaccatgcaatccacTCGAGGAGTACTAAAGTGCCAGTGTGGACTGAGGCACCAAAGAATCACATTATTATGTCATATAACTTGCCTTATTTGTAGTGACCCGTGGGCTTGGAAACAGAACCATTTGCAGCTGTCAGGGAAGT----GCACAGTGCCTGACCTTTCCCGCAGCCTCCTCCCCACTGGTCTTCCATGAGAGGATCACCCC-TTG-GAATGTGGAGAGTTTCCTGTTAAATGCTAAAGACCACAGGAGCGTTTGGGAGGGGGAAGATGTTTGGGGAGCAACTTGGTTGTCCTGAGGTGCCCATCACCCTTCACCGTTTCAGCAATATGGATCTTCCAAGGATCTGGGAATTGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTGGATGAGAAGAGACCAGAGTCTTTCTCTGTGTAGGCACCATCCAGCCCAAGATGAGCATTGCTCCAGAAACACATGCACTCTTGATGCTAAACCCAATCTATTGAGGACTTAATACAAACTGCGATTTTTTAAAACcattta i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36418132 937 + 96509753 gctggagggcagtgtcatgatcacagctcactgaagcctcaacctcctagattcaagctatgctctcacctcagcctcctgattagctggtagct-ggactacaggcaggtgccataatgcctggctattatattttatacatattttggaaagacagggtctcaccatgttgcccgggcaggtcttgaacgcctgcagttcaagcgatcctcccaactggaccttcctcagtgctgg------gattgtatgtgtgagccactgggcccTAcctgccgcttttattataaggatacttgtcattggatttcgggcccatcctaatccaagatgagatgccctcatctgaaggtgctggatttaattacatctgcagagtgtttcccaaataaaggcacattcacaagttccagTTAGACATATCTTTTAATCGACCACCATGCAATCCACTCGAGGAGTATTAAAATGCCAGTGTGGACTGAGGCTCCAAAGAATGACATTATTATATCAAACACATTGCCTTCTTTGTAGTGACCTGTGGGCTTGGAAACAGAACCATTTGCAGCTGTCAGGGAAGT----GCACAGAGCCTGGCCTTTCCCGCAGCCTCTTCCCCACTGGCCTTCCATGAGAGGATCGCCCC-TTGAGAGTGT-GAGAGATTCCTCTTAAATGCTAAAGACCACAGGAGCATTTGGGAGGGGGAAGATGTTTAGGGAGCAACTTAGTTGCCCTGAGGTGCCCATCACCCTTCACTGTTTCAG--------------CAAGGATCTGGGAATGGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTGGATGAGAAGAGGCCAGAGTCTTTCTCTGTGTAGGCACCACCCAGCCCAAGAGGAGCATTGCTCCAGAAACACATGCACTCACGATGTTAAACCCAATCTATTGAGTACTTAATGCGAACTGGGAATTTTTTTAAGCACTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 67799 934 + 80412 gctggagggcagtgtcatgatcacagctcactgaagcctcaacctcctagattcaagctatgctctcacctcagcctcctgattagctggtggct-ggactacaggcaggtgccataATGCCTGgctattatattttaaacatattttggaaagacagggtctcaccatgttgcccgggcagGTCTTGAATGCCTgcagttcaagcgatcctcccaactggACCTTcctcagtgctgg------gattgtatgtgtgagccactgggccctaCCTGCCGCTTTTATTATAAGGATACTTGTCATTGGGTTTCGGGCCCATCCTAATCCAAGATGAGATGCCCTCATCTGAAGGTGCTggatttaattacatctgcagagtgttttccaaataAAGGCACATTCACAAGTTCCAGTTAGACATATCTTTTAATCGACCACCATGCAATCCACTCGAGGAGTATTAAATCGCCAGTGTGGACTGAGGCACCAAAGAATGACATTATTATATCAAACACATTGCCTTCCTTGTAGTGACCTGTGGGCTTGGAAACAGAACCATTTGCAGCTGTCAGGGAAGT----GCACAGAGCT--GACTTTCCCGCAG-CTCTTCCCCACTGG-CTTCCATGAGAGGATCACCCCTTTGAGAGTGC-GAGAGATTCCTCTTAAATGTTAAAGACCACAGGAGCATTGGGGAGGGGGAAGATGTTTAGGGAGCAACTTAGTTGCCCTGAGGTGCCCATCACCCTTCACTGTTTCAG--------------TGAGGATCTGGGAATGGGAACCAGGCATAAGACAGATACATGTGGATGAGAAGAGGccagagtctttctctgtgtaGGCACCACCCAGCCCAAGATGAGCATTGCTCCAGAAACACATGCACTCACGATGTTAAACCCAATCTATTGAGTACTTAATGCGAACTGGGAAtttttttAAGCACTTA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=763659.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 114463 1500 + 478999 attcttaccacagtcctttgtcatcttattatctccattttacagataaagaaacaggcacagagggtttaagtaacatgtacaaggtcacacaatcacaactagtaaagccaggattaaagtccagtcagtctgcattcaaagcctgtgctcctGCCCCAAAATGACAAGTAATGACTTAAAGGCAAGAAAAACACACTCTCCTCTACCCACCATCCTCATACAGA--CTTCCAGCCCAGGATCTAAACcattcattcatttgctctcatattcattcattcattcattca--------gttcttcatcacacattTAGTGAAGCTCTGTCATGGAATGTCCAAACAGAAGGTACAAAAATGAGGCAGGTATATTTTCTCCCATCTAAAGGGGGATGACCACGTGAAGAGAACCGATGGGCTGTGTGTCCCATGGCCTTACAGGGCAGTGGTGGAGGGTGGCCCAGGTCATCCACTCTCTGGGGAGGCAGAACCAGAAGCACCAGTTGGACAACTGCTAAAGAGATGTTTGTGCAGCCTCATATGTTAAGTCCTATATTTTGAAAGCTTTTTAAATTTTTTCTTTAAGATTTTAGATGCTTACCACTGAGTACCAGAGGGATGTAGCCTGATGCCCTTATCAACAAAGTCAGGGATGGTGGCACACAAGGTTTGACTACTGCATACACGGTCACAGTGCTACCCCCAGATAGCCTGATTTCCCCTGCCTTCTCTGGTGGGGAGAAGGGCTGGCAGAGCCATTAGCATGGGCTTCAGCCAATCCTGGCCACTTTGATGCTCCTGGTGCTGACCCAgggtcctggaggatgggctgaggcggcggggtagagatgttcagggcagtggcccctttccatccacactggaactatttcagtattttaccaccaattcggctattcccttatcggctggctgaacatcggccctgCTCCAGGTCTCAGTTTCCCCTTTGTAAAGGGAAAGCCCTGGATTCAGGGGTGACTAG--GTCATCATGGTCTTGAGATTCCAGGCCTGTAGGCAGGGGGAGAGAGGTTCACTAGGAGTGCAGAAGACCAAGGTTGGGGAGAGGCAGAGGAGAGAGTGGCCTCCCTTTGGCCCAGGTGGGAGATTCACAGAGACAACCTTCCTTCTTCTCCAAGGCAGGACTTGTTAACAGTGAGCTTCAGGCAGTCTGGCACTTGGGACTAACTAGGATGTCACCCTCCCTGCAG---CCTCCACTCCATAGACAACATGAGAGGAGTGTG-TAAGTATAACTAGGAACAGGCTAGTGTCCTGATATTCTCTGTGATAGAGGGGACAGCCCTCCTCAGAGACCCGGGGGAGCCCAGAACCATGGACAGCCTGAACACACTTTACTTTCTCAGCAGTGGCAACCAGAACCCTAGCCTACTAAAGCCGAAATTaaaaggagaaaaacctaaattcctgcctgtaccaggctgactcacatcaaggccctgctaggactaagctaactttatataca s panTro4.chr18 74596131 1511 - 76611499 attcttaccacagtcctttgtcatcttattgtctccattttacagataaagaaacaggcacagagggtttaagtaacatgtacgacgtcacacaatcacagctagtaaagccaggattaaagtccagtcagtctgcattcaaagcctgtgctcctGCCCCAAAATGACAAGTAATGACTTAAAGGCAAGAAAAACAGACCCTCCTCTACCCACCATCCTCATACACAGCCTTCCAGCCCAGGATCTGAGCcattcattcatttgctctcatattcattcattcattcattcattcattcagttcttcatCATACATTTAGTGAAGCTCTGTCATGGAATGTCCACACAGAAGGTACAAAAATGAGGCAGGTGTATTTTCTCCCATCTAAAGGGGGATGACCACGTGAAGAGAACTGATGGGCTGCATGTCTAATGGCCTTACAGGGCAGTGGTGGAGGGTGGCCAAGGTCATCCACTCTCTGGGGAGACAGAACCAGAAGCACCAGTTGGACAACTGCTAAAGAGATGTTTATGCAGCCTCATATGTTAAGTCCTATATTTTGAAAGCTTTTTAAATTTTTTCTTTAAGATTTTAGATGCTTACCACTGAGTACCAGAGGGATGTAGCCTGATGCCCTTATCAACAAAGTCAGGGATGGTGGCACACAAGGTTTGACTACTGCATACACGGTCACAGCACTACCTCCAGATGGCCTGAATTCCCCTGCCCTCTCTGGTGGGGAGAAGAGCTGGCAGAGCCATTAGCATGGGCTTCAGCCAATCTTGGCCACTTTGATGCTCCTGGTGCTGACCCAgggtcctggaggatgggctgaggtag-ggggtagagatgttcagggcagcggcccctttccatccacactggaactatttcagtattttaccaccaattcatctattcccttgtgcactggctgaatatcagccctgCTCCAGGTCTTAGTTTCCCCTTTGTAAAGGAAAAGCTCTGGATTCAGGGGTGATGAGAGGCCATCATGGTCTTGAGATTCCAGGCCTGTAGGCAGGGGGTGAGAGGTTCACTAGGAGTGCAGAAGACCAAGGTTGGGGAGAAGCAGAGGAGAGAGTGGCCTCCCTTTGGCCCAGGTGGGAGGTTCACAAAGACACCCTTCCTTCTTCTCCAAGGCAGGACTTGTTAACAGTGAGCTTCAGGCAGTCTGGCACTTGGGACTAACTAGGATGTCACCCTCCCTGCAG---CCTCCACTCCATAGGCAACATGAGAAGAGTGTG-TAAGTATAACTAGGAACAGGCTAGTGTCCTGATATTCTCTGTGATGGAGGGGACAATCCTCCTCAGAGACCCAAGGGAGCCCAGAACCATGGACAGCCTGAACACACTTTACTTTCTCAGCAGTGACAATCAGAACCCTGGCTTACAAAAGCAGAAATTaaaaggagaaaaacctaaattcctgactgtaccaggctgactcactccaaggccctgctaggactaagctaactttatgtaca i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90208549 1503 - 108868599 attcttactacagtcctttgacatcttattatctccattttacagataaagaaacaggcacagagggtttaagtaacttgcacaaggtcacacaatcacaactattaaagccagaattaaagtccagtcggtctgcattcaaagcctgtgctcctGCCCCAAAATGAAAAGTAACGACTTAAAGGCAAGAAAAACAGACCCTCCTCTACCCACCATCCTCATACACAGCCTTCCAGCCCAGGATCTGAGCcatttattcatttgctctcacattcattcattcattcattca--------GTTCTCCATCACACATTTAGTGAAGCTCTGTCATGGAATGTTCACACAGAAGGTACAAAAATGAGGCAGGTGTATTTTCTCCCATCTAACGGGGGATGACCACATGAAGAGAACTGATGGGCTGTGTGTCCCATGGCCTTACAGGGCAGTGGCGGAGGGTGGCCCGGGTCATCCACTTTCTGGAGAGGCAGAACCAGAAGCACCAGTTGGACAACTGCT--AGAGCTGTTTATGCAGCCTCATATGTTAAATCCTATATTTTGAAAGCTTTTTAAATTTTTTCTTTAAGATTTTAGATGCTTATCACTGAGCACCAGAGGGATGTAGGCTGATGCCCATATCAACAAAGTCAGGGACCGTGGCACACAAGGATTGACTACTGCAGACACGGTCACAATGCTACCTCTAGATGGCCTGAATCCCCCTGCCCTCTCTGGTGGGGAGAAGGGCTGGCAGAGCCATTAGCATGGGCTCTGGCCAATCCTGGCCACTTTGACGCTCCTGGTGCTGACCCAgggtcctggaggaagggatgaggtgg-gcagtagagatgctcagggcagcagcccctttccatccacactggaactatttcagtattttaccaccaattcggccattcccttatgcgctggctgaacatcagccctgctccaggtctcagtttccccattgtaaagggaaagctgtggattcAGGGGTGACCAGAGGTCATCATGGTCTTGAGATTCCAGGCCTGTAGGCAGGGGGTGAGAGGTTCACTAGGAGCACAGAAGGCCAAGGTTGGGGAGAGGCAGCAGAGAGAGTGGCCTCCCTTCAGCCCAGGTGGGAGGTTCACAGAGACACACTTCCTTCTTCCCCAAGGCAGGACTTGTT-ACAGTGAGCCTCAGGCAGTCTGACTCTTAGGACTAACTACAATGTCACCCTCCCTGCAGCGTCCACCACTCCATAGACACCACGAGAGGAGTGTG-TAAGTATAACTAGAAACAGGCTAGTGTCCTGATATTCTCTGTGATGGAGCGGACAGCCCTCCTAAGAAACCCGGAGGAGCCCAGAACCATGGGCAGCCTGAATACACTTTACTTTCTCAGCAGTGACAATCAGAACCCTGGCCTACTAAAGCAGAAATTaaaaagagaaaaacctaagttcctgcctgttccaggctgactcactccaaggccctgctaggattaagataactgtatataca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45217430 1503 - 121039945 attcttaccacagtcctttgtcatcttattatctccattttacagataaagaaacaagcacagaggatttaagtaacatgtacaaggtcacacaatcacaactagtaaagccaggattaaagtccagtcagtctgcattcaaagcctgtgctcctGCCCCAGAATGACAAGTAATGACTTAAAGGCAAGAAAAACAGACCCTCCTCTACCCACTATCCTCATACACAGCCTTCCAGCCCAGGATCTGAGCcattcattcatttgctctcatattcattcattcattcattca--------gttcttcatcacacattTAGTGAAGCTCTGTCATGGAATGTCCACACAGAAGGTACAAAAATGAGGCAGGTGTATTTTCTCCCATCTAAAGGGGGATGACCACATGAAGAGAACTGATGGGCTGTGTGTCCCATGGCCTTACAGGGCAGTGGTGGAGGGTGGCCCAGGTCATCCACTCTCTGGGGAGGCAGAACCAGAAGCACCATTTGGACAACTGCTAAAGAGATGTTTATGCAGCCTCATATGTTAAGTCCCACATTTTGAAAGCTTTTTAAATTTTTTCTTTAAGATTTTAGATTCTTACCACTGAGTACCAGAGGGAAGTAGCCTGATGCCCTTATCAACAAAGTCAGGGATGGTGGCACACAAGATTTGACTACTGCATACACGGTCACAGTGCTACCTCCAGATGGCCTGAATTCCCCTGCCCTCTCTGGTGGGGAGAAGGACTGGCAGAGCCATTAGCATGGGCTTCAGCCAATCCTGGCCACTTTGATGCTCCTGGTGCTGACTCAgggtcctggaggaagggctgaggtgg-ggggtagagaagatcagggcagcagctcctttccatccacactggagctatttcagtattttaccatcaattcggctattcccttatgcactggctgaacatcagccctgCTCCAGGTCTCAGTTTTTGCTTTGTAAAGGGAAAGCTCTGGATTCAGGGGTGATGAGAGGTCATCATGGTCTT-AGATTCCAAGCCTGTAGGCAGGGGGTGAGAGGTTCACTAGGAGTGCAGAAGACCAAGGTTGGGGAGAGGAAGAGGAGAGAGTGGCCTCCCTTCGGCACAGGTGGGAGGTTCACAGAGACACCCTTCCTTCTTCTCCAAGGCAGGACTTGTTAACAGTGAGCTTCAGACAGTCTGGCGCTTGGGACTAACTAGGATGTCACCCTCCCTGCAG---CCTTCACTCCATAGACAACATGAGAGAAATGTGTTAAGTATAACTAGGAACAGGCTAGTGTCCTGATATTCTCTGTGATGGAGGGGACAGCCCTCCTCAGAGACCCGGGGGAGCCCAGAACCACGGACAGCCTGAACACACTTTACTTTCTCAGCAGTGACAACCACAACCTTGGCCTACTAAAGCAGAAATTaaaaggagaaaaacctaagttcctgcctgtaccaggctgactcactccaaggccctgctaggACTAAGCTAACTTTATATACA i nomLeu3.chr6 C 0 M 919 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 68733 0 + 80412 C e macFas5.chr10 36419069 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=2553.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 115963 15 + 478999 aggccaagcagagcc s panTro4.chr18 74597642 15 - 76611499 aggtcaagcacagca i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90210052 15 - 108868599 aggccaggaagagcc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 68733 0 + 80412 C e macFas5.chr10 36419069 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M e nomLeu3.chr6 45218933 919 - 121039945 M a score=548862.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 115978 1118 + 478999 cagaaggaatggactccaggaacagggatgagaagaacaagttcttcttatcagcttccccctttgagattctttcctaggccagtatgtctttgctctgctctcataactatttttgtaactatttctgtaagtttgtaaggattttgtaagttcctgttttccatctgtgcaacactgagaaggtcacaagacatgtctgagcaagcctaaaatagtaaccatctgctgagggcctgctggacggcccagcagaggtcaccaggcatgtttgagtcatacacctgtcactgtttgattaactgcctttgttctgcttctgtaagcttgctaagcccaccctgtgagtttcacgcagctgcatgcttaaaaaccaggccccatctttgttccaggctcagccttttggatgcgaatctactaggccagtggccactttaataaaatcctcctgtctcatc-cattggtctctccagtctcttgaatcccgcaacaCTACAATGGCTCCAAGACAGCATGTGGGATCTAAGTAATAACtttttattttttttattttttttatttttgtacaagactgggtctggctttttcacccaggctggagtgcagtggtgcaatcacagctcactgcagccacctcctggtctcaagccaccctcccaccttagcctcctaagtaacttaggactacagttgtataccactatggttggctaatttttgtattttttgcagagacaaggtctcactgtatt-----gctcaggctggtttcaaattcttgagctcaagagatttactagtctcagccttccaaagtgctaggattacaggcacgagacaccgttcctggccAGTAATTTTGTTTTATTATATTAAGGTGAGGTTTATACCACAttcttctggttacagaagtaatacgtgctcattgtat-acactgaaaaatgtaagcagtataaagaagaaaataaaaaaggatatgaaaatcactagtggtcccattgcctaCCGTAACATTATGTGCTGCTTCTTAATCTTTACTTCCTCTCCCTCCgtgtgtgtctttgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtggttttttgttt-----gtttttttgGCACATAGTacaat s panTro4.chr18 74597657 1114 - 76611499 cagaaggaatggactccaggaacggggatgagaaaaataagttcttcttatcagcttccccctttgagattctttcctaggccagtatgtctttgctctgctctcataattatttttgtaactatttctgtaagtttgtaaggattttgtaagttcctgttttccatctgtgcaacactgagaaggtaacaagacatgcctgagcaagcctaaaatagtgaccatccactgagagcctgctgggcagcccagcagaggtcaccaggcatgtttgagtcatacacctgtcactgtttgattaactgcctttgttctgcttctataagcttgcca-tcccgccctgtgagtttcacgcagctgcatgcttaaaaaccaggccccatctttgttcggagctcagccttttggatgcgaatccactaggccagtggccactttaataaaatcctcctgtctcatc-cattggtctctccagtctcttgaatcccgcaaTGCTACAATGGCTCCAAGACAGCATGTGGGATCTAAGTAATAACttttttgtttgtttgttttt---atttttgtataagactgggtctggctttttcacccaggctggagtgcagtggtgcaatcacagctcactgcagccacctcctggtctcaagccaccctcccacctcagcctcccaagtaacttaggactacagttgtataccactatggttggctaatttttgcattttttgcagacacaaggtctcactatatt-----gctcaggttggtttcaaattcttgagctcaagaggtttactagtctcagctttctaatgtgctaggattacaggcgtgagacaccgtgcctggccAGTAATTTTGTTTTATTATATTAAGGTGAGGTTTATACCACAttcttctggttacagaagtaatacatgctcattgtat-acactgaaaaatgtaagcagtataaagaagaaaataaaaaagaatatgaaaatcattagtggtcccattgcctaccataacattatgtgctgctttctaatctttACTTCCTCTCCCTCCAtgtgtgtctttgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgGTTTTTTGTTT-----GTTTTTTTGGCACATAGTacaat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90210067 1115 - 108868599 cagaaggaatggactccaggaacagggatgagaaaaacaagttctccttatcagcttccccctttgagattctttcccaggccaatatttctttgctctgctctcataactatttttgtaactatttctgtaagtttataaggattttttaagttcctgttttccacctgtgtgaccctg---aggtcacaagacatgcctgagcaaacctaaaatagttaccatctgctgagagcctgctgggtggcccagcagaggtcaccagacatgtttgagtcatacacttgtcactgtttgattaactgcctttgttctgcttctgtaagcttgctaagcccaccctgtaagttttgcacagctgcatgcttaaaaaccaggccccatcttttttccgggctcagccttttggatgcaaatccactgggcaagtggtcactttaataaaatcctcctgtctcacc-cattggtatctccagtctcttgactccctcaacaCTAAGATGGCTCCAAGACAGCATGTGAGATTTAAGTAATAACtt----gtttgtttgttttt---atttttgtatgagactgggtctggctttttcacccaggctggagtgcagtggtgcaatcacagctcactgcagccacttcctgggctcaagccaccctcccacctcagcttcccaggtaacttaggactacaggtgtacaccactatcgttggctaatttttgtattttcc-cagagacaaggtctcactgtcttactgagctcaggctggtctcaaattcctgagctcaagagatttaccagtttcagccttccaaagtgctaggattacaggcatgaaacactgtgcctggccAGTAATTTTGTTTTATTATATTAAGGTGAGGTTTATACCAACttcttctgattacagaagtaatacatgctcattatataacactg-aaaatgtaagcagtataaagaagaaaataaaaaagaatatgaaaatcactagtggtcccattgcctaccgatacactatGTGCTGCTTCCTAATCTTTACTTCCTCTTCCTGCATGTGTGTCTTtgtgtgtgtgtg--tgtctgtctgtctatctgtctgtGTGGTTTTTTTGGCACATAGGacaat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45219860 1109 - 121039945 cagaaggaatggactccaggaacggggatgagaagaacaagttcttcttattggcttccccctttcagattctttcctaggcctgtatgtctttgctctgctctcataactatttttgtaactatttctgtaagtttgtaaggattttgtaagttcctgttttccatctgtgcaacactg---aggtcacaagacatgcctgagcaagcctaaaatagtgaccatcagctgagggcctgctgggcggcccagcagaagtcaccaggcatgtttgagtcatacacctgtcgctgtttgattaactgcctttgttctgcctctataagcttgctaagcctgccctgtgagtttcacgcagctgcatgcttaaaaaccaggccccatctttgttcaggcctcagccttttggatgcgaatccactaggccagtggtcactttaataaaatcctcccgtctcatcacattggtctctccagtctcttgaatcccccaacaCTACAATGGCTCCAAGACAGCACGTGGGATCTAAGTAATAACtt----ttttgtttgttttt---atttttgtacaagacagggtctggctttttcaccccggctggagtgcagtggtgcaatcacagctcactgcagccacctcctggtctcaagccatcctcccacctcagcctcccaagtaacttaggattacagttgtataccactatgattggctaatttttgtattttttgcagagacaagggctcactatatt-----gctcaggctggtttcaaattcttgagctcaagagatttactagtctcagccttccaaagtgctaggattacaggtgtgagacaccgtgcctggccAGTAATTTTGTTCTATTATATTAAGGTGAGGTTTATATCACAttcttctggttacaggagtaataaatgctcattgtat-acactgaaaaatgtaagcagtataaagaagaaaataaaaaagaatatgaaaatcactagtggtcccattgcctaccataacattatgtgctgcttcctaatctttacttcctctccctccatgtgtgtcttcatgtgtgtgtgtctgtctgtgtggttttttgttt-----gtttttttgGCACATAGTacaat i nomLeu3.chr6 M 919 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 68733 0 + 80412 C e macFas5.chr10 36419069 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=503190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 117096 421 + 478999 agctgacatttatatcttcccgaccagtgttgagcatggtgttaagcaattgacaaagtgtattgtatttaactcctacagaaaacctaaaaaggggaagggcagtataattaatagaattttccagatgaaaagactggggcctgagttgaggttaCATTTTATATATGGCATTATATTGTACTTCAGACATGTAACATAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTGGTCTGTTAGTCTGTataataacataagcatcttttgtgggattaatagtttttccaaagcatgcctgggatgtttgcataatattctagtgtttaaatatgttgcttattgccaggtgtggtggctcatgcctgtaatcccagcattttgggagttcgagacagatggattgcctgagctcaggagtttgagtccagc s panTro4.chr18 74598771 421 - 76611499 agctgacatttatatctctctgaccagtgttgagcatggtgttaagcaattgacaaagtgtattgtatttaactcctacagaaaatctaaaaaggggaagggcagtataattaatagaattttccagatgaaaagactggggcCTGAGTTGAGGTCACATTTTATATACGGCATTATATTGTACTTCAGACATGTAACATAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTGGTCTCTTAGTCTGTataataacataagcatcttttgtgggattaatagtttttccaaagcatgcctggaatttttgcataatattctagtgtttaaatatgttgtttattgccaggtgtagtggctcacgcctctaatcccagcattttgggagttcgagacagatggattgcctaagcttaggagtttgagtccagc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90211182 421 - 108868599 agctgacatttatagctcccctaccagtgttaatcattgtgttaagcaattgacaaggtgtattttatttaactcctacagaaaacctataaaggcgaagggcagtataattaacagaattttccagatgaaaagactggggcCTGACTTGAGGTCACATTTTATACACAGCATTGTATTTTACTTCAGACACTTAACAAAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTCGTCTGTTAGTCTacataataacataagcatcttttgtaggattaatagtttttccaaagcatgcctggaatgcttacataacattttagagtttaagtatgttgtttatcgccaggcacagtggctcacgccggtaatcccagcattttgggaatccgagacaggtggattgcctgagctcaggagtttgagaccagc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45220969 421 - 121039945 agctgacatttatatctccctgaccagtgttgagcatggtgttaagcaattgacaaagtgtattgtatttaactcctacagaaaacctaaaaaggggaagggcagtataattaatagaattttccagatgaaaagactggggcCTGAGTTGGGGTCACATTTTATATATGGCATTATATTGCACTTCAGACACTTAACATAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTGGTCTCTTAGTCTatataataacataagcatcttttgtgggattaatagtttttccaaagcatgcctggaatgtttgcataatattctagtgtttaaatatattgtttattgccaggtgcggtggctcacgcctgtaatcccagcattttgggagtttgaggcaggtggattgcctgagcttaggagtttgagaccagc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36419069 416 + 96509753 AGCTGTCATTTATATCTCCCCTACCAGTGTTGCACATGGTATTAAGCATTTGACAAAGTATATTGTA-TTAACTCCTGCAGAAAACCTAAAAAGGGGAAGGGCAGTATAATTAATAGAATTTTCCATATGAAAAGACGGGGACTTGAGTTGAGGTCACAATTTATATATGGCATTATATTGTACTTCACACACGTAACATAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTGGTCTCTTAGTCTATATAATAACATAAGCAACTTTTGTGAG----ATTGTTTTTCCGAACCATGCCTGGAATATTTGCATAACATTCCAGTGTTTAAATATGTTGTTTACTgccaggtgtggtggctcacgcctgtaatcccagcattttgggactccaaggcaggtggattgcctgagcttaggagttcaagatcagc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 68733 420 + 80412 AGCTGTCATTTATATCTCCCTTACCAGTGTTGCACATGGTATTAAGCATTTGACAAAGTGTATTGTA-TTAACTCCTGCAGAAAACCTAAAAAGGGGAAGGGCAGTATAATTAACAGAATTTTCCATATGAAAAGACGGGGACTTGAGTTGAGGTCACAATTTATATATGGTATTATATTGTACTTCACACACGTAACATAGTAAGTGTCCTGGAGAATCTTGGTCTCTTAGTCTATATAATAACATAAGCAACTTTTGTGAGATTAATTGTTTTTCCGAACCATGCCTGGAATATTTGCATAACATTCCAGTGTTTAAATATGTTGTttattgccaggtgtggtggctcacgcctgtaatcccagcattttgggactccaaggcaggtggattgcctgagcttaggagttcaagaccagc i papAnu2.JH684867 C 0 I 414 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=182775.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 117517 247 + 478999 ctaggcaacacggtgaaa--ccccatctctactaaaatac-aaaaaaatagtgaggcgtggttgg-tgtgcctgtattcccagctacttgggaggctgaaacaggagcattgcttgaacctgggagaaggattttgcagtgagctgagatcgtggcactgcaccccagtctgagcaacagagtgagaccccatct-----------aaaaaaaatgttgtttatcaaaccattttcatctttgaaacatttcaggtctcttc s panTro4.chr18 74599192 248 - 76611499 ctaggcaacacagtgaaa--cctcatctctactaaaatac-aaaaaaatagtgaggcttggtggggtgtgcctgtattcccagccacttgggaggctgagacaggagaattgcttgaacctgggagatggattttgcagtgagctaagatcgtggcactgcaccccagcctgggcaacagagtgagaccccgtct-----------aaaaaaaatgttgtttatcaaaccattttcatctttgaagcatttcaggtctcctc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90211603 253 - 108868599 ctagccaacatggtgaaa--ccccatctctactaaagtac-aaaaaaatagccagacatggtggggtgtacctgtattcccagctacttgggaggctgagacaggagaagtgcttgaacctgggaagtggaggttgtggtgagccgagattgtgccactgcaccccagcctgggcaacagtgtgagaccttgtctcaaaa-----aaaaaaaaatgat-tttatcaaaccattttcatctttgaaacatttcaggtctcctc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45221390 256 - 121039945 ctaggcaacacggtgaaaccccccatctctactaaaatacaaaaaaaatagcaaggcgtggtggggtgtgcctgtattcccagctacttgggaggctgagacaggagaattgcttgaacctgggaggtggatgttgcaatgagccgagatcgtgccactgtaccccagcctgagcaacagagcaagaccctgtctcaaaa------aaaaaaaatgttgtttatcaaaccattttcatctttgaaacatttcagttctcctc i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36419485 258 + 96509753 cttagcaacacagggaaa--ccccatctctactaaaatac-aaaaacatagccaggcgtggtggggtgtgcctgtattcccagctacttgggagactg-gacaggagaatttcttgaacctgggggatggatgttgcagtgagctgtgatcgtgccactgcaccacagcctgggcaacagagcaagacttcgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTTGTTTCTCAAACCATTTTCATCTTCGAAACATTTCAGGCCTCCTC i macFas5.chr10 C 0 M 5716 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 69153 414 + 80412 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=572796.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 117764 1183 + 478999 tttggctttttcgcattattaataatactgtgataaacatccttcagcagaaaccttcataggctagcttcctagaagtagaggtattaggtccaaggttttgaattgttttaaagctattgatttatctggataaaattgcttccagagatattgtcccattttgctttccaatcagTGGATCTCACCTTCAGTATTTTGTGCAATTAAAAAAAATAATGTTTCTCCTTTTAAAGATTATATTTAAAATAGCTTTTAAATATGAAAAATTTGTATCTACAAATAAGAGATAGTGACAAAAAATAAATAATAAAATAAACACAAGAGCAGAAAGTAGATTGAAACATTAAAATTCAAATCACAGGCCTCTGTTATGGAGAAGACAGCTGCAATAGCTTTTCTGTTCTTTTATCTA-CATTGGTAGGTTCTTCTTTTAATTAATTTTTACCCCAACTTAAGTGCTGGCTGGTTTGGCAATTTGTTGCTGGGATGGAAAGAAGAAATGTGCACCTTGTCTTTTGCAGGTTATGAGAGCCTTGTCTGTCCTTGTGGTTGTGTGGGTGT---------------CTGTTAGATTATTGTGAATACTGAGCTTTGAAAATAACCTAACAGTCAATCAATTGCTGAGCTTCTATTACCAGTAGTGGGACATAATGTACATCATGTAGATAGGCAGGCTTGTCACTGACAAGGGGGCTGACCCCTGGAAAACCAGCACAGAGCCAGCTCTTCTGTGTGAATCCACTCTCTCCAGAATATACCATAAGTCATGGAAAGAAATAAGAGTCTCAGGAAATGAGACTCTTACCGCGATGAGAGGTGAACCTTGAAA-TCTATTTTAGCAATTAGGAAGAGAAGTCCCATTTCGCATCCCAAATCAAGTAGAGGCCTGCTAGTCCAAACATAGTTTCTGAATAACCTGAGTCACCTGGGCCCTGAGGAATCCTGGCCTCTTAGTCCACATTTGCAGAAATATCAGGAGGTCAATCAGGAAGCTGGTTAGGCAGCTCAACACAGGGTCAGAAAGCTCCTAGGTATGCAAATAAATGTGCACACTGGAAATTGAGTTCTGTAATTTTTCCATGACCTAGAAAATtacgatgatgaaaatgttctacattcatgctgcctagttcagtagccactagccacatgtggctattgagtaattgagatgtggctagta s panTro4.chr18 74599440 1184 - 76611499 tttggcttttttgcattataaataatactgtgataaacatccttcagcagaaaccttcatacgctagcttcctagaagtagaggtattaggtccaaggttttgaattgttttaaagctattgatttatctggataaaattgcttccagagatattgtcccattttgcattccaatcagTGGATCTCACCTTCAGTATTTTGTGCAATTAAAAAAAATAATGTTTCTCCTTTTAAAGATTATATTTAAAATAGCTTTTAAATGTGAAAAATTTGTATCTACAAATAAGAGATAGTGACaaaaaataaataatataataaaCACAAGAGCAGAAAGTAGATTGAAACATTAAAATTCAAATCACAGGCCTCTGTTATGGAGAAGACAGCTGCAATAGCTTTTTTGTTCTTTTATCTA-GATTGGTAGCTTCTTCTTTTAATTAATTTTTACCCCAACTTAAGTGCTGGCTGGGTTGGCAATTTGTTGCTGGGATGGAAAGAAGAAATGTGCACCTTGTCTTTTGCAGGTTATGAGAGCCTTGTCTGTCTTTGTGGTTGTGTGGGTGT---------------CTGTTAGATTACTGTGAATATTGAGCTTTGAAAATAACCTAACAGTCAATCAATTGCTGAGCTTCTATTTCCAGTAGTGGGACACAATGTACATCATGTAAATAGGCAGACTTGTCACTCACAAGAGGGCTGACCCCTGGAAAACCAGCACAGAGCCAGCTCTTCCATGTGAATCCACTCTCTCCAGAATATAACATAAGTCATGGAAAGAAATAAGAGTCTCAGGAAATGAGACTCTTACCATGATGAGAGGTGAACCTTGAAAAGCTATTTTAGCAATTAGGAAGATAAGTCCCCTTTTGCATCCCAAATTAAGTAGAGGCCTGCTAGTCCAAACATAATTACTGAATAACCTGAGTCACCTGGGCCCTGAGGACTCCTGGCCTCTTAGTCCACATTTGCAGAAATATCAGGAGTTCAATCAGGAAGCTGGTTAGGCAGCTCAACACAGGGTCAGAAAGCTCCTAGGCATGCAAATAAATGTGCACACTGGAAATTGAGTTCTGCAATTTTTCCATGACCTAGAAAGctatgatcatgaaaatgttctacattcatgctgcctagttcagtagccactagccacatgtggctattgagtaattgagatgtggctagta i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90211856 1177 - 108868599 tttggctttttcacattataaataattctgtgataaacatccttcagcagaaaccttcgtaggctagcttcctagaagtagaggtattaggtccaaggttgtgaattgttttaaagctattgatttttctggataaaattgcttccagagatactgtctca--TTGCATTGCAGTCAGTGGATCTCACCTTCAGTATTTTGTGCAATTAAAAAAAAGAATGTTTCTCCTTTTAAAGATTATATTTAAAATAGCTTTTAAATATGAAAAATTTGTATCTACAAATAAGAGATAGTGAAAA-----AAATAATAAAAGAAACACAAAAACAGAAAGTAGATGAAAACATTAAAACTCAAATCACAGGCCTCTGTCATGGAGAAGACAGCTGCAATATCTTTTTTGTTCTTTTATCTATCCTTGATACATTCTTCTTTTAATTAATTTTTACCCCAACTTAATTGCTGGCTGAGTTGTTGATTTGTTGCTGGGATGGAAAGAAGAAATTTGCACCTTGTCTTTTGCAGGTTATGAGAGCGCTGTCTGTCCTCATGGTTATGTGGGTGT---------------CTTTTAGATTATTGTCAATATTGAGCTTTGAAAATCACCTAACAGTCAACCAATTGCTGAGCTTCTATTACCACTAGTGGGACACAATGTACATCATGTAGAGAGGCAGACTTGTCACTGACAAAAGGTTTGACCCCTGGAAAACGAGCACAGAGCCAGCTCTTCTGTCTGAATCCACTCTCTCCAAAACATAACATAAGTCATGGAAAGAAATAAGAGTCTCAAGAAATGAGACTCTTACCGTGATGAGAGGGGAACCTTGAAAAGCTACTTTAGTGATTAGG-AGAGAAGTCGCCTTTTGCAACCCAAATCAAGCAGAGGAGTGGTAGTCCAAATATAATTTCTGAATAACCTGAGTCACCTGGATCCTGAGGAATCCTGGCCTCTTAGTCTACATTTGCAGAAATATCAGGAGGTCAATCAGGAAGCTGGTTAGTCATCTCAACACAGGGTCAAAAAGCTCCTAGGTATGCAAATAAATGTGCACACTGGAAATTGAGTTCAGTAATTTTTCCATGGCCCAGAAAActacgatgatgaaaatgttctacatttgtgctggccagttcagtagccactagccacatgtggctattgagtaactgaaatgaggctagtg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45221646 1183 - 121039945 tttggcttttttgcattataaatagtactgtgatacacatctttcagcagaaaccttcataggctagcttcctagaaggagaggtattaggtccaaggttatgaattgttttaaagctattgatttatctggataaaattgcttccagagatattgtccaatttcacattccaatcagTGGATCTCACTTTCAGTATTTTGTGCAATTAAAAAA---AATGTTTCTCATTTTAAAGATTATATTTAAAATAGCTTTTAAATATGAAAAATTTGTATCTACAAATAAGAGACAGTGACAAAAAATAAATAAT-----AAACACAAGAGCAGAAAGTAGATGAAAACATCAAAATTCAAATCACAGGCCTCTGTTAT---GAAGACAGCTGCAGTAGCTTTTCTGTTCTTTTATCTA-CATTGGTAGATTCTTCTTTTAATTACTTTTTACCCCAACTTAAGTGCTGGCTGGGTTGGCAATCTGTTGCTGGGATGGAAAGAAGAAATGTGCACCTTGTCTTTTGCAGGTTATGAGAGCCTTGTCTGTCCTTGTGGTTGTGTGGGTGTTAGATTATTAGATTATTGTTAGATCATTGTGAATATTGAGCTTTGAAAATAACCTAA----CAATCAATTGCTGAGCTTCTATTACCAGTAGTGGGACACAGTGTACCTCATTTAGAGAGGCAGACTTGTCACTGACAAGGGGACTGACCCCTGGAAAACCAGCACAGAGCCAGCTCTTCTGTCTGAATCCACTCTCTCTAGAATAGACCATAAGTCATGGAAAGAAATAAGAGTCTCAGGAAATGAGACTCTTACCGCAATGAGAGGGGGACCCTGAAAAGCTATTTTAGCGATTAGGAAGA-AAGTCCCCTTTTGCATCCCAAATCAAGTAGAGGCCTGGTAGTCCAAAAATAATTTCTGAATAACCTGAGTCATCTGGGCCCTGAGGAATCCTGGCCTCTTAGTCCACATTTGCAGAAATATCAGGAGGTCAATCAGGAAACTGGATAGGCAGCTCAACACAGGGTCAGAAAACTCCTAGGTATACAAATAAATGTGCACACTGGAAATTTAGTTCTGTAATTTTTCCATGACCTAGAAAActatgatgatgaaaatgttctacattcatgctgcctagttcagtagccaccagccacatgtggctattgagtaactgagatgtggctagta i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 69153 414 + 80412 I e macFas5.chr10 36419743 5716 + 96509753 M e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=387318.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 118947 495 + 478999 caactgaccagct-aatgttaaattttgttttatttgaattaattttaattttaatagtcacctgtggctattggctactgcactggatagcacagAGATGAGAAATAATAGAAACCTTTTT-TGTTGTTGTTTCAATGGCTAACATTGTCAAAAGTTGAATTCCTGTTTTATGTAAAATTTTGGTTTATATTTTCTCAAAGAAGGGAAGTACAAaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaGGATGATCAAGCAGAACTTTGGTAAGGAAGGGTGAAGCAGAGACACTTAACTCAGAGTGGGGAAAACAGCAATGACCTTGTTTGAAATGCAGCTCCTGTCTATGTGGCTCTCTGTGCTCTGTTGGGGTGTCAG-TTCTTTACTTCTTAGTTAAAGCAGTTATTTCGGCGGTGCAATGCTTTTTTGTTCAATAAGCATGACTTTTTACACAGCTGGTTTATCTCCAGTATGGAAACTCTCTGCTTAATCATCTTG s panTro4.chr18 74600624 490 - 76611499 caactgaccagct-aatgttaaattttgttttatttgaattaattttaattttaatagtcacctgtggctattggttactgcactggatagcacagAGATGAGAAATAATAGAAACTTTTTT-TGTTGTTGTTTCAATGGCTAACATTGTCAAAAGCTGAATTCCTGTTTCATGTAAAATTTTGGTTTATATTTTCTCAAAGAAGTGAAGTACAAaaaacaaaacaaaacaaaacaaaa-----GGATGATCAGGCAGAACTTTGGTAAGGAAGGGTGAAGCAGAGACACTTAATTTGGAGTGGGGACAACAGCAATGGCCTTGTTTGAAACGCAGCTCCTGTCTGTGTGGCTATCTGTGCTCTGTTCAGGTGTCAG-TTCTTCACTTCTTAGTTAAAGCAGTTATTTCAGCTGTGCAATGCTTTTTTGTTCAATAAGCATGATTTTTTACACAGCTGGTTTATCTCCAGTATGGAAACTTTCTTCTTAATCATCTTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90213033 490 - 108868599 caactgaccagctaaattgtaaattttgttttatttgaattaattttaattttaataggcatctgtggctattggctactgtagtgggtagcacagAGATGAGAAATAATAGAAATCTTTTTGTTTGGTTGTTTCAAGGGCTAACATTGTCAAAAGCTCAATTCCTGTTTTATGTAAGGTTTTGGTTTATATTTTCTCAAAGAAGTGAAGTACGGAA---AAAAGAAAACAAAACAAAA-----GGATGATCAAGCAGAACTTTGGTAAGGAAGGGTGAAGCAGAGATACTTAACTCAGTGTGGGGACAATAGCAATGACCTTGTTTGAAACGCAGCTCCTGTCTGTGTGGCTCTCTGTGCTCTGCTGGGGCATCAGATCCTTTACTTCTTAGTCAAAGCTGTTATTTCGATGGTGCAATGCTTTTTTGTTCAATAAGCATGATTTTTTACACAGCTGGTTTATTTCCAGTATGGAAGTTCTCTGCTTAATCGTCTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45222829 486 - 121039945 caactgaccagct-gatgttaaattttattttatttgaattaattttaattttaatagtcacctgtggctactggctactgcactggatagcacagAGATGAGAAATAATAGAAACCTTTTTCTGTTCTTGTTTCAATGGCTAACATTGTCAAAAGCTCAATTCCTGTTTTATGTAAAATTTTGGTTTATATTTTCTCAAAGAAGTGAAGTACAA-----AAAACAAAACAAAACACAA-----GGATGACCACGCAGAACTTTGGTAAGGAAGGGTGAAGCAGAGACACTTAACTCAGAGTGGGGACAACAGCAATGACCTTGTTTGAAACGCAGCTCCTGTCTGTGTGGCTCTCTGTGCTCTGTTGGGGTGTCAG-TCCTTTACTTCTTAGTTAAAGCAGTTCTTTCGATGGTGCAATGCTTTTTTGCTCAATAAGCATGATTTTTTACACAGCTGGTTTATCTCCAGTATGGAAGCTCTCTGCTTAATCATCTTG i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 69567 491 + 80412 CAACTAACCAGCT-TatgttaaatattgttttatttgaattaaatttaattttaatagtcaCCTGTGGCTATTGGCTACTGCAGTGGATAGCACAGAGATGAGAAATAATAgaaacctttttgtttgtttgtttcaatggCGAACATTGTCAAAAGCTCAGTTCCTGTTTTATGTAagattttggtttatattttctcaaagaagtgaagtacaaaaaa-gaaaaaaaagaaaacaaaa-----tgatgatCAAGCAGAACTTTGGTAAGGAAGGGTGAAGAAGAGACACTTAACTCAGGGTGGACACAACAGCAATGACCTTGTTTGAAATGCAGCTCCTGTCTGTGTGGCTCTCTGTGCTCTGTTGGGGCATCAGTTCCTTTACTTCTTAGTTAAATCAGTTATTTCGATGGTACAATGCTTTTTTGTTCAATAAGTGTGATATTTTGCACAGCTGGTTTATTTCCAGTATGGAAGCTCTCTGCTCAATCGTCTTG i papAnu2.JH684867 I 414 I 219 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36419743 5716 + 96509753 M e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=697155.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 119442 891 + 478999 ATTTCTCTGGGCTTGTTCCTACTCTGCAGATTTAAGCATGACACTTGTATCTCTCTCTCCAGGCTCTGATCTAGGATGACAGCTTCTATGATGTGCCCATCTACAGAAATATGCAAATTGCAACTTTAGGAAGATTAAAAGAGGGCCCTGCAAAAGGCATCTACAGGCCCCATGTGCTGTTCA-CCTTTCTTATTTATTGGTGAAGTGAGTCCTCATCCATTTATTGGGCAGTTGCAAGCAAAGGAATTA----ACTATGACAATTCACCTTGATGTACAACAATTTAGTCTGTTTGGAGTTTCCACTGTTGGAAAAAACCT------------AGTTATCCTAATTAAGAACAGTTACAGATAGTATAGTGATAGCt--------tttttttttttttttttttgagacagggtcttgctctgtcactc-------agattggagtggagtagcatgatcatggctcactgcagcctcaacctccctgggctcagtgattctcccacctcagtctcctgagtaactgggaatacaagcacatgccaccatgcctgaatattttttctattttgttttgtttta--------------tttgttttgtttcgttttgtagagatggggttttgccatgtcacctaggctggtattgaacttctggactcaggtgatcctctctcctcagcctcccaaagtactgggattacaggtgtgaaccagcatgccATGCCTATAGTGATACCTTTAAGTAACCCTCTCTTTTCTTCTTTTGGGCAATTTTTCAAAGCAACAGGCACTTTATTAAATAAGAAAGTTGATGTGCTTTCCTAATGCCTGCTAATAAAGTAAAGAACCAAGGAACCTCTGTGATTTCAATGAAATCCCTCCAGATGTTATAGGCTACTTGTTACAGACAGGTATGATAGGAAGTGT s panTro4.chr18 74601114 872 - 76611499 ATATCTCTGGGCTTGTTCCCACTCTGCAGATGTAAGCATGACACTTGTATCTCTCTCTCCAGGCTCTGATCTAGGATGACAGTTTCTATGGTGTGCCCATCTACAGAAACACGCAAATTGCAACTTCAGGAAGAGAAAAAGAGGGCCCTGCAAAAGGCATCTACAGGCCCCATGTGCTGTTCA-CATTTCTTATTTATTGGTGAAGTGAGTCCTCATCCATTTATTGGACAGTTGCAAGCAAAGGAATTA----ACTGTGACAATTCACCTTGATGTACAACAATTTAGTCTGTTTGGAGTTTCCACTGTTGGAAAATACCT------------AGTTATCCTAATTAAGAATAGTTATAGATAGTATAGTGATAGCC--------tttttttttttttttttttgagacagggtcttgctctgtcaccc-------agattggagtggagcagcatgatcatggctcactgcagcctcaacctccctgggctcagtgattctcccacttcagtctcctgagtaactgggaataccagcacatgccactgtgcctgaatattttttctattttgttttgtttt---------------------------------gtaaagatggggttttgccatgtcacctaggctggtattgaacttctggactcaagtgatcctctctcctcagcctcccaaagtactgggattacaggtgtggaccagcatgccATGCCTATAGTGATATCTTTAAGTAACCCTCTCTTTTCTTCTTTTGAGCAATTTTTCAAAGCAACAGGCATTTTATTAAATAAGAAAGTCGATGTGCTTTCCTAATGCCTGCTAATAAAGTAAAGAGCCAAGGAACCTCTGTGATTTCAATGAAATCCCTCCAGATATTATAGGCTACTTGTTACTGACAAGTATGGCAGGAACTGC i panTro4.chr18 C 0 I 1 s ponAbe2.chr14 90213523 880 - 108868599 ATTTTTCTGGGCTTGTTCCCACTCTGCAGATGTAAGCATGACACCTGTATCTCTCTCTCCAGGTTCTGATCTAGGATGACAGTTTCTATGATGTGCCTGTCTAGAGAAATACCCAAATTGCAACTTTAGGAAGAGAAAAGGAGAGCCCTGCAAAAGGCATCTACAGGCCCCATGTGCTGTTCA-GCTTTCTTATTTATGGGTGAAGTGAGTCCTCATCCATTTATTGGGCAGTCGTAAGCAAAGGACTTA----ACTATGACAACTCACCTTGAGGTGCAACAATTTTGTCTGTTTTGAGTTTCCACTGTTGAAAAAACCCT------------AGTTATTCTAATTAAGAATAGTTATAGATAGTACAGTGATAATCtttttttttttttttttttttttttttgagacaggctcttgctctgtcaccc-------agattggaatgcagcagcatgatcatggctaactgcagcctcaacctccctgggctcagtgattctcccacctcagtctcctgagtaactgggaatacaagcacatgccaccatgcctaaatattttttgtattttgttttgtttt---------------------------------gtagagatggggctttgccatgtcacctaggctggcattgaccttttggacgcaaatgatcctctctcctcagcctcccaaagtactaggattacaggtgtgaaccagcatgccACGCCTATAGTGATATCTTTAAGTAAGCCTCTCCTATCTTTTTTTGAGCAGTTTTTCAAAGCAACGGGCACATTATTAAATAAGAAAGTTGATGTGCTTCCCTAATGCCTGCTAATACAGTAAAGAACTAAAGAACCTCTGTGATTTCAATGAAGTCCCTTCAGATGTTATGGGCTACTTGTTACTGACAAGTATGGTAGGAACTGT i ponAbe2.chr14 C 0 I 1 s nomLeu3.chr6 45223315 911 - 121039945 ATTTCTCTGGGCTTGTTCCCACTCTGCAGATGTAAGCATGACACCTGGATCTCTCTCTCCAGGCTCTGATTTAGGATGACAGTTTCTATGATGTGCCCACCTACAGAAATACGCAAATTGCAACTTTAGGAAGATTAAAAGAGGGCCCTGCAAAAGGCATCTACAGGTCCCATGTGCTGTTCA-TCTTTCTTATTTATTGGTGAAGTGAGTCATCATCCATTTATTGGGCAGTTGCAAGCAAAGGAATTAACTGACTATGACAATTCACCTTGATGTACAACAATTTAGTCTGTTTGGAGTTTCCACTGTTGGAAAAAACCC------------AGTTATCCTAATTAAGAATAGTTATAGATAGTATAGTGATAGCC------tttttttttttttttttttttgagacagggtcttgctctgtcaccc-------agattggagtggagcagcatgatcatggctcactgcagcctcaacctccctgggctcagtgattctcccacttcagtctcctgagtaactgagaatacaagcacatgccactgtccctgaatattttttctattttgttttgttttattcgttttgttttgtttgttttgttttgttttgtagagatggggttttgccatgtcacctaggctggtattgaacttctggactcaagtgatcctctctcctcagcctcgcaaagtactgggattacaggtgtggaccagcatgccATGCCTATAGTGATATCTTTAAGTAACCCTCTCTTTTCTTCTTTTGAGCAATTTTTCAAAGCAACAGGCACTTTATTAAATAAGAAAGTTGATGTGCTTTCGTAATGCCTGCTAATAAAATAAAGAACAAAGGAACCTCTGTGATTTCAATGAAATCCCTCCAGATGTTATAGGCTACTTGTTACTGACAAGTATGGTGGGAACTGT i nomLeu3.chr6 C 0 I 1 s papAnu2.JH684867 70277 910 + 80412 aTTTCTCTGGGCTTGTTTCCACTCTGCAGATGTAAATATGGCACCTGTATGTCTCTCTCCAGGTTCTGATCTAGTGTGACAATGTCTATGACTTGCCCACCTAGAGAAATGCACACATTGCAacttgaggaagagaaaaagagggccCTGCAAAAGGCATCTACAGGCCCCACGTGCTGTTTACCCTTTCTTATTTATTGGTGAAGTGACTCCTCATCCATTTATTGGGCAGTTGTAAGCAAAGGAATTAACTGACTATGACAATTCATCTTGATGTACAAAACTTTAGTCTGTTTTGAGTTTCCACTGTTGGGAAATACCTAGATATACTAACAGTTATACTAATTAAGAACAGTTACAGATAGTATAgtgatagtc----tttttttttttttttttttttttgagacaagttcttgctctgttacccagattAGAGATTagagtagagtggcatgatcatggctcactgcagtctcaacctccccgGGCTCAGTGATTCTCcaccctcagtctcctgagtaaggGGGaatacaagcacatgccaccatgcctacgtattttttgtattttgttttgtttt-----------------------gttttgttttgtagagatgagactTGGccatgtcacctaggctggtatTGAATTTCTGGTCTCAACTGATCCTTtctcctcaggctcccaaagtactgggattacaggtgtggaccagcATGCCACGCCTATAGTGATATCTTTAAGTAAGCCTCTCCTTGCTTCTTTTGAGCAATTTTTCAAAGCAACAGACACCTTATTAAATGAGAAAGTTGATCGGTTTTCCTAATGCCTGCTAATAAAGTAAAGAACTAAGGAACCTCTTTGATTTCAATGAAGTCCCTACAGATGTTATGGGCTACTTGTTACTGACAAGTATGGTAGGAACTAT i papAnu2.JH684867 I 219 I 2754 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36419743 5716 + 96509753 M e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=943382.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 120333 1161 + 478999 GGTCAAGCTGTGATAGGCAAATAGATCTTGCTGAAGAGGAAGAATGATTGGCTAAGATAATGTCCCAGGACAGCTGGCATACCTTTAGACACAGCTAAATTGAATGCTTTCTGAGGATGAGtgtattagtctg-tctcaca-tgctataaagacatacctgagaatgggtaattgaaaaagaaaagagattgaattggctcacagttctgtgggctgtacagacttatgcttatagggaagcctcaggaaacttacaatcatggcagaaggtgaaaaggaagcaagcacatattcacatggctgaaacgagtcaggggaggtgctttttaactttttaaacaagcagatcttaggataactttatcatcagacagcactagggggatgaggctaaaccattagaaaccacctccatgatgcaaacaccttctactaagcctctcctccaacactggcaattacaattccacatcagattggggatgcgggggtgcacaaatccaaaccatatcaAGAAGCATGTTAAAAATTGAGGGAAGTTCTAATCAAATGGCAAGTCAGGACATGGCATTCCATCAACATAACACTCCTCTCAATACATTCCAAAATGGGAGAAAGGAAAAAGTGCAAGGATGAAGAAGGGACACAGCAAAGTGACAAGATGACTAACAAGATGACCCCTGTGGAAAGCATTTACTGATTCAACAACCAAATAATGAAGAAAATAAGAGCAAATTTGCTGAGTTTCTATGCTCTTTATGTTTATTAGGGAAGGGCAAAAGCCAGTCCCTCGACATTGTTACTGTTAATTAACATCATCACTGCCTGCTCTTAAGTGTCTAGATACTTTCAAGAATCTAGTATTATCCTCACTTAA-ATGTTTTTTGGATGTGCCCTGTCATGCATGTGATATTGCAAAAAGATTCTACATTAACCACAGCAAGATGGCTATGTAATAATTGGGATCACTTTAGGGGAGCATATTTCTACCACATTTTGAGATGGAAAATGAAGTAAAGATATCCATTTGTCAATTTCTTCTACATTATGCCAAACATTCAAAGAGATTATTTTATTTATTTCAAAGATGTACACATGTTGAAATTAAAATTTAAATTAAGAAAATTTATAAACTGAGTCAAAAGAAAAGTAAGCGAGGC-------------------------------AG s panTro4.chr18 74601987 1160 - 76611499 GGTCAAGCTGTGATAGGCAAATAGATCTTGCTGAAGAGGAAGAATGATTGACTAAGATAATGCCCCAGGACAGCTGGCATACCTTTAGACACAGCTAAATTGAATGCTTTCTGAGGAGGAGtgtattagtctg-tctcacactgctataaagacatacctgagaatgggtaattgaaaaagaaaagagattgaattggctcacagttctgtgggctgtacagacttatgcttatagggaggcctcaggaaacttacgatcatggcagaaggtgaaaaggaagcaagcacatattcacatggctgaaacgagtcaggggaggtgctacaca-ctttttaaacaagcagatcttgggagaactttatcatcagacagcactagggtgatgcggctaaaccattagaaaccacctccatgatgcaaacaccttccactaagcctctcctccaacactggcaattacaattccacatgagattggggatg-gggggtgcacaaatccaaaccatttcaAGAAGCATTTTAAAAATTGAGGGAAGTTCTAATCAGATGGCAAGTCAGGATAGGGCATTCCATCAACATAACACTCCTCTCAATACATGCCAAAATGAGAGAAAGGAAAAAGTGCAAGGACGAAGAAGGGACACAGCAAAATGACAAGATGACTAACAAGATGACCCCTGTGGAAAGCATTTACTGATTCAACAACCAAATAATGAAGAAAATAAGAGCAAATTTGCTGAGTTTCTATGCTCTTTATGTTTATTAGGGAAGGGCAAAAGCCAGTCCCTCGACATTGTTACTGTTAATTAACATCATCACTACCTGCTCTTAAGTGTCTAGATACTTTCAAGAATCTATTATTATCTTCACTTAA-ATGTTTCTTGGATGTGCCCTGTCATGCATGTGATATTGCAAAAAGATTCTACATTAACCACAGCAAGATGGCTATGTAATAACTGGGATCACTTTAGGGGAGCATATTTCTACCACATTTTGAGATGGAAAATGAAGTAAAGATATCCATTTGTCAATTTCTTCTACATTATGCCAAACATTCAAAGAGATTATTTTATTTATTTCAAAGATGTATACATGTTGaaattaaaatttaaattaagaaaatttattaaCTGTGTCAAAAGAAAAGTAAGCGAGGC-------------------------------AG i panTro4.chr18 I 1 C 0 s ponAbe2.chr14 90214404 1187 - 108868599 GGTCAAGCTGTCATAGGCAAATAGATCTTGCTGAAGAGGAAGAATTATTGGCTAAGATAATA-CCTAGGACACCTGGCATA-CTTTAGACACAGCTAAATTGAATGCTTTCTGAAGAGGAGtgtattaatctgttctcacactgctataaagacatacatgagactgggtaattgaaaaagaaaagggattgaattggctcacagttctgtgggctgtacagacttatgcttatagggaggcctcagaaaacttacaatcatggcagaaggtgaaaaggaagcaagcacatgttcacatggctgaaaggagtcaggggaggtgctacaca-ctttttaaacaagcagatctcaggataactttatcatcagacagcatgagggggatgaggctaaaccattagaaaccacctctatgatccagtcaccttccagcaagcccctcctccaacactggcaattacaattccacataagattgggggtg-gggagtgcacaaatccaaaccatgtcaAGAAGCATTTTAAAAATTGAGGGAAGTTCTAATCAGACGGCAATTCAGGACAGGGCATTCCATCAGCATAATACTCCTCTCAATACATGCCAAAATGGGAGAAAGGAAAAAGTGCAAGGATGAAGATGGGACACAGCAAAATGGCAAAATGACTAACAAGATGACCCCTGTGGAAAGCATTTACTGATTCAAAAACCAAATAATGAAGAAAATAAGAGCAAATTTGCTGAGTTTCTATGCTCTTTATGCTTATTAGGGAAGGGCAAAAGCGAGCCCCTCGACATTGTTATTGTTAATTAACATCATCACCACCTGCTCTTAAGTGTCTAGATACTTTCTATAATCTAGTATTATCTTCACTCAA-ATGTTTTTTGGATGTACCCT-TCATGCACATGATATTGCAAAAACATTCTACATTAGCCACAGCAAGATGGCAATGTAATAATTGGGGTCACTTTAGGGGAGCGTATTTCTACCACATTTTGAGACGGAAAATGAAGCAAAGATGTCCATTTGTC-ATTTCTTCTACATTATGTC-AACATTCAAAGAGATTATTTTATTTATTTCAAAGATGTATACATGTTGaaattaaaatttaaattaagaaaatttataaaCTGAGTCAAAAGAAAAGTAAGCCAGGCAGTTGGTTAATGTGTCGGTTAATGCCACCATAG i ponAbe2.chr14 I 1 C 0 s nomLeu3.chr6 45224227 1160 - 121039945 GGTCAAGCTGTGACAGGCAAACAGATCTTGCTGAAGAGGAAGAATGATTGGCTAAGATAATGCCCCACAACAGCTGGCATATCTTTAGACACAGCTAAATTGAATGCTTTCTGAGGAGGAGtgtattagtctg-tctcacactgctataaagacatacccgagaatgggtaattgaaaaagaaaagagattgaattggcttacagttctgtgggttgtacagacttatgcttatagggaggcctcaagaagcttacaattgtggcagaaggtgaaaaggaaacaagcacatattcacatggctgacaggagtcaggggaggtgctacaca-ctttctaaacaagcagatctcaggagaaatttatcatcagacaacagtagcgggatgaggctaaaccattagaaaccacctccatgatgcaaacaccttccactaagcctctcctccaacactggcaattacaattccacgtgagattgggggtg-ggtggtgcacaaatccaaaccatatcaAGAAGCATTTTAAAAATTGAGGGAAGTTCTAATCAGATGGCAAGTCAGGATAGGGCATTCCGTCAGCATAATACTCCTCACAATAAATGCCAAAATGGGAGAAAGGAAAAATTGCAAGGATGAAGACGGGACACAGCAAAATGACAAGATGACTAACAAGATGACCCCTGTGGAAAGCATTTACTGATTCAACAACCAAATAATGAAGAAAATAAGAGCAAATTTGCTGAGTTTCTATGCTCTTCATGTTTATTAGGGAAGGGCAAAA-CCAGCCCCTCGACATTGTTACTGTTAATTAACATCATCACCGCCTGCTCTTAAGTGTCTAGATACTTTCAAGAATCTAGTATTATCTTCACTTAACATATTTTTTGGATGTGCCCTGTCATGCATGTGATATTGCAAAAACATTCTACATTAGCCACAGCAAGATGGCTATGTAATAATTGGGATCACTTTAGGGGAGCATATTTCTACCACATTTTGAGACGGAAAATGAAGTAAAGATGTCCATGTGTCAATTTCTTCTACATTATGCCAAACATTCAAAGAGATTATTTTATTTATTTCAAAGATGTATACATGTTGAAATTAAAATTTAAATTAAGAAAATTTATAAACTGAGTCAAAAGAAAAGTAAGTGAGGC-------------------------------AG i nomLeu3.chr6 I 1 C 0 s papAnu2.JH684867 73941 1160 + 80412 GGTCAAGCTGTGATCGGCAAATAGATCTTGCTGAAGAGGAAGAATGATTGGCTAAGATAATCCCCCAGGACAGCTGGCATACGTTTAGACAAAGTTGAATTGAATGCTTTCTGAGGAGgagtgtgttagtctgttctcatagtgctataaagacatacctgagactgggtaattcaaaaagaaaatagattgaaTTGGCTCACATTTCCATGGGCTGTACAGACTTATGTTtatagggaggcctcaggaaacttataatcatggcagaaggcgaaaagGAAGCAAGCACATATTCACACGGCTGAAACGAGtcaggggaggtgctacaca-ctttttaaacaagcagatctcaggagaactttGTCTtcagacagcactagggggatgagGCTAAACCACTAGAAACCAcgtccatgatccaatcaccttacACCAAGCCCTTCCCCCAACACTGGCCATTACAATTCCATATGAGATTGGGAGTG-GAGGGtgcacaaatccaaaccatatcaagaagcATTTTAAAAGTTGAGGGAAGTTCTAAT-AGATGGCAAGTCAGGATAGGGCATTCCATCAGCATAATACTCCTCTCAATCCACGCCAAAGTGGGAGAAAGGGAAAAGTGCAAGGATGAAGACGGGACACAGCAAAATGACAGGATGACTCACAAGATGGCCCCTGTGGAAAGCATTTACTGACTCAAAATCCAAACCATGAAGACAGTAAGAGCAAATTTGCTGAGTTTCTATGCTCTTTATGTTTATTAGGTAAGGGCAAAAGCCAGCCCCTTGACATTGTTATTGTTAATTAACATCATCACCGCCTGCTCTTAAGTGTCTAGATACTTTCTAGAATCTAGTATTATTTTGACTCAA-ATGATTTTTGGATATGCCCTGTCATGCACGTGATATTGCAGAAACATTCTACATTAACCACAGCAAGATAGCTATATAATATATGGGATCACTTTAGGGAACTGTATTTCTACCctattttgagatggaaaatGAAGTAGAGAtgtccatttgtcaatttcttctaCATTATGTCAAATATTcaaagagattattttatttatttcaaagatgcattcatgttgaaattaaaatttaaattaagaaaatttataaaCTGAGTCAAAAGAAAAGTAAGCGAGGC-------------------------------AG i papAnu2.JH684867 I 2754 I 926 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36419743 5716 + 96509753 M e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=119525.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 121494 146 + 478999 TTCTGCACGCCCTG-AAGTGTCAGGCATATATGA--CTAAAGTATTCGGCATTTggccaggtgtggtagctcatgctgtcattccaggatgttgagaggctgaggcaggtggattgcttgagctcagaactttgagaccaagcaaggca s panTro4.chr18 74603147 147 - 76611499 TTCTGCATGCCCTGGAAGTGTCAGGCATATATGA--CTAAAGTATTCGGCATTTggccaggtgtggtagctcatgctgtcattccaggatgttgagaggctgaggcgggtggattgcttgagctcagaactttgagaccaagcaaggca i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90215591 147 - 108868599 TTCTGCATGCCCTGGAAGTGTCAGGCATATATGA--CTAAAGTATTCGGCATTTggccaggtgtggtagctcatgctgtcattccaggacgttgagaggctgaggcaggtggattgcttgcgttcagaactttgaaaccaagcaaggca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45225387 149 - 121039945 TTCTGCATGCCCTGGAAGTGTCAGGCATATATGACTCTAAAGTATTCAGCATTTggccaggtgtggtagctcatgctgtcattccaggacgttgagaggctgaggcaggtggattgcttgagctcagaactttgagaccaagcaaggca i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 76027 135 + 80412 TTCTGCATGCCCTGGAAGCGTCAGGCATAAATGACTCTAAAGTATTCAgcatgtggccaggtgtggtagctcatgttGTCATTCCAGGatgtggagaggctgaggcaggtggattgc--------------ttgagaccaagcaaggca i papAnu2.JH684867 I 926 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e macFas5.chr10 36419743 5716 + 96509753 M e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=295047.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 121640 234 + 478999 acatggtggaaccctatctctacgaaaaatatgaaaattagccaagcatggtggtgctcgcctttttataccacctactggaaaagctaaggtgagaggatcatttgaacccaggaggtcaaggctgcagtaagctctggttgcaccactgcactccaa-cctgggtgcaagagggggaccctCTGCCCAGGACTC-TTGGGATATGACTATACCCATAGGGACTGCCCGCAGTAA s panTro4.chr18 74603294 234 - 76611499 acgtggtggaaccccatctctatgaaaaatatgaaaattagccaagcatggtggtacccaccttttagtaccagctactggaaaggctaaggtgagaggatcatttgaacccaggaggtcaaggctgcagtaagctctggttgcaccactgcactccaa-cctgggtgaaagagggagaccctCTGCCGAGGACTC-TTGGGATATGACTATACCCATAGGGATTGCCCTCAGTAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90215738 236 - 108868599 acatggtggaacccgatctctatgaaaaatatgcaaattagccaagcgtggtggtgcccgccttttagtaccagctactggaaaggctaaggtgagaggatcatttgaacccaggaggtcaaggctgcagtaagctctggttgcaccactgcactccagccctgggtgcaagagggagaccctCTACCCAGGACTCTTTGGGATATGACTATACCCATAGGGATTGCCTGCAGTAA i ponAbe2.chr14 C 0 I 143 s nomLeu3.chr6 45225536 234 - 121039945 acatggtggaaccccatctctatgaaaaatatgaaaattagcaaagcatggtggtgctcgccttttagtgccagctactggaaaggctaaggtgagaggatcatttgaacccaggaggtcgaggctgcagtaagctctggttgccccactgcactccag-cctgggtgaaagagggagaccctCTGCTCAGGACTC-TTGGGATATGACTATACCTATAGGGATTGCCCGTAGTAA i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36425460 234 + 96509753 acatggtgaaaccccatctctatgaaaaatacaaaaattagccaagcatgggggtgcctgccttttagtactagctactggaaaggctaaggtgagaggatcatttgagcccaggaggttgaggctgcagtaagctctggttgcaccactgcactccag-cctgggtgaaagagggagaccctCTGCCCAGGACTC-TTGGGATAGGACTATACCCATAGGGATTGTCCGCAATAA i macFas5.chr10 M 5716 C 0 s papAnu2.JH684867 76162 234 + 80412 acatggtgaaaccccatctctacgaaaaacacgaaaattagccaagcatgggggTGCCTGCCTTTTAGTACCAGCTACTGGaaaggctaaggtgagaggatcatttgagcccaggaggttgaggctgcagtaagctctggttgcaccactgcactccag-cctgggtgaaagagggagacCCTCTGCCCAGGACTC-TTGGGATAGGACTATACCCATAGGGATTACCCGCAGTAA i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=11943.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 121874 14 + 478999 CCTCACATTTGAGT s panTro4.chr18 74603528 14 - 76611499 CCTCACATTTGAGT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45225770 14 - 121039945 CTTCATATTTGAGT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36425694 14 + 96509753 CTTCACATTTGAGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 76396 14 + 80412 CTTCACATTTGAGT i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90215974 143 - 108868599 I e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=120761.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 121888 118 + 478999 GGAAGTGGAGATCATATGTACCTGTACCAATATGTAGTGAAAAAGGAAAACATAAGAAATCATGGCAGAAATGGCACAAAGTATAAAAGAGGCTTGGTGTAATTGAGAGAGGCATTCT s panTro4.chr18 74603542 118 - 76611499 GGAAGTGGAGATCATATGTACCTATACCAATATGTAGTGAAAAAGGAAAACATAAGAAATCATGGCAGAAATGGCACAAAGTATAAAAGAGGCTGGGTATAATTGAGAGAGGCTTTCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90216117 109 - 108868599 GGAAGTGGAGATCATATGTACCTATACCAA----TAGTAGCAAAAGAAAACAT-AGAAATGATAGCAGAAAT-GCCCAAAG-ATAAAAGAGGGGGGGGGTAA-TGAGAGA-GCTTTCT i ponAbe2.chr14 I 143 C 0 s nomLeu3.chr6 45225784 118 - 121039945 GGAAGTGGAGATCATATGTACTTATACCAATATGTAGCATAAAAGAAAAACATAAGAAATCACGGCAGAAATGGCACAAAGTATAAAAGAGGCTTGCTGTAATTGACAGAGGCTTTCT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36425708 118 + 96509753 GGAAGTGGAGATCATATGTACTGATGCCAATATGTAGCAAAAAAGAAAAACATAAGAAATCATGGCAGAAATGGCCCAAAGAATGAAAGAGGGTGGAGGTAATTGAGAGAGGCTTTCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 76410 118 + 80412 GGAAGTGGAGATCATATGTACCGATGCCAATAtgtagcaaaaaagaaaaacataagaaatcATGGCAGAAATGGCCCAAAGAATGAAAGAGGGTGGAGGTAATTGAGAGAGGCTTTCT i papAnu2.JH684867 C 0 I 150 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=1362646.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 122006 1212 + 478999 GGTGATAAAATTTGAACTGATTTCTGGAGAATGGGTTG-AATTCCAATAGAGGGAGATGGACCAAAGTTAATTCTGATGAGGGAAATGTCTTGAGCAAAATCTAGAAAAGGGAAACATGCCCATTTTAAGTGTTAATGAG-GGTCCAGTTGGGGTACAGTGCAGGAAGAGAGTTCT-AGTGAAAAGGTAGTTGGTCTGATAGGACAGGGTCTTGCAGGCAgaggcagatactatcattattccattgttcagattggaaaacagacacagagagcccaaggtcacaaagccagaaagtgAATCTGGGCAGTCTAGCGGTAGCACCCTCTTCTTAAATGATCTATTAAAGGGCCTCTTCTCCAGGCACTCTAAAACTCTTCTCCATCTTTAGCTCCCCCAGAGTACAGTGAGGCCCCCTGTCTACCTCACATGATGGGGTCTCAGAAaagcaacagatcccaactcatactagcttttaaata-aa--aaaaaaaa-aaccttgcaaaacaagaagtgcagaggttgggagagagccagcactggttaattcagcagctcaacaataaatccaa-gacctgggtattggttcacctctccacaccaccatcctcaTGGGCCAGCTTCTACCTCCTCCTGAATGCTGTGTCTTTGCCTAGTTTTCTCCCTGATTTTAGCTCAAGTGCTG----CTTCCTGGGGGCAACCTTTCCTGCCTCCCTCTTGGGGTCAGTCCACCTTCCCAGGCTCTTGCAGCACCCCTGGGTCTGCTGAACTTTCCCTTGTTACATAATTCTGTGACTAACATCACCTCTTTCTGTTAGACTCTCAGCTCCACTAGAGAAGAAATTCTGTGCATTTTTGCTCACTATTGAACCCTGGAGTCTACTACTCAAATATTTGTCAAATG-AGTAAATGGTAGCTCTGTGCAGGGCCGAGGAACACAAGAACCACAAGAAACATGCAATCTGCCAAAATACTCATTACAGCTCACTCTCCTCTGGTGACATTTCCCTGAGGCACATTCCTGTTGGTTTCTTCCCCTCAAGAAGCATTCTTCTTTCTCCTTCCTATAAAAGCCAG-GATTTTCTCAGATAGCCACACCATGCCCCATGCAAAGAGATTTGGATTATTCTATCATCTTGAGGCATTTCTGTGGAAACTGCTGTCAGTCCAGGTGGCCCATGACCTAAGCTGACCCAAGCCGACTGAAGGGAGGACGTAT s panTro4.chr18 74603660 1213 - 76611499 GGTGATAAAATTTGAACTGATTTCTGGAGAATGGGTTG-AATTCCAATAGAGGGAGATGGACCAAAGTTAATTCTGATGAGGGAAAAGTCTTGAGCAAAATCTAGAAAAGGGAAACATGCCCATTTTAAGTGCTAATGAG-GGTCCAGTTGGGGTACACTGCAGGAAGAGAGTTCT-AGTGAAAAGGTAGTTGGTCTGATAGGTCAGGGTCTTGCAGGCAgaggcagatactatcattattccatttttcagattggaaaacagacacagagagctcaaggtcacaaagccagaaaatgaatctgggcagtctagcggtagcaccctcttcttaaATGATCTATTAAAGGGCCTCTTCTCCAGGCACTCTAAAACTCTTCTCCACCTTTAGCTTCCCCAGAGTACAGTGAGGCCCCCTGTCTACCTCACAGGATGGGATCTCAGAAaagcaacagatcccaactcatactagcttttaaata-aa--aaaatatataaccttgtaaaacaagaagtgcagaggttgggagagagccagcactggttaatttaccagctcaacaataaatccaa-gacctgggtatttgttcacctctccacactaccatcctcaTGGGCCAGCTTCTACCTTCTCCTGAATGCTGTGTCTTTGCCTAGTTTCCTCCCTGATTttagctcaagtgcta----cttcctgggggcaatctttcctgcctctctcttggggtcagtccgccttcccaggctcttgtagcacccgtgggtctgctgaactttcccttattacataattctgtgactaacatcacctctttctgttagactctcagctccactagagaagaaattctgtgcattcttgctcactattgaaccctggagtctactactcaaatatttgtcaaatg-agtaaatGGTAGCTCTGTGCAGGGCCAAGGAACACAAGAACCACAAGAAACATGCAGTCTGCCAAAATACTTATTACAGCTCACTCTCCTCTGGTGACATTTCCCTGAGGCACATTCCTGTTGGTTTCTTCCCCTCAAGAAGCATTCGTCTTTCTCCTTCCTATAAAAGCCAG-GATTTTCTCAGATAGCCACACCATGCCCCATGCAAAGAGATCTGGATTATTCTATCATCTTGAGGCATTTCTGTGGAAACTGCTGTCAGTCCAGGTGGCCCATGACCTAAGCTGACCCAAGCCGACTGAAGGGAGGACGTAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90216226 1205 - 108868599 GGTGATAAAATTTGAACTGATTT-TGGAGAATGGGTTGAAATTCCAATAGAGGGAGATGGACCAAAGTTAATTTTGATGAGGGAAATGTCTTGAGTAAAATCTAGAAAAGGAAAACATGCCCATTTTAAGCATTAACGAGTGGTCCAGTTGGGGTACAGTGCAAGAAGAGAGTTCT-AGTGAAAAGGTAGTTGGTCCGATAGGTCAGGGTCTTGCAGGCAgaggcagatactatcattattccatttttcagattggaaaacagacacagagagtccaaggtcacaaagccagAAGG-GAATCTGGGCAGTCTAG-GGTAGCACCCTCTTCTTAAATGATCCATTAAAGGGCCTCTTCTCTAGGCACTCTAAAACCCTTCTCCATCTTTAGCTTCCCCAGAATACAGTGAGGCCCCCTGTCTACCTCACAGGATGGGGTCTCAGAAaagcaacagatcccaactcatactagcttttaaata-aa--aaaatttataaccttgtgaaacaagaagtgcagaggttgggcaagagccagccctggttcattcagcagctcaacaataaatccaaggacctgggtattggttcacctctccacgccactgccctcaTGGGCCAGCTTCTACCTCCTCCTGAATAC--TGTCTTTGcctagttttctccctgattttggctcaattgctg----cttcctgggggcagcctttcctgcctctgtcttggggtcagtctgccttcacaggctcttgtagcacccctgggtctgctgcattttcccttattacataattttgtgactaatgtcagctctttctgctagattctaaactccactagggaataaattctgtgcatttttgatcattattgaaccctggagtctaccatgcaaatatttgtcaaatg-aG-AAATGGTAGCTCTGTGCAGGACCAAGGAACCCAAGAACTACAAGAAA----TAATCTGCCAAAACACTCATTACAGCTCACTCTCCTCTGGTGACG-TTCCCTGAGGCACATTCCTGTTGGTTTCTTCCCCTTAAGAAGCATTCTTCTTTCTCCTTCCTATAAAAGCCAG-GTTTTTCTCAGATAGCCACACCATGCCCCATGCAAAGAGATTTGGCTTATTCTACCATCTTGAGGCATTTCTGCGGAAACTGCTATCAGCCCAGGTAGCCCATGACCTAAGCTGACCCAAGCTGACTGAAGGGAGGACGTAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45225902 1216 - 121039945 GGTGATAAAATTTGAACTGATTTCTGGAGAATGGGTTG-AATTCCAATAGGGGGAGATGGACCAAAGTTAATTTCGATGAGGGAAATGTCTTGAGCAAAATCTAGAAAAGGAAAACATGCCCATTTTCAGTGTTAATGAG-GGTCCAGTTGGGGTACAGTGCAGGAAGAGAGTTCTAAGTGAAAAGGTAGTTGGTCTGATAGGTCAGGGTCTTGCAGGCAgaggcagatactatcattattccagttttcagattgggaaacagacacagagtgcccaaggtcacaaagccagaaagtgAATCTGGGCAGTCTAGCGGTAACACCCTCTTCTTAAATGATCTATTAAAGAGCCTCTTCTCCAGGCACTCTAAAACTCTTCTCCATCTTTAGCTTCCCCAGAGTACAGTGAGGCCCCCTGTCTACCTCACAGGATGGGGTCTCAGAAAAGCAACAGCTcccaactcatactagcttttaaata-aaacaaaaattataaccttgcaaaacaagaagtgcagaggttgggcaagagccagccctggttcattcagcagctcaacaataaatccaa-gacctgggtatttgttcgcctctccacaccaccatccccaTGGGCCAGCTTCTATCTCCTCCTGAATGCTGTGTCTTTGCCTAGTTTTCTCCCTGATTTTAGCTCAAGTGCTG----CTTCCTGGGGGCAGCCTTTCCTGCCTCCCTATTGAGGTCAGTCCGCCTTCCCAGGCTCTTGTAGCACCCCTGGGTCTGCTGAGCTTTCCCTTATTACATAATTCTGTGACTAATGTCAGCTCTTTCTGTTAGACTCTCAGCTCCACTACAGAAGAAATTCTGTGCATTTTTGCTCACTATTGAACCCTGGAGTCTACTACTCAAATATTTGTCAAATG-AGTAAATGGTAGCTCTGTGCAGGGCCAAGGAACCCAAGAACCACAGGAAACATGCAATCTGCCAAAATACTCATTACAGCTCACTCTCCTCTGGTGATGTTTCCCTGAGGCACATTCCTGTTGGTTTCTTCCCCTCAAGAAGCGTTCTTCTTTCTCTTTCCTACAAAAGCCAG-GATTTTCTCAGATAGCCACACCATGCCCCATGCAAAGAGATTTGGATTATTCTATCATCTTGAGACATTTCTGCGGAAACTGCTGTCAGTCCAGGTGGCCCATGACCCAAGCTGACCCAAGCCGACTGAAGGGAGGACGTAT i nomLeu3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36425826 1135 + 96509753 GGTGATACAATTTGAACTGATTTCTGGAGAATGGGTTG-AATTCCAATAGGGGGAGATGGACC-AAGTTAATTTTGACGAGGGAAATGTCTTGAGCGAAATCTCAAAAAGGAAAACAGACCAATGTAAAGTGTTAATGAGCGGTCCGGTTGGTGTGCGGTGTAGGAGGAGAGTTCCAAGTGAAAAGGTAGTTGGTCTGATAGGTCAGGGTCTTGCAGGcagaggcagatactatcattattccatttttcagattggaaaacagacacagagagtccaaggtcacaaagctgggaagcgaatctgggcagtctaggggtagcacccTCTTCTTAAATGATCCATTAAAGGTTCTCTTCTGCAGGCATTCCAAAACTCTTCTCCATCTTTAGCTTCCGCAGAGTACCATGAGGCCCCCTGTCTACCTCACAGGATGGGGCCTTAGAAaagcaacagatcccaactcatactagcttttaaattaaa--aaaatgtataatcttgcaaaacaagaagtgcagaggttgggcaagagccaacattgcttagttcagcagctcaacaataaatccaaggacctgggtattggtgcacctctccacaccaccatcctcaTGGGCCAGCTTCTACTTCCTCCTGAATGCTGTGTCTTTCCCTAGTTTTCTCCCTGATTTTAGCTCAAGTGCTGCTTCCTTCCTGGGGCCAGCCTTTCCTGCCTCCCTCTTGGGGTCAGTCCATCTTCCCAGGCTCTTGCAGCACACCTGGGTCTGCTGCACTTCCCCTTATTACATAATTCCGTGAATAACGTCACCTCTTTCTGTTGGACTCAAAGCTCCACTAGGGAAGAAATTCTGTGCATA-TTGCTCACTATTGAACCCTGGAGTCGACCACCCAAATATTTGTCAAATG-AATAAATGGTAGCTC--TACAGG---------CCAAAGGAACCCAAGAAACATGCAAACTACCAAAATACTCTTTACAACTCACTCCCCTCTGGAGAGTTTTCCCTGAGGCACATTCCTGTTGGTTTCTTCCCCTCAAGAAGCATTCTCCTTTCTCCTTCCTATAAAAGCCAGTTTTTTTCTCAGATAGCCACAGCATGCCACAAGCAAAGAGATTTGGATTATTCTATCATTT--------------------------------------------------------------------------GGACATAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 76678 1139 + 80412 GGTGATATAATTTGAACTGATTTCTGGAGAATGGGTTG-AATTCCAATAGGGGGAGATGGACCAAAGTTAATTTTGATGAGGGAAATGTCTTGAGCaaaatctcaaaaaggaaaacaggcTCATGTAAAGTGTTAATGAGCGGTCCGGTTGGGGTGCGGTGCAGGAAGGGAGTTCCAAGTGGAAAGGTAGTTGGTCTGATAGGTCAGGGTCTTGCAGGCAGAGGCAGATACTATCATTATTCCATTTTTCAGATTGGAAAACAGACACAGAgggtccaaggtcacaaagccgGGAAGCGAATCTGGGCAGTCTAGGGGTACCACCCTCTTCTTAAATGATCCATTAAAGGTTCTCTTCTGCAGGCA-TCCAAAACCCTTCTCCATCTTTAGCTTCCCCAGAGTACCATGAGGCTCCCTGTCTACCTCACAGGATGGGGCCTCAGAAAAGCAACAGATCCCAACTCATACTAACTTTTACact-aa--aaaatgtataattttgcaAAACGAGAAGTGCAGAGGTTGGGCGAGAGCCAGCATTGGTTAGTTCAGCAGCTCAACAATAAATCCAAGGACCTGGGTATTGGTGCACCTCTCCACACCACCATCCTCATGGGCCAGCTTCTACTTCCTCCTGAATGCTGTGTCTTTCCCTAGTTTTCTCCCTGATTTTAGCTCAAGTGCTGCTTCCTTCCTGGGGCCagcctttcctgcctccctcttgggGCCAGTCCATCTTCCCAGGCTCTTGCAGCACACCTGGGTCTGCTGCACTTCCCCTTATTACACAATTCCGTGAATAATGTCACCTCTTTCTGTTAGACTCAAAGCTCCACTAGGGAAGAAATTCTGTGCATT-TTGCTCACTATTGAACCCTGGAGTTGACCAcccaaatatttgtcaaatgaaaaaaatggtaGCTC--TACAGGGCCAAGGAACCaaagaaacacaagaaacatGCAAACTATCAAAATACTCTTTACAACTCACTCCCCTCTGGAGAGTTTTCCCTGAGGCACTTTCCTGTTGGTttcttcccctcaagaagcattctcctttctccttcctataAAAGCCAAtttttttCTC----AGCCACA-CATGCCCCATGCAAAGAGATTTGGATTATTCTATCATTT--------------------------------------------------------------------------GGACATAA i papAnu2.JH684867 I 150 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35479114 6711 - 95678458 M a score=449896.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 123218 265 + 478999 TCTATGCACTCTATGCAGTTCCACAAGGTGCTGGTTGTCCCGGCTGCTGCTGGTGG---TCTTCATGTAGCCAAGGTATCACTAGTGCATATGGAGAAAACAGAGCAACTGGAGAGAAACCGAGTAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGGGATATGATATGAGCGATAAGACAGAGGATGGTCTTAGGAAAATCTCCTGTATTTTCCTTTTGGACAATGGTATAAATGAATAAAAGTTCCAATCACTGGGATAGAAAAC s panTro4.chr18 74604873 268 - 76611499 TCTATGCATGCTGTGCAGTTCCACAGGGTGCTGGTTGTCCCGGCTGCTGCTGCTGGGGGTCTTCATGTAGCCAAGGTATCACTAGTGCATATGGAGAAAACAGAGCAACTGGAGAGAAACTGAGTAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGGGATATGATATGAGCGATAAGACAGAGGATGGTCTTAGGAAAATCTCCTGTATTTTTCTTTTGGACAATGGTATAAATGAATAAAAGTTCCAATCACTGGGATAGAAAAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90217431 259 - 108868599 TCTATGCACCCTATGCAGTTCCACAGGGCTCTGGTTTCCCCAGCTGCTGCTGGTGG---TCATCATGTAACCAAGGTATTGCTAGTGCTTATGGAGAAAACAGAGCAAGTGGAGAGAAACTGATTAGGTAAAAGTGGACAGGGCTTGGTGATGTTTGG------GATATGAGGGATAAGACAGAAGATGGTCTTAGGAAAATCTCCTGTTCTTTCCTTTTGGAAAATGGTATAGATGAATAAAAGTTCCAATCACTGGGATAGAAAAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr6 45227118 262 - 121039945 TCTATGCACCCTATGCAGTTCCACAGGGTGCTGATTGTCCCAGCTGCTGCTGGTGG---TCTTCATGTAGCCAAGGTATCACTAGTGCATATGGAGAAAACAGAGCAACCGGAGAGAAACCGAGTAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGGGATATGATATGAGGGATAAGAGAGAGGATGATCTTAGGAAAATCTT---TATTTTCCTTTTGGACAACGGTATAAATGAATAAAAGTTCCAATCACTGGGATAGAAAAC i nomLeu3.chr6 C 0 N 0 s rheMac3.chr10 35485828 260 - 95678458 TCTATGCACCCTATGCAGGTCCACAGGGTGCTGGTTGCCCCAGCTGCTGCTGGTGG---TCTTCATGTAGCCAAGGTATCGCTAGTGTATGTGGAGAAAACAGAGCAACTGGAGAGAAACCGAGGAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGG-----GATATGAGGGATAAGACAGAGAATGGTCTTAGGAAAATCTCCTGTTTTTTCCTTTTGGATAATGATATAGATGAATAAAAGTTCCAATCACGGGGATAGAAAAC i rheMac3.chr10 M 6711 C 0 s macFas5.chr10 36426961 260 + 96509753 TCTGTGCACCCTATGCAGGTCCACAGGGTGCTGGTTGCCCCAGCTGCTGCTGGTGG---TCTTCATGTAGCCAAGGTATCGCTAGTGCATATGGAGAAAACAGAGCAACTGGAGAGAAACCGAGGAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGG-----GATATGAGGGATAAGACAGAGAATGGTCTTAGGAAAATCTCCTGTTTTTTCCTTTTGGATAATGATATAGATGAATAAAAGTTCCAATCACGGGGATAGAAAAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684867 77817 260 + 80412 TCTATGCACCCTATGCAGGTCCACAGGGTGCTGGTTGCCCCAGCTGCTGCTGGTGG---TCTTCATGTAGCCAAGGTATCCCTAGTGCATGTGGAGAAAACAGAGCAGCTGGAGAGAAACCGAGGAGGTAAAAGTGGGCAGGGCTTGGTGATGTTTGGG-----GATATGAGGGATAAGACAGAGGATGGTCTTAGGAAAATctcctgttttttccttttggataATGATATTGATGAATAAAAGTTCCAATCACAGGGAtagaaaac i papAnu2.JH684867 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I a score=224491.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 123483 136 + 478999 ACTTGGAAAATATGAGATTCATTCAGGCAAGCCTTTCATACACTATTCCATAATCAGTTTCATAAGTGAAAGGGAGTCAGAACTCATTTCTACCTTGTTTGCTTCTATCATACTGTGTTGTACCCTGTTGGATCTA s panTro4.chr18 74605141 136 - 76611499 ACTTGGAAAATATGAGATTCATTCAGGCAAGCCTTTCATACACTATTCCATAATCAGTTTCATAAGTGAAAGGGAGTCAGAACTCATTTCTACCTTGTTTGCTCCTATCATACTGTGTTGTACCCTGTTGGATCTA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90217690 133 - 108868599 ACTTGGAAAATATGAGATTCATCCAGGCACGTCTTTCATAAACTATTCCATAATCAGTTTCGTAAGTGAAAGGGAATCAGAACTCATCTCCACCTTGTTTGCTTCTATCATACTGTGTTGTA--CTGTT-GATCTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77013301 134 - 143122389 acaTGGGAAATATGAGATTCTTTCAGGCAAGTCTTTCATACACTATTCCATAATCAGTTTCATAAGTGAAAGGGAGTCAGAAC-CATTTCTACCTTGTTTGCTTCTATCATAC-GTGTTGTACCCTGTTGGATCTA i nomLeu3.chr5 N 0 C 0 s rheMac3.chr10 35486088 135 - 95678458 -ACTGGAAAATATGAGATTCATTCAGGCAAGTCTTTCATACACTATTCCATCATCAGTTTCATAAGGGAAAGGGAGTCAGATCTCATCTCCACCTTGTTTGCTTCTATCATACTGTGTTCTACCTTGTTGGATCTA i rheMac3.chr10 C 0 M 51253 s macFas5.chr10 36427221 135 + 96509753 -ACTGGAAAATATGAGATTCATTCAGGCAAGTCTTTCATACACTATTCCATCATCAGTTTCATAAGGGAAAGGGAGTCAGATCTCATCTCCACCTTGTTTGCTTCTATCATACTGTGTTCTACCTTGTTGGATCTA i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.JH684867 78077 135 + 80412 -actggaaaatatGACATTCATTCAGGCAAGTCTTTCATACACTATTCCATCATCAGTTTCATAAGGGAAAGGGAGTCAGATCTCATCTCCACCTTGTTTGCTTCTATCATACTGTGTTCTACCTTGTTGGATCTA i papAnu2.JH684867 C 0 I 1 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I a score=35321.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 123619 42 + 478999 CTTATCAC----------ATTCCTCCTGCTAGTGGACTT-ACCTGCTAATGTT s panTro4.chr18 74605277 42 - 76611499 CTTATCAC----------ATTCCTCATGCTAGTGGACTT-ACCTACTAATGTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90217823 42 - 108868599 CTTATCAT----------ATTCTTCCTGGCAGCAGACTT-ACCTACTAATGTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77013435 43 - 143122389 CTTATCAC----------ATTCCTCCTGCTAGTGGACTTAACCTGCTAATGTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36427357 52 + 96509753 TTGATAACTAGATGATAGCTTCGTACTGGTAGTGGACTT-ACCTACTAGTGTT i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.JH684867 78213 52 + 80412 TTGATAACTAGATGATAGCTTCGTACTGGTAGTGGACTT-ACCTACTAGTGTT i papAnu2.JH684867 I 1 n 1 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=500146.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 123661 631 + 478999 TGCACTTCTGCCTTGCCAGCATGGAACCTCTGAGACAGCAGGAGCAGTGTGTGTGCATGCATGTGTGTGTGCACTTTtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAATTGGATTCCCCACAGCACATTATTGTTTTATCCATAGTAAATGGTGGATGAATATTTGCAGGATTTAGCTGGACTGCAGCATTGTGGAGGTCAGATAACCACATTTTGACAGACAAGTTGCATTCTAACCTTGAAGCAGACAAAATGCCCATCTTATCAGCCTCGCTCACATCAGCTGTGCCTTTCCTTTGTGGTTGTATGTTTATGAAGCTCATCCAACAAGCTTCTTAAAAAGGGGATTGGACCTTCGCCAGCCTCAGGCTGCATGGCAGGGTGACTGTGTCTTTGAATATCCCAGATGGAGGCTGGTCACCCTTTTGTCTTTGGGTGAAT-AGACTACTCAGGAAGGCAGGGATGCAGGCACCCCC-------ATTTCTTGTTAATGAGTTTGCAATTTATTTTGGCAGATCTAAAATAATAATTCAAAGGCAGTGTAGAAGAAGATGGGGACATTACTTTTAATTGTTTAATATTGTTATGACATGACATGTGCTTACAGAAAGAGAGGCAAGCCACCATCTTCAAGGGAG s panTro4.chr18 74605319 621 - 76611499 TGCACTTCTTCCTTGCCAGCCTGGAACCTCTGAGACAGCAGGAGCAgtgtgtgtgcatgcatgtgtgtgtgcacttttgtgtgtgtgtgtgt----------AATTGGATTCCCCACAGCACATTATTGTTTTATCCATAGTAAATGGTGGATGAATATTTGCACGATTTAGCTGGACTGCAGCATTGTGGAGGTCAGATAACCACATTTTGATAGACAAGTTGCATTCTAACCTTGAAGCAGACAAAATGCCCATCTTATCAGCCTCGCTCACACCAGCTGTGCTTTTCCTTTGTGGTTGTATGTTTAAGGAGCTCATCCAACAAGCTTCTTAAAAAGGGGATTGGACCTTCACCAGCCTCAGGCTGCATGGCAGGGTGACTGTGTCTTTGAATATCCCAGATGGAGGCTGGTCACCCTTTTGTCTTTGGGTGAAT-AGACTACTCAGGAAGGCAGGGATGCATGCACCCCC-------CTTTCTTGTTAATGAGTTTGCAATTTATTTTGGCAGATCTAAAATAATAATTCAAAGGCAGTGTAGAAGAAGATGGGGACATTACTTATAATTGTTTAATATTGTTATGACATGACATTTGCTTCCAGAAAGAGAGGCAAGCCACCATCTTCAAGGGAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90217865 622 - 108868599 TGCACTTCCTCCTTGCCACCCTGGAAGCTCTGAGGCAGCAGGAGCAGTGTGTGTGTACGCATGTGTGTGTGCACTTTCTTGTGTGTGTGT------------AATAGGATTCCCCACAGCACATTATTGTTTTATCCATAGTAAATGGTGGATGAATATTTGCAGGATTTAGCTGGACTGCAGCATTGTGGAGGTCAGATAACCACATTTCGATAGAGAAGTTGCATTCTAACCTTGAAGCAAACAAAATGCCCATCTTATCAGCCTCCCTCACACTGGCTGTGCCTTTCCTTTGTGGTTGTATGTTTAAAGAGCTCATCCAACAAGCTTCTTAAAAAGGGGATTGGCCCTTTGCCAGCCTCAGGCTGCATGGCAGGGTGACTGTGCCTTTGAATATCCCAGATGGAGGCTGGTCATCCTTTTGTCTTTGGGTGAATAAGACTACTCAGGAAGGCAGGGATGAATGCACCCCCCACCCCACTTTCTTGTTAATGAGTTTGCAATTTATTTTGGCAGATCTAAAATAATATTTCAAAGGCAGTATAGAAGTAGAT-GGGACATTACTTGTAATTAT----TACTGTTATGACATGACATTTGCTTACAGAAAGAGAGGCAAGCCACCATCTTCAAGGGAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77013478 629 - 143122389 TGCACTTCTGCCTTGCCAGCATGGAAGCTCTGAGACAGCACGAGCAgtgtgtgtgcatgcatgtgtgtgtgcacctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt--AATTGGATTCCCCACAGCACATTATTGTTTTATCTATAGTAAATGGTGGATGAATATTTGCAGGATTTAGCTGGACTGCAGCATTGTGGAGGTCAGTTAACCACATTTTGATAGACAAGTTCCATTCTAACCTTGAAGCAGACAAAATGCCCATCTTATCAGCCTCGCTCACACCGGCTGTGCCTTTCCTTTGTGTTTGTATGTTTAAACAGCTCATCCAACAAGCTTCTTAAAAAGGGGATTGGACCTTCGCCAGCCTCAGGCTGCATGGTAGGGTGACTGTGTCTTTGAAGATCCCAGATGGAGGCTGGTCACCCTTTCGTCTTTGGGTGAAT-AGACTACTCAGGAAGGCAGGGATGCATGCACCCCC-------CTTTCTTGTTAATGAGTTTGCAATTTATTTTGGCAGATCTAAAATAATAATTCAAAGGCAGTGTAGAAGCAGATGGGGACATTACTTTTAATTGTTTAATATTGTTATGACATGACATGTGCTTACAGAAAGAGAGGCAAGCCACCATCTTCAAGGGAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36427409 599 + 96509753 TGCACCTCCTCCTTGCCAGCCTAGAAGCTCTGAGACAGCAGGAGCAGTGTGTGTGCACGCATGTGTGTGTGT------------------------------AACTGGATTCCCCACAGCACATTATTGTTTCATCCATAGTAAATGGTGGAGGAAAATTTGCAGGCCTTAGCTGGACTACAGCACTGTGAAGGTCAGATAACCACATTT-GATAGACAGGTTGGATTCTAACCTTGAAGCAGACAAAATGCCCATCTTATCAGCCTCACTTACACCGGCTGTGCCTTTCCTTTGTGGTTGTACGTTTGAAGAGCTCATGCCAAAAGCTTCTTAAAAAGGGGATTGGATGTTCACCAGCCTCAGGCTGCATGGCAGGGTGACTGTGTCTTTGAATATCCCAGCTGGAGGCTGGTCATCCTTTAGTCTTTGAGTGAAT-AGACTACTCAGGAAGGCAGGGATGCGTGCAACCTC-------CTTTCTTGTTAATGAGTTTGCATTTTATTTTGGCAGATCTAAAATAATATTTCAAAGGCAGTGTAGAAGCAGATAGGGACATTACTTGTAATCGTTTAATATTGCT-TGACATGACATTTGCCTACAGAAAGAGAGACAAGCCACCATCTTCAAGGGAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=194433.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 124292 372 + 478999 GGCATAGTCATCGACTGTGATCCTGGTGTCCATGTTGGAATATCATGGCAACTGTCTCCCAGCACTGAACTCGATGACTTCTGCTGCATTCCCAGTGTTAGCTGAGTTGCTTAATTTACTTTCTTCAACGCCATGTGTGAAAGGGAAGCTAGAAAACTGCACTATGTATGGCTTCGTGCACTGAAAATTTGACATTATCAAAGGAGGCATGATCTTGTTTCTCTCCATCCCTCTCCAAATGTTTTCTATAATTATATTCAGAGGCTCATGGGTCTTACCATGGGTGATCAAGGAAGGGCTGGTAACTCTTTCAACCACAGGTAAAATATTACAAACATCTGAAATATGCATttttacaggtgagagaaatga s panTro4.chr18 74605940 372 - 76611499 GGCATAGTCATCGACTGTGATCCTGGTGTCCATGTTGGAATATCATGGCAACTATCTCCCAGCACTGAACTCGATTACTTCTGCTGCATTCCCAGTGTTAGCTGAGTTGCTTAATTTACTTTCTTCAATACCATGTGTGAAAGGGAAGCTAGAAAACTGCACTATGTATGGCTTCGTGCACTGAAAATTTGACATTATCAAAGGAGGCATGATCTTGTCTCTCTCTATCCCTCTCCAAATGTTTTCTATAATTATATTCAGAGGCTCATGGGTCTTACCATGGGTGATCAAGGAAGGGCTGGTAACTCTTTCAACCACAGGTAAAATATTACAAACATCTGAAACCTGTATttttacaggtgagagaaatga i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90218487 372 - 108868599 GGCATAGTCATTGACTGTGATCCTGGTGTCCATGTTGAAATATCATGACAACTACCTCCCAGCACTGGACTTGATTACTTCTACTGCATTCGCAGTGATAGCTGAGTTGCTTTATTTACTTTCTTCAACACCATTTGTGAAAGGGAAGCTAGAAAACTGCACTATGTATGGCTTCATGCACTGAAAATTTGACGTTATCGAAGGAGGCATGATCTTGTCTCTCTCTATCCCTCTACAAATGTTTTCTATAATTATATTCAAAGGCTCATGGGTCTTACCATGGGTCATCGAGGAAGGGCTGGTAACTCTTTCAACCACAGGTAAAATATTACAAACATCTGAAACCTGCATttttacaggtgagagaaatga i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77014107 371 - 143122389 GGCATAGTCATCGACTGTGATCCTGGTGTCCATGTTGGAATATCATGGCAACTGTCTCCCAGCACTGAACTCGATTACTTCTGCTGCATTCCCAGTGTTAGTTGAGTTGCTTAATTTACTCTCTTCAATGCCATGTGTGAAAGGGAAGCTAGAAAACTGCACTATGTATGGCTTCGTGCACTGAAAATTTGACATTATCAAAGAAGGCATGATCTT-TCTCTCTCTATCGCTCTCCAAATGTTTTCTATAATTATATTCAGAGGCTCATGGGTCTTACCATGGGCGATCAAGGAAGGGCTGGTAACTCTTTCAACCACAGGTAAAGTATTACAAACATCTGAAACCTGCATttttacaggtgagagaaatga i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36428008 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=948660.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 124664 1159 + 478999 ggccagaaaagttaagtgCATCATGTTGAGTACAATTTTAtttggtgatcaggcagccctgggttcaaatcctggctctattgctaccaattaagccacttaactccatctgagcctcaggttgcccatctgcataataagcagtaatagcagctgtcctgcaggactactgtgagaattacaactcaggcaatgatcatgatatttcttggcacagaggtgttcactacctaggtagtgttattattATTAGGCCTAAAGTCACAAAGGGAGTTTTTGAGAACGCTGGAATGAAAACTTGTTCCTCTCAGCTCTGAGCTTATTAGAGCCCACCGTTTTGCATGAATAAAGCAGCCCTGGAGTCTCTCAGGGGAGGGTGTTTGTAACATCTGTTCAGGCACGGTTTCATTTGCTATATACCCAGAGACTAGCACGGTACAAGTTGTGGGGAGATACTCATGTGAGTTGGCGGACTTTGGGTCAAATATTTTCCCTAAACCCAGGTCTCTATGGCATTCTACAGTACACTCTGCATCCTTCTAAGGGACACTGGAAGAGCAAATGGATTGTACAGTGAGTTACAAATAAAATGGCCAATCTCAGCATGAAAGGCTGGGGGTGTTACCTGAATGAGGATGCAGACCACTCCATCTACATACAAGCAAACCTAAGT-------GACCATGAGCCTGCCGGAAAGAAATCACATGCTATGTAAAGGCTTAGTAACAGTGATGAATATTTGAACTTGAACTCCAGCTCCAGAGCAGTTCAGTGGCCTCTCTTCCAGGAACAGAAGCCAAAGCAGCTCAGGATTCTTGAAGGCTCTGAAAGGTCAATGACAATCCTGGTATATGTCAAGACTTTCCCACCAAAGAAGGGCTCCATGTGTAGAGACTTAGAAAGGATTCCCAACTTCCGCCCCTTCAAAACCAGAAACAAAGGTGGGGGACAGCCCAATTAAGTGGCCCTAGAGATTTGCCCAGGAGCTGGAGCCCTCCGGAGAAGTCCAGTTTTCCTATGCAGGGAGAGGACTGGGAGTTCTCTGGTCACAAGCGTTCTGCCTTTGTTTTCATGAAGCTAT----------------------------------------------------GTCTCTTACCTGGTAAGAAAAATGGAACTTCATGCAGCTGCTGAAAACTTTAACCAAAACCC----AAAGATGCTGGCACAAAGA s panTro4.chr18 74606312 1157 - 76611499 ggccagaaaagttaagtgcatcgtgttgagtacaattttatttggtgatcaggcagccctgggttcaaatcctggctctgttgctaccacttaagccacgtaactccatctgagcctcaggttgcccatctgcgtaataagcagtaacagcagctgtcctgcaggactactgtgagaattacaactcaggcaatgatcat---atttcttggca--gaggtgttcactacctaggtagtgttattattATTAtgtctaaagtcacaaagggagtttttgagaaagctggaatgaaaacttgttcctcccaacACTGAGCTTATTAGAGCACACCGTTTTGCTTGAATAAAGCAGCCCTGGAGTCTCTCAGGGGCGGGTGTTTGTAACATCTGCTCAGGCACGGTTTCATTTACTATATACCCAGAGACTAGCACTGTACAAGTTGTGGGGAGATACTCATGTGAGTTGGCAGACTTTTGGTCAAATATTTTCCCTAAATTCAGGTCTCTATGGCATTCTACAGAACACTCTGCATCCTTCTAAGGGACACTGGAAGAGCAAATGGATTGTACAGTGAGTTACAAATAAAATGGCTAATCTCAGCATGAAAGGCTGAGGGTGTTACCTGAATGAGGATGCAGACC-CTCCATCTACATACAAGCAAACCTAAGC-------GACCATGAGCCTGCCGGAAAGAAATCACATGCTATGTAAAGGCTTAGTAACAGTGATGAATATTTGAACCTGAACTCCAGCTCCAGAGCAGTTCAGTGGCCTCTCTTCCAGGAACAGAAGCCAAAGCAGCTCAGGATTCTTGAAGGCTCTGAAAGGTCAATGAGAATCCTGGTATATGTCAAGACTTTCCCACCAAAGAAGGGCTCCATGTGTAGAGACTTAGAAAGGATTCCCAACCTTGGCCCCTCCAAAACCAGAAACAAAGGTGGGGGACAGCCCAATTAAGTGGCCCTAGAGATTTGCCCAGGAGCTGGAGCCCTCCGGAGAAGTCCAGTTTTCCTATGCAGGGAGAGGACTGGGAGTTCTCTGGTCACAAGCGTTCTGCCTTTGTTTTCATGAAGCTTT----------------------------------------------------GTCTCTTACCTGGTAAGAAAAATGGAACTGCAGGCAGCTGCTGAAAACTTTAACCAAAAACTGGTTAAAGATGCTGGCACAAAGA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90218859 1158 - 108868599 ggccagaaaagttaagtgCATCATGTTGAATACAATTTTAtttggtgatcaggcagccctgggttcaaatcctggctctactgctaccaattaagccacttaactccatctgagcctcaggttgcccatctgtgtcataatcagtaatagcagctatcctgtaggactactgtgagaactacaactcaggcaatgatcatgatacttcttgacacagAGGTATTTATTACCTAGGTAGTGTTATTATTATGAtgtttaaagtcacaaagggagtttacgagaaagctggaatgaaaacttgtttctctcaactctgagCTTATTAGTGCACACTGTTTTGCTTGAATAAAGCAGCCCTGGAGTCTCGCAGGAGAGAGTGTTTGTAACATCTGCTCATGCACAGTTTCATTTACTATATACCCAGAGACTAGCACT-TACAAGTTGTGGGGAGATACTCATGTGAGTTGGTGGACTTTTGGTCAAATATTTTCCCTAAATCCAGGTCTCTATGGCATTCTACAGAACACTCTGTATCTTTCTAAGGGACACTGGAAGAGCAAATGGATTGTACAGTGAGTTACAAATAAAATGGCCAATCTCAGCATGAAAGACTGAGGGTGTTACCAGAATGAGGATGCAGACC-CTCCATCTACATACAAGCAAACCTAAGT-------GCCCATGAGCCTGCTGGAAAGCAATCACATGCTATGTAAAGGCTTAGTAACAGTGATGAATATTTTAACTTGAACTCCAGCTCCAGAGCAGTTCAGCGGCCTCTCTTCCAGGAACAGAAGCCAAAGCAGCTCAGGATTCTTGAAGGCTCTGAAAGGTAAATGAGAATCCTGGTATATGTCAAGACTTTCCCACCAAAGAAGGGCTCCGTGTGTAGAGACTTAGAAAGGATTCCCAACTTCGGCCCCTTCAAAACCAGAAACAAAGGTGGCAGACAGCCCAATTAAGTGGCCCTAGAGATTTGCCCAGGAGCTGGAGCCTTCTGGAGAAGTCCAGTTTTCCTATGCAGGGAGAGGACTGGGAGTTCTCTGGTCACAAGCATTCTCCCTTTGTTTTCATGAAGCTAT----------------------------------------------------GTCTCTTACCTGGTAAGAAAAATGGAACTTCATGCAGCTGCTGAAAACTTTAACCAGAAACC---CAAAGATGTTCGCACAAAGA i ponAbe2.chr14 C 0 I 27415 s nomLeu3.chr5 77014478 1159 - 143122389 ggccggaaaagttaagtgcatcatgtagattacaattttatttggtgatcaggcagccctgggttcaaatcctggctgtattgctaccagttaagccacttaactccatctgagcctcaggttgcccatctgtgtcataagcagtaatagcagctatcctgtaggactactgtgagaattacagctcaggcaatgatcatgatatttcttggcacagaggtgttcactacctaggtagtgttattattATTAGgtctaaagtcacaaagggagtttttgagaaagctggaatgaaaacttgtttctctcagctctgagCTTATTAGAGCACACCGTTTCGCTTGAATAAAGCAGGCCTGGAGTCTCTCAGGGGAGGGTGTTTGTAACATCTGCTCAGGCACGGTTTCATTTACTATATACCCAGAGACTAGTACTGTACAGGTTGTGGGGAGATACTCATGTGAGTTGTTGGACTTTTGGTCAAATATTTTCCCTAAACCCAGGTCTCTATGGCATTCTACAGAACACTCTGCATCCTTCTAAGGGACACTGGAAGAGCGAATGGATTGTACAGTGAGTTACAAATAAAATGGCCAATCTCAGCATGAAAGGCTGAGGGTGTTACCTGAATGAGGATACAGACC-CTCCATCTACATGCAAGCAAACCTAAGT-------GACCATGAGCCTGCCGGAAAGAAATCACATGCTATGTAAAGGTTTAGTAACAGTGATGAATATTTGAACTGGAACTCCAGCTCCAGAGCAGTTCAGTGACCTCTATTCCAGGAACAGAAGCCAAAGCTGCTCAGGATTCTTGAAGGCTCCGAAAGGTCAACGAGAATCCTGGTATATGTCAAGACTTTCCCACCAAAGAAGGGCTCCGTGTGTAGAGACTTAGAAAGGATTCCCAACCTTGGCCCCTCCAAAACCAGAAACAAAGGTGGGGGACAGCCCAATTAAGTGGCCCTAGAGATTTGCCCAGGAGCTTGAGTCTTCCGGAGAAGTCCAGTTTTCCTATGCAGGGAGAGGACTGGGAGTTCTCCGGTCACAAGCGTTCTGCCTTTGTTTTCATGAAGCTAT----------------------------------------------------GTCTCTTACCTGGTAAGAAAAATGGAACTGCATGCAGCTGCTGAAAACTTTAACCAGAAACC---CGAAGATGTTGGCACAAAGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36428008 1208 + 96509753 GGCCAGAAGTGTTAAGTGCATCATGTTGAATACAATTTTGtttggtgatcaggcagccctggggtcaaatcctgtctctattgctaccaattaagccacttaactccatctgagcctcaggctgcccatctgtgtaataagcagtaatagcagctctcctgcaggactatggtgagaattacagctcaggcaacgatcatcatactttttggcacagaggtgttcactacccaggcagtgttattattAT---GTCTAAAGTCACAAAGGGAGTTTTTAAGAAAGATGGAAAGAAAACTTGTTTCTCTCAATTCTGAGCTTATTAGAGCACACTGTTTTGCTTGAATAAAGCAGCCCTGGAGTCTCTCAGGGGAGGGTGTTTGTAACATCTGCTCAGGCACGGTTTCATTTCCTATATACCCAGAGACTAGCCCTGTACAAGTTGTGGGGAGATACTCATGTGAGTTGGCGAACTTTTGGTCAAATATTTTCCCTAAGCGCAGGTCTCTATGGCATTCTACAGAACACTCTGCATCCTTCTAAGGGACACTGGAAGAGCAAATGGATTGTACAGTGAGTTACAAATAAAATGGCCAATCTCAGCATGAAAGACTGAGGGTGTTACCT-AATGAGGACGCAAACCACTCCATCTACATACAAGCCCATCTACATACAAGCAAACCACGAGCCTGCCAGAAAGAAAGAACATGCTATGTAAAGGTTTAATAACAGTGATGAATATTT------GAACTTCAGCTCCAGAGCAGTTCATTGGCCTCCCTTCCAGGAACAGAAGCCAAAACACATCAGGATTCTTGAAGGCCCTGAAAGGTAAATGAGAATCCTAGTGTATGGCAAAACATTCCCACAAAAGAAGGGCTCCGTGTGTAGAGACTTAGAAAGGATTCCCAACTTCAGTCCCTTCAGAACCAGAAGCAAAGGTGGGGGACAGCGCAATTAAGTGGCCCTAGAGATTTG-CCAGGAACTAGAGCCTTCCGGAGAAGTCCAGTTTTCCTATGCAGGGAGAGGACTGGGACTTCTCTGGTCACAAGCATTGTGCCTTTGTTTTCAGGAAGACTTTTGGAGTCCCCCAGCATTGGAGGAACATTGCCTTACTGCGGACTCAAGCACAGTCTCTTACCTGGTAAGAAAAATGGAGCTGCATGCAGCTGCTGAAAACTTTATCCAGAAACC---CAACGATGTTGGCACAAAGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=393899.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 125823 516 + 478999 AAGGAGGCCTGAAGAAAACAAGTGACCATGGAAACACATTTAGCTCTTAATCTGACCAATTTCTCATGGGCCAGGCCTGGTGCCAGGAATGCTGTGATGAAT------AAGGCCTGAGCTGAGATTGTGAGGATGAGACGGAGTCCACCCTGTGGGGATCTGGGATGATAGAAGGGCTCCGCAGATAGAGGA-CCCGGTGGCCAGAAGTTCTGCTGAGTGGAAAAGGGCTCGGAGTAACTGAGGTCAGCTGGATTCCTTAAACATTGCCCAGAGCCCTTGAAGCCATCTAAGGGCAC---------------------------ACTTCTCAGGCCTGCTCCGAACCACACTCAACTGGGAATCTTTTAAGGACAGCTGCTCTGTTAGGCTTGCCTGAGATGGTGCAGTTTTCCCCCGCGGCGGCAGAGGCACAGACAGTTAAGAATGCAGGAGCGGGGCCTCACAATGCCTTGGACTAGGGCAAAGGAGGACCCCCGCCTC-TCCCCTCCCGGGGCTAAGACATGGGAGGACCCCGACCGGTGGATCCAT s panTro4.chr18 74607469 515 - 76611499 AAGGAGGCCTGAAGAAAACAAGTGACCATGAAAACACATTTAGCTCTTAATCTGACCCATTTCTCATGGGCCAGGCCTGGTGCCAGGAATGCGGTGATGAAT------AAGGCCTGAGCTGAGATTGTGAGGATGACAGGGAGTCCACCCTGTGGGGATCTGGGATGATA-AAGGGCCCCACAGATAGGGGA-CCCCATGGCCAGAAGTTCTGCTGAGTGGAAAAGGGCTTGGAGTAACTGAGGTCAGCTGGATTCCTTAAACACTGCCCAGAGCCCTTGAAGCCATCTAAGGGCGC---------------------------ACTTCTCAGGCCTGCTCTGAACCACACTCAACTGGGAATCTTTTAAGGACAGCTGCTCTGTTAGGCTTGCCTGAGATGGTGCAGTTTTCCCCCGCGGCGGCAGAGGCACAGACAGTTAAGAATGCAGGAGCGGGGCCTCACAATGCCTTGGACTAGGGCAAAGGAGGACCCCCGCCTC-TCCCCTCCCGGGGCTAAGACATGGGAGGACCCGGACCCGTGGATCCAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18557318 550 + 99152023 AAGGAGGCCTGAATAAAACAAGTGACCATGAGAACACATTTAGCCCTTAATCTGACCCATTTCTTATGGGCCAGGCCTGGTGCTAGGAATGCGGTGATGAATAAGTGGAAGGTGTGAACTGAGATTGTGAGGATGAGAGGGAGTCCACCATGTGGGAATCTGGGATGATGGAAGGGCCCCGCAGATAGGGGACCCCCGTGGCCAGAAGTTGTGTTGAGTGGAAAAGAGCTTGGTGTAACTGAGGTCAGCTAGATTCCTTAAATACTGCCCAGAGCCCTTGAAGCTATCTAAGGGCTCTTATCTAAGGGCTCTTAGATAGAGCAGGCTTCTCATGCCTGCTCCAAACCACACACGACTCGGAATTTTTTAAGGACAGCCGCCCTGTTAGGTTTGCCTGAGATGGTGTAGTTTTCTCCCGCGGCGGTAGAGGCACAGACAG-TAAGAGTGCAGAAGCCGGGCCTCACAATTCCTTGGACTAGGGCACAGGAGGACCCCCGCCCCAACCCCGCCCTGGACTAAAGCCTGTGAAGACCCCACCCCATGGCTCCAT i ponAbe2.chr15 I 37155 C 0 s nomLeu3.chr5 77015637 511 - 143122389 AAGGAGGCCTGAAGAAAACAAGTGACCATGAAAACACATTTAGCTCTTAATCTGACCCATTTCTCATGGGCCAGGCCTGGTGCCAGGAATGTGGTGACGAAT------AAGGCCTGAGCTGCGATTGTGAGGATGAGAGGGAGTCCACCCTGTGGGGATCTGGGATGATAGAAGGGCCCGGCAGATAGGGGA-CCCCGTGGCCAGAAGTTCTGCTGAGTGGAAAAGGGCTTGGAGTAACTGAGGTCAGCCGGATTCTTTAAACACTGCCCAGAGCCCTTGAAGCCATCTAAGGGCAC---------------------------AATTCTCAGGCCTGCTCCAAACCACACTCAACTGGGAATCTTTTAAGGACAGCTGCTCTGTTAGGCTTGCATGAGATGGTGCAGTTTTCCCCTGCGGGGGCAGAGGC----ACAGTTAAGAATGCAGGAGCCAGGCCTCACAATGCCTTGGACTAGGGCAAAGGAGGA-CCCCGCCCC-TCCCCTCCCGGGGCTAACACATGGGGGGACCCCGACCCGTGGATCCAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36429216 512 + 96509753 AAGGAGGGCTGTAGAA---AAGTGACCATGGAAACACATTGAGCTCTTAATCTGACCCATTTCTTCTGGGCCAGGCCTGGAGCCAGGAATGTGGTGATGAAT------GAGGCCTGAGCTGAGATCGTGAGGATGAGAGGGAGTCCACCCTGTGGGGATCTGGGATGATGAAAGGGCTCCGCAGATGGGGGA-CCCCCTGGCGAGAAGTTCTGCTGAGTGGAAAAGGGCTTGGAGTAACTGAGGTCAGCTGGATTCCTTAAACACTGCTCAGAGCCCTTGAAGCCATCTAAGGGCAC---------------------------ACTTCTCAGGCCTTCTCCAAGCCACGCTCAACTGGGAATCTTTCAAGGACAGCTGCTCTGTTAGGCTTGCCTGAGATGGTGTAGTTTTCCCCCGCCGCGGTAGTGGCACAGGCAG-TAAGTGTTTAGGAGTCGGGCCTCACAATGCCGTGGACTAGGGCAAAGGAGGACCCCGTCCTC-TCCCAGCCCTAGGCTAAAACACGGGAGGACCCCGACCGGTGGCTCCAT i macFas5.chr10 C 0 I 1370 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=546.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126339 1 + 478999 T s panTro4.chr18 74607984 1 - 76611499 T i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18557868 1 + 99152023 T i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016148 1 - 143122389 T i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36429728 1370 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=81608.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126340 127 + 478999 GACTCTGGCACCAGAGGATCCCCGCTCTCCAGCGCCCTAGACTGAGGCAACAGAAGACCTCAGACCTGCTCCATCCTGAACTAGAGCACAGTGGGACCCGCGACCTGCCGTGGTCTCAGGCACTGGA s panTro4.chr18 74607985 127 - 76611499 GACTCTGGCACCAGAGGATCCCCGCTCTCCAGCGCCCTAGACTGAGGCAGGAGAAGACCTCAGACCCGCTCCGCCCTGAACTAGAGCACAGTGGGACCCGCGACCTGCCGTGGCCTCAGGCACTGGA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18557869 127 + 99152023 GACTCTGGCACCAGAGGAACCCCGCTCTCCAGCGCCCTGGCCTGAGGTGGGAGAGGACCTCGGACCTGCTCCGCCCTGAACTAGAGCACAGTGGGACGCGCGACCAACCATGGCCTCAGGCACTGGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016149 127 - 143122389 GACTCTGGCACCAGAGGATCCCCGCTCTCCAGCGCCCTAGACTGAGGCAGGAGAGGACCCCGGACCTGCTCCGCCCTGAACTAGAGCACAGTGGGACCCGCGACCTGCCGCGGCCTCAGGCACTGGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36431098 123 + 96509753 GACTATGGCATCAGAGAA-CCCAGCTCCCC-GCGCCCTGGACAACAGCACCGGAGGACCCAGCACCCG--GCGTCCTGGACTAAGGCACAGTAGGACTCCGGCCGCATTGTGTACTCCTGCACAGGA i macFas5.chr10 I 1370 T 1493 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=37968.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126467 59 + 478999 GGACACCTGCAACGCCGTGCGCTAGACTATGCTACTGAAGGACCTCTACCGCGGCTCAG s panTro4.chr18 74608112 59 - 76611499 GGACACCTGCAACGCCGTGCGCTAGACTATGCTACTGAAGGACCTCTCCCGCGGCTCAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18557996 59 + 99152023 GGACACCTGCAACGCCCTGCGCTAGACTATGCTACTGAGGGACCTCTCCCCGCGCTCCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016276 59 - 143122389 GGACCCCTGCAACGCCGAGCCCTAGACTATGCTACTGAAGGACCTCTCCCGCGGCTCAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36429728 50 + 96509753 GGACCCCTGCAATGCCAAGAGCTAGGTTATGCTGCTGAAGGACCTCTCCG--------- i macFas5.chr10 T 1493 C 0 e chlSab2.chr2 37896243 31 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=176314.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126526 156 + 478999 CCCTGGACTAAGGCACCGGAGGATCCCCGCCCTGCCCC-----GCCCCG-----CGGTGTCCTGGACTGTG-CACTGCAGAACCCCCACCCT----TCCACACCCTGGACTCTGGCTCCCGAGGACCTTGGCCCCGGCTCGCCCTGAACTACTCCTGCCCCTCAGCGCCCT s panTro4.chr18 74608171 156 - 76611499 CCCTGGACTAAGGCACCGGAGGATCCCCGCCCTGCCCC-----GCCCCG-----CGGTGTCCTGGACTGTG-CACTGCAGAACCCCCACCGC----TCCACACCCTGGACTCTGGCTCCCGAAGACCTGGGCCCTGGCTCGCCCTGAACTACTCCTGCCCCTCAGCGCCCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18558055 156 + 99152023 CCCTGGACTAAGGCACCTGAGCATCCCC-----GCACC-----ACTCCG-----CGGTGTCCTGGACTGTGCCACTGCAGAACCCCCGCCCCTCCATCCACACCCTGGACTCTAGCACCCGAGGACCCCGGCCCTGGCTTGCCCTGAACTACTCTTGTCTCTCCGCGCACT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016335 162 - 143122389 CCCTGGACTAAGGCACCTGAGGATCTCCGCCCCGCACC-----GTCCCGCCTCACGGTGTCCTGGACTGCATCACTGCAGAACCCCCACCCC----TCCACACGCTGGACTCTGGCTCCCGAAGACCTGGGCCCTGGCTCGCCCTGAACTACTCCTGCCCCTCAGCGTCCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36429778 162 + 96509753 CCCTGGACTAAGGCACCGGAAGATccccgccctgccccgccctgccccg-----cggtgtcctgGACTGTGCCACTGCAGAACCCCCGCCCC----TCCACACCCTGGACTCTGGCTCTGGAGGACTCCGGCCCTGGCTCGCCCTGAACTACTCCTGCCCCTCAGCGCGCT i macFas5.chr10 C 0 I 2 s chlSab2.chr2 37896274 157 - 90373283 CCCTGGACTAAGGCACCAGAGGATCCCGGCCCTGCCCC-----GCCCCG-----CAGTGTCCTGGACTGTGCCACTGCACAACCCCCGCCCC----TCCACACCCTGGACTCTGGCTCTGGAGGACTTTGGCCCTGTCTCGCCCTGAACTACTCCTGCCCCTCAGCGCGCT i chlSab2.chr2 I 31 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=2000.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126682 2 + 478999 GG s panTro4.chr18 74608327 2 - 76611499 GG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18558211 2 + 99152023 GG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016497 2 - 143122389 GG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37896431 2 - 90373283 GG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36429940 2 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=577596.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 126684 539 + 478999 ACTGTGGTTCCAGAGGACCTGGTCCTGGGGCAACTTGTGCTACCGCGTGGACTCCAGGACCCCAGTCCTTCCACGCCCTAGACCAAGACACGGGAGAACCTCTGACTCGCCGCCCCC-GAACTAGGGCACCAGAGGACCCACACCTTGCCGTGCCCCGGACTACAGCACGGAAGGACCCCCGATCCGCCGGGCACTGGGCTCCTGCACAGAGGGACCCCCGCCATGGAGGTCTGGACTACCCCTGCCCCACCGCACCCTGGACTACTGCACGCCAAGACCCTCGCCTGAACACGCCCTACACTCTGGCATGGGGGAACCCGGCCCCGCAGAGCCCTGGACTCTGGCATTGGAGGACTC---CTCGGCTAGGTTCTGGACTCCTGCACCAGAGGACTCCTGC-CCTGCCACACCCTGGACACCTGCACTAGAGAACCCTGCCCCGTCGCCCCCTAGACTATGGCACGGGAGGACCCCTGCCACCGACTTCGGCACGGTAAGACCCCTGACCCGCCTTGCACTGGATTCCAGCACTGGAGGACCCC s panTro4.chr18 74608329 540 - 76611499 ACTGTGGTTCCAGAGTACCTGGTCATGCGGCAACTTGGGCTACCGCGTGGACTCCAGGACCCCAGTCCTGCCAGGCCCTAGACCAAGACACCGGAGAACCTCTGACTCGCCGCCCCCTGGACTACGGCACCAGAGGACCCAGACCTTGCCGTGCCCTGGACTACAGCACGGAAGGACCCCCGATCCGCCGGGCACTGGGCCCCTGCACAGAGGGACCCCCGCCATGGTGGTCTGGACTACCCCTGCCCCACCGCACCCAGGACTACTGCACGCCAAGACCCTCACCTGAACGCGCCCTACACTCTGGCATGGGGGAACCCGGCCCCGCAGAGCCCTGGACTCTGGCATTGGAGGACTC---CTCGGCTACGTCCTGGACTCCTGCACAAGAGGACTCCTGC-CCCGCCACACCCTGGACACCTGCACTAGAGAACCCTGCCCCGTCGCCCCCTAGACTATGGCACGGGAGGACCCTTGCCACCGACTTCGGCACGGTAAGACCCCTGACCCGCCTTGCACTGGATTCCAGCACTGGAGGACCCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18558213 501 + 99152023 ACTGTGGTTCCAGAGGACCTGGTCCTGCGGCAACTTGGGCTACCCTGTGGACTCCAGGACCCCATTCCCGCCCGGCCCTAGAGCAAGACACGGGAGAACCTCTGATCTGCCGCCCCCTGGACTAGGGCACCAGAGGACCCACACCTTGCCGTGCCCTGGACTACAGCACGGAAGGACCCATGATCCGCCCGGCACTGGGCTCCTGCACAGAGGGACGCCCGCCATGGAGGTCTGGACTACTCTTGTCCCACCGCACTCTGGACTACTGCACGCCAAGACCCTCGCCTGAACGCGCCCTACACTCTGGCATGGGGAAACCCCGCCCCGCGGAGCCCTGGACTCTGGCATTGGAGGACTC---CTTGGCTACGTTCTGGACT----------------------------------------CTTGCACTAGAGAACCCTGCCCCGTCGCCCCCTAGATTATGGCACGGGAGGACTCTTGCCACCGACTTCCGCACGGTAAGACCCCTGACCCGCCTTGCACTGGATTCCAGCACTGGAGGACCCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77016499 515 - 143122389 ACTGTGGTTTCAGAAGACCTAGCCCTGTGGCAACTTGGGCTACCGCGTGGACTCCAGCACCCCAGTCCTGCCAGGCCCTAGACCGAGACACGGGAGAACCTCTGACTCGCCGTCCCCTGGA-TAGAGCAGCAGGGGACCCACACCTTGCCGTGCCCTGGACTACAGCACGGAGGGACCC-CGATCCGCCGGGCACTAGGCTCCTGCACAGAGGGACCCCCGCCGTGGAGGTCTGGACTACCCCTGCCCCACCGCACTCTGGACTACTGCACGCCAAGACCCTCGCCTGAACGCGCCCTACACTCTGGCATGGGGAAACCCGGCCCCGCAGAGCCCTGGACTCTGGCATTGGAGGATTC---CTCGGCTACGTTCTGTACTCCTGCACCAGAGGACT------------------------CCTGCACTAGAGAACCCTGCCCCGTCGCCCCCTAGACTATGGCACAGGAGGACCCTTGCCACGGACTTCCTCACAGTAAGACCCCTGACCCGCTATGCACTGGATTCCAGCACTGGAGGACCCC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36429942 529 + 96509753 ACTGTGTTTCCAGAGGACCTGGTCCTGCGGCAACTTGGGCTACCTCGTGGACTCCAGGACCCCAGTCCTGCCAGGCCCTAGACCAAGACCCAGGAG-------GACCCGACACCCCCTGT--------ACCAGAGGACCCATACCTTGCCGTGCCCTGGACTACAACTCGGCAGGACCCCCGATTCGCTGAGCACTGGACTCCAGCACAGAGGGACCCCCGCCATGGAGATATGGACCACTCCTGCCCCACCGCACCCTGGACTACCGCACGCCAAGACCCTCGCCTGAACGCGTCCTACACTCTGGCATGGGGAAAACCGGCCTCACAGAGCCCTGGACTCTGGCATTGGTGGACTCCCACTCGGCTACGTCCTGGACTCCTGCACCAGAGGACTCCTGTCCCCCCCGCACCCTGGACACCTACACTAGAAAACCCTGTCCCGTCTCCCCCTAGACTATGGCAGGGGAGGACCCTGCAAACCGACTCCGGCACAGTAACACCGCTTACCCGTCATGGGCTGTATTCCAGCACTGGAGGACCCC i macFas5.chr10 I 2 C 0 s chlSab2.chr2 37896433 535 - 90373283 ATTGTGTTTCCAGAGAACCTGGTCCTGCGGCAACTTAGGCTACTGCGTGGACTCCAGGACCCCAGTCCTGCCGGGCCCTAGACCAAGACCCAGGAG-------GACCTGCCACCCCCTGTACTAGATCACCAGAGGACCCACACCTTGCCGTGCCCTGGACTACAGCTTGAAAGGACCCACCATCCGCTGAGCACTGGGCTCCAGCACAGAGGGACCCCCACCATGGAGATACCAACCACCCCTGCCCCACAGCACCCTGGACTACCGCACGCCAAGACCCTTGCCTGAACGCGCCCTACACTCTGGCAT-GGGAAATCCGGCCCCTCAGAGCCCTGGACTCTGGCAGTGGGGGACTCCCACTCCGCTACGTCCTGGACTCCAGCACCGGAGGACTCCTGT-CCCGCCGCACCCTGGACACCTACACTAGAAAACCCTGTCCCGTCTCCCCCTAGACTATAGGAGGGGAGAACCCTGCAAACCGACTCCGGCACAGTAACACCCCTGACCCGCCATGCGTTGTATTCGGGCACTGGAGGACCCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=83193.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 127223 105 + 478999 CTGCCACGGCGCTCTCTGGACTACCCCTGCGCCACCGCGTCCTGCACTACAGCACAGCAGGACCGCCGTCCCACCGCGCACTGGACTGAGGCACAGCAGCACCCG s panTro4.chr18 74608869 99 - 76611499 CTGCCACGGCGCTCTCTGGACTAGCCCTGCGCCACCGCGTCCTGCACCACAGCACAGCAGGACCGCCGTCCCACCGCGCACTGGACTGAGGCACAGCAG------ i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18558714 105 + 99152023 CTGCCACGGCGCTCTCTGGACTACCCCTGCCCCTCCGCGTCCTGCACTACAGCACAGCTGGACCGCCGTCCCACTGCGCACTGGACTGAGGCACAGCAGGACCCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77017014 105 - 143122389 CTGCCACGGCGCTCTCTGGGCTACCCCTGTCCCACCGCGTCCTGCACTACAGCACAGCAGGACCGCCGTCCCACCGCGCGCTGGACTGAGGCACAGCAGGACCCG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37896968 105 - 90373283 CTGCCACGGCGCTCTCTGGACTACCCCTGCCCCACTGCGTCCTGCCCTGCAGCACAGCAGGACAGTCGTACCACTGCGCGCTCGACTGAGGCACAGCAGGACTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36430471 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=5565.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 127328 13 + 478999 GGCCTCGTGGTTG s ponAbe2.chr15 18558819 13 + 99152023 GGCCTCGTGCATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77017119 13 - 143122389 GGCCTCGTGCATG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36430471 13 + 96509753 AATCCCGTCGCTC i macFas5.chr10 C 0 I 108 s chlSab2.chr2 37897073 13 - 90373283 GGCCTCGTGTGTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M e panTro4.chr18 74608968 0 - 76611499 C a score=175129.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 127341 269 + 478999 GTGGACCGCAGGACGAGGTGACCCCCCGCCCCGCTGCGCGTTGGACTATGGCACAGGAGGACCACCATTCCCGCATGCCCTGGACCACTGCAGGACAGGTCCCCCACTCCGCAGCGGCCTGGAATATGGCACTGCAGGACCCCCGCCCTGCTGCTCCACGGACTCCACCACTGAAGACCCTCGCCCCCCTGCACCCTGGACAAAGGCACGGGAGGACCCGGCTTCACCGCCCAGTGGGCTATCGCATAGGAAAACCCCCAGC-CCACCCC s panTro4.chr18 74608968 211 - 76611499 -----------------------------------------------------------GACCACCACTCCCACATGCCCTGGACCACTGCAGGACAGGTCCCCCACTCCGCCACGCCCTGGAATATGGCACTGGAGGACCCCCGTCCTGCCGCTCCGCGGACTCCACCACCGAAGACCCCCGCCCCCCTGCGCCCTGGACAAAGGCATGGGAGGACCCGGCTTCACCGACCCGTGGGCTATCGCATAGGAAAacccccacctccacccc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18558832 268 + 99152023 GT-GACTGCAGGACGAGGTGACCCCCTGCCCCGCCGCGCGTTGGACTATGGCACAGGAGGACCACCACTCCCGCATGCCCTGGATCACTGCAGGACAAGTCCCCCACTCGGCCGCGCCCTGGAATATGGCACTGGAGGACCCCAGTCCCGCCGCTCCGTGGACTCCACCACCGAAGACCCTCGCCCTGCTGCGCCCTGGACAAAGGTACGGGAGGACCCGGCTTCACTGCCTCATGGGCTATCGCATAGGAAAACCCCCACC-CTACCCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77017132 267 - 143122389 GT-GACTGCAGGACGAGGTGACCCCC-GCCCCGCCGCGCGATGGACTATGGCACAGGAGGACCACCACTCCCGCATGCCCTGGATCACTGCAGGACAGGTCCCCCACTCCGCCGTACCCTGGAATATGGCACTGGAAGACCCCCGTCCCGCCGCCACTCGGACTCCACCACGGAAGACCTTCGCCCCCTTGCGCCCTGGACAAAGGCACGGGAGGACCCGACTTCACCGACCCATGGGCTATCACATAGGAAAACCCCCACC-CCACCCC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37897086 263 - 90373283 GTGGACTGCAGGGCGAGCTGACCCCT-GCCCCGCGGCGTGTTGGACTATGGCTCAGGAGGACCACCACTCCCGCATGCCCTGGACCACCGCAGGACAGGTCCCCCACTCCGCCGCG-CCGGGAAAACGGCACTGGAGGACTCTGGTCCAACCGCTCTAGGGACTCTACCACCGAAGACCCTCACCCCGCTGCGCCCTGGACAAAGGCACAGGAGGACACAGTCTCACTGCCCCGTGGGCTATCGCATAGGAAATCCCCCAAC-CCA---- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36430484 108 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=1215291.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 127610 1076 + 478999 CATC--GCGCCAGAGACTCTGACAAGAGAGAACCCCTGCCCCCTGCTCCCCGGACTACAGCAAGGCAGGAACCACCCTCCTCCAGGATCCTCACTATGGCAACTGTGGAACCCCGCCCTGGTACGCCCTGGACTAAGTCACCGAAGGACCCCGACCCCACCACACCGTGAACTCCAGCACTGGAGGACCATTGCCTTACTGCGGACTCAAGCACTGGACTATCGCAGGGCTGGATCCCTGTCCCGCCATGCCCTACACTATGGCACGGGAGGACCCAGCCTCACTGAGCTCTGGACTCCAGCACCGGAGGACACCTACACGGAGGACTCCTGCTCCGCCACG------TCCTGGACTCCTGCACAAGAGAACCCCCGCCCCGCGGCACCCTGGATATAGCAAGGCAGGAATCCCGCCCTGCAGTGTTCTGGACTGCGGCACCTGAGAATCCATGCCCCACCGCGCCCTGGACTGCTGCTCCACAGGACTCCTGTTCCACTGCACCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCTCCC--------------------------------------GGCAG--------CCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCCCCTCGCATCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCCCCCTGGCGTCTTGGACTAAGGCACAGTAGGACCCC-GCAGCATCGTGTACTCCTGCACAGGAGGACCCTCGCAGGGCTGCGTCCTGGACTGAGCTACTGAAGGAGCCTCACCCCTGCCTCACCCTGGTCTAAGGCACTGGAGAACTCTTGCTCCGCAGAGCTGCGGACTCTTGCACGAGAGAACCTGCGCCCAGCCGTGCCCTGGACTGTGGCACAGTAGGGCCCACACCGGGCCATGGACTCCTGTACTGGAGGAAGAGTGGTGATAAATGTCCAGGTTTACAAGTTGAAAAGTAGCAGTCAATGTGCTACAATGGATGGATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAaacattatgtgtaattgcctagccagatcaactacacaagacaaagaaataaaagaaatccatatagggaaggaagaggtaagattgtttctgttttctgaaaatataatcttaagatacagaaaatctt s panTro4.chr18 74609179 1113 - 76611499 caccccGCGCCAGAGACTCTGAGAAGAGAGGACCCCTGCCCCCTGCTCCCCGGACTACAGCAAGGCAGGAACCACCCTCCTCCAGGACCCTCACTATGGCAACTGTGGACCCCCGCCCTGGTACGCCCTGGACTAAGTCACCCAAGGACCCCGACCCCACAACGCCGTGAAC---AGCATTGGAGGACCATTGCCTTACTGCGGACTCAAGCACTGGACTATCGCAGGGCAGGATCCCTGTCCCGCCATGCCCTACACTATGGCACGGGAGGACCCAGCCTCACTGTGCTCTGGACTCCAGCACCGGAGGACTCCTACACGGAGGACTCCGGCTCTGCCACG------TCCTGGACTCCTGCACAAGAGAACCCCCGCCCCGCTACACCTTGGATATAGCAAGGCAGGAATCCCGCCCTGTCGCGCTCTGGATTGTGGCACCTGAGGATCCACGCCCCAGCGCTCCCTGGACTACTGCTCCGCAGGACTCCTGTTCCACCGCACCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCTCCCCGCGACCGGGACTAAGGCACCAGAGGACCCAGCCCCCTGGCGT--------CCTGGACTATGGCGCCAGAGGACCCAGCCCCTCGCATCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCCCCCTGGCGTCCTGGACTAAGGCACAGTAGGACCCC-GCAGCATCGTGTACTCCTGCACAGGAGGACCCTCGTAGGGCTGTGCCCTGGACTGAGCTACTGAAGGAGCCTCACCCCTGCCTCACCCTGGACTAAGGCAATGGAGAACTCTTGCTCTGCAGAGCCGCAGACTCTTGCAGGAGAGAACCTCCGCCCAGCCGTGCCCTGGACTGTGGCACAGTAGGGCCCACACCGCGCCATGGACTCCTGTACTGGAGGAAGAGTAGTAATAAATGTCCAGGTTTACAAGTTGAAAAGTAGCAATCAATGTGTTACAATGGATGGATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAAACATTATGTGTAATTGcctagccagatcaattacacaagacaaagaaataaaagaaatccataaagggaaggaagaggtaagattgtttctgttttctgaaaatataatcttaagatacagaaaatctt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18559100 1113 + 99152023 CACCCCGCGCCAGAGATTCTAGCAAGAGAGGACCCCTGCCCCCTGCTTTCCGGACTACAGCAAGGCAGGAACCACACTCCTCCGAGGTCCTCACTATGGCAAGTGTGGA-CGCAGCCCTGGTAC-CCCTGGACTAAGTCACCGAAGGACCCCGACCCCACCAAACCGTGAATTCCAGCATTGGAGGACCATTGCCTTACTGCGGACTCAAGCACTGGACTATTGCAGGGCAGGATCCCTGTCCCGCCACGCCCTACACTACCGCACTGGAGGACCCAGCCTCACTGCGTTCTGGACTCCAGCACCGGAGGACTCCTGCACGGAGGACTCCGGCTCTGCCACG------TCCTGGACTCCTGCAGAAGAGAACTCCCGCCCCGCTGCACCCTGGATATAGCAAGGCAGGAATCCCGCCCTGTCGCGCTCTGGGCTGTGGCACCTGAGGATCCACGCCCCAGCGCGCCCTGGACTACTGCTCCGCAGGACTTCTGTTCCACCGCACCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCTCCCCGCGACCTGGACTATGGCACCAGAGGACCC--------AGCCTCCCTGCGTCCTGGACTAAGGCACCAGAGGACCCAGCCCCTCGCGCCCTGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCCCCCCTGCGTCCTGAACTAAGGCACAGTAGGACCCC-GCAGCATCATGTACTCCTGCACGGGAGGACCCTCGCAGGGCTGCTCACTGGACTGAGCTACTGAAGGAGCCCCACCCCTGCCTCACCCTGGACTAAGGCACTGGAGAACTCTTGCTCCGCAGAGCCGCGGACTCTTGCAGGAGAGAACCTGCGCCCAGCCGTGCCCTGGACTATGGCACAGTAGGGCCCACACCGCGCCATGGACTCCTGTACTGGAGTAAGAGTAGTGACAAATGTCCAGGTTTACAAGTTGAAAAGTAGCAATCAATGTGCTACAATAGATGTATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAAACATTATGTGTAATTGcctagacagaacaattacacaagacaaagaaataaaagaaatccatatagggaaggaagaggtaagattgtttctgttttctgaaaatataatcttaagatacagaaaatc-t i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77017399 1112 - 143122389 CACCCCGCGCCAGAGACTCTGACAAGACAGGACCCCTGCCCCCTGCTCCCCGGACTACAGCAAGGCAGGAACCACCCTCTTCCGAGGTCCTCACTATAGCAACTGTGGACCCCCGCCCTGGTACGCCCTGGAGTAAGTCACGGAAGGACCTCGACCCCACCACGCCGTGAACTCCAGCATTGGAGGACCATTGCCTTCCTGCGGACTCAAGCACTGGACTATCGCAGGGCAGGATCCCTGTCCCGCCATGCCCTACACTATGGCACGGGAGGACCCAGCCTCACTGTGCTCTGGACTCCGGCACCGGAGGACCCCTACACGGAGGACTCCCGCTCCGCCACG------TCCTGGACTCCTGCACAAGAGAACCCCCGCCCCGCTGCACCCTGGATACAGCAAGGCAGGAATCCCGCCCTGTTGCGCTCTGGACTGCGGCACCTGAGGATCCACACCCCAGCGCGCCCTGGACTACTGCTCCGCAGGACTCCTGTTCCGCTGCACTCCGGACTATGGCACCAGAGGACCCAGCTCCCCGCGACCTGGACTATGGCACCAGAGGGCCC--------AGCCTCCCTGCGTCCTGGACTAAGGCACCAGAGGACCCAGCCCCTCGCATCCTGGACTATGGCACCAGAAGACCCAGTCCCCTGGCGTCCTGGACTAAGGCACAGTAGGACCCC-GCAGCATCGTGTACTCCTGCACAGGAGGACCCTCGCCGGGCTGCGCCCTGGACTGAGCTGCTGAAGGAGCCCCGCCCTTGCCTCACCCTGGACTAAGGCGCTGGAGAACTCCTGCTCCGCAGAGCCACGGACCCTTGCAGGAGAGAACCTGCACCCAGCCGTGCCCTGGACTGTGGCCCAGTAGGGCCCACACCGTGCCATGGACTCCCGCACTGGAGGAAGACTAGTGACAAATGTCCAGGTTAACAAGTTGAAAAGTAGCAATCAATGTGTTACAATGGATGAATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAAAC---ATGTGTAATTGcctagccagaacaattacacaagacaaagaaataaaagaaatccatatagggaaggaagacgtaagattgtttctgtttactgaaaatacaatcttaagatacagaaaatc-t i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36430592 1044 + 96509753 --CACTGTGCCAGAGACTCTGACAAGAGAGGACTCCTGCCCCCTGCTCCCCCGACTACAGCAAGGCAGGAACCACACTCCTCGGAGGTCCCTACTGTGGCAACTGTGGACCCCTGCCCTGGTATGCCCTGAACTAAGTCAGGCAATGACCCCGACCCCACCACGCCGTGAACTCCAGTATTGGAGGACCATTGCATTACTGTGGACTCAAGCACTGGACTATCTCAGGGCAGGATCCCTGTCCCGCCATGCCCTACTCTATGGCACGAGAGTACCCAGCCTCACTGCGCTCTGGACTCCAACACCCCAGGACTCCTACACGCAGGACTCCCGCTCCTACACAGTCCCATCCTGCACTCCTGCACAAGAGAACCCCCGCCCGGCTGCACCCTGGATATAGCAAGGCAGGAATTCCGCCCTGTGGCGCTCTGCACTGTGGCACCTGAGGATCCACAGTCCAGCGCGCCCTGGACTACTGCGCCACAGGACTCCGTGTCCGCCGCGCCCTGGACTATGGCATCAGAGAACCCAGCTCCCCGCG-----------------------------------------------------------------------------------CCCTGGACAACAGCACCGGAGGACCCAGCACCC-GGCGTCCTGGACTAAGGCACAGTAGGACTCCGGCCGCATTGTGTACTCCTGCACAGGAGGACCCTTGCAGGGCAGCGCACTGGACTGAGCTACTGAAGGAGCCCCACCCCTGCCTCACCCTGGACTAAGGCACTGGAGAACTCTTCCTCCACAGAGCCGCGGACTCTTGCAGGAGAGAACCTCCACCAAGCC-TGCCCTGGACTGTGGCCCAGTAGGGCCCACACCACGTCATGGACTCCTGTACTGGGGGAAGAGTAGTGATAAATGTCCAGGTTTACTAGTTGAAAAGTAGCAATCAATGTGTTACAATGAATGGATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAAACATTATGTGTAATTGcctagccagaacaattacacaagacaaagaaataaaataaatccatatagggaaggaagaggtaagattgtttctgttttctgaaaatataatcttaagatagagaacatctt i macFas5.chr10 I 108 I 57213 s chlSab2.chr2 37897349 992 - 90373283 ---GTAGTGCCAGAGACTCTGACAAGAGAGGACCCCTGCCCCCTGTTCCCCCAACTACAGCAAGGCAGGAACCACACTCCTCCGAGGTCCTCACTGTGGGAACTGTGAACCCCGGCCCTGGTATGCCCTGTTCTAAGTCACCCAATGACCCCGACCCCACCAGGTCGTGAACTCCAGCACTGGAGGCCCATTGCCTTACTGCGGACTCAAGCACTGGAGTATGGCAGGGCAGGATCCCTGTCCTGCCATGCCCTACACTGTGGCACGGGAGGACCCAGCCTCACTGTGCTCTGGACTCCAGCACCCCAGGACTCCTACACGGAGGACTCCCACTCCACCACG--------------TCCTGGACAAGGGAACCCCCGCCCCACTGCACCCTGGATATAGGAAGGCAGGAATCCCGCCCTGTCGCGCTCCTGACTGTGGCACCTGAGGGCCCACCTCCCAGCGTGCCCTGGACTACTGCTCCGCAGGACTCCTGTTCTGCCGCGCCCTGGACTATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCACCAGAGGACCCAGCACCC-GGCGTCCTGGACTAAGGCACAGTAGGACTCCGGCCGCATTGTGTACTCCTGTACAGGAGGACTCTTGCAGGGCAGTACACTGGACTGAGCTACTGAAGGAGCCGCATTCCTGCCTTACCCTGGACTAAGGCACTGGAGAACTCTTCCTCCACAGAGCCGCAGACTGTTGCAGGAGAGAACCTCCACCCAGCC-TGCCCTGGACTGTGGCCCAGTAGGGCCCACACCAGGTCATGGACTCTTGTACTGGAGGAAGAGTAGTGATAAATGTCCAGGTTTACAAGTTGAAAAGTAGCAATCAATGTGTTACAATGAATGGATTTGATGTAAAATTACAAATGCTGAAAACATTATGTGTAATTGcctagccagaacaattatacaagacaaagaaataaaacaaatccatatacggagggaagaggtaagattgtttctgttttctgcaaatataatcttaagatggagaaaatctt i chlSab2.chr2 C 0 I 2622 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=2910222.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 128686 5646 + 478999 TTTTTATTATTAATGTTCTATTTACTTATTTTTATAATATTTTATAAATAAACTTTATTCATATAAAACAGGCCAAACATCTGACATTCAAAAATGGCTACTGTTATAAAATCAGAAACATAGTCAGAGTGTTGGGAATATTGAAATTTCTAAATCTTTATGAATAACACAATCACTTAAGTTATATCCACAAAGAACAGAAAAGAGGCAAGCTTGAAAATATGAGGATAGAAAGATGTCACAGTGATGTGTTTTTAGAAACAGTACCTTCACCTCTAAGCAACTTTCAGGTAGGTGATAGCTAGCTCATAGGCACCAGAAATTCATAACAGAAATTAAATTACCCAAAAGGCACAGAAGAAAATGTTAACACAAGTATAAAAGTAATTTTATGTAAGGTTAAAACCTATTTTTAAAATGCTTCCAAATATGTAAAACTATACACAAGTCCATTACACATTCAGCTTAAGTTTACCATTAAAAAGTGTACACACAATACTGTAACTGTAAATACATGCCACCGTTTATAATGTAGCATTTACCACCACAGCACCCAAAGATATTAACAGAAACCAACTCCCCACTAAAATCTAGGGAAAGGTTTTAGAGCTAGTGAAATAATTTATTGCAGACCGTATTTATTATAAAGAAACTATTGGCTCATTCTACTGTATCCACACTCCCTCACAATCTTAAGGGAGATACAATAAGTCCACTCTCTTCTCCTAAAATGATATTTAGCACATTTGACAAGGAGGAGTGGTTGCtttattcc-tttttcttatctttttt--tctttttctttttttctttctttctttttttttttttttAAGAATAAATCACTTTCACAAAACTGAGACTCAAACTTTTTTGAAGCTCAGCTTGATTTGCTGGAACTACACAGAGACATGTTTGATCACACAACAGCAACTGTACATCCTCCCAAGTCTGGAATACGGAATTGATGGAGGACACTTACTTGCTTAAAATGTATTTGATTATTCTGCATTTATGATAAAAATATCATCCAGGGATCATATTCAAGAGGGTAAATTTAGGATTACATGTTTCTAGAACATATAACATGTAATGCCATCCAAAACCAACAACAAACAACATAGAGCACTGAAACCGAAGAGCCACTTAAAATTTAGAATTAGGAAATTTCAATCTATAATTGCCAAACAATAAGTGAGTTATAATATTTTTCTAATTAGAAAAATATCACCTAAAGTGGAAAGCCAGCATTTAGTTGGGGACTATGAGATACTACATCCTTGGTCTGGCTGGCCACCATTTTAAAGACCACCACAGATCTCAAGGCATGAGACCTCTCACCAACAAAATCTATCCCTGCTATTGCACCTAGTGCCATCTCAATATGTGGCAGACAGCAAATGTTCTAACTTAATCTGATAGATGCTCCTTTAGCATATAAAAGAGCTTGCTAAGTCCCTATTACCTGTAGCAGTCTATCAACTAAATATTTAAGAAGTCATTTCATAGGCAAGGTTTATGAATGACTTAGAAGTAAAATTAGTAATTTCTAAACCACTGTAGTGTTTTCTATGTTTTTAGAGATATTCCTAACACAGAGTTTTCCGAGGAGCTGTGAAAACAAGTACAAACGTACATAAGTAATTTTGTCAGGGATGTTTCTGTACTAATTTGGGGGAGACTTGTGGGCCATAAATAAATGAGATACACATCCTAAAAATAATGGTAAAAATTATCAAGTACCACTTTCAGATGGTTACTCAAGTATCAACTTGGTATGCAAGTAAGTTCACGGATTTCTTCACCTATGATTTCATACTCAAAGTGCTACATCTTACTTAGGTACTGATAACATTTAGAAACCTTTATAATCAGCCTCTTAAAGAAAATCCAGCCTTTTCAGATGGTAAACTTGTCTTTACTAACTTTAATGCCCGTAACTATTTCGATATAACCAAACAAAAATTTTTAAAAATATATTCCTTACAGCTCCTGATTAACTTA-TTTTTTGATACATTCTGAGGCTAGTAACAAAATTTAGACCAGAATAGGTTTTCATATATCAAAAAA-AGGAAAGGAACACGGAGAGCACAGATGAGACGTATGGAGGCTCTATACTATAGACCCATCCTTGCTCTGTGCGGGAATCATCACAGGAATCGCGCCCATTCGACTTAGATTAGGGGCAGCTACCTTAGCAGGTGGGAGAGTCGGACTCTGAGGAGTGCGTTCAAAGTCTTCACTTGGTACTTGTTTATACTGAGTCTTGGAATATCCTTCCATGTTGGAAGGAGATATGGATCCCAGGGATGAATGATTACTGCCTATGTAGCTTCTGGCAGTGGACGTGCGGCTCTTTGGAGGCGGCACATCTTCCTTGATATCGTGATGAACTTCCTTTTCATATTTTTCTTCTCTGCACTTTTTACGACAGCAAAAGATGATAAGACCAATGAGCACTAGAGCAAGCAAAGTTCCTATAATGGCTCCTGCAATTAGTCCAGCTTTATTTGAAGGAGGGACAACGTTTACACGCAACAGGCACTGATCAGAGCCCACTCTGTTTCTGA-TGTACAGCTGTATGTCCCAGAGTACTCAGAAGAAGCATTTTT---ATAGATATAACAGATGAAGTCATTTCTGCTAACCATGAAGTGGGCATTTTCTGTGAGTCAGACAATTTTTGCCACTCATACTGTAATGGAAGTGAACCTTCTTTTGGTTCACATTTTAATTTAAAGTCACTTCCAATTTCTTCTGATCCATCAACGTAACATCTTGTACCTGAAGGCTTACCAAGAACTACCAGCTGAATCTTCCTATTTGCAACACCAGGAGCTCTTTTCACTTTGCACTGATCTGTGCCAATATCTGACAGCTGAAAATTCGTTACATTTATTGATGCATCACCAGATTTGAGATCATTACTCTTAAAATGTACTCGGCCTTTCAGATCTGGATAGTAGTCATCATAAATTTTGTCTCCAGAATATAAAATAATCACTTGATCCACCTTCTGATTATCAGCTGGTGATATCAGCCACTCGATGTCCAGTGGTCCCTGGTCTTCAGGACTAAGCGTAAATTTGCATGGCAGATAGGCAGTTTCCCCTTTGGCTTTTTCAATCATCTGCTCAGGAGTAGTGATACTCCAACCTCTGATGAAATCCGCGACTCTGCACAGGAGCACGAAGCGCAGCAGGAGCGCCATGGTGGCTGCCGTGCCGTGGGCGGCGGCTGCAGGTAGGCGGCTCTCGCTCCAGGTCCTAGGCTCCCCGCGCCTGGCGCACTCAAGG-tagagaaaatcttaaagactccaccacaataaacggttaaagctgataaagaaattcaataaagttaatagttacaaaatca---tacagatagcattattgtttctatacattaatgacaaactattacctgaaaaataaattaataaggcaattcaatttataatagaatcaaaacagatataaaaatatgtaaaagacttaggagtaaatttaatcaagaatgtgaaagatttgcacactgaaaactatagcacattgatgaaaaaagttaaaatggcataaataaatggagaaacatcctttattgattgattcaaaaattagtattgtaaaagtgtcaatgctacccaaagcaatctacagattaaatgcaaccactatcaaattcccagaaatagaaaaattactgctaaaatttgtatgaaaccacaaaagaccctgactaaccaaagcaatcttgaacaaaaagaataaagctggaggcatcagactacccgattccaaactatattacaaagctatagtaattaaaacaacatagcagtggcataaaaacagacatgtagaacagtgcaaagggatatagaacccgtaaataaatccgtatgtctgtggtcaattgacttttt-gataaaataactaaaaatacacaatgaagaaagaaaattattttcaataaatggtgtagaaaaaactgactatccacatacagaagaataaaatttgacttttcttttgctctttatacaagcatgaaatcaaaattaaagacttaaatgtaaaactactacaaggaaatacagaagaagactgtatgacattggcctgagctatgattttctgtagattattccaaaagcacaggcaacaaaagcaaaaacacatgaatgagattgcataaaactaaaaagcttttccacaggaaaagaagtgataatagaatgaagagaacccacaaatgggataacatttttaaaccatacatcagataaggggctcatataataatatataagtaactcaacctactcaaacataagaataaaactatgcttattaaaaaaaataagcaaagaaccagaatagacatttcgtaaggcatacaaaaggccaacaggtacatg-aaaaaatcataaa--catttctaattatcagagaaatgcaaatcaaagccacaatgagatatcacctcacacattttactagggctattataaaaaaagatggaagataagtgttgatgaggatgtggagaaaaagaaaccctgtgcactgttggtaagaatggaaattagcacagccatcttggaaaacagtatgaagcttcctc-aagaaattataaatatatttaccctatgatccatcaatcccacttctggatacgtgtccaaaggaattttaatcagtatgtcaaaaacagacatctgcaatttcatgttcattgcagcattattcataatacccatgaattagaaacaacctaagtgcttatcaactgaagactagataaaaatatgtggaaaaattggaacccttctacaccactggtgagactttaaaatgtaaagcagtctcgcagttcttcaaatggttaaacatagagttatcacgtgacccagcaattccactcctatgtgtttaccaaaaagaaaataaaacaaatgctacacaaacagtagtacacaaatgtttatagcaacac-aaagtagaaaacaacagaaatgttcatcagctgaggagtggataaataaaatgtggtgtgtccataaaatagaatcttatttagcaagaaaaggtaaaaaactgttaatgcatgctccaaaatggatgaacattaaaaatatgttaggtgaaagatgtgagtaaaaagtgactatgtgttattataattccatttatgtgaaatgtccagaataggcaaattcatagtcagaaagtagacgagtggttgcctagactaggaggggtttaaaaaagactggagaaaatggggaaagattgctaatgggcgcaagtctcttttaaggaaaat-aaaatgttctaaaattatattatgatgattatttgtccatccagttaatatactaaaagaatttgaagtttgtactttaaatgagtgaattacacaatgtataaattatatctcaataaagctgtggaaaGTTAaaagtatatgtaggatgcatacaaaaatactacttatctttataaatgaatgaaaatctgtcatttgcaaaaacatggatgaatttagaggacattatgctaagtaaaataagccagacacagaaagacaaatatctcatagtatcacttatatgtgaaatccaaaactgtgcactcatagaagttaagaa s panTro4.chr18 74610292 5633 - 76611499 TTTTTATTATTAATGTTCTGTTTACttatttttataatattttataaataaactttattcatataaaaCAGGCCAAACATCTGACATTCAAAAATGGCTACTGTTATAAAATCAGAAACA------GAGTGTTGGGAATATTGAAATTTCTAAATATTTATGAATAACACAATCACTTACGTTATATCCACAAAGAACAGAAAAGAGGCAAGCTTGAAAATGTGAGGATAGAAAGGTGTCACAGTGATGTGTTTTTAGAAACAGTACCTTCACCTCTAAGCACCTTTCAGGTAGGTGATAGCTAGCTCATAGGCACCAGAAATTCATAACAGAAATTAAATTACCCAAAAGGCACAGAAGAAAATGTTAACCCAAGTATAAAAGTAATTTTATGTAAGATTAAAACCTATTTT-AAAATGCTTCCAAATATGTAAAACTATAGACAAATCCATTACACATTCAGCTTAAGTTTACCATTAAAAAGTGCACACACGATACTGTAACTGTAAATACATGCCACTGTTTATAATGTAGCATTTACCACCACAGCACCCAAAGATATTAACAGAAACCAATTCCCTACTAAAATCTAGGGAAAGGTTTTACAGCTAGTGAAATAATTTATTGCAGACCGTGTTTATTATAAAGAAACTGTTGGCTCATTCTACTGTATCCACACTCACTCACAATCTTAGGGGAAATACAATAAATCCACTTTCTTCTCCTAAAATGATATTTAGCACATTTGGCAAGGAGGAGTAGTCCCTTTACTCC-ttcttcttatctttttt---ctttttctttttctttttcttt--------ttttttttGAGAATAAACCACTTTCACAAAACTAAGACTCAAACTTTTTCAAAGCTCAGCTTGATTTGCTGGAACTACACAGAGACATGCTTGATCACACAACAGCAACTGTACATCCTCCTACGTCTGGAATACAGAATTGATGGAGGACACTTACTTGCTTAAAATATATTTGATTATTCTGCATTTATGATAAAAATATCATCCAGGGATCATATTCAAGAGGGTAAATTTAGGATTACATGTTTCTAGAACATATAATATGTAATGCCATGCCAAACCAACAACAAACAACATAAAGCACTGAAACTGAAGAACCACTTAAAATTTAGAATTAGGAAATTTCAATCTATAATTGTCAAACAATAAATGAGTTATAATATTTTTCTAATAAGAAAAATATCACCTAAAGTGGAAAGCCAGTATTTAGTCCGGAACTATGAGATACTACATCCTTGATCTGGCTGGCCACCATTTTAAAGACCACCACAGATCTCAAGGCATGAGACCACTCACCAACAAAATCTATCCCTGCTATTGCACCTAGAGTCATCTCAATATGTGGCTGACAGCAAATGTTCTAACTTAATCTGATAGATGCTCCTTTAGCATATAAAAGAGCTTGCTAAGTCCCTATTACCTGTAGCAGTCTATCAACTAAATATTTAAGAAATCATTTCATAGACAAGGTTTATGAATGACTTAGAAGTAAAATTAGTAATTTCTAAACCACTGTAGCATTTTCTATGTTTTTAGAGATATTCCTAACACAGACTTTTCCAAGGAGCTGTGAAAACAAGTACAAACACACATGTGTAATTTTGCCATGGATGTTTCTGTACTAATTTGGGGGAGACTGGTGGGCCATAAATAAATGAGATACACATCCTAAAAATAATGGTAAAAATTAACAAGTACCGCTTTCAGATGGTTACTCAAGTATCAACTTGGTATGCAAGTAAGTTCACCAATGTCTTCACTTATGATTTCATATTCAAAGTGCTACATCTTACTTAGGTACTGATAA-ATTTAGAAACCTTTATAATCTACCTCTTAAAGAAAATCCAGCTTTTTCAGATGGTAAACTTGTCTTTACTAACTTTAATGCCTGTAACTATTTCGATATAACCAAAGaaaaattttaaaaaatatattCCTTACAGCTCCTGATTAACTTA-TTTTTGGATACATTTTGAGGCTAGTAACAAAATTTAGACCAGAATAGGTTTTCATATATCAAAAAA--GGAACGGAACACAGAGAGCACAGATGAGACGTATGGAGGATCTATACTATAGACCCATCCTTGCTCTGTGCGGGAATCATCACAGGAATCACGCCCATTCGACTTAGATTAGGGGCAGCTACCTTAGCAGGTGGGAGAGTCGGACTCTGAGGAGTGCGTTCAAAGTCTTCACTCGGTACTTGTTTATACTGAGTCTTGGAATATCCTTCCATGTTGGAAGGAGACATGGATCCCAGGGATGAACGATTACTGCCTGTGCAGCTTCTGGCAGTGGACGTATGGCTCTTTGGAGGTGGCACATCTTCCCTGATATCGTGATGAACTTACTTTTCATATTTTTCTTCTCTGCGCTTTTTACGACAGCAAAAGATGATAAGACCAATGAGCACTAGAGCAAGCAAAGTTCCTATAATGGCTCCTGCAATTAGTCCAGCTTTATTTGAAGGAGGGACAACGTTTACACGCAACAGGCACTGATCAGAGCCCACTCCGTTTCTGA-TGTACAGCTGTATGTCCCAGAGTACTCAGAAGAAGCATTTTTTTTACAGATATAACAGATGAAGTCATTTCTGCTAACCATGAAGTGGGCATTTTCTGTGAGTCAGACAATTTTTGCCACTCATACTGTAATGGAAGTGAACCTTCTTTTGGTTCACATTTTAGTTTAAAGTCACTTCCAATTTCTTCTGAACCATCAACATAACATCTTGTACCTGAAGGCTTACCAAGAACTACCAGCTGAATCTTCTTATTTGCAACACCAGGAGCTTTTTTCACTTTGCACTGATCTGTGCCAATATCTGACAGCTGTAAATTCAGTACATTTATTGATGCATCACCAGATTTGAGATCATTACTCTTAAAATGTACTCGGCCTTTCAATTCTGGATAGTAATCATCATAAATTTTGTTTCCAGAATATAAAATAACCACTTGATCCACCTTCTGATTATCAGCTGGTGATATCAGCCACTCGATGTCCAGTGGTCCCTGGTCTTCAGGACTAAGCGTAAATTTGCATGGCAGATAGGTAGTTTCCCCTTTGGCTTTTTCAATCATCTGCTCAGGAGTAGTGATACTCCAACCTCTGATGAAATCCGCGACTCTGCACAGGAGCACGAAGCGCAGCAAGAGCGCCATGGTGGCTGCTGTGCCGTGGGCGGCGGCTGCAGGCAGGCGACTCTCGCTCCAGGTCCTAGGCTCCCCGCGCCTCGCGCACTCAAGa-tagagaaaatcttaaagactccaccaaaataaatggttaaagctgataaagaaattcaataaagttaatggttacaaaatcaacatacagctagcattattgtttgtatacactaatgac----tattacctgaaaaataaagtaataaggcaattcaatttataatagaatcaaaacagatataaaaatatataaaagacttaggagtaaatttaatcaagaatgtgaaagatttgcacactgaaaactatagcacattgatgaaaaaaattaaaatggcataaataaatggagaaacatcctttattgatggattaaaaaattagtattgtaaaagtgtcaatgctacccaaagcaatctacagattaaatgcaaccactatcaaattccccaaaatagaaaaaatactgctaaaatttgtatggaaccacaaaagaccccgactaaccagagcaatcttgaacaaaaagaacaaagctggaggtatcagactacccaattccaaactatattacaaagccatagtaattaaaacaacatagcagtggcataaaaacagacaggtagagcagtgcaaagggatatagaacccgtaaataaatccgtgtgtctgtggtcaattgacttttttgataaaatgactaaaaatacacaatgaagaaagaaaattattttcaataaatggtgtagaaaaaactgaatatccacatacagaagaataaaatttgacttttcttttgctctttatacaagtatcaaatcaaaattaaagacttaaatgtaaaactactacaaggaaatatagaagaagactgtatgacattggcctgagctatgattttctgtagattattccaaaagcacaggcaacaaaagcaaaaacacacgaatgagattgcataaaactaaaaagcttttccacaggaaaagaagcgataatagaatgaagagaccccacaaatgggataacatttttaaaccatacatcagataaagggctcatataataatatataagtaactcaacctactcaaaaataagaataaaactatgcttattaaaaaaa-taagcaaagaaccagaatagacatttcctaaggcatacaaaaggccaacaggtacatg-aaaaaataaaaaaaacatttctaattatcagagaaatgcaaatcaaagccacaatgagatatcacctcacacattttactaaggctattataaaaaaagatggaagataagtgttgatgaggatgtggagaaaaagaaaccctgtacactgttggtaggaatggaaattagtacagccatcttggaaaacagtatgaagtttcctc-aagaaattataagtatatttaccctatgatccatcaatcccacttctggatatatgtccaaaggaatttcaatcagtatgtcaaaaagagacatctgcaatttcatgttcgttgcagcattattcataatacccatgaattagaaacaacctaagtgcttatcaactgaagaatggataaaaatatgtggaaaaattggaacccttctacaccactggtgagactttaaaatgtaaaacagtctggcagttcttcaaatggttaaacatagagttatcacatgacccagcaattccacttctatgtgtttaccaaaaagaaaataaaacaaatgctacacaaacagtagtacacaaatgtttatagcaacac-aaagtagaaaacaacagaaatgttcatcagctgaggagtggataaataaaatgtggtgtgtccataaaacagaatcttatttagcaagaaaaggcaaaaaactgttaatgcatgctccaaaatggatgaacattaaaaatacattaagtgaaagatgtgagtaaaaagtgactatgtgttattatgattccacttatgtgaaatgtccagaataggcaaattcatagtcagaaagtagacaagtggttgcctagactaggaggggtttaaaaaaggctggagaaaatggggaaagattgctaatgggtgcaagtctcttttaaggagaattaaaatgttctaaaattatattatgatgatgatttgtccatccagttaatatactaaaagaatttgaagtttgtactttaaatgagtgaattacacaatgtataaattatatctcaataaagctgtggaaaGTTAaaagtatatgtaggatgcatacaaaaatactacttatctttataaatgaatgaaattctgtcatttgcaaaaacatggatggatttagaggaaattatgctaagtaaaataagccagacacagaaagacaaatatctcttaatgtcacttatatgtgaaatccaaaactgtgcactcacagaagttaagag i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18560213 5579 + 99152023 tTTTTATTATTAATGTTCTGTTTACttatttttataatattttataaataaactttattcatataaaaCAAGCCAAACATCTGACATTCAAAAATGGCTACTGTTATAAAATCAGAAACATA----GAGTGTTGGGAATATTGAAATTTCTAAATCTTTATGAATAACACAATCGCTTAAGTTATATCCACAAAGAACAGAAAACAGGCAAGCTTGAAAATGTGAGGATAGAAAGGTGTCACAGTGATGTGTTTTTAGAGACAGTACCTTCACCTCTAAGCACCTTTCAGGTAGGTGATAGCTAGCTCATAGGCACCAGAAATTCATAACAGAAATTAAATTACCCAAAAGGCACAGAAGAAAATGTTAACACAAGTATAAAAGTAATTTTATGTAAGGTTAAAACCTATTTTTAAAGTGCTTCCAAATATGTAAAACTATACACAAATCCATTACACATTCAGCTTAAGTTTACCATTAAAAAGTGTACACAC-ATACTCTAACTGTAAATACATGCCACTGTTTATAATGTAGCATTTACCACCACAACACCCAAAGATATTAACAGAAACCAACTCCCTACTAAAATCTAGGGAAAGGTTTTAGAGCTAGTGAAATAATTTATTGCAGACCGTATTTGTTATAAAGAAACTGTTGGCTCATTCTACTGTATCCACACTCCCTCACAATCTTAAGGGAAATACAATAAATCCACTTTCTTCTCCTAAAATGATATTTAGCACATTTGGCAAGGAGGAGTAGTCCCTTTACTCCttttttcttatctttttt----------tctttttctttcttt--------tttttttAAAGAATAAATCACTTTCACAAAACTAAGACTGAAACTTTTTCGAAGCTCAGCTTGATTTGCTGGAACTACACAGAGACATGTTTGATCACACAACAGCAACTGCACATCCTCCCAAGTCTGGAATACAGAATTGATGGAGGACACTTACTTGCTTAAAATGTATTTGATTGTTCGGCATTTATGATAAAAATATCATCCAGGGATCATATTCAAGAGGGTAAATTTAGGATTACATGTTTCTAGAACATATAATATGTAATGCCATCCAAAACCAACAACAAACAACAAAAAGCATTGAAACCCAAGAATCACTTAAAATTTAGAATTAGGAAATTTCAATCTATAATTGTCAAACAATAAATGAGTTACAATATTTTTCTAATAAGAAAAATATCACCTCAAG-----------------------------------------------------TGGCCACCATTTTGAAGACCACCACAGATCTCAAGGCATGAGACCACTCACCAACAAAATCTATCCCTGCTATTGCATCTAGGGCCATCTCAATATGTGGCTGACAGCAAATGTTCTAACTTAATCTGATAGATGCTCCTTTAGCATATAAAAGAGCTTGCTAAGTCCCTATTACCTGTAGCAGTCTATCAACTAAATATGTAAGAAGTCATTTCATAGACAAGGTTTATGAATGACTTAGAAGTAAAATTAGTAATTTCTAAACCACTGTAGTGTTTTCTATGTTTTTAGAGATATTCCTAACACAGAGTTCTCCAAGGGGCTGTGAAAACAAGTACAAACATACATGTATAATTTTGTCATGGATGTTTCTGTACTAATTTGGGGGAGACTGGTGGGCCATAAATAAATGAGATACACATCCTAAAAATAATGGTAAAAATTATCAAGCACCACTTTCAGATGGTTATTCAAGTATCAACTTGGTATGCAAGTAAGTTCACCGATTTCTTCACCTATGATTTCATATTCAAAGTGCTACATCTTACTTAGGTACTGATAC-ATTTAGAAACCTTTATAATCAACCTTTTAAAGAAAATCCAGCTTTTTCAGATGGTAAACTTGTTTTTACTAACTTTAATGCCTGTAACTATTTCGATATAACCAAACaaaaattttttaaaatatattCCTTACAGTTCCTGATTAACTTATTTTTTTGATATATTTTGAGGCTAGTAACAAAATTTAGACCAGAATAGGTTTTCATATATCAAAAAA-AGGAAAGGAACACGGAGAGCACAGATGAGACGTGTGGAGGCTCTATACTGTAGACCCATCCTTGCTCTGTGCCAGAATCATCACAGGAATCGCGCCCATTCGACTTGGATTAGGGGCAGCTACCTTAGCAGGTGGGAGAGTCGGACTCTGAGGAGTGCGTTCAAAGTCTTCACTTGGTACTTGTTTATACTGAGTCTTGGAATATCCTTCCATGTTGGAAGGAGACATGGATCCCAGGGATGAATGATTACTGCCTATGTAGCTTCTGGCGGTGGACGTACGGCTCTTTGGAGGCGGCACATCTTCCCTGATATCGTGATGAACTTCCTTTTCATATTTTTCTTCTCTGCGCTTTTCACGACAGCAAAAGATGATAAGACCAATGAGCACTAGAGCAAGCAAAGTTTCTATAATGGCTCCTGCAATTAGTCCAGCTTTATTTGAAGGAGGGACAACGTTTACACACAACAGGCACTGATCAGAGCCCACTCTGTTTCTGACTGTACAGCTGTATGTCCCAGAGTACGCAGAAGAAGCATTTTT--TACAGATATAACAGATGAAGTCATTTCTGCTAACCACGAAGTGGGCATTTTGTGTGAGTCAGACAATTTTTGCCACTCATACTGTAATGGAAGTGAACCTTCTTTTGGTTCACATTTTAGTTTAAAGTCACTTCCAATTTCTTCTGATCCATCAACGTAACATCTTGTACCTGAAGGCTTAACAAGAACTACCAGCTAAATCTTCTTATTTGCAACACCAGGAGCTTTTTTCACTTTACACTGATCTGTGCCAGTATCTGACAGCTGTAAATTCGTTACATTTATTGATGCATCACCAGATTTGAGATCATTACTCTTAAAATGTACTCGGCCTTTCAGATCTGGGTAGTAGTCATCATAAATTTTGTCTCCAGAATATAAAATAATCACTTGATCCACGTTCTGATTATCTGCTGGTGATATCAGCCACTCGATGTCCAGTGGCCCCTGGTCTTCGGCACTAAGTGTAAATTTGCATGGCAGATAGGCAGTTTCCCCTTTGGCTTTCTCAGTCATCTGCTCAGGAGCAGTGATACTCAAACTTCCGGTGAAATCCGCGACTCCGCACAGGAGCACGAAGCGCAGCAAGAGCGCCATGGTGGCTGCCGTGCCGTGGGCGGCGGCTGCAGGTAGGCGGCTCTCGCTCCGGGTCCTAGGCTCCCCGCGCCTCGCGCACTCAAGATtagagaaaatcttaaagactccaccaaaataaacggttaaagctgataaagaaattcaataaagttaatagtcacaaaatcaacatacagatagcattattgtttctatacactaatgacaaactattacctgaaaaataaattaatacggcaattcaatttataatagaatcaaaacagatataaaaatatataaaagac--aagagtaaatttaatcaagaatgtgaaagatttgcacactgaaaactatagcacattgatgaaaaaaattaaaatggcataaataaatggagaaacatccttaattgatggattcaaaaattagtattgtaaaagcgtcaatgctacccaaagcaatctacagattaaatgcaaccactatcaaattcccagaaatagaaaaattactgctaaaatttgtgtggaaccacaaaagaccctgactaaccaaagcaatcttgaacaaaaagaacaaagctggaggcatcagactacccgattccaaactatatcacaaagctatagtaattaaaacaacatagcagtggcataaaaacagacatgtagaacagtgcaaagggttatagaacccgtaaataaatccttgcttctgtggtcaattgatttttt-gataaaataactaaaaatacacaatgaagaaagaaaattactttcaataaatggtgtagaaaaaactgactatccacatacagaagaataaaatttgacttttcttttgctctttatacaagcgtcaaatcaaaattaaagacttaaatgtcaaactactaaaaggaaatatagaagaagactgtatgacattggcctgagctatgattttctgtagattattccaaaagcacaggcaacaaaagcaaaaacacgctaatgagattgcataaaactaaaaagcttttccacaggaaaagaagcaataatataatgaagagaacccacaaatgggataaaatttttaaaccatacatcagataaggggctcatataataatatataagtagctcaacctactcaaaaataagaataaaactatgctttttaaaaaaaataagcaaagaaccagaatagacatttcctaaagcatacaaaaggccaacaggtacatg-aaaaaatcataaa--catttctaattatcagagaaatgcaaatcaaagccacaatgagatatcacctcacacattttactagggctattataaaaaaagatggaagataagtgttgatgaggatgtggagaaaaagaaaccctgcacactgttggtaggaatggaaattagtatagccatcttggaaaacagtatgaagcttcctc-aagaaattataaatatatttaccctatgatccatcaatcccacttctggatatatgtccaaaggaatttcaatcagtatgtcaaaaagagacatctgcaatttcatgttcattgcagcattattcataatacccatgaattagaaacaacctaactgcttatcaactgaagaatggataaaaatatgtggaaaaattggaactcttctacaccactggtgagactttaaaatgtaaaacagtctggcagttcttcgaatggttaaacatagagttatcacatgacccagcaattccactcctatgtgtttaccaaaaagaaaagaaaacaagtgctacacaagcagtagtacacaaatgtttatagcaacacaaaagtagaaaacaacagaaatgttcatcagctgaagagtggataaataaaatgtggtgtgtccataaaatagaatcttatttagcaagaaaaggtaaaaaactgttaatgcatgctccaaaatggatgaacattaaaaatatgttaagtgaaagatgtgagtaaaaagtgactatgtgttattatgattccatttatgtgaaatgtccagaataggcaaattcatagtcagaaagtagatgagtggttgtctagactaggaggggtttaaaaaaggctggagaaaatggggaaagattgctaatgggtgcaagtctcttttaagtagaattaaaatgttctaaaattatattatgatgattatttgtccatccagttaatatactaaaagaatttgaagtttgtactttaaatgagtgaattacgcaatgtataaattatatctcaataaagctgtggaaaGTTAaaagtatatgtaggatgcatacaaaaatactacttatctttataaatgaatgaaattctgtcatttgcaaaaacatggatgaatttggaggacattatgctaagtaaaataagccagacacaggaagacaaatatctcttaatatcacttatatgtgaaatccaaaactgtgcactcatagaagttaagag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77018511 5636 - 143122389 tTTTTATTATTAATGTTCTGTTTACTTATTTTTATAATGTTTTATAAATAAACTTTATTCATATAAAAGAGGCCAAACATCTGACATTCAAAAATGGCTACTGTTATAAAATCAGAAACATA----GAGTGTTGGGAATATTGAAATTTCTAAATCTTTATGAATAACACAATCGCTTAAGTTATATCCACAAAGAACAGAAAAGAGGCAAGCTTGAAAATGTGAGGGTAGAAAGGTGTCACAGTGATGTGTTTTTAGAAACAGTACCTTCACCTCTAAGCACCTTTCAGGTAGGTGATAGCTAGCTCATAGGCACCAGAAATTCATAACAGAAATTAAATTACCCAAAAGGCACAGAAGAAAATGTTAACACAAGTATAAAAGTAATTTTATGTAAGGTTAAAACCTATTTTTAAAATGCTTCCAAATATGCAAAACTATACACAAATCCATTACACATTCAGCTTAAGTTTCCCATTAAAAAGTGTACGCACAATACTCTAACTGTAAATACATGCCACCGTTTATAATGTAGCATTTACCACCACAGCACCC-AAGATATTAACAGAAACCAACTCCTTACTAAAATCGAGGGAAAGGTTTTAGAGCTAGTGAAATAATTTATTGCAGACCGTATTTATTATAAAAAAACTGTTGGCTCATTCTACTGTATCCACACTTCCTCACAATCTTAAGGGAAATACAGTAAGTCCACTTTCTTCTCCTAAAATGATATTTAGCACATTTGGCAA-GAGGAGTAGTCCCTTTACTCC-tttttcttatcttcttttttctttttatttttgtttttcttt-tttttttttttttttAAGAATAAATCACTCTCACAAAACTAAGACTCAAACTTTTTCGAAGCTCAGCTTGATTTGCTGGAACTACACAGAGACATGTTTGATCACACAACAGCAACTGTACATCCTGCCAAGTCTGGAATACAGAATTGATGGAGGACACTTACTTGCTTAAAATGTATTTGATTATTCTGCATTTATGATAAAAATATCATCCAGGG-----ATTCAAGAGGGTCAATTTAGGGTTACATGTTTCTAGAACATATAATATGTAATGCCATCCAAAAACAACAACAAACAACATAAAGCACTGAAACCGAAGAACCACTTAAAATTTGGAATTAGGAAATTTCAATCTATAATTGCCAAACAATAAATGAGTTATAATGTTTTTCTAATAAGATAAATATCACCTAAAATGGAAAGCCAGTATTTAGTTGGGAACTATGAGATACTACATCCTTGATCTGGCTGGCCACCATTTTAAAGACCACCACAGATTTCAAGGCATGAGACCACTCACTAACAAAATCTATCCCTGCTATTGCACCTAGTGTCATCTCAATATGTGGCTGACAGCAAATGTTCTAACTTAATCTGATAGATTCTCCTTTGGCATATAAAAGAGCTTGCTAAGTCCCTATTACCTGTAGCAGTCTATCAACTAAATATTTAAGAAGTCATTTCATAGACAAGGTTTATGAATGACTTAGAAGTAAAATTAGTAATTTCTAAACCACTGTAGTGTTTTCTATGTTTTTAGAGATATTCCTAACACGGAGTTTTCCAAGGAGCTATGAAAACAAGTACAAACATACATGTGTAATTTTGTCATGGATGTTTCTGTACTAATTTGGGGGAGACTGGTGGGCCATAAATAAATTAGATACACATCCTAAGAATAATGGTAAAAATTATCAAGTACCACTTTCAGATGGTTATTCAAGTATCAACTTGGTATGCAAGTAAGTTCACCAATTTCTTCACTTATGATTTCATATTCAAAGTACTACATCTTACTTAGGTACTGATAA-ATTTAGAAACCTTTATAATCAACCTCTTAAAGAAAATCCAGCTTTTTCAGATGGTAAACTTGTCTTTACTAACTTTAATGCCTGTAACTATTTCGATATAACCAAACAAAAATTTTTAAAAATATATTCCTTACGGTTCCTGATTAACTTATTTTTTTGATATATTTTGAGGCTAGTAACAAAATTTAGACCAGAATAGGTTTTCATATATCAAAAAAAAGGAAAGGAACATGGAGAGCACAGATGAGACGTATGGAGGCTCTATACTACAGACCCATCCTAGCTCTGTGCGGGAATCATCACAGGAACCGCGCCCATTCGACTTAGATTAGGGGCAGCTACCTTAGCGGGTGGGACAGTCGGACTCTGAGGAGTGGGTTCAAAGTCTTCACTTGGTACTTGGTTATACTGAGTCTTGGAATATCCTTCCATGTTGGAAGGAGGCATGGATCCCAGGGATGAATGATTACTGCCTATGTAGCTTCTGGCAGTGGAGGTACGGCTCTTTGGAGGCGGCACATCTTCCCTGATATCGTGATGAACTTCCTTTTCATATTTTTCTTTTCTGCGCTTTTTACGACAGCAAAAGATGACAAGACCAATGAGCACTAGAGCAAGCAAAGTTCCTATAATGGCTCCTGCAATTAGTCCAGCTTTATTTGAAGGAGGGACAACGTCTACACGCAACAGGCACTGATCAGAGCCCACTCTGTTTCTGACTGTACAGCTGTATGTCACAGAGTACTCAGAAGAAGCATTTTT--TACAGATATAACAGACGAAGTCATTTCTGCTAACCAGGAAGTGGGCATTTTTTGTGAGTCAGACAATTTTTGCCATTCATACTGTAATGGAAGTGAACCTTCTTTTGGTTCACATTTTAGTTTAAAGTCACTTCCAATTTCTTCTGATCCATCAACGTAACATCTTGTACCTAAAGGCTCACCAAGAACTACCAGCTGATTCTTCTTATTTGCGACACCAGGAGCTTTTTTCACTTTGCACTGATCTGTGCCAATATCTGACAGCTGTAAATTCGTTACATTTATTGATACATCACCAGATTTGAGATCATTACTCTTAAAATGTACTCGGCCTTTCAGATCTGGATAGTAGTCATCATAAATTTTGTCTCCAGAATATAAAATAATCACTTGATCCACCTTCTGATTATCAGCTGGTGATATCAGCCACTCGATGTCCAGTGGTCCCTGGTCTTCGGGACTAAGCGTAAATTTGCATGGCCCATAGGCAGTTTCCCCTTTGGCTTTTTCAATCATCTGCTCAGGAGTAGTGATACTCAAACTTCTGGTGAAATCCGCGACTCCGCACAGGAGCACGAAGCGCAGCAGGAGCGCCATGGTGGCCGCCGTGCAGTGGGCGGCGGCTGCAGGTAGGCCGCTCTCGCTCCGGGTCCTAGGCTCCCCGCGCCTTGCGCATTCAAGa-tagagaaaatcttaaagactccaccaaaataaatggttaaagctggtaaagaaattcaataaagttaatagttacaaaatcaacatacagatagcattattgtttctatacattaatgagaaactattacctgaaaaataaattaataaggcaattcaatttataatagaatcaaaacagatat-aaaatatataaaagacttaggagtaaatttaatcaagaatgtgaatgatttgcacactgaaaactatagcacattgatgaaaaaa-ttaaaatggcataaataaatggagaaacatcctttattaatggattcaaaaattagtattgtaaaagtgtcaatactacccaaagcaatctacagattaaatgcaaccactatcaaattcccagaagtagaaaaattactgctaaaatttgtatggaaccacaaaagaccctgactaaccaaagcaattttgaacaaaaagaacaaagctggaggcatcagactacctgattccaaactatat-acaaagctatcataattaaaacaacacagcagtggcataaaagcagacatgtagaacagtgcaaagggatatagaacccataaataaatccatgtgtctgtggtcaattgatttttt-gataaaataactaaaaatgcacaatgaagaaagaaaattattttcaataaatggtgtagaaaaaactgactatccacatacagaagaataaaatttgacttttcttctgctctttatacaagcatcaaatcaaaattaaagacttaaatgtaaaactactacaaggaaatat---agaagactgtatgacattggcttgagctatgattttctgtaggttattccaaaagcacaggaaacaaaagcaaaaacacatgaatgagattgcataaaactaaaaagcttttccacaggaaaagaagcgataatagaatgaagagaacccacaaatgggataacattttaaaaccatacatcagataaggggctcatataataatatataagtaactcaacctactcaaaaataagaataaaactatgcttattaaaaaaaataagcaaagaaccagaatagacatttcctaaggcatacaaaaggccaacaagtacatgaaaaaaatcataaa--catttctaattatcagagaaatgcaaatcaaagccacaatgagatatcacctcacacattttgctagggctattataaaaaaagatagaagataaatgttgatgaggctgtggagaaaaagaaaccctgtacactgttggtaggaatggaaattagtaaaaccatctt-gaaaacagtatgaagcttcctcaaagaaattataaatatatttaccctatgatccataaatcccacttctggatatatgtccaaaggaatttcaatcagtatgtcaaaaaaagacatctgcaatttcatgttcattgcagcattattcataatacccatgaattagaaacaacctaagtgcttatcaactgaagaatggataaaaatatgtggaaaaattggaacccttctataccactggtgagactttaaagtgtaaaacagtccggcagttcttcaaatggttaaacatagagttatcacatgacccagcaattccactcctatgtgtttaccaaaaagaaaataaaacaaatgctacacaaacagtagtacacaaatgtttatagcaacac-aaagtagaaaacaacagaaatgttcattagctggggagtggataaataaaatgtggtgtgtccataaaatagaatcttatttagcaagaaaaggtaaaaaactattaatgcatgctccaaaatggatgaatattaaaaatatgttga--ggaagatgtgagtaaaaagtgactatgtgttattatgattccatttatgtgaaatgtccacaataggcaaattcatagtcacaaagtagatgagtggttgcctagactaggaagggtttaaaaaaggctggagaaaatggggaaagattgctaatgggtgcaagtctcttttaaggagaattaaaatgttctaaaattatattatgatgattatttgtccatccagttaatatactaaaagaatttgaagtttgtactttaaatgagtgaattacacaatgtataaattatatctcagtaaagctGGGGAAAGTTAaaagtatatgtaggatgcatacaaaaataccacttatctttataaatgaatgaaattctgtcatttgcaaaaacatggatgaatttagaggacattatactaagtaaaataagccagatacagaaagacaaatatctcataatatcacttatatgtgaaatccaaaaatgtgcattcatagaagttaagag i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37898341 2622 - 90373283 I e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36431636 57213 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=229901.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 134332 290 + 478999 tagaatggtggtttatcagaggctgagcagggtggggagcaggggtggaaaaaggggaaatattgaatgggataatgcttcagttaggagaaagacattctggtgatatggtgcacagcaaagtgactgcagttactcataatgtagtgcatatcttaaaagtgctaaaatagtacattttaaatgtttcaccataatgtaatacatatctgaggtgaaggatacgttatttagcctaattagtccatttcacaatatctacatgtatcgtaccacattgtaccctatat s panTro4.chr18 74615925 290 - 76611499 tagaatggtggtttattagaggctgagcagggtgggggatgggggtggaaaaaggggaaatattcaatgggataatgcttcagttaggagaaagacattctggtgatatggtgcacagcaaagtgactgcagttacttataatgtagtgcatatcttaaaagtgctaaaatagtacattttaaatgtttcaccataatgtaataaatatctgaggtgaaggatacgttatttagcctaatttgtccatttcacaatatttacatgtatcgtaccacattgtaccccatat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18565792 290 + 99152023 tagaatggtggtttatcagaggctgagcagggcggggggtgggggtggaaaaaggggaaatattctgtgggataatgcttcagttaggagaaagacattctggtgatatagtgcacggcaaagtgactgcagttactcataatgtagtgcatatcttaaaagtgctaaaatagtacattttaaatgtttcaccataatgtaataaatatctgaggtgaaggatatgttatttagcctgatttgtccattttacaatatttacgtgtatcgtatcacattgtactctatat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77024147 280 - 143122389 tagaatggtggtttatcagaggcagagcagggcagggggcaggggtggaaaaaggggaaatattgaatggcataatgcttcagttaggataaatacattctggtgatatggtacacagcaaagtgactgcagttactcataatgtagtgcatatcttaaaagtgctaaaatagtacattttaaatgtttcaccataatgttataaatatctgaggtgaaagatacgttagttagcctaatttgtccatttcacaatatttacatgt----------attgtaccctatat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37900963 288 - 90373283 tagaatggtggtttttcagaggctgagcagggcagagtg-gggggtgaaaaagggggaaatattcagtgggataatgcttcagcaaggagagatacattctggtgatatggtgcacagcaaagtgacagcagttactcataatgtagtgcgtgtcttaaaactgctaaaatactacatttcaaatgtttcaccataatgtaataaatatgtgaggtggaggatatgttatttaacctaatttgtccatttcacaatatttacatgtactgtaccacattgtaccc-atat i chlSab2.chr2 I 2622 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36431636 57213 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=123369.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 134622 260 + 478999 atatttatttatcaataaaatcaaCATTTTAAAAAGTGAGGAACACAGATGTGCTAGATCTTCATCTAAAGACATTTCTGAGAAAAGTGTATCTGTTTTCTTTCAGAAGAAATTTACACTTAATAGATATTATGGTAACTAAAGTAAGGCAGATAATTTTGGCCATCAGCTTTTATTGTGGGATAATCTCTTTTTGCTGACCTTGTAAAAGCTGTGGCATATT---AACAAGTAGGAACATTTTTTTTATCATGATCAGGTAA s panTro4.chr18 74616215 259 - 76611499 atatttatttatcaataaaaTCAACATTTTAAAAAGTGAGAAACACAGATGTGCTAGATCTTCATCTAAAGACATTTCTGAGAAAAATGTATCTGTTTTATTTCAAAAGAAATTTACACTTAATAGATATTATGGTAACTAAAGTAAGGCAGATAATTTTGGCCATCAGCTTATATTATGGGATAATCTCTTTTTGCTGACCTTGTAAAAGCTGTGGCATATT---AACAAGTAGGAACATTTTTTT-ATCACGATCAGGTAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77024427 262 - 143122389 gtatttatttatcaataaaaTCAACATTTTAAAAAGTGAGAAAAACAGATGTGCTAGATCTTCATCTAAAGATATTTCTGAGAAAAATGCATCTGTTTTCTTTCAGAAGAAATTTCCACTTAATAGATATTATGGTAACTAAAGTAAGGCAGATAATTTTGGCCATCAGCTTATATTATGGGATAATCTCTTTTTGCTGACCTTGTAAAAGCTGTGGCATATTAACAACAAGTAGGAACATTTTTTT-ATCATGATCAGGTAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37901251 261 - 90373283 atatttatttatgaataaaaacaaaaTTTTAAAAAGCGAGCTAAACAGATGTGGTAGATCTTCATCTAAAGACATTTCTGAGAAAAATATATCTGTTTTCTTTCAGAATAAATTTACAGTTAATATATATTATAGTAACTAAAGTAAAGCAGATAATTTTGGCCATCAGCTTATACTGTGGGATAATCTCTTTTTGCTGACCTTGTAAAAGCTGCCGCAGATTAACAAGAAGTAGGAAAGATTTTT--ACCATGATCAGGTAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18566082 0 + 99152023 C e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e macFas5.chr10 36431636 57213 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=338961.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 134882 440 + 478999 AGATTCTGCAAGTTTCTATTTTGAATA----TTTCCCCA-GGAATCACAAAGTGTGAATGCCTTTTATTTCAGAGGTCTAGCCCTAAATGGTTTAGTCAATTACATCATGCATTCTGAAATAAGTACTGGTGCATTTGGGAAGGTACTAtatataattgtgttttaaatttaactatcatataaatctacttttctagttaacagtttatattttataGAGGCCCTCCATATACATAAGAGCTTTTCTGATAGTATATCCATTAGATTTCAAAGATAAGTAAAGGAACAATTTTGCTTtta-tttattattattattatt---tttTaaggctagtcaagtgaagcagtgggagtggagaaggaacTGCTTTAATTTTTATATGTTGGTGTTACAGGCTATATGTGACAGGCTGTATATTTTTCTGCTGAATTTTAGAAACAAAATGAA s panTro4.chr18 74616474 444 - 76611499 AGGTTCTGCATGTTTCTATTTTGAATAATATTTTCCCCA-GGAATCACAAAGTGTGAATGCCTTTTATTTCAGAGGTCTAGCCCTAAATGGTTTAGTCAATTACATCATGCATTCTGAAATGAGTACTGGTGCGTTTGGGAAGGTACTATATATAATTGTGTTTTAAATTTAACTATCATATAAGTCTACTTTTCTAGTTAAGAGTCTATATTTTATAGAGGCCCTCCATATATATAAGAGCTTTTCTGATAGTATATCCATTAGATTTCAAAGATAAGTAAAGGAACAATTTTGCtttta-tttattattattattatt---ttttaaggctagtcaagtgaagcagtgggagtggagaaggaacTGCTTTAATTTTTATATGTTGGTGTTACAGGCTATATGTGACAGGCTATATATTTTTCTGCTGAATTTTAGAAACAAAATGAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77024689 440 - 143122389 AG-TTCTGCATGTTTCTATTTTGAATAATATTTTCCCCA-GGAATCACAAAGTGTGAATGCCTTTTATTTCAGAGGTCTAGCCCTAAATGGTTTAGTCAATTACATCATGCATTCTGAAATAAGTACTGGTGCATTTGTGAAGGTACTATATATAATTGT-TTTTAAATTTAACTATCATATAAATCTACTTTTCTAGTTAAGAGTCTATATTTTATAGAGGCCCTCCTTATACATAAGAGCTTTTCTGATAGTATATCCATTAGATTTCAAAGATAACTAAAGGAACAATTTTGCTTT---TTTTTTATTATTGTTATT---TTTTaaggctagtcaactgaagcagtgggagtggagaaggaacTGCTTTAATTTTTATATGTTGGCGTTACAGGCTATATGTGACAGGCTATATATTTGTCTGCTGAATTTTAGAAACCAAATGAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36488849 445 + 96509753 AAATTCTAAAT-TTTCTATTTTGAATAATATTGTCCCCC-AGAATCGCAAAGTGTGAATGCCTTTTGTTTCAGAGGTCTAGCCCTAAATGGTTTAGTCAATTACATCATGCATTCTAAAACAAGTCCTGGTGCGTTTGTGATGGTACTACATATAATTGTGTTTTTAATTTAACTATCATATATGTCTACTTTTCTC-TTAAGAGTCTATATTTTACAGAGGCCCTCCATACATATAAGGGCTTTTATGATATTCTATCCACTAAATTTCAAACATAAGTTAAGGAACAGTTTTGCTTTTA-TTTTTTATTATTGTTATTACATTTTaaggctagtcaagtgaagcagtgggagtgcagaaggaaATGCTTTAATTTTTATATGTTGGTGTTACAGGCTGTATGTGACAGGCTATATATTTGTAGGCTGAATGTTAGAAACAAAGTGAA i macFas5.chr10 I 57213 C 0 s chlSab2.chr2 37901512 448 - 90373283 AGGTTCTGCATGCTTCTATTTTGAATAATATTTCCCCCCTAGAATCACAAATTGTGAATGCCTTTTATTTCATAGGTCTAGCACTAAAGGCTTTAGTCAGTTATATCATGCATTCTGAAATAAGTACTTGTGCATTTGACAAGGTACTATATATAATCGTGCTTTTAATTTAACTATCATATATGTCTACTTTTCTC-TTAAGAGTCTATATTTTACAGAGGCCCTCCATACATATAAGGGCTTTTATGATAGTCTATCCACTAAATTTCAAACATAAGTTAAGGAACAATTTTGCTTttatttttttattattgttattatattTTaaggctagtcaagtgaagcagtgggagtggaaaaggaacTGCTTTAATTTTTATATGTTGGTGTTACAGGCTGTATGTGACAGGCTATATATTTGTAGGGTGAGTGTTAGAAACAAAGTGAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18566082 0 + 99152023 C e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=5131239.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 135322 4246 + 478999 ATATTTATTTCCTATTTCATTAGATTTAGGGATGATGATTACATTGAGGGGTTGGGACTAGACTGAAGGCACCACATCATCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTGTTATGTTATATTGACAAAAACTTTTATTGTGGCAGGCAATATAGCTCCCTATTGAAATATGTGAAAAATGTAGAGAAAAAAGGACAATATTAGTTATCAAGGGATATTTAGGCCTGAGATGCATGATGCTAATATTCAAAACATACACTTTTTAAAAATTAGATTTAAAATGTAAATTGAAGCAGAACATTTAGAAAAAGACATAATATCTACTATAAAAGTCCTGGGTTAGAAAAGTTAAAATGCTAAATGAAAAAATAATGCTTCTTGGGTGGCTTAAAATCGAATATGAGACAAAAGATTACTCAGAAATTTTTCTAAGATTAAAAACGTGTATACAGTTTCTTTGATATAAAATGAAATAAATGTCTGGATATAACTTTAACAGAATAGAATAGGGAGACAAGGGCAACGAGCAGGTGTATGTAGAATAAAGTGAACATATTATTGTAATAATGAGAGGGACAGAGTTGAATGATTGCTCTTGGAGACAAGGGATTTTGATGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTGTTTGCAAGTT--TAAAAATGTAACTTAAACCTGGTGAAGGAATAAAGGGTGGTTGGAGGGATGATTCTTTGTACACTAAACTTATTTTAATGACTAATGAATTAATCATAAGTTCAAATGATTTTATGGAGGCCCTTTC---TTTATTTGATATTTCTGGACTCCTTTTTTCTTTGTGTGTGCTCCATTTTTACCTACTTGAACAATTTTTACCCCCAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCAAATGTTCCAACATGATATAATCCCTGAAGGCATTTGCAGCTGGGGGAGTAGGGGAAAAGGGGTTTCTCTTTCAACAAATGCATGTTAACCTCGGTGAAAACTCAGAAGTTTAAACATGGTCCCCCTTGCGTCATGTGGCTACCCCAGGACCAATCATTGCACCAGACATAGGAGATAATCTCAAAAGCCAGGTTGGAGTCAAGGTTCTCCAGTGGAATTTCCACTTTAGAAATCAGTTTTGTCAGGCTTTGTGTTTGCATATTACAGACATGATAGCCATAtagctatctattcca------gtagagatgaaaacctaagagcatatgcccattcaaaggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcaacagccaaaacctgaaaatagtccaaatatccatggacaggtgaatttgtgacttataaacttactatggtatctgtatataatgaaataatactccctagtaagaacagaacaattgatagatgtagcaacatgaataaatctcaaaaatagtgatgctgagtgatcagaaagtatacataccctatgattttatgtatttggaaataaaaactcacggatagtgactagaagtggatcagtggttgcctgtggatggaatggggataggcaggaaaaagtgagtagaaaaagcacaaggaaactttggtgg-----------taaaggtaatggatatgtttgctattttcatatgttgttggttttgtagagctacaaatgccaagaattatcaaaatgtacaattgaagtatgtgcagtttattgcatgtaaatAAACCTTTTAAAAATTAACCGATACAAATTGACTTACATGACCAGAAAGCTCTTGAAAAACTCTCCTGTTTTCTCCCCTATTTTTATTCTTGCATGCCCTTATAGCCTGTGTTAACACATTTCTCATCTTACCGTTATTTTGTGTCTACATTTCACCAAGTCAATATAACTATCACCATAATTTCTTGGTTTCTCTTTAGTTCATTAGTAATTATGAGTAATGTATTGAAATGTTAAAGATATGTTCATGCATTCAGAATGCTCTGCTCTCTGATCCACATAATAGTGAATTATGCTCTCAATAATTACACAGTATAGTACttt-------tttttttttttttttttttgagacggagtcacacttggttacccaggctgaagtgcaatggtgcattctgggctcactgcaacctccacctcacgggttcaagtgattttcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatctgccttcatccccggctaatttttgtatttttattggagac-agggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaacctctgacctcaggtgacctgcctgtcttggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagccaccacccctggccAGAATATTGCTACTTTTGCAAATAGCTACAATTGACCCTGATCTGG--ACTTTGAGTTGATCACAGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAAAACTGCAAAATTAGACTAATAATAA----CATAGAATGCTTTCAGTATAAGAAATAATActatcctaagcaa---------aaataaataaataaataaaactggaggaattatattatctaacttcatattatactacagaattacagtaaccaaaagagtaggg-tactggcataaaaagaggcccatagatcaatgaaacacaatagagaacccagtaacaaatctacatacctacagtgaactcatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtgggaaatggtgttg-aaaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaaacagactagtatctatcactgaatacaaaagtaaaatcaaagttgattaaagatgtaaagctaagacctcaaactataaaactagtacaaaaaaactttgggggaaatctccaggatattggtctgggcaaaaatatcttgagcaataccccacaagcacaggcaaccaaagcaaaaatggacaaatggatcacattaagttaaaa-gcttctgcacggaaaatgatacaagcaacaaagttaagagataatccacagaatgagagaaaatatttgcaaactactcatccaacaaaggattaataatcagaatatataaaaagctcaaacaactctttaagaaacaatctaataacctggctaaaaaaaagggggcaaaagattcgaatagatatttctcaaaagaagacctacaaatggcaaacaggtataagaaaaggtgctcaatatcactgatcatcagagaaatgcaaatcaaaactacaatgagatatcatctcaccacagtttatatgacttgtatgcaaaagacaggcagtaacaaatgctagcagggaagcagagaaaagggaacacttgtacattgctcctgggaatgtaaattaataaaaccaccaaggtgaacagtttggatgtttctcaataaactaaaagttgagctagcatatgatctagcaatcctactgctgggtctctaccaaaaataaaggaaatcagtatgtcaaatacatatctgcactcccatatttgttgcagcactgtttacaaaactaagatttggaagaaaccttagtgtccatcaacagatgaatggataaagaaaatgtggtacatatacacaatggaggactattcagccgtaacaaagaacaagatccagtcattgtcagtaacactgatggaacattatggatcattatattaagtgaaataagccaggtgcagaaagacaaatgttacatgttcttacttatttgtgggatctaaaatcaaaacaaactcatggacatagagagtataaggatggttatcagaggctgggaaaggtagttggggggggattttgtgggaaggtggggatggttaatgggtataaaaatagagagttaataagacctactattttatagcacaatagggtgactatatccaataataatttcattgtacattttgaaataactaagactgtaattgaattttttataacttgaaggataaatgcttgaggggagggataccccattccccaagatgtgcttatttcaccttgcatgcctgtatcaaaacatctcagggaccccacagatacatacacatactatgtacccacaaCATTTTTAAACAATCTAATACAA-TTTTTTAAATGGCTCTTATTTTTTGTTACCTTCAATTATTGTAAAATATATTCTATTATTTATGATTTGCCTTGTTTGAAAACAAATTTTAAAAACACTATTTAAGACCAGATAAATGGACTAGGAGTAACTTGCATAAAAATGACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTGAGATGGT s panTro4.chr18 74616918 4244 - 76611499 ATACTTATTTCATATTTCATTAGATTTAGGGATGAT---TACATTGAGGGGTTGGGACTAGACTGAAGGCACCACATCATCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTCTTATGTTATATTGACAAAAACTTTTATTGTTGCAGGCAATATAGCTCCCTATTGAAATATGTGAAAAATGTAGAGAAAAAAAGACAATATTTGTTATCAAGGGATACTTAGGCCTGAGATGCATGATGCTAATATTCAAAACATACACTTTTTAAAAATTAGATTTAAAATGTAAATTGAAGCAGGACATTTAGAAAAAGACATAATATCTACTATAAAAGTCCTGGGTTAGAAAAGTTAAAATGCTAAATGAAAAAATAATGCTTCTTGGGTGGCTTAAAATCGAATATGAGACAAAAGATTACTCAGAAATTTTTCTAAGATTAAAAACATGTATACAGTTTCTTTGATATAAAATGAAATAAATGTCTGGATATAACTTTAACAGAATAGAATAGGGAGACAAGGGCAAAGAGCAGGTGTATGCAGAATAAAGTGAACATATTATTGTAATAATGAGAGGGACAGAGTTGAATGATTGCTCTTGGAGACAAGGGATTTTGATGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTATTTGCAAGTT--AAAAAAGGTAACTTAAACCTGGTGAAGGAATAAAGGGTGGTTGGGGGGATGATTCTTTGTACACTAAACTTATTTTAATGACTAATGAATTAATCACAAGTTCAAATGATTTTATGGAGGCTCTTTC---TTTATTTGATATTTCTGCACTCCTTTTTTCTTTGTATGTGCTCCATTTTTACCTACTTGAACAATTTTTACCCTCAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCAAATGTTCCAACATGATGTAATCCCTGAAAGCATTTGCAGCTGGGGGAGTAGGGGAAAAGGGGTTTCTCTTTCAACAAATGCATGTTAATCTCAGTGAAAACTCAGAAGTTTAAACATGGTCCGCCTTGGGTCATGTGGCTACCCCAGGACCAATCATTGCACCAGACATAGGAGATAATCTCAAAAGCCAGGTTGGAGTCAAGGTTCTTCAGTGGAATTTCCACTTTAGAAATCAGTTTTGTCAGGCTTTGTGTTTGCATATTACAGACATGATAGCCATATAGCTATCTATTCCACTTCC-GTagagatgaaaacctaagagcatatgcccattcaaaggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcaacagccaaaacctgaaaacagtccaaatatccatggacaggtgaatttgtgacttacaaacttactatggtatctgtatataatgaaataatactccctagtaagaacagaacaattgatagatgtagcaacatgaataaatctcaaaaatagtgatgctgagtgatcagaaagtatacataccctatgattttatgtatttggaaataaaaactcatggatagtgactggaagtggatcagtggttgcctgtggatggaatggggataggcaggaaaaagtgagtagaaaaagcacaaggaaactttggtgg-----------taaaggtaatggatatgtttgctattttaatatgttgttggttttgtagagctataaatgccaagaattatcaaaatgtacaattgaagtatgtgcagtttattgcatgtaaatAAACCTTTTAAAAATTAACCGATACAAATTGACTTACATGACCAGAAAGCTCTTGAAAAACTCTCCTGTTTTCTCCCCTATTTTTATTCTTGCATGCCCTTATAGCCTGTGTTAACACATTTCTCATCTTACCATTCTTTTGTGTCTACATTTCTCCAGGTCAATATAACTACCACCATAATTTCTTGGTTTCTCTTTAGTTCATTAGTAATTATGAGTAATGTATTGAAATGTTAAAGATATGTTCATGCATTCAGAATCCTCTGCTCTCTGATCCACATAATAGTGAATTATGCTGTCAATAATTACACAGTATAGTGCttt-------tttcctttttt--------gagacagagtcacacttggttacccaggctggagtgcaatggtgcattctgggctcactgcaacctccacctcatgggttcaagtgattttcctgcctcagcctcctgagtagctgggat-acaggcatctgccatcatccccagctaatttttgtatttttattggagac-agggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaacctctgacctcaggtgacctgcctgtcttggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagccaccacacctggccAGAATATTGCTACTTTTGCAAATAGCTACAATTGACCCTGATCTGG--ACTTTGAGTTGATCACAGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAAAACTACAAAATTAGCCTAATAATAAATAACATAGACTGCTTTCAGTATAAGAAATAATActatcctaagcaa---------aaataaataaataaataaaagtggaggaattatattatctgacttcatattatactacagaattatagtaaccaaaagagtaggg-tactggcataaaaagagacccatagatcaatggaacacaatagagaacccagtaacaaatctacatacctacagtgaactcatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtgggaaatggtgttg-aaaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaaacagactagtatctatcaccgaatacaaaagtaaaatcaaagttgattaaagatgtaaagctaagacctcaaactataaaactagtacaaaaaaactttggggaaaatctccaggacattggtctgggcaaaaatatcttgagcaatacccgacaagcacaggcaaccaaagcaaaaatggacaaatggatcacattaagttaaaacgcttctgcacggaaaatgatacaatcaacaaagttaagagacaatccacagaatgggagaaaatatttgcaaactactcatccaacaaaggattaataatcagaatatataaaaagctcaaacaactctttaagaaacaatctaataacctggtttaaaaaaagggggcaaaagatttgaatagatatttctcaaaagaagacctacaaatggcaaacaggtataagaaaaggtgctccatatcaccgatcatcagagaaatgcaaatcaaaactacaatgagatatcatctcaccacagtttatatgacttgtatgcaaaagacaggcagtaagaaatgctagcagagatgcagagaaaagggaacacttgtacactgctcctgggaatgtaaattaataaaaccaccaaggtgaacagtttggatgtttctcaataaactaaaagttgagctaccatatgatctagcaatcctactgctgggtctataccaaaaataaaggaaatcagtatgtcaaatacatatctgcactcccatatttgttgcagcactgtttacaaaactaagatttggaagaaaccttagtgtccatcaacagatgaatggataaagaaaatgtggtacatatacacaatggaggactattcagctgtaacaaagaacaagacccagtcattgtcagtaacactgatggaacattatggatcattatattaagtgaaataagccaggtgcagaaagacaaatgttacatgttcttacttatttgtggaatctaaaatcaaaacaaactcatggacatacagagtataaggatggttatcaggggctgggaaaggtagtggagggggaggtttgtgggaaggtggggatggttaatgggtataaaaatagagagttaataagacctactattttatagcacaatagggtgactatatccaataataatttaattgtacattttgaaataactaagactgtaattgaattttttataacttgaaggataaatgcttgaggggagggatatcccattccccaagatgtgcttatttcacattgcatgcctgtatcaaaacatctcagggaccccacagatacatacacatactatgtacccacaaCATTTTTAAACAATCTAATACAA-TTTTTTAAATAGCACTTATTTTTTGTTACCTTCAACTATTGTGAAATATATTCTATTATTTATGATTAGACTTGTTTGAAAACATATTTTAAAAACACTATTTAAGACCAGATAAATGGACTAGGAGTAACTTGCATAAAAATGACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTGAGATGGT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18566082 4241 + 99152023 atatttatttcttatttTATTAGATTTAGGGATGATGATTACGTTGAGGGATTGGGACTCGACTGAAGGCACAACATCATCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTGTTATGTTATATTGACAAAAACTTTTATTGTGGCAGGCAATATAGCTCCCTATTGAAATATGTGAAAAATGTAGAGAAAAAAAGACAATATTTGTTATCAAGGGATATTTAGGCCTGAGATACATGATGCTAATATTCAAAACATACACTTTTTAAAAATTAGATTTAAAATGTAAACTGAAGCAGAACATTTAGAAAAAGACATAATATCTACTATAAAAGTCCTGGGTTAGAAAAGTTAAAATGCTAAATGAAAAAATAATGCTTCTTGGGTGGCTTAAAATCGAATATGAGACAAAAGATTACTCAGAATTTTTTCTAAGATTAAAAACATGTATACAGTTTCTTTGATATAAAATGAAATAAATGTCTGGATATAACTTTAACAGAATAGAATAGGGAGACAAGGGCAAAGAGCAGGTGTATGCAGAATGAAGTGAACATATTATTGCAACAATGAGAGGGACAGAGTTGAATGATTGCTCTTGGAGACAAGGGATTTTGATGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTGTTTGCAAGTT-AAAAAAATGTAACTTAAACCTGGTGAAGGAATAAAGGGTGGTTGGGGGGATGATTCTTTGTACACTAAACTTGTTTTAATGACTAATGAATTAATGATAAGTTCAAATGATTTTATGGAGGCCCTTTC---TTTATTTGATATTTCTGGACTCCTTTTTTCTTTGTATGTGCTGCATTTTTACCTACTTGAACAATTTTTACCCACAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCAAATGTTCCAACACGATGTGATCCCTGAAAGCATTTGCAGCTGGGGGAGTAAGGGAAAAGGGGTTTCTCTTTCAACAAATGCATGTTAATCTCAGTGAAAACTCAGAAGTTTAAACAtggtcctccttgggtcacgtggctaccccaggaccaatcattgtaccagacataggagataatctcaaaagccaggctggagtcaaggttctcccgtggagTTTccactttagaaaccagttttgtcaggctttgtgtttgcatattacagacatgatagccatatagctatctattccacttccagtagagatgaaaacctaagaacatatgcccattcaaaggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcagcagccaaaacctgaaagcagtccaaatatccatggacaggtgaatttgtgacttataaacttactatggtatctgtatataatgaaataatactccctagtaggaacagaacaattgatagatgtagcaacatgaataaatctcaaaaacagtgatgctgaatgatcagaaagtatacataccctgtgattttatgtatttggaaataaaaactcacagatagtgactggaagtggatcagtggttgcctgcggatggaatggggataggcagaaaaaagtgagtagaaaaagcacaaggaaactttggtgg-----------taaaggtaatggatatgtttgctattttaatatgttgttggttttgtagagctacaaatgccaagaattctcaaaatgtacaactgaagtatgtgcagtttattgcacgtaaatAAACCTTTAAAAAATTAACCGATACAAATTGACTTACGTGACCAGAAAGCTCTTGAAAAACT---CTGTTTTCTCCCCTATTTTTATTCTTGCCTGCCCTTATAGACTGTGTTAACACATTTCTCATCTTACTGTTCTTTTGTGTCTACATTTCTCCAGGTCAATATAACTCTCACCATAATTTCTTGGTTTCTCTTTAGTTCATTAGTAATTATGAGCAATGTATTGAAATGTTAAAGATACGTTCATGCATTCAGAATCCTCTGCTCTCTGATCCACATAACAGTGAATTATGCTGTCAATAATTACACAGTATAGTGCttt-------tttcttctttt-----tttgagacggagttgcgcttggttacccaggctggagtgcaatggtgcattctgggctcactgcaacctccagctcacgggttcaagtgattttcctgcctcagcctcctgagtaggtgggattacaggcatctgccgtcatccccggctaatttttgtatttttattggagac-agggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaacctctgacctcaggtgatctgcctgtcttggc--cccaaagtgctgggattataggcatgagccaccacacccggccAGAATATTGCTACTTTTGCAAATAGCTACAATTGACCCTGATCTGG--ACTTTGAGTTGATCATAGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAAAACTACAAAATTAGACTAATAATAAATAACATAGAATGCTTTCAGTATAAGAAATAATActatcctaagcaa---------aaataaataaataaataaaagtggaggaattatattatctgacttcatattatactacagaattatagtaaccaaaagagtatgg-tactggcataaaaacagacccatagatcaatggaacacaatagagaacccagtaacaaatctacatacctacagtgaactcatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtgggaaatggtgttgaaaaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaaacatactagtatctatcaccaaacacaaaagtaaaatcaaagttgattaaagatgtaaagctaagacctcaaactataaaactagtacaaaaaaactttggggaaaatctccaggacattggtctgggcaaaaatatcttgagcaataccccacaagcacagtcaaccaaagcaaaaatggacaaatggatcatattaagttaaaaagcttctgcacagaaaatgatacaatcaacaaagttaagagacaatccacagaatgggagaaaatatttgcaaactactcatccaacaaaggattaataatcagaatatataaaaagctca---aactctttaagaaacaatctaataacctggttaaaaaaaaggaggcaaaagatttgaatagatatttctcaaaagaagacctacaaatggcaaacaggtataagaaaaggtgctcaatatcactgataatcagagaaatgcaagtcaaaactacaatgagatatcatctcaccacagtttaaatgacttgtatgcaaaagacaggcaataacaaatgctagcagggatgcagagaaaagggaacgcttgtacactgctcctaggaatgtaaattagtaaaaccactaaggtgaacagttcggatgtttctcaataaactaaaagttgagctgccatatgatctagcaatcctactgctgggtgtataccaaaaataaaggaaatcagtgtgtcaaatacatatctgcactcccatatttgttgcagcactgtttacaaaactaagatttggaagaaaccttagtgtccatcaacagatgaatggataaagaaaatgtggtacatatacacaacggaggactattcagccataacaaagaacaagatccagtcattgtcagtaacattgatggaatattacggattattatgttaagtgaaataatccaggcacagaaagacaaatgttacatgttctcacttattggtggaatctaaaatcaaaacaaactcacggacatagagagtataaggatggttatctgaggctgggaaaggtagttgggggggg--tttgtgggaaggtggggatgggtaatgggtatagaaatagagagttaataagac---ctattttatagcacaatagggtgactatattcaataataatttaattgtacatttttaaataactaagactgtaattgaattttttataacttgaaggataaatgcttgaggggagggataccccattccccaagatgtgcttatttcacaatgcatgcctgtatcaaaacatctcatggaccccacagatacatacacatactatgtacccacaaCATTTTTAAACAATCTAATACAA-TTTTTTAAATGGCACTTATTTTTTGTTATCTTCAACTATTGTAAAATATAATCTATTATTTATGATTAGCCTTGTTTGAAAACAAATTTTAAAAACACTATTTAAAACCAAATAAATGGACTAGGAGTAACTTGCATAAAAAGGACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTGAGATGGT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77025129 4221 - 143122389 ATATTTATTTCATATTTCATTAGATTTAGGGATGATGATTACATTGAGGGATTGGGACTAGACTGAAGGCACCACATCATCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTGTTATGTTATACTGACAAAAACTTTTATTGTGGCAGGCAATATAGCTCCCTATTGAAATATGTGAAAAATGTAGAGAAAAAAAGACAATATTTGTTATCAAGGGATATTTAGGCCTGAGATTCATGATGCTAATATTCAAAACATACACTTTTT-AAAATTAGATTTAAAATGTAAATTGAAGCAGAGCATTTAGAAAAAGACAAAATATCTACTATAAAAGACCTGGGTTAGAAAAGTTAAAATGCTAAATGAAAAAATAAAGCTTCTTGGGTGGCTTAAAATAGAATATGAGACAAAAAATTACCCAGAAATTTTTCTAAGATTAAAAACATGTATACAGTTTCTTTGATATAA--------AAATTTCTGGATATAACTTTAACAGAATAGAATAGGGAGACAAGGGCAAAGAGCAGGTGTATGCAGAATGAAGTGAACATATTATTGTAACAATGAGAGGGACAGAGTTGAATGATTGCTCTTGGAGACAAGGGATTTTCATGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTGTTTGCAAGTTAAAAAAAATGTAACTTAAACCTGGTGAAAGAATAAAGGGTGGTTGGGGGGATGATTCTTTGTACACTAAACTTGTTTTAATGACTAATGAATTAATCATAAGTTCAAATGATTTTATGGAGGCCCTTTC---TTTATTTGATATTTCTGGACTCCTTTTTTCTTTG--TGTGCTCCATTTTTACCTACTTGAACAATTTTTACCCGCAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCAAATGTTACAACATAATGTGATCCCTGAAAGCATTTGCAGCTGGGGGCATAGGGGAAAAGGGACTTCT-------AAAATGCATGTTAATCTCAGTGAAAACTTAGAAGTTTAAACATGGTCCTCCTTGGGTCATGTGGCTACCCCAGGACCAATCATTGCACCAGACATGGGAGATAATCTCAAAAGCCAGAGTGGAGTCAAGGTTCTCCAGTGGAGTTTCCACTTTAGAACTCAGTTTTGTCAGGCTTTGTGTTTGCATATTACAGACATGATAGCCATATAGCTATCTATTCCACTTccagtagagatgaaaacctaagagcacaggcccattcaaaggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcaacagccaaaacctgaaaacagtccaaatatccatggacaggtgaatttgtgacttataaacttactgtggcatatgtatataatgaaataatactccctagtaagaacagaacaattgatagatgtaacaacatgaataaatctcaaaaatagtgatgctgagtgatcagaaagtatacataccctatgattatatgtatttggaaataaaagcttatggatagtgactggaagtggattagtggttgcctgtggatggaatggggataggcaggaaaaattgagcagaaaaagcacaacgaaactttggtgg-----------taaaggtaatggatatgtttgctattttcatatgttgttggttttgtagagctacaaatgccaagaattatcaaaatgtacaattgaagtatgtgcagtttattgcatgtaaatAAACCTTTTAAAAATTAACCGATACAAATTGACTTACATTACCAGAAAGCTCTTGAAAAACTCTCCTCTTTTCTCCCCTATTTTTATTCTTGCATGCCCTTATAGACTATGTTAACACATTTCTCATCTTACTGTTCTTTTGTGACTACATTTCTCCAGGTCAATATAATTATCACCATAATTTCTTGGTTTCTCTTTAGTTCATTAGTAATTATGAGTAACGTATTGAAATGTTAAAGATATGTTCATGCATTCAGAATCCTCTGCTCTCTGATCCACATAATAGTGAATTATGCTGTCAATAATTACACAGTATAGTGCttt-------tttttttttt---------gagatggagtcatgcatggttacccaggctggagtgcaatggtgcattctgggctcactgcaacctccacctcatgggttcaagtgattttcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatctgccatcatccccgactaatttttgtatttttattggagac-agggtttcaccatgttggccaggctcgtcttgaacctctgacctcaggtgatgcacctgtcttggcctcccaaagtgctgggattataggcatgagccaccacacccagccAGAATATTGCTACTTTTGCAAATAGCTACAATTGACCCTGATCTGG--ACTTTGAGTTGATCATGGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAAAACTAGAAAATTAGGCTAATAATAAATAACATAGAATGCTTTCAGTATAAGAAATAATActatcctaagcaa---------aaataaataaataaataaaactgggggaattatattatctgacttcatattatactacagaattatagtaaccaaaagagcatgg-tactggcataaaaacagacccatagatcaatggaacacactagagaacccagtaacaaatctacatacctacagtgaactgatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtgggaaatggtgttg-aaaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaaacagactagtatctatcaccaaattcaaaagtaaaatcaaagttgattaaagatgtaaagctaagacctcgaactataaaactagtacaaaaaaactttggggaaaatctccaggacattggtctgggcaaaaatatcttgagcaataccccacaagcacaggcaatcgatgcagaaatggacaaatggatcacattaagttaaaaagcttctgtacagaaaatgatacaatcaacaaagttaagagacaatccacaaaatgggagaaaatatttgcaaactactcatctgacaaaggattaataatcagaatatataaaaagctcaaacaactctttaagaaacaatctaataacctggtttaaaaaaagg-ggcaaaagatttgaatagatatttcccaaaagaagacc-acaaatggcaaacaggtataagaaaaggtgctcaatatcaccgatcatcagagaaattcaagtcaaaaccacaatgagatatcatctcaccacagtttatatgacttgcatgcaaaagacaggcaataacaaatgctagcagggatgcagagaaaagggaacacttgtacactgctcctgggaatgtaaattagtaaaaccactaaggtgaacagtttggaggttgctcaataaactaaaacttgagctaccatatgatctagcaatcctactgctgggtgtataccaaaaataaaggaaatcagtatgtcaaatacatatctgcactcccgtatttgttgcagcactgtttacaaaactaagatttggaagaaaccttactgtccatcaacagatgaatggataaagaaaatgc-gtacatatacacaatggaggactattcagccataacaaagaacaagatccagtcactgtcagtaacactgatggaacattacggatcattatgttaagtgaaataagccaggcacagaaagacaaatgttacatgttctcacttatttgtggaatctaaaatcaaaacaaactcatggacatagagaatataaggatggttatcagaggctgggaaaggtagtggcagggg---ttggtgggaaggtgggggtggttaatgggtataaaaatagagagttaataagacctactattttatagcacaatagggtgactatattcaataataatttaattgtacattttgaaataactaagactgtaattgagttttttgtaacttgaaggataaatgcttgaggggagggataccccattccccatgatgtgctcatttcacattgcatgcctctatcaaaacatctcatggacaccacagatacatacacatactatgtacccacaaCATTTTTAAACAACCTAATACAA-TTTTTTAAATGGCACTTATTTTTTGTTACCTTCAACTATTGTAAAATATATTCTATTATTTATGATTAGCCTTGTTTGAAAACATATTTTAAAAACATTATTTAAAACCAAATAAATGGACTAGGAGTAACTTGCATAA-----ACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTGAGATGGT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36489294 4225 + 96509753 ATATTTATTTCATATTTCATTAGATGTAGGGATGATGATTACTTCAAGGGATTGTCACTAGACTGAAAGCACCACATCACCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTGTTCTGTTATGTTGACAAAAACTTTTATTGT----GGCAATATACCTCACAATTGAAATATGTGAAAAATATACAGAAAAAAAGACAATATTTGTTATCAAGGGATATTTAGGCCTGAGCTGCAGGATGCAAATATTTAAAACATACACTTTTTAAAAATTGGATTTAAAAAGTAAATTGAAGCAGAGCATTTAGAAAAAGACATAATATCTACTATAAAAGTCCTGGGTTAGAAAAGTTAAAATACTAAATGAGAAAATAATGCTTCTTGGGTAGCTTAAAATCGAATATGAGGCAAAAAATTACTCATAATTTTTTCTAAGATTAAGAACATGTATACAGTTTCTTTGATATAAAATGAAATAAATGTCTGGATATAACTTT-----AATAGAATAGGGAAACAAGGGTAAAGGAGAGGTGTATGCAGAATAAAGTGAACATATTATTCTAACAATGAAAGGGACAGAATTGAATGATTGCCCTTGGAGACAAGGGATTTTGGTGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTGTTTGCAAGTT--AAAAAATGTACCTTAAACCTGGTGAAGGAATAAAGGGTGGTGGAGGGGATGATTCTTTGT--ACTAAACTGGTTTT-ATGACTAATGAATTAATCATAAGTTCAAATGATTTTATGGAGGCCCTTTCTTTTTTATTTGATATTTCTGGACTGTTTTTCTCTTTGTATTTGCTCCATTTTTACCTGTTTGAACAATTTTTCCCTGCAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCACATGCTCCAGCATGATGTGATCCCTGAAAGCATTTGCAGCTGGGGGAG--GAGGCAAAGGGGCTTCTCTTTCAACAAATGCATATTAATCTCGGTGAAAACTCAAAAGTTTAAACATGGTCCTCCTTGGGTCATGTGGCTACCCCAGGACCAGTCATTGCACCAGACATAGGAGATAGTCTCAAAAGCCAGGCTGGAGTCAAGGTTCTCTGGTGGAGTTTCCACTTTAGAAATGGGTTTTGTCAGGCTTTGTGTTTTCGTGTTACAGACATGATAGCCATATATCTATCTATTCCACTTCCAGTGgagatgaaaacctaa-cgcatatgcccactcaatggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcaacagccaaaacctgaaaacagtccaaatgtccatagacaggtgaatttgtgactgataaacttactatggtatatgtatataatgaaataatactccctagtaagaacagaacaattgatagatgtagcaacatgaataaatctccaaaatagtgatgctgagtgatgaaaaagtatacccaccctatgatttcatgtatttggaaataaaaactcac----agggactgcaggtggatcagtggttgcctgtggatgggatggggataggcaggcaaaagtgagtag-aaaaatacaagaaagt--gagtagaaaaacacaaataaaggtaatggatatgctttttatttgaatatgttgttggttttatagagctacaaataccaagaataatcaaaatgtacaattgaagtatgtgcagtttattgcatgtaaatAAACCTTTTAAAAATTAACTGATACAAATTGACTTACATGACCAGAAATCTGTTG-AAAGCTCTCGTGTTTTCTCCCCTATTTTTATTCTTGCATGCCCTTACAGACTGTGTGCACACATTTCTCATCTTACTGTTCTTTTATGTCTACATTTCTTCAAGTCAATATACCTATTACCATAATTTCTTGGTTTCTCTTTAGTTCATTAGTAACTATGAGTAATGTATTGAAATGTTAAAGATATGTTCATGCATTCAGAATCCTCTGCTCTCTGATCCACATAATAGTGAATTAAGCTGTCAACAATTACACAGAATATTGCTCC-------tttgtttgttt---gttttttgatgaagtctcgcttggttacccaggctagaatgcaatggcacattctgggctcactgcaatctccacctcccgggttcaagcaattttcctgcctcagcctcctgagcagctgggattacaggcatctgccatcatcctcaactaatttttgtgtttttattacagac-agtgtttcaccacgttggctaggccagtcttgaacccatgacctcatgtgatctgcccacctgggcctcccaaagagctgggattacaggcataagccaccatgcccagccAGAATATTGCTACTTTTGCAAATAGCTACAATTAACCCTGATCTGGACACCTTGAGTTGATCATAGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAAAACTATAAAAGTAGACTAATAATAAATAACATAGAATGCTTTCAGTATAAGAAATAACActatcctaagcaa---------aaataaataaataaataaagctggaggaattatattatctgacttcatattatcctacagaattatagtaaccaaaagaatatgg-tactggcataaaaacagacccatagatcaatggaacagaatagagaacccagtaacaaatctacatagctacagtgaactcatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtggtaaatggtgttg-aaaaaactggatatccatatgaggaggaatgaaaacagactagtatctctcataatatatgaaagtaaaatcaaagttgattaaa--------------a-ctccaacaataaaactagtacaaaaaaagtttgaggaaaatctccaggacattggtctgggcaaaaatatcttgagcaataccccacaagcacaggcaatcaaaacaaaaatggacaaatggatcacactaagttaaaaagcttctgcacagaaaatgatacaatcaacaaaattaagagaaaatccacagaatgggagaaaatatttgcaaactactcttctgacaagggattaacaatcagaatatatgaaaagctccaacaactctttaagaaacaatctaataacctgattttaaaaaagg-tgcaaaagatttgaacagatatttctcaaaagaagacctacaaatggcaaacaagtataagaaacggagctctgtatcactgatcatcagagaaatgcaaatcaaaactacaatgagatatcatctcaccacagtttaaatgacttgtacgcaaaagacaggaaataacaaatgctagcaaggatgcagagaaaagggagcccttgtccactgctgctgggaatgtaagtttgtaaaaccactgaggtgaacagtttggaggtttctcaataaactaaaagttgagctaccatatgatctagcaatcccactgttgggtgaataccaaaactaaaggtaatcagtatgtcaaatacatatctgcactcccatatttgttgcagcactgattacaaagctaaaatttggaagaaaccttagcgcccatcaacagaggaatggataaagaaaatgtagtacatatatacaatggaggactattcagtcataacaaagaataagttccagtcattctcagtaccattgatggaacattatagatcattatgttaagtgaaataagccaggcacagaaagacaaatgtcacatgttctcacttatttgtggaatctaaaatcagaacagactcatgaacatagagagtataaggatggttatcagaggcttggaagggtagttggggctg---ttggtaggaagggggggatggtcaatgggtataaaaatagagagttaataagacctatta--agatagcacaataggttgactctattcaataaaaatttaattgtacattttgaaataactaagactgtaattgaatattttataacttgaaggataaatgcttgaggggagggataccccattccccatgatgtgcttatttcacattgcaggcc-atatccaaacatctcatggaccccacagatacatacacatactatgtacccacaaTATTTTTAAACAATCAACTACAA-TTTTTTAAATGGCACCTACCTTTTGTTACCTTCAACCGTTGTAAAATATATTCTATTATTTATTATTAGTCCTGTCTGAAAACAAATTTTAAAAACACTATTTAAAACCAAATAAATGGACTAGGAGAAACTTGTATGAAAATGACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTAGGATGGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37901960 4237 - 90373283 ATATTTATTTCATATTTCATTGGATGTAGGGATGATGATTACTTCAAGGGATTGTCACTAGACTGAAAGCACCACATCATCAATCACTTGGAAACAATATTTTGCCTATGTGTCC-----TGTTGACAAAAACTTTTATTGT----GGCAATATAGCTCACAATTGAAATATGTGAAAAATGTGCAG-AAAAAAGAAAATATTTGTTATTAAGGGATATTTAGGCCTGAGGTGCAGGATGCAAATATTTAAAACATACAGTTTTTAAAACTTAGATTTAAAATGTAAATTGAAGCGGAGCACTTAGAAAAAGACATAATATGTAATATAAAAGTCCTGGGTTTAAAAAGTTAAAATACTAAATGAGAAAATAGTGCTTCTTGGGTAGCTTAAAATTGAATACGAGACAAAAAATTATTCAGAACTTTTTGTAAGATTAAAAATATGTATGCAGTTTCATTGATATAAAATGAAATAAATGTCTGGATATAACTTT----------AATAGGGAAACAAGGGTAAAGGAGAGGTGTATTCAGAATAAAGTGAACATATTATTATAACAATGAGA-GGACAGAATTGAAGGATTGCTCTTGGAGACAACGGATTTTGATGTCTAAGTTAATGACAAATCTTTTGTTTGCAAGTT--TAAAAATGTACCTTAAACCTGGTGAAGGAATAAAGGGTGGTGGAGGGGATGATTCTTTGTACACTAAACTGGTTTTAATGACTATCGAATTGATCATGAGTTCAAATCATTTTATGGAGGCCCTTTCTTTTTTATTTGATATTTGTGGACTGCTTTTCTCTTTGTATTTGCTCCATTTTTACCTGCTTGAACAATTTTTCCCCGCAAAGTTTAGGAAACACTGTAACCACATGCTCCAGCATGATGTGATCCCTGAAAGCATTTGCAGCTGGGGGAG--GAGGCAAAGGGGCTTCTCTTTCAACAAATGCATATTAATCTCAGTGAAAACTCAGAAGTTTAAACAGGGTCCTCCTTGGGTCATGTGGCTACCCCAGGACCAGTCATTGCACCAGACATAGGAGATAGTCTCAAAAATCAGGCTGGACTCAAGGTTCTCTGGTGGAGTTTccactttagaaatgggttttgtcaggctttgtgttttggtgttacagacatgatagccatatatctatctattccacttccagtggagatgaaaacctaa-agcatatgcccactcaatggattttacatgaatcttcatagcagctttacttgcaacagccaaaacctgaaaacagtccaaatgtccatggacaggtgaatttgtgactgataaacttactatagtgtatgtatataatgaaataatactccctagtaagaacagaacaattgatagatgtagcaacatgagtaaatct-caaaatagtgatgctgagtgaggaaaaagtataccaatcctatgatttcatgtatttggaaataaaaactcac----agggactgcaggtggatcagtggttgcctgtggatgggatggggataggcaagagaaagtgagtagaaaaaacacaagaaaactggggtgg-----------taaaggtaatggatatactggttatttgaatatgttgtttgttttatagagctacaaatgcgaacaataatcaaaatgtacaattgaagtatgtgcagtttttggcttgtaaatAAACCTTTTAAAAATTAACTGATACAAATTGACTTACATGACCAGAAATCTGTTG-AAAACTCTTGTGTTATCTCCCCTA-TTTTATTCTTGTGTGCCCTTACAGACTGTGTGAACACATTTCTCATCTTACTATTCTTTTATGTCTACACTTTTCCAGGTAAATATCACTATCGCCATAATTTCTTGCTTTCTCTTTAGATCATTAGTAATTACGAGTAATGTATTGAAATGTTAAAGATATGTTCATGCATTCAGAATCCTCTGCTTTCTGATCCACATAATAGTGAATTAAGCTGTCAACAATTACACAGAATATTGCTCCttttttgtttgtttgttt---gttatttgatgaagtcttggttggttacccaggctggaatgcagtggcacattctgggctcactgcaatctccatctcccgggttcaagcaattttcctgcctcagcctcctgagcagctgggattacaggcatctgccatcatcctcaattaatttttgtgttattataagagatgggggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaacccctggcctcaggtgatctgcccaccttagcctcccaaagagctgggattgcaggcataagccaccacacccACCCAGAATATTGCTACTTTTTCAAATAGCTACAACTAACCCTCATCTGGACACCTTGAGTTGATCATAGCTTTGTAAAAGAGGATAGCATTGTAGAACTATAAAATTAGACTAATAATAAATAGCATAGAATGCTTTCAGTATAAGAAATATTAATATCCTAAGCAAAAATAAAATAAAtaaataaataaataaaactggaggaattctattatctgacttcatattatactacagaattatagtaaccaaaagaatatggttactagcataaaaacagacccatagatcaatggaacagaatagagaacccaggaacaaatctacatagctacagtggactcatttttgacaaaggtgccaagaacatacactggtggtaaatgttgttg-aaaaaactggatatccacatgcagaggaatgaaagcagactagtatctctcacaacatatgaaagtaaaatcaaagttgattaaaaatgtaaagctaaga-ctccaacaataaaactagtacaaaaaacgtttgaagaaaatctccaggacattggtctgggcaaaaatatcttgagcaatactccacaagcacaggcaaccaaaacaaaaatggacaaatggatcacactaagttaaaaagcttctgcgcagaaaatgatacaatcaacaaaattaagagataatccacagaataggagaaaatatttgcaaactactccttccacaagggattaataatcagaatatataaaaagctcgaacaactctttaagaaacaatctaataacctggttaaaaaagggg-ggcaaaagatttgaacagatatttctcaaaagaagacctacaaatggcaaacaggtataagaaagggtgctccatatcactgatcatcagagaaatacaaatcaaagctacaatgagatatcatctcaccacagtttaaataacttgtatgcaaaagacaggcaataacaaatgctagcaaggatgcagagaaaagggaacccttgtccactgctgctgggaatgcaaattcgtaaaaccactgaggtgaacagtttggaggtttctcaataaactaaaagttgagctaccatatgatctagcaatcccactgttgggtgaataccaaaactaaaggtaatcagtatgtcaaatacatatctgcactcccatatttgttgcagcactgattacaaagctaaaatttggaagaaaccttagtgcccatcaacagaggaatggataaagaaaatgtagtacatatatacaatggaggactattcagtcataacaaagattaagttccagtcattctcagtaccattgatggaacattatagatcattatgttaagtgaaataagccaggcacagaaagacaaatgtcacatgttctcacttatttgtggaatctaaaatcaaaacagactcatggacat----agtataaggacggatatcagaggcttggaaaggtagttggggctg---ttggtaggaaggtggggatggtcaatgggtataaaaatagagagttaaaaagacctactatttgacagcacaataggttgactctattcaataaaaatttaattgtacattttgaaataactaagactgtaattgaatattttataacttgaaggataaatgcttgaggggagggataccccattccccatgatgtgcttatttcacattgcaggcc-atatcccaacatctcatggaccccacagatacatacacatactatgtacccacaaCATTTTTAAACAATCTACTACAATTTTTTTAAATGGCACCTACTTTTTGTTACCTTCAACTGTTGTAAAATAAATTCTATTATTTAAGATTAGCCCTGTCTGAAAACAAATTTTAAAAACACTATTTAATACCAAATAAATGGACTAGGAGAAACTCATATGAAAATGACAGAAATTGCTGCTACTTCTTCTAATTATTGAGATGGT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH684867 78265 1 + 80412 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=1733388.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 139568 1040 + 478999 ATTTCTATATTTGTGAAATTATCTG--ATAGAAAATTGAATTGTTTCCAACATTATT---TTTCATAATTAAACATGTTATATTGCTACTTCTTTAAAAGTAGCCTTTAAAATATTACCAATCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAAACATTAAACTATTCTT---AAAAAAAGTAATTTATTTAATTACCTAACATCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTAGCAAGTTGTGCTAGCTAACTGCTGAGAATCATTGTCTACATATGAGATAAATCATCTATCAATCCTTTAAAGAAGACTTTATGAGCCATAGAGATTGTAGTCCAATCTGTATCACTGACTTTAAACATTGGATAATTGACACTCCGTGTTGTCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATGTCAATAGGTACCTCTTGGAGTGCCATTTTCCTTGTAACCCTTAGATTAATTCAGATTGACTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTATATCATGCTGCTTTGCATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAGCCTACACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGCTCTTGTTTTCCTTCTGGGTAATCTTTTTCATGTCACCACTCTTGTCAGCATCTGCATTGGGCAAATTTCCTAGGACCTCCCTTCTGCGTCTTTTAAAATATGAAAACAAAATCAATGTAGCGCAGCAAGCCAGGGAAAGTCTGCTTTGATTGACTTACGGCCATAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCCCAGGTCAGCCACTGAGCCCAC-CGCTGTTCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCGTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGGGCTTCAGCCCGAGGAGAACACGGTGGAGATGGAGGAGCCCCTGGGCGTCCGCAGGTTAACTGAAAACATGAGAGGACACAAGCACGGGACCAAGTCTGTCACTAACCTGTAAAGTACTCTCACCAAGCCGACCGGGCACTTTGTCTGAGCGCCTGCCTTTG s panTro4.chr18 74621162 1043 - 76611499 ATTTCTATATTTGTGAAATTATCTGTGATAGAAAATTGAATTGTTTCCAACATTATTATTTTTCATAATTCAACATGTTATATTGCTACTTCTTTAAAAGTAGCCTTTAAAATATTACCAATCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAAACATTAAACTATTCTT---TAAAAAAGTAATTTATTTAATTACCTAACATCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTAGCAAGTTGTGCTAGCTAACTGCTGAGAATCATTGTCTACATATGAGATAAATCATCTGTCAATCCTTTAAAGAAGACTTTATGAGCCATAGAGATTGTAGTCCAATCTGTATCACTGACTTTAAACATTGGATAATTGACACTCCGTGTTGTCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATGTTAATAGGTACTTCTTGGAGTGCCATTTTCCTTATAACCCTTAGATTAATTCAGATTGACTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTATATCATTGTGCTTTGCATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAGCCTATACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGCTCTTGTTTTCCTTCTGGGTAATCTTTTTCATGTCACCACTCTTGTCAGCATCTGCATTGGGCAAATTTCCTAGGACCTCCCTTCTGCGTCTTTTAAAAAATGAAAACAAAATCAATGTAGCGCAGCAAGCCAGGGA--GTCTGCTATGATTGACTTATGGCCATAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCCCAGGTCAGCCACTGAGCCCAC-CGCTGTCCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCGTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGGGCTTCAGCCCGAGGAGAACAGGGTGGAGATGGAGGAGCCCCTGGGCGTCCGCAGGTTAACTGAAAACATGAGAAAACACAAGCACGGGACCAAGTCTGTCACTAACCTGTAAAGAACTCTCACCAAGCCGACTGGGCACTTTGTCTGAGCGCCTGCCTTTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18570323 1041 + 99152023 ATTTCTATATTTGTGAAATTCTCTGTGATAGAAAATTGAATTGTTTCCAACATTATTATTTTTCATAATTAAACATGTTATATTGCTACTTCTTTAAAAGTAGGCTTTAAAATATTATCAATCTACTTTAAAGTCTGCTTGCCAAAATATTAAACTATTCTTAAAAAAAAAAGTAATTTCTTTAATTACCTAACTTCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTGGCAAGTTGTGCTAGTTAACTGCTGAGAATCATTGTCTACATATGAGATAAATCATCTGTCAGTCTTTTAAAGAAGACTTTATGAGACATAGAAATTGTAGTCTAATCTGTATCACTGACTTTAAACATTGGATAATTGACATTCCATGTTGCCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATGTTAATAGGTGTTTCTTGGAGTGCCATTTTCCTTATAACCCTTAGATTAATTCAGATTGACTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTATATCATTGTGCTTTGCATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAGCCTACACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGCTCTTGTTTTCCTTCTGGGTAATCTTTTTCATGTTACCACTCTTGTCAGCATCTGCATTGGGCAAATTTCCTAGGACCT-CCTTCTGCTTCCTTGAAAATATGAAAACAAAATCAGTGTAGCGCAGCAAGCCAGGGAAAGTCTGCTTTGATTGACTTATGGCCATAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCCCAGGTCAGCCACTGAGTCCACACGCTGTCCTCCTGCGT------GTGGCTCTGTGAGCCGTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGGGCTTCAGCCCGAGGAAAACACGGTGGAGATGGAGGAGCCCCTGGGCGTCGGCAGGTTAACTGAAAACATGAGAGGACGCAAGCACGGGACCAAGCCTGTCACTAACCTGTAAAGAACTCTCACCAAGCCGACTGGGCACTAT-TCTGCGCGTCTGCCTTTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77029350 1042 - 143122389 ATTTCTATATTTGTGAAATTATCTGTGATAGAAAATTGAATTGTTTCCAGCATTATTATTTTTCATAATTAAACATGTTATATTGCTACTTCTTTAAAAGTAGGCTTTAAAATATTGCCAATCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAAATATTAAACTATTCTT---AAAAAAAGTAATTTATTTAATTACTTAACTTCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCCCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTAGCAAGTTGTGCTAGTTAACTGCTGAGAATCATTGTCTACGTATGAGATAAATCATCTGTCAATCTTTTAAAGAAGACTTTATGAGCCTTAGAGATTGTAGTCCAATCTGTATCACCGACTTTAAACATTGGATAATTGACACTCCATGTTGCCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATGTTAATAGGTGCTTCTTGGAGTGCCATTTTCCTTATAATCCTTAGATTAATTCAGATTGACTGAATTC--TGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTATATCATTGTGCTTTGCATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAACCTACACAGATTTCAGATGTGTAGAAAACAGCTCTTGTTTTCCTTCTGGGTAATCTTTTTCATGTCACCACTCTTGTCAGCATCTGCATTGGGCAAATTTCCTAGGACCTCCCTTCTGCTTCTTTTAAAATATGAAAACAAAATCGATGTAGCACAGCAAGCCAGAGAAAGTCTGCTTTGATTGACTCACGGCCATAGTCACCCGGCAGTTCCTTCAGATGCGGCTTCCCTGCTCAGCCACTGAGCCCAC-TGCGGTTCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCATTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGGGCTTCAGCTCGAGGAGAACACGGTGGAGATGGAGGAGCCCCTGGGTGTCCTCAGGTTAACTGAAAACATGAGAGGACACAAGCGTGGGACCAAGTCTGTCACTAACCTGTAAAGGACTCTCACCAAGCCGACT-GGCACTCTGCCTGCGTGCCTGCCTTTG i nomLeu3.chr5 C 0 M 928 s macFas5.chr10 36493519 1030 + 96509753 ATTTCTATATTTGTGAAATTACCTGTGATAGAAAATTGAATTGTTTCCAACATTATTATTTTTCATAGTTAATCATGTTATATTGCTACTTTTTAAAAAGTAGCCTGTAAAATATTACCAACCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAGCTATTACACTATTCTT--AAAAAAAAGTAATTTCTTTAATTACCTAATTTCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTATCAAGTTGCGCT-GTTAACTGCTGAGAATCATAGTCTGCATATGAGATAAATCATCTGTCAGTCCTTTAAAGAAGACTTTATGAGCCATAGAGATAGTAGTCCAATCTGTATCACTGACTTTAAATAGTGGATAATTGACACTCCATGTTGCCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATCTT-ATATGTGCCTCTTGGAGCGCCATTTTCCTTATAATCCTTAGAGGAATTCA----GATTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGTCAGAATTATATCATTGTGCTTTGAATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAGCCTACACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGCTCTTGTTTTCCTTCCGGGTAATCTTTTTCATGTCATCACACTTGTCAGCATCTGCATTGGGCACATTTCCTAGGACCTCCCTTCTTCC-----------ACCAAAACAAAATCGATATAGCGCAGCAAGCCAGGGAAAGTCTACTTTGATTGACTTATGGCGGTAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCCCAGGTCAGCAACTGAGCCCAGGCGCTGTCCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCCTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGTGCTTCAGCCCGAGGAGAACAGGGTGGAGATAGAGGAGCCCCTGAGGGACCTCAGGTTAACTGAAAACATGAGAGGACACAAGCGTGGGACCAAGTCTCTCACTAAACCATAAAGAACTCTCACCAAGCCGACTGGACACTCAGTCTGCGCGCCTGCCTTTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32565255 1024 - 90941950 ATTTCTATATTTGTGAAATTACCTGTGATAGAAaattgaaatgtttccaacattattatttttca----taatcatGTTAtattgctactttttaaaaagtagcctgTAAAATATTACCAACCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAGCTATTAcactattctt--ttaaaaaagtaatttatttaattaccTAATTTCCTCAAGCAATGTCCTAATTTTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATTGATATTATCAAGTTGCGCT-GTTAACTGCGGAGAATCATCGTGTGCATATGAGATAAATCATCTGTCAGTTCTTTAAAGAAGACTTTATGAGCCATAGAGATAGTAGTCCAATCTGTATCACTGACTTTAAATAGTGAATAATTGACACTCCAGGTTGCCTGTAAGCCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATCTT-ATATGTGCCTCTTGGAGCGCCATTTTCCTTATAATCCTTAGAGGAATTCA----GATTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTATATCATTGTGCTTTGAATCTAGTTTCACTTTTCCAAAAGCCTACACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGCTCTTGTTTTCCTTCCGGGTAATCTTTTTCATGTCATCACTCTTGTCAGCATCTGCATTGGGCACATTTCCTAGGACCGCCCTTCTTCC-----------ACGAAAACAAAATCGATATAGCGCAGCAAGCCAGGGAAAGTCTACTTTGATTGACTTATGGCCGTAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCCCAGGTCAGCCACTGAGCCCAGGCGCTGTCCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCCTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGTGCTTCAGCCCGAGGAGAACA-GGTGGAGATAGAGGAGCCTCTGGGGGACCTCA-GTTAACTGAAAACATGAGAGGACACAAGCGTGGGACCAAGTCTCTCACTAAACCATAAAGAACTCTCACCAAGCCGACTGGACACTCTGTCTGCGCGCCTGCCTTTG i papAnu2.chr10 I 457 C 0 s chlSab2.chr2 37906197 1022 - 90373283 ATTTCTATATTTGTGAAATTACCTGTGATAGAAAATTGAATTGTTTCCAACATTA----TTTTCATAGTTAATCATGTTATATTGCTACTTCTTTAAAAGTAGCCTTTAAAATATTACCAACCTATTTTAAAGTCTACTTGCCAAACTATTAAACTATTCTT--AAAAAGAAGTAA----TTTAATTACCTAATTTCCTCAAGCAATGTCCTAATTGTCTCAAGCAATTATCTGATTTTCTCAAGCAATGGATATTATCAAGTTGCACT-GTTAACTGCTGAGAATCATCGTCTGCATATGAGATAAATCATCTGTCAGTCCTTTAAAAAAGACTTTATGAACCATAGAGATAGTAGCCCAGTCTGTATCACTGACTTTACATAGTGGATAATTGACACTCCATGTTGCCTATAAGGCTATTTCACAGCAGCTGAGTGATCTT-ACATGTGCCTCTTGGAGCGCCATTTTCCTTATAACCCTTAGATGAATTCAGACTGACTGAGTTCTGTGTCAGTGGAAATTGCCAGAATTGTATCATTGTGCTCTGGGTCTAGTTTTACTTTTCCAAAAGCCTACACAGATTTCAGATGTTTAGAAAATAGC---TGTTTTCCTTCTGGGTAATCATTTTCA------------TGTCAGCATCTGCATTGGGCACATTTCCTAGGACGTCTCTTCTGCCTCTTTTAAAATATGAAAATAAAATCGATATAGCACAGCAAGCCAGGGAAAGTCTACTTTGATTGACTTATGGCCTTAGTCACCCAGCAGTTCCTTCAGATGTGGCTTCTCAGGTCAGCCACTGAGCCCAGGCGCTGTCCTCCTGCCTGCAGAAGTGGCTCTGTGAGCCCTTTGAGGAGAAAATGGGGGACTTTGTGCTTCAGCCCGAGGAGAAGAGGGTGGAGATAGAGGAGCCCCTGGGCGACCTCAGGTTAACTGAAAACATGAGAGGACACAAGCGTGGGACCAAGTCTCTCACTAAACCATAAGGAACTCTCACGAAGCCGACTGGACACTCTGTCTGCGTGCCTGCCTTTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=202740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 140608 166 + 478999 CCACCACTGTGTGCAGGAATGCCTGGGGCATGACTGGGCCATCCCAGTGTTCTTATTTCTATACATTCCGAGGTTACCCCTCAGCAAAACGCCAGAGGCTGGCAGACACAGCGGAGCATCCTGCAGTAGGGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAAGGACCACTTGA s panTro4.chr18 74622205 166 - 76611499 CCACCACTGTGTGCGGGAAGGCCTGGGGCACGACTGGGCCATCCCAGTGTTCTTATGTCTATACATTCCGAGGTTACCCCTCAGCAAAACGCCAGAGGCTGGCAGACACAGCGGAGCATCCTGCAGTAGGGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAAGGACCATTTGA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18571364 166 + 99152023 CCACCACCGTGTGCGGGAATGCCTGGGGCACGACTGGGCCATCCCAGGGTTCTTATTTCTATACATTCCGATGTTACCCCTCAGCAAAACGCCAGAGGCTGGCAGACACAGTGGAGCATCCTGCAGTAGGGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAAGGGCCACTTGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36494549 166 + 96509753 CCATGACCATGTGCAGAAATTCCTGAGGCACGACTGGGTCACCCCAGTGTTCTTATTTCTAGTCATTCCGAGGTTACTCCGCAGCAAAACAACAGAGGCTTGCGGACACAGTGGAGCATCCTGCAGTAGGGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAACGGCCATTTGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32566279 166 - 90941950 CCGTGACCATGTGCAGAAATGCCTGGGGCACGACTGGGTCACCCCAGTGTTCTTATTTCTAGTCATTCCGAGGTTACTCCGCAGCAAAACAACAGAGGCTGGCGGACACAGTGGAGCATCCTGCAGTAGGGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAAGGGCCATTTGA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37907219 166 - 90373283 CCGTGACCATGTGCAGAAATGCCTGGGGCACGACTGGGTCACCCCAGCGTTCTTATTTCTAGTCATTCCGAGGCTACTCCGCAGCAAAACAACAGAGGCTGGCAGACACAGTCGAGCATCCTGCAGTAGAGATCCGAAGCCGTGGAATCTCCAAAGGGCCATTTGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M e nomLeu3.chr5 77030392 928 - 143122389 M a score=110508.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 140774 65 + 478999 CCGCGTCCCAGAAGCTCCAGCTCAGGCTGGACATTGCCCAGAAAGCCCACATCGTCTTTGGCAAG s panTro4.chr18 74622371 65 - 76611499 CCGCATCCCAGAATCTCCAGCTCAGGCCGGACATCGCCCAGAAAGCCCACATCGTCTTTGGCAAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18571530 65 + 99152023 CCGCGTCGCAGAAGCTCCAGCTCAGGCTGAACATTGCCCAGAAAGCCCAGATCGTCTTTGGCAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77031320 65 - 143122389 CCGCGTCCCAGAAGCTCCAGCTCATGCTGGAAATTGCCCAGAAAGCCCAGATCGTCTGTGGCAAG i nomLeu3.chr5 M 928 C 0 s macFas5.chr10 36494715 65 + 96509753 CCGCCTTCCAGAAGCTCCAGCTCATGCTGGACGTCGCCCAGAAAGCCCAGACCGTCTTTGGCAAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32566445 65 - 90941950 CCGCCTTCCAGAAGCTCCAGCTCATGCTGGACATTGCCCAGAAAGCCCAGAACGTCTTTGGCAAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37907385 65 - 90373283 CCGCCTTCCAGAAGCTCCAGCTCATGCTGGACGTCGCCCAGAAAGCCCAGACCGTCTTTGGCAAG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=9950.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 140839 8 + 478999 ACCTCCCG s panTro4.chr18 74622436 8 - 76611499 ACCTCCCG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18571595 8 + 99152023 ACCTCCCG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77031385 8 - 143122389 ACCTCCTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32566510 8 - 90941950 ACCTGCCG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37907450 8 - 90373283 ACCTCCCG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e macFas5.chr10 36494780 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=260937.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 140847 497 + 478999 Gattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgaacattttttcatgtgtctgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatccttcgcccactttttgatgggattgtttgatttttt-ctggtacatttgtttaagttctttgtagattctggatattagccctttgtcagatgggtagattgcaaaatttttctgccattctgtaagttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaaggtctttagtttagttagatcccatttgtcaatttt-ggcttttgttgccattgtttttggtgatttagacatgaagtccttgcccatgcctatgttctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatttaagtctttaatccatcttgaaAAGTtaataataataaaaataataatatggaagaaatttaaaaaaa s panTro4.chr18 74622444 498 - 76611499 Gattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgaacattttttcatgtgtctgttggctgcataaatgtcttcttctaagaagtgtctgttcatatccttcccccactttttgatgggattgtttgatttttttcttgtatatttgtttaagttctttgtagattctggatattagccctttgtcagatgggtagattgcaaaatttttctcccattctgtaagttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttagttaggtcccatttgtcaatttt-ggcttttgttgccattgcttttggtgatttagacatgaagtccttgcctatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacacttaagtctttaatccatcttgaaAAGttaataataataaaaataataatatGGAAGAAATTAAAAAAAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18571603 497 + 99152023 Gattgtggttttgatttacatttctctgatggccagtgatgatgaacattttttcatgtgtctgttggctgcataaatgacttcttttgagaagtgtctgttcatatccttcgcccactttttaatgggattgtttgatttttt-cttgtacatttgtttaagttctttgaagattctggatattagccctttgtcagatgggtagattgcaaaatttttctcccattctgtaagttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttagttagatcccatttgtcagtttt-ggcttttgttgccattgcttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatttaagtctttaatccgtcttgaaAAGTTAATAATAATACAAATAATAATATGGAAGAAATTAAAAAAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77031393 498 - 143122389 Gattgtgattttgatttgcatttctctgatggccagtgataatgaacattttttcatgtgtctgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatccttcgcccactttttaatgggattgtttgatttttt-cttgtacatttgtttaagttctttgtagattctggatattagcgctttgtcagatgggtagattgcaaaaattttctcccattctgtaagttgcctgttcactctcatggtaatttcttttgctctgcagaagctctttagtttaattatatcccatttgtcagttttgggcttttgttgccattgcttttggtgatttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatttaagtctttaatccatcttgaaAAGTtaataataataaaaataataataTGGAAGAAATCAAAAAAAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37907458 0 - 90373283 C e papAnu2.chr10 32566518 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36494780 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=5601.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 141344 8 + 478999 aCCTCCCA s panTro4.chr18 74622942 8 - 76611499 ACCTCCTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18572100 8 + 99152023 ACCTCCCG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77031891 8 - 143122389 ACCTCCCG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36494780 8 + 96509753 ACCTGCCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37907458 0 - 90373283 C e papAnu2.chr10 32566518 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=72651.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 141352 47 + 478999 GAGACCAGGAACTTGG----GGCGCGCGGCCTGAGATCACCCCAAGCTCTG- s panTro4.chr18 74622950 51 - 76611499 GAGACCAGGAACTTGGTCGGGGCGCGCGGCCTGAGATCACCCCAAGCTCTG- i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18572108 51 + 99152023 GAGACCAGGAACTTGGTCGGGGTGCGCGGCCTGAGATCACCCCAAGATCTG- i ponAbe2.chr15 C 0 I 580 s nomLeu3.chr5 77031899 51 - 143122389 GAGACCAGGAACTTGGTCTGGGCGCGAGGCCTGAGATCACCCCTATGTCTG- i nomLeu3.chr5 C 0 I 1 s macFas5.chr10 36494788 51 + 96509753 GAGACCAGGAACTCGGTCAGGGCGCGCGGCCTGAGATCACATC-AGTTCTGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32566518 51 - 90941950 GAGACCAGGAACTCGGTCAGGGCGCGCGGCCTGAGATCACATC-AGCTCTGG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37907458 51 - 90373283 GAGACCAGGAACTCGGTCAGGGCGCGCGGCCTGAGATCACATC-AGCTCTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=1677991.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 141399 1072 + 478999 GGTGCCTTCCTGTCCTTCTGCTTCTTCCTTGGCCGCTTTAGGGGGCGCGCCTTGCCATGCGTCTCCCTGCGGGCGGCGCGGTGGTGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGCGCTTTTGAGACTGCGACCGGCACTGGGCACCAGGCACCTGCGGATTGGCCTCCCCACGCCGGGTTCAGGGACctccagcgctccgcggtgcaggctgcaggcgacctcaacgtggagctgctgccagcgccacaggccccagGGGAGGCCCAGGATGCTGCTTCCCCGCCCCAAGAAGGGCAGTTTGGAGGAAAGTCTTTGGCCTGATGGAAGGCGGCGCCCATCGGGGGCGGGGCTGAGAACTAGGCCGGCGCCGCTGCCTGGTAAGCGGGGACCAAGAGGCCCACGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTCCAAATCCCGGACGTCCAGGAGGAACAACGGCGTCAAGCTGGCTGACACCAGGAACACCCAGAAGTCCCCGCTCCTGTCTGTCCTTCCGCACTCAGGAGCGGGGATGGCCACAGGGACACCATCTGCCCACAAACCGCTGGCGTTTGCTGCCATGGTGCGCGGAGAT---------------GCGGTCCCCGAGGAGGCCACTTTCGGCCAGGACGCCGGGATCGTATCAGCGGCAGCATCCCGCGCTGACACTCAGTATTGACTTTCCCCGGACATTGCTGGATTTTTTCCTTTTTAAAACAATTTTGCAGTGGGAGAACAAAAAAGGGCATCCTCAGAGCTTTTAC-AAAATTCTCCTGGACCTGTTGTTCTATGGTGTTCACCTCTGCGTTTTACGCACCACTAATGGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAAG--------GCCCCACCCAGCGCTTTAGACACCCCTGAGGGACACTCGCGGCTCAGGAGGATAAATGTTCTCAGGGGCCTGCTGTGAGGAGGACATGCAG--------CCCCTCAGCCAC-CACATCTTCCTCCATTCCAGCCTGGAAAGAGAGACCTTGCCCTCCACCTTACAGGCCTTCCTGACCTTGGGACC--CACTCTAGAGGCCACGCGCATTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATGG s panTro4.chr18 74623001 1043 - 76611499 GGTGCCTTCCTATCCTTCTGCTTCTTCCTTGGCCGCTTTAGGGGGCACGCCTCGCTGTGGGTCTCCCTGCGGGTGGTGCAGTGGTGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGCGCTTTTGAGACTGCGGCAGGCACCGGGCACCAGGCACCTGCGGATTGGCCTCCCCAGACCGGGCTCAGGGACCTCCAGTGCTCCGCGGTGCGGGCTGCAGGCGACCTCAACGTGGAGCTGCTGCCAGTGCCACAGGCCCCAGGGGAGGCCCAGGATGCTGCTTCCCCGCCCCAAGAAGGGCAGTTTGGAGGAAAGTCTTTGGCCTGATGGAAGGCGGCGCCCATCGGGGGTGGGGCTGAGAACTAGGCTGGCGCCGCTGCCTGGTAAGCGGGCACCAAGAGGCCCACGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTCCAAATCCCGGATTTCCAGGAGGAACAACGGCGTCAAGCTGGCTGACACCAGGAACACCCAGAAGTCCCCGCTCCTGCCTGTCCTTCCGCACTCAGGAGCGGGGATGGCCACAGGGACACCATCAGCCCACAAACCGCTGGCGTTTGCTGCCATGGTGCGCGGAGATATGGTGCGCGGAGATGCGGTCCCCGAGGAGGCCACTTTCGGCCAGGACGCCGGGATCGTATCAGCGGCAGCATCCCGCGCTGACACTCAGTATTGACTTTCCCCGGACATTGCTGGATTTTTTGCTTTTTAAAACAATTTTGCAGTGGGAGAACAAAAAAGGGCATCCTCAGGGCTTTTGC-AAAATTCTCCTGGACCTGTGGTTCTGTGGTGTTCACCTCTGCGTTTTACGGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAGG--------GCCTAACCCAGCGCTTTAGACACCCCTGAGGGACATTCGCGGCTCAGGAGGATAAAGGTCCTCAGGGGCCTGCCGCGAGGAGGACATGCAG--------CCCCTCGGCCAC-CACATCTTCCTCCATTCCAGCCT--------------------------------------------TGGGACC--CACTCTAGAGGCCACGCGCATTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18572739 1042 + 99152023 GGTGCCTTCCTGTCCTTCTGCTTCTTCCTTAGCCGCTTTAGGGGGTGCGCCTCGCCGTGGGTCTCCCTGCGGGCGGCGCAGTGGTGCTCCTGGATGTCATCTCCAGGCGCTTTTGAGACTGCCGCCGGCACCGGGTGCCAGGTACCTGCGGATTGGCCTCCCCACGCCGGGCTCAGGGACCTCCAGCGCTCCGCGGTGCGGGCTGCAGGCGACCTCAACGTGGAGCTGCTGCCAGCGCCACAGGCCCCAGGGGAGGCCCAGGATGCTGCTTCCCGGCCCCAAGAAGGGCAGCTT--CGGAAAGTCTTT---------------GGCGCCCATCGGGGGCGGGGCTGAGAACTAGGCTGGCGCCGCTGCCTGGTAAGCGGGGACCAAGAGGCCCACGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTCCAAATCCCGGACTTCAAGGAGGAGCAACAGCGTCAAGCTGGCTGACA----------CCAGAAGTCCCCGCTCCTGTCTGTCCTTCCGCACTCAGGAGCGGGGATGGCCGCAGGGACGCCATCCGCCCACAAATCGCTGCCGTTTGCTGCCATGGTGCGCGGAGAT---------------GCGGTCCCC---GAGGCCACTTTCGGCCAGGACGCCGGGATCGTATCATCCGCAGTATCCAGCGCTGACACTCAGTATTGACTTTCCCCGGACATTGCTGGATTTTTTGCTTTTTAAAACAATTTTGCAGTGGGAGAACAAAAAATGGCATCCTCAGAGCTTTTGC-AAAATTCTCCTGGACCTGTGGTCCTACGGTGTTCACCTCTGCGTTTTACTGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAGG--------GCCCCACCCGGCGCTTTAGACACTCCTGAGGGACATTCGCGGCTCAGGAGGATAAAGGTCCTCAGGCGCCTGCTGCGAGGAGGACATGCAG--------CCCCTCGGCCAC-TGCATCTTCCTCCATTCCAGCCTGGAAAGAGAGACTTTGTCCTCCACCCTACAGGCCTTCATGACCTTGGGACC--CACTCTAGAGGCCACGCGCATTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATGG i ponAbe2.chr15 I 580 C 0 s nomLeu3.chr5 77031951 1065 - 143122389 GACGCCTTCCTGTCCCTCTGCTTCTTCCTTGGCCGCTTTAGGGGGAGCGCCTCACCGTGGGTCTCCCTGCAGGCGGCGTGGTGGTGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGCGCTTTTGAGACTGTGGCCGGCACCGGGCGCCCAGCACCTGCGGATTGGCCTCCCCACGCCGGGCTCAGGGACCTCCAGCGCTCCGCCGTGCTGGCTGCAGGCGACCTCAACGTCGAGCTGCTGCCAGCGCCACAGGCCCCAGGGGAGGCCCAGGATGCTGCTTCCCGGCCCCAAGAAGGGCAGTTTGGAGGAAAGTCTTTGGCCTGATGGAAGGCGGCGCCCATTGGGGGCGGGGCTGAGAACTAGGCTGGCGCCGCTGCCTGTTAAGTCCGGACCAAAAGGCCCACGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTCCAAATCCCGGACTTCAAGGAGGAACAACGGCGTCAAGCTGGCTGACACCAGGAACACCCAGAAGTACCCGCTCCTGTCTGTCCTTCCGCACTCAGGAGCAGGGATGGCCGCAGGGACACCATCCGCCCACAAACCGCTGGCGTTTGCTGCCATGGTGCGCGGAGAT---------------GCGGTCCCT---GAGGCCACTTTTGGCCAGGACGCCGGGATCCTATCAGCGGCAGCATCCCGCGCTGACACTCAGTATTGACTTTCCCAGGACATTGCTAGATTTTTTCCTTTTTAAAACAATTTTGCAGTGGGAGAGCAAAAAAGGGCATCCTCAGAGCTTTTGC-AAAATTCTCCTGGACCT---GTTCTATGGTGTTCGCCTCTGCGTTTTACTGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAGG--------GCCCCACCCAGCGCTTTAGACACCCCTTAGGGACATTCGCAGCTCAGGAGGATAAAGGTCCTCAGGGGCCTGCTGCGAGGAGGACATGCAG--------CCCCTCGGTCGC-CACGTCTTCCTCCATTCCAGCCTGGAAACAGAGACCTTCCCCTCCACCCCACAGGCCTTCATGACCTTGGGACC--CACTCTAGAGGCCACACGCATTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATG- i nomLeu3.chr5 I 1 C 0 s macFas5.chr10 36494839 1069 + 96509753 GGAGCCTTCCTGGCCTTCTGCTTCTTCCTCGGCCGCCTTAAGGGGCTCGCCTCGCCCTGTGTCTCCCTGCTGGTGGCGCGGTGGCGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGTG-TTTTGAGACTGCGGCAGGCACCCGGGGACCGGCACCTGTGGATTGGACTCCCCACGCTGGGCTCAGGGACCTCCAGCGCCCCGCGCTGTGGACCGAAGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCTGCCAACGC-GCAGGCCCCA-GGGAGGCCCAGGATGCTGCCTCCAGGCCCCAAGAAGTGCAGTTT--CAGAAAGTCTTTGGTCTGATGGAA-------------GGAGGCGGGGCCGAGAAC--GGCTGGCGCTGCTGCCTGGTAAGCCAGGACCAAGAGGCCCAAGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTGCAAATCTGGGACTTCAAGGAGGAGTAAGGGCATCAAGCTGGCGGACACCAGGAACACCCAGAGGTCCCCGGTCTTGTCTGTCCTTCCCCGCTCAGGAGCGAGTATGGCCGCAGGGACGCCATCCGCCCACAAACCGATGGCGTTTGCTGCCATGGTGCACGGAGAT---------------GCGGTCCCC---GAAGCCACTTTCGGCCAGGACACCGGGATCACCTCAGCCACAGCATCCCGCGCTGACGCTCAGTATTGCCTTTCCCCGCACGTTGCTGGATTTTTTCCTTTTTAAAAGAATTTTGCAGTGGGAGAACAAAAAAGAGCATCCTCAGAGCTTTTGCGAAAATTCTCCTGGACCTGTGGTTCTATGGTGTTCACCTCTGCCTTTCACTGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCCATAAGGGTCTCCCTGCCCCACCCGGTGCTTTAGACACCTCTGATGGACCCCCGTGGCTCAGGAGGATAAAAGTCCTCAGGGGCCTGCTGCCGGGAGGACGTGCAGACATGAGGCTCCCCGCTCCCTCCTTCCTGCCTCCATTCCAGACTGGAAAGAGAGACCTGGCCCTCCACCTCACAGGCCCTCATGACCTTGGGACCCACACTTTAGAGGCCATGCGCGTTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32566569 1069 - 90941950 GGAGCCTTCCTGGCCTTCTGCTTCTTCCCCGGCCGCCTTAAGGGGCTCGCCTTGCCCTGTGTCTCCCTGCTGGTGGCGCGGTGGCGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGTG-TTTTGAGACTGCGGCAGGCACCCGGGGACCGGCACCTGTGGATTGGACTCCACACGCTGGGCTCAGGGACCTCCAGCGCGCCGCGCTGCGGGCTGAAGGCGACCTCAAGGTGGAGCTGCTGCCAGCGCTGCAGGCCCAA-GGGAGGCCCAGGATGCTGCCTCCAGGCCCCAAGAAGGGCAGTTT--CAGAAAGTCTTTGGTCTGATGGAA-------------GAAGGCGGGGCTGAGAAC--GGCTGGCGCTGCTGCCTGGTAAGCCAGGACCAAGAGGCCCAAGGCCTCCATCAGGAACCAGGTGCTTCTGCAAATCTGGGATTTCAAGGAGGAGTAAGGGCATCAAGCTGGCGGACACCAGGAACACCCAGAGGTCCTCACTCTTGTCTGTCCTTCCCCGCTCAGGAGCGAGTATGGCCGCAGGGACGCCATCCGCCCACAAACCGATGGCGTTTGCTGCCATGGTGCACGGAGAT---------------GCGGTCCCC---GAGGCCACTTTCGGCCAGGACACCGGGATCACATCAGCCACAGCATCCCGCGCTGACGCTCAGTATTGACTTTCCCCGGACGTTGctggattttttcctttttaaaagaattttgcaGTGGGAGAACAAAAAAGAGCATCCTCAGAGCTTTTGCGAAAATTCTCCTGGACCTGTGGTTCTATGGTGTTCACCTCTGCGTTTCACTGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAGGGTCTCTCTGCCCCACTCGGCGCTTTAGACACCTTTGAGGGACCCCCGTGGCTCAGGAGGATAAAAGTCCTCAGGGGCCTGCTGCCGGGAGGACATGCAGACATGAGACTCCCCGCACCC-CCTTCCTGCCTCCATTCCAGACCGGAAAGAGAGACCTGGCGCTCCACCTCACAGGCCCTCATGACCTTGGGACCCACACTTTAGAGGCCACGTGCGTTTCCACTGCCAAAGCAATGACACAGGAGATGG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37907509 1065 - 90373283 GGAGCCTTCCTGGCCTTCTGCTTCTTCCCCGGCCGCCTTAAGGGGCTCGCCTCGCCCTGAGTCTCCCTGCTGGTGGCGCGGTGGTGCTCCTGGATGTCACCTCCAGGTG-TTTTGAGACTGCCGCGGGCACCC-GGGACCGGCACCTGTGGATTGGACTCCCCACGCTGGGCTCAGGGACCTCCAGCGCGCCGCGCTGCAGGCTGAAGGCGACCTCAACGTGGAGCTGCTGCCAGCGCCGCAGGCCCCA-GGGAGGCCCAGGATGCTGCCTCCAGGCCCCAAGAAGGGCAGTTT--CAGAAAGGCTTTGGTCTGATGGAA-------------GGAGGTGGGGCTGAGAAC--GGCTGGCGCTGCTGCCTGGTAAGCC-GGGCCAAGAGGCCCACAGCCTCCGTCAGGAACCAGGTGCTTCTGCAAATCTGGGACTTCAAGGAGGAGTAAGGGCATCAAGCTGGCGGACACAAGGAACACCCAGAGGTCCCCGGTCTTGTCTGTCCTTCCGCGCTCAGGAGCCAGTATGACCGCAGGGACGCCATCCGCCCACAAACCCATGGTGTTTGCTGCCATGGTGCACGGAGAT---------------GCGGTCCCC---GAGGCCACTGTCGGCCAGGACACCGGGATCCCATCAGCCGAAGCATCCCGCACTGACACTCAGTATTGACCTTCCCCGGACGTTGCTGGATTTTTTCCTTTTTAAAAGAATTTTGCAGTGGGAGAACAAAAAAGAGCACCCTCAGAGCTTTTGCAAAAATTCTCCTGGACCTGTGGTTCTATGGTGTTCACCTCTGCCTTTTACTGACCACTAATTGGCCAGAGCTCCTAAGGCCTATAAGGGTCTCCCTGCCCCACTCCGGGCTTTAGACACCTTTGAGGGACCCCCGCAGCTCAGGAGGATAAAAGTCCTCAGGGGCCTGCTGCCGGGAGGACATGCAGACATGCAGCCCCTCGGCCAC-CGCGCCTTCCTCCATTCCAGACTGGAA--AGAGACCTTGGCCTCCATCCCACAGGCCCTCATGACCTTGGGACCCACACTTTAGAGGCCATGCGGGTTTCCACTGCCAAAGCAATGAAACAGGCGATGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=153572.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 142471 304 + 478999 AAAGAAATTCTTggccaggcgcggtggctcacgcctgtagtcccagcactttgggaggccaaggcgggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctagcaaggtgaaaccccgtctgtattaaaaacacccaaaagg-tggccgggcttggtggcgggctcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcgggagagtggcgtgaacccgggaggcggagcttacagtgagccgagattgcaccactgcagtccagcctgggggacagagcgagactacgcctc-----aggaaaaaaa s panTro4.chr18 74624044 304 - 76611499 AAAGAAATTCTTggccaggcgcggtggctcacacctatagtcccagcactttgggaggccaaggtaggcagatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggctagcaaggtgaaaccccgtctgtactaaaaacactcaaaagg-cggccgggcttggtggcgggctcctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcgggagagtggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcagtccagcctgggggacagagcgagactacgcctc-----agaaaaaaaa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18573781 310 + 99152023 AAAGAAATTCTTggccaggcgcggtggctcacgcctgtagtcccagcactttgggaggccaaggtgggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctagcaaggtgaaaccccgtctctactaaaaacacacaaaaagttagccaggcttggtggccggagcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcgggagagtggcgtgaaccagggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccaccgcactccagcctgggggacagagcgagactacgtctcacaaaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77033016 302 - 143122389 ---GAAATTCTTggccaggcgcggtggctcaagcctgtagtcccagcactttgggaagccaaggcgggcagatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggctagcaaggcgaaaccccgtctctactaaaaacacacaaaaagttggcaaggcttggtggctggtgcctgtagtcccagctactccggaggctgaggcgggagagtggcgtgaacccgggaggtggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcccgggggacagagcgagagtacgtctc-----agaaaaaaaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37908574 0 - 90373283 C e papAnu2.chr10 32567638 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36495908 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=947184.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 142775 680 + 478999 aaaTTATTTTGCCTTCACTATATGCCTAAGTAATTTCTCTATTAGAGCCCAGAGTCATGGGGCCCACACCGCCAGCTGACACATGAAAGTGTGGCAACGATGTGGTGGTGTCTCTGTGTGGCAGCGTGGTGGTGTGTCTGTGTGGTGGTGTGTCCGCATTTCTGTGTGGTGGTGTGTCCGTGTGGCAGAGTGTCTGTGTGGTGCTATGTCCATGTGGTGGTGTGTTCATGTATCTGCATGGTGATGTCTCCGTGTGACAGTGTGTTTGTGTATCCGTGTGACA--GTGTCTGTGTGTCCTTGTTTCCACATGGCAGTGTCTGTGTGGTGGTGTCTGACAGTGTGGAGGTGTGTCCATGTGACAGTGAGGCGGTGTGTGTGT----GTGTGGCAGTGTCCATGTGGCAGTGTGTTTTTGTGTTCGTGTGA--GTGTGATGGTGTGTCCATGTGACAGTGTAGTGATGTCTCT-TGTGT------GTGTCCCTGTGATAGTGTGGTGGTGTGTCCATG------------------------------------TGGTGACGTCTCCGTGTGTCTGTGTGTCCCTGTGATAGTGTGGTGGTGTGTCCGTGTG--GATTTCTCCGTATGTCT-GTGTGTCCGTCCATGTGAATGTGCCAGTGTGT--------CCATGTGACGGTGTCTCCGTGTGGTAATGTC--------------------------------------------------------------------TCCGTGTGTCTGTACATGTGACAGTGTGGTGGTGTGTGCGT s panTro4.chr18 74624348 644 - 76611499 aaaTT---TTGCCTTCACTATATGCCTAAGTAATTTCTCTATTAGAGCCCAGAGTCGTGGGGCCCACACCGCCAGCTGACACATGAAAATGTGGCAACGATGTGGTGgtgtctctgtgtggcagcgtggtggtgtgtctgtgtggtg---------------------------tgtccgtgtggcagagtgtctgtgtggtgctatgtccatgtggtggtgtgttcatgtatctgcatggtgatgtctccgtgtgacagtgtgtttgtgtatccatgtgaca--atgtctgtgtgtccttgtgtCCACATGGCATTGTCTGTGTGGTGGAGTCTGACAGTGTGGAGGTGTGTCCATCTGACAGTGTGGCGGTGTGTCTGT----GTGTGGCAGTGTCCATGTGGCAGTGTGTTT----GTTCGCGTGA--------TGGTGTGTCCATGTGACAGTGTAGTGATGTCTCT-tgtgt--ctgtgtgtccctgtgatagtgtggtggtgtgtccatg------------------------------------tggtgatgtctccgtgtgtctgtgtgtccctgtgatagtgtggtggtgtgtccgtgtg--gatttctccgtatgtct-gtgtgtccgtccatgtgaatgtgccagtgtgt--------ccatgtgacggtgtgtccgtgtgGTAATGTC--------------------------------------------------------------------TCCGTGTGTCTGTACATGTGACAGTGTGGTGGTGTGTCCGT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18574091 568 + 99152023 aaaTTATTTTGCCTTCACTATATGCCTAAGTAATTTCTCTGTTAGAGCCCAGAGTCGTGGGGCCCACACCGCCAGCTGACACATGAAAGTGTGGCAACGATGTGGTGGTGTGTCTGTGTGGCAGTGTGTCCGCATTTCTGTGTGGCA------------------------------------------GTGTCTGTGTGGTGCTATGTCCATGTGGTGGTGTGTTCATGTATCTGCATGGTGATGTCTCCGTGTGACAgtgtgtttgtgtatccgtgtgaca--gtgtctgtgtgtccttgtgtccacatggcagtgtctgtgtggtggtgtctgacagtgtggaggtgtgtccatgtgactgtgtggcggtgtgtctgt----gtgtggcagcgtccatgtggcagtgtgtttgtgtgtttgtgtgagagtgtgATGGTGTGTCCA--------TGTAGTGATGTCCCT-tgtgt--------------------------------------------------------------------------------------------gtctgtgtgtccctgtgatagtgtggtagcgtgtccgtgtggtgatttctccgtatgtct-gtgtgtccatccatgtgaacgtgccagtgtg------------------------tccgtgtggtaatgtc--------------------------------------------------------------------tccgtgtgtctgtacatgtgacagtgtggtggtgtgtccgt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77033318 704 - 143122389 aaaaTTATTTTCCTTCACTATATGCCTAAGTAATTTCTCTATTAGAGCCCAGAGTCGTGGGGCCCACACCGCCAGCTGACACATGAAAGTGTGGCAACGATGTGGTGGTGTCTCTGTGTGGCAGTGTGTCCGCATTTCTGTGTGGTG------------------------GTGTGTCCGTGTGGCAGAGTGTCTGTGTGGTGCTATGTCCATGTGGTGGTGTGTTCATGTATCTGCATGGTGATGTCTCCGT------GTGTGTTTGTGTATCCGTGTGACA--GTGTCTGTGTGTCTTTGTGTCCACATGGGAGTGTCTGTGTGGTGGTATCTGACAGTGTGGAGGTGTGTCCATGTGACAGTGTGCCGGTGTGTCTGT----GTGTGGCAGTGTCCATGTGGCAGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTGAGAGTGTGATGGTGTGTCCATGCGACAGTGTAGTGATGTCTCT-TGTGTGTCTGTGTGTCCTTGTGGTAGTGTGATGGTGTGTCCATGTGGTGATGTCTCTGTGTGTCTGTCCATTTGACAGTTTGGTGATGTCTCCGTGTGTCTGTGTGTCCCTGCGATAGTGTGGTGGTGTGTCCGTGTGGTGATTTCTCCGTATGTCT-GTGTGTCCGTCCATGTGAATGTGCCAGTGTGTCCGTGTGACCGTGTGACGGTGTGTCCGTGTGGTAATGTC--------------------------------------------------------------------TCCGTGTGTCTGTACATGTGACAGTGTGGTGGTGTGTCCGT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36495908 673 + 96509753 AAATTCTTTTGCCTTCACTATCTGCCTAAGTAATTTCTCTATTAGAGCCCAGAGTCATGGGGCCCACACAGCCAGGTGACACATGAAAGTGTGGCAACGATGTGGTGGTGTGTCCATGTGGCAGCGTGGTGGTGTGTCTGTGTGGCAGTGTGTCCGCATTTCTGTGTGGTGGTGTGTCCGTGTGGCAGAGTGTCTGTGTGGTGCTGTGTCCATGTCGTGGTGTGTTCATATATCTGCGTGGTGATGTCTCCGTGTGACAGTGTGTTTATGTATCCGTGTGACAATGTGTCTGTGTGTCCTTGTGTCCATGTGGCAGTGTCTGTGTGGTGGTGTCTGACAGTGTCGAGGTGTGTCCATGTCACAGTGTGGCAGTGTGTCTGTGTGTGTGTGGCAGTGTCCATGTGGCAGTGTGTC----TGTTCGTGTGA--GAGTGATGGTGTGTCCCTGTGACAGTGTGGTGATGTCTCTGTGTGT--CTGTGTGTCCCTGTGGTA-TGTGGTCGTGTGTCCTTA------------------------------------TGGTGATGTCTCCGTGTGTC--TGTGTCCGTGTGACAGTGTGGTGCTGTGCCCGTGTGGTGACTTCTCCGTGCACATGGTCTGTCCGTCCATGTGA------CAGTGTGG----------------CAGTGTGTCCGTGTCGTAATGTC--------------------------------------------------------------------TCCGTGTGTCTGTACATGTGACAGTGTGGTGGTGTGTCTGT i macFas5.chr10 C 0 I 104 s papAnu2.chr10 32567638 668 - 90941950 AAATTCTTTTGCcttcactatctgcctaagtaatttctctATTAGAGCCCAGAGTCGTGGGGCCCACACAGCCAGGTGACACACGAAAgtgtggcaacgatgtggtggtgtgaccttgtggcagcgtggtggtgtgtctgtgtggcagtgtgtccgcatttctgtgtggtggtgtgtccgtgtggcagagtgtctgtgtggtgctgtgtccatgtcgtggtgtgttcatatatctgtgtggtgatgtctccgtgtgacagtgtgtttatgtatccgtgtgacaatgtgtctgtgtgtccttgtgtccatgtggcagtgtctgtgtggtggtgtctgacagtgcggaggtgtgtccatgtcacagtgtggcagtgtgtctgtgtgcgtgtggcagtgtccatgtggcagtgtgtc----tgttcgtgtga--gagtgatggtgtgtccctgtgacagtgtggtgatgtctctgtgtgt--ctgtgtgtccctgtggta-tgtggtcgtgtgtcctta------------------------------------tggtgatgtctccatgtgtc--tgtgtccgtgtgacagtgtggttctgtgcccgtgtggtgacttctccgtgt-----gtctgtctgtccatgtga------cagtgtgg----------------cagtgtgtccgtgtcgtaatgtc--------------------------------------------------------------------tccgtgtgtctgtacatgtgacagtgtggtggtgtgtctgt i papAnu2.chr10 C 0 I 104 s chlSab2.chr2 37908574 730 - 90373283 AAATTCTTTTGGCTTCACTATCTGCCTAAGTAATTTCTCTATTAGAGCCCACAGTGGTGGGGCCCACACTGCCAGCTGACACATGAAAGTGTGGCAACAATGTGGTGGTGTGACCTTGTGGCAGCCTGGTGGTGTGTCTGTGT-GCAGTGTGTCTGCATTTC------------TGTCCATGTGGCAGAGTGTCTGTGTGGTGCTGTGTCCATGTCGTGGTGTGTTCATATATCTGCGTGGTGATGTCTCCGTGTGACAGTGTGTTTGTGTATCCCTGTGACAATGTGTCTGTGTGTCCTTGTGTCCATGTGGCAGTGTCTGTGTGGTGGTGTCTGACAGTGCGGAGGTGTGTCCATGTCACAGTGTGGCGGTGTGTCTGTGT--GTGTGGCCGTGTCCATGTGGCAGTGTGTCTTTGTGTTTCTGTGA--GAGTGATAGTGTGTCCTTGTGACAGTGTGGTGATGTCTCTGTGTGT--CTGTGTGTCCCTGTGGTAGTGTGGTCGTGTGTCCTTA------------------------------------TGGTGATGTCTCCATGTGTC--TGTGTCCGTGTGACAGTGTGGTACTGTGCCCGTGTGGTGACTTCTCCGTATGTCT-GTCTGTCCGTCCATGTGA------CAGTGTGG----------------CAGTGTGTCCGTGTCGTAATGTCTCCGTGTGTCTGTACATGTGACAGTGTGGTGGTGTGTCTGTGTGTCCGTATGGTGATATCTCCATGTGTCTGTGTGTCTGTCCATGTGGCCATGTGGCGGTGTGCCCGT i chlSab2.chr2 C 0 I 32 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=2037058.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 143455 1249 + 478999 GTAACAATGTGGCGGTGTTCCCTTCCCGGCTTGCGGAGCTGGCGTCTTTCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGGAGACCCCCAGCTTGGAGGGCAGGAGGTGGCTTCTGTGGAGGGAGGCGCAGGGAGCCCCAACAGCCGAGTTT-TGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGGAGAAAGGTGCCCGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCACTCCGGGCCTGCATTT--TGGGGCGAGCACTCCAGCTCGGTCATCTTGTCCTAAGTCCTTTGTGTGCCGTGGAGATTGCTGAGTTTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTCGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATGGCTGGCGAAACATCAAACATTGGGCACCTTCTGCCAAGAAAACTCCCGGAAGAAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAACCAGAGGAGTCACACACAGATTTCTGTTTGGTTGGAGATCGGCCGTTTTTCCCTGTGGGTGGGGGAAGCGCAGCAGCTCTGCAGCGGGAAGGAAGGGGGGTTCTGTGTGGCCAGGAAGGTCCTGGCCCGGGGCGGAGGGGCCAGAGGTGATGTGCGGCGAAAGGCTGTGCAGGGCAGCGGGCAGTGTGCATCGCCCCTACTGCCGGGCGCCCAGGAGGAGGACAGGTCCCGGCCTGGCAGGAGCAGAGGCGACGGGGCTGGAGTCCCCGCACCAGGCTTGAGGGCCGGCGGAGCCGCAGGCTGTGGCGGAGGGGGACTCCCGGGCACCTGGTGGGTGTCCCCATGACCAGGATGCACACCGGGCTCCGGAGGCCAGGCGGACCAAGCTAGGGGTGCCAGGGGAGGCTCGAGGTTCCCTCGGTGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTCTCCTGCTGCTGTCCC-----------CCCTTCGCTCAGGGGCGCCCCGCCAGGGTCGCCTATCTGGGACCTCAGCGCAGCTCCTAGTGGGCGGGAGGCTGAGGCAGAGGCCTCCGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCCACCACTCGTGATG----CAGGGCGAGCTCAAGCTGTGCCACCCAGGCAGGAAACCCTCCGACCTTGCCAGCTTTGGCGCCAGCCTTGGTGACTCTCTCCAGCTCAGCTTCAACACCTTTCAACAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTCTGTATTTCCTATCCTTTATCAAATAGGAATTTAAATATGCATATGGAGTGAT s panTro4.chr18 74624992 1261 - 76611499 GTAACAATGTGGCGGTGTTCCCTTCCCGGCTTGCGGAGCTGGCGTCTTTCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGGAGACCCCCAGCTTGGAGTGCAGAAGATGGCTTCTGTGGAGGGAGGAGCAGGGAGCCCCAACAGCCGAGTTTGTGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGGAGAAAGGCGCCCGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCACTCCGGGCCTGCATTT--TGGGGTGAGCACTCCAGCTTGGTCATCTTGTCCTAAGTCCTTTGTGTGCCGTGGAGATTGCTGAGTTTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTCGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATCGCTGGTGAAACATCAAACATTGGGCACATTCTGCCAAGAAAACTCCCGGAAGAAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAACCAGAGAAGTCACACACAGATTTCTGTTTGGTTGGAGATCGGCCGTTTTTCCCTGTGGGTGGGGGAAGCGGAGCAGCTCTGCAGCGGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGTGGCCAGGAAGGTCCTGGCCCGGGGCGGAGGGGCGAGAGGGGATGTGTGGCGAAAGGCTGTGCAGGGCAGCGGGCAGTGTGCATCGCCCCTACTGCCGGGGGCCCAGGAGGAGGACAGGTCCCGGCCTGGCGGGAGCAGAGGCGGCGGGGCTGGAGTCCCCACACCGGGCTTGAGGGCCGGCGGAGCCGCAGGCTGTGGCCGAGGGGGACTCCCGGGCAGCTGGTGGGCGCCCCCATGACCAGGATACACACCGGGCTCCGGAGGCCAGGCGGACCAAGCTAGGGGTGCCAGGGGAGGCTCGAGGTTCCCGCGGTGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTCTCCTGCTGCTGTCCCACACATGGGCCGCCTTCGCTCAGGGGCGCCCCGCCAGGGTCGCCTATCTGGGACCTCAGCGCAGCTTCTAGCGGGTGGGAGGCTGAGGCAGAGACCTCGGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCCACCACTCGTGACA----CAGGGCAAGCTCAAGCTGTGCCGCCCAGGCAGGAAACCCTCCGACCTTGCCAGTTTTGGCGCCAGCCTTCGTGACTCTCTCCAGCTCAGCTTCAACACCTTTCAACAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTCTGTATTTCCTATCCTTTATCAAATAGGAATTTAAATATGCATATGGAGTGAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18574659 1279 + 99152023 gtAACAATGTCGCGGTGTTCCCTCCCCGGCTTGCGGAGCTGGCGTCTTTCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGGAGA-CCCCAGCTTGGCGGGCAGGAGGCGGCTTCTGTGGAGGGAGGCGCAGGGAGCCCCAACAGCCGAGTTTGTGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGGAGAAAGGCGCCGGGGCAGCCAGGACAAGCCTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGATCGACTCTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGATCGACTCCGGGCCTGCATTT--TGGGGCGAGCACTCCAGCTCGG---TCTTGTCCTAAGTCCTTTGTGTGCCGTGGAGATTGCTGAGTTTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTCGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATGGCTGGTGAAACATCAAACATCGGGCACCTTCTGCCAAGAAAACTCCCGGAAGAAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAACCAGAGGAGTCACACACAGATTTCTGTTTGGTTGGAGATGCGCCGTTTTTGCCTGTGGGTGGCGGAAGCGGAGCAGCTCTGCAGCTGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGCGGCCAGGAAAATCCTGGCCCGGGGCGGAGGGGCGAGAGGTGATGTGCGGTGAAAGGCTGTGCAGGGCAGCGGGCAGTGTGCATCGCCTCTACTGCGGGGCGCCCAGGAGGAGGACAGGTCCGGGCCTGGCGGGAGCAGAGGCGGCGGGGCTGGAGTCCCCGCACCAGGCGTGAGGGCAGGCGGAGCCGCAGGCTGTGGCCGAGGGGGACTCCCGGGCACCTGGTGGGCGTCCCCATGACCAGGATGCACACCGGGCTCCGGAGGCCAGGGGGACCAAGCGAGGGGTGCCAGGGGAGGCTCGAGGTTCCCGCGGCGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTCTCCTGCTGCTGTCCCGCACATGGGCCGCCTTCGCTCAGGGGCACCCCGCCAGGGTCGCCTATCTGGGACCTCAGCGCAGCTCCTAGCGGGCGGGAGGCTGAGGCAGAGACCTCGGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCCACCAGTCGTGACG----CAGGGCGAGCTCAAGCTGTGCCGCCCAGGCAGGAAACCCTCCGACCTTGCCAGCTTTGGCGCCAGCCTTGGTGACTCTCTCCAGCTCAGCTTCAACACCTTTCAACAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTCTGTATTTCCTATCCTT-------TAAGGATTTAAATATGCATATGTAGTGAT i ponAbe2.chr15 C 0 I 38 s nomLeu3.chr5 77034022 1239 - 143122389 GTAACAATGTGGCGGTGTTCCCTCCCTGGCTTGCGGAGCTGGCGTCTTTCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGGAGG-CCCAAGCTTGCCGAGCAGGAGGCAGCTTCTGTGGAGGGAGGCGCAGGGAGCCCTAACAGCCAAGTTTGTGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGAAGAAAGGTGCCGGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCACTCCAGGCCTGCATTT--TGGGGCGAGCACTCCAGCTCGGTCATCTTGTCCTAAGTCCTTTGCATGCCATGGAGATTGCTGAGTTTTGAATAAGGGAAGGTCATCTTTGTCGCGGAAAGC-------------------CTGTCACTTTTCAGCCTCATCGCTGGTGACACATCAAACATCCGGCACCTTCTGCCAAGAAAACTCCCGGAAGAAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAAACAGAGTCGTCACACACAGATTTCTGTTTGGTTGGAGATCTGCCGTTTTTCCCTGTGGGTGGGGGAAGCGGAGCAGCTCTGCAGCGGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGCGGCCAGGAAGGTCCTGGCCCGGGGCGGAGGGGCGAGAGGTGATGTGCAGAGAAAGGCTGTGCAGGGCAGCGGGCAGTGTGCATCGCCCCTACTGCCGGGCGCCCAGGAGGAGGACAGGTCCGGGCCTGGCGGGAGCAGAGGCGGCGGGGCTGGAATCCCCGCACCAGGAGTGAGGGCCGGCAGAGCCGCAGGCTGTGGCCGAGGGGGACTCCCGGGCACCTGGTGGGCGTCCCCATGACCAGGATGCACACCGGGCTCCGGAGGCCAGGCGGACCAAGCTAGGGGTGCCAGGGGAGGCTCGAGGTTCCCGCGGCGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTCTCCTGCTGCTGTCCCGCACATGGGCCGCCTTCGCTCAGGGGCGTCCCGCCAGGGTCGCCTATCTGGGACCTCAGCGCAGCTCCCGGCGGGCGGGAGGCTGAGGCAGAAACCTCGGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCCACCACTCCTGACG----CAGGGCGATCTCAAGTTGTGCCGCCCAGGCAGGAAACCCTCCGACCTTGCCAGCTTTAGCGCCAGCCTTGGTGA--CTCTCCAGCTCAGCTTCAACACCTTTCAACAGTTTTGTGTTCTCTTTTATCAAAATAATTCTTTCTGTATTTGCTGTCCTTTATCAAATAAGAATTTGAATATGCATATGGAGTGAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36496685 1257 + 96509753 GTAACAGTGTAGCGGTGTTCCTTCCTCAGCGTGCAGAGCTGGCACCTTGCCCTCTCAGCCCAGGATGCCCCAGAAGG-CCCCAGCTTGGCGGGCAGGAGGTGGTTCCTGTGGAGGGAGGTGCAGGGAGCCCCTACAACTGAGTTTGTGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGGAGAAAAGCACCCGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCGCTCTGGGCCTGCATTTCCTGGGCCGACTACTCCAGCTCAGTCATCTTGTCCTGAGTCCTTTGTGGAACTTGGAGATTGCTGAGATTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTTGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATCGCTGGTGAAACATCAAATGTCGGACACCTTCTGCCAAGAAAACTCCTGGAAGTAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAACCAGAGGAGTCACACGCGGATTTCTGTTTGTTTGGAGATCTG-AGTTTTTCCCTGTGGGTGGCGGAAGCGGAGCAGCTCTGCGGCGGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGCTA-CAGGAAGGTCCTGGCCTGGGGCGGAGGCGCCAGAGGGGATGGGCGGTCAGGGGCTGTGCAGGCCACCGGGCAGTGTGCATTCCCCCGGCT---GGTCGCCCAGGAGGAGGACAGGTCCCGGCCTGGCGGGATCAGAGGCAGCGAGGCTGCGGTCCGCGAACCAGGCGTGATGGCTGGCAGAGCC-TAGGCCATGGTGGAGGGGGACTCCCGGGCACCTGCTGTGCATCCTCATGACCAGGACACACGCCGGCCTCTGGAGGCCAGGCAGACCAAGCGAGGGGCGCCAGGCAAGGCTTGGGGTTCCCGCAGCGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTGTCCTGCTGCTGTCCGGAACATGGGCCGCCTTCCCTCAGGCGCGCCCCTCCAGTGTCGCCTATCTGTGACCTCAGCACAGCTCCTGGCAGGCGGGAGGCTGGGGCGGAGGCCTCAGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCTGCCACTGGTGGAGGCACTAGGGCGAGCTCAAGCTATG---CCCAGGCAGGAAACTCTCCGACCTTGCCAGCTTCCGCGCCAGCTTTGGTGACTCTCTCCAGTTCAACTTCAACACCTTTCAACAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTATGTATTTGCTATCCTTTATCAAATAAGAATTTAAAGATGCATGTGGAGTGAT i macFas5.chr10 I 104 C 0 s papAnu2.chr10 32568410 1257 - 90941950 gtgacagtgtagtggtgtTCCTTCCTCAGCGTGCAGAGCTGGCACCTTGCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGAAGG-CCCCAGCTTGGCGGGCAGGAGGTGGTTCCTGTGGAGGGAGGTGCAGGGAGCCCCTACAGCTGAGTTTGTGGGGTCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAGGAGAAAAGCACCCGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCGCTCTGGGCCTGCATTTCCTGGGCCGAGTACTCCAGCTCAGTCATCTTGTCCTGAGTCCTTTGTGGGCCTTGGAGATTGCTGAGTTTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTTGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATCGCTGGTGAAACATCAAACATGGGACACCTTCTGCCAAGAAAACTCCTGGAAGTGAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAAGCAGAGGAGTCACCCGCGGATTTCTGTGTGTTTGGAGATCCG-CGTTTTTCCCTGTGGGTGGCGGAAGCGGAGCAGCTCTGCGGCGGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGCTA-CAGGAAGGTCCTGGCCTGGGGCGGAGGGGCGAGAGGGGATGGGCGGCCAGGGGCTGTGCAGCGCACCGGGCAGTGTGCATCCCCCCTGCT---GGTCGCCCAGGAGGAGAACAGGTCCCGGCCTGGCGGGATCAGAGGCAGCGGGACAGTGGTCCGAGAACCAGGCGTAATGGCTGGCAGAGCC-TGGGCCATGGCGGAGGGGGACTCCCGGCCACCTGCTGTGCATCCTCATGACCAGAACACACGCCGGCCTCTGGAGGCCAGGCAGACCAAGCAAGGGGCGACAGGCAAGGCTTGGGGTTCCCGCAGCGGGAGGTGGGTCCCTGGACCCTGGTGTCCTGCTGCTGTCCAGAACATGGGCCGCCTTCCCTCAGGGGCGCCCCTCCAGGGTCGCCTATCTGCGACCTCAGCACAGCTCCTGGCGGGCGGGAGGCTGGGGCGGAGGCCTCAGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCTGCCACTGGTGGAGGCACCGGGGCGAGCTCAAGCTATG---CCCAGGCAGGAAACTCTCCGACATTGCCAGCTTCCGCGCCAGCTTTGGTGACTCTCTCCAGCTCAACTTCCACACCTTTCAACAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTCTGTATTTGCTATCCTTTATCAAATAAGAATTTAAAGATGCATGTGGAGTGAT i papAnu2.chr10 I 104 I 1088 s chlSab2.chr2 37909336 1235 - 90373283 GTGACAGTGTGGCAGTGTTCCTTCCCCAGCGTGCGGAGCTGGCTCCTTGCCCTCTCAGCCCAGGACGCCCCAGAAGG-CCCCAGCTTGGTGGGCAGGAGGTGGTTCCTGTGGAGGGAGGTGCAGGGAGCTCCCAAAGCCAAGTCTGTGGGATCCCCTGCATTGGGTGGGAGTGAAGAGAAAAGCACCTGGGCAGCCAGGACAAGC-----------------------------CTGGGCCTGCCCTAAGGAGGTGACCCGCTCTGGGGCTGCATTTCCTGGGCAGAGTACTCCAGCTCAGTCATCTTGTCCTGAGTCCTTTGTGGGCCTTGGAGTTTGCTGAGTTTTGAAGAAGGGAAGGTCATCTTTGTTGCGGAAAGCCTGATGTGTTTCTCTATTGCTGTCACTTTTCAGCCTCATCACTGGTGAAACATCAAACATGGGACACCTTCTGCCAAGAAAACTCCTGGAAGTAAATGTGGGGACTGGCAGTATCCAACCAGAGGAGTCACATGGGGATTTCTTTGTGGTTGGAGATCTG-CGTTTTTCCCTGTGGGTGGCGGAAGCGGAGCAGCTCTGCCGCGGGAAGGAAGGTGGGTTCTGTGCTA-CAGGAAGGTCCTGGCCTGGGGCAGAGGGGCGAGAGGGGATGGGCGGCCAGGGGCAGTGCAGGCCACCGGGCAGTGTGCATGCCCCCTGCTGCAGGTCGCCCAGGAGGAGGGCAGGTCCCGGCCTGGTGGGAGCAGAGGCAGCAGGGCTGAAGTCTCAGCACCAGGCGTCAGGGCTGGGGGAGCCATAGGCCATGGTCGAGGGTGACTCCTGGGCACCTGCTGTGCATCCTCGTGACCAGGACACACACCAGGCTCTGGAGGCCAGGT------------GGACGGCAGGC-------------CCCGTGGCGGGAGGTGGGTCCCTGGCCCCTGGTCTCCTGCTGCTGTCCCCAACATGGGCCGCCTTCCCTCAAGGGCGCCCCTCCAGGGTCGCCTATCTGCGACCTCAGCACAGCTCCTGGCCGGCGGGAGGCTAGGGCGGAGGCCTCAGGGCCCAGCTGGGTCTGCAGTTTCTGCCACTGGTGGAGGCACCACGGCGAGCTCAAGCTGTG---CCCAGGCAGGAAACTCTCCGACCTTGCCAGCTTCCGCGCCAGCTTTGGTGACTCTCTCCAGCTCAGCTTCAACACCTTTCATCAGTTCTGTGTTCTCTATTATCACAAGAATTCTTTCTGTATTTGCTATCCTTTAACAAATAAGAATTTAAAGATGCATGTGGAGTGA- i chlSab2.chr2 I 32 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=52269.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 144704 33 + 478999 TATCACAGTTGAAACATTAAACAATATACAATT s panTro4.chr18 74626253 32 - 76611499 -ATCACAGTTGAAACATTAAACAATATACAATT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18575976 33 + 99152023 TATTACAGTTGAAACATTAAACAATATACAATT i ponAbe2.chr15 I 38 C 0 s nomLeu3.chr5 77035261 32 - 143122389 -ATCACAGTTGAAACATTAAACAATACACAATT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36497942 31 + 96509753 -ATCACAGTTGAAACATTAAA-AATATATAATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32570755 32 - 90941950 GATCACagttgaaacattaaa-aatatataatt i papAnu2.chr10 I 1088 M 1183 s chlSab2.chr2 37910571 32 - 90373283 TATCACAGTTGAAACATTAAA-AATATATAATT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=900868.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 144737 762 + 478999 TCATGTGTCTTTTTT-GTttaatgtataattttctaagaagtaaaattatgactctactgcaaatataagataaacacatatcaacaatgtttttcaactcaataagcgatgagggttccagtaa-caggttcaaatcattgcaaggaacattaaaggagctttacagccaatgttaacgtcagatcgctgggtacttacagtactggttagtatccaacatagccagaagctgtcatctttgtgagttctctcttccatggcacagaaatGATGCGTTTTTCTACTGTACAAAATATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCAGAAAAGACCAGAATTGCACTGA------AAG-AAAATCTCAGTAATATCTCTCACCTGTATTCTTACTT--TTTCTTCCTTTATGAAATATCTTTCAACTGCATTTTCTATCTGAAAGTTTAT----AGAGAGATGAAAATGAATAAAAGCATAGTAAGTGAATATTTTGATAACATTTTGcagctttattcatgtctaacgaacataaaacacacttccaatatttaaagtgtaaatgagatgaatttgatatgtacatgtgcccattaa----tcaccatgaaggggacaatgagcatatccaatactctcaaagcttcccagtt-ctcttttGTAATGCACACTCATACCTCTCAGGTGTGAAGTATTGAGCTTcacacacacacaca--cacaAATATATACT----------------------Gggatatctaattgtttcagaagcatttgttgaaaa s panTro4.chr18 74626285 763 - 76611499 TCATGTGTCTTTTTTTGTttaatgtataattttctaaaaagtaaaattatgactctattgcaaatataagataaacacatatcaacaatgtttttcaactcaataagcgatgagggttccagtaaataggttcaaatccttgcaaggaacattaaaggagctttacagccagtgttaaagtcagatcgttgggtacttacagtactggttagtatccaacgtagccagaagctgtcatctttgtgagttctctcttccatggcacagaaatAATGTGTTTTTCTACTGTACAAAATATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCAGAAAAGACCAGGATTGCACTGA------AAA-AAAATCTCAGTAAT--CTCTCACCTGTATTCATACTTCTTTTCTTCCTTTATGAAATATCTTTCAACTGCATTTTCTATCTGAAGGTTTAT----AGAGAGAGGAAAATGAATAAAAGCATAGTAAGTGAATATTT-GGTAACATTTTGcagctttattcatgtctaatgaacataaaacacacttccaatatttaaagtgtaaatgagatgaatttgatatgtacatgtgcccattaaacaatcaccatgaaggggacaatgagcatatccaatactcccaaagcttcctagtt-ctcttttGTAATGCACACTCATACCTCTCAGGTGTGAAGTATTGAGCTTCACACATACACACA------AATATATACT----------------------Gggatatctaattgtctcagaagcatttgttgaaaa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18576009 770 + 99152023 TTATGTGTCTTTTTTTGTttaatgtataattttctaagaagtaaaattatgactctactacaaatataagataaacacagatcaaccatgttattcaactcaataagcgatgaggattccagtaa-taggttcaaatcattgcaaggaacattaaaggagctttacagccaatgttaaagtcagatcgttgggtagttacaatactggttagtatccaacatagccagaagctgtaatctttgtgagttatctcttccatggcacagaaatGATGCGTTTTTCTACTGTACAAAATATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCAGAAAAGACCAGGATTGCACTGA------AAGAAAAATCTCAGTAATATCTCTCACCTGTATTCATACTTCTTTTCTTCCTTTATGAAATATCTTTCAACTGCATTTTCCATCTGAAGGTTTATAGAGAGAGAGAGGAAAATGAAAAGGAAAATAGTAAGTGAATATTTTGATAACATTTTacagctttattcatgtctaacgaacataaaacacgcttccaatatttaaagtgtaaatgagatgaatttgatatgtacatgtgcccattaaacaatcaccatgaaggggacaatgagcatatccaataccctcaaagcttcccggtt-ctcctttGTAATGCACACTCATACCTCTCAGGTGTGAAGTATTGAGCTACACACATACACACA------AATACACGCT----------------------Gggatatctaattgtttcagaagcatttgttgaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77035293 770 - 143122389 TCATGTGTCTTTTTTTGTttaatgtataattttctaagaagtaaaattatgactctactgcaaatataagataaacacataccaacaatgttattcaactcaataagcgatgagggttccagtaa-taggttcaaatcattgcaaggaacattaaaggagatttacagccaatgttaaggtcagatcgttggttagttacaatactggttagtatccaacatagccagaagctgtaatctttttgagttttctcttccatggcacagaaatGATGCATTTTTCTGCTGTACAAAATATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCAGAAAAGACCAGGATTGCACTGA------AAAAAAAATCTCAGTAATATCTCTCACCTGTATTCATACTTCTTTTTTTCCTGTATGAAATATCTTTCAACTGCATTTTCTATCTGAAGGTTTATAGAGAGAGAGAGGAAAATGAATAAAAGCATAGTAAGTGAATATTTTGATAACATTTTacagccttattcatgtctaatgaacataaaacacacttccaatatttaaagtgtaaatgagattaatttgatatatacatgtgcccattaaacaatcaccatgaaggggacaacgagcatatccaatactctcaaagcttccCAGTT-CTCCTTCGTAATGCACACTCATACCTCTCAGGTGTGAAGTATTGAGCTTCACACATACACACA------AATACACACT----------------------Ggaatatctaattgtttcagaagcatttgttgaaaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36497973 791 + 96509753 TCAAGTGTT-------GTTTAATTT-taattttctaagaagtaaaattatgactctagtgcaaatataagataaacacgtttcaacagtgttattcaactcagtaagcaatgagggttccagtaa-taggttcaaatcattgcaaggaacattaaagtaactttacagccaatgttaaggtcagatcgtgggttagttacaatactggttagtatccaacatagtcagaagctgtcatctttgtgagttatctcttccatggcacagaaatTATGCGTTTTTCTACTGTACAAAACATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCACAAAAGACCAGGATTGCACTGA----AAAAAAAAAATCTGAGTACTATCTCTCACCCGTATTCATACTTCTTTTCTTCCTTTATGAAATATCTTTCAACTGCATTTTCTATCTGAAGGTCTGTGGAGAGAGAGAGTAAAATGAATAAAAGCATATTAAGTGAATATTTTGATAAC-ATTTacagctttattcatgtctaatgaacataaaacacactaccaatatttaaagtgt-aatgagatgaatttgatatatacatgtgcccattaaacaatcaccaTGAAGACTTCAGTGAGCATATCCAATACTCTCAAAGCTTCACAGTTCCCCCTTGGTAATGCATGCTCATACCTCTCAGGTGTGAAGTACTGAGCTacacacacacacacacacacaaatacacacacacacacaTGCAGATACACACTGggatatctaattgtttcagaagcatttgttgaaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37910603 776 - 90373283 TCAAGTGTt-------gtttaattt-taattttctaagaagtaaaattatgactgtagtgcaaatataagataaacacatatcaacaatattattcaactcaataagccatgacggttccagtaa-taggttcaaatcattgcaaggaacagtaaaggagctttacagccaatgttaagatcagatcattggttagttacaatactggttagtatctaacatagtcagaagctgtcatttttgtgagttatctcttccatggcacagaaatTATGCGTTTTTCTACTGTACAAAATATTTATCTTTTCTACTACTTCTGCACATAAAAATATTGCTAGTCACAAAAGACCAGGATTGCACTGAAAAGAAAAAAAAAATCTGAGAAGTGTCTCTCACCTGCATTCATACTTCTTTTCTTCCTTTATGAAATATCTTTCAACTGTACTTTCTATCTGAAGGTCTGTGGAGAGAGAGAGTAAAATGAATAAAAGTACAGTAAGTGAATATTTTGATAACAATTTACAGA-ttattcatgtctaatgaacataaaacacacttccaatatttaaagtgt-aatgagatgaatttgatgtatacatgtgcccattaaacaatcaccatgaagggatcagtgagcatatccaatactctcaaagcttccCAGAT-CCCCTTGGTAATGCACACTCATACTTCTCAGGTGTGAAGTACTGAGCTacacacacacacacacacacaaatacacacacaca------------------GGGATATCTAATTGTTTCAGAAGCATTTGTTGAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32570787 1183 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=293293.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 145499 179 + 478999 tgttatgtccatgaatggtctaagaactttatcaaaaattagctgatagatgatatacatgtgtatatctatatttgtactacattgtcttaagtattactgtaatgttataagtcttgaatccaggtgctgttaattctccagcagcacctggtttcaaagtaactgtttcctttcaa s panTro4.chr18 74627048 179 - 76611499 tgttatgtccatgaatggtctaagaattttatcaaaaattagctgatagctgatatacatgtgtgtatctgtatttgtactacattgtcttaagtattactgtaacgttctaagtcttgaatccaggtgctgttgattctccagcagcacctggtttcaaagtaactgtttcctttcaa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18576779 178 + 99152023 tgttatgtccatgaatgatctaagaactttatcaaaaattagctgatagctgatatacatgtgtatatctatatttgtactaca-tgtcttaagtattactgtaactttataagtcttgaatccaggtgttgttaattctccaacagcacctggtttcaaagtaactgtttcctttcaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77036063 178 - 143122389 tgttatgtccatgaatggtctaagaactttatcaaaaattagctgATAGCTGATATACATGTGTATATCTATATTTGtactacattgtcttaagtattactgtaactttataagtcttgaatccaggtactgttaattctccaacagcacctggtttcaaagtaactgttt-ctttcta i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36498764 171 + 96509753 tgttatgtccatgaatgctctaagaactttattaaaaattagctgaaagctgatatacatgtgtatatctatatttgcactacatcgtcttaag---tactgtaacttgataagtcttgaaaccaggtgctgttaattctccagcagcacctggtttcaaagtaattg-----tttcaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32571970 176 - 90941950 tGTTATGTCCATGAATGCTCTAAGAACTTTATTAAAAACTAGGTGAAAGCtgatatacatgtgtatatctatatttgTACTACATTGTCTTAAG---TACTGTAACTTGATAAGTCTTGAAACCAGGTGCTGTTAATTATCCAACAGCACCTGGTTTCAAAGTAATTGTTTCCTTTCAA i papAnu2.chr10 M 1183 C 0 s chlSab2.chr2 37911379 176 - 90373283 TGTTATGTCCATGAATGGTCTAAGAACTTTATTAAATACTAGCTGATAGCTGATATACATGTGTATATCTATAGTTGCactacatcgtcttaag---tactgtaacttgataagtcttaaaaccaggtgctgttaattctccaacAGCACTTGGTTTCAAAGTAATGGTTTCCTTTCAA i chlSab2.chr2 C 0 I 49 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=214593.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 145678 183 + 478999 agtaatttgccattataggtcctctacccatcgatgtacatttcagaattttagtttctcaatttctaaaataagaaatccagctgtgatttgattggaattgttatagatcaatgtggaaagagtagacatcttaacaatattgagatttatgactcataaattccatttatttaggtctcg-- s panTro4.chr18 74627227 183 - 76611499 agtaatttgccattataggtcctctacccatcgatgtacatttcagaattttagtttctcaatttctaaaataagaaatccagctgtgatttgattggaattgtaatagatcaatgtgggaagagtagacatcttaacaatattgagatttatgactcataaattccatttatttaggtctca-- i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18576957 183 + 99152023 agtaatttgccattataagtcctctacccatcgatgtaaatttcagaattttagtttctcaatttctaaaataagaaatccagctgcgatttgattggaattgttatagatcaatgtgggaagagtagacatcttaacaatattgagatttatgactcataaattcaatttatttaggtctca-- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77036241 183 - 143122389 agtaatttgccattatagaccttctacccatcaatgtacatttcacattgttagtttctctatttctaaaataagaaatccagctgtgatttgattggaattgtaatagatcaatgtgggaagagtagacatcttaacagtattgagatttatgactcataaattccatttatttaggcctca-- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36498935 185 + 96509753 agtaatttgcctttataggtcctctacccattgacatacatttcagaattttagtttcccaatttctaaaataaggaatacagttgtaatttgattggaattgttgtagatcaatgtgggaggagtagacattttaaccgtattgagatttatgactcatacgttccattgactgaggtctctta i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32572146 185 - 90941950 AGTAATTTGCCTTTATAGGTCCTCTACCCATCAACATACATTTCAGAATTTTAGTTTCTCAATTTCTAAAACAAGGAATACAGCTGTGATTTGATTGGAATTCTTACAGATCAATGTGGGAAGaatagacattttaacagtattgagaTTTATGACTCATACATTACATTGATTGAggtctctta i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37911555 49 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=1649645.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 145861 988 + 478999 tttattttagcaatattttgtagttttgtagttttcaaatgtttctcttttttgctggtttatctctaagtactacatattttgatattTACAATAATATCAAAATTATGGTAATATTAATGCAAATGTTGTTTTATTTTTTCCTCCATTAATTGTCAGGTAGTTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATAAAACTGAATTTTGCGAGAAATGTATACATATTGTATATATAC-T--TTTTTTCAGTTTGGCAGATTGACTGCATTATCATATCATAATTTAAAATTGCACTAATTACCACTCAGCCTCCTCTCAAGGACAATATATCAAAATATATAGCATGTTTCAGTTTACTTAGCATCATGAAACTCTCATATTGCACTTACTTTTGGAAACCTGGAATAATAAAATAATGTAAATGTCAGTTCACAGGCGACATATGAGTACATGCGACAATTTTCTAAATATCGACCTATCGCTCTTTAATTCTATGTTAATATTGTCAATTTTTT-CCTCCTCTTGCAACTCTCTTATGCAGCTTATTGACTTTTGGTTCAATTCCTTCCCTGTTTTCCCCCC-AATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTTTATTTGGACACTTTTAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATCCatatccaaaataaatgagcggagggaccaaaaagatgtttgtgcagcgtgtccgttagcaatattattcacaataatcaaagggagggagcagcccatgtgaatattgatggatgagtggttaaacaaaatgtggtatatacggcaacataataatattcagccttaaaatatattctcacacatgctacaaaatagatgaaacttgaagacatgctaagtgaaataagccagtcagaaaaattcaaacattc--tatcatgccacttctatgagttacttagtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat s panTro4.chr18 74627410 979 - 76611499 tttattttagcaatattttgtagttttgtagttttcaaatgtttctcttttttgctggtttatctctaagtaC---ATATTTTGATATTTACAATAATATCAAAATTATGGTAATGTTAATGCAAATGTTGTTTTATTTTTTCCTCCATTAATTGTCAGGTAGTTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATAAAACTGAATTTTGTGAGAAATGTATACATATTGTATATATAC-T--GTTTGTCAGTTTGGCAGATTGACTGCATTATCATATCATAATTTAAAATTGCAC-------CACTCAGCCTCCTCTCAAGGACAATATATCAAAATATATAGCATGTTTCAGTTTATTTAGCATCATGAAACTCTCATATTGCACTTACTTTTGGAAACCTGGAATAATAAAATAATGTAAATATCAGTTCACAGGCGACATACGAGTACATGCGACAATTTTCTAAATATCTACCTATCGCTCTTTAATTCTATGTTAATATTGTCAATTTTTT-CCTCCTCTTGAAACTCTCTTATGCAGCTTATTGAGTTTTGGTTCAATTCCTTCCCTGTTTTTCCCCCTAATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTTTATCTGGACACTTTTAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATTCatatccaaaataaatgagcggagggaccaaacagatgtctgtgcagcgtgtccattagcaatattattcacaataatcaaagggagggagcagcccatgtgaatattcatgaatgaatggttaaacaaaatgtggtatatacggcaacataataatattcagccttaaaatatattctcacacatgctacaaaatagatgaaacttgaagacatgctaagtgaaataagccagtcagaaaaattcaaacattc--tatcatgccacttctatgagttacttagtgaaagctgtagagacagaaagtaggatggtgat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18577140 987 + 99152023 tttattttagcaatattttgtagttttgtagttttcaaatgtttctcttttttgcaggcttatctctaagtactacatattttGATATTTACAATAATATCAAAATTATGGTAACATTAATGCAAATGTTGTTTTATTTTTTCCTCCATTAATTGTCAGGTAGTTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATAAAACTGAATTTTGCGAGAAATGTATACATATTGTATATATACTT--TTTTTTCAGTTTGGCAGATTGACTGCATTATCATATCATAATTTAAAATTGCAT-AATTACCACTCAGCCTCCTCTCAAGGACAATATATCAAAACGTATATCACGTTTCAGTTTATTTAGCATCATGAAACTCTCATATTGCACTAATTTTTGGAAACCTGGAATAATAAAATAATGTAAATATCAGTTCACAGGCGACATATGAGTACATGCGACAATTTTCTAAATATCGACCTATCGCTCTTTAATTCTATGTTTATATTGTCAATTTTTT-CCTCCTCTTGAAACTCTCTTATGCAGCTTATTGACTTTTGGTTCAATTCCTTCCCTGTTTTTCCCCCTAATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTTTATTTGGACACTTTTAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATCCatatccaaaataaatgagtgcagggaccaaacagatgtttgtgcagcgtgtccgttagcaatattattcacagtaatcaaagggagggagcagcctgtgtgaatattgatggatgagtggttaaacaaaatgtggtatatacggcaacataataatattcagccttaaagtatattctcacacatgctacgaaatagatgaaacttgaagacatgctaagtgacat--gccagtcagaaaaattcaaacattc--tatcatgccacttcgatgagttacttagtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77036424 985 - 143122389 tttattttagcaatattttgtagttttgtacttttcaaatgtttctcgtttttgcaggtttatctctaagtactacatattttgATATTTACAATAATATCAAAATTATGGTAATATTAATGCAAATGTTGTTTTATTTTTTCCTCCATTAATTGTCAG---GTTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATAAAACTGGGTTTTGCGAGAAATGTATACATATTGTATATATACTT--TTTTTTCAGTTTGGCAGATTGATTGCATTATCATATCATAATTTAAAATTGCACTAATTACCACTCAGCCTGCTCTCAAGGACAACATATCAAAATATATATCATGTTTCAGTTTATTTAGCATCATGAAACTCTCATATTGCACTTACTTTTGGAAACTTGGAATAATAAAATAATGTAAATATCAGTTCACAGGTGACATATGAGTACATGCGACAATTTTCTAAATATCAACCTATTGCTCTTTAATTCTATGTTTATATTGTCAATTTTTT-CCTCCTCTTGAAACTCTCTTATGCAGCTTATTGACTTTTGGTTCAATTCCTTCCCTGTTTTTCCCCC-AATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTTTATTTGGACACTTTTAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTGGTATTAAAATGCAAATCCatatccaaaataaatgagtgcagggaccaaacagatgtttgtgcagcatgtccattagcaatattattcacaataatcaaagggagggagcagcccatgtgaatattgatggatgagtggttaaacaaaatgtggtatatat-gcaacataataatattcagccttaaaatatattctcacacatgctatgaaatagatgaaacttgaagacatgctaagtgaaataagccagtcagaaaaattcaaacattc--taccatgccacttctatgagttacttagtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36499120 984 + 96509753 tttattttaacaatattttgtagtttcgtagttttcaaatgtttctcttttttgaaggtttatccctaagtaCTACACGCTTTGATATTTGCAATAATATCAAAATTATGGTAATATTAATGTAAA---TGTTTTATTTTTTCCTCTGGTAATTGTCAGGTAGCTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATACAACGGGGTTTT--GAGAAACATATACATATTGTATATATAC-ATTTTTTTTCAGTTTGGCAGATTGACTCCACTATCATATCATAATTTAAAATTGCACTAATTACCAC-CAGCCTGCTCTCAAGGACAATACATGAAAATATGTATCATGTTTCAG-TTATTTAGCAACATGAAACTCTCACATTGCACTTACTTTTGGAAACCTGGAATAAAACAGTAATGTAAATATCAGCTCACAGGCGACATATGGGTACATGTGACAATTTTCTAAATATCAACCTTTCGCTATTTAATTCTATGTTTATATTGTCAATTTTTTCCCTCCTCTTGAAACTCTCTTACACTGCTTATTAAATTTTGGTTCAATTCTCTCCCTACTTTTTCC-CTAATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTTCATTTGGACACTTTTAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATCCatatccaaaataaataagcgcagggaccaaacagatgtttgcgcagcgtgtccatgagcaatattatccacaataatcaaagggagggagcagcccatgtgaatattgatggatgagtagttaaa-aaaatgtggtatatacggcaacatcataatattcagccttaaaatatattctga-acatgctatgaaatagatgaaacttgaagatatgccaagtgaaataagccagttcgagaaattcaaacattctatatcatgccatgtctgtgagttacttagtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32572331 984 - 90941950 tttattttagcaatattttgtagtttcgtagttttcaaatgtttctcttttttgcaGGTTTATCCCTAAGTACTACACGCTTTGATATTTGCAATAATATCAAAATTATGGTAATATTAatgtaaa---tgtttcattttttcctccagTAATTGTCAGGTagctttaaataataatttaattgtatgaTACAACAGGGTTTT--GAGAAACATATACActttgtgtatatac-a--ttttttcagtTTGGCAGATTGACTCCACTATcatatcataatttaaaattgcACTAATTACCAC-CAGCCTGCTCTCAAGGACAATACCTCAAAATATGTATCACGTTTCAGTTTATTTAGCATCATGAAACTCTCACATTGCACTTACTTTTGGAAACCTGGAATAAAACAATAATGTAAATATCAGCTCACAGGCAACATATGGGTACATGTGACAATTTTCTAAATATCGACCTTTCACTATTTAATTCTCTGTTTATATTGTCGATTTTTTCCCTCCTCTTGAAACTCTCTTACACTGCTTATTAAATTTTGGTTCAATTCTCTCCCTACTTTTTCCAATAATCTACTTTCTAATATTTTACTGATGCTGTGCTCCTTTTCATTTGgacacttttaaaaagctgcataATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATCCATATCCAAAATAAATGAGCACAGGGACCAAACAGATGTTTGTGCAGTGTGTCCATGAGCAATATTATCCACAATAATCAAAGGGAAGGAGCAGCCCATGTGAATATTGATGGATGAGtagttaaa-aaaatgtggtatatacggCAACGTCATAATATTCGgccttaaaatatattctga-acaTGCTATGAAATAGATGAAACTTGAAgatatgccaagtgaaataagccagttcgAGAAATTCAAACATTCTATATCATGCCATTTCTGTGAGATATTTTGtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat i papAnu2.chr10 C 0 I 6873 s chlSab2.chr2 37911604 985 - 90373283 TTTATTTTAACAATATTTTGTAGTTTCATAGTTTTCAAACGTTTCTCTTTTTTGCAGGTTTATCCCTAAGTACTACACCCTTTGATATTTGCAATAATATCACAATTATGGTAATATTAATGCAAA---TGTTTTATTTTTTCCTCCAGTAATTGTCAGGTAGCTTTAAATCATAATTTAATTGTATGATACAATGGGGTTTT--GAGAAACGTATACATATTGTATATATAC-A--TTTTTTCAGTTTGGCAGATTGACTCCACTATCATATCATAATTTAAAATTGCACTAATTACCAC-CAGCCTGCTCTCAAGGACAATACATCAAAATATATATCAAGTTTCAGTTTATTTAGCATCAGGAAACTCACACATTGCACTTAGTTTTGGAAACCTGGAATAAAACAATAGTGTAAATATCAGCTCACAGCCGACATATGAGTACATGTGACAATTTTCTAAATATCGACCTTTCGCTATTTAATTCTATGTTTATATTGTCAATTTTTTTCCTCCTCTTGAAACTCTCTTACGCTGTTTATTAAATTTTGGTTCAATTCTCTCCCTATTTTTTCCCCTAATCTACTTTCGAATATTTTACTGATGTTGTGCTCCTTTCCATTTGGACACTTTAAAAAAGCTGTGTAATTTCTCCTTTGTATTAAAATGCAAATCCatatccaaaataaatgagcgcagggaccaaacagatgtttgtgccgcgtgtacatgagcaacattatccacaataatcaaagggacggagcagcccatgtgaatattgacggatgagtggttaaacaaaatgtggtatatacggcaacataataatattcagccttaaaatatgttctga-acatgctaagaaatagatgaaacttgaagatatgccaactgaaataagccagtccgagaaattcaaacattctatatcacaccatttctatgagttacttagtgaaatttgtagagacagaaagtagaatggtgat i chlSab2.chr2 I 49 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=24916.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 146849 15 + 478999 tgctagggggaagga s panTro4.chr18 74628389 15 - 76611499 tgctagggggaagga i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18578127 15 + 99152023 tgctagggggaggga i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77037409 15 - 143122389 tgctagggggaggga i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36500104 15 + 96509753 tgctatggggagggg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32580188 15 - 90941950 tgctacggggagggg i papAnu2.chr10 I 6873 C 0 s chlSab2.chr2 37912589 15 - 90373283 tgctatggggagggg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35486223 51253 - 95678458 M a score=629198.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 146864 260 + 478999 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtaaagcattttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaatagtgcaaatatacttaatgccacaaaactgtgcacttaaagtgattaaaaaggtaaattttatgttgtgtatatctttccagaattataaaCCTGCCATCACAGTATAGAAATAGAATATATTATATAGCGTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT s panTro4.chr18 74628404 260 - 76611499 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtaaagcattttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaatagtgcaaatatacttaatgccacaaaactgtgcacttaaagtgattaaaaaggtaaattttatgttgtgtatatctttccagaattataaaCCTGCCATCACAGTATAGAAATAGAATATATTATATAGCGTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18578142 260 + 99152023 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtacagcgttttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaatagtgcaaatatacttaatgccacaaaactgtgcacttaaagtgattaaaaaggtaaattttatgttgtgtatatctttccagaattataaaCCTGCCATCACAGTACAGAAATAGGATATATTATATAGCGTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77037424 260 - 143122389 gagggagaggaaggggaagttgatgttcagtgagtacagcgttttagttggagaagaagacaagttctagaggtctatggtggtgactgttgcacaatagtgcaaatatacttaatgccacaaaactttgcacttaaagtgattaacaaggtaaattttatgttctgtatatctttccagaattataaaCCTGCCATCACAGTATAGAAATAGAATATATTATATAGGGTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35537512 260 - 95678458 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtacagagttttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaacagcgcaaatatacttaatgccacaaaatcgtgcacttaaagtgattaaaaaggtaaatcttatgttctgtatatctttccagaattataaaCCTGTAATCACAGTATAGAAATAGAACATGTTATATAGCTTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i rheMac3.chr10 M 51253 C 0 s macFas5.chr10 36500119 260 + 96509753 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtacagagttttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaacagcgcaaatatacttaatgccacaaaatcgtgcacttaaagtgattaaaaaggtaaatcttatgttctgtatatctttccagaattataaaCCTGCAATCACAGTATAGAAATAGAACATGTTATATAGCTTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32580203 258 - 90941950 gagggagaggaatagGAAGTTGGTGTTCAATGAGTAGAGAGTTTTAGTTGGAGAAGAAGACAAGTTTTGGAGGTCTATGGTGGTGACTGTTGCACAACAGTgcaaatatacttaatgccacaaaACCGTGCACTTAAAGTGATTAAAAACGTAAATCTTTTGTTCTGTATATCTTTCCAGAATTATAAACCTGCAATCACAGTATAGAAATAGAACA--TTATATAGCTTTAGGTGATGATAGTTTACACATTTGCACAt i papAnu2.chr10 C 0 I 10 s chlSab2.chr2 37912604 260 - 90373283 gagggagaggaatgggaagttggtgttcaatgagtacagagttttagttggagaagaagacaagttttggaggtctatggtggtgactgttgcacaacagtgcaaatatacttaatgccacaaaaccatgcacttaaagtgattaaaaaggcaaattttatgttctgtgtatctttccagaattataaaCCTGCAATCACAGTATAGAAATAGAACATGTTATATAGTGTTAGGTGATGATATTTTACACATTTGCACAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=1012406.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 147124 595 + 478999 AATTAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCAGATACGGTAGTCTAAGACATAACAATATTGATGTAAGAAAGCCGTAAGAAATGTTTATTTTCAATCAGATTTACTA-AAAAAATTTATTGAACTGGTCAATTTTCTTTGCCAATATTACTGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAGGTGTGAGAAAGCATCAAGGAAACTAAAATTGCATTCTCATACTGACTGCATACAATAATTCTGAAAACAGCAGAAGTTATGTATATCCCCCATAAGTAAAACATGAGTAACACAACAGAACAAAAATTAATAGGAGACAATTCAAACAATGGTGACCTGTTATTCTTATCTAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAACAGGAATTTGCTATTTCAAATATATTATCTGAGATGTCTATATTTATATTTTGAGATGCCATACAAACTTGAGTCAATGACATAGAATTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGTCATTTCTTTTGACATT------AAACTACTAAAGAGGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTACATTTACAGCATTTAAAATGTGTTCAGCATGAAATATTAGTTACAGGATAAGTG s panTro4.chr18 74628664 595 - 76611499 AATTAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCAGATAAGGTAGTCTAAGACATAACAATATTGATGTAAGAAAGCCATAAGCAATGTTTATTTTCCATCAGATTTACTA-AAAAATTTTATTGAACTGGTCAATTTTCTTTGCCAATATTACTGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAGGTGTGAGAAAGCATCAAGGAAACTTAAATTGCATTCTCATACTGACTGCATACAATAATTCTGAAAACAGCAGAAGTTATGTATATCCCCCATAAGTAAAACATGAGTAACACAACACAACAAAAATTAATAGGAGACAATTCAAATAATGGTGACTTGTTATTCTTATCTAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAACAGGAATTTGCTATTTCAAATATATTTTCTGAGATGTCTATATTTATATTTTGAGATGACATACAAACTTGAGTCAATGACATAGAATTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGACATTTTCTCTAAACTACTAGAGAGGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTACATTTACAGCATTTAAAATGTGTTCAGCATGAAATATTAGCTACAG------CT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18578402 601 + 99152023 AATTAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCAGATAAGGTAATCTAAGACATAACAATATTGATGTAAGAAAGCCATAAACAATGTTTATTTTCAATCAGATTTACTA-AAAAATTTTATTGAAATGGTCAATTTTCTTTGCCAATATTACTGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAAGTGTGAGAAAGCATCAAGGAAACTTAAATTGCATTCTCATACTGACTGCATACAATAATTCTGAAAACAGCAGAAGTTATGTATATCCCCCATAAGTAAAACATGAGTAACACAACACAACAAAAATTAATAGGAGATAATTCAAATAATGGTGACCTGTTATTCTTATCCAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAACAGGAATTTGCTATTTCAAATATATTATCTGAGATGTCTATATTTATATTTTGAGATGCCATACAAACTTGAGTCAATGACACAGACTTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGACATTTTCTCTAAACTATTAAAGAGGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTACATTTACAGCATTTAAAATGTGTTCAGCATGAAATATTAGCTACAGGGTAAGCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77037684 599 - 143122389 AATTAGAATTTTGAAGCCTTAATTTCAGATTAGGTTGTCTAGGACATAACAATATTGATGTCAGAAAGCCATAAGCAATGTC--TTTTCAATCAGATTTACTA-AAAAATTTTATTGAACTGGTCAATTTTCTTTGCCAATATTACTGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAAGTGTGAAAAAGCATCAAGGAAACTTCAATTGCATTCTCATACTGACTGCATACAATAATTCTGAAAATAGTGGAAGTTATGTATATCCCCCATAAGTAAAACATGTGTAACAAAACAAAACAAAAATTAATAGGAGACAATTCAAATAATGGTGACCTGTTATTCTTATCTAGTTAAGTACCATTCTTTTCTAACGGGAATTTGCTATTTCAAATATATTATCTGGGATGTCTATATTTATATTTTGAGATGCCATACAAACTTGAGTCAATGACATAGAATTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGACATTTTCTCTAAACTACTAAAGAGACATTAATGAGCCATAAATTATATTATCTACATTTGCAGCATTTAAAATGTGTTCAGCATGAAATATTAGCTACAGAGGAAGCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35537772 599 - 95678458 AATTAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCAGATAAAGTAGTCTAGGACATAACAATATTGATGTAAGAAAGCCATAGGCAATGTTTATTTTAAATCAGATTTACTGGAAAAATTTTATTGAA-TGGTCACTTTTCTTTGCCAATATTACCGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAAGTGTGAAAATGCATCAAGGAAACTTAAATTGCATTCTCATACTAACTGCATACAATAATTCTGAAAACAGCGGAAGTTATATTTATCCCCCATAAATAAAACATGAGTAGCAAAACAAAACAAAAATTAATAGGAGACAATTCAAATAATGGCGACCTGTTATTCCTATCTAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAAGAGGAATTTGATATGTCAAATATATTATCTGAGATGTCTATA-TTATATTTTGAGATGGTATACAAAC-CAAGTCAATGACATGGAATTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGAAGTTTTCTCTGAACTACTAAAGAAGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTACATTTACAGCATTTAAAATGTTTTCAGCATGAAATATTAGCTACAGAGTAAGCT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36500379 599 + 96509753 AATTAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCATATAAGGTAGTCTAGGACATAAAAATATTGATGTAAGAAAGCCATAGGCAATGTTTATTTTAAATCAGATTTACTGGAAAAATTTTATTGAA-TGGTCACTTTTCTTTGCCAATATTACCGTATTCTTATTTCTAGTAATAGAAGTGTGAAAATGCATCAAGGAAACTTAAATTGCATTCTCATACTAACTGCATACAATAATTCTGAAAACAGCGGAAGTTATATTTATCCCCCATAAATAAAACATGAGTAGCAAAACAAAACAAAAATTAATAGGAGACAATTCAAATAATGGCGACCTGTTATTCCTATCTAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAAGAGGAATTTGATATGTCAAATATATTATCTGAGATGTCTATA-TTATATTTTGAGATGCTATACAAAC-CAAGTCAATGACATGGAATTTTACAAATCAAGAAGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGAAGTTTTCTCTGAACTACTAAAGAAGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTACATTTACAGCATTTAAAATGTTTTCAGCATGAAATAATAGCTACAGAGTAAGCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37912864 596 - 90373283 AATCAGAATTTCAAAGCCTTAATTTCAGATAAAGTAGTCTAGGACATAACAATATTGATGTAAGAAAGCCATAAACAATGTTTATTTT-CATCAGATTTACTAGAAAAATTTTATTCAACTGGTCATTTCTCTTTGCCAATATTACTGTATTCTTATTTGTAGTAATAGAAGTGTGAAAAAGCATCAAGGAATCTTAAATTGCATTCTCATACTGACTGCATACAACAGTTCTGAAATCAACAGAAGTTATATATATCCCCCGTAAGTAAAACATGAG-----GAACAAAACAGAAATTAATAGGAGACAATTCAAATAATGGCGACTTGTTATTCCTATCTAGTTAAGTACTATTCTTTTCTAAGAGGAATTTGGTATTTCAAATGTATTATCTGAGATGCCTATATTTATATTTTGAGATGCTATACAAACTTGAGTCAATGACATGGAATTTTACAAATCAACAGGCTTATTCTGGGGCCATTTCTTTTGAAGTTTTCTCTGAATTACTAAAGAAGCATTAATGATCCATAAATTATATTATCTCCATTTACAGCATTTAAAATTTGTTCAGCATGAAATATTAGCTACAGACTAAGCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32580461 10 - 90941950 I a score=963840.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 147719 445 + 478999 AAATAAATTAAACATGGAATAAAGATTTATCCTTAAATATAAATTACAAGAAGACTT-GGTATTAGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAATGTCATAACCTTTTTGGGGAAACTCTGGGAAAAATGGAGAAACTCTGAAGGGTTTTAAGTATCTTTCCTGAAGCTACAGACTCCATAATCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCAACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCCTGGTTGCAGAGCAGAGCTTCTCATCCAAACCCTTTCCCTTTTTAGTGTCTGTGTATCAGTATAAAAGTTCTATAAACTGTAGTTACTTATTTTAATCCCAAAGCACAGTAACAATATATTTCATCCAAGGGTTGGCAGTTTCTGTGAGT--GTTTTGTCTAATTCTCCAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAACAGCCTAAAAAGTAAAA s panTro4.chr18 74629259 446 - 76611499 AAACAAATTAAACATGGGATAAAGATTTATCCTTAAATATAAATTACAAGAAGACTTTGATATTAGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAATGTCATAACCTTTTTGGGGAAACTCTGGGGAAAATGGAGAAACTCTGAAGGGTTTTAAGTATCTTTCCTGAAGCTACAGACTCCATAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCGACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCCTGGTTGCATAGCAGAGCTTCTCATCCAAACCCTTTCCCTTTTTAGTGTCTGTGTATCAGTATAAAAGTTCTATAAGCTGTAGTTACTTATTTTAATCCCAAAGCACAGTAACAACATATTTCATCCAAGGGTTGGCAGTTTCTGTGAGT--GTTTTGTCTAATTCTCCAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAAGAGCCTAAAAAGTAAAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18579003 497 + 99152023 AAATAAATTAAACATGGAATAAAGATTTATCCTTAAATATAAATTACAAGAAGACTTTGATATTAGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTATGTTCCCCAAAAAGTGTCATATGTTCCCCAAAAAGTGTCATTTTTGTTCCCCAAAAAGTGTCATAA-CTTTTTGGGGAAACTCTGCGAAAAACGGAGAAACTCTGAAGGGTTTTAAGTATCTTTCCTGAAGCTGCAGACTCCATAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCTACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCTTCGTCGCATAGCAGAGCTTCTCATCCAAATCCTTTCCCTTTTTAGTGTCTGTATATCAGTATAAAAGTTCTATAAACTGTAGTTACTTATTTTAATCCCAAAGCAGAGTAACAATATATTTCATCCTAGGGCTGGCAGTTTCTGTGAGT--GTTTTGTCTAATTCT-CAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAAGAGCCTAAAAAGTAAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77038283 445 - 143122389 AAATAAATTGAACATGGAATGAAGATTTATCCTTAAATATAAATTACAAGAAGACTTTGATATTAGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAGTGTCATAACCTTTTTGGGGAAACTCTGGGAAAAGTGGAGAAACTCTGAAGGGTTTTAAGTATCTTTCCTGAAGCTACAGACTCCATAACCTCTCTTTACAGGGAGGCCCTGCAGCTCCTACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCTTGGTTGCATAGCGGAGCTTCTCATCCAAACCCTTTCCCTGTTTAGTGTCTGCATATCAGTATAAAAGTTCTATAAACTGTAGTTACTTATTTTAATCCCAAAGCACAGTAACAATATATTTCATCCTAGGGCTGGCAGTTTCTGTGAGT--GTTTTGTCTAATTCT-CAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAAGAGCCTAAAAAGTAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35538371 424 - 95678458 AAATAAATTAAACATGGAATGAAGATTTGTCCTTAAATATAATTTACAAGAAGACTTTGATATTTGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAGTGTCATGACCTTTTGGGGGAACCTCTGGGAAAAATGGAGAAACT-----------------------CTGAAGCTACACTCTCCCTAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCTACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCTTGATCGCATAGCAGAACTTCTCATCCAAACCCTTTCCCTTTTTAGTGTCTCTGTATCAGTATAAAAGTTCCGTAAACTGTAGTTCCTTATTTTAATCCCAAAGTACAGTAACAATATATTTCATCCTAGGGTTGGCAGTTTCTGTGAACTGTTTTTGCTTAATTCT-CAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAAGAGCCTAAAAAGTAAAA i rheMac3.chr10 C 0 M 19087 s macFas5.chr10 36500978 424 + 96509753 AAATAAATTAAACGTGGAATGAAGATTTGTCCTTAAATATAATTTACAAGAAGACTTTGATATTTGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAGTGTCATAACCTTTTAGGGGAACCTCTGGGAAAAATGGAGAAACT-----------------------CTGAAGCTACACTCTCCCTAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCTACATAAATGAGTGGCTGAGATTCTTGATTGCATAGCAGAACTTCTCATCCAAACCCTTTCCCTTTTTAGTGTCTCTGTATCAGTATAAAAGTTCCGTAAACTGTAGTTCCTTATTTTAACCCCAAAGTACAGTAACAATATATTTCATCCTAGGGTTGGCAGTTTCTGTGAACTGTTTTTGCTTAATTCT-CAAAACTCTATCTACAGGATTCCAAAGAGCCTAAAAAGTAAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32580471 421 - 90941950 aaataaattaaacatggaATGAAGATTTGTCCTTAAATATAATTTACAAGAAGactttgatatttgtttttcacaaGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAGTGTCATGACCTTTTGGGGGAACCTCTGGGAAAAATGGAGAAACT-----------------------CTGAAGCTACACTCTCCCTAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCGGCTCCTACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCTTGATTGCATAGCAGAACTTCTCATCCCAACTCTTTCCC-TTTTAGTGTCTCTGTATCAGTATAAAAGTTCTGTAAACTGTAGTTCCTTATTTTAATCCCAAAGCACAGTAACAATATATTTCATCCTAGCGTTGGCAGTTTCTGTGAGC--GTTTTGTTTAATTCT-CAAAACTCTATCTACGGGATTCCaaagagcctaaaaagtaaaa i papAnu2.chr10 I 10 C 0 s chlSab2.chr2 37913460 422 - 90373283 AAATAAATTAAACATGGAATGAAGATTTGTCCTTAAATATAATTTACAAGAAGACTTTGATATTTGTTTTTCACAAGTGAAGCATTCTTAT-----------------------------------------------------AAAGTGTCATGACCTTTTGGGGGAACCTCTGGGAAAAATGGAGAAACT-----------------------CTGAAGCTACACTCTCCCTAACCTCTCTTTACAGGGAGCTCCTGCAGCTCCTACAGAAATGAGTGGCTGAGATTCTTGATTGCATAGCAGAACTTCTCATCCCAACGCTTTCCCTTTTTAGTGTCTGTGTATCAGTATAAAAGTTCTGTAAACTGTAGTTCCTTATTTTAATCCCAAGGCACAGTAACAATATATTTCATCCTAGCATTGGCAGTTTCTGTGAGT--GTTTTGTTTAATTCT-CAAAACTCTATCTACGGGATTCTAAAGTGCCTAAAAAGTAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=746410.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 148164 439 + 478999 TATTTTAAAAAGGGGAAAGGGAGAAAGGGAAAGAAAATAAAATTAATAGCCCA-TTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAATACCTTTCTGTTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCATTTAACATTTATGTCTTCAACAAAAGTTTGGAATCCTGAAAAAGACATT----------------------------------------------------------TAATTTCCTAATAAATATATTTGAATTGAATTGAAATCCTTACATATTACTTTAAATAAAGAACACAAGATGATTTATGATGTAGAAAATTCTATCCCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTGTTAAATAATATTTTTggccaggcatgtggcttacatctggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtggattgcttgagctgagtagttgcagaccaggctcggcaacatggtgaaacccaatctttaccaaaaaa s panTro4.chr18 74629705 439 - 76611499 TATTTTTAAAAGGGGAAAGGGAGAAAGGGAAAGAAAATAAAATTAATAGCCCA-TTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAGTACCTTTCTGCTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCATTTAACATTTATGTCTTCAACAAAAATTTGGAATCCTGAAAAAGACATT----------------------------------------------------------TAATTTGCTAATAAATATATTTGAATCGAATTGAAATCCTTACATATTACTTTAAATAAAGAACACAAGATGATTTATGATGTAGAAAATTCTATCCCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTGTTAAATAATATTTTTggccaggcatgtggcttacacctggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtggattgcttgagctgagtagttgcagaccaggctcggcaacatggtgaaacccaatctttacaaaaaaa i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18579500 437 + 99152023 TATTTTAAAAAGGGGAAAGG--AGAAGGGAGAGAAAATAAAATTAATAGCCCATTTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAATACCTTTCTGTTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCATTTAACATTTATGTCTTCAACAAAAGTTTGGAATCCTGAAAAAGACATT----------------------------------------------------------TAACTTGCTAATAAATATATTTGAATTGAATTGAAATCCTTATATATTACTTTAAATAAAGAACACAAGACGAATTATGATGTGGAAAATTCTATCCCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTGTTAAATAATGTTTTTggccaggcatgtggcttacacctggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtgga-tgcttgagctgaggagttgcagaccaggctcaacaacatggtgaaacccaatctttacaaaaaaa i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77038728 494 - 143122389 CATTTTAAAAAGGGGAAAGAGAGAAAGGGAAAGAAAATAAAATTAATAGCCCA-TTCAGTCACTGTTATTAAACACCAGAATA-CTTTTTGTTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCATTTAACATTTATGTCTTCAACAAAAGTTTGTAATCCTGAAAAAGACATTTAATTTGCTAATAAATATATTTGAATTGAATTGAAATCCTTATATATTACTTTAAATATAATTTGCTAATAAATATATTTGAATTGAATTGAAATCCTTATATATTACTTTAAATAAAGAACACTAGATGAATTATGATGTAGAAAATTCTATCCCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTGTTAAATAACATTTTTTgccaggcatgtggcttacacctggaatcccaatacttcgggaggcaaaggcaggtggattgcttgagctgaggagttgcagaccaggcttggaaacatggtgaaacccaatcttta--aaaaaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36501402 438 + 96509753 TATTTTAAAAAGGGGAAAGAGACAAAGGGAAAGAAAATAAAATCAATAGCCCA-TTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAATACCTTTCTGTTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCATTTAGCATTTATGTCTTGAACAAAAGTTTGGAATCCTGAAAAAGAAATT----------------------------------------------------------TAATTTGCTAATAAATATATTTGAGTTGAATTGAAATCCTTATATATTACTTCAAAT-AAGAACACAAGATGAATTATGATATAGAAAATTCTATCTCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTATTGAATAATATTATTTgccaggcatgtggcttacatctggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtggattgtttgagctgaggagttgcagaccaggttcagcagtatggtgaaacccaatcttgaaaaaaaaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32580892 436 - 90941950 tattttaaaaaggggaaagagacaaagggaaagaaaataaaatcaatagccCA-TTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAATACCTTTCTGTTAATCTAATTAAAATTAGTGACATCGTTTAGTATTTATGTCTTGAACAAAAGTTTggaatcctgaaaaagaaatt----------------------------------------------------------taatttgctaataaatatatttgagtgTAATTGAAATCATTATATATTACTTCAAAT-AAGAACACAAGATGAATTATGATATAGAAAATTCTATCTCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTATTGAATAATATGATTTGCCAGGCATGTGGCTTACATCTggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtggattgtttgagctgaggagttgcagaccaggttcggcagtatggtgaaacccaatcttg--aaaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37913882 438 - 90373283 TATTTTAAAAAGGGGAAAGAGACAAAGGGAAAGAAAATAAAAGCAATAGCCCA-TTCTGTCACTGTTATTAAACACCAGAATACCTTTCTGTTAATCTAATTAAAATTCGTGACATCGTTTAGCATTTATGTCTTGAACAAAAGTTTGGAATCCTGAAAAAGAAATT----------------------------------------------------------TAATTTGCTAATAAATATATTTGAGTGGAATTGAAATCCTTATATATTACTTCAAAT-AAGAACACAAGATGAATTATGATATAGAAAATTCTATCTCTCATTGTCCAAAATCTAATAGTTAAATTGAACTTATTGAATAATATTATTTgccaggcatgtgacttacatctggaatcccaatactttgggaggcaaaggcaggtggactgtttgagctgaggagttgcagaccaggttcggcagtagggtgaaacccaatcttgaaaaaaaaa i chlSab2.chr2 C 0 I 29 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=14313.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 148603 31 + 478999 aaaaaaaaat------------------tttagccaggcgtagtggatt s panTro4.chr18 74630144 49 - 76611499 aaaaaaaaaagaaaaaagaaaaagaaaacttatccaggcatagtggctt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18579937 29 + 99152023 aaaaaaaaa-------------------tttagccaggcatagtggct- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77039222 29 - 143122389 aaaaaaaaa-------------------tttagccatgcgtagtggct- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36501840 23 + 96509753 aaaaaaaaa----------------------agccaggtgtggtg---- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32581328 23 - 90941950 aaaaaaaaa----------------------agccaggtgtggtg---- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37914320 29 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=1390112.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 148634 916 + 478999 gcctgcctgtagtcccagctactcaggaggatgaggtgggaggatcaccggagcctggggaagctggggctgcagtgagccatgattgtgccactgcactccagcttgggcaacagactgagaccctgtctcaaagaaagacagaaaga--------------aagacaagaaagacaagaaag---acaagaaagac-aagaaagaaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaagaaagaaagaaagaaagata-aagagagaaaggaaggaag-----------------------gaaAATTAATAGTTTTGGTGGCAATAATCTTT------------ATGGAATTTTGCTTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTAGTGACATGATCTGCTTAAGTGTATTGACCCTAGCAATCAGAGGCCTCCGTATCCCCACAATGACTTAACAGTTACATTTGACAAGCCTTGATTCTCCTATCCTACGCACAGCATAGTCAGAATTTCAGAATTCCAACTTTCCCCATGCTATttgggcacgttgcttaacatctctaagactcgatatttatactcttaagatactactaataatagtacctagtttttatgatataatgtgcatcaaaagcattatactttcaggcagatggcaattcctcaataaatatttgctaatgttTTAGTACAAACAGGAAAATTGGATTATGATATTTATGACACTGTTGATTCTCCTTCTAGAAACAT----TTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAATTAGAGCACTATTTTGTATTCAGATTGAAAATACTATATGTTCAGAT-TTTTTAAAAAACAGTATTGCATGAATGTTTTAATTAAAAT--ATTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGGGAGATAAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAAATCTTTCAGCTCAACTAAGATTTG-AAAAAAAAA s panTro4.chr18 74630193 882 - 76611499 gcctgcctgtagtcccagctactcaggaggatgaggtgggaggatcaccggagtctggggaagctggggctgcagtgagccatgattgtgccactgcactccagcttgggcaacagaatgagaccctgtctcaaagaaagacagaaaGA---------------------------Caaggaag-------gaaggac----------------ggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaaga---aagagagaaaggaaggaag-----------------------gaaAATTAATAGTTTGGGTGCCAATAATCTTT------------ATGGAATTTTGCTTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTAGTGACATGATCTGCTTAAGTGTACCGACCCTAGCAATCAGAGGCCTCCATATCCCCACAATGACTTAACAGTTACATTTGACAAGCCTTGATTCTCCTAACCTACACACAGCATAGTCAGAATTTCAgaattccaactttccctatgctatttgggcacattgcttaacttctctaagatttgatatttttactcttaagatactactaataatagtacctagtttttatgatataatgtgcatcaaacgcattatactttcaggcagatggcaatttctcaataaatatttgctaatgttTTAGTACAAACAGGAAAATTGGATTATGATATTTATGACACTGTTTATTCTCCTTCTAGAAACAT----TTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAATTAGAGCACTATTTTGTATTCAGATTGAAAATACTATATGTTCAGAT-TTTTTAAAAAACAGTATTGCATGAATGTTTTAATTAAAAT--ATTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGGGAGATAAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAAATCTTTCAGCTCAACTAAGATTTG-AAAAAAAAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18579966 832 + 99152023 ---tgcctgtagtcccagctactcaggaggatgaggtgggaggatcacctgagcctggggaagctggggctgcagtgagccatgattgtgccactgcactccagcttgggcaacagactgagaccctgtctcaaagaaagacagaaaga------------------------------------------------------------------------------------------------aagaaaga---aagagagaaagGAAGGAAG-----------------------GAAAATTAATGGTTTTGGTGCCAATAATCTTT------------ATGGAATTTTGCTTTAATGAAAT-GATTTAACTAAGTAGTGACATGATCTGCTTAAGTGTATTGACCCTAGCAATCAGAGGCCTCCATATCCCCACAATGACTTAACAGTTACATTTGACAAGCATTGATTCTCCTATCATACATACAGCATAGTCAGAATTTCAgaattccaactttccctatgctatttgggcatgttgcttaacatctctaagactcgatatttatactcttaagatactactaataatagtacctagtttttatgacataatgtgcatcaaaagcattatactttcaggcagatggcaatttctcaataaatatttgctaatgttTTAGTACAAACAGGAAAATTGGATTATGATATTTATGACACTGTTGATTCTCCTTCTAGAAACAT----TTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAGTTAGAGTGCTATTTTGTATT-AAATTGAAAATACTATATGTTCAGAT-TTTTTAAAAAACAGTATTGCATGAATGTTTTAATTAAAAT--ACTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGGGAGATAAGCAAAATAAGGTTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAAATCTTTCAGCTCAACTAAGATTTGAAAAAAAAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77039251 865 - 143122389 ---tgcctgtagtcccagctactcaggaggatgaggtgggaggatcacctgagcctggggaagctggggctgcagtaagccatgattatgccactgcactctagcttgggcaacagactgagaccctgtctcaaagaaagacagaaaga-----------------------------aggaaa-------gaaaga-----------------gaaagaaagaaagaaag-aaagaaagaaagaaagaaagagagaaggaaggaaggaaaaaag-----------------------gaaaaaTAATGGTTTTGGTGCCAATAATCTTT------------ATGGAATTTTGCTTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTAGTGACATGATCTGCTTAAGTGTATTGACCCTAGCAATCCGAGGCCTCCATATCCCCACAATGACTTAACAATTACA------------TGATTCTCCTATCATACATACAGCATAGTCAgaatttcagaattccaactttccctatgttatttgggcacattgcttaacatctctaagactcaatatttatactcttaagatactactaataatagtacctagtttttatgatataatgtgcatcaaa-gcattatactttcaagcacatagcaatttctcaataaatatttgctaATGGTTTAGTACAAACAGGAAAATTGGATTATGATTTTTAtgacactgttgattctccttctagaaacat----ttgtttctaaaacttgttttcaagttagagcactattttgTATTCAAATTGAAAATACTACATATTCAGAT-TTTTTAAAAAACAGTATTGCATGAATGTTTTAATTAAAAT--ATTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGAC-GGAGAGATAAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAAATCTTTCAGCTCAACTAAGATTTGAAAAAAAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36501863 970 + 96509753 gcttgcctgtagtcccagatactcaggaggatgaggtgggaggatcatgtaagcctggggaagctggggctgcagtgcaccatgattgtgccactgcactccagcttgggcaacagattgagaccctgtctcaaagaaagaaagagaaagagaacaaaagaaCAAGagaaagaaagcaagaaagcaggaaggaaggagggagggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggagaaagaaaagaaagaaggaacgaaaAATAATGTTCTTGGTGCCAATAATCTTTGTGAAATTATACATGGAATTTTGCTTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTTGTGACATGAT----TTAAGTGTACTGACCCTAGCAATCAGAGACCTCCGAATCCTCACAATGACTTGACAGTTACATTTGACAAGAATTGATTCTCCTATCATACATACAGCATAGTCAgaatttcagaactccaactttccctatgctatttgtgcacattgcttaacatctctaagactcgatatttttactcttaaaatactactaataatagtacctagtttttatcatataacatgtatcaaaagcattatactttcaggcagatagcaatttctcagtaaatatttgctaatgttTTAGTACAAACAGGAAAATTAAATTATGATATTTATGACACTGTTGATTCTCTTTCTAGAAATATTTAATTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAG-TAGAGCAGTATTTTGTGTTCAAATTGAAAATACTATATGTTCATAC-TTTTTTAAAAAAAGTACTGCTTGAATATTTTCATTAAAACA-ATTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGAGAGATCAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTTGTGGAGAGCTTTCAGCTCAAATATGATTTG-AAAAAAAAA i macFas5.chr10 C 0 I 4 s papAnu2.chr10 32581351 920 - 90941950 gctttcttgtagtcccagatactcaggaggatgaggtgggaggatcacgtgagcctggggaagctggggctgcagtgcaccgtgattgtgccactgcactccagcttgggcaaaagactgaggccctgtctcaaagaaagaaagagaaagagaacaaaagaacaggagaaagaaagcaagaaagcaggaaggaaggag------------------------ggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaag-----------------------gaaaaataatgtttttggtgCCAATAATTTTTGTGAAATTATACGTGGAATTTTGCTTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTTGTGACATGAT----TTAAGTGTACTGACCCTAGCAATCAGAGACCTCTGAATCTCCACAATGACTTCACAGTTACATTTGACAAGAATTGATTCTCCTATCATACATACAGCATGGTCAGAATTTCAGAACTCTAACTTTCCCTATGCTATTTGTGCACACTGCTTAACATCTCTAAGACTCGATATTTTTACTCTtaaaatactactaataatagtaTCTAGTTTTTATGATATAACGTGTATCAAAAGCATTATACTTTCAGGCAGATAGCaatttctcagtaaatatttgctaatgttTTAGTACAATCAGGAAAATTGGATTATGATATTTATGACACTGTTGATTCTCCTTCTAGAAATATTTAATTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAG-TAGAGCAGTATTTTGTGTtcaaattgaaaa---tatatgttcattc-tttttttaaaaaagtattccttgaatattttcatttaaaaa-attcctaaatGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGAGAGATCAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAAAGCTTTCAGCTCAaataagatttg-aaaaaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 I 4 s chlSab2.chr2 37914349 959 - 90373283 gcttgcctgtagtcccagatactcaggaggatgaggtgggaggatcatatgagcctcgggaagctggggctgcagtgcaccatgattgtgccactgcactccagcttgggcaacagactgagaccctgtctcaaagaaagaaagagaaagagaacaaaagaaCAAGAGAAAGAAAGCAAGAAAGCaggaaggaaggaa------------ggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggagaaagaaaggaaggaaggaaggaaAAATAATGTTTTTGGTGCCAATAATCTTTGTGAAATTATACGTGGAATTTTGCCTTAATGAAATAGATTTAACTAAGTTGTGACACTAT----TTAAATGTACTGACCCTAGCAATCAGAGACCTCCGAATCGCCACAATGACTTGACAGTTACATTTGACAAGAATTGATTCTCGTATCATACATACAGCGTAGTCAGAATTTCAGAACTCCAACTTTCCCTATGCTGTTTGTGCACATTGCTTAATATCTCTAAGACTCGATATTTTTACTCTTAAAATACTACTAATAATAGTACCTAGTTTTTATCATATAACGTGTATCAAAAGCATTATACTTTCAGGCAGATAGCAATTTCTCAGTAAATATTTGCTAATGTTTTAGTACAAACGGGAAAATTGGATTATGATATTTATGACAC-GTTGATTCTCCTTCTAGAAATATTTAATTGTTTCTAAAACTTGTTTTCAAA-TAGAGCAGTATTTTGTGTTCAAATTGAAAATACTATATGTTCATACTTTTTTTAAAAAAAGTATTGCTTGAATATTTTCATAAAAAAATATTCCTAAATGAGCTTGAGCAAGGAGGACAGGAGAGATCAGTAAAATAAGGCTTTGTGGCATAGGAGACATTTGGTGGAGAGCTTTCAGCTCAAATAAGACTTG-AAAAAAAAA i chlSab2.chr2 I 29 I 36898 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=1727730.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 149550 1463 + 478999 GAGAATTTTTATAAAAAATGTAAAGGCAGGATTTACACTGATGAGCTTGTGGAGAAAATACAGAGTCTAACATAATTCAAAAGAGACTAATCAGTCAAAGTGGTTTTGAAGG-AATATCTTGAAGAGAGAGAACATAAAATGAAGATCAGGTATGTA---------------------------------GTTATTTTAATAATCTATCCATGAGATAAAAAGCATTGGGTTTTATTT------GTCAAAATGGGACAATAGTTCCAAGAACCATTATTTGCTCAGCCTAAAGAGGTTTTTACATTTTGAACCAGCGACATATTGTGCTAAGTAGGATAATATCCAAATTTGTGTCTATATCAATAATTTTGTTCTCAATTAAAAACACTTTATTCACACAACTGATGATTATCTGCATTTGATTTAGTGCTGAACTGTCAAAGGGGGACTAACAAAAACAAAATATTAGAGTTGCAAGCAGTGTAAGTGGAAAATAATGATCATATTGAACTCATCATTACTGaaataagaaaacaaagcaaaaaataaataagaaaaaaatTGACTACGTGAACATTTGCTTCTCTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCAAAAAAGCATCTGGGTCCATGAACCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAGATAAGAAGAAGCAAAACACATCAGCTTCCAGAGAAGGTTAAGAAACCTCTCATACCCTACCCTACCCCACCTGACACCAGGCAAAGGATCACTGCTTCTGGGAGAGGGATGCAAGAAAAATACTCCTCCATCAGGAGAGGAACAAGGATTGTTTTGGGGCCCAGGATTTTGCACTAATGCAGAGTCGTGCTACTGTGGTAAAGGTTTGGAAAGTCTCCATCCAGTGACCACAGACAAAGGTACATTGTTCCTATGGAAGGAGAAATAAAAGAGTTTGCCCTTATTGTGGGGTTGAAAACTtgcaatgatataaatcaggggttttctactactgaggtgggaggagggtaaggtattatttcttctgcaaaaaacaacacaggtaagtgacagtttgactcccactagaaaaagagtcaagaagtgttaaaaataccccatctctgagtgtccaatgatgaaactggctcaaaaacaacacaaaccatccctctgtccccaacctgaattttttgcctagtcacacacacacacacaca------------------------------aaatgatgttctacagttagagaagaacaagaaagtggagagagaccctctctataacataggttgtaaggactaccgaaagctaactgtggaacaggatcattggcatatgctctccagagtctaaggccccacacaaggcacatcatatagcagtctactgctggagaaatctgagttacattgttcactgaatgtttcagacaccgcagcaaaaagcaacctttgttcctgcccacactaatagcacgacacaaacaaaaatgaaacagaaatataaaacaatctcgac s panTro4.chr18 74631075 1490 - 76611499 GAGAATTTTTATAAAAAATGTAAAGGCAGGATTTACCCTGATGAGCTTGTGGAGAAAATACAGAGTCTAACATAATTCAAAAGAGACTAATCAGTCAAAGTAGTTTTGAAGG-AATATCTTGAAGAGAGAGAACATAAAATGAAGACCAGGTATGTA---------------------------------GTTATTTTAATAATCTATCCATGAGATAAAAAGCATTGGGTTTTATTT-TATTTGTCAAAAAGGGACAATAGTTCCAAGAACCATTCTTTGTTCAGCCTAAAGAGGTTTTTACATTTTGAACCAGCGACATATTGTGCTAAGTAGGATAATATCCAAATTTGTGTCTATATCAACAATTTTGTTCTCAATTAAAAACACTTTATTCACACAACTGATGATTATCTGCACTTGATTTAGTGCTGAACTGTCAAAGGGGGACTAATAAAAACAAAATATTAGAGTTGCAAGCAGTGTAAGTGGAAAATAATGATCATATTGAACTCATCATTACTGAAATAAGAAAACAAAGCAAAAAATAAATAAGAAAAAAATTGACTACATGAACATTTGCTTCTCTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCAAAAAAGCATCTGGGTCCATGAACCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAGATAAGAAGAAGCAAAACACATCAGCTTTCAGAGAAGGTTAAGACACCTCTCATACCCTACCCTACCCCACCTGACACCAGGCAAAGGATCActgcttctcggagagggatgcaagaaaaatactcctccatcaggagaggaacaaggattgttttggggcccaggattttgcactaatgcagagtcgtgctactgtggtaaaggtttggaaagtctccgtccagtgaccacagacaaaggtacattgttcctatggaaggagaaataaaaGAGTTTGTCCTTATTGTGGGGTTGAAAACTtgcaatgatataaatcagaggttttctactactgaggtgggaggagggtaaggtattatttcttctgcaaaaaacaacacaggtaagtgacagtttgactcccactagaat--gagtcaagaagtgctaaaaataccccttctgtgagtgtccaatgatgaaactggctcaaaaataacatgaatcatccctctgtcccCAACCTGAATTTTTTGCCTAGTcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaAAATGATGTTCTACAGTTAgagaggaaaaaaaaagtggagagagaccctctctataacataggttgtaaggactaccgaaagctaactg--gaacaggatcattggcatatgctctccagagtctaaggccccacacaaggcacataatatagcagcctactgctggagaaatctgagttacattggtcactgaatgtttcagacaccacagcaaaaagcaacctttgttcctgcccacactaatagcatgacataaa----aatgaaacagaaatataaaacaatctcgac i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18580798 1464 + 99152023 GAGAATTTTTATAAAAAATGTAAAGGCAGGTTTTACCCTGATAAGCTTGTGGAGAAAATACAGAGTCTAACATAATTCAAAAGAGACTAATCAGTCAAAGTAGTTTTGAAGG-AATATCTTGAAGAGAGAGAACATAAAATGAAGATCAGGTATGTA---------------------------------CTTATTTTAATAATCTATCCATGAGATAAAAAGCATTGGGTTTTATTT-TATTTGTCAAAAAGGGACAATAGTTTCAAGAACCATTCTTTATTCAGCCTAAAGAGGATTTTACATTTTGAATCAGCGACATATTGTGCTAAGTAGGATAATATCCAAATTTGTGTCTATATCAACAATTTTGTTCTCAGTTAAAAACACTTTATTCACACAACTGATGATTATCTGCATTTGATTTAGTGCTGAACTGTCAAAGGGGGACTAACAAAAACAAAATATTAGAGTTGCAAGCAGCGTAAGTGGAAAATAATGATCATATTGAACTCATCATTACTGAAATAAGAAAACAAAGCAAAAAGTAAATAAGAAAAAAATTGACTACATGAACATTTGCTTCTTTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCAAAAAAGCATCTGGGTCCATTAACCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAGATAAGAAGAAGCAAAACACGTCAGCTTTCAGAGAAGGTTAAGAAACCTCTCATACCCTACCTTATCCCACCTGAGACCAGGCAGAGGATCACTGCTTCTGGGGCAGGGATGCGGGAAAAATACTCCTCCATCAGGAGAGGAACAAGGATTGTTCTGGCGTCTCTGATTTTGCACTAATGCAGAGTTGTGCGAGTGTGATAAAAGTTTGGAAAATCTCGATCCAGTGACCACAGACAAAGGTGCATTGTTCCTATAGAAGGAGAAATAAAAGAGCTTGTCCTTATTGTGGGGTTGAAAACTtgcaatgacataaatcacaggttttctaccactgaggtgggaggagggtaaggtattatttcttctgcaaaaaacaacacagataagtgacagtttgcctcccactagaataagagtcaagaagtgctaaaaataccccttctctgagtgtccaatgatgaaactggctcaaaaataacatgaatcatccctctgtccccaacctgagttttttgcctagtcacacacacacaaa----------------------------------aaatgatgttccacagttagagaggaaccagaaagtggagcgagaccctctctataacataggtggtaaggactatggaaagctaactgtggaacaggatcattggcatatgctctccagagtctaaggcctcacacaaggcacatcatatagcagcctactgctggagaaatctgagttacttggttcactgaatgtttcagacaccgcagcaaaaaccaacctttgttcctgcccacactaatagcatgacacaaaccaaaatgaaacagaaatataaaacaatctcaac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77040116 1464 - 143122389 GAGAATTTTTATAAAAAATGTAAAGGCAGGATTTACCCTGATGAGCTTGTGGAGAAAATACAGAGTCTAACGTAATTCAAAAGAGACTAATCAGTCAAAGTATTTTTGAAGG-AATATCTTGAAGAGAGAGAACACAAAATGAAGATCAGGTATGTA---------------------------------ATTATTTTAATAATCTATCCATGAGATAAAAAGCATTGGGTTTTATTT-TATTTGTCAAAAAGGAACAAAAGTTTCAAGAACCATTCTTTGTTCAGCCTAAAGAGGATTTTACATTTTGAACCAGCGACATATTGTGCTAAGTAGGATAATATCCAAATTTGTGTCTATATCAACAATTTTGTTCTCAATTAAAAACACTTTATTCACACAACTGATGATTATCTGCATTTGATTTAGTGCTGAACTGTCAAAGGGGGACTAACAAAAACAAAATATTAGAGTTGCAAGTGGCGTAAGTGGAAAATAGTGATCATATTGAACTCATCATTACTGAAATAAGAAAACAAAGCATAAAACAAATAAGAAAAAAATTGACTACATGAACATTTGCTTCTCTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCAAAAAAGCATCTGGGTCCATGAACCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAGATAAGAAGAAACAAAACACATCAGCTTTCAGAGAAGGTTAAGAAACCTCTCATACCCTACCCTATCCCACCTGAGACCAGGCAAAGGATCActgcttctgggggagggatgcaggaaaaatacttctccatcaggagaggaacaaggattgttttggggcccaggattttgcactaatgcagagtcatgctactgtggtaaagggttgaaaaatctccatccagtgaccacagacaaaggtgcattgttcctatggaaggagaaataaaaGAGTTTGTCCTTATTGTGGGGTTGAAAACTTGAAATGATATAAATCAGAAGTTTTCTACCACTGAGGTGGGAGGAGGGCAAGGTATTATTTCTTCTGCAAAAAACAACACAGTTAAGTGACAGTTTGACTCCCACTAGAATAAGAATCAGGAAGTGTTAAAAATAGTCCTTCTCTGAGTGTCCAATGATGCAACTGGCTTAAAAATAACATGAATCATCCCTCTGTCCCCAACCTGAATTTTCTGCCTAGTCACACACACACAAA----------------------------------AAATGATGTTCTACAGTTAgagaggaacaagaaagtggagagagaccctctctataacataggtggtaaggactactgaaagctaactgtggaacaggatcaatggcatatgctctccagagtctaaggccccacacaaggcacatcatatcacagcctactgctggagaaatctaagttacattgttcactgaatgtttcagacacggcagcaaaaaccaacctttgttcctgcccacactaatagcatgacacaaaccaaaatgaaacagaaatataaaacaatattgac i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36502837 1454 + 96509753 GAGAATTTTTATAACAAATGTAAAGGCAGGATTTACCCTGATGAGCTTGTGAAGAAAATACAGAGTCTAACGTAATCCAAAAGAGACTAATCAGTCAAAGTAGTTTTGAAGGAAATATCTCGAAGAGAGAGAACATAAAATGAAGATCAGGTATGTA---------------------------------ATTATTTTAATAATCTACCCATGAGATAGAAAGCACTGGGTTT--TTT-AATTGATCACAAAGGGAAAATAGTTTCAAGAACCATTCTTTGTTCAGCCTAAAGCAGATTTTACATTTTGAAACAATGACATATTGTGCTAAGTA-GATAATATCCACATTCGTGTGTATATGAACAATTCTGTTCTCAA-TAAAAACACTTTATTCACACAAGTGATGATTATCTGCATTTGATTTAGTGCAGAAAGGCCAAAGGGGGACTCAT------AAAATTTTAGAGTTGCAAGCAGCTTAACTGGAAAATCATGATCATATTCAACTCATCATGACTGAAATAAGAAAACAAAGCAAAAAGTAAATAAGAAAAAAATGGACTACATGAACATTTGCTTCTCTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCTTAAAAGCATCTGGGTCCACCAAGCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAGATAAGAAGAAACGAAACACATCAGCTTTCAGAGAAGGTTAAGAAACCTCTCACACCCTACTCCACCCCACCTGAGACCAGGCAAAGGATCActgcttctgggggacggatggaggaaaaatacttccccatcaggagaggaacaaggattgtttcggggtccaggattttgcactaatgcagagtcgtgctactgtggtaaagggttggaaaatctccatccagtgaccacagacaaaggtgcattgttcctatggaaggagaaagaaaagagttagcccTTATTGTGGGTTTGAAAACTTTcaatgatataaatcaaaggttttctaccactgaggtgggagga-ggcaaggtattatttcttccttaaaaaccaacacagataagtgatagtttgactcccactggaacaagagtcgcaaagtgctaaaaatatcccttctctgagagtccaatgatgaaactggctccaaaataacatgaatcatccctctgcccccaacctgaattttctgcctagtcacacacacacaag----------------------------------aaatgatgttctacagttagagaggaacaagaaagtggagagagaccctctctgtgacataggtggtaaggactaccggaaggtaactgtggaacaggagcattggcatatgccctgcagagcctaaggccccacacaaggcacatggtatggcagcctactgctggagaaattgaagttacatggttcactgaatgtttcagacaccacagcaaaaaccagcctttgttcctgcccacactaatagcatgacacaaaccaaaatgaaacagaaacataaaacaatcttgac i macFas5.chr10 I 4 C 0 s papAnu2.chr10 32582275 1418 - 90941950 gaa-----------------------------------------------gaaga-----------------------aaaagagactaATCAGTCAAAGTAGTTTTGAAGGAAATATCTTGAAGAGAGAGAACATAAAATGAAGATcaggtatttattattttataaataaatcaggtatttattatttattattttaatactctACCCGTAAGATAGAAAGCACTGGGTTT--TTTAAATTGATCACAAAGGGAAAATAGTTTCAAGAGCCATTCTTTGTTCAGCCTAAAGcagattttacattttgaaacaaTGACATATTGTGCTAAGTA-GATAATATCCACATTCGTGTGTATATGAACAATTCTGTTCTCAA-TAAAAACACTTTATTCACACAAGTGATGATTATCTGTGTTTGATTTAGTGCTGAAAGGCCAAAGGGGGactaat------aaaattttagaaatgcaaGCAGCTTAACTGGAAAATCATGATCATATTCAACTCATCATGtctgaaataagaaaacaaagcaaaaattaaataagaaaaaaattgactacGTGAACATTTGCTTCTCTCCTAAGAATCAAAACCCTTAATTTGCTGTGGCAAAAAAGCATCTGGGTCCACCAAGCCATGCAAAAGTCTACTGTTTCTGGGAAATAAGAAGAAGCAAAACACATCAGCTTTCAGAGAAGGTTAAGAAACCTCTCACACCCTACTCCACCCCACCCGAGACCAGGCAAAGGACCACTGCTTCTGGGGGATGGATGGAGGAAAAATCCTTCCCCATCAGGAGAGGAACAAGGATTGTTTTGGGGCCCAGGATTTTGCACTAATGCAGAGTCGTGCTACTGTGGTAAAGGGTTGGAAAATCTCCATCCAGCGACCACAGACAAAGGTGCATTGTTCCtatggaaggagaaaggaaagagttaGCCCTTATTGTGGGTTTGAAAACTCTCAATGATACAAATCAAAGGTTTTCTaccactgaggtgggagga-ggcaagatattatttcttcctcaaaAACCAACACAGATAAGGGACAGTTTGACTCCCACTGGAATAAGAGTCGCAAAGTgctaaaaatatcccttctctgagaGTCTGATGATGAAACTGGCTCAAAAATAACATGAATCATCCCTCTGCCCCCAACCTGAATTTTCTGcctagtcacacacacacaag----------------------------------aaatgaTGTTCTGCAGTTAGAGAGGAACAAGAAAATGGAGAGAGACCCTCTCTGTGACATAGGTGGTAAGGACTACCGGAAGGTAACTGTGGAACAGGAGCATTGGCATATGCCCTGCAGAGCCTAAGGCCCCACACAAGGCACATGGTATGGCAGCCTACTGCTGGAGAAATTGAAGTTACATGGTTCACTGAATGTTTCAGACACCACAGCAAAAACCAACCTTTGTTTCTGCCCACACTAATAGCATGAcacaaaccaaaatgaaacagaaacataaaacaatCTTGAC i papAnu2.chr10 I 4 C 0 e chlSab2.chr2 37915308 36898 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=176088.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 151013 100 + 478999 ataaataattatctcatgatctactgtttttctacatcagatgatttgcattttttagaaattgggagacacataaaagcaagttagaaatttgagttat s panTro4.chr18 74632565 100 - 76611499 ataaataattatctcatgatctactgtttttctacatcagatgatttgcattttttagaaattgggagacacataaaagcaagttagaaatttgagttat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18582262 100 + 99152023 ttaaataattgtctcatgatctactgtttttctacatcagatgatttgcattttttagaaattgggagacacataaaagcaagttagaaatttgagttat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77041580 100 - 143122389 gtaaataattatctcatgatctactgtttttctacatcagatgatttgcatattttagaaattgagagacacataaaagcaagttagaaatttgaattac i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36504291 100 + 96509753 ataagtaattatctcatgaactactgtttttgtacatctgatgatttgcattttttagaaattgggagacacataaaagcaagttagaaatttgagttat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32583693 100 - 90941950 ATAAATAATCATCTCATGAGCTACTGTTTTTGTACATCTgatgatttgcattttttagaaATTGGGAGACACATAAAAGCAATTTAGAAATTTGAgttac i papAnu2.chr10 C 0 I 333 s chlSab2.chr2 37952206 100 - 90373283 ATAAATAATCATCTCATGAGctactgtttttgtacatctgatgatgtgtattttttagaaattgggagacacataaaagcaagttagaaatttgagttat i chlSab2.chr2 I 36898 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=2114455.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 151113 1257 + 478999 gagttataatattttcaaaggataaaaagtcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaaatgaaagtaatttaaaataataatgatcaaaatgttaaaggatctagttaaaaaaagacaacatgtatggaaaaatgaggaatttcagcaaagatgggaacagtaaaaggcaaaatctagaaataagtgaaagcatgagaacagagatgaagtattacatcagcaagctgattagcagactggtcatcagagttaaagaaagaagcagtaaattttatactaggtcaatacaaatcatttgaatggtagcacaaagggaggaaagagaaaaaccaaataaaccaatgaaccaagcaaataaaatactccagtgaatcaaagaattttctggtaatatgaaattaaccaaaatacaattaattggaattacagaaggagagtaaaaacagaatgtgagagaagaaaaatttgaaaaagatgactgaggagaccaaataacctcaaa-atatacaagaaagattaatacaaaatttaaagaacgctagaataatcacactagtgaaactgctgaaaaccaacgattagcataaatcttgaattcagtcacagaaaaaataagaacactgtgtagagagataaacagaaacaaacattgtaatgaactgcttgtcagtaactctacaagtcagaaaccaatgatacaaaattcttaaataactgaagaaaagtcaacccccaatcttatatccattaactgtaatacagcaaaaataacaattaaat---gacatttgcagattaacactggaagagtcccttgctaacaggtatgcactaaaataaatgtcaaaatcatttcttgaggcaaaaggaatatggaagcaggtgaaagttgaaactacacaaagaaataaataatgccagagaagatataaagatatataacccaattattttacattgctctaaagataattgattgtctaa--ttttttaaaaaaagagtaactttatattatggaattcataatatttgagactataatgcatgacataaatagtataaaggagagaggaaacagaaatatacattttaaggtttttataccatagttggtatagtacaaattataggttactgtaataagctagaataggtattgaaatctctagagaaaccatgaacatTTTTAAAAAATGGTATGTGCATTAATGTTTTCATAGAACTTCCAGCTTTTATTTATTTGTTT s panTro4.chr18 74632665 1250 - 76611499 gagttataatattttcaaaggataaaaagtcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaagtgcaagtaatttaaaataataatgatcaaaatgttaaaggatctagttaaaaaaagacaacatgtatggaaaaatgaggaatttcagcaaagatggaaacagtaaaaggaaaaatctagaaataagtgaaagcatgagaacagagatgaagaattacatcagcaagctgattagcagactggtcatcagagttaaagaaagaagcagtaaattttatactaggtcaatacaaatcatttgaatggtagcacaaagggaggaaagagaaaaaccaaataaaccaataaaccaagcaaataaaatactccagtgaatccaagaattctctggtaatatgaaattaactaaaatacaattaattggaattacagaaggagagtaaaaacagaatgtaagagaagaaaaatttgaaaaagatgactaaggagaccaaataacctcaaa-atatccaagaaagattaatacaaaatttaaagaacgctagaataatcacactagtcaaactgctgaaaaccaatgattagcataaatcttgaattcagtcacagaaaaaataggaacactgtgtagagagataaacagaaacaaacattataatgaactgcttgtcagtaactctacaagtcagaaaccaataatacaaaattcttaaataactgaagaaaagtcaatccccaatcttatatccattaactgtaatacagcaaaaataacaattaaat---gacatttgcagattaacactggaagagtcccttgctaacaggtatgcactaaaataaatgtcaaaatcatttcttgaggcaaaaggaatatggaagcaggtgaaagttgaaactacacaaagaaataaa----gccagagaagatataaagatatataacccaattattttacattgctctaaagataattgattgtctaa--ttttttaaaaaaagagtaactttatattatggaattcataatatttgagactataatgcatgacataaatagtataaaggagagaggaaacagaaatgtacattttaaggtttttataccatagttggtatagtacaaattataggttactgtaataagctagaataggtattgaaatctctagagaaaccaTGAACATTTTTAAAAAATGGTATGTGCATT---GTTTTCACAGAACTTCCAGCTTTTATTTATTTGTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18582362 1246 + 99152023 gagttatagtattttcaaaagataaaaagtcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaaatgcaagtaatttaaaataataatgatcaaaatgttaaaggatctagttaaaaaaag---acatgtatggaaaaatgaggaatttcagcaaagatgggaacagtaaaaggcaaaagctagaaataagtgaaagcatgagaacagagatgaagaattacatcagcaagctgattagcagactggtcatcagagttaaagaaagaagcagtaaattttatactaggtcaatacaaatcatttgaatggtagcacaaagggaggaaagagaaaaaccaaataaaccagtgaaccaagcaaataaaatactccagtgaatccaagaattctctggtaatatgaaattaactaaaatacaattaattggaattccagaaggagagtaaaaacagaatgtgagagaagaaaaatttgaaaaagatgactaaggagaccaaataacctcaaa-atatccaagaaagattaatacaaaatttaaagaatgctagaataatcacactagtcaaactgctgaaaaccaacgattagcataaatcttgaattcagtcacagaaaaaataggaacactgtgtagagagataaacagaaacaaacattataatgagctgcttgtcagtaactctacaagtcagaaaccaatgatacaaaattcttaaataactgaagaaaagtcaacccccaatcttatatccattaactgtaatacagcaaaaataacaattaaat---gacattttcagattaacactgcaagagtcccttgctaacaggtatgcactaaaataaatgtcaaaatcatttcttgaggcaaaaggaatatggaagcagatgaaagttgaaactacacaaagaaataaatagtgccagagaagatataaagatatacaacccaattattttacattgctctaaagataattgattgtctaa--tttttttaaaaaagg--aactttatatcatggaattcataatatttgagactataatgcatgacataaatagtataaaggagagaggaaac--aaatatacattttgaggtttttgtaccatagtaggtataatacaaattataggttactgtaataagctagaataggtattgaaatctctagagaaaccaTGAACATTTTTAAAAAATGGTATGTGCATTAATGTTTTCATAGAACTTCCAGCT----TTTATTTGTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77041680 1239 - 143122389 gagttataatattttcaaaagataaaaagtcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaaatgcaagtaatttaaaataataatgatcaaaatgttaaaggatctagtttaaaaaagacaacatgtatggaaaaatgaggaatttcagcaaagatgggaacagtaaaaggcaaaagctagaaataagtgaaagcatgagaacagagatgaagaattacatcagcaagctgattagcagactggtcatcagagttaaagaaagaagcagtaaattttatcctaggtcaatacaaattatttgaatggtagcacaaagggaggaaagagaaaaaccaaataaaccaatgaatcaagcaaataaaatactccagtgaatcgaagaattctctggtaaaatgaaattaactaaaatacaattaattggaattccagaaggagagtaaaaacagaatgtgagagaagaaaaatttgaaaaagatgattaaggagaccaaataacctcaaa-atctccaagcaagattaatacaaaatttaaagaatgctagaataatcacactagtcaaactgctgaaaatc---gattagcataaatcttgaattcagtcacagaaaaaataggaacactgtgtagagagataaacagaaacaaacattataatgaactgcttgtcagcaattctacaagtcagaaaccaatgatacaaaattcttaaataactgaagaaaagtcaacccccaatcttatatccattaactgtaatacagcaaaaataacaattaaat---gacattttcagattaacactggaagagtcccttgctaacaggtctgcactaacataaatgtcaaaatcatttcttgaggcaaaaggaatatggaagcagatgaaagttgaaactacacaaagaaataaatagtgccagag--------aagatatataacccaattattttacattgctctaaagaca----attgtctaa--tttttttttaaaagt--atctttatattatggaattcataatatttgagactataatgcatgaaataaatagtataaaggagagaggaaacagaaatatacattttaagatttttgtaccatagttggtataatacaaattatgggttaccgtaataatctagaataggtattgaaatctctagggaaaccaTGAACATTTTT-TAAAATGGTACATGAATTAATATTTTCATAGAACTTCCAGCTTTTATTTATTTGTTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36504391 1250 + 96509753 gagttataatattttcaaaagataaaaagtcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaaatgcaagtaatttaaaataataatgatcaaaatgttaaaggatctagttaaaaaaaa--gacatgcatggaaaaatgaggaatttcagcagagatgggaacagtaaaaggcaaaagctagaaataagtgaaagcttgagaacagagatgaagaattacatctgcaagctgattagcagactggtcatcagagtt-aagaaagaagcagtaaattttataataggtcaacacaaattatttgaatggcagcacaaagggaggaaagagaaaaacaaaataaaccaatgaaccaagcaaataaaatactccggtgagtccaagaattctctgctaatacgaaattcactaaaatacaattaattggaattccagaaggagattaaaaacagagtgagagagaagaaaaatttgaaaaaggtgactgaggaccccaagtaacctcaaaaagctccaagaaagattaataaaaaatttaaagaatgctagaataatcacactagtctaactgatgaaaaccaacgattagcagaaatcttgaattcagtcacag-aaaaataggaacattgtgtacagagataaacaaaaacaaacattatagtgaaccgcttgtcagcaactctacaagtcacaaaccaatgatacaaaatttttaaataactgaaaaaaagtcagtcaccaatcttatatccattaatt---atataactaaaataacaatgaaatgaagacattttcagattaacactggaagagtcccttgataacaggtctgcactaaaataaatgtcaaaacgatttcttgaggcaaaaggaatatggaagcagatgaatgttgaaactacacaaagaaataaagagtgccagggaagatataaagatatgtagcccaattattttacattgctctaaagatcatggattgtctaaattttttttttaaaagagtaacttcacatcatggaattcataatatgtgagactataatgcatgacataaatagtgtaaaggagggaggaaacagaaatatacaatttaaggtttttataccatagttgatataatacaagctataggttactgtaataagctagaataggtattgaaatctctagagaaacAATGAACATTTTTAAAAGATTATATGTGCATTAATGTTTTCATAGAACTTCTAGCTTTTATTTAT------ i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32584126 1256 - 90941950 gagttataatattttcaaaagataaaaagtcAATGGAATCAAATTCGGAGATAATTCAGATGTTGGAActaaatgcaaataatttaaaataataatgatcaaAATGTTAAAGGATCTagttaaaaaaaa--gacatgcatgGAGAAATGAGGAATTTCAGCAGAGATGGGAACAGTAAAaggcaaaagctagaaataagTGAAAGCTTGAGAACAGAGATGAAGAATTACATCAACAAGCTGATTAGCAGACTGGTCATCAGAGTA-AGAAAAGAAGCAGTAAATTTTATATTAGGTCAACACAAATTATTTGAATGACAGcacaaagggaagaaagaggaaaacaaaataaaccaatgaaccaagcaaataaaatacTCCGGTGAGTCCAAGAATTCTCTGCTAATACGAAATTAACTAAAATACAATTAATTGGAATTCCAGAAGGAGATTAAAAACAGAGtgtgagagaagaaaaatttgaaaaagatgaCTGAGGACCCCAAGCAACCTCAAAAAGCTCCAAGAAAgattaatacaaaatttaaagaacGCTAAAATAATCACACTACTCTAACTGATGAAAACCAACGATTAGCATAAATCTTGAATTCAGTcacag-aaaaataggaaaattgtGTACAGagataaacagaaacaaacattACAGTGAACTGCTTGTCAACAACTCTACAAGTCACAAACCAatgatacaaaatttttaaataactaaaaaaaaatcagtccccAATCTTATATTCATTAACT---ATATAACTAAAACAACaattaaatgaagacattttcagattaaCACCGGAAGAGTCCCTTGCTAACAGGTCTGCACTAAAATAAACGTCAAAACGATTTCTTGAGGCAAAATGAATATGGAAGCAGATGAATGTTGAAactacacaaagaaataaagagtgcCAGGGAAGATATAAAGATATGTAGCCCAATTATTTTACATTACTCTAAAGATCATGGattgtctaaatttttttttaaaaagagtaactTCACATCATGGAATTCATAATATTTGAGACTATAATGCATGACATAAATAGTGTAAAGGAGGGAGGAAACAGAAATATACAATTTAAGGTTTTTATACCATAGTTGATACAATACAAACTATAGGTTACTATAATAAGCTAGAATAGGTATTGAAATCTCTAGAGAAacaatgcacatttttaaaagattatatgtGCATTAATGTTTTCATAGAACTTCtagcttttatttgtttttat i papAnu2.chr10 I 333 C 0 s chlSab2.chr2 37952306 1252 - 90373283 gagttataatattttcaaaagataaaaa-tcaacagaatcaaattcagagataattcagatgttggaactaaatgcaagtaatttaaaataataatgaccaaaatgttaaaggatctagttaaaaaaaa--gacaggcatggagaaa--aggaatttcagcagagatgggaacagtaaaaggcaaaagctagaaataagtgaaagcttgagaacagagatgaagaagtacatccgcaagctgattagcagcctggtcatcagattt-aagaaagaagcagtaaattttatattaggtcaacataaattatttgaatggcagcacaaagggaggaaagaggaaaacaaaataaaccaatgaaccaagcaaataaaatactccagtgagtccaagaattctctggtaatatgaaattaactaaaacacaattaattggaattccagaaggagattaaaaacagagtgtgagagaagaaaaatttgaaaaagatgactgaggacaccaagcaacctcaaatagctccaagaaagattaataaaaaattgaaagaatgctagaataatcacactagtctaactgatgaaaaccaacgattagcataaatcttgaattcagtcacag-aaaaataggaacattgtgtacagagataaacagaaacaaacattacagtgaactgcttgtccgcaactctacaagtcacaaaccaatgatacaaaatttttaaataactgaaaaaaagtcagtcaccaatcttatatccattaact---atataactaaaataacaattaaatgaagacattttcagattaacactggaagtgtcccttgctaacaggtctacactaaaataaacgtcaaaacaatttcttgaggtaaaaggaatatggaagcagatgaatgttgaaactacgcaaagaaataaagagtgccagggaagatataaagatatgtagcccaattattttacattgctctaaagatcatggattgtctaaatttttttttaaaaagagtaacttcacatca-ggaattcataatatttgagactataatgcatggcataaatagtgtaaaggagggaggaaacaggaatatacaatttaaggtttttatacaatagttgatataatacaaactataggttactgtaataagctagaataggtattgaaatctctagagaaacAATGAATATTTTTAAAAGATTATATGTGCATTAATGTTTTCATAGAACTTCTAGCTTTTATTTGTttgttt i chlSab2.chr2 C 0 I 21 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=161320.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 152370 158 + 478999 GTATTCAT-------TTAAt---tttatttatttt-----ttttgagatggagtctcgccctgttgcccaggctgcagtgcaatggtgtgatctcagctcactgcaaccacctccgcctcccagg-ttccaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagg s panTro4.chr18 74633915 160 - 76611499 TTATTCAT-------TTAAt---tttatttattttc----ttttgagatggagtctcgccctgttgcccaggctgcagtgcaatggtgtgatctcagctcactgcaaccacctccgcctcccagggttccaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18583608 162 + 99152023 TTATTCAt-------tttat---tttatttatttattta-ttttgagatggagtctcaccctgttgcccaggctgcagtgcaatggcatgatctcagctcactgcaaccacctccgcctcccagg-ttccaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagg i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77042919 162 - 143122389 TTATTCAt-------tttat---tttatttatttatttatttttgagatggagttttgccctgttgcccaggctggagtgcaatggcatgatctcagctcactgcagccacctctgcctcccaga-ttccaatgattctcctgcctcagcctcc-gagtagctgggattacagg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36505641 140 + 96509753 ---------------TTGAt---tttatttatttatttatttttgagatgcagtctcgac------------ctggagtgcaatggcatgatctcagctcactaca---acctccgcctcccagg-ttccaatgattcgcctgcctcagcctcccaagtacctgggattacagg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32585382 158 - 90941950 ttatttatttatttatttatttatttatttatttatttatttttgagacacagtctcgac------------ctggagtgcaatggcgtgatctcagctcactaca---acctctgcctcccaga-ttccaatgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacagg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37953558 21 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 152528 1 + 478999 t s panTro4.chr18 74634075 1 - 76611499 t i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18583770 1 + 99152023 t i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77043081 1 - 143122389 t i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32585540 1 - 90941950 t i papAnu2.chr10 C 0 I 621 e chlSab2.chr2 37953558 21 - 90373283 I e macFas5.chr10 36505781 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=286333.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 152529 544 + 478999 gcccaccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttggccaggcttgtctcaaactcctggcctcatgatcggcccacctcagcttcccaaagtgctgggattacagacttgagacaccgtgccaggccCCAGCTTTTAGTTTTTAAGGTAGTTGTTGTGTTATTACATGTGAAGTAAGGTTATTCTTAAATATCCATGTTTTGAGAATTAATGATAATGACAAGTTAATTTATCTCAATCTAAATGA--TTTTAATATTAAATATTTAAATATTtttattacttttcctttttaacagaagtcattctaactggtgtgagatggtatttcactgatgttttgttttgcatttctctgatgattagtgatggtatgcatgtgttaatatgtttgttggccacatatgtgttcttctgaaaactgt----tcacgttctttgcccattttttaatggggttatttattttttgctcgttgatttgcctaagtctcttatggcttctggataataggcctttgctgta s panTro4.chr18 74634076 550 - 76611499 gcccaccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagagacgaggtttcaccatgttggccaggcttgtctcaaactcctggcctcatgatcggcccacctcagcttcccaaagtgctgggattacagacttgagacactgtaccaggccCCAGCTTTTAGTTTTTAAGGTAGTTGTTGTGTTATTACATGTGAAGTAAGGTTATTCTTAAATATCTATGTTTTGAGAATTAATGATAATGACAAATTAGTTTATCTCAATCTAAATGACattttaatattaaatatttaaatatttttattatttttcctttttaacagaagtcattctaactggtgtgagatggtatttcactgatgttttgttttgcatttctctgatgattagcgatggtatgcatgtgttaatatgtttgttggccacatatgtgttcttctgaaaactgtctgttcacgttctttgcccattttttaatggggttatttattttttgctcgttgatttgcctaagtctcttatggcttctggataataggcctttgctgta i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18583771 550 + 99152023 gcccaccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagagacgcggtttcaccatgttggccaggcttgtctcaaactcctgaccttgtgatcggcccacctcagcctcccaaagtgctgggattacagacttgagacaccgtgccaggccCCAGCTTTTAGTTTTTAAGGTAGTTGTTGTGTTATTACAGGTGAAGTAAGATTATTCTTAAATATCCATGTTTTGAGAATTAATGATAATGACAAATTAATTTATCTCAATCTAAATGACattttaatattaaatatttaaatatttttattatttttcctttttaacagaagtcattctaactggtgtgagatggtatctcattgatgttttgttttgcatttctctgatgattagtgagggtatacatgtgttaatatgtttgttggccacatatgtgttcttttgaaaactgtctgttcatgttctttgcctatttcttaatggcgttatttattttttgctcgttgatttgcctaagtctcttatggcttctggataataggcctttgctgta i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77043082 545 - 143122389 gcccaccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagagacgaggtttaaccatgttggccaagcttgtctcaaactcctgacctcgtgataggcccacctcagcttcccaaagtgctaggattacagacttgagacaccgtgccaggccCCAGCTTTTAGTTTTTAAGGTATTTGTTGTGTTATTACATGTGAAGTAAGGTTATTCTTAAATATCCATGTTTTGAGAATTAATGATAATGACAAATTAATTTATCTCATTCTAAATGACATTTTAATATCAAATATTTAAATATTtttattatttttcctttttaacagaagtcattctaactggtgtgagatggtatttcattgatgttttgttttgcatttctctgatgattagtgatggtatgcatgtgttaatatgtttgttggccacatatgtgttcttttgaaaacttt----tcatgttttttgcccattt-ttaatggggttatttattttttgcttattgatttgtctaagtctcttatggattctggataataggcctttgctgta i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37953558 21 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32585541 621 - 90941950 I e macFas5.chr10 36505781 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=68918.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 153073 57 + 478999 tgcatagtgtgtgaatattttcttccactcggtaggctgtctgttcaatcccttgag s panTro4.chr18 74634626 56 - 76611499 tgcataatgtgtgaatattttcttccattctgtag-ctgtctgttcaatcccttgag i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18584321 57 + 99152023 tgcatagtgtaggaatattttcttccattctgtaggctgtctgttcaatcccttgag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77043627 57 - 143122389 tgaatagtgtgtgaatattttcttccattctgtaggctgtctgttcaatcccttgag i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36505781 57 + 96509753 tgcatagtgtgtacatattttcttccattctgtaggctgtctgttcaatcccttgat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32586162 57 - 90941950 tgcatagtgtgtagatattttcttccattctgtaggctgtctgttcaaTCCCTTGAT i papAnu2.chr10 I 621 C 0 e chlSab2.chr2 37953558 21 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=451220.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 153130 270 + 478999 agtttctcatgctgtgcagaagaagctctttagtttaattaaatcatacttgtcaatttttatttttctggcaattgcttttgaggacttacccataaattcattgccaagtgcaatgtccaggtgaatatttcctaggttttcttccaggatttttatagGCAGAGGATGTAATCTCATGTCAATGGGTCTTAATAATCAAATGACTCCACACTGAGAATCATTACTGTGAAAAATCGATTTTGTTATAATGATAGAAATTTAAACATA s panTro4.chr18 74634682 270 - 76611499 agtttctcatgctgtgtagaagaagctctttagtttaattaaatcatacttgtcaattttcatttttctggcaattgcttttgaggacttacccataaattcattgccaagtgcaatgtccagatgaatatttcctaggttttcttccaggatttttatagGCAGAGGATGTAATCTCATGTCAATGGGTCTTAATAATCAAATGACTCCACACTGAGAATCATTACTGTGAAAAATTGATTTTGTTATAATGATGGAAATTTAAACATA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18584378 267 + 99152023 agtttctcatgctgtgc---agaagctctttagtttaattaaatcatacttgtcaattttcatttttctggcaattgcttttgagaacttacccataaattcaatgccaactgcaatgtccagatgaatacttcctgggttttcttccaggatttttatagGCAGAGGATGTAACCTTAGAACAATGGATCTTAATAATCAACTGACTCCACACTGAGATTCAATACTGTGAAAAATCAGTTTTGTTATAATGATGGAAATTTAAACATA i ponAbe2.chr15 C 0 I 2649 s nomLeu3.chr5 77043684 270 - 143122389 agtttcttatgctgtgcagacgaagctctttagtttaattaaatcatactttttaattttcatttttctggcaattgcttttgaggacttacccataaattcattgccaagtgcagtgtcctgatgaatatttcctaggttttcttccaggatttttatagGCAAAGGATGTAATCTTATGCCAGTGGGTCTTAATAATCAAATGACTCCACACTGAGAATCATTACTGTGAAAAATCAATTTTGTTATAATGATGGAAATTTAAATGTA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36505838 270 + 96509753 agtttctcatgctgtgcagaagaagctatttagtttaattaaatcacacttgtcagttttcatttttctggcaattgcttttgagtacttacccacaaattcattgcgaagtgcaatgtccagaagaatatttcctagtttttcttccaggatttttgtagtcagaggATGTAATCTTATGCCAATGGGTCTTATTAATCAAATGACTCCACAGTGAGAATCATTACTCTGAAAAATCAATTTTGTTATAATGATGGAAATTTAAATATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32586219 270 - 90941950 AGTTTCTCATGCTGTGCAGAAGAAGCTATTTCGTTTAATTAAATCACACTtgtcagttttcatttttctggcaaTTGCTTTTGAGTACTTACCCACAAATTCATTGCAAAGTGCAATGTCCAGAAGcatatttcctagattttcttccaggatttttgtaGTCAGAGGATGTAATCTTATGCCAATGGGTCTTATCAATCAAATGACTCCACAGTGAGAATCATTACTCtgaaaaatcaattttgttataatgatggaaatttaaatact i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37953579 269 - 90373283 agtctctcatgctgtgcagaagaagctatttagtttaattaaatcccacttgtcagttttcatttctctggcaattgcttttgagtacttacccacaaattcattgcgaagtgcaatgtccagaaaaatatttccaagtttttcttccaggatttttgtagtcagaggATGTTATCTTATGCCAATGGGTCTTATTAATCAAATGACTCCACAGTGAGAATCATTACTCTGAAAAATCAA-TTTGTTATAATGATGGAAATTTAAATATT i chlSab2.chr2 I 21 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=82832.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 153400 66 + 478999 TAAAAGTAAAAACAGATGCCACCTCTTTGCTAGAACTCTACAAGGCAAATTACTATAAGAGAGCCA s panTro4.chr18 74634952 66 - 76611499 TAAAAGTAAAAACAGATGCCACCTCTTTGCTAGAACTCCACAAGGCAAATTACTATAAGAGAGGCA i panTro4.chr18 C 0 I 62 s nomLeu3.chr5 77043954 66 - 143122389 TGAAAGTAAAAACAGATGCCACATTTTTGCTAGAACTCTACAAGGCAAACTACTATAAGAGAGGCA i nomLeu3.chr5 C 0 I 4033 s macFas5.chr10 36506108 66 + 96509753 TGAAAGTAAAAATAGATGCCACCTTTTTGCTAGAATTCTACAAGGCAAATTGCTATAAGAGAGGCA i macFas5.chr10 C 0 I 32 s papAnu2.chr10 32586489 66 - 90941950 tgaaagtaaaaatagatGCCACCTTTTTGCTAGAATTCTACAAGGCAAATTGTTATAAGAGAGGca i papAnu2.chr10 C 0 I 56 s chlSab2.chr2 37953848 66 - 90373283 TGAAAGTAAAAACAGATGCCACCTTATTGCTAGAATTCTACAAGGCAAATTGCTATAAGAGAGGCA i chlSab2.chr2 C 0 I 32 e ponAbe2.chr15 18584645 2649 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=2820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 153466 3 + 478999 TTG s panTro4.chr18 74635080 3 - 76611499 TTG i panTro4.chr18 I 62 C 0 s macFas5.chr10 36506206 3 + 96509753 TTG i macFas5.chr10 I 32 C 0 s papAnu2.chr10 32586611 3 - 90941950 ttg i papAnu2.chr10 I 56 C 0 s chlSab2.chr2 37953946 3 - 90373283 TTG i chlSab2.chr2 I 32 C 0 e ponAbe2.chr15 18584645 2649 + 99152023 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M e nomLeu3.chr5 77044020 4033 - 143122389 I a score=993290.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 153469 821 + 478999 CAGTGAAATAAGTGAAAGCACATTATAAATAAACTTACCTGATTTTACAAACTAACCTGTAAAGGGATTTGTACTAATTTTTCCATTGCCTGCATTGCCCTTTCTTCTAGATCCAATTTATATTTTTGTACTTCACCAATGTGTCTTCACCAATGTGTACTTTCCATACGTTTTTTAAGATTTAATATTACTTTTTCCAACATCTTTTTAGCCTCCTCAAGATTTTTACATTCCTGTTGTA-TTTTTTCATACATAATAACTCCTGTTGAATACCTTGATTGTTTTGAGTCAAACAGACATATTTTGAAGATACAGCTTCCAGCTCTGCTGTAAGATCATCAAACTACATTAATAAAATAATATAACTTGAAAATGAAGTAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAGTAACAAATTTTGAAATACATTTACTTGCAATAAAATGTTATCTATAATGTAGATTCTTTAAATGTTAACCCTTAAATTACTCAGAAATTCAAGAACAAAGTAAAAGCCACCATAAGTC----ACATATATTCTTTACTATCATC---TTTGCCACAGAACTTTTGCACTTGATCTTTCTTTTACTTTTCTGATAATTTGTGTTTTTTCCTCCTTAAATGGCTCTATGTTAACTCTTATTAGAAAGTTTCAAACCCCTTTCTCTCATCATCGTGCCCCAAAATTTGTC-----AAAAAAAGTTTCAGAGATATAATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTTAGAATAAGACTTTGAAAATAATGTAATACTCTATgctaggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactat s panTro4.chr18 74635083 819 - 76611499 CAGTGAAATAAATGAAAGCACATTATAAATAAACTTACCTGATTTTACAAACTAACCTGTAAAGGGATTTGTACTAATTTTTCCATTGCCTGCATTGCCCTTTCTTCTAGATCCAAATTATATTTTTGTACTTCACCAATGTGTCTTCACCAATGTGTACTTTCCATACGTTTTTTAAGATTTAATATTACTTCTTCCAACATCTTTTTAGCCTCCTCTAGTTTTTTACATTCCTGTTGTA-TTTTTTCATACATAATAACTCCTGTTGAATACCTTGATTGTTTTGAGTCAAACAGACATATTTTGAAGATACAGCTTCCAGCTCTGCTGTAAGATCATCAAACTACATTAATAAAATAATATAGCTTGAAAATGAAGTAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAATAACAAATTTTGAAATACATTTACTTGCAATAAAATGTTATCTATAATGTAGATTCTTTAAATGTTAACCCTTAAATTACTCAGAAATTCAAGAACAAAGTAAAAGCCACCATAAGTC----ACATATATTCTTTACTATCATCATCTTTGCCACAGAACTTTTGCACTTGATCTTT-----ATTTTTCTGATAATTTGTGTCTGTTCCTCCTTAAATGGCTCTACGTTAACTCTTATTAGAAAGTTTCAAACCCCTTTCTCTCATCATCATGCCCCAAAATTTGTC-----AAAAAAAGTTTCAGAGATATAATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGCTCTTAGAATAAGACTTTGAAAATAATGTAATACTCTATgctaggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactat i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18587294 829 + 99152023 CAGTGAAATAAATAAAAGCAGATTATTAATAAACTTACCTGATTGTACAAACTAACCTGTAAGGGGATTTCTACTAATTTTTCCATTGCCTGCATTGCCCTTTCTTCTAGATGCAGTTTATATTTTTGTACTTCACCAATGTGTCTTTACCAATGAGTACTTTCCATACATTTTTTAAGATTTAATATTACTTCTTCCAACATCTTTTTAGCCTCCTCAAGTTTTTTGCATTCCTGTTGTATTTTTTTCATACGTACTAACTCCTGCTGAATACCTTGATTGTTCTGAATCAAACAGACATATTTTGAAGATCCAGCTTCCAGCTCTGCTGTAAGATCATCAAACTACATTAATAAAATAATGTAGCTTGAAAATGAAGTAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAATAACAAATTTTGAAATACATTTACTTGCAATAAAATGTTATCTATAATGTAGATTCTTTAAATGTTAACCTTTAAATTACTCAGAAATTCAAGAACAAATTAAAAGCCACCATAAGTCACAAACATATATTCTTTACTATCATCATCTTTGCCACAGAACTTTTGCATTTGACCTTTCTTTTATTTTTCTGATAATTTGTGTTTGTTCCTCCTTAAATGGCTCTAAGTTAACTCTTATTAGAAAGTTTCAAACCCATTTTTCTCATCATCATGCCCCAAAATTTGTC-----AAAAAAAGTTTCAGAGATATAATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGTCTCTTAGAATAAGACTTTGAAAATAATGTAATACTCTATgctaggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcacttt i ponAbe2.chr15 I 2649 C 0 s macFas5.chr10 36506209 828 + 96509753 CAGTGAAATAAATGGAAGCACATTATAAATAAACTTACTTGATTTTATAAACTAACCTGTAAAGGGATTTCTACTCATTTTTCTATTGCCTGCATTGCCCTTTCTTCTAGATCCAATTTATAATTTTGTACATCACCAATTTGTCTTCACCTGTGTGTTCTTTCCATAAGCATCTTAAGATTTAATATTTCTTCTTCCAACATA-TTTTATCCTCCTCAAATTTTTTATATTCCTATTGTACTTTTTTCATAGATAGTAACTCCCATTGAATAACTTGATTTTATTTAGTCAAATAGACATATTTTGAAGATACAGCTCCCAGCTGTGTTGTAAGATCATCAAACTACATTAATAAAATAATACAGCTTGATAATGAAGGAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAGTAACAAATTTTGAAATACATTTACTTGCAATAAAATGTTATCTATAACATACATTCTTTAAATGTTAACCCTTAAGTTACTCAGAAATTCAAGAACAAAGTAAAAGCCACCATGAGTAACAATCATATATTCTTTACTATCGTC---TTTGCCACAGAAC-TCTGCACTTGATCTTTCTTTTATTTTTCTGATAATTTGTGTTTTTTCCTCCCTAAATGGCTCCAAGTTAACTCTTATTAGAAAGTTTCAAACCCCCTTCTCTCATCATCATGCCCCAAAATTTGTC-AAAAAAAAGAAGTCTCAGAGGTATTATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAACAAATGGATCTTAGAATAAGACTTTGAAAATAATGTAATACTCTATgctaggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcacttt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32586614 829 - 90941950 caGTGAAATAAATGGAAGCACATTATAAATAAACTTACTTGATTTTATAAACTAACCTGTAAAGGGATTTCTACTCATTTTTCTATTGCCTGCATTGCGCTTTCTTCTAGATCCAATATATAATTTTGTACATCACCAATTTGTCTTCACCAGTGTGTTCTTTCCATAAGCATCTTAagatttaatatttcttcttccaaCATA-TTTTATCCTCCTCAAATTTTTTACATTCCTGTTGTACTTTTTTCATAGATAGTAACTCCCATTGAATAACTTGATTTTATTTACTCAAATAGACATATTTTGAAGATACAGCTCCCAGCTGTGTTGTAAGATCATCAAactacattaataaaataatacagcttGATAATGAAGGAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAGTaacaaattttgaaatacatttacttgcaataaaatgttatctataaCATACATTCTTTAAATATTAACCCTTAAGTTACTCAGAAATTC-AGAACAAAGTAAAAGCCACCATGAGTCACAATCGTATATTCTTTACTATCGTC---TTTGCTACAGAACTTCTGCActtgatctttcttttctttttctgataattTGTGCTTGCTCCTCCCTAAATGGCTCCAAGTTAACTCTTATTAGAAAGTTTCAAACCCCCTTCTCTCATCATCATGCCGcaaaatttgtcaaaaaaaaaaaagtctcagaggTATTATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAACAAATGGATCTTAGAATAAgactttgaaaataatgtaatactctatgctaggcatggtggttcatgcctgtaatcccagcacttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37953949 827 - 90373283 CAGTGAAATAAATGGAAGCACATTATAAATAAACTTACCTGATTTTACAAACTAACCTGTAAAGGGATTTCTACTCATTTTTCTATTGCCTGCATTGCCCTTTCTTCTAGATCCAATTTATAATTTTGTACATCACCAATTTGTCTTCACCAGTGTGTTCTTTCCATAAGCATCTTAAGATTTAATATTTCTTCTTCCAATGTATTTTTATCCTCCTCAGATTTTTTATATTCCTGTTGTACTTTTTTCATAGATAATAACTCCCATTGAATAACTTGATTTTATTTAGTCAAATAGACATATTTTGAAGATACAGTTCCCAGCTGTGTTGTAATATCATCAAACTACATTAATAAAATAATACAGCTTGATAATGAAGGAGGCTGAGAATAATCTCATACAAAACCAGTAACAAAATTTGAAATATATTTACTTGCAATAAAATGTTATCTATAACATACATTCTTTAAATGTTAACCCTTAAGTTACTCAGAAATTCAAGAACAAAGTAAAAGCCACCATGAGTCACAATCATATATTCTTTACTATCATC---TTTGCCACAGAACTTCTGCACTTGATCTTTCTTTTATTTTTCTGATAATTTGTGTTTGTTCCTCCCTAAATGGCTCCAAGTTAACTCTTATTAGAAAGGTTCGGACCCCCTTCTCTCATCATCATGCCCCAAAATTTGTC----AAAAAAAAGTTTCTGAGATATTATATTGAGTTATTTAGGCCAAAGTCAATAAATGGATCTTAGAATAAGTCTTTGAAAAGAATGTAATACTCTATgctaggcatggtggctcatgcctgtaattccagcacctt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M e nomLeu3.chr5 77044020 4033 - 143122389 I a score=126967.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154290 76 + 478999 aggaggctgtggcagaaagattacttgaggccaggaatttgaaaccagccagagcaacatagtgataacataatct s panTro4.chr18 74635902 76 - 76611499 aggaggctgtggcagaaagattacttgaggccaggaatttgaaaccagccagagcaacatagtgataacataatct i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18588123 76 + 99152023 aggaggctgtggcagaaagattacttgaggccagggatttgaaccagcccagagcaacatggtgataacataatct i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048053 76 - 143122389 Agaaggctgtggcagaaagattacttgaggccaggaatttgaaaccagccagagcaacatagtgataacataatct i nomLeu3.chr5 I 4033 C 0 s macFas5.chr10 36507037 76 + 96509753 aggaggctgtggcagaaagatgacgtgaggccgggaatttgagaccagccagagcaacatagtgataccatactct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587443 76 - 90941950 aggaggctgtggcagaaagAAGACGTGAggctgggaatttgagaccagccagagcaacatagtgataccatactct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37954776 76 - 90373283 aggaggctgtggcataaagatcacattaggccgggaatttgagaccagccagagcaacatagtgataccatactct i chlSab2.chr2 C 0 I 41 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=4864.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154366 18 + 478999 ---------cgac--aaaaaa--------ttttattt s panTro4.chr18 74635978 21 - 76611499 ---------cgac--aaaaaaaaa-----tttttttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18588199 21 + 99152023 ---------cgac--aaaaaaaat-----tttttttt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048129 20 - 143122389 ---------caaccaaaaaaaaaa-----attta--- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507113 35 + 96509753 caacaacaacaac--aaaaaaaaaaaaccctgcattt i macFas5.chr10 C 0 I 2 s papAnu2.chr10 32587519 29 - 90941950 caacaacaacaac--aacaaaaa------ctgcattt i papAnu2.chr10 C 0 I 2 e chlSab2.chr2 37954852 41 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=30761.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154384 18 + 478999 aaaattaaccaggcatgg s panTro4.chr18 74635999 18 - 76611499 taaattagccaggcatgg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18588220 18 + 99152023 taaattagccaggcatgg i ponAbe2.chr15 C 0 n 0 s nomLeu3.chr5 77048149 18 - 143122389 aaaattagccaagcatgg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507150 18 + 96509753 aaaactagccaggcatgg i macFas5.chr10 I 2 C 0 s papAnu2.chr10 32587550 18 - 90941950 aaaactagccaggcatgg i papAnu2.chr10 I 2 C 0 s chlSab2.chr2 37954893 18 - 90373283 aaaactagccaggcatgg i chlSab2.chr2 I 41 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=384130.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154402 228 + 478999 tgacttatgcttgtagatccaactagttgggagactaaggcacaaggatggcttggactcagagttcatggctgcagtgaattatgaccaagccactccacttctgcctggatgacagacagagaccatatctc-aaaaaaacacaaaaTAATCCTATAAATAAGGATTCTAATGCCATAAGCCTTTCCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGCTAATTTGAATTGCATTTT s panTro4.chr18 74636017 224 - 76611499 tgacttatgcttgtagatccaactagttgggagactaaggcacaaggatggcttggactcagagttcagggctgcagtgaattatgaccaagccactccacttctgcctcgatgacaga----gaccatatctc-aaaaaaacacaaaaTAATCCTATAAATAACGATTCTAATGCCATAAGCCTTTCCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGTTAATTTGAATTGCATTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7084257 228 + 72422247 tgacttatgcttgtagatccaactagttgggagactaaggcacaaggatggcttggactcagagttcagggctgcagtgaattatgaccaagccactgcacttctgcctggatgacagacagagaccatatctc-aaaaaaacacaaaaTAATCCTATAAATAAGGATTCTAATGCCGTAAGCCTTTCCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGGTAATTTGAATTGCATTTT i ponAbe2.chrUn n 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048167 229 - 143122389 tgacttacgcttgtagatccaactgattgagagactaaggcacaagggtggcttggactcagagttcagggctgcagtgaattatgaccaagccactgcacttctgcctggatgacagacaaagaccatatctcaaaaaaaacacaaaataaaCCTATAAATAAGGATTCTAATACCATAAGCCTTTCCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGCTAATTTGAATTGCATTTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507168 228 + 96509753 tgccttatgcttgcagctccaactagttgggagaccaaggcaaaaggatggattggactcagagttcatggcagtggtgaattatgacaaaattagtgcacttctgcctggatgagagacaaagaccatatctc-aaaaaaacacaaaaCAATCATATAAATAAGGATTCTAATGCCATAAGCCTTTCCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGCTAATTTGAATTGCATTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587568 227 - 90941950 tg-cttaTGCTTGCAGCTCCAACTagttgggagaccaaggcaaaaGGATGGATTGGACTCAGAGTTCATAGCGGTGGTGAATTATGACAAAAttactgcacttctgcctggatGAGAGACAaagaccatatctc-aaaaaaccacaaaacaatcaTATAAATAAGGATTCTAATGCCATAAGCCTTTCCCTAGTCTGTAAATGTTTTATGCTAAtttgaattgcatttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37954911 228 - 90373283 tgccttatgcttgcagctccaactagttgggagaccaaggcaaaaggatggatgggactcagagttcatggcggtggtgaattatgacaaaattactgcacttctgcctggatgagagacaaagaccatatctc-agaaaaacacaaaaTAATCATATAAATAAGGATTCTAATGCCATAAGCCTTTTCCTAGGCTGTAAATGTTTTATGCTCATTTGAATTGCATTTT i chlSab2.chr2 C 0 T 11613 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=1018.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154630 2 + 478999 TA s panTro4.chr18 74636241 2 - 76611499 TA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7084485 2 + 72422247 AA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048396 2 - 143122389 AA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507396 2 + 96509753 AA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587795 2 - 90941950 aa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37955139 11613 - 90373283 T e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=275381.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 154632 547 + 478999 AAAGTAATGACTCTTGGGGTAGAGGCCATAGAATACAGCACCCAGATATAAATCCACATATTTGCCTTACAAGAAATAAATCCACATTcttgccttacaagagctcctgaaggaagcactaaacatggaaagggacaaacagtatgagccactgggaaaacataccaaattgtaacgaccatcgacactataaagaaactgcattaactaatgggaaaaataaacagctaacaacatcatgacaggataaatttcacatgtaacaatattaaccttaaatgtaactgggctaaatgccccagtaaaaagacacagactggcaagttggaaaaagactcaagacccattggtgtgctgtattcaggagacccatctcacatgcaaagacacacacaggctcaaaataaagggacggaggaatatttaccaagcaaatgaaaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcaggggttgcaatcctagtctccgataaaacagactttaaatggaaaagatcaaaagagacaaag---ggcattacaAAG s panTro4.chr18 74636243 547 - 76611499 AAAGTAATGACTCTTGGGGTAGAGGCCATAGAATACAGCACCCAGATATAAATCCACATATTTGCCTTACAAGAAATAAATCCACATTcttgccttacaagagctcctgaaggaagcactaaacatggaaagggacaaacagtatgagccactgcaaaaacataccaaattgtaatgaccatcgacactataaagaaactgcattaactaatgggaaaaataaacagctaacaacatcatgacaggataaatttcacatgtaacaatattaaccttaaatgtaactgggctaaatgccccagtaaaaagacacagacgggcaagttggaaaaagactcaagacccattggtgtgctgtattcaggagacccatctcacatgcaaagacacacacaggctcaaaataaagggacggaggaatatttaccaagcaaa---aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcaggggttgcaatcctagtctctgataaaacaaactttaaatggaaaagatcaaaagagacaaagaagggcattacaAAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7084487 533 + 72422247 AAAGTAATGACTCTTGGGGTAGAGGCCATAGACTACAGCACCCAGATAGAAATCCACATATTTGCCTTACAAGAAATAAATCCACATTcttgccttgcaagagctcc-gaaggaagcactaaacatgggaagggacaaacagtatgagccactactaaaacataccaagttgtaatgaccatcaacactataaagaaactgcattaactaatgggaaaaataaatagctagcaacatcatggcaggataaatttcacatgtaacaatattaaccttaaatgtaaataggctaaatgtcccagttaaaagacacagactggcaagttggaaaaacactcaagacccattggtgtgctgtattcaggagaccaatctcacatgcaaagacacacacaggctcaaaataaagggatggaggaatatttaccaagcaaa---------------tgaagagaaaaaaaaaaaagcaggggttgcaatcctagtctccgataaaacagactttaaatggaaaagatcaaaagagacaaagaagggca-tACAAAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048398 547 - 143122389 AAAGTAATGACTCTTGGGGTAGAGGCCATAGAATACAGCACCCCGATAGAAATCCACATATTTGCCTTACAAGAAATAAATCCACATTcttgccttacaagagctcctgaaggaagcactaaacatggaaagggacaaacagtatgagccactacaaaaacataccaaattgtagagaccattgacactataaagaaactgcattaactaatgggaaaaataaacagctagcaacatcacgacaggataaatttcacatgtaacaatattaaccttaaatgtaaatgggctaaatgccccagtctaaagacacagactggcaagttggaaaaagactcgagacccattggtgtgctgtattcaggagactcacctcacgtgcaaagacacacaccagctcaaaataaagagatggaggaatatttaccaagcaaatgaaaagcaaaa---aaaaaaaaaaaaaaaaaaagcaggggttgcaatcctagtctctgataaaacagactttaaatggaaaagatcaaaagagacaaagaagggcattacaAAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37955139 11613 - 90373283 T e papAnu2.chr10 32587797 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36507398 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=92447.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155179 103 + 478999 CAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGACTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCATTCAGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCATGCTTCTTTGAGTGGGTGAG s panTro4.chr18 74636790 103 - 76611499 CAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGACTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCATTCAGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCATGCTTCTCTGAGTGGGTGAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7085020 103 + 72422247 CAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGACTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCATGCTTCTTTGAGTGGGTGAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77048945 103 - 143122389 CAGTGCCATCTTCTTTTCCTCAGGACTCTGCTCCATCAGCCATCAGGAGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCATGCTTCTTTGAGTGGGTGAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37943526 103 - 90373283 CAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAAACTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGGGTGAG i chlSab2.chr2 T 11613 I 11544 e papAnu2.chr10 32587797 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36507398 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=109921.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155282 213 + 478999 ATTAAAGGCTGGTCCAACTGCACCAGGAGCATGCTTGCAGAGGTGGCTGCTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCTTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGCTACTGACAAGCTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAGGGCAAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGACTTTTTTCTGCACTTG s panTro4.chr18 74636893 213 - 76611499 GTTAAAGGCTGGTCCAACTGCATCAGGAGTATGCTTGCAGAGGTGGCTGCTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGCAACTGACACACTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAAGGCGAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGACTTTTTTCTGCACTTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7085123 212 + 72422247 GTTAAAGGCTGGTCCAACTGCCCCAGGAGCACGCTTGCAGAGGTGGCTGCTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGCTACTGACACGCTGCTCCGAGTGAGCTTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAA-GGCAGAGCCCCTGGGTGGTAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77049048 213 - 143122389 GTTAAAGGCTGGTCCAACTGCACCAGGAGCATGCTTGCAGAGGTGGCTGCTTGCTCTTTGAGTCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGCTGCTGACACGTTGCTCCGAGTGAGCTTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTCACCAGGGCCACAGAAGGCCGAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGACTGCTTTCTGCACTTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37943629 11544 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32587797 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36507398 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=38063.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155495 41 + 478999 AACATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTT s panTro4.chr18 74637106 41 - 76611499 AACATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7085335 41 + 72422247 AACATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCCGTGGTCTGCCTGTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77049261 41 - 143122389 AATATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCGGCCTCTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507398 32 + 96509753 AACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCTTGTGGA--------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587797 32 - 90941950 aacatgaagtcCTCCTCAAGATGGCTTGCGGA--------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37943629 11544 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=175683.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155536 108 + 478999 GGCAACCAAGAAGCCTGCAGTGCCATATAAGCTCGGAGGCATGGACTAGAGCCCCAAAGGCAGTGAACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCATTTCCTCTGTGTGGC s panTro4.chr18 74637147 108 - 76611499 GGCAACCAAGAAGCCTGCAGTGCCATATAAGCTCAGAGGCATGGACTAGAGCCCCAAAGGCAGTGAACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTAATTTCTTCTGTGTGGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7085376 108 + 72422247 GGAAATCAAGAAGCCTGCAGTGCCATATGAGCTCTGAGGCATGGACTAGAGCCCCAAAGGCAGCGAACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTACTCATTTCCTCTGCGTGGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77049302 108 - 143122389 GGCAACCAAGAAGCCCGCAGTGCCACACGAGCCCTGAGGCGTGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCGCACGCCCTGCTCCTGATCCTACTGCTCATTTCCTCTATATGGC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507430 108 + 96509753 GGCAACCAAGAAGCCCACAGTGCCATACAAGCCCTGAGACATGGACTGGAGCCCTAAAGCAAGCACACACCCTGCCACTGAGCCTGCTGCTCATTTCCTCTGTCTGGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587829 108 - 90941950 GGCAACCAAGAAGCCCGCAGTGCCATACAAGCCCTGAGACATGGACTGGAGCCCTAAAGCAAGCACACACCCTGCCACTGAGCCTGCTGCTCATTTCCTCTGTCTGGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955173 108 - 90373283 GGCAACCAAGAAGCCCGCAGTGCCATACAAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCTAAAGCAAGCACACACCCTGCCACTGAGCCTGCTGCTCCTTTCCTCTGTCTGGC i chlSab2.chr2 I 11544 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M a score=68641.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155644 58 + 478999 TCCATTTGTAGCACAGTTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGACAAGCTG s panTro4.chr18 74637255 55 - 76611499 TCCATTTG---CACAGCTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGACAAGCTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7085484 58 + 72422247 TCCATTTGTAGCACAGTTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGACAAGCTG i ponAbe2.chrUn C 0 I 1225 s macFas5.chr10 36507538 58 + 96509753 TCCATTTGCAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATACCTGGCAAGGCCAAGCTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587937 58 - 90941950 TCCATTTGCAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCGTGTGCATACCTGGCAAGGCGAAGCTG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955281 58 - 90373283 TCCATTTGCAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATACCTGGCAAGGCCAAGCTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=70881.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155702 102 + 478999 GCTCAAAGAGGAACCAGCCACTTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTAGACCAGC-CACCAACCTCACTCACTGCCTGCCAGACATGGCACATCAGTTCTTC s panTro4.chr18 74637310 102 - 76611499 GCTCAAAGAGCAACCAGCCACTTCTGCAAGGGTGTGACAGGAGCAGGTAGACCAGA-CACCAACCTCACTCGCTGCCAGCCAGACACGGCACATCAGTTCTTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507596 99 + 96509753 GATCAAAGAGCAATGAGCCAAGTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGACGGTGGACCAGCACACCAACCTCACTCGCTGCCATTCAG----GGTACATCATTTCTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32587995 99 - 90941950 GATCAAAGAGCAATGAGCCAAGTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGACCAGCACACCAACCTCACTCGCTGCCATTCAG----GGTACATCATTTCTTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955339 99 - 90373283 GATCAAAGAGCAACGAGCCAAGTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGACCAGCACACCAACCTCACTCGCTGCCGTTCAG----GATACATCATTCCTTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7085542 1225 + 72422247 I e rheMac3.chr10 35538795 19087 - 95678458 M e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=43778.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155804 35 + 478999 TACCCTAGAGGTAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTT s panTro4.chr18 74637412 35 - 76611499 TACCCTAGAGGTAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35557901 35 - 95678458 TACCCTAGAAGTAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTT i rheMac3.chr10 M 19087 C 0 s macFas5.chr10 36507695 35 + 96509753 TATCCTAGAGGTAGGGCCTCAGTGCCATCGGCTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32588094 34 - 90941950 TATCCTAGAGGTAGGGCCTCAGTGCCATCTGC-TT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955438 35 - 90373283 TATCCTAGAGGTAGGGCCTCAGTGCCATCTGCTTT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e ponAbe2.chrUn 7085542 1225 + 72422247 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=21669.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155839 29 + 478999 TTCTGAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCA s panTro4.chr18 74637447 29 - 76611499 TCCTGAGGCCTCTGCTCCATTAGCCATCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35557936 29 - 95678458 TCCTCAGGCATCTGCTCCATCAGTCGTTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507730 29 + 96509753 TCCTTAGGCCTCTGCTCCAGCAGCCATCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32588128 29 - 90941950 TCCTCAGGCCTCTGCTCCAGCAGCCATCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7085542 1225 + 72422247 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=39228.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155868 98 + 478999 GGTGGCAGCCACACAGGCTGTGGGAACCTGCCTATCCTTGCTTCCTTGAGTAGCAGAGGTTGGTGGCTGCTCTACCTGCTCCCGGTGCACCCCTGCAA s panTro4.chr18 74637476 98 - 76611499 GGAGGCAGCCACACAGGCTGTGGGAACCTGCCTATCCTTGCTTCCTTGAGTAGCCGAGGTTGGTGGCTGCTCCATCTGCTCCCGGTGCACCCCTGCAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35557965 98 - 95678458 GGTGGCAGCCACTCAGGTTGTGGGAACCTGGCCATTCCTGCATCCTTGAGTAGCTGAGGTTGCTGGATGGTGCACCTGCTGCAGGTGCACCCTTGCAG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507759 98 + 96509753 GGTGGCAGGCACTCAGGCTGTGGGAACCTGACCATCCCTGCTTCCTTCAGTGGGTGAGGTTGGTGACTGGTCCAACTGCTACACGCACACCCTTGCCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7085542 1225 + 72422247 I e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=12867.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155966 16 + 478999 AGGTGGCTGGTTGCTC s panTro4.chr18 74637574 16 - 76611499 AGGTGGCTGGTTGCTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558063 16 - 95678458 AGGTGGCTGGTTGCTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507857 16 + 96509753 AGGTGGCAGGCTGTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37761591 16 - 90373283 AGGTGGCTGGATGCTC i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7085542 1225 + 72422247 I e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=39073.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 155982 67 + 478999 TTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCAGAGGCCCCAGCTACTGACATG----------------------------------------CTCCTCTGAGTGAGC s panTro4.chr18 74637590 67 - 76611499 TTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTAGCATGCAGAGGCCCCAGCTACTGACACG----------------------------------------CTCCTCTGAGTGAGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086767 67 + 72422247 tttGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGTCATACACAGCCCCCAGCTACCGACATG----------------------------------------CTGCTTCGAGTGAGC i ponAbe2.chrUn I 1225 C 0 s rheMac3.chr10 35558079 67 - 95678458 TTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTG-------------------------GCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------- i rheMac3.chr10 C 0 I 48 s macFas5.chr10 36507873 66 + 96509753 TTTGAACCAGCTTGGCCTTGCCTGTCATACACAGGCCCCAGCTACCCACGTA----------------------------------------CCGCTCTGAGTGAG- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37761607 67 - 90373283 TTTGAGGCAGCTTGAACTTGCCTGGCATGCAGAGGCCCCAGCTACCTACACG----------------------------------------CTGTCCCAAGTGAGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=23305.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156049 37 + 478999 TTGTCCTGCCTTGGCCCAAATTCTAAGTCTGGTCAGG s panTro4.chr18 74637657 37 - 76611499 TTGTCCTGCCTTGGCCCAAATTCTAAGTCTGTTCAGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086834 37 + 72422247 TTGTTCTGCTTTGGCCCAAATTTTATCTCTGGCCAGA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507939 37 + 96509753 TTGTCCTGCCTGAGGCCAAATTCTAAGTCTGGAAAGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37761674 37 - 90373283 TTGTCCTGCCATGGCCCAAATTCAAAATCTGGCCTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=155559.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156086 376 + 478999 TCCACAGAAGGCAGAGTCCCCTGGGTGGTAATGCTGGCTGCTTTCTGCATTTGAACACAAAGTCCTCCTCCAGACGACCTGTGGTCTGCCCCTTGGCAATGAAGAAGCCCGCAGTGCCATAT-GAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGTGCACACCGTGCTCCTGATCCTGCTGCTCATTTCCTCTCTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCCGAGCGAAGCCAAGCTGGCTCAAAGAGGAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGAGCAGACACTAAACTCACTCGCTGCCGGTTGGGGCACATCAGTTCTTCTCCCATAGAGGTCGGGCC s panTro4.chr18 74637694 376 - 76611499 TCCGTAGAAGGCAGAGTCCCCTAGGTGGTAATGCTGGCTGCTTTCTGCATTTGAACACAAAGTCCTCCTCAAGACGACCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAATGAAGAAGCCCACAGTGCCATAT-GTGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGTGCACACCGTGCTCCTGATCCTGCTGCTCATTTCCTCTCTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCCGAGCGAAGCCAAGCTGGCTCAAAGAGGAACCAGCCACCTCCGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGAGCAGACACTAAACTCACTCACTGCCGGTTGGGGCACATCAGTTCTTCTCCCATAGAGGTTGGGCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36507976 376 + 96509753 GCCACAGAAAGCCTAGACCCCTGGATTGCAATTCTGGCTGCTTTCTTCACTTGAATAGAAAGTTCTCCTTCAGACGGCCTGTGGTCTGCTTCTTGACAACAAAGAAGCCCGCAGTG-CATTCTGAGCCCTGGGGAATTGCCTGGAGCCCTAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCCTTTCCTCTATATGGTCCCATTTGTAACACAATTGTTGCACTGAGGTATGTGCATGCCAGGCAAGACCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCAACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCCGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCGCTGCTGGTCAAGGTACATAATTTCTTCTACCCTAGTGGCAAGGCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37761711 375 - 90373283 GTCACAGAAAGCTGAGTCCCCTGGGTAGTAATTCTGCCTGCTTTGTGCACTTGAATATAAAGTCCTCCTCAAAACGGCCAGTGGTGTGCCTCTTGGCAATGAAGAAGCCCGCAGTG-CATAC-GAGCCCTGATGCATGAACTGGAGCCCAAAACACAGTGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGTTCATTTACTCTGTATGGCTCCACATGTGTCACAGTTGTTGCACTCAGGCTTCTGCATGCTGGGGAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAACCATCTCTGCAAGGGTGTGCCAAGAGACGGTGGAACACCCACCAAAATGACTCGCTACCGGTCAGGCTACATCAGTTCTTCTACCCTAAAGGTAGGGCC i chlSab2.chr2 C 0 I 178 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=611.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156462 3 + 478999 CCA s panTro4.chr18 74638070 3 - 76611499 CCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508352 3 + 96509753 TCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e chlSab2.chr2 37762086 178 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=21622.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156465 44 + 478999 GTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGTCTCCAG s panTro4.chr18 74638073 44 - 76611499 GTGCCATTTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGTCTCCAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508355 44 + 96509753 GTGTCATCTGCTTTTCCTCGGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37762264 44 - 90373283 gtGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCACCAGCCATCAG i chlSab2.chr2 I 178 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e papAnu2.chr10 32588157 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=25863.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156509 36 + 478999 GTGGCAGCCACTCAGACTGTTGGAACCTGGCCATCC s panTro4.chr18 74638117 36 - 76611499 GTGGCAGCCACTCAGACTGTTGGAACCTGGCCATCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508399 36 + 96509753 GTGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAATCTGGCCATCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32588157 35 - 90941950 GTGGCAGGCACTCA-GCTGTGGGAACCTGACCATCC i papAnu2.chr10 C 0 M 1643 s chlSab2.chr2 37762308 36 - 90373283 GTGGCAGCCACTTAGGTTGTTATAACCTGGCCATCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=80716.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156545 203 + 478999 ATGCTTCCTTGTGTGGGTCAGTTT----GATGGCTGCTACATCTGCTCCAGGCACACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGACAGCTTGGC--------CTTGCCTGGCATGCACAGGCTCCAGCTACCGATACGCTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCATTAGGCAAAATTCTAAGTCCGGTCAGGGCCACAGAAGGCAGAGTCCCCT s panTro4.chr18 74638153 203 - 76611499 GTGCTTCCTTGTGTGGGTCAGTTT----GATGGCTGCTACATCTGCTCCAGGCACACCCTTGCGGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGACAGCTTGGC--------CTTGACTGGCATGCACAGGCTCCAGCTACTGACATGCTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCATTAGGCCAAATTCTAAGTCCAGTCAGGGCCACAGAAGGCAGAGTCCCCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508435 203 + 96509753 CTGCTTCCTTCAGTAGCTGAGGCT----GCTGGCTGGTCCACCGGTTCCAGGTGCACCATTGCAGTGGTGGCTGGTTGTTCTTTGAGCCAGCTTGGC--------CTCACCTGGCATGCAGAGGCCCCAGCTACTGAAATGCTCCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTTGGGCCAAATTCTAAGTCTGGTCAAGGCCACTGAAGGCCGAGTCCCCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37762344 215 - 90373283 CTGTTCCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGATGGATGGTCCAACTGGTCCAGGCACACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGATCTTTGAGCCAGCTTGGCCAGCTTGTCCTACCTGGCATGCAAAGCCCCCAGGTACTGACACACTGCTCCGAGTGAGCTTGTCCTGCATTGGCATAAAGTCTAAATCTGGCCAGGTTCACAGAAGGCCAAGTCCCCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e papAnu2.chr10 32588192 1643 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=223756.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 156748 373 + 478999 GGGTGGTAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACCAAGAAGCCCACAGAGCCATACTAGCCCGGAGGCATTGACTGGAGCCCCAAATGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCTGTTTTCTCTGTGTGGCCCCATTTGTAGCACAGTTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGCCAAGCTGGCGCAAAGAGAAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGAGGACCAGCCACCAACCTCGCTCACAGCTGGTCGGTGTACATCACTTCTTCTACCCAAGAGGTAGAGCCCCAGTGCCATCTGCTTTT s panTro4.chr18 74638356 373 - 76611499 GGGTGGTAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACCAAGAAGCCCACAGAGCCATACTAGCCCCGAGGCATTGACTGGAGCCCCAAATGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCTGTTTTCTCTGTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGTAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCATTCACAGCCGGTCGGTGTACATCACTTCTTCTACCCAAGAGGTAGAGCCCCGGTGCCATCTGCTTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508638 283 + 96509753 GGGTGGTAATCCTGGCTGCTTTCTGTTTTGGAACATGAAGTCCTTCTCAAGAAGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTAAAACC-AGAAGCCCGCAGTGCCATACGAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCACTGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTC-ATTTCCTCTATATGGCTCCATTTGTAAGACAATTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTTTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCA---------------------------------------------------------------------------------------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32589835 369 - 90941950 GGGTGGAAatcctggctgctttctgcaCTTGAACGTAAAGTCCTCCTCAAGATGTCATGTGGTCTCCCTATTTGCAACCAAGAAGCCCACAGTGCCATCTGAGCCCTGAGGAATTGACTGGAGCCCTAAAGGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTACTC-CTCTCCACTATACGGCTCCATTTGTAAGACAATTGTTGCACTGAGGCTTCTGCACGCCACGCAAGGCCAAGCTGAAtcaaagagcaaccagccacctctgcaagggtgTGCCAGGAGCCAGTGGACCAGCCACCAATCTCACTGGATGCCACTCATGGTACATCAG---TTCTACCCTAGAGGTAGGGCCCCAGTGTCTTCCGATTTT i papAnu2.chr10 M 1643 C 0 s chlSab2.chr2 37762559 369 - 90373283 GGGTGGTAATCCTGACTGCTTTCTGCACTTAAATATAAAGTCCTCCTCAAGAGAGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAATCAATAAGCCCGCAGTGCAGTACAACCCATGCGGCATGGACTGGAGCCCAAAAGGAAGTGCATACCCTGTTTATGAGCCTGTTGCTC-ATTTCCTCTATATGGTTCCATTTGTAGCACAGTTG-TGTACTGAAGCTTGTGCATGCCGGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAAAGGGTGGACCAGCCACCAACCTCAT--GCTGCTGCTCAGGATACTTCAGTTCTTCTACCCTACACGAGGGGCCCCAGTGCTATCTGCTTTT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=152169.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157121 264 + 478999 CCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGACGCAGACATGCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTCCACCTGCTCCAGGTGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTCGAGCCACCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGGACCCAGCTACTGATACACTGCTCCGAGTGAGCTTGCCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAGGCAGAGC--C s panTro4.chr18 74638729 264 - 76611499 CCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGACGCAGCCATGGAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTCCACCTGCTCCTGGTGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGGCTCCAGCTACTGACACACTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAGGCAGAGC--C i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36508921 263 + 96509753 ---CAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCACACAGTCTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGAGTGAGGTTGGTGGCTGCTCCACCTGCTCCAGGGGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGACTCCAGGTATGGACATTCTGCTCCGAGTGAACTTGTCCTGCCTGGGTCCAAATTCTACACCCTGCCAGGGCCACAGAAACCCTAGGAAC i macFas5.chr10 C 0 I 1 s papAnu2.chr10 32590204 173 - 90941950 CCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGTCATCAGGTGGCAGCCACTCAGGCTGTTTGAAACTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTCCA-------------------------------------------------------------------------------------------TCTGCTCCAAGTGAGCTTGTCCTGCCTGAGGCCAAATTCTAAGTCTGACCAGGGCCACAGAAGGCCTAGG--C i papAnu2.chr10 C 0 I 1 s chlSab2.chr2 37955473 263 - 90373283 CCTCAGGCCTCTGCTCCAGCAGCCATCAGGTGGCAGGCACTGAGGCTGTGGGAACCTGACCATCCCTGCTTCCTTCAGTGGGTGAGGTTGGTGACTGGTCCAACTGCTACACGCACACCCTTGCCAAGGTGGCAGGCTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGTCTGTCATACACAGGCCCCAGCTACCCACGTATCGCTCTGAGTGAG-TTGTCCTGCCTGAGGCCAAATTCTAAGTCTGGAAAGGGCCTCAGAAAGCCTAGA--C i chlSab2.chr2 N 0 I 1 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e rheMac3.chr10 35558146 48 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=178336.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157385 154 + 478999 CCTGGGTGGTAATACTGGCTGCTTTCTGCATTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCATCTTGGCAACGAAGAAGCCCACAGTGCCACACGAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCT s panTro4.chr18 74638993 154 - 76611499 CCTGGGTGGTAATACTGGCTGCTTTCTGCATTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCATCTTGGCAACGAAGAAGCCCACAGTGCCACACGAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCCGTGCACACCCTGCTCCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558194 154 - 95678458 CCTGTGTGGAAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGCCCATAAATTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAACAAAGAAGCCCGCTGTGCCATCTGAGCCCTGAGGAATTGACTGGAGCCCTAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCT i rheMac3.chr10 I 48 I 45 s macFas5.chr10 36509185 152 + 96509753 --TGTGTGGAAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGCCCATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAATGAAGAAGCCCGCAGTGCCATCTGAGCCCTGAGGAATTGACTGGAGCCCTAAAGGCAGCCCACACCCTGCTCCT i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.chr10 32590378 154 - 90941950 CCTGGGTGGAAATTCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAATATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGAAACGAAGGAGCCCACAGTGCCAACTGAGCATTGAGGAATTGACTGGAGCCCTAAAGGCAGCCCACACGCTGCTCCT i papAnu2.chr10 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 37955737 154 - 90373283 CCTGGATTGCAATCCTGGCTGCTTTCTTCACTTGAACATAAAGTTCTCCTTCAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGACAACAAAGAAGCCCGCAGTGCCATCTGAGCCCTGGGGAATTGACTGGAGCCCTAAAGGCAGTGCACACCCTGCTCCT i chlSab2.chr2 I 1 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=37138.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157539 53 + 478999 GAGCCTGCTGCTCGTTTCCTCTATGTGGCTCCATATGTAGCACAGTTGTCGCA s panTro4.chr18 74639147 53 - 76611499 GAGCCTGCTGCTTGTTTCCTCTATGTGGCTCCATATGTAGCACAGTTGTCGCA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509337 53 + 96509753 GAGCCTCCTGCTCCTTTTCTCTGTGTGGCTCCATTTGTAAGACAATTGTTGCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32590532 53 - 90941950 GAGCCTGCTGCTCTTTTCTTCAATATGGCTCCATTTGTAAGACAGTTGTTGCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955891 53 - 90373283 GAGCCTGCTACTCCTCTCCACTATACGGCTCCATTTGTAAGACAATTGTTGCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e rheMac3.chr10 35558348 45 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=294025.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157592 259 + 478999 CTGAGGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCGAAGAGTAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGATGGACCAGCCACCAACCTCACTCACTGCCGGTCAGGGTACATCACTTCTTCTACCCTAGATGTAGGGTCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGAGGCAGCCACTCAGGTTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGGGTGATGTTGG s panTro4.chr18 74639200 259 - 76611499 CTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGTAACGAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCGCTGCCGCTCAGGGTACATCACTTCTTCTATCCTAGATGTAGGGTCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGTCTTTGCTCCATCAGTCTCCAGGTGGCAGCCATTCAGGTTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGGGTGATGTTGG i panTro4.chr18 C 0 I 641 s rheMac3.chr10 35558393 259 - 95678458 CTGCGGTCTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCAACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGATCAGCCACCAACCTCACTCGCTGCTGGTCAAGGCACAAAATTTCTCCTACCCTAGTGGCAAGGCCTCAGTGTCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAACTGGCAGCCAGTCCGGCTGTTGGAACCTTGCCATCTCTCCTTCCTTGAATGGGTGAGGTTGG i rheMac3.chr10 I 45 C 0 s macFas5.chr10 36509390 259 + 96509753 CTGAGGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCAACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGATCAGCCACCAACCTCACTCGCTGCCGGTCAAGGTACTTAATTTCTTCTACCCTAGTGGCAAGGCCTCAGTGTCATCTGCTTTTCCTCGGGCCTCTGTTCCATCTGACATCAGGGGGCAGCCACTCAGTCTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGAGTGAGGTTGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32590585 254 - 90941950 CTGAGGCTTGTtcatgccaggcaaggccaagctggctt-----GCAACCAGCCAACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACTGATGGTCAGTGTACCCCATTTCTTCTACCCTAGAGGTAAGGCCTCAGTGCCACCTACTTTTCCTCAAGCCTCTGCTCTGTCAGCCATCAAGTGGCAGCCAGTCCGGCTGTTGGGACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37955944 256 - 90373283 CTGAGGCTTGTGCATGCCACGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCAGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACTGCCGCTTATGGTACATCAGTT---CTACCCTAGAGGCAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCCGCCATCAGGTGGCAGCCATTCAGACTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=6115.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157851 8 + 478999 TGGCTGCT s panTro4.chr18 74640100 8 - 76611499 TGGCTGCT i panTro4.chr18 I 641 C 0 s rheMac3.chr10 35558652 8 - 95678458 TGGCTGTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509649 8 + 96509753 TGGCTGCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32590839 8 - 90941950 ACACTGGT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37956200 8 - 90373283 CAGCTGCT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=140495.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 157859 157 + 478999 CCACCTGCTCCTGGAGCACCCTTGCAGAGGTGGCTTGTTGCTCTTTGAGACAGCTTGGCCATGCCTTTCATGCACAGGCTCCAGCTACTGACACGCTGCTCTGAGTGTGCTTGTCCTGAGTTAGGCCAAATTCTAAGTCCGGTCAGGGCCACAGAAG s panTro4.chr18 74640108 157 - 76611499 CCACCTGCTCCTGGAGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGACAGCTTGGCCATACCTTTCACGCACAGGCTCCAGCTACTGACACGCTGCTCTGAGTGTGCTTGTCCTGCGTTAGGCCAAATTCTAAGTCCGGTCAGGGCCACAGAAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558660 156 - 95678458 CCACCGGTTCCAGGCACACTCTTGCAGATGTGGCTGTTTGCTCCTTGAGCCAGCTTTACCTCGCGTGGCATGCACAGACCCCAGCTACTGCCATGCTGCTCTGAGTGGG-CTGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAATCTGGCCAGGGCCACAGAAG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509657 157 + 96509753 CCACCTGCTCCAGGGGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAACTTGGCCTTGCCTGGCATGCACAGACCTCAGGTACCAAAGTGCTGCTCTGAATGAGTTTGTCCTGCCTGAGGCCAAATTCTGAGCCTGGCCAGGGCCACAGAAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32590847 146 - 90941950 GCAACTGCTCCAGGCGCACTgttgcagaggtggctggttgctctttgagcCACCATGGCCTTGCCTTTCATGCACGTGCCCCA-----------GCTGCTCCGAGTGATCTTGTGCTGCCTGGGGCCAAATTTTAAATCTGCCCAGGGCCACAGAAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37763840 155 - 90373283 -CCCATGGTCTAGGTACACCCTTGTAGAGGTGGCTGGTTGATCTTTGAGCCAGCTTGGCCT-GCCTGGCATGCATAGCCCCCAGGTACTGACACACTCCTCCGAATGAGCTTGTCCTGCATTGGCACAAAGTCTAAATCTGGCCAGGGTCACAGAAG i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7086871 0 + 72422247 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=19015.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158016 14 + 478999 GCAGAGTCCCCTGG s panTro4.chr18 74640265 14 - 76611499 GCAGAGTCCCCTGG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086871 14 + 72422247 GCAGAGTCCCCTGG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558816 14 - 95678458 GCCGAGTCCACTGG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509814 14 + 96509753 GCCTAGGCCCCTGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32590993 14 - 90941950 GCAGAGTCCTCAGG i papAnu2.chr10 C 0 I 15 s chlSab2.chr2 37763995 14 - 90373283 GCCAAGTCCCCTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=10804.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158030 12 + 478999 GTGGTAATCCTG s panTro4.chr18 74640279 12 - 76611499 GTGGTAATCCTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086885 12 + 72422247 GTGGTAATCCTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558830 12 - 95678458 GTGGAAATCCTG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509828 12 + 96509753 GCGCAAATCCTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764009 11 - 90373283 GTGT-AATCCTG i chlSab2.chr2 C 0 I 22 e papAnu2.chr10 32591007 15 - 90941950 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=52699.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158042 65 + 478999 GCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACC s panTro4.chr18 74640291 65 - 76611499 GCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086897 65 + 72422247 CCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAGGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGGAACC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558842 65 - 95678458 GCTGCTTTCTGCACTTCAACCTAAAGTCATCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGACAACC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509840 65 + 96509753 GCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTCTGGTCTGCCTCTTGGCAATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37764020 22 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32591007 15 - 90941950 I e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=14903.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158107 37 + 478999 AAGAAGCCCACAGAGCCATACTAGCCCGGAGGCATTG s panTro4.chr18 74640356 37 - 76611499 AAGAAGCCCACAGAGCCATACTAGCCCCGAGGCATTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086962 37 + 72422247 AGGAAGCCCGCAGTGCCACACGAGCCCTGAGGCATGG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509905 37 + 96509753 AAGAAGCCCGCAGTGCCATCTGAGCCCTGGGGAATTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37764020 22 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32591007 15 - 90941950 I e rheMac3.chr10 35558907 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=270537.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158144 357 + 478999 ACTGGAGCCCCAAATGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCTGTTTTCTCTGTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGCTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGCAAGGCCAAGCTGGCGCAAAGAGAAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACAGCTGGTCGGTGTACATCACTTCTTCTACCCAAGAGGTAGAGCCCCAATGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGATGCAGCCATGCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTC s panTro4.chr18 74640393 357 - 76611499 ACTGGAGCCCCAAACGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCTGTTTTCTCTGTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTGTACTGAGGCTTGTGCATGCTGGGTAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACAGCCGGTCGGTGTACATCACTTCTTCTACCCAAGAGGTAGAGCCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGACGCAGCCATGCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7086999 356 + 72422247 ACTGGAGTCCCAAAGGCAGCACACACCCTTCTCCTGAGCCTGCTGTTC-ATTTCCTCTATATGGCTCTATTTGTAGGACCGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCCGGGCAAGGACAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGTCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACAGCCGGTCGGTGTACATCACTTCTTCTACCCAAGAGGTAGAGCCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGATGCAGCCATGCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTCGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGCTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr10 36509942 350 + 96509753 ACTGGAGCCCTAAAGGCAGTGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTC-CTTTCCTCTATATGACTCCATTTGTAAGACAGTTGTTGCACTGACGTTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTT-----GCAACTAGCCAACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGCTGGACCAGCCACCAACCTCACTCACTGCC-GCTTGTGTACCTCATTTCTTCTACCCTAGAGGTAAGGCCTCAGTGCCGTCTACTTTTCCTCAAGCCTCTGCTCTGTCAGCCATCAGGTGGCAGCCAGTCCGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCCTACTTCCTTGAGTGGGTGAGGTTGGTGGCTGGTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764042 355 - 90373283 ACTGGAGCCCAAAAGGAAGCGCACACCCTGTCCCTGAGCCTGCTACTC-ATTTCCTCTATATGGCTCCATTTGTAGCACAGTTG-TGCACTGAGGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGGGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCTGGTGGACCAGCCACCAACCTCACATGCTGCCAGTCAGGGTACATCAGTTCTTCTACCCTAGACGTAGGGACCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTTTTCCATCAAACATCAGGAGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAACCTGGCCATCCCTGCTTCCTTCAGTGGCTGAGGGTGCTGGCTGGTC i chlSab2.chr2 I 22 C 0 e papAnu2.chr10 32591007 15 - 90941950 I e rheMac3.chr10 35558907 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=3295.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158501 3 + 478999 CAC s panTro4.chr18 74640750 3 - 76611499 CAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7087355 3 + 72422247 CAC i ponAbe2.chrUn C 0 I 2727 s macFas5.chr10 36510292 3 + 96509753 CAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591022 3 - 90941950 CAC i papAnu2.chr10 I 15 C 0 s chlSab2.chr2 37764397 3 - 90373283 CAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35558907 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=123383.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158504 106 + 478999 CTGCTCCAGGTGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATACACAGGCCCCAGCTACCGACATGCTGCTCTGAGTGAGC s panTro4.chr18 74640753 106 - 76611499 CTGCTCCAGGTGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATACACAGGCCCCAGCTACCGACATGCTGCTCTGAGTGAGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247432 106 - 108868599 CTGCTCTAGGCGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCATGCGTAGGTCCCAGCTACTGACACGCTGCTCCGAGTGAGC i ponAbe2.chr14 I 27415 C 0 s macFas5.chr10 36510295 106 + 96509753 CTGCTCCAGGCACACTCTTGCAGATGTGGCTGTTTGCTCCTTGAGCCAGCTTTACCTCGCGTGGCATGCACAGACCCCAGCTACTGCCATGCTGCTCTGAGTGGGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591025 106 - 90941950 CTGCTCCAGGTGCACAtttgcagaggtggctggttgctctttgagccagcttggccttgcctggcatgcacagACTCCAGATATGGACATTCTGCTGTGAGTGAAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764400 106 - 90373283 CTGCTCCAGGCGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCCCCTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCCGGCATGCACAGGTCCCAGCTACAGACACGCTGCTCAGGGTGATC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35558907 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=85256.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158610 128 + 478999 TTGTTCTGCTTTGGCCCAAATTTTATCTCTGTCCAGGG----------CAGAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGCCTACTTTCTGCACTTGAATATCAAGTCCTCCTCAGGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACG s panTro4.chr18 74640859 128 - 76611499 TTGTTCTGCTTTGGCCCAAATTTTCTCTCTGTCCAGGG----------CAGAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGCCTGCTTTCTGCACTTGAACATCAAGTCCTCCTCAGGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTGCAACG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247538 138 - 108868599 TTGTCCTGCCTTGGCACAAATTCTCAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAGTCCGAGTTCCCTAGATGGTAATCTTGGCTGCTTTCTGCACTTGAATGTGAAGTCCTCCTCAAGAAGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591131 138 - 90941950 TTGtcctgcctgggttcaaattctaccCCTGGCCAGGGCCACAGAAACCCTAGGAACCTGGGTGGAAatcctggctgctttctgcaCTTGACTATAAAGTCCTCCTCAAGACGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAACA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764506 137 - 90373283 TTGTCCTGCTT-GGCACAAATTCTAAGTCTCGCCTGGGCCACAGAAGGCCGAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTGGCTGCTTTCTACACTAGAATATAAAGTCCTCCTCAAGACAGCCTGTGGTCTGCATCTTGGCAACC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35558907 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=20480.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158738 21 + 478999 AAGAAGCCCGCAGTGCCACAC s panTro4.chr18 74640987 21 - 76611499 AAGAAGCCCGCAGTGCCACAC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247676 21 - 108868599 AAGAAGCCCACAGTGCCATAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558907 21 - 95678458 AAGAAGCCTGTAGTGCCATAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591269 21 - 90941950 AAGAAGCCCGCGGTGCCATCT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764643 21 - 90373283 AGGAGGCGGGCAGTGCCATAA i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=85238.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158759 70 + 478999 GAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCACACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCATTTCC s panTro4.chr18 74641008 70 - 76611499 GAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCATTTCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247697 70 - 108868599 GACCTCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCTGAACCTGCTGCTTGTTTCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558928 70 - 95678458 GAGCCCTGAGGGATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCTCACACCATGCTCCTGAGCCTGCTGCTCTTTTTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591290 70 - 90941950 GAGCCCTGAGGAATTGACTGGAGCGCTAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCCTTTTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37956223 70 - 90373283 GAGCCCTGAGGAATTGACTGGATCCCTAAAGGCAGCGCACACCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCCTTTCC i chlSab2.chr2 N 0 N 0 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=3575.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158829 3 + 478999 TCT s panTro4.chr18 74641078 3 - 76611499 TCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247767 3 - 108868599 TCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35558998 3 - 95678458 TCT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591360 3 - 90941950 TCT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764734 3 - 90373283 TTT i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=127965.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 158832 181 + 478999 CTGTGACTCCATACCTAGCACAGATGTTGCACTGAGGCTTGTGTATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGCGTGTGCCAGGAGCCGGTGGAGCAGCCACCAAACTCACTTGTTGCAGGTCAGGGCACATCAGTTCTTCTACCCTAGAGGTAGGGCC s panTro4.chr18 74641081 181 - 76611499 CTGTGACTCCATACCTAGCACAGATGTTGCACTGAGGCTTGTGTATGCCAGGCAAGGCCAAGCCGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGCGTGGGCCAGGAGCCGGTGAAGCAGCCACCAAACTCACTTGTTGCAGGTCAGAGCACATCAGTTCTTCTACCCTAGAGGTAGGGCC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247770 181 - 108868599 CTGTGCCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTGCACTGAGGCTTGTGCATGCCGGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACTTCTGCAAGGGTATGCCAGGCGCCGGTGCACCAGCCACCAACTTCACTCGCTCCCGGAAATGGCACATCACTTCTTCTACCCTAAAGATAGGGCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591363 181 - 90941950 GTGTGGCTCCATTTGTAAAACAATTGTTGCACTGAGGCttgtgcatgccaggcaaggcgaagctggctcaaagagcaaccagccaACTCTGCAAGGGTGTGCCAGGAGCCGGTGGACCAGCCACCAACCTCACTCGCTGCTGGTCAAGGTACATAATTTCTTCTACCCTAGTGGCAAGGCC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37764737 181 - 90373283 GTGGGGCTCCAGTTTTAGCACAGTTGTTGCACTGAGTCTTGTGCATGCTGGGCAAGGCCAAGTTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCAGCAAGGGTGTGCCCGGAACGGGAGGACCAGCCACCAACCTCACTCACTGCCAGACATGGTATATCAGTTCTTCCATCCTAAAGGTAGGGCC i chlSab2.chr2 C 0 I 181 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=1337.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159013 4 + 478999 CCAG s panTro4.chr18 74641262 4 - 76611499 CCAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247951 4 - 108868599 ACAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591544 4 - 90941950 GCAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37764918 181 - 90373283 I e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=62798.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159017 90 + 478999 TGCCATCCGCTTTTCCTCAGGCCTTTGCTCCATCAGCCATCAGGAGGCAGCCATTCAGGCTGTGGGAACTTGGCCATCCCTACTTCCTTG s panTro4.chr18 74641266 90 - 76611499 TGCCATCCGCTTTTCCTCAGGCCTTTGCTCCATCAGCCATCAGGAGGCAGCCACTCAGGCTGTGGGAACTTGGCCATCCCTACTTCCTTG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90247955 88 - 108868599 GGCCATTTGCTTTTCCTAAGGCCTCTGCTCTATCAGCCATCACGTGGCAGCCACTCGGGCTGTGGGAACCAGGCCAT--CTACTTCCTTG i ponAbe2.chr14 C 0 I 590 s papAnu2.chr10 32591548 90 - 90941950 TGTCATCTGCTTTTCCTCGAGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGACACTCAGGCCCTTGTAATCTGGCCATTCCTGCTTCCTTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37765099 90 - 90373283 TGCCACCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCACCAGCCATCAGGTGGCAGCCACTTTGGCTGCTGTAACCTGGCCATCCCTGTTTCCTTG i chlSab2.chr2 I 181 C 0 e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=147797.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159107 371 + 478999 AGTAGCTGAGGTTGGTGGCTGCTCCACATGTCCCAGGTGCACCCTTGCAGAGGTGACTGGTTCCTATTTGAGTCAGCTTGGC--------CTTGCCTGGCATGCATAGTCTCCAGCTACTGACATGCTGCTGTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTTGGCCCAAATTCTAAGTCTGGTCAGGGCCACAGAACGCCAAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTG-CTGCTTTCTATACTCGAACATAAAGTCCTCCTCAAGACAGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAACCAAGAAGCCCGCAGTGACATATGAGCCCTGAGCCATGGACTGGAGCACCAAAGGCAGTGTACACCCTGCTCCTGAGCCTGCCTCTAATGTCCTCTGTGTGGT s panTro4.chr18 74641356 371 - 76611499 AGTAGCTGAGGTTGGTGGCTGCTCCACATGTCCCAGGTGCACCCTTGCAGAGGTGACTGGTTCCTATTTGAGTCAGCTTGGC--------CTTGCATGGCATGCATAGTCTCCAGCTACTGACATGCTGCTGTGAGTGAGTTTGTCCTGCCTTGGCCCAAATTCTAAGTCTGGTCAGGGCCACAGAACGCCAAGTCCCCTGGGTGGTAATCCTG-CTGCTTTCTGTACTCGAACATAAAGTCCTCCTCAAGACAGCCTGTGGTCTGCCTCTTGGCAACCAAGAAGCCCGCAGTGACATACAAGCGCTGAGCCATGGACTGGAGCACCAAAGGCAGTGTACACCCTGCTCCTGAGCCTGCCTCTAATGTCCTCTGTGTGGT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32591638 362 - 90941950 AATAGGTGAGGTTGCTGGCTGGCCCACCGGTTCCAG---------TGCAGTGGTGGCTGGTTGTTCtttgagccagcttggc--------cttgcctggcatgcagAGGCCCCAGCTACTGAAATGCTGCTCTGAGTGAGCTTGTCCTGCCTTGGGCCAAATTCTAAGTCTGGTCAAGGCCACTGAAGGCCGAGTCCCCTGGGTGGTaatcctggctgctttctgttttggaacaTGAAGTCCTTCTCAAGAAGGCCTGTGGTCTGCCTCTTTAAAACCAG-AAGCCCGCAGTACCATACGAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCGCATACTCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCATTTCCTCTACATGGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37765189 373 - 90373283 AGTGAGTGAGGTTGGTGGATGGTGCAACTGGTCCAGGCACACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGATCTTTGAGCCAGCTTGGCCAGCTTGGCCTGCCTGGCATGCAGAGCCCCCAGGTACTGACACACTGCTCCGAGTGAGCTTGTCCTGCATTGGCACAAAGTCCAAATCTGGCCACAGCCATAGAAGGTCGAGTCCCCTGAGTGGTAATCCTG---GCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCTCATCACAGCCTGTGGT----CTTTTGGCAACCAATAAGCCCGCAGTGCAACACAAGCCCTGTGACATGGACCGGAGCCCAAAAGGAAGTGCACACCCTGTCCCTGAGCCTGCTGCTCATTTCCTCTATATGGT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90248043 590 - 108868599 I e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049410 0 - 143122389 C a score=9550.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159478 13 + 478999 TCCATTTGTAGAA s panTro4.chr18 74641727 13 - 76611499 TCCATTTGTAGAA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77049410 13 - 143122389 TTCATTTGTAGGA i nomLeu3.chr5 C 0 I 9494 s papAnu2.chr10 32592000 13 - 90941950 TCCATTTGTAAGA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37765562 13 - 90373283 TCCATTTGTAACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90248043 590 - 108868599 I e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C a score=32169.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159491 70 + 478999 CAGTTGTTGCACTGAGACTTGTGCATGCTGGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCT s panTro4.chr18 74641740 70 - 76611499 CAGTTGTTGCACTGAGACTTGTGAATGCTGGGCAAGCCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32592013 70 - 90941950 CAATTGTTGCACTGAGGCttgtgcatgccaggcaaggccaagctggctgGAAGAGCAACCAGCCACCttt i papAnu2.chr10 C 0 M 1037 s chlSab2.chr2 37765575 69 - 90373283 CAGTTG-TGCACTGAGGCTTCTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGTGAAACCAGCCACCTCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90248043 590 - 108868599 I e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=13517.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159561 70 + 478999 GCAAGGGTGCACCTGGAGCATGTGGACCAGCCACCAACCTCACTTGCTGCCAGACATGGTACCTCAGTTA s panTro4.chr18 74641810 70 - 76611499 GCAAGGGTGTGCCAGGAGCAGGTGGACCAGCCACGAACATCACTCGCTGCCGGACATGGTACCTCAGTTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37765644 70 - 90373283 GCAAGGGTGTGCTAGGAAAGGGTGGACCAGCCACCAACCTCACATGCAGCCGGTCAGGATACATCAGTTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90248043 590 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=106545.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159631 249 + 478999 TTCTACCCTAAAGGTAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCAGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCACTCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCCGGCTTTGTTGAGGGGGTGAGATTGGTGGCTGGTCCAACTGCTCTAGGCACACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCTTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGGTACTGACACGCTACTCTGAGTGAGCG s panTro4.chr18 74641880 249 - 76611499 TTCTACCCTAAAGGTAGGGCCCCAGTGCCATCTGCTTTTCCTCCGGCCTCTGCTCCATCAGCCATCAGGTGGCAGCCACTCAGGCTGTGGGAACCTGGCCATCCTGGCTTCGTTGAGGGGGTGAGATTGGTGGCTGGTCCAACTGCTCTAGCCACACCCTTGCAGAGGTGTCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCTTTGCCTGGCATGCACAGGCCCCAGGTACTGACACGCTGCTCTGAGTGAGCG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90248633 246 - 108868599 TTCTACCCTAAAGATAGGGCCACAGGGCCAT-TGCTTTTCTTAAGGCCTCTGCTCTATCAGCCATCACGTGGCAGCCAATCGGGCTGTGGGAAGCAGGCCATCT--ACTTCATCGGCTGAGCGAGGTTTGTGGCTGGACCAACTGGTCCAGGCGCACCCTTGCAGAGGTGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCTGGCACACACAGGCCCGAGGTACTGCCACACTGCTCCAAGTGAGCT i ponAbe2.chr14 I 590 C 0 s chlSab2.chr2 37765714 248 - 90373283 TTCTACCCTAGAGGTAGGGCCCGAGCGCCATCTGCTTCTTCTCAGGCCTCTTCTCTATCAAACATGAGGAGGCAGCCACTCAGGCTGTTGGAATCTGGCCATCCCTGCTTCCTTTAGTGGCTGAGGTTCGTGGCTGGTCCACCTGCTCCAGGCACACCCTTGCAGAGGCGGCTGGTTGCTCTTTGAGCCAGCTTGGCCTTGCCCGGCATGTA-AGGCCCCAGGTACTGACACACTGCTCCCAGTGAGCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e macFas5.chr10 36510401 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=146218.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 159880 213 + 478999 TGTCATGCCTGGGGCCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGTCACAAAAGGCTGAGTCCCCTAGGTTGTAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCACAAGATGGCCTGTGATCTGCCTCTTGGCAACCAAGAAGCCCACGGTGCCTTATGAGCCCTGAGGCATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGTG--TACACCCTGCTCCTGAGC s panTro4.chr18 74642129 213 - 76611499 TGTCATGCCTGGGACCAAATTCTAAGTCTGGCCAGGGTCACAGAAGCCTGAGTCCCCTAGGTTGTAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAACATAAAGTCCTCCACAAGATGGCCTGTGATCTGCCTCTTGGCAACCAAGAAGCCCAAAGTGCCATATGAGCCCTGAGGGATGAACTGGAGCCCCAAAGGCAGTG--TACACCCTGCTCCTGAGC i panTro4.chr18 C 0 N 0 s ponAbe2.chr14 90248879 213 - 108868599 TGTCCTGCATTGGCCACAATTCTAAGTCTGGCCAGGGCCACAGAAGGACAAGTACCCTAGATGATAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTGAGCATGAAGTCCTTCTCAAAACGGCCTGCGGTCTGCCTCTTGGTAACCAAGAAGCTCGCAGTGCCATACCATCCGTGAGGCACGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGTG--CACACCCTGGTCCTAAGC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36510401 213 + 96509753 TGTCCTGCCTGGGGCCAAATTCTAAATCTGGCCAGGGCCACAGAAGGCCGAGTCCACTGGGTGGAAATCCTGGCTGCTTTCTGCACTTCAACCTAAAGTCATCCTCAAGATGGCCTGTGGTCTGCCTCTTGACAACCAAGAAGCCTGTAGTGCCATATGAGCCCTGAGGGATGGACTGGAGCCCCAAAGGCAGCT--CACACCATGCTCCTGAGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37765962 215 - 90373283 TCTCGTGCCTAGTCACAAATTCTAAGTTTGGCCTGGGTTACAGAAGGCAGAGTCCCCTGGGTGTTAATCCTGGCTGCTTTCTACACTTGAACATAAAATTCTCTTCAAGATGGCCTGTAGTCTGCCTCTGGGCAACCAGTAAGCCTGCAGTGCAATACAAGCCCTGTGGCACAGACTGGAGCCCAAAAGGAAGCGCACACACCCTGTTCCTGAGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=10164.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160093 13 + 478999 CTGCTGGTCATTT s panTro4.chrUn_GL393519 3 13 + 413329 CTGCTGGTCATTT i panTro4.chrUn_GL393519 N 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249092 13 - 108868599 CTGCTGCTCATTT i ponAbe2.chr14 C 0 I 2 s macFas5.chr10 36510614 13 + 96509753 CTGCTGCTCTTTT i macFas5.chr10 C 0 I 2 s chlSab2.chr2 37766177 13 - 90373283 CTGCTGCTCATTT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=2820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160106 3 + 478999 TCT s panTro4.chrUn_GL393519 16 3 + 413329 TCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249107 3 - 108868599 TCT i ponAbe2.chr14 I 2 C 0 s macFas5.chr10 36510629 3 + 96509753 TCT i macFas5.chr10 I 2 C 0 s chlSab2.chr2 37956293 3 - 90373283 TCT i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35559001 0 - 95678458 C e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=26185.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160109 29 + 478999 GTGTGGCTCCATTTGTAGCACAGTTGTTG s panTro4.chrUn_GL393519 19 28 + 413329 GTGTG-CCCATTTTGTAGCACAGTTGTTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249110 29 - 108868599 ATGTGGCTCCATTTATAGGACAGTTGTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35559001 29 - 95678458 GTGCGGCTCCATTTGAAGCACAGTTGTTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36510632 29 + 96509753 GTGTGGCTCCATTTGAAGCACAGTTGTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37956296 29 - 90373283 ATGTGGCTTCATGTGTAAGACAGTTGTTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32592083 1037 - 90941950 M e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=570687.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160138 359 + 478999 CACTGAGGCTTGTGAATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGATCCACCTGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACCCACTTAAGGAAGCAGGGAATGTGTGTTTGTACCATGCATTGCACTACAAGTACATTTCtcctgagtttggtggcctaggttttcttc--taggttttctatggttttaggtcttaagtttaactcttcaatccatcgtaagttaatttttgtataaagtgtaaggaagtggcccagtttcagttttctgcgtatggctagccagttttcctaacaccatttattgaataaggaatcctttccccattgcttgtttt s panTro4.chrUn_GL393519 47 359 + 413329 CACTGAGGCTTGTGAATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGCAAGGATCCACCTGGAGCAGGTGGACCAGCCACCAACCTCACCCACTTAAGGAAGCAGGGAATGTGTGTTTGTACCATGCATTTCACTACAAGTACATTTCtcctgaatttggtggcctaggttttcttc--taggttttttatggttttaggtcttaagtttaactcttcaatccaactcaagttaatttttgtataaagtgtaaggaagtggcccagtttcagttttctgcatatggctagccagttttcctaacaccatttattgaataaggaatcctttccccattgcttgtttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249139 356 - 108868599 CACTGAAGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGCCTCAAAGAGCAACCAGCCACCTCTGTAAGGGTCCGCCTGGAGCAGATGGACCAGCCACCAACCTCACCCACTCAAGGAAGCAGGGAATGCGTGTTTGTACCATGCATTTCACTACAAGTACATTTCCCCTGAGGTTGGTGgcctatgttttcttc--tagtttttt--tgcttttaggtctt-agtttaactcttttatccttcttaagttaatgtttgtataaagtgtaaggaagtggcccagtttcggttttctgcatatggctagccagttttcctaacaccatttattaaatagcgaatcctttccccagtgcttacttt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35559030 355 - 95678458 CACTGAGGCTTGTGCATGCCAGTCAAGGCCAAGCTGGGTCAAAGAGAAGCCAGCCATGTCTGCAGGGATCCACCTGGAGCAGGTGGACCACTCGCCAACCTGACCCACTCAGGGAAGCAGGGAGTGTGTGTTTGTACCATGCATTTCACTGAAAGTACCTTTCTCC-ACGGTTGGTGgcctaggttttcttc--taggttttttatggttttagatcttgca-ttaactccttaatccatcttaagttaatttttgtattaa--gtaagggaatggcccagtttcagttttctgcatacggctggccagttttcccaacaccatttattgaacagggaatcctttccccattgcttgtttt i rheMac3.chr10 C 0 I 5694 s macFas5.chr10 36510661 354 + 96509753 CACTGAGGCTTGTGCATGCCAGTCAAGGCCAAGCTGGGTCAAAGAGAAGCCAGCCATGTCTGCAGGGATCCACCTGGAGCAGGTGGACCACTCGCCAACCTGACCCACTCAGGGAAGCAGGGAGTGTGTGTTTGTACCATGCATTTCACTGAAAGTACCTTTCTCC-ACAGTTGGTGgcctaggttttcttc--taggttttttatggttttagatcttgca-ttaactccttaatccatcttaagttaatttttgtattaa--gtaagggaatggcccagtttcagttttctgcatacggctggccagttttcccaacaccatttattgaacagggaatcctttccccattgcttgttt- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32593123 356 - 90941950 CACTGAGGCTTGTGCATGCCAGTcaaggccaagctggctcaaaGAGAAGCCAGCCATGTCTGCAGGGATCCACCTGGAGCAGGTGGACCACTCGCCAACCTGACCCACTCAGGGAAGCAGGGAGTGTGTGTTTGTACCATGCATTTCACTGAAAGTACCTTTCTCC-ACGGTTGGtggcctaggttttcttc--taggttttttatggttttaggtcttgcGTTTAActc--taatccatcttaagttaatttttgtattaagtgTAAGGGAAtggcccagtttcagttttctgcatacggctggccagttttcccaacaccatttattgaacagggaatcctttccccattgcttgtttt i papAnu2.chr10 M 1037 I 5888 s chlSab2.chr2 37956325 359 - 90373283 CACTGCGGCTTGTGCATGCCAGGCAAGGCCAAGCTGGCTCAAAGAGCAACCAGCCATGTCTACAGGGATCCGCACGGAGCAGGTGGACCACTCGTCAACCTGACCCACTCAGGGAAGCCGGGAATGTGTGTTTGTACCATACATTTCACTGCAAGTACCTTTCTCT-GCAGTTGGTGAcctaggttttcttctataggttttttatggttttaggtcttgcatttaactctttcatccatcttaatataatttttgtattaagcgtaagggaatagcccagtttcagttttctgcatacggctagccagttttcccaacaccttttattg-atagggaatcgtttccccattgcttgtttt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=5730.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160497 6 + 478999 tgtcag s panTro4.chrUn_GL393519 406 6 + 413329 tgtcag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249495 6 - 108868599 tgtcag i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36511015 6 + 96509753 tgtcag i macFas5.chr10 C 0 I 5562 s chlSab2.chr2 37956684 6 - 90373283 tgtcag i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=342366.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 160503 755 + 478999 gtttgtcaaagatcagatggttttagatgtgttgtgtcatttctgaggcctctgttctgttccatttgtctatatatctggtttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtagccttgtagaatagtttgaagtcaggtaccgtgatgcctccagctttattgtttttgctta-gattgtcttggctacgcgagctcttttttggctccatatgaaatttaaagtagtgtttctaattgtgggaagaaagtcaatggtagcttcatggagatagcactgattctataaattactttgggagatatggcATTCAGGCACAGAAATGTCCTTGTGTtaggcaataccattcaggacataggcataggcgaagacttcatcactagaacaccaaaagcgatggcaacaaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaaactaaagagtgtctgcacagcaaaagaaactatcatcagagtgaacaggcaaccctcagaaagggagaaaattgttgcaatctatccatctgacaaagggctaatatgcagaatctataaaa-acttaaacaaatttacaagaaaaaaacaaacaaccccatcaaaaagtgggcaaaggatatgaacagacacttcccaaaggagacatttatgcagccaatgaacatgtgaagcaaag--------cactggtcattagagaaatggaattcaaaaccataatgagatacaatcttacgccacttggaatggccatcattaaa s panTro4.chrUn_GL393519 412 754 + 413329 gtttgtaaaagatcagatggttttagatgtgtggtgtcatttctgaggcctctgttctgttccatttgtctatatatctggtttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtagccttgtagaatagtttgaagtcaggtactgtgatgcctgcagctttgttgtttttgctta-gattgtcttggctacgcaagctcttttttggctccatatgaaatttaaagtagtgtttct-attgtgggaagaaagtcaatggtagcttgatggagatagcactgattctataaattactttgggagatatggcATTCAGGCACAGAAATGTCCTTGTGTtaggcaataccattcaggacataggcataggtgaagacttcatcacgagaacaccaaaagcgatggcaacaaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaaactaaagagtgtctgcacagcaaaagaaactatcatcagagtgaacaggaaaccctcagaatgggagaaaattgttgcaatctatccatctgacaaagggctaatatgcagaatctataaaa-acttaaacaaatttacaagaaaaaaacaaacaaccccatcaaaaagtgggcaaaggatatgaacagacacttcccaaaggagacatttatgcagccaatgaacatgtgaagcaaag--------cactggtcattagagaaatggaattcaaaaccataatgagatacaatcttacgccacttggaatgtccatcattaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90249501 753 - 108868599 ttttctcaaagatcttgcggttttacat-tgtggtgtcatttctgagacctccgttctgttccattggtctgtat-cctggtttggtaccagcaccatgctgtttacattactgtggccttgtagagtagtttgaagtcaggtactgtgatgcctccagctttgttctttttgcttaggattgtcttggctatgcggactcttttttggttccatatgaaatttaaagaactttttttaattttttgaaaaaagtcagtggtagcttgatggggatagcactgaatctataaatcactttgggtggtatgacACTCAGGCACAGAAATGTCCTTGTGTtaggcaataccattcaggacataggcatgggcagagacctcatcactagaacaccaaaagcaaaggcaacaaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaagctaaagagtgtctgcagagcaaaagaaactatcatcagagtgaacaggcgatccacagaatgggagaaaatttttgcaatctatccatctgacaaagggctaatatgcagcatctacaaagcacttaaacaaatttacaag---aaaataaacaaccccatgaaaaagtgggcaaatgatatgaacagacacttcccaaagaag------atgcagccaaagaacacatgaagcaaagcacatcatcactggtcattagag-aatggaaatcaaaaccacaatgagatacaatctcacgccacttagaatggccatcattaaa i ponAbe2.chr14 C 0 I 4209 s chlSab2.chr2 37956690 762 - 90373283 gtttgttaaagatcagacagttttagttgtgtggtgtcatttctgaggtctctgttcagttccattggtccatatatctggattggtacgagtaccacgctcttttggttactgtagccttgtagaatagtttgaagtcaggtactgtgatgcctccagctttgtgctttttatttaggattctcttggctatgtgggctctttgctggttccatatgaaatttaaagcagtttttctaattctttgaagcaagtcagtggtagcttgatggggatagcactgaatctataaattactttaggtggtatggcACTCAGGCACAGAAATGTCCTTGAGTAGggcaataccattcaggacataggcatggacaaagtcttcatcactagaacaccaaaagcaatggcaaccaaagccaaaattgacaaatgggatctaattaaactac--agtgtctgcagagcaaaagaaacaatcatcagagtgaacaggcaacccacagaatgagagaaatttattgcaatctctccatctgaccaagggctaatatacataatctacaaagaacttaaacaaatttacaagagaaaaacaaagaaccccatcaaaaagtgggcaaa-gatatgaacagacacttcccaaagaagacatttatgcaaccaacgaacatgtgaagcaaagcacattaccactggtcattagagaaatggaaagcaaaatcacaatgagacacaatctcatgccagttagaatggccatcattaaa i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=211096.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 161258 891 + 478999 aaatcaggaaacaacagaagctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgttggtgggagtataaatcagttcaaccatcgtggaagacagtgtgatgattcctcaatgatctacaactagaaataccatttgacccagcaatcccattacagtgtatatactcaaaaaaatataaatcattccaatataaagacacatgcacacgtatgcttattgcggcagtgttcacaacaggaaagacttggaaccaacccaaatgcccaccaatgatagactggataaagaaaatgtggcatatatacaccatggaatactatgcagtcat-aaaaaaggatgagttcatatcctttgcagggacatggatgaagctggaaactgtcattctcagcaaactaacacaagaagagaaaaccaaacaccacatgatctcactcataagtaggacctgaacaatgagaacacatggacacaggaagggaaacatcacacacaagggcctgtcagggtggggggctagaaaagggatggcat------------------tagatcatgggttggtgcatgcagcaagccaccatagcatgtgtatacgtatgtaacaaacctgcatgttctgcacatgtaccccagaacttaaagtataa-ttaaaaaaaaaTAAATTTGcttttaattaagcttttcaacatagaacttgtaaagaaaatacttctgaatcttttactaccacatcatagctgggacaaactgctgatattttaaaagtaacacaaatatcaaacagaaagaactagacttaggaaccaaactcaggtttctgtagtgaacagggcagaatcttaactttgggtcgccaccactactccctcagtttggccttggctagcaaaagatgc s panTro4.chrUn_GL393519 1166 892 + 413329 aaatcaggaaacaacagaagctggagaggatgtggagaaataggaacgcttttactctattggtgggagtataaatcagttcaaccatcgtggaagacagtgtgatgattcctcaaggatctacaactagaaataccatttgacccagcaatcccattacagtgtatatactcaaaaaaatataaatcattccaatataaagacacatgcacacgtatgcttattgcggcagtattcacaacaggaaagacttggaaccaacccaaatgcccaccaatgatagactggataaggaaaatgtggcatatatacaccatggaatactatgcagtcataaaaaaaggatgagttcatatcctttgcagggacatggatgaagctggaaactgtcattctcagcaaactaacacaagaacagaaaaccaaacaccacatgatctcactcataagtaggacctgaacaatgagaacacatggacacaggaagggaaacatcacacacaagggcctgtcagggtggggggctagaaaagggatggcat------------------tagatcatgggttggcgcatgcagcaagccaccatagcatgtgtatacatatgtaacaaacctgcatgttctgcacatgtaccccagaacttaaagtataa-tttaaaaaaaaGAAATTTgcttttaattaaacttttcaacatagaacttgtaaagaaaatacttctgaatcttttactaccacatcatagctgggacaaactgctgatattTTGAAAGAAACACAAATATCAAACAGAAAGAACTAGACTTAGGAACCAAACTCAGGTTTCTGTAGTGAACAGGACAGAATCTTAACTTTGGGACACCACCACTACTCCCTCAGTTTGGCCTTGGCTAGCAAAAGATGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37957452 908 - 90373283 aaatcgggaaacaatagatgttggagaggatgtggagaaagaggaatgcttttacaatgttggtgggagtataaattagttcaacaattgtggaagacagtgtgatgattcctcaaggatctataactagaaatagcatttgacccagcaatgccattactgggtatatacctccaaaattataaatcattctaatataaagacacatgcacacgtatgtttattgaggcactgttgacaacagcacagac-tggaaccaacccaaatgcccatcaaggatagactagataaagaaaatgtggcatatatgcaccatggtgtactatgcagccac-aataatggatgagttcatatcttttgcagggacatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactaacacaaaaacagaaaaccaaacaccacgcgttctcactcataagtgggagttgaacaatgggaacacatggacacaggaaggggaacaccacacaccagggcctgtcagggtggggagctaggagagggatggcattagcagaaatccatactgtagatcacggactgatggctgcagcaagccagcatggcatgtgtatacccataaaacaatcccacatgttctgcacatataccacagaacttaaagtataattttaaaaaaaGGAAATTTGcttttaagtaaacttttaatcatagaacttaaaaaaaaaatccttttgaatcttttactaccacatcatagcttggacaaagtgctgatattttaaaagtaacacaaacatcaaacagaaagaactagacttaggaaccaaactcaggtttctgtagttaacagg-cagaatctcaacactgggtcaccaagactactccttcagcctggccttggctagcaaaagatgg i chlSab2.chr2 C 0 I 49 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=2556.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 162149 35 + 478999 aaccacttatgcaaaaaataaaaataaaaaagtt-a s panTro4.chrUn_GL393519 2058 36 + 413329 AACCACTTATGTGaaaaataaaaataaaaaagttaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e chlSab2.chr2 37958360 49 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=214187.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 162184 882 + 478999 aaaaaatcatttctgctaactggaattttttttttttttttttgcagccacatgagttttagccaattcagaagccttgttccccacaatttggagca-ttctttggatttgaccaagtcaggaAGAGATgggagaaaagtgaaacaacaacaacaaaaccccaaacataaacaaacaaaaagagttaagcaaaacaaacaaatgcacaattcatatgattactgagtgttctaatggtaacgagaaattaaaagcagctggtgagtaatcttaaattttagtcattaaggaaaaattttaagacaaaactctaattcagctacttacctggaaataagtctcaggctggtgattgttctctgccatcttagaagctggaaaaaacttacactcaccttccctgtcagaagcaagctgaaactcaagaaaggaggtgcctgctctccatcatcacggaagcaggaaaacttgcc----ttgttggaaataagtaaaacttcagaaaaggagttgtatagcaaaatcaaccttagatctcaaccaaattttgggagatcagggattctctgcaggggagaagctccctaacctcagcacattatcctattggtttgggcaataaagatagcccaggttggtatcaagcaataatgagatttatcaaaggtcaggaccacctTTGTAATCTCCTTCTCTCttttttttttttttttttttttttttgagacggagtctcactgtctcgcctgggctgcagtgcagtggcacgatcttggctcactgcaagctccacttcccaggttcacaccattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggactacaggcacccgccaccatgcccagctaattttttgtattttt s panTro4.chrUn_GL393519 2094 875 + 413329 aaaaaatCATTTCTGCTAACTGGAAttttttttttttttttttgcagccacatgagttttagccaattcagaagccttgttccccacaatttagagca-ttctttggatttgaccaagtcaggaAGAGATgggagaaaagtgaaacaacaacaacaaaaccccaaacataaacaaacaaaaagagttaagc-aaacaaacaaatacacaattcatatgattactgagtgttctaatggtaacgagaaattaaaagcagctgatgagtaatcttaaattttagtcattaaggaaaaattttaagacaaaactctaattcagctacttacctggaaataagtctcaggctggtgatcgttctctgccatcttagaagctggaaaaaacttacactcaccttccctgtcagaagcaagctgaaactcaagaaaggaggtgcctgctctccatcatcatggaagcaggaaaacttgcc----ttgttggaaataagtaaaacttcagaaaaggagttgtatagcaaaatcaaccttagatctcaaccaaattttgggagatcagggattctctgcagggaagaagctccctaacctcagcacattatcctattggtttgggcaataaagatagcccaggttggtatcaagcaataatgagatttatcaaaggtcaggaccacctTTGTAATCTCCttctctc------tctcttttttttttttttttgagacggagtctcactgtctcgcctgggctgcagtgcagtggcacgatcttggctcactgcaagctccacttcccaggttcacaccattctcctgcctcagcctcccaagcagctgggattacaggcacccgccaccatgcccagctaattttttgtattctt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37958409 871 - 90373283 AAAAAATATTTTCTGATAACTGGA--TTTTTTTTTTCACttttgcagccacagggcttttagccaattcagatgccttgctccccacaatttggaacatttccttggatttgaccaagtcaggaAGAGatgggagaaaagtgaaacaacaacaataaaaccccaaacacaaacacacacaaagaattgagcaaaacaaacaaatgcaccatttatatgattactgagtgttctcatggtaaggagaaattaaaagcagctggtggataatcttaaattttagtcatt-agaaaccattttaagacaaaattctaattcagctacttacctggaaataaggcttaggctggtgatcgttctctgccatcttagaagctggaaaaaactgacactcacctttcctgtcagaagcaagccaaaactcaggaaaggaggtgcctgctctccatcgccatggaagcaggaaaacttgccttcgttgttggaaatgagtaaaacttcagaaaaggacttgtacagcaaaatcaactttagatcttaaccaaattttgggagatcaggaactctctgtaggggagaaactccccaacctcagcaaattatcctattggtttgggcaataaagatagcccaggttggtatcaatcaataatgagatttatcaaaggtcaggaccacctTTGTAATCTCCttct-------------tttttttcttttctttgagtcggagtctcgctcagtcacccaggctggagtgcagtggcgcgatcccagctcactgcaagctccgactcccaggttcatgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcacccgccaccgtgcctggctaattttttgtattttt i chlSab2.chr2 I 49 N 0 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=234477.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 163066 2524 + 478999 cgtagagacggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatccatctgtctcagcctccgaaagtgctgggattacaggcgtgaaccaccgcgcccagccCTCTGTctttttttttttttttaatctttattggtatagtctgctttgtcagaaactaggagtgcaacacctgcttttttctattttccatttccttgaaatatttttctccattcctttattttgagcctatgtagggcactgcatgtgagatgggtttcttgaagacggcatactccaatgggtcttggttctttatccagcttgccccctgtgtctttcaattggagcatttagcccatttccatttaaggttagtaatggtatgtgtggatttgatcctgtcgtcatgctgtcagctggcttttttgcagacttatgtatgtggttggtttttagcatcacttgtctgtgtacttcagtgtgtttttgtagtggctggtggtggtcttttctttccatatttagtgcttccttcaggagctcttgtaaggtaggtctggtgataatgaattccctcagcatttgcttgtctgaaaaggatcttgtttctccttcacttatgatgcttaattttgctggacatgaaattctgggttgaaatttcttttctttaagatgttgaatatcttttctggcttgtacagtttcagttgagaggtctgctaagtctgatggaattccctttgcaggtgatgttgcctttctccctagctgcctttaacactttttcttttattttgaccgcagagaatctgatgattatgtgtcttggggatgatcttctcatggcatatcttactgaggttctctggatttcctgaagttgagtgttggcctgtctggctaggttggggacattctcatgaatgatattctgaaatgtgttttccaagttggttccattctcctcatctccttcaggtacattaatcagtcatagatttagtcgtttatataatcccatatttctcggatgttttcttcattccctttcattcttttttcccccattcttgtttgcctgttttatttcagaaagccagtttccaggctctgggattctttcctcttcttggtctattctgttggatggtcttgcacatgagatggagctggtctgacctcagccctccctagtctgcttgcctctcccaggaccccagcctggccacatctgcttacagggcactctcatgtgcccacacatactacaataattttcataatgcaatcacacacaatcaccatgtgactgcattatgaaaattcttctagtgtgatttacagctctgtcaggtcagttattttcttctttatacttgctattttgtctgttagttcctgcaatgttttacaatgatttttagcttccttgtattggattacaacatacttctttcactcagggaactttgttcctacccatatcctgaactctgcttgtatcatttcagacatctcagcctcagcccagttctgaacacttgctggagagttgatgcagtcatttggagaaaagaaagcatgctgaatttttgagttttcagtgttcttgcacagagtctttttctcatctttatgggcttatccaccttcaatctttgaggctgctgacctttggacagggtatttttcctttattatatctgatgaccttgaggatttgattgtggtgtaaggtggattcagccaacaggttttgtctttggaggattttaaggggccaacatgcagctcccaattcttggactgtgtgctttaactctggggaacttgtattgggccacaactttgttctctggctcctcgaggtttggagtccaccgcactgaggggaccaaagtgcggcagctgtggcagaatgctagcagatgcaaaagtccctgcctccctgtgggcattcacctagtggtggaggcaaaacagctggggtgtgggccagggggcccctgctgactgtgtgtgctgttgcactggaggtagttctggtttggggtgggtggctggccagtgaaggtgccttctctgatcccccccaagcaacagtggtcactcagggtataagaaggtcccttttcctctgcacagcattacctcaagggtgagatgctagcaggggtggggtttttggttctgtgcccaccatggcttcatcttcagtggcagttggtgtgggttggggtgtgtgctgcattcccatatgctgttagggcaagtacaacaaaacccacctgtgtaaacacacacagctaagtgatgtaggaagtttccatataaagggctgcagtatggagaggtaatgtgtaggctggtacgtggctgtagaggtcaccttgctgcagctctccactgatcagccacggtccgcttgtacagaagctatggtgtgggcacccagaagtgccctctaagcaggtgtggcctggctggggtcctgggagaggcaagcagactaaggggtgc s panTro4.chrUn_GL393519 2969 2522 + 413329 cgtagagacggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatccatccgtctcagcctccgaaagtgctgggattacaggcgtgaaccaccgcgcccagccCTCTGTc-ttttttttttttttaatctttattggtatagtctgttttgtcagaaactaggagtgcaacacctgcttttttctattttccatttccttgaagtatttttctccattcctttattttgagcctatgtagggcactgcatgtgagatgggtttcttgaagatggcatactccaatgggtcttggttctttatccagcttgccccctgtgtctttcaattggagcatttagcccatttccatttaaggttagtaatggtatgtgtggatttgatcctgtcgtcatgctgtcagctggcttttttgcagacttatgtatgtggttggtttttagcatcacttatctgtgtacttcagtgtgtttttgtagtggctggtggtggtcttttctttcaatatttagtgcctccttcaggagctcttgtaaggtaggtctggtgataatgaattccctcagcatttgcttgtctgaaaaggatcttgtttctccttcacttatgatgcttaattttgctggacatgaaattctgggttgaaatttcttttctttaagatgttgaatatcttttctggcttgtacagtttcagttgagaggtctgctaagtctgatggaattccctttgcaggtgatgttgcctttctccctagctgcctttaacactttttcttttattttgacctcagagaatctgatgattatgtgtcttggggatgatcttctcatggcatatcttactgaggttctctggatttcctgaagttgaatgttggcctgtctggctaggttggggacattatcatgaatgatattctgaaatgtgttttccaagttggttccattctcttcatctctttcaggtacattaatcagtcatagatttggtcgtttatataatcccatatttctcggatgttttgttcattccctttcattcttttttcccccattcttgtttgcctgttttatttcagaaagccagttttcaagctctgggattctttcctcttcttggtctattctgttggatggtcttgcacatgagatggagctggtctgacctca-ccctccctagtctgcttgcctctcccaggaccccagcctggccacacctgcttacagggcactctcaggtgcccacacatactacaataattttcataatgcaatcacacacaatcaccatgtgactgcattatgaaaattcttctagtgtgatttacagctctgtcaggtcagttattttcttctgtatactcgctattttgtctgttagttcctgcaatgttttacaatgatttttagcttccttgtattggattacaacatacttctttcactcagggaactttgttcctacccatatcctgaactctgcttgtatcatttcagacatctcagcctcagcccagttctgaacacttgctggagagttgatgcagtcatttggagaaaagaaagcatgctgaatttttgagttttcagtgttcttgcacagagtctttttctcatctttatgggcttatctaccttcaatctttgaggttgctgacctttggacagggtatttttcctttattatatctgatgaccttgaggatttgattgtggtgtaaggtggattcagccaacaggttttgtttttggaggattttaaggggccaacatgcagctcccaattcttggactgtgtgctttaactctggggaacttgtattgggccacaactttgttctctggcacctcgaggtttggagtccactgcactgaggggaccaaagtgcggcagctgtggcagaatgctagcagatgcaaaagtccctgcctccctgtgggcattcacctagtggtggaggcaaaacagctggggtgtgggccagggggcccctgctgactgtgtgtgctgttgcactggaggtagtgctggtttggggtgggtggctggccagtgaaggtgccttctctgatcccccccaagcaacagtggtcactcagggtataagaaggtcccttttcctctgcacagcattacctcaagggtgagatgctagcaggggtggggtttttggttctgtgcccaccatggcttcatcttcagtggcagttggtgtgggttggggtgtgtgctgcattcccatatgctgttagggcaagtacaacaaaacccacctgtgtaaacacacacagccaagtgatgtaggaagtttccatataaagggctgcagtatggagaggtaatgtgcaggctggtacgtggctgtagaggtcaccttgctgcagctctccactgatcagccacggtccgcttgtacagaagctatggtgtgggcacccgaaagtgccctctaagcaggtgtggcctggctggggtcctgggagaggcaagcagactaaggggtgc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 1444 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 165590 696 + 478999 tgaggtcagaccagccccatctcatgtgcaagactgcccagcagagatcaggtcTCAGAGGAGAACTCTCTCAAaagtgaatcctcagcacagcacaactgctctacacaaacgcggccagacttcttttttaagcaagtccccCTTTTTAGGaagagaactcttagacctgatctgtgctgggcaatcttgcacgtgagatggggctggtctgacctcagcactccttaagtgctgggataaagtgtctcataagagcaagtggagcctagagacatagatgtccctgccctccgggctccacatcagctgacttgctgctccaccactttccttgtctcctgggggctacaccccagagaggtgtaagttaggagttacttaatgtaatcaccccaggatggagggtctgtgctgtgggcccaagccagggttccttgtctggtgatgagcagtaaggagtgtgttgtacccgtggaaggtggactgacttgttccttgtgtcaactgcagcttgttggaggtgtcaatatggcacttagggtctttgctcccttgatattctgagggtagcaagggcagttccactgcagaggcagtggcagagaggatttctgttgctcctggaagctctgtccagggagttgctgagttgctactggcttgaaggctcaagtggggggctggctggagacc e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e panTro4.chrUn_GL393519 5491 1444 + 413329 I e nomLeu3.chr5 77049423 9494 - 143122389 I a score=311.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166286 21 + 478999 caggccaggaagacc---tgccca----------- s nomLeu3.chr5 77058917 35 - 143122389 caggccagaagggctagttgcccaaacagcaaagg i nomLeu3.chr5 I 9494 C 0 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I e panTro4.chrUn_GL393519 5491 1444 + 413329 I a score=152.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166307 3 + 478999 tca s panTro4.chrUn_GL393519 6935 3 + 413329 tca i panTro4.chrUn_GL393519 I 1444 C 0 s nomLeu3.chr5 77058952 3 - 143122389 tgg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90250254 4209 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32593479 5888 - 90941950 I e macFas5.chr10 36511021 5562 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35559385 5694 - 95678458 I a score=298018.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166310 131 + 478999 tggcccacccctctctctgggaactctgtcccaggaaggtttcaaatctccattggccagggaacactggtgggtgtagctggaggcctcaggtgggagatcctgtccagtgatgaggaacaggatcaggg s panTro4.chrUn_GL393519 6938 131 + 413329 tggcccacccctctctctgggaactctgtcccaggaaggtttcaaatctccattggccagggaacactggtgggtgtagctggaggcctcaggtgggagatcctgtccagtgacgaggaacaggatcaggg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90254463 131 - 108868599 tggcctgcccctctctccgggagctctgtcccaggaacatttcacatttccattggccaaggaacgctggtggggatggctggaggccccagctgggaggtcctgtccagtgagatggaacaggatcaagg i ponAbe2.chr14 I 4209 C 0 s nomLeu3.chr5 77058955 131 - 143122389 tggcccatccctctctctgggaactctgtcccaggaaggtttcaaatctccattggccagggaacactggtgggggtagctggaggcctcaggtgggaggtcctgtccagtgacgaggaacaggatcaggg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565079 130 - 95678458 tggccctcccctctctctgggaactctgtcccaggaaggtttcaaatctccgttggctagggaacactggtgggtgtagctggaggcctcaggtgggaggccctgtccagtgatgaggaacaggatcagg- i rheMac3.chr10 I 5694 C 0 s macFas5.chr10 36516583 131 + 96509753 tagccctcccctctctctgggaactctgtcccaggaaggtttcaaatctctgttggccagggaacactagtgggggtagctggaggccttaggtgggaggtcttgtccagtgagggggaacaggatcagga i macFas5.chr10 I 5562 C 0 s papAnu2.chr10 32599367 131 - 90941950 TGGCCCTCCCCTCTCTCTGGGAACTCTGTCCCAGGAAGGTTTCAAATCTCCGTTGGCCAGGGAACACTGGTGGGGGTAGCTAGAGGCCTCAGGTGGGAGGTCCTGTCCAGTGATGAGGAACAGGATCAGGG i papAnu2.chr10 I 5888 I 3141 s chlSab2.chr2 37771042 131 - 90373283 tggcccacccctctctctgggagctctgtcccaggaacatttcaaatttccattggccaaggaatgctgctgggggtagctgcaggccccagttgggaggtcctgtccagtgaggtggaacaggatcaggg i chlSab2.chr2 N 0 C 0 a score=2100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166441 1 + 478999 g s panTro4.chrUn_GL393519 7069 1 + 413329 g i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90254594 1 - 108868599 g i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059086 1 - 143122389 g i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565209 1 - 95678458 g i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36516714 1 + 96509753 g i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37771173 1 - 90373283 g i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32599498 3141 - 90941950 I a score=16296.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166442 6 + 478999 cctgct s panTro4.chrUn_GL393519 7070 6 + 413329 cctgct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90254595 6 - 108868599 cctgct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059087 6 - 143122389 cctgct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565210 6 - 95678458 cctgct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36516715 6 + 96509753 cctgct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32602639 6 - 90941950 CCTGCT i papAnu2.chr10 I 3141 C 0 s chlSab2.chr2 37771174 6 - 90373283 cctgct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=778374.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166448 295 + 478999 tacagaagcattctggccatgatttggtaaagcagctgtgctatgccacaggatctcttctgtccctggtgagtttgtactctccaaagcccgcacgctggaatgactaagttgcccaaacaggaaagatggtggcctgcctcATCTTTTCTCTCAGAA-TTTATCCTGTGTGATGGAGCTTAATTTTTAGGTTGTTAATTTTACTGTCAGCGTT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTGAGAT--ATATAAGAATTCATTTTCTCCTGTAAATAAACCTGTT s panTro4.chrUn_GL393519 7076 297 + 413329 tacagaagcattctggccatgatttggtaaagcagctgtgctatgccacaggatctcttctgcccctggtgagtttgtactctccaaagcccgcacgctggaatgactaagttgcccaaacaggaaagatggtggcctgcctcATCTTTTCTCTCAGAA-TTTATCCTGTGTGATGGAGCTTAATTTTTAGGTTGTTAATTTTACTGTCAGCGTT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTGAGTTTTATATGAGAATTCATTTTCTCCTGTAAATAAACCTGTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90254601 292 - 108868599 tacagaagcagtctggccatgatttggtaaatcagctatgctgtgctgtgggatctcttctttccctggtcggtttgtactctccaaagcctgcaggctggaatgactaagttgcctgaacgggaaagatggcggcctgccccatcttttctctcagagttttatctTGTTTCATGGAGCTTAACTTTTGGCCTGTTGATTTTACTGTCTACATT--AGACTTGTTGAGAAAGAAT----CCGTAATCTTTTAGGTTAGAT--AAATGAGAATTCATTGTCTTCTGTAAATGAATCTGCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059093 295 - 143122389 tacagaagcagtctggccatgatttggtaaagcagctgtgctatgccacaggatctcttccgcacctgctgcgtttgtactctccaaagcctgcacgctggaatgactaagttgcccgaacaagaaagatggtggcctgcATCATCTTTTCTCTCAGAA-TTTATCCTGTGGGATGGAGCTTAATTTTTAGGCTGTTAATTTTACTGTCAGCATT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTTAGAT--ATATGAGAATTCATTTTCTCCAGTAAATAAAACTGTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565216 295 - 95678458 tacagaagcagtctggccatgatttggtaaagcagctgtgccgtgccacaggatctcttctgcccttgatgggtttgtagtctccaaagcccacacactagaatgactaagttgcctgaacaggaaagatgggggcttgccccATCTTGTCTCTCAGAA-TTTATCCTCTGTGATACAGCTTAATGTTTAGGCTGTTAATTTTACTGTCAGCATT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTTAGAT--ATATGAGAATTCATTTTTTCCTGTAAATAAACTTGTT i rheMac3.chr10 C 0 I 241 s macFas5.chr10 36516721 295 + 96509753 tacagaagcagtctggccatgatttggtaaagcagctgtgccgtgccgcaggatctcttctgcacctggtgggtttgtagtctccaaagcccacacactagaatgactaagttgcctgaacaggaaagatgggggcttgccccATCTTGTCTCTCAGAA-TTTATCCTCTGTGATACAGCTTAATGTTTAGGCTGTTAATTTTACTGTCAGCATT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTTAGAT--ATATGAGAATTCATTTTCTCCTGTAAATAAACTTGTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32602645 295 - 90941950 TacagaagcagtctggccatgattTGGTAAAGCAGCTGTGCCGTGCCACAGGATCTCTTCTGCCCTTGATGGGTTTGTAGTCTCCAAAGCACACACACTAGAATGACTAAGTTGTCTGAACAGGAAAGATGGGGGCCTGCCCCATCTTGTCTCTCAGAA-TTTATCCGGTGTGATGCAGCTTAATGTTTAGGCTGTTAATTTTGCTGTCAACATT--AGAGTTGTTCAGAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTTAGAT--ATATGAGAAttcattttttcctgtaaataaaCCTGTT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37771180 291 - 90373283 tacagaagcagtctggccatgatttggtaaagcagctatgctgtgctgcaggatctcttctgcctctggttggtttgtactctccaaagcccgcaggctggaatgactaagttgcctgaacaggaaaggtggcggccttcctcGTCTTTTCTCTTAGAG-TTTATCTTGTTTGATGGAGCTTAATTTTTAGCCTGTTGATTTTACTGTCTACATC--AGACTTGTTCAGAAAGAAT----CTGTTATCTTTTAGGTTAGAT--ATATGAGAATTCATTGTCTTCTGTAAATAAACCTGTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10100192 294 + 96796970 tacagaataagtctggccatgatttgttcaagcagctgtgctgtg---tgggatctcttctgcccctggtcagtttgtatactccaaagtcttcaggctggaatggatgagtcacccaaccaataaagatggaggcctgcccgatctttcctctcagag-ttTACCTTGTATGATGGCACTTAATCTTTAGGCTGTTAATTTTACTGTCAGCATTAGAGAGTCGTTCACAAAGAATCTCACTGTTATCTTTTAGGTTAGAC--ACATGAGAATTGATTGCTTCCTGTAAATAAACCCGTT i calJac3.chr16 N 0 C 0 a score=302376.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166743 150 + 478999 GATGT-TTGCTCTCTGGAAAGAAGTCCCTTTCAGCTATCTGACTTTGATCACAATCATGTAGAGCAGTAGTCAGTCTACAATGACATGATTGAATTTCCATTTCCAGTGTTTCCTAGCTGTGTCTTACATTCTCCAGTTCAGAACTGAGC-----A s panTro4.chrUn_GL393519 7373 150 + 413329 GATGT-TTGTTCTCTGGAAAGAAGTCCCTTTCAGCTATCTGACTTTGATCACAATCATGTAGAGCAGTAGTCAGTCTACAATGACATGATTGAATTTCCATTTCCAGTGTTTCCTAGCTGTGTCTTACATTCTCCAGTTCAAAACTGAGC-----A i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90254893 156 - 108868599 CATGTCTTGTTCTCTGGAAAGAAGTCTCTTTCAGCTCTCTGACTTTGGTCACAATCATGTAGAGCAGTAGCCAGTCTACAATGACATAATTGAATTTCCATTTCCAGTGTTTCGTTGTTGTGTCTTACATTGTCCAGTTCGGAAATGAGCATTTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059388 150 - 143122389 CATGT-TTGTTCTCTGGAAAGAAGTCCCTTTCAGCTATCTGACTTTGATCACAATCATGTAGAGCAGTAGTCAGTCTACAATAACATGATTGAATTTCCATTTCCAGTGTTTCCTAGCTGTGTCTTATATTCTTCAGTTCAGAACTGAGC-----A i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36517016 150 + 96509753 CATGT-TTGTTCTCTGGAAAGAAGTCTCTTTCATCTATCTGACTTTGATCACAGTCAGGTAGAGCAGCAGTCAGTCTAAAACGACATGATAGGATTTCCATTTCCAGTGTTTCCTAGCTGTGTCTTACATCCTGCAGTTCAGAACTGAGC-----A i macFas5.chr10 C 0 I 100 s papAnu2.chr10 32602940 150 - 90941950 CATGT-TTGTTCTCTGTAAAGAAGTCTCTTTCATCTATTTGACATTGATCACAGTCATGTAGGGCAGTAGTCAGTCTAAAACGACATGATAGGATTTCCATTTCCAGTGTTTCCTAGCTGTGTCTTACATTCTGCAGTTCAGAACTGAGC-----A i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37771471 149 - 90373283 CATGTCTTGTTCTCTGGAAAGAAGTCACTTTCAGCTATCTGAC--TGGTCACAGTCATGTAGAGCAGTAGCCAGTCTACAATAACGTTATTGAATTTCCATTTCCAGTGTTTCTTTGTTGTGTCTTACATTGTCCAGTTCAGAACTGAGC-----A i chlSab2.chr2 C 0 I 5 s calJac3.chr16 10100486 151 + 96796970 CATGTCTTGTTCTCTGGAAAGAGGTCTCTTTCTGCTACCTGACTTTGGTCACCATCATGTAGGGTAGCAGCTGGTCTACCATGAGATGACTATATTTCCATTTCCAGCCTTTCCTTCTGGCGTTTTTCATTCTTGAGCTCAGAACTGAGC-----A i calJac3.chr16 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35565511 241 - 95678458 I a score=121315.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166893 46 + 478999 -----TTCTCAGTTGTCAAAATCCTAAGCTGTCCACTGTACTTAAATACTG s panTro4.chrUn_GL393519 7523 46 + 413329 -----TTCTCAGTTGTCAAAATCCTAAGCTGTCCACTGTACTTAAATACTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90255049 45 - 108868599 -----TTCTCAGTTGTCAACATGCTAAGCTGTCCACTGTACTGAAATACT- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059538 42 - 143122389 -----TTCCCAGTTCTCAAAATGCTAAGCTGTCCACTGTACT----TATTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565752 46 - 95678458 -----TTCTCAGTTGTCAAAATGCTAAGCTGTCCACTGTACTTAAATATTG i rheMac3.chr10 I 241 C 0 s macFas5.chr10 36517266 46 + 96509753 -----TTCTCAGTTGTCAAAATGCTAAGCTGTCCACTGTACTTAAATATTG i macFas5.chr10 I 100 C 0 s papAnu2.chr10 32603090 46 - 90941950 -----TTCTCAGTAGTCAAAATGCTAAGCTGTCCACTCTACTGAAATACTG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37771625 46 - 90373283 -----TTCTCAGTTGTCAAAATGCTAAGCTGTCCGCTGTACTGAAATACTG i chlSab2.chr2 I 5 I 1727 s calJac3.chr16 10100637 51 + 96796970 TTTTATTCTCAGTTGTCAAAGTGATAAGCTGTTCACTGTACTGAAACACTG i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=40759.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166939 23 + 478999 GTTTTCGTTAATGCTTCTTCATT s panTro4.chrUn_GL393519 7569 23 + 413329 GTTTTCGTTAATGCTTCTTCATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90255094 23 - 108868599 GTTTTTGTTAATGCTTCCTCATT i ponAbe2.chr14 C 0 I 1761 s nomLeu3.chr5 77059580 23 - 143122389 ATTTTTCTTAATGCTTCTTTATT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565798 23 - 95678458 ATTTTTGTTATTGTTTCCTCCCT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36517312 23 + 96509753 ATTTTTGTTATTGTTTCCTCCCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32603136 23 - 90941950 ATTTTTGCTAATGCTTCCTCATT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10100688 22 + 96796970 -TTTTTGCTAATGTTTCCTCAGT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37771671 1727 - 90373283 I a score=29412.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166962 22 + 478999 CAGTTGTATAGCCTTTAGAAGT--------- s panTro4.chrUn_GL393519 7592 22 + 413329 CAATTGTATAGCCTTTAGAAGT--------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059603 22 - 143122389 CAATTTTACAGCCTTTAGAAGT--------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565821 22 - 95678458 CAATTTTACAGCCTTTAGAAGT--------- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36517335 22 + 96509753 CAATTTTACAGCCTTTAGAAGT--------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32603159 22 - 90941950 CAATTTTACAGCCTTAAGAAGT--------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10100710 31 + 96796970 CAGTTTTATAGCATTTCGAAGACTGTCATTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90255117 1761 - 108868599 I e chlSab2.chr2 37771671 1727 - 90373283 I a score=2932.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166984 5 + 478999 TT---------TTC s panTro4.chrUn_GL393519 7614 14 + 413329 TTATCACTCTTTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90256878 5 - 108868599 ---------TTTTT i ponAbe2.chr14 I 1761 C 0 s nomLeu3.chr5 77059625 14 - 143122389 TTATCATTCTTTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565843 5 - 95678458 ---------TTATC i rheMac3.chr10 C 0 I 9 s macFas5.chr10 36517357 5 + 96509753 ---------TTATC i macFas5.chr10 C 0 I 9 s papAnu2.chr10 32603181 5 - 90941950 ---------TTATC i papAnu2.chr10 C 0 I 108 s chlSab2.chr2 37773398 5 - 90373283 ---------TTTTT i chlSab2.chr2 I 1727 C 0 s calJac3.chr16 10100741 5 + 96796970 ---------TTTTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=72331.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 166989 25 + 478999 TTTTACACTTTCAATTTCCTCCAAA s panTro4.chrUn_GL393519 7628 25 + 413329 TTTTACACTTTCAAGTTCCTCCAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90256883 25 - 108868599 TTTCACATTTTCAATTTCCTCCAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059639 25 - 143122389 TTTCACACTTTCAATTTCCTCCCAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565857 25 - 95678458 TTTCACACTTTCAATTTCCTCCAAA i rheMac3.chr10 I 9 C 0 s macFas5.chr10 36517371 25 + 96509753 TTTCACACTTTCAATTTCCTCCAAA i macFas5.chr10 I 9 C 0 s papAnu2.chr10 32603294 25 - 90941950 TTTCACACTTTCAATTTCCTCCAAA i papAnu2.chr10 I 108 C 0 s chlSab2.chr2 37773403 25 - 90373283 TTTCACACTTTCAATTTCCTCCAAA i chlSab2.chr2 C 0 I 314 s calJac3.chr16 10100746 25 + 96796970 TTTTTCACTTTCAATGTCTTCTAAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=73627.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167014 39 + 478999 ATTTTATTTTCCCTTAGCTGGTTCTGATGTTTTGTTTCA s panTro4.chrUn_GL393519 7653 39 + 413329 ATTTTATTTTCCCTTAGCTGGTTCTGATGTTTTGTTTCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90256908 39 - 108868599 TATTTCTTTTCTCTTAGCTGGCTCTGATGTTTCATTATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059664 39 - 143122389 AATTTATTTTCCCTTAGCTGATGCTGATGTTTTATTTCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565882 39 - 95678458 AGTTTCTTTTCCCTTAGCTGGCTCTGCTGTTTTATTTTG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36517396 39 + 96509753 AGTTTCTTTTCCCTTAGCTGGCTCTGCTGTTTTATTTTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32603319 39 - 90941950 AGTTTCTTTTCCCTTAGCTGGCTCTGCTCTTTTATTTTG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10100771 39 + 96796970 TATTTCTTTTCCTTTAGCTGGTTCTGATGTTTTATTATG i calJac3.chr16 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37773428 314 - 90373283 I a score=1407646.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167053 542 + 478999 TCTAGTTCCAGTCTTAGCATGGCAATTTCTTCCCGCAACATGCTGTTTTCACGCAAGAGATCTTCTTCTTT-------------CTTATGACTAAGAGAAAGCTAAGTAAACAAAGGGAACTTTTAGTTAGCACTCAATAGAATGACATATCATGATTTCTTCTAAAATCAAAGAATGACATTTATATTTCTATAATGAAATAATTCCCATAGTGGATATTTAACTGGAAAAAA-GTTGGACAAAACTTCAAATCTAGAAGAGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------AAAAAGTTGAAATATTTATCTAAAGACCATGAAAAATAAATCACTAGAGGATTTTTAAGAATTTCAGAATTGGAAAAGCCTTTCTCTGAATTAC-AAAAA-ACCCAGAGGCATAAAATAGAAGATTAATACATTTGGCTACATTTTTTAAATTGGGTTTACACTCTGATATCTAACCTACAAACCACACCATCATAAGAGCCTTAGCTATGCATATATTAGGACAGAAGCAATTCCTCAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTCTGAGGAATGTTTTATCAATATACT s panTro4.chrUn_GL393519 7692 541 + 413329 TCTAGTTCCAGTCTTAGCATGGCAATTTCTTCCCGCAACATGCTGTTTTCACGCAAGAGACCTTCTTCTTT-------------CTTATGACTAAGAGAAAGCTAAGTAAACAAAGGGAACTTTTCGTTAGCACTCAATAGAATGACATATCATGATTTCTTCTAAAATTAAAGAATGACATTTAGATTTGTATAATGAAATAATTCCCATAGTGGATATTTAACTGGAAAAAA-GTTGGACAAAACTTCAAATCTAAAAGAGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------AAAAA-TTGAAATATTTATCTAAATACCATGAAAAATAAATCACTAGAGGATTTTTAAGAATTTCAGAATTGGAAAAGCCTTTCTCTGAATTAC-AAAAA-ACCCAGAGGCATAAAATAGAAGATTAATACATTTGGCTACATTTTTAAAATTGGGTTTACACTCTGATATCTAACCTACAAACCACACCATCATAAGAGCCTTAGCTATGCATATATTAGGACAGAAGCAATTCCTCAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTTTGAGGAATGTTTTATCAATATACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90256947 609 - 108868599 TCTAGTTCCAGTCTTAGCATGGCAATTTCTTCCTGCAACGTACTATTTTCATGCAAGAGGTCTTTTTCTTT-------------CTTATAACTAAGAGAAAGCTAAGTAAACAAAGGGAACTTTTAGTTAGCACTCAATAGATTGATATATCATGATTTCTTCTGAAATTAAAAAATAACATCTGTATTTGTATAATGAAAGAATCCCCATAGTGGATATTTAACTGGAAAAAA--CTGGACAAAACTTCAAACCTAATAGAGTGTAAATTCCTCTAGTGACTTATTTTTCATAGTCTTTAAATAAAGATTTAAACTTTTGGAATCTGCTCCTGAATTCCTAAAAG-TTTAAATCTTTATTTAAAGACTATGAAAAATAAATCACCAGAGGATTTTTAAGAATCTCAGAATTAAAAAAGCCTTTCTCTGAATTACAAAAAA-ACCCAGAGGCATAAAATATAAGATTAATACATTTGACTATATTTTTAAGATTAGGTTTATATTCTGATATCTAACCTATCAACCACACCAACCTAAGAGCCTTAGCTATGCATATATTTGGACAGAAGCAATTTCTCAAAGTTCTTCAAGTTTCTTTTACTGAAGAACATTTTACCGATATTCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77059703 542 - 143122389 TCTAGTTCCAGTCTTAGCATGGCAATTTCTTCCTGCAACATGCTATTTTCATGCAAGAGATCTTTTTCTTC-------------ATTATGACTAAGAGAAAGCTAAGTAAACAAAATGAACTTTTAGTTAGCACTCAATAGAATGACATATCATGATTTCTTCTAAAATTAAAGAATGACATTTATATTTGTATAATGAAATAATTCCCATAGTGGATATTTAACTGGAAAAAA-GTTGGACAAAACTTCAAATCTAAAAGGGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------AAAAAGTTGAAATATTTATCTAAAGACCATGAAAAATAAATCACTGGAGGATTTTTAAGAATTTCAGAACTGGAAAAGCCGTTCTCTGAATTAC-AAAAA-ACCCAGAGGCATAAAATAGAAGATTAATACATTTGGCTACATTTTTAAAATTGGGTTTACACTCTGATATCTAACTTCTAAGCCACACCATCGTAAGAGCCTTAGCTATGCATATATTTGAACAGAAGCAATTTCCCAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTCTGAGGAATGTTTTATCAATATACT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35565921 555 - 95678458 TCTACTTCCAGTCTCAGCATGGCAATTTCTTCCTGCAACATGCGATTTTCATGCAAGAGATCTTTTTCTTTCTTATTTTTCTTGCTTATGGCTAAGAGAAACCTAAGTAAAGAAAGGGAACTTTTAGTTAGCACTCAAGAGAATGACATATCATGATTTCTTCTGAAATTAAAGAATGACATTTATATTTGTATAATGAAAGAATTTCCATAGTGGATATCTAACTGGAAAAAT-GTTGGACAAAACTTCAAATCTAAAACAGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------AAAAAGTTGAAATATTTATTTAAAGACCATGAAAAATAAATCCCTAGAGGATTTTTAAGAATTTCAGAATTGGAAAAGCCTTTCTCTGAATTAT-AAAAA-AACCAGATGCATAAAATATAAGATTAATATGCTTGAGTATATTTTTTAAATTGGGTTTATTCTCTGATATCTAATCTATCAACTACACCATTGTAAGAACCTTAGCTATGCATATATTTGGACAGAAGCAATTTCTTAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTCTGAAGAAAGTTTTATCAATATACT i rheMac3.chr10 C 0 I 14 s macFas5.chr10 36517435 543 + 96509753 TCTACTTCCAGTTTCAGCATGGCAATTTCTTCCTGCAACATGCAATTTTCATGCAAGAGATCTTTTTCTTT-------------CTTATGGCTAAGAGAAACCTAAGTAAAGAAAGGGAACTTTTAGTTAGCACTCAAGAGAATGACATATCATGATTTCTTCTGAAATTAAAGAATGACATTTATATTTGTATAATGAAAGAATTTCCATAGTGGATATCTAACTGGAAAAAT-GTTGGACAAAACTTCAAATCTAAAACAGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------AAAAAGTTGAAATATTTATTTAAAGACCATGAAAAATAAATCCCTAGAGGATTTTTAAGAATTTCAGAATTGGAAAAGCCTTTCTCTGAATTAT-AAAAACAACCAGATGCATAAAATATAAGATTAATATGCTTGAGTATATTTTTTAAATTGGGTTTATTCTCTGATATCTAATCTATCAACTACACCATTGTAAGAACCTTAGCTATGCATATATTTGGACAGAAGCCATTTCTTAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTCTGAAGAAAGTTTTATCAATATACT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32603358 541 - 90941950 TCTACTTCCAGTCTCAGCATGGCAAGTTCTTCCTGCAACATGCGATTTTCATGCAagagatctttttcttt-------------cttattggtaAGAGAAACCTAAGTAAACAAAGGGAACTTTTAATTAGCACTCAAGAGAATGACATATCATGATTTCTTCTGAAATTAAAGTATGACATTTATATTTGTAGAAGGAAAGAATTCCCATAGTGGATATTTAACTGGaaaaaa-gttggacaaaacttcaaatctaaaaatgtgtaaattcc--------------------------------------------------------------------aaaaagttgaaatACTTATTTAAAGACCATGAAAGATAAGTCACTAGAGGATTTTT-AGAATTTCAGAATTGGAAAAGCCTTTCTCTGAAATAT-AAAAA-AcccaaatgcataaaatataagattaatatgcttgagtatattttttaaattgggtttatTCTCTGATATCTAATCTATCAACCACACCATTGTAAGAACCTTAGCTATGCATATATTTGGACAGAAGCAATTTCTTAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTTTCTGAAGAAAGTTTTATCAATATAct i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37773742 542 - 90373283 TCTAGTTCTAGTCTTAGGATGGCAATTTCTTCCTGCAACGTACTACTTTCATGCAAGAGACCTTTTTCTTT-------------CTTATGACTAAGAAAAAGCTAAGTGAATAAAGGAAACTTTTAATTAGCACTCAATAGAATGACATACCTTGATTTCTTCTGAAATTAAAAAGTAACATGTATATTTGTATAATGAAAGAATCCCCATAGTGGATATCTAACCGGAAAAAA-ATTGGACAAAACTTCAAACCTAATAGAGTGTAAATTCC--------------------------------------------------------------------CAAAAGTTTAAATATTTATTTAAAGACCATGAAAAATAAATCACTAGAGGATTTTTAAGAATCTCAGAATTAAAAAAGCCTTTATCTCAGTTAC-AAAAA-ACCCATAGGCATAAAACGTAAGATTAATACATTTGACTATATGTTTGAGATTGGGTTTACACTTTGATATCTAACCTATCAACCACACCACCGTAAGAGCCTTAGCTATGTATATATTTGAACAGAAGCAATTTCTCAAAGTTCTTTAAGTTTCTTTTACTCAAGAACGTTTTAGCGACATTCT i chlSab2.chr2 I 314 C 0 s calJac3.chr16 10100810 491 + 96796970 TCCAGTTCCAGTCTTAGCATGGCAAGTTCTTCTTGCAATATGCAATTTTCATGTAAGAGATCTTCGTCTTT-------------CTTTTGGCTAAGAGCAATCTAAGTAAACAAAGAGAACTTTTAGTTAGCCCTCAATAGAATGACATA-----ATTTGTTCTGAAATTAAAGAGTAACCTGTATATTTGTATAATGAAAGAATTCCCGTAGAGAATATTTAACTGGAAAAAACATTGGACAAAACTTCAAGCCTAACAGAGTGTGAATTCC--------------------------------------------------------------------CAAAAGTTTAAATATTTATTTCAAGATCATAAAAAATAAATCACTAGAGAATTTTCAAGAATCTCAAAATTGTAAAAGCCTTTCTCTGAGTTAC-AAAAA-CCCCAGAGGCATAAAATATAAGATTAACACATTTGACTATATATTTTAAGTTGCGTTTACACTCTGATAAGT-----------------------------------------------GGATAGAAGCAATTTCTCAAAGTTCTTTAAGTTCCTTTGTCTGAAGAATGTTTTATCAACATTCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=224161.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167595 113 + 478999 GCTTTTCTAATATTTTTACAGTCAGTTATAAGAATTACATTTATTCATAACTGTTAAATCTAAGCATTGTACCCTTCTACAATGTACACACCGGCATCTAAGCATTGCACTTC s panTro4.chrUn_GL393519 8233 113 + 413329 GCTTTTCTAATATTTTTACAGTCAGTTATAAGAATTACATTTATTCATAACTGTTAAATCTAAGCATTGTACCCTTCTACAATGTACACACCGGCATCTAAGCATTGCACTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257556 111 - 108868599 ACATTTCTAATATTTTTATACTCAGTTATAAGAATTATATTTATTTATAAC--CTAAATCTAAGCACTGTACCCTTCTACACTGTACACATCTGTATCTAAGCATTGCACTTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060245 112 - 143122389 ACTTTTCTAATATTTTTACAGTCAGTTATAAGAATTACATTTATTCATAACCGTTAAATCTAAGCATTGTA-CCTTCTACAATGTACATATCTGCATCTAAGCATTGCACTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36517978 108 + 96509753 GCTTTTCTAATATTTTTACAGTCAGTTATAAGAATTGCATTTATTCATAACTGTT-----TAAGCATTGTGTCCTTCCACAATGTACACATCGGCATCTAAACATTGCACTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32603899 108 - 90941950 acttttctaatatttttacagTCAATTATAAGAATTGCATTTATACATAACTGTT-----TAAGCATTGTACCCTTCCACAATGTACACATAGGCATCTAAACATTgcacttc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37774284 113 - 90373283 ACATTTCTAATATTTTTATTCTCAGTCATAAGAATTACATTTATTTATAACTGTTAAATCTAAGCACTGTACCCTTCTACACAGTACATATCTGTATCTAAGCATTGCACTTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10101301 113 + 96796970 ACTTTTCTAGTATTTGTACAGTCAGGCATAAGAATTACATTTATTCATCATGGTTAAATCTAAGCACTGTCCCCTTCTACATTCTACACATCTGCATCTAAGCACTGCACTTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I a score=91789.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167708 56 + 478999 TACATACAACACTCAACTCATTTAAGATCACGATTCTTAAAAGGAGAGATCAAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 8346 56 + 413329 TACATACAACACTCAACTCATTTAAGATCACGATTCTTAAAAGGAGAGGTCAAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257667 56 - 108868599 TACATACAATACTGAACTCATTTAAGATGGTGATTCTTAAAAGGAGAGGTCAAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060357 56 - 143122389 TACATACAACACTGAACTCATTTAAGATCATGATTCTTAAAAGGAGAGGTCAAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36518086 56 + 96509753 TACAAACAACACTGAACTCATTTAAGATCACGATTCTTAAAAGGAGAGGTCAAAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37774397 56 - 90373283 TACATACAATACTGAACTCATTTAAGATCACGACTCTTAAAAGGAGAGGTCGAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10101414 56 + 96796970 TGCATACAACACTAAACTCATGTAAGATAACAATACTTAAAAGGAAAGGTGGAAAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I a score=32257.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167764 64 + 478999 ATATATGCagccaggaccagtggctcacacctgtaatcccagcacttcaggaggctgaggcagg s panTro4.chrUn_GL393519 8402 64 + 413329 ATATATGCagccaggaccagtggctcacatctgtaatcccagcatttcaggaggctgaggcagg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060413 64 - 143122389 ATGTATGCagccaggatcagtggctcacacctgtaatctcagcacttcaggaggctgaggcagg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36518142 64 + 96509753 ATATAAGCAgccaggagcagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtggg i macFas5.chr10 C 0 I 208 e ponAbe2.chr14 90257723 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37774453 0 - 90373283 C e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I e calJac3.chr16 10101470 0 + 96796970 C a score=29594.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167828 127 + 478999 agaatcgtgtgaacctgggaggcagaggttgcagtgaactgagtttgtgccattgcactccagcgtgggtgacagtgcaagactccatctAGAATacacacacacacacacacacacacacacaTA------T s panTro4.chrUn_GL393519 8466 133 + 413329 agaatcgtgtgaacctgggaggcagaggttgcagtgaactgagtttgtgccattgcactccagcgtgggtgacagtgcaagactccatctAGAATacacacacacacacacacacacacacacacacacacGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060477 115 - 143122389 agaatcatgtgaacctgggaggcagaagttgcagtgaactgagattgtgccattgcactccagcatgggtgacagtgcaagactccatctAGAATacacacacacgcacacacaT------------------ i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90257723 0 - 108868599 C e chlSab2.chr2 37774453 0 - 90373283 C e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36518206 208 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I e calJac3.chr16 10101470 0 + 96796970 C a score=1820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167955 2 + 478999 AT s panTro4.chrUn_GL393519 8599 2 + 413329 AT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257723 2 - 108868599 AT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060592 2 - 143122389 AT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37774453 2 - 90373283 AT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36518206 208 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I e calJac3.chr16 10101470 0 + 96796970 C a score=58025.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 167957 53 + 478999 ATATGCAACGTGCAAGATTTTTGCCAGGTCTTCTGATGCTACTGTTAGTGATC s panTro4.chrUn_GL393519 8601 53 + 413329 ATATGCAACGTGCAAGATTTTTGCCAGGTCTTCTGATGCTACTTCTAGTGATC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257725 53 - 108868599 ATATACAAGATGCAGGATTTTCCCCAGGTCTGCTGATGCTACCTATAGTGATC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060594 53 - 143122389 ATATGCAACGTGCAGGATTTTTGCCAGGTCTTCTGATGCTACTGCTAGTGATC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37774455 53 - 90373283 ATATACAAGATGCAGGATTTTCCCCAAGTCTTCTGACGCTACTTCTAGTGATC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10101470 53 + 96796970 ATATGCAAGATGCAGCATTTTCCTCAGGTCTTCTGATGCTACTTCTAGTGATA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36518206 208 + 96509753 I e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I a score=15962.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168010 13 + 478999 CTCCAC-AAAAT--CA s panTro4.chrUn_GL393519 8654 13 + 413329 CTCCAC-AAAAT--CA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257778 15 - 108868599 CTCCAC-AAAACCACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060647 15 - 143122389 CTCCAT-AAAATCACA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36518414 13 + 96509753 cTTCAT-AAAAT--CA i macFas5.chr10 I 208 I 2 s chlSab2.chr2 37774508 14 - 90373283 CTCCACAAAAAT--CA i chlSab2.chr2 C 0 I 2 s calJac3.chr16 10101523 13 + 96796970 CTCCAC-AAAAT--CA i calJac3.chr16 C 0 I 2 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C e rheMac3.chr10 35566476 14 - 95678458 I a score=1324954.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168023 657 + 478999 GTTGCTTCTGTGGTGTAAATATATAAATACAAAAGAAGCCTTTTATTTCAAAATACAGATGGTAAATAAGATATAACTTACAAGGCTTTTCTTAGAAATCATGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTCTTTCCTCTTCATAATGTTTGAAACATTATAGTAGTAAGTGTGAAATAC-GGGAAACGTACTGAACTATTCATCTGGGAACAAAATACTTATCAATAAATTATCACTAAATGTGTATCATGGCATGTCATTGTTTTCAAAGCTCTTTGCATTGAATTGAGAAACTACTCGGAGCAAACTGTTCCTCTCCTCAAAAGCAAGG----ATAATGACATCCACAATGTGGCCTCTGACCCAGCTGTACATTTCCTACTTTCCTATTAGTGAAAATAACAAACTGACTTCTCTATTAATA-TTTTAAA---AAGAACTAATGTCCCAAAACTAGCAAATCTGTTGTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATATTGGAAAGATAATCAATTCTTATGAAAAATATCAAATGCTTTTCCTTTGGATTGAGGCCATTGTGAAGGTCACTACTCGACTGTTGCAGGCAAATGCAGTTGAATTAAGAACATGGCTTTATCCTATGTGTACATATATAGATATATGACCAAGGATATAC-AGG---------gtgtgtg s panTro4.chrUn_GL393519 8667 656 + 413329 GTTGCTTCTGTGGTGTAAATATATAAATACAAAAGAAGCCTTTTATTTCAAAATACAAATGGTAAATAAGATATAACTTACAAGGCTTTTCTTAGAAATCATGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTCTTTCCTCTTCATAATGTTTGAAACATTATAGTAGTAAGTGTGAAATAC-GGGAACCATACTGAACTATTCATCTGGGAACAAAATACTTATCAATAAATTATCACTAAATGTGTATCATGGCATGTCATTGTTTTCAAAGCTCTTTGCATTGAAATGAGAAACTACTCGGAGCAAACTGTTCCTCTCCTCAAAAGCAAGG----ATAATGACATCCACAATGTGGCCTCTGACCCAGCTGTACATTTCCTACTTTCCTATTAGTGAAAATAACAAACTGACTTCTCTATTAATA-TTTTAAA---AAGAACTAATGTCCCAAAACTAGCAAATCTGTTGTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATATTGGAAAGATAATCAATTCTTATGAAAAATATCAAATGCTTTTCCTTTGGATTGAGGCCATTGTGAAGGTCACTACTCGACTGTTGCAGGCAAATGCAGTTGAATTAAGAACATGGCTTTATCCTATGTGTACATATATAGATATATGATCAAGGATATAC-AGG---------GTGTGT- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90257793 648 - 108868599 GTTACTTCTGTG--GTAAATATATAAATACAAAAGAAGCCTTTTGTTTCAAAATATGAATGGTAAGTAAGATACAACTGATAGAGATTTTCTTAGAAATCATGAGATTATTTGCCATTGTGATAACTTTTATTTCCTCTTTATAATGTTTGAA-----AGAGTAATAACTATGAAATAG-GGGAAATATATGGAACTATTTCTCTAGGAACAAAATACTTATCAATAAATTATCACTAATTGTGTATCATGGCATGTCATTGTTTTCAAACCTCTTTACATTGAAATGAGAAACTGCTTGGAGCAAAGTGTTCTTCTCCACAAAAGTAAGG----ATGATGACATCCACAATGTGGCCTCTGACCCAGCTATACATTTCGTACTTTCCTATCAGTGAAAACAAT-AATTGACTTCTCTATTAACATTTTTTTA---AAAAACTAATGTCCAAAAACTAAAAAATTTGTTTTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATA-TGGAAAAATCAGCAATTCTTCCGAAAAATATCAAATGCTTCTCCTTTGGATTGAGGCTATTGTGAAGGTCACTACTCGACTGTTGCAGGCAAATGGAGTTGAATTAAGAACATGGCTTTATCCtatatgtacatatataaatatatgacaaaggatatat-aga---------atatat- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77060662 654 - 143122389 GTTACTTCTGTGGTGTAAATATATAAATATAAAAGAAGCCCTTTATTTCAAAATACAAATGGTAAATAAGATACAACTTACAAGGCTTTTCTTAGAAATCATGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTCTTTCCTCTTTATAATGTTTGAA-----ACAGTAGTAAGTGTGAAATAG-GGGAAACATACTGAACTATTCATCTGGGAACAAAATACTTATCAATAAATTATCACTAAATGTGTATCATGGCATGTCATTGTTTTCAAAGCTCTTCGCATTGAAATGAGAAACTACTTGGAGCAAACTGTTCCTCTCCTCAAAAGCAAGG----ATAATGACATCCACCATGTGGCCTCTGACCCAGCTATACATTTCCTACTTTCCTATTAGTGAAAATAACAAACTGACTTCTCTATTAATA-TTTTAAAAAGAAGAACTAATGTCCAAAAACTAGCAACTCTGTTGTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATATAGGAAAGATCATCAATTCTTATGAAAAATATCAAATGCTTTTCCTTTGGATTGAGACCATTGTGAAGGTCACTACTCAACTGTTGCAGGCAAATGCAGTTGAATTAAGAACATGGCCTTATCCTATATGTACCTATATAGATATATGACCAAGGATATAAGGGG---------GGGTG-- i nomLeu3.chr5 C 0 I 126 s rheMac3.chr10 35566490 652 - 95678458 GTTACTTTTGTGGTGTAAATGTGTTAATACAACAGAAGCCTTATATTTCAAAATACAAATGGTAAATAAGATACAACTTACAATGTTTTTCTTAGAAATTGTGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTCTTTCCTCTTTATAATGTTTGAA-----ATAGTAATAAGTGTGAAATAA-GGGAAATATACTGAAATATTTCTCTGGGAACAAAATGCTTATCAATAAATTATCACTAAATGTATATCATGGCAAGCCATTGTATTCAAAACTCTTTGCATTGAAATGAGAAACTTCTTGGAGCAAACTGTTACTCTCCTCAAAAGCAAGGATAAATAATGACATCCACAATATGGCCTCTGACCCAGCTATATATTTCCTACTTTCCTATTAGTGAAAATAACAAACTGATTTCTCTATCAATA-TTTTAAAAAGATGAACTAATGTCCAAAAACTAGAAAATCTGTTGTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATATTGGAAAGATCATCAATTCTTATGAAACATATGAAATGCTTCTCCTTTGGATTGAGGCCATTGTGAGGATCACTACTTGACTGTTGCAGTCAAATGTAGCTGAATTAAGAACATGGTTTTATCCTGTATGTACATATATAGATATATGATAAAGGATCTAT-GGA---------------- i rheMac3.chr10 I 14 C 0 s macFas5.chr10 36518429 650 + 96509753 GTTACTTTTGTGGTGTAAATGTGTTAATACAACAGAAGCCTTATATTTCAAAATACAAATGGTAAATAAGATACAACTTACAATGTTTTTCTTAGAAATTGTGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTCTTTCCTCTTTATAATGTTTGAA-----ATAGTAATAAGTGTGAAATAA-GGAAAATACACTGAAATATTTCTCTGGGAACAAAATGCTTATCAATAAATTATCACTAAATATATATCATGGCACGCCATTGTATTCAGAACTCTTTGCATTGAAATGAGAAACTTCTTGGAGCAAACTGTTACTCTCCTCAAAAGTAAGG----ATAATGACATCCACAATATGGCCTCTGACCCAGCTATATATTTCCTACTTTCCTATTAGTGAAAATAACAAACTGATTTCTCTATCAATA-TTTTTAAAAGATGAAGTAATGTCCAAAAACTAGAAAATCTGTTGTCAGTAGCAAAACTTATTTTTGATATTGGAAAACTCATCAATTCTTATGAAAAATATGAAATGCTTCTCCTTTGGATTGAGGCCATTGTGAGGATCACTACTTGACTGTTGCAGTCAAATGTAGCTGAATTAAGAACATGGTTTTATCCTGTATGTACA-------GGATAGGATAAAGGATATAT-GGAGTGTCTGTG------- i macFas5.chr10 I 2 C 0 s chlSab2.chr2 37774524 644 - 90373283 GTTACTTCTGTGATGTAAATATACAAATACAAAAGAAGCTTTTTATTTCAAAATATGAATGGTAAATAAGATACAACTTATAGAAATTTTCTTAGAAATC---AGATTATTTGTCATTGCCACAACTTTTCTTTCCTCTATATAATGTTTGAA-----ACAGTAATAAGTGTGAAGTAG-GGGAAATATACTGAACTATTTCTCTAGGAACAAAATACTTATCAATAAATTATCAGTAAATGTGTATCATGGCATGTCATTATTTTCAAAGCTCTTTGCATTGAAATGAGAAACTACTTGAAGCAAATTGTTACTCTCCTCAAAAGCAAGA----ATAATGACATTCACAATGTGGCCTCTGACCCAGCTATACATTTCCTACTTTCCTGTCAGTGAAAATAATCAATTGACTTCTCCATTAATA-TTTTTAAAAAATAAACTAATGTCCAAAAACTGGAAAATTTGTTCTTAGTAGCAAAACTTATTTTTGATA-TGGAAAGATCATCAATTCTTATGAAAAATATCAAATTTTTCTCCTTTGGATTGAGACCATTGTGAAGGTCACTACTTGACTGTTGTAGGCAAATGGAGTTGAATTAAAAACATGGCTTTATCCTATGTGTTCacatatagatatatgacaaatgatatat-aga---------------- i chlSab2.chr2 I 2 C 0 s calJac3.chr16 10101538 644 + 96796970 GTTCTTTCTATGGTATAAATATATAAATACAAAAGAAGTCTTTCATTTCAAAATATGAATGGTAAATATATTACAACTTATAGAGCTTTTCTTAGAACTCATGAGATTATTTGCCATTGCAATAACTTTTATTTCCTCTTTATAATGTTTAAA-----ACAATAATTCGTGTTAAATAGAGGAAAATATACTGAACTATTTCTCTGGAAACAAAATACTTATCAACAAATTGTCACTAAATGTGTATTGTGGCATGTCACTGTTTCCAAAGCTCTTTGCACTGAAATGAGAAACTACATGGAGTAAACTGGTATTCTCCTCAAACATAAGG----ATAGTGACATCCACAATATGGCCTCTGAATCAGCTATACATTTCCTGCTTTCCTATGAGTGAAAATAATAAACTGACCTTTCCATTAATA-TTCTAAGAAGATGAAATAATGTCCAAAAGCTAGAAAATCTGTTGTTAATAGTAAAACTTATTTTTGATAGTAAAAAGAACTTCAATTCTTATGAAAACTACCAAATGTTTCTCCTTTGGATTGAGGCCATTGTGAATGTCACCACTAGACTGCTGCAGGCAAATGGAGTTGAATTAAGAACATGGCTTTATCCtatatatacatatatagatacatgataaaggatat---------------------- i calJac3.chr16 I 2 C 0 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C a score=-2860.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168680 56 + 478999 tgtgtgtgtgtgtgtgtATATacacacacacacacacacac--acGTGTGTATATATA s panTro4.chrUn_GL393519 9323 13 + 413329 ---------------------------------------------GTGTGTATATATA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258441 13 - 108868599 ---------------------------------------------acacacatatata i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061442 58 - 143122389 TGTGTGTGTGTGTacatatatacacacacacacacacacacTTATTAATGGATATATG i nomLeu3.chr5 I 126 C 0 s rheMac3.chr10 35567142 13 - 95678458 ---------------------------------------------GTGTGTGTATATA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36519079 56 + 96509753 --tatacatatacacacatatgtgtgtatatatatacacacatatgtgtgtatatata i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37775168 17 - 90373283 -----------------------------------------atatatacatacatata i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10102182 25 + 96796970 ---------------------------------gtacatatatatgtccatatatatg i calJac3.chr16 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32604007 0 - 90941950 C a score=80327.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168736 32 + 478999 TGATTTAAAAATCCTTTATACCTTCCAAAATA s panTro4.chrUn_GL393519 9336 32 + 413329 TGATTTAAAAATCCTTTATACCTTCCAAAATA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258454 31 - 108868599 tGACTTAAAAATCCTTTACA-TTTCCAAAATA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061500 32 - 143122389 TGATTTAAAAATCCTTTATACTTTCCAAAATA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35567155 32 - 95678458 TATTTTAAAAATCCTTTATCCTTTCCAAAATA i rheMac3.chr10 C 0 I 355 s macFas5.chr10 36519135 32 + 96509753 tGTTTTAAAAATCCTTTATCCTTTCCAAAATA i macFas5.chr10 C 0 I 4 s papAnu2.chr10 32604007 32 - 90941950 tgttttaaaaatcctgtgtactttccaaaata i papAnu2.chr10 C 0 I 4 s chlSab2.chr2 37775185 31 - 90373283 tgactttaaaatcctttata-tttccaaaata i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10102207 32 + 96796970 tgatataAAAATCCTTTATGCTTTCCAAAATA i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=-15751.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168768 11 + 478999 A----------AGCTTTTTAA s panTro4.chrUn_GL393519 9368 11 + 413329 A----------AGCTTTTTAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258485 13 - 108868599 CA--------TAGTTTTTTAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061532 9 - 143122389 A----------AGCTTTTT-- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36519171 11 + 96509753 -AAG------TTATTTTT--- i macFas5.chr10 I 4 I 1 s papAnu2.chr10 32604043 11 - 90941950 -aag------ttgtcttt--- i papAnu2.chr10 I 4 I 1 s chlSab2.chr2 37775216 7 - 90373283 -----------aatgttt--- i chlSab2.chr2 C 0 I 3 s calJac3.chr16 10102239 19 + 96796970 --CATAGGGTTGGGTTTTCAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35567187 355 - 95678458 I a score=436869.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168779 166 + 478999 AAATATATACACATATGAAAACATTTGATAATGACTAAAGAAAATACCTCAGAATTCATTTCCTTTTCAGCCACTTCTATCTGCTTTTGTTTATTAGTCAGAATCTCATCTTGTGATATTCCAGTGTTCTGTTCTTCAGAAAGTTGTTTCTGGGTATCATTTTGTT s panTro4.chrUn_GL393519 9379 166 + 413329 AAATATACACACATATGAAAACATTTGATAATGACTAAAGAAAATACCTCAGAATTCATTTTCTTTGCAGCCACTTCTATCTGCTTTTGTTTATTAGTCAGAATCTCATCTTGTGATATTCCAGTGTTCTGTTCTTCAGAAAGTTGTTTCTGGGTATCATTTTGTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258498 161 - 108868599 AAATATATACTCATGTAAAAACATTTGAAAATAACT-----AAATACCTCAGAACTCATTTTCTTTTCAGCCACTTCTATCTGCTTTTCTTCATGAATCAGAATCTCATCTTGTAATATTCCAGTGTTCTGTTCTTCAGAAAGTTGCTTCTGAATATCATTTTGTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061541 166 - 143122389 TAATACATACACATATACAAACATTTGAAAATGACTAAAGAAAATACCTCAGAATTCATTTTCTTTTCAGCCACTTCTGTCTGCTTTTGTTTATTAGTCAGAATCTCATCTTGTGATATTCCAGTGTTCTGCTCTTCAGAAAGCTGTTTCTGGGTATCATTTTGTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35567542 166 - 95678458 AAATAAATACACATATTAAAACATTTGAAAATGACTAAAGAAAATACCTCAGAATTCATTTCCTTTTCAGCCACTTCCATCTGCTCTTGTTTATTAGTCAGAATCTCTTCTTGTGACATTCCAGCGATCTGTTCTTCCAAAACTTGCTTCTGGGTATCATTTTGTT i rheMac3.chr10 I 355 C 0 s macFas5.chr10 36519183 166 + 96509753 AAACAAATACATATATTAAAACATTTGAAAATGACTAAAGAAAATACCTCAGAATTCATTTCCTTTTCAGCCACTTCCATCTGCTCTTGTTTATTAGTCAGAATCTCTTCTTGTGACATTCCAGCGATCTGTTCTTCCAAAACTTGCTTCTGGGTATCATTTTGTT i macFas5.chr10 I 1 C 0 s papAnu2.chr10 32604055 166 - 90941950 aaataaatacacatattaaaacatttgaaaatgactaaagaaaatacctcagaattcattttcttttcagccACTTGCATCTGCTCTTGTTTACCAGTCAGAATCTCTCCTTGTGATATTCCAGCATTCTGTTCTTCCGAAACTTGCTTCTGGGTATCATTTTGTT i papAnu2.chr10 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 37775226 162 - 90373283 atatatatacatatataAAAACATTTGAAAATAACCAAAGAAAATACCTCAGAATTAATTTTCTTTTCAACCACTTCTATCTGAT----TTTATTAGTCAGAATCTCATCTTGTGATATTCCAGTGTTCTGTTCTTCAGAAAGTTGCTTCTGAGTATCATTTTGCT i chlSab2.chr2 I 3 C 0 s calJac3.chr16 10102258 162 + 96796970 ----ATATACACATATAAAAATATTTGAAAATGACCAAAGAAAATTCCTTAGAATTCATTTTCTTTTCAGCCACTTCTGTCTGCTTCTGATAATCAGTCAGAATCTCAGCTAGTCATATTCTACCATTCTGTTCTTCAGAAAGTTGCTTCTGGTTAACGTTTTGTT i calJac3.chr16 C 0 I 1162 a score=2628.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168945 2 + 478999 CG s panTro4.chrUn_GL393519 9545 2 + 413329 TG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258659 2 - 108868599 CG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061707 2 - 143122389 CA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35567708 2 - 95678458 CA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36519349 2 + 96509753 CA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32604221 2 - 90941950 CA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37775388 2 - 90373283 CA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e calJac3.chr16 10102420 1162 + 96796970 I a score=1999624.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 168947 736 + 478999 TCACTAGAAGAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAAGATGGCACCATCAGATGTCATTCACACAATGTATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAGGGGCCTCACATCTGTTAACCCTGCTCTc-ccagtcatgttggcaccagggactagttttgtggaagataatttttccatggacctgaggt-gggggatggttccaggatgattcaagcacattacatacattgtgcacttcatttctattattac------taatatataatgaaataattatataactcaccatcat-gtagaatcagtgggagccctcagcttattttcctgcaactagatggtctcatctaggggtgacaggagatggtgacagatcataaa-gcattagattctcatcaggagtgaacaacctagatcccatgcatgagcagcttgcaatagggttcaagtcacactcttatgagaatctaatgtcaccgctgatctgacaggaggaggagctcaggtggtaatgtga----cagagagtggctgtaaaca--gatgaagcttc-acttgctcatctaccactaacttcttgctgtgtggcccaggtcctaacaggccagggactggtact-ggtctgtggcctggggattggaa----acccctgTGTTAACTCAAACTTTTTACGTTTATTTTTTGGAAACAGTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTGTAA s panTro4.chrUn_GL393519 9547 736 + 413329 TCACTAGAAGAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAAGATGGCACCATCAGATGTCATTCACACAATGTATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAGGGGTCTCACATCTGTTAACCCTGCTCTc-ccagtcatgttggcaccagggactagttttgtggaagataatttttccatggacctgaggt-gggggatggttccaggatgattcaagcacattacatacgttgtgcacttcatttctattattac------taatatataatgaaataattacataactcaccatcat-gtagaatcagtgggagccctcagcttattttcctgcaactagatggtctcatctaggggtgacaggagatggtgacagatcataaa-gcattagattctcataaggagtgaacaacctagatcccatgcatgagcagcttgcaatagggttcaagtcacactcctatgacaatctaatgtcaccgctgatctgacaggaggaggagctcaggtggtaatgtga----cagagagtggctgtaaaca--gatgaagcttc-acttgctcacctaccactaacctcttgctgtgtggcccagatcctaacaggccagggactggtact-ggtctgtggcctggggattgaaa----acccctgTGTTAACCCAAACTTTTTATGTTTATTTTTTGGAAACAGTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTGTAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90258661 721 - 108868599 TCACTAGAAGAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAAGATGGTGTCATCAGATGTCATTCACACAATTTATATCTGCACATTATTCCAAGACAAGGCAAAGGGCTCTCACATCTGTTAACCGGGTAtcc-ccaaccatgctggcaccagggactggttttgtggaagacaatttttccaggaacctgaggt-ttgggatggttccaggatgatttaagtacactacattcattgtgcactttatttctattattat------taatatctaatgaaataattatataactcaccaaaat-gtagaatcagtgggagccctgagcttgttttcctgcaactagatggtcccatttaggggtgacggaagatggtgacagatcataaaggcattcgattctcataaggagtgaacaacctatatcccctgcatgagcaacttacaatagggttcaggtcacactcttaggacgatctaatgccaccgctgatctgacaggaggaggagcttgggcagtaatgcgagcgtcagagagtggctggaaaca--gatgaagcttt-gcttgctcacctgcctctaacctcctgctgtgtggcccaggtcctaacaggccagggactggtact-ggtctgtggcttg------------------------TAACTCATACTTTTTATGTTTATTTTTTGGAAACACTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTATGTAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77061709 741 - 143122389 TCATTAGAAAAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAAGATGGCGCCATCAGATGTCATTCACACAATGTATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAGGGGTCTCACATCTGTTAACCcagctctctccagtcatgttggcaccagggactggttttgtggaagataatttttctgtggacctgaggt-tggggatggttccagcatgattcaagcacattacatacattgtgcacttcatttctattattac------taatatataattaaataattatataactcaccataat-gtagaatcagtgggagacctcagcttgttttcctgcaactagatggtctcatctgggggtgacaggagatggtgacagatcataaa-gcattagattctcataaggagtgagcaacctagatcccctgcataagcagcttacaagagggtttgagtcacacccttatgacaatctaatgccaccgctgatctgacagaaggaggagctcaggcggtaatgtgagtgacagagagtggctgtaaaca--gatgaagcttc-acttgctcacctaccactaacttcttgctgtgtggcccaggtcctaacaggccagggactggtact-ggtccatcacctggggatcggaa----acccctgTGTTAACCCATACTTTTTATGTTTATTTCTTGGAAACACTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTATAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35567710 746 - 95678458 TCACTAGAAGAAATTTTGATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAACATGGTGCCATCAGATGTCATTCACACAATGCATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAAGGATCTCACATCCGTTAACCcagctctccccaaccatgttggcaccagggactggttttgtggaaggtgatttttctgtggacctgagtt-gagggatggttgcaggatgattcaagcacataacattcattgtgcacattatttctattattac------ttttatataatgaaataattacatagctcaccataatggtagaatcactgggagcctt-agcttgttttcctgcaactagatggtcccatctgggggtgacagtagatggtgacagatcataaa-gcattagattctcataaggagtgaacaacctagataccctgtgtaagcagcttacaacagggtttgagtcacactcctatgacaatctaatgccatcaccgatctgacaggaagaggagctcaggcagtaatgtgagtgacagagagtggctttaaaca--gatgaagcttt-gcttgctcacctgccattagcctcctgctgtgtggcccaggtcccaacaggccagggactggtactgggtgcatggcctggggattgggaagccAGCCCTGTGTTAACCCATACTTTTTATCTTTATTTTTTGGAAACACTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTGTAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36519351 745 + 96509753 TCACTAGAAGAAATTTTGATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAACATGGTGCCATCAGATGTCATTCACACAATGCATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAAGGATCTCACATCCGTTAACCcagctctccccaaccatgttggcaccagggactggttttgtggaaggtgatttttctgtggacctgagtt-gagggatggttgcaggatgattcaagcacataacattcattgtgcacattatttctattattac------ttatatataatgaaataattatataactcaccataat-gtagaatcactgggagcctt-agcttgttttcctgcaactagatggtcccatctgggggtgacaggagatggtgacagatcataaa-ggattagattctcataaggagtgaacaacctagatcccctgtgtaagcagcttacaagagggtttgagtcacactcctatgacaatctaatgccaccactgatctgacaggaagaggagctcaggcagtaatgtgagtgacagagagtggctttaaaca--gatgtaacttt-gcttgctcacctgccactagcctcctgctgtgtggcccaggtcccaacaggccagggactggtactgggtgcatggcctggggattgggaagccAGCCCTGTGTTAACCCATACTTTTTATCTTTATTTTTTGGAAACACTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTGTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32604223 738 - 90941950 TCACTAGaagaaattttgattttcatGAAATACTGGAGGTGTCCCTAAAATGATCTACAGGGCAACATCGTGCCATCAGATGTCATTCGCACAATGCATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAGGGGTCTCACATCTCTTAACCCAGCTCTCCCCAACCAtgttggcaccagggactgg-tttgtGGAAGGTAATTTTTCTGTAGA-CTGAGTT-GGGGGATGGTtgcaggatgattcaagcacataaCATTCATTGTgcatattatttctattattat------ttatatataatgaaataattacatagctcaccataat-gtagaatcagtgggagcctc-agcttgttttcctgcaactagatggtcccatctgggggtgacagGAGATGGTGACAGATCAtaaa-gcattagattctcataaggagtgaaCAACCTAGATACTCTGTGTAAGCAGCTTACAACAGGGTTTGAGTCTCACTACTATGACAATCCAATGCCACCACCGATCTGATAGGAAgaggagctcaggcagtaatgtgagtgaCAGAGAGTGGCTTTAAACA--GATGTAACTTT-GCTTGCTCACCTGCCACTAGCCTCCTGCTCTGTGGTCCAGGTCCTAACAGTCCagggactggtact-ggtccatggcctggggatTGGGA----AGCCCTGTGTTAACccatactttttatatttatttttgggaaACACTTTCCACTTATATTCTTGATTCCTCTGTAT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37775390 741 - 90373283 TCACTAGAAGAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGGAGGTGTCCCCAAAATTATCTACAGGGTAAGATGGCGCCATCAGATGTCATTCACACAATGTATATCTGCACATTAATCCAAGACAAGGCAAAGGGGTCTCACATGTGTTAACCcagctctccccaaccatgttggcaccagggactggttttgtggaagataatttttccaggaacctgaagt-gggggatggttccaggatgattcaagcacattacatttattgtgcactttattgctattattat------taacacataatgaaataattacataagttaccaaaat-gtagactcagtggtagccctgagcttgttttcctgcaactggatggtcccatctgggggtgacaggagacggtgacagatcataaa-gcattaggttctcataaggaatgaacaacctgaatcccctgcatgagcagtttacaacagggttcaagtcacactcctatgacaatctaatgccaccactgatctgacaggagcaggagttcaggcagtaatgcaagtgatgcagaatggctgtaaaca--gatgaaagtttcacttgctcacgtgccactaacctcctgctgtgtggcccaggtcctaacaggccagggactggtact-ggtccgtggcctggggattcgaa----acctctgTATTAACCCATACTTTTTATGTTTATTTTTTGGAAACACTTT-CACTTATATTCTTGATTCCTATGTAT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 s calJac3.chr16 10103582 748 + 96796970 TCACTAGAAGAAATTTTAATTTTCATGAAATACTGCAAGTATCCCTAAAATGATTTACAGGGCAAGATGTCACCATGAGATGTCTTTAACACAATGTATATCTGCTGATTAATCCAAGACAAAGCAAAAGGGTCTCACATCTGTTAACCcagctgtccccaaccatgttggcaccagtcagtggttctatggaggataatttttccatggatctgaggtggggggatgtttccaaaatgattcaagaacattgcatttattgtgtactttacttctattattattaatcataatatacaatgaaataattatataactcatcataat-gtagaatcagtgggagccatgagcttgttttcctgtagctacatggtcccatctaggggtgataggagacagtgacatatcatcag-gcattagattctcataaggagtgcatgacctagatcccctgcatgagtagcttacaacaggg-tagggtgacactcttaggacaatccaatgccaccactgatctgacaggaggaagagcccaggcagtaatgcaagtgaagggaagtggttgtaaacactaatgaaccttt-attt-ctcacctgccactaacctcctgctgtgtggtccagttcctaacaggccagggattggtact-agtctgtggcctggggattggga----gcccctgTGTTAGCCCATACTTTTTATATTTATTTTCTGGAAACACTTTCCACTTATGTTCTTGATACCTATCTAT i calJac3.chr16 I 1162 C 0 a score=855537.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 169683 310 + 478999 TTTATAGACAAATTAGAAATTCCCTTTGGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATAGAACTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGAGAGAGAGATGTGAAATAAACTGATCATTAATCGCTTTCAATTTCAC-TTTTATTTCATGCATATTAAGAAGAAAACTGggaagccctaggcagagcaattgggcaagagaaataaagggcatccaaattggaaaagagaaagtcaaactctctcttcaccaatgatatgatcttatgcctagaaaaccctacagactcctacaaaacactcctagat s panTro4.chrUn_GL393519 10283 310 + 413329 TTTATAGACAACTTAGAAATTCCCTTTGGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATAGAACTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGAGAGAGAGATGTGAAATAAACTGATCATTAATCGCTTTCAATTTTAC-TTTTATTTCATGCATATTAAGAAGAAAACTGggaagccctaggcagagcaattgggcaagagaaataaagggcatccaaattggaaaagagaaagtcaaactctctcttcaccaatgatatgatcttatgcctagaaaaccctacagactcctacaaaacactcctagat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90259382 310 - 108868599 TTTATAAACAACTTAGAAATTCCTTTTAGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------ATGT-TTTTAACATAGGATTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGAGAGAGAGATGTGAAATAAACTAATCGTTAAGCACTTTCCATTTTac-tcttatttcatgcatattaagaataaaactgggaagtcctaggcagagcaattgggcaagagaaataaagggcatccaaattggaaaagaggaagtcaaactatctcttcaccaatgatatgatcttatacctagaaaaccctaaagactcctacaaaacactcctagat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77062450 310 - 143122389 TTTATAGACAACTTAGAAATTCCCTTTGGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATAGAACTTTGAATTAATTTTATCTCTGTATGAGAGAAAGATGTGAAATAAACTGATCATTAACCGCTTTTAATTTTAC-TTTCATTTCATGCATATTAAGAATAAAACTGggaagtcctaggcagagcaactgggcaagagaaataaagggcatccaaactggaaaagagaaagtcaaactatctcttcaccaatgatatgatcttatgcttagaaaaccctaaagactcctaaaaaacactcctagat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35568456 304 - 95678458 TTTATAGACAACTTAGAAATTCCTTTTGGAACAAGACAAGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATACAACTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGCGACAGAGATGTGAAATAAACTAATCCTTA------TTCGCTTTTAC-TTTTATTTCATGCATGTTAAGAataaaactgggaagtcctaggcagagcaattgggcaagagaaataaaggacatccaaattgaaaaaaagaaaatcacactatctcttcatcaattatatgatcttatccctagaaaaccctaaagactcctacaaaacactcttagac i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36520096 310 + 96509753 TTTATAGACAACTTAGAAATTCCTTTTGGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATACAACTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGCGACAGAGATGTGAAATAAACTAATCCTTAATCACTTTCAATTTTAC-TTTTATTTCATGCATATTAAGAATAAAACTGggaagtcctaggcagagcaactgggcaagagaaataaaggacatccaaattggaaaaaagaaaatcacactatctcttcatcaattatatgatcttatccctagaaaaccctaaagactcctacaaaacactcttagac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32604961 310 - 90941950 TTTATAGACAACTTAGAAATTCCTTTTGGAACAAGACAGGGTCTGATATT------------------GTGT-TTTTAACATTcaactttgaattaattttatctgtGTATGTGACAGAGATATGAAATAAAGTAATCATTAATCacttttgattttac-ttttatttcatgcaTGTTAAGAATAAAACTGGGAAGTCCTAGGCAGAGCAATtgggcaagagaaataaaggacatccaaattggaaaaaagaaagtcaaattatctcttcaccaatgatatgatcttatccctagaaaaccctaaagactcctacAAAACACTCCTAgac i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37961722 310 - 90373283 TTTATAGATAACTTAGAAATTCCTTTTGGAACAAGACAGGGTCTAATATT------------------GTGT-TTTTAACATACAACTTTGAATTAATTTTATCTGTGTATGCGACAGAGATGTGAAATAAAGTAATCATTAATCACTTTTGATTTTAC-TTTTATTTCATGCATGTTAAGAataaaactgggaagtcctaggcagagcaattgggcaagagaaataatggacatccaaattggaaaaaagaaagtcaaattatctcttcaccaatgatgtgatcttatccctagaaaaccctaaagactcctacaaaacactcctagac i chlSab2.chr2 N 0 C 0 s calJac3.chr16 10104330 323 + 96796970 TTTATAAACAACTCAGAAATGCCTTTTGGAACAAGACATGCTCTAATATTTAAGCAATGAAGAGCAACATGTATTTTAATGTAGAAC--AGAATTAATGTTAACTG-GTATG----ACAGATGTAAAATAAATTCATCCTTAATCCCTTTCCTTTTTACTTTTTATTTCATGAAAGCTAAGAATAAAACTAggaattcccaggcaaagcaactgggcaagaggaataaagagcacccaaactggaaaagaggaagtaaaactatctcttccccaatgatattgtcttataactagaaaaccataaaaactcctactaaacactcctagat i calJac3.chr16 C 0 I 16316 a score=306606.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 169993 144 + 478999 ttgataaatgaatttagtaaagtctcagaggttacaaaatatacaaataccaatgaatagtaccactatacaccaactacaaccaagctgagag-tcatatcaagaatccaatcctttttacaatggctgcaaaata--gtaaaata s panTro4.chrUn_GL393519 10593 144 + 413329 ttgataaatgaatttagtaaagtctcagaggttacaaaatatacaaacaccaatgaatagtaccaccatacaccaactacaaccaagctgagag-tcatatcaagaatccaatcttttttacaatggctgcaaaata--gtaaaata i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90259692 147 - 108868599 ttgataaatgaattcagtaaagtctcagaggttacaaaataaatgaataccaatcagtagcaccactatacaccaactacaaccaagctgagagttcatatcaacaatccaatctcttttacagtggctgcaaaaaagtgtgaaata i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77062760 144 - 143122389 ttgataaataaatttagtaaagtctcagatgttacaaaatatacaaatactaaggtatagtaccactatacaacaactacaaccaagctgagag-tcatatcaagaatccaatcccttttacaatggctgcaaaaca--gtaaaata i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35568760 144 - 95678458 ttgataaataaattcagtaaagtctcagagactacaaaatgtacaaataccaatgagtagtaccactatacaccacctacagccaagctgtgca-tcacaacaagaacccagtccctttgacaatggctgcaaaaga--gtaaaata i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36520406 144 + 96509753 ttgataaataaattcagtaaagtctcagagactacaaaatgtacaaataccaatgagtagtaccactatacaccacctacagccaagctgtgca-tcacaacaagaacccagtccctttgacaatggctgcaaaaga--gtaaaata i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32605271 144 - 90941950 ttgataaatgaattcagtaaagtctcagagGCTACAAAATGTACAAATACCAATGAGTAGTACCACTATACACTACCTACAACCAAGCTGCGAG-TCACGTCAAGAACCCAGTCCCTTTGACAATGGTTGCAAAAGA--GTAAAATA i papAnu2.chr10 C 0 I 5680 s chlSab2.chr2 37962032 144 - 90373283 ttgataaatgaatgcagtaaagtctcagaggctacaaaatgtacaaataccaatgagtagtaccactatacacaacctacaaccaagctgtgag-tcacgtcaagaacccagtccctttgacaatggctgcaaaaga--gtaaaata i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I a score=523910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 170137 313 + 478999 cctaggaatatacttaatgaaggaggtgagtgatctatcaaaggataactggaaaacgccactgaagaaaatcatagatcatacaaataaatgaacatacattctatgttcctggactgaaagcattgatattgtgaaaatg-ccatagtgcccaaagtagtctacagagtcaatacagtttctaccaaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagctgtcattcatgtagaaccacaaaagagcctgaatagcaacagacataccaagaaaaaggaacaaacatgttggcatcaaattacct s panTro4.chrUn_GL393519 10737 313 + 413329 cctaggaatatacttaatgaaggaggtgagtgatctatcaaaggataactggaaaacgccactgaagaaaatcacagatgatacaaataaatgaacatacattctatgttcctggactgaaagcattgatattgtgaaaatg-ccatagtgcccaaagtagtctacagaatcaatacagtttctaccaaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagctgccattcatgtagaaccacaaaagagcctgaatagcaacagacataccaagcaaaaggaacaaacatgttggcatcacattacct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90259839 313 - 108868599 cctaggaaaatacttaatgaaaaaggtgagtgatctatataaggataactggaaaacaccactaaagaaaataacagatgacacaaacaaatgaaaatacatcctatgttcatggactgaaagaactgatatagtgaaaatgaccacagtgcctaaagcagtctacacattcgatacaattccttccaaagtaccaatgtcattcttcacagaattatttt-aaatgctgacattcatgtaagaccacaaaagagcctgaatagcaacagacataccaagcaaaaggaacaaatatgttggcatcacattacct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77062904 313 - 143122389 cctaggaatatacttaatgaaggaggtgagtgatctataaaaggttaactggaaaacaccactgaagaaaatcacagatgatacaaataaatgaacatacatcctatgttcctggaccgaaagcattgatattgtgaaaatg-ccatagtgtccaaagcagtctacagagtcaatacaatttctaccaaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagttgccattcatgtagaaccacaaaagagcctgaatagcaacagacataccaggcaaaaggaacaaacatgttggcatcacattacct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35568904 314 - 95678458 cctaggaaaatacttaacgaagcaggtgagtcagctataaaaggataactggaaaacaccactgaagaaaatcagagatgacacaaataaatgaacatacatcctatgctcctggactgaaagcattaatattgtgaaaatgaccatagtgcccaaagcagtctacagatccaatacagtttctatccaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagctgccattcatgtagaaccacaaaagagcccgaatagcaatgcacacacagaacaaaaggaacaaacatgttggcatcacatgacct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36520550 314 + 96509753 cctaggaaaatacttaacaaagcaggtgagtcagctataaaaggataactggaaaacaccactgaagaaaatcagagatgacacaaataaatgaacatacatcctatgctcctggactgaaagcattaatattgtgaaaatgaccatagtgcccaaagcagtctacagatccaatacagtttctatccaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagctgccattcatgtagaaccacaaaagagcccgaatagcaatgcacacacagaacaaaaggaacaaacatgttggcatcacatgacct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37962176 314 - 90373283 cctaggaaaatacataatgaaggaggtgagtcaactataaaaggataactggaaaacacctctgaagaaaatcagagatgacacaaataaatgaacatacatcctatgttcctggactgaaagcattgatattgtgaaaatgatcatagtgcccaaagaagtctacagatccaatacaatttctatcaaagtaccaatgtcattcttcacagagttattttaaaaagctgccattcatgtagaaccacaacagagcctgaatagcagcacacacaccaagcaaaaggaacaaacacgttggcatcacatgacct i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I a score=139924.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 170450 173 + 478999 gacttca------actctaaggccacagtaac--aaacatcatggtactggtataaaagtacatacacagatcaatggaacagaatagacaactcagaaaaaaggccacttacaaccaaatgatctctgagaaaggatacaaaaacatacactggagaaagtacacgttattcaacaaatg s panTro4.chrUn_GL393519 11050 179 + 413329 gacttcaaatgatactctaaggccacagtaac--aaacatcatggtactggtataaaagtagatacacagatcaatggaacagaatagacaactcagaaaaaaggccacttacaaccaaatgatctctgagaaaggatacaaaaacatacactggagaaagtacacgttattcaacaaatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90260152 180 - 108868599 gacttcaaattatactctacggccacagtaacaaaaacggcgtggtactggtataaaaatagctacatagatcaatggaacagaatagacaactcagaaataaagccac-tacaaccaaatgatctctgagcaaggatacaaaaacatacactggagaaagtacaggttattcaataagtg i ponAbe2.chr14 C 0 I 3380 s nomLeu3.chr5 77063217 179 - 143122389 gacttcaaattatactctaaggccacagtaac--aaacatcatggtaccggtataaaagtagacacacagatcagtggaacagaatagacaactcagaaaaaaagccacttacaaccaaatgatctctgagaaaggatacaaaaacatacactggagaaggtacacgttattcaataaatg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37776902 180 - 90373283 gacttcaaattatactctaaggccacagtaacaaaaatagcatggtactggtataaaagtagatacacagatcaatggaatgaaacagacaactcagaaataaagccac-cacaattaaatgatctctgagcaaggatacaaaaacatacactggagaaagtacatgttattcaataaatg i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I a score=624476.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 170623 865 + 478999 gtgctgggaaaaaaagatagtcacatatagaagaataaaattggatctctatctctcaccatgt-aaaaaattaattcaagatggattaatggcctaaacctaagaccagaagacattagcctaggcaaataatttatgatgaggaccctgaaagcaaaagcaacaaaaataaaaataaataaataaataaataaataaataaataaagacctaattaaactaaaaagcttcagcacagcaaaagaaataatcatcaaagtgagccaaccacctatacaatggggaaaatatgggcaaattatgaatctaacaaaggattaa-tgtccataacctaccagaaactcaaacaaatcagcaggaaaaatacaaacaattccattaaaaagtgggcacatgacatgaatagacatttttcaaaagaagatgtacaaatggtgaacaagaatataaaaacatgctaaatattactaatcatcagggaaatgtacaataaaacaacagtgagatatcacctcacttcagccagaatggtcactactaaaataagaaaaacagcagatgttggtgtggatgtggtgaaaaaagaagatttatacactgctggtggggatacaaattagtacaaatctatggaaaacattatggagagttct-------gttaaagtagatcttaccattctatccagcattctcatttctggatacctacccaaaataaaagaaatcatactctcaaaaagacacctatatacatatgtttactgcagcacaattcac-atatgcaaagatatgttatcagccagtgtccatcaactgatgagtggaataaagaaaat-----tatatatatatatatat----------------------------atatatatat---atatat s panTro4.chrUn_GL393519 11229 857 + 413329 gtgctgggaaaaaaagatagtcacatatagaagaataaaattggatctctatctctcaccatgtaaaaaaattaattcaagatggattaatggcctaaacctaagacctgaagacattagcctaggcaaataatttatgatgaggaccctgaaagcaaaagcaacaaaaataa--------aaataaataaataaataaataaataaagacctaattaaactaaaaagcttcagcacagcaaaagaaataatcatcaaagtgagccaacaacctatacaatggggaaaatatgggcaaattatgaatctaacaaaggattaa-tgtccataacctaccagaaactcaaacaaatcagcaggaaaaatacaaataattccattaaaaagtgggcacatgacatgaatagacatttctcaaaagaagatgtacaaatggtgaacaagaatataaaaacatgctaaatattactaatcatcagggaaatgtacaataaaacaacagtgagatatcacctcacttcagccagaatggtcactactaaaataaaaaaaacagcagatgttggtgtggatgtggtgaaaaaagaagagttatacactgctggtgggg-tacaaattagtacaaatctatggaaaacattatggagagttct-------gttaaagtagatcttaccattctatccagcattctcatttctggatacctacccaaaataaaagaaatcatactctcaaaaagacacctatatacatatgtttactgcagcacaattcac-atatgcaaagatatgttatcagccagtgtccatcaactgatgagtggaagaaagaaaat-----Catatatatatatatat----------------------------atatatatat---atatat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90263712 873 - 108868599 gtgctgggaaaaaaagatagccacatgttgaagaatgaaactggatctctatctctcaccatat-caaaaattaattcaagatggattaaaggcctaaacctaagacctgaaaacattggcctaggcaaagaatttatgatgaagaccctaaaaacaaatgcaacaaaaatga--------aaataaataaat-------------acgacctaattaaaataaaaagcctcagcacagcaaaagaaataatcatcggagtaaaccaacaacctatacaatgggaaaaaaaattgaaaattatgaatctaacaaagtactaa-tatctataacctacaagaaactcaaacaaatcaacaggaaaaacacaaataattccattagaaagtggccacattacatgaatagtcatttctcaagagaagatgtacaaatggtaaacaagcatataaaaacatgctaaatctctctaatcatcagggaaatgcacaataaaacaacagtgagatatcaccttgctgcagccagaatggccactattagaaatcaaaacacaacagatgttggtgtggatgtggtgaaaagagaacagtgatacactgctggtgggaatacaaattcatacaaatctatggaaaacagtatggagagttctcaaagaactaaaagtagatcttaccattttacccagcatgctcatttctggatatctatccaaaataaaagaaatcgtactctcaaaaagacacctgcacacatatgtttactgcagcacaattcacaatatgcaaagatatggaatcaaccagtgtccatcaactgatgagtggaataaagaaaatggagatatatacaTATATATAT---------------TATCTCACATCacatatatgtatcacatatat i ponAbe2.chr14 I 3380 I 66 s nomLeu3.chr5 77063396 820 - 143122389 gtgctgggagaaaaagatagccccatatagaagaataaaactggatctctatcgctcaccatataaaaaaataaattcaagatggattaatggcctaaacctaagacctgaagatattagcctaggcaaataatttatgatgagggccctaaaagcaaaaccaacaaaaataa--------aaataaataaat-------------aagacctaatgaaactaaaaagcttcagcacagcaaaagaaataatcatcaaagtaagccaacaacctatacaatggggaaaatatgggcaaattatgaatctaacaaagcattaattatccataacctaccagaaactcaaacaaatcagcaggaaaattacaaata-----attaaaaagtgggcacatgacatgaatagacatttctcagaagaagatgtacaaatggtgaacaagaatataaaaacatgctaaatattactaatcatcagggaaatgtacaataaaacaacagtgagatatcacctcacttcagccagaatggtcactactaaaa-ataaaaaacaacagatgttggtgtggatgtggtgaaaaaagaacagttatacactgttggtggggatacaaattagtacaagtctatggaaaatattatggagagttct-------gttaaagtagatcttaccattctatccagcattctcatttctggatacctacccaaaataaaagaaatcgtactctcaaaaagatacctacatac--ctgtttactgcagcacaattcac-atatacaaagatatgatatcagccagtgtgcatcaactgatgagtggaataaagaaaat-----tttatgtatatatat------------------------------------------------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37777082 882 - 90373283 ctgctgggaaaaaaagatagccacacgttgaagaatgaaactggatctctatctctcaccatatacaaaacttaatccacaatgtattaaaggcctaaacttaagacctgaaaacattatcctaggcaaagaatttatgatgaagaccctaaaagcaaaagaaacaaaaatga--------aaataaataaat-------------gagacctaattaaactaaaaagcttcagcacagcaaaagaaataatcatcagagtaaaccaacaacctacacaatgggaaaaatatttgcaaactatgaatctaacaaaggactaa-tatctacaacctacaagaaactcaaacaaatcaccagaaaaaatacaaataattccattaaaaattagccaaattacatgaatagacatttctcaaaagaagatgtgcaaatggtgaccaagcatat-aaaacatgctaaatatcactaagcatcagggaaatgtaaaataaaacaacagtgagatatcacctcactgcagccagaatgaccactattaaaa--ataaaaaaaacagatattggtgtggatgtggtgaaaagagaacagttagacactgctggtgggaatacaaattagtacaaatctatgtaaaacagtatggagagttctcaaagaactaaaagtagatcctaccattttattcagcagtctcatttctggatatctacacaaaataaaagaaatcgtactctcaaaaagacacctgcatacatatgtttactgcagcacaattcacaatatgcaaagacacggaatcaaccagtgtccatcaactgatatgtggaataaagaaaaggga--tatatatatatatatatgcacacacacacacatatcttacatcacataaatatatctcatgt-- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I a score=-3312.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171488 25 + 478999 atatatatatatatgtatgtatgta---------------------------------------------------------- s panTro4.chrUn_GL393519 12086 5 + 413329 ata--------------------ta---------------------------------------------------------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37777964 83 - 90373283 atatgtatatatatgtatgtgtgtatatacactcacacatatacatacgtcatacatacctaAGACTGGGTAATTCATACACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90264585 66 - 108868599 I e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I e nomLeu3.chr5 77064216 0 - 143122389 C a score=1324.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171513 3 + 478999 tGT s panTro4.chrUn_GL393519 12091 3 + 413329 tgt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90264651 3 - 108868599 TGC i ponAbe2.chr14 I 66 C 0 s nomLeu3.chr5 77064216 2 - 143122389 -gt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778047 3 - 90373283 TAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10104653 16316 + 96796970 I a score=200055.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171516 186 + 478999 atacctgagactgggtaattcataaaggaaagaggcttaattgattcacagttacacatggctgggaaggcctcaggaaactt-acaatcatggcagaaggtaaaggggaagcaggcaacttcttcaaaaggtggcaggagagagagaa--gtgaaaggga-aagagcccattatagaattatctgctct s panTro4.chrUn_GL393519 12094 187 + 413329 atacctgagactgggcaattcataaaggaaagaggcttaattgattcacagttacacatggctgggaaggcctcaggaaactt-acaatcatggcagaaggtaaaggggaagcaggcagcttcttcaaaaggtggcaggagagagagaa--gtgaaagtgataagagctcattatagaactatctgctct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 311 s ponAbe2.chr14 90264654 187 - 108868599 ACacctgagactgggtaattcataaaggaaagaggatgaattgattcacagttatgcacggctggagaggcctcaggaaacttaataaccatggtagaaggtgaaggggaaccaggcatcttcttcataaggcggcaggagagagagaa--tggaagggga-aagagccccttatgaaaccatcagctct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064218 186 - 143122389 atacctgagactcggtaattcataaaggaaagaggtttaattgattcacagttacacatggctggggaggcctcaggaaactt-acaatcatagcagaaggcaaaggggaagcaggcaccttcttcaaaaggcggcaggagagagagaa--gtgaaaggga-aagagcccattatagaattatctgctct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778050 185 - 90373283 atacctgagactgggtaattcataaaggaaacaggcttaattgattcacagttatgcatggctggggaggcctcaggaaacttaacgaccatggcagagggtgaaggggaagctggcaccttctttgtaaggcagcag--gagagagaa--gtgaagcaga-aagagccccttatgaaaccatcagctct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10120969 183 + 96796970 atacctgagactgggtaattcacacaggaaacaggattaattgattcacacttacacctggctagggaggcctcaggaaacat------catgatggaaggtgaaggggaagcaggcaccttcttcaaaaggtggtaggagagagagagacgtgaagggga-aagagtcccttatgaaactatcagctct i calJac3.chr16 I 16316 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C a score=129288.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171702 192 + 478999 tgtgagaactcact----atcaagagaacagcatggaggaaaccgaccccatgatccaat-acctcccagctggtctttctctcaacacctgggaattacaatttgacatgagatttggg-tggaaacacaaagcgaaactatTGGGGGGGGTG--TATCCTTACTTTTAAAATATCAAAATGTCATTATTTATATTTCA s ponAbe2.chr14 90264841 198 - 108868599 tgtgagaactcactcactatcacaagaacagcatggaggaaaccgaccccatgatccaatcacctcccagctggtctttc-ctcaacacctgggaattacaatttgacatgagatttgca-tagaaacacaaagccaaactatTGGGGGGGGGGGGCATTCttatttttaaaatatctaaatgtcattatttataattca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064404 186 - 143122389 tgtgagaact--------atcacgagaagagcatggaggaaaccgacctcatgatccaat-acctcccagctggtctttctctcaacacctgagaattacaatttgacatgagatttggg-tggaaacagaaagccagacta-tGCGGGGGGTG--TATCCTTACTTTTAAAATATCT-AATGTCATTATTTGTATTTCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778235 196 - 90373283 tgtgagaactcactcactatcacaagaacagcatggaggaaacagataccatgatccaattacctcccagctggtctttctctcaacacctgggaattacaatttgacatgagatttgca-tggaaacacaaagccaaactaCTGGATGGGG-G--TATCCTTACTTTTAAAATATCTAAATGTCATCATTTATAATTCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10121152 192 + 96796970 tgtgagaactcact----atcatgagaacagcatgggggaaattgacaccatgacccaatcacctcccaccagatctttctctcaacacctgggaattacaattttacttgagatttgggttggggatacaaagccaaactatatcaGGGAG----TATCCTTACTTTTAAAATATCTGAATGTCATTATTTGTATTTTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C e panTro4.chrUn_GL393519 12281 311 + 413329 I a score=31674.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171894 35 + 478999 AAAATAGCAATTTTT-ATTAGTAATGATT---TTGTTTG s panTro4.chrUn_GL393519 12592 36 + 413329 AAAATAGCAATTTTT---TAGTAATGATTGATTTGTTTG i panTro4.chrUn_GL393519 I 311 C 0 s ponAbe2.chr14 90265039 34 - 108868599 -aaatagtaattttt-attaGTTATGATT---TTGTTCG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064590 35 - 143122389 AAAATAGCAATTTTT-ATTAGTAATGATT---TTGTTTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778431 35 - 90373283 AAAATAGCAATTTTT-GTTAGTTATGATT---TTCTTTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10121344 36 + 96796970 AAAATAGGATTTTTTGATTACTTATGATT---TTGTTGG i calJac3.chr16 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C a score=70274.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171929 58 + 478999 AAAATAAAATGACCTGGTAAATTTTCTTCAATTTTAGCCTAGTATTTAGTCAAA--ATAT s panTro4.chrUn_GL393519 12628 56 + 413329 AAA-TAAAATGACCCGGTAAATTT-CTTCACTTTTAGCCCTGTATTTAGTCAAA--ATAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265073 57 - 108868599 TAAGTAAAATGATCTGGTAAATTTTATTCACTTTTAACC---TATTCAGTCAAAATATAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064625 58 - 143122389 AAAATAAAATGACCTGGTAAATTTTCTTCACTTTTAGCCTAGTATTTAGTCAAA--ATAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778466 60 - 90373283 AAAATAAAATGATCTGGTAAATTTTCTTCACTTTTAACCTACTATTTAGTCAAAATATAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10121380 58 + 96796970 AAAATAAAATGATCTGGTAAATTTCTTTCACTTTTAGCCTAGTACTTAGTCAAA--ATAT i calJac3.chr16 C 0 I 308 s canFam3.chr2 81134680 58 - 85426708 AAAAGAAAATGTTTTGGTAACTTGTGCATACTTTTAGCCTAGTATCTAATCCTA--ATAC i canFam3.chr2 N 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C a score=32408.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 171987 21 + 478999 AAAAAGCCGAATTTGCCAGCA s panTro4.chrUn_GL393519 12684 21 + 413329 AAAAAGCTGAATTTGCCAGCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265130 21 - 108868599 AAAAAGCTAGATTTGCCAGCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064683 21 - 143122389 AAAAAGCTGAATTTGCCAGCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37778526 21 - 90373283 AAAAAGCTGGATTTGCCAGAA i chlSab2.chr2 C 0 N 0 s calJac3.chr16 10121746 21 + 96796970 aaaaaGCTGGATTTGCCAGTA i calJac3.chr16 I 308 C 0 s canFam3.chr2 81134738 20 - 85426708 AAAAAGCTG-ATTTACCAACA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32605415 5680 - 90941950 I e macFas5.chr10 36520864 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35569218 0 - 95678458 C a score=1605957.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 172008 596 + 478999 GAAAACTGTAATTACTTTTAAATGAGGTAAAGATGTATAAGAATATCACTGTTATTGTACTGAGAAGAAAGTGAAT-----GAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAGTATCACTACCATATACATACATGAACTGACAAAGAGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTATGTTAGGACTTAAGCAAAAGCTTCTAAAAATACC-AAAAACAGAAAGAAAATAATTAATTTTAACGAATAAATTATACAGAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTATTTAAAAAAAA--GAAAACAGATCTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCTTGACCAAAATTTTAAAATGAAGTCTACAATTCTGGAATATAAAATAC-TTTCATTTTGAACATAGTTAATTGAAGGCAACTTTTATACAGAAAATTTTCGGTTAAAGTTGACTCTAACTTA--------GGAAAGAAATGACTTGTACCAATGGTAACAACAAGCCACCCAAAAGCCAGTATGAAATCTAGTCAATCAATCAATGACCACTGCTCTTGCTCACCAACCAATATCAATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAC---GCAGCAGCACCTGCTCCACCAGAATAGAC---AGTGCC s panTro4.chrUn_GL393519 12705 592 + 413329 GCAAACTGTAATTACTTTTAA-TGAGGTAAAGATGTATAAGAATATCACCGTTATTGTACTGAGAAGAAAGTGAAC-----AAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAGTCTCACTACCATATACATACATGAACTGACAAAGAGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTATGTTAGGACTTGAGCAAAAGCTTCTAAAAATACC-AAAAACAGAAAGAAAATAATTAATTTTAAGGAATAAATTATACAGAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTATTAAAAAAAAAAAGAAAACAGATATTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCTTGACCAAAATTTTAAAATGAAGTCTACAATTTTGGAATATAAAATAG-TTTCATTTTGAACATAGTTAATTGAAGGCAACTTTTATACAGAAAATTTTCGGTTAAAGTTGACTCTAACTTA--------GGAAAGAAATGACTTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCACCCAAA-GCCAGTTTGAAATCTAGTCAATCAAT----GACCACTGCTCTTGCTCACCAACCAATATCAATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAT---GCAGCAGCACGTGCTCCATCAGAATAGAC---AGTGCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265151 594 - 108868599 GAATATTGTAACTATTTTTTAATGAGATAAAAATGTATAACAATATCATTATTACTGTACAGGGAAAAAAGTGAAC-----ATGAAAAGGAGTTTAAAAAGACAGAATATGACTATCATATACATACATGAACTGAC----AGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTATGTTAGGACTTGAGCAAAAGCTTCCAAAAATACCAAAAAACAAAAACAAAACAATTATTTTTAAGAAATAAATTATACAAAGAACTCTTCTTGTTAAGAC---------------------------------------------------------------------------------GATGTATAAAAAAAAAA-----------ACTTCATGAGAGCTATTATTAACCAAGTCGTCATAACCAAAACTTTAAA------TCCACAATTCTGAAATATTAAAAAG-TTTCATTTTGAACATAGTTAATGGAAGGCAAATTTTGAACAGAAAATTTCTGGTTGAAGTTGACTCAAACTTA--------GGAAAGAATTGACCTGTAGCCATGGTAACAAGAAGCCACCCAGA-GCCAGTTCAAAATCTAGTCAATCGATCAATGACCACTGGTCTTGCTCACCAACCAATATCAATGTGAGCAGCTTCCTTCTGAAAGACAGCCAA---GCAGCCACAGCTGCTCCAACAGAATAGAC---AGTGCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77064704 594 - 143122389 GAAAACTGTAATTACTTTTAAATGAGGTAAAGATATAAAAGAATATCACTGTTATTGTACAGAGAAGAAAGTGAAC-----AAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAATATCACTACCATATACATACATGAACTGACAAAGAGACTAAAATCTCCTTCTGGAGATTATGTTAGGACTTGAGCAAAAGCTTCTAAAAATACC-AAAAACAGAAAGAAAATAATTAATTTTAAGGAATAAATTATACAGAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ACGTATTAAAAAAAAG---AAAACAGATCTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCTTGACCAAAATTTTAAAATGAAGTCGACAATTCTGGAATATAAAATAG-TTTCATTTTGAACATAGTTAATTGAGGGCAACTTCTATACGGAAAATTTTTGGTTGAAGTTGACTCTAACTTA--------GGAAAGAAATGACCTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCACCCGGA-GCCAGTTTGAAATCTAGTCAATCAATCAATGACCACTGGTCTTGTTCACCAACCAATATCAATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAC---GCAGCAGCACCTGCTCCATCAGAATAGAC---AGTGCC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35569218 599 - 95678458 gaaaactgtaATTATTTTTAA-TGAGGTAAAAATGTATAAGAATATCACTGTTACTGTACAGAGAAGACAGTGAACAAGAAAAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAATATCACTACCATATACATACATTAACTGACAAAGAGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTGAGTTAAGACTTGAGCAAAAGCTTCTAGAAATACT-AAAAACAGAAACAAGACAAATAATTTTAAGGAATAAATTTTACAGAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTATTTTAAAAAAA--GAAAACAGATCTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCTTGACCAAAATTTTAAAATGAGGTGTAAAATTCTGCAATATAAAATAG-ATTCATTTTGATCATAGTTAATTGAAGGCAACTTTTAAACCAAAAATGTTCAGTTAAAGTTGAGTCTAACTTA--------GGAAAGAAATGACCTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCACCCAGA-GCCAGTTTGAAATCTAGTCAACCAATCAATGACCACTGGTCTTGCTCACCAACTAATACAGATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAA---GCAGCAGTACCTGCTCCATCAGAAGAGCC---AGTGCC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36520864 595 + 96509753 gaaaactgtaATTATTTTTAA-TGAGGTAAAAATGTATAAGAATATCACTGTTACTGTACAGAGAAGACAGTGAACAAGAAAAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAATATCACTACCATATACATATATTAACTGAC----AGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTATGTTAAGACTTGAGCAAAAGCTTCTAGAAATACT-AAAAACAGAAACAAGACAAATAATTTTAAGGAATAAATTTTACAGAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ACGTATTTTAAAAAAA--GAAAACAGATCTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCTTGACCAAAATTTTAAAATGAGGTGTAAAATTCTGCAATATAAAATAG-ATTCATTTTGATCATAGTTAATTGAAGGCAACTTTTAAACCAAAAATGTTCAGTTAAAGTTGAGTCTAACTTA--------GGAAAGAAATGACCTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCACCCAGA-GCCAGTTTGAAAACTAGTTAACCAATCAATGACCACTGGTCTTGCTCACCAACCACTACAGATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAA---GCAGCAGTACCTGCTCCATCAGAAGAGCC---AGTGCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32611095 594 - 90941950 Gaaaactgtaattatttttaa-tgaggtaAAAATGCATAAGAATATTACTGTTATTGTACAGAGAAGACAGTGAac-----aagaaaaggaatttaaaaag--agaatatcactaccatatacatatattaaccGACAAAGAGACTAAAACCTCCTACTGGAGTTTATGTTAGGACTTGAACAAAAGCTTCTAGAAATACC-AATAACAGAAATAAGGCAATTAATTTTAAGGAATAAATTATgcaaagaaat------------------------------------------------------------------------------------------------atgtattttaaaaaat--gtaaatagatcTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCGTgaccacaattttaaaatgaggtctAAAATTCTggaatataaaatag-tttcattttgaACATAGTTAATTGAAGGCaacttttaaacagaaaatgttcAGTTAAAGTTGAGTCTAACTTA--------GGAAACAAATGACCTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCGCCCAGA-GCCATTTTGAAATCTAATCAGCCAATCAATGACCACTGGTCTTGCTCACCAACCAATACAGATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAACACAGCCAA---GCAGCAGCACCTGCTCCATCAGAATAGCC---AGTACC i papAnu2.chr10 I 5680 C 0 s chlSab2.chr2 37962490 594 - 90373283 gaaaactgtaATTATTTTTAA-TGAGGTAAAAATGTATAAGCATATTACTGTTATTGTACAGAGAAGACAGTGAAC-----AAGAAAAGGAATTTAAAAAG--AGAATATCACTACCATATACATATATTAAGTGACAAAGAGACTAAAATCTCCTACTGGAGATTATGTTAGGACTTGAACAAAAGCTTCTAGAAATACC-AATAACAGAAACAAGGCAATTAATTTTAAGGAATAAATTATGCAAAGAAAT------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTATTTTTAAAAAT--GTAAACAGATCTTCCTGAGAGCTATTATTAACCAATTCATCGTGACCACAATTTTAAAATGAGGTGTAAAATTTTGGAATATAAAATAG-TTTCATTTTGAACATAGTTAATTGAAGGCAACTTTTAAACAGAAAATGTTCAGTTAAAGTTGAGTCTAACTTA--------GAAAAGAAATGACCTGTACCAATGGTAACAAGAAGCCACCCAGA-GCCAGTTTGAAATCTAGTCAACCAATCAATGACCACTGGTCTTGCTCACCAACCAATACAGATGTGAGCAGCTTGCTTCTGAAATACAGCCAA---GTAGCAGCATCTGCTCCATCAGAATAGCC---Agtgcc i chlSab2.chr2 N 0 N 0 s calJac3.chr16 10121767 684 + 96796970 GAAAATTGGAATTACTTTTTCATAAGGTAAACGTGCATAAGAATGTTATTACTATTGTACAGAGAAGAAAGTGAAC-----AAGGAAGAGAATTTAAAAAGAGAGAATATCACTACCATATACATACATGAACTGACAAAGAGACTAAAATCTCCCACTGAATATTATGTTAGGACTTGAGCAAAAGCTTCTAAAAATACC-AAGAACAGAAACAAAACAATTATTTTTAAGAAATAAACTGTACAGAGAACTCCTCTGGTTAAGATAAGACTatagatagatagatagatagatggatagatacatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatgatagataga---tagatagatCTTCCAGAAACCTATTATTAACCAATTCATCCTGATCAAA-----AAAGATAAGTCTACAATTCTGGGATTTAAAATAC-TTTCATTTTGAACATAGTTAATGGAAGGCAACTTTTAAATAGAAAATTTCCAGTTAAAGTTGACTCCAACTTT--------GGAAAGAACTGACCTGTAGCCATGATAACAAGAAGACACCCAGA-GCCAGTTCTAAATCTAGTCAATTGATCAATGACCACTGGCGTTGCTCACCAACCAATATCAATGTAAGCAGCTTCCTTCTGAAAGACAGTTAA---GCAGCAG---CTGCTCCATCAGAACAGAC---AGTGCC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81134758 534 - 85426708 GAAAATTATATTTTTTTTCA--TGGACTAAATACATGCAAG--------------------------------------------------------------AAAATATTATGAGCATATAGCTATGTAAATTTACAAAAAGACTGAATTTTTCCATAGGAGATTA--TCAATACTGAAAAAAA-----------------AAAAACAAAACCA--GCAATTACTGTTTTAAAAC-TGCCATACAGATAACTCTTCTAGTTAAATT----------------------------------------------------------------------------------AAACATCCAAAAAAGA-------TGGATCTTCCTGAAAGCAATTATTAAACAATTCTTCTCGACCCAAATTTCAGAAGTAAATCTGTAATTATGG-ATACGAAATAGCTTTCATTTTGAAAACAGTTAATAGAA-GCAACTTTTAAATAGAAAACAACTGGTTAAAGACACCTCAAAGTTATGTTGGCGGGGGAATGCTAACATGCAGCCATGGTAACGAGAACCCA-TCAGA-ACCAGTTTTAAATGTTTGTAAT-GATCAATGCCATCTGTCCTCACTCACTAGCCA--ACCAATGTCAGCTTCTCCCTCATGAAGTATAGCCAATGTGGGACAAAATC-ACTCCAATACGCATGCCTTGAGTGCC i canFam3.chr2 C 0 I 6 a score=300971.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 172604 130 + 478999 TGACCAGTATTCCTCTTACTATAGGAAGCAAAAAA-TTCCAACTCTG-TATCTTTATTTCAAATACCAAAGGTTCA--TAATCCCTTGAAAAGAATTTGTAAGTCCATTAAATGTGCCACCCTAATTTTTTTTT----- s panTro4.chrUn_GL393519 13297 128 + 413329 TGACCAGTATTCCTCTTACTATAGGAAGCAAAAAA-TTCTAACT--G-TCTCTTTATTTCAAATACCAAAGGTTCA--TAATCCCTTGAAAAGAATTTGTAAGTCTATTAAATGTGCCACCGTAATTTTTTTTT----- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265745 123 - 108868599 TGACCAGTA-TAGTCTTACTAAAGGAAGCAAAAAA-TTCCAACTCTG-TCTTTTTATGTCAAATACTGAAGGTCCA--TAATCCCTTGGAAAGAATTTGTGAGTCCATTACATTTACCACCCTAAAAA----------- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065298 130 - 143122389 TGACCAGTATTCCTCTTACTATAGGAAGCAAAAAA-CTCCAACTCTG-TCTCTTTATTTCAAATGCCAAAAGTTCA--TAAACTCTTGAAAAGAATTTGTAAGTCCATTAAATGTGCCACCCTAATTTTTTTTT----- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35569817 131 - 95678458 TGACCAGTATTCTTCTTACTATAGGAAGCAAAAAAATTCCAACTCTG-TCTTTTTATTTCAAATACCAAAGGTTCA--TAATCCCTTGAAAAGAATTTGTAAGTCCATTAAATGTGCCACCCCAATTTTTAAAA----- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521459 131 + 96509753 TGACCAGTATTCTTCTTACTATAGGAAGCAAAAAAATTCCAACTCTG-TCTTTTTATTTCAAATACCAAAGGTTCA--TAATCCCTTGAAAAGAATTTGTAAGTCCATTAAATGTGCCACCCCAATTTTTAAAA----- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32611689 129 - 90941950 GGACCAGTATTCCTCTTACTATAGGAAGCAAAAAATTTCCAactctg-tctttttatttcaaataccaAAGATTCA--TAATCCCTTGAAAAGAATTTGTAAGCCCATTAAATGTGccaccccaattttt--tt----- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37779139 129 - 90373283 TGACCAGTACACATCTTACTATAGGTAGCAAAATA-TTCCAACTCTG-TCTTTTTATTCCAAATACCAAAGATCCA--TAATCCCTTGGAAAGAATTTGTGAGTCCATCACATTTACCACTCTAATATTT-TAA----- i chlSab2.chr2 N 0 C 0 s calJac3.chr16 10122451 131 + 96796970 TGGCCAATATATGTCTTCCTATAGGAAGCAAAAAA-TTCCAACTCTGTTCTTTTTATTTCAAATACTGAAGGTTCA--CAATCCCTTGGAAAGAATTTGTAAGTACATTAAATTTACCACCCTAACATTTTTTT----- i calJac3.chr16 C 0 I 1 s canFam3.chr2 81135298 102 - 85426708 TCAACAGTCTTACCC-----------------AAA-TTACCATGGTG---------CTTCAGATGATGACAAACCACTTAATTCTCTGAAA----------AGTCTCCCAAGTCTTAAACTCCACTTTTCCTGAAACTG i canFam3.chr2 I 6 C 0 a score=10947.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 172734 9 + 478999 T-AAATAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 13425 10 + 413329 TTAGATAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265868 8 - 108868599 --AAATAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065428 8 - 143122389 --AAATAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35569948 8 - 95678458 --AAATAAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521590 8 + 96509753 --AAATAAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32611818 8 - 90941950 --ttttttaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37779268 8 - 90373283 --AAATAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81135400 9 - 85426708 -TATATAGAA i canFam3.chr2 C 0 I 170 e calJac3.chr16 10122582 1 + 96796970 I a score=539829.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 172743 293 + 478999 TACTAGTggccaggcgcagtggctcatgcctgtaat---cccagcactttgaaaggccgaagtgggtggatcacctgaggtacagagtttgagaccagcctgaccaacagggtgaaacc--ccatctctattaaaaatacaaatattagccaggcgtggtggcatgcccccgtaatcccagctccttggaaggctgagggaggagaaatacatgaa-ccagaaggcggaggttgcagtgaactgagatcataccactgaactccagcctgggggatacagcaagactccatctca---------aaat s panTro4.chrUn_GL393519 13435 293 + 413329 TACTAGTggccaggtgcagtggctcatgcctgtaat---cccagcactttgaaaggctgaagtgggtggatcacctgaggtacagagttcgagaccagcctgaccaatgtggtgaaacc--ccatctttattaaaaatacaaatattagccgggcgtggtggcatgcccccgtaatcccagctccttgggaggctgagggaggagaaatgcatgaa-tcagaaggtggaggttgcagtgaactgagatcataccactgaactccagcctgggggatacagcgagactccatctca---------aaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90265876 296 - 108868599 TACTAGTggccggatgtggtggcttacatctgtaatccacccagcactttgtgaggacaaggc-ggtggattgcctgaggtcaggagttcgagaccagcctgacaaacagggtgaaatc--ccatctctactaaaaatatgaaaattagccaggcgtcatggcacgcacctgtaatcccatctcctcaggtgcctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgaggtcacgccactgcactgcagcctgggtgacagagcgagactctatctct---------aaat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065436 302 - 143122389 TACTAGTggccaggcacagtggctcacacctgtaat---cccagcactttgaaaggccaaagtgggtggatcacctgaggtacagagttcgagactagcctgaccaacagggtgaaacc--ccatctctactaaaaatacaaatattagccgggcgtggtggcatgcccccgtaatcccagctccttgggaggctgagggaggagaaatgaattaa-ccagaaggcagaggttgcagtgaactgagatcacgccactgaactccagcctgggggatacagcaagaccccatctcaaaaaaaattaaat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35569956 280 - 95678458 AGTGAGTggctgggtgcagtggctcatgcctgtaat---cctagcactttgaagggccgaagtgggtggatcacctga-gtaaagagtgtgaggccagcctgtccaacatggtgaaacc--ctgtctctactaaaaatacagaaattagccaggtgtggtggcatgccgctgtaatcccagctcctcaggagactaaggcaggagaaatacatgaacccaggaggcggagggtgcagtgaactgagaccccaccactgcactccagcctgggtgatagagtgagac---------------------- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521598 293 + 96509753 AGTGAGTggctgggtgcagtggctcacgcctgtaat---cctagcactttgaagggccgaagtgggtggatcacctga-gtaaagagtgtgaggccagcctgtccaacatggtgaaacc--ctgtctctactaaaaatacagaaattagccaggcgtggtgtcatgcccctgtaatcccagctcctcatgaggctaaggcaggagaaatacatgaacccaggaggcggagggtgcagtgaactgagaccccaccactgcactctagcctgggcgacagagtgagactccatctca---------aaaa i macFas5.chr10 C 0 I 6 s papAnu2.chr10 32611826 296 - 90941950 agcaggtgaccaggtgcagtggctcatgcctgtaat---cctagcactttgaagggccaaagtgggtggatcacctgaggtaaagagttcgagaccagcctgcccaacaaggtgaaattagtagtctctactaaaaatacagaaagtagccaggtgtggtggcatgccgctgtaatcccagctcctcaggagactaaggcaggagaaatacatgaacccaggaggaggagggtgcagtgaactgagaccccaccactgcactccagcctgggcgatagagtgagactctatctca---------aaaa i papAnu2.chr10 C 0 I 6 s chlSab2.chr2 37779276 294 - 90373283 TACTAGTggctgggcgtagtggctcatgcctgtaat---cccagcactttgggaggctgaggcgggtggattgcctgaggtcaggagttcatgaccagcctgacaaacagggtgaaacc--ccatctcgaataaaaatatgaaaattagctgggcatgattgcatgaacctataatcccagctcctcaggtggctgaggcaggagaatcgcttgaacacaggaggtggaggttgcagtaagccgaggtcacgtcactgcactgcagcttgggtgacagaatgagactctgtctct---------aaat i chlSab2.chr2 C 0 N 0 e canFam3.chr2 81135409 170 - 85426708 I e calJac3.chr16 10122582 1 + 96796970 I a score=-2387.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173036 1 + 478999 -a s panTro4.chrUn_GL393519 13728 1 + 413329 -a i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065738 1 - 143122389 -a i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521897 1 + 96509753 C- i macFas5.chr10 I 6 C 0 s papAnu2.chr10 32612128 1 - 90941950 c- i papAnu2.chr10 I 6 C 0 e ponAbe2.chr14 90266172 0 - 108868599 C e canFam3.chr2 81135409 170 - 85426708 I e rheMac3.chr10 35570236 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10122582 1 + 96796970 I a score=1911.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173037 1 + 478999 a s panTro4.chrUn_GL393519 13729 1 + 413329 a i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266172 1 - 108868599 a i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065739 1 - 143122389 a i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521898 1 + 96509753 A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32612129 1 - 90941950 a i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968190 1 - 90373283 A i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e canFam3.chr2 81135409 170 - 85426708 I e rheMac3.chr10 35570236 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10122582 1 + 96796970 I a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173038 1 + 478999 a s panTro4.chrUn_GL393519 13730 1 + 413329 a i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266173 1 - 108868599 a i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065740 1 - 143122389 a i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36521899 1 + 96509753 A i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32612130 1 - 90941950 a i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968191 1 - 90373283 A i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81135579 1 - 85426708 A i canFam3.chr2 I 170 C 0 e rheMac3.chr10 35570236 0 - 95678458 C e calJac3.chr16 10122582 1 + 96796970 I a score=325690.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173039 125 + 478999 ataaaaTACTAGTAAAGTTTGC--AATTCCTCTGACTCAGTTTACCATAATTACAATT---ATGTTTACTAGTAAAAGAATAAATAGTGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCTCTCTAAATAAAAAAA---T s panTro4.chrUn_GL393519 13731 124 + 413329 ataaaaTACCAGTAAAGTTTGC--AATTCCTCTGACTCAGTTTGCCATAACTACAATT---ATGATTACTAGTAAAAGAATAAATAGTGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCTCTCTAAATAAAAAAA---- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266174 129 - 108868599 ataaaaTACCAGTAAAGTTTGCAAAATTCCTCTGACTCATTTTACCATAATTGCAATTATCATGATTACCAATAAAAG----AATAGTGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCTCCCTAAGTGAAAAAATATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065741 126 - 143122389 ataaaaTACCAGTAAAGTTTGC--AATTCCTCTGACTCAGTTTACCGTAATTACAATT---ATGATTACCAGTAAAAGAATAAATAGTGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCTCTCAAAATAAAATAA--TT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35570236 96 - 95678458 -------------------------------ctgactcaGTTTACCATAATTACAATT---ATGATTACTAGTAAAAGAATAAATAATGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCACCCTAAATAAAAAAA---A i rheMac3.chr10 C 0 I 2 s macFas5.chr10 36521900 125 + 96509753 ATAAAATACTAGTAAAGTTTGC--AAGTCCTCTGACTCAGTTTACCATAATTACAATT---ATGATTACTAGTAAAAGAATAAATAATGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCACCCTAAATAAAAAAA---A i macFas5.chr10 C 0 I 2 s papAnu2.chr10 32612131 125 - 90941950 atcaaatactAGTAAAGTTTGC--AATTCCTCTGACTCAGTTTACCATAATTACAATT---ATGattacaaataaaagaataaataatgaataaccACAATATTGGGCTCTTCTccctaaataaaaaaa---t i papAnu2.chr10 C 0 I 420 s chlSab2.chr2 37968192 125 - 90373283 ATAAAATACAAGTAAAGTTTGC--AATTCCCCTGACTCAGTTTACCATAATTACAATT---ATGATTACAAATAAAAGAATAAATAATGAATAACCACAATATTGGGCTTTTCTCCCTAAATAAAAAAA---T i chlSab2.chr2 C 0 I 1 s calJac3.chr16 10122583 124 + 96796970 ATAAAATATCAGTCAAGTTTGC--AATTCTTCTGAATCATTTTACCATAACTACAATGATCATAATCACCAGTAAAAG----TATAGTGAATAACCACAAAATTGGGCTTTTCTCCCCAGACAAAAAAC---T i calJac3.chr16 I 1 C 0 s canFam3.chr2 81135580 104 - 85426708 ATGAAACATAAATGAAGTTTGC--TCTTCCTTTGTTCCATTCTACTATAATTAAAACTAACATAAATACCAGTAAAAGAATAAGTAGCAAGTAACCACAAGATTAG--------------------------- i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=562190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173164 201 + 478999 AATATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAGAGCCAAAACAATTTTTAAAATGCATGTAATTACTGGGCAAAACTGTTAGAATGAA-CCATGTCAAACATTT------TTAAAGTGAG---AATTAAT---------CAAACAATATATCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataagtatttattaggtagcttcatccaatatgctaggcctttttct s panTro4.chrUn_GL393519 13855 201 + 413329 AATATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAAAGCCAAAACAATTTTAAAAATGCACGTAATTACCGGGCAAAACTGTTAGAATGAA-CCATGTCAAACATTT------TTAAAGTGAG---AATTAAT---------CAAACAATATATCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataagtatttattaggtagcttcatccaatatgctaggcctttttct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266303 201 - 108868599 AATATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAAAGCCAAAAGAATTTTAAAAATACATATAATTACCAGGCAAAATTGTTAAAATGAA-CCTTCTCAAATATTT------TTTAAGTGAG---AATCAAT---------CAAACAATATACCCAG----GATAAACTCCattcattcatttaatacttatttattaggtagctatgtctgataggctatgcctttttct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77065867 201 - 143122389 AATATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAGAGCCAAAACAATTTTTAAAATGCATGTAATTACGGGGCAAAACTGTTAGAATGAA-CCACATCAAATATTT------TTAAAGTGAG---AATTAAT---------CAAACAATATATCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataagtatttattaggtagcttcatccaatatgctaggcctttttct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35570334 201 - 95678458 AGTATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAGAGCCAAAACAATTTTTTAAATGCATATAATTAGCAGGCAAAACTATTAGAGTGAA-CCACGTCAAACTTTT------TAAAAGTGAG---AATCAAT---------CAAACAATATACCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataaggatttattaggtagctacatccagtatgctaggcctttttct i rheMac3.chr10 I 2 C 0 s macFas5.chr10 36522027 201 + 96509753 AGTATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAGAGCCAAAACAATTTTTTAAATGCATATAATTAGCAGGCAAAACTATTAGAGTGAA-CCACGTCAAACTTTT------TAAAAGTGAG---AATCAAT---------CAAACAATATACCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataaggatttattaggtagctacatccaatacgctaggcctttttct i macFas5.chr10 I 2 C 0 s papAnu2.chr10 32612676 198 - 90941950 aatataaag-aatgtagcttattataaaaagccaaaacaattattaaaatgcttataATTACCAGACAAAACTAATAGAATGAC-Ccatgtcaaaatttt--------aaagtgaG---AATCAAT---------CAAACAACATACCCAG----GATgaact-cattcactcatttaataagGATTTATTAGGTAGCTACATCCAATATGCTAGGACttttttt i papAnu2.chr10 I 420 C 0 s chlSab2.chr2 37968318 199 - 90373283 AATATAAAG-AATGTAGCTTATTATAAAAAGCCAAAACAATTATTAAAATGCATATAATTACCAGACAAAACTAATAGAATGAC-CCATGTCAAAATTTT--------AAAGTGAG---AATCAAT---------CAAACAACATACCCAG----GATAAACTCCattcactcatttaataaggatttattaggtagctacatccaatatgctaggcctttttct i chlSab2.chr2 I 1 C 0 s calJac3.chr16 10122707 204 + 96796970 GATATGAAGAAATGTAGCTTATTATAAAGAGCTAAAAGAATT-TAAAAATACACATAATTGCCAGGCAAAATTGTTACAATGAA-CCATGTCAAACATTT------TTCAAGCAATATCAATCAGT---------CAATCAATATACCCAG----GATAAACTCCGttcactcatttaataagtatttattaggtaactacatttgatatgctaggcctttttct i calJac3.chr16 C 0 I 490 s canFam3.chr2 81135684 185 - 85426708 ------------------------------GCCCAAGTAATCCACAAAATGCAGATAACGGACAGGTTAAATTGTCAGAATGGATCCATGCCAGCCGTTCTTTCTGTTTAAGTGAG---AATTGGTATTATGTTAAAAACAATACACACGGTTTAGTTAAACtccattcactc----aacaaacatttattgaatagcactat---atatgctagaatgttctct i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=509813.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173365 200 + 478999 aggcagtgaggatatggtagtgaaaaataaaaaccccattcatgagagtgagaaaaacacacaataacaacagacagataaggcaaaatatacagtatgttagaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttatgtgtt-tcatggggagggtggtgggaa----agttggggt-ggtcagaaaagtccctgctgagaaag s panTro4.chrUn_GL393519 14056 200 + 413329 aggcagtgaggatatggtagtgaaaaataaaaaccctattcatgagagtgagaaaaacacacaataacaacagacagataaggcaaaatatacaggatgttacaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttatgtgtt-tgatggggagggtggtgggaa----agttgggat-ggtcagaaaagtccctgctgagaaag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266504 201 - 108868599 aggaagtcaggatatggtaatgcacaataaaaaccctattcatgagagtgagataaacacacaataacaacaaacagataaggcaaaatatacagtacattagaggagaaaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttatgtgtt-tgatgggaagggtggtgggta----agctgggat-ggccagaaaagtccctgctgagaaag i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77066068 200 - 143122389 aggcagtgaggatatggtagtgaaaaataaaaaccctattcatgagagtgagaaaaacacacaataacaacagacagataaggcaaaatatacagtatgttagaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaacgtttatgtgtt-cgatggggagggtggtgggaa----tgttgggag-ggtcagaaaagtccctgctgagaaag i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35570535 200 - 95678458 aggcagtgtggatatggtagtgaaaaataaaatcccaatgcatgagagtgaggtaaacacacaataataatggacacagaagacaaaatatacagtacattagaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttacgtgtt-tgatggggagggtggtgggaa----agttgagat-ggtcagaaaagtctctgctgacaaag i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36522228 200 + 96509753 aggcagtgtggatatggtagtgaaaaataaaatcccaatgcatgagagtgaggtaaacacacaataataatggacacagaagacaaaatatacagtacattagaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttacgtgtt-tgatggggagggtggtgggaa----agttgagat-ggtcagaaaagtctctgctgacaaag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32612874 200 - 90941950 AGGCAGTGAGGATATAGTAGTGAAATATAAAATCCTTATTCATGAGAGTGAGATAAACACACAATAACAACAGACAGAGAAGACAAAATATACAGTACGTTAGAGGAG-AAAAACTAAAGcaggaaaatgaaatgtttatgtgTT-TGATGGGGAGGGTGGTGGGAA----CATTGGGAT-GGTCAGAAAAGTCTCTGCTGAGAAag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968517 200 - 90373283 aggcagtgaggatatggtagtgaaaaataaaatccctattcatgagagtgagataaacacacaataacaacagacagagaagacaaaatatacagtacgttagaggag-aaaaactaaagcaggaaaatgaaatgtttatgtgtt-tgatggggcgggtggtgggaa----agttgggat-ggtcagaaaagtctctgctgagaaag i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81135869 200 - 85426708 aagcactgaggacacggccatgaacagaaaaaaccctactcacgaggatagtaa----acatagtaacaataaactacctaggcaaactacacagtatg--agaggag-aaaaactaaagcagagaaatcaaatttcaatgtgttgtagcaaaaggggtggtcgaaatactagtcaggataaaccaagaagggccttgctgagaaag i canFam3.chr2 C 0 I 373 e calJac3.chr16 10122911 490 + 96796970 I a score=220389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173565 107 + 478999 GGGATT--TTTTTTTCTAATAC-AAAAAACCTTTTATTTGTATATCAAAGACTCTAAGAAATGACGACATAAGGTTAACGGCATTGATGTCAAGATACAAATGGGTTTGA s panTro4.chrUn_GL393519 14256 107 + 413329 GGGATT--TTTTTTTCTAATAC-AAAATACCTTTTATTTGTATATCAAAGTCTCTAAGAAATGATGACATAAGGTTAACAGCGTTGATGTCAAGATACAAATGGGTTTGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266705 97 - 108868599 AGGA------TTTTTCTAATAC-AAAGAAACTTTTATTTGTACATCAAAGACTCTAAAAACTGATGAC-----GTTAACAGAGTTGATGTCAAGACAC-AATAGGTTTGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77066268 106 - 143122389 GGGATT--TTTTTTTCTAATAC-AAAA-ATCTTTTATTTGTATATCAAAGACTCTAAGAAATGATGACATAAAGTTAACAGCGTTGATGTCAAGATACAAATGGGTTTGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35570735 110 - 95678458 gggatttttTTTTTTCTAATACAAAAAAACCTTTTATTTGTATATCAAAGACTCTAAGAAATGATGACATAAGGTTAACAGTGTTGATGTCAAGATACAAATGGGTTTGA i rheMac3.chr10 C 0 I 196 s macFas5.chr10 36522428 110 + 96509753 gggatttttTTTTTTCTAATACAAAAAAACCTTTTATTTGTATATCAAAGACTCTAAGAAATGATGACATAAGGTTAACAGTGTTGATGTCAAGATACAAATGGGTTTGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32613074 109 - 90941950 gggatttctttctttctaatac-aaaaaaccttttatttgTATATCAAAGACTCTAAGAAATGATGATATAAGGTTAAGAGTGTTGATGTCAAGATACAAATGGATTTGA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968717 109 - 90373283 GGGATTTCTTTCTTTCTAATAC-AAAAACCCTTTTATTTGTATATCAAAGATTCTAAGAAATGATGATATAAGGTTAAGAGTGTTGATGTCAAGATACAAATGGATTTGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I e calJac3.chr16 10122911 490 + 96796970 I a score=193043.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173672 91 + 478999 AGTTAGAGATGTTAAATCACTTTGTTTCACTGAACCTTCCCTTCATTACGTTAGAGAGCATCCCTGGTAGGCACCCAATTGAACCTCAAGC s panTro4.chrUn_GL393519 14363 91 + 413329 AGTTAGAGATGATAAATCACTTTGTTTCACTGAACCTTCCCTTCGTTACGTTAGAGAGCATCCCTGGTAGGCACCCAATTGAACCTTAAGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90266802 89 - 108868599 AGTTAGAGATGATAAATCAC--TGTTTCATTGAACCTTCCCTCAATTACGTTAGAGAGCATCCCTGGTATGCTCTCAATTGAATCTTAAGC i ponAbe2.chr14 C 0 I 111 s nomLeu3.chr5 77066374 91 - 143122389 AGTTAGAGATGATAAATCACTTTGTTTCACTGAACCTTCCCTCCATTACATTAGAGAGCATCCCTGGTGTGCTCCCAATTGAATCTTAAGC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571041 91 - 95678458 AGTTAGAGATGATAAATCACTTTGTTTCATTGAACCTTCCCTTGGTTACATTAGAGAGCCTCCCTGGTATGCTCCCAGTTGAATCTTAAGC i rheMac3.chr10 I 196 C 0 s macFas5.chr10 36522538 86 + 96509753 AGTTAGAGATGATAAGTCACTTTGTTTCATTGAACCTTCCCTTGGTTGCATTAGAGAGCCTCCCTGGTACACTCC-----GAATCTTAAGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32613183 91 - 90941950 AGTTAGAGATGATAAATCACTTTGTTTCACTGAACCTTCCCTTGGTTACATTAGAGAGCCTCCCTGGTACACTCCCAGTTGAATCTTAAGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968826 91 - 90373283 AGTTAGAGATGATAAATCACTTTGTTTCATTGATCCTTCCCTTGCTTACATTAGAGAGCCTCTCTGGTACACCCCTAGTTGAATCTTAAGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I e calJac3.chr16 10122911 490 + 96796970 I a score=33694.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173763 23 + 478999 ATGACGCGTCTAGGTAGCATGCT s panTro4.chrUn_GL393519 14454 23 + 413329 ATGATGCGTCTGGGTAGCACACC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77066465 23 - 143122389 ATGACGCATCTGGGTAGCACACG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571132 23 - 95678458 ATGATGCATCTGGGTAGTACATG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36522624 23 + 96509753 ATGATGCGTCCAGGTAGTACATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32613274 23 - 90941950 ATGATGCATCTGGGTAGTACATG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968917 23 - 90373283 ATGATGCACCTGGGTAGTACATG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90266891 111 - 108868599 I e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I e calJac3.chr16 10122911 490 + 96796970 I a score=123686.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173786 58 + 478999 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCCTTAATGTCTTTCTTTTTACCCTTTTTCCTCTT s panTro4.chrUn_GL393519 14477 58 + 413329 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCCTTAATGTGTTTCTTTTTACCCTTTTTCCTCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90267002 55 - 108868599 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTATTCCTAAATGTGTTTCTTTTTACCCTTTT---TCTT i ponAbe2.chr14 I 111 C 0 s nomLeu3.chr5 77066488 58 - 143122389 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTTTTCCTTAATGTGTttctttttaccctttttcttctt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571155 55 - 95678458 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCCATAATGTGTTTCTTTTTACCCTTTT---TCTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36522647 55 + 96509753 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCCATAATGTGTTTCTTTTCACCCTTTT---TCTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32613297 55 - 90941950 GTTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCcataatgtgtttctttttaccctttt---tctA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37968940 55 - 90373283 GGTCTTCCTCAGAAAGTGGTTGTTCCATAATGTGTTTCTTTTTACCCTTTT---TCTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I e calJac3.chr16 10122911 490 + 96796970 I a score=20300.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173844 7 + 478999 CTTctta s panTro4.chrUn_GL393519 14535 7 + 413329 CTTCTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90267057 7 - 108868599 CTTCTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77066546 7 - 143122389 cttcttA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571210 7 - 95678458 CTTCTTA i rheMac3.chr10 C 0 I 3 s macFas5.chr10 36522702 7 + 96509753 CTTCTTA i macFas5.chr10 C 0 I 373 s papAnu2.chr10 32613352 7 - 90941950 CTTCTTA i papAnu2.chr10 C 0 I 3 s chlSab2.chr2 37968995 7 - 90373283 CTTCTTA i chlSab2.chr2 C 0 I 3 s calJac3.chr16 10123401 7 + 96796970 ctgctga i calJac3.chr16 I 490 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I a score=1667091.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 173851 592 + 478999 gaaagggggttttaaataaagaactgaaggaatggaaagagaaagctaggaggataactggggaaaaagcattccagacacagggaactgcgaatcacagaggtgtgcctggcatctttaagcactaggggtagataagggacggcaag-agatcagtttggctgaagcagagcaagggagata----------------------------------------------------------attaggaggaactttgacacatactccgggtgaaatgggagataaacagaagggctggggcagaggaatgacacaatttgacttatgttttaaat-acatccactgagttaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaaaccaggactatcaattccca-gtctatgacactcatctagactgcagatgagggtggctcagatgtacaagatatgactgacttctggacatattcttcaggtagacctgacaagatttactgagagattagatgtgaggtgt-cagaga--gagagaga----gatgagtcaagaatgacaccgagatatttggcagagcaactggaagag-ttgcccttaaccaaaaataggaaagactacatgaggtgcagatttcaggaaggacatcagtagccc s panTro4.chrUn_GL393519 14542 595 + 413329 GAaaggggattttaaataaagaactgaaggaatggaaagagaaagctaggaggatatctggggaaaaagcattccagacacagggaactgtgaatcacagaggtgtgcctggcatctttaagcactaggggtagataagggatggcaag-aattcagtgtggctgaagcagagcaagggagata----------------------------------------------------------attaggaggaactttgacaagtactccgagtgaaatgggagataatcagaagggctggggcagaggaatgacacaatttgacttatgttttaaat-acatccactgagttaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaaaccaggactatcaattccca-gtctatgacactcatctagactgcagatgagggtggctcagatgtatgagatatgactggcttcaggacatattcttcaggtagacctgacaagatttactgagagattagatgtgaggtgt-cagaga--gagagagatagagatgagtcaagaatgacaccgagatttttggcagagcaactggaagag-ttgcccttaaccaaag-taggaaagactacatgaggtgtagatttcaggaaggacatcagtagccc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90267064 652 - 108868599 gaaaagggattttaagtaaagaactgaagtaatggaaacagtaagctagaagaatatctgaggaaaaagcattccagacacagggaactgctaagtgcagaggtgtgcctggagtcattaagcactagggataggtaaggaatagcaagaagttcagtgtggctgaaacagagcaaaagagataagaaacagaagtttaagcaggagagagaacatgccagatagttgacggccttttagttattaggaggaactctgacacatactcagagtgaaatgggaggcaatcagaagggctggggcaggagaatgacacaatttgacttatgttttaaat-acatccactgagttaagaattgatgaaagaggaagtttttaaaaacgaggactatcaattccca-gtctatgacactcatctagactgcagatgatggtggctcagatgtacaagatatgactggcttctggacatattcttcaggtagacctgatgagatttactgagagattagatgtgaagtgtgaagaga--gagagaaa----gatgagtctagaatgataccgaggtttttggcagagcaattggaaaagtttgccattaaccaaag-taggaaagactacatgaggtgtagatttcaggaaggtcatcagtagccc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77066553 589 - 143122389 GAaaggcggttttaaataaagaactgaaggaatggaaagagaaagctaggaggatatctggggaaaaagcattccagacacagggaactgccaagcacaggagtgtgcctagag-ctttaagcactaggggttgataagcgagggcaag-aattcagtgtggctgaagcagagcaagggagata----------------------------------------------------------attaggaggaactttgacacgtagtcagagtgaaatgggagacaatcagaagggcttgggcagaggaatgacacaatttgacttatgttttacac-acatccactgagctaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaagcgaggacgatcaattccca-gtctatgacactcatctag-ccgcagatgagggtggctcagatgtacaagatatgactggcttctggacatattattcaggtagacctgacaagatttactgagagattagatgtgaggtgt-cagaga--gagagaga----gatgagtcaagaatgacacctagatttttggcagagcaactggaagag-ttgcccttaaccaaag-taggaaagagtacatgaggtgtagatttcaggaaggacatcagtagccc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571220 592 - 95678458 GAAaggaggttttaaataaagaactgaaggaatggaaagagtaagctaggaggatatctggggaaaaagcattccagacacagggaacttccaagtacagaggtgtgcttggagtctttaagcactaggggtagataagggatggcaagaagttcagtgtggctaaagcagagcaagggagaga----------------------------------------------------------attaggaggaaatttgacacatactcagagtgaaatgggaggcaatcagaagggctggggcacaggactgacacaatttgacttatattttaagt-acatccactgagttaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaagccaggactatcaattacca-gtctatgacactcatgtagactgcagatgagggtggctcagatgtagaagatatgactggcttctggacatattcttcaggtagacctgacaagatttactgagagattagatgtgaggtgt-cagaga--gagagaga----gatgagtcaagaatgacactgagatttttggcagagcaactggaagag-ttgcccttaaccaaag-taggaaagactacatgaggggtagatttcaggaaggccatcagtagccc i rheMac3.chr10 I 3 C 0 s macFas5.chr10 36523082 592 + 96509753 gaaaggAGGTtttaaataaagaactgaaggaatggaaagagtaagctaggaggatatctggggaaaaagcattccagacacagggaactgccaagtacagaggtgtgcttggagtctttaagcactaggggtagataagggatggcaagaatttcagtgaggctgaagcagagcaagggagata----------------------------------------------------------attaggaggaactttgacacatactcagagtgaaatgggaggcaatcagaagggctggggcacaggactgacacaatttgacttatattttaagt-acatccactgagttaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaagccagaactatcaattgtca-gtctatgacactcatgtagactgcagatgagggtggctcagatgtagaagatatgactggcttctggacatattcttcaggtagacctgacaagatttactgagagattagatgtgaggtgt-cagaga--gagagaga----gatgagtcaagaatgacaacgagatttttggcagagcaactggaagag-ttgcccttacacaaag-taggaacgactacatgaggtgtagatttcaggaaggccatcagtagccc i macFas5.chr10 I 373 C 0 s papAnu2.chr10 32613362 594 - 90941950 GAAAGGAGGTTTTAAATAAAGAACTGAAGGAATGGAAAGAGTAAGCTAGGAGGATATCTGGGGAAAAAGCATTCCAGACACAGGGAACTGCCAAGTACAGAGGTGTGCTTGGAGTCTTTAGGCACTAGGCGTAGATAAGGGATGGCAAGAAGTTCAGTGTGGCTAAAGCAGAGCAAGGGAGATA----------------------------------------------------------ATTAGGAGGAAATTTGACACATACTCAGAGTGAAATGGGAGGCAATCAGAAGGGCTGGGGCACAGGACTGACACAATTTGACTTATATTTTAAGT-ACATCCACTGAGTTAAGAATTGATGAAAAGGGAAGTTTTTAAAAGCCAGGACTATCAATTACCA-GTCTATGACACTCATGTAGACTGCAGATGAGGGTGGCTCAGATGTAGAAGATATGACTGGCTTCTGGACATATTCTTCAGATAGACCTGACAAGATTTACTGAGAGAATAGATGTAAGGtgt-cagagatggagagaga----gatgagTCAAGAATGACAACGAGATTTTTGGCAGAGCAACTGGAAGAG-TTGCCCTTAACCAAAG-TAGGAAAGACTACATGAGGGGTAGATTTCAGGAAGGCCATCAGTAGCCC i papAnu2.chr10 I 3 I 266 s chlSab2.chr2 37969005 595 - 90373283 GAAAGGAGGTtttaaataaagaactgaaggaatggaaagagtaagctaggaggatatctggggaaaaagcattccagacacagggaactgccaagtacagaggggtgcttggagtctttaagcactaggggtagataagggatggcaagaagttcagtgtggctaaagcagagcaagggagaga----------------------------------------------------------attaggaggaaatttgacacatactcagagtgaaatgggaggcaatcagaagggctggggcacaggactgacacaatttgacttatattttaagtaaaatccactgagttaagaattgatgaaaagggaagtttttaaaagccagaactatcaattgcca-gtctatgacactcatgtagactgcagatgagggtggctcagatgtagaagatatgactggcttctggacatattcttcaggtagacctgacaagatttactgagagaatagatgtaaggtgt-cagagacggagagaga----gatgagtcaagaatgacaatgagatttttggcagagcaactggaagag-ttgcccttaaccaaag-taggaaagactacatgaggtgtagatttcaggaaggccatcagtagccc i chlSab2.chr2 I 3 C 0 s calJac3.chr16 10123408 650 + 96796970 gaaacgggattttaagtaaaggacttaaagaacagaaagagtaagccaggaggatagctgaagaaaaggccttccagacacaggtaacagccaaatacagaggtgtgcctggagtctttaagcaataggggcagataaaaaacagcaagaagttcagtgaggctgaagcagagcaaagcaagtaagaaatagaagtttaagcaggagagataatgtgccagatggtgttccgccttttcgttattaggaggagttttgacacatactcagagtgaaatgggagataatcagaaggg-tggggcaaaggaatgacacaatttgactgatgtattaaat-acatccactgagttaagaattgatttaaaggaaattttttttaaaccagggcaatcagttaccaggtctatggcactcatctagactacagacgatggtggctcagatatacaagatatgactggcttctggatataatcttcagggagacctgacaagatttactgaaagattagatgtgaggtgt-cagaga--cagagaaa----gatgagtcaaaaatgacaccaaggttttaggcagagcaacctgaaggc-ttgccattaaccaaag-taggaaagattaaatgaggtgtagatttcagaaaggacattagtagccc i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I a score=3435932.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 174443 1286 + 478999 aattttggatctgacaagtgtgtgatacccaataactaaccaaa---------------------------------tagagacgtcaagtaggcaggctgatatagaaatctggaattaaggagaaagatctgagctggagacatacattcagaaatcactagcatatacacagtagaaaaagtcacgaggggtcaggtgcagtggcttacacctgtaatcccaacagtttgtgagaccaaggcagacagatcccctgaggtcaggagtttgagaccagggtggccaacatggggaaatgctgtgtctactaaaaatacaaaaatcagctgggcacggtggcatgcacctgtaatgccagctactcaggaggccgaagcaggagaattgcttgaacccaggaggcagaggttgtagtgagccgagatcacaccactgaactccagcctgggaggcagagtgaaactctgtctccaa----------aaaagaaaaagaaaaagtcacgagaaagaagactgaggagtgagccctggg-aaacaacaatgtccaaaaggagaaagatgaggaggagcaagcaaaacagaccatgatgaatggactagaaaggcaggaggaaaagcctgagggagtgaggtcctgaaagccaag-tgaagatgccgttagggaggagatgccctccattggctcaaatattgctgacagattaaataaaatgaggtggaag--aaaagggcctagatttattacagaaaaaaaaaatagtgataatcttgaggaaaaacaatgctggaggactgctgaaattgaagacttactggcatgagatcaagagtgaatgaaaagaaaatttgagttcgtgagtgtagacagttcttttaaggaCATCATACTTAAGAGTCATGGCTGAGAATGTTGTAATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAAGTAATAGACAAATAG-------TTTCAAATTTTACATAAAAGGTGTAGTTTTCAAATTTTATATAACAATTATATATTTTAAAGCTTATAAAAATTATACACATGTGGCA-TTAAAAATGCCAGACCAAGGTGTTAAAT-CTTAAAACTATAGAACTAAAAGTTGCCTTGACCATTTCTAGATTACATAAGCTAATTATCATTTTGTTCATGCTTATACATAAAGACCAAGAAAAACTAAAAGTTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGGACAGTTGATGCTCATCGAATATACAAAGTAATTGATCACCATAAAATACTGAATTCTAT-------TAACAGGAATAAAGTGGCAGAAATGCAGAAAATAATCTTATTTTAC s panTro4.chrUn_GL393519 15137 1282 + 413329 aattttggatctgacaagtgtgtgatacccaataactaaccaaa---------------------------------tagagatgtcaagtaggcaggctgatatagaaatctggaattaaggagagagatctgagctggagacatacatttggaaatcactagcatatacacagtagaaaaagtcatgaggggctgggtgcagtggctcacacctgtaatcccaacactttgtgaggccaaggcagacagatcacctgaggtcaggagtttgagaccaggctggccaacatggggaaatgctgtgtctactaaaaatacaaaaatcagctgagcatggtggcatgcacctgtaatgccagctactcaggaggctgaagcaggagaattgcttgaacccaggaggcagaggttgtagtgaaccgagatcacaccactgaactccagcctgggtgacagagcgaaactctgtctccaa----------aaaagaaaaagaaaaagtcataagaaagaagattgaggagtgagccctggg-aaacaacaatgtccaaaaggagaaagatgaggaggagcaagcaaaacagaacatgatgaatggactagaaaggtaggaggaaaagcctgaggcagtgaggtcctgaaagccaag-tgaagacgcccttagggaggagatgtcctccattgcctcaaatattgctgacagattaaataaaatgaggtggaag--aaaagtgcctagatttattacagaaaaaaaa--tagtgataatcttgaggaaaaac---gttggaggactgctgaaattgaagacttactggcatgagatcaagagtgaatgaaaagaaaatttgagttcatgagtgtagacagttcttttaaggaCATCATACTTAGGAGTCATGGCTGAGAATGTTGTAATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAAGTAATAGACAAATAG-------TTTCAAATTTTACATAACAGGTGTAGTTTTCAAATTTTATATAACAATTACATATTTTAAAGCTTATAAAAATTATACACATTTGGCA-TTAAAAATGCCAGACCAAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTTGCCTTGACCATTTCTAGATTACAGAAGCTGATTATTATTTTGTTCATGCTTATAGATAAAGACCAAGAAAAACTAAAAGCTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGGACAGTTGATACTCATCAAATACACAAAGTAATTGATCACCGTAAAATACTGAGTTCTAT-------TAACAGGAATAAAGTGGCAGAAATGCAGAAAATAATCTTATTTTAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90267716 1309 - 108868599 aattttgggtctgacaagtgtgtgatacccaacagctaatcaaatacctatttattaggtagctacgtctgataggctaggcctgtcaagcagccaggctgatatagagatccggaattaaggagccagatctgagttggagacatgcatttggaaatcactagcatatacacagtagaaaaagtcacaaggggccaggcacggtggctcacgcctgtaatcccaacacttcgtgaggccaaggcgggcagatcacctgacatcaggagtttgagaccaacctggccaacatggggaaaccctgtcactactaaaaatacaaaaattagccaggcatggtgtcgcacacctgtaatcccagctactcaggag------gcaggagaagtgctggaacccaggaggcagaggttgcaatgagccaaggtcgtgccactgaactccagcctgggggacaaagccagacttcatctttaa----------aaaaaaaaaaaaaaaagtcatgagaaagaagattgaggactgagccatgag-aaacaacaatgtccaaaaggagaaagatgaggaggagcaagcaaaacagaccatgatgaatggactagaaatgcaggaggaaaagcctgagggagtgaggtcctgaaagccaag-tgaagacgccattagagaggagatgccctccattggctcaaatattgctgacagattaaataaaatgaggtgtaag--aaaaatgcctagatttatgacagaaaaaaat--tagtgataatcttgaggaaaaacaacgttggaggactgctgaaactgaagact--ctggtgtgagatcaagagtgaatgaaaagaaaatttgagttcgtgagtgtagacagttcttttaaggaCATCATACTTAGGAGTCATGACTGAGAATGCTGTAATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAAGTAATAGACAAATAG-------TTTCAAACTTTATATAACAGGTGTAGTTTTCaaattttatataacaattatatattttaaaggttataaaaattataCACATGTGGCA-TTACAAATGCCAGACCGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAA-TAAAAGTTGCCTTGAACATTTCTAGATTCCATAAGCTGATTATCATTTTGTTCATGCTTATACATAAAGACCAAGAAATACTAAAAGTTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGGACAGTTGACACTCATCAAATATACAAAGTAATTGATCACAGTAAAATACTGAGTTCTAT-------TAACAGGAATAAAGTGGGAGAAATGCAGAAAATAATCTTATTTTAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77067142 1262 - 143122389 aattttggaactgacaagtgtgtgatacccaataactaaccaaa---------------------------------tagagacgtcaagtaggcaggctgatatagaagtctggaattaaggagagagatctgagctggagacatacatttggaagtcactggcatatacacagtagaaaaagtcacgaggggctgtatgcagtggctcacacctgtaatcccaacactttgtgaggccgaggcagacagatgccctgaggtc-ggagtttgagacccggctggccaacatggggaaatgcagtctctactaaaaatacaaaaatcagccaggcatggtggtgcgcacctgtaatgccagctactcaagaggccgaagcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgtagtgagccgagatcacaccactgaacgctagcctgggtgacagagaaaaactctgtctccag----------aaaagaaaaagaaaaggtcatgagaaagaagattgagcactgagccctgga-aaacaacaatgtccaaaaggagaaagatgaggagaagcaagaaaaacagaccacgatgaatggactagaaaggcaggaggaaaagcctgagggagtgaggtccagaaggccaag-tgaagatgccgttagggaggagatgccctccattgcctcaaatattgctgacagattaaacaaaaagaggtgtaag--aaaaatgcctacatttattaaagaaaaaaat--tagtgataatcttgaggaaaaacagcgttggaggactgctgaaattgaagacttactggcatgagatcaagagtgaatgaaaagaaaatttgagttcgtgagtgtagacagttattttaagaaCATCATATTTAGGAATCATGACTGAGAATGTTGTAATTTTCTTCCACGGTCATGGAAAAGTAATAGACAAATAG-------TTTCAAGTTTTACATAACAGGTGTAGTTTTCAAATTTTATATAACAATTATATATTTTAAAGGTTATAAAAATTATACACATGTGGCA-TTAAAAATG------AGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTCACCTTGAACATTTCTAGATTACATAAGCTGATTGTCATTTTGTTCATGCTTATACATAAAGGCCAAGAAATACTGAAATTTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGGACAGGTGATACTCATCAAATATACAAAGTAATTGATCACAGTAAAATACTGAGTTCTAT-------TACCAGGAATAAAGTGGCAGAAATTCAGAA---------------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35571812 1286 - 95678458 aattttgagtctgacaagtgtgtgatacccaatagctaaccaaa---------------------------------tagagatgtcaagtaggcaggctgatatggaaatctggaattagggagagagatctgagcgagagacatacattttgaaatcgctagcatatacatagtagaaaaagtcacgaggggctgggtgcagtggctcatgcctgtaatctcaacactttgtgaggccaaggcagacagatcacctgaggtcaggagtttgagaccaggctggacaacatggggaaatgctgtctctactaaaaatgcaaaaattagccgagcatggtgacacgaacctgtaatgccagctactcaggaggctgaagcaggagaatcgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgagatcacaccactgaactctagcctgggtgacagagtgaaactccgtctc----------------aaaaaaagaaaaagtaatgagagagaagattgaggactgagccctgggaaaaaaataatgtcaaaatggagaaagatgacgaggagcaagcaaaacagatcatgatgaatggactagaaaggcaggaggaaaagcctaagggagtgaggtcctgaaagccaagttgaagacgctgttagagaggagatgtcctccattggctcaaatactgttgacagactaaataaaatgaagtgttag--agaaatgcctagatttattacagaaaaaaat--tagtgataatcttgaggaaaaacaatgttggaggagtactgaaactgaagacttactggtgtgagatcaagagtgaatgaaaagaaaa-ttgagttcatgagtgtagacagttcttttaaggaCACCATACTTAGAAGTCATGACTGAGAATGTTGTCATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAAGTAATAGACAATTAG-------TTTTAAATTTTATATAACAGGTGTAGTCTTCAAATTTTACATAACaattatatattttaaagattat-aaaattataCACATATGGCA-TTAAAAATGCCAGACTGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTTGCCTTGAACATTTCTAGATTCCATAAACTGAATATCACTTTGTTCATGCTTACACGTAAAGACCAAGAAACACTAAACGTTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGAACAGTTGATACTCATCAAATATACAAAGTAATTGATCACAGTAAACTACTGAGTTCTATTCATAGGCAACAGGAATAAAGTGGTAGAAATGCTGaaaataatcttattttat i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36523674 1279 + 96509753 aattttgggtctgacaagtgtgtgatacccaatagctaaccaaa---------------------------------tagagatgtcaagtaggcaggctgatatggaaatctggaattagggagagagatctgagcgagagacatacattttgaaatcgctagcatatacatagtagaaaaagtcacgaggggctgggtgcagtggctcatgcctgtaatctcaacactttgtgaggccaaggcagacagatcacctgaggtcaggagtttgagaccaggctggacaacatggggaaatgctgtctctactaaaaatacaaaaattagctgagcatggtggcacgaacctgtaatgccagctactcaggaggctgaagcaggagaatcgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgagatcacaccactgaactctagcctgggtgacagagtgaaactctgtctc----------------aaaaaaagaaaaagtaatgagagagaagattgaggactgagccctgggaaaaaaataatgtcaaaatggagaaagatgacgaggagcaagcaaaacagatcatgatgaatggactagaaaggcaggaggaaaagcctaagggagtgaggtcctgaaagccaagttgaagacgctgttagagaggagatgtcctccattggctcaaatactgttgacagactaaataaaatgaagtgttag--agaaatgcctagatttattacagaaaaaaat--tagtgataatcttgaggaaaaacaatgttggaggagtgctgaaactgaagacttactggtgtgagattaagagtgaatgaaaagaaaa-ttgagttcatgagtgtagacagttcttttaaggaCACCATACTTAGAAGTCATGACTGAGAATGTTGTCATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAAGTAATAGACAATTAG-------TTTTAAATTTTATATAACAGGTGTAGTCTTCAAATTTTACATAACAATTATATATTTTAAAGATTAT-AAAATTATACACATGTGGCA-TTAAAAATGCCAGACTGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTTGCCTTGAACATTTCTAGATTCCATAAACTGAATATCACTTTGTTCATGCTTACACGTAAAGACCAAGAAACACTAAACGTTTCAAGGAGAGTATTTCTTGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGAACAGTTGATACTCATCAAATATACAAAGTAATTGATCACAGTAAACTACTGAGTTCTAT-------CAACAGGAATAAAGTGGTAGAAATGCTGAAAATAATCTTATTTTAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32614222 1275 - 90941950 AATTTTGGGTCTGACAAGTGTGTGATACCCAATACCTAACCAAA---------------------------------TAGAGATATCAAGTAGGCAGGCTCATATGGAAATCTGGAATTA-GGAGAAAGATCTGAGCCAGAGACATACATTTGGAAATCACTAGCATATACACGGTAGAAAAAGTCAcgaggggctgggtgcagtggctcatgcctgcaaccccaacactttgtgaggccaaggcagagagatcacctgaggtcaggagtttgagaccaggctggccaacatagggaaatgctgtctctactaaaaatacaaaaattagccgagcatggtggcaccaACCTGTAATGCctgctactcagggggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagccgagatcacaccactgaactccagcctgggtgacagagtgaaactctgtctc----------------aaaaaaagaaaaagtcatgagAGAGAAGATTGAGGACTGAGCTCTCAG-AAAAAACAATGTCCAAATGGAGAAAGATGAGGAGGAGCAAGCAAAAGAGGCCATGATGAATGGATTagaaaggcaggaggaaaagCCTGAGGGACTGAGGTCCTGAAAGCCAAGTTGAAGATGCTGTTAGAGAGGAGATGTCCTCCATTGGCTCAAATTCTGCtaacagattaaataaaatgaagtgtaCG--AAAAATGCCTagatttattacagaaaaaaat--tagtgatAATCTTGAGGAAAAACAATGTTGGAGGAGTACTGAAACTGAAGACTTACTGGTGTGAGATCAagagtgaatgaaaagaaaa-ttgagttCATGAGTGTAGACAGTTCTTTTAAGGACATCATACTTAGAAGTCATGGCTGAGAATGTTGTAATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAA-TAATAGacaattaa-------tttcaaattttatataacaGGTGTAGTCTTCaaattttacataacaattatatattttaaaagttat-aaaactaTACACATGTGGCA-TTAAAAATGCCAGACTGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTCACCTTAAACAATTCTAGATTCCATAAGCTGAATATCACTTTGTTCTTGCTTATACATAAAGACCAAGAAACACTAAACGTTTCAAGGAGAGTATTTCTGGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGAACAGTTGATACTCATCAAATATGCAAAGTAATTGATCACAGTAAACTACTGAGTTCTAT-------TCACAGGAATAAAGT-GCAGAAATGCAGAAAATAGTCTTatgttat i papAnu2.chr10 I 266 C 0 s chlSab2.chr2 37969600 1272 - 90373283 aattttgggtctgacaagtgtgtgataccgaatagctaaccaaa---------------------------------tagagatgtcaagtaggcaggctgatacggaaatctggaattagggagagagatctgagccagagacatacatttggaaatcactagcatatacacggtagaaaaagtcacgaggggctgggtgcagtggctcatgcctgtaatcccaacactttgtgaggccaaggcagagagatcaactgaggtcaggagttcgacaccaggctggccaacatggggaaatgctgtctctactaaaaatacaaaaattagccgagcatggtggcatgaacctgtaatgccagctagtcaggaggctgaggcaggagaa--acttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagccgagatcacaccactgaactccagcctgggtgacagagtgaaactctgtctc----------------aaaaacagaaaaagtcacgagagagaagattgaggactgagccctggg-aaaaaacaatgtccaaatggagaaagatgaggaggagcaagcaaaagaggccatgattaatggattagaaaggcaggaggaaaagcctgagggactgaggtcctgaaagccaagttgaagacgctattaga---gagatgtcctccattggctcaaattctgctaacagattaaataaaatgaagtgtacg--aaaaatgcctagatttattacagaaaaaaat--tagtgataatcttgaggaaaaacaacgttggaagagtactgaaactgaagacttactggtgtgagattaagagtgaatgaaaagaaaa-ttgagttcatgagtgtagacagttcttttaaggaCATCATACTTAGAAGTCAAGGCTGAGAATGTTGTAATTTTCTTCCACAGTCATGGAAAA-TAATAGACAATTAA-------TTTCAAATTTCATATAACAAGTGTAGTCTTCAAATTTTACATAACAATTATATATTTTAAAAGTTAT-AAAATTATACACATGTGACA-TTAAAAATGACAGACTGAGGTGTTAAATTCTTAAAACTATAGAACTAAAAGTCGCCTTAAACATTTCTAGATTCCATAAGCTGAATATCACTTTGTTCATGCTTATACATAAAGATCAAGAAACACTAAACATTTCAAGGAGAGTATTTCTGGCTTGATAAAAATCAGCCAATTCTAGAACAGTTGATACTCATCAAATATACAAAGTAATTGATCACAGTAAACTACTGAGTTCTAT-------TAACAGGAATAAAGTGGCAGAAATGCAGAAAATGGTCTTATGTTAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10124058 1260 + 96796970 cattttggatctgactagtgtgtgatacccaataactaactaaa---------------------------------gagagatgtcaaggaggcagactgacatagagatctggaacgaaggagagagatct------aaaacatacatttggaaatcactagcatatacacagtagaaaaagtcatgaggggctgtgggtggtggcccacatctgtaatcccaacact--ggcaggc--gggcaggcagattaccagagatcagaagattgagacaagcctggccaacgtgaggaaaccctgtccctactaaaaatacaaaaattagccaggtatggtggcaaccatcagtaattctagctactcaggaggctgaagcaggagaattgcttgaactcaggaggcaaaggttgcagtcagccgagatcacaccactggactccagcctggatgacagaatgagactccatctcaaaggaaaaaaagaaaagaaaaacaaaaagtcatgagaaagaagactgagaactgagcccttgg-aaacaacaatgtgcgaaaggtgaaagatgaggagaagcaagcaaaacagaccatgatgaatgaaccagaacagcaggaggaaacacctgagggagtgaggtcctgaaagccag--tgaagatgctgttatggaggacatgtcctccgatgggtcaaatattgctgacagattaactaaaatgaggtgtaagaaaaaaatccctagatttattacaaaaagaaat--t-gtgataaccctga-gaaaaacaattttggaggagtgctgaaactgaagactt-ctggtgtgaagccaagagtgaatggaa----------------------TAGACAGTTCTTTGAAGGACATCACACTTAGGAGTCATGACTATGAATGAAGTAATTTTCTTCCACAGTCAAGAAATAGTGATAGATAAGAAATAGAATTTTTCAAATTTTACATAAATAGTGCAGCTTTCAAATTTTATGTAACAATTATGTATTTTAAAGGTTTTAAAAATTATACA-ATATGGCGTTTTAAAATACCAGACCAAGGTATTAAATTCTTAAAATTATAGAACTAAAAGACCGCTTGAACATTTGTAGATTATATAAGCTGATTATCATTTTGCTCATGTTT----GTAAAGACTAAGGAATACTAAAAGTTACAAGGGGATTATTTCTTACTTGACAAAAATCAGCCAATTCTAAGACAGTTGATACTCATCAAATATACAAAG----TGATCACAGTAAAATACTGAGTTCTAT-------TAATAGTAGTAAAATAGAAAACATGCAGGaaataatcttattttat i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136069 373 - 85426708 I a score=47662.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 175729 18 + 478999 AAATGAAATTTTTAAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 16419 18 + 413329 AAATGAAATTTTAAAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269025 18 - 108868599 AAATGAAGTTTTTAAAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573098 18 - 95678458 aaatgaaattttaaaaat i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36524953 18 + 96509753 AAATGAAATTTTAAAAAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32615497 18 - 90941950 aaatgaaattttaaaaat i papAnu2.chr10 C 0 I 784 s chlSab2.chr2 37970872 18 - 90373283 AAATGAAAATTTAAAAAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125318 18 + 96796970 aagtgaaattttaaaaat i calJac3.chr16 C 0 I 15 s canFam3.chr2 81136442 18 - 85426708 aagTGAATTTTCGAAGAT i canFam3.chr2 I 373 C 0 e nomLeu3.chr5 77068404 0 - 143122389 C a score=10773.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 175747 6 + 478999 TATATG----- s panTro4.chrUn_GL393519 16437 6 + 413329 TATATG----- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269043 6 - 108868599 TATATG----- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573116 6 - 95678458 tatatG----- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36524971 6 + 96509753 TATATG----- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37970890 6 - 90373283 TATATG----- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125351 6 + 96796970 tatatg----- i calJac3.chr16 I 15 I 26 s canFam3.chr2 81136460 11 - 85426708 TATATAATATG i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32615515 784 - 90941950 I e nomLeu3.chr5 77068404 0 - 143122389 C a score=155047.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 175753 66 + 478999 AAGTCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATATGGTGAGGTGAATACCAAAATATATCCTTTTCTCAAAGGAAAGATAA s panTro4.chrUn_GL393519 16443 66 + 413329 ACATCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATATGGTGAGGTGACTACTGAAATATATCCTTTTTTCAAAGGAAAGATAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269049 66 - 108868599 AAGTCACTGTGGAAAG-----------------------------------------------------------------------------------------ATATGGTAAGGTGAATACTGAAATATATCCTTTTCTCAAAGGAAGGATAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77068404 35 - 143122389 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TACTGAAATATATCCTTTTCTCAAAGGAAAGATAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573122 66 - 95678458 AAGTCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATGTGGTGTGGTGAATACTGAAATATATCCTTTTCTAAAAGGAAGGATAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36524977 66 + 96509753 AAGTCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------CTATGGTGTGGTGAATACTGAAATATATCCTTTTCTCAAAGGAAGGATAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32616299 66 - 90941950 AAGTCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATGTGGTGTGGTGAATACTGAAATATATCCTTTTCTAAAAGGAAGGATAA i papAnu2.chr10 I 784 C 0 s chlSab2.chr2 37970896 66 - 90373283 AAGTCACTGTGGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATGTGGTGTGGTGAATGCTGAAATATATCCTTTTCTAAAAGGAAGGATAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125383 154 + 96796970 AAGTCACTGTTGAAAAAtatgcaacaatcctgcaagatctgtacatgtaccccagaactttacatgcaatttaaaaaTATAACATAAATAAAAGTTAAAAAATATATATGGTGAGTAGAATACTGTAATATAT-TTTTTTTCAAAGGAAGGGTAA i calJac3.chr16 I 26 C 0 s canFam3.chr2 81136471 66 - 85426708 AAGTCACTATTGAAAA-----------------------------------------------------------------------------------------ATTTGATGTGGTGCATGTTGAAATATATGCTCTTTAAAATGGAAGAATAA i canFam3.chr2 C 0 I 252 a score=859399.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 175819 313 + 478999 TGTCACACATGCTGGGCACTTTTATAAATAAGTGTTACTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTTAGCAcaagggtc--------agcaaattagcacctgtgggccaaatccagcccactgcctgtttttgtaagtaaagaatcttggaacacagccatgcttattcactttacAGTCCATAGAGTCaattagctgggtgtgatgttgcacacttggggtcccagctaatagagaggctgaggtgggaggatcactagagcccagaaagtcaaggctgtagtgagctgtgatcacacaattgcactccagcctgggcaacagag-- s panTro4.chrUn_GL393519 16509 313 + 413329 TGTCACACATGCAGGGCACTTTTACAAATAAGTGTTACTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTTAGCAcacgggtc--------agcaaattagcgcctgtgggccaaatccagaccactgcctgtttttgtaagtaaagaatcttggaacacagccatgcttattcactttacAGTCCATAGAGTCaattagctgggtgtgatgttgcacacttggggtcccagccagtagaaaggctgaggtgggaggattactagagtccagaaagtcaaggctgcagtgagctgtgatcacacaattgcactccagcctgggcaacagag-- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269115 324 - 108868599 TGTCACGCATGCAGAGCACTTTTACAAATAAGAGTCAATGCATTATTTGACTCTTATTTGACCCTTCCTTTTAGCAcaagggtc--------agcaaataagcacctgtgggcaaaatccagcccacagcctgtttttgtaagtcaagtatcttggaacacagccatgcttattcACCTTACAGTCCATAGTGTCaattagctgggtgtgatgttgcacacctgtggtcccagctagtagagaggctgaggtggaaggatcactagagcccagaaagtcgaggctgcagtgagccatgatcacacaactgcactccagcctgggaaacagag-- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77068439 313 - 143122389 TGTCACACATGCAGGGCACTTTTACAAATGAGTGTTACTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTTAGCAcaagggtc--------agcaaattagcccctgtgggctaaatccagcccaatgcctgtttttgtaagtaaagaatcttggaacacagccatgcttattcactttacAGTCCATAGATTCaattagctgggtgtgatgtcgcacacttgtggtcccagctagtagacaggctgaggtgggaggaccactagagcccagaaagtcaaggctgcagtgagccgtgatcacacaactgcactccagcctgggcaacagag-- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573188 312 - 95678458 TGTCACACATGCAGGACACTTTTATGAATAAGAGTTACTGCA-----------TTCGCAGCACCTTCCTTTTAGCACAA-ggtc--------agcacattagcacctgtgggccaaatccagcccactgcctgtttttgtaagtcaagtatcttggaatgcagccatgcttattcACTCTACAGTCCACAGAGTCaattagctgggtgtgatgctgcacatctgtggtcccagctagtagagaggctgaggtgagaggatcactagaacctagaaagttgaggctgcagtgagccatgatcatacaactgcactccagcctgggcaagagag-- i rheMac3.chr10 C 0 I 332 s macFas5.chr10 36525043 320 + 96509753 TGTCACACATGCAGGACACTTTTATGAGTAAGAGTTACTGCA-----------TTCGCAGCACCTTCCTTTTAGCACAA-GGTCAGCACATTAgcacattagcacctgtgggccaaatccagcccactgcctgtttttgtaagtcaagtatcttggaatgcagccatgcttattcACTCTACAGTCCACAGAGTCaattagctgggtgtgatgctgcacatctgtggtcccagctagtagagaggctgaagtgagaggatcactagaacctagaaagttgaggctgcagtgagccatgatcatacaactgcactccagcctgggcaacagag-- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32616365 308 - 90941950 TGCCACACATGCAGGACACTTTTATGAATAAGAGTTATTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTTAGCACAA-GGTC--------AGCACATTAGCACCTGTGGGCCGAat----cccactgcctgtttttgtaagtcAAGTATCTTGGAACACAGCCACGCTTATTCACTCTACAGTTCACAGAgtcaattagctgggtgtgatgttgcacacctgtggtcccagctagcagagaggctgaggtgggaggatcactagagcccagaaagttgaggctgcagtgagccgtgatcacaaaactgcactccagcctgggcaacagag-- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37970962 302 - 90373283 TGTCACACATGCAGGACACTTTTATGAATAAGAGTTACTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTTAGCACAA-ggtc--------agcacattagcacctgtgggccgaat----cccactgcttgtttttgt-----aagtatcttggaacccagccatgcttattcACTCTACAGTTCACAGAGTCaattagctgggtgtgatgttgcacacctgtggtcccagctagcagagaggctgaggtgggaggatcactagagcc-agaaagttgaggctgcagtgagccgtgatcacacaactgcactccagtctggtcaacagag-- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125537 315 + 96796970 TGTCACGCATCTAGGGCACTTTTATAAATAAGATGCACTGCA-----------TTAGCAGCACCTTCCTTTGAGCAcaggggtc--------agcaaattagcacgtgtgagccaaatccagtccactgcctatttttgtaagtaaagtatcttgaaacaaagccatgcttattcacttGATAATCCATAGAGTCaattagctgggtgtgatgctacacagctgtggtcccagctaatagagaggctgaggtgggaggatcaccagagcccaggaagtcaaggctgccgtgagtcacaatcatgcaactgcattccagcctgggtaagagtgag i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136537 252 - 85426708 I a score=256791.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176132 146 + 478999 accctgtctcaa------aaa----aaataaaTATAtat----------------------------------------------------------agtccacaaagcctaaaa-atttactaaatggctctttgcagaaaaagctggccagctcctgGTTTAGCAGATGAAAGATACTTTGATATATTTTAATAAAAGTTTTACCCAATATAC s panTro4.chrUn_GL393519 16822 147 + 413329 accctgtctcaa------aaa----aaataaaTATAtat----------------------------------------------------------agtccacaaagcctaaaatatttactaaatggctctttgcagaaaaagctggccagctcctgGTTTAGCAGATGAAAGATACTTTGATATATTTTAATAAAAGTTTTACCCAATATAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269439 146 - 108868599 actctgtctc-a------aaa----TAATAAATATAtat----------------------------------------------------------agtccacaaagcctaaaatatttactaactggctctttgcagaaaaagctgggaaactcctgGTTTAGCAGATGAAAGATCCTTTGATGCATTTTAATGAAAGTTTTACCCAATATAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77068752 151 - 143122389 accctgtctcaa------aaaaTATATATAAATATAtat----------------------------------------------------------agtccacaaagcctaaaatatttattaactggctctttgcagaaaaagctggccagctcctgGTTTAGCAGATGAAAGATCCTTTGATATATTTTAATAAAAGCTTTACCCAATATAC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36525363 205 + 96509753 accttgtctcaaaTACTCAAa---------tatatatatatatatatatatacacacacacacacatatatatatatatagagagagagagagagagagTTTgcaaaccctaaaatatttactaactggttctttgcagaaaaatctggccaactcctgGTTTAGTAGATGAAAGAT-CTTTGATATATTTTAATAAAAGTTTTACCCAATATAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32616673 142 - 90941950 accctgtctcaa------aaa---------tatatatac----------------------------------------------------------agtctgcaaagcctaaaatatttactatctgactctTTGCAGAAAAATCTGACCAAATCCTGGTTTAGTAGATGAAAGATCCtttgatacattttaataaaagttttaccCAATATAc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37971264 142 - 90373283 accctgtctcaa------aaa---------CATATAtac----------------------------------------------------------agtctgcaaagcctaaaatatttactaactgactctttgcagaaaaatctgaccaaatcctgGTTTAGTAGATGAAAGATCCTTTGATACATTTTAATAAACGTTTTACCCAATATAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125852 123 + 96796970 accgtgtctcaa------gaa-----aataaaTAcatac----------------------------------------------------------agtccacaaaacctaaaatatttactaactggctatttgcagaaaaagctggc---------------------AAAGATCCTTTTATGTATTTTAACAA--GTTTTATCCAATATAT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81136537 252 - 85426708 I e rheMac3.chr10 35573500 332 - 95678458 I a score=345400.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176278 145 + 478999 TCAAATGTTTATATTAAATATAG-----ATCCCCATGTACAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAAGGTCCAATATTTTGGCACTCAGGCACTGACAA-------CAAAAATTTAATAACTAGCAATCTCGTTGCTAACAAGGTACAGTGTCAATGT s panTro4.chrUn_GL393519 16969 145 + 413329 TCAAATGTTTATATTAAATATAG-----ATCCCCATGTACAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAAGGTCCAATATTTCGGCACTCAGGCACTGACAA-------CAAAAATTTAATAACTAGCAATCTCGTTGCTAACAAGGTACAGTGTCAATGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269585 144 - 108868599 TGAAATGTTTATATTAAATATAG-----ATCCCCATGTACAATGCCT---TGGCAATATTC-GA-----CTGAGGGTCCAATATTTCAGCACTCAGGCACTGACAA-------CAAAAATTTAATAACTAGCAATCTTGTTGCTAACAAGGTACAGTGTCAATGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77068903 145 - 143122389 TGAAATGTTTATATTAAATATAG-----ATCCCCATGTGCAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAGGGTCCAATATTTTGGCACTCAGACACTGGCAA-------CAAAAATTTAATAACCAGCAATCTTGTTGCTAACAAGGTACAGTGTCAATGT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36525568 134 + 96509753 TGAAACATTTATATTAAATATAG-----ATCCCTATGTACAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAAGATCCAATATTTCAGCACTCAGGCACTGACAA-------CAAAAATTTAATAACTAGCAAT-----------CAAGGTAGAGTGTAAATGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32616815 132 - 90941950 tgaaatgtttatattaaatatag-----atCCCCA--TACAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAAGATCCAATATTTCAGCACTCAGGCACTgacaa-------caaaaatttaataaCTAGCAAT-----------CAAGGTACAGTGTCAATGG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37971406 132 - 90373283 TGAAATGTTTATATTAAATATAG-----ATCCCCA--TACAATCCCT---TGGCAATATTCAGA-----TTGAAGATCCAATATTTCAGCACTCAGGCACTGACAA-------CAAAAATTTAATAACTAGCAAT-----------CAAGGTACAGTGTCAATGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10125975 144 + 96796970 TCAAGTGTTTATATGAAGTATAG-----ATCCCCATGCACAATCCCT---TGGCAATATTCAAA-----TTGA-GGTCCACTATTTCAGCACTCAGGCACCGACAG-------CAAAAATTTAATAACTAGCAATCTTGTGGCTAAAAAGGTACAGTGTCAATGT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81136789 165 - 85426708 TCAAATGTTTATACAGAATATGGGACAAGTTGCCATGTGAAATCTCTTCGTAGTAATATTCAGATCAATTTGAGAGTCCAACATTTGAGCACTCGTGCATTGGGAACCAAAACCAAAAACCTAATAATTAGCAGTTTTGTTGGTAATAAGGTAGAGTGCCAGTGT i canFam3.chr2 I 252 C 0 e rheMac3.chr10 35573500 332 - 95678458 I a score=328168.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176423 98 + 478999 AGCGTGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTACC--AAACTAAATGCTTTAAATACATTTT s panTro4.chrUn_GL393519 17114 98 + 413329 AGCGTGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTACC--AAACTAAATGCTTTAAATACATTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269729 95 - 108868599 AGCATGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAAATATTATAACAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTATC--A---CTAACGTTTTAAATACATTTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77069048 98 - 143122389 AGCATGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAACATGTGTTACC--AAACTAAATGCTTTAAATACATTTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573832 100 - 95678458 AGCATGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTATCTAAAACTAAAGGCTTTAAATACATTTT i rheMac3.chr10 I 332 C 0 s macFas5.chr10 36525702 100 + 96509753 AGCATGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTATCTAAAACTAAAGGCTTTAAATACATTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32616947 98 - 90941950 AGCATGTAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTATC--AAAGTAAaggttttaaatacatttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37971538 98 - 90373283 AGCATATAGCTTCCATTTGCAACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTTATC--AAAGTAAAGGTTTTAAATACATTTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10126119 98 + 96796970 AGCATGTAGCTTCCACTTGAGACACAGCAGATATTACAAGAATTCTAACAAAATTATCTTAAGATGTGTCATC--AAACTAAATGCTTTAAATACATGTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81136954 90 - 85426708 AGCAGGTAACTTCCCTTTGCAACTCAGCAGATATTAAAAGTATTCT---AAAGTTATTGTAAGA-----CATC--AAACCAAACACTTTAAATATACTTT i canFam3.chr2 C 0 I 190 a score=373369.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176521 134 + 478999 AATTGTG-AAATAATCAGTATACTCTAGATCTAACCTCATTTGT---AAAAAATGTTTGCATACCGTATTATTTTCTGGGTATGAAAATTGAGCCATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTGATAATGATAAATTCC s panTro4.chrUn_GL393519 17212 134 + 413329 AATTGTG-AAATAATCAGTATACTCTAGATATAACCTCATTTGT---AAAAAATGGTTGCATACTGTATTATTTTCTGGGTATGAAAATTGAGCTATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTGATAATGATACATTCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269824 135 - 108868599 AATTGTGAAAATAATCAGTATACTCTAGATCTAACCTCACTTGT---AAAAAATGGCTGCATACTACATTAATTTCTGGGTATGAAAATTGAGCTATTTCCTATTGTTAAGGATTTAGTTTTAATAAGGGTAATTTCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77069146 134 - 143122389 AATTGTG-AAATAATCAGTATACTCTAGATCTAACCTCATTTGT---AAAAAATGGTTGCATACTGTATTATTTTCTGGGTATGAAAATTGAGCTATTTCTTATTGGCAAGGATTTACTTTTGATAATGATAAATTCC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35573932 136 - 95678458 AATTGTG-AAATAATCAGTTTACTCTATATCTAACCTCATTTGT-AAAAAAAATGGTTGCATGCTACATTATTTTCTGGGAATGAAAATTGAGCTATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTGATAATGATAATTTCC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36525802 137 + 96509753 AATTGTG-AAATAATCAGTTTACTCTATATCTAACCTCATTTGTAAAAAAAAATGGTTGCATACTACATTATTTTCTGGGAATGAAAATTGAGTTATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTGATAATGATAATTTCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32617045 134 - 90941950 aattgtg-aAATAATCCGTATACTCTAGATCTAACCTCATTTGT---AAAAAATGGTTCCATACTACATTATTTTCTGGGAATGAAAATTGAGCTATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTAATAATGATAAATTCC i papAnu2.chr10 C 0 I 533 s chlSab2.chr2 37971636 134 - 90373283 AATTGTG-AAATAATCAGTATACTCTAGATCTAACCTCATTTGT---AAAAAATGGTTCCATACTACATTATTTTCTGGGAATGAAAATTGAGCTATTTCCTATTGGTAAGGATTTACTTTTAATAATGATAAATTCC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10126217 117 + 96796970 AATTGTG-AAATAATCCACACACTCTAGATCTAACCACAGTTTT---AAAAAATGGTTGCATACCATAATCTTTTCTCAGTATGAAAATTGAGGTATTTCCTATTGTTAAGGATTTAAACT----------------- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81137234 115 - 85426708 ATTTGTT-AAACAATCAAAACCCTGCAGACCTAAATTCATTT-T---CTCAGATAGTTACATGCTGCATTATTTTATAGGTGTGAAAACTTA---CTTCCTTATGGATGGAGAGTTA---------------GACTCC i canFam3.chr2 I 190 C 0 a score=528758.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176655 214 + 478999 TATTGATAAGGATCCATCTTTTTGATATAATAACGCTGTAAGAAATGTCCTtatacataagtatatatgtgacaaatctatacaaatatccttaacataca-tatatatccttactatgttatatatGTGTGTGTGCAAATATGCTAATA---AATTAATGTTC--AAAATATATTTaccaacagtgt----atg-aattgtctttttcaatgagaccatttcct s panTro4.chrUn_GL393519 17346 214 + 413329 TATTGATAAGGATCCATCTTTTTGATATAATAATGCTGTAAGAAATGTCCTTACACATAAGTATATATGTGACAAATCTATACAAATATCCTTAACATACC-TATATATCCTTACTATGTTATATATATGTGTGTGTGAATATGCTATTA---AATTAATGTTC--AAAATGTATTTaccaacagtgt----atg-aaatgtctttttcaatgagaccatttccc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90269959 211 - 108868599 TATTGATAAGGATCCATCTTTTTGATATAATAATGCTGTAATAAATGTCCTTATACATAAGTATGTATGTAACAAATCTATACAAATATCCTTTACATATATTACATATCTGTA--ATGTTATACATGTGTTTGTG--AATATGCTACTG---AATTAATGTTC--AAAATGTATTTaccaacagtgt----atg-aaatgtcttttacaatgaaaccatttccc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77069280 214 - 143122389 TATTGATAAGGATCCATCTTTTTGATATAATAATGCTGTAAGAAATGTCCTtatatataagtatatatgtgacaaatctatacaaatatctttaacataca-tatatatccttactatgttatatatGTGTGTGTGCACATATGCTACTA---AATTAATGTTC--AAAATGTATTTaccaacagtgt----atg-aaatgtctttttcaatgagactgtttcct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574068 212 - 95678458 TACTGAAAAGGATTCACCTTTTTGATATAATGATGCTGTAATAAATGTCCTtatacataagtatatatgtaacaaatctatataaatatccttaacataca-tatatatccttactatgttatatatgtgtgtgtg--aatatGCTACTA---AATTAATGTTT--GAAATGTGTTCACCAACAGTGT----GCG-AAATGTCTTTTTCaatgagaccatttcct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36525939 212 + 96509753 TACTGAAAAGGATTCACCTTTTTGATATAATGATGCTGTAATAAATGTCCTtatacataagtatatatgtaacaaatctatataaatatccttaacataca-tatatatccttactatgttatatatGTGTGTGTG--AATATGCTACTA---AATTAATGTTT--GAAATGTGTTCACCAACAGTGT----GCG-AAATGTCTTTTTCaatgagaccatttcct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32617712 211 - 90941950 TACTGATAAGGATCCATC-TTTTGATATAATGATGCTGTAATAAATGTTCTTATACGTAAGTATATACGTAACAAATCTACACAAGTATccttaacataca-tatatatccttactatgttatatatgtgtgtgtg--aatatggtACTC---AATTAATGTTC--GAAATGCATTTACCAACAGTGT----ACG-ACATGTCTTTTTCAATGAGACcatttcct i papAnu2.chr10 I 533 C 0 s chlSab2.chr2 37971770 211 - 90373283 TACTGATAAAGATCCATC-TTTTGATATTATGATGCTGTAATAAATGTTCTTATATGTAAGTATATACGTAACAAATCTATACAAGTATCCTTAACATACA-TATATATCCTTACTATGTTATATATGTGTGTGTG--AATATGCTACTC---AATTAATGTTC--CAAATGCATTTaccaacagtgt----ata-acatgtctttttcaatgagaccatttcct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10126334 171 + 96796970 ---------AGCTCCAACTTTTTGATGGAAAAATGCTACATTAAATGTCCTTATAC--------ATATGTAACATATCTTTACAAATATCCTTACTATATG-------------------------TGTGTGTGTA--AATATGCTACTA---AATTAACACTC--AAAATATATTTaccaacagtgt----aagaaaatgtctctttcaatgagaccatttcc- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81137349 164 - 85426708 -----------CTCCAAGTTTTTGAT----------------AGATAATCTTA-----ACATATATATGTAACATGTTT----AAGTATTCTTAATATATC-TGTCaa--------attttata--------------aatataataatatataataaatGTTCTTAGAATATGTGTGTCTA-AGTGTTGACACA-AGTCATGTTTTCCTATAGGATCTACTCCT i canFam3.chr2 C 0 I 309 a score=886489.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 176869 331 + 478999 ttgcagcaacacacatggagctggaggccattatcctaagcaaactaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttactca-tttgtgggaactaaacaatgaaaactcatggacacaaagaggagaataacagacaccagggtctacttgagggtggagtgtggcaggagggagatgaccaaaaaactacctctcgagtattttgcttattatgtggctgatgaagtaatctgtagtccaaacctccatgacacagtttacctatataataaacctacacatgaacttctgaagctaaaataaaagttcattaaaaagaaaagga s panTro4.chrUn_GL393519 17560 330 + 413329 ttgcagcaacacacatggagctggaggccactatcttaagcaaactaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttactca-ttactgggaactaaacaatgagaactcatggacacaaagaggagaataacagacactggggcctacttgagggtggagcgtggcaggagggagacgaccaaaaaactacctttcgagtattttgcttattatgtggctgatgaaataatctgtaccccaaacctccatgatacagtttacctatataataaacctgcacatgtac-cctgaagctaaaataaaagttcactgaaaagaaaagaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90270170 331 - 108868599 ttccaacaacacagatggagctggaggccattaaactaagcaagttaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttactca-ttagtgggaactaaacaatgagaacccatggacacaaagaggagaataacagacaccagggtctacttgaaggtggagcatggcaggagggggacgaccaaaaaactacctttcaggtgttttgcttattatttggctgatgaaataatctgtagtccaaatctccatgatacagtttacctatataacaaatctgcacatgtacccttgaagctaaaagaaaagttcactaaaaagaaaagaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77069494 324 - 143122389 ttgcagcaacacagatggagctggaggccattatcctaagcaaactaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttactca-ttagtgggaactaaac-atgagaactcatggacacaaa---gagaataacagacaccagggtctacttgagggtggagcgtggcaggagggagacgaccaaaaaactacctttcgagtattttgcttattatgtggctgatgaaataatctgtagtccaaacctccatgatacagtttacctatataataaacctgcatatgaacttctgaagctaaaataaaagttcattaaaaagaaa---a i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574280 331 - 95678458 ttgcagcaacacagatcaagctggagaccattatcctgaacaaaccaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttgctca-ttagtgggaactaaacaatgagaactcatggacacaaagaggagagtaacagacaccagggtctacttgagagtggagcgtggcaggagggagatgaccaaaaaactgccttttgggtcttttgcttattatgtggctgatgaaataatctgtagcccaaaccaccatgatacagtttacctatgtaacaaacctgcacatgtacccctgaagctaaaataaaagttaactaaaaagaaaagaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36526151 331 + 96509753 ttgcagcaacacagatcaagctggagaccattatcctgaacaaaccaatgcaggaacagaaaatcaaatgccacatattcttgctca-ttagtgggaactaaacaatgagaactcatggacacaaagaggagagtaacggacaccagggtctacttgagagtggagcgtggcaggagggagatgaccaaaaaactgccttttgggtcttttgcttattatgtggctgatgaaataatctgtagcccaaacctccatgatacagtttacctatgtaacaaacctgcacatgtacccctgaagctaaaataaaagttaactaaaaagaaaagaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32617923 329 - 90941950 ttgcagcaacacagatggagctggcGGCCACTAttataagcaaattaatgcagaaacggAAAATCAAATGCCACATATTCTTACTCATTTAGTGGAAACTAaacaatgagaactcatggacacaaagaggagaaTAACAGGCAAaagggtctacttgagggtggagcaTGGCTGGAGGGAGATGACCAAAAGACTACCTTTTGGGTATTTTGCTTATTATGtggctgatgaaataatctgtagcCCAAACTTCCATGatgcagtttacctatataacaaa-ctgcacatgtacctctgaagcT-AAATAAAAGTTCACTAAAACGTAAAG-A i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37971981 329 - 90373283 ttgcagcaacacagatggagctggtggccattattctaagcaaactaatgcagaaacagaaaatcaaatgccacatattcttactca-tgagtgggaactaaacaatgagaactcatggacacaaagaggagaataacagggaaacgggtctacttgagggtggagcatggctggagggagacgaccaaaaaactaccttttgggtattttgcttattatgtggctgatgaaataatctgtagcccaaacctctatgatacagtttacctaaaaaacaaa-ttgcacatgtacctctgaggctaaaataaaagttcactaaaaagtaaag-a i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10126505 312 + 96796970 -tgcagcaacgcagatggagctggaggccattatcctaagcaaactaaggcaggaacacaaaatcaaatgccacatgttcataccca-ctagtgggagctaagcaatgagaactcatggatgcaaagagaa----cacagacact-gggcctacttgagagtggacggtggcaggagggagagaaccaaaaagctacctattaagtattttgcctattatgtggctgaggaaataatct-------------ccataatacatattacctatataacaaacctgcacatgtacccatgaagctaaaataaaagttcactaaaaggaaaagaa i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81137513 309 - 85426708 I a score=947441.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177200 304 + 478999 aatgccttttccctcacatttgccaatgccggtta------tttttcaaataaat--------taatgactgg-aaaaaa---cggtaactcattgtttactgattttcatttttctgattaacaggcaaggctgaatatT-CTAGTAAAAGTATAAAATTTGTTCATCATGAA----AGCCCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----TATAGTTATCTCCTA-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGATTTTCAGGTTTTCTGCTCTTCCTTTGTGGAATTAATCCATCATCA s panTro4.chrUn_GL393519 17890 308 + 413329 aatgccttttccctcacatttgccaatgctggcta------tttttcaaataaat--------taatgactgg-aaaaaa---cggtaactcattgtttactgattttcatttttctgattaacaggcaaggctgaatatT-CTAGTAAAAGTATAAAATTTGTTCATCATGAATATTAGCCCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----TATAGTTATCTCCTA-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGATTTTCAGGTTTTCTGCTCGTCCTTTGTGGAATTAATCCATCATCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90270501 308 - 108868599 aatgccttttccctcacatttgccaatactggtta------tttttcaaataaat--------taatgactgg-aaaaaa---tggtaactcattgtttgctgattttcatttttctgattaacaggcaaggctgaatatC-CTAGTAAAACTATAAAATTTGTTCATCATGAATATTAGCCGAAATTAGGGTTAGTTTGACAGCA----CATAGTTATCTCCTG-TTCAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCACTTTCAGTGTCAGGAAATTGCTGATTTTCAGGTGTTCTGCTCTTCCTTTGAGGAATTAATCCATCATCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77069818 308 - 143122389 agtgccttttccctcacatttgccaatactggtta------tttttcaaataaat--------taatgactgg-aaaaaa---cggtaactcattgtttactgattttcatttttctgattaacaggcaaggctgaatatT-CTAGTAAAAGTATAAAATTTGTTCGTCATGAATATTAGCCCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----TATAGTTATCTCCTT-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGATTTTCAGGTGTTCTGCTCTTCCTTTGTGGAATTAATCCATCATCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574611 307 - 95678458 aatgcctttcccctcaaatttgccaatactggtta------tttctcaaataaat--------ttatgactag-aaaaaa---tggtaactcgttttttgctgattatcatttttctgattaccaggtgaggctgaatatc-CTAGCAAAAGTACAAAATTTGTTAATCATGAATATTAG-CCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----CATGGTTTTCTCCTG-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGACTTTCCGGTGTTCTGCTCTTGCTTTGTGGATTTAATCCATCATCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36526482 307 + 96509753 aatgcctttcccctcaaatttgccaatactggtta------tttctcaaataaat--------ttatgactag-aaaaaa---tggtaactcgttttttgctgattatcatttttctgattaccaggtgaggctgaatatc-CTAGCAAAAGTACAAAATTTGTTAATCATGAATATTAG-CCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----CATGGTTTTCTCCTG-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGACTTTCCGGTGTTCTGCTCTTGCTTTGTGGATTTAATCCATCATCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32618252 307 - 90941950 AATTCCTTTCCCCTCACATTTGCCAATACTcgtta------tttttcaaataaat--------taatgacTGG-AAAAAA---TGGTAACTCATTTTTTGctgatttccatttttctgattACCAGGCAAGGCTGAATATC-ctaggaaaactataaaattt-ttaatcatgAATATTAGCCCCAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----TATGGCTATCTCCTA-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGACTTTCAGGTGTTCTGCTCTTGCTTTGTGGAATTAATCCATCATCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37972310 306 - 90373283 aattcctttcccctcacatttgccaatacttgtta------tttttcaaataaat--------caatgactga-aaaata---ttgtaactcattttttgctgatttccatttttctgattaccaggcaaggctgaatatc-ctAGGAAAAATATAAAATT--TTAATCATGAATATTAGCCCAAATTAGGATTAGTTTGACAGCA----TATGGCTATCTCCTA-TTAAATGTTGCCATAGGCTTACCTGTGATACTCTTCATTCTCAGTGTCAGGAAATTGCTGACTTTCAGGTGTTCTGCTCTTGCTTTGTGGAATTAATCCATCATCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10126817 305 + 96796970 aatgacttttccctcacatttgccaatactgggta------tgtttcaaataaat--------taatgagtggaaaaaaa---cgataactca----ttgctgactttcatttttctgattaccagACAAATGTTAATATC-CTAGTAAAAGTATAAAATTTGTTCATCATGAATATTATCCCAAATTAGGATTAGTTTGATAGCA----CATAGTTATCTCCTA-TTAAATGTTGCCATAGGCTTGCCTGTGATACTGTTCATTCTCTGTGCTGGAAGATTGCTGATTTTCAGGTTTTCTGCTCCTTCTTCGTTGAATTAAGCCATAATCA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81137822 325 - 85426708 AATGACTTTTTCCTTACATTTGCTAACCTAGGttattttttttttttagttaaatatttatCACTATGCCTGC-AAAACAATTTGATACCTTAAGGTCT------TTGCCTTTTTCTGTTTAGCACCCTGGGTGGAATATCTCTACTAAAAATATAAAATGTGTTAAACATGAACATTAGTTCCAAACAGAATTTGTTTTATAGAAAAATAATAATTATCTACTGTTTAAATATTGCTATAGGCTTACCTATCAGAATCTTCATTCTGCGTAGTAGGAAACAGGTGGTTATCAGTTTCTCCAGTCTTTCTTTGTTGAATTAGTCcagcagca i canFam3.chr2 I 309 I 49 a score=21540.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177504 7 + 478999 CCATTGC s panTro4.chrUn_GL393519 18198 7 + 413329 CCATTGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90270809 7 - 108868599 CCATTGC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070126 7 - 143122389 CCATTGC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574918 7 - 95678458 CCATTGC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36526789 7 + 96509753 CCATTGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32618559 7 - 90941950 CCATTGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37972616 7 - 90373283 CCATTGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127122 7 + 96796970 CCACAGC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81138147 49 - 85426708 I a score=99249.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177511 31 + 478999 CAGCACTGGCACCATTAGTCAGGTTTTCTGG s panTro4.chrUn_GL393519 18205 31 + 413329 CAGCAGCGACACCATTAGTCATGTTTTCTGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 35 s ponAbe2.chr14 90270816 31 - 108868599 CAGCAGTGGCACCGTTAGTCAGGTTTTCTGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070133 31 - 143122389 CAGCACTGGCACCATTAGTCAGGTTTTCTGG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574925 31 - 95678458 CAGCAGTGGCATCATTAGTCAGGTTTTCTGG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36526796 31 + 96509753 CAGCAGTGGCATCATTAGTCAGGTTTTCTGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32618566 31 - 90941950 CAGCAGCGGCATCATTAGTCAGGTTTTCTGG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37972623 31 - 90373283 CAGCGGCGGTATCATTAGTCAGGTTTTCTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127129 31 + 96796970 CAGGAGCGACACCGTTAGTCAGGTTTTCTGG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138196 31 - 85426708 cagcagcagcagcagcaTATATGTTTTCTGC i canFam3.chr2 I 49 C 0 a score=484703.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177542 209 + 478999 TAATCCCACAGGATT--ACTTCCATGCTTCTTTATTTCTTCTTCAACCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAGGAT------GGTTATCACTTTATTGAATAAAAATAACCTTTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTTTGCCATTATTTTAGTCATTAAAAATATTTCACACTTAAATTTGATCATATATACAGAACTATAACCGTATAATTTTA s ponAbe2.chr14 90270847 211 - 108868599 GAATCCCACAGGATTACACTTCTGTGCTTCTTCATTTCTTCTTCAACCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAGGAC------GGTTATCACTTTATTGAATAAAAAGAACCTTTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTTTGTCATTATTTTAGTCATTAAAAATATTTCACTCTTAAATTTGATCATATATACAGAACTATTATCATATAATTCTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070164 209 - 143122389 TAATCCCACAGGATT--ACTTCCATGCTTCTTTATTTCTTCTTCAACCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAACGAT------GGTTACCACTTTATTGAATAAAAATAACCTCTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTTTGTCATTATTTTAGTCATTAAAAATATTTCGCACTTAAATTTGATCATATATACAGAAATATTACCATACAATTTTA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35574956 209 - 95678458 TAATCTCACATGATT--ACTTCCGTGCTTCTTCATTACTTCTTCAACCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAGGAT------GGTTATCACTTTATTGAATAAAAAGAACCTTTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTGTATCATTATTTTAGTCATTAAAAATATTTCATGCTTAAGTTTGATCATATATACATAACTATTACCATATAATTTTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36526827 209 + 96509753 TAATCTCACATGATT--ACTTCCGTGCTTCTTCATTACTTCTTCAACCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAGGAT------GGTTATCACTTTATTGAATAAAAAGAACCTTTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTGTATCATTATTTTAGTCATTAAAAATATTTCATGCTTAAGTTTGATCATATATACATAACTATTACCATATAATTTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32618597 215 - 90941950 TAATCCCATATTATT--ACTTCCGTGCTTCTTCATGTCTTCTTCAGCCTTGAATGGAAGTTTGATATTAAGGATATTAAGGATATTCACTTTATTGaataaaaagaactttttaa----attgattttatcaATTGACTCAGTTTGTCATTATtgtagtcattaaaaatatttcacacttAGGTTTGATCATATGTACAGAACAATTACCATCTAATTTTA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37972654 215 - 90373283 TAATCCCATATTATT--ACTTCCGTGCTTCTTCATTTCTTCTTCAGCCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAGGATATTAAGGATATTCACTTTATTGAATAAAAAGAACCTTTTTA----ATTGATTTTATCAATTGACTCAGTTTGTCATTAGTGTAGTCATTAAAAATATTTCACACTTAAGTTTGATCATATATACAGAACAATTACTATCTAATTTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127160 213 + 96796970 TGATTCCACATGATT--ACTTCCATGCTTCTGCATTTCTTCTTCAGCCTTGAGTGGAAGTTTGATATTAAAAAT------GGTTATTGCTTTATTGAATTCAAAGAACCTTTTTGTTTTAATTATTTTATCACTTGACTCAGTTTGTCATTATTTTGGTAATTAAAAATATTTCACACTTAAATTTGATCGTATATACAGAACTGTTACCATATAATTTTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138227 162 - 85426708 TCCTTCCATTTTATT--ACTCGTGTGCTGCTTCCTTTCTTTTCCAGTCTTGAATGGAAATTTGAT---------------AGTTACAACTTCATTCATTAAAAAGAACTTTTTTC----ATTAATTGTATCATTTGACTC--TTTAATGTAATTTTAATCAATAAAACTATCTTGCACTTAACTT------------------------------------ i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 18236 35 + 413329 I a score=53444.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177751 19 + 478999 AGATGTAATTATCATGTCA s panTro4.chrUn_GL393519 18271 19 + 413329 AGATGTAATTATCATGTCA i panTro4.chrUn_GL393519 I 35 C 0 s ponAbe2.chr14 90271058 19 - 108868599 AGATGTAATTATCCTATCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070373 19 - 143122389 AGATGTAATTATCATGTCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575165 19 - 95678458 AGATGCAATTATCATATCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36527036 19 + 96509753 AGATGCAATTATCATATCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32618812 19 - 90941950 AGATGTAATTATCATATCA i papAnu2.chr10 C 0 I 638 s chlSab2.chr2 37972869 19 - 90373283 AGATGTAATTATCATATCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127373 19 + 96796970 AGATGTAATTATTATATCA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138389 5 - 85426708 ---------TATCA----- i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=22364.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177770 20 + 478999 TTAGTATATCACTGAAATTT s panTro4.chrUn_GL393519 18290 19 + 413329 TTAGTATATCA-TGAAATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90271077 20 - 108868599 TTAGTATATCATTGAAATTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070392 17 - 143122389 T---TATATCATTGAAATTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575184 20 - 95678458 TTAGTGTATCATTGAAATAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36527055 20 + 96509753 TTAGTGTATCATTGAAATAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37972888 2 - 90373283 -----------TT------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127392 20 + 96796970 TTAGTATGTCATTGAAATTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138394 19 - 85426708 -TTACATGTAATTGCAATTT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32618831 638 - 90941950 I a score=742685.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 177790 246 + 478999 TTGTAAAGTTTGCTTGATTCCAGCTGTTTGACTGAATAAAACAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCCCAAAAACTCTTCAGAATCTTATATATGAA--TTTACCCCATTTGACTCGTGGGAACACAAAAATAAAACGACATAGACACAAAATGTG---TCTTCTGTCTTTACCACCTAGATTTTACATTAAACACTCAGATGTAGAGGATGAGACACTG----GGGGG s panTro4.chrUn_GL393519 18309 239 + 413329 TTGTAAAGTTTGCTTGATT---GCTGTTTGA----ATAAAACAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCCCAAAAACTCTTCAGAATCTTATATATGAA--TTTACCCCATTTGACTCGTGGGAACACAAAAATAAAACGACATAGACACAAAATGTG---TCTTCTGTCTTTACCACCTAGATTTTACATTAAACACTCAGATGTAGAGGATGAGACACTG----GGGGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90271097 245 - 108868599 TTGTAAAGTTTGCTTGATT---TCTGTTTGAGTAGATAAAACAGAACTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGACCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCTCAATCACTCTTCAGAATCTTATATATGTA--TTTACCCCATTTGACTTGTGGGAACACACAAATAAAAAGAAAAAGACGCAAAATGTGTCTTCTTCTGTCTTTACCACCTAGATTTTACATTAAACAGTCAT-TTTAGAGGATGAGACACTG----TGGGG i ponAbe2.chr14 C 0 I 1036 s nomLeu3.chr5 77070409 243 - 143122389 TTGTAAAGTTTGCTTGATT---TCTGTTTGACTGAATAAAACAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTGGTGCTTTTATTCCCAAAAACTCTTCAGAATCTTATATATGAA--TTTACCCCAGTTGACTCGTGGGAACACAAAAATAAAAAGACATAGACGCAAAATGTG---TCTTCTGTCTTTACTACCTAGATTTTACATTGAACTCTCAGATGTAGAGGATGAGACACTG----TGGGG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575204 246 - 95678458 TTGTAAAGTTTGCTTTATT---TCTGTTTGACTGAATAAAATAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTTGAGCTTTTATTCCCAACCACTCTTCAGAATCTTATATATGTA--TTTACCCCATTTGACTCATGGGAACACACAAATAAAAAGACAAAGACGCAAAATGTGTCCTCTTCTGTCTTTACCACCTAGATCTTACATTAAGCAGTTAGATTTAGAGGATGAGACACTG----TGGGG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36527075 246 + 96509753 TTGTAAAGTTTGCTTTATT---TCTGTTTGACTGAATAAAATAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCCCAACCACTCTTCAGAATCTTATATATGTA--TTTACCCCATTTGACTCATGGGAACACACAAATAAAAAGACAAAGACGCAAAATGTGTCCTCTTCTGTCTTTACCACCTAGATCTTACATTAAGCAGTTAGATTTAGAGGATGAGACACTG----TGGGG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32619469 243 - 90941950 TTGTAAAGTTTGCTTCATT---TCTGTTTGACTGAATAAAATAGAATTCTTCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCttcattttatgcttttattcCCAACGACTCTTCGGAatcttatatatgta--tttatcccATTTGACTCGTGggaacacacaaataaaaagacaaagatgcaAAATGTG---TCTTCTGTCTTTACCACCTAGATCTCACATTAAACAGTCAGATTTAGAGGCTGAGACACTG----TGGGG i papAnu2.chr10 I 638 C 0 s chlSab2.chr2 37972890 244 - 90373283 --GTAAAATTTGCTTCATT---TCTGTTTGACTGAACAAAATAGAATTTTCCAAAA-TTCAAAAAGGGCCCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCCCAACCACTCTTCAGAATCTTATATATGTA--TTTATCCCATTTGACTCGTGGGAACACATAAATAAAAAGACAAAGATGCAAAATATGTCTTCTTCTGTCTTTACCACCTAGATCTCACATTAAGCAGTCAGATTTAGAGGATGAGACACTG----TGGGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127412 249 + 96796970 TTGTAAAGTTTGCTTTATT---TCTGTTTGAATGAATAAAAC--AATTTTCTAAAATTTCAAAAAGGGTCCTCCTTCATTTTGTGCTTTTATTCCCAACCACTCTTAAGAATCTAATATAAACA--TTGACCCCATTTGCCTTGTGGAAACACATAAATAAAAAGACAAAGATGCAAAATGTGTCTTCTTCTGTCTTTACCACCTGGATTTTCCATTAAACAGTCAGGTTTAGAGAATGAGACATTGACCTCAGGG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138413 235 - 85426708 TTGGAAATTCTGCTTCATT---TCTGTTGGAATAGA-ACAACATAATTTTCCAGAA-TTCCAAAAAGGACTTTCTTAATTTTGTGTTCATATCTACA------CTTTGCCACCTAACATTCCCAACTTCTCCCCATCTGACCAGCAGATATAAAGAAATAAAAAGACACA-----AAAATCTGTCCTCTTCCGTCTTTACCATCTGGATTTTGC-TTACACCGACAGATTCAAAGGATGTGACATTG----TGATG i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=581416.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178036 179 + 478999 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATGGCCCTTTTCTGCACTAAGATATTCTCCT-CCCCCACTGCCTTTGATCGTTCTTTTTTCATTTGGTTCCT--GGATATCAAAAACATGATGGTGCTCACTGAAACATGAAAACCAAAGTTTGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTGCA s panTro4.chrUn_GL393519 18548 179 + 413329 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATGGCCCTTTTCTGCACTAAGATATTCTCCT-CCCCCACTGCCTTTGATCGTTCTTTTTTCCTTTGGTTCCT--GGATATCAAAAACATGATGGTGCTCACTGAAACATGAAAACCAAAGTTTGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTGCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272378 180 - 108868599 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGTTTGCCCTTTTCTGCACTAAGATATTCTTCT-CCCCCACTGCCTTTGAGCATTCTTTTTTCATTTGGTTCCT-GGGATATCAAAAACATGATGGTGCTCACTGAAACATGGGAACCAAAGTTTGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTGCA i ponAbe2.chr14 I 1036 C 0 s nomLeu3.chr5 77070652 179 - 143122389 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATTGCCCTTTTCTGCACTAAGATATTCTTCT-CCCCCACTGCCTTTGATCGTTCTTTTTTCATTTGGTTCCC--GGATATCAAAAACATGATGGTGCTCACTGAAATATGAAAACCAAAGTTTGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTGCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575450 180 - 95678458 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATTGCCCTTTTCTGCACTGAGATTTTCTTCT-CCCCCACTGCCTTTGACCATTCTTTTTTCATTTGGTTCCT-GGGTTATCAAAAACATGATGGTTCTCACTGAAACATGGGAACTAAAGTTCGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTAGG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36527321 180 + 96509753 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATTGCCCTTTTCTGCACTGAGATTTTCTTCT-CCCCCACTGCCTTTGACCATTCTTTTTTCATTTGGTTCCT-GGGATATCAAAAACATGATGGTTCTCACTGAAACATGGGAACCAAAGTTCGCCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTACA i macFas5.chr10 C 0 I 763 s papAnu2.chr10 32619712 179 - 90941950 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATTGCCCTTTTCTGCACTGAGATATTCTTCT-CCCCCACTGCCTTTGATCAtt-ttttttCGTTTGGTCCCT-GGGATATCAAAAACATGATGGTTCTCACTGAAACATGGGAACCAAAGTTCACCACAACACAAGGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTACA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37973134 180 - 90373283 CTTCAGGAATAGAAAGGAAGATTGCCCTTTTCTGCACTGAGATATTCTTCTCCCCCCACTGCCTTTGATCATT-CTTTTTCATTTGGTCCCT-GGGATATCAAAAACATGATGGTTCTCACTGAAACATGGGAACCAAAGTTTGCCACAACACAAAGAGCAGAGTGAAACTGCTGAGGTACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127661 172 + 96796970 --TCAGGAATAGAA---GAGATTTCCCTTTTCTGCACTAAGATATACTTCT-CCCTGACTGCCTTTGATCGTTCTTTTTCCATTTGGTTCCT--GGATATCAAAAACACGAAGGTGCTCACTGAAACATGGGAACCAAAGTTTGCCACAACACAAGGATC--AGTGAAACTGCTGAGGTGCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138648 171 - 85426708 CTCCAGGAACAAAGACGAAGCTT-TCCATTTCTGCACTGAGCTATTCTT-T-CCCCAACTGCCTTTTATAATTCTTTTTTCATTTGGATCCCAGGGCTATCAAAAAAGTCACAGTGTTCATTAAAATATGTGAACCAAAGTTCACCACAACATAAAAGG---AGCAAAACTGATATT----- i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=616429.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178215 187 + 478999 AGCATGGAATTCCAGAAAATTAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATAGCTATACAATTTTCCAGCTGGAAATTACAAAGAATAAGTAATTATCTTCTTTAGCCACATTATCTAGTGATAATCAGACTAAAACCAAGAAAGATAAAA-GGATTGGTCCAAATCTCCTAAAGTGGCATTACCTAGCAT s panTro4.chrUn_GL393519 18727 187 + 413329 AGCGTGGAATTCCAGAAAATTAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATAGCTATACAACTTTCCAGCTGGAAGTTACAAAGAATAAGTAATTATCTTCTTTAGCCACATTATCTAGTGATAATCAGACTAAAACCAAGAAAGATAAAA-TGATTGGTCCAAAGCTCCTAAAGTGGCATTTCCTAGCAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272558 187 - 108868599 AATGTGGAATTCCAGAAAATGAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATAGCcatacaattttctagctggaagatacacagaataagaaactatcttctttagccacataatctattgataatcagactaaaaccaagaaagatcaaa-tgattggtccaaagCTCCTAAAGTGGCATTACCTAGCAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77070831 187 - 143122389 AGCGTGGGGTTCCAGAAAATGAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATAGCTATACAATTTTCCAGCTGGAAGATACACAGAATAAGTAATTACCTTCTTTAGCCACATTATCTAGTGATAACCAGACTAAAACCAAGAAAGATAAAA-TGATTGGTCCAAAGCTCCTAAAGTGGCATTACCTAGCAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575630 187 - 95678458 AGTATGGAATCCCACAAAATGAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATagtcatacaattttctagctggaagatacacagaataagaaattatcttctttagccacattatctattgataatcagactaaaaccaagaaagataaaa-tgatggatccaaagCTCCTAAAGTGGCATGACCTAGCAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528264 187 + 96509753 AGCATGGAATCCCAGAAAATGAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTCAATAGTCATACAATTTTCTAGCTGGAAGATACACAGAATAAGAAATTATCTTCTTTAGCCACATTATCTATTGATAATCAGACTAAAACCAAAAAAGATAAAA-CGATTGATCCAAAGCTCCTAAAGTGGCATGACCTAGCAT i macFas5.chr10 I 763 C 0 s papAnu2.chr10 32619891 187 - 90941950 AGCGTGGATGCCCAGAAAATAAG--ATGCTCCTCAAATTTCACATTCCATAGCCATACAATTTTCTAGCTGGAAGATACACAGAATGAGAAATTATCTTCTTTAGCCACATTAACTATTGATAATCATACTAAAaccaagaaagataaaa-tgattgATCCAAAGCTCCTAAAGTCGCATGACCTAGCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37973314 187 - 90373283 AGCGTGGATGCCCAGAAAATAAG--ATGCTCCCCAAATTTCACATTTGATAGCCATACAATTTTCTAGCTGGAAGATACACAGAATAAGAAATTATCTTCTTTAGCCACATTATCTATTGATAATCAGACTAAAACCAAGAAAGATAAAA-TGATTGATCCAAAGCTCCTAAAGTGGCATGACCTAGCAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10127833 188 + 96796970 GTCGAGGAATTCCAGAAAATGAG--ATGCTCCCCAGATTTCCCATTCAATAGCCATAACATTTTCTAGCTGGAGGATATACAGAAAAAGAAATTATCTTTTTTAGCCACATTATCTGTTGATAATCACGCTAAAACCAAGAAAGATAAAACTGGTTGAGCCGAAGTTCCTCAAGTGGCATCACCTAGCAT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81138819 184 - 85426708 AGTGTAGAATTTTGGGAAATGAGTAATGCTCCCCAAATTTCACATTCCATaaccataaaattttatagctagagggtataaa-----agtaattatcaactttaatcccattttctattgataatgggaataaaaccaaaaaaggttaca-tgatttgtccaaagttcctaaagtggcaTTACCTAGCAT i canFam3.chr2 C 0 I 132 a score=61599.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178402 22 + 478999 TTTATG---GCACCATTCAGGATTG s panTro4.chrUn_GL393519 18914 22 + 413329 TTTATG---GCACCACTCAGGATTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272745 22 - 108868599 TTTATG---GCACCATTCAGAATTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77071018 25 - 143122389 TTTACGGCAGCACCATTCAGGATTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575817 22 - 95678458 TTTACA---GCACCATTCAGGATTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528451 22 + 96509753 TTTACA---GCACCATTCAGGATTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620078 22 - 90941950 TTTACA---GCACCATTCAGGATTA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37973501 22 - 90373283 TTTACG---GCACCATTCAGGATTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128021 22 + 96796970 TTTACA---GCACCATTCAGGATTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81139003 132 - 85426708 I a score=439912.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178424 153 + 478999 TTCCATAATAATGAAAGAATCTCTCTAGGGTTTGTATCTCTTGAAAACTCAATGTACAGAATT---CTTTCT--GAGTTAAATATTAAATTTTTCACTGGTGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCGTACACTTACTACACTTTGTTA s panTro4.chrUn_GL393519 18936 153 + 413329 TTCCATAATAATGAAAGAATCTCTCTAGGGTTTGTATCTCTTGAAAACTCAATGTACAGAATT---CTTTCT--GAGTTAAATATTAAATTTTTCACTGGTGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTTACTACACTTTGCTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272767 143 - 108868599 TTCCCTAATAATCAAAGTATATCTCTAGGGTTTGTATCTCTTGAAAACTCAATGTACAGAATT---CTTTCT--GAG----------ACTTTTTCACTGATTATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTTACTACGCTTTGTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77071043 152 - 143122389 TTCCATAATAATGAAAGAATCTCTCTAGGGTTTGTATCTCTTGAAAACTCAATGTACAGAATT---CTTTCT--GAGTTAAATATTAAA-TTTTCACTGGTGATTTATGCTACTTACCTGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTTACTACACTTTGTTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575839 153 - 95678458 TTTGAGAATAATGAAAGAGTATCTCTAGGGTTTGTATCTCTTTAAACCTCAATGTACAGAATT---CGTTCT--GAGTTAAATATTAAATTTTTCACTGATGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTTAGTACACTTTGTTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528473 153 + 96509753 TTTGAGAATAATGAAAGAGTATCTCTAGGGTTTGTATCTCTTTAAACCTCAATGTACAGAATT---CGTTCT--GAGTTAAATATTAAATTTTTCACTGATGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTTAGTACACTTTGTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620100 153 - 90941950 TTCCATAATAATGAAAGAATATCTCTGGGGTTTGTATCTCTTTAAAACTCAATCTACAGAATT---CTTTCt--gagttaaatattaaatttttcacTGATGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTATACTTACAACACTTTATTA i papAnu2.chr10 C 0 I 365 s chlSab2.chr2 37973523 153 - 90373283 TTCCATAATAATGAAAGAATATCTCTGGGGTTTGTATCTCTTTAAAACTCAACGTCCAGAATT---CTTTCT--GAGTTAAATATTAAATTTTTCACTGATGATTTATGCTACTTACATGATAGGA-TCATGTATGCCTACACTAACAACACTTTATTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128043 154 + 96796970 TTCCACAACGATG-AAGAGGATCTCCAGGGTTTGTCTCTTTTTAAAACTCAATCTACAGAACTCAGCTTTTT--GAGTTAAATGCCAAATTTTTCACTGATGATTTATGCTGC-TATATGATAGAA-TCATACATGCCTAAACTTACTACACTTTGTTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81139135 153 - 85426708 TTTTATTTTAATG-GAGGATATCTCTAGATTTTGTTTATTTTT-CACCTCAAACATCAGTTTT---CTCCCTTAGAGTCAAATACTGAAGGTTT-GCTGAAAATCTATGCTACCTACATGATAAAAGTCGTATGTGTCAAAATATATCATACTTTATTA i canFam3.chr2 I 132 C 0 a score=116980.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178577 36 + 478999 AACAGCATAACATAAAAATCTAATTCCACAGAAACA s panTro4.chrUn_GL393519 19089 36 + 413329 AACAGCATAACATAAAAATCTAATTCAACAGAAACA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272910 36 - 108868599 AACAACATAATGTAAAAATCTAATTCAACACAAACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77071195 36 - 143122389 AACAGCATAACATAAAAATCTAATTCAACAGAAACA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35575992 36 - 95678458 AACAACATAATGTAAAAATTGAATTCAACAGAAACA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528626 36 + 96509753 AACAACATAATGTAAAAATTGAATTCAACAGAAACA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620618 36 - 90941950 AACAACATAATGTAAAAATCTAATTCAACAGAAACG i papAnu2.chr10 I 365 C 0 s chlSab2.chr2 37973676 36 - 90373283 AACAACATAATGTAAAAATCTAATTCAACAGAAACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128197 36 + 96796970 AACCATATAATGTAAAAATCGAATTTAACAGAAACA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81139288 33 - 85426708 ---AACAAAATGTAAAGGTTTGATTCAACAAAAACA i canFam3.chr2 C 0 I 2440 a score=456127.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178613 142 + 478999 TTTGAACATAAAGGTATACCTC----TCTATCACAGTCCTTATTTATTTCTGGTTCTTGAGACATTTTCTGCAGATGCAAAAATAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCCGTGTATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATG---TTAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 19125 142 + 413329 TTTGAACATAAAGGTATACCTC----TCTATCCCAGTCCTTATTTATTTCTGGTTCTTGAGACATTTTCTGCAGATGCAAAAATAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCCGTGTATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATG---TTAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90272946 143 - 108868599 TTTGAATATGAAGGTATACCTC----TCTATCACCATCCTTATTTATTTCTGGTTCTTGAGACATTTTCTGCAGATGCAAAAACAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCTGTG-ATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATG-TTTTAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77071231 141 - 143122389 CTTGAACATAAATGTATACCAC----TCTATCACAGTCCTTATTTATTTCTGGCTCTTGAGACATTTTCTGCAGATGCAAAAATAGAAGGTTACTTTGCTTGTTGTATTTCCGTG-ATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATG---TTAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 I 6076 s rheMac3.chr10 35576028 144 - 95678458 TTTGAATATAAAGGTATACCTC----TCTATCACAATCCTTGTTTATTTCTTGTTCTTGAGATATTTCCTGTAAATGCAAAAATAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCTGTG-ATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATGtttttaaaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528662 144 + 96509753 TTTGAATATAAAGGTATACCTC----TCTATCACAATCCTTGTTTATTTCTTGTTCTTGAGATATTTCCTGTAAATGCAAAAATAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCTGTG-ATGTCTCCTCTCTTGGAATGCATGTTTTTAAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620654 144 - 90941950 TTTGAATGTAATGGTATACCTC----TCTATCACAATCCTTGTTTATTTCTGGTTCTTGAGACATTTCCTGCAAATGCAAAAATAGAAGGTCAATTTGCTTgttgtatttctgtg-atgtctCCTCTTTTGgaatgcatgttttaaaaa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37973712 144 - 90373283 TTTGAATATAATGGTATACCTC----TCTATCACAATCCTTGTTTATTTCTGGTTCTTGAGACATTTCCTGCAAATGCAAAAATAGAAGGTTAATTTGCTTGTTGTATTTCTGTG-ATGTCTCCTCTTTTGGAATGCATGTTTTTAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128233 144 + 96796970 TTTAAATATAAAGTTGTACCTC----TCTCTCACAATCCTTATTTGTGTCTGGTTCTTGAGACATTTTCTGCAGATGCAAAAATAGAAGATTAATTTGCTTGTTGTATTTCTCAG-ATGTCTGCTTTTTAGGAGTGCATGTTTTTAAAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81141761 148 - 85426708 TCTGAATGTACAGATCTATCACCGTGTCTATCACATTCCATATTCATTTCTGGTTCTCGAGCCATATTTTGCAGTTGCACAAGTGGAATGTTAATTTGCTTGGTTTGGCTTTCAG-ATGTCTTTTCAGCCAGGATACATGTTTGTAAAA i canFam3.chr2 I 2440 C 0 a score=252385.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178755 113 + 478999 TAATTTTATT----------CTTAAGTAATCAAGTATGGAC-ATGAAAAATTAGaaaat-----aaaataaaa------------tttaactgttaaaataatt----aaataaa--taaataattaaaattaaGAATTAACTTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 19267 113 + 413329 TAATTTTATT----------CTTAAGTAATCAAGTATGGAC-ATGaaaaattagaaaat-----aaaataaaa------------tttaactgttaaaataatt----aaataaa--taaataattaaaattaagaattaacttttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90273089 113 - 108868599 AAATTTTATT----------CTTAAGTAATCAAGTATGGAC-ATGaaaaattagaaaataattaaaattaaaa------------tttaaatattaaaataaat----aaat-------aataattaaaattaagaattaacttttt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77077448 125 - 143122389 TAATTTTATT----------CTTAAGTAATCAAGTATGGAC-ATGAAGAATTAGAGAAa----aaaaataaaatttaaagtctattttaactgttaaaataatt----aaat-aa--taaataattaaaattaagaattaacttttt i nomLeu3.chr5 I 6076 C 0 s rheMac3.chr10 35576172 133 - 95678458 taattttattttaaGTGATCTTTAAGCAATCAAGTATGGACAAAGaaaaattagaaaataactaaaattaaaa------------tttaactgtcaaaatagttaaataaataaa--taattaattaaaattaaaaattaacttttt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528806 122 + 96509753 TAATTTTAT-----------TTTAAGCAATCAAGTATGGACaaagaaaaattagaaaataactaaaattaaaa------------tttaactgtcaaaatagttaaataaataaa--taattaattaaaattaaaaattaaatTTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620798 110 - 90941950 taattttat-----------tttaagtaatcaAGTATAGacaatgaaaaattagaaaataattaaaattaaaa------------tttaactgtta------------aaataaa--taattaattaaaattaaaaattagcttttt i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37973856 106 - 90373283 TAATTTTAT-----------TTTAAGTAATCAAGTACAGACAATGAaaaattagaaaataattaaaattaaaa------------tgtaactgtta----------------aaa--taaataattaaaattaaaaattaaCTTTTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128377 115 + 96796970 TAATTTTATT----------CTTAAGTAATCAAGTATGGACAATAAAAAATTGGaaaat------aattaaaa------------tatacctattagaataatt----aaataaaattaaataattaaaattaaGAATTAACttttt i calJac3.chr16 C 0 I 303 s canFam3.chr2 81141909 67 - 85426708 TAACTTTATC----------CTTAGGTAATCAAATACGGACAAAGAAAAA-TAGAAAAT------AATTAAAA------------TTTAGTTATTA--------------------------------------------------- i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=687265.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 178868 247 + 478999 AATCTATGTTTAGCTACTGCCACATCATTGGCTTCTGACTAACATG-GGAAAATAATTCACCTTAGACAAAGGGAGAATAAAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTGTTTGGACTAAACTTAATTTGTTATGTGTTAAATCTACC-AAAAATGAATTAGCAGATGATTTGTAGTGTTCCAAGGGCTTCCTCACTTGAAAAGAGTATATCTCATGAAACCCTAACTAGTGAGCCCCTAT s panTro4.chrUn_GL393519 19380 248 + 413329 aatCTATGTTTAGCTACTGCCACATCATTGGCTTCTGACTAACATGTGAAAAATAATTCACCTTAGACAAAGGGAGAATAAAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTTACCATTTGTTTGGACTAAACTTAATTTGTTATGTGTTAAATCTACC-AAAAATGAATTAGCAGATGATTTGTAGTGTTCCAAGGGCTTCCTCACTTGAAAAGAGTATATCTCATGAAACCCTAACTAGTGAGCCCCTAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90273202 248 - 108868599 aatCTATGTTTAGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACATGTGAAAAATAATTCACCTTAGACAAAGGGAGAAAAAAAGCATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------GGTCACTATTTGTTCGGACTAAACTTAATTTGTTATGTGTTAAATCTACC-AAATATGAATCAGCAGATCATTTGTAGTGTTCCAAAGTCTTCCTCACTTGAAAAGAGTTTACCTCATGAAACCCTAACTAGTGAGCTCCTAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77077573 248 - 143122389 aatCTATGTTTAGCTACTGCCACGTCATTGGCTTCTGACTAACATGTGAAAAATAATTCACCTTAGACAAAGGGAGAATAAAAACGTGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTCTTTGGACTAAACTTAATTTCTTATGTGTTAAATCTACC-AAAAATGAATTAGCAGATGATTTGTAGTGTTCCAAAAGCTTCCTCACTTGAAAAGAATATATCTCATGAAGCCCTAACTAGTGAGCCCCTAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35576305 245 - 95678458 aatCTACGTTCAGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACATGGGAAAAATAATTCACCTTAGCCAACGG----------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACAATTTGTTTGGACTAAACTTAATTTGTTCTGTGTTAAATCTACC-AAAAATGCATCAGCAGATGATTTGTAGTGTTGCAAAATCTTCCTCACTTGAAAAGAGTTTACCTCACCAAACCCTAACCAGTGAGCCTCTAC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36528928 248 + 96509753 AATCTACATTCAGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACATGTGAAAAATATTTCACCTTAATCAAAGGGAGAAGAAAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTGTTTGGACTAAACTTAATTTGTTCTGTGTTAAATCTACC-AAAAATGCATCAGCAGATGATTTGTAGTGTTGCAAAATCTTCCTCACTTGAAAAGAGTTTACCTCACCAAACCCTAACCAGTGAGCCTCTAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32620908 248 - 90941950 aatCTACGTTCTGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACATGGGAAAAATAATTCACCTTAGCCAATGGGAGAAGATAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTGTTTGGACTCCACTTAATTTGTTACGTGTTAAATCTGCC-AAAAATGCATCAGCGGATGATTTGTAGTGTTGCAAAGTCTTCCTCACTTGAAAAGAGTTTACCTCACCAAACCCTAACCAGTGAGCCGCTAC i papAnu2.chr10 C 0 I 1273 s chlSab2.chr2 37973962 248 - 90373283 AATCTACATTCAGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACATGGGAAAAATAATTCACCTTAGCCAACGGGAGAAGAAAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTGTTTGGACTCCACTTAATTTGTTATGTGTTAAATCTGCC-AAAAATGCATCAGCGGATGATTTGTAGTGTTGCAAAGTCTTCCTCACTTGAAAAGAGTTTACCTCACCAAACCCTAACCAGTGAGCCTCTAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10128795 247 + 96796970 AATCTATGTTTAGCTACTGCCACATCACTGGCTTCTGACTAACTCATGAAAAATAACACACCTTAGCCAAAGGGAGAAGACAAACATGAACCAGCAAACTTA-ACTT------------------------------TGTCACCATTTGTTT-GATTAAACTTAATTCTTTATGTGTTAAGTCTACC-AAAAATAAATTAGCAAATGATTTGTAATGTTGCAAAGGCTTCCTCACTTGAAAAAGTTTTACTTCACCATACCCTAACTAGTGAGCCCCTAC i calJac3.chr16 I 303 C 0 s canFam3.chr2 81141976 200 - 85426708 ------------GCTGTTCCTAAGTCACTGGATTATAACTAAGAAGTGAG---------------------GACAGAAGAAAAGCATAAATCCATTCACTTATATTT------------------------------TGTCA-GGTTTTTCTTAACTAAAC--AATTCAATACA-GTTACATCTACCAAAAAATGAAT---CAGATGATTTTTAATGTTACAA----------ACTTAAAAACACTTTATTCCCTTGTATCTTAAAGAGTGAGCCCCGAC i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=9186.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179115 26 + 478999 AGTGCACTGAAGTGCTTTTTAAAAAG s panTro4.chrUn_GL393519 19628 26 + 413329 AGTGCACTGAAGTGCTTTTTTAAAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90273450 26 - 108868599 AGTGCACTGAAGTGCTTTTTCAAAAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77077821 26 - 143122389 AGTGCACTGAAGTACTTTTTAAAAAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35576550 2 - 95678458 ------------------------AG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529176 2 + 96509753 ------------------------AG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37974210 2 - 90373283 ------------------------AG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10129042 26 + 96796970 TGTGCATTTAAGTCCTTTTCTAAAAG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81142176 25 - 85426708 AATGCATTTCAGGAGTTTTTACAAG- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32621156 1273 - 90941950 I a score=285792.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179141 93 + 478999 ATTCCTAATTGGATTGTAGGCACGCTTTAAATTATTAGGAGCTGA-----AATCAACACCAAACAGGAAGAAATGCAAATTCTTAAATTTTAATTGAA s panTro4.chrUn_GL393519 19654 93 + 413329 ATTCCTAATTGAATTGTAGGCACGCTTTAAATTATTAGGAGCTGA-----AAAAAACACCAAACAGGAAGAAATGCAAATTCTTAAATTTTAATTGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 M 603 s ponAbe2.chr14 90273476 93 - 108868599 ATTCCTAACTGGATTGTAGGCACCCTTTAAACTATTAGGAGCAGA-----AATCAACACCAAACAGAAGGAGATGCAAATTCTTAAATTTTAATTGAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77077847 93 - 143122389 ATTCCTAACTGGATTGTAGGCATGCTTTAAATTATTAGGAGCTGA-----AGTCAACACCAAAGAGAAAGAAATGCAAATTCTTAAATTTTAATTGAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35576552 93 - 95678458 ATTACTAACTGGATTGTAGGCATGCTTTCAATTATTAGGAGCTGA-----AATCAACACCAAAAAGAAAGAAATGCAAATTCTTAAATTTTAATTCAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529178 93 + 96509753 ATTACTAACTGGATTGTAGGCACGCTTTCAATTATTAGGAGCTGA-----AATCAACACCAAACAGAAAGAAATGTAAATTCTTAAATGTTAATTGAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32622429 93 - 90941950 ATTACTAACTGGATTGTAGGCATGCTTTCAATTATTAGGAGCTGA-----AATCAAcaccaaacagaaagaaatgcaaattcttaaattttaattgaa i papAnu2.chr10 I 1273 C 0 s chlSab2.chr2 37974212 93 - 90373283 ATTACTAACTGGATTGTAGGCACGCTTTCAATTATTAGGAGCTGA-----AATCAACACCAAACAGAAAGAAATGCaaattcttaaattttaattgaa i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10129068 93 + 96796970 ATTACAAGCTGGAGTGTAGGCACATTTTAAATTATTAGGAGCTGA-----AATTCACACCAAACAGAAAGAAATGCAAATTTTTACATTTTAATTGAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81142201 90 - 85426708 TTTGAAACCTAGATAATAGGCAAACTAT--ATTTTTGGGGGGCAAATATCAATTAACATCAAA------GAAAAATAAATTCCtatattttaatttaa i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=1017887.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179234 441 + 478999 ATTATATGCTGTAATATGATAGTGTTATGTATC----TAGATGATCTGCTTAAGTCCAGTTCTAATATATTCTAAGGTGTACTAATTACAGTGGATAAAAA-TTTTTTAATAATCTGTACTGATTTTCTGCAACTAAAATAAGGTAGAAGGTTATTGTGTTTGTGCACTAACACCAAATGTCCCATTCTGCAAGATGTGATTCTTGTAAT-AGGCAGTTGGGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGAACAGAAATGCTGAGGTCAGTG----AGAGACCACAAGGCAGAATATGTCTTTAACCTTGGTATCTGTGACTGACAATATAAAACTGCAGATTTTCAATCACTGGCCGTGATTATTCTTTAACCATGAATCCAGCTCAGGGACCTTCAGTGTTACATTGTTCACAGTTCTA-TTGCTTAATAATATAATCCAATAATTGATG s ponAbe2.chr14 90273569 440 - 108868599 ATTATATACTATAATATGATAGTGTTATGTATC----TATACTATCTGCTTAAGTCCAGTTCTAATATATTCTAATGTGTACTAATTACAGCAGataaaaa-atttttaataatatGTACTGATTTTCTGCAACTGAAATAAGTTAGAATGTTATTGTGTTTGTGCACTAACACCAAAGGTCCCATTCTGCAAGATATGATTCTTGTAAT--GGCAGTTGGGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGAACAGAAATGCTGAGGTCAATG----AGAGGCTACAAGGCAGAATATATCTTTAACCTTGGTATCAGTGACTGACAATATAAAACTGCAGATTTTCAATCACTGGCTATGATTACTCCTTAACCATGAATCCAGCTCAGGGACCATCAGAGTTACATTGTTCATAATTCTA-TTGCTTAATAATATAATCCAATAATTAATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77077940 441 - 143122389 ATTATATGCTGTAATATGATAGTGTTATGTATC----TAGATTATCTGCTCAAGTCCACTTCTAATATATTCTAATTTGTACTAATTATAGTGGATAAACA-TTTTTTAATAATCTGTACTGATTTTCTGCAACTGAAATAAGGTAGAAGGTTATTGCGTTTGCGCACTAAAACCAAATGTCCCATTCTGCAAGATATGATTCTTGCAAT-AGGCAGTAGCGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGGAAAGAAACGCTGAGGTCAATG----AGAGACCACAAGGCAGAATATATCTTTAACCTTGGTATCAGTGACTGACAATATAAAACTACAGATTTTCAATCACTGGCCGTGATTACTCTTTAGCCATGAATCCAGCTCAGGGACCTTCAGTGTTACATTGTTCATAGTTCTA-TTGCTTAACAATATAATCCAATAATTGATG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35576645 438 - 95678458 ATTATATGTTGTAATATGATAGTGTTATGTATC----TAGTTTATCTGCTTAAGTCCAGTTCTAATATAGTCTAACGTGTACTAATGACAGTGGATAAAAA---TTTTAATAACCTGTACTGATTTTCTGCAACTGTAGTAAGTGCGAATGTTATTGTGTTTCTGCACTAACACCAAAGGTCCCATTCTGCAAGATACGATTCTTGTAAT-AGGCATTTGGGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGAAGAGAAATGCTGAGGTCAGTG----AAAGACCACAAGGCAGAATATATCTTTAACCTTGCTATCAGTGACTG-CAATATAAAACTGCAGATTTTCAATCACTGGCCATGATTACTCTTCAACCACGAATCCAGCTCAGGGACCATCAGTTTTGCATTGTTCATAGTTCCA-TTGCTTAATAATATAATCCAATAATTGATG i rheMac3.chr10 C 0 I 37 s macFas5.chr10 36529271 438 + 96509753 ATTACATGTTGTAATATGATAGTGTTATGTATC----TAGATGATCTCCTTAAGTCCAGTTCTAATATATTCTAATGTGTACTAATTACAGTGGATAAAAA---TTTTAATAATCTGTACTGATTTTCTGCGACTGAAGTAAGTTCGAATGTTATTGTGTTTCTGTACTAATACCAAAGGTCCCACTCTGCAAGATATGATTCTTGTAAT-AGGCATTTGGGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGAAGAGAAATGCTGAGGTCAGTG----AAAGACCACAAGGCAGAATATATCTTTAACCTTGCTATCAGTGACTG-CAATATAAAACTGCAGATTTTCAAGCGCTGGCCATGATTACTCTTTAACCATGAATCCAGGTCAGGGACCATCAGTGTTGCATTGTTCATAATTCCA-TTGCTTAATAATATAATCCAATAATTGATG i macFas5.chr10 C 0 I 4 s papAnu2.chr10 32622522 438 - 90941950 attatatGTTGTAATATGATAGTGTTATGTATC----TAGTTTAACTGCTTAAGTCCAGTTCTAATATATTCTAATGTGTACTAATGACAGtggataaaaa---ttttaataatctgTACTCATTTTCTGCGACTGCAGTAAGTTCAAATGTTATTGTGTTTCTGCACTAACACCAAAGGTCCCATTCTGCAAGATACGATTCTTGTaat-aggcatttgggttgcttttaTGACCTGGTTCCCTCCCTGAAGAGAAACGCTGAGGTCAATG----AGAGATCACAAGGCAGAATATATCTTTCACCTTGCTATCAGTGACTG-CAATATAAAACTGCAGATTTTCAATCACTGGCCATGATTACTCTTCAACCACAAATCCAGCTCAGGGACCATCAGTGTTACATTGCTCATAATTCTA-TTGCTTAATAATATAATCCAATAATTGATG i papAnu2.chr10 C 0 I 4 s chlSab2.chr2 37974305 437 - 90373283 attatatattgtaaTGTGATAGTGTTATGTATC----TAGTTTATCTGCTTAAGTCCAGTTCAAATATATTCTAATGTGTACTAATGACAGTGGATAAAAA---TTTTAATAATCTGTACCGATTTTCCGCAACTACAGTAAGTTCGAATGTTTTGATGTTTCTGCACTAATACCAAAGGTCCCACTCTGGAATATATGATTCTTGTAAT-AGGCATTTGGGTTGCTTTTATGACCTGGTTCCCTCCCTGAAAAGAAATGCTGAGGTCAATG----AGAGACCACAAGGCAGAGTATATCTTTCACCTTGCTATCAGTGACTG-CAACATAAAACTGCAGATTTTCAATCACTGGCCGTGATTACTCTTCAACCACGAATCCAGCTCAGGGACCATCAGTGTTACACTGTTCATAATTCCA--TGCTTAATAAGATAATCCAATAATTGATG i chlSab2.chr2 C 0 I 4 s calJac3.chr16 10129161 433 + 96796970 ATTATACACTGTAATATGATAGTGTTATGCATC----TAGACTGCCTGTTTAAATCCAGTTCTAATATATTCTGACGGGTATGAATGACAGTGGATAAAAA-TGTTTAATTAATATG-ACTGATTTTCTGAAACTTAAGTAAGTTAGAATGTTATTCTGTTTGTACATTAACACAAAAGGTCCCATTCGTCAAGATATACTCCTTGTTACCAGGCAGTTGGGTTGCTTTTA-GACCTGGTTCTCTCTTTGAACAGAAACCCTGAGGTCAGTG----AG--------AGGCAGAATGCATCTTTAACCTTGGCATCAGGGACGGACAGGATCAAACTGCAGGTTCTCAGTCACTGGCCATGATTACTCCTTTACCACGCATCCAGCTCAGGGACCATCACTGTTACACTGTTCATAATTTCAATTGCTTAATAATATTATCCAATAATTGATG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81142291 415 - 85426708 attatataC-----TATGATAGTGTTAGACATCGCTATAGATTATCTGCTTGTATCCAGCTCTAATATATGGTAATGTCCAC---TGAGAGTGGATAAGAAAAATATTAATAATATG----GATTTCCTGTG-CTGAAATAACTGAAAGAGTTAT--TGTTTATAATCCAACTACAAAGGTCCCATCCTGGAAGGTGTGATTCT--ACAT-AGGCGATCGTGCTGATTTCACGACCCCATTCTCTC-----------------AAGTCAACTACACAGAGATCACAAAGCAGAATAAATCTTTAATCTTGGCATTTGTAACTGGAAATAGAGAACTAGACACTTTGAACCACTGAGAATAATCACTCCTTGTACATGAGTCTAAGTCAGTAGTCATCATTGTTATACTGCTCATAATTTCAACTGCTTA--AACATGACTCAATATTTGATG i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 19747 603 + 413329 M a score=46318.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179675 29 + 478999 GTA----CTTTATCATGTTAGGGTGTTGTAAAA s ponAbe2.chr14 90274009 33 - 108868599 TTACCTTCTTCATCATGTTAGGGTGTTGTAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77078381 29 - 143122389 TTA----CTTTATCATGTTAGGGTGTTGTAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529713 29 + 96509753 ----TTTCTTTATCATGTTAGGGTGTTGTAAGA i macFas5.chr10 I 4 C 0 s papAnu2.chr10 32622964 29 - 90941950 ----TTTCTTTATCATGTCAGGGTGTTGtaaga i papAnu2.chr10 I 4 C 0 s chlSab2.chr2 37974746 29 - 90373283 ----TTTCTTTATCATGTCAGGGTGTTATAAGA i chlSab2.chr2 I 4 C 0 s calJac3.chr16 10129594 27 + 96796970 TTACTTTCTTTATCATGTTAGAGTGTT------ i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81142706 33 - 85426708 CTACCTTCTTTATCATGTAAAGAAGTTACAAAA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35577083 37 - 95678458 I e panTro4.chrUn_GL393519 19747 603 + 413329 M a score=174077.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179704 98 + 478999 ATAAAAGAACAAACAAAGGTCTGGAAT------------------ATGTTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTAGCTATAAGCTAATCAAAAAGGCAGATAAGAA--TATTTTA s panTro4.chrUn_GL393519 20350 98 + 413329 ATAAAAGAACAAACAAAGGTCTGGAAT------------------ATGTTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTAGCTATAAGCTAATCAAAAAGGCAGATAAGAA--TATTTTA i panTro4.chrUn_GL393519 M 603 C 0 s ponAbe2.chr14 90274042 93 - 108868599 ATAAAAG----AATAAAGTTCTGTAAT-------------------TGTTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTAGTTATAATCTAATCAAAAAGGCAGATGaaaa--tatttta i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77078410 96 - 143122389 ATAAAAGAACAAGCAAAGTTCTGGAAT------------------ATGTTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGGAAGATTAGCTATAAGCTAATCAAAAATGCAGATAAGAA--TATTT-- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529742 93 + 96509753 ATAAAAG----AACAAAGTTCTGGAAT-------------------TTCTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTACCTATAAGCTAATCAAAAAGGTAGATAAGAA--TATTTCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32622993 93 - 90941950 ataaaag----aacaaagttctGGAAT-------------------TTCTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTACCTATAAGCTAATCAAAAAGGtagataagaa--tatttta i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37974775 93 - 90373283 ATAAAAG----AACAAAGTTCTGGAAT-------------------TTCTTTT-------GCCTCTATTCCAAAAGGAAAGATTACCTATAAGCTAATCAAAAAGGCAGACAAGAA--TGTTTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10129621 99 + 96796970 -------TGTTAACAAAGTTCTGGATT-------------------TTTTTTTTTTTTTGGTCTCTATTCCAAAGAGAAAGATTAGCTATAAACTAATCAAGAAGGCAAATACGAAtttatttta i calJac3.chr16 C 0 I 299 s canFam3.chr2 81142739 82 - 85426708 ATAGAAGAAGCAAAGAATATTTAGAATTATTTTTGTCTCAAAAGATTTTTTTT-------GCCTAAATTCCAAGGATGAAGTTTAGCTA------------------------------------ i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35577083 37 - 95678458 I a score=5096.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179802 3 + 478999 AAT s panTro4.chrUn_GL393519 20448 3 + 413329 AAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274135 3 - 108868599 aat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77078506 1 - 143122389 --T i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529835 3 + 96509753 AAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32623086 3 - 90941950 aat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37974868 3 - 90373283 AAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81142821 3 - 85426708 AAC i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35577083 37 - 95678458 I e calJac3.chr16 10129720 299 + 96796970 I a score=164518.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179805 82 + 478999 AAGAATACCATAAAATAAGAGTATTTTAAATTTTATAG-TGGTTATG-TTTTTAAGCTAAATATCAAATGTTAAGTTAGAATTT s panTro4.chrUn_GL393519 20451 82 + 413329 AAGAATACTGTAAAATAAGAGTATTTTAAATTTTATAG-TGGTTATG-TTTTTAAGCTAAATATGAAATGTTAAATTAGAATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274138 83 - 108868599 aagaatattgtaaaataagaatattttaaattttataG-TGGTTATGTTTTTTAAGTTAAATATCAAATGTTAAATTAGCATCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77078507 82 - 143122389 AAGAATACTGTAAAATAAGAGTattttaaattttatag-ttgttatg-tttttaagctaaatatcaaatcttaaattAGAATTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36529838 82 + 96509753 AAGAATATTGTAAAATAAGAGTACTTTAAATTTTATAG-CGGTTATG-TTTTTAAGTTAAATTTCAAATGCTAAATTAGAATCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32623089 83 - 90941950 aagaatattgtAAAGTAagagtattttaaagtttatag-tgGTTATGTTTTTTAAGTTAAGTTTCAAATGCTAACTTAGAATCT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37974871 83 - 90373283 AAGAATATTGTAAAGTAAGAGTATTTTAAAGTTTATAG-TGGTTATGTTTTTTAAGTTAAGTTTCAAATGCTAACTTAGAATCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10130019 78 + 96796970 AAGAATATT-TAAAATAAGAATATTCTAAATTTTATAGAGGGTTATAATGTTTAAGTTAAATATCAAAT-----ATTAGAATAT i calJac3.chr16 I 299 C 0 s canFam3.chr2 81142824 78 - 85426708 TTAGTTACTA-AAAATCATAGCATTTTAAGTTTTGTAA-CTCGtaaa-atttta---taaaaactaaatattaaattataCTCT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35577083 37 - 95678458 I a score=1689515.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 179887 559 + 478999 ATTAATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGAATTTATTAAAATAAATTTTAAGAATCT-ATTAAAAAATTC-TTAAAAAA-AG-AATCTATTGATTCTTAAAACCTAGTCTGAAAGGTAATTTCATTTGGACTATCTAATATTATTCAAGCAAAGAAAACAACGTTAAATCAAAAATTTAAACTTAAAATTTTCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGAC-----TTTAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTGAAGACAACATTTTATTTTATTTCATAAACTGAGTGT-----------TT-AGTCTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATAATTC------TCCAAAACTTCAACAAACCACTTGGGGAGACACCTGATG-----------------------------------------------------------------------------------TGATTCACTCACAAATTCATCCACCCAACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACATATAAGGTAACTCAGTATGTTGTTC s panTro4.chrUn_GL393519 20533 560 + 413329 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGaatttattaaaataaattttaagaatcttattaaaaaattc-ttaaaaaa-aG-AATCTATTGATTCTTAAAACCTAGTCTGAAAGGTAATTTCATTTGGACTATCTAATATTGTTAAAGCAAAGAAAACAACattaaatcaaaaatttaaatttaaaattttCCATGCCTCTGACTGGCTATTTTCACTGAC-----TTCAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAGATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTGAAGACAACATTTTATTTTATTTCATAAATTGAGTGT-----------TT-AGTCTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATAATTC------TCCAAAACTTCAACAAACCACTTGGGGAGACACCTGATA-----------------------------------------------------------------------------------TGATTCACTCACAAATTCATCCACCCCACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACATATAAGGTAACTCAGTATGTTGTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274221 560 - 108868599 ATTCATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGaatttattaaaataaattttaagaatct-attaaaaaattctttaaaaaa-aG-AATCTATTGATTCTCAAAACCTAGTCTGAAAGGTAATTTCATTTGGACTATCTAATATTATTAAAGCAAAGAAAACAACattaaatcaaaaatttaaatttaaaattttCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGCCTTTAATTTAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTTAAGACAAC-----ATTTTATTTCATAAATTGAGTGT-----------TT-AGTTTTTCGTGAAATAGTTACTTAAGAAATAATTC------TCCAAAACTTCAACAAACCACTTGGGGAGACACCTGATG-----------------------------------------------------------------------------------TCATTCACTCACAAATTCATCCACCCAACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAATAGAAGCATATAAGGTAACACAGTATGTTGTTC i ponAbe2.chr14 C 0 I 3 s nomLeu3.chr5 77078589 556 - 143122389 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGAATTTATT-AAATTACTTTTAAGAGTCT-ATTAAAAAATTC-TTAAAAAACAG-AATTTATTGATTCTTAAAACCTAGTCCAAAAGGTAATTTCATTTGGACTATCTAATATTATTAAAGCAAAGAAAACAACATTAAATCAAAAATTTAAATTTAAAATTTTCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGAC-----TTTAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCCGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTGAAGACA---TTTTATTTTATTTCATAAACTGTGTGT-----------TT-AGTCTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATAATTC------TCCAAAACTTCAACAAGCCACTTGGGGAGACACCTGATG-----------------------------------------------------------------------------------TGATTCACTCACAAATTCACCCACCCAACATAAATGAACAAAATCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACATATGGGGTAACTCAGTATGTTGTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35577120 555 - 95678458 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGAATTTATT-----AAATTTTATGAATCT-ATTAAAAAGTTC-TTAGAAAAAAG-AATCTATTGACTCTCAAAACCTAGTCTGAAAGGTAATTTCCTTTGAACTATCTAATATTACTAAAGCAAAGaaaataacattaaatcaaaaatttaaatttaaaattCTCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGCC-----TTTAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTTAAGACAACATTTTATTTTATCTCATAACTTGAGTGT-----------TT-AGTGTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATCATTC------TCTAAGACTTCAACAAACCACTTGGGGAGACACCTGATA-----------------------------------------------------------------------------------AGATTCACTCACAAATTCATCCACCCAACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACGTATAAGGTAACACAGTGTGTTGTTC i rheMac3.chr10 I 37 I 3 s macFas5.chr10 36529920 554 + 96509753 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGC-GAATTTATT-----AAATTTTAAGATTCT-ATTAAAAAGTTC-TTAGAAAAAAG-AATCTATTGATTCTCAAAACCTAGTCTGAAAGGTAATTTCCTTTGAACTATCTAATATTACTAAAGCAAAGAAAATAACATTAAATCAAAAATTTAAATTTAAAATTCTCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGCC-----TTTAAGCCTTTGTGACTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGCCTTTATAAAAATAGATTTAAGACAACATTTTATTTTATCTTATAAATTGAGTGT-----------TT-AGTGTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATCATTC------TCTAAGACTTCAGCAAACCACTTGGGGAGACACCTGATA-----------------------------------------------------------------------------------AGATTCACTCACAAATTCATCCACCCAACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACATATAAGGTAACACAGTGTGTTGTTC i macFas5.chr10 C 0 I 3 s papAnu2.chr10 32623172 555 - 90941950 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGctgaatttatt-----aaattttatgaatCT-ATTAAAAAGTTC-TTAGAAAAAAG-AATCTATTGATTCTCAAAACCTAGTCTGAAAGATAATTTCATTTGGACTACCTAATATtattaaagcaaagaaaacaatattaaatcaaacatttaaatgtaaaattttccaTGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGCC-----TTTAAGCCTTTGTGATTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTAAAATGAACCACTTAGAACAGT----TAAAAACTATTGcctttataaaaatagatttaagacaacattttattttatctcataaaTTGAGTGT-----------TT-AGTGTTTCATGAAATAGTTACTTAGGAAATCATTC------TTTAAGACTTCAACAAACCACTTGAGGAGACGCCTGATG-----------------------------------------------------------------------------------AGATTCACTCACAAATTCATCCACCCAacataaatgaacaaaaccaCCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACATATAAGGTAACACAGTATGTTGTTC i papAnu2.chr10 C 0 M 856 s chlSab2.chr2 37974954 555 - 90373283 ATTGATTCTTCTGTTAATGAGATTGCTGAATTTATT-----AAATTTTACGAATCT-ATTAAAAAGTTC-TTAGAAAAAAG-AATCTACTGATTCTCAAAACCTAGTCTGAAAGGTGATTTCATTTGGACTACCTAATATTATTAAAGCAAAGAAAACAACATTAAATCAAAAATTTAAAAGTAAAATTTTCCATGCCTCTGGCTGGCTATTTTCACTGCC-----TTTAAGTCTTTGTGATTCTTCCTC------TGATGTCAGCTTTAAGTCTTGTTCTGTTGAGAAATCCATATATTCAGTTACAATGAACCACTTAGAATAGT----TAAAAAGTATTGCCTTTATAAAAATAGATTTAAGACAACATTTTATTGTATCTCATAACTTGAGTGT-----------TT-AGTGTTTCATGTAATAGTTACTTAGGAAATCATTC------TCTAAGACTTCAACAAACCACTTGGGGAGACACCTGATG-----------------------------------------------------------------------------------AGATTCACTCACAAATTCATCCACCCAACATAAATGAACAAAACCACCAGAAACACAACTTTAAAATACAGTAGAAACTTATAAGGTAACACAGTATGTTGTTC i chlSab2.chr2 C 0 I 3 s calJac3.chr16 10130097 646 + 96796970 ATTGATTCTTCTCTTAATAAGTTTGCtaaatttattaaaataaattttaaGCATGT-ACTAAAAGATTC-TTCAAAAAAAGAAATCGATTGATTCTCAAAGCCTAGTCTGAAAGGTAATTTCATTTGGACTATCTAATATTATTAAAGCAAAGAAAACAATATTAAACCCAAAATTTAAATTGAAAATTTGACATGCCTCTGGCTGTCTATTTTCACTTCC-----TTTAAGCCTTTGAGGCTCTTCCTC------TGATGTCATCTTTAAGTCTTGTTCTGAAGAGAAATTCATATATTCAGTTAAAATGAACTGCTTACAACA-T----GAAAAATTACTGCCTTTGT-AAAACAGATTTAAGACA---TTTCATTTTGTTTTATAAATTGAGCATTTAAATGGAACTT-AGTCTTTCATGAAGTAGTTACTTAAGAAATAATTC------TCTAAAACGTCAACAAACCACTTGGGGAGATATCAGATGTCACTAGATTGAAGACATACAAACATGTCAAACATTCACTCACAAATTCATTCACCCAACATAAATTAACAAAACCACTTCAAACATTCACTCACAAATTCATTCACCCAACATAAATTAACAAAACCACCAGAAACACAATTTTAAAATACAG----AACATAAAAGATAACATAGTATATTGTTC i calJac3.chr16 C 0 I 3 s canFam3.chr2 81142902 502 - 85426708 ---------------------------------------------------------------------------------------ATTGACT-TCAATATATCCACTCAAAG--AGTTTCACTTGAAACATGTAATATTAGAAAAGCAGGGAAAACAATATAAAATCAGAAATTTAAATTTAAAGCTTTACATACCTGGGGGTGGTTATTTTCACTTTT-----ATCAGGCCTTTCTTGCTCTTGCTTTTGCTGTGATGCCACTTCTAAGTCTGGTTCTGATGACAAATCTATATATTTAGTTAAAATGGACTACTTAGAATGGTTAGATAAAAGCTATTACCTCTATAAAAATAG----AAAATATCATTT-----------ATCACTGAAGAGT-----------TTAAATTCATCTTTAGCTGAATATTTAAGAAATACTTCTAATTATCTAAAATTTCAACAAACCATTTGA-GAAATACTAAACGTCACCAGGTTAAAGGCACACAAACATCTCCA----------------------------------------------------AGATTCATTCACAAATTCATCCA-CTAACATCCATGAACAAAACAATCAGAAACAAAAGTTTAAAATCCAGTAGAAACATATAAAAT--CACAAGAGATTATTC i canFam3.chr2 C 0 I 3 a score=19497.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 180446 7 + 478999 ACTTCCT s panTro4.chrUn_GL393519 21093 7 + 413329 ACTTCCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274784 7 - 108868599 ACTTCCT i ponAbe2.chr14 I 3 C 0 s nomLeu3.chr5 77079145 7 - 143122389 ACTTCCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35577678 7 - 95678458 ACTTCTT i rheMac3.chr10 I 3 C 0 s macFas5.chr10 36530477 7 + 96509753 ACTTCTT i macFas5.chr10 I 3 C 0 s chlSab2.chr2 37975512 7 - 90373283 ACTTCCT i chlSab2.chr2 I 3 C 0 s calJac3.chr16 10130746 7 + 96796970 ACTTCCT i calJac3.chr16 I 3 C 0 s canFam3.chr2 81143407 7 - 85426708 ACTTTGT i canFam3.chr2 I 3 C 0 e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M a score=9646.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 180453 6 + 478999 AATAGt s panTro4.chrUn_GL393519 21100 6 + 413329 AATAGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274791 6 - 108868599 AATAGt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079152 6 - 143122389 AATAGt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35577685 6 - 95678458 AATCAt i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36530484 6 + 96509753 AATCAt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37975519 6 - 90373283 AATCAt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81143414 6 - 85426708 AACAGT i canFam3.chr2 C 0 I 176 e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M e calJac3.chr16 10130753 0 + 96796970 C a score=831851.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 180459 489 + 478999 gaagcagtaaatgtaaagaaaaggaaatttagttttaaagagaaacaagttttcctgcacttagctagtctgactctaaggatagtaacaagcagg-cccaggaaaggtcatggtgaccctgtctgagaagccagagcccacaggtatgggctccagacatcccagagcaaggttaagaaaacaaattcctttaccatctcccctccccctcagcatttattcatagctatttttacaaatgcatatattttgcaaattcttgttttccttcaatgcagctgcaaggtcacaagctatgcagtggttgcaaaactgtcactatatgattaactgcctttgttctgcttctataagtttgcctatataagccaagccctgtc--tttgttcagggctcagctttttgatgcaaatccgctgagctggtgtgcacctaaacaaaatcctcttgtttgacccactgggtctctcctgcctcctgttttctgcaaA s panTro4.chrUn_GL393519 21106 490 + 413329 GAAGCAGTAAATGTAAAGAAAAGAAAATTTAGTTttaaagagaaacaagttttcctgcacttagctactctgactgtaaggatagtatcaggcagggcccaggaaaggttgtggtgaccctgtctgagaagccagagcccacaggtatgggctccagacatcccagagaaaagttaagaaaacaaattcctttaccatctcccctccccctcagcatttattcatagctatttttacaaatgcatatattttgcaaattcttgttttccttcaatgcagctgcaaggtcacaagctatgcagtggttgcaaaactgtcactatatgattaactgcctttgttctgcttctgtaagtttgcctatataagccaagccctgtc--tttgttcagggctcaggtttttgatgcaaatccactgaactggtgtgcacctaaataaaatcctcttgtttgacaaactgggtctctcctgcctcctgttttctgcaaA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90274797 492 - 108868599 gaagcagtaaatgtaaagaaaaggaaattcagttttaaagagaaacaagttttcctgcacttagctactctgactctaaggatagtaaaaagcagggcccaggaaaggtcgtggtgaccctgcctgagaagccagaacccacaggtgtgggctccagacatcccagagcaaggttaagaaaagaaattcccttaccatctccccttcccctcagcatttactcatagctatttttacaaatgcatattatttgcaagttcttgttttccttcattgcagctgcaaggtcacaagctatgctgaggttgcaaaactgtcactagatgattaactgcctttgttctgcttctgtaagcttgcctacataagccaagccttgtcaatttgttcagggctcagcttttggctgcaaatccactgagctggtgcgcacctaagtgaaatcctcctgtttcatccactgggtctctcctgcctcctgttttctgcaac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079158 490 - 143122389 gaagcagtaaatgtaaagaaaaggaaatttagttttaaagagaaacaagttttcctgcacttagcaactctgactctaaggatagtaacaggcagggcccaggaaaggtcatagtgatcctgtctgagaagccagagcccacaggtatgggcttcaggcatcccagagcaaggttaagaaagcaaatcaccttaccatctccccttcctctcagcatttactcatagctatttttaccaatgcatatattttgcaaattcttgttttccttcaatgcagctgcaaggtcacaagctatgtggaggttgcaaaactgtcactatatgattaactgcctttgttcttcttctgtaagtttgcctatgtaagccaagccctgtc--tttgttcggggctcagctttttgaagcaaatctgctgagctggtgcacacctaaataaaatcctcttgttcgacccactgggtgtctcctgcctcctgttttctgcaac i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35577691 489 - 95678458 gaagcagaaaatgtaattagaaggaaatttagttttaaagagaaacaagttttcctgcacttagctactctgactctaaggatagtaacaggcagggcccaggtaaggtcatgttgaccctgtctgagaagccagagcccacaggtatggg-tccagacatcccagagcaaggttaagaaaacaaattcctttaccgtctccccttcccctcagcatttactcatagatatttgtacaaatgcatatattttgcaagttcctcttttccttcaatgtagttgcaaagtcacaagttatgctgaggttgcaaaactgtcactatatgattaactgcctttgttctgcttctgtaagcttgcctttataagccaagctctgcc--tttgttcaggactcagttgttggaagcaaatctgctgagctgctgtgcacctaaataaaatcctcctgtttcacccactgggtctctcctgcctcctgttttctgcaac i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36530490 489 + 96509753 gaagcagaaaatgtaatgagaaggaaatttagttttaaagagaaacaagttttcctgcacttagctactctgactttaaggatagtaacaggcagggcccaggtaaggtcatgttgaccctgtctgagaagccagagcccacaggtatggg-tccagacatcccagagcaaagttaagaaaacaaactcctttaccatcctcccttccccgcagcatttactcatagctatttttacaaatgcatatattttgcaagtttctgttttccttcaatgtagttgcaaagtcacaagctatgctgaggttgcaaaactgtcactatatgattaaccacctttgttctgcttctgtaagcttgcctttataagccaagctctgcc--tttgttcaggactcagttgttggaagcaaatctgctgagctgctgtgcacctaaataaaatcctcctgtttcacccactgggtctctcctacctcctgttttctgcaac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37975525 489 - 90373283 gaggcagtaaatgtaatgaaaaggaaatttagttttaaagagaaacaaattttcctgcacttagctactctgactctaaggatagtaacaggcagggcccaggtaaggtcgtgctgaccctgtccgagaagccggagcccacaagtatggg-tccagacatcccagagcaaggctaagaaaacaaattcctttaccgtctccccttcccctcagcatttactcatagctatttgtacaaatgcatatattttgcaagttcctcttttccttcaatgtagttgcaaattcacaagctatgctgaggttgcaaaactgtcactatatgattacctgcctttgttctgcttctgtaagcttgcctttataagccaggctctgtc--tttgttcaggactcagcatttggatgcaaatccactgaactggtatgcacctaaataaaatcctcctgtttgacccactgggtctctcctgcctcctgttttctgcaac i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81143420 176 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M e calJac3.chr16 10130753 0 + 96796970 C a score=50763.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 180948 22 + 478999 AATAGTACCTTACAAACGATTT s panTro4.chrUn_GL393519 21596 22 + 413329 AATAGTACCTTACAAATGATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275289 22 - 108868599 aATAGTACCTTATAAATGATTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079648 22 - 143122389 aATAATACCTTATAAATGATTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35578180 22 - 95678458 aATAGTACCTTATAAATGATTT i rheMac3.chr10 C 0 I 485 s macFas5.chr10 36530979 22 + 96509753 aATAGTACCTTATAAATGATTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976014 22 - 90373283 aATAGTACCTTATAAGTGATTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10130753 22 + 96796970 AACAGTACCTTATAATTGATTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81143420 176 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M a score=130088.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 180970 82 + 478999 CCAAAATTACTACTGACACCTTTATTAGTGTACAATGTCTTCTTAACATCTAAA-ATGTTTCCATCCACTATTATGACAAAtt s panTro4.chrUn_GL393519 21618 82 + 413329 CCAAAATTACTACTGACACCTTTGTTAGTGTACAATGTCTTCTTAACATCTAAA-ATGTTTCCATCCACTATTATGACAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275311 83 - 108868599 CCAAAATTACTACTAACACCTTTATTAGTGTACAATGTCTTCCTAATATCTAAACATGTTTCCCTCCACTATTCTGACATATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079670 82 - 143122389 CCAAAATCACCACTGACACCTTTATTAGTGTACAATGTCTTCTTAACATCTAAA-ATGTTTCCGTCCACTATTATGACAAATT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531001 82 + 96509753 GCAAAATTACTACTAATGCCTTTATTAGTGTACAATGTCTTCCTAATATCTAAA-ATGTTTCCCTCCACTATTCTGACAAATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976036 82 - 90373283 CCAAAACTACTACTGACACCTTTATTAGTGCACAATGTCTTCCTAATATCTAAA-ATGTTTCCCTCTACTATTCTGACAAATT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10130775 79 + 96796970 TCAAAAT---CACTGACACATTTATTAGTGTAGAATGTCTTCCTAATACCTAAA-ATATTTCCCTCCACTATTCTGACAAGTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81143420 176 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35578202 485 - 95678458 I a score=116800.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181052 105 + 478999 tattttcatttttctttttttttgtttt------------agctggggtcttgctctgtcaccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaacctctgactccctggt s panTro4.chrUn_GL393519 21700 116 + 413329 TATATTCAtttttctttttttttgtttt-ttttttgtttgagccagggtcttgctctgtcaccaggctggagtgcggtggcacaatctcagctcactgcaacctctgactccctggt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275394 105 - 108868599 TAttttcatttttctttttttttgtttt----------tgagccagggtcttg--ctgtcaccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagctcactgcaacctccaactccctggt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079752 117 - 143122389 TATTTTCATttttctttttttttttttgtttttttgtttgagccggggtcttgctctgtcaccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagctcactccaacctctgactccctggt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531083 117 + 96509753 TATTTTCTTttcttttttttcttcttttttttttgttttgagccagggtctttctctgtcaccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaacctctgactccctggt i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976118 106 - 90373283 TCttttcttttctttttttttttttttttttt---ttttgagccagggtctttctctgtcaccaggctggagtgcagtgg--------caactcactgcaacctctgactccctggt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81143420 176 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32623727 856 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35578202 485 - 95678458 I e calJac3.chr16 10130854 0 + 96796970 C a score=308747.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181157 194 + 478999 tcaaatgattctcctgtctcagtctcctgagaagctgtgattacaggcacacaccatcatgcccagctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccattggccaggatggtcttgatcttttgaccttgtgatccacctgctccagcctcccaaaatgctgcaattacaggtgtgagccaccacacc s panTro4.chrUn_GL393519 21816 194 + 413329 tcaaatgattctcctgtctcattctcctgagaagctgggattacaggcacacaccatcatgcccagctaatttttgtaattttagtagagatggggtttcaccattggccaggatggtcctgatcttttgaccttgtgatccacctgctccagcctccgaaaatgctgcaattacaggtgtgagccaccacacc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275499 194 - 108868599 tcaaaggattctcctgtctcagtctcccaagaagctgggattacaggcatgtaccattatgcccagctaattttcgtgtttttagtggagatggggtttcaccattggccaggatggtcctgatattttgaccttgtgatctgcctgctccagcctcccaaaatgctgggattacaggtgtgagccatcacacc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77079869 194 - 143122389 tcaaatgattctcctgtctcagtctcctgagaagctgggattacaggcacacaccatcatgcccagctaatttttgtgttttcagtagagatggggtttcaccattggccggggtggtactgatcttttgaccttgtgatccatctgctccagcctcccaaaatgctgaaattacaggtgtgagccaccacacc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531200 194 + 96509753 tcaagcgattctcctgtctcagtctcccaagaagctgggattacaggcattcaccatcatgcccagctagttttcatttttttagtagagatggtgtttcacgattggccaggatgatcctgatcttttgaccttatgatccacctctttaggcccccaaaaatgctgggattccaggtgtcagccaccacAAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32624591 193 - 90941950 tCAAGTga-tctcctgtctcagtctcccaagaagctgggattacaggcatgcaccatcatgaccagctaattttcatatttgtagtagagatggtgtttcatgattggccaggatgttcttgatcttttgaccttgtgatccacctcctccagccccccaaaatgctgggattacagttgtgagacACAACAAC i papAnu2.chr10 M 856 C 0 s chlSab2.chr2 37976224 194 - 90373283 tcaagcgattctcctgtctcagtctccaaagaagctgggattacaggcatgcaccatcatgcccagctaattttcctatttgtagtaaagatggtgtttcatgattggccaggatgttcctgatctcttgaccttgggatccacctcctccagtcccccaaaatgctgggattacagttgtgagacacaacaac i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81143420 176 - 85426708 I e rheMac3.chr10 35578202 485 - 95678458 I e calJac3.chr16 10130854 0 + 96796970 C a score=10955.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181351 8 + 478999 cagccTTG s panTro4.chrUn_GL393519 22010 8 + 413329 cagccTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275693 8 - 108868599 cagccTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080063 8 - 143122389 tggccTTA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531394 8 + 96509753 AAGCCTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32624784 8 - 90941950 TGgcctta i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976418 8 - 90373283 tggccTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81143596 8 - 85426708 CAAATTTC i canFam3.chr2 I 176 C 0 e rheMac3.chr10 35578202 485 - 95678458 I e calJac3.chr16 10130854 0 + 96796970 C a score=203476.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181359 80 + 478999 TTTTCATCTTTTAA-AAC----AATGCTATGGGAAGTCTTCCTTGATTCTGCAGATCTTTCCCCAGATAAACAGGTAACTCCTTC s panTro4.chrUn_GL393519 22018 80 + 413329 TTTTCATCTTTTAA-AAC----AATGCTATGGGAAGTCTTCCTTGATTCTGCAGATCTTTCCCCAGATAAACAGGTAACTCCTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275701 80 - 108868599 TTTTCATCTTTTAA-AAC----AATGCTATGAGAAGTCTTCCTTGATTCTGCATGTCTTTCCCCAGATAAACAGGTACCTCCTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080071 80 - 143122389 TTTTCATCTTTTAA-AAC----AATGCTATTGGAAGTCTTCCTTGATTCTGCAGGTCTTTCCCCAGATAAACAGGTAACCCCTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531402 81 + 96509753 TTTTCATCTTTTAAGAGC----AATGCTGTGTGAAGTCTTCCTTGATTCTGCATGTCTTTCCCTAGATAAAAAGGTACCTCCTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32624792 80 - 90941950 ttttcatcttttaa-aac----aatgatatGTGAAGTCTTCCTTGATTCTGCATGTCTTTCCCCAGATAAAAAGGTACCTCCTTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976426 80 - 90373283 TTTTCATCTTTTAA-AAC----AATGATATGTGAAGTCTTCCTTGATTCTGCATGTCTTTCCCCAGATAAAAAGGTACCTCCTTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10130854 80 + 96796970 TTTTTATCTTTTAA-AAC----AACGCTATGTGAAGCCTTCCTCGATTCTGCATGTCTTCCTCCTGATAAACAGGGACCTCCTTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81143604 84 - 85426708 CTTGCATCTTTTAG-GACTCAGACTGCTGTGTAAAGTCATCCTTGATTATGGCTATCCTTTCTCAGATAAAAATGCATCTCTTTC i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35578202 485 - 95678458 I a score=391918.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181439 116 + 478999 CTTGAGGTTGCCTTAGGACCTCACTGATTTTTCTACTGCACCTTTACCACCTGAACTGTACACTATTCCTCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGAGGACAGTCTTG s panTro4.chrUn_GL393519 22098 116 + 413329 CTTGAGGTAGCTTTAGGACCTCACTGATTTTTCTACTGCACCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCTCCACAGGTCTGTCCCCTCTACTCCAAGACTGCAGAGGACAGTCTTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275781 116 - 108868599 CTTGAGGCTGCCTTAGTACTTCACTGATTTTTCTACTGCACCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCTCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAAACTGCAGAGGACAGTCTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080151 116 - 143122389 CTTGAGGTTGCCTTAGTACTTCACTGATTTTTCTACTGCATCTTTACCACCTGAACCGTACATTACTCCTCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGAGCACAGTCTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35578687 116 - 95678458 CTTGAGGCTGCCTTCTGACTTCACTGATTTTTCTACTGCATCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCCCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGGGGACAGTCTTG i rheMac3.chr10 I 485 C 0 s macFas5.chr10 36531483 116 + 96509753 CTTGAGGCTGCCTTCGTACTTCACTGATTTTTCTACTGCATCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCCCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGGGGACAGTCTTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32624872 115 - 90941950 -TTGAGGCTGCCTTGTGACCTCACTGATTTTTCTACCGCATCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCCCCACATGTCTTTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGAGAACAGTCCTG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976506 116 - 90373283 CTTGAGGCTGCCTTCTGACTTTGCTGATTTTTCTACTGCATCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTCCCCCACATGTCTGTCCCCTCTGCTCCAAGACTGCAGAGAACAGTCTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10130934 114 + 96796970 CTTGAGGCTGCCTTAGTACTTTACTAATTTTTCTACTGCATCTTTACCACCTGAACTGTACATTATTGTTC--CATGTCTGTCCCCTCTCCTCCAAGACTGAAGGGGACAGTCTTG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81143688 116 - 85426708 TTTGGGGTTACCTTAATACCTTACAGCTTTTTCTAGTGCACCTTCACCACCTGAACTGTAAACTACTTCTTTATGTGTCTAGTTCTTTTGCTCCTACACTGTAGGGGACAATCTCG i canFam3.chr2 C 0 I 157 a score=1152935.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181555 399 + 478999 CACATCATCT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATACATGCTAGGTGTTAGGGTTTAAA-AAGAATGAAAATAAAGCCTGTCAGGGATGGCTTTTCTAGAACACCTGCCCAAGCAGAGACTTAAATATTGAGGCTAGCTAGATTAAAAGTGG-TAGAGGGCAAGAAAGGGTGACAGCATGCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGCGAGGCCTGAAAGAGTGAAAGTATTTGCCTGCAATAGAAGGAGGAGTGAGTAGGGCATTAAGAGCCACTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCACACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGTAGAATAGGGCAGAAGTC-AGATTATGAAAGCCTTATGTGTACCTTTAAGATGCTT s panTro4.chrUn_GL393519 22214 399 + 413329 CACATCATCT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATACATGCTAGGTGTTAGGGTTTAAA-AAGAATGAAAATAAAGCCTGTCAGGGATGGCTTTTCTAGAACACCTGCCCAAGCAGAGACTTAAATACTGAGGCTAGCTAGATTAAAAGTGG-TAGAGGGCAAGAAAGGGTGACAGCATGCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGCGAGGCCTGAAAGAGTGAAAGTATTTGCCTGCAATAGAAGGAGGAGTGAGTAGGGCATTAAGAGCCACTCAGTAATTCCAGAGA-AAGGGCACACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGTAGAGTAGGGCAGAAGTC-AGATTATGAAAGCCTTATGTGTACTTTTAAGATGCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90275897 389 - 108868599 CACATAATCT------------------------TACTCA------------CATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TAAATACATGCTAGGCATTAGCGTTTAAA-AAGAATGAAAATAAAGCATGCCAGGGACGGCTTTTCTAGAACACCTGCCCAAGCAGAGACTTAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGGGG-TAGAAGGCAGGAAAGGGTGACAGCATGCCACGCAGCAGCAAGA-GCGGGAGCGAGGCCTGAAAGAGTGAAAGTATTTGCCTACAATAGAAGGATGAGTGAGTAGGGCATTACCAGCAGCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCACACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGGAGAGTGGGGAAGAAGTC-AGATAATGAAAGCCTTATGTGTAATTTTAAGATGCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080267 398 - 143122389 CACATCATCT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATACACGCTAGACTTTAGGGTTTAAA-AAGAAAG-AAATAAAACCTgtcagggatggcttttctagaacacctgcccaagcagagacttaaatattgaggctagccagattaaaagtgg-tagagggcaagaaagggtgacagcatgccacacagcagcaaga-gcaggagcgaggcctgAAAGAGTGAAAGTATTTGCCTACAATAGAAGGAGGAGTGAGTAGGGCATTACCAGCCCCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCACACAGGGAAAAGAGCTAAAGATGGAGAGTAGGGCAGAAGTG-AGATTATGAAAGCCTTATGTGTAATTTTAAGATGCTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35578803 375 - 95678458 CACATCATAT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATATATGCTAGGCATTAGGGTTTAAA-AACAATGAAAATAAAGCATATCACAGATGGCTTTTCTAGAACACATGCCCAAGCAGAGACTGAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGCGG-TAGAGGGCAGGAAAGGGTAACAGCATTCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGTGAGGCCTGAAAGAGTGA-----------------------ACGAGTGAGTAGGACATTACCAGCAGCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCGCACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGGAGAGTGGGACAGAAGTC-AGATCATGAAA-CCTGATGTGTAATTTTAAGATGCTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531599 376 + 96509753 CACATCATAT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATATATGCTAGGCATTAGGGTTTAAA-AACAATGAAAATAAAGCATATCACAGATGGCTTTTCTAGAACACATGCCCAAGCAGAGACTGAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGCGG-TAGAGGGCAGGAAAGGGTAACAGCATTCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGTGAGGCCTGAAAGAGTGA-----------------------ACGAGTGAGTAGGACATTACCAGCAGCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCGCACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGAAGAGTGGGGCAGAAGTC-AGATTATGAAAGCCTTATGTGTAATTTTAAGATGATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32624987 375 - 90941950 CACATCATCT------------------------TTGTAAAA--ATAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATACATGCTAGGCATTAGggtttaaa-aacaatgaaaataaagcgTATCAGGGATGGCTTTTCTAGAACACATGCCCAAGCACAGACTGAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGCGg-tagagggaaggaaagggtAACAGCATTCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGTGAGGCCTGAAAGAGTGA-----------------------ACGAGTGAGTAGGACATTACCAGCAGCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCACACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGGAGAGTGGGGCAGAAGTC-AGATTATGAAA-CCTGATGTGTAATTTTAAGATGCTT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976622 375 - 90373283 CACATCATCT------------------------TTGTAAAA--ACAGTCTTTATTTTACTCAGAAATTTCTTATTGAG-TCCTGC--TACATACATGCGAGGCATTAGGGTTTAAA-AACAATGAAAATAAAGCATATCAGGGATGGCGTTTCTAGAACATATGCCCAAGCACAGACTGAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGCAG-TAGAGAGCAGGAAAGGGTAACAGCATTCCACACAGCAGCAAGA-GCAGGAGCGAGGCCTGAAAGAGTGA-----------------------ACGAGTGAGTAGGACATTACCAGCAGCTCAGTAATGCCAGAGA-AAGGGCGCACAGGGAAAAGGGCTAAAGATGGAGAGTGGGGCAGAAGTC-AGATTACGAAA-CCTTATGTGTAATTTTAAGACGTTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10131048 398 + 96796970 CAAGTCATCT------------------------TTGTATAA----AGTCTTTATTTTACTCAGCAATTTTTTATTGAG-TCCTGCTATACATACATACTAGGTGTTAGGGTTGAGA-AACAATGAAAATAAAGCACATCAGGGTTGGCTTTTGTAGAAATCATGCACAAGTGGAGGCTTAAATATTGAGGCTAGCCAGATTAAAAGAGG-TAGAGTACAGGAAAGGATGACAGCATGCCAGGAGGCAGCAAGA-TAGGGAGTAAGGCCTGAAAGAGTCAATGTATTTGCCTAGAATAGAAAGATGAGCGAGTAGGGCATTACCAGCCATTCAGTAATGCCAGAGA-AACGGCACACAGGGAAAATGGCTAAAGATGGACAGTAGGGCAGAAGTC-AGATTATGAAAGCCTTAT-TGTAATTTTAAGATGCTT i calJac3.chr16 C 0 I 310 s canFam3.chr2 81143961 429 - 85426708 TAAATCATCTTTCAGTCTTCATGTTACTTAGTACTTATAAAAGTAAAGTCTTTATGTTACTTAGT-ACTACTTACTGAGTTCCCAC--TAAGTGATAGATAGGGGACCGGGTTTAAAGAAGCACGTAGATGTAAGGTGTCAGGAATAGCTTTCCTAGACATAATGCCTAAACTGAGACTGCAACAGTGACGTCAGACAGATTCAAAGGGATTAGAGGGCAGAAAATGGGGAGACCATGCAAGGCTGTAGTAAGACAAGGGAGAGAAGCACACAACAGGGTAAATATTTGTCTAAAATAGAGAGATTACAGAGGAAGACATCACTAGCAGTTCAG-GATACCAGAGATAAGGGCAGACGGTATAAAGGGCTAAAGATGAAGACTTAGGCAGAAGTCAAGATTATGAAAGCTTTGTATGTAATTTTAAGATGCCT i canFam3.chr2 I 157 C 0 a score=182405.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 181954 61 + 478999 AGACATTAACG----TTCAAGAGTGGTCCCTGGTCCTATCTGTATTAAGATGTAGATCATTTT-AA s panTro4.chrUn_GL393519 22613 61 + 413329 AGACATTAACG----TTCAAGAGTGGTCTCTGGTCCTATCTGTATTTAGATGTAGATCATTTT-AA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276286 62 - 108868599 GGACGTTAATG----TTCAAGAGTGGTCCCTGGTCCTATCTGCATTTAGATATAGGTCACTTTAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080665 61 - 143122389 AGACATTAACG----TTCAAGAGTGGTCCCTGGTCCTATCTGCGTTTAGATGTAGATCATTTT-AA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579178 61 - 95678458 GGACATTAATG----TTCAAGAGTGATCCCTGGTCCTATCTGCATTTAGATAAAGATCATTTT-AA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36531975 61 + 96509753 GGACATTAATG----TTCAAGAGTGATCCCTGGTCCTATCTGCATTTAGATAAAGATCATTTT-AA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32625362 61 - 90941950 GGACATTAATG----TTCAAGAGTGATCCCTGGTCCTATCTGCAtttagaaaaatatcatttt-aa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37976997 61 - 90373283 GGACATTAATG----TTCAAGAGTGATCCCTGATCCTATCTGCATTTAGAAAAATATCATTTT-AA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10131756 61 + 96796970 GGACATTAATG----TTTAAGAGTGGCCCCTGGTCCTATCTGCATT-AGATATTGATCACTTTAAA i calJac3.chr16 I 310 C 0 s canFam3.chr2 81144390 64 - 85426708 GGACATAAATATGTTTTCAACAGTGGTTCACGGTCGTATATGCATTT-GAGACAGATCACTCT-AA i canFam3.chr2 C 0 I 899 a score=105831.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182015 38 + 478999 TGC-CAAAACCAATATTCCTAGTGAGCCATTATTCATTA s panTro4.chrUn_GL393519 22674 38 + 413329 TGC-CAAAACCAATATTCCTAGTGAGCCATTATTCATTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276348 38 - 108868599 TGC-CAAAACCAATATTCTTAGTGAACTATTATTCATTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080726 38 - 143122389 TGC-CAAAACCAATATCCCTAGTGAGCCATTATTCATTA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579239 38 - 95678458 TGC-CAAAACCAATATTCCTAGTGAGCTGTTATTCCTTA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532036 38 + 96509753 TGC-CAAAACCAATATTCCTAGTGAGCTGTTATTCCTTA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32625423 38 - 90941950 tgc-cAAAACCAATATTCCTAGTGAGCCAATAGTCATTA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37977058 38 - 90373283 TGC-CAAAACCAATATTCCTAGTGAGCCAATAGTCATTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10131817 39 + 96796970 TGCAAAAAACCAATATTCCTAATGAACCATTATTCATTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81144454 899 - 85426708 I a score=957363.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182053 333 + 478999 AGACAAGGTGACAGCTAGCTCATGTGGACACAGCTG---AGATGATACTATGTAGCAAATTCCCAATAATTCTCATGAACACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCATAGAAATTATAATaaatcacttaatattt-gtttgggaaggtgctttataaagttatagtgtatatgaatat---------------------------------------------------------------------------aactaatagttgtgaattcagagctgtgagaataaagcaaaaaaaatcacactgtgtttgagtcagc-aatctttagatttctatctagtcttcctacccagtcCATAAATTCTAAGTATAATCCTAGTACTCGCTCTCAAGTTTAAGTTAAATGCT s panTro4.chrUn_GL393519 22712 328 + 413329 AGACAAGGTGACAGCTAGCTCATGTGGACACAGCTG---AGATGATACTATGTAGCAAATTCTCAATAATTCTAATGAACGCTTGGAAAGTCAATTCTACAAT-AAGTCATAGAAATTATAATAAATCACTTAATA-----TTTGGGAAGGTGCTTTATAAAGTTATAGTGTATATGAATAT---------------------------------------------------------------------------AACTAATAGTTGTGAATTCAGAGCTGTGACAATAAAGC-AAAAAAATCACACTGTGTTTGAGTCAGC-AATATTTAGATTTCTATCTAGTCTTCCTACCCAGTCCATAAATTCTAAGTATAATCCTAGTACTCGCTCTCAAGTTTAAGTTAAATGCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276386 326 - 108868599 AGACAAGGTGAC----AGCTCATGTGGACAAAGCTA---AGGTGATACTATGTAGCAAATTCTC---AATTCTCATGAACACATGGAAAGTCAGTTCTATAAT-AAGTCAGAGAAATTATAATAAATCACTTAATACTTGGTTTGGGCAGGTGCTTTCTAAAGTTATAGTGCATATGAATTT---------------------------------------------------------------------------AACTAATAGTTGTGAAGTCACAGCTGTGACAATAAAGC-AAAGAAACCACATTGTGTTTGAGTCAGC-TATCTTTAGATTTCCATCTAGTCTTCCTACCCACTCCGTAAATTCTAACTATAATCCTGGTACTCACTCTCAAGTTTATGTTAAACACT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77080764 325 - 143122389 AGACAAGGTGACAGCTAGTTCATGTGGACACAGCTG---AGATGATACTATGTAGCAAATTCTCAATAATTCTCATGAACACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCATAGAAATTATAATAAATCACTTAGTATTT-GTTTGGGAAGGTGCT--------TTGTAGTATATATGAATAT---------------------------------------------------------------------------AACTTATAGTTGTGAATTCAGAGCTGTGACAATAAAGC-AAAAAAGCCACACCGTGTTTGAGTCAGCAAATTTTTAGATTTCTATCTAGTCTTCCTACCCAGTCCATAAATTCTAAGTATAATCCTAGTACTCACTCTCAAGTTTATGTTAAATGCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579277 333 - 95678458 AGACAAGGTGACAGATAGTTCATGTGGACACAGCTG---AGATGTTACTATGTAGCAAATTCTCAATAATTCTCATGAGCACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCAAAGAAATTACAATCAATCACTTAATATTTGGTTTGGGAAGGTGCTTTCTAAAGTTATAGTGCATACGAATAT---------------------------------------------------------------------------AACTCATAGTTGTGGATTCAGAGCTGTGACAATAAAGC-AATGAAACCATGATGTGTTTGAGTCAGT-GATCTTTAGATTTCTACCTAGTCTTCCTACCCAGTCTGTAAATCCTAAGTATAATCCTGGTACTCACTCTCAAGTTTACATTAATTACT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532074 333 + 96509753 AGACAAGGTGACAGATAGTTCATGTGGACACAGCTG---AGATGTTACTATGTAGCAAATTCTCAATAATTCTCATGAACACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCAAAGAAATTACAATaaatcacttaatatttggtttgggaaggtgctttctaaagttatagtgcatatgaatat---------------------------------------------------------------------------aactcatagttgtggattcagagctgtgacaataaagc-aatgaaaccatgatgtgtttgagtcagT-GATCTTTAGATTTCTACCTAGTCTTCCTACCCAGTCTGTAAATCCTAAGTATAATCCTGGTACTCACTCTCAAGTTTACATTAATTACT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32625461 333 - 90941950 AGACAAGGTGACAGATAGCTCTTGTGGACACAGCTG---AGATGTTACTATGTAGCAAATTCTCAATAATTCTCATGAGCACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCAAAGAAATTATAATCAATCACTTAATATTTGGTTTGGGAAGGTGCTTTCTAAAGTTATAGTGCATACGAATAT---------------------------------------------------------------------------AATTCATAGTTGTGAATTCAGAGATGTGACAATAAAGC-AATGAAACTACACTGTGTTTGGGTCAGT-AATCGTTAGATTTCTATCTCATCTTCCTACCCGTTCTGTAAATTCTAAGTATAATCTTGGTACTCACTCTCAAGTTTACGTTAAATACT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37977096 333 - 90373283 AGACAAGGTGACAGATAGCTCTTGTGGACACAGCTG---AGCTGTTACTATGTAGCAAATTCTCAGTAATTCTCATGAGCACTTGGAAAGTCAATTCTATAAT-AAGTCAAAGAAATTATAATaaatcacttaatatttggtttgggaaggtgctttctaaacttatagtgcatatgaatat---------------------------------------------------------------------------aattcatacttgtgaactcagagatgtgacaataaagc-aatgaaactacactgtgTTTGAGTCAGT-AATCTTTAGATTTCTATCTCATCTTCCTACCCGGCCTGTAAATTCTAAGTATAATCTTGGTACTCACTCTCAAGTTTACGTTAAATACT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10131856 395 + 96796970 ACACAAAGTGATGGATAGCTCATGTGGACATGGCTG---AGATGATACTATGCAGAAAATTCTCAATAATTCTTATAAACACTTGGATAGTCAATTCTATAATAAAGTGATAGAAATGATAAGAAATCACT----------ATTTGAATGGTGCTTTTTAAAGCTATAGTGtatatgtatatatatatgtgtgtgtgtgtatatatgtatatacatatgtgtgtatatatatatgttttatatatatacatatGAAAAACTAATAGTTGTGAATTCAGAGCAGTGAAAATAGAGC-AAAGAAACCACACTGTGTTGGAGTTCAG-AATCTTTAAATTCCTATCTAGTTTTCCCATCTAGTTCCTATTTTCTAAATATAATCCTGGTA----CTCTCAAGTTTACATTAAATACT i calJac3.chr16 C 0 I 1151 s canFam3.chr2 81145353 328 - 85426708 AAACAAGG----AGATGGACTATGCCTACACAGCTGAGAAGAGGACACTATGTAGTAAATTCTCAATGATTCCAATTACTGCTGGGAAAGTCAACTCCAAAATAAAGTCATAGCGAATATAGGAAATATCTTAATATTCTGTTTGGGAAGGTGCTTTTGTTTGTTACAGTGAATAT-AGTGT---------------------------------------------------------------------------GACCAATACTTATGAATTTAGAGCTATAAAAATAAAGC-TAAGAAACTACGTCGT----GAGTAAAC-AATCTTTACATCTCTACCTAGTTTTCCCAACTGGTCCCCAAATTCTAAATCTAATCCCGCTACCCACTCTCAAGTGAAAGCTGAATACG i canFam3.chr2 I 899 C 0 a score=322731.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182386 115 + 478999 AGCCTATACAAAAAATACTCTTTCTCTTACTTCTTTTTTGTTATTTATATGTTGCTTTGTTTAAAGGAAGAACACAAAAATGCCCTGCTAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGCTGCAGGCT s panTro4.chrUn_GL393519 23040 115 + 413329 AGCCTATACAAAAAACACTCTTTCTCTTACTTCTTTTTTGTTATTTATATGTTGCTTTGTTTAAAGGAAGAACACAAAAGTGCCCTGCTAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGCTGCAGGCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276712 110 - 108868599 AGCCTATACAAAAAACACTCTCTTTCTT-----CATTTTGTTATTTATATATTGCTTTGTTTAAAGGAAGAACACAAAAATGCCCTGATAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGCTACAGGCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081089 109 - 143122389 AGCCTATACAAAAAACAC------TCTTACTTCTTTTTTGTTATTTATATGTTGCTTTGTTTAAAGGAAGAACACAAAAATGCCCTGCTAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGCTGCAGGCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579610 114 - 95678458 AGCCTATACAAAAAACACTCTTTCTCTTGCTT-CTTTTTGTTATTTATATGTTGCTTTGCTTAAAGAAAGAACACAAAAATGCCCTGCTAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGTTGCAGGCA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532407 114 + 96509753 AGCCTATACAAAAAACACTCTTTCTCTTGCTT-CTTTTTGTTATTTATATGTTGCTTTGCTTAAAGAAAGAACACAAAAATGCCCTGCTAAAG-GG-ATTCT-GTTTGGTTGCAGGCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32625794 113 - 90941950 AGTCTATa-aaaaaaCACTCTTTCTCttactt-ctttttgttatttatatgttgatgtttttaaaggaagaacaCAAAAATGCCCCACTGAAG-GG-ATTCT-GTTTGGTTGCAGGCT i papAnu2.chr10 C 0 M 1121 s chlSab2.chr2 37977429 114 - 90373283 AGCCTATA-AAAAAACACTCTTTCTCTTACTT-CTTTTTGTTATTTATATGTTGCTGTTATTAAAGGAAGAACACAAAAATACCCCACTGAAG-GG-ATTCTAGTTTGGTTGCAGGCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10133402 110 + 96796970 AGCCTATA-CAAAAATGCTCTTTCTCTTC----CTTTTTCTGATTTATATGTCACTTTGGTTAAAG-AAGAACATAGAAATCCCCTGCTAAAATGG-GTTCT-ATTTGGTTGCAGGCT i calJac3.chr16 I 1151 C 0 s canFam3.chr2 81145681 112 - 85426708 AGCCTA---AAAGAAATTATTTCCTCCTAATT-CTCTTTCTTATTTATATGTGGCTTTGGTTAGAGGAAGAATGCAAAAATGTCTTGCTGAAA-GATGCTCT-GTTTGGTGGTAGGTT i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=273197.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182501 115 + 478999 GCAAGAGGGGAA-AAACACAAAGCACATTTTG-CAGAAAATGATTTTTTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGACTTTGCTGTGCTTCCTTAAT s panTro4.chrUn_GL393519 23155 115 + 413329 GCAAGAGGGGAA-AAACACAAAGCACATTTTG-CAGAAAATGATTTTTTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCGCTCTAGGACTGATTTTGCTGTGATTCCTTAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276822 114 - 108868599 GCAAGA-GGGAA-AAACACAAAGCACATTTTG-CAGAAAATGATTTTGTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGCCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGAATTTGCTGTGCTGCCTTAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081198 114 - 143122389 GCAAGA-GGGGA-AAACACAGAGCACATTTTG-CAGAAAATGATTTTTTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGACTTTGCTGTGCTTCCTTAAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579724 115 - 95678458 TCAAGAGGGGAA-AAACAGAAAGCATATTTTG-CAGAAAATGGTATTTTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGAATTTGCTGTGCTTCTTTAAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532521 115 + 96509753 TCAAGAGGGGAA-AAACAGAAAGCATATTTTG-CAGAAAATGGTATTTTAGAAGTCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGAATTTGCTGTGCTTCTTTGAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37977543 115 - 90373283 ACAAGAGGGGAA-AAACAGAAAGCACATTTTG-CAGAAAGTGGTATTTTAGAAATCAGAACTATGACATGAAGTCAAGCAGGGCACTCTAGGACTGAATTTGCTGTGCTTCTTTAAT i chlSab2.chr2 C 0 N 0 s calJac3.chr16 10133512 115 + 96796970 GCAAGAGGGGAAGAAACACAGAGCACGTTTTG-CA-AAAATAATATTTTAGAAGTCTGAACTACGACATGAAGCCAAACAGGGCACCCTAGGACTGAATTTGCCGTACTTCTTTAAT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81145793 104 - 85426708 GCATGAAAGGAGTAAACACAAAGTAAATTTTACCACAAAATTATTTTTGAAAAATCAGAACTATG--GTGAAATCATG-AGGAC--------ACTGAACTCTCTCTGATTCTTTA-- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=133268.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182616 51 + 478999 ATGCTCCTTGCTCTCTTTCTTTTCTGGAAGCTGTGACTCACACAGGTCATG s panTro4.chrUn_GL393519 23270 51 + 413329 ATGCTCCTTGCTCTCTTTCTTTTCTGGAAGCTGTGACTCACACAGGTCATG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276936 49 - 108868599 ACGCTCCTTG--CTCTTTCTTTTCTGGCAGCTGTGACTCACACAGGTCATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081312 51 - 143122389 ATGCTCCTTGCTCTCTTTCTTTCCTGGCAGCTGTGACTCACACAGGTCATG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35579839 51 - 95678458 ACACTCCTTGCTCTCTTTCTTTTCTGGCAGCCATGACTCACACAGGTCATG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532636 51 + 96509753 ACACTCCTTGCTCTCTTTCTTTTCTGGCAGCCATGACTCACACAGGTCATG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789161 51 - 90373283 ATGCTGCTTGCTCTCTTTCTTTTCTGGTGGCTGTGACTCACACAGGTCATG i chlSab2.chr2 N 0 C 0 s calJac3.chr16 10133627 51 + 96796970 ACGTTTCTTGCTTTCTTTGTTTTCTGGCAGCTGTGACTCACACAGGTCATG i calJac3.chr16 C 0 I 318 s canFam3.chr2 81145897 46 - 85426708 -----CCTTTTTTGCTCTGTTTTCTAGTAGCAGTGATTCACACAGGCCATG i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=2800.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182667 1 + 478999 G s panTro4.chrUn_GL393519 23321 1 + 413329 G i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90276985 1 - 108868599 G i ponAbe2.chr14 C 0 I 317 s nomLeu3.chr5 77081363 1 - 143122389 G i nomLeu3.chr5 C 0 I 318 s rheMac3.chr10 35579890 1 - 95678458 G i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36532687 1 + 96509753 G i macFas5.chr10 C 0 I 318 s chlSab2.chr2 37789212 1 - 90373283 G i chlSab2.chr2 C 0 I 319 s canFam3.chr2 81145943 1 - 85426708 G i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M e calJac3.chr16 10133678 318 + 96796970 I a score=4592.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182668 3 + 478999 AGA--- s panTro4.chrUn_GL393519 23322 3 + 413329 AGA--- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90277303 3 - 108868599 AGA--- i ponAbe2.chr14 I 317 C 0 s nomLeu3.chr5 77081682 3 - 143122389 AGA--- i nomLeu3.chr5 I 318 C 0 s rheMac3.chr10 35579891 3 - 95678458 AGA--- i rheMac3.chr10 C 0 I 312 s macFas5.chr10 36533006 3 + 96509753 AGA--- i macFas5.chr10 I 318 C 0 s chlSab2.chr2 37789532 3 - 90373283 AGA--- i chlSab2.chr2 I 319 C 0 s calJac3.chr16 10133996 3 + 96796970 aga--- i calJac3.chr16 I 318 C 0 s canFam3.chr2 81145944 6 - 85426708 AGCATA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=75463.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182671 43 + 478999 AAATTTCATACTCCTTCCTCATGCCCAGCTTAAATACTAGTGT s panTro4.chrUn_GL393519 23325 43 + 413329 AAATTTCCTACTCCTTCCTCATGTCCAGGTTAAATACTAGTGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90277306 43 - 108868599 AAATTTCCTACTCCTTCCTCACGTCCAGGTTAAATACTAGTGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081685 43 - 143122389 AAATTTCCTACTCCTTCCTCATGTCCATGTTAAATACAACTGT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36533009 43 + 96509753 AAATTTCCTACTCCTTCCTCATGTCCAGGTTAAATACTAGTGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789535 43 - 90373283 AAATTTCCTACTCCTTCCTCATGTCCAAGTTAAATACTAGTGT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10133999 43 + 96796970 aaacttcctactccttcctcatgtccaggttaaatactaatac i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81145950 37 - 85426708 GAATTCTCTA------ACTGAAACATAGCTCCAATATTAATAT i canFam3.chr2 C 0 I 26010 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35579894 312 - 95678458 I a score=225146.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182714 172 + 478999 ACAACGTGGAAACCTGTAAATTATCTGACATTTCTCTCTGTCCTCCAAACCTTTCTCATTCAATTATCACTAAATCATATTGACTATACCTCTCTTCTGCCTCTGCTTTATATTACCACTTCCACTGAGAACATAAACATTTACAAAATGGCTTTTATTA--CAAAAAAGCCTT s panTro4.chrUn_GL393519 23368 170 + 413329 ACAACGTGGaaacctgtaaattatctgacatt--tctctgtcccccaaacctttctcattcaattatcactaaatcatattgactatacctCTCTTCTTCCTCTGCTTTATATTACCACTGCCACTGAGAACATAAACATTTACAAAATGGCTTTTATTA--CAAACAACCCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90277349 172 - 108868599 ACAACCTGGAAACCTGTAAATTATCTGACATTTCTCTCTGTCCCCCAAGCCTTTCTTATTCAATTATCACTAAATCATATTGACGATACCTCTCTTCTGCCTCCGTTTTGTATTCCCATTGCCACTGGGAACATAAACACTTACAAAATGGGTTTTATTT--AAAAGAAAACTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081728 103 - 143122389 ACAACGTCGAAATCTGTAAATTATCTGACATTTATCTCTGTCCCCCAAACCTTTCTCACTCAATTATCATTAAATCATATTGACTATACCTCTCTTCTAC-----------------------------------------------------------------------CTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36533052 171 + 96509753 ACGACCTGGAAACCTGTAAATCATCTGACATTTCTCTCGGTCCCCCAAGCCTTTCTCATTCAATTATCACTAAATCATATTAATTATACCTCTCTTCTGCCTCTGCTTTATATTCCCACTGCCACTGGGAACATAAAC-TTTACAAAATGGCTCTTATTT--AAAAGAAAACCG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789578 172 - 90373283 ACAACCTGGAAACCTGTAAATCATCTGACATTTCTCTCGGTCCCCCAAGCCTTTCTCATTCAATTATCACTAAATCATATGGACTATACCTCTCTTCTGCCTCTGCTTTATATTCCCACTGCCACTGGGAACATAAACATTTACAAAATGGCTTTTATTT--AAAAGAAAACCG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10134042 174 + 96796970 acaacctggaaacctgtgaatcatctgagatttttctctgtcccccaaacttttctcattcaggcatcaccaaatcatgttgactatacctCTCTTCTGCCTCTGCTTTATATTCCCACTGCTACTGGGAACATAAGCATTTACAAAATGGCTTTTATTTAAAAAAAAAAACCG i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81145987 26010 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M e rheMac3.chr10 35579894 312 - 95678458 I a score=125639.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182886 71 + 478999 CCAACTATTAATGTTATTTCTTACATG---AA--AAAAA-----TTAAGCAAAACAAATGAAAAAAGCATAACACCAAAA-------A s panTro4.chrUn_GL393519 23538 71 + 413329 CCAACTATTAATGTTATTTCTTACATG---AA--AAAAA-----TTAAGCAAAACAAATGAAAAAAGCATAACACCAAAA-------A i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90277521 81 - 108868599 CCAACTATTAATGTTATTTCTTACATGAAAAA--AAAAA-----TTAAGCAAAACAAATGAAAAAGGCATAACACCAAAAAAAAAACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081831 70 - 143122389 CCAACTATTAATGTTATTTCTTACATG---AA--AAAAA-----TTAAGCAAAACAAGTGAAAAAA-CATAACATCAAAA-------A i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35580206 77 - 95678458 CCAGCTATTAATGTTAGCTCTTACATG---AAATAAAAA-----GTAAGCAAAACAAATAAAAAAGGCATAACACCATAA---AAACA i rheMac3.chr10 I 312 C 0 s macFas5.chr10 36533223 77 + 96509753 CCAGCTATTAATGTTAGCTCTTACATG---AAATAAAAA-----GTAAGCAAAACAAATAAAAAAGGCATAACACCATAA---AAACA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789750 63 - 90373283 CCAACTATTAATGTTATTTCTT-CATG---AA--AAAAA-----TTAAGCAAAACAAATGAAAAAGGCAT--------------AACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10134216 75 + 96796970 CCAACTATCAATGTTATTTCTTACATG---AA--AAAAAACAATTTAAGCAAAACAAATGAAAAAGGCAAAACACCAAAA-------- i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81145987 26010 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=362369.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 182957 159 + 478999 AAGGCCAACACATTAAAATGAGT-AACGGAGATTCCAAAC----TTTATTTCACCATGGGCAGGTGAAAACCTTAGAATACATTGAT-ACTAGTCCAAGGATGTGTGACATGGAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGCTTCCTTTGTCTCCTGGTTTCTTTACA- s panTro4.chrUn_GL393519 23609 159 + 413329 AAGGCCAACACATTAAAATGAGT-AACTGAGATTCCAAAC----TTTATTTTGCCACGGGCAGGTGAAAACCCTAGAATACATTGAT-ACTAGTCCAAGGATGTATGACATGGAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGCTTCCTTTGTCTCCTGGTTTCTTTACA- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 1771 s ponAbe2.chr14 90277602 163 - 108868599 AAGGCCAACATATTAAAATGAGT-AATAGAGATTCTTAACTTTATTTATTTCACTATGGACGGGTGAAAACCTTGTAATACATTGAT-GCTACTCCAAGGATGTCTGACAAGGAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGCTTCCTTTGTCTCCTGGTTTCTTTACA- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77081901 159 - 143122389 AAGGCCAACGCATTAAAATGAGT-AACTGAGATTCCAAAC----TTTATTTCACCATGGACAGGTGAAAACCTTATAATACATTGAT-ACTAGTCCAAGGACGTGTGACATGGAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGCTTCCTTTGTCTCCTGGTTTCTTTTCA- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35580283 159 - 95678458 AAGGCCAACATATTAAAATGAGT-AACTGAGATTCCTAAC----TTTATTCCACCATGGATGGGTGAAAACCTTATAATACATTGAT-ACTAGTCCAAGGATGTGTGACGAGCAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGTTTCCTTTGTCTCCTGGTTTCTTTACA- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36533300 159 + 96509753 AAGACCAACATATTAAAATGAGT-AACTGAGATTCCTAAC----TTTATTTCACCACGGATAGGTGAAAACCTTATAATACATTGAT-ACTAGTCCAAGGATGTGGGACAAGCAAACTATAGCTGACTACTGCAAAAGTTTCTTTTGTCTCCTGGTTTCTTTACA- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789813 163 - 90373283 AAGGCCAACATATTAAAATGAGT-AACTGAGATTCCTAACGTTATTTATTTCACCACGGATGGGTGAAAACCTTATAATACACTGATAACTGGTCCAAGGATGTGTGACAAGCAAACTATAGTTGACTACTGCAAAAGCTTCCTTTGTCTCC-AGTTTCTTTACA- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10134291 163 + 96796970 AAGGCCAACATTTCAAAATGAAT-AACTGAGATTCTTAACTTTATTTTTTTCACCACGGATGGGTGAAAATCTTATAATACACTGAT-ACCAGTCCAAGGATGTGTAACAAGGAAACATTAGCCgattactgcgaaagcttcctttgtctcctgctttctttacc- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81171997 130 - 85426708 AAGAACAACATTTTAAATGGAATGAATTGAGCCTCCTGAC----TT--GTTCAGTAGAGAGGGCTGAAAATTTCAAAATGGACTGAT-ACTTGGCTAAGGAAAT-----------------------------AAAAGCTTCCTTTGTCTTCCAGTATCTTTAACT i canFam3.chr2 I 26010 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=81009.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 183116 42 + 478999 TGGT----TATCTTCCATCAATCC--------------cagcaaactataggccacagga s panTro4.chrUn_GL393519 25539 42 + 413329 tggT----TATCTTCCATCAATCC--------------cagcaaactataggccacaggc i panTro4.chrUn_GL393519 I 1771 C 0 s ponAbe2.chr14 90277765 46 - 108868599 TGGTAAAGAACCTTCCAACAATCC--------------cagcaaactacaggttacagac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77082060 42 - 143122389 TGGT----TATCTTCCATCAGTCC--------------cagcaaactataggccacaggc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35580442 42 - 95678458 AGGT----TATATTCCATCAATCC--------------cagcaaactataggccacagtc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36533459 42 + 96509753 AGGT----TATATTCCATCAATCC--------------cagcaaactataggccacagtc i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37789976 42 - 90373283 TGGT----AACGTTCCATTATTCC--------------caacaaactagaagccacaggc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10134454 54 + 96796970 tggt----taccttccatcaatcctc--tatgaggggtcaaaaaactacaggccacaggc i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81172127 55 - 85426708 TGGT----ATTCTTCAATCTATCCTCCACACGAGACACCTgcaaactat-ggccacaggc i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32625907 1121 - 90941950 M a score=1802937.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 183158 621 + 478999 caaatccaatctgccttttggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcatgcctgtttgcttacata-taatcatggtggctttcacactacaacaacagacaacagcctggttaagtagatatgacagagaccacatagtctaaaatatttcccacctggtcctttacagaaaaagcttgctaa--ccc--ATTTTacaccataagcagaatatgccttaatattcaaatttaatcttgtaactcccctgctcaaatttctccaatgAGCCCCtgcagcacacattgttggct-cct-atcaatagccattccttattct---ttcttgcagaagaaacacaagtctattgggatatttattatcccaatcc--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaatgtttattctaagctaatcat-gt------atttgccatcccattgcctggtttgggaatgagcatgtggtgtgacccagccaatgaaatgttacaggaagccccttgcatgcttctaagttttctccctgtttaaaagacacatgtgaagaaaagcagccctt-------gaaatgttgtgttgtgagaacaagatgtttggagctgctgcggattagccaaccacaaaaggaaacatgaa s panTro4.chrUn_GL393519 25581 621 + 413329 caaatccaatctgccttttggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcatgcctgtttgcttacata-taatcatggtggctttcacactacaacaacagacaacagcctggttaagtagatatgacagagaccacatagtctaaaatatttcccacctggtcctttacagaaaaagcttactaa--ccc--ATTTTacaccataagcagaatatgccttaatattcaaatttaatcttgtaactcccctgctcaaatttctccaatgAGCCCCtgcagcacacattgttggct-cct-atcaatagccattccttattct---ttcttggagaagaaacacaagtctattgggatatttattatcccaatcc--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaatgtttattctaagctaatcat-gt------atttgccatcccattgcctggtttgggaatgagcatgtggtgtgacccagccaatgaaatgttacaggaagccccttgcatgcttctaagttttctccctgtttaaaagacacatgtgaagaaaagcagccctt-------gaaatgttgtgttgtgagaacaagatgtttggagctgctgcggattagccaaccatgaaaggagacatgaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90277811 525 - 108868599 caaatccaatctgccttacggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcatgcctgtttgctcacata-tactcatggtggctttcacactacaacagcagacaacagcagggttaagtagacacgacagagaccacatagtctaaaatatttcccacctggtcctttacagaaaaagcttgctaa--ccc--ATTTTacaccataaccaga--atgccttaatacccaaatttaatcttgtgactcccctgctcaaatttctccaatgAGCCCCtgcagcacacaatgttggctccct-accaatagccattccttattct---ttcttgcagaagaaacacaagtctattgggatatttattatcccaatcc--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaatgtttattctaagctaatcag-gt------atttgccttcccagtgcctggtttgggaatgagcaggtaccgtgacccagccaatgaaatgttacaggaagcctcttgcatgcttcaaagttttcTCCCAGTT------------------------------------------------------------------------------------------------------ACGTGAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77082102 621 - 143122389 caaatccaatctgccttgtggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcatgcctgtttgcttacata-taatcatggtggctttcacactacaacaacagacaacagccttgttaagtagatctgacagagatcacacagtctaaaacatttcccacctgg-cctttacagagaaagcttgctaa--ccc--ATTTTATACCATAAGTAGAATATGCCTTAATACTCAAATTTAATCTTGTGACTTCCCTGCTCAAATTTCTCCAATGAGCCCCTGCAGCACACATTGTTGGCTCCCT-ACCAATAGTCATTCCTTATTCT---TTCTTGCAGAAGAAACACAACTCTATTGGGATATTTATTATCCCAATCc--------------cccatctcagcctcagaaagagaaatgtttattctaagctaatcat-gt------attcgccttcccagtgcctggtttgggaataagcatgtggtgtgacccagccaatgaaatgttacaggaagccccttgcattcttctaagttttctccctgtttaaaagacacacgtgaagaaaagcagccctt-------gagatgttgtgttgtgagaacaagatgtttggagctgctgcggattagccaaccatgaaaggagacatgaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35580484 620 - 95678458 caaatccaatctgcctcatggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcaggcctatttgcttacaaa-gaatcatggtggctttcacactacaacagcagacaacagcaggggtaagtagatatgacggagaccacatagtctcaaatatttctcacctggtcctttacagaaaaagcttgctaa--ccc--ATTTTACACCATAACCAGA--ATGCCTTAATACTCAAATTTAATCTTGTGACTCCCCTGCTCCCATGTCTCCAATGAGCCCCTGCAGCAAACATTGTCGGCTCCCT-ACCAATAACCATTCCTTATTCT---TTCTTGCAGAAGAAACACAAGTCTATTGGGATATTTATTATCCCAATCT--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaacattaattctaagctaatcac-at------atttgcattcccagtacctggtttgggaatgagcaggtagtgtaacacagccaatgaaatattacaggaagccccttgtgtgcttctaagttttctgcctgtttagaagaaacaggtgaagaaaagaagccctt-------gagatgttgtgttgtgagaacaagatgtttggagctgttgcagATTAGCCAACTGTGAAAGGAGACATGAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36533501 620 + 96509753 caaatccaatctgcctcatggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcaggcctatttgcttacaaa-gaatcatggtggctttcacactacaacagcagacaacagcaggggtaagtagatatgacggagaccacatagtctcaaatatttctcacctggtcctttacagaaaaagcttgctaa--ccc--ATTTTACACCATAACCAGA--ATGCCTTAATACTCAAATTTAATCTTGTGACTCCCCTGCTCCCATGTCTCCAATGAGCCCCtgcagcaaacattgtcggctccct-accaataaccattccttattct---ttcttgcagaagaaacacaagtctattgggatatttattatcccaatct--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaacattaattctaagctaatcac-at------atttgcattcccagtacctggtttgggaatgagcaggtagtgtaacacagccaatgaaatattacaggaagccccttgtgtgcttctaagttttctgcctgtttagaagaaacaggtgaagaaaagaagccctt-------gagatgttgtgttgtgagaacaagatgtttggagctgttgcagATTAGCCAACTGTGAAAGGAGACATGAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32627036 616 - 90941950 CAAATTAAATCTG-CTTATggc--tgtaaataaagttttataggaGCTCAGTCATGCCTGTTTGCTT-CATA-GAATCATGGTGGCTTTCACTCTACAACAGCAGACAACAGCAGGGGTAAGTAGTTATGAAAGAGACCACATAGTCTAAAATATTTCCCGCCTGGTCCTTTACAGGAAAAGCTTGCTAA--CCC--ATTTTACACCATAACCAGA--ATGCCTTAATACTCAAATTTAATCTTGTGACTCCCCTGCTCCAATGTCTCCAATGAGCCCCTGCAGCAAACATTGTTCACTCTCT-ACCAATAGCCATTCCTTATTCT---TTCTTGCAGAAGAAACACAAGTCTATTGGGATGTTTATTATCCCaatct--------------ccctcctcagcctcagaaaGAGAAACGTTAATTCTAAGCTAATCAC-GT------ATTTGCATTCCCAGTGCCTGGTTTGGGAATGAGCAGGTAGTGTAACACAACCAATGAAATGTTACAGGAAGCCCCTTGTGTGCTTCTAAGTTTTCTGCCTGTTTAGAAGACACAGGTGAAGAAAAGAAGCCCTT-------GAGATGTTGTGTTGTGAGAACAAGATGTTTGGAGCTGTTGCAGATTAGTCAACCATGAAAGGAGACATGAA i papAnu2.chr10 M 1121 C 0 s chlSab2.chr2 37790018 612 - 90373283 caaatccaatatgccttatggctttgtaaataaagttttataggagctcagtcatgtctgtttgct--caca-tcatcatggtggctttcactctacaacagcagacaacagca-gggtaagtagatatgagagagaccacatagtctcaaatatttcccacctggtcctttacagaaaaagcttgctaa--ccT--GTTTTacaccataaccaga--atgccttaatactcaaatttaatcttgtgactcccctgctcaaatgtctccaatgAGTCTCtgcagcaaacactgttggctccct-accagtagcca----ttattct---ttcttgcagaagaaacac-agtctattgggatatttattatttcaatcc--------------ccctcctcagcctcagaaagagaaaagtttattctaagctaatcac-at------atttggcttcccagtccctggcttgggaaagagcatgtagtgtgacccagccaatgaaatgttacaggaagccccttgcatgctcctaagttttctccctgtttaaaagacacatgcgaagaaaagcagccttt-------gcgatgttgtgctgtgagaacaagatgtttggagctgttgcggattagccaaccatgaaaggagacatgaa i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10134508 610 + 96796970 caaatccagtctgtcttacggctttgtaaataaagtttcattggcactcagtcatgcctacttgcttacatattattcagggtggctttcacactgcaacagtag----------tgttacgtagatttgacagagaccacatagtctaaaatatttcccacatgttccttcacag-aaaagcttgccaa--cccctgttttacaccataacctga--agggcttactgctccagtttaatcttgtgactcccctgctcaaatttctccagtgagtccctatAGCAAACACTGCTGGCTCCCT-ACCAATACCCATTCCTTATTCT---TTCTTGCAGAAGAAACACAGGTCTATTGGGAAATTTATTATCCCAATAT--------------ccctcccgagcttcagaaagag-aatgattgttctaagctaattac-ataattacatttgctttcccagtgtctggtttggg-------atgcggtgtggtccagccaatgaaatgttacgggaagtccactgcatgcttctgagttttctccctatttaaaagatccatttaaagaaaagcagccctg-------gtgaggttgtgttgtgagaacaagatgtttggagttgttgcgaattagccaaccatgaaaggagacacgaa i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81172182 607 - 85426708 caaatccaacctgccatctggttctgtaaataaagttgtaatggagcacagtcacatctatttcaatacata-ttgctatggctactttcacacgacaatggcaga-----------------------gtgtgagaccccagggcctaaaatattcactatctggcccttttaag-aaaagcctggtgatcccC--ATTTTATGCCATAACCAAA--GGGCCCTAAT--TCAAATCTAATCTGATTACTCTTCTATTTCAAATTCTCCTATCAATCCctgc------------tggctccctccccaacagccattccatattcttcattcttgctggagaaccacagctttatttggatagttagtgtcccaatacacaaagaatgtggtctcgccccagctgcaaaaggagaaaggattattctaagctaatcacagt------acctgacttaccagtgactggtttaggaacaagcaagtcatgttacctagcctataaaatgttaggggaagtttactgcaagctgctgagttttcttcctatataaaagaaacacaaagacaaacacagttcttctggtcatggatattgtcatgtgaaaat---atgcctgaagctgttgcTAATTAGCCAAGCAGGAAAAGAGACAggga i canFam3.chr2 C 0 I 162 a score=1058974.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 183779 382 + 478999 gaaaacactgccaacagcacagctgaaagagggaCAAATGGGATCC-TAGGATATCACTGAACAACCAAAACAACTCTGGTTCCTACTGTTTTAGCCACTGCTCATCTAGTATTTACAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAATTTCCCATGGCCCACAGGGTAAGACCTACTCATTTCTATAGTATTAAAAAAGTCTATCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAAACTCTGGTGTCTCACACTTTTGGTACTAGCAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCACTC-GGCATCTTGTCTTTTGCAGTTGTTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCATCAGATGTT-CTTCTGGCAAACACACAA s panTro4.chrUn_GL393519 26202 382 + 413329 gaaaacactgccaacagcacagctgaaagagggacaaatgggatcc-tAGGATATCACTGAACAACCAAAACAACTCTGGTTCCTACTGTTTTAGCCACTGCTCATCTAGTATTTACAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAATTTCCCATGGCCCACAGGGTAAGACCTACTCATTTCTATAGTATTAAAAAAGTCTATCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCCACCTCTGGTGTCTCACACTTTTGGTACTAGCAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAATTTCACTC-GGCATCTTGTCCTTTGCACTTGTTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCATTAGATGTT-CTTCTGGCAAACACACAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90278336 379 - 108868599 TAAAACACTGCCAACAGCACAGCTGAAAGAGGGACAGGTGGGATCC-TAGGATATCACTCAACAA-AAAAACAACTCTGGTTC---CTGTTTTAGCCACTGCTCATCTAGTATTTGCAGTCCGAAGCATTCTACCTGGTAAACTTCCCATGGCCCACAGGATAAGACCTACTCATTTCTATAGTATT-AAAAAGTCTATCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAACCTCTGGTATCTCACACTTTTGGTACTAGCAAAAGTGAATTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCATTCAAGCATCTTGTCTTTTGCACTTGCTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCATTAGATGTTCCTTCTGGCAAACACACAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77082723 371 - 143122389 taaaacactgccaacagcacagctgaaagagggaCAAGTGGGATCA-TAGGATATCACTGAACAACCAAAACAACTCTGGTTCCTACTGTTTTAGCCACTGCTCATCTAGTATTTACAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAATTTCCCATGGCCCACAGGATAAGACCTACTCATTCCTATAGTATTAAAAAAGTCTATTATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAACATCTGGTGTCTCACACTTTTGGTACTAGCAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCACTCAAGCATCTTACCTTTTGCA---------CTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCATTAGATGTT----CTGGCAAACACACAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35581104 380 - 95678458 TAAAACACTGTCAACAGCACA---GAAAGAGGGACAAGAGGGATCCCTAGGATATCACTTAACAAACAAAACAACTCTGGTTCCTACTGTTTTCGCCACTGCTCATC-AGTATTTGCAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAACTTCTCATGGCCCACAGGATAAGACCTGCTCATTTCTGTAGTATT-AAAAAGTCTGTCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAACCTCTGGTATCTCACACTTTTGGTGCTAGCAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCACTCAAGCATCTTGTCTTTTGCACTTGCTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCCTTAGATGTTCCTTCTGGCCAACACACAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36534121 380 + 96509753 TAAAACACTGTCAACAGCACA---GAAAGAGGGACAAGAGGGATCCCTAGGATATCACTTAACAAACAAAACAACTCTGGTTCCTACTGTTTTCGCCACTGCTCATC-AGTATTTGCAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAACTTCTCATGGCCCACAGGATAAGACCTGCTCATTTCTGTAGTATT-AAAAAGTCTGTCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAACCTCTGGTATCTCACACTTTTGGTGCTAGCAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCACTCAAGCATCTTGTCTTTTGCACTTGCTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCCTTAGATGTTCCTTCTGGCCAACACACAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32627652 380 - 90941950 TAAAACACTGTCGACAGCACA---GAAAGAGGGACAAGAGGGATCCCTAGGATATcactgaacaaacaaaacaactctgGTTCCTACTGTTTTCACCACTGCTCATC-AGTATTTGCAGTCCAAAGCATTCTACCTGGTAAACTTCCCATGGCCCACAGGATAAAACCTACTCATTTCTGTAGTATT-AAAAAGTCTGTCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCTCATTCCCAACCTCTGGTATCTCACACTTTTGGTGCTAACAAAAGTGAACTGCTCAGAAACCCTGCAAAGTTCACTCAAGCATCTTGTCTTTTGCACTTGCTGCTCTTCCTGCCAAACAGGCAATCTCCTTAGATGTTCCTTCTGGCCAACACACAA i papAnu2.chr10 C 0 I 102 s chlSab2.chr2 37790630 384 - 90373283 taaaacacggccaacagcacagctgaaagagggtaaagtgagatccttaggaaatcactgaacaaacaaaacaactctggTTCCTACTGTTTTGGCCCCTGTTCATCTAGTATTTGCAGTCCAAAGCATTCTACCGGGTCAATTTCCCATGGCCCACAGGGTAAGACCTACTCATTTCTGTAGTATT-AAAAAGTCTATCAGAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCACCACATTCCCAACCTCTCATATCTCACATTTTTGGTGCTAGCAAAAGTGAACTCCTCAGAAACCCTGCCATGCTCACTCAAACATCTTGTCTTCTGCACTTGCTGCTCTTCCTCCCAAACAGGCAATCTCGTTAGATGTTCCTTCTGGCAAACACACAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10135118 380 + 96796970 caagacactgccaacagcacagatgaaagagggacacaagggatcc-tAAAGTATCACTGAACAACCAAAACAACTCTGGTTCCTACAGTTTTAGCCACTGCTCATT-AGTCTTTGCAGCCCAAAGCATTCTACCTGGTAAATTTCCCATGGCCCACAGGATAAGAGCTACTCATTTCCTTAGTATT-AAAAAGTCTATCATAAACTTGCCTTAGCTAAGTATTCGCCTCATTCCCAACCTCTCACATCTCAGACTTTTCAAAATAGC-AAAGTGAACTGCTCAAAAACCCTGCAAAGTTCACGC-AGCGTCTTGCCTTTTGCACTTGCTGCTCTTCCTCCCAAACGGGCAGTATCATTAGGTGTTTCTTCTGCCAAACCCACAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81172789 162 - 85426708 I a score=689902.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 184161 350 + 478999 ACTTGTTGCATGTTCCTCCTGCCAAAAATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTCTCACTCTGCAGGCTTACTTTGAATCATACCTACTTTTTTTC---AAAACTTTCATTCCTCATCACGTATGTCTGGCACATAATTAAT-----ACATAATAAATCATAATTTT-AAGCTTCCAGTTGGCAACTAGCACACAGTAAGCACTGaataaagtagtaaaat-aat-aaaaatgacaatgataataacaaGCTCCTGTCTGTATTTTTAATTGTGTGTGTTCTGTAGCATTAG-AAAAATGATTAGTATCTAAAAGACATTTGATAG---TTATTTGTTAAGTGGACAAGTGAAAACA s panTro4.chrUn_GL393519 26584 350 + 413329 ACTTGTTGCATGTTCCTTCTGCCAAAAATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTCTCACTCTGCATGCTTACTTTGAATCATACCTACTTTTTTTC---AAAACTTTCATTCCTCATCACATATGTCTGGCACATAATTAAT-----ACATAATAAATCATAATTAT-AAGCTTCCAGTTGGCATCTAGCACACAGTAAGCACTGAATAAAGTAGTAAAAT-AAT-AAAAATGACAATGATAATAACAAGCTCCTGTCTGTATTTTTAATTGTGTGTGTTCTGTAGCATTAG-AAAAATGATTAGTATCTAAAAGACATTTGATAG---TTATTTGTTAAGTGGACAAGTGAAAACA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90278715 351 - 108868599 CCTCGTTGCGTGTTCCTTCTGCCAAACATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTCTCTCTTTGCATGCTTATCTTAAATCATACCTACTTTTTCCA---AAAATTTTCATTCCTCATTACATATGTCTGGCACATAATCAAT-----ATATAATAAATCATAATTAT-AAGCTTCCAGTGGGCATCTAGCACACAGTAAGCACTGAATAAAGTAGTAAAAT-AAT-GAAAATGACAATGATAATAACAAGCTCCTGTCTTTATTTTTAATTGTTTGTGCTCTGTAGCATTAGAAAAAATGGCTAGTATCTAAAAGACATTTGATAG---TTATTTGTTAAGTGGACAAGTGAAAATA i ponAbe2.chr14 C 0 I 1264 s nomLeu3.chr5 77083094 344 - 143122389 TATTGTTGCATGTTCCTTCTGCCAAACATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTCTCACTCTGCATGCTTATCTTGAATCATACCTACTTTTTTTC---AAAACTTTCATTCCTCATCACATATGTCTGGCACATAATTAAT-----ATATAATA------AATTAT-AAGGTTCCAGTGGGCATCTAGCACACAGTAAGCACTGAATAAAGCAGtaaaat-aat-aaaaatgacaatgataataacaaGCCCCTGTCTGTATTTTTAATTATGTGTGTTCTGTAGCATTAG-AAAAATGGTTAGTATCTAAAAGACATTTGATAG---TTGTTTGTTAAGTGGATAAGTGAAAACA i nomLeu3.chr5 C 0 I 4 s rheMac3.chr10 35581484 307 - 95678458 TCTTGTTGCATGTTCCTTCTGCCAAACATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTTTCACTCTGCATGCTTCCCTTGAATCATACCTACTTTTTTTTTTCAAAACTTTCATTCCTCATCACATATGTCTGGCACATAATCAAT-----ATATAATA------------------------------------------------TGAATGAAGTAGTAAAAT-TTTAAAAAATGACAATGATAATAACAAGctcctgtctgtatttttaattgtttgtgtttcatagcgttag-acaagtggttagtatctaaaagacatttgatag---ttatttgttaagtggacaagtGAAAACA i rheMac3.chr10 C 0 I 4 s macFas5.chr10 36534501 354 + 96509753 TCTTGTTGCATGTTCCTTCTGCCAAACATTATTCTTCTGCTTCTTT-ACCTAGAAAAATTCTTTTCACTCTGCATGCTTCCCTTGAATCATACCTACTTTTTTTTTTCAAAACTTTCATTCCTCATCACATATGTCTGGCACATAATCAAT-----ATATAATAAATTATAATTAT-AAGATTCCAGTGGGCATCTAGCACACAGTAAGCACTGAATGAAGTAGTAAAAT-TTTAAAAAATGACAATGATAATAACAAGctcctgtctgtatttttaattgtttgtgtttcatagcgttag-acaagtggttagtatctaaaagacatttgatag---ttatttgttaagtggacaagtGAAAACA i macFas5.chr10 C 0 I 4 s chlSab2.chr2 37791014 357 - 90373283 TCTCACTACATGTTCCTCCTGCCAAATATCATTCTTCTGCTTCTTT-TCCT-GAAAAACTGTTCTCACTCTGCATGCTTACCTTAAATCATAACTCCTTTCTTTTT--AAAGCTTTCATTCCTCATCACATATGTCTGGCACATAATCAGTACAGCATATAATAAATCATAATTAT-AGGCTTCCAGTGGGCATCTAGCACACAGTAAGCACTGATTAATGTAGCAAAGTAAAAAAAAAATGACAATGATAATAACAAGCTCCTATCTGTATTTTTAATAAGTTGTGTTCTGTAGGATTAG-AAAAATGCTTAGTATCTAAAATACATTTGATAG---TTATTTGTTAAGTGGACAAGTGAAAACA i chlSab2.chr2 C 0 I 4 s calJac3.chr16 10135498 359 + 96796970 TCTTGTTACGTGTTCCTTCTGCCAAACGTCATTCTTCTGCTTCTTTAACCTAGAAAACTTCTACTCACTCTGTAT-CTTTACGTAAATCCTATCTACTATTTTTT---AAAGCTTTCATTTCTCATCACATATGTCTGGCACATAATCAATATAATGTATAATAAATCATAATTATAAAGCTTACAGTGGGCATCTAACACACAGTAAGCCCTGAATAAAGTAGCAAAAT-AGT-AAAAATGACAATGATAATAACAAGCTCCTGTCTGTATTTTTAATTGTTTGTGCTCTGTAGGTTTAC-AAAAATGCTTAGTATCTAAAAGACATTTTATAGTTATTATTTGTCAAGTGGTCAAGTAAAAACA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81172789 162 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=44520.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 184511 18 + 478999 TAGAAATGTTTTCTTTGT s panTro4.chrUn_GL393519 26934 18 + 413329 TAGAAATGTTTTCTTTGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90280330 18 - 108868599 TAGAAATGTTTTCTTTGT i ponAbe2.chr14 I 1264 C 0 s nomLeu3.chr5 77083442 18 - 143122389 TAGAAATGTTTTCTTTGT i nomLeu3.chr5 I 4 C 0 s rheMac3.chr10 35581795 18 - 95678458 TAGAAATGTTTTCTTTGT i rheMac3.chr10 I 4 C 0 s macFas5.chr10 36534859 18 + 96509753 TAGAAATGTTTTCTTTGT i macFas5.chr10 I 4 C 0 s chlSab2.chr2 37791375 18 - 90373283 TAGAAATGTTTTCGTTGT i chlSab2.chr2 I 4 C 0 s calJac3.chr16 10135857 18 + 96796970 TAAAAATGTTTTCTTTGT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81172789 162 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=1183804.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 184529 491 + 478999 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATAGAGACACCTCTAT-----TATGAGCACCTT-AAAGATCAAAACTACATCTATTCCATCTTTGTCTTCTGCAACTTATAAAAC-----CTAACTTACAGAAGCTTTTTGATAAATAGATGGCTAAATTAAAGGTGTCCTCATCCAGTTTGGATTATACAATGTATTAGGTGTCCACAACCAGGTGGC-ATACTAGTatttttgttaatgtgaagcatttttctacttttattataatctgctgagcctagagttgggcaatttgtatatttattatgacaatcttttggtaaatggtagcagagcatcttgttctaacaaaatTACTGttatcaagacaattgaccagcaggtag-agaacacatcttgttcaaacaaagtaaatgtatctctttccaacttcaaatgaggaggaatcaagtcagtaagagtgagaccttgttgggacaaggatatgtaacatgacttgtgct s panTro4.chrUn_GL393519 26952 491 + 413329 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATAGAGACACCTCTAT-----TATGAGCACCTT-AAAGATCAAAACTACATCTATTCCATCTTTGTCTTCTGCAACTTATAAAAC-----CTAACTTACAGAAGCTTTTTGATAAATAGATGGCTAAATTAAAGGTGTCCTCATCCAGTTTGGATTATACAATGTATTAGGTGTCCACAAACAGGTGGC-ATACTAGTatttttgttaatgtgaagcatttttctacttttattataatctgctgagcctagagttgggcaatttgtacatttattatgacaatcttttggtaaatggtagcagagcatcttgttctaacaaaatTACTGttatcaagacaattgaccagcaggtag-agaacacatcttgttccaacaaagtaaatgtatctctttccaacttcaaatgaggaggaatgaagtcagtaagagtgagaccttgttgggacaaggatatgtaacatgacttgtgct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90280348 492 - 108868599 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATAGAGACAGTTCTAT-----TATGAGCACCTT-AAAGATTAAAACTATATCTATTCCATCTTTGTCTCCTGCAACTTATAAAAC-----CTAACTTACAGAAGCTCTTTGATAAATAGATGGCTAAATTAAAGGTGTCCTCATACAGTTTGGACTATACAATGTATTAGGTGTCCACAACCAGGTAGC-ATACTAGcatttttgttagtgtgaaacatttttctatttttatgataatctgctgagcctagagctgggcaatttgtatatttattatgaccatcttttggcaaatggtagcagagcatcttgttctaacaaaatTACTGttatcatgacaattaaccagcaggtagaagaacacatcttgttccaacaaagtaaatatatctctttccaacttcaaatgaggagaaatgaagtcagtaatagtgagaccttattgggacaagcatatgtaacatgacttgtgct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77083460 492 - 143122389 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATAGAGACAGCTCTAT-----TATGAGCACCTT-AAAGATCAAAACTACATCTATTCCATCTTTGTCTCCTGCAACTTATAAGAC-----CTAACTTACAGAAGCTCTTTGATAAATAGATGGCTAAATTAAAGGTGTCCTCATACAGTTTGGATTATACAATGTATTAAGTGTCCACAACCAGGTGGC-ATACTAGTatttttgttattgtgaaaaatttttctacttttattataatctgctgagcctagagttgggcaatttgtatatttattatgacaagcttttggtaaatggtagcagagcatcttattctaacaaaatTACTGttatcaagacaattgaccagcaggtagaagaacacatcttgttccaacaaagtaaatgtatctctttccaacttcaaatgaggaggaatgaagtcggtaatagtgagaccttgttgagacaaggatatgtaacatgacttatgct i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35581813 480 - 95678458 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATGGAGACAGCTCTAT-----TATGAACACCTT-AAGGATCAAAACTACATCTATTTCATCTTTGTCTCCTGAAACTAATAAAAC-----CTAACTTACAAAAGCTCTTTGATAAATAGGTGGCTAAATTAAAGTTGTCCTCACACtgtttcggttatacaatgtattaggtgtccacaaccaggtagc-atactagcatttttgttattgtgaaacatttttctacttttattataatatcctgagcctagagttgggcaatttgtatatttattttgacaatctcttggcaaatggtagcacagcatcttgttctaacaaaatTACTGTTACCATGACAATTAACC------------AATTAACcttgttccaacaaagtaaatgtgtctctttccaacttcaaatgaggaggaatgaagtcagtaatagtgagaccttgtggggacaagcatatgtaacatgacttgtgct i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36534877 480 + 96509753 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGAAATGGAGACAGCTCTAT-----TATGAACACCTT-AAGGATCAAAACTACATCTATTTCATCTTTGTCTCCTGAAACTAATAAAAC-----CTAACTTACAAAAGCTCTTTGATAAATAGGTGGCTAAATTAAAGTTGTCCTCACACTGTTTCGGTTATACAATGTATTAGGTGTCCACAACCAGGTAGC-ATACTAacatttttgttattgtgaaacatttttctacttttattataatatcctgagcctagagttgggcaatttgtatatttattttgacaatctcttggcaaatggtagcacagcatcttgttctaacaaaatTACTGTTATCATGACAATTAACC------------AATTAACcttgttccaacaaagtaaatgtgtctctttccaacttcaaatgaggaggaatgaagtcagtaatagtgagaccttgtggggacaagcatatgtaacatgacttgtgct i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37791393 492 - 90373283 AAATTCTGTTGAAAAAGCACAGAAATGGATTGGAGACAGCTCTAT-----TGTGAGCACCTT-AAAGATCAAAACTACACCTATTTCATCTTTGTCTCCTGCAACTTACAAAAC-----CTAACTTACAGAAACTCTTTGATAAATAGATGGCTAAATTAAAGGTGTCCTCATACTGTTTGGATTATACAAAGTATTAAGTGTCCACAACCAGGTAGC-ATACTAGcatttttgttagtgtgaaatatttttctacttttattataatctactgagcctagagttgggcaatttgtatatttattatgataatctttaggcaaatggtagcagagcctctttttctaacaaaatTACTGttatcaccacaattaaccagcaggtagaagaacacattttgttccaacaaagtaactgtatctgtttccaacttcaaattaggaggattgaagtcagtaatagtgagactttcttgggacaaacatatgtaacatgacttgtgct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10135875 491 + 96796970 TAATTCTGTTGAAAAAGCACAGCAATGAAATGGAGACGGCTCTATTCTCCTATGAACTCCTT-GAAGATTAAAACTACTTCTGCTCCATCTTGGTCTCCTACAACCTATAAAAT-----CTAACTTACAGAAGCTCTTTGATAAACATA-GGCTAAATTAaaggtggcctcatacagtttgaattatacaatgtattaggtgtccacatccagatagc-atactagcatttttgttattgtgaagcatttttgtatgtttattatcatctgctgggcctagagttgagcaatttgtgtatttattgtgaaaatcttttgacaaatggtagcagagcaccttgatttaacaaaatTACCGttatcatgaca----accagcaggtagaagaaaacatcttgttccaacaaagtaaataaatctcttt-cagtttcaaattaggaggaatgaggtcagtaatagtgagaccttgtttgtacaagcatatgtaacatgacctgggct i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81172951 469 - 85426708 aaatcttaaaaaaaaaACACA------ACACAAAGACAGCTCTATTCTATTATGAGCACCTTGAAAGACCAAAACT----CTCTTCCATCTTTGCTTCCTATAACTTGCAAAACCAAAGCCAACCTAAAGAATTTCTGTGATAGAGATC-CACTAAGTCAAAGGTTTCTTCCTACATttcagaccatgcaacacactaggtg-ccacctctggggagcaacggtaacatctttgtgactgcgaa-catttttgtgcttttattataatttgttgagccca-agttgccctttttgaatatttattatgatcatcttttgactaa---taacagagtatcttatttccaaaaaactacagt----------attatgcaacaaacaggagagaaca--ttgttctaatgaagtcaacatatcacattctgactt------aagagaagtgaagtcactaatagtgagattgtgttgatgcaacagcatctaaaataacctgtgct i canFam3.chr2 I 162 I 331 e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=501217.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 185020 231 + 478999 tTGGCGTTCTTTTGTGATCAAAAATTCCTTACTTTTATTTTTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccaggtcacagactggtaccagtccatggactattatgaaccacaccacacaggaggaggtgagcagcaggcaaaccagggaagcttcacctgtacttacagccacaccccatggctcatattaccgcctgaactctgcctccagtca s panTro4.chrUn_GL393519 27443 231 + 413329 tTGGCGTTCTTTTGTGATCAAAAATTCCTTACTTTTATTTTTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccaggtcacagactggtaccagtccacggactattatgaaccacaccatacaggaggaggtgagcagcaggcaaaccagggaagcttcacctgtacttacagccacaccccatggctcatattactgcctgaactctgcctccagtca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90280840 231 - 108868599 tcAGTGTTCTTTTGTGATCAAAAATTCCTTACTTTTACTTTTTTATCTATGGTAGGACCATGCAGAGcagcggtcctcaactcccaggccacagacttgtaccagtccatggactattatgaaccacaccacacaggaggaggtgagcagcagacaagccagggaagcttcacctgtacttacagccacaccccatggctcatattaccgcctgaagtctgcctccagtca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77083952 230 - 143122389 tcGGCATTCTTTTGTGGTCAAAAATTCCTTACTTTTA-TATTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccaggccacagactggtaccagtccgtggactattatgaactgcaccacacaggaggaggtgagcagcaggcaaaccagggaagcttcacctgtatttacagccacagcccatggctcatattaccgcctgaactctgcccccagtca i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35582293 230 - 95678458 tcAGCGTTCTTTTGTGATCAAAAATTCCTTACTGTTACTTTTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccagtctacagacttgtaccagtccatggattattaggaaccgcaccacacaggaggaggggagcagcaggcaagccagggaggcttcacctgtacttacagcca-gccccatggcttgtactaccgcctgaattctgcctccagtca i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36535357 230 + 96509753 tcAGCGTTCTTTTGTGATCAAAAATTCCTTACTGTTACTTTTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccagtctacagacttgtaccagtccatggattattaggaaccgcaccacacaggaggaggggagcagcaggcaagccagggaggcttcacctgtacttacagcca-gccccatggcttgtactaccgcctgaattctgcctccagtca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37791885 228 - 90373283 tcACTGTTCTTTCATCATCAAAAATTCCTTACTTTTACTTTTTTATCTATGGTAGGACCACCCAGAGcaggggtccacaactcccaggccacagac---taccagtccatggactattatgaaccacaccacacaggaggaggtgagcagcaggcaaaccagggaagctttgcctgtacttacagtcatacaccatggctcatattactgcctgaactctgcctccagtca i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10136366 231 + 96796970 tcACTGTTCTTTTGTGATCAAAACTTCCTTTCTTTTACTTTTTTGTCTATGGTAGGACCACCCAGAAcaggcatccacaactcccaggccacagactggtacaaatccatggccgttttggaaccatgccacacaggtggaggtaagcagcaggcaagccagggaagcttcatctgtgtttacaaccatggcccatggctcatcttaccacctgagccccacctcctgcca i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81173420 331 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=556752.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 185251 255 + 478999 gatcagtgatagcac-tagat-actcattggagcatgaaccctattgtgaactgctcatctgagggatctaggttgtgtgcttcatatgagaaactaat---gcctgatgatctgtcactgtctcac-----tttgcccccagatgagaccatct-agttgcagaaaaataagctcagagtttccacggattctacattatggtaagttgtataattatttcattat-atattacaatgtaataataat----ataaagtagcacaataaa s panTro4.chrUn_GL393519 27674 255 + 413329 gatcagtgatagcac-tagat-actcattggagcatgaaccctattgtgaactgctcatctgagggatctaggttgtgtgcttcatatgagaatctaat---gcctgatgatctgtcactgtctcac-----tttgcccctagatgagaccatct-agttgcagaaaaataagctcagagtttccacggattctacattatggtaagttgtataattatttcattat-atattacaatgtaataataat----ataaagtagcacaataaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90281071 255 - 108868599 gatcagtgataacat-tagat-actcattggagcatgaaccctgttgtgaactgcccatccgaaggatctaggttgtgtgcttcgtatgagaatctaat---gcctgattatttgcaattgtctcac-----tttgcccccagatgagaccatct-agttgcagaaaaataagctcagagcttccacggattccacattatggtaagctgtataattatttcattat-atattacaatgtaataataat----ataaagtagctcaataaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77084182 259 - 143122389 gatcagtgatagcac-tagat-actcattggagcatgaactctgttgtgaagtgctcatccgagggatctaggttgtgtgcttcatatgataatctaat---gcctgatgatatgtcactgtctcac-----tttgcccccagatgagaccatct-agttgcagaaaaataagctcagagtttccacggattctacattatggtaagttgtataattatttcattat-atattgcaatgtaataataatataaataaagtagcacaataaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35582523 264 - 95678458 gatcagtgatagcat-tagat-actcattggagcatgaaccctgttgtgaactgcccgtctgaggaatgtaggttgtgtgtttcatatgagaatctaat---gcctgatgatctgtcactgtctcacattgctctgcccccagatgagaccatct-ggttgcagaaaaataagctcagagcttccacggattctacatgatggtaagttgtataattatttcattat-atattacaatgtaatcataatataaataaagtagcacaataaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36535587 264 + 96509753 gatcagtgatagcat-tagat-actcattggagcatgaaccctgttgtgaactgcccatctgaggaatgtaggttgtgtgtttcatatgagaatctaat---gcctgatgatctatcactgtctcacattgctctgcccccagatgagaccatct-ggttgcagaaaaataagctcagagcttccacggattctacatgatggtaagttgtataattatttcattat-atattacaatgtaatcataatataaataaagtagcacaataaa i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37792113 263 - 90373283 gatcagtgatagcat-tagat-actcactggagcatgaaccctgttgtgaactgcccatccgagggatctaggttgtgtgcttcatatgagaatctaat---ggctgatgatctgtcactttctcacattgttctgcccccacatgagaccatct-agttgcagaaaaataagctcagagcttccacagattctacatgatggtaagttgtataattatttcattat-atattacaatgtaatc-taatataaataaagtagcacaataaa i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10136597 254 + 96796970 gatcagtgacagcat-----t-actcattggagcatgaaccctgtcgtgaactgaccacgtgagggatctacattatgtgcttcttatgagaatctaat---gcctaatgacctgtcactgtctccc-----tttgcccccagataggaacatct-agttgcaggaaaacaagctcagagcttct-ttgattctacattatagtacgttgtatcattatttcattac-agattacaatgtaataataatacaaataaagaagcacaacaaa i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81173751 225 - 85426708 AACTAATGAgggcacctggatggctcactgg---ttgag----gttgtga--------tcccaggttctgggattgagtcctacatcaggcatccgtatggagcctgcttctccctctgcctctctc-----tttgcctctctctgtgtgtctctgaggaataaagaaataa-----------------attctaaaaaaTACTAAG----ATAACGAATTTATTTTCAGACAATACTGC-CTCATATT----TTAAATTACCAAAAAGAA i canFam3.chr2 I 331 I 149 e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=218438.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 185506 109 + 478999 tgaaacatggctgaataatcctgaaaccatccccaccttcccccagcccatggaaagactgtcttccacaaaaccggtccctgatgccaaaaacattgtggacaactgA s panTro4.chrUn_GL393519 27929 109 + 413329 tgaaacatggctgaataatcctgaaaccatccccaccttcccccagcccatggaaagactgtcttccacaaaaccggtccctgctgccaaaaacattgtggacaactgA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90281326 109 - 108868599 tgtaacatgattgaataatcctgaaaccatccccacctttccccagcccatggaaagattgtcctccacaaaaccggtccctggtgccaaaaaggttggggacaactgA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77084441 88 - 143122389 ---------------------tgaaaccatccccaccctcccccagcccatggaaagattgtcttccacaaaactggtccctgatgccaaaaacattgtggacaactgA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35582787 109 - 95678458 tgtaaaatgattgaataatcctgaaaccatccccaccttcccccagcccatggaaagattgtcttccacaaaaccggtccctggtgccagagaggttggggacaactgA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36535851 109 + 96509753 tgtaaaatgattgaataatcctgaaaccatccccaccttcccccagcccatggaaagattgtcttccacaaaaccggtccctggtgccagagaggttggggacaactgA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37792376 109 - 90373283 tgtaacatgattgaataatcctgaaaccatccccaccttcccccagcccatggaaagattgtcttccacaaaaccggtccctggtgccacaaagtttgtggacaactgA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10136851 108 + 96796970 tgtaatgtgcttgaataattctgaaatcatctgcatttgtccctagtcaatgaaaaaattgtcttccacataatgggtctcccgtgccaaaaa-gttggggacaactgA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81173976 149 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=1248398.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 185615 526 + 478999 CCTAAAGTAATTCATTATCACAAGTCTTACCTGGATTGCTGTTTTCAGAAGAGATTTTTAGCATCTGTTTTTCTTTATAGTCAGAAAGTAATTCACAAATTCTATGTATA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAAATACTTACCAAATGT-A--AAATTCTT-AGAGTATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAATTTAACAGTATTATCC---CATACACTT---ATGAGTACATTCTACAAACTTTTCTTTAAGC------TTCTAATTAAAGAAGAAAAAAAATTA-GGTGAAATGCTCATAAATCAAGGGCACTGTGACCCAGTAAATCAGCATGCATTAGCATGACATAATAGAAAGTGTCCCAACTCTGCATAagtcctagctccataatgaacagctatttgttcttggacaactttcttctcttaggctcaatgtcttcttctacaaagtgaggactttgctgccttatttcactaggttgttataaagatttaacaaggtaacattttttaaatg s panTro4.chrUn_GL393519 28038 526 + 413329 CCTAAAGTAATTCATTATCACAAGTCTTACCTGAATTGCTGCTTTCAGAAGAGATTTTTAGCATCTGTTTTTCTTTATAGTCAGAAAGTAATTCACAAATTCTATGTAAA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAAATACTTACCAAATGT-A--AAATTCTT-GGAGTATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAATTTAACAGTATTATCC---CATACACTT---ATGAGTACATTCTACAAACTTTTCCTTAAGC------TTCTAATTAAAGAAGAAAAAAAATTA-GGTGAAATGCTCATAAATCAAGGGCACTGTGACCCAGTAAATCAGCATGCATTAGCATGACATAATAGAAAGTGTCCCAACTCTGCATAagtcctagctccataatgaacagctatttgttcttggacaactttcttctcttaggctcaatgtcttcttctacaaagtgaggactttgctgccttatttcactaggttgttataaagatttaacaaggtaacattttttaaatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90281435 526 - 108868599 CCTAAAGTAATTCACTGTCATAAGTCTTACCTGGGTTGCTGTTTTCAGAAAAGACTTTCAGCATCTGTTTTTCTTTGTAGTCAGAAAGTAACTGGCAAATTCTATGTATA--AAATTGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAAATACTTACCAAATGT-A--AAATTCTTAAGAGTATTTCAAACAATATCA----GAATATCAGAACTTAACAGTATTATCC---CGTCCACTT---ATGAGTACATTCTGCAAACTTCTCTTTAAGC------TTCTAGTTAAGGAAGAAAAAAATGTAGGGTGAAATACTCATAAATCGAGGGCA-TGTGACCCAGTAAATTAGGTTGCATTAACCTGACACAGTAGAAAGTGTCCCAACTCTGCATAagtcctagctccataatgaacagctatttgttcttggatgacttgcttctcttaggctcaatgtcttcttcaac-aagtgaggactttgctgccttatttccctaggttgttataaaaatttaacaagataacattttttaaatg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77084529 524 - 143122389 CCTAAAGTAATTCATTATCACAAGTCTTACCTGGATTGCTGTTTTCAGAAGAGATTTTTAGCATCTGTTTTTCTTTGTAGTCAGAAAGTAATTCACAAATTCTATGTGTA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAGATACTTACCAAATGT-A--AAATTCTT-AAAATATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAACTTAACAGTATTATCC---CATCCACTT---ATGAGTACATTCTACAAACTTCTCTTTAAGC------TTCTAATTAAAGA--AAAAAAAATAA-GGTGGAATGCTCATAAATTGAGGGCACTGTGACCCAGTAAATCAGCTTGCATTAGCATGACATAATAGAAAGTGTCCCAACTCTGCATAagtcctagctccataacgaacagctatttgttcttggacaacttgcttctcttaggctcaatgtcttcttctctaaagtgaggactttgctgccttatttcactaggttgttataaagatttaacaagataacattttttaaatg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35582896 525 - 95678458 TCTAATGGAATTCACTATCACAAGTCTTACCTGGATTGCTGTTTTCAGAAGAGATTGTTAGCATCTGTTTTTCTTTGTAGTCAGAAAGTAATTGGCAAATTCTATATATA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAA--ACTTAGCAAATGT-A--AAATTCTT-AGAGTATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAACTTAACAGTATTATCC---CATCCACTT---ATGAGTACATTCTATAAACTTCTCTTGAAGC------TTCTAATTAAAGAAGGAAAAAATGTAAGGTGAAATGCTCACAAATCGAGAGCAGTATGATCCAGCAAATTAGCTTGCATTAGCATGACATAATAGAAAGCGTTCCAACTCTgcttaagtcctggctccataatgaacagctatttgttcttggacaacttgcttctcttaggctcaatgtcttcttctacaaagtgagggctttgctgccttatttcactaggctgttataatgatttaacaagataacattttttaaatg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36535960 525 + 96509753 TCTAATGGAATTCACTATCACAAGTCTTACCTGGATTGCTGTTTTCAGAAGAGATTGTTAGCATCTGTTTTTCTTTGTAGTCAGAAAGTAATTGGCAAATTCTATATATA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATACTGATATAAAAA--ACTTAGCAAATGT-A--AAATTCTT-AGAGTATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAACTTAACAGTATTATCC---CATCCACTT---ATGAGTACATTCTATAAACTTCTCTTGAAGC------TTCTAATTAAAGAAGGAAAAAATGTAAGGTGAAATGCTCACAAATCAAGAGCAGTATGATCCAGCAAATTAGCTTGCATTAGCATGACATAATAGAAAGCGTTCCAACTCTgcttaagtcctggctccataatgaacagctatttgttcttggacaacttgcttctcttaggctcaatgtcttcttctacaaagtgagggctttgctgccttatttcactaggctgttataatgatttaacaagataacattttttaaatg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37792485 527 - 90373283 CCTAAAGTAATTCACTATCACAAGTGTTACCTGGATTGCTGTTTTCAGAACAGATTTTTAGCATCTGTTTTACTTTGTTGTCAGAAAGTAATTGGCAAGTTCTATGTATA--AAAATGTAATAAACCAAATTACTATTTTAATATTGACATAAAAAATACCTACCAAATGTAA--AAATTCTT-AGAGTATTTCAAACAATATCA----TAATATCAGAACTTAACAGTATTATCC---CATCCACTT---ACGAGTACATTCTACCAACTTCCCTTTAAGT------TTCTAATTAAAGTAGAAAAAAAAATAAGGTGAAATGCTCATAAATCGAGGGCACTGTGACCCAGTAAATTAGCTTGTATTAGCATGACATAATAGAAAGTGTCCCAACTCTgcttaagtcctggctccataatgaacagctatttgttcttggacaacttgcttctcttaggctcaatggcttcatcaacacagtgaggactttgctgccttatttcactaggttgttataacgatttaacaaggtaaca-tttttaaatg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10136959 515 + 96796970 CTTAAAGTAATTCACTGAC------TTTACCTGGATTGCTGTTTTGAGAAGAGTTTTTTGACATCTGTTTTTCTTTGTAGTCAGAAAGTAACTGGCAAATTCTATGTATA--AAAATGTAACAAATAAAATGACTATATTAATGCCGATACAAAATTTACTTTCCAAATGT-A--AAATTCTT-AGAATATTTC-TACAATATTA----GAATATCAGAACTTAACAATATTATCC---CATCCACTT---ATGTGTACATTCTACAAACTTCTCATTCAGC------TTCTAATTGAAGAGGACAAAAAGTAA-GGTGAAATACTCATAAACCAAGGGCACTGTGACTCCGTACATTAATTTGCATTAGCTGGACATAACAGAAAGTGCCCCAACTCCAAATAagtcctagctccacaaggaacagctatttattcttggaaaatttacttctcttaggctcagagtcttcc---acaaagtgggaactttgctgcctt-tttcactggattgtgatgaagattaaacaagataccatgtTTTAAATG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81174125 536 - 85426708 CCATAAGTAATTCACTCTAAAAAATCATACCTAGATCATGATTCTGTGAAGAATTTTCAGGTTTCATTTCTTCTTCATGTTCAGAAATTAGTTGGTCACTGCTACGTATAAGAAAGAGTGATAAACAATGAGACTTTTTTAATACTGATATGAAAAATATTTACCAGATAT-ATCAAATTCTT-AAGATTTTTCAAAGAATATCAGGGTTAACATCAAAACTTAA----ATTACCCGAATAGGTACTTCAAATTTGTTAGTTCTAAAAACTTTT-ATCAAGTATGTAATTATAATTAAAGGAGAAACAAAAGTAAGGTGAACCAGTCATGAGTTGAAGGCATTTTG-CTCAGTAAACTAA---GAGTTAGCCTGCCATAATGGAAAGTGTCTCAAATC--CCAAagtcccagctctaaaaccagcagctttttgttcttagaccagccacttctcttccactcaaagtctttctctataaaacaggaatcttaccatcttatattacaaggctgttaggaggatttaatgaggtattatacccaaaacg i canFam3.chr2 I 149 I 23 e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=179536.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 186141 74 + 478999 ctcagagaaatagtaaagCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 28564 74 + 413329 ctcagagaaatagtaaagCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90281961 74 - 108868599 ctgagAGAAATAGTAAAGCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77085053 74 - 143122389 cttagACAAATAGTAAAGCAATGGAATAATCTGTTCCTAAGCTTTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35583421 74 - 95678458 ctcagagaaatagtaaagCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTCATGACTGAAATTATCTCGGAATCCCAAAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36536485 74 + 96509753 ctcagagaaatagtaaagCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTCATGACTGAAATTATCTCGGAATCCCAAAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37793012 74 - 90373283 ctcagaaaaatagtaaagCAATGGAATAATCTGTTCCTAAACTTTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10137474 74 + 96796970 CTCAGAGAAATAGTAGAGACATGGAATAATCTGTTCCTAAACTCTATGACTAAAATTATCTTGGAATCCCAAAT i calJac3.chr16 C 0 I 297 e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=1482634.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 186215 708 + 478999 AAAACCCCATGTGTATTTTGTTCATAGGTTCTAATATGCAAATGCTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTTTGCTTCTTAGTTGTCCTACTCCTTATGGCTTATCATTCAGGGCATCTCAACTGTGTCATAGTTTGTAACTAAATTTTTTCATAAATCTCTCATTAAAGTAGATAATGTGATTGTCCACTATTACGGAGTTGACCAATTTGTTGTGCTAAGGGCAGAAAAACCAATGGATGTTAAGACCTGGCTTGGAGCAATGATCCTTCTCTACAGACTCAAACTCTGAGCCAGCAGATGTTTGTTAGGATAATGCTTTATGTTGATGTTCAATTCCAGCTGACATGGGAGACCAAAACTCTACTTTTA--TTTTTTTTCAGTTTTCATGAAGAAGTTGCAAATTGACATTCTCTAATTTTTGACGTACATACTTATAATATATTTTGCACTGA-------ACACATTATTGAGCTCTAA-ATCATCTCACAGACCATCTTCCATGACTATTTTTGCAGCACAAATCAC-ATTTCGATATTTTGGTGGCACCCA--TTTTGCTTTGATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAGTGAAATGATCTTCCAGTGACTGCACaaaatatggaatgcttcaaagagttgtgctgcctccttat-gcagaagccgtgctaactttctctgtattgttccaattttagg s panTro4.chrUn_GL393519 28638 703 + 413329 AAAACCCCATGTGTATTTTGTTCATAGGTTCTAATATGCAAATGCTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTTTGCTTCTTAGTTGTCCTACTCCTTATGGCTTATAATTCAGGGCATCTCAACTGTGTCATAGTTTGTAACTAAATTTTTTCATAAATCTCTCATTAAAGTAGATAATGTGATTGTCCACTATTACGGAGTTGACCAATTTGTTGTGCTAAGGGCAGAAAAACCAATGGATGTTAAGACCTGGCTTGGAGCAATGATCCTTCTCTACAGACTCAAACTCTGAGCCAGCAGATGTTTGTTAGGATAATGCTTTATATTGATGTTCAATTCCAGCTGACATGGGAGACCAAAACTCTACTTTTA--TTTTTTTTCAGTTTTCATGAAGAAGCTGCAAATTGACATTCTCTAATTTTTGACATACATACTTATA-----TTTTGCACTGA-------ACACATTATTCAGCTCTAA-ATCATCTCACAGACCATCTTCCATGACTATTTTTGCAGCACAAATCAC-ATTTCGATATTTTGGTGGCACCCA--TTTTGCTTTGATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAGTGAAATGATCTTCCAGTGACTGCACaaaatatggaatgcttcaaagagttgtgctgcctccttat-gcagaagccatgctaactttctctgtattgttccaattttagg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90282035 704 - 108868599 AAAACCCAATGCGTATTTTGTTCATAGGTTCCAATATGCAAATGTTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTTTGCCTCTTAGTTGTCCTACTCTTTATGGCTTATAATTCAGGGCATCTCAACTATGTCATAGTTTGTAACTAAATTTATTTACAAATATCCCATAAAAGTAGATAATGTGATTGTCCACTATTACGGAGTTGATCAA----TCACACCAAGGGCAGAAAAACCAATGGATGTTAAGACCTGGCTTGGACCAATGATCCTTCTCTACAGACTCAAACTCTCAGCCAGCAGATGTTTGTTAGGATAATGCTTTATATTGATGTTCAATTCCAGCTGACGTGGGAGACCAAAAGTCTACTTTTA--TTTTTTTT-AGTTTCCATGAAGAAGTTGCAAGTTGACATTCTGTAATTTTTGACATACATACTAACAATATATTTTGCACCAA-------ACATGTTATTCAGCTCTAA-GTCATCTCATAGACCATCTTACATGACTATTTTTGCAGCGCAAATCACAATTTCAATATTTTGGTGGCACCTA--TTTCGCTTTAATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAGTCAAATGACCTTCCAGTGACTGCACaaaatatggaatgcttcaaagatttgtgctgcctccttat-gcagaagccatgctaactttccccatattgttctaattttagg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77085127 697 - 143122389 AAAACCCAACGTGCATTTTGTTCGTAGGTTTTAATATGCAAATGTTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTTTGTTTCTTAGTTGTCCTACTCCTTATGGCTTATAATTCAGGGCATCTCAACTATGTCATAGTTTGTAACTAAATTTTTTCATAAATATCTCATTAAAGTAGATAATGTGATTGTCCACTATTATGGAGTTGACCAA----TCACACCAAGGGCAGAAAAACCAATGGATGTTAAGACCTGGCTTGGACCAATGATCCTTCTCTACAGACTCAAACTCTGAGCCAGCAGATGTTTGTTAGGATAATGCTTTATATTGATGTTCAATTCCAGCTGACATGGGAGACCGAAACTCTACTTTTA--TTTTTTTC-AGTTTTCATGAAGAATCTAAAAGTTGACATTCTCCAATTTTTGACATACATACTAACAATATATTTTGCACCGA-------ACACGTTATTCAGCTCTAA-ATCATCTCATAGACCATCTTCTATGACTATTTTTGCAGCACAAATCATAATTTCAGTAT-------GCACCCA--TTTTGCTTTGATCCACACTGTTTCCATAGAGCTAGTCAGCAAATAGTCAAATGACCTTCCAGTGACTGCACaaaatacggaatgcttcaaaaagttgtgctgcctccttat-gcagaagccatgctaactttctctgtattgttccaattttagg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35583495 706 - 95678458 AAAACCCAGTGTGTATTTTGTTCATAGATTCTAATATGCAAATGTTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTCTACTTCTTAGTTGTTCTGCTCCTTATGGCTTATAATTCAGGACATCCCAACTATGTCATAGTTTGTAACTAAATTTACTCATAAATATCTCATTAAAGTAGCTAATGTGATTGTCCACTATTACAGAGTTGACCAA----TCACACCAAGGGCAGAAGAACCAATAGATGTTAAGACCTGGCTTGAACCAATGATCCTTCTCTACTGACTCCAACTCTGAGCCAGCAGATGTTTGTTAAGATAATGCTTTATATTGATGTTCAATTGCAGCTGACAT-GGAGACCAAAACTCTACCTTTATTTTTTTTTT-AGTTTCCATGAAGAAGTTGCAAGTTGACATTCTCTAATTTTTGACATACATACTAACAACATATTTTGCACTGA-------ACATGTTATTCAGCTCCAA-GTCATCTCATAGACCATCTTACATGACTATTTTTTTAGTGCAAATCACAATTTCATTATTTTGGTGGCACCCA--TGTTGCTTTGATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAATCAAATAACCTTCCAGTGACTGCCCaaaatatagaacacttcaaaaatttgtgctgcttccttactgcagaagccatgctaattttctctgtattgttcccattttagg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36536559 706 + 96509753 AAAACCCAGTGTGTATTTTGTTCATAGATTCTAATATGCAAATGTTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTAATTCTACTTCTTAGTTGTTCTGCTCCTTATGGCTTATAATTCAGGACATCCCAACTATGTCATAGTTTGTAACTAAATTTACTCATAAATATCTCATTAAAGTAGCTAATGTGATTGTCCACTATTACAGAGTTGACCAA----TCACACCAAGGGCAGAAGAACCAATAGATGTTAAGACCTGGCTTGAACCAATGATCCTTCTCTACTGACTCCAACTCTGAGCCAGCAGATGTTTGTTAAGATAATGCTTTATATTGATGTTCAATTGCAGCTGACAT-GGAGACCAAAACTCTACCTTTATTTTTTTTTT-AGTTTCCATGAAGAAGTTGCAAGTTGACATTCTCTAATTTTTGACATACATACTAACAACATATTTTGCACTGA-------ACATGTTATTCAGCTCCAA-GTCATCTCATAGACCATCTTACATGACTATTTTTTTAGTGCAAATCACAATTTCATTATTTTGGTGGCACCCA--TGTTGCTTTGATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAATCAAATAACCTTCCAGTGACTGCCCaaaatatagaacacttcaaaaatttgtgctgcttccttactgcagaagccatgctaattttctctgtattgttcccattttagg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37793086 705 - 90373283 AAAACCCTATGTGTATTTTGTTCATAGGTTCTAATATGCAAATGTTGTAGTTTTCAGAAAATGTTATTAAGTCCTCATTTTGCTTCTTAGTTGTCCTACTCCTTATGGCTTATACTTCAGGGCATCTCAATGATGTCATAATTTATAACCAAATTTACTCATAAATATCTCATTAAAGTAGATAATGTGATTGTCCACTATTACGAAGTTGATCAA----TCACACCAAGGGCCGAAGAACCAATGGATGTTAAAACCTGGCTTGGAGCAATGATCCTTTTCTACAGACTCAAACTATGAGCCAGCAGATGTTTGTTAGGATAATGGTTTATATTGATGCTCAATTCCAGCAGACAT-GGAGACCAAAACTCTACCTTTA--TTTTTTTT-AGTTTTCATGAAGAAGTTGCAAGTTGACATTCTCTAATTTTTGACATACATACTAACAATATATTTTGCACCAA-------ATATGGTATTCAGCTCTAA-ATCATCTCATAGACCATCTTACATGACTATTTTTGCAGGGCAAATCACAATTTTAATATTACAGTGGCACCCATTTTTTGCTTTGATTCACACTGTTTCCTTAGAGCTAGTCAGCAAATAGTCAAATGACCTTCCAGTGACTGCACaaaatatggaatgctttgaaaatttgtactgcctccttac-acagaagccatgctaattttctctgtattgttccaattttagg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10137845 694 + 96796970 aaaaCCCAATGTGTATTTTGTTCA-AGGTCCTAAGATGCAAA---CGTAGTTTTCAGGG---------AAGTCTTCATTTTGCTTATTAGTTGTCCTAATCTTTATAGCTTATAATTCAGGGCATCTCAACTATTTCATAGCTTGTAACTAAATTTATTCATAAATATCTCAATAAAGTTGATAACGTGACTGTCCACTATTACAGAGTTTATCAA----TCACACCAAGGGCAAAAAAAACAATGGATGTCAAGATGTGGCTTGAACCAATGATCCTTCTCTACAGACTCACACTCTGAACCAGCAGATGTTTTTTAAGATGATGCTTCATATCCATGTTCATCTCCAGCTGACATGGAAGACCAAAACCCTACAT-----TTCTTTTT-AGGTTCCATGAAGAAGTTGCAATTTGACATTCTCTAATTTTCAAGATACTTACTAACAATATATTTTGTACACAATACCCCACATATTATTCAGCTCTGGTGTCATCTCACAGACCAGCTTACAGGAATATTTTTGTAGCACAAATAGCAATTTCAATATTTAGGTGGCACTCG--TTTTGCTTCAATTCACACCATTTTCTTACAGCTAGTCAGCAAACAGTCAAATGACCTTCGAGTGACTAGGC-aaatatggaatgcttcaaaaatgtgtgcagcctccctat-gcag-ggccatgctaatttcctctgtactgttcccattttagg i calJac3.chr16 I 297 C 0 e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I e papAnu2.chr10 32628032 102 - 90941950 I a score=219212.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 186923 77 + 478999 atatgtgccgccaaagcaggcacAAAGCCCTACTTTTACACATGATTTGTGATGAGTCATGGGCAAGGCTTGGCTCT s panTro4.chrUn_GL393519 29341 77 + 413329 atatgtgccaccaaagcaggcacAAAGCCCTACTTTTACACATGATTTGTGATGAGTCATGGACAAGGCTTGGCTCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90282739 75 - 108868599 atatgtgccacccaagcaagaacAAAGCCCTACTTTT--ACATGATTAGTGATGAGTCATGGACAAGGCTTGGCTCT i ponAbe2.chr14 C 0 I 9 s nomLeu3.chr5 77085824 77 - 143122389 atatgtgccgccgaagcaagcacAAAGCCCTACTCTTACACATGATTAGTGACGAGTCATGGACAAGGCTTGGCTCT i nomLeu3.chr5 C 0 I 4 s rheMac3.chr10 35584201 77 - 95678458 atatgtgctgctgaagcaagcacAAAGCCCTACTTTTACACATGATTAGTGATGAGTCATGGACAGGGCTTGGCTCT i rheMac3.chr10 C 0 I 13 s macFas5.chr10 36537265 77 + 96509753 atatgtgctgctgaagcaagcacAAAGCCCTACTTTTACACATGATTAGTGATGAGTCATGGACAGGGCTTGGCTCT i macFas5.chr10 C 0 I 4 s papAnu2.chr10 32628134 77 - 90941950 ATATGTGCTGCGGAAGCAAGCACAAAGCCCTACTTTTACACATGATTAGTGATGAGTCATGCACAGGGCTTGGTTCT i papAnu2.chr10 I 102 I 4 s chlSab2.chr2 37793791 76 - 90373283 -tatgtgctgctgaagcaagcacCAAGTCCTACTTTTACACATGATTAGTGATGAGTCATGGACAAGGCTTCGCCCT i chlSab2.chr2 C 0 I 13 s calJac3.chr16 10138539 77 + 96796970 atatgtgctgctgaagcaggcacAAAGCCCTACTTTTACAAATGGACAGTGATGAGTCATGGACAAGGTTTGGCTCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I a score=-1208.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187000 22 + 478999 -TGTCCATGACTCATCACTACTT s panTro4.chrUn_GL393519 29418 22 + 413329 -TGTCCAAGACTCATCACTACTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77085905 7 - 143122389 -AGTCCAA--------------- i nomLeu3.chr5 I 4 C 0 s macFas5.chr10 36537346 9 + 96509753 -AGTCCAA------------CT- i macFas5.chr10 I 4 C 0 s papAnu2.chr10 32628215 9 - 90941950 -AGTCCGA------------CT- i papAnu2.chr10 I 4 C 0 s calJac3.chr16 10138616 8 + 96796970 AAGTCCAA--------------- i calJac3.chr16 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90282814 9 - 108868599 I e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I e chlSab2.chr2 37793867 13 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35584278 13 - 95678458 I a score=900.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187022 4 + 478999 ACTT s panTro4.chrUn_GL393519 29440 4 + 413329 ACTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90282823 4 - 108868599 AACT i ponAbe2.chr14 I 9 C 0 s nomLeu3.chr5 77085912 2 - 143122389 --CT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138624 2 + 96796970 --CT i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I e chlSab2.chr2 37793867 13 - 90373283 I e papAnu2.chr10 32628224 0 - 90941950 C e macFas5.chr10 36537355 0 + 96509753 C e rheMac3.chr10 35584278 13 - 95678458 I a score=439212.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187026 154 + 478999 AACCCACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGGTACAATTTGAAAATATTTTAAAATCTTGAGCTAGAGATGGAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCATGTAAATCAGATCACTCAAGGGGCCAACCACAGCTGGGAG s panTro4.chrUn_GL393519 29444 154 + 413329 AACCTACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGATACAATTTGAAAATATTTTAAAATCTTGAGCTAGAGATGGAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCATATAAATCAGATCACTCAAGGGGCCAACCACAGCTGGGAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90282827 154 - 108868599 AACCTACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGCTGGAATTTGAAAATACTTTAAAATCTTGAGCTAGAGATGGAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCATGTAAATCAGATCACTCAAGGGGCCAAGCACAGCTGGGGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77085914 154 - 143122389 AACCTACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGCTAGAATTTGAAAATATTTTAAAATCTTGAGCTAGAGATGGAAGTAGCTTGGATGATTTTCATTATCATGTAAATCAGATCTCTCAAGGGGCCAACCACAACTGGGAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584291 154 - 95678458 AACCTACTTGAGACTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGGTCGaatttaaaaatattttaaaatCTTGAGCTACAGATGAAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCGTGTAAAACAAATCACTCAAGGGGCCCACCACAACTGGGAG i rheMac3.chr10 I 13 C 0 s macFas5.chr10 36537355 154 + 96509753 AACCTACTTGAGACTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGGTCGAATTTAAAAATATTTTAAAATCTTGAGCTACAGATGAAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCGTGTAAAACAAATCACTCAAGGGGCCCACCACAACTGGGAG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628224 153 - 90941950 GACCTACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTCCCTGTGAGGTagaatttgaagatattttaaaatcttgagttACAGATGAAAGTAGCTTGGACGATTTTCATTATCATGTAAAACAGATCACTCAA-GGGCCGACCACAACTGGGAG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37793880 153 - 90373283 AACCTACTTGAGATTCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGCGAGGTAGAATTTGAAAATATTTTAAAATCTTGAGCTAGAGATGGAAGTAGCTTGGATGATTTTCATTATCATGTAAATCAGATCATTAAA-GGGCCAACCACAACTGGGAG i chlSab2.chr2 I 13 C 0 s calJac3.chr16 10138626 145 + 96796970 AACCTACTTGAGATCCTGAGAATTCTCTTCAATGGCTTCCTGTGAGGTAGAATTTGAAAATATTTTTAAATCTTGAGGAAGAGATGTAAGCAG---------TTTTCATCATTATGGAAAACAGATCACTCAAGGGGCCAACCACAACTGGGCG i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81174661 23 - 85426708 I a score=167907.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187180 57 + 478999 CCACTGCTT-GGGGAAGGCTCATATGGGACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTACACAGGA s panTro4.chrUn_GL393519 29598 57 + 413329 CCACTGCTT-GGGGAAGGCTCATATGGGACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTACACAGGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90282981 58 - 108868599 CCACTGCTCAGGGGAAGGTTCATATGGGACTTTCTACTGCCC-------AAGGTTCTATACAGGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77086068 57 - 143122389 CCACTGCTC-GGGGAAGGCTCATATGGGACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTACACAGGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584445 57 - 95678458 CCACTGCTC-AGGGAAGATTCATATGGAACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTCTACAGGA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537509 57 + 96509753 CCACTGCTC-AGGGAAGATTCATATGGAACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTCTACAGGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628377 57 - 90941950 CCACTGCTC-GGAGAAGGTTCATATGGGACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTATAGAGAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794033 57 - 90373283 CCAGTGCTT-CGGGAAGGTTCATGTGGGACTTTCTACTGCCT-------AAGGTTCTATACAGGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138771 58 + 96796970 CCCACACTCTGAGGAAGGTTAATGTCGGACTTTCTGTTGCCT-------AAGGTACTATACAGGG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81174684 64 - 85426708 CCACAACTC-TGGGAAGGGCAATATGAGACCTTCCATGACCTAATAAAAAAGGTATTCCACAGGA i canFam3.chr2 I 23 I 213 a score=3276.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187237 1 + 478999 T s panTro4.chrUn_GL393519 29655 1 + 413329 T i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283039 1 - 108868599 T i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77086125 1 - 143122389 T i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584502 1 - 95678458 T i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537566 1 + 96509753 T i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628434 1 - 90941950 T i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794090 1 - 90373283 T i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138829 1 + 96796970 T i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81174748 213 - 85426708 I a score=200866.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187238 69 + 478999 ATAAAGGTGCCTCACAGTGTAGATCTGGTAGCAAAGAAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAC s panTro4.chrUn_GL393519 29656 69 + 413329 ATAAAGGTGCCTCACAGTGTAGATCTGGTAGCAAAGAAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283040 69 - 108868599 ATAAAGGTGCCTCACAGTATAGGTCTGGTAGCAAAGAAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAC i ponAbe2.chr14 C 0 I 15 s nomLeu3.chr5 77086126 69 - 143122389 ATAAAGGTGCCTCACAGTACAGATCTGGTAGTAAAGAAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584503 66 - 95678458 ATACAGGTGCCTCACAGTACAGATCTGGTAGCA---AAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537567 66 + 96509753 ATACAGGTGCCTCACAGTACAGATCTGGTAGCA---AAGAAGAAACAAACACTGATCTCTTTCTGCCAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628435 69 - 90941950 ATAAAGGTGCCTCACAGTACAGATCTGATagcaaagaagaagaaacaaacactGATCTCTTTCTGTCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794091 69 - 90373283 ATAAAGGTGCCGCACAGTACAGATCTGGTAGCAAAGAAGAAGAAACAAACACTGATCTCCTTCTGCCAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138830 65 + 96796970 AT--AGATGCTTCAGGGTACAGATCTGGTAGCAAAGAAGA--AATCAAATGCCGATCTCTTTCTGCCAC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81174961 66 - 85426708 ATAAAGCAGGCTTCGGGTACAGATGTAGGAACA---AAGGGGAAGGAAAGTCCAGTCTCTTCTTGTAGT i canFam3.chr2 I 213 C 0 a score=22932.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187307 7 + 478999 ATTATTT s panTro4.chrUn_GL393519 29725 7 + 413329 ATTATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77086195 7 - 143122389 ATTATTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584569 7 - 95678458 ATTATTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537633 7 + 96509753 ATTATTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628504 7 - 90941950 ATTATTT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794160 7 - 90373283 ATTATTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138895 7 + 96796970 ATTATTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81175027 7 - 85426708 Attattt i canFam3.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90283109 15 - 108868599 I a score=944151.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187314 323 + 478999 GAACCCCTCTGACCCTTTATAACAAGCCCACCTCATATCTGCTAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTGAAAGGATCTCTTACCATGAAGGTCTCAGCTAATTCTTAGCTAAGATGTGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATACAGGAGGAAGGGTCAATTTGCTCACTTTGTGTGCGGATAAAGTCAGGATGCCCAGCGGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAAtggctgagcatataagcataggtaagggaactaaaaaatgttgtaacttcaaagtcactgtgtgaatccccatgaagacttgagggatctgaatc s panTro4.chrUn_GL393519 29732 323 + 413329 GAACCCCTCTGACCCTTTATAACAAGCCCACCTAATATCTGCTAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTGAAAGGATCTCTTACCATGAAGGTCTCAGCTAATTCTTGGCTAAGATGTGGGTTCCACATTAGG-TTCCGAATACAGGAGGAAGGGTCAATTTGCTCACTTTGTGTGCGGATAAAGTCAGGATGCCCAGCGGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAAtggctgagcatataagcataggtaagggaactaaaaaatgttgtaacttccaagtcactgtatgaatccccatgaagacttgagggatctgaatc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283124 314 - 108868599 GAACCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCTACCTAATATCTGCTAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTCAAAGGATCTGTTACCATGAAGGTCTCAACTAATTCTTGGCTAAGATGTGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATATGGGGGGAAGGGTCAATTTGCTCATTTTGTGTGTGGATAAAGTCAGGATACCCAGGGGCCAGAGCAGGGGGCTGGTGCTTTGGGAACAATGGCTGAGCATATAACCATAGGTATGGGAACAAAA---------AACATCAAAGTCACTGTATGAATTGCCACGAAGACTTGAGGGACCTGAATC i ponAbe2.chr14 I 15 I 15 s nomLeu3.chr5 77086202 323 - 143122389 GAACCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCCACCTAATATCTGCTAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTGAAAGGATCTCTTACCATGAAGGTCTCAGCTAATTCTTGGCTAAGATGTGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATACGAGAGGAAGGGTTAATTTGCTCACTTTGTGTGCGGATAAAGTCAGGATGCCCAGCGGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAAAAAtggctgagcatataagcataggtaagggaagtaaaaaatgttgtaacttcaaagtcactgtatgaatcaccatgaagacttgagggatctgaatc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584576 323 - 95678458 GAACCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCCAATTAATATCTGCCAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTCAAAGGATCTCGTACCATGAAGATCTCAGCTAACTCTTGGCTAAGACGCGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATATGGGGGGAAGGGTCAATTTGCTCACTTTGTCTGCGGATAAAGGCAGGATGCTCAGCGGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAAtggctgagcaaataagcatgggtatgggaacatacaaacgttgtaacttcaaagtcactgtatgacttgccatgaagacttgaggactctgaatc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537640 323 + 96509753 GAACCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCCAATTAATATCTGCCAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTCAAAGGATCTCGTACCATGAAGATCTCAGCTAACTCTTGGCTAAGACGCGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATATGGGGGGAAGGGTCAATTTTCTCACTTTGTCTGCGGATAAAGGCAGGATGCTCAGCGGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAATGGCTGAGCAAATAAGCATGGGTATGGGAACATACAAACGTTGTAACTTCAAAGTCACTGTATGACTTGCCATGAAGACTTGAGGACTCTGAATC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628511 282 - 90941950 GAACCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCC-ATTAATATCTGCCAG-AGAAAAGACCAACAACGGCCTCAAAGGATTTAGTACCATGAAGGTCTCAGCTAATTCTTGGCTAAGATGTGGTTTCCACATTAGG-TTCTGAATATGGGGGCAAGTGTCAATTTGCTCACTTTGTCTGCAGATCAAGTCAGGATGCCCAGCTGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAATGGCTGAGCATAGAAGCATAGATATGGGAACTTA----------------------------------------AAGACTGGAGGGATCTGAATC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794167 323 - 90373283 GAATCCCTCTGACCCTTTAGAACAAGCCCAATTAATATCTGCCAG-AGAAAAGACCAACAATGGCCTCAAAGGATCTTGTACCATGAAGGTCTCAGCTAATTCTTGGCTAAGATGTGGGTTCCACATTAGG-TTCTGAATATGGGGGGAAGGGTCAATTTGCTCACTTTGTGTGCGGATAAAGTCAGGATGCCCAGCTGCCAGAGCAGGGTGCTGGTGCTTTGGGAACAATGGCCAAGCATATAAGCATAGATATGGGAACTGAAAAACGTTGTAACTTCAAAGTCACTGTATGACTCGCTATGAAGACTTGAGGGATCTGAATC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10138902 313 + 96796970 GAAGCTCTCTGATAGTTTAGAACAAGCCCAACTAATATGTGCTAG-AGAAAAGACCAACCTGGAACTCAAAGGATCTCTTACCATGTAGGTGTCAGTTACATCTGTGGTAAGATGTGAGTTCCACATTAGG-TTTTGAATGTCAGGGGAAGAGTCAATTTGCTCACTTCATGTGTGGATAAAGGCAGGATGCCGAGCTGCCAGAGCAGGGTGCTGGTACCTTGAGAACAATGGCTGAGCACATAAGCACAGGAATGTGAACTAAAAAACGTGGTAACTTTGAAGTCTATGTATG----------AAGACTTGAgggatctgaatc i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81175034 297 - 85426708 gaactcctttaatagtttagaatggtcctaactaaagtctgctagcagaaaagacaaacaaaatcctcgaaggttaattcatcatgaagg-----------tctgggctaatatatggtttccacgtaaggtttttgagtgtgaagggaagggt---------------gtatggggctaaagccagaaggcccagctgccagaacagcatgccggtggctttggaatagcagctgagcatataagcatatgta-ataaacaaaaaagggttgtaagtttgaattctaagtgtggatcaccatgaggact-gacgaatgaggatc i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=100401.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187637 37 + 478999 agtaagggcaccttggtgtcaaaggtcaacaattacc s panTro4.chrUn_GL393519 30055 37 + 413329 agtaagggcaccttggtgtcaaaggtcaacaattacc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77086525 37 - 143122389 agtaagggcatcctggtgtcaaaggtcaacaattacc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584899 37 - 95678458 agtaagggcatctttgtgtcaaagatcaaccattacc i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36537963 37 + 96509753 AGTAAGGGCATCTTTGTGTCAAAGATCAACCATTACC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628793 37 - 90941950 AGTAAGGGCATCTTGGTGTCAAAGATCAACCATTACC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794490 37 - 90373283 AGTAAGGGCATCTTGGTGTCAAAGGTCAACCATTACC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10139215 37 + 96796970 aataagggcatcttggtgtcaaaggtcaaccattacc i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81175331 37 - 85426708 agcaagggcatcctatgagcaaaagtcaatcatgact i canFam3.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 90283438 15 - 108868599 I a score=695520.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187674 229 + 478999 aggcagcagaagcagtttgagtggcaacaatgcagcaacagaaacaa-tggaaacaacagaatgattggaatgtcc-ttttttc-tctcctccttctgacttgataaaagggactgtcttccttggatttagtgaacccctttggttcttgaaaaattcaaggagta---tgtaggagacagtccccagaagacagtacaaggctttctgctaaactggacatttcaagacccaa s panTro4.chrUn_GL393519 30092 229 + 413329 aggcagcagaaccagtttgagtggcaacaatgcagcaacagaaacaa-tggaaacaacagaatgattggaatgtcc-ttttttt-tctcctccttctgactggataaaagggactgtcttccttggatttagtgaacccctctggttcttgaaaaattcaaggagta---tgtaggagatagtccccagaagacagtacaaggctttctgctaaactggacatttcaagacccaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283453 229 - 108868599 AGGCAgcaggaccagtttgagtggcaacaatgcggcagcagaatcag-cggaaacaacagaatgattgcaatgtcctttttttt-tctcctccttctgacttgataaaaaggactgtcttccttggatttagtgaacccctttggttcctgaaaaattcaaggagta---tgtaggacatggtccccagaagacagtacaagactttctgat-aactggacatttcaagacccaa i ponAbe2.chr14 I 15 C 0 s nomLeu3.chr5 77086562 229 - 143122389 aggaagcaggaccagtttgagtggcaacaatgcagcaacagaaacaa-cggaaacaacagaatgattggaatgtcc-ttttttt-tctcctccttctgacttgataaaagggactgtcttccttggatttagtgaacctcttctgttcttgaaaaattcaaggagta---tgtaggagattgtccccagaagacagtacaagactttctgctaaactggacatttcaagacccaa i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35584936 229 - 95678458 aggcagcaggacca-tttgagtggcaacaatgcagcaacaggagcaa-gtgaaacatcagaatgactggaatgtcc-tttttttccctcctccttctgacttgataaaagggactgtcttccttggatttagtgaatcccttcagttattgaaaaattcaaggagta---tgtaggaaatagtctccagaagacagtacaaggctttctgttaagctggacatttcaagacccaa i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36538000 229 + 96509753 AGGCAGCAGGACCA-TTTGAGTGGCAACAATGCAGCAACAGGAGCAA-GTGAAACATCAGAATGACTGGAATGTCC-TTTTTTTCCCTCCTCCTTCTGACTTGATAAAAGAGACTGTCTTCCTTGGATTTAGTGAATCCCTTCAGTTATTGAAAAACTCAAGGAGTA---TGTAGGAGATAATACCCAGAAGACAGTCCAAGGCTTTCTGTTAAACTGGACATTTCAAGACCCAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32628830 221 - 90941950 AGGCAGCAGGACCAGTTTGAGTGGCAACAACGCAGCAACAGAAACAA-GGGAAACATCAGAATGACTGGAATGTCC-TTTTTAT-TCTCCTCCTTCTGACTTGATAAAAGGGACTGTCTTCCTTGGATTTAGTGAATCCCTTCAGTTAT--------TCAAGGAGTA---TGTAGGAAATAGTCTCCAGAAGACAGTACAAGGTTTTTTGTTAAGCTGGACATTTCAAGACCCAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794527 229 - 90373283 AGGAAGCAGGACCAGTTTGAGTGGCAACAATGCAGCAACAGAAACAATAGGATACAACAAAATGATTGGAATGTTC-GTTTTTT--CTCCTCCTTCTGACTTGATAAAAGGGACTGTCTTCCTTGGATTTAGTGAGCCCCTTCAGTTATTGAAAAATTCAAGGAGTA---TGTAGGAGATAGTCTCCAGAAGACAGTACAAGATTTTCTGCTAAACTGAACATTTCAAGACCCCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10139252 229 + 96796970 aagcagcaggaccagtttcggtggcaacaatgcagcaacagaatcaa-cagaaaaaacagaacaattaaaatgtcc-tttgtct-tctcctccttctgacatgataaaaaggattgtcttctttgggcttagtgaacccctttggttcttgaaaaattcaaagagta---catagaaaatagtccccataagacactataagacttcctgctaaactggacatctcaagacccaa i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81175368 228 - 85426708 ggcctgcagaaccagtttcaacagcaatgttgcaggaacagaatcaa-aggaaaccacagaatgatgagcatgtcc-ttttttc----catccaaaaggcttatgaaagaggactgtc-tctctggtcttagggaaacccttaggttctcgggaaattcaagggggaaagTATAGGCGATAACCCACAAGGAAAAGTATAAAGTTTTCTATGAAACTGAACATCTTAGGACACAA i canFam3.chr2 C 0 I 169 a score=918150.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 187903 287 + 478999 ataactaatcag-aaaaatcaa-----------------------------------------------agatgtgaTACTCTTTTTT-ATGCCATGCATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATATTGGGATCTCTAAGGATAAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGGTAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACTTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGCAGGGGACTAACTCACTGCCACTCTAAAACTACCTGAACCAAACTATGACATCTCACCTGAT-ATGTAAGATGCA--ATTGTTATAAT-TATTTTAAACCTCAATT s panTro4.chrUn_GL393519 30321 287 + 413329 ataactaatcag-aaaaatcaa-----------------------------------------------agatgtgaaactctttttt-atcccatgcATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATATTGGGATCTCTAAGGATAAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGGTAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACTTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGCAGGGGACTAACTCACTGCCACTCGAAAACTACCTGAACCAAACTATGACATCTCACCTGAT-ATGTAAGATGCA--ATTGTTATAAT-TATTTTAAACCTCAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283682 287 - 108868599 ataactaatcag-aaaaatcaa-----------------------------------------------agatgtgacactatttttt-atcccATGCATAGGTGCTACACTTGG-ATCAAATGAACAATGTTGGGATCTCTATGGATAAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGATAAAGAATCCTGCACCCACTCGTACTTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGCAGGGGACTAACTCACTGCCACCCGAAAACTACCTGAATGAAACTATGACATCTCACCTGAT-ATGTAAGATGCA--ACTGTTACAAT-TATTTTAAACCTGAATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77086791 288 - 143122389 ataactaatcag-aaaaatcaa-----------------------------------------------agatatgacactctttttt-atcccatgcATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATATTGGGATCTCTAAGGATAAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGGTAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACTTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGCAGGGGACTAACTCATTGCCACTCTAAAACTACTTGAACCAAACTATGACATCTCACCTGATAATGTAAGATGCG--ATTGTTATAAT-TATTTTAAACCTCAGTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35585165 288 - 95678458 acaactaatcag-aaaaataaa-----------------------------------------------agatatgacactgttttttaatcccaTCCATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATGTTGGGATCTCTAAGTATCAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGATAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACCTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGAAGGGGACTAACTGACTGCCACTCTAAAACTACCTGAACCACACTATGACATGTCACCTCAT-ATGTAAGATGCG--ATTGTTATAAT-TACTTTAATCCTCAATT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36538229 287 + 96509753 ATAACTAATCAG-AAAAATCAA-----------------------------------------------AGATATGACACTATTCTTTAATCCCATGCATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACGGTGTTGGGATCTCTAAGTATCAAGGTC-TAAAAGTCCTGAGATAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACCTCTAACTTGTCTTGCTTTTTGTCTGATTTCTGGCTGATGAAGGGGACTAACTGACTGCCACTCTAAAACTACCTGAACCACACTATGACATGTCACCTCAT-ATGTAAGATGCG--ATTGTTATAAT-TACTTTAATCCTCAATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32629051 288 - 90941950 ATAActaatcag-aaaaatgaa-----------------------------------------------agatatgaCACTGTTTTTTAATCCCATCCATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATGTTGGGATCTCTAAGTATCAAGGTCTTAAAAGTCCTGAGATAAAGAATCCTGTATCCATTGGTACTTCTAAATCgtcttgctttttttctgatttctggcTGATGCAGGGGACTAACTGACTGCCACTCTAAAACTAGCTGAACCGCACTATGACATCTCACCTGAT-ATGTAAGatgtt--attgttataat-tattttaaacctCAATT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37794756 287 - 90373283 ATAACTAATCTG-AAAAATCAA-----------------------------------------------AGATGTGACACTACTTTTT-ATCCCATGCATAGGTGTTATACTTGG-ATGAAATGAACAATGTTGGGATCGCTAAGGATAAAGGTCTCAGAAGTCCTGAGATAAAGAATCCTGCACCCATTGGTACTTCTAACTTGTCTTGCTTTTGGTCTGATTTCTGGCTGATGCAGGGGACTAACTGACTGCCACTCTAAAACTACCTGAACCAAACTATGACATCTCACTTGAT-ACGTAAGATGCA--ATTGTTACAAT-TATTTTAAACCTCAATT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10139481 289 + 96796970 aggactaaccagaaaaaatcaa-----------------------------------------------agatgtgacattatttTTT-ATCCCATGCATAGGTGTTATACTTGGAATGAAATAAACAATGTTGGGATCTCTAAGGATAAAGGTCTTAAAAGTCCCGAGATAAAGAATCCTGCACCCATTGGTTCTTCTAACTAGTCTAGCTTTTTGTTTGATTTCTAGCTGATGCAGGGGACCAACTCACTGCCACTTTAAAACTACCTTAACCAGACTATGACATCTCACCTGAT-ATATAAGATACA--ATGGTTATAAT-TATTTTAAACCTCAATT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81175765 335 - 85426708 ataaataagtaa-ataaataaataaataaataaataaataaataaataaaATCTTTTTAAAAAGCACCCAGGTATAACATTATGTGA--ACCCCATGCAGAAGGGTTATAGTTGGAATGAAACAGATACAGTGAGGATCCCTAAGGATAAAGGTCTCAAGAGTCCTGACATAAAGAACCCTGCACCCATTGCTACTTCTAACTAGTCTAGCCTTTTGCTTGGTTTCTGGGTGATGATAGGCTCTAACTCACTGCCATCCCAAAGT--GCTGAATCAAATTATACCTTCTCAGCTGTT-ACATAGGAAGTAACACTATTTTACTATATTTTAAACCTCAGTT i canFam3.chr2 I 169 I 253 a score=1525625.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 188190 502 + 478999 TAGCATTAACTAGCCTTTTCATGTAAACACTTACACATGATGATGACTAGAAACAGCATACTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTGAGAAGATACATCAACATTTTGCTCAAGTAGAAGATTGACTATACTTGCTGATCC-------ACAACA-----TACAGCAAGTATGAGGGCAGTTCTAAAATTACAGAGA--TAATTTCTCCTTTAGGAACTGTAATAAAGTTATTTTAAAAGCTAATTTG-ATATACTTTACCAATTTGACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATCAAACATTTACATGCGCTAA--AAGACATAAGCATCTTGGGTGCTCAAGAGTTCATCTTTGTAAAATACCACCAAGG------TTAAAAGGAAGGGAC--AAAAAGGAAA--CCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGCATAGCAGAAGCTACTAATTTAAAGTCCTTTGATGGGCAAGAAACAATGCTAGGGCCACTTATCTGAAGTGGACAAAGA---TTTAAGTGAAG------ATTTTGTCACA s panTro4.chrUn_GL393519 30608 502 + 413329 TAGCATTAACTAGCCTTTTCATGTAAACACTTACACATGATGATGACTAGAAACAGCATACTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTGAGAAGATACATCAACATTTTGCTCAAGTAGAAGATTGACTATACTTGCTGATCC-------ACAACA-----TACAGCAAGTATGAGGGCAGTTCTAAAATTACAGAGA--TAATTTCTCCTTTAGGAACTGTAATAAAGTTATTTTAAAAGCTAATTTG-ATATACTTTACCAATTTGACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATCAAACATTTACATGCGCTAA--AAGACATAAGCATCTTCAGTGCTCAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACCACCAAGG------TTAAAAGGAAGGGAC--AAAAAGGAAA--CCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGCATAGCAGAAGCTACTAATTTAAAGTCCTTTGATGGGCAAGAAACAATGCTAGGGCCACTTATCTGAAGTGGACAAAGA---TTTAAGTGAAG------ATTTTGTCACA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90283969 492 - 108868599 TAGCATTAACTAGCCTTTTAATATAAATGATTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATAGTCTCTGGCCGCCTGTCCAGATAGGTCTTGAGAAGATACATCAATATTCTGCTCAAGTAGAAGGCTGACTATACTTGCTGATCC-------ACCACA-----CACAGCAAGTATGAGGGCAGTTCTAAAATGACAGAGA--------------TAGGAACTGTAATAAAGTTATTTCAAAAGCTAATTTG-ATATACTTTACCAATTTCACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATCAAACATTTACATGCACTAA--AAGACATAAGCATCTTCAGTGCTCAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACTACCAAGG------TTAAAAGGAAAGAGA--AAAAAAAAAACCCCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGCATAGCAGAAGCTACTAATTTAAAGTCCTTTGATGGGCAAGAAATAATGTTAGGCCCACTTATCCGAAGTGGACAAAGA---TTTAAGTGAAG------ATTTCATCACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77087079 504 - 143122389 TAGCATTAACTAGCCTTTTAATGTAAACACTTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATACTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTGAGAAGATACATCAATATTTTGTGCAGGTAGAAGGCTGACAATACTTGCTGATCC-------ACAACA-----TACAACAAGTGTGAGGGCAGTTCTAAAATGACAGAGA--TAATTTCTCCCTTAGCAACTGTAATAAAGTTATTTTAAAAGCTAATTTG-ATATACTTTACCAATTTAACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATCAAACATTTACATGCACTAA--AAGACATAAGCATCTTGGGTGCTCAAGAGTTCATCTTTGTAAAATACCACCAAGG------TTAAAAGGAAGGGACAAAAAAAGGAAA--CTTCTTATCTCAGTGGGGTATTGCATAGTAGAAGCTACTAATTTAAAGTGCTTTGATGGGCAAGAAACAAAGCTAGGGCCACTTATCTGAAGTGGACAAAGA---TTTAAGTGAAG------ATTTTATCACA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35585453 502 - 95678458 TAGCATTAACTAGCCTTTTAATGTAAACACTTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATAGTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTTAGAAGAGACATTAATATTTTGCTCGAGTAGAAGGCTGACTATACTTGCTGATCC-------ACAACG-----TACAGCAAGTATGAGAGCATTTCTAAAATGACAGAGA--TAATTTCTCCCTTAGGAACTGTAATAAACTTATTTTAAAAGCTAATTTTGATATACTTTATCAACTTAACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATTAAAGATTTACATGCACTAA--AACACACAAGCA-CTTGGGTGCTTAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACCAACAAGG------TTTAAAGGAAGGGAC--AACAAGGAAA--CCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGTGTAGTAGAAGACATTAATTTAAAGTCCTTTAATGGGCAAGAAACAATGCTAGTGTCACTTATCTGAAGTGGACAAAGG---TTTAAGTGAAG------ATTTCCTTACA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36538516 502 + 96509753 TAGCATTAACTAGCCTTTTAATGTAAACACTTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATAGTCTCTGGCCATCTGTCCAGATAGATCTTTAGAAGAGACATTAATATTTTGCTCGAGTAGAAGGCTGACTATACTTGCTGATCC-------ACAACG-----TACAGCAAGTATGAGAGCATTTCTAAAATGACAGAGA--TAATTTCTCCCTCAGGAACTGTAATAAACTTATTTTAAAAGCTAATTTT-ATATACTTTATCAATTTAACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATTAAAGATTTACATGCACTAA--AACACATAAGCGTCTTGGGTGCTTAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACCAACAAGG------TTTAAAGGAAGGGAC--AACAAGGAAA--CCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGTGTAGTAGAAGACATTAATTTAAAGTCCTTTAATGAGCAAGAAACAATGCTAGTGTCACTTATCTGAAGTGGACAAAGG---TTTAAATGAAG------ATTTCCTTACA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32629339 501 - 90941950 TAGCATTAACTCTCCTTTTAATGTAAACACTTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATAGTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTTAGAAGAGACATCAATATTTTGCTCAAGTAGAAGGCTGACTATACTCGCTGATCC-------ACAATG-----TACAGCAAGTATGAGAGCATTTCTAAAATGACAGAGA--TAATTTCTCCCTTAGGAACtgtaataaacttattttaaaagctaattta-ATATACTTTATCAACTTAACATCTTGCCTGTCCATGCAGAATTAAAGATTTACATGCACTAA--AACACATAAGCA-CTTGGGTGCTTAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACCAACAAGG------TTTAAAGGAAGGGAC--AACAAGGAAA--CCTCTTATCTCAGTGGGGTATTGCATAGTAGAAGACATTAATTTAAAGTCCTTTAATGGGCAAGAAACAATGCTAGTGTCACTTATCTGAAGTGGACAAAGT---TATAAGTGAAG------ATTTCCTTACA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37795043 508 - 90373283 TAGCATTAACTCACCTTTTAATGTAAACACTTACACATTATGATGACTAGAAACAGCATAGTCTCTGGCCGTCTGTCCAGATAGATCTTTAGAAGAGACATCAATATTTTGCTCAAGTAGAAGGCTGACTATACTTGCTGATCC-------ACAACG-----TACAGCAAGTATGAGAGCATTTCTAAAATGACAGAGA--TAATTTCTCCCCTAGGAACTGTAATAG--TTATTTTAAAAGCTAATTTG-ATATACTTTACCAATTTAACATCTTGCCTATCCATGCAGAATGAAACATTTACATGCGCTAAATAAGACGTAAGCATCTTGGGTGCTCAAGAGTTCATCTTTGTAAAATACAACCAAGGTTAAAATTAAAAGGAAGGGAC--AAAAAGGAAA--CCGCTTGTCTCAGTGGGGTATTGCATAGTAGAAGCTACTAATTTAAAATCCTTTGATGGGCAAGAAACAATGCTAGGGCCACTTATCTGAAGTGGACAAAGT---TATGAGTGAAG------ATTTCCTTACA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10139770 501 + 96796970 TAGTGTTAACTAGCCTTTTAATGTGAACACTTACATGTCATGATGACTGGAAATTGCGTAATCTTCAGCAGTCCATCCAGATGCATCTTGAGAGAATACATCGACATCTTGCTGAAGTAGAATGCTAACTATACTTGCTGATCC-------ACAACA-----CACAGCAAGTATGAGAGCAGTTCTAAAATGACAGGGA--GAATTTCTTCCTTAGGAACTTTAGTAAAGCTATTATAAAGGCTAGTTTG-ATATACTCTACCAATTTAATATCTTGCCTGCCCATGCAGAATTAAACATTTACATGCACTAA--AAGACGTAAGCATCTTGAGTGCCTAAGTGTTCATCTTTGTAAAATACCACCAGGG------TTAAAAGGAAGGGTC--AGAAAGGAAG--ACTCTTATCTCAGTGAGGTATTGCATAGTAGAAGTTAGTAATTTAAAGGTC-TTGATGAGCAAGAAACTTTGTTATGGCTGCTTATCTGAAGTGGACAAAGA---TTTAAGTGAAG------ATTTTTTTCCA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81176353 478 - 85426708 TAGTAATAACTAGCATTTTAATGTAAAC--TTACATATTAATACTATTAATAATAGCATATTCTTCTGCAGTCCATCCATATACATCTTAGGAAAA-----------CCTTCCTAAAGAGAAGACTGACTATATTTCATGGTTCATCTTTTACAGCATATTTTACAGCAAGCATAAGGGCTATTCTAAAATAACAGAGAGATAACTTCATCCTTAAGAAC-----TCAGAGTATTTAAGCACCTAATCTG-ATATACTTCATCAGGGTAATATCTCACATGTTGCTACAGAATTGAC----------CACTAA--CA-----------------TGTCCAAGTGTTCATTTTTGTAAATTAACCCCACGG------CTAAAATGAAGGGAC--AAAAAAGAAG--TCTCTGGTTCCACTTGGGTAT--CATAGTAGAAGTTGCTAATTTAAAACCCTCTGATGAACAAGAAACTATGCCGAGGTCACTGATCTGAATAGGTGAAGGGTTTTTTAAAAAAAATTCCCCATTTTGTgaca i canFam3.chr2 I 253 I 149 a score=528261.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 188692 167 + 478999 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATTAGCTAGGGGCTAAGATAA-ATAAGAGCTCTCTGCATGCTGAAAGCAGtaatattaataataatggtaagaatagtaGTCACAGGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgtgctacgcactgaattaaatg s panTro4.chrUn_GL393519 31110 167 + 413329 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATTAGCTAGGGGCTAAGATAA-ATAAGAGCTCTCTGCATGCTGAAAGCAGTAATATTAATAATAATGGTAAGAATAGTAGTCACAGGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgtgctatgcactgaattaaatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90284461 167 - 108868599 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAACAGAAAATCAGCTAGGGTGTCAGATAA-ATAAGAGCTCTCTGCATGCTGAAAGCAGTAAGATTAATAATAATGGTAAGAATAGTAGTCACAGCAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--AAAGCAtgtgctaggcactgaattaaatg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77087583 167 - 143122389 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATTAGCTAGGGGGTAAGATAA-ATAAGAGCTCTCTGCATGCTGAAAGCAGtaatattaataataatggtaagaatagtaGTCACAGGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgagctaggcactgaattaaatg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35585955 164 - 95678458 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATCAGCTAGAGGGTAAGATAA-GTAAGAGCTCTCTGCTTGCTGAAAGCAGTAATATTAATAATAATGGTAAGAA---TAGTCACAAGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgtgctaggcactgaattaaatg i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36539018 167 + 96509753 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATCAGCTAGGGGGTAAGATAA-ATAAGGGCCCTCTGCTTGCTGAAAGCAGtaatattaataataatggtaagaatagtagtcataGGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgtgctaggcactgaattaaatg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32629840 164 - 90941950 GCTTCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATCAGCTAGAGGGTAAGATAA-GTAAGAGCTCTCTGCTTGCTGAAAgcagtaatattaataataatggtaaGAA---TAGTCATAGGAGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAagcatgtgctaggcactgaatTAAATG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37795551 164 - 90373283 GCTCCCCTAGACTGATATGCTGTAATAGAAAATCAGCTAGAGGGTAAGATAA-GTAAGAGTTCTCTGCTTGCTGAAAGCAGTAATATTAATAATAATGGTAAGAA---CAGTCATAGGCGTTTCAGTTAATGATGCCAA--TAAGCAtgtgctaggcactgaattaaatg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10140271 159 + 96796970 GCCTCCCTAGACTGATACCCT-TAATAGAAAATCAGCCAGAGGCTCAGATAA-ATAAGAGTATTCTGCATGCTGAAAGCAATAGTATTAAAAATAATGGTAAGAAGTGTA-------TGGCATCAGTTAATGTTGCCAA--TAAGCATGTGCTAGGCACTGAATTAAATG i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81176980 166 - 85426708 TCTTCCTTAAACTGGTACAGTGTACCTCCAAACCACCTGGAGGCCAGGTCGGTATAAAAGCTATCTGTAGGCTTAAAACAGTAATATTCACACTAATGATAAGAA-AACAGTCATA---GTTGCAGTTAGTGATGTTAAGTTAAACAtgtggtaggcactaaatcacatg i canFam3.chr2 I 149 I 1 a score=344078.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 188859 139 + 478999 ccacacgtatctttcttgcttatgcacagccaactttgaaggata---tattctcctacttttcacatatgacaacatattggg---tggtaaatcacgttcccaatgtcacacacgtagcaagtaagaaagttaggaattaaac s panTro4.chrUn_GL393519 31277 139 + 413329 ccacatatatctttcttgcttatgcacagccaactttgaaggata---tattctcctacttttcacatatgacaacatatttgg---tggtaaataacgttcccaaggtcacacacgtagcaagtaagaaagttaggaattaaac i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90284628 134 - 108868599 ccacatatatcttt----cttatgcacagccaactttgaaggata---tattctcctacttttcatatatgacaacatatttgg---tggtaaataacgtccccaaggtcacacacctagcaagtaagaaagttaggaatt-aac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77087750 139 - 143122389 ccacatatatctttgttgcttatgcacagccaactttgaaggata---tattctcctacttttcacatatgacaacatatgggg---tggtaaataacattcccactgtcacatacctagcaagtaagaaagttaggaattaaat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35586119 139 - 95678458 ccatatatatcttccttacttatgcacagccaactttgaaggatg---tattctcctacttttcatatatgacaacatgtgtgg---tggtaaataagattcccaaggtcacacacctagcaagtaagaaagctagggattaaac i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36539185 139 + 96509753 ccatatatatcttccttacttatgcacagccaactttgaaggatg---tattctcctacttttcatatatgacaacatgtgtgg---tggtaaataagattcccaaggtcacacacctagcaagtaagaaagctagggattaaac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32630004 138 - 90941950 CCATATATATCTTCCTTACTTATGCACAATCAA-TTTGAAGGATA---TATTCTCCTACTTTTCATATATGACAACACATTTGG---TGGTAAATAAgattcccaaggtcacacacttaCCAAGTAAGAAAGCTAGGGATTAAAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37795715 138 - 90373283 tcatatatatcttccttacttatgcacaatcaa-tttgaaggata---tattctcctacttttcatatatgacaacacatttgg---tggtaaataagattctcaaggtcacacacttaccaagtaagaaagctagggattaaac i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81177147 144 - 85426708 ttatatatatataa-ttatttacacacaaccacccttgaaggatatattattatcctccttttcatatcaggatatgtatctggtgatggtaagtaatgtttccaaggtcacatacccagcaaggaggcaagctaacaattaaac i canFam3.chr2 I 1 C 0 e calJac3.chr16 10140430 0 + 96796970 C a score=919016.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 188998 279 + 478999 ccagtcttgtgtgaatccaaagcgtagctcttttctctttatcacCCACCTACAGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCACTTAAAACTATCTTCACTCCCTCTCTCCATACCAACTAAAAATAAAAACATCAAAATACACTGGAAATAAAAAAGGAAAA---AAGCTGTTGAACCCACAGTATGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGCT---AACATTAATATTCTTCAA-AGAAA-GCAACTTAAAGCAGA--GTCAT-TGAAAAGACAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 31416 279 + 413329 ccagtcttgtgtgaatccaaagcctagctcttttctgtttatcacCCACCTACAGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTATATCCACTTAAAACTATCTTCACTCCCTCTCTCCATACCAACTAAAAATAAAAACATCAAAATACACTGGAAATAAAAAAGGAAAA---AAGCTGTTGAACCCACAGTATGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGCT---AACATTAATATTCTTCAA-AGAAA-GCAACATAAAGCAGA--GTCAT-TGAAAAGATAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 90284762 279 - 108868599 ccagtcttgtgtgaatccaaagcctagctcttttctctttatcacCCATCTATGGCTTGTCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCACTTAAAACTATCTTCACTCCGTCTCTCCATACCAATTAAAAATAAAAACATCAAAATACGCTGGAAATAAAAAAGGAAAA---AAGCTTTTAAAGCCACAGTATGTGGGAACAGCAATTCATTGTCATGTAGGGATAAGCT---AACATTAATATTCTTCAA-AGAAA-GCAACTTAAGGCAGA--GTCAT-TGAAAAGACAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 n 0 s nomLeu3.chr5 77087889 278 - 143122389 ccagtcttgtgtgaatccaaagtctagctcttttctctttatcacCCATCTATGGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCACTTAAAACTATCTTCACTCCCTCTCTCCATACCAACTAAAAAT-AAAACATCAAAATACACTGGAAATAAAAAAGGAAAA---AAGCTGTTGAACCCACAGTATGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATATGCT---AACATTAATATTCTTCAA-AGAAA-GCAACTTAAAGCAGA--GTCAT-TGGAAAGACAAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35586258 281 - 95678458 ccagtcttgtgtgaatccaaagcctagctcttttctctttatcacCCACCTACGGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCACTAAAAACTATCTTCACTCCCTCTCTCCACACCAGTTAAAAATAAAACCATCAAAATACACTGGAAATAGAAAAGGAAAAGCTAAGCTG-TGAACCCATAGTGTGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGCT---AACATTAATATTCTTCAA-ACAAG-GCAACTTAAAGTAGA--GTCAT-TGAAAAGACAAAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36539324 278 + 96509753 ccagtcttgtgtgaatccaaagcctagctcttttctctttatcacCCACCTACGGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCGCTTAAAACTATCTTCACTCCCTCTCTCCATACCaattaaaaataaaaacatcaaaatacactggaaataaaaaaggaaaa---aAGCTG-TGAACCCATAGTGTGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGCT---AACATTAATATTCTTCAA-ACAAG-GCAACTTAAAGTAGA--GTCAT-TGAAAAGACAAAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32630142 277 - 90941950 CCAGTCTTGTGTGAATCCAAAGCCtagctcttttctctttatcaccCACCTACGGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTGTATCCACTTAAAACtatcttccctccctctctccataccaattaaaaataaaaccatcaaaatacactggaaataaaaaaggaa-----aagctgtTGGACCCACAGTATGTGGGAATAGCAATTAACTGTCAAGTAGGGATAAGCT---AACAGTAATATTCTTCAA-ACAAG-GCAACTTAAAGCAGA--GTCAT-TGAATAGAAAAAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37795853 278 - 90373283 ccagtcttgtgtgaatccaaagcctagctcttttctctttatcacCCACCTACGGCTTGCCTTCATTAAAGGAAAAGTTTATCCACTTAAAACTATCTTTACTCTCTCTCTCCAAACCAATTTAAAA-AAAACCATCAAAATACACTGGATATAAAAAATGACGA---AAGCTGCTGAAACCACAGTATGTTGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGTT---AACATTAATATTCTTCAA-AGAAA-GCAACTTAAAGCAGA--GTCAT-TAAAAAGACAAAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10140430 275 + 96796970 CCAGTCTTGTGTGAATCTAAAGCCTAGCTCTTTTCTCTTTATCACCCACCTACAGCTTGCCTTTATTAAAGGAAAAGCGTATCCACTTAAAACTGTCTTCACCCCCTCTCTCCATACCAATT-----TAAAAACATCAAAATACACTGGAAATAAAAAAGAAAAA---AAGCTGATGAACCCAAAGTATGTGGGAATAGCAATTAATTGTCATGTAGGGATAAGCA---AACATTAATATTCTTCAA-AAAAAGGCAACTGAAAGCAGA--GTCAT-TCAAAAGACAAAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81177291 277 - 85426708 ctagtcttctgtgaatctaaagtccatctcttttctctttatcacTCACCTATGATTTATCCTCATTAAAGGAAGAGTCTATTCACCTAAGGTTCTCTTTCATCCTTCAATCCATTCCAATTAAAAATGAAAATGATAAAACATACTGGACATGAAAAAGTATAA---AAACTGATGAACCCAGAGTATCTGCTAATGGTAA-------CCACTTCGGGATCATCTAACAACATCAGTATTCTTCAACAAAAA-GTAA--TAAAGCAAAGTGTCATCCAAAAAAACAAAA i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=1975606.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 189277 666 + 478999 GGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTAATACAGCATATTTAGTGGAAAAGCATATAAGATACAGAGGTTAAAACCTACTA--GAAAGGGTTAAAAAGTTCAATACTGAGTCAtaaagtaaactgaaagttaaagttc--------aaacttCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAAGATCATGTAACCAAAAACATCATACAACAAATAACATCAGTCAATATAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-ACAGTTCTTTATGTTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGCTTTTCTACTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAAGTATAATTTGATCTTATTAATTTATTATTTATGACTTGAGTGACTGCTATCAATCTAGAA--------------CAACACACAGATTAAAAGAAATAACCATACCTTCCATATCTATCAAGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTTCCTGTTTTTGTTCATGTACGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCACACTGTAAAACAATATAAAACAAAAACAATATGTAATTCAAAAAATTATGTATCTCTCAACTGAACTGGAAGCT-------------TATGGACTTACA------CTCACAGAAAGTAAATAAAATTTGGTCGCTTCCTTCTCACTCTTCTGTACTTT s panTro4.chrUn_GL393519 31695 655 + 413329 GGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTAATACAGCATATTTAGTGGAAAAGCATATAAGATACAGAGGTTAAAACCTACTA--GAAAGGGTTAAGAAGT-----------TCATAAAGTAAACTGAAAGTTAAAGTTC--------AAACTTCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAAGATCATGTAACCAAAAACATCATACAACAAATAACATCAGTCAATATAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-ACACTTCTTTATGTTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGCTTTTCTACTTAACTGATT-TGTGTTGATATTGATCACTATGTCCCAATAAGtataatttaatcttattaatttattatttatGACTTGAGTGACTGCTATCAATCTAGAA--------------CAACACACAGATTAAAAGAAATAACCATACCTTCCATATCTATCAAGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTTGCTGTTTTTGTTCATGTACGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCACACTGTAAAACAATATAAAACAAAAACAATATTTAATTCAAAAAATTATGTATCTCTCTACTGAACTGGAAGCT-------------TATGGACTTACA------CTCACAGAAAGTAAATAAAATTTGGTCGCTTCCTTCTCACTCTTCTGTACTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7090085 674 + 72422247 GGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTAATACATCATATTTAGTGGAAAAGCATATAAGACACAGAGGTTAGAAACTACTA--GAAAAGGTTAAGAAGTTCAATACTGAGTCATAAAGTAAAC--AAAGTTAAAGTTC--------AAACTTCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAAGATCATGTAACCAAAAACATCATACAACAAATAACATCAGTCAATATAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAGA-ACAGTTCTTTATGTTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGCTTTTCTACTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATATCCCAATAAGTATAATTTAGTCTTATTAATTTATTATTTATGACTTGAGTGA---CTATCAATCTAGTA--------------CAACACACAGATCAAAAGAAATAACCATACCTTCCATATCTATCAAGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTTGCTGTTTTTGTCCATGTACGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCATACTGTAAAACAATATAAAACAAAAACAATATGTAATTCAAAAAATTATGTATTTGTCAACTGAATTGGAAGCTTTATATAAGATCCTATGGACTTACA------CTCATAGAAAGTAAATAAAATGTAGTCGCTTCCTTCTCACTTTTCTGTACTTT i ponAbe2.chrUn I 2727 C 0 s nomLeu3.chr5 77088167 672 - 143122389 GGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTAATACAGCATATTTAGTGGAAAAGCATATAAGACACAGAGGTTTAAAACTACTA--GAAAGGGTTAAGAAGTTCAATACTGagtcatagattaaactgaaagttaaagttc--------aaacttCATAAAATTATTATGAAATCCCTTT-GCTAACATAAGATCACGTAA-CAAAAACGTCATACAACAAATAACATCAGTCAATATAATAAGAGAAGATGAATCCTAATAAA-ACAGTTCTTTATATTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGCTTTTCTACTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAAGTATAATT-----GTATTAATTTATTATTTATGACTTGAGTGACTGCTATCAATCTAGAA--------------CAACACACAGATTAAAAGAAATAACTATACCTTCCATATCTATCAAGTGCACTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTCGCTGTTTTTGGTCATGTACGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCacaatgcaaaacaatataaaacaaaaacaatacGTAATTCAAAAAATTATGTATTTCTCAACTGAATTGGAAGCTTTATATAAGATCCTATGGACTCACA------CTCATAGAAAGTAAATAAAATGTAGTCTCCTCCTTCTCACTCTTCTGTACTTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35586539 673 - 95678458 GGATTCTCAACTCC-TATTTATGTTCCATACAGCATATTTATCAGAAAAGCATAGAAGACACAGAGGTTAAAAACTACTG--GAAAGGGTTAAGAAGTTCAATACTGAGTCATAAAGTAAACTAAAAGTTAAAGTTT--------ACATTTCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAATATCAGGTAACC-AAAATGTCATACAACAAATAACATCAGTCAATACAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-ACTGTTCTTCATGTTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGTTTTTCTGCTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAAGtataatttaatcttattaatttattatttatGACTTGAGTGACTGCTATCAATCTAGAA--------------CAACACAGAGATTAAAAG----AACTATACCTTCCACATCTGTCACGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTTGCTGTTTTTGTTCATGTACGCCAAGTAACAGCGGTGTGAGGTCATGCTGTAAAACAATATAAAGCAAAAACGA-ATGCAATTCAAAAAAGTACATACTCCTCAACTGAAGCGGAAACTTTATATAAGATCCTACGGACTTACA------CGCATACAAAGTAAGTAACATGTAGCTGCTTCCTCCTCAATCTTCTGTGCTTT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36539602 674 + 96509753 GGATTCTCAACTCC-TATTTATGTTCCATACAGCATATTTATCAGAAAAGCATAGAAGACACAGAGGTTAAAAACTACTG--GAAAGGGTTAAGAAGTTCAATACTGAGTCATAAAGTAAACTAAAAGTTAAAGTTT--------ACATTTCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAATATCAGGTAACC-AAAATGTCATACAACAAATAACATCAGTCAATACAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-ACTGTTCTTCATGTTG--------------------------------------------------------CCCAGTCCAAATAATTGTTTTTCTGCTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAAGTATAATTTAATCTTATTAATTTATTATTTATGACTTGAGTGACTGCTATCAATCTAGAA--------------CAACACAGAGATTAAAAG----AACTATACCTTCCACATCTGTCACGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTAGCTGTTTTTGTCCACGTACGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCATGCTATAAAACAATATAAAATAAAAACAATATGTAATTCAAACAATTATGTATTTCTCAGCTGAACTGGAAACTTTATATAAGATCCCATGGACTTACA------CTCATAGAAAGTAAATCAAATGTAGCTGCTTCCATCTCACTCTTCTGTGCTTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32630419 679 - 90941950 GGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTCATGCAGCGTATTTAGCAGAAAAGCATATAAGACACAGAGGTTAAAAACTACTA--GAAAAGGTTAAGAAGTTCAATACTGGGTCAAAAAGTAAACTAAAAGCTAAAGTtc--------acatttcataaaattaacaTGAAATCCCTTTAGCTAACATAATATCATCTAACCAAAAACATCATACAACAAATAACATCAGTCAATACAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-CCTGTTCTTCATGTTG--------------------------------------------------------TCCAGtccaaataattgtttttctacTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAAGTATAATTTAATCttactaatttattatttatgactTGAGTGACTGCTATCAATCTCGAA--------------CAACACacagattaaaagaaataactataCCTTCCACATCTGTCACGTGCACTTAAATTAgcttttttcttgattaaaaattTCACCACTTGCTGTTTTTGTCCATGTACACCAAGCAAAAGTGGAGTGAGGCCATGctgtaaaacaatataaaacaaaaacaatatgtaattcaaaaaatTACCTATTTCTCAGCTGAACTGGAAACTTTATATAAGATCCCGTGGACTTACA------CTCATAGAAAGTAAATCAAATGTAGCTGCTTCCATCTCACTCTTCTGTGCTTT i papAnu2.chr10 C 0 I 34 s chlSab2.chr2 37796131 672 - 90373283 GGATTTTCAACTCCTTATTTATGTTTAATATAGCATATTTAGTAGAAAAGCATACAAGACACAGAGGTTAAAAACTACTA--GAAAGGGTTAAGAAGTTCAATACTGAGTCATAAAGTAAACTGAAAGTTAAATTTC--------AAGCTTCATAAAATTAATATGAAATCCCTTTAGCTAACATAAGATCATGTAACCAAAAACGTCATACAACAAATAACATCAGTCAATATAATAAGATAAGATGACTCCTGCTAAA-ACTGTTCTTCATGTTC--------------------------------------------------------TCCAGTCCAAATAACTGCTTTTCTATTTAACTGATT-TGTGTTGATACTGATCACTATGTCCCAATAACTATAACTTAATCTTA-----TTATTATTAATGACTTGAGTGA---CTATCAATCTAGAA--------------CAACACACAGATTAAAAGAAATAACTATACCTTCCATATCTGTCAAGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCACTTGCCGTTTTTGTCCATGTAAGCCAAGCAAAAGTGGTGTGAGGCCATGCTGTAAAACAATATAAAACAAAAACAATATGTAATTCAAAAAATTACGTATTTCTCAAATAAATTGGAAACTTTATATAAGATCCCACGGACTTACA------CTCATAGAAAGTAAATAAAATGTAGCTGCTTCCATCTCACTCTTCTGTGCTTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10140705 726 + 96796970 TGATTTTCAACTCC-TATTTATGTTTAATATAGCATATTTAATGGAAGAGCGTATAAGAAGCAGAGGTTAAAAACTACTA--GAAAGGTTTAAGAAGTTCAGTACTGAGTCATAAAGTAAACTAAAAGTTGAAGTTC--------ACACTTCATAACACTCATAGGAACTCCCGTTAGCTAACGTAGGATCATATAACCAAATATGTCACATAACAAGTAACATCAGTCCATATAATAAGAGAAGATGAATCCTACTAAA-ACTGTTCTTTATGTGAACTAAAAAAAGTGGTAACTTTAAAGTTATTGTATGGATCGCCATGTGACTGCTTATCCCAGTCCAAATAACTGCTTTTCCCCTTAACTCATT-GGTGTTGATACTCATCACTATGTCCCAACAAGTAGAAGTGAATCTTATTAATTTACTACTTATGACTTGAGTGA---CGATCACTCTAA-----------------AACACACAGATTAAAAGAATTAACTATACCTTCCAAATCTATCAAGTGCATTTAAATTAGCTTTTTTCTTGATTAAAAATTTCACCATTTGCTCTTTTTGTCCATGTACACCCAGCAAAAGTGGTGTCAGGCCACTCTGTAAAACAATATAAAGCAAAAACAATATGTAATTCAAAAAATCACATATTTCTCAACTGAACTGGAAACTTTATATAAGATCCTATGGACTTACA------CTCGCAGAAAGGAAATAAAACGT---CGCTTCCTTCTCGCTCTTCTGTGCTTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81177568 669 - 85426708 -------CAACTCC-TACTTATGCTTATT---GTATATCTTTT---AAAGTATGAAATAGA---ATCTTAAAAAATATTAATAAAAGAGTTCAGATATCCAGAATTGTGTCATAAAGTAAACTACAAGTTGGGAGTCCCCATTATAAAACTAATAATATTAATATGAAACCCTTTT----AATATAAAATCCGATGGCAAAAAAACT---ATTGCAAATGACATCAATCAATATTACAAAGAAATATGAATTCTGCTATACACTGTTC---ATGTTG--------------------------------------------------------GCCTGTCAGAAAAATTGC-TTTCTACCTAAGAGATGACATCCTGACATTTTTCACTAT------ATGACTATAACTTAATCATCTTAAGATAAAATTTATGACATGAGAAATTGTTACCACTCAAGACAAAATAGTAAGGTTTAAAAAACAAAACAAAAAAA--TACTCTACCTTTTAACCGTATCCCCTGAAAGTAGACGTGCTCCTTTTCCTACTAAAAATTTCACCATTTGCTCTTTGTTTTCATTTAGAGCAACTAAAACTGGTGTGAGGCCATCCTGTAAA-------AGTGAAAAGACAACTTATAATTTATAAAATTACATATTTGCATGCTAAATTTTAAAATTTCTATACATTCTGCTAAACTTAAAACATATACTGTAGAAAGTAAAATAAAATTAGCCCCTTCCTTCTCACCACTCTGTGTTTT i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=16776.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 189943 7 + 478999 -CCCACGT s panTro4.chrUn_GL393519 32350 7 + 413329 -CCCACAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7090759 7 + 72422247 -CCCACAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77088839 7 - 143122389 -CCCACAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35587212 7 - 95678458 -CCCACGT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36540276 7 + 96509753 -CCCACAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37796803 7 - 90373283 -CCCATGT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10141431 7 + 96796970 -CCCACAC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81178237 8 - 85426708 CACCACCT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.chr10 32631098 34 - 90941950 I a score=74118.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 189950 30 + 478999 GCCACTCCTTCCCTT-GGAAACATCCCTTCT- s panTro4.chrUn_GL393519 32357 30 + 413329 GCCACTCCTTCCCTT-GGAAACATCCCTTCT- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7090766 27 + 72422247 GCCACTC---CCCTT-GGAAACACCCCTTCT- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77088846 30 - 143122389 GCTGCTCCTTCACTT-GGAAACATCCCTTCT- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35587219 30 - 95678458 GCTGCTCCTTCCCGT-GGAAACACCCCTTCT- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36540283 30 + 96509753 GCTGCTGCTTCCCTT-GGAAACACCCCTTCG- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32631132 30 - 90941950 GCTGCTGCTTCCCTT-GGAAACACCCCTTCG- i papAnu2.chr10 I 34 C 0 s chlSab2.chr2 37796810 30 - 90373283 GCTGCTGCTTCCCTT-GGAAACACCCCTTCG- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10141438 31 + 96796970 GCTCCTCCTTCCCTTGGGAAACACCTCTCCT- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81178245 28 - 85426708 ---GCTTCTTCTTTT-TAAAAGACTGCTTTCT i canFam3.chr2 C 0 I 237 a score=83371.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 189980 29 + 478999 CTGCCTCACCAC--ATTAAATCTGATCATCT s panTro4.chrUn_GL393519 32387 29 + 413329 CTGCCTCACCAC--ATTAAATCTGATCATCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7090793 29 + 72422247 CTGCCTCACCAC--ATTAACTCTGATCATCT i ponAbe2.chrUn C 0 I 1718 s nomLeu3.chr5 77088876 29 - 143122389 CTGCCTCACCAC--CTTAACTCTGATCATCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35587249 29 - 95678458 CTGCCTCACCAC--ATCAACGCTGATCATCT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36540313 29 + 96509753 CTGCCTGACCAC--ATCAACTCTGATCATCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32631162 29 - 90941950 CTGCCTGACCAC--ATCAACTCTGATCATCT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37796840 29 - 90373283 CTGCCTGACCAC--ATCAACTCTGATCATCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10141469 29 + 96796970 CAGCCTCATTGC--ATTAACTCTGGTCATCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81178510 31 - 85426708 CTACCTCTTCATAGATTACCTGAAGTCATTC i canFam3.chr2 I 237 C 0 a score=478221.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 190009 160 + 478999 CAAAAACTCACTTTAAACATTTACTGTTTCCAAGACTCTTTGTTTCTAAATGAGCATTTGGCATGGCACTTTTGGATGA----T-Ttttttt----tcatttaaacaaaaagcttcttgagggcaggggctgtatcttttatctctatTATTATCCAATCCTAAGACAA s panTro4.chrUn_GL393519 32416 161 + 413329 CAAAAACTCACTTTAAACATTTACTGTTTCCAAGACTCTTTGTTTCTAAACGAGCATTTGGCATGGCACTTTTGGATGAt-t-t-ttttttt----tcatttaaacaaaaagcttcttgagggcaggggctgtatcttttatctcta-tattatccaaccctaagacaA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7092540 162 + 72422247 caaaaactcactttaaACATTTACTGTTTCCAAGACTCTTTGCTTCTAAACCAGCATTTGGCATGGTACTTTTGGATGATAA-T-Ttttttt----tcatttaaacaaagagcttcttgagggcaggggctgtatcttttatctcta-tattatccaaccctaagacaA i ponAbe2.chrUn I 1718 C 0 s nomLeu3.chr5 77088905 162 - 143122389 CAAAAATTCGTTTTAAATATTTACTGTTTCCAAGACTCTTTGCTTCTAAACCAGCATTTTGCATGGCAGTTTTGGATGATAA-T-Ttttttt----tcatttaaacaaagagcttcttgaggacaggggttgtatcttttatctcta-tattatccaaccctaagacaA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35587278 162 - 95678458 CAAAAACTCACTTTCAACATTTACTGCTTCCAAGACTCTTTGCTTCTAACCCAGCATTTGGCATGGCACTTTTGGATGATGA-T-Ttttttt----ccatttaaacaaagagcttcttgagggcaggggatgtatcttttatctcta-tattatccaaccctaagacaA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36540342 162 + 96509753 CAAAAACTCACTTTCAACATTTACTGCTTCCAAGACTCTTTGCTTCTAACCCAGCATTTGGCATGGCACTTTTGGATGATGA-T-Ttttttt----ccatttaaacaaagagcttcttgagggcaggggatgtatcttttatctcta-tattatccaaccctaagacaA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32631191 160 - 90941950 CAAAAACTTACTTTCAACATTTACTGCTTCTAAGACTCTTTGCTTCTAACCCAGCATTTGGCATGGCAC-TTTGGAtgatga---ttttttt----ccatttaaacaaaaagcttcttgagggcaggggaTGTATCTTTTATCTCTA-TATTATCCAACCCTAAGACAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37796869 163 - 90373283 CAAAAACTCACTTTCAACATTTACTGCTTCCAAGACTCTTTGCTTCTAACCCAGCATTTGGCATGGCACTTTTGGATGATGATT-Ttttttt----ccatttaaacaaagagcttcttgagggcaggggctgtatgttttacctctg-tattatccaaccctaatacaA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10141498 161 + 96796970 TAAAAACTCACTTTAAACACTTACTGGTTCCAAAA-TCTTTGCTTCTAATCCAGCATTTGGCATAGTATTATTAGATAATAA-TAtattttc----ccatctaaacaaagagctgcttaacggcaaggcctgtatcttttatctcta-tatcctcaaaccttatgac-a i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81178541 154 - 85426708 TACAAACTCGCTTCAAACATTGCCTGGCTCCAAGAATCTTTGCTTCTCTCACATAATATACCATGGTAC------------A-C-tctattccacaccatctaaaccaagagcttctcaaaggcaggggtgatttttttaatctctg-tatctccactctctaaaacat i canFam3.chr2 C 0 I 2537 a score=1751650.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 190169 588 + 478999 AATTGTTGTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTTCTT-TAGTTTCA----CATGTTTTACC-AAAGTTCAAGCTCCAACATGCAATAAATATTGCTA-TTAATACTCA-CACTGCCCA--TTTCAAGAATTTTTTCCAACATTTATTCATTTAAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAGATAGATAATCAGTTCATAGGATTACTGAAAC--------TAAGAGATTTCCTATCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GTTT------TGAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTAAGCCAAAGCTCTACAAACTTAAGAGACATACT-GGATAGCCCACAATATAGCTTCAATTGAC-AAAAA---AGGTTTAGAATTTGCTACAATT----CTGAGAAAACTCTGCTCTTAAAAACGACTTACTGACCTAAGCACTTGAATGATTGAACAAAGGGACACAAAGTCCTGAGAGAGCCATCCTCTACTTATTGGAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGTGAATAACTGATGGTAGAAAGGAAAAGGTATTATTCTGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTT s panTro4.chrUn_GL393519 32577 588 + 413329 AATTGTTGTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTTCTT-TAGTTTCA----CACGTTTTACC-AAAGTTCAAGCTCCAACGTGCAATAAATATTGCTA-TTAATACTCA-CACTGCCCA--TTTCAAGAA-TTTTTCCAACACTTATTCATTTCAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAGATAGATAATCAGTTCATAGGATTACTGAAAC--------TAAGAGATTTCCTATCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GTTT------TTAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTAAGCCAAAGCTCTACAAACTTAAGAGACATACT-GGATAGCCCATAATACAGCTTCAATTGACAAAAAA---AGGTTTAGAATTTGCTACAATT----CTGAGAAAACTCTGCTCTTAAAAACGACTTGCTGACCTAAGCACTTGAATGATTGAACAAAGGGACACAAAGTCCTGAGAGAGCCATCCTCTACTTATTGGAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGTGAATAACTGATGGTAGAAAGGAAAAGGTATTATTCTGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7092702 592 + 72422247 AATTGTTGTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTTCTT-TAGTTTCA----CATGTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAACGTGCAATAAAAATTGCTA-TTAATACTCA-TACTGCCCA--TTTCAAGAA-TTTTTCCAACATTCATTCATTTAAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAGACAGATAATCAGTTCATAGGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTATCCGTATTCTTAATAACTCCATG------GTTT------TTAGTGTTTAAACATGCCATCCTGATTAAGCCAAAGCTCTACAAACTTAAGAGACATATT-GGATAGTCCATAATACAGCTTCAATTGAC-AAAAA---AGGTTTAGAATTTGCTACAATTCTAACTGAGAAAACTCTGCTCTTAACAACGACTTACTGAGCTAAGCACTTGAATGATTGAACAAAGGGACACAAAGTCCTGAGAGGGCCATCCTCTACTTATTGGAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGTGAATAACTGATGGTAGAAAGGAAAAGGTATTATTCTGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77089067 588 - 143122389 AATTTTTGTATATAAAGCAAGAATTTGCATGTAATATATTTCTT-TAGTTTCA----CATGTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAACGTGCAATAAAAATTGCTA-TTAATACTCA-TACTGCCCA--TTTCAAGAA-TTTTTCCAACATTTATTCATTTAAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACT----AGATAATCAGTTCATATGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTATCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GTTT------TTAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTAAGCCAAAGCTCTACAAACTTAAGAGACATACT-GGATAGTCCGTAATACAGCTTCAATTGAC-AAAAA---AGGTTTAGAATTTGCTACAATTCTAATTGAGAAAACTCTGCTGTTAACAATGACTTACTAACCTAAGCACTTGAATGATTGAACAAAGGGACACAAAGTCCTGAGAGGGCCATCGTTTACTTATTGAAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGTCAGTGAATAACTGATGGTAGAAAGGAAAAGGTATTATTCTGTAAGCTGACAGATAGTGCCAATAATATTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35587440 586 - 95678458 AATTCTTGTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTTCTT-TAGTTTCA----CATGTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAATGTGCAATAAAAATTGCTA-TTAATACTCA-TACTGCCCC--TTTTAAGAA-TTTTT---GTTTTTATTCATTTAAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAAATAGGTAATCAGTTCACAGGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTGTCTGTATTCTTAAT-ACTCCATG------GATT------TTAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTATGTCAAACCTCTGCAAACTTAAGAGACATAAT-GGATAGTCCATAATACAGCTTCAATTGAC-AGAAA---AAGTTTAGAATTTGCTACAATTCTAATTGAGAAAA--CTGCTCTTAGCAATGACTTACTGACCTAAGCACTTGAATATCTGAACAAAGAGACACAAAATCCTGAGAGGGCCATTCTCTACTTAATGAAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGGGAATAACTGAAGGTATAAAGGAAAAGGTATTATTCCGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36540504 587 + 96509753 AATTCTTGTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTTCTT-TAGTTTCA----CCTGTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAATGTGCAATAAAAATTGCTA-TTAATACTCA-TACTGCCCC--TTTTAAGAA-TTTTT---GTTTTTATTCATTTAAAATCTATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAAATAGGTAATCAGTTCACAGGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTGTCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GATT------TTAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTATGTCAAACCTCTGCAAACTTAAGAGACATAAT-GGATAGTCCATAATACAGCTTCAATTGAC-AGAAA---AAGTTTAGAATTTGCTACAATTCTAATTGAGAAAA--CTTTTCTTAGCAATGACTTACTGACCTAAGCACTTGAATATCTGAACAAAGAGACACAAAATCCTGAGAGGGCCATTCTCTACTTAATGAAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGGGAATAACTGAAGGTATAAAGGAAAAGGTATTATTCCGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32631351 589 - 90941950 AATTCTTGTGTATAAAGCAAGAatttgaatgtaaaatatttctt-tagtttCA----CATGTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAATGTGCAATAAAAATTGCTA-TTAATACTCC-TACTGCCCC--TTTGAAGAA-ttttt---gcattcattcatttaaaatctatttgtatttaatttttccagATTGTTAACTAAATAGGCAATCAGTTCACAGGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTGTCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GATT------TTAGTGTTTAAACCTGCCATCCTGATTATGTCAAACCTCTGCAAACTTAAGAGACATAAT-GGATAGTCCACAATACAGCTTCAATTGac-aaaaaaagaagtttagaATTTGCTATAATTCTAATTGAGAAAA--CTGCTCTTAACAACGACTTACTGATCTAAGCACTTGAGTAACTGAACAAAGAGACACAAAATCCTGAGAGGGCCATTCTCTACTTAATGAAAGACTACT-ACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGTGAATAACTGAAGGTGTAAAGGAAAAGGTATTATTCTGTAAGCTGATACACAGTGccaataatattc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37797032 584 - 90373283 AATTGTTTTGTATAAAGCAAGAATTTGAATGTAAAATATTCCTT-TCGTTTCA----C--GTTTTACCAAAAGTTCAAGCTCCAATGAGCAAGCAAAATTGCTCTTTCATACTCA-TACTGCCCA--TTTCAAGAA-TTTTTCCAACATTTATTCATTTAAAGTATATTTGTATTTAATTTTTCCAGATTGTTAACTAAATAGATAATCAGTTCACAGGATTACTGAAAC--------TAACAGAATTCCTATCTGTATTCTTAATAACTCCATG------GTTT------TTGGTGTTTACACCTGCCATCCTGATTATGTCAAAGCTCTACAAACTTAAGAGAGATACT-GGACAGTCCATAATACAGCTTCAATTGAC-AAAAA---AGTTTTAGAATTTGCTACAATTCTACTTGAGAAAACTCTGCTCTTAACAACGACTTACTGACCTAA------GAAGAATTGAACAAAGAGACACAAAATCCTGAGTGGGCCATCCTCTACTTACGGAGAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATGGCAGCGAATAACTG-ATGTAGAAAGGAAAAGGTATTATTCCGTAAGCTGATAGATAGTGCCAATAATATTC i chlSab2.chr2 C 0 I 225 s calJac3.chr16 10141659 592 + 96796970 tattgtTGTGTATAAAGCAAGAATTTGCATGTAAAATGTTTCTT-TAGTTTCA----CATGTTTTACCAAAACATCAAGCTCCAACATACAACAAAAATTGCTA-TTAAGACTCA-TACTGTCCATTTTTCAAGGA-TTTTTCCAACATTTATTCACTTAAAATCCATTTGTATTTAAATTTCCCAGATTGTTAACTAAATAGATAATGAATTCA---GACTGCTCAAACTAA---ATTAACAGAATTTCTATCTGTATTCTTAATAATTCCA--------GTTT------TTAGTGTTTAAAACTGCCATCCTGATTAAGTCAAGGCTCTACAAATTTAAGAGACATACT-GAATAGTCCATAAGACAGCTTCAGTTGAC-AAAAA---AGATTTAGAATTTGCTACAATTCTGATTGAGAAAACTCTGCTCTTTATAACGACTTACTGACCTAAGCACTTGAATGAT--GACAAAAAGACGCTAAATCCCGAAAGGACCATCCTCTACTTATTGAAAGACTACTCACTGCAAATTTCTAAAGACCT----TCTGAATAGCAGTGAATAACTGATGGTAGGAAGGAAAAATTATTATTCTGTAAGCTTAGAGATACTTCCAGTAATATTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81181232 576 - 85426708 AATGGCCGTGCATAAAACAAATACTTGGACATCAAACCTTTCCTAAAGCATCAGGATCATGTTTTACCAACAAATTAGGCCCCACCTTCTAAGGAAAATTGCTG-TGAAGACTCATTAACACCTA--CTGTCAGAA-TTTTCCAATGCTTGTTTCAACTACAATCTATTTGTATTTACTTCCCTCACATTGCTAACCGAACAGACAG-GAGTTCAGAGGAATGCTGAAGCAAAGTTATTAAAACAATTACCATCTGTATTGTCCCTAACTACATGCTGAATGTTTAACACAGTAGTGATTAAAC-----------ACTATGCCAGGGCCCTATGAATTTGAAAGACATCCTAAGATAGTCTATCGCACAGCTTCAACTAAA-AAAGA---AGGTTCACGGATTTCTACTGCTGCAATTGGGAAAACCCTGCTTGTAATAATCA-------------------GAATGGT--AGCAAA-ACACGTAAAATCTTTAAAGGGTCAGACTCTACTTATTAAAAGACTACTCA-----------TAAAGACTTCCCATCTGGGTGCCGGTGAATGACTGACAGTTGGAAGAAAAGGTAATTATTTTTCAAGCCAAC-GAGATGACCAATAATTTT- i canFam3.chr2 I 2537 C 0 a score=149561.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 190757 65 + 478999 ATTTTAATGTCCCAACGACAGAGAT--AAGTCAGACTAggccaggaatggtggctcacacctgtaat s panTro4.chrUn_GL393519 33165 65 + 413329 ATTTTAATGTCCCAATGACAGAGAT--AAGTCAGACTAggccaggaatggtggctcacatctgtaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7093294 65 + 72422247 ATTTTAATGTCTCAATGACAGAGAT--AAGTCAGACTAggccaggaatggtggctcacacctgtaat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77089655 65 - 143122389 AATTTAATGTCTCAATGACAGAGAT--AAGTCAGACTAggccaggaatggtggctcacacctgtaat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35588026 65 - 95678458 ATTTTAATGTCTCAACCACTGATAA--AAGTCAGACTCgggcaggaatggtcgctcacacctgtaat i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36541091 65 + 96509753 ATTTTAATGTCTCAACCACTGATAA--AAGTCAGACTCgggcaggaatggtcgctcacacctgtaat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32631940 65 - 90941950 attttaatgtctCAACCACTGATAA--AAGTCAGACTCGGGCAGgaatggtggctgacacctgtaat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37797841 64 - 90373283 ATTTTAATGTCTCAACAAC-AAGAT--AAGACAGGTGAggccaggaatggtggctcatgcccataat i chlSab2.chr2 I 225 C 0 s calJac3.chr16 10142251 67 + 96796970 ATTTTAATGTCCCTACCACGGAGATAGAAGTCAGattaggccaggtgtagtggctcacacctgtaat i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81181808 10 - 85426708 ---------------------------------------------------------CATCTGTAAT i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=495217.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 190822 211 + 478999 cttagcattttgggagcctgaggtgggtgattcacttgagcccaggagttcaagatcagcctgagaaacatggcaaaaacctcatctctact-----------aaaaaaaaaaaaaaatacaaaaac--agattggaggaccaccagagcttagggacgtcaaggctgtggtgatctgtgaccgcaccactgcactccagcctggggaacagagtgagacccca s panTro4.chrUn_GL393519 33230 207 + 413329 ctc-tcattttgggagcctgaggtgggtgattcacttgagcccaggagttcaagatcagcctgagaaacatggcaaaaacatcatctctact--------------aaaaaaaaaaaatacaaaaac--agattggaggaccaccagagcttagggacgtcaaggctgtggtgatctgtgaccgcaccactgcactccagcctggggaacagagtgagacccca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7093359 206 + 72422247 cctagcattttgggaggctgaggtgggtgattcacttgagcccaggagttcaagatcagcctgagaaacatggcaaacacctcatctctact----------------aaaaaaaaaatataaaaac--agattggaggaccacctgagcttagggacgtcaaggctgtggtgagctgtgattgcaccactgcactccagcctggggaacagagtgagacccca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77089720 207 - 143122389 cctagcattttgggaggctgaggtgggtgattcacttgagcccaggaattcaagatcagcctgagaaacatggcaaaaacctcatctctact-----------------aaaaaaaaatacaaaaactgagattggaggaccacctgagcttagggatgtcaaggctgtggtgagctgtgattgcaccactgcactccagcctggggaacagagtgagacccca i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35588091 212 - 95678458 cctagcattttgggaggctgaggtgggtgattcgcttgagcccaggagttcaagatcagtctgggaaacatggcaaaaacctcatctctact------------aaaaaaaaaaaaaatacaaaaactgagattggaggacgacctgagcttggggaggtcaagggtgtggtaagctgtgatcacaccactgcaccacagcctggggaacagattgagacccca i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36541156 210 + 96509753 cctagcattttgggaggctgaggtgggtgattcgctggagcccaggagttcaagatcagtctgggaaacatggcaaaaacctcatctctact--------------aaaaaaaaaaaatacaaaaactgagattggaggacgacctgagcttggggaggtcaagggtgtggtaagctgtgatcacaccactgcaccacagcctggggaacagattgagacccca i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32632005 224 - 90941950 cctagcattttgggaggctgaggcgggtgattcgcttgagcccaggagttcaagatcagtctgggaaacatggcaaaaacctcatctctactaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatacaaaaactgagattggaggatgacctgagcttggggaggtcaaggctgtggtaagctgtgattgcaccactgcactacagcctggggaaccgagtgagaaccca i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37797905 209 - 90373283 cctagcattttgggaggctgaggtaggtgatttgcttcagtccaggagttcaacatcagcctgagaaacatggcaaaaacctcatctttacc---------------aaaaaaaaaaatataaaaacagagattggaggaccacctgagcttagggaggtcaaggctgtggtgagctgtgattgcatcactgcactccagcctagggaagagagtgagaaccca i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10142318 115 + 96796970 cccagtattttgggaggctgaggtg-------------------------------------------------------------------------------------------------------------ggaggaccacccgagcttggggagattaaggctaccatgagctgtcactgcaccactgcgctccagcctgggagacagagtgagacccca i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81181818 0 - 85426708 C a score=36826.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 191033 10 + 478999 tctcaaaaac s panTro4.chrUn_GL393519 33437 10 + 413329 tctcaaaaac i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7093565 10 + 72422247 tctcaaaaac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77089927 10 - 143122389 tctcaaaaac i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35588303 10 - 95678458 tctcaaaaaC i rheMac3.chr10 C 0 I 185 s macFas5.chr10 36541366 10 + 96509753 tctcaaaaac i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32632229 10 - 90941950 tctcaaaaac i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37798114 10 - 90373283 tctcaaaaac i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10142433 10 + 96796970 tcttaaaaat i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81181818 10 - 85426708 TCTCAAAGAG i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=377614.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 191043 184 + 478999 aaacaaac------------aaaaaTTTAGATTAATGTTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCCAACTCTTCTAGAAATATCTGAAGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TACACTTATGTATTCAGTGG---TTAAGCAGGAG-TGTATCCGGATTTTGAGAAAtttgttgttg------------ttg s panTro4.chrUn_GL393519 33447 184 + 413329 aaacaaac------------aaaaaTTTAGATTAATGTTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAAATCCAACTCTTCTAGAAATATCTGAAGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TACACTTATGTATTCAGTGG---TTAAGCAGGAG-TGTATCCGGATTTTGAGAAATTTGCTGTTG------------TTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7093575 193 + 72422247 aaacaaac------------aaaaaTTTAGATTAATGTTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAATTCCAACTCTTCTAGAAATATCTGAAGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TACACTTATGTATTCAGTGGTTCTTAAGCAGGAG-TGTATCCGGATTTCGAGAAATTTGTCGttg------ttgttattg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77089937 197 - 143122389 aa--aaac------------aaaaaTTTAGATTAATGTTATTGGAAAGGAAATATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCCAACTCTTCTAGAAGTATCTTAAGTTTCTGAAACATGGGAATTTACACAT-TATACTTATGTATTCAGTGGTTCTTAAGCAGGAG-TGTATCTGGATTTTGAGAAATttgtggttgttgttgttgttgctg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36541376 189 + 96509753 aaacaaaca----------aaaaaAGTTAGATTAATGTTATTGGAAAAGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCCAACTCTTCTAGAAATATCTTACGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TACACTTATGTATTCAGTGTTTCTTAAGCAGGAG-TGTATCCAGATTTTGAGAAATTTGTTGTTG------------TTG i macFas5.chr10 C 0 I 3 s papAnu2.chr10 32632239 189 - 90941950 aaacaaaca----------aaaaaagttagatTGATGTTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCcaacttttctaaaaatatcttACGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TACACTTATGTATTCAGTGTTTCTTAAGCAGGAG-TGTATCCAGATTTTGagaaatttgttgttg------------ttg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37798124 179 - 90373283 -----aaaa----------aaaaaaGTTA-----ATGTTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCCAAGTCTTCTAGAAATATCTTAAGTTTCTGAGATATAAGAATTTACATAT-TATACTTGTGTTTTCAGTGGTTCTTAAGCAGGAG-TGTATCCAGATTTTGAGAAATTTGTTGTTG------------TTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10142443 197 + 96796970 aaataaataaatgaaaaagaaaaaaaAAAGACTAATATTATTGGAAAGGAAAGATTTAAAGGAATTAGCACATATCCAACTCCAACTCTTCTACAGATATTTTAAGTTTCTGAGATCCATGAATTTACACAT-TAAACTTATCTATTCAGTGGTTCTTAGGTAGGA---GCATCTGGATTTTAAGGAATTTGTTGCTG------------TTG i calJac3.chr16 C 0 I 6 s canFam3.chr2 81181828 142 - 85426708 --------------ATACAGACAGATGAAGGCTAATGTT--------GGAGAGAGTGGAAGGAAGTAGCCAGTATCCAACTTC---------AGAGAT---TTAATATTTTTACATCTCTAAATTTGTATATGTATACCTACCCATTCAGTAGTTCTTAGCCAAGAGTTGTATCAG------------------------------------- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr10 35588313 185 - 95678458 I a score=2239701.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 191227 758 + 478999 ttgttagagacagggtctcattatgttgaccaggctagactagaactcctaagctcaggcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgggactacagccatgcaccaccatgcctggcTTCAAggaaacatttttaaacatac-atatccaggctttattagacttactctatcaaaatcttcaggggaaaacctagacttgaagattatttaaaaattttcctgaggtaactggaat------gcacaactctagctggaagctagtgCAATAGACAATTATTTCAGTCTCA-TCTCTCAT-CACATAAACAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAACACCACAAAATTTTCCCCGGTAAGAGTAGAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTTTTTACTTATAAGCCCCTTATCTCCCACCTTCCCATCAAGACATTCTAGAATTGAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTCTACCAGAATAGTATACTAAGT---------TGGTTAATTACTTGTTATT-------------------------------------------------------------------------------------------CCTTCTACTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACATATTCACTGCCAGTCTGGT-TCCTCAGAGGCCTCCTAAAATTGATCTCTAGGC-AGTTTACAACCCACTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATGGAAAAGAACCCTGTCTCACCATATAAAGGAAACAAATGAATGa--acaac s panTro4.chrUn_GL393519 33631 759 + 413329 TTGttagagacagggtctcattatgttgaccaggctagactagaactcctaagctcaagcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgggactacagccatgcaccaccatgcctggcTTCAAGGAAACCTTTTTAAACATAC-ATATCCAGGCTTTATTAGACTCACTCTATCAAAATCTTCAGGGGAAAACCTAGACTTGAAGATTATTTAAAAATTTTCCTGAGGTAACTGGAAT------GCACAACTCTAGCTGGAAGCTAGTGCAATAGACAATTATTTCAGTCTCA-TCTCTCATCCACATAAACAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAACACCACAAAATTTTCCCTGGTAAGAGTAGAAAAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTTTTTACTTATAAGCCCCTTATCTCCCACCTTCCCATCAAGACATTCTAGAATTGAAAGCAGAATTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTCTACCAGAATAGGATACTAAGT---------TGGTTAATTACTTGTTATT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTCTACTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACATATTCACTGCCAATCTGGT-TCCTCAGAGGCCTCCTAAAATTGATCTCTAGGC-AGTTTACAACCCACTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATGGAAAAGAACCCTGTCTCACCATATAAAGGAAACAAATGAATGA--ACAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7093768 758 + 72422247 ttgttaaagacagggtctcattatgttgaccaggctagactagaactcctaagctcaagcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgagactacagccctgcaccaccatgcctggcTTCAAggaaacatttttaaacatac-atatccaggctttattagacttactctatcaaaaccttcaggggaaagcctagacttgaagattatttaaaaattttcctgaggtaatcggaat------gtacaactctagctggaagctagtgCAATAGACAATTATTTCAGTCTCA-TCTCTCATTCACATAAACAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAATACCACAAAATTTTCCCTGGTAAGAGTAGAACAAGGTCTAGTGAACTCAAAATCCAACCTGATCTTGTTACCTACAAGCCCCTTATCTCCCACCTTCCCACCAAGACATTCTTGAATTGAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTCTACCAGAATAGGATACTAAGT---------CAGTTAATTACTTGTTATT-------------------------------------------------------------------------------------------CCTTCTGCTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACATATTCACTGCCAATCTGGT-TCCTCAGAGCCCTCCTAAAATTGATCTCTAGGC-AGTTTACAACCCACTAACTCCCTCTTCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATGGAAAAGAACCTTGTCTCACCATACAAAGGAAACAAATGAAC-A--ACAAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77090134 756 - 143122389 ttgttagagacagggtctcattatgttgaccaggctagactcaaactcctaagctcaagcaatcttcccacctcagcctccctagcagctgggactacagtcctgcaccaccatgcctggcTTCAAGGAAACATTTTTAAACCTACAATATCCAAGCTTTATTAGACTTACTCTGTCAAAATCTTCAGGGGAAA-CCTAGACTTGCAGATTATTTAAAAATTTTCCTGAAGTAACTGGAAT------GCACAACTCTAGCTGGAAGCTAGTGTAATAGACAATTACTTCAGTCTCATTTTTTCATCCACAAAAACAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGCAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAACACCACATAATTTTCCCTGGTAAGAGTAGAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAGCCTGATCTTGTTACTTATAATCCCCTTGTCTCCCACCTTCCCATCAAGACATTCTAGAATTGAAAGCAGATTTGAGAC-----TGTAATTGGCCATTTCTACCAGAATAGGATACTAAGT---------CAGTTAATTACTTGTTATT-------------------------------------------------------------------------------------------CTTTCTGCTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACATATTCACTGCCAACCTGGC-TCCTCAGAGGCCTCCTAAAATTGATCTCTAGGC-AGTTTACAACCCACTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATGGAAAAGAACCTTGTCTCACCATACAAAGGAAACGAATG----a--acaac i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35588498 752 - 95678458 ttgttagagagagggtctc---atgttgaccaggctagacttgaactcctgagctcaagcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgggactacagccatgcaccaccatgcctggcTTCAAGGAAACATTTTTAAACATAC-ATATCTAGGCTTTACTGGACTTACTCTATCAAAATCTTCAGGAAAAAGCCGAGACTTATTGATTATTTAAAAATTTTCCTCAGGTTACTGGGAT------G------TCTAGCTGGAAGCTAGTGCAATAGATGATTACTTCAGTCTCA-TCTCTCATCCACATAACCAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAACATCACATAATTTTCCCCGGTAAGAGTAGAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTCGTTCCTTATAAGCCCCTTGTCTCCCACCTTCCCATAAAGACATGCTAGCGTTGAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTTTACCAGAATAGGACACTAAGT---------CAGTTAATTACTTGTCGTT-------------------------------------------------------------------------------------------CCCTCTGCTCAAGTGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACCTATTCACTGCCTATCTGGA-TCCTCAGAGGCTTCCTGAAATTGATCTCTAAGC-AGTTTACAACCCACTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATTGAAAAGAACCTTGTCTCACCATACAAAGGAAACAAATGAATGATCACAAC i rheMac3.chr10 I 185 C 0 s macFas5.chr10 36541568 756 + 96509753 TTGttagagagagggtctc---atgttgaccaggctagacttgaactcctgagctcaagcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgggactacagccatgcaccaccatgcctggcTTCAAGGAAACATTTTTAAACATAT-ATATCCAGGCTTTATTAGACTTACTCTATCAAAATCTTCAGGGGAAAGCCTAGACTTGTGGACTATTTAAAAATTTTCCTGAGGTAACTGGAAT------GCACAACTCTAGCTGGAAGCTAGTGCAATAGACGATTACTTCAGTCTCA-TCTCTCATCCACATAACCAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCGTTTGCTGAAAATACCACATAATTTTCCCTGGTAAGAGTAAAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTCGTTCCTTATAAGCCCCTTGTCTCCCACCTTCCCATAAAGACATGCTAGCATTGAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTTTACCAGAATAGGACACTAAGT---------CAGTTAATAACTTGTCGTT-------------------------------------------------------------------------------------------CCCTCTGCTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACAA---------------------------CATT--ACCACCTATTCACTGCCTATCGGGA-TCCTCAGAGCCCTCCTGAAATTGATCTCTAGGC-ATTTTTCAACCCATTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTTTCTAAAATTTAAAAGAACCTTGTCTCACCATACAAAGGAAACAAATGAATGA--acaac i macFas5.chr10 I 3 C 0 s papAnu2.chr10 32632428 753 - 90941950 ---ttagagacagggtctc---atgttgaccaggctagactcgaactcctgagctcaagcaatcctcccacctcagcctccctagcagctgggactacagccatgcaccgccatgcctggcttcaaggaaacatttttaaatgtac-atatctAGGCTTTATTAGACTTACTCTATCAAAATCTTCAGGGGAAAACCTAGACTTGtggactatttaaaaattttcctgaaGTAACTGGAAT------GCACAACTCTAGCTGGAAGCTAGTGCAATAGACGATTACTTCAGTCTCA-TCTCTCATCCACATAACCAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGAGACTCATTTGCTGAAAATACCACATAATTTTCCCCGGTAAGAGTAGAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTTGTTCCTTATAAGCCCCTTGTCTCCCACCTTCCCATCAAGACATGCTAGAGTTGAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTTTACCAGAATAGGACACTAAGT---------CAGTTAATAACTTGTCATT-------------------------------------------------------------------------------------------CCCTCTGCTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATT--ACCACCTGTTCACTGCCAATCTGGT-TCCTCAGAGCCCTCCTGAAATTGATCTCTAGGC-ATTTTACAACCCATTAACTCCCTCTCCCAAACTGAAAACTGTCATTCTCTAAAATTGAAAAGAACCTCGTCTCACCATACAAAGGAAACCAATGaatga--acaac i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37798303 759 - 90373283 TTGttagaaacggggtctcattatgttgaccaggctagactcgacctcctgagctcaagcaatactcccacctcagcctccctaacagctgggaccatagccacacagcaccatgcttggcTTCAAGGAAACATTTTTAAATGTAC-ATATATAGGATTTATTAGATGTGCTCTATCAAAATCTTCATGGGAAAGCCTAGACTTGCAGATTATTTAAAAATTTTCCTGAGGTAATTGGAAT------GCACAACTCTAGGTGGAAGCTAGTGCAACAGACAATTACTTCAGTCTCA-TCTGTCATTCACATAACCAATTCCCTTTATCATTTGAGGATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAGAGACACTCATTTGCTGAAAATGTCACATAATTTTCCCTGGTAAGAGTAGAACAAAGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACCTGATCTTGTTCCTTATAAACCCCTTATCGCCCACCTTCCCATCAAGATATTCGAGAGTTGAAAGCAGAGTTGAGAG-----TCTAACTGGCCCTTTCTACCAGAATAGGACAGTAAGT---------TGGTTAATTACTTGTTATT-------------------------------------------------------------------------------------------CCTTCTGTTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------TATTA---------------------------CATT--ACCACCTATTCACTGCCAATCTGGT-TCCTCAGAGGCCTCCTAAAATTGGTATCTAGGC-AGTTTACGACGTACTAACTCCCTTTCCCAAACAGAAAACTGTCATTCCCTAAAATGGAAAAGAACCTTGTCTCATCATACAAAGGAAACAACTGAATGA--ACAAC i chlSab2.chr2 C 0 I 3 s calJac3.chr16 10142646 753 + 96796970 ttgttagagacagggtctcattatgttgcccaggctagattcaaactcctgttctcaagctatcctcccacctcagcctccctagcagttggaactacagccatgcaccaccatgcctggcTTCAAGGAAATATTTTTAAACATAC-GTATCCAGGCTTTATTAGACTTAGTCTATCAAAACCTTCAGGGGCAG-CCTAGACTTGTAGATCATTGAAAAA-TTTCCTCAGGTTACTGGGAT------GCACAATTCTGAC----AACTAGTGCAACACACAATTACTTCAGTCTCA-TCTCCCACCCACATGACAAAGTCCCTTTATCACTTAAGTATTTGGCCAAAAAGAGGAAAGAGTAGGAAAGACACTCATTTGCTGAAAACACCACATAATTTTCCCAGGTACGAGTAGATCAGGGTCTAGTAAACTCAAAATCCAACTTGATCTTGTTACTTATAAGTGCCTTATGTCCCACCTTCCTATAAAGACATTCTAGATTTCAAAGCAGAGTTGAGAC-----TCTAATTGGCCATTTCTATCAGAATAGGATAATAAGT---------CAGTTGATTACTTATTATT-------------------------------------------------------------------------------------------CCCTCTGCTCAAGGGTTTCC-------------------------------------------------------------CACTA---------------------------CATC--ACCACCTATTCACTGCCAGTCTGGT-TCCTCAGAGGTCTCCGAAAATTGATCTCTAGGG-ATTTTACAACTCACTAACTCCCTTTCCCAAACTGAAAACTGTCTTTCTCTAAAACTGAAGAGATCCTTGTGTTACCATACAAAGGAAACAGATAAATGA--ACAac i calJac3.chr16 I 6 C 0 s canFam3.chr2 81181970 789 - 85426708 ------------------------------------AAACTCAAAACCCT----------------------------------------------------------------------------------ATTTCCAAATTTCT-GCGTACACACGTTATTGGATTCACTCCGTCGAAATCTTCACGGGACAGTTTTGGCTTGTAAATTCTTTTAAAG--TTCCCTAGTTGACTGTGATTCACCAGCACAAGTCTAGCTGAGAACTAGTACAGTACACAACCATGCCAGTCTCC-TCTTTCACCTATGTGGCCAATTCTCCCTATCACTTGAGGATTCAGCCAAAAACAGAAATGAGT--------CACTTATC-----AAACCTGCATTCAATTTCCATGGCTAGAGGTAGAACAAGGTCTAGTAAACTCAAAATGCAACTTGATTCCATTATTTACACACTCCTTATGT----CCTTCCCATCAAGACATTCTAGATTTGCAAGCAGAGTTTAGACTCGTATCTAAGTGGCTATAGCTG-CAAAATACTATACTGTGTTCTTTCCTCTGCTTGTCCACTttttttttaaagatttttattgatttattcatgagagatgagagagagagagagagagagagagacaggcagagacacaggcagagggagaagcaggctcctccattcaaggagtgccatgtgggactcgattcgggagaccacgggatcatgccctgagccgaaggcatatgctcaatcactgagtcacacaggcgtcccTTTTCGTGCCCATTCAACCACCAGTTTACTGCCAATCTGATGTCCTTAGAGTCCTCCTAGAATTGATCTCTATATAAATTTACAACACACTCACTGGTTCGT---GAGTAAGAATTACTATCCCTGAAAATTGAAGA-----------CTCCTTACCTA----------------------- i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=306864.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 191985 181 + 478999 aataacaacacacacacacacacacacacacacacaaacaaaaacaaaa-acaaaaaaaaaCCTCTTCATGGTCTTTTCCC-CCATTACCTAATTTCCAAGTTGGCCTTGGTATTTCTGATTGCTGCATTTTTCCCTTTCCAATTCTGCCTCATGAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC s panTro4.chrUn_GL393519 34390 156 + 413329 AATAACAacacacacacacacacacacacac--------------------------aAAACCTCTTCATGGTCTTTTCCC-CCATTACCTAATTTCCAAGTTGGCCTTGATATTTCTGATTGCTGCATTTTTCCCTTTCCACTTCTGCCTCATGAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7094526 148 + 72422247 AACAACAACACACACACACACAC----------------------------------AAAACCTCTTCATGGTCTTTTCCC-CCATTACCTAATTTCTAAGTTGGCCTTGATATTTCGGATTGCTGCATTTTTCCCTTTCCATTTCTGCCTCATGAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77090890 144 - 143122389 aacaacaacacacacacac--------------------------------------aaaacCTCTTCATGGCCTTTTCCC-CCATTACCTAATTTCCAAGTTGACCTTGATATTTCTGATTGCTGTGTTTTTCCCTTTCCATTTCTGCCTCATGAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTCAGCCTTGCC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589250 168 - 95678458 AACAACcacactcacacacacacacacgcatgcagagacatacacacac-acac---aAAACCTCTTCACAGTCTTTTCCCTCCATTACCTAATTTCCAAATTGG-----------CTGATTGCTGTCTTTTTCCCTTTCTGCTTCTGCCTCACAAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCT i rheMac3.chr10 C 0 I 90 s macFas5.chr10 36542324 177 + 96509753 aacaaccacactcacacacacacacacgcatgcagagacat--acacac-acac---aAAACCTCTTCACAGTCTTTTCCCTCCATTACCTAATTTCCAAATTGGCCTTGATATTTCTGATTGCTGTCTTTTTCCCTTTCCGCTTCTGCCTCACAAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633181 180 - 90941950 aacaaccacactcacacacacacacacgcatgcagagacatacacacGCTGCAC---AAAACCTCTTCACAGTCTTTTCCCTCCATTACCTAATTTCCAAATTGGCCTTGATATTTCTGATTGCTGTCTTTTTCCCTTTCCACTTCTGCCTCATAAG-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143399 164 + 96796970 ----accacagacacacacacacacacacacacacacac-----------acac---acacCCTCTTCATAGTTTTTTTCT-CCATTATCTAATTGAAAAATTGGCCTCAATATTTCTGATTGCTCTCTTTTTCCCTTTTCATTTTTGCCTCATGAA-------CAATCAGAAAT-ATCTTAAGCCTTGCC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81182759 168 - 85426708 AACATAAACACTGA-AGAAAAACAAACACAA-------------------TCCA---AAAACCTTGTCTTGATATTTCCCCTCACTTGCCAAATGTCTAAATCACTCTGCATGTTCCTGACTGCTTTCTCCTTTGCCCCTCTTTTGTCCCTCTTAAGTCAAGGCTGATAAAAGACAAGCTCCAACCGTGTT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37799062 3 - 90373283 I a score=70939.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192166 56 + 478999 ACTGAGAGATACATCACCTCATATCTATTAGTG----------------------TTTTTTT------AGGAATTTGCCAA-AGT s panTro4.chrUn_GL393519 34546 56 + 413329 ACTGGGAGATACATCACCTCATATCTATTAGTG----------------------TTTTTTT------AGGAATTTGCCAA-AGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7094674 58 + 72422247 ACTGAGAGATACATCACCTCATATCTATTAGTG----------------------TTTTTTT----TCAGGAATTTGCCAA-AGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091034 55 - 143122389 ACTGAGAGATACATCACCTCATATCTATTAGTG----------------------TATTTT-------AGGAATTTGCCAA-AGC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542501 84 + 96509753 ACTGAGAGATACATCACCTCATATCTATTACCGTTTTGGTTTGGtttttttttttttttttttttttttGGAACTTGCCAA-AGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633361 73 - 90941950 ACTGAGAGATACATCACCTAATATctattactgttttgttttgg-----------ttttttttttttttggaacttgCCAA-AGT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143563 57 + 96796970 ACTGAGAGATACATCACTTCATGTATACGACTT----------------------TTTTTTT-----TAGGAACTTGCCAA-AGC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81182927 40 - 85426708 -------AATAAATCAC--------------------------------------TTTTTGATCAAATAGGAACTTCTCAACAGC i canFam3.chr2 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37799062 3 - 90373283 I e rheMac3.chr10 35589418 90 - 95678458 I a score=108145.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192222 53 + 478999 AGCAGGATTACTATTCACTGAAACAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT s panTro4.chrUn_GL393519 34602 53 + 413329 AGCAGGATTACTATTCACTGAAACAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7094732 52 + 72422247 AGCAGGATTACTATTCACTGAAACTT-GTTT-AGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091089 53 - 143122389 AGCAGGATTAATTTTCACTGAAACAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589508 53 - 95678458 AGCAGGATTACCATTCACCGAAATAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i rheMac3.chr10 I 90 C 0 s macFas5.chr10 36542585 53 + 96509753 AGCAGGATTACCATTCACCGAAATAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633434 53 - 90941950 AGCAGGATTACCATTCACTGAAACAT-GTTTAAGTTTTCTTGGAGTTTTAATGT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143620 47 + 96796970 AGCAGGATTTCTATTCACTGAAATGTAGTTTCA--TTTCTTGGAGTTTT----- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81182967 46 - 85426708 AGCAAGATT-TGATATTGTAAAATAC-ACTT--GTTTT----GTGTTTTAAGAC i canFam3.chr2 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37799062 3 - 90373283 I a score=89091.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192275 25 + 478999 AAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- s panTro4.chrUn_GL393519 34655 24 + 413329 AAAACCTA-TTCCAGGGCAAATTTT---------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7094784 25 + 72422247 AAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i ponAbe2.chrUn C 0 I 261 s nomLeu3.chr5 77091142 25 - 143122389 AAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589561 25 - 95678458 GAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542638 25 + 96509753 GAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633487 25 - 90941950 GAAACCTATTTCCAGggcaaatttt---------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799065 25 - 90373283 AAAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i chlSab2.chr2 I 3 C 0 s calJac3.chr16 10143667 24 + 96796970 -AAACCTATTTCCAGGGCAAATTTT---------- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81183013 35 - 85426708 AAAGCCTATTTCCAAGGCAAATTTTGCTTTCCTCT i canFam3.chr2 C 0 C 0 a score=95485.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192300 48 + 478999 GTCATTTTACATTTGTTAGGG---------------------------GAAAAAAAACTTGACAGGGAAAAATTG s panTro4.chrUn_GL393519 34679 48 + 413329 GTCATTTTACATTTGTTAGGG---------------------------AAAAAAAAACTTGGCAGGGAAAAATTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091167 47 - 143122389 GTCATTTTACATTCATTAGGG----------------------------AAAAAAAACTTGGCAGGGAAAAATTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589586 54 - 95678458 GTCATTTTACATTCATTAGGGGGA---------------------AAAAAAAGAAAACCTGGCAGGGAAAAACTG i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542663 54 + 96509753 GTCATTTTACATTCATTAGGGGGA---------------------AAAAAAAGAAAACCTGGCAGGGAAAAACTG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633512 54 - 90941950 gtcattttacattcattaggggga---------------------aaaaaaagaaaacctggcagggaaaaattg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799090 51 - 90373283 GTCATTTTACATTCATTAGAG------------------------AAAAAAAAAAAACCTGGCAGGGAAAAATTG i chlSab2.chr2 C 0 I 4 s calJac3.chr16 10143691 75 + 96796970 GTCATTTTACATTGATTAGAGGCAAaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaACCTGGGAGGAAAAAATTT i calJac3.chr16 C 0 I 1 s canFam3.chr2 81183048 46 - 85426708 GTTGTTTGACACTAAATAAGA-----------------------------AAACAAACTGGGTGAGAAAACATTT i canFam3.chr2 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7094809 261 + 72422247 I a score=277926.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192348 111 + 478999 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTACAAATTCAGTG-TTTTTTTTTTAAAAAGCATTAACCACAAGTGCACTG-AAAAA-AACTGTACCCTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAACAA s panTro4.chrUn_GL393519 34727 111 + 413329 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTACAAATTCAGTGTTTTTTTTTTTAAAAAGCATTAACCACAAGTGCACTG--AAAA-AACTGTACCCTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAACAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7095070 108 + 72422247 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTACAAATTCAATG---TTTTTTAAAAAATGCTTTAACCACAAATGCACTG--AAAA-AACTGTACCCTCTAATGCTTCTTTAAAAGAAACAA i ponAbe2.chrUn I 261 C 0 s nomLeu3.chr5 77091214 108 - 143122389 AAAAAAAAACAGTATTACATTTTACAAATTCAGTG---ATTTTTAAAAAAAGTATTAACCACAAGTGCACTG--AAAA-AACTGTACTGTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAACAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589640 108 - 95678458 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTGCAAATTCAGTG---TTTT--AAAAAAAATATTAACCACAAGTGCATTAAAAAAA-AACTGTAACCTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAGCAA i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542717 108 + 96509753 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTGCAAATTCAGTG---TTTT--AAAAAAAATATTAACTACAAGTGCATTAAAAAAA-AACTGTAACCTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAGCAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633566 110 - 90941950 aaaaaaaaaaagtattacctTTTGCaaattcagtg---ttttaaaaaaaaaatattaaccacaagtgcatttaaaaaa-aactgtaaccTCTAATGCTTCTTTAAAAGTAGCAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799145 110 - 90373283 AAAAAAAAAAAGTATTACCTTTTACAAATTCAGTG---TTTT-TTAAAAAAACATAAACCACAAGAGCATTAAAAAAACAACTGTACCCTCGAATGATTCTTTAAAAGTAACAA i chlSab2.chr2 I 4 C 0 s calJac3.chr16 10143767 106 + 96796970 AAACAAAATAATTATTACCTTTTACAATTT--GTG---TTTT--AAAAAAACAATTTACCACAAGTGCATTAAAAAAA-AACCGTACCCTCGAATGTTTCCTTAGAAGTAATAA i calJac3.chr16 I 1 C 0 s canFam3.chr2 81183094 101 - 85426708 TTGAAAATAAAGTTTCAGA----ACACATTCTGTG---TTCT----CAAAAATATTTGCCATAAATACATAA-AAGAA-ACCTGTATTCTCTAATGCTTCTTTAGAGGTATCAT i canFam3.chr2 C 0 I 924 a score=324972.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192459 90 + 478999 TATTTAAAATAAAGTCTTAG---ATAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATACGGAAAACTGGCCCT s panTro4.chrUn_GL393519 34838 90 + 413329 TATTTAAAATAAAGTCTTAG---ATAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTGTCCCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7095178 90 + 72422247 TATTTAAAATAAAGTCTTAG---AAAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTAGCCCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091322 90 - 143122389 TATTTAAAATAAAGTCTTAG---ATGATAAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATGTGGAAAACTGGCCCT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589748 90 - 95678458 TATTTAAAACAAAGTCTTAG---ATAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTGGCCCT i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542825 90 + 96509753 TATTTAAAACAAAGTCTTAG---ATAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTGGCCCT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633676 90 - 90941950 CATTTAAAACAAAGTCTTAG---ATAATtaagtcatttcaaaatattttcattcaggtTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTGGCCCT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799255 90 - 90373283 TATTTAAAATAAAGTCTTAG---ATAATTAAGTCATTTCAAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGGAAAACTGGCCCT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143873 93 + 96796970 TATTTAGCATAAAATATTAGATAATAATTAAGTCATTTCTAAATATTTTCATTCAGGTTATGCTTGAGCTTCCAAATATGAAAAACTGACCCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81184119 85 - 85426708 TATTTAAAGCAAAAGCTTAG---AC-----AGTTATTTCAAAATATTTTCATCCAGGAAATGTTTGAGCTTCCAAATATGAAAAATCGACCCT i canFam3.chr2 I 924 I 759 a score=83134.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192549 32 + 478999 TACACAGGTCAATGTTAACACGAATGCATTTC s panTro4.chrUn_GL393519 34928 32 + 413329 TACACAGGTCAATGTTAACAAAAATGCATTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7095268 32 + 72422247 TACACAGGTCAATGTTAACACGAATACATTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091412 32 - 143122389 TACACAGGTCAGTGATAAAACGAATGCATTTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589838 32 - 95678458 TACCCAGGTCAACGTTAAAATGAATGCATTTC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542915 32 + 96509753 TACCCAGGTCAACGTTAAAATGAATGCATTTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633766 32 - 90941950 TACCCAGGTCAACattaaaatgaatgcatttc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799345 32 - 90373283 TACACAGATCAATGATAAAACGAATGCATTTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143966 32 + 96796970 TACACAGGTCAGTGCTCAAACAAATGCATTTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81184204 759 - 85426708 I a score=244291.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192581 75 + 478999 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTATACCTTGTTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAGAGCAGTGC s panTro4.chrUn_GL393519 34960 75 + 413329 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTAAAAGTTGTTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAGAGCAGTGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 M 3000 s ponAbe2.chrUn 7095300 75 + 72422247 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTATACCTTGTTTTTTGATTCAATATCAGCACCGTATAAGAGCAGTGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091444 75 - 143122389 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTATACCTTGTTTTTGGATTCAATATCAGCACCGTATAAGAGCAGTGC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589870 85 - 95678458 AGTATTTTGAAGATGAAATTGGTAAAAATTGGTAGATCTATACCTTATTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAGAGCAGTGC i rheMac3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36542947 75 + 96509753 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTATACCTTATTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAGAGCAGTGC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633798 75 - 90941950 agtattttgaagat----------aaaattggTAGATCTATACCTTATTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAGAGCAGTGC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799377 75 - 90373283 AGTATTTTGAAGAT----------AAAATTGGTAGATCTATACCTTGTTTTTTGATTCAATATCAGCACCATATAAAAGCAGTGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10143998 75 + 96796970 AGTATTTTGAAAAT----------AAAACTGGTAGATCTATACCTTGTTTGCTGATTCAGTGTCGGCACCGCACAAAAGCAGTGC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81184963 75 - 85426708 AGTACGTTGTAAAA----------AAAAAAAGTTGACTTGTACCGTGTTTTTGGCCTCTATATTTGCGTTTTGTAAAAGCAGCTT i canFam3.chr2 I 759 C 0 a score=1386764.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 192656 556 + 478999 TTTGGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCGGTATTTCCATACTCATCTTGAATATTTCCATCAGCGCCATGTTCCAGCAACAT---TAACACACATTCATCTTCCTGGCATTGTACGGCCTGTCAGTATTAGACCAA-AAACAAATTATAAGTCCTAGGAATTCAAAAT-AACATTCCACAGCTTTCACCAACTAGTTATATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATCTATTGAAATCAAACCCATCTCACGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTTATCAGAGCTGTCCTTTTTTTGTTGTCAAGGACGTTAAGTTGACATCGTCTGTCCAGCAGGAGTTGTACTACTTCTGAATTTCCATTGGCAGAGGCCAAATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTC--AGGAAATTGTAGTGCACTAGCT--AATGCCACATTAATGATTCATGTAGTTGCAAACACTGAATAGCCT---ATTACTCTGCCTTCAAAACAAAC--TCAA-TTTTCCTTTGAAGAAAGCACACTACTTATTACCTC s ponAbe2.chrUn 7095375 561 + 72422247 TTTGGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCGGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCCAGCAACAT---TAACGCACATTCATCTTCCTGGCATTGTACGGCCTGTCATTATTAGACCAA-AAACAAATTATAAGTCCTAGGAATTCAAAAT-AACCTTCCACAGCTTTCACCAAGTAGTTACATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATCTATTGAAATCAAACCCATCTCACGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTTATCAGAGCTGTCCTTTTTTTGTTGTCAAGGACATTAAGTTGACATCGTCTGTCCAACAGGAGTTTTACTACTTCTGAATTTCCATTGGCAGAGGCCAAATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTTTTAGGAGATTGTAGTGCACTAGCT--ACAGCCACATCAATGATTCATGTAATTGTAAACACTGAATAGCCTGCTATTACTCTGCCTTCAAAACAAAC--TTAA-TTTTCCTTTGAAGAAAGCACACTACTTATTACCTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77091519 561 - 143122389 TTTGGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCAGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCCAGTAACAT---TAACGCACATTCATCTTCTTGGCATTGTATGGCCTGTCAGTATTAGACCAA-AAACAAATTATAAGTCCTAGGAATTCAAAAT-AACATTCCACAGCTTTCACCAACTAGTTATATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATCTATTGAAATCAAACCCATCTCACACTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTTATCAGAACTGTCCTTTTTTTGTTGTCAAGGACATTAAGTTGACATTGTCTATCCAGCAGGAGTTTTACTACTTCTGAATTTCCATTGGCAGAGGCCAAATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAAAGGACTTTTTAGGAAATTGTAGTGCACTAGCT--ACAGCCACATTAATGATTCATGTAATTGCAAACACTGAAAAACATGCTATTACTCTGCCTTCAAAACAAAC--TAAA-TTTTCCTTTGAAGAAAGCACACTACTTATTACCTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr10 35589955 561 - 95678458 TTTTGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCAGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCCAGCAACAT---TAATGCACATTCATCTTCTTGGCATTGTACAGCCTGTCAGTATTAGACCAA-AAATAAATTATAAGTCCTGAGAATTAAAAAC-AACATTCCACAGCTTTCACCAACTAGTTCCATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATGTATTGAAATCAAAGCCATCTCATGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTGATCAGAGCTGTCCTCTTTTTGTTGTCAAGGACATCAAGTTGACATCGTCTGTCCAGCAGGAGTTTTACTATTTCTGAATTCCCATTGGCAGAGGCCAGATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTTTTAGGAAATTGTAGTGCACTATCT--ACAGCTACATCAATGATTCATGCAATTGCAAACACTGAATAGCCTGCTATTGCTCTGCCTTCAAAACAAAC--TTAA-TTTCCCTTTGAAGAAAGCACCCTACTTATTACCTC i rheMac3.chr10 C 0 N 0 s macFas5.chr10 36543022 561 + 96509753 TTTTGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCAGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCCAGCAACAT---TAATGCACATTCATCTTCTTGGCATTGTACAGCCTGTCAGTATTAGACCAA-AAATAAATTATAAGTCCTGGGAATGAAAAAC-AACATTCCACAGCTTTCACCAACTAGTTCTATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATGTATTGAAATCAAAGCCATCTCATGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTGATCAGAGCTGTCCTCTTTTTGTTGTCAAGGACATCAAGTTGACATCGTCTGTCCAGCAGGAGTTTTACTATTTCTGAATTCCCATTGGCAGAGGCCAGATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTTTTAGGAAATTGTAGTGCACTATCT--ACAGCTACATCAATGATTCATGCAATTGCAAACACTGAATAGCCTGCTATTGCTCTGCCTTCAAAACAAAC--TTAA-TTTCCCTTTGAAGAAAGCACACTACTTATTACCTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32633873 560 - 90941950 TTTCGCCATTAATTTATCTTCATTGTAGATAGCATAGTGTAGAGCAGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCTAGCAACAT---TAATGCACATTCATCTTCTTGGCATTGTACAGCCTGTCAGTATTagaccaa-aaataaattataagtcCTGGGAATTAAAAAC-AACATTCCACAGCTTTCACCAACTAGTtacatttaaatgagaaaactcatTTTTATGCTATGTATTGAAATCAAAGTCATCTCACGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTGATCAGAGCTGTCCTCTTTTTGTTGTCAAGGACGTTAAGTTGACATCGTCTGTCCAGCAGGAGTTTTACTATTTCTGAATTCCCATTGGCAGAGGCCAGATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTTTTAGGAAATTGTAGTGCACTATCT--ACAGCTACATCAATGATTCATGCAATTGCAAACACAGAATAGCCTGCTATTACTCTGCCTACAAAACAAAC--TTAATTTTCCCTTTGAAGAAAGCACACTACTTATTACC-- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37799452 558 - 90373283 TGCTGCTGCTAATTTATCTTCATTGTAGATAGTATAGTGCAGAGCAGTATTTCCATACTCATCTGGAATATTTGGATCAGTGCCATGTTCTAGAAACAT---TAACGTACATTCATCTCCTTGGCATTGTACAGCCTGTCAGTATTAGACCAA-AAACAAATTATAAATCCTAGGAATTCAAAATAAACATTCCACAGGTTTCACCAACTAGTTACATTTAAATGAGAAAACTCATTTTTATGCTATGTATTGAAATCAAAGCCATCTCACGCTGATATAGTTGACTACTGCATACCTTGATCAGAGCTGTCCTCTTTTTGTTGTGAAGGAGATTAAGTTGACATCGCCTGTCCAGCAGGAGTTTTACTACTTCTGAATTCCCATTGACAGAGGCCAAATGTAGAGCAGTCCTATGAGAGTGAGAAGACTTTTTAGGAAATTGTAGTGGGCTCT------AGTCACATCAATGATTCATGTAATTGCAAACACTGAATAGCCTGCTATTACTCTGCCTTCAAAACAAAC--TTAA-TTTTCCTTTTAAGAAAGCACACTGCTTATTACCTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10144073 565 + 96796970 TCTGGCCAGTAATTTGTCTTCATTGTAGACCGCATAGTGTAGTGCGGTATTGCCATACACATCCGGAATGTTTGGATCAGTGCCATGTTCTCCTAACATTAATAATGCACATTCATCTTCTTGGCATTGTACGGCCTGCAAGTATGATA-AAA-AAACAAATTATAAGCCCTCAGAATTCAAAATAAACATTCCACAGCTTTCATCAACTAGTTATATTTACTTGAGGAAACTAATTTTTATTCTATGTACTGAAATCAAATCCATCTCACACTGAT-TAGCTGACTACTGCATACCTTTATTAGAGCTGTCCTCTTTTTGCTATCCAAGACATGAAGGTCACATTGTCTGTCCAACAGGAGTTTTACTACTTCTGGATTTCCATTGGCACAGGCCAAATGGAGAGCAGTCCTGTGAGAGTGAGAAGCCTTTTTAGGAAATTGTAGTCCACTATTT--AAAGCTATATCAATGATTCATGTCATTGCAAACACTGAATAGCCTGCTATTCCTCTTCCTTCAAAACAAACATTTAA-TTTTCCTGTGAAGAAAGCACGCTAATTATTACCTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81185038 560 - 85426708 CTCTGCTATTGAGACAATCCCTTCGTGGGCTGCATAATGGAGAGCTGTGTTGCCCTTGTTGTCTTTCACTTTAGGATCAGCACCGTGTTCCAGGAGAAG---AGTTACACATGCCTCTTCTTGGCATTGTATAGCCTGTGAGCATTACAACAAGAAACAGAATGTAAATTCTGGGAATTGAAAGGAAACATGCCACAAGTTTCACCAATGAGTTATGTTTAAATGCAACAA---ATGTTCATTCCAAGGACTTCAATCCAATCCACCTCAGGCAGACATAGCTG-TGACCACCCACCTTCACGAGAGCTGTCCTGTCTTCGCCATCACAGAGGTTAAGCTGGCAGTGCCGATCTACCAGGAGCTTCACCATATCTTCACGGCCAATGGCACAGGCCAAGTGGAGAGCAGTTCTGTGAGTGTGAAAGGACTTGTCAAGAAATTACAGTGTACCTTTTCAAAAATTGCA-AATCAATTCATAGAATTGTAAATGTTAAATACTACATTATTCTCATGACTCCAAAACAAAGAATTAG-TTTACTTTAGAAGAAAGTACAATATTTTTTTAG-- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=403554.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 193212 166 + 478999 TCATTAGTCACTGTATTAATGAAAGAgcagcctatttgaatagaaagagcatagctcttggatgacattcaacttgggctggaatcctacttgaagctctgtcgcttcctagctgttgcttagcctttttgtgtctcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- s ponAbe2.chrUn 7095936 166 + 72422247 TCATTACTCACTGTATTAATGAaagagcagcctatttgaatagaaagagcatagcccttggatgacactcaacttgggctggaatcctacttgaagctctgtcgcttcctagctgttgcttagcctttttgtgtttcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77092080 166 - 143122389 TCATTACTCACTGTATTAATGAAAGAgcagcctatttgaatagaaagagcatagtccttggatgacattcaacgtgggctggaatcctacttgaagctctgtcgcttcctagctgttgcttagccttttgctgtctcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34469900 165 + 198365852 TCATGACTCACTGTATTAATGAAAGAGCAG-CTATTTGAATAGAaagagcagagcccttggatgacattcagcttgggctggaacccttcttgaaggtctgtcacttcccacctgttgcttagcctttttgggtatcaatttccacatcaacaaaatgggaaagaa----------- i rheMac3.chr3 N 0 C 0 s macFas5.chr10 36543583 164 + 96509753 --ATGACTCACTGTATGAATGAAAGAGCAGCCTATTTGAACAGGaagagcagagcccttggatggcattcaacgtgggctggaatcctacttgaagctctgatgcttcccagctgttgcttaccctttttggctctcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32634433 166 - 90941950 TCATGACTCACTGTATGAATGAAAGAGCAGCCTATTTGAATAGGAAGAGCAGAGCCCTTGGATGGCATTCAACGTGGGCTGGAATCCTACTTGAAGCTCTGATGCTTCCCAGCTGTTGCTTACCctttttgggtctcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37800010 166 - 90373283 TCATGACTCACTGTATTAATGAAAGAgcagcctatttgaatagagagagcagagcccttggatgacattcaacttgggctggaatcctacttgaagttctgtcacttcccagctgttgcttagccttttggggtctcaatttcctcatcaataaaatgggaatgaa----------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10144638 166 + 96796970 TCATTACTCTCCGTTTTAATGAAAAAGCAGCCAATTTGAAGAgaaagatcatggcctttagattccactcaacttgggatggaatcctactttaagctctgtcccttcctagctgttgcttagcctttttgggtctcaatgtcctcatcaataaaatgggaatTAA----------- i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81185598 171 - 85426708 TGATTTTTCACCGCTCTATTaaaagagcagcctatctgattaggaagagcatgacctcaagaggcagctcaacctgggtttgattcccactttaa-ctctgtcacttcacagtgaccacttagcctt-----atcgcaatttccttatccacaaaatgggcataaaataGGCATAAA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=275479.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 193378 182 + 478999 aatag--------------------------------------------tcagtttc-----tcagagg-------------------------------aaaccactgtaatg---------------------------------------------cttaaataagactctacac--aaaatatag--aatagttcctaacacaaataacagctcaaaacttgtaagatattatAATTTTTACTAATACCACTAAAGACAACATTTGAATTAAGTGAAACGATACAATTATACCTACACTTTCAGGTA s ponAbe2.chrUn 7096102 177 + 72422247 aatag--------------------------------------------ccaatttc-----tcagagg-------------------------------aaaccactgtaatg---------------------------------------------cttaaataagactctacgc--aaaacatag--aatagtttctaacacaa----cagCTCAAAACTT-TAAGATATTATAATTTTTACTGATACCACTAAAGACAACATTTGCATTAAGAGAAATGATACAATTATACCTACACTTTCAGATA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77092246 171 - 143122389 aatag--------------------------------------------tcagtttc-----tcagagg-------------------------------aaaccactgtaatg---------------------------------------------ctcaaataagactctacac---aaacatag--aatagttcctaacacaaataacagctcaaaaattgtgagatgttatAATTTTTACTAATACCACTAAAGACAACATTTGAATTAAGTGAAATGATACAATTATACTTACA---------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34470065 184 + 198365852 aatag--------------------------------------------tggatttc-----tcagagg-------------------------------aaaccactgcaatg---------------------------------------------cttaaataagactccacacgaaagatatag--aatagttcctaacacaaataacagctcaataattgtaaggtattatCATTTTTACTAATACCACTAAAGACAACATTTGAATAAAGTGACATGATACAATTATACCTACACTTTTAGGTA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36543747 184 + 96509753 aagag--------------------------------------------tcgatttc-----tcagagg-------------------------------aaaccacagtaatg---------------------------------------------cttaaataagactctacacaaaagatatag--aatagttcctaacacaaataacagctcagtaattgtaagatattatAATTTTTACTAATACCACTAAAGACAACATTTGAATTCAGTAAgataatacaattatacctacactttcaggta i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32634599 184 - 90941950 aagaG--------------------------------------------TCGATTTC-----TCAGAGG-------------------------------AAACCACAGTAATG---------------------------------------------CTTAAATAAGACTCTACACGAAAGATATAG--AATAGTTCCTAATACAAATAACAGCTCAGTAATTGtaagatattataatttttactaATACCACTAAAGACAACATTTGAATTTAGTGAGATGATACAATTATACCTACACTTTCAGGTA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37800176 183 - 90373283 aatag--------------------------------------------tggatttt-----tcagagg-------------------------------aaaccactgtaatg---------------------------------------------cttaacaaagactctacacaaaacatacag--aattgttcctaacacaaataacagctcagtaactgtaagatattatAATTTTCACTAATACCACTAAAGAGAACATTTGAATT-AGTGAGATGATACAATTATACCTACACTTTCAGGTA i chlSab2.chr2 C 0 I 512 s canFam3.chr2 81185769 290 - 85426708 AATAGTTATCTCAggtcacctgtctggctcactctgaagagcatgtcactcgatctcgggagccaggggttcgagacccctgttggttatagaggtcacaaaacaatagtaataataaataaaaTAAAAGgtacttatctcacaggacctcttgtgatccttaaatgaggatccatgcaaagtgtttagatactagttcctaccacaAATAT-------------------TATTAAAGCTATTACTACAACTTACAAAGAC-TCACTACAATTAGGTAAAATGATCCAATTATGCCTAC-TTTGCAGCTA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=16423.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 193560 32 + 478999 CATTTTAAAGATTACAGGTAGCGTTGTActgt s ponAbe2.chrUn 7096279 32 + 72422247 CATTTTAAAGATTACAGGTAGCATTGTATTgt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34470249 27 + 198365852 TGTTTTAAAGATTACAGGTAACATTGT----- i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36543931 27 + 96509753 tgttttaaagattacaggtaacgatgt----- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32634783 27 - 90941950 TGTTTTAAAGATTACAGGTAACGATGT----- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81186059 26 - 85426708 -CGTTAAAGGATGAGCAAGAATACTCt----- i canFam3.chr2 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37800359 512 - 90373283 I e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C e nomLeu3.chr5 77092417 0 - 143122389 C a score=810473.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 193592 460 + 478999 attttattgagtctaagatgatcattgtctccatgttttaacatttcttacactgaaataccacttattaattcatgatttactataattataattggcagcatttaaataattttcttagtgagacataaaataatggggcatcatacaatccctggtgccttacattaagtagaat-atgTTATAATATAACAGGTCTGGGGCAGTTCCAGTCAGATGACT----------------AGCATTTAGATAAATTTTAGTTCTTAAAAGAAC-TATGGAATAAGAGGGCTGAGGTGAAAACAAAAAC-AATTTTCTAAAATAATCTATTTCTTACTTTGGTTTTCAA-AAACTTTAAGCCAAAGAAATCTTGAAATTCAAATGAATAG--------CAT------------------------------GGGCTCATTTTTTTCAATACTT-AGATTTAT---ACAACGT--------ATGTACATCAGATATTTCCAATCATTCATATTAGGATTTAAGACTGTTATAA s ponAbe2.chrUn 7096311 459 + 72422247 attttagtgattctaagatgatcattgtctccatgttttaacatttcttacactgaaatactacttat-aattcatgatttgctataactataattggcagcatttaaataattctcttagtgagacataaaataatgtggcatcgtacaatccctggtgccttacattaagtagaat-atgTTATAATATAACAGGTCTGGGGCAGTTCCAGTCAGATGACT----------------AGCATTTAGATAAATTTTAGTTCTTAAAAGAAC-TATGGAATAAGAGGGCTGAGGTGAAAACAAAAAC-AATTTGCTAAAATAATCTATTTCTTACTTTGGTTTTCAA-AAACTTTAAGCCAAAGAAAACTTGAAATTCAAATGAATAG--------CAT------------------------------GGGCTCATTTTTTTCAATACTT-AGATTTAT---ACAATGT--------ATGTACATCAGATATTTCCAATCATCCATATTAGGATTTAAGACTGTTATAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77092417 413 - 143122389 ----------------------------------------------TTTACACTGAAATCCCActtat-aattcatgatttactataactataattggcagcatttaaataactctcttattgaaacataaaataatggggcatcatacaatccctggtgccttacattaagtagaat-atgTTATAATATAACAGGTCTGGGGCAGTTCCAGTCAGATGACT----------------AGCATTTAGATAAATTTTAGTTCTTAAAAGAAT-TGTAGAATAAGAGGGCTGAGGTGAAAACAAAAAC-AAATTTCCAAAATAATCTATTTCTCACTTTGGTTTTCAA-AAACTTTAAGCCAAAGAAAAATTGAAATTCAAATTAATAG--------CAT------------------------------GGGCTCATTTTTTTCAATACTT-AGATTTAT---ACAATGT--------ATGTACATCAGATATTTCCAATCATTCATATTAGGATTTAAGACTGTTATAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34470276 458 + 198365852 AATTTGGT-attcttagatgatcattgtctccatgttttaccaattcttacactgaaataccacttat-aattcatgatttactataaccataactggcagcatttaagtaattctcttattgagacgtaaaatgatggggcatcatacagtccctggtgccttacattaagtagaat-atgTTATAATGTATCAGTCCTGGGGCAGTTCCAGTCAGATGACT----------------AGCATTTAGATAAATTTTAGTTCTTAAAAGAAC-TATGGAATAATAGGGCTGAGGTGAAAACAAAAACAAAATTCCTAAAATAATCTATTTCTTACTTTGGTTTTC-A-AAACTTTAAGCCAAAGAAAACTTGAAATTCAAATGAATAG--------CAT------------------------------GAGGTCATTTTTTTCAATACTT-AGATTTAT---ACAATGT--------ATGTACATCACATATTTGCAATCATTCATATTAGGATTTAAGACTGTTATAA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36543958 460 + 96509753 attttagtgattctaagatgatcattgtctctatgttttaccatttctcacactgaaataccacttat-aattcatgatttactataactataattggcaggttttaaataattctcttattgagacatacaataaaggggcatcatacaatccttggtgccttacattaagtagaat-atgttacaatataacaggtctggggcggttccagtcagatgact----------------agcatttagataaatgttagttcttaAAAGAAC-TATGGAATAAGAGGGCTGAGGTGAAAACACAAAC-AAATTTTAAAAATAATCTATTTCTTACTTTGGTTTTCAA-AAACTTTAAGGTGAAGAAAACTTGAAATTCAAATGAATGG--------CAT------------------------------GGGCTCATTTTTATCAATACTTAAGATTTAT---ACAATGT--------ATGTACATCAGATATTTCCAATCATTCATATTAGGATTTAAGACTGTTATAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32634810 455 - 90941950 ATTTTAGTGATTCTAAGATGATCATTGTCTCTATGTTTTACCATTTCTCACACTGAAATACCACTTAT-AATTCATGATTTACTATAACTATAATTGGCAGGAGTTAAATAATTCTCTTATTGAGACATACAATAATGGGGCATCATACAATCCCTGGTGCCTTACATTAAGTAGAAT-ATGTTACAATATAACAGGTCTGGGGCGGTTCCAGTCAGATGACT----------------AGCATTTAGATAAATGTTAGTTCTTAAAAGAAC-TATGGAATAAGAGGGCTGAGgtgaaaacac-----aaatttttaaaataatctatttcttACTTTGGTTTTCAA-AAACGTTAAGCCAAAGAAAACTTGAAATTCAAATG-ATGC--------CAT------------------------------GGGCTCATTTTTATCAATACTTAAGATTTAT---ACAATGT--------ATGTACATCAGATATTTCCAATCATTCATATTAGGATTTAagactgttataa i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37800871 454 - 90373283 attttagtgattctaagatgatctttgtctccatgttttaacatttcttacactgaaataccacttat-aattcatgatttactataactataattggcagtatttaaataattctcttattgagacatacaataatgggacatcatacaatccctggtgccttatattaagtagaat-atgTTATAATATAATAGGTCTGGGGCAGTTCTGGTCAGATTACT----------------AGCATTTAGCTAAATTTTAATTCTTAAAAGAAC-TATGGAATAAGACAGCTGAGGTGAACACAAAAAC-AAATTTCTAAAATAATCTATTTCTTAATTTGGTTTTC-A-AAACTTTAAGCCAAAGAAAACTTAAAATTCAAATGAATAG--------CAT------------------------------GGACTCATTTTTTTCAATACTT-AGATTTAT---ACAATGT--------ATTTACATCAGATATTTCCAATCATTCATATTAAGATTTAAGAC----ATAA i chlSab2.chr2 I 512 C 0 s canFam3.chr2 81186085 513 - 85426708 atttcaatgattccaagatgctcattttgtc-accttttaatatctctgacatcggaatccaatttct-aattcaaaatgtcttaaaactataactggcatgatttctaaaaatttcttcttggtacata-aatagtggggcatcatacaatcTACAGTG---TGCCTTAAGTGAAAGAATGACAT-ATACAACAGGTCTGTTGCACTTCTAGTCCTATGCTTGGAATTACATTGTTCAAGAACTAAAATAATTTTCAGTAGGTGAAAGCACATGACGGGTAAAAGAGACCA--CAATAGCAAAAGA-ATATTTTTAAG------TAATTCTTAGTTTGCTTTTCAAGGAAGTTTGAGCCAAAGGAAACTCGGATTTCAAAGAAACAGGCACAGCTCATTTTATCTTTTTTGGAGGGGGGGATGTGGGGAAGCTCATTTTATTAAGCATTT-CAATTAATAGAAAAATGTTTAGAATCATAGAAATCAAGTATTTCCAAGTACCAATATTAGTATTTAGTATTATTGCAA i canFam3.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=786821.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 194052 482 + 478999 ATTTTCTCTTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGC-ttttttcaacttttacattcggggatacaggtgcaggatgtgcaggttggttaacataggtaaacgtgttccaagagggttggctgtacagattatttcattactcaggtgttaagcctagtacccattagttctatttcctgcttctttccttcctc-------ccaccctccaccctctgataggccccagtgtgtgttgcttccctctaggtgtctgtgtgttctcctcatttagctcccacctataagtgagaccatgcagtatttggttttctcttcctatgttagtttgctaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaaggacaggctcttgttctttcttttatggctacatagtattccatgctgtttatgtaccacatttAAGTTCTTAAAACAGCTAAAACAGTGTTTACCCAAGTCTTATACAT s ponAbe2.chrUn 7096770 481 + 72422247 ATTTTCTCTTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGC-ttttttcaacttttacattcggggatacaggtgcaggatgtgcaggttggttaacataagtaaacgtgcaccagg-gggttggttgtacagactatttcattacccaggtgttaagcccagtacccattagttctatttcctgcttctttccttcctc-------ccaccctccaccctctgataggccccagtgtgtgttgcttccctctgggtgtctgtgtgttcacctcatttagctcccaactataagtgagaccatgcagtatttggttttctcttcctatgttagtttgttaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaaggacaggctcttgttctttcttttatggctacatagtattccatgctgtttatgtaccacatttAATTTCTTAAAACAGCTAAAAGAGTCTTTACCCAGGACTTATAAAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77092830 489 - 143122389 ATTTTCTCTTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGC-ttttttcaacttttacatttggggatacaggtgcaggatgtgcaggttggctaacataggtaaacgtgcgccgagggtgttggttgtacagattatttcattacccaggtgtgaagcccagtacccgttagttctatttcctgcttctttccttcctcccaccctccaccctccaccctctgataggccccagtgtgtgatgcttccctgtaggtgtctgtgtgttctcctcatttagctcccaactataagtgagaccatgcggcatttggttttctgttcctatgttagtttgctaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaaggacaggctcttgttctttcttttatggctacatagtattccatgctgtttatgtaccacatttGAGTTCTTAAAACAGCTAAAACAGTCTTTACCCAAGACTCATAAAT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34470734 469 + 198365852 ATTTTCTCTTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGC-ttttttcaactttcacattcaggagtacaggtgcaggatgtgcagatttgtt-acatatgtaaacgtgtgccaagggggttggatatacagattatttcattacccaggtgttaaacccagtacccattagttctatttcctgcttctttccctcctc-------ccaccttccacactctgataggccccagtgtatgttggttccctctaggtgtctgtgcattcccatcctttagttcccacctatatgtgagaccatgcggtatttggttttctgttcctatgtaagtttgctaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaagga-atgctctcgttctttcttttatgcctgaatagtattccatgctgtttatgtaccacattttAGTTCTTAAAAGTACTAAAACAGTCTGTACC-----------CAT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36544418 482 + 96509753 TTCTTCTCCTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGCTttttttcaacgtttacttttaggggtacaggtgcaggatgtgcaggtttgtt-acataggtaaaaatgtgtcaagggggttggttgtacaaattatttcattacctaggtgttaagcccagtacccattagttctatttgctgcttctttccctcctc-------ccaccctccaccctctgataggccccagtgtgtgtcgcttccctctaggtgtctgtgcgttctcatcatttagctcccacctataagtgagaccgtgcggtatttggttttctgttcctgtattagtttgctaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaaggacatgctctcgttctttcttttatgactgcatagtattccatgcaatttgtgtaccacattttGGTTCTTAAAAGTACTAAAACAGTCTTTACCCAAGACTTATACAT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32635265 482 - 90941950 tttttctccttttaaaatggaTTTATGAAACTATTTGTGGAGCtttttttCAACGTTTACTTTTAGGGGTACaggtgcaggatgtgcaggtttgtt-acataggtaaaaatGTGTCAAGGGGGTtggttgtacaaattatttcattactcAGGTGTTAAGCCCAGTACCTATTAGTTCTATTTcctgcttctttccttcctc-------ccaccctccaccctctgataggccccagtgtgtgtcgcTTCCCTCTAGGTGTCTGtgcattctcatcatttagctcccacctataagtgagaccgtgtggtacttggttttctgttcctgtattagtttgctaaggataatggccttcaacaccatccatgtccctgcaaaggacatgctctcgttctttcttttataactacatagtattccatgctgtttGTGTACCGCATTTTAGTTCTTAAAAGTACTAAAACAGTCTTTACCCAAGACTTACACAT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37801325 481 - 90373283 TTTTTCTCCTTTTAAAATGGATTTATGAAACTATTTGTGGAGC-TTTTCTCAATGGttacattcaggagtacaggtgcaggatgtgcaggtttgtt-acataggtaaatgtgcaccaaggcagttggttgcatagattatttcattatccaggtgttaagcccagtacccgttagttgtatttccagcttgtttccctcctc-------ccaccctctaccatctgataggccccagtgtgtggtgcttccctctaggtatctatgcattctcatcatttagctcccacctataagtgaaaccatccggtattttgttttctgttcctgtattagtttgctaaggataatggccttcaacaccacccatgtccctgcaaaagacatgctctcgttctttcttttatggctgcatagtattccatgcagtttgtgtaccacattttAGTTCTTAAAAGTACTAAAACAGTCTTTAGCCAAGACTTATACAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81186598 0 - 85426708 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=290994.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 194534 143 + 478999 TTTCAAAAGGGCAGTTAAGGGTTATCTTTTACTATTTTCCACCTTCAGAAGTGCTTTTGTTTGAAAGGAGG----GAGGAAAAGCTTCAATTGAGATTAAGTCCTAATGCCCCAATTTTGATTCTCTCAGCTTGCTCAGGTGCAGCA s ponAbe2.chrUn 7097251 143 + 72422247 TTTCAAAAGGGCAGTTAAGGGTTATCTTTTATTATTTTCTACCTTCAGAAATGCTTTTGTTTGAAAGGAGG----GAGGAAAAGCTTCAATTGAGATTAAGTCCTAATGCCCCAATTTTGAATCTCTCAGCTTGCTCAGGCCCAGCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77093319 143 - 143122389 TTTCAAAAGGGCAGTTAAGTTTTATCTTTTACTATTTTCTACCTTCGGAAATGCTTTTGTTTGAAAGGAGG----GAGGAAAAGCTTCAACTGAGATTAAGTCCTAATGCCCCAACTTTAAATCTCTCAGCTTGCTCAGGCCTAGCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34471203 143 + 198365852 TTTCAAAAGGGCAGTTAAGGGTTATCTTTTACTATGTTCTACCTTCAGAAATGCTTTTGTTTGAAAGGAGA----GAGGAAAAGCTTCAATTGAGATTAAGTCCTAATGCCCCAATTTTAAATCTCTCAGCTTGCTCAGGCCCAGCA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36544900 143 + 96509753 TTTCAGAAGGGTAGTTGAGGGTTATCTTTTACTATTGTCTACCTTCAGAAATGCTTTTGTTTGAAAGGAGG----GAGGAAAAGTTTCAATTGAGATTACCTCCTCATGCCCCAATTTTAAATCTCTCAACTTGCTTGGGAGCAGCA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32635747 143 - 90941950 TTTCAGAAGGGTAGTTGAGGGTTATCTTTTACTATTGTCTACCTTCAGAAATGCTTTTgtttgaaaggagg----gaggaaaagttTCAATTGAGATTACCCCCTAATGCCCCAATTTTAAATCTCTCAACTTGCTCATGTGCAGCA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37801806 143 - 90373283 TTTCAAAAGGATAGTTAAGGGTTATCTTTTACTATTGTCTACCTTCAGAAATGCTTTTGTTTGAAAGGAGG----GAGGAAAAGCTTCAATTGAGATTAAGTCCTAATGTCCCAATTTTAAATCTCTCAGCTTGCTCAGGCCAAGCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81186598 143 - 85426708 TGTCAAAAGGGCAGGTAAAGGTAATCTTTTACAATTTCTGATCTTCAGAAATGTTTTCCTTTGACAGGAAGTTCCAAGGAAAAGCTTCAGGTGAGATTAAGTCCTAATACTTCCATTTAAAATTTCTCACCTT----Aggggcaccc i canFam3.chr2 C 0 I 547 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=258942.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 194677 142 + 478999 GGTAAACATGAAG--TTTTCAAAGGTGGAAGGATCCTGAGAGATAGCAGAATATGCCTGCCATATAATAGGTGTCTGGCTTATGTTTGATGACTAAACGGATTGAAAGAATGGATAAACATAGGTTGGAAGTTCAATATTTTTT- s ponAbe2.chrUn 7097394 142 + 72422247 GGTAAACATGACG--TTCTCAAAGGTGGAAGGATCCTGAGAGATAGCGGAATATGCCTGCCATATAATAGGTGTCTGGCTTATGTTTGATGACTAAACGGATTGAAATAATGGATAAACACAGCTTGGAAGTTCAATATTTTTG- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77093462 142 - 143122389 GGTAAACATGAAG--TTTTCAAAGGTGGAAGGATCCTGAGAGATAGCAGAATATGCCTGCCACATAATAGGTGTCTGGCTTATGTCTGATGACTAAGCAGATTGAAAGAATGGATAAACACAGCTTGGAAGTTCAATATTTTTA- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34471346 141 + 198365852 GGTAAACATGAAG--TTTTCAAAGATGGAAGGATCCTGAGAGATGGTAGAATGTGCCTGCTGCATAATAGGTGTCTGGCTTATGTTTGATGACTAAACAGATTGAAAGAATGGATAAACACAGCTTAGGACTTCAATATTTTT-- i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36545043 141 + 96509753 GGTAAATATTAAG--TTTTCAAAGACGGAAGGATCCTGAGAGATGGTAGAATATGCCTTCCACATAATAGGTGTCTGGCTTATGTTTGATGACTAAACGGATTGAAAGAATGCATAAACACAGCTTAGGAGTTCAATATTTTT-- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32635890 140 - 90941950 GGTAAATATGAAG--TTTTCAAAGATGGAAGG-TCCTGAGAGATGGTAGAATATGCCTTCCACATTATAGGTGTCTGGCTTATGTTTGATGACTAAACGGATTGAAAGAATGCAGAAACACAGCTTGGgagttcaatattttt-- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37801949 141 - 90373283 GGTAAACATGAAG--TTTTCAAAGATGGAAGGATCCTGAGAGATAGTAGAATATGCTTGCCACATAATAGGTGTCTCGTTTATGTTTGATGGCTAAATGTGTTGTAAGAATGGATAAACACAGCTTAGGAGTTCAATATTTTT-- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81187288 133 - 85426708 GGGCAACATGAAATCTTTTTAAGATTGAAAAGATCCTGA------GTAGACTATGTCTGCTACGTAACCCGTGTTCAGGTTCTGTTTGAGAAATAAATGGACTGAA-----GAATAAATACATTTGGAGAGTTCAATAGtttt-t i canFam3.chr2 I 547 I 211 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=369407.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 194819 234 + 478999 AAAGAAAACTCCTGTTGAGTAGAGCAATACATTTGCGATAGTAACGATCATTTATATTTGCTA------------------------------------------------------------TTTTAGTTTTCATAAATATATAACTAAACTAAAAT--AATTAATCCATACTATTTACACAT--CA---ATCTATATATAAT-------------------AAGATGTATAC-------------------ACAATAAAATCTACCAGAAGAGGTAAACAGAAGCCCTCTACTTCTGAAGAGGGTAAAAGTTCACAGAAGATAGCCATCC------------------------ACAGGTA---------------- s ponAbe2.chrUn 7097536 255 + 72422247 AAAGAAAACTCCTGTTGAGTAGAGCAATATATTTGCAATAGTAATGATCATTTATATTTGCTA------------------------------------------------------------TTTTAGTTTTCATAAATATATAACTAAACTAAAAT--AATTAATCCATACTATTTATACATGTTA---ATCTATATATAATGAAAACACAATTATATAATAAAATGTATAT-------------------ACAATAAAATCTACCAGAAGAGTTAAACAGAATCCCTCTACTTCTGAAGAGGGTAAAAGTTCACAGAAGATAGCCATCC------------------------CCAGGTA---------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77093604 257 - 143122389 AAAGAAAACTCCTGTTGAGTAGAGCAATACATTTGCAATAGTAATGATCATTTATATTTGCTA------------------------------------------------------------TTTTAGTTTTCATAAATATATAACTAAACTAAAAT--AATTAATCCATACTATTTACACATGTTA-ATATATATATATAATGAAAAGATAATTATATAATAAAATATATAT-------------------ACAATAAAATCTACCAGAAGAGGTAAACAGAATCCCTCTACTTCTGAAGAGGGTAAAAGTTCACAGAAGATAGCCACCC------------------------ACAGGTA---------------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34471487 258 + 198365852 AAAGAAAACTCCTGTTGAGTAGAGCAATACATTTGCAATAGTAATGATCATTTATATTTGCTA-------------------------------------------------------------TTTAGTTTTCATAAATATATAACTAAACTAAAAT--AATAAATCCACACTTTTTACACATGTTA---ATCTATATATAACGAAAAGATAA---------------TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCTACAGGAAGAGGTAAACAGATTCCCTCTACTTCTGAAGAGGGTAAAAATTCACAGAAGATAGCCATCC------------------------ACAGGAA---------------- i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36545184 249 + 96509753 AAAGAATGCTCCTGTTGAGCAGAGCAATACATTTACAATAGTAATGATCATTTATATTTGCTA------------------------------------------------------------TTTTAGTTTTCATAAATATATAACTAAACTAAAAT------AATTCATACCTTTTACACATGTT-----TATATATATAATGAAAATATAATTTTATAATAAAATGTATAT-------------------ACAATAAAATCTACAGGAACAGGTAAACAGAAACCCTCTACTTCTCAAGAGGGTAAAAGTTCACAGAAGATAGCTATCC------------------------ACAGGAA---------------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32636030 249 - 90941950 aaagaatgctcCTGTTGAGTAGAGCAATACATTTACAATAGTAATGGTcatttatatttgcta------------------------------------------------------------ttttagttttcataaatatataactaaaataaaat--aattaattcataCCTTTTacacatgtt-------tatatataatgaaaagataattttataataaaatgtatat-------------------acaat-aaATCTACAGGAACAGGTAACCAGAAACCCTCTACTTCTC-AGAGGGGAAAAGTTCACAGAAGATAGCTATcc------------------------acaggaa---------------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37802090 238 - 90373283 AAAGAAAACTCCTTTTGAGTACAACAATACATTTGAAATAGTAATGATCGTTTATATTTGCTA------------------------------------------------------------TTTTAGTTTTCATAAATA---AACT----------------AATCCATACTTTTTACAAATGTTT---ATCTATATGTAATGAAAAGACAATTATATAATAAAATGTATAT-------------------ACAATAAAACCTACAGCAACAGGTAAACAGAATCCCTCTACTTCTGAAGAGGGTAAAAGTTCACAGAAGACAGTCATCC------------------------ACAGGAA---------------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81187632 356 - 85426708 AAAGAAAAGTTTTGTAAAGTAAACTAATACTTTTGAAATAGCAATAAAAATTTATATTTGCTACTTTTTTTCAGAAGAGGGAAACAACAAAAGTTCTATAAGCTATCACGGTATCATTTGTATTTTTTATTTTCATGAGGATTTAACTAAAATAAAATTTTATTGTTATTTACTTATTGC--TTGTTATAAAGCTGCACATAACAAAATCATATGTATATATTTA-ACGTATGC-------------------ATAATAAAATCTACAAT-ACAGATAAAAATATTCCCCTGAGTTCTGAAGAGGCTAAAGGTTGTCAGAAAATACCAATCCTCGCCCATCAATTTTTCTTTTTTAATAGAAAGAggggcatctgggta i canFam3.chr2 I 211 I 171 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=1213863.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 195053 659 + 478999 TAAAAATAAATAATAGAATGTAAGAAATTATTTGTATCTATGCAAGTAGCATATTCCTTCTCTTCCCAAGGATTATTTCATTACTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTGCAGATG---TTCATTGCAGAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGAAAAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTATATTTTCCACATATTTCCAGCTAACACAAGAGCAGATTCTATTTGTGTATATGTAT-AACAAACTGA-TTTTTT-CTCACT---TGATACAGCAAAGTACATCTCTGCATGCCGACATATCTCTGTATCTACTGACACCCTCAATGGTTACATATTATTCCATCCTATGGATGCACTGAAATTTGTTCATAAAATCT-TTATATGAGTTCTTCTAAATACATGGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACAGCTG----------------TGTCTGTTTCATATAGATATTTCAGTATAATGGAACAGATGGGTAAAAGGCATACACATTTTAAAAATGTGGTTCTTACCATCAAAGTGTCTATTTGAAAAGCCGCAGCAACTTAAACTTTCAGCAGGTATATAAGTACCACTGTTCTTCACCCTCACAAACTTTGTGGACACAAAACAGTATTTCATTCCTTTATAtttatttattt---attttt-----------------------ttgagatggag s ponAbe2.chrUn 7097791 681 + 72422247 TAAACATAAATAATAGAATGTGAGAAATTATTTGTATCTATGCAAGTAGCATATTCCTTCTCTTCCCAAGGATTATTTCATTACTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTTCAGATG---TTCATTGCAGAAATCACA-----GACAAGAGAAACGGAAAAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTGTATTTTCTACGTATTTTCAGCTAACACAAGAGCAGATTCTGTTTGTGTATATGTAT-AACAAACTGA-TTTTTTTCTCACT---TGATATAGCAAAGTACATCTTTGCATGCCGACATATTTCTGTATCTACTGACACCCTCAATGGTTACATATTCTTCCATCCTATGGATGCACTGAAATTTGTTCATAAAATCT-TTATATGAGTTCTTCTCAATACATGGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACAGCTG----------------TGTCTGTTTCATATAGATATTTCAGTATAATGGAATAGATGGGTAAAAGGCATACACATTTTAAAAATGTGGTTCTTACCATCAAAGTGTCTATTTGAAAAGTCACAGCAACTTAAACTTTCAGCAAGTATATAAGTACCACTGTTCTTCACCCTCACAAACTTTGTGGACAGAAAACAGTATTTCATTCCTTTATATTTATTTATTT---Atttttattttttatttatttact--tttttgaaatggag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77093861 679 - 143122389 CAAAAATAAACAATAGAATGTAAGAAATTATTTGTTTCTATGCAAGTAGCATATTCCTTCTCTTCCCAAGGATTATTTCATTACTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTTCAG-TG---TTCATTGCAGAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGAAAAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTATATTTTCTACATATTTTCAACTAACACAAGAGCAGATTCTGTTTGTGTATAAGTAT-AGCAAGCTGA-TTTTTT-CTCACT---TGATATAGCAAACTACATCTTTGCATGTCGACATATCTCTGTATCTACTGACACCCTCAATGGTTACATATTCTCCCATCCTGTGGGTGCACTGAAATTTGTTCATAAAATCT-TTATATGAGTTCTTCTCAATACATGGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACAATTG----------------TGTCTGTTTCATATAAGTATTTCAGTATAATGGAATAGATGGGTAAAAGGCATACACATTTTAAAAATGTGGTTCTTACCATCAAAGTGTCTATTTGAAAAGTCGCGGCAACTTAAACTTTCAGCAAGTATATAAGTACCACTGTTCTTCACCCTCACAAAGTTTGTGGACAGAAAACAGTATTTCATTCCTTTATATTTATTTATTC---Atttttattttttatttatttatt--tttttgagatggag i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34471745 666 + 198365852 TAAAAATAAATAATAGAATGTGAGAAATTAGTTGTATCTATGCAAGCAGCATATTCCTTCTCTTTCCAAGGATTATTTCATTACTAATGAACCAACTTAACTAAAACTTTTCAGACA---TTCATTGCAGAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGAAAAACTTCACTTG-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTATATTTTCTACATATTCTCAGCTAACACAAGGGCAGACTCTGTTTGTGTATATGTGT-AACAAAATGATTTTTTTTCTCACT---TGATATAGCAAACTACATTTTTGCATGCCAACATATCTCTGTGTCTACTGACACCCTCAATGGTTACACATTATTCCATCTTATTCATGCACTGAAATTTGTTCATAAAATCT-TTATATGAGTTCTTCTCAATACACTGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACGGATG----------------TGTCCGTTTCATACAGATATTTCAGTATATGggaattgatgggtaaaaggcacacatatttttaaaatatgattcttaccaccaaattgtctatttgaaaagttgcagcaacttaaactttcaacaacagtgtaagtaccactgttctttaccctcacaaactttgtggatagaaaacaatatttcactccgtt-------tttactt---atttgttttatt--------------tttttgagatggaa i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36545433 675 + 96509753 TAAAAATAAATAATAAAATGTGAGAAATTATTTGTATCTATGCAAGTAGCACATTCCTTCTCTTTCCAGGGATTATTTCATTACTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTTCAGATA---TTCATTGCAGAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGAAGAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTATGTTTTCTACATATTTTCAGGTAACACAAGAGCAGATTCTGTTTGTGTATGTGTAT-AACAAACTGA-TTTTTTCCTCACT---TGATATAGCAAAGTACATCTTTGCATGTCAACATATCTCTGTATCTACTGACACCTTCAATGGTTACATATTATTTCATCCTATGGATGCACTGAAATTTTTGCATAAAATCT-TTATGTGAGCTCTTCTTAATACACTGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACATATG----------------TGTCTATTTCATATAGATATTTCAGTATAATAGAGTTGATAGGTAAAAGGCATACACATTTTTAACATGTGGTTCTTATCATCAAAGTG--TGTTAGAAAAGTTGCAGCGGCTTAAACTTTCAGCAACTACATAAGTACCACTGTTCTTCACCCTCACAAACTTTGTGGATAGAAGACAGTATTTCATTCCttt------atttattt---atttttattatttatttatttatttatttttgagatgaag i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32636279 675 - 90941950 taaaaataaataataaaatgtgagaaattaTTTGTATCTATGCAAGTAGCACATTCCTTCTCTTTCCAAGGATTATTTCATTACTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTTCAGATA---TTCATTGCAGAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGGAAAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATAAGTTTGATTATGTTTTCTACATGTTTTCAGGTAACACAAGAGCAGATTCTGTTTGTGTAGGTGTAT-AACAAACTGA-TTTTTTCCTCACT---TGATATAGCAAAGTACATCTTTGCATGTCAACATATCTCTGTATCTACTGACACCTTCAATggttacatattatttcatcctaTGGATGCACtgaaattttttcataaaatct-ttATGTGAGCTCTTCTTAATACACTGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACATATG----------------TGTCTATTTCATATAGATATTTCAGTATAATAGAGTTGATAGGTAAAAGGCATACACATTTTTAACATGTGGTTTTTATCATCAAAGTG--TGTTAGAAAAGTTGCAGCAGCTTAAACTTTCAGCAACTACATAAATACCACTGTTCTTCACCCTCACAAAGTTTGTGGATAGAagacagtatttcattccttt------atttattt---atttttattatttatttatttatttatttttgagatgaag i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37802328 655 - 90373283 TAAAAATAAATAGTAGAATTTGAGAAATTATTTGTATCTGTTCAAGTAGCATATTCTTTCTCTTCCCAAGGATTATTTCATTATTAATGA---AACTTAACTAAAACTTTTCAGATA---TTCATTGCATAAATCACA-----GATAAGAGAAAGGGAAAAACTTCACTTA-----CAAATCCCCAGAAATATGTTTGATTATGTTTTCTACATATTTTCGGGTAACACAAGAGCAGATTCTGTTTGTGTATGTGTAT-AACAAACTGA--TTTTTTCTCTCT---TGATATAGCAAAGCACATCTTTGCATGTCAACATATATCTATATCTACTGACACTCTCAATGGTTACAAATTATTCCATCCTATGGATGCACTGAAATTCATTCAGAAAATCT-TTACATGAGTTCTTCTCAATACACTGCTATTTTAAGCAATACTAAGAAAAACAGATG----------------TGTCTGTTTCATATAGATATTTCAGTATAATGGAATTGATGGGTAAAAGGCATACACATTTTAAAAATGTTGTTCTTACCATCAAAGTGTCTATTTGAAAAGTTGCAGCAACTTAAACTTTCAGCAACTATGTAAGTACCACTGTTTCTCACTCTCACAAACTTTGTGGATAGAAAACAGTATTTCATTCCtt--------tttattt---at-----ttatt--------------tatttgagatggag i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81188159 672 - 85426708 taaaaGTAAATA----AAT---AGAAATTCTTTTTGCCTACACAAGATTCATATTCTTGCTGTTCTCCTGGATTACTTCATTGATAATAA---ACCTTTGTTGGAA-TTTTTATATACCTTTTCCTGTAGAAATCAGACTTTTTTTTTAAGAAACAAGAAAAATTCACTTACAATCCAAATGTTTCAAGATAACTAATTTTATATTTTTCACATCTTTTTGGCCAACACAAAACCATTGTCTGCTTATGTGTTTGTATCATCAAACCAT-TTTTCCCCTCATTTAATGATCCACTAAAGTACAGCTTTGCATGTTAATGTGTATCAATTATCTCTGCCACAttcagtggtcacatagtagtccagcctatggatacactgccacttatttataaaggccattaaatgagttctt---aatataccgctattgtaaatagtgctgagaaaagcatatagtatattgtttatctttaattatttactaaagatattttaaattaataaaattcatgggtaaaaggaatacatatttttCAATTGGGACT-TAACCACCGAA----CTATCTGAAAAGT--CAAAAAC---AACTTTAACCAGGAGTATGAGTACCATCATTCCTTATCTTCACAAAGCCTGCAGATGGAAAATGGGATTTTACTCCttt-------tttattttagattttt--------------------tttttgacacagag i canFam3.chr2 I 171 I 120 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=355879.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 195712 212 + 478999 tctcactccatcacccaggctggagtgtagtggtgcaatctcagctcactgcaacctccgtctccctggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggattacaggtgcatgccaccatgcccagctaattctttgta-tttttagtagaaacggg-tttcaccatgctggccaggctagtatcaaactcctgacctcgtgat s ponAbe2.chrUn 7098472 213 + 72422247 tctcactccatcacccaggctggagtgtagttgtgcaatttcagctcactgcaacctccgcctccctggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctggaattacaggtgcatgccaccatgcccagctaattctttgta-tttttagtagaaacggggtttcaccatgctggccaggctagtatcaaactcctgacctcgtgat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77094540 213 - 143122389 tctcattccatcacccaggctgaagtgtaggggtgcaatctcagctcactgcaacctctgcctccctgattcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggtgcacaccaccatgcccagctaattctttgta-tttttagtagaaacagggtttcaccatgctggccaggctagtctcaaactcctgacctcatgat i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34472411 213 + 198365852 tctgactctatcacccaggctggaatgcattggctcaatcttggctcactgcaacctctgcctccctggtttaagcaattctccacccttggcctcctgagtagcggagattacaggtgcatgccaccatgcctggctaattctttgta-tttttagtagagacatcttttcatcatgtaggccaggctagtctcaaactcctgatcttgtgat i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36546108 214 + 96509753 tctcattccatcacccaggctggagtgtagtggtgcaatctcagctcactgcaacctccacctccctggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggtgcatgccaccatgcctggctaattttttgtattttttagtagagacggggtttcaccatgctggccaggctagtctcaaattcttgacctcgtaat i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32636954 214 - 90941950 tctcattccatcacccaggctggagtgtagtggtgcaatctcagctcactgcaacctccacctccctggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggtgcatgccaccatgcctggtcaattttttgtattttttagtagagacggggtttcatcatgctggccaggctagtctcaaattcttgacctcgtaat i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37802983 213 - 90373283 tgtcaccccatcacccaggctggagtgtagtggtgcagtctcagctcactgcaacctccgcctccctggttcaagcaactctcctgcctcagcctcctgagtagcggggattacatgtacatgccaccatgcccagctaactttttgta-tttttagtagaaatggggtttcaccatgctggctgggcttatctcaaactcctgacctcatgat i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81188831 120 - 85426708 I e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=507903.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 195924 307 + 478999 ccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccatggctggccTTTCATTCCTCTTCTAACTTAAACAGAAAATAGTCTTTCATTCCTCTTCTAACT------TAAATTCCTTC----TCTTAGCAGGAATGCTATGTTTTCCTATGTACACAGGTCACTGGTAGACATGCAAAAAA--------------GTACCTTGCCCAATTTTAAA-----TTGAGCTTATTTTATTATATCTGCATATATATgccggtttcagtggctcatgactgtaatctcagcactttgggaggctgaggtgggtggatcacaaggacagg s ponAbe2.chrUn 7098685 303 + 72422247 ccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgtggctggccTTTCATTCCTCTTCT----TAAACAGAAAACATTCTTTCATTCCTCTTCTAACT------TAAATTCCTTC----TCTTACTAGGAACGCTATGTTTTCCTATGTGCACAGGTCACTGGTAGACATGCAAAAAA--------------GTACCTTGCCCAGTTTTAAA-----TTGAGCTTATTTTATTATATCTGCATATATATgccggtttcagtggctcatgcctgtaatctcagcactttgggaggctgaggtgggtggatcacaaggacagg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77094753 307 - 143122389 ccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcataagccaccgtggctggccTTTCATTCCTCTTCTAACTTAAATAGAAAACAGTCTTTCATTCCTCTTCTAACT------TAAATTCCTTC----TCTTACCAGGAACACCATGTTTTCCTATGTGCACAGGTCACTGGTAGATATGCAAAAAG--------------GTACCTTGCCCAATTTTAAA-----TTGAGTTTATTTTATTATATCTGCATATATATGCCAGTTTcagtggctcatgcctgtaatctcagcactttgagaggctgaggcaggtggatcacaaggacagg i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34472624 307 + 198365852 ccacctgccttggcctcccaaaatgctggcattacagatgtaagccaccacagccagcctttcatttctcttctaacttaaatagaaaacagtatttcattcatcttctaact------taaatttcttc----tcttaccaggaacactacgttttcctatgtgcacaggtcactggtaCATATGCAAAAAA--------------GTACCTTGCCCAAGTTTAAA-----TTGAGCTTATTTTATTATATTTGCATATTTAggctgggttcagtggctcaggcctctaatctcagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacaaggacagg i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36546322 311 + 96509753 ccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcagccggccTTTCATTCCTCTTCTAACTTAAATAGAAAACAGTATTTCATTCCTCTTCTAAAT------TAAATTCCTTCCTTATCTTACCAGGAACACTACGTTTTCCTATGTGCACAGGTCACTGGTAGATATGCAAAAAA--------------GTACCTTGCCCAATCTCAAA-----TTGAGCTTATTTTATTATATCTGCACATATATGCTTGGTTcagtggctcaggcttgtaatctcagcactttgggaggctgaggcggctggatcacaaggatagg i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32637168 311 - 90941950 ccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcagccggccTTTCATTCCTCTTCTAACTtaaatagaaaacagtatttcATTCCTCTTCTAAAT------TAAATTCCTTCCTTATCTTACCAGGAACACTACGTTTTCCTATGTGCACAGGTCACTGGTAGATATGCAAAAAA--------------GTACCTTGCCCAATCTCAAA-----TTCagcttattttattatatctgCACATATATGCTTGGttcagtggctcaggcttgtaatctcagcactttgggaggctgaggcggctggatcacaaggatagg i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37803196 303 - 90373283 ccacctaccttggcctcccaaactgctgggattacaggcgtgagccaccgcaactggccTTTCATTGCTCTTCTAAATTAAATAGAAACCAGTACTTCATTCCTCTTCTA----------AAATTCCTTC----TCTTACCAGGAACACTACATTTTCCTATGTGCACAGGTCACTGGTAGATATGCAAAAAA--------------GTACATTGCCCAAGTTTAAA-----TTGAGCTTATTTTATTATATCTGCATATATATgccgggttcagtggctcatgcctgtaatctcagtattttgggaggcctagatgggtggatcacaaggacagg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81188951 284 - 85426708 ccaactgactgggccacccaga-------------------gaccccCTATTTCATTCCTTTAATACCTTCCCT-------GTAAAACATATTCttttgtatctgatacacatatgttgtaaatattttg----------caaggacattctcttttattttattaata--ttattttctgatatacagagagttttaattttttatgtggctgaatcaacctccagaactcttgcttttattttattattattattttttaagattttctttatt----------tgtga----gagacacagggggagagagggaggcagagcacaggcagagg i canFam3.chr2 I 120 I 47 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=184319.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 196231 119 + 478999 agttcaagaccagcctggcaaagatggtgaaatcccgtcttgattaagaacacaaaaaattagccaggcatggtggtgggtgcctgtaatcccagctacttggtaggctgaggcaaaga s ponAbe2.chrUn 7098988 119 + 72422247 agttcaagaccagcctggcaaagatggggaaatcccatcttggttaaaaacacaaaaaattagccgggcatggtggcgagtgcctgtaatcccagctacttggtaggctgaggcagaga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77095060 119 - 143122389 agttcaagaccagcctggcaaagatggcgaaatctcatctttatgaaaaatacaaaaaattagccgggcgtggtggtgggcgcctgtaatcccagctactcggtaggctgaggcagaga i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34472931 119 + 198365852 aattcaagaccagcctggccaagatggtgaaatgctgtctctattaaaaatacaaaaaattagccaggtgtggtcgtgggcgcctgtaatcccagctactctgtaggctgaggtagaga i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36546633 119 + 96509753 agttcaagactagcctggccaagatggtgaaatcctgtctctattgaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgggcacctgtaatcctagctactcaataggctgaggcagaga i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32637479 119 - 90941950 agttcaagaccagcctggccaagatggtgaaatcctgcctctattgaaaatacaaaaaattagctgggtgtggtggcgggcacctgtaatcctagctactcaataggctgaggcagaga i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37803499 107 - 90373283 agttcaagaccagcctggtcaagatggtgaaatcccgtctctattaaaaatacaaaaatttagctgggtgtggtggcggttgcctgtaatccca------------gctgaggcagaga i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr2 81189235 47 - 85426708 I e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=626300.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 196350 341 + 478999 attacttgaacc-aggaaccagaggttgtagtgagctgatattgcaccactgcactccagcctgggctatggag----------tgagagtctgtctcagaaa-------aataaataaaTA--------TTTGCACATATAAATAGGCATTTGTGTTTTCT--TCTGGTACTTTTCTCCTTTTGTATCTTTAAAATTTTTAATCTATACTCCA---GGAACTTATTTTTGTGACATAAAAATCTAGGTAGTTTTCTCCAAACAGCATGCATT-----TAAT-----TTATGAATAATTCACCTTGTTTTACCAATATGAAACATCACCATTATCAAGTGCTAAATTCTT-ACATATATTTGGGTATTTCTGGATTTCCTATT s ponAbe2.chrUn 7099107 349 + 72422247 attacttgaacc-gggaaccggaggttgtagtgagccgatattgtgccactgcactccagcctgggcaacggag----------tgagagtctgtctcagaaa-------aataaataaataaataaataTTTGCACGTATAAATAGGCATTtgtgttttct--tctggtacttttctcctttcgtatattaaaaatttttaatctatacttca---ggaacttatttttgtgacataaaaatctaggtagttttctccaaacagcatgcatt-----taat-----ttatgaataattcatcttgttttaccaatatgaaacatcaccattatcaagtgctaaattctt-acatatatttgggtatttctggatttcctgtt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77095179 349 - 143122389 attgcttgaacc-gggaaccagaggttatagtgagctgatattgcgccactgcactccagcctgggcaacggag----------tgagagtctgtctcagaaa-------aataaataaataaataaaTATTTGCAcatataaataggcatttgtgttttct--tctggtacttttctccttttgtatatttaaagtttttaatctatactcca---ggaacttatttttgtgacataaaaatctaggtagttttctccaaacagcttgcatt-----taat-----ttatgaataattcatcttgttttaccaatatgaaacatcaccattatcaagagctaaattctt-acatatatttgggtatttctggacttcctatt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34473050 354 + 198365852 actgcttgaacctaagaggcagaagttgtagtgggccgacattgtgccagtgcactccagcctggacaacagag----------tgagactctgtctcagaaa-------aataaataaataaataaataTTTGCATATATAAATAGACATTTGTGTTTTCT--TCTGGTGCTTTTCTCCTTTTGTATATTTAAAATTTTTAATCAATACTCCA---GGAACTTATTTTTGGGACATAAAAATCTAGCTGGTTTTCTTCAAACAGCATGAATTATTCAGCAT-----TGATGAATAATTCATCTTG-TTTAACAATATGAACCATCACCACTATCAAGTGATAAATTCTT-ACATGTATTTGGGTACTTCTGGATTTCCTATT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36546752 350 + 96509753 attgctcgaacccgggaggcggaggttgtagtgagctgatattgcgccactgcactccagcctgggcaacagag----------tgagattctgtcccagaaa-------aataaataaataaataaaTAGTTGCATATATAAATAGGCTTTTGTGTTTTCT--TCTGGTGCTTTTCTCCTTTTGTATATTTAAAATTTTTAATCTATACTCCA---GGAAATTACTTTTGTGACATAAAAATCTAGCTAGTTTTCTCCAAACAGCATGCATT-----TCAT-----TTATTAATGATTAATCTTGCTTTATCAATATGAAACATCACCATTATCAAGTGCTAAATTCTT-ACATATATTTGGGTATTTCTGGATTTCCTATT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32637598 350 - 90941950 attgctcgaacccgggaggcggaggctgtagtgagctgatattgcgccactgcactccagcctgggcaacagag----------tgagattctgtcccagaaa-------aataaataaataaataaatagttgcatatataaataggcttttgtgttttct--tctggtacttttctccttttgtatatttaaaatttttaatctataCTCCA---GGAAATTACTTTTGTGACATAAAAATCTAGCTAGTTTTCTCCAAACAGCATGCATT-----TCAT-----TTATTAATGATTAATCTTGCTTTATCAATATGAAACATCACCATTATCAAGTGCTAAATTCTT-ACATATATTTGGGTATTTCTGGATTTCCTATT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37803606 347 - 90373283 attgcttgaacccgggaggcagaggttgttgtgagccgatattgtgccactgcactcctgcctgggcaacagag----------tgagagtctgtctgagata-------aataaataaataaaCA---ATTTGCATATATAAATAAGCATTTGTGTTTTCT--TCTGGTACTTTTCTCCTTTTGTATATTTAAAATTTTTAATCTATATTCCA---GGAATTTATTTTTGTGATATAAAAATCCAGCTAGTTTTCTCCAAACAGCATCCATT-----TCAT-----TTATGAATAATTCATCTTGTTTTACCAATATGAAACATCACCATGAACAAGTGCTAAATTCTT-ACATATATTTGGGTATTTCTGGATTTCCTACT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81189282 352 - 85426708 gtctccagaatc---aggccctgggctgaaggcagc----gctgtaccgctgagcc---acctgggctgcccgaactcttgcttttaaagtcattcttaagaatggtcttggtcaacataaaaa-----------atgggcatagaagcgttcatgttttcttctcttgtactgt----attttgcatatttaacatttttaatctgtattccatctggaacttatttttatgagattaaattctagctagttttctccaaatagcagatatg-----tcatcaacattatgaatgattcaccttttcctactaatatgaaatgtcaccagcatcaagttacaaagtcttaacatatacttaggtgtttggcattttcttat- i canFam3.chr2 I 47 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10144804 0 + 96796970 C a score=254829.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 196691 104 + 478999 CTGTTCTGTTCACTTA--TGTCTTTTCAGCTGTTAGTAAAC----AATTTGTGGAAATAACACACGCACATTTTGATATCTGGAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTGTTA s ponAbe2.chrUn 7099456 104 + 72422247 ctgttctgttcattta--tgtcttttcAGCTGTTAGTAAAC----AATTTGTGGAAATAGCACATGCACATTTTAATATCTGGAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTGTTA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77095528 104 - 143122389 ctgttctgttcattta--tgtcttctcagctgttagtaaac----aatttgtggaaatagcacatgcacattttgatatctggaaaa--------------------gcaagtcttt-------ttccattctgttA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34473404 104 + 198365852 CTGTTCTATTTATTGA--TGTCTTTTCAGCTGTTAGTGAAC----AATTTGTAGAAATAGCACATGCACATTTTGACGTCTGAAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTGTTG i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36547102 104 + 96509753 CTGTTCTATTCATTGA--TATATTTTCAGCTGTTAGTAAAC----AATTTGTGGAAATAGCACATTCACATTTTGATATCTGGAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTGTGA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32637948 104 - 90941950 CTGTTctattcattga--tatttttgcAGCTGTTAGTAAAC----AATTTGTGGAAATAGCACATTCACATTTTGATATCTGGAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTggta i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37803953 102 - 90373283 CTGTACTATTCATTGA--TGTTTTTTCAGTTGTTAGTGAAC----AATTTGTGGAAATAGCACATACACATTTTGATATCTGGAAAA--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCAT--TGTTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10144804 104 + 96796970 CTATTCTATTCATTTA--TGTATTTTCAGCTGTTAGTAAAC----AATTTGCAAAAATAGCACATGCACATTTTGATATCCGGAAAG--------------------GCAAGTCTTT-------TTCCATTCTGTTA i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81189634 135 - 85426708 ctgttccattcatttatctgtcttttcAGCTGTTAGTCAACGAAAAATTTGAAGAAGT--TTAAGGTACATTTTAATAACTGGAAGGTATTCTATAAAATTtttttttcaagttttcattttagttccagtttgtta i canFam3.chr2 C 0 I 207 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=830850.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 196795 376 + 478999 CAAAAAA---------------------------------------------TCAATTTATCACAATGATA-----AAATACATCATGTGCAA---------------------------T----TTAAAGACACTAAGACTTTGCTATTTTTATTTGGCTTATGTAAAAGTGATAAACACAGAAAAAGCTCACATCTTAAGAAAAACGAACCTTCCTATTCAAAGATATGAACCATACTTCCCATTTC--AGTTTCCTTTTAAGGTTACTCAGTAAAGAACGTGTTTACATAGGGTACACATCGATATAAAATCCATATTGGATTTTATTTGAAAAATATTTAGCCCAGAAGTTGATATATTATGGGACTTAGT--TCTCAATATACACCTTTCTATAGTGTATAGAACATTGTTTTAAAATGTGTACATTAAAAATAATCTGCTGCATCGACTTAATTT s ponAbe2.chrUn 7099560 374 + 72422247 CAAAAAA---------------------------------------------TCAATTTATCACAATGATA-----AAATACATCATGTGCAA---------------------------T----TTAAAGACACTAAGACTTTGCTATTTTTATTTGGCTTACATAAAAGTGATAAACACAGAAAAAGCTCACATCTTAAGAAAAACGAACCTTCCTATTCAAAGATATGAACCATACTTCTCATTTC--AGTTTCATTTTAAGGTTACTCAGTAAAGAACATATTTACATAGGGTACA--TCGATATAAAATCCATATTGGATTTTATTTGAAAAATATTTAGCCCAGAAGTTGATATATTATGGGACTTAGT--TCTCAATATACACTTTTCTATAATGTATAGAACATTGTTTTAAAATGTGTACATTAAAAATAATCTGCAGCATCGACTTAATTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77095632 370 - 143122389 CAAAAAA---------------------------------------------TTAATTTATCACAATGATA-----AAATACATCATGTGCAA---------------------------T----TTAAAGACACTAAGACTTTGCTATTTTTATTTGGCTTATGTAAAAGTGATAAACACAGAAAAAGCTCACATCTTAATGAAAATGAACCTTCCTATTCAAAGACACAAACCATACTTCCCATTTC--AGTTTCCTTTTAAGGTTACTCAGTAAAGAACATATTTACATAGGGTACA--TCGATATAAAATCTATACTGGATTTTATTTGAAAAA----TAGCCCAGAAGATGATATATTATGGGACTTAGT--TCTCAATATAAACCTTTCTATAATATATAGAACATTCTTTTAAAATGTGTACATTAAAAATAATCTGCTGCATTGACTTAATTT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34473508 398 + 198365852 CACAAAA---------------------------------------------TTAATTTATCACAATAATA-----AAATGCAGCATGTGCAATTTAAAAACAAAATACAGCATGTCCATT----TTAAAAACGCTAAAACTTCGCTATTTTTATTTGGCTTACATAAAAGTGATAAACACAGAAAAAGCTCACATGTCCAGAAAAACGAATCTTCCTATTCAAGGACATGAACCATACTTCCCATTTC--AGTTTCCTTTTACAGTTCCTTAGTAAAGAACGTATTTACGTAAGGTACA--GCAACATAAAACCCATGTTGGATTTTATTTGAAAAATATTTAGCCCAGAAGTTGATACATTATGGGACTTAGT--TCCAAATATACTCCTTTCTATAATGTATAGGACATTGTTTTAAAATGTGTACATTAAAAATAATCTGTTGCAT---TTTAATTT i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36547206 373 + 96509753 CAAAAAA---------------------------------------------TTAATTTATTACAGCAATA-----AAATACAGGATGTGCAG---------------------------T----TTAAAAATGCTAAAACTTTGCTATTTTTATTTGGCTTATGTAAAAGTGATAAACACAGCAAAAGCTCACATCTTAAGAAAAATGAATCTTCCTATTCAAGGACACGAACCAT-CTTCCCATTTC--AGTTTCCTTGTAAGGTTCCTCAGTAAAGGACATATTTACATAGGGTACA--TTGATACAAAATCCATATTGGATTTTAATTGAAAAATATTTAGCCCAGAAGTTGATACATTATGGGACTTAGT--TCTCAATATACACCTTTCTATAATGTATAGAACATTGTTTTAAAATATGTACATTAAAAATAATCTGCTGCATGGATTTAATTT i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32638052 373 - 90941950 caaaaaa---------------------------------------------ttaatttattacaGCAATA-----AAATACAGGATGTGCAG---------------------------T----GTAAAAATGCTACaactttgctatttttatttggcTTACGTAAAAgtgataaacacagaaaaagctcACATCTTAAGAAAAACGAATCTTCCTATTCAAGGACACGAACCAT-CTTCCCATTTC--AGTTTCCTTGTAAGGTTCCTCAGTAAAGGACATATTTACATAGGGTACA--TTGATATAAAATCCATATTggactttatttgaaaaatatttagccCAGAAGTTGATACATTATGGGACTTAGT--TCTCAATATACACCTTTCTATAATGTAtagaacattgttttaaaatatgtacattaaaaataatctgctGCATGGATTTAATTT i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37804055 370 - 90373283 CAAAAAA---------------------------------------------TTAATTTATCAC---CATA-----AAATGCAGCATGTGCAA---------------------------T----TTAAAAACGCTAAAACTTTCCTATTTTTATTTGATTTATGTAAAAGTGATAAACACAGAAAAAGCTCACATCTTAAGAAAAACGAATCTTCCTATTCAAGGGCATGAACCATATTTCCCATTTC--AGTTTCCTTGTAAGGTTCCTCAGTAAAGAACATATTTACATAGGGTACA--TCGATATAAAATCCACATTGGATTTTATTTGAAAAATATTTAGCCCAGAAGTGGATATATTATGGGACTTAGT--TCTCAA-ATACACCTTTCTATAATGTATAGAACATTGTTTTAAAATGTGTACATTAAAAATAATCTGCTGCATCGACTTAATTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10144908 365 + 96796970 CAAAA-------------------------------------------------AATTTATCACGATAATA-----AATGCCAGCATGTGTAA---------------------------T----TTAAGAGTGCTAAAACTTTCCTATTTTTATTTGGCTTAGGTGAAAATGAGAA--Atagaaagagctcacatcttaagaaaaatgaatcttcctagtcaaggacacaaaccat-ctttccatttC--AGTTTCCTTCCAAGGTTCCTCAGTAAAGAACATATATACATAGGGTACA--CTGATATAAAATGCATGTTAGATTTTATTTGAAGAATATTTAGCCCAGAAGTTGACATCTTATGGGACTTAGT--TCTCAATATA--CCTTTCTATAATGTAGATAACATTGTTTTAAAATGCTTACATTAAAAATAATTTGCTGCATCAACTTAATTT i calJac3.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr2 81189976 396 - 85426708 caaaaaaaAAAGTTCAGGTGTACAATATAGTGAGTGATTGCAAAATTTTTCTTAATTTTATCACAATGAAAAGAACAGAGACCGCACGTATAA---------------------------TAAGCTCAGAATTTCTAAAACCATAACGTTTCTA-TTGCGTCATGGAATACTGATAAACACGGGAAGAGTACACATTTTCAGAAAAATGAGACTTCCTATTCACAGTCA-GAACCAT-CTACCCATTTCCAAATCTCCTTCCAAGGTCCCTCAGTAAATAATATAGGTACAAACTGTACA--CAGATAGAAGTCAGATACTGCCCTGTATCCAAAGTA----------------------ATTCTGGGAATTACTTCTCTCAGCATG---CTCTCTTTAAT------AACATTGGTATAGGAT--GTCCATTAAAAACAAACTACTACATATACGTAATTT i canFam3.chr2 I 207 N 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=992430.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197171 478 + 478999 TGCGAGTTAAATCACTTTAAAACCGTCTATTAGTG-----------TTCTATAAGGGAAATTATAATTGGATTGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTTATAAAGGGACCTGGGCCCTGACATCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGGGGCCTGCGGAGGAAGAGAAAGCCTGGCTCCTCCCTCC--CTGTGCCAGGAGGGTATGTCCCCA--TCATCCCCCCATGTCCC-GCCTCTTCCCATCCCAGGCCCGGTTACCTCTTTTGCTTGTCCCTCTTGTTCATGTCAGTGTCCCTGAGCATGACGATGAGATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTCGACGGACGTGGTACCTCGGCTCCATGAAGGCGCTGTCGTCGTAGTCTCCCCAAGTGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGACAGCAC s ponAbe2.chrUn 7099934 477 + 72422247 CGCGAGTCAAATCACTTTAAAACAGTCTATTAGTG-----------TTCTATAAGGGAAATTATAATTGGATTGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTTATAAAGGGACCTGGGCCCTGACCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGGGGCCTGCGGAGGAAGAGAAAGCCTGGCTCATCCCTCC--TGGCGCCAGGAGGGTATGTCCCCA--TCATCCCCCCATGTCCC-GCCTCCTCCCA-GCCAGGCCCGGTTACCTCTTTTGCTTGTCCCTCTTGTTCACGTCAGTGTCCCTGAGCATGACGATGAGATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTCGACAGAGGTGGTACCTCGGCTCCTTGAAGGCGCTGTCGTCGTAGTCTCCCCAAGCGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTCCCGCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGACGGCAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77096002 478 - 143122389 TGCTAGTTAAATCACTTTAAAACAGTCTATCAGTG-----------TTCTATAAGGGAAATTATAATTGGATTGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTTATAAAGGGACCTGGGCCCTGACCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGGGGCCTGCGGAGGAAAAGAAAGCCAGGCTCATCCCTCC--CCGCACCAGGAGGGTTTGTCCCCA--TCATCCCCCCATGTCCC-GCCTCCTCCCAGCCCAGGCCTGGTTACCTCTTTTGCTTGTCCCTCTTGTTCATGTCAGTGTCCCTGAGCATGACGATGAGATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTTGACGGACGTGGTACCTCGGCTCCATGAAGGCGCTGTCGTCGTAGACTCCCCAAGCGCCCACGTTGCTCTTCCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGACAGCAC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34473906 473 + 198365852 TTCGAGTTAAATCACTTTAAAACCATTTATTAGTG-----------TTCTGTGAGGGAAATTATAATTGGATTGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTCATAAAGGG-CCTGTGCCCTGTCCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGAAGTGTGAGGTCTGTGGAGG-CGAGAAAGCCAGTCTCCCCA-TTC--TCCCACCAGGAGGGTATGTCTCCA--TCATCCCTTCACATCCTGGCCTTCTCCCAGCCCAGGCCCAGTTACCTCTTTTGCTTGTCCCTCTTGTTCACGTCACTGCCCTTGAGCATGATGAT---ATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCATCAGGCAGCTCTGTGTAGCTTGTCCAGATCTTCTTGACGGATGTTGTACCTGGGCTCCATGAAGGTGCTGTAATGGTAGTCTTCCCAAGTGCCCACGTCGCTCTTGCCGCTCCCGCTGTAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCAC i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36547579 473 + 96509753 TGCGAGTTAAGTCACTTTAAAACTGTCTATTAGTG-----------TTCTGTGAGGGAAATTATAATCGGATTGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTCTGTGTTGCTGTTCGTAAAGGG-CCTGTGCCCTGACCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGAGGCCTGCGGAGGAAGAGAAAGCCAGGACCCCTA------CCCAGTCAGGAGGGTATGTCCCCA--TCATCCCCCCACGTCCC-GCCTCCTCCCAGCCCAGGCCCGGTTACCTCTTTTGCTTGTCCGTCTTGTTCACGTCAGTGTCCCTGAGCATGACGATGAGATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTCCACGTACGTGGTACCTGGGCTCCATGAAGGCGCTGTCGTCGTAGTCTTCCCAAGCTTCCACGTTGCTCTCCCCGTTCCCCTTGCAGCGGGGGAAGCAGTGGCAGCAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32638425 472 - 90941950 TGCGAGTTAAGTCACTTTAAAACAGTCTATTAGTG-----------TTCTGTGAGGGAAATTATAATCGGATTGGAAATCAGCTaaagttttgtttctgtgttgCTGTTCGTAAAGGG-CCTGTGCCCTGACCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGGGGCCTGCGGAGGAAGAGAAAGCCAGGA-CCCGA------CCCCGTCAGGAGGGTATGTCCCCA--TCATCCCCCCACGTCCC-gcctcctcccagcccaggcCCGGTTACCTCTTTTGCTTGTCCGTCTTGTTCACGTCAGTGTCCCTGAGCATGACGATGAGATCCTTTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTCCACGGACGTGGTACCTGGGCTCCATGAAGGCGCTGTCGTCGTAGTCTTCCCAAGCTTCCACGTTGCTCTCCCCGTTCCCCTTGCAGCGGGGGAAGCAGTGGCAGCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37804425 487 - 90373283 TGCGAGTTAAGTCACTTTAAAACAGTCTATTAGGGAAATTCTATAATTCTATAAGGGAAATTATAATCAGATAGGAAATCAGCTAAAGTTTTGTTTCTGTGCTGCTGTTCATAAAGGG-CCTGTGCCCTGACCTCTCTGAGGTTTCCACACCCAGGGTGGTGTGGGGCCTGCGGAGGAAGAGAAAGCCTGGCCCCCGA-TCC--CCACACCAGGAGGGTATGTTCCCA--TCATCCCCCCATGTCCC-GCCTCCTCCCAGTCCAGGCCCGGTTACCTCTTTTGCTTGTCTGTCTTGTTCACGTCAGTGTCCCTGAGCATGACCATGAGATCCTTTCTGCGGACTTTACCCCATCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGTCCAGATCTTCTCCATGGATGTGGTACGTGGGTTGCATGAAGGCGCTGTCGTCCTAGTCTTCCCAAACGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTTCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10145273 475 + 96796970 TACAAGTTAAATCAGTTTGAAACAGTC----AGTG-----------TTCTATAAGGGAAATTATAACTGGATTGGAAATGAACTAAAATTTTGGGTTCGTGTTGCTGCTCTTAAAGAGGCCTGCGCCCCGAC--CTCTGAGTTTTTCAAACCCTGGGCGGTGTGGGTCCTGCGGAGG-AGAGAAATCCAGTCCCTGACCCCCCGCTGTGCCAGGAGAGCATGTCCCTACCCCATGTCCCCACATCCC-ACCTCCTCCCAGCCCAGGCCAGGTTACCTCTTCTTTTTGTCCCTCTTGTTCACGCCGGGGCCCCTGAGCATGACGATGAGATCCGCTCTGGGGACTTTACCCCACCAGGCAGCTCTGTGGAGCTTGCCCAGATCTTCTCGACGGACGTGGTACCTTGGCTCCCTGAAGGCGCTGTCGTCGTGGTCTCCCCAAGCGCCCACGTTGTTCTTGCCACTCCCCCAGCAGCAGGGGAAGCAAAGGCAGTAC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=30222.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197649 18 + 478999 CACTTGCCCATCTTGCTC s ponAbe2.chrUn 7100411 18 + 72422247 CACTTGCCCATCTGGCTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77096480 18 - 143122389 CACTTCGCCATCTTGCTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34474379 18 + 198365852 CACTTGCCCATCTTGTTC i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548052 18 + 96509753 CACTTGGCCATCTTGCTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32638897 18 - 90941950 Cacttggccatcttgctc i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10145748 18 + 96796970 CACTTGCCCATCTTGCTC i calJac3.chr16 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37804912 0 - 90373283 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=35123.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197667 47 + 478999 CTGAGTGTCTTCATAAAGGAGTTGTCATGGTCTCCAG-AAGTGCCCAC s ponAbe2.chrUn 7100429 47 + 72422247 CTGAGCGTCTTCATAAAGGAGTCGTCATGGTCTCCAG-AAGTGCCCAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77096498 47 - 143122389 CTGAGCGTCTTCACAGCGGAGTTGCCCTGGTCTCCAG-AAGCGCCCAC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548070 47 + 96509753 CTGTGCGTCTTCATAGCGGAGTCGTCCTGGTCTCCAG-AAGGGCCCAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32638915 48 - 90941950 ctgtGCGTCTTCATAGCGGAGTCGTCCTGGTCTCCAGAAAGGGCCCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37804912 0 - 90373283 C e rheMac3.chr3 34474397 0 + 198365852 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10145766 0 + 96796970 C a score=22104.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197714 46 + 478999 ATTGCTCGTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGATGGCAA s ponAbe2.chrUn 7100476 46 + 72422247 GTTGCTCTTGCCGCTCCCCCCGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548117 46 + 96509753 GTTGCTCTCACCACTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGTGGCAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32638963 46 - 90941950 GTTGCTCTCGCCACTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCGGCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37804912 0 - 90373283 C e rheMac3.chr3 34474397 0 + 198365852 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10145766 0 + 96796970 C e nomLeu3.chr5 77096545 0 - 143122389 C a score=49724.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197760 65 + 478999 CACTTGCCCATCTTGCTCCTGAGCGTCTTCATAAAGGAGTCGTCGTGGTCTCCAGAAGTGCCCAT s ponAbe2.chrUn 7100522 65 + 72422247 CACTTATCCATCTTGCTCCTGAACGTCTTCATAAAGGAGTCGTCATGGTCTCCAGAAGTGCCCAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548163 65 + 96509753 CACTTGGCCATCTTGCTCCTAAGTGTCTTCATAGCGGAGTCGTCCTGGTCTCCAGAAGTGCCCAC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639009 65 - 90941950 CacttggccatcttgctcctaaGTGTCTTCATAGCGGAGTCGTCCTGGTCTCCAGAAGTGCCCAC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37804912 65 - 90373283 CATTTTCCCATCTCCCTCCTGAGCATCTTCACAGCGGAGTCGTGCTGGTCTCCAGAAGTGCCCAC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr3 34474397 0 + 198365852 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10145766 0 + 96796970 C e nomLeu3.chr5 77096545 0 - 143122389 C a score=87776.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197825 64 + 478999 GTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCGGTGGTGGCACCACTTGCCCATCTTGCTT s ponAbe2.chrUn 7100587 64 + 72422247 GCTGCTCTTGCCGCTCCCCCCGCAGCAGGGGAAGCGGTGGCGGCACCACTTGCCCATCTTGCTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77096545 64 - 143122389 GTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCACCACTTGCCCATCTTGCTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548228 64 + 96509753 GTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCACCACTTGCCCATCTTGCTC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639074 64 - 90941950 GTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCACCACTTGCCCATCTTGCTC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37804977 64 - 90373283 ATTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCAGCAGGGGAAGCAGTGGCAGCACCACTTGCCCATCTTGCTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr3 34474397 0 + 198365852 C e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M e calJac3.chr16 10145766 0 + 96796970 C a score=824987.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 197889 435 + 478999 CTGAGATCAAATGGCTTCTTCACAGCAGAGGCAGCGGGCATTGAACAAACCTCAGCCACCATCTGCTTTTAACAGCCAGGGGAGGCCGGTAGTAGCGAACAGATCGC-GTCTACCAACCAGTTTCACCAACTAGCAGGAAACCCTGGGTTTCCAATCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATCCCAGCCAAAACT-TGCCAAGCCCAGCAAGGGAGCCC-------------------AGCCCAC-CCCACCCAGGGAAAACCCACACCCACCCGGGGAAAGCCCACGCCCACC--AGGGG-GACCCCACGCC-CA-CCCCAGGAAAGGCCAA-GCCCCCCCTC-----CC--------AAGGAAACACCCAGCCCAGTCAAGGGAATGCCAAACCCAGCAGAGAAAAGGTCAAGTCCAGCAAAGGAATGCGA-GGGAGGAAACGCCAATCCAAGCAAGAAACACCAGGCAAAGCTACTAA s ponAbe2.chrUn 7100651 420 + 72422247 CTGAGATCAAATGGCTTCTTCGCAGCAGAGGCAGCGGGCATGGAACCAACCTCAGCCACCATCTGCTTTTAACAGCCAGGGGAGGCCGGTAGTAGCGAGTAGATCGC-CTCTACCAACCAGTTTCACCAACTAGCAGGAAACTCTGGGTTTCCAATCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATCCCAGCCAAAACC-TGCCAACCCCAGCAAGGGAGCCC-------------------AGCCCAC-CCCACCCAGGGAAAACCCACGCCCACCC-----------------------GGGG-GACCCCACGCC-CACCCCCAGGAAAGGCCAA-GCCGCCCCCCCCCCACC--------AAGGAAACACCCAGCCCAGTCAAGGGAATGCCAAACGCAGCAGAGAAAAGGTCAAGCCCAGCAAAAGAATGTGA-GGGAGGAAACGCCAATCCAAGCAAGAAACACCAGGCAAAGCGACTAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77096609 428 - 143122389 CTGAGATCAAATGGCTTCTTCGCAGCAGAGGCAGTGGGCATTGAACAAACCTCAGCCACCATCTGCTTTTAACAGCCAGGGGAGGCCGGTAGTAGCGAGCAGATCGC-GTCTACCAAGCAGTTTCACCAACTAGCAGGAAACTCTGGGTTTCCAGTCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATCCCAGCCAAAACC-TGCCAACCCCAGCAAGGGAGCCC-------------------AACCCAC-CCCACCCAGGGAAAacccacacccacccggggaaagcccacgcccacg-----------cccacacc-cacccccaGGAAAGGCCAA-GCCCCCCCTC-----CC--------AAGGAAACACCCAGCCCAGTCAACAGAATGCCAAACCCAGCAGAGAAAAGGTCAAGCCCAGCAAAGGAATGCGA-GGGAGGAAACGCCAATCCAAGCAAGAAACACCAGGCAAAGCGACTAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34474397 416 + 198365852 CTGAGACCAAATGGATCCTTCATAGAGCAGCCAGCAGGCATTGAACAAACCTCCGCCACCATCTGCTTTTAACAGCCAGGGGAGGCTGGTAGCAGCGAGCAGATCAC-GTCTACCAACCATTTTCAACAACTAGCAGGAAACTCTGGGTTTCCAATCTGCTCTAAGAGAAAGGTCAATCCCAATCAAAACC-TGCCAACCTCAGCTGGGGAGCCC-------------------AGTCCAC-CCCACCCAGGGAAAACCCACACCCACCCAGAGA-----------------------GACCCTATGCC-CA-CCTCAGAAAAGACCAAGCCCCCGACCC-----CC--------AAGGAAACAcccagcccagtcaagggaatgccaaacccagcaaagaaaacatcaagcccagcaaaggaatgcaa-gggaggaaatgccaatccaagcaagaaactccaggcaaagcgactaa i rheMac3.chr3 C 0 I 55 s macFas5.chr10 36548292 444 + 96509753 CTGAGACCAAATGGCTTCTTCACAGCGGAGGCAGCGGGTATTGAAGAAACCTCAGCCACCATCTGCTTTGAACAGCCAGGGGAGGCCGGTAGTAGCGAGCAGATCGC-CTCTACCAACCAGTTTCACCAACTGGCAGGAAACTCTGGGTTTCCGATCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATCCCAGCCAAAACC-TGCCAACCCCAGCACTGGAGCCC-------------------GGCCCAC-CCCACCCAGGGAAAATCCACACCCACCCGGGGAAAGCCCACGCCCACC--CGGGGTGACCCCACGCC-CC-CCCCAGGAAGGGCCAA-CCCCCGCCCC-----CCACCGCCCAAAGGAAACACCCAACCCAGCCAAGGGAATGCCAAGCCCAGCAGAGAAAATGTCAAGCCCAGCAAAGGAATGCGA-GGGAGGAAACGCCAATCCAAGCGAGAAACACCGGGCAAAGCGATTAA i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639138 442 - 90941950 CTGAGACCAAATGGCTTCTTCACAGCGGAGGCAGCGGGTATTGAAGAAACCTCAGCCACCATCTGCTTTGAACAGCCAGGGGAGGCC-GTGGTAGCGAGCAGATCGC-CTCTACCAACCAGTTTCACCAACTAGCAGGAAA--CTGGGTTTCCGATCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATCCCAGCCAAAACC-TGCCAACCCCAGCACTGGAgccc-------------------ggcccac-cccacccagggaaaatccacacccacccggggaaagcccacgcccacc--cggggtgaccccacgcctcc-ccccaggaagggccaa-cccccgcccc-----ccaccgcccaaaggaaacacccaacccaaccaaggGAATGCCAAGCCCAGCAGAGAAAAGGTCAAGCCCAGCAAAGGAATGCGA-GGGAGGAAAGGCCAATTCAAGCGAGAAACACCGGGCAAAGCGATTAA i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805041 435 - 90373283 CTGAGACCAAATGGCTTCTTCACAGTGGAGGCAGCGGGTATTGAAGAAACCTCAGCCACCATCTGCTTTGAACAGCCAGGGAAGGCCGGTAGTAGCGAGCAGATCGCGGTCTACTAACCAGTTTCACCAACTAGCAGGAAACTCTGGGTTTCCGATCTGTTTGAAGAGAAAGGTCAATcccagccaaaacc-tgccagccccagcaggggagccc-------------------agcccac-cccaaccAGGAAAAACCCACACCCACCAGGGGAAAACCCACGCCCACC--CGGGGTGACCCCACTCC-CA-CCCCAGGAAGGGCCAA-CCCC---CCC-----CC-------AAAGGAAACACCCAACCCAGCCAAGGGAATGCCAAACCCAGCAAAGAAAAGGTCAAGCCCAGCAAAGGAACGCGA-GGGAGGAAACGTCAATTCAAGCTAGAAACACTAAGCAAAGCGACTAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10145766 452 + 96796970 CTGAGGCCAAAGGGCTTCTTCAAAGGGGGAGCAGATGGCTTTGGAGAAACCTCAGCCCCCATCCGCTTCCACCAGCCCGAGGAGCCGGGTAATAGCTAGCCAATCGC-CTCTGCCAACAAGTTTCACCAACAAGCAGGAAACTCCAAGTTTCCAATCTGTCAGAGGAGAAAGGACAAGGCCAGGCAAAACCTTGCCAAGCCCAGGGGGAGAGGCCAAGACCAGCGAGGTTTGAAAGGCCACACCCACCCAGGGGAAGTCCACGCCCACCCAGGGGAATCCC-CGCCCACCCCCAGGGAAATCCCACGCC-CA-CCCAGGGAAAGGCCAA-TCCC-----------CC--------AAGGAAACACCCAGCCCAG-CAGGGGAATTCCAAGCCCAGTCTAGAAAAGGTCAATCCCAGCAAAGAAACGCTAGGGGAGAAAATGCCAATCCACTGGAGGACGACCAAGCCAAGCGACCAA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=28794.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198324 33 + 478999 C-----------------AGCCAAGCCAAGCTAGGAACGCAAGGCCAAGG------- s ponAbe2.chrUn 7101071 23 + 72422247 ------------------GGCCAAGCCAAGCGAGGAACGCA---------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097037 50 - 143122389 CGCCAAGCCAAGGAGGAATGCCAAGCCAAGCAAGGAACGCCAAGCCAAGC------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548736 32 + 96509753 ------------------CGCCCAGCCAAGCGAGGAACGCCAAGCCAAGC------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639580 32 - 90941950 ------------------CGCCCAGCCAAGCGAGGAAAGCGGAGCCAAGC------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805476 32 - 90373283 ------------------GGCCGAGCCAAGCGAGGAACGCCAAGCTAAGC------- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10146218 39 + 96796970 ------------------AGCCAAGCCAAGCGACCGACGCCAAGACAGGCTGTTACA i calJac3.chr16 C 0 C 0 e rheMac3.chr3 34474813 55 + 198365852 I e panTro4.chrUn_GL393519 35035 3000 + 413329 M a score=65746.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198357 71 + 478999 ---------GAGGAACGCCAAGCGAAGCGTACCC-GTTACAGGTAAGCCAAGCCGTTATgcgcgtgcggggcgcgcgtgcg s panTro4.chrUn_GL393519 38043 71 + 413329 ---------GAGGAACGCGAAGCGAAGCGTACCC-GTTACAGGTAAGCCAAGCCGTTATGCGCGTGCGGGGCGCGCGTGCG i panTro4.chrUn_GL393519 M 3000 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101094 24 + 72422247 --------------------------------------------GAGCGAAGCCGTTAT-------------GCGCGTGCG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097087 71 - 143122389 ---------AAGGAATGCAAAGCGAAGCCTAGCC-GTTACAGGTAAGCCAAGCTGTTATGCGTGTGCGGCACGCGCGTGCG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548768 70 + 96509753 ---------CAGGAACGCAGAGCCAGGCCTAGCC-GTTACAGGCAAGCCAAGCCGTTATGCGCGTGC-GCGTGCGCGTGCG i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639612 64 - 90941950 ---------CAGGAACGCAGAGCCAGGCGTAGCC-GTTACAGGCAAGCCAAGCCGTTA------TGC-GCGTGCGCGTGCG i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805508 72 - 90373283 ---------TAGGAACGCAAAGCCAAGCCTAGCTGGTTATAGGCAAGCCAAGCCCTGAtgcacgtgcggcgtgcgcgtgcg i chlSab2.chr2 C 0 I 31 s calJac3.chr16 10146257 69 + 96796970 GACGCATGCATGGAACGCCAACACGCGTGT-----GTTGCATGTA-------CCATAGTGCGCTTGTGGCGTGCGCGTGTG i calJac3.chr16 C 0 C 0 e rheMac3.chr3 34474813 55 + 198365852 I a score=-562.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198428 46 + 478999 ---------------gggcgcgcgcCTCAGACGTTATGC----------------------GGCGTGTGCGTGAGGCGTGCGC s panTro4.chrUn_GL393519 38114 33 + 413329 ---------------GGGCGCGCGCCTCAGACGTTATG-----------------------------------AGGCGTGCGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101118 18 + 72422247 ---------------GCGTGCGCGCCTCAGACG-------------------------------------------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097158 18 - 143122389 ---------------GCGGGCGCGCCTCAGATG-------------------------------------------------- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548838 17 + 96509753 ---------------GTGTGCGCGCCTCAGTC--------------------------------------------------- i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639676 18 - 90941950 ---------------GTGTGCGCGCCTCAGTCG-------------------------------------------------- i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10146326 83 + 96796970 GCGTGCCCGTGCAGCAGGCACGCAAGCCAGCCGTTACACACGCGTGGATACACGCGCGTGAGGCGTGCGCGTGAGACGTGCGC i calJac3.chr16 C 0 I 10 e chlSab2.chr2 37805580 31 - 90373283 I e rheMac3.chr3 34474813 55 + 198365852 I a score=462112.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198474 232 + 478999 GTGTCATTGCACGTGGTCCAGGAAGTGGCCGATGTGTGCAATCCGCGTGCGCAAGTCTTGGCGCCACAAATGTCAGTGACAGCCTTGCGTTACTGGCAAAGTTCATGGGAGTTGGCCCAGCTTTCTGGCCACTG---AGGAGAGAAGCCTGTGGTGGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTGGGGCTAGAGCGCCTGGAACTCGAGGATGCTGACAGCCTCCTCTGAG-GAAAGCC s panTro4.chrUn_GL393519 38147 230 + 413329 GTGTCATTGCACGTGGTGCAGGAAGTGGCCGATGTGTGCAATCCGCGTGCGCAAGTCTTGGCGCCACAAATGTCAGTGACAGCCTTGCGTTACTGGCAAAGTTCATGGGAGTTGGCCCAGCTTTCTGGCCACTG---AGGAGA--AGCCTGTGGTGGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTGGGGCTAGAGCGCCTGGAACTCGAGGATGCTGACAGCCTCCTCTGAA-GAAAGCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101136 230 + 72422247 GCGTCATCGCACATGGTGCAGGAAGTGGCCGATGTGTGCAATCCGCGTGCGCAAGCCTTGGCGCCACAAATGTCAGTGACAGCCTTGCGTTACTGGCAAAGTTCATGGGAGTTGGCCAAGCTTTCTGGCCATTG---AGGAGA--AGCCTGTGGTGGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTGGGGCTAGAGCGCCTGGAGCTTGAGGATGCTGACAGCCTCCTCTGAA-GAAAGCC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097176 230 - 143122389 GCGTCATTGCACGTGGCACAGGAAGTGGCCGATGTGTGCAATCCGCGTGCACAAGTCTTGGCGCCACAAATGTCAATGACAGCCTTGCGTTACTAGCAAAGTTCTTGAGAGCTGGCCAAGTTTTCTGGCCATTG---AGGAGA--AGCCTGTGGTGGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTGGGGCTAGAGCGCCCGGAACTTGAGGATGCTGACAGCCTCCTCTAAA-GAAAGTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr10 36548855 227 + 96509753 -CGTCATTGCACGTGGCACAGACAGTGGCCAATGTATGCAACCTGC--GCACAAGTCTTGGTGCCACGAATATCAGTGACAGCCTTGCGTTCCCGGCAAACTTCGTGGGAATTGGCCGAGCCTTCAGGCCATCG---AGGAGA--GGCCTCTGGTTGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACAGGGGCTAGAGCGCCTGGAACTGGAGGATGCTGACAGGCTCCTCTGAG-GAAAGCC i macFas5.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr10 32639694 228 - 90941950 GCGTCATTGCACGTGGCACAGACAGTGGCCAATGTATGCAACCTGC--GCACAAGTCTTGGTGCCACGAATATCAGTGACAGCCTTGCGTTCCCGGCAAACTTCGTGGGAATTGGCCGAGCCTTCAGGCCATAG---AGGAGA--GGCCTCTGGTTGAAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTGGGGCTAGAGCACCTGGAACTGGAGGATGCTGACAGGCTTCTCTGAG-GAAAGCC i papAnu2.chr10 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805611 231 - 90373283 gcgTCATTGGACGTGGCGCAGACAGTGGCTGATGTGTGCAACCCGCCTGCACAAGTCTTGGCGCCACAAATGTCAGTGACAGCTTTGTGTTATCGGCAAACTTTATGGGAGTTGGCCGAGCTTTCAGGCCACTG---AGGAGA--GGCCTCTGGTGGGAAAAAGCCTCTTGAAGCAGGACTCGGGCTAATGCACCTGGAACTTGAGGATGCTGACAGCCTCCTCTGGGAGAAAGCC i chlSab2.chr2 I 31 C 0 s calJac3.chr16 10146419 228 + 96796970 GCGTCTCTGCACGTGGCAC----AGTGGCCGACATGTGTCA-CCGCATGTGCAAGTTCTGGCGCCACAAACGTCAGTGGCGGCCTTGTGTTCCCACCAAATTGTGCGGGAGTTGGTCAAGCTCTCAAGCCATTGAGAAGGAGA--CGCAGCTACTGGGAAAAAGCCTCTAGAAGCAGGACCGGGACTAGAGCGCCAGGAACTTGAGGACTCTGACAGTCTCCTCTGAA-GAAAGCC i calJac3.chr16 I 10 C 0 e rheMac3.chr3 34474813 55 + 198365852 I a score=142874.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198706 61 + 478999 CCCAAGACACTA---GTGGTGGCGCTGTTGCGGGTG-------GCCGCCGCTGCAGCTTAGAGCTCTGGTT s panTro4.chrUn_GL393519 38377 61 + 413329 CCCAAGACACTA---GTGGTGGCGCTGTTGCGGGTG-------GCCGCCGCTGCAGCTTAGAGCTCTGGTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101366 64 + 72422247 CCCAAGACACTAGTGGTGGTGGTGCTGCTGCGCGTG-------GCCGCCGCTGCAGCTCAGAGCTCGGGTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097406 61 - 143122389 CCCAAGACACTA---GTGGTGGTGCTGTTGCGGGTG-------GCCACCACTGCAGCTCAGAGCTCGGATT i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34474868 61 + 198365852 cccagGACTCTA---GTAGTGGTGCTATTGTGGGTG-------AACGCTGCTGCAGCTCAGAGCTCGGGAT i rheMac3.chr3 I 55 C 0 s macFas5.chr10 36549082 61 + 96509753 CACAAGACACTC---GTGGCGGTGCTGTTGCCGGTG-------GCCACAGCTGCAGCTCAGAGCTCGGGCt i macFas5.chr10 C 0 N 0 s papAnu2.chr10 32639922 61 - 90941950 CACAAGACACTC---GTGGCGGTGCTGTTGCCGGTG-------GCCACAGCTGCAGCTCAGAGCTCGGGct i papAnu2.chr10 C 0 N 0 s chlSab2.chr2 37805842 61 - 90373283 CCCAAGAGGCTA---GTGGTGGTGCTGTTGCTGGTG-------GCCCCGGTTGCAGCTCAGAGCTCGGGTT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10146647 68 + 96796970 CCCAAGGCAGTT---GTGACGGTGCTGTTGTGGGGGGTGGGGCGTGGCAGCTGCAGCTGGGAGCTCGGGCT i calJac3.chr16 C 0 C 0 a score=72193.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198767 25 + 478999 GGCGGAGCTGGATGCAAATGGCCTC s panTro4.chrUn_GL393519 38438 25 + 413329 GGCGGAGCTGGATGCAAATGGCCTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101430 25 + 72422247 GGCGGAGCTGGATGCACATGGCCTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097467 25 - 143122389 GGCGGAGCTGGATGCAAATGGCCTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34474929 25 + 198365852 GGCAGAGCTGGATGCAAATGGCCTC i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34717736 25 + 192294377 GGCAGAGCTGGATGCAAATGGCCTC i macFas5.chr3 N 0 C 0 s papAnu2.chr3 33107618 25 + 180432695 GGCAGAGCTGGATGCAAATGGCCTC i papAnu2.chr3 N 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805903 25 - 90373283 GGCAGAGATGGATGCAAATCGCCTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10146715 25 + 96796970 GTCGGAGCTCGCTACAGATGGCCTC i calJac3.chr16 C 0 I 311 a score=1061969.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 198792 418 + 478999 AAAATCTCCGAGCACAAGACGCCCACGGAGCCCAGGGCCTGCCTGAGGCGCCTTCCACACCTGCTCCTCCTTGGTCCGCACCCAGAACACAGGGCCATCAGCAACGGGGCACTC-GGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGCTGCTAGCTCCTGCTGTGGTGCCCCCTGCCTG--GTGTCCAAACCAGGGCCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGGCCTGCAAGAGGGGGCTGGGAGGAGCACCTACCACTGATGGGGAGATGCAGGAAGGC-ACCCCCACGTGCAGATCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCAGGGAGCCAGATCGGAGCCTCCCTGGCAGC--CTGTGAGCTGGACCCAGGCAGTG s panTro4.chrUn_GL393519 38463 418 + 413329 AAAATCTCTGAGCACAATACGCCCACGGAGCCCAGGGCCTGCCTGAGGCGCCTTCCACACCTGCTCCTCCTTGGTCCGCACCCAGAACACAGGGCCATCAGCAATGGGGCACTC-GGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGCTGCTAGCTCCTGCTGTGGTGCCCCCTGCCTG--GTGTCCAAACCAGGGCCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGGCCTGCAAGAGGGAGCTGGGAGGAGCACCTACCACTGATGGGGAGATGCAGGAAGGC-ACCCCCACATGCAGATCCTGGGAACAGGGCACTGCCAGCACCAGGGAGCCAGATCGGAGCCTCCCTGGCAGC--CTGTGAGCTGGACCCAGGCAGTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101455 420 + 72422247 AAAATCTGCGAGCACAAGACGCCCGTGGAGCCCAGGGCCTGCCTGAGGCGCCTTCCACACCTGCTCCTCCTTGGTCCGCACCCAGAACACAGGGCCATCAGCAACGCGGCACTC-GGGGCCGCAGAATCGGGGCTGGGCTGCTAGCTCCTGCTCTAGTGCCCCCTGCCTGGTGTGTCCAAACCAGGGCCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCTGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCCGGCCTGCAAGAGGGGGCTTGGAGGAACACCTACCACTGATGGGGAGATGCAGGAAGGC-ACCCCCACGTGCAGATCCTGGGAACAGGACACTGCTAGCACTAGGGAGCCAGATCGGAGCCTCCCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCAGGCAGTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097492 418 - 143122389 AAAATCTCCGCGCACAAGACGCCCACGGAGCCCAGGGCCTGCCTGAGGCGCCTTCCACACCTGCTCCTCCTTGGTCCACACCTAGAACACAGGGCCATCATCAACGGGGCACTT-GGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGCTGCTAGCTCCTGCTCTGGTGCCCCCTGCCTG--GTGTCCAAACCAGGGCCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTTGCTTCACTGGCATACAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGGCCTGCAAGAGGGGTCTTGGAGGAGCACCTACCACTGATGGGGAGATGCAGGAAGGC-ACCCCCACATGCAGATCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCAGGGAGCCAGTTCGGAGCCTCCCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCAGGCAGTG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34474954 418 + 198365852 AAAATCGCTGAGCACAAGACGCCCAAGGAGCCTAGGGCCTGCCTGAGGCACCTTCGACACCTGCTCCTCCTTGGTCCACACCCTGAACACAGGACCATCAGCGACTGGGCTCTC-AGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGCGGCCAGCTCCTGCTCTGGTGACCCCTGCCTG--GTGCTCAAGCCAGGGTCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGCCCTACCAGAGGAGTTCTGAAGGAGCACGTACCACCGATGGGGAGATGCAAGAAAGCAACCCCCATGTGCACATCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCAGCGAGCCAGACCAGTACCT-CCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCGGGCACGG i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34717761 418 + 192294377 AAAATCGCTGAGCACAAGACGCCCAAGGAGCCTAGGGCCTGCCTGAGGCACCTTCGACACCTGCTCCTCCTTGGTCCACACCCTGAACACAGGACCATCAGCGACTGGGCTCTC-AGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGCGGCCAGCTCCTGCTCTGGTGACCCCTGCCTG--GTGCTCAAGCCAGGGTCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGCCCTACCAGAGGAGTTCTGAAGGAGCACGTACCACCGATGGGGAGATGCAAGAAAGCAACCCCCATGTGCACATCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCAGCGAGCCAGACCAGTACCT-CCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCGGGCACGG i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33107643 418 + 180432695 AAAATCGCTGAGTACAAGACGCCCAGGGAGCCTAGGGCCTGCCTGAGGTGCCTTCGACACCTGCTCCTCCTTGGTCTGCACCCTGAACACAGGACCATCAGTGACTGGGCTCTC-AGGGCCACAGAATCGGGGCTGGGTGGCCAGCTCCTTCTCTGGTGACCCCTGCCTG--GTGCTCAAGCCAGGGTCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCCCGGGGTGCTTCGCTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTGCAGGCCGCTGTCTCCAGCCCTACCAGAGGAGTTCTGAAGGAGCACGTACCACCGATGGGGAGATGCAAGAAAGCAACCCCCATGTGCACACCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCATCGAGCCAGACCGGTACCT-CCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCGGGCACGG i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37805928 413 - 90373283 AAAATCTCCAAGCACAAGAAGCCCACGGAGCCCAGGGCCTGACTGAGGTGCCTTCCACACCTGCTCCTCCTTGGT-----CCCAGAACACAGGGCCATCAGCGACGGGGCACTC-AGGGTCACAGAATCAGGGCTGGACGGCTAGCTCCTGCTCTGGTGCACCCTGCCTG--GTGTCCAGGCCAGGGCCAACAGCTGTGGGGCTTCTGGCTTGGGGTGCTTCACTTCACTGGCATGCAGTAGGGT--TGAGGTTCAGACCACTGTCTCCAGGCCTGCAAGAGGGGGCTTGGAGGAGCACCTACTGCTGATTGGGAGATGCAGGAAGGC-ACCCCCATGTGCAGATCCTGGGAACAGGACACTGCCAGCACCAGGGAGCCACACTCGGGCCTCCCTGGCAGC--CTCTGAGCTGGACCCAGGCAGTG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr16 10147051 365 + 96796970 aaaaTCACAGAACACAAGCCACCCACAAAGCCCAG----------------------------------------------------CGCGGGGCCATCAGTGACGTGGCACTCAGGGGCCACAGGTTTGGGGCTGGGTGGCCAGCTCCCGGCC--GTTGCCCCTACACG--GTGTCCAAGCCAGGGCCAACCGCTGTGGGGCTTCTGGC---AGAGGCTCCACTCCCCTGGCATGCAATAGGGGCACGGGGTGTGGGTGGCTGTCTCCAGGCAGGCAGGCAGGG-CTTGGAGGAGCACCTATCCCTGAGGGCAAGATGCAAAAAGGA-GGCCCTGTGTGCAGATCCTGGGACCAGGATGCTGCAAGCCCTGGGAAGCCAGACTGAGGCAACCCTGGCAGCAGAGTTGAGCTGGATCCAGGCAATG i calJac3.chr16 I 311 N 0 a score=438739.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199210 196 + 478999 GCACCTCTACCCTCCTGCTGGGACCCTCCTGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCACCCATACTGCAGGTGCTTTGGTGTGGGAGGAAAAATGCATTCTggccgggcactgtggctcacgcgtgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggcggatcataaggtcaggagataaagacc s panTro4.chrUn_GL393519 38881 196 + 413329 GCACCACGACCCTCCTGCTGGGACCCTCCTGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCACCCATACTGCAGGTGCTTTGGTGTGGGAGGAAAAATGCATTCTggccaggcactgtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggcggatcataaggtcaggagataaagacc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7101875 196 + 72422247 GCACCTCTACCCTCCTGCGGGGACCCTCCTGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCATCCATACCGCAGGTGCTTTGGTGTGGGAGGAAAAATGCATCCTgaccgggcactgtggctcacccctgtaatcctagcactttgggaggccgaggcgggcggatcatgaggtcaggagataaagacc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77097910 196 - 143122389 GCACCTCGACCCTCCTGCTGGGACCCTCCTGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCATCCATGCCGCGGGTGCTTTGGTGTGGGAGGAAAAATGCATTCTggccgggcactgtggctcacgcctgtaatcctagcactttgggaggccgaggcgggcagatcatgaggtcaggagataaagacc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34475372 195 + 198365852 GCACCTCGATCCTCCTGCTGGGACCCTCCAGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCACCCATATGGCAGGTGCTTTGATGT-GGAGGAAAAATGAATTCTggctggtcgcggaggctgacgcctgtaatcctagcactttgggaagctgaggcgggcagatcacgaggtaaggagatcaagacc i rheMac3.chr3 C 0 I 221 s macFas5.chr3 34718179 194 + 192294377 GCACCTCGATCCTCCTGCTGGGACCCTCCAGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCACCCATATGGCAGGTGCTTTGATGT-GGAGGAAAAATGAATTCTggctggtcgcggaggctgacgcctgtaatcctagcactttgggaagctgaggcgggcagatcacgaggtaaggagatcaagac- i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33108061 195 + 180432695 GCACCTCGATCCTCCTGCTGGGACCCTCCAGCTGTGCAGGCTTATGCAGCCAGGCTCCAGGCTGCTTCACCCATACGGCAGGTGCTTTGATGT-GGAGGAAAAATGAATTCTGGCTGGTCGTGgaggctgacgcctgtaatcctagcactttgggaagctgaggcgggcagatcacgaggtaaggagatcaagacc i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37806341 196 - 90373283 GCACCTCAACCCTCCTACTGGGACCCTCCTGCTGTGCAGGCTTATGAAGCCAGGCTTCAGGCTGCTTCACCCATACCGCAGGTGCTTTGGTGTGGGAGGAAAAATGGATTCTggctgggccaggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggacgtggaggtgggcggatcatgaggtcgggagatgaagacc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=160143.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199406 139 + 478999 atcctggctaacacggtgaaacctcatctctactaaaaatacaaaatacta-gcgggcatggtggtgggcgcctgtagtcccagctactcgg------gaggcaggagaatggcgtgaacctgggaggcggagcttgcagtgagcc s panTro4.chrUn_GL393519 39077 139 + 413329 atcctggctaacacggtgaaacctcatctctactaaaaatacaaaatacta-gcgggcatggtggtgggcgcctgtagtcccagctactcgg------gaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagcc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7102071 139 + 72422247 atcctggctaacatggtgaaacatcatctctactaaaaatacaaaatacta-gaaggcatggtggtgggcgccagtagtcccagctactccg------gaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagcc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77098106 139 - 143122389 atcctggctaacacggtgaaaccttatctctactaaaaatacaaaatacta-gccagtgcggttgtgggcgcctgtagtcccagctactagg------gaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggggcttgcagtgagcc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34718373 59 + 192294377 ---------------------------------------------------------------------------------------cttgcgaggctgaggcaggagaatggtgtgaacccaggaggcagagcttgcagtgagct i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33108256 146 + 180432695 accctgactaacacgatgaaacttcgtctctactaaaaatacaaaaaattagccgggcgtggtggcgggcacctgtactcccacttacttgcgaggctgaggcaggagaatggtgtgaacccaggaggcagagcttgcagtgagct i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37806537 145 - 90373283 atcctggctaacaaggtgaaacctcatctctactaaaaatatgaaaactta-ccgggcatggtggcaggcgcctgtaatcccacctaatggggaggctgaggcatgagaatggtgtgaacccaggaggtggaggttgcagtgagcc i chlSab2.chr2 C 0 I 45 e rheMac3.chr3 34475567 221 + 198365852 I a score=80128.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199545 110 + 478999 caagatcgcatcactg-----caacctgggtgacaaagcaagactctgtc-------------aaaaaaag---aaagagagagagagagagacagagacaaagacagagacggagacagagagacagacg s panTro4.chrUn_GL393519 39216 109 + 413329 -gagatcgcatcactg-----caacctgggcgacaaagcaagactctgtc-------------aaaaaaag---aaagagagagagagagagacagagacaaagacacagacggagacagagagacagatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7102210 108 + 72422247 -gagatcgcatcactg-----cagcctgggctacaaagcaaga--ctgtc-------------aaaaaaaggaaaaaaagaaagagagagagagagagacaaagacagagacagag--agacagacagaga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77098245 94 - 143122389 -gagatcacatcactg-----cagcctgggcgacaaagcaagactctgt--------------aaaaaaag---aaagagaa------------agagacaaagatagagacagag--agacagacagaga i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34718432 126 + 192294377 -gaaatcgtaccaccgcactccagcctgggcgacagagcaagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaa---aaaaaaagaaaagaaaagaaaaaga-aaggagagagagagagagagagagacaggaa i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33108402 115 + 180432695 -gaaatcctaccaccgcactccagcctgggcgacagagcaagactccatctc-----------aaaaaaaa---aaaaaaagaaaagaaaagaaaaaga-aaaagaaaggagagagagagagagacaggaa i papAnu2.chr3 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 37806682 45 - 90373283 I e rheMac3.chr3 34475567 221 + 198365852 I a score=17972.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199655 13 + 478999 gagagagagaAAA s panTro4.chrUn_GL393519 39325 13 + 413329 gagagagagaAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7102318 13 + 72422247 gaaagagagaAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77098339 13 - 143122389 gaaagagagaAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34718558 13 + 192294377 gaggaagaagaag i macFas5.chr3 C 0 I 4 s papAnu2.chr3 33108517 13 + 180432695 gaggaagaagaag i papAnu2.chr3 C 0 I 4 s chlSab2.chr2 37806727 13 - 90373283 GAGAGAGAGAAAG i chlSab2.chr2 I 45 C 0 e rheMac3.chr3 34475567 221 + 198365852 I a score=413493.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199668 189 + 478999 ATGGATTCTAAGCCTGGGACACCGACCTGCTCCTGCCAACAAAAGCAGAGGGGAAGCCAATTGCAAGTGC-----------------------------AAAAAAAAAGTTTTTATTTCAGTGGGATGAATGTCTAGGTGtgcagtcactggagt-aaacgtcactgggacatgctgtgtaattctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt s panTro4.chrUn_GL393519 39338 189 + 413329 ATGGATTCTAAGCCTGGGACACCGACCTGCTCTTGCCAACAAAAGCAGAGGGGAAGCCAATTACAAGTGC-----------------------------AAAAAAAAAGTTTTTATTTCAGTGGGATGAATGTCTAGGTGtgcagtcactggagt-aaacatcactgggacatgctgtgtaattctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7102331 189 + 72422247 ATGGATTCTAAGCCTGGGACACCGACCTGCTCTTGCCAAC-AAATCAGAGGGGAAGCCAATTACAAGTGCA----------------------------AAAAAAAaagtttttatttcagtgggatgaatgcctaagtgtgcagtcactggagt-aaacttcactgggacatgctatgtaatcctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt i ponAbe2.chrUn C 0 I 2001 s nomLeu3.chr5 77098352 189 - 143122389 ATGGATTCTAAGCCTGGGACACCAACCTGCTCTTGCCAACAAAAGCAGAGGGGAAGCCAATTACAAgtgc------------------------------aaaaaaaagtttttatttcagtgggatgaatgcctaggtgtgcagtcactggagtaaaacttcactgggacatgctgtgtaattctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt i nomLeu3.chr5 C 0 I 8452 s rheMac3.chr3 34475788 218 + 198365852 aTGAATTCTAAGCCCGGGACACCAACCTGCTCTTGCCAACAAAAACAGAGGGGAAGACAATTACAAATGaaataaaaaagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGGTTTTTATTCCAGTGGAATGAATACCTAGGTGtgcagtcactggagt-aaatttcactggggcatgctgtgtagttctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt i rheMac3.chr3 I 221 I 8111 s macFas5.chr3 34718575 198 + 192294377 atgaaTTCTAAGCCCGGGACACCAACCTGCTCTTGCCaacaaaaacagaggggaagacaattacaaatg--------------------caaaaaaaaaaaaaaaaaGGTTTTTATTCCAGTGGAATGAATACCTAGGTGtgcagtcactggagt-aaatttcactggggcatgctgtgtaattctttgtgtacattgctgagttctactgctaatgtt i macFas5.chr3 I 4 I 8346 s papAnu2.chr3 33108534 196 + 180432695 atgaaTTCTAAGCCTGGGACACCAACTTGCTCTTGCCAACAAAAACAGAGGGGAAGccaattaaaaatg----------------------caaaaaaaaaaaaaaaggtttttattcCAGTGGGATGAATACCTAGGCGTGCAGTCACTGGAGT-AAATTTCACTGGGGCATGCTGTGTAATTCTTTGTGTACATTGCTGAGTTCTACTGCTAATGTT i papAnu2.chr3 I 4 I 7894 s chlSab2.chr2 37806740 180 - 90373283 -TTGGTTCTAACCCTGGGACACCGACTTGCTCTTGCTAACAAAAGCAGACGGGAAGCCAATT-------------------------------------TAAAAAAAAGTTTTTATTTCAGTGGGACGAATACctaggcgtgcagtcactggagt-aaacttcactggggcatgctgtgtaattcttggtgtatattgctgagttctactgctaatgtt i chlSab2.chr2 C 0 I 2813 a score=103119.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 199857 1128 + 478999 AGcccatttcattcatgaaattggtaatttatgacatcccttttttctttatcattattagttaaggtttgtcaattttatagatattttcaaagaaccagctttatttctttgcttttctttgttgttttcttttggctgtttcatttatttctgctcttatccttattatattctttcttatatttgttttgattttattttgctactattttctactttcttgatgtgatagcttgaatttttatttgagagatttctacttttctattatatatatttagtgaaatacattttcctctcaacactgacgtcaactgtgttaaatcaagtttgatatgttgtatttttatttttattcagtttaatatatttaattgtttcccttgagacgttctccttagaagtgtgcttgctgtttagcactattcacaatagcaaagacatggaatcaacctaaatgcccattggtaatagactggatgaagaaaatgcagtacccatacaacatggaatactatgcagccataaaaatgaaggagatcatgtccattgcagggacatggatggaacaggaagccattatcctcaggaaactaatgcagaagcagaaagccaaacatctaatgttctcacttataagtaggagctgaacaatgagaacacatggacacagggaagtaagcaacacacactggggcctgtggatgggggagggagagggagagcattgggaaaaatctctaatgcatgctgggcttaaaccgaggtgatgggttgataggtagggaaaaccaccatggcacaaatttacctatgtaacaaacctgcacatccttcacacctaccccagaacttaaaataaataaaaatgtaaaaaaaagaactaaaaaagtatgctgtttatttttcaagtatttaagattctgctgttattttacttttttatttttaatttgatgccattttggctggaggatacattctacaggatttcagtttttaaaaaattcttaatgtttgttaaaatccaggatacagtccattttggtttatgttctgtgggtacctaaatgttctgctgtattctgctgctagggggtggagcctgttttTTTCTTCTTTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 39527 1123 + 413329 AGcccatttcattcatgaaattggtaatttatgacatcccttttttctttatcattattagttaaggtttgtcaattttctagatcttttcaaagaaccagctttatttctttgcttttctttgttgttttcttttggctgtttcatttatttctgctcttatccttattatattctttcttatatttgttttgattttattttgctactattttctgctttcttgatgtgatagcttgaatttttatttgagagatttctacttttctattatatacatttagtgaaatacattttcctctcagcactgacgtcaactgtgttaaatcaagtttgatatgttgtatttttatttttattcagtttaatatatttaattgtttcccttgagacgttctccttagaaatgtgcttgctgtttagcactattcacaatagcaaagacatggaatcaacctaaatgcccatcggtaatagactggatgaagaaaatgcagcatccatacaacatggaatactatgcagccataaaaatgagggagatcatgtccattgcagggacatggatggaacaggaagccattatcctcaggaaactaatgcagaaacag----ccaaacatctaatgttctcacttataagtaggagctgaacaatgagaacacatggacacagggaagtaagcaacacacactggggcctgtggatgggggagggagagggagagcattgggaaaaatctctaatgcatgctgggcttaaaccgaggtgatgggttgataggtagggaaaaccaccatggcacaaatttacctatgtaacaaacctgcacatccttcacacctaccccagaacttaaaataaataaaaatgtaaaaaaaagaactaaaaa-gtatgctgtttatttttcaagtatttaagattctgctgttattttacttttttatttttaatttgatgccattttggctggaggatacattctacaggatttcagtttttaaaaaattcttaatgtttgttaaaatccaggatacagtccattttggtttatgttctgtgggtacctaaatgttctgctgtattctgctgctagggggtggagcctgttttTTTCTTCTTTTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I e papAnu2.chr3 33108730 7894 + 180432695 I e macFas5.chr3 34718773 8346 + 192294377 I e rheMac3.chr3 34476006 8111 + 198365852 I e nomLeu3.chr5 77098541 8452 - 143122389 I a score=978.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 200985 3 + 478999 TT-A s panTro4.chrUn_GL393519 40650 4 + 413329 TTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77106993 3 - 143122389 TT-A i nomLeu3.chr5 I 8452 C 0 s macFas5.chr3 34727119 3 + 192294377 TT-G i macFas5.chr3 I 8346 C 0 s papAnu2.chr3 33116624 3 + 180432695 TT-G i papAnu2.chr3 I 7894 C 0 s calJac3.chr21 34673782 3 - 50472720 TT-A i calJac3.chr21 N 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I e rheMac3.chr3 34476006 8111 + 198365852 I a score=130107.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 200988 76 + 478999 TCTCCAGGTACAATTTGCCCTATGAGACACCTGATACAGTAAGTAGCCCATCAGGTATCCAGCAGTAAAAACTAAA s panTro4.chrUn_GL393519 40654 76 + 413329 TCTCCAGGTACAATTTGCCCTATGAGACACCTGATATAGTAAGTAGCCCATCAGGTATCCAGCAGTAAAAACTAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77106996 76 - 143122389 TCTCCAGGTACAATTTGCCCTATGAGACACCAGATATAGTAAGTAGCCCATCAGGTATCCAGCAGTAAAAACTAAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34484117 76 + 198365852 TCTCCAGGTACAATTTGCTCTATGAGACACCTGATATAGTAAGTAGCCCATCAGGGATCCAGCAGTAAAAAGTAAA i rheMac3.chr3 I 8111 C 0 s macFas5.chr3 34727122 76 + 192294377 TCTCCAGGTACAATTTGCTCTATGAGACACCTGATATAGTAAGTAGCCCATCAGGGATCCAGCAGTAAAAAGTAAA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33116627 76 + 180432695 TCTCCAGGTACAATTTGCTCTATGAGACACCTGATATAGTAAGTAGCCCATCAGGGATCCAGCAGTAAAAAGTAAA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34673785 71 - 50472720 TATCCAGGTTCAATCTGCCCT-----ACACTTGAAATAGTAAGTAGCCCATCAGGTATCCAGCAGTAAAAACCAAA i calJac3.chr21 C 0 I 280 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I a score=1265705.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 201064 795 + 478999 TTAGTGGAAGGAAGTCCTGTCCCAACTGGTTTGACATATTGTGGCTGAATTTTTAGGTTTTAGTGAAAATAATAATGATGGCTTGATCTTCAAAGTTGTTTTTTTTTTTTTT--ACCATTTCCCAAATAGCTGGGGATTATTGTGGTGTAACCACTTAAAACTCTGATGAAATGTGGAAAGAATTTCTTTTTCTAATTGATACTTTGTGAGTGCAACTACTTTGCATTGTGCAGAGAGAAAAAAATATATTCCAGGCATTCGCCAAATCAAAAGTGCATGAACAAGTCCCTAAATTTCTTCCTGTCCTCAGATTTCCACCATAAAGTTTCAGACCAAATAAAAAATTGTTTTTTCACTAATTTTCTTTGAGGAAATGTAAGAG---AAAAAAAAGAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGGCAATTATATGAGATTGTAAAATCCGAATGTGGATTAGCTTCAACTCATCAAAGATTCAAGAACAGCTACAGTTCTAAGAATGAGCC---------------------AAAAAAAAATGGGTATGCATTGAGGGGAGGGAATTAGGAAGGGAATTTATAGCCATTCAGACA-TTTCCCAACATTAAGCCTTCATGAATTTTGCATTGGAAAGAAATATTTATAAATTAAGAAACTCAGTATCCAGTCCACCCTGTGATAAATACTGCAATGTGCCCAAGCATTCCAATTTGAGTATGGCTTTGTGCTTTGCCAATCATAACAATGGGAGATAGAAGTAATAAGAGCCTGCATGAAGCACTGTGCTAATGATAATTTTCCCAGTAAGAACAAAAG s panTro4.chrUn_GL393519 40730 797 + 413329 TTAGTGGAAGGAAGTCCTGTCCCAACTGGTTTGACATATTGTGGCTGAATTTTTAGGTTTTAGTGAAAATAATAATGATGGCTTGATCTTCAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACCATTTCCCAAATAGCTGGGGATTATTGTAGTGTAACCACTTAAAACTCTGATGAAATGTGGAAAGAATTTCTTTTTCTAATTGATACTTTGTGAGTGCAACTACTTTGCATTGTGCAGAGAGAAAAAAATATATTCCAGGCATTCGCCAAATCAAAAGTGCATGAACAAGTCCCTAAATTTCTTCCTGTCCTCAGATTTCCACCATAAAGTTTCAGACCAAATAAAAAATTGTTTTTTCACTAATTTTCTTTGAGGAAATGTAAGAG---AAAAAAAAGAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGGCAATTATATGAGATTGTAAAATCCGAATGTGGATTAGCTTCAACCCATCAAAGATTCAAGAACAGCTACAGTTCTAAGAATGAGCC---------------------AAAAAAAAATGGGTATGCATTGAGGGGAGGGAATTAGGAAGGGAATTTATAGCCATTCAGACA-TTTCCCAACATTAAGCCTTCATGAATTTTGCATTGGAAAGAAATATTTATAAATTAAGAAACTCAGTATCCAGTCCACCCTGTGATAAATACTGCAATGTGCCCAAGCATTCCAATTTGAGTATGGCTTTGTGCTTTGCCAATCATAACAATGGGAGATAGAAGTAATAAGAGCCTGCATGAAGCACTGTGCTAATGATAATTTTCCCAGTAAGAACAAAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77107072 788 - 143122389 TTAGAGGAAGGAAGTCCTGTCCCAACAGGTTTGACATATTGTGGCTGAATTTTTAGGTTTTAGTGAAAATAATAATGATGGCTTGATCTTCAAAGTTTTTTTT-----------ACCATTTCCCAAATAGCTGGGGATTATCCTAGTGTAACCACTTAAAACTCTGATGAAATGTGGAAATAATTTCTTTCTCTAACTGATACTTTGTGAGTGCAACTATTTTGCATTGTGCAGAGAGAAAAAAATATATTCCAGGCATTCGCCAAATCAAAAGTGCATGAACAAGTCTCTAAATTTCTTCCTGTCCTCAGATTTGCACCATAAAGTTTCAGACTAAATAAAACATTGTTTTTTCACTAATTTTCTTTGAGGAAATATAAGAG----AAAAAAAGAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGGCAATTATATGAGATTGTAAAATCTGAATGTGGATTAGCTTCAACCCATCAAAGATTCAAGAACAGCTACAGTTCTAAGAATGAGCCAA-------------------AAAAAAAAAAAGCTATGCATTGAGGGGAGGGAATTAGGAAGGGAATTTATAGCCATTCAGATATTTTCCCAACACTAAGCCTTCACGAATTTTGCATTGGAAAGAAAGATTTATAAATTAAGAAACTCAGTATCCAGTCCACCCTGTGATAAATGCTGCAATGTGCCTGAGCATTCCTATTTGAGTATGGCTTTGTGCTTTGCCAATCATAACAATGTGAGATAGAAGTAATAAGAGCCTGCATGAAGCACTGTGCCAATGATAATGTTCCCAGTAAGAACAAAAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34484193 801 + 198365852 TTAGAGAAGGGACGTCCTGCCGCAACTGGTTTGACCTATTGTGGCTGAATGTTTAGGTTTTAGTGAAAATAATAATGAT-GTTTGATCTTCGAAGTTTTGTTTT----------ACCGTTTCCCAAATAGCTTGCAATTATTGTGGTGTAACCACTTAACATTCTGATGAAACGAGGAAAGAATTCCCTTTTCTAATTGATACTTTGTGAGTGCAACTACTTTGCATTGTGCAGAGAGAAAAAGATATATTCCAGGGATTCGCCAAATCGAAAGTGGATAAACAAGTCTCTAAATTTCCTCCTGTCCTCAGACTTGCACCATAAAGTTTCAGACCGAATAAAAGA-TTTTTTTTCACTACTTTTCTTTTAGGAAAGGTAAGAG--------AAAAAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGTCAATTATATCAGATTGAAAAATACAAATGTGGATTATCTTCAACCCATGAAAGATTTAAGAACAGCTACAGTTCTCAGAATGAGCCAAAAAAAAAAAAGTGTTAAAAAAAAAAAAATGGGTATGCATTGA-GGGAGGGAATTAGGAAGGGAATTTATAGCCATTCAGACATTTTCCCAACATTAAGTGTTCACGAATTGTGCATTTGAGAGAAAGGTTTATAAATTAAGAGACTCAGTATCCAGTCCACCCTAGGATAAGTGCTGCAATGTGCCCAAGCATTCCTATTTGAGTATAGCTTTGTGCTTTGCCAATCATAGCAATGGGTGATAGAAGTAAGAGGAGCCTGCATGCAGCACTGTGCTAATGATAATGTTCCCAGTAAGAACAAAAG i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34727198 786 + 192294377 TTAGAGAAGGGACGTCCTGCCGCAACTGGTTTGACCTATTGTGGCTGAATGTTTAGGTTTTAGTGAAAATAATAATGAT-GTTTGATCTTCGAAGTTTTGTTTT----------ACCGTTTCCCAAATAGCTTGCAATTATTGTGGTGTAACCACTTAACATTCTGATGAAACGAGGAAAGAATTCCCTTTTCTAATTGATACTTTGTGAGTGCAACTACTTTGCATTGTGCAGAGAGAAAAAGATATATTCCAGGGATTCGCCAAATCGAAAGTGGATAAACAAGTCTCTAAATTTCCTCCTGTCCTCAGACTTGCACCATAAAGTTTCAGACCGAATAAAAGA-TTTTTTTTCACTACTTTTCTTTTAGGAAAGGTAAGAG--------AAAAAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGTCAATTATATCAGATTGAAAAATACAAATGTGGATTATCTTCAATCCATGAAAGATTTAAGAACAGCTACAGTTCTCAGAATGAGCCAA---------------AAAAAAAAAAAAATGGGTATGCATTGA-GGGAGGGAATTAGGAAGGGAATTTATAGCCATTCAGACATTTTCCCAACATTAAGTGTTCACGAATTGTGCATTTGAGAGAAAGGTTTATAAATTAAGAGACTCAGTATCCAGTCCACCCTAGGATAAGTGCTGCAATGTGCCCAAGCATTCCTATTTGAGTATAGCTTTGTGCTTTGCCAATCACAGCAATGGGTGATAGAAGTAAGAGGAGCCTGCATGCAGCACTGTGCTAATGATAATGTTCCCAGTAAGAACAAAAG i macFas5.chr3 C 0 I 301 s papAnu2.chr3 33116703 789 + 180432695 TTAGAGGAGGGACGTCCTGCCCCAACTGGTTTGACCTATTGTGGCTGAATGTTTAGGTTttagtgaaaataataatgat-gtttGATCTTCGAAGTTTTGTTTT----------ACCGTTTCCCAAATAGCTTGCAATTATTGTGGTGTAACCACTTAACATTCTGATGAAACGAGGAAATAATTCCCTTTTCTAATTGATACTTTGTGAGTGCAACTACTTTGCATTgtgcagagagaaaaagatataTTCCAGGGATTCGCCAAATCGAAAGTGGATAAACAAGTCTCTAAATTGCCTCCTGTCCTCAGACTTGCACCATAAAGTTTCAGACcgaataaaagatttttttttcactacttttcttttaggaaaggtaagag--------aaaaaaagaaacaagtgtttTGAAGGGTAGAATTTTGTCAATTATATCagattgaaaaatacaaatgtggATTATCTTCAACCCATGAAAGATTTAAGAACAGCTACAGTTCTCAgaatgagccaaaa-------------aaaaaagaaaaaatgggtaTGCATTGA-GGGAGGGAATTAGGAAGGGAACTTATAGCCATTCAGATATTTTCCCAACATTAAGTGTTCACGAATTGTGCATTTGAGAGAAAGGTTTATAAATTAAGAGACTCAGTATCCAGTCCACCCTAGGATAAGTGCTGCAATGTGCCCAAGCATTCCTATTTGAGTATAGCTTTGTGCTTTGCCAATCATAGCAATAGGTGATATAAGTAAGAGGAGCCTGCATGCAACACTGTGCTAATAATAATGTTCCCAGTAAGAACAAAAG i papAnu2.chr3 C 0 I 294 s calJac3.chr21 34674136 780 - 50472720 TTAGAGGAGGGAAGTCCTGTTCCACCTAGTCTGACATATTGCGACTGAATTTTTAAGTTTTAGTGAAAATAATAATGATGATTTGATCTTCAAAGTTTT---------------ATCATTTCCCAAATAGCTTGGGATTATTGTAGTGCAACCACTTAAAATTCTGATGAAATGTTGAAAGAATT-CATTTTCTAATTGATACTCTGTGACTGCAACTACTATGCATTGTGCATAGAGAAAAA-ATATATTCCAGGCATTCTTCAAATCTAACGTGTGTGAACAAGTCTTTAAATTTCCTCCTGTCCTCAGATTTGCACCATAAAGTTTCAGACCAAATAAAAAAAATTTCTTTCACTACTTTTCTTTGAGAAAATGTAAGAGAAAAAAAGAGAGAAAGAAACAAGTGTTTTGAAGGGTAGAATTTTGACAATTATATCAGATTGAAAAACACAAATGTGGATTAGCTTCAACCCATCAAAGATTCAAGAACAGCTACAGTTCTAACAATGAGCC----------------------AAAAAAAATGGGTATGCATTCAAGGGAGGAAATTAGGAAGGGAATTTATAGTCACTCAGACATTTTCCCAACAGTAACACTTCACGAACTTCACATTGGAAAGAAAGATTTATAAATCAAGAAACTCAATATGCAGTCCACCCTAGGATAAATGCT---ATGTGCCCATGCATTCCTATTTGAATATGGCTCCATGCTTTGCCAATCACAACAATGGTTGATAGAAGTAATAAGAGCCTGCATGAAGCACTGTGCTAATGATAACGTTCCTGGTAAGAACAGAAG i calJac3.chr21 I 280 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I a score=15501.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 201859 8 + 478999 AGAGGCCA s panTro4.chrUn_GL393519 41527 8 + 413329 AGAGGCCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77107860 8 - 143122389 AGAGGCCA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34484994 8 + 198365852 AGAGGCCA i rheMac3.chr3 C 0 I 307 s macFas5.chr3 34728285 8 + 192294377 aGAGGCCA i macFas5.chr3 I 301 C 0 s papAnu2.chr3 33117786 8 + 180432695 agaggcca i papAnu2.chr3 I 294 C 0 s calJac3.chr21 34674916 8 - 50472720 AGGGGCCA i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I a score=1904.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 201867 12 + 478999 TTACTTTTAAA-C s panTro4.chrUn_GL393519 41535 12 + 413329 TTACTTTTAAA-C i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77107868 12 - 143122389 TTACTTTTAAA-C i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34728293 5 + 192294377 ------TTAAA-- i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33117794 12 + 180432695 ttagatttaaaa- i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34674924 11 - 50472720 TTACTTTAAAC-- i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I e rheMac3.chr3 34485002 307 + 198365852 I a score=392950.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 201879 248 + 478999 ATCATTGAATATAATCAAACACTGGGTAGGCTTGTCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACGGTTATAGCTATAAAGTAAAAAAGACATATTATAAAATTTCTGTCATTAAGAAAAGTATTTATTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGACGGTAAATTCTTTGGAATTAGTTGACTTCATGTAAGTTGATTTGTTCAGTAACACAGAGTAGACTTCTTGTAAATAGGAACAAGTGTGCATCTGATCAAG s panTro4.chrUn_GL393519 41547 248 + 413329 ATCATTGAATATAATCAAACACTAGGTAGGCTTGTCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACGGTTATAGCTATAAAGTAAAAAAGACATATTATAAAATTTCTGTCATTAAGAAAACTATTTATTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGACGGTAAATTCTTTGGAATTAGTTGACTTCATGTAAGTTGATTTGTTCAGTAACACAGAGTAGACTTCTTGTAAATAGGAACAAGTGTGCATCTGATCAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77107880 244 - 143122389 ATCATTGAATATAATCAAACACTGGCTAGGCTCATCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACGTTTATAGCTATAAAATAAAAAAGACATATTATGAAATTTCTGTCGTTAAGAAAAC----TATTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGATGGTAAATTCTTTTGAATTAGTTGACTTCATGTAAGTTGATTTGCTCAGTAACACAGAGTAGACGTCTTGTAAATAGGAACAAGGGTGCATTTGAACAAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34485309 242 + 198365852 ATCATTGAATGTAATCAAACACTGGGTAGGCTTGTCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACATTTACAGCTATAAAAGAAAAAAGAC--ATTATGAAATTTCTGTCATT-AGAAAACTAT---TTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGACTGTAAATTATTTTGAATTAGTTGACTTCATGTAAATTGATTTGTTCCATAACACAGAGTAGACTTCTTGGAAATAGGAACAAGGGTGCATTTGATCAAG i rheMac3.chr3 I 307 C 0 s macFas5.chr3 34728298 243 + 192294377 ATCATTGAATGTAATCAAACACTGGGTAGGCTTGTCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACATTTACAGCTATAAAAGAAAAAAGAC--ATTATGAAATTTCTGTCATTAAGAAAACTAT---TTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGACTGTAAATTATTTTGAATTAGTTGACTTCATGTAAATTGATTTGTTCCATAACACAGAGTAGACTTCTTGGAAATAGGAACAAGGGTGCATTTGATCAAG i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33117806 243 + 180432695 atcattgaacgTAATCAAACACTGGGTAGGCTTGTCTGTATTTAGATTTTATAACTCTACATTTacagctataaaagaaaaaagac--attacgAAATTTCTGTCATTAAGAAAAGTAT---TTATTACAAATGTGAATTTCTCTAGactgtaaattattttgaattagttGACTTCATGTAAGTTGATTTGTTCCATAACACAGAGTAGACTTCTTGGAAATAGGAACAAGGGTGCATTTGATCAAG i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34674935 241 - 50472720 ATAATTGAATGTAATCAAACACTGGGTAGGCTTATCTGTATTTGGATTTTATAACTCTACATTTATAGCTATAATAGAAAAAAATA--CGTATAAAATTTCTGTGGTT-AAAAAACTA----TTATTACAAATGTGAATTTCTGTAGACGGTAAATTCTTTTAGATTAGTTGACTTCATGTAAGTTGATCTGTTCAGTAACACGGAGTGGACTTCTTATAAATAGAAACGAGGGTACATTTGATCAAG i calJac3.chr21 C 0 I 496 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I a score=82117.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 202127 47 + 478999 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATCCCTTTTCTGCCTTCCCTCAGA s panTro4.chrUn_GL393519 41795 47 + 413329 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATTCCTTTTCTGCCCTCCCTCAGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77108124 47 - 143122389 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATCTCTTTTCTGCCCTCCCTCAGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34485551 47 + 198365852 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATCCCTTTTCTGCACTCCCTCAGA i rheMac3.chr3 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34728541 47 + 192294377 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATCCCTTTTCTGCACTCCCTCAGA i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33118049 47 + 180432695 ATCCACTATTTTCT--TATATGTATATCCCTTTTCTGCACTCCCTCAGA i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34675672 49 - 50472720 AACCACTATTTTCTTATATATATATATTCCTTTTCTGTCCTCCCTCAGA i calJac3.chr21 I 496 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e chlSab2.chr2 37806920 2813 - 90373283 I a score=1065350.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 202174 501 + 478999 ATACTATCTTTCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCCAGAATATCGCATATTCGATCAGTGTCCACAAATGTTAGATACAGAATGTTAAATTACTAttaggtttgcgcaaatgtagttgtgattaatggcaaaaatcgcaattatttttgcaccaacctaaTAGTAACATTGAAACACAATATTAGTTATTCAACATCAGAAAGATCTTCCAGAACAGTCATCACCACAGATGGGCCAAACTATTATTTGTAGGGCACTGCAGTAAGTTAGAATTTTATCAAATTCATAAATTAATGGATATTTTGTTAAGGGATATGAACAGCCTGTAGTATAAATTTGAGCTATACATTGTTGGGAGAACAAAATAATAAAACGATATAATAGTAGCAATCAAGTGGTGACCTTTCTGTCACACTTACAATTTTCAATGCACTTGTCTACTTATTATTTCATGTGTGGATGGGTTAGCTGAGTGGCGGGGCCATCAG s panTro4.chrUn_GL393519 41842 500 + 413329 ATACTATCTTTCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCCAGAATATTGCATATTCGATCAGTGTCCAAAAATGTTAGATACAGAATGTTAAATTACTAttaggttcacgcaaatgtagttgtgattaatggcaaaaatcgcaattatttttgcaccaacctaaTAGTAACATTGAAACACAATATTAGTTATTCAACATCAGAAAGATCTTCCAGAACAGTCATCACCACAGATGGGCCAAACTATTATTTGTAGGGCACTGCAGTAAGTTAGAATTTTATCAAATTCATAAATTAATGGATATTTTGTTAAGGGATATGAACAGCCTGTAGTATAAATTTGAGCTATACATTGTTGGGAGAACAAAATAATAAAACGATATAATAGTAGCAATCACGTG-TGACCTTTCTGTCACACTTACAACTTTCAATGCACTTGTCTACTTATTATTTCATGTGTGGATGGGTTAGCTGAGTGGTGGGGCCATCAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77108171 501 - 143122389 ATACTATCTTCCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCCAGAATACTGCCAATTCAATCAGTGTCCACAAACGTTAGATACAGAATGTTAAATTACTAttaggttggtgaaaatgtagttgtgattaatggcaaaaattgcaattatttttgcaccaacctaaTAGTAACATTGAAAAACAATATTAGTTATTCAACATCAGAAAGATCTTCCGGAACTGTCATCACCACAGATGGGCTGAACTATTAATTGTAGGGCATTGTAGTAAGTTAGAATTTTATCAAATTCATAAATTAATGGATATTTTGTTAAGGGATATGAACAGCCTGTAGTATAAATTTGAGCCATACATCATTGGGAGAACAACATAATAAAACAATATCATAGTAGCAATCATGTGGTGGCCTTTCCGTCACACTTAGAATTTTCAATGCACTTGTCTATTTATTATTTCATGTGTGGATGGGGTAGTTGAGTGGCGGGGCCACCAG i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34485598 497 + 198365852 ATACTATCTTTCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCTAGAATACTTCATATTCAATCAATGTCCACAAACGTTAGATACAGAATGCTAAATTACTAttaggttgctgcaaaagtagttgtgattaatggcaaaaatcgcaattatttttgcaccaacctaGTAGTAACATTGAAAAACAGTATTAGTTATTGAACATCAGAAAGATCTTCTGGAAGAGTCGTCACCACATATGAGCTGAACTATTATTTGTAGGGCATTGTAGTA----AAAATTTTATCAAATTCATAAATTGATGGATATTTTGTTAAGGAATATGAAGAGCCTGTTGTATATATTAGAGTTATACACCATTGGGAGAACAAAACAATAAAACAATATAATAGTAGCAATCACGTGGTAACATTTCCGTCACACTTACAATTTTCAATGCACTTTTCTATTTATTATTTCCTGTGTGGATGGGGTAATTGAGTGGCCAGGCCATCAG i rheMac3.chr3 C 0 I 1023 s macFas5.chr3 34728588 497 + 192294377 ATACTATCTTTCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCTAGAATACTTCATATTCAATCAATGTCCACAAACGTTAGATACAGAATGCTAAATTACTAttaggttgctgcaaaagtagttgtgattaatggcaaaaatcgcaattatttttgcaccaacctaGTAGTAACATTGAAAAACAGTATTAGTTATTGAACATCAGAAAGATCTTCTGGAACAGTCGTCACCACATATGAGCTGAACTATTATTTGTAGGGCATTGTAGTA----AAAATTTTATCAAATTCATAAATTGATGGATATTTTGTTAAGGAATATGAAGAGCCTGTTGTATATATTAGAGTTATACACCATTGGGAGAACAAAACAATAAAACAATATAATAGTAGCAATCACGTGGTAACCTTTCCGTCACACTTACAATTTTCAATGCACTTTTCTATTTATTATTTCCTGTGTGGATGGGGTAATTGAGTGGCCAGGCCATCAG i macFas5.chr3 C 0 I 972 s papAnu2.chr3 33118096 501 + 180432695 ATACTATCTTTCACAAAACAACACACATCTCTTCCACCAACTTCTCCCTAGAATACTTCATATTCAATCAATGTCCACAAACGTTAGATACAGAATGCTAAATTActattaggttgctgcaaaagtagTTGTGATTAATGGCAAAAAtcgcaattatttttgcaccaacctagtagtAACATTGAAAAACAGTATTAGTTATTGAACATCAGAAAGATCTTCTGGAACAGTCGTCACCACATATGAGCTGAACTATTATTTGTAGGGCATTGTAGTaagttaaaattttatcaaattcaTAAATTGATGGATATTTTGTTAAGGAATATGAAGAGCCTGTTGTATATATTAGAGTTATACACCGTTGGgagaacaaaacaataaaacaatataatagtAGCAATCACGTGGTAACCTTTCCGTCACACTTACAATTTTCAATGcacttttctatttattatttcctgtGTGGATGGGGTAATTGAGTGGCCAGGCCATCAG i papAnu2.chr3 C 0 I 972 s chlSab2.chr2 37809733 493 - 90373283 ATACTGTCTTTCACAAAGCAATACATACCTCTTCCACCAACTTCTCCCCAGAATACTACATATTCGAACAATGTCCACAAATGTTAGATACAGAATGTTAAATTACTAttaggttggtgcaaaagtagttgtgattaatggcaaaaatcacaattgtttttgcaccaacctaaTAGTAACATTGAAAAACAATATTAGTTATTCAA-ATCAGAAAGATCTTTTGGAACAGTCATCACCACAGATGGGCTGAACTATTGTTTTTAGGGCATTGTAGTAAGTTAGAATTTTAACAAATTTGTAAATTAGTGGATATTTTGTTAAGGGATATGAACAACCTGTAGTATACATTTGAGCTATATATCA---GGAGAACAAAATAATAAAACAATATAATAGTAGCAATCACGTGGTGACCTTTCCATCACACTTACCATTTTCAATGCACTTGTC----TATTATTTCATGTGTGGATGGGGTAGCTGAGTGGTTGGGCCATCGG i chlSab2.chr2 I 2813 C 0 s calJac3.chr21 34675721 489 - 50472720 ATAGTATGTTTTACAAAACAACA-----------CACCAACTTCTCCCCAGAACACTCCATATTCAATCAATGTACACAAATGTCAGAGACAGAATGGTATATTACCAttaggttggtgcaaaagtaattgcaattaatggcaaaaattgcaatcatttttgcaacaacctaaTAATAACATTGAAAATCAGTATCAGTTATTCAACATCAGAAAGACATTCAGAAACAGTCATTAACACAGATGGACTGAACTATTATTTGTAGATCATTGTCGTA-GTTAAAATTTTATCAAATTCAGTAATTAATGGATATTTTGTTAAGGGATATGAACAAGCTGTAGCATAAATTTGATCTATACATCATTGGGAAAACAAAATAACACAATGACATAATAGTAGCAAACACGGGGTGACTTTTCCGTCACACTTGCAATTTTTAATGCACTTGTCTATTCATTATTTCATGTGCAGATGGGGTAGCTCAGTGGTCGGGTCATCAG i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I a score=3874.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 202675 5 + 478999 ATGTC s panTro4.chrUn_GL393519 42342 5 + 413329 ATGAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77108672 5 - 143122389 ATGTC i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37810226 5 - 90373283 ATGTC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34676210 5 - 50472720 ATGTC i calJac3.chr21 C 0 I 1 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e papAnu2.chr3 33118597 972 + 180432695 I e macFas5.chr3 34729085 972 + 192294377 I e rheMac3.chr3 34486095 1023 + 198365852 I a score=1156464.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 202680 532 + 478999 ATATATACAGATGACTCCCTTCTATACACCATTCTGCCATTAGTTGATGTATATTTTACTTTTGCTTTTCCCTTCCCATTTCACTACTAGATAAAAATCCTAATCTTGACTTCTAAATCACACCTAGTTTTACTCATGTGTAGTTGTACCTGACAAAGAATTACACTACATAAATTCCATCCATTAGAGGTGTGGCCGAATGGACAGAAAACCATTAACATTGATTACTTCAGTGCATGTGGGATTGCAAATGC---AGATGAGAAGGAGAAGATTTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTATGTATTCTAATGCAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTAAAATGTTCTTAAAAGTTCATGTCCTTAATGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTATTGCAACAAATGCAACAATTTATTTCACTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCAGAACTTGCACAGAGATATTTAAACGAACAAAGAAACAAAAAATCTAGGGAAGAAGTGAA s panTro4.chrUn_GL393519 42347 532 + 413329 ATATATACAGATGACTCCCTTCTATACACCATTCTGCCATTAGTTGATGTATATTTTACTTTTACTTTTCCCTTCCCATTTCACTACTAGTTAAAAATCCTAATCTTGAGTTCTAAATCACACCTAGTTTTACTCATGTGTAGTTGTACCTGACAAAGAATTACACTACATAAATTCCATCCATTAGAGGTGTGGCCGAATGGACGGAAAACCATTAACATTGATTACTTCAGTGCATGTGGGATTGCAAATGC---AGATGAGAAGGAGAAGATTTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTATGTATTCTAATGCAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTAAAATGTTCTTAAAAGTTCATGTCCTTAATGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTATTGCAACAAATGCAACAATTTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCAGAACTTGCACAGAGATATTTAAACGAACAAAGAAACAAAAAATCTAGGGAAGAAGTGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77108677 530 - 143122389 ATATATACAGATGACTCCCTTCTATACCCCATTCTGTCGTTAGTTGATGTGTATTTTACTTTTGCCTTTCCCCTCCCATTTCACTACTAGTTTAAAATCCTAATCTTGAGTTCTAAATCACACCTAGTTTCACTTATGTGTAGTTGTACCTGACAAAGAATTACACTACATAAATTCCTTCCATTAGAAGTGTGGCGGAATGGACAGAAAACCATTAACATTGATTATTTCAGTGCAGGTGGGATTGCAAATTC---AGATGAGAAAGAGAAGATCTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTGTTTATTCTAATACAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTAAAACGTTCTTAAAAGTTCATGTCCTTAACGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTATTGCAACAAATGCAACAATTTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCTGAACTTGCACAGAGATATTTAAACGAACAAACAAACAAAAA--CTAGAGAAGCAGTGAA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34487118 526 + 198365852 ATATATACAGATGCCTCCCTTCTATACCCCATTCTGCCATTAGTTGATGTGTATTTCACTTTTGCTTTTCCCTTCCCATTTCACTAGTAGTTAAAAATTCTAATCTTGAGTTCTAATTCACACTTAATTTTACTCATGTGTACTTGTACCTGACAAATAATTACGCTACATAAATTCCATCCATTAGAGTTGTGGTGGAATGGACAGAAAACCATTAAC----ATTACTTCAGTGCAGATGGGATTGCAAATGC---AGATGACAAGGAGAACATTTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTATTTATTCTAATACAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTACAATATTCTTAAATGTTCACATCCTTAATGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTGTTGAAACAAATGCAACAATGTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCAGAACTTCTACAAAGATATTTAAACAAACAAATAAACAAAAA--CTAGAGAAGAAGTGAA i rheMac3.chr3 I 1023 M 314 s macFas5.chr3 34730057 526 + 192294377 ATATATACAGATGCCTCCCTTCTATACCCCATTCTGCCATTAGTTGATGTGTATTTCACTTTTGCTTTTCCCTTCCCATTTCACTACTAGTTAAAAATTCTAATCTTGAGTTCTAATTCACACTTAATTTTACTCATGTGTACTTGTACCTGACAAATAATTACGCTACATAAATTCCATCCATTAGAGTTGTGGTGGAATGGACAGAAAACCATTAAC----ATTACTTCAGTGCAGATGGGATTGCAAATGC---AGATGACAAGGAGAACATTTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTATTTATTCTAATACAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTACAATATTCTTAAATGTTCACATCCTTAATGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTGTTGAAACAAATGCAACAATGTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCAGAACTTGCACAAAGATATTTAAACAAACAAATAAACAAAAA--CTAGAGAAGAAGTGAA i macFas5.chr3 I 972 I 1 s papAnu2.chr3 33119569 526 + 180432695 ATATATACAGATGCCTCCCTTCTATACCCCATTCTGCCATTAGTTGATGTGTATTTCACTTTTGCTTTTCCCTTCCCATTTCACTACTAGTTAAAAATtctaatcttgagttctaattcaCACTTAATTTTACTCATGTGTACTTGTACCTGACAAATAATTACACTACATAAATTCCATCCATTAGAGTTGTGGTGGAATGGACAGAAAACCATTAAC----ATTACTTCAGTGCAGATGGGATTGCAAATGC---AGATGACAaggagaacatttttattttttctttatataagttTACCTTATTTATTCTAATACAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTACAATATTCTTAAATGTTCACATCCTTAATGTTCTGTAAAGGAAGCATAAACTCATTTGTTGAAACAAATGCAACAATGTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGatataaataaaactgttcaGAACTTGCACAAagatatttaaacaaacaaataaacaaaaa--ctagagaagaagtgaa i papAnu2.chr3 I 972 I 1 s chlSab2.chr2 37810231 525 - 90373283 ATATATACAGATGACTCCCTTCTGTACCCCATTCTGCCATTAGTTGATGTGTATTTTACTTTTGCTTTTCCCCTCCCATTTCACTACTAGTTAAAAATCCTAATCTTGAGTTCCAAATCACACCTAG-TTTACTCATGTGTAGTTGTACCTGACAAAGAATAACACTACATAAATTCCATCCATTAGAGGTTTGGCGGAATGGACAGAAAACCACTAACATTGATTACTTAAGTGTTGGTGGGATTGCAAATGC---AGAAGATGAGAAGAAGATTTTTATTTTTTCTTTATATAAGTTTACCTTATTTATTCTAATACAAGGCTCAAGTATCATTTATAGTGAAACATTAAAACGTTCTTAAATGTTCATGTCCTTAATGTTCTGGAAAGGAAGCATAAACTCATTTATTGCAACAAATGCAACAATTTATTTCATCCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTCAGAACTTGCACAGAGATATTTAAACAAAC----AAACAAAAA--CTAGAGAAGAAGTGAA i chlSab2.chr2 C 0 I 1 s calJac3.chr21 34676216 505 - 50472720 AAATAGACAGGTGACTCCCTTCTATACCCCATTCTGCCATTAGTCTGTGTGTGTTTGACTTTTGCTTTTCCCTTCCCATTTCATTACTAGTTAAAAATCCTAGTCTTGTGTTCTAAATCACACGTAGTTTAACTCATGTGTAGTTGTACCTGAAAAATAATTACACTGCATAAAATCTATCAGTTAGAGGTGTGGCAGAATGGACACTAAACTACTAAC---------TTTAGTGCAGGTGAGATTGAGAATGCAGAAGATGAAAAGGAGAAGATTTGTATTTTTTCTTTATAAAAGTTTATCTTATTTATTCTAACCCAAGGCTCAAGTATCATTTGTAATGAAACATTGAAACGTTCTTAAAAGTTCATGTGTTGAATGTTCTGTAAAGGAAGTATAAACTC----------ACAAATGCAGCAATTTATTTCATTCCTCAGATTATTGATCCTGATATAAATAAAACTGTTTAGAACTTGCACAGACATATTTAAACAAAC---------AAAA--ATAGAGAAAATGTGAA i calJac3.chr21 I 1 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I a score=483090.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 203212 308 + 478999 -GAAAAGAATGCTTT--TTAAATTACTTAATCATTGTTGATGGACTGACAACATCCAACTTACATCTCCTGAATTAAACCTGATATTTTCTTGGAGAGTAGTGAGGAGTAGTTGAGGGTAGATAGGAAAGAGAGTGTATTTTGAGAAATGTaaaatttagagaagcttaatttaaacactccctgtgtgtca-------------------------------------aagagctattaaataaaattttcatgattttaatat-aagtgaatctgaactagcatatggtctaagtttcttttaagttgcacatggatttaaaatataggggaaaaagatcacttggc s panTro4.chrUn_GL393519 42879 308 + 413329 -GAAAAGAATGCTTT--TTAAATTACTTAATCATTGTTGATGGACTGAAAACATCCAACTTACATCTCCTGAATTAAACCTGATATTTTCTTGGAGAGTAGTGAGGAGTAGTTGAGGGTAGATAGGAAAGAGAGTGTATTTTGAAAAATGTaaaatttagagaagcttaatttaaacactccctgtgtgtca-------------------------------------aagagctattaaataaaattttcatgattttaatat-aagtgaatctgaactagcatatggtctaagtttcttttaagttgcacaaggatttaaaatataggggaaaaagatcacttggc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77109207 308 - 143122389 -AAAAAGAATGCTTT--TAAAATTACTTAATCATTGTTGATGGACTGAAAACATCCAACTTACATCTCCTGAATTAAATCTGATATTTTCTTGGAGAGTAGTGAGGAGTAGTTGAGGGTAGATAGAAAACAGAGTGTATTTTGAAAAATGTaaaatttagagaagcttaatgtaaacactccctgtgtgtca-------------------------------------aagagctattaaataaaattttcatgattttaatat-aagtgaatctgaactagcatatggtctaagtttctcttaagttgcacatggatttaaaatgcagaggaaaaagatcacttgtc i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr3 34730584 336 + 192294377 -GAAAAGAATGCTTT--TTAAATTACTTAATCATTGTTGATGGACTGAAAACATCCAGCTTACATTTCCTAAATGAAATCTGATATTTTCTTGGAGAGTAGTGAGGAGTGGC-------AGATAGAAAACAGAGTGTATTTTGAAAAATGTAAAATTTAGAGCAGCTTAATTTAAACAGTCCTTGTGTGTCAAAGAACTattaaatataatttaaatataattaaatataaGAACTATTAAATATAATTTTCATGATTTGAATGT-AAGTGAATCTGAACTAGCATATGTCCTAAGTTCCTTTTAAGTTGCACATGGATTTAAAATTTAGGGGG--AAGATCACTCGAA i macFas5.chr3 I 1 C 0 s papAnu2.chr3 33120096 306 + 180432695 -gaaaagaatgcttt--ttaaattacttaatcaTTGTTGATGGACTGAAAACATCCAGCTTACATTTCCTAAATGAAAtctgatattttcttctagagtaGTGAGGAGTGGCAGAGGGTAGATAGAAAACAGagtgtattttgaaaaatgtaaaatttagagCAGCTTAATTTAAACAGTCCTTGTGTGTCA-------------------------------------AAgagttattaaatataattttcatgatTGGAATGT-AAGTGAATCTGAACTAGCATATGTTCTAAGTTTCTTTTAAGTTGCACATGGATTTAAAATGTAGGGGG--AAGATCACTcgaa i papAnu2.chr3 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 37810757 308 - 90373283 -AAAAAAAATGCTTT--TTAAATTACTTAATCATTGTCGACGGACTGAAAACATCCAACTTACATCTCCTGAATTAAATCTGATATTTTCTTGAAGAGTAGTGAGGAGTGGTTGAGGGTAGATAGAAAACAGTGTATATTTTGAAAAATGTAACATTTAGAGAAGCTTAATTTAAACActtcttgtgtgtc--------------------------------------aaaagctactaaatataattttcatgattataatataaagtgaatctgaactagaatatggtctaagtttcttttaagttgcacatgaattgaaaatgtagggggaaaagatcacttggc i chlSab2.chr2 I 1 C 0 s calJac3.chr21 34676721 310 - 50472720 AAAAATTGATGCTTTAAAAAAAGTACTTAATCATTATTGTTGGACTGAAAACATCTAACTTACATCTGCTGAATTAAATCTGATATTTTCCTGGAGAGTAGTGAGGGATGGTTGAGGGTAGATAGAAAGCAGAGTGTACTTTGAAAAATATAAAGTTTAGAGAAGCTTAATTTAAACTctccctgtgtgtca-------------------------------------aagagctattaaatataatttctgtgattttaatat-aagtgaatttgaactaggatatggtctaagtttcttttaagttgca-atggatttaaaatgtaggggaaaaagatcacttggc i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I e rheMac3.chr3 34487644 314 + 198365852 M a score=2346190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 203520 1130 + 478999 aaatatgtttttggttttgaaaaacttccaaatgtttaaaaagtacttttcaaatcaaccatacccatatgcatccagg-ttttctcatccTCACCAGTGAAGGATAAAAAGAAATAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGGTGATACATATGCTGTAAAACTATGTCAGAAATATCAGTTGATTCTTTAGGGAATTGGTTAAAAAAATAAATTTAGTCCTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATCTAACAC--TTATTCTTAGTGGCTTA-----GGATCATGGATGATATTAATCTGTCACAAGATGATTCTATGACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGCAT--ATGATATTGCTATTTTATTTTGTTCCAAGTCTTGTCACTATTGGTGGAAAACAGTTTTCCAAAGGAATGAACATTTAGATAAATTATGGAATGAAGAATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATGCATTGATAATAACTGAACATCTTTGGCATCTGGCTTCCAGATACAGTGACGATTCCTTCAAGACATCTAGAAATTAAATAGATGTGCGTGAACACTTT---AAAAAATGTAAATACATTAAATGTCAGTTATTTTGAAATAAGTTATTTTTTTAAACAGGAAGCATTTTTAATTAAAAATTAGAAAAT----AGCTATATTTGGACAATTAGTTACTCAATGTTTTTTCCAAATAAC-AGATGAAATATACTTTGATGTTTTTTGTTTTAAATAAATGCAAATATATGGATGCAAAACAAATCAAACATTGCTACAAATGAAATATATGTGCTGTCAGTAATTCTCAAACATTGAATAATATTCAGTGAACTTCAACACATACCTTTGGTGGCCCGTTAAAATTCATTATAATGAATTTTGAATTAGATTCCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGCTTTTAGCGTCTGTCGTTTTTTTCTATATTCAt------ttttc-ttttttttttttgactgaggtggcgtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtagcacaatctcggcttactgcaagcaccgcctcccaggttcaagagattctcttacctgagcttctcaagtagct--ggttacaggtgcgtgccaccacgcccagctaattttt s panTro4.chrUn_GL393519 43187 1130 + 413329 aaatatgtttttggttttgaaaaacttccaaatgtttaaaaagtacttttcaaatcaaccatacccatatgcatccagg-ttttctcatccTCACCAGTGAAGGATAAAAAGAAATAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGGTGATACATATGCTGTAAAACTATGTCAGAAATATCAGTTGATTCTTTAGGGAACTGGTTAAAAAAATAAATTTAGTCCTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATCTAATAC--TTATTCTTAGTGGCTTA-----GGATCATGGATGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCTATGACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGCAT--ATGATATTGCTATTTTATTTTGTTCCAAGTCTTGTTACTATTGGTGGAAAACAGTGTTCCAAAGGAATGAACATTTAGATAAATTATGGCATGAAGAATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATGCATTGATAATAACTGAACATCTTTGGCATCTGGCTTCCAGATACGGTGACGATTCCTTCAAGACATCTAGAAATTAAATAGATGTGCATGAACACTTT---AAAAAATGTAAATACATTAAATGTCAGTTATTTTGAAATAAGTTATTTTTTTAAACAGGAAGCATTTTTAATTAAAAATTAGAAAAT----AGCTATATTTGGACAATTAGTTACTCAATGTTTTTTCCAAATAAC-AGATGAAATATACTTTGATGTTTTTTGTTTTAAATAAATGCAAATATATGGATGCAAAACAAATCAAACATTGCTACAAATGAAATATATGTGCTGTCAGTAATTCTCAAACATTGAATAATATTCAGTGAACTTCAACACATACCTTTGGTGGCCCGTTAAAATTCATTATAATGAATTTTGAATTAGATTCCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGCTTTTAGCGTCTGTCGTTTttttctattttcat------ttttc-ttttttttttttgactgaggtggcgtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtagtgcaatctcggcttactgcaagcaccgtctcccaggttcaagagattctcttacctgatcttctcaagtagct--ggttacaggtgcgtgccaccacgcccagctaattttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77109515 1117 - 143122389 aaatatgtttttggttttgaaaaacttccaaatgtttaaaaagtacttTTCAAATCAACCATAGCCATATGCATCCAGA-TTTTCTCATCCTCACTATTGAAGGATAAAAAGAACTAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGGTGATACATATGCTGTAAAACT-------AAAAATCAGTTGATTCTTTAGGGAATTGGTT-AAAAAGTAGATTTAGTCCTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATCTAACAC--TTATTCTTAGCGACTTA-----GGATCATGGATGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCTATGACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAACGCAT--ATAATATTGCTATTTTATTTTGTTCCAAGTCTTGTTACTATTGGTGGAAAACAGTGTTCCAAAGAAATGAACATTTAGATAAATTACGGCATGAAGTATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATACATTGATAATAACTGAACATCTTTGGCATCTGGATTCCGGATACAGTGACGATTCCTTCAAGACATCTAGAAATTAAATAGATGTGCATGAACACTTT---AAAAAATGTAAAAACATTAAATGTCAGTTATTTCAAAATG----TTTTTTTTAAATAAGAAGAATTTTTAATTAAAAATTAGAAAATAGGGAGCTATATTTGGACAATTAGTTACTCAATGCTTTTTCCAAATAAC-AGATGAAATATATTTTGATGTTTTTTGTTTTAAATAAATGCAAATATATAGATGCGAAACAAATCAAACATTGCTACAAACAAAGTTTATGTGTTGTCTGTAATTCTCAAACATTGAATAATATTCAGTGAACTTCAACAAATGCCTTTTGTGGTCCATTAAAATTCACTATAATGAATTTTGAATTAGATTCCAAAATGAACACACTTTTTTCTTAGCTTTTAGTGTCTGTTGGttttttctattttaa--------------tttttttttttgtctgaggtggagtctcactctgtctcccaggctggagagcaatggtgcaatctcggcttattgcaacctctgcctcccaggttcaagtgattcccttgcctcagcttctcaagtagctgaggttacaggtgcctgccaccacgcccagctaattttt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34487969 1133 + 198365852 AAATATGTTTTTGCTTTTGAAAAATTTCCAAATGTTTAAAACGTACTTTTCAAATCAAACATAGCCATATGCATCCAGGTTTTTGTCATCCTCACTATTGAAGGATAAAAAGAACTAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGGTGATACGTATGTTGCAAAATT-------AAAAATCAGTTTATTCTTTAGAGAATTTGTTAAAAAAATAAATTTAGTCTTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATATAACAC--TTATCCTTAGCGACTTAGGATGGGATCATGGAGGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCTATCACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGCAT--GTGATAATGCTATT---TTTTTTTCTAAGTCTTGTTACTATTGGTGGAAAACAATGTTCCAAAGGAAAGAACATTTAGATAAATTATGGCATGAAATATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATACATTGATAATCACTGAACATCTTTGGCATCTGTCTTCCAGATACAGTCACGATTCCTTCACAGTATCTAGAAATTAAATAGATGTGAATGAACACTTT--CAAAAAATGTAAAAACAATAAATATCAGTTATTTTGAAATAAGTTATTTTT---AATACTAAGCATTTTTAGTTAAAAATTAGAAAATAGAGAGCTATATTTAGACAATTAGTTACTCAAT-GTTTTTACAAATAAC-AGAAGAAACATATTTTGACATTTTTTGTTTTAAATAAATGCAAATATATAGATGCAAAACAAATCAAACATTGTTGCCAACAAAATATGTGTGTTGTCTGTAATTCTCAAACACTGAGTAATACTCAGCGAACGTCAACACATGCCTTTGGTGGTCACTTAAAATACATTATAATGAATTTTAAATTTGATTCCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGCTTTTAGTGTCTGCCATTTTTTTCTATTttcttcttttcttttc---ttttttttttgtctcaggtggagtctcactctgtcacccaggttggaatgcagtggcgcaacctcggcttactgcaacctccgcctcccaggctctagcgattttctcacctcagctgctccagtagctgaggttacaggtacgtgccaccatgcccacctaattttt i rheMac3.chr3 M 314 C 0 s macFas5.chr3 34730920 1136 + 192294377 AAATATGTTTTTGCTTTTGAAAAATTTCCAAATGTTTAAAACGTACTTTTCAAATCAAACATAGCCATATGCATCCAGGTTTTTGTCATCCTCACTATTGAAGGATAAAAAGAACTAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGGTGATACGTATGTTGCAAAATT-------AAAAATCAGTTTATTCTTTAGAGAATTTGTTAAAAAAATAAATTTAGTCCTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATATAACAC--TTATCCTTAGCGACTTAGGATGGGATCATGGAGGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCTATCACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGCAT--GTGATAATGCTATT---TTTTTTTCTAAGTCTTGTTACTATTGGTGGAAAACAATGTTCCAAAGGAAAGAACATTTAGATAAATTATGGCATGAAATATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATACATTGATAATCACTGAACATCTTTGGCATCTGTCTTCCAGATACAGTCACGATTCCTTCACAGTATCTAGAAATTAAATAGATGTGAATGAACACTTT--CAAAAAATGTAAAAACAATAAATATCAGTTATTTTGAAATAAGTTATTTTT---AATACGAAGCATTTTTAGTTAAAAATTAGAAAATAGAGAGCTATATTTAGACAATTAGTTACTCAAT-GTTTTTACAAATAAC-AGAAGAAACATATTTTGACATTTTTTGTTTTAAATAAATGCAAATATATAGATGCAAAACAAATCAAACATTGTTGCCAACAAAATATGTGTGTTGTCTGTAATTCTCAAACACTGAGTAATACTCAGCGAACGTCAACACATGCCTTTGGTGGTCACTTAAAATACATTATAATGAATTTTAAATTTGATTCCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGCTTTTAGTGTCTGCCGTTTTTTTCTATTTTCttcttttcttttccttttttttttttgtctcaggtggagtctcactctgtcacccagcttggaatgcagtggcacaacctcggcttactgcaacctccgcctcccaggctctagcgattttctcacctcagctgctccagtagctgaggttacaggtacgtgccaccatgcccacctaattttt i macFas5.chr3 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33120402 1133 + 180432695 aaatatgtttttgcttttgaaaaatttccaaatgtttaaaaagtacttttcaaatcaaaCATAGCCATATGCATCCAGG-TTTTGTCATCCTCACTATTGAAGGATAAAAAGAACTAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGAGATGATACGTATGttgcaaaatt-------aaaaatcagtttattcTTTAGagaatttgttaaaaaaataaatttagtccTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATATAACAC--TTATCCTTAGCGACTTAGGATGGGATCAAGGAGGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCTGTCACTATTTCCAGAAGTGGAAAagtgcagaaatagaaaatgcat--gtgatattgctattttgtttttttccaagtcTTGTTACTATTGGTGGAAAACAATGTTCCAAAGGAAAGAACATTTGGATAAATTATGGCATGAAATATCATTTTCAATCCTTTATGCATAGATACATGGATAATCACTGAACATCTTTGGCATCTGTCTTCCAGATACAGTCACGATTCCTTAACAGTATCTAGAAATTAAATAGATGTGAATGAACacttt--caaaaaatgtaaaaacaataaatatcagttattttgaaataagtaattttt---aatacgaagcatttttagttaaaaattagaaaat----agctATATTTAGACAATTAGTTACTCAAT-GTTTTTACAAATAAC-AGAAGAaacatattttgacattttttgttttaaataaatgcaaatatatagaTGCAAAACAAATCAAACATTGCTGCCAACAAAATATGTGTGTTGTCGGTAATTCTCAAACACTGAGTAATATTCAGCGAACGTCAACACATGCCTTTGGTGGTCAGTTAAAATACATTatgatgaattttaaatttgattcCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGCATTTAGTGTCTGccgtttttttctattttcttcttttcttttc-ttttttttttttgtctcaggtggagtctcactctgtcacccaggttggaatgcagtggtgcaaactcggcttactgcaacctccgcctcccaggctctagcgattctctcacctcagctgctccagtagctgaggttacaggtacgtgccaccatgcccacctaattttt i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37811065 1117 - 90373283 aaatatgttttcggttttgaaaaacttctgaatgtttaaaaactacttTTCAAATCAACCGTAGCCATATGCATCCAGA-TTTTCTCATCCTCACTATTGAAGAATAAAAAGAACTAGAATTAAGGCAAAAT-GATGAAGAGATGATACATATGCTGTAAAACT-------AACAATCAGTTGATTCTTCAGGGAATTGGTTAAAAAAATAAATTTAGTCCTTATGGCAATTTAACCCAAAGAATCTAACAC--TTATTCTCAGCGACTTA-----GGATCATGGATGATATTAATCTGTCACAAAATGATTCCATGACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGGAT--ATCATATTGCTATTTTATTTTGTTCCAACTCTTGTTGCTATCTGTGGAAAACAGTGTTCCAAAGGAATGAACATTTAGATAAAGTATGTCATGAAATATCCTTTTCAATCCTTTATGCATAGATATACTGATAATAACTGAACATCTTTGGCATCTGGCTTCCAAATACATTGACGATTCCCTCACAGCATCTAGAAATTACATAGATGTGCATTAACACTTT--AAAAAAATGTAAAAACATTAAATGTCAGTTATTTTAAAATACATTATTTTTTTAAATAAGAAGCATTTTTAATCAAAAATTAGAAAATAGAGAACTATATTTGGACAA----TTACTCAATGGTTTTTCCAAATAACAAAAAAAAATGTATTTTGACGTTTTCTATTTTAAATAAATGCAAATATATAGATGCAAAACAAATCAAACATTGCT----ACAAAGTATGTGCGTTGTCTGTAATTCTCAAACATTGAATAATATTCAGTGAACTTTAATGCATGCCTTTGGTGGTCTATTAAAATTCATTATGATGAATTTTGAATTAGATTCCAAAATGAACACACTATTTTCTTAGTTTTTAGTGTTTGTTGGttttttctattttcat------------tttttttgtttggtctgaggtggagtctcactctgtcacccaggctggagtgcagtagcacaatctcaggttactgcaacctccgcctcccaggttcaagcaattctcttccctcagcttcttaagcagctgaggttacaggtgcaggccaccatgcccagctaattttt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34677031 1128 - 50472720 aagtatgtttttggttttgaacaacttccaaatgtttaaaaagtacttttcaaatcaaccatagccatatgcatccagg-ttttctcatccTCACTATTGAAGGATAAAAAGAACCAGAATTAAGGCAAAATGGATGGAGATGTGATACATATGGTATAAAGCTA------AAAAATCAGTTGATTCTCAAGGGAATTTGTTGAAAAAATAAATTTGGTCCTTATGGCAATTTAGGCCAAAGAATCTAACACTTTTATTCATAGTGATTTA-----GGATCATGGATGATATTAATCTGTCACAAAATGATCCTATGACTATTTCCAGAAGTGGAAAAGTGCAGAAATAGAAAATGCATACACGATATCGTTGTTTTATTTTATTCTGAATCTTGTCACTGCATGTGGAAAACAGTGTTCTAAAGGAATGAACATTTAGATAAATTATGAAATGAAATATCATTTTTAATTCTTTATGCATAGACACATTGATAATAACTGAATATCTTTGGCATCTGGCTTCCAGATACAGTGACGATTTCCTCATGGCATCTGGAAACTAAAGAGATGTGTATGAACACTTTTTTAAAAAATGTGAAAACATCAAATGTCAGttattttaaaataagttttttta---aat---aagcatttttaattaaaaattaGAAAATAGAGAGCAATATGTGGACAATCAGTTACTAATTTATTTTCCCAAATAAC-AGATAAAATATATTTTGAAGTTTT-TGTTTTAAATACATTTAAATATATAGATGCAAATCAAATCAAACATTGCTACAAACAAAATA--TGTGTTATCTATAATTCTCAAGCATTGAATAATATTCAGTGAACTTCAACACATGCATTTGGTGATCCATTAAAATTCATTTGAATGAATTTTGAATTAGATTCCAAAATGAACACACTAttttcttttcttttagtgtctattgtttttttctattttctt------cttct-ttttttttttttccctgaagcggattctcactctgtcacccaggctggagtgcagtggcaccatctcggcttactgcaaactctgcatcccaggttcaagggattctcttgcctcagcttcctgggtagctgagattacaggtgcacacaaccatacccagctaattttt i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7102520 2001 + 72422247 I a score=261863.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 204650 93 + 478999 gtattgttggtagagatgaggtttcaccatgttggccaggctggtctcgaactcccgacctcaggcgatccacccaccttggcctcccagagt s panTro4.chrUn_GL393519 44317 93 + 413329 gtattgttggtagagatgaggtttcaccatgttggccaggctggtctcgaactcccgacctcaggcgatccacccaccttggcctcccagagt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7104521 93 + 72422247 gtatttttagtagagacggggttttgccatgttggccagtctggtctcgaactcccgacctcaggcgatccacccaccttggcctcacagagt i ponAbe2.chrUn I 2001 C 0 s nomLeu3.chr5 77110632 93 - 143122389 gtatttttggtagagatgaggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcccgacctcaggcgacccacccaccttggcctctcagagt i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr3 34489102 93 + 198365852 gtacttttgggagacatgagatttcaccatgtcggtcaggctggtctcgaactcccaacctcaggtgattcacccaccttggcctcccagagt i rheMac3.chr3 C 0 N 0 s macFas5.chr3 34732056 93 + 192294377 gtacttttggtagacatgagatttcaccatgtcggtcaggctggtctcgaactcccaacctcaggtgattcacccaccttggcctcccagagt i macFas5.chr3 C 0 N 0 s papAnu2.chr3 33121535 93 + 180432695 gtacttttggtagacatgagatttcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcccaacctcaagtgattcacccaccttggcctcccggagt i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37812182 93 - 90373283 gtatttttggtagagatgaggtttcaccatgttggccaggctgggctcgaactcccaacctcaagtgatccacccaccttggtctcccagagt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34678159 92 - 50472720 gtatttttagtagagacgaggtttcacaatgttgaccaggctgatctggaactcccgacctcaggtgatccacctgcc-tgtccacccaaagt i calJac3.chr21 C 0 C 0 a score=2100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 204743 1 + 478999 g s panTro4.chrUn_GL393519 44410 1 + 413329 g i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7104614 1 + 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77110725 1 - 143122389 g i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 33121628 1 + 180432695 G i papAnu2.chr3 C 0 N 0 s chlSab2.chr2 37812275 1 - 90373283 g i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34678251 1 - 50472720 g i calJac3.chr21 C 0 C 0 a score=781819.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 204744 689 + 478999 ctgggattacaggcgtgagccactgcacctggcTGGTTTT---------------TTTTTTTCTATTTTCATTACTAAGACTAAACAATAGTTATGTGACTGAATACAGCTGATCA-TTTTACCAACTCCTTTCAGCAAATTAA--TTTTGTCATTTTAATTAAGTTCAAATTTAAGAAGTGAATAAATATAGATACTATAGCACATATATTTCCCAAAACATAATATA-ATAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg------------CATTTGGGAAATAAAAGAGTATTATATTTTACTCAAACAACATCAAACATGCAGTCAAGTAAGTTTGATGAAGAAGATAATATTTTAGCCTAAGAATGAGAATTCTGTAAGACAATGTGTTACTTTATAGTATCAGTTATGTGACCCTTCCACACTGATATTTTGGGTGCAATTGCACCCTCTTTGCCATATACTCTTGGGAGAATAGAAGG---TTCTTCACATTTTTCCATTCATTGTAACTTCTCCTGTAGGACAGCCCACAGATACATTTCCTAGACTATATTAAGGAAACAAAAGCAAACAAATAT--GAGAAAATAATAAAGGTAAGTGTCTGGGAGGGTGAGAAATCAAATTCAGTGGGGTTTAAACTATATCTCATACAAGTGTCCCAAAGTTGTGCTTTTGGAGAAATTCACCTTGGATAGAGACATGGTCAAGTGA s panTro4.chrUn_GL393519 44411 697 + 413329 ctgggattacaggcatgagccactgcacctggcTGGTTTT---------------TTTTTTTCTATTTTCATTACTAAGACTAAACAATAGTTATGTGACTGAATACAGCTGATCA-TTTTACCAACTCCTTTCAGCAAATTCA--TTTTGTCATTTTAATTAAGTTCAAATTTAAGAAGTGAATAAATATAGATACTATAGCACATATATTTCCCAAAACATAATATA-ATAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----tgCGCATTTGGGAAATAAAAGAATATTATATTTTACTCAAACAACATCAAACATGCGGTCAGGTAAGTTTGATGAAGAAGGTAATATTTCAGCCTAAGAATGAGAATTCTGTAAGACAATATGTTACTTTATAGTATCAGTTATGTGACCCTTCCACACTGATATTTTGGGTGCAATTGCACCCTCTTTGCCATATACTCTTGGGAGAATAGAAGG---TTCTTCACATTTTTCCATTCATTGTAACTTCTCCTGTAGGACAGCCCACAGATACATTTCCTGGACTATATTAAGGAAACAAAAGCAAACAAATAT--GAGAAAATAATAAAGGTAAGTGTCTGGGAGGGTGAGAAATCAAATTCAGTGGGGTTTAAACTATATCTCATACAAGTGCCCCAAAGTTGTGCTTTTGGAGAAATTCACCTTGGATAGAGACATGGTCAAGTGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7104615 710 + 72422247 ctgggattacaggcgtgagccactgcaccgggctGTTTTTGTT--------TTTGTTTTTTTCTATTTTCATTACTAAGACCAAATAATAGTTATGTGACTGAATACAGTTGATCA-TTTTACCAACTCTTTTCAGCAAATTTATTTTTTGTCATTTTAATTAAGTATAAATTTAAGATGTGAATAAATATAGATACTATAGCACATATATTTCCCAAAACATAATATA-TTAtgtgtgtgtgtgtgcatgtgcgtgtgtgtgtgtgCGCGCGCACGCGCATTTGGGAAATAAAAGAGTATTATATTTTACTCAAACAACATCAAACATGCGGTCAGGTAAGTTTGATGAAGAAGGTAATATTTCAGCCTAAGAATGAAAATTCTGTAAGACAATATGTTACTTTATAGTATCAGTTATGTGACCCTTCCACACTGATATTTTGGGTGCAATTGCACCCTCTTTGCCATATACTCTTGGGAGAATAGAAGA---TTCTTCACACTTTTCCATTCATCGTAACTTCTCCTGTAGGACAGCCCACAAATACATTTCCTGGAATATATTGAGGAAAGAAAAACAAACAAATAT--GAGAAAATAAGAAAGATAAGTGTCTGGGAGGGTGAGAAATCAAATTTAGTGGGGTTTAAACTACATCCCATACAAGTACCCCAAAGTTGTGCTTTTGGAGAAATTCACCTTGGATAGAGACATGGTCAAGTGA i ponAbe2.chrUn C 0 I 4 s nomLeu3.chr5 77110726 701 - 143122389 ctgggattacaggcgtgagccactgcacctgacTGTTTTT---------------TTTTTTTCTATTTTCATTACTAAGACTAAATAATAGTTATGTGACTGAATACAGCTGATCA-TTTTACCAACTTTTTTCAGCAAATTTATTTTTTGTCATTTTAATTAAGTACAAATTTAAGAAGTGAATAAATATAGATACTATAGCACATATATTTCCCAAAGCATAATATATATTtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtg----tgtgCATTCAGGAAATAAAAGAGTATTATATTTTACTCAAATAACATCAAACATGTGGTCAGGTAAGTTTGATGAAGAAGGTAATATTTTAGCCTAAGAATGAGAATTCTGTAAGACAATGTGTCACTTTATAGTATCAGTTATGTGACCCTTCCATACTGATATTTTGGGTGCAACTGCACCCTCTTTGCCATATACTGTTGGGAGAATAGAAGG---TTCTTCACACGTTTCCATTCATCGTAACTTCTCCTGTAGGACAGCCCACAAATACATTTCCTGGATTATATTAAGGAAACAAAAACAAATGAATATA-GAGAAAATAATAAAGGTAAGTGTCTGGGAGGGTAAGAAATCAAATTCAGTGGGGTTTAAACTATATCTCACACAAGGACCCCAAAGTTGTGCTTTTGGAGAAATTCACCTTGGATAGAGACATGGTCAAGTGA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 37812276 696 - 90373283 ctgggattacaggtgtgagccattgcAGTCAGCTGttttttttttgttttgttttgttttttctattttCATTACTAAGACTAAATAATAGTTATGTGAATGAATACAGCTGATCA-TTTTACCAGCTCTTTTCAGCAAATTTATTTTTTGTCATTTTAATTAAGTATACATTTTAGAAGTG----AATATAGATACTATAGCACATATATTTCCCAAAACATAATATA-TTAtgtgtatgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtT----------------CATTTGGGAAATAAAAGAGTATTATATTTTACTCAAACAATATCAAACATGCAGTCAGGTAAGTTTGATGAAGAAGGTAATCTTTTAGCCCAAGAATGAGAATTCTGTAAGACAATGTGTTACTTTATAGTATCAGTTATATCACCATTCCATACTGATATTTTGGGTGCAGTTGCACCCTCTTGGCCCTATACTCTTGGGAGAATAGAAGG---TTCTTCACACTTTTCCATTCACCATCATTTCTCCTGTAGGACAGCCCATAAATATATTTCCTGGAATATATTAAGGAAACAGAAACAAACAAATATAGGGAAAAAAAATAAAG----GTGTCTGTGAGGGTGAGAAATCAAATTCAGTGGGGTTTAAACTATATCCCTTCCAAGTACCCCAAAGTTGTGGTTTTGGAGAAATTCACCTTGGAGAGAGACATGGTCAAGTGA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34678252 678 - 50472720 ctgggattacaggtatgagccactgcacctggcccttttt------------------ttttctgttttCATTACCAAGACTAAATAATAGTTATGTGACTGAATACAGTTGATCATTTTTACCAACTCTTTTCAGTGAATTACTTTTTTGTCATTTTAATTAAGTACAATTTTTAGAAGTAAATAAATATAAATCCAATAGCACATATATTTCCCAAAATATAATAAA-Atgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----------tTTGGGAAATAAAAGAGTACTGTAATTTACTC----AACATCAAACATACAGTCAGGTAAGTTTGATGAAGAAAATAATATTTTAGCCTAAGAATTAGAATTCTGTAAGACAATGTG-----TTATAGTATCAGTTATGTG----CTCCACACTGATATTTTGAGTGCAATTGTACCCTCTTTGCC-CATACTTTTGGGAGAATAGAAGGTTCTTCTTCACACTTTTCTATTTA---TAATTTCTCCTGTAGGACAATGCACAGGTAAGTTTCTCAGAATATATTAAAGAAACAAAAACAAACAAATATG-GAGAAAAAAATAAAGTTAAGTGCCTGGGAGTGTGAGAAATCAAATTCAGTGGGGTTTAAACTATATCCCGTGCAAATATCCCCAAGTTGTGCTTTTGAATAGATTCATCTTGGATAGAGAAGTGGTCAAGTGA i calJac3.chr21 C 0 C 0 a score=-1162.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 205433 10 + 478999 CCATGTCTCT- s panTro4.chrUn_GL393519 45108 10 + 413329 CCATGTCTCT- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77111427 9 - 143122389 -TATATTCCC- i nomLeu3.chr5 C 0 I 1 s chlSab2.chr2 37812972 4 - 90373283 -TACA------ i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34678930 10 - 50472720 -TATAGTCCCT i calJac3.chr21 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7105325 4 + 72422247 I a score=810483.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 205443 728 + 478999 TTACCTTTACCTTTTTT--AAAAAACAATACATAGCTGTATCCTTGGAAGAGAGGCAAGGAGTGCTGTAGGGTGACTATCTTTGATTTCTGTTGTGGTTCAGAGGAAGTGTAACTTTCTTAAAAGATACCTTGACTTTTGTCACATTTAGCTATTCGTTCCTTTTTATTTAGGAAAAAAAGGCTGAGCCTGCTGTGGCTTGGGCTCTTATTATCTTTTCTTGGGCTTCTTGGATCTCATAAATGATAACTCTACTTTTATTGTTGCCTTCTCCAAAGGAACCTGAATACCAGCATCACCTTCATTTACCCTAAAGCATGATTCTCTGCCTAAGAAAACCCCTATGGTTGACATTTACATTTACTTTATACCTCTCTTAATCTTT-TGAGGAATGCCTCTCTACCTATTCTGCATGGTAAAGTTCTAATTAATTACAACTATGAAACAGATATTTCCTTCTTTTCTTATGTTTCAGATATTGA---ATTACTTTATTATTGCCAAGCACAATCTGCTTTGCTAAATTATTCAGTATAAGCTTGCTTCTTCCA-TTAGACTTTGGAATTCCTGAGATAAGAAATTACGCTTTATTCTGAAAGTGTGCTTAAATCAATGGAAAGTTGGTTTGTCCAAACTGGATATAGAGGAATAGAGTTATTCTGTACACAGCCACTTTTAGTTGCAAGAGCAGCTAGAAATAGGAGTTATGCTACCTTTTC-AAAGACATGTCCTCA s panTro4.chrUn_GL393519 45118 728 + 413329 TTACCTTTACCTTTTTT--AAAAAACAATACATAGCTGTATCCTTGGAAGAGAGGCAAGGAGTGCTGTAGGGTGACTATCTTTGATTTCTGTTGTGGTTCAGAGGAAGTGTAACTTTCTTAAAAGATACCTTGACTTTTGTCACATTTAGCTATTCGTTCCTTTTTATTTAGGAAAAAAAGGCTGAGCCTGCTGTGGCTTGGGCTCTTATTATCTTTTCTTGGGCTTCTTGGATCTCATAAATGATAACTCTACTTTTATTGTTGCCTTCTCCAAAGGAACCTGAATACCAGCATCACCTTCATTTACCCTAAAGCATGATTCTCTGCCTAAGAAAACCCCTATGGTTGACATTTACATTTACTTTATACCTCTCTTAATCTTT-TGAGGAATGCCTCTCTACCTATTCTGCATGGTAAAGTTCTAATTAATTACAACTATGAAACAGATATTTCCTTCTTTTCTTATGTTTCATATATTGA---ATTACTTTATTATTGCCAAGCACAATCTGCTTTGCTAAATTATTCAATATAAGCTTGCTTCTTCCA-TTAGACTTTGGAATTCCTGAGATAAGAAATTACACTTTATTCTGAAAGTGTGCTTAAATCAATGGAAAGTTGGTTTGTCCAAACTGGATATAGAGGAATAGAGTTATTCTGTACACAGCCACCTTTAGTTGCAAGAGCGGCTAGAAATAGGAGTTATGCTACCTTTTC-AAAGACATGTCCTCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7105329 723 + 72422247 TTCCCTTTACCTTTTTT--AAAAAACCATACATAGCTGTATCCTTGGAAGAGAGGCAAGGAGTGCTGTAGAGTGACTGTCTTTGATTTCTGCTGTGGTTCAGAGGAAGTGTAACTTTCTTAAAAGATACCTTGACTTGTGTCACATTTAGCTATTCGTTCCTTTTTATTTAGG-AAAAAAGTCTGAACCTGCTGTGGCTCCAGCTCTTATTACTTTTTCTTGGGCTTCTTGGATCTCATAAATGATAACTCTACTTTTATTGTTGCCTTCTCCAAAGGAAACTGAATACCAGCATCACCTTCATTTACCCTAAAGCATGATTTTCTGCCTAAGAAAACCCCTATAGTTGACATTTATATTTACTTTATACCTCTCTTAATCTTT-TGAGGAATGCCTCTCTACCTATTCTGCATGGTAAAGTTCTGATTACTTACAACTATGAAACAGATATTTCCTTCTTTTTGTATGTTTTATATATTGA---ATTACTTTATTATTGCCAAGCACAATCTGCTTTGCTAAATTATTC---ATAAGCTTGCCTCTTCCA-TTAGACTTTGGAATTCCTGAGATAA-AAATTACATTTTATTCTGAAAGTGTGCTTAAATCAATGGAAAGATGGTTTGTCCAAACAGGATATAGAGGAATAGAGTTATTCTGTACACAGCCACCTTTAGTTGCAAGAGCGGCTAGAAATAGGAGTTATGCTACCTTTTT-AAAGACATGACCTCa i ponAbe2.chrUn I 4 C 0 s nomLeu3.chr5 77111437 716 - 143122389 ------TTA-CTTTTTA--ATAAAGCAATACATAGCTGTATCTTTGGAAGAGAGGCAAGGAGTGCAGTAGGGTGACTGTCTTTGATTTCTGTTGGGGTTCAGAGGAAGTGTAACTTTCTTAAAAGATACCTTGACTTTTGTCACAGTTAGCTATTTGTTCCCTTTTATTTAGG-AAAAAAGCCTGAGTCTGCTGTGGCCCGGGCTCTTATTACCTT---TTGGCCTTCTTGGATCTCATAAATGATAACTCTACTTTTATTGTTGCCTTCTCCAAAGGAACCTGAATACCAGAATCACCTTCATTTACGCTAAAGCATGATTCTCTGCCTAAGAAAACCCCTACAGTTGACATTTACATTTACTTTATACCTCTCTTAATCTTT-TGAGGAATGC----CTACCTATTCTGCATGGTAAAGTTCTAATTTATTACAACTATGAAACAGATATTTCCTTCTTTTCTTATGTTTTATATATTGAATTATTACTTTATTGTTGCCAAGCACAGTCTGCTTTGCTAAATTACTTAATATAAgcttgcctcttcca-ttagactttggaattcctgagataagaaattatgttttattcTGAAAGTGTGCTTAAATCAATGGAAAGATGGTTTGTCCAAACAGGATATAGAGGAATAGAGTTATTCTGTACACAGCCACCTTTAGTTGCAAGAGCGGCTAGAAATAGGAGTTATACTACCTTTTT-AAAGACATGACCTCA i nomLeu3.chr5 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 37812976 716 - 90373283 TTCCCTTTACCTTTT----AAAAAACAATACATAGCTGTATCCTTGGAAGAGAGGCAAGGAGTGCGGTAGGGTGACTGTTTTTGATTTCTGTTGGGGTTCAGAGGAAGTGTAACTTTCCTGAAAGATACCTTGACATTTGTCACATTTAGCTATTCATTTCTTTTTATTTAGG-AAAAGAGCCTGAGCCTGCTGTGGCTCGGGCTCTTAGTACCTTTTCTTGGGCTTCTTCGATCTCATGAATGATAACTCTACTTTTATTGTTGCCTTCTCCAAAGGAACCCGAATACCAGCATCACCTTCA-TTATCTTAAAGCATGATTCTCTGCCTAAGAAAACCGCTATA------ATTCACATTTACATTATACCTCTCTTAATCTTT-TGAGGAATGCCTCTCTACCTATTCTGCATGGTAAAGTTCTAATTTATTACAACTATGAAGCAGGTATTTCCTTCTTTCCTTATTTTTTATATGTTGG---ATTATTTTATTATTGCCAAGCACAGTCTGCTTTGCTAAATTATTTAATATAAGCTTGCCTCTTCCATTTGGAATCTGGAATTCCTCAGATAAGAAATTATGTTTCATTCTGAA--TGTGCTTAAATCAGTGGGAAGATGGTTTGTCCAAACATGATATAGAGGAATAGAGCTATTCTGTACAC-GCCGCCTTTAGTTGCAAGACCGGCTAGAAATAAGAGTTATACTACCTTTTT-ACAGACATGACCTCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 s calJac3.chr21 34678940 684 - 50472720 ------TTACCTTTTTTCCTACAAGCAATACATAGCCCTATCCTTGGAAGAGAGGCAGGGAGTACAGTAGGGTGACTACCTTCAATTTTTGTTGGGGTTCAGAGGAATTGTGACTTTCCTAAAAGATACCCTGGCTTTTGTCACATTTAGCTATTTGTTCTTTTGTATTTAGG-AAAAAAGCCTGAGCTTGCTGTGGCTTGGGCTCTTATCACCTATTCTTGGG---CTTGAATCTCATAAATGATAAGTCAGCTCTTAGTGTTGCCTTCTCCAAAGGAACCTAAATACCAGCATCACCTTCA-TTATCCTAAAGCATGATTCTCTGCTTAAGAAAATCCCTATCGTTTACATTTACACCTACTGTAGACCTCTCTTAATCTTTCTGAGGAGTGCGTCTCTTCCTACACTGCATGGCAAAGTTCCG-TTTATTACAACTATGAAAGAG--------------------------------GG---ATTACTTTATTATTGCCAATCACAATCAGCTTTGCTAAATTATTCAATATAAGCTTGCCTCTTCTA-TTTGACTTTGGAATTCCTGAGATAAGAAATTATGTTTCATTCTGAAGGTGTGCTTAAATCAGTGGAAAGATGGTTTG----AACAGGATATAGTGGAACAGAGTTATTCTGTACACAGCCACCTGTAGTTGCACAAGTGGCTAGAAATGGGAGTTATACTACCTTTTTAAAAGACATGACCTCA i calJac3.chr21 C 0 N 0 a score=160790.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 206171 133 + 478999 gccaggtgcagtggctagtgcctgtaatcccagcaatttgggaggctgaggcgggcggat--catgaggtcaggagatc----gagaccgtcctggcta--acacggtgaaacccaa-ctctactaaaaataaaa-------ataaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 45846 133 + 413329 gccaggtgcagtggctagtgcctgtaatcccagcaatttgggaggctgaggcgggcggat--catgaggtcaggagatc----gagaccatcctggcta--acacggtgaaacccaa-ctctactaaaaataaaa-------ataaaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7106052 130 + 72422247 gccgggcgcggtggctagtgcctgtaatcccagcaatttgggaggctgaggcagtcggat--cacgaggtcaggagatc----gagaccatcctggctaacacacggtgaaacccaa-ctctactaaaaataaaa-------at----- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77112153 128 - 143122389 gccaggcgcggtggctagtgcctgtaatcccaacaatttgggaggctgagatgggcggat--cacgaggtcaggaactt----gagaccatcctggcta--acacagtgaaacccga-ctctactaaaaataaaa-------at----- i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr7 4853298 133 + 171882078 gctgggcgtggtggctcacacctgtaatcccaacactttgggaggctggggtgggaggattccttgaatccaggagttcccttgaacccagcctgggca--acatagtgagacctggtctctaataaaaattcaa-------------- i macFas5.chr7 N 0 C 0 s papAnu2.chr7 2653947 133 + 162156779 gccaggcacggtggctcacacctgtaatcccaacactttgggaggctgaggtgggaggattccttgaatccaggagttcccttgaacccagcctgggca--acatagtgagacctggtctctaataaaaattcaa-------------- i papAnu2.chr7 N 0 C 0 s chlSab2.chr2 37813692 133 - 90373283 gccaggtgcaatggctcatgcctgtaatcccagcaatttgggaggccgaggtgggcagat--caagaggtcaggagatc----gagaccatcctggcta--tcacggtgaaacccga-ctctactaaaaatacaaaaaaaaa------- i chlSab2.chr2 C 0 N 0 a score=1473869.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 206304 1390 + 478999 taaaaataaaataaaataaaataaaataaattagctgggcatggtggtgagtgcctgtagtcccagccactggggaggctgagg-gggagaatggcttgaactcagcaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcaccactgcactccagcctgggtgacagagcaagactctttctcaaaaataaataa-----------ataaat--aaataaacaaaataaaggtaggctatactaagttaaagatgctggctgt-aaccctagagccatcacaaa-----ataaaataa-ggtaaaatacagatacagtaaataagccactagtgaagacaaaatagaTACAATGAAATTAGAAAAAAA-TTAAAATCCTTTAAAAAGCCCCATTTGCCTCGATTTTCCTAATTACACAAAGGAGGCAAAGTGTGAAAAAGGATAGATCACGTTCCTCTAAGGACCCATGTCAGGTATCTGTGGAATGCAGGCGGTGCAGGAGGGTGGGAATGGGTGGGTGCCCAGCGTTGCTAAAGCTATGGAGTGTCTTCCCGTT---TTTAAAGAAATCCAGAAGTGCAGATCTATTCATTCAACCATTCATTGATGTAAAATCTGGTTTCtaaggtgttcagtttgatgactaatatatgtatactttgccatcaaaatcaaactcattcacattcccatcacctcgcagagctgccctctttcatgtgtgtggtgagaaca-ataagatctacctcctcagcaaatgtcaagtatacatcgcagtgttgttagctatattcacaatgttgaacagtggatctccagaacttattcatcttgcataactgaaattttataccctttgaccaacatctgcccatctctccttcccccagcccctggcaaccactctatacccagcaatcccatttctttggggatatagccaaaggaaataaaatcaatatctggaaaacatacctgcactgttatgtccatttgggcatttttaacaatagccaagtaatagaaacaacctaaatgtctgtcaatggataaatggataaagaa--------------------------atgaaaaaaaatacacacacacacacacacacacacacaca------------------------------------------------gtgggatattatttagcatt----aatgaataaaaaaatcctgccatttttgacagcatggatggacttggagaacatgcttggtgaaataagccaagcacagaaagacgaataacacattgtctcacttataGGATGACACTGCATTCACGTTTCAGCCACCTCTGCCACACCCACCCATGCAAACACACCCACCCATCTCAGTTCCTGCCCCTGACTGGGGGACAGGGTGGGCGCTCTCTG-GCACATGTTCCACTCAT------GCTTCTCCACCTCCAGCTATTTTAGGCTCTGACACTGAAAATGAAATTCTTACCAAG s panTro4.chrUn_GL393519 45979 1366 + 413329 --aaaataaaataaaataaaataaaataaattagctgggcatggtggtgagtgcctgtagtcccagctactggggaggctgagg-gggagaatggcttgaactcagcaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcaccactgcactccagcctgggtgacagagcaagactctttctcaaaaataaataa-----------ataaat--aaataaacaaaAtaaaggtaggctatactaagttaaagatgctggctgt-aaccctagagccatcacaaa-----ataaaataa-ggtaaaatacagatacagtaaataagccactagtgaagacaaaatagaTACAATGAAATTAGAAAAAAA-TTAAAATCCTTTAAAAAGCCCCATTTGCCTCGATTTTCCTAATTACACAAAGGAGGCAAAGTGTGAAAAAGGATAGATCACGTTCCTCTAAGGACCCATGTCAGGTATCTGTGGAATGCAGGCGGTGCAGGAGGGTGGGAATGGGTGGGTGCCCAGCATTGCTAAAGCTATGGAGTGTCTTCCCATT---TTTAAAGAAATCCAGAAGTGCAGATCTATTCATTCAACCATTCATTGATGTAAAATCTGGTTTCtaaggtgttcagtttgatgactaatatatgtatactttgccatcaaaatcaaactcattcacattcccatcacctcgcagagctgctctctttcatgtgtgtggtgagaaca-ataagatctacctcctcagcaaatgtcaagtatacatcgcagtgttgttagctatattcacaatgttgaacagtagatctccagaacttattcatcttgcataactgaaattttataccctttgaccaacatctgcccatctctccttcccccagcccccggcaaccactctatacccagcaatcccatttctttggggatatagccaaaggaaataaaatcaatatctggaaaagatacctgcactgttatgtccatttgggcatttttaacaatagccaag--atag--------------tctgtcaatggataaatggataaagaa--------------------------atgaaaaaaa-----tacacacacacacacacacacacaca------------------------------------------------gtgggatattatttagcatt----aatgaataaaaaaa-cctgccatttttgacagcatggatggacttggagaacatgcttggtgaaataagccaagcacagaaagacgaataacacatggtctcacttataGGATGACACTGCATTCACGTTTCAGCCACCTCTGCCACACCCACCCATGCAAACACACCCACCCATCTCAGTTCCTGCCCCTGACTGGGGGACAGGGTGGGCGCTCTCTG-GCACGTGTTCCACTCAT------GCTTCTCCACCTCCAGCTATTTTAGGCTCTGACACTGAAAATGAAATTCTTACCAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7106182 1388 + 72422247 --aaaataaaataaaataaaataaaataaaatagctgggcgtggtggtgagcgtctgtagtcacagctactggggaggctgagg-gggagaatggcttgaactcagtaggcggagcttgcagtgagccgagatctcaccactgcactccagcctgggtgacagagcaagactctgtctcaaaaataaataa-----------ataaat--aaacaaacaaaAtaaaggtaggctatactaagttaaagatgctggctat-aaccctagaaccaacacaaa-----ataaaataa-ggtaaaatacagatacagtaaataagccactagtgaagataaaatagaTACAATGAAATTAGAAAAAAA-TTAAAATCCTTTAAAAAGCCCCATTTGCCTCTATTTTCCTAATTACCCAAAGGAGGCGAAGTGTGAAAAAGGATAGATCATGTTCCTCTAAGGTCCCATGTCAGCTATCTGTGGAATGCAGGCGGTGAAGGAGAGTGGGAATGGGTGGGTGCCCAGCGTTGCTAAAGCTGTGGGGTGTCTTCTCGTT---TTTAAAGAAATCCAGAAGTGCAGATCTATTCATTCATTCATTCATTGATGTAAAATCTTGTTtctaaggtgttcagtttgatgactaatatatgtatactttaccatcaaaatcaaactcactcacattcccatcacctcgcagaactgccctctttcatgtgtgtggtgag---a-ataagatccaccttcttagcaaatgtcaagtatacatcgcagtgttgttagctatattcacaatgttgaacagtagatctccagaacttattcatcttgcataactgaaattttataccctttgaccaacatctacccatctcaccttctcccggcccctggcaaccactctatatccagcaatcccatttctttggggacacagccaaaggaaataaaatcaacatctggaaaagatatctgcactgttatgtccatttgggcatttttaa-aatagccaagtaatagaaacaacataaatgtctgtcaatggataaatggataaagaa--------------------------atgaatacacacacacacacacacacacgcacacacacaca------------------------------------------------gtgggatattatctagcattaatgaatgaataaaaaaatcctgccatttttgacagcatggacggacttggagaacatgcttggtgaaataagccaagcacagaaagacgaatagcacatggtctcacttataGGACGACACTGCGCTCATGTTTCAGCCACCTCTGCCACACTCACCCATGCAAACACACCCACCCGTCTCAGTTCCTGCCCCTGACTGGGGGACAGGGTGGGCGCTCTCTG-GCACATGTTCCACTCAT------GCTTCCCTACCTCCAGCTATTTTTGGCTCTGACACTGAAAATGAAATTCTTACCAAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77112281 1373 - 143122389 ------------aaaataaaataaaataaattagctgggcatggtgatgggtgcctgcagtcccagctactggggaggctgagg-gggagaatggcttgaattcaggaggcagagcttgcagtgagcccagatcacaccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactccatctcaaaaacaaacaa-----------acaaat-aaaataaacaaaAtaaaggtaggctatactaagttaaaaatgccagctgtaaaccctagagccatcacaaa-----ataaaataa-ggtaaaatagagatacagtaaataagccactagtgaagaaaaaatagaTACAATGAAATCAGAAAAAAT-TTAACATCATTTAAAAGGTCCCATGTGCCTCTATTTTCCTAATAACACAAAGGAGGCAAAGTGTGAAAAAGGATAGATCATGTTCCTCTAAGGACCCATGTCAGGTATCTGTGGAATGCAGGCAGTGCAGGAGGGTGGGAATGGGTGGGTGCCCAGTGTTGCTGAAGCTGTGGGGTGTCTTCCTGTT---TTTAAAGAAATCCAGAAGTGCAGATCTATTGATTCATCCATTCACTGATATAAAATCTGGTTTCtaaggtgttcagtttgatgactaatatatgtgtactttaccaccacaatcaaactcactcacattcccatcacctctcagagctgccctctttcatgtgtgtagtgagaaca-ataagatctaccttcttagcaaatgtcaagtatacatcacagtgttgttagctatattcacaatgttgaacagtagatctccagaacttattcatcttgcgtaactgaaattttgtaccctttgaccaacatctgcccatctctccttcccccagaccctggcaaccactctatacccatcaatcccatttc--tgggggtatagccaaaggaaataaaatcaatatctggaaaggatacctgcactgttatgtccatttgggcattttttacaatagccaagtaatagaaacaacctaaatgtctgtcaatggataaatggataaataa--------------------------atgaatata------tatatgtatatatatagacacacaca------------------------------------------------gtgggatattatttagcatt----aatgaataaaaaattcctgccatttttgacaatatggacggacttggagaacatgcttggtgaaacaagccaagcacagaaagatgaataacacatggtctcacttataGGATGACACTGCGTTCATGTTTCAGCCACCTCTGCCACACCCACCCATGCAAACACACCCACCCGTCTCAGTTCCTGCCCCTGACTGGGGGACAGGGTGGGCGCTCTCAGAGCACATGTTCCACTCAT------GCTTCCCCACCTCCGGCTATTTTAGGCTCTCGCACTGAAAATGAAATTCTTACCAAG i nomLeu3.chr5 C 0 I 424 s macFas5.chr7 4853431 1443 + 171882078 ---------------------------aaattagctgggtgtggtggtgcatgcccatagatccaactagttgagaggttaaggtgggaggatcacttgaacccaggagttcgaggttgcagtgagctgagatttcaccactgcattccaatctgggcaagagagcaagactctgtctcaaaaaaaaaaaa-----------aaaaagaaaaaaaagaaaaaaaaagataggttatgctaagttaaagatgcctgctgtaaaccctagggccatcacaaaataaaattaaataatggcataatagggata---taaatacaacactaatgaagataaaatagatacaatgaaattagaaaaaaatttaGTATCTTTTAAAAAGCCCCATTTGCCTCTATTTTCCTAGTTACACAAAGGAGGCAAAGTGTGAAAAAGAATAGACCATGTTCTTCTAAGGACCTATGTCAGGTGTCAGTAGAATGGAGGTGATGCAGGAGGGTGGGAA----TGGATGCCCAATGTTGCTAAAGCTGTGGGGTGTCTTCTCTTTTCATTTTTTAAAATCCAGAAATGTAGATATGTTCATTCATCCATTCACTGATGTAAAACCTGGTTtctgaggtgttcagcttgctgactgatctatgtatacgtcaccatcacaatcacactcactcacatttccatcacctcgcagagctgccctcttttgtgtgtgtgatgagaacacatgagatctaccctcttagcatgtgtcaagtatacatcgcagtgttgttagctatagtcacagtgttgtacagtggatctccagaacttactcatcttgcataactgaaattttgtatcctttgaccaacatctccccgtctctccttctcccagcccctggcaaccactatatacccagtaatcccctttc--tggggatatagtcaaaggaaataaaatcaatatctgaaacaggtatctgaactgtcatgttcattttggcattttttacaatagccagataatgg-aacaatctaaatgtctgccaatggataaatgaataaagaaactgtgacatatacacacaCatatatatatatatatgtatatatacacacacacatatatacacacacacgcatacacacacacGTATAGGTATatgtatatacatacatatatggcagaatattatttagccct--------aacaaggaaatcctgccatttttgaccacatggatgaacttggagaacatgcttggtgaaataagccaagcacagaaagacaaatagcacatgatctcgcttatacgACGGCACTGTGTTCATGTCTCAGCCACATCTACCACATCCACCCATGCAAACACAGCCA-CTGTCTCAATTCCCGCCCCTGACTGGGGTACA-GGTGGGTGCTCTGTGAACACATGCTCTACTCCTGGCCCAGCTTCCTCATCTGCAGCTATTTCAGGCTGTCACACTGGAAATGAAATTCTTATCAAG i macFas5.chr7 C 0 I 421 s papAnu2.chr7 2654080 1430 + 162156779 ---------------------------aaattagctgggtgtggtggtgcatgcccatagaTCCAACTAGTTGaaaggttaaggtgggaggatcacttgaacccaggagtttgaggttgcagtgagctgagatttcaccactgcgtTCCaatctgggcaagagagcaagactctgtttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaaaagataggttaTGATAAGTTAAACATGCCTGCTGTAAAACCTAGAGACATC----------ATGAAATAATGGCaaaatagggata---taaataaaacactaatgaagataaaatagatacaatgaaattagaaaaaaatttagtatcttttaaaaagccCCATTTGCCTCTATTTTCCTAGTTACACAAAGGAGGCAAAGTGTGAAAAAGAATAGACCATGTTCTTCTAAGAACCTATGTCAGGTGTCAGTAGAATGGAGGTGATGCAGGAGGGTGGGAA----TGGATGCCCAATGTTGCTAAAGCTGTGGGgtgtcttctcttttcattttttaaaatccagaaatGTAGAtctgttcattcatccattcccTGATGTAAAACCTGGTTTCTGAGGTGTTCAGCTTGCTGACTGATCTATGTATACGTCACCATCACAATCACACTCACTCACATTTCCATCACCTCGCAGAGCTGccctcttttgtgtgtgtgatgagaacacatgagatctaccctcttagcatGTGTCAAGTGTACATCGCAGTGTTGTTAGCTATAGTCACAGTGTTGTACAGTggatctccagaacttactcatcttgcataactgaaattttgtatcctttgaccaacatatCCCCGTGTctccttctcccagcccctggcaaccactatatACCCAGTAATCCCCTTTC--TGGGGATAtagtaaaaggaaataaaatcaatatctGAAACAGGTATCTGAACTGTCATGTTCATTTTGGCATTTTTTACAATAGCCAGATAATGG-AACAATCTAAATGTCTGccaatggataaatgaataaagaaactgtgac------------------atatatatatgtatatacacacacacacacatatacacacacacgcatacacacacacgtataggtatatgtatatacatacatatatggcagaatattatttagccct----aagaaagaaggaaatcctgccatttttgaccacatggatgaacctggagaacatgcttggtgaaataagccaagcacagaaagacaaatagcacaTGATCTCGCTTATACGACGGCACTGTGTTCATGTCTCAGCCACATCTACCACATCCACCCATGCAAACACAGCCA-CTGTCTCAATTCCCGCCCCTGACTGGGGTACA-GGTGGGTGCTCTGTGAACATGTGTTCTACTCCTGgcccagcttcctcatctgcagcTATTTCAGGCTGTCACACTGGAAATGAAATTCTTATCAAG i papAnu2.chr7 C 0 I 421 a score=1365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 207694 1 + 478999 A s panTro4.chrUn_GL393519 47345 1 + 413329 A i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7107570 1 + 72422247 A i ponAbe2.chrUn C 0 I 421 s nomLeu3.chr5 77114078 1 - 143122389 A i nomLeu3.chr5 I 424 C 0 s macFas5.chr7 4855295 1 + 171882078 A i macFas5.chr7 I 421 C 0 s papAnu2.chr7 2655931 1 + 162156779 A i papAnu2.chr7 I 421 C 0 a score=1097.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 207695 2 + 478999 TG s panTro4.chrUn_GL393519 47346 2 + 413329 TG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr5 77114079 2 - 143122389 TA i nomLeu3.chr5 C 0 C 0 s macFas5.chr7 4855296 2 + 171882078 TA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 2655932 2 + 162156779 TA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7107571 421 + 72422247 I a score=1258487.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 207697 1080 + 478999 ATATGTGTTGTGTTGACATAAAACTGATAGAAAGTGTACCAAAAAACATGGAAGTTTTAAACATAATCCACCAAAAGAACA----TACTCACAGTCGACGTTTCTTTCATTATTAAGAATGAATGTCCATAACCCTCACTAAGACAAAAGTCATCCC--ATTTGTCTACATTTTTTTT-CTTTGCAAACACACACTGAATGACTTTGTGTGACAAGCTGTGAAGTTTT------ACCAATTCTTCAAACTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTAATCCTGAGAGGCGAGCAGCTGTCGCTGGTAATTCTAAGC-CTAGAATTCCACCACCTAATAGGTGAAAATTATAGTAGGCTGATCATAAAACCATGTTGTTAACTTTTTAAAATTTAATGACTACCAAGGAATTTCACCTTAGTGATACATCTTTTGAGAGATTAGAAAATGAAGAAATGCACGTGTTCAATGATCCATTTTAGAATTTAAAAAGTCTTTCAAATGAGCAACTT-----ATTCATATATTGTGAAGAACCCCTGGAAACAGTTATTTAATAATGTGGCTAAACGCGTATTCAGAGTAATGCTTCCTGTATATTTGCACATTTA--TACACTTATGTCCCGCTCCTGGAATAGACTTACCAGTT-TCCTTTTCAGAAAATTTCAGAATTTCTGGAATGTGCCGAAGTACTAGTGGGTAACTTAGATTTGGAATACACTGTATTAGGTGTAACTGGAAAACTGAGAGGCTTCCTACACTGGAAGGTCAAAGATCTTTCCTGGAGGAGAGTTAAGAATTTGCCTTTTCTTACCATGACTCTGTTAAAAGAGAATATAAACAATGCAGTTTCACAAAAGGAAGGGGACAGTGGTGTAAATAAACCTCCCCATCATGTTCTG-GTGGCTTTCCTGTAAGTCTTGAACGTTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGGCCCCCACCTCCTGAGGAAGCAAGACCCCGAAACCCCGAGACGATGGGCTGTGCTGCTTTGGCCCCATCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGGCCCTGCTGCCACCCAGCTGTCATTAACGCCACCCTCACCTCCCAGGAACTGCATCACT s panTro4.chrUn_GL393519 47348 1079 + 413329 ATATGTGTTGTGTTGACATAAAACTGATAGAAAGTGTACCAAAAAACATGGAAGTTTTAAACATAATCCACCAAAAGAACA----TACTCACAGTCGACGTTTCTTTCATTATTAAGAATGAATGTCCATAACCCTCACTAAGACAAAAGTCATCCC--ATTTGTCTACATTTTTTTTTCTTTGCAAACACACACTGAATGACT--GTGTGACAAGCTGTGAAGTTTT------ACCAATTCTTCAAACTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTAATCCTGAGAGACGAGCAGCTGTCGCTGGTAATTCTAAGC-CTAGAATTCCACCACCTAATAGGTGAAAATTATAGTAGGCTGATCATAAAACCATGTTGTTAACTTTTTAAAATTTAATGACTACCAAGGAATTTCACCTTAGTGATACATCTTTTGAGAGATTAGAAAATGAAGAAATGCACGTGTTCAATGATCCATTTTAGAATTTAAAAAGTCTTTCAAATGAGCATCTT-----ATTCATATATTGTGAAGAACCACTGGAAACAGTTATTTAATAATGTGGCTAAACGCGTATTCAGAGTAATGCTTCCTGTATATTTGCACATTTA--TACACTTATGTCCTGCTCCTGGAATAGACTTACCAGTT-TCCTTTTCAGAAAATTTCAGAATTTCTGGAATGTGCCGAAGTACTAGTGGGTAACTTAGATTTGGAATACACTGTATTAAGTGTAACTGGAAAACTGAGAGGCTTCCTACACTGGAAGGTCAAAGATCTTTCCTGGAGGAGAGTTAAGAATTTGCCTTTTCTTACCATGACTCTGTTAAAAGAGAATATAAACAATGCAGTTTCACAAAAGGAAGGGGACAGTGGTGTAAATAAACCTCCCCATCATGTTCTG-GTGGCTTTCCTGTAAGTCTTGAACGTTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGGCCCCCACCTCCTGAGGAAGCAAGACCCCGAAACCCCGAGACGATGGGCTGTGCTGCTTTGGCCCCATCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGGCCCTGCTGCCACCCAGCTGTCATTAACGCCACCCTCACCTCCCAGGAACTGCATCACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7107992 1080 + 72422247 ATATGTGTTGTGTTGACATAAAACTGATAGAAAGTGTGCCAAAAAACACAGAAGTTTTAAACATAATCCACCAAAAGAACG----TATTCACAGTCGACATTTCTTTCATTATTAAGAATCAACGTCCATAACCCTCGCTAAGACAAAAGTCATCCC--GTTTGTCTACATTTTTTTT-CTTTGCAAACACACACTGAATGACTTTGTGTGACATGCTGTGAAGTTTT------ACCAATTCTTCAAGCTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTAATCCTGAGAGAAGAGCAGCTGTCGCTGGTAATTGTAAGT-CTAGAATTCCACCACCTAATACGTGAAAATTATAGTAGACTGATCATAAAACCATGTTGTTAACTTTTTAAAATTTAATGACTACCAAGGAATTTCATCTTAGTGATACATCTTTTGAGAAATTAGAAAATGAAGAAATGCACGTGTTCAATGACCCATTTTAGAATTTAAAAAGTCTTTCAAATGAGCATCTT-----ATTCATATATTGTGAAGAACCACTGGAAACAGTTATTTAATAATGTGGCTAAGCACGTATTCAGAGCAATGCTTCCTGTATATTTGCACATTTG--TATACTTATGTCCTGCTCCTGGAATAGATTTACCAGTT-TCCTTTTTAGAAAATTTCAGAATTTCTGGAATGTGCTGAAGTACTAGTGGGTAACTTAGATTTGGAATACAGTGTATTAGGTGTAACTGGAAAACTGAGAGGCTTCCTACACTGGAAGGTCAAAGATCTTTCCTGGAGGGGAGTTAAGAATTTGCCTTTACTTACCATTATTCTGTTAAAAGAGAATATAAACAATGCAGTTTCACAAAAGGAAGGGGACAGTGGTGTAAATAAACCTCCCCGTCATGTTCTC-CTGCCTTTCCTTTAAGTCTTGAACGCTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGGCCCCCACCTCCTGACGAAGCAAGACCCCGAAACCCCGAGACGATGGGCTGTGCTGCTTTGGCCCCATCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGGCCCTGCTGCCACCCAGTTGTCATTAACGCCACCCTCACCTCCCAGGAACTGCATCATT i ponAbe2.chrUn I 421 C 0 s nomLeu3.chr5 77114081 1064 - 143122389 ATACGTGTTGTGTTGACATAAAACTGATAGAAAGTGTACCAAAAAA-ATGGAAGTTTTAAACATAATCCACCACAAGTACA----TACTGACAGTGGACATTTCTTTCATTATTAAGAATTAACGTCCATAACCCTCACTAAGACAAAAGTCATCCC--GTTTGTCTACATTTTTTT--CTTTGCAAACACACACTGAATGACTTTGTGTGACAAGCTGTGAAGTTTT------ACCAAATCTTCAAACTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTCATCCTGAGAGAAGAGCAGCTGTCGCTGGTAATTCTAAGC-CTAGAATTCCACCACCTAATAGGTGAAAATTATAGTAGACTGATCATAAAACCATGTTGTTAACTTTTTAAAATTTAATGACTACCAAGGAATTTCACCTTAGTGATACATCTTTTGAGAAATTAGAAAATGAAGAAATGCACGTGTTCAATGATCCATTTTAGAATTTAAAAAGTCTTTCAAATGAGCATCTT-----ATTCATATATTGTGAAGAACCACAGGAAACAGTTATTTAATAATGTGGCTAAACACGTATTCAGAGTAATGCTTCCTGTATATTTGCACATTTA--TATACTTATGTCCTGCTCCTGGAATAGATTTACCAGTT-TCCTTTTCAGAAAATTTCAGAATTTCTGGAATGTGCCAAAGTACTAGTAGGTAACTTAGATTTGGAATACACTGTATTAGGTGTAACTGGAAAACTGAGAGGCTTCCTACACTGGAAAGTCAAAGATCTTTCTTGGAGGAGAGTTGAGAATTTGCCTTTTCGTACCATTACTCTGTTAAAAGAGAATATAAACAATTCAGTTTCACAAAAGGAAGGGGACAGTGGTGTAAATAAACCTCCCCATCATGTTCCC-GTGGCTTTCCTATAAGTCTTGAACGTTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGGCCCCCACCTCCTGAGGAAGCAAGACTCCGAAACCCCGAGAT--------------CTTTGGCCCCATCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGGCCCTGCTGCCACGCAGTTGTCATTAACACCACCCTCACCTCCCAGGAACTGCTCCGCT i nomLeu3.chr5 C 0 N 0 s macFas5.chr7 4855298 1073 + 171882078 ATATGTGTTGTGTGGACATAAAGCTGATAGAAAGTGTACCAAAAAA-ATGGAAGTTTTAAAGATAATCCATCAAAAGAACATATTTACTTACAGCTGACATTTCTTTTATTGTTGAGAATTAATGTCTATAACCCTCACTAATACAAAACTCATCCCTTGTTTATATACATTTAT----TTTTGCAAACTCACACTGAACGACTTTGTGTGACAAACTGTGAAGTTTTAAATTGACCAATTCTTCCAACTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTAATCCTGAGAGAAGAGCAGCTGTCGCTGGTA---TTAGGTGTTAGAATTCCAACACCTAATAGGTGAAAATTATATTAGGCTGATCATAAAACCATGTTGTTAACTTTCTAAAATTTAATGTCTACCAAGGAATTTCACCCTAGTGGTACATCTTTTGAGAAATTAGAAAACGAAGAAATGCATGCGTTCAATGGTCCATTTCAGCATTAGAAAA----TTCAAATTAGCATCTTATTTCATTCATATTTCCTGAAGAACCACTGGAAACAGTTATTTAATAGTGTGGCTAAATGTATAGTCAGAGAAACACTTCCTGTATATTTGCACATTTATGTATATTTATGTCCTATTCCTGGAATAGATTTACAAGTTCTGTTTTTCAGAAAATTTCAGAGTTTCTGGAATGTGCAGAAGTATTAGTAGGTAACTTAGATTTGGAATACACTGTATTAGAGATAATTGGAAAAATGAAAGGCTTCCTACACTGGAAGGTCAAAGATCTTTCCCGGAGGGGAGCTAAGAATTTGCCTTTACTTACCATTATTCTGTTAAAAGAGACCATGAACAACGCAGTTTCACAAAAGGAATGGGAGAATGGTGTAAGTAAACCTCCCCATCACGTTCTCAGTGGCTTTCCTTTAAGTCTTGAACGTTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGTCCCCCAACTCCTGAGGAAGCAAGAGCCCGCAACCCCTGGACGATGCGC------------------TCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGTCCCTGCTGCCCCGCAGTTGTTATTAATGCCACCCTCACCTCCCAGGGACTGCACCACT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 2655934 1073 + 162156779 ATATGTGTTGTGTGGACATAAAGCTGATAGAAAGTGCACCaaaaaa-aTGGAAGTTTTAAACATAATCCATCAAAAGAACATATTTACTTACAGCTGacatttcttttattgttaaGAATTAATGTCTATAACCCTCACTAATACAAAAGTCATCCCttgtttatatacatttat----gtttgCAAACTCACACTGAACGACTTTGTGTGACAAACTGTGAAGTTTTAAATTGACCAATTCTTCCAACTCTTTGATTTGCATTATGCTGTTTAATCCTGAGAGAAGAGCAGCTGTCGCTGGTA---TTAGGTGTTAGAATTCCAACACCTAATAGGTGAAAATTATATTAGGCTGATCATAAAACCATGTTGttaactttctaaaatttaatgTCTACCAAGGAATTTCACCCTAGTGGTACATCTTTTGAGAAATTAGAAAACGAAGAAATGCATACGTTCAATGGTCCATTTCAGCATTAGAAAA----TTCAAATTAGCATCTTATTTCATTCATATTTCCTGAAGAACCACTGGAAACAGTTATTTAATAGCGTGGCTAAATGTATAGTCAGAGAAACACTTCCTGTATATTTGcacatttatgtatatttatgtccTATTCCTGGAATAGATTTACAAgttctgtttttcagaaaatttcagAGTTTCTGGAATGTGCAGAAGTATTAGCAGGTAACTTAGATTTGGAATACACTGTATTAGAGATAATTGGAAAAATGAAAGGCTTCCTACACTGGAAGGTCAAAGATCTTTCCCGGAGGGGAGCTAAGAATTTGCCTTTACTTACCATTATTCTGTTAAAAGAGACCATGAACAACGCAGTTTCACAAAAGGAATGGGAGAATGGTGTAAGTAAACCTCCCCATCACGTTCTCAGTGGCTTTCCTTTAAGTCTTGAACGTTTTCCACTGGGTGTTACAGTCGAGAGTCCCCCAACTCCTGAGGAAACAAGAGCCCGCAACCCCTGGACGATGCGC------------------TCTTGCTTGTGTTGTTTGAAGGGGCCCTGCTGCCCCGCAGTTGTTATTAATGCCACCCTCACCTCCCAGGGACTGCACCACT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 a score=1829272.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 208777 2472 + 478999 CGGACGGACAAGACACCTATGTAATGACCATAGTAAGACCCCATGTGCGTGGCTAATGAGGCAGTG-CCCAACGTGGCGTGGAAGCCCTGCTAGGGAAATCCCGCCCTGCCACCCCAGATGCGCCACCCCAGACCTGCTCTCGGACCTGCGGCCCCTGGCCCCTGGCCCTTTCCCGTTGTCACCGAGGCTTCTTGCTAAGAAATGGAACTTCAGAAAACCCCCAAATATATACTGCATTAGGTAAGGGTTTCATTCTAATGGAGTCCCATGTGACCCTGGCTTTCCGTCCGGCAGCAATGCACTCCTGTCTATGAATGAGATGAAAAGAGTGCCCACAACAAGCCAATTTCTTTCAGGAGCGACTAAGACATGCGCATGTCCGGGGGTGCCTCAGAGCACCCGGGAGGGACCCAGGCCTGGGCAGGGAGAG---GGGGCCGGCCCTAGGGGAGCAAAGCTCTTGAAA--CTGGCCTCTGTTGCCGGGCTCCTGACCCTGCCCTCCCATCCCTGCACTACAAGAGGACAGCGGCGACTACAGGAGGCGCCGAAGACGCTGCTGAAGGCCCTAAAGAAACTTCAGCAGAACCGGAA--CTCCCCTTGCAGGTCCAGCCGCGGGCCCTGCGCCCTCCCGCTCAGCCGAGCGGGGCCGAGGGCGCGTTTGCTGAGTGTCTGGTGGCCTCTACCCAAGCGCCTCTTCAGAGGGCTGTTCCTGCGGCCCAGAGACTGCTTGAGGCGCTCGGG-GAAGGAAAAGCAGGCGCTGGTGCGCC----------GGGGGCTCTGCG-------------------GGGGACGGCGCGGAGCTGA-CTGAAGGGCCGCTGCGGTAGCGCAGGGCGCAGGAGCTGCTCCGCCCCGGAGCGCCGGGAAGGTTGGCGCTGGCA------------------------GCCTCCAGCCCCTGCCAGCCGGGCGAGAGCAGGC---GGAGAAGGAGGATGCACCGTCACCTATGGCTCGCCTCCACCGGCCGGCACGCAAGGTGAGCTCTGCGTGCGCCCGG-CGGGACAGTGAGGTAAAAGGGCGGGAGCGCGGGAGAGGACTCGTGGCCCCGGCTCAGCCCGCACCCC-TCTCCTCTGGGATCCCGAATCGCGGGCTGCGTGGTGGGCCAGGAGAGGTGCAGAGCAGGCGGGGCGCCGCGGCCAGTCCGGAGCGCAAACTTT-CCCTGGCGACTGCAGCGCTGAATCTGGGCGCAGGAGAGCGCGGGGTCCGGGCTGCTCAGCCCTGCCCGGCGGGGTACCTGGGCGCAGCGCACATGGGTCAGCCGGTAGGAATTGCGGGATGGGGGACACCCAGCGCCACCGTCG--GGAGCCGTAGGAGCGAGATGGACCACCTGGAAGGCCCGGGTCAGCCCTTGGGCTCTGAGGCACGCGGCGTCCCGGCGCTGGTGGCAGGGTGGACTCGGATCCCGCGAGGGTG--TCGCGCTAGTCGCGGGGGCTGCTTGAGGCCGGGGGACTTCGAGCCGCCGCTGCACCACTCGCTCCCAGCCCAGGAGGAAGGCGCCGGCTGGCGTTGCGCTCTGCTCGGACTCAGGGCAGGAGCGGGGGAGGTCTGCGAAAGCCGGGAGCGAGCCGGGGAGGGCCCGCGAACTGGAGAGGCTCAGCGCGCTGCTGCGGACGCGGCGGATGGCCGACCACGGGTGCCAGGGGAGGCCCAGGCTGCGGCGCCGCAGGGCAGCCCCCGCGCCCACCTGCCCCTGCGCGCCGGCCCTGGCGAGCCTCTGTGGAGGTCAG---------GGGACCGTAGCCTCTCCT-GGGGTTCCTGCCTAGCGACTGAGGGGCGGCAGGAGGCGCAGCTCCGGTTTTCCGCATGCAGCGCCGCGTGCTCGCCGCCTGGTTTT-GTCCGGGTCAGGCAGACCAGCCCCAGGACGCGCCCAGCCGACCCACGCATGGCAACCTGCCCTTCTTGGCAGGAGTCGCAGAGGGCTTTGGCTTCTGAGGTGGAAGTACCTGTTATGTCTCCTAATTCCGGAGTTTGCGGGGGTTTGGGCTGGCGGGGGGCTCATTGGGAAAATGC---TTTTCAAAGCATTCTGTTTGGCTGCCGTGAGCACCTATTTGCCTTATGTGCATATTGAGAAATGTGTGCTTCTACTAAGGTTAGTCGCTGAGCCCAGGGACAGTGTAGGCCTGGATTTCAAATGCATTAATTAGGGTCCAGCACCCAGCCTAGAGACTTCCACAAATGCAGT-----AGTTATTTAGTCACGGGGACTGAATGCGGAGAAAGTAGCCACA--CCGTT-ATAGGCAATTGTTATACCCTTGTGATCCTGCAGAAAACCTGTTTCTTAAATGTGCTTCCCCCCTCTTTCTTTCTATGTACTT--TCAGTGCCTTGCAGAACTAGGAGTAGCGTGCTGACTTTGAACACGTGGTAGATATTTCAGAAAGGTAAAATTGTTAGGCTTGTGGATTTGACAGATACAAAATACAGTTGCTCAGACAACTAAAGCATTTATTTTAATAATTGGACTAATGTTTCATTTGATAACATACTAAAAAATAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 48427 2473 + 413329 CGGACGGACAAGACACCTATGTAATGACCATAGTAAGACCCCATGTGCGTGGCTAATGAGGCAGTG-CCCGACGTGGCGTGGAAGCCCTGCTAGGGAAATCCCACCCCGCCACCCCAGATGCGCCACCCCAGACCTGCTCTCGGACCTGCGGCCCCTGGCCCCTGGCCCTTTCCCGTTGTCACTGAGGCTTCTTGCTAAGAAATGGAACTTCAGAAAACCCCCAAATATATACTGCATTAGGCAAGGGTTTCATTCTAATGGAGTCCCATGTGACCCTGGCTTTCCGTCCGGCAGCAATGCACTCCTGTCTATGAATGAGATGAAAAGAGTGCCCACAACAAGCCAATTTCTTTCAGGAGCGACTAAGACATGCGCATGTCCGGGGGTGCCTCAGAGCACCCGGGAGGGACCCAGGCCTGGGCAGGGAGGC---GGGGCCGGCCCTAGGGGAGCAAAGCTCTTGAAA--CTGGCCTCTGTTGCCGGGCTCCTGACCCTGCCCTCCCATCCCTGCACTACAAGAGGACAGCGGCGACTACAGGAGGCGCCGAAGACGCTGCTGAAGGCCCTAAAGAAACTTCAGCAGAACCGGAA--CTCCCCTTGCAGGTCCAGCCGCGGGCCCTGCGCCCTCCCGCTCAGCCGAGCGGGGCCGAGGGCGCGTTTGCTGAGTGTCTGGTGGCCTCTACCCAAGCGCCTCTTCAGAGGGCTGTTCCTGCGGCCCAGAGACTGCTTGAGGCGCTCGGG-GAAGGGAAAGCAGGCGCTGGTGCGCC----------GGGGGCTCTGCG-------------------GGGGACGGCGCGGAGCTGA-CTGAAGGGCCGCTGCGGTAGCGCAGGGCGCAGGAGCTGCTCCGCCCTGGAGCGCCGGGAAGGTTGGCGCTGGCA------------------------GCCTCCAGCGCCTGCCAGCCGGGCGAGAGCAGGC---GGAGAAGGAGGATGCACCGTCACCTATGGCTCGCCTCCACCGGCCGGCCCGCAAGGTGAGCTCTGGGTGCGCCCGG-CGGGACAGTGAGGTAAAAGGGCGGGAGCGCGGGAGAGGACTCGTGGCCCCGGCTCAGCCCGCACCCC-TCTCCTCTGGGATCCCGAATCGCGGGCTGCGTGGTGGGCCAGGAGAGGTGCAGAGCAGGCGGGGCGCCGCGGCCAGTCCGGAGCGCAAACTTT-CCCTGGCGACTGCAGCGCTGAATCTGGGCGCAGGAGAGCGCGGCGTCCGGGCTGCTCAGCCCTGCCCGGCGGGGTACCTGGGCGCAGCGCGCATGGGTCAGCCGGTAGGAATTGCGGGATGGGGGACACCCAGCGCCACCGTCG--GGAGCCGTAGGAGCGAGATGGACCACCTGGAAGGCCCGGGTCAGCCCTTGGGCTCTGAGGCACGCGGCGTCCCGGCGCTGGTGGCAGGGTGGACTCGGATCCCGCGAGGGTG--TCGCGCTAGTCGCGGGGGCTGCTTGAGGCCGGGGGACTTCGAGCCGCCGCTGCACCACTCGCTCCCAGCCCAGGAGGAAGGCGCCGGCTGGCGTTGCGCTCTGCTCGGACTCAGGGCAGGAGCGGGGGAGGTCTGCGAAAGCCGGGAGCGAGCCGGGGAGGGCCCGCGAACTGGAGAGGCTCGGCGCGCCGCTGCGGACGCGGCGGATGGCCGACCACGGGTGCCAGGGGAGGCCCAGGCTGCGGCGCCGCAGGGCAGCCCCCGCGCCCACCTGCCCCTGCGCGCCGGCCCTGGCGAGCCTCTGTGGAGGTCAG---------GGGACCGTAGCCTCTCCT-GGGGTTCCTGCCTAGCGACTGAGGGGCGGCAGGAGGCGCAGCTCCGGTTTCCTGCATGCAGCGCCGCGTGCTCGCCGCCTGGTTTT-GTCCGGGTGAGGCAGACCAGCCCCAGGACGCGCCCAGGCGACCCACGCATGGCAACCTGCCCTTCTTGGCAGGAGTCGCAGAGGGCCTTGGCTTCTGAGGTGGAAGTACCTGTTATGTCTCCTAATTCCGGAGTTTGCGGGGGTTTGGGCTGGCGGGGGGCTCATTGGGAAAATGC---TTTTCAAAGCATTCTGTTTGGCTACCGTGAGCACCTATTTGCCTTATGTGCATATTGAGAAATGTGTGCTTCTACTAAGGTTAGTCGCTGAGCCCAGGGACAGTGTAGGCCTGGATTTCAAATGCATTAATTAGGGTCCAGCACCCAGCCTAGAGACTTCCACAAATGCAGT-----AGTTACTTAGTCACGGGGACTGAATGCGGAGAAAGTAGCCACA--CTGTTAATAGGCAATTGTTATACCCTTGTGATCCTGCAGAAAACCTGTTTCTTAAATGTGCTTCCCCCCTCTTTCTTTCTATGTACTT--TCAGTGCCTTGCAGAACTAGGAGTAGCGTGCTGACTTTGAACACGTGGTAGATATTTCAGAAAGGTAAAATTGTTAGGCTTGTGGATTTGACAGATACAAAATACAGTTGCTCAGACAACTAAAGCATTTATTTTAATAATTGGACTAATGTTTCATTTGATAACATACTAAAAAATAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7109072 2498 + 72422247 CGGACGGACAAGACACCTATGTAATGACCAAAGTAAGACCCCATGTGCGTGGCTAATGAGGCAGTG-CCCAACGTGGCTTGGAAGCCCTGCTAGGGAAATCCCGCCCCGCCACCCCAGATGCGCCACCCCAGACCTGCTCTCGGACCTGCGGCCCCGGGCCCCTGGCCCTTTCCCGTTGCCACCGAGGCTTCTTGCTAGGAAATGGAACTTCAGAAAAGCCCCAAATATATACTGCATTAAGTAAGGGTTTCATTCTAATGGGGTCCCATGTGACCCTGGCTTTCCGTCCGGCAGCAATGCACTCCTGTCTATGAATGAGATGAAAAGGGTGCCCACAACAAGCCAATTTCTTTCAGGAGCGACTAAGACATGCGCATGTCCAGGGGTGCCTCAGGGCACCCGGGAGGGACTCAGGCCGGGGCAGGGAGGC---GGGGCCGGCCCTAGGGGAGCAAAGCTCTTGAAA--CTGGCTTCTGTTGCCGGGCTCCTGACCCTGCCCTCCCATCCCTGCACTACAAGAGGACAGCGGCGACTACAGGAGGCGCCGAAGACGCTGCTGAAGGCCCTAAAGAAACTTCAGCAGAACCGGAA--CTCCCCTTGCAGGTCCAGCCGCGGGCCCTGCGCCCTCCCGCTCAACCGAGCGGGGCCGAGGGCGCGTTTGCTGGGTGTCTGGTGGCCTCTACCCAAGCGCCTCTTCAGAGGGCTGTTCCTGCGGCCCAGAGACTGCTTGAGGCGCTCGGG-GCGTGGAAAGCAGGCGCCGGTGCGCC----------GGGGGCTCTGCG-------------------GGGGACGGCGCGGAGCTGA-CTGCAGGGCCGCTGCGATAGCGCGGGGCGCAGGAGCTGCTCCACCAGGGAGCGCCGGGAAGATTGGCGCTGGCAACCTGGGGAGGTAACCCGGCACCGGCCTCCAGCGCCTGCCAGCCGGGCGAGAGCAGGC---GGAGGAGGAGGATGCACCGTCACCTATGGCTCGCCTCCACCGGCCGGCGCGCAAGGTGAGCTCTGGGTGCGCCCGG-CGGGACAGTGAGGTAAAAGGGCGCGAGCGCGGGAGAGGACTCGTGGCCCCGGCTCAGCCTGCACCCC-TCTCCTCTGGGATCCCGAATCGCGGGCTGCGTGGCGGGCGAGGAGACGTGCAGAGCAGGCGGGGCGCCGCCACCAGTCCGGAGCGCAAACATT-CCCTGGCGACTGCAGGGCTGAATCTGGGCGCAGGAGAGCGCGGGGTCCCGGCTGCTCAGCCCTGCCCGGCGGGGTACCTGGGCGCAGCGCGCATGGGTCAGCTGGTAGGAATTGCGGGATGGGGGACACCCAACGCCACCTTCG--GGAACCGGAGGAGCGAGATGGACCACCTGGAAGGCCTGGGTCAGCCTTTGGGCTCTGAGGCACGCGGGGTCCCGGCGCTGGTCGCAGGGTGGACTCGGATCCCGCGAGGGTG--TAGCGCTAGTCGCGGGGGCTGCTTGAGGCCGGGGGACTTCGAGCTGCCGCTGTACCACTCGCTCCCAGCCGAGAAGGAAGGCGCCGGCCGGCGTTGCGCTCTGCTGGGACTCAGGGCAGGAGCGGGGGAGGTCTACGAAAGCCGGGAGCGAGCCGGGGAGGGCCCGCGAACTGGAGAGCCTCGGCGCGCCGCTGCGGACGCGGCGGATGGCCGACCACGGGTGCCAGGGGAGGCCCAGGCTGCGGCTCCGCAGGGCAGCCCCCGCGCCCACCTGCCCTTGCGCGCCGGCCCTGGCGAGCCTCTGTGGGGGTCAG---------GGGACCGTAGCCTCTCCT-GGGGTTCCTGACTAGCGAATGAGGGGCGGCGGGAGGCGCCGCTCCGGTTTCCCGCATGCAGCGCCGCGCGCTCGCCGCCTGGTTTT-GCCCGGGTCAGGCAGACCAGCCTCAGGACGCGCCCAGGCGACCACCGCATGGCAACCTGCCCTTCTTGGCAGGAGTCGCAGAGGGCCTTCGCTTCTGAGGTGGAAGTACCTGTTGTGTCTCCCAATTCCGGAGTTTGCGGGGGATTGGGCTGGCGGGGGGCTCATTGGGAAAATGC---TTTTCAAAGCATTCTGTTTGGCAGCCGTGAGCACCTATTTGCGTTATGCGCATATTGAGAAATGTGTGCTTCTACTAAGGTTAGTCGCTGAGCCCAGGGACAGTGTCGGCCTGGATTTCAAATGCATTAATTAGGGTCCAGCACCCAGCCTAGAGACTTCCACAAATGCAGT-----ATTTATTTAGTCACGGGGACCGAATGCCGAGAAAGTAGCCACACTCTGTT-ACAGGCAGCTGTTATACCCTTGTGATCCCGCAGAAAACCTGTTTCTTAAATGTGCTTCCCCCCTCTTTCTTTCTATGTACTT--TCAGTGCCTTTCCGAACGAGGAGTAGCTTGCTGACTTTGAACACGTGGTAGATATTTCAGAAAGATAAAATTGTTAGGCTTGTGGATTTGACAGATACAAAATACAGTTGCTCAGATAACTAAAGCGTTTATTTTAATAATTGGACTAATGTTTCATTTGATAACATACTAAAAAATAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr7 4856371 2503 + 171882078 AGGACCGACGACACACCGACGGAATGACCATAGTAAGACCCCATGTACATGGCTAACGAGGCAGTGACCCCATGTGGCTCGGAAGCCCTGCTGGGAAGATCCCGCCCGGTCACCCCAGACGC--------------GCTCTCCGACCTGCACCCCCAG------GGCCCTTTCCCGTT---------GCTTGTTGTCAAGAAACAGAACTTCCGAAAACCCCCAGATAAACACTGCATTAGGTGAGGATTTCATTCTAATCCAGTCCAGTGTGACCCTGGCTGTCCCTCCCTTAGCAATGCATACCTGTCTATGAGGGAGATGGAAAGAATGTCCA----AGGCCAGTTTCTTTCAGAAGCGCCT-AGAGATGCGCATGTACAGGGGTGTCATGGAGCACCCGGGAAGGAC-CAGGCCTGGGCAGGGAGGCGCTGGGGCCGACTCTA-GGGAGCAAAGCTCTCCAAGTCCCGACCTCCGTCACCCGACTGCTGACCCTGCCTTCCCATCCCTGCTGCACAAGGGAGCGGTGGTGACTACTCGAGGCGCTGAAGATACTGTTGAGGGCCCTGAAGAAACTTCGGCAGGGCAGGGCCTCTCCCCTTGCAGGCCGAG-CGCGGGCCCTGCGCCCTCCCCCTCCGCCGAGCCCGGCCGAGGGCGCGTTTGC-GAGAGTCTGGCGGCCTCTACCGGAGCG-CTCCGCAGAGGGCCGATGCTCCAGCCCGGAGACGACATGTGGCGCTCGGGCGAGGTGAGAGCGGGCGTGAGTGCGCCGGGGGCGC-GGGGGGCTCTGCGGCGGGCGGCGCGCGGCCCCGGGCGCGGCGCGGAGCGGAGCTGCAGGGCGGCGGCGGGAGCGCGGGGCGCAGGAGCCGCTCCGCCCGGGAGCGCCGGGGAAGTTCGCGCTGGCAGCATGGGGCGGTGACGCCGCACCGGCCTTCCGCGCCTGCCAGCCGGGCGAGAGCAGGCGGAGGAGAAGGAGGATGCACCCTCACCGACGGCTCGCCTCCCGGAGCCGGCGCGCAGGGTGAGCCCTGGGCGCGCCGGGCCGGGGCAGTGGGGTAAGAGGACGCGAGCGGGGAAGAGAACCGGCGGCCCCGGCTCGGTCCGCACCCCTTCTCCTCGGGGCGCCGGAGCGGCAGGCTGCGTGGCCGGGGAGGAGAGGTGCAGAGCAGGCGGGGCG-CGCGGCCAGGCCAGAGCGCAAACTTTACCCCGGCGACTGCGGGGCTGAAGCCGGGCACGGAAGGGCGCGGGGTCCGGGCGGCTCAGCCCTGCCGGACGGGGCACCGGGGTGCAGTGACC-----------------AATTG-GGGGTGGGGGACACCCGCTGCCACCATCGCAGGAGCCGGAGGGGAGAGATCGCCCACCTGGAAGGCCAGCGTCAGCCCCGGGGCTCTGAGGCGCGCGGCGTCCCGGCGCTGCTCGCGGGGTGGACTCGGACCCCGCGGGGGTGGCGCGCGCGAGTCGCGCGGGGTGCTCGAGGCCAGGGGACTCGGAGCCGCCGCTGCACCGCACGCTCCCAGCCCAGGAGGAAGGCGCTGCCCGGCGGAGCGCTCGACTCGGACCCGGGGCAGGACCCGGGGAGGTCTGCGAAAGCCGGGAGCGAGCAGGGGAGGGCCCGGGAGCTGGAGACCCTCGGCGCGCCGCTGCGGACCGGGCGGGTGGCAGACCGCGGGTGCCA-GGGCGACCCAGGCTGCGGCTCCGCAGTGCAGCCCCCGCGCCCACCTGCCCTGGCGCGCCGGCCCTGGTGAGCCTCTGTGGGGGTCGGGAGGGTCGTGGGAGCGCAGCCTCTCCTGGGGGTCCCTGGCTCGGGGCTGAGGGGCGGCTGGAGGCGCCGCCCGGGTTTCCCGCATGCAGCGCCGCGTGCTCGCTGCCTGGCTCTGGCCCGGGCCCCGC-GACGAGCCCCAGGACGCGCCCAGGCGACCACCGCATGGCACCCTGCCCTTCTTGGCAGGAGTCGCAGAAGGCCTTCGCTTCCGAGGTGGAAGTACCTGTTGTGCCTCCCAATTCCGGAGTTTGCGGGGGTTGGGGGTG--GGGGGGCTTGTTGGGAAAACGC-TCTTTTCGAAGCATTCTGTTCGGATGCCATGAGCACCTATTTGCGTTATGCGCATACTGAGAAATGCGCGTTTTCGCGAAGGTTGGTCGTTGAGCCCAGGGACAATGTCTGCCTGGATCTCAAATGCATTAATTAGGGTCCAGCACTGAGCGGAGAGACTTCCACAGATGCAGTGGTTAAGTTATGTAGTCACGGGGACCGAATGCCGGGAAAGTAGCCACACTCTTTT-ATAGGCGGTTGTTACAGTATTGTGATCCTGCAGAAAACCTGTTTCTTAAATGTGCTTTTCCCCAC-TTCTTTCCACATACTTTCTCAGTGCCTTGCAGAGAGAGGAGTAGCTTGCTGGCTTTGAACGCGTGGCAGATATTTCAGAAAGGTAAAATTATTGCACTTGTGGATTTGACGGATACAAAATACAGTCGCTCAGATAACTAAAGCGTTTATTTTAATAATTGGACTAATGGTTTATTTGATAACATACTGAAAGACAAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 2657007 2513 + 162156779 AGGACCAACGACACACCGACGGAATGACCATAGTAAGACCCCATGTAGGTGGCTAACGAGACAGTGACGCCATGTGGCTTGGAAGCCCTGCTGGGAAGATCCCGCCCCGTCACCCCAGAAGC--------------GCTCTCCGACCTGCACCCCCAG------GGCCCTTTCCCGTTGCCACGGCGGCTTGTTGTCAAGAAACAGAACTTCAGAAAACCCCCAGATAAACACTGCATTAGGTGAGGATTTCATTCTAATCCAGTCCAGTGTGGCCCTGGCTGTCCCTCCCTTAGTAATGCATACCTGTCTATGAGGGAGATGGAAAGAATGTCCA----AGGCCAGTTTCTTTCAGAAGCGCCT-AGAGATGCGCATGTACAGGGGTGTCATGGAGCGCCCGGGAAGGAC-CAGGCCTGGGCAGGGAGGCGCTGGGGCCGACTCTA-GGGAGCAAAGCCCTCCAAGTCCCGACCTCCGTCACCCGACTGCTGACCCTGCCCTCCCATCCCTGCTGCACAAGGGAGCAGTGGTGACTACTCGAGGCGCTGAAGACACTGTTGAGGGCCCTGAAGAAACTTCAGCAGGGCAGGGCCTCTCCCCTTGCAGGCCGAG-CGCGGGCCCTGCGCCCTCCCCCTCCGCCGAGCCCGGCCGAGGGCGCGTTTGC-GAGAGTCTGGCGGCCTCTACCGGAGCG-CTCCGCAGAGGGCCGATGCTCCAGCCCGGAGACGACATGTggcgctcgggcgaggtgagagcgggcgcgagtgcgccgggggcgctggggggctctgcggcgggcggcgcgcggccccgggcgcggcgcggagcggagctgcagggcggcggcgggagcgcggggcgcAGGAGCCGCTCCGCCCGGGAGCGCCGGGGAAGTTCGCGCTGGCAGCATGGGGCGGTGACGCCGCACCGGCCTTCCGCGCCTGCCAGCCGGGCGAGAGCAGGCGGAGGAGAAGGAGGATGCACCCTCACCGACGGCTCGCCTCCCGGGGCCGGCGCGCAGGGTGAGCCCTGGGCGCGCCGGGCCGGGGCAGTGGGGTAAGAGGACGCGAGCGGGGAAGAGAACCGGCGGCCCCGGCTCGGTCCGCACCCCTTCTCCTCGGGGCGCCGGAGCGGCAGGCTGCGTGGCCGGGGAGGAGAGGTGCAGAGCGGGCGGGGCG-CGCGGCCAGGCCAGAGCGCAAACTTTACCCCGGCGACTGCGGAGCTGAAGCCGGGCACGGAAGGGCGCGGGGTCCGGGCGG-TCAACCCTGCCGGACGGGGCACCGGGGTGCAGTGACc-----------------aattg-ggggtgggggacaccCGCTGCCACCATCGCAGGAGCCGGAGGGGAGAGATCGCCCACCTGGAAGGCCAGCGTCAGCCCCGGGGCTCTGAggcgcgcggcgtcccggcgctgctcgcggggtggactcggaccccgcgggggtggcgcgcgcgTGTCGCGCGGGGTGCTCGAGGCCAGGGGACTCGGAGCCACCGCTGCACCGCACGCTCCCAGCCCAGGAGGACGGCGCTGCCCGGCGGAGCGCTCGACTCGGACCCGGGGCAGGAGCCGGGGAGGTCTGCGAAAGCCGGGAGCGAGCAGGGGAgggcctgggagctggagaccCTCGGCGCGCCGCTGCGGACCGGGCGGGTGGCAGACCGCGGGTGCCA-GGGCGACCCAGGCTGCGGCTCCGCAGTGCAGCCCCCGCGCCCACCTGCCCTGGCGCGCCGGCCCTGGTGAGCCTCTGTGGGGGTCGGGAGGGTCGTGGGAGCGCAGCCTCTCCTGGGGGTCCCTGGCTCGGGGCTGAGGGGCGGCTGGAGGCGCCGCCCGGGTTTCCCGCATGCAGCGCCGCGTGCTCGCCGCCTGGCTCTGGCCCGGGCCCCGC-GACGAGCCCCAGGACGCGCCCAGGCGACCACCGCATGGCACCCTGCCCTTCTTGGCAGGAGTCGCAGAAGGCCTTCGCTTCCGAGGTGGAAGTACCTGTTGTGCCTCCCAATTCCGGAGTTTgcgggggttgggggtg--ggagggcttGTTGGGAAAATGCTTCTTTTCGAAGCATTCTGTTCGGATGCCATGAGCACCTATTTGCGTTATGCGCATACTGAGAAATGCGCGTTTTCGCGAAGGTTGGTCGTTGAGCCCAGGGACAATGTCTGCCTGGATCTCAAATGCATTAATTAGGGTCCAGCACTGAGCGGAGAGACTTCCACAGATGCAGTGGTTAAGTTATGTAGTCACGGGGACCGAATGCCGGGAAAGTAGCCACACTCTTTT-ATAGGCAGTTGTTACAGTATTGTGATCCTGCAGAAAACCTGTTTCTTAAATGTGCTTTTCCCCAC-TTCTTTCCACATACTTTCTCAGTGCCTTGCAGAGAGAGGAGTAGCTTGCTGGCTTTGAACGCGTGGCAGATATTTCAGAAAGGTAAAATTATTGCACTTGTGGATTTGACGGATACAAAATACAGTCGCTCAGATAACTAAAGCgtttattttaataattggaCTAATGGTTTATTTGATAACATACTGAAAGACAAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 a score=83081.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 211249 308 + 478999 CAGAggttgggcgcagtgctcaggcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcggcggattacgagatcaagagatcgagaccatcctggccaacatgttgaaaccccatctctactaaaaatgccaaaattagctggacgtgctggtgtgcgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcagaattgcttgaacccgggaggcggaggctgcagtgagctgagattgcaccattgcactccagcctggcaacagaacgagactccatctcaaaaataaaataaaataaaataaaataaaG s panTro4.chrUn_GL393519 50900 303 + 413329 CAGAggttgggcgcagtgctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcggcggattacgagatcaagagatcgagaccatcctggccaacatgttgaaaccccatctctactaaaaatgccaaaattagctggacgtgctggcgtgcgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcagaattgcttgaacccaggaggcggaggctgcagtgagctgagattgcaccattgcactccagcctggcaacagaacgagactccatctca-----aaaataaaataaaataaaataaaG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7111570 303 + 72422247 CAGAggttgggcgcaatgctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggccgcggattacgagatcaagagatcgagaccatcctggccaacatgttgaaaccccatctctactaaaaatgccaaaattagctggacgtgatggcgtgcgcctgtagacccagctacttgggaggctgaggcagaattgcttgaacccgggaggcggaggctgcagtgagctgagattgcaccattgcactccagcctggcaacagaacgagactccatctca-----aaaataaaataaaataaaataaaG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 e papAnu2.chr7 2659520 0 + 162156779 C e macFas5.chr7 4858874 0 + 171882078 C a score=122702.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 211557 171 + 478999 CAGAGTATTTGAGACATAGAAAACAATAAATTACGATGACTCTGCACTCTGAGTAGAAGTAAAAATAAGCCAACTTGTTAATC-TTTTTATGTTTCAACTTACTGCCCGGTGAGCGTGGTGGAAAATTCCTTGCGTGCAGCTGTGCCAGGGAAGGACAGCCAGCTTCCTTTC s panTro4.chrUn_GL393519 51203 171 + 413329 CAGAGTATTTGAGACATAGAAAACAATAAATTACGATGACTCTGCACTCTGAGTAGAAGTAAAAATAAGCCAACTTGTTAATC-TTTTTATGTTTCAACTTACTGCCCGGTGAGCGTGGTGGAAAATTCCTTGCGTGCAGCTGTGCCAGGGAAGGACAGCCAGCTTCCTTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7111873 171 + 72422247 CAGAGTATTTGAGACATGGAAAACAATAAATTACGATGACTCTGCACGCTGAGTAGAAGTAAAAATAAGCCAACTTGTTAATC-TTTTTATGTTTCAACTTACTGCCCGGTGAGCGTGGTGGAAAATTCCTTGCGTGCAGCTGTGCCAGGGAAGGACAGCCGGCTTCCTTTC i ponAbe2.chrUn C 0 I 189 s macFas5.chr7 4858874 167 + 171882078 CAGACTATTTGAG---TGGAAAACAATAAATTAGGATGATTCTGCACCCTGACTAGAAGCAAAAATAAGCC-TTTTGTTACTTATTTTTATGTTCCAACTTACTGCCCAGTGAGGGTGGTGGAAAATACCTGGTGTGCAGCTGTCCTGGGGAAGGACAGCAGGCTCCTTTC- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 2659520 167 + 162156779 CAGACTATTTGAG---TGGAAAACAATAAATTAGGATGATTCTGCACCCTGACTAGAAGCAAAAATAAGcc-ttttgttacttatttttatattccaaCTTACTGCCCAGTGAGGGTGGTGGAAAATACCTGGTGTGCAGCTGTCCTGGGGAAGGACAGCAGGCTCCTTTC- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 a score=2025.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 211728 3 + 478999 TCT s panTro4.chrUn_GL393519 51374 3 + 413329 TCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7112233 3 + 72422247 TCT i ponAbe2.chrUn I 189 C 0 s macFas5.chr7 4859041 3 + 171882078 TTT i macFas5.chr7 C 0 N 0 s papAnu2.chr7 2659687 3 + 162156779 TTT i papAnu2.chr7 C 0 N 0 a score=954483.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 211731 3727 + 478999 AGGTTACAGCAGGGAAGGACAGCCGGCTCCTTTCTCCAGGTCACAGGATCTGCTCTGCTTGGATTTGATACGGTGGTTAGTGCAGCCCATAGTCCAGTTGCTGCAGCAAAAGTTGCTTGAGTCTTTGATAGGAGAGGACACTTGAAAGCAGGAAATGAGAAACACATTTTGATCTTTATGTAGGAACTCATTGTTCCTGACTCTCTCCTGGGATAAAGGACAGGGAAGAGTGGACTTTTTTGCACTTCTAGTTCCTTCTCCCTGTAGCTGTAGTCGTAGCAAGTAAAGGGGTTGTACTGATGCTTTTTAAGGCATATTATCAACATACAGCCATGACTTGTCCAGAGAATCTCACCTGAC-AAAAACTCagagaagaaagagaaagaagatgaaATGGCTGGTTTTCAGGTAAATGTGTCCCAGTTCAAGGGCtgtgacatggatagactgcatggtggtgaagtcagggcttttagggtatccatcatcagaataacatacatGTCTCTGAAttttgatattagccatcctaacaagtgtgaaatgatatgtcatcattgtttctatttgtatttgcctcatgattgaagatgttgagcagcttttcaaatactcttagtttacgtcttcacta-aaaaaatatttctttacctgtcttttaatcatgttatcattactgtcattattattgttgttttggttttttatttgtatgagttccttacatattttggatattaaccacttaacagtggtttgcagatattttctcccaacctgtaagttttcttattgttttctgtttataagttttttagtttgatgtagtccaacttttttatatttgcctttgtggcgcactttttgtgtcagatccaaaaaaatactgtcaagaccaatataaaggaggttgaccacattttgttttcttttaggatttttaagaattcatgtgttttatttgtccttattttgagttaattttgggatatgatgtaagaaaaatcatctaattttattcttttgcttgtggatacccaattttcttagctccaaataataaagggatttcacttactgcattgtgcattttcaatatccttgttcaagattaattgattttataggcataggtttt------tttttttctaggctctctactttgttctgtaggttttcgtgttcatttttatgcacatgctgtcttgtttttattactatagtattgaatataatttaaaatcagaaactataggggcgggtgcggtggctcacacacctgtaatcccagtactttgggaggccgaggtgggtggatcatgaggtcaggagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaatctcgtctctactaaaaatataaaaattagccgggcatggtggcgagcacctgtaatcccagctactcaggagactgatgtaggaaaatcacttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcgtaccattgcactccaacctgggtgacagagtgagactccatctc-aaaaaaaaaaaaaaaaaagatcagaaactataatatccttagctttcttcttcctcaagattgctttagctattcaaagtctgttgtaatttcacataaattttaagcttgtattttctattactgtgaaacaagttattggaatttttatagggagtttattaaatctatagatcattttggataatgtagaattttaacaatatttactcctccaatctatgatagctttacattttttgtcttctccagtttcctttatcaatattttatttttcagcataaagatctttcaccttagttgttaaatttgttcctaagaaatttattgttttttattttattttaaatgaaatcattttcttccttttaattggatagtttgttgttagggtataaaaacacaattgagatttgtatgctgtttttatattctgaaaattcattgagtgcatttattagtttaaataggtttttggtgtactatttatggtttttgtatataagatcatgtcatctacaaaaagtgac---attttttcaatttagatggctttaaaata-tttttccccaaattcttctacttaggactac---tagtatgttaaaatagaagcattaaaattgggcaCAAGGTGGCTTCATTGTGACTC--CTCTTATTTCGAGCAGACTCAactgctttcagaactttgatctgtagggcagatgccagggccagggttctgaagctgggtttgcatatggcggccctgatagtag--gtgtgtggatgaagtgtgacttctgctgagtacctgagagggttttctctccctttgtgggtctctaggtgggcagaactgtctataaactatggtgaagagggctgaaactgagtcacagacctgcttcagaggccacagtaaaggtgaaaggttaaattctgtaggtctgcctccattatcatgaa----tgtctctccccagttctctgtatgggaaggactaattccagaccataactgggaggcattggagatggttacagagtcacttcaggattctcagtgtgactgagtaggatgggtcaattcctagtctgtagacaagatcaggggttctcagatttgccccctgaatgagggcctgccttcccaaaacagccctcctcagtctttgtttttcacagggtatcataatgccctctctaatcccaaagctcccataaaggcacttttgtccatggatggctgcaaaagtattgtagctgtgggaagataaacaagagtgatccccttattccaacatccttgctgatgtcactcTCCTTATATGGTTTCACTTTGTATTTTGCTGTATTACAAATTTGTCTGTTATTTTAGATT----CATTCAGAACAATATGCTATAATTTCCACACCATGTAAGAAGTAAATCAGAC---AGGCACTCCCTATTTATTAAAATGTTCATTTGTACGTTACAGTTAACTGAAATCATATAGGAATCATTAACATTTTTGTTTTCTCAACCTATATCTAAATGATAAATTACAAAAAATTATTTCAAAATATTTGCATTGTATATAACTCATATTTTACAACATACATGGTTTTACTTTATTTCAAAGTCTAATGCTTTTCTTTGCTTCTAAAGAGTGAATTGCAGCCTTTTTATTTTCTGTGAAAATAGCATCAATATATTAATAGTAACACATTATCTTTACTGTCTTTACATAATCATTA---AAAAAATTTTACTAGAGCATTTTCTTAATGTCTGTAGTGCATTTTCTGTAAAATTTTACTGCCATACAGTAGACATCAATGATTCCAAGTATGTGCGCTCCA--TAGGTGCACAATCACAGGTGAACTCGGTAGTTACCTAGAAAAAGGTGTTATAATGATATATCAATGTTGCATACAGAATTTTATAGGTAAATGTTTATCT-------TGTCTTGCAATTCCTAATTACTGTGTTTTTAGTAAGGATACATTTATAGGCAGTTTATTGTGTTTCTGTTTTACCTATGTATTATAATTTTGAATGACAATTTGCAACTCTGTATATATACTTTAAATCAAGGTGGGGTTTAATTCAAAGATGAATTAACCAGCTGTC-TATCACTGTTAAATTATACATATGTATGTGCATGGTTGTCTCTATAAATATAACACCAACTTTGTTTATGGTTCATCTTGTGTATTTCTCCTCTTGGCTGAttttttttttttttttt s panTro4.chrUn_GL393519 51377 3715 + 413329 AGGTTACAGCAGGGAAGGACAGCCGGCTCCTTTCTCCAGGTCACAGGATCTGCTCTGCTTGGATTTGATACGGTGGTTAGTGCAGCCCATAGTCCAGTTGCTGCAGCAAAAGTTGCTTGAGTCTTTGATAGGAGAGGACACTTGAAAGCAGGAAATGAGAAACACATTTTGATCTTTATGTAGGAGCTCATTGTTCCTGACTCTCTCCTGGGATAAAGGACAGGGAAGAGTGGACTTTTTTGCACTTCTAGTTCCTTCTCCCTGTAGCTGTAGTCGTAGCAAGTAAAGGGGTTGTACTGATGCTTTTTAAGGCATATTATCAACATACAGCCATGACTTGTCCAGAGAATCTCACCTGAC-AAAAACTCAGAGAAGAAAGAGAAAGAAGATGAAATGGCTGGTTTTCAGGTAAATGTGTCCCAGTTCAAGGGCtgtgacatggatagactgcatagtggtgaagtcagggcttttagggtatccatcatcagaataacatacatGTCTCTGAAttttgatattagccatcctaac--gtgtgaaatgatatgtcatcattgtttctatttgtatttgcctcatgattgaagatgttgagcagcttttcaaatactcttagtttacgtcttcacta-aaaaaa-atttctttac----cttttaatcatgttatcattactgtcattattattgttgttttggttttttatttgtatgagttccttacatattttggatattaaccacttaacagtggtttgcaaatattttctcccaacctgtaagttttcttattgttttctgcttataagttttttagtttgatgtagtccaacttttttatatttgcctttgtggcgcactttttgtgtcagatccaaaaaaatactgtcaagaccaatataaaggaggttgaccacattttgttttcttttaggatttttaagaattcatgtgttttatttgtccttattttgagttaattttgggatatgatgtaagaaaaatcatctaattttattcttttgcttgtggatacccaattttcttaactccaaataataaagggatttcacttactgcattgtgcattttcaatatccttgttcaagattaattgattttataggcataggtttt------tttttttctaggctttctactttgttctgtaggttttcgtgtccatttttatgcacatgctgtcttgtttttattactatagtattgaatataatttaaaatcagaaactataggggcgggtgcggtggctcacacacctgtaatcccagtactttgggaggccgaggtgggtggatcatgaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaacatggtgaaatctcgtctctactaaaaatataaaaattagccgggcatggtggcgagcacctgtaatcccagctactcaggagactgatgtaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcgtaccattgcattccaacctgggtgacagagtgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagatcagaaactataatatccttagctttcttcttcctcaagattgctttagctattcaaagtctgttgtaatttcacataaattttaagcttgtattttctattactgtgaaacaagttattggaatttttatagggagtttattaaatctatagatcattttggataatgtagaattttaacaatatttactcctccaatctatgatagctttacattttttgtcttctccaatttcctttatcaatattttatttttcagcataaagatctttcactttagttgttaaatttgtttctaagaaatttattgttttttattttattttaaatgaaatcattttcttccttttaattggatagtttgttgttagggtataaaaacacagttgagatttgtatgctgtttttatattctgaaaattcattgagtgcatttattagtttaaataggtttttggtgtactatttatggtttttgtatataagatcatgtcatctacaaaaagtgac---attttttcaatttagatggctttaaaata-ttttttcccaaattgttctacttaggactac---tagtatgttaaaatagaagcattaaaattggtcaCAAGGTGGCTTCATTGTGACTC--CTCTTATTCTGAGCAGACTCAactgctttcagaactttgatctgtagggcagatgccagggccagggttctgaagctgggtttgcatatggcggccctgatagtag--gtgtgtggatgaagtgtgacttctgctgactacctgagagggttttctctccctttgtgggtctctaggtgggcagaactgtctataaactatggtgaagagggctgaaactgagtcacagacctgcttcagaggccacagtaaaggtgaaaggttaaattctgtaggtctgcctccattatcatgaa----tatttctccccagttctctgtatgggaaggagtaattccagaccataactgggaggcattggagatggttacagagtcacttcaggattctcagtgtgactgagtaggatgggtcaattcctagtctgtagacaagatcagggcttctcaggtttgccccctgaatgagggcctgccttcccaaaacagccctcctcagtctttgtttttcacagggtatcataatgccctctctaatcccaaagctcccataaaggcacttttgtccatggatggctgcaaaagtattgtagctgtgggaagataaacaagagtgatccccttattccaacatccttgctgatgtcactcTCCTTATATGGTTTCACTTTGTATTTTGCTGTATTACAAATTTGTCTGTCATTTTAGATT----CATTCAGAACAATATGCTATAATTTCCACACCATGTAAGAAGTAAATCAGAC---AGGCACTCCCTATTTATTAAAATGTTCATTTGTACGTTACAGTTAACTGAAATCATATAGGAATCATTAACATTCTTGTTTTCTCAACCTATATCTAAATGATAAATTACAAAAAATTATTTCAAAATATTTGCATTGTATATAACTCATATTTTACAACATACATGGTTTTACTTTATTTCAAAGTCTAATGCTTTTCTTTGCTTCTAAAGAGTGAATTGCAGCCTTTTTATTTTCTGTAAAAATAGCATCAATATATTAATAGTAACACATTATCTTTACTGTCTTTACATAATCATT----TAAAAATTTTACTAGAGCATTTTCTTAATGTCTGTAGTGCATTTTCTGTAAAATTTTACTGCCATACAGTAGACATCAATGATTCCAAGTATGTGCGCTCCA--TAGGTGCACAATCACAGGTGAACTTGGTAGTTACCTAGAAAAAGGTGTTATAATGATATATCAATGTTGCATACAGAATTTTATAGGTAAATGTTTATCT-------TGTCTTGCAATTCCTAATTACTGTGTTTTTAGTAAGGATACACTTATAGGCAGTTTATTGTGTTTCTGTTTTACCTATGTATTATAATTTTGAATGACAATTTGCAACTCTGTATATATACTTTAAATCAAGGTGGGGTTTAATTCAAAGATGAATTAACCAGCTGTC-TATCACTGTTAAATTATACATATGTATGTGCATGGTTGTCTCTATAAATATAACACCAACTTTGTTTATGGTTCATCTTGTGTATTTCTCCTCTTGGCTGA-----tttttttttttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7112236 3715 + 72422247 AGGTTACAGCAGGGAAGGACAGCCGGCTCCTTTCTCCAGGTCACAGGATCCGCTCTGCTTGGATTTGATAGGGTGGTTAGTGCAGCCCATAGTCCAATTGCTGCAGCAAAAGTTGCTTGAGTCTTTGATAGGAGAGGGCACTTGAAGGCAAGAAATGAGAAACAGATTTTGATCTTTATGTAGGAGCTCATTGTTCCTGACTCTCTCCTGGGATAAAGGACAGGGAAGAGTGGACTTTTTTGCACTTCTAGGTCCTTCTCCCTGTAGCTGTAGTCGTAGCAAGTAAAGGGGTTGTACTGATGCTTTTTAAGGCATATTATCAACATACAGCCATGACTTGTCCAGAGAATCTCACCTGACAAAAAACTCAGAGAAGAAAGAGAAAGAGGATGAAATGGCTGGTTTTCAGGTAAATGTGTCCCAGTTCAAGGACtgtgacatggatagactgcatagtggtgaagtcagggcttttagggtatccatcaccagaataacatacaCGTCTCTGAAttttgacattagccatcctaacaagtgtgaaatgatatgtcttcattgtttctatttgtatttgcctaatgattgaagacgttgagcagcttttcaaatactcttagtttacatcttcactacaaaaaatatttctttacctgtcttttaatcatgttatcattattgtcattattattgttgttttggttttgtatttg-------------------ttggatattaaccacttaacagtggtttgcaaatattttctcccaacctgtaagttttcttattgttttctgtttagaagttttttagtttgatgtaatccaacttttttatatttgcctttgtggcgcactgtttgtgtcagatccaaaaaaatactgtcaagaccaatataaaggaggttgaccacatctcgttttcttttaggatttttaagaattcatgtgttttatttgtccttattttgagttaattttgggatatgatgtaagaaaaatcatctaattttattc-tttacttgtggatatccaattttctcagctccagatgataaagagatttcacttactgcattgtgcattttcagtatccttgttcaagattaattgattttataggcataggttttgttttgtttttttctgggctctctactgtgttctgtgggttttcgtgtccatttttatgcacatgctgtcttgtttttattactatagtattgaatataatttaaaatcagaaactataggggcgggcatggtggctcaaacacctgtaatcccagtactttgggaggccgaggcacgtggatcatgaggtcaggagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaatcccatctctactaaaaatataaaaattagctgggcgtggtagcgcacgcctgtaatcccagctacttaggaaattgatgtaggagaatcacttgaacctaggaggcagaggttgcagtgagccgagatcgtaccattgcaccccagcctgggtgacagagcaagactccatctc--aaaaaaaaaaaaaaaaaaatcagaaactataatgtccttagctttcttcttcctcaagattgctttagctattcaaagtctgttgtaatttcacataaattttaagcttgtattttctgttactgtgaaacaagttattgaaatttttatagggagtttattgaatctatagacaattttggataatgtagaattttaacaatatttactcctccaatctatgatagctttatattttttgtcttctccaatttcctttatcaatattttatttttcagcataaagatctttcgcctcagttgttaaatttgttcctaagaaatttattat------ttttattttaaatgaaatcattttcttccttttaattggatagtttgctgttagggtataaaaacacaattgagatttgtatgctatttttatattctgaaaattcattgagtgcatttattagtttaaataggtttttggtgtactatttttggtttttgtatataagatcatgtcacctacaaaaagtgacattattttttcaatttagatggctttaaaatatttttttcccaaattgttctacttaggactaccagtagtatgttaaaatagaagcattaaaattgg-CAGAAGGTAGCTTCATTGTGAATCCTCTCTTATtttgagcagactcaactgctttcagaactttgatctgtagggcagatgccagggccagggttctgaagttggttttgcatatggtggccctgacagtagttgtgtgtggatgaagtgtggcttctgctgagtacctgagagggttttctctccctgtgtgggtcccctgctgggcaggactctctgtaaactatggtgaagagggctgaaactgagtcacagacttgcttcagaggctacagtaagggccaaaggctaagttctgtaggtctgcctccatggccatgaatgagtgcctctccccagttctctgtgtgggaaggactaattccagaccataatggggaggcattggagatggttacagagtcacttcaggattctcagtgtgactgagtagggtgggtcaattcctagtctgtagacaagatcaggggttctcaggtttgcccccttaatgagggcctgccttcccaaaacagccctcctcggtctttgtttttcacagggtgtcataatgccctctctaatcccaaagctcccataaaggcacttttgtccatggatggctgcaaaagtattgtaactgtgggaagataaacaagagtgatccgcttattctaacatccttgctgatgtcactcTCCTTATATAGTTTCATTTTGTATTTTGCTCTATTACAAATTTGTCTGTCATTTTAGACTCAAACACTCAGAACAATATGCTATAATTTCCACAACATGTAAGAAGTAAATCAAACAGTAGGCACTCCGTAGTTATTAAAATGTTCATTTGTACGTTACAGTTAACTGAAGTCATATAGGAATCATTAACATCT---TTTTCTCAACCTATACCTAAATGATAAACTACAAAAAATTATTTCAAAATCTGTACATTGTATATAACTCATATTTTACGACATACATGGTTTTACTTTATTTCAAAATCTAATG-----CTTTGCTTCTAAAGAGTGAATTGCAGCCTTTTTATTTTCTGTAAGAATAGCATCAATATATTAATAGTAAAAAGTTATCTTTAC--TCTTTAAATATTTATTCATTAAAACAATTTACTAGAGCATTTTCTTAATGTCTGTAGTGCATTTTCTGTACAATTTTACTGCCATACAGTAGACATCAATGATTCCAAGTATGTGCGCTCCAAGTAGGTGCACAATCACAGGTGAACTCTGTAGTTACCTAAAAAAAGATGTTATAATGGTATATCAATGTTGCATACAGAATTTTATAGGTAAATGTTTATCTTATGTTCTGTCTTGCAATTCCTAATTACTGTGTTTTTATTAAGGATACATTTATA-----------TTGTTTCTGTTTTACCTACGTATTATAATTTTGAATGACAATTTGCAACTCTGTATACATACTTTAAATCAAGGTGGGGTTTAATTCAAAGATGAATTAACCAGCTGTCTTATCATTGTTAAATTATACATATCTATGTGCATGGTTGCCT------GTATAACACCAACTTTGTTCATGGTTCATCTTGTGTATTTCTCCTCTTGGCTGattttttttttatttttt i ponAbe2.chrUn C 0 I 2795 a score=2358.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 215458 27 + 478999 tttcgacggagtctggctctgttgtca s panTro4.chrUn_GL393519 55092 27 + 413329 tttcgacggagtctcgctctgttgtca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7115951 2795 + 72422247 I a score=130628.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 215485 525 + 478999 ggctggagtgcagtggtatgatctcggctcactgcaacctctgcctcccaggttcaagcgattctcctgccatagcctcccaagtagctgggatttcaggcgtgcaccaccatgcccagctaatttttaaatttttagtagacagggtttcaccatgttggccaggcctgggtcttgaactcctgacctcaggtgattggcctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcgcccagccC--GTCAAATATAGTATTATTTTTTGTTtctagatatcccatataagtgtattcagacaacctgtcttgttgtgactgcctttatttagcatgttaag----attttgattttatatgttacatatgctgattttgcaaagctgagcaatattctatttttatattccaaattttatttattcatttaagaaagtttaagctgctttagcctatcagcttttgtcaataatgctgc-------atgggtgtgcaaacaac---tcatttgaccacacatgtgtag s panTro4.chrUn_GL393519 55119 530 + 413329 ggctggagtgcagtggtatgatctcggctcactgcaacctctgcctcccaggttcaagcgattctcctgccatagcctcccaagtagctgggatttcaggcgtgcactaccatgcccagctaatttttgaatttttagtagacagggtttcagcatgttggccaggct--ggtcttgaactcctgacctcaggtgattggcctgcttcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgcgcccagccC--GTCAAATATTGTATTATTTTTTGTTtctagatatcccatataagtgtattcagacaatctgtcttgttgtgactgcctttatttagcatgttaag----attttgattttatatgttacatatgctgattttgaaaagctgagcaatattctatttttatattccaaattttatttattcatttaagaaagtttaagctgctttagcctatcagcttttgtcaataatgctgcaataaatatgggtgtgcaaataac---tcatttgaccacatatgtgtag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7118746 534 + 72422247 ggctggagtgcagtggtgcaatctcggctcactgtaacctccacttcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggattacaggtgtgtgcca-----cccagctaatttttgaatttttagtagacagggtttcaccatgttggccaggct--ggtcttgaactcctgacctcaggtgatcagcctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgaaccaccgcgcccagcccctgccaaatattgtattattttttgtttttagatatcccatataagtgtattcagacaatctgtcttgttgtgactgcctttatttagcatgttaagatttattttgattttatatgttacatatgctgattttgaaaagctgagcaatattctatttttatattccaaattatatttattcatttaagaaagtttaagctgctttagcatgtcagcttttgtcgataacgctgcaataaatatgggtgtgcaaataactcttcatttgaccatatatgtgcag i ponAbe2.chrUn I 2795 C 0 a score=3301573.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 216010 7095 + 478999 ctgtatttctaagttttctattgttttattgttcttgttgtgtgcatttatgccagcaccaaattcctttagctactgtagcttcacaatgtattccaaaatcaggaggtgtgacacccccgatattgttcttgatatttcaagattgttgagtcttcttggtctctttgtagtctgtataattctggggttgcttttttatttctgcaaaaataaactgagaatttggaaaggactgtattgaatctgtagaccactttatgtagtctggacatcttcataatattaagtattcccacccttgaaGAAAAGCAtgttcgagggtgtattgtttaactcccgtatatttgtgaatgtttcattttctattttattcaattttggttataaagaataagcagtaatatttcaatttaaaaaaaggtgttaagacttgtttcatggcctaacgtcttctatcaagaatattttctgaaatattgaaaacattgtgtattttgttggatgaggtgttctctacgcatgttgaatttgatttttatagtgtattcaagtcttctgttcactgtgtatttcttgcttcaatgtcatcaatgtttgctttataaactggaaaccctgatgtatgatatagatgtataactggaaaccctgatgtgtgatgtagatgtagatacaggtataagcacacacacaggaatccacacacaaacaacatatacaatttttataggtttccaatgaatgaaccttt---gtattatttaatgtc-ttttttatcctgtagttttgaattaaattttataaaatatgataatgattgacttaaagtcttt---------tgtcacagtgactacttctgctctcatttggctaacatttgcatggaatatctttttccatcctgcttttagtctatctttgtgattggatccagtgattctcttgtacacagaatatagttgatgctgttaatacaatttttagaatctcttcatgaaatatgtcttttgattgggaaagttagtccattaatatttttaaagtattctgaaatggaacttactatt---attatattaatcattgttttattattgtagccattttgttc--ctttttcatctttcttgctgtctcactgatttctctggtgatatggtctgatttctttctcaatttctatgttgtatttctctaatatttgtggttatcatgaagattacaaaaatcttcttaaaattacaatatattttgaattGGTAAGATATTCAGATGCTT--AGTTTTTTTCAGTATGTCTGCTCTCAACTTT----GTAA-GTCACAAATTATATTGTCATATT--GTGTTTATAACTACTTTCATGTTTTTGTCTATCAAATTTTGAAAA----TAGAATTGTTTTCTGTATTATAATTTTAA---TACAATTTCCTGttatgtgcatgtctttattagagagttatatgttttttatataatgtaggttttt-tctagaattttattttcagtggaagagacacccctaagcattttcagtaaggcagatatactagtgatgtacttttactgcattttgttactttggaatttttttt-gaagaattttcctagttatagtattcttgctttgaaagtttttgtttcagcactttgactatatcacttaactttttttctggcctgcaaggactgtgttgataaatccactgcaaatctcaatgaagcatgctatagatgacacaacaggtttatcttactgcttgcttccaagattccttttgcctac--gacttttaaaattttgcttataatctgtcttgttatgagtaactttgtgtttatcttagccaaagtaatttaagcttcttgATATTTTACAAGTATTT--------------TGTTTGAGAATTTCT--GTCTTTATGACttactgtagtcttcagctccataatttttgaaggtttttataa--------ttttttgtgatattctcattttgctgctttcattcagttgtctatgttcccatttcatacactgagcatcatttagatggttattttgaatattttcaagtaatttgtatatctcaattttttagggttcatatctggaaatttattgtgtttttttggccatgttactctggtactctgttgtcatctttcattgtgatttgagcattaacagaaagctgtcacagtctttataaagtggtttggagtctgacaccaattgaccaggct--agagattctggaggtt----tctaaagcctgttctcaggctgtgtctactcTGGGATTGTGTGTTTATTTTCTTTC-----TTCAGAAAGAAGTCAGAAGTTTACTTCTATAAGCATCATGCTGCA-TTGGAGAGG-AAGAAGGGCTGT-GGTGGGTAAATGCAAC--AAATTTTCCTTCCTCTACT-ATTTGGCTTTTGGCATTCTGCTTGCCT--GGGGTGCTGCAAACT-CTTGA-TTTTTAAACTTA-TCACAATGGAATTTT--GTTCAGGATATTTTT-GTTAAGTGTATATGTATATGAAGAAA--TTAGGGCCTAT-GATTTTTATTGTG--TCATTTTG--CTAATGTGCTTGACATAACTTTATACATTA-GGTTTCTAACACGTACTCACCTG-AATCTAA-TAAGTGAGG--TAATTTATTTTCCC---TTTTCCCAGATGTGTATTCTCATTTTATGGAAGACATGTTGCCAGAGTAAAGCACAATATATTCATCTTGAAATGTAATACTGAGAAGATATGGAAGTTATGGAAGTTGTGGCCTTCAGAATTGACACTTACGGAGAGACTAGAACAGCGTGGGTGAGTTGTGAGGGGCAGGAAGCATGTCTTAATGGACTTAACCAATTTTCGTCAACTATTCACAGTAAAATCTTTCAATGTACaaaatttaataatctgataaacaataaacaaaatatttgaataggcatttttcat---aagacgtacaaagggcagacaggcatacgaaaaggtgctcaacatttttgatcatcagacaaatgcaaatcaaaactacaatgagatattacgtgactcagtt-aaatggcttatatccaaaaggtaggcagtaacaaatgctggaga-gaagtggagaaagggagcccttgtatgctgttgacaggaatgtaacattttgaaaattcttcaaaacaactaaaaataaagctaccatataattcaggaatgccactcctgaggattcacttactagaaaggaaatccatacattgaagagatatctaccctcccatgtttgttacagcagtgtgctccagccaatatttggaagtaacct-gatgtccatcaagaaatgactggataaagaaaacatggcacatatacacaatggaatactatttagccataaaaaataagatcctattatttgcaacaacattgatggaaccatag---attaagtgaaataagccaggcacagaaaaacaaactttccatgttctcacttatttgtcggagctaaaaatcaaaacaatataactcatgtaggtagaggtagttgccagaggctgggaagggcagtggggaatgtaggggacggtagggatggttaatgagtacaaaaaaaaagaaagaattaataagacctagtgtttgatagtacatctgggtgactatagtcaataataattttaattgtacattttataataacgaaaaaagtaaaattagattggttgtaacacaaagaataaatgcctgaggggatgatggataccccattttccatgatgtgattatttctttctatgcctgtattaaagtatctcatatatcacatcaatatatctccaactaagtacccacaaaaataaaaaATTTAAACCAATTCAAAATGCC---AGAAtttctatacatgaactataaactacctgaaaaagtcaagtaaacaattttatttataataactacaaaaagtttactcataaatg----taaccaaaatggtgaaagatttctatatt-aaaattaaaaaacactgagtagaaaaactttctaaatcacaaataaatggaaagatatttctggttcattgattggcagaattaatactgttaaaatgtctacactgagcaaaacaatctacagattcaaagcagtctcttatctgtatacaaatgaaattatttagaatatttcaaaaattctaaagttcatatggcatcacaaaa-acactaaacagcaacagaaattaagcacaaataatacagctggaagcattacactacctttgaaatacactacaaagctttaggaattgatacagtatgataactggtttaaaaagagaaacataggtgaataaagcagaatgcagagcccagaaacaaattcataaaatttcaggatcttacacaaaggtgacaagaacacacagtggggaaaggacagttacttcaaaagtggtgttatgaaaactgagtatctccaggcagaacaatgaaatgagaccctccaccaacataaatcaaagactcaaaactctggaactgctac-aaaaaacagagtgaaagctccatgacattggtggggacaataattttttcttatttatttcacctcaaaatcccagcaaacaaaagtggaagtagacaaatgagattacttgaaaactgaaaagcttctacacagcactaggtacaaccaacagaagaaaaataacgtataaataagagaaaatatttatgagttatatatctgacaaagggttactatccaaaatagacaggaaactcaaacaactatagaacaataaacaagtaactattaaaatgggtgaaagatgtaaataaacatttcttaaaggaagacatacaaatgg-taaaaaatatatgaaaaaaatgcgaggtaaattatcataaggctaatctaaggttaaggctaatctaaggttaggactaatctaaacctctattagataacaactcactactgttagaatgactattaataaaaagccaaaaaaataattattggcaaagatgtggagcaaagggaatgcttgcgcactgaatgtaaatcagcgtagccattatacaaaacagtatggagatttctcaaacattaaaagctgaactatcatatgatacagcaatatcattattgggc--acatatcaaaaaaatcaagtatgtgaaagagacatctgtgctgttatgtttattgcagcactattcacaatagccaagatataaaatcaaactcagggtttattatcaaataaaatgataaagaacatgtggcatacatccattctgtacgaatggattattattcagccttaaaatagaaaatactgtcattttcaattacatggatgaacatgaaggagattatgttaattgaaataatccagacacagaaagacaaatacctcatgattttgctcatatgtggaattttaaaaaattgatcgcattgaagtagagactaaaatagtggaacgagaggctaagatattttggaaggggattgggtagatgtctttcaaagaatatataatt--agttagattaaaggaataagtt-----aaaaaaatctgttgtaaagcctggtgactatagttaatgatgacatactgttatgttttaaaaatactgatatagtcaatgttaagtgttctccatcacaaaaatgataactatatgaggtaaagcacttgttaattagccagaatttaatattacacaatgtatgcatgcttt-aaaccacattttacatgac-aatacatataattttatctgtcaatttaaaaaaTGTAGAAACATGAAAAG--------------------------GTAGTGTTTCAAATAATCAGTCTGTGTCTTATTCATAAGCTTAGCAGAGTAGTATCAAAATATATAGTTTTTGTGATGTTTTTGTCATTTCATTTGTCAGTCATAAGCATAGAAACTCAGATATTTACCAGCATGTGCAAGAACCAGCACAGTGCCTGGGAGAATCCTATGTACTTTAGAGCTTTTACTTTGAGCTCCAGGTACCTGGAATTCCTGGTATAGAAGACACTAAAAAGGCAGGTGCTGCTAATGGTTTCGCCTCTGGCCCTTCTGTAAACACTGAAAACAAGTTTGCTTCCAAAATCACTGAGAAAATGTTTTAATCCAAAAGCCTGCCATTGTCTTTGAGATTTCTCTAAAGAGAATGACCTAGAATTTGGCTGTAATTAGGTGTCTGAGAATAAAAACTGTGGACTGTAACTGTGCCCATTCAAATAAAAGAAGTTATAATAATATGAGTGAGAAATTTCCCAAGATGGCAATACGAATCCGCAAAAAAGATTATTCCAAATTTTAAACCCACAAAGGTTATTTTATTTTTGTCCAAAACTTATTATACCCACTCAACAACAGAAGATTCTGCATGGAAACATAAGCGGTGGGATAAATATTTCATAGAAATTTGAATTTAAAATATTTTACTTACCACTAACTCTCCTTAATACAATTTTATTTCTAAGACATGTCTCTAATGGGATATCCAAATTTTGATTTGTTTTCTTATGTAGCACTAATAATACATGGCCCACTGGTATTAATACTTCACTTAGTCTAATTTGATATTTACCATTCTTTGTGTTATAATATAATAATGTTT----------AACAATGCTATCTGTCCAACGATCTAATCCATGGATACTGCGTTATCTTATCTAAATTAAGTGACAAGAATGTTGCATTTGTAATCTATAAATGACCTCAAATTCTCCAGCTACAAAGAATTTTTAGGCACATTAAAAATAATTCTAACTTGTCCTCAGAACCTGCAGAGTACTGTGTGAAATAACATGGGGTGGGGAGAACAGTGAGCAAGATGTTGCCATAAGACAGGCAAAGAAAGAGAAGGGCTGTAATGCATATGTATTTGGGGGTGAAGATAAAAAGACAGTG----------AAAGAAAAACTGAAGATAATTAGAAAATAAAAGAAGCAGAATTTATCTGTCTAAATTTAGAGTTAGTTGTGCAGCCTGACTACAGATTTCCTCTCTCACCATGCAAAACCAACGCCACTTCTTCACTCTGGGTGTTTTTAATCTCTTATATGAAGATACAAACTCACTCGAGCAGAAATATTTCCTGATAATTGTAAAGCATTTGTTACACACCTAGCACCGTCTTGTGTTTGTTTACTTCATAC-AAATGGCAAGAAA s panTro4.chrUn_GL393519 55649 7096 + 413329 ctgtatttctaagttttctattgttttattgttcttattgtgtgcatttatgccagcaccaaattcctttagctactgtagcttcataatgtattccaaaatcaggaggtgtgatacccccaatattgttcttgatatttcaagattgttgagtcttcttggtctctttatagtctatataattttggggttgcttttttatttcttcaaaaataaactgagaatttggaaaggactgtattgaatctgtagaccactttatgtagtctggacatcttcataatattaagtattcccacccttgaaGAAAAGCAtgttcgagggtgtattgtttaactcccatatatttgtgaatgtttcattttttattttattcaattttggttataaagaataagcaataatatttcaatttaaaaaaaggtgttaagacttgtttcatggcctaacgtcttctatcaagaatattttctgaaatatcgaaaacattgtgtattttgttggatgaggtgttctctacgcatgttgaatttgatttttatagtgtattcaagtcttctgttcactgtgtatttcttgcttcaatgtcatcaatgtttgctttataaactggaaaccctgatgtatgatatagatgtataattggaaaccctgatgtgtgatgtagatgtagatacaggtataagcacacacacaggaatccacacacaaacaacatatacaatttttataggtttccaatgaatgaagcttt---gtattatttaatgtc-ttttttatcctgtagttttgaattaaattttataaaatatgataatgattgacttaaagtcttt---------tgtcacagtgactacttctgctctcatttggctaacatttgcatggaatatctttttccatcctgcttttagtctatctttgtgattggatccagtgattctcttgtacacagaatatagttgatgctgttaatacaatttttagaatctcttcatgaaatatgtcttttgattgggaaagttagtccattaatatttttaaagtattctgaaatggaacttactatt---attatattaatcattgttttattattgtagccattttgttc--ctttttcatctttcttgctgtctcactgatttctctggtgagatggtctgatttctttctcaatttctatgctgtatttctctaatatttgtggttatcatgaagattacaaaaatcttcttaaaattacaatatattttgaattGGTAAGATATTCAGATGCAT--AGTTTTTTTCAGTATGTCTGCTCTCAACTTTGTTAGTAA-GTCACAAATTATATTGTTATATT--GTGTTTATAACTACTTTCATGTTTTTGTCTATCAAATTCTGAAAA----TAGAATTGTTTTCTGTATTATAATTTTAA---TACAATTTCCTGTTATGTGCATGTCTTTATT----AGTTAtgtgttttttatataatgtaggttttt-tctagaattttattttcagtggaagagacacccctaagcatttttagtaaggcagatatactagtgatgtacttttactgcattttgttactttggaatttttttt-gaagaattttcctagttatagtattcttgctttgaaagtttttgtttcagcactttgactatataacttaactttttttctggcctgcaaggactgtgttgataaatccactgcaaatctcaatgaagcatgctatagaggacacaacaggtttatcttactgcttgcttccaagattccttttgcctac--ggctttaaaaattttgcttattatctgtcttgttatgagtaactttgtgtttatcttagccaaagtaatttaagcttcttgATATTTTACAAGTATTT--------------TGTTTGAGAATTTCT--GTCTTTATGACttactgtagtcttcagctccataatttttgaaggtttttataa--------ttttttgtgatattctcattttgctgctttcatttagttgtctatgttcccatttcatacactgagcatcatttagatggttattttgaatattttcaagtaatttgtatatctcaattttttagggttcatatctggaaatttattgtgtttttttggccatgttactctggtactctgttgtcatctttcattgtgatttgagcattaacagaaagctgtcacagtctttataaagtggtttggagtctgacaccaattgaccaggctagagagattctggaggtt----tctaaagcctgttctcaggctgtgtctactcTGGGATTGTGTGTTTATTTTCTTTC-----TTCAGAAAAAAGTCAGAAGTTTACTTCTATAAGCATAATGCTGCA-TTGGAGAGG-AAGAAGGGCTGT-GGTGGGTAAATGCAAC--AAATTTTCCTTCCTCTACT-ATGTGGCTTTTGGCATTGTGCTTGCCT--GGGGTGCTGCAAACT-CTTGA-TTTTTAAACTTA-TCACAATGGAATTTT--GTTCAGGATATTTTT-GTTAAGTGTATATGTATATGAAGAAA--TTAGGGCCTAT-GATTTTTATTGTG--CCATTTTG--CTAATGTGCTTGACATAACTTTATACATTA-GGTTTCTAACACGTACTCACCTG-AATCTAA-TAAGTGAGG--TAATTTATTTTCCC---TTTTCCCAGATGTGTATTCTCATTTTATGGAAGACATGTTGCCAGAGTAAAGCACAATATATTCATCTTGAAATGTAATACTGAGAAGATATGGAAGTTATGGAAGTTGTGGCCTTCAGAATTGACACTTACGGAGAGACTAGAACAGCGTGGGTGAGTTGTGAGGGGCAGGAAGCATGTCATAATGGACTTAACCAATTTTCGTCAACTATTCACAGTAAAATCTTTCAATGTaaaaaatttaataatctgataaacaataagcaaaatatttgaataggcatttttcat---aagacgtagaaagggcagacaggcatacgaaaaggtgctcaacatttttgatcatcagacaaatgcaaatcaaaactacaatgagatattatgtgactcagtt-aaatggcttatatccaaaaggtaggcagtaacaaatgctggaga-gaagtggagaaagggagcccttgtatgctgttgacaggaatgtaacattttgaaaattcttcaaaacaactaaaaataaagctaccatataattcaggaatgccactcctgaggattcacttactagaaaggaaatccatacattgaagagatatctaccctcccatgtttgttacagcagtgtgctccagccaatatttagaagtaacct-gatgtccatcaagaaatgattggataaagaaaacatggcacatatacacaatggaatactatttagccataaaaaataagatcctattatttgcaacaacactgatggaaccatag---attaagtgaaataagccaggcacaaaaaaactaactttgcatgttctcacttatttgtcagagctaaaaatcaaaacaatataactcatgtaggcagaggtagttgccagaggctgggaagggcagtggggaatgtaggggatggtagggatggttaatgagtac-aaaaaaaagaaagaattagtaagacctagtgtttgatagtacatctgggtgactatagtcaataataattttaattgtacattttataataacgaaaaaagtaaaattagattggttgtaacacaaagaataaatgcctgaggggatgatggataccccattttccatgatgtgattattgctttctatgcctgtattcaagtatctcatatatcacatcaatatatctccaactaagtacccacaaaaataaaaaATTTAAACCAATTCAAAATGCC---agaatttctatacattaactataaactacctgaaaaagtcaagtaaacaattttatttataataactacaaaaagtttactcataaatg----taaccaaaatggtgaaagatttctatattaaaaactaaaaaacactgagtagaaaaactttctaaatcacaaataaatggaaagatatttctggttcattgattggcagaattaatactgttaaaatgtctacactgagcaaaacaatctacagattcaaagcagtctc-tatcagtatacaaatgaaattatttagaatatttcaaaaattctaaagttcatatggcatcacaaaa-acactaaacagcaacagaaattaagcacaaataatacagctggaagcattacactacctttgaaatacactacaaagctttaggaattgatacagtatgataactggtttaaaaagagaaacataggtgaataaagcagaatgcagagcccagaaacaaattcataaaatttcaggatcttacacaaaggtgacaagaacacacagtggggaaaggacagttacttcaaaagtggtgttatgaaaactgagtatctccaggcagaacaatgaaatgagaccctccaccaacataaatcaaagactcaaaactctggaactgctac-aaaaaacagagtgaaagctccatgacattggtagggacaataattttttcttatttatttcacctcaaaatcccagcaaacaaaagtggaagtagacaaatgagattacttgaaaactgaaaagcttctacacagcactgggtacaaccaacagaagaaaaataacgtataaataagagaaaatatttacgagttatatatctgacaaagggttactatccaaaatagacaggaaactcaaacaactatagaacaataaacaagtaactattaaaatgggtgaaagatgtaaataaacatttcttaaaagaagacatacaaatgg-taaaaaatatatgaaaaaaatgctaggtaaattatcataaagctaatctaaggttaaggctaatctaaggttaggactaatctaaacctctattagataacaactcactactgttagaatgactattaataaaaagccaaaaaaat-attattggcaaagatgtggagagaagggaatgcttgcgcactgaatgtaaatcagcgtagccattgcacaaaacagtatggagatttctcaaacattaaaagctgaactatcatatgatacagcaatatcattattgggc--acatatcagaaaaatcaagtatgtgaaagagacatctgtgctgttatgtttattgcagcattattcacaatagccaagatataaaatcaaactcagggtttattatcaaataaaatgataaagaacatgtggcatacatccattctgtacgaacggattattattcagccttaaaatagaaaatattgtcattttcaattacatggatgaacatgaaggagattatgttaactgaaataatccagacacagaaagacaaatacctcatgattttgctcatatgtggaattttaaaaaattgatcgcattgaagtagagactaaaatagtggaaccagaggctaagatattttggaaggggattgggtagatgtctttcaaagaatatataatt--agttagattaaaggaataagtt-----aaaaaaatctgttgtaaagcctggtgactatagttaatgatgacatactgttatgttttaaaaatactgatatagtcaatgttaagtgttctccatcacaaaaatgataactatatgaggtaaagcacttgttaattagccagaatttaatattacacaatgtatgcatgcttt-aaaccacattttacatgac-aatacatataattttatctgtcaattttaaaaaTTTAGAAACATGAAAAG--------------------------GTAGTGTTTCAAAT----AGTCTGTGTCTTATTCATAAGCTTAGTGGAGTAGTATCAAAATATATAGTTTTTGTGATGTTTTTGTCATTTCATTTGTCAGTCATAAGCATAGAAACTCTGATATTTACCAGCATGTGCAAGAACCAGCACAGTGCATGGGAGAATCCTATGTACTTTAGAGCTTTTACTTTGAGCTCCAGGTACCTGGAGTTCCTGGTATAGAAGACACTAAAAAGGCAGGTGCTGCTAATGGTTTCACCTCTGGCCCTTGTGTAAACACTGAAAACAGGTTTGCATCCAAAATCACTGAGAAAATGTTTTAATCCAAAAGCCTGCCATTGTCTTTGAGATTTCTCTAAAGAGAATGACCTAGAATTTGGCTGTAATTAGGTGTCTGAGAATAAAAACTGTGGACTGTAACTGTGCCCATTCAAATAAAAGAAGTTATAATAATATGAGTGAGAAATTTCCCAAGATGGCAATACGAATCCGCAAAAAAGATTATTCCAAATTTTAAACCCACAAAGGTTATTTTATTTTTGTCCAAAACTTATTATAACCACTCAACAACAGAAGATTCTGCATGGAAACATAAGCGGTGGGATAAATATTTCATAGAAATTTGAATTTAAAATATTTTACTTACCACTAACTCTCCTTAATACAATTTTATTTCTAAGACATGTCTCTAATGAGATATCCAAATTTTGATTTGTTTTCTTATGTAGCACTAATAATACATGGCCCACTGGTATTAATACTTCACTTAGTCTAATTTGATATTTACCATTCTTTGTGTTATAATAACGTTTTTCTT-----TAACAAACAATGCTATCTGTCCAACGATCTAATCCATGGATACTGCATTATCTTATCTAAATTAAGTGACAAGAATGTTGCATTTGTAATCTATAAATGACCTCAAATTCTCCAGCTACAAAGAATTTTTAGGCACATTAAAAATAATTCTAACTTGTCCTCAGAACCTGCAGAGTACTGTGTGAAATAACATGGGGTGGGGAGAACAGTGAGCAAGCTGTTGCCATAACACAGGCAAAGAAAGAGAAGGGCTGTAATGCACATGTATTTGGGGGTGAAGATAAAAAGACAGTG----------AAAGAAAAACTGAAGATAATTAGAAAATAAAAGAAGCAGAATTTATCTGTCTAAATTTAGAGTTAGTTGTGCAGCCTGACTACAGATTTCCTCTCTCACCATGCAAAACCAATGCCACTTCTTCACTCTGGGTGTTTTTAATCTCTTACATGAAGATACAAACTCACTCGAGCAGAAATATTTCCTGATAATTGTAAAGCATTTGTTACACACCTAGCACCGTCTTGTGTTTGTTTACTTCATAC-AAATGGCAAGAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7119280 7034 + 72422247 ctgtatttctaagttttctattgttttattgttcttattgtgtgcatttatgccagcaccaaactcctttagctactgtagcttcataatgtatttcaaaatcaggaggtgtgatgctcccaatattgttcttgatatttcaagattgttgagtcttcttggtctctttatagtctatataattttggggttgcttttttatttctgcaaaaataaactgagactttggaaaggactgca------------gacagtttatgtagtctggatatcttcataatattaagtattcccacccttgaaGAAAAGCAtgttcgagggtgtatcgtttaatttccatatatttgtgaatgtttcattttttattttattcaattttggttataaataataagcaataatatttcaatttaaaaacagttgttaagacttgtttcatggcctaacgtcttctatcaagaatgttttctgaaatgttgaaaaaattgtgtattttgttgtgtgaggttttctctatgcatgttgaatttgatttttatagtgtattcaagtcttctgttcactgtgtatttcttgcttcaatgtcatcaatgtttgctttata---------------------------------aattggaaaccctgatgtgtgatatagctgtagatataggtataagcacacacacaggaatccacacaca---cacgtatacaattgttataagtttccaatgaatgactctttttgttattatttaatgtctttttttatcctgtagttttgaattaaatttcataaaatatgata---attgatttaaaatgttt---------tgtaacggtgactacttctgctttcatttggctcacatttgcatggaatatctttttccatcctgcttttagtctatctttgtcattggatccagtgattctcctgtatacagaatatagttgacgctgttaatacaatttttataatctcttcatgaaatatgtcttttgattgggaaagttagtccattaatatttttaaagtattctgaaatggaacttactattgtcattatattaatcattgtttcattattgtagccatttccttcctctttttcatctttcttgctgtctcactgatttctgtggtgacatggtctgatttctttctcactttctctactgtatttctctagtatttgtggttgtcatgaggattacaaaaatcctcttaaaattacaatatattttgaattggtaagatcttcagatgcatacagtttttttcagtatgtctgctgtcaactttgttagtaatgtcacaaattatattgttatatt--gtgtTTATAACTATTTTCATGTTTTTGTCGATCAAATT-TGAAAATAATTAGAATTGTTTTCTGTGTTATAATTTTAATACTACAATTTCCTGTTATGTGCCTGTCTTTAAT--AGAGTTATGTGTTTTTTATGTAACATAGGTTTTTCTCTAGAATTTTATTTTCAATGGAAGAgactcccctaagcatttttagtaaggcagatatactagtgatgtacttttactgcattttgttactttggaattttttttggaagaattttcctagttacagtattcttgcttggaaattttttgtttcagcactttgactatatcacttaactttttttctggcctgcaaggactgtgttgataaatccactgcaaatctcattgaagcatgctatagatgacacatcaggtttatcttac----tgcttccaagattccttttgcctatgagacttttaaaattttgcttataatctgtcttgttatgagtaactttgtgtttatcttagccaaagtaatttaagcttctggacattttacaagtttttttc-----------tgtttgataatttttcagtctttatgacttactgtattcttcagctccataatttttgaaggtttttataat-------ttttttgtgatattatcattttgctgctttcatttagttgtctgtgttcccatttcatatactgggcatcatttagatggttatgttgaatattttcaggtaatttgtgtatctcaattttttagggttgatatctggaaatttattgtgtttttttggccatattactccggtactctgttgtcatctttcattgagatttgagcatt------aagctgtcacagtccttataaagtggcttggagtctgacaccaattgaccacgct--agagattctggaggct----tctcaagcctgttgtcaggatgtgtctactcTGGGATTGTGTGTTTAttttctttc-----ttcagaaagaagtcagaagtttacttctataagcatcatgctgca-ttggagagg-aagaagggctgt-ggtgggtaaatgcaac--aaattttccttcctctact-atttggctattggcattgtgcttacct--gcggtgctgcaaact-cttga-tttttaaactta-tcacaatggaatttt--gttcagtgtattttt-gttaagtgtatatgtatatgaagaaa--ttagggcctgt-gatttttattatg--ccattttg--ctaatgtGCTTAATATAACTTTATACATTA-GGTTTCTAACACATATTCACCTG-AGTCTAG-TAAGTGAGG--TAATTTATTTTCCC---TTCTTCCAGATGTGTCTTCTCATTTTATGGAAGACATGTTGCCAGAGTAAAGCACAACAGATTCATCTCGAGATGTAATACTGAGAAGATATGGAAATTATAGAAGTTGTGGCCTTCAGAATTTACACTTACGGAGAGACTAGAACAGTGTGGGTGGG-TGTAAGGGGCAGGAAGCATGTCATAATGGACTTAACCAATTTTCATCAACTATTCACAGTAAAATCTTTCAATGTAATaaatttaataatatgat----aataagcaaaatatttgaataggcatttttcataagaagacgtacaaagggcagacaggcatatgaaaaggtgctcaacatttttgatcatcagacaaatgcaaatcaaaactacaatgaggtattatgtcactcagtt--aatagcttatatcc-aaaggtagacagtaacaaatgctggaga-gaagtggagaaagggagcccttgtatgctgttgacaggaatgtaacattttgaaaattcttcaaaataactaaaaataaagctaccatataattcaggaattccactccggaggattcacttactagaaaggaaatccatacattgaagagatatctaccctcccatgtttgttacagcagtgtgctctagccaatatttggaagtaacct-gatatccatcaacaaatgattggatgaagaaaacatggcacatagacacaatggaatactatttaaccataaaaaataagatcctatt-tttgcaacaacattgatggaaccagag---attaagtgaaataagccaggcacagaaaaacaaactttccatgttctcacttatttgtcagagctaaaaatcaaaacgatataactcatgtaggtagagatagttgccagaggctgggaagggcagtggggaatgtaggggacggtagggatggttaatgagtac--aaaaaaagaaagaattagtaagacctagtgtttgatagtacatctgggtgaccatagtcaataataattttaattgtacattttataataatgaaaagagtataatgagattggttgtaacacaaagaataaatgcctgaggggatgatggatactccattttccatgatgtgattattgctttctatgcctgtattaaagtatctcacatatcacatcaatatatctccaactaagtacccacaaaaataaaaaATTTAAACCAATTCAAAATGCC---agaatttctatacattaactataaactacacaaaaaagtcaagtaaacaatgttatttataataactacaagaagtttactcataaatg----tagccaaaatggtgaaagatttttatattaaaaactaaaaaacactgggtagaaaaactttctaaatcacaaataaatggaaagatatttctggttcattgattggcacaattaatactgttaaaatgtctacactgagcaaaacaatctacagattcaaagcagtctc-tatcagtatacaaatgaaattatttagagtatttcaaaaattctaaagttcatatggcatcacaaaa-acactaaacagcaaaagaaattaagcacaaataa---agctggaagcattacactacctttgaaatacactacaaagctttaggaattgatacagtatgat-actggtttaaaaagagaaacataggtgaataaagcagaatgcagagcccagaaacaaattcataaattttcaggatcttacaaaaaggtgacaagaacacacagtggggaaaggacagttacttcaaaagtggtgttatgaaaactgaatatctccaggcagaacaatgaaatgagaccctcaatcaacataaatcaaagactcaaaactctggaactgctac-acagaacagagtgaaagctccatgacactggtggggaaaataattttttcttatttatttcacctcaaaatcccagcaaa-aaaagtggaagtagacaaatgagattacttgaaaactgaaaagctcctacacagcactagatacaaccaacagaagaaaaataacgtataaataagagaaaatatttacgagttatatatctgatgaagggttactatccaaagtagacaggaaactcaaacaactatagaacaataaacaagtaactattaaaatgggtgaaagatgtaaataaacatttcttaaaggaagacatacaaatggttaaaaaatatatg-aaaaaatgctaggtaaattattataaggctaatctaaggttaagg-----------------ctaatctaaacctctattagacaacaactcactattgttagaatgactattaataataagccaaaaaaataattattggcaaagatgtggagtaaagggaatgcttgcacactgaatgtaaatcagcatagccattatacaaaacagcatggagatttctcaaacattaaaagctgaactatcatatgatatagcaatctcattattgggc--atatatcaaaaaaatcaagtatgtgaaagagacatctgtgctgttatgtttattgcagcactattcacaatagccaagatataaaatcaaactcagggttcattatcaaataaattgataaagaacatgtggcatacataca--------gaatggattattattcagccttaaaatagaaaatcttgtcattttcaattacatggatgaacctgaaggagattatgttaattgaaataatccagacacagaaagacaaatacctcatgattttgctcctatgtggaattttaaaaaattgattgcattgaagtagagactaaaatagcggaaccagaggctaagatattctggaaggggattgggtagatgtctttcaaagactacataatt--agttagattaaaggaataagtt-----aaaaaaatctgttgtaaagcctggtgactatagttaatgatgatatactgttatgttttataaatactgatatagtcaatgttaagtgttctccatcacaaaaatgataactatatgaggtaaagcatttgttaattagccagaatttaatattagacaatgtatgcatgcttcaaaaccacattttacatgacgaatacatataattttatctgtcaatttaaaaaaTTTAGAAACATGAAAAG--------------------------GTAGTGTTTCAAATA---AGTCTGTGTCTTATTCATAAGCTTAGCTGAGTAGTATCAAAATATATAGTTTTTGTGACGTTTTTGTCATTTCATTTGTCAGTCATAAGCATAGAAACTCTGATATTTACCAGCATGTGCAAGAACCAGCACAGTGCATGGGAGAATCCTATGTACTTTAGAGCTTTTACTTTGAGCTCCAGGCACCTGGAATTCCAAGTATAGAAGACACTAAAAAGGCAGGTGCTGCTAATGGTTTCACCTCTGGCCCTTCTGTAAACACTGAAAACAGGTTTGCATCCAAAACCACTGAGAAAATGTTTTAATCCAAAAGCCTGCCATTGTCTTTGAGATTTCTCTAAAGAGAACGATCTAGAATTTGGCTGAAATTAGGTGACTGAGAATAAAAACTGTGGACTGTAACTGTGCCCATTCAAATAAAAGAAGTTATAATAATATGAGTGAGAAATTTCCCAAGATTGCAATACGAATCTGGAAAAAAGATTATTCCAAATTTTAAACCCACAAAGGTTCTTTTATTATTGTCCAAAACTTATTATACCCACTCAACAACAGAAGATTCTGCATGGAAACATAAGCAGTGGGATAAATATTTCATAGAAATTTGAATGTAAATTATTTTACTTACCACTAACTCTCCTTAATAC---TTTATTTCTAAGACACGTCTCTAATGAGATATCCAAATTTTGATTTGTTGTCTTACGTAGCACTAATAATACATGGCCCACTGGTATTAATACTTCACTTAGTCTAATTTGATACTTACCATTCTTTGTGTTATAATACAATAATGTTTTTCTTTAACAAACAATGCTATCTGTCCAACGATCCAACCCATGGATACTGAATTATCTTACCTAAATTAAGTGACAAGAATGTTGCATTTGTAATCTATAAATGACCTCAAACTCTCCAGCTACGAAGAATTTTTAGGCACATTAAAAATAATTCTAAGTTGTCCTCAGAACCTGCAGAGTACTGTGTGAAATAACACGGGGCGGGGAGAACAGCGAGCAAGCTGTTGCCATAACACAGGCAAAGAAGGAGAAGGGCTGTAATGCACATGTATTTGGGGGTGAAGATAAAAAGACAGTG----------AAAGAAAAACTGAAGATAATTAGAAAATAAAAGAAGCAGAATTTATCTGTCGAAATTTAGAGTTAGTTGTGCAGCCTGGCTACAGATTTCCTCTCTCACCATGCAAAACCAATGCCACTTCTTCATTCTGGGTGTTTTTAATCTCTTATATGAAGATACAAACTCACTCGAGCAGAAATATTTCCTGATAATTGTAAAGCATTTGTTACACTCCTAGCACCATCTTGTGTTTGTTTACTTGATACAAAATGACAAGAAA i ponAbe2.chrUn C 0 I 594 s nomLeu3.chr4 74683806 6943 + 152096393 ctgtatgtcttag---------gttttattgtt--------------------tagttccaaacccctttagctattgtagcttcataatgtattttgaaatcaggaggtgtgatgcccccagtattgttctt-atatttcaagattgttgagtcttcttggtttcttcatactctatataattttgggattgcttttttatttctgcaaaaataaactgagaatttggaaaggactgcattgcatctgtagaccactttaggtagtctggatatcttcataatgttaagtattcccaccctcgaagaaaagcatgttcgagggtgtattgttcaacttctatatatttgtgaatgtttcattttttattttatacaattttggttataaataataagc---aatattttaactaaaaaaaa---gctaagacttgttttctggcctaaagtattctatcaagaatgttttctgaaatattgaaaaaattgtgtattttgctgtgaga-gtgttctctaggcatggtgaatttgatttttatagtgttttcaagtcttctgttcactgtgtatttcttgcttcagtgtcatcaatgtttgctttata---------------------------------aactggagaccctgatgtgtgatatagatgtagatgtaggtataagcacacacacaggaacacacacaca---cacatatacaattgttataggttaccaatgaatgaaccttt---ttgtta-ttaatgtc-ttttttgtcttgtagtt-----ttaaattttataaaatatgataattattgacttaaaatgtgttttcccgaatataacggtgactacttctgctctcgtttggctaacatttgcatggaatatctttttccatc-----------ctatctttgtcattggatctagtgattctcttgtacacagaatatagttgaagcttttaatataatttttagaatctcttcatgaaatatgtcttttgattggtaaagttagtccataaatatttttaaaatatgctgaaatggaacttactatt---gt--tatTAATCA----TTTATTATTGCAGCCATTTTGTT---CTTTTTCATCTTTCTT--------ACTGATTCCTGTATTGACATAGTCT--tttctttctcccttcttacagtgtatttctctagtatttgtggttatcatggagattacagaaatcctcttaaagttacaatatattttgaattggtaagatcttcagatgcatacagtttttttcagtatgtctgctctcaactttgttattaatgtcacaaattatctttttataATAGGTGTTTATAACTCCTTTCATGTTTTTGTCTATCAAATTTTGAAAAGTATTAAAATTGTTTTCT---TTATAATTT------TACAATTT--TGTTATGTGCATGTctttatcagagagtta--tgttttttatgtaatgtggttttttttctagaattttattttcaatggaagagactccctttagcattcttagtaaggcagatatactagtgatgtacttttactgcattttgttactttggaatttttttt-gaagaattttcctagttatagtattcttgcttgaaaattttttgtttcagcactttgactatatcgcttaactttttttctggcctgcaaggactgtgttgataaatccactgtaaatctcattgaagcattctagagatgacacatcaggtttctcttac----tgcttccaagattccttttgcctat--gacttttaaaattttgcttataatctgtc--gttatgaataactttgtgtttatcttagtcaaagtaatttaagcttcttgatattttacaagtttttttcttaggtttgagaagttgagaatttctcagtcattatgacttactgtgttcttcagctccataatttttggaggtttttatacttttaatctttttgttgatattctcattttgctgctttcatttagttgtctgtgttcccatttcatacactgagcatcacttaaatggttattttgaatattttcaggtaatttgtatatctcaattttttagggttgatatctgtaaatttattatggttttttggccatattactctggta--ctgttgtcatctttcactgagatttgagcattaacagaaaactttcacagtctttataaagtggcttagagtctgacaccagctgaccaggct--agagattctggaggctgagctctcaagcctgttctcaggatgtgtctactcTGGAGCTGTG-GTTTATTTTCTTTCTCTCTTTCGGAAAGAAGTCAGAAGTTTACTTCTATAAACAACATGCTGCATTTGGAGAGGAAAGAAAAGGTGTGGGGGGGTAAATGGCACTTAATTTTCCCTCCCCCTACTAATTTGGCTCTTGGCATTGGGCTTACCCGGGGGGGGCTGCAAACTCCTTGATTTTTTAAACTTATTCACAGTGGAATTTCCGGTTCAGTTAATTTCTGGTTAAGTGGATATGTATATGAAGAAAATTAGGGGTTTATGGATTTTTATTAAGCCCCCTTTTGGCCAAAGGGGCCTAAAATACTTTTATAACTTACCCTTTCCTACACCTTTTCACCTGTAGTCCAAGTAAGAGGGGAATAATTTATTTTTCCTCTTCTTCCCAAAGTGGTTCTCTCCCTTTTT---------------AGAGTAAAGCATAATAGA-TCATTTCAAAATGCAATACTGAGAAGATATGGAAGTTGTGG----------CTTCAGAATTTACACTTACAGAGCAACTAGAACAGCGTGGGTGAG-TGTAAGGGGCAGGAAGCATGTTATAATGGACTTAACTAattgtcatcaactattcaaagtaaaatctttcaatgtaataaatttaatattctgataa--aaaaggcaaaatatttgaatagacatttttcataagaagatatacaaagggcagacaggcatatgaaaaggtgctcaacatttttgatcatcagacaaatgcaaatcaaaactacaatgagatattatgtcactcagttaaaatggcttatatccaaaaggtaggcagtaacaaatgctgaagaggaattggagaaacggagcctttgtatgctgttggcaggaatgtaacattttgaaaattcctcaaaacaactaaaaataaagttaccatataattcaggaattccactcctggggatttacttactagaaaggaaatccatacactgaagagctatctaccctcccatgtttgttgcagcagtgtgctctagccaatatttggaagtaacctaaatgtccatcaacaaatgactggataaag-acacatggcacatatacacaatggaatactctttaatcataaaaaataagatcctattatttgcaacaacatagatggaaccagagattattaagtgaaataagccagacatagaaaaacaaactttacatgttttcttttatttgtcagagctaaaaaccaaaacaatataactcatgtaggtacagatagttaccagaggctgggaagggtagtggggaatggaggggaaggtagggatggttaatgagtac-----aaaaaaaagaattagtaagacctagtgtttgatagtacatttgggtgactatagtcaataataa-ttaaattgtacattttataataactaaaagagtataattagactagttgtaacacaaagaataaatgcccgaggggatgatggataccccattttccatgaagtgattattgctttctgtgcctgtattaaagtatctcatatatcacataaatatatctccaactaggtccccacaaaaataaaaaatttaaaacaattcaaaatgtcagtagaatttctacacattaactataaactacctgaaa-----aaataaacaatgttatttataataactacaaaaaa-ttactcataaataaatttaaccaaaatggtgaaagatttctatattaaaaactaaaaaacactgagttgaaaaaatttttaaatcacaaataaatggaaagatatttctggttcactgattggcagaattaatattgttaaaatgtctatactgagcaaaacaatctacagattcaaggcagtccc-tatcaatatacaaattaaattact--aagtatttcaaaaattctaaagttcatatggcatcacaaaagacactaagtagcaaaagaaattaagcacaaatcacaaagctggaagcattacactacctttgaaatacactacaaagctttaggaacT------------------------------------------------------------------------------------------------------------ggacatacagtggggaaaggacagttccttcaaaagtggtgttacgaaaactgaatatccccaggcagaacaatgaaatgagaccgtccaccaacagaaatcgaagactcaaaactctggaactgctacaaaaaaacagagtgaaagctccatgacattggtggggacatcaattttttttta--aatttaacctcaaaatcccagcaaa-caaagtggaaatagacaaacgagattacttgaaaactaaaaagcgtctacacaacactagatacaaccaacagaagaaaaataacgtataaataagagaaaatatttatgagttatacatctgataaagggttattatccaaaatagacaggaaactca---aactgtagaacaataaa----taactattaaaatggatgaaagatgtaaataaacatttcttaaaggaagacatacaaatggttaaaaaatatatgaaaaaaatgctaggtaaattatcataaggctaatctaaggttaaggctaatctaaggttaggactaatctaaacctctattggataacaactcactcttgttagaatgactattattaaaaagccaaaaaattaattattggcaaagatgtggagaaaagggaatgcttgcacactgaatgtaaatcagtgtagccattatacaaaacagtatggagatttctcaaacagtaaaagctgaactatcatatgacacagcaatctc---attgggcatatatataaaaaaaatcaagtatgtgaaagagacatctgtgctgttatgtttattgcagcactatgcacaatagccaagatataaaatcaaattcagtgtttattatcaaataaactgataaagaacatgtggcatacataca--------gaatg---tattatacagccctaaaatagaaaatcttgtcatttttgattacatggatgaacctaaaggagattatgttaattgaaataatccagacacagaaagacaaatacctcatgattttgctcatatgtggaattttaaaaagttgatctcattgaagtagagactaaaatggtggaaccagaagctaagattttttggaaggggattgggtagatgtcttttgaaggatacgtaattacagttagattaaaggaataagttaaaaaaaaaaaacctgttgtaaagtccgatgactatagttaatgatgatatactg-tatgtttaaaaaatgctgatacagtcaatgttaagtgttctctatcacaaaaatggtaactatatgaggtaaagcatttgttaattagctagaatttaacattagacaatgtatgcatgcttcaaaaccacattttacatgataaatacatagaactgt---tgtcaattaaaaaaaTTTAAAAACATGAAAAGTTTTAAATTTAAAAACATGAAAAGTTTTAGTGTTTCAAATAATGAGTCTGTGTCTTATTCATAAGCTTAGCCTAGTAGTATGAAAATATATAGTTTTTGTGATGTTTTTGTCATTTCATTTGTCAGTCATAAGCACAGAAACTCTGATATTGACCAGCATGTTCAAGAACCAGCACAGCCCATGGGAGAAGCCACTGTACTTTAGAGCTTTTACTTTGAACTACAGGCACCTGGAATTCCAAGTATAGAAGACACTAAAAAGGCAGGTGGTGCTAATGGTTTCACCTCTGGCCCTTCTGTAAACACTGAAAACACGTTTGCGTCCAAAATCACTGAGAAAATGTTTTAATCCAAAAGCCTGCCATTGTCTTTGAGATTCCTCTAAAAAGAATGACCTAGAATTTCGCTATAACTAGGTGACTGAGAAAAAAAACTGTGGACTGTAACTGTACGCATTCAAGTAAAAGAAGTTATAGTAATATGAGTCAGAAATTCCCCAAGATTGCAATATCAATCTAGAAAAAATATTATTCCAAATTTTAAACCCACAAAGGTTATTTTATTACTGTCCATGACTTACTATACACACTCAACAACAGAAGATTCTGCATGGAAACATAAGCAGTGGGATAAATATTTCATAGAAATTCAAATTTAAAATGTTTTACTTACCACTAACTCTCCTTAAGAA---TTTATTTCTAAGATACATCTGTTATGAGATATCCAAATTTTGATTTGTTTTCTTATGTAGCACTAATAATATATGGCCCACTGGTATTAATGCTTCACTTATTCTAATTTGATATTTACCATTCTTTGTGTTATAATTTCATAACATTTTTCTTTAACAAACAATGCTCTCTGCCTAACGATCTAGCCCATGGATACTGCATTATCTTATCTAAATTAAGTGACCAGAATGTTGCATTTGTAATCTATAAATGACCTCAAATTCTCCAGCTACAAAGAATTTTTAACCACATTAAAAATAATTCTAACTTCTCCTCAGAACCTGTAGAGTACTGTGTGAAATAACATGGGGTGGGAAGAACAGTGAGAAAGCTATTGCCATAACACAGGCAAAGAAAGAGAAGAGCTGTAACGGACATGCATTTGGGGGTGAAGATAAAAAGACAGTGGAAaaaagtaaaaaaaaaactaaagataattagaaaataaaagaaacagaaTTTATCTTTCTAAATTTCCAGTTAGTTGTGTAGCCTGGCTAGAGATTTCCTCTCTCACCATGCAAAATCAATGCCACCTCTTCAGTCTGGGTGTTTTTAATCTTTTATATGAAGATACAAACTCACTTGAGCAGAAATATTTACTCATAATTGTAAAGCATCTGTTACACACCTAGCACTGTCTTG----TGTTTACTTCATAC-AAATGGCAAGAAA i nomLeu3.chr4 N 0 C 0 a score=1724192.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 223105 3458 + 478999 ATCCCATGGCTTATGAAGCCTCCTGAGTTTTTACCTTAAAAGCATGGCTCAATAAATTCAATAATTATATCAAATATGTCTACTATAAAACATGAAAGAAACAGTAATAAAAACATTTTGCTTAAATAGAATTCTCTAATT-----GAAAAGATTAAATATACTAATTAAATAATAAAATTTAAC--AATATACTCACTGCAAAATTACTCAGATCTTCAAATTATTTAGTTAGCACCATTACATTTTACCGAAAGAGCTATAATCATTAGGCAGGTCACATAAAGAATACTTCATGAACTTTGAAAGAAGAAAATTGTATATTAGGTCTAGCATGAATAGAAGGCAAGCTAGAACAAAGGGTTTGGATGGGGAGATTCTGAACCACAAGATTTTAGAGATGAATGGAAAGCAGAGGAAATAAATTTGCTTTCAGAATCTGTGAGGTTTTAGTTTGCTAGTATATCATAAACACTCATGAAATCATCTGCTTTGTTCTGATATATTTTCCTACTCAGAATAGGTCCACACTC------ACATAAAAACAATTACTTCT---CCAATTCTTTTATATCTGAAGTTTATCTTTAGAGTAATATATTTAGAAATTTTACACCATGTAAATTAAAACTAAAATTTTGTGTTTGTAGAACC--AGAGATAACATGTTCAAAAAAATGTAGGCTGAATTTTCTAAATAGTTATTCAGAATTCAGAAATGTAGGGCTTTTGATTATACTCCTATATAATCTTCAGTATAACCATCACAATAACTTCACAGTTACAAAATAAATAAAAATGTAACACGTGGGAACAATATTCTCTAAATTATTTGAAGTATAAGGCCACTGGGAAAAAGAATCACTACAGATGTTATTCCACCATATTACTTAATGGTATAGTCTTACCATGTTTTACCTACAAGCCTGAGTAAGGTAGAATAAGTTAATGTTGACAGCAGGATGACACTTCAATCAATGCACAAGACCCTTAACATA-TTAAAAATATTTTTTATTTGTTAAAACAAATAAAGTTTACAAATAATCT--GAGACATATCAAAATCCACTCTATTTTATTAGTTTTATGTGCATTTGGTGAAACAATTTTCTTCTAAATTTTACAGTG----TTTATTAATAAAATGCAGAGGATA-TGCACTGAACACCTACCTCATGCATCGCTTACAACACTGTTATCACTTAACCACAAACAGCCTCTCCACTTAGATTTTCTTCATGTATCTTACATTTCCAGGTCCTTAATCTTTTATGGAGAAGTATATAAATGATGACCACCTAATACAGAAGGACCGCTCAGAGCTGTAATGCATCAAACATTGACCACATGCTTCCATATAAACATTAGGAATAAAGGCAAAGCACTAAGTTATTCGAAAGTTTAATTATATCAATACTTGCTATTCAAAACATTTAAAATTATTTTAATGCAAATAAT-TACACTC--AATATAATTTTAAATCTTCAAGAAGCAATCTCCTACTACTTTTATCCTACATACAAATAAATTATCCAATTATTTTAACTTTGGATTATTCTCTATAATGAACACTCTGAATAATTTAACTCATGACAGGATTCATACAATTAACCTTTTAAACATTTGTCttatagtttacatcacattgattacccttttatcagatctcagtagcaccaaaaacctgacaatggtatagacactgcccactagcctctagacac---------cacggtcatatgcccatggcaacgttgaggAGGTTGAGATGATGAAGTCCATCTTGTACATGCCCACCGAGAAACTCACCGGCAGCAGGATGTGCTGATGGCTCTTGCCTCTGCAAAGATCCTTAGGTAGAGGCTGGGGCTGTGAAGGTACCAGGATCTCCTGTAGTTCCTGAAT--GAGAGTCATCATGTAGACACTTGAGAACAGCATTATCTGTTTAAGAAAAACATCTCTGAATAATGACAGAGTGAAAAACAGTCCTCTGATTATGGAGTTTATTGGGAAAAGTGAACAGTATTTACTGACATGCAAATTGATCTGGGTCACATTGGAAGAAGCCACAGTG--TAAAAGATCAGGCTACTACTAACAGGAAAACTGAGAGACCATGAGAACAAATGGAAGGTAAAAATTGTGGATTTCCATTTAAACCTCACCAACCAGGAAATGCTGGGGCTGATGTTGACGACCTGCAGCATGTCCAGGAGGCAGGTGGTACAAATGGAGAGGACCCTGATCACCCTCCTCAGGTAGAAAGATGCCTCATATTTGAAGTCATTCTGAAAATTCAGTGATTCAAAGAGCTGTGGAGACAAGAACACCATGGTGAGAAGGACCACCATGTGGATGAGGGCCACATGACAGACTGGTAGGTAAGTGCGCTCTGGCCTGAGATCCAGAAAAAGCAGAAAAGGAGAAGACGCAGAAAAGAAGGAGAAAAGTGTTGGCTGAGATGCCAATACCAGCTTAGAAATGAAAGGCATTTTTCATGGGAACACAAGTGCAAAGTAATCATCTGAATTACAAAGACAAACATACTTTGTACATCAAAATATGAAGTATAAAAA--ACATTTTGTACTTCACATCATCTGTATTATATATTCTATGGCCAAAATTATCATAAACATTAT------TTTTATTCCACTAATTTTTTTCTTAATTAATCCTATCATATAAATCCTTGatatatatagtgtatgtgtgcatgtatgtatatataatttgatat-----ataatgttgagaatgtattttgaagaatgtatATG----------------AAAAACTGGCTCACTTTTTACAAAGCATTTCTTAATGAAGAGTGATGGTTACATAACAATAACTCACATGTTTGTATAGTTGAGCTAAAGTAA-----ATTTTATGTTAAGGGAAAATAATCACCTAAAGAAAAAGTTGAAAAAAAAGTTTAACTGACTCACATCACAGTACTCAGTTTCTCTTATTATttctttcacttttaagaatgcttataattacattaggcccaaatctgtaattcaagttaatgtttttgttttagagtcagctggttatcaaccttgatttcatctgcagcctgaattcccatttctcatataccataatacatgcctagaacctggtggttagacatggggacctttgcatggcattattccacttaccacaAGTCCTATTAAACGAATC-CCTTAAAATAATTCTGGCTCTGTTCAAGTTTTGTTTTTATCCCAGAGAAATCTCATGAAAGCTTTATTTCATCTCAGGTGGAAATTGCTAAAATCCAGTTTTCAATGCTACAAGTACATGGACTACCTTTTTCTACTTTATGGGATCCATGAATTTGCATTAAGTGATAATTTTCTTGATGCTTCACTTTATACAG----------------------------------AGATACCCTTCCATGGAAAGATGCCTTTCCAAGCCTTGGAAAAACACCAAGGTCACTAATAGTAAAGATAATTCTCCATCTCTTAATCATGA-TATCTCTGTATGAGAACCCTTCATAAAATT s panTro4.chrUn_GL393519 62745 3497 + 413329 ATCCCATGGCTTATGAAGCCTCCCGAGTTTTTACCTTAAAAGCATGGCTCAATAAATTCAATAATTATATCAAATATGTCTACTATAAAACATGAAAGAAACAGTAATAAAAACATTTTGCTTAAATAGAATTCTCTAATT-----GAAAAGattaaatatactaattaaataataaaatttaaC--AATATACTCACTGCAAAATTACTCAGCTCTTCAAGTTATTTAGTTAGCACCATTACATTTTACCGAAAGAGCTATAATCATTAGGCAGGTCACGTAAAGAATACTTCATGAACTTTGAAAGAAGAAAATTGTATATTAGGTCTAGCATGAATAGAAGGCAAGCTAGAACAAAGGGTTTGGATGGGCAGATTCTGAACCACAAGATTTTAGAGATGAATGGAAAGCAGAGGAAATAAATTTGCTTTCAGAATCTGTGAGGTTTTAGTTTGCTAGTGTATCATAAACACTCATGAAATCATCTGCTTTGTTCTGATATATTTTCCTACTCAGAATAGGTCCACACTC------ACATAAAAACAATTACTTCT---CCAATTCTTTTATATCTAAAGTTTATCTTTAGAGTAATATATTTAGAAATTTTACACCATGTAAATTAAAACTAAAATTTTGTGTTTGTAGAACC--AGAGATAACATGTTCAAAAAAATGTAGGCTGAATTTTCTAAATAGTTATTCAGAATTCAGAAATGTAGGGCTTTTGATTATACTCCTATATAATCTTCAGTATAACCATCACAATAACTTCACAGTTACAAAATAAATAAAAATGTAACACGTGGGAACAATATTCTCTAAATTATTTGAAGTATAAGGCCACTGGGAAAAAGAATCACTACAGATGTTATTCCACCATATTACTTAATGGTATAGTCTTACCATGTTTTACCTACAAGCCTGAGTAAGGTAGAATAAGTTAATGTTGACAGCAGGATGACACTTCAATCAATGCACAAGACCCTTAACATA-CTAAAAATATTTTTTATTTGTTAAAACAAATAAAGTTTACAAATAATCT--GAGACATATCAAAATCCACTCTATTTTATTAGTTTTATGTGCATTTGGTGAAACAATTTTCTTCTAAATTTTACAGTGTTTCTTTATTAATAAAATGCAGAGGCTA-TGCACTGAACACCTACCTCATGCATCGCTTACAACACTGTTATCACTTAACCACAAACAGCCTCTCCACTTAGATTTTCTTCATGTATCTTACATTTCCAGGTCCTTAATCTTTTATGGAGAAGTATATAAATGATGACCACCTAATACAGAAGGACCGCTCAGAGCTGTAATGCATCAAACATTGACCACATGCTTCCATATAAACATTAGGAATAAAGGCAAAGCACTAAGTTATTCGAAAGTTTAATTATATCAATACTTGCTATTCAAAACATTTAAAATTATTTTAATGCAAATAAT-TACACTCTGAATATAATTTTAAATCTTCAAGAAGCAATCTCCTACTACTTTTATCCTACATACAAATAAATTATCCAATTATTTTAACTTTGGATTATTCTCTATAACGAACACTCTGAATAATTTAACTCATGACAGGATTCATACAATTAACCTTTTAAACATTTGTCTTATAGTTTACATCACATTGATTATCCTTTTATCAGATCTCAGTAGCACCAAAAACCTGACAATGGTATAGACACTGCCCACTAGCCTCTAGACAC---------CACGGTCATATGCCCATGGCAACGTTGAGGAGGTTGAGATGATGAAGTCCATCTTGTACATGCCCACCGAGAAACTCACTGGCAGCAGGATGCGCTGATGGCTCTTGCCTCTGCAAAGATCCTTAGGTAGAGGCTGGGGCTGTGAAGGTACCAGGATCTCCTGTAGTTCCTGAAT--GAGAGTCATCATGTAGACACTTGAGAACAGCATTATTTGTTTAAGAAAAACATCTCTGAATAATGACAGAGTGAAAAACAGTCCTCTGATTATGGAGTTTATTGGGAAAAGTGAACAGTATTTACTGACATGCAAATTGATCTGGGTCACATTGGAAGAAGCCACAGTG--TAAAAGATCAGGCTACTACTAACAGGAAAACTGAGAGACCATGAGAACAAATGGAAGGTAAAAATTGTGGATTTCCATTTAAACCTCACCGACCAGGAAATGCTGGGGCTGATGTTGATGACCTGCAGCACGCCCAGGAGGCAGGTGGTACAAATGGAGAGGACCCTGATCACCCTCCTCAGGTAGAAAGATGCCTCATATTTGAAGTCATTCTGAAAATTCAGTGATTCAAAGAGCTGTGGAGACAAGAACACCATGGTGAGAAGGACCACCATGTGGATGAGGGCCACATGACAGACTGGTAGGTAAGTGTGCTCTGGCCTGAGATCCAGAAAAAGCAGAAAAGGAGAAGACGCAGAAAAGAAGGAGAAAAGTGTTGGCTGAGATGCCAATACCAGCTTAGAAATGAAAGGCATTTTTCATGGGAACACAAGTGCAAAGTAATCATCTGAATTACAAAGACAAACATACTTTGTACAACAAAATATGAAGTATAAAAA--ACATTTTGTACTTCACATCATCTGTATTATATATTCTATGGCCAAAATTATCATAAACATTAT------TTTTATTCCACTAA-TTTTTTCTTAATTAATCCTATCATATAAATCCTTGATATATATAGTGTATGTGTGCATGTATGTATATATAATTTGATGT-----ATAATGTTGAGAATGTATTTTGAAGAATGTATACG----------------AAAAACTGGCTCACTTTTTACAAAGCATTTCTTAATGAAGAGTGATGGTTACATAACAATAACTCACATGTTTGTATAGTTGAGCTAAAGTAA-----ATTTTATGTTAAGGGAAAATAATCACCTAAAGAAAAAGTTGAAAAAAAAGTTTAACTGACTCACATCACAGCACTCAGTTTCTCTTATTATttctttcacttttaagaatacttataattacattaggcccaaatctgtaattcaagttaatgtttttgttttagagtcagctggttatcaaccttgatttcatctgcagcctgaattcccatttgtcatataccataatacatgcctagaacctggtggttagacatggggacctttgcatggcattattccacttaccacaAGTCCTATTAAACGAATC-CCTTAAAATAATTCTGGCTCTGTTCAAGTTTTGTTTTTATCCCAGAGAAATCTCATGAAAGCTTTATTTCATCTCAGGAGGAAATTGCTAAAATCCAGTTTTCAATGCTACAAGTACATGGACTACCTTTTTCTACTTTATGGGATCCATGAATTTGCATTAAGTGATAATTTTCTTGATGCTTCACTTTATACAGAGATACCCTTCCATGGAAGATACCCTTCCATGGAAGATACCCTTCCATGGAAAGATGCCTTTCCAAGCCTTGGAAAAACACCAAGGTCACTAATAGTAAAGATAATTCTCCATCTCTTAATCATGA-TATCTCTGTATGAGAACCCTTCATAAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7126908 3441 + 72422247 ATCCCATGGCTTATGAAGCCTCCCGAGTTTTTACCTTGAAAACATGGGTCAATAAATTCAATAATTATATCAAATATATCTACTATAAAACATGAAAGAAACAATAATAAAAACATTTTGCTTAAATAGAATTCTCTAATT-----GAAAAGattaaatatactaattaaataataaaatttaacttaatataCTCACTGCCAAATTATTCAGATCTTCAAATTATTTAGTTAGCACCATTACATTTTACAGAAAGAGCTATAATCATTAGGCAGGTCACGTAAATAATACTTCATGAACTCTGAAAGAAGAAAATTATACATTAGGTCTAGCATGAATAGAAGGCAAGCTAGAACAAAGGGTTTGGATGGGGAGATTCTGAACCATAAGAGTTTAGAGATGAATGGAAGGCAGAGGAAATAAATTTGCTTTCAGAATCTGTGAGGTTTTAGTTTGCTAGTGTATCATAAACACTCATGAAATCATCTGCTTTGTTCTGACATATTTTTCTACTCAGAATAGGTCCACACTC------ACACAAAAACAATTACTTCA---CCAATTCTTTTACATCTAAAGTTTATCTTTAGAGTAATATATTTAGAAATTTTACACCATGTAAATTAAAACTAAAATTTTGTGTTTGTAGAACC--AGAGATAACATGTTCAAAAAAATGTAGGCTGAATTTTCTAAATAGTTATTCAGAATTCAGAAATGTAGGGCTTTTGATTATACTCCTATATAATCTTCAGTATAACCATCACAATAACCTCACAGTTACAAAATAAAT---AATGTAACACGTGGGAACAATATTCTCTAAATTATTTGAAGTATAAGGCCACTGGGAAAAAGAATCACTACAGGTGTTATTCCACCATATTACTTAATGGTATAGTCTTACCATGTTTTATCTACAAGCCTGAGTAAGGTAGAATAAGTTAATGTTGGCAGCAGGATGACACTTCAATCAATGCACAAAACCCTTAACATA-TTAAAAACATTT----TTTGTTAAAACAAATAAAGTTTACAAATAATCTAAGAGACATATCAAAATCCACTCTATTTTATTAGCTTAATGTGCATTTGGTGAAACAATTTTCTTCTAACTTTGACAGTGTTTCTTTATTAATAAAATGCAGAGGATATTGCACTGA------ACCTCATGCATCGCTTACAACACTGTTATCACTTAACCACAAACAGCCTCTCCACTTAGATTTTCTTCATGTATCTTACATTTCCAGGTCCTTAATCTTTTATGGAGAAGTATATAAATGATGACCACCTAATACAGAAGGACCGCTCAGAGCTGTAATGCATCAAAAGTTGACCACATGCTTCCACATAAACATAAGGAATAAAGGCAAAGCACTAAGTTATTCGAAAGTTTAATTATATCAATACTTGCTTTTCAAAACATTTAAAATTACTTTAATGCAAATAATATACACTCTGAATATAATTTTAAATCTTCAAAAAGCAATCTCCTACTACTTTTATCCTACATACAAATAAATTATCCAATTATTTTAACTTTGGATTATTCTCTATAATCAACA--CTGAATAATTTAACTCATGACAGGATTCATAAAATTAACCTTTTAAACATTTGTCTTACAGTTTACATCACATTGATTATCCTTTTATCAGATCTCAGTAGCACCAAAAACCTGACAATGGTATAGACACTGCCCACTAGCCTCTAGACAC---------CACGGTCATATGCCCATGGCAGGGTTGAGGAGGTTGAGATGATGAAGTCCATCTTATACATGCCCACCAAGAAACTCACCGGCAGCAGGATGCGCTGATGGCCCTTGCCTCTGGAAAGATCCTTAGGTAGAGGCTGGGGCTGTGAAGGTACCAGGATCTCCTCTAGTTCCTGAAT--GACAGTCATCATGTACACACTTGAGCACAGCATTATTTGTTTAAGAAAAACATCTCTGAATAATGACAGAGTGAAAAACAGTCCTCTGATACTGGAGTTTATTGGGAAAAGTGAACAGTATTTACTGACATGCAGATTGGTCTGGGATACATTGGAAGAAGCCACAGTGTATAAAAGATCAGGCTACTACTAACAGGAAAACT--GAGACCATGAGACCAAATGGAAGGTAAAAATGGTGGATTTCCGTTTAAACCTCACCAACCAGGAAATGCTGAGGCTGATGGTGACGACCTGCAGCACGCCCAGGAGGCAGGTGGTACAAATGGAGAGGCCCCTCATCACCCTCCTCAGGTAGAAAGATGCCTCATATTTGAAGTCATTCTGAAAACTCAGTGATTCAAAGAGCTGTGGAGACAAGAACACCGTGGTGAGAAGGACCACCGTGTGGACAAGGGCCACATGACAGACTGCTAGGTAAGTGGGCTCTGGCCTG------AGAAAAAGCAGAAAAGGAGAAGATGCAGAAAAGAAGGAGAAAAGTGTTGGCTGAGATGCCAACACCAGCTTAGAAATGAAAGGCATTTTTCACGAGAACACAAGTGCAAAGTAATCATCTAAATTAC--AGACAAACATACTTTGTACATCAAAATATGAAGTATAAAAA-CATATTTTGTACTTCACATCATCTGTATTATATATTCTATGGCCAAAATTATCATA------AT------TTTTATTCCACTAATTTTTTTCTTAATTAATCCTATCATATAAATCCTTGATATATATAGTGTATGTGTGCATGTATGTATATATAATTTGATGT-----ATAATGTTGAGAATGTATTTTGAAGAATTTATATG----------------AAAAATTGGCTCACTTTTTACAAAGCATTTCTTAATGAAGAGTGATGGTTACATAACAATAACTCAC--GTTTGTATAGTTGAGCTAAAGTAA-----ATTTTATGTTAAAGGAAAATAATCACCTAAAGAAAAAGTTGAAAAAAAAGTTTAACTGACTCACATCACAGCACTCAGTTTCTCTTATTATttctttcacttttaagaatgcttataattacattaggcccaaatctgtaattcaagttaatgtttttgttttagagtcagctggttatcaaccttgatttcatctgcagcctgaattcccatttgtcatataccataatacattcctagaacctggcagttagacatggggacctttgcgtggcattattccacttaccacaAGTCCTATTAAACGAATCTCCTTAAAATAATTCTGGCTCTGTTCAAGTTTTGTTTTTATCCCAGAGAAATCTCATGAAAGCTTTATTTCATCTCAGGAGGAAATTGCTAAAATCCAGTTTTCAATGCTAAAAGTACATGGACTACCTTTTTCTACTTTATGGGATCCATGAATTTGCATTAAGTGATAATTTTCTTGATGCTTCACTTTATACAG----------------------------------AGATATCCTTCCATGGAAAGATGCCTTTCCAAGCCTTGGAAAAACACCAAGGTCGCTAACAGTAAAGATAATTCTCCATATCTTAATCATGA-TATCTCTGTGTGAGAACCCTTCATAAAATT i ponAbe2.chrUn I 594 C 0 s nomLeu3.chr4 74690749 3480 + 152096393 ATCCCATGGCTTATGAAGCCTGCTGAGTTTTTACCTTAAAAA-ATGGCTCAATAAATTCAATATTTATATCAAATATATCTACCATAAAACATGAAATAAAC---AATAAAAACATTTGGCTTAAATAGGATTCTCTAATTGAGAGGAAAAGATTAAATGTACTAATTAAATAATAAAATTTAAATTAATACACTCACTGTGAAATTACTCAAATCTTCAAATTATTTAGTTAGCACTATTACATTTTAGAGAAAGAACTATAATCATTAGGCAGGTTACGTAAAGAATATTTCATGAACTCTGAAAGAAGAAAATTATATATTAGGTCTAGCATGAGTAAAAGGCAAGTTAGAACAAAGGGTTTGCAAGGGGAGATTCTGAACCATAAGATTTTAGAGATGAATGGGAAGCAGAGGAAATAAATTTGCTTTCAAAATCTGTGAGGTTCTACTTTGCTAGTAAATCATAAACACTCTTGAAATTATCTGCTTTGTTCTGATATATTTTTCTTCTCAAAATAGGTCCACACTCACACTTACACAAAAACAATTACTTCTTCCCCAATTCTTTTACATCTAAAGTTTATCTTTAAAGTAATATATTTAGAAATTTTACACCATGTAAATTAAAACTAAAATTTTGTGTTTGTAGAACCAAAGAGGTCACATGTTCAAAAAAATGTAGGCTGAATTTTGTAAATAGTTATTCAGAATTCAGAAATGTAGCGCTTTTGATTATACTCCTGTATAATCTTCAGTATAACCATCACAATAACCTCACAGTTACAAAATGAATAAAAATGTAACCTATAGGAACAATATTCTCTAAATTATTTGAAGTATAAGGCCACTGGGAAAAGGAATCACTACAGATGTTATTCTACCATGTTACTCAATGGTATAGTCTGACCATGTTTTACCTACAAGCCTGAGTAAGGTAGAATAAGTTAATGTTGGCAGCAGGATGACACTTCAATCAATGTACAACACCCTTATCATATTTGAAAACATTTTTTATTTGTTAAAACAAATAAAGTTTACAAATAATCTAAGAGACGTATCAAAATCCACTCTATTTTATTAGCTTAATGTGCATTTGGTGAAACAATTTTCTTCTAAATTTTACAGTG----TTTATTAATAAAATGCAGAGGATATTGCACTGAACACCTACCTCACGCATCACTTACAACACTGTTATCACTTAACCACAAACAGCCTCTCCACTTAGATTTTCTTCATATAT----------------CTTAATCTTTTATGGAGAAGTATATAAATGATGACCAGCTAATATAGAAGGACCTCTCAGAGCTGTAATGCAACAAAAATTGACCACATGCTTCCACATAAACATTAGGAATAAAGGCAAAGCACTAAGTTATTTGAAAGTTTAATTATATCAATACTTGCTTTTCAAAACACTTAAAATTATTTTAATGCAAATAAT-TACACTGTGAATATAATTTTAAATCTTCAAAAAATAATCTCCTACTACTTTTATCCTACATAAAAATGAATTATCCAATTATTTTAACTTTGGATTATTCTCTATAATCAACACTGTGAATAATTTAACTCATCACAGGATTTATAAAATTAACCTTTTAaaaacatctcttatagtttacatcacattgattatccttttatcagatctcagtagcaccaaaaacctgacaatgctatagacactgcccactagcctctggacacccagggtgacagggtcatatgcccatagcagggttgaggaggttgagatgatgaagtccatcttgtacctgACCACCAAGAAACTCACCAGCAGCAGGATGGGCTGATGGCCCTTTCCTCTGGAAAGATTCTAAGGTAGCAGCTGGGGCTGTGAAGGTACCAGGATCTCCTCTAGCTCCTGAACAAGAGAGTGATCATGTAGACATTTGAGAGCAGCATTGTTTGTTTAAGAAAAACATCTCTGAATAATGACAGAGTGAAAAACAGTTCTCCGATTATGGAGTTTATTGGGAAAAGTGAACAGTATTTACTGACATGCAGATTGGTCTGGGTCACACTGGAAGAAGCCACAGTG--TAAAAGATGAGGTTACTACTAAGAGGAAAACTGAGAGACCATGAGAATAAATGGAAGGTAAAAATGGTGGATTTCCCTTTAAACCTCACCAACCAGGAAGTGTTGGGGCTGATGGTGACGACCTGCAGCGCGCCCAGGAGGCAGGTGGTACAAATGGAGAGGACCCTCATCACCCTCCTCAGGTAGAAAGATGCCTCATATTTGAAGTCATTCTGAAAATTCAGTGATTCAAAGAGCTGTGGAGACAAGAACACCGTGGTGAGAAGGACCACCATGTGGACAAGGGCCACATGACAGACTGGTAGGTAAGCGCGCTCTGGCCTGAGATCCAGAAAAAGCAGAAA---AGAAGATGCGGAAAAGAAGGAGAAAAGTGTTGGCTGAGATGCCAATACCAGCTTAGAAAAGAGAGGCATTTTTGATAGGAACACAAGTGGAAAGTAATCATCTAAACTGCAAAGAGAAACATATTTTGTACATCAAAATATAAAGTACAAAAAACATATTTTGTACTTCACATCATCTATATTATGTATTCTATGGCCAAAATTATCACAAACATCATTACTTATTTTATTCCACTAATTTTTTTC----TTAAACCTATCATATAAATCCTTGATACATATAGTGTACGTGTGCATGTATGTATATATAATTTGATGTATAAAATAATGTTGAGACTGTATTTTGAAGAATTTGTATGATAGGATTAATCAAGAAAAAATCGGCTCACTTTTTACAAAGCATTTCTTAATGAAGAGT-ATAATTATGTAGCAATAACTCATATGCTTGTATAGTTGAGCTAAAGCAAATTTTATTTTATGTTAAAGGAAAATAATCACCAAAAGAAAAAGTTGAAAAAAAAGTTTGACTGACTCACATCATAGCACTCAGTTTCTCTTATTATttctttcactttcaagaatgcttgtaattacattaggcccaaatctgtaattcaagttaatcttttggttttagagtcagctggttatcaactttgatttcatctgcagcctgaattcccctttgtcatatacc---atatattcctagaacctggtgattagacatgggcacctttgcgtggcattattccacctaccacaAGTCCTATTAAACGAACCTCCTTAAACTAATTCTGGCTCTGTTCAAGTTTTGTTTTTATCCCAGAGAAACCTCATGAAAGCTTTATTTCATCTCAGGAGGAAATTGCTAAAATCCAGCTTTAAATGCTAAAAGGACATGGACTACCTTTTTCTACTTTATGGGATCTATGAATTTGCATTAAGTGATAATTTTCTTGATGCTTCACTTTATACAG----------------------------------AAATACTCTTCCAT------------------GCCTTGGAAAAACACTAAGGTCTCTAATAGTAAAGATAATTCTCCATATCTTAATCATGATTATCTCTGTATGAGAACCCTCCATAAAATT i nomLeu3.chr4 C 0 I 311 a score=812007.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 226563 1627 + 478999 TTATTGAATAATTCTGCAATTACTTTCTTCTTTGCCCTGAATACAGTCATCACTATTGTATCCAACTAATTCAGCCCGCAGCTTAGAATAATAGAGCTC-------------tggctcatgcctataattccaccgctttgagaggctgaggcagggacattgcttcagataaacagtttgaaattagcttgagcaacacagtgacaccctgtgtctatcaaaaataagaaagaaattagctaggcatggtggcacgtacctgtggtcccagttacatgggaagctgacatggaaggatcacttgagcataggatcttgaggctatagtgagcCAGTGAGTTGTGATGGTACTAATGCACAAACCACAAATATAAATGTGCAAGGCAATGAAGATGATTTGACAGTATTTTTTACCTCATACTCAGAAATTAACATCTGAGTTAGAAAACTGCTAACCAATTTTAAACCACCTGATATGGATGAGTTTACAAAAAGGAAATTGCATAGTTTATATATCAGTTTTTATTTTTTCTCCCAACACATAATCTAGTATAAGTACACATTTATCTCAATGTCCAGAACCAAACAATGGATAGTTGCCACCAAAATATACTGATGCCATCAACATGATATGGTTCTTTTGTCATGTTAAACCTAAAAGAAGCTCCAGGATAGTATCAGATTAAAGCCATAATAATCTCCATATATTAAATACTGCAGTCTAGTTCCAGAAAATAAACATGGACAATTAATATACAAATAACTACTTACTACTTATGTAGAAATCACTTTTACTAAATATACTGTATGTATTAAAAGTTATATCACAGAAAGAGGTAATACAATTAGATAAAACAACATACGTAAGAATTCTATTTTTTTCTCCCCATAAGGTATCCAGATCACACACTTTAATTCATGCCACACCCTCTCTAATGACTACTACATACCGCAAAAGAATGTATCTGCTAATTATCAAACTTTATTTTTCTCTAATGAAGG-TTTTCAGGTCATTAATGCTGAGTCTGGAGAAAAGAACAGTGGCTCCCATGAACAagggttgacaaatgtaacacacttggttatatttgaatttcaggtaaatgatgaattgttatttgtatatactccagtagttgcttacacatattatacacagatataaaaacattgcatagctatactaaaa-------------------------------------------------------------------------------------------agttatttgttgtttaccccaaatttaaatgtaacttatgttttctctattttatgtcacaaatctgccaCAACTACCATAGAACTATTGTATAATTTGGGACAACATGTTACAAACATGGGAAAACAGAATAAAAGAAAAAATATCAAAGGTTTTATAAAggctgagtgctgtgacttatgcctgtaatttaagcattttaggaggcagcagtgggaggac----tgagcccaagagtttgagacctgcctgggcaacataatgagaaccaatcttcacaaaaaaaattcaaaaattagccaggcattgtaccacctgcctgtagctctggctacttgtgaggctgaggcagcaagttcacttgagcctacacggtcaaggcttctgagacccctgatcaaaccactgcactcattcctgggtgtcagagtgtgaacttgtctcaaaaaaaCa s panTro4.chrUn_GL393519 66242 1628 + 413329 TTATTGAATAATTCTGCAATTACTTTCTTCTTTGCCCTGAATACAGTCATCACTATTGTATCCAACTAATTCAGCCCGCAGCTTAGAATAATAGAGCTC-------------tggctcatgcctataattccaccgctttgagaggctgaggcagggacattgcttcagataaacagtttgaagttagcttgagcaacacagtgacaccctgtgtctatcaaaaataagaaagaaattagctaggcatggtggcacgtacctgtggtcccagttacatgggaagctgacatggaaggatcacttgagcataggatcttgaggctatagtgagcCAGTGAGTTGTGATGGTACTAATGCACAAACCACAAATATAAATGTGCGAGGCAATGAAGATGATTTGACAGTATTTTTTACCTCATACTCAGAAATTAACATCTGAGTTAGAAAACTGCTAACCAATTTTAAACCACCTGATATGGATGAGTTTACAAAAAGGAAATTGCATAGTTTATATATCAGTTATTATTTTTTCTCCTAACACATAATCTAGTATAAGTACACATTTATCTCAATGTCCAGAACCAAACAATGGATAGTTGCCACCAAAATATACTGATGCCATCAACATGATATGGTTCTTTTGTCATGTTAAACCTAAAAGAAGCTCCAGGATAGTATCAGAGTAAAGCCATAATAATCTCCATATATTAAATACTGCAGTCTAGTTCCAGAAAATAAACATGGACAATTAATATACAAATAACTACTTACTACTTATGTAGAAATCACTTTTACTAAATATACTGTATGTATTAAAAGTTATATCACAGAAAGAGATAATACAATTAGATAAAACAACATACGTAAGAATTCTATTTTTTTCTCCCCATAAGGTATCCAGATCACACACTTTAATTCATGCCACACCCTCTCTAATGACTACTACATACCGCAAAAGAATGTATCTGCTAATTATCAAACTTTATTTTTCTCTAATGAAGGTTTTTCAGGTCATTAATGCTGAGTCTGGAGAAAAGAACAGTGGCTCCCATGAACAagggttgacaaatgtaacacacttggttatatttgaatttcaggtaaatgatgaattgttatttgtatatactccagtaattgcttacacatattatacacagatataaaaacattgcatagctatactaaaa-------------------------------------------------------------------------------------------agttatttgttgtttaccccaaatttaaatgtaacttatgttttctctattttatgtcacaaatctgccaCAACTACCATAGAACTATTGTATAATTTGAGACAACATGTTACAAACATGGGAAAACAGAATAAAAGAAAAAATATCAAAGGTTTTATAAAggctgagtgctgtgacttatgcctgtaattgaagcattttaggaggcagcagtgggaggac----tgagcccaagagtttgagacctgcctgggcaacataatgagaacccatcttcacaaaaaaatttcaaaaattagccaggcattgtaccacctgcctgtagctctggctacttgtgaggctgaggcagcaagttcacttgagcctacacggtcaaggcttctgagacccctgatcaaaccactgcactcattcctgggtggcagagtgtgaacttgtctcaaaaaaaCa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7130349 1623 + 72422247 TTATTGAATAATTCTGCAATTACTTTCTTATTTGCCCTGAATACAGTCATCACTATTGTATCCAACTAATTCAGCCCACAGCTTAGAATAATAGAGGTC-------------tggctcatgcctataattccaccgctttgagaggctgaggcagggacattgcttcag----ccagtttgagattagcttgagcaacacagtcacaccctgtgtctatcaaaaataagaaagaaatgagctaggcatggtggcacgtacctgtggtcccagttacatgggaagctgacatggaaggatcacttgagcataggatcttgaggctacagtgaCCCAGTGAGTTGTGATGGTACTAGTGCACAAACCACAAATATAAATGTGCAAGGCAATGAAGATGATTTGCCAGTATTTTTTACCTCATACTCAGAAATTAACATCGGAGTTAGAAAACTGCTAACCAATTTTAAACCACCTGATATGGATGAGTTTACAAAAAGGAAATTGCATAGTTTATATATCAGTTTTTATTTTTTCTCCTAACACATAATCTAGTATAAGTACACATTTATCTCAATGTCCAGAACCAAACAATGGATAGTTGCCACCAAAATATACTGGTGCCATCAACATGATATGGTTCTTTTGTCATGTTAAACCTAAAAGAAACTCCAGGATAATATCAGATTAAAGCCATAATAATCTCCACATATTAAATACTGCAGTCTAGTTCCAGAAAATAAACATGGACAATTAATATACAAATAACTACTTACTACTTATGTGGAAATCACTTTTACTAAATATACTGTATGTATCATAAGTTATATCACAGAAAGAGATAATTCAATTAGATAAAACAACATAGGTAAGAATTCTATTTTTTTCTCCCCATAAGGTATCCAGATCACACGCTTTAATTTATGCCACACCCTCTCTAATGACTACTACATACCGCAAAAGAATGTATCTGCTAATTATCAAACTTTATTTTTCTCTAATGAAGG-TTTTCAGGTCATTAATGCTGAGTCTGGAGAAAAGAACAGTGGCTCCTATGAACAAGGATTAACaaatgtaacacacttggttatatttgaatttcaggtaaatgatgaattgttattagtatatacttcaataattgcttacacatattacacccagatataaaaacattgcatagctatactaaaa-------------------------------------------------------------------------------------------agttatttgttgtttatcccaaatttaaatgtaacttatgttttctctattttatGTCACGAATCTGTCACAACTACCATAGAACTATTGTATAATTTGGAACAACACGTTACAAACATGGGAAAACAGAATAAACGAAAAAATATCAAAGGTCTTATAAAggctgcgtgctgtgactcatgcctgtaatttaagcattttaggaggcaacagtgggaggac----tgagcccaagagtttgagacctgcctgggcaacataatgagaacccatcttcacaaaacaatttcaaaaattagccaggcattgtaccacctgcctgtagctctggctgctcgtgaggctgaggcagcaagttcacttcagcctacacggtaaaggcttccgagagccctgatcaaaccactgcactcattcctgggtgacacagtgtgaacttgtctcaaaaaaGta i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 74694540 1711 + 152096393 TTATTGAATAATTCTGCAATTACTTTCTTATTTGCCCTGAATACAGTCATCACTATTGTATCCAACTAATTCAGCCCACAGCTTAGAATAATACAGCTCTggccaggtgttgtggctcatgccttcaattccaccactttgagaggctgaggcaaggacattgcttgag----ccagtttgagattagcttgagcaacacaacgacaccctgtgtctatcaaaaataaaaaagaaattagctaggcctggtggcatgtacctgtggtcccagttacatgggaagctgatatggaaggatcacttgagcacaggaacttgaggctacagtgagccagtgaGTTGTGATGGTACTAACGCACAGACCATAAATATAAATGTGTAACATAATGAAGATAATTTGACAGTATTTTTTACCTCATACTCAGAAATTAACATCTGAGTTAGAAAACTGCTAACCAGTTTTAAACCACCTGATGTGGATGAGTTTATACAAAGGAAATTGTATAGCTTATGTATCAGTTTTTATTTTTTCTCCTAACACATAATCTAGTATAGGTACACATTTATCTCAATGTCCAGAACCAAACAATGGATAGTTGCCACCAAAATACACTGGTGCCGTCAACATGATATGGTTCTTTTGTCACGTTAAACCTAAAAGAAGCTCCAGGATAATATCAAATTAAAGCCATGATAATCTCCACATATTAAGTATCGCAGTCTAGTTCCAGAAAATAAACATGGACAATTAATATACAAATAACTACTTAGTACTTACATAGAAATCACTTTTACT-AATATACTGCACATA-------TTATATCACAGAAAGAGATAACATAATTAGATAAAACAGCATAGGTAAGAATTCTAATTTTTTCTCCCCATAAGGTATCCAGATCACACACTTTAATAAATGCCACACCCTCTCTAATGACTACTGCATACTGCAAAAGAATGTATCTGCTAATTATCAACCTTT-TTTTTCTCTAACGAAGG-TTTTCAGGT-ATTAATGTTGAGTCTGGAGAAAAGAACAGTGGCTCCCATGAACAAGGGTTGACAAATGTAACACACTTGGTTCTATTTGAATTTCAGGTAAACG----ATTGTTATTTGTATATACTCCAATAACTGCTTACACATATTATACACAAATATACAAACATTGCATAGCTATACTAAAACTATACTAAAACATTACAATATTACAACATTTTAACTAAAACATTAAAACTATACTAAAACCATAcaaacattgcatagctatactaaaagaactatttgttgtttatcccaaatttaaatgtaacgtatgtttccg-tattttatGTCATGTATCTGCCACAACTACCATAGAACTATTGTATAATTTGGAACAACATGTTACAAACATGGGAAAACAGAATAAAAGAAAAAATACCAAAGGTCTTATAAAggccgagtgctgtggctcatgcctgt-----aagtattttaggaggtaacggtgggaggactgcttgagcccaagagttttagacctgcctgggcaacatagtgagaccccattgtcacaaaaaaatttcaaaaattagccaggcattgtagcataagcctgtagctctggctactcgtgaggctgaggcagcaagttcacttgagcctagaaggtcaaggcttctgagagccatgatcaaaccactgcactcattcctggatgacagagtgtgtatttgtctcaaaaaaata i nomLeu3.chr4 I 311 I 4627 a score=1060450.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 228190 4000 + 478999 tcaaaacatgagatgcagcaaactactgagagaaattcacagcagtaaacacctacattaaaaataaacaattctaaattaataacctaaTGtttggc-aaaaatagttaagggctaattaactactcatcacaccttggagaaagaatatcagtgcggcaagcaaaagtcatgtagaatatctaagagaaaagactgaggagtgaggtgcctgggggattcgggctttgaaaattatccacatattcctgagaatccagaagcccataagcatgttcagggtcaatcaagggacaggcaaatgctcacaaagacctacgaagctgttatctctcatgtctgctttacctccaagcactgcacaagcaggaagaaaagaaaacagcaaagttgtaatctttctggctaagtaaacccaactgcaagaactagtagatttatatttgatgtgagcaggcatttgagaaaatctctgtcaaataactagctcacatgaagctaataaagcagagatttttattgctaaacacgacaaaaggatgatattttaaaaataattttgaaaactcaccaaacaaacaagtaaaatttacaataagcaacaaaaaaacccaacgggatgagagagaatattatttcagggttgttgtgatagaaaaagtctagttttcagcaacagcaatgaaatacaaagcgtgcaaataaattaatgaaaaaataatggcccactaataagataacagatattaacagaaacagtcctagaggaatcgtaggcattgaaaaatctagaaaaagtctttaaattacctgtcttaaatgtgctgcaaagataaataacatcaaaaggaaaaacatttcagaagaatagtgtctcatcaaatagaaaatattaatagagatagagattataaactgaagccaaactctaaagttgaaaattaagataactaaaataaaaaattcaccacaaaggttcaacaaaagatttaagtagacgaaagacacaaccagcaagcttgaggtcacttcaattcgtattatcccaactagcagaaataaaaaataatgaataaagatgaacagagcctaagataacaatgggatactataaaatgtgccattacaagcattatgaaaactcccgaaagaagggagaaagataaaatggggcagaaagaacatctgaagaaataatggctaaaaagttcccaagcatgatgaaatacgtgaatctacacattccaaaatctcattgaattca---tagtataaactcaaagaactctacaccaagacaaattacaataaaactttcaaaagctaaagagacaactttgaagaaagttatggagaaaagactactatttgcaatgcatctacactgacattaacaactcactaaaaact--agagtccagaatataatttctcactaaaaactacggagtccagaatatgataggacaatatatttaaagtgtagaaagaaaaaaaaaaagccaacaaagaactctattttcagcaaaactgctcttcaaagatgaaggacatccttgaagacctttgaagacactaagagctatatagattaaaacaaatttaacagcttgtcactagtagacctggtatgcattaaatgacaaaggttatcttttgggttgaaatgaaatgacaaactaggtaataatgcaaggccatatgaaaaaataaagaatgccagtaaaaatgagtacatggcaaaatataaatgccactattaaagaatattttgtaac-----ttttatctattgttcttttttacatgtaatttaaaatactaatgcataaaataattataaatttttgttaatgtcatacaatgcataaagatgtaatatgtgacaaaacaacataacattggaggagcagatctctattgaaacagcttttaaaataaaactgaa-ttacgagcggtattaatttaaagtacagttacacagtgatgagattaattgtcatccttaaggtagccactaaaaacacaactaaagaaagaagtgaaagaggaaatgagaagagaatcaaaactgttttggaaaaatactagaacattaaagatgtcagtaatataagagttaattaacaaaaatatacaagactttagaaaacaactagaaaaatggcagaagtgtgcccttccttataaatagtttaaatagaaattaacatctacaattacaatgcaaagattggcagatggtttaaaaataaacaaaaacatgaactaactttatgttatctacaggagaatctctttagtcctaagctcacaaataggttgaaagtgaaaggatgggtaaaaagattccacacaaatagtaagcaaaataagctggggtggttacccttagacaagataggcattaagacaacattgctataattaattgacacaggaaatttt----atgttaaaaaattataaatctatcaagaagataaaatagttttaaatatgcatgtacctaacaaagaccccaatatatgaagcac-aaatggcagaatggtagaagtagaaaattctcaatgtgaactgctgactttaatataccaACTAGACCTAACGGACGAATTCAGAAACACCTAATCAAAAACCTTGAAATGAGCAAAAATTGATTGCATTTTCAGATTGT---TTTCAAGCAAGCAATTTAACCACCTTGCTATTTTATGGCATGCTTATTTTTTTAAAAAAAGTTATGATGAAATATGCATAACATCATACTCAATACAAAGTTTCTGGTATATTTATAATTATGCAACTATAGCCATGGTATAACTTTAAAATATTTCCACTATCAGGACTAGACAATCAT-----TACTGATTTCCCTTTTATGGACATTCCATTTTATCACCTTTATTGTTTGGTTTGGTTTCGtttttg------------------------agatggagtctctgtcatgcaggcttgagtgcagtggtgcgatctcagctcactgcaacctctgcctgcctcgcgggttcaatagattctcctgactcagcttcctgagtacctgggattacaggcgcccaccactgcacctggctaattt--tgtttttagtagagacatggtttcaccatgttggccaggctgctctcgaactcctaacctcaggcaatccacctgcctcagcctcccaaagtgctagaattaaacgtgtgagccaccatgcctggtcCATTTTTATTACCTCTTTA------TTATTGTGGTATGATTACTattttgtataaatggaatgatacactgtattatgttttgtgtctggtttatttcactt-----aatgcatgtgaggtcagttatgtcattTTTTTTTTTTTTACTAATTTTTTGTATATTTTAGAAAATGCATTTAGAAGAGAATAAAAAACTTTTAAAATAACTTCCATATTTCTCAATGTTGTGCATTTTTTTCAAAAAATAAGCAAATAttttatttttttggtttctttgagacagatcttattctatcaccatggctggagtgaagtaacatgatcatggcttactgcagattctacctcctaggctcaagtagtcttcccacctcaggctaccaagtatctgggaccacagctgcacaccaccatgcccaactaatttttaaattttgtgtatagatggggtctcattatgttgcatgggcttgtctcaaactcctgcgctcatgagattctcctgcctaggcctcccaaagggctgggattacaggtgtgagccaccacacccagccTAtttttttctaaagacagggtctcattctgtcctcagctcaagtgctgtggcgtaatcatagctgaaggcagcctcaatgtactgagctcaagtgatcctccctcactgacccaaagtgctgggattacaggcatcagccaccatgtccagcCTGAAATAATATTTTAATTaaatattaagaaaaatagaagaaataagatctagtgttttgtaacacaataggacaactatagttaactgtaatttattgtataAAAGATAGAAT s panTro4.chrUn_GL393519 67870 4026 + 413329 tcaaaacatgagatgcagcaaagtattgagagaaattcacagcagtaaacacctacattaaaaataaacaattctaaattaataacctaaTGCTTGGCAAAAAATAGTTAAGGGCTAATTAACTACTCATCACACCTTGGAGAAAgaatatcagtgcggcaagcaaaagtcatgtagaatatctaagagaaaagactgaggagtgaggtgcctgggggattcgggctttgaaaattatccacatattcctgagaatccagaagcccataagcatgttcagggtcaatcaagggacaggcaaatgctcacaaagacctacgaagctgttatctctcatgtctgctttacctccaagcactgcacaagcaggaagaaaagaaaacagcaaagttgtaatctttctggctaagtaaacccaactgcaagaactagtagatttatatttgatgtgagcaggcatttgagaaaatctctgtcaaataactagctcacatgaagctaataaagcagagatttttattgctaaacacgacaaaaggacgatattttaaaaatacttttgaaaactcaccaaacaaacaagtaaaatttacaataagcaacaaaaaaacccaacgggatgagagagaatattatttcagggttgttgtaatagaaaaagtctagttttcagcaccagcaatgaaatacaaagtgtgcaaataaattaatgaaaaaataatggcctgctaataagataacagatattaacagaaacagtcctagaggaatcgtaggcattgaaaaatctagaaaaagtctttaaattacctgtcttaaatgtgctgcaaagataaataacatcaaaaggaaaaacatttcagaagaatagtgtctcatcaaatagaaaatattaatagagatagagattataaactgaagccaaactctgaagttgaaaattaagataactaaaataaaaaattcaccacaaagtttcaac-aaagatttaagtagacgaaagacacaaccagcaagcttgaggtcacttcaattcgtattatcccaactaacagaaataaaaaataatgaataaagatgaacagagcctaagataacaatgggatactataaaatgtgccattacaagcattgtgaaaactcccgaaagaagggagaaagataaaatggggcagaaagaacatctgaagaaataatggctaaaaagttcccaagcatgatgaaatacgtgaatctacacattccaaaatctcattgaattca---tagtataaactcaaagaactctacaccaagacaaattacaataaaactttcaaaagctaaagagacaactttgaagaaagttatggagaaaagactactatttgcaatgcatctacactgacattaacaactcactaaaaact--agagtccagaatataatttctcactaaaaactacggagtccagaatatgataggacaatatatttaaagtgtagaaagaaaaaaaaaaagccaacaaagaaccctattttcagcaaaactgctcttcaaagatgaaggacatccttgaagacctttgaagacactaagagctatatagattaaaacaaatttaacagcttgtcactagtagacctggtctgcattaaatgacaaaggttatcttttgggttgaaatgaaatgacaaactaggtaataatgcaaggccatatgaaaaaataaagaatgccagtaaaaatgagtacatggcaaaatataaatgccactattaaagaatattttgtaac-----ttttatctattgttcttttttacatataatttaaaatactaatgcataaaataattataaatttttgttaatgtcatacaatgcataaagatgcaatatgtgacaaaacaacataacattggaggagcagatctctattgaaacagcttttaaaataaaactgaa-ttacgagtggtattaatttaaagtacagttacacagtgatgagattaattgtcatccttaaggtagccactaaaaatacaattaaagaaagaagtgaaagaggaaatgagaagagaaacaaaacagttttcgaaaaatactagaacattaaagatgtcagtaatataggagttaattaacaaaaatatacaagactttagaaaacaactagaaaaatggcagaagtgtgcccttccttataaatagtttaaatagaaattaatatctacaattacaatgcaaagattggcagatggtttaaaaacaaacaaaaacatgaactaactttatgttatctacaggagaatctctttagtcctaaactcacaaataggttgaaagtgaaaggatgggtaaaaagatttcacacaaatagtaagcaaaataagctggggtggttacccttagacaagataggcattaagacaacattgctataattaattgacataggaaattttataaatgttaaaaaattataaatctatcaagaagataaaatagttttaaatatgcatgtacctaacaaagaccccaatatatgaagcacaaaatggcagaatggtagacgtagaaaattctcaatgtgaactgctgactttaacataccaACTAGACCTAACGGACAAATTCAGAAACACCTAATCAAAAACCTTGAAATGAGCAAAAATTGATTGCATTTTCAGATTGT---TTTCAAGCAAGCAATTTAACCACCTTGCTATTTTATGGCATGCTTATTTTTTAAAAAAAAGTTATGATGAAATATGCATAACATCATACTCAATACAAAGTTTCTGGTATATTTATAATTATGCAACTATAGCCATGGTATAACTTTAAAATATTTCCACTATCAGGACTAGACAATCAT-----TACTGATTTCCCTTTTATGGACATTCCGTTTTATCACCTTTATTGTTTGGTTTGGTTTCATTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCATGCAGGCagatggagtctctgtcatgcaggcttgagtgcagtggtgcgatctcagctcactgcaacctctgcctgcctcgcgggttcaatagattctcctgactcagcttcctgagtacctgggattacaggcgcccgccactgcacctggctaattt--tgtttttagtagagacatggtttcaccatgttggccaggctgctctcgaactcctaacctcaggcaatccacctgcctcagcctcccaaagtgctagaattaaacgtgtgagccaccatgcctggtcCATTTTTATTACCTCTTCA------TTATTGTGGTATGATTACTattttgtataaatggaatgatacactgtattatgttttgtgtctggtttatttcactt-----aatgcatgtgaggtcagttatgtca---ttTTTTTTTTTACTAATTTTTTGTATATTTTAGAAAATGCATTTAGAAGAGAATAAAAAACTTTTAAAATAACTTCCATATTTCTCAATGTTGTGCATTTTTTTCAAAAAATAAGCAAATAttttatttttttggtttctttgagacagatcttattccatcaccatggctggagtgaagtaacatgatcatggcttactgcagattctacctcctaggctcaagtagtcttcccacctcaggctaccaagtatctgggaccacagctgcacaccaccatgcccaactaatttttaaattttgtgtatagatggggtctcatcatgttgcatgggcttgtctcaaactcctgcactcatgagattctcctgcctaggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacacccagccTAtttttttctaaagacagggtctcactctgtcctcagctcaagtgctgtggcgtaatcatagctgaaggcagcctcaatgtactgagctcaagtgatcctccctcactgacccaaagtgctgggattacaggcatcagccaccatgtccagcCTGAAATAATATTTTAATTaaacattaagaaaaatagaagaaataagatctagtgtttcgtaacacaataggacaactatagttaaccgtaatttattgtataAAAGATAGAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7131972 4021 + 72422247 tcaaaacatgagatgcagcaaactgttgagagaaattcacagcagtaaacacctacattaaaaataaacaattctaaattaataacctaatgtttggc-aaaaatagttaagggctaattaactactcatcacaccttggagaaagaatatcagtggggcaagcaaaagtcatgtagaatatctaagagaaaagactgaggagtgagatgcctggggcattcgggctttgaaaattatccacatattcctgagaatccagaagcccataagcatgctcagggtcagtcaagggacaggcaaatgctcacaaagacctaagaaggtgttatctctcatgtctgctttaccttcaagcaccacacaagcaggaagaaaagaaaacagcaaagttgtaatctttctgcctgagtaaacccaactgcaagaactagtagatttatatttgatgtgagcaggcatttgagaaaatctctgtcaaataactagctcatgtgaagctaataaaacagagatttttattgctaaacacgacaaaaggacgatattttaaaaataattttgaaaactcactaaacaaacaagtaaaatttacaataagcaacaaaaaaacccaacaggatgagacagaatattatttcagggttgttgtaatagaaaaagtctagttttcagcaaaagcaatgaaatacaaagcgtgcaaataaattaatgaaaaaataatggcccactaataagataacagatattaacagaaacagtcctagaggaatcgtaggcattgaaaaatctagaaaaagtctttaaattacctgtcttaaatgtgctgcaaagataaataacatcaaaaggaaaaacattacagaagaataatgtctcatcaaatagaaaatattaatagagatagagattataaactgaagacaaactctaaagttgaaaattaaggtaactaaaataaaaaattcaccacaaaggttcaacaaaagatttaagcagatgaaagacacaatcagcaagcttgaggtcacttcaattcgtattatcccaactagcagaaataaaaaataatgaataaagacaaacagagcctaagataacaatgggatactataaaatgtgccattacaagcattatgaaaactcctgaaagaagggagaaagataaaatggggcagaaagaacatctgaagaaataatggctaaaaagttcccaagcatgatgaaatacatgaatctacacattccaaaatttcattgaattcaaagtagtataaactcaaagaactctacaccaagacaaattacaataaaactttcaaaagctaaagagacaactttgaagaaagttatggagaaaagactactatttgcaatgcatctacactgacattaacaactcactaaaaactacacagtccagaatataatttctcactaaaaactatggagtctggaatatgataggacaatatatttaaagtgtagaaag--aaaaaaaaagccaacaaaggactctattttcagcaaaattgctcttcaaagatgaaggacatctttgaagacctttgaagacaccaagagctatatagatcaaaacaaattgaacagcttgtcactagtagacctggtctgcattaaatgacaaaggttatcttttgggttgaaatgaaaagacaaactaggtaataatgcaaggccatatgaaaaaataaagaatgccagtaaaaatgagtacatggcaaaatataaatgccactattaaagaatattttgtaacttttattttatctattgttcttttttacatataatttaaaatactaatgcataaaataattataaatctttgttaatgtcatacaatgcataaagatgtaatatgtgacaaaacaacataacattggaggagcagatctctattgaaacagcttttaaaataaaactgaatttatgggtggtattaatttaaagtacagttacatggtgatgagattaattgtcatccttaaggtagccactaaaaatataactaaagaaagaagtgaaagaggaaatgagaagggaatcaaaactgttttggaaaaatactagaacattaaagatgtcagtaatataggaattaattaacaaaaatatacaagactttagaaaacaactagaaaaatggcagaagtgtggccttccttataaatagtttaaatagaaattaacatctacaattccaatgcaaagattggcagatggtttaa----aaacaaaaacatgaactaactttatgttatctacaggagaatctctttagttctaaactcacaaataggttgaaagtgaaaggatgggtaaaaagatttcacaaaaatagtaagcaaaataagctggggtggttacacttagacaagataggcattaagacaacattgttataattaatcgacataggaaattttataaatgttaaaaaattataaatctatcaagaagataaaatagttttaaatatgcatgtacctaacaaagaccccaatatatgaagcacaaaatgacagaatggtagaagtagaaaattctcagtgtgaactgttgactttaatataccaACTAGACCTAACGGACAAATTCAGAAACACCTAATCAAAAACCTTGAAATGAGCAAAAATTGATTGCATTTTCAGATTGTTTGTTTTCAGCAAGCAATTTAACCACCTTGCTATTTTATGGCATGCttattttttttaaaaaa-ttatGATGAAATATGCATAACATCATACTCAATTCAATGTTTCCGGTATATTTATAATTATGCAACTATAGCCATGGTATAACTTTAAAATATTTCCACTATCAGGACTAGACAATCATTACTCTACTGATTTGCCTTTTGTGGACATTCCGTTTTATTACCTTTATTGTTTGGTTTGGTTTCAtttttt------------------------agatggagtctctgtcatgcaggcttgagtgcagtggtgcgatctcagctcactgcaacctctgcctgcctcgcgggttcaatagattctcctgactcagcttcctgagtagctgggattacaggcgcccgccactgcacctggctaattttgtgtttttagt--agacttggtttcaccatgttggccaggctgctctcaaactcctaacctcaggcaatccacctgcctcagcctcccaaagtggtggaattaaacgtgtgagccaccatgcccggccCGTTTTTATTACCTGTTTAACTATGTTATTGTGGTATGATTACTattttgtataaatggaatgatacactgcattatgttttgtgtctggtttatttcacttaacacaatgcaggtgaggtCAGTTATGTCA-----TTTTTTTTTACT--TTTTTTGTATATTTTAGAAAATGCATTTAGAAGAGAATAAAAAACTTTTAAAATAACTTCCATATTTCTCAATGTTGTGCATTTTTTTCAAAAAATAAGCAAATAttttatttttttggtttctttgagacagatcttattctatcaccatggctggagggaagtaacatgatcatggctcactgcagattctacctcctaggctcaagaagtcttcccacctcagtctaccaagtatctgggaccacagctgcacaccaccatgcccaactaatttttaaattttgtgtgtagatgggatctcactatgttgcatgggcctgtctcaaactcctgagctcatgagattctcctgcctaggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacacccagccTAtttttttctaaagacagggtctcactctgtcctcggctcaagtgctgtggcgtaatcatagctcaatgcagcctcaatgtactgagctcaagtgatcctccctcattgacccaaagtgctgggattataggcatcagccaccatgtccagcCTGAAACAATATTTTAATTAAACATTAAGAAaaatagaagaaataagatctagtgttttgtaacacaataggacaactatagttaactgtaatttattgtataaaagatagaat i ponAbe2.chrUn C 0 I 2737 e nomLeu3.chr4 74696251 4627 + 152096393 I a score=789865.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 232190 1602 + 478999 TGTTGAGTAAGGTGTGAGCACCAGTTTAGGGTTTTGGCACATTCTTTACACTTGAAGAGTTTCTATCTG--GTATGAATTATTTGATGTTGAGTATGGGTTGAGTGTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTCTTCACATTTGAAAGGTTTCTTTC-CAGTATGAATTCTCTGATATTGAGAAAGGTGTGAGCTCCTGGTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGAATTTCTCTCCAGTG-TAGATTCTCTGATG-TTGAGTAAGGTGTGAGCCCTAGATAAAAGCT-TTGCTGCATTCTTT-ACATTTGAAAGACTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTCGAGTAAGGTGTGAGCCCCTGTTAAAGGCTTTGCCACATTCTTTATGTGTGAAGTGTTTCTCTCCAGTATGTATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTGTGAAGCTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTTTTTGACACTTGAAAGGTTTCCCTCCAGTGTGAATTCTCTGATGCTGAGTAATGTATGAGCTTCTATTAAA------------------------------------------------------------------------------------GGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGGCTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTAAGTAAGGTATGAGCCTCTGTT----AAAAGCTTTGCCACAGTCCTTACACTTGATAGGTTTGTTTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGCAAGGTGTGAGCTCTTCTTAAAGGCTTTGTCACATTTTTCACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTATGAATTTTCTGATGTCCAAGTTGTAAGCCCCTGGTAAAAGCTTTGCCACGTTCTTTACATTTTACTGATTTCTCTCCAGTGTTAATTATCTTATGTCTCTTCAGATGTGACTGACTAAAGACTATTATACATTTTTTATTACATCTTTGTGAGCTCTCTCCAATATAAGTTCTTCGATGTTGAGTAAGTTTTGAGGATGGGTTAGAAGTTTCACCACATTCATTAGGGTTGTAAGGCTTTTCTTGAATATGGATA-----------------CTTTGAGGATTGATAAAACACTTTCTCACATTCATTACATTTGTAATAGTTTTCTAGAAAATGAGTATTCTGATGTTTACTAATATTTGAGTCATGGCTAAAATTTATCTGATTTTTATTACAAAAGACAGATTCCAAAAATTGATGTTGATATTTACTCACAGGAATACATGGTTCTGTAGGAGTAGCTGGCAGAAACTGAGGCTTCTTCAGAAATATTCTATGTTCTTCATCTCCTTTCACAGTTAAATTTTTGTTATGAGAAGTTGTCAAATATTGGCTACATAAATTATAACATTCTTTTTGTC------CTTCACCTATACTTTCCCAGTTTTTCCATAAGCATAAATTTTCAAGGCCACAGCTCTCATATCTTCCCAGTGTTGCTTTTCCTAGTGTTGCTTTTTTGAATGACTCTTCTATGCCTTGCTCTGGTAAAATGCCTTGGTTGTAATAAGAATATATAGCTCAAAGTAGTAAAAATAACTAATTATTCTACATACTGAATTTAGCTGAATATACTTTACAAATCTAATATGAAATTTTACCAAGCTGAGAACATGAGCACAATGCCATAGTAGAAAACCAACAgaggacagagcaag s panTro4.chrUn_GL393519 71896 1605 + 413329 TGTTGAGTAAGGTGTGAGCACCAGTTTAGGGTTTTGGCACATTCTTTACACTTGAAGAGTTTCTATCTGTTATATGAATTATTTGATGTTGAGTATGGGTTGAGCGTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTCTTCACATTTGAAAGGTTTCTCTC-CAGTATGAATTCTCTGATATTGAGAAAGGTGTGAGCTCCTGGTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGGATTTCTCTCCAGTG-TGTATTCTCTGATG-TTGAGTAAGGTGTGAGCCCTAGATAAAAGCT-TTGCTGCATTCTTT-ACATTTGAAAGACTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTCGAGTAAGGTGTGAGCCCCTGTTAAAGGCTTTGCCACATTCTTTATGTGTGAAATGTTTCTCTCCAGTATGTATTCTCTGATGTTGAGTAACGTGTGAAGCTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTTTTTGACACTTGAAAGGTTTCCCTCCAGTATGAATTCTCTGATGCTGAGTAATGTATGAGCTTCTATTAAA------------------------------------------------------------------------------------GGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGGCTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTAAGTAAGGTATGAGCCTCTGTTTTTAACAAG---TGTAACATTCCTTACACTTGATAGGTTTCTTTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGCAAGGTGTGAGCTCTTCTTAAAGGCTTTGTCACATTTTTCACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTATGAATTTTCTGATGTCCAAGATGTAAGCCCCTGGTAAAAGCTTTGCCACGTTCTTTACATTTTACTGATTTCTCTTCAGTGTTAATTATCTTATGTCTCTTCAGATGTGACTGACTAAAGACTATTATACATTTTTTATTACATCTTTGTGAGCTCTCTCCAATATAAGTTCTTCGATGTTGAGTAAGTTTTGAGGATGGGTCAGAAGTTTCATCACATTCATTAGGGTTGTAAGGCTTTTCTTGAATATGGATA-----------------CTTTGAGGATTGATAAAACACTTTCTCACATTCATTACATTTGTAATAGTTTTCTAGAAAATGAGTATTCGGATGTTTACTAATATTTGAGTCATGGCTAAAATTTATCTGATTTTTATTACAAAAGACAGATTCCAAAAATTGATGTTGATATTTACTCACAGGAATACATGGTTCTGTAGGAGTAGCTGGCAGAAACTGAGGCTTCTTCAGAAATATTCTATGTTTTTCATCTCCTTTCACAGTTAAATTTTTGTTATGAGAAGTTGTCAAATATTGGCTACATAAATAATAACATTCTTTTTGTC------CTTCACCTATACTTTCCCAGTTTTTCCATAAGCATAAATTTTCAAGGCCACAGCTCCCATATCTTCCCAGTGTTGCTTTTCCTAGTGTTGCTTTTGTGAATGACTCTTCTATGCCTTGCTCTGGTAAAATGCCTTGGTTGTAATAAGAATATATAGCTCAAAGTAGTAAAAATAACTAATTATTCTACATACTGAATTCAGCTGAATATACTTTACAAATCTAATATGAAACTTTACCAAGCTGAGAACATGAGCACAATGCCATAGTAGAAAACCAACAgaggacagagcaag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7138730 1586 + 72422247 TGTTGAGAAAGGTGTGAGCACCAGTTTAGGGTTTTGGCACATTCTTTACACTTCAAGGGTTTCTATCTG--GTATGAATTATTTGATGTTGAGTAAGGGTTGAGCGTCTGTTAAAAGCTTTGCC-CATTCCTCACATTTGAAAAGGTTCTCTCTCAATATGAAATCCCTGAAGGTGAAAAAAGTGTGGACCTCTGGTAAAAGCTTTGCACCA-TCTTTATATTGGAAGAATTTCTCTCCAGTGTTGAATTCTCTGATGTTTGAGTAA-GTGTGAGCCTTAGATAAAAGCTGTTGCCGCATTCTTTCACATCTGAAAGACTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTCGAGTACGGTTTGAGCCCCTGTTAAAGGCTTTGCCACATTCTTTATATTTGAAGTGTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTGTGAAGCTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTTTTTGACACTTTAAAGGTTTCTCTCCACTATGAATTCTCTGATGCTGAGTAATGTATGAGCTTCTATTAAA------------------------------------------------------------------------------------GGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGGCTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTATGAGCCTCTGTT----AAAAGCTTTGCCACATTCCTTACACTTGAAAGGTTTCTTTCCAGTATGGATTCTCTGACGTTGAGCAAGGTGTGAGCTCTTCTTAAAGGCTTTGTCACATTTTTCACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTATGAATTTTCTGATGTCCAAGATGTAAGCCCC-GGTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTCACTGATTTATCTCCAGTGTTAATTATCTTATGTCTCTTCAGATGTGACTGACTAAAGACTATTATACATTTTTTATTACATCTTTGTGAGCTCTCTCCAATATAAGTTCTTCGATGTTGAGTAAGTTTTGAGGATGGGTCAGAAGTTTCACCACATTCATTAGGGCTGTAAGGCTTTTCTTGAATATGGATA-----------------CTTTGAGGATTGATAAAACACTTTCTCACATTCATTACATTTGTAATAGTTTTCTAGAAAATGAGTATTCTGATGTTTACTAATATTTGAGTCATGGTTAAAATTTATCTGATTTTTATTACAAAAGACAGATTCCAAAAATTGATGTTGATATTTACTCACAGGAATACACGGTTCTGTAGGAGTAGGTGGCAGAAACTGAGGCTTCTTCTGAAATATTCTATGTTCTTCATCTCCTTTCACAGTTAAATTCTTGTTATGAGAAGTTGTCAAATATTGGCTACATAAATTATAAC-TTTTTTTTGTC------CTTCACCTATACTTTCCCAGTTTTTCCAAAAGCATAAATTTTCAAGGTCACAGCTCCCATATCTTCCC---------------AGTGTTGCTTTTTTGAATGACTCTTCTATGCCTTGCTCTGGTAAAATGCCTTGGTTGTAATAAGAATACATAGCTCAAAGTAGTAAAAATAACTAATTATTCTACATACTGAATTCAGCTGAATATACTTTACAAATCTAATATGAAATTTTACCAAGCTGAGAACATGAGCACAATGCCATAGTAG-AAACCAACAGAGGACAGAGCAAG i ponAbe2.chrUn I 2737 I 5687 s nomLeu3.chr4 74700878 1693 + 152096393 TGTTGAGTAAGGTGTGAGCACCAGTTCAGGGTTTTAGCACATTCTTTACACTTGCAGGGTTTCTACCTG--GTATGAATTATTTGATGTTGAGTAAGGGTTGAGCGTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAAGGTTTCTCTC-CGGTATGAATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTGTGAGCTCCTGGTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGAATTTCTCTCCAGTA-TGGATTCTCTGATG-TTGAGTAAGGTGTGAGCCCCAGATAAAAGCT-TTGCCACATTCTTT-ACATTTGAAAGACTTCTCTCCAGCATGGATTCTCTGATGTCGAGTAAGGTGTGAGCCCCTGTTAAAGGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGAAGTGTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTGTGAAGCTCTGTTAAAAGCTTTGCCACATTCCTT-ACACTTGAAAGGTTTCTCTCCAGTATGCATTCTCTGATGCTGAGTAACGTATGAGCTTCTATTAAAGGCTTTGCCACATTCCTTACATTTGAAAGGTTTCTCTCCGGTATGGATTCTCTGGTGTTCAGTAAGGTATGACCCCCTGTTAAAGGCTTTGCCACATTCTTTACATCTGAAAGCTCTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGTAAGGTATGAGCCTCTGTT----AAAAGCTTTGCCACATTCCTTACACTTGAAAGGTTTCTCTCCAGTATGGATTCTCTGATGTTGAGCAAGGTGTGAGCTCTTGTTAAAGGCTTTGTCACATTTTTTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTATAAATTTTCTGATGTCCAAGATGTAAGCCCCTGGTAAAAGCTTTGCCACATTCTTTACATTTCACTGATTTCTCTCCAGTGTTAATTATCTTACGTCTCTTTAGATGTGATTGACTAAAGACTATTATACATTTTTTATTACATCTTTGTGAGCTCCCTCCAATATAAATTCTTTGATGTTGAGTAAGTTTTGAGAATGGGTCAGAAGTTTCACCACATTCGTTAGAGTTGTAAGGCTTTTCTTGAATATGGATATTTTCAGGGAAAATAAGCTTTGAGGATTGGTAAAATACTTTCTTACATTCATTACAATTGTAATAGTTTTCTAGAAAATGAGTACTATGATGTTTACTAATATTTGAGTCATGGTTAAAGTTTACCTGATTTTTATTACAAAAGACAGATTTCAAAAATTGATGTTGATATTTACTCATAGGAATACATGGTTCTGTAGGAGCAGCTGACAGAAACTGAGGCTTCTTCTGAAATATTCTATGTTCGTTGTCTCCTTTCACAGTTAAATGTTTGTTATGACTAGTTGTCAAATATTGGCTACATAGATTATAACATTCTTTTTGTCCTTCATCTTCACCTACACTTTCCCAGTTTTTCCATAAGCATATATTTTCAAGGCCACAGCTCCCATATCTTCCC---------------AGTGTTGCTTTTTTGAATGAATCTTCTATGCCTTGCTTTGGTACAATGCCTTGCTTGTAATAAGAATACACAGCTGAAAGAAGTAAAAATAACTAATTATTCTACATACTGATTTCAGTTGAATATACTTTACAAATCTAATATGAAATTTTACCAAGCTGAGAACATCAGCACAATGCCATAGTAGAAAACCAagaaaggacagagcaag i nomLeu3.chr4 I 4627 C 0 a score=508670.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 233792 2024 + 478999 atggctaaatagaaggctccagtgatcatttcccctggaaggacaccaatataacaactatctattaaaaaa-------caaacaaaaaccttcataagaataaaggcgagcactcacagtacctggttttaaccctgcagtacacaaagaggcactaaaacagggtaggaaagacagtcttgaatcactaatgccactcctcactcatgccctggcagtagtcacatgctatgtagacagaatctgtacacttgggagagggagagcactgggattgtgagcattgaactcagtgctgccctatcatagcagaaagcaaaactggaatgaactcagctgatgcctgcccacagagggtgtgtttcaactggccctggacagaggggaatcaccc-tcccagtgattggaacttgagttctggcaagcttcaccaccatagtctaaaatgctctggggccctaaagaaacttaaaa--cagtctaggtcacaaggacagcaactcccagg-----tgtcatgctgaactgggcttagagccagtggacttgggggccacattacctactaagatacaagctggggcagctaagagagttcttataccacccctcctccaaactgaggctgcacagctcacagattcaagagaccacttccatctacttaagaagacag-aaagagtaaacaggactttgtcttgtattttggataccagcaaggccaccagtcagagttataaaacacccttctcagccactagctcctaattaaaatttctaggtacatactggactataaggaaatctgctgccttgaatgaagaaatccggtactaacaagacccatcaactgctaagtaaagggcccttggcctggaataacctgcagtgataaccaggtagtttgctgtgagctttcattgagactctgaggcttgctagaatcaggtgagactcggcacattcacaactgtggtggctacagggagacactgaaaaaggtagaggaaaaact--agagaacttcatcttgcaacttaggtcccagcatggccaaagagaggaagagcacc-agtgggctcttggggtcccttattccaggtcttggcacttggatggcacttctggacctgtactgggacagaagggacaccactgaccaaaaggatgagtaccaggccaagcatcattcactataagtgaactaaagagccttgaaccttaagagaacattggtggaagcctggcagtattcccgatgggcctgtggtgatggcagcaataggatgaggcccctctgcctgttgagtaaggagggaaaaatgggaagaaccgaatttcatggtttaattgctagctctaccacagtacaatagaacacaaagtagactcctaaggttattgactccagcccctggctcctggatggcaccactgggcttgcccagaacctgagggaactcactactctgaaggaaaggatacaaacctggctggcttaccacctacagattataaagccccaagaccttgagcaattactggtggtaccaggtag-ggttacagctcaccatgggtgtgatcaagtgctgtgctggtttcaggtctgacccactgcagtcctaCtgatagcaacagaagacaaactcctaggcagacagggatgggtgcactggtgaaactcgaccttcaaggaaacaacagtctaaaaagcctgaaaactgagctaccagttccagaaagaattcatggactagagtgagaacttccatccctgtctaacctgctctctattggttctttgagaatgatgccttttaaccaattgaatggtgtcttttccaagcccacccatgaaccaatcagcatgcattctcctgttttaaacccataaaaatcccagactcagcctcacagatggctacctactttcaggttccctcttgctgctgatagcAAGaccagaaaacaaagaacaaaatggcaagagtaagtctttatataatcaataacaacactgaatgtaaatggactaaatt s panTro4.chrUn_GL393519 73501 2030 + 413329 atggttaaacagaaggctccagtgatcatttcccctggaaggacaccaatataacaactatctattaaaaaa-------caaacaaaaaccttcgtaagaataaaggcgagcactcacagtacctggttttaaccctgcagtacacaaagaggcactaaaacagggtaggaaagacagtcttgaatcactaatgccactcctcactcatgccctggcagtagtcacatgctatgtagacagaatctgtacacttgggagagggagagcactgggattgtgagcattgaactcagtgctgccctatcatagcagaaagcaaaactggaatgaactcagctgatgcctgcccacagagggtgtgtttcaactggccctggacagaggggaatcaccc-tcccagtgattggaacttgagttctggcaagcttcaccaccatagtctaaaatgctctggggccctaaagaaacttaaaa--cagtctaggtcacaaggacagcaactcccaggtaagatgtcatgctgaactgggcttagagccagtggacttgggggccacattacctactaagatacaagctggggcagctaagagagttcttataccacccctcctccaaactgaggctgcacagctcacagattcaagagaccacttccatctacttaagaagacag-aaagagtaaacaggactttgtcttgtattttggataccagcaaggccaccagtcagagttataaaacacccttctcagccactagctcctaattaaaatttctaggtacatactggactataaggaaatctgctgccttgaatgaagaaatccggtactaacaagacccatcaactgctaagtaaagagcccttggcctggaataacctgcagtgataaccaggtagtttgctgtgagctttcattgagactctgaggcttgctagaatcaggtgagacttggcacattcacaactgtggtggctacagggagacactgaaaaaggtagaggaaaaact--agagaacttcatcttgcaacttaggtcccagcatggccaaagagaggaagagcaccaagtgggctcttggggtcccttattccaggtcttggcacttggatggcacttctagacctgtagtgggacagaagggacaccactgaccaaagggatgagtaccaggccaagcatcattcactataagtgaactaaagagccttgaaccttaagagaacattggtggaagcctggcagtattcccgatgggcctgtggagatggcagcaataggatgaggcccctctgcctgttgagtaaggagggaaaaatgggaagaaccaaatttcatggtttaattgctagctctaccacagtacaatagaacacaaagtagactcctaaggttattgactccagcccctggctcctggatggcaccactgggcttgcccagaacctgagggaactcactactctgaaggaaaggatacaaacctggctggcttaccacctacagattataaagccccaagaccttgagcaattactggtggtaccaggtag-ggttacagctcaccatgggtgtgatcaagtgctgtgctggtttcaggtctgacccactgcagtcctaCtgatagcaacagaagacaaactcctaggcagacagggatgggtgcactggtgaaactcgaccttcaaggaaacaacagtctaaaaagcctgaaaactgagctaccagttccagaaagaattcatggactagagtgagaacttccatccctgtctaacctgctctctattggttctttgagaatgatgccttttaaccaattgaatggtgtcttttccaagcccacccatgaaccaatcagcatgcattctcctgttctaaacccataaaaatcccagactcagcctcacagatggctacctactttcaggtcccctcttgctgctgatagcAAGaccagaaaacaaataacaaaatggcaagagtaagtctttatataatcaataacaacactgaatgtaaatggactaactt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4 74702571 2024 + 152096393 atggctaaatagaaggctccagtgatcatttcccctgcaaggtcaccaatttaacaaccatctattaaaaaagaaaaagaaaaaaaaaaccttcataagaataaaggtgaacactcacagtacccggttttaaccttgtactac--------tcactaaaagagggtaggaaagaccatcttgaatcactaatgccacccctcactcatgccctggcagctatcacatactatgtagatagaagctgtacacttgggagacagagagcactgggattgtgagcactgaactcagtgctgccctatcacagcaggaagcaaaactggaatgcactcagctgatgcctgcccacagaggaagtatttcaactggccctgggcagagaggaatcacccttcccagtgattgaaacttgagttctggcaagcctcatcgacatagtctaaagtgctctggggccctaaacaaacttgaaaggcagtctaggtcacaaggactgcaactcccaggtgagtcctagtgctgaactgggcttagagccagtggacttggggtccacattgcctactgagatacaagctggggtggctaagagagtgcttacaccacccctcctccaaactaaggctgcacagctcacagattcaagagaccacgtccatctacttaagaagacagaaaagagtaaacaggactttgtcttgcattttggataccagcaaggccaccagtcagagttgtgaaac-ctcttttcagccactagctcctagttaaaatttctaggtacacgctgggccagaaagaaatctgctgccttgaatgaaaaattatggcactgacaagacccatcaactgctaagtaaagagccctcggcctggaataacctgcagtgataaccaggtagtttgctgtgagctttcactgggactctgaggcttgctagaatcaggtgagacttagcacattcacaactgtggcggctacagggagtcactgaaaaaggtagaggaaaaactacagaggatttcatcttgcaacttaggtcccagcatgaccaaagggaggaagagcaccatgtgggctcttggggtcccttattccaggccttggcacttggatggcacttctggacctgcactgagacagaaggggcaccactgacaaaaagggtgagtaccaggccaagcatcattcactacaagtgaactaaagagccttgaatcttaagggaacatcggtggtagcctggcggtattccccatgggcctgtggtgatggtagcaatgggataaggctcctctgcctgtggaataaggagggaaaaatgggaagaactgaatcttacggtttaattgctagctctaccacagtacaacagaaaacgaagtagactcctaaggttattgact--ggcccctggctcctggatggcaccgatgggcttgcccagagcctgagggaactcactactctgaaggaaaggatacaagactggctggcttaccacctacagattataaagccccaggaccttgagcaattactggtggtaccaggtagttgttacagctcaccttgggtgtgatcaactgctgtgctggtttcaggtctgacccactgcagtcctaCtgatagtgacagaagacaaactcctacgcagacagggatgggt-ccttcgtgaaactcgaccttcaaggaaaggacagtct--aaagcctgataactgagctaccagttccagaaagaattcatggactggagtgagaacttccatccctaacccact--ctctctattggttctttgagaatgattccttttaatcaattgaatggtgccttttccaagcccacccatgaaccagtcagcatgcattcccccattctaaatccataaaaatcctggactcagcctcacagatggctacccgctttcaggtgccctcttgctgttgacagcAAGaccagaaaac----aacaaaatggcaggagtaaatctttatataatcaataacaacactgaatgtaaattgactaaact i nomLeu3.chr4 C 0 N 0 e ponAbe2.chrUn 7140316 5687 + 72422247 I a score=381954.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 235816 4159 + 478999 ctccaatcaaaagacacagagtggctaaatggatacaaaaattaagacccagcgatttgttgcctacaagaaacacacttcacctataaacacatagattaaaaagatttaaaaaaattccatgtcaaagaaaacaaacaaaaatagcagtagttgctacacttatgtcagacaaaatagatttcaagacaaaactagaagaagagacaaagatggtcactctataataataatgagtttaattcagcatgaggatg-taagaatgttacatacatatgcatccaacactgaagtactcagatatattaagccagtattattagagctaaagagagagacaggctccaatataataatacctggagaatgcaacatcacactttcagcattggataaatcttccagacagaaaaccaacaaagaaatctcaggcctaatctgcactataaaccaaatggacacaatggatatttacagaacattttatccaatggcttcagactacacattttgctctgcagtgcatgaatcattctcatggatagaccatatgttaggtcacaaaacaagtcttaacacattttaaaaattaaaataatatcaagcatcttttgtgactacaataaaaaaacctagaaatcaataacaagacaaatttttgaaactatacaaacacatagaatttaaacaatatgctcctgaaaggccagtgggtcaatggggatattaataaataaattgaaatatttctgtaatatgtcacaatggaaatacttaggatttacagtaaaagcagtactaaaagtttataactaaaagtgtctacataaaaaaattcaaatgaacaacttcatgacagatttaatgcaatttccatgaaaataccaccagtattcttcacagaactagaaaaaaaaccctaaaattaatatggatcaaaaaagtgcctacatagccaaagtaatactaaccaaacaaataaataaaaaatatggggtcatcacattaccctacttcaaattatactacaaggctatagttatcaaaacaacatggtattggtattaaaatttacacacagaccaatgaagcaaaatacagaatccagaaattaagccaaacacaggcaactaaactaatcatcaacaaggcatataaagacacaaattggggaaagaacaccctattcaataaatggtgctaggaaatactggcaagccacacgcagaggaataaaactggatccccatctctgaccttatacaaaaatcaattcaagatggatcaaatatttcaatctaaggcctgaaagcatatgaattctaaatgataacataagaaaaaaaactcttctcgacattgatttaggcaaagaattcatgactaagaccccaaaagcaaatgcaacaaaaacaaacataaataaatgggacctaatttaactaaaaagcttctgcactgcaaaggaaataagcagcagagtacacagacaacccacagagtagcagaatatatttgcaaactacacatctgacaaaaagctagtatccagaatctataaggaactcaaagaaattagcaaaataataattccatcaaaaagtaggcaaagaaaatgaatatatattttttcaaaagaagatatacaaacagctaataacaacctaaaaatgctcaacatcaataatcaaggaaatacaaatgaaaaccacagttagatatcaaataactcctacaaaaatggccattttttgtaggccaaaaaaagtcaagaaaacaacagatgttggcattggatgtggtgaaatgggaacacttaacaaaataatgtcatttgcagcaacttggatggagccgaaggtcattattctaagtgaaataactcagaaatggaaaactagatatcgtatgttcttacatataagtgggagctaatctatgaggatgcaaaggcataagaataatgtaaaagactttggggacttgagggggaaggctgggaggcgggtgagggataaaaaactacatattaaggacagtgtgcactgctcaggtgacaagtgcactgaaatctcagaaaacacactaaagaacttatccatgtcatgaaaaaccacctgtatttccaaaacaattgacacttaaaaaaaaaaaacctaatgacatatcttagagagctagaaaaacaagagcaaaccaaaccaaaattagaagaaaagaaataataaagatcaaagcagaaataaatgaatttgaaataaaatacaaaaggtcaataaaatgcaaagttgttttttggaaaaaaaaaaaaagaaacctgacagacctttactcagactaagaaaaaaaaaaaaaaaaaactcagcaggcagtggctcatgcctgtaatcccaggactttaggaggctgaggcgggcggctggatcacctgaggtcaggagttcaagatcagcctggccaacatggcaaaaccccgtctctattaaaaaacacaaaaattagccaggcgtggtggtgggcgcctgtaatctcacctactcaggaggctgaggcaggtagaattgcttgaactcgggaggcggaggttgcagtaagctgagatcgagccactgcactccagcctgggcaacagagcaagtctccatctcaaaaacaaataaataaataaaagaataaaaggaaaagactcaaataatatcaaagatgaaaaaggagacatttcaactctacaacttatactgcaggaattcaaaagatcattagtgagtactatgagcagatagatgccataaattggaaaatctagaacaaatggataaatttctagacacatagaacctaagaagattgaattattaagaaatccacaacctgaatacacaaacaagacgtgatgagatccataatacaaagcctcccatcaaagaaaagcctgaaatctgatggtttcactgaatttgacaaaacatgtataaaactaatagcaatcccacttaaactatttcaaaacagaggaggaggaaatactttcaacctcgttctgtaaggcaagcattactctcatactaaaatcagacaaatgcatatcaaaaaaatctataggccaatatcagcaatagatgcaaaatttctcataaaaatactggcaagtaaaattcagcaacagattaaaagtttattattcctcatcatcaagtaggatttatctcatggatgcaaagatacttcaacatatgcaaatcaattaatgtaatataccatatcaacaaaagaaagaacaaaaaccacatgatcattttaattgatcctgaaaatcatttgacaaaacttaatatctcctcatgaaagaaaccctcaaaactatagaagaaacatacatgcagccaaaaaacacatggaaaaatgctcaccatcactggccatcagagaaatgcaaatcaaaaccacaatgagataccatctcacaccagttagaatggcaatcattaaaaagtcaggaaacaacaggtgctggagaggatgtggagaaataggaacacttttacactgttggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaataccatttgacccagccatcccattactgggtatatacccaaaggactataaatcatgctgctataaagacacatgcacatgtatgtttattgcagcactattcacaatagcaaagacttggaaccaacccaaatgtccaacaatgatagactggattaagaaaatgtggcacatatacaccacggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcctttgtagggacatggatgaaattggaaatcatcattctcagtaaactatcgcaagaacaaaaaaccaaacaccacatattctcactcataggtgggagttgaacaatgagaacacatggacccaggaaggggaacatcacactctggggactgttgtggggtggggggaggggggagggatagctttaggagatatacctaatgctaaatgacgagttaatgggtgcagcacaccagcataccacatgtatacatatgtaactaacctgcacattgtgcacatgtaccctaaaacttaaagtataataaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 75531 4152 + 413329 ctccaatcaaaagacacagagtggctaaatggatacaaaaattaagacccagcgatttgttgcctacaagaaacacacttcacctataaacacatagattaaaaagatttaaaaaaattccatgtcaaagaaaacaaacaaaaatagcagtagttgctacacttatgtcagacaaaatagatttcaagacaaaactataagaagagacaaagatggtcactctataataataatgaggttaattcagcatgaggatgttaagaatgttacatacatatgcatccaacactgaagtactcagatatattaagccagtattattagagctaaagagagagacaggctccaatataataatacctggagaatgcaacatcacactttcagcattggataaatcttccagacagaaaaccaacaaagaaatctcaggcctaatctgcactataaaccaaatggacacaatggatatttacagaacattttatccaatggcttcagaatacacattttgctctgcagtgcatgaatcattctcatggatagaccatatgttaggtcacaaaacaagtcttaacacatttaaaaaattaaaataatatcatgcatcttttgtgactacaataaaaaaacctagaaatcaataacaaaacaaatttttgaaactatacaaacacatagaatttaaacaatatgctcctgaaaggccagtgggtcaatggggatattaataaataaattgaaatatttctgtaatatgtcacaatggaaatacttaggatttacagtaaaagcagtactaaaagtttataactaaaagtgtctacataaaaaaatgcaaataaacaactttatgacagatttaatgcaatttccatgaaaataccaccagtattcttcacagaactaggaaaaaaaccctaaaattaatatggatcaaaaaagtgcctacatagccaaagtaatactaaccaaacaaataaataaaaaatatggggtcatcacattaccctgcttcaaattatactacaaggctatagttatcaaaacaacatggtattggtattaaaatttacacacagaccaatgaagcaaaatacagaatccagaaattaagccaaacacaggcaactaaactaatcatcaacaaggcatataaagacacaaattggggaaagaacaccctattcaataaatggtgctaggaaatactggcaagccacatgcagaagaataaaactggatccccatctctgaccttatacaaaaatcaattcaagatggatcaaatatttcaatctaaggcctgaaagcatacgaattctaaatgaaaacataagaaaaaaaactcttctcgacattgatttaggcaaagaattcatgactaagaccccaaaagcaaatgcaacaaaaacaaacataaataaatgggacctaatttagctaaaaagcttctgcacagcaaaggaaataagcagcagagtacacagacaacccacagagtagcagaatatatttgcaaactacacatctgacaaaaagctagtatccagaatctataaggaactcaaagaaattagcaaaataataattctatcaaaaagtaggcaaagaaaatgaatatatattttttcaaaagaagatatacaaacagctaat---aacctaaaaatactcaacatcaataatcaaggaaatacaaatgaaaaccacagttagatatcaaataactcctacaaaaatggccattttttgtaggcc-aaaaaagtcaagaaaacaacagatgttggcattggatgtggtgaaatgggaacacttaacaaaataatgtcatttgcagcaacttggatggagctgaaggtcattattctaagtgaaataactcagaaatggaaaactagatatcgtatgttcttacatataagtgggagctaatctatgaggatgcaaaggcataagaataatgtaaaagactttggggacttgagggggaaggctgggaggcgggtgagggataaaaaactacatattaagtacagtgcgcactgctcaggtgacaagtgcactgaaatctcagaaaacacactaaagaacttatccatgtcatgaaaaaccacctgtatttccaaaacaattgacacttaaaaaaaaaaaacctaatgacgtatcttagagagcgagaaaaacaagagcaaaccaaaccaaaattagaagaaaagaaataataaagatcaaagcagaaataaatgaatttgaaat-aaatacaaaaggtcaataaaatgcaaagttgtttctgg---aaaaaaaaaaagaaacctgacagacctttactcagactaagaaaaaaaaacacaaaaaactcagcaggcagtggctcatgcctgtaatcccaggactttaggaggctaaggcgggcggctggatcacctgaggtcaggagttcaagatcagcctggccaacatggcaaaaccccgtctccactaaaaaacacaaaaattagccaggcgtggtggtgggcgcctgtaatctcacctactcaggaggctgaggcaggtagaattgcttgaactcgggaggcggaggttgcagtaagctgagatcaagccactgcactccagcctgggcaacagagcaagtctccatctcaaaaataaataaataaataaaagaataaaaggaaaagactcaaataatatcaaagatgaaaaaggagacatttcaactctacaacttatactgcaggaattcaaaagatcattagtgagtactatgagcagatagatgccataaattggaaaatctagaacaaatggataaatttctagacacatagaacctaagaagattgaattattaagaaatccacaacctgaatacacaaacaagatgtgatgagatccataatacaaagcctcccatcaaagaaaagcctgaaatctgatggtttcactgaatttgaccaaacatgtataaaactaatagcaatcccacttaaactatttcaaaacagaggaggaggaaatactttcaacctcgttctgtaaggcaagcattactctcatactaaaatcagacaaatgcatatcaaaaaaatctataggccaatatcagcaatagatgcaaaatttctcataaaaatactggcaagtaaaattcagcaacagattaaaagtttattattcctcatcatcaagtaggatttatctcatggatgcaaagatacttcaacatatgcaaatcaattaatgtaatataccatatcaacaaaagaaagaataaaaaccacatgatcattttaattgatcctgaaaatcatttgacaaaatgtaatatctcctcatgaaagaaaccctcaaaactatagaagaaacatacatgcagccaaaaaacacatgaaaaaatgctcaccatcactggccatcagagaaatgcaaatcaaaaccacaatgagataccatctcacaccagttagaatggcaatcattaaaaagtcaggaaacaacaagtgctggagaggatgtggagaaataggaacacttttatactgttggtgggactgtaaactagttcaaccattgtggaagtcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaataccatttgacccagccatcccattactgggtatatacccaaaggactataaatcatgctgctataaagacacatgcacatgtatgtttattgcagcactattcacaatagcaaagacttggaaccaacccaaatgtccaacaatgatagactggattaagaaaatgtggcacatatacaccacggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcctttgtagggacatggatgaaattggaaatcatcattctcagtaaactatcgcaagaacaaaaaaccaaacaccacatattctcactcataggtgggagttgaacaatgagaacacatggacccaggaaggggaacatcacactctggggactgttgtggggtggggggaggggggagggatagctttaggagatatacctaatgctaaatgacaagttaatgggtgcagcacaccagcataccacatgtatacatatgtaactaacctgcacattgtgcacatgtaccctaaaacttaaagtataataaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7140316 5687 + 72422247 I a score=565526.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 239975 2129 + 478999 aagaaacatacctcagcatataaaagttatatatagatatatagatatcacatatagtatgatactaaatggggaaaaatgaaaagcttttcctctaagattgacaacatgacagagatgcacactttcactactgttattcaacacatggcagctagagcaattagcaagagaaaaaataaagggcaagcaaattggaaaggaagaagtcaaattatgtttgtttgcagatgatgtggtcttatatttggaaaatcctaattcactaaaacactatgagaactcacaattttagtcaagatataggattaaaaagttagcagcatttctatatgccaacagtgaacaatgtgaaaaagaaatcaagagagtggtcccatttacgatagcctcaaattaaaattaaatacctaggaattaaccaaagacgttaaagatctctacaatgaatactataaaacattgatgcaagaaatttaaaaagacaaaaatatgtattttatgttcatgaataagaatcagtatttttagtgtctatattaaccaatgcaatctacagacttaatgcaaccctatcaaaacatc---gatactcttcacagaaacaggaaaaacaatcctataatgcagacagaaccacgaaagactcagaatagccaaagttcttgtaagaaaaaattttgcctttatgtgcctggcttatttgtcttaccatatgatctccagttccatccatgttgttgcaaataacaggatcttattctttataagtgaaaagtactcctgggggtgtgtatgtacatttgctttatccattcatctgttgacatgttgcttctaaatcttggctaatgtaaacaatgctgtgtgaaaggaaaacaaatctttggaccccaaaatcactaagctaaagggaaaagtcaagttgggaactgcttagggcaaatctgc-ttctcattctattcagtcatccctctgctcactgCaagtcctaccagtacacaggagaaaatttaaaaatcaataaaagcaaaataattcaatgaaaacaaaaaagcaactgtcattatctccataagaggtgactgtgtaggtagaaaatccaaaTGTAACTGACTAGCTGTTAGCTTAACTGTACAAAACACTATTAATATTCCTAAATTCTATCCATACTTAGAAAATAAAATACAATAGCAAACTTCACCTGCTCCACCCTATATTACTCCCTATGTTGATAACATTTGAGATGTCTCATGTAGCTGATTTATTTAAATATTTGCACCAATTCAGATTTAATCAAattttactattatttttacttctttgtttttgccgactattgattattattattatttttttaagacagtctcactctgtggcccaggcttgagtgcagtggcacaatctcagctcactataacctctgcctcctcggttcaagtgattgtcctgcctcagtctcccgagtagctgggattgcaggtgcacaccaccacacctggctaatttttgtatttttagtatagacggagtttcaccatgttggccacgctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacacccagcctgattagtatttttaATGCATTTCTTTGAATTCATTTTCTCATCTTTAGGGAGTGCATCCTCCAGTTTTGTTTTTTTGGTTTTTTTTCCCCTCACAGAGTTTACAGGTAGTCAGTAGTATATACTTCTGAATAAATTCTGTCTTAGGTTGGTTTCAGtgatagtttggctgactgtaaatttctatttccaatgttcttttctgtgagaactcactattgatttctgcacttctttttgcttctgatgtcaccaccctgatcaaatcaaagtctctctcattcctttgaagcaaatcagtttatatcattctggtgatataaaatgtgaccttcatgtttctgggtatgctttttgtttttgttgttttccatttatccatttcaacataacatgaacttttataacaaaagcacattatccttttccagtttctggaagtttttctcaattatttttGTTACTaattctttgaaatttattaaaactgg s panTro4.chrUn_GL393519 79683 2125 + 413329 aagaaacatacctcagcatataaaagttatatatagatatatatatatcacatatagtatgatactaaatggggaaaaatgaaaagcttttcctctaagattgataacatgacagggatgcacactttcactactgttattcaacacatggcagctagagcaattagcaagagaaaaaataaagggcaagcaaattggaaaggaagaagtcaaattatgtttgtttgcaaatgatgtggtcttatatttggaaaatcctaattcactaaaacactattagaactcacaattttagtcaagatataggattaaaaagttagcagcatttctatatgccaacagtgaacaatgtgaaaaagaaatcaagagagtggtcccatttacgatagcctcaaattaaaattaaatacctaggaattaaccaaagacgttaaagatctctacaatgaatactataaaacattgatgcaagaaatttaaaaagacaaaaatatgtattttatgttcatgaataagaatcagtatttttagtgtctgtattaaccaatgcaatctacagacttaatgaaaccctatcaaaacatc---gatactcttcacagaaacaggaaaaacaatcctataatgcagacagaaccacgaaagactcagaatagccaaagttcttgtaagaaaaaattttgcctttatgtgcctagcttatttgtcttaccatatggtctccagttccatccatgttgttgcaaataacaggatcttattctttataagtgaaaagtactcctgggggtgtgtatgtacatttgctttatccattcatctgttgacatgttgcttctaaatcttggctaatgtaaacaatgctgtgtgaaaggaaaacaaatctttggaccccaaaatcactaagctaaagggaaaagtcaagttgggaaccgcttagggcaaatctgc-ctctcattctattcagtcatccctctgctcactgaaaGTCCTACCAGTACACAGGAGAAAATTTAAAAATGAATAAAAGCAACATAATTCAATGAAAACAAAAAAGCAACTGTCATTATCTCCATAAGAGGTGACTGTATAGGTAGAAAATCCAAATGCAACTGACTAGCTGTTAGCTTAACTGTACAAAACACTATTAATATTCCTAAATTCTATCCATACTTAGAAAATAAAATACAATAGCAAACTTCACCTGCTCCACCCTATATTACTCCCTATGTTGATAACATTTGAGATGTCTCATATAGCTG----ATTTAAATATTTACACTAATTCAGATTTAATCAAATTTTACTATTATTTTTACTTCTTTGTTTTTGCCGACTATTGATTATTATTATTAtttttttaagacagtctcactctgtggcccaggcttgagtgcagtggcgcaatctcagctcactataacctctgcctcctcggttcaagtgattctcctgcctcagtctcccgagtagctgggattgcaggtgcacaccaccacacctggctaatttttgtatttttagtatagacggagtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacacccagccTGATTAGTATTTTTAATGCATTTCTTTGAATTCATTTTCTCTTCTTTATGGAGTGTATCCTCCAGTTTTGTTTTTTTGGTTTTTTTTCCCCTCACAGAGTTTACAGGTAGTCAGTAGTATATACTTCTGAATAAATTCTGTCTTATGTTGGTTTCAGTGATAGTTTGGCTGACTGTAAATTTCTATTTCCAATGTTCTTTTCTGTGAGAACTCACGATTGATTTCTGCACTTCTTTTTGCTTCTGATGTCACCACCCTGATCAAATCAAAGTCTCTCTCATTCCTTTGAAGCAAATCAGTTTACATCATTCTGGTGATATAAAATGTGACCTTCATGTTTCTGGGTATGCTTTTTGTTTTTGTTGTTTTCCATTTATCCATTTCAACATAACATGAATTTTTATAACAAAAGCACATTATCCTTTTCCAGTTTCTGGAAGTTTTTCTCAATTATTTTTGTTACTaattctttgaaatttattaaaactgg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7146003 2123 + 72422247 aagaaacatacctcagcatataaaagctatatatagatatat--gtatcacatattgtatgatactaaatggggaaaaatgaaaagcttttcctctaagatagagaacatgacagggatgcacactttcactactgttattcaacacctggcagctagagcaattagcaagagaaaaaataaagggcaaccaaattggaaaggaagaagtcaaattatgtttgtttgcagatgatgtggtcttatatttggaaaatccgaattcactaaaacactattagaactcacaattttagtcaagatataggattaaaaagttagcagcatttctatatgccaacagtgaacaatgtgaaaaacaaatcaagagagtggtcccatttacgatagcctcaaattaaaattaaatacctaggaattaaccaaagacgttaaagatctctacaatgaatactataaaacatggatgcaagaaatttaaaaagacaaaaatatgtattttatgttcatgaataagaatcagtatttttagtgtctatattaaccaatgcaatctacagacttaatgcaaccctatcaaaacatcaatgacactcttcacagaaacaggaaaaacaatcctataatgcagacagaaccacgaaatactcagaata-------TTCTTGTAATAAAAaattttgtctttatgtgtctggcttatttgtcttaccacatgatctccagttccatccacgttgttgcaaataacaggatcttattctttataagtgaaaagtactcctgggggtgtatatgtacatttgctttatccattcatctgttgacacgctgcttctaaatcttggctaacgtaaacaatgctgtgtgaaaggaaaataaatctttggaccccaaaatcactaagctaaagggaaaagtcaagttgggaactgcttagggcaaatctgctctctcattctattcagtcatccctctgctcactgaaaGTCCTATCAGTACACAGGAGAAAATTAAAAAATGAATAAAAGCAAAATAATTCAATGAAAACAAAAAAGCAACTGTCATTATCTCCATAAGATGTGACTGTGTGGGTAGAAAATCCAAATGTAACTGACTAGCTGTTAGCTCAACTGTACAAAACACTATTAATATTCCTAAATTCTATCCATACTTAGAAAATAAAATACAATAGAAAACTTCACGTGCTCCACCCTATATTACTCCCTATGTTGATAACATTTGAAATGTCTCATGTAGCTGATTTATTTAAGTATTTGCACTAATCCAGATTTAACCAAATTTTACTATTATTTTTACTTCTTTGTTTTTGCCAATTATTGGTTATTATTATTAtttttttaagacagtctcactctgtggcccagccttgagtgcagtggcacaatctcagctcactataacctctgcctcctgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacagatgcacaccaccatgcctggctaattttcgtatttttagtacagacggggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacacccagccTGGTTAGTATTTTTAACGCATTTCTTTGAATTCATTTTCTTTTCTTTATGGAGTGCATCCTCCAGTTTTGTATTTTTGG-TTTTTTTCCCCTCACAGAGTTTACGGGTAGTCAGTAGTATATACTTCTGAATAAATTCTGTCTTATGTTAGTTTCAGTGATAGTTTGGCTGACTGTAAATTTCTATTTCCAATGTTCTTTTCTATGAGAACTCACTATTGATTTCTGCACTTCTTTTTGCTTCTGGTATCACCACCCTGATCAAATCAAAGTCCCTCTCATTCCTTTGAAGCAAATCAGTTTATATCATTCTGGTGATATAAAATGTGACCTTCATGTTTCTGGGTATGCTTTTTGTTTTCGTTGTTTTCCATTTATCCATTTCAACATAACATGAAATTTTATAATAAAAGCACATTATCCTTTTCCAGTTTCTGGAAGTTTTTCTCAATTATTTTTGTTACTaattctttgaaatttattaaaactgg i ponAbe2.chrUn I 5687 C 0 a score=1820851.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 242104 3610 + 478999 ctttatgccaagtaaagtggtaactattacatatgcaatttaaatggctgcataatattctctaatcactatatatgtccattaaaatcaaagtgggaaataatctattcgaatcttctatatccttaTCCTTTcactttattttatgtgttctacttgtccattttatctag-tttttttccctctctcttcctgcttttcttttgaatttatttatttatttattgagactgagtctcactctgttccccaggctggagtgcagcggcatgatttcggcttactgcaacctctgcctcccggattcaagtgattctcgtgcctctgcctcctgagtagctgggacaacaggtgtaagccaccacgcccagctaatttttttctttgtatttttagaatagaaggagtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgaccccaggtgatccacctgccttggcctcccaaattgctgggaatacaggtgtgaaccactctgcccagtctcttttgaata-atttaaat-ccttctaccctcacccaccaattccatcttttttcctttgattggtttggaaattaaacctctattggtttggaatctttactattcttttagttgttttccttgaaattttacactgcattttgcattacaatttaacaaaggctaaaattaagctaattttaactccctccacaaaataatgcaaacactgtagaatgccttcactctgatcacctcATTTTTGTATTTATTTTCAGTTGTTCG------CTTATTCTGTCTTGTTTCCTTTAATTCCACCAACCACAAACAGAAGTTGTTTTACATACAGCTTTCTTATTGTTGCAAATACGTGATTAGAGTTTCAGATGTGTCATCTGCTTACTAGCTACTAGATTCTAACTATTCATAACTGCACTCCTTAATCTTTTCCTTTCTTGCTAACCTTCTCTATTAACATTTCTTTATTGAAACTTTGTTGGTCTTAAATGCTCTTAAGTCTTAAAGATTATATTTTTCTGTAAATGACTACCTCAAttttatttatttatttatttatttttgagacagagtctcactctgtcgccaggctggactgcagtggcgtgacctcggctcactgcaacctctgcctcccaggctcaagtgattctcctgcctctgcctctcaagtagctgggattagaggcacctgccaccacgcccggctaatttttgtatttttagtagacacagggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatctgcctgccttggcctctcaaagtgctaggattacaggcatgagccaccacacccggcTCTCACCTTCATTCTTGAAATACGACTCTACAGTTCTTCATTGGTAATGATTATTGCCACTGACTCTCCTTCATGGTGGTTTGTTTC--CTCTGTCTACAATTTTCCCTGGAACCTCTGCTGCTCCTGGTATGCACCACTCCAAACTCACTGAGGCCAGACTCTGAGGACACGCCCATCTTTTGTAGTCACTCTCGTGATTGTCGttatttgatgaatttattttttaaattaattaatgtatttttttgagacagagtcttgc-tctgttgcccaagatggagtgcagtggcgtgatctcagctcactgcaacctccgcctcccaagctcaagcgattcttctgcctcagcctcccgagcagctgggattacaggcacccaccaccaagcccagataacttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttggccaggctggtctcgaactcctgacctcgtgatctgtccacctcagcctccgaaagtgctgggaccacaggcgtgagacaccccactggccatgaatttattTTATGGAAGAAGATAAACATACTAAAGATTTCATAATTATTTTTCACTAATGTTATACTAACAAGAAGTTACATTATTAAATAATTGCACTAATACTGGTACTCAATATTAGATAGTGGTACAGTTAC-TTTTTTGTTCCTCCCATATAAATTTCTCAGCTATGAATTTGTCTTGCCACAAAAGAGGCCTAAAGGATAAATCTATTCAGGCAGATTTGAGAAGAGTAGTTgactcccccaaaatacacattttcctatttcaacatcattgttaatgaaatgaagtggcagtgctcacctggaagaaaacacttgcaaaacatacatccaacaaaagatctgtaaccaaaatatacaagagctcttactgttcaatagtaagacgataaatcaccctaataaaaaataggcaatggtttaaacagatgcttcaccaaagaagacatacagacagaagcaagcacaagaaaagatgctctagattgggtgccgtggctcacgcctataatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcacctgagctcaggagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtgtctactaaaaatacaaaaaattatctgagcatggtggcaggtgcctgtactcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacctgggaggtggagcttgcagtgaacgaagatcgcgccacagcactccagcctgggcgacagagcaagactcagtctcaaaaaa-----------------------------------------------------ggatata-----tataatgatatagcactgcatatgtatcagaatggctaaaattaaagatggaccataccaaagctggtcaagatatagagccactgaaactctcatacactactgctgaaaatggaaaatggttcaactgctttgggaaacaacttggcagtgtattaaaaagttgagcatgcacttaccatatgcactaggcattctactaccaggtatttagccaagagaaacaaaggaatatgcctacagaaaggctagttcactactgatcgtagTCACATTGC----TTGATACTTGAGGTCCACAGGAGCAGTAATAGTGACTAAAATTCACTGAGATTTACTAAGTTCCAGGTATTACTTTCATATATTAATTTGTTTAATCTTCATTAACATTTCCATGAGgaagcagtgagggaggaaggacatctctctggccagccaaattcctggccagccaaattccctTAAGTCAACCATCAATCACTTACCATCGAGGTCGAGTTCATCCTCCTCCAAGGGAAGGCTGAAGATACTGATGGCGGCTCAGTTATGGTATCTCTCAGGGAAGGG-AAAAAACTGGCTTCTTCCCTAGAGAGTGGGGCCGTGATCAATGTGGCCATGATTAATGACACACATGTCCTTTTCATGATGAGTTTCATGGTGCATCGCATGCTAGCCTACAGACTGTACCTTTCCACTC-TTCCTGTTTCACTTTGCAATGATATTCACTAGAAAAAGGATCTTTTTCTGCGCTAACAGGCAGCCAATCTTCCAGCAAATGAACTGGGTCACTTAATGAAGAACCATAAGTTGTCATCAATAGTGATGCAGACTTCTCAATGATCAGGTTTGCAGGTTTACAAAGACAGATCAGTAGTTCTTCGTGACAAAGAACAGTAAATGATTATGATCAAAATTGTATTCTTATAATCTAAAACACCAATATTGTCttt s panTro4.chrUn_GL393519 81808 3602 + 413329 ctttatgccaagtaaagtggtaactattacatatgcaatttaaatggctgcataatattctctaatcactatatatgtccattaaaatcaaagtgggaaataatctattcgaatcttctatatccttattctttcactttattttatgtgttctacttgtccattttatctagttttttttccctctctcttcctgcttttcttttgaatttatttatttatttattgagactgagtctca--ctgttccccaggccggagtgcagcggcatgatttcggcttactgcaacctctgcctcccggattcaagtgattctcgtgcctcagcctcctgagtagctgggacaacaggtgtaagccaccacgcccagctaatttttttctttgtatttttagaatagaaggagtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgaccccaggtgatccacctgccttggcctcccaaattgctgggaatacaggtgtgaaccactctgcccagtctcttttgaata-attgaaat-ccttctaccctcacccaccaattccatcttttttcctttgattggtttggaaattaaacctctattggtttggaatctttactattcttttagttgttttccttgaaattttacactgcattttgcattacaatttaacaaaggctaaaattaagctaattttaactccctccacaaaataatgcaaacactgtagaatgccttcactctgatcacctcATTTTTGTATTTATTTTCAGTTGTTCG------CTTATTCTGTCTTATTTCCTTTAATTCCACCAACCACAAACAGAAGTTGTTTTACATACAGCTTTCTTATTGTTGCAAATACGTGATTAGAGTTTCAGATGTGTCATCTGCTTACTAGCTACTAGATTCTAACTATTCATAACTGCACTCCTTAATCTTTTCCTTTCTTGCTAACCTTCTCTATTAACATTTCTTTATTGAAACTTTGTTGGTCTTAAATGCTCTTAAGTCTTAAAGATTATATTTTTCTGTAAATGACTACCTCAATtttatttatttatttatttatttttgagacagagtctcactctgtcgccaggctggactgcagtggcgtgacctcggctcactgcaacctctgcctcccaggctcaagtgattctcctgcctctgcctctcaagtagctgggattagaggcacctgccaccacgcccggctaatttttgtatttttagtagacacagggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatctgcctgccttggcctctcaaagtgctaggattacaggcatgagccaccacagccggcTCTCACCTTCATTCTTGAAATATGACTCTACAGTTCTTCATTGGTAATGATTATTGCCACTGACTCTCCTTCATGGTGGTTTGTTTC--CTCTGTCTACAATTTTCCCTGGAACCTCTGCTG----TGGTATGCACCACTCCAAACTCACTGAGGCCAGACTCTGAGGACACGCCCATCTTTTGTAGTCACTCTCGTGATTGTTGTTATTTGATGAATTTAGTTTTTAAATTAATTAATGTAtttttttgagacagagtcttgc-tctgttgcccaggatggagtgcagtggcgtgatctcagctcactgcaacctccgcctcccaagctcaagcgattcttctgcctcagcctcccgagcagctgggattacaggcacccaccaccaagcccagataacttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgaccttgtgatctgtccacctcagcctccgaaagtgctgggaccacaggcttgagacaccccactggccATGAATTTATTTTATGGAAGAAGATAAACATACTAAAGATTTCATAATTATTTTTCACTAATGTTATACTAACAAGAAGTTATATTATTAAATAATTGCACTAATACTGGTGCTCAATATTAGATAGTGGTACAGTTAC-TTTTTTGTTCCTCCCATATAAATTTCTCAGCTATGAATTTGTCTTGCCACAAAAGAGGCCTAAAGGATAAATCTATTCAGGCAGATTTGAGAAGAGTAGTTgactcccccaaaatacacattttcctatttcaacatcattgttaatgaaatgaagtggcagtgctcacctggaagaaaacacttgcaaaacatacatccaacaaaagatctgtaaccaaaatatacaagagctcttactgttcaatagtaagatgataaatcaccctaataaaaaatgggcaatggtttaaacagatgcttcaccaaagaagacatacagacagaagcaagcacaagaaaatatgctctagattgggcgccgtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcacctgagctcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaattagctgagcatgatggcaggtgcctgtactcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcggagcttgcagtgaacggagatcacgccacagcactccagcctgggcgacagagcaagactcagcctcataaaa-----------------------------------------------------ggatata-----tataatgatatagcactgcatatgtatcagaatggctaaaattaaagatggaccataccaaagctggtcaagatatagagccactgaaactctcatacactgctgctgaaaatggaaaatggttcaaccgctttgggaaacaacttggcagtgtattaaaaagttgagcacgcacttaccatacgcactaggcattctactgccaggtatttacccaagagaaacaaaggaatatgcctacagaaaggctagttcactactgatcgtagTCACATTGC----TTGATACTTGAGGTCCACAGGAGCAGTAATAGTGACTAAAATTCACTGAGATTTACTAAGTTCCAGGTATTATTTTCATATATTAATTTGTTTAATCTTCATTAACATTTCCATGAGGAAGCAGTGAGGGAGGAAGGACATCTCTCCGGCCAGCCAAATTCCTGGCCAGCCAAATTCCCTTAAGTCAACCATCAATCACTTACCATCGAGGTCGAGTTCATCCTCCTCCAAGGGAAGGCTGAAGATACTGATGGAGGCTCCGTTATGGTATCTCTCAGGGAAGGG-AAAAAACTGGCTTCTTCCCTAGAAAGTGGGGCCGTGATCAATGTGGCCATGATTAATGACACACATGTCCTTTTCATGATGAGTTTAATGGTGCATCGCATGCTAGCCTACAGACTGTACCTTTCCACTC-TTCCTGTTTCACTTTGCAATGATATTCACTAGAAAAAGAATCTTTTTCTGGGCTAACAGGAAGCCAATCTTCCAGCAAATGAACTGGGTCACTTAATGAAGAAC---AAGTTGTCATCAATAGTGATGCAGACCTCTCAATGATCAGGTCTGTAGGTTTACAAAGACAGATCAGTAGTTCTTCGTGACAAAGAACAGTAAATGATTATGATCAAAATTGTATTCTTATAATCTAAAACACCAGTATTGTCttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7148126 3615 + 72422247 ctttatgccaagtaaagtggtaactattacatatgcaattgaaatggctgcataatattctctaatcgctatatatgtccattaaaatcaaagtgggaaataatctattcaaatcttctacatccttaTCCTTTcactttattttatgctttctacttgtctattttatctag-tttttttccctctctcttcctgcttttcttttgaatgtacttatttatttattgagactgagtctcactctgttccccaggctggagtacagcggcatgatttcagcttactgcaacctctgcctcccggattcaagtgattcttgtgcctcagcctcctgagtagctgggacaacaggtataagccactacgcccagctaatttttttctttgtatttttagaatagaaggagtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcggcctcccaaattgctgggaatacaggtgtgaaccactctgcccagtctcttttgaata-atttaaat-ccttctaccctcacccaccaattccatcttttctcctttgattggtttggaaattaaacctctattggtttggaatctttactattcttttcgttgtcttccttgaaattttacactgcattttgcattacaacttaacaaagcctaaaattaagctgattttaactccctccacaaaataatgcaagcactgtagaatgccctcactctgatcacctcatttttgtatttattttcagttgttcgcttagacttattctgtcttattttctttaattccaccaaCCACAAACAGAAGTTGTTTTACATACAGCTTTCTTATTGTTGCAAATACATGATTAGAGTTTCAGATGTGTCATCTGCTTACTAGCTACTAGATTCTAACTATTCATAACTGCACTCCTTAATCTTTTCCTTTCTTGCTAACCTTCTCTATTAACATCTCTTTATTGAAACTGTGGTGGTCTTAAATGCTCTTAAGTCTTAAAGATTATATTTTTCTGTAAATGACTACCTCAAt----tttatttatttatttatttttgagacagagtctcactctgtcaccaggctggagtgcagtggcgtgacctcggctcactgcaacctccgcctcccaggctcaagtgattctcctgcctctgcctcccaagtagctgggattagaggcacctgccaccacgcccggctaatttttgtatttttagtagacacagggtttcaccgtgttggccaggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatctgcctgccttggcctctcaaa-tgctaggattacaggcatgagccaccgcacccggctCTCACCTTCATTCTTGAAATACGACTCTACAGTTCTTCACTGGTAAAGATTATTGCCACTGACTCTCCTTCATGGTGGTTTGTTTC----CTGTCTACAGTTTTCCCTGGAACCTCTGCTGCTCCTGGTATGCACCACTCCAAACTCACTGAGGCCAGACTCTGAGGACACGCCCATCTTTTGTAGTCACTCTCGTGATTGTCGTTATTTGATGaatttattttttaaattaattaatatatttttttgagatagagtcttgc-tctgttgcccaagata------agtggcacgatctcagctcactgcaacctccgcctcccaagctcaagtgattctcctgcctcagcctcccgagcagctgggattacaggcacccaccaccaggcccagctaacttttgtatttttagtagagatggggtttcaccacgttggccaggctggtctcgaactcctgacctcgtgatccgcccacctcagcctccgaaagtgctgggactacaggcgtgagccaccccactggccATGAATTTATTTTATGGAAGAAGATAAACATACTAAAGATTTCATAATTATTTTTCACTAATGTTATACTAAC--GAAGCTATATTATTAAATAATTGCACTAATACTGGTGCTCAATATTAGATAGTAGTACAGTTACTTTTTTTATTCCTCCCATATAAATTTCTCAACTATGAATTTGTCTTGCCACAAAAGAGGCCTAAAGGATAAATCCATTCAGGCAGATTTGAGAAGAGTACTTGACTCCCCCAAAATATACATTTTCCTATTTCAACATcattgttaatgcaatgaagtggcagtactcacctggaagaaaacacttgcaaaacacacatccaacaaaagatctgtaaccaaaatatacaagagctcttactgttcaatagtaagatgataaatcaccctaataaacaacgggcaatggttgaaacggatgcttcaccaaagaagacatacagacagaagcaagcacaagaaaagatgctctagattgggcgccgtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggt-gatcacccgagctcaggagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaaattagctgagcattgtggcaggtgcctgtactcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacctgggaggcggagcttgcagtgagcggagatcgcgccgcagcactccagcctgggcgacagagcaagactcagtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggaaagattctctacatcagtagccagtaag-ggatata-----tataatgatatagcaccgcatatgtatcagaatagctaaaattaaagacggaccataccaaagctggtcaagatatagagcaactgaaactctcatacactgcagctgaaaatggaaaatggttcaaccactttgggaaacaacttggcagtgtattaaaaagttgagcatgcacttaccatatgcactaggcattccactaccaggtatttacccaagagaaacaaaagaatatgcctacagaaaggctagttcactactgatcgtagTCACATTGC----TTGATACTTGAGGTCCACAGGATCAGTAATAGTGACTAAAATTTTCTGAGATTTACTAAGTTCCAGGTATTATTTACATATATTAATTCGGTTAATCTTCATTAACATTTCCATGAGGAAGCAGTGAGAGAGGAAGGACATCTCTCC----------------GGCCAGCCAATTTCCCTTAAGTCAACCATCAATCACTTACCATCGAGGTCGAGTTCATCCTCCTCCAAAGGAAGGCTGAAGATACTGATGGAGGCTCAGTTATGGTATCGCTCAGGGAAGGG-AAAAAACTGGCTTCTTCCCTAGAGAGTGGGGCCATGATCCATGCGGCCGTGATTAATGACACAC--GTCCTTTTCATGATGAGTTTCATGATGCGTCGCATGCTAGCCTACAGACTCTACCTTTCCACTC-TTCCTGTTTCACTTTGCAATGATAGTCACTAGAAAAAGGATCTTTTTCTGGACTAACAGGCAGCCAATCTTCCAGCAAATGAACTGGGTCGCTTA--------------------ATCAATAGTGATGCAGAGCTCTTGATGATCAGGTTTGTAGGCTTACAAAGACAGATCAGTAGTTCTTTGTGACAAAGAACAGTAAATGATTATGATCAAAATTGTATTCTTATAATCTAAAACACCAATATTGTCttt i ponAbe2.chrUn C 0 I 3378 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 153447 3651 + 1200634 ctttATGCCAAGTACAGT--taagtattccatatgcaattgaaatggctgcataatattctctaatcgctatatatgtccattaaaatcaaagtgggaaataatctattcaaatcttctatattcttatcctttcacttcattttatgctttctgcttgtctatTTTATCTGT-TTTTTTCCCCTCTCTCTTCCTTC-TTTCCTTTGAAtttatttatttatttattgagactgagtctcactctgttccccaggctggagtgcagcagcatgattttggc--actgcaacctctgcctcccgggttcaagtgattcccgtgactcagcctcctgagtagctgggacaacaggtgtgagccaccacacccagctaatttttttctttgtatttttagtataggtggggtttcaccatgttagccaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaattgctggggatacaggtgtgagccaccatgcccagtcTCTTTTGAATACATTTAATTCCCTTCTACCCTCACCCACCAATTCCATCTTTTTTCCTTTGATTGGTTTGGAAATTAAAcctctattggtttggaatcttttctattcttttagttgtcttccttgaaattttatactgcattttgcattacaatttaacaaagcctaaaattaagctaattttaactctctccacaaaataatgcaagcactgtagaatgttttcactctgatcaccTTATTTTTGTATTTATTTCCAGTTGTTCGCTTAAACTTAT--TGTCTTATTTCCTTTAATTCCACCAACCACAAACAGAAGTTGTTGTACATACAGCTTTGTTACTGTTGCAAATACATGATTAGAG--TCAGATGTGTCATCTGCTTACTAGCTACCAGATTCTAACTATTCATAACTGCACTCCTTAATCTTTTCCTTTCTTGCTAACCTTCTCTATTAACATTTCTTTATTGAAACTTTGTTGGTTTTAAATTCTCTTAAGTCTTAAAGATTATATTTTTCTGTAAATGACTACCTCACTtttatttatttatttatttatttatttgagacagtctcactctgtcgccaggctggagtgcagtggggtgacctcggctcactgcaacctccacctccagggctcaagtgattctcctgcctctgcctcccaagtagctgggattagaggcacctgccaccacacccagctaatttttgtatttttagtagacacagggtttcaccatgttggccaggctggtcttgatctcctgacctcaggtgatctgcctgccttggcctcccaaagtgctaggattacaggcatgagccaccgtgcctgacTCTCACCTTCATTCTTGAAATATGACTCTACAGTTCTTCGTTGGTAATGATTACTGCCACTGACTCTCCTTCATGGTGGTTTGTTTCCTCTCTGTCTACAATTTTCCCTGGAACCTCTGCTGCTCCTGGTATGCACCACTCCAAACTCATTGAGGACAGACTCTGAGGACACGCCCATCTTTTGTAGTCACTCTCGTGATTCTCattatttgatgaatttattttttaaattaattaatgtatttttttgagacagagtctttcatctgttgcccaagatggagtgcagtggcgtgatctcaggtcactgcaacttccgcctcccaagctcaagtgattctcctgcctcagcctcccgagcagctgggattacaggcacccaccaccacgcccagctaatttttgtatttttagtacagatggggtttcactgtgttggccaggctggtcttgaactcctgacttcgtgatccgcccacctcagcctccgaaagtgctgggactacaggcatgaaccaccgtgctggccatgaatttattTTATGGAAGAAGATAAACATACTAAGGATTTCATAATTATTTTTCACTAATGTTATACTGACAAGAAGTTGTATTATTAAATAATTGCACTAATACTGGTGCTCAATATTAGAT-GTAGTACAATTAC-TTTTTTCTTTCTCCTATATAAATTTCTCAACTATGAATTTCTCTTGCCACAAAAGAGGCCTAAAGGATAAATCTATTCAGGCAGATTTAAGAAGAGTAGTTAactcccccaaaatatacgttttgctatttcaacatcattgttaattaaatgaaatggcagtgctcacctggaagaaaacacttacaaaacatacatccaacaaaagatttgtaaccaaaatatacaagagctcttactgttcaatagtgaaatgataaatcaccctaataaaaaatgggcaatggtttaaatggatacttcactaaagaagacatacagacagaagcaagcacaag-----atgctctagactgggcaccgtggctcacagctgtaatcccagcacttcaggaggccgaggcgggtggatcacctgagctcaggagtttgagagcagcctggtcaatatggtgaaaccccatctctgctaaaaatagaaaaaattagctgagcatggtggcaggtgcctgtactcccagctacttgggaggctgaggcaggagagtagcttgaacccaggaggcggagcttgcagtgaacagagattgtgccacagcactccagcctgggtggcagagcaagactctgtctcaaaaaa----------------aaaaaggaaagattctctacatcagtagtcagtatgagaataaacaaactacactgatatagcactgcatacgtatcagaatggctaaaattaaagatggaccataccaaagctggtcaagatgcagagacactgaaactctcatacactgctaccaaaaatggaaaatggttcaaccactttgggaaacaacttggcagtgtattaaaaagttgagcatgcacttaccatatacactaggcattctactaccgggtatttactctaaagaaacaaaagaatatgcctacataaaggctagttcactactgatcatagTCACATTTCTTATTTGATACTTGAGGTCCACAGGAGCAGTaacagtggctaaaattcactgagatttactaagttccaggtattatttacatacattaattcatttaattttcattgacagtttcatgaggaagCAACGAGGGAGGAAGGACACCTCT--GGCCAGCCAAATCCCTGGCCAGCCAGATTCCCTTAAGTCAACCGTCAATCACTTACCATTGAGGTCGAGTTCATCCTCCT-CAAGGGAAGGTTGAAGATACTGATAGAGGCTCAGTGATGGTATCGCTCAGGAAAGGGAAAAAAACTGGCTTCTTCCCTAGAGAGTGGGGCCGTGATCAATGTGGCCATGATTAATGATATACATGTCCTTTTCATGATGAGTTTCATGGTGAATCATATGCTAGCCTACAGAGTGTACCTTTCCACTCTTTCCTGTTTCACTTTGAAATGATATTCACTAGAAAAAGGATCTTTTTCTGGACTAACAGGCAGCCAGTCTTCCAGCAAATGAACTGGGTCACTTAATGAAGAACCATAAGTTGTCATCAACAGTGATGCAGAGCTCTCGATGATCAGGTTTGTAGGTTTACAAAGACAGATCAGTAGTTCCTCATGACAAAGAACAGTAAATGATTACGATCAAAATTGTATTCTTATAATTTAAAACACCAATATTGTCttt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random N 0 C 0 a score=31528.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 245714 136 + 478999 ctttttctttttttttttttttttgagacggcgtctttctctgtcacccaggctggagtccactggcgtgatctcagctcacttcaatccccgtttcctgggttcaagcaattctcctgcctcaacctttcaagta s panTro4.chrUn_GL393519 85410 129 + 413329 -------tttttttttttttttttgagacggagtctttctctgtcacccaggctggagtccaccggcgtgatctcagctcacttcaatccctgtttcctgggttcaagcaattctcctgcctcaacctttcaagta i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 157098 123 + 1200634 -------------tttttttttttgagatgtagtcttgctctgtcacccaggctggagtccactggtgtgatctcagctcacttcaacccccgtctcctgggttcaagcaattctcctgcctcaacctttcaggta i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7151741 3378 + 72422247 I a score=1044156.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 245850 2075 + 478999 gctgggagtacaggtgtgtgccaccacgcccagctaattttctgtatttttagtccagacggggtttcaccatgtttgccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgacccacccaccttggactcccaaagtgctgagattacaggcatgagccactgcacctggcTAATGCCTTGCAGTACACATCTAAAGAGAGCATTTGACTTTATCTAACCAGTGCTTGACTCTGAAATCTGTTAACTGTATGTCTTCTATGTCTGAAAGTATAAGTATTTTTTTTCCAATTCctatgctaagtgctctatttacttccttatctcatgtgaaccttacaaaccatacgaacgtatttttTAGAAATTTTCCTTGAAACTTTAAGAAAGCAAATGGCAATGTGGTGTGTGCTTTCTTAAACTTCCTTAAAACTTTATTCAGTGTATCCTCTTCCCAGCCTCACTTTTTGTGACTCTTGGCAATGACTGCATCTTTCACACCATAGAAAATAACCTGCTCTGAAACATCAACGCTCACAAGCTGGTCTTACCAGAACCTCCATGAACCAAATGCTGCAAAGAAGCCTCAGAATCACAGATGCATAACATCTAGCTAGCCTGATAACATTACACAGCTGTTTATTTTTTATTTTTATGTCTATTACTTTTAGTGTAGCAGTTTTCTTATACTCAAATGTCTAAACATTGAAAACTCAGCCAATGCAAAGCTATACAACAAACCCTTTGACAGCCTTCGCACATTTGAACAGTATTATTTTTCTTAAATGAGCCAATTCTGAGACACAAATTTCATAATTCTTGAAAGATTTTCTTCCACAATAGAAATTTTGGTTAAAATGA-TTTATTTGACCCGAATCAAATTATGGAATTATGTTCTAAAACTAACTGTATTACATTTATTACATCTATTGGTCCTCAAGCCAAACTTCTGCCAGCCATTTCTCGTCTTCGTGCTGTGCTCACAAGGACCAGCAGCATGTGCTAATACTGACTGTCTGCCCAGTAACATGCTAGAGTATGAGGAAGGCACCTCAGGCACATGGAGGCAATAGCTGCAACTGGGTCAAGGCACATGCCCTATTTCTTCATCACTCACACACTCAGAAATCCACAATGGGGAATATGCATTTTGCATGGAAGAAG-AAAAAAATGACTCAATCCTAGCTAGGGGGATTCCCACCTCACTCCCTCACAGCACTCTCTACCCAACCACCTTCCCTCGCCACACTCAGACATGCTCACACCTACACACAAGGATGATCTGGCCACTTCTCCCATTAATTCACCACTCCTAGAAAAACTGTATTTGGCTTAAATTTATCAAGCTGTCTGGCTGCCTGAAGATTTATAGATGTCAAAATAAAAAACTAATTACAACTCGGAATACCGCAGTAGCACCTGATTTAATGTCTAAGGCAGCAGgccagtgaacatactgagaaaggagaaccctcacacactctccataaaggagccatgatggggatcagcatggaggatcctcagaaaactaaaactagagttactatatgcccacaatcccactgatgggtatacatccaaaagaaacaaaaaacaatatatcaaaaagatatctgc-actcccatgtttatctcagccctattcacaacagccaatatatggagtcaacctaagtgcccataacagatgaatgcataaag-aaatgtggtatgtatacacaatggaatactattcagccataaaaaagaatgggatcctgtcatttgcagctacaaggcataactggggatcattgtgttaagtgaaataatccaggcacagaaagaaaaatattacatgttcttagtcatatgtgagagctgaaaaagtggatcttatgaagacagagaataaactgatgattaccagaagctgggaaggatttggcaggggaggg---ctcaggaggctgaggcaggagaattgctggaacccgggaggtggaggttgcagtgagccaagatcgtgccattgcactccaggctgggggacaagagcgagacttcatctcaaaaataaaat-------cataaaataaaataaaa s panTro4.chrUn_GL393519 85539 2066 + 413329 gctgggagtacaggtgtgtgccaccacgcccagctaattttctgtatttttagttcagacggggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgacccacccaccttggactcccaaagtgctgagattacaggcatgagccactgcacctggcTAATGCCTTGCAGTACACATCTAAAGAGAGCATTTGACTTTATCTAACCAGTGCTTGACTCTGAAATCTGTTAACTGTATGTCTTCTATGTCTGA------AAGTATTTTTTTTTCAATTCctatgctaagtgctctatttacttccttatctcatgtgaaccttacaaaccatacgaacgtatttttTAGAAATTTTCCTTGAAACTTTAAGAAAGCAAATGGCAATGTGGTGTGTGCTTTCTTAAACTTCCTTAAAACTTTATTCAGTGTATCCTCTTCCCAGCCTCACTTTTTGTGACTCTTGGCAATGACTGCATCTTTCACACCATAGAAAATAACCTGCTCTGAAACATCAACGCTCACAAGCTGGTCTTACCAGAACCTCCATGAACCAAACGCTGCAAAGAAGCCTCAGAATCACAGATGCATAACATCTAGCTAGCCTGATAACATTACACAGCTGTTTATTGTTTATTTTTATGTATATTACTTTTAGTGTAGCAGTTTTCTTATACTCAAATGTCTAAACATTGAAAACTCAGCCAATGCAAAGCTATACAACAAACCCTTTGACAGCCTTCGCACATTTGAACGG---TATTTTTCTTAAATGAGCCAATTCTGAGACACAAATTTCATAATTCTTGAAAGATTTTCTTCCACAATAGAAATTTTGGTTAAAATGA-TTTATTTGACCTGAATCAAATTATGGAATTATGTTCTAAAACTAACTGTATTCCATTTATTACATCAATTGGCCCTTAAGCCAAAATTCTGCCAGCCATTTCTCGTCTTCGTGCTGTGCTCACAAGGACCAGCAGCATGTACTAATACTGACTGTCTGCCCAGTAACATGCTAGAGTACGAGGAAGGCACCTCAGGCACATGGAGGCAATAGCTGCAACTGGGTCAAGGCACATGCCCTATTTCTTCATCACTCACACACTCAGAAATCCACAATGGCGAATATGCATTTTGCATGGAAGAAG-AAAAAAATGACTCAATCCCAGCTAGGGGGATTCCCACCTCACTCCCTCACAGCACTCTCTACCCAACCACCTTCCCTCGCCACACTCAGACATGCTCACACCTACACACAAGGATGATCTGGCCACTTCTCCCATCAATTCACCACTCCTAGAAAAACTGTATTTGGCTTAACTTTATCAAGCTGTCTGGCTGCCTGAAGATTTATAGATGTCAAAATAAAAAACTAATTACAACTCGGAATACTGCAGTAGCACCTGATTTAATGTCTAAGGCAGCAGgccagtgaacatactgagaaaggagaaccctcacacagtctccataaaggagccgtgatggggatcagcatggaggatcctcagaaaactaaaactagagttactatatgcccacaatcccactgatgggtatacatccaaaagaaacaaaaaacaatatatcaaaaagatatctgc-actcccatgtttatctcagccctattcacaacagccaatatatggagtcaacctaagtgcccataacagatgaatgcataaag-aaatgtggtatgtatacacaatggaatactattcagccataaaaaagaatgggatcctgtcatttgcagctacaaggcataactggggatcattgtgttaagtgaaataatccaggcacagaaagaaaaatattacatgttcttagtcatatgtgagagctgaaaaagtggatcttatgaagacagagaataaactgatgattaccagaagctgggaaggatttggcaggggaggg---ctcaggaggctgaggtaggagaattgctggaacccgggaggtggaggttgcagtgagccaagatcgtgccattgcactccagcctgggggacaagagcgagacttcatctcaaaaataaaat-------cataaaataaaataaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7155119 2067 + 72422247 gctgggactacaggtgtgtgccaccacgcccagttaattttctgtatttttaatccagacggggtttcaccatgttgaccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgacccacccaccttggactcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacctggctAATGCCTTGCAGTACACATCTAAAGAGAGCATTTGACTTTATCTAACAAGTGCTTGACTCTGAAATCTGTTAACTGTATGTCTTCTATGTCTGA------AAGTATTTTTTTTTCAATTCCTATGCTAAGTGCTGTATTTACTTCCTTATCTCATGTGAACCTTACAAACCATATGAACGTATTTTTTAGAAATTTTCCTTGAAACTTTAAGAAAGCAAACGGCAATGTGGTGTGTGCTTTCTTAAACTTCCTTAAAACTCTATTCAGTGTATCCTCTTCCCATCCTCACTTTTTGTGACTCTTGGCAATGACTGCGTCTTTCACACCATAGAAAATAACCTGCTCTGAAACATCAAGGCTCACAAGCTGGCCTTACCAGAACCTCCATGGACCAAACACTGCAAAGAAGCCTCAGAATCACAGATGCATAACATCTAGCTAGCCTGATAACATTACACAGCTGTTTATTTTTTATTTTTATGTCTATTACTTTTAGTGTAGCAGTTTTCTTATACTCAAATGTCTAAACATTGAAAACTCAGCCAATGCAAAGCTATACAACAAACGCTTTGACAGCCTTCGCACATTTTAACAGTATTACTTTTCTTAAATGAGCCAATTCTGAG--ACAAATTTCATAATTCTTG--AGATTTTCTTCCACAATAGAAGTTTTGGTTAAAATGA-TTTATTTGACCTGAATCAAATTATGGAATTATGTTCTAAAACTAACTGTATTCCATTTATTACATCTATTGGCCCTTAAGCCAAAATTCTGCCAGCCATTTCTCATCTTCGTGCTGTGCTCACAAGGACCAGCAGCATGTACTAATACTGACTGTCTGCCCAGTAACATGCTAGAGTACGAGGAAGGCACCTCAGGCACATGGAGGCAATAGCTGCAACTGCGTCAAGGCACATGCCCTATTTTTTCATCACTCACACACTCAGAAATCCACAATGGGGAATATGCATTTTGCATGGCAGAAGAAAAAAAATGACTCAATCCCAGCTAGGGGGATTCCCACCTCACTCCCTCACAGCACTCTCTACCCAACCACCCTCCCTCGCCACACTCAGACATGCTCACAGCTACACACAAGGATGATCTAGCCACTTCTCCCATCAATTCACCACTCCTAGAAAAACTGTATTTGGCTTAACTTTATCAAGCTGTCTGGCTGCCTGAAGATTTATAGATGTCAAAATAAAAAACTAATTACAACTCGGAATACTGCAGTAGCACCTGATTTAATGTCTAAGGCAGCAGgccagtgaacatactgagaaaggggaaccctcacacactctccataaaggagccatgatggggatcagcatggaggatcctcagaaaactaaaactagagctaccatatgcccacaatcccactgatgggtatacatccaaaagaaacaaaaaacaatatatcaaaaagatatctgcaactcccatgtttatctcagccctattcacaacagccaatacatggagtcaacctaagtgctcataacagatgaatgcataaag-aaatgtggtatgtatacacaatggaatactattcagccataaaaaagaatgggatcctgtcatttgcagctacaaggcataaccggggatcattgtgttaagtgaaataatccaggcagagaaagaaaaatattacatgttcttagtcatatgtgagagctgaaaaagtggatcttatgaagacagagaataaactgatgattaccagaagctgggaaggatttggcaggggaggg---ctcaggaggctgaggcaggagaattgctggaacccgggaggtggaggttgcagtgagccaagatcgcgccattgcactccagcctgggggacaagagcaagatttcatctcaaaaataaaaT-------CGtaaaataaaataaaa i ponAbe2.chrUn I 3378 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 157221 1971 + 1200634 gctgggactacaggtgtgtgccaccatgtccagctaattttttgtatttttagtcgagatggggttt-accatgttggccagg--------------ctgacctcaggtgacccacctgccttggactcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacctggcTAATGCCTTGCAGTACACATCTAAAGAGAGCACTTGACCTTATCTAACAAGTGCTTGACTCTGAAATCTGTTAACTCTATGTCTTCTATGTCTGA------AA-----------------------------------------------------------------------------ATATTTTTTAGAAATTTTCCTTGAAACTTCAAGAAAGCAAATAGCAATGTGGTGTGTGCTTTCTTAAACTTACTTAAAACTCTATTCAGTGTATCCTCTTCCCATCCTCACTTTTTGTGATACTTGGCAATGACTGCATCTTTCACATCATAGAAAATAACCTGCTCTGAAACATCAAGGCTCACAAGCTGGTCTTGCCAGAACCTCCATGAACCAAACACTGCAAAGAAGCCTCAGAATCACAGATGCATGACATCTAGCTAGCCTGATAACATTACACAGCTGTTTATTTTTTATTTTTATGTCTATTACTTTCAGTGTAGCAGTTTTCTTATACTCAAATGTCTAAACATTGAAAACTCAGCCAATGTAAAGCTATACAACAAACACTTTGACAACCTTCACACATTTGAACAGTATTATTTTTCTTAAATGAGCCAATTCTGAGACACAAATTTCATAATTCTTGAAAGATTTTCTTCCACAATAGAAGTTTTGGTTAAAATGACTTTATCTGACCTGAATCAAATTATGGAATTATGTTCTAATGCTAACTGTATTCTATTTATTACATCTGTTGGCCCTTAAGCCGAAATTCTGCCAGCCATTTCTCGTCTTCGTGCTGTGCTCACAAGGACCAGCAGCATGTACTAAT----ACTGTCTGCCCAGTAACATGCTAGAGTATAAGGAAGGCACATCAGGCACGTGGAGGCAATAGCTGCAACTGGGTCAAGGCACATGCCCTATTTTTTCATCACTCACACACTCAGAAATCCACAATGGGGAATAGCCATTTTGCATGGAAGCAG-AAAAAAATGACTCAATCCCAGCT-GGGGGATTCCCACCTCACTCCCTCACAGCACTTTCTACCCAACCACCCTCCCTCACCACACTCAGACATGCTCACACCTACACACAAGGATGATTT-GCCACTTCTCCCATCAATTCACCACTCCTAGAAAAACTGTATTTGGCTTAACTT--------TGTCTGGCTGCCTGAAGATTTATAGATGTCAAAATAAAAAACTAATTACAACTCAGAACTCTGCAGCAGCACCTGATTTAATGCCTACGGCAGCAGgccagtgaacatactgagaaaggggaaccctcacacactctccataaaggagccatggtggagatcagcacggaggatcctcagaaaactaaaactagagctaccatatgcccacaatcccactgatgggtatacatccaaaagaaaaaatatat-atatatcaaaaagatatctgc-atgcccatgtttatctcagccctattcacaacagccaatatatggagtcaacctgaatgcccataacggatgactgcataaagaaaatgtggaatgtatacacaatggaatattattcagccataaaaaagaatgagatcctgtcatttgcagctacaaggcataactggggatcactgtgttaagtgaaataatccaggcacagaaagaaaaatattacatgttcttagtcatatgtgagagctgaaaaagtggatcttatgaagacagagaataaattgatgactaccagaagctgggaaggatTTGGCAGTGGAGGgctactcaggaggctgaggc---agaattgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagataagatcgtgccactgcactccagcctgggggacaagagcaagatttcatctcaaaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 a score=-2688.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 247925 3 + 478999 T-TG- s panTro4.chrUn_GL393519 87605 3 + 413329 T-TT- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7157186 3 + 72422247 t-tt- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 159192 4 + 1200634 taTT- i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr16 53546451 3 - 80997621 --TTA i macFas5.chr16 N 0 C 0 s papAnu2.chr16 50367251 3 - 74645514 --tta i papAnu2.chr16 N 0 C 0 a score=13356.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 247928 4 + 478999 AAAA s panTro4.chrUn_GL393519 87608 4 + 413329 AAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7157189 4 + 72422247 aaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 159196 4 + 1200634 TAAA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53716621 4 - 80904711 AAAA i rheMac3.chr16 N 0 C 0 s macFas5.chr16 53546454 4 - 80997621 AAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50367254 4 - 74645514 aaaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50421957 4 - 75148670 AAAA i chlSab2.chr16 N 0 C 0 s calJac3.chr5 93296563 4 + 159171411 AAAA i calJac3.chr5 N 0 C 0 s canFam3.chr9 41578173 4 + 61074082 AGAA i canFam3.chr9 N 0 C 0 a score=1011159.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 247932 304 + 478999 AAGTTCCCGGTTATCATGTTGTTGAGTAGTACTTAATCAGAATATACTTGAAAACAAAAGATTCTTTGTGGTTTTTTAACTCTTGGTAA---TTAATCCATTTTAGGCAGTC-TTAAAAAAATGATGTAGGACAGGGAAACCAATATGAAATGGGTAGTCTGAAAAGCAGTTATTAG-ATATTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTATTTACCCCACTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAAACGGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TCTCTATATTTACTATCATTT s panTro4.chrUn_GL393519 87612 304 + 413329 AAGTTCCCGGTTATCATGTTGTTGAGTACTACTTAATCAGAATATACTTGAAAACAAAAGATTCTTTGTAGTTTTTTAACTCTTGGTAA---TTAATCCATTGTAGGCAGTC-TTAAAAAAATGATGTAGGACAGGGAAACCAATATGAAATGGGTAGTCTGAAAAGCAGTTACTAG-ATACTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTGTTTACCCCACTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAAACGGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TCTCTATATTTACTATCATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7157193 304 + 72422247 aaGTTCCCGGTTATCATGTTGTTGAGTACTACTTAATCAGAATATACTTGAAAACAAAAGATTCTTTGTGGTTTTTTAACTCTTGGTAA---TTAATCCATTGTAGGCAGTA-TTAAAAAAATGATGTAGGGCAGGGAAACCAATATGAAATGGGTAGTCTGAAAAGCAGTTACTAG-ATATTGACCATCATTTTAGGAAAGACAGGCTATTTACCCCGCTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAAACGGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TCTCTATATTCACTATCATTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 159200 302 + 1200634 AAGTTCCCAGTTATCATGTTG-TGAGTACCACTTAATCAGAATATACTTGAAAACAAAAGATTCTTTGTGGCTTTTTAACTCTTGGTAA---TTAATCCACTGTAGGCAGTATTTTAAAAAATGATGTAGGACAGGGAAACCAATATGAAATGGGTAGTCTGAAAAGCAGTTACTAG-CTATTGACCATCATTTTCAGAAAGGCAGGCTATTTACCCCGCTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAATTCAAATGGG----AAAAACCAAACTTGCCA-----TCTCTATACTTACTATCATTT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 I 300 s rheMac3.chr16 53716625 300 - 80904711 AAGTTCCCGGTTATCATGTTG-TGAGTACTATTTAATCAGAATATACTTGAAAACAACATATTCTTTGTGGGTTTTTAACTCTTGGTAATTTTTGACTCTTGGCAGGCAGTATTTTAAAAAATGATGTAGGACAGAGAAACCAGTATGAAATGGGTAGTATCAAAAGCAGCTACTAG-ATACTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTATTTATCCTGCTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAATTAGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TC-------TTGCTATAATTT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53546458 300 - 80997621 AAGTTCCCGGTTATCATGTTG-TGAGTACTATTTAATCAGAATATACTTGAAAACAACATATTCTTTGTGGGTTTTTAACTCTTGGTAATTTTTGACTCTTGGCAGGCAGTATTTTAAAAAATGATGTAGGACAGAGAAACCAGTATGAAATGGGTAGTATCAAAAGCAGCTACTAG-ATACTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTATTTATCCTGCTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAATTAGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TC-------TTGCTATAATTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50367258 300 - 74645514 aagttcCCGGTTATCATGTTG-TGAGTACTATTTAATCAGAATATACTTGAAAACAACATattctttgtgggtttttaaCTCTTGGTAATTTTTGACTCTTGGCaggcagtattttaaaaaatgatgtaggACAGAGAAACCAGTATGAAATGGGTAGTATCAAAAGCAGCTACTAG-ATACTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTATTTATCCTGTTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAATTAGG----AAAAACCAAACTTGCCGTC---TC-------ttgctataattt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50421961 304 - 75148670 AAGTTCCCAGTTATCATGTTG-TGAGTACTATTTAATCAGAATATACTTGAAAACAACATATTCTTTGTGGGTTTTTAACTCTTGGTAA---TTAATCCATTGCAGGCAGTATTTTAAAAAATGATGTAGGACAGAGAAACCAGTATGAAATGGGTAGTATCAAAAGCAGCTACTAG-ATACTGACCATCATTTTAGGAAAGGCAGGCTATTTATCCTGCTATATGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAATTAGG----AAAAACCAAACTTGCCATC---TCTTTATATTTGCTATAATTT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93296567 303 + 159171411 AAGTTCCTGGTTATCATGTTG-TGAGTACTATTTAATCAGAATATACTTG-AAATAAAAGATTCTTTGTGGATTTTTAACTTTTGGTAA---TTAAACCTTTGTAGACAGTATTTTAAAAAATGATGTAGGACAGAGAAATCAATATGAAATGGGTAGTCTGAAAAGCAGTTACTAG-ATACTGAACACCATTTTAGGAAAGGCAGACTATTTACCCTGCTATGTGCTCCCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCTGTTAAGTCAAATGGG----AAAAACCAAACTGGCCATC---TTTCTATATTTGCTATCATTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42606378 244 - 122082543 AGGGTTCTGATTTTTGTGTTG-CAGATATTATAAAATCAGAATATACCCGAAA-----------------GACTTTTCACTC-TGATAG----TAACTCCTTGT-GGTGGTGCCTTAACATCTGATGTAGCAAAGACA------TATGAAGTGCATACTCTCAAA--CAAATACCTA-GTAGTAAGCAT-----------------------------ACTAT------CTAGGGAGGCATGGCTTTAAGGGCTATTAATTCAAGAAGG----AAAAAAAAAAAATCGCATCACGTTTCTGCAATTGCTATCACTT i mm10.chr11 N 0 C 0 s canFam3.chr9 41578177 308 + 61074082 ATGTTCCTGATTGTCATGTTG-TAGATACTATTTAATCAGAACACACCTAAAAACAAAAGATATTTTGTAATTTTTT-ATTCTTGGTAA---TTAATCCATTGTAGGAAGTATAAAAAAAACTGACATAAGAAAGAAAAGCCAATAGGAAACAGGTCTCCTGAAAAGCAATTTCTAATATGTCACACATCACTTTGGGACAGGATGGCTATTTATCTGGCTATATTCTTTCAGGTAAACTTGTCTTCAATTCCAGTATAGTCAAAAGGGAAAAAAAAATCAAACTTGCTGTC---TCTCTACCTTTGCTATTACTT i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=1791853.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 248236 501 + 478999 AAAAAATTCTGTTAAGAGACACCAAAACATAGTATTTCGTACCTCCTTGCAAC---ATAAAAAATTGGCTTCCCAGCTTTGGAATTCCCAGCTTGGT-AAAAAATACTTA-------ATGTTTTCAAAGCCTTGATCTCTTCTTTTTCACATACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGGGTAAC-T-GTGAGGCTTTGTGTTGTCTACTGAGTATGT----AAAACAGTCCATAATTG--GATAAACAATAAAATGC-TAAAATGAAAAATTATTTTAAAAGCAACAGGCATTCTAAAGGGTAATTTGACAACATGCACAAAAAATCTCAAGATATTACTCTTTGAACCACAA--AAGCACTTTTAGGACTATTCTAAGAGAACTACTGGATGAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACT-TCTTTGTGTCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTTTAACGAATTCATTTTATTAATCTTTTCCTTTCTAGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG s panTro4.chrUn_GL393519 87916 501 + 413329 AAAAAATTCTGTTAAGAGACACCAAAACATAGCATTTCTTACCTCCTTGCAAC---ACAAAAAATTGGCTTCCCAGCTCTGGAATTCCCAGCTTGGTAAAAAAATACTTA-------ATGTTTTCAAAGCCTTGATCTCTTCTTTTTCACATACCTGATGCCT-AAAGAAAAAG----AACAGGGTAAC-T-CTGAGGCTTTGTGTTGTCTACTGAGTATGT----AAAACAGTCCATAATTG--GATAAACAATAAAATGC-TAAAATGAAAAATTATTTTAAAAGCAACAGGCATTCTAAAGGGTAATTTGACAACATGCACAAAAAATCTCAAGATATTACTCTTTGAACCACAA--AAGCACTTTTAGGACTATTCTAAGAGAACTACTGGATGAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACT-TCTTTGTGTCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTTTAATGAATTCATTTTATTAATCTTTTCCTTTCTGGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7157497 508 + 72422247 AAAAAATTCTGTTAAGAGACACCAAAACATACTATTTCTTACCTCCTCGCAAC---ATAAACAATTGGCTTCCCAGCTTTGGAATTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTAATGTTTTATGTTTTCAAAGCCTTGATCTCTTCTTTTTCACGTACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGGGTAAC-T-CTGAGGCTTTATGTTGTCTACTGAGTATGT----AAAACAGTCCATAATTG--GATAAACAATAAAATGC-TAAAATGAAAAATTATTTTAAAAGCAACAGGCATTCTAGAGGGTAATTTGACAACATGCACAAAAAATCTCAAGGTATTGCTCTTTGAGCCACAA--AAGCACTTTTAGGACTATTCTAAGAGAACTACTGGATAAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACA-TCTTTGTGCCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTTTAATGAATTCATTTTATTAATCTTTTCCTTTCTAGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 159802 500 + 1200634 aaaaaaTTCTGTTAAGAGACACCAAAACATAGTATTTCTTACCTCCTTGTAAC---ATAAAAAATTGGATTCCCAGCTTTGGAATTCTCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ATTTTTTCAAA-CCTTGATCTCTTCTTTTTCACGTAACTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAAGATAAC-T-CTGAGGCTTTATGTTGATTACTGAATAAGT----AAAAAAGTCTATAATTG--GATAAACAATAAAATAC-TGAAATGAAAAATTATTTTAAAAGCAACAGGCAATCTAAAGGGTGATTTGACAACATGCACAAAAAATCTCAAGGTATTACTCTTTGAACCACAA--AAGCACTTTTAGGACTATTCTAAGAGAACTACTGGATGAGGATATTAACCATAAGATTG-----TTTTTAC-TCATGACA-TTTTTGTCCCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTATAATGAATTCATTTTATCAATCTTTTCCTTTTTAGTTTATGGATTTTGAATGTATGAAAAAG i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random I 300 C 0 s rheMac3.chr16 53716925 500 - 80904711 AAAAAATTCTGTTAAGGGACACCAAAACATAGTACGTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAAAATAGGATTCCCAGCTTTGGAAGTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ACGTTTTCAAAGCCTTGAATTCTTCTTTTTCATGTACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGAGTAAC-T-ATGAGGCTTTATGTTGTCTACTGAGTATGT---AAAAAAAGTCTCTAACTG--GATAAACAATAAAATAC-TAAAATGAAAAAATATTTTAAAAGCAACAGGCAttctaaagggtaatttggcaacatgcaccaaaaatttcaaggtactactctttgaaccacaa--aagcacttttaggactattctaagagaaCTATTGGACAAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACG-TTTTTGTCCCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTCTAATGAATTCATTTTATCAATCTTTTC-----TAGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53546758 500 - 80997621 AAAAAATTCTGTTAAGGGACACCAAAACATAGTACGTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAAAATAGGATTCCCAGCTTTGGAAGTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ACGTTTTCAAAGCCTTGAATTCTTCTTTTTCATGTACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGAGTAAC-T-ATGAGGCTTTATGTTGTCTACTGAGTATGT---AAAAAAAGTCTCTAACTG--GATAAACAATAAAATAC-TAAAATGAAAAAATATTTTAAAAGCAACAGGCAttctaaagggtaatttggcaacatgcaccaaaaatttcaaggtactactctttgaaccacaa--aagcacttttaggactattctaagagaaCTATTGGACAAGGATATTAACCACAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGATG-TTTTTGTCCCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTCTAATGAATTCATTTTATCAATCTTTTC-----TAGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50367558 501 - 74645514 aaaaaattctgttaagGGACACCAAAACATAGTATGTCTTACCTCCGtgcaacataataaaaaataggaTTCCCAGCTTTGGAAGTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ACGTTTTCAAAGCCTTGAATTCTTCTTTTTCATGTACCTGAtgcctaaaagaaaaag----aacagagtaac-T-ATGAGGCTTTATGTTGTCTACTGAGTATGT--aaaaaaaagtctctaactg--gataaacaataaaatac-taaaatgaaaaaatattttaaaagcaacagGCATTCTAAAGGGTAATTTGGCAACATGCACCAAAAATTTCAAGGTACTACTCTTTGAACCACAA--AAGCACTTTTAGGACTATTCTAAGAGAACTATTGGACAAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACG-TTTTTGTCCCAGACAGaag--------------tttatga------ttttttaatgaattcattttatcaatcttttc-----taGTTTATGGATTTTGAATGGATGAAAAAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50422265 488 - 75148670 AAAAAATTCTGTTAAGGGACACCAAAACATAGTATGTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAAAATAGGATTCCCAGCTTTGGAAGTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ACGTTTTCAAAGCCTTGAATTCTTCTTTTTCATGTACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGAGTAAC-T-ATGAGGCTTTATGTTGTCTACTGAGTATGT---AAAAAAAGTCTCTAACTG--GATAAACAATAAAATAC-TAAAATGAAAAAATATTTTAAAAGCAACAGGCAttctaaagggtaatttggcaacatgcaccaaaaatttcaaggtactactctttgaaccacaa--aagcacttttaggactattctaagagaaCTATTGGACAAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACG-TTTTTGTCCCAGACAGAAG--------------TTTATGA------TTTTTTAATGAATTCATTTTATCCATCTTTTC-----TAGTTTATGGATTTTGAA------------ i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93296870 508 + 159171411 AAAGTACTCTGTTTAGAGACACCAAAACATAGTATTTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAAAATAGGATTCCCAGCTTTGGAAGTCCCAGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ACGTTTTCAAAGCCTTGAACTCTTCTTTTTCATGTACCTGATGCCTAAAAGAAAAAG----AACAGAGTAAC-T-CTGAGGCTTTATATTGCCTACTGAGTATGTAAAAAAAAAAGTCTATAATTG--GATAAACAATAAAATAC-TAAAATGAAGAAATGTTTTAAAAGCAACAGATATACTAAAGGTTAATTTGGCAACATGCGCCAAAAATTTCAAGATACTACTCTTTGAACCACAG--AAGCACTTTTAGGACTATTCTCAGAGAACTATTGGACAAGGATATTAACCATAGGATTG-----TTTTTAC-TCATGACA-TTTTTGCCCCAGACACAAG--------------TTTATGA------TTTTGTAATAAATTCATTTTATCAATCTTTTCCTTTCTAGTTTATGGATTTTGAATGAATGAAAAAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42606622 480 - 122082543 GAAAAACCCTATTAAAAGAGACTAAAATGTA----TTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAAAATAGGATTCCCAGCTTTGGAGGTGCCAGCTTGGT-AGAAGATGCTTA-------ACGTTTTCAAGGCCTTGAACTCTTCTTTCTCATGTACCTGGTGCCTAAAACAAAGAG-------GGAGTCACTT-AAGAGTCTTTATACAAATTGTTGCCTAGTTAAAGAAAAATGTGATTAATCAACAATAAAAAGAAAAACAC-CAAAAAGCAAAA-TACCTAAAAAGCAACCAGTTTTCTGAAGGGC-------------------AAAATGTCAAGGTGTG--TTCCTGAGTCAGGA--TGACTCTCTTGGGATTACT-TAACACCACCCCTGGACATGCATGGT--------GGTTGCTCGCCTTTTAC-CCATGCTACTTCTTTTTTCAGATAAAAG------------GATTTTTAGTTTGCTTTTCCTTGCAAGTTCAGTTCATCAATCCTCTC-------ATTTATGGTTTTTAGAAAGGTGAGAAAG i mm10.chr11 C 0 I 1139 s canFam3.chr9 41578485 518 + 61074082 -TTAAACTCTGTTAAGAGAAACTAAAACATAGTATTTCTTACCTCCGTGCAACATAATAAAATATAGGATTCCCAGCTTTGGAAGTCCCTGCTTGGT-AGAAAATACTTA-------ATGTTTTCAAAGCCTTGAACTCTTCTTTTTCATGTACTTGATGCCTGCAAGAAAAAACAAAAACAGAGTAAC-TCATTAGGCTTTATACTGTCCACTGAGTATTT----CTAAAAACCCATGATTA--GAACTGTAATAAAATATATAAAAGGACAAAATATTTAAAAAGCAAAATACTTTCTGAAGGGAAATTTTACAACAAATACCCAAAATTTCAAGGTGTTACTCTTTGAAACACAATGAGTAGTTCTTAAAACTAGGCTAAGAAAAGTACTGGGCAGTAATATTAACTATAGGATTT-----TTTTTTTATCATGGTA-TTTTTTTCT-----AGAAGCCACTGGGTTTTTATCTATTT------GTTTTTTAAGAGTTCAGTATATCAATCTTTTT-TTATTGGTTTAT-GATTTTGAATAATTAAAAAG- i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=298829.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 248737 112 + 478999 GCCTT-GCTTTGCCCATG--TTTTTTTTTCTTTCTGATTTATGGGAGTCTATCCTCATAAATGGTATGAAAATA-TTTTTTCAGATCATTACTCAGTTTTATCAACACCATTTATT s panTro4.chrUn_GL393519 88417 114 + 413329 GCCTT-GCTTTGCCCATGTTTTTTTTTTTCTTTCTGATTTATGGGAGTTTATCCTCATAAATGGTATGAAAATA-TTTTTTCAGATCATTACCCAGTTTTATCAACACCATTTATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158005 109 + 72422247 GCCTT-GCTTTACCCATG-----TTTTTTTTTTTTGATTTATGGGAGTTTATCCTCATAAACGGTATGAAAATA-TTTTTTCAGATCATTACTCAGTTTTATCAACACCATTTATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160302 108 + 1200634 GCCTT-GCTTTGCCCAT------TTTTTTTTCTTTTGTTTATGGGCATATATCCTCGTAAATGATATGAAAATA-TTTTTCCAGATCATTACTCAGTTTTATCAACACCATTTATT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53717425 102 - 80904711 GCCTTAGCTTTGCTCATG----------CTTTTTTGATTTATGGGAGTCTA---TCATAAATGGTATGAAAGTA-TTTTTCCAGATCATTACTCAGTTGTATCAACACCATTTACT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53547258 102 - 80997621 GCCTTAGCTTTGCTCATG----------CTTTTTTGATTTATGGGAGTCTA---TCATAAATGGTATGAAAGTA-TTTTTCCAGATCATTACTCAGTTGTATCAACACCATTTACT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368059 102 - 74645514 GCCTTAGCTTTGCTCATG----------CTTTTTTGATTTATGGGAGTCTA---TCATAAATGGTATGAAAGTA-TTTTTCCAGATCATTACTCAGTTGTATCAACACCATTTACT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50422753 98 - 75148670 ----TAGCTTTGCTCATG----------CTTTTTTGATTTATGGGAGTCTA---TCATAAATGGTATGAAAGTA-TTTTTACAGATCATTACTCAGTTGTATCAACACCATTTACT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93297378 110 + 159171411 GTCTT-GTTTTGCTCATG----TTTTTTTTTCTTTGATTTATGGGAGTTTATCCCCATAAATGGTATGAAAACA-TTTTTCCAGATTATTACTGAGTTGTAGCAATACCATTTATT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41579003 104 + 61074082 GCCTT-CCTTTGTACATG-----------TTTTCTTCTCCATGAGAATTTATCCTCATGAATGGTATAAACATCTTTTTTCCAGATGGTCACTCAGTAGTACCAACACCATCTATT i canFam3.chr9 C 0 I 741 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=1130945.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 248849 350 + 478999 GAAAGTCCATCCTAATCTT---GATTTCAAATACCAC-TTTTATCATATATTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttactttttatatagtctgctcaagacgcagtgtgcttctttaacttcaagattaatgtcattcatcaactctagaaaacattcatcctttaccctttcaaatattacttcttc-ccattctcactgagctcaatttctagggaacacct-actagacatattttggaacttctc--attctatcttctgcatctcttaatctctttcatattttccatttctttgtc----tgtaatgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactacctt-c-AGCTATAA s panTro4.chrUn_GL393519 88531 350 + 413329 GAAAGTCCATCCTAATCTT---GATTTCGAATACCAC-TTTTATCATATATTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttactttttatatagtctgctcaagactcagtgtgcttctttaacttcaagattcatgtcattcatcaactctagaaaacattcaccctttaccctttcaaatattacttcttc-ccattcccactgagctcaatttctagggaacacct-actaggcatattttggaacttctc--attctatcttctgcatctcttaatctctttcatattttccatttctttgtc----tgtaatgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactacctt-c-AGCTATAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158114 353 + 72422247 GGAAGTCCATCCTAATCTT---GATTTCAAATACCAC-TTTTATCATATATTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttaatttttatatagtctgctcaagactcagtatgcttctttaacttcaagattcatgtcattcatcaactccagaaaacattcatcctttaccctttcaaatatttcttcttc-ccattctcactgagctcaacttctagggaacacctaactagacatattttgggacttctcatattctatcttctgcatctcttaatctctttcatattttccatttctttgtc----tgtaatgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactacctt-c-AGCTATAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160410 349 + 1200634 GAAAGTCCATCCTAATCTCCAAGATTTCCAATACCAC-TTTTATCATATATTATGTTCCCATATGTAAT----------------AAA----------------GCCtggtttaatttttatgtagtctgcttaagactcagtgtgcttctttaccctcaagattcatggcattcttcaactctagaaaacattcatcctctaccctttcaaata----ttcttt-ccattctcactgagctcaatttctagggaacacct-actagacatattttggaacttctc--attctatcttctgcgtctcttaatctctttcatattttgcatttctttgtc----tgtaatggctgtatgctaggtaatttgattagaaactacctt-c-AGCTATAA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53717527 350 - 80904711 GAAAGGCCATCCTAATCTC---GATTTTGAATACCAG-TTTTACCATATGTTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttaattgttatatagtttgctcaagactcagtgtgcttctttaacctcaagatacacgtcgttcatcaactccagaaaacatccatccattagcctttcaaatattacttctcc-ccattctcactgagctcaatttctagggaacacct-actagacatattttggaccttctc--attctatcttctgcatctcttaacctctttcatatttgccatttatctgtc----tgtactgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactagctt-c-AGCTATAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53547360 350 - 80997621 GAAAGGCCATCCTAATCTC---GATTTTGAATACCAG-TTTTACCATATGTTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttaattgttatatagtttgctcaagactcagtgtgcttctttaacctcaagatacacgtcattcatcaactccagaaaacatccatccattagcctttcaaatattacttctcc-ccattctcactgagttcaatttctagggaacacct-actagacatattttggaccttctc--attctatcttctgcatctcttaacctctttcatatttgccatttatctgtc----tgtactgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactagctt-c-AGCTATAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368161 350 - 74645514 GAAAGGCTACCCTAATCTC---GATTTTGAATACCAG-TTTTACCATATGTTATGTTCCCATATGTATT----------------AAA----------------GCCTGGTTTAATTGTTATATAGTTTGCTCAAGACTCAGTGTGCTTCTTTAACCTCAAGATACACGTTATTCATCAACTCCAGAAAACATCCATCCATTAGCCTTTCAAATATTACTTCTCC-CCATTCTCACTGAGCTCAATTTCTAGGGAACACCT-ACTAGACATATTTTGGACCTTCTC--ATTCTATCTTCTGCATCTCTTAACctctttcatattttccatttatctgtC----TGTACTGACTGTATGCTAGGTAATTTGCTTAGAAACTAGCTT-C-agctataa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50422851 350 - 75148670 GAAAGGCCATCCTAATCTC---GATTTTGAATACCAG-TTTTACCATATGTTATGTTCCCATatgtatt----------------aaa----------------gcctggtttaattgttatatagtttgctcaagactcagtgtgcttctttaacctcaagatacacgtcattcatcaactccagaaaacatccatccattagcctttcaaatattacttctcc-ccattctcactgagctcaatttctagggaacacct-actagacatattttggaccttctc--attctatcttctgcatctcttaacctctttcatattttccatttatctgtc----tgtactgactgtatgctaggtaatttgcttagaaactagctt-c-AGCTATAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93297488 374 + 159171411 GAAAGTTCATCCTAATCTTCGTGATTTTGAATATAAC-TTTTATCATATATGATGTTCCCATATGTATT----------------AAAATATATTTCTGAAAaggcctggcttaatttttatatagtctgctcaagacttagtgtgcttctttaatctcaagattcatgtcattcatcaactctagaaaacgttcttccattatcttttcaaatattacttcttt-ccattctcactgagctcaatttctagggaacacct-actagacatatgttggatcttagc--attctatcttttgcattttttaatctttttcatattttccatttctttatccatatgtactgactttacactaggtaatctgcctggaaactatcttcc-agCTATAA i calJac3.chr5 C 0 I 35 s canFam3.chr9 41579848 370 + 61074082 AAAAGTCCATTCTAGTCTCCCTGGTTCTGAATGCCACTTTTTATCATGTATTAAATTCCCGTATGTATTTTAAAACATTTCTGAAAaa----------------gtatgatttgatttttacgtattctgctgaacactcagtgtgtgtaattaatttgaagattcatctcattcaccaaccctgggacatgttcat-cgttgtctcttcaaatattacctcttcactattctctctaagctccatttct--gagacacct-att--tcgcatgttggaccttctc--attctgtcatatgcatcttgtaacttctttcctatttttcacttctttatctctctgtactaactatatatt-ggtaatgtactcagaaattatctt-ctagCTATGC i canFam3.chr9 I 741 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=5984.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249199 23 + 478999 ACTT-----AATTAAT--------TAATTAATTAAC s panTro4.chrUn_GL393519 88881 23 + 413329 ACtt-----aattaat--------taattaattaaC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158467 31 + 72422247 ACtt-----aattaattaattaggtaattaattTAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160759 23 + 1200634 ACTT-----AATTAAT--------TAATTAATTTAC i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53717877 16 - 80904711 Attt--------------------tatttttttttg i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53547710 16 - 80997621 Attt--------------------tatttttttttg i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368511 16 - 74645514 attt--------------------tatttttttttg i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423201 16 - 75148670 Attt--------------------tatttttttttg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41580218 23 + 61074082 attttaaaaaataaag--------tatttaa----- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e calJac3.chr5 93297862 35 + 159171411 I a score=37397.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249222 11 + 478999 agatggagttt s panTro4.chrUn_GL393519 88904 11 + 413329 agatggagttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158498 11 + 72422247 agatggagttt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160782 11 + 1200634 agatggagttt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53717893 11 - 80904711 agacggagttt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53547726 11 - 80997621 agacggagttt i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368527 11 - 74645514 agacggagttt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423217 11 - 75148670 agacggagttt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93297897 11 + 159171411 agacagagttt i calJac3.chr5 I 35 C 0 s canFam3.chr9 41580241 11 + 61074082 aaatataGTTC i canFam3.chr9 C 0 I 190 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=324342.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249233 115 + 478999 tgctcttgtcgcccaggctggagtgcagtggcacgatctcagctcactgcaacctctgcctcccaggttcaaatgattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaag s panTro4.chrUn_GL393519 88915 115 + 413329 tgctcttgtcgcccaggctggaatgcagtggcacgatctcagctcactgcaacctctgcctcccaggttcaaatgattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158509 115 + 72422247 tgctcttgttgcccaggctggagtgcagtggcgcgatctcagctcactgcaacctctgcctcccaggttcaaatgattttcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160793 115 + 1200634 tgctcttgtcacacaggctggagtgcagccacatgatctcagctcactgcaacctctgcccaccaggttcaaaggattctcttgcctgagcctcccaagtagctgggattataag i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53717904 115 - 80904711 cgctcttgttgaccagactggagtgcaatgacgcgatctcggctcactgcaacctctgcctccagggttcaaacgattctcctgccttggcctcccaagtagctgggattacaag i rheMac3.chr16 C 0 I 249 s macFas5.chr16 53547737 115 - 80997621 cgctcttgttgaccagactggagtgcaatgacgcgatctcggctcactgcaacctctgcctccagggttcaaacgattctcctgccttggcctcccaagtagctgggattacaag i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368538 115 - 74645514 cgctcttgttgaccagactggagtgcagtgccgcgatctcggctcactgcaacctctgcctccagggttcaaacgattctcctgccttggcctcccaagtagctgggattacaag i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423228 115 - 75148670 cgctcttgttgaccagactggagtgcagtggcgcgatctcggctcactgaaacctctgcctccagggttcaaacgattctcctgccttggcctcccaagtagctgggattacaag i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93297908 115 + 159171411 tgcccttgttgcccaggctgaaatgcagtggcgcaatctcagctaattgaaacctctgcctcccaggtccaagtaaatctcccacctcaatctcccgagtagctggaattacagg i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580252 190 + 61074082 I a score=372912.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249348 201 + 478999 cacccgtca-catgcctggctaatttttatttttattttt----tttttagtagagatggggtttcgccatgttggccaggcttctct-caaactccaaacctcatgtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattataggcgtaagctactgcactcTTCCT-AATTTTTTTTAAGTATACATGTTTTCTTTTACACTT s panTro4.chrUn_GL393519 89030 202 + 413329 cacccgtca-catgcctggctaatttttatttttattttt---atttttagtagagatggggtttcgccatgttggccaggcttgtct-caaactccaaacctcatgtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattataggcgtaagctaccgcactcTTCCT-AATTTTTTTTAAGTATACATATTTTCTTTTACACTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158624 202 + 72422247 cacccgtcaccatgcctggctaatttttatttttattttt----tttttagtagagatggggttttgccatgttggccaggcttgtct-cgaactccaaacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcactctgccT-AAATTTTTTTAAGTGTACGTATTTTCTTTTACACCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 160908 198 + 1200634 cagttgccgccacgcttagctaatttttatttttat--------tttttagtagagatgggatttctccatgttggccaggcttgtct-caaacttctgacctcaggtgatccacccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccacctcactcagcGT-AAATTTTTTTAAGTATACATATTTTCTTTTACACTT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr16 53547852 207 - 80997621 tgcccaccaccacgcccagctaatatatatatatatatatatattttttagtagagatgaggtttcaccattttggccaggcttgtct-ccaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggccttccaaagtgccgggattacaggcaagagccaccgcactcggccTAAAATTTTTTAAACTATACATATTTTCTTTTACACCT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368653 204 - 74645514 tgcccaccaccacacccagcttatatatatatatatatat---ttttttagtagagatgaggtttcaccattttggccaggcttgtct-ccaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggccttccaaagtgccgggattacagacaagagccaccgcactcggcctaaaattttttaaactatacatattttcttttatacct i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423343 204 - 75148670 tgcccaccaccacgcccagctaatatatatatatatattt--tttttttagtagagatgaggtttcaccatgttggccaggcttgtct-ccaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggccttccaaagtgccgggattacaggcaagagccactgcactcggccT-AAATTTTTTAAACTATACATATTTTCTTTTACACCT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93298023 199 + 159171411 ctcccaccagcacatccagcta---tttttgtttgtttgc-----ttttagtagagataggatttcaccatgttggtcaggcttgtctcccaactcctgacctcaggtgacccacctgcttcagcctcccaaagtgctgggactacaggtgtaagccaccatgcctggtcT-AAATTTTTTTAAGTATACATATTTTCTTTTACACCT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580252 190 + 61074082 I e rheMac3.chr16 53718019 249 - 80904711 I a score=102881.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249549 50 + 478999 AGTGTATCTATGAGTATTGTGATTTGGGAAGGAGACTGTATTAACTCAGC s panTro4.chrUn_GL393519 89232 50 + 413329 AGTGTATCTGTGAGTATTGTGATTTGGGAAGGAGACTGTATTAACTCAGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158826 50 + 72422247 AGTGTATCTATGAGTATTGTGATTTGGGAAGGGGACTGTATTAACTCAGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161106 50 + 1200634 AGTGTATCTATGAGTCTTGTGATTTGGGAAGGAGACTGTATTAACTCAGC i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548059 48 - 80997621 AATATTTC--TGAGTCTTATGTCTTGGGAAAGAGATTGCATTAGCTCAGC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368857 48 - 74645514 AGTATTTC--TGAGTCTTATGTCTTGGGAAAGAGATTGCATTAGCTCAGC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423547 48 - 75148670 AGTATTTC--TGAGTCTTATGTCTTGGGAAAGAGACTGCATTAGCTCAGC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93298222 50 + 159171411 AGTATTTCTATGAGTCTTGTGTCTTGGGAAGGAGATTGTATTAGCTCAGC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41580442 42 + 61074082 aatatatatatatatattgtatat--------aGGTTGTATTATCTCAGT i canFam3.chr9 I 190 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e rheMac3.chr16 53718019 249 - 80904711 I a score=304760.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249599 96 + 478999 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGT---CAGCATTTTAAAAATATTAATGGAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAaaacatatacatgtgcatag s panTro4.chrUn_GL393519 89282 96 + 413329 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGT---CAGCATTTTAAAAATATTAATGGAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAaaacatatacatgtgcatag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158876 96 + 72422247 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGT---CAGCATTTAAAAAATATTAATGGAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAaaacatatacatgtgcatag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161156 95 + 1200634 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGT---CAGCATTTTAAAAATATT-ATGGAAACAACCTAGATATCATTGGATAGGAGAAAAAAatatatatgtgcatag i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718268 96 - 80904711 CCATCGTGCTGCTGGTACCAGGT---CAGAATTTTAAAAATATTAATGAAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAATAATtatacatgtgcatag i rheMac3.chr16 I 249 C 0 s macFas5.chr16 53548107 96 - 80997621 CCATCGTGCTGCTGGTACCAGGT---CAGAATTTTAAAAATATTAATGAAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAATAATtatacatgtgcatag i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50368905 96 - 74645514 CCATCGTGCTGCTGGTACCaggt---cagaattttaaaaatattaatggaaaCAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAATAATTATACATGTGCATAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423595 96 - 75148670 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGT---CAGAATTTTAAAAATATTAATGGAAACAACCTAGATATCATTTGATAGGAGAAATAATtatacatgtgcatag i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93298272 72 + 159171411 CCATCATGCTGCTGGTACCAGGTCAGCAGCATTTTAAAAA--------AAAACAatatatatat-------------------atatatatatatataG i calJac3.chr5 C 0 I 746 s canFam3.chr9 41580484 96 + 61074082 CCATCATGTTGCTGGTACCAGGT---CACCATTTGTTTAATATTAATGGAAACAACCTACATATCATTTGATAAGAGAAATAGGTACACATATGTATAG i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=298723.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249695 124 + 478999 ataaatgactgggagactatacaccatacgttaactgaattatttctgagcag----------gaggataaacaatttttaatttttttttact---ttctttagatttct--atattGAGTAATTCAATAA-TTTTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 89378 124 + 413329 ataaatgactgggagactatacaccatacgttaactgaattatttctgagcag----------gaggataaacaatttttaatttttttttact---ttctttagattttt--atattGAGTAATTCAATAA-TTTTTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7158972 124 + 72422247 ataaatgactgggagactatacaccatatgttaactgaattatttctgagcag----------aaggataaacaatttttaa-ttttttttact---ttctttagatttct--atattGAGtaatttaataatttttttt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161251 125 + 1200634 ataaatgactgggagactattcaccatacgtcaactgaattatttcagagcag----------gagaataaacaatttttaa--tttttttactttcttctttagatttct--atattgagtaatttagtaa-ttttttt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718364 124 - 80904711 ataaatgactgggaga-tattcagcaaacgttaactgaattatttctgacagg----------gaggataaacaatttttat--tttttttactttcttctttagatttct--atatcgaataatttaataa-ttttttt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548203 125 - 80997621 ataaatgactgggagactattcagcaaacgttaactgaattatttctgacagg----------gaggataaacaatttttat--tttttttactttcttctttagatttct--atatCGAATAATTTAATAA-TTTTTTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369001 125 - 74645514 ATAAATGACTGGGAGACTATTCAGCAAACGTTAACTGAATTATTTCTGACAGG----------GAggataaacaatttttat--tttttttactttcttctttagatttct--atatcgagtaatttaataa-ttttttt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423691 125 - 75148670 ataaatgactgggagactattcagcaaacgttaactgaattatttctgacagg----------caggataaacaatttttat--tttttttactttcttctttagatttct--atatCGAGTAATTTAATAA-TTTTTTT i chlSab2.chr16 C 0 I 12 s canFam3.chr9 41580580 137 + 61074082 ATAAATGACTATGTGGCTATCTGTCAGATGTCAACTGCATTATTTCTAAGAGGTGAATATCTTTAAGAAGAGTAAATGAGAA--TTTTTTAACTCTCCTCTTTAGATTTCTCAGTTTTGAATAATTCAACAA-TTTTATT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e calJac3.chr5 93298344 746 + 159171411 I a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249819 1 + 478999 T s panTro4.chrUn_GL393519 89502 1 + 413329 T i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159096 1 + 72422247 t i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161376 1 + 1200634 t i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718488 1 - 80904711 t i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548328 1 - 80997621 T i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369126 1 - 74645514 t i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41580717 1 + 61074082 T i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e chlSab2.chr16 50423816 12 - 75148670 I e calJac3.chr5 93298344 746 + 159171411 I a score=-3476.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249820 2 + 478999 --AA s panTro4.chrUn_GL393519 89503 2 + 413329 --AA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159097 2 + 72422247 --ta i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161377 1 + 1200634 ---a i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718489 2 - 80904711 --aa i rheMac3.chr16 C 0 I 10 s canFam3.chr9 41580718 2 + 61074082 TT-- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e chlSab2.chr16 50423816 12 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50369127 0 - 74645514 C e macFas5.chr16 53548329 0 - 80997621 C e calJac3.chr5 93298344 746 + 159171411 I a score=62641.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249822 143 + 478999 ATAAC--AGAATATTggctgggcatggtggctcgtgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggccggtggatcacctgaggtcaggagatcgaggccatcctggctaaaacggtgaaaccctgtctctacaaaaaatacaa s panTro4.chrUn_GL393519 89505 143 + 413329 ATAAC--AGAATATTggctgggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggccagtggatcacctgaggtcaggagatcgaggccatcctggctaaaacggtgaaaccctgtctctacaaaaaatacaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159099 143 + 72422247 ataaG--AGAATATTggctgggcacggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggtggatcacctgaggtcaggagatcgaggccatcctggctaaaacggtgaaaccctgtctctacaaaaaatacaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161378 145 + 1200634 ataactgagaatattggccgggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggtggatcacctgaggtcaggtgatcaaggccatcctggctaaaactgtgaaaccctgtctctacaaaaaatacaa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s canFam3.chr9 41580720 19 + 61074082 ----------ATA-----------------------------------------------GCTGAG---------------------------------------------------------------------AAAAGTATAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e chlSab2.chr16 50423816 12 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50369127 0 - 74645514 C e macFas5.chr16 53548329 0 - 80997621 C e rheMac3.chr16 53718491 10 - 80904711 I e calJac3.chr5 93298344 746 + 159171411 I a score=82444.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 249965 166 + 478999 aaaattagccaggcgtgctggcgagcgcctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccaggaggcagagcttgcagtgagccgagatcatgccactgcactccagtctgggcagcagagcgagattctgtctcaaaaaaaaa--------------aaaa s panTro4.chrUn_GL393519 89648 178 + 413329 aaaattagccaggcgtgctggcgagcgcctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatggcatgaacccaggaggcagagcttgcagtgagccgagatcatgccactgcactccagtctgggcaacagagcgagattctgtctcaaaaaaaaaaaaacaaaaaa--caaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159242 175 + 72422247 aaaattagccaggcgtggtggcgggcacctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatggtgtgaacccaggaggcagagcttgcagtgagccgagatcatgccactgcactccagcctgggcaacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaa-aaacaatga----caaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161523 180 + 1200634 aaaattagccagccccagtggcgggcacctgtagtcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatggcatgaacccgggaggcagagcttgcagtgagccgagatcctgccactgcactccagcctgggcaacagagtaagactctgtctcaaaaaaaaagaaagaaagaaagaaaaa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580739 0 + 61074082 C e chlSab2.chr16 50423816 12 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50369127 0 - 74645514 C e macFas5.chr16 53548329 0 - 80997621 C e rheMac3.chr16 53718491 10 - 80904711 I e calJac3.chr5 93298344 746 + 159171411 I a score=8431.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250131 12 + 478999 aaaaaCTGAGGC s panTro4.chrUn_GL393519 89826 12 + 413329 aacaaCTGAGAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159417 12 + 72422247 aaaaCCTGAGAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161703 12 + 1200634 aaaccctgagag i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548329 12 - 80997621 AATAACTGAAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369127 12 - 74645514 aataactgaaaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299090 10 + 159171411 AAGAACTAAG-- i calJac3.chr5 I 746 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580739 0 + 61074082 C e chlSab2.chr16 50423816 12 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53718491 10 - 80904711 I a score=25240.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250143 8 + 478999 TATTATAA s panTro4.chrUn_GL393519 89838 8 + 413329 TATTATAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159429 8 + 72422247 TATTATAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161715 8 + 1200634 tattataa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718501 8 - 80904711 TATTATAA i rheMac3.chr16 I 10 C 0 s macFas5.chr16 53548341 8 - 80997621 TATTATAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369139 8 - 74645514 tattataa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423828 8 - 75148670 TATTATAA i chlSab2.chr16 I 12 C 0 s calJac3.chr5 93299100 7 + 159171411 -ATTATAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580739 0 + 61074082 C a score=701380.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250151 217 + 478999 AGCTACCTTCA---TTTTTTTAAAACAGAAAATGGGTCTCCAAAAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAaataagatctaacatttattaaacactttacaagtaccagatactgtgctaagtatac--tatatatattagaacacataatcttcaaaaGCACAAAAGACTGCTTTGTAAGGAAAGGTAGGATCTTA-GAAAAAAAGGAGTAATAAAAACATT s panTro4.chrUn_GL393519 89846 217 + 413329 AGCTACCTTCA---TTTTTTTAAAACAGAAAATGGGTCTCCAAAAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAaataagatctaacatttattaaacactttacaagtaccaggtactgtcctaagtatac--tatatatattagatcacataatcttcaaaaGCACAAAAGACTGCTTTGTAAGGAAAGGTAGGATCTTA-GAAAAAAAGGAGTAATAAAAACATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159437 217 + 72422247 AGCTACCTTCA---TTTTTTTAAAAAAGAAAATGGGTCTCCAAAAGCATCGGTGGAAATTTAGAATAAAaataagatctaacatttattaaacactttagaagtaccagatactgtcctaagtatac--tatatatattagatcacataatcttcaaaaGCACAAAAGACTGCTTTGTAAGGAAAGGCAGGATGTTA-GAAAAAAAGGAGTAATAAAAATATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161723 213 + 1200634 agctacttcat---ttttttaaaaaAAGAAAATGGGTCTCCAAAAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAAATAAGATCTAAC----ATTAAACACTTTACAAGTACCAGATACTGTCCTAAGTATAC--TATATATATTAGATCACTTAATCTTCAAAAGCACAAAAGACTGCTTTGTAAGGAAAGGTAGGATCTTA-AAAAAAAAGGAGTCATAAAAATATT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718509 217 - 80904711 AGCTACCTTCA---TTTTTTTTAAAAAGAAAATGGGTCTCCAAGAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAaataagatctaacatttattaaacagtttacaagtaccagatagtacgctaagtatat--tatacatattggatcacttaatcttcaaaaGCACAAAAGATTGCTTTGTAAGGGAAGGTAGGATCTTA-GAAAAAAAGGAGTGATAAAAATAGT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548349 218 - 80997621 AGCTACCTTCA--TTTTTTTTTTAAAAGAAAATGGGTCTCCAAGAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAaataagatctaacatttattaaacagtttacaagtaccagatagtacgctaagtatat--tatacatattggatcacttaatcttcaaaaGCACAAAAGATTGCTTTGTAAGGGAAGGTAGGATCTTA-GAAAAAAAGGAGTGATAAAAATAGT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369147 218 - 74645514 agctaccttca--ttttttttttaaaagaaaatgggtCTCCAAGAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAAATAAGatctaacatttattaaacagttTACAAGTACCAGATAGTACGCtaagtatat--tatacatattgGATCACTTAATCTTCAAAAGCACAAAAGATTGCTTTGTAAGGGAAGGTAGGATCTTA-GaaaaaaaGGAGTGATAAAAATAGT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50423836 220 - 75148670 AGCTACCTTCATTTTTTTTTTTTAAAAGAAAATGGGTCTCCAAGAGCATCAGTGGGAATTTAGAACAAAaataagatctaacatttattaaacagtttacaagtaccagatagtacgctaagtatat--tatacatattggatcacttaatcttcaaaaGCACAAAAGATTGCTTTGTAAGGGAAGGTAGGATCTTA-GAAAAAAAGGAGTGATAAAAATAGT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299107 221 + 159171411 AGCTAGCTTTA--TTTTTTTAAAAAAAGAAAATGGGTCTCCAGGAGCATCAGTGGGAATTTAAAACAAAaataaaatctaacatttattaaacactttagaagtaccagatactgtcctaagtatattatatatatattagataacttaatcttcaaaaGCACAAAAGAGTGCTTTGCAAGGGAAGATAGGATCTTAGGAAAAAAAGGAGTAATAAAAATATT i calJac3.chr5 C 0 I 132 s canFam3.chr9 41580739 202 + 61074082 AGCTACCTTCA---TTTCTTTAAAACA-AAAATGAGTCTCAAAGAGCATCAGTGGGAGCTaagaacaaaaataacacttaac----attaaacactata----taccatttactgttttaggtgtct--cacacacattaggtcatttagtcttcaaaaGCAC---AGGTTATTTTATAAGGGAAGTTAGGGTCTTA-G---GTAAGGAGCAATAAATAGATT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=148648.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250368 50 + 478999 TTCCTAGAAAAATAGAAAAATGGCCAGGATGCCCTCAGTGATGTTAAATT s panTro4.chrUn_GL393519 90063 50 + 413329 TTCCTAGAAAAATAGAAAAATGGCCAGGATGCCCTCAGTGATGTTAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159654 50 + 72422247 TTCCTAGAAAAATAGAAAAATGGCCAGGATGCCCTCAGTGATGTTAAATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161936 50 + 1200634 TTCCTAGAAAAATAGAAAAATGGCTAGGATGCCCTCAGTGATGTTAAATT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718726 42 - 80904711 TTCC--------TAGAAAAATGGCTAGGATGTCCTCAGTGATGTCAAATT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548567 42 - 80997621 TTCC--------TAGAAAAATGGCTAGGATGTCCTCAGTGATGTCAAATT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369365 42 - 74645514 TTCC--------TAGAAAAATGGCTAGGATGTCCTCAGTGATgtcaaatt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424056 42 - 75148670 TTCC--------TAGAAAAATGGCTAGGATGTCCTCAGTGATGTCAAATT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299460 50 + 159171411 ttCCTAGAAAAATAGAAAAATGGCTAGGATGCCATCAGTGGTGTTCAATT i calJac3.chr5 I 132 C 0 s canFam3.chr9 41580941 50 + 61074082 TTCTTAGAAAAGTGGAAAAATGGCTTGGCTCTCCTCAGTAATGTCAAATA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=601835.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250418 266 + 478999 TAAAAATTGTTTGTTTTGATGTACTCATC------TTTATATGTATTTCTAT------TTACTTA---T-TTTTTTTACTTCTT---TTAATTTATAtttttacttatttctttatttatagacaa-gtctcattctgtagcctaggctgg-aatgcagtggtgcattca-----cagttcacttcagc--------------cttgagcaaacctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtacgcaccaccacacctggttaatatcttattatttgtagagatggagtcttgct s panTro4.chrUn_GL393519 90113 266 + 413329 TAAAAATTGTTTGTTTTGATGTACTCATC------TTTATATGTATTTCTAT------TTACTTA---T-TTTTTTTACTTCTT---TTAATTTATAtttttacttatttctttatttatagacaa-gtctcattctgtagcctaggctgg-aatgcagtgatgcattca-----cagttcacttcagc--------------cttgagcaaacctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgcgcaccaccacacctggttaatattttattacttgtagagatggagtcttgct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159704 271 + 72422247 TAAAAATTGtttgttttgatgtactcatt------tttatatgtatttctatttctagttactta---t-tttttttacttctt---ttaatttata-ttttACTTAtttctttctttatagacaa-gtctcattctgtggcctaggctgg-aatgcagtggtgcattcc-----cagttcactgcagc--------------cttgacctaacctctcacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgtgcaccaccacacctggttaatattttattatttgtagagatggagtcttgct i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 161986 282 + 1200634 TAAAAATTGTTTGTTTTGATGtattcatttttatatttatatgtatttatatttatatttacttatatt-tctttttacttatt---tttatttatatttttagttatttctttatctataaacaaggtcttgttctgtggcctaggctgg-aatgcagtagtgcattca-----cagttcactgcagc--------------cttgaacaaacctcgcacctcagcatcctaggtagctgggaccacaggtgcgtaccaccacacctggttaatgttttattatttgtagagatggagtcttgct i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53718768 240 - 80904711 TAAAAA----TTGTTTTGATTCATTCatt------ttta----tatttatat------ttacttt---t-ttttt-----------------------ttttactcatttctttttgcatagacaaggtctcattctgtcacctaggctggaaatgcagtgatgcaatca-----cagttcactgcatc--------------ctcgagcaaccctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgcgcaccaccacacctggttaatactctattatttgtagagatagagtcctgct i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548609 240 - 80997621 TAAAAA----TTGTTTTGATTCATTCATT------TTTA----TATTTATAT------TTACttt---t-ttttt-----------------------ttttactcatttctttttgcatagacaaggtctcattctgtcacctaggctggaaatgcagtgatgcaatca-----cagttcactgcatc--------------ctcgagcaaccctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgcgcaccaccacacctggttaatactctattatttgtagagatagagtcctgct i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369407 238 - 74645514 t-aaaa----ttgttttgattcattcatt------ttta----tatttatat------ttactta---t-ttttt-----------------------ttttact-atttctttttgcatagacaaggtctcattctgtcacctaggctggaaatgcagtggtgcaatca-----cagttcacagCATC--------------CTcgagcaaccctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgcgcaccaccacacctggttaatactctattatttgtagagatagagtcctgct i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424098 241 - 75148670 TAAAAA----TTGTTTTGATTCattcatt------ttta----tatttatat------ttactta---tatttct-----------------------ttttaCTCAtttctttttgcatagacaaggtctcattctgtcacctaggctggaaatgcagtggtgcaatca-----cagttcactgcatc--------------ctcgagcaaccctcccacctcagcctcccaggtagctgggaccacaggtgcgcaccaccacacctggttaatactctactatttgtagagatagagtcctgct i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299510 283 + 159171411 TGAAAACT--TTGTTTTGatttattcatt------ttta----tatttatat------atattta---t-ttatatttcttttttacttaatttatatttttagttatttctttatttatagttaaggtctcgttctgtcacctaggctgg-aatgcagtggtacaatcacagtgcagttcattgcagtctcaacctcccagactcaagcaatcctccaacctcagcctcccaggtagctgggactacaggtgtgcaccaccacacctggttaatattttattatttgtagagacagactcttact i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580991 0 + 61074082 C a score=91591.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250684 132 + 478999 atgttgcccaggctggtctcaaactcct-ggctcaagcaatcctcctgccttggcatcccaaaatgctgggattacagacatgagccacagtgcccaacc------------TAtttatttatttattt--------aagacaaggtctcacc s panTro4.chrUn_GL393519 90379 144 + 413329 atgttgcccaggctggtctcaaactcct-ggctcaagcaatcctcctgccttggcatcccaaaatgctgggattacagacatgagccacagtgcccaacctatttatttatttatttatttatttattt--------aagacaaggtctcacc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7159975 152 + 72422247 atgttgcccaggctggtctcaaactcct-ggctcaagcaatcctcctgccttagcatcccaaaatgctgggattacagacatgagccacagtgcccaacctatttatttatttatttatttatttatttatttaAAaaagacaaggtctcacc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162268 149 + 1200634 atgctgcccaggctggtctcaaactcctgggctcaaacaatcctcctgccttggcatcccaaaatgctgggattacagacatgagctacagtgcccaaccTattgattgattgattgattgattgattg----aAtaaagacaaggtctcact i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299793 109 + 159171411 atgttgcccaggctg--------------ggctcaagcaatcctct----------tcccaaaatgctgggattacaagcataagccactgtgcccaact------------tacttatttatttaatt--------aagacaaggtctcaca i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580991 0 + 61074082 C e chlSab2.chr16 50424339 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 50369645 0 - 74645514 C e macFas5.chr16 53548849 0 - 80997621 C e rheMac3.chr16 53719008 0 - 80904711 C a score=291613.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250816 101 + 478999 atgttgcccaggctggtcttgaactcctggtctcaagtgattctccaaccttggcctctcaaaatgttgggattacaggtatgacccaccatgcctggccT s panTro4.chrUn_GL393519 90523 101 + 413329 atgttgcccaggctggtcttgaactcctggtctcaagtgattctccaaccttggcctctcaaaatgttgggattacaggtatgacccaccatgcctggcct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160127 101 + 72422247 atgttgcccaggctggtcttgaactcctggtctcaagtgattctccaaccttggcctctcaaaatgttgggattacaggtatgagccaccatgcctggccT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162417 101 + 1200634 atgctgcccaggttggtcttgagctcctggcctcaagtgactctacaaccttagcctctcaaaatgttgggattacaggtatgagccaccatgcctggcct i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719008 101 - 80904711 atgttgtccaggctggtcttgaactcctggcctcaagcaatcctcctgccttggcctctcaaaatgttgggatcacaggtattagccaccatgcctggcct i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548849 101 - 80997621 atgttgtccaggctggtcttgaactcctggcctcaagcaatcctcctgccttggcctctcaaaatgttgggatcacaggtattagccaccatgcctggccT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369645 101 - 74645514 atgttgtccaggctggtcttgaactcccggcctcaagcaatcctcctgccttggcctctcaaaatgttgggatcacaggtattagccaccatgcctggcct i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424339 88 - 75148670 atgttgtccaggctggtcttgaactcctggcctcaagcaatcctcctgccttggcctctcaaaatgttgggatcacaggtatta-------------gccT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93299902 101 + 159171411 atgtggcccaggctagtcttgaactcctggcctcaagtgattctcctaccctggcctctcaaaatgttgggattacaggtattagccaccatgcctggcct i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41580991 0 + 61074082 C a score=613629.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 250917 183 + 478999 AAAAATAGTATTATATTTTTGTATTATATAATTTTCAATTAGGTAATATGAATATTCTGTACAG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACATAGGAATAAACGTTTGCTACACTAAGAAAAATCTAACAAAGCTAAAAATAAAAATTAATTTGGAAAGTACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT s panTro4.chrUn_GL393519 90624 183 + 413329 aaaaatagtattatatttttgtattatataattttCAATTAGGTAATATGAATATTCTGTACAG----------------------------AAAATATGCCCTTAGTTACATAGGAATAAACATTTGCTACACTGATAAAAATCTAACAAAGCTAAAGATAAAAATTAATTTGGAAAGTACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160228 211 + 72422247 AAAAATAGTATTGTATTTTTGTAATATATAATTTTCAATTAGGTAATATGAATATTCTGTACAGAAAATACAGAATATTTCTGTACATATATAAAATATGTCCTTAATTACATAGGAATAAACATTTGCTACACTGAGAAAAATCTAACAGAGCTAAAAATAAAAATTGATTTGGAAAGGACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162518 183 + 1200634 aaaaataatattatatttttgtattatataatttttaattaGGTAATATGAATATTCTGTACAG----------------------------AAAATATGCTCTTAATTACATAGGAATAAACATTTGTTACACTGAGAAAAATCTAATAGAGCTAAAAATAAAAATTAATTTGGAAAGGTCA---TTATATACTCATACATTCTTATGTTTAT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719109 183 - 80904711 aaaaatagtattatatttttgtagtatataattttCAGTTAGGTAATGTGAATATTCTATATGG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACACAGGAATAAACATTTGTTGCACTGAGAAAAATCTAATAGAGCTAAAAATAAAAATTAATTTGGAAAGGACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53548950 183 - 80997621 AAAAATAGTATTATATTTTTGTAGTATGTAATTTTCAGTTAGGTAATGTGAATATTCTATATGG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACACAGGAATAAACATTTGTTGCACTGAGAAAAATCTAATAGAGCTAAAAATAAAAATTAATTTGGAAAGGACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369746 183 - 74645514 aaaaatagTATTATATTTTTGTAGTATATAATTTTCAGTTAGGTAATGTGAATATTCTGTATGG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACACAGGAATAAACATTTGTTGCACTGAGAAAAATCTAatagagctaaaaataaaaattaatttggaaaggACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424427 183 - 75148670 AAAAATGGTATTATATTTTTGTAGTATATAATTTTCAGTTAGGTAATGTGAATATTCTATATGG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACACAGGAATAAACATTTGTTGCACTGAGAAAAATCTAATAGAGCTAAAAATAAAAATTAATTTGGAAATGACA---TTATATACCCATACATTCTTATGTTTAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300003 174 + 159171411 aaaaatagttttatatttttgtattatataattttCAATTAGGTAATGTGAATATTCTATATGG----------------------------AAAATATGCCCTTAATTACATAGGAATAAACATTTGTTACACTGAGAAAAATTTAATAGAGT------TAAAAATTAATTTGGAAAAGACA---TTATATACCCCTACATTC---TGTTTAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41580991 184 + 61074082 AAAAATAGTTTTATATTTTTGTACTATGTAATTTTCATTGAGGTAATATGAAAATTTTGTGTGA----------------------------AAAATATTTCTCTAATCACTTAGGAATAAACA--TGTTACATGGAAATGAATATAATACAGCTAAAGATAAAAATTAAGCTAGAAAGGAGATTGTTATGTACTCACACATTTTTTTTCTTtt i canFam3.chr9 C 0 I 188 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=60852.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251100 19 + 478999 ACATTCTTTCATATATTCA s panTro4.chrUn_GL393519 90807 19 + 413329 ACATTCTTTCATATATTCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160439 19 + 72422247 ACATTCTTTCATAAATTCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162701 19 + 1200634 ACATTCTTTCATATATTCA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719292 19 - 80904711 ACATTCTTTCATATATTCA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549133 19 - 80997621 ACATTCTTTCATATATTCA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369929 19 - 74645514 ACATtctttcatatattca i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424610 19 - 75148670 ACGTTCTTTCATATATTCA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300177 19 + 159171411 ACATTCTTTCATATATTCA i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I e canFam3.chr9 41581175 188 + 61074082 I a score=243344.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251119 73 + 478999 TATATTCTTTTAACAGTATCAATGGTTTGGAGTTATGTGTACAAAACCATGACCTATATGTAATACAACTAAC s panTro4.chrUn_GL393519 90826 73 + 413329 TATATTCTTTTAACAGTATCAATGGTTTGGAGTTATGTGTACAAAACCATGACCTATATGTAATACAACTAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160458 73 + 72422247 TATATTCTTTTAACAGTATCAATGGTTTGGAGTTATGTGTACAAAACCATGACCTATATGTAATACAACTAAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162720 73 + 1200634 TACATTCTTTTAACAGTATTAATGGTTTGGAGTTATGTGTACAAAACCATGACCTATATGTAATACAACTAGC i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719311 73 - 80904711 TATATTCTTTTAACAGTATCATTGGTTTGGATTTATATATACAAAACCATGACCTATATGCAATACAACTAAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549152 73 - 80997621 TATATTCTTTTAACAGTATCATTGGTTTGGATTTATATATACAAAACCATGACCTATATGCAATACAACTAAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50369948 73 - 74645514 tatattctttTAACAGTATCATTGGTTTGGATTTATATATACAAAACCATGACCTATATGCAATACAACTAAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424629 73 - 75148670 TATATTCTTTTAACAGTATCATTGGTTTGGATTTATATATACAAAACCATGACCTATATGCAATACAACTAAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300196 66 + 159171411 TACATTCTTTTAACAGTATCAATGGTTTGGAGTTATATGTACCAAACTATGACCTATATGTAACAC------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41581363 73 + 61074082 cACATTCTGTTAATGGTATCAAAGAGTTGGAGTCACATGCACACAACTATGGCCTATATGTAATATGATCAAT i canFam3.chr9 I 188 C 0 e mm10.chr11 42607102 1139 - 122082543 I a score=473019.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251192 155 + 478999 AACAGGCACTTACAATTCAAGGCATATGATATACAAAGCT----------TTAACTTCTCATCATCAGATTTTGTTTTTTTCTTTCTGTT-TTGGCAGATACTGTGAACA-CAACATTCAACTCACAGACACT-ATGGAGACCTT--------ACTAAGCATAAGGTAC----TGTGAAA s panTro4.chrUn_GL393519 90899 155 + 413329 AACAGGCACTTACAATTCAAGGCATATGATATACAAAGCT----------TTAACTTCTCATCATCAGATTTTGTTTTTTTCTTTCTGTT-TTGGCAGATACTGTGAACA-CAACATTCAACTCACAGACACT-ATGGAGACCTT--------ACTAAGCATAAGGTAC----TGTGAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160531 155 + 72422247 AACAGGCACTTACAATTCAAGGCATATTATATACAAAGCT----------TTAACTTCCCATCATCAGATTTTGTTTTTTTCTCTCTGTT-TTGACAGATACTATGAACA-CAACATTCAACTCACAGACACC-ATGGAGCCCTT--------ACTAAGCATAAAGTAC----TGTGAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162793 154 + 1200634 AACAGGCACTTAAAATTCAAGGCATATTATATACAAAGCT----------TTAACTTCTCATCATCAGATTTTG-TTTTTTCTTTCTGTT-TTGGCACATACTATGAACA-TAACATTCAACACACAGACACT-ATGGAGACCTT--------ACTAAGCATAAAGTAC----TGTGAAA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 I 13811 s rheMac3.chr16 53719384 150 - 80904711 AACAAGCACTTACAATTCAAGGCATATTATATACAAATCT----------TTAACTTATCATCATCAGATCCTGTTTTT-----TCTGTT-TTGGCACAAACTATGAACA-TAACACTCAACTCACAGACACA-AAGGAGCACTT--------ATTAAGCATCAAGTCC----TGTGAAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549225 150 - 80997621 AACAAGCACTTACAATTCAAGGCATATTATATACAAATCT----------TTAACTTATCATCATCAGATCCTGTTTTT-----TCTGTT-TTGGCACAAACTATGAACA-TAACACTCAACTCACAGACACC-AAGGAGCACTT--------ATTAAGCATCAAGTCC----TGTGAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50370021 150 - 74645514 AACAAGCACTTACAATTCAAGGCATATTATATACAAATCT----------TTAACTTCTCATCATCAGAtcctgttttt-----tctgtt-ttggcaCAAACTATGAACA-TAACACTCAACTCACAGACACC-AAAGAGCACTT--------ATTAAGCATCAAGTCC----TGTGAAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424702 150 - 75148670 AACAAGCACTTACAATTCAAGGCATATTATATACAAATCT----------TTAACTTCTCATCATCAGATCCTCTTTTT-----TCTGTT-TTGGCACAAACTATGAACA-TAACACTCAACTCACAGACACC-AAGGAGCACTT--------ATTAAGCATCAAGTCC----TGCGAAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300262 156 + 159171411 AACAGGCAATTATAATTCAAGGCATATTATATACAAATCT----------TTAACTTCTCATCATCAGATTCTGTTTAGTTCTTTCTGTT-TTGGCACATACTACGAATATTAACACTCAACTCACAGACACC-ATGGCGTACTT--------ACTAAGCAAAAAGTAC----TGTGAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42608241 138 - 122082543 AGTAGGCTCTTACTGTCTAACTTAACTTTTATAAA---------------TTAACTTCTGAACATCAGGTGAGAATGTTTTCCTTCTGTCATTGGCACATCCTATGAATA-AAACAACCAACTCACAGCCGTT--------------------------CACAATGTACTGTTTGTGAAA i mm10.chr11 I 1139 C 0 s canFam3.chr9 41581436 172 + 61074082 AATAGGCACTTATAGTGCAAGGCA-ATTATATGCAAATCTCTAACGTGAATTAATTTCTGAATGTCATATTCTGCTTTATTATTTGT-TT-CTAGCACATATTATGAACA-AAACATTTCATCCACAATTGCTAATGAAGCACTCACTAAGTAACTAAGCGTAAAGTAC----GAGGAAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=239654.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251347 90 + 478999 TGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAACTACTCTCACTGTATCATCAT-AGAGTCAGTGTCTAACCATGAAGATCTTTTTGTTCACAAGCTAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 91054 90 + 413329 TGTACTTTG-------AAAGATTCAGCAAACTACTCTCACTGTATCATCAT-AGAGTCAGTGTCTAACCATGAAGATCTTTTTGTTCACAAGCTAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160686 89 + 72422247 TGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAACTACTCTCACTGTATCATCAC-AGAGTAAGTGTCTAACAATGAGGATA-TCTTATTCACAAACTAAAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719534 90 - 80904711 GGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAACTACTCTCATTGTATCATCAT-AGAGTAAGTGTCTAACAATGACGATCTTTTGGTTCACAAACTAAAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549375 90 - 80997621 GGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAACTACTCTCATTGTATCATCAT-AGAGTAAGTGTCTAACAATGACAATCTTTTGGTTCACAAACTAAAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50370171 90 - 74645514 GGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAATTACTCCCATTGTATCATCAT-AGAGTAAGTGTCTAACAATGAGGATCTTTTGGTTCACAAACTAAAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424852 90 - 75148670 GGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAAAATACTCTCATTGTATCATCAT-AGAGTAAGTGTCTAACAATGAGGATCTTTTGGTTCACAAACTAAAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300418 90 + 159171411 GGTACTTTA-------AAAGATTCAGCAGGCTACTCTCACTGTATCATTAT-AGAGTAAGTGTCTAACAATGAGGATCTTTTGGTTCATTAACTAAAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42608379 52 - 122082543 ------------------------------------------TATAATCA----AGTGTGTGTCTACTAGTGAGAATCTTTTAGTTGATAGATTAGAG i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41581608 98 + 61074082 GGTACTTTAAAGACTCAAGGATTCAGCACACTACCTTCACTGTAACATCATAAAAGTGAATGTCTAACAATGAGGATCTTTTACCTCACAAACTATAT i canFam3.chr9 C 0 I 144 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=746626.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251437 282 + 478999 -----------------------------------------------GCCATGAAATGGGATTC-----------------------------AAAACAAATGTCCACAGAAATTTTATAGCAATACTGAAGTAGAC-TATATTTTCTGAGCCTTAATCT--------AAAAGAAGTTAAAGCCATTCATCTTTATGAGGGTTCTGAAAAGTGTtatagtgtagtag--aaaagttctgcacttaaaaccaaaagacctatgaatcaggtgtgggatctcacacaagccagttattcacactgagtt---gcattttccttaactatcatctgaaaataatgttttctt----cattccctggtaggtattaaatg s panTro4.chrUn_GL393519 91144 279 + 413329 -----------------------------------------------GCCATGAAATGGGATTC-----------------------------AAAACAAATGTCCACAGAAATTTTATAGCAATACTGAAGTAGAC-TATATTTTCTGAGCCTTAATCT--------AAAAGAAGTTAAAACCATTCATCTTTATGAGGGTTCTGAAAAGTGTTACAGTGTAGTAG--AAAAGTTCTGCACTTAAAACCAAAAGACCTATGAATCAGGTGTGGGATCTCACACAAGCCAGTTATTCACACTGAG-T---GAATAT--CTTAACTATCATGTGAAAATAATGTTTTCTT----CATTCCCTGGTAGGTATTAAATG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7160775 281 + 72422247 -----------------------------------------------CCCACTAAATGGGATTC-----------------------------AAAACAAACGTCCACAGAAATTTTATAGCAATACTGAAGTAGAC-TATATTTTCTGAGCCTTAATCT--------AAAAGAAGTTAAAACCATTCATCTTTATGAGGGTTCTGAAAAGTGTtatagtgtagtag--taaagttctgcacttaaaaccaaaagacctacgaatcaggtgtgggatctcaca-aagccaattattcacactgagtt---gcattttccttaactatcatctgaaaataatgttgtctt----cactccctGGTAAGTAGTAAATG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719624 281 - 80904711 -----------------------------------------------CCCACTAAATGGGATTC------------------------------AAACAAAAGTCCACAGAAATTTTATAGCAATATTGAAGTATAC-TATATTTTCTGGACCTTAATCT--------GAAAGAAGTCAAAACCATTAACCTTTATGAGGGTTCTGAAAAATGTTACAGTGTAGTAG--AAAAGTCCTTCACTTAAAACCAAAAGACCTATGAAACaggtgtggaatcttaagcaagtcaattattcacattgagtt---gcatcttccttaactataatttgaaaataatgctgtctt----cactccctggtaagtactaaatg i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549465 281 - 80997621 -----------------------------------------------CCCACTAAATGGGATTC------------------------------AAACAAAAGTCCACAGAAATTTTATAGCAATATTGAAGTATAC-TATATTTTCTGGACCTTAATCT--------GAAAGAAGTCAAAACCATTAACCTTTATGAAGGTTCTGAAAAATGTTACAGTGTAGTAG--AAAAGTCCTTCACTTAAAACCAAAAGACCTATGAAACaggtgtggaatcttaagcaagtcaattattcacattgagtt---gcatcttccttaactataatttgaaaataatgctgtctt----cactccctggtaagtactaaatg i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50370261 281 - 74645514 -----------------------------------------------CCCACTAAATGGGATTC------------------------------AAACAAAAGTCCACAGAAATTTTATAGCAATATTGAAGTATAC-TATATTTTCTGGACCTTAATCT--------GAAAGAAGTCAAAACCATTAACCTTTATGAGGGTTCTGAAAAATGTTACAGTGTAGTAG--AAAAGTCCTTCACTTAAAACCAAAAGACCTATGAAACAGGTGTGGAATCTTAAGCAAGTCAATTATTCACATTGAGTT---GCGTCTTCCTTaactataatttgaaaataatgttgtCTT----CACTCCCTGGTAAGTACTAAATG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50424942 281 - 75148670 -----------------------------------------------CCCACTAAATGGGATTC------------------------------AAACAAAAGTCCACAGAAATTTTATAGCAATACTGAAGTATAC-TATATTTTCTGGACCTTAATCT--------GAAAGAAGTCAGAACCATTAACCTTTATGAGGGTTCTGAAAAATGTTACAGTGTAGCAG--AAAAGTCCTTCACTTAAAACCAAAAGACCTATGAAACaggtgtggaatcttaagcaagtcaattactcacattgagtt---gcatcttccttaactataatttgaaaataatgttgtctt----cattccctggtaagtactaaatg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300508 313 + 159171411 -----------------------------------------------TCCACTAAATGGGATTCCATTGGTTCACTAACCNNNNNNNNNNATTCAAACAAATGTCCACTGAAATTTTATAGCAATACTGAAGTATACTTATATTTTCTGAAACTTAATCT--------AAAAGAAGTTAAAACCATTAACCTTCATGA-GGTTCTGAAAAATGCtatagtgtagtagaaaaaagtcctacacttaaaaccgaaagatctatgaatcagacatggaatcttaagcaagtcaattattcacattgagct---gctttttccttaactataatttgaaaataatgttgtctt----cactccctggtaagtattaaatg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42608431 269 - 122082543 -----------------------------------------------TCCTCTAAATGAGATAT------------------------------AAAACAATGTT--------TGTTGTAGCAGTATTTAAGTGTAC-TATATTTTCTGAGTCTTAAACTAAAAAAAAAAAAAAAATTAGAACCATGGACTTTTTGAAGGGTT--------------AGTACGGTAA-TAAGAACTTAGGATTTAAATCCAAAAGAACCATAAAGCAGGTGTGAA--TTCAGGTCAATAAGTTATGTCTGCTTAG-T---GTATTTTCTAAAACTATAACATGAAAATAATGGTATCTCTCTATATGTTCTTTAAAGTATTAAATG i mm10.chr11 C 0 I 268 s canFam3.chr9 41581850 318 + 61074082 gccctgggccaaaccgctgcgccacccagggatcccACAAACTATATCCTTCTAAGTGAGATTC-----------------------------AAAACAAATGTCCACAGAAATTTTATAGCAATACTGAAATACAC-TGAATTTTCTGAGTCTCAATAT--------GAAAGAAGTTAAGAGCATTAACTTTTGGGAGCGTTCTGAAAAATGTCACAGTGTGGCAG-AAAGAGTTCAGAACTTTAG-CCACAGGATCTATGAATTAGG-GTGGAATCTTGGGCAAATTAGTCACTCACTTTGACCTATAGCATCTCCTTTAACTATAAT-------------TATCCA----TTGTCCCTTCTAAGTATTAAGTG i canFam3.chr9 I 144 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=300774.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251719 170 + 478999 tgaaaacttatgaaagcgAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTACTATTATGG--CAATCAACATATAAAACATATTCTTtatatatatatatatatatatatatataaataatatataGAAT--AGGAGAAAAGTTGGGTCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAGATGCAT s panTro4.chrUn_GL393519 91423 164 + 413329 TGAAAACTTATGAAAGCGAGACGATAAAATATGATT--------TGTTACTACTATTATGG--CAATCAACATACAAAACATACTCTT------TCTCTCTCTCtatatataaataaataatatataGAAT--AGGAGAAAAGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAGATGCAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7161056 155 + 72422247 TGAAAACTTATGAAACCAAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTACTATTATGG---AATCAACATATAAAACA--------------CTCTGTCTCtatatataaataaataatatataGAAT--AGGAGAAAAGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAGATGCAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53719905 139 - 80904711 tgaaaacttatgaaagcAAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTATTGTTATGA--CAATCAACATATAAAAAACACACCC------------------tatatatataaataatatat---------------aGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAAATACAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549746 139 - 80997621 tgaaaacttatgaaagcAAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTATTGTTATGA--CAATCAACATATAAAAAACACACCC------------------TATATATATAAATAATATAT---------------AGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAAATACAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50370542 139 - 74645514 TGAAAACTTATGAAAGCAAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTATTGTTATGa--caatcaacatataaaaaacacaccc------------------tatatatataaataatacat---------------agttGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAAATACAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50425223 139 - 75148670 tgaaaacttatgaaagcAAGATGATAAAATATGATT--------TGTTACTATTGTTATGA--CAATCAACATATAAAAAACACACCC------------------TATATATATAAATAATATAT---------------AGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGTGATTATTAAATACAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300821 144 + 159171411 tgaaaacatatgaaagcaagatgataaaatgtga----------tgttactatTTTTATAA------CAACATATAAAACATACTCTC--------------------TCTATATAAGTAATATATAGCAT--AGGAGAAAAGTTGGATCCCCAAACATGGCAATGCGATTATTAGATACAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41582168 157 + 61074082 CAAAACTACCTCAAAGCAACATGACAAATTACCATTCAATAAGATACTATTATTTTTATAAGTAAATCAA-ATATAAAACAA------------------------AGCACATGTCAACAATATATAAGGTAAAAAAAAAAAGTGGGATCCCAAAATATGGCAATGAGGTCATTAGGCACAT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42608700 268 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1257414.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 251889 388 + 478999 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTAGT-GGTAAACTCTGCTTCTCAACCAAAAAGAAAGCAATCTAC-ATTTCAAGGTTGTACTTTACCTCATCATAAATTCCTCAAACTTTTAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCGGTATG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCGAGGTATACAAGAAGTGTTGCCAT-TTATCAAAAGGTCATCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATATAGCA--AACTACTTAG--AAAAAAGTAGCAGTTCACATTTA-----GCAGTACACATTTCTTTAACTTGTAACT-GTTGCTTTTCCTTTAACTGTCAGCTGGTGGTCCCTGTTGATTTGTAA----ACAGCACCCAAAAGACCTCAG s panTro4.chrUn_GL393519 91587 388 + 413329 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTAGT-GGTAAACTCTGCTTCTCAACCAAAAAGAAAGCAATCTAC-ATTTCAAGGTTGTACTTTACCTCATCATAAATTCCTCAAACTTTTAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCGGTATGTTATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCGA-GTATACAAGAAGTGTTGCCAT-TTATCAAAAGGTCATCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATATAGCA--AACTACTTAG--AAAAAAGCAGCAGTTCACATTTA-----GCAGTACACATTTCTTTAACTTGTAACT-GTTGCTTTTCCTTTATCTGTCAGCTGGTGGTCCCTGTTGATTTGTAA----ACAGCACCCAAAAGGCCTCAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7161211 389 + 72422247 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTAGT-GGTAAACTCTGCTTCTCAACCAAAAAGAAAGCAATCTAC-ATTTCAAGGTTGTACTTTACCTCATCACAAATTCCTTAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCGGTATG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTATGCAAGAAGTGTTGCCAT-TTATCAAAAGGTCATCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATATAGCA--AACTACTTAG--AAAAAAGTAGCAGTTCACATTTA-----GCAGTACACATTTCTTTAACTTGTAACTGGTTGCTTTTCCTTTAACTATCAGCTGGTGGTCCCTGTTGATTTGTAA----ACAGCATCCAAAAGACCTCAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53720044 394 - 80904711 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTGGTGGGCAAACTCTGCTTCTCAAACAAAAAGAATGCAATCAACTATTTCAAGGTTGTACTTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTACGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATACAGCA--AACTACTTAGAAAAAAAATTACCAGTTCACATTTT-----GCGCTACACATTTCTTTAACTTGCAACTGGTTGCTTTTCCTTTTACTGTCAGCTGGTGGTCTCTGCTGATTTGTAA----ACAGCACCAAAAAGACCTCAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53549885 394 - 80997621 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTGGTGGGCAAACTCTGCTTCTCAAACAAAAAGAATGCAATCAACTATTTCAAGGTTGTACTTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTACGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATACAGCA--AACTACTTAGAAAAAAAATTACCAGTTCACATTTT-----GCGCTACACATTTCTTTAACTTGCAACTGGTTGCTTTTCCTTTTACTGTCAGCTGGTGGTCTCTGCTGATTTGTAA----ACAGCACCAAAAAGACCTCAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50370681 393 - 74645514 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTGGTGGGCAAACTCTGCttctcaaacaaaaagaatgcaATCAACTATTTCAAGGTTGTACTTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTACGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATACAGCA--aactacttag-aaaaaaattagcagttCACATTTT-----GCGCTACACATTTCTTTAACTTGTAACTGGTTGCTTTTCCTTTTACTGTCAGCTGGTGGTCTCTGCTGATTTGTAA----ACAGCACCAAAAAGATCTCAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50425362 394 - 75148670 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATATCTAACAAGTGGCCTGGTGGGCAAACTCTGCTTCTCAAACAAAAAGAATGCAATCAACTATTTCAAGGTTGTAATTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACGGGCTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTACGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATACAGCA--AACTACTTAGAAAAAAAATTAGCAGTTCACATTTT-----GCGCTACACATTTCTTTAACTTGTAACTGGTTGCTTTTCCTTTTACTGTCAGCTGGTGGTCTCTGCTGATTTGTAA----ATAGCACCAAAAAGACCTCAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93300965 392 + 159171411 CTTTCCTCATAG-TCTTCTATCATAATTAACAAGTGGTCTGGT-GGTAAATTCTGCTTGTCAACCAAACAGAAAGCAATCAAC-ATTTCAA-GTTGTACTTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTATGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTAGATATAGCA--AACTACTTAGAAAAAAACGTAGCAGTTCACATTTA----GGCAGTACATATTTCTTTAACTTGTCACTGGTTGCTTTTCCTTTTACTGTCAGCTGGTGGTCTCTGTTGATTCGTAA----ACAGCAACAAAAAGACCTCAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42608968 389 - 122082543 CTATATTAATAC-AGCATGAGCACATTCAGTAAGTGGTTTGGT-AATAAACTTTGTTTCAC-ACCTCCCAAAACATATTCATC-CTTTCAAAGTTGTGTTTTACCTGGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGCTTGTGCTCCGGAGGACCCAGATACGCGAGAAGTGTGGCCATCTTATCAAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTATGATCCCTGGTAACAACAGGAAATGCTTAT-----TAAATGGCACTTCACATTAATTGGGGAGTCTGACCTTCCTTTAGACTGCCACCGCTTGCTTTTCTTCTAACTAC-------TGTTCCTGCCTGATTTGTAAGTTTGCAGCATC-GAAAGATTTCAG i mm10.chr11 I 268 C 0 s canFam3.chr9 41582325 390 + 61074082 CTTTCCTATTAGAAATACAAGTCTACCTAACAAGTGGCCTGGT-GGTAAATCTTGCACCTCAACCAAA-AGAAAGCAATTATT-ATTTTAACATGGTACTTTACCTAGTCATAAATTCCTCAAACTTTGAACTGGTAAGGTTAAGGCTGGACCAGTGTG-TATCTGCCACAGGTTTGTGCTCTGGAGGACCCAGGTATGCAAGAAGTGTTGCCATCTTATCGAAAGGTCGTCTTCCAACAGCTTTGTGATCCCTAGATACAGCA--AACTAGTTAG--AAAAAAGTAGCAGTTCACATTTA-----GCAGTACACATTGCTTTAGATTATCACCGGTTGCTTTTCTTCTTACTGTCAGCTGGTGGTTCTTGATGATTTGTAA----ACAGCACCAAAAAGACCTCAA i canFam3.chr9 C 0 I 1285 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1940.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 252277 2 + 478999 GC s panTro4.chrUn_GL393519 91975 2 + 413329 GC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7161600 2 + 72422247 GC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53720438 2 - 80904711 GA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53550279 2 - 80997621 GA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50371074 2 - 74645514 GA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50425756 2 - 75148670 GA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93301357 2 + 159171411 GC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42609357 2 - 122082543 AT i mm10.chr11 C 0 I 936 s canFam3.chr9 41584000 2 + 61074082 GC i canFam3.chr9 I 1285 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=798673.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 252279 340 + 478999 CCATGTCTACTTCAATCCATTAATAATGCATAAAAGATTAAAATGCTCTGTGGTTTAAACTCCCATCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCATAGTCCACTACTTTTCCTGTGAATGTGCTAACCACTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGGACTCATTTTTCCTTTGTAAG-GAACTCCTCATACTTAGGAATTTTGTCCCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GAACAGCAAG-TAATTTATGTTAAC-ACAAGAGACTAATAAGA-GCTAATGAAACAATGCCCAAATTAATAATTTCAATTTTTAAGTAttttttc-----tttttttttttttttcccctg s panTro4.chrUn_GL393519 91977 338 + 413329 CCATGTCTACTTCAATCCATTAATAATGCATAAAAGATTAAAATGCTCTGTGGTTTAAACTCCCATCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCATAGTCCACTACTTTTCCCGTGAATGTGCTAACCACTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGGACTCATTTTTCCTTTGTAAG-GAACTCCTCATACTTAGGAATTTTGTCCCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGTTAAC-ACAAGAGACTAATAAGA-GCTAATGAAACAATGCCCAAATTAATAATTTCAATTTTTAAGTAttttttc-------tttttttttttttcccctg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7161602 336 + 72422247 CCATGTCTACTTCGATCCATTAATAATGCACAGAAGATTAAAATGCCCTGTGGTTTAAACTCCCATCTCCGAATTGCTTACCCTTAGCTTCACAGTCCAGTACTTTTCC-GTGAATGTGCTAACCACTTTTATTGCCATTTAAAAATCATTTGGACTCATTTTTCCTTTGTAAG-GAACTCCTCATACATAGGAATTTGGTCCTTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGTT-AC-ACAAGAGACTAACAAGA-GTTAATGAAACAATGCCCAAATTAATAATTTCAATTTTTAAGTAttttttc-------tttcttttttttttccctg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53720440 318 - 80904711 CCATGTTTACTTCAATCCATTAATAACTCATAAAAGATGAAAATGCCCTGTCATTTAAACTCCCTTCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCACAGTCCACTACTTTTCCCGTGAATGTGCTAATCATTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGAACTCATTTTTCCTTTGTTAG-GGACTCCTCATACATAGGAATTTGGTCTCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGAT-AC-ACAAGAGACTACCAAGA--TTAATGAAACAATGCCCAAATTAATAATTTCAA-------------------------tttttttttttatttctg i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53550281 336 - 80997621 CCATGTTTACTTCAATCCATTAATAACTCATAAAAGATGAAAATGCCCTGTCATTTAAACTCCCTTCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCACAGTCCACTACTTTTCCCGTGAATGTGCTAACCATTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGAACTCATTTTTCCTTTGTTAG-GGACTCCTCATACATAGGAATTTGGTCTCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGAT-AC-ACAAGAGACTACCAAGA--TTAATGAAACAATGCCCAAATTAATAATTTCAATTTTTAAGTAttttctt-------ttttttttttttatttctg i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50371076 336 - 74645514 CCATGTTTACTTCAATCCATTAATAACTCATAAAAGATGAAAATGCCCTGTCATTTAAACTCCCTTCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCACAGTCCACTACTTTTCCCGTGAATGTGCTAACCATTTttattggcatttaaaaataatctgaactCATTTTTCCTTTGTTAG-GGACTCCTCATACATAGGAATTTGGTCTCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGAT-AC-ACAAGAGACTACCAAGA--TTAATGAAACAATGCCCAaattaataatttcaatttttaagtattttctt-------ttttttttttttatttctg i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50425758 335 - 75148670 CCATGTTTACTTCAATCCATTAATAACTCATAAAAGATGAAAATGCCTTGTCATTTAAACTCCCTTCTCCCAATTGCTTACCCTTAGCTTCACAGTCCACTACTTTTCCCGTGAATGTGCTAACCATTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGAACTCATTTTTCCTTTATTAG-GGACTCCTCATATATAGGAATTTGGTCTCTTTACAAGTTTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATAAT-AC-ACAAGAGACTACCAAGA--TTAATGAAACAATGCCCAAATCAATAATTTCAATTTTTAAGTAttttctt--------ttttttttttaatttctg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93301359 320 + 159171411 CCATGTCTACTTCAATCCATTAATAATTCATAAAAGGTTAAAATGCCCTGTTATTTAAACTCCCATCTCCCAGTTGCTTAGCCTTAGCTCCATAGTCTGCTACTTTTCCCATGAAAGTACTAACCATTTTTATTGGCATTTAAAAATAATTTGGACTCATTTTTCCTTTTTAAG-GAATGCCTCATACACAGGAATTTGGTCTCTTTACAAATGTATATAA--CTAGATG-----------------GGACAGCAAG-TAATTTATGTT-AC-GCAAGAGACTAATAAGA-GCTAATGAAACAATGCCCAAAT---TAATTTCAATTTTTAA---------------------ttttttttttctctg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42610295 273 - 122082543 CCATGCCTACATCAACCCATAAACACTCCATAAAGGATTAACAAGTTTACT--TTTAAACTTCCATCTCCTAGATGTTTAGC--------CACAGT-------------------------------------------------------------------------------GATCTCCTCAGACACAGAAATTGGAGCCCTTTACAATTCTATATAAACTTAAAAGGAAATAACTCTGACAAAGGACAGCAGGTTAATTTATGTC-ACTAGAAGCTTTTACTAAAAAGCTAGTGAAATAATTTCCAAA----TACTTTGAGTTACTGCATCTCGTCTCATTCTCTCTAGTTTGCCTTACCTCT- i mm10.chr11 I 936 C 0 s canFam3.chr9 41584002 277 + 61074082 CCATGTC-ACTTTAACCCATTAACAATTCATGAAGGATTAAAATGCTCT----CTTAAACCACCATCTCCTAATAAGTTAGTCTCAGATTCATGGTCTTCTACCACTCTCATGAATGAGCAAATAATTTTCATTAGCATTT-AGGATTTTCTGGACTCATTTCACATTTGTAAGAGAACTCCTCATGCACAGGAATTTAGACCCTTTATAAACATACACAA--CTAGATa-------------------------aa-taa---------aa-aaataaaaataaaaaaa----aataaaataaaaCCTGgg-----------gatccctgggtgg-------------------------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=299231.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 252619 167 + 478999 agatggagttttgctctta----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacaacctc------ggctcactgc----aacctccgcctcccaggttcaagtaattatcctgcctcagcctcc------------------------------------------------------------------caagtagccaggattacaggcgcctgac-----------------accatgcac-agctaat--------------------ttttgaatttttagtag---------------------------------------------------------------------------- s panTro4.chrUn_GL393519 92315 167 + 413329 agatggagttttgctctta----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacaacctc------ggctcactgc----aacctccgcctcccaggttcaagtaattctcctgcctcagcctcc------------------------------------------------------------------caagtaaccgggattacaggcgcctgac-----------------accatgcac-agctaat--------------------ttttgaatttttagtag---------------------------------------------------------------------------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7161938 167 + 72422247 agatggagttttgctcttg----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcgcaacctc------ggctcactgc----aacctccgcctcccaggttcaagtgattctcctgcctcagcctcc------------------------------------------------------------------caagtagctgtgattacaggtgcctgac-----------------accatgcct-ggctaat--------------------ttttgaatttttagtag---------------------------------------------------------------------------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53720758 166 - 80904711 agatggagtttagctcttg----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacgatctt------ggatcactgc----aacctccgcctccc-tgttcaagcgatttttctgcctcagtctcc------------------------------------------------------------------caagtagctgggattacaggcgtctgcc-----------------accatgccc-agttaat--------------------ttttgcatttttacgag---------------------------------------------------------------------------- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53550617 166 - 80997621 agatggagtttagctcttg----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacgatctt------ggatcactgc----aacctccgcctccc-tgttcaagcgatttttctgcctcagtctcc------------------------------------------------------------------caagtagctgggattacaggcgtctgcc-----------------accatgccc-agttaat--------------------ttttgcatttttacgag---------------------------------------------------------------------------- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50371412 166 - 74645514 agatagagtttagctcttg----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacgatctt------ggatcactgc----aacctccgcctccc-ggttcaagcgatttttctgcctcagtctcc------------------------------------------------------------------caagtagctgggattacaggcgtctgcc-----------------accatgccc-agttaat--------------------ttttgcatttttacgag---------------------------------------------------------------------------- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50426093 166 - 75148670 agatggagtttagctcttg----tggcccagg--------ctggagtgcaatggcacgatctt------ggatcactgc----aacctccgcctccc-ggttcaagcgatttttctgcctcagcctcc------------------------------------------------------------------caagtagctgggattacaggtgtctgcc-----------------accatgccc-agttaat--------------------ttttgcatttttactag---------------------------------------------------------------------------- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93301679 138 + 159171411 agacagagtttcactcttg----tggcccagg--------ctggagctcaatggcgtgatctc------aattcactgc----aact----------------------ttctcctgcctcagcctct------------------------------------------------------------------caagtagctgggattacaggt------------------------accacgccc-agctaat--------------------ttttgtatttttagtag---------------------------------------------------------------------------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41584279 365 + 61074082 cgcagcggtttggcgcctgcctttggcccagggcgcgatcctggagacccgggatcgaatcccacatcgggctccctgcatggagcctgcttctccc----tctgcctgtgtctctgcctctctctctctctctgtgagactatcataaaaaaaaaaaaaaccaaaaaaaaaCATCCCCAACTAGAAAGGACAGCAAGGGATTCAGGCTACAAAAGACTTACTAAAAACAGCTGATAAAACAATACCCAAGTTAATACTTCCTAATTACTGTTTTCTTTtttttttttaagatttttatttatttattcatagagacacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagagagagagagag i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42610568 0 - 122082543 C e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=363208.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 252786 152 + 478999 agatggggtttcaccatgttggctaggctgatctcgaactc------------ctgacctcag-------gtgatccacccacctcggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggca----tcagccacagtgcc----aggcc-----AGTATTTTCTATATAAAGCTTTATTTGCATATACTTA- s panTro4.chrUn_GL393519 92482 152 + 413329 agacggggtttcaccatgttgaccaggctgatctcgaactc------------ctgacctcag-------gtgatccacccacctcggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggca----tcagccacagtgcc----aggcc-----AGTATTTTCTATATAAAGCTTTATTTGCATATACTTA- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7162105 165 + 72422247 agatggggtttcaccatgttggctaggctgatctcgaactc------------ctgacctcag-------gtgatccacccgcctcggccacccaagcatcagagattacagg---ctgagattacaggca----tcagccaccatgcc----aggcc-----AGTATTTTCTATATAAAGCCTTATTTGCATATACTTA- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53720924 151 - 80904711 agacagggtttcaccatgttggccaggctgatctcgaactc------------ctgccctcag-------gtgatctgcctgcctaggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggcg----tgagccaccatgtc----aggcT-----GGTATTTTCTATACAAAGCTTTA-TTGCATATACTTA- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53550783 151 - 80997621 agacagggtttcaccatgttggccaggctgatctcgaactc------------ctgccctcag-------gtgatctgcctgcctaggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggcg----tgagccaccatgtc----aggcT-----GGTATTTTCTATACAAAGCTTTA-TTGCATATACTTA- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50371578 151 - 74645514 agacagggtttcaccatgttggccaggctgatctcgaactc------------ctgccctcag-------gtgatctgcctgcctaggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggcg----tgagccaccatgtc----aggct-----ggtATTTTCTATACAAAGCTTTA-TTGCATATACTTA- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50426259 151 - 75148670 agacagggtttcaccatgttggccaggctgatctcgaactc------------ttgccctcag-------gtgatctgcctgcctaggccacccaaa-------------gtg---ctgagattacaggcg----taagccaccatgtc----aggcT-----GGTATTTTCTATACAAAGCTTTA-TTGCATATACTTA- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93301817 152 + 159171411 agacggtatttcaccatgttggccaggctgatcttgaactc------------ttgacctcag-------gtgatccacccgactcagcctcccaaa-------------gtg---ctgagattacaggtg----tgagccacggtgcc----aggcc-----AGTATTTTCTATATAAAGCTTTATTTGCATATACTTA- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42610568 173 - 122082543 agacacggtcttaccacgtagccctggcaggcccagagctcacgtagaccagtctggcctcagagtcacagagatctaccagcctctgcattgcaca-------------cag----tgggattaaaagca----t--ggcactgtgcc----tgactGACTGGGTACTTTCTATATGCTGCTTGGTTTTCATACACTTA- i mm10.chr11 C 0 I 99 s canFam3.chr9 41584644 169 + 61074082 aggcagagacacaggcagagggagaagcaggctccatgcag------------ggagcccgac-------gtgggactcaatcccaggcctccagga-------------tcacaccccaggctgcaggcagcactaaaccgctgcgccacagaggctgcccTACTGTTTTCTACATAAAGCTTTATTTGCTTATACTTCA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=692366.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 252938 285 + 478999 GAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTGAAACACTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTATGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACACT-----------------AATTTGAACTTCTTTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--ACAAACCCAAAGAGCTAATCTGTGATTTCTTAACTTGAG---------AAAATAATAATAATAACCACCACTGGAACCTACATAGGTTTGTTGATTATTTAACATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAGACT------------ s panTro4.chrUn_GL393519 92634 280 + 413329 GAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTGAAACACTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTATGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCGAACACT-----------------AATTTGAACTTCTTTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--ACAAACCCAAAGAGCTAATCTGTGATTTCTTAACTTGAG---------AAAATAATAATAATAACCACCACTGGAACCTACATAGGTTTGTTGATTATTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTG-----AAAAAAAAAAAGACT------------ i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7162270 276 + 72422247 GAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTGAAACACTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTACGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACACT-----------------AATTTGAACTTCTTTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--ACAAACCCAAAGAGCTAATCTGTGATTTCTTAACTTGAG---------AAAATAATAATAATAACCACCACTGGAACCTACATAGGTTTGTTGATTATTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTG---------AAAAAAAGACT------------ i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53721075 278 - 80904711 AAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTAAAACGCTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTACGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACGCT-----------------AATTTGAACTTCTCTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--AAAAACCCAAAGAGCGAATCTGTGATTTCTTAACTTGAC---------AAAAAAATAATAATAATAACCACTGGAACCTAGGTAGGTTTGTTGATTATTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTG-------AAAAAAAGAATCT------------ i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53550934 278 - 80997621 AAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTAAAACGCTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTACGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACGCT-----------------AATTTGAACTTCTCTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--AAAAACCCAAAGAGCGAATCTGTGATTTCTTAACTTGAC---------AAAAAAATAATAATAATAACCACTGGAACCTAGGTAGGTTTGTTGATTATTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTG-------AAAAAAAGAATCT------------ i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50371729 275 - 74645514 AAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTAAAACGCTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTACGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACGCT-----------------AATTTGAA---CTCTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--AAAAACCCAAAGAGCGAATCTGTGATTTCTTAACttgac---------aaaaaaataataataataaccactgGAACCTAGGTAGGTTTCTTGATTATTTAATATGACTTAaccttttgtttgtatttttttg-------aaaaaaagaatct------------ i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50426410 277 - 75148670 AAGTATCACAAATGAGTTTATCATAGAATTAAAACGCTGACAATATTTTAATTACTGAATTCCTACGAATTAGCTGTTCTTCAGATTCAAATGCCAACGCT-----------------AATTTGAACTTCTCTGGGTCT--------ATGACAGTTTGCAAGCCAT--AAAAACCCAAAGAGCGAATCTGTGATTTCTTAACTTGAC---------AAAAAAATAATAATAATAACCACTGGAACCTAGGTAGGTTTGTT-ATTATTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGTATTTTTTTG-------AAAAAAAGAATCT------------ i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93301969 287 + 159171411 GAGTATCACAAATGAGTTCATCATAGAATTAAAACACTGACAATATTTCAGTTACTAAACTCCTAAGAATTAGCTGTCCTTCAGATTCAAACGCCAATGCT-----------------AATTTAAACTTCTTTGGGTCT--------ATGACAATTTGCAAGCCAT--AAAAACCCAAAGAGCTAATTTGTGATTTCTTAACTTGATTTAAAAAAAAAAATCATCATCATCATCATCACTGGAACCTAAGTAGGTTTGTTG---ACTTAATATGACTTAACCTTTTGTTTGCATTTTTTTT----TTTGAAAAAAGAATCT------------ i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41584813 293 + 61074082 TAGTATTACA------------ATGAGAATCAGACACTGACAACATTTTAATTATTAAATTCCCAAGAATGAGCTGCTCTTCAGATTCAGATGCCAATAGTCACTTGAGCTTCTAGTAAATTTAAACTTCTCTACATCTTGTTGTTCATGTTGG-ATGCAAACCAGAAAAAAACCCGAATGGCTAATTTGTGATTTTTCAGCTTAAC---------ATTAAAA-------AACAATCTGTAGCACCTAGGCAGGCTTGTTGATCATTTAATATGAATCAATC-TTTGCCTATTTATTTTTT----------AAAAGAGTCTAGAATTCTACAT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42610741 99 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1546110.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 253223 492 + 478999 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAGTTTTTAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTGATCTAAATTAAAATGGAGAATGTTCACTATCCTCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTAGAAAGACACTGGCCAATTTTCTCCTGATTGTTCCGGAGTAGATGATGTAAAGCGAGCACATTGCCGTCACTGCTGAAGGAGAGGCTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCCATATCAAGAAAAAACATTAGAAAATGCAAAGTCACTAGAA-TTTTCAACACCAGAGACACACCATACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATACGAAGTAACTTTGTGAAGCAACTGAGATGACAATTACAAATATGGAGGGC-------TTGTTCCCACAATGTGATTTGTCATTAGACAAAGTAAAAAG-GACAAGGAGAAAGTTGGCTTTCCATTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC s panTro4.chrUn_GL393519 92914 488 + 413329 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTGATCTAAATTGAAATGGAGAATGTTCACTATCCTCAGGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTAGAAAGACACTGGCCAATTTTCTCCTGATTGTTCCGGAGTAGATGATGTAAAGCGAGCACATGGCTGTCACTGCTGAAGGAAAGGCTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCCATATCAAGAAAAAACATTAGAAAATGCAAAGTCACTAGAA-TTTTCAACACCAGAGACACACCATACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATACGAAGTAACTTTGTGAAGCAACTGAGATGACAATTACAAATATGGAGGGC-------TTTTTCCCACAACGTGATTTGTCATTAGACAAAGTAAAAAG-GACAAGGAGAAAGTTGGCTTTCCATTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7162546 490 + 72422247 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAATTATGGACTATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTAATCTAAATTTAAACGGAGAATGTTCACTATCCTCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTAGAAAGACACTGGCCGATTTTCTCCTGATTGTTCCGGAGTAGATGATGTAAAGCGAGCACATTGCCGTCACTGCTGAAGGAAAGGCTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCCATATCAAGAAAAAACATTAGAAAATGCAAAGTCACTAGAA-TTTTCAACACCAGAGACACCCC------ATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATACGAAGTAACTTTGTGAAGCAACTGAGATGACAATTACAAATATGGAGGGC-------TTGTTCCCACAACGTGATTTGTCATTAGACAAAGTTAAAAG-GACAAGGAGAAAGTTGGCTTTCCATTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53721353 481 - 80904711 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTAATCTAAATTTAAACAGAGAGTATTCACTATCCCCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTGGACAGATACTGGCCGATTTTCTCCTGATTGTTCCAGAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCGTCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTCAAAAATGCAAAGTTATTAGAA-TTTTCAACACCAGATACAC-CCAAACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATATGAAGTAACTTTGTGAAGTAACTGAG------ATTACAAATATGGAGGGC-------TTGTTCCCAAAATGTGACTTGACATCAGACAAAGCAAAAAG-GACAAGAAGAAAGTTGGCTTCCCATTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC i rheMac3.chr16 C 0 I 19 s macFas5.chr16 53551212 481 - 80997621 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTAATCTAAATTTAAACAGAGAGTATTCACTATCCCCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTGGACAGATACTGGCCGATTTTCTCCTGATTGTTCCAGAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCATCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTCAAAAATGCAAAGTTATTAGAA-TTTTCAACACCAGATACAC-CCAAACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATATGAAGTAACTTTGTGAAGTAACTGAG------ATTACAAATATGGAGGGC-------TTGTTCCCAAAATGTGACTTGACATCAGACAAAGCAAAAAG-GACAAGAAGAAAGTTGGCTTCCCATTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC i macFas5.chr16 C 0 I 2 s papAnu2.chr16 50372004 481 - 74645514 ttctctttctaaacCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATTAccaataattttattaatctaAATTTAAACAGAGAGTATTCACTATCCCCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTGGAAAGATACTGGCCGATTTTCTCCTGATTGTTCCAGAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCGTCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTCAAAAATGCAAAGTTATTAGAA-TTTTCAATACCAGATACAC-CCAGACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATTTATATGAAGTAACTTTGtgaagtaactgag------attacaaaTATGGAGGGC-------TTGTTCCCAAAATGTGACTTGACATCAGACAAAGCAAAAAG-GACAAGAAGAAAGTTGGCTTTCCACTTCT----GATACCTGGCTTCAGCTTC i papAnu2.chr16 C 0 I 2 s chlSab2.chr16 50426687 481 - 75148670 TTCTCTTTCTAAACCATAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGTAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTAATCTAAATTTAAACAGAGGGTATTCACTATCCCCATGACTGGGAAATCTTACCTGTTGCTGGAAAGATACTGGCCGATTTTCTCCTGATTGTTCCAGAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCGTCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTCAAAAATGCAAAGTTATTAGAA-TTTTCAACACCAGATACAC-CCAGACTTACGTTTGAAT-------------------TAAATTTATATGCAGTAACTTTGTGAAGTAACTGAG------ATTACAAATATGGAGGGC-------ATGTTCCCAAAATGTGACTTGACATCAGACAAAGCAAAAAG-GACAAGAAGAAAGTTGGCTTTCCATTTCT----GATACATGGCTTCAGCTTC i chlSab2.chr16 C 0 I 2 s calJac3.chr5 93302256 481 + 159171411 TTCTCTTTCTAAACTGTAATTCTTAGTCCAAGAA--------GATGCAAAG----TAAAAAG--------------CACTATTCATGACCAATAATTTTATTAATCTAACTTTAAATGGAGAGTGTTCACTATCCCCATGACTGGGAAATTTTACCTGTTGCTGGAAAGATACTGGCCAATTTTCTCCTGATTGTTCCAAAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCATCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGCATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTCAAAAATGCAAAATCATTAGAA-TTTCCAACACCAGATACAC-CCAGACTTATGTTTGAAT-------------------TAAATAAATATGATGCAATTTTGTGAAATAACTGAG------ATTACAAATGTGGAGGGC-------TTGTTCACACAATGTGACTTGTCATTAGACAAAGCAAGACA-GACAAGGAGAAAGTTGGCTTTCCATTTCT----AATCCCTGGCATCAGCTTC i calJac3.chr5 C 0 I 11 s mm10.chr11 42610840 447 - 122082543 TTCTCTTTCCAAATCATAATACTG----CAAAAA--------TGTGCAAAT----AGAAGAT--------------CAATATTTAGGATCAATAATTTTATTAATTCAACTTAAACTA---AGTGTTTAATTTCCCCAAGACTTGGAAAATATACCTGTTACTGGAAAGATACTGGCCAATTTTCTCCTGATTGTTCCAAAGCAGCCGATGTAAAGCAAGCACATTGCCATCGCTGATGAAGGAAAGACTATGGTTTACTGCATCACTTGTGGGACAATCTGATGCTATATCTAGGAAAAACCTGCAAAAATACAAAGCCATTAGAA-TTTTTAACCCCAGGTATAC-------TTATGC----AT-------------------TACATTTATATAGAGTCTAGTAATATAGTAGCTGTG------ATTGCAAAGGAGGGGGCC-------TTATGCCCTCAGTGT----------------AAATGAGAAG-CACAAGGAGAAAGTTGTCTTCCCATTTCT----GATAT-TAGTTTCCACTTC i mm10.chr11 I 99 I 18 s canFam3.chr9 41585106 518 + 61074082 TTCTCTTTCCAAACTATAATTCTTATTCTAAGCA--------GATGCAAAG----TAAAAAAGCATTATTCACAACCATTACTCATGACCAATAATTTT-----TATAAGTTAAAATTAAGAGCTTTCAAAATTTCCATGACCAGGAAATCCTACCTGTTGCTGGAAAGATACTGGCCAATTTTCTCTTGATTGTTCCAGAGTAGACGATGTAAAGCAAGCACATTGCCATCACTGATGAAGGAAAGACTATGATTTACTGTATCACTTGTAGGACAATCAGATGCTATATCAAGGAAAAACCTTTAAAAATACAAAGTCATTAGAATTTTTTAAAACCAGATACAC-TCATATCTATGTTTGAATCaaatttattaaaaaaaaacaaatttatatGAACTAACTTTGCAAAATAACTGAG------ATTATAAGTATGGAGGATTATGATATTATTCACACA---TGAC-TGTCATTAAACAAAACAAGAAGAGACAAGAAGAAATTTGGCATTCCATTTCTGATAGATACCTGGCTTTGGTTTC i canFam3.chr9 C 0 I 11 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=10507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 253715 11 + 478999 TGTAG---TTAAAG s panTro4.chrUn_GL393519 93402 11 + 413329 TGTAG---TTAAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7163036 11 + 72422247 TGTAG---TTAAAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53551695 14 - 80997621 AGTAGGCTCTGAAG i macFas5.chr16 I 2 I 3 s papAnu2.chr16 50372487 14 - 74645514 AGTAGGCTCTGAAG i papAnu2.chr16 I 2 I 3 s chlSab2.chr16 50427170 14 - 75148670 AGTAGGCTCTGAAG i chlSab2.chr16 I 2 I 3 s calJac3.chr5 93302748 11 + 159171411 TGAAG---TTAGAG i calJac3.chr5 I 11 C 0 s mm10.chr11 42611305 11 - 122082543 TGAAG---TTGGAG i mm10.chr11 I 18 C 0 s canFam3.chr9 41585635 11 + 61074082 TGAAG---TCAGAC i canFam3.chr9 I 11 C 0 e rheMac3.chr16 53721834 19 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=438835.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 253726 158 + 478999 AACAGCAAAATTgagatggatgaaactttggaaagaggctggtatttt-acagat-aaggaaatgaaggtccagac---------aaaagacctc-cccaaagatatata----gcctgttaggtcaaagccagtattaaaactttgttccttttaactttctttgggccctca s panTro4.chrUn_GL393519 93413 158 + 413329 AACAACAAAATTGAGATGGATGAAACTTTGGGAAGAGGCTGGTatttt-acagat-aaggaaatgaaggtccagac---------aaaagacctc-ccgaaagatatata----gcctgttaggtcaaagccagtatcaaaactttgttccttttaactttctttgggccctca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7163047 158 + 72422247 AACAACAAAATTgagatggatgaaactttggaaagaggctggtatttt-acagat-aaggaaatgaaggtccagac---------aaaagacctc-cccaaagatatata----gtctgttaggtcagagccaggattaaaactttgttccttttaactttctatgggtcctca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53721853 152 - 80904711 AACAACAAAATTgagatggatgaaacttcggaaagaggctagtatttt-acagat-aaggaaacgaaggtccagac----------aaagacttc-cccaaagatacata----gcct-----gtcagagccaggattaaaactttgatccttttaactTTGTATGGGTACTCA i rheMac3.chr16 I 19 C 0 s macFas5.chr16 53551712 152 - 80997621 AACAACAAAATTGAGATGGATGAAACTTCGGAAAGAGGCTAGTatttt-acagat-aaggaaacgaaggtccagac----------aaagacttc-cccaaagatacata----gcct-----gtcagagccaggattaaaactttgatccttttaactTTGTATGGGTACTCA i macFas5.chr16 I 3 C 0 s papAnu2.chr16 50372504 152 - 74645514 AACAACAAAATTGAGATGGATGAAACTTCGGAAAGAGGCtagtatttt-acagat-aaggaaatgaaggTCCAGAC----------AAAGACTTC-CCCAAAGATACATA----GCCT-----GTCAGAGCTAGGATTAAAACTTTGATCCTTTTAACTTTGTATGGGTCCTCA i papAnu2.chr16 I 3 C 0 s chlSab2.chr16 50427187 152 - 75148670 AACAACAAAACTgagatggatgaaactttggaaagaggctagtatttt-acagat-aaggaaacgaaggtccagac---------aaaagacttc-cccaaagatacata----gcct-----gtcagagccaggattaaaactttgatccttttaactTTGTATGGGTACTC- i chlSab2.chr16 I 3 C 0 s calJac3.chr5 93302759 145 + 159171411 AACAACAAAATTGAGATGG-----ACTTTGGAAAGAGGC--------t-acagac-aaggaaatgaaggtccagac---------aaaagacctc-cccaaaaatatata----gcctgttaggtcagagccaggattaaaactttgatccttttaactttctatgggtattca i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42611316 158 - 122082543 AACAAT-AAATTTATATGGATAAAATCTGGAGAACAAGCTAGTATCttaacagataaaagacatggaggcctaggt----------aaagacttctcttaaagttacaccagctgcct-----gtcagagccaggagtggaactttggtagtcttaacCATCTGTGAGTAGTCA i mm10.chr11 C 0 I 628 s canFam3.chr9 41585646 167 + 61074082 AACAACTAAATTTAGATGGATGAGACtctggatcaaagccagtacttt-acagat-aaggaaacagagactaagatgaaacaaaagaaagacctc-cccaaagctatata----acctattaggtcagagccagggttagactttttgttcttttaactttctatgggtagtct i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=537355.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 253884 202 + 478999 gtctgccagAATATGAATCCTGTGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTCCAATTTTCCTAAAAGAATAAAAGTCAGTAACAATTACAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGGCTAGCTTAGATGATAAG---GATCAATTAGATTCACACTGCATGAAAAGCA s panTro4.chrUn_GL393519 93571 202 + 413329 gtctgccagAATATGAATCCTGTGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTCCAATTTTCCTAAAAGAATAAAAGTCAGTAACAATTACAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGGCTAGCTTAGATGATAAG---GATCAATTAGATTCACACTGCATGAAAAGCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7163205 202 + 72422247 gtctgccagAATATGAATCCTGTGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATATCTTTTAAACTCTAATTTTCCTAAAAGAATAAAAGTCAGTAACAATTAAAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGCCTAGCTTAGATGATAAG---GATCAATTAGATTCACACTGCACGAAAAGCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53722005 202 - 80904711 GAGTGCCAGAATATGAATCCTATGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTCAAGTTTCCCTAACAGAAAAGCAGTCAGTAACAACTACAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGCCTAGCTTAGATGACGAG---GATCAATTAGATTCATACTACATGAAAAGCA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53551864 202 - 80997621 GAGTGCCAGAATATGAATCCTATGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTCAAGTTTCCCTAACAGAAAAGCAGTCAGTAACAACTACAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGCCTAGCTTAGATGACGAG---GATCAATTAGATTCATACTACATGAAAAGCA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50372656 200 - 74645514 GAGTGCCAGAATATGAATCCTATGCTGACATTCACTCTCT-TTCCAACATGGCTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTC--GTTTCCCTAACAGAAAAGCAGTCAGTAACAACTACAATGATGATAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGCCTAGCTTAGATGATGAG---GATCAATTAGATTCATACTACATGAAAAGCA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50427339 201 - 75148670 -AGTGCCAGAATATGAATCCTATGCTGACATTCACTCTCT-TTCCTACATGGTTTGTCATTCAGCAATATACCTTTTAAACTCCAGTTTCCCTAACAGAAAAGCAGTCAGTAACAACTACAATGATGCTAAACTGGAAGAGAGAGTTGTACAAGCCTAGCTTAGATGACAAG---GATCAATTAGATTCATACTACATGAAAAGCA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93302904 201 + 159171411 gtctgccagAATATAAATCCTGTGCTGATATTTACTCTCT-TTCCATTATGGCTTTTACTTCAGCAATACACCTTTTAAACTCCAATTTCCCTAACACAAAAA-AGTCAGTAACAACTACAATGATGATAAGCTGGAAGAAAGAGTTGTACAAGTCTAGTTTAGATGATGAG---GATCAATTAGATTCACACTGCATGAAAAGCA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41585813 194 + 61074082 atctgctAGAACATGAAACCTATGCTGATATTCACTTTTTCCTTCAAAACAGCTTACAGTCCAACAATATACCTTTTAAACTCCAGCT---------AGAAAGAAGTTGATATGAACCATAATGA---GAAACTGGAAGAGAGAGATGTACAAGTCTAGCTTAGACTATGAGTCAGACCAATTAGTTTCACACTACATGAAAAGCA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42611474 628 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1518242.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 254086 611 + 478999 GAATTCCAGACAT------Aaatttacaaagcactttcttatgaattatctcattttttc-tctctaaaaacaact----caggcaaagag---tttatccccactttacagataaaccaataactcagagaaataaagtgaAATAACTGGTTATGGAAATCCAGCAGAAAAGTTTTCTAAAAT--CATAAAGTTCAGTTACTCATGAACAAAATCTTACGTGTTTGCATTACTTGGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTATCACAAATATT-CTGATACTAATAAAAA---CCTTATTAAACATTCTTATGCATTATCAATACCAATTTGGTTTTAGTTTTAAATAAAAGGAATCCTATTTCTTCCTTATCCCCATATTGTACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCCAAAATGCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTACCAAATTATAAAAAATATTAATTTATTTCAAGACTGTCTTTTATAGTAAAATAAAATAAGGCAAGCTATG-TCTTGACCTAGAG-----CAGGAAGAGAAAAAAACCTACAC-GGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGATTTATGTGAAACTGAAAATAT s panTro4.chrUn_GL393519 93773 610 + 413329 GAATTCCAGACAT------Aaatttacaaagcactttcttatgaattatctcattttttc-tctctaaaaacaact----caggcaaagag---tttatccccactttacagataaaccaataactcggagaaataaagtgaAATAACTGGTTATGGAAATCCAGCAGAAAAGTTTTCTAAAAT--CATAAAGTTCAGTTACTCATGAACAAAATCTTACGTGTTTGCATTACTTTGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTATCACAAATATT-CTGATACCAATAAAAA---CCTTATTAAACATTCTTATGCATTATCAATACCAATTTGGTTTTAGTTTTAAATAAGAGGAATCCTATTTCTTCCTTATCCCCATATTGTACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCCAAAATGCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTACCaaattataaaaaa-attaatttatttCAAGACTGTCTTTTATAGTAAAATAAAATAAGGCAAGCTATG-TCTTGACCTAGAG-----CAGGAAGAGAAAAAAACCTACAC-GGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGATTTATGTGAAACTGAAAATAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7163407 599 + 72422247 GAATTCCAGACAT------Aaatttacaaagcactttcttatgaattatctcattttttt-tctctaaaaacaact----caggcaaagag---tttatccccactttacagataaaccaataactcagagaaataaagtgaaataactggttatggaaatccagcagaaaagtTTTCTAAAAT--CATAAACTTCAGTTACTCATGAACAAAATCTTACGCGTTTGCATTACTTGGTTAAAAAGATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTATCACAAATATT-CTGATACCAATAAAAA---CCTTATTAAACATTCTTATGCATTATCAATACCAATTTGGTTTTAGTTTTAAATAAAAGAAATCCTGTTTCTTCCTTATCTCCATATTGCACCATCCTCAAATCCTTTACTTAACT--AGACATGTCCAAAATGCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAGATCACTACCaaattataaaaaatattaatttatttCAAGACTGTCTTTTATAG-----TAAAATAAGACAAGCTATG-TCTTGACCTAGAG-----CAAGAAGAGAAAAAAACCTACAC-AGAACTTCATGTAAAACA-------GGATTTATGTGAAACTGAAAATAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53722207 610 - 80904711 GAATTCCAGACAt-----aaaatttacaaaacactttcttatgaattatctcatttttttccctctaaaaaaaact----caggcaaagac---tttattcccactttacagataaaccagtaactcagagaaataaagtgaAATAACTAGTTATGGAAATCTAGCAGAAAAGTTTTCTACAAT--CATAAAGTTCAGTTTCTCATAAACAAAATCTTACGTGTTTGCTTTACTTGGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTACCACAAATACT-CTAACATCAA-AAAAA---CCTTATTAAACATTGTTATGTATTATTGATACCA---TGGTTTTAGTTTTAAATAAAAAGAATCCTACTTCTTCCTTGTCCCCATATTGAACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCAAAAATCCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTATCaaattataaaaaatattattttatttCATGACTGTCTTTTATAGTAAAATAAAATAAGACAAGTTATG-TCTTGACCTAGAG-----CAGGAAAAGAAAAAAACCTACACTGGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGACTTATGTGAAACTGAAAATAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53552066 610 - 80997621 GAATTCCAGACAt-----aaaatttacaaaacactttcttatgaattatctcatttttttccctctaaaaacaact----caggcaaagac---tttattctcactttacagataaaccagtaactcagagaaataaagtgaAATAACTAGTTATGGAAATCTAGCAGAAAAGTTTTCTACAAT--CATAAAGTTCAGTTTCTCATAAACAAAATCTTACGTGTTTGCTTTACTTGGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTACCACAAATACT-CTAACATCAA-AAAAA---CCTTATTAAACATTGTTATGTATTATTGATACCA---TGGTTTTAGTTTTAAATAAAAAGAATCCTACTTCTTCCTTGTCCCCATATTGAACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCAAAAATCCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTATCAAATTATAAAAAATATTATTTTATTTCATGACTGTCTTTTATAGTAAAATAAAATAAGACAAGTTATG-TCTTGACCTAGAG-----CAGGAAAAGAAAAAAACCTACACTGGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGACTTATGTGAAACTGAAAATAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50372856 610 - 74645514 GAATTCCAGacat-----aaaatttacaaaacactttcttatgaattatctcatttttttccctctaaaaacAACT----CAGGCAAAGAc---tttattcccactttacagataaaccAGTAACTCagagaaataaagtgaaataactAGTTATGGAAATCTAGCAGAAAAGTTTTCTACAAT--CATAAAGTTCAGTTTCTCATAAACAAAATCTTACGTGTTTGCTTTACTTGGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATTTAAGTACCACAAATACT-CTAACATCaa-aaaaa---CCTTATTAAACATTGTTATGTATTATTGATACCA---TggttttagttttaaataaaaagaatcctaCTTCTTCCTTGTCCCCATATTGAACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACC--AGACATGTCAAAAATCCCTCTTggttttcaaatatgaaaatcactatcaaattataaaaaatattattttatttcatgactgtcttttatagtaaaataaaataagacaagttATG-TCTTGACCTagag-----caggaaaagaaaaaaacctacacTGGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGACTTATgtgaaactgaaaatat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50427540 608 - 75148670 GAATTCCAGACAT------Aaatttacaaaacactttcttatgaattatctcattttttt-tctctaaaaacaact----caggcaaagac---tttattcccactttacagataaaccagtaactcagagaaataaagtgaAATAACTAGTTATGGAAATGTAGCAGAAGAGTTTTCTACAAT--CATCAAGTTCAGTTTCTCATAAACAAAATCTTACGTGTTTGCTTTACTTGGTTTAAAGAATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTGCAAATTTAAGTACCACAAATACT-CTAACATCAA-AAAAA---ACTTATTAAACATTGTTATATATTATTGATACCA---TGGTTTTAGTTTTAAATAAAAAGAATCCTACTTCTTCCTTGTCCCCATATTGAACCATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCAAAAATCCCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTATCAAATTATAAAAAATATTATTTTATTTCATGACTGTCTTTTATAGTAAAATAAAATAAGACAAGTTATG-TCTTGACCTCGAG-----CAGGAAAAGAAAAAAACCTACACTGGAACTTCATGTAAAACAGGTACATGGACTTATGTGAAACTGAAAATAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93303105 597 + 159171411 GAATTCTAGACAT------Aaatttacaaagcactttcttattaattatctcatttttttccctctaaaaacaact----caggcaaacag---tttatcactactttacagataaatcaataactcagagaaataaagtaaAATA----GTTATG--ATTTTAGAAAACTTGTCTGCTAGATTTCCATAACATTCAGTTACTCATGAACAAAATCTTACGTGTCTGCATTACTTGGTTTAA---ATAACATTTT-AGTTTAGATACACTTCCAAATGTAAGTATCACAAATATT-CTAACATCAA-AAAAAAATCCTCACTATACATTGTTATGTATTATTGATACCAGTTTGGCTTTAGTTTTAAATAAAAGGAATCCTACTTCTTCCTT-TCCCCTTATTGTAACATCCTCAAATCCTTTATTTAACT--AGACATGTCAAAAATCGCTCTTGGTTTTCAAATATGAAAATCACTACCaaattataaaaaatattaatttatttCATGA----CTTTTACAG-----TAAAATAAGACAAGTTATA-TCTTGACCTAGAG-----CAGGAAGAG-AAAAAACCTACACAGAAACTTCATGTAAAACAAGTACATGGACTTAAATGAAACTGAAAATAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42612102 542 - 122082543 GACTTCTGAACATCAG--CACCttcacaaagcactttcccaggaatcatctcacttgttt-tttaaaaaagtaacc----ctggcaaagacagtactaccccaaggttacaaataaaccaacaattcagagaattaaagtgaAG-AATCAGTTATGAAAATTCAGTCGTAAAGCCT-CTACAAT--TATCTGTTTC-----TTCGCACTCAAAATCTTATATTTTTGTACATTTTGGTATATGAAGTATTGTTTTAAATTCAGAGACACTTCTAAACTGCAGAAACAAAAGTATTATTAACATAAA-AGCAC---CCTGACATAAC------CTGTATCG-------CA---TGGTTATGGTTTTTAATACGAGGAATC--------TTCTTGAGCCCATTCTGCAGCA------------TTGCCTAAGTGAGAAAACGCCAACAGTGCTTTACAGGTTCCAGAGA---------------------------------GTTTTCTCA-----GTGTCTTAAAGTTAAACAGAACAA---AAATGTGG-TCTTAGTCTAGAAAGGATTGGGGGGGTGGGGAATCACATACAGAAATTTAATGTAGACCAGATACACGGACTGCAGTAAAA-TGGAGACAT i mm10.chr11 I 628 I 20 s canFam3.chr9 41586007 454 + 61074082 GAATTCTGGACCTTAACCtacattttcaaagcactttctcatacactatctcatttgttt-cct-taaagccaactcagacaggcaaacag---tattgtccttatctacagataaACCAACAACTCAA---------------------------------------------------------CATAAA----------------------------------------------------------------A--------------------------------------------------AAAAT---TGTCATTATACACTATTATGCATTATGTGTACCATTCGGGTTTTAGGTTTTACTAGATAGAA-CCTTTTTCTTCTTTTCCTCCATATTGTAGCAACCTCAAATCCTTTATTTTAGT--AGATGTGTCAAAAATCTCTACTGGTTTTCAAATATGGAAATCACTACCAAATTATAAAGAATATGGATTTACTGTGCCATAGCCTCCTACAGGAAAATAAAGTAAGATTAACTCTGCTCTTGACCTAGAG-----AGGGAAGATGTAAAAACCTACACAAGAGCTTCATGTAGACCTAGTACGCAGACTTAAATGAAACTGACAATAG i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=81493.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 254697 33 + 478999 TTGATTCAAACAGAGCAAGTGAATAAGTGGCAA s panTro4.chrUn_GL393519 94383 33 + 413329 TTGATTCAAACAGAGCAAGTGAATAAGTGGCAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7164006 33 + 72422247 TTCATTCAAACAGAGCAAGTGAATAAGTGGCAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53722817 33 - 80904711 TTGATTCAAACAGAGCAACTGAATAAGTGGCAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53552676 33 - 80997621 TTGATTCAAACAGAGCAACTGAATAAGTGGCAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50373466 33 - 74645514 ttgattCAAACAGAGCAACTGAATAAGTGGCAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50428148 33 - 75148670 TTGATTCAAACAGAGCAACTGAATAAGTGGTAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93303702 33 + 159171411 TTGATTCAAACAGAGTAACTGAATACGTGGCAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41586461 17 + 61074082 TTAATTCAAATAGAGCA---------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42612644 20 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=719494.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 254730 242 + 478999 GTAGCTTACCTTCAAGCTGCATCAAAGCTGCTTTTCACAAAATCATTGAAAGGCCGCATATGCTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCAATACTCTGAAGTATTTACACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTTTATACATTAATATATTCTTTAAAAATATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTTGATATA------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTAGTT-AAAATCA----------------------ATCATTTCTCA--TTCTA s panTro4.chrUn_GL393519 94416 242 + 413329 GTAGCTTACCTTCAAGCTGCATCAAAGCTGCTTTTCACAAAATCATTGAAAGGCCGCATATGCTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCAATACTCTGAAGTATTTACACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTTTATACATTAATATATTCTTTAAAAATATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCGATATA------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTAGTT-AAAATCA----------------------ATCATTTCTCA--TTCTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 5 s ponAbe2.chrUn 7164039 241 + 72422247 GTAGTTTACCTTCACGCTGCATCAAAGCTGC-TTTCACAAAATCATTGAAAGGCCGCATATGCTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCAATACTCTGAAGTATCTACACAATAAAACAGCATTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATACATTAATATAGTCTTTAAAAATATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCGATATA------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTAGTT-AAAATCA----------------------ATCATTTCTCA--TTCTA i ponAbe2.chrUn C 0 I 5 s rheMac3.chr16 53722850 243 - 80904711 GTAAATTACCTTCGTGCTGCATCAAAGTTGGTTTTCACAAAATCGTTGAAAGGTCGCATATGTTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCGATACTCTGAAGTATCTATACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATACATTAATATATTCTTTAAAAGCATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTGAT------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTACTTAAAAATTA----------------------ATCATTCCTCA--TTCTA i rheMac3.chr16 C 0 I 315 s macFas5.chr16 53552709 243 - 80997621 GTAAATTACCTTCGTGCTGCATCAAAGTTGGTTTTCACAAAATCGTTGAAAGGCCGCATATGTTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCGATACTCTGAAGTATCTATACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATACATTAATATATTCTTTAAAAGCATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTGAT------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTACTTAAAAATTA----------------------ATCATTCCTCA--TTCTA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50373499 243 - 74645514 GTAAATTACCTTCGTGCTGCATCAAAGTTGGTTTTCACAAAATCGTTGAAAGGCCGCATATGTTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCGATACTCTGAAGTATCTATACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATAcattaatatattctttaaaagcaTGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTGAT------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTACTTAAAAATTA----------------------ATCATTCCTCA--TTCTA i papAnu2.chr16 C 0 I 5 s chlSab2.chr16 50428181 243 - 75148670 GTAAATTACCTTCGTGCTGCATCAAAGTTGGTTTTCACAAAATCGTTGAAAGGCCGCATATGTTCTTCTTTTGTGAAGAGAACATGATTGGCGATACTCTGAAGTATCTATACAATAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATACATTAATATATTCTTTAAAAGCATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTTAT------------------------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTACTTAAAAATTA----------------------ATCGTTCCTCA--TTCTA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93303735 245 + 159171411 GTAGCTTACCTTCGTGCTGCATCAAAGTTGCTTTTCACAAAATCATTGAAAGGCCGCATGTGCTCTTCTTTGGTGAAGAGAACATGATTGGCTATACTCTGAAGTATCTACACATTAAAACAGGGTTATAAATAATCAGATTATTTATTGTATGAAGTCTATACATTAATATATTCTTTAAAAATATGAATTT------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTGAT--------------AAA-------------------------------------------------------------------ATTTCTGCTAGTAGTT-AAATTCA----------------------ATCACTCCTCA--TTTTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42612664 440 - 122082543 GCTGCTTACCTTCGTGCCAAGTCAAAGTTGCTTTTCACAAAATCATTAAAAGGTCTCATATGCTCTTCTTTTGTGAACAGTACATGATTGGCAATGCTCTGAAGTACCTAAACAATCAAACAAGATTATGAGTAGTCAGATTATTTGCTATATGAAACCTATAAATTAATATAGTCATTAAAA-TATAAATTTTCCATTGATATTTCTACTGGCAGTTCAAATCAATTATTCATTATTGTAAAAAATATCCTAAATATTGTTTTAATTCTTTTCAAGTAGAAATATTATTATACATGTTATAGATACAAAGTATCTATTACATGTGTATTGTGTGATATGTGCATATATGCACACGTTTGCAAGTGTGAGTTGgtacatgtgtgcaagcatatggaggccagagtttgacgctatttccccccatcattgcccatcttcta i mm10.chr11 I 20 C 0 s canFam3.chr9 41586478 240 + 61074082 --ATCCTACCTCCGTGCTGCATCAAAGTTGCTCTTCACAAAATCATTAAAAGGCCGCATATGCTCTTCTTTTGTGAAAAGAACATGATTGGCAATACTCTGAAGTATCTAAATAATACAAAAGGGTTATA---AACCAGATCATTCATTGTATGAAACGAACACAGTCATATACTCTTTAAAAGTACTAATTG------------------------------------------------------------------------------------------TCTCATTGAT--------------GTA-------------------------------------------------------------------ATTTCTACTAGTGATT-AAAGTAA----------------------ATTATTATTCA--TTCTA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=8190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 254972 2 + 478999 TA s panTro4.chrUn_GL393519 94663 2 + 413329 TA i panTro4.chrUn_GL393519 I 5 C 0 s ponAbe2.chrUn 7164285 2 + 72422247 TA i ponAbe2.chrUn I 5 C 0 s rheMac3.chr16 53723408 2 - 80904711 TA i rheMac3.chr16 I 315 C 0 s macFas5.chr16 53552952 2 - 80997621 TA i macFas5.chr16 C 0 I 315 s papAnu2.chr16 50373747 2 - 74645514 TA i papAnu2.chr16 I 5 C 0 s chlSab2.chr16 50428424 2 - 75148670 TA i chlSab2.chr16 C 0 I 5 s calJac3.chr5 93303980 2 + 159171411 TA i calJac3.chr5 C 0 I 2 s mm10.chr11 42613104 2 - 122082543 ta i mm10.chr11 C 0 I 56 s canFam3.chr9 41586718 2 + 61074082 TA i canFam3.chr9 C 0 I 2 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=356998.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 254974 167 + 478999 TTTTAGGTAGTGTTTCTATTC-TTCCTaattata---attat-------------------------att---------------tacatg--------------------------------------------------tacaaata---catattaaaa----ATGTTTAATGTC--TTAAAAT--------------------AAAAAATCCTACAGCCTTCACTGTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTACGCAAAAAATGATC-CTCATGACACAAGACA s panTro4.chrUn_GL393519 94665 169 + 413329 TTTTAGGTAGTGTTTCTATTC-TTCCTAATTATA---ATTAT-------------------------ATT---------------TACATG--------------------------------------------------TACGAATA---CATATTAAAA----ATGTTTAATGTCTTTTAAAAT--------------------AAAAAATCCTACAGCCTTCATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATCTCTAGAATGATTACGCAAAAAATGATC-CTCATGACACAAGACA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7164287 167 + 72422247 TTTTAGGTAGTGTTTCTATTC-TTCCtaaatata---attat-------------------------att-----------------cata--------------------------------------------------taagaata---catattaaaa----atgtttaatgtcttttaaaat--------------------aaaaaatCCTACAGCCTTCATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTACGCAAGAAATGCTC-TTCATGACACAAGGCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53723410 169 - 80904711 TTTTAGGTAGTGTTTCTATCC-TTCCCAAATGCAATTATTAT-------------------------ATT---------------TACATG--------------------------------------------------TAAAAATA---CGTATTAAAA----ATGTTCAATGCCTTTTTA-----------------------AAAAAATCCTATAGTCTACATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTATGCAAAAAATGATC-TTCATAACACAAGACA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53553269 169 - 80997621 TTTTAGGTAGTGTTTCTATCC-TTCCCAAATGCAATTATTAT-------------------------ATT---------------TACATG--------------------------------------------------TAAAAATA---CGTATTAAAA----ATGTTCAATGCCTTTTTA-----------------------AAAAAATCCTATAGTCTACATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTATGCAAAAAATGATC-TTCATAACACAAGACA i macFas5.chr16 I 315 C 0 s papAnu2.chr16 50373749 169 - 74645514 TTTTAGGTAGTGTTTCTATCC-TTCCcaaatacaattattat-------------------------att---------------tacatg--------------------------------------------------taaaaata---tgtattaaaa----atgttcaatgcctttttt-----------------------aaaaaatcctatagTCTACATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTATGCAAAAAATGATC-TTCATAACACAAGACA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50428431 169 - 75148670 TTTTAGGTAGTGTTTCTATCC-TTCCCAAATATAATTATTAT-------------------------ATT---------------TACATG--------------------------------------------------TAAAAATA---CGTATTAAAA----ATATTGAATGCCTTTTTA-----------------------AAAAAATCCTATAGTCTACATTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTATGCAAAAAATGATC-TTCATAACACAAGACA i chlSab2.chr16 I 5 C 0 s calJac3.chr5 93303984 171 + 159171411 TTTTAGGTAGTGTTTCTATTC-TTCtaaaatataattactat-------------------------att---------------tacata--------------------------------------------------taaaaata---catatt-aaa----atgtttaatgtcttttaaaat--------------------aaaaaatCCTACAGCCTACTTTCTAG--T--CTGTTTCAGAATGTCTAGAATGATTACACAAATAATGATC-TTCATAACACAAGACA i calJac3.chr5 I 2 C 0 s mm10.chr11 42613162 273 - 122082543 ttccagggaccctgcctctgc-ctccagcatgctgggattataggctgaatgtcatgaacccctgacatt---------------tacatgggtgctgggggatctgagccacagtcctcatgcttgcatggtaggcactttacacatggctcatgttcaca----gtttcAAATGCTGTTAACAACAACAACAATAATAAAGACTAAAGAAATCCTACAATCTGCATCTTTATTT--CCACCTCAAATTTTTCAAAGCAGTTACACAGAAAACCCTCACTGATTAGACAAATTA i mm10.chr11 I 56 I 80 s canFam3.chr9 41586722 174 + 61074082 TACTGGGTGTTGTTGCTGTTCTTTCCCAAATATAACTATTAC-------------------------ATACATATACATGTATTACACATA--------------------------------------------------TAAAGATA---AATACTAAAATTTCATTTTAAACATCTCTTTTAAT--------------------AAAAAA-----------------AAG--TTGCCATTTCAGAATTTCCAGAATGAACACATAGAAATCTATC-TTCAGAA-ATAATC-- i canFam3.chr9 I 2 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=111784.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 255141 44 + 478999 TCTGCTATAATAAAACGTATTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG s panTro4.chrUn_GL393519 94834 44 + 413329 TCTGCTATAATAAAATGTTTTTTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7164454 44 + 72422247 TCTGCTATAATAAAAAGTTTTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53723579 44 - 80904711 TCTGCTATAACAACATGTTTTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53553438 44 - 80997621 TCTGCTATAACAACATGTTTTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50373918 44 - 74645514 TCTGCTATAACAACATGTTTTCTCACGAAAATAAGGTCCATCAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50428600 44 - 75148670 TCTGCTATAACAACATGTTTTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93304155 44 + 159171411 TTTACTGTAATAAAATGTTTTCTCATGAAAATAAGGTCCATCAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41586896 38 + 61074082 TTCGCTAAGAT----TATTTTCCCATAATAATAAGGT--ATCAG i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42613435 80 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=4683619.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 255185 1611 + 478999 GTACCTAACTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAAT-----AAAA-ACACATAACTGAAAACCGTAGGGTATTTCCAATATAAATGTAAGAGGAAGTACT----GTAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTGGAAGGGGAATTTAAGATAGCTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTCCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACAGTGAGACAATGTCAGGATTCATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTGCTGCACTGATACTGTTCTGAGGGAAACATTGGCTAACCCCCTAAAAACA---AGTTGAGACTTGAGTATAAGGTTTGAATTAAAATAGGGGCATGGGAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAAATTT-GCACAACAACTCTGAGTCAATCAGTCCTCATGAATGACACATTTCTA---TTTTTTCTTCTCCCAAAACATGAGAAAATAAAGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTTAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAGATGGGTAGAAGAAACCTGAAAACAGATCTTCACTGTATCATCACC---TATACTGCAAGTTTGAGGAGTCATGAAAACAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTATTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-ATTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAACACACCCCCAAAACATCCTATACCTGATAGTACATATTTATGTTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TGAAGAAAAAAATGCTTGCTATA-AAAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTATTGAGGAAAAAAAA----ACTTACTTACAAGTAATGTTATTGCCTGTTGC----------CAGCTTCCTT-----TATAACAACCTACCTATTATTTGAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGCACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAG---CAGAACAGCAAACCCCTATGTC-----TACCTCAATGTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTTAAGAATTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGTAATGTGAACCCAATATTTAAAGTGGATT--GATTTTCTCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGACTGGGAAGAGTGCCATAAAATGGGTTCAGCCCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTGCTTTAAATCATGTTATAGATGAAAATTATATTATT--TTGGAATTTACATTTT-TATATATAC--------CATATATATTCATTTTT-----AAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTCTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----GTAGCAGTGAT--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATGTTTTGTGATTCCGAGGATAAACCTTCCTTTCAAAGGATATTGGTGTGG--------GGGACCCAGATTTACATGCAGAA-----TATCACGTAACT---A-TTTTTTGCACAATGCCTCAATAAATTAATATTTCCTGTCCTAAATTC---------------ACAT-----------GGCTGACTCCAGATTAACTCTG----GAATCGGGATTATTTCACTTCATCCTGTTCAACGCAGTGCTTCATGAAGTCCACATTT s panTro4.chrUn_GL393519 94878 1610 + 413329 GTACCTAACTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAAT-----AAAA-ACACATAACTGAAAACCGTAGGGTATTTCCAATATAAATGTAAGAGGAAGTACT----GTAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTGGAAGGGGAACTTAAGATAGCTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTCCGATTCCAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACAGTGAGACAATGTCAGGATTCATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACTGATACTGTTCTGAGGGAAACGTTGGCTAACCACCTAAAAACA---AGTTGAGAATTGAGTATAAGGTTTGAATTAAAACAGGGGCATGGGAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAAATTT-GCACACAAACTCTGAGTCAATCAGTCCTCATGAATGACACATTTCTA---TTTTTTCTTCTCCCAAAACATGAGAAAATAAAGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTTAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAGATGGGTAGAAGAAACCTGAAAACAGATCTTCACCGTATCATCACC---TATACTGCAAGTTTGAGGAGTCATGAAAACAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTATTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-ATTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACATCCTATACCTGATAGTACATATTTATGTTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TGAAGAAAAAAATGCTTGCTATA-AAAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTATTGAGG-AAAAAAA----ACTTACTTACAAGTAATGTTATTGCCTGTTGC----------CAGCTTCCTT-----TATAACAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAG---CAGAACAGCGAACCCCTATGTC-----TACCTCAATGTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTAAAGAATTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGTAATGTGAACCCAATATTTAAAGTGGATT--GATTTTCTCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGACTGGGAAGAGTGCCATAAAATGGGTTCAGCCCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTGCTTTAAATCATGTTATAGATGAAAATTATATTATT--TTGGAATTTACATTTT-TATATATAC--------CATATATATTCATTTTT-----AAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTCTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----GTAGCAGTGAT--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATATTTTGTGATTCCAAGGATAAACCTTCCTTTCAAAGGATATTGGTATGG--------GGGACCCAGATTTACATGCAGAA-----TATCACGTAACT---A-TTTTTTGCACAATGCCTCAATAAATTAATATTTCCTGTCCTAAATTC---------------ACAT-----------GGCTGACTCCAGATTAACTCTG----GAATCGGGATTATTTCACTTCATCCTGTTCAACGCAGTGCTTCATGAAGTCCACATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7164498 1611 + 72422247 GTACCTAACTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAATAAAACAAAA-ACACATAACTGAAAACCATAGGGTATTTCCAATATAAATGTAAAAGGAAGTACT----GTAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTGGAAGGGGAACTTAAGATAGCTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTCAGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACAGTGAGACAATGGCAGGATTCATAAATCTGAAGAACATGGCACTTCCTACTGCACTGATACTGTTCTGAGGGAAACGTTGGCTAACCACCGAAAAACA---AGTTGAGAATTGAGTATAAGGTTTGAATTAAAATAGGGGCATGGGAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAAATTT-GCACAGAAACTCTGAGTCAATCAGTCCTCATGAATGACACATTTCTA--TTTTTTTCTTCTCCCAAAACATGAGAAAATAAAGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTTAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAGATGGGTAGAAGAAACCTGAAAAAAGATCTTCACTGTATCATCACC---TATACTGCAAGTTTGAGGAGTCATGAAAACAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAC-GAAAGTGTGGTCAAC-ATTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACATCCTATACCTGATAGTACATATTTATGTTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AC-TGAAGAAAAAAATGCTTGCTAT--AAAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTATTGAGG-AAAAAAA--------ACTTACAAGTAATGTTATTGCCTGTTGC----------CAGCTTCCTT-----TATAACAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAA---CAGAACAGTGAACCCCTATGTC-----TACCTCAATTTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTTAAGAATTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGTAATGTGAACCCAATATTTAAAGTGGATT--GATTTTCTCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGACTGGGAAGAGTGCCATAAAACTGGTTCAGCCCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTGCTTTAAATCATGTTATAGATGAAAGTTATATTATT--TTGGAATTTACATTTT-TATATATAC--------TATATATATTCATTTTT-----AAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTCTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----GTAGCAGTGAT--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATATTTTGTGATTCCAAGGATAAACCTTCCTTTCAAAGGATATTGGTGTGG--------GGGACCCAGATTTACATGCAAAA-----TATCACGTAACT---A-TTTTTTGCATAATGCCTCAATAAATTAATATTTCCTGTCCTAAATTC---------------ACAT-----------GGCTGACTCCAGATTAACTCTG----GAATCGGGATTATTTCACTTCATCCTGTTCAACACAGTGCTTCACGCAGTCCACATTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53723623 1656 - 80904711 GTAC----CTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAATAAAACAAAA-ACACATAACTGAAAACCATAGGGTATTTCAAATATAAATGTAAGAGGAAGTACT----ATAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTACAAAGGGAATTTAAGATAGTTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATATGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAACGCTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTGAGAATTGAGTATAAGGTCTGAATTAAAATAAGGACATGAAAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAACTTC-GCACAAACACTCTGAATCAATCAGTCCTCATGAATGACATATTTCTA--TTTTTTTCTTCTCCCAAAACATGAGAAAAT--GGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTAAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAAATGGGTAGAAGAAACCTGAAAAAAGATCTTCACTGTATCATCACT---TGTACCGCAAGTTTGATGAGTAATGAAAGCAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-TTTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACATCCTATACCTGATAGCACATATTTACATTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TTAAGAAAAAAATGCTGGCCATATACAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTGAGGGGA-AAAAAAA--CAACTTACTTACAAGTAATGTTACTGCCAGTTCCTTTTCTTCA-TAGCTTCCTTTATAATATAAGAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAC---CAGAAGAGAGAATCCCTGTATC-----TACCTCAATTTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTTAAGAACTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGCAATGTGAACCCAATATTAAAAAGGGATT---ATTTTCCCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGCTTGGGAAGAGTGCTATAAAACTGGTTCAGCTCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTACTTTAAATCATGTTATAGATGaaaatta---tatt--ttacaatttacattttttatatatac--------tatatatGTGTATTTTT-----AAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTTTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----CTAGCAGTGAC--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATAATCTGCGATTCCAAGGATAAACCTTCATTTCAAAGGATATTGGTGGGG-----GTGGGGTCCCAGATTTACATGCAGAA-----TATCACGTAGCT---A-TTTTTTTCACAATGCCTCAATA----AATATTTCCTGTCATAAGTTATGACAGGAAATTATGACATAAATTATGATAGGCTGACTCCAGATTAACTCTGGAAAGAATCGGGATTATTTCACTTCACCCTGTTCAATGCAGTGCTTCAAGCAGTCCACATTT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53553482 1651 - 80997621 GTAC----CTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAATAAAACAAAA-ACACATAACTGAAAACCATAGGGTATTTCAAATATAAATGTAAGAGGAAGTACT----ATAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTACAAAGGGAATTTAAGATAGTTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATATGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAACGCTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTGAGAATTGAGTATAAGGTCTGAATTAAAATAAGGACATGAAAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAACTTC-GCACAAACACTCTGAATCAATCAGTCCTCATGAATGACATATTTCTA--TTTTTTTCTTCTCCCAAAACATGAGAAAAT--GGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTAAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAAATGGGTAGAAGAAACCTGAAAAAAGATCTTCACTGTATCATCACT---TGTACCGCAAGTTTGATGAGTAATGAAAGCAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-TTTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACATCCTATACCTGAAAGCACATATTTACATTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TTAAGAAAAAAATGCTGGCCATATACAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTGAGGGGA-AAAAAAA--CAACTTACTTACAAGTAATGTTACTGCCAGTTCCTTTTCTTCA-TAGCTTCCTTTATAATATAAGAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAC---CAGAAGAGAGAATCCCTGTATC-----TACCTCAATTTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTTAAGAACTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGCAATGTGAACCCAATATTAAAAAGGGATT---ATTTTCCCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGCTTGGGAAGAGTGCTATAAAACTGGTTCAGCTCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTACTTTAAATCATGTTATAGATGAAAATTA---TATT--TTACAATTTACATTTTTTATATATAC--------TATATATGTGTATTTTT-----AAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTTTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----CTAGCAGTGAC--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATAATCTGCGATTCCAAGGATAAACCTTCATTTCAAAGGATATTGGTGGGG-----GTGGGGTCCCAGATTTACATGCAGAA-----TATCACGTAGCT---A-TTTTTTTCACAATGCCTCAATA----AATATTTCC-----TAAGTTATGACAGGAAATTATGACATAAATTATGATAGGCTGACTCCAGATTAACTCTGGAAAGAATCGGGATTATTTCACTTCACCCTGTTCAATGCAGTGCTTCAAGCAGTCCACATTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50373962 1654 - 74645514 GTAT----CTAATGAATTCCTttgtaat---ataaacaaaataaaacaaaa-acacataactgaaaaccatagggtatttcaaatataaatgtaAGAGGAAGTACT----ataa----gaaaagctgaaaatttagTTGCAAAGGGAATTTAAGATAGTTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAACGCTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTGAGAATTGAGTATAAGGTCTGAATTAAAATAAGGACATGAAAACAAAGAGTTCAAAGGTCAAACTTC-GCACAAACACTCTGAATCAATCAGTCCTCATGAAtgacatatttcta--tttttttcttctcccaaaaCATGAGAAAAT--GGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTAAGGTatctcag-aggaaagaaaaacctCATGGATGAGATGGGTAGAAGAAACCTGAAAAAAGATCTTCACTGTATCATCACT---TGTACCGCAAGTTTGATGAGTAATGAAAGCAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-TTTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACACCCTATACTTGATagtacatatttacattttgttgtGTACCAGTTACAactga-at-ttaagaaaaaaatgctggccatatacaaaacaaaa------tcttagattcctgagggaa-aaaaaaa--caacttacttACAAGTAATGTTACTGCCAGTTCCTTTTCTTCA-TAGCTTCCTTTATAATATAAGAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGgggaactaaaagaaaaaaggatctcAC---CAGAAGAGAGAATCCCTATATC-----TACCTCAATTTATAAttctgtcaaat-----------------------aaaaataa--------------tttaagaactcAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGCAATGTGAACCCAATATTAAAAATGGatt---attttcccttta--ta-aaacatTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGCTTGGGAAGAGTGCTATAAAACTGGTTCAGCTCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTACTTTAAATCATGTTAtagatgaaaatta---tatt--ttacaatttacattttttatatatac--------tatatatgtgtattttt-----aaagaacactTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTTTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----CTAGCAGTGAC--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTCCACTCAATAATCTGCGATTCCAAGGATAAACCTTCATTTCAAAGGATGTTGGTgggg-------ggggTCCCAGATTTACACACAGAA-----TATCACGTAGCT---A-tttttttCACAatgcctcaata----aatatttcctgtcATAAGTTATGACAGGAAATTATGACATAAATTATGATAGGCTGACTCCAGATTAACTCTGGAAAGAATCGGGATTATTTCACTTCACCCTGTTCAATGCAGTGCTTCAAGCAGTCCACATTT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50428644 1651 - 75148670 GTAC----CTAATGAATTCCTTTGTAAT---ATAAACAAAATAAAACAAAA-ACACATAACTGAAAACCATAGGGTATTTCAAATATAAATTTAAGAGGAAGTACT----ATAA----GAAAAGCTGAAAATTTAGTTGCAAAGGGAATTTAAGATAGTTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAACGCTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTGAGAATTGAGTATAAGGTCTGAATTAAAATAAGGACATGAAAACAAAGAGTTCAACGGTCAAACTTC-GCACAAACACTCTGAATCAATCAGTCCTCATGAATGACATATTTCTA--TTTTTTTCTTCTCCCAAAACAAGAGAAAAT--GGTTTCCTCTCAATTCTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTACAATTAAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAGATGGGCAGAAGAAACCTGAAAAAAGATCTTCACTGTATCATCACT---TGTACCGCAAGTTTGATGAGTAATGAAAGCAGACCAAATTTTCACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAT-GAAAGTGTGGTCAAC-TTTATAAGGTGAAACTAAATTTTCAACAGCACATCCCCAAAATATCCTATACCTGATAGTACATATTTACATTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TTAAGAAAAAAATGCTGGCCATATACAAAACAAAA------TCTTAGATTCCTGAGGAAA-AAAAAAA--CAACTTACTTACAAGTAATGTTACTGCCAGTTCCTTTTCTTCA-TAGCTTCCTT-----TATTAGAACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAC---CAGAAGAGAGAATCCCTGTATC-----TACCTCAATTTATAATTCTGTCAAAT-----------------------AAAAATAA--------------TTTAAGAACTCAAGAAATGGTTGTCCAGCCTGAAAAGCAATGTGAACCCAATATTAAAAATGGATT---A-TTTCCCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGCTTGGGAAGAGTGCTATAAAACTGGTTCAGCTCCCAT---CCCTTCCCAGTGTCCCCTACTTTAAATCATGTTATAGATGAAAAtta---tatt--ttgcaatttacattttatatatatac--------tatatatgtgtattttt-----aAAGAACACTTAATGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTTTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTGTTTAAA----CTAGCAGTGAC--------------------------------------------------------------------TACAAAACTGTAGCATTTCACTCAATAATCTGCGATTCCAAGGATAAACCTTCATTTCAAAGGATATTGGTGGGG----GGGGGGGTCCCAGATTTACATGCAGAA-----TATCACGTAGCT---A-TTTTTTTCACAATGCCTCAATA----AATATTTCCTGTcataagttatgacaggaaattatgacataaattatgacaggCTGACTCCAGATTAACTCTGGAAAGAATTGGGATTATTTCACTTCACCCTGTTCAATGCAGTGCTTCAAGCAGTCCACATTT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93304199 1714 + 159171411 GTACCTAACTAATGAATTCCTTACTAAT---TTAAACAAAATAAAACAAAA-ACACATAAGTGAAAACCATAGGGAATTTAAAATATAAATGTAAGAGGAAGTACT----ATAA----GAAAAGCTAAAAATTCAGTTGGAAGGGGAATTTAAGATAGCTAGATTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCGATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCTACTGCACCAATGCTGTTCTGAGGGAAACGTTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTGAGAATTGAGTATAAGGTTTGAATTAAAATAAGGACATGGGAACAAAGAGCTCAAAGGTCAAACTTT-GCACAAAAACTCTGAATCAATCAGTCCTCATTAATGACACATTTCTA--TTTTTTTCTTCTCCCAAAA-ATGAGAAAATAAAGTTTCCTCTTAATCTTAGTCTTGTATCATATT-----AAAGTAAAATTCAGGTATCTCAG-AGGAAAGAAAAACCTCATGGATGAGATGGCTAGAAGAAACCTGAGAAAAGATCTTCATTGTATCATCACT---TATACTGCAAGTTTGATAAGTAATAAAAGCAGACCAAATTTTTACACAAAGATGATCATAATTTACTAAGATTAACAGACAA-GAAAGTGTGGTCAAC-TTTATAAAGTAAAACCAAATTTTCAACAGCACACCCCCAAAACATCCTATACCGAATAGTACATATTTACATTTTGTTGTGTACCAGTTACAACTGA-AT-TCAAG-AAAAAATGCTTGCCATATACAAAATAAAA------TCTTAGATTCCTGGGGCGG-GGGAGGGGGGAACTTACTTACAAGCAATGTTATTGCCAGTTCCTTTTCTTCA-CAACTTCCTTTATAATATAATGACCTACCTATTATTTAAACCAT-GGAGGGATGGGAATTCTTGGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCTCAC---CAGAAGAGAGAAACCCTATGTC-----TGCCTCAATTTATAATTCTGTCAAACAAACAA-----------------AAAAAAAA--------------TTTAAGAATGCAAGAAACAGTCATCCAGCCTGAAAAGCAATGTGAACCTAATATTTAAAGTGTACT--TATTTTCCCTTTA--TA-AAACATTCTACATT-AAGAT--AAAGTAAAAGGTACCTTAGATTGGAAAGAGTGCTATAAAACTGGTTTAGCTCCCAT---ACCTTCCCAGCATCCCCTGCTTTAAATCATGTTCTATATGaaaatta---tattaatagtaatttacatttt-tatatatac--------tatatatatttattttt-----aaaGAACATTTAACGTAACATTTTAATCTCTACAGCTATTCTTGCTTAGTGTGGCTAACTGCTATTTAAA----GTAGCAGTGACTAtccctggtggtttagtggttaggattcagcaaaaaaataaataaaaataaataaaGTAGCAGTGATTACAAAGCTGTAGCATTCCACTCAATATTCTGTGATTCCAAGGATACACCTTCATTTCAAAGGATATTGGTTGGG-------AGGGGTGCAGATTTACATGCGGAA-----TATCACATAACT---ATTTTTTTTCACAATGCCTCAATAAATTAATA-TTCCTGTCATAAATTC---------------ACAT-----------GGCTGACTCCAGAATAACTCTTGAAAGAATATGAATTATTTCACTGCAACCTGTTTAATGTAGTGCTTCATGCAGTCCACATTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42613515 1571 - 122082543 gtgtgtgtatatAAAGTTCCTCTGCAAT---ACAAACAAATTAAAACAAAAGGCACATAACTGAA--------------------GCAAAATGAAGACAAAGTACTTTGAATAT----GAAACACTGAAAAATTAGCTATAAGGAAAATTAAACGTTGTAAGAGTATCAAAATAATTCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCAATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCATACGGCGAGACAATGGCAGGATTGATGAATCTGAGAAACATGGCACTTCCTACGGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAGCGCTGGCTAACCACCTGAGGAGGAGGAGTTGAGAGTTGAGCAGACAGTTTGTGTTGAAATATAAG--TGGAAACAAAGGCTTCAA-GGTCAAAGTCT-GCACAAA-ATTCCAATT--ATCAATCTTT-TGAATGATCTGTTTTTAACTTTTTTCCTTGTCCCAAAACACCAGAAAATACGGTTTATCCTTAACTGTAATCATGTGTGATTTTTTTTAAAGACACAATTA---------AA-AGAGAAGAAAAATCTC-------------CTCAAAGAAACCTGAAAAAAGAT-TTTACTTCATAATCATT------------------ATAGCCAACAAAAGTAGACTTAA-TTTCACACAAAGGTTAACATATTTTTCTATCATCAACAGACATAAAAAGTACAGTTGACTTTTATAAG----AGCTGAGTTTCTAACAGCAC--CTCCTACATACTCTATTCCTAAGAGGAATAGCTAACACT---TTGCACACCCGTTAAAATTGACAT-TTCAGTGCAA----CTTACCATACACATCTCTG---------CTTAGATTTCTACTGAGT-GAAAAAA-----CTTACTTACAAGCCATGTTCCTGCCAGCCACTTTTCTTCATAAGCATGCTTCCTAATATAAGGACCTACCTATTATTTAAATCACAGGAGAAACAGGAACTCTTGGGAACCTAAAAGAAAAAAGGATCCTAC---CAGAAGACAGATCCCCCACGCTCCACATACCTCAATTTATTCTTCTGCCAAGCAAGTaataaaataaattaaaaccaaaaacaaaacaaaacaaaaTCTTTCAGGGCCCAGGAAATAGCTGCTCTCCTTGAAAAGTCACAGGAAGGCAATGT---AAACGGACC--TATTCTCTCTATAACAA-AAATGTTCTGCA-T-AGGATGCAAAGGAACAGGCACGCCAGACAGGGGGCAATGGCATAGAACTGGCTGCCCTTCGAC---CTCTTCCTAATACTTCCCATTTTAAGCTA----ACACTTGGAAACTGAATTATC--CTAGAATTTA-ATTTT-TGTATAGAC--------CATATACATATTTCTTTTTTTAAAAGAACAC---ATGCAATAGTCAAA-------AGCTATTCTCATTTGCTGTGGCTAACT--------------------GTGAT--------------------------------------------------------------------AGTGGAGCCGTAGCACT---CACAATAA--TGGGAACACAAGGACAC-CCTGCATCTCAAAGGCTCCTGGGGTGGAGAAATGAGAAAACAGGGTTTATGTGCAGAAGTACTTATCATTTTATT---T-TTCTTTACTGGGTGTC----------AATATTT---GTCTTTAATTC---------------ACAG-----------ACTCAACTGCAGATTAACTCTT-----------GAATATTTCACTTTATTCTGATCCACTTTGTGCTTTGTGTTATCTAtattt i mm10.chr11 I 80 I 228 s canFam3.chr9 41586934 1648 + 61074082 -------TTTAATGAATTCCTTTGCAATTTAACAAATAAAAGTAAAATAAA-ACATATAAGTGAAAACCACGGGGAATTTTTAAAATCAATTCAAAAAGAAGTACA----ATAAAAACAAAAAACTGAAAATTTAGTTGGAAGAGAAATTTA----------------AAAGTAGATCACCTTTGACATTAACTTCAAGCCCCTTTCAATTCTAGGTGGTGGCTTTTTATCTAAAATCCCTGCTTCGTACGGTGAGACAATGGCAGGATTGATAAATCTGAGGAACATGGCACTTCCCACTGCACCGATGCTGTTCTGAGGGAAACGCTGGCTAACCACCTAAAAACAAGGAGTTCAAAATTGACTATATAGTTTGAATTTAAA-AAGGAAATGGGAAGAAAAAGCTCAAGGGTCAAACTTTGGCACAATAACTCTGAAGTATT--ACTCTTGTAACCAACACCTTTCTA--TTTTTTCCTACTCCCAAAACATCGGTAAATAAAATTTATCCTCAATTCCTGCCCTCCATCCTTTT-----AAAGCACAATAAAGATATCTAAGAAAAAAAGAAAAATCTCCTGAATGACTGGTGTAGGAGAGACCTGAAAAAAGATCTTAAATTTATCATTGTTGTTTATATTGCAAGTTTGTTAATTTA-AAAAGCAGACCAAATTTTAACACAAAGATTATCCTATTTTACTAAGATTAATAGACAT-GAGAGTGTGGTCAACTCTCACAAGGCAAAGCTAAGTTTTCAACAGCATA-CCCAGCAACATCCAATTTCTGATAGTAAATACTTACATTTTGTTGGATACCTGGTACAACCCA-GTATCTTGAGCAAAATGTTTGCTACCCACAAACAAAAGTAAGTTTTTTAGATTCCTATCAAGA-GAAAAAA-----CTTACTTACAAGTAACATTATTGCCAGTTTCTTTTCTTCCTCAGAATGCTT-----TATAAGG----ACCTATTATTTAAATCAT-GGAGGAACAGGAATTCTCAGGGACCTAAAAGAAAAAAGGATCCCACCAACAGAAAAGAGAACCCCTTTGTG-----TACCTCAGTGCATAAATCTGTCAAAT-----------------------AAAAA-AA--------------GTTAAGGAAACAAGAAATGGTTGCCCACGCTGAAAAACAATGTGAGCCCAATATTTAAAATGGATTTTGTTTCTCTCTTTT--TATAAACATTCTACTTTGAAGGT--AAAGTAATAGGCACATTAGATTGGGAAAAATGTTATGACACTGGCTCAGCTCCCACCGGCTCTTTCCAGTGACTCCTGTTTGAAGTTA----ACATATGAAAATTAGATTATT--CTAAAACTTACATATT-TTCACAGATAACACACACACACACATATATTTTT-----AAAGAACACTT-TTATAACATTTTAATCTCTACAATTGCTCTTGCTTAGTGTAGCTAACTGCTGCTTACAACTGATGGCCACAGC--------------------------------------------------------------------AGCAAAGCCACAGGGCTCTGTGCAATATTCTAAGATTCTAGGGATAGACC-ACATTTCAGAGGATATTGGGGGAA---AATGAGAAAATGGGATTCATGTGCAGAA-----TCTCACATAACTCTAG-TTTATTTTATAATGCTTTAATAAAGTAATACTTCTTGTCACGAATTC---------------ACAT-------GGCACACTGACTCCAGATTAACTCTGGGAAGATTAAGAATTATTTTATTTCTTTCTATCCCCTTTAGGGTTTCATGTGGTATACATTT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1077614.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 256796 443 + 478999 TAAATGCATTCTTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCTGTAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAATTAGATCTTAGAGAAT-----------------AAAGTATTTGTAAGCGGTG--------------AG------GTGTAAC-AATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACACA-----CAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACCCTTCAATAAGGGGAAACTGGTGAAGGTGGCTAAATATAGCTGCTTTATTAGAATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTGAAATATATAAATTTAGAATTAGATATAGAAGTTTTAGCTAAAACTATAAAAAGATAAAGAATTAAGAA-AAAATTTGAGTG-CTTCGACTATTCCAGTAtagtg-ttcaaccttctggggatgaggaacctctttgaaatctgataaaggtt s panTro4.chrUn_GL393519 96488 442 + 413329 TAAATGCATTCTTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCCGTAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAATTAGATTTTAGAGAAT-----------------AAAGTATTTGTAAGCGGTG--------------AG------GTGTAGC-AATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACACA-----CAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACCCTTCAATAAGGGGAAACTGGTGAAGGTGGCTAAATATAGCTGCTTTATTAG-ATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTGAAATATATAAATTTAGAATTAGATATAGAAGTTTTAGCTAAAACTATAAAAAGATAAAGAATTAAGAA-AAAATTTGAGTG-CTTCGACTATTCCACTAtagtg-ttcaaccttctggggatgaggaacctctttgaaatctgataaaggtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166109 448 + 72422247 TAAATGCATTCTTAT-C--ACTGCTTATAATCTTAAAATAGCTTTCTGTAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAATTAGATTTTAGAGAAT-----------------AAAGTATTTGTAAGCAGTG--------------AG------CTGTAAC-AATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTGCACACAGTTCAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACCCTTCAATAAGGGGAAACTGGTGAAGGTGGCTAAATATAGCTGCTTTATTAGAATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTGAAATATATAAATTTAGAATTAGATATAGAAGTTTTAGCTAAAACCATAAAAAGATAAAGAATTAAGAA-AAAATTTGAGTG-CTTTGACTATTCCAATAtagtg-ttcaaccttctggggatgaggaacctctttgaaatctgataaagttt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53725279 455 - 80904711 TAAATGCG---TTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCTATAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAACTAGATTTTAGAGAAA-----------------AAAATATTTGTAAGAGGTGATAAAAA-GAGGTCAG------TTGTAACTAATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACGCG-----TAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACTCTTAAATAAGCGGAAACTGGTGAAGGTGACTAAATATAGCTGCTTTATTAGAATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTCAAATATATAAATTTAGAATTAGACACAGAAGTTTTAGCTGAAACTATAGAAAGATGTAAAATTAAGAA-AAAATTCGAGTG-CTTCAACTATTCCAGTAtggtgtttcaaccttctggggatgaggaacctctctgaaatctgataaaggtt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53555133 455 - 80997621 TAAATGCG---TTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCTATAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAACTAGATTTTAGAGAAA-----------------AAAATATTTGTAAGAGGTGATAAAAA-GAGGTCAG------TTGTAACTAATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACGCG-----TAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACTCTTAAATAAGCGGAAACTGGTGAAGGTGACTAAATATAGCTGCTTTATTAGAATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTCAAATATATAAATTTAGAATTAGACACAGAAGTTTTAGCTGAAACTATAGAAAGATGTAAAATTAAGAA-AAAATTCGAGTG-CTTCAACTATTCCAGTAcggtgtttcaaccttctggggatgaggaacctctctgaaatctgataaaggtt i macFas5.chr16 C 0 I 304 s papAnu2.chr16 50375616 455 - 74645514 TAAATGCG---TTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCTATAATCTCTGATAGGAAGTTAGTAAAAActagattttagagaaa-----------------aaaatatttgtaagaggTGATAAAAA-GAGGTCAG------TTGTAACTAATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACACG-----TAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACTCTTAAATAAGCGGAAACTGGTGAAGGTGACTAAATATAGCTGCTTTATTAGAATGGCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGctcaaatatataaatttagaattagACACAGAAGTTTTAGCTGAAACTATAGAAAGatgtaaaattaagaa-aaaattcgAGTG-CTTCAACTATTCCAGTACGGTGTTTCAACCTTCTGGGGATGAGGAACCTCTCTGAAATCTGATAAAGGTT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50430295 454 - 75148670 TAAATGCG---TTAT-C--ACTGCTTATAATCTCAAAATAGCTTTCTATAATCTCTAATAGGAAGTTAGTAAAAACTATATTTTAGAGAAA-----------------AAAATATTTGTAAGAGGTGATAAAAA-GAGGTCAG------TTGTAACTAATATAGTCCCACCTTCAGTTACACTACAGG-----TAGTTCAGGAAGCTTTCTTTATGTTACAGTGTT--------TATTGCATG------------AAGAACAACCTTAACTCTTAAATAAG-GGAAACTGGTGAAGGTGACTAAATATAGTTGCTTTATTCGAATGTCTTTAAAACCTAAATACCATT-------TATTTTTAGCTCAAATATATAAATTTAGAATTAGACACAGAAGTTTTAGCTGAAACTATAGAAAGATGTAAAATTAAGAA-AAAATTCGAGTG-CTTCAACTATTCCAGTAcggtgtttcaaccttctggggatgaggaacctctctgaaatctgataaaggtt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93305913 433 + 159171411 TAAAGTCGTTCTTAT-----CTGCTTATAACCTCAAAATAGCTTTCTATAATC---AATAGGAAGTGGGTAAAAATTAGATTTTAGAGAAT-----------------AAAATATTTGTAAGAGGTGAT-AAAA-GAGATGAG------TTGTAACTAATACAGTCCCACCTTCAGGAACACTACACA-----TAGTGCAGAAAGCTTTCTT--TGTTACAGTGCT--------TACTGCATG------------AAGAACAACCTTAACACTGAAATAAGGGGAAACTGGTAAAGGTGGCTAAATATAGCTGCTTTATTAAAATGACTTTAAAACCTATATAC-----------------TAGCTGAAATATATAAATTTAGAATTAGATATAGAAGTTTTAGCTAAAACT----AGAGATATAGAGTTAAGAA-AAAATTCGAGTG-CTTTGACTATTCCAGTACAg---ttcaaccttctggggacaaggaacctctttgaaatctgataaaggtt i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42615314 384 - 122082543 TAAATGTGTCCTTAC-CCAAGGCCCAAAAATCTCAAAATAATTTTCTATTGTTTCTGATAAAAAAAAAATTAGAAAAAGATTTCAGAAAAT-----------------GATTCCTTGGGGGGTAGTCGTAGGAACGAGCTCAGAGAGGTTTGTGA--GCTCCAGTTC--CCTTTGTATACGGTGC-CG-----TGGCTCGGGGAGC-TTCTCTGGGTTACAGTTCT--------T-TTGTGTGCTTACAGCACCCAGGGAGAACCTTAG----GAAATCCTGAGAAATTGG-GGAGTTGGCTAAATATAGCTGTGTT----------------------------------------TTTTTAGCTGAAATA-----------------------GAGTTTT----------------GCATATAAAACTAAG---AAAATTCAAG-----TTTACTTTTCTAGGACAGTT-TTTAAACTTTTGAGGTACTAGAATCTC----AGATCTGATTAAAAAA i mm10.chr11 I 228 C 0 s canFam3.chr9 41588582 410 + 61074082 TAAATGTCTTCTCATTC--ACTGCATTCACTCT--AAATAGTTTTCTACTGTACCTGATAGAGAATCAGTAAATGTAAGATTTCAGAGAATGATTTTTTAAGCCAAAGAATATCCTTGTAAATGATGATAACAG-------AG------TTGTAACTAATATATTCTTACTTTCATTTATAATAC--G-----CAGCTCAGGAAGCTTCCTTTGTCTTAAAGTCCTCTGAGTGCTACTGCAGG------------AAGGACAACCTTA-CACTTAAATAGGAGGAAGCTGG---------CTAAATATAGCAGCCTTACTAGAATAGCTTTAAAACCCAAATAGTGTTTGAGAACTATTTTTAGCTGAAATA-----------------------CAGTTTT----------------AGAAATAGAATTAAGAAGAAAATTCAAGTGTCTCTTACCACTGTAGTACACTA-TTTAACCTTTTAGGAAGTAGGAAC----------------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=33111.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257239 9 + 478999 agaaaaatg s panTro4.chrUn_GL393519 96930 9 + 413329 agaaaaatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166557 9 + 72422247 agaaaaatg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53725734 9 - 80904711 agaaaaatg i rheMac3.chr16 C 0 I 320 s macFas5.chr16 53555892 9 - 80997621 agaaaaatg i macFas5.chr16 I 304 C 0 s papAnu2.chr16 50376071 9 - 74645514 AGAAAAATG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50430749 9 - 75148670 agaaaaatg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93306346 9 + 159171411 agaaaaatg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42615698 9 - 122082543 AAAAAAGCA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41588992 9 + 61074082 AGAAAAATG i canFam3.chr9 C 0 I 1 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=22820.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257248 12 + 478999 gatgtatgcttt s panTro4.chrUn_GL393519 96939 12 + 413329 gatgtatgcttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166566 12 + 72422247 gatgtatgcttt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53555901 12 - 80997621 aatgtatgcatt i macFas5.chr16 C 0 I 4 s papAnu2.chr16 50376080 12 - 74645514 AATGtatgcatt i papAnu2.chr16 C 0 I 4 s chlSab2.chr16 50430758 12 - 75148670 aatgtatgcatt i chlSab2.chr16 C 0 I 4 s calJac3.chr5 93306355 12 + 159171411 aatgtatgcatt i calJac3.chr5 C 0 I 2 s mm10.chr11 42615707 5 - 122082543 AATAT------- i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41589002 12 + 61074082 AATGTATACATT i canFam3.chr9 I 1 C 0 e rheMac3.chr16 53725743 320 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=265584.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257260 96 + 478999 cac--acaaatttcttcacataattttagaatattcatagaccATCACT-----GCTACTGAGTGGTTCTCTTAAAACTCCCAAATTT-TAATCTCAAAA--CAGA s panTro4.chrUn_GL393519 96951 96 + 413329 cac--acaaatttcttcacataattttagaatattcacagaccATCACT-----GCTACTGAGTGGTTCTCTTAAAACTCCCAAATTT-TAATCTCAAAA--CAGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166578 96 + 72422247 cac--acaaatttcttcacatgattttagaatattcataggccATCACT-----GCTACTGAGTAGTTCTCTTAAAACTCCCAAATTT-TAGTCTCAAAA--CAGA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53726063 91 - 80904711 cac--acaaaattcttcacataattttagaatattcatagaccATCATT-----GCTACTGAGTGGTTCTTCTAAAACTCCCAAATTT-TAATCT-------TAGA i rheMac3.chr16 I 320 C 0 s macFas5.chr16 53555917 91 - 80997621 cac--acaaaattcttcacataattttagaatattcatagaccATCATT-----GCTACTGAGTGGTTCTTCTAAAACTCCCAAATTT-TAATCT-------TAGA i macFas5.chr16 I 4 C 0 s papAnu2.chr16 50376096 91 - 74645514 cac--acaaaattcttcacataattttagaatattcatAGACCATCATT-----GCTACTGAGTGGTTCTTCTAAAACTCCCAAATTT-TAATCT-------TAGA i papAnu2.chr16 I 4 C 0 s chlSab2.chr16 50430774 96 - 75148670 cac--acaaaattcttcacataattttagaatattcatagaccATCATTCAAGAACTACTGAGTGGTTCTTCTAAAACTCCCAAATTT-TAATCT-------TAGA i chlSab2.chr16 I 4 C 0 s calJac3.chr5 93306369 98 + 159171411 caccgacaaacttcttcacataattttagaatattcatagaccATCATT-----GCTACTGAGTGGTTCTTTTAAAACTCCCAAATTT-TAATCTTAAAA--CAGA i calJac3.chr5 I 2 C 0 s mm10.chr11 42615712 91 - 122082543 -------CAGATTCATCATATAATTTCAACATGTGCAAAGACCAACGTT-----GACATGGA---GTTCTTTTAGAATTTCCAAATTTAGAATTTCCAAACTGAGA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41589014 93 + 61074082 TAC--GCAAAAT---TCATACAACTTCAGAATGTTCCAGGAACACCATT-----GCTACCGAGTGGTTCTTTTAGAATTCCCAAATTT-TAATCTTAAAA--CAGA i canFam3.chr9 C 0 I 17663 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=10152.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257356 3 + 478999 CAA s panTro4.chrUn_GL393519 97047 3 + 413329 CAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166674 3 + 72422247 CAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53726154 3 - 80904711 CAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53556008 3 - 80997621 CAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50376187 3 - 74645514 CAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50430870 3 - 75148670 CAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93306467 3 + 159171411 CAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42615803 3 - 122082543 CAA i mm10.chr11 C 0 I 12482 e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=604918.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257359 267 + 478999 TTCTCTggttgggcatggtggctcacacctgtaatcccagcattctgggagactgaggctggtggatcaattgaggttaggagttccagaccagcctggcaaacatggtgaaactccatctctactaaaaatagaaaaattagctggacgtggtggtgcacgcctgtaatctcagctacttgggaggctgaggcacgagaatcgcttgaacccaggaggtggaggttgcggtgagccatcgtgccactgcactccagtctgggtgac s panTro4.chrUn_GL393519 97050 267 + 413329 TTCTCTggttgggcttggtggctcacgcctgtaatcccagcattctgggagactgaggctggtggatcaattgaggttaggagttccagaccagcctggcaaacatggtgaaactccatctctactaaaaatagaaaaattagctggacgtggtggtgcacgcctgtaatctcagctacttgggaggctgaggcacgagaatcacttgaacccaggaggtggaggttgcggtgagccatcgtgccactgcactccagcctgggtgac i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166677 267 + 72422247 TTCTCTggttgggcacggtggctcacacctgtaatcccagcactctgggagactgaggctggtggatcaattgaggctaggagttccagaccagcctgggcaacatggtgaaactccatctctaccaaaaatagaaaaattagctggacgtggtggtgcacgcctgtaacctcagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagccaccgtgccactgcactccagcctgggtgac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53726157 267 - 80904711 CTCTCTggctgggcgtggtggctcacacctgtaatcccagcactctgggagaccggggcagacagatcacttgaggctaggagttcaaaaccagcctggccaacatggcgaaacccgatttctactaaaaatacaaaaagtagctggacgtggtggtgcacacctgtaatcccaactacttgggaggctaaggcaggagaatcgcttgaacccaggaagtggaggttgcagtgagccattgtgccactgcactccagcctgggtgac i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53556011 267 - 80997621 CTCTCTggctgggcgtggtggctcacacctgtaatcccagcactctgggagaccgaggcagacagatcacttgaggctaggagttcaaaaccagcctggccaacatggcgaaacccgatttctactaaaaatacaaaaagtagctggacgtggtggtgcacacctgtaatcccaactacttgggaggctaaggcaggagaatcgcttgaacccaggaagtggaggttgcagtgagccattgtgccactgcactccagcctgggtgac i macFas5.chr16 C 0 I 16391 s papAnu2.chr16 50376190 267 - 74645514 Ctctctggctgggcgtggtggctcacacctgtaatcccagcactctgggaggccgaggcagacagatcacttgaggctaggagttcaaaaccagcctggccaacatggcgaaacccgatttctactaaaaatacaaaaagtagctggacgtggtggcgcacacctgtaatcccaactacttgggaggctaaggcaggagaatcgcttgaacccaggaagtggaggttgcagtgagccattgtgccactgcattccagcctgggtgac i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50430873 267 - 75148670 CTCTCTggctgggcgtggtggctcacacctgtaatcccagcactctgggaggccgaggcagacagatcacttgaggctaggagttcaaaaccagcctggccaacatggcgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaagtagctggacgtggtggcgcacacctgcaatcccaactacttgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagccattgtgccaccgcgctccagcctgggtgac i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93306470 267 + 159171411 TTCTCTggctgggcatggtggctcatgactgtaattccagcactctggaaggccaaggtaagtggatcacttgaggctaggatttcgagaccagcctggccaatatggtgaaatcccatctctactaaagatacaaaaattagccaggtgtgatggcatatgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggagctggaggttgcagtgagccatcttgttactgctctccagcctgactgat i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=2548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257626 1 + 478999 a s panTro4.chrUn_GL393519 97317 1 + 413329 a i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166944 1 + 72422247 a i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53726424 1 - 80904711 a i rheMac3.chr16 C 0 I 16645 s macFas5.chr16 53572669 1 - 80997621 A i macFas5.chr16 I 16391 C 0 s papAnu2.chr16 50376457 1 - 74645514 a i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50431140 1 - 75148670 a i chlSab2.chr16 C 0 I 16455 s calJac3.chr5 93306737 1 + 159171411 a i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257627 2 + 478999 ga s panTro4.chrUn_GL393519 97318 2 + 413329 ga i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166945 2 + 72422247 ga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572670 2 - 80997621 GA i macFas5.chr16 C 0 I 4 s papAnu2.chr16 50376458 2 - 74645514 ca i papAnu2.chr16 C 0 I 16526 s calJac3.chr5 93306738 2 + 159171411 ga i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e chlSab2.chr16 50431141 16455 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53726425 16645 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1500.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257629 1 + 478999 g s panTro4.chrUn_GL393519 97320 1 + 413329 g i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166947 1 + 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572676 1 - 80997621 G i macFas5.chr16 I 4 C 0 s papAnu2.chr16 50392986 1 - 74645514 G i papAnu2.chr16 I 16526 C 0 s calJac3.chr5 93306740 1 + 159171411 g i calJac3.chr5 C 0 I 22569 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e chlSab2.chr16 50431141 16455 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53726425 16645 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=27043.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257630 53 + 478999 cATGCAAGTGACTGTGTAAAGTGATATGTAAAGTCATGGAAAAAGGAAAG------AGC s panTro4.chrUn_GL393519 97321 53 + 413329 cATGCAAGTGACTGTGTAAAGTGATATGTAAAGTCATGGAAAAAGGAAAG------AGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7166948 57 + 72422247 cATGCAGGTGACTGTGTATG--AATAAGTAAAGTCATGGAAAAAGGAAAGAGGAACAGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572677 51 - 80997621 CAGGTGAGTGATTGTATATG--AATATGCAAATGCATGGAAAAATGACAG------TGG i macFas5.chr16 C 0 I 6 s papAnu2.chr16 50392987 51 - 74645514 CATGTGAGTGACTGTATATG--AATATGCAAATGCATGGAAAAATGACAG------TGG i papAnu2.chr16 C 0 I 6 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e chlSab2.chr16 50431141 16455 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53726425 16645 - 80904711 I e calJac3.chr5 93306741 22569 + 159171411 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=13755.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257683 7 + 478999 CTTAACT s panTro4.chrUn_GL393519 97374 7 + 413329 CTTAACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167005 7 + 72422247 CTTAACT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743070 7 - 80904711 CTTAACT i rheMac3.chr16 I 16645 C 0 s macFas5.chr16 53572734 7 - 80997621 CTTAACT i macFas5.chr16 I 6 C 0 s papAnu2.chr16 50393044 7 - 74645514 CTTAACT i papAnu2.chr16 I 6 C 0 s chlSab2.chr16 50447596 7 - 75148670 CTTAACT i chlSab2.chr16 I 16455 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e calJac3.chr5 93306741 22569 + 159171411 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=221392.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257690 101 + 478999 AGTAACGGTCTGTGGAGGTAGAAGTCAAAGACATCCTTCTCCTGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAGAT--AAAAAGAAGGATAACTT-AAAAAAAATTACAGAT s panTro4.chrUn_GL393519 97381 101 + 413329 AGTAACGGTCTGTGGAGGCAGAAGCCAAAGACATCCTTCTCCTGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAGAT--AAAAAGAAGGATAACTT-AAAAAAAATTACAGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167012 100 + 72422247 AGTAACGGTCTCTGGAGGTAGAAGTCAAAGACACCTTTCTCCAGCCTGTCCCTGGATCTGAGGCAAAT--AAAAAGAAGGATACCTT--AAAAAAATTACAGAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743077 102 - 80904711 AGTAACAGTCTCTGGAGGTGGAAGTCAAAGACACCTTTCTCCAGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAAAT-AAAAAAAAAGGATACCTT-AAAAAAAATTACAGAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572741 102 - 80997621 AGTAACAGTCTCTGGAGGTGGAAGTCAAAGACACCTTTCTCCAGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAAAT-AAAAAAAAAGGATACCTT-AAAAAAAATTACAGAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50393051 102 - 74645514 AGTAACAGTCTCTGGAGGTGGAAGTCAAAGACACCTTTCTCCAGTCTGTCCCTGGATCtaaggcaaac-aaaaaaaaaggatacctt-aaaaaaaattacagat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50447603 104 - 75148670 AGTAACAGTCTCTGGAGGTGGAAGTCAAAGACACCTTTCTCCAGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAAATAAAAAAAAAAGGATACCTTAAAAAAAAATTACAGAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93329310 100 + 159171411 AGTAACAGTCTCTGGAGGTGGAAGTCAAAGACACTTTTCTCCAGTCTGTCCCTGGATCTAAGGCAAA---AAAAAAAAGGACACCTT-AAAAAAATGTACATAT i calJac3.chr5 I 22569 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e canFam3.chr9 41589107 17663 + 61074082 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=177673.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257791 72 + 478999 ATCATTAAAGAAAAGCATATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACAAATTTTAATGATCAAGAGGAGAAG s panTro4.chrUn_GL393519 97482 72 + 413329 ATCATTAAAGAAAAGCATATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACAAATTTTAATGATCAAGAGGAGAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167112 72 + 72422247 ATCATTAAAGAAAAGCGTATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACAAATTTTAATGATCAAGGGGAGAAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743179 67 - 80904711 ATCATC-----AAAGTGTATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACTAATTTTAATGATCAAGGGGAGAAG i rheMac3.chr16 C 0 I 35 s macFas5.chr16 53572843 67 - 80997621 ATCATC-----AAAGTGTATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACTAATTTTAATGATCAAGGGGAGAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50393153 67 - 74645514 atcATT-----AAAGTGTATTTGtatataacttttataattaaaaactaattttaatgaTCATGGGGAGAAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50447707 67 - 75148670 ATCATT-----AAAGTGTATTTGTATATAACTTTTATAATTAAAAACTAATTTTAATGATCAAGGGGAGAAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93329410 72 + 159171411 ATCATTAAATTAAAGTGTATATGCATATAACTTTTATAATTAAAAACTAATTTTAATGATCAAAGGGAGAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41606770 68 + 61074082 ATTTTTAGAGAAAA----ATTTGTGTGCAACTTTTATAATTACAGACTAATTTTAAGAATCAAGAGGAGGAA i canFam3.chr9 I 17663 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=19491.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257863 14 + 478999 TTATGAGGGCCTTG s panTro4.chrUn_GL393519 97554 14 + 413329 TTATGAGGGCCTTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167184 14 + 72422247 TTATGAGGGCCTTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572910 8 - 80997621 ------AGGCCTTG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50393220 8 - 74645514 ------GGGCCTTG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50447774 8 - 75148670 ------GGGCCTTG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93329482 14 + 159171411 TTATGAGGGCCTTG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41606838 14 + 61074082 TTGTGAGAGCCTGT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42615806 12482 - 122082543 I e rheMac3.chr16 53743246 35 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=14290.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257877 7 + 478999 CTTCATG-- s panTro4.chrUn_GL393519 97568 7 + 413329 CTTCATG-- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167198 7 + 72422247 CTTTATG-- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572918 7 - 80997621 CTTCATG-- i macFas5.chr16 C 0 I 4 s papAnu2.chr16 50393228 7 - 74645514 Cttcatg-- i papAnu2.chr16 C 0 I 4 s chlSab2.chr16 50447782 7 - 75148670 CTTCATG-- i chlSab2.chr16 C 0 I 46 s calJac3.chr5 93329496 7 + 159171411 CTTCATG-- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42628288 7 - 122082543 CCTCATG-- i mm10.chr11 I 12482 C 0 s canFam3.chr9 41606852 7 + 61074082 --TCACATC i canFam3.chr9 C 0 C 0 e rheMac3.chr16 53743246 35 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=-2507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257884 7 + 478999 CAGTGTT s panTro4.chrUn_GL393519 97575 7 + 413329 CAGTGTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167205 7 + 72422247 AAGTGTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53572929 3 - 80997621 aaa---- i macFas5.chr16 I 4 I 13 s papAnu2.chr16 50393239 3 - 74645514 aaa---- i papAnu2.chr16 I 4 I 8 s calJac3.chr5 93329503 7 + 159171411 CAGTGCT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42628295 7 - 122082543 CAGTACT i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41606859 6 + 61074082 CAGGGT- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr16 50447789 46 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53743246 35 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=-608.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257891 17 + 478999 AGC--------AAAAAAAAAAAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 97582 18 + 413329 AGC-------AAAAAAAAAAAAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167212 25 + 72422247 AGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743281 16 - 80904711 ---------aacaaaacaaaaaaaa i rheMac3.chr16 I 35 I 3 s macFas5.chr16 53572945 16 - 80997621 ---------aacaaaacaaaaaaaa i macFas5.chr16 I 13 I 3 s papAnu2.chr16 50393250 16 - 74645514 ---------aacaaaacaaaaaaaa i papAnu2.chr16 I 8 I 3 s calJac3.chr5 93329510 14 + 159171411 ---------AGTTAAAAAAAAAA-- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42628302 17 - 122082543 -------GGGGAGGAGTGAGGGAG- i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41606865 17 + 61074082 ------AGTGGAAAAGTGAAGAC-- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr16 50447789 46 - 75148670 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1904555.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 257908 611 + 478999 GAGCACTTTTATGTGAAAAGATGATAAAACTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCCATCAGAGGATGTGATCTCAATTCGTAATAAAGCATCCAGGAGTTTTTATAGATAGGTAGCACCATATACCTATAGAAATGCATGAGTAGGACTTCATTATGCCTGCTCCATACATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGCTCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATACCTCAG--------CACACACACACACAAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAGTGTCATTATTTTACTGGCCAAACTGTTGCCTCAGAGGAGAGTCTGAATGGAGTCAGTCTGCCAATTCTACTTCTTTACAAAACATGTTCCAGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCAAGAACCAAATAGAGTAACCAGAACTCAAGCCAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGGTTAGTG----------CATTTTTGTTCTCAGGTAGA---------TAGCTGAAGAGTGGCAAAAACATAAACCCAAAGTTGACAACTACTTGCTAAA----TTAAGGCAAA-GGTGACTGATTAATATTTCTCCTGAGATTTATCTGCGTATA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC s panTro4.chrUn_GL393519 97600 619 + 413329 GAGCACTTTTATGTGAAAAGATGATAAAACTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCCATCAGAGGATGTGATCACAATTCATAATAAAGGATCCAGGAGTTTTTATAGATAAGTAGCACCATATACCTATAGAAATGCATGAGTAGGACTTTATTATGCCTGCTCCATACATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGCTCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATACCTCAGcacacacacacacacacacacaAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAGTGTCATTATTTTACTGGCCAAACTGTTGCCTCAGAGGAGAGTCTCAATGGAGTCAGTCTGCCAATTCTACTTCTTTACAAAACATGTTCCGGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCGAGAACCAAATAGAGTAACCAGAACTCAAGCCAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGGTTAGTG----------CATTTTTGTTCTCAGGTAGA---------TAGCTGAAGAGTGGCAAAAACGTAAACCCAAAGTTGACCACTACTTGCTAAA----TTAAGGCAAA-GGTGACTGATTAATATTTCTCCTGAGATTTATCTGCGTATA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167237 618 + 72422247 GAGCAGTTTTATGTGAAAAGATGATAAAACTGGTAGGATCCACTTCAGAGCTAACATGTTGCCCATCAGAGGATGTGATCAGAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTTTATAGACAGGTAGCACCATATACCTATAGAAATGCATGAGTAGGACTTTATTATGCCTGCTCCATACATTTTACCTAAAAAGAAGACAATCAGCTCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATACCTCAG--------CACACACACACAGAAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAGTGTCATTATTTTACTGGCCAAACTGTTGCCTCAGAGGAGAGTCTGAATGGAGTCAGTCTGCCAATTCTA---CTTTACAAAACATGTTCCAGAGCAGCTGGTAGAGTAAATGCTGAGAATCAAATAGAGTAACCAGAACTCAAGCCAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGGTTAGTGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTCAGGTAGA---------TAGGTGAAGAGTGGCAAAAACGTAAACCCAAAGTTGACAACCACTTGCTAAA----TTAAGGCAAA-GGTGACTGATAAATATTTCTCCTGAGATTTATCTGCGTGTA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743300 620 - 80904711 GAGCAGTTCTATGTGAAAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTCTGTAGATAGGTAGCACCATATACCTACAGAAATGCATGAGTAGGAGTTGATTATGCCTGCTCCATATATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGTCCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATATGTCAG------CACACACACGCACACAAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAACGTCATTATTTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGGAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACTTCTTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTAACCAGAACTCGAGCTAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGCTTAGCGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTTAGGTAGA---------AAGCTAAAGAGTAGCAAAAATGTAAACCCAAAGTTGACAACCACTTGCTAAA----TTAAGGCAAATGGTGACTGATTAATATTTATCCTGAGATTTAACTGTGTACA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i rheMac3.chr16 I 3 C 0 s macFas5.chr16 53572964 620 - 80997621 GAGCAGTTCTATGTGAAAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTCTGTAGATAGGTAGCACCATATACCTACAGAAATGCATGAGTAGGAGTTGATTATGCCTGCTCCATATATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGTCCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATATGTCAG------CACACACACGCACACAAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAACGTCATTATTTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGGAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACTTCTTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTAACCAGAACTCGAGCTAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGCTTAGCGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTTAGGTAGA---------AAGCTAAAGAGTAGCAAAAATGTAAACCCAAAGTTGACAACCACTTGCTAAA----TTAAGGCAAATGGTGACTGATTAATATTTATCCTGAGATTTAACTGTGTACA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i macFas5.chr16 I 3 C 0 s papAnu2.chr16 50393269 620 - 74645514 gagcaGTTCTATGTGAAAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGCTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTCTGTAGATAGGTAGCACCATATACCTACAGAAATGCATGAGTAGGAGTTGATTATGCCTGCTCCATATATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGTCCTGCACATTCGGTACATAATCATTACTTGACATACGTcag------cacacacacgcacacaaaatgAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAACGTCATTATTTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGGAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACTTCTTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTAACCAGAACTCGAGCTAGTTCATcctgagaacaaaacaaaatcagcttAGCGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTTAGGTAGA---------AAGCTAAAGAGTAGCAAAAATGTAAACCCAAAGTTGACAACCACTTGCTAAA----TTAAGGCAAATGGTGACTGATTAATATTTATCCTGAGATTTAACTGTGAATA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i papAnu2.chr16 I 3 C 0 s chlSab2.chr16 50447835 620 - 75148670 GAGCAGTTCTATGTGAAAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTCTGTAGATAGGTAGCACCATATACCTACAGAAATGCATGAGTAGGAGTTGATTATGCCTGCTCCATATATTTTACCTTAAAAGAAGACAATCAGTGCTGCACATTCTGTACATAATCATTACTTGACATACGTCAG------CACACACACGCACACAAAATGAAT-GATACAAACCTTGAAACAGAACGTCATTATTTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGGAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACTTCTTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGTTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTAACCAGAACTCGAGCTAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGCTTAGCGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTTAGGTAGA---------AAGCTAAAGAGTAGCAAAAATGTAAACCCAAAGTTGACAACCACTTGCTAAA----TTAAGGCAAATGGTGACTGATTAATATTTATCCTGAGATTTAACTGTGTACA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i chlSab2.chr16 I 46 C 0 s calJac3.chr5 93329524 606 + 159171411 --GCAGTTTTATGTGAAAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAAAGGATCCAGGAGTTTTTGTAGATAGGTAGCACCATATACCTATAGAAATGCATGAGTAGGAGTTTATTATGTCGGCTACATATACTTTACCTTAAAAGAAGACAGTCAGCTCTGCACAATCTGTA------CATTACTTGACATACCTTAC--------CACACACACACATGAAATGAAT-AATACAAACCTTGAAACAGAATGTCATTATTTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGGAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACCTCTTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGCTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTAACCAGAACTCGAGCTAGTTCATCCTGAGAACAAAACAAAATCAGGTTAGTGCAAACAATCCCATTTTTGTTCTCAGGGAGA---------AAGCTGAAGAGTAGCAAAAATGTAAACCCAAAGTTGACAACCCCTTGCTAAA----TTA----AAATGATGACTGATTAATATTTCTCCTGAGATTTATCTGTGTACA------------------------------------------------------------------TTGTTTATGATAGA----------------------------------------------------TGAC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42628319 586 - 122082543 ---CAAC----TGTGACAAGATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGTTGCCAATCCGAAGATGTGATGATGACTCGTAATAAAGGGTCCAAGAGCTTTTGTAGGTAAGTAGCACCATACACCTAAAGAAACACACAGTCAGGCCAATA----GCCACAGCCACACATCCTACATTTAA--AACATAATCC-CTCCACACAGTCTCTA---AGTTTCTTCTCAACAAACCT-AG------TGCACGTGTGCACACAAAGTCAAT-GACACCAACCTTGAAGCAGAATGTCATTATCTTACTGGCCAAGCTGTTGCCTCGAAAGAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACCTCCTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAGCTGGTAGAGTAAATGCCGGGAATCAAACAGAGTGACCAGAACCCGAGCCAGCTCATCCTGGTAACAAAGCACAATTGTGTTTCTGTGAACAATTTTACTT---CTCTTAGGTAGATTTAAAATTTTGTAAAAGGATAGAAAAAAGGCAGATCTAAAACTCATAAT---------AA----TCAAGGTAAACAATAACT------TATTATTCCTAACATTTACCT-------------------------------------------------------------------------TTGTCTATTAAAGA----------------------------------------------------TGAC i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41606882 711 + 61074082 ---AAGCTGTAGATGAAAGAATGACAAACCTGGTAGGATCCACTTCAAAGCTAACATGCTGCCAATCAGAGGATGTGATCACAATTCGTAATAACGGATCCAAGAGTTTTTGTAGGTAGGTAGCACCATATACCTAAAGAAATATAAAAGCAGGAATTTATTATGCCTTCTCCAAATGTCTTGCATTA----AAGAAATTCTGTTCTGTATATTCTGCACATAATCAGT--TTGCTATACCTTGG------------CACAAAAAAAAGATAAATGGATACAAACCTTGAAACAGAAGGTCATTATTTTACTGGCTAAGCTGTTTCCTCGGAAAAGAGTCTGCATGG----AGTCTGCCAATTCTACTTCCTTAGAAAACATGTTCCAGAGCAATTGGTAGAGTAAATGCCGAGAATCAAACAGAGTCACCAAAACTCGAGCTAGTTCATCCTGAGAACAAAATAAAATTGTGTTAGTGTGAATAATCCTGTTTT--TTCTTAAGCAGG---------AAACTG-----------TAAGGTAAATCCAAAACCGTCAACTACCTGCTAAATGGCTTTAGTTCAATGGTGACTAATT----TTCCCCCTGGTGTTTCTCTGTGTGCATGTGTCTATTTCTTCATGCCTACAGCAGCTGTTTCAGGTCTATTGGtttttttaaaaaagatttatttattcatgacagagagagaggcagagacacaggcagagggagaagcaggctccacacagggagcttgac i canFam3.chr9 C 0 I 111 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=815461.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 258519 305 + 478999 TAT--ATACGATGTCTACG-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACCggtgaaagctattaagagaggcct-aggctttaccaggagac-----aaaat-------ctccaagattcagttcaaattacatcacaaaatgaaagaGAACAGAAACAGAAGATGACAGCAAATACTTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA----CTCTCTTCTCATACAGTCAGGGGAACTCAGTGAATGCTGAACATAGACTAGGT--AGAGACATGACAAAAACAGAAAGACTATAG s panTro4.chrUn_GL393519 98219 303 + 413329 TAT--ATACGATGTCTACA-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTggtgaaagctattaagagaggcct-aggctttaccaggagac-----aaaat-------ctccaagattcagttcaaattacatcacaaaatgaaagaGAACAGAAACAGAAGATGACAGCGAATACTTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA------CTCTTCTCATACAGTCAGGGGAACTCAGTGAATGCTGAACATAGACTAGGT--AGAGACATGACAAAAAGAGAAAGACTATAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7167855 308 + 72422247 TAT--ATATGATGTCTACG-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTGGTGAAAGCTATTAAGAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGGAGAC-----AAACT-------CTCCAAGATTCAGTTCAAATTACATCACAAAATGAAAGAGAGCAGAAACAGAAGATGACAGCAAATAATTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTTCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTACTCTCTTTCTTCTCATACAGTC-GGGGAACTCAGTGAATGCTGAACATAGACTAGGT--AGAGACACGACAAAAACAGAAAGACTACAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53743920 305 - 80904711 TAT--ATACGATGTCTACA-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTGGTGAAAGCTATTGAGAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGGAGAC-----AAAAC-------CTCCAAGATTCAGCTCAAATTACATCACAAAATGAAAGAGAACAGAAACAGAAGATGACAGCAAAGAATTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA----CTCTCTTCTCATACAGTCAGGGGAACTCAGTGAATACTGAATATATACTAGGC--AGAGACATGACAAAAACAGAAAGACTATAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53573584 305 - 80997621 TAT--ATACGATGTCTACA-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTGGTGAAAGCTATTGAGAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGGAGAC-----AAAAC-------CTCCAAGATTCAGCTCAAATTACATCACAAAATGAAAGAGAACAGAAACAGAAGATGACAGCAAAGAATTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA----CTCTCTTCTCATACAGTCAGGGGAACTCAGTGAATACTGAATATATACTAGGC--AGAGACATGACAAAAACAGAAAGACTATAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50393889 307 - 74645514 TAT--ATACGATGTCTACG-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTGGTGAAAGCTATTGGGAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGGAGAC-----AAAAC-------CTCCAAGATTCAGCTCAAATTACAtcacaaaatgaaagagaacagaAACAGAAGATGACAGCAAAGAATTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA--ctctctcttctcatacagtCAGGGGAACTCAGTGAATACTGAATATATACTAGGC--AGAGACATGACAAAAACAGAAAGACTATAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50448455 305 - 75148670 TAT--AAACGATGTCTATG-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATTAACTGGTGAAAGCTATTGAGAGAGGCCT-AGGCTTCACCAGGAGAC-----AAAAC-------TTCCAAGATTCAGCTCAAATTACATCACAAAATGAAAGAGAACAGAAACAGAAGATGACAGCAAAGAATTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTGCACA----------GAGCAGAAATAAGA--CTGATGATCAGAAGAATTCCA----CTCTCTTCTCATACAGTCAGGGGAACTCAGTGAATACTGAATATATACTAGGC--AGAGACATGACAAAAACAGAGAGACTATAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330130 303 + 159171411 TAT--ACACGATGTCTACA-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGTTAATTCCAAGGATCAACTGGTGAAAGCTATTAAGAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGCAGAC-----AAAAT-------CTCCAGGATTCAACTCAAATTGTATCACAAAATGAAAGAGAGCAGGAATAGAAGATGACAGCAAAGAGTTTAGTTTGATTTGTACAAG-CATTTACACA----------GATCAGAAGTAAGA--CTGATGATCAGAAGAGTTCTA----CTCTTTTCTTGTATAGTCAGGGAAACTC--TGAATACTGAGCATAGACTAGGC--AGAGATATGACAAAAATAGAAAGACTATAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42628905 217 - 122082543 TTTTAATAC-CTGTTTCTA-----------------------------------------------------------------------------ATAGCTGCTAATGCTAAAAATTAACTAGTGAAAGAT-----GAGAGATTTAAGGCTTTACCAGAAGGC-----AAGGCAGAAAGACATCAGGATCTGGCT-AAATTACATCATAAAATAAG-----------------------------------TGTTCGTTTTGAACAA----------------------------------------------------------A----CTGTATTCTTA-----------GAAATGATTAAATAC--AATATGACCAAGGCCAAAATAAACAACAAAAATGCAAATACTAAGG i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41607704 388 + 61074082 TTT--AAGCAATCTCTAcacccagtgtggggcttgaactcatgaccccaagatcaaaagttgcatattcttcccacagagccagccaggcACCTTGGCAGCTATTAATTCTAAGAATTAACTGATGAAA---AGTAAAAGAGGCCT-AGGCTTTACCAGGAGACAGAAAAAAAA-------ATCCAGGATTCAGTTCAAATT--ATGACAAAACCAAAGAGAGTAGAAATAGAACATGATGGCACAGAATTTAGTTTGATATGCCCAAATCATTTTCTTAGGAAATCGGTGAGCAGGAATAAGACTCTGGTGATCACAAGACCTCTA---------TTCTCAGCTGGTCAGGGAAATTCAGC--ACACTGAAAATGGGCTTAGC--AGAGAAATAACAAAAATGGAAAGACTACAG i canFam3.chr9 I 111 I 172 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=87987.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 258824 30 + 478999 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAC s panTro4.chrUn_GL393519 98522 30 + 413329 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168163 30 + 72422247 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53744225 30 - 80904711 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAc i rheMac3.chr16 C 0 I 382 s macFas5.chr16 53573889 30 - 80997621 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAc i macFas5.chr16 C 0 I 313 s papAnu2.chr16 50394196 30 - 74645514 GATTTTTGAGaaatcaggaagaaaa---ggaat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50448760 30 - 75148670 GATTTTTGACAAATCAGGAAGAAAA---GGAAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330433 30 + 159171411 GATTTTTGAGAAATCAGGAAGAAAA---GGAAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42629122 30 - 122082543 GATTATTTAAAAATCAGAATGGAGG---GGGTC i mm10.chr11 C 0 I 3 s canFam3.chr9 41608264 32 + 61074082 gatTTGTAGTAAGTCAGGAAAAAGATTTGGGC- i canFam3.chr9 I 172 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=15389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 258854 9 + 478999 TGGGCGTTC s panTro4.chrUn_GL393519 98552 9 + 413329 TGGGTGTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168193 9 + 72422247 TGGGCATTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50394226 9 - 74645514 tgGGCATTC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50448790 9 - 75148670 TGGGCATTC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330463 9 + 159171411 TGGGCATTC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42629155 9 - 122082543 TAGATAGTT i mm10.chr11 I 3 C 0 s canFam3.chr9 41608296 9 + 61074082 TGAGCATTT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e macFas5.chr16 53573919 313 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53744255 382 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=723050.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 258863 266 + 478999 AGAACCCAGAGATCAGCCAGATTTACATACAAAGCAAGGGGGACAGGGATGAGGGCTGAAATTCC----AATTACCTAAATGACATCC-TTGTAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAG-AAAAATGATCTACTGGTAAATCACTGTTTAATC--AC-------AAGAAGAAATTTATAGAGAATAGGGGTAGCCAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAACGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC s panTro4.chrUn_GL393519 98561 266 + 413329 AGAACCCAGAGATCAGCCAGATTTACATACAAAGCAAGGGGGACAGGGATGAGGGCTGAAATTCC----AATTACCTAAATGACATCC-TTATAACTCCCTCTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAG-AAAAATGATCTACTGGTAAATCACTGTTTAATC--AC-------AAGAAGAAATTTATAGAGAATAGGGGTAGCCAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAAGGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168202 266 + 72422247 AGAACCCAGAGATCATCCAGATTTACAAACAAAGCAA-GGGGACAGGGATGAGGGCTGAAATTCC----TATTACCTAAATGACATCCTTTATAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAG-AAAAATGATCTACTGGTAAATCACTGTTTAATC--AC-------AGGAAGAACTTTATAGAGAATAGGGGTAACCAT--AAAAATATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAGCAGGGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53744637 277 - 80904711 agaaCCCAGAGATCAGTCAGATTTACATACAAAGCTAGAGGTGTAAGGATGAGGGCTGAAATTCCTATCTATTACCTAAATGACATCCTTTATAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAGAAAAAATGATCTCATGGTAAACCACTGTTTAATC--AC--ATGATAAGAAGAAATTTATAGAGAATAGGGGAAGCTAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAAAGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i rheMac3.chr16 I 382 C 0 s macFas5.chr16 53574232 277 - 80997621 aGAACCCAGAGATCAGTCAGATTTACATACAAAGCTAGAGGTGTAAGGATGAGGGCTGAAATTCCTATCTATTACCTAAATGACATCCTTTATAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAGAAAAAATGATCTAATGGTAAACCACTGTTTAATC--AC--ATGATAAGAAGAAATTTATAGAGAATAGGGGAAGCTAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAAAGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i macFas5.chr16 I 313 C 0 s papAnu2.chr16 50394235 277 - 74645514 AGAACCCAGAGATCAGTCAGATTTACATACAAAGCTAGAGGTGTAAGGATGAGGGCTGAAATTCCTATCTATTACCTAAATGACATCCTTTATAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAGAAAAAATGATCTAATGGTAAACCACTGTTTAATC--AC--ATGATAAGAAGAAATTTATAGAGAATAGGGGAAGCTAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAAAGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTGGCC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50448799 277 - 75148670 AGAACCCAGAGATCAGTCAGATTTACATACAAAGCTAGAGGTGTAAGGATGAGGGCTGAAATTCCTATGTATTACCTAAATGACATCCTTTATAACTCCCTGTAGTAAAG--------------CAGTTTGGGGTACACTCAAGAAAAAATGATCTAATGGTAAACCACTGTTTAATC--AC--ATGATAAGAAGAAATTTATAGAGAATAGTAGAAGCTAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAG-TAACAACAAAGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330472 272 + 159171411 AGAACCCAGAGATCAGCCAGATTTACATACAAAGCTAGGGGGATAGGGATGAGGGCTGAAATTCCTATCTATTAGCTAAAT-ACATCTTTTATAACTCCCTGTATTAAAG--------------CAGTTT-GGGTACACTCAAG-AAAAATGATCTAATAGTAAATCACTGTTTAATC--AC-----ATAAGAAGAAATGTATAGAGAATGGGGGTAGCCAT--AAAAAGATGCCTCAATCCTCAAGCAGTTAACAACAAAGGCCAGGATCATGGCCCATAGCTCT---CTAATTCTTGCC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42629164 265 - 122082543 AAAACCCAAAATCCAGTCAGATTTACATACAA--CTAGAG---TTAGGATTGAGGCTAACAGTTC----TATTATTTGTACAACATCCTTTCCAAATTCCT----TAAAGTTTTTGTGGTTTTTTGTTTTGTTTTACAATTATT-AAAACT---------GTAATTCACTGTTAAACCCAAC--ATTGAGAGAAGA----CAAAGAAAATACCAGTAGCTATAAAAAAAGAGCCCTCAACCTTCAAACAG-TAC---TAAAGTCC---ATCATGGTCCAGAGCCCTGCCCTCAGCCTGGCC i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41608305 259 + 61074082 AGAATCAAGCGATCAGCAAGATTTATGTACAAAGC--------CAGGGTTGGCAGCT--AATTCCCACCTACTCCCTAAATGCTAAGGCTCGTAATTCCCCAT-----AG--------------TATTTTTTGGTACACTCAAC-AAAAATGATGCGGTAGTCAATCACTATTTAACC--ACACATGCTACAAAGAGATTTAAAGAGAACAGGGGTA-------GAAGAGAGGCCCCACCCTTCAAGAAG-TGACAATAAAAGCCAGGATCGGTGACCATAGCTCT--TTTAATTTTTGTC i canFam3.chr9 C 0 I 549 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=88766.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259129 35 + 478999 TGGTCCCAGGATTACAATAATGTGATAGGTGAGAT s panTro4.chrUn_GL393519 98827 35 + 413329 TGGTCCCAGGATTACAATAATGTGATAGGTGAGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168468 35 + 72422247 TGGTCCCAGGATTACAATAATGTGATAGGTGAGAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53744914 35 - 80904711 TGATCCCAGGATTACAATAATGTTATAGGTGAGAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53574509 35 - 80997621 TGATCCCAGGATTACAATAATGTTATAGGTGAGAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50394512 35 - 74645514 TGATCCCAGGATTACAATAATGTTATAGGTGAGAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50449076 35 - 75148670 TGATCCCAGGATTACAATAATGTGATAGGTGAGAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330744 35 + 159171411 TGGTCCCCGGATTACAATAATGTGATAGATGAGAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42629429 27 - 122082543 TGGTCCCAAGATTCTAAGAACAAGACA-------- i mm10.chr11 C 0 C 0 e canFam3.chr9 41608564 549 + 61074082 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=51831.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259164 16 + 478999 CTGGCCTAATAGAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 98862 16 + 413329 CTGGCCTAATAGAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168503 16 + 72422247 CTGGCCTAATAGAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53744949 16 - 80904711 CTGGCCTAACAGAAAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53574544 16 - 80997621 CTGGCCTAACAGAAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50394547 16 - 74645514 CTGGCCTAACAGAAAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50449111 16 - 75148670 CTGGCCTAACAGAAAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93330779 16 + 159171411 CTGGCCTAATAGAAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42629456 16 - 122082543 CTGGAGTAAGGGAAAA i mm10.chr11 C 0 I 3753 s canFam3.chr9 41609113 16 + 61074082 CTGGCCTACTATAAGT i canFam3.chr9 I 549 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=130002.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259180 56 + 478999 TTCCTTCTCAAAGTCATTTAATAT---------------------AAAACTCAACAACAAATTAAAGCTACTTGAAT s panTro4.chrUn_GL393519 98878 56 + 413329 TTCCTTCTCAAAGTCATTTAATAT---------------------AAAACTCAACAACAAATTAAAGCTACTTGAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168519 56 + 72422247 TTCCTTCTCAAAGTCATTTCATAT---------------------AAAACTCAACAACAAATTAAAGCTACTTGAAC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53744965 53 - 80904711 TTCCTTCTCAAAGTCATTTAATAT---------------------AAAACT---CAACGAATTAAAGCTACTTGAAC i rheMac3.chr16 C 0 I 313 s macFas5.chr16 53574560 53 - 80997621 TTCCTTCTCAAAGTCATTTAATAT---------------------AAAACT---CAACGAATTAAAGCTACTTGAAC i macFas5.chr16 C 0 I 318 s papAnu2.chr16 50394563 53 - 74645514 TTCCTTCTCAAAGTCATTTAATAT---------------------AAAACT---CAACGAATTAAAGCTACTTGAac i papAnu2.chr16 C 0 I 316 s chlSab2.chr16 50449127 53 - 75148670 TTCCTTCTCAAAGTCATCTAATAT---------------------AAAACT---CAACGAATTAAAGCTACTTGAAC i chlSab2.chr16 C 0 I 311 s calJac3.chr5 93330795 53 + 159171411 TTCCTTCTCAAAGTCTTTTAATAT---------------------AAAACT---CAATGAATTAAACCTACTTGAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41609129 74 + 61074082 CTCTCTCAAAAAGTCATATACAATTCATTAGAAATGATCTACCAAAAAACA---GAATGAATTAAAGCTTCTTAGAT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42629472 3753 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1200834.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259236 529 + 478999 TTAACTGATTC---TTTATTTAAAAAATTACTGAGTATTTTCAGTGCTAATCATAGGTAGATCCTAATAAGATAATTC---ACAATAGTCATTTTCAAAACATTTGAACGTTTGTGAAGTAATTTTAGGCTTTAGGAAGATTTCAATGATTT----------------------------GGCGCTgttgc----------taaccaatcagtataaaatttcagttatacaaagtaagttct----------------------------------agagatctgtggt----------gcagcattctgcctacagatagcaatactgtattctacacttaaaaa-------------------------------------------------------tatgttagagggt-----agatctcat---------gctaggcgttctca--------------ccaaa-----------ataaaaTACCAgaggagaagcatttca---------------ggtggtagcagcagcaagggtgct---taaggcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtgtggctttggtgaacaagaaggaaaatggcataagatgatgttagaga----tgaggcagggcccaaatcaggtggagccttgtaggacaggataaggagtttgaattttac-tttaagtac-aggtgtaacaaatat s panTro4.chrUn_GL393519 98934 530 + 413329 TTAACTGATTC---TTTATTTAAAAACTTACTGAGTATTTTCAGTGCTAATCATAGGTAGATCCTAATAAGATAATTC---ACAATAGTCACTTTCAAAACATTTGAACGTTTGTGAAGTAATTTTAGGCTTTAGGAAGATTTCAATGATTt----------------------------ggggctgttgc----------taatcaatcagtataaaatttcagttacacaaggtaagttct----------------------------------agagatctgtggt----------gcagcattgtgcctacagatagcaatactgtattctacacttaaaaa-------------------------------------------------------tatgttagagggt-----agatctcat---------gctaggcgttctca--------------ccaaa-----------ataaaaTACCAgaggagaagcatttca---------------ggtggtggcagcagcaagggtgct---taaggcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtgtggctttggtgaacaagaaggaaaatggcataagatgatgttagaga----tgaggcagggcccaaatcaggtggagccttgtaggacaggataaggagtttgaattttacttttaagtac-aggtgtaacaaatat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7168575 529 + 72422247 TTAACTGATTC---TTTATTTAAAAAATTACTGAGTATTTTCAGTGCTAATCATAGGTAGATCCTAATAAGATAATTC---ACAATAGTCATTTTCAAAACATTTGAATGTTTGTGAAGTAATTTTAGGCTTTAAGAAGATTTCAATGATTt----------------------------ggggctgttgc----------taatcaatgagtataaaatttcagttatacaagataagttct----------------------------------agaaatctgtggt----------gcagcactgtgcctatagatagcaatactctattctacacttaaaaa-------------------------------------------------------tatgttagagggt-----agatctcat---------gctaggcgttctca--------------tcaaa-----------ataaaaTACCAgaggagaagcatttca---------------ggtggtggcagcagcaagggtgct---taaagcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtgtggctttggtgaacaagaaggaaaatggcatgagatgatgttagaga----tgagggagggcccaaatcaggtggagccttgtaggacaggataaggagtttgaattttac-tttaagtAC-AGGTATAACAAATAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53745331 534 - 80904711 TTAACTGATTC---TTAATTTAAAAAATTACTGAGTATTTTCATGGCTAATTATAAATAGGTGCTAATAAGATAATTC---AGAACATCCATTTTCAAAACATTTGAACATCTGTGAACTAATTTTAGGCTTCAAGAAGGTTTCAATAATTt----------------------------ggggctgttgc----------taatcaatgagtgtaaaatttcagttatacaaggtaagttct----------------------------------agagatctgctgt----------gcagcattgtgcctacagacagcaatactgtattatacacttaaaaa-------------------------------------------------------tctgttagagcgt-----agatctcat---------gctacgtgttctca--------------ccaaa-----------ataaaaTACCAgagaagaagcatttca---------------ggtggtggcagaagcaagggtgct--ctaaggcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtgtggctttggtgaacaagaaagaaaatagcataagatgatgttagagatctctgaggcagggcccagatcaggtagagccttgtaggacaggataaggagttttaattctac-tttaagtAC-AGGTATAAAAAATTT i rheMac3.chr16 I 313 I 19 s macFas5.chr16 53574931 534 - 80997621 TTAACTGATTC---TTAATTTAAAAAATTACTGAGTATTTTCATGGCTAATTATAAATAGGTGCTAATAAGATAATTC---AGAACATCCATTTTCAAAACATTTGAACATCTGTGAACTAATTTTAGGCTTCAAGAAGGTTTCAATAATTt----------------------------ggggctgttgc----------taatcaatgagtgtaaaatttcagttatacaaggtaagttct----------------------------------agagatctgctgt----------gcagcattgtgcctacagacagcaatactgtattatacacttaaaaa-------------------------------------------------------tctgttagagggt-----agatctcat---------gctacgtgttctca--------------ccaaa-----------ataaaaTACCAgagaagaagcatttca---------------ggtggtggcagaagcaagggtgct--ctaaggcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtgtggctttggtgaacaagaaagaaaatagcataagatgatgttagagatctctgaggcagggcccagatcaggtagagccttgtaggacaggataaggagttttaattctac-tttaagtAC-AGGTATAAAAAATTT i macFas5.chr16 I 318 C 0 s papAnu2.chr16 50394932 534 - 74645514 ttaactgattc---ttaatttaaaaaattactgagtaTTTTCAGTGCTAATTATAAATAGGTGCTAATAAGATAATTC---AGAACAtccattttcaaaacattttaacatCTGTGAACTAATTTTAGGCTTCAAGAAGGTTTCAATAATTT----------------------------GGGGCTGTTGC----------TAATCAATGAGTGTAAAATTTCAGTTATACAAggtaagttct----------------------------------agagatctgctgt----------gcAGCATTGTGCCTACAGACAGCAATACtgtattatacacttaaaaa-------------------------------------------------------tctgttagagggt-----agatctcat---------gctACGTGTTCTCA--------------CCAAA-----------ATAAAATACCAGAGAAGAAGCATTTCA---------------GGTGGTGGCAGAAGCAAGGGTGCT--CTAAGGCAGAAACAAGTCTAAC---AAGAAGGAA--CAGAAAGG----------------TAGC-TGGTGTGGCTTTggtgaacaagaaagaaaatagcataaGATGATGTTAGAGATCTCTGAGGCAGGGCCCAGATCAGGTAGAGCCTTGTAGGACAGGATAAGGAGTTTTAATTCTAC-TTTAAGTAC-AGGtataaaaaattt i papAnu2.chr16 I 316 C 0 s chlSab2.chr16 50449491 534 - 75148670 TTAACTGATTC---TTAATTTTAAAAATTACTGAGTATTTTCAGTGCTAATTATAAATAGGTGCTAATAAGATAATTC---AGAACATCCATTTTCAAAACATTTGAACATCTGTGAACTAATTTTAGGCTTCAAGAAGGTTTCAATAATTt----------------------------ggggctgttgc----------taatcaatgagtgtaaaatttcagttatacaaggtaagttct----------------------------------agagatctgctgt----------gcagcattgtgcctacagacagcaatactgtattatacacttaaaaa-------------------------------------------------------cctgttagagggt-----agatatcat---------gctacgtgttctca--------------ccaaa-----------ataaaaTACCAgagaagcagcatttca---------------ggtggtggcagaagcaagggtgct--ctaaggcagaaacaagtctaac---aaggaggga--cagaaagg----------------tagc-tggtatggctttggtgaacaagaaagaaaatagcataagatgatgttacagatctctgaggcagggcccagatcaggtagagccttgtaggacaggataaggagttttaattctac-tttaagtAC-AGGTATAAAAAATTT i chlSab2.chr16 I 311 I 19 s calJac3.chr5 93330848 479 + 159171411 TTAACAA--------TTATTAAGAAAATTACTGAGTATTTTGAGTGCTAATTATAGGCAGGTGGTAACAAGAAAATTC---AGAATTTCCATTTTCAAAACATTTGAACATCTGTGAACTAATTTTAGGCTTCAAGAAGATTTCAATAATTT----------------------------GGAGCTgttac----------taatcaatgagtataaaatttcagttatacaaagtaagttct----------------------------------agagatgtgcagt----------gcagctttgtacctac--------------------------------------------------------------------------------------------------------agATCTCAT---------ACTAAGTGTTCTCA--------------CCAAA-----------ATCAAATACCAgaggagacacatttca---------------ggtggtaacaacagcaagggttat--ctagggcagaaacaagtctaacacaaagaaggga--cagaatgg----------------tagc-tggtatggctttggtgaacaagaaggaaaatggcctaagatgatgatagaga----tgtggcagggcccagatcaggtagagacttgtaagacagaataaggagtttgaat------tttaAGTAC-AGATATAACAAATAT i calJac3.chr5 C 0 I 3 s canFam3.chr9 41609203 721 + 61074082 TTAACTGATTCCTTTTTATTAAGAGAATTACTGATAATTTTTAGTGCTAATTACAGGTATGTGGTAAAAAGGTAATTCAGAAGAATATCCATTTTCAAAAAACATGAAGATTTCTG---TAATGTGAGGTTACAAGAGAGTTTCAATAGATTCCTTGTCCTAACTCCTTAGAGTTCCAACAGGGATTCCACCtttgtgcattaaacaattatt-tacagtgtccttgttatgtgccaggttctacttcaagcactacagcagtgaacaagacagacaaggtctctgctttcacagggctcacattatggtgca-acaataaacaagataatattacatagtgaataagtgctaagaagaaaactaaacaagataacgtgatagaatgactataagtgtggttcttgctggatggccaagaagacctcattaaaacagagacacctgtactgaaacttgagtaatggccaagaagttggccacataagagatgagggaagaagcattccaggcagctgtggtggtggtggcagcaacagcaagggtgctctctaaggtgg----aagtcctat---gtgaaaagattcagaaggaatctgagtttcaccatcagcatggtttaagtttggtgaacaagaaggagagtggcatgagacaatgccaacaa----tgaagcagagcc---------------cttgtaagccagagtaaggaatttgaattttac-tttaagtATAAGGAATAAGAT---- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42629472 3753 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=19709.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259765 27 + 478999 cctacagc-tttaagcagaAACAAATCT s panTro4.chrUn_GL393519 99464 27 + 413329 cctacagc-tttaagcagaAACAAATCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169104 27 + 72422247 CCTACAGC-TTTAAGCAGAAACAAATCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575465 19 - 80997621 -----TAC-TTTAAGTACAGGTATA--- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395466 19 - 74645514 -----tac-tttaagtacaAGTGTA--- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331330 27 + 159171411 CCCACAGC-TTTAAGAAGAAACAAATTT i calJac3.chr5 I 3 C 0 s canFam3.chr9 41609924 28 + 61074082 CGTACAACTTTTAAGCAGAAACAAATCT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42629472 3753 - 122082543 I e chlSab2.chr16 50450025 19 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53745865 19 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=176992.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259792 70 + 478999 ----ACAATGACAGATTACCTTATTAGTTATACTTTACTATAAGTGAAACCATTTTTGGTACACTAAAAAGGAA s panTro4.chrUn_GL393519 99491 70 + 413329 ----ACAATGACAGATTACCTTATTAGTTATACTTTACTATAAGTGAAACCATTTTTGGTACACTAAAAAGGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169131 70 + 72422247 ----ACAATGACAGATTACCTTATTAGTTATAATTTACTATAAGTAAAACCATTTTTGGTACACTAAAAAGGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53745884 70 - 80904711 ----ACGACGACAGATTACCTTATTAGTCATAATTTACTACAACTGAAATCAGTTTTGGTACAATAAAAAGCAA i rheMac3.chr16 I 19 C 0 s macFas5.chr16 53575484 70 - 80997621 ----ACGACGACAGATTACCTTATTAGTCATAATTTACTACAACTGAAATCAGTTTTGGTACAATAAAAAGCAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395485 70 - 74645514 ----ACGACGACAGATTACCTTATTAGTCATAATTTACTACAACTGAAATCAGTTTTGGtacaataaaaagcaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450044 70 - 75148670 ----ACGACGACAGATTACCTTATCAGTCATAATTTACTACAACTGAAATCAGTTTTGGTACAATAAAAAGCAA i chlSab2.chr16 I 19 C 0 s calJac3.chr5 93331357 70 + 159171411 ----ACAATGACAGATTATCTTATTAGTTATAATTTACTATAACTGAAATGGTTTTTGGTACACTAAAAAGCAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41609952 73 + 61074082 ACAGGCAATGACAAATTACCTCATTAGTTATAATTTAC-AAGGCTTAAATGACTTTTGGTATAATATAAACTGA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42629472 3753 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=196076.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259862 75 + 478999 ATAGCCTTT-----------------TAACACTGGAAAGGAACCACCACCCTTCTCAACGTTTTCACATG-TATT---AGGAATGATGTGATTTGA s panTro4.chrUn_GL393519 99561 75 + 413329 ATAGCCTTT-----------------TAACACTGGAAAGGAACCACCACCCTTCTCAACGTTTTCACATG-TATT---AGGAACGATGTGATTTGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169201 75 + 72422247 ATACCCTTT-----------------TAATACTGGAAAGGAACAACCACGCTTCTCAATGTTTTCACATT-TATT---AGGAATGATGTGATTTTA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53745954 75 - 80904711 ATAGCCTTT-----------------TAACACTGGAAAGCAACAACAACCCTTCTCAACGTTTTAGCATG-TATT---AAGAATGATGTGATTTTA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575554 75 - 80997621 ATAGCCTTT-----------------TAACACTGGAAAGCAACAACAACCCTTCTCAACGTTTTAGCATG-TATT---AAGAATGATGTGATTTTA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395555 75 - 74645514 atagcCTTT-----------------TAACACTGGAAAGGAACAACAACCCTTCTCAACGTTTTAGCATG-TATT---AAGAATGATGTGATTTTa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450114 75 - 75148670 ATAGCCTTT-----------------TAACACTGGAAAGGAACAACAACCCTTCTCAACGTTTTAGCATG-TATT---AAGAATGATGTGATTTTA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331427 89 + 159171411 ACATCCTTTGCTGGAAGGACATATACTTTTGCTGGAAAGGAAAA---ACCCTTCTCAATGTTTTAGCATG-TATT---AAGAATGATGTGATTTTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42633225 76 - 122082543 ATGGCTTTT-----------------TTA-AATGAAAATGAACAA-AAGCTTCCTCAAAGTTTTCAAATG-TATTACCAAGAATGTTGTAGTTTGA i mm10.chr11 I 3753 I 273 s canFam3.chr9 41610025 72 + 61074082 ATAGCATTT-----------------TAACATGGAAAAGGA----CAACCCTTCTCAAATTTTTAGCATGTTATT---AAAAATAGTATGGTTTTA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=189848.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 259937 81 + 478999 GGAAAATTTTTCATTAAATTAAGAGAGAGACCTAATAGCCATATGATGTTTTCAGTGTTTAAAACAAACAATATCATAATA- s panTro4.chrUn_GL393519 99636 81 + 413329 GGAAAATTTTTCATTAAATTAAGAGAGAAACCTAATAGCCATATGATGTTTTCAGTGTTTAAAACAAACAATATCATAATA- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169276 75 + 72422247 GGAAAATTTTTCATTAAATTAAGAGAGAGACCTAATAGCCATA------TTCCAGTGTTTAAAATAAACAATATCATAATA- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746029 78 - 80904711 GGAAAATTTTTCATTAAATGAAGAGAGAGACCTAATAGCCATATGATGTTTTTAGTGTTTAAAACA---AATATCATAATA- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575629 78 - 80997621 GGAAAATTTTTCATTAAATTAAGAGAGAGACCTAATAGCCATATGATGTTTTTAGTGTTTAAAACA---AATATCATAATA- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395630 78 - 74645514 ggaaaatttttcattaaattaagAGAGAGACCTAATAGCCATATGATGTTTTCAGTGTTTAAAACA---AATATCATAATa- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450189 78 - 75148670 GGAAAATTTTTCATTAAATTAAGAGAGAGACCTAATAGCCATATGATGTTTTCAGTGTTTAAAACA---AATATCATAATA- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331516 77 + 159171411 GGAAAATTTTTTATTAAATTAAGAG----ACCTAATAGCCATATGATGTTTTTGGTGTTTAAAACAAACAATATCATAATA- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41610097 66 + 61074082 AGACAATTTTTTATT---------GAGAAGCCAAACAGTCA----GTATCTTCAATGTTTAAAACA---AGCATCATAATTT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42633301 273 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=402309.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260018 189 + 478999 TCAAATGCAAAT--ACAGTGCTTACATTTTT--AAAAGTTGTGTAAGATATTATGGGGAA---AAGAACAGCAAACTGGAGGTAGTAAACAGGCACAAATCGTGGATTCCAATTCCAGCGTTG-------------CAACAACTGACTGAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACTTAAT-----------------------TACCTTC--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACAGCGGAGTAGATCAGTGA s panTro4.chrUn_GL393519 99717 189 + 413329 TCAAATGCAAAT--ACAGTGCTTACATTTTT--AAAAATTGTGTAAGATATTATGGGGAA---AAGAACAGCAAACTGGAGGTAGTAAACAGGCACAAACTGTGGATTCCAATTCCAGCGTTG-------------CAACAACTGACTGAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACTTAAT-----------------------TACCTTC--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACAGCGGAGTAGATCAGTGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169351 189 + 72422247 TCAAATGCAAAT--ACAGTGCTTAAATTTTT--AAAAATTGTGTAAGATATTATGGGGAA---AAGAACAGCAAACTGGAGGTAGTAAACAGGCACAAATCGTGGATTCCAATTCCAGCACTG-------------CAACAACTGACTAAAAGTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTAAT-----------------------TACCTTC--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACACTGGAGTAGATCAGTGA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746107 192 - 80904711 TCAAATGCAAATAAAAAGTACTTACATTTTT-AAAAAATTGTATAAGACATTCTGGGGAA---AAGAATAGCAAACTGGAGGTAGTACACAGGCACAAATTGTGGATTCCAGCTCCAGTGTTG-------------CAACAACTAACTAAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTAAT-----------------------TACCTTA--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACACCAGAGTAGATCAGCGA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575707 192 - 80997621 TCAAATGCAAATAAAAAGTACTTACATTTTT-AAAAAATTGTATAAGACATTCTGGGGAA---AAGAACAGCAAACTGGAGGTAGTACACAGGCACAAATTGTGGATTCCAGCTCCAGTGTTG-------------CAACAACTAACTAAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTAAT-----------------------TACCTTA--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACTCCAGAGTAGATCAGCGA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395708 192 - 74645514 tcaaatgcaaataaaaagtacttacatttta-aaaaaattgtgtaagACATTCTGGGGAA---AAGAATAGCAAACTGGAGGTAGTACACAGGCACAAATTGTGGATTCCAGCTCCAGTGTTG-------------CAACTACTAACTAAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTAAT-----------------------Tacctta--tcaa------------------------------------atatatgaa-----------------------gACACCAGAGTAGATCAGCGA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450267 192 - 75148670 TCAAATGCAAATAAAAAGTACTTACATTTTT-TAAAAATTGTGTAAGACATTCTGGGGAA---AAGAATAGCAAACTGGAGGTAGTACACAGGCACAGATTGTGGATTCCGGCTCCAGTGTTG-------------CAACAACTAACTAAAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTATT-----------------------TACCTTA--TCAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACACCAGAGTAGATCAGCGA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331593 188 + 159171411 TCGAATGAAAAT--ACAGTGCTTACATTTTT-AAAAAGCTGTATAACACATTACGGGAAA---AAGTACAGCAAACTGGAGGCAGTAAACAGGCACAAATCGTGGATTCCAATTCCAGCGTTG-------------CAACAACTG----AAATTA------------------------------------------------------------GGTT-------------------------TAACCTAAC-----------------------CACCTTATTTTAA------------------------------------ATATATGAA-----------------------GACACCAGAGTAGATCAGTGA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42633574 166 - 122082543 TCAAATGCAAAT-----------------TT-CAAATGTAATGTAATACTTCAAGTAAAAATTAAGGTGTGTAAGGCAGAGATAGTTATTGAGCACAAATCGCAGATTATAGATTTAGTACTAT------------TAACAACTAAT---AGTTA------------------------------------------------------------GG-T-------------------------TAACT--AT-----------------------TACTTTA--T-AT------------------------------------ATACGTAAA-----------------------GATAAGAGA------CAACGC i mm10.chr11 I 273 C 0 s canFam3.chr9 41610163 356 + 61074082 TCAAATGCAAA---AATATGCCTACATTTTTTTAAAAATCATGCAATTCATTAT--AGAA---AAGAGTTGTGACCTGGACA-----------CACAAGCCTTTAATTCTAGCTCTAGCATTATGACAACTACATACAACAATTAACCCTAATTATCTCATTTAGTACATGAAAAGTACACACCATGTCAGGGGTTTTAATTTTCTTTTGATCAGGGTttatatatatataatattataatatataacttattaatataggttatatattttattatatctta--ttaATATAGGTtatatatttttattatatatttatatattatatatagatagatacatatatCTGGGGGGgggacaactgggt-gctcagtgg i canFam3.chr9 C 0 I 128 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=242319.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260207 97 + 478999 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAATGGA-ATTTTTCAGTGGGAT---------------------------------GAAATGATAT----------------AGGA-CACTATTCAGGTCTAGCAGTGCCAACCACTTCCCTACAGCTGAAA s panTro4.chrUn_GL393519 99906 97 + 413329 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAATGGA-ATTTTTCAGTGGGAT---------------------------------GAAATGATAT----------------AGGA-CACTAGTCAGGTCTAGCAGTGCCAACCACTTCCCTACAGCTGAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169540 96 + 72422247 T-TTCTA--------------------ATCAGTGTTTAAACGGA-ATTTTTCAGTGGGAT---------------------------------GAAATGATAC----------------AGAA-CACTAGTCAGGTCTAG-GGTGCCAACCACTTCCCTACAGCTGAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746299 97 - 80904711 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAACGGA-ACTTTTTAGTAGGAT---------------------------------GGAAAGATAT----------------AGAA-CACCAGTCAGGTCTAGTGGTGCCAACCATTTCCCTACAGCTGAAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575899 97 - 80997621 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAACGGA-ACTTTTTAGTAGGAT---------------------------------GGAAAGATAC----------------AGAA-CACCAGTCAGGTCTAGTGGTGCCAACCATTTCCCTACAGCTGAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395900 97 - 74645514 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAACGGA-ACTTTTTAGTAGGAT---------------------------------GGAAAGATAT----------------AGAA-CACCAGTCAGGTCTAGTGGTGCCAACCATTTCCCTACACCTGAAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450459 97 - 75148670 T-TTTTA--------------------ATCAGTGTTTAAACGGA-ACTTTTTAGTAGGAT---------------------------------GGAAAGATAT----------------AGAA-CACCAGTCAGGTCTAGTGGTGCCAACCATTTCCCTACAGCTGAAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331781 97 + 159171411 T-TCTTA--------------------ATCAGTGTTCAAACAGA-A-TTTTCAGTGGGAT---------------------------------AAAATGATAT----------------AGACTCACTAGTCAGGTCTAGGAGTGCCAACCACTTCCCTACAGCTGAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42633740 106 - 122082543 TGTTTTA---------CATTTCTTCCCATTGGTGATTCCATGAACGTTTGTCACTGGGTT---------------------------------GGAAAG--------------------AAAG-AACTAGTCAGGGGTAGGAGTACCAACCACTTCTCAATAGTTAGAA i mm10.chr11 C 0 I 243 s canFam3.chr9 41610647 160 + 61074082 t-ttttaaaaGATATATATATGGAGGGATCAGTGTTTAAATGGA-ATTTTTCAGTGGGACAGGGAAGGAATCTGAGTTTCACCATCAGTATGAGGAATAAGATCCTCATACTTCAGGTAAGAA-CACTACTCTGA------GGTTCCAACTACTTTCCCAAAGCTGAAA i canFam3.chr9 I 128 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=52562.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260304 23 + 478999 AGTCACCTAACTAAACA---TCTAAG s panTro4.chrUn_GL393519 100003 23 + 413329 AGTCACCTAACTAAACA---TCTAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169636 23 + 72422247 AGTCACCTAACTAAACA---TCTAAG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746396 26 - 80904711 AATCACCTAACTAAACATCTTCTAAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53575996 26 - 80997621 AATCACCTAACTAAACATCTTCTAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50395997 26 - 74645514 AATCACCTAACTAAACATCTTCTAAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50450556 26 - 75148670 AATCACCTCACTAAACATCTTCTAAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93331878 23 + 159171411 AGTCACCTAACTAAACA---TCTAAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41610807 21 + 61074082 -ACCACTCAAAT-AATA---TCTGAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42633846 243 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=16579.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260327 5 + 478999 ATTTC s panTro4.chrUn_GL393519 100026 5 + 413329 ATTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169659 5 + 72422247 ATTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746422 5 - 80904711 ATTTC i rheMac3.chr16 C 0 I 315 s macFas5.chr16 53576022 5 - 80997621 ATTTC i macFas5.chr16 C 0 I 326 s papAnu2.chr16 50396023 5 - 74645514 ATTTc i papAnu2.chr16 C 0 I 311 s chlSab2.chr16 50450582 5 - 75148670 ATTTC i chlSab2.chr16 C 0 I 338 s calJac3.chr5 93331901 5 + 159171411 ACTTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42634089 5 - 122082543 ATTTT i mm10.chr11 I 243 C 0 s canFam3.chr9 41610828 5 + 61074082 GTTTC i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1289181.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260332 383 + 478999 TTCTGGCTCTAAAATTTTATCAattcattcaacaaacatttattgaacaaatatgttctgaaggatttgctatgtg---ccaggcacttttctTCCCCACTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACACTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGCTCTCCTTGATCACCCATCACTGTGACCAGTTCCACCAATTGCTCAAACCCATCAGCCAATACCGTTTCTG-AAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAGGGATTTTCATCAGAACTTCCATAAATGTAGC---TGTCTGGAGATCCTTGTAGTACCCTAAACCTGATGTGGACAAATGGATGCAAATTTACTAACATGGCCTTACTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA s panTro4.chrUn_GL393519 100031 383 + 413329 TTCTGGCTCTAAAATTTTATCAattcattcaacaaacatttattgaacaaatatgttctgaaggatttgctatgtg---ccaggcacttttctTCCCCACTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACACTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGCTCTCCTTGATCACCCATCACTGTGACCAGTTCCACCAATTGCTCAAACCCATCAGCCAATACCGTTTCTG-AAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAGGGATTTTCATCAGAACTTCCATAAATGTAGC---TGTCTGGAGATCCTTGTAGTACCCTAAACCTGATGTGGACAAATGGATGCAAATTTACTAACATGGCCTTGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7169664 389 + 72422247 TTCTGGCTCTAAAATTTTATTAACTAATTCAACAAAcatttattgaaccaacatgttctgaaggatttgctatgtg---ccaggcacttttctTCCCCACTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACACTGGCCAGATGTGCCATCGCTGTAGGGAGCTCTCCTTGATCACCCATCACTGTGATCAGTTCCACCAATCGCTCAAACCCATCAGCCAATACCGTTTCTG-AAGTATGTCAAATTCTGTGCCTTGTGGAGGGATTTTCGTCAGAACTTCCATAAATGCAGCTCTTGTCTGGAGATCCTTGTAGTACCCTAAACCTGATGTGGACAAATAGATGCAAATTTACTAACATGGCCTGGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53746742 387 - 80904711 TTCTGGCCCTAAAGTTTTACCcattcattcaacaaacacttactgaacaaatatagtctgaaggatttgctatatg---ccaggcactTTTCTTTCCCGCTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACATTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGTTCTCCTTGATCACCCATCATTGTGACCAGTTCCACCAATCTCTCAAACCGATCAGCCAATACCGTTTCTGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAATGTAGCTCTTGTCTGGAGATCTTTGTGGTAACCTAAGCCTAATGTGGACAAACAGATGCCAATTTACTAACATGGCCTTGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i rheMac3.chr16 I 315 C 0 s macFas5.chr16 53576353 387 - 80997621 TTCTGGCCCTAAAGTTTTACCcattcattcaacaaacacttactgaacaaatatagtctgaaggatttgctatatg---ccaggcactTTTCTTTCCCGCTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACATTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGTTCTCCTTGATCACCCATCATTGTGACCAGTTCCACCAATCTCTCAAACCGATCAGCCAATACCGTTTCTGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAATGTAGCTCTTGTCTGGAGATCTTTGTGGTAACCTAAGCCTAATGTGGACAAACAGATGCCAATTTACTAACATGGCCTTGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i macFas5.chr16 I 326 C 0 s papAnu2.chr16 50396339 387 - 74645514 ttctgGCCCTAAAGTTTtacccattcattcaacaaacacttactgAACAAATATAGTCTGAAGGATttgctgtatg---ccaggcacttttcttTCCCGCTTACTCTACGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACATTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGTTCTCCTTGATCACCCATCATTGTGACCAGTTCCACCAATCTCTCAAACCGATCAGCCAATACCGTTTCTGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAATGTAGCTCTTGTCTGGAGATCTTTGTGGTAACCTAAGCCTAATGTGGACAAACAGATGCCAATTTACTAACATGGCCTTGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i papAnu2.chr16 I 311 C 0 s chlSab2.chr16 50450925 387 - 75148670 TTCTGGCCCTAAAGTTTTACCcattcattcaacaaacacttactgaacaaatatagtctgaaggatttgctatatg---ccaggcactTTTCTTTCCCGCTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACATTGGCCAGA---GCCATCGCTATAGGGAGTTCTCCTTGATCACCCATCATTGTGACCAGTTCCACCAATCTCTCAAACCGATCAGCCAATACCGTTTCTGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAATGTAGCTCTTGTCTGGAGATCTTTGTGGTAACCTAAGCCTAATGTGGACAAACAGATGCAAATTTACTAACATGGCCTTGCTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i chlSab2.chr16 I 338 C 0 s calJac3.chr5 93331906 387 + 159171411 TTCTGGCTCTAAAATTTTATCAattcattcaacaaacatttattgaacaaatatattctgaaggatttgctatgta---ctaggcatttttcCTCCCCACTTACTCTATGCACTTACCCACTGAGAACAAGGAACCACATTGGCCAGA---GCCATAGCTATAGGGAGCTCTCCTTGATCACCCATCATTGTGACCAGTTCCACCAATCTCTCAAACCGATCAGCTAATACTGTTTCTGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAACGTAGCTCTTGTCTGAAGATCCTTGTGGTAACCTAAACCTGGTGTGGACAAACAGATGCAAA-TTACTAACATGGCCTTGCTGGAGTAATTTTT-----------------------------------------------------------TGCTTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42634094 445 - 122082543 TTCCAGTTCTTAAATTTTGTCAATTCACTTAATAAACACTT-CTGAGGATACTTATTTTGAAGCACTAGCTGTATG---TCAAGCATTCTATTACCCTACTTTCTCAATAAACTTACCCACTGAGAACAAGGGACCACATTGGCAAGA---GCCATAGCTATAGGGAGTTCTCCCTGGTCTCCCATCATTGTGACCAGTTCCACAAGTCTCTCAAATCGATCTGCCAACACCGTTTCCGCAAGTGTATCGAATTCTGTTCCTTGTTGAAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAACGTAGCTCTTGTCTGAAGATCCTTGTGATAACCTAAGCCTGATGAGGATAGACAGATGCAAATTTACCACCACAGCCTGGCTGAAGCAA-TTTTCATTTTGCATGTTATGTCAACTCTAGatttttatgttttatgtctatgagtgttttgcatgccta i mm10.chr11 C 0 I 103 s canFam3.chr9 41610833 385 + 61074082 TTCTGGCTCTAAAGTTTTAGCAATTCACGCAATAAACATTCCTGGAATGAATAAATTTGGAAGGACCTACTATATGTGCCCAGTC---CTGGTTCCACACTTCCTCAATGAACTTACCCACTGGGAACACGGGACCACGTTGGCCAGA---GCCATGGCTATTGGGAGCTCTCCCTGGTCTCCCATCATCGTCACCAACTCCACCAGCCTCTCAAACCGGTCGGCCAGCACTGTTTCCGCAAGTGTGTCAAATTCTGTGCCTTGTTGGAGGATTTTTGTCAGAACTTCCATAAATGTAGCTCTTGTCTGAAGATCTTTGTGATAACCTAAACCTGATATAGACAGATAAATGTATATTTACTAACATGG-CTTGTTGAAGTAA-TTTT-----------------------------------------------------------GAAAA- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=80680.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260715 35 + 478999 TCTTACAAGCCAGTTCTCTAGGCTGTGTATTTCTA s panTro4.chrUn_GL393519 100414 35 + 413329 TCTTACAAGCCAGTTCTCTAGGCTGTGTATTTCTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7170053 35 + 72422247 TCTTACAAGCCAGTTCTCTGGGCTGTGTATTTCTA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53747129 35 - 80904711 TCTTAAATGCCAGTTCTCTAGGTTTTGTATTTCTA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53576740 35 - 80997621 TCTTAAATGCCAGTTCTCTAGGTTTTGTATTTCTA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50396726 29 - 74645514 TCTTACATGCCA------TAGGTTTTGTATTTCTA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50451312 35 - 75148670 TCTTACATGCCAGTTCTCTAGGTTTTGTATTTCTA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93332293 35 + 159171411 TCTTACATGCCAGTTTTCTAGGTTTTGTATTACTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42634642 35 - 122082543 ccttcccacccAGCTCTCTAGGTTTTATATTTCTG i mm10.chr11 I 103 I 177 s canFam3.chr9 41611218 35 + 61074082 CCTAGAGAATTGGCATGTGAGACCAGCAATTTCTA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=2003223.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 260750 633 + 478999 TATGAAACTTTCATTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACCGTCTATGCTGGCACTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGCACAGTGCCTCCGTGATGCCAACCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCACTTTCATCTTCAGCTTCACTGCAGTCACTCAAAAGGTTCATAAATAGTGTGAAGTATCTGAGAAAT-AAAAAGACTGACCTTTACATAGCAAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACTATCACATGTGCACGGTGTGACTGGCCCTGGATTAACTGCTTCTCTCCTCTCTCAGGATAATCAGCCAGGGTGACTCATTATGAAGCATGCTGTGTTGG--GCATGATTATA-CCTGATATAGCCTAGCATACCTTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGCAATGTTTCCTGG-TAAATGTGTCATTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTACACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAGTGAAGCAATCTGGGTTTTATTATAAGCAAAATTTCAGGGATCATATTATTTTCTTT--AAAAATCATAAAACACAG-TTATTTTCCTAATCCTAGTCCTG-CAT s panTro4.chrUn_GL393519 100449 633 + 413329 TATGAAACTTTCATTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACCGTCTATGCTGGCACTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGCACAGTGCCTCCGTGATGCCAACCTCTGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCACTTTCATCTTCAGCTTCACTGCAGTCACTCAAAAGGTTCATAAATAGTGTGAAGTATCTGAGAAAT-AAAAAGACTGACCTTTACATAGCAAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAATCAGACATTCCAAAACAATCACATGTGCACGGTGTGACTGGCCCTGGATTAACTGCTTCTCTCCTCTCTCGGGATAATCAGCCAGGGTGACTCATTATGAAGCATGCTGTGTTGG--GCATGATTATA-CCTGATATAGCCTAGCATACCTTTCATAACATAAGCATCAGATAGATGCAATGTTTCCTGG-TAAATGTGTCATTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTACACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAGTGAAGCAATCTGGGTTTTATTATAAGCAAAATTTCAGGGATCATATTATTTTCTTT--AAAAATCATAAAACACAG-TTATTTTCCTAATCCTAGTTCTG-CAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7170088 633 + 72422247 TATGAAACTTTCATTTAACCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACCGTCTACGCTGGCACTGAGTAAGTTTGACATTGCAAAGACCGCACAGTGCCTCCGTGATGCCAGCCTCTGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCACTTTCATCTTGAGCTTCACTTCAGGCATTCAAAAGGTTCATAAATAGTGTGAAGTATCTGAGAAAT-AAAAAGACTGACCTTTACATAGTGAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCACATGTGCATGGTGTGACTGGCCCTGGATTAACTGCTTCTCTCCTCTCTCACGATAATCAGCCAGGGTGACTCATTATGAAGCACGCTGTGTTGG--GCATGATTATA-CCTGATATAGCCTAGCATACCTTTCATAACATAAGCATCAAATAAATGCAATGTTTCCTGG-TAAATGTGTCATTTTTAATGTTAAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTACACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAGTGAAGCAATCTGGGTTTTATTATAAGCAAAATTTCAGGGATCATATTATTTTCTTT--AAAAATCATAAAACACAG-TTATGTTCCTACTCCTAGTCCTG-AAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53747164 637 - 80904711 AATGAAACTTTCTTTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACTGTCTACGTTGGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGTACAGTGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTGCAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGTATCTGAGAAATAAAAAAAACCGACCTTTACGTAGGGAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCATATGTGCATGGTGTGACTGGCCCTGGGTTAACTGTTTCTCTCCTCTCTCAGGATAATCAGCCAGGGTGGCTCATTATGAAGTGTGCTATGTTGG--ACATGATTTTA-GCTGATATAGCCTAGTATACCCTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGTAATGTAACCTGGTTAAATGTGTCACTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTAGACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAATGAAGCAATTTGGGTTTTATTATAAGTAAAATTTCACTGATCATATTATTTTCTTTAAAAAAATCACAAAACACAG-TTATTTTCCTA-TCCTAGTCCTGTCAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53576775 638 - 80997621 AATGAAACTTTCTTTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACTGTCTACGTTGGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGTACAGTGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTGCAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGTATCTGAGAAATAAAAAAAACCGACCTTTACGTAGGGAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCATATGTGCATGGTGTGACTGGCCCTGGGTTAACTGTTTCTCTCCTCTCTCAGGATAATCAGCCAGGGTGGCTCATTATGAAGTGTGCTATGTTGG--ACATGATTTTA-GCTGATATAGCCTAGTATACCCTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGTAATGTAACCTGGTTAAATGTGTCACTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTAGACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAATGAAGCAATTTGGGTTTTATTATAAGTAAAATTTCACTGATCATATTATTTTCTTTAAAAAAATCACAAAACACAGTTTTTTTTCCTA-TCCTAGTCCTGTCAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50396755 636 - 74645514 AATGAAACTTTCTTTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACTGTCTACGTTGGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGTACAGTGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTGCAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGtatctgagaaat-aaaaaaaccGACCTTTACGTAGGGAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCATATGTGCATGGTGTGACTGGCCCTGGGTTAActgtttctctcctctctcaggaTAATCAGCCAGGGTGGCTCATTATGAAGTGTGCTATGTTGG--ACATGATTTTA-GCTGATATAGCCTAGTATACCCTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGCAATGTAACCTGGTTAAATGTGTCACTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTAGACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAATGAAGCAATTTGGGTTTTATTATAAGTAAAATTTCACtgatcatattattttctttaaaaaaatcacaaaacacag-TTATTTTCCTA-TCCTAGTCCTGTCAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50451347 636 - 75148670 AATGAAACTTTCTTTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACTGTCTACGTTGGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGTACAGTGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTGCAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGTATCTGAGAAAT-AAAAAAACCGACCTTTACATAGGGAAGGCCGTATCAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCATATGTGCATGGTGTGACTGGCCCTGGGTTAACTGTTTCTCTCCTCTCTCAGGATAATCAGCCAGGGTGGCTCATTATGAAGTGTGCTATGTTGG--ACATGATTTTA-GCTGATATAGCCTAGTATACCCTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGCAATGTTACCTGGTTAAATGTGTCACTTTTAATGTTTAGTATATAAAATTAGTGGTCCAAACAGCTTAGACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATGACTTAATGAAGCAATTTGGGTTTTATTATAAGTAAAATTTCACTGATCATATTATTTTCTTTAAAAAAATCACAAAACACAG-TTATTTTCCTA-TCCTAGTCCTGTCAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93332328 626 + 159171411 TATGAAATTTTCATTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGACCACTGTCTACATTGGCATTGAGTAAATTTGACATTGCAAGGACTGTACAATGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTGCAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGTATCTGAGAAAT-AAAAAGAATGACCTTTACATAGCAAAGTCCATAACAACTAGAAAGCTAACCAGACATTCCAAAACAATCACATGTGCATGGTGTGACTGGTCCTCAGTTAACTGCTTCTCTCCTCTCTCGGGATAATCAGCCAGG----CTCATTATGAAGTGTGCTGTGTTGG--ACATGATTTTA-CCTGATATAGCCTAGTATACCTTTCATAACATAAGCATCAAATAGATGTAATGTTTCCTGG-TAAATGTGTCACTTTTGATGGTTAGTATATAAAATTTGTGGTCCAGACAGCTTAGACAATGTCACTT------------------------TTGTAAATCACTTAATGAAACAATCTGGGTTTTATTATAAGCAAAATTTTACTGATCA---TATATTCTTT--AAAAATAAAAAAACACAG-TTATTTTCCTA-TTCTACTTCTGTCTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42634854 603 - 122082543 tatgTAGCTTTCATTTGATCTCACCTATGGAGTGCATGAGTCCACTGTCCACATTAGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGCACTGTACAGTGCCTCAGGGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCCGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTACAGTCATTCAAAAGGTTCATAAATAATGTGAAGTACCTGGAAAAT-ACAGAGACTGACC-TTACACCATGAAGGCCACACCAACCAGCAAGCTAACCATCCATTCT-GAATGATTATGTGGGC-CACTGTAA-----------GCATCTGCTTTTATA--ATACTGGGGTCAGAAGTCAACGTGGCTCATTATTGAGT------TGCTGGTAGCATTATTTTATCCTGACAAAGTACAGTGT-TCATTCCTGACATAAGCACAGAAAATGCACCTTGTCTGCTGG-CAAA--AGTCAGTTTTAATATTTAGC-TACAAAACTCATGGTCCAAACCAGTTAGACATTGTCATTT---------------------------TAAATGACTTAAC-AGGCAATCTAGA-TTCATTACAAGGAAAATTTCAACTATCCCACTGTTTTCTTT--AAAAAACACAACACA-AA-TTATTTTTCTA-TCTTGGTTCTGTCT- i mm10.chr11 I 177 I 112 s canFam3.chr9 41611253 647 + 61074082 TATGAAGCTTTCATTTGATCTCACCTATGGAATGCATGAGGCCACTGTCCACATTAGCATTGAGTAAGTTTGACATTGCAAGGACTGTACAGTGCCTCAGTGATGCCAGCCTCCGAGACATGCCACGTTTCCTGCCACCTGTTTGTGCATTTTCATCTTCAACTTCACTACAGTCATTCAATAGGTTCATGAACAATGTGAAATACCTGAGAAAT-AAAAAGACTGACTCTTACATGGCGAAGGCCACATC-ACCAGAAAGCTAATCAGATATTTTGGAATCATGACATGTACATCATATGAGCGGTCTTCGA-TATCTGCTTCTCA---GTCTTGGGGGAATCAGCCAGGGTGGCTCATGATGAAGTGTGCTATGCTGA--ATATGATTTTATCCTGACAAAGCC-AGTACATATTTCATAACATAGGCATGAAACAGATGCAATCTTTCCTGG-TCAATGCATCACTTTTAGTGTTTACCATACAAAACTAGTGGTCCAAAGAGTTTAGAGAATGCtatttttttttttttttttaaGAATGCTATTTTAAAGGACTTAGTGAGGTGATCTGGGTTTTACTGCCAATAA---TTCACTGCTTGGATTATTGTCTTA--GAAA--CACAAAACACAG-CTGTTTTCCTA-ACTCAGTCCTATCAT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=-19341.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 261383 101 + 478999 GGGGAACAtttctt-------------tgtttt------------------cttt------------------tttgtttt-----------------------tttgtttttgttttgttttgtctttGAgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt s panTro4.chrUn_GL393519 101082 83 + 413329 GGGGAACATTTCtt-------------tgtttt------------------cttt------------------tttgtttt-----------------------tttgtttttgttttgttttgtctt------------------tgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7170721 62 + 72422247 GGGGAACATTTC-------------------------------------------------------------TTTGTTTT-----------------------TTTGTTTTTGTTTTGTTTTGT---------------------------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53747801 25 - 80904711 GGGGATTA-----------------------------------------------------------------CTTGTTTT-----------------------------------------------------------------------------------TGTGTGTGT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53577413 25 - 80997621 GGGGATTA-----------------------------------------------------------------CTTGTTTT-----------------------------------------------------------------------------------TCTGTGTGT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50397391 25 - 74645514 GGGGATta-----------------------------------------------------------------cttgtttt-----------------------------------------------------------------------------------tgtgtgtgt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50451983 20 - 75148670 GGGA----------------------------------------------------------------------TTGTTTT-----------------------------------------------------------------------------------TGTGTGTGT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93332954 28 + 159171411 GAGGAATATTC--------------------------------------------------------------TTTGTTTT-----------------------------------------------------------------------------------TGTGTGTGT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41611900 132 + 61074082 AGGGAATATTGCTTCATGCATGGGCTATATTTTATAGGCAGCTGCTGATGGCCTTAATACCAAAGAAATGAGATCCATTTTCTAAATATTATCACATTTGCCACTTTGGTTAGATTTTGTTTTGT---------------------------------------TGTATGT-- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 42635457 112 - 122082543 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1114063.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 261484 379 + 478999 gGCGGC-GGGGGGCTTTATTTGC-TTTTGCTTTGTG-TTTTTTGGTGACTGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTGTCCCCTTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCCTCAGGCTGCACAGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGA---AAAAAAAAAAATTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGTTATTTCA------CTTCCTCTCAAATAAACCTCTTATTAACAGATAT---AAACTTTAGGAACTACCTGTTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAATTAATATGCAGATCCTAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GAGGAGAAGACAATAGTAACTTTC s panTro4.chrUn_GL393519 101165 377 + 413329 gGCGGC-GGGGGGCTTTATTTGC-TTTTGCTTTGTG-TTTTTTGGTGACTGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTGTCCCCTTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCCTCAGGCTGCACAGGGAGACCAGCTAGAAGAGAAATTACTGCTTCCATGCTTGCCTGCTCCAAATCTCTG-----AAAAAAAAAATTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGTTATTTCA------CTTCCTCTCAAATAAACCTCTTATTAACAGATAT---AAACTTTAGGAACTACCTGTTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAATTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GAGGAGAAGGCAATACTAACTTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7170783 377 + 72422247 gGCGGTGGGGGGGCTTTATTTGC-TTTTGCTTTGTG-TTTTTTGGTGACTGAAA-TTACTTAAGAAATAAC--TGTCCCCTTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCCTCAGGCTGCACAGGGAGAACAGCTAGAAGTCAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGG---AAAAAAAAAAATTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGTTATTTCA------CTTCCTCTCAAATAAACCTCTTATTAACAGATAT---AAACTTTAGGAACTACCTGTTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAATTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--AAGGAGAAGGCAATACTAACTTTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53747826 373 - 80904711 GGT----GGGGGGCTTTATTTGCTTTTTGCTTTATG-TTTTTTGGTGACCGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ATTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCTTCAGGCTGCAGAGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGG---AAAAAAAAAATTTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGCTCTTTTG------CTTCCCCTCAAATAAACCTCGTACTAACGGATAT---AAGCCTTAGGAAATATCTATTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAGTTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GGGGAGAAGGTAATACTTACTTTC i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53577438 373 - 80997621 GGT----GGGGGGCTTTATTTGCTTTTTGCTTTATG-TTTTTTGGTGACCGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ATTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCTTCAGGCTGCAGAGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGG---AAAAAAAAAATTTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGCTCTTTTG------CTTCCCCTCAAATAAACCTCGTACTAACGGATAT---AAGCCTTAGGAAATATCTATTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAGTTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GGGGAGAAGGTAATACTTACTTTC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50397416 373 - 74645514 ggt----ggggggctttatttgctttttgctttatgtttttttggtgACCGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ATTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCTTCAGGCTGCAGAGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCaaatctctgg---aaaaaaaaaatttagagacc--ATAAATCTTTCAGGCTCTTTTG------CTTCCCCTCAAATAAACCTCTTACTAATGGATAT----AGCCTTAGGAAATATCTATTTCATTAAACAAATTATCAGCACAACCCAAATAATTTGAGTTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GGGGAGAAGGTAATACTTACTTTC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50452003 373 - 75148670 GGT----GGGGGGCTTTATTTGCTTTTTGCTTTATG-TTTTTTGGTGACCGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ATTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCTTCAGGCTGCAGAGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGG---AAAAAAAAAATTTAGAGACC--ATAAATCTTTCAGGCTCTTGTG------CTTCCCCTCAAATAAACCTCTTACTAATGGATAT---AAGCCTTAGGAAATATCTATTTCATTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAGTTAATATGCAGATCCCAGAATACAAAATC----ATCTCAAAT--GGGGAGAAGGTAATACTTACTTTC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93332982 374 + 159171411 G------AAGGGGATTTATTTGCTTTTTGCTTTGTG-GTTTTTGGTGACTGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ATTTGGCTTCCATTAATTCCACACCGTCTCCTTCCTCAGGCTGCAGTGGGAGACCAGCTAGAAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAATCTCTGGAAAAAAAAAAAAAATTAGAGACC--AGAAATCTTTCAGGTTCTTTCA------CTTCCCCTCAAATAAACCTCCTATTAACAGATAT---AAACTTTTGGAACTACCTACTTCACTAAACAAATTATTAGCACAACCCAAATAATTTGAGTTAATATGCAGACCCCAAAATACAAAAAC----ATCTCAAAT--GGGGAGAAGGCAATACTAACTTTC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42635569 328 - 122082543 GGG----AGAAAGCTGTATTTGTGTTTTG--TGCTG-TTTTTTGGCGGCTGACATTTACTTAAGGAATAACTGTG----ATTTGGCCTCCATCAGCTCCACCCCATCTCCTTCTTCGGGCTGCAGTGGAAGACCAGCGAGGAGAGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCTTGGTCCAGATCTCTAA---AAAAAAGTCATTTAGAAACT--ATGAGCCTTTTA---------------------------------------------GACAG---GAAACTAAGGCGCTCTCTACTTCACTTAGTAAACTATAAATACAACCTAAATAACATCAGTAAATATACTAAGCTCAGAACACACACACAAAGACCTAAAACTGGTGGGGAA----------ACTTAC i mm10.chr11 I 112 C 0 s canFam3.chr9 41612032 373 + 61074082 ----------GGGCTTTGTT----TTTTGCTTTGC--CTTTCTGGGGACTGAAATTTACTTAAGAAATAACTGTG----ACTTGGCTTCCATCAATTCCACACCATCTCCTTCCTCCGGCTGCAGTGGAAGACCAGCCAGGAGTGAAACTACTGCTTCCATGCTTGCCTGGTCCAAGTCTCTGA---AGAAAGAAAATTTAAAGACCATATAAATTTTTCAGGTTCTTCCACTCCACCTTCCCCTCAAATAAACACCTTCCTAAGAGAACTTTAGGAATTTAGAAACAACCTATTTCATTTAACTGTTTATCAGTACAACCTAAATAATTTCAGTTAACATGCACAAC-CAGAATGCAAAAAT----ATTTCAAGTT-AGGGAGATGATGATAATAACTTTC i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=86697.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 261863 45 + 478999 TACAAAGTAATCTT-GGCAAAATGACTATCTTCAATCAGAAGCATG s panTro4.chrUn_GL393519 101542 45 + 413329 TACAAAGTAATCTT-GACAAAATGACTATCTTCAATCAGAAACACG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7171160 41 + 72422247 TACA----AATCTT-GGCAAAATGACTATCTTCAATTAGAAGCATG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53748199 43 - 80904711 TACAAAGTAATCTT-GGCAAAATGACTACCTTAAATT--TAGAATG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53577811 43 - 80997621 TACAAAGTAATCTT-GGCAAAATGACTACCTTAAATT--TAGAATG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50397789 43 - 74645514 TATAAAGTAATCTT-GGCAAAATGACTACCTTAAATT--TAGAATG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50452376 43 - 75148670 TACAAAGTAATCTT-GGCAAAATGACTACCTTAAATT--TAGAATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93333356 45 + 159171411 TACATAGTAATCTT-GGCAAAATGACTACCTTAAGTCAGAAGTATG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42635897 46 - 122082543 GAATAAGTAATCTTAAGCATAATATCTTCATTAAATCAAAATTATg i mm10.chr11 C 0 I 315 e canFam3.chr9 41612405 0 + 61074082 C e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=805186.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 261908 374 + 478999 TAcaattggccctctgtctcagcgagttctgtatccacggattcaaccaaccatggattgaaactattt-gggggaaaaaaaagtagggtttcatct--------gtactcaacatgtaaaga--tttttctttgtcgttattccctaaacaatatggtataacaacttgtgtttatataagatttatatt-tattagatattataagtaatctaatgataatttaaaatatatgggaggatgtgcatagtttatatgcaaatactatgacattttgtatcagggacttcag--tctgtggattttagtgttcatggaagtgagatgtgggcaggagtttggggggtggttcctggaaccaattcctgacagatactgagagacgacC s panTro4.chrUn_GL393519 101587 374 + 413329 TAcaattggccctctgtctcagcgagttctgtatccacggattcaaccaaccatggattgaaactattt-aggggaaaaaaaagtagggtttcatct--------gtactcaacatgtacaga--tttttctttgtcgttattccctaaacaatatggtataacaacttgtatttatataacatttatatt-tattagatattataagtaatctaatgataatttaaaatatatgggaggatgtgcgtagtttatatgcaaatactatgacattttgtatcagggacttcag--tctgtggattttagtgttcatggaagtgagatgtgggcaggagtttggggggtggttcctggaaccaattcctgacagatactgagagacaacC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7171201 374 + 72422247 TAcaattggccctctgtctcagcgagttctgtatccacggattcaaccaatcatggattgaaactattt-gggggaaaaaaaagtagggtttcatct--------gtactcaacaagtgcaga--tttttctttgtcgttattccctaaacaatatggtataacaacttatatttatataacatttatatt-tattagttattataagtaatctaaagataatttaaaatatatgggaggatgtgcgtagcttatatgcaaatactatgacattttgtatcagggacttgag--tctgtggattttagtgttcatgggagtgagatgtgggcaggagtttggggggtggttcctggaaccaattcctgacagatactgagagacgacC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53748242 374 - 80904711 TAcaattagccctctctatcagtgagttctatatccatggattcatccaaccacggactgaagaaagtt-gggggaaaaaaaagtagggtttcatct--------gcactcaacatgtgcaga--tttttctttgttgttattccctaaacaatatgatataacaac---tatttatataacatttatattgtattagatattataagtaatcgaaagataatttaaaatatatgggaggatgtgcacagtgtatatgcaaatactatgacattttacgtcagagacttgagcatctgtggattttagtgttcatgggagtgagatgtggggagcggtttggggagtggttcctggaactaatccctgacagatcctgagagaagact i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53577854 374 - 80997621 TAcaattagccctctctatcagtgagttctatatccatggattcatccaaccatggactgaagaaagtt-gggggaaaaaaaagtagggtttcatct--------gcactcaacatgtgcaga--tttttctttgttgttattccctaaacaatatgatataacaac---tatttatataacatttatattgtattagatattataagtaatcgaaagataatttaaaatatatgggaggatgtgcacagtgtatatgcaaatactatgacattttacgtcagagacttgagcatctgtggattttagtgttcatgggagtgagatgtggggagcggtttggggagtggttcctggaactaatccctgacagatcctgagagaagact i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50397832 374 - 74645514 TACAATTAGCCCTCTCTATCAGTGAGTTCTATATCCATGGATTCATCCAACCACGGACTGAAgaaagtt-gggggaaaaaaaagtagggTTTCATCT--------GCACTCAACATGTGCcga--tttttctttgttgttattccctaaacaatatgatataacaac---tatttatataacatttatattgtattagatattataagtaatcgaaagataatttaaaatatatgagaggatgtgcatagtgtatatgcaaatactatgacATTTTACgtcagagacttgagcatctgtggattttagTGTTCATGGGAGTGAGATGTGGGGAGCGGTTTGGGGAGTGGTTCCTGGAACTAATCCCTGACAGATCCTGAGAGAAGACT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50452419 375 - 75148670 TAcaattagccctctctatcagtgagttctatatccatggattcatccaaccatggactgaagaaagttgggggggaaaaaaagtagggtttcatct--------gtactcaacatgtgcaga--tttttctttgttgttattccctaaacaatatgatataacaac---tatttatataacatttatattgtattagatattataagatatcgaaagataatttaaaatatatgggaggatgtgcatagtgtatatgcaaatactatgacattttatgtcagagacttgagcatctgtggattttagtgttcatgggagtgagatgtggggagcggtttggggagtggttcctggaactaattcctgacagatcctgagagaagact i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93333401 376 + 159171411 TAcaattggccctctgtatcagtgagttctatatccatggattcaataaaccatggactgaaaatattgggaggggggggaaagtaggaattcatctgtacataggtactcaatatgtacagatttttttctttgttattattccctaagcaatatggtata-----------ttatataacacttatactgtattaggtattataagtaatctaaagataatttaaagtatatgggaggatgtgcatagtttatatgcaaatactatgacattttatatcagc-acttgagcatctgtggattttaatgttcatgggagtgaggtgtgggcagggatttggggagtggttcctggacctaatccctggcagatattgagagatgact i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 42635943 315 - 122082543 I e canFam3.chr9 41612405 0 + 61074082 C e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=14030.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 262282 5 + 478999 ATATT s panTro4.chrUn_GL393519 101961 5 + 413329 ATATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7171575 5 + 72422247 ATATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53748616 5 - 80904711 gTATT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53578228 5 - 80997621 gTATT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50398206 5 - 74645514 GTATT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50452794 5 - 75148670 gTATT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93333777 5 + 159171411 gTATT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42636258 5 - 122082543 ATATT i mm10.chr11 I 315 C 0 e canFam3.chr9 41612405 0 + 61074082 C e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=7551178.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 262287 2520 + 478999 ATAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTAAAGGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGCATTTATCATTAAAGCAGACTTAATTACACTTAATTACTTCCTTTTTTTTCTGTCTCTGGTGCCTGAATCAGGAAATCAATTATTTTTTAGAAAGA-CCAACACAA-TGAGTTCCTCAAATAATACCTT------TTTCTATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAGGCTTTATGTACCTTATTTCCCAATAACGGTAGACTATTCTTCATAAACTGACAACACTAACTTCCCAAACATACCGCTCTCGCACATTTATTTTTACAGAAAGTCTATCAGTCAAAAAAAAGTAGTAA-TAAAGATTAGTATCTTTACATATTTCAACCACAAAAGTTTGACATCTAAAAAAT--TTAAATACACATAAAATACAAGTATAAAGCTGTA-ATGAAGTAATTATAATTCTTACAGGAAAACCCACTAATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAATACATTTTACATCATCATCTGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGACTGTCAGGTATTCTACAATCTTATTCCTAAAGAATGGCGGAGAAAAGAGAAACAGCCAACAATTTTTT--------------TGAAGC--cacacacacacacacacCTTTAATTGTGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TACAGTGCAAATAA---------TTTGGCAG-----ATAACCCAGGTGACATGACGACTTTATAAAAGAGATACTGATGTCACAGAC------GTAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACGTGGATATTTAACCTCCAACA----TGG--CCCTTATTTATGGTATCAAATTGGAAACAGA--------------ATCAAATTCTTAGCTCAAGTACAGCACAG--TTTTAGAAAAATGGAGGCTTG------------------------CCACAGGCACAAAGCTTACGGAAATTTGA-GGAGAGACGTAGAGAAACACAAACGTGTAAATTGCTCTCTTTTTATGTCTTCCTTCCTACCAATAACCAGATATCTACTCTATTTCTGTACTTCATTCAACAAATTAAGATTTACAAGACCCTACATTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATAAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCGTTACTTCAACCAACTGACACAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATACAGACAC-AGAGACGAT------AAAAAAATTATCAGATATAGACAAAAGAGAAAGCATTCAAAGTACTTTAGTCATCAAATAAAATGAACTACATGTAAGTCTGAA----AACA--------ATATTTAT-----TTTTATGA---------------------GAACATACACACCTTCTGGTTACCTGACTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACTACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTGATCTCTTAAAGTATGTTTCTGCTACATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATATAACATCATTGGTTCAATGCTAGCTTGCCCTAGATGTTCAGAGCTGCCTTCAGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGCTCTACAAATTGAGTGTTGGTATCCGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAATCATTTGCCATCAATGCCCAGAAGACAGA---CCTCTAGAGAGATGCAACCGACTGATCTAAA---CacacaaacacagaagtgcacccacaggcacacagccaaacaagcatacagatacatgcagacactcatacccatacacaAGGCAGGTATACCCTCAGGCACACATACACACCAGAGTTCCTAAGAAGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTTGGC-AATTTTTAAAAACTGTG-------------AGCA----------------CCTAATTTAAATAA-TTGGAAAGAAAAAGCCTT-CCTTATTTCAAAC---------------------AAGGTGAAAAATAAAAAAGAGCACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGCATTCTTCAGTTTGTTAAATAGCATCAGATAAAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGTTCCTTAACATTGGCCTGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAACAGCTGATCCATACATTTGCTGACAGGTGTACCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTGACATTCACTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTACTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTGCGCATCCTCCTCCACTCAGATGGGACATTCGACTCCTAACAATGGTCATGTGAA-ACTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGGGCAAAGCATGAATTAAACCTAAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTACTCTTTATCC----------------AACATTTCTTCCATGACAAAAGTACA s panTro4.chrUn_GL393519 101966 2520 + 413329 ATAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTAAAGGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATATGTCAATAAGTATTTATCATTAAAGCAGACTTAATTACACTTAATTACTTCCTTTTTTTTCTGTCTCTGGTGCCTGAATCAGGAAATCAATTATTTTTTAGAAAGA-CCAACACAA-TGAGTTCCTCAAATAATACCTT------TTTCTATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAGGCTTTATGTACCTTATTTCCCAATAACGGTAGACTATTCTTCATAAACTGACAACGCTAACTTCCCAAACATACCGCTCTCGCACATTTATTTTTACAGAAAGTCTATCAGTCAAAAAAAAGTAGTAA-TAAAGATTAGTATCTTTACATATTTCAACCACAAACGTTTGACATCTAAAAAAT--TTAAATACACATAAAATACAAGTATAAAGCTGTA-ATGAAGTAATTATAATTCTTACAGGAAAACCCACTAATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACATTTTACATCATCATCTGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGACTGTCAGATATTCTACAATCTTATTCCTATAGAATGGCGGAGGAAAGAGAAACAGCAAACACTTTTTT--------------TGAAGC----CACACACACACACGCCTTTAATTGTGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TACAGTGCAAATAA---------TTTGGCAG-----ATAACCCAGGTGACATGACGACTTTATAAAAGAGATACTGATGTCACAGAC------GTAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACGTGGATATTTAACCTCCAACA----TGG--CCCTTATTTATGGTATCAAATTGGAAACAGA--------------ATCAAATTCTTAGCTCAAGTACAGCACAG--TTTTAGAAAAAGGGAGGCTTG------------------------CCACAGGCACAAAGCTTACGGAAATTTGA-GGAGAGACGTAGAGAAACACAAACATGTAAATTGCTCTCTTTTTATGTCTTCCTTCCTACCAATAACCAGATATCTACTCTATTTCTGTACTTCATTCAACAAATTAAGATTTACAAGACCCTACATTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATAAGAGGTCACCTCTCCTTGCCATCGTTACTTCAACCAACTGATACAGTTTCGTTTTCATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATACAGACAC-AGATACAAT------GAAAAAATTATCAGATATAGACAAAAGAGAAAGCATTCAAAATACTTTAGTCATCAAATAAAATGAACTAAATGTAAGTCTGAA----AACA--------ATATTTAT-----TTTTATGA---------------------GAACGTACACACCTTCTGGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACTACCAATATCAATGTATAAGAGGTTTTTCTGATCTCTTAAAGTATGCTTCTGCTACATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATATAACATCATCGGTTCAATGCTAGCTTGCCCTAGATGTTCACAGCTGCCTTCAGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGCTCTACAAATTGAGTGTTGGTATCCGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAATCATTTGCCATCAATGCCCAGAAGACAGA---CCTCTAGAGAGATGCAACCGACTGATCTAAa---cacacaaacacagaagtgcacctgcaggcacacagccaaacaagcatacagatacatgcagacactcatacccatacacaaggcaggtataccctcaggcacacatacacacCAGAGTTCCTAAGCAGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTCGGC-AATTTTTAAAAACTGTG-------------AGCA----------------CCTCATTTAAATAA-TTGGAAAGAAAAAGCCTT-CCTTATTTCAAAC---------------------AAGGTGAAAAATAAAAAAGAGCACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGCATTCTTCAGTTTGTTAAATAGCATCAGATAAAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGGTCTTTATCATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTCCTCAAGGTTACACAGCATTAAGGACAACAGCTGATCCATACATTTGCTGACAGGTGTACCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTGACATTCACTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTACTTCTCTGCTGGAGGCACACTCCCCCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTGCGCATCCTCCTCCACTCAGATGGGACATTCGACTCCTAACAATGGTCATATGAA-ACTTTCAGCAGCCTAAACATGAAATTTTTGGGCAAAGCATGAATTAAACCTAAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTACTCTTTATCC----------------AACATTTCTTCCATGACAAAAGTAC- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7171580 2519 + 72422247 AAAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTAAATGCTTATTATACAGTCCATAGCGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGTATTTATCACTAAAACAGACTTAATTAGACTTAATTACTT-CTTTTTTTTCTGTCTCTGGTGCCTGAATCAGGAAATCAATTATTTTTTAGAAAGA-CCAACACAA-TGAGTTCCTCAAATAATACCTT------TATCTATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAGGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAACGGTAGACTATTCTTCATAAACTGACAACACTAACTTCCCAAACATACCGCTCTCGCACCTTTATTTTTACAGAAAGTCTATCAGTC-AAAAAAAGTAGTAATTAAAGATTGGTATCTTTACATATTTCAACCACAAAAGTTTGACATCTAAAAAGT--TTAAATACACATAAAATAAAAGTATAAAGCTGTA-ATGAAGTAGTTACAATTCTTACAGGAAAACCCACTAATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGAAAGACATTTTACAACATCATCTGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGGCTGTCAGGTATTCTACAATCTTATTCCTATAGAATGGCGGAGAAAAGAGAAACAGCAAACAATTTTTT--------------TGAAGC--------CACACACACATCTTTAATTGTGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGCAAATAA---------TTTGGCAG-----ATAACCCAGGTGACATGACGACTTTATAAAAGAGATACTGATATCACAGAC------GTAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACGTGGATATTTATCCTCCAACA----TGG--CCCTGATTTATGATATCAAATTGGAAACAGA--------------ATTAAATTCTTAGCTCAAGTACAGCACAG--TTTTAGAAAAAGGGAGGCTCG------------------------CCACAGGCACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GGAGAGACGTAGAAAAAAACAAACATGTAAATTGCTCTCTTTTTATATCTTCCTTTCTACCAATAACCAGATATCTACTCTATTTCTGTATTTCATTGAACAAATTAAGATTTACAAGACCCTACATTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCGTTACTCCAACCAACTGACACTGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACATGAACATACCTATACAGACACAAGAGACAAT------AAAAAACTTATCAGATATAGACAAAAGAGAAAGCATTCAAAATACTTTAGTCATCAAATAAAATGAACTAAATGTAAGTCTGAA----AACAATA---AGATATTTAT-----TTTTATGA---------------------GAACATACACAACTTCTGATTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACTACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTTATCTCTTAAAGTATGTTTCTGCTACATTTCAG--TAGAAAGCTTACCTGACCAGATGTAACATCATTGGTTCAATGCTAGCTTGCTCTAGATGTTCAGAGCTGCCTTCAGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGCTCTACAAATCGAGTGTTGGTATCAGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAATCATTTGCCATCAATGCCCAGAAGACAGA---CTTATAGAGAGATGAAACTGACTGATCTAAa---cacacaaacagagaagtgcacccacaggcacacagccaaacaagcatacagatatatgcagacactcatacccatacacaaggcaggtataccctcaggcacacatacacacCAGAGTTCCTAAGAAGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAAGTTTTTGGC-AATTTTTAAAAACTGTG-------------AGCA----------------CCTAATTTAAATAA-TCGGAAAGAAAAAGGCTT-CCTTATTTCAAAC---------------------AAGGTGAAAAATAAAAAAGAGCACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGCATTCTTCAGTTTGTTAAACAGCATCAGATAAAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGGTCCTTAACATTGGCCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAACAGCTGATCCATACATTTGCTGACAGGTGTACCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTGACATTCACTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTACTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATATTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTGCGCGTCCTCCTCCACTCACATGGAACACTCGACTCCTAACAATGGTCATGTGAA-ACTTTTAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACCTAAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTACTCTTTATCC----------------AACATTTCTTCCATGACAAAAGTACA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53748621 2512 - 80904711 ATAAAGCTTGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTGAATGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGTATTTATCATTAAAGCAG----------ACTTAATTATTTCCTTTTTTTTCTGTCTCTGGTGCTTGAATCAGGAAATCAATTATTTCTTAGAAAGATTCAACACAA-TGAGTTCCTCAAGTAATACCTT----------TATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAAGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAACTCTATACTATTCTTCATAACCTAGCAACACTAACTTCCCAAACATATCGCTCTTTCACATTTATTTTTACTG--AGTCTATCAGTCAAAAAAAAGCAGTAA-TAAAGATTAGTGTCTTCACATATTTCAAACACAAAAGTTTGACATCTAAAAAGT--TTAAATACACATAAAATACAAGTATAAAGCTATA-ATGAAGTAGTTATAATTCTCACAGTAAAACCCACTCATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACACTTTACATCATCATCCGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTATAGAATGGTGGAGGAAAGAGAAACAGCAAACAATTTTTT--------------TGAAGC--------CACACACACACCTTTAGTCATGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGCAAATAA---------TTTCCCAG-----ATAACCTAAGTGACATGATGACTTTATAAAAGAGATACCGCTATCACAGAC------ATAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACATCGATATTTACCCTCCATCA----TGG--CCCTTAGTTACGGTATCAGATTGGAAACAGA--------------ATCAAATTCTTAGCTCAATTATAGCATAG--TTTTAGAAAAAGGGAGCACTG------------------------TCACAGGCACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GAAGAGATATAGAGAAAAACAAACATGTAAATTGCTCTCTTTTCATGTCCTCCTTTCTACCAATAACCATGTATCTACTCTTTTCCTGTACTTCATTGAACATATTAAGATTTACAAGACCCTACACTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCATTACTTCAACTAACTGACACAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATATAGACAT-AGAAACAAT------AAAAAAATTATCAGATATAGACAAAGGAGAAGGCATTCAAAGTACTTTAGTCATCAAGTAAAATGAATTAAATTTAAGTTCGAA----AACAATA---AGATATTTAT-----TTAGAAAA---------------------GAACATACACAACTTCTGGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACCACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTTATCTCTTAAA--ATGTTTCTGCTATATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCCAGATGTTCAGAGCTGCCTTCGGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGTTCTACAAACTGAGTATTGGTATCGGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAAAGATTTGCCATCAATGCCCACAAGACAGAC--CCCCTAGAGAGATGAAACTGACTGATCTAA-----ACACAGA---GTAAGTGCACCCACAGGCACAGAGCCAAACAAGCATACAGATATACGAAGACACTCGTACCCATACACAAGGCACGTATACCCTCAGGCACATGTACACACCAGAGTTCCTAAGAGGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTTGGA-AATTTTTAAAAACTATG-------------AGTA----------------CCTAATTTAAATAA-TCTCAAAGAAAAAGG-----CTTGTTTCAAACACGTCACTCTATTCATAGGGAAAGGTGAAAAATAAAAAAGAGAACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATACAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAAGAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCATTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTCACATGGGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACC-----TTAGTT--GAGACTTGACAAATTATTCTTTATCC----------------AACATTTATTCCATGACAAAAGTACA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53578233 2514 - 80997621 ATAAAGCTTGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTGAATGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGTATTTATCATTAAAGCAG----------ACTTAATTATTTCCTTTTTTTTCTGTCTCTGGTGCTTGAATCAGGAAATCAATTATTTCTTAGAAAGATTCAACACAA-TGAGTTCCTCAAGTAATACCTT----------TATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAAGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAACTCTATACTATTCTTCATAACCTAGCAACACTAACTTCCCAAACATATCGCTCTTTCACATTTATTTTTACTGAAAGTCTATCAGTCAAAAAAAAGCAGTAA-TAAAGATTAGTGTCTTCACATATTTCAAACACAAAAGTTTGACATCTAAAAAGT--TTAAATACACATAAAATACAAGTATAAAGCTATA-ATGAAGTAGTTATAATTCTCACAGTAAAACCCACTCATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACACTTTACATCATCATCCGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTATAGAATGGTGGAGGAAAGAGAAACAGCAAACAATTTTTT--------------TGAAGC----------CACACACACCTTTAGTCATGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGCAAATAA---------TTTCCCAG-----ATAACCTAAGTGACATGATGACTTTATAAAAGAGATACCGCTATCACAGAC------ATAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACATCGATATTTACCCTCCATCA----TGG--CCCTTAGTTATGGTATCAGATTGGAAACAGA--------------ATCAAATTCTTAGCTCAATTATAGCATAG--TTTTAGAAAAAGGGAGCACTG------------------------TCACAGGCACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GAAGAGATATAGAGAAAAACAAACATGTAAATTGCTCTCTTTTCATGTCCTCCTTTCTACCAATAACCATGTATCTACTCTTTTCCTGTACTTCATTGAACATATTAAGATTTACAAGACCCTACACTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCATTACTTCAACTAACTGACACAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATATAGACAT-AGAAACAAT------AAAAAAATTATCAGATATAGACAAAGGAGAAGGCATTCAAAGTACTTTAGTCATCAAGTAAAATGAATTAAATTTAAGTTCGAA----AACAATA---AGATATTTAT-----TTAGAAAA---------------------GAACATACACAACTTCTGGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACCACCGATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTTATCTCTTAAA--ATGTTTCTGCTATATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCCAGATGTTCAGAGCTGCCTTCGGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGTTCTACAAACTGAGTATTGGTATCGGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAAAGATTTGCCATCAATGCCCACAAGACAGAC--CCCCTAGAGAGATGAAACTGACTGATCTAAA---CACACAGA---GTAAGTGCACCCACAGGCACAGAGCCAAACAAGCATACAGATATACGAAGACACTCGTACCCATACACAAGGCACGTATACCCTCAGGCACATGTACACACCAGAGTTCCTAAGAGGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTTGGA-AATTTTTAAAAACTATG-------------AGTA----------------CCTAATTTAAATAA-TCTCAAAGAAAAAGG-----CTTGTTTCAAACACGTCACTCTATTCATAGGGAAAGGTGAAAAATAAAAAAGAGAACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATACAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAAGAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCATTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTCACATGGGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACC-----TTAGTT--GAGACTTGACAAATTATTCTTTATCC----------------AACATTTATTCCATGACAAAAGTACA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50398211 2519 - 74645514 ATAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTGAATGTTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGTATTTATCATTAAAGCAg----------acttaattatttccttttttttccgtCTCTGGTGCTTGAATCAGGAAATCAATTATTTCTTAGAAAGATTCAACACAA-TGAGTTCCTCAAGTAATACCTT----------TATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAGGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAACTCTACACTATTCTTCATAACCTAGCAACACTAACTTCCCAAACATATCGctctttcacatttatttttactgaaagtctatcagtcaaaaaaaaa-agtaa-taaagattaGTGTCTTTACATATTTCAAACACAAAAGTTTGACACCTAAAAAGt--ttaaatacacataaaatacaagTATAAAGCTATA-ATGAAGTAGTTATAATTCTCACAGTAAAACCCACTAATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACATTTTACATCATCATCCGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTATAGAatggtggagaaaagagaaacagcaaaCAAtttttt--------------tGAAGC--------CACACACACACCTTTAGTCATGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGCAAATAA---------TTTCCCAG-----ATAATCTAAGTGACATGATGACTTTATAAAAGAGATACTGCTATCACAGAC------ATAAAAGCCAGAAGGG----AACAA--GCAACATCGATATTTACCCTCCATCA----TGG--CCCTTAGTTATGGTATCAGATTGGAAACAGA--------------ATCAAATTCTTAGCTCAATTATAGCATAG--TTTTAGAAAAAGGGAGCACTG------------------------TCACAGGCACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GAAGAGAtgtagagaaaaacaaacatgtaaattGCTCTCTTTTCATGTCCTCCTTTCTACCAATAACCATGTATCTACTCTTTTCCTGTACTTCATTGAACATATTAAGATTTACAAGACCCTACACTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCATTACTTCAACTAACTGACACAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATATAgacat-agaaacaat------aaaaaaattatcagataTAGACAAAGGAGAAGGCATTCAAAGTACTTTAGTCATCaagtaaaatgaattaaatttaagTTCGAA----AACAATa---agatatttat-----ttagaaaa---------------------gaacATACACAACTTCTGGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGgcaaattattttatcaattacCACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTTATCTCTTAAA--ATGTTTCTGCTATATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCCAGATGTTCAGAGCTGCCTTCGGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGTTCTACAAACTGAGTATTGGTATCGGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGaac-aaata------tattaaagattTGCCATCAATGCCCACAAGACAGAC--CCCCTAGAGAGATGAAACTGACTGATCTAAA---CACACAGA---GTAAGTGCACCCACAGGAACAGAGCCAAACAAGCCTACAGATATACGAAGACGCTCGTACCCATACACAAGGCACGTATACCCTCAGGCACATGTACACACCAGAGTTCCTAAGAGGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGcaattttttgga-aatttttaaaaactgtg-------------agtA----------------CCTAATTTAAATAA-TCTCAAAGAAAAAGG-----CTTGTTTCAAACACGTCACTCTATTCATAGggaaaggtgaaaaataaaaaagagaacactttaCCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATACAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAAGAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGCGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCATTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATACGTTGCCAGGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTCACATGGGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACCTTAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTATTCTTTATCC----------------AACATTTATTCCAtgacaaaagtaca i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50452799 2520 - 75148670 ACAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTGAATGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTAATCACTTTCTGATATGTGTCAATAAGTATTTGTCATTAAAGCAG----------ACTTAATTATTTCCTTTTTTTTTCATCTCTGGTGCTTGAATCAGGAAATCAATTATTTCTTAGAAAGATTCAACACAA-TGAGTTCCTCAAGTAATACCTT----------TATCTAATCATAACATAAATGCAATCTGAGGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAAGTCTACACTATTCTTCATAACCTAGCAACACTAACTTCCCAAACATATTGCTCTTTCACATTTATTTTTACTGAAAGTCTATCAGTCAAAAAAAAGCAGTAA-TAAAGATTAGTGTCTTTACATATTTCAAACACAAAAGTTTGACATCTAAAAAGT--TTAAATACACATAAAATACAAGTATAAAGCTAAA-ATGAAGTAGTTATAATTCTCACAGTAAAACCCACTAATACTTGA----AGGTCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACATTTTACATCATCATCCGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTATAGAATGGTGGAGAAACGAGAAACAGCAAATAATTTTTT--------------TGAAGC--------CACACACACACCTTTAGTCATGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGCAAATAA---------TTTCCCAG-----ATAACCTAAGTGACATGATGACTTTATAAAAGAGATACTGCTATCACAGAC------ATAAAAGGCAGAAGGG----AACAA--GCAACATCGGTATTTACCCTCCATCA----TGG--CCCTTAGTTATGGTATCAGATTGGAAACAGA--------------ATAAAATTCTTAGCTCAATTATAGCACAG--TTTTAGAAAAAGGGAGCACTG------------------------TCACAGGCACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GAAGAGATGTAGAGAAAAACAAACATGTAAATTGCTCTCTTTTCATGTCCTCCTTTCTACCAATAACCTTGTATCTACTCTTTTCCTGTACTTCATTGAACATATTAAGATTTACAAGACCCTACACTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCATTACTTCAACTAACTGACACAGTTTTGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATACCTATATAGACAT-AGAAACAAT-----AAAAAAAATTATCAGATATAGACAAAAGAGAAGGCATTCAAAGTACTTTAGTCATCAAGTAAAATGAATTAAATTTAAGTTCAAA----AACAATA---AGCTATTTAT-----TTAGAAAA---------------------GAACATACACAACTTC-GGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGT-AAAGAATGGCAAATTATTTTATCAATTACCACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTTCTTATCTCTTAAA--ATGTTTCTGCTATATTTCAG--TAGAACGCTTACCTGACCAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCCAGATGTTCAGAGCTGCCTTCGGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGTTCTACAAACTGAGTATTGGTATCGGTCAATAAAACCTATAGA-----------AAGAAC-AAATA------TATTAAAGATTTGCCATCAATGCCCAAAAGACAGAC--CCCCTAGAGAGATGAAACTGACTGATCTAAA---CACACAGA---GTAAGTACACCCACAGGCACAGAGCCAAACAAGCATACAGATATACGAAGACACTCGTACCCATACACAAGGCACGTATACCCTCAGGCACATGTATACACCAGAGTTCCTAAGAGGC-AAGCTGACCCCTACATTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTTGGA-AATTTTTAAAAACTGTG-------------AGTA----------------CCTAATTTAAATAA-TCTCAAAGAAAAAGG-----CTTGTTTCAAACACGTCACTCTATTCATAGGGAAAGGTGAAAAATAAAAAAGAGAACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATACAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGACAAGAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGTGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCATTGACTGGACCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTCACATGGGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACCTTAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTATTCTTTATCC----------------AACATTTATTCCATGACAAAAGTACA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93333782 2543 + 159171411 ATAAAGCTAGGCTTGGTCAAAGAAACATATGTGAATGCTTATTATACAGTCCATAGTGTTTTATCACTTTCCGATATGTGTCAATAAGTATTTATCATGAAAGCAG----------ACTTAATTACTTCCTTTTTTT---GTCTCTAGTGCTTGAATCAGAAAATCAATTATTTCTTCGCAAGATTCATCACAA-TGAGTTCCTCAAATAATACCTTTATCTTTATCTATCTAATCATAACATAAATTCAATGTGAGGCTTTATGTATCTTATTTCCCAATAACTGTAGACTATTCTTCATAAACTGACAACACTAACTTCCCAAACATATTGTTCTCTCACATTTATTTTTAGTG--AGTC--TCAGTC-AAAAAAAGTAGTAA-TAAAAATTAGTGTCTTTATATATTTCAAACACAGAAGTTTCACATCTAAAAAGT--TTAAATATGCATAAAATACAAGTATAAAGCTGTA-ATGAAGTAGTAAC-ATTCTCACAATAAAACCCACTAAT----------AGATCATTCTCTT-------------------------------------------------------------------ATTTACCTTGTAAGACATTTTACATCATCATCTGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAATCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTATAGAATGATGGAGAAAAGACAAACAGCAAACAATTTTTT--------------TGAAGCCACACACATGCACACACACGTCTAGTCATGTA------------------------------------A--GATTTCT--------------------TATAGTGTAAATAA---------TTTGCCAG-----ATAACCTAGGTGACATGATGACTTTATAAAAGAGATACTGCTATCACAGAC------ACAAAAATCAAAAGGG----AACAA--GCAATGTGGATATTTAGCCTCCATAA----TGG--CCCTTAGTTATGGTATCAGATGGGAAACAGA--------------ATCAAA-TCTTAGCTCAAGTATAGCACAG--TTTTAGAAAAAGGGAACACTG------------------------TCACAGACACAAAGCTTAGGGAAATTTGA-GGAGAGATATAGAGAAAAACAAACATGTAAATTGCTC-CTTTTTTTGTCTTCCTTTCTACCAATAACCAGATACTTACTCTTTTTCTGTACTTCATTTAACATATTAAGATTTACAAGACTCTACCTTGCTCTTTTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGGCAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTTGCCATCATTACTTCAACTAACTGACACAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATATCTATAAAGACAT-AGAAACAAT------AAAAAAAAGATCAGATATATGCAAAAGAGAAGACATTCAAAATACTTTGGTTGTCAAGTTAAATGAATTAAATGTAAGTTTGAA----AACAATA---AGATATTTAT-----CTCACAAATATCTTTGTTAAGATATTTATGAACATACACAACTTCTGGTTACCTTATTGTCA----CACCCTAGTTTGTGTGCAGTAAAAGAATGGCAAATTAGTTTATCAATTACTACCAATATCAATGTGTAAGAGGTTTTGCTTCTCTCTTAAA--ATGTTTCTGCTACATTTCAG--CAGAACGCTTACCTGACCAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCTAGATGTTCAGAGCTGCCTTCAGTATGATTATCTAGCAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGCTCTACAAATTGAGTATTGGTATCAGTCAATAAAACCTAGAGA-----------AAGAAC-AAATA------CATTAATGATTTGCCATCAATGCACAGAAGACATAC--CCCCTAGAGAGATGAAATTGACTGACCTAAa---cacacaaacaggta--------cacaggcacacaaccaaagaagcatacagataaacacagacactcatatgcatacacaAGGCATTTATACCCTCAGGCACCCTTACACACCAGAGTTCCTAAGAAGC-AAGCTGGCCCCTACACTGAGATGACTCTTCTTTCTGCAATTTTTTGGC-AATTTTTTAAAACTATG-------------AGTA----------------CCTAATTTAAAAGATTCTGAAAGAAAAAGGCTT-CATTATTTCAAACAAGTCAACCTATTCATAGGGAAAGGTGAAACAAAAAGAAGAGAACACTTTACCTGTCCTTGGGCGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATAAAGAGCAGGACTCAATTCTAGGCCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATCTGAAGACCCACTTTCTCATGGTTACACACCATCAAGGACAACAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGTGTTTCCCTCTGAGGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCACTGACTGGGCCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAGGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGGAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCTGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTCACATGGGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAAATTTTTGTGCAAAGCATGAATTAAACCTAAA-TTAGTT--GAGACTTGACAAATTACTCTTTATCC----------------AACATTTCTTCCATGACAAAAGTACA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42636263 2628 - 122082543 ACCAAGTCATACCTGAACAAA-AAATGGATGAAA----TTATCATCCAAT-CACAG----TTACCA-TTTCTGATATATATC---AAGCATCTGTCATTACAGCAT------------------------------------------------------GTACGCAATTATGCCTTACAAAGACTCATAATTA-T--GTTCCTCAATCAATGTTTT----------TATCTAA-------AGTAATACAGCCTAATGCTTTATGTATCT--TCTCTCAATAACTGTTAACCATACTTCCTAAGCTAATACCACT---TTCCTAAGACTACC------TCACA--TGCTTCAACTAAAAGTCCTTCCAGTAAAA--------TAA-TAAA----AGGAACTTTAAATATCTCAAATGCAAAAGCTTACCACCTACAAAACAACTTAACACACCTA------------GCAGCTATCTCTGTACTGGTTTTCATGAGTAAAGTAAAACATGATAGAACTTTA----AAAACCGCctctttccctctctccttctccgttttccttcccctccccacctctctctcTGTCCATTTTGTTCTGTTTTATTTTACCTCGTAAGACATTTTATGTCATCATCTGCTGCTTGGTTTGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTTAGATATTCTACCATCTTATTCCTGCAGAAT----GAAAAAAGGAAAAGAACAAGTAAGTTTTTAACACATAGTTTACTGATTA--------TTTAGACAAAAGTTTTATCATATAGTTGTATATcccagattggccctgaacttttgccttg--gctttctgactgaaggaactgtaggcatatgcTGAGAACCAAAACAGCGCTCTACTAGTGAAAACAGCTGAGGGGCTAGGGTGACTTTATACAACAGATACCGCTATCAGGGGTGATGGAATAAAAGTCAGAAGGA----CACAGATACAATTCAGATGCTGGTTCTTTGCAC----TGT--CCCTTTGCAATG---------TGGAAACAGAAACTTTTAGTGACCATAAATTAATTAGTTCCAGGAAAGGAGAGAATTTTTAAAAAAAGAAAGACTGAAAACAAAACAGAAAAACAAATGCTTGTGGGCACAGAGCTTTGAGAAAGTTGGTTAAGAATAATCAGAAAAAACAAATATGCACAAATATGTACCTCCCTCCCCTCCCCAC-ACAAAAAGC------TCTGCTACTTTTCTACACTTTGTTTAACA---TAATACTTACAAGACCCTGCTTTGCTCTTCTGAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGACAAAACGAGAGGTCATCTCTTCTTGCCATCATGACTTCAACTAACTGACACAATTTTGTTTTTATTTGTATTGCATGGACCATATTCCCAAGAACACGAACGTATCTAATTAAACAT-GGAATTA--------AAAAAAATGATCAGATATGGACAAAAGATAAGGTATTCTAAA---TTTAATCTTTAAGTAAACTTAAGTAAATGTAATTTTAGACGTGAATAATATTTAAAT-TTTAC-----TTAGGTAG---------------------GAACATATACAACTTCTGATTATCTTATTGCCATAGTCACACTGG---GTCTGTAGTAAAACAATGGCAAACTACTTCATC----ATCCCCATTATCAGGGCATACGAGGT----CTTACCTCTTAAAACAAGACTCTGCTGTGATTCAGGACAGAATGCTTACCTGACCAGATTTAGCATCATTGTCTCAATGCTCGCTTGTCCCAGATGCTCAGAGCTGCCTTCAGTATGATTATCCAGTAGGTTTTTCATTATGGCTATGGTTTGCTCTACAAACTGAGTATTGCTGTCACTTAGTAATACCTATACACACACACACACAAAACC-AAAAAACAGCCCATTAGCGATCTAACATCAATGAACAGAAACCA-----TTATCAGGGCAATGAAACTGATGTAACCAT----CACAC------GCAGGCACAC-TACAGGC----AAGTAAACAAACACACAGATACACAGAGGTACGAG-GCACACAGCCAAG--ACTCCTAACTCCAGGCATACCCACAGGCCTGAGTTCTTTAGAAGC-AAGTTGATCCCTAGGTT-ACATGA-TTTTTTTTCTGTAATTAT---GA-AAGGTTTTAAAGTTGTA-------------AGTGAATTATCATGTTGGTCTATAATTTAAATAA-TTTGAAAGAAACAGTCTTGATTTATTTCAAAC-TATTATTATATTCATAAAGAAAGGTAAAAAACAAAGTGGAGAAGACGTCACCTGTCCTTGAGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAGTTTGTTAAACAGCATTGGATACAGAGCAGGACTCAACTCCAGACCCACCAGGTCCTTAACATTGGTCCGTATCTGAAGCCCCACTTTCTCGTGGTTACACACCATTAAGGACAGAAGCCGGTCCATAAATCTGCTGACAGGTGAATCAATATTCCCTTCAGAAGACATTACAGAAATCATAGACCCTTTGCGTTCACTGACAGCGCCCATAGGTGGGCTGTATGTCGCTAGGCCAGAGCTGCTTCTCTGTTGCAGGCACACC---CCACCAAGGGCACAAAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCACTCCTGCAGGGAGTCTGTGTCAGACAAGTCTATGGAGCCTCCTCCACTGACATGGGACATCCGTCTCTTAACAATGGTCTTATGAAGACTTTCTGCAGCCTAAACACAACATTTTTGTGAAAAGCATGAATTCAACATAGACTGAATA--AAAATCTTACAAATTACTC-TTATCCATTTCTACCAGTAGGAAAGGTACattttataataataataaa i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41612405 2414 + 61074082 ACAAAACCAAGCCTCACAAAAGAAATACACATGAATGATTATTATGTAGTTTGT--TGTTTAATTACTTTCTGACATGTGACAATAAGTATTTACCATTAGAGTAA------------------------------------------------ATGCAGGA----AATTACTTTTTAGAAAGACTCAAGCCAAGTAAGTTCCTTAAATATTACCTT----------TATCAAATTACAAAATAAACAAAGCCTAAGGCTTTATACCTTTTATTTCCCAACAACTATAGATTATCCTTTCTAAATAGACG--ACTAACTTTCCAAGTA------------------------------AAACTTTCAGTTAAAAACAGA---AAA-TAAAGACTAA----TCTATATAATTCAAATGCAAAAGCTTGATATCCAAAAAAC----------ACATATTATA-------ATAGGCATG-GTGAAGTACTTATCAACATCCCAAGTAAACCTGTGAATACTTAATTAGAAGTCCTTCTCTCTCTTTGTTTTTTT------------------------------------------------------TTTTACCTTGTAAGACATTTTACATCATCATCTGCTGCCTGGTTGGATGTTCCCATAACCCAGTCTGTCAGGTATTCTACCATCTTATTCCTGCAGAATGGCAGGGGAAAGGAAAACAGC-AACAATTCTTT----------------AAGT--------CACACATACACTTTTTGTCATACA------------------------------------AATATTTTTT--------------------AATAATGCAAATAA---------TTTGCCAA-----ATCACTCAGGTGACATGAGAGTTTTATAAAAGAGATACCACCACTCCGACT------CCAAGCATTGGAAGGGCTCTGACAG--GCAACCAGGATACTGATCTTCCATTGATACTGATTCCCTTAGCCAGGGTATCAGTTTGGAAGCAAT---------------------TCTTAGCTCCAGTATT--------ATTTAGAAAAAGGGAGCACTG------------------------GCATGGGCACAAAGCTTTGGGAAATTTGA-AAATACAGGAGGAGAAAAACTGAAATGTAAAAGGCTGCTTTTCTA-----CCCCCCCTCATGATAATCAAGTACCTATTATTTTTCTATACTTCATTTAGCA---GAAGATTTACAAGACTCCACTTTGCTCTCTTCAGAACTCACCTAAATTTCATCTCTTGACAAAATGAGAGGTCATCTCTCCTCGCCATCATCACCTCGACTAACTGACAGAGTTTCGTTTTTATTTGAATTGCATGGACCATATTCCCAAGCACACGAACATATCTATTTAGACAC-AGAAACATTCAGGAGAAAAAAAATATCAGATATAAGCAAAAGAGAAGGTTCTCTAAATGTTTTGATCTTTAAGTGAAATG-ATTAAATGTAACTATTAA----AGTTGTA---GTATTTTTATGTTTATTATAGGA---------------------ATACATACATAACTTCTGGTTACCTTATTGTCA----TACTCCAATTTGGGTACAAT-AAAGAATGGCAAATTATTTCACTAGTAATTACCAATACTGAT------------------------------GTGTTTCTGTTACATTTCAG--TAGAATGCTTACCTGACTAGATTTAACATCATTGTTTCAATGCTAGCTTGCCCCAGGTGTTCAGAGCTGCCTTCAGTATGATTATCTAGTAAGTTCTTCATTATAGCTATGGTTTGCTCCACAAACTGAGTATTGGTGTCAGTCAATAAAACCTACACA-----------AAGAACAAAATA------CAT------TTTGGCATCAAAATGC---AGACAGACTATACATAGAGTGATGCAAATGTCTGACCTAAATGTCATATACATGCAAAAATGTACCCACAGGCATATATCCAAATAGACACGCAG--------AGACACTCATACCCATACCCAAGATATTTATAACCCTTGGCACACTCACACATTACAGTTCCCAAAAACTAAAACTGATTCCTACATC-AGAGGATTCTTTTTTCTGCAATTTTTCGCCTATTTTTTAAAAATTGTATGATATTCATGCCAGTA----------------TCAAGTT-----AA-TCAAAAAGAAAAAGGCTT-CATTA--TCAAACAAATCACTCTATTCATGGGGAAGGGTGAAAAATAAAGCAGAGAACACTTTACCTGTCCTTGGGAGTCAAAAAACTTGCTGATGGTATTCTTCAATTTGTTAAATAGCATTGGATAAAGAGCAGGACTCAATTCTAGACCCACCAGATCCTTAACATTGGTCCGTATTTGAAGTCCCACTTTCTCATGGTTACACACCATTAAGGATAACAGCCGATCCATAAATTTGCTGACAGGTGTATCTGCATTTCCCTCTGAAGACATCACTGAAATCATGGAACCCTTACGTTCACTGACTGGGCCCATGGGTGGGCTATAGGTTGCCAAGCCAGAATTGCTTCTCTGCTGCAGGCACACT---CCCCCAAGGGCACAGAGGAAGCCAGTCATGTTGATCCATTCCTGTAGGGAGTCCGTGTCAGACAAATCTATGGATCCTCCTCCACTGACATGAGACATTCGCCTCTTAACAATGGTCTTGTGAAGGCTTTCAGCAGCCTAAACACAAATTTTTTATGGAAAGCATGAATTCAACTTCAA-TTGGTTGAGAGACATGATAAAAT-CACTTTATCC----------------AACATTTTTTCCATGACAAAAGAACA i canFam3.chr9 C 0 I 4737 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=39567.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 264807 12 + 478999 AAAAATGTAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 104486 12 + 413329 AAAAATGTAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7174099 12 + 72422247 AAAAATGTAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751133 12 - 80904711 AAAAATGTAAAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53580747 12 - 80997621 AAAAATGTAAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50400730 12 - 74645514 aaaaatgtaaaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50455319 12 - 75148670 AAACATGTAAAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93336325 12 + 159171411 AAAAGTGTAAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42638891 12 - 122082543 aaaaaCTTGAAA i mm10.chr11 C 0 I 135 s canFam3.chr9 41619556 12 + 61074082 AAAGATGAAAAA i canFam3.chr9 I 4737 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=267618.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 264819 105 + 478999 AACACAT---------------------TAAAATCAACCCCAAAA--------------------------------------------------ATTACCATATACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTGTCA----TACACT--AATATAATCGCCC--A-AGTATCAAATTTCTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 104498 105 + 413329 AACACAT---------------------TAAAATCAACCCCAAAA--------------------------------------------------ATTACCATATACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTGTCA----TACACT--AATATAATCGCCC--A-AGTATCAAATTTCTTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7174111 105 + 72422247 AACACAT---------------------TAAAATCACCCCCCCAA--------------------------------------------------ATTACCATATACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTGTCA----TACACT--AATATAATCGCCC--A-AGTATCAAATTTCTTTT i ponAbe2.chrUn C 0 I 6054 s rheMac3.chr16 53751145 105 - 80904711 AATACAT---------------------TAAAATCAACCCCCAAA--------------------------------------------------ATTACCATACACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTATCA----TATACT--AATATAATCACCC--G-AGTATCAAATTTCTTTC i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53580759 105 - 80997621 AATACAT---------------------TAAAATCAACCCCCAAA--------------------------------------------------ATTACCATACACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTATCA----TATACT--AATATAATCACCC--G-AGTATCAAATTTCTTTC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50400742 105 - 74645514 aatacat---------------------taaaatcaacccccaaa--------------------------------------------------atTaccatacacatttttaaagagccac-tgatttatttttatca----tatact--AATATAATCACCC--G-AGTatcaaatttctttc i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50455331 105 - 75148670 AATACAT---------------------TAAAATCAACCCCCAAA--------------------------------------------------ATTACCATACACATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTATCA----TATACT--AATATAATCATCC--G-AGTATCAAATTTCTTTC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93336337 101 + 159171411 -----------------------------AAAGTTAAATCCCCAA--------------------------------------------------ATTACCATATAAATTTTTAAAGAGCCAC-TGATTTATTTTTGTCATAGCTACACT--AATATAATCACCC--G-AGTATCAAATTTGTTTT i calJac3.chr5 C 0 I 313 s mm10.chr11 42639038 179 - 122082543 aacccattctaagctatcatgtgagtgctagaactcacacccagatcctctgaagagcaaccagtgctcttaaacactgagccatctctctaatcccTACCATACACA-CATTAGAGAGCCACTTAATACATTTTTGTCA----TA-GCTAGAATAAAATCACCCTGA-AGTGTCAAATTCCTTTT i mm10.chr11 I 135 I 1 s canFam3.chr9 41619568 100 + 61074082 ---------------------------AATAAGTCCAAACCTAAG--------------------------------------------------ACTATCATATACATTTTTTAAGAGCCAC-TAGTATATTTTTGTCA----TAGACT--AGTATACCAACCA--ACAGTAACAAACTTCTTTG i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=791430.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 264924 365 + 478999 AAAAAGCTTTGATTTCacatggatgaaccttggaaacgtt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagcccacatattcta-aaattccatttacagaaaagatccagcagagacaaatctgcagagacagaaag-tagattcaaggttgcctagggctggagaagc------cgggggaagagagacaagaaagtggcgg-----ggaggtggg----------gtagggtgttagaggcagaaat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------ggatacaggggtttt--------------t----------------ttcctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaac-ggactgtgg------taatggttgcacaactctggg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagcc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gacacttta----------------aatgggtgaattgtatgg----------tat s panTro4.chrUn_GL393519 104603 375 + 413329 AAAAAGCTTTGATTTCacatggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagcccacatattcta-aaattccatttacagaaaagatccagcagagacaaatctgcagagacagaaag-tagattcatggttgcctagggctggagaagc------cgggggaagagagaCAAGAAAGTcccgg-----ggaggtggg----------gtagggtgttagaggcagaaat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------ggatacaggggtttt--------------t----------------ttcctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaac-ggactgtgg------taatggttgcacaactctggg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagcc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gacacttta----------------aatgggtgaattgtatggtatgtaattatat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7180270 375 + 72422247 aaaaagctttgatttcacatggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagtccacatattcta-aaattccatttacagaaaagatccagcatagacaaatctgcggagacagaaaa-tagattcatggttgcctagggctggagaagc------cgggggaagagagacaagaaagtggcgg-----gcaggtggg----------gtaggatattagaggcagaaat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------ggatacaggggtttt--------------t----------------ttcctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaac-tgactgtgg------taatggttgcacaactctggg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagcc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gacacttta----------------aatgggtgagttgtacggtatgtaattatat i ponAbe2.chrUn I 6054 C 0 s rheMac3.chr16 53751250 356 - 80904711 AAAAAGCTTTGATTTCacatggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagcccgcatattctattaattccatttacagaaaatatccagaataggcaaatctacagagacagaaag-tagattcgtggttgcctagggctggagaagt------taggggaagagagGCAAGAAAGCgggtg-----gggggtgg-------------------ttagaggcagagat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------gggtacaggg--ttt--------------t----------------tttctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaacttgattgtgt------tgatggttgcacaactctgtg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagtc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gataattta----------------aatgggtgaattgtatggcat---------- i rheMac3.chr16 C 0 I 15 s macFas5.chr16 53580864 356 - 80997621 AAAAAGCTTTGATTTCacatggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagcccgcatattctattaattccatttacagaaaatatccagaataggcaaatctacagagacagaaag-tagattcgtggttgcctagggctggagaagt------taggggaagagaggcaagaaagcgggtg-----gggggtgg-------------------ttagaggcagagat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------gggtacaggg--ttt--------------t----------------tttctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaacttgattgtgt------tgatggttgcacaactctgtg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagtc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gataattta----------------aatgggtgaattgtatggcat---------- i macFas5.chr16 C 0 I 15 s papAnu2.chr16 50400847 354 - 74645514 aaaaa--tttgatttcacatggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcaCAAAAGCCCGCATATTCTATTAATTCCATTTAcagaaaatatccagaataggcaaatctacagagacagaaag-tagattcgtggttgcctagggctggagaAGT------TAGGGGAAGAGAGGCAAGAAAGCGGGTG-----GGGGGTGG-------------------TTAGAGGCAGAGAT-----------------------------------------------AGCTAAA---------------------------------GGGTACAGGG--ttt--------------t----------------tttCTCAATTG---ATGAAA----------------------TTGTTCTaaaacttgattgtgg------tgatggttgtacaactctgtg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagtC---------------------------------------------------------------------------ACTGAATTG-GATaattta----------------aatgggtgaattgtatggcat---------- i papAnu2.chr16 C 0 I 15 s chlSab2.chr16 50455436 357 - 75148670 AAAAAGCTTTGATTTCacaaggatgaaccttggaaacatt--------atgctaagtgaaagaagctaatcacaaaagcccgcatattctattaattccatttacagaaaatatccagaataggcaaatctacagagacagaaagttagattcgtggttgcctagggctggagaagt------tgggggaagagaggcaagaaagcgggtg-----gggggtgg-------------------ttagaggcagagat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------gggtacaggg--ttt--------------t----------------tttctcaattg---atgaaa----------------------ttgttctaaaacttgattgtgg------tgatggttgcacaactctgtg------------------------aatata----------------------------------------------------ctaaaaacagtc---------------------------------------------------------------------------actgaattg-gataattta----------------aatgggtgaattgtatggcat---------- i chlSab2.chr16 C 0 I 21 s calJac3.chr5 93336751 358 + 159171411 aaaaaGCTTTGATTTCacatgggtgaaccttggaaaggttctaagtgaatgctaagtgaaagaagctaaccacaaaagcccacatattcta-caattccatttatagaaaatatccagaataggcaaatctacagagacagaaag-tagatttgtggttgcctaggactggagaagt------ggagggaagagaggcaagaaagtga--g-----ggaggggg-------------------ctagaggcagagat-----------------------------------------------agctaaa---------------------------------gggtacaggg--ttt--------------t----------------ttcctaaatta---atgaaa----------------------ttgttttaaaac-tgactgtgg------taatggttgcacaactct--g------------------------aatatt----------------------------------------------------caaaaaacagtc---------------------------------------------------------------------------actgaaatg-gacacttta----------------aacgggtgaattgtatggtat---------- i calJac3.chr5 I 313 I 10 s mm10.chr11 42639218 378 - 122082543 AAAAATCTCTGATGT-GTAGTgatgaaccttaaacaattt--------aaggaga---aaaaaagctagtcacaaaggcccatatcaccta-tgattccattgg-acaaaatactcagagaaggtaattttgtagaaatagaaca-tagattagcagctactcaaggctggagcggt-------agagacagagaggtaggaaa------t-----acagcaag-------------------ttagagctagaaat-----------------------------------------------agctaat---------------------------------ggggagcagg--tttggtgggagggggcat----------------tctgtgagagc---atgaaa----------------------atgtactaaaat-tgattgtgtataaactgacagttatagaattctgtg------------------------actata----------------------------------------------------ctaaaaacaatc---------------------------------------------------------------------------attaggttg-accaccttatgaaagataactctacagtatatgaattctatGCTGA---------- i mm10.chr11 I 1 C 0 s canFam3.chr9 41619668 629 + 61074082 AAAAAGCTTTGGCTa-acatgaacaaaccttgcaaacatt--------atgccaagtgaaaaaa----------------------------aaaatcatattatgtgaaatgtccagaatagacaaatct------acagaaag-caaactggtggttcccaagcgttggcagggtgtggggtggtggtggggagattagagaatgatagctcatggatatgggttttttttaattggggtgatagttgtggaactttgtaaatacactaTTTTTGTCTTGCTTTTTCATGGTCCAGGATGCCAGCTGAAGTTGTCAGCACAATGAAACCGAACTGGCAGGATGGATGCAGAT--TAT--------------TCTGCCATTCTTCTAGATCTCTGAGTTGTACATCAAATCTAGGGCTGATCACTCCACACTTGTTTAACATC-TACCTGTGAGGTTCACAACATTTTCCCAGCTCTGTGGTCATCAATGATTTCAAGCTCACCAATGTAACCATGCTTTATCATCACAGTTGGAAACTAGACAATGACTTTGGAACATGGCCTAAGGAAAACCTGTGCCTCTCTTTACGGCACAGTTGATGCCAGATGTTCATGTATACCATTATGGCAGCATGGAAAGGTGGCAGAAAGtgaactgtaacatttta----------------agtgtgcaaattgtgtcatat---------- i canFam3.chr9 C 0 I 14 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=10778.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 265289 13 + 478999 attaaacagttat s panTro4.chrUn_GL393519 104978 13 + 413329 attaaacagttat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7180645 13 + 72422247 attaaacagttat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751621 6 - 80904711 ATTAAA------- i rheMac3.chr16 I 15 C 0 s macFas5.chr16 53581235 6 - 80997621 ATTAAA------- i macFas5.chr16 I 15 C 0 s papAnu2.chr16 50401216 6 - 74645514 attaaa------- i papAnu2.chr16 I 15 C 0 s calJac3.chr5 93337119 13 + 159171411 attaaACAGTTAT i calJac3.chr5 I 10 C 0 s mm10.chr11 42639596 13 - 122082543 TTTAAACAGTCAA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41620311 13 + 61074082 aataaaATGTTAC i canFam3.chr9 I 14 C 0 e chlSab2.chr16 50455793 21 - 75148670 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=224187.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 265302 79 + 478999 ccccccaaaag--ctttcattctaaaGCTACATGTCCCCTCCA--AATAAAGCTATTAGGTACACAATTTTGCTTCATAAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 104991 79 + 413329 ACCCCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTCCA--AATAAAGCTATTAGGTACACAATTTTGCTTCATAAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7180658 79 + 72422247 CCCCCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTCCA--AATAAAGCTATTAGGTACACAATTTTGCTTCATAAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751627 79 - 80904711 CCCTCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTTCA--AATAAAGGTATTAGGTACATAATTTTGCTTCACAAAAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53581241 79 - 80997621 CCCTCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTTCA--AATAAAGGTATTAGGTACATAATTTTGCTTCACAAAAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50401222 79 - 74645514 ctCCCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTTCA--AATAAAGGTATTAGGTACATAATTTTGCTTCacaaaaa i papAnu2.chr16 C 0 I 245 s chlSab2.chr16 50455814 79 - 75148670 TCCCCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCCTTCA--AATAAAGGTATTAGGTACATAATTTTGCTTCACAAAAA i chlSab2.chr16 I 21 C 0 s calJac3.chr5 93337132 79 + 159171411 ACCCCCAAAAG--CTTTCATTCTAAAGCTACATGTCCCTTCCA--AATAAAGGTATTAGGTACACAATTTTGCTTTATAAAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42639609 66 - 122082543 -CACCCACACT--CCCACCCTCAAAAGAAAAA-----CTTTCATGACTAAGGCTGT---------ATTATTTCCTCAAAACAA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41620324 77 + 61074082 -CCCCCAAAAAACCTTTCATCCTAAGGCCACATGTCCTCTCCA--AATGA---CATTAGGTACATATTCTTGCTTTACAAAAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=687435.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 265381 259 + 478999 CATAACATTTT---TCTTATTGTAATTAAGTATGACAG-AAAAAAAC---ATGGGGGAATAACCAGTTTATATAAATTGCCTA---ATAATGGGAGGAATATGAACATTACAAATCAATTACACACAAACACCAAC---TCATCAATTTCCAGAGTAACAG--------------------------ATAATATAGTCAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATCTCATTTAATCT----ATGGGTTCAATCTTTTGCCCAAGACATTCCTTAATTAGAATACTTAACAA s panTro4.chrUn_GL393519 105070 256 + 413329 CATAACATTTT---TCTTATTGTAAT----TATGACAGAAAAAAAAC---ATGGGGGAATAACCAGTTTTTATAAATCGCCTA---ATAATGAGAGGAATATGAACATTACAAACCAATTACACATAAACACCAAC---TCATCAATTTCCAGAGTAACAG--------------------------ATAATATAGTCAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATTTCATTTAATCT----ATGGGTTCAATCTTTTGCCCAAGACATTCCTTAATTAGAATACTTAACAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7180737 259 + 72422247 CATAACACTTT---TCTTATTGCAATTAAGTATGACAG-AAAAAAAC---ATGGGGGAATAATCAGTTTTTATAAATCGCCTA---ATAATGAGAGGAATATGAACATTACAAATCAATTACACACAAACACCAAC---TCATCAATTTCCAGAGTAACAG--------------------------ATAATATAGTCAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATTTCATTTTATCT----ATGGGTTCAATCTTTTGCCCAAGACATTCCTTAATTAGAATACTTAACAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751706 259 - 80904711 TGTAACTTTTT---TCTTATTGTAATTAAGCATGACCA-AAAAA------ATGGGGGAGTAACCAGTTTTTATAAATCATCTA---ATAATGAGAGCAATATGAACATTACAAATCAAGTACACACAAACACCAACTGATCATTAATTTCCAAAGTAACGG--------------------------GTAACACAGTGAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATTTCATTTACTCT----ATGGGCTCAATCTACTGCCTAAGACATTCCTTAATTAGAATACCTAACAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53581320 259 - 80997621 TGTAACTTTTT---TCTTATTGTAATTAAGCATGACCA-AAAAA------ATGGAGGAATAACCAGTTTTTATAAATCATCTA---ATAATGAGAGCAATATGAACATTACAAATCAAGTACACACAAACACCAACTGATCATTAATTTCCAAAGTAACGG--------------------------GTAACACAGTGAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATTTCATTTACTCT----ATGGGCTCAATCTACTGCCTAAGACATTCCTTAATTAGAATACCTAACAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50401546 259 - 74645514 cataacttttt---tcttattgtaattAAGCATGACCa-aaaaa------aTGGGGGAATAACCAGTTTTTATAAATCACCTA---ATAATGAGAGCAATATGAACATTACAAATCAAGTACACACAAACACCAACTGATCATTAATTTCCAAAGTAACGG--------------------------GTAATACAGTGAATAGTAATAGTTGAATGAActgtccaca-------ttttaaaatttcatttactcT----ATGGGCTCAATCTACTGCCTAAGACATTCCTTAATTAGAATACCtaacaa i papAnu2.chr16 I 245 C 0 s chlSab2.chr16 50455893 259 - 75148670 TGTAACTTTTT---TCTTATTGTAATTAAGCATGACCA-AAAAA------ATGGGAGAATGACCAGTTTTTATAAATCACCTA---ATAATGAGAGCAATATGAACATTACAAATCAAGTACACACAAACACCAACTGATCATTAATTTCCAAAGTAATGG--------------------------GTAATACAGTGAATAGTAATAGTTGAATGAACTATCCACA-------TTTTAAATTTTCATTTACTCT----ATGGGCTCAATCTACTGCCTAAGACATTCCTTAATTAGAATACCTAACAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93337211 261 + 159171411 TATAACTCTTT---TCTTATTGTAATTAAGCATGACAG-AAAAAAAC--AACAGAGGAATAACCAGTTTTTACAAATCACCTA---AAAAT--GAGTAATATGAATATTACAAATGAAATACACGCAAATACCAACTGATCGTTAATTTCCAAAGTAATAG--------------------------ATAAAACCATCAATAGTAATAGTTGAATGAACTGTCCACA-------TTTTAAAATTTCATTTAATCT----GTGGGTTCAATCTTCTGCCCAAGACATTCCTTAATTAGAACACCTAACAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42639675 286 - 122082543 ------CTTTT---ACTTGCTCTAAGTGACCATAACAA-GAAAAACAGCAATTGGAGGATAAACAGTTTGTCTCAAAGACCTG---ATAATGAAAGCAGTAT-AGTAATACAAATTAGTTATACACAA--ACCAGTTAATTCTTAATTTCTAGGGTAATAGAGAATTGGTGGTAGTTGCTGAATAAAATGATTCACTTGATGATAATAGTTAAATAAAATGTCCAAA-------GTTTAAAATTGCACTCAACCTTAAAGTGCGCTCGATTATGTGCTCAGCAGCCCCTTTAATTAGAGTATCTAAGAA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41620401 247 + 61074082 CATAACTTTTTTTCTCTTGTTCTAATTAAGAATGACAA-GAAAAAAGCA-ATGGGAG--------GCTTT-----AACATCTAATTATAATGAGAGCAATATGGCCATTACAAATCAAATATACACAAATGCAA-----TTATTAATTTCTGGGGTAATAG--------------------------ATGA------------TAATAGTTGGATGAAATGTCCAAAAAAATTTTTTTTGAATTTCACTTAACCT----AGGAGTTCAGTCTTCTGCCCACCAGATCCCTTAATTAAAATACCAAATGA i canFam3.chr9 C 0 I 240 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=48294.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 265640 14 + 478999 AATAGCAAAATGAA s panTro4.chrUn_GL393519 105326 14 + 413329 AATAGCAAAATGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7180996 14 + 72422247 AATAGCAAAGTGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751965 14 - 80904711 AATAGCAAAATGAA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53581579 14 - 80997621 AATAGCAAAATGAA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50401805 14 - 74645514 aatagcaaaatgaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50456152 14 - 75148670 AATAGCAAAATGAA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93337472 14 + 159171411 AATAGCAAAATGAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42639961 14 - 122082543 TACAGCATAATGag i mm10.chr11 C 0 I 125 s canFam3.chr9 41620888 14 + 61074082 AATAGTAAAATGTA i canFam3.chr9 I 240 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1164474.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 265654 432 + 478999 TTGTTTC----------CATGTT---------------------TT---TTTTCTCTACCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACCCTGATGAAGGGATAAAGAGCAAGAA--AAGAT----AAATGGTCTCTGC----AACAGTCTCTAGc-agtgctgcccagtatttctgtgatgatggaaacattttctctctctgctgtcca-------------gactgtcatatgtggctactgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattgtatttaatt--ttcattatgttaaaat------------ttaaatagtcacacgtagctagtggctaccatattacgaagtacaggtctagaTAAACCACAACTAAATATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCGTGAGAGATTACCAAAGAGAAGGACATATATTTAGCAGATCAGTTAATAGACAAAAGTC s panTro4.chrUn_GL393519 105340 436 + 413329 TTGTTTC----------CATGTT---------------------TT---TTTTCTCTACCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACCCTGATGAAGGGATAAAGAGCAAGAA--AAGATAAAGAAATGGTCTCTGC----AACAGTCTCTAGc-agtgctgcccagtatttctgtgatgatggaaacattttctctctctgctgtcca-------------gactgtcatatgtggctactgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattgtatttaatt--ttcattatgttaaaat------------ttaaatagtcacacgtagctagtggctaccatattacgaagtacaggtctggaTAAACCACAACTAAATATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCGTGAAAGATTACCAAAGAGAAGGACATATATTTAGCAGATCAGTTAATAGACAAAAGGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7181010 436 + 72422247 TTGTTTC----------CATGTT---------------------TT---TTTTCTCTACCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACCCTGATGAAGGGATAAAGAGCAATAA--AAGATAAAGAAATGGTCTCTGC----AACAGTCTCTAGc-agtgttgcccagtatttctgtgatgatggaaacattttctctctctgctgtcca-------------gattgtcatatttggctactgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattgtatttaatt--ttcattatgttaaaat------------ttaaatagtcacacgtagctagtggctaccatattacaaagtacagGTCTAGATAAACCACAACTAAATATCCGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTA--AGTGACTCGTGAAAGATTACCAAAGAGAAGTACATATATTTAGTAGATCAGTTAATAGACAAAAGTC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53751979 454 - 80904711 TTGTTTC----------CATGTTA--------------------AC---TCTTCTCTGCCT----CTGTTGTTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGGAACACCCTGATGAAGGGAGGAAGAGCAAGAA--AAGGTAAAGAAATGGTCTCTGCAACCAACAGTCTCTAGG-AATgctgcccagtatttctgtggcgatgggaacattt--tctctctgctgtccaacagagtaagt--aattgtcaaatgtggctactgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattttatttaatt--ttaattatgttaaaattta-------agttaaatcatcacacat-gctagtggctaccatattacaaagtacagGTCTAGATAAACCACAATTAAACATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCATGAAAGATTACCAAAGTGAAGTACATATATTTAGCAGATCAATTAATAGACAAAAGTC i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53581593 454 - 80997621 TTGTTTC----------CATGTTA--------------------AC---TCTTCTCTGCCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACCCTGATGAAGGGAGGAAGAGCAAGAA--AAGGTAAAGAAATGGTCTCTGCAACCAACAGTCTCTAGG-AATgctgcccagtatttctgtggtgatgggaacattt--tctctctgctgtccaacagagtaagt--aattgtcaaatgtggctactgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattttatttaatt--ttaattatgttaaaattta-------agttaaatcatcacacat-gctagtggctaccatattacaaagtacagGTCTAGATAAACCACAATTAAACATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCATGAAAGATTACCAAAGTGAAGTACATATATTTAGCAGATCAATTAATAGACAAAACCC i macFas5.chr16 C 0 I 128 s papAnu2.chr16 50401819 456 - 74645514 TTGTTTC----------CATGTTA--------------------AC---TCTTCTCTACCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACCCTGATGAagggagaaagagcaagaa--aaggtaaagaaatgGTCTCTGCAACAAACAGTCTCTAGG-AATGCTGCCCAGTATTTCTGTGATGATGGGaacattttctctctctgctgtccAACAGAGTAAGT--AATTGTCAAATGTGGCTACTGGGTACTTGCAATGTGGCTACTATATGATTGAggaactaaattttatttaatt--ttaattatgttaaaattta-------agttaaatcATCACACat-gctagtggctaccatattacaAAGTACAGGTCTAGATAAACCACAATTAAATATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCATGAAAGATTACCAAAGTGAAGTACATATATTTAGCAGATCAATTAATAGACAAAAGTC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50456166 456 - 75148670 TTGTTTC----------CATGTTA--------------------AC---TCTTCTCTACCT----CTGTTGCTCCTTTTCTGAAAATTCTGTGAAACACACTGATGAAGGGAGAAAGAGCAAGAA--AAGGTAAAGAAATGGTCTCTGCAACAAACAGTCTCTAGG-AATgctgcccagtatttctgtgatgatgggaacattttctctctctgctgtccaacagagtaagt--aattgtcaaatgtggctagtgggtacttgcaatgtggctactatatgattgaggaactaaattttatttaatt--ttaattatgttaaaattta-------agttaaatcatcacacat-gctagtggctaccatattacaaagtacagGTCTAGATAAACCACAATTAAATATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTTTACTG--AGTGACTCATGAAAGATTACCAAAGTGAAGTACATATATTTAGCAGATCAATTAATAGACAAAAGTC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93337486 453 + 159171411 TTGTTTC----------CATGTTA--------------------AT---TTTTCTCTACCT----CTGCTGCTCCTTTTCTGAAAATTTTGTGAAGCACCCTGATGAAGGGGAAAAGACCAATAA--AGGGTAAAGAAATGGTCTCTGCAACAAATAGTCTCTGGc-agtgctgcccagtatttctgtgatgatagaaacattttctctctctgctgtccaatagagt------aagtgtcatatgtggctactgagtacttggaatgtggctagtatatgactgagaaactaaattttaattttac--ttaattatgttaaaattta-------agtcaaatagtcacatgtagctagtggctaccgtgttacaaagtacagGTCTAGATAAACCACAACTAAATATCAGTCTTCAGACAACTATATG------CTTACTATACTG--AGACACACACAAAAGATTACCAAAGTGAAGTACATATATTTAGCAGTTCAGGTAACAAACAACAGTC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42640100 449 - 122082543 ctgtctcaaagcaaacaCACGTTACGAGAATTCTTAGAAATATTCT---CTTTCTCTATCTACAGCTATTAGATCTTTTCTAAACGTTCTTTG-AATACTTCAAC-AAAGGACAAAGAACATCAA--TGAGT----AACTGGTCTCTCAACTAAGTGGTTTCTAGC-AGAGATATTTAATATTCCTGTAGTCAT-GTAACCTTTTACATCTCTACTATCCAACTGAGTAAAT--AAATACTGAACCT---------------------TGGCTACTATAAAATTGAAAAAGTAAGTCTAACTTGTTTAATTAAATGAGTTAAAAGTGA------CATTCTAACAGATACATGTGGCTAATATCTACAAGAGTAGGCAA-ACAGA--CAGACAGACCACAGGTA-------TTCTTAAAACAACTCCATATAATATCCTACTCTTC-----GTAGCTCATCAAGGATTACTTAAGTGAAG----------CAACAGATCTATTAATACACAAAAATT i mm10.chr11 I 125 C 0 s canFam3.chr9 41620902 460 + 61074082 --GTTTC----------AATTTTA--------------------ATGTATTTTCTCTACCT----TTGTCGTCCCTTTCCTGAAAATTCCACGAAATACTCTGAT----GGAAAAAGAGAAGGAAAGAGGATAAGGGAATGGTCCCTACCATAAATCATCTCTAGCTCATgctggccaatatttctgtaataatggcaacattg-gtatctgtgttgtccaatgcagtatagcaaatggccacgtgtagctaatgagtcctcgaaatgtggttactgtatgactgagcaactcaattttaactgtat--ttaattaatttagattttcatttaaactttaaaaaatcacatgtggctggtggctaccatatt----CATGCAGTTTCAGATGAACCACAACTAAATAACAGTCTTACAACAACTATATA------CATATTATACTAACAGTGACTCA--AAAGATTATTGGAGTGAAATACCTATGTCTAGCAGATCAGTTTAAAGACAAAATC- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=4024314.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 266086 1316 + 478999 AACTTTACA----GACTTACCTGGCTGTCATCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAAGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAATTATCACTTGAAAGCAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACGTCAACCAGCAATGGCCAAGTTTCAAACTTGATGTATAATAAGTACTCAGATATTA---CACTTCTAACACGCACATATCTTGGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATTACACATATGTAACAATAGGTTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTAGGAGGGGTGTTTCTCTTGCTAAGAGCACACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTAAGTGCGCCTCCGCAGTGCCATCACTC-TTTCTGAAGTGCTGCTGTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCCAATCAAGTCACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCCATGGAGAACCTCATAAGCCCTACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAGGAGCAGA-GCAAATGCCTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCACAGGAAAGGT--ACTTATCTTAAACTCTACAATGTCC----ACAGCACAAAATAGCTA--TTCCCACCTATAATTTACTCAAAACATATGCCAATGTGCATAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGTGGGGTAAATTATATGATC-ACAACTGATAGTAACATATACTGCCAGTTATTTTTAAAACATATAGCATATTAAAAACTCACTGGGAGAC--------TATTTCAAATGCTTTTTCTTTTCATCTTTGTTTCATTTCTTTGTTCAGAAAAGGATTTCAAGTAAGCTACTTGAATCTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTAACCTTAAATACATTCT--------CACAATTAGATGCCA----------CGTGCTTC-AGGCAGGTTGAGT-------AAAAAAACCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCACATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGCTACAGTTGGGCAAGAGGTGATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCAGGTATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCACTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGCGCCACACTTCTAGTTTGGTCTGCCCTTGTTGGCAAATCGGGG-AGG--GGGGGCGGGGGCGGTTGCGCTTCATCCTGCTGCACTATCCTGAGAGTCAAAGTTGTAAGACA-TATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATGTATAAAACCCAACAATGCA--ATAAACTGCgtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt s panTro4.chrUn_GL393519 105776 1311 + 413329 AACTTTACA----GACTTACCTGGCTATCATCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAAGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAATTATCACTTGAAAGCAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACGTCAATCAGCAATGGCCAAGTTTCAAACTTGATGTATAATAAGTACTCAGATATTA---CACTTCTAACGCGCACATATCTTGGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATTACACATATGTAACAATAGGTTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTAGGAGGGGTGTTTCTCTTGCTAAGAGCACACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTAAGTGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTC-TTTCTCAAGTGCTGCTGTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCCAATCAAGTCACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCAATGGAGAACCTCATAAGCCCTACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAGGAGCAGA-GCAAATGCCTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCACAGGAAAGGT--ACTTATCTTAGACTCTACAATGTCC----ACAGCACAAAATAGCTA--TTCCCACCTATAATTTACTCAAAACATATGCCAATGTGCGTAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGTGGAGTAAATTATATGATC-ACAACTGATAGTAACATATACTGCCAGTTATTTTTAAAACGTATAGCATATTAAAAACTCAGTGGGAGAC--------TATTTCAAATGCTTTTTCTTTTCATCTTTGTTTCATTTCTTTGTTCAGAAAAGGATTTCAAGTAAGCTACTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTAACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGTCA----------CGTGTTTC-AGGCAGGTTGAGT-------AAAAAAACCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCACATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGCTACAGTTGGGCAAGAGGTGATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCAGGTATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACACGGCAACCAGAACAGCTTCACTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGCGCCACACTTCTAGTTTGGTCTGCCCTTGTTGGCAAATCGGGGAAGG--AGGGGCGGGGGCGGTTGCGCTTCATCCTGCTGCACTATCCTGAGAGTCAAAGTTGTAAGACA-TATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATGTATAAAATCCAACAATGCA--ATAAACTGC-------Atgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7181446 1297 + 72422247 AACTTTACA----GACTTACCTGGCTATCATCCATTTTGGCTTTTGGCTAGTTAAAGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAGTTATCACTTGAAAGCAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACGTTCATCAGCAACAGCCAAGCTTCAAACTTGATGTATAGTAAGTACTCAGATATTA---CACTTCTAACACACACATATCTTGGATTTACTTC-AAAGCTATTCCTGATTACACATATGTAACAATAGGTTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTGGGAGGGGTGTTTCTGTTGCTGAGGGCACACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAGTGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTC-TTTCTGAAATGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCCAATCAAGTCACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCAATGGAGAACCTGATAAGCCC-ACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAGGAGCAGA-GAAAATGCTTCAAATGATAAACCGAAAAACTTCCTTTCACTAACTTCACAGGAAAGGT--ACTTATCTTAGTCTCTACAATGTCC----ACAGCACAAAATAGCTA--TTCCCACCTATAATTTACTCAAAACATATGCCAATATGCGTAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGTGGAGTAAATTACATGATC-ACAACTG----------ATACAGCCAGTTATTTTTAAAACGTATAGCATATTAAAAACTCAGTGGGAGAC--------TATTTCAAATGCTTTTTATTTTCATC---------TTACTTTGTTCAGAAAAGGATTTCAAGTAAGCTACTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTAACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGCCA----------TGTGCTTC-AGGCAGGTTGAGT-------AAAAAAACAACTATTCACATTTACCTGTTGACATCACGTTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGCTACAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACATTTCATCCACCCCACACCAGGTATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGATATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGCGCCACACTTCTGGTTTGGTCTGCCCTTGTTGGCAAATCAGGG-AGGGTGGGGGCAGGGGTGGTTGCGCTTCATCCTGCTGCACTATCCTGAGAGTCAAAGTTGGAAGACA-TATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATGTATAAAACCCAACAATGCA--ATAAACTGCCtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53752433 1301 - 80904711 AACTTTACA----AACTTACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAGGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAGTTATCACTTGAAAACAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACATTCATGAGCAACAGTCAAGTTTCAAACTTGAGGTATATTAAATACTCAGATATTA---TACTTGTAATATGCACATATCTTAGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATCACACATACGTAACAAGAGGCTTCCAAAATTGAGGGT-GGGTGCCTGGAAGGGGTGTCTCTGTTGCTAAGGGCATACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCAAATCAAGTTACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCAATGGAGAACCTGATAAGCCCCACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAAGAGTAGA-GCAAATGCTTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCAGAAGAAAGGT--ACTTATCTTGGACTCTACAATGTCC----ACAGAATAAAATAACTA--TTCCCACCTATAATTTACTCGAAACATACGCCAATATTCATAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGCAGAGTAAATTACATAATC-ATAACTGATAGTAACATACACTGCCAGTTATTTTTAAAATGTATAGCATATTAACAACTCAGTAGGAGACTAACAATTTATTTCAAATGCTTTTTATTTTCATC---------TTACTTTGTTCAGAGAAGGATTTCAAGTAAGCTATTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTGACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGCCA----------TGTGCTTTGAGGCAGACTGAGT-------AAAAAAACCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCGGATATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGGGC--CACTTCTAGTTTGGTCTGGGCTTGTCGGCAAATCGGGG-GGG----------------TTCCGCTGCATCCTGCTGCACTATCCTGACAGTCAAGGGTGGAAGACA-TATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATATATAAAACCCAACAATGCA--ATCAACtgtgtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i rheMac3.chr16 C 0 I 29662 s macFas5.chr16 53582175 1302 - 80997621 AACTTTACA----AACTTACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAGGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAGTTATCACTTGAAAACAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACATTCATGAGCAACAGTCAAGTTTCAAACTTGAGGTATATTAAATACTCAGATATTA---TACTTGTAATATGCACATATCTTAGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATCACACATACGTAACAAGAGGCTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTGGAAGGGGTGTCTCTGTTGCTAAGGGCATACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCAAATCAAGTTACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCAATGGAGAACCTGATAAGCCCCACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAAGAGTAGA-GCAAATGCTTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCAGAAGAAAGGT--ACTTATCTTGGACTCTACAATGTCC----ACAGAATAAAATAACTA--TTCCCACCTATAATTTACTCGAAACATATGCCAATGTTCATAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGCAGAGTAAATTACATAATC-ATAACTGATAGTAACATACACTGCCAGTTATTTTTAAAATGTATAGCATATTAACAACTCAGTAGGAGACTAACAATTTATTTCAAATGCTTTTTATTTTCATC---------TTACTTTGTTCAGAGAAGGATTTCAAGTAAGCTATTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTGACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGCCA----------TGTGCTTTGAGGCAGACTGAGT------AAAAAAAACCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCGGATATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGGGC--CACTTCTAGTTTGGTCTGGGCTTGTCGGCAAATCGGGG-GGG----------------TTCCGCTGCATCCTGCTGCACTATCCTGACAGTCAAGGGTGGAAGACA-TATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATATATAAAACCCAACAATGCA--ATCAACtgtgtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i macFas5.chr16 I 128 I 29417 s papAnu2.chr16 50402275 1302 - 74645514 AACTTTACA----AACTTACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAGGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAGTTATCACTTGAAAATAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACATCCATGAGCAACAGTCAAGTTTCAAACTTGAGGTATATTAAATACTCAGATATTA---TACTTGTAATATGCACATATCTTAGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATCACACATATGTAACAAGAGGCTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTGGAAAGGGTGTTTCTGTTGCTAAGGGCATACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCAAATCAAGTTACTGCACTTAGAGCCCTGCCTGCCAATGGAGAACCTGATAAGCCCCACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAAGAGTAGA-GCAAATGCCTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCAGAAGAAAGGT--ACTTATCTTGGACTCTACAATGTCC----ACAGAATAAAATAACTA--TTCCCACCTATAATTTACTCGAAACATATACCAATGTTCATAAAACTTCACTATCTACAACTTACGCAGAGTAAATTACATAATC-GTAACTGATAGTAACATACACtgccagttatttttaaaatgtatagcaTATTAACAACTCAGTAGGAGACTAACAAtttatttcaaatgctttttattttcatc---------ttactTTGTTCAGAGAAGGATTTCAAGTAAGCTATTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTGACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGCCA----------TGTGCTTTGAGGCAGACTGAGT------aaaaaaaaCCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCGGATATCTGCTTCCTCACAGAGGTGTCGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCACAGAAACATGTACAGGGC--CACTTCTAGTTTGGTCTGGGCTTGTCGGCAAATCgggg-ggg----------------TTCCGCTGCATCCTGCTGCACTATCCTGACAGTCAAGGGTGGAAGACA-TATATTTGCAACTCGggtaattttacatataaaaccCAACAATGCA--atcaactctgtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt i papAnu2.chr16 C 0 I 29249 s chlSab2.chr16 50456622 1301 - 75148670 AACTTTACA----AACTTACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAGGATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAGTTATCACTTGAAAACAACTTTAAGTCTAGAGCTAAACATCCATGAGCAACAGTCAAGTTTCAAACTTGGGGTATATTAAATACTCAGATATTA---TACTTGTAATACGCACATATCTTAGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATCACACATATGTAACAAGAGGCTTCCAAAATTGAGGGT-GGGCGCCTGGAAGAGGTGTTTCTGTTGCTAAGGGCATACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTCAGCAGTGCCATCACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAC-AGCAAATCAAGTTACTACACTTAGAGCCCTGTCTGCCAATGGAAAACCTGATAAGCCCCACCCAAAAGGCAGAGT---AGGAAGAGTAGAGGCAAATGCTTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCAGAAGAAAGGT--ACTTATCTTGGACTCTACAATGTCC----ACAGAATAAAATAACTA--TTCCCACCTATAATTTACTCGAAACATATGCCAATGTTCATAAAACTTCACTATCTACAACTTAGGCAGAGTAAATTACATAATC-ATAACTGATAGTAACATACACTGCCAGTTATTTTTAAAATGTATAGCATATTAACAACTCAGTAGGAGACTAACAATTTATTTCAAATGCTTTTTATTTTCATC---------TTACTTTGTTCAGAGAAGGATTTCAAGTAAGCTATTTGAATTTCCCCTGTAAACTTACAAAGTAGTGACCTTACATACATTCT--------CACAATCAGATGCCA----------TGTGCTTTGAGGCAGACTGAGC------AAAAAAAACCACCATTCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGCAAACTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACACTTCATCCACCCCACACCGGATATCTGCTTCCTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCAGAGAAACATGTACAGGGC--CACTTCTAGTTTGGTCTGGGCTTGTCGGCAAATCGGGG-GGG----------------TTCCGCTGCATCCTGCTGCACTATCCTGACAGTCAAGGGTGGAAGACA-AATATTTGCAACTTGGGTAATTTTATATATAAAACCCAACAATGCA--ATCAACtgtgtg-tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt-- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 93337939 1284 + 159171411 AACTTTACA----CACTTACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGATAGTTAAGTATTAGTTTTGTTGCTTGTTCCCATTTTGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAATTATCACTTAAAAGCAACTTTAAGTCTAAAATTAAACACCAGTCAGAAACAGCCAAGTTTCAAACTTGATGTATATTAAGTACTCAGACGTTA---TACTTGTAATATGCACATATCTTGGATTTACTTCAAAAGCTATTCCTGATCACACATATGTAACAAGAGGCTTCCAAAATTGAGGGTGGGGGGCCTGGAAGGGGTGTTTCTGTTGTGAAGGGCATACCTCAGTGTTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTCAGTAGTGCCATTACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAATACAAG-AGCAAATCAAGTTATTGCACTTAGAGCCCTGCCTGATGATGGAGAACCTGATAAGTCCCACTCAAAAGGCAGAGT---AGAGGGAGCAGG-ACAAATGCTTCAAATGATAAAGCCAAAAACTTCCTTTCACTAACCTCACAGGAAAGGT--ACTTATCTTGGACTTT----TATCTTGGAATAGCATAAAATAGCTG--TTCCCACCTATAATTTACTCAAAACATATGCCAATGTGTGTAAAACTTCACTATCTACAACGTAGGCAGAGTAAATTACATAATC-ATAATTGATGGTAACATATACTGCCAGTTATTTTAAAAATGTACAGCATATTAAAAATTCAGTGAGAGACTAACAATTTATTTCAAATG----TTATTTTCATC---------TTGCTTTGTTCAGAAAAGGATTTCAAGTAAGCTACTTGAATTTCCCCTG-AAACTTACAAAGCAGTAACCTTAAATACATTCT--------CACAATCAGATGCCG-----------GGGCTTTGAGGCAGACTAAGT-------AAAAAAACCACTATTCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGAAAACTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAGGTTATGCACTGACACTTCATCCACACCACACCGGATATCTGCTTCCTCGCAGAGATGGCGAAAACAAGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGTTCCAAAGAAACATGTACAAGGC--CACTTCCAGTTTGGTCTGGGCTTGTCGACAAATTGGTG-GGG----------------TTCCACTGCATCCTGCTGTACTATCCTGAGAGTCAAGGGTGAAAGACG-TATATTTGTAACTTGGGTAATTTTATGTATAAAACCCAGCAATGCA--ATAAACTGCATG-TGTGTGTATAAATAA------------ i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42640549 1217 - 122082543 CACTGAAAAAAACAACTCACCTGGCCATCTTCCATTTTGGCTTTTGGGTAGTTAAGGATTAGTTTTGTAGCCTGTTCCCACTTTGCATGTGTATCTTCCCAGGCCTAAAATGAAGTCAATTATCACTAGGGAGCAACTTTAGGGGTGAA----------------------------TTCAAAGTCAACATGTAATGCAGGTTCTGAGAATACCCTACTTGTAATATGCACATAACTCAGCTTTGCTTCTCAAGTTGTT-CTGAT--CACATAGCTAACAG--------TAACATAGGGAGG-GGG----------AGGTGCTGCAGCTGCTGAGGCCATACCTCAATGTTTCCTGCAGTAGGGTGCTCAATGCGCCTTAGCAGGGCCATCACTCTTTTCTGAAGCGCTGCTCTTCCTAAGCAAAGACAGCAAGCAAACCCAGTTAGTG--TTTAGAGCCAT-CTTCACATCTGGGAGCCT-----GCCCCACACACAGAGTAGAGT----GAAGGAATGAA-ACAAATGATTCTGATGATCGAGGTGAGCACGTGCTCTCACCAACCTCTGCAAGAGTATTCATTGATCCCCAACTCCAAAAGGTCT----ACAACATAAAACAGCCATCTTCCCACCTAT-GTTTA-TGGAAATATATGCCTAGGTGTTTAAAATCTTCCCATTTATAATTCAAGCAGAGTAATTTCTATAATCTATAACTAACATCAACTTACAGTGCCAGTTACCAATAAG----TTTGAATATTAAAAATTCAGTA--------------AATTTCAAATGTCACTGAATTACATC----------TACCTTGTTCAGAAAAGGATTTCAAGTAAACCGTATGAATTTGTCCTGAAAACTTTCAAACTGTT--CTTTAAATAGACTCCACTGTAAAAATAATTAGATGTCAGTCAAAGTAACATGGTT--AAAAAGAGTAAGAGA-AAAAAAAAAAAAAAAGAGCCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACTGAGGCAAATTCCATGAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAAGTTGTGTACTGACACTTCATCTACCCCACATCGAATATCTGCTTCTTCACAGAGGTGGCGGAAACAGGACATAGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGATTCCACAGAAACATGTATAAGGC--CACTTCTAGCTTGGTCTGGGCTTGTCGGCATATAGGTG-GGG----------------TTCCACTGCACCCTGCTGTGCTATCCTGGGAGGAAGG------AGGGA-TGTATCTGCAACTTAGGTGACTTTATTTAC-AAACTCAACAATGTACCATTTAC---------------------------------- i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41621362 1281 + 61074082 AACTTTACA----AACTCACCTGGCCATCTTCCATTTTAGCTTTTGGGTAGTTGAGGATTAGTTTTGTAGCTTGTTCCCACTTCGCATGTGTATCTTCCCAAGCCTAAAATGAAGGCAATTACCACTTGAAAGCAACTTTAAACCTAGAACTAAAAATCAATCAGCAAGAGACAGGTCTCAAACTTGGTACATATTATA-------ATATCC---TACTTGTAATACGCACATATCTTCGATTTGCTTCAAAAGCTATTTCTGGTCACACACACATGACCTGAGGCTTCTACATTTGTGGGT-GGGGGCCTGGGAGGGCTGGTGCTTTTGCTAAGGGCATACCTCGGTATTTCCTGCAGTGGGATGCTCAATGCGCCTTAGTAGTGCCATCACTCTTTTCTGAAGTGCTGCTCTTCCTAAGCAAAGACAAC-AGCAAATCAACTCATTGCACTTAGAGCCCTGCTTGCCAAGGGAGAAGCTGGCAAGCCCAACCCATAAGGCAGAGGAGGAGGAGGAGCAGA-ATCAATGCTTC-AATGATAAAAGTGAACACTTCCTTTCACCAACCTCACAGGAAAGGT--ATTTAACTTGGACTCTACAATGTCC----ACAGCATAAAATCGATA--TTCCCATCTGTAG-TTACTCAAAACATGTGCCACCGTC--TAGAACTTCACTATATATAGTTCAGCCATAGTAAATTATAAAATTTGTAACTGACAGCAATTTATACTGCCAGTTTTTAAACAAATATGCTGCATATTAAAAGCTCAGTATGAAGTTAACGATTTATTTCAAATGCTATTTACTTTCACC---------CTATCTTGTGTAGAAAAGG-TTTCAGGTAAGCAATTTGAATTAATCCTATAAACTTACAAAGTAGTTCC------TACATTCC-----TAGCACAATTGGATGTCA----------TGTGATTCAAGGCAAACTGAACAAGAGGAAGAAAAAACATTACCCACATTTACCTGTTGACATCATATTGCTGACAGAGGCAAATTCCATAAATGTGTTATAGTTGGGCAAGAAGTTGTGCACCGACACTTCGTCCACCCCACACCGGATATCTGCTTCCTCACAAAGGTGACGGAAACAGGACATGGCAACCAGAACAGCTTCAGTGTCAGGGCTCCACAGAAACATGTACAGGGC--CACTTCTAGTTTAGTCTGAGCTTGTCGGCATATTGGCG-GAG----------------TACCGCTGCACCCTGCTGCACTATCCTGAGAGTCAGGAATGGGAGTCATTATGTTTGCAATGTAGCTAATTTTATTTACAAAATCCAACAATACA--ACAAACTATATACCATGTATGT------------------ i canFam3.chr9 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=263093.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267402 267 + 478999 CTCAGCATACAATAACTCACAAGAGTTTTCTCCTTTAATCATCACAGGAATTTTTCAAACCCTCAAATATCTTG-TCCAAATGAGAAATGAG--ATTATCTGGACCAACATAAAGCTACTCTCTGTCCAATTTCAAATCAAATAGGTATTATCCTATTCCAGATtccagaaacataaactgattctaac--ataaacaggt-aaaacact-gtaacataaatctgctgca-gtaatgatataatgtacttaccagtc-aattagaaatgaCAAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 107087 267 + 413329 CTCAGCATACAATAACTCACAAGAGTTTTCTCCTTTAATCATCACAGGAATTTTTCAAACCCTCAAATATCTTG-TCCAAATGAGAAATGAG--ATTATCTGGACCAACATAAAGCTACTATCTGTCCAATTTCAAATCAAATAGGTATTATCCTATTCCAGATtccagaaacataaactgattctaat--ataaacaggt-aaaacacc-gtaacataaatctgctgca-gtaatgatataatgtacttaccagtc-aattagaaatgaCAAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7182743 267 + 72422247 CTCAGCATACAATAACTTACAAGAGTTTTCTCCTTTAATCATCAAAGGAATTTTTCAAACTCTCAAGTATCTTG-TCCAAATGAGAAATGAG--ATTATCTGGACCAACATAAAGCTACTATTTGTCCAATTTCAAATCAAATAGGTATTATCCTATTCCAGATTCCAGAAACGTAAACTGATTCTAAC--ATAAACAAGT-AAAACACC-GTAACATAAATCTGCTACA-GTAATGATATAATGTACTTACCAGTC-AATTAGAAATGACAAAAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50457923 267 - 75148670 CTCAGCATACAATAAATCACAAGAGTTTTTTCCTTTAATAATTATAGGAATTTTTCAAACCCCAAGATATCTTG-TCCAAATGAGAAATGAG--ATTACGTCGACCAACATAATGCTACTATCTGTTCAATTTCAAATCAAATAGGTATTATCCTAATCCAGATtccagaaatgtaaactgattctaac--atggacaggt-aaaacacc-ataacataaatctactgca-gtaacaatataatgtatttcccagtc-aattagaaatgaCAAAAA i chlSab2.chr16 C 0 I 29281 s calJac3.chr5 93339223 267 + 159171411 CTCAGCATAAGGTAACTCACAAGAGCTTTTTCCTTTAATCATTATAGAAATTTTTCAAACCCCAACACATCTTG-TTCAAATGAGAAATGAG--ATTATCTGGACCAACATAATGCTACTATCTGTCCAA-GTCAAATCAAATAGGTATTATCCTATTCCAGATTCCAGAAATGTAAACTGATTCTAAC--ATGGACAGGTAAAAACACC-ATAACATAAAACTACTGCA-GTAATAATATAATGTACTTCCCAGTG-AATTAGAAATGACAGAAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 42641766 187 - 122082543 CATAGCACACAA-AATAAATAAGAATTTACCTTTCTAATAAT---AAGATCTTTT-----TCTGATGTGCCTTACTCTAAATCAGATGTGAACCAATATATGGTTC-ATATAATGGTACTGC-------ATTTCAATTGGAATAGATATTATCCT-----AGATTCCAGAAATGCAGATAGTCTGTAACAAATATACAATT-AAGACACA------------------------------------------------------------------ i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41622643 258 + 61074082 --CTGCATACAATAACCCACAAAAGCTTTC-CCTTGCATCATAACAGGAATCTTC--AACTCCTCAGTATCTTG-TCTGAATGAGAAATGAG--ATT---TGAACCAACATCATGCTAGTATTTGTCCAATTTCAAATCAAACAGATATT---TGATTCCAGATTCTAGGAATGCAGATTGA-GCAAAC--ACACACAAGG-AAGGTACCCACAGCATACATCTACTGAATGAAAAAATGCAATGCATTTCCAACTCAAATTCTAAATGACAAAGG i canFam3.chr9 C 0 C 0 e papAnu2.chr16 50403577 29249 - 74645514 I e macFas5.chr16 53583477 29417 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=2974.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267669 9 + 478999 AAGAAGTAg s panTro4.chrUn_GL393519 107354 9 + 413329 AAGAAGTAg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183010 9 + 72422247 AAGAAGTAg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s calJac3.chr5 93339490 9 + 159171411 AAAAGGAAG i calJac3.chr5 C 0 N 0 s mm10.chr11 42641953 5 - 122082543 GAGAa---- i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41622901 9 + 61074082 GAGTAATAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e chlSab2.chr16 50458190 29281 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50403577 29249 - 74645514 I e macFas5.chr16 53583477 29417 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1000.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267678 1 + 478999 g s panTro4.chrUn_GL393519 107363 1 + 413329 g i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183019 1 + 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s mm10.chr11 42641958 1 - 122082543 g i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 41622910 1 + 61074082 G i canFam3.chr9 C 0 N 0 e chlSab2.chr16 50458190 29281 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50403577 29249 - 74645514 I e macFas5.chr16 53583477 29417 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=51093.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267679 135 + 478999 ctgggcatggtggctcatgcctgtaatcctagcactttgg-----gaggccgaggtgggcggatcacgaggtt----------------------gggagatcgagaccatcctgggctaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaacataaaaaaacaa s panTro4.chrUn_GL393519 107364 135 + 413329 ccgggcatggcggctcacgcctgtaatcccagcactttgg-----gaggccgaggtgggcggatcacgaggtt----------------------gggagatggagaccatcctgggctaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaacataaaaaaacaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183020 135 + 72422247 ccgggcgtggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgg-----gaggccgaggtgggcggatcacgaggtc----------------------gggagatcgagaccatcctgggctaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaacataaaaaaacaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s mm10.chr11 42641959 161 - 122082543 ctggacgtggtggcacacgcttttaatcccagcactcaggaggcagaggcagaggcaggcggatttctgagttcaaggccagcctggtctacagagtgagttccaggacagccagggct-acacagagaaaccctgtctcaaacaaacaaacaaacaaacaa i mm10.chr11 C 0 N 0 e chlSab2.chr16 50458190 29281 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50403577 29249 - 74645514 I e macFas5.chr16 53583477 29417 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=40895.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267814 161 + 478999 ttagccggccgtggtggcgggcacctgtagtcccagttactcaggagaggctgagtcaggagaatggtgtgaacctgggaggcggaacttgcagtgagcggagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagtaagactctgtctc-------aaaaaaaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 107499 168 + 413329 ttagccggccgtggtgttgggcacctgtagtcccagttactcaggagaggctgagtcaggagaatggtgtgaacctgggaggcggaacttgcagtgagcggagatcgcgccactgcactccagcctgggcgacagagtaagactctgtttcaaaaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183155 155 + 72422247 ttagccggccgtggtggcgggcacctgtagtcccagttactcgggagaggctgagtcaggagaatggtgtgaacccgggaggcggaacttgcagtgagtggagatcgcgccactgcactccagcctgggtgacagagtaagactctgcctc-------------aaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 e chlSab2.chr16 50458190 29281 - 75148670 I e papAnu2.chr16 50403577 29249 - 74645514 I e macFas5.chr16 53583477 29417 - 80997621 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=4383.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267975 13 + 478999 aaaaaaaaaaaag- s panTro4.chrUn_GL393519 107667 13 + 413329 aaaaaaaaaaaaG- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183310 13 + 72422247 aaaaaaaaaaaaa- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53612894 13 - 80997621 -AGGAAACAAAATC i macFas5.chr16 I 29417 C 0 s papAnu2.chr16 50432826 13 - 74645514 -aggaaacaaaatc i papAnu2.chr16 I 29249 C 0 e chlSab2.chr16 50458190 29281 - 75148670 I e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=241501.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 267988 200 + 478999 aaaGCCTAGGTTTTAAAGACCAATAAAATAGTAAACGTGAACGAGGAAAAAAAGAAATGAGGAAACAGTTACAAACATAGATACTGAAGGTAATTATATGATAATATAGAAATAAAATACAGCCTT----TAATTGTACAAGTAAAATATATAAATATTATATACAACTCTGCACTGATAAAATTGAAAAACATGTTTTGTAGG s panTro4.chrUn_GL393519 107680 200 + 413329 AAAGCCTAGGTTTTAAAGACCAATAAAATAGTAAACATGAACGAGGAAAAAAAGAAATGAGGAAACAGTTACAAACATAGATACTGAAGGTAATTATATGATAATATAGAAATAAAATACAACCTT----TAATTGTACAAGtaaaatatataaatattatataCAACTCTGCACTGATAAAATTGAAAAACATGTTTTCTAGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183323 204 + 72422247 aaaGCTAAGGTTTTAAAGACCAATAAAATAGTAAACATGAACAAGGAAAAAAAGAAATGAGGAAACAGTTACAAACATAGATACTGAAGGTAATTATATGATAATATAGAAATAAAATACAACCTTTATGTAATTGTACAAGtaaaatatataaatattatataCAACTCTGCACTGATAAAATTGAAAAACATGTTTTCTAGG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s macFas5.chr16 53612907 199 - 80997621 AAAGTCTAGGTTTTAAAGACCAATAAAATAGTAAACATGAACGAGGAAAAAGAGAAATGAGTAAACAGTTACAAACATGGATACTAAAGATAATTACATGAGAATATGG-----AAATATAACCTTTATGTAATTGTACAAGTAAAATATATAAGTATTATATACAACTCTGCACTGATAAAATTGAAAAATATATTTTCTAGC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50432839 199 - 74645514 aaaGTCTAGGTTTTAAAGACCAGTAAAATAGTAAACATGAAcgaggaaaaagagaaatgagtaaACAGTTACAAACATGGATACTAAAGATAATTACATGAGAATATGG-----AAATATAACCTTTATGTAATTGtacaagtaaaatatataagtattatATACAACTCTGCActgataaaattgaaaaatatattttctagc i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50487471 199 - 75148670 AAAGTCTAGGTTTTAAAGACTAATAAAATAGTAAACATGAACAAGGAAAAAGAGAAATGAGTAAACAGTTACAAACATGGATACTAAAGATAATTACATGAGAATATGG-----AAATATAACCTTTATATAATTGTACAAGTAAAATATATAAGTATTATATACAACTCTGCACTGATAAAATTGAAAAATGTATTTTCTAGC i chlSab2.chr16 I 29281 C 0 e rheMac3.chr16 53753734 29662 - 80904711 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=4579900.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 268188 2709 + 478999 AAAGAACAAACCATGAAAAGTGACTTTAaaaataatagaaattcttcaaaaaattaaaaatagaataaccatatgatccagcaattccgcttctggatgtatattcggaagaa-tgaaagcagggccttgaagttactggcacacccatgttcatagtagcattatttataatagtcaaaaggtggaaacaaccgaaaaatccattgacagatacatttagatcaacaaaatgttggtatatacatac-----g--atatcattcagctttcaagaggaaggaaatcctgacatgctacaacaa----gatgaacactatttcagccat-----aaagaatgaaatcctgcctttcaaggcaacatgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtcaaaaagacaaatactgtatgattccacttatgtgacatagtgaa--attcagagagacagaaagtagaaggatggttg-caggaattgcaggtaggaaagaatggagagcagttgaatagacacagaatttgttttgcacgatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagatagtgctactaaactgtgtacttaaaaatggctaagatggtaaattttatgttatatgtattctaccgcataaaaaaTTTTAAAGAGAGACAGAAAAACTACATAGATCCA--TAAGGCAGCTCAAATAAAAG--GATTAAAGAGTTATTTTAAGTAGACAATAGATAAGCTAGTTCTAGAAACAGCA-TAAGAAACCAGTAGCAGTACTTGACTTAGGAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGAGGGAGTAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTCCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCATTATGTCAA--TTTATTTTTTTCTTTAAAACTAAT---AAGCAAAAGTCAAAGGAAATCTTAAGAGCTTCTAAACTTGATGATTTTACAATGAATTTCTATCTAATCAGATAATTTCTATTACTTAAATTATTCCAGACCATAGAAAAGAGTAATAGTTCCCAAATTCATATT-CTAATTTAGCACAAATAAGTGTTAGAATAAC----TACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTTTGTTAAATATACACATGTTCTAAGAATCAGAAAGCTGAAACACTGGAAGGAAATGTTTCATTAAGTAGCTACCCAGTACATTTGCCAATAGCCAACCAAATTTACCT--CA----CGCACACACACAAATCAACATACTAAAAGTAAGGATTTCCAA---ACATATTTCCACTCCAAATTTAAAGTGAAAGTTTAAATAACATATAAACCATCTGACTGGATACAATTCAGCCCTAAAGCTAGAGTTCAGGGCCCCTTATCTTTTGTTCATTATTAATTTTAAAATTTTTGATGTATTTATTAGtatttatgaataacatagtaacattcccatagatttgcagagatcaaatcgaggtaattagcatatccataatctcatttatcatttctttgtgctgggaacattcaacatcctcctcctaactctttgaaactgtgtaacatattgttgttaattacagtcatcttacagtgctatacaacactagaacttgctcttcctatctagctgtaattttgaaacctttaacaaattgctttctaccatccctgcaccctatgcttcccagcctgtagtattctgttctactttttacctctatgagatcaacgtttttttagcttccacaaatgaatgagaacacacagtacttaatgttctgtccctggcttacttcacttaatatgatgtcctccagttcaatccatgtgcctcagactacaggatttcattcttgcttatggctaaatagtattccattgtgtatgtataccatattttctttatgcattcatctgttgttagatacttaggatgattccatatcttggctattgtgaatagtgctgcaataaacacgggggtgccgatgtctcgtcaatatactgatttccttttctttggataaatgtccaataatatattgttggaccatataatagttctatttgcagttttttgaggaacctccacactgttctccatggtggctgtactagtttacatttccactagccccatttaagtgttcacttttctccacatctttgccagcatttgctattttttgtctttttgatagtagccattctaagtggggtgagatgacacctcattgtggttttgatttgcatttccctgatgactagtgatgttgagctttttaggaaaacatatttgttggtcatgtgtctgtcatcttttaagaaatatctattcaggtcatttgcccatttttcagttggattc--------ttttttttttttttttttgctattgagatgtcaagagttccttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaatattttctcccattctgtaggttgtcttttcactctgccaatttcttcctttgAATTAATATTAATTTTTTAAAGAAAAGTAACTTAAACGCTTGACAATATGGAATTAAAAATACAGTATCTTCAAgctgggtgcggtggtgcatgcttatagctgcagctatctgaaggctgaggcagaagaggatcgcgtaagtccagaagtttgagaccagcctgggcaacataacagcaagactcagtctc-tTTTT-AAAAAATGGTATATTCAATTTGGGGA s panTro4.chrUn_GL393519 107880 2699 + 413329 AAAGAACAAACCATCAAAAGTGACTTTAAAAATAACAgaaattcttcaaaaaattaaaaatagaataaccatatgatccagcaattccgcttctggatatatatttggaagaa-cgaaagcagggccttgaagttatttgcacacccatgttcacagtagcattatttataatagtcaaaaggtggaaacaaccggaaaatccattggcagatacatttagatcaataaaatgttggtatatacatacaatgga--atatcattcagctttcaagaggaaggaaatcctgacacgct---acaa----gatgaatactatttcagccat-----aaagaatgaaatcctgcctttcaaggcaacatgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtcaaaaagacaaatgctgtatgattccacttatgtgacatagtgaa--attc----agacagaaagtagaaggatggttg-caggagttgcaggtagggaagaatggagagcagttgaatagatacagaatttgttttgcacgatgaaaaggttttggagattggttgcacaacactgtgaaagatggcgctactaaactgtgtacttaaaaatggctaagatggtaaattttatgttatgtgtattctaccgcataaaaaaTTTTAAAGAGAGACAGAAAAACTACATAGATCCA--TAAGGCAGCTCAAATAAAAGGTGATTAAAGAGTTATTTTAAATAGACAATAG----GCTAGTTCTAGAAACAGCA-TAAGAAACCAGTAGCAGTACTTGACTTAGAAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGAGGGAGTAGGAAGCTTACTTTTCCAATGAATTCCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCATTATGTCAA--TTTA-TTTTTTCTTTAAAACTAAT---AAGTAAAAGTCAAAGGAAATCTTAAGAGCTTCTAAA-TTGATGATTTTACAATGAATTTCTATCTAATCAGATAATTTCTATTACTTAAATTATTCCAGACCATAGAAAAGAGTAATAGTTCCCAAATTCATATT-CTAATTTAGCACAAATAAGTGTTAGAATAAC----TACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTATGTTAAATATACACATGTTCTAAGAATCAGAAAGCTGAAACACTGGAAGGAAATGTTTTACTAAGTAGCTACCCAGTACATTTGCCAATAGCCAACCAAGTTTACCT--CA------CACACACACAAATCAACATACTAAAAGTAAGGATTTCCAA---ACATATTTCCGCTCCAAATTTAAAGTGAAAGTTTAAATAACATATAAACCATCTGACTGGATACAATTCAGCCCTAAAGCTAGAGTTCAGGGCCCCTTATCTTTTGTTCattattaattttaaaatttttGATGTATTTATTAGtatttatgaagaacatagtaacattcccatagatatgcagagatcaaatcgaggtaattagcatatccataatctcatttatcatttctttgtgctgggaatattcaacatcctcctcctaactctttgaaactgtgtaacatattgttgttaattacagtcatcttacagtgctatacaacactagaacttgctcttcctatctagctgtaattttgaaaactttaacaaattgctttctaccgtccctgcaccctatgcttcccagcctgtagtattctgttctactttttacctctatgagatcaacgtttttttagcttccacaaatgaatgagaacacacagtacttaatgttctgtccctggcttacttcactaaatataatgttctccagttcaatccatgtgcctcaaactacaggatttcattcttgcttatggctgaatagtattccattgtgtatgtataccatattttctttatgcatgcatctgttgttagatacttaggatgattccatatcttggctattgtgaatagtgctgcaataaacacgggggtgcagatgtctcgtcaatatactgatttccttttctttggataaatgtccaataatatattgttggaccatataatagttctatttgcagttttttgaggaacctccacactcttctccatagtggctctactagttttcatttccactagccacatttaagtgttcacttttctccacatctttgccagcatttgctattttttgtctttttgatagtagccattctaagtggggtgagatgacacctcattgtggttttgatttgcatttccctgatgactagtgaggttgagcttttttggaaaacatatttgttggtcatgtgtctgtcgtcttttaagaaatatctattcaggtcatttgcccatttttcagttggat----------ttttttttttttttttttgctattgagatgtcaagagttccttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaatattttctcccattctgtaggttgtcttttcactctgccaatttcttcctttgaattaatattaattttttaaaGAAAAGTAACTTAAATGCTTGACAATATGGAATTAAAAATACAGTATCTTCAAgctgggtgcagtggtgcatgcttatagctgcagctatctgaaggctgaggcaaaagaggatcgcgtaagtccagaagttttagaccagcctgggcaacataacagcaagactcggtctc-tTTTT-AAAAAATGGTATATTCAATTTGGGGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7183527 2715 + 72422247 AAAGAACAAACCATCAAAAGTGACTTTAaaaataacagaaattcttcaaaaaattaaaaatagaataaccatatgatccagcaattccacttctggatatatattcggaagaa-tgaaagcagggccttgaagttatttgtacacccatgttcacagtagcattatttataatagtcaaaaggtggaaacaaccaaaaaatccattgggagataaatttagatcaataaaatgttggtatatacatacaatgga--atatcattcagctttaaagaggaaggaaatcctgacatgct---acaa----gatgaatactatttcagccat-aaagaaagaatgaaatcctgcctttcaaggcaacatgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtcaaaaagacaaatgctgtatgattccacttatgtgaggtagtgaa--attcagagagacagaaagtagaaagatggttg-caggagttgcaggtagggaagaatggagagctgtt-----------gaatttgttttgcacaatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagatagtgctactaaaccgtatacttaaaaatggctaagatggtaaattttatgttatgtgtattctaccgcataaaaaaTTTTAAAGAGAGACAGAAAAACTACATAGATCCA--TAAGGCAGCTCAAATAAAAGGTGATGAAAGAGTTATTTTAAATAGACAATAGATAGGCTAGTTCTAGAAACAGCA-TAAGAAACCCGTAGTAGTACTTGACTTAGGAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGAGGGAGCAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTCCCTTCCTGAT-TATAGTGAAAATTTCTATTATGTCGA--TTTATTTTTTTCTTTAAAACTAAT---AAGCAAAAGTCAAAGGAAATCTTAAGAGGTTCTAAACTTGATGATTTTACAATAAATTTCTATCTAATCAGATAATTTCTATTACTTAAATTACTCCAGGCCATAGAAAAGACTGATAGTTCCCAAATTCACATT-CAAATTTAGCACAAATAAGTGTTAGAATAACTAGTTACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTATGTTAAATATACACATGTTCTAAGAATCAGAAAGCTGAAACACTGGAAGGAAATGTTTTATTAAGTAGCTACCCAGTACATTTGCCAATAGCCAATCAAGTTTATCT--CA--CACACACACACACAAATGAACATACTAA----AAGGATTTCCAA---ACATATTTCCGCTCCAAATTTAAAGTGAAAGTTTAAATAACATATAAACCATCTGACTGGATACAATTCAGCTCTAAAGCTAGAGTTCAGGGCCCTTTATCTTTTGTTCattattaattttaaaatttttGATGTATTTATTAGtatttatgaagaacatagtaacattcccatagatatgcagagatcaaatcgaggtaattagcatatccataatctcatttaacatttctttgtgctgggaacattcaacatcctcctcctaactctttgaaactgtgtaacatattgttgttaattacagtcatcttacagtgctatacaacactagaacttgctcttcctatctagctgtaattttgaaacctttaacaaattgctttctaccctccctgcaccctatgcttcccagcctgtagtattctgttctactttttacctctatgagatcgatgtttttttagcttccacaaatgaatgagaacacacagtacttaacattctgtcactggcttacttcacttaatataatgtcctccagttcaatccatgtgcctcaaactacaggatttcattcttgcttatggctgaatagtattctattgtgtatatataccatattttctttatgcattcatctgttgttagatacttaggatgattccatatcttggctattgtgaatagtgctgcaataaacacgggggtgcagatgtctcgtcaatatactgatttccttttctttggataaatgtccaataataaattgttggatcatataatagttctatttgcagttttttgaggaacctccacactgttctccaaagtggctgtactagtttacatttctactagccacatttaagtgttcacttttctccacatctttgccagcatttgctattttttgtcattttgatagtagccattctaagtggggtgagatgatacctcattgtggttttgatttgcatttccctgatgactagtgatgttgagcttttttggaaaacatatttgttggtcatgtgtctgtcttcttttaaaaaatatctattcaggtcatttgcccattttttagttggattcttttttttttttttttttttttttttgctattgagatgtcaagagttctttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaacattttctcccattctgtaggttgtcttttcactctgccaattttttcctttgaattaatattaattttttaaaGAAAAGTAACTTAAATGCTTGACAATATGGAATTAAAAATGCAGTATCTTCAAgctgggtgcggtggtgcgtgcttacagctgcagctatccgaaggctgaggcagaagaggatcgcttaagtccagaagtttgagaccagcctgagcaacataataacaagactcagtctc-ttttt-aaaaaaTGGTATATTCAATTTGGGGA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr16 53783396 2696 - 80904711 AAAGAACAAACCATCAAAAGTGACTTTAaaaacaacagaaattcttcaaaaaattaaaaataaaataacgatatgatccagcaattccacttctggatatatattcagaagaattaaaagcagggtcttgaagttatttgtacacccatgttcacagtagcattatttgtaatagccaaaaggtggaaacaaccgaaaaatccactggcatataaatttagataaacaaaatgttggtatacacatacaatggaatatatcattcagccttaaagaagaaggaaatcctgacatgct---ccaacatggatgaatactatttcagccattaaaaaaagaatgaaatcctgtctttcatggcaacacgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtccaaaagacaaataccgtatgagtccacttatatgaggtagtcaatgattcagagagacagaaagtaaaaggatggttgccaggagttgagggtagggaagaaaggagagctgtttaatagacacagaatttgttttgcaagatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagatagtgctactaaactgtatacttaaaaatggctaagatggtaaactttattttgtgtgtattttactgcaTACAAAGTTTTAAAAAGCGACAGAAAACCTACATAGATCCATTTATGGGAGTTCAAATAAAAGGTGATTAATGAGTTATTTTAAATAGGCAATAGATAGGCTAGTTCTAGAAATAGCATTAAGAAACCAGTAGCAGT-----ACTTAAGAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGACTGAACAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTTCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCATTATGTCAA--TT---TTTTTTCTTTAAAACTAATGATAAGCAAAAGTCAAAGGAAATCTTAACAGCTTCTAACCTTGATGATTTTATAATG-ATTTCTAT---ATTGGATAATTTCTATTATTTAAATTATTCCAGGCCATAGAAAAGACTGATAGTTCCCGAACTCACATTACTAATTTGGCACAAATAACTGTTAGAATAATTAGTTACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTATGTTAAATATACACATTTTCTAAGCATCAGAAAGCCGAAGCACTGGAAGGAAATGTTTTATTAAGTAGCTACCCAATACATTTGCCAATAGCCAACCAAGTTTACCT--CACACACACACACACACAAATGAACATACTAAAAGTATGGATTTCCAATTTTTTTTTTTCAGCTCCAAATTTAAAGTGAATGTTTATATAACATAGAAACTATCTGACTGGATACAATTCAGCTCTAAAACTAGAGTTCAGGGCCCTTTATCTTTTG----TTATTAATTTTAAGTTTTTTGATG----TATTAatgtttatgaagaacatagtaatgtttccatagatatacagagatcaaatcaaggtaattagcacatccatcatctgatttatcatttctttgtgctgggaacattcaacatcctcctcctagttctttgaaactgtgtaacata---ttgttaattacagtcatcttacagtggtatacaacactagaacttactcttcctatctagttgtaactttgaatcctttaacaaatcgctccctacccttcctgcgccctatccttcccagcctgtagtattctgttctactttttacttctatgagatcaac--ttttttagcttccatgtatgaacaagaacatgcagtgtttaacgttctgtccctggtttatttcacttaatataatgtcctccaattcaatctatgtgcctcaaaatacagaatttcattcttttttatggctgaatactattccactgtgtatatataccatattttctttatgcattcatctgttgttagatacttaggatgattccatatctcggccattgtgaatagtgctgcaataaacatgggggtgcagatg-------------------tcccttcctttggatagatgtccaataatgaattgttggatcacatggtagttctagttgcagttttttgaggaaccttctcactgttctccatagtggctgtactagtttacattcccactagccacatttaagagttcacttatctccacacctttgccagcacttgctaatttttgtctttttgatagtagccattctaaccaggataagatgatatctcactgtggttttgatttgca-ttccctgatgactagtgatgttgagctttttaaaaaaatgtgtctgttggtcatatgtctgtcttcttttaagaaatgtctattcaggtcatttgcccattttttaattggattc-------------tttttttttatttgctgtcaagacgtc-agagttccttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaatattttctcctattctgtaggttgtcttctcactctgccgattgtttcctttgcATTAATGTTAATTTTTTAAAGAAAAGTAACTTAAATGCTTGACAATATGGAATTTAAAATATGGTACATTCAAgctgggtgcagtggcgcatgcttatagctgcagctatctgaaggttgaggtggaagaggatcgcataagcccagaagtttgagaccagcctgggcaacataatagcaagacttagtctc-tttttaaaaaaaTGGTATGTTCAATTTGGGGA i rheMac3.chr16 I 29662 C 0 s macFas5.chr16 53613106 2695 - 80997621 AAAGAACAAACCATCAAAAGTGACTTTAaaaacaacagaaattcttcaaaaaattaaaaataaaataacgatatgatccagcaattccacttctggatatatattcagaagaattaaaagcagggtcttgaagttatttgcacacccatgttcacagtagcattatttgtaatagccaaaaggtggaaacaaccgaaaaatccactggcatataaatttagataaataaaatgttggtatacacatacaatggaatatatcattcagccttaaagaagaaggaaatcctgacatgct---ccaacatggatgaatactatttcagccattaaaaaaagaatgaaatcctgtctttcatggcaacacgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtccaaaagacaaataccgtatgagtccacttatatgaggtagtcaatgattcagagagacagaaagtaaaaggatggttgccaggagttgagggtagggaagaaaggagagctgtttaatagacacagaatttgttttgcaagatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagatagtgctactaaactgtatacttaaaaatggctaagatggtaaactttattttgtgtgtattttactgcaTACAAAGTTTTAAAAAGCGACAGAAAACCTACATAGATCCATTTATGGGAGTTCAAATAAAAGGTGATTAATGAGTTATTTTAAATAGGCAATAGATAGGCTAGTTCTAGAAATAGCATTAAGAAACCAGTAGCAGT-----ACTTAAGAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGACTGAACAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTTCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCATTATGTCAA--TT---TTTTTTCTTTAAAACTAATGATAAGCAAAAGTCAAAGGAAATCTTAACAGCTTCTAACCTTGATGATTTTATAATG-ATTTCTATCTAATTGGATAATTTCTATTATTTAAATTATTCCAGGCCATAGAAAAGACTGATAGTTCCCGAACTCACATTACTAATTTGGCACAAATAACTGTTAGAATAATTAGTTACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTATGTTAAATATACACATTTTCTAAGCATCAGAAAGCTGAAGCACTGGAAGGAAATGTTTTATTAAGTAGCTACCCAATACATTTGCCAATAGCCAACCAAGTTTACCT--cacacacacacacacacaAATGAACATACTAAAAGTATGGATTTCCAA---ATATATTTCAGCTCCAAATTTAAAGTGAATGTTTATATAACATAGAAACTATCTGACTGGATACAATTCAGCTCTAAAACTAGAGTTCAGGGCCCtttatcttttg----ttattaattttaaattttttgatg----tattaatgtttatgaagaacatagtaatgtttccatagatatacagagatcaaatcaaggtaattagcatatccatcatct--cttatcatttctttgtgctgggaacattcaacatcctcctcctagttctttgaaactgtgtaacata---ttgttaattacagtcatcttacagtggtatacaacactagaacttactcttcctatctagttgtaactttgaatcccttaacaaattgctccctacccttcctgtgccctatccttcccagcctgtagtattctgttctactttttacttctatgagatcaac--ttttttagcttccatgtatgaacaagaacatgcagtgtttaacgttctgtccctggtttatttcacttaatataatgtcctccaattcaatctatgtgcctcaaaatacagaatttcattcttttttatggctgaatactattccactgtgtatatataccatattttctttatgcattcatctgttgttagatacttaggatgattccatatctcggccattgtgaatagtgctgcaataaacatgggggtgcagatg-------------------tcccttcctttggatagatgtccaataatgaattgttggatcacatggtagttctagttgcagttttttgaggaaccttctcactgttctccatggtggctgtactagtttacattcccactagccacatttaagagttcacttatctccacacctttgccagcacttgctaatttttgtctttttgatagtagccattctaaccaggataagatgatatctcactgtggttttgatttgca-ttccctgatgactagtgatgttgagctttttaaaaaaatgtgtctgttggtcatatgtctgtcttcttttaagaaatgtctattcaggtcatttgcccattttttaattggattc------------ttttttttttatttgctgtcaagacgtc-agagttccttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaatattttctcctattctgtaggttgtcttctcactctgccaattgtttcctttgcATTAATGTTAATTTTTTAAAGAAAAGTAACTTAAATGCTTGACAATATGGAATTTAAAATATGGTACATTCAAgctgggtgcagtggcgcatgcttatagctgcagctatctgaaggttgaggtggaagaggatcgcataagcccagaagtttgagaccagcctgggcaacataatagcaagacttagtctc-tttttaaaaaaaTGGTATGTTCAATTTGGGGA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50433038 2699 - 74645514 aaagaacaaaccatcaaaagtgactttaaaaacaacagaaattcttcaaaaaattaaaaataaaataacgatatgatgcagcaattctacttctggatatatatttagaagaattaaaagcagggtcttgaagttatttgtacacccatgttcacagtagcattatttataatagccaaaaggtggaaacaaccgaAAAATCCACTGGCATAtaaatttagataaataaaatgttggtatacacatacaatggaatatatcattcagccttaaagaagaaggaaatcctgacatgct---acaatatggatgaatactatttcagccattaaaaaaagaatgaaatcctgtctttcaTGGCAACAcgaatggaactggaggacattatgctaagtaaaataagcccatgtccaaaagacaaatactgtatgagtccacttatatgaggtagtCAATgattcagagagacagaaagtaaaaggatggttgCCAGGAGTTGAGGGTAGGGAAAAAAGGAGAGCTGTTTAATAGACACAGAAtttgttttgcaagatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagATAGTGCTActaaactgtatacttaaaaatggctaagatggtaaactttattttgtgtgtattttactgCATACAAAGTTTGAAAAAGCGACAGAAAACCTACATAGATCCATTTATGGGAGTTCAAATAAAAGGTGATTAATGAGTTATTTTAAATAGGCAATAGATAGGCTAGTTCTAGAAATAGCATTAAGAAACCAGTAGCAGT-----ACttaagaagaaaagtataaactGAAGGTCAAGACTGAACAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTTCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCattatgtcaatttt---ttttttctttaaaactaatgaCAAGCAAAAGTCAAAGGAAATCTTAACAGCTTCTAACCTTGATGATTTTATAATG-ATTTCTATCTAATCggataatttctattatttaaattattccagGCCATAGAAAAGACTGATAGTTCCCGAACTCACATTACTAATTTGGCACAAATAACTGTTAGAATAATTAGTTACTTTCAAAAGTGATAATGCATATTAtgttaaatatacacattttctaaGCATCAGAAAGCTGAAGCACTGGAAGGAAATGTTTTATTAAGTAGCTACCCAATACATTTGCCAATAGCCAACCAAGTttacctcacacacacacacacacacaaatgaacatACTAAAAGTACGgatttccaa---atatatttcaGCTCCAAATTTAAAGTGAATGTTTATATAACATAGAAACTATCTCACTGGATACAATTCAGCTCTAAAACTAGAGTTCAGGGCCCTTTatcttttg----ttattaattttaaattttttgatg----taTTAATGTTTATGAAGAACATAGTAATGTTTCCATAGATAGACAgagatcaaatcaaggtaattagcatatccatcatct--cttatcatttctttgtgctgggaacattCAACATCCTCCTCCTAGTTCTTTGAAACTGTGTAACATA---TTGTTAATTACAGTCATCTTACAGTGGTATACAACACTAGAACTTACTCTTCCTATCTAGTTGTAACTTTGAATCC-TTAACAAATCGCTCCCTACCCTTCCTGCGCCCTATCCttcccagtctgtagtattctgttctactttttacttctatgagatcaac-tttttttagcttccatGTACGAacaagaacatgcagtgtttaacgTTCTGtccctggtttatttcacttaatataatgtcctccaattCAATCTATGTGCCTCAAaatacagaatttcattcttttttatggctgaatactattccactgtgtatatataccatattttctttatgcattcatctgttgttAGATACTTAGGATGATTCCATATCTcggccattgtgaatagtgctgcaataaacatgggggtgcagatg-------------------tcccttcctttggataaatgtccAATAATGAATtgttggatcacatggtagttctagttgcagttttttgaggaaccttctcactgttctccatagtggctgtactagtttacattcccactagccaCATTTAAGAGTTCACTTATCTCCACACCTTTGCCAGCacttgctaatttttgtctttttgatagtagccattctaaccaggataagatgatatctcactgtggttttgatttgca-ttccctgatgactagtgatgttgagctttttaaaaaaatgtgtctgTTGGTcatgtgtctgtcttcttttaagaaatgtctattcaggtcatttgcccattttttaattggattc------------ttttttttttatttgctgtcAAGACGTc-agagttccttgtatattctggatattaatcctctGCTGGAtacatactttgcaaatattttctcctattctgtaggttgtcttctCACTCTGCCAATTGTTTCCTTTgcattaatgttaattttttaaagaaaagtaacttAAATGCTTGACAATATGGAATTTAAAATATGGTACAttcaagctgggtgcagtggcgcatgcttATAGCTGCAGCTATCTGAAGGTTGAGGTGGAAGAGGATCGCATAAGCccataagtttgagaccagcctgggcaacataatagcaagacttagtctc-tttttaaaaaaatggtatgtTCAATTTGGGGA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 50487670 2693 - 75148670 AAAGAACAAACCATCAAAAGTGACTTTAaaaacaacagaaattcttcaaaaaattaaaaataaaataatgatatgatccagcaattctacttctggatatatattcagaagaattaaaagcagggtcttgaagttatttgtacacccatgttcacagtagcattatttataacagccaaaaggtggaaacaaccgaaaaatccactggcatataaatttagataaataaaatgttggtatacacatacaatggaatatatcattcagccttaaagaagaaggaaatcctgacatgct---acaacatggatgaatactatttcagccattaaaaaaagaatgaaatcctgtctttcacggcaacacgaatggaactggaggacattatgctaaataaaataagcccatgtccaaaagacaaatactgtatgagtccacttatatgaggtagtcaatgattcagagagacagaaagtaaaaggatggttgccaggagttgagggtagggaagaaaggagagctgtttaatagacacacaatttgttttgcaagatgaaaaggttttggagattggttgcacaacaatgtgaaagatagtgctactaaactgtatacttaaaaatggctaagatggtaaactttattttgtgtgtattttactgcaTACAAAATTTTAAAAAGCGACAGAAAACCTACATAGATCCATTTATGGGAGTTCAAATAAAAGGTGATTAATGAGTTATTTTAAATAGGCAATAGATAGGCTAGTTCTAGAAATAGCATTAAGAAACCAGTAGCAGT-----ACTTAAGAAGAAAAGTATAAACTGAAGGTCAAGACTGAACAGGAAGCTTACTTTTCCACTGAATTTCCTTCCTGATGTATAGTGAAAATTTCCATTATGTCAA-------TTTTTTTTTTAAAACTAATGATAAGCAAAAGTCAAAGGAAATCGTAACAGCTTCTAACCTTGATGATTTTATAATG-ATTTCTATCTAATCGGATAATTTCTATTATTTAAATTATTCCAGGCCATAGAAAAGACTGATAGTTCCTGAACTCACATTACTAATTTGGCACAAATAACTGTTAGAATAATTAGTTACTTTCAAAAGTGATAATGTATATTATGTTAAATATACACATTTTCTAAGCATCAGAAAGCTGAAGCCCTGGAAGGAAATGTTTTATTAAGTAGCTACCCAATACATTTGCCAATAGCCAACCAAGTTTACCTcacacacacacacacacacaAATGAACATACTAAAAGTACGGATTTCCAA---ATATATTTCAGCTCCAAATTTAAAGTGAATGTTTATATAACATAGAAACTATCTGACTGGATACAATTCAGCTCTAAAACTAGAGTTCAGGGCCCtttatcttttg----ttattaattttaaattttttgatg----tattaatatttatgaagaacatagtaatgtttccatagatataaagagatcaaatcaaggtaattagcatatccatcatct--cttatcatttctttgtgctgggaacattcaaca---tcctcctagttctttgaaactgtgtaacata---ttgttaattacagtcatcttacagtggtatacaacactagaacttactcttcctatctagttgtaactttgaatcctttaacaaatcgctccctacccttcctgcgccctatccttcccagcctgtagtattctgttctactttttacttctatgagatcaac-tttttttagcttccatgtaggaacaagaacatgcagtgtttaacgttctgtccctggtttatttcacttaatataatgtcctccaattcaatctatgtgcctcaaaatacagaatttcattcttttttatggctgaatactattccactgtgtatatataccatattttctttatgcattcatctgttgctagatacttaggatgattctatatctcggccactgtgaatagtgctgcaataaacatgggggtgcagatg-------------------tcccttcctttggataaatgtccaataatgaattgttggatcacatggtagttctagttgcagttttttgaggaaccttctcactgttctccatagtggctgtactagtttacattcccactagccacatttaagagttcacttatctccacacctttgccagcacttgctaatttttatctttttgatagtagccattctaaccaggataagatgatatctcactgtggttttgatttgca-ttccctgatgactagtgatgttgagcttttcaaaaaaatgtatctgttggtcatgtgtctgtcttcttttaagaaatgtctattcaggtcatttgcccattttttaattggattc-------------tttttctttttttgctgtcaagacgtc-agagttccttgtatattctggatattaatcctctgctggatacatactttgcaaatattttctcctattctgtaggttgtcttctcactctgccaattgtttcctttgcATTAATGTTAATTTTTTAAAGAAAAGTAACTTAAATGCTTGACAATACGGAATTTAAAATATGGTACATTCAAgctgggtgcagtgatgcatgcttatagctgcagctacctgaaggttgaggtggaagaggatcgcataagcccagaagtttgagaccagcctgggcaacataatagcaagacttagtctcttttttaaaaaaaTGGTATGTTCAATTTGGGGA i chlSab2.chr16 C 0 N 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=4230.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 270897 3 + 478999 Aca s panTro4.chrUn_GL393519 110579 3 + 413329 Aca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7186242 3 + 72422247 ACA i ponAbe2.chrUn C 0 I 6796 s rheMac3.chr16 53786092 3 - 80904711 ACA i rheMac3.chr16 C 0 N 0 s macFas5.chr16 53615801 3 - 80997621 ACA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50435737 3 - 74645514 ACA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=-1704.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 270900 2 + 478999 -ta s panTro4.chrUn_GL393519 110582 2 + 413329 -tg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s macFas5.chr16 53615804 2 - 80997621 CC- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 50435740 2 - 74645514 CC- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e ponAbe2.chrUn 7186245 6796 + 72422247 I e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=3411.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 270902 5 + 478999 ctaca s panTro4.chrUn_GL393519 110584 5 + 413329 ctaca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7193041 5 + 72422247 ctata i ponAbe2.chrUn I 6796 C 0 s macFas5.chr16 53615806 5 - 80997621 TTACA i macFas5.chr16 C 0 N 0 s papAnu2.chr16 50435742 5 - 74645514 TTACA i papAnu2.chr16 C 0 N 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=130275.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 270907 500 + 478999 aatcctc-aaaaaacgggtacagaagaaacatactgcaacacaataaaaaccacatgagagacccccacagctagaatcatatggaatggggaaaaatggaaagcttttcctctaagatctggaacatgataaggatgcccactgtcaccactgttatttaacatagtactggaaaccctagctaaagcaatcagtgcagcccctgatatggcccccaacccaccctgccccctgccaccagcagtgtagcccccccgcaatagcgcacccaacacacccaaaccgccccgcctccccgaaccacgggcattgcagcaccccatagcaccctcaacctgaaaccaccacccccccgcaacagccgtgcagtgcagccctggataggacacttagcccacctcactgttgccagcaatacagtctgggatagtttccccaacaggctccccgccgagggcagtgcagccccggttagggcccccaaaccacccctgggtgca s panTro4.chrUn_GL393519 110589 498 + 413329 aatcctc-aaaaaacgggtacagaagaaacatactgcaacacaatagaaaccacatgagagacacccacagctagaatcatatggaatggggaaaaatggaaagcttttcctctaagatctggagcatgataaggatgcccactgtcaccactgttatttaacatagtactggaaaccctagctaaaacaatcagTGCAGCCCCTGATACGGCCcccaacccaccctgccccctgccaccagcagtgtag-ccccccgcaatagcgcacccaacacacccaaaccgccccgcctccccgaaccacgggcattgcagcaccccatagcaccctcaacccgaaaccgccacccctcc-caacagccgtgcagtgcagccctggataggacacttagcccacctcactgttgccagcagtacagtctgggatagtttccccaaccggctccccgccgagggcagtgcagccctggttagggcccccaaaccaccccccggtgca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7193046 499 + 72422247 aatcctcaaaaaaacgggtacagaagaaacataccacaacataataaaaaccacatgagagacacccacagctagaatcatatggaatggggaaaaatggaaagcttttcctctaagatctggaacacgataaggatacccactgtcaccactgttatttaacacagtactggaaatcctagctaaagcaatcagtacagcccttgatatggcccccaacccaccctgccccctgccaccagcagtgtagcccccccacaatagcgcactcaacacaaccaaactgccccaccttcccgaaccacgggcattgcagcaccccatagcaccctcaacccgaaaccgccaccccccc-c-acagccgtgcagtgcagccctggatagcacacttagcccacctcactgttgccagcaatacagtccgggatagtttccacaaccagctccccgccgagggcagtgcagccccggttagggcccccaaaccaccacccggtgca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=82410.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 271407 176 + 478999 ggcagcacagccccagatagcacacctaaccagccacccaaggtgggcagtgacgcctgagatagggcccccaacccgtcccaggccaagggcagtgcagccctggatagcgcacttaccccgacgcttttctacactctggccggttgcagtgtccatcgctgccaccaaccgca s panTro4.chrUn_GL393519 111087 175 + 413329 ggcagcacag-cccagatagcacacctaaccagccacccaaggcgggcagtgacgcctgagatatggcccccaacccgtcccaggccacgggctgtgcggccctggatagcgcacttaccccgacgcctttctacactctggccggttgcagtgaccatcgctgccaccgaccgca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 M 942 s ponAbe2.chrUn 7193545 163 + 72422247 ggcagcacagccccagatagcacacccaaccagccacccaaggcgggcagtgacgcctgagatagggcccccaacccgtcccaggccatgggcagtgcagccctggatagtgcactta-------------ctacgctctggctggctgcagtgtccatcgctgccaccaacctca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32615803 176 - 90373283 ggcagcacagccccagatagcacacccaactagccactcaaggcgggcagtgacacctgagatagggcccccaaaccgtcccaggccacgggcagtgcagccctggatagcgcacttactctgacgccttcctatgctctggccagctgcagtgtccgcggctgccaccaaccaca i chlSab2.chr2 N 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=89147.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 271583 437 + 478999 gcgggcaaggcaagccagc--------------------gaggcaaggcgaggcaagccggcgaggtg--gtgagccagggaggccagccacagcccggtaggctgcagcctccagcatgcagtggctggcacctcctactccaagctggcaatggagcagctatgaagtcagatgccgacgaggctggaatagtgcaactctatctcttaacatgctttatataccgagattataaactacatgttctgattggatgagaggaaaacactaggcctactctgattggactttattgtcacgttctgattggttagcctaagacttgttctgatccaatcagaacatgaaaataacgtccaatcagagtaggcgtagatgttt-ctctcatccaatcagaacgtgaagtccgagaaccaggcctgcacaaccccccagtatataaggtatgctaaggggg s ponAbe2.chrUn 7193708 459 + 72422247 gcgggcgaggcaagccagctaggcgaggccaggcgaggcgaggccaggcgaggcaagccggcgaggcgaggtgagccagggaggccagccacagccccacaggctgcagcctccagcgtgcagtggctggcacctcctactccaagctgggaacagagcagctatgaagtcaaacgcggacaacgctggaatagtggaactcgctcccttaacatgctttatataccgagattataaactacatgttctgattggatgagaggaaaatgctaggcctactctgattgggctttattgtcacgttctgattggttagcctaacacttgttctcatccaatcagaacatgaaaataacacccaatcagagtaggcgtagatgttttctctcatccaatcagaacgtgaagtccgggaaccaggccggcacaaccccc-agtatataaggtatgctaagggag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32615979 410 - 90373283 gcgatcaaagcaagccggc--------------------gag----------------------------gcgagacagcgaggacagacacagccccacaggctccagcctccagcttgcggcagccagcacctcctactccaaactgggaacggagcagctacgaagtcagacacagacaaggctggaatggggagactggcccatgtaacatgctttatataccgagattataaactacatgttctgattggatgagaggaaaaagctacgcctactctgattggactttattttcacattctgattggttagtctaagacttgctctcatccaatcagaacatgaaaataacgtccaatcagagtaggcacagcagttttctctcatccaatcagaacatgaagtccaggaaccgggcctgcacaacctc--agtatataaggcatactaatgtga i chlSab2.chr2 C 0 I 121 e panTro4.chrUn_GL393519 111262 942 + 413329 M e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=5982.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 272020 115 + 478999 cgtcgcgctgttgcaggctatcgtgtgttaacctgtacttctgccgcagagtttggagaaagcggcagcagattgtgctgccgcaggctggagcctggaacctggagccctggag s ponAbe2.chrUn 7194167 115 + 72422247 cgtcgtgctgttgcaggctctcgcgtgttagtctgtgattttactgcgcagttgagagaagacggcagcggagtctgcagctgcaggctggttctttgagcctgtggcgccaggg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32616389 121 - 90373283 I e panTro4.chrUn_GL393519 111262 942 + 413329 M e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=134073.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 272135 674 + 478999 ccttgaatggtgtgtgg----tggcaatggagagaggcagctggcagtgacagctgctccgtgcttggctacaggaaggaaagaagg--agaaagcacctaccataggctggaggctagagcctgcaggactgcggctggcctcgctggc--tcgcctccctggctggcctcgctgtggttggtggcagcgacggatactgcagctggccagagtgtagaaaggcaatggggtaggtaagctatccagggctgcccgcggcgggggctggttggggtattattccaggtgtcactgctttgggtgtactagagtgtta-ttttgggcgtcactgcttttaggtgtgctatccggggctgcactgccctcagcagcgggtgg-----gggggggt------------------tggtggggggcgggttggggtcactatcttgggctgtattgatggcagcagtagggctggttgggggtgctattgggtgctgcactg-cccgcgacaggggccgggttggggctgctattgtggttgcactgccggcggcatggtggtgggagggctggttagggtgcggactggtgggggtgcttactggtcgggcttcattgccgacagcggggtggggatgctatctggggctgcactgcccatggt-gggggcttgttgggggcgctatgtggggttgcaatgtccatggca s ponAbe2.chrUn 7194282 660 + 72422247 cttgacttggcatgtgagcaatggcaatggagagagacagctggcagtaagagctactccgtgcctggctacaaggaggaaagagggctagaaagcacctaccgtaggctggaaactagagactgcgggactgtggctggcctcgctggc--tcgcctcgctg-----------tgtggttggtggcagcgacggacactgtaactggccagagcgtagaaaggcgatggggtaggtacgctatctggggccgcccgcggtggaggctggttggggtgttactccgagtgtcactactttgggtgtactaaagtgttaattctgggcgtcactgcttttaggtgtgctatccggggctgcactgctgtcagcagcaggggg-----tgggggg----------------------------gcgggtggggggcgctatcctgggctgtattgctggcagcagtagggctggttgggggcgctattggctgctgcactg-cccgcgacaggggccgggttggggctgctattgtggttgcactgtcggcggcgtgtgggtgggaggactggttagggcgtggactggtgggggcgcttcctggtcgggcttcattgccgacagcggggtggggatgctatctggggctgcactgcccatggc-gggggcttgttgggggcgctatgtggggcttcaatgcccatggca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32616510 678 - 90373283 ctctgcttggtgtgtgg----cggccatggagagaggcagctggtggtgagagctgctccatgcctggctacaggaagggaaggagg-----aggcacctaccacaggctggaggctagagcctgtggggctgtggctggcctcgctggccttcacctcactgggtcgcctcgccgtggttggtggcagcgatgaacactgcagctggccagagcgtagaaaggcgatggggtaggtgcgctgtccggggctgcccgcagcggggaatggttggggtgttattccaa-cgtcactatttt-ggcgtactagagtgtta-ttctgggcgtcactagtttcaggtgtgctgt-cgtgactgcactgctctcagcagcagagggacgtagggggggtgtggacggggtggcggtgtgggggggggcaggttggagtcactatctt-ggctatattactggcagcagtagggctggttgggggcgctattgggtgctgcactgccccccgacaggggccgggttggggccgctattgtggttacgctgccggcggcatgggggtgggaggactggtc----------------ggggtcctgactgctcgggcttcattgcccacagcggagtggggatgctcttcagggctgctctgcccatggcggggggcttgttgggggcaccatgtggggttgcaatgcccgtggca i chlSab2.chr2 I 121 I 1 e panTro4.chrUn_GL393519 111262 942 + 413329 M e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=43262.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 272809 87 + 478999 ggggagaggttagaggcagtatcagatgctacactgctggtggtggggcggggcagcggtgggtgcgggtaggtgcttggagggtgc s ponAbe2.chrUn 7194942 87 + 72422247 ggggataggttagaggcagtatcaggtgctacactgctggtggtggggcggggcagcggggggtgccggtaggtgcttggacgatgt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119416245 87 + 137160470 ggggataggttagaggcagtatccggtgctacactgctggtggtggggcaggggagtgaggggtgcaggtaggtgctTGGAGGGTGT i rheMac3.chr13 N 0 C 0 s chlSab2.chr2 32617189 87 - 90373283 ggggataggttagaggcagtatccggtgctacactgctggtggtggggcaggggagtgaggggtgcaggtaggtgcttggagggtgt i chlSab2.chr2 I 1 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 111262 942 + 413329 M e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=988989.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 272896 1323 + 478999 ggtttcgggcgctatc-gggccagactgcccatgatagagggcaggtttgggtgcgctactaggggatacactcctcacagcaaggggcggtttgggggtgatacccggccggtggcaggcggggtggtggggtgggttgtgggcaccgttcgggggctgcactgtggtcagtggcggtggggcgagttaggtgctctatcagctgctgcactgtttgtggtgggggctgggtttggtgtgctatcggggacc------atatttttggcagcggtatacaggttaggggtgctgtcggaggctgcactgcccatggcggggtgcgggtggggtgcactatccagggcatcattccccctgggtgggggacagtt-gggggtgctatctgctatgtagggctgcactgctcgtcgtggggagggggttggggaccttaaggatccatggctgcactattgacggcatggagcaggtggccgtgctct--ccggggcatcactgcccgcagccgggggttagctggaggtcctatccgtggctgcatggccgacggcagacggtaggatgggggagttatctggtgctgcgacgtccgaggcagggatgggttgggggcgctattgggttttacattgcagcggcgaggggcggtgttgggggcgctatcccagagccaacatcaggcagcggattaggggcgccatcaggggctgccttgctggtggcggCAGAGCTTGCAGCAACAG----GGTCTCCAAGG-AAGGAGCCTTCTTCCTCTTTCTGGATTTCAGACTCTAAAAGGCGATCTC------------------------CTCCTGCTCCTGCTAGAGCGCAGCGAGCGCACGGCGTTTCCGCAGTAATCCTGAGCACGGCAAGGA-CCCCTTACCCGCCGGGGTTCCCGGGGCCATGCCCTTTTCGCTCTGTGTTGCGGAGACCACCTGGCACCCCTAGGCACGCTGGACACGGAGTGGCGGGGACACCACGGGGAGACAGGGCTCTGTGGGTGGAGGCATTGGGATGGGGAACCGGCATTTGGGTGGGAGGGCTGGCTGTGTCTGAGTTCCTGCTGATTTTGTTCCCCAAGGAGCGCAGTCCTGGTGGGCCCAGCGGTTCCTGTGGATTGGAGCCAGGCAGTGTGATGTTACCAGT-CACCACTCCAGG--TCCCAGT--------TCCTGGCCCGCTTGAGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGGGTGGATATGAGTGCCTTCACTGAGACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGGATGACAAGGTGAGGCTCTAACGCTATCAGTCTCTGCATTCTCCtctaggcttttttggctgtgtgtgtccagctg s panTro4.chrUn_GL393519 112205 1322 + 413329 ggttttgggcgctatc-gggccagactgcccatgatagagggcaggtttgggtgcgctattgggggatacattcctcacagcaaggggcagtttgggggtgatacccggccggtggcaggcggggtggtggggtgggttgtgggcaccgttcgggggctgcactgcggtcagtggcgggggggcaagttaggtgctctatcagctgctgcactgtttgtggtgggggctggttttggtgcgctatccgggacc------atatttctggcaacggcatacaggttaggggtgctgttggaggctgcactgcccatgg-ggggtgcgggtggggtgcactatccaggacattattccccctgggtgggggatagtt-gggggtgctatctgctatgtagggctgcactgctcgtcgtggggaggggattggggaccttaaggatccatggctgcactattgacggcagggagcaggtggccgtgctct--ccggggcatcactgcccgcagtcgggggttggttggaggtcctatccgtggctgcatggcccacggcaggcagtaggatgggggagttatctggtgctgtgacgtccgaggcagggacgggttggaggcgctatggggttttacactgcagcggcgaggggcagtgttgggggcgctatcccagagccaacatcaggcagcggattaggggcgccatcaggggctTCCTTGCTGGTGGCGGCAGAGCTTGCAGCAACAG----GGTCTCCAAGG-AAGGAGCCTTCTTCCTCTTCCTGGATTTCAGACTCTAGAAGGCGATCTC------------------------CTCCTGCTCCTGCTAGAGCGCAGCGAGCGCACGGTGTTTCCGCAGGAATCCTGAGCACGGCAAGGA-CCCCTTACCCGCCGTGGTTCCCGGGGCCACGCCCTTTTCGCTCTGTGTTGCGGAGACCACCTGGCACCCCTAGGCACGCTGGATACGGAGTGGCGGGGACACCACGGGGAGACAGGGCTCTGTGGGTGGAGGCATCAGGATGGGGAACCGGCATTTGGGTGGGAGGGCTGGCTGGGTCTGAGTTCCTGCTGATTTTGTTCCCCAAGGAGCGCAGTCCTGGTGGGCCCAGCGGTTCCTGTGGATTGGAGCCGGGCAGTGTGATGTTACCAGT-CACCACTCCAGG--TCCCAGT--------TCCTGGCCCGCTTGAGCCAAAAGGAGAGGCTGGACTTTGGAGGGTGGATATGAGTGTCTTCACTGAGACTGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGGATGAGAAGGTGAGGCTCTAACGCTATCACTCTCTGCATTCTCCTCTAGGCTTTTTTGGCTTTGTCTGCCCAGCTG i panTro4.chrUn_GL393519 M 942 M 404 s ponAbe2.chrUn 7195029 1319 + 72422247 gatttcgggcgctatc-gggccagactgcccatgatagagggcaggtttgggtgtgctattgggggatacactcaccacagcaaggggcagtttgggggcgatacccggccggtcgtaggcggggtggtggggtgggctgtgggcaccgttcgggggctgcactgcggtcagtggcgggggggcgagttaggtactttatcagctgctgcactgtttgtggtgggggttgggtttggtgcgctatcgaggacc------atattcctggcagcggcatacaggtt-ggggtgctgtcggaggctgcactgcccatggcggggtgcgggtggggtgcactatccagggtatcattcctggtgggtaggggatagtt-gggggtgctatctggtatgtagggctgcactgttcgccgtggggagggggttggggaccttaagcatccatggctgcactattgacgtcggggagcaggttgctgcgctct--ccggggcaccactgcccgcagtcgggggttggttggaggtcctatcggtggctgtatggcccacggcaggcggtaggataggtgagttatctggtgctgcgatgtccaaggcagggacgggttgggggcgctattgggttctacactgcagcggcgaggggcagtgttgggggcgctatcccagagctaacagcaggcagcggattaggggcgctatcaggggctgccttgctggtggcggCAGAGCTTGCAGCAACGG----GGTCTCCAAGGAAAGGAGCCTTCTTTCTCTTCCTGAATTT--GACTCTA----GCGATCTC------------------------CTCCTGCTCCTGCTAGAGCGCAGCGAGCGCACGGCGTTTCCGCAGGAATCCTGAGCGCGGCAAGGACCCCCTTAGCCGCCGTGGTTCCCGGGGCCACGCCCTTTTCGCTGTATGTGGCGGAGACCACCTGGGACCCCTAGGCACGCTGGACACGGTGTGGC--GGACACCACGGGGAGACAGGGCTCTGTGGGTGGAGGCATCAGGATCGGGAACCGGCACTTGAGAGGGAGGGTTGGCTGGGTCTGAGTTCCTAATGATTCTGCTCCCCAAGGAGCGCAGTCCTGGTGGGCCCAGCGGTTCCTGTGGATTGGAGCCGGGCAATGTGGTGTTACCAGTCCACCACTCCAAACCCCCCAGT--------TCCTGGCCTGCTTGGGCCGAAAGGAGAGGCTGGACTTCGGAGGGTGGGTATCAGTGCCTTCACTGAGACCGGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGGATGACAAAGTGAGGCTCTGACGCTATCACTCTTTGCATTCTCCtctaggcttttttggctttgtctgcctagctg i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119416332 1327 + 137160470 GGTTTCAGGCGCTATCGGGGCCACACTGTCCAtgatagagggtggg-ttgggtgtgctattgggagataaactccccgcagcaaggggcagtttggggacgatacctggccggtggcaggcggggtggtagggtgggttgtgggcaccgttcgggggctgctctgcggtcagtg-----ggggcgagttaggggctccatcagcttctgcactgtttatggtgggggccgggtttggtgcgctctcggggacttccgggacgtttctggcagcggcataccgcttaggggcgctgacgggggctacactgcccacgaagggatgcgggtggggtgcgccatccagggcatcattccccgtggctgcgggatagttggggggtgctgtctgctatgtggggctgcactacacgtcgtggggagggggttgcggacctcaaggatccgtggctgcactattcacggcggggagcaggttgctgtgctctgcctggggcgtgactgcctgca-------gtgggttaggggtcctctcagtggctgcatggcccacggcagggggtaggatggggaagtgttctggtgctgcgatgtcggaggtgggggcggattgggggcgctattgagttctacactgcagcggcgaggggcggtgttaggggcactgtccaagggccaacagcaggcagcgggttagggacgctatctggggctgccctgccagtggcgGCAGAGGTTGCAGCAACAGCAGTGGTCTCCAAGG-AAGGAGCTTTCCTCCTCTCCCTGGACTCCAGACTCTAGAGGGCGATCTC------------------------CTCCTGCTCCTGCTCCAGTGCAGCAAGCGCGCAGCGTTTCCGCAGGAATCCTGAGCCGGGCATAGGCCCCAACACCCGCTGTGGTTCCCGGGGCCACGACC-TTTCTCTCTGTATTGCAGAGACTGCCTGTGACCCCCAGGCACGCTGGACACGGAGTAGC--AGACACCACAGGGGCACAGGGCCCTGTGGGTGGAGGCATCAGGATCAGGAACCTGCACTTGGGTGGGAGGGCTGGCTGGGTCTGAGTTCCTGCTGGTTCTGCTCCCCAAGGAACGCAGCCCTGGTGGGCCCAGCGGTTCCTGTGGATTGGAGCCAGGCAACGTGGTGTTACCCGT-CTTCACTCCAGG--CCCCAGTACCTGGTCCCCTGGTCCGCTTGGGCCAAAAGGAGAGGCGGGACTTCGGAGGGTGGATGTGAGTGCCTTCACTGAGACCAGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGGATGACAAGGTGAGGCTCTAACGCTATCA--CTTTGCGTGCTCCtctaggc-tttttggctttgcctgcccagctg i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32617276 1326 - 90373283 ggtttcaggcgctatgggggccacactgtccatgatagagggtggg-ttgggtgtgctattgggagacacactccccgcagcaaggggcagtttgggggcgatacctggccggtggcaggcggcgtggtagggtgggttgtgggcaccgttcgggggctgctctgtggtcagtg-----ggggcgagttaggggcactgtcagctgctgcactgtttgtggtgggggccgggtttggtgcgctatcggggact------atatttctggcagcggcataccgctttggggtgctgacgggggctacaccgtccacggtgggatgctggtggggtgcgctatccagggcatcattccccgtggctgcaggatagttggggggtgctatctgctctgtggggctgcactacccgtcgtggggagggggttgcagaccttaaggatccgtggctgcactattcacggcggggagcaggttgctgtgctctgcctggggcgtcactgcctgca-------gtggattaggggtcctctcagtggctgcatgacccacggcaggggataggatggggaagtgttctggtgctgcgatgtcggaggtgggggcgggttgggggcgcttttgagttctacaccgcagtggcgaggggcggtgttgggggcactgtcccggggccaacagcaggcagcgagttaggggcgctatcaggggctgTGCTGCCAGTGGCAGCAGAGGTTGCAGCAACAGCAGTGGTCTCCAAGG-AAGGAGCTTTCCTTCTCTCCCTGGACTCCAGACTCTAGAGGGCGATCTCctcctgctcctgctcctgctcctgctcctgctcctgctccAGTGCAGCAAGCTCGCAGCGTTTCCGCAGGAATCCTGAGCAGGGCATAGGCCCCAACACCCGCTATGGTTCCCCGGGCCACGACC-TTTCTCTCTGTGTTGCAGAGACCACCTGGGACCCGTAGGCACGACAGACACGGAGTAAC--GGACACCACGGGAGGACAGGGCTCTGTGGGTGGAGGCATCAGGATCGGGAACCGGCGCTTGGGTGGGAGGGCT-GCTGGGTCTGAGTTCCTGCTGGTTCTGCTCCCCAAGGAGCAAA-----------CCCAGCGGTTCCTGTGGATTGGAGCCAGGCAATGTGGTGTTACCAGT-CTCCACTCCAGG--CCCCAGT--------TCCTGGTCCGCTTGGACCAAAAGGAGAGGCTGGACTTCGGAGGGTGGATGTGAGTGCCTTCACTGAGACCAGCCCCTGCCACCCAGTGGCCAGGATGACAGGGTGAGGCTCTAACGCTATCA--TTTTGCGTGCTTCtctaggcttttttggctttgcctgcccagctg i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=1899.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 274219 4 + 478999 ttcc s ponAbe2.chrUn 7196348 4 + 72422247 ttcc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119417659 4 + 137160470 ttcc i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32618602 4 - 90373283 ttct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 113527 404 + 413329 M e nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 162947 13811 + 1200634 I a score=240131.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 274223 301 + 478999 atgccaggaggaggaggagttacatgctggaagcttgcagatagcctggggctgctgctcgccttgctgcggttggtggcagctaccgagactacctcgcaccagagcggtaggaggACGGCCAGCTGTGGCCATGGCAGGGGCAGGGCTGCGGCGGTGGCCAGGTAGTAGGAGCTTTGTAGGGTGGGCCAGTGCATTGAGGGCAACAGCAGCGATGGTTATAGTGACATCTGCGCTAGTTGTGGCAGCAGCCGCAAGTCCAGGGGCCGGGAAGAGGGAGT-AGGAGCGCTGCGGGGCCTGC s ponAbe2.chrUn 7196352 302 + 72422247 atgtcaggaggaggaggagttacatgctggaagcttgcagatggcctggggctgccactcgccttgctgcggttggtggcagctacggagactgcctcgcaccagagcggtaggaggacggccaactgcggccatggcaggggcaggGCTGCGATGGTGGCCAGGTAGTGGGAGCTTTGTAGGGTGGGCCAGTGCATTGAGGGCAACAGCGACGATGGTTATATTGACATCTGCGCTAGTGGTGGCAGCAGCCGCAAGTCCAGGGGCCGGGAAGAGGGAGTTAGGAGCATTGCCGGGCCTGC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 176758 301 + 1200634 ATGCCAGGaggagaaggagttacatgccggaagcttgcagatggcctggggctgccgctcgccttgctgtggtcggtggcagctacagagactccttcatgccacagcggtaggaggacagccagctgcagcaatggcaggggcaggGCTGCGGCGGTGGCCAGGTAGTAGGAGCTTTGTAGGGTGGGCCAGTGCATTGAGGGCAACAGCAGCGATGGTTATAGTGACATCTGCGCTAGTGGTGGCAGCAACAGCAAGTCCAGGGGCCAGGAAGAGGGAGT-AGGAGCCCTGCGGGGCCTGC i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random I 13811 C 0 s rheMac3.chr13 119417663 300 + 137160470 atgccaggaggaggaggaattacatgctggcaacttgcagatggcctggggctgccgctcggctggctgcggttggtggcagctacggagactgcagcgggccagaacggtaagaggacggccagctgcggCCATGGCGGGGGCAGGGCTGCGGC-GTGGCCAGGTAGTAGGAGCTTTGCAGGGTGGACCCGTGCATTGAGGGCAACAGCAGCAATGGTTGTAGTGACATCCACGCTAGTGGTGGCAGCAGCAGCAAGTCCGGGGGCCGGGAAGAGGGAGT-TGGAGTGCTGCGGGGCCTGC i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32618606 300 - 90373283 atgccaggaggaggaggagttacatgctggcaacttgcagatgtcctgggactgccgctcacctcactgcggttggtggcagctacggagactgcagcgggccagaacggtaagaggatggccagctgtggCCATGGCGGGGGCAGGGCTGCGGT-GTGGCCAGGTAGTAGAAGCTTCGCATGGTGGGCCCGTGCATTAAGGGCAACAGCAGCAATGGTTGTACTGACATCCACGCTAGTGGTGGCAGCAGCAGCAAGTCCGGGGGCCGGGAAGAGGGAGT-AGGAGCGCTGCGGGGCCTGC i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 113527 404 + 413329 M a score=204320.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 274524 166 + 478999 CCGGCCAGGCCTAGGGTGGGTAGGAAGCTTCGGGTGCTGTACCACAGGCCTCGGTGGAAGTGGTGGAGGAACAGCCAGGGCAAGGAGGAGTTCTCCCCCTTCTCCTGCAGTCTCTGGAGGGCGACCTCCTCCTACTGGCGCATGAGCCCGGTGTGAGTGTCAGCAT s ponAbe2.chrUn 7196654 166 + 72422247 CCGGCCAGGCCTGGGGTGGGAAGGAAGCTTCGGGTGCTGTACCACAGGCCTGGGTGGAAGTGGTGGAGGAACAGCCAGCGCAAGGAGGAGTTCTCCCCCTTCTCCTGCAGTCTCTGAAGGGCGACCACCTCCTGCTGGCGCATGAGCCAGGTGTGTGTGTCAGCAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 177059 165 + 1200634 CCAACCAGGCCTAGGGTGGGTAGGAAGCTTCGGGTGTTGTACCACAGGCCTCGGTGGAAGTGGTGGAGGAACAGCCAGAGCAAGGAGGAGTTCT-CCCCTTCTCCTGCAGTTTCTGGAGGGTGACCACCTCCTGCTGGCGCATGAGCCAGGTGTGAGTGTCAGCAT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 I 6996 s rheMac3.chr13 119417963 165 + 137160470 CCGGCCAGGACTGGGCTGGGTAGGAAGCTTCGGGTGCTGTACCACA-GTCTCGGTGGAAGTGGTGGAGGAATAGCCAGGGCAATGAGGAGTTCTATCCCTTCTCTTGCAGTCTCTGGAGGGCGACCTCCTCCTGCTGGCGCATGAACCATGTGGGAGTGTCAGCAT i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 1886 165 - 38368 CCGGCCAGGACTGGGCTGGGTAGGAAGCTTCGGGTGCTGTACCACA-GTCTCGGTGGAAGTGGTGGAGGAACAGCCAGGGCAATGAGGAGTTCTACCCCTTCTCTTGCAGTCTCTGGAGGGCGACCTCCTCCTGCTGGCGCATGAACCAGGTGGGAGTGTCAGCAT i papAnu2.JH685195 N 0 C 0 s chlSab2.chr2 32618906 165 - 90373283 CCGGCCAGGACTGGGCTGGGTAGGAAGCTTCGGGTGCTGTACCACA-GTCTCGGTGGAAGTGGTGGAGGAACAGCCAGGGCAATGAGGAGTTCTACCCCTTCTCTTGCAGTCTCTGGAGAGCGACCTCCTCCTGCTGGCGCATGAACCAGGTGGGAGTGTCAGCAT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 113527 404 + 413329 M a score=471575.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 274690 410 + 478999 ATTATCTCACTCTTTCTTCCAATATAATAcagtcatgcactacat---aacaaggtttcaccagtgatggcctgcatgtatcagggtagttctataaaattataatgaaactgaaaaatcctcattgtctactgacagcatagccgtcttaaccttgtaatacaacgcaatactcacgtgtttgtagtgatgatggcgtaaacaaacctactgagctcctggttctatgaaagtatagcgcatataggccaggcgtggtgattcacacctgtaatcccagcacttcggggggccaaggcgggcagatcacgaggtcaggagatcgacaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtttctactaaaaatagaaaaaattagctaggggtggtggcaggcccctgtagtccca s ponAbe2.chrUn 7196820 390 + 72422247 ATTATCTCACTCTTTCTTCCAATataataa---catgca----------------ttttgccagtgatggcctgcatgtattaaggtagttctataaaattataatgaaactgaaaaattttcattgcatagtgacggtatagccatcttaaccttgtaatacaatgcaatactcacgtgtttgtagtgatgatggcgt----aaacctccttagcccctcgttctgtaaaagtgtagcacatataggccaggcgtagtgactcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcgggcagatggcaaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacaggatgaaatcccgtctctactaaaaatagaaaaaattagctaggggtggtggcaggcccctgtagtccca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 184220 403 + 1200634 ATTATCTCACTCTTTCTTCCAATTTAATAcagtcatgcactgcat---aaca---ttttgccaatgatggcctgcatgtatcagggtagttctgtaaaattataatgaaactgaaaaattctcattgcctggtgacagcatagccatcttaaccttgtaatacaacgcaatactcacgtgtttgtagtgatgatggcgt----aaacctactgagctcctggttctgtaaaattatagcacatataggccaggcgtggtgactcacacctgtaatcccagcactttggggggctgaggcgggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatagaaaaaattagctaagggtggtggcaggcccctgtagtccca i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random I 6996 C 0 s rheMac3.chr13 119418128 404 + 137160470 ATTATCTC--CATATCTTCCAAGGTAATATagtcatgcactgcat---aaca---ttttgccagccatggcctgcatgtatcagggtagtcctataaaattataatgaaactgaaatattctcattgcctagtgacaacatagccatcttaaccttgtaatgcaaggcagtagtcacgtgtttgtggtgatgatggcataaacaaacctactgagctcctctttctgtaaaa-tataacacatacaggccaggcgtggtgactcacgcgtgtaatccaagcactttgggaggccgaggcgggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaatagaaaaaattagccaggagtggtggcaggcccctgtagtccct i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 2051 408 - 38368 ATTATCTC--CATATCTTCCAATGTAAtatagtcatgcactgcataacaaCA---TTTTGCCAGCCATGACCTGCATGTATCAGGGTAGtcctataaaattataatgaaactgAAATATTCTCATTGCCTAGTGACAACATAGCCATCTTAACCTTGTAATGCAAGGCAGTACTCACGTGTTTGTGGTGATGATGGCATAAACAAACCTACTGAGCTCCTCTTTCTGTAAAAGTATAACAcatacaggccaggcgtggtgactcacacgtgtaatccaagcactttgggaggccgaggcgggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatagaaaaaaatagccaggggtggtggcaggcccctgtagtccct i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32619071 406 - 90373283 ATTCTCTC----TCTCTTCCAATGTAATATagtcatgcactgcatagcaaca---ttttgccagccatggtctgcatgtatcagggtagtcctataaaattataatgaaactgaaatattctcattgcctagtgacaacatagccatcttaaccttgtaatgcaaggcagtactcacgtgtttgtggtgatgatggcataaacaaacctactgagctcctctttctgtaaaagtataacacatacaggccaggcgtggtgactcacacctgtaatccaagcactttgggaggccgaggcgggcagatcacgaagtcaggagatcgagaccatcctggctaacacagtgaaaccccgtctctactaaaaatagaaaaaattagccaggggtggtggcaggcccctgtagtccct i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e panTro4.chrUn_GL393519 113527 404 + 413329 M a score=141398.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 275100 84 + 478999 gctactcgggaggctgaggcaggagaatggggtgaacccggaaggtggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactcg s panTro4.chrUn_GL393519 113931 84 + 413329 gctgcttgggaggctgaggcaggagaatggggtgaacccagaaggtggagctcgcagtgagccgagatcacgccactgcactcc i panTro4.chrUn_GL393519 M 404 C 0 s ponAbe2.chrUn 7197210 84 + 72422247 gctacttgggaggctgaggcaggagaacggggtgaacctgaaacgtggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcgctac i ponAbe2.chrUn C 0 I 434 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 184623 84 + 1200634 gttactcaggaggctgaggcaggagaatggggtgaacccggaaggtgaagcttgtagtgagccgagatcgcaccactgcactct i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119418532 84 + 137160470 gctacttgtgaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccggaaggtgcagcttgtagtgagctgagatcacgccactgcactcc i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 2459 84 - 38368 gctacttgtgagactgaggcaggagaatggcgtgaacccggaagatggagcttgtagtgagctgagatcacgccactgcactcc i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32619477 84 - 90373283 gctacttttgaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccggaaggtggagcttgtagtgagctgagatcatgccactgcactcc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=70326.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 275184 44 + 478999 agacttggcgacagagcgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 114015 44 + 413329 agacttggcgacagagcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 1 s ponAbe2.chrUn 7197728 44 + 72422247 agacttggcgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaa i ponAbe2.chrUn I 434 I 2 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 184707 44 + 1200634 agacttgaggacagagcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 I 4 s rheMac3.chr13 119418616 44 + 137160470 agagttggtgacagagcgagacgcagtctcaaaaaataaaaata i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 2543 44 - 38368 agagttggtgacagagtgagactcagtctcaaaaaataaaaata i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32619561 44 - 90373283 agacttggcgacagagcgagactcagtctcaaaaaataaaaata i chlSab2.chr2 C 0 I 9 a score=3775.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 275228 18 + 478999 gtatagcacatttaagta- s panTro4.chrUn_GL393519 114060 18 + 413329 gtatagcacatataagta- i panTro4.chrUn_GL393519 I 1 C 0 s ponAbe2.chrUn 7197774 18 + 72422247 gtatagcacatgtaagta- i ponAbe2.chrUn I 2 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 184755 18 + 1200634 atatagcacatataagta- i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random I 4 C 0 s rheMac3.chr13 119418660 6 + 137160470 -------------aaaaag i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 2587 6 - 38368 -------------aaaaag i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32619605 9 - 90373283 I a score=1179666.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 275246 749 + 478999 tacatagtacataaaagttgata------atg--aacaactatgttactggtttatgtgtttagtatactatgatttttgacattattttagaatgcattccttctacttac----aaacaaaaaagttaact--aaaatagcctgaggcaggtccttcaggagctatttcagaagaaggcattgttaccatgggagatgacagctccatgtgtggtattgcttcggaagaccttccagtgggaggagatgtggagatggaagactgatgttgatgatcctgacccagtgtaggcctaggctagtgtgtgtgtatttgtgtgttagcttttaccaaaacgaagtttaagaaatCTGTATGCTTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GATACAACTTACA--GAGAGGAAGCATCGAGGCACCTGAGTGTATCTTTTTAACGCTGACATTATCATTGAGAAAAAAATTAAAACACAGAAAAAGCTATTTTTCTTAAGAAAAAGTTTGAGTG-TTTTTAACAAATCTATGAATTGATTTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGGTAATGTACCTTCAACAATGCAATCATGTGCACATACTTTA--CTGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCACCTATAGATATATTCAACTGATTACCTGTGCCTGTGAGAATACAC--GAGG-----------------TAAACTCTAATGATGTATCAATAAGTAGAAAGCTATGAAGCAAATTGAGACAATTATCTAAATCATCCTGTCAGAAATTCCCTT s panTro4.chrUn_GL393519 114078 746 + 413329 tatatagtacataaaagttgata------atg--aacaactatgttactggtttgtgtgtttagtatgctgtgatttttgacattattttagaatgcattccttctacttac----aaacaaaaa-gttaactgtaaaatagcctgaggcaggtccttcaggagctatttcagaagaaggcattgttaccatgggagatgacagctccatgtgtggtattgcttcagaagaccttccagtgggacgagatgtggagatggaagactgatgttgatgatcctgacccagtgtaggcctaggctagtgtgtgtgtatttgtgtgttagcttttaccaaaacgaagtttaagaaatTTGTATGCTTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GATACAACTTA------GAGGAAGCATCGAGGCGCCTCAGTGTGTCTTTTTAACGCTGACATTATCATTGAGAAAAAAATTAAAACACAGAAAAAGCTATTTTTCTTAAGAAAAAGTTTGAGTG-TTTTTAACAAATCTATGAATTGATCTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGGTAATGTACCTTCAACAATGCAATC--GTGCACATACTTTATACTGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCACCTATAGATATATTCAACTGATTACCTGTGCCTGTGAGAATACAC--GAGG-----------------TAAACTCTAATGATGTATCAATAAGTAGAAAGCTATGAAGCAAATTGAGACAATTATCTAAATCATCCTGTCAGAAATTCCCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7197792 761 + 72422247 tatatagtacataaaagttggta------atgataacaac--tgttactggtttatgtatttagtatactatgatttttggcatgattttagaatgcattccttctacttac----aaa-aagaa-gttaactgtaaaatagcctgaggcaggtccttcaggagatatttcagaagaaggcattgttaccatgggagatgacagctccatgtgtggtattgcttcaggtgaccttccagtgggacgagatgtggagatggaagagtggtattgatgatcctgacccagtgtaggcctaggctagtgtgtgtgtatttgtgtcttagcttttaccaaaacgaagtttaaaaaatTTGTATGCTTATTTTTTGTTATGAATACTTACAAGGTGATACAACTTACAAGGAGAGGAAGCATCGAGGCACCTTAGTGTGTCTTTTTAACGCTGACATTATCATTGAGAAAAAAATTAAAACACAGAAAAAGCTATTCTT-------AAAAGTTTGAGTG-TTTTTAAGAAATCTATGAATTGATTTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGGTAATGTACCTTCAACAATGCAATT--GTGCAAATACTTTA--CTGAGGAGGCGCTTAACGCAGGCTGAATCGCCTATAGATATGTTCAACTGGTTACCTGTGCCTGTCAGAACACAT--GAGGTTCCTAACTACCTCTCTTAAACTCTAGTGATGTATCAATAAATAGAAAGCTATGAAGCAAATTGAGACAATTATCTAAATCATCTTAGCAGAAATTCCCTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 184773 753 + 1200634 tacgtagtacatgaaagttgata------atg--aacaactatgttactggtttatgtgtttagtacactatgatttttggtattattttagaaagcattccttctacttac----aaacaaataagttaactgtaaaatagcctgaggcaggtccttcaagagctatttcagaagaaggcattgttaccacgggagatgacagcttcatgtgtggtattgcttcagatgaccttccagtgggacgagatatggagatggaagactgatattgatgatcctgatccagtgtaggcctaggctagtgtttgtgtatttgtgtcttagcttttaccaaaacgaagtttaagaaatTTGTATGCCTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GGTACAACTTACAAAGAGAGGAAGCATCGAGGCACCGCAGCGTGTCTTTTTAATGCTGACATTATCAATGAGAAAAAAAGTAAAACACAGAAAAAGCTATTCTT---AAGAAAAAGTTTGAGTGTTTTTTAACAAATCTATGAGTTGATTTGCAATTTCATGGTGTCTTTATTGGTAATGTACCTTCAACAATGCAATCATGTGCACATGCTTTC--CTGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCACCTATAGATATATTCAACTGATTACCTGTGCCTGTCAGAATACACATGAGG-----------------TAAACTCTAATGATGTATCAATAAGTGGAAAGCTATGAAGCAAATTGAGACAATTATCTAAATCATCCTATCAGAAATTCCCTT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119418666 735 + 137160470 tacttaatacataaaagttgataatg---atg--agcaactgtgttactggtttatgtatttagtgtactatggtttttggcatttttttagaatgcattccttctacttatatt-tttaaaaaaagttaactgtaaaacagcctgaggcagggccttcaggagatatttcagaagaagacgttgttgccatgggagatgacggctccatgtgtggtattgctccagaagaccttccaatgggacaagatgtggagatgggagactgacattgataatcctgacccagtgtaggcgtaggctagtgtgtgtgtatttgtgtcttagcttttaccacaacgaagtttaaagaatTTGTATGCTTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GATACAACTTACAAAGAGGGGAAGCATTGGGGCACCTCAGTGTGTCTTTTTAAAGCTAACATTATCATTGAGAAAATAATTAAAACACAGAAAAAGCTATTCTT---CAGAAAAAGTTTGAGTG-TTT----------TATGAATTGATTTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGATAATGCACCTTCAACAGTGCAATCATGTGCACATATTTTA--CCGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCAGCTATAGATATATTCAGCTGATGACCTGTGCCTGTTAGAATACACACCTGGTT--------CCTCTCTTAAACTCTAATGAT-------------------TATGAAGCAAATTAAGACAATTATCGAA---ATCCTAGCAAAAATTCCCTT i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 2593 755 - 38368 tacataaTACATGAAAGTTGATA------ATG--AGCAActgtgttactggtttatgtatttagtGTACTATGGTTTTGGGCATTTTTAAAGAATGCATTCCTTctacttatattaaaaaaaaaaagttaactgtaaaacagcctgaggcaggtccttcaggagataTTTCAGAAGACGAGGTTGTTGCCAtgggagatgacagctccatgtgtggtATTGCTTcagaagaccttccagtgggacaagatgtggagatgGGAGACTgacattgatgatcctgacccagtgtaggcctaggctagtgtgtgtgtatttgtgtcttaGCTTTTACCACAACGAAGTTTAAAGAATTTGTATGCTTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GATTCAACTTACAAAGAGAGGAAGCATTGGGGCACCTCAGTGTGTCTTTTTAAAGCTAACGTTATcattgagaaaataattaaaacacagaaaaagctaTTCTT---CAGAAAAAGTTTGAGTG-TTT----------TATGAATTGATTTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGATAATGCACCTTCAACAGTGCAATCATGTGCACATATTTTA--CCGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCAGCTATAGATATATTCAGCTGATGACCTGTGCCTGTTAGAATACACACCTGGTTCCTAACTACCTCTCTTAAACTCTAATGATG-----GTAAGTAGAAAGCTATGAAGCAAATTAAGACAATTATCGAA---ATCCTAGCAAAAATTCCCtt i papAnu2.JH685195 C 0 I 50 s chlSab2.chr2 32619614 757 - 90373283 tacatagtacataaaaggtgataatgataatg--aacaactgtgttactggtttatgtatttagtgtactatggtttttggcatttttttagaatgcattccttctacttatatttaaaaaaaaaagtcaactgtaaaacagcctgaggcaggtccttcaggagatatttcagaagac---gttgttgccatgggagatgacagctccatgtgtggttttgcttcagaagaccttccagtgggacaagatgtggagatgggagactgacattgatgatcctcacccagtgtaggcctaggctagtgtgtgtgtatttgtgtcttagcttttaccacaacgaagtttaaaaaatTTGTATGCTTATTTTTTGTTCTGAATACTTACCAA--GATACAACTTACAAAGAGAGGAAGCATTGGGGCACCTCAGTGTGTC-TTTTAAAGCTAACATTATCATTGAGAAAAAAATTAAAACACAGAAAAAGCTATTCTT---AAGAAAAAGTTTGAGTG-TTT----------TATGAATTGATTTGCAATTTCATGGTATCTTTATTGATAATGCACCTTCAACAGTGCAATCATGTGCACATATTTTA--CCGAGGAGGCACTTAACACAGGCTGAATCAGCTATAGATACATTCAACTGATGACCTGTGCCTGTTAGAATACACACCTGGTTCCTAACTACCTCTCTTAAACGCTAATGATG-----GTAAGTAGAAAGCTATGAAGCAAATTAAGACAATTATCTAA---ATCCTAGCAAAAATTCCCTT i chlSab2.chr2 I 9 C 0 a score=123009.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 275995 114 + 478999 TTT----ATCTGGACTACTAGGCCAATAAAATATCATTAATTTCTGGAACCTGTGAAG-TTTGCCTCTGTTCAGTTAATTAGGGAAATGAGTCTCTAAACAAATAAATAATGTAAACCA s panTro4.chrUn_GL393519 114824 118 + 413329 TTTTTTTATCTGGACTACTAGGCCAATAAAATATCATTAATTTCTGGAACCTGTGAAG-TTTGCCTCTGTTCAGTTAATCAGGGAAATGAGTCTCTAAACAAATAAATAATGTAAACCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198553 114 + 72422247 CTT----ACCTGGAATACTAGGCCAATAAAATATCATTAATTTGTGGAACCTGtgaag-tttgcctctgttcagttaattaggaaaatgagtctctaaacaaattaataatgtaaacca i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185526 109 + 1200634 TTT----ACCTGGAATACTAGGCCAATAAAATATCATTAATTTCTGGAACCTGTGAAG-TTTGCCTCT-----GTTAATCAGGAAAATGAGTCTCTAAACAAGTTAGTAATGTAAACCA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119419401 112 + 137160470 TTT----ATCTGGAATACTCAGTGAATAAAAT---ATTAATTTCTGAAAGTTGGGAAGTTTTGCCTCAGTTCAGTTAATTAGGAAAATGAGTCGCTAAACAAATAAATAATGTAAACCA i rheMac3.chr13 C 0 M 198 s chlSab2.chr2 32620371 115 - 90373283 TTT----ACCTGGAATACTCAGTGAATAAAATATCATTAATTTCTGGAACTTGGGAAGTTTTGCCTCAGTTCAGTTAATTAGGAAAATGAGTCTCTAAACAAATTAATAATGTAAACCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I a score=2910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276109 3 + 478999 GCA s panTro4.chrUn_GL393519 114942 3 + 413329 GCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198667 3 + 72422247 gCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185635 3 + 1200634 GCA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32620486 3 - 90373283 GCA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I e rheMac3.chr13 119419513 198 + 137160470 M a score=86578.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276112 68 + 478999 GATTGTGGTCTCCACAAGAGTCA-AAGGCAAATAACTGCTCTCAACCATTTGTAAATCCAGTCAAGGAA s panTro4.chrUn_GL393519 114945 68 + 413329 GATTGTGGTCTCCACAAGAGTCA-AAGGCAAATAACTGCTCTCAACTATTTGTAAATCCAGTCAAGGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198670 68 + 72422247 GATTGTGGTTTCCACAAGAGTCA-AGGGCAAATAACTGCTCTCAACTATTTGTAAATCCAGTCAAGGAA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185638 68 + 1200634 GATTGTGGTCTCCACAAGAGTCA-AAGGCAAATAACTGCTCTCAACTATTTGTAAATCCAGTCAAGGAA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119419712 69 + 137160470 GATTGTGGTCTCCACAAAAGTCATAGGGCAAGTAACTGCTGTCAGCTGTTTGTAAATCCAGTCAAGGAA i rheMac3.chr13 M 198 I 1 s chlSab2.chr2 32620489 68 - 90373283 GATTGTGGTCTCCACAAAAGTCA-AGGGCAAGTAACTGCTGTCAGCTATTTGTAAATCCAGTCAAGGAA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I a score=99931.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276180 143 + 478999 AAATAGTTTTGTCATAACGAAGAATATTTTATTATAAAATTTGTTATATGATATTGATTATATAAAATATTTTAACATCACGTTAAATTAATATGTTAAGGGAAATTAGATTTTGAAATGTTTTATTCTCATTGCTCTATCTT s panTro4.chrUn_GL393519 115013 135 + 413329 AAATAGTTTTGTCATAATGAAGaatattttattataaaattcgttatatgatattgattatataaaatatattaaCATCACATTAAATTAATATGTTAAGGGAAATTACATTTTGAAATATTTTATTCTCATTGC-------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198738 125 + 72422247 AAATAGTTTTGTCATAATGAAGAGtattttattataaaatttg--------------ttatataaaatGTATTAACATCACATTAAATTAATATGTTGAGGGAAATTAGATTTTGAAATATTTTATTCTCATTGC----TCTG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185706 143 + 1200634 AAATAGTTTTGTCATAATGAAGAATATTTTATTATAAAATTTGTTATATGATATTAATTATATAAAATATATTAACATCACATTAAATTAATATGTTAAGGGAAATTAGATTTTGAAATATTGTATTGTCATTGCTCTATCTT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32620557 143 - 90373283 GAATAGTTTTGTCATAATAAAGCACATTTTATTATAAAATTCGTTATATGATGTTAATTATGTAAAATATATTAAAATCACATTAAATTAATGTTATTAGGGGAATTAGATTTTGAAATATTTTATTCTCATTGCTCTATCTT i chlSab2.chr2 C 0 I 466 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I e rheMac3.chr13 119419781 1 + 137160470 I a score=2571.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276323 12 + 478999 AACTGTATCTAT s ponAbe2.chrUn 7198863 12 + 72422247 AACTATATTTAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185849 12 + 1200634 AACTATGTTTAT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32620700 466 - 90373283 I e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I e rheMac3.chr13 119419781 1 + 137160470 I e panTro4.chrUn_GL393519 115148 0 + 413329 C a score=22306.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276335 28 + 478999 TTGAATGTTCTAGTAGCATGTAGAATCT s panTro4.chrUn_GL393519 115148 21 + 413329 -------TTCTAGTAGCATGTAGAATCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198875 28 + 72422247 TTGAATGTTCTAGTAGCATGTAGAATCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185861 28 + 1200634 TTGAATGTTCTAGTAGCATGtagaatct i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32621166 28 - 90373283 TTGAATGTTTTAGTAGCATGTAGAATCT i chlSab2.chr2 I 466 C 0 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I e rheMac3.chr13 119419781 1 + 137160470 I a score=143225.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276363 138 + 478999 AATAAAATATCAACTATATA---------------------GGGACCTGA---------AAATACATTGTAGCTATTACTTATCTTTGCGTTTTCAATGTCAGAAAGTTCATTGTCATAGGTAATCTAGTAAGCAAAAGTTAATAATTTTTCTGAATTTAATTAATTT s panTro4.chrUn_GL393519 115169 133 + 413329 AATAAAATATCAACTATATA---------------------GGGACCTGA---------AAATACATTGTAGCTATTA-----CTTTGCGTTTTCAATGTCAGAAAGTTCATTGTCATAGGTAATCTAGTAAGCAAAAGTTAATAATTTTTCTGAATTTAATTAATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7198903 137 + 72422247 AATAAAGTATCAACTGTATA---------------------GGGACCTGA---------AAATACATTGTAGTTATTACTTATCTTTGCGTTTTCAATGTCAGAAAGTT-ATTGTCATAGGTAACCTAGTAAGCATAAATTAATAGTTCTTCTGaatttaattaattt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 185889 168 + 1200634 aataaaatatcaactatataatctaataaaatatcaactatataatctaataaaatatcaaataCATTGTAGCTATTACTTATCTTTGCGTTTTCAATGTCAGAAAGTTCATTGTCATATGTAATCTAGTAAGCATAAATTAATACTTCTTCTGAATTTAATTAATTT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119419782 137 + 137160470 AATAAAATATCAACTATATA---------------------GGGACCTGA---------AAATACATTGTAGCTATTATTCATCTTTGAATTTTTGATATCAGAAAGTTCATTGTCATAGCTAACTTAGTAAGCATAAA-TAATAATTCTTCTGaatttaattaattt i rheMac3.chr13 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 32621194 131 - 90373283 AGTAAAATATCAACTATATA---------------------GGG---------------AAATACATTGTAGCTATTACTTACCTTGGAGTTTTCAATGTCAGAAAGTTCATTGTCATAGGTAACCTAGTAAGCATAAATTAATAATTCTTCTGAATTTAATGAATT- i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 3348 50 - 38368 I a score=603529.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276501 345 + 478999 AAATAATTGTATCATGTGCATTAACCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATGCCCTATGGCAAGAAGTTCTAAATCCCTAATGTACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATCTCTTTCTTCCACTAACAAAAAATTCTATCTCAATAGTTGTAAATC-AGTTgtatcactagtcccattccatctatgagaaaactccagttcagggatgttaagtgacttcattaatgccccacagctaatcagtaggaaataaccaggagtggaggctagaaaccactccagatctatagtcttaacattgcgctat s panTro4.chrUn_GL393519 115302 344 + 413329 AAATAGTTGTATAATGTGCATTAACCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATG-CCTATGGCAAGAAGTTCTAAATCCCTAATGTACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATCTCTTTCTTCCACTAACAAAAAATTCTATCTCAATTGTTGTAAATC-AGTTgtattactagtcccattccatctatgagaaaactccagttcagggatgttaagtgacttcattaatgccacacagctaatcagtaggaaataaccaggagtggaggctacaaacaactccagatctatagtcttaacattgcgctat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7199040 344 + 72422247 aaataattGTATCATGTACATTAACCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATG-CCTATGGCAAGAAGTTCTAAATCCGTAATGTACATCTCTAAAAAACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATCTTTTTCTTCCACTAACAAAAAATTCTATCTCAATAGCTGTAAATC-AGTTgtatcactagtcccattccatctatgagaaaattccagttcagggatgttaagtgacttcgttaatgccacacagctaatcagtaggaagtaaccaggagtggaggctaggaacaactccaaatctatagtcttaacgttgcactat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 186057 340 + 1200634 AAATAATTGTATCATGTGCATTAACCAGTTCAGGTAATCCAAGTTACATTTTACATG-CCTACAGCAAGAAGTTCCAAATCCCTAATGTACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATC----TCTTCCACTAACAAAAAATTCTATCTCAATAGCTGTAAATC-AGTTgtatcactagtcccattccatctatgagaaaactccagttcagggatgttaagtgacttcatcaatgccacacagctaatcagtaggaaataaccaggagtggaggctagaaagaactccagatctatagtcttaacattgcactat i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119419919 344 + 137160470 aaataattaCATCATGTACATTAACCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATG-CCTACTGCAAGAAGTTCTAAATCCCTAATGCACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCGAGACTTATCTCATCTTTTTATCCATCTATCTCTTTCTTCCACTAACTAAAAATTCTATCTCAATGGCTATAAATC-AATTgcatcactagtcccattccatctatgagaaaactccagctcagagatgttaagtgacttcattaatgccacacagctaatcagtaggaaataaccaggagtggaggctagaaacaactccaaatctgtagacttaacattgcactat i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 3398 344 - 38368 AATTAATTGTATCATGTACATTAACCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATG-CCTATGGCAGGAATTTCTAGATCCCTAATGTACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATCTCTTTCTTCCACTAACAAAATATTCTATCTTAATAGCTGTAAATC-AGTTGTATTACTAGTCCCATTCCATCTATGAGAAAACTCCAGTTGAGGGATGTTAAGTGACTTCATTAATGCCACACAGCTAATCAGTAGGAAATAACCAGGAGTGGAGGCTAGAAACAACTCCAAATCTGTAGACTTAACATTGCACTAC i papAnu2.JH685195 I 50 C 0 s chlSab2.chr2 32621325 337 - 90373283 --------GTATCATGTACATTAATCAGTTCATGTAATCCAAGTTAAATTTTACATG-CCTATGGGAGGAATTTCTAAATCCCTAATGTACATCTCTAAAAGACCTGATTTCTTTCCCCAGACTTATCTCATCTTTTTATCTATCCATCTCTTTCTTCCACTAACAAAATATTCTATCTTAATAGCTGTAAATCTAGCTgtattactagtcccattccatctatgggaaaactccatttgagggatgttaagtgacttcattaatgccacacagctaatcagtaggaaataaccaggagtggaggctagaaacaactccaaatctatagacttaacattgcactaT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=513792.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 276846 482 + 478999 gttTGCTGTGTA--CTCTCTGACATACAAGTCATAAAAGTATTTCTCAATTCTCTGGGAAATTTCTACACTCCACTCTTGCTCAGCCTGTT-CATATACCCAGAGCCCATCACTTATGTCAGCCTTTTGAGT---------------------------------------TTTACAAATTTTGTTAAAATAAGATACCATTCCTGGTGCTTTTTCCAA---TTCTAAATA--GAGTGATTTTTATTTTTGTGCAATTCTTAACCATTGGATCTATTCCCTTATTATGCCATTTGTCATTATTTACCAGCATTGTTTTTACA-TTTTTATAGGTATTCTCTTCTCTACTAATTTAGGGGCTCTTTGAAGATAATAATTACCTTGCTGTACTTTAAATACACCAAAATTTGTTATG---------ATTGCTGAAGAAGTAAAAAC--AAAGTGAAAGCTACCAATTTTATTCAGTTCAAATAGTggtatacctcagatatcgtggattcagttccaggccactgcaataaagcaagtcagac s panTro4.chrUn_GL393519 115646 486 + 413329 gttTGCTGTGTA--CTCTCTGACATACAAGTCATAAAAGTATTTCTCAATTCTGTGGGAAATTTCTACACTCCACTCTTGCTCAGCCTGTT-CATATACCCAGAGCCCATCACTTAAGTCAGCCTTTTGAAT---------------------------------------TTTACAAATTTTGTTAAAATAAGATACCATTCCTGGTGCTTTTTCCAA---TTCTAAATACGGAGTGATTTTTATGTTTGTGCAATTCTTAACCGTTGGACCTATTCCCTTATTATGCCATTTGTCATTATTTACCAGCATTGTTTTTACA-TTTTTATAGGTATTCTCTTGTCTACTAATTTAGGGGCTCTTTGAAGATAATAATTACCTTGCTGTGCTTTAAATACACCAAAATTTGTTATG---------ATTGCTGAAGACGTAAAAACAGAAAGTGAAAGCTACCAATTTTATTCAGTTCAAATAGTggtatacctcagatattgtggattcagttccaggccactgcaataaagcaagtcagat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7199384 461 + 72422247 gtttgccAGGTA----CTCTGACATAAAAGTCATGAAAGTATTTCTCAATTCTCTGGGAAATTTCTACACTCCACTCTTGCTCAG--------------CCAGAGCCCATCGCTTATGTCAGCCTTTTGAAT---------------------------------------TTTACAAATTTTGTTAAAATAAGATACCATTCCTGATGCTTTTTCCAGTTCTTCTAAATATAGAGTGATTTTTATTTTTGTGCAATTCTTAACCATTGGACTTATTCCC---TTATGCTATTTGTC---ATTTACCAGCATTGGTTTTACA-TTTTTATAGGTATTCTCTCTTCCACTAATTTAGGGGTTCTTTGAAGATAATAATTACCTTGCTATACTTTAAATATACCAAAATTTGTTATG---------ATAGCTGAAGAAGTA-------AAAGTAAAATCTACCAATTTTATTCAGTTCAAATAGTggcatgcctcagatattgtggattcagttccaggccactgcaataaagcaagttagac i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 186397 489 + 1200634 gtttgccATGTACTCTCTTTGACATACAAGTCATAAAAGTATTTCTCAATTCTCTGGGAAATTTCTACACTCCACTCTTGCTCAGGCTGTTCCATATACCCAGAGCCCATCACTTATGTCAGCCTTTTGAAT---------------------------------------TGTACAAATTTTGTTAAAATAAGATACCATTCCTGATGCTTTTTCCAATTCTTCTAAATATAGAGTGATTTTTATTTTTGTGCAATTCTTAACCATTGGACctattcccttattatgccatttgtcattatttaccagcattgttcttacattttttataggtattctctcctccactaatttaggggctctttgaagat-aTAATT-CCTTGCTGTACTTTAAATACACCAAAATTCGTTATG---------ATTGCTGAAGAAGTAAAAAC--AAAGTAAAAGCTACCAATTTTATTCAGTTCAAATAGTggcatacctcagatattgtggattcagttccaggccactgcaataaagcaagtcagat i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119420263 496 + 137160470 gtttgccATGTT--CTCTCAGGCATACAAGTCCTAAAA-TATTTCTCAATTATCTGGGAAATTTCTACACTCCGCTCTTTCTCAGCCTGTTCCATATACCCAGAGCCCATCATTTCTGTCAGCCTTTTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------------------------TGATGCTTTTTCCAGTTCTTCTAAATATAGAGTGATTTTTATTtttgtgcacttcttaaccattcgacctattcccttattatgccatttgtc----tttatcagcattgtttttaca--ttttataggtattctctcctccactaaattaggggctctttgaagataATAATTACCTTGCTGTACTTTAAATTCAGCAAAATTTGTTTTTGGTGTA---ATTGCTGAAGAAATAAAAACGGAAAGTATAAGCTACCAGTTGTATTCAGTTCAAATAGTggcatacctcagatattgtggattcagttccagaccactgccataaagcaagtcagac i rheMac3.chr13 C 0 I 27 s papAnu2.JH685195 3742 489 - 38368 GTTTGCCATGTC--CTCTCAGGCATACAAGTCATAAAAGTATTTCTCAATTATCTGGGAGATTTCTACACTCCGCTCATTCTCAGCCTGTTCCATATACCCAGAGCCCATCACTTCTGTCAGCCTTTTGAAT---------------------------------------TTCACAAATTTTGT-----TAAGATACCATTCCTGATGCTTTTTCCAGTTCTTCTAAATAtagagtgatttttatttttgtgcacTTCTTAACCATTCGACCTATTCCCTTATTATGCCATTTGTC----TTTATCAgcattgtttttaca--ttttataggtATTCTGTTCTCCACTAAATTAGGGGCTTTTTGAAGATAATAATTACCTTGCTGTACTTTAAATTCAGCAAAATTTGTTTTTGGTGTATTGATTGCTGAAGAAGTAAAAACGGAAAGTATAAGCTACCAGTTGTATTCAGTTCAAATAGTGGCATACCTCAGATATTGTggattcagttccagaccactgccaTAAAGCAAGTCAGAT i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C a score=10456.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277328 20 + 478999 ggaagtgtttggtttcccag-------- s panTro4.chrUn_GL393519 116132 20 + 413329 ggaagtgtttggtttcccag-------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7199845 19 + 72422247 -gaagtgtttggtttcccag-------- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 186886 19 + 1200634 -gaagtgtttggtttcccag-------- i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 4231 27 - 38368 -GAAGTGTTTTGCATATGAAAGAACTtt i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C e rheMac3.chr13 119420759 27 + 137160470 I a score=356877.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277348 300 + 478999 tgcatctaaagtttatgtttatactacactgtagtctagtaggggtgcaatagtattatgtcCGTCGTACCATttctgtctattcaatatattggctatgggtttgtcataaatagctcttattattttgcggt--gtttcaccaatacctagt---ttgagagtttttaacataaagggatgttgaattttatcaaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttttggttatgtgatgtattgtgtttattgatttgcaaatgttgaaccagc-cttgcgtcc s panTro4.chrUn_GL393519 116152 300 + 413329 ggcatctaaagtttatgtttatactacactgtagtctagtaggggtgcaatagtattatgtcCATcttaccatttctgtctattcaatatattggctatgggtttgtcataaatagctcttattattttgaggt--gtttcaccaatacctagt---ttgagagtttttaacataaagggacgttgaattttatcaaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttttggttatgtgatgtattgtgtttattgatttgcaaatgttgaaccagc-cttgcgtcc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7199864 303 + 72422247 tgcatctaaaatttatgtttctacttcactgtagtctagtaagggtgcaatagtattatgtccaTCTTATCATttctgtctattcgatatattggctatgggtttgtcataaatagctcttattattttgagat--gtttcaccaatacctagtttattgagagtttttaacataaagggatgttgaattttatcaaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtggtttgtgtctttggttttggttatgtgatgtattgtgtttgttgatttgcaaatgttgaaccagc-cttgcatcc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 186905 280 + 1200634 tgcatataaaatttatgtttatactacactgtagtctagtaagggtgcaatagtattatgtcCATCTTGTCATttctgtctattcaatatattggctatgggtttggcataaatagctcttat-----------------------tacctagtttatt--gagtttttaacataaagggatgttgaattttatcaaaggccttttctgcatctattgagataatcatatggtttttgtgtttggttttggttatgtgatgtattgtgtttattgatttacaaatgttgaaccagc-cttatgccc i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 I 264 s rheMac3.chr13 119420786 304 + 137160470 tgcatataaaagttatgtttatactacactgtggtctagtgagggtgcaatagtagtatgtctaCCTTATCATttctgcctattcaatttattggctatgggtttgtcataaatagcttttattattttgagatgggttgcaccaatacctagcttattgagagtttttaacataaagggatgttgaattttatcaaaagcc-tttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttttggttatgtgatgtattgtgttcattgatttgcaaatgttgaaccatc-cttgcgtcc i rheMac3.chr13 I 27 C 0 s papAnu2.JH685195 4258 306 - 38368 tgcatataaaagttatgtttatactacacTGTAGTCTAGTGAGGGTGCAATAGTAGTATGTCTACCTTATCATTTCTGCCTATTCAAtgtattggctatgggtttgtcataaatagcttttattattttgagatgtgtttcaccaatacctagtttattgagagtttttaacataaagggatgttgaattttatcaaaagccttttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttttggttatGTGATGTATTGTGTTCATTGATTTGCAAATGCTGAACCAGCGCTTGCGtcc i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C a score=2730.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277648 2 + 478999 ta s panTro4.chrUn_GL393519 116452 2 + 413329 ta i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 276 s ponAbe2.chrUn 7200167 2 + 72422247 ta i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 187449 2 + 1200634 ta i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random I 264 C 0 s rheMac3.chr13 119421090 2 + 137160470 ta i rheMac3.chr13 C 0 I 273 s papAnu2.JH685195 4564 2 - 38368 ta i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C a score=2100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277650 1 + 478999 g s panTro4.chrUn_GL393519 116730 1 + 413329 g i panTro4.chrUn_GL393519 I 276 C 0 s ponAbe2.chrUn 7200169 1 + 72422247 g i ponAbe2.chrUn C 0 I 277 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 187451 1 + 1200634 g i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119421365 1 + 137160470 g i rheMac3.chr13 I 273 C 0 s macFas5.chr12 115010186 1 - 132586672 g i macFas5.chr12 N 0 C 0 s papAnu2.JH685195 4566 1 - 38368 g i papAnu2.JH685195 C 0 I 1545 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C a score=373087.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277651 340 + 478999 aatccacctggtcttgggctttttttgatcagtaggctattaattactgcctcaatttcagaacttgttattggtcgattctggaattcaacttcttcctgaattagtcttgggaaggtgtgtgtgtccaggaatttgttcatttcttctagattttctagtttatgtgcatagaggtgtttatagtattctctgatggtagtttgtatttcggtggag-t-----------------taatcatttttttgtgtgtctatttgattcttccctc-atttcttctttattagtctag-ctagtggtctattgattgtg-tatttttttcaaaacacgagctcctggattcattga-tttttt s panTro4.chrUn_GL393519 116731 336 + 413329 aatccacctggtcttgggctttttttgatcagtaggctattaattactgccttaatttcagaacttgttatttgtctattctggaattcaacttcttcctgggttagtcttgggaaggtgtgtgtgtccaggaatttgttcttttcttctagattttctagtttatgtgcatagaggtgtttatagtattctctgatggtagtttgtatttcggtggag-t-----------------ttatcatttttttgtgtgtctatttgattcttccctc-atttcttccttattaatctag-ctagtggtctattg----tg-tatttttttcaaaacacgagctcctggattcattga-tttttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7200447 339 + 72422247 aatccacctggtcttgggctttttttgatcagtaggctattaattattctctcaatttcagaacttgttattggtctattctggaattcaacttcttcctgagttagtcttgggaaggtatatgtgtccaggaatttgttcatttcttctagattttctagtttatgtgc--agaggtgttgacagtattctctgatggtagtttttatttcggtagag-t-----------------ttatcattttttattgtgtctatttgattcttccatc-atttcttctttattagtctagcctagtggtctattgattgtg-tatttttttcaaaacacgagctcctggattcattga-tttttt i ponAbe2.chrUn I 277 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 187452 344 + 1200634 aatccacctggtcttgggctgtttttgatcagtaggctattaattactgcctcaatttcagaacctgttattggtctattctgggattcaacttcttcctgagttagtcttgggaaggtgtatgtgtccaggaatttgttcatttcttctagattttctagtttatgtgcatagaggtgtttatagtattctctgatggtagtttgtatttcggtggagtt-----------------ttatcattttttattgtgtctatttgattcttctctc-atttcttatttattagtctagcctagtggtctattgattttgttatttttttcaaaacaccagctcctggattcattgattttttt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119421366 342 + 137160470 aattcacctggtcttgggccttttttgatcagtaggctattaattactgcctcaatttcagaacttgttattggtctattctggacttcaacttcttcctgagttaatcttgggaaggtgtacctgttcaggaatttgttcatttcttctagattttctagtttatgtgcatagaggtgtttatagtattctctgatggtagtttgtatttctgtggag-t-----------------ttatcatttttgattgtgtctatttgattcttctctcatttttttctttattagtctag-ctagtggtctgttgattttgttacttttttcaaaacaccagctcctggattcattga-tttttt i rheMac3.chr13 C 0 I 12 s macFas5.chr12 115010187 357 - 132586672 actctgtctggtcctgggatttttttggttgatagactatttattactgtctcaatttc-gaactcattattgatctattcagggattcagtttctctgtggttcagttttgggagggtgtatgtgtccaggaatttgtctacctattctagattttctgttttatgtgcatagagatgtttacagtattctctgatggttggttgtatttctatgggg-tcagtgggatatcatttcttatcatttctgattgtgtttatttgattcttctctc-ttttcttctttatttgtctag-ctagtggtccatccattttgttaattgtttccaaaaaccagctcctagattcactga-tttttt i macFas5.chr12 C 0 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C e papAnu2.JH685195 4567 1545 - 38368 I a score=5298.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 277991 9 + 478999 ggagagttt- s panTro4.chrUn_GL393519 117067 9 + 413329 ggagagttt- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7200786 9 + 72422247 ggagagttt- i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 187796 9 + 1200634 ggagagttt- i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr12 115010544 9 - 132586672 -gaaggtttt i macFas5.chr12 C 0 I 3 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C e papAnu2.JH685195 4567 1545 - 38368 I e rheMac3.chr13 119421708 12 + 137160470 I a score=554804.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 278000 523 + 478999 ttatttctgcatctccttcagttctgctctgatcttag----ttctttttttctgttagcttttgaatt-------------------------------------tgtttgttcttgcctttccagctcttttaattgtgatgttagagtgtcaattttagatct------------------------------ttcccactttctga--tgtgggcatttagtgctataaatttcgctcttaacactgctgtagttgtgtcccagagattctggtacattgtctctttgttctcattggtttcaaagaatttcttgacttctgccttaatttcgttatttttctaggagtcattcaggagcaggttgttcaatttccatttgatggtgtggctttgagtgaatttctcaatcttgagttgtaatttggttgtgctgccgtctaagagactgtttgtt-atgattttaattcttttgcatttgctgaggagtgttttacttctgattacgtgatcaattttaaggtgccacgtggtgatgaaaagaatgtatactctgttgttttgagctggagagctctgtaggtatctatcag s panTro4.chrUn_GL393519 117076 523 + 413329 ttatttctgcatctctttcagttctgctctgatcttag----ttctttttttctgctagcttttgaatt-------------------------------------tgtttgctcttgcctttccagctcttttaattgtgatgttaggatgtcaattttagatct------------------------------ttcccactttctga--tgtgggcatttagtgctataaatttcgctcttaacactgctgtagttgtgtcccagagattctggtacattgtctctttgttctcattggtttcaaataatttcttgacttctgccttaatttcgttatttttccaggagtcattcaggagcaggttgttcaatttccatttgatggtgtggctttgagcgaatttgtcaatcttgagttctaatttggttgtgctgccgtctaagagactgtttgtt-atgattttagttcttttgcatttgctgaggagtgttttacttctgattatatgatcaattttaaggtgccacgtggtgatgaaaagaatgtatactctgttgttttgagctggagagctctgtaggtatctatcag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7200795 520 + 72422247 ttatttctgcatctccttcagttctgctctgatcttaattatttctttttttctgttaac-tttgaatg-------------------------------------tgtttgctcttgcttttccagctcttttaattgtgatgtcagggtgtcaattttagatct------------------------------ttcccactttctgatgtgtgggcatttagtgctgtaaatttcccttttaatactgctttagctgtgtcccagagattctggtacattgtccctttgttctcattggtttcaaagaatttcttgacttctaccttaatttggttatttatccaggagtcattcaggagcaggtt----aatttccatttgatggtgtggctttgagtgaatttctcaatcttgagttctaatttggttgtgctgccgtctaagagac----tgtt-acgattttagttcttttgcatttgctgaggagtgttttacttctgattacatgatcaattttaaagtgccacgtggtgatgaaaagaatgtatactctgttgttttggggtggagagctctgtaggtatctatcag i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 187805 524 + 1200634 ttatttctgcatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttttcttctgctagcttttgaatt-------------------------------------tgtttgctcttgcctttccagctcttttaattgtgatgttagggtgtcaattttagatct------------------------------ttcctgctttctga--tgtggacatttagtgctataaatttccctcttaacactgctttagttgtgtcccagagattctggcacattgtctctttgttctcattggtttcaaacaatttcttaacttctgccttaatttcgttatttatccaggagtcattcaggagcaggttgtttgattcccatttgatagtgtggctttgagtgaatttctcaatcttgagttctaatttggttgtgctgccatctaagaggc----tgttgatgattttaggtcttttgcatttgctgaggagtgttttacttctgattacatgatcaattttaaagtgccacatggtgatgaaaagaatgtatactctgttgttttggggtggagagttctgtagatatctatcag i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119421720 516 + 137160470 tcatttctgcatctccttcagttctgctctgatcttagttatat--------------gtttttgggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------------------------------------------------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttctga--tgtgggcatttagtgctataaatttccctcttaacactgctttagttgtgtcccagagattctagtgcactgtatctttgttctcattggtttcaaggaacttcttgacttctgccttaagtttgttgtttatccaggagtcattcaagagcaggttgttcaatttccatttgatggtgtggctttgagtgaatttcttaatcttgagttctaatttggttgtgctgccatctaagagac----tgtt-atgattttggttcttctgcatttgctgaggagtgttttacttctgattacgcgatcaattttaacgtgccaggtggtactgaaaagaatgtatactctgttgttttggggtggagagctctgtaagtatctatcag i rheMac3.chr13 I 12 C 0 s macFas5.chr12 115010556 526 - 132586672 gtgtgtctctatctccttcaattctgctttgatcttggttatttcttgtctttt-ctagctttggggtt-------------------------------------tgtttgcgcttgtttctctagttcttttagttgaggtgttaggttgttaacctgagatct------------------------------ttctagctttttga--tgtggacatttagtgctattcatttccctcttaacactgctttagctgcatcccagggattctggtacattgtttctttgttctcactagtttcaaagatcttcttgatttctaccttaatttcattgtttgcccaagagtcattcaggagcaggttgttcaattttcatttgatggtatgactttgagtgaatttcttaatcttgagttctaatttggttgtgctgccatctaagagactgtttgtt-atgattttagttcttttgcatttgctgaggagtgttttacttctgattacacgatcaattttaaagtgccacgtggtgacaaaaagaatgtatactctgttgctttggggtggagagctctgtaggtaactatcag i macFas5.chr12 I 3 C 0 e chlSab2.chr2 32621662 0 - 90373283 C e papAnu2.JH685195 4567 1545 - 38368 I a score=358152.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 278523 215 + 478999 gtctgcttgatccagagctgagttcaggtcctgaatatctttgttagtattctgtctcaatgatctgtctaatattgtcagtgaggtattaaagtcttccactattattgtgtgggagtctaagtctctttgtgactct--------ttgctttatgaatctgggtgctcctatgttgggtgcatatgtagattaatagagttagctctttttgcttaattga s panTro4.chrUn_GL393519 117599 215 + 413329 gtctgcttgatccagagctgagttcaggtcctgaatatctttgttagtattctgtctcaatgatctgtctaatattgtcagtgaggtattaaagtcttccactattattgtgtgggagtctaagtctctttgtgactct--------ttgctttatgaatctgggtgctcctatattgggtgcatatatatattaatagagttagctctttttgcttaattga i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7201315 205 + 72422247 gtctgcttaatccagagctgagttcaggtcctgaatatgtttgatagtattctgtctcagtga----tctaatattgtcagtgaggtattaaagtcttccactattattgtgtggg-gtc----tctctttgtgactct--------ttgctttatgaatctgggtgct-ctatattgggtgcatatatatattaatagagttagctctccttgctgaattga i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 188329 214 + 1200634 gtctgcttgatccagaactgagttcaggtcctgaatatctttgttagtattctgtctcaatgatctgtctaatattgtcagtgaggtattaaagtcttccact-ttattgtgtgggagtctaagtctctttgtgacact--------ttgctttatgaatctgggtgctcctgtattggatgcatatatatattaatagagttagctcttcttgcttaattga i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119422236 215 + 137160470 gtctgcttgatccagagctgagttcaggttctgaatatctttgttagaattctgtctcgatgatctgtctaatattgtcagtaaggtattaaagtcttccactgttattgtgtaggagtctaagtctctttgtgactct--------ttgctttatgaatctgggtgctcttgtattgggtgcatatatattttagtatagttagctcttcttgcttaattga i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr12 115011082 223 - 132586672 gtctgcttgatccggagctgagttcaagtcctgaatatctttgttagtgttctgtctcaatgatctgtctaatattgtcagtgaggtattaaaatcttccactattattgtgtggggatctaagtctctttgtcagtctctaatcacttgctttgtgaatctgggtgctccagtattgggtgcatatatattttagtataattagcttttgttgtttaattga i macFas5.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32621662 215 - 90373283 gtctgcttgatccagagctgagttcaggttctgaatatctttgttagaattctgtctcgatgatctgtctaatattgtcagtaaggtattaaagtcttccactattattgtgtgggagtctaagtctctttgtgaccct--------ttgctttatgaatctgggtgctcttgtattgggtgcatatatgttttagtatagttagctcttcttgcttaattga i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 4567 1545 - 38368 I a score=1341831.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 278738 585 + 478999 acccttcaccatta--tgtaatgccc----ttgtcttttctgatctttttggtttaaagtctgttttgtcagaaactaggatcgcaaccccttctt-----tgatttctatttgcttggtaaattttcctccttccctttattttgagcctatgtgtgtatttgcacgtcagatggctcttttcaagacagcatagtg--atgggtcttggccttttatccagcttgcctttctgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaagttagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctgtcatcatgatgctagctggtcattttgcagaactgtgcatgtggttgcttcatagtgtccctggtctgtgtatttcagtgtg--tttttgtagtggctggtaacaattttttctttcaattttcagtgcttctttcaggag-ctcttacaaggcaggcctgagggtgacaaattccctcaggatttgcttgtttgtaaaggatcttatttctctttagcttaggaagcttagtttgaccagatatgaagctctaggctggaaattattttcttcaagaatgttgaatattggcccc s panTro4.chrUn_GL393519 117814 587 + 413329 acccttcgccattg--tgtaatgccc----ttgtcttttctgatcttttgggtttaaagtctgttttgtcagaaactaggattgcaaccccttctt-----tgatttctatttgcttggtaaattttcctccttccctttattttgagcctatgtgtgtatttgcacgtcagatggctcttttcaagacagcatagtgtgatgggtcttggccctttatccagcttgcctttctgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaagttagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctgtcatcatgatgctagctggtcattttgcagaattgtgcatgtggttgcttcatagtgtccctggtctgtgtatttcagtgtg--tttttgtagtggctggtaacaattttttctttcaattttcagtgcttctttcaggag-ctcttacaaggcaggcctgagggtgacaaattccctcaggatttgcttgtttgtaaaggatcttatttctctttcgcttatgaagcttagtttgaccagatatgaagctctaggctggaaattattttcttcaagaacgttgaatattggcccc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7201520 583 + 72422247 accctttaccatta--tgtaatgcccttctttgtcttttttgatctttttggtttaaagtctgttttgtcagaaactaggattgcaaccc---ctt-----tgatttctatttgcttggtaaattttcctccatccctttattttgagcctatgtgcgtctttacacatgatatggcgcttttcaagacagcatagtg--atgggtcttggccctttatccagcttgcctttctgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaggctagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctg---tcatgatactagctggtcattttgcagaattgtgtatgtggttgcttcatagtgtccctggtctgtgtatttcagtgtg--gttttgtagtggctggtaacaattttttctttcaattttcagtgctgctttcaggagcctcttacaaggcaggcctgagggtgacaaattccctcaggatttgcttgtttgtgaaggatcttatttctctttt-cttatgaagcttagtttgaccagatatgaagctctaggctggaaattattttcttcaagaatgttgaatattggcccc i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 188543 650 + 1200634 accctttaccatta--tgtaatgcccttctttgtcttttctcatctttttggtttaaagtctgttttgtcagaaactaagattgcaacctcttctt-----tgatttctatttgcttggtaaattttcctttgtccctttattttgagcctatgtgtgtctttgcacatgagatggctcttctcaagacagcatagtg--atgggtcttggccctttatccagcttgcctttctgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaggttagtattgttatgtgttaaggttagtattgtcatgtatttacatttaaggttagtattgttattgttacaaattatgtaatctgatcctgtcatcatgatgctagctggtcattttgcagaattgtgtatgtggttgcttcatagtgtcactggtctgtgtatttcagtgtg--tttttgtagtggctggtaacaattttttctttcaattttcagtttttcttttaggag-ctcttacaaggaaggcccaagggtgacaaattccctcaggatttgcttgtttgtaaaggattttatttctctttcgcttatgaagcttagtttgaccagatatgaagttctaggctggaaattattttctttaagaatgttgaatattggcccc i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119422451 592 + 137160470 accctttaccgtta--tgtaatgcccttctttgtcttttctgacctttttggtttaaagtctgttttgtcagagactaggattgcaaccccttcttctctatgatttctatttgcttggtaaattttcctccatcactttattttgagcc--tgtgtgtctttgcatgtgagatggctcttttcaagacggcatagtg--atgggtcttggccctttatccagcttgcctttccgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaggttagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctgtcatcatgatgctagctggtcattttgcagaattgtgtatgtgattgcttcatagtgttactggtctgtgtatttcagtgtg--tttttgtagtaactggtaaaaattttttctttcaattttcagtgcttctttcaggag-ctcttataagccaggcccaaggctgacaaattccctcacgattagcttgtttgtaaaggatcttatttctctttcgcttatgaagcttagtttgaccagacatgaagttctaggctggaaattattttcttcaagaatgttgaatactggcccc i rheMac3.chr13 C 0 I 14 s macFas5.chr12 115011305 591 - 132586672 accctttaccatta--tgtaatgtccttctttgtctttttcgatctttttgatttaaagtctgttttgtcagaaactagggttgcgactgcttcttctc--tgatttctatttgcttggtaaattttcctccatccctttattatgagcctatgtgtgtctttgaatgtgagatggttcttttcaaggcagcatagtg--atgggtcttggctgtttatccagcttgcctttctgtgtcttttaattggggcgttaagcccatttacatttaaggttggtattgttatgtat-------------------------------------------------------------gaatttgatccggtcatcatggtgctagctggtcattttgcagaattgtgcatgtggttgcttcatagtgtcactggtctgtgtatttcagggtg--tttttgtagtggctggtaacaattttttctttcaattttcagtgattctttcagggg-ctcttacaaggcaggcctgagggtcacaaattccctcaggatttgcttgtctgtaaaggatcttatttctcttttgcttatgaagcttag-ttgaccagatatgaagttctaggctggaaattattttcttcaagaatgttgaatattggcccc i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 6112 594 - 38368 accctttaccatta--tgtaatgcccttctttgtcttttctgatctttttggtttaaagtctgttttgtcagagactaggattgcaaccccttcttctctctgatttctatttgcttggtaaattttcctccatcactttattttgagcc--tgtgtgtctttgcatgtgagatggctCTTTTCAAGACGGCATAGTG--ATGGGTCTTGGCCCTTTATCCAGCTTGCCGTtccgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaggttagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctgtcatcatgatgctagctggtcaTTTTGCAGAATTGTGTATGTGATTGCTTCATAGTGTTACTGGTCTgtgtatttcagtgtgtttttttgTAGTAACTGGTgaaaattttttgtttcaattttcagtgcttctttcaggag-ctcttataagccAGGCCCAagggtgacaaattccctcacgattagcttgtttgtaaaggatcttatttctctttcacttatgaagcttagtttgaccaGACATGAAGTTCTAggctggaaattattttcttcaagaatgttgaatactggcccc i papAnu2.JH685195 I 1545 C 0 s chlSab2.chr2 32621877 594 - 90373283 accctttaccattatgtgtaatacccttctttgtcttttctgatctttttggtttaaagtctgttttgtcagagactaggattgcaaccccttcttctctctgatttctatttgcttggtaaattttcttccctcactttattttgagcc--tgtgtgtctttgcatgtgagacggctcttttcaagacggcatagtg--atggattttggccctttatccagcttgcctttccgtgtcttttaattgaggcattaagcccatttacatttaaggttagtattgttatgtgt-------------------------------------------------------------gaatttgatcctgtcatcatgatgctagctggtcattttgcagaattgtgtatgtgattgcttcatagtgttactggtctgtgtatttcagtgtg--tttttgtagtgactggtaaaaattttttctttcaattttcagtgctgctttcaggag-ctcttataagccaggcccgagggtgaaaaattccctcaggattagcttgtttgtaaaggatcttatttctctttcgcttatgaagcttagtttgaccagacatgaagttctaggctggaaattattttcttcaagaatgctgaatactggcccc i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=26845.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 279323 16 + 478999 caatctcttctggctt s panTro4.chrUn_GL393519 118401 16 + 413329 caatttcttctggctt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7202103 16 + 72422247 caatctcttctggctt i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 189193 16 + 1200634 caatctcttctggctt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr12 115011896 16 - 132586672 caatctcttccagctt i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 6706 15 - 38368 -aatctcttctggctt i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32622471 15 - 90373283 -aatctcttgtggctt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr13 119423043 14 + 137160470 I a score=2040257.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 279339 945 + 478999 ggagggtttccactgagaggtccactgttactcttatggctttccctttgtaggtgacctggactttctctctggctgcccttaacattctttctttcatttcaaccttggagaatctgatcattatgtgtcctgggattgatcttctcatggagtgtcctactggagttctctgaatttcttgaatttaaatgttggcctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctaaagtatgttttccaactcgattccattctccccatctctttgaggtaccccaatcagtcgtaggttctgtctctttacataatcccatatttcttggagattttgtttagtc-ttttttattcttttatctctattgtttcctgcct----------------------------------------------------gttttatttcagaaagatagtcttcaagctctgagattctctcccctacttgTCTCCATTTTTCTCGGGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGAAA-----TTACCACACCGTTTACAATTACtgtgtatgtttgtgtttatgtgtgcacgtgtgtgtatgATGAACCCAAGGAAAGAATATTCTAAAATGAGGACCAGTAATGTTATTTTCTATAGTTTTTTCTTAGTACTGAACCCAAAAAAGGAATATCGAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGtagagtaagatagagataaatcctac-----aattgccacttataatctgggtaactttggga-----------------------------------aaattacctttcttttgaacttattttattaacttttagaatgagaataataaaaataccctcctcataggactgtggtgaagattaagagaactgattaatataaaacacagcatggggccaagc----atatggtaagaccttaaggaattttatttCGTTAATTATAAAACACACATTTCT-CCCTACATTTTAACATCTCAGTAGAGAAAA--TGTCTTAG-AATTTATGT-----------TCTTATAGTT s panTro4.chrUn_GL393519 118417 945 + 413329 ggagggtttccactgagaagtccactgttactcttatggctttccctttgtaggtgacctggactttctctctggctgcccttcacattctttctttcatttcaaccttggagaatctgatcattatgtgtcctgggattgatcttctcgtggagtgtcctactggagttctctgaatttcttgaatgtaaacgttggcctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatggtatcctaaagtatgttttccaacttgatgccattctccccatctctttgaggtactccagtcagtcgtaggttctgtctctttacataatcccgtatttcttggagattttgtttagtc-ttttttattcttttatctctattgtttcctgcct----------------------------------------------------gttttatttcagaaagatagtcttcaagctctgagattctctcccctacttgTCTCCATTTTTCTCGGGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGAAA-----TTACCACACCGTTTACAATTACtgtgtatgtttgtgtttatgtgtgcacgtgtgtgtatgATGAACCCAAGGAAAGAATATTGTAAAATGAGGACCAGTAATGTTATTTTCTATAGTTTTTTCTTAGTACTGAACCCAAAAAAGGAATATCGAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGtagagtaagatagagataaatcctac-----gattgccacttataatctgggtaactttggga-----------------------------------aaattacctttcttttgaacttattttattaactcttagaatgagaataataaaaataccctcctcataggactgtggtgaagattaagagaactaattaatataaaacacagcatggggccaagc----atatggtaagaccttaaggaatTTtatttcgttaattataaaacacacatttct-ccctacattttaacatctcagtagagaaaa--tgtcttag-aatttatgt-----------tcttacagtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7202119 956 + 72422247 ggagggtttccgttgagaggtccactgctactcttacggctttccctttgtaggtgacctggactttctctctggctgcccttaacattttttctttcattttgaccttggagaatctgatcattatgtgtcctgggattgatcttctcatggagggtcctactggagttctctgaatttcttgaatttaaatgttggcctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgttttccaacttgattccattctccccatctctttgaggtaccccaatcagtcgtaggttctgtctctttacataatcccatatttcttggaggttttgtttagtc-ttttttattcttttatctctattcttttttgcct----------------------------------------------------gtcttatttcagaaagatagtcttcaagctctgagattctctcccctacttgTCTCCATTTTTCTCATGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGAAA-----TTACCACACTGTTTACAATTACTGTGTATATTTGTGTTTATGTGTGCACGTGTGTGTATGATGAACCCAAGGAAAGCATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTACGGTTTCTTCTTAGTACTGAACCCAATAAAGGAATATCAAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGtagagtaagatagagataaatcctac-----aattgccacttataatctgggtaactgtggga-----------------------------------aaattacctttc-tttgaacttattttattaatttttagaatgagaatagtaaaaataccctcctcataggacagtggtgaagattaagaga----attaatataaaacacagcatggggctaagcctatatatggtaagaccttaaggaatTTtatttcattaattataaaacacacatttctcccctacattttaacatctcagtagagaaaa--tgtcttac-aatTTGTGTTCTTATATGAATCTTATAGTT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 189209 935 + 1200634 ggagagtttccactgagaggtccactgttagtcttatggctttccctttgtaggtgacctggactttctctctggctgccctt---attttttctttcattttgaacttggagaatctgatcattatgtgtcctgggattgatattctcatggagtgtcct----------tctgaatttcttgaatttaaatgttggtctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgttttccaacttgattccattctccccatctctttgaggtaccccaatcagtcgtaggttctgtctc--tacataatcccatatttcttggagatat--tttagtc-ttttttattctttcatctctattcttttctgcct----------------------------------------------------gtcttatttccgaaagatagtcttcaggctctgagattctctcccccacttgTCTCCATTTTTCTCAGGAGGCATTTTAACAAAATTTAAAGAAA-----TTACCACACTGTTTACAATTACtgtgtatatttgtgtttatgtgtgcatgtgtgtgtatgATGAACTCAAGGAAATAATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTATGGTTTCTTCTTAGTACTGAACCCAATAAAGGAATATCAAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGTAGAGTAAGATAGAGATAAATCCTACAATTTAATtgtcccttataatctgggtaactttggga-----------------------------------aaattacctttc-tttgaaattattttattaatttttagaatgagaataataaaaataccctcctcataggactgtggtgaatattaagagaattaattaatataaaacacagcatggggccaagc----atatggtaagaccttaaggaatTTtatttcattaattataaaacacacatttctccccttcattttaacatctcagtagagaaaatgtgtcttac-aatttatgt-----------tcttatagtt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119423057 1009 + 137160470 gtagggtttccactgagaggtccactgttagtccgatggctttccctttgtagatgacctggactttctctctggctgcccttaacattttttcttacatttcgaccttggaaaatctgatgattatgtgtcctgggattgatcttctaatggagtatcctactgaagttctctgaatttcttgaatttaaatgttggcctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgttttccaacttgattccattctccgcatctctttgaggtaccccaatcagtcataggttctgtctctttacataatcccatatctcttggaggttttgtttactc-ttttttattcttttatctctattcttttctgccttataaaggcagtcttcaagctctgagattcATAAAGATAGTCTTCTTAAGAAgtcttatttcataaagatagtcttcaagctctgagattctctcccccacttgTCTCCTTTTTTCTCAGGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGACAGGGATGTACCACACTGTTTACAATTACtgtgtatgtttgtgtttatgtgtgcatgtgtgtgtatgATGAAACCAAGGAAAGCATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTATGGTTTCTTCTTAGTACTGAAC------------------------------CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------------------------------------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTacctttc-tttgaaattattttgttaatttttagaatgaaaataataaaaataccctcctcataggacagtggtgaagattaagagaattaattaatataaaacacagcatggagccaagc----atatgctaagcccttaaggaatTTtatttcattaattataaaacacacatttctcccctacattttaacatgtcagtagagaaaatgtgtcttac-agtttatgc-----------tcttatagtt i rheMac3.chr13 I 14 C 0 s macFas5.chr12 115011912 952 - 132586672 gtagggtttccactgagaggtccactgttagtccgatggctttccctttgtagatgacctggactttctctctggctgcccttaacattttttcttacatttcgaccttggaaaatctgatgattatgtgtcctgggattgatcttctcatggagtatcctactggagttctctgaatttcctgaatttaaatattggcctgccttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgttttcaaactcgattccattctccccatctctttgaggtaccccagtcagtcataggttctgtctctttacataatcccatatttcttggagg-tttgtttactctttttttattcttttatctctattcttttctgcct----------------------------------------------------gtcttatttcagaaaggtagtcttcaagctctgagattctctcccccacttgTCTCCATTTTTCTCAGGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGACAGGGATGTACCACACTGTTTACAATTACTGTGTATGTTTGTGTTTATGTGTGCATGTGTGTGTATGATGAAACCAAGGAAAGCATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTATGGTTTCTTCTTAGTACTGAACTCAATAAAGGAATATCAAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGTAGAGTAAGATAGAGATAAATACTAC-----AATtgccacttataatctgggtacctttgcga-----------------------------------aaattacctttc-tttgaaattattttgttaatttttagaatgaaaataataaaaataccctcctcataggacagtggtgaagattaagagaattaattaatataaaacacagcatggagccaagc----atatgctaagcccttaaggaatTTtatttcattaattataaaacacacatttctcccctacattttaacatctctgtagagaaaacgtgtcttac-aatttatgt-----------tcttatagtt i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 6721 936 - 38368 gtagggtttccactgagaggtccactgttagtcttgTGGCTTTCCCTTTGTAGATGACCTggactttctctctggctgcccttaacattttttctttcatttcgacCTTGGGGAATCTGATCATTATGTGTCCTGGGATTGATCTTCTAATGGAGTATCCTACTgaagttctctgaatttcttgaatttaaatgttggcctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgttttccaacttgattccattctccgcATCTCTTTgaggtaccccaatcagtcataggttctgtctctttacataatcccatatctcttggaggttttgtttactc-ttttttattcttttatctctattcttttctgcct----------------------------------------------------gtcttatttcataaagatagtcttcaagctctgaggtTCTCTCCcccacttttcttcatttttctcaggaggtattttaacaaaatttaaagaaa-----ttaccACACTGTTTACAATTACtgtgtatatttgtgtttatgtgtgcacatgtgtgtatgatGAACCCAAGGAAAGAATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTATGGTTTCTTCTTAGTACTGAACCCAATAAAGGAATATCAAGAATCTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGTTGAGTAAGATAGAGATAAATCCTAC-----AATTGCCACTTCAAATCTGGGTAACTTTGGGA-----------------------------------AAATTACCTTTC-TTTGAAC--------TTAATATTTAGAAtgagaacaataaaaatactCTGCTCATAGGACTGTGATGAAggttaagaa----aattaatataaaacacAGCATGGGGCCAAGC----ATATGGTAAGACCTTAAggaattttgtttcattaattatAAAACACACATTTCTCCCCTACATTTTAACATGTCAGTAGAGAAAATGTGTCTTACGAGTTTATGC-----------TCTTACAGtt i papAnu2.JH685195 C 0 M 476 s chlSab2.chr2 32622486 936 - 90373283 gtagggtttccactgagaggtccactgttagtcttgtggctttccctttgtagatgacctggactttctctctggctgcccttaacattttttctttcatttcgaccttggggaatctgatcattttgtgtcctgggatcga---tctaatggagtatcctactgaagttctctgaattttttgaatgtaaatattggtctgtcttgctaggttggggaagttctcctggatgatatcctgaagtatgctttccaacttgattccattctctgcatctctttgaggtaccccaatcagtcataggttctgtctctttccataatcccatatttcttggaggttttgtttactc-ttttttattattttatctctattcttttctgcct----------------------------------------------------gtcttatttcataaagatagtcttcaagctgtgagattctctctctcacttCTCTTCATTTTTCTCAGGAGGTATTTTAACAAAATTTAAAGAAA-----TTACCACACTGTTTACAATTACTGTGTATATTTGTGTTTATGTGTGCACATGTGTGTATGATGAACCCAAGGAAAGAATATTCTAAAATGAGGACCAATAATGTTATTTTCTATGGTTTCTTCTTAGTACTGAACCCAATAAAGGAATATCAAGAATGTTTCAGAC------------------------------------------------------------AGTAGAGTAAGATAGAGATAAGTCCTAC-----AATtgccacttaaaatctgggtaactttggga-----------------------------------aaattacctttc-tttgaac--------ttaatgtttagaatgagaataataaatatactctcctcataggactgtggtgaaggttaagaaaattaattaatataaaacacagcatggggccaagc----atatggtaagaccttaaggaatTTtgtttcattaattataaaacacacatttctgccctacattttaacacgtcagtagagaaaatgtgtattac-aatttatgc-----------tcttatagtt i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=1616981.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 280284 1004 + 478999 GATGAAGCAAGGATTCTTACCTAAATACATGATTTATAATTGAAACATAGTTTTTTGTTTAAAAATGTTAGAAATCAACACTATGAAATCAGATACCAATTCTGTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAGGGAAATAAAATGGAGAATTTTGCAAATTAGGACAAAATTAATATATG-TTCTCTTTATTTTGAGTTTattcatatttattccacaaacatttgaatggataaccatgtgccaaattctgtgtaggacaaatttcataag------atgaataacatat---atttgtcttcaaagatctaacacatgttcatggaagacaacagaaccatataagtacagcatcagttataaatatctaagctaattgtttacatagaaacaagacttaattcataggagaggagagggtggggaaagaaaaaatgaaagatgtgatttctgaactaagtctcaacagactggtaacatgagtcaggtgaaaggtgagaggaagtacgctctaaaaggaggaaataaaaaaggacttgggagaagaagagagaagaatctctctt----ag-gaaactacatgatatttaatttggatgaaatatttgcagaaggagtaaa-aattctaagctagaagtttaagaagggtcag-cttacggaggaccttgcctggttatgctgatgggcttaaactgtggcaggagttaaatgaaaatactctggaacagtttaaaatggaggggtgatacactcacaattttatttccaaactgttgttcagaatgaattaaagtggataggattgaagacaaagaggatggttaggagcttattgtgatcatcattaacagtggtattgcacatgtagtaaaatgggcagatttgaaagattatgaaggtgatagaatctatagtac---------------------------ttgatgattaatggaatgtg--aaatagagatagaagttaagTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATAAACAAATGCCATGCAGATC----TAGAGCAGGGGCCA s panTro4.chrUn_GL393519 119362 1004 + 413329 gatgAAGCAAGGATTCTTACCTAAATACATGATTTATAATTGAAACATAGTTTTTTGTTTAAAAATGTTAGAAATCAACACTATGAAATCAGATACCAATTCTGTCAGTGGGGAGAGTTTGCAGTGAGGGAAATAAAATGGAGAATTTTGCAAATTAGGACAAAATTAATATATG-TTCTCTTTATTTTGAGTTTattcatatttattccacaaacatttgaatggataaccatgtgccaaattctgtgtaggacaaatttcataag------atgaataacatgt---atttgtcgtcaaagatctaacacatgttcatggaagacaacagaaccatataagtacagcatcagttataaatatctaagctaattgtttacatagaagcaagacttaattcataggagaggagagggtggggaaacacaaaatgagagatgtgatttctgaactaagtctcaacagactggtaacatgagtcaggtgaaaggtgagaggaagtacgctctaaaaggaggaaatgaaaaaggacttgggagaagaagagagaagaatctctctttctccg-gaaacgacatgatatttaatttggatgaaatatttgcagaaggagtaaa-aattctaagctagaagtt-aagaagggtcag-cttatggaggaccttgcctggttatgctgatgggcttaaactgtggcaggagttaaatgaaaatactctgaaacagtttaaaatggaggggtgatacactcacaattttatttccaaactgttgttcagaatgaattaaagtggataggattgaagacaaagaggatggttaggagcttattgtgatcatca---acagcggtattgcacatgtagtaaaatgggcagatttgaaagattatgaaggtgatagaatctgtagtac---------------------------ttgatgattaatggaatgtg--aaatagagatagaagttaagTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATAAGCAAATGCCATGCAGATC----TAGAGCAGGGGCCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7203075 980 + 72422247 GATGAAGCAAGGATTCTTACGTAAGTACATGATTTATAATTGAAAC--AGTTTTTTGTTTAAAAATGTTAGAAATCAATACTATGAACTCAGATACCAATTCTGTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAGGGAAATAAAATGGAGAATTTTGCAAATTAGGACAAAATTAATATATG-TTCTCTTTATTTTGAGTTTattcatatttattccacaaacatttgaatggataaccatgtgccacattctgtgtaggacaaatttcataag------atgaataaca--c---atttgtcttcaaagatctaacacatgttcatggaagacaacagaaccgtataagtacagcatcagttataaatacctaagctaatggtttacatagaagaaagacttaattcataggagaggagagggtggggaaagacaaaatgaaagatgtgatttctgaactaagtctcaacagactgctaacatcagccaggtgaaaggtgagaggaagtaccctctagaaggaggaattaaaaaaggacttgggagaagaagagaGAAG-ATCTTTCTTTCTCAG-GAAACTACATGATATTTAATTTGGATGAAATATTTGCAGAAGGAGTTAA-AATTCTAAGCTagaagtt-aagaagggtcag-cttacagaggaccttgcctggttatgctgatgggcttgaactgtaacaggagttaaatggaaatactctggaacagtttaaaatggaggggtgatacactcacaattttatttccaaactgttgttcagaatgaatt---------------------aaagagggtggttaggagcttattgtgatcatcatcaacagtggtattggagat---gtaaaatgggcagatttgaaagattatgaaggtgatagaatctataggac---------------------------ttgatgattaatggaatttgaaaaatagagatagaagttaagTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATAAACAAATGTCATGCAGATC----TAGAGCAGGGGCCA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 190144 963 + 1200634 gatgAAGCAAGTATTCTTACCTAAATACATGATTTATAATTGAAACATAGTTTTTTGTTTGAAAATGTTAGAAATCAACACTATGAACTCAGATACCAATTCTCTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAGGGAAATA-----GAGAATTTTGCAAATTAGGACAAAATTAATATATG-TTCTCTTTATTTTGAGTTTattcatatttattccataaacatttgaatgggcaaccatatgccaaattctgtgtaggacaaatttcataagatgaatatgaataacacat---atttgtcttcaaagatctaatacatgttcatggaagacaacagaaccatataagtacagcatcagttataaatacctaagctaattgtttacatagaagaaagagttaattcataggaagggagagggtggggaaagacaaaatgaaagacttgatttctgaactaagtctcaacagactggtaacatgagccaggtgaaaggtgagaggaagtatgctctagaaggaggaaataaaaaaggacttgggagaagaagagagaagaatctttcttgctcaa-gaaactacatgatatttaatttggatgaaatatttgcagaaggagtaaa-aattctaagctagaagtt-aagaagggtcag-cttacggagGACCTTGCCTAGTTATGCTGATGGGCTTGAACTT--------GTTAAATGGAAATACTCTGAAACAGTTT------------------------------------AAACTGTT-TTCAGAATGAATTAAAGTGGATAGGATTGAAGACAAAGAGGGCGATTAGGAGCTTATTGTGATAATTATTAATAGTGGTATTGGAGATATAGTAAAATGGGTAGATTTGAAAGATTATGAAGGTGATAGAATCTATAGGAC---------------------------TTGATGATTAATGGAATATG--AAATGGAGATAGAAGTTAAGTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAGATGATAAACAAATGCCATGCAGATC----TAGAGCAGGGGCCG i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119424066 1027 + 137160470 gatgAAGCAAGTATTCTTATTTAAA-ACATGATTTATAATTAAAACATAGTTTTTTGTTTAAAAATGTTATAAATCAACACTATGAACTCAGATACCAATTCTCTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAAGGAAATAAAATGGAGAAATTTGCAAATTAGGACAAGATTAATATATGTTTCTCTTCATTTTGAGTTTattcatatttattccacaaacatttgagtggataaccatgtgccagatcctgtgtaggacaaatttcataag------atgaataaaacataa-gtttgtcttcaaagatctaacacatgttcatggaggacaacagaaccatgtaaatacggtaacatttataaatacctaagctaattgtttacagagaagaaagacttaattcataggagaggagagggtggggaaagacaaaatgaaagatgtgatttctgaactaagtctcagcagactggtaacgtgagccaggtgaaaggtgaggggaagtatgctctagaaggaggaaattaaaaaggacttgggagaagaagagagacgaatctttcttgctcaagggaactacatgatatttaatttggatgaaatatttgcagaaggagtgaa-AAATC------------T-AAAAAGGGTCAGCCCTACAGGGCACCTTGCATAGTTACGCTGATCGGCTTAAACTTTAGCAAGAGTTAAATGGAAATACTCTGAAACAGTTTAAAATGGAGGGGTGATACATGCACAATTTTATTTCCAAACTGTTGTTCAGAATGAATTAAAGTGGATAGGATTAAAGACAAAGAAGGCAGTTAGGAGCTTATCATGATCATTATTAATAGTGGTATTGGAGATGTAGTAAAATGGGCAGATTTGAAAGATTATGAAGGTGATAGAATCTGTATGTTTAATGATTAATGATTATGGAATGATTATTGATGATTAATGGAATGTG--AAATAGAGATAGAAGGTAAGTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATA---TAATGCCATGCAGATCTGGATGGAATAGGGGCCA i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr12 115012864 1006 - 132586672 gatgAAGCAAGTATTCTTATTTAAA-ACATGATTTATAATTAAAACATAGTTTTTTGTTTAAAAATGTTATAAATCAACACTATGAACTCAGATACCAATTCTCTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAAGGAAATAAAATGGAGAAATTTGCAAATTAGGACAAAATTAATATATG-TTCTCTTTATTGTGAGTTTattcatatttattccacaaacatttgaatggataaccatgtgccaaattctgtgtaggacaaatttcacaag------atg-ataaaacataatattagtcttcaaagatctaacacatgtttatggaagacaacagaaccgtataagtacagcatcagttataaatacttaagctaattgtttacatagaagaaatacctaattcataggagaggagagggtggggaaaggcaaaatgaaaggtgtgatttctgaaccaagtctcagcagact-gtaaagtgagccaggtgaaaggtgaggggaagtacgctctagaagaaggaaataaaaaagggcttgggagaagaagagaa--gaatctttcttgctcaa-gaaactacatgatatttaatttagatgaaatatttgcagaaggagtaaacaaatctaagctagaagtt-aagaagggtcag-cttacggagGACCTTGCCTAGTTATGCTGATGGGCTTGAACGTTAGCAGGAGTTAAATGAAGACACTCTGAAACAGTTTAAAATGGAGGGGTGATATACTCACAATTTTATTTCCAAACTGTTGTTCATTCTGAATTAAAGTAGATAGGATTAAAGACAAAGAGGGTAGTTAGGGACTTATTGTGATCATTATTAATAGTGGTTTTGGAGATGTAGTAAAATGGGTAGATTTGAAAGATTATGAAGGTGATAGAATCTATAGGAC---------------------------TTGATGATTAATGGAATATG--AAATAGAGATAGAAGTTAAGTGGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATAAACAAATGCCATGCAGATC----TAGAGCAGGGGACA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32623422 1004 - 90373283 gatgAAGCAAGTATTCGTATTTAAATACATGATTTATAATTGAAACATAGTTTTTTGTTTTAAAATGTTAGAAATCAACACTGTGAACTCAGATGCCTATTCGCTCAGTGGGGATAGTTTGCAGTGAAGGAAATAAAATAGAGAAATGTGCAAATTAGGACAAAGTTAATATATG-TTCTCTT-----TGAGTTTattcatatttatttcacaaacatttgaatggataaccatgtgccagatcctgtgtaggacaaatttcataag------atgaataaaacgtaa-gtttgtcttctaagatctaacacgtgttcatggaagacaacagaaccatgtaaatacggtaatagttataaatgcctaagctaattgtttacatagaagaaagacctaattcataggagaggagagggtggggaaagacaaaatgaaagatgtgatttctgaactaagtctcagcagactggtaacgtgagccaggtgaaaggtgaggggaagtacgctctagaaggaggaaattaaaatggacttgggagaagaagagagatgaatctatcttgctcaa-gaaactacatgatatttaatttggatgaaatatttgcagaaggagtgaa-aaatctaagctagaaatt-aagaagggtcag-cttatggagCACCTTGCCTAGTTATGCTGATCGGCTTAAACTTTAGCAGGAGTTAAATGGAAATACTCTGAAACAGTTTAAAATGGAGGGGTGATACATACACAATTTTATTTCCAAACTGTTGTTCAGAATGAGTTAAAGTGGATAGGATTAAAGGCAAAGAGGGCAGTTAGGAGCTTATCATGATCATTATTAATAGTGGTATTGGAGATGTAGTAAAATGGGCAGATTTGAAAGATTGTGAAGGTGATAGAATCTGTAGGAC---------------------------TTGATGATTAATGGAATGTG--AAATAGAGATAGAAGTTAAGTTGTAATAACCACATCTCAGTTCAAATGATATAAAAATGCCATGCAGATC----TGGAGTAGGGGCTA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e papAnu2.JH685195 7657 476 - 38368 M a score=531326.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 281288 239 + 478999 TGTTCCCAAACAATTTGCCTGAGCCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCACAATAAACCAATGCCAAACAGTTGTGCATTGATA-TATCATCCATTCTTCTGGAAA-----TTCTTTGAGGATTTCACATACAGATGTCCATATTGAATTAATACATAATTATCAAGAG-AAAAATAGCCCTGAGTCAACATTCTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTGGATTTTCTCATTGTCCTTTTCCATA s panTro4.chrUn_GL393519 120366 239 + 413329 TGTTCCCAAACCATTTGCCTGAGCCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCACAATAAACCAATGCCAAACAGTTGTGCATTGATA-TATCATCCATTCTTCTGGAAA-----TTCTTTGAGGATTTCACATACAGATGTCCATATTGAGTTAATACATAATTATCAAGAG-AAAAATGTCCCTGAGTCAACATTCTAGAAATGTTCAATCGTCTAGAGTGGATTTTCTCATTGTCCTTTTACATA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7204055 239 + 72422247 TGTTCCCAAACCGTTTGCCTGAGCCATTGTGCCTGACACAGTGCTGAGTCCACAATAAACCAATGCCAAACAGTTGTGGATTGACA-TATCATCCATTCCTCTGGAAA-----TTCTTTGAGGATTTCACATACAGATGTCCATATTGAATTAATACATAATTATCAAGAG-AAAAATATCCCTGAGTCAACATTCTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTGGATTTTCTCATTGTCCTTTTCCATA i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 191107 241 + 1200634 TGTTCCCAAACCATTTGCCTGAGCCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCACAATAAACCAATGCCAAACAGTTATGTATTGACATTATCATCCATTTCTCTGGAAA-----TTCTCTGAGGATTTCACACACAGATGTCCGTAGTGAATTAATACATAATTATCAAGAGAAAAAATATCCGTGAGTCAACATTCTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTGGATTTTCTCATTGTCCTTTTCCATA i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119425093 244 + 137160470 TGTTCCCAAATCATTTGCCTGAACCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCAC-ATAAACCAATGTCAAACAGTTGTGCATTGACA-TATCATCCATTCCTCTGGAAATTCTTTTCTTTGAGGATTTCACACACACCTGTCCATATTGAATTAATACATAATTACCAAGAGAAAAAATATCCCTGAGTCAGCATTGTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTCGTTTTTCTCATTGTCCTTTTCTATA i rheMac3.chr13 C 0 M 545 s macFas5.chr12 115013870 232 - 132586672 TGTTCCCAAACCATTTGCCTGA--------GCCTAACGCAGTGCTGAGTCCACAATAAACCAATGCCAAATAGTTGTGCATTGACA-TATCATCCATTCCTCTGGAAA-----TTCTTTGAGTATTTCACACACAGATGTCCTTATTAAACTAATACGTAATTATCAAGAGAAAAAATATCCCTGAGTCAACATTCTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTGGGTTTTCTCCTTGTCCTTTTCCGTA i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 8133 235 - 38368 tGTTGCC-AATCATTTGCCTGAACCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCAC-ATAAACCAATGTCAAATGGTTGTGCATTGACA-T---ATCCATTCCTCTGGAAA-----TTCTTTGAGGATTTCACACACAGATGTCCATATTGAATTAATACATAATTACCAAGAGAAAAAATATCCCTGAGTCAGCATTGTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTCGTTTTTCTCATTGTCCTTTTCTATA i papAnu2.JH685195 M 476 C 0 s chlSab2.chr2 32624426 239 - 90373283 TGTTCCCAAATCATTTGCCTGAACCATTGTGCCTAACACAGTGCTGAGTCCAC-ATAAACCAATGTCAGACAGTTGTGCATTGACA-TATCATCCATTCCTCTGGAAA-----TTCTTTGAGGATTTCACACACAGATGTCCATATTGAATTAATACATAATTACCAAGAGAAAAAATATCCCTGAGTCAGCATTGTAGAAATGTTCAATTGTCTAGAGTCGTTTTTCTCATTGTCCTTTTCCATA i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=964385.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 281527 555 + 478999 ACAACATAGTGACTTGGAATATAACGTGGCACTAAAAAATAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAATTCCTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGCAGTTCTCTGGTCTTAATTCTTTTATGGTTCCAGG-AGAATTACATTTCAAATTCCGTAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAATACTTTGTTCAAAGGCAACTTTTATTATGAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAATTGTTTAGAGCATCATTAAAATAACCTTTTTAATAAGACCACTTTCTCTTGAAAAAGTGTAGTACCCTCTTATTTAATATTACCATATTACAATTGACTGTATGTTTGCTGAAAGTCTTATAGTATGGTATTTAGTTTATTGAACTAGCACAAAATATACATGAACTTTATCAGTTTTCATTTTCCCTTTAACAAACCAAGAACAATATTAAATGACATTTTATGACATTTGATAGGTATTTAAAATTTGTTATTGCGGCTCTTCAGTGAACCATAAAATAACAAGTGTCACAATATGG s panTro4.chrUn_GL393519 120605 554 + 413329 ACAACATAGTGACTTGGAATATAACGTCGCACTAAAAAATAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAATTCCTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGCAGTTCTCTGGTCTTAATTCTTTTATGGTTCCAGG-AGAATTACATTTCAAATTCCATAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTACAATACTTCGTTCAAAGGCAACTTTTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAATCGTTGAGAGCATCATTAAAATAACCTTTTTAATAAGACCACTTTCTCTTGAAAAAGTGTAGTACCCTCTTATTTAATATTACCATATTACAATTGACTGTATGTTTGCTGAAAGTCTTATAGTTTGGTATTTAGTTTATTGAACTAGCACAAAATATAGATGAACTTTATCAGTTTTCATTTTCCCTTT-ACAAACCAAGAACAATATTAAATGACATTTTATGACATTTGATAGGTATTTAAAATTTGTTATTGCGGCTCTTCAGTGAACCATAAAATAACAAGTGTCACAATATGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7204294 549 + 72422247 ACAGCATAGTGACTTGGAATATAACATGGCACTAAGAAATAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAATTCTTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGCATTTCTCTGGTCTTAATTCTTTTATGGTTCCAGGAAGAATTGAGTTTCAAATTCCATAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAGTACTTCATTCAAAGGCAACTTTTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAATTGTTCAGAGCATCATTACAATAACCTTTTTAATACGACTGCTTTCTCTTGAAAAAGTTTAGCACCCTCTTATTTAATATTACCGTGTTACAATTGACTGTATATTTGTTGAAAGTCTTG-----TGGTATTTAGTTTATTGAACCAGCACAAAATATACATGAACTTTATCCGTTTTCGTTTTCCCTTT-TCAAACCAAGAACAATATTAAATGGCATTTTCTGGCACTCGATAGGCATTTAAAATTTGTTATTGCAGCTCTTCAGTGAACCATAAAAT-GCAAGTGTAACAGTGTGG i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 191348 548 + 1200634 ACAACATAGTGACTTGGAATATAACATGGCACTAAGAATTAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAATTCCTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGCATTTCTCTGGTCTTAATTCTTTTATGGTTCCAGGGAGAATTACGTTTCAAATTCCATAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAGTACTTCATTCAAAGGCAATTCTTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAACCAAAGAAATTGTTTAGAGCATCATTAAAATAACCTTTTTAAT------GCTTTCTCTTGAAAAAGTGTAGCACCCTCTTATTTAATATTACCATATTACAATTGACTGGATATTTCTTGAAAGTCTTATAGTATGGTATTTAGTTTCTTGAACCAGCACAAAATATACATGAAATTTATCAGTTTTCATTTTCCCTTT-ACAAATCAAGAACAATATTAAATGACATTTTATGACATTTGATAGGTATTTAAAATTTGTTACTGCGGCTCTTCAGTGAACCATAAAAT-ACAAGTGTCACAGTATGG i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr12 115014102 553 - 132586672 ACAACATAGTGACTTGGAATATAACATGACACTAAGAAATAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAATTCCTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGCATTTCTCTGGTC-TAATTCTTTTATGGTTCCAGGGAGAATTGCATTTCACATTCCATAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAGTACTTCGTTCAAAGGCAATTTTTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAATTGTTTAGAGCATCATTAAAATAACCTTTTTAATATGACTGCTTTCTCTTGAAAAAATGTAGCACCCTCTTATTTAATATTACCGTATTACAATTGACTATATATTTGTTGAAAGTCTTATAGTATGGTATTTAGTGTATTGAACCAGCACAAAATATACATGAACTTTATCAGTTTTCATTTTCCCTTT-ACAAACCAAGAACAATATTAAATGACATTTTATGACATTTGATAGGTATTTAAAATTTGTTATTGCGGCTCTTCAGTGAACCATAAAAT-ACAAGTGTAACAGTATGG i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 8368 551 - 38368 ACAACACAGTGACTTGGAATATAACATGACACtaagaaatagaagaataaaaagggTCTTTGAAGCAATTCCTTTTTATCTTGCTTTATTCTTAACAGTATTTCTCTGGTCTTAATTCTTTTATAGTTCCAGGGagaattatatttcaaattcCATAATTGCACAGGAGGATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAGTACTTTGTTCAAAGGCAATTATTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAA---TTTAGAGCATCATTAAAATAACCTTTTTAATATGACTTCTTTCTCTTGAGAAAGTGTAGCACCCTCTTATTTAATATTACCATGTTACAATTGACTATATATTTGTTGAAAGTCTTATAGTATGGTATTTCATTTATTGAACCAGCACAAAATATGCATGAAGTTTATcagttttcattttcccttt-acaAACCAAGAACaatattaaatgacattttatgaCATTTGATAggtatttaaaatttgttattgtGGCTCTTCAGTGAACCATAAAAT-ACAAGTGTCACAGTGTGG i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32624665 551 - 90373283 ACAACACAGTGACTTGGAATATAACATGACACTAAGAAATAGAAGAATAAAAAGGGTCTTTGAAGCAattcctttttctcttgctttattcttaacagtatttctctggtcttaattctttTATAGTTCCAGGGAGAATTACATTTCAAATTCCATAATTGCACAGGAGAATTGGAGTCTTGTAAAAATTTAGAGTACTTTGTTCAAAGGCAATTATTATTATCAACTGAACCTATGCTGTGATGCAGCCAAAGAAA---TTTAGAGCATCGTTAAAATAACCTTTTTAATATGACTTCTTTCTCTTGAGAAAGTGTAGCACCCTCTTATTTAATATTACCATGTTACAATTGACTATATATTTGTTGAAAGTCTTATAGTATGGTATTTCGTTTATTGAACCAGCACAAAATATGCATGAACTTTATCAGTTTTCATTTTCCCTTT-ACAAACCAAGAACAATATTAAATGACATTTTATGACATTTGATAGGTATTTAAAATTTGTTATTGTGGCTCTTCAGTGAACCATAAAAT-ACAAGTGTCACAGTGTGG i chlSab2.chr2 C 0 C 0 e rheMac3.chr13 119425337 545 + 137160470 M a score=668728.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 282082 288 + 478999 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGCAGGAAACATTTAAATCAGCATCATTTTCCATCAATGTTTTGCTCCTGATTCTCTGCcaagttcattatctcctctgtgcctaaatttgtccatatgaaaaattaggagaaaaaag-aataaattaatactt-gcctctaaaatgatctgaaacccaggtatggaaaatcttacacaagTTTAAAAGACTGGTTTATTCACTACTGTCCTCATTCGTTTGAACGGACCGCAATGTTCtgtgggagagtagctgagagactgat s panTro4.chrUn_GL393519 121159 288 + 413329 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGCAGGAAACATTTAAATCAACGTCATTTTCCATCAGTGTTTTGCTCCTGATTCTCTGCcaagttcattatctcctctgtgcctaaatttgtccatatgaaaaattaggagaaaaaag-aataaattaatactt-gcctcTAAAATGATCTGAAACCCAGGTATGGAAAATCTTACACAAGTTTAAAAGACTGGTTTATTCACTACTGTCCTCATTCGTTTGAACAGACTGCAATGTTCTGTGGGAGAGTAGCTGAGAGACTGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7204843 288 + 72422247 CTGTGCTTTCCTTATGAGAAATGCAGACAGGAAACATTTAAATCAGCATCATTTTCCATCAATGTCTTGTTCCTGATTCTCTGCcaagttcattgtctcctctgtgcctaaatttgtccatatgaaaaattaggagaaaaaag-aataaattaatactt-gcctcTAAAATGATCTGAAACCCAGGGATGGAAAATCTTACACAAGTTTAAAAGCCTGGTTTATTCATTGCTGTTCTCATTCGTTTGAACAGACTACAGTGTTCTATGGGAGGGTAGCTGAGAGACTGAT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 191896 289 + 1200634 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGCAGGAAGCATTTAAATCAGCATCATTTTCCATCTATGTCTTGCTCCTGATTCTCTGCcaagttcattatttcctctgtgcctaaatttgttcatatgaaaaattaggagaaaaaaataataaattaatactt-gcctcTAAAACGATCTGAAATCCAGGTATGGAAAATCTTACACAAGTTTAAAAGACTGGTTTATTCACTACTGTCCTCATTTGTTTGAACACACTACAATGTTCCGTGGGAGAGTAGCTGAGAGACTGAT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119425882 286 + 137160470 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGTAGGAAGCATTTGAATCAG---TATTTTCCATCAATGTCTTGCTCCTGATTCTCTGCcgagttcattatctcctctgtgcctaaatttgtccatatgaaaaattaggagaaaaaAG-AATGAATTAATACTTGGCCTCTAAAATGATCTGAAATCCAGGTATGGAAAATCTTACACAAGTTTAAACGACTGGTTTATTCACTACTGTCCTCATTTGTTTGAACACACTACAATGTTCCGTGGGAGAGTAGCTGAGAGACTGTC i rheMac3.chr13 M 545 I 7 s macFas5.chr12 115014655 288 - 132586672 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGCAGGAAGCATTTAAATCAGCATCATTTTCCATCAATGTCTTGCTCCTGGTTCTCTGCcaagttcattatctcctctgtgcctaaatttggccatatgaaaaattaggagaaaaaag-aacaaattaatactt-gcctcTAAAATGATCTGAAATCCAGGTATGGAAAATCTTACACAGGTTTAAAAGACTAGTTTATTCACTACTGTCCTCATTTGTTTGAATCCTCTACAATGTTCCAtgggagcgtagatgagagactgat i macFas5.chr12 C 0 I 2 s papAnu2.JH685195 8919 285 - 38368 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGTAGGAAGCATTTAAATCAG---TATTTTCCATCAATGTCTTGCTCCTGATTCTCTGCCGAGTTCATCATCTCCTCTGTGCCTAAATTTGTCCACATgaaaaattaggagaaaaaag-aataaattaatactT-GCCTCTAAAATGATCTGAAATCCAGGTATGGAAAATCTTACACAAGTTTAAACAACTGGTTTATTCACTACTGTCCTCATTTGTTTGAACACACTACAATGTTCCGTGGGAGAGTAGCTGAGAGACTGTC i papAnu2.JH685195 C 0 I 1 s chlSab2.chr2 32625216 288 - 90373283 CTGTGCTTTCATTATGAGAAATGCAAGCTTGAAGCATTTAAATCAGCATCATTTTCCATCAATGTCTTGCTCCTGATTCTCTGCcaagttcattatctcctctgtgcctaaatttggccatatgaaaaattaggagaaaaaag-aacaaattaatactt-gcctcTAAAATGATCTGAAATCCAGGTATGGAAAATCTTACACAGGTTTAAAAGACTGGTTTATTCACTAGTGTCCTCATTTGTTTGAATCCTCTACAATGTTCtgtgggagcgtagatgagagactgat i chlSab2.chr2 C 0 I 2 a score=7036.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 282370 14 + 478999 gcaataatagtcct s panTro4.chrUn_GL393519 121447 14 + 413329 GCAATAATAGTCCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7205131 11 + 72422247 GA---AATAGTCCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 192185 11 + 1200634 GC---AATAGTCCT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr12 115014945 11 - 132586672 gc---aatagtcct i macFas5.chr12 I 2 C 0 s papAnu2.JH685195 9205 6 - 38368 GA---GAGA----- i papAnu2.JH685195 I 1 C 0 s chlSab2.chr2 32625506 11 - 90373283 gc---aatagtcct i chlSab2.chr2 I 2 C 0 e rheMac3.chr13 119426168 7 + 137160470 I a score=1892459.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 282384 885 + 478999 tttcacaccttccatccagaaagacaatttttttatttgcagctgaagctattatatccagagcctatggctgtttgcctctTCTAACGTTGGAAATTTTGAAAGAGAAACAGCAAGTAAAATGTGAAAATGTCCTCTGGGATATTATTTTATTACTACATGTCCCTT---ATTTAGCAAACTATATGCAATATAAAAAA-TTAAGTC--------TGGTGCCTGGTTGGC-AAAAAATCAAATAACAGGTACTAAAGAAATAATGATGAGCTAACCTAAGCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtg----tgAGTGCGCGCACGCCATAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATAAAAAAGTCATTAGAGGAGAGGGAAAAGCCATATCGCTTGaaaaaagcaccatggtatcatggtagaagaatgggctttagacgctggcaagcttgggtttcaattatggcattttgtagtgcgctatttatttctgagcattaatttctacaatgaaaaaatacata------ataccatagggtttgaaggatcaagtgagatgattgaaataaagtatgaatcaagatgtctgtc--aTTAATTCTCTCTTT--TAATCATGGGAGCTATTGACAATGCAAAA-GTGTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCTTGAGATAACGTGTCAGGTTGTTCGCTAATGCCTTTTTCATAGAAATATTGTTGAGCTGCCTTCACATAGATAGAACATCTGGGTTACAAC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGGTACAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATTTTAGTAACTGCTGAACCGTGTGAtgttgagtcaatcacatt s panTro4.chrUn_GL393519 121461 875 + 413329 TTTCACACCTTCCATCCAGAAAGACAATTTTTTTATTTGCAGCTGAAGCTATTATATCCAGAGCCTATGGCTGTTTGCCTCTTTTAACGATGGAAATTTTGAAAGAGAAACAGCAAGTAAAATGTGAAAATGTCCTCTGGGATATTATTTTATTACTACATGTCCCTT---ATTTAGCAAACTAGATGCAATATAAAAAATTTAAGTC--------TGGTGCCTGGTTGGC-AAAAAATCAAATAACAGGTACTAAAGAAATAATGATGAGCTAACCTAAGCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----------tgtgtg----tgagtgCACGCACGCCATAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATGAAAAAGTCATTAGAGGAGAGGGAAAAGCCATATCGCTTGaaaaaagcaccatggtatcatggtggaagagtgggctttagacgctggcaagcttgggtttcaattatggcattttgtagtgcgctatttatttctgagcattaatttctacaatgaaaaaatacata------ataccatagggtttgaaggatcaagtgagatgattgaaataaagtatgaatcaagatgtctgtc--aTTAATTCTCTCTTT--TAATCATGGGAGCTATTGACAATGCAAAA-GTGTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCTTGAGATAATGTGTCAGGTTGTTCGCTAATGCCTTTTTCATAGAAATATTGTTGAGCTGCCTTCACATAGATAGAACATCTGGGTTACAAC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGGTACAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATTTTAGTAACTGCTGAACCGTGTGATGTTGAGTCAATCACA-t i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 2093 s ponAbe2.chrUn 7205142 848 + 72422247 TTTCACACCTTCCGTCCATAAAG--AATTTTTTTATTTGCAGCTGAAGCCATTATATCCAGAGCCTATGGCTGTTTGGCTCTTTTAACGATGGACATTTTAAAAGAGAAACAGCAAGTAAAATGTGAAAATGTCCTCTGGGATATTATTTCATTACTACATGTCCCTT---ATTTAGCAAACTAGATGCAATATAAAAAA-TTAAGTT--------TGGTGCCTGGTTGGC-AAAAAATCAAATAACAGGTACTA---AAATAATGGTGAGCTAACCTAAGCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgta--------------tgtgtg----tgggtgtgCGCACGCCATAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATGAAA----------AGGAGAGGGAAAAGCCATATCACTTGAAAAAATcaccatggtatcatggttgaagaatgggctttagacgctggcaagcttgggtttcaattatggcATTTTGTAGTGTGCTAT-------TGAGCATTAATTTCTACAATGAAAAAATACATA------ATATCATAGGGTTTGAAGGATCAAGTGAGATGATTGAAATAAAGTATGACTCAAGATGTCTGTCATATTAATTTTCTCTTTTATAATCATGGGAGCTGTTGACAGTGCAAAA-GTGTACCCAGTAGTATAGCAGTAGAGTGATAGTGTATCTCTTGAGATAATGTGTCAGGTTCTTCGCTAATGCCTTTTTCGTAGAAATATTGTTGAGCTGCCTTCAC----ATGGAACATCTGGGTTACAAC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGGTATAGCTTTCTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTGGTAAC----TGGTGCATTTTAGTAACTGCTGAACCGTGTGGTGTTGAGTCAGTCACATT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 192196 892 + 1200634 TTTCACACCTTCCATCCATAAAGACATTTTTTTTATTTGCAGCTGAAGCTATTATATCCAGAGCCTATGGCTGTTTGGCTCTTTCAAGGATGGAAATTTTAAAAGAGAAACAGCAACTAAAATGTGAAAATGTCCTCTGGGATATTATTTTATTACTACATGTCCCTTATCATTTAGCAAACTAGATGCAATATAAAAAA-ATAAGTCA----CTTTGGTGCCTGGTTGGC-AAAAATTCAAATAACGGGTATTAAAGAAATAATGGTGAGCTAACCTAAGCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtatgtgtg----cgtgtgCATGCACGCCATAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATGAAAAAGTCATTAGAGGAGAGGTAAAAGCCATATCGCTTGaaaaaagcaccatggtatcatggtcgaaaaatgggctttagaggctggcaagcttgggtttcaattatggcattttgtagtgtgctatttatttctgagcattaatttctacaatgaaaaaatacata------at---atagagtttgaaggatcaagtgagatgattgaaataaagtatgaatcaagatgtctgtcataTTAATTCTCTCTTT--TAATCATGGGAGCTATTGACAATGCAAAAGGTGTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCTTGAGATAATGTGTCAGGTCCTTCTCTAATGCCTTTTTCATAGAAATATTGTTGAGCTGTCTTCACATAGATAGAACATCTGGGTTACAAC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGATGTAACTTTTTGAAATTGCCTGCCTGAATTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATTTTAGTAACTGCTGAACTGTGTGGtgttgagtcaatcacatt i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119426175 874 + 137160470 TTTCACGCCTTCTATCCGTAAAGACAATTTTTTTATTTGCAGCTGAAGCTATTATATCCAGAGCCTATGGCTGCTTGGCTCTTTTAACGATTGAAATTTTAAAAGAGAAACAGCAAGTAAAATGTGAATATGCCCTCTGGGATTTTATTTTATTACTACATGTCCCTTATCATTTAGCAAACTACATGCAACATAAAAAA-TTAAGTTAGTTTGTTCCGTGCCTGGTTGGCAAAAAAATCAAATAACATGTACTAAAGAAATAATGGTGAGCTAACCCAACCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----------cgtgCG------------------CCATAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATGAAAAAGTCATTAGAGAAGAAGGAAAAGCCATATCACTTGaaaaaagcaccatggtatcatggtcaaagaatgggttttagaggatggcaggcttgggtttcaattatggcattttgtagtgtgctgtttatttctgagcattaatttctacaatgaaaaaacacata---------tcatagggtttgaaggatcaagtgagatgattgaaatgaagtatgaatcaagatgtctgtcataT----TCTCTCTTT--TAATCATGGGGGCTATTGACAATGCAAAA-G-GTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCCTGAGATAATGTGTCAGGTCCTTCGCTAATACCTTTTTCATAGAAATACTGTTCACCTGCCTTCACGTAGATAGAATATCTGGGTTACAGCCGCTTTACACTTTGCAGAAAAGCTACCAGATACAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATATTAGTAACTGCTGAACTGTGTGGtgttgagtcaatcacatt i rheMac3.chr13 I 7 C 0 s macFas5.chr12 115014956 889 - 132586672 tttcacaccttccatccataaagacaattcttttatttgcagctgaagctattatatccaaagcctatggctgtttgGCTCTTTTAACGATGGAAATTTTAGAAGAGAAACAGCAAGTTAAATGTGAAAATGTCCTCTGGGATATTATTTTATTACTACATGTCCCTT---ATTTAGCAAACTAGATGCAATATAAAAAA-TTAAGTCAGTTTGTTTGGTGCCGGGTTGGC-AAAAAATCAAATAACCGGTACTAAAGAAATAATGGTGAGCTAACCTAAGCGCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----------CGCGCG----CGCGCACGTGTGCACCATAAAGCCAAGGTA--GAGAGGTGAATGAAAAAGTCATTAGAGGAGAGGTAAAAGCCATATCGCTCGAAGAAAgcaccatggtaccatggttgaagaatgggttttagaggccggcaagcttgggtttcaattatggtattttgtagtgtgctatttatttctaaacattaatttctacaatgaaaaaatacataactaatatctcatagggtttgaaggatcaagtgagatgattgaaataaagTATGAATCTAGATGTCTGTCATATTAA-TTCTCCTTT--TAATCATGGGAACCACTGACAATACAAAA-G-GCACCC---AGTATAGCACTAGAATGATAGTGTATCTCCTGAGATAATGTGTCAGGTCCTTTGCTAATGCCTTTTTCATAGGAATATTGTTGAGCTGCCTTCACATAGATAGAACATCTGGGTTACAAC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGATATAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATATTAGTAACTGCTGAACTGTGTGGtgttgagtcaatcacact i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 9211 880 - 38368 TTTCACGCCTTCTATCCGTaaagacaatttttttatttgcagCTGAAGCTATTATATCCAGAGCCTATGGCTGCTTGGCTCTTTTaatgatggaaattttaaaagagaaacagcaagTAAAATGTGAATATGCCctctgggattttattttattactacatGTCCCTTATCATTTAGCAAACTACATGcaacataaaaaa-ttaagttaGTTTGTTCCGTGCCTGGTtggcaaaaaaatcaaataacaggTACTAAAGAAATAATGGTGAGCTAACccaacctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg----------tgtgtgtgcgcgcgcgcgcgtgcgccaTAAAGCCAAGGTG--GAGAGGTGAATGAAAAAGTCAttagagaagaaggaaaagccaTATCGCTTGAGAAAAGCACCATGGTATCATGGTCGAAGAATGGGTTTTAGAGGATGGCAAGCTTGGGTTTCAATTATGGCATTTTGTAGTGTGCTGTTTATTTCTGAGCATTaatttctacaatgaaaaaaCACATA---------ACATAGGGTTTGAAGGATCAAGTGAGTTGATTGAAATGAAGTATGAATCAAGATGTCTGTCATAT----TCTCCCTTT--TAATCATGGGGGCTATTGGCGATGCAAAA-G-GTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCCTGAGATAATGTGTCAGCTCCTTCGCTAATACCTTTTTCATAGAAATACTGTTCACCTGCCTTCACATAGATAGAATATCTGGGTTACAGC-------CGCTTTACAGAAAAGCTACCAGATACAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATT--AGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATATTAGTAACTGCTGAACCAT---GTGTTGAGTCCATCACATT i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32625517 854 - 90373283 tttcacaccttccatccataaagacaattcttttatttgcagctgaagctattatatccagagcctatggctgcttgactctTTTAACGATGGAAATTTT--AAGAGAAACAGCAAGTAAAATGTGAAAATGCCCTCTGGGATATTATTTTATTACTACATGTCCCTTATCATTTAGCAAACTACATGCAACATGAAAAA-TTAAGTTAGTTTGTTCCGTGCCTGGTTGGCAAAAAAATCAAATAACAGGTACTAAAGAAATAATGGTGAGCTAACCTAACCTC----------TGTGTGTGTGTGTG----------CGCGCG------------------CCATAAAGCCAAGGTGTCGAGAGGTGAATGAAAAAGTCATTAGAGGAGAAGGAAAAGCCTTATCACTTGAAAAAAGCATCATGGTATCATGGTCGAAGAATGGGTTTCAGAGGATGGCAAGCTTGGGTTTCAATTATGGCATTTTGTAGTGTGCTATTTATTTCTGAGCATTAATTTCTACAATGAAAAAACACATA---------ACATAGGGTTTGAAGGATCAAGTGAGATGATTGAAATACAGTATGAATCAAGATGTCTGTCATAT----TCTCTCTTT--TAATCACGGGGGCTATTGACAATGCAAAA-G-GTACCC---AGTATAGCAGTAGAATGATAGTGTATCTCCTAAGATAATGTGTCAGGTCCTTCGCTAATACCTTTTTCATAGAAATATTGTTCAGCTGCCTTCACATAGATAGAATATCTGGGTTACAGC-------CACTTTGCAGAAAAGCTACCAGATATAGCTTTTTGAAATTGCCTGCCTGGGTTTAAATTACAGTCTTGTAGTAACTCTTTGGTGCATATTAGTAACTGCTGAACCAT---GTGTTGAGTCAATCACATT i chlSab2.chr2 C 0 C 0 a score=60940.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283269 25 + 478999 gattggaaaggaaatttaacgcatc s panTro4.chrUn_GL393519 124429 25 + 413329 gattggaaaggaaatttaacgcatc i panTro4.chrUn_GL393519 I 2093 C 0 s ponAbe2.chrUn 7205990 25 + 72422247 GATCGGAAAGGAAATTTAATGCATC i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 193088 25 + 1200634 gattggaaaggaaatttaatgcatc i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119427049 25 + 137160470 gatcagaaaggaaatttaatgcatc i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr12 115015845 25 - 132586672 gatcggaaaggaaatttaatgcatc i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 10091 25 - 38368 GATCAGAAAGGAAATTTAATGCATC i papAnu2.JH685195 C 0 C 0 s chlSab2.chr2 32626371 25 - 90373283 GATCGGAAAGGAAATTTAATGCATC i chlSab2.chr2 C 0 N 0 a score=606374.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283294 360 + 478999 agacaagggaaagttactaaggtt----agtt----gacatagaatgctcttaagttagt----tcatggtaagttatgcaagtAGAGGAGATCATAGATAACTAAATAGCAGGCAAACTGCAAAAAGACTAGCAGAAGTTggccaggcatagtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggtggatcatgaggtcaggagttcaagaccagcctgtccaacttgatgaaaccctgtctcta-caaaaat---ataaattaaccaggcatggtggctggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagat s panTro4.chrUn_GL393519 124454 364 + 413329 agacaagggaaagttactaaggtt----agtt----gacatagaatgctcttaagttagtaagttcatggtaagttatgcaagtAGAGGAGATCATAGATAACTAAATAGCAGGCACACTGCAAAAAGACTAGCAGAAGTTggccaggcatagtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggtggatcatgaggtcaggagttcaagaccagcctgtccaacttgatgaaaccctgtctcta-caaaaat---ataaattaaccaggcatggtggctggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7206015 364 + 72422247 AGAGAAGAGAAAGTTACCAAGGTT----AGTA----GACATAGAATGCTCTTAAGTTAGTAAGTTCATGGTAAGTTATGCAAGTAGAGGAGATCATAGATAACTAAATAGCAGGGAAACTGCAAAAAGACTAGCAGAAGTTggccaggcatagtggctcaggcctgtaatcccagcgctttgggaggccaaggcaggtggatcacgaggtcaggagttcaagaccagcctgtccaacatgatgaaaccacgtctcta-caaaaat---ataaattaaccaggcatggtggctggcacttgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaagaggcggaatttacagtgagccgagat i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 193113 366 + 1200634 agacaagggaaagttaccaaagttagtgagta----gatataggatgctctgaagttagtaagttcatggtaagttatgcaagtAGAGGAGATCATAGATAACTAAAT---AGGGAAACTGCAAAAAGACTAGCAGAAGTTggccgggcatagtggctcgtgcatgtaatcccagcactttgggaggccgaggcggatggatcacgaggtcaggagttcaagaccagcctgtccaat---ataaaaccctgtctctaccaaaaatgtaataaattagccaggcatggtggctggcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaagagaattccttgaacccaagaggcagaggttgcagtaagccaagat i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119427074 366 + 137160470 agacaagggaaagttaccaaggtt----agtc----gacacaaaatgcttt-aagttagtaagtccaTGGTTAGTTATGCAAGTAGAAGAGATCATAGATAACTAAGTAGCAGGGAAACTGCAAAAAGTCTAGCAGAAGTTggccgggcgtagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggtggatcacgagatcaggagttcaagaccagcctgtccaacatgatgaaaccccatctctaccaaaaatataataaattaggcaggcatggtggctagcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccagga-gcggaggttgcagtgagccgagat i rheMac3.chr13 C 0 C 0 s macFas5.chr12 115015870 371 - 132586672 agacaagggaaagttaccaaggtt----agttagtagacatagaatgctct-aagttagtaagttcatgctaagttatgcaagtagaagagatcatagataactaaatagcagggaaactgcaaaaAGACTAGCAGAAGTTggctgtatgtggtggctcactcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggtggattacgaggtcaggagttcaagatcagcctgtccaacatgattaaaccctgtctctaccaaaaatataataaattagccaggcatggtggcaggcacctgtaatcccagctacttgagaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgagccgagat i macFas5.chr12 C 0 C 0 s papAnu2.JH685195 10116 366 - 38368 AGACAAGGGAAAGTTACCAAGGTT----AGTC----GACACAAAATGCTTT-AAGTTAGTAAGTTCATGGTAAGTTATGCAAGTAGAAGAGATCATAGATAACTAAGTAGCAGGGAAACTGCAAAAAGTCTAGTAGAAgttggccaggcgtagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggtggatcacgagatcaggagttcaagaccagcctgtccaacatgatgaaaccccgtctctaccaaaaatataataaattaggcaggcatggtggctagcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaatccagga-gcggaggttgcagtgagccgagat i papAnu2.JH685195 C 0 N 0 a score=67729.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283654 62 + 478999 cgtgccactgcactccagcctaggcaacagag-tgagactc-tgtctc--aaaaaaaaaaaaaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 124818 60 + 413329 cgtgccactgcactccagcctaggcaacagag-tgagact---gtctc--aaaaaaaaaaaaaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7206379 66 + 72422247 cgcgccactgcactccagcctaggcaacagagttgagactcttgtttccaaaaaaagaaaaaaaaa i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 193479 62 + 1200634 tgcgccactgcactccagcctaggcaacagag-tgagactc-tgtctc--aaaaaaaaagaaaaaa i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr13 119427440 62 + 137160470 cacgccactgcactacagcccagacaacagag-taagactc-tgtctc--aacaaaaaaaaaaaaa i rheMac3.chr13 C 0 N 0 s macFas5.chr12 115016241 62 - 132586672 cgtgccactgcactccagcctaggcaacagag-tgagactc-tgtctc--aaaaaaaagaaagaaa i macFas5.chr12 C 0 I 4 a score=19111.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283716 34 + 478999 aaaaaaGACTAGCAGAAGCACATCAGTTGTTACT s panTro4.chrUn_GL393519 124878 31 + 413329 aaa---GACTAGCAGAAGCACATCAGTTGTTACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7206445 28 + 72422247 aaaaaaGACT------AGCACATCAGTTGTTACT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 193541 29 + 1200634 a-----GACTAGCAGAAGCACATCAGTTATTATT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr12 115016307 34 - 132586672 gaaaaaGACTAGCAGAAGCACATCAGTTATTATT i macFas5.chr12 I 4 N 0 a score=17373.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283750 33 + 478999 ATTCTGTAGCAAGTTCAACCAGAATGTATCTCT s panTro4.chrUn_GL393519 124909 33 + 413329 ATTCTGTAGCAAGTTCAACCAGAATGTATCTCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7206473 33 + 72422247 ATTCTGTAGGAAGTTCAACCAGAATGTATCTCT i ponAbe2.chrUn C 0 C 0 s nomLeu3.chr4_GL397525_2_random 193570 33 + 1200634 ATTCTGTAGGAAGTTCAACCAGAATGTATTTCT i nomLeu3.chr4_GL397525_2_random C 0 N 0 a score=902.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283783 4 + 478999 CTGC s panTro4.chrUn_GL393519 124942 4 + 413329 TTGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chrUn 7206506 4 + 72422247 TTGC i ponAbe2.chrUn C 0 N 0 a score=26745.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283787 19 + 478999 tgttctcacagcaaaaatt s panTro4.chrUn_GL393519 124946 19 + 413329 tgttctcacagcaaaaatt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18620887 19 + 99152023 tgttctcacagcaaaaatt i ponAbe2.chr15 N 0 C 0 s macFas5.chr7 88197398 19 - 171882078 tgttctcacagcaaaaatt i macFas5.chr7 N 0 C 0 s papAnu2.chr7 85318388 19 - 162156779 tgttctcacagcaaaaatt i papAnu2.chr7 N 0 C 0 s chlSab2.chr29 3534833 19 - 24206276 tgttctcacagcaaaaatt i chlSab2.chr29 N 0 C 0 a score=3646631.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 283806 2063 + 478999 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccttcatttgatcattacacaatgtatacatgttttgaagcatcatagtttatcccataaatatatataattagtatgtcaattaaaat--taaaa---------AATAACGATAGCAACAACTATTACTCCCTTATATTACACTACTACAAGCGCTTTGTTTATAGCTTATATCCTTGGGAACCTTTTTTCTATTGCATATAGAATGTATGATACAGTCTGTGCTAAATGTCATAGAGCTTTTACAAGCCAGATAAAATTTGAGTGTACAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAATGTAGAGCCCATCTCAGGAAATTAGGATATAAAAATTTTCCAGCAAATGATTTGTAAGAAGTCATGAGTTTTATGGGGAATAACTGGTTAGCCTGGTAACAGATCTAGTGAGTTCTGAAGAATCATATATCCCATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTATAATGCATTGTGGGTAGCTGTTGCAGCCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCACTGACCTTATATTATTAAGTGTGTACAATATAGATTTAAAGGGTAGACATTGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTCAAGAATATGTACCGTATTCTCTCAACTGACAGTAATTAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGCTCATTTTGAAGAACTTGTGAAAAGCTAGGCCTTGGTGCCAAGGATAGAGAGAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGACacctctttggaggaaaatgtggccatattgaccaaaatttaaagtgtgcacacttaggccaggtgtggtggctcacgcctataatccctgcactttgggaggccgaggtgggtggatcacttcaggtcaggagtttgaggcccgcctggccaacatggtgaaatcccatctctactaaaaatgcaaaaatgagccgggtgtgatggcaggtgcctgtagtcccagctattcaggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagctgaaatcatgccactgtattccagcctgggtggcagagagagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaa-------------aagtgcacagtttatgactcagcattttcacttt-cagaatatttctttcagatattgtgtattttgcaaatttctacataaattaataagctttcagcattatttgtcatagctgaatcttggaaacaaatac--gtctattaataggtgactgaatcaataaatcatgttacatttagagaatgaaaaa--ctacacagccattaagaattaagatagatgtatacattttgataagaagcaatatgtccaagaagtagttctaagtgaaa----taaagtacagaaatgtgtgattagtacgctataatttatttaaaaaC--GTGCTTacaaagtaatgataaatgattgaggtgacagatatcccaattaccttgatttggtcactacatactatatacctgtatcaaaataacacgtgtaccttgtaaatatgtaaaactattacctgttaataTTATGCATTATGTAAATTAAAAATTAAATGCCCAAAGCCATGTGTTTATACACATATTTGTAAATGCACTGATTATCTATATGTGACTTAGGAATAGCAGTTTTCTTTTAGAAGAACTGAGGGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTACTGTCTAAAAATACTATTCAATATTTATTT-------TTTTCTATGTGGCTGGATTACTTAAGTAAAAGAAAGCTTTGAAGGCAAAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGAACATACTAAAGTAAAAAAATCTGTCCTCACATTCTTTTCATTTCTTCCTATAAGCAATAAAAGAGATTCTTACCCTTTTGTTCAAATTGAAATCTCCCCCTTCACATTCTGTATT s panTro4.chrUn_GL393519 124965 2064 + 413329 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccttcatttgatcattacacaatgtatacatgtattgaagcatcatattttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaat--taaaa---------AATAATGATAGCAACAACTATTACTCCCTTATATTACACTACTACAAGCGCTTTGTTTATAGCTTATATCCTTGGGAACCTTTTTTCTATTGCATATAGAATGTATGATACAGTCTGTGCTAAATGTCATAGAGCTTTTACAAGCCAGAAAAAATTTGAGTGTACAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAATGTAGAGCCCATCTCAGGAAATTAGGATATAAAAATTTTCCAGCAAATGATTTGTAAGAAATCATGAGTTTTATGGGGAATAACTGGTTAGCCTGGTAACGGATCTAGTGACTTCTGAAGAATCATATATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTATAATGAATTGTGGGTAGCTGTTGCAGCCTTCTCCTACTCCATTTCTTTATTTCATGTGGTCACTGACCTTATATTATTAAGTGTGTACAATATAGATTTAAAGGGTAGACATTGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTCAAGAATATGTACCGTATTCTCTCAACTGACAGTAATTAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACTATAACGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGCTCATTTTGAAGAACTTGTGAAAAGCTAGGCCTTGGTGCCAAGGATAGAGAGAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGACacctctttggaggaaaatgtggccatattgaccaaaatttaaagtgtgcacacttaggccaggtgtggtggctcacgcctataattcctgcactttgggaggccgaggtgggtggatcacttcaggtcaggagtttgaggcccgcctggccaacatggtgaaatcccatctctactaaaaatgcaaaaatgagccgggtgtgatggcaggtgcctgtagtcccagctattcaggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagctgaaatcgtgccactgtattccagcctgggcggcagagagagactccgtctcaaaaaaaaaaaaa-----------------gtgcacagtttatgactcagcattttcacttt-cagaatatttctttcagatattgtgtattttgcaaatttctacataaattaataagctttcagcattatttgtcatagctgaattttggaaacaaatac--gtctattaataggtgactgaatcaataaatcatgttacatttagagaatgaaaaa--ctacacagccattaagaattaagatagatgtatacattttgataagaagcaatatgtccaagaagtagttctaagtgaaa----taaagtacagaaatgtgtgattagtacgctataatttatttaaaaaT--GTGCTTacaaagtaatgataaatgattgaggtgacagatatcccaattaccttgatttggtcactacatactatatagctgtatcaaaataacacgtgtaccttgtaaatatgtaaaactattacgtgttaaCATTATGCATTATGTAAACTAAAAATTAAATGCCCAAAGCCATGTGTTTATACACATATTTGTAAATGCACTGATTATCTATATGTGACTTAGGAATAGCAGTTTTCTTTTAGAAGAACTGAGGGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTATTGTCTAAAAATACTATTCaatatttatttatttattttttCTATGTGGCTGGATTACTCAAGTAAAAGAAAGCTTTGAAGGCAAAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAAGAAGATTGTTATTGATGATTGGAACATACTAAAGTAAAAAAATCTGTCCTCACATTCTTTTCATTTCTTCCTATAAACAATAAAAGAGATCCTTACCCTTTTGT-CAAATTGAAATCTCCCCCTTCACATTCTGTATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18620906 2068 + 99152023 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccttgatttgatcgttacacaatgtatacacgtactgaagcatcatattttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaataaaaAAA---------AATAATGACAGCAACAACTATTACTCCCTTATATTACACTACTACAAGCGCTTTGTTTATAGCTTATATCCTTGGGAACCTTTTTTCTATTGCATATAGAATGTATGATACAGTCTGGGCTAAATGTCATAGAGATTTTACAAGTCAGATAAAATTTGAGTGTACAGTTAAGAGGTTAAAAAGCCATCTGCCACAATGTAGAGCCCATCTCAAGAAATTAGGATATAAAAATTCTCCAGCAAATGATTTGTAAGAAGTCATGAGTTTTATGGGGAATAACTGGTTAACCTGGTAACAGATCTAATGAGTTCTGAAGAGTCATGTATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTATAATGGATTGTGGGTAGTTGGTGCAACCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCATTAACCTTATATTATTAAGTATGTACAATATAGATTTAAAGGGTAGACATTGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTCAAGAATATGTACCGTATTCTCTCAACTGACAGTAATTAATGTCATTGATGTGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGCTCATTTTGAAGAACTTGTGAAAAGCTAGGCCTTGGTGCCAAGGTTAGAGAGAAAAGCAACAGCAATGAGGAAAGCACTGacaactttttggagggaaatgtggccatattgaccaaaatttaaagtgtgcacacttaggccaggtgcggtggctcatgcctataatccctgcactttgggaggccgaggtggatggatcacttgaggtcaggagtttgaggcccgcctggcc-acatggtgaaatctcttctctactaaaaacac-aaaatgagctgggtgtgatggcaggtgcctgtagtcccagctattcaggagactgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagccgagatcgcgccactgtactccagcctgggcgacagagagagactccgtttttaaaaaaaaa--------------------gtgcacactttatgactcagcattttcactttccagaatatttctttcagatattgtatattttgcaaatttgtacatatattaataagctttcagcattgtttgtcatagctgaatcctggaaacaaatacatgtctattaataggtgactgaatcaataaatcatgttacatttagagaatgaaaaa--ctacacagccattaagaattaagatagatgtatacattttgatgagaagcaatatgtccaacaagtagttctaagtgaaataattaaagtacagaaaagtgtgattagtacactataatttatttaaaaaCATGTGCTTacaaattaatgataaatgattgaggtgacagatatcccaattacctagatttggtcattacatactatatagctgtatcaaaataacacatgtaccttgtaaatatgtaaaactattgcatgttaataTTATACATTATGTAAATTAAAAATTAAATGCCCAAAACCATGTGTTTTTACATATATTTGTAAAGGCACTGATTATCTATACGTGACTTAGGAACAGCAGTTTTCTTTCAGAAGAACTGAGGGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTATTGTCTAACAATACTATTCaatatttatttatttattttttCTATGTGGATGGATTACTTAAGTAAAAGAAAGCTTTGGAGGCAAAGCTAGTGTAC--TGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAGTAGTATGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGAAGATACTAAAGTGAAAGAATCTGTCCTCACATTCTTTTCATTTCTTCCTA-AAACAATAAAAGAGATTCTTACCCTTTTGTTCAAATTGAAATCTCCCCCTTCACATTCTGTATT i ponAbe2.chr15 C 0 M 702 s rheMac3.chr7 87919848 2091 - 170124641 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccctgatttgatcattgcacaatgtatacatgtactgaagcatcacattttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaat--taaaaAGTAATAATAATAATGATCGCAATAACTATAACTCCCTTATATTACACTACTGCAAGACCTTTGTTTATAGCATATATCCTTGGGAGCCTTTTTTCTGTGTCATATAGTATGTGTGATACAGTCTGTGCTAAATGTCATAGAGCTTCTACAAGCCAGATAAAACTTGAGTGTATAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAACATAGAGCCCATCTCAAGAAATTGGGATATAAAAGTTCTGCAGCAAATGATTTGTATGAAGTCATGAGTTATATGGGGAATAACTGGTTGACCTGGTAACAGATCTAGTGAGTTCTGAAGAATCATGTATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTGTAATGGATTGTGGGTAGTTGGTGCAGCCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCATTAACCTTTTATTATTAAGTGTGTACAATATAGATTTAAAGGGTAGACAATGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTC--GGATATGTACCATATTATCTCAACTGACAGTAATTAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGTTCATTTTGAAGAACTAGTGAAAAGTTAGGCCTTGTTGCCAAGAATAGAGAGAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGATacctctttggagggaaatgtggccatatagaccaaaatttaaagtgtgcatacttaggccaggtgcggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggcggatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaatcccatttctactaaaaacacaaaaatgagccgggagtgatggcaggtacctgttgtcccagctattcagaaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagccgagatcgcaccactatactccagccccggtgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagtgcatactttatgactcagcattttcactttccagaatatttctttcagatattgtatattttgcaaatttctatgtatattaataagctttcagcattgtttttcatagctgaatcctggaaacaaatacgtgtctattaataggtgactgaatcaataaatcgtgttacattcagagaataaaaaaacccccccagccattaagcattaagatagatgtatacattttgataagaagcaatatgtccaagaagtggttctaagtgaaataattaaagtacagaaaagtgtgattagtatgctataatttatttaaaaaCATGTGCTTacaaagtaatgataaatgtttgaggtgaaagatatcccaattacccagatttgggcattacatactatatacctgtgtcaaaataacacatgtaccttataaatatgtaaaactattatgtgttaataTTATGCATTATGTAAATTAAAAATTAAGTGCCAAAATCC-TGTGTTTATACATATATTTTTAAATGCACTGATTATCTGTATGTGACTTAGGAACAGCAGTTTTCTTTCAGAAGAACTGAGGGTCTTGGATGGGAGAGC------ATTGTGTAAAAATACTATTCaatatttatttatttattttttCTATGTGGGTGGATTACTTAAGTGAAAGAAAGCTTTGGAGGCAGAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGGACACACTAAAGTAAAATAATCTGTCCTCGTATTCTTTTCATTTCTTCCTATAAA-AATAAAAGAGATTCTTACCCTTTTGTTCAAATTTAAATCT-CCCCTTCACGTTCTGTATT i rheMac3.chr7 N 0 C 0 s macFas5.chr7 88197417 2088 - 171882078 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccctgatttgatcattgcacaatgtatacatgtactgaagcatcacattttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaat--taaaaAGTAATAATAATAATGATCGCAATAACTATAACTCCCTTATATTACACTACTGCAAGACCTTTGTTTATAGCATATATCCTTGGGAGCCTTTTTTCTGTGTCATATAGTATGTATGATACAGTCTGTGATAAATGTCATAGAGCTTCTACAAGCCAGATAAAACTTGAGTGTATAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAACATAGAGCCCATCTCAAGAAATTGGGATATAAAAGTTCTGCAGCAAATGATTTGTATGAAGTCATGAGTTATATGGGGAATAACTGGTTGACCTGGTAACAGATCTAGTGAGTTCTGAAGAATCATGTATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTGTAATGGATTGTGGGTAGTTGGTGCAGCCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCATTAACCTTTTATTATTAAGTGTGTACAATATAGATTTAAAGGGTAGACAATGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTC--GGATATGTACCATATTATCTCAACTGACAGTAATTAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGTTCATTTTGAAGAACTAGTGAAAAGTTAGGCCTTGTTGCCAAGAATAGAGAGAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGATacctctttggagggaaatgtggccatatagaccaaaatttaaagtgtgcatacttaggccaggtgcggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggcggatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaatcccatttctactaaaaacacaaaaatgagccgggcgtgatggcaggtacctgttgtcccagctattcagaaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagccgagatcgcaccactatactccagccccggtgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-------aagtgcacactttatgactcagcattttcactttccagaatatttctttcagatattgtatattttgcaaatttctatgtatattaataagctttcagcattgtttttcatagctgaatcctggaaacaaatacgtgtctattaataggtgactgaatcaataaatcatgttacattcagagaataaaaaa--cttcacagccattaagcattaagatagatgtatacattttgataagaagcaatatgtccaagaagtggttctaagtgaaataattaaagtacagaaaagtgtgattagtatgctataatttatttaaaaaCATGTGCTTacaaagtaatgataaatgtttgaggtgaaagatatcccaattacccagatttgggcattacatactatatacctgtgtcaaaataacacatgtaccttataaatatgtaaaactattatgtgttaataTTATGCATTATGTAAATTAAAAATTAAGTGCCAAAATCC-TGTGTTTATACATATATTTTTAAATGCACTGATTATCTGTATGTGACTTAGGAACAGCAGTTTTCTTTCAGAAGAACTGAGGGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTATTGTGTAAAAATACTATTCAAtatttatttatttattttttctatGTGGGTGGATTACTTAAGTGAAAGAAAGCTTTGGAGGCAGAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGGACACACTAAAGTAAAATAATCTGTCCTCGTATTCTTTTCATTTCTTCCTATAAA-AATAAAAGAGATTCTTACCCTTTTGTTCAAATTTAAATCT-CCCCTTCACGTTCTGTATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85318407 2081 - 162156779 ataaatgtttgaggtgatggatatgctaattaccctgatttgatcgttacacaatgtatacatgtactgAAGCGTCACAttttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaat--taaaaagtaataataataatgatcgcaataaCTATAACTCCCTTATATTACACTACTGCAAGACCTTTGTTTATAGCATATATCCTTGGGAGCCTTTTTTCTGTGTCATATAGTATGTATGATACAGTCTGTGCTAAATGTCATAGAGCTTCTACAAGCCAGATAAAACTTGAGTGTACAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAACATAGAGCCCATCTCAAGAAATTAGGATATAAAAGTTCTGCAGCAAATGATTTGTATGAAGTCATGAGTTATATGGGGAATAACTGGTTGACCTGGTAACAGATCTAGTGAGTTCTGAAGAATCATGTATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTGTAATGGATTGTGGGTAGTTGGTGCAGCCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCATTAACCTTTTATTATTAAGTGTGTACAATATAGATTTAACGGGTAGACAATGGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTC--GGATATGTACCATATTATCTCAACTGACAGTAATTAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGTTCATTTTGAAGAACTAGTGAAAAGTTAGGCCTTGGTGCCAAGAATAGAGAGAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGATACCTCTTTGGAGGGAAATGTGGCCATATAGACCAAAATTTAAAGTGTGCAtacttaggccaggtgcggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggccgaggtgggcggatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaatcccatttctactaaaaacacaaaaatgagccgggcgtgatggcgggtacctgttgtcccagctattcagaaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagccgagatcgcaccactgtactccagccccggtgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaa--------------aagtgcgcaCTTTATGACTCAGCATTTTCACTTTCCAGAATATTTCTTTCAGATATtgtatattttgcaaatttctATGTATATTAATAAGCTTTCAGCATTGTTTTTCATAGCTGAATCCTGGAAACAAATATGTGTCTATTAATAGGTGACTGAATCAATAAATCATGTTACATTCAGAGAATAAAAAA--CTTCACAGCCATTAAGCATTAAGATAGATGTATACATTTTGATAAGAAGCAATATGTCCAAGAAGTGGttctaagtgaaataattaaAGTACAGAAAAGTGTGATTAGtatgctataatttatttaaaaacatgtgcTTACAAagtaatgataaatgtttgaggtgaaagatatcccaattacccagATTTGGGCATTACATACTATATACCTGTGTCAAAATAACACATATaccttataaatatgtaaaactattaTGTGTTAATATTATgcattatgtaaattaaaaattaagtgcCAAAATCC-tgtgtttatacatatatttttaaatgcactgaTTATCTGTATGTGACTTAGGAACAGCAGTTTTCTTTCAGAAGAACTGAGGGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTATTGTGTAAAAATactattcaatatttatttatttattttttcgatGTGGGTGGATTACGTAAGTCAAAGAAAGCTTTGGAGGCAGAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGGACACACTAAAGTAAAATAATCTGTCCTCgtattcttttcatttcttcctataaa-aataaaagagattctTACCCTTTTGTTCAAATTTAAATCT-CCCCTTCACGTTCTGTATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3534852 2069 - 24206276 ataaacgtttgaggtgatggatatgctaattaccctgatttgatcgttacacaatgtatacatgtactgaagcatcacattttatcccataaatatgtataattagtatgtcaattaaaaT--GAAAAAG---TAATAATAATGATCGCAATAACTATAACTCCCTTATATTACATTACTGCAAGACCTTTGTTTATAGCATATATCCTTGGGAGCCTTTTTTCTGTGTCATATAGTATGTATGATACAGTCTGTGCTAAATGTCATAGAGCTTCTACAAGCCAGATAAAACTTGAGTGTATAGTTAAGAGGTCAAAAAGCCATCTGCCACAACATAGAGCCCATCTCAAGAAATTAGGATATAAAAGTTCTCCAGCAAATGATTTGTATGAAGTCATGAGTTATATGGGGAATAACTGGTTGACCTGGTAACAGATCTAGTGAGTTCTGAAGAATCATGTATCC-ATCTATGCCCATATTGAAATAGTGGCAGTGCTAGGTTTGTTCTGTAATGGATTGTGGGTAGTTGGTGCAGCCTTCTCCTACTCCATATCTTTATTTCATGTGGTCATTAACC-TTTATTATTAAGTGTGTACAATGTAGATTTAAAGGGTAGACAATCGGTCACCTTTGATGAAAGAGTCTTACTTC--GGATATGTACCATATTATCTCAACTGACAGTAATGAATGTCACTGATATGGACAGTATTCATATCACCATAATGAAGCCATAAAACATTGTGGCTAAAATAATTTGTGAAGCTCATTTTGAAGAACTAGTGAAAAGTTAGGTCTTGGTGCCAAGGATAGAGACAAAAGCAACAGTAATGAGGAAAGCACTGATacctcttcggagggaaatgtggccatattgactaaaatttaaagtgtgcatacttaggctgggtgcggtggctcacgcctataatcccagcactttgggaggccgaggtgggtagatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggtcaacatggtgaaatcccatctctactaaaaacacaaaaatgagccgggcgtgatggcgggtacctgttgtcccagctattcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggcggaggttgcagtgagctgagatcgcaccactgtactccagccccggcgacagagcgagactccgtctcaaacaaaaaaaa----------------aagtgcacactttatgactcagcattttcactttccagaatatttctttcagatattgtatattttgcaagtttctatgtatattaataagctttcagcgttgtttttcatagctgaatcctggaaacaaatacatgtctattaataggtgactgaatcaataaatcatgttacattcagagaataaaaaa--cttcacagccattaagcattaagatagatgtatacattttgataagaagcaatatgtccaagaagtggttctaagtgaaataattaaagtacagaaaagtgtgattagtatgctataatttatttaaaaaCATGTGCTTacaaagtaatgataaatgtttgaggtgaaagatatcccaattacccagatttgggcattacatactatatacctgtatcaaaataacacatgtaccttataaatatgtaaaactattatgtgttaataTTATGCATTATGT-------AAATTAAGTGCCAAAATCCATGTGTTTATACATATATTTTTAAATGCACTGATTATCTGTATGTGACTTAGGAACAGCAGTTTTCTTTCAGAAGAACTGAGCGTCTTGGGTGGGAGAGCTATCTTATTGTGTAAAAATGCTATTCAAtatttatttatttattttttctatgtaGGTGGATTACTTAAGTGAAAGAAAGCTTTGGAGGCAGAGCTAGTGTACTGTGTGTTTCACTTAGGACATCACTTAAGACAAACCAATAGTTTGACACAGGAAGATTGTTATTGATGATTGGGACACACTAAAGTAAAATAATCTGTCCTCATATTCTTTTCATTTCTTCCTATAAA-AATAAAAGAGATTCTTACCCTTTTGTTCAAATTTAAATCT-CCCCTTCACGTTCTGTATT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 a score=454696.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 285869 355 + 478999 CCATCCTCTACCACAGTTACAGGGAGCGAGTACCTTTGCTTACCACCTTTCTCTCCTTTCCCTGCTCAACcttaccttacaaaaacaaaaacataattcttccttgatctaacatcccccttcagtttt--catctctctcctctcctttagccaagccccatgtctataccggttctctgtatctctcattgtcacttcactcctcagcctacagcaatctggtttccttctccacaatgtctctgaaattttgccaaagtcaccagtgatttctatgtacctaaatcaaatggttacttgtaagttcgtgaattgtttgactttttagcagtgtttgaccagactgacaactctc s panTro4.chrUn_GL393519 127029 355 + 413329 CCATCCTCTACCACAGTTACAGGGAGCGAGTACCTTTGCTTACCACCTTTCTCTCCTTTCCGTGCTCAACcttaccttacaaaaacaaaaacataattcttccttgatctaacatcccccttcagtttt--catctctctcctctcctttagccaagccccatgtctataccggttctctgtatctctcattgtcacttcactcctcagcctacagcaatctggtttccttctccacaatgtctctgaaattttgccaaagtcaccagtgatttctatgtacctaaatcaaatggttgcttgtaagttcgtgaattgtttgactttttagcagtgtttgaccagactgacaactctc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87921939 355 - 170124641 TCATCCTCTA-CAAAGTTACAGGGAGCAAGTACCTTTGCTT-CCACCTTTTTCTCTTTTCCCTGCTCAACcttaccttacaaaaacaaaaatataattcttccttgatctaacatcccccttcagttttaacatctctctcctctcctttagccaagacccatgtctataccggttctctctatctctcagtgtcacttcactcctcagcctacagcaatctggcttctttctccacaacatcgctgaaattttgccaaagtcatcagtgatttctatgtacctaaatcaaatggtcacttgtaagtttgtgaattatttgactttttagcagcatttgactagacggactactctc i rheMac3.chr7 C 0 I 30 s macFas5.chr7 88199505 355 - 171882078 TCATCCTCTA-CAAAGTTACAGGGAGCAAGTACCTTTGCTT-CCACCTTTTTCTCTTTTCCCTGCTCAACcttaccttacaaaaacaaaaatataattcttccttgatctaacatcccccttcagttttaacatctctctcctctcctttagccaagacccatgtctataccggttctctctatctctcagtgtcacttcactcctcagcctacagcaatctggcttctttctccacaacatcgctgaaattttgccaaagtcatcagtgatttctatgtacctaaatcaaatggtcacttgtaagtttgtgaattatttgactttttagcagcatttgactagacggactactctc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85320488 351 - 162156779 TCATCCTCTA-CACAGTTACAGGGAGCAAGTACCTTTGCTt-ccacctttttctcttttccctgctCAACCTTaccttacaaaaacaaaaatataattcttcTTTGATCTAACATCCCCCTTCAGTTTTAacatctctctcctctcctttagCCAAGACCCATGTCTATACCGGTTCTCTCTATCTCTCAGTGTCACTTCACTCCTCAGCCTACAGCAATCTGGCTTCTTTCTCCACAACATCGCTGAAATTTTGCCAAAGTCATCAGTGATTTCTATGTACCTAAATCAAATGGTCACTTGTAAGTTTGtgaattatttgactttttagcAGCATTTGACTA----GACTACTCTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3536921 355 - 24206276 TCATCTTCTA-CACAGTTACAGGGAGCAAGTACCTTTGCTT-CCACCTTTTTCTCTTTTCCCTGCTCAACcttaccttacaaaaacaaaaatataattcttccttggtctaacatccctcttcagttttaacatctctctcctctcctttagccaagacccatgtctataccggttctctctatctctcagtgtcacttcactcctcagcctacagcaatctggcttccttctccacaacatcgctgaaattttgctaaagtcatcagtgatttctatgtacctaaatcaaatggtcacttgtaagtttgtgaattgtttgactttttagcagcatttgactagactgactactctc i chlSab2.chr29 C 0 I 4 e ponAbe2.chr15 18622974 702 + 99152023 M a score=691.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 286224 6 + 478999 taaatg s panTro4.chrUn_GL393519 127384 6 + 413329 taaatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88199860 6 - 171882078 tcATAG i macFas5.chr7 C 0 I 24 s papAnu2.chr7 85320839 4 - 162156779 --AAAA i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s chlSab2.chr29 3537280 6 - 24206276 tGAGAG i chlSab2.chr29 I 4 I 20 e ponAbe2.chr15 18622974 702 + 99152023 M e rheMac3.chr7 87922294 30 - 170124641 I a score=148709.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 286230 129 + 478999 aaaattcaa--agaaaatcccattttctttgcttattttcttctg-ttttttttttccctctttatttacttttcctgtttcttttttggtattttgcttctccacctatccactatatatttatttgtgct s panTro4.chrUn_GL393519 127390 129 + 413329 aaaattcaa--agaaaatcccattttctttgcttattttcttctg-tttttttttcccctctctatttacttttcctgtttcttttttggtattttgcttctccacttatccactatatatttatttgtgct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87922324 130 - 170124641 aaaattgaattgaaaaattcaattttctttgcttattttcttctg--tttttttccccctctctacttaattttcctatttctattttggtattttgctactccacctatccactatatatttatttgtgct i rheMac3.chr7 I 30 C 0 s macFas5.chr7 88199890 130 - 171882078 AAAATTGAATTGAAAAATTCAATTTTCTTTGCTTATTTTCTTCTG--TTTTTTTCCCCCTCTCTACTTAATTTTCCTATTTCTATTTTGGTATTTTGCTACTCCACCTATCCACTATATATTTATTTGTGCT i macFas5.chr7 I 24 C 0 s papAnu2.chr7 85320845 126 - 162156779 ------GAATtgaaaaattcaattttctttgcttattttcttctgtttttttttccccctctctacttaattttcctatttctattttGGTATTTTGCTACTCCACCTATccactatatatttatttgtgct i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s chlSab2.chr29 3537306 129 - 24206276 AAAATTGAATTGAAAAATTCAATTTTCTTTGCTTATTTTCCTCTG---TTTTTTTCCCCTCTCTACTTAATTTTCCTATTTCTTTTTTGGTATATTGCTACTCCACCTATCCACTATATATTTATTTGTGCT i chlSab2.chr29 I 20 C 0 e ponAbe2.chr15 18622974 702 + 99152023 M a score=1081395.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 286359 615 + 478999 tattatggcattgctggtggcttgacgttagactctctgctcttttctcatacatatttcttaggcagtatttcttaggaagtatatacccacttcaggtccaaatgccctttctgtgctaacagcttctaatatctaatatatctattaccctctcctgagcttgagacttttctgtccaatcgctgactggttgtctttacttggatatctcagtgacacatagttgaccatgtgtacaagtgaactcattgtgttacctcaaattttcccttcTGGGGTTTGCTATGTCACAAATTAATTACTTTTTGGAGGCAGAtttccttactgtgatatcaagagtgagt-gaaaaaagtgtctggtgaatagtagttatttcacaaatatttattgactcaaggaTTGAATCAATTAATGATACCATGTATGATAAATATCATCAAATGTATAGTACAGAACATTTTGAAACATTTAAGATATTGAAAGACAAGACACCAAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTACCTCTCTAAGGATGACTATGAATAACAAGGAAAAAGAGTTAATCaagcattaattccctgttaaatttctttctgcttaaa s panTro4.chrUn_GL393519 127519 615 + 413329 tattatggcattgctggtggcttgacgttagactctctgctcttttctcatacatatttcttaggcagtatttcttaggaagtatatacccacttcaggtccaaatgccctttctgtgctaacagcttctaatatctaatatatctattaccctctcctgagcttgagacttttctgtccaatcgctgactggttgtctttacttggatatctcagtgacacatagttgaccatgtgtacaagtgaactcattgtgttatctcaaattttcccttcTGGGGTTTGCTATGTCACAAATTAATTACTTTTTGGAGGCAGAtttccttactgtgatatcaagagtgagt-gaaaaaagtgtctggtgaatagtagttatttcacaaatatttattgactcaaggaTTGAATCAATTAATGATACCATGTATGATAAATATCATCAAATGTATAGTACAGAACATTTTGAAACATTTAAGATATTGAAAGACAAGATACTGAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTACCTCTCTAAGGATGACTATGAATAACAAGGAAAAAGAGTTAATCaagcattaattccctgttaaatttctttctgcttaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18623676 600 + 99152023 TATTATGGCATTACTGGTAGCTTGACAttagactctctgctcttttctcatgca--------------tatttcttaggaagtatatacccacttcaggtccaaatgccctttctgcactaacagcttctaatgtctaatatatatattaccctctcctgagcttgagacttttctgtccaatcgctgactggttgtctttacttggatatctcagtgacacataattgaccatgtgtacaagtgaactcatcgtgttacctcaaattttcccttcTGGGGTTTGCTATGTCACAAATTAATTACTTTTTGGAGGCAGATTTCCTTACTATGATATCAAGAGTGAGT-GAAAAAagtgtctggtgaatagtagttatttcacaaatatttattgactcaaggaTTGAATCAATTAATGATACCATGTATGATAAATATCATCAAATGTATAGTACAGAGCATTTTGAAACA-TTAAGATATTGAAAGACAAGACACTGAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTACCTCTCTAAGGATGACTATGAATAACAAGGAAAAAGAGTTAATCaagcattaattccctgttaaatttctttctgcttaaa i ponAbe2.chr15 M 702 C 0 s rheMac3.chr7 87922454 598 - 170124641 tattatggcattactggtggcttgacattagactctcttctcttttctcatacg--------------tatttcttaggcagtat-tacccacttcaggtccaaatgccctttctgtgctaacagcttctaatatctaatatatctattacccactcctgagcttgagacttttatgtccaattgctgaccggttgtctttacttggatatctcagtgacacatagttcaccatgtgtacaagtgaactcatcatgttacctcaaattttcccttctgcggtttgctatgtcacaaattaatTACTTTTTGGAGGAAGAtttccttactgtgatatcaaaagtgagt-gaaaaaagtgtctggtgaatagcagttattccacaaatatttattgactcaaggaTTGAATGAATTAATGATACCATCTATGATAAATATAGTCAAATGTATAGTACAGAACATTTTGAAACA-TTAAGATATTGAAAGACAAGATACCAAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTA-CTTTCTAAGGATGAATATGTATAACAAGGAAAAAGGGTGAATCaagcattaattccctgttaaatttctttctgcttaaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88200020 598 - 171882078 TATTATGGCATTACTGGTggcttgacattagactctcttctcttttctcatacg--------------tatttcttaggcagtat-tacccacttcaggtccaaatgccctttctgtgctaacagcttctaatatctaatatatctattacccactcctgagcttgagactgttatgtccaattgctgaccggttgtctttacttggatatctcagtgacacatagttcaccatgtgtacaagtgaactcatcatgttacctcaaattttcccttctgcggtttgctatgtcacaaattaatTACTTTTTGGAGGAAGAtttccttactgtgatatcaagagtgagt-gaaaaaagtgtctggtgaatagcagttattccacaaatatttattgactcaaggaTTGAATGAATTAATGATACCATCTATGATAAATATAGTCAAATGTATAGTACAGAACATTTTGAAACA-TTAAGATATTGAAAGACAAGATACCAAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTA-CTCTCTAAGGATGAATATGTATAACAAGGAAAAAGGGTGAATCaagcattaattccctgttaaatttctttctgcttaaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85320971 596 - 162156779 tATTATGGCATTACTGGTGGCTTGACATTagactctcttctcttttctcatacG--------------TATTTCTTAGGCAGTAT-TACCCACTTCAGGTCCAAATGCCCTTTCTGTGCTAACAGCTTCTAATATCTAATATATCTATTACCCACTCCTGAACTTGAGACTTTTATGTCCAATTGCTGACCGGTTGTCTTTACTTGGATATCTCAGTGACACATAGTTCACCATGTGTACAAGTGAACTCATCATGTTACCTTAAATTTTCCCTTCTGTGGTTTGCTATGTCACAAATTAATTACTTTTTGGAGGAAGATTTCCTTACTGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAAAAAGTGTCTGGTGAATAGCagttattccacaaatatttattgactcaaggattgaatgaattaatgatacCATCTATGATAAATATAATCAAGTGTATAGTACAGACcattttgaaaca-ttaaaatattgaaagacaAGATACCAAAAGTGCAGATTATCCTAAT---GTAAAATTATGCTA-CCCTCTAAGGATGAATATGAATAACAAGGAAAAAGGGCGAATCAAGCATTAATTCCCTGTTAAAtttctttctgcttaaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3537435 598 - 24206276 TATTATGGCATTACTGGTggcttgacattagactctcttctcttttctcatacg--------------tatttcttaggcagtat-tacccacttcaggtccaaatgccctttctgtgctaacagcttctaatatctaatatatctattacccactcctgagcttgagacttttatgtccaactgctgaccggttgtctttacttggatatcttagtgacacatagttcaccatgtgtacaagtgaactcatcatgttacctcaaattttcccttctgcggtttgctatgtcacaaattaatTACTTTTTGGAGGAAGAtttccttactgtgatatcaagagtgagt-gaaaaaagtgtctggtgaatagtagttattccacaaatatttattgactcaaggaTTGAATGAATTAATGATACCATCTATGATAAATATAATCAAATGTATAGTACAGACCATTTTGAAACA-TTAAGATATTGAAAGACAAGATACCAAAAGTGCAGATTATCCTAATGTGGTAAAATTATGCTA-CTCTCTAAGGATGAATATGAATAACAAGGAAAAAGGGTGAATCAAGCATTAATTCCCTGTTAAATTTCTTTCTGCTTAAA i chlSab2.chr29 C 0 I 245 a score=428951.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 286974 253 + 478999 atatttggagttg-tttttctatcttgtactgaactctgaTATGTATAGCAATGTATGTGTGAAATCCTGTGATTCAAGGGTAGAAACTAAATTAAAAAAAGGGAAGAATCAAAATTTAACAAAGTAGCT----AATCTTTCTGAGGGCAAGTTGTCAAAATTTTGGCAATGGTGTTGAGTGTATGCAGTGTATGCATGACC-----------AATATCCAGAAAGGGGTATCCTGGAAGAGGTTGTATATAGTACTCATCTTCACTCA s panTro4.chrUn_GL393519 128134 253 + 413329 atatttggagttg-tttttctatcttgtactgaactctgaTATGTATAGCAATGTATGTGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTAGAAACTAAATTTAAAAAAGGGAAGAATCAAAATTTAACAAAGTAGCT----AATCTTTCTGAGGGCAAGTTGTCAAAATTTTGGCAATGGTGTTGAGTGTATGCAGTGTATGCATGACC-----------AATATCCAGAAAGGGGTATCCTGGAAGAGGTTGTATATAGTACTCATCTTCACTCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18624276 247 + 99152023 atatttggagttg-tttttctatcctgtactgaactctgaTATGTATAGCAATGTATGTGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTATAAACTAAA-TAAAAAAAGGGAAGAATCAAAATTTAACAAACTAGCTAATAAATCTTTCTGAGGGCAAGTTGTCAAAATTTTGGCAATGGTGTTG---------AGTGTATGCATGACC-----------AATATCCAGAAAGGGGTATCCTGGAAGAGGTTGTATATAGTACTCATCTTCACTCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87923052 248 - 170124641 atatttggagttgttttttctatcctgtactgaactctgaTATGTATAGCAATGTGTATGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTAGAAACTAAA-TAGAAAAAGAGAAGAACCAAAGTTTAACAAAGTAGCTAATAAATCTTTCTGAGAGTAAGTTGTCAACATTTTGGCAATGGTGTTG---------AGTATATGCATGACC-----------AACATCCATAAAGGAGTATCCTGGAAGAGGTTGTACATAGTACTCATCTTCACTCA i rheMac3.chr7 C 0 M 171 s macFas5.chr7 88200618 247 - 171882078 atatttggagttg-tttttctatcctgtactgaactctgaTATGTATAGCAATGTGTATGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTAGAAACTAAA-TAGAAAAAGAGAAGAACCAAAGTTTAACAAAGTAGCTAATAAATCTTTCTGAGAGTAAGTTGTCAACATTTTGGCAATGGTGTTG---------AGTATATGCATGACC-----------AACATCCATAAAGGAGTATCCTGGAAGAGGTTGTACATAGTACTCATCTTCACTCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85321567 247 - 162156779 atatttggaattg-tTTTTCTATCCTGTACTGAACTCTGATATGTATAGCAATGTATATGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTAGaaactaaa-tagaaaaagagaagaaccAAAGTTTCACAAAGTAGCTAATAAATCTTTCTGAGAGTAAGTTGTCAACATTTTGGCAATGGTGTTG---------AGTATATGCATGACC-----------AATATCCAGAAAGGAGTATCCTGGAAGAGGTTGTACATAGTACTCATCTTCACTCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3538278 258 - 24206276 atatTTGGAGTTG-TTTTTCTATCCTGTACTGAACTCTGATATGTATAGCAATGTATATGTGAAATGCTGTGATTCAAGGGTAGAAACTAAA-TAGAAAAAGAGAAGAATCAAAGTTTAACAAAGTAGCTAATAAATCTTTCTGAGAGTAAGTTGTCAACATTTTGGCAGTGGTGTTG---------AGTATATGCATGACCAGAATATCCAGAATATCCATAAAGGAGTATCCTGGAAGAGGTTGTACATAGTACTCACCTTCACTCA i chlSab2.chr29 I 245 C 0 a score=48216.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 287227 42 + 478999 GTGAATTTTTGACTGAAGGAAAATTTTTAAAAAATTTATTAG s panTro4.chrUn_GL393519 128387 42 + 413329 GTGAATTTTTGACTGAAGGaaaatttttaaaaaatttattaG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18624523 42 + 99152023 GTGAATTTTTGACTGAAGGaaaattttttaaaaatttattat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88200865 42 - 171882078 GTGAATTTTTGACTAAAGGAAATTTAAAAAAAAATTTATTAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85321814 42 - 162156779 GTGAATTTTTGactaaaggaaattttaaaaaaaatttattag i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3538536 42 - 24206276 GTGAATTTTTGACTAAAGGAAATTTTAAAAAAAATTTATTAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e rheMac3.chr7 87923300 171 - 170124641 M a score=1765541.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 287269 978 + 478999 ATACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGTGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAAAAGGCAAGAAAAGATCTTTGCATCAAAGAGCTT-AAAGTATTATAGTTAATTTAAACATATAGTTGTTTTACATTCTTTTAATAAAGGTTTAATCATATGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAAtgtt---gtagttgttactctgttcaccagtattttgtttt-tcctcctgagtgcatgatagaattgtacctccctgacacttggaaattaggtgtgaccaaaagactaccctgatttgcctatcgatttctgaatagatgtaatggcatgcaattttcagatggaagttgtaagagctagtgtgtgatttgccTAAGAAGGATGGTGACATTTTACTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCA-TATGGGCAGAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGAAGACAGGGATTGAATTTATAGACATAGAGATACCTGAAACAGGGCAGCAAAATAATATTTTCAAGAACATGTTTTCTATCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTG--ATATACCACTCACATAAAGTCTTAAACGCTCTACATTTTAATTAAACTTTAATTATATCTTTTAATTTCCATGGCTGGCTTTAAATTAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAACTGGGTTTACAGCTGTATTTTCTCACTACTGTTAATTGAATGCTGATGGTAGGGATAGTTCTTACTA-TTTTTT-CCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAACTAAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTAAAGGTTTTTCTTATTTCTGCCCCACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAGGAAGGATTGTGCTTGCCGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC s panTro4.chrUn_GL393519 128429 979 + 413329 ATACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAAAAGGCAAGAAAAGATCTTTGTATCAAAGAGTTTTAAAGTATTATAGTTAATTTAAACATATAGTTGTTTTACATTCTTTTAATAAAGGTTTAATCATATGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAAtgtt---gtatttgttactctgttcaccagtattttgtttt-tgctcctgagtgcatgatagaattgtacctccctgacacttgcaaattaggtgtgaccaaaagactaccctgatttgcctatcgatttctgaatagatgtaatggcatgcaattttcagatggaagttttaagagctagtgtgtgatttgccTAAGAAGGATGGTGACATTTTATTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCA-TATGGGCAGAAAGACCAGTATTAGCAAACCCATGGAAGACAGGGATTGAATTTATAGACATAGAGATACCTGAAACAGGGCAGCAAAATAATATTTTCAAGAACATGTTTTCTGTCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTG--ATATACCACTCACATAAAGTCTTAAACGCTCTACATTTTAATTAAACTTTAATTATATCTTTTAATTTCCATGGCTGGCTTTAAATTAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAACTGGGTTTACAGCTGTATTTTCTCACTACTGTTAATTGAATGCTGATGGTAGGGATAGTTCTTACTA-TTTTTTTCCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAAC-AAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTTAAGGTTTTTCTTATTTCTGCACCACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAGGAAGGATTGTGCTTGCCGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18624565 982 + 99152023 ataCAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAAAAGGCAAGAAAAGACCTTTGCATCAAAGAGCTT-AAAGTATTATAGTCAATTTAAACATATAGTTGTTTTACATCCTTTTAATAAAGGTTTAATTATATGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAATGTtgtggtggttgttactgtgttcaccaatattttgtttt-tcctcctgagtgcatgataggattgtacctccctgacacttggaaattaggtgtgaccaaaagactaccctgatttgcctatcgatttctgaatagatgtaatcgcatgcaattttcagaatgaagttttaagagatagtgtgtgatttgccTAAGAAGGATGGTGACATTTTACTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCG-TATGGGCAGAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGGAGACAGGAATTGAATTTATAGACATAGAGATACCTGAAACAGGGCAGCAAAATAATATTTTCAAGAACATGTTTTCTATCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTG--ATATACCACTCACATAAAGTCTTAAACCCTCTACattttaattaaactttaattataacttttaattttCATGGCTGGCTTTAAATAAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAACTGGGTTTACAGCTGTATTTTCTCACTACTGTTAATTGAACGCTGATGGTATGGATAGTTCTTACTA-TTTTTTTCCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAACTGAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTTAAGGTTTTTCTTATTTCTGCACCACAGGTTTTGGCTTAAACTAAAGGAAGGATTGTGCTTGCTGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87923471 984 - 170124641 ATACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAACAGGCAAGAAAGGACCTTTGCATCAAAGAGCTT-AAAGTATTACAGTCAATTTAAACATGTAATTGTTTTACATTCTTTTAATGAATATTTAATTATGTGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAAGGTtgtggtagttgttactctgttcaccaatattttgttttattctcctgagtgcatgatagaattgtacctccctgacacttggaaattaggtgtgaccaaaagactacactgaattgcctatcgatttctgaatagatgtaatggcatgtaattttcagatggaagttttaagagctagtgtgtggtttgccTAAGAAGGATGGTGACATTTTATTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCATTATGGGCACAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGGAGACAGGAATTGAATTGATAGACATAGAGATACCTGAAACA-GGCAGTAAAATAATATTTTCAAGAACGTGTTTTCCATCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTGATATATACCACTCACAAAAAGTCTTAAACACTCTACattttaattaaactttaattataacttttaattttCATGGCCGGCTTTAAAAAAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAGCTGGGTTTACAACTGTATTTTCTCACTACTCTTAATTGAATGCTGATGGTATGGCTAGTTCTTACTA-TTTTTT-CCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATGCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAACTAAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTTAAGGTGTTTCTTATTTCTGCAACACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAAGAAGGATTATGCTTTCTGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i rheMac3.chr7 M 171 C 0 s macFas5.chr7 88200907 984 - 171882078 ATACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAACAGGCAAGAAAGGACCTTTGCATCAAAGAGCTT-AAAGTATTACAGTCAATTTAAACATGTAATTGTTTTACATTCTTTTAATGAATATTTAATTATGTGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAAGGTtgtggtagttgttactctgttcaccaatattttgttttattctcctgagtgcatgatagaattgtacctccctgacacttggaaattaggtgtgaccaaaagactacactgaattgcctatcgatttctgaatagatgtaatggcatgtaattttcagatggaagttttaagagctagtgtgtggtttgccTAAGAAGGATGGTGACATTTTATTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCATTATGGGCACAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGGAGACAGGAATTGAATTGATAGACATAGAGATACCTGAAACA-GGCAGTAAAATAATATTTTCAAGAACGTGTTTTCCATCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTGATATATACCACTCACAAAAAGTCTTAAACACTCTACATTTTAATTAAACTTTAATTATAACTTTTAATTTTCATGGCCGGCTTTAAAAAAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCGTATCCTCAACTTTCTGCAGCTGGGTTTACAACTGTATTTTCTCACTACTCTTAATTGAATGCTGATGGTATGGCTAGTTCTTACTA-TTTTTT-CCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAACTAAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTTAAGGTGTTTCTTATTTCTGCAACACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAAGAAGGATTATGCTTGCTGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85321856 987 - 162156779 atACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAACGGCCAAGAAAGGACCTTTGCATCAAAGAGCTT-AAAGTATTATAGTCAATTTAAACATGTAattgttttacattcttttaatgaatatttaattatgtGCTTACATGAGGAACAAAGGAAGCTTAAAGGTTGTGGTAGTTGTTACTCTGTTCaccaatattttgttttgttctccgGAGTGCATGATAGAATTGTACCTCCCTGACACTTGGAAATTAGGTGTGACCAAAAGACTACACTGAATTGCCTATCGATTTCTGAATAGATGTAATGGCATGTAATTTTCAAATGGAAGTTTTAGGAGCTAGTGTGTGGTTTGCCTAAGAAGGATGGTGATATTTTATTGCAGAGGATAGAAAGTGAGGGCATTATGGGCAGAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGGAGACAGGAATTGAATTGATAGACATAGAGACACCTGAAACAtggcaataaaataatattttcaagaacATGTTTTCTAtcaatatttctaatttaattttatagcaTCTAAGAAAGTGATATATACCCCTCACAAAAAGTCTTAAACaatctacattttaattaaactttaattataacttttaattttcatggctggctttaaaaaaaatttaattctacTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAGCTGGGTTTACAGCTGTATTTTCTCACTACTCTTAATTGAATGCTGATGGTATGGCTAgttcttacaattttttt-ctccctgtaaCTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGcattcaaaaaactaaaaaactccaCACTGCTTCCTACTGCTTAaggtttttcttatttctgcaaCACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAAGAAGGATTATGCTTGCTGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3538578 984 - 24206276 ATACAAAGTAAGAACCCATGGTCCTGAGGGCTTTCTAAGGTAAAAAGACAACAGGCAAGGAAGGACCTTTGCATCAGAGAGCTT-AAAGTATTACAGTCAATTTAAACACGTAATTGTTTTACATTCTTTTAATGAATATTTAATTGTGTGCTTACATGAAGAACAAAGGAAGCTTAAAGGTtgtggtagttgttactctgttcaccaatattttgttttgttctcctgagtgcatgatagaattgtacctccctgacacttggaaattaggtgtgaccaaaagactacactgaattgcctattgatttctgaatagatgtaatggcatgtaattttcagatggaagttttaagagctagtgtgtggtttgccTAAGAAGGATAGTGGCTTTTTATTGCAGA-GATAGAAAGTGAGGGCATTATGGGCACAAAGACCAGCATTAGCAAACCCATGGGAGACAGGAATTGAATTGATAGACATAGAGATACCTGAAACAGGGCAGTAAAATAATATTTTCAAGAACATGTTTTCCATCAATATTTCTAATTTAATTTTATAGCATCTAAGAAAGTGATATATACCACTCACAAAAAGTCTTAAACACTCTACATTTTAATTAAACTTTAATTATAACTTTTAATTTTCATGGCCGGCTTT-AAAAAAATTTAATTCTACTTACCAGGATTTTAAGAGCTTCTGAATTTGTCCTATCCTCAACTTTCTGCAGCTGGGTTTACAGCTGTATTTTCTCACTACTCTTAATTGAATGCTGATGGTATGGCTAGTTCTTACTA-TTTTTT-CCCCCTGTAACTATGTTCACTTAATTCAAGGTCCTCAGGTCTCTGTAAACCTTTGCATTCAAAAAACTAAAAAACTCCACACTGCTTCCTACTGCTTAAGGTTTTTCTTATTTCTGCAACACAGGTTTTGGCTCAAGCTAAAAGAAGGATTATGCTTGCTGTGAATGTAGATAGGCACAAGATC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 a score=383318.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 288247 163 + 478999 ATATATttcaaaggaaatcatattcaaattcaaatacaaCCTAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATCCACTAACACTCACTTTCTATTCCTTCCTAGTAATTGTTCAGTCTCCAGAAATTATTTCCGTAATTTATTCCTGTTATTTCAGAATTGAGTCTTTG s panTro4.chrUn_GL393519 129408 163 + 413329 ATATATTTCAAAGGAAATCATATTCAAATTCAAATACAACCTAATGATGATCTTGTGGTAAATGTATCCACTAACACTCACTTTCTTTTCCTTCCTAGTAATTGTTCAGTCTCCAGAAATTATTTCCGTAATTTATTCCTGTTATTTCAGAATTGAATCTTTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18625547 163 + 99152023 ATATATTTCAAAGGAAATCATATTCAAATTCAAATACAACCTAATGGTGATCTTGTAGTAAATGTATTCACTAACACTCACTTTCTATTCCTTCCTAGTAATTGTTCAGTCTCCAAAAATTATTTCCTTAATTTATTCCTGTTATTTCAGAATTGAATCTTTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87924455 163 - 170124641 ATGTATTTCAAAGGAAATCATATTCAAATTCAAATACAACATAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATTCACTAACATTCACTTTCTATTCCTTCCTAGTAACTGTTCAGTCTCCAAAAATTATTTCCTTAATTTATTCCAGTTATTTTAGAATTGAATCTTTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88201891 163 - 171882078 ATGTATttcaaaggaaatcatattcaaattcaaatacaaCATAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATTCACTAACATTCACTTTCTATTCCTTCCTAGTAACTGTTCAGTCTCCAAAAATTATTTCCTTAATTTATTCCAGTTATTTTAGAATTGAATCTTTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85322843 163 - 162156779 ATGTATTTCAAAGGAAATCATATTCAAATTCAAATACAACCTAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATTCACTAACATTCACTTTCTATTCCTTCCTAGTAATTGTTCAGTCtccaaaaattatttccttaatttattCCAGTTATTTTAGAATTGAATCTTTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3539562 163 - 24206276 ATGTATttcaaaggaaatcatattcaaattcaaatacaaCCTAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATTCACTAACATTCACTTTCTATTCCTTCCTAGAAACTGTTCAGTCTCCAAAAATTATTTCCTTAATTTATTCCAGTTATTTTAGAATTGAATCtttg i chlSab2.chr29 C 0 I 1377 s calJac3.chr10 87619372 163 - 132174527 atataTGTTAAAGGAAATCATATTTGAAATCAAATACAACCTAATGGTGATCTTGTGGTAAATGTATTCACTAATATTCACTTCCTATGCCTTCCTAGTAATTGTTCAGTCTCCAAAAATTATTTTCCTGATTTTTTCCTCTTATTTTAGAAATAAACCTTTA i calJac3.chr10 N 0 C 0 a score=1551526.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 288410 940 + 478999 AAGGGAATAAGCCCACTGAATTATATGTTGATACAGCCATTCACAAATTGCTTTTTTAATACATTCTTCAAAATGTAAAAATGTTGGTTTCAATTGGTCACTTTCTTCTCCAAACAATTTTTTT-A-AAGTGGATCAAACATGAAATAAGtttatttctttctttatttttttgagacggagtctcg--ctgtcacccaggttggagtgcagtggcgcaatcttggctcattgcaacctctgcctcctgggttcgagcaagtctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgtgtgccaccacacccagctaatttttgtattttttagtagagacagggttttgctatgttggccaggctggtctcgaactcctgaccttaaatgatccacacacctcggcctcccagagtgctgagattacaggcatgagccaccatgctgggccAAAAGAA----GTTTATTGCTCACTTAAAATCTGAATGGGTGCTCCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCATCATCTTCA-TAAATGTCTTTCAATGTCATTGTGCTCAATGGTATCAAAAATCATCAAGGCCCttgtatgggtagggcctgaagtgttgcacagcagttttcattgttttctctgaactagaactcggtcacatgaccacacctaactccaaaggggacccagaaatgtgatctacacttgaaaaagaggaaatggatttgTCTTTTTCACACAATTGATATCTTAACTTCTGAGTTGACTAACATCTACCTTGTTTGATCTATATGTGGAGAAAAAGAGTTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTGTGGATTTCTGGGCATAAGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATTGGGCAACATGGATGAAAAATT s panTro4.chrUn_GL393519 129571 937 + 413329 AAGGGAATAAGCC-ACTGAATTATAGGTTGATACAGCCATTCACAAATTGCTTTTTTAATACATTTTTCAAAATGTAAAAATATTGGTTTCAATTGGTCACTTTCTTCTCCAAACAATTTTTTT-A-AAGTGGATCAAACATGAAATAAGtttatttctttctttatttttttgagacggagtctca--ctgtcacccaggttggagtgcagtggcgcaatcttggctcattgcaacctctgcctcctgggtttgagcaagtctcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgtgtgccaccacacccagctaatttttgtatttttcagtagagacagggttttgctgtgttggccaggctggtctcgaactcctgaccttaaatgatccacacacctcggcctcccagagtgctgggattacaggcatgagccaccatgccaggccGAAAGAA----GTTTATTGCTCACTTAAAATCTGAATGGGTGCTCCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCATCATCTTCA-TAAATGCCTTTCAATGTCATTGTGCTCAATGGTATCAAAAATCATCAAGGCCCttgtatgggtagggcctgaagtgttgcacagcagttttaattgttttctctgaactagaactcagtcacatgaccacacctaactccaaaggggacctagaaatgtgatctacacttgaaaaagaggaaatggatttgTCTTTTTCATACAATTGATGTCTTAACTTCTGGGTTGACTAACATCTATCTTGTTTGATCTAAATGTGGAGAAAAAG--TTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTGTGGATTTCTGGGAATAAGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATTGGGCAACATGGATGAAAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18625710 926 + 99152023 AAAGGAATAAGCC-CCTGAATTATATGTTGATACAGCCATTCACAAATTGTTTTTTTAATACATTCTTCAAAATGTAAAAATATTGGTTTCAATTGGTCAAGTCCTTCTGCAAACAATTTTTTTAA-AAGTGGATCAAACATGAAATAAGtttatttctttattta-ttttttgagatggagtctcg--ctgtcacccaggttggagtgcagtggtgcaatcttggctcaccgcaacctctacctcctgggttcaagcgattctcctgccttggcctcccaagtagatgggattacaggtgtgtgccaccacacccagctaatttttgtattttttagtagagacaaggttttgccatgttggccaggctggtctcgaactcctgaccttaagtgatccacacacctcggcctcacagagtgctgggattactggcatgagcca-------------AAAGAA----GTTTATTGCTCACTTAAAATCTGAATGGGTGCTCCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGAAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCATCATCTTCA-TAAATGTCTTTCAATGTCATTGTGCTCAACGGTATCAAAAATCATCAaggtccttgtatgggtagggcctgaagtgttgcatagcagttttaattgttttctatgaactagaactcagtcacatgaccacacctaactctaaaggagacttagaaatgtgatctacacttgaaaaagaggaaatggatttgTCTTTTTCACCCAATTGATGTCTTAACTTCTGGGTTGACTGACATCTATCTTGTTCGATCTATATGTGAAGAAAAAGAGTTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTGTGGATTTCTGGGAATAAGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATTGAGCAACGTGGATGAAAAATT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87924618 938 - 170124641 AAGGGAATAAGCC-ACTGAATTATATGTTGATACAGCCATTCACAAATTGTTTTTTTAATACGGTCTTCAAAATGTAAAACTATTGAGTTCAATTGGTCACGTTCTTCTCCAAACAATTTTTTTTT-AAGTGGATCAAACATGAAATAAG----tttctttctttatttttttgagacggagtctcgctctgtcacccagggtggactgcagtggcgtgatcttggctcactgcaccctctgcctcccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgtgattacaggcacgtgccaccacacccagctaatttttgtattttttagtagagacggggtttttccatgttggccaggctggtctcgacctcatgaccttgggtgatccacccacctctgtctcccagagtgctgggattacaggtgtgaaccaccatgctgggcTGAAAGAA----GTTTACTGCTCACTTAAAATCCAAATGGGTGCTTCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCACCATCTTCA-AAAGTGTCTTTCAATGTCATTGTGCTCAACAGTATCAAAAATCATCAAGGCCCTTGTCTGGGTAGGGCCTGAAGTGTTGCACTGAAGTTTTAATTGTTttctatgaactagaactcagtcacatgaccacacctaactccaaaggggacttagaaatgtgatctacacttgaatacgaggaaatggatttgTGTGTCTCACACAATTGATGTCTTAACTTCCGGGTTGACTAACATCCATCTTGTTTGATCTATATGTGGAGAAAAAGAGTTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTGTGGATTTCTAGGAATAGGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATCGGGCAACATGGATGAAAAATT i rheMac3.chr7 C 0 I 10 s macFas5.chr7 88202054 938 - 171882078 AAGGGAATAAGCC-ACTGAATTATATGTTGATACAGCCATTCACAAATTGTTTTTTTAATACGGTCTTCAAAATGTAAAACTATTGAGTTCAATTGGTCACGTTCTTCTCCAAACAATTTTTTTTT-AAGTGGATCAAACATGAAATAAG----tttctttctttatttttttgagacggagtctcgctctgtcacccaggctggactgcagtggcgtgatcttggctcactgcaacctctgcctcccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcacgtgccaccacacccagctaatttttgtattttttagtagagacggggttttgccatgttggccaggctggtctcgacctcatgaccttgggtgatccacccacctctgtctcccagagtgctgggattacaggcgtgagccaccatgctgggcTGAAAGAA----GTTTACTGCTCACTTAAAATCCAAATGGGTGCTTCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCACCATCTTCA-AAAGTGTCTTTCAATGTCATTGTGCTCAACAGTATCAAAAATCATCAAGGCCCTTGTCTGGGTAGGGCCTGAAGTGTTGCACTGAAGTTTTAATTGTTttctatgaactagaactcagtcacatgaccacacctaactccaaaggggacttagaaatgtgatctaCACTTGAATACGAGGAAATGGATTTGTGTGTCTCACACAATTGATGTCTTAACTTCCGGGTTGACTAACATCCATCTTGTTTGATCTATATGTGGAGAAAAAGAGTTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTGTGGATTTCTAGGAATAGGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATCGGGCAACATGGATGAAAAATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85323006 935 - 162156779 AAGGGAATAAGCC-ACTGAATTATACGTTGATATAGCCATTcacaaattgtttttttaatacagtcttcaaaatgtaaaactattgagGTCAATTGGTCACGTTCTTctccaaacaatttttttttaaagtggatcAAACAtgaaataag--------tttatttatttttttgagacagagtcttgctctgtcacccaggctggactgcagtggcgtaatctcagctcactgcaacctctgcctcccgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcacgtgccaccacatctagctaatttttgtattttttagtagagacggggttttgccatgttggccaggctggtctcgaccttctgaccttgggtgatccacccacctctgtctcccagagtgctgggattacaggcgtgagccaccatgctgggctgaaAGAA----GTTTACTGCTCACTTAAAATCCAAATGGGTGCTTCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCAGGACTTCTCTTTGACTTCACCATCTTCA-AAAGTGTCTTTCAATGTCATTGTGCTCAACGGTATCAAAAATCATCAAGGCCCTTGTCTGGGTAGGGCCTGAAGTGTTGCACTGCAGTTTTCATGGTTTTCTATGAACTAGAACTCAGTCACATGACCACACCTAACTCCAAAGGGGACTTAGAAATGTGATCTACACTTGAATACGAGGAAATGGATTTGTGTGTCTCACACAATTGATGTCTTAACTTCCGGGTTGACTAACATCCATCTTGTTTGATCTATATGTGGAGAAAAAgagtttataagaaataaagatgGGTAGCTCTGTGGATTTCTAGGAATAGGATCCTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAACTGCCAATCGGGCAGCATGGATGAAAAATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87619535 930 - 132174527 AAGATGACAAGCC-ACTGAATTATATGTTGATAGAGCCATTCTCAATTTGTTTTCTTTATACATTCTTCAAAATGTAAAAATATTGGATTCAGTTGGTTGTGTTCTTCTCCAAACATTTTTTTAAA-AAGTGGATCAAATATGAAGGAAGtttctttctttcttttttttttt--ttttgagtcttgctctgtcgcccaggctggagtacagtggtgtaatcttggtccactgcaacctctgcctcccaggttcaagtgattctccagcctcagcttcctgagtaattgggattacagtagcgtgccaccacatccagctaagttttgtattttttagtagagatggggtttcaccatgttgg-caggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacccacctcagccacccagagtactaggattacaggagtgagccatcgtgccctgcTGAAATAAATTTATTTATTGCTCACTTAAAATCCAAATAGGTGTTCCTGATTGGCAGGTTCTTCAAGTGCTGATTCTGGAATTCTGGACTTCTCTTTGACTTCCCCATCTTCAGTAAGTGTCTTTCAATGTCACTGTGCTCAATGGTATAAAAAATCATCAAGGTCCTAGtatgggtagggcctgaagtgttgcacagaagttttaattattttctatgaagtagaactcagtaacatgaccacacccaactcc-aaggggacttagaaatgtgatctacacttgaaaaagaggaaatgaatttgttgTTCTCACACA----ATGTCTTAATTTCTGGGTTGACTAACATC---------TGATCTATATGTGGAGAAAAAGAGTTTATAAGAAATAAAGATGGGTAGCTCTCTGGATCTCTGGGAATAGGATACTTCTGGATTTAGTGGGCAAGATCTTCAAATTGCCCATTGGGCAACATGGATGAAAATCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=7259.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 289350 8 + 478999 TGGGGTCT s panTro4.chrUn_GL393519 130508 8 + 413329 GTGGGTCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18626636 8 + 99152023 GTGGGTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88202992 8 - 171882078 CTGGGTTT i macFas5.chr7 C 0 I 2 s papAnu2.chr7 85323941 8 - 162156779 CTGGGTTT i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s calJac3.chr10 87620465 8 - 132174527 GTGGGTCT i calJac3.chr10 C 0 I 2 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87925556 10 - 170124641 I a score=158993.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 289358 618 + 478999 TGTGAATAATTTAAAAAGCAAAGAAAAA-----GAAACTTGACATTTTGGAGACAAACCTGTGTGAGTGTTTTATTGGTACAAACGTATTTAACACTAGGGGTTTTGTACAATTTTTTGCCTTTTCTACTAGAAAACAATGTAAAGTGATTTCACAATGTGAGGAG--AAAAAAAAATTGCCGCTGTGACCAAACGCACAGTCTGTTGTGCAGCAACAATGGGCTTCGATCAACTCAGTCGTGATTCAGCTGTAGAAATGCTTTTCCTTCACCTTGTTTGAGCTTTTCCTTTCTTTCCTGTTTTGATTTGCAAAAGAAAATGTC-TTTTTTGTGTGAACTTGTGTTGTACTCTGTAGAAAATTACGGGTTTTACTTTAATGGTTTAAGAAAAAAAGCAAGAAGAGCCCTCGTCGCTTTTCTTACCTCATCACAGAGTTTGTGTAGTGAATTTAAAAAGAGAAAAAAAATTGTTACAAATTTGGAGCAAGGGAGTATGTTTTTCAAAAGAACCTCCTTCCTTTTTTTGTGTGTTTTTCCTTTTGTCCCAATGGGGAATCTAAATCTGTTTTAATTGCACAGACACATAGACAAAAAGTCATTTTTTATCTGCCAAGTGTGGTACCTT s panTro4.chrUn_GL393519 130516 621 + 413329 TGTGAATAATTTAAAAAGCAAAGAAAAAAAAAAGAAAC--GACATTTTGGAGACAAACCTGTGTGAGCATTTTATTGGTACAAATGTATTTAACACTTGGGGTTTTGTACAATTTTTTGCCTTTTCTACTAGAAAACAATGTAAAGTGATTTCACAATGTGAAGAG--AAAAAAAAATTGCCGCTATGGCCAAACGCACAGTCTGTTCTGCAGCAACAATGGGCTTCGATCAACTCAGTCGTGATTCAGCCGTAGAAATGCTTTTCCTTCACCTTGTTTGAGCTTTTCCTTTCTTTCCTGTTTTGATTTGCAAAAGAAAATGTC-TTTTTTGTGTGAACTTGTGTTGTACTCTGTAGAAAATTACGGGTTTTACTTTAATGGTTTAAGAAAAAAGGCAAGAAGAGCCCTCGTCGCTTTTCTTACCTCATCACAGAGTTCGTGTAGTGAGTTTAAAAAGAGAAAAAAAATTGTTACAAATTTGGAGCAAGGGAGTATGTTTTTCAAAAGAACCTGCTTCCTTTTTTTGTGTGTTTTTCCTTTTGTCCCAACAGGGAATCTAAATCTGTTTTAATTGCACAGACACATGGACAAAAAGTCATTTTTTATCTGCCAAGTGTGGTACCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18626644 622 + 99152023 TGTGAATAATTTAAAAAGCAAAGAAAAA--AAAGAAACTTTACATTTTGGAGACAAACCTGTGTGAGTTTTTTATTGGTACAAACATATTTAACACTAGGGGTTTTGTACAATTTTTTGCCTTTTCTACTAGAAAACAATGTAAAGTGATTTCACAATGTGAAGAGAAAAAAAAAAATTGCCACTATGACCAAACGCACAGTCTGTTCTGCAGCAACAACGGACTTCGATCAACTCAGTCGTGATTCAGCCGTAGAAATGCTTTTCCTTCACCTTGTTTGAGCTTTTCCTTTCTTTCCTGTTTTGATTTGCAAAAGAAAATGTCTTTTTTTGTGTGAACTTGTGTTGTACTCTGTAGAAAATTATGGATTTTACTTTAATGGTTTAAGAAAAAAGGCAAGAAGAGCCCTCGTCACATTTCTTACCTCATCACAGAGTTCATGTAGTGAATTTAAAA--GAAAAAAAAATTGTTACAAATTTGGAGCAAGGGAGTATGTTTTTCAAAGGAACCTCCTTCCTTTTTTGGTGTGTTTTTCTTTTTGTCCCAATGGGGAACCTAAATCTGTTTTAATTGCACAGACACATGGACAAAATGTCATTTTTTATCTGCCAAGTGTGGTACCTT i ponAbe2.chr15 C 0 I 53 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85323949 2 - 162156779 I e macFas5.chr7 88203000 2 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87925556 10 - 170124641 I e calJac3.chr10 87620473 2 - 132174527 I a score=4228.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 289976 50 + 478999 TGTTTATTTGTTATTAAACTGTTTAGACCCAGAATTTTTTTTTTCTTCTC s panTro4.chrUn_GL393519 131137 50 + 413329 TCTTTATTTGTTATTAAACTGTTTAGACCCAGAATGTTTTTTTTCTTCTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18627266 53 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85323949 2 - 162156779 I e macFas5.chr7 88203000 2 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87925556 10 - 170124641 I e calJac3.chr10 87620473 2 - 132174527 I a score=273.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 290026 1 + 478999 A s panTro4.chrUn_GL393519 131187 1 + 413329 A i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18627319 1 + 99152023 A i ponAbe2.chr15 I 53 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85323949 2 - 162156779 I e macFas5.chr7 88203000 2 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87925556 10 - 170124641 I e calJac3.chr10 87620473 2 - 132174527 I a score=39855.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 290027 24 + 478999 GTTTCTGAGATTAACAAAATTTGA s panTro4.chrUn_GL393519 131188 24 + 413329 GTTTCTGAGATTAACAAAATTTGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18627320 24 + 99152023 GTTTCTGAGATTAACAAAATTTGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87925566 24 - 170124641 GTTTCAGAGATTAACAAAGTTGGA i rheMac3.chr7 I 10 C 0 s macFas5.chr7 88203002 24 - 171882078 GTTTCAGAGATTAACAAAGTTGGA i macFas5.chr7 I 2 C 0 s papAnu2.chr7 85323951 24 - 162156779 GTCTCAGAGATTAACAAAGTTGGA i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s calJac3.chr10 87620475 24 - 132174527 GTTTCTGAGATTAACAAAGTTTGA i calJac3.chr10 I 2 I 16 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=208843.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 290051 176 + 478999 AGGTAATGGTGCCCCTCATGGCAGAAAAAGTTTGTTAGCGCAAAGATAATTTATTAAGATTAGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTGCTATGTTAACAGCCTGATCtgtgtgtgtgtaagtgtgtgtgtg------ACTGCACATGAGCGTGTATGCATATT-ATGTAGTTTTTGTCTCCA s panTro4.chrUn_GL393519 131212 182 + 413329 AGGTAATGGTGCCTCTCATGGCAGAAAAAGTTTTTTAGCACAAAGATAATTTATTAAGATTAGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTGCTATGTTAACAGCCTGATCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgACTGCACATGAGCGTGTATGCATATT-ATGTAGTTTTTGTCTCCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18627344 176 + 99152023 AGGTAATGGTGCCTCTCATGGCAGAAAAAGTTTGTTGGCACAAAGATAATTTATTAAGATTAGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTGCTATGTTAACAGCCTGATCTGTGTGTGTGTAAGTGTGTGCGTG------ACTGCACGTGAGCCTGTATGCATATT-ATGTAGTTTTTGTCTACT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87925590 169 - 170124641 AGGTAATTGTGCCTCTCATGGCAGAAAAAGTTTGTTAGCACAAAGATAATTTATTAAGATTAGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTACTATGTTAACAGCCTGATCTGTGT--------GTATGTGTGTG------AGTGCACACGAGTGTGTATGCATTTTCATGTAGTTTTTGTCTCCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88203026 169 - 171882078 AGGTAATTGTGCCTCTCATGGCAGAAAAAGTTTGTTAGCACAAAGATAATTTATTAAGATTAGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTACTATGTTAACAGCCTGATCTGTGT--------GTATGTGTGTG------AGTGCACACGAGTGTGTATGCATTTTCATGTAGTTTTTGTCTCCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85323975 169 - 162156779 AGGTAATTGTGCCTCTCATGGCAGAAAAAGTTTGTTAGCACAAAGATAATTTATTAAGATTCGGAGAGGAAACTCTGGAAGGAATACTACTATGTTAACAGCctgatctgtgt--------gtgtgtgtgtg------agtgcacatgAGTGTGTATGCAttttcatgtagtttttgtctccA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87620499 16 - 132174527 I a score=3048965.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 290227 1798 + 478999 ATATGATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGCCTGCATAATGCACGTTAATTGCCCCCACTGGTCCCAGGATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGACTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATTTGTGGCATGTTCTACATCTGAGTAAAGCCTGAAAGGGGCCTTTGTAAAGAAAAGAATCAAAAGGTGCCTTACTTAGAGGCT----ATTTGACTCCTGGGCA-ACATTTAGGATATGGAATTATGGGCAGGTGGAGCAGTAACTTTTCTGTATCTCGAAGTCCACTTTGTTTCAGATGTTGGTATAAAAAGGAGCATAAATTTTCATGACTATTTTCCTTCACAAACAGCTTT---ATT--ATTAGGCTTATTAGACACAGAATTAAGAA-TTTTTTTG-----TCAAATAGTAATTTTGTCCTTGCAGATTATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAGGAAAATGGGAGTCATTGCTGCCTGTCTAACTAGTTCAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAACAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGTTCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATT---CTCTTTCACACAGATACAGCGTAGCACATATTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAATCTTTGTAGGTGGTAGCTAATTTATTTCATGAAATTTAACATTCTGATTCAAAAGAGTCAAAAGAAAAAAGGACTGGGGAATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATC--------------------------------------TTTTGGTACAGAAAGGT--------CCTCAATGCACAATTACTGTGCTGAAAGTGGATCTCGCCTGTGAGATACCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTGAAACCTTGCttttttttttttttttttttCCTTGTTCTCGTCCTCTGCCTCTTGGGCAGAATTTAATTACCTCTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATGTA-ATTGCCCCAGGTC-AAGCTTTTTACACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTTCCAAA-TTTTTCTGCTAATTTTATTAACCTGCACCAAATGGTCTTGAAAAATGCTGTTTTCATAAAGCTTCAATTATTTCATTCTTCTACTTAATACATCTTGTTTTTCCTTGACTAGCAAATTAAGCTTGAACTAGTTAGACTGGCTGGCAGCAAGTCCTCTGCCATGTGATTACCGTATATTTATACCTTATGTCTCACAACTTTTT-GCAAGTACACTTGTACTATTTTATACTCTTCTCTGGGTATAATTTTTTGTATCCAAATCTTTCTACATTTTTATTATATGCAAATAATATTTTCCCGCCATCGTT----ATGGAAAATTCTATATTTTGTCAACGTTCATTTTCTTCTCAAAAGCCTTTTGTTATTATTTCCAAATGAATATTAT--GTGTGTCTCAGACAACCACAGAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTACTGCTACTGTGTCAATGGCAGCATTTTGATATAGGTGGAGGGACGATCACATCAAccccataatttgtgtcagcttctcctgaagttatcagaagcatacaatttaagtaaaaacag---tatcttcgctatccaaatgatgttccaaggtaaatctcctcagatcccttccagtacatgtatgctccaaggcctgctctatgtagaacttttggagccatcaACGTACTGCTTGAGGTTGTTTTGAACAAAAGGTATTTGACAtaagctctataagatcagggactctttt s panTro4.chrUn_GL393519 131394 1796 + 413329 ATATGATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGCCTGCATAATGCACGTTAATTGCCCCCACTGGTCCCAGGATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATTTGTGGCATGTTCTACATCTGAGTAAAGCCTGAAAGGGGCCTTTGTAAAGAAAAGAATCAAAAGGTGCCTTACTTAGAGGCT----ATTTGACTCCTGGGCTTACATTTAGGATACGGAATTATGGGCAGGTGGAGCAGTAACTTTTCTGTATCTGGAAGTCCACTTTGTTTCAGATGTTGGTATAAAAAGGAGCATAAATTTTCATGACTATTTTCCTTCAGAAACAGCTTTCTGATT--ATTAGGCTTACTAGACACGGAATTAAGAA-TTTTTTTG-----TCAAATTGTAATTTTGTCTTTGCAGATTATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAGGAAAATGGGAGTCATCGCTGCCTGTCTAACTAGTTCAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAACAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGTTCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTG----TCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGATACAGCGTAGCACATATTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAAACTTTGTAGGTGGTAGCTAATTTATTTCATGAAATTTAACATTCTGATTCAAAAGAGTCAAAAGAAAAAAGGACTGGGGAATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATC--------------------------------------TTTTGGTACAGAAAGGT--------CCTCAATGCACAATTACTGTGCTGGAAGTGGGTCTCGCCTGTGAGATACCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTGAAACCTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTT---CCTTGTTCTCGTCCTCTGCCTCTTGGGCAGAATTTAATTACCTCTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATGTA-ATTGCCCCAGGTC-AAGCTTTTTACACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTTCCAAA-TTTTTTTGCTAATTTTATTAACCTGCACCAAACGGTCTTGAAAAATGCTGTTTTCATAAAGCTTCAATTATTTCATTCTTCTACT-AATACATCTTGTTTTTCCTTGACTAGCAAATTAAGCTTGAACTAGTTAGACTGGC----AGCAAGTCCTCTGCCATGTGATTACCATATATTTATACCTTATGTCTCACAACTTTTTTGCAAGTACACTTGTACTATTTTAGACTCTTGTCTGGATATAATTTGTTGTATCCAAATCTTTCTACATTTTTATTATATGCAAATAATATTTTCCCACCATTGTT----ATGGAAAATTCTATATTTTGTCAACGTTCATTTCCTTCTCAAAAGCGTTTTGTTATTATTTCCAAATGAATATTATCTGTGTGTCTCAGACAACCACAGAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTACTGCTACTGTGTCAATGGCAGCATTTTGATATAGGTGGAGGGACGCTCACATCAAccccataatttgtgtcagcttctcctgaagttatcagaagcatacaatttaagtaaaaacag---tatcttcgctatgcaaatgatgttccaaggtaaatctcctcagatcccttccagtacatctatgctccaaggcctgctctatgtagaacttttggagccatcaatgTACTGCTTGAGGTTGCTTTGAACAAAAGGTATTTGACAtaagctctataagatcagggattctttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 2 s ponAbe2.chr15 18627520 1793 + 99152023 ATATGATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGCCTGTATAATGCATGTTAATTGCCCCCACTAGTCCCAGGATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATTTGTGGCATGTTCTACATCTGAGTAAAGCCTGAAAGGGGCCTTTGTAAAGAAAAGAATCAAAAGGTGCTTTGCTTAGAGGCT----GTTTGACTCCCGGGCT-ACATTTAGGATATGGAATTATAGGCAGGTGGAGCATTAACTTTTCTGTATCTCGAAGTTCACTTTGTTTTAGATGTTGGTATAAAAAGGAGCATAAATTTTCATAACTATTTTCCTTCACAAACAGCTTTCTTATT--ATTAGGCTTATTAGACATGGAATTAAGAATTTTTTTTG-----TCAAATTGTAATTTTGTCTTTGCAGATTATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAGGAAAATCGGAGTCATTGCTGCTGGTCTAACTAGTTTAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAATAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGTTCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGATACAGCATAGCATATCTTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAAACTTTGTAAGTGGTAGCTAATTTATTTCATGAAATGTAACATTCTGATTCAAAAGAGTCAAAAGAAAAAAGGACTGGGGAATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATC--------------------------------------TTTTGGAACAGAAAGGT--------CCTCAGTGCACAACTACTGTGTTGGAAGTGGCTCTCGCCTGTGAGATACCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTGAAATCTTGCTTTTTTTTTTTT--------TCTTGTTCTCATCCTCTGCCTCTTGGGCAGGATTTAATTACCTCTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATGTACATTGCCCCAGGTC-AAACTTTTTATACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTACCAAT-TTTTTTTGCTAATTTTATTAACCTGCACCAAATGGTCTTGGAAAATGTTGTTTTCATAAAGCTTCAATTATTTCATTCTTCTACT-AGTACATCTTGTTTTTCTTTGACTAGCAAATTAAACTTGAACTAGTTAGACTGGC----AGCACATCCTCTGCCATGTGATTACCATATATTTATACCTTATATCTCACAACTTTTTTGCAAGTACACTTGTACTATTTTAGACTCTTCTCTGGTTGTAATTTTTTGTATCCAAATCTTTTGACATTTCTATTATATGCAAATAATATTCTCCCTCCATCATT----ATGGAAAATTCTATATTTTCTCAAGGTTCATTTTCTTCTCAAAAGCCTTTTGTTATTATTTCCAAATGAATATTGTCTGTGTGTCTCAGACAACCACGAAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTATTGCTACCGTGTCAATGGCAGCATTTTGATATAGGTGGAGGGATGCTCACATCAAccccataatttgtatcagcttctcctgaagttatcagaagcatacaattgaagtaaaaagag---tatctttgctatgcaaattatgttcccaggtaaatctcctcagatctcttccagtacatgtatgctccaaggcctgctctatatagaacttttggagccatcaACGTACTGCTTGAAGTTGCTTTGAACAACAGGTATTTGGCAtaagctctataa---cagggactctttt i ponAbe2.chr15 C 0 I 1 s rheMac3.chr7 87925759 1850 - 170124641 ATATTATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGGCTGTATAACGCACGTTAATTGCCCCCACTAGTCCCAGAATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAATAATGAGGAATGGGGAGATCTGTGGCATGTCCTATATCTGAGTAAAACCTGAAAGGGGCCTTTGTGACGAAAAGAACAAAAATGTGCTTTACTTAGAGGCTGATGATTTTACTCCTGGGCC-ACACTTAGGATATGGAATTATGGGCAGGTGGAGCAGTAACTTTTCTGTATCTTGAAGTCCACTTTGTTTTAGATGTTGGTATAAAAAGGAGTATAAATTTTCATAACTATTTTCTTTTACAAACAGCTTTCTTATT--ATTAGGCTTATTAGACGTGGAATTAAGAA--TTTTTTG-----TCAAATTGTAATTTTGTCTTTGCAGATTATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAAGAAAATGGGAGTCATTGCCACCCGTCTAACTAGTTCAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAACAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGATCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGGTGCAGCATAGCGCATCTTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAAACTTTGTAAGTAGTAGCTAATTTATTTCGTGAAAGAAAACACCCTGATTCAAAAGAATCAAAAGAAAAAAGGACTGGAGGATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATCtttttttttttttttttttttttttCAGTTCTTTAATCTTTAGGAAGAGAAAGGTCCTCAGTGCCTCAGTGCACAACTACTGTGCTGGGAGTGGCTCTTGCCTGTGAGATACCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTGAAACCTTGC-TTTTTTTTTCTTTTTTTT-TCTTGTTCTCATCCTCTACCTCTTGGGCAGAATGTAATTACCACTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATATACATTGCCCCAGGTC-AAGTTTTTTATACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTTCCAAA-ATTTTTTGCTAATTTTATTAACCTGCACCAAATGGTCTTGCAAAATGCTGTTTTCATAAAGCTTCAATTATTTCATTCTTCTGCT-AGTGCGTCTTGTTTACCTTTGACTAGCAAATTAAACTTGAACTAGTTAGACTGGC----AGCAAGTCCTCTGCCATGTGATTACTGTATATTTACACCTTATATCTCACAACTTTTTTGAAAGTACACTTGTACTATTTTAGACTCTTCTCTGGGTATAAATTTTTGTATCCAAATCTTTCTACATTATTTTTATATGCAAATAATATTCTCCCTCCATCACT----ATGGAAAATTCTATATTTTGTCAAGGTTCATTTTCTTCTCAAAAGCCTTTTGTTATTATTTCCAAATGAATAATTTCTGTGTGTCTCAGACAACCACAAAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTATTGCTACTGTGTCAATGGCAGCATTATGATATAGGTGGAGGGATGCTTACATGAAccccataatctgtatcagcttctcgtgaagttatcacaagcatacaatttaagtaaaaacag---tatctttgctatgcaaatgatgttccaaggtaaatctcctcagatctcttccagtaaatgtatgctccaaggcctcctctatataaaacttttggagcagtcaACGTACTGCTTGAAGTTGCTTTGAACAAAAGGCATTTGACAtaagctctataagatcagggactctttt i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 88203195 1842 - 171882078 ATATTATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGGCTGTATAACGCACGTTAATTGCCCCCACTAGTCCCAGAATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATCTGTGGCATGTCCTATATCTGAGTAAAACCTGAAAGGGGCCTTTGTGACGAAAAGAACAAAAATGTGCTTTACTTAGAGGCTGATGATTTTACTCCTGGGCC-ACACTTAGGATATGGAATTATGGGCAGGTGGAGCAGTAACTTTTCTGTATCTTGAAGTCCACTTTGTTTTAGATGTTGGTATAAAAAGGAGCATAAATTTTCATGACTATTTTCTTTTACAAACAGCTTTCTTATT--ATTAGGCTTATTAGACGTGGAATTAAGAA--TTTTTTG-----TCAAATTGTAATTTTGTCTTTGCAGATTATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAAGAAAATGGGAGTCATTGCCACCCGTCTAACTAGTTCAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAACAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGATCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGGTGCAGCATAGCGCATCTTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAAACTTTGTAAGTAGTAGCTAATTTATTTCGTGAAATAAAACACCCTGATTCAAAAGAGTCAAAAGAAAAAAGGACTGGAGGATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATC---------TTTTTTTTTTTTTTTTCAGTAGGCTAATCTTTAGGAAGAGAAAGGTCCTCAGTGCCTCAGTGCACAACTACTGTGCTGGGAGTGGCTCTTGCCTGTGAGATACCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTGAAACCTTGCttttttttttctttttttt-tcttgttCTCATCCTCTACCTCTTGGGCAGAATGTAATTACCACTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATATACATTGCCCCAGGTC-AAGTTTTTTATACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTTCCAAA-ATTTTTTGCTAATTTTATTAACCTGCACCAAATGGTCTTGCAAAATGCTGTTTTCATAAAGCTTCAATTATTTCATTCTTCTGCT-AGTGCGTCTTGTTTACCTTTGACTAGCAAATTAAACTTGAACTAGTTAGACTGGC----AGCAAGTCCTCTGCAATGTGATTACTGTATATTTACACCTTATATCTCACAACTTTTTTGAAAGTACACTTGTACTATTTTAGACTCTTCTCTGGGTATAAATTTTTGTATCCAAATCTTTCTACATTATTTTTATATGCAAATAATATTCTCCCTCCATCACT----ATGGAAAATTCTATATTTTGTCAAGGTTCATTTTCTTCTCAAAAGCCTTTTGTTATTATTTCCAAATGAATAATTTCTGTGTGTCTCAGACAACCACAAAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTATTGCTACTGTGTCAATGGCAGCATTATGATATAGGTGGAGGGATGCTTACATGAAccccataatctgtatcagcttctcgtgaagttatcacaagcatacaatttaagtaaaaacag---tatctttgctatgcaaatgatgttccaaggtaaatctcctcagatctcttccagtaaatgtatgctccaaggcctcctctatataaaacttttggagcagtcaACGTACTGCTTGAAGTTGCTTTGAACAAAAGGCATTTGACAtaagctctataagatcagggactctttt i macFas5.chr7 C 0 I 1 s papAnu2.chr7 85324144 1813 - 162156779 ATATTATTATCTCTGAAGATGAAACATACTCAAGGCTGTATAACACACGTTAATTGCCCCCACTGGTCCCAGAATTGAGATCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATCTGTGGCATGTCCTATATCTGAGTAAAACCTGAAAGGGGCCTTtgtgaagaaaagaacaaaaaggtgCTTTACTTAGAGGCTGATGGTTTTACTCCTGGGCT-ACACTTAGGATACGGAATTATGGGCAGGTGGAGCACTAACTTTTCTGTATCTTGAAGTCCACTTTGTTTTAGATGTTGGTATAAAAAAGAGCATAAATTTTCATGACTATTTTCCTTTACAAACAGCTTTCTTATT--ATTAGGCTTATTAGACATGGAATTAAGAA--TTTTTTG-----TCAAATTGTAATTTTGTCTTTGCAGATTATCTTTAAAAGGATTATATTcttagaagacaagaaaatgggaGTTATTGCCACCCGTCTAACTAGTTTAGGCTTAATTTGCTAGTCAATGAAAAACAAGATGTACTAGAAGAATGAAATGATCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGATACAGCATAGCGCATCTTCACTCATTGTGTGTGACTTGGAGAGAAAACTTTGTAAGTGGTAGCtaatttatttcatgaaatataACACCCTGATTCAaaagagtcaaaagaaaaaaggactggGGAATCTAAGAGATATCC-AACATGACCCTTCAGTAGGCTAATC--------------------------------------TTTAGGAAGAGAAAGGTCCTCAGTGCCTCAGTGCACAACTACTGTGCTGGGAGTGGCTCTTGCCTGTGAGATATCCCATGCAGAGGACTATCTGTGGCAAATGGAAAGTgaaaccttgcttttttttttctttttttt-tcttgttctcgTCCTCTACCTCTTGGGCAGAATGTAATTACCACTGTCCCTTCCCTGGTATTTGTTTGTATATACATTGCCCCAGGTC-aagttttttatactttttccttgggctattgaaataatttccaaa-attttttgctaattttattaACCTGCACCAAATGGTCTTGCAAAATGCTGTTTTCATAAAGCTtcaattatttcattcttctgct-agTACATCTTGTTTTCCCTTGACTAGCAAATTAAACTTGAACTAGTTAGCCTGGC----AGCACGTCCTCTGCCATGTGATTACTGTATATTTATACCTAATATCTCACAACTTTTTTGAAAGTACACTTGTACTATTTTAGAGTCTTCTCTGGGTATAAATTTTTGTATCCAAATCTTTCTACATTATCATTATATGCAAATAATAGTCTCCCTCCATCACT----ATGGAAAATTCTATATTTTGTCAAGgttcattttcttctcaaaagccttttgttattatttccaaATGAATAATTTCTGTGTGTCTCAGACAACcacaaaaagttttgtttttgtcacaCTCTATTGCTACTGTGTCAATGGCGGCATTATGATATAGGTGGAGGGATGCTTACATGAACCCCATAATCTGTATCAGCTTCTCGTGAAGTTATCACAAGCATACAATTTAAGTAAAAACAG---TATCTTTGCTATGCAAATGATGTTCCAAGGTAAATCTCCTCAGATCTCTTCCAGTAAATGTATGCTCCAAGGCCTCCTCTATATAAAACTTTTGGAGCAGTCAACGTACTGCTTGAAGTTGCTTTGAACAAAAGGCATTTGACATAAGCTCTATAAGATCAGGgactctttt i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s calJac3.chr10 87620515 1792 - 132174527 ATAGGATTAGCTCTGGAGATGAAACATACTCAAGCCTGTAGAATGCATATTAATTGTCCCCATTGCTCCCAGAATTGAGGTCTCCAGAGACAGAGCCTCAGAGTCTGGAAGGGATAAGTAATGAGGAATGGGGAGATCTGTGGCATGTTGTGTATCTGAGTAAAATTTGAAAGGGGCCTTTGTGAAGAAAACAACCAAAAGGTGCTTTACTTAGAGGCTGAC-ATTTGACTCCTGGGCT-ACATTTTGGATATGGAGTTATGGGCAGGTGGAGCAGTAACTTCTCTATATCTCAAAGTCCACCGTGTTT-AGATATTGGTATAAAAAGGAGCATACATTTTCATGACTAGTTTCCTT--CAAACAGTTTTCTTATTACATAAGGTTTGTTTGACATGGAATTAAGAA--TTTTTTGTTTTATCGAATTGTAATTTTATC-TTGCAGATCATCTTCAAAAGGATTATATTCTTAGAAGACAGGAAAATGGGAGTCATTGCTGCCCATGTAACTAGTTCAGGCTTAATTTGCTAGTCAGTGAAAAACAAGATATACTAGAAAAATGAAATGATCAAAGCTTTATGGAAACAGCATTTTGCAAGACCATTTGGTGCAGGTTTGGGCAATAATTTGGACTAACTCTCTTGTTTATTGTTCTCTTTCACACAGATACAGCATAGCGAATCTTCACTCATTGTGTGTGACGTGGAGAGAAAACTTTGTAAGTGGTAGCTAATTTATTTCATGAAATATAACATTCTTATTTGAAAGAGTCAAAAGAAAACAGGACTGGGGAATCTAAGAGATATCCTGACATGACCCTTCAGTAGGCTGATC--------------------------------------TTTTGGAACAGAAAGGT--------CCTTAACAAACAACTACTGTGCTGGGAGTGGCTCTCGCCTGTGAAATGTCCCATGCAGAGAACTATCTGTGGCTAATGGAAAGTGAAACCTTGCTTTTTTTTTTTT--------TCTTGTTC---TCCTCTGCCTCTTGGGCAGCATTTAATTACTACTATCCC----------TTTGTTTGTATATACATTGCCCCAGGTTAAAATTTTTTACACTTTTTCCTTGGGCTATTGAAATAATTTCCAAATTTTTTTTGCTAATTTTATTAACGTGTACCAAATAGTCTTGCAAAATGCTGTTTTCATAAAGCCTTGATTATTTCATTATTCTACT-AGTACATCTTGTTTTTCCTTGACTAGAAAATTAAGCTTGAACTAGTGAGACTGGC----AGCAAGTCCTCTGCCATGTGATTACCACATCTTTGTGCCTTATGTCTCACAACTTTTTTGCAAGTACACTTGTACTTTTTTAGACTCTTCCCTGGATATATTGCTTTGTATCCAAATCTTTCTACATTATTATTATATGCAAATAATATTCTGCCTCCATCACTGACCATGAAAAATTCTATCTTTTGTTATGGATCATTTTCT-----AATGCCTTTTTAAATTTTTTCCAAAGGAATATTATCTGTATGTCTCAGACAACCACAAAAAGTTTTGTTTTTGTCACATTCTATTGCTACTGTGTCAATGGCAGCATTATAATATAGGTTGAGGGACACTCACATTAATcccataatctgtatcagcttctcgggaagttatcacaagcatacaatttaagtaaaaacagtaatatctttgatatgcaaattatgttccaaggtaaatctccttagatctcttccagtaaatgtatgctccaaatcctcctttatatagagcttttggaaccatcaACATACTGCTTGAAGTTTCTTTGAACAAACGGTATTTGACATAAGCTCTATAAGATTAGGGACAttttt i calJac3.chr10 I 16 I 318 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=165597.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 292025 96 + 478999 attttattcattgttctttatcttctagagcaataatttgcaaaatgactatttattgaataaaCTAGGAC-----GGAGGTGAAAAGGAAAGAACAGCTC s panTro4.chrUn_GL393519 133192 96 + 413329 attttattcattgttctttatcttctagaacaataatttgcaaaatgactatttattgaataaaCTAGGAC-----GGAGGTGAAAAGGAAAGAACAGCTC i panTro4.chrUn_GL393519 I 2 C 0 s ponAbe2.chr15 18629314 97 + 99152023 attttattcattgttatttatcttctagaacaataatttgcaAAATGACTACTTATTGGATAAACTAGGACG----GGAGATGAAAAGGAAAGAACAGCTC i ponAbe2.chr15 I 1 I 996 s rheMac3.chr7 87927610 97 - 170124641 attttactcattgttctttatcttctagaacaataatttgcaaaatgactatttattgaataaaCTAGGAAG----GGAGATGAAAAGGAAAGAACAGCTC i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 88205038 97 - 171882078 attttactcattgttctttatcttctagaacaataatttgcaaaatgactatttattgaataaaCTAGGAAG----GGAGATGAAAAGGAAACAACAGCTC i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 85325958 97 - 162156779 attttactcattgtTCTTTATCTTCTAGAACAATAATTTGCAAAAtgactatttattgaataaactaGGAAG----ggagatgaaaaggaaagaacagctC i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s calJac3.chr10 87622625 101 - 132174527 ATTTTATTCATTGTTCTTTATCTTCTAAAATAACAAATTGCAAAACAACTATTTATTGAATAAAGTAGGAAGGAATGGAGATAAAAAGGAAAGAACAGCTC i calJac3.chr10 I 318 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1922169.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 292121 1066 + 478999 ATCCTTCCAAGGGGAAGAGAGCAGTATCCCAAATCCAAATTGAAGAAAATAAACATATATCTATTCACCAGAAGA---GATAGAAGGGAGACAGGGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAAACCAGTGAGGACCTTGGAGACTACTAATACCACTGGATTTGTAAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCTGGGAGATCCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCTCTCATCTACCTTCTGACCCTCCTAGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTATGTACATCCTACTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGCTGTGTCAGTTCTGACGTGCCCATAATGGCAGCCAATCTCATCTCCCAGACACAGAGCATCTCCTGTGCTGGCTGCCTGCTCCGGTTCTA---CTTCTTCTCCATGTGTGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTCCTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCTTAATGACCCATCACGTTTGTGCTCATTTTTGTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTATTGACCCCTTTGACACTAATATCTCAGGTCCTCTTTTGTGGTCCAAACACTATCGACCAT-TTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTACTCTGACTTGTGGTATCATTAGCGCTCTCATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTTGGGACTTATTTCTGTGTTCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCTTCAGGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTGTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTCTCTTCTATGGTTCTCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCATGGGATAAAGAAATTTGTGACCTTGTTCTATACTTTGTCAACTCCATTCTTTAATCCTCTGATCTACAGTTTCCGGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC s panTro4.chrUn_GL393519 133288 1068 + 413329 ATCCTTCCAAGGGGAAGAGAGCAGTATCCCAAACCCAAATTGAAGAAAATAAACATATATCTATTCACCAGAAGAAGAGATAGAAGGGAGACAGGGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAAACCAGTGAGGACCTTGGAGACTACTAATATCACTGGATTTGTGAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCAGGGAGATCCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCTCTCATCTACCTTCTGACCCTCCTGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTATGTACATCCTACTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGCTGTGTCAGTTCTGACGTGCCCATAATGGCGGCCAATCTCATCTCCCAGACACAGAGCATCTCCTGTGCTGGCTGCCTGCTCCGGTTCTA---CATCTTCTCCATGTGTGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTCTTGCCGTTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCTTAATGACCCATCACGTTTGTGCTCATTTT-GTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTATTGACCCCTTTGACACTAATATCTCAGGTGCTCTTTTGTGGTCCAAACACTATCGACCAT-TTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCATTACCTGGAATTACTCTGACTTGTGGTATCATTAGCTCTCTCATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTTGGGACTTATTTCTGTGTTCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCTTCAGGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTCTCTCACCTTGCTGTAGTGTCTCTCTTCTATGGTTCTCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCATGGGATAAAGAAATTTGTGACCTTGTTCTATACTTTGTCAACTCCATTCTTTAATCCTCTGATCTA--GTTTCCGGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18630407 1070 + 99152023 ATCCTTCCAAGGGGAAGACAGCAGTGTCACAAACCCAAATTGAAGAGAATAAACATGTATCTATTCACCAGAAGAAGAGATAGAAGAGAGACAGGGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTGTACAGGCCAGACCAATGAGGACCTTGGAGACCACTAATATCTCCGGATTTGTGAATGAGATCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCAGGGAGATGCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCTCTCATCTACCTTCTGACCCTCCTGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGTTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTATGTGTATCCTACTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGCTATGTCAGTTCTGATGTGCCCATAATGGTGACCAATCTCATCTCCCAGACACAGAGCATCTCCTATGCTGGCTGCCTGCTCCAGTTCTACTTCTTCTTCTCCATGTGTGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGATTTCTTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCTTAATGACCTATCATGTTTGGGCTCATTTT-GTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTATTGACCCCTTTGACATTAATATCTCAGACGCCCTTTTGTGGTCCAAACACTATCGACCAT-TTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGTGCTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTAC-CTGACTTGTGGTATCATTAGCTCTCTCATCATCTTTCCTACCTTCTTGTATACCCTTGGGACTTATTTCTGTGTCCTAAGCACAGTGCTACAGGAGCCTTCAGATTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTCTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTCTCTTCTATGGTTGCCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCATGGGATACAGAAGTTTGTGACCTTGTTCTATGCTTTGGCGACTCCATTCTTTAATTCCCTGATCTACAGTTTCCAGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i ponAbe2.chr15 I 996 C 0 s rheMac3.chr7 87927707 1070 - 170124641 ATCCTTCCAAGGGGAAGATAGCAGTATCACAAACCCAAATTGAAGGAAATCAACATGTATCTATTCACCAGAAGAAGAGATAGAAGAGAGACAGTGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAGACCAATGAGGACCTTGGAGACTACTAATATCTCTGGATTTGTGAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCAGGGAGATTCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCCTTCATCTACCTCCTGACCCTCATGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTAGGTACATCCT-CTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGTTACGTCAGTTCTGATGTGCCCATAATGTTGGCCAATCTCATCTCCCAGACAAAGAGCATCTCCTATGCCGGCTGCCTGCTCCAGTTCTACTTCTTCTCCTCCATGTGTGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTATTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCCTGATGACCCATCATGTTTGTGCTCAATTT-GTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTACTGACCCCTTTGACACTCATATCTCAGGTGCCCTTCTGTGGTCCAAACACTATTGACCACTTTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTACTCTGACTTGTGGTATCATTAGCTCTCTAATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTTGGGACTTATTTCTGTGTCCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCCTCAAGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTCTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTGTCTTCTATGGTTCCCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCGTGGGATACAGAAATTTGTGACCTTGTTCTATGCTTTGGCAACTCCATTCTTTAATCCCC-GACCTACAGTTTCCAGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88205135 1070 - 171882078 ATCCTTCCAAGGGGAAGATAGCAGTATCACAAACCCAAATTGAAGGAAATCAACATGTATCTATTCACCAGAAGAAGAGATAGAAGAGAGACAGTGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAGACCAATGAGGACCTTGGAGACTACTAATATCTCTGGATTTGTGAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCAGGGAGATTCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCCTTCATCTACCTCCTGACCCTCATGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTAGGTACATCCT-CTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGTTACGTCAGTTCTGATGTGCCCATAATGTTGGCCAATCTCATCTCCCAGACAAAGAGCATCTCCTATGCCGGCTGCCTGCTCCAGTTCTACTTCTTCTCCTCCATGTGTGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTATTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCCTGATGACCCATCATGTTTGTGCTCAATTT-GTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTACTGACCCCTTTGACACTCATATCTCAGGTACCCTTCTGTGGTCCAAACACTATTGACCACTTTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTACTCTGACTTGTGGTATCATTAGCTCTCTAATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTTGGGACTTATTTCTGTGTCCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCCTCAAGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTCTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTGTCTTCTATGGTTCCCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCGTGGGATACAGAAATTTGTGACCTTGTTCTATGCTTTGGCAACTCCATTCTTTAATCCCC-GATCTACAGTTTCCAGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85326055 1071 - 162156779 ATCCTTCCAAGGGGAAGATAGCAGTATCACAAACccaaattgaagaaaataaacatatatctATTCACCAGAAGAAGAGATAGAAGAGAGACAGTGCAGAATTTCTGTGGTTCTTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAGACCAATGAGGACCTTGGAGACTACTAATATCTCTGGATTTGTGAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCGCAGGGAGATTCAGATCCTCCTTTTTGTGGTCTTCTCCTTCATCTACCTCCTGACCCTCATGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCCAGAAACTCCACACACCTATGTACATCCTCCTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGTTACGTCAATTCTGATGTGCCCATAATGTTGGCCAATCTCATCTCCCAGACAAAGAGCATCTCCTATGCCGGCTGCCTGCTCCAGTTCTACTTCTTCTCCTCCATGTGCGCTGCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTATTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCCCACCCTGATGACCCATCACGTTTGTGCTCAATTT-GTGATCTTCTGCTGGGTGGGTGGCTGTCTCTGGTTACTGACCCCTTTGACACTCATATCTCAGGTGCCTTTCTGTGGTCCAAACACTATCGACCAC-TTTTTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTACTCTGACTTGTGGTATCATTAGCTCTCTCATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTTGGGACTTATTTCTGTGTCCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCCTCAAGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGGCTCTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTCTCTTCTATGGTTCCCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGGGACTATCGTGGGATACAGAAATTTGTGACCTTGTTCTATGCTTTGGCAACTCCATTCTTTAATCCCCTGATCTACAGTTTCCAGAACAAGGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87622726 1057 - 132174527 ATCCTTCCAAAGGGAAGATAGCAGTATCACAAACCTAAATTGAAGAAAATAAACATATATCTATTCTCCAGAAGAAGAGATAGAAGAGAGAC--TGTAGAA------------TTACTATCTCTGTCACCTCTACAGGCCAGACCAATGAGGACCTTGAAGACTACTAATATCTCCGGATTTGTGAATGAGTTCATCCTCTTGGGCTTCCCCTGCCACAGGGAGATGCAGATCTTCCTTTCTGTGGTCTTCTCCCTCATCTACCTTCTGACCCTCATGGGTAACACATCCATCATCTGTGCTGTGTGGTCAAGCAAGAAACTCCACACACCCATGTATATCCTCCTGGCCAATTTCTCCTTCCTGGAGATCTGCTATGCCAGTTCTGATCTGCCTATAATGTTGGCCAATCTCATCTCCCAGACACAGAGCATCTCCTATGCCGGCTGCCTGCTCCAGTTCTACTTCTTCTCCTCCATGTGTGCTTCAGAGTGCTTATTTCTGTCAGTGATGTCTTTTGATAGGTTTCTTGCCATTTGTAGACCTTTGCACTATCACACCTTGATGACCCATCACCTTTGTGCTAGGTTT-GTGGTCTTCTGCTGGGTGGGTGGTTTTCTCTGGTTACTGACCCCTTTGACACTAATATCTCAGGTGTCCTTCTGTGGTCCAAACACTATCGACCAT-TTTCTCTGTGATCTGGCACCTTTGCTGGCACTGTCTTGTGCTCCAATACCTGGAATTACTCTGACATGTGGTATCATTAGCTCTCTCATCATCTTTCTTACCTTCTTGTATATCCTAGGGACTTATTTCTGTGTCCTAAGCACAGTGCTACAGGTGCCCTCAGGCTTAGGAAGGCATAAGGCTTTCTCAACTTGTGCCTCTC--ACCTTGCTGTAGTGTCTCTCTTTTATGGCTCCCTTATGGTGATGTATGTTAGCCCAGGTTCTGGCGACAATCGTGGGATACAGAATTTTGTGACCTTGTTCTATGCTTTGGCAACTCCATTCTTTAATCCCCTGATCTACAGTTTCCAGAACAAAGATATGAAAGAGGCACTAAAGAAATTTC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=118303.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 293187 476 + 478999 TGAGGAATCGCCACACTGTCGATTGAACcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaataccatttgacccagccatcccattactgggtatatacccaaaggactataaatcatgctgctataaagacacatgcacacatatgtttatcgcagcactattcacaatagcaaagacttggaaccaacccaaatgtccaacaacgatagactggattaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatagtatgcagccataaaaaatgatgagttcatatcctttgtagggacatggatgaagctggaaaccat---tctcagcaaactatcgcaaggacaaaaaccaaacatcgcatgttctcactcataggtgggaattgaataatgagaacacttggacacaggaagggggacttcacacactcgggcctgttgtgggtt---tggggggggagggatagcaAAAAAAA-----TTTA s panTro4.chrUn_GL393519 134356 479 + 413329 TGAGGAATCGCCACACTGTCGATTGAACcagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaaatgccatttgacccagccatcccattactgggtatatacccaaaaaattataaatcatgttgctataaagacatatgcacatgcatgttaattgaggcactattcacaatagcaaagacctggaaccaacccaaatgtccaacaatgatagactggattaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatatcctttgtagggacatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgcaaggacaaaaaccaaacatcgcatgttctcactcataggtgggaattggataatgagaacacttggacacaggaagggggacttcacacactggggcttgttgtggggt----ggggggggagggatagcaAAAAAAA----ATTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18631477 486 + 99152023 TGAGGAATCAGCACACTGTTGGTTaaaccagtgtggcgattcctcagggatctagaactagaagtaccatttgacccaggaatcccattactgggtatatatccaaaggattataaatcatgctgctataaagacatatgcacacgtatgtttattgtggcactattcacaatagcaaagacctggaaccaacccaaa-gtccaacaatgatagactggattaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaactgatgagtccatgtcctttgtagggacatggaagaagctggaaaccatcattctcagcaaactattgcaaggacaaaaaccaaacatcgcatgttctcactcataggtgggaattgaacaatgggaacacttggacacaggaagggggacatcacacactggggcttgttgtggggtggggggagggggagggatagcaAAAAAAATGAAATTTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85327126 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88206205 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87928777 0 - 170124641 C e calJac3.chr10 87623783 0 - 132174527 C a score=802596.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 293663 468 + 478999 TGTATGTGTTATAGTAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGGCAAATTTAATATAATTCATCATTAATGTTTAGAAGGATGAAAGATGATGAGACCAATGAGATCATGC---TTT--TTTCCATTTTATTCTACTTTTATATATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGGTCCAGATATGTTTGTACCTTAAATAGATTTTTTTATTTTTGCAATTCTAC---TT---AATATTTTCATCTATTTCTCTAAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTT--GGTTTTCAGTACATACTGTTTGGTATGTTTCAACATCCTCAGATTCTGCCTTCATTGAAGCAAG----TTGTTTCATTTTTTTGAGAGCATAGCAATGGTTGAATGTATTGCAACTATACAAATAGTTTTCCACTGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAacacacacac s panTro4.chrUn_GL393519 134835 470 + 413329 TGTATGTGTTATAGTAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGGCAAATTTAATATAATTCATCGTTAATGTTTAGAAGGATGAAAGATCATGAGACCAATGAGATCATGC---TTT--TTTCCATTTTATTCTACTTCTATATATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGGTCCAGATATGTTTGTACCTTAAATAGATTTTTTTATTTTTGCAATTCTAC---TT---AATATTTTCATCTATTTCTCTGAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTTTTGGTTTTCAATACATACTGCTTGGTATGTTTCAACATCCTCAGATTCTGCCTTCATTGAAGCAAG----TTGTTTTATTTTTTTGAGAGCATAGCAATGGTTGAATGTATTGCAACTATACAAATAGTTTTCCACTGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAACACACACAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18631963 475 + 99152023 TGTGTGTGTTATAATAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGTCAAATTTAATACAATGCATCATTAATGTTTAGGAGGATGAAAGATCATAAGACCAATGAGATCATGC---TTT--TTTTCATTTTGTTCTACTTTTATATATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCAAGGTTGCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGGTCCAGATATGTTTGTACCTTAAATAGA-TTTTTTAATTTTGCAATTCTACATAAT---AATATTTTCATCTATTTCTCTAAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTTTTGGTTTTCAATACATACTGCTTGGTACATTTCAACATCCTCAAATTCTGCCTTCATTGAAGCaaa-ttttttttttttttttttGAGAGCACAGCAATGATTGAATGTATTGCAACTATGCAAATAGTTTTCCACCGATCTTTCAAATTACCAGATTAAAacacacacac i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87928777 470 - 170124641 TGTATGTGTTACAGTAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGTCAAATTTAATATAATGCATCATTAATGTTTAGGAGGATGAAAGCTCATGAGACCAATGAA--CATGC---TTT--TTTTCATTTTATTCTACTTTTATATATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGTTCCAGATATGTTTGTACCTTAAATAGATTTTTAAAATTTTGCAATTCTAC---TT---AATATTTTCATCTGTTTCTCTAAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTTTTGGTTTTCAATACATGCTGCTTGGTATGTTTCAACATCCTCAGATTCTGCCTTCATTGAAGCAAG--TTNNNNNNNNNNTTTTTGAGAGCATAGCAATTGTTGAATGTATTGGAACTGTACAAATAGTTTTCCACCGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAacacacacac i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88206205 474 - 171882078 TGTATGTGTTACAGTAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGTCAAATTTAATATAATGCATCATTAATGTTTAGGAGGATGAAAGCTCATGAGACCAATGAAATCATGC---TTT--TTTTCATTTTATTCTACTTTTATATATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGTTCCAGATATGTTTGTACCTTAAATAGATTTTTAAAATTTTGCAATTCTAC---TT---AATATTTTCATCTGTTTCTCTAAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTTTTGGTTTTCAATACATGCTGCTTGGTATGTTTCAACATCCTCAGATTCTGCCTTCATTGAAGCAAGtttttttttttttttttttGAGAGCATAGCAATTGTTGAATGTATTGGAACTGTACAAATAGTTTTCCACCGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAacacacacac i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85327126 475 - 162156779 TGTATGTGTTACAGTAGGAAATTTCTAAAGGATCCAAGAGTCAAATTTAATATAATGCATCATTAATGTTTAGGAGGATGAAAGCTCATGAGACCAATgaaatcatgctttttt--ttttcattttattctacttttatatATTGGGAAGATAATTTGAAAGAATTAATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGTTCCAGATATGTTTGTAccttaaatagattttttaaattttgcaattCTAC---TT---AATATTTTCATCTGTTTCTCTAAAACTGAGCTTCTGCTTACTCTTTTGGTTTTCAATACATGCTGCTTGGTATGTTTCAACATTCTCAGATTCTGCCTTCATcgaagcaag--tttttttttttttttttgagagcatAGCAATTGTTGAATGTATTGGAACTATACAAATAGTTTTCCACTGATCCTTCAAATTACCAgattaagacacacacac i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87623783 470 - 132174527 TGTATGTGTTACAGTAGGAAATTTCTAAAGAATCCAAGAGTCAAATTTAATATAATGCATCATTAATGTTTAGGAGGATGAAAGATCATGAGACCAATGAGATCATAC---TTTCCCCCCCATTTTATTCTACTTTTATATATTGGGAAGATCATTTGAAAGAATTTATTGGACCCATGGTTTCAGTCTTAGGAAGTTATTACTATTATGTTCCAGATATGTTTGAACCTTAAATAGATTTCTTTA-TTTTGCAATTCAAC---TTAAAAATATTTTCATCTCTTTCTCTAAAACTGAGCTGCTGCATACTCTTTTGGTTTTCAGTACATACTGCTTGGTATGTTTCAACATCCTCAGATTCTGCCTTCAGTGAAGCAAG--------TTGTTCTTTTTGAGAGCATAGCAATGGTTGAATGTATTGCAACTATACAAATAGTTTACCACTGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAACACATACAC i calJac3.chr10 C 0 I 911 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=43742.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 294131 48 + 478999 acatacacacCC----------------------------------CCAAAACTCTCAACAATTCAGGGACAATTTTAA-GCT s panTro4.chrUn_GL393519 135305 58 + 413329 ACACCcccacccacccacccac------------------------ccaAAACTCTCAACAATTCAGGGACAATTTTAA-GCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18632438 52 + 99152023 acacagacacac------acac------------------------CCGAAACTCTCAACAATTCAGGGACAATTTTAA-GCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87929247 77 - 170124641 gcacacacacac------acacacatacacacacacacacacCCCACAAAAACCCTCAACAATTCAGGGACAATTTTAAGGCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88206679 77 - 171882078 acacacacacac------acacacacacacacacacacacacCCCACAAAAACCCTCAACAATTCAGGGACAATTTTAAGGCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85327601 50 - 162156779 acacacacacac------acac---------------------------aaaccctcaACAATTCAGGGACAATTTTAAGGTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87624253 911 - 132174527 I a score=427183.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 294179 287 + 478999 CTGCCTTTTTATTCTTTATAATTTGAAGTATAACTTCTGGGGCTAACAAGGGCCTTCAATAATATTATGTTG-------------ACTTGATTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTGGCATATGTAGACACAAGAAGGTCAGGTGATGCCCAGTGCAAACCAAAGAGCCATAGAATCTGTGAGATCACTGACAATCTAGGCCTACTAAGCACT--TTTTTTGTGTGTGTAGTTCTTCATTAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTC--GGGTAAGTTCTACCCTCTAATTTA------------------TTTTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 135363 286 + 413329 CTGCCCTTTTATTCTTTATAATTTGAAGTATAACTTCTGGGGCTAACAATGGCTTT-AATAATAATATGTTG-------------ACTTGATCGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTAGCATATGTAGACACAAGAAGGTCAGGTGATGCCCAGTGCAAACCAAAGAGCCATAGAATCTGTGAGATTGCTGATAATCTAGGCCTACTAAGCACT--TTTTTTGTGTGT--AGTTCTTCATAAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTCAGGGGTAATTTCTACCCTCTGATTTA------------------TTTTTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18632490 292 + 99152023 CTGCCTTTGTATTCTTTATAATTTGAAGTATAACTTCTGGGACCAACAAGGGCTTTCAATAATATTATGTTG-------------ACTTCATTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTAGCATAGGTAGACACAAAAAGGTCAGTTAATGCCCAGTGCAAACCGAAGTGCTATAGAATCTGTGAGATTGCTGACAATCTAGGCCTATTAAGCACA--TTTTTTTTGTGT--GGTTCTTCATAAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTCAGGGGTAATTTCTACCCTCTAATTTC-------------TTTCTTTTTTTT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87929324 320 - 170124641 CTACCTTTGTATTGTTTATAATTTGAAGTATAACTTCCGGGACTAACAAGGGATTTCAATAATATTATGTTGACTTCATTGATTTACTTCATTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTAGCATAAGTGGACACAAGAAGGTCAGTTGATGCCCACAGCAAACTAAAGAGCTACAGAATCTGTGAGATCACTGACAATCTAGGCCTATTGTGCACTTATTTTTTGTGTGT--AGTTCTTAGTAAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTTAGGGGTAATTTCTACCCTTTAATTTCTTGTGTGTGTGTGTTTCTTTTTCCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88206756 307 - 171882078 CTACCTTTGTATTGTTTATAATTTGAAGTATAACTTCCGGGACTAACAAGGGACTTCAATAATATTATGTTG-------------ACTTCATTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTAGCATAAGTGGACACAAGAAGGTCAGTTGATGCCCACAGCAAACTAAAGAGCTACAGAATCTGTGAGATCACTGACAATCTAGGCCTATTGTGCACTTATTTTTTTTGTGT--AGTTCTTAGTAAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTTAGGGGTAATTTCTACCCTTTAATTTCTTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTCCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85327651 302 - 162156779 CTGCCTTTGTATTCTTTATAATTTGAAGTATAACTTCCGAGGCTAACAAGGGACTTCAATAATATTATGTTG-------------ACTTGATTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTAGCATAAGTGGACACAAGAAGGTCGGTTGATGCCCAGAGCAAACCAAAGAGCTGTAGAATCTGTGAGCTCACTGACAATCTAGGCCTATTGTGCACTTAttttttttGTGT--AGTTCTTAGTAAAACTCTGGAAAAGTGTTCCTGAGGGGTAATTTCTACcctttaatttcttgt-----ttttttttttttttct i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87625164 283 - 132174527 ctggccCTGTATTCTTTTTAATTTGAAGTATACTTTTCAGGACCAACAAGTGTCTTCCATTATGTTACGTTG-------------ACTTGCTTGACACCTCACATTTTGCCAATGCTAACACTTTATCATGTGCAGACACAAGAAGGGCAGTTGATACTCAGTATAAGCCAAAGAGCGATAGAATTTGTGAGATCACTGCCAATCTAGGCCT--TGTGCACT--TATTCGTCGTGT--AGTTCTTTGTAAAACTCTGG--AAGTGTTCCTCAGGGGTAATTTCTACCCTCTAATTTC------------------TTGTTTT i calJac3.chr10 I 911 I 571 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=620309.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 294466 509 + 478999 GAGTAGCAATTTATTAA---T------------TTGCAGTACTGCACTCCATGAGGAAATCTTGTGCTAAATCTTGATTCTGGGGTAACTCCAGCACTGACTTTACTACCAAAGCGTAGTTAAATATTTGCAGCATTCTGCTGGATATTTTTACATGACGATCTATTTCAAATTCAAATGTCTAATCCTAAATTTGTTAATCTCCTTTTAAGTTAGCTCTAGCCATCCTTATTTTCTCATGGATCTGTTGATTTATAGCATGAACTTGAAATCTTGACAGTAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTTCTAATCTGTCATTAAA-CAGATTAGGCATCTTCCCTGGGATCATTTGTCATCTTTACGCTCGTC--TTTTCTGTGCAGGTTCCTAGCACTCCATATCTGTGATGGCATAATCACTTCATAAATGGTCTGTCTCTGTTATCTCCCATGTCAAATTCCAGAATTATGTTCTTGAACCTCCA---------TCACTTATTTTCTCTCTACCTAAACACAGGAAAAAAACC s panTro4.chrUn_GL393519 135649 513 + 413329 GAGTAGCAATTTATTAA---TA---------ATTTGCAGTACCGCACTCCATGAGGAAATCTTGTGCTAAATCTTGATTCTGGGGTAACTCCAGCACTGACTTTACTACCAAAGTGTAGTTAAATATTTGCAGCATTCTGCTGGATATTTTTACATGAAGATCTATTTCAAATTCAAATGTCTAATCCTAAATTTGTTAATCTCCTTTTAAATTAGTTCTAGCCATCCTTATTTTCTCATGGATCTATTGATTTATAGCATGAACTTGAAATCTTGACAGCAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTTCTAACCTGTCATTAAAACAGATTAGGCAGCTTCCCTGGGATCATTTGTCATCTTTACGCTCGTC--TTTTTTGTGCAGGTTCCTAGCACTCCATATCTGTGATGGCATAATCACTTCATAAATGGTCTGTCTCTGTTATCTCCCATGTCAAATTCCAGAATTATGTTCTTGAACCTCCA---------TCACTTATTTTCTCTCTACCTAAACACAGGAAAAAATCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18632782 498 + 99152023 GAGTAGCAATTTATTAA---TA---------ATTTGCAGTACTACCCTCCATGAGGAAATCTTGTGCTAAATCTTGATTCTAGGGTAACTCCAGCACTGACTTTACTACCAAAGTATTGTTAAATATTTGCAGCATCCTGCTGGATAT-----------------TTTCAAATTCAAATGTCTAATCCTAAATTTGTTAATCTCCTTTTAAATTAGCTCTAGCCATCCTTATTTTCTAATGGATCTATTGATTTATAGCGTGAACTTGAAATCTTGACAATAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTTCTAATCTGTCATTAAA-CAGATTAGGCATCTTTCCTGGGATCATTTGTCATCTTTATGCTCATC--TTTTTTGTGCAGGTTCCGAGCACTCCATATCTGTGATGGCATAATCACTTCATAAATGGTCTGTCTCTGTTATCTCCCTTGTCAAATTCCAGAATTATATTCTTAAACCTCCA-----TCAGTCACTTATTTTCTCTCTACCTAAACACAGG-AAAAATCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87929644 532 - 170124641 GAGTAGCaatttattattaataataataataattattattaCTGCACTCCATGAGGAAATCTTG-GCTAAATCTTGATTCTAGGGtaactccagcactgactttactaccaaagtgtagttaaatatctgcagcgtcctgctggatatttttacatgaagatgtatttcaaattcaaacgtttaatcctaaatttgttaatctccttttaaattagctctagccacCCTTATTCTCTAATGGATCTATTGATTTATAGCATGAACTTGAAATCTTGACAATAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTCCTAATCTGTCATTAAA-CAGATTAAGCATCTTCCCTGAGATCATTTGACATCTTTACGCCCATC-TTTTTTTGTGCAGATTTCTAGCATGCCGTATCTGTGATGGCATAATCACTTCATAAATGGTCTGTTTCTGTCATCTCCCATGTCAAATTCCAGAATTCTATTCTTAAACCTCCTTTCCGTCAGTCACTTATTTTCTCTCTACTTAAACACAGG-AAAAATCC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88207063 529 - 171882078 GAGTAGCAATttattat---tattaataataattattattaCTGCACTCCATGAGGAAATCTTG-GCTAAATCTTGATTCTAGGGTAACTCCAGCACTGACTTTACTACCAAAGTGTAGTTAAATATCTGCAGCGTCCTGCTGGATATTTTTACATGAAGATGTATTTCAAATTCAAACGTTTAATCCTAAATTTGTTAATCTCCTTTTAAATTAGCTCTAGCCACCCTTATTCTCTAATGGATCTATTGATTTATAGCATGAACTTGAAATCTTGACAATAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTCCTAATCTGTCATTAAA-CAGATTAAGCATCTTCCCTGAGATCATTTGTCATCTTTACGCCCATC-TTTTTTTGTGCAGGTTTCTAGCATGCCGTATCTGTGATGGCATAATCACTTCATAAATGGTCTGTTTCTGTCATCTCCCATGTCAAATTCCAGAATTCTATTCTTAAACCTCCTTTCCGTCAGTCACTTATTTTCTCTCTACTTAAACACAGG-AAAAATCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85327953 531 - 162156779 gagtagcaatttattaa---taataataattattattattactgcacTCCATGAGGAAATCTTATGCTAAATCTTGATTCTAGGGTAACTCCAGCACTGACTTTACTACCAAAGTGTAGTTAAATATCTGCAGCATCCTGCTGGATATTTTTACATGAAGATGTATTTCAAATTCAAACGTTTAATCCTAAATTTGTTAATCTCCTTTTAAATTAGCTCTAGCCACCCTTATTCTCTAATGGATCTATTGATTTATAGCATGAACTTGAAATCTTGACAATAGAATTCCTTACCATCTCATTCCCACTCCTAATCTGTCATTAAA-CAGATTAAGCATCTTCCCTGAGATCATTTGTCATCTTTACGCCCATCttttttttGTGCAGGTTCCTAGCACGCCATATCTGTGATGGTATAGTCACTTTATAAATGGTCTGTTTCTGTCATCTCCCATGTCAAATTCCAGAATTCTATTCTTAAACCTCCTTTCCGTCAGTCACTTATTTTCCCTCTACTTAAACACAGG-AAAAATCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=442707.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 294975 314 + 478999 CAAATTCTTTAGCTTGTAAATGTTTTTAG---GTTCTGAATTTCTTCTTAAACTTTATTTTTACCTTAATATATGTCTCATCACTCCCATTTGACTCACTCTCTCTAATTCACAGAGTATAATCTTAGTTTTACAACCTGAGCTTAAAATTGTTCTATTCATACCTTGCCCATGTTTAGATGCCTCATACGAAACTTTCCTTGCCCACTACAGTATATCATAATGTTATTTTCTAAGTTCATTGC-CTTTTGAGTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTGGTCTGCCTTTTGGGTATCTATTACAGCAttgtttgtgc s panTro4.chrUn_GL393519 136162 317 + 413329 CAAATTCTTTAGCTTGTAAATGTTTTTAGTTTCTTCTCAATTTCTTCTTAAACTTTATTTTTACCTTAATATATGTCTCATCACTCCCATTTGACTCACTCTCTCGAATTCACAGAGTATAATCGTAGTTTTACAACCTGAGCTTAAAATTGTTCTATTCATACCTTGCCCATGTTTAGATACCTCTTACAAAACTTTCCTTGCCCACTACAGTATATCATAATGTTATTTTCTAAGTTCATTGA-CTTTTGAGTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTGGTCTGCCTTTTGGGTATCTATTACAGCATTGTTTGTGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18633280 314 + 99152023 CAAATTCTTTAGCTTGTATAAGTTTTTAG---GTTCTCAATTTCTTCTTAAACTTTATTTTTACCTTAATATATGTCTCATCACTCCCATTTGACTCACTCCATCTAATTTACAGGGTATAATCTTAGTTTTACAACCTGAGCTTAAGATTGTTCTATTCACACCTTGCCCATGTTTAGATACCTCTTACAAAACTTTCCTTGCCCACTGCAGCATATCATAATGTTATTTTCTAAATTCATTGC-CTTTTGAGTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTAGTCTGCCTTTTGGGTATCTATTACAGCATTGTTTGTGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87930176 317 - 170124641 CAAATTCCTTAGCTTGTATATGATTTAAGGTTCTTCCCAATTTCTTCTTAAACTTTATTTTTACTTTAATGCATGTCTCATCACTCCCATTTGACTCACTCTCTCTAATTCACAGAGTATAATCTTAGTTTTGCAACCTGAGCTCAAAATTGTTCTATTCATACCTTGTCCATTTTTATATACCACTTATAAAACTGTTCTTGCCCACTACAGTATATCATAATGTTATTTTCTAAATTCATTGC-CTTTTGATTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTGGTCTGCCTTTTGGGTATCTATTGCAGCATTGTTTGTGC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88207592 317 - 171882078 CAAATTCCTTAGCTTGTATATGATTTAAGGTTCTTCCCAATTTCTTCTTAAACTTTATTTTTACTTTAATGCATGTTTCATCACTCCCATTTGACTCACTCTCTCTAATTCACAGAGTATAATCTTAGTTTTGCAACCTGAGCTCAAAATTGTTCTATTCATATCTTGTCCATTTTTATATACCACTTATAAAACTTTTCTTGCCCACTACAGTATATCATAATGTTATTTTCTAAATTCATTGC-CTTTTGATTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTGGTCTGCCTTTTGGGTATCTATTGCAGCATTGTTTGTGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85328484 317 - 162156779 CAAATTCCTTAGCTTGTATGTGATTTAAGGTTCTTCCCAATTTCttcttaaactttatttttactttaatacaTGTCTCATCACTCCCATTTGACTCACTCTCTCTAATTCACAGAGTATAATCTTAGTTTTGCAACCTGAGCTCAAAATTGTTCTATTCATACCTTGTCCATTTTTATATACCACTTATAAAACTTTTCTTGCCCACTACAGTATATCATaatgttattttctaaattcATTGC-CTTTTGATTTTTGCCAAATATTTACTCAAAATTGGTCTGCCTTTTGGGTAtctattgcagcattgtttgtgc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46709185 276 - 64190966 CAAATTCTTTAGTTTGTATGTAATTCAAGGTTCCTCTCAACTAGTCCTCAAACTATAACCTTA-TTAACTATATGTCCCATTACTCCTG-TTGACTCACTTTCCCTAATTAAT---GTACAATCTTAGTTTTACAATCTGAGCTTAAT-TTTTTTTACTGATAACTTGCCCATTTTTAGGCACCAGTCATG---CTTTCCTTGA-----------------AAC----TTTTTGAAATTCATAGCATTTTTGAGGCTTGCCattgagct------------cctgtgtgttaggcatttctctgagcattgagggtat i canFam3.chr15 N 0 I 208 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=331890.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295289 253 + 478999 ta--ttttttactttcctaccagttagaatataagtttctttagggcaggaaatatga---------tctttttactgctcctgaatggcttctgcaatagtaatagctcaatTATTG----AGTTAACAAGGttattcgacaaacatttattgagctcctattatgtattaggcattatctgagcactgaagctatagcagtgatacctattcccatgcagtttatattacagtatgggaagacagggatcaagaaatagagaaata s panTro4.chrUn_GL393519 136479 262 + 413329 TA--TTTTTAACTTTCCTACCAGTTAGAATATAAGTTTCTTTAGGGCAGGAAATATGAGTTATACTCTCTTTTTACTGCTCCTGAATGGCTTCTGCAATAGTAATAGCTCAATTATTG----AATTAACAAGGttattcgacaaacatttattgagctcctattatgtattaggcattatctgagcactgaagctatagcagtgatacctattcccatgcagtttatattacagtatgggaagacagggatcaagaaatagagaaata i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18633594 268 + 99152023 TATTTTTTTAACTTTCCTACCAGTTAGAATATAAGTTTCTTTAGGGCAGGAAATATGAGTTATACTCTCTTTTTACTGCTCCTGAATGGCTTCTGCAATAGTAATAACTCAATTATTGAGTTAGTTAACAAGGttattcaacaaacatttattgagctcctatgatgtattaggcattatttgagcactgaagctatagcagtgatatctattctcatgcagtttatattacagtatgggaagacagggatcaagaaatagagaaata i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87930493 262 - 170124641 TA--TTTTTGACTTTCCTACCAGTTAGAAAATAAGTTTCTTTAGGGCAGGAAGTATGAGCTATACTATCTTTTTACTGCTCCTGAATGGCTTCTGCAATAGTAATAACTCAATTATTG----AGTTAACAAGGtcattcaacaaacatttattgagctcctattacgtattaggcattatctggacactgaagctatagcagtgatatctattctcatgcagtttatattacagtatgggaaagcagggttcaagaaatagagaaata i rheMac3.chr7 C 0 I 2237 s macFas5.chr7 88207909 262 - 171882078 TA--TTTTTGACTTTCCTACCAGTTAGAAAATAAGTTTCTTTAGGGCAGGAAGTATGAGCTATACTATCTTTTTACTGCTCCTGAATGGCTTCTGCAATAGTAATAACTCAATTATTG----AGTTAACAAGGtcattcaacaaacatttattgagctcctattacgtattaggcattatctggacactgaagctatagcagtgatatctattctcatgcagtttatattacagtatgggaaagcagggttcaagaaatagagaaata i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85328801 261 - 162156779 TA--TTTTTGACTTTCCTACCAGTTAGAATATAAGTTTCTTTAGGGCAGG-AGTATGAGCTATACTATCTTTTTACTGCTCCTGAATGGCTTCTGCAATAGTAATAACTCAATTATTG----AGTTAACAaggtcattcaacaaacatttattgcgCTCCTATTATGTATTAGGCATTATCTGGGCACTGAAGCTATAGCAGTGATATCTATTCTCATGCAGTTTATATTACAGTATGGGAAGGCAGGGttcaagaaatagagaaata i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46709461 208 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=4381.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295542 7 + 478999 aatatgt s panTro4.chrUn_GL393519 136741 7 + 413329 aatatgt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18633862 7 + 99152023 aatatgt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88208171 7 - 171882078 aatttat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85329062 7 - 162156779 aatttat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46709461 208 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=349395.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295549 331 + 478999 aggatacaatat--ttcctgtggtgatacattctttgaagaagggcaaagcagatgatgggaatagatactagtgagagtgggga---tgctcttttaaatagaatagtctgggaaggcttcatttaagctaaattttgaggaga--cctataggaagtgagggagTTCTGTCCTTCCTATTTCAAGTTTACGGTGAGCAGGAAAGCAAGGCAATCATCAAAATGAGTGTGGAAATGCTCTAACAAGTACACTT--AGAGATCCAAATCCAAATGGTGGCTATCAAGAAAGGCAAGAAG--TTTGGTTTAAAAATGTGCCTGAAGATGCACCATTGAAAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 136748 333 + 413329 aggatacaatat--ttcctgtggtgatacagtctttgaagaagggcaaagcagatgatgggaatagatactagtgagagtgggga---tgctcttttaaacagaatagtctgggaaggcttcatttaagctaaattttgaggaga--cctataggaagcgagggagTTCTGTCCTTCCTATTTCAAGTTTAAGGTGAGCAAGAAAGCAAGGCAATCATCAAAATAAGTGTGGAAATGCTCTAACAAGTACACTTTTAGAGATCCAAATCCAGATGGTGGCTATTAAGAAAGGCAAGAAG--TTTGGTTTAAAAATGTGCCTGAAGATGCACCATTGAAAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18633869 330 + 99152023 cagatacaatat--tccctgtagggatacattctttgaagacgggcaaagcagatgatgggaatagatactagtgagagtgggga---tgctcttttaaatagaatagtctgggaaggcttcatttaagctaagttttgaggaga--cctgcaggaagtgcgggagTTCTGTCCTTCC-ATTTCAAGTTTAAGGTGAGCAAGAAAGCAAGGCAATCATCAAAATGAGTGTGGAAATGCTCTAACCAGTGCACTT--AGAGATCCAAATCCAAATGGTGGCTATTAAGAAAGGTGAGAAG--ATTCGTTTAAAAATGTGCCTGAAGATGCACCATTGAAAAAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88208178 327 - 171882078 agcatacaatat--ttcctgtggtgatacattccttgaagaagggcaaagcaggtgatgggaatagatgctagtgagagtgggga---tgctcttttaaataggatagtctgggaaggcttcatttaagctaaattttaaggaga--cctacaggaagtgagggagTTCTGTCCTGCCTATTTCAAGTTTAAGGTGAGCAAGAAAGCAAGGCAGTCATCAAAATGAGTGTGGAAATGCTCTAACAAGTACACTT--AGAGATCCAAATCCAAATAGTGGCTATT----AAGGCAAGAAG--TTTGGTTTAAAAATGTGCCTGAAGATGCACCACTGAAAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85329069 331 - 162156779 agcATACAATAT--TTCCTGTGGTGATACATTCTTTGAAGAAGGGCAAAGCAGGTGATGGGAATAGATACTAGTGAGAGTGGGGA---TGCTCTTTTAAATAGGATAGTCTGGGAAGGCTTCATTTAAGCTAAATTTTAAGGAGA--CCTACAGGAAGTGAGGGAGTTCTGGCCTGCCTATTTCAAGTTTAAGGCGAGCAAGAAAGCAAGGCAGTCATCAAAATGAGTGTGGAAATGCTCTAACAAGTACACTT--AGAGATCCAAATCCAAGTGGTGGCTATTAAGAAAGGCAAGAAG--TTTGGTTTAAAAATGTGCCTGAAGATGCACCACTGAAAAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46709669 331 - 64190966 AGAATAGAatatagttccgatggtgataaatactttgaagaaaaataaagcaggtgaagagaacatataataatggaaggggggagggtgctcttttaaatagcacagtctgggaaagcttcctttaatctgaatttttagaagagcccaaaaggaagtaaaagggTTCTGTTTTGGCTATTTCACATTTTAGGTGAGCTAGAAATCAAGA--------AAATAGAGTGTAGGAACATTCTGAGAAGTGTGATT--AGAGAATCAAGTTAAAATAGTTGC-ATTAAGAAAGGCAAGAAGATTCTGTTTCAAAAGCATACCTGGAGACATGCCTTTGAGAAGT i canFam3.chr15 I 208 I 2459 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=1000.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295880 1 + 478999 G s panTro4.chrUn_GL393519 137081 1 + 413329 G i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18634199 1 + 99152023 G i ponAbe2.chr15 C 0 I 2088 s macFas5.chr7 88208505 1 - 171882078 G i macFas5.chr7 C 0 I 2385 s papAnu2.chr7 85329400 1 - 162156779 G i papAnu2.chr7 C 0 I 2392 e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=161.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295881 3 + 478999 GCA s panTro4.chrUn_GL393519 137082 2 + 413329 -CA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18634200 2088 + 99152023 I e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85329401 2392 - 162156779 I e macFas5.chr7 88208506 2385 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=873.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295884 3 + 478999 GCA s panTro4.chrUn_GL393519 137084 3 + 413329 GCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18636288 3 + 99152023 GCA i ponAbe2.chr15 I 2088 C 0 e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85329401 2392 - 162156779 I e macFas5.chr7 88208506 2385 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=26194.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295887 35 + 478999 GTGTGCAGG---GACAATGCCACCTAACCCGCGTTCAG s panTro4.chrUn_GL393519 137087 38 + 413329 GTGTGCAGGAGGGACAATGCCACCTAACCCGTGTTCAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18636291 35 + 99152023 GTGTGCAGG---GACAATGCCCCCTAACCCGCGTTCAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88210891 35 - 171882078 GTGTGCAGG---GGCAGCGCCACCTGAGCCGCGTTCAG i macFas5.chr7 I 2385 C 0 s papAnu2.chr7 85331793 35 - 162156779 GTGTGCAGG---GGCAGCGCCACCTGAGCCGCGTTCAG i papAnu2.chr7 I 2392 C 0 e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I e calJac3.chr10 87625447 571 - 132174527 I a score=3604.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295922 6 + 478999 AGCGAA s panTro4.chrUn_GL393519 137125 6 + 413329 AGAGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18636326 6 + 99152023 AGCGAA i ponAbe2.chr15 C 0 I 3314 s macFas5.chr7 88210926 6 - 171882078 CGCGAA i macFas5.chr7 C 0 I 28 s papAnu2.chr7 85331828 6 - 162156779 CGCGAA i papAnu2.chr7 C 0 I 28 s calJac3.chr10 87626018 6 - 132174527 AGCAGC i calJac3.chr10 I 571 C 0 e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87930755 2237 - 170124641 I a score=410571.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 295928 239 + 478999 GCCACCTGGTCGGCCACCGGCAGCTTGGGG-AAGAAGGGCATGTGGCGCGCCCACTCCACCTTGCTGAAGAGCAGCCgtgaaatttttaataatatttttatttaacccaactcacccaaaatagtatttcaacatggaattagtataaacactattaatgagatgtttacattctttcatcccaccaagtgttcaaaactggtatttgattttatacttggagcacatcttaattagga s panTro4.chrUn_GL393519 137131 239 + 413329 GCCACCTGGTCGGCCACCGGCAGCTTGGGG-AAGAAGGGCGCATGGGGCACCCACTCCACCTTGCTGAAGAGCAGCCgtgaaatttttaataatatttttatttaacccaactcacccaaaatagtatttcaacatgtaattagtataaacactcttaatgagatgtttacattctttcatcccaccaagtgttcaaaactggtatttgattttatacttggagcacatcttaattagga i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18639646 239 + 99152023 GCCACCTGGCCGGCTACCGGCAGCTCAGGG-AAGAAGGGCGCGCGGTGCGCCCACTCCACCTTGCTGAAGAGCAGCCgtgaaatttttaataatatttttatttaagccaactcacccaaaatagtattgcaacatgtaattagtataaacactattaatgagatgtttacattctttcatcccaccaagtgttcaaaactggtatttgattttatacttggagcacatcttaattagga i ponAbe2.chr15 I 3314 C 0 s rheMac3.chr7 87932992 239 - 170124641 GCCACCTGCTCGGCCACTGGCAGCTCGGGG-AAGAAGGGCGCGTGGCGCGCCCACTCCACCTTGCTAAAGGGCAGCCgtgaaatttttaatagtatttttatttaacccaattcacccaaaatagtatatcaacatgtaattagtataaacactattaatgagatgtttacattctttcatcccaccaagtgttcaaagctggtatttgattttaaacttggagcacatcttaattaggg i rheMac3.chr7 I 2237 C 0 s macFas5.chr7 88210960 239 - 171882078 GCCACCTGCTCGGCCACTGGCAGCTCGGGG-AAGAAGGGCGCGTGGCGCGCCCACTCCACCTTGCTAAAGGGCAGCCgtgaaatttttaatagtatttttatttaacccaattcacccaaaatagtatatcaacatgtaattagtataaacactattaatgagatgtttacattctttcatcccaccaagtgttcaaagctggtatttgattttaaacttggagcacatcttaattaggg i macFas5.chr7 I 28 C 0 s papAnu2.chr7 85331862 239 - 162156779 GCCACCTGCTCGGCCACTGGCAGCTCGGGG-AAGAAGGGCGCGTGGCGCGCCCACTCCACCTTGCTGAAGGGCAGCTACGAAATTTtcaatagtatttttatttaacgCAATTCACCCAAAATAGTATATCAACATGTAATTAGTATAAACACTATTAATGAGATGTTTACATTCTTTCATCCCACCAAGTGTTCAAAGCTGGTATTTGATTTCAAACTTGGAGCACATCTTAATTAGGG i papAnu2.chr7 I 28 C 0 s calJac3.chr10 87626024 240 - 132174527 GCCACCTGATCCGCCACCCGCAGCTCAGGGTAAGAAGGGCGCCTTGCGCGACCTGTCCACTGTGCTGAAGAGCAGCCgtgaaatgtttaataatacttttatttaatccaattcacccaaaatagcatttcaacaggcaattagtataaacattattaatgagatgtttgcattctttcatcccaccacgtgttcaaaatcgatatttgattttatacttagagcacatcttaatcggga i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46710000 2459 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=376249.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 296167 179 + 478999 ctagtcactttgcaggtgctcagtaaccacatgtgggtcgtggct-----------------------attgtattggacagtacagGTTAAAGAGAGGTCTAAGGACTAAATACAGACCTCAAATAATATTGAGGTTAAACAAATAC-TAAATTGACTTTATTTTTCAGAATGAAGTTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCAT s panTro4.chrUn_GL393519 137370 179 + 413329 ctagtcactttgcaggtgctcagtaaccacatgtgggtcgtggct-----------------------attgtattggacagtacagGTTAAAGAGAGGTCTAAGGACTAAATACAGACCTCAAATAATATTGAGGTTGAACAAATAC-TGAATTGACTTTATTTTTCAGAATGAAGTTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18639885 202 + 99152023 ctagtcacattgcaggtgctcagtaaccacatgtgggtcgtggctattgtattggacagtacTGTCTAATTGTATTGGACAGTACAGGTTAAAAAGAGGTCTAACGACTAAATACAGACCTCAAATAATATTGAGGTTAAACAAATAG-TGAATTGACTTTATTTTTCAGAGTAAAGTTTCTTTgcctggagagaacaagcat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87933231 179 - 170124641 ctagtcacattacacgtgctcagtaaccgcatgtgagtcgtggct-----------------------attgtattggacagtacagGTTAAAAAGAGGTCTAAGGACTAAATATAGACCTCAGATAATATTGAGGTTAAACAAATAG-TGAATCGACTTTATTTTTCAGAATAAAGTTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88211199 179 - 171882078 ctagtcacattacacgtgctcagtaaccgcatgtgagtcgtggct-----------------------attgtattggacagtacagGTTAAAAAGAGGTCTAAGGACTAAATATAGACCTCAGATAATATTGAGGTTAAACAAATAG-TGAATCGACTTTATTTTTCAGAATAAAGTTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85332101 179 - 162156779 CTAGTCACATTACACGTGCTCAGTAACCGCATGTGAGTCGTGGCT-----------------------ATTATATTGGACAGTACAGGTTAAAAAGAGGTCTAAGGACTAAATATAGACCTCAGATAATATTGAGGTTAAACAAATAG-TGAATcgactttatttttcagaataaagtTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87626264 178 - 132174527 ccagtcacactctaagtgctcggtaaccacatgcgggtcggggct-----------------------acagtattggacagtatagGTTAAAAAGAGGTCTAAGGACTCAATACAGAGCTCAAATAATATTGAGGTTAAACTAATAG-TGAAT-GACTTTAGTTTTCAGAATAAAGTTTCTTTGCCTGGAGAGAACAAGCTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17478877 178 + 64190966 ctggttacatttcaagtggtcagtagccacgtgtgagtcatggct-----------------------gtcgtgttggatagtgcagg-tatagaGAAGTCTGAGGACTAAATATAGAACTTCAA-AATGTTGAGGTTAAACAAATAACTGAATTGTCTTTATTTTTCAGAATATGGTTTCTTTGCCTAGAGGGACTAAGTAT i canFam3.chr15 n 2459 T 91605 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=13944.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 296346 7 + 478999 GCTCTTA s panTro4.chrUn_GL393519 137549 7 + 413329 GCTCTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18640087 7 + 99152023 gctctta i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87933410 7 - 170124641 GCTCTTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88211378 7 - 171882078 GCTCTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85332280 7 - 162156779 GCTCTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87626442 7 - 132174527 GCTCTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17479055 91605 + 64190966 T e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=2526373.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 296353 1374 + 478999 TTTCACGTATTTTCCTAATTGAAATCCTGATTT--TGGCAGGGGAAAGAACCCACTGAGTGTGCTACATGTTGGAACTAGTGACCTTACACATCCATGCTCCATCTCCTGGGAA--AGTCTTTCCTGAAGAATTG-TATCTTCAGTCTGTTTGTCCTGA--TTTGTCCCAAACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGGCTAAAATTTCCCTTTCAGACATTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGTTGGGAGGGTCAATCAGTTGTAGAACAATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCACT--------CAAAACCCAGAGATTTTGCTTCTATA------TGTACAGAAAGAGGACTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACGTTGCTGAGG-AGGCATGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATGTGAAAATTTTCACTATTTTATAGTTTTTT--TCTTTACAACGA----CT-ATTCACTATAAAATATATGATTTATTTGTATAATTAAAAAGT----AGACAAAATGGAATACAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCAGTTAGTAAAACTTTTATGTTTTTATGTAC---ACATTTAGACTA----AAAACATAC-----TTTAAAATATTTCAATTTTATATATGAACATCTTTTTCAAGCACAATGAGAGCTTAGATACAAGTGAGGA-TTTTAGTTATTCAGTTAATTA-------------TGGTTCGTTGG-CCCCCTCCCCCAAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGAGAAAGAGTAAGT-GAAGAATCCTCTATATCCATTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACACTAAA--TCTCACTGCAGCTTACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTTATTTACCTTTAGTTTAACTTTT-TCTCTCAGAACTCCAGATAATGCAGTAGTAACTTATAAGCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATCATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCGAGA--CAGTGTTTTAC---CCCTTACTCATCCTGCTCCCCTTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTGAT----TTCCACCCTGTGTAATCTCTAGAGGAAACATAGCTCAGAGATAT---GGAATAGTCAAAATGAATGGGTTGTTTGAGTTA----TTtctctctctctctcgctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtTTGCTGTCCAGTATCTCCATCCC-TTTTTATGTTTGAGGTAATCCCAATATTATCAGGCTTGGAGCTTCTATTTATGTAATTGTTGTTTATATTgccagatattagctctcctagcttcccttgcacttaaagttgtaggaatgtactcttgcctttacc----agatacagctataccaggctttgaatcaagaagcA--GAAGTAGGAAGAG s panTro4.chrUn_GL393519 137556 1350 + 413329 TTTCACGTATTTTCCTAATTGAAATCCTGATTT--TGGCAGGGGAAAGAACCCACTGAGTGTGCTACATGGTGGAACTAGTGACCTTACACATCCATGCTCCATCTCCTGGGAA--AGTCTTCCCTGAAGAATTG-TATCTTCAGTCTGTTTGTCCTGA--TTTGTCCCAAACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGTCTAAAATTTCCCTTTCAGACATTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGTTGGGAGGGTCAATCAGTTGTAGAACAATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCATT--------CAAGACCCAGAGATTTTGCTTTTATA------TGTATAGAAAGAGGAGTTAGAAATCCATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAGGGAGGTAAGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATGTGAAAATTTTCATTATTTTGTAGTTTTTT--TT------ATGA----CT-GTTCACTATAAAACATATGATTT----GTATAATTAAAAAGT----AGACAAAATGGAATACAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCAGTTAGTAAAACTTTTATGCTTTTATGTAC---ACATTTAGACTA----AAAACATAC-----TTTAAAATATTTCAATTTTATATATGAACATCTTTTTCAAGCACAATGAGAGCTTAGATACAAGTGAGGA-TTTTAGTTACTCAGTTAATTA-------------TGGTTCGTTGG-CCCCCTCCCCCAAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGAGAAAGAGTAAGT-GAAGAATCCTCTATATCCATTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGTTGCACAACACTAAA--TCTCACTGCAGCTAACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTTATTTACCTGTAGTTTAACTTTT-TCTCTCAGAACTCCAGATAATGCAGTAGTAACTTATAAGCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATCATGAGATATACAAGTCCTCAACTACCCGAGA--CAGTGTTTTAC---CCCTTACTCATCCTGCTCCCCTTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAT----TTCCACCCTGTGTAATCTCTAGAGGAAACATAGCTCAGAGATAT---GGGATAGTCAAAATGAATGGGTTGTTTGAGTTA----TTtctctctctctctctctctctctctGTGTGTGTGTGT----------------TTgctgtccagtatctccatccc-tttttatgtttgaggtaatcccaatattatcaggcttggagcttctatttatgtaattgttgtttatattgccagatattagctctcctagctttccttgcacttaaagttgtaggaatgtactcttgcctttacc----agatacagctataccaggctttgaatcaagaagcA--GAAGTAGGAAGAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18640094 1377 + 99152023 tttcacgtattttcctaattgaaatcctgattt--tggcaggggaaagaaCCCACTGAGTGTGCTACATGGTGGAACTAGTGGCCTTACACATCCATGCTCCATCTCCTGGGAA--AGTCTTTCCTGAAGAATTG-TATCTTCAGCTTCTTTGTCCTGA--TTTGTCCCAAACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGGCTAGAATTTCCCTTTCAGACACTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGTTGGGAGGGTCAATCAGTTGTAGAACAATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCACT--------CAAAACCCAGAGATTTTGCTTTTATA------TGTACAGAAAGAGGACTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAGG-AGGCAAGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATGTGAAAATTTTCATTATTTTGTCGTTTTCT--TCTTTACAATGA----CT-ATTTACTATAAAATATATGATTT----GTATAATTAAAAAGT----AGACAAAATGGAATACAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCAGTTATTAAAACTTTTATGCTTTTATGTAC---ACATTTAGACTAAAACAAAACATACtttaatttaaaatatttcaattttatatatGAACATCTTTTTCAAGCACAATGAGAGCTTAGATACAAGTGAGGA-TTTTAGTTATTCAGTTAATTA-------------TGGTTCAGTGG-CCCCCTCCCCCAAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGAGAAACAGTAAGT-GAAGAATCCTCTATATCCATTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACACTAAA--TTTCACTGCAGCTTACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTTATTTACCTCTAGCTTAACTTTT-TCTCTCAGAACTCCAGATAATGCAGTAGTAACTTATAAGCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATGATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCAAGA--CAGTGTTTTAC---CGCTTACTCATCCTGCTCCCATTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAC----TCCCACCCTGTGTAACCTCTAGAGGAAACATAGCTCAGAGATAT---GGGATAGTCAAAATGAATGGATTGTTTGAGTTGATATTTtctctctctctctctctctctctctctgtgtgtgtgt------gtgtgtgtgtTTgctgtccagtatctccatccc-tttttatgtttgaggtaatcccaatattatcaggcttggagcttctatttatgtaattgttgtttatattgccagatattagctctcccagcttcccttacacttgaaggtgtaggaatgtactcttggctccacc----agatacaggtataccaggctttgaatcaagaagca--gaagcaggaagag i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87933417 1378 - 170124641 TTTCACAGATTTTCCTAATTCAAATCCTGATTT--TGGTAGGAGAAAGAACCCACTGAGTGTACTACGTGGTGGAAGTAGTGACCTTACACATCCATG------CTTCTGGGAA--AGTCTTTCCCGAAGAATTG-TATCTTCAGCTTCTTTGTTCTGA--TTTGTCCCAGACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGGATGAAATTTCCCTTTCAGACATTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGGTGGGAGGGTCAATCCGTTGTAGAACCATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCACTGAGGTATATAAAACCCTGAGATTTTGCTTTTATATGTAAGTGTACAGAAATAGGACTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAGG-AGGCAAGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATATGATAATTTTCATTATTTTGTGGTTTTTT--TCTTTACAATGA----CT-----ACTGtaaaatatataattt----gtataattaaaaaat-----GACAAAGTAGAATATAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCGGTTATTAAAACTTTTATGCTTTTATGTACACAACATTTAGACTAAAACAAAACATAC-----TTTAAAATATTTCAGTTTTATATATGAACATCTTTTTCAAGTACAATGAAAGCTTAGATACGAGTGAGGA-TTTCAGTTATTCAGTTAATTA-------------TGGTTCATTGGCCCCCCTCCCCCCAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGTGAAGGAGTAAGT-GAAGAATCCTCTCTATC--TTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACATTAAATTTTTTACTGCAGCTTACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTCA-TTACCTTTAGTTTAACTTTT-TCTCTCGGAACTCCAGGTAATGCAGTAGTAACTTACAATCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATCATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCAAGAGGCAGTGTTTTAC---CCCTTACTCATTCTGCTCCCCTTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAT----TTCCACCCTGTGTGATCTCTAGAGGGAACATAGCTCAGAGATAT---AGGATATTCAAAATAAATG----GCTTGAGTTGATATTTTCTCTCTGTCTCTCTTTCTCTCTCtgtgtgtgtgtat----gtgtgtgtgtgtTTgctgcccagtatctccatccc-tttttatgtttgaggtaatcccaatattatcaggcttggagcttctatttatgtaattgttgtttatattgccagatattagctctcccagcttcccttgcacataaaggtgtagaaatgtactcttggctccacc----agatacagctataccaggctttgaatcaagaagcA--GAAGTAGGAAGAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88211385 1378 - 171882078 TTTCACAGATTTTCCTAATTCAAATCCTGATTT--TGGTAGGAGAAAGAACCCACTGAGTGTGCTACGTGGTGGAAGTAGTGACCTTACACATCCATG------CTTCTGGGAA--AGTCTTTCCCGAAGAATTG-TATCTTCAGCTTCTTTGTTCTGA--TTTGTCCCAGACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGGATGAAATTTCCCTTTCAGACATTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGGTGGGAGGGTCAATCCGTTGTAGAACGATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCACTGAGGTATATAAAACCCTGAGATTTTGCTTTTATATGTAAGTGTACAGAAATAGGACTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAGG-AGGCAAGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATATGATAATTTTCATTATTTTGTGGTTTTTT--TCTTTACAATGA----CT-----ACTGTAAAATATATAATTT----GTATAATTAAAAAAT-----GACAAAGTAGAATATAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCGGTTATTAAAACTTTTATGCTTTTATGTACACAACATTTAGACTAAAACAAAACATAC-----TTTAAAATATTTCAGTTTTATATATGAACATCTTTTTCAAGCACAATGAAAGCTTAGATATGAGTGAGGA-TTTCAGTTATTCAGTTAATTA-------------TGGTTCATTGGCCCCCCTCCCCCCAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGTGAAGGAGTAAGT-GAAGAATCCTCTCTATC--TTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACATTAAATTTTTTACTGCAGCTTACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTCA-TTACCTTTAGTTTAACTTTT-TCTCTTGGAACTCCAGGTAATGCAGTAGTAACTTACAATCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATCATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCAAGAGGCAGTGTTTTAC---CCCTTACTCATTCTGCTCCCCTTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAT----TTCCACCCTGTGTGATCTCTAGAGGGAACATAGCTCAGAGATAT---AGGATATTCAAAATAAATG----GCTTGAGTTGATATTTtctctctgtctctctttctctctctgtgtgtgtgtat----gtgtgtgtgtgtTTgctgcccagtatctccatccc-tttttatgtttgaggtaatcccaatattatcaggcttggagcttctatttatgtaattgttgtttatattgccagatattagctctcccagcttcccttgcacataaaggtgtagaaatgtactcttggctccacc----agatacagctataccaggctttgaatcaagaagcA--GAAGTAGGAAGAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85332287 1370 - 162156779 TTTCACAGATTTTCCTAATTCAAATCCTGATTT--TGGTAGGAGAAAGAACCCACTGAGTGTGCTACGTGGTGGAAGTAGTGACCTTACACCTCCATG------CTTCTGGGAA--AGTCTTTCCTGAAGAATTG-TATCTTCAGCTTCTTTGTCCTGA--TTTGTCCCAGACTGA----CAGAAGTACCTGCAG-AGCTGGATGAAATTTCCCTTTCAGACATTGCTGTTTAGGTGAGAGTACAGAGTGGGTGGGAGGGTCAATCCGTTGTAGAACGATACTTAGGTATAATCCAATTTATATACCCACTGAGGTATATAAAACTCTGAGATTTTGCTTTTATATGTAAGTGTACAGAAATAGGACTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAGG-AGGCAAGTGTGTGTGTAGAGGTGTGGAGATatgataattttcattattttgt-gtttttt--tctttacaatga----CT-----ACTGTAAAATATACgattt----gtataattaaaaaat-----gacaaagtacAATATAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCCCAGTTATTAAAACTTTTATGCTTTTATGTACACAACATTTAGACTAaaacaaaacatac-----tttaaaatatttcagttttatatatGAACATCTTTTTCAAGCACAATGAAAGCTTAGATACGAGTGAGGA-TTTCAGTTATTCAGTTAATTA-------------TGGTTCATTGGcccccctcccccAAGTCTAAGAATTTTTGGCTTAAAGTGAAGGAGTAAGT-GAAGAATCCTCTCTATC--TTCTTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACGTTAAA--TTTCACTGCAGCTTACAGAGATTTTCCAGATGAT-----AATTTA-TTACCTTTAGTTTAACTTTT-TCTCTCGGAACTCCAGGTAATGCAGTAGTAACTTACAATCAGCACAGTATCTTCTAACAGCATTCATCATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCAAGAGGCAGTGTTTTAC---CCCTTACTCATTCTGCTCCCCTTTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAT----TTCCACCCTGTGTGATCTCTAGAGGGAACATAGCTCAGAGATAT---AGGATATTCAAAATAAATG----GCTTGAGTtgatattttctctctgtctctctttctctc----tgtgtgtgtat----gtgtgtgtgtgtttgctgccCAGTATCtccatcct-tttttatgtttgAGGTAATCCCAATATTATCAGGCTTGGAGCTTCTATTTATGTAATTGTTGTTTATATTGCCAGATATTAGctctcccagcttcccttgcacATAAAGGTGTAGAAATGTACTCTTGGCTCCACC----AGATACAGCTATACCAGGCTTTGAATCAAG-AGCA--GAAGTAGGAAGAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87626449 1370 - 132174527 TTTCACAGATTTTCCTGATTCAAATCCAGATTT--TGGTGGGCAAAAGAGGCCACTGAGAGTGCTACATGGTGGAACTAGTGATCTTACACATCCATTCACCATCTCCTGGGAG--GGTCTTTCCTGAAGAATTG-TAGCTTCAGCTTCATTTTCCTGA--TTTGTCACAGACTGA----CAGAAGCACCCACAG-ACCTAGCTGACATTTCCCTTTCAGACCTTGCTCTCTAGGTGAGAGTACAGAGTGGGTGGGAGGGTCAATCGGTTGTGGAACAATACTCAGGTATAATCCAATCTACACACCTATT--------AAAAACCCAGAGATTTTGCTTTCACATGTAAATGTACAGAAAGAGGGCTTAGAAATACATCCACCAAACTAAACACATTGCTGAAG-AGACAAGTATGTGTGTAGA-GTGTGGAGATGTGAGAATTTTTATTATTTTGTACTTTTTTTGTCTCTACGGTGA----TTTTTTTACTGTAAAATAAGTGATTT----GTATAATTAAAAAAT----AGACAAAACGGAATATAATTCATTTCAGTGTAGCTAAGCAAGTCCCAGTTACTAAACC--------TTTTATGTACACAACATTTAGACTAAAACCaaaaatattttaatttaaaatatttCAATTCTATATATGAACATCTTTTTCAGACACAATTAGAACTGAGATACAAGTGAGGATTTTTAGTTATTCAGTTAATTAATAACTAAAGGGGGGGTCCATTGAACCCCCTTCCCCCAGTCTAGGAACTTTTGGCTTAAAGTGAAGGAGTACGT-GAAGAATCTTCTATATCCATTTGTCACTAGTTCTAAGAAGGATGAAAGGCAAGT-GCACAACCTTAAA--TTTCACTGCAGATTACAGAGATTTTCCAGATAAT-----AATTTATTTCCCTTTAGTTTAATTTTT-TCTCTCAGAATTCCAGATAATGCAGTACTAACTTATAAGCATCACAGCATCCTCTAACAGCATTCATGATGAGATAGACAAGTCCTCAACTACCCAAGGGACTTTTTTTTTTTTATTCGTACTCATCCTGCTGCCCTCTCACTGCTGTTGCATAGGTGGATAATTTAAT----TTCTACTCTGTGTAATCTTTACAGGGAACATAGCTCAGAGATATTACGGGATAGTCAAAATGAATGGCTTGTTTTACATGATAAATTTT-----------------------TGTGTGTGTGT----------------TTGCTTCCCACTATCTTGATCCCTTTTTTATGTTTGACGTAAACCCAATATTATCAGGCTTGAAGCTTCTATTTAAGTAATTGTTGTTTATTTTgccatatactagctctcccagcttcccttgaac-taaaggcataggaatgtactcttggctctacc----agagacagctatactgggctttgaatcaagaagcA--GAAGTAGGAGGAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46712459 1310 - 64190966 tttcacagGTTTTCCTCATTTTAATCCTGGTTTGATGGCAG----AAGAACCTCCTGAGTATGTCA-----TGGAAGTAGTGCTCTCACACATCCATGAACTACCTTCTAGGAATGGGTCTTTCCTGAAGAATTGCTATCTTCAGCTTCATTATCCTCATGTGTGTTCTAGACCAATAGTCAGAAGCTCCTTTAGAAGTTGGATGAAGTTTCCTTCTCAGATATTGCTTTTTAGATGAGAGTAGGGGATGGGTGTGAGGGCCAGTAAGTCATAGGGCAATTTTTAAGTATAATCCAATTTACATAGTCATT--------CAAAATCCAGAACTTATATTTTTAAatataaatgcacagaaaaaggtc-tagaagtatgcctatcaaactgaACACATTGCTAAAG-GGACAGGTGTGTG----GAAGTATGGAGATATGAAGATTTTCATCATTTTGTACTCTACT--CTTTTACAATGAAAATTT-ATTCATTGTAAA---------------GTGTATTTAAAAAGCATGTAGAGAAAATAGCATATTATTCATCTCAGTGTAGCTAAGCAAGCCTTGGTTATTGAAAA--------TTCTGTGTGTATGACATTTAGACCAAAACaaaaaatat-ttaattttaaatattttattttaaaatatGAATATCTTCTTCAGACACTATGAAAA---ACCTACATATAAAGA-TCTCATTTATTTGGTTAATTG-------------TTGT--------CCCA-----------------------GGCTCAAGATAAAACAGTAAGTGGAAGGATCTTCCTTATTCACTCTTAG--------AAGAGGAAT-AAAGATGAGT-GGGCAGCATTACA--TTTCCCTGCAGCTAATGAGTCTTTCCTAGAAGGTGGAGGATTTTTTTCCCCTTTAGTTGAACTTCTGTTTCTTAGAATTGCAGATAATGCAGCAATAACTTATCGGAATTGGAGTATGTTCCACTAGGACTCATCATGAGCTAGACAAGCCTTCACCTACTCATAGGGAAGTTTATTTC---CCCCTTGTCATCCTGCTTCTAATTCATTGCTATTACATA--TGAATCATTTAGTTAAATCTTACCTTGTGTAACTTCTAGAGGGAACATGGCCCAGAGATATCA-TGGTGAGTCCAAATAAATGGGTTGTAGTAGTTGGCATTCTCCTTT--------------------------TGTTT----------------TGGCTGCCTAGTATCTCAAACTT-TTTACTGGCTTG-GAAAATCATAATATTAGGAGGCTTGGAGCTTATCTTT-CATAGTTGGATTTTTTATTgccaggtattagctcttctagcctcttttgcaggtacag-cacagggaggtactcttggttccaccaaggagatacagctacccccgattttgatttagaggctagtgatgcaagaaGAG i canFam3.chr15 I 2459 I 10 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=61452.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 297727 37 + 478999 CAACAATGTTGAAATATTGGCATAAGAAATGACAATG s panTro4.chrUn_GL393519 138906 37 + 413329 CAACAATGTTGAAATATTGCCATAAGAAATGACAATG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18641471 37 + 99152023 caacaatgttgaaatattggcataagaaatgacaata i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87934795 37 - 170124641 GAACAATGTTGAAATATTGGCATAAAAAATGACAATA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88212763 37 - 171882078 GAACAATGTTGAAATATTGGCATAAAAAATGACAATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85333657 37 - 162156779 GAACAATGTTGAAATATTGGcataaaaaatgacaata i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87627819 37 - 132174527 CAGCAAAGTTGAAATGTTGGCATAAAAATTGACAATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=358682.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 297764 305 + 478999 AACAggctgggcgcagtggcttgcgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggcggatcacgaagtcaagagaccaagaccatcctggctaacacggcgaaaccccgtctctagtaaaaatac--aaaaaaattagccgggcgtggtggctggcacccgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaaaggtgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcaccgctacactccagcctga--gacggagcaagactccgtctc--aattaaaaaaaaaaaaaaaaaa-------- s panTro4.chrUn_GL393519 138943 310 + 413329 AAGAggctgggcgcagtggctcgcgcctgtaatcccagcactttggtaggtcaaggcgggcggatcacgaagtcaagagatcaagaccatcctggctaacatggcgaaacgccgtctctagtaaaaatac--aaaaaaattagccgggcgtggtggctggcgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaaaggtgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcactgctgcactccagcctga--gatggagcaagactccgtctc--aattaaaaaaaaaaaaaaaaGA---CAATG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18641508 307 + 99152023 aagaggacgggcgtggtggctcgtgcctgtaaccccagcactttgggaggccgaggtgggcagatcacgaagtcaggagatcaagaccgttttggctaacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaaaaatcagcc-atcctggtggcaggtgactgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaacggcgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagccaagatcgcactgctgcactccagcctga--gagggagcaagactccgtttc--aattaaaaaaaaaaaaaaaaat-------g i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87934832 317 - 170124641 AAGAggccaggtgcagtggctcctgcctgaaatcccagcactttgggaggccgaggcgggcggatcacgaagtcaggagatcaagatcatcctggctaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaatac--aaaaaaattagccgggcatggtggcgggtgcctgtagtccccgctactcaggaggctgaggcaggagaatggcgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagccgagatggtgctactgtactccagcctgggtgacagagcaagactcagtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGACAATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88212800 315 - 171882078 AAGAggccaggtgcagtggctcctgcctgaaatcccagcactttgggaggccgaggcgggcggatcacgaagtcaggagatcaagatcatcctggctaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaatac--aaaaaaattagccgggcatggtggcgggtgcctgtagtccccgctactcaggaggctgaggcaggagaatggcgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagccgagatggtgctactgtactccagcctgggtgacagagcaagactcagtctc--aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGACAATG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85333694 315 - 162156779 aagaggccaggtgcagtggctcctgcctgaaatcccagcactttgggaggccgaggccggcggatcacgaagtcaggagatcaagaccatcctggctaacacggtgaaaccccacctctactaaaaatat--aaaaaaattagccaggcatggtggcgggtgcctgtagtccccgctactcaggaggctgaggcaggagaatggtgtgaactgggaggcggagcttgcagtgagctgagatggtgctactgcactccagcctgggtgacagagcaagactcagtctc--aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagacaatg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87627856 0 - 132174527 C a score=2582277.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 298069 1522 + 478999 aaaaaGGT-AGCACACTTGTTGCAGAAAAGACAAGTTCCTAGAACAGAATGACAGTGGTGCTCATGTAGCATCTTGGTGGCCTATAgcacagccatgactgcagtca---tgatttttcatcatcagttctgcatggtggtttgcatatgtatctttgaatttgagcctcaactttggctctttagctttcattggttctgtgagattcctgctactccatcaataagtcctttttcatttaca-taatcagctagagtcagcttttattggatgtaagtgagaacactggcagaATTATACTCTAATAGAGTTATCTCAGGTGGGTATAGTCTCTACAATCTGCAGAGGGCAAGAAG-AACTAACGCTTTGGCATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCACAGTGGTCTATGAAGCTTTATCCCTTAACATATTTTATTGAAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGAGGGTTTTAAGAtgtctgtgtgtgtctgga-tttttttcacttagcataatgttctacaggttcatccacatcgtcactaatggaagaatttctctattttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatatatcacattttgtgtatctactcatctgatgacaaataccta--ggttgcttccgtgtcttggttattgtgaataatgctgcaatgaatttggaagtacagatatctctttgacatattgatttcaatttctttggatatatgcccagaagggaaattgcttaatcatatggtaattctattttaagtgttttgtggaacttctatactgttttccacggttatattaatttacatttccaccaacagtgcacaaatgtttacttttctctgcaccctcagcaatacttatctttcatctttttggtgatagccattctaacagatatgaggtgatacttcattCagttgaactctt----aaaagtagagagtagaatggtggttaactaaggctggagggaagaggcggctgaggggaggagagatggtgatcaaagg------atacaacaattcagtttgatggaaggaataagatttagtgatctgtttcatagaatggtgactataataaataataatgcaccacatatttagaaactactaaaagagtggatttcaaatgttttaaccacaaaaaataagtataggaga---------tgatgaatttattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtaaatgattatcaaaacatcacattgtatcccataaatatataattatcatgtgttcattagaaataaaaTTTAAC-----AAATAATAAAAGAGGTATATGTTCACAGAAAAAACTTGAATATGAAGTCTAATGTAGACTGGATATTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAACATATTGGAGACAACATCACAAACACCTCTCTTTCCTATCCCCCTAATTTTTGTGCCTTAGTTAAAAATATGAAAATTTCAGAGTGTTGGCAGGTGATCAGGTTAAGTAAAGAA s panTro4.chrUn_GL393519 139253 1520 + 413329 AAGAAGGT-AGCACACTTATTGCAGAAAAGACAAGTTCGTAGAACAGAATGACAGTGgtgctcatgtagcatcttggtggcctatagcacagctatgactgcagtca---tgatttttcatcatcagttctgcatggtggtttgcatatgtatctttgaatttgagcctcaactctggctcttcagctttcattggttctgtgagattcctgctactccatcaataaatcctttttcgtttacaataatcagctagagtcagcttttattggatgtaagtgagaacactggcagaATTATACTCTAATAGAGTTATCTCAGGTGGGTATAGTCTCTACAATCTGCAGAGGGCAAGAAG-AACTAACGCTTTGGCATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCGCAGTGGTCTATGAAGCTTTATCCCTTAACATATTTTATTGAAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGAGGATTTTAAGATGCCTAtgtgt--ctgga-tttttttcacttagcataatgttctacaggttcatccacatcgtcactaatggcagaatttctctattttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatatatcacattttgtgtatctactcatctgatgacaaataccta--ggttgcttccatgtcttggttattgtgaataatgctgcaatgaatttgggagtacagatatctctttgacatactgatttcaatttctttggatatatgcccagaagggaaattgctcaatcatatggtaattctattttaagtgttttgtggaacttctatactgttttccacggttatattaatttacatttccaccaacagtgcacaaatgtttacttttctctgcaccgtcagcaatacttatctttcatctttttggtgatagccattctaaccgatatgaggtgatacttcattCagttgaactctt----aaaagtagagagtagaatggtggttaactaaggctggagggaagaggcggctgaggggaggag-catgttgatcaaagg------atacaacaattcagttagatggaaggaataagatttagtgatctgtttcatagaatggtgactataataaataataatgcaccatatatttagaaactactaaaagagtggatttcaaatgttttaaccacaaaaaataagtataggaga---------tgatgaatttattaattatcttgatttaatcatttcacaatgtaaacgattatcaaaacatcacattgtatcccataaatatataattatcatgtgttcattagaaataaaaTTTAAC-----AAATAATAAAAGAGGTATATGTTCATAGAAAAAACTTGAATATGAAGTCTAATGTAGACTGGATGTTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAACATATTGGAGACAACATCACAAACACCTCTCTTTCCTTTCCCCCTAATTTTTGTGCCTTAGTTAAAAATATGAAAATTTCAGAGTGTTGGCAGGTGATCAGGTTAAGTAAAGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18641815 1528 + 99152023 aagaaggt-agcacacttattgcagaaaagacaagttgccagaacagaatgacagtggtgctcatgtagcattttggtggccgatagcacagccatggctgcagtcatgttgatttttcatcttcagttctgcacgatggtttgcatatgtatctttgaatttgagcctcaactctgg--cttcagctttcattggttctgtgagattcctactactccatcaataaatcctttttcatttaca-taatcaactacagttagcttttattggctgtaagtaagaacactggcagaATTATACTCTAATAGGGTTATCTC----GGGCAAAGTCTCTACAATCTGCAGAGGGCAAGAAG-AACTAACGCTTTGGGATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCACAGTGGTCTATGAAGCTTTATCCCTTAACATATTTTATTGTAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGAGGATTTTAAGAtgtctgtgtgtgtctggc-tttttttaacttagcataatgttctacaggttcatccacattgtcactaacggcagaatttctctattttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatatatcacattttgtgtatctacccatctcatgacaaataccta--ggttgcttccatgtcttggttattgagaataatgctgcaatgaatttaggagtactgatatctctttgacatactcatttcaatttctttggatatgtgcccagaagtgaaattgcttaatcatatggtagttctatttt-tgtgttttgtggaacttctatactgttttccatggttatattaatttacatttccaccaacagtgcacaaatgtttacttttctctgcaccctcagcaatacttatctttcatctttttgatgatagccattct-acagatatgaggtgatacctcattCagttgaactctt----agaagtagagagtagaatggtggttaactaaggctggatggaagaggtggctgaggggaggagagatgtcgatcaaaggatcaacatctaacaattcagttagatggaaggaataagatttagtgatctctttcatagaatggtgactataataaataataatgcaccatatatttagaaactactaaaagagtggatttcaaatgttttaaccacaaaaaataagtacaggaga---------tgatgaatttattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtaaatgattatcaaaacatcacattgtatcccataaatatataattatcatgtgttcattagaaataaaaTTTAACAAATAAAATAATAAAAGAGGTATATGTTCACAGGAAAAACTTGAATATGAAGTCTAACCTAGACTGGATGTTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAACGTATTGGAGACAACATCACAAACACCTCTCTTTCCTTTCCCCCTAATTTTTGTGCCTTAGTTAAAAATATGAGAATTTCAGAGTGTTGGCAGATGATCAGGTTAAGTAAAGAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87935149 1536 - 170124641 AAGAAGGTAAGCACACTTATTGCAGAAAAGACAAGTTCCTAGAACAGAATGACAGTGGTGCTCATGTAGCAGCTTAGTGGCCCATAgcacagtcatggctgcagtcatgtcgatttttcatcaccagttctgcatggtggtttgcatatgtatctttgaatttgagcctcaattatggttcttcagctttcgttggttctgtgagattcctgctactccatcaacaaatcc-ttttcattgaca-taatcagctagagtcagcttttattggatgtaagtaagaacactggcagaATTATACTCTGATAGAGTTATCTCAGGTGGGTATAGTCTCTACACTCCGCAGAGGACAAGAAG-AACTAGTGCTTTGGGATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCACAGTGGTCTATGAAGCTTTATCCCTTAACATATTTTATTATAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGAGGATTTTGAGAtgtctgtgtgtgtctggcttttttttcacttagcataatgttctacagattcatccacattgtcactaatggcagaatttctcta-tttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatgtatcacattttgtgtatctactcatctgatgacaaatacctactgtgtgcttccatgt--------ctgtgaataatgctgcaatgaatttgggagtgcagatatctctttgacatactgatttcagtttctttggatatatgcccagaagtgaaattgcttaatcatatggtaattctatttttagtgttttgtggaacttctatattgttttccatggttatattaatttacatttccgccaacagtgcacgaatgtttacttttctctgcaccttcagcaatacttatctttcatctttttgatgatagccattctaacagatatgaggtgatagctcattCagttgaactcttaaaaaaaaaaagagagtagaatggtggttaactaaggctggaggggagaggtcgctgaggggaggagagatgttgatcaaagg------atacaacaattcagttagatggaaagaataagatttagcaatctctttcatagaatggtgactataataagtaataatgcactgtatatttagaaactactaaaagagtggatttcaaatgttttaaccacaaaaaataagtataggagatgatgaatttgatgaatttattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtgaatggttatcaaaacagcacattgcatcccataaatacataattatcatgtgttcattggaaataaaaTTTAACAAATAATATAATAAAAGAGGTATATGTTCATAGAAAAAACCTGAATATGAAGTCTAATGTAGACTGGATGTTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAGCGTATAGGAGACAACATCACAAACACCTCTCTTTCCTTTCCCCCTAATATTTGTGCCTTAGTTAAAAACATGAAAG-TTCAGAGTGTTGGCAGGTGATCAGATTAAGTAAAGAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88213115 1542 - 171882078 AAGAAGGTAAGCACACTTATTGCAGAAAAGACAAGTTCCTAGAACAGAATGACAGTGGTGCTCATGTAGCAGCTTAGTGGCCCATAgcacagtcatggctgcagtcatgtcgatttttcatcaccagttctgcatggtggtttgcatatgtatctttgaatttgagcctcaattatggttcttcagctttcattggttctgtgagattcctgctactccatcaacaaatcc-ttttcattgaca-taatcagctagagtcagcttttattggatgtaagtaagaacactggcagaATTATACTCTGATAGAGTTATCTCAGGTGGGTATAGTCTCTACACTCCGCAGAGGACAAGAAG-AACTAGTGCTTTGGGATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCACAGTGGTCTATGAAGCTTTATCCCTTAACATATTTTATTATAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGAGGATTTTGAGAtgtctgtgtgtgtctggcttttttttcacttagcataatgttctacagattcatccacattgtcactaatggcagaatttctcta-tttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatgtgtcacattttgtgtatctactcatctgatgacaaataccta--ggttgcttccatgtcttggttactgtgaataatgctgcaatgaatttgggagtgcagatatctccttgacatactgatttcagtttctttggatatatgcccagaagtgaaattgcttaatcatatggtaattctatttttagtgttttgtggaacttctatattgttttccatggttatattaatttacatttccgccaacagtgcacgaatgtttacttttctctgcaccttcagcaatacttatctttcatctttttgatgatagccattctaacagatatgaggtgatagctcattCagttgaactcttaaaaaaaaaaagagagtagaatggtggttaactaaggctggaggggagaggcggctgaggggaggagagatgttgatcaaagg------atacaacaattcagttagatggaaagaataagatttagcaatctctttcatagaatggtgactataataagtaataatgcactgtatatttagaaactactaaaagagtggatttcaaatgttttaaccacaaaaaataagtataggagatgatgaatttgatgaatttattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtgaatggttatcaaaacagcacattgcatcccataaatacataattatcatgtgttcattggaaataaaaTTTAACAAATAAAATAATAAAAGAGGTATATGTTCATAGAAAAAACCTGAATATGAAGTCTAATGTAGACTGGATGTTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAGCGTATAGGAGACAACATCACAAACACCTCTCTTTCCTTTCCCCCTAATATTTGTGCCTTAGTTAAAAACATGAAAG-TTCAGAGTGTTGGCAGGTGATCAGATTAAGTAAAGAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85334009 1530 - 162156779 aagaagGTAAGCACACTTATTGCAGAAAAGACAAGTTCCTAGAACAGAATGACAGTGGTGCTCATGTAGCAGCTTAGTGGCCCATAGCATAGTCATGGCTGCAGTCATGTCGATTTTTCATCACCAGTTCTGCATGGTGGTTTGCATATGTATCTTTGAATTTGAGCCTCAATTATGGTTCTTCAGCTTTCATTGGTTCTGTGAGATTCCTGCTACTCCATCAACAAATCC-TTTTTATTGACA-TAATCAGCTAGAGTCAGCTTTTATTGGATGTAAGTAAGAACACTGGCAGAATTATACTCTGATAGAGTTATCTCAGGTGGGTATAGTCTCTACAATCCGCAGAGGACAAGAAG-AACTAGTGCTTTGGGATTGCAGGTTGCTCTGAATTCTCCCTTAGCTCCACAGTGGTCTATGAAGCTTTATCccttaacatattttattatagaaaatatttcaaaagtcaaAATAACTTGGAAGAGGATTTTgagatgtctgtgtgtgtctggcttttttttcacttagcataatgttctacagattcatccacattgtcacTAATGGcagaatttctcta-tttttaagggccaaatagtattccactgtgtgtatgtatcacattttgtgTATCTACTCATCTGATGACAAATA-cta--ggttgcttccatgtcttggttactgtgaataatgctgcaatgaatttgggagtgcagatatctctttgacatactgatttcagtttctttggatatatgcccagaagtgaaattgcttaatcatatggtaattctatttttagtgttttgtggaacttctatattgttttccatggttatattaatttacatttccgcCAACGGTGCACGAATGTTTACTTTTCTCTGCACCTTCAGCAAtacttatctttcatctttttgatgatagccattctaacagatatgaggtgatagctcattcagttgaactctt-aaaaaaaaaagagagtagaatggtggttaacTAAGGCTGGAGGGGAGAGGCAGCTGAGGGGAGgagagatgttgatcaaagg------atacAACAATTCAGTTAGATGGAAAGAATAAGATTTAGCGATCTCTTTCATAGAATggtgactataataaataataatgcacTGTGTATTTAGAAACTACTAAAAGAGTGGATTTCAAATGTTTtaaccacaaaaaataagtataggAGA---------TGATGAatgtattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtgaatggttatcaaaacatcacattgtatcccataaatacgTAATTATCATGTGtttattggaaataaaatttaacaaataaaataataaaagaggtaTGTGTTCATAGAAAAATCTTGAATATGAAATCTAATGTAGACTGGATGTTTTTAGTCAAATCATTAACTTTCTCTTCAGCATATAGGAG--AACATCACAAAcacctctctttcctttccccctaATATTTGTGCCTTAGTTAAAAACATGAAAGTTTCAGAGTGTTGGCAGGTGATCAGATTAAGTAAAGAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87627856 1497 - 132174527 AAGAAGGT-AGCACACTTATTGCAGAAAAGACGAGTTCCTGGAACAGAATGACAGTAGTGCTTATGTAGCACCTTGGTGGCCCATGGCACAGCCATGGCTGCAGTCACGTTGATTTTTCATTACCATTTCTGCATGGTGGTTTGCATATGTATATTTGAATTCAAGTCTCAACTCTGATTCTTCATCTTTCATTGGTTCTGTGAGATTCCTGCTACTCCATCAATACATC--TTTTCATTGACA-TAATCAACCACAGTCAGCTTTTATTGGATGCAAGTAAGAACCCTGGCAGAATTATACTCTAATAGAGTTACCTCAGGTAGGTATACTCTCTACAATCTGCAGAGGGCAAGAAGAAACTAACACTTTGGGGTTGCAGATTGCTCTGAATT---------CTCCACAGTGGTCTGTGAAGCTTTATCCCTTAACATGTTTTATTATAGAAAATATTCCAAAAGTCAAAATAACTTGGAAGGGGATTTTAAGAtgtctgtttatgtctg----ttttttcatttagcataatattctacaggttcacccatgttgtcactaatggcagaatttctcta-tttttaagggtcaaatagtattccactgtgtatatatattatattttgtttacctacttatctgatgatggatacaca--ggttgcttccatgtcttggttattgtaaataatgctgcaatgaatttgggagtgcagatatctctttgacatactgatttcaatttctttggttatatacccagaagtgaaattgcttaatcatatggtaattctatttttagtgtcttgtggaacttctatactttttttgatggttatattaatttacatttcaatcgacagtacccaagtgtttccttttctcctcatcctcatcaacgcttatcttccattgttttcatgatagccattctaacagatatgaggtgatagctcattCagttgaactctt----aaaagtagagagtggaatggtgcttaactgaggctggagggaagaggtggctgcgggaaggagagatgttgatcaaagg--gtacacacaacaattcagttagatgggaggaatagaatttagtgacctttttcatagaatggtgactataataaataatattgcactgtatatttaaaaac------aaaagtgaatttcaaatgttttaaccacaaaaaatgagtataga------------tgatgaatttattaattagcttgatttaatcatttcacaatgtaaacgattatcaaaacatcaaattatattccataaatatataATTTGCA--TGTTTATTAGATATAAAATTTAACAAATACAATAACAAAAGAGGCATATGTTCATAGAAAAACCTTAAATATGAAGTCTTATGTAGTTTGGATGTTGTTAGTCAAA-CATTAACTTTCTCTTCAATGTATTGGAGACATCATCACAAACACC-----------TCCCCGTAATTTTTGTGCCTTAGTTAAAAATATGAAAATTTCAGACTGTTGGCAGATGATCAGGTTAAGTAAAGAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=14630.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 299591 11 + 478999 GTTTATGTTAA s panTro4.chrUn_GL393519 140773 11 + 413329 GTTTATGTTAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18643343 11 + 99152023 GTTTATGTTAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87936685 11 - 170124641 GTTTATGTTAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88214657 11 - 171882078 GTTTATGTTAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85335539 11 - 162156779 GTTTATATTAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87629353 0 - 132174527 C a score=89568.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 299602 390 + 478999 GTGGTGACttttttaaattttttatttatttattttttatttatATGTAttttttattatactttaagttctagggtacatgtgcacaatgtgcaggtttgttacatatgtatgcatgtgccatgttggtgtgctgcacccattaactcgtcatttacattaggtatatctcctaaagctatccctccctcctctccccaccccacaacaggccccggtgtgtgatgttccccttcctgtgtccaagtgttctcattgttcaattcccacctacgagtgagaacatgcggtgtttgtttttttgtccttgagatagtttgctgagaatgatggtttccagcttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcaaacattttttatggct s panTro4.chrUn_GL393519 140784 388 + 413329 GTGGTGACTGCtttt--tttattttttatttattttttatttatatGTAttttttattatactttaagttctagggtacatgtgcacaatgtgcaggtttgttacatatgtatgcatgtgccatgttggtgtgttgcacccattaactcatcatttacattaggtatatctcctaatgctatccctccctcctctccccaccccacaacaggccccggtgtgtgatgttccccttcctgtgtccaagtgttctcattgttcagttcccagctatgagtgagaacatgtggtgtttgtttttttgtccttgagatagtttgctgagaatgatggtttccagcttcatccatgtccctacaaaggacgtgaactcaatcattttttatggct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18643354 363 + 99152023 GTGGTGACTGCTttt-------------tttattttttatttata------------aataaataaagttctagggtacatgtgcacaatgtgcaggtttgttacatatgtatacatgtgccatgttggtgtgctgcacccattaactcgtcatttacattaggtatatctcctaatgctattcctcccccctcccccaaccccacaactgtccccggtgtgtgatgtgccccttcctgtgtccatgtgttctcattgttcaattcccacctatgagtgagaccatgcggtgtttggttttttgtccttgcaatagtttgctgagaatgatggtttccag-ttcatccatgtccctacaaaggacatgaactc-atcattttttatggct i ponAbe2.chr15 C 0 M 5933 e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85335550 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88214668 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87936696 0 - 170124641 C e calJac3.chr10 87629353 0 - 132174527 C a score=3921.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 299992 45 + 478999 gcatagtattccatggtgtagatgcaccacattttcttaatccag s panTro4.chrUn_GL393519 141172 45 + 413329 gcatagtattccatggtgtatatgcgccacattttcttaatccag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18643717 5933 + 99152023 M e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85335550 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88214668 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87936696 0 - 170124641 C e calJac3.chr10 87629353 0 - 132174527 C a score=101252.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 300037 85 + 478999 GTGGTGACTGCTTTAAGGTAGCTTATATTTTGGTTGATAGAGTTGATTCCCTGATATCCTATGTTTATTTTCTGTAACAGTAGAT s panTro4.chrUn_GL393519 141217 85 + 413329 GTGGTGACTGCTTTAAGGTAGCTTATATTTTGGTTGATAGAGTTGATTCCCTGGTATCCCATGTTTATTTTCTGTAACAGTAGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87936696 85 - 170124641 GTGGTGACTGCTTTAAGGTTGCTTATATTTTGGTTGATAGAGTCGATTCCCTGGTATCCCATGTTTATTTTCTGTAACAGTAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88214668 85 - 171882078 GTGGTGACTGCTTTAAGGTTGCTTATATTTTGGTTGATAGAGTCGATTCCCTGGTATCCCATGTTTATTTTCTGTAACAGTAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85335550 85 - 162156779 GTGGTGACTGCTTTAAGGTTGCTTATATTTTGGTTGATAGAATTGATTCCCTGGTATCccatgtttattttctgtaacaGTAAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87629353 75 - 132174527 GTGGTGACTGC----------CACTTATTTTGGTTGATAGAGTTGATTCCCTGGCTTCCCATGGTTATTTTCTGTAACAGTAAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18643717 5933 + 99152023 M e canFam3.chr15 46713769 10 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1129368.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 300122 776 + 478999 GTTTCTTCACTATAAGCTCA--AAGTATAGAAGCCCAGGTTTGAGTAAGAAATATTTAATTATTTGGCATATTTGAATGTATGCATGCCCTTCTATGCATTCTCTTCAGAGCTGGAACAGGAATTTCCCTTAAGAA---TCTATACCATTTCTAGTTTTTATTTGCTGCGCACCATGAACACCTTACCAAGACTTAGTAATAAGGAAAATACAAATTAAAAAACATTCTTGTTTCAGTGACGGATTCTCGTTCTTTGATATTATAGATAAAGCAATTTAATTTTTGTGAGTACAGTGAGTAGATGCTGTTTTTCATTATAGAAAAACCTATAGTTGGCAAGGAAAAAACAGTTGATAAATTTAAAACACATTTAAGATACATAAAGTTGCATTAGGAT-AAAGCCAAAATACAAATTAGAAACATGGGTCTTAGCTTTGTACATACCAACTGAATTACATATAGTTTTAGGACTTAAAAAA-TCTCCAAAATGGAAAAATGATACATAGATGAATAAAAATTGTACAGATCTTACCTACGATGAA-ACTTAGGACTTTGTATACTTTTTGCTTTGAGATAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCACGCTTTTATGAG--TAAGAAGCCAAGTGCTCAGACATCACCAGAAAATAGTTT--TTTTTTAAAATGAGAGAAATTTTGCATTTCTTATGGAATAATTGTAGAAGAATGTATATCATTTCAGTGTGTTCCAATATATTTCTTTTGATGGCACTCCCAGCACTTTTTTAAGGGCATCTG s panTro4.chrUn_GL393519 141302 750 + 413329 GTTTCTTCACTATAAGCTCAGAAAGTATAGAAGCCCAGGTTTGAGTAAGAAATATTTAATTATTTGGCATATTTGAATGTATGTATGCCCTTCTATGCATTCTCTTCAGAGCTGGACCAGAAATTTCCCTTAAGAA---TCTATACCATTTCTAGTTTTTATTTGCTGCACACCATGAACACCTTACCAAGACTTAGTAATAAGGAAAATACAAATTAAAAAACATTTTTGTTTCAGTGACGGATTCTTGTTCTTTAATATTATAGATAAAGCAATTTAATTTTTGTGAGTACAGTGAGTAGATGCTGTTTTTCATTATAGAAAAACCTATAGTTGGCAAGGAAAAAACAGTTGATAAATTTGAAACACATTTAAGATATATAAAGTTGCATTAGGAT-AAAGCCAAAATACAAATTAGAAACATGGGTCTTAGCTTTGTAGATACCAACTGAATTACATATAGTTTTAGGACTTAAAAAAATCTCCAAAATGGAAAAATGAT---------------------------CTTACCTACGATGAA-CCTTAGGACTGTGTATACTTTTTGCTTTGAGATAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCACGCTTTTATGAGAGTAAGAAGCCAAGTGCTCAGACATCACCAGAAAA--GTTT--TTTTTTAA--CGAGAGAAATTTTGCATTTCTTATGGAATAATTGTAGAAGAATGTATATCATTTCTGTGTGTTTCAAGATATTTCTTTTGATGGCACTCCCAGCACTTTTTTAAGGGCATCTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87936781 777 - 170124641 GTTCCTTCACTATAAGCTTAGAAAGTATAGAAGCCCAGGTTTGAGTAAGAAATATTTAATGATTTGGCATATGTGAATGTATGCATGCCTTTCTATGTATTCTCTTCAGAGCTGGGCCAGGAATTTCCCTTAAGAA---ACTATACCATTTCTAGTTTTTACTTGCTGCGCACCATGAACATCTTACCAATACTTAGTAATAAGGAAAATACACATT-AAAAAAATTCCTATTTCAGTGACAGATTCTTGGTCATTGATATTATAGATAAAGCAATTTAATTTTTGTGAGTATAGTGAGTAG-TGCTGTTTTTCATTATAGGAAAACCTAGAGTTGGCAAGGAAAGAATAGTTGATAAATTGGAAACACATTTAAAATATATAAAGTTGCATTAGGAT-AAGGCCAAAATACAAATTAGAAACATGGGTCTTAGCTTTGTATAT-CCAACTGAATTACATATAGTTTTAGGACTTAAAAAAATCTCCAAAAGGGAAAAATGATACATAGATGAATAAAAATTGTACAGAGCTTATCTACAATGAA-CCTTAGGGCTGCATTTACTTTTTGCTTTGAGATAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCATGCTTTTATAAGAGTAAGAAGTCAAATGCTCAGACATCACCAGAAAATAGTTT--TTTTTTTA-ATGAGAGAAATTTTGCATTTCTTATGGAATAATGGTAGAAGAATGTATATCATTTCTGTGTGTTTCAAGATATTTCTTTTGACGGCACTCCAAGCACTTTTTGAAGTGCATCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88214753 777 - 171882078 GTTCCTTCACTATAAGCTTAGAAAGTATAGAAGCCCAGGTTTGAGTAAGAAATATTTAATGATTTGGCATATGTGAATGTATGCATGCCTTTCTATGTATTCTCTTCAGAGCTGGGCCAGGAATTTCCCTTAAGAA---ACTATACCATTTCTAGTTTTTACTTGCTGCGCACCATGAACATCTTACCAATACTTAGTAATAAGGAAAATACACATT-AAAAAAATTCCTATTTCAGTGACAGATTCTTGGTCATTGATATTATAGATAAAGCAATTTAATTTTTGTGAGTACAGTGAGTAG-TGCTGTTTTTCATTATAGGAAAACCTAGAGTTGGCAAGGAAAGAATAGTTGATAAATTGGAAACACATTTAAAATATATAAAGTTGCATTAGGAT-AAGGCCAAAATACAAATTAGAAACATGGGTCTTAGCTTTGTATAT-CCAACTGAATTACATATAGTTTTAGGACTTAAAAAAATCTCCAAAAGGGAAAAATGATACATAGATGAATAAAAATTGTACAGAGCTTATCTACAATGAA-CCTTAGGGCTGCATTTACTTTTTGCTTTGAGATAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCATGCTTTTATAAGAGTAAGAAGTCAAATGCTCAGACATCACCAGAAAATAGTTT--TTTTTTTA-ATGAGAGAAATTTTGCATTTCTTATGGAATAATGGTAGAAGAATGTATATCATTTCTGTGTGTTTCAAGATATTTCTTTTGACGGCACTCCAAGCAGTTTTTGAAGTGCATCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85335635 776 - 162156779 GTTCCTTCACTATAAGCTTAGAAAGTATAGAAGCCCAGGTTTGagtaagaaatatttaatgatttgGCATATGTGAATGTATGCATGCCTTTCTATGTATTCTCTTCAGAGCTGGGCCAGGAATTTCCCTTAAGAA---ACTATACCATTTCTAGTTTTTCCTTGCTGCGCACCATGAACATCTTACCAATACTTAGTaataaggaaaatacaaattaaaaaaaattcctatttcAGTGACAGATTCTTGGTCATTGATATTATAGATAAAgcaatttaatttttgtgagtacagtGAGTAG-TGCTGTTTTTCATTATAGAAAAACCTAGAGTTGGCAAGGAAAGAATAGTTGATAAATttgaaacacatttaaaatatataaagttgcATTAGGAT-AAGGCCAAAATACAAATTAGAAACATGGGTCTTAGCTTTGTATAT-CCAACTGAATTACATATAGTTTTAGGActtaaaaaaatctccaaaagggaaaaatgataCATAGATGAATAAAAATTGTACAGAGCTTACCTACAATGAA-CCTTAggactttgtttactttttgctttGAGATAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCATGCTTTTATGAGAGTAAGAAGCCAAATGCTCATACATCAccagaaaatagttt--tttttt---atgaGAGAAATTTTGCATTTCTTATGGAATAATGGTAGAAGAATGTAtatcatttctgtgtgtttcAAGATATTTCTTTTGGTGGCACTCCAAGCACTTTTTGAAGTGCATCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87629428 771 - 132174527 GTTCCTT-----TAAGCTCAGAAAGTATAGAAGCCCAGGTTTGAGTAAGAA--ATTTAATGATTTGGCATGTGTGAATGTATGCACACCCTTCTATGTATTCTCTTCAGAGCTGGA-CAGGAATTTCCCTTAAGAA---ACTATACCACTTCTTGTTTTTATTTGCTGCACACCATGGACACTTTATCAATACTTAGTAATAAGGAAAATACAAATTTAAAAATATTCCTGTTTTAGTTTCAGATTCTCAGTCTTTGATATTATAGATAAAACAATTTAATTTTTGTGAGTACAGTGAGCAGATACTGCTTTTCATTATAGAAAAACCTGTAATTGGCTAGAAAAAAATAGTTGATAAATTTGAAGCACATTTAAAATACATAACATAACATTAGGAT-AAGGCCAAAATACAAATTAGAAACATGAGTCTTAGCCTTGTACATACCAACTGAATTACATATAGATTTAGGACTTAAAAAAATCTCCAAAATGGAAAAATGATACATAGATGAATAAAAATCATACAGAGCCTACCTACAATGGACCCTCAGGACTGTGTATACTTTTGCTTTCGAGACAGGATCAGGGCTCTTTGTGTGTAATGAGTCACACTTTTATAAGAGTAAGAAGCCAAATGCTCAGACATCACCAGAAAACA--TT--TTTTTTAA-ATGAGAGAAATTTTGCATTTCTTGGAGAATAATGGTAGAAGAATGCGTATCATTCCTGTGTATTTTAAGATATTTCTTTTGATGGCACTCCCAGCACTTTTTAAAGTGCATCTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46713779 762 - 64190966 GTTCCTCTACTAAAATCTTAGAAGGTGCTGAAACCCAGGTCTGGGTAAGGAATACTTAATGATTTGGCATGTGTGAAT-TGTGCATGTCTTTCTATGTATCCTCTTCAAAATTGGACTAAGAATTTTCTGTTAGAAGCGACCATATTATTCCCCATTTTCATTTGCTGCACACCCTGAACACTTTACCAATGCTTGGTAGT-----AAACACAAGTGAAAAAACACTACTCTTTCAGCGACAGATACTGGATTCTCAATCTTATAAATAAAGCAATTGAAATTTTGTTAGTGCAGTGAGTAGATGCTATATTTCATTATAGAAAGATCTGTAATTGG-AAAGAAAAAATAGT------------GATACATTTGAAACACAAAAAATAATATTAGGATAAAAGCCAAGATACAAGATGGTAGCTTGAGTCTTAGCTTTGTACATATCAACCTGATTACATCAGCTTTCAGACTTCAAAAAAATGACCAAAACAGAGAGATGACTCATTGATGAATGAAAACTCTACAGAACTT-TCCACGGTAGACCTTTATGATTGTGGGTATTTTCT--TTCAAGACAGGATGAGGGTTCTTTGTGTGTAACGAGTCACACTTTCATGAGAGTAAGGGATCAAATACTCAGACATGCTCAGAAGATAGTTTTATTCTCTCA-ATGAGAGAAATTTGGTATTCCTGAGAGAATGA---TAGGAAATTTTATATCATTTCTCTGTATTTTTAGAAATTTCTTTTGATGATGCTCCCAGGACTTTCTTGAGTGCATCTT i canFam3.chr15 I 10 C 0 e ponAbe2.chr15 18643717 5933 + 99152023 M e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=102727.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 300898 46 + 478999 TCATATCTTTGTTCCAGAGACTGTAGGTCAGGGGATTAAAGAATGG s panTro4.chrUn_GL393519 142052 46 + 413329 TCATATCTTTGTTCCAGAGACTGTAGATCAGGGGATTAAAGAATGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 80520567 46 - 99152023 TCATATCCTTGTTCTGGAAACTGTAGATCAGGGAATTAAAGAATGG i ponAbe2.chr15 n 0 I 272 s rheMac3.chr7 87937558 46 - 170124641 TCATATCTTTGTTCCAGAGGCTGTAGATCAGGGTATTAAAGAATGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88215530 46 - 171882078 TCATATCTTTGTTCCAGAGGCTGTAGATCAGGGTATTAAAGAATGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85336411 46 - 162156779 TCATATCTTTGTTCCGGAGGCTGTAGATCAGGGGATTAAAGAATGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87630199 45 - 132174527 TCATATCTTTGTTC-AGAGGCTGTAGATCAGGGGATTGAAGAATGG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46714541 46 - 64190966 TCATATCTTTGTTTCGAAGGCTGTAGATCAGAGGATTAAAGAAAGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=491736.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 300944 273 + 478999 GGTTGCTGTGCAGTAAAACAATGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGCGGCTCCTGGAGCCTGGACTCACATACATCACCATGACTGAGCCATAGAAGAAAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACATGTAGAGAAAGCTTTGTTCCTGCCTGAGCCAGCTGGGACCCACAGAACAGCTCGCAAAACTAAGATATGGGACCCAAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTACTGTAGCACAAGTCAGAGTAGTTTTGGGAAC s panTro4.chrUn_GL393519 142098 273 + 413329 GGTTGCTGTGCAGTAAAACAATGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGTGGCTCCTGGAGCCTGGACTCACATACATCACCATGACTGAGCCATAGAACGAAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACATGTAGAGAAGGCTTTGTTCCTGCCTGAGCCAGCTGGGACCCACAGAACAGCTTGCAAAACTAAGATATAGGACCCAAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTACTGTAGCACAAGTCAGAGTAGTTTTGGGAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87937604 273 - 170124641 GGTTGCCATGCAGTAAAACAATGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGTGGCTCCTGGAGCCTAGACTCACATACATCACCATGACTGAGCCGTAGAACAGAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACACGTAGAGAAAGCTTTGTTCCTGCCTGAGCCAGCTGGGACCTGCAGAACAGCTCACAAAACTAAGATATAGGATCCAAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTACTGTAGCACGAGTCAGAGCAGTTTTGGGAAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88215576 273 - 171882078 GGTTGCCATGCAGTAAAACAATGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGTGGCTCCTGGAGCCTAGACTCACATACATCACCATGACTAAGCCGTAGAACAGAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACATGTAGAGAAAGCTTTGTTCCTGCCTGAGCCAGCTGGGACCTGCAGAACAGCTCACAAAACTAAGATATAGGATCCAAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTACTGTAGCACGAGTCAGAGCAGTTTTGGGAAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85336457 273 - 162156779 GGTTGCCATGCAGTAAAACAATGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGTGGCTCCTGGAGCCTAGACTCACATACATCACCATGACTGAGCCGTAGAACAGAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACATGTAGAGAAAGCTTTGTTCCTGCCTGAGCCAGCTGGGACCTGCAGAACAGCTCACAAAACTAAGATATAGGATCCAAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTACTGTAGCACGAGTCAGAGCAGTTTTGGGAAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87630244 273 - 132174527 GGTTGCCATGCAGTAAAACGGTGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGGTGGCTCCTGGAGCCTGGACTCACATACATCACCACGACTGAGCCATAGAACAGAGAAACAACCAAGAAATGGGAAGCACATGTGGAGAAAGCTTTGTTCCAGCCTGAGCCAGCTGGGACCCGCAGAACAGCTCGCAAAACTAGGGTATAGGACCTGAGAATGTAGAGGAAGGTGATGAAGATGATGAGAGAGCTTATGGTAGCATAAGTCAGAGTAGTTTTAGGAAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46714587 273 - 64190966 GGTTGCCATGCAGTAAAACAAGGTCACAAATTTCTGTGTCCCAGGATGGCTCCTGGATCCTGGACTCACATACATCACCATGACTGAGCCATAGAACAAGGAAACCACCAAGAAATGTGAAGCACATGTAGAAAAAGCTTTGTTCCTACCTGAGCCAGCTGGGACTCGAAGTACGGCTCGCAAAACTAAGGTATAGGATCCAAGGATGTAGAGAAAAGTGATGAAGATGATAAGGGAGCTTACGGTAGCACAAGTTAGAGTAGTTTTGGGAAC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 80520613 272 - 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=121085.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 301217 51 + 478999 TGGGGCACAGGACAGTGCCAGCAATGGTCCCAGGTTACAGAAAAAATGGTC s panTro4.chrUn_GL393519 142371 51 + 413329 TGGGGCACAGGACAGTACCAGCAATGGTCCCAGGTTACAGAAAAAATGGTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 80520885 51 - 99152023 TGGAGCACAAGACAGCACCAGCAAAGGTGCCAGATCACAGAAAAAATGGTC i ponAbe2.chr15 I 272 I 121 s rheMac3.chr7 87937877 51 - 170124641 TGGGGCACAGGACAGTACCAGCAATGGCCCCAGGTCACAGAAAAAATGGTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88215849 51 - 171882078 TGGGGCACAGGACAGTACCAGCAATGGCCCCAGGTCACAGAAAAAATGGTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85336730 51 - 162156779 TGGGGCACAGGACAGTACCAGCAATGGCCCCAGGTCACAGAAAAAATGGTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87630517 51 - 132174527 TGGGGCACAGGACAGTGCCAGCAATGGTCCTAGGTCACAGAAAAAATGGTC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46714860 51 - 64190966 TGGAGCACAGGACAGAGCCAGCAGTGGTCCCAGGTCACAGAAAAAATGGTC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=206947.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 301268 121 + 478999 AGTGATGTTAGGGCCACAGAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATGGATAGAAAACCACCTGCCCTGCAGAAGGCCACTAATCGGACACACAGGTGGTGAGTCATGACT s panTro4.chrUn_GL393519 142422 121 + 413329 AGTGATGTTAGGGCCACAGAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATGGATAGAAAACCACCTGCCCTGCAGAAGGCCACTAATCAGACACACAGGTGGTGAGTCATGACC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87937928 121 - 170124641 AATGATGTTAGGACCACACAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATAGATAGAAAACCACCTGCCCAGCAGAAGACCACTAATCGGGCACACGGGTGGTAAGTCATGATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88215900 121 - 171882078 AATGATGTTAGGACCACACAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATAGATAGAAAACCACCTGCCCAGCAGAAGACCACTAATCGGGCACACGGGTGGTAAGTCATGATG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85336781 121 - 162156779 AATGATGTTAGGACCACACAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATAGATAGAAAACCACCTGCCCAGCAGACGACCACTAATCGGGCACACGGGTGGTAAGTCATGATG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87630568 121 - 132174527 AATGATGTTAGGGCCACAGAAAGGCACTCGGGACATAAGCACTGCAGGCATCAGTATGGATAGAAAACCAGCTGCCCAGCAGAAAGCCACTAATCAGGCACGCAGCTGGTGTGTCATGATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46714911 121 - 64190966 AATGATATTAGGGCCACAGAAGGGCACCTGGGACATAAGAATTGCAGGTATCAGTATGGATAGAAAGCCACCTACCCAGCAGAAAACCACTAATCGGGCACATAGATGGTGAGTCATGATG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 80520936 121 - 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=791962.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 301389 365 + 478999 GTGGGATAATGCAAAGGTCGACAGATGGTAAGGAACCGATCAAAGGACATCACAGACAGAAAGTAGCCTTCTGCAGCACACATGG---AGAAGTAGAAGAACTGGAGCAGGCAGCCAGCATAGGAGATGCTCTTGATATGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGG-ACATCAGAACTAATGCAGCAGATCTCCAGGAAAGAGAAATTAGCCAAGAGGATGTACATAG-GTGTGTGGAGTTTCTGGCTTGACCACACAGCGCAGATGATGGATGTGTTACCCATGAGGGTCAGAAGGTAGATGAGGGAGAAGACCACAAAGAGGAGGATCTTGGTCT-CCCTGCAGCAGGCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT s panTro4.chrUn_GL393519 142543 363 + 413329 GTGGGATAATGCAAAGGTCGACAGATGGTAAGGAACCGATCAAGGGACATCACAGACAGAAAGTAGCCCTCTGCAGCACACATGG---AGAAGAAGTAGAACTGGAGCAGGCAGCCAACATAGGAGATGCTCTTGATATGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGGCACATCAGAACTAATGCAGCAGATCTCCAGGAAAGAGAAATTAGCCAAGAGGATGTACATAGTGTGTGTGGAGTTTTTGGCTTGACCACACAGCGCAGATGATGGATGTGTTACCCGTGAGGGTCAGAAGGTAGATGAGGGAGAAGACCACAGAAAGGAGGATCTGGATCT-CCCTGC----GGCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 80521057 365 - 99152023 GTGGGATAGTGCAAAGGTCTACAAATGGCAAGAAATCTATCAAAAGACATCACTGACAGAAATAAGCACTCTGCAGCACACATGGAGAAGAAGAAGTAGAACTGGAGCAGGCAGCCAGCATAGGAGATGCTCTGTGTCTGGGAGATGAGATTGGTCACCATTATGGGCACATCAGAACTGACATAGCAGATCTCCAGGAAGGAGAAATTGGCCAGTAGGATACACATAG-GTGTGTGGAGTTTCTGGCTTGAACACACAGCACAGATGATGGATGTGTTACCCAGGAGGGTCAGAAGGTAGATGAGAGAGAAGACCACAAAAAGGAGGATCTGCATCT-CCCTGC----GGCAGGGGAAGCCCAAGAGGAT i ponAbe2.chr15 I 121 n 121 s rheMac3.chr7 87938049 361 - 170124641 GTGGGGTAATGCAAAGGTCTACAGATGGCAAGGAACCGATCAAAGGACATCACAGACAGAAAGTAGCCCTCTGCAGCACACATGG---AGAAGAAGTAGAACTGGAGTAGGCTGCGAGCATAGCAGATGCTCTTGATCTGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGGCACATCAGAACTAATGTAGCAGATCTCCAGGAAAGAGAAGTTGGCCAAGAGGATGTACATAG-GTGT-TGGAGTTTCTGGCTTGACCACACAGCACAGATGATGGATGTGTTACGCATGAGGGTCAGAAGGTAGATGAGGGAGAAGACCACAAAAAGGAGGATCTATATCT-CCCTGC----TGCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88216021 361 - 171882078 GTGGGGTAATGCAAAGGTCTACAGATGGCAAGGAACCGATCAAAGGACATCACAGACAGAAAGTAGCCCTCTGCAGCACACATGG---AGAAGAAGTAGAACTGGAGTAGGCTGCGAGCATAGCAGATGCTCTTGATCTGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGGCACATCAGAACTAATGTAGCAGATCTCCAGGAAAGAGAAGTTGGCCAAGAGGATGTACATAG-GTGT-TGGAGTTTCTGGCTTGACCACACAGCACAGATGATGGATGTGTTACGCATGAGGGTCAGAAGGTAGATGAGGGAGAAGACCACAAAAAGGAGGATCTATATCT-CCCTGC----TGCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85336902 362 - 162156779 GTGGGGTAATGCAAAGGTCTACAGATGGCAAGAAACCGATCAAAGGACATCACAGACAGAAAGTAGGCCTCTGCAGCACACATGG---AGAAGAAGTAGAACTGGAGCAGGCTGCGAGCATAGGAGATGCTCTTGATCTGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGGCACATCAGAACTAATGTAGCAGATCTCCAGGAAAAAGAAGTTGGCCAAGAGGATGTACATAG-GTGT-TGGAGTTTCTGACTTGACCACACAGCACAGATGATGGATGTGTTACCCATGAGGGTCAGAACGTAGATGAGGGAGAAGACCACAAAAAGGAGGATCTATATCTACCCTGC----TTCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87630689 365 - 132174527 GTGGGGTAATGCAAAGGTCGACAGATGGCAAGGAACCCATCACAGGACATTATAGACAGAAAGTAGCCCTTTGCAGCACACATGGAGAAGAAGAAGTAGAACTGGAGCAGGCAGTCAGCATAGGAGATTCTCTTGATCTGGGAGATGAGATTGGCCAACATTTTGGGCACATCAGAACTAATGTAGCAGATCTCCAGGAAAGAGAAGTTAGCCAAGATGATGTACATGG-GTGTGTGAAGTTTCTGGCTTGACCACACAGCACAGATGATGGATGCATTACCAATGAGGGTCAGAAGGTAGACGAGGGAGAAGATGACAAAAAGGAGAATCCAGATGT-CCCTGC----GGCAGGGGAAGCCCAGGAGGAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46715032 365 - 64190966 GTGGGGTAATGTAGAGGTCGACAGATAGCAAGGAACCGATCATAGGACATCGCAGACAGAAAGTAGCCCTCAGCGGCACACATGGAGAAGAAGAAATAGAACTGGAGCAGGCAGCCGGCGTAGGAGATGCTCTTGGTCTGGGAGATGATGTTGGCCAACATCTTGGGCACATCAGAACTGACATAGCAGATCTCCAGCAAAGAGAAGTTGGCCAGCAGGATGTACATGG-GCGTGTGGAGTTTCCGGCTTGACGCCACGGCGCAGATGATGGATGTGTTCCCCATGAGAGTCAGAAGGTAGATGATTGAGAAGATGACAAAGAGCAGGACCTGGAGCT-CCCTGC----GGCAGGGGAAGCCCAGGAGAAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1227590.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 301754 847 + 478999 AAATTCACTCACAGGCCCAGAAATGTTATTGGCTTCTATGACACTCATTCTTCTAATCTATGAAGGAAATGAACGATAGGGACCACTACAATAACCATTTTCTCTCTCTTAAAGTGTTATATTTATTTCTTTTGACTCCAAGACAATCTTTTAATGCACTTTTGTG-AAAAGTTCCATATAGTTCTCAATTCAATAACTCACCTCCCA-TCTTTGTCTTAGTTCAATGAAATCAGGGTTATGGGAGAATGTGGCTCAACATGTTACTACGTGATCC---------CACAGCCTCCACTATATCATATCTCTGTTTTTCAGAGTGTAAGTTTCATTGACATCACATAACATAGGGTCCAAACGACTTTCTCTATTTGCATTTAAATTAATTC-TGCTTTGATGTAATGTTTTGTAATACACATATTCAAATATTTATACATATAATTTCTCCCTATT------------------------------AGA-AAATTTTGTATTGTATTTTGAAAAATTCTAAGAAAAATC--AGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAACCTCATTATGTTGTCAATAAAT-----TATGTTTTTAGGAGATCTGTCCTGGATAGTTCTGTTGACTGAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACAGATTTCATGCTAGC----------------------------------------------------ACGTGTTTGTTTGCTCCGTATAGTGGCATTTAACTTCTATTTGCTGAGCAACAGCTAATTTGACAC--AGAAAA-----GTTGC-----------------CTTCAACCCTTTACTAGG-------AAGATCTTGCTCTATGATAGAAAAACAGCAAGAGGCAGATGGAAAAACATCTATTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTATACTGGTGATGAATTATCTTATATTA s panTro4.chrUn_GL393519 142906 847 + 413329 AAATTCACTCACAGGCCCAGAAATGTTATTGGCTTCTACGACACTCATTCTTCTAATCTATGAAGGAAATGAACGATAGGGACCACTACAATAGCCATTTTCTCTCTCTCAAAGTATTATATTTATTTCTTTTGACTCCAAGACAATCTTTTAATGCACTTTTGTG-AAAAGTTCCATATAGTTATCAATTCAATAACTCACCTTCCA-TCTTTGTCTTAGTTCAATGAAATCAGTCTTATGGGAGAATGTGGCTCAACATGTTACTATGGGATCC---------CACAGCCTCCACTATATCATATCTCTGTTTTTCAGAGTGTAAGTTTCATTGACATCACATAACATAGGGTCCAAATGGCTTTCTCTATTTGCATTTAAATTAATTC-TGCTTTGATGTAATGTTTTGTAATACACATATTCAAATATTTATACATATAATTTCTCCCTATT------------------------------AGA-AAATTTTGTTTTGTATTTTGAAAAATTCTAAGAAAAATC--AGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAATCTCATTATGTTGTCAATAAAT-----TATGTTTTTAGGAGATCTGTCCTGGATAGTTCTGTTGACTGAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACATATTTCATGCTAGC----------------------------------------------------ACGTGTTTGTTTGCTCCGTATAGTGGCATTTAACTTCTATTTGCTGAGCAACAGCTAATTTGACAC--AGAAAA-----GTTGC-----------------CTTCAACCCTTTACTAGG-------AAGATCTTGCTCTATGATAGAAAAACAGCAAGAGGCAGATGGAAAAACATCTGTTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTATACTGGTGATGAATTATCTTATATTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87938410 858 - 170124641 ACATTCACTCACAGGCCCAGAAATATTATTGGCTTCTACAACACTCATTCTTCTAATCTATGAAGGAAATGAACGATAGGGACCACTACAATAGTCGTTTTCTCTGTCTTAGAAGGTTATATTTATTTCTTTTGACTCCAAGACACTCTTTTAATGCACTTTTGTGAAAAAGTTCCATATAGTTCTTAATTCAATAACTCACCTCCCA-TCTTTGTCTTAGTTCAGTGAAATCAGGGTTATGGGAGAATGTGGCT-AACATGTTACTATGTGATCCCACAGCCCCCACAGCCCCCACTATATCATATCTCTATTTTTCAGACTATAGGTTTCATTGACATCACATAACATAGGGTCCAAATGGCTTTCTATATTTTCATTTA----AATTC-TGCTTTGATGTAATGTTTTGTGATACACATATTCAAGTATTTATACATATAATTTCTCCCTATT--------------------------ACAAAGA-AAATTTTGTATGGTATTTTGAAAAATTCTAAGAAAAATC--AGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAATCTCATTATAGTGTCAATAACT-----TATGTTTTTAGGAGATCTGTCCTGGATAGTTCTGTTGACTGAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACAGATTTCATGCTAGC----------------------------------------------------ACGTGTTCATTTGCTTCGTATAGCAGCATTTAACTTCTATTTGCTGAGCAACAGCTAATTTGACACAGAGAAAA-----GTTGC-----------------CTTCACCCCTTTACTAGG-------AAGATCTTGCTCTATAATAGAAAGACAACAAGAGGCGGATGGAAAAACATCTATTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTATACTGGTGATGAATTATCttatatta i rheMac3.chr7 C 0 I 7 s macFas5.chr7 88216382 858 - 171882078 ACATTCACTCACAGGCCCAGAAATATTATTGGCTTCTACAACACTCATTCTTCTAATCTATGAAGGAAATGAACGATAGGGACCACTACAATAGTCGTTTTCTCTGTCTTAGAAGGTTATATTTATTTCTTTTGACTCCAAGACACTCTTTTAATGCACTTTTGTGAAAAAGTTCCATATAGTTCTTAATTCAATAACTCACCTCCCA-TCTTTGTCTTAGTTCAGTGAAATCAGGGTTATGGGAGAATGTGGCT-AACATGTTACTATGTGATCCCACAGCCCCCACAGCCCCCACTATATCATATCTCTATTTTTCAGACTATAGGTTTCATTGACATCACATAACATAGGGTCCAAATGGCTTTCTATATTTTCATTTA----AATTC-TGCTTTGATGTAATGTTTTGTGATACACATATTCAAGTATTTATACATATAATTTCTCCCTATT--------------------------ACAAAGA-AAATTTTGTATGGTATTTTGAAAAATTCTAAGAAAAATC--AGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAATCTCATTATAGTGTCAATAACT-----TATGTTTTTAGGAGATCTGTCCTGGATAGTTCTGTTGACTGAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACAGATTTCATGCTAGC----------------------------------------------------ACGTGTTTATTTGCTTCGTATAGCAGCATTTAACTTCTATTTGCTGAGCAACAGCTAATTTGACACAGAGAAAA-----GTTGC-----------------CTTCACCCCTTTACTAGG-------AAGATCTTGCTCTATAATAGAAAGACAACAAGAGGCGGATGGAAAAACATCTATTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTATACTGGTGATGAATTATCTTATATTA i macFas5.chr7 C 0 I 7 s papAnu2.chr7 85337264 858 - 162156779 ACATTCACTCACAGGCCCAGAAATGTTATTGGCTTCTACAACACTCATTCTTCTAATCTATGAAGGAAATGAACGATAGGGACCACTACAATAGTCGTTTTCTCTGTCTTAGAaggttatatttatttcttttgactcCAAGACACTCTTTTAATGCACTTTTGTGAAAAAGTTCCGTATAGTTCTCAATTCAATAACTCACCTCGCA-TCTTTGTCTTAGTTCAGTGAAATCAGGGTTATGGGAGAATGTGGTT-AACATGTTACTATGTGATCCCACAGCCCGCACAGCCCCCACTATACCATATCTCTATTTTTCAGACTATAGGTTTCATTGACATCATATAACATAGGGTCCAAATGgctttctatattttcattta----aattc-tgtGTTGATGTAATGTTTTGTAATACACATATtcaagtatttatatatatattttctccctatt--------------------------acaaaga-aaattttgtatggtattttgaaaaattctaagaaaaatc--aGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAATCTCAGTATGTTGTGAATAACT-----TATGTTTTTAGGAGATCTGTCCTGGATAGTTCTGTTGACTGAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACAGATTTCATGCTAGC----------------------------------------------------ACGTGTTTATTTGCTTCGTATAGCGGCATTTAACTTCTATTTGCTGAGCAACAGCTAATTTGATACAGAGAAAA-----GTTGC-----------------CTTCACCCCTTTACTAGG-------AAGATCTTGCTCTATAATAGAAAGACAACAAGAGGCGGATGGAAAAACATCTATTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTATACTGGTGATGAATtatcttatatta i papAnu2.chr7 C 0 I 690 s calJac3.chr10 87631054 873 - 132174527 AAACTCGCTCACAGGCCCAGAAATGTTACTGTCTTCTAAGATACTCATTCTTCTAATTTATGAAGGAAATGAACAATAGGGACCACTACAATAGCCATTTTCTCCCTCTTAAAAGGTTATATTTATTTCTTTTGACTCCAAGACACTCTGGTAATGCACTTCTGTGAAAAGGTTCTATATAGTTCTCAATTCAATAACTCATCTCCCA-TCTCTGCCTTAGTTCAATGAGAGCAGGGTTATGGGAGAATGTGGCTCAATGTG-TACTATGTGCTCC---------CAAAGCCCCCACTATATCA-ATCTCTATTTTTCAGAGTATAAGTTTCATTGACATCACATAACATAGGGTCCAAATGGC---------AGGTATTTAAATTAATTC-TGCTTTGATGTAATGTTTTGTAATACGCACATTCAAATATTATTACATATAATTTCTCCCTATT--------------------------GCAAAGAGAAATTTTATATAGTAGTCTGAAAAATTCTAAGAAAAACC--AGTTTAAACATAATCTAAAATTGAATTAGGTCAGTACAAAAAGAGAATCTCATTATGTTGTCAGTAACTTATAATATATTTATAGGAGATCTGTTCTGGGTAGTTCTGTTGACTAAAGTAGGGTACTGAGGATGCTGCCACAGATTTCATGCTAAC----------------------------------------------------ATGTGTCTATTTGCGTCTTATAGTGGCATTTAACGTCTGTTTGCTGGGCAACAGCTAATTTGACACAGAGAAAA-----ATTGCCGTCACCCTTTTACTTGCTTCACCCCTTTACTTGATCTCTATGAGATCTTGCTCTATAATAGAAAGACAGCAAGAGGCAGATGGAAAAATATCTATTTCCTTAGCTCAGATGCCTTCTCATCTTGTTACTACACTGGTGataaattatattaaaaaa i calJac3.chr10 C 0 I 2 s canFam3.chr15 46715397 911 - 64190966 GAACTCACTCACAGACCCAGAGATATTGTTGGCTCCTGAGATACTCATTCTCCTATTCTATGAAGGGAGTGAGCAAGAAGTATCAGTATATTAATCATTTTCCCTCTATTTTAAGGTTATTTTTATTTCTTCTGATTCCTGTA-GCTCCTTCAATACACTTCTGTGAAAAGGCCCTATGTGCTTCTCAATTCAGTAACTCCCTTCCCAGGATCTGGCTTAGCCCAATGAGATCAGGGTTCTGGGAGAGCCTGGCA---------------TGCTCC---------CACGGCCCCCACTCAACCA-GCCTTCA-TTTTCAGAGTATAGATTTCACTAACATTGGGTAACATCGTGTCCAGATTGTTTTCTCCATTTGCATTTAAATTAATTCTTTTTTTGGCACATAGTTTCATAAAATACACACTCATATATTTATATACCTGATTTCTTCTTGCTGAAAAGAAAATTTTGTACAAAAAAAAAAAAAGA-AAATTTTGTACAGTATTTTGGGAGATTTTAAGAAAAATCAAAACTTAAATATAACCTGAAATCGAACTAAGTC-------AAAGAGCATCATACTATGTCGTTGGTAAC------AATATTGTCAGGAGATCTGTCCTGAGTAACTCTGGCTACTGAGGCCAGGCGCTGAAGACGCTGCTGCAGATTCCACTCTAGCAAGGACCTATTAGCTTttctttttaagtttttattttaattccagttagttaacatatatattagcttcTTACCCTTGTGTTTAACTTTTATTTGCTTA-CAACAGCTAATTTGATACGAAAAGGACCTTTGTTGG-----------------CTTCACTCCTTTATTAGG-------AGATCCTGGTTCTCAAATAGAAAAAATGCCAGAGGCAAAT-GAAGGACACCTGTTT-CTTAGCTCAGATGCCTCCTCATCTTATTACTGCA-TAGTGATGAATCATCTTATGTAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 80521422 121 - 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1313281.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 302601 902 + 478999 ----------AAAAATAAAC-----CATAAATTTAACTTTAAAAATGTGAGA-----GGAATACACCAGTGtagaatgttagtgtcagaaaggacctctagtcttattaagctcaatttcctcgtatcacagaaactgagaccagagaggttagaatgatccaaagttatgttggctgttagaagaaaga--ggcctaaaacttaggtgttcatatattcagttcagactttttctcataagcctctgctaTTGTGGGACCCTGC--TTTTTTTGTCAGCTCAGATGGTTGCAAAAG--TATATTGTGTATGTATTATACTGTTCCTTCCTTTGAATTAGATCCCTATT----TA--TAATAAAGGAGGAC---ATTAACCAGGTTACTAACCAAAGCTGACAATTGCTACATCATATCCCCTATTCAACTTTGACCTGCCCTTTGCCCTAATTCTTGGCATCATTTATGGCATAAATCTACTTTTGGACACTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTAAGATAGTAAGCATAACAACAACCACTGTCATGTATTAAATGTTTATTGTGACAGTTACATAATGTTCATTATCTCATTAAATCCTCCTCCCCTCTCCTTTCCAGTTTTAGAG--------TAGAAAAACACTCTCACATGTTTAAATGTACCATTTGAATTCTATTGTGCTTCTAAATACATTGAATCTAAAATTCAAGTTTTTATTCTGTCCAGCTTTCAGCTATGTATAT-AATGTGCTAGCTGTTTTCTCTCATTGCATCTGATTCCATTTGTTCACATGTAACTTGCTTCTATCTAATTTTTGCTTGTGAATTTGAAAGATTTGCCTCTGGACATCTGTGTTAGGAACTGAGGTTATATATCATAGGAAAATATTATTTACATATTTCTTATAGAT----TATGTAGTTTACATTAGATACATCACCT s panTro4.chrUn_GL393519 143753 894 + 413329 ----------AAAAATAAAC-----CATAAATTTAACTTAAAAAATGTGAGA-----GGAATACACCAGTGtagaatgttagtgtcagaaagggcctctagtcttataaagctcaatttcctcgtatcacagaaactgagaccagagagtttagaatgatccaaagttatgttggctgttagaagaaaga--ggcctaaaacttaggtgttcatatattcagttcagactttttctcataagcctctgctaTTGTGGGACCCTGC--TTTTTTTGTCAGCTCAGATGGTTGCAAAAG--TATATCGTGTATGTATTATACTGTTCCTTCCTTTGAATTAGATCCCTATT----TA--TAATAAAGAAG--------TAACCAGGTTACTAACCAAAGCTGACAATTGCTACATCATATCCTCTATTCCCCTTTGACCTGCCCTTTGCCCTAATTCTTGGCACCATTTATGGCATAAATCTACTTTTGGACACTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTAAGATAGTAAGCATAACAACAACCACTGTCATGTATTAAATGTTTATTGTGAC-GTTACGTAATGTTCCTTATCTCGTTAAATCCTTCTCCCCTCTCCTCTCCAGTTT--GAG--------TAGAAAAACATTCTCACATGTTTAAATGTACCATTTGAATTCTATTGTGCTTCTAAATACATTGAATCTAAAATTCAAGTTTTTATTCTGTCCAACTTTCAGCTATGTATAT-AATATGCTAGCTGTTTTCTCTCTTTTCATCTGATTCCATTTGTTCACATGTAACTTGCTTGTATCTAATTTTTGCTTGTGAATTTGAAAGATTTGCCTCTGGACATCTGTGTTAGGAACTGAGGTTATATATCATAGGAAAATATTATTTACATATTTCTTATAGAT----TATGTAGTTTACATTAGATACATCACCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87939275 901 - 170124641 ----------aaaaataaaC-----CATAAATTTAACTTTAAAAGTGTGATA-----GGAATACACCAGTGtagaatgttagtgtcagaaaggacctctagttttattaagctcaatttcctcatatcacagaaatagagaccagagacgttagaatgatacaaagttatcttggctgttagaagaagga--ggcctaaaacttaggtgtttatatattcagttcagaccttttctcataagcctctgctaTCGTGGGACCCTGC--TTTTTTTGTCAGCTCAGATGGTTGCAAGGG--TATATTGTGTA-GTATTAGACCTTTCCTTCCTTTGAATTAGATCCCTATT----TA--TAATAGAGAAGGAC---ATTAACCAGGTTACTAACCAAAGCTGACAACTGCTACATTATACCCCCTATTCCTCTTTGACCTGCCCTTTGCCCTAATTCTTGGCACCATTTATGATGCAAATCTACTTTTGGACACTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTAAGATAGTAAGCATAACAACCACCATTGCCATGTATTAAACATTTATTGTGACAGTTATATAATGTTCATTATCTCATTAAATCCTACTCCCCTCTCCTTTCCAGTTTTAGAG--------TAGAAAAGCACTCTCACATGTTTAAATGTACCATTGGAATTCCACTGTGCTTCCAAATATATTGATTCTAAAATCCAAGTTTTTATTCTGCACAGCTTTCAGCGATGTATAT-TATATGCTAGCTGTTTTCTCTCATTGCATCTGATTGAATTGGTTCACATGTAACTTACTTATATCAAATTTTTGCCTGTGAATTTGGAAGATTTGCCTCAGGACATCTGTGTTAGGAACCGAGGTTATATATCATAGGAAAATATTATTTACATATTTCTCATAGAT----TCTATAGTTTACATTAGATACATCACCT i rheMac3.chr7 I 7 C 0 s macFas5.chr7 88217247 901 - 171882078 ----------AAAAATAAAC-----CATAAATTTAACTTTAAAAGTGTGATA-----GGAATACACCAGTGtagaatgttagtgtcagaaaggacctctagttttattaagctcaatttcctcatatcacagaaatagagaccagagacgttagaatgatacaaagttatcttggctgttagaagaagga--ggcctaaaacttaggtgtttatatattcagttcagaccttttctcataagcctctgctaTCGTGGGACCCTGC--TTTTTTTGTCAGCTCAGATGGTTGCAAGGG--TATATTGTGTA-GTATTAGACCTTTCCTTCCTTTGAATTAGATCCCTATT----TA--TAATAGAGAAGGAC---ATTAACCAGGTTACTAACCAAAGCTGACAACTGCTACATTATACCCCCTATTCCTCTTTGACCTGCCCTTTGCCCTAATTCTTGGCACCATTTATGATGCAAATCTACTTTTGGACACTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTAAGATAGTAAGCATAACAACCACCATTGCCATGTATTAAACATTTATTGTGACAGTTATATAATGTTCATTATCTCATTAAATCCTACTCCCCTCTCCTTTCCAGTTTTAGAG--------TAGAAAAGCACTCTCACATGTTTAAATGTACCATTGGAATTCCACTGTGCTTCCAAATATATTGATTCTAAAATCCAAGTTTTTATTCTGCACAGCTTTCAGCGATGTATAT-TATATGCTAGCTGTTTTCTCTCATTGCATCTGATTGAATTGGTTCACATGTAACTTACTTATATCAAATTTTTGCCTGTGAATTTGGAAGATTTGCCTCAGGACATCTGTGTTAGGAACCGAGGTTATATATCATAGGAAAATATTATTTACATATTTCTCATAGAT----TCTATAGTTTACATTAGATACATCACCT i macFas5.chr7 I 7 C 0 s papAnu2.chr7 85338812 901 - 162156779 ----------aaaaataaac-----cataaatttaactttaaaaatgtgaca-----gGAATACACCAGTGTAGAATGTTAGTGTCAGAAAGGACCTCTAGTTTTATTAAACTCAATTTCCTCATATCACAGAAATAGAGACCAGAGACATTAGAACTATACAAAGTTATCTTGGTTGTTAGAAGAAGGA--GGCCTAAAACTTAGGTGTTTATATATTCAGTTCAGACCTTTTCTCATAAGCCTCTGCTATCGTGGGACCCTGC--tttttttGTCAGCTCAGATGGTTGCAAGGG--TATATTGTGTA-GTATTATACCTTTCCTTCCTTTGAATTAGATCCCTATT----TA--TAATAAAGAAGGAC---ATTAACCAGGTTACTAACCAAAGCTGACAGCTGCTACATTATATCCCCTATTCCTCTTTGACCTGCCCTTTGCCCTAATTCTTGGCACCATTTATGATGTAAATCTACTTTTGGACACTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTAAGATAGTAAGCATAGCAACAACCACTGCCatgtattaaacatttattgtgaCAGTTACATAATGttcattatctcattaaatcctaCTCCCCTCTCCTTTCCAGTTTTAGAG--------TAGAAAAGCACTCTCACATGTTTAAATGTACCATTGGAATTCTATTGTGCTTCCAAATACATTGATTCTAAAATCCAAGTTTTTATTCTGCACAGCTTTCAGGTATGTATAT-CATATGCTAGCTGTTTTCTCTCATTGCATCTGGTTGAATTTGTTCACATGTAACTTACTTATATCAAATTTTTGCCTGTGAATTTGGAAGATTTGCCTCAGGACATCTGTGTTAGGAACTGAGGTTATGTATCATgggaaaatattatttacatatttctcaTAGAt----tctatagtttacattagatACATCACCT i papAnu2.chr7 I 690 C 0 s calJac3.chr10 87631929 893 - 132174527 ----------aaaaataaac-----cataaatttaacttaaaaaatGTGAGA-----GGAATACACCAGTGtagcatgttaatgtccgaagggatctctagtctcaccaagctcaatttcctcatatcacagaaactgagaccagagaggttagatggatccaaagttatcttggctgttagaagaaaga--ggcctaaaacttaggtgtttgtatattcagttcagacctttgctcataagccgctGCTATTGTGGGATCTTCCTTTTTTTTTGTCAGCTCAGATGGTTACAAAAGTATATATTGTGTATGTATTATAACTTTCCCTCCTTTGATTTAGATTCCGGTT----TA--TAATAAAGAAAGAC---ATTAACAAGGTTACTAACCAAAGCTGACAATTGCTACATCACATCCCCCATTCTT------------CTTCGCCCTAATTCTTGGCACCATTTATGACACAAATTTACTTTTGGACTCTTTCTT-TAAAGAACATTTGACTTCTGAGACAGTAAGCATAACAACAACTGCTGCCATGTATTAAACATTTATTGTGACAGTTACGCAATGTTCATGATCTCATTAAATCCTACTCCCCTCTCCTCTCCAGTGTTAGAG---------AGAAAAACACTCTCACATGTTTAAATGTACCATTTGAATTCTATTGTTCCTTTAAATATATTGATTCTAAAATCCAAGTTTTTATTCTGCACAGCTTTCAGCTATGAATAT-AATATTTTAGTTGTTTTCTCTCATTGCATCTGATTCAATTTGTTCACATGTAACTTGCTTATATCAAATTTTTACTCGTAAATTTGGAAGATTTGCCTCAGGACATCTGTGTTAGGAACTGAGGTCATATTCCTTAGGAAAATATTATTTACATATTTATCATAGAT----TATATAGTTTACACTAGCTACATCACCT i calJac3.chr10 I 2 C 0 s canFam3.chr15 46716308 893 - 64190966 AAAGACAATAAAAAAGGAACAAAAGCATATATTTAACGCTAAAACTATGGGAGAAATGAAATATAGCAGTCTAGAATGTTAGTGTC-----GGGTCTCAGGGATTATCAAGCT------------------GAGACTGAAACCACACAGGTTAGACTACTCCAAGGTCATGCTGACTTTTGGTGGAAGAAACACCCCCAAACTTTGGTGTTTGGATGTT-AGTTCAGACCTTTTCCCATAAACCT-TGTTACTGT-GGACCCTAT--TTTT--------CTCAGATAATTGCAAAAT--TGTATGGTGCATGTATTACAGCTTTCCCTCCTTTCAACCAGATGCCTATTATTATAATTAATAAAGAAGGACTTTAATAATAAGGCTACTAATCAAAGCTGGAAATCACTATCTTAAATCCTCCATTCTTCTTTGATCTGCACCGTGTCCTAATTCTTGGTACCTTTTATGACATGAGCCCACTTTTGGACACTTTCTTCTAAAACACATTTGACTTCCAAAATAGTAAGTGTAACAACAACCACTGTCATGTATTAAATATTTATGGTGGCAGTCACTTAATTTTCATTATCTCATTAAATTCTCCTCCTCTCTCCTCTTTAGTTCTAGAGACTTAAAACAAACAAGCACGTTCACATTTCTAAATGTAGCATT-GAATTTTATTGTCCCTCTGAGGATGTTGATTCTAAAATCCAACCTTTTTCTCTACATGGCTGTCAGCTGTGTGTGTGTGTGTATTAGCTGCATTTCATTATTGTTTTTGATTCGGTGGATTCACATGCAACTTGCTTATATCAAATTTACACTCGTGTATGTGGAGGATTAGCCTCAGGA------------------AAGCCACATACCATAGGAAAG-ATTATTTACATGTTTTTCATAGGCTATATATATAGTTTACATCAGGTATGTGAGCT i canFam3.chr15 C 0 I 4319 e ponAbe2.chr15 80521422 121 - 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=7365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 303503 5 + 478999 GAGgc s panTro4.chrUn_GL393519 144647 5 + 413329 GAGgc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87940176 5 - 170124641 GAGGC i rheMac3.chr7 C 0 I 3679 s macFas5.chr7 88218148 5 - 171882078 GAGGC i macFas5.chr7 C 0 I 3506 s papAnu2.chr7 85339713 5 - 162156779 GAGGC i papAnu2.chr7 C 0 I 3220 s calJac3.chr10 87632822 5 - 132174527 GAGGC i calJac3.chr10 C 0 I 16210 e ponAbe2.chr15 80521422 121 - 99152023 I e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=179582.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 303508 1971 + 478999 caggtttgtgtccttcccttccatgcagcgagtcctccaggccccaggtaggtctagaggtgttgtctggtacccagggactggagtcaaaaaccttagacgtctacctggtattctattatactgcaactgagctggccctcaagccacaagacacagcccttcccactcttccctcttctttccacaggcagaggagaatgaccctgtggccaccaccatcacaggcctatggtgagtaactgccacactcccacctgtgtgtacttaaggcccacaggctcttcagtcagcttgtggtgaatgctgctatgcctgggaatcacctttcatggacatgggctcccctctggcccagagaagctccagaaatgccataaaagagccatgggctagaatagggaacctcaagagcccccttgatgcactatgcccatttgactgtgctggtacttaaggtacaagacaaagtccccttgacctttctctttgcttctctcaagcagaaggagtctgtcactgtagtcaccacagctgggaatgtgctaggtctcacctgaagctagtatgtctcgagtctcacccaaggcatattgcatactatttgggtgttgcttctcattattcaggacccaagggctctttagtcaataggtgatgggtcttgccaggactggttctttccttcaaggcagcaggttcccttctagcccagggtgtgtctagaaatgtcatctcggagctagggcctggaatggtgcctcatgacggaccaatattctttcttactgtaatgagctgggatctaagatgcaagacaaacatcatctttactcttcgctttcttttattcaagcagaagtaaaggatctcttttggagccacgagctgtgctgctggggttaggggaggtgtgggcaaggactctcttagctgccccagctgttgtttcagtaagtcatgtgttcccaagtccattggctccaagcccagctcagcaccaggacttgctgtccttgtggcctagactgcctgtcaaatttatttaggaccctagagtactccagctcatggcagcaaggcttgccagaactcaagctccatctgctggagtgggcaaattgccctctggctggaccttgtctaaaggctccctctgtgggtctgtgtcagctgagttcagcacagttttgctttccactgtgatagggcagcactgagttcaatgcaaagtctcacgattgctgcactttccctctcccaaacacacatttctctgtgccatgtggctgctgtagtggggatgagggagagttggcatcaacaattcacggctctctttctgactctctttagtgcctctttcaatgatacggagataaaaccaggtattgtgagtgctcatattatttttggttcttatgaaggtgctgtgtttgtgtagacagttggtacatttggtgttcctgtgggaggacaattgatggagccttctattccaccattttgctccagccacttccaaATGCtttttctttttcttatttatttatttttgagatggagtctcactctgtcacgaggctggagtgcagtggtgcaatctccgctcactgcatcctccacctcccaggttcaagcaattctcttgccttagcctcctgagtagctggggttacaggtgcacaccaccacacccagccaatttttgtatttttattagacatggcgtttcaccatgttggccaggatggtctcgatctcttgacatcgtgatctgcccactttggcctcccaaagtgctgagattacaggcgtgaaccactgcacccggccCcaaatgctttttctgaatctatggagattatatgtttttagtatttttgttaatgtggtgtactacatttattgatttgcatatgttgaatcatccctgcatctcaaggataaatctctcttgatcatgaggtg s panTro4.chrUn_GL393519 144652 1967 + 413329 caggtttgtgtccttcccttccatgcagcgagtcctccaggccccaggtaggtctagaggtgttgtctggtacccaggaactggagtcaaaaaacttagaagtctacctggtgttctattatactgcagctgagctggccctcaagccacaagacacagcccttcccactcttccctcttctttccacaggcagaggagaatgaccctgtggccaccaccatcacaggcccatggtgagtaactgccacactcccacctgtgtgtacttaaggcccagaagctgttcagtcagcttgtggtgaatgctgctatgcctgggaatcacctttcatggacatgggctcccctctggcccagagaagctccagaaatgccataaaagagccatgggctagaatagggaacctcaagagcccccttgatacactacgcccatttgactgtgctggtacttaaggtacaagacaaagtccccttgacctttctttttgcttttctcaagaagaaggagtctctcactgtagtcaccacagctgggaatgtgctaggtctcacctgaagctagtatgtctcgagtctcacccaaggcatatggcatactatttgggtgttgcttctcattgttcagggcccaagggctctttagtcaataggtgatgggtcttgccaggactggttctttccttcaaggcagcaggttcccttctagcccagggtgtgtctagaaatgtcatctgggagctagggcctggaatggtgcctcatgactgaccaatattctttcttactgtaatgagctggtatctaagatgcaagacaaacatcatctttactcttccctttcttttcttcaagcagaagtaaaggatctcttttggagccacgagctgtgctgctggggttaggggaggtgtgggcaagcactctcttagctgccccagctgttgtttcagtaagtcatgtgctcccaagtccattggctccaagcccagctcagcaccaggacttgctgtccttgtggcctagactgcctgtcaaatttatttaggaccctagagtactccagctcatggtggcaaggcttgccagaactcaagctccatctgctggagtgggcaaattgccttctggctggaccttgtctaaaagctccctctgtgggtcggtgtcagctgagttcagcacagttttgctttccactgtgatagagcagcactgagttcaatgcaaagtctcacgattgctgcactttccctctcccaaacacacatttctctgtgccatgtggctgctgtagtggggatgagggagagttggcatcaacaattcacggcgctctttctgactctcttcagtgcctctttcaatgatatggagataaaaccaggtattgtgagtgctcatattatttttggttcttatgaaggtgctgtgtttgtgtagacagttggtacatttggtgttcctgtgggaggacaattgatggagccttctattccaccattttgctccacccacttccaaATGCtttttctttttcttatttattt----ttgagatggagtctcactctgtcacgaggctggagtgcagtggtgcaatctccgctcactgcaacttccacctcccaggttcaagcaattctcctgccttagcctcctgagtagctggggttacaggtgcacaccaccacacccagccaatttttgtatttttattagacatggcatttcaccatgttggccaggatggtctcaatctcttgacatcgtgatctgcccactttggcctcccaaagtgctgagattacaggcgtgaaccactgcacccggccCcaaatgctttttctgcatctatggagattatatgttttttgtatttttgttaatgtggtgtactacatttattgatttgcatatgttgaatcatccctgcatctcaaggataaatccctcttcatcatgaggta i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 80521422 121 - 99152023 I e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85339718 3220 - 162156779 I e macFas5.chr7 88218153 3506 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87940181 3679 - 170124641 I e calJac3.chr10 87632827 16210 - 132174527 I a score=111778.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 305479 446 + 478999 tgatacttttaatgtgctgttgaattctgtttgtgagtatttaagtttgttgagaa-tttttgcatctttattcatcaagaatattgacctgtaattttcttatcttataaagtctttggctttgatatcacagaaatactagcctcatttaatgagtttggaaatgtggtttttcttcaataatttggaagagtatataaagaactggtaatttttaaaaaatgtttggtggcatttattaacaaagccatctcttcctgagcttctttgctgagaggtttttaatcag-ttttttattggtgatgcaatcttcttattcactattggtctgtttaaattttcggtttcttcatgattcagtcatagtagggtgaacatttccagaaatttatcatttcttcttggccttccaatttattgtcaaataattgtttatagtaatccct s panTro4.chrUn_GL393519 146619 445 + 413329 tgatacttttaatgtgctgttgaattctgtttgtgagtatttaagtttgttgagaa-tttttgcatctttattcatcaagaatattgacctgtaattttcttatcttataaagtctttggctttgatatcacagaaatactagcctcatttaatgagtttggaaatgtggtttttcttcaataatttggaagagtatataaagaactggta-ttttaaaaaaatgtttggtggcatttattaacaaagccatctcttcctgagcttctttgctgggaggtttttaatcag-ttttttattgctgattcaatcttcttattcattactggtctgtttaaattttctgtttcttcatgattcagtcatagtagggtgtacatttccagaaatttatcatttcttcttggccttccaatttattgtcaaataattgtttatagtaatccct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 756518 441 - 1485088 tggtActtttaatgtgctgttgaattctgtttgtgagtatttcagtttgtcgagaattttttgcatctttattcatcaagaatattgacctgtacttttcttg--ttataaagtctttggctttgatatcacagaattactagcttcatttaatgagtttggaaatgtggtttttcctcagtaatttggaagagtgtataaataactggta-ttttaaaaaaatgtttggtggcatttattaacaaagccatctcttcctgagctgctttgctgagaggtttttaatcagtttttttattgctgattcaatcttcttat----tattgatctgtttaaattttctatttcttcatgattcagtcatagtagggtgtacatttccagaaatttatcatttcttcttggccttccaatttattgtgaaataattgtttatagtaatccct i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 N 0 C 0 e ponAbe2.chr15 80521422 121 - 99152023 I e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85339718 3220 - 162156779 I e macFas5.chr7 88218153 3506 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87940181 3679 - 170124641 I e calJac3.chr10 87632827 16210 - 132174527 I a score=875489.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 305925 1729 + 478999 tatgatcatttgtatttttatggcatgagttgtattgtttcttctttcatttctgattttattt----gggtcttctctattttttcttggttagtctagctaagatttgccaacattattttatatttcatcgattatttctattgttttcctattctgtatttgatttatttaatttctgttctaatctctgttatttaattcctttggtaaatttgggcttaatttgttcctttttacttccttgaagtttaaagtaaggtgggtttgtttttggacatttttcttatgtttagagtagatgtttattgc--tatactgcctcaataccactttagctgcatccataagttttgttattttgcgtttttggtctttttttataggtagatacattctaatttccctcgatatctttttgacataatggtttttcaagagtgtattgatttccacatatttgtgaattttctagttttgcttgttattgattttagttttatatcattatagatagaaaagatacttttcctacttacataatttctatattcttaaatttacttgtgcttgttatgtggcctaacagatgacctatcctgaaaaatgttatatagtcacttgagaagaatgtgtattctgctgtcactggatagttctgtacatgtctatgaggtccttttgttttataggatgtttaagattgctatttccctactggttttctgctagagattcattcccattattgaaagtggcgtaatgttgtgtctcattgttattttattgctgtctatttctcccttcaaatctgtcaatgtttgccttatatatagttaggtactctgatcttgggtgcctatacatttatagttgttctaacatcctgataattgacctttttatcattatataatgaccttttttatttcatgtgacagtttttaacctaaagtctatttggcctggtataaatttagccactcctgctgtcttttcgttatgatttgcatggaatatttttttccctcccttcactttcagcctttgggcatccttgaatctatagtctcttgttgacagcctatagtttgattttattttttaatgcatttggacgttctttgtcttttgactggggaatttttaatccatttacaGTCAGCTGGATGTAGGTTCCACATCCACAGAGTCAACCAACCATGCATAAAAAAAA-TCACACACCCCCATAAAAATAAC--TGATAAAAAATGGAATAATAAAAGTAATGCaaactagatggtgtaacaggtatttatatactgtttacattctattagatatgataagtaatctagagatggtttaaagtataggggatggtgtgcatgggttatatgcaaatactatatcactt-----------aatataaaggactttagcatccataaattttggtatccacaggcgatcttgaaacccatctttcatggatactgtgggacaactgTATTTACAAAGTTGtattaataagtaaggacttgctatggcacttcattttattttttctgtctgtgttataattcttct----ttcttttttctcttgctgttttcttt--------------------------------------------tgtgttcattgatatttttgtattgatatgtatttatttcctttt-----tcttttgtatattttctgtagtattttattttttt-ggttaccttggggcttatgtaaaacatcatatatatggaggcaaagtttattctaagctaataacaact s panTro4.chrUn_GL393519 147064 1754 + 413329 tatgatcttttgtatttttatggcatgagttgtattgtttcttctttcatttctgattttatttatttgagtcttctctattttttcttggttagtctagctaagatttgccaatattattttatatttcatcgattatttctattattttcctattctgtatttgatttatttaatttctgttctaatctctgttatttaattcctctggtaaatttgggcttaatttgttcctttttacttccttgaagtttaaggtaaggtgggtttgtttttggacatttttcttatgtttagagtagatgtttattgc--tgtactgcctcaataccactttagctgcatccataagttttgttattttgcgtttttggtctttttttatatgtagatacattctaatttccctcgatatctttttgacataatgggttttcaagagtgtattgatttccacatatttgtgaattttctagttttgcttgttattgattttagttttatatcattatagatagaaaagatacttttcctacttacataatttctatattcttaaatttacttgtgcttgttatgtggcctaacagatgacctatcctgaaaaatgttatatagtcacttgagaagaatgtgtattctgctgtcactggatagttctgtacatgtctatgaggtccttttgttttataggatgtttaagattgctatttccctactgattttctgctagagattcattcccattattgaaagtggcgtaatgttgtgtctcactgttattttattgctgtctatttctcccttcaaatctgtcaatgtttgccttatatatagttaggtactctgatcttgggtgcctatacatttatagttgttctaacatcctgataattgacctttttatcattatataatgaccttttttatttcatgtgacagtttttaacctaaagtctatttggcctggtataaatttagcgactcctgctgtcttttcgttatgatttgcatggaatatttttttccctcccttcactttcagcctttgggcatccttgaatctatagtctcttgttgacagcctatagtttgattttattttttaatgcatttggacgttctttgtcttttggctggggaattg--aatccatttacaGTCAGCTGGATGTAGGTTCCACATCCACAGAGTCAACCAACCATGCATAAAAAAAAATCACACACCCCCATAAACATAACAATGATAAAAA-TGGAATAATAAAAGTAATGCaaactagatggtgtaacaggtatttatatactgtttacattctattagatatgataagtaatctagagatggtttaaagtataggggatggtgtgcatgggttatatgcaaatactatatcacttctatatcacttaatataagggactttagcatccataaattttggtatccacaggtgatcttgaaacctatctttcatggatactgtgggacaactgTATTTACAAAGTTGtattaataagtaaggacttgctatggcacttcattttattttttctgtctgtgttataattcttctgtctttcttttttctcttgctgttttcttt--------------------------------------------tgtgttcattgatatttttgtattgatatgtatttatttccttttctttttcttttgtatattttctgtagtattttattttttttggttaccttggggcttatgtaaaacatcatatatatggaggcaaagtttattctaagctaataacaact i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18649705 1780 + 99152023 tatgatcatttgtatttttatggcatgaattgtattgtttcttctttcatttctgattttatttatttgagtcttctctattttttcttggttagtctagctaagatttgccaatattattttatatttcatcggttttttctattgttttcctattctgtatttgatttttttaatttctgctctaatctctgttatttaattcctctggtaaatttgggcttaatttgttcctttttacttccttgaagtttaaagtaaggtgggtttgtttttagacatttttcttacatttagagtagatgtttattgctatatactgcctcaataccactttagctgcatccataagttttgttattttgtgtttttggcctttttttatatgtgggtacattctaatttccctcgatatctttttgacataatggtttttcaagagtgtattgatttccatatatttgtgaattttctagttttgcttgttattgattttagttttatatcactatagatagaaaagatacttttcctacttacacaatttctatattcttaaatttacttgtgcttgttatgtggcctaacagatgacctatcctgaaaaatgttatatggtcacttgagaagaatgtgtactctgctgttgctggatagttctgtacatgtctatgaggtccttttgttttataggatgtttaagattgctatttccctactgattttctgctagagattcattcccattattgaaagtggcgtaatgatgtgtctcactcttattttattgctgtctatttctcccttcaaatctgtcaatgtttgccttatatatagttaggtactctgatcttgggtgcctatacatt--tagttgttctaacatcctgataattgacctttttatcattatataatgaccttttttatttcgtgtgacagtttttaacctaaagtctatttggcctggtataaatttagccactcctgctgtcttttgattatgatttgcatggaatatttttttccctcccttcactttcagcctttgggcgtccgtgaatctatagtctcttgttgacagcctatagtttgattttattttttaatgcatttagacgttctatgtcttttgactggggaattt--aatccatttacaCTCAGCTGGATGTAGGTTCCACATCCACAGAGT----CAACCATGCATAAAAAAAT-TCACACACCCCCATAAAAATAACAATGATAACAA-TGGAATAATAAAAGTAATGCaaaccagatggtgtaacaggtatttatatactgtttatattctattagatatgataagtaatatagagatggtttaaagtacaggggatggtgtgcatgggttatatgcaaatactatatcactt-----------aatataagggacttgagcatccataaattttggtatctacaggggatcttgaaactcatctttcttggatactgtgggataactgTatttacaaagttgtattaataagtaaggacttgctatggcacttcattttattttttctttctgtgttataattcttttgtctttcttttttctcttgctgttttctttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTGATACTTTTGTATtgatatgtatttatttccttttctttttcttttgtatattttctgtagtatttt-ttttttt-ggttaccttggggcttatgtaaaacatcatatatatgtaggcaaagtttattctaagctaataacaact i ponAbe2.chr15 M 5933 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 756959 1715 - 1485088 taggatcatttgtatttttatggcatgagttgtattgtttcttctttcatttctgatttt-tttatttgagtcttctatattttttcttggttagtctagctaagatttgccaatattattttatatttcatcgattttttctattgtt---ctattctgtatttgatttatttaatttctgttctaatctcta----ttaattcctctggtacatttgggcttaatttgttccttttttcttccttgaagtttaaagtaaggtgggtttgtttttggacatttttcttatgtttagagtagatgtttattgc--tgtactacctcaataccactttagctgcatccataacttttgttattttgtgtttttggtc----tttatatgtagatacattctaatttccctcgatatctttttgacataatggttgttcaagagtgtattgattaccacatatttatgaatttcctagttttgcttgttattgattttaattttatatcattatagatagaaaagatactttccccactt--ataatttccatattcttaaatttacttgtgtttattatgtggcctaacagatgacctatcctgaaaaatgttatatgatcacttgagaagaatgtgtattctgctgtcgctggatagttctgtacatgtctatgaggtccttttgttttataggatgtttaagattgctacttccctactgattttctgctggagattcattcccattgtcataattggcataatgatgtgtctcactgttattttattgctgtctatttctcccttcaaatctgtcaatgtttgccttatatatagttaagtactctgatcttgggtgcctatacatttatagttgttctaacatcctgataattgacctttttatcattatataatgaccttttttatttcgtgtgacagtttttaacctaaagtctatttggcctggtataaatttagccactcctggtgtcttttggttatgatttgcatggaatatttttttctctcccttcactttcagcctttgggagtccttgaatctatagtctcttgttgacagcctatagtttgattttattttttaatgcatttggacgttctttgtcttttgactggggaattt--aatccatttacaGTCAGCTGGATGTAGGTTCCACATCCACAGAGTCAACCAACCTTGCATAAAAAA---TCACACACCCCCATAAAGATAACAATGATAACAA-TCGAATAATAAAAGTAATGCaaaccagatggtgtaacaggtatttatatacagtttacattctattagatatgataaataatctagagatggtttaaagtataggggatggtgtgcatgggttatatgcaaatact-----actt-----------aatataagggacttgagcatccataaattttggtatctacaggggatcttgaaacccatctttcaaggatactgtgggataactCTATTTACAAAGTTGtattaataagtaaggacttgctatggcacttcattttattttttctttctgtgttataattcttt-----ttcttttttctcttgctgttttcttt--------------------------------------------tgtgttcattgatatgtttgtattgatatgtatttatttccttttctttttcttttgtatattttctgtagtattttattttttt-ggttaccatggtgcttatgtaaaacatcatatatatggaggcaaagtttattctaagctaataacaact i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85339718 3220 - 162156779 I e macFas5.chr7 88218153 3506 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87940181 3679 - 170124641 I e calJac3.chr10 87632827 16210 - 132174527 I a score=436667.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 307654 606 + 478999 caactttaatcacataaaaaattctgc------actt--------ctcccactttgttattg----------------atgtcacaattacatcttttatgtgtgtatatctactattatacttctgtagttatagtaatttctactttgttgtcttttgacttt-catattagaaaaaggt-------gcaccaccattacaatgttgcacaattttgtatttgtttaaataattagcttttccagtaagttttatattttaatatgcttagttatgcttagttttgctatttagtattattttgtttgagttaaagagctcacctgtcatttattttatgacaaatctagtggtgatgaagttgtttctctcagcttttgcttgagaaagtctttatctattcttcatttttgaagaaaatttttttccagaaattgcattcttggttgagaatttctctctttcagcattGtcttgcttcttcaaaattcactcttttt--------------gacttttgacatataattataatatgtctttgtgtggacttcccttgaatttgttttatttcagttgcatttggcctcatgtatctgtatgtcctttttcttctacagatttggcaagcttttagccagcaccttactttcc s panTro4.chrUn_GL393519 148818 596 + 413329 caactttaatcacataaaaaattctac------actt--------ctcccactttgttattg----------------atgtcacaattacatcttttatatgtgtatatctactattatacttctgtagttatagtaatttctactttgttgtcttttgacttttcatattagaaaaaggt-------gcaccaccattacaatgttgcacaattttgtatttgtttaaataattagcttttccagtaagttttatattttaatatgct-----------agttttgctatttagtattattttgtttgagttaaagagctcacctgtcatttattttatgacaaatctagtggtgatgaagttgtctctctcagcttttgcttgggaaagtctttatctattcttcatttttgaagaaaatttttttccagaaattgcattcttggttgagaatttttctctctcagcattGtcttgcttcttcaaaattcactcttttt--------------gacttttgacatataattataacatgtctttgtgtggacttcccttgaatttgttttatttcagttccatttggcctcatgtatctgtatgtcctttttcttctacagatttggcaagcttttagccagcactgtactttcc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18651485 597 + 99152023 caactttaatcacat-aaaaattctacacttttactt--------ctcccactttgttattg----------------atgtcacagttacatcttttatatgtgtatatctactattatacttctgtagttgcaataatttctactttgttgtcttttgacttt-catattagaaaaaggt-------gcaccaccattacaatgttgcacaattttgta----tttaaataattagcttttcgggtaagttttatattttaatttgct----------tagttttgctatttagtttctttttgtttcagtcaaagagctcacctgtcatttattttatgacaaatctagtggtgatgaagttttctctctcagcttttgtttgggaaagtcttcatctattcttcatttttgaagaaaatttttttccagaaattgtattcttcgttgataatttttctctttcagcattGtcttacttcttcaaaattcattcttttt--------------gacttttgacatttaattataacatatcattgtgtggacttcccttgaatttgttttatttgagttccatttggcctcatgtatctgtatgtccttttccttctacaggttcggcaagctgttagccagcactgtactttcc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 758674 595 - 1485088 caagtttaatcatataaaaaattctac------actt--------ctcccactttgttattg----------------atgtcacaattacatcttttatatgtgtatatctactattatacttctgtagttataataatttctactttcttttcttttgacttt-catattagaaaaaggt-------gcaccaccattataatgtagcacaattttgtatttgtttaaataattagcttttccagtaagttttatattttaatatgct----------cagttttgctatttagtatctttttgtttgagttgaagagctcacctgtcatttattttatgacaaatctagtggtgatgaggttg-ctctctcagcttttgtttgggaaagactttatctattcttcatttttgaagaaaaattttttccagaaattgcattcttggttgagaatttttctctttcagcattgtcttgcttcttcaaaatttactctttat--------------gacttttgacatttaattataatatgtctttgtgtggacttcccttgaatttgttttatttgagttccatttggcctcatgtatctgtatgtccttttccttctacagatttggcaagcttttagccagcactgtactttcc i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87649037 628 - 132174527 CAACTCTAATCACATAAAAAGCTCTAC------ACTTTTACTCCCCCCCCACTTTGTTGTCACAATCACTTCTTTTATGTGTCACAATTAGTTCTTTTATATGTGTATATGTACTATCATACTTCTGTAGTTGCAATAATTTCTACTGTGTTGTCTTGTGACTTT-CATATTAGAAAAAGGTAATTTTCACACCATTATTACAATGTTGCACTATGTTGTATTTGTTTAAATAACTAGCTTTTCCAGTCAATTTTACGTTTTAATAGGCT----------TAGTTTTGCTACTTA---TCTTTTTATTTGCATTTAAGAACTCAAATGTcatttattttatgacaaatctattggtgatgaatttg----tctcagc--ttgttttgcaaagctgttatttgttcttccgttttgaagaacag-tttttccagaaatttcattgttagttgagaattt-tatctttcagcattGTC-TGCTGCTTCAAAATTCACTTTTTTTttttttttttttaggacttttgacctttaattaaaatgt-tctttctgtggacttctcttgtatttgttttatttgggttccatttggcctcatgtatctgtatatccttttccttctacagatttggcaagtttttagccagcactgtgctttcc i calJac3.chr10 I 16210 C 0 e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85339718 3220 - 162156779 I e macFas5.chr7 88218153 3506 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87940181 3679 - 170124641 I a score=1788771.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 308260 789 + 478999 ttcttatttttctcttctccatctggaacttttgtgatcagtatattatttcactttatgatgtaccttaagtccgtaggttcattggctcttttt--tattcttttttcttttgctcctttgtctatataatttgaaatgactggtgtctggattagctgattccttcttctgtttgatcaagtctacttgtgaacaccccctagtga-tttttttatttccgtcatagaattcttagctccagaatttctaattgtttcttcttgtaaaatttctatatctttacttcaata--tttttatcttgctcatctatcattgttgtgatttcatttaattgtgtctcagtgttctcttgtggcatgctgaATTATCATGGAGCCCCAGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTGCTTCTTTCATATGTGATAACTATAATGAACTTTAACAAATCTCAAATTCGAGTACATTCCCAATCACCTTCTAAAAGTAACCTCCTAACCTCCACTGATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCATAGATTTCAACTACAGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGCCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttcagtgtgtgtaaaaatcacctgggatcctatttaacattcaagtttctgagccttcccctagCCAG------------TAGATTTTATATACAAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAAA---TCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTAATTTGATGTTTTATCTTTCAAGA s panTro4.chrUn_GL393519 149414 802 + 413329 ttcttatttttctcttctccatctggaacttttgtgatcagtatattatttcactttatgatgtcccttaagtccgtaggttcatttgctcttttt--tattcttttttcttttgctcctttgtctatataatttgaaatgactggtgtctggattagctgattccttcttctgtttgatcaagtctacttttgaacaccccctagtga-tttttttatttcagtcatagaattcttagctccagaatttctaattgtttcttcttgtaaaatttctatatctttacttcaata--tttttatcttgctcatctatcattgttgtgatttcatttaattgtgtctcagtgttctcttatggcatgctgaattaccATGGAGCCCCAGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTCTTTCATATGTGATAACTATAATGAACTTTAACAAATCTCAAATTTGAATACATTCCCAATCACCTTCTAAAAGTAACCTCCTAACCTCCACTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCGATAGATTACAACTGCAGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGTCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttccgtgtgtgtaagaatcacctgggatcctatttaacattcaagtttctgagccttcccctagccaggctctgtgccagtagatttTATACACGAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAAAA--TCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGACTACATTTAATTTGATGTTTTATCTTTCAAGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18652082 801 + 99152023 ttcttatttttctctcctccatctggaacttttgtgatcagtatactatttcactttatgatgtcccgtaagtccataggttcatttgctcttttt--cattcttttttcttttgctcctttgtctatataatttgaaatgactggcgtctggattagctgattcctccttctgtttgatgaagtctacttttgaacaccccctagtgattttttttatttcggtcatagaattcttagttccagaatttctaattgtttcttcttgtaaaatttctatatctttacttcaata--tttttaacttgctcatcta-cactgttgtgatttcatttaattgtgtcgcagtgttctcttgtggcatgctgaATTATCATGGAGCCCTGGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTCTTTCATATGTGATAACTAAAATGAACTTTAACAAATCTCAAATTCGAGTACATTCCCAATCACCTTCTAAAAGTAACCTCCCAACCTCCACTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCATAGATTACAACTACAGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGTCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttcagtg-gtgtaagaatcacctgggatcctatttaacattcaagtttctgagccttcccctagccaggctctgtgctagtagatttTATATACAAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAAAA--TCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTAATTTGATGTTTTATCTTTCAAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 759269 796 - 1485088 ttcttatttttctctcctccatctggaacttttgtggtcagtatattatttcactttatgatgtcccttaagtctgtaggttcatttgctcttttt--tattcttttttcttttgctcctttatctatataatttgaaatgactggtgtctggattagctgattccttcttctgtttgatcaagtctacttttgaacactacctagtgattttttttattttggtcatagaattcttagctccagaatttctaattgtttctttttgtaaaatttctatat-----cttcaata--tttttatcttgctc-tctataattgttgtgatttcatttaattgtgtctcagtgttctcttgtggcatgctgaATTATCATGGAGCCCTGGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTCTTTCATATGTGATAACTAAAGTGAACTTTAACAAATCTCAAATTTGAGTACATTCCCAATCACCAGCTAAAAGTAACCTCCCAACCTCCACTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCCTAGATTACAACCACAGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGTCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttcagtgtgtgtaagaatcacctgggatcctatttaacattcacgtttctgagccttcccctagccaggctctgtaccagtagatttTATATACAAAATATGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAAA---TCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTAGTTTGATGTTTTATCTTTCAAGA i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 I 2 s rheMac3.chr7 87943860 804 - 170124641 TTCttatttttctctcctccatctggaacttttgtgattggtatattatttcactttatgatgtcccttaagtccataggttcatttgctcttttt---attcttttttcttttgctcctttgtctatataatttcaaatgactagtgtctggatgagctgattccttcttctgtttgctctagtctacttttgaac-cccctgagtga-attttttatttcggtcatagaattcttagctccagaatttctaattgtttctttttgtaaaatttctatatctttatttcaatatttttttatcttgctcatctatcattgttgtgatttcatttaattgtctctgcgtgttctcttgtggcatgctgaATTATCATGGAGCCCTGGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTCTTTCATTTGTGATAACTAAAATGAACTTTAACAAATCTCAAATTTGAGTACTTTCCCAATCACCAGCTAAAAGTAACCTTCCAGCCTCCTCTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCCTACATTACACCTACGGGACAACCAGAGGAGACCCATGGTCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttcagtgtgtgtaagaatcacctgggattctatttagcattcaagtttctgagccttctcctagccaggctctgtgccagtagatttTATATACAAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAATAATTCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTGGCTTGGTGTTTTATCTTTCAAGA i rheMac3.chr7 I 3679 C 0 s macFas5.chr7 88221659 804 - 171882078 TTCttatttttctctcctccatctggaacttttgtgattggtatattatttcactttatgatgtcccttaagtccataggttcatttgctcttttt---attcttttttcttttgctcctttgtctatataatttcaaatgactagtgtctggatgagctgattccttcttctgtttgctctagtctacttttgaac-cccctgagtga-attttttatttcggtcatagaattcttagctccagaatttctaattgtttctttttgtaaaatttctatatctttatttcaatatttttttatcttgctcatctatcattgttgtgatttcatttaattgtctctgcgtgttctcttgtggcatgctgaATTATCATGGAGCCCTGGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTCTTTCATTTGTGATAACTAAAGTGAACTTTAACAAATCTCAAATTTGAGTACTTTCCCAATCACCAGCTAAAAGTAACCTTCCAACCTCCTCTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCCTACATTACACCTACGGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGTCACTAGAATGGTCcagtgacctt----tatacttcagtgtgtgtaagaatcacctgggattctatttagcattcaagtttctgagccttcccctagccaggctctgtgccagtagatttTATATACAAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTTTCAAGTGATTAAAAAAATAATTCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTGGTTTGGTGTTTTATCTTTCAAGA i macFas5.chr7 I 3506 C 0 s papAnu2.chr7 85342938 803 - 162156779 ttcttatttttctctcctccatCTGGAACTTTTGTGATtggtatattattttactttatgatgTCCCTTAAGTCCACAGGTTCAtttgctcttttt---attcttttttcttttgctcctttgtctatataatttcaaatgactAGTGTCTGGATGAGCTGATTCCTTCTTCTGTTTGCTCTAGTGTACTTTTGAAC-CCCCtgagtga-attttttatttcggTCATAGAATtcttagctccagaatttctaattgtttctttttgtaaaatttctatatctttatttcaatatttttttatcTTGCTCATCTATCATTGTTGTGATTTCATTTAATTGTCTCTGCGTGTTCTCTTGTGGCATGCTGAATTATCATGGGGCCCTGGAGCTCTCCTTTCCTCATGTGTGCTTCTTC-TTCATTTGTGATAACTAAAATGAACTTTAACAAATCTCACATTTGAGTACTTTCCCAATCACCTGCTAAAAGTAACCTTCCAACCTCCTCTTATTCCTCAGATGTGGTAGTTTGAAAGTTGTTCCCCTACATTACACCTACAGGCCAACCAGAGGGGACCCATGGTCACTAGAATGGTCCAGTGACCTT----TATACTTCAGTGTGTGTAAGAATCACCTGGGATTCTATTTAGCATTCAAGTTTCTGAGCCTTCCCCTAGCCAGGCTCTGTGCCAGTAGATTTTATATACAAAATGTGAGGGAACCATTACCCTTGTCAAGTGACTaaaaaaaCAATTCAGAGGTGAAGCAATTAGATTTGGCTACATTTGGTTTGGTGTTTTATCTTTCAAGA i papAnu2.chr7 I 3220 C 0 s calJac3.chr10 87649665 797 - 132174527 ttcttatttttttctcctccatctggaacttttgtgatcagtatattatttcactttatgatgtcttgtaagtttgtaggttcatttgttctttttaaaaattctttttcttttgctcctttgactatataatttcaaatgactagtgtctgggttagttgattccttcttctatttgatcaagtctactcctgaac-cctcc-------ctatttcattttggtcatagaattcttatcttcataatttctaa-tattcctttttaataaatttctatatctttatttcaata--ttgttatcttgctcatttatcattattgtgatttcatttaattgtctctctgtg--ctcttctggcatactgaattATCATGGGGCCGTGGAGCTCTCCTTTCCTCATATGTGCTTCTTCTTTCATATGTGATAATTAAAATGAACTTTAACAAACCTCAAATTTGAGAGCTGTCCCAATCACCTGCTAAAAGTTACCTCCCAGCCTCCTCTTATTCCTCAGATGTGGTGGTTTAAAAGTTTTTCCCCTTAATCACACCTACAGGCCCACCAGAGGGGACCCATGGTTACTGGAATAGTGTAGTGACCTTAATAAATacttcagtgtgtgtaagaatcacctgggatcctatttagcattcaagtttctgaccctttccctagccaggctctgcgccagtagatttTATGTACAAAACGTGAGGGAAGCATTAGACTTTCCAAGTGGTTAAAAAAAA---TCAGAGGTGAAGTAATTAGATTTGGCTACACTTAATTTGACGTTGTATCTTTCAAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=915709.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 309049 538 + 478999 GATTGGGATGGTTCTAGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATATGGCTTCTAACTGTTACTGGGTGCTTATGTCTTTTCTTTACTCTGATCAACAATATTgggcaggtgtagtggctcacgcccataatcccagcactttgagaagccaaggcgggaggttcacttgagcccaggagtttgagaccagcctggacaacctggggagacctccatctctgcaaaataaaacaaacaaaca---gacagacata---aaaacacctagctgggcgtgttggtatacacctttggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggattgcttgagccacaaggtcaatgctccagtgagccgtgattgtgtcactgcactctagcctggaaaacagagcaagaccctgtctc-aaaaaacaaaCAGCATACGTCTTATTGTTTTGTTCGCTTGTTTCTGAAATAATCTCGTTAGTAAAGCACTATACTTGATAAACAGTCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGATTTTGGAGAGACAAGATT s panTro4.chrUn_GL393519 150216 538 + 413329 GATTGGGATGGTCCTAGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATACGGCTTCTAACTGTTACTGGGTGTTTATGTCTTTTCTTTACTCTAGTCAACAATATTgggcaggtgtagtggctcacgcccataatctcagcactttgagaagccaaggcgggaggttcacttgagcccaggagtttgagaccagcctggacaacctagggagacctccatctctgcaaaataaaacaaacaaaca---gacagacata---aaaacacctagctgggcatgttggtatacacctttggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggattgcttgagccacaaggtcaatcctccagtgagccgtgattgtgtcactgcactctagcctggataacagagcaagaccctgtctc-aaaaaacaaaCAGCATACGTCTTATTGTTTTGTTTGCTTATTTCTGAAATAATCTCAGTAGTAAAGCACTATACTTGATAAACAGTCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGATTTTGGAGAGACAAGATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18652883 541 + 99152023 GATTGGGATGGTTCTAGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATACGGCTTCTAACTGTTACTGGGTGTTTTTGTCTTTTCTTTACTCTGGTCAACAATATTgggcaggtgtagtggcacatgcccataatctcagcactttgagaagccaaggcgggaggttcccttcagcccaggagtttgagaccagcctggacaacctagggagacctccatctctgcaaaataaaacaaacaaaca---gacagacagacataaaacacctagctgggcgtgttggtatacacctgtggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggactgtttgagccacaaggtcagtgctccagtgagccgtgattgtgtcactgcactctaacctggataacagagcaagaccctgtctc-aaaaaacaaaCAGCATACGTCTTATTGTTTTGTTCACTTATTTCGGAAATAATCTGGTTAGTAAAGCACTATACTTGATAAACAGTCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGATTTTGGAGAGACAAGATT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87944664 535 - 170124641 GATTGGCATGGTTCTAGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATATGGCTTATAACTGTTACTGAATGTTTATGCCTTTTCTTTACTCTGGTCAACAATATTgggcaggtgtagtggctcatgcccataatctcagcactttgagaagccaaggcgggaggttcacttgcgcccaggagttcgaaaccagactggacaacctagggagacctccatctctgcaaaataaaacaaacaa-------acgaacata---aaaacccctagctgggcgtggtggtgtacacctgtggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggatcacttgagccacagggtcaatgctccagtgagccgtgattgtgtcaccgcactctagcctggataacagagcaagaccctgtctcaaaaaaaCATACAGCATACGTCTTATTGTTTTGTTTGCTTATTTCTGAAATAATCTCATTAGTAAAGCACTGTACTTGATAAACAGCCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGACTTTGGAGAGACAAGATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88222463 535 - 171882078 GATTGGCATGGTTCTAGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATATGGCTTATAACTGTTACTGAATGTTTATGCCTTTTCTTTACTCTGGTCAACAATATTgggcaggtgtagtggctcatgcccataatctcagcactttgagaagccaaggcgggaggttcacttgcgcccaggagttcgaaaccagactggacaacctagggagacctccatctctgcaaaataaaacaaacaa-------atgaacata---aaaacacctagctgggcgtggtggtgtacacctgtggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggatcacttgagccacagggtcaatgctccagtgagctgtgattgtgtcaccgcactctagcctggataacagagcaagaccctgtctcaaaaaaaCATACAGCATACGTCTTATTGTTTTGTTTGCTTATTTCTGAAATAATCTCATTAGTAAAGCACAGTACTTGATAAACAGCCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGACTTTGGAGAGACAAGATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85343741 535 - 162156779 GATTGGGATGGTTCTCGTGAAAATTATAGCTAATCTGAATATGGCTTATAACTGTTACTGAATGTTTATACCTTTTCTTTACTCTGGTCAACAATATTGggcaggtatagtggctcatgcccataatctcagcactttgagaagccaaggcgggaggttcacttgagcccaggagttcgaaaccagactGGACAACCTAGGGAGacctccatctctgcaaaataaaacaaacaa-------aggaacATA---AAAACacctagctgggcgtggtggtgtacacctgtggtcccagctacttgggaagctgaggtaggaggatcacttgagccacaGGGTCAATGCtccagtgagccgtgattgtgtcaccgcactctagcctggataacagaggaagaccctgtctcaaaaaaacaaacagcacacgtcttattgttttgtttgcttatttctgaaataatctcATTAGTAAAGCACTATACTTGATAAACAGCCTGATTTAATGAATAAGGATTTAAACTTTAGACTTTGGAGAGACAAGATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87650462 537 - 132174527 TATTGGGGTGGTTCTAGTGAAAATTATAACTAATCTGAATATAGCTT----CTGTTATTGAATGTTTATGCTTTTTCTTTACTCTTGTTAAAAATATTGTGCAGCTATAgtggctcatgcccataatctcagcactttaagaggccaaggtgggaggttcacttgttcccaggagttcaagaccagcctggacaatctagggagacccccatttctgcaaaatacaacaaacaaacaaacaaaagacatg---aaaactcctagctggtcttggtggtgtatacttgtggtcccagctactgtggaagctgaggtaggaggatcacttgagccacaaggtcaatgctccagagagccatgattgtgcccctgtactctaacctgggtatcagaggaagaccctgtctc-aaaaaacaaaCAGTATATGTATTTTTGTTTTGTTTGCTTATTTCTGAAATAATCTTGTTAGTAAAGCATTATACTTGATAAAAAGGCCGATGTAATGAACAAGGATTTGAACTTTAGACTTTGGAGAGACAAGATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46717201 4319 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760065 2 - 1485088 I a score=875759.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 309587 506 + 478999 AACTAACCGTTGATCACAAGGAGCACACTGTGCAACAAGCTACTCTGATAGGACAAAAGTCCTAGGAGGGCTATATAAGCAAAATCTCATTCAAGGACTGAACTTTAAGCCCTATTCACTTTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGACATC------------TATAGGGAAGAGAGAAGAGGATGTGTTTCTGAGCTTTCCTTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CATTAATTTCCTCCCTTCCTTCTCCACACCCT-GGCATGTTG-GCCCATAGCCACAAGGTGGCAGGATAA--CCAGTAACATTTTATTCAAGCCAACTGAAGCCCTGCGGGGGCTTTGA-AGTTCACACA-CACTGTCC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCAGAGTCATATTACTAGATGACTGGATTGCTTCTTTTGTCCCTCAATCCTGCTCTCCTTTCAGTGCTAACTCAAGAAAACACTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG s panTro4.chrUn_GL393519 150754 506 + 413329 AACTAACCGTTGATCACAAGCAGCACACTGTGCAACAAGCTACTCTGATAGGACAAAAGTCGTAGGAGGGCTATATAAGCAAAATCTCACTCAAGGACTGAACTTTAAGCCCTATTCACTTTTAGCTAATCAAATG---------------------------ATGGGCACGTTGACTTC------------TATAGGGAAGAGAGAAGAGGATGTGTTTCTGAGCTTTCCTTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CATTAATTTCCTCCCTTCCTTCTCCACACCCT-GGCATGTTG-GCCCGTAGCCACAAGGTGGCAGGATAA--CCAGTAACATTTTATTCAAGCCAACTGAAGCCCTGCAGGGGCTTTGA-GGTTCACACA-CACTGTCC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCAGAGTCATATTACTAGATGACTGGATTGCTTTTTTTGTCCCTCAATCCTGCTCTCCTTTCAGTGCTAACTCAAGGAAACGCTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18653424 505 + 99152023 AACTAACCTTTGATCACAAGGAGCACACTGCGCAACAAGCTACTCTGATAGGACAAAAGTCCTAGGAGGGCTGTGTAAGCAAAATCTCACTCAAGGACTGAACTTTAAGCCCTATTCACTGTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGACTTC------------TATAGGGAAGAGAGAAGAGGATGTGTTTCTGAGCTTTCCTTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CATTAATTTCCTCCCTTCCTTCTCCACACCCT-GGCATGTTG-GCCCATAGCCACAAGGTGGCAGGATAA--CCAGTATCATTTTATTC-AGCCAACTGAAGCCCTGCAGGGTCTTTGA-AGTTCACACA-CTCTGTTC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCAAAGTCATATTACTAGATGACTAGATTCCTTCTTTTGTCCCTCAATCCTGCTCTCCTTTCAGTGCTAACTCAAGGAAATGCTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87945199 506 - 170124641 AATTAACCTTTGATCACAAGGAGCACAGCGTGCAGTAAGCTACTCTGACAGGACAAAAGTCCTAGGAGGGCTATATAAGCAAAATCTCATTCAAGGACTGAACTTTAAGCCCCATTCACTTTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGACTTC------------TGTAGGGAAGAGAGAACAGGATGTGTTTCTGAACTTTCTTTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CATTAATTTCTTCCTTTCCTTCTCCAAGCCCT-GGCATGTTG-GCCCATAGCCACAAGGGGGCAGGATAA--CCCTCATCATTTTATTCAAACCAACTGAAGCCCTGCAGGGGCTCTGA-AGTTCACACA-CTCTGCCC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCAGAGTCATATTACTAGATGACTAGATTCCTTCTTTCTTCCCTCAATCCTGCTGTCCTTTCAGTGCTAATTCAAGGCAACGCTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88222998 506 - 171882078 AATTAACCTTTGATCACAAGGAGCACAGAGTGCAATAAGCTACTCTGACAGGACAAAAGTCCTAGGAGGGCTATATAAGCAAAATCTCATTCAAGGACTGAACTTTAAGCCCCATTCACTTTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGACTTC------------TGTAGGGAAGAGAGAACAGGATGTGTTTCTGAACTTTCTTTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CATTAATTTCTTCCTTTCCTTCTCCAAGCCCT-GGCATGTTG-GCCCATAGCCACAAGGGGGCAGGATAA--CCCTCATCATTTTATTCAAACCAACTGAAGCCCTGCAGGGGCTCTGA-AGTTCACACA-CTCTGCCC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCAGAGTCATATTACTAGATGACTAGATTCCTTCTTTCTTCCCTCAATCCTGCTGTCCTTTCAGTGCTAATTCAAGGCAACGCTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85344276 504 - 162156779 AATTAACCTTTGATCACAAGGAGCACAGCGTGCAATAAGCTACTCTGACAGGACAAAAGTCCTAGGAGGGCTATATAAACAAAATCTCATTCAAGGACTGAACTTCAAGCCCCATTCACTTTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGACTTC------------TGTAGGGAAGAGAGAACAGGATGTGTTTCTGAACTTTCTTTCTTCAGTCAGGCAACTC--TGAtt--cattaatttcttcctttccttctccaagCCCT-GGCATGTTG-GCCCGTAGCCACAAGGGGGCAGGATAA--CCCTCATCATTTTATTCAAACCAACTGAAGCCCTGCAGGGGCTCTGA-AGTTCACACA-CTCTGCCC-ACCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACGTCATCCAGAGTCATATTACTAGATGACTagattccttctttcttccctcaatCCTGCTGTCCTTTCAGTGCTAATTCAAGGAAACACTAAGTTTAC-ACTTTGCAGGAGCCCCTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87650999 481 - 132174527 AATTACTCTTTGATCACAAGGAATTCACTGTGAAACAAGCTACTCTGGTAGGACAAAAGTTTTAGAAGGTCTATATCAGCAAAATCACACTCAAGGGCTGAACTTTAAGCCCTCTTCACTTTTAGCTAATCAAGTG---------------------------ATGGGCAAGTTGGCTTC------------TAAGGGGAAGAGAGAAGAGGATGTGTTAC----------TTCTTCAGTCAGGCAACTCTGTGATT--CCATCATTTCCTCCCTTCCTTCTCCAAGCCCT-GGCATGTTG-GCCCAGAGCCACAAGGTGGCAGGATAA--CCCTCATCATTTCATTCTAACCAACTGAAGTCCTGCAGGGGCTCTGA-TGTTCACACA---CTGCCC-GCCTTCCACATACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAACATCATCCCGCGTCATATTACTAGATAACTAGATTCCTTCTTTCTTCCCTCAATCCTACTCTCGTTTCAGTTCTAACTCAAGGAAACG--------------TTGCAGGAGCCCCTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46721520 513 - 64190966 AAACAGTCATTGCCCACAAAGAGCTTCCAGCGTAATGAGCTACTTTGGCAG-----AAGCTCCATCATGG------------AACTGTGTGCAAGGGGAACACTTTATAGCCTTTTCATTCTTCACTGCCGAAGCAGATACGAGGTCGTCCTACACCCACAGTAAGGTACAGTGGACTTCCTGGGCATGGTTCATAGGAAGCTGGGAGTCAGGCCAGTTTCAGGTGTCTTCTTCTGCTGTTAGAC-ATTCTGTAGCTTGTGTTAGGTGACTTCCCT-CTTCTCTAAGCTTTAGGCATTTTGAGCACACCAGTATGAAGTGGCAGGAACAGGTCAGAATGTCGTGATCCAAGCTGAGCAAGG--CAGCAAGAGTGGAGACAGCTCACTCAACTCTGTTCGGTGTTCCGCAGTCC-CCGCAGAAAGTAACTCGGGGCAAATAT--TTCTGAGTAGCATCAATTGCTAGCCTTACTTCTCTTTTTTCTCCT------------------GGTGCTAACTAAAGGATACTCTAACTTTTCTATTTTGGAAGTACCACTG i canFam3.chr15 I 4319 I 1247 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760065 2 - 1485088 I a score=192701.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 310093 117 + 478999 GAATAGTTAAAGCTTTAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAAAAAATACCTGTTGATTTTCTGTTATTTTAATGGATACCTAGCTTCCTTTTATAAATTGGCATTAC s panTro4.chrUn_GL393519 151260 113 + 413329 GAATA----AAGCTTTAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAAAAAATACCTGTTGATTCTCTGTCATTTTAATGGATACCTAGCTTCCTTTTATAAATTGGCATTAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18653929 117 + 99152023 CAATAGTTAAAGCTTTAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAAAAAATACATGTTGATTTTCTGTCATTTTAATGGATACCTAGCTTCCTTTTATAAATTGGTATTAC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87945705 117 - 170124641 GAGTATTTAAAGCTTTAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAGAAAATACCTGTTGATTTTCTGCCATTTTAATGGATACCTAGTTTCCTTTTATAAATTGGTATTAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88223504 117 - 171882078 GAGTATTTAAAGCTTTAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAGAAAATACCTGTTGATTTTCTGCCATTTTAATGGATACCTAGTTTCCTTTTATAAattggtattac i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85344780 117 - 162156779 GAGTATTTAAAGCTTCAAACCATTTCACATCCAACTCAATGATCTGTTACAGAAAATACCTGTTGATTTTCTGCCATTTTAATGGATACCtagtttccttttataaattgGTATTAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87651480 106 - 132174527 GAATATTTAAGGCTTAACACCATTTCACATTCAACTCAATGATCTGTTACAGAAAATACCTGTTGATTTCCTGTCATTTTAATGGCGACCTAGTTTCTTTTTATAA----------- i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46722033 1247 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760065 2 - 1485088 I a score=680500.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 310210 436 + 478999 AATAGTCTGGTATTAG---TATTGATCT---------GGAATCTATGTGCTTCCAGATCAGTCCCATTCCTTTTACTTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTCCATGAAACCACATCTCTCTAAGAAGATGCTGGAAAGTCAGTCTTTCTCAAAAA----GTAGTTTTC----CCCTCAAGTTTCA-ACAC--ATTACTCCACTGTAAGTTTAGACAGtataaatatgt-----------------ataaaatatatatat----ataa-------------------------------------------------tatatatatat-tttagtataat-----attatGCTTCAGCTTTTCCTGCATGTTTTTCTTTCTTTTCTCTTACACC-CTTCTCTGTGATCTCATCTGACAATCACTACCATGGCAACCAAGCCTCTGTGATG-TTCCAGC--------AAGCTCATTGTC-------TTCTCTTCACTAAACTTTAGTTAGTAGTTGGTCCCAGTCAGTAACACTCTGGG s panTro4.chrUn_GL393519 151373 436 + 413329 AATAGTCTGGTATTAG---TATTGATCT---------GGAATCTATGTGCTTCCAGATCAGTCCCATTCCTTTTACTTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTCCATGAAACCACATCTCTCTAAGAAGATGCTGGAAAGTCGGTCTTTCTCAAAAA----GTAGTTTTC----CCCTCAAGTTTCA-ACAC--ATTAGTCCACTGTAAGTTTAGACAGtataaatatgt-----------------ataaaatatatacat----atat-------------------------------------------------tatatatatat-atTAGTATAAT-----ATTATGCTTCAGATTTTCCTGCATGTTTTTCTTTCTTTTCTCTTACACC-CTTCTCTGTGATCTCATCTGACAATCACTACCATGGCAACCAAGCCTCTCTGACA-TTCCAGC--------AAGCTCATTGTC-------TTCTGTTCACTAAACTTTAGTTAGTAGCTCGTCCCAGTCAGTAACACTCTGGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18654046 483 + 99152023 AATAGTCTGGTATTAA---TATTGGTA----------GTAATCTATGTGCTTCCAGATCAGTCCCATTCCTCTTACTTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTCCATGAAACCACAACTCTCCAAGAAGATGGTGGAAAGTCAGTCTTTCTCAAAAA----ATAGTTTTC----CCCTCAAGTTTCA-GCAT--ATTACCCCACTGTAAGTTTAGACAGtatatatatat-----------------ataaaatatatgtac----gtatatatgtatatatatgtgtgtatatatgtatatat-atatgtg-tgtgtgtatatatatataATTACTATAAT-----ATTATGCTTCAGCTTTTTCTGCATGTTTTTCTTTCTTTTCTCTTACACC-CTTCTCTGTGATCTCATCTGTCAATCACTACCATGGCAACCAAGCCTCTGTGACA-TTCCAGC--------AAGCTCATTGTC-------TTCTCTTCACTAAACTTTAGTTAGTAGCTGGTCTCAGTCAGTAACACTCTGGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87945822 501 - 170124641 AATAGTCTGGTATTGG---TATTGATATTG-----CAATAGTCTATGTGCTTCCAAATCAGTCCCATTCCTTTTACCTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGATACCATTCTTCCATGAAACCACATCTCTCCAAGAAAATGCTGGAAAGCCAGTCTCTCTCAAAAA----GTGATTTTC----CCCTCAAGTTTCA-ACAC--ATTACTCTACTGTAAGTTTAGCCAGTATATATATATATA--------------ATATAAGATGTATACTATAATACATACATAAAGTCTAAAGTTTAAATACTtatatataatatata----atatatatatatat-TTTACTATAAT-----ATTATGCTTCAGCTTTCCCTGCAAGTTTTTCTCTCCTTTCTCTTACACC-CTTCTCTGTGCTCTCATCTGACAATCGCTGCCATGGCAACCAAGCCTCTGTGACATTTCCAGCAAGCTCAGAAGCTCATTGTC-------TTCTCTTCACTAAACTTTGGTTAGTAGCTAATCTCAGTCAGTAACACTCTGGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88223621 502 - 171882078 aatagtctggtattgg---tattgatattg-----CAATAGTCTATGTGCTTCCAAATCAGTCCCATTCCTTTTACCTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTCCATGAAACCACATCTCTCCAAGAAAATGCTGGAAAGCCAGTCTCTCTCAAAAA----GTGATTTTC----CCCTCAAGTTTCA-ACAC--ATTACTCTACTGTAAGTTTAGCCAGtatatatatat-----------------atataagatgtatactataatacatacataaagtctaaagtttaaatacttatatataatatataatatatatatatatatat-tttactataat-----attatGCTTCAGCTTTTCCTGCAAGTTTTTCTCTCCTTTCTCTTACACC-CTTCTCTGTGCTCTCATCTGACAATCGCTGCCATGGCAACCAAGCCTCTGTGACATTTCCAGCAAGCTCAGAAGCTCATTGTC-------TTCTCTTCACTAAACTTTGGTTAGTAGCTAATCTCAGTCAGTAACACTCTGGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85344897 513 - 162156779 AATAGTATGGTATTGG---TATTGATATTG-----CAAtagtctatgtgcttccaaatcaGTCCCATTCCTTTTACCTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTCCATGAAACCACATCTCTCCAAGAAAATGCTGGAAAGCCAGTCTCTCTCAAAAA----GTGATTTTC----CCCTCAAGTTTCA-ACAC--ATTACTCTACTGTAAGTTTagccagtatatatatatatatatatataacatatatataagatgtatactgtaatacatacat--aGTCTAAAGTTTAAATacttatatataatgtata----ttatatatatatat-tttactataat-----attatGCTTCAGCTTTTCCTGcaagtttttctttcctttctcttacaCC-CTTCTCTGTGCTCTCATCTGACAATCGCTGCCATGGCAACCAAGCCTCTGTGACATTTCCAGCAAGCTCAGAAGCTCATTGTC-------TTCTCTTCACTAAACTTTGGTTAGTAGCTAATCTCAGTCAGTAATACTGTGGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87651586 403 - 132174527 -------------TTG---TATGGGTATTA-----CAATACTCTGTGTGCTTCCAAATCAGTCCCATTCCTTTTACTTTTAGAATAAGACAAAATGTAGCTCAGACACCATTCTTTCATGAAACCACATCTCTCCAAG---ATGCTAGAAA----GTCTTTCTCAAAAA----GCAGTTTTC----CCTTCAAGTTTCA-ACACATATTACTCTGCTGT-----------Gtttatatattt-------------------------tatatat----------------------------------------------tata-------tatacatatat-attactataat-----attatGCTTCAGCTTTTCCTGCATTTTTTTCTTTCCTTT-TCTCTTACC-CTTGTCTATGATCTCGTCTGACAATCACTGCCACGGCAACCAATCCTCTGTGACATTTCCAGC--------AAGCTCACTATC-------TTCTCTTCACTAAATTTTAGTTAGTAGCTGGTCTCAGTCAGTAACACCCTGGG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46723280 434 - 64190966 AATATTTTGTTATTAGTAATATTTATGTTGTATCCCATTAGTATGTAATCTTCCAAATCAACTCTTTCTCTTTTGAGTTT----------------CACCTTAGAAACCAGTCTTCTCTGACATGTCACTTCCCCCAG---------TAGAGACAGCCATTCTGAAAAGAATTGAAAATTTCTAGATATTTAAGCTTCAGATAA--ATTCCTCAAACGTGAGCTTGAAC-TCATATGTTTTT-----------------CTGTCACTTAATCAT---------------------------------------------------------CAT-CATCATC-ATTATTATTATTAATGATGATGATGATGTTTTTCTCTC----TTTTCTTTCCATTTTCTGGTTCCATTTCTTTGTGTTTTCTTCTTAGAGTTGGTGCCATAGCAACTGAGGTTCTGTGATATTTCCAGT--------AAACTCACTGCCTCATTTGTCTTATTCAGCAAA--TCAGTATGTAGCTGAGCTCATACAGTAAAGCCCTGGG i canFam3.chr15 I 1247 I 47103 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760065 2 - 1485088 I a score=1355893.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 310646 787 + 478999 AGGGCTCAGGCCACATCACGAAATGTGACAGGATAGCCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAG--AAAGAATTTTAATGCAATGGcaaacaaccaatcaaacaagcaaacaaaaacaataaacCCTTCCTTGAGGACCAAGAAGACATTGATTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGGTGGAGATCTAGGTCCTGATTCGGTTTCTGAATTTGACCACTAGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTACCCACCTACAGTGGAGCCAAGGCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGGTTGAAATAACCTGGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCTGTGAGTGGTGCAGTTAAGGACACCCAGACTGCCCTTTCACTCTGCTTTCCCTGGGGTAATGTGTATGGCTCCTAGTCTTTCACGTTCTCTTCTGTAATTCGGGAGGAGGAAGAGAAGATACTCACTGCACATATTGTGTCAGTTAATACTAATCTGAGAGCAATAATTTACGATCTTTTGAGGTGAGGTTTGATTTTTACCACTGTGCTGTTCCTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTGTAACTAAGTTGAGGTGAGAATTAATTGAGGACTATATATTTGAGCCTCCTTAGAATCTCACCCACCTTTGAGATAACTTCATGTTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCAGTGAAAAAACACTGGTACACT---TTGATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTGGGAGG------- s panTro4.chrUn_GL393519 151809 787 + 413329 AGGGCTCAGGCCACATCACCAAATGTGACAGGATAGCCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAG--AAAGAATTTTAATGCAATGGCAAACAGCCAATCAAACAAGCAAACAAAAACAACAAACCCTTCCTTGAGGACCAAGAAGCCATTAGTTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGGTGGAGACCTAGTTCCTGATTGGATTTCTGAATTTGACCACTAGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTGCCCACCTACAGTGGAGCCAAGGCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGGTTGAAATAACCTGGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCTGTGAGTGGTGCAGTTAAGGACACCCAGACTGCCCTTTCACTCTGCTTTCCCTGGGGTAATGTGTATGGCTCCTAGTCTTTCACGTTCTCTTCTGTGATTTGGGAGGAGGAAGAGAAGATACTCACTGTACATATTGTGTCAGTTAATACTAATCTGAGAGCAATAATTTACGATCTTTTGAGGTGAGGTTTGATTTTTACCACTGTGCTGTTCCTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTGTAACTAACTTGAGGTGAGAATTAATTGAGGACTATATATTTGAGCCTCCTTAGAACCTCACCCACCTTTGAGATAACTTCATATTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCAGTGAAAAAACACTGGTACACT---TTGATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTGGGAGG------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18654529 780 + 99152023 AGGGCTCAGGCCACATCACCAAATGTGCCAGGATAGGCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAGACAAAGAATTTTAATGCAATGGCAAACAGCCAATCAAACAAGCAAACAAAAACAACAAACCCTTCCTTGAGGACCAAGTAGCCATTAATTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGGTGGAGACCTAGGTCCTGAATGGGTTTCTGAATTTGACCACTGGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTAGAATAAAATTGCCTACCTACAGTGGAGCGAAGGCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGGTTGAAATAACCTGGCTGGTTGTGGGAGAGGCCCCCTCTGTGAGTGGTGCAGTTCAGGACACCTGGACTGCCCTTTCACTCTGCTTTCCC-----TAATGTGTATGGCTCCTAGTCTTTCACGTTCTCTTCTGTAATTTGGGAGGAGGAAGAGAAGATACTCACTGTACATATTGTGTCAGTTAATACTAATCTGACAGCAATAATTTATGATCTTTTGAGGTGAGGTTTGACTTTTACCACTGTGCTGTTCCTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTG----TAAGTTGAGGTGAGAATTAATTGAGGACTATATATTTAAGCCTCCTTAGAATCTCACCCGCCTTTGAGGTAACTTCATATTTTAGGTTTTGTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCAGTGAAAAAACACTGGTACACT---TTGATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTGGGAGG------- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87946323 791 - 170124641 AGGGTTCAAGCCACGTCACCAAACGTGCCAGGACAGCCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAGACAAAGAATTTTAATGCAATGGCAAACAGCCAATCAAACACGCCAACAAAAACAACAAACCCTTCCTTGAGGACCAAGATGCCATTAATTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGATGGAGACCTAGGTCCTGATTGGGTTTCTGAATTTGACCACTGGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTGCCCACCTACAGTGGAGCCAAGTCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGATTGAAATAGCCCGGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCCGTGAGCGGTGCAGTTCAGGACACCCGGACTGCCCTTTCACTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGTGTGGCTCCTAGTCTTTCATGTTCTCTTCTGT-ATTTGGGAAGAGGAAGAGAAGAGACTCACTGTACATATTGTGTTAGTTAATAGTAATCTGGGAGCAATAATTTATAATCTTTTGAAGTGAGGTTTGATTTTTACCATTCTCCTGTTCTTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTGTAACTAATTTCAGATGAGAATGAATTGAGGACTATATATTTGAGCCTCCTTAGAGTCTCACCCACCTTTGAGGTAGCTTCGTATTTTAGGTTTTATCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCCGTGAAAAGACATTGGTACACTAAGGTAATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTGGGGGG------- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88224123 791 - 171882078 AGGGTTCAAGCCACGTCACCAAACGTGCCAGGATAGCCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAGACAAAGAATTTTAATGCAATGGCAAACAGCCAATCAAACACGCCAACAAAAACAACAAACCCTTCCTTGAGGACCAAGATGCCATTAATTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGATGGAGACCTAGGTCCTGATTGGGTTTCTGAATTTGACCACTGGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTGCCCACCTACAGTGGAGCCAAGTCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGATTGAAATAGCCCGGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCCGTGAGCGGTGCAGTTCAGGACACCCGGACTGCCCTTTCACTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGTGTGGCTCCTAGTCTTTCATGTTCTCTTCTGT-ATTTGGGAAGAGGAAGAGAAGAGACTCACTGTACATATTGTGTTAGTTAATAGTAATCTGAGAGCAATAATTTATAATCTTTTGAAGTGAGGTTTGATTTTTACCATTCTCCTGTTCTTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTGTAACTAATTTCAGATGAGAATGAATTGAGGACTATATATTTGAGCCTCCTTAGAGTCTCACCCACCTTTGAGGTAGCTTCGTATTTTAGGTTTTATCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCCGTGAAAAGACTTTGGTACACTAAGGTAATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTGGGGGG------- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85345410 791 - 162156779 AGGGTTCAAGCCACATCACCAAACGTGCCAGGATAGCCTTGAACTCATCAATTGCTGGGTAAGACAAAGAATTTTAATGCAATGGCAAACAGCCAATCAAACACgccaacaaaaacaacaaaccctTCCTTGAGGACCAAGATGCCATGAATTAGCTAACCTAAGAGCTCCAGATGGAGACCTAGGTCCTGATTGGGTTTCTGAATTTGACCACTGGGCAGAAAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTGCCCACCTACAGTGGAGCCAAGTCCCCCAGATCCTTTTTGTCAGGTAAGAATAGATTGAAATAGCCCGGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCTGTGAGCGGTGCAGTTCAGGACACCCGGACTGCCCTTTCACTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGTGTGGCTCCTAGTCTTTCATGTTCTCTTCTGT-atttgggaagaggaagagaagagactcACTGTACATATTGTGTTAGTTAATAGTAATCTGAGAGcaataatttataatcttttgaaGTGAGGTTTGATTTTTACCATTCTCCTGTTCTTGTCTCCTAATATGTTGTATCAGATTGTAACTAATTTGAGATGAGAATAAATTGAGGACTATATATTTGAGCCTCCTTAGAGTCTCACCCACCTTTGAGGTAGCTTCGTATTTTAGGTTTTATCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTATATGCTGGGCCGTGAAAAGACATTGGTACACTAAGGTAATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGCGGTAGGGGG------- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87651989 788 - 132174527 AGGGCTCAAACCGCATCGCCATACGTGCCAGGATAGCCTTGAA---GTCAATTGCTGGGTAAGACAAAGAATTTTAATTCAATGGTAAACAGCCAATCAAACAAGCAAACGAAAACAACAAACCCTTCCTTGAGGACCAAGAAGCCATTAATTAGCTAAACTAAGAGCTGCAGGTGGAGACCAAGATCCTGATTGGGTTTCTGAATTTGACCATTTGGCAG-AAACTAGCACCCAAAACCAGTTGGAATAAAATTGCCCACCTGCAGTGGAGCCAAGGCCCCCAGACCCTTCTTGTCAGGTAAGAATA----GAAATAGCCCAGCTGGTTGTGGGACAGGCCCCCTCTGCGAACAGTGCAGATCAGGACACCCAGACTGCCCTTTCACTCTGCCTTCCCTGGG-TAATGTGTATGACTCCTAGTCTTTCATGTCCTCTTCTGTAATTTGGGAGAAGGAAGAGAAGAGACTCATCACACATATTGTGTCAGTTAATACTAATCTGAGAGCAATAATTTTCCATC-TTTGAAATGAGGTTTGATTTTTACCATTCTGCTGTTCCTGTCTCCTAACATGTTGTATCAGATTGTAACTAATTTGAGATGAGAATGAATTGAGGAGTATATAGTTGAGACTCTTTAGAGTCTCACCCTGCTTTGAGGTAACTTCATATTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGGCTTAAGTCCTTAAATCAGTATATGTTGGGCAGTGAAAA-ACATTGGTACACCAAGGTAATTGCCTAAGCTTAGTGAACAGCAGGGGTGGGGTGGGAGTGGGGG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760065 2 - 1485088 I a score=3824732.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 311433 1796 + 478999 CAGGCCTTTTTAACACCTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGGTCTCTGCACTCCCTCCATCTCCCTTCTGCCCTTTCCATGCATAGCCTTCACAGCAGTTTTTTGTGAATTATTTATTTTTTT-GAGCTCTCTCTTAAGGTTAATTTTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTATAAAGGTGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAATGTGGGAAAACATATTGGC-AAAAAGAATATAAGGATAAAACCATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTTGGGCTC-TAATGGCATTTAAATGCAAAATGTA--ATATACATGTTTAT-----TTATATTTTTAAAATATTAATAATTGattagttaattcaacaataataattgttaacattccagacactactataaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattattgacttgtggaagttatattgtaatgggggaagacaggg--taaataaactatgtggcatgct---tggggggcgatgagtaaagatggagaaaaattagaaggttcaggtcaataggaagtgtgtgttggaggtgacaggtggcaggtgtacatttttccctcagcttaattaaggtttaatttgaaaacattgtatatatttatggtatacaaggtgatattttgatatatgtgtacattgcaaaatgattaaatcaaact------gattaaca-tatccgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctcttagcaattttcaagtattcttttggcccttagtatc------------------------tgtggttctgcatctgcagattcaatcaatcacagatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaatatgacaaaaaataattcaaatata------tagtataacaactatttacgtagcatttacattgtcttagctactataagaaatgtagac-----------------------------attattt--------------------aaactacatggaaggatgtgtgtaagttatatgcaaatactgcaccattttacatgaggcggttgagcatctgctgattttgttgtctccagcgtgagctggaactagtctcccctagatataaagagacaactgaacaatatgttattattaattacagtcaccatgctatacagtacatctccagatcttattgatcttgtttagctgagactttgaactctttaaccaatatctccccatccccactgggtgtaattttcaatagctagtcagggaaggcctcactgagaaggtgatatttgagaaaagacttgaaggaagtgttggggcaagaaatataaatatctagcaaaagagcattacaggcagaggagatggtatgtataggcgccacaaggcagggggatggctggcatgcttaacacacagcaagaaagccTCATCtcttcttcatgcctgcctcacattgaatatatttaaatatggttccctccccatcataaccctgcaatggccattgcagaaatcaccaataacattcatgtgtctaagtcttatggacattt--ttttttcaagatgtatctcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-cattttttcctttggcttcagtgtcaactctactctactttgcctcctgattgcccagaaaactcccacatttctggctacaactcctctatttgatttgtgggcttcttttcctttatttggccattaaattctgaagctctgtgaggctgagttccaggccttcacat s panTro4.chrUn_GL393519 152596 1792 + 413329 CAGGCCTTTTTAACAACTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGGTCTCTGCACTCCCTCCACCTCCCTTCTGCCCTTTCCATGCATAGCCTTCACAGCAATTATTTGTGAATTATTTATTTTTTT-GAGCTCT----TAAGGTTAATTTTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTATAAAGGTGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAATGTGGGAAAACATATCGGC-AAAAAGAATATAAGGATAAAACCATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTACATTTATAGTTGGGCTG-TAATGGCATTTAAATGCAAAATGTA--ATATACATGtttatattatttatatttttaaaatattaataattGATTAGTTAATTCAACAATAATAATT---AACATTccagacactactctaaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattcctgacttgtggaagttatattgtaatgggggaagacagggggtaaataaactatgtggcatgct---gggggggcgatgagtaaagatggagaaaaattagaaggttcaggtcaataggaagtgtgtgttggaggtgacaggtggcaggtgtacatttttccctcagcttaattaaggtttaatttgaaaatgttgtatatatttatgatatacaaggtgatattttgatatatgtgtacattgcaaaatgattaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctcttagcaattttcaagtatttttttggcacttagtatc------------------------tgtggttctgcatctgcagattcaatcaatcacagatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaatatgacaaaaaa--attcaaatata--------gtataacaactatttacgtagcatttacattgtcttagctactgtaagaaatgtagag-----------------------------attattt--------------------aaagtacatggaaggatgtgtgcaagttatatgcaaatactgtgccattttatatgaggcggttgagcatctgctgattttgttgtctccagggtgagctggaactagtctcccctagatataaagagacaactgaacaatatgttattattaattacagtcaccatgctatacagtacatcttcagatcttattgatcttgtttagctgagactttgaactgtttaaccaatatctccccatccccactgggtgtaattttcaatagctagtcagggaaggcctcactgaaaaggtgatatttgagaaaagacttgaaggaagtgttggggcaagaaatataaatatctaccaaaagagcattacaggcagaggagatggtatgtataggtgccacaaggcagggggatggctggcatgcttaacacacagcaagaaagccTCATCTCTTCCTCATGCCTGcctcacattcaatatatttaaatatggttccctccccatcataaccctgcaatggccattgcagaaatcaccaataacattcatgtctctaagtcttatggacattt--ttttttcaagatatatctcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-cattttttcctttggcttcagtgtcaactctattctactttgcctcctgattgcccagaaaactcccacatttctggctacaactcctctatttaatttgtgggcttcttttcctttatttggccattaaattctgaagctctgtgaggctgagttccaggccttcacat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18655309 1829 + 99152023 CAGGCCTTTTTAACAACTCTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGGTCTCTGCACTCCCTCCACCTCCCTTCTGCCCTTTCCATGCGTAGCCTTCACAGCAATTATTTGTGAATTATTTATTTTTTC-GAGCTCTCTCTTAAGGTTAATTGTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTGTAAAAGTGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAATGTGGGAAAACATATTGGC-AAAAAGAATATGAGGATAAAACCATTT---G--TTTCCCCTTGCATCTGTACTTATATTTATAGTTGGGCTC-TAATGGCATTTAAATGCAAAATGTAATATATACACGtttatattatttatatttttaaaatattaataaCTGattagttaattcaacaataataatcgttaacattccagacactactctaaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattcctgacttgtggaagtcatattctaatgggggaagacaggg-gtaaataaactatgtggcatgct---gggggggcgatgagtaaagatggagaaaaattagaaggatcaggtcaataggaagtgtgtgttggaggtggcaggtgGCAGGTGTACAtttttccctcagcttaatt-agatttaattgcaaaacactgtatatatttatggtatacaacgtgatattttgatatatgtatacattgcaaagtgagtaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctcttagcaattttcaagtatTTTTTTGGCCCTTAGTATCTGTGGTTCCGCATCTGCAGattcatgtggttccgcatctgcagattcaatcaatcacagatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaatatgacaaaaaataattcaaatata---atatagtataacaactatttacgtagcatttacactgtcttagctactataagaaatgtagaa-----------------------------attattt--------------------aaactacgtggaaggatgtgtgtaagttatatgcaaatactgcgccattttacatgaggcggttgagcatctgctgattttgttgtttccagggtgacctggaactagtctcccctagatataaagagacaactgAacaatatgttattattaattacagtcaccatgctatacagtacatctccagatcttattgatcttgtttagctgagactttgaactctttaaccaatatctccccagccccacTGGgtgtaattttcaatagctagtcagggaaggcctcattgaaaaggtgatatttgagaaaagacctgaaggaagtgttggggcaagaaatataaatatctagcgagagagtgttccaggcagaggagatggtatgtataggtgccacgaggcagggggatggctggcatgcttaacacacagcaagaaagcctcatctcttcctcatgcccgcctcatattcaatatatttaaatatggttccctccccatcataaccctgcaatggccattgcagaaatcaccaatagcattcatgtctctaagtcttatggacattttattttttcaagatatatctcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-cgttttttcctttggcttcagtgtcaactgtattctactttcccacctgattgcccagaaaattcccacctttctgggtacaactcctctatttaatttgtgggcttcttttcctttatttggccattaaattctgaagctctgtgaggctgagttctaggccttcacat i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 760067 1723 - 1485088 CAGGCCTTTTTAACAACTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTGGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGGTCTCTGCACTCTCTCCACCTCCCTTCTGCCCTTTTAATGCGTAGCCTTCACAGCAATTATTTGTGAATTATTTATTTTTTC-GAGCTCTCCCTTAAGGTTAATTTTTCTTCAGAAATATTTACTCTCAGTATTATAAAAATGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAGTGTGAGAAAACATATTGGC-AAAAAGAATATAAGGATAAAACCATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTTGGGCTC-TAATGGCATTTAAATGCAAAATTTA--ATATACATGTTTATATTATTTATATTTTTAAAATATTATTAATTGattagttaattcaacaataataattgttaacattccagacactactctaaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattcctgactcgtggaagctatattctaatgggggaagacaggggataaataaactatgtggcatgctgtggggggggtgatgagtgaagatggagaaaaattagaaggatcaggtcaataggaagtgtgtgttgg-------aggtggcaggtgtacAtttttctctcagcttaattaaggtttaatcgcaaaacattgtatgtatttatcgtatacaaggtgatattttgatatatgtatacgttgcaaaatgattaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctcctagcaagtttcaagtatTCTTTTGGCCCTTAGTATC------------------------TGTGGTTCTGCATCTGCAGATTCAATCAATCACAGATGGAAAGTATTTA-AAAAAAATAAAAATAACAACTTGACAAAAAATAATTCAAATata---atatagtataacaactatttaagtagcatttacattgtcttagctactataagaaatgtagag-----------------------------attattt--------------------aaactacatggaaggatgtgT-----------------------------------------------------------------------------CTGGAACTAGTCTCCCCTAGATATAAAGAGACAACTGAacaatttgttgttactaattacagtcaccatgctatacagtacatctccagatcttattgatcttgtttagctgagactttgaactctttaaccaatatctccccatccccactGGgtgtaattttcaatagctagtcagggaaggcctcactgaaaaggtgatatttgagaaaagacttgaaggaagtgctggggcaagaaatataaatatctagggaaagagtgttacaggcagaggagatggtatgtataggtgccacgaggcagggggatggctggcatgcctaacacacagcaagaaagcctcatctcttcctcatgcccacctcacattcaatatatttaaatatggtttcctcaccaccataaccctgcaatggccattgcagaaatcaccaataacattcatgtctctaagtcttacggacatt---ttttttcaagatatatctcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-ggttttttcctttggcttcagtgtcaactctattttactttccctcctaattgcccagaaaattcccacctttctggctacaactcctgtatttaatttgtcggcttcttttcctttatttggccattaaattctgaagctctgtgaggctgagttccaggccttcacat i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 I 2 C 0 s rheMac3.chr7 87947114 1799 - 170124641 CAGGCCTTTTTAACAATTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGACTCTGACTCAGCTCACAGCTCTCTGCCCTCCTTCCACCTCCCTTCTGCCCTTTCCATGCGTAGCCTTCACAGCAATTATCTGTGAATTATTTATTTTTTC-AAGCTCTCTCTTAAGGTTAATTTTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTATACAAATGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAATGTGAGAAAACATATAAACCAAAAAAAAAATAAGCATAAAACCATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTCGGGCTCATAATGGCATTTAAATGCAAAATTTA----ATAGGTGtttatattatttatatttttaaaatattaataattGATCAGttaattcaacaataataattgttaacattccagacactactctaaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattcctgacttgttcatattatattcaaatgggggaagacagggggtaaataaactatatggcatgct---gggggggtgatgagtaaagatagagaaaaattagaagggtcaggtcaataggaagtgtgtgttgg-------aggtggcaggggtacatttttccctcagtttaattaaggtataattgcaaaacatagtatacctttacggtatacaaggtgctttttagatatatgtatacactgcaaaatggttaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctctttgcaattttcaagtatgctgttggcccttagtatt------------------------tgtggctctgcatctgcatattcaatcaatcacggatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaacataa-aaaaaataattcaaatttaaaaatatagtataacaacttttt--gtagcatttacattgtcttagctagtatatgtaatgtagag-----------------------------attattt--------------------aaactacatggaaggatgtgtgtgggttatgtgcaaatactgtgccattttatacgaggcggttgagcatctgctgattttgtggtctccagggtgtcctggaactagtctcccctagatatcaagagacaactgaacaatatgtaattattaactacagtcactatgctatacagcagatctccagaactcattgatcttgtttagctgagactttgaactctttaacaaatatctccccatgcccactgggtataattttcaaaagctagtcagggaaggcctcactgaaaaggtgacatttgggaaaagacttgaaggaagtgttggggcaagaaatataaatatctagcgaaagagtattccaggcagaggagatggtatgtataggtgccacgaggcaggggtatggctggcatacttaacagacagcaagaaaaccTCatttcttcctcatgtccacctcatgttcaatatatttaaatatggttccctccccatcatacccctacaatggccagtgcagaaatcaccaataacattcacgtctctaagtcttacatacattt--ttttttcaagacacatttcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-ctttttttcctttggcttcagtgacaactctactctactttccctcctgatttcccagaaaatttccacctttctggctacaactcctctatttaatttgtgggcttgttttcctctaattggccattaaactctgaagctctgcaaggctgagttccaggccttcacat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88224914 1796 - 171882078 CAGGCCTTTTTAACAATTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGActctgactcagctcacagctctctgccctccttccacctcccttctgccctTTCCATGCGTAGCCTTCACAGCAATTATCTGTGAATTATTTATTTTTTC-AAGCTCTCTCTTAAGGTTAATTTTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTATACAAATGTAGAAGTTTATTGTAGAGAAATGTGAGAAAACATATAAAC--ACAAAAAAATAAGCATAAAACCATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTCGGGCTCATAATGGCATTTAAATGCAAAATTTA----ATAGGTGTTTATATTATTTATATTTTTAAAATATTAATAATTGATCAGttaattcaacaataataattgttaacattccagacactactctaaatactcatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattcctgacttgttcatattatattcaaatgggggaagacagggggtaaataaactatatggcatgct---gggggggtgatgagtaaagatggagaaaaattagaagggtcaggtcaataggaagtgtgtgttgg-------aggtggcaggggtacatttttccctcagtttaattaaggtataattgcaaaacatagtatacctttacggtatacaaggtgctttttagatatatgtatacactgcaaaatggttaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcacatgcttgccattttattgttgtgagaacatttaagatcaactctctttgcaattttcaagtatgctgttggcccttagtatt------------------------tgtggctctgcatctgcatattcaatcaatcacggatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaacat-a-aaaaaataattcaaatttaaaaatatagtataacaacttttt--gtagcatttacattgtcttagctagtatatgtaatgtagag-----------------------------attattt--------------------aaactacatggaaggatgtgtgtgggttatgtgcaaatactgtgccattttatacgaggcggttgagcatctgctgattttgtggtctccagggtgtcctggaactagtctcccctagatatcaagagacaactgaacaatatgtaattattaattacagtcactatgctatacagcagatctccagaactcattgatcttgtttagctgagactttgaactctttaacaaatatctccccatgcccactgggtataattttcaaaagctagtcagggaaggcctcactgaaaaggtgacatttgggaaaagacttgaaggaagtgttggggcaagaaatagaaatatctagcgaaagagtattccaggcagaggagatggtatgtataggtgccacgaggcaggggtatggctggcatacttaacagacagcatgaaagcctcatctcttcctcatgtccacctcatgttcaatatatttaaatatggttccctccccatcatacccctgcaatggccagtgcagaaatcaccaataacattcacgtctgtaagtcttacatacattt--ttttttcaagacacatttcttctcagcagaattcagcactgctgttccaaca-ctttttttcctttggcttcagtgacaactctactctactttccctcctgatttcccagaaaatttccacctttctggctgcaactcctctatttaatttgtgggcttgttttcctctaattggccattaaactctgaagctctgcaaggctgagttccaggccttcacat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85346201 1774 - 162156779 CAGGCCTTTTTAACAATTGTCTTTGCTGAGTTTCATGCTGAAAAAGCCTTGAGACTCTGACTCAGCTCACAGCTCTCTGCCCTCCTTCCACCTCCCTTCTGCCCTTTCCATGCGTAGCCTTCACAGCAATTATctgtgaattatttattttttc-aagctcTCTCTTAAGGttaatttttcttaagaaatatttactcTCAATATTATACAAATGTAGAAGTTTATTGTagagaaatgtgagaaaacatataaacaaaaaaaaaaataagcataaaaccATTTAAGG--TTTCCCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTCGGGCTCATAATGGcatttaaatgcaaaattta----ataggtg---------tttatatttttaaaatattaataattgatcAGTTAATTCAACAATAATAATTGTTAACATTCCAGACACTACTCTAAATACTCatgaatacagcagtgaacaaaatggataaaaattccTGACTTGTTCATATTATATTCAAATGGGGGAACACAGGGGGTAAATAAACTATATGGCATGCT---gggggggTGATGagtaaagatggagaaaaattaGAAGGGTCAGGTCAATAGGAAGTGTGTGTTGG-------AGGTGGCAGGGGTACATTTTCCCCTCAGTTTAATTAAGGTATAATTGCAAAACATAGTATACCTTTACGGTATACAAGGTGCTTtttagatatatgtatacactgcaAAATggttaaatcaaact------aattaaca-tatctgtcacctcaCATGCTTGCCATTTTATTgttgtgagaacatttaagatcaaCTCTCTTTGCAATTTTCAAGTATGCTGTTGGCCCTTAGTGTT------------------------TGTGGCTCTGCATCTGCATATTCAATCAATCATGGatggaaaatatttagaaaaaaataaaaataacaacataacaaaaaataattcaaatttaaaaatacagtataacaactttTT--GTAGCATTTACATTGTCTTAGCTAGTATATGTAATGCAGAG-----------------------------ATTATTT--------------------AAACTACATGGAAGGATGTGTGTGGGTTATGTGCAAATGTCGCGCCATTTTATATGAGGCAGTTGAGCATCTGCTGATTTTGTTGTCTCCAGGGTGTCCTGGAACTAGTCTTCCCTAGATATCAAGAGACAACTGAAcaatatgttattattaattaCAGTCACTATGCTATACAGCAGATCTCCATAACTTATTGATCGCGTTTACCTGAGACTTTGAA-----------------CCCCATCCCCACTGGGTATAATTTTCAAAAGctagtcagggaaggcctcactgaaAAGGTGACATATGGGAAAAGACTTGAATGAAGTGTTGGGGcaagaaatataaatatctagcaaaagaatgttccaggcagaggagatGGTATGTATAGGTACCACGAAGCAGGGGTATGGCTGGTATACTTAACAGACAGCATGAAAGCCTCATCTCTTCCTCATGTCCACCTCATgttcaatatatttaaatatggttCCCTCCCCATCATACCCCTGCAATGGCCATTGCAGAAATCACCAATAACATTCACGTCTGTAAGTCTTATGGACAttt--tttttACAAGATACATTTCTTCTCAGCAGAATTCAGCACTGCTGttccaaca-cttttttttctttggcttcaGTATCAACTCTCTTCTACTTTCCCTCCTGATTTCCCAGAAAATTCCCACCTTTCTGGCTGCAACTCCTCTATTTCATTTGTGGGCTTGTTTTCCTCTAATTGGCCATTAAACTCTGAAGCTCTGCAAGGCTGAGTTCCAGGCCTTCACAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87652777 1810 - 132174527 -CAGCCCTTTTAACAACTTTCTGTG--GAGTTTTGTGCTGAAAAAGACTTAAGGCTCAGACTCAGCCCACAGCTCTCTGTACTCCCTCCATCTCTCTTCTGCCCTTTCCATGCATAGCCTTCATAGCAATTATTTGTGAATTGTTTCCCTTTTCTGAGCTCTCTCTTAAGGTTAATTTTTCTTAAGAAATATTTACTCTCAATATTATACAAGTGTAGAAATTTATTGCAGAAAAATGTGAGAAAACATATTGGC-AAAAAGAATATAAGGATAAAACCATTTAAGATTTTTTTCCTTCCATCTATACTTATATTTATAGTTGGACTCATAATTGCatttaaatgtaaaattta--atatacatg---------tttatatttttaa-----tattaattgattattt-------taacaataattGTTAACATTccaggcactactctaaatgctcatggatacagcagtgaacaaaatggataaaaattactgatttgtggaagttatatcctaat-gagaaagacaggggg----tcaactatatggtatgct---ggtggagtgaggagtaaagatggagaaaacttataaaggtcaggccaataggaagtgtgtgtggg-------aggTAGCAGGGGTGCAtttttccctcagcttaattaaggtttacttgcaaaacactgtatatatttatggtatacaaggtgatattttgatatttgtatacatcacaaaatgattaaatcaaactaatctaaattaacgttatctgttgcctcacatgcttgccagtttattgttgtgagaacatttaagatcaactctcttagcaattttcaaatatgctgttggcccttagtaac------------------------tgtggttctgcatctgcagattcaatcagtcatggatgaaaaatatttggaaaaaaataaaaataacaatataac----aataattcaaattta----tatagtat---aattatttacatagcatttacattgttttagctattataagtaatgtagagcttacattacttataatacatagagctacattacttataatagctaagctacatggaagctacatggaaggatgtgtgtaggttataagcaaa------gtcattttacatgaggtggttgagtgtctgctgattttgttgcctccagggtgtcctggaactagtctaccctagatatcaagagacaactgtacaatatgttattattaattacactcaccatgctataccgtagatctccagaacttactcatcttgtttagctgagactttgagctctttaaccaatatctccctatccccacTGGgtgtaattttcaataactagtcagggaaggcctcactgaaaaggtgatattaggg-agggaaaagaaggaagtgttggggcaagaaatagaaatatctagtgaaagagtgttccaggcagaggagatggtctgtataggtgccacaaggcaggggtatgccgggcttgcttaagagacagcaaggaagcctaatgtCTTCCTCATGccctcctcacattcaatatagttaaatatggttttctccccacaacacccctgcaatggccattgcagaaatcaccaataacattcatgtctttaagtctttggacttttt--ttttttcaagatatacctcttctcagcagaattcagcactgttgttccaatatttttttttcctttggtttcagggacaactctgttttacttt-----ctgatttcccagaaaatccccacctttctggctacaactcctctatttaatttgtgggcttgttttaatcta-ttggctctcaaactctgaagttctgcaaggctgagtTTCAGCCCCTCACAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1966063.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 313229 1078 + 478999 ctttcaatgctatactattgtctaggtcattttcttctccaaagctttggtta---ttacttatttgccaatgagtatatcaaattgttaatacaaattgca-tcctcagagttccagatgacaactgctacatggtattaatatttgactgctggatgatagttttacttgaatgtttcaggggcacctcaaactcaactccaaaattgatctaatgaactttcccaaaccACATTCCCTTCTTGCATTTCTGAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTACAGTGCTAccctgaaagcagatccagagactaagatt-cacctgcaggtgattcatttggtaggtatcagaatctctggtaggagaactgggaagtggggcaaagacccttataaagagtgaactatgaagcagttaccagaatggataactgtggattaaacttggaataactctgagatccagtgtagataactcatctcagaaacatgctgagagataaagggtattcgtacaacagtttctgatagtcattagttatggactgtctcctagccgcattgattcctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagtggcttctgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaatgcaggggtgaatgctggaagtcaggctggcatgcactgaagtattagggtgagacgccatggcaaggtatc--tgaccatctTTCTAACCGTTCACCTCCATTTCCAATCTTTAAATACATTTTACTTCCCAAATATGTAATAATATGCATTTCCTTCAATTTCTACCACCACCTCTAC----------TGACTGCCTCCATCTTTTTCAAATATACTTGCCTcattcagcacattcaca---ttgtgcaaccaccacctcttttgagctccaaaacactgccatcaccccatagaaaaccccAGTCCTCTTCCCCTCCATCCATGGCCGCCACCTGGAGTGTGTTTGGCCCATGGAGGACACTGCACATTGTTGGTGGGCATGATTAAATAGTTGCTGCTTTTCTGCAGTTATCACTGTATTTTGAGTGAAAGTTTCATAATTTtcagtgttt s panTro4.chrUn_GL393519 154388 1089 + 413329 ctttcaatgctatactattgtctaggtcattttcttctccaaagctttggtta---ttacttatttgccaatgagtatatcaaattgttaatacaaattgca-tcctcagagttccagatgacaactgctacatggtattaatatttgactgctggatgatagttttacttgaatgtttcaggggcacctcaaactcaactccaaaattgatctaatgaactttcccaaaccACATTCCCTTCTTGCATTTCTGAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTACAGTGCTATcctgaaagcagatccagagacttagatttcacctgcagatgattcatttggtaggtatcagaatctctggtaggagaactgggaagtggggcaaagacccttataaagagtgaactatgaagcagttaccagaatggataactgtggattaaacttggaataactctgagatccagtgtagaaaacttatctcagaaacatgctgagagataaagggtattcgtacaacagtttctgatagtcattagttatggactgtctcctagcggcattgattcctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagcggcttctgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaatgcaggggtgaatgctggaagtcaggctggcatgcactgaagtattagggtgaggcgccatggcaaggtatc--tgaccatctTTCTAACCTTTCACCTCCATTTCCAATCTTTAAATACATTTTACTTCCCAAATATGTAATAATATGCATTTCCTTCCATTTCTACCACCACCTCTACCTGCAGAGGTTGACTGCCTCCATCTTTTTCAAATATACTTGCCTcattcagcacattcaca---ttgtgcaaccaccacctcttttgagctccaaaacactgtcatcaccccatagaaaaccccAGTCCTCTTCCCCTCCACCCATGGCCGCCACCTGGAGTGTGTTTGGCCCATGGAGGACACTGCACATTGTTGGTGGGCATGATTAAATAGTTGCTGCTTTTCTGCAGTTATCACTGTATTTTGAGCAAAAGTTTCATAATTTtcagtgttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18657138 1093 + 99152023 ctttcaatgctatactatcctctaggtcattttcttctccgaagctttggtta---ttacttatttgccaatgagtatatcaaattgctaatacaaactgca-tcctcggaattccaggtgacaactgctacatggtattaatatttgactcctgggtgatagttttacttcagtgtttcaggggcacctcaaactcaactccaaaactgatctaatgaactttcccaaaccacattctcttcttacaTTTCTAAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTATAGTGCTATcctgaaaggagatccggagactaagatt-cacctgcaggtgattcatttggtaggtatcagaatctctggtaggagaactgggaagtggggcaaagaccctgataaagagtgaactatgaagcagttaccagaatggataactgtggattaaacttggaataactctgagagccagtgtagaaaactcatctcagaaacatgctgagaggtaaagggtatttgtataacggtttctgatagtcattagttatggactgtctcctagaggcattgatccctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagtggcttctgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaatgcagaggtgaattctggaagtcaggctggcatgcactgaagtattagggtgaggcaccatggcaaggtatcTGTGACCATCTTCCTAACCTTCCACCTCCATTTCAAATCTTTAAACACATTTTACTTCCCAAATATGTAATAATATGCATTTCCTTCCATTTCTACCACCACCTCTACCTGCAGAGGTTGACCGCCACCATCTTTTTCAAATATACTTGCCTcatttagcacattcacagtgttgtgcaaccaccacctctttcgagctccaaaacactgtcatcaccccacagaaaaccccAGTCCTCTTCTCCTCCACCCATGGCCACCACCTGGAGTGTGTTTGGCCCTTGGAGGACACTGCACGTTGTTGGTGGGCATGATTAAATAGTCGCTGCTTTTCTGCACTTATCACTGTATTTTGAGCGAAAGTTTCATAATTAtcagtgttt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 761790 1094 - 1485088 ctttcaatgctatactatcctctaggtcattttcttctccaagtctttggtta---ttacttatttgccaatgagtatatcaaattgttaatacaaattgcacccctcggaattccagatgacaactgctacatggtattaatatttgactgctggatgatagttttacttgaatgtttcaggggcacctcaaattcaactccaaaattgatctaatgaacttccccaaaccACATTCCCTTCTTGCATTTCTAAGAGAATGGATTCCCGTTCATCTGACTATAGTGCTATcctgaaagcagatccagagactaagact-cacctgcaggtgattcatttggtaggtatcagaatctctgctaggagaactgggaagtggggcaaagacccttataaagagtgaactctgaagcagttaccagaatggatatctgtggattaaacttggaataactctgagacccagtgtagaaaactcatctcagaaacatgctgagaggtaaagggtatttgtacaacagtttctgatagtcattagttatggactgtctcttagcggcattgattcctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagtggcttctgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaatgcaggggtgaatgctggaagtcaggctggcatgcactgaagtattagggtgaggcgccatggcaaggtatcTGTGACCATCTTCCTAACCTTTCACCTCCATTTCCAATCTTTAAATACGTTTTACTTCCCAAATATGTAATAATAGGCATTTCCTTCCATTTCTACCACCACCTCTATCTGCAGAGGTTGACCGCCACCATCTTTTTCAAATATACTTGCCTcatttagcacattcacagtgttgcgcaaccaccacctctttcgagctccaaaacactgtcatcaccccatagaaaaccccAGTCCTCTTCCCCTCCACCCATGGCCACCACCGGGAGTGTGTTTGGCCCTTGGAGGACACTGCACATTGTTGCTGGGCATGATTAAATAGTTGCTGCTTTTCTGCACGTATCATTGTATTTTGAGTGAAAGTTTCATAATTTtcagtgttt i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87948913 1096 - 170124641 ctttcaatgctatactatcctctaggtcattttcttctccaaagctttggttatttttacttatttgccaatgagtatatcaaattattaatacaaattgca-tcctaggaattccagatgacaactgctacatggtattaatatttgactgctggatgatagttttacttgaatgtttcacaggcacctcaaactcaactccaaaactgatctaatgaactttcccaaaccacatgctcttcttgcaTTTCTAAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTACAGTGCTATcctgaaagcagatccagagactaggatt-cacctgcaggtgattcatttggtaggaatcagaatctctggtaggagaactgggaagtggggcaaagacccttataaagagtgaactatgaagcagttaccagaatggataactggagattaaccttggaataactctgagagccagtgtagaaaactcatctcagaagcgtgctgagaagtaaagggtatttgtacaccagtttctgatagtcattagttatggactgtctcctagtggcattgattcctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagcagcttccgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaacgcgagggtgagtgctggaagtcaggctggcatgccctgaagtattagggtgaggcgccatggcaaggtatccgtgaccatctTCCTAACCTTCCACTTCCATTTCCAATCTTTACATACATTTTACTTCCCGAATATGTAGTAATATGCATTTCCTTCCATTTCCACCACCACCTCTACCTGCAGAGGTTGACCGCCACCCTCTTTTTCAAATATACTTGCCTcatttagcacattcacagtgttgtgccaccaccacctctgtcaagctccaaaacactgtcatcaccccatagaaaaccccAGTCCTCTTCCTCTTCACCCATGGCCACCACCCGGAGTGTGTTTGGCCACTGGAGGACACTGCACATTTTTGCTGGGCATGATTAAATAGTTGCTGCTTTTCTGCACTTATCACTGTATCTTGAGCAAAAGTTTCATAATTTTCAGTGttt i rheMac3.chr7 C 0 I 299 s macFas5.chr7 88226710 1096 - 171882078 ctttcaatgctatactatcctctaggtcattttcttctccaaagctttggttatttttacttatttgccaatgagtatatcaaattattaatacaaattgca-tcctaggaattccagatgacaactgctacatggtattaatatttgactgctggatgatagttttacttgaatgtttcacaggcacctcaaactcaactccaaaactgatctaatgaactttcccaaaccacattctcttcttgcaTTTCTAAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTACAGTGCTATcctgaaagcagatccagagactaggatt-cacctgcaggtgattcatttggtaggaatcagaatctctggtaggagaactgggaagtggggcaaagacccttataaagagtgaactatgaagcagttaccagaatggataactggagattaaccttggaataactctgagagccagtgtagaaaactcatctcagaagcgtgctgagaagtaaagggtatttgtacaccagtttctgatagtcattagttatggactgtctcctagtggcattgattcctcagcatgcccaacctgcagcagggacagcaaaagcagcttccgtgatcagagaaagccctcaggtaaggaaacgcgagggtgagtgctggaagtcaggctggcatgccctgaagtattagggtgaggcgccatggcaaggtatcTGTGACCATCTTCCTAACCTTCCACTTCCATTTCCAATCTTTACATACATTTTACTTCCCGAATATGTAGTAATATGCATTTCCTTCCATTTCCACCACCACCTCTACCTGCAGAGGTTGACCGCCACCCTCTTTTTCAAATATACTTGCCTcatttagcacattcacagtgttgtgccaccaccacctctgtcaagctccaaaacactgtcatcaccccatagaaaaccccAGTCCTCTTCCTCTTCACCCATGGCCACCACCCGGAGTGTGTTTGGCCATTGGAGGACACTGCACATTTTTGCTGGGCATGATTAAATAGTTGCTGCTTTTCTGCACTTATCACTGTATCTTGAGCAAAAGTTTCATAATTTtcagtgttt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85347975 1093 - 162156779 CTTTCAATGCTATACTATCCTCTAGGTCATTTTCTTCTCCAAAGCTTTGATTA---TTACTTATTTGCCAATGAGTATATCAAATTGTTAATACAAATTACA-TCCTAGGAATGCCAGATGACAACTGCTACATGGTATTAATATTTGACTGCTGGATGATAGTTTTACTTGAATGATTCAGGGGCACCTCAAATTCAACTCCAAAACTGATCTAATGAACTTTCCCAAACCACATTCTCTTCTTGCATTTCTAAGAGAATGGATTCCCATTCATCTGACTACAGTGCTATCCTGAAAGCAGATCCAGAGACTAGGATT-CACCTGCACGTGATTCATGTGGTaggaatcagaatctctggtaGGAGAACTGGGAAGTGGGGCAAAGGCCTTTATAAAGAGTGAACTATGAAGCAGTTACCAGAATGGATAACTGTGGATTAACCTTGGAATAACTCTGAGAGCCAGTGTAGAAAACTTATCTCAGAAGCGTGCTGAGAAGTAAAGGGTATTTGTACACCAGTTTCTGATAGTCATTAGTTATGGACTGTTTCCTAGTGACATTGATTCCTCAGCATGCCCAACCTGCAGCAGGGACAGCAAAAGCAGCTTCCATGATCAGAGAAAGCCCTCAGGTAAGGAAACGTGAGGGTGAGCGCTGAAAGTCAGGCTGGCATGCCCTGAAGTATTAGAGTGAGGTACCATGGCAAGGTATCTGTGACCATCTTCCTAACCTTCCACCTCCATTTCCaatctttaaatacattttacttcCCGAATATGTAGTAATATGCATTTCCTTCCATGTCCACCACCACCTCTACCTGCAGAGGTTGACCGCCACCCTCTTTTTCAAATATACTTGCCTCATTTAgcacattcacagtgttgtgccaCCACCACCTCTGTCAAGCTCCAAAACACTGTCATCACCCCATAGAAAACCCCAGGCCTCTTCCCCTCCACCCATGGCCACCACCCGGAGTGTGTTTGGCCATTGGAGGACACTGCACATTTTTGCTGGGCATGATTAAACAGTTGCTGCTTTTCTGCACTTATCACTGTATCTTGAGCAAAAGTTTCataattttcagtgttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=1446485.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 314307 837 + 478999 tatctgggttgataggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagcaactataacaattttaaggatta--acatgtcatgacatttattctttactagaggtcttccaaagaacaaagataaattt-acttattttaaaaacagaataaaattcatcctgtcttgcaaAAAT----ACACAAAAATACAAAAACAAATATACTTgcctcataattagtttcac-atttacccttgtccttctctaaactcttcactaccgtggccacagttactgtttcaaaaagggagatgaaatcatgtcatattctattctctgtgcctgaaatccacttttcaccctcatctccctttatttaaagtatgttattcatttttctagggtctcaactcaagcattcctttctcaagaagccttttatggtatgaagagtgagacagagttccctgcgccacctccattgaatcatgttaggccttaatgtacctttcctttataacacttactgaatgattaatttggcatttatttacctggctatttt-attcagtgtttaggatttatactagattgtaagctcctcaagagtgttccaggtctagtttaggtcaccatgtatccctgattagtaccacacatcccagtgcaccatg-gttctcaacaaataacatgttatataaatcaatAAATGACAGGAATAAAGATGTTTTTCAATTTGTATTACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAACA-CTGATTTTTAAGAATCACTCCCAATTCT s panTro4.chrUn_GL393519 155477 836 + 413329 tatctgggttgataggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagcaactataacaattttaaggatta--atatgtcatgacatttattctttactagaggtcttccaaagaacaaagataaattt-acttattttaaaaatagaataaaattcatcctgtcttgcaaAAAT----ACACAAAAA-ACAAAAACAAATATACTTgcctcataattagtttcac-atttacccttgtccttctctaaactcttcactaccgtggccacagttactgtttcaaaaagggagatgaaatcatgtcatattctattctctgtgcctgaaatccacttttcaccctcatctccctttatttaaagtgtgttattcatttttctagggtctcaactcaagcattcctttctcaagaagccttttatggtatgaagagtgagacagagttccctgtgccacctccattgaatcatgttaggccttaatgtacctttcctttataacacttactgaatgattaatttggcatttatttacctggctatttt-attcagggtttaggatttatactagattgtaagctccccaagagtgttccaggtctagtttaggtcaccatgtatccctgattagtaccacacatcccagtgcaccatg-gttctcaacaaataacatgttatataaatcaatAAATGACAGGAATAAAGATGTTTTTCAATTTGTATTACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAGTGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAGACA-CTGATTTTTAAGAATCACTCCCAATTCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18658231 839 + 99152023 tatctgggttgattggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagcaactataacaattttaaggatta--atatgtcatgacttttattctttactagaggtcttccaaagaacaaagataaattt-atttattttaaaaatagaaaaaaattcatcctgtcttgcaaAAATACACACACAAAAA-ACAAAAACAAAtgtacttgcctcataattagtttcac-atttgccgttgtccttctctaaactcttcactaccgtggccagagttactgtttcaaaaagggagatgaaatcatgtaatattctgttctctgtgcctgaaatctacttttcacccccgtctccctttacctaaagtatgttattcatttttctggggtctcaactcgagcactcctctctcaagaagccttttatggtatgaagagtgacagagagttccctgcgccatctccattgaatcatgttaggccttaatgtacctttcctttataacacttactgaatgattaatttggcatttatttacctggctatttt-attcagggcttaggatttatactagattgtaaactccagaagagtgttccaggtctagtttaggtcaccatgtatccctgattagtaccacacatcccagtgcaccatg-gttctcaacaaat-acatgttgtataaatggatAAATGACAGGAATAAAGATGGTTTTCAATTTGTATTACAATATTTTCTACTATCTGGTAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGTAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAACA-TTGATTTTTAAGAATTGTTCCCAATTCT i ponAbe2.chr15 C 0 I 9 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 762884 840 - 1485088 tatctgggttaattggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagtaactataacaattttaaggattaatatatgtcatgacttttattctttactagaggtctcccaaagaacaaagataactttaatttattttaaaaatagaataaaattcatcctgtcttgcaaAAAT----ACACAAAAA-ACAAAAACAAGTGTACTTGCCTCATAGTTAGTTTCACAATTTGCCCTTGTCCTTCTCTAAACTCTTCACTACCGTGGCCAGAGTTACTGTTTCAGAAAGGGCTATGAAATCATGTcatattctattctctgtgcctgaaatccacttttcaccctcatctccctttatctaaagtatgttattcatttttctggggtctcaactcaagcattcctttctcaagaaggcttttatggtatgaagagtgagacagagttctctgcaccacctccattgaatcatgttaggccttaatgtacctttcctttataacacttactgaatgattaatttggcatttatttacctggctattttaattgagggtttaggatttgtactagattgtaagctccacaagagtgttccaggtctagtttaggtcaccatgtatccctgattagtaccacacatcccagtgcaccatg-attctcaacaaat-acctgttatataaatCCATAAATGACAGGAATAAAGAAGTTTTTCAATTTGTATTACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAACA-CTGATTTTTAAGAATCACTTCCAGTTCT i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87950308 836 - 170124641 tatctgggttgattggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagcaacaataacaattttgaggatta--atatgtcatgacttttattctttactagaagtcttccaaagaa-aaagataaattt-gtttcttttaaaaatagaataaaattcatcctgtcttgcaaAAAT----ACACAAAAA-ACAAAAACAAATATACTTgcctcataattagtttcac-atttgcccttgtccttctctaaactcttcgctaccatggccagagttactgtttcaagaa-ggagatgaaatcatgtcatagtctattctctgtgcctgaaatccacttttcaccctcatctccctttatctaaactatgttattcatttttggggggtcttaactcaagcattcctttctcaagacgacttttatgctatgaagagtgagacaaagttccctgcaccacctccattgaatcatgttaggccttaacgtacctttcctttataacacttactgaacgattaatttggcatttatttacctggctatttt-attcaGGGTTTAGGATTTGTGGTAGATCATAAGCTCCACAAGAGTGTTCCAGGTCTAGTTTAGGTCACCATGTATCCCTGATTAGTACCACACATCCCAGTGCACAGTGTATAGGTAAGGTATAGTGTAAGGTATAAATGGATAAGTGACGGGAATAAAGATGGTTTTCAATTTGTATCACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAGCATTTGATTTTTAAGAATCACTCCCAATTCT i rheMac3.chr7 I 299 C 0 s macFas5.chr7 88227806 836 - 171882078 tatctgggttgattggatccaattttagtttttgagtttcttttttgagcaacaataacaattttgaggatta--atatgtcatgacttttattctttactagaagtcttccaaagaa-aaagataaattt-gtttcttttaaaaatagaataaaattcatcctgtcttgcaaAAAT----ACACAAAAA-ACAAAAACAAATATACTTgcctcataattagtttcac-atttgcccttgtccttctctaaactcttcgctaccatggccagagttactgtttcaagaa-ggagatgaaatcatgtcacagtctattctctgtgcctgaaatccacttttcaccctcatctccctTTATCTAAACTATGTTATTCATTTTTGGGGGGTCTTAACTCAAGCATTCCTTTCTCAAGACGACTTTTATGCTATGAAGAGTGAGACAAAGTTCCCTGCACCACCTCCATTGAATCATGTTAGGCCTTAACGTACCTTTCCTTTATAACACTTACTGAACGATTAATTTGGCATTTATTTACCTGGCTATTTT-ATTCAGGGTTTAGGATTTGTAGTAGATCATAAGCTCCACAAGAGTGTTCCAGGTCTAGTTTAGGTCACCATGTATCCCTGATTAGTACCACACATCCCAGTGCACAGTGTATAGGTAAGGTATAGTGTAAGGTATAAATGGATAAGTGACAGGAATAAAGATGGTTTTCAATTTGTATTACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAGCATTTGATTTTTAAGAATCACTCCCAATTCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85349068 836 - 162156779 tatctGGGTTGATTGGATCcaattttagtttttgagtttcttttttgagCAACAATAACAGTTTTGAGGATTA--ATATGTCATGACTTTTATTCTTTACTAGAAGTCTtccaaagaa-aaagataaattt-gtttcttttaaaaatagaataaaattcatCCTGTCttgcaaaaat----acacaaaaa-acaaaaacaaatatactttCCTCATAATTAGTTTCAC-ATTTGCCCTTGTCCTTCTCTAAACTCTTCGCTACCATGGCCAGAGTTACTGTTTCAAGAA-GGAGATGAAATCATGTCATAGTCTATTCTCTGTGCCTGAAATCCACTTTTCACCCTCATCTCCCTTTATCTAAACTACGTTATTCATTTTTgggggggCTTAACTCAAACATTCCTTTCTCAAGACGACTTTTATGCTATGAAGAGTGAGACAGAGTACCCTGCACCACCTCCATTGAATCATGTTAGGCCTTAACGTACCTTTCCTTTGTAACACTTACTGAACGATTAATTTGGCATTTATTTACCTGGCTATTTT-ATTCAGGGTTTAGGATTTGTACTAGATCATAAGCTCCACAAGAGTGTTCCAGGTCTAGTTTAGGTCACCATGTATCCCTGATTAGTACCACACATCCCAGTGCACAGTGTATAGGTAAGGTATAGTGTAAGGTATAAATGGATAAGTGACAGGAATAAGGATGGTTTTCAATTTGTATTACAATGTTTTCTACTATCTGGCAGAATCTTAGTAGGATTTAATAGAAATCAGGCAATGTCTACTCCTTAACCTGACTTTGAGAGAGAAGCATTTGATTTTTAAGAATCACTCCcagttct i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=498918.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 315144 414 + 478999 GACTTTTTCTCATCATTATGTGGGTGAGGTAGAGATATTTCTGAGGCTTTTTTGTTCAGGAACTTGTCTCCTTGGACATTTTCACTAGGTCAGCACTAGATCAttgctacatgaagtatggtctattgaccagcaacatcagtgtcagctggagacttttagaaatgcagaatctccattctaactggtgtgagatgatagctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgacgatgagcttttttt-ca--tgtttgttggctgcataaatgtcttc-tttgagaagtgtccattcgcatcctttgcccactttttgatggggttg----tttgttttttccttgtaaatctgtttaagttttttg-tagattctggatattagtcctttgtcagatggatagattgcaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 156313 415 + 413329 GACTTTTTCTCATCATTATGTGGGTGAGGTAGAGATATTTCTGAGGCTTTTTTGTTCAGGAACTTGTCTCCTTGGACATTTTAACTAGGTCATCACTAGATCAttgctacatgaagtatggtctattgaccagcaacatcagtgtcagctggagacttttagaaatgcagaatctccattctaactggtgtgagatgatatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgacgatgagcttttttttca--tgtttgttggctgcataaatgtcttc-tttgagaagtgtccgttcgcatcctttgcccactttttgatggggttg----tttgtttttttcttgtaaatctgtttaagttctttg-tagattctggatattagccctttgtcagatggatagattgcaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 763724 412 - 1485088 GACTTTTTCTCGTCATTATGTGGGTGAGGTAGAGATATTTCTGAGGCTTTTTTGTTCAGGAACCTGTCTCCTTGGACATTTTCACTAGGTCAACACTAGATCAttgctacatgaagtatggcctattgaccagcaacatcagtgtcagctggagacttttagaaatgcagaatctccattctaacaggcatgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttccctaatgaccagtgatgatgagcttttttt-catgtgtttgttggctgcataaatgtcttc-tttgagaagtgtccgttcatatccttcgcccactttttgatgggg--------ttgtttttttcttgtaaatctgtttaagttctttg-tagattctggatattagccctttgtcagatggagagattgcaaaa i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87951144 416 - 170124641 TATTTTTTTCTGTCATTATGTCGGTGAGGTAGAGATATTCCCGAGGCTTTCTTGTTCAGGAACTTGTCTCCTTGGACATTTTAACTAGGTCATGACTAGACCAttgctacatgaagtatggtctattgaccagcaacatcagtatcagctggagacttttagaaatgcagaatctcCAGT----ctggcatgagacggtatctctttgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagcttttctctcatgtgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagcgtctgttcttatcctttgcccgcttttcgatggttttc--ttttttctttttccttgtaaatctgtttaagttctttg-tagattctagatattagccctttgtcagatggatagattgcaaaa i rheMac3.chr7 C 0 I 732 s macFas5.chr7 88228642 417 - 171882078 TATTTTTTTCTGTCATTATGTCGGTGAGGTAGAGATATTCCCGAGGCTTTCTTGTTCAGGAACTTGTCTCCTTGGACATTTTAACTAGGTCATGACTAGACCAttgctacatgaagtatggtctattgaccagcaacatcagtatcagctggagacttttagaaatgcagaatctcCAGT----ctggcatgagacggtatctctttgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagcttttctctcatgtgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagcgtctgttcttatcctttgcccacttttcgatggttttc-tttttttttttttccttgtaaatctgtttaagttctttg-tagattctagatattagccctttgtcagatggatagattgcaaaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85349904 423 - 162156779 tatttttttctgtcattatgTCGGTGAGGTAGAGATATTCCCGAGGCTTTCTTGTTCAGGAACTTGTCTCCTTGGACATTTTAACTAGGTCATGACTAGACCATTGCTACATGAAGTATGGTCTATTGACCAGCAACATCAGTATTAGCTGGAGACCTTTAGAAAGGCAGAATCTCCAGtctaactggcatgagacggtatctctttgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagcttttctctcatgtgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagcgtctgttcttatcctttgcccacttttcgatggttttctttttttttttttttcttgtaaatctgtttaagttctttgttagattctggatattagccctttgtcagatggatagattgcaaaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=669716.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 315558 835 + 478999 attttctcccattctgtaggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaataagatcccatttgtctattttgatttctgttgccattgcttttggtgttttagtcatgaagtctttgcccatgccaatgtcctgaatggcatcgcctaggttttcttttagggtttgtatgggcttaggtcttacacttaagtttttaatctatcttgagttaatttttgtgtaagatgtaaggaagggatccagtttcagctttctgcatatgtgatcactaaaaagtcagaaaacaacagatgctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgttggtgggagtgtaaattagttccaccattgtggaagacagtgtggtgattcctcaaggatctagaactagaaataccatttgacccagtgatcccattactggatatacacccaaaggattatacatcattctactataaagacacatgcacaagtatgtttattgcagcactgttcaaaatagcaaagacttggaactaaaccaaatgcccatcaatgatagactgaatacagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaaggatgagttcatgtccttttcagggacatagatgaggctggaaaccatcattctcagcaaactaacacaagaacaaaaaaccaaacaccgcatgttggctcactcatcagtgggagttgaacaatgagaacacatggac-acatggagggcaacattgcacactgggggcttttcaggggtggggggctaggg s panTro4.chrUn_GL393519 156728 835 + 413329 attttctcccattctgtaggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaataagatcccatttgtctattttgacttctgttgccattgcttttggtgttttagtcatgaagtctttgcccatgccaatgtcctgaatggcatcgccgaggttttcttctagggtttgtatgggcttaggtcttacacttaagtctttaatctatcttgagttaatttttgtgtaagatgtaaggaagggatccagtttcagctttctgcatatgtgatcactaaaaagtcagaaaacaacagatgctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgttggtgggagtgtaaattagttccaccattgtggaagacagtgtggtgattccttaaggatctagaactagaaataccatttgacccagtgatcccattactgggtatacacccaaaggattatacatcattctactataaagacacatgcacaagtatgtttattgtagcactgttcaaaatagcaaagacttggaactaaaccaaatgcccatcaatgatagactgaataaagaaaatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaaggatgagttcatgtccttttcagggacatagatgaggcttgaaaccatcattctcagcaaactaacacaagaacagaaaaccaaacaccgcatgttggctcactcatcagtgggagttgaacaatgagaaaacatggac-acagggagggcaacattgcacactgggggcttttcaggggtggggggctaggg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 764136 829 - 1485088 tttttatcccattctgtaggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaataagatcccatttgtctattttggcttttgttgccattgctttttgtgttttagtcatgaagtctttgcccatgcctgtgttgtgaatggtattgtctaggttttcttctagggtttttgtgggtttaggtcttacacttaagtctttaatctatcttgagttaatttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagctttctgtgtatgtgatcactgaaaagtcagaaaacaacagatgctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgt---tgggagtgtaaattagttccaccattgtggaagatggtgtggcgattcctcaaggatctagaactagaaataccatttgacccagtgatcccattactgggcatacacccaaaggattataaatcactctactataaagacacatgcatgagtatgtttattactgcactgttcaaaatagcaaagacttggaactaaaccaaatgcccatcaatgatagattggataaagaaaatgtggcacatatacactatggaatactatgcagccat-aaaaaggatgagttcatgtccttttcagggacatagatgaggctggaaaacatcattctcatcacactaacacaagaacagaaaaccaaacaccgcatgtt--ctcactcatcagtgggagttaaacaatgagaacacatggacaacagggagggcaacattgcacaccgggggcttttcaggggt-gggggctaggg i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88229059 781 - 171882078 attttctcccagtgtgtaggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagttcgttagtttaataagatcccatttgtctattttgacttttgttgccattgc------tattttagtcatgaagtctttgcccatgccagtgtcctgaatggtattgcctaagttttcttctagggtttttatgggtttaggtcttacacttaagtctttaatctatcttgagttaacttttgtataa------------ggatccagtttcagctttctgcatatgTTatcgttaaaaagtcaggaaacaacagatgctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgttggtgggagtgtaaattagttccaccattgtggaagacagtgtggcaattcctcaaggatctagaactagaaataccatttgacccaaccatctcattactgggtatatacccaaaggattataaatcattctactataaagacacatgcacaagtatgtttattgcagcactgttcaaaatagcaaagacttggaaccagaccaaatgcccatcaatgataggctggataaagaaaatgtggcatatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaaggatgagctcgtgtccttttcagggacatggatgagactggaaaccatcattctcagcaaactatcacaaggacagaaa-----------------------------------agttgaacaatgagaacacatggac-at-gggaggggaacatcggacactgggggcttttcgggggtgggggactaggg i macFas5.chr7 C 0 N 0 s papAnu2.chr7 85350327 814 - 162156779 attttctcccagtgtgtaggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagttcgttagtttaataagatcccatttgtctattttgacttttgttgccattgt------tattttagtcatgaagtctttgcccatgccagtgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctaggatttttatgggtttaggtcttacacttaagtctttaatctatcttgagttaacttttgtataa------------ggatccagtttcagctttctgcatatgttatcgctaaaaagtcaggaaacaacagatgctggagaggatgtggagaaataggaatgcttttacactgttggtgggagtgtaaattagttccaccattgtggaagacagtgtggcaattcctcaaggatctagaactagaaataccatttgacccaaccatcccattactgggtatatacccaaaagattataaatcattctactataaagacacatgcacaagtatgtttattacggcactgttcaaaatagcaaagacttggaaccagaccaaatgcccatcaatgataggctggataaagaaaatgtggcatatatacaccatggaatactatgcagccgtaaaaaaggatgagctcgtgtccttttcagggacatggatgagactggaaaccatcattctcagcaaactatcacaaggacagaaaagcaaacaccacatgtt--ctcactcatcagtgggagttgaacaatgagaacacatggac-at-gggaggggaacatcagacactgggggcttttcgggggtggggggctaggg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=47976.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 316393 188 + 478999 g-agggatagcattgggagaaatacctaatgtagatgattggttgatgggtgcagcaaatcaccatggcacgtgtatacctatgcaacaaacctgcacgttctgcacatgtatcccagaacctaaagtatatatatctataaaaagaaaTGCAGAATCTCATGCCCCTCTGACTCAATAAGCATTTTAA s panTro4.chrUn_GL393519 157563 189 + 413329 ggagggatagcattgggagaaatacctaatgtagatgatgggttgatgggtgcagcaaatcaccatggcgcgtgtatacctatgtaacaaacctgcacgttctgcacatgtatcccagaacttaaagtatatatatctataaaaagaaaTGCAGAATCTCATGCCCCTCTGACTCAATAAGCATTTTAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 764965 188 - 1485088 g-aggaatagcattgtgagaaatacctaatatagatgatggattgatgggtgcagcaaatcaccatggcacgtgtatacctatgtaacaaaactgcacgttctgcacatgtatcccaaaacttaaagtatGTATATCTATAAAAAGTAATGCAGAATCTCATGCTCCTCTGACTCGGTAAGCATTTTAA i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46723714 47103 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=107313.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 316581 275 + 478999 AAAGTCTATCAGTATTTTGCATCACTTTGTTCCTCCAAGCCTTGGCCCAACACCTAGCACATAAGA---------TGAAGTTTTGGGTGATGAATGAATATGCTAAAAAAT------AAGAGTGAAGGAATATATGAAAGGAGGGAAAGAACACCATGGGAAATTGAAAATATATCATACTATGATATTTGAGTATTAGATCCTGACAGTTTAGTTTCAACACTTTTGGTTTTGTATGATATGAGGAAATAGTGTTCACTTTGTCAGTATTAAGCTCATAGGtgttaaag s panTro4.chrUn_GL393519 157752 275 + 413329 AAAGTCTGTCAGTATTTTGCATCACTTTGTTTTTCCAAGCCTTGGCCCAACACCTAGCACATAAGA---------TGAAATTTTGGGTGATGAATGAATATGCTAAAAAAT------AAGAGTGAAGGAATATATGAAAGGAGGGAAAGAACACCATGGGAAAGTGAAAACATATCATACTATGATATTTGAGTATTAGATCCTGACAATTTAGTTTCAGCACTTTTGGTTTTGTATGATATGAGGAAATAGTGTTCACTTTGTCAGTATTAAGCTCATAGGtgttaaag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 765153 275 - 1485088 AAAGTCTATGAGTATTTTGCATCACTTTGTTTCTCCAAGCCTGGGCCCAACACCTAGCACATAAGA---------TGAAGGTTTGGGTGATGAATGAATATGCTAAAAAAT------AAGAGTGAAGTAATATATCAAAGGAGGGAAAGAACATCATGGGAAAGTGAAAATATATCATACTATGATATCTGGGTATTAGATCCTGACAATTTAGTTTCAGCACTTTTGGTTTTGTATGATAAGAGGAAATAGTGTTCACTTTGTCAGTATTAAGCTCATAGAtgttaaag i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46770817 281 - 64190966 AAGGTCTGTGAGTATTTTA---CACTTTATTTCCCCATACCTGGACTCAATACTTAACACATAGAATATACTCAGTAAATCTTTGGGAG----AAGaatatattaaaaaataaataaaaGAGTGAATGAATGCTTCAAAGGAGAGAAAGAAAATGGTGAGAAA--GAAAATACATCATAGTACAGTATCTGAATAATAGACACTGACAATTTAGTTTTAGCACCTTTGAGTGTATTTGGGATGGGGAAATAGCATACATTTTGTCACTAGTAAGCCCATGGCTTTTGGAG i canFam3.chr15 I 47103 I 1 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=29596.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 316856 120 + 478999 caaactaaatatggcctgagaaggactt-gtacttccatatttgaatccttgtggatgaaccgtaacctagcttaataggcagacaaaattgaaaacctaacttacgagtatgcacctgca s panTro4.chrUn_GL393519 158027 120 + 413329 caaactaaatatggcctgagaaggactt-gtacttccatatttgaatccttgtggatgaactgtaacttagcttaataggcagacaaaattgaaaacctaacttgcgagtatgcacctgca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s nomLeu3.chrUn_GL397501_2 765428 117 - 1485088 caaactaaatatggcctgagaagaacttcgtacttccatatttgaatccttgtggatgaactgtaacctagcttaat----agacaaaattgaaaacctaacttaggagtatgcacttgca i nomLeu3.chrUn_GL397501_2 C 0 N 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46771098 1 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=27435.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 316976 294 + 478999 acaaatagctaagtcttagccaatctcagtggccatacttcaatcattaatacactgatgaggcaaatgccaatctgtaaccaatgcagctgttcctgtaactcactgctgatttctgtatgtcatttcccttttgtttgtctataaatttaccaccacatggctgtgctggagcctctgtgaatctgctgtgattctgggggctgcctgatttgtgaatcattcattgctcaattcaactcctttaaatttaattcagctgaagttttttcttttatcaTATGTCTGGAAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 158147 294 + 413329 acaaatagctaagtcttagccaatctcagcggccatacttcaatcattaatacactgatgaggcaaatgccaatctgtaaccaatgcagctgttcctgtaactcactgctgatttctgtatgtcatttcccttttttttgtctataaatttaccaccacatggctgtgctggagcctctgtgaatctgctgtgattctgggggctgcctgatttgtgaatcattcattgctcaattcaactcctttaaatttaattcagctgaagttttttcttttatcaTATGTCTGGAAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46771098 1 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=89034.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 317270 579 + 478999 TCCTATAAGAGTAATGTAAAC--AGCATTTGGTTTCCAGGGTGGGATGCAGTTCCAGGAGAAAGGATACCATTCATTTCTTCTGAACGCCTTCAAGAGACATGTGAATGATAAATGTGCCTGATAACATCTCAGGCACGTTTGTGTTATGAGAGGAAACT---AAGGAAAATCTGAAAGTTTCTTGGGTGTATAAATAGAGATGGCTGGAAGAAGATGGGGGAAAGTGAAAGCCATAACTGTTGAGAAAATTAAGCTTGTTGAAATATGCAAATTGGGTCTCGGCTCCATACACGGTGCTGATAGTTAGGACACT-------GAGACTGTCTCAAGAAGACAACCTTAAAGGCCTGAGAAT-------CCAGTCTGTTTCC-----CTCTTCTAGGGCACCTCCTTCCCAGAAATGACACCATTAACACTTTTTAGCACTTATGTAAAGGTCT-----GGATCATTTGAAGTTACATGCCACTGTAGGACATTTTCTCTCTGAGTTGTTGGTAGACATTTATACTGTAGAGAAAATTTTGCACAATTTAAGTAACTA-TTTAGAAAATGAAACAAAA-AATGGACAAATATGAAAAATA---TAGAAAAATTA s panTro4.chrUn_GL393519 158441 581 + 413329 TCCTATAAGAATAAAACCAAATAAGCATTTGGTTTCCAGGGTGGGATGCAGTTCCAGGAGAAAGGATACCATTCATTTCTTCTGAACGTCTTCAAGAGACATGTGAATGATAAATGTGCCTGATAACATCTCAGGCACGTTTGTGTTATCAGAGGAAACT---AAGGAAAATCTGAAAGTTTCTTGGGTGTATAGATAGAGATGGCTGGAAGAAGATGGGGGAAAGTGAAAGCCATAACTGTTGAGAAAATTAAGCTTGTTGAAATATGCAAATTGGGTCTCAGCTCCATACATGGTGCTGATAGTTAGGACACT-------GAGACTGTCTCAAGAAGACAACCTTAAAGGCCTGAGAAT-------CCAGTCTGTTTCC-----CTCTTCTCGGGCACCTCCTTCCCAGAAATGACACCATTAACACTTTTTAGCACTTATGTAAAGGTCT-----GAATCATTTGAAGTTACATGCCACTGTAGGACATTTTCTCTCTGAGTTGTTGGTAGACATTTATACTGTAGAGAAAATTTTGCACAATTTAAGTAACTa-tttagaaaatgaaacaaaa-aatggacaaatatgaaaaata---tagaaaaatta i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46771099 578 - 64190966 TTCTATGAGAATAATATGAAC--AGAATTTGGTTTTCAGGGTGGGATGTGGTTTCAGGATCAACAATA-CATTCATTTGAGCCTAAGATCGTAAAGGCA----------------------------GTCTAAGGCACA-TTGTGTTGGGGGATGAAATTCAAAAGGCAATTGAGGAAAAATTCAGGATATATTGATAGGGAGGCCTGGAAGGATAT-GGAGAAAATTAAAGACACAGCCATTGAAGAAATTAAGCTTGTTAAAATACACAGATCGGGTCATTTTTCTACACACAGGGCTGATAGTTAGAACACCTGGGAAGAAAATTGTTTTAGGGTGACAACTTTGAAGGCCTGAGACTTGCCTGCCTAAATCATTCCCAAAATCTCTTTTAATGCACTCTCATCCCAGAAATAACAACTTTATTGGATTTTA-CACTTATATAAAGTTTTAAAAAAAATCATTTTAAGTTGCATACCACTCTAGGACATTTGCTCTTTGACTCATTACTAAGCATGTATACTGT-TCGaaaattatatataattaaaataactattttagaaaatctaagaaaattatatacaattaaaataactattttaGAAAATCTA i canFam3.chr15 I 1 I 6310 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=146211.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 317849 1612 + 478999 TTAATGGCACAGTTCATTTACATCAAATTGTTACTAATACTTTGCTGCATTACTCCTATTTTTTCTACTTCGAATCATATTATGACTAATTTTGAATTCTACTTTTTATTCTATTTTTAT-CACTTTAATAGCCTATCTTAAGTCTTTACCCATATTTTGGGATAATCTTTAAAAATATTTACTTTAATACGGGGAAGCATTCTATCATGTACACATACTACAGTTCTTAACAATAATCTACTGGTGGATGTTTCATTTATTTACATATTCCATTCATTCTCCAGGGCTTATTTTTCAATGAGGAAGCTTGAAGAATTGAGATAGATAAGAGGAAATGTAAACGTACAAAGTAGAGTATGTCTGAGGGAGGAGTACGAAACCAAGAAGCTGAAACTCTTGTCACACTTTATTTATGTGATGATTTTAGAGCATTGGTCCTATTGGAAGGACACTGGCAGGGTCCCTAAAACAGCACATGCTGCACTGAAGAGAACCTTGTTTCTTAAATGAGCTCTAGGCAACAAGTACATTTCCTTAGAACATTTATAGAAAATATGAGATACAACGAATGTCTTCGTGTACCTATGTATTGTTTTTATCTTTAACGATTAGGTATGCCTATCACGCAATGTTTTTTACAGATTTTGCTGTCAAAGGCTCCTCAGTGGCTGCTTCAGCCAGCAGCTAGGACTTCAGGTCAAAGTCCTGTTATGCTGATGCAGCTTCATTTCCTGAAGCAAGATCACTCCCACTTCACTCTGATGGGAGAGTCTTCTTTCTTTACAACTATTAAGCTAAGATTTTTGAGTTAACATTTTaaaaatatatttttccttttatttttagttgacatgtaataattatgtttatgagatatagagtactagtccaatacacatagacaatatggggtgatcaaatcaaggtaattagcacatcgcctcatgcatttagcacttctttgtcttgtgaacattcaaaatcctctcttctagctttgtaaaaatacacaataaattatagttaactatattcaccttacagtactacagaaacatttaaaacattatttcttgagatcttggttctttaggtgactgttgtggtggtgattaatcagtatcatgaaaatacttatgttgtctatcatggtatttcagaagactacagttatagagctgggtgcatacaattaccaaccacaatgatatgcatttacatatttcaccttttgacctatttcttcatgaatatagttcatctgtttataactcttatacttgtgtgactgttgatagaaggcctgaatgtttatgcttgcaaaaatgtatgttatcgcttattttattgtgtaaggtgatctttgaagtgttctgctgtgtttttatttttgtgtttttatatgttactcaaataaataccttttaaaaatgtaaataaatatatcttaaagaatttttaaaattattttttccagaattaaattttcaggatttcagtcttttgggatggcgatttttggaattttagactttaaggattttgttcttttgattttcaacattcgattatggtgtttggaactgtgtctttcaagattgtgatTGATTCC s panTro4.chrUn_GL393519 159022 1612 + 413329 ttaatggcacagttcatttacatcaaactgttactaatactttgctgcattactcctattttttctacttcgaatcatattatgactaattttgaattctactttttattctatttttattcactttaatagcctatcttaagtcttcacccatattttgggataatctttaaaaatatttactttaatacggggaagcattctatcatgtacacatactacagttcttaacaataatctactggtggatgtttcatttatttacaTATTCCATTCATTCCCCAGGGCTTATTTTTCAATGAGGAAGCTTGAAGAATTGAGATAGATAAGAGGAAATGTAAACGTACAAAGTAGAGTATGGCTGAGGGAGGAGTACGAAACCAAGAAGCTGAAACTCTTGTCACACTTTATTTATGTGATGATTTTAGAGCATTGGTCCTATTGGAAGGACACTGGCAGGGTCCTTAAAACAGCACATGCTGCACTGAAGAGAACCTTGTTTCTTAAATGAGCTCTAGGCAACAAGTACATTTTCTTAGAACATTTATAGAAAATATGAAATACAACAAATGTCTTCGTGTACCTATGTATTGTTTTTATCTTTAAGGATTAGGTATGCCTATCGCGCAATGTTTTTTACAGATTTTGCTGTCAAAGGCTCCTCAGTGGCTGCTTCAGCCAGCAGCTAGAACTTCAGGTCAAAGTCCTGTTATGTGGATGCAGCTTCATTTCCTGAAGCAAGATCCCTCCCACTTCACTCTGATGGGAGAGTCTTCTTTCTTCACAACTATTAAGCTAAGATTTTTGAGTTAACATTTTaaaaatatatttttccttttatttttagttgacatgtaataattatatttatgagatatagagtactagtccaatacacatagacaatatgggatgatcaaatcaaggtaattagcacatcacctcatgcatttagcacttctttgtcttgtgaacattcaaaatcctctcttctagctttgtaaaaatacacaataaattatagttaactgtattcaccttacactactacagaaacatttaaaacgttatttcttgagatcttggttctttaggtgactgttgtggtggtgattaatcagtatcatgaaaatacttacgttgtctatcatggtatttcagaagactacacttatagagctgggtgcatacaattaccaaccacaatgatacgcatttacatatttcaccttttgacctatgtcttcatgaatatagttcatctgtttataactcttatacttgtgtgactgttgatagaaggcctgaatgtttatgcttgcaaaaatgtatgttatcgcttattttattgtgtaaggtgatctttgaagtgttctgttgtgtttttatttttgtgtttttatatgttactcaaataaataccttttaaaaatgtaaataaatatatcttaaagaatttttaaaattattttttccagaattaaattttcaggatttcagt-ttttgggatggtgatttttggaattttagactttaaggattttgttcttttgattttcagcattcgattatggtgtttggaactgtgtctttcaagattgtgatTGATTCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46771677 6310 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=205106.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 319461 1079 + 478999 AAATGCAACACAGGGTTAAAGGAAAGTGGAAAAGACAT---GAAAAAAATCTGAGCTGTGCCTTATCTGAAGCTGTTGTGTGAGAATTATAGAAACATGTAGAGAGTAGACATCTAAAGTTAGGTTTCTGTCTGCTGGAATACATGAGTCAACCTCATCTTCCTTGGTCTCCCATTT------GAGAAAGTGTTCAGCAAAGAGGAACACAGTGGCGCTCACATCCAAAATTTCTTAGAAGGCCTTT--AAAAGGGTCAGTGTTGGAAGGTAACATTATCAAGTATAGCAGTTATTTGGAGCCCACCCAATAACCATATTG------------TGGTTACAAGCGGATGTAAAGGGCACTGCAGTCTTTCCTGATTTAGGAAGCACCGAT--TACACCTGACTCTTTAGGAGAGTATGTAGCAGACACATTTTGAGCCATGGCTATCATACCCTGGACAGCTCCTCTTGGAGGAGTGGTGACTAAGAGCACGCTGTGTGTACACTCAGTCTTCACTGCTGACCTCCAGTCTCCACCTGCTTCATTTTTAAATAAATGTGCCAAGGTTTATTTTTGACCCTTCTGGATCATCCAACATTTCCAAGTGGACTCATCTAGGGATAACAGTGAGAAAGTTTTGGGAAGATCTCAAAAAGTGTTTCTT-AACTGAGATCTTAATTGGTTCAGCCTTTAGGGAAAAAGGGAAAGATGATGAGGCCTGGGTCTAATCTGAATAATCAGTTGACCTTAAGCC-TGAATCAGAATATCAAATATAATTGGAAGCCTTGATATATG-TTTTTATACTAACATAGCTATGTTTTCCCACAAAATAGATGATACTGGATTTAGGACTGAAAATGTAAGAACAAGGGGTTCTATGAAGTCCAAGGATATAAAGACAGAAGTCAGTTATGGCAAAGAATTTACAAAATGCTTCAAAGGCTTA-TCTATCTCTTCCCTTCTTTCTACAATTCTGCACATGTGCCAGCCCCAAGGGTTCTGTACTTATGTTGAGATTTTTGGA---TCAATATCTGTTTTAGTGGTACTTAACTTTAAACTATTTGCCCACTTGTTTCATGAATTTGTCATTTTAGTTTCACttaag s panTro4.chrUn_GL393519 160634 1080 + 413329 AAATGCAACACAGGGTTAAAGGAAAGTGGAAAAGACAT---GAAAAAAATCTAAGCTGTGCCTTACCTGAAGCTGTTGTGTGAGAATTATAGAAACATGTAGAGAGTAGACATCTAAAGTTAGGTTTCTGTCTGCTGGAATACATGAGTCAACCTCATCCTCCTTGGTCTCCCATTT------GAGAAAGTGTTCAGCAAAGAGGAACACAGTGGCGCTCACATCCAAAATTTCTTAGAAGGCCTTT--AAAAGGGTCAGTGTTGGAAGGTAACATTATCAAGTATAGCAGTTATTTGGAGCCCACCCAATAACCATATTG------------TGGTTACAAGCAGATGTAAAGGGCACTGCAGTCTTTCCTGATTTAGGAAGCACCGAT--TACACCTGACTCTTAAGGAGAGTATGTAGCAGACACATTTTGAGCCATGGCTATCGTACCCCGGACAGCTCCTCTTGGAGGAGTGGTGACTAAGAGCACGCCGTGTGTACACTTGGTCTTCACTGCTGACCTCCAGTCTCCACCTGCTTCATTTTTAAATAAATGTGCCAAGGTTTATTTTTGACCCTTCTGGATCATCCAGCATTTCCAAGTGGACTCATCTAGGGATAACAGTGAGAAAGTTTTGGGAAGATCTCAAAAAGTGTTTCTTTAACTGAGATCTTAATTGGTTCAGCCTTTAGGGAAAAAGGGAAAGATGATGAGGCCTGGGTCTAATCTGAATAATCAGTTGACCTTAAGCC-TGAATCAGAATATCAAATATAATTGGAAGCCTTGATATATG-TTTTTATACTAACATAGCTATGTTTTCCCACAAAATAGATGATACTGGATTTAGGACTGAAAATGTAAGAGCAAGGGGTTCTATGAAGTCCAAGGATATAAAGACAGAAGTCAGTTATGGCAAAGAATTTACAAAACGCTTCAAAGGCTTA-TCCGTCTCTTCCCTTCTTTCTACAATTCTGCACATGTGCCAGCCCCAAGGGTTCTGTACTTATGTTGAGATTTTTGGA---TCAATATCTGTTTTAGTGGTACTTAACTTTAAACTATTTGCCCACTTGTTTCATGAATTTGTCATTTTAGTTTCACTTaag i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46777987 1095 - 64190966 AAATACAAAAAAGAGTTAGAGGAAAGTGAAGAAGACATCACCAAAAAGATCTGAGCTGTACCTTACCTAGAGCTGTAATGTGAGGATTACAGAATCCAAGAGAGGGCAGACATCCAAATGTAGATTTCTCTCTCCTG--------GAGCCAGCCTCGGTCTCCTTGTTCTCTTATCTCAGTGGGAGAACGTATGTAGCCAAGCAAAACGCAGTGCTGCTCCAATCC-ACGTTTCTTAGCAGCTTTCTGAAAGAGGGTGAGTGTTGTTAGGTAATATTATCAAG-GTAGCAATGATCTGAAGCCCACACAATGATTATATTGACCTTTTCAAGCTCGTTACATGAAGTCATAAAGGACGCTATGGTCTCTTGTGATTTGGGAATGACTGATGATACCCCTGTCTCTAAAGGAGTGTATGTAGCAAACACATTCTGAAGTGTGATTATTCTGTTCTCGACGGTCCATCTTGGAGGTGTGATGGTCCAGAGCACTCTGTGTGTGCACTCAGGCCTTACTGCTGAGCTCCAGG----GCCTTGTCTACTTTTTAATAAATGTGCCAAGGTTTGCTTCTGACCCTCCTGGATTATCTGACTTTTCCCAGTGGCCTTATCTAGGAATAACAATGAGGAAGTTTTGGCTAGGTCTCAGAAAGTATTTCTTTAACCGAGGCCTAAATTGGTCCAACCTCTAGGGGAAAAGGGAAAGATGGTGAGGCCCGGATCTAAACTAAAGAATAAGTTGGTCTTAAGCCTTGGATCAGGATGTCAAATATAACCAGAAGCATCTGCATATATTTTTTATAGTAATGCAGGTGTGTTTTCCCATAAG--AGATAACACTGTATTTAGGAATGAAAATGTAAGAGCAAAGGTTTCTACAAAGCCAAAGGATATAAAGATAGAGTTTAGTTATTATAAAGAATTTACAAAACCCTTCAAAGACTTGTTCCATTTGCTTCTTTCTTTCTACAATTGAATACATATACCAGCCCTAAGCCTGCTGTGGTAATGCTGGGATTTTTAGATAGTTAACAATTCTTCCATTATTACTTGACTGTGAACTGTTGCCCTACTTGTTTTGTGAATTTGTCCTTTTAGTCTCACTTCAG i canFam3.chr15 I 6310 I 155 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=37689.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 320540 232 + 478999 aagtacattgtcaagctatagtgaatttggcgaagaacaactagaggggacttagaagtacggaaaatgagtaacagtagaaggaattgggatatttaaattggagaacaaaaagttttattgaaacaaatgaagggtaattatttaataaagcaattgaatttgtcccatttaatctctaaagtacagaatt----actataatt-----ctatagggtgacacattttaattca------------------------------------------------------------tcatg s panTro4.chrUn_GL393519 161714 229 + 413329 ---tacattgtcaaactatagtgaatttggtgaagaacaactagaggggacttagaagtacggaaaatgagtaacagtagaaggaattgggatatttaaattggagaacaaaaaggtttattgaaacaaatgaagggtaattatttaataaaacaattgaatttgtcccatttaatctctaaagtacagaatt----actataatt-----ctatagggtgacacattttaattca------------------------------------------------------------tcatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46779237 300 - 64190966 aagcacttgggtaaatgacagtgattttgaaggacagtaacttagagggtcttagaagtatgaaaaatgagtaacagcagaaggaatttggatatttaaattggaagacaagggactctatcaggaaaaagggaaggtgatcatttaacagaacaattcagtttgacctattt-gtctccaaagcatagaattaagaataatagttaaaagttatagggagatacattataattaatatggagtataactttcttttctttctttttttttttgagggttatatatatttatttattcatg i canFam3.chr15 I 155 I 111 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=196799.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 320772 1278 + 478999 gagacttactttttaacagagaaatatatgcaatgatggaacgagctgA---AGAACAATACTTTCTATCAGTTGCTTTTGTCAGATATAGGTTGGGAAAGTGGGAGAGGGTATCTAAGCATCAGATGCAAATTTCTTTCAATCTTGAAATTCCATGATACGATCTAAGATATTTCAAGAAAAAAACC-------------------ATTCAGGTTGATTTCAACAACATAAAAAAC-TGTAATGGAAAATATTAAGGCTAATTAGAACGTGAAGTTTT-ATTAACATTGATAACAATAATAATATTTTCTAAGGAACACTAGTTGACAGCAGACAAAAGGAGGGGGGATGA-AATACTGGAC----TTGTGGTCAGCAAAGTCCCAGGGTTATGCCACAGGACTACAAGTACTCCAACTCTATTAA----GGAATAAATTGCTAATTTTTTTTTTTTTTTCCCTGAAGCAATGTGTGTGGAAGTCTTTCACTTTCTGAGCCAAAACTTGA---------------------------------------GGAGC-------------------------------------TGACCCTGAGGTGGCAG--------------TTTTCCTGGgggagctgcttagatagcttttcatgcagggatagtccctcaat----gcattacctttcagaggctat-ggcat-caggcctctatccagaaggggaggaggactagagagcg--------ctcgggggagag--ggcgataagagagagat-ttgcttgtctaggtgatgttg--ctgagtagcccagtgtggactctgtgtcagagagctccaaagtacagcagcaactt-ggggtcttTAC---------AGCCCCAGAATTTATCTTATCTATggc----------------------------------------------------------------------atttgagt-------------------------------------------------------taacaggattcagcttactgtaaagaagtaaacaccctagggggctatataaagaagccctctttggcccatttgtctaacaGATGGTCTCTGAAATTGTTTGCAGTGACTTTTTAC--CTTTTTTTTTTTTGCTGTGTTTTTCCAGATTTAGACATTTATACTTTCTCTCAAGCTCATGTCATGCCAACAAAAAGTAGAGAATTAAACTAATTAGTCTACACT-AAGGTTTCCATTTACAAAAGAGAATTTATTTTAA------Tattatgaaaacaacatgtgcttattttag-aaaaaaataataacacaggaaagtataggaagtttaaatcatccacaataccatttctaagaccatttctagcctcctctgtttctctgtatttcgtatattagatatctatgtaattattttcaaaattggaatcgtagtgcatgcagttttgttaatacttttgtttaatatatcatgtgtctttccccatagcactatgtgttctttgaaacatgattct s panTro4.chrUn_GL393519 161943 1278 + 413329 gagacttactttttaacagagaaatatatgcaatgatggaacgagctgA---AGAACAATACTTTCTATCAATTGCTTTTGTCAGATCTAGGTTGGGAAAGTGGGAGAGGGTATCTAAGCATCAGATGCAAATTTCTTTCAATCTTGAAATTCCATGATACGATCTAAGATATTTCAAGAAAAAAACC-------------------ATTCAGGTTGATTTCAACAACATAAAAAAC-TGTAATGGAAAATATTAAGGCTAATTAGAACGTGAAGTTTT-ATTAACATTGATAACAATAATAATATTTTCTAAGGAACACTAGTTGACAGCAGACAAAGGGAGGGGGGATGA-AATACTGGAC----TTGTGGTCAGCAAAGTCCCAGGGTTATGCCACAGGACTACAAGTACTCCAACTCTATTAATAAAGGAAGAAATTGCTAATTATTTTTT------CCCTGAAGCAATGTGTGTGGAAGTCTTTCACTTTCTGAGCCAAAACTTGA---------------------------------------GGAGC-------------------------------------TGACCCTGAGGTGGCAG--------------TTTCCCTGGgggagctgcttagatagcttttcatgcagggatagtccctcagt----gcattacctttcagaggctat-ggcat-caggcctctatccagaaagggaggaggactagagagcg--------ctcaggggagag--ggtgataagagagaggt-ttgcttgtctaggtgatgttg--ctgagtagcccagtgtggactctgtgtcagggagctccaaagtacagcagcaactt-ggggtcttTAC---------AGCCCCAGAATTTATCTTATCTATggc----------------------------------------------------------------------atttgagt-------------------------------------------------------taataggattcagcttactgtaaagaagtaaacaccctagggggctatataaagaagccctctttggcccatttgtctaacaGATGGTCTCTGAACTTGTTTGCAGTGACTTTTTATGTTTTTTTTTTTTTTGCTGTGTTTTTCCAGATTTAGACATTTATACTTTCTCTCAAACTCATGTCATGCCAACAAAAAGTAGAGAATTAAACTAATTAGCCTACACT-AAGGTTTCCATTTACAAAAGAGAATTTACTTTAA------TATTATGAAAACAACACGTGCTTATTTTAG-AAAAAAATAATAACACAGGAAAGTATAGGAAGTTTAAATCGTCCACAATCCCATTTCTAAGACCActtctagcctcctctgtttctctatattttgtatattagatatctatgtaattattttcaaaattggaatcgtagtgcatgcagttttgttaatacttttgtgtaatatatcatgtgtctttccccatagcactacgtgttctttgaaacatgattct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46779648 1509 - 64190966 gagaatagctttctaacaaacaaacccgttcagtgatggaacaagctactttagaagACTATTGGCTATCA-TGGGTTTTGTCAAATGTAGGCTAAAAAAGTGGTAGAAGTGATTTAAGCATCACAAGTAAATTTTTTTCAAACCTGAAATTCCATGATATGCATTAAGATATGTCAAAAAACAAAACAAAAACAAAAAATACCCTTACCCAGG-TAACTTCAATGACATAAAAAAAGTGTAATGGGAAATACTAAGGTTAGTGAAAACTTGAGATTTTCACTAACAT---TAATATGAATAGTATTTTCTAAGGGCCATAAGTTGACAGTAGACAAAGGAGGAAAAGAAGAGAGTTCTGCACCACGCTGTGGTCGGTAAGATCCCAG----------TAAGACTACAAATAGTCCAATTCTATTAAT---TGAGGAAATTGGTA----TTTTTT------TTCTGGAAAAATGTGTGTAGGACTCTCTCACTCTCTGAGCTGAAATTTGAATTGCTCTTTAGTTGGGTAGTTCTGCAAGAACtgtgtagggagcttatggggggttttgaggatgaacaaggaaaaagatatgaccatgaggtggcagtagcacgcacaacttttatttggggataccgctttgaacgatttgcttgctggggaaatcctttacttttcatgagaactttcagaagctataggcatgtaggccactacccagaaggggagaaggacta-agagctagctaatccccaggagaaagatggggattagagagtaatcttacttgagtaggtgttattagcctggaga---tggggaggactttatgtcagaaagttccaaaaggcagcaataacttgggggtctttatctatctatgggtaacagaatttatctcatccatggctagcagatattgagcacagtttcctgggatatgcaaattaagcaggctctagatggttaaaagtctatttatttgggttatctataaaataattaggtatgtaaaaattttagcagctgtaggcttttggggctaccaggatccagcctgctgtgaagaagtaaacgacgtaggcgcccatagagagaagccatctttggatcatttatataacaGTTGTGCTTGGAAATAGATTGTAATGCCCTTTTAC--------TTTATTTTCTGTGTTTATTCAGATTTCAGCATTCATGCTTTTTCTAATACTCCCACTGTGCCACCATAAAGTAGAGAATTACTTAAACTGGTCCACGTTAAAGGGGTTTAGTATCAAAAGATAATTTATTTTACTTTTATTATTTTGAAAGTAACACATGCTTATTTTAGAAAAAAAAGAATAACACAATGAAATAT---AAGTTTAAATCACTCACATTCCCATTTCTAGGACCATTACTAGTTCAC---ATTTC----TAATATACATAATTCATATTTAGACAACT-TTTTcaaaattgaaatcattgtacatgtag-tttgtcattatttttgttta--atatcatgagtctt--cccatagcactaaatattctttgaattaagatttt i canFam3.chr15 I 111 I 2041 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=25784.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 322050 285 + 478999 taatgagaacattatagtccatttttatcaatgtacTTTATCCTTCTGTTTGGGGGCACTTATAATTTTATGCAAAATCTCTGTAAATTTGTGAAAATATTCTCAGAAATAGATAACGTGTG--TATTTTTAAGATGTTTACCTCGTTTTTGCCCATTTAACTCCGTAGCAAGGTAAGCTGTCATCAGTTGGAGGTAAGCggaagacagtagagagtacagagccctggactgtgactcagaggatgagcaccagatccagtttgctgtgccacagtggtaagtcac s panTro4.chrUn_GL393519 163221 287 + 413329 taatgagaacattatagtccatttttatcaatgtacTTTATCCTTCTGTTTGGGGGCACTTATAATTTTATGCAAAATCTCTGTAAATTTGTGAAAATATTCTCAGAAATAGATAACATATGGGTATTTTTAAGATGTTTACCTCGTTTTTTCCCATTTATCTCCGTAGCAAGGTAAGCTGTCATCAGTTGGAGGTAAGCGGAAGACagtagagagtacagagccctggactgtgactcagaggatgagcaccagatccagtttgctgtgccacagtggtaagtcac i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46781157 2041 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87654587 0 - 132174527 C a score=83683.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 322335 344 + 478999 ctaatctttatgtgcttggattcctcatatgtaatacaggatcacaactattgttctcactcatgcaatactactattgtgagaacctcatgaattaGAGAAACTCTGAATTTGCAATTTAGCTTTAGAACACTGACAAGTAGCTCATTGATTCTTGCCTCATTCCTCTGGAATAAAGTAGCTTTTTATCAAACAAGTGAACACATTGCTTTCAGTGGAGGCAGAAGGAATTCATTTTGAAAAATGCACATAGCATTCTCCAACCCATTTTTGCATATTCTTTTTTAAGGGAATGCCTTGTGTGAGAGGACTAGCAGGGTATCAGAACTGTTTTTTGAAAGA--AC s panTro4.chrUn_GL393519 163508 344 + 413329 ctaacctttatgtgcttggattcctcatatgtaatacaggatcacaactattgttctcactcatgcaatactactattgtgagaacctcatgaattaGAGAAACTCTGAATTTGCCATTTAGCTTTAGAACACTGATAAGTAGCTCATTGATTCTTGCCTCATTCCTCTGGAATAAAGTAGCTTTTTATCAAACAAGTGAACACATTGCTTTCAGTGGAGGCAGAAGGAATTCATTTTGAAAAATGCACGTAGCATTCTCCAACCCATTTTTGCATATTCTTTTTTAAGGGAATGCCTTGTGTGAGAGGACTAGCAGGGTATCAGAACTGTTTTTTGAAAGA--AC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87654587 340 - 132174527 Ctaacctttatgtccttggattcctcatatgtaatataggatcagaactattgttctcactcatgtaatactactattgtgagaacctcatgagtt----aaacactgaatttgcaatttagctttag-acactgacacatagCTCATTCATTCTTGCCTCATTCCTCTGTAATAAAGTAGCTTTTCATCAAACAATTGAACCCATTGCTTTCAATGGAGGCAGAAGGAATTCATTTTGAAAAATGCACATAGCATTCTACAAACCATTTTTGCACATTATTTTTTAAGGGAATGCCTTGTGTGAGAGGACTAGCA-GGTGTCAGAACTGTGTTTTGAATGAACAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46781157 2041 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=143813.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 322679 415 + 478999 TTTGTTTGCAGGTGCTTTCAA------------------ATATGTTGTCTTCAACTATCATTTTCAGTGTAAAAAGCGGGCTTGG--------------AGTAAGCACTGCCTGCAGACCACTTTTGTGAGCCCTCCCTTCAGTGATGTGATGGCAATCCAGGCCCCTGCTGGGAGAGATTTCTGCCTGGTTAAACCTCT----CACAGCTTCTAATCCTCTCTTTCTCATCTGGCTTTCCTTAGCCTTCTCCAAAGTCACTCACAGAAGGCATCCCACTCAACCTCACCTTGGGGTAAATCAAAATAGTCCTCCTTCTGAAGCTACCGGGTAAAGCGGTGGTAGCTGTGCAGCTGCTGCTGAT--CAACAGGCTCCAGAAACAGCAGCAGGAGGTGAGC-AGTCCCTGCGTTGGCCACCAAGTGGTAGGTGGCCAGCCCTACCTCCAAGTTGC s panTro4.chrUn_GL393519 163852 415 + 413329 TTTGTTTCCAGGTGCTTTCAA------------------ATATGTTGTCTTCAACTATCATTTTCAGTGTAAAAAGTGGGCTTGG--------------AGTAAGCACTGCCTGCAGACCACTTTTGTGAGCCCTCCCTTCAGTGATGTGATGGCAATCCAGGCCCCTGCTGGGAGAGATTTCTGCCTGATTAAACCTCT----CACAGCCTCTAATCCTCTCTTTCTCATCTGGCTTTCCTTAGCCTTCTCCAAAGTCACTCACAGAAGGCATCCCACTCAACCTCACCTTGGGGCAAATCAAAATAGTCCTCCTTCTGAAGCTACCGGGTAAAGCGGTGGTAGTTGTGCAGCTGCTGCTGAT--CAACAGGCTCCAGAAACAGCAGCAGGAGGTGAGC-AGTCCCTGCGTTGGCCACCAAGTGGTAGGTGGCCAGCCCTACCTCCAAGTTGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87654927 375 - 132174527 GTTGTTTCCAGGTGCTTTCAA------------------ATATGTTGTTTTCAACTATCATTTTCAGTGTAGAACTTGGGCTTGG--------------AGTAAGCCCTGCCTAAAGACCACCTGTGTAAGCCCTCCCTCTAGTGATGTGATGGC-ATCGAGGCTCCTGCTGGGAGAGATTTCTGCCTGGTTAAACCTCT----CACAGCCTCTATTCCTCTCTTTCTCATCTGGCTTTCCCTAGTCTTCTCTGAAGTGGCTCACAGAAGGTATCGCACTCAACCTCACCTTGTGGTAAGTCAA---------------------------------------AGCTGTGCAGCTGCCGCTGAT--CAGTAGGCTTCAGAAATAACAGCAGGAAGTGAGC-AGTCCTGGGATTGGCCACCAAGTAGTAGGTGGCAAGCCTTAACTCCAAACTGT i calJac3.chr10 C 0 I 3411 s canFam3.chr15 46783198 450 - 64190966 TTTGTTTCCAAGTACTTTCTATTATGTCATCCCATTGGGATTTGTTTTCTTCAAGTACCATTTTTAGTGTGAAAAATGAAATTGAACTAAGCACTAAGTACTAAGCACTGTCTACAGACTGCCTTTCTGAACCTGGCTTCCAGTGATGTGATGGC-ATCCAGACCCCTGCTGGGAGTTCTCTCTACATGGTTGACTCTCTCTTCCATAGTCCCTAATCCTCTCTCTTTTGTCCACTTTTCCTTAGTCTTTTCTAGAGTTGCTCACAGAAGTCATCCTATTTGATCTC-CCTTGGGACAAA--AATATTTGTTTTCTCCTGCAGCCTCCAGGCAAGGTGATAGTAGCTCTGTAGCTGCAGCTAATGAGAAAAGATTCCAGAAACAGCAATAGGAAGTAAGCAAGTCCCAGGCTTGGCCACCAAGTGGTAGGTGGTGAGCCTTAACTTCAGATTGC i canFam3.chr15 I 2041 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=1146.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 323094 2 + 478999 AC s panTro4.chrUn_GL393519 164267 2 + 413329 AC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87658713 2 - 132174527 AC i calJac3.chr10 I 3411 C 0 s canFam3.chr15 46783648 2 - 64190966 AC i canFam3.chr15 C 0 I 1852 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=176843.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 323096 498 + 478999 TGTTTACTTATTCATCTTTCATGGTAAAGCCTCCAGTTGCCTATTATGAAATCAGCAATAATCATGTGTCCCCTATCTGGGTCCCTGAAAAGATGGAAAGAGGC---AGATCAGGCTGGTGCTCTGAGAATGACAGACATC----AAACAAGAATGAAAAGTGTCACCCTCC---------TTGGACTTATTCAGTAACTCATGCCCTTGAGCAAAGGAGGATTTTCTATCAAAGGACATGGATTTCTGTGTCTTTCTCTTGA------------GATAACATTGCTGGGTGACCACAGAAAGCTGGCTCTGGAAGCACAGAAGCTGCCTTTCCTTGAGTAATAATGTCTCTTCAAAGGGAGCTGGAGCATGAGTAGTGTACATGCCTCAGATTTCAGTGAAAAGTTCAGAGGAGGCCTGAGAAG---GTCCTGGGAATGAATCATCTAGATGACTCAACCTTGCAAAGCCATCCACCTCATTGTGGATATCATTCAAT---ACATTTGGTGCTCCATCATCCTATTTCCAT s panTro4.chrUn_GL393519 164269 501 + 413329 TGTTTACTTATTCATCTTTCATGGTAAAGCCTCCAGTTGCCTATTATGAAGTCAGCAATAATCATATGTCCCCTATCTGGGTCCCTGAAAAGATGGAAAGAGGC---AGATCAGGCTGGTGCTCTGAGAATGACAGACATC----AAACAAGAATGAAAAGTGTCACCCTCC---------TTGGACTTATTCAGTAACTCATGCCCTTGAGCAAAGGAGGATTTTCTATCAAAGGACATGGATTTCTGTGTCTTTCTCTTGA------------GATAACATTCCTGGGTGACCACAGAAAGCTGGCTCTGGAAGCACAGAAGCTGCCTTTCCTTGAGTAATAATGTCTCTTCAAAGGGAGCTGGAGCATGAGTAGTGTACCTGCCTCAGATTTCAGTGAAAAGTTCAGAGGAGGCCTGAGAAGAAGGTCCTGGGAATGAATCATCTAGATGACTCAACCTTGCAAAGCCATCCACCTCATTGTGGATATCATTCAAT---ACAATTGGTGCTCCATCATCCTATTTCCAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87658715 503 - 132174527 TGTTTACTTAT---CCTCTCATGGTAAGGCCTCCAATTTCCTATTATGAAGTCAGCAGTAATCGTATGTTTCCTATCTGGGTCCCTGAAAAGATGGAAAGAGGC---AGATCAGCCTGGTGCTATGAGAATGACAGATGTCAGTTAAACAAAAATAAAAAGTGTTATCCTCCTGAGAGAGTTTGGACTTATTCAATTTCTCATACCCATGAGCAAAGGAGGATTTTCTATCAAAAGACATGGATTTCTCTGTCTTTCTCTTGA------------GATAACATGTGTGGATGACCACAGAAAGCTGGCTCTGGAAGCATAGAAGCTGCCTTTCCTTG---AATAATGTCTCTTTAAAGGGATCTGGAGCATGAGAAGTGTACATGCTTCAGATTTCAGTGAAAAGTTCAGAGGAGGCCTGAGAAGAAGGTCCTGGGAATGAATCATCTAGATGATTCAGCCTTGCAAAGCTATCCACCTCATTGTGGATATCATTCAAT---ACAATTGGTGCTCTAT-----TATTTCCAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46785502 502 - 64190966 TGCTTTCTTGACCGTCTCCCATGGTAAAGCCTGCAGCTCCTCATTATGAGATGAGGAACCACCATATATGCCCCTTCTAGATCCCAGAAAAGAGAGAAAGAGGCAGAAGACCAGACTGGTTCTCTGGCAGAGAGACACTTTAGCTAAGCAC-AGTGAAGGGCATCATCCTCCTGACAGAGTTGGGGTTTAGTCAGTAACTCATGCCTTTGGGCAAAGGAGGATTTGGTGTGAAAATATACAGACTTTTCTATCTTCCACTTGAGTTCACCATGAGGATAACGTGCCCTGGTAATCACCTACAGCTGGCTCTGGAGGCCCTGAAGCTCCCTTTCCTTG---------ACCTCC--------------------AGATTTGTCTGTGCTTCAGAGTTCAGTGAGAAGTTCAGGAGAGGCCTGAGGAGAAAGGCCCCGGGATTCATTGTCAAGATGACTTAACCCTGCAAAACCATCAACCTCCTTGTGAATGTCACTCAATATCACACTTGATGCGGAGTCATTGGATTTCCAT i canFam3.chr15 I 1852 I 1256 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=399760.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 323594 1144 + 478999 GGCTATTTCCTCACATTTTTCAAAGTCTGTTTCTTGAG-------------CCCTGAC----TGTGTCAAATAGCATGCCCTGTTATTCTTGGGCTTCCCTCTCTATTCTAGCATTCAGGGAGATTTCAGAGGCTGGGGTAAATCTCAGACCAAGAAGACGCAACGGTTTTGAGGTAGAGATCCTAGGAATATAG---AATTCTGAGCTATGCAGTG---GTCCTTTGCTTTCAGGAAATCAAGTTTGATAGTATCACCTGAAGCAT-ACTTACATTATCCACAAATGACAGCTCCTTACTTGAGCAGTTAAATTGTGGCAAGTCTTAACACACAGATTCCTCTTAAATGCCACCTAATCCCTGCCTGGCTTCAAGCCTCTGGCTTCCCTTGGAGAGGGGCAGAGTCTCTCTGTGTGAGAGAttcttcatttctgctttctgccctgtcagtttctactt-acttgctcttcCACCTTGTCCACAAGGCTTATCTAGCGGCT-GTTTACCTCTGAGCAGAGAAAATGGAAGTCAGCAGAGACAAGGTTGAACTTTCTCAGGAAGGATTTTTTTTTTCCACTTTATCGTGCAGCAAGA--GTAAAGCCTTTTTTTCGGTGATTCTTTCCTCCACAATGGCCATTGGCTGCCCTCTGTCACACACAGGTGTGACTCCCTTGTTATTAACTGTCAGGTGGGAATTTCTAGGG-AAGAAGGAGAGTGCTTTGTTAACCTCTTAACATCTCCCCAAATTGCATCATATTCTCTCCCTTTCCCCTCCCAGCTACCTTTTCTATTTT-TGATTTCCTCTTTTTCAGTCTGATTTGGGGATTTCAGTTCCCACTAACTTTGTATAATATCCTCCTA-TCTCTG--AAAGAACAAGTTCCATCTCCATTTTCCAGGAGAGTTTTTT-T---CCTTGCAGTAAGAGCACCCCATCATCTCT-CCATTTCTACCTCCCCATCCCAGTGCTCCC-------------TTTATGGCAGTACAATTGAAGAGGGACCCACAGTCTTGCTGAAGG-AACATG-ACCTTCCTACTGAAGTTGGGATTACGGAATAG-AGGGAGAAGAGGAAAGATGGATGTTTATCTGAATGGTCGGATCTTGTTTTCCAGAGGACACAGGCCAGTGGGAAACTTTTGGGAAGGAAGTCAAAAAA----------------------TCAAAGCCAGAACTGGGTT s panTro4.chrUn_GL393519 164770 1142 + 413329 GGCTATTTCCTCACATTTTTCAAAGTCTGTTTCTTGAG-------------CTCTGAC----TGTGTCAAATAGCATGCCCTGTTATTCCTGGGCTTCCCTCTCTATTCTAGTATTCAGGGAGATTTCAGAGGCTGGGGTAAATCTCAGACCAAGGAGATGCAATGGTTTTGAGGTAGAGATCCTAGGAATATAG---AATTCTGAGCTATGCAGTG---GTCCTTTGCTTTCAGGAAATCAAGTTTGATAGTATCACCTGAAGCAT-ACTTACATTATCCACAAATGACAGCTCCTTACTTGAGCAGTTAAATTGTGGCAAGTCTTAACACACAGATTCCTCTTAAATGCCACCTAATCCCTGCCTGGCTTCAAGCCTCTGGCTTCCCTTGGAGAGGGGTAGAGTCTCTCTGTGTGAGAGATTCTTCATTTCTGCTTTCTGCCCTGTCAGTTTCTACTT-ACTTGCTCTTCCACCTTGTCCACAAGGCTTATCTAGCAGCT-GTTTACCTCTGAGCAGAGAAAATGGAAGTCAGCGGAGACAAGGTTGAAATTTCTCAGGAAGGATTTTTTTTTCCCACCTTATCGTGCAGCAAGA--GTAAAGCCTTTTTTTCGGTGGTTCTTTCCTCCACAATGGCCATTGGCAGTCCTCTGTCACACACAGGTGTGACTCCCTTGTTATTAACTGTCAGGTGGGAATTTCTAGGG-AAGAAGGAGAGTGCTTTGTTAACCTCTTAACATCTCCCCAAATTGCATCATATTCTCTCCCTT-CCCCTCCCAGCTACCTTTTCTATTTT-TGATTTCCCCTTTTTCAGTCTGATTTGGGGATTTCAGTTCCCACTAACTTTGTATAATATTCTCCTA-TCTCTG--AAAGAACAAGTTCCATCTCCATTTTCCAGGAGAGTTTTTT-----CCTCGCAGTAAGAGCACCCCATCATCTCT-CCATTTCTACCTCCCCATCCCAGTGCTCCC-------------TTTATGGCAGTACAATTGAAGAGGGACCCGCAGTCTTGCTGAAGG-AACATG-ACCTTCCCACTGAAGTTGGGATTACGGAATAG-AGGGAGAAGAGGAAAGATGGATGTTTATCTGAATGGTCGGATCTTGTTTTCCAGAGGACACAGGCCAATGGGAAACTTTTGGGAAGGAAGTAAAAAAA----------------------TCAAAGCCAGAACTGGGTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87659218 1132 - 132174527 GGCTATTTCCTCACTTTTTTGAAAGTGTGCTTCTTGAG-------------CTCTGCCTGAATGTGTCAAATAGCATGCCCTGTTGTTCCTGGGCTTCCCTCTCTATTCCAGTATCTAGGGAGATTTCAGAGGCTGGTATAGATCTCAGACCAAGGAGACACAATGGTCTTACGGGAGAGATCCTAGGAATATAG---AATTCTGAGCTATGCAATG---GTCCTTTGCTTTCAGGAAATCAACTTTGATAATATTACCTAAGGCAT-ACTTACATTATCCACAAACGACAGCTCCTCATTTGA----TTAAAGTGTGGCAAGGCTTAACACACAGATTCCTCTTATATGCCACC-AATCCCTGCCAGGCTTCAGGCCTCTGGCTTCCCCTGGAGAGGGGCAGGGTCTTTCTGTGGGAGAGATTCTTCATTTCTGCTTTCTGCCCTGTCAGTTTCTACTTAACTTGCTCTTCCACCTTGTTCACAAGGCTTACCTGGCAGCT-GTTTATCTCTGAGCAGAGAAAATGGAAGTCAGCGGAGATAGGGTTGAAATTTCTCAGGAAGGATTTTTTCT---CAACTTATCCTGGAGCAAGA--GTAAAACTGTTTTTTCTGTGACTCTTTCCTCCTCAGTGGCCACTGGCTAGCCTCTGTCACACACAGGTGTAACTCCTTTGTTATTAACTGTCAGGTGGGAATTTCTAGGG-AAGGAGGAGAGTGCTTTGTTAACCCCTTAACAGCTCCCCAAATTGCATTACATTCTCTTCCTTTCCCCTCCCAACTACCTTTTCTATTTCATGATTTCTCTTTTTTCAGTTTGGTTTGGGGATTTCAGTTTTCACTAATTTTGTATCATATCCTCCTACTCTCTG--AAAGAACGAGTTCCAGCTCCATTTTTCAGGAGAGTTTTTT-TTTCTCTCACAATTAGAGAGGCCCACAATCTCTATCATTTTTAC---------------CTCCC-------------TTTATAGCAGTACAATTGAAGAGGGACT--CAGTCCTGCTGACGGAAACTTG-ACCTTCCCACTTAAGTTGGGAGTGCAGCATAGAAGGGAGAAGAGGAAAGTTGGATTTTTATCTGAATGGTCGGATCTTATTTTCCAGAGGACACCGACCATTGGGAAACTTCTGGGAAATAAGTCAAAAAA----------------------TCAAAGCCAGGTCTGGGTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46787260 1186 - 64190966 GGCAACCCCCTTGCATTTTAGGAAGGCTGTGTGTTGAGCGCACACTGCAGTCTCTGAC----TGTGTCAAACAGAACGCCCTGCTATACTTGATATTCCTTCTCTATTGTGGTATCCA-GGAGCTGTCAGAGCCTGGACTAGATCTCAAACCAAGGAGATACAATGCCACTGGGGCAGAGATCCTAGGGATACAGCACAATTCTGGACTGTGGAGTGCGTATCCTTTGTCCTTAGG-AATTTGTTTTGATGGCATTACCTGAGCCATCGCTCCAATTGTCCACAAATGACAGTTTCTCATTTGGCCAGTTAACTTGTGGCAAGCTTCAACCCAGGTGTTTCCCTTAATCTCCGCCTAGCCCCTGCCTAGCTTGAGGCTTCTGGCTTCCCCTAGCGAGGGCCAGCCTCTCTGTGTAGGGGAGATGCTCCGTTTTTGCTTTCTTCCTTA-CAGTTTCCACTC--CTTGTTCTTCTACCTGGTACTGGGG-------TAGCAGTTAGGATACTTTTGAGCAGAGGAAGTGAAGCTCAGTGGAGACAGAGCTGAAATTTCTCAGAAAGGGCTTTTTTG---CATC---TCCTGCAACAAGGATATAAAAGCCTTTTTTCTGTGATTCTTTCCTCCACGATGGCCTTTG----CTCTCTCTCACACATGGGTGTGGCACCC----TATTAAGTTATAGGTGGGAAGAGCTAGGGCACAGAGGAGAGTGCTTCATTAACTTTGTGACTTCTCCCAAGTATGCATGATGTTTCCTTTCTTTTCCCTCTTATCAACTTTTTCTACTTCATGATTTCCTCTTTTCTAGTCCGGTTTGGGGA-GTCAGTTCTCACTACTTTTGTATCATATCCTTTGA-AAGTTGAAAAAAAACAAGACCCTTCTCCATTTTCTAGGAGAATTTTCTATTTTCCTTGCAATAAGAGCCACCCACAAGCTCCACCATTTCTGTCCTTCCTCTCCATT-TTCCCAATATCAAGCACTTTTGTAGCAGGAAGATTGAAAAAGAGCCCATAATCTTATCAGAGGAAACTTGAACCTACAAACTGAGATTGGGGGTAGAGAGGAG-AAGAAAGAAGAGAGTGATAGATTTCTATCTGAATGGTAACATCTTCTTTTCCAGAGGATATGAGCATTTAACAAACTTCTGGGAAGGAAGTCATGAAATCAGAGCCAGAATTTTTTTTTTTCAGAGCCAGAATTGAGTT i canFam3.chr15 I 1256 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=30394.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 324738 194 + 478999 TTGGTAATTTAATCTCCCAAAGAGAGAAAAG-TCCCCATACTCTAATTCATATTTTGTTTGACTTGACTGAAGCCCTTTTGAATATTTTTTCTGCTTCTGTTCTGTTCTTGCAATAACAATGACATAAGTTTGCCTTTGGAGACATTAAAATAGTTTTCTCATC------------------TCTT--GTTCCAAGCatttattttatttttttg s panTro4.chrUn_GL393519 165912 194 + 413329 TTGGTAATTTAATCTCCCAAAGACAGAAAAG-TCCCCATACTCTAACTCGTATTTTGCTTGACTTGACTGAAGCCCTTCTGAATATTTTTTCTGCTTCTGTTCTGTTCTTGCAATAACAATGACATAAGTTTGCCTTTGGAGACACTAAAATAGTTTTCTCATG------------------TCTT--GTTCCAAGCAtttattttattttattt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 13 s canFam3.chr15 46788446 206 - 64190966 TGGGTAATTTAGTATTCCAAAGATAGAAATGTTCCCCACTCTCTGATTCATATCATGCTTGGCTTGATTGAAACTCTTTTTGAAATTTTTT-TGC-------CTGTTTTTAGAATACTAATTACATAAGTTTGATTATGAAGATATTAAAAT-GTTTTTTCATCATACTGATCATTCATTTTTCTTAAGTACCACGCATGTGAGGTGCTTTGTTG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=-827.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 324932 15 + 478999 g-----------------tgtatttatttatt------- s canFam3.chr15 46788652 39 - 64190966 AAGTTTGGGAAACAAATTTATATTTAATTTTTCCATACA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e panTro4.chrUn_GL393519 166106 13 + 413329 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=3668.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 324947 39 + 478999 tatttatttattattacagtacttttaagttttagggta s panTro4.chrUn_GL393519 166119 38 + 413329 TAtttatttattattactgtacttt-aagttttagggta i panTro4.chrUn_GL393519 I 13 C 0 s canFam3.chr15 46788691 39 - 64190966 CATTCATGAGTTTTGACTAAAATCTTAGGCTTTGTAATG i canFam3.chr15 C 0 I 71 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=6987.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 324986 76 + 478999 catgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgcgctgcacccactaactcatcat s panTro4.chrUn_GL393519 166157 76 + 413329 catgtgcacaatgtgcaggttagttacatacgtatacatgtgccatgctggtgcgctgcacccactaactcgtcat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46788730 71 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=117312.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 325062 741 + 478999 ctagcattaggtatatctcccaatgc--------------------tatccctccccgctcccc-----caacccacaa--cagtcccccaagt-------------gtgatgttccccttcc---tgtgtc-----catttgttctc------------------------attgttc-----tcacctatgagtgaaaatatgtggtgtttggttttttgttcttgcaatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgttcctacaaaggacatcaagtcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccatattttcttaatccagtctatcattgttggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaataatgccgcaataaacatacgtgtgtgtgtgtc-------tttatagcagcatgatttatagtcctttgggtatatacccggtaatgggatggc-gggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagtttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcctatttctccatatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgattgccattctaactggtatgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatggtgagcattttttcatgtgttttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctattcatgtccttcgcccactttttgatggggttgttagttttttt s panTro4.chrUn_GL393519 166233 746 + 413329 ctagcattaggtatatctcccaatgc--------------------tatccctcccccctcccc-----caacccacaa--cagtccccagagt-------------gtgatgttccccttc----tgtgtc-----catgtgttctc------------------------attgttcaagtcccacctatgagtgagaatatgcggtgtttggtattttgttcttgcgatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacaggaactcatccttttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtctatcattgttggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaataatgccgcaagaaacatacgtgtgcgtgtgtc-------tttatagcagcatgatttatagtcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttccggttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagtttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcctatttctccatatcctctccagcacctgttgtttcctgacttttgaatgatcgccattctaactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatggtgagcattttttcatgtgttttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtccttcgcccactttttgatggggtggtttgttttttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46788801 819 - 64190966 ctaacatacagaataacccccagtgcccgttacccattcactcccaccccccgccctcctccccttctaccacccctagttcatttcccagagttagcagtctttacgttctgtctccctttctgatatttcccacacatttcttctcccttcccttatattccctttcactattatttatattccccaaatgaatgagaacatataatgtttgtccttctccgactgacttacttcactcagcataataccctccagttccatccacgttgaagcaaatggtgggtatttgtcatttctaatagctgagtaatattccattgtatacataaaccacatcttctttatccattcatctttcgttggacaccgaggctccttccacagtttggctatcgtggccattgctgctataaagatcggggtgcaggtgtcccggcgtttcattgc------atttgta-tctttggggtaaatccccaacagtgcaattgctgggtcgtagggcaggtctatttttaactgtttgaggaacctccacacagttttccagagtggctgcaccagttcacattcccaccaacagtgtaagagggttcccttttctccgcatcctctccaacatttgttgtttcctgccttgttaatttgccccattctcgctggtgtgaggtggtatctcattgtggttttgatttgtatttccctgatggcaagtgatgtagagcattttctcatatgcatgttggccatgtctatgtcttcctctgtgagatttctgttcatgtcttttgcccatttcatgattggattgtttgtttcttt i canFam3.chr15 I 71 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=46862.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 325803 522 + 478999 cttgtaaatttgtttgagttcattgtagattctggatattagccctttgtcagatgagtaggttgtgaaaattttctcccattttgtatgttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttgtcttttgttgccattgcttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacgtttaagtctttaatgcatcttgaattgatttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagctttctacatatggctagccagttttcccagcaccattCCAAGCATTTATTTTTCAAGCACCGTATGTGGGCCTTTTGTTCTGTGGAGAATAGGGGAAATAAATTTAAATTTATTTTTTTCCATAGACATTTGCAAGAGTTTTTGTAGTGTCTTTTTTTTTTTTTT----GGCTTATC s panTro4.chrUn_GL393519 166979 526 + 413329 cttgtaaatttgtttgagttcattgtagattctggatattagccctttgtcagatgagtaggttgcgaaaattttctcccattttgtaggttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctcttgagtttaattagatcccatttgtcaattttgtcttttgttgccattgcttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctgtgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacgtttaagtctttaatccatcttgaattgatttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagctttcttcatatggctagccagttttcccagcaccattCCAAGCATTTGTTTTTCAAGCACCATATGTGGGCCTTTTGTTCTGTGGAGAATAGGGGaaataaatttaaatttatttttttCCATACACATTTGCAAGAGTTTTTGTAGTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTATC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46789620 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=3319.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 326325 22 + 478999 AACATTTTTGTTTTTTAAAAAC s panTro4.chrUn_GL393519 167505 22 + 413329 AACATTTTTGTTTTTTGAAAAC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46789620 21 - 64190966 ggcgtttttgtctttcaagaa- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87660350 0 - 132174527 C a score=19956.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 326347 63 + 478999 TTTTCTA--------TCCACCAACTCTGT---------CTCTTTTGCAGTTCATTTGGGTATAAAGTTTTGCTTAAGAGG s panTro4.chrUn_GL393519 167527 71 + 413329 TTTTCTACCAACTTTTCCACCAACTCTGT---------CTCTTTTGCAGTTCATTTGGGTATAAAGTTTTGCTTAAGAGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87660350 63 - 132174527 TTATCTA--------TACACCAAATCTGT---------CTCTTTTGCTGTTCATTTGGGTATAAAGATTTGCTTAAGAGG i calJac3.chr10 C 0 I 1199 s canFam3.chr15 46789641 70 - 64190966 ttttCTA--------GCCACTAAATCACTAAATAGCCACTATCTTGCTATTTATTTGGATATAAATATTTGCTTGAAA-- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=213191.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 326410 589 + 478999 TGTATCAACCTCCTAGAGTGAGGCTTTTGAGAAGAGGGGCTACTTCTAAACTTCTATCACTTATGTCCATTTTCTTAATTTTATACCCAATACATGtgtggcaaagtttgttagctacatatttaacacccaattttattatcttcctaactaatacaacctcaattttattcaATTTGAG--AATGTGCCCAGTTTAAAAAATTAGATGTTGCAGTCTCTTCTGTTTATGGTGATTATCATTTGACATGCTTATGT----TCCGATATATAAACGGAATATAGTTTTGCC--------GCtgtctgacacttcagcagccatcttcaggtaataaggtgaacttaaggaaagaaacacatactacaaaagatttgtcaaaaaggcagggaagcctaggtccctgatgatatcttggcactgcccacctctggactgcagtggactgactatctttagaa--gcacgcatgagagaagaaaactaaacct--ttatgttgcataaattactgtagcttgagtttctattatatgcagctgaatctaagtctaCTATGTGCAGCAAATTTGAGTCCCTGGATAGATCTTGAGTTTCCAACACTTAA----GT s panTro4.chrUn_GL393519 167598 597 + 413329 TGTATCAACCTCCTAGAGTGAGGCTTTTGAGAAGAGGGGCTACTTCTAAACTTCCATCACTTACGTCCATTTTCTTAATTTTATACCCAATACATGtgtggcagagtttgttagctacatatttaacacccaattttattatcttcctaactaatacaacctcaattttattcaATTTGAG--AATGTGCCCAGTTTAATAAATTAGATGTTGCAGTCTCTTCTGTTTATGGTGATTATAATTTGACATGCTTATGT----TCCGATATATAAACGGAATATAGTTTTGCCTCTTTCTtgctgtctgacatttcagcagccatcttcaggtaataaggtgaacttaaggacagaaacacgtactacaaaagttttgtcaaaaaggcagggaagcctaggtccctgatgatatcttggcactgtccacctctggactgcagtggactgattatctttagaa--gcactcatgagagaagaaaactaaacct--ttatgttgcataaattactgtagcttgagtttctattatatgcagctgaatctaagtctaCTATGTGCAGCAAATTTGAGTCCCTGGATAGATCTTGAGTTTCCAACACTTAA----GT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87661612 599 - 132174527 TGTATCAACCTCCTAGAGTGAGACTTTTGAGAAAAGGGGCTACTTCTAAACTTCTATCACTT-TGTCCATTTTCTTAATTTTATACCCAATACCTGtgtggcaaagtttgttagctgcatacttaatatccaattttattatcttcctgactaatgcaacctcaattttgttcaATTTGAG--AATGTGCCCAGTTTAATACATTAGATGTTGCAGTCTCTCTTGTTTATGATGGTTATCATTTGACATGCTTATGT----TTAGAAATATAAATGGAATGTGGTTTTACCTCTTTCTTGTTGTCTGATACTTCAGATGGCATCTTCAGATAATAAGGTGAACTTAAGGATGGAAACATACACTACAAAAGATTTGTC-AAAAGGCAGGAAagcctaggtccctgatgacatcttggcactgctcacctctggactgcagtggactgattatctttagaa--acacccatgagagaagaaaactaaacct--ttatgttgcatgaattactgttacttgagtttctattataggcaactgaatataagtctaCTATGTGCAGCAAATTTGAGTCCCTGGATAGATCTTGAGTTTCTAACACTTAATGGTGT i calJac3.chr10 I 1199 C 0 s canFam3.chr15 46789711 581 - 64190966 ---ATCAACCTCCTAAAATGGCATCCTTGAGAAGAGGGTCTAGTTCTTAATTTCCATCACTG-----TATTTTCTT-ATTTAATTCCCAATACATGTGTGGCAGAGTGTGTTACATGCATACTTATTAT-CACTTTTCTTATCTTCCTGCCTAATACAATCTCAGTTCTATTC---TGGAGGCAAGGTACCCAGTTTGAAAAATCAAATGTTGTAGCCTCCTTTA--CATAGGGGTCATTATGTAGCACACTTCTGTTCAATCAAAATTGCAGGTGTAATAGAG--TGGCCTCCTTCCTGCTGTCTGCAGCTCCAGCTGCTGTCTTAGGATAACAAGGTGGCTTTGAGGATGAAAATATATACTAAAAAGGACTTACC-AAAAGCCATGAGAGCTTGAGTCCTTGATGCCATCTTGGAACTGCCTTCCTCTGGACAGCCATTGA---ACTATCTCTAGAAGTGTATGTGTGAGGGAAAAAAAAAAACCCCAAACACTTTGTATAAGTTGCTGTTACTTGGGACTCTTCTACA--CAGCTGAATCCAAGTCTAATATTT---ACAATTCTGGGTTCCTGGATAGACCTTGAGTTTCAAATAGTTAT----CC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=37971.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 326999 159 + 478999 AAAATGTGGAGTAATTGAATTACTTAATAAAAAGTAATAATTATTTATTCCAACCATAGATACTTTGCTTCTTTGGCCATAGTTGAATTATTATCTTTTAAAAATGGTTCTGTTTTTATTAAGATGACTAGTAGTATATACTTTTGATAGATAAATGGC s panTro4.chrUn_GL393519 168195 159 + 413329 AAAATGTGGAGTAATTGAATTACTTAATAAAAAGTAATAATCATTTATTCCAACCATAGATACTTTGCTTCTTTGGCCATAGTTGAATTATTATCTTTTAAAAATGGTTCTGTTTTTATTAAGATGACTAGTAGTATATACTCTTGATAGATAAATGGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87662211 158 - 132174527 AAAATGTGGAGTAATTGAATTACTTAATAAGAAGAAATAATTATTTATTCCAACTATAGATTCTTTGTTTCTTTGGACATAATTGAGTTGTTACCTTTTAAAAATGGTTCTGCTTTTATTATGATGATTAATAGTATATG-TTTTGATATATAAATGGC i calJac3.chr10 C 0 I 1101 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46790292 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=21775.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 327158 99 + 478999 TTATGTTCTTTAAAAGAGATGAGTGCCCAGTTTG----CTCATAATAAAAACTCAGAAGAGATAAACGTTTAAAATATGTTCTTATAATAAACACAGATAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 168354 103 + 413329 TTATGTTCTTTAAAAGAGATGAGTGCCCAGTTTGACTACTCATAAAAAAAACTCGGAAGAGATAAACGTTTAAAATATGTTCTTATAATAAACACAGATAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87663470 101 - 132174527 ttaTGTTCTTTAAAAGAGATGAGTGTCCAGTTTGATTGCTCATA--AAAAATTCAAAAACAATAAAGGTTTAAAATATGTTGTTTTAATAAACACAGACAAAT i calJac3.chr10 I 1101 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46790292 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=55122.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 327257 605 + 478999 AAAAGGTAGGTAtccatggtgtacatgtgccacattttcttaatccagtctatcattattggccatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaatagtgctgcagtaaacatacatgtgcatgtgtctttatagcagcatgatttataatcctttgagtatatacccagtaatgcgatggctgggtcaaatggtaattctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttctacaatgattcaactagtttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcccatttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgatcgccattctaactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgagcatgttttcatgtttcttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatcctttgcccactttttgatggggttgttagtttttttcttgtaaatttgtttgagttcatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcctttgtagag s panTro4.chrUn_GL393519 168457 605 + 413329 AAAAGGTAGGTAtccatggtgtacatgtgccacattttcttaatccagtctatcattattggccatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaatagtgctgcagtaaacacacatgtacatgtgtctttatagcagcatggtttataatcctttgagtatacacccagtaatgcgatggctgggtcaaatggtaattctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatgattcaactagtttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcccatttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgacttttgaatgatcgccattctaactggtgtgagatggtatctcatcgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgagcattttttcatgtgtgttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgctcatatcctttgcccactttttgatggggttgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataaaaaatgatgagttcatgtcctttgtaggg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18659070 9 + 99152023 I e canFam3.chr15 46790292 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87663571 0 - 132174527 C a score=77052.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 327862 303 + 478999 acatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgcaaggacaaaaaaccaaacaccgcatgttctcactcataggtgggaattgaacaatgagaacacatggacacaggaaggggaacatcacacaccggggcctgttgtggggtggggggaggggggagggatagcattaggagatatacctaatgctaaatgacaagttaatgggtgcagcacaccaacatggcacatgtatacatatggaacacacctgcaggttgtgcacatgtaccctaaaac--aaagtataataaaaaaa s panTro4.chrUn_GL393519 169062 303 + 413329 acatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcgcaaggacaaaaaaccaaacaccacatgttctcactcataggtgggaattgaacaatgagaacacatggacacaggaaggggaacatcacacaccggggcctgttgtggggtggggggaggggggagggatagcattaggagatatgcctaatgctaaatgacaagttaatgggtgcagcacaccaacatggcacatgtatacatatgtaacacacttgcaggttgtgcacatgtacccgaaaac--aaagtataattaaaaaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18659079 302 + 99152023 acatggatgaagctggaaaccatcattctcagcaaactatcacaaggacaaaaaaccaaacaccacatgttctcactcataggtaggaattgagcaatgagaatacatggacacaggagggggaacatcacacaccagggcctcttgtggggttgggggagaggggagagatagcattaggagata---ctaatgctaaacgacgagttaatgggtgcagcacacaaacatggcacatgtatatatatgtaacaaacctgcatgttgtgcacatgtaccctaaaacttaaagtataataaaaaaa i ponAbe2.chr15 I 9 C 0 e canFam3.chr15 46790292 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87663571 0 - 132174527 C a score=324753.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 328165 721 + 478999 aaaGGTAGGTATCAAAAACATAACAATTCAAACCCTCTTTTAATTAAAGTTGGTTCTTGTATTAGTAGTAAGCAGGGAGCTTGGGGGGAGAGATGTGTACAAGTGTAGATGGGAGGTTCCCAGGTAAAGTTCTTGATTGGGAAGGTTCATTTGATTGTATGACATGTTCCTCCATTCTCTCtgtctctgtctctgtcttttgtt---tttgttgttgttgttgCTCTAAGCATCTAGAATGAAAACCACAAGGCCAGGGTTTGCTATCAAGGACCACTCTTTCCTTTGCAGAAAAAGCTGGTTCTGAGTGAAATAGAAGGACTAGGGTGCCAAATTAACTCCTCTCCACAAAGTGACCCCACATGGAAAAGTACTTGAGAAGCTCTGTAAAGACATGGTAAAAGCTTACCAAAGACAGTAGCATTATCCTTTCCCTTACACACAAAGTGGAGGGGAAGTGTGGGTAAGTGGTGTGTCTAAAAGCATTGCTTTAAATTATGCATCCATTTGTAAACACTAATTTTTTGTTA-CTCCATGTTGTTTGTAAATTGATCAAAAAATGCATATTTGTCATGGAAAAATTAGGAAATAAAGATATTAGCATAAAAAAGGAAACAACGAATCTTAATTACCCATAATCCCATGACTTCATGTTTGTGTAAGATTATATAATACTATTGTTTCATGATCTGCCATTTTCACTCAGTGACATATTTTGCACGTG s panTro4.chrUn_GL393519 169365 709 + 413329 a--GGTAGATATCAAAAACATAACAATTCAAACCCTCTTTTAATTAAAGTTCGTTCTTGTATTAGTAGTAAGCAGGGAGCTTGGGGGGAGAGATGTGTACAAATGTAGATGGGAGGTTCCAGGGTAAAGTTCTTGATTGGGAAGGTTCATTTGATTGTATGACATGTTCCTCCATTCTCTCTTTCTCT----CTGTCTTTTGTT---------GTTGTTGTTGTTCTAAGCATCTAGAATGAAAACCACAAGGCCAGGGTTTACTATCAAGGACCACTCTTTCCTTTGCAGAAAAAGCTGGTTCTGAGTGAAATAGAAGGACTAGGGTGCCAAATTAACTCCTCTCCACAAAGTGACCCCACGTGGAAAAGTACTTGAGAAGCTCTGTAAAGACATGGTAAAAGCTTACCAAAGACAGTAGCATTATCCTTTCC-TTACACACAAAGTGGAGGGGAAGTGTGGGTAAGTGGTGAGTCTAAAAGCATTGCTTTAAATTATGCATCCATTTGTAAACACTAATTTTTTCTTAACTCCATGTTGTTTGTAAATTGAACAAAAAATACATATTTGTCATGGAAAAATTAGGAAATAAAGATACTAGCATAAAAGAGGAAACAATGAATCTTAATTACCCATAATCCCATGACTTCATGTTTGTGTAAGATTATATAATACTATTGTTTCATGATCTGCCATTTTCACTCAGTGACATATTTTGCACGTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18659381 720 + 99152023 aaaGGTAGGTATCCAAAACATAGCAATTCAAGCTCTCTTTTAATTAAAGTTGTTTCTTGTATTAATAGTAAGCAGGGAGCTCGGGGGGAGAGATGTGTACAACTGTAGATGGGAGGTCCCCGGGTAAAGTTCTTGTTTGCAAAGATTCATTTGATTGTATGACATGTTCCTCCACTCTCTCTCTCTCT----CTGTCTTttgttgttgttgttgttgttgttgttCTAAGCATCTAGAATGAAAACCACAAGGCCAGGGTTTGCTACCAAGGACCACTCTCTCCTTTGCAGAAGGAGCTGGTTCTGAGTGAAATAGAAGGACTAGGGTGCCAAATTAGCTCCTCTCCACAATGTGACCCCACGTGGAAAAGTACTTGAGAAGCTCTGTAAAGACATGGTAAAAGCTTACCAAAGACAGTAGCATTATCCTTTCC-TTACACACAAAGTAGAAGGGAAGCGTGGGTAAGTGGTGTGTCTAAAAGCATTGCTTTAAATTATACATCCATTTGTATACACTAATTTTTTCTTAACTCCGTGTCATTTGTAAATTGGATGAAAAATGCATATTTGTCATGGGAAAATTAGGAAATAAAAATATTAGCATAAAAGAGGAAACAACGAATTTTAGTTACACATAATCCGATGACTACATGTTTGTGTAAGATTATATAATAATATTGTTTCATGATCTGCCATTTTCACTCAGTGACATATTTTGCACGTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87663571 701 - 132174527 AAAGGTAGGTATCCAAAACATGACAACTAAAACTCTCTTTTAATTAAAGTTGGTTCTTGTATTAGTAGTAAGCAGGGTGCTTGTGGGGAGAGATAGG--CAAATGTAGATGGAAGTTTCCTGGGTAAAGTTCTTATTTGGGAAGATTCATTGGATTGTATGGCATGTTCTTCCCGTCTCTCTTGCT------CTGTCTTTT-TT---------GTTGTCATTGTTCCAGGCATCTAGTATGAAAACCACAAGGCCAGGGTTTGCTACCAAGAACCACTCTCTCTTTTGCAGAAAGGGCTGATTCTGAGTGAAATAGAAGGACTAGGGTGCCAAATTAACTCCTCTCCACAAAGTGACCTCACATGGAAAAGTATTTGAGAAGCTCCATAAATACATGCTAAAGGCTCACCAAAGACAGTAGCATTATCCTGTCT-TTACACATAAAGTAGAGGGGAAGCTTGCATAAGTGGTGTGTCTAAAAGCATTGCtttaaattatacatcttttttaaaatattaa-tttttCTTAACTCCACATCTTTTGTAAATTGGGTGAAGAATGTGTACTTGTCATGGAAAAATTAGGAAATAAAGATATTAGCATAAAAGAGGAAACAAAGAATCTAAATTACCCATAAATCCATGACTCCACGTTTGTGTACAATT---TAATAATATTGTTTCATGATCTGCCATTTTCACTCAATAACATATTTT-TATGTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46790292 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=41653.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 328886 69 + 478999 AAATACGTTTTACATAAATATTTGTATAATTTGACTAGTTATTACCTTAAAACTACTGGAAAGAAATCC s panTro4.chrUn_GL393519 170074 69 + 413329 AAATACGTTTTACATAAATATTTGTATAATTTGAGTAGTTATTACCTTAAAAGTACTGGAAAGAAATCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18660101 69 + 99152023 AAATATGTTTTACATAAATATTTGTATAATTTGAGTAGTTATTACCTTAAGACTACTGGAAAGAAATCC i ponAbe2.chr15 C 0 M 415 s calJac3.chr10 87664272 69 - 132174527 AAATACATTTTACATAAATATTTCTATAATTTGTGTAGTTATTACCTTAAGACTACTAAAAAGAAACCC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46790292 63 - 64190966 AAATATTTGTTACATAAAT-CATATGTAATTTACTTAGTTATTGTCTTA-----ATCATAAAGAATTTC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=184315.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 328955 488 + 478999 --CTTAGTTCTTCTACTTCACT-CATTTCTTCTCTACAGTATTCATTTCTGGGGTAAATCCAGCTCTTTGGCTTGCATGGCCATGTAGTTCTGAAGTTAGCTACACAGGACTTAGCCACATTTCCCAGAATaggatgta-tggtacagcagaattcttactgaacttgaagtcagaagaactggttccttcacttactatgggtgaccttggacagtatacttgatttctttgaatctcatcagtgaaatgagtatgggaatgtctaccttaactgtgtgatgacagaatttgtgaggatgaactgaacaactatataaaagtgtttgggaaatgctgaagagccctacaaatgaaagacattaataatattAACTGAAATAGATTCCATAAATACTATGTGTAAGATCCTACCTTGATttaccgcatttaatcatcaaatccactgtctgacaaaagtattatcattagttctattttatagtctaaacaa s panTro4.chrUn_GL393519 170143 488 + 413329 --CTTAGTTCTTCTACTTCACT-CATTTCTTCTCTACAGTATTCATTTCTGGGGTAAATCCAGCTCTTTGGCTTGCATGGCCATGTAGTTCTGAAGTTAGCTACACAGGACTTAGCCACATTTCCCAGAATaggatgta-tggtacagcagaattcttactgaacttgaagtcagaagaactggttccttcacttactatgggtgaccttggacagtatacttgatttctttgaatctcatcagtgaaatgagtatgggaatgtctaccttaactgtgtgatgacagaatttgtgaggatgaactgaacaactatataaacgtgtttgggaaatgccgaagagccctacaaatgaaagacattaataatattAACTGAAATAGATTCCATAAATACTATGTGTAAGATCCTACCTTGATttacctcatttaatcatcaaatccactgtctgacaaaagtattatcattagttatattttatagtctaaacaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87664341 481 - 132174527 --CTTAGTTCTTCTATTGCACT-CGTTTCTCCTCTAAAGTATTCCTTTCTGGGATAAATCCAGCTCTTTGGCTTGCATGGCCATGCAGTTCTGAAGTTAGCTATGTAGGACTTAACCACATTTCCCAGAGTAGAAGgta-tggtacagcagaattcttattagacttgaagtcagaaggactgattcctccacttactatgtgtgaccctggacagtatactagatttctttgaatctcatctgcaaaatgagtatggaaatatctcccttaactatg---tgaccaaatttgtgaggatgaactg---aactatgtacaagtgtttaggaaatgctgaagag-cctacaaatgaaagacattaataatattAACTGAAATAGATTCCATCAATGCTATGTATGAGATCCTGTCTTGATttacctcatttattcatcaaatccactatctgacaaaaatatgatcattagttctattttacagtctaaacaa i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46790355 485 - 64190966 CTATAAGTATATCTCCCCAAATGCATGCCTCCTCTACAGCATTCATTTATTAGATAAATCCAGGCTTTTGACCTGCAATGCCATGCAGTTCGTAAGGTAGCTACATAGAACATGGCCATAGTTTCTAGGAGAGAAGGTGCTGGCACAGCAAAATTCTTACTGATACCGAAGTCAGAGGAActagttccttcacttac-gcatgtagccttaaacaacatgcttggtttctttgaatctcatctctgcaaaaagtatgagaatgtctaccctaactctg---tcacagaatttgtgaggatgaattgagagagtatgtcaaagtgttttgtaaatgataaagaactttccaagtaaaaagtat---tagtattaactgacatcaattgcatacatattatgtataagattctattctgattaacctcatttattcatcacagccattctgtgaggaaagcattatcattagctctggtttatagatTTAAAAA i canFam3.chr15 C 0 I 165 e ponAbe2.chr15 18660170 415 + 99152023 M e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=136466.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 329443 618 + 478999 atctaggcagaaaggtcaaataatttgcataagctcacacaatcagtgaCTTAGATTTGATCCAATCTATTTCATTCGATAGTGTTGGTCTTTTCCCCTAatagtagtaaaaactgtgggctccattgttagcctgcctgagatcagatgccatctccaactagg-caagttaccttttctgcctgtttcactcttcaaaaattagagatacaataataccaacccaatttctttgggtttcataagtaggaaataaaataatacatagaaaagacttggaacattgcctgacacaaaataggtgtcttaaaacgttaattattattATTTTCAATGTTGCCAAGACAGCGAACCCTGTGGTGGTGAATTTGCATGTGAAAACCTGTTAAACTGATACACACTCTTTCTTTTCTCCTAATATTGTCGCACTTGCACCTTATGTCCTAAGTTTTCTAGTAATCTTGAATGTACATAATGTTTAGTTGTG-AAATAAATTTTGCTTTGTGAGGGAATTAGTTGTAATTGAGGGTAGAATCAAAGTTTGTTCAGCGAATTCCATCTATTCAGT-TGTAAAGGCAGCGAATAAACACCATGACTTGTATTTGAAAGTAGAAAATA s panTro4.chrUn_GL393519 170631 617 + 413329 atctaggcagaaatgtcagataatttgcataagctcacacaatcagtgacttagagttgATCCAATCTATTTCATTTGATAATGTTGGTCTTTTCCCCTAatagtagtaaaaactg--ggctccattgttagcctgcctgagatcagatgccatctccaactagg-caagttaccttttctgcccgtttcactcttcaaaaattagagatacaataataccaacccaatttctttgggtttcataagtgggaaataaaataatacatagaaaagacttggaacattgcctgacacaaaataggtgtcttaaaacgttaattattattATTTTCAATGTTGCCAAGACAGCGAACCCTGTGGTGGTGAATTTGCATATGAAAACCTGTTAAACTGATACACACTCTTTCTTTTCTCCTAATATTTTCGCACTTCCACCTTATGTCCTAAGTTTTCTAGTAATCTTGAATGTACATAATGTTTGGTTGTACAAATAAATTTTGCTTTGTGAGGGAATTAATTGTAATTGAGGGTACAATCAAAGTTTGTTCAGCGAATTCCATCTATTCAGT-TGTAAAGGCAGCGAATAAACACCATGACTTGTATTTGAAAGTAGAAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87664822 603 - 132174527 atgtaggcagaaagatcaaataatttgcataagctcacacaattagtgaCTTGGCTTTGATGTAATCTATTTCATTCTATAGTGTTGGTCCTTTCCCCCGacaatagtaaaatgtgtggactccattgttagcctgcctgggatcatataccatctccaactaggttaagttaccctttttgcctgtttgactcttcataaattagacatacaatagtactgacccaatctcttcaggttgcataagtaggaaataaaattatacatagaaaagacttggagcattacctgacacaaaataggtggcttcaaatg----ttgttattattTTCAAAGTTGCCAAGAGAGCAAACCCTGTTGTGGTGAATTTGGATATGTAAACCTGTTAAACGAATACACAC----TCTTTTCTCATAATATTGTCGCACTTGCACCTTACGTTGTAAGTATTCTAGTAATCTTGACTGTACATAATGTTTGGTTGTACAAATAAATTTTGCTTTGTGAGGGAATTAGTTGTAATTGAGGA-ACATTCGAAGTTTGCTCAGC---------TTAACAAGCATTTAAAGGCATCTAATAAACACCATGACTTGTATTTGAAAGTAGAAAATA i calJac3.chr10 C 0 I 352 e ponAbe2.chr15 18660170 415 + 99152023 M e canFam3.chr15 46790840 165 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=69.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 330061 2 + 478999 CC s panTro4.chrUn_GL393519 171248 2 + 413329 CT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18660170 415 + 99152023 M e canFam3.chr15 46790840 165 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I e calJac3.chr10 87665425 352 - 132174527 I a score=18466.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 330063 88 + 478999 GACTTTCAATTGTCATTTCCCCCGAGGAAACCATTAACCAGCACAATTGTTTTTAAATATCAACCTG----------------------------------AAATAACACTGTATTTTTACT s panTro4.chrUn_GL393519 171250 88 + 413329 GACTTTCAATTGTCATTTCCCCCGAGGAAACCATTAACCAGCACAATTATTTTTAAATATCAACCTG----------------------------------AAATAACACTGCATTTTTACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87665777 122 - 132174527 GAATTACAATTTTCATTTCCCCTGAGGAAACTACTAACCAACACATTTATTTTTAAATATCAACCTGCTGTGTTCTTTTGAAAGTCTAAGTACTAAGGAAAAGATAACACTGTATTTTTACT i calJac3.chr10 I 352 C 0 e ponAbe2.chr15 18660170 415 + 99152023 M e canFam3.chr15 46790840 165 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=195395.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 330151 433 + 478999 ---------GCTATTCTTTCTCTCTCCTTCTCTCTCT-TTGGGATACAGTTT-GGCTTTGAAAAAATATGGTATATATGCGGTGTTTGGTCAAATAATTTAGCACTATGGAAAAGGTTGTGAACCAGTCATAGTATTTGAGGTTGTAAGAAGAAACCTTTGAAAAGGTAGTGGCTGCACAAATGTATTAACTTAGTACCACAAAGTAGGGAGTTCCGAAACTGTGGTGGAAATATTGCCTGCCTTGACTACCTGTTCTTCCTGAGTCCATTTGCTGATCAGAACTCAGGTAACTTAAAAGTCATATACCCTGGAAAGGAGTATGGAAACAGGAAAGATCCTCAGC-GGCTATACAAGTGAGAGATATGGCAGAGTTCTAATAAGATTGACTAAAAGCTTGATACTGTCTTACATCAAAGGAGCAAATAATTGTTCTACCTGGAAT s panTro4.chrUn_GL393519 171338 430 + 413329 ---------GCTATTCTTTCTCTCTCCTTCTCTCTCT-TTGGGATACAGTTT-GGCTTTGAAAAAATATGGTATATATGCGGTGTTTGGTC---TAATTTAGCACTATGGAAGAGGTTGTGAACCAGTCATAGTATTTGAGGTGGTAAGAAGAAACCTTTGAAAAGGTAGTGGCTGCACAAATGTATTAACTTAGTACCACAAAGTAGGGAGTTCTGAAACTGTGGTGGAAATATTGCCTGCCTTGACTACCTGTTCTTCTTGAGTCCATTTGCTGATCAGAACTCAGGTAACTTAAAAGTCATATACCCTGGAAAGGAGTAAAGAAACAGGAAAGATCCTCAGC-GGCTATACAAGTGAGAGATATGGCAGAGTTCTAATAAGATTGACTAAAAGCTTGATACTGTCTTACATCAAAGGAGCAAATAATTGTTCTACCTGGAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18660594 431 + 99152023 ---------GCTATTCTTTCTCCTCTCCTTTCTCTCTCTTGGGATACAGTTTAGGCTTTGAAAAAATATAGTATATATGCAGTGTTTGGTAAAATAATTTAGCACTATGGAAAAGGTTGTGAACCAGTCATAGTA-TTGAGGTTGTAAGAAGAAACCTTTGCAAAGGTAGTGGCTGCACAAATGTATTAACTTAGTAATACAAAGTAGGGAGTTCTGAAACTGTGGTGGAAATATTGCCTGCCTTGACTACCTGTTCT---TGAGTCCGTTTGCTGGTCAGAACTCAGGTTACTTAAAAGTCATATACCCTGGAAAGGAGTAAAGAAACAGGAAAGATCCTCAGT-GGCTATACAAGTGAGAGATACTGCAGAGTTCTAATAAGATTGAGTAAAAGCTTGATACTGTCTTACATCAAAGGAGCAAATAATTGTTCTACCTGGAAT i ponAbe2.chr15 M 415 C 0 s calJac3.chr10 87665899 436 - 132174527 GCTACCCATAGTATTTTTTCTCTCTCCTTCTCTCCCT-TTGGGATACAGTTT-GGCTTTAGAAAAATATGGTATATATGCAGTGTTTGGTCAAATAATTTAGTGTGACAGAAAAGGTTGTGTACCAGTCAAGGTATCTGGGATTGTAAGAAGAGGCA-TTGAAAAACTAGTGGCTGCACAAATGTATTAACGCAGTAACACAAGGTAGGGAGTTCTGAAACTGTGGTGGAAATATTGCCTGCCTTGACGACCTGTTCTTCTTGAGTCCATTTGCTGATCAGATCTCAGATTACATAAAAGTCATATATCCTGGAAAGGGGTATAGAAACAGGAAACATCCTCAGCAGGCTATGCAAGTGAGAGAT--GACAGAGTTCTGATAA----GACTAAAAAGTTGATATTTACTTATGTCAAAGGAGCAAATAATTGTTTTACCTGGGAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46790840 165 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=653693.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 330584 1070 + 478999 GTCCAGGCCCCAATTCACAAATGCATTCCTACCTTTTGAACTGAATAAT-GATCTCTTTCCCAATAAACTGTTATAAGACAAAAAATCTGAAAGG-AAAATTGTTGCACATACATCATATTCTTATATTCTGTATTTTCTGGGACAGTCTGTTTCAGATTAGATGATGAGTCCTAATTCAGGTTTGCAAAATATTATCAAGGCAAATCTTTATGGAGATTTTATTGAGATATTA--TTTTATAACAAAA-AATGG-GATAACTGTAATGTTCATCAAAAAAATTGGTGGTAGAAGGAAGGAAGGTGTTGGAGTGTTCAGTAACCTTACCCCAGAATGCCACAGTACAAATTCTGTGAGAAGTCATTCTTGTGTAGTAGAGGCATTCATTTTTCTCCTAATATCCCTTCTGAAAATTCCCT-----------TTTACTAGTCAGCTCTTAGCTTCTTGGAAAGAAGGCCCTTCGTCTAGGACAATGTTCATCTCCCCACATAAAAATTCACAATTCATGGCATGTTAGTTCAATAAAATATTATGCTTTCTAAGGAT-GATAATTATGAAAACTTGCTATAA-ATGGGAGCAAGTTCAACATTAAATCACATGAAACAGACATATTAACAAAAATAGA-----------------TACATTAGAGCAATTGAACTATAAATGCTTTTTTCCTTTAAAAATTTTCCTTCATGTTATTTTCACATTCTTTT-AGCAACAAATGACAATGAACTGCCATTG-----ATTTTATTTTTTGAACTTAAGCAGTGTATCTACAAGTACACCATTGCCCTGTCCAATTTTTAGGGGGAGATATTCTATTATCTAAAACTCAATAAA--TTGACCCATCACGTTTTTGGTGATACCTTATTTA-GGTAAAAATATTAGGCATTTAGAAGAATGCATTTGTGAATATTTTGACTGATATTACTATAGATGGAATTAGAATCTGCCCTTTAGGGGCTCAGAAGGAAGTAATGTTTGGATGTCATTAGGCTAGAAT-ATTTTATTGTCCCACAAAAATGTTGATAAATTGCTTATAAGGGCTTATTTATTAGAAATGACCATGTCACC-AAATAATAAAGCCAAATATG s panTro4.chrUn_GL393519 171768 1068 + 413329 GTCCAGACCCCAATTCACAAATGCATTCCTACCTTTTGAACTGAATAAT-GATCTCTTTCCCAATAAACTGTTACAAGACAGAAAATCTGAAAGG-AAAATTGTTGCACATACATCATATTCTTATATTCTGTATTTTCTGGGACAGTCTGTTTCAGATTAGATGATGAGTCCTAATTCAGGTTTGCAAAATATTATCAAGGCAAATCTTTATGGAGATTTTATTGAGATATTA--TTTTATAACAAAA-AATGG-GATAACTGCAATGTTCATCAAAAAAATTGGTTGTAGATGGAAGGAAGGTGTTGGAGTGTTCAGTAACCTTACCCCAGAATGCCACAGTACAAATTCTGTGAGAAGTCATTCTTGTGTAGTAGAGGCATTCATTTTTCTCCTAATATCCCTTCTGAAAATTCCCT-----------TTTACTAGTCAGCTCTTAGCTTCTTGGAAGGAAGGCCCTTCGTCTAGGACAATGTTCATCTCCCCACATAAAAATTCACAATTCATGGCATGTTAGTTCAATAAAATATTATGCTTTCCAAGAAT----AATTATGAAAACTTGCTATAA-ATGGGAGCAAGTTCAACATTAAATCACATGAAACAGACATATTAACAAAAATAGA-----------------TACATTAGAGCAATTGAACTATAAATGCTTTTTTCCTTTAAAAATTTTCCTTCATGTTATTTTCACATTTTTTTTAGCAACAAATGACAATGAACTGCCATTG-----ATTTTATTTTTTGAACTTAAGCAGTGTATCCACAAGTACACCATTGACCTGTCCAATTTTTAGGGGGAGATATTCTGTTATCTAAAACTCAATAAA--TTGACCCATCATGTTTTTGGTGATACCTTATTTA-GGTAAAAATATTAGGCATTTAGAAGAATGCATTTGTGAATATTTTGACTGATATTACTACAGATGGAATTAGAATCTGCCCTTTAGGGGCTCAGAAGAAAGTAATGTTTGGATGTCATTAGGCTAGAAT-ATTTTATTGTCCCACAAAAATGTTGATAAATTGCTTATAAGGGCTTATTTATTAGAAATGACCATGTCACC-AAATAATAAAGCCAAATATG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18661025 1075 + 99152023 GTACAGGCCCCCATTCACAAATGCATTCTTACCTTTTGAACTGAATAAT-GATCTCTTTCCCAATAAACTGTTCTAAGACAAAAAATCTGTAAGG-AAAATTGTTGCACACACATCATATTCTTATATTCTGTATTTTCTGGGACAGTCTGTTTTGGATTGGATGATGAGTCCTAATTTAGGTTTGCAAAATATTATCAAGGCAAATCTTTATGGAGATTTTATTGAGATATAA--TTTTATAACAAAA-AATGG-GATATCTGTGATATTCAACAAAAAGATTGGTGGTAGAAGGAAGGAAGATGTTGGAGTGTTCAGTAACCTTACCCCAGAATGCCGCAGTACAAATTCTGTGAGAAGTCATTCTTGTGTAGTAGAGGCATTCATTTTTCTCCTAATATCCCTTCTGAAAATTCCCT-----------TTTACTAGTCAGCTCTTAGCTTCTTGGAAGGAAGGCCCTTCCTCTAGGACAATGTTCATCTCACCACATAAAAATTCACAATTCACGGCATGTTAGTTCAAGAAAATATTATGCTTTCTATGAAT-GATAATTAT-AAAACTTGCTATAA-ATGGGAGTGAGTTCAACATTAAATCACATGAAACAGACATATTAACAAAAATAGA-----------------TACATTAGAGCAATTGAATTATAAATGCTTTTTTCCTTTAAAATTTTTCCTTCATGTTATTTTCACATTCTTTT-AGCAACAAATGACAATCAACTGCCATTGATTTTATTTTATTTTTTGAACTTAAATAGTGTATCCACAAATACACCATTGCTCTGTCCAATTTTTA-GGGGAGATATTCCATTATCTAAAACTCAATAAA--TTGACCCATCATGTTTTTGGTGATACCTTATTTAGGGTAAAAATATTAGGCATTTAGAACAATGCATTTCTGAATATTTTGACTGATATTATTATAGATGGAATTAGAATCTGCCCCTTAGGGGCTTAGAAGGAGGTAATATTTGGATGTCATTAGGCTAGAAT-ATTTTATTATCCTACAAAAATGTTGAAAAATTGCTTATAAGGGCTTATGTATTAGTAATGACCATGTCACCAAAATAATAAAGCCAAATATG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87666335 1060 - 132174527 GTCCAGGCCCAAATTCAT-AATGCATTCCTACCTTTTGAACTGAATAAC-TATCCCTTTCCCAAGAAACTGCTTTAAGTCAAAAAACCTAAAAGG-AAAATTGTTGTACACAGATAATATTCTTATATTCTGTATTTTCTGGGACAGTCTGTTTTGGATTAGATGATGAGTCCTAATTTAGGCTTGTGAAATATTATTAAGGAAAATCTTTATTAAGATTTT-----------A--TTTTATAAC-AAA-AATGG-GTTAACTGTAACGTTCAACAAAAAGATAGGTGGTCGAAGGAAGGAAGGTGTTGGAG---TCAGTAGCCTTACCCCACAATACCTCGGTACAAATTCTGTGGGAAGTCATTCTCGTGTAGTAGAGGCATTCATTTTTCTCCTAATATCCCTTTTGAAAATTCCCTTTCTTAAATCCTTTACTAGTCAGCTCTTAGCTTCTTGGAAGGAAGGCCCTTCATCTAGGACAATGTTCATCTGACCATATAAACATTCACAATTCATGGCAT----ATTCAAGCACATACTGTGCTTTCTAAAAAT-GATAATTATAAAAACTTGCAATAA-ATGGGAGGAAGTTCAAAGTTAAATCACATGAAACAGACATATAAACAAAAA---A-----------------TGCATTAGAGTAATTGAATTCTAAATGCTTTTTTCCTTTAAAATTTTTCATTCATGTTATTTTCACATTCTTTT-GTCAACAAATGACAATGAACTG-CATTGATTTTATTTTATTTTTTGAACTTAAGCATTATGTCCACAAGTACATTATTGCCCTCTCCAATTTTTAGGGGGAGATATTCTATTATCTAAAACCCAATAAATTTTGACCCATTATATTTTTGGCACTACCTTTTTTTAGGTAAAAATATTAGGCATTTAGAATAATGCATTTCAGAATATTTTGACCAATGTTACTATTCATGGAATTAGAATCTGCCTTTAAGGGGCTCAGAAGGAGGTAATATTTGGATGTCATTAGGGTAGAAT-ATTTTATTGTTCTACAAAAATGTTGATCAATTGCTTATAAGAGCTCGTTTATTGGTAAGGTCCATGTCACCAAAATAATAAAGCCA------ i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46791005 1054 - 64190966 GTCCATTTCAAAAATCACAAATGCAATCTTATCTTTTGAACTGAGTAATCCATTTCTCTCCCAGAAAACTGTTCTAAGATAAAAACCCCAGAGGGAAAAATTGATACATGCATATAGTAGTCTTATATCCTGGATTTTCCAGG---GGCAGTTTTAGATTAGATGATGAGTCCTAATACA-GTTTGCAAAACATCATCATGACAAATCTTTATGAAGATTTAACTGAGATATGAATTTTTACAATAAAAGAATGGAAATAACTGTACTATATAACAAAAGGATTGGTGATGTATGGAAGGAGGAT-------------------------CTGAATCCCTGAATAATAATTC--TAAGTGGTCATTATCGTGTAGTGGTGGCATTCATTTTTCTCC-AATTCCCCTTGTGGAAATTTCCTTTCCTACATCCTGCAAAAATCAGTTTCAAGCTATGTGGAAGGACAGTCCTCCTTTTAGGAAAATATTGATCTCACCACATAAAAATGTACAATCCAT-ACAT-TTAGTTGAATGGAATATTAAAGTTCCCAAAAAGCAATAATTATAAAAACTTGGTATAATACAGGAACAAGTTTGATGTTATATTAAATAAAACACACATGTAAATGAAAATGTAAAGTGTATTGATTGTATCACAGtaaagtgattgaattatggatgcttttcttccttaaaaattttccttactgttattttaatactgttgc-agcaacaaataacaaTTGATTGCCACTT-----ATT---TTTTTTGAACTTAAGTAATTTATTTCGAAGTAGATCATGTCCCT---CCATTTTTAGAAGGAAACATTCTATTATCTAAAACCCAATTAA--TTGACCAATTAAAGTTTTGGTGATCCTTT-------GTAAAAATATTA-ACACCCAGAATACCGTATTTCTGAATATTTTGATTGAT-----TGTTGTTAGAATTAGAATCTGCCCCTTAAGGAAAACAAACAACAT-ATGTCTGAATGTCATTAGGCCAGCATAACATTATAGTCCCATAGAAATTTTGGATAATCACTT-TAAGGGTTTATTTATCTGAGGTGACCAGATCACCAAAATAATACAGTCAAATAAG i canFam3.chr15 I 165 I 816 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=271193.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 331654 427 + 478999 ATAGGAATCACAATCAGAAAATATGTTTTTTCTTCTTTTATTTACAACCAACCA-------AACAAAATAACATAGATGTAATTTTGTCAATGTCAGAACAATAAATTTAAGTCAAATAGAACTTAAAGAATTTTTATTACAGATGAATCAGATGGAAACTATCCAGAAAACACCCAAATATGTACATTCCTCAGTTAATACTCAGTCTAGGTGCCAAAGGGAAGCCACACGCTTCCATT------TATCTATATAATTTGGCAACTTTAATTTGTAAGGGGCCCAACAGGTGTTTAATTTCATAGGCTGATATAGTCAATATCACTAGATCCATATTTTTTAGATTTAAATAACTATATAATTCTGATTTCTCTTTGTTAGACTGTACTGATCTGATCATGGAGGAATAATCTAATATGGCTTAGATTATGTTGGAACT s panTro4.chrUn_GL393519 172836 427 + 413329 ATAGGAATCACAATCAGAAAATATGTTTTTTCTTCTTTTATTTACAACCAACCA-------AACAAAATAACATAGCTGTAATTTTGTCAATGTCAGAACAATAAATTTAAGTCAAATAGAACTTAAAGAATTTTTATCACAGATGAATCAGATGGAAACTATCCAGAAAACACCCAAATATGTACATTTCTCAGTTAATACTCAGTCTAGGTGCCAAAGGGAAACCACACGCTTCCATT------TATCTATATAATGTGGCAACTTTAATTTGTAAGGGGCCCAACAGGTGTTTAATTTCATAGGCTGATATAGTCAATATCACTAGATCCATATTTTTTAGATTTAAATAACTATATAATTCTGATTTCTCTTTGTTAGACTGTACTGATCTGATCATGGAGGAATAATCTAATATGGCTTAGATTATGTTGGAACT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18662100 427 + 99152023 ATAAGAATCACAATCAGAAAATATATATTTTTTTCTTTTATTTACAACCAACCA-------AACAAAATGACATAGCTATAATTTTGTCAATCTCAGAACAATAAATTTAAGTCAAATAGAACATAAAGAATTTTTATCACAGATGAATCAGATGGAAACCATCCAGAAAACACCCAAATATGTGTATTCCTCAGTTAATACTCAGTCTAGGTGCCAAAGGGAAACCACACGCTTCCATT------TATCTATATAATTTGGCAACTTTAATTTGTAAGGGGCCCAACAGGTGTTTAATTTCATAGTCTGATATAGTCAATATCACTAGGTCCATATTGTTCAGATTTAAATAACTATATAATTCTGATTTCTCTTTGTTAGACTGTACAGATCTGATCATGGAGGAATAATCTAATATGCCTTAGATTATGTTGGAACT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87667395 420 - 132174527 -----AATCACAATCAGAAAATATAT-TTTTCTTTTTTTATTTACAACCTACCA-------AACAAAATAACATAGTTATAATTTTGTCAGTCTCAGAACTATAAATTTAAATCAAATAGAACATAAAGAATTTTTAT--CAGATGAATCAGATGAAAACTATCCAGAAAATACCCAAATATATATATTACTCAGTTAAT----AGTCTAGGTGCCAAAGGGAAACCAAATGCTTCCATTTATCTATATCTATATAATTTGGCAATTTTAATTTGAAAGGGGCCCAACAGATGTTTAATTTCATAGGCTGATATAGTCAATATTACTAGATCCATATT-TTTATATTTAATTAGCTATATAATTCTGATTTCTCTTTGTTAGACTATACTGACCTGATCATGGAGAAATAATCTAATATGCCTTAAATTATGTTGGAACT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46792875 408 - 64190966 aaaagaaCCACAAACAGAAAAA-----TTTTTTTCATTTATTTACAATGAAACAACTAAACAACAAAATGACA------TGATTTAACTGATCCCAGAACTGTTAAATTA--TCAAGTAGAACACAAA-AATTTTTATCACAGAAGAATCGTAT--AAACTACCCAGAAAACACCCAGATGTGTACATT-CTTAGTTCATGTACACTCTGAGTGTCAAACAAGAACCCAGTACTTCCATT------TAGTTATATAATCTGGCCACTTTACGATTATAGTGGCCCCATAGATGTTTAACTTCATAAACTG--ATAGTTAATATCACTAGACTTATATT-GGAAGATTTGTATAACTGTATAATCCTGATTGCTTTCTGTGAGACTATACTGACC------TGGAGCAATCACATAGTACATCTTGGGTCATGTAGCAACG i canFam3.chr15 I 816 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=589660.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 332081 607 + 478999 CCCCAGAACTTTCCTCAGGGCTGCCTTTATCTCCTTATTCTGGAGGCTATAGATAAGGGGATTGAAGAGTGGGGTCACCATAGCATAGAACAAAGTTTTGATTTTCTGCATCCCCATAGAGTGTCCAAGTCCTGGACTCACACACATGACCATAAGAGAGCCATAGAACAGTGATACCACAGCCAAATGAGACCCACAGGTAGAGAAGGCTTTATGTTTCCCAGTGCTCGAAGGCATACCCAACACAGCTTTCAGGACAAGAGTATAGGATCCAATAATAAAGAGGAAGTTACCAAAAATAACTAATGAGCTTAGAGTGTAGCAAAACAGTTGGATTCTTGGGGCAGAGACACAAGCCAATGCAAATAGTGGCCCTGGGTCACACACAACATGGTCATTAATGTTTGGACCACAGAAGGGCATCTGAGAGATGAGAACAGTGGGGATCAGGAAACACAGAAATCCACAAACCCAGCACAGTATGACCAGTTTGGCACAGAGATGCCCAGTCATGATTTATTAGGATAGTGCAAGGGATGGCAGATAACAAGGTACTGATCAAAGGCCATCACAGTCAAAATCAAGCATTCAGATGTACC-AAAGAGAA s panTro4.chrUn_GL393519 173263 606 + 413329 CCCCAGAACTTTCCTCAGGGCTGCCTTTATCTCCTTATTCTGGAGGCTATAGATAAGGGGATTGAAGAGTGGGGTCACCATAGCATAGAACAGAGTTTTGATTTTCTGCATCCCCGTAGAATGTCCGAGTCCTGGACTCACACACATGACCATAAGAGAGCCATAGAACAGTGATACCACAGCCAAATGAGACCCACAGGTAGAGAAGGCTTTATGTTTCCCAGTGCTCGAAGGCATACCCAACACAGCTTTCAGGACAAGAGTATAGGATCCGATAATAAAGAGGAAGTTACCAAAAATAACTAATGAGCTTAGAGTGTAGCAAAACAGTTGGATTCTTGGGGCAGAGACACAAGCCAATGCAAATAGTGGCCCTGGGTCACACACAACATGGTCGTTAATGTTTGGACCACAGAAGGGCATCTGAGAGATGAGAACAGTGGGGATCAGGAAACACAGAAATCCACAAACCCAGCACAGTATGACCAGTTTGGCACAGAGATGCCCAGTCATGAT--ATTAGGATAGTGCAAGGGATGGCAGATAACAAGGTACTGATCAAAGGCCATCACAGTCAAAATCAAGCATTCAGATGTACCCAAAGAGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18662527 603 + 99152023 CCCCAGAACTTTCTTCAGGGCTGCCTTTAT---CTTATTGTGGAGGCTATAGATAAGGGGATTGAAGAGTGGGCTCACCACAGCATAGAACAAAGTTTCGATTTTCTGCATCCCCGTAGAATGTCCGAGTCCTGGGCTCACATACATGACCATAAGAGAGTCATAGAACAGTGATACCGCAGCCAAGTGAGACCCACAGGTAGAGAAGGCGTTGTGTCTCCCAGTGCTTGAAGGCATGCCTAACACAGCTTTCAGGAGAAGAGTATAGGATCCAATAATAAAGAGGAAGTTACCAAAAATAACTAATGAGCTTAGAGTGTAGCAAAACAGTTGGATTCTTGGGGCAGAGACACAAGCCAATGCAAGTAGTGGCCCTGGGTCACACACAACATGGTCAATACTGTTTGGACGACAGAAGGGCATCTGAGAGATGAGGACAATGGGGATCAGGAACCACAGAAATCCACAAACCCAGCACAGTATGACCAATTTGGCACACAGATGCCCAGTCATGAT--ATTAGGATAGTGCAAGGGACGGCAGATAGCAAGGTACCGATCAAAGGCCATCACAGTCAAAAGCAAGCATTCAGATGTACCCAAAGAGAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88125908 606 - 171882078 CCCCAGGACTCTCTTTAGAGCATCTTTCATGTCTTTGTTTCGAAGACTGTAGATAAGGGGATTTAAGAGTGGAGTCATTGCTGAGTATACCAGAGTGATGATCTTCTGCATTGCTGCTGGGTTCCCTGATGTTGGGCTCACATACATCACCATAAGGGTTCCATAGAATAGACACACCACCATTAGGTGGGACCCACATGTGGAGAAAGCTTTAGTTCGACCAGCACCAGAGGAAATACGAAGCACAGCTCTGATGACCAGAGTGTAAGATCCCAGGATGGAGAAGAAGGGCCCAAAGATAATCATCGAGCTGAAGGTGTAACAGATAAGCTCAGTGGAAGGAGCAGAGATGCAGGCCAGTGCAAACAATGGGCCTGGGTCACACACAAAGTGGTCAATGATGTTAGGCCCACAGAAGGGAAGCTGGGAGATAAGAACAATAGGGACTGGATAGCAGAGAAATCCACCTACCCAACATACACAGACCAGAATTACACAGAACTTCCCAGTCATGAT--GGAGGGGTAGTGTAATGGACGACAGATGGCCAGGTACCGATCACAAGCCATAAGTGATAAGAAGAAACACTCTGTTGTACCCAGTGAAAA i macFas5.chr7 N 0 C 0 s calJac3.chr10 87667815 603 - 132174527 CCCCAGAACTTTCCTCAGGGCTGCCTTTATCTCTTTATTCTGGAGGCTATAGATGAGGGGATTGAAGAGTGGGGTCACCATAGCATAGAAAAAAGTTCTAATTTTCAGCATCCCCATAGAATGTCCGAGTCCTGGGCTCACATACATGACCATAAGAGAGCAATAGAACAGTGATCCCACAGCCAAATGAGACCCACA-GTAGGGAAGGCCTTGTGCTTCCTAGTGCTTGAAGGCATACCCAACACAAGTATCATGACAAGAGTGTGGGATCCGATAATAAAGAGGAAGTTACCTAAAATAACTAAGGAGCTGACAGTGTTGTAAAACAGTTGGGTTTTGGGGGCAGAGGCACATGCCAATGCAAATACTGGCCCTGGGTCACACACAACATAGTCAGTAATGTTTGGACCACAGAAGGGCATCTGAGAGATGAGAACAGTGGGGATCAGGAACCACAGAAATCCACAAACCCAGCACATTTTGGCCAGTTTGGCACAGAGATACCCATTTATGAT--TTTAGGATAGTGAGAGGAATGGTAGATAGCAAGGTACCAGTCAAAGGCCATCACAGTCAAAGT-GAGCACTCAGATGTACTCAA-GAGAA i calJac3.chr10 C 0 I 5351 s canFam3.chr15 46793283 606 - 64190966 CCCCAGAACTTTCCTCAGGGCTGCCTTTATCTCCTTATTCCGGAGGCTATAGATGAGCGGGTTGAAGAGTGGAGTTACCATAGCATAGAACAAAGTTGCAACTTTCTGTATACCTGCAGAATGCCCAAGTCCTGGGCTCACATACATGATCATCAGAGAGCCATAGAATAGTGATACCACAGCCAAATGAGAACCACAGGTAGAGAAGGCCTTATGTCTCCCGAGGGTTGAAGGCATGTGCAACACAGCTAACAGGACAAGTGTATAGGACCCAAGGATGAAAAGGAAGTTACCAAAGATAACTAATGAGCTTAGACTATAGCAAAGCTGTTGGATTGTTGGGGCAGATGCACATGCCAATGCAAACAGTGGCCCTGGGTCACACACAACATGGTCAATAATGTTTGGACCACAGAAGGGCATCTGAGAGATGAATGCAATGGGGATCAGGAACAACAGAAAACCACAAACCCAGCAGATAATGACCAGTTTGGTAGATAAATACCTAGTCATGAT--ATTAGGGTAGTGCAAGGGACGGCAGATAGCAAGGTACCGATCAAAGGCCATGATGGCCAAGAGCAAACATTCAGAAGTTCCCAAAGAGAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=279419.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 332688 292 + 478999 GAAGAAATAAAATTGGAGAAAACATCCAGCAAAGGAGATGGTTTTTTTCTCTGAAAGGAAGTTGACCAACATCTTGGGAACTGTAGAAGAGACATACCATATCTCTAAAAAGGAGAAATTTCCCAGGAACATGTACATGGGAGTGTGACGTCGCCGGTCACACCACAGGGCGCAAGCAATGGCTCCGTTTCCTGTTATGGTCAGTGCATATGTTGTAGTGAAGAGTGAGAAGAGGAAGATCTGAATTGTCCACTCAAAAGATAAATCTTGGAGTATAAATTCATTTACTAAA s panTro4.chrUn_GL393519 173869 292 + 413329 GAAGAAATAAAATTGGAGAAAACATCCAGCAAAGGAGATGGTTTTTTTCTCTGAAAGGAAGTTGACCAACATCTTGGGAACTGTAGAAGAGACATACCATATCTCTAAAAAGGAGAAATTTCCCAGGAACATGTACATGGGAGTGTGAAGTCACCAGCCACACCACAGGGTGCAAGCAATGGCTCCATTTCCTGTTATGGTCAGTGCATATGTTGTAGTGAAGAGTGAGAAGAGGAAGATCTGAATTGTCCACTCACAAGATAAATCTTGGAGTATAAATTCATTTACAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18663130 291 + 99152023 GAAGAAAT-AAATTGGAGAAAACATCCAGCAAAGGAGATGGTTTTTTTCTCTGAAAGGAAGTTGACCGACATCTTGGGAACTGTAGAAGAGACATACCATATCTCTAAAAAGGAGAAATTTCCCAGGAACATGTGCATGGGAGTGTGAAGTCGCCAGTCACACCACAGGGACCAAGCAATGGCTCCATTCCCTGTTATGGTCAGTGCATATGTTGTAGTGAAGAGTGAGAAGAGGAAGATCTGAATTGTCCACTCACAAGAGAAACCTTGGAGTATACATTCATTTACAAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88126514 292 - 171882078 AAAGAAATAGAATTGCAGGAAGCAGCCAGAGAAGGAGATGGTTTTAGTCTCTGAGAGGATATTGACTAGCATGTTTGGGACAGTGGAGGAAGTGTACCAGATCTCTAGAAAGGCAAAGTTTCCCAAAAGGATGTACATGGGTGTGTGGAGCCGCCTGTCCCATTTCACTGCACAGACAATAGCTCCATTCCCTAGCAGTGTCATGAGATAGAGAACAAGGATGAATGAGAAGAAGCAGCTCTGCATCTCTCTTTGACCATGGAAACCCAGGAGGACAAACTCAGTCACAAAA i macFas5.chr7 C 0 N 0 s calJac3.chr10 87673769 286 - 132174527 AAAGAAAAAGAACTAGAGAAAATATCCAGTAAAGGAGATGGGTTTTTTCTCTGAAAGGAAGTTGACCAACATCTTGGGAACTGTAGAAGAGACATACCATATCTCTAAAAAGGAAAAATTTCCCAGGA------ACATAGGATTGTGAAGTTGCTAGTCACACCACAGGGCACAAGCAATGGCTCTATTTGTTGTTATGGTCAGTGCATATGTTGTAATGAAGAGTCAGAAGAGGAAGATTTGAATTGTCCACTCACAAGAGAAAACTTTGACTATAAATTCATTTACAAAA i calJac3.chr10 I 5351 C 0 s canFam3.chr15 46793889 292 - 64190966 AAAGAAATAAAATTGGACGAAACATCCAGTAAAGGAGATGGTCTTTTTTTCTGAGAGGAAATTGGCCAACATATTGGGGACTGTAGAAGAGACATACCAGATCTCTAGAAAGGAGAAATTCCCCAGGAACATGTACATGGGGCTATGGAGTCTCCCTTCACACCAAATAGCACAAACAATGGCCCCATTCCCTGTTACCGTCAAAGTATACGTTGTAGTGAAGAGTGAGAAGAGGAGGATCTGAATCTTCCACTCACAAGAGAAACCTAGGAGTATAAATTCTCTTACAGAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=179899.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 332980 291 + 478999 GCAAAGCTGGAATTTGGCTCAGAGACATTCATTGGGCCAGTGACCTGCAAGGTCAAGAGACACATTATCAGTCAGGACTCTTTTACAAAATGAGTTCCTTTTTTAAGAATGAAGAGAAGACAATGAACATGAAGTCATTTTTCAAAAGAATAA----TTAGGAAGAGAATATAGTTTACTTTTTCTTGGCTATACAGTATATGAGTTTTGGGCTTAGTAGGTAGCTGATTGAACAAAAA----CTTCTGCCAGCTTCTAAATCTCTCCTTAAT--ATGCAATCGTGATAGAACTAGGTAAA----- s panTro4.chrUn_GL393519 174161 287 + 413329 GCAAAGCTGGAATTTGGCTCAGAGACATTCATTGGGCCAGTGACCTGCAAGGTCAAGAGACACATTATCAGTCAGGAATCTTTTACAAAATGAATTCCTTTTCTAAGAATGAAGAGAAGACAATGAACATGAAGTCATTTTTCAAAAGAATAA----TTAGGAAAAGAATGTAGTTTACTTTTTCTTGGCTATACAGTATATGAGTTTTGGGCTT----GGTAGCTGATTGAACAAAAA----CTTCTGCCAGCTTCTAAATCTCTCGTTAAT--ATGCAATCGTGATAGAACTAGGTAAA----- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18663421 295 + 99152023 GCAAAGCTGGAATTTGGCTCAGAGACATTCATTGGGCCAGAGACCTGCAAGGTCGAGAGACACATTATCCATCAGGACTCTTTCACAAAATGAGTTCCTTTTTTAAGAATGAAGAGAAGACAATGAACATGAAGTCATTTTTCAAAAGAATAA----TTAGGAAGAGAACATAGTTTACTTTTTCTTGGCTATACAGTATATGAGTTTTGGGCTTAGTAGGTAGCTGATTGAACAAAAACAATCTTCCGCCAGCTTCTAAGTCTCTCCTTAAT--ATGCAATCATGATAGAACTAGGTAAA----- i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87674055 292 - 132174527 GCAAAGCTGGAAATGGGCTTAGAGACATTCATTCAATCAGTGACCTGGAAGGTCAAGAGATGCATTATCAGTCAGGACTCTTTTACAAAATGTGTTTCTATTTTAAGAATGAAG---AGGCAATGAACACGAAGTCATTTTTCAAAAGAATAA----TTAGGAAGATAATGTAGTTTACTTTTTCTTGGCTATATGGTATATGAGTTTTGGGCATAGTAGGTAGCTGATTGAACAAAAACAAACTTCTGCCAGCTCCTAAATCTCTCCTTAAT--ATGCAATCATACTAGAATGAGGCAAT----- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46794181 277 - 64190966 GCGAAGCTGGAATATGGCTCAGAGACATTCACTGGGTCAGTCATCTGCAAGGGCAAGAGACATACTGTTA-TCAGGACTAGTTT--CAAATGTGCTCCTTTTTC-AGAAAGAAGAGAAGACAATGAGCATGGCATCAGTTTTCAAAAGAATCATGGGTTAGGAAGAGAACA-AGTCTACTTGTTCTTGGTTATGTG--CTCTGAGTTTTGGGCAGAGT-AGTAGCGG---------------------GCCTGCTTCTGAATCTCTTCTTCATTAATGCTCCCATGACAGAACTAGGGGAGTTAAA i canFam3.chr15 C 0 I 214 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=261729.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 333271 396 + 478999 GTTAAATTCCTTTTGTAAGG-TCATTATTTTGGGACAGAAATGATTTAATATAGTTTCTGGATAGCATACAACCCAAAGTTAGTACTTTGAGAAGGCACAAATGTGTTAGTTTCTTACTGCAAACCCAACTTATAGTGCAATAGACTCAGCAAGGAAAGTTTTGAC----CATTTACATTTCAGCTAAACATATTACTTAAC--ATTATTTACATATGCAAAAGAAATGCAC-ATATTTTAAAATAAATTGGTAGCTATCACGTTAAAGCCATTATCTCTGAATTTCTATTGCTGCTGTTGTTAGCTTAAG-------------TGATTATCTAATGTTGCTTACCAATATTGACTTTTAATATTAATATTGTAAAGCTGCATTGTTTTCTGTAGAAAGGGAAGGCTTTAAGTTTCT s panTro4.chrUn_GL393519 174448 396 + 413329 GTTAAATTCCTTTTGTAAGG-TCATTATTTCGGGACAGAAATGATTTAATATAGTTTCTGGATAGCATACAACCCAAAGTTAGTACTTTGAGAGGGCACAAATGTGTTAGTTTCTTACTGCAAACCCAACTTACAGTGCAATAGACTCAGCAAGGAAAGTTTTGAC----CATTTACATTTCAGCTAAACATATTACTTAAC--ATTATTTACATATGCAAAAGAAATGCAC-ATATTTTAAAATAAATTGGTAGCTATCACGTTAAAGCCATTATCTCTGAATTTCTATTGCTGCTGCTGTTAGCTTAAG-------------TGATTATCTAATGTTGCTTACCAATATTGACTTTTAATATTAATATTGTAAAGCTGCAATGTTTTCTGTAGAAAGGGAAGGCTTTAAGTTCCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18663716 396 + 99152023 GTTAAATTCCCTTTGTAAGG-TCATTATTTTGGGACAGAAATGATTTAATATAGTTTCTGGACAGCATACAACTCAAAGTTAGTACTTTGAGAAGACACAAATGTGTTAGTTTTTTACTGCAAACCCAACTTATAGTGCAATAGACTCAGTAAAGAAAGTTTTGAC----CATTTACATTTCAGCTAAACATATTACTTAAC--ATTAATTACATATGCAAAGGAAATGTAC-ATATTTTAAAATAAATTGGTAGCAATCACGTTAAAGCCATTATCTCTGAATTTTTATTGCTGCTGTTGTTAGCTTAAG-------------TGATTATCTAATGTTACTTACCAATATCGACTTTTAATATTAATATTGTAAAGCTGCAATGTTTTCTGTAGAAAGCAAAGGCTTTAAGTTTCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87674347 396 - 132174527 GTTAAACCCCTTTTGTCAGC-TCATTATTTTGGGACAGAAATGATTTATGATAGTTTCTGGATAGCATATGACTCAAAGTTAGTACTTTGAGAAGGCACAAATGTGTTAGCTTCTTATTGCAAACCCAGCTTATAGTGCAATAGACTCAGTAAAGAAAGTTTTGAC----CATTTACATTTCAGCTAAACATATTACTTAAC--ATTATTTACATATGCAAAAGAAATGCAC-ATATTTTAAAATAAATTGGTAGTAATCACAGTAAAGCGATTATCTCTGAGTTTCTATTGCTGCTATTGTTAGCTTAAG-------------TTATTGTCTAATGTTACTTACCAATATTGACTTTTAATGTTAATATTGTAATGCTGCAATGTCTTCTGTAGAAAGCAAAGGCTTTAAGTTTTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46794672 394 - 64190966 GTTAAACTCATTTTGTAAAGTTTGTTATTTTTGAGCAGGGATGAGGTATGATAGTTTATGGATAGCACATAACACAAAGTTAACACTTAG--------TACATGTATTAGTTTCTTATTCTAAACCCA--TCGTAGGGCAATAGATACAGAAAAGAAGGCTTTAATTCTACTCTTATATATCAGTTAAATATATTGCTTAACATATCAGTTATGTATGAAAAATAAATGGACAATATTGTAGAGCAAGTTGGCAGTAAT----TTTAAGCCAATATCTCTCA-TTTCTATTCCTGTTGCTGTTAGCTTAAGCATCATAAAAATATGATACCATAATGTTACTTACCAGTGCTGACTT------TTAATATTTCAGTGTTGCAGTGTCTTCTGTTGGAAGCAGTGAC--TAAGTTTCC i canFam3.chr15 I 214 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85351141 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 87951560 732 - 170124641 I a score=168445.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 333667 100 + 478999 GATTAATCTTTTACCTT---AATTTCATAAACTGATA------CA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATACAGTATTGATTTAGTC------ATTATGTA-----------CAAAAGTTTGCAA s panTro4.chrUn_GL393519 174844 100 + 413329 GATTAATCTTTTACCTT---AATTTCATAAACTGATA------TA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATATAATATTGATTTAGTC------ATTATGTA-----------CAAAAGTTTGCAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18664112 100 + 99152023 GATTAATCTTTTACCTT---AATTTCAGAAACTGATA------TA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATATTATATTGATTTAGTC------ATTATGTA-----------CAGAAGTTTGCAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87952292 99 - 170124641 gaTTAATCTTTTACCTT---AATTTCATAAACTGATA------TA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATATCATATTGA-TCAGTC------ATTACGTA-----------CAAAAGTGTGCAA i rheMac3.chr7 I 732 C 0 s macFas5.chr7 88229840 100 - 171882078 gaTTAATCTTTTACCTT---AATTTCACAAACTGATA------TA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATATCATATTGATTCAGTC------ATTATGTA-----------CAAAAGTGTGCAA i macFas5.chr7 N 0 C 0 s papAnu2.chr7 85351141 100 - 162156779 gattAATCTTTTACCTT---AATTTCATAAACTGATA------TA-GTGATTATTATATTG-----------------ATAAAAT----CAATATCATATTGATTCAGTC------ATTATGTA-----------CAAAAGTGTGCAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87674743 95 - 132174527 GATTAATCTTTCACCTT---AATTTCATAAACTGATA------TA-GTGAT-----TATTG-----------------GTAAAAT----CAATATCATATTGATTTCGTC------ATTATGTA-----------CAAAAGTTTGCAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46795066 148 - 64190966 ACCTAATCTTTCACCTGTAAAAGTTTGCAAAGTAATAACTAGGTATGGGACTTTTATTTTTTGAAGCTATTTTCCCCCATAAAATTTGGCAATGATTTTTTTATATGCTTGtttaaattatatattgttttaaattaaaaatttGCAA i canFam3.chr15 C 0 I 167 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=125585.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 333767 70 + 478999 AGATCTAGACATTAAACTTTATTTTTGAAGGTATTTCATAAAATTTGGAGATTGATTTTCCTTATATGCT s panTro4.chrUn_GL393519 174944 70 + 413329 AGATCTAGACATTAAACTTTATTTTTGAAGGTATTTCATAAAATTTGGAGATTGATTTTCCTTATATGCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18664212 70 + 99152023 AGATCTAGACATTAAACTTTATTTTTGAAGGTATTTCATAAAATTTTGAGATTGATTTTCCTTATATGCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87952391 70 - 170124641 AGATCTAGACATTAAACTTTATTTTTGAAGGTATTTCATAAAATTTTGAGATTGATTTTCCTTATATGCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88229940 70 - 171882078 AGATCTAGACATTAAACTTTATTTTTGAAGGTATTTCATAAAATTTTGAGATTGATTTTCCTTATATGCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85351241 70 - 162156779 AGATCTAGacattaaactttatttttgaaggtatttcataaaattttgagATTGATTTTCCTTATATGct i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87674838 70 - 132174527 AGATCTAGACATTAAACTATTTTTTGAAGTTTTTTTCATAAAATTTTGAGATTGATTTTCCTTATATGCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46795214 167 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=117387.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 333837 65 + 478999 TTTTATAAAATTGAAAAATTTTACTAAATGACAGAAATTAAACACTTTTTTT---TGTTATAGGTAAA---- s panTro4.chrUn_GL393519 175014 65 + 413329 TTTTGTAAAATTGAAAAATTTTACTAAATGACAGAAATCAAACACTTTTTTT---TGTTATAGGTAAA---- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18664282 65 + 99152023 TTTTGTAAAATGGAAAATTTTTACCAAATGACAGAAATCAAACACTTCATTT---TGTTATAGGTAAA---- i ponAbe2.chr15 C 0 I 4 s rheMac3.chr7 87952461 64 - 170124641 TTTTGTAAAACTGAAAATTTTTACTAAATGACAGAAATCAAGCAC-TTTTTT---TGTTGTAGGTAAA---- i rheMac3.chr7 C 0 I 4 s macFas5.chr7 88230010 64 - 171882078 TTTTGTAAAACTGAAAATTTTTACTAAATGACAGAAATCAAGCAC-TTTTTT---TGTTGTAGGTAAA---- i macFas5.chr7 C 0 I 4 s papAnu2.chr7 85351311 65 - 162156779 ttttgtaaaactgaaaatttttacTAAATGACAgaaatcaaatacttttttt---tgttgtaggTAAA---- i papAnu2.chr7 C 0 I 4 s calJac3.chr10 87674908 64 - 132174527 TTTTGTAAAATTTAAAATTTCTAGTAAATGACAGAAATTAAACAC-TTTTAT---TGTTATAGGTAAA---- i calJac3.chr10 C 0 I 6477 s canFam3.chr15 46795381 72 - 64190966 ttttaaaaaTTAAAAAAATTGCAGCAGAAGACAGAAGTCAAATACTTTTTTTTAGTGTTATAAGTAAATGTA i canFam3.chr15 I 167 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1352025.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 333902 726 + 478999 CTTCCTCCTACATTC-TTCT-AAAAATGTATTTAGGGATTTGAGTTACCTGAAAAAA---CTTTTTTTTCCTCAGA--AATATGGAGGGATGTGAGTTCTAGATGTCAAGAGGGCTTGCATTTTGAGAAGAAACAC-AAATTTTCAGAAG---TTTTTCTTCCAATTTGATCTCTACACCAGTGCTCTAGGAATTCTTTTGGTATGACTAGTTAGAAGTTATGTTTGTGCCTCTTTTAGTAATAGATGCC-TCTT--TAATTGGCTTCCAACCAGAAACATTAATAAACCAACATTAGGAAATTATGG-----------------------------------------------------------------AAACGGATTGACATGGGAGTGTCATGATTCTCAGCAGTGCTCAAAAGGTGAAGCCATCATCGTTTTGACATGAACCAAATCTCTAAATGATTTATTTTATAAACCATA---TTCTGCCTCCAGCTAGAC----AGTTTTATTGTGGCCCCAAAATTAAAAATGCACTTTATAAAACTCACTTTCTCCTGGGATGTAGCTTCTATAGCATTAGGAAAGTTATCTTCCAAGCCAATGAATCTTTAAAAAGTTAATGATTAGATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACAACTATTCTAAGACATCATTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACGGATTCCAAAAAATCTTCCAGAAGACACAGTCTGAGGAGAAATAAGATACAAA--ATGTTACCAAAAGTTCTGACATAATGTTTAGGAACATTTCAAGTGTTA s panTro4.chrUn_GL393519 175079 723 + 413329 CTTCTTTCTGCATTC-TTAT-AAAAATATATT-AGGGATTAGAGTTACCTGAAAAAA---CTTTTTTTCCCTCAGA--AATATGGAGGGATGTGAGTTCTAGATGTCAAGAGGGCTTGCATTTTGAGAAGAAACAC-AAATTTTCAGAAG---TTTTTCTTCCAATTTGATCTCTACACCAGTGCTCTGGGAAGTCTTTTGGTATGACTAGTTAGAAGTTATGTTTGTGCCTCTTTTAGTAATAGATGCC-TCTT--TAATAGGCTTCCAACCAGAAACATTAATAAACCAACATTAGGAAATTATGG-----------------------------------------------------------------AAACGGATTGACATGGGAGTGTCATGATTCTCAGCAGTGCTCAAAAGGTGAAGCCATCATCGTTTTGACATGAACCAAATCTCTAAATGATGTATTTTATAAACCATA---TTCTGCCTCCAGCTAGAC----AGTTTTATTGTGGCCCCAAAATTAAAAATGCGCTTTATAAAACTCACTTTCTCCTGGGATGTAGCCTCTATAGCATTAGGAAAGTTATCTTCCAAGCCAATGAATCTTTAAAAAGTTAATGATTACATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACAACTGTTCTAAGACATCATTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACGGATTCCAAAAAATCTTCTGGAAGACACAATCTGAGGAGAAATAAGATACAAA--ATGTTACCAAAAGTTCTAACA--ATGTTTAGGAACATTTCAAGTGTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18664351 725 + 99152023 CTTCCTCCTACACTCTTTAT-AAAAATATATT-AGGGATTTGAGTTACCTGAAAAAAAACTTTTCTTTTCCTCAGA--AATATGGAGGGATGTGAGTCCTAGATGTCAAGAGG----ACATTTTGAGCAGAAACAC-AAATTTTCAAAAG---TTTTTCTTCCAACTTGCTCTCTACACCAGTGCTCTGGGAAGTCTTTTGGTATGACTAGTGAGAACTTATGTTTGTGCTTCTTTTAGTAATATATGTC-TCTT--TAATAGGCTTCCAACCAGAATCATT----AACCAACATTAAGAAATTATGGAATGA------------------------------------------------------------AAAGGGATTGACACATGAGTGTCATGATTCTCAGCAGTGCTCAAAATGTGAAGCCATCATCGTTTTGACATGAACCAAATCTCTAAATGATTTATTTTATAAACCATA---TTCTGCCTCCAGCTAGAT--AGAGTTTTATTGTAGCCCCAAAATTAAAAATGCATTTTATAAAACTCACATTCTCCTGGGATGTAGCCTCTGTAGCATTAGGAAAGTTATCTTCCAAG---ATGAGTCTTTAAAAAGTTAATGATTACATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGACTAATGACAACTATTCTAAGGCATCATTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACAGATTCCAAAAAATCTTCTGGAAGACACAGTCTAAGGAGAAATAAGACACAAA--ATGTTACCAAAAGTTCTGACATAATGTTTAGGAACATTTCAAGTGTTA i ponAbe2.chr15 I 4 C 0 s rheMac3.chr7 87952529 725 - 170124641 CTTCCTCCTACCTTA-TTAT-AAAAATGCTTT-AGGGATTTGAGTTACCTGAGAAAAA--CTTTTTTTTCCTCAGA--AATATGGAGGGATGTGAGTCCTAGATGTCAAGAGGGCTTACATTTTGAGCAGAAACAC-AAATTTTCAAAAG---TTTTTCTTTCAACTTGCTCTCTATACCAGTGTTCTGGGAAGTCTTTTGGTATGACTAGCTAGAAGCTATGTTTGTGCTTCTTTTAGTAATATATGTC-TCTT--TAATAGGCTTCCAACCAGAATCATTAATAAACCAACATTGAGAAATTATGGAAAGA------------------------------------------------------------AAAGGGATTGACACAGGAGTGTCATGATTCTTAGCAGTGCTCAAAAGGTGAAGCCATC---------ACATGAACCAAATCTCTAAATAATTTATTTTATAAACCATA---TTCTGCCTCCAGCTGGAC--AGAGTTTTACTGTGGCCCCAAAATTAAAAATGCACTTTATAAAACTCACATTCTCCTGGGATGTAGCCTCTATAGCATTAGGAAGGTTATCTTTCAAGCCAATGAATCTTT-AAAAGTTAATGATTACATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACAACTATTCTAAGGCATCGTTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACAGATTCCAAAAAATCTTCTGGAAGACACAGTCTAAGGAGAAATAAGATACAAAATATGTCATCCAAAGTTCTGACATAATGTTTAGGAACAATTTAGGTGTTA i rheMac3.chr7 I 4 C 0 s macFas5.chr7 88230078 725 - 171882078 CTTCCTCCTACCTTA-TTAT-AAAAATGCTTT-AGGGATTTGAGTTACCTGAGAAAAA--CTTTTTTTTCCTCAGA--AATATGGAGGGATGTGAGTCCTAGATGTCAAGAGGGCTTACATTTTGAGCAGAAACAC-AAATTTTCAAAAG---TTTTTCTTTCAACTTGCTCTCTATACCAGTGTTCTGGGAAGTCTTTTGGTATGACTAGCTAGAAGCTATGTTTGTGCTTCTTTTAGTAATATATGTC-TCTT--TAATAGGCTTCCAACCAGAATCATTAATAAACCAACATTGAGAAATTATGGAAAGA------------------------------------------------------------AAAGGGATTGACACAGGAGTGTCATGATTCTTAGCAGTGCTCAAAAGGTGAAGCCATC---------ACATGAACCAAATCTCTAAATAATTTATTTTATAAACCATA---TTCTGCCTCCAGCTGGAC--AGAGTTTTACTGTGGCCCCAAAATTAAAAATGCACTTTATAAAACTCACATTCTCCTGGGATGTAGCCTCTATAGCATTAGGAAGGTTATCTTTCAAGCCAATGAATCTTT-AAAAGTTAATGATTACATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACAACTATTCTAAGGCATCATTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACAGATTCCAAAAAATCTTCTGGAAGACACAGTCTAAGGAGAAATAAGATACAAAATATGTCACCCAAAGTTCTGACATAATGTTTAGGAACAATTTAGGTGTTA i macFas5.chr7 I 4 C 0 s papAnu2.chr7 85351380 725 - 162156779 CTTCCTCCTACCtta-ttat-aaaaatgcttt-aGGGATTTGAGTTATctgagaaaaa--cttttttttcctcaga--aatatGGAGGGATGTGAGTCCTAGATGTCAAGAGGGCTTACATTTTGAGCAGAAAcac-aaattttcaaaag---tttttcttTCAACTTGCTCTCTATACCAGTGCTCTGGGAAGTCTTTTGGTATGACTATCTAGAAGCTATGTTTGTGCTTCTTTTAGTAATATATGTC-TCTT--TAATAGGCTTCCAACCAGAATCATTAATAAACCAACATTGAGAAATTATGGAATGA------------------------------------------------------------AAAGGGATTGACACAGGAGTGTCATGATTCTTAGCAGTGCTCAAAAGGTGGAGCCATC---------ACATGAACCAAAtctctaaataatttattttataaaccatA---TTCTGTCTCCAGCTGGAC--AGAGTTTTACTGTGGccccaaaattaaaaatgcactTTATAAAACTCACATTCTCCTGGGATGTAGCCTCTATAGCATTAGGAAGGTTACCTTTCAAGCCAATGAATCTTT-AAAAGTTAATGATTGCATATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACATCTATTCTAAGGCATCATTATTTACAAAG--AGCTTGCCCACCAGACAGATTCCAAAAAATCTTCTGGAAGCCACACTCTGAGGAGAAATAAGATACAAAATATGCCACCCAAAGTTCTGACATAATGTTTAGGAACAATTTAGGTGTTA i papAnu2.chr7 I 4 C 0 s calJac3.chr10 87681449 732 - 132174527 ctccctcCTACATTC-TTAT-AAAAATATATT-AGGGATTTAAGTTACCTGAAAAAAA--ACTTTTTTTTCTCAGA--AATATGGAGGGATATGAATCCTGGAAGTCATGAGGGCTTTTGTTTTGAACACAAACAC--AATTTTCAAAAG---TTTTGCTTCCAATTTACTCTCTACACCAGTGCTCTGGAAAGTC-TGGAGCATGACTAGTTAGAAGCTATGTTTGTGCTTCTTTTAGTAATATGTGAC-TCTTTATAATAGGCTTACAACCAGAATCATTAATAAACCAACATTAAGAAATTATGGAATGA------------------------------------------------------------AAAGGGATTGGCACAGGAGTGTCATGATTCTTGGCAGTGTTCAAAAGGTAAAACCGTCATTGTTTTGACATGAACCAAATCTCTAAATGATTTATTTTATAAACTATA---TTCTGCCTCCAGCTAGAC--AGAGTTTTACTGTGGCCCCAAAATTAAAAAGGAAATTTAAAAAATGCATGTTCTCCTGGGATGTAGCCTCTACAGCATTAGAAAAGTTACCTTCCAAGCCAATGAATCTTTAAAAATTTAATGATTACACATTCTCTGAAGAATCAGTAAAGAGTAATGACAATTTTTCCAAGACATCATTAATTACAAAG--AGCTTGCCTACCAGATGGGTTCCAAAAAA-CTCCTGGAAGACACAGTCTGAGGAGAAATAAAATACAAA--ATGTCACCAAAATTTCTGACATAATGTTTAGGAACATTTCAAGTGTTA i calJac3.chr10 I 6477 C 0 s canFam3.chr15 46795453 776 - 64190966 CTTCATCCCACATTC-TAATGGAAAAGGTGCC-AGGGATCTGAGTTCCCTGAATA-----TTTTTGCCATTTTGGGACAAGATGCAGGGATGTGAATTCTGAAAATTGTGAGGGCTTACATTTGGGGCACAAACACAAAATTTTCAAAAGCAATTTTACTTCCAACCTATTGTTTACCCCAGTGCTTGGAAGAGTCTTTAAGACTGATTTGGTGGAAATTGTCTTTGTGCTTCTTTTAGTAGTATGTCCTATTTT--TTAAATGTCCCAAGCCAGGAGCATTAATAAGTCAGCATTAAGAAATTCTGGAATCaaaacaaaacaaaagaaaagaaaaaacaaaaacaaacaaacaaaaaAGAAATTCTGGAATGAAAGGCATTGACACAGAGACATTATGACAATCTGCAGCGCTC-ATAGGTAAAGGTATCATCGTTTTGATGTCTACCAAATCTC---------CATTTCATGAACCATATATTTCTCTGCCCAGCTGGATAAAGAGTATTATTGCTTCACAATAATTAAGAATGCATCTTCTTTACCAAATGTTCTCCTGGGACTTTGCCTCTATAGCATTAGAAAAGTTCTCCTCCAAGCCAATGGATCTTTAAAAAGTTGATGGTTGCATGTTCTCTGAGGAATTAGTACAGGG---TGACAACTT--------CATCAATGTTTTAAAAATTTGCTTGCCTGGGATATGGATTCCGAAAAG-CTTCCAGAGGTCACAATTTGAGGAACAA-AAATCACAAT--GTGTCAC------TCTTGATATGGAGTTCAGGAACACTTCTAttttta i canFam3.chr15 C 0 T 72710 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=91105.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334628 52 + 478999 CTGTGCATATGTTGGAGGATATACAGCCCAGTGAGGAAAATACTGATGTTCC s panTro4.chrUn_GL393519 175802 52 + 413329 CTGTGCATATGTTGGAGGATATACAGCCCAGTGAGGAAAGTACTGATGTTCC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18665076 52 + 99152023 CTGTGCATATGTTGGAGGATATACAGCCCAGTGAGGAAAATACTGAGGTTCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87953254 52 - 170124641 CTGTGCATATGTTGGAGGATATAGAGCCCAGTGAGGAAAATACTGAGGTTCC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88230803 52 - 171882078 CTGTGCATATGTTGGAGGATATAGAGCCCAGTGAGGAAAATACTGAGGTTCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85352105 52 - 162156779 CTGTGCATATGTTGGAGGATATAGAGCCCAGTGAGGAAAATACTGAGGTTCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87682181 51 - 132174527 CTATGGATATGTTGGAGGATATGGAGCCCAGTGAGGAAA-TACTGAGCTTCC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46796229 72710 - 64190966 T e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=121318.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334680 71 + 478999 AACATTGTCACATATTG--AGCAAAAACTTACAGAATTTAGAAATAACTTTTAGAAGGATGGCACTTTTTTGG s panTro4.chrUn_GL393519 175854 71 + 413329 AACATTGTCACACATTG--AACAAAAACTTACAGAATTTAGAAATGACTTTTAGAAGGTTGGCACTTTTTTGG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18665128 71 + 99152023 AACATTGTCACTCATTG--AATAAAAACTTACAGAATTTAGAAATAACTTTTAGAAGGATGGCACTTTTTTGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87953306 71 - 170124641 AACATTGTAGCATATTG--AATAAAAACTTATAGAATTTAGAAATAACTTTTAGAAGGATGGCACTTTTTTGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88230855 71 - 171882078 AACATTGTAGCATATTG--AATAAAAACTTATAGAATTTAGAAATAACTTTTAGAAGGATGGCACTTTTTTGG i macFas5.chr7 C 0 I 307 s papAnu2.chr7 85352157 71 - 162156779 AACATTGTAGCATATTG--AATAAAAACTTACAGAATTTAGAAATAACTTTTAGAAGGATGGCACTTTTTTgg i papAnu2.chr7 C 0 I 306 s calJac3.chr10 87682232 61 - 132174527 AACATTGTAGCATATTA--AAT----ATTTATAGAATTTAGAAATAACTTATACAAGAATGGCACTG------ i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17387450 67 + 64190966 AACACTGTCAGATATTGACAATAAAAATTTGTGGAAGTCAGAAGTACATTTTAGAAGGCCAGCATGG------ i canFam3.chr15 T 91605 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=9198.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334751 4 + 478999 CAGA s panTro4.chrUn_GL393519 175925 4 + 413329 CAGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18665199 4 + 99152023 CAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87953377 4 - 170124641 CAGA i rheMac3.chr7 C 0 I 310 s macFas5.chr7 88231233 4 - 171882078 CAGA i macFas5.chr7 I 307 I 1 s papAnu2.chr7 85352534 4 - 162156779 cagA i papAnu2.chr7 I 306 I 1 s calJac3.chr10 87682293 4 - 132174527 CAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17387517 4 + 64190966 CATA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1782.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334755 3 + 478999 TTC s panTro4.chrUn_GL393519 175929 3 + 413329 ATC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18665203 3 + 99152023 ATC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88231238 2 - 171882078 -TT i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 85352539 2 - 162156779 -TT i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s calJac3.chr10 87682297 3 - 132174527 GTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17387521 3 + 64190966 ATT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87953381 310 - 170124641 I a score=322046.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334758 163 + 478999 CTTTAGATATGAGAAAAAAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTGACAGAAATACTTGAGAGGAACATGTGACTTCCCAATTAACATGAAAGAAGTATTGACTTTTATTTGT----GTCCCTTCTATTTTTACTTTATGGCATTTAGGGGCCAATATAGTGT s panTro4.chrUn_GL393519 175932 163 + 413329 CTTGAGATATGAGAAAAAAGTATAAGAAGTAGCAACGTTTAAGTTAATTGACAGAAATACTTGAGAGGAACATGTGACTTCCCAATTAACATGAGAGAAGTATTGACTTTTATTTGT----GTCCCTTCTATTTTTATTTTATGGCATTTAGGGGCCAACATAGTGT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18665206 166 + 99152023 CTTTAGATATGAGAAAAAAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTAACAAAAATACTTCAGAGGGACGTGTGACTTCCCAATTAATATGAGAGAAGTATTTACTTTTATTTATTAG-GTCCCTTCTATTTTTACTTTATGGCATTTAGGGGCCAACATAGTGT i ponAbe2.chr15 C 0 N 0 s rheMac3.chr7 87953691 167 - 170124641 CTTTAGATATGAGAAGACAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTGACAGAGATACTTCAGAGGAACATGTGACTTCCCACTTAATATGAGAGAAGTATTTACTTTTATTGATTAGTGTCCCTTCTCTTTTTACTTCATGGCATTTAGGTGCCGACACAGTGT i rheMac3.chr7 I 310 C 0 s macFas5.chr7 88231240 167 - 171882078 CTTTAGATATGAGAAGACAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTGACAGAGATACTTCAGAGGAACATGTGACTTCCCACTTAATATGAGAGAAGTATTTACTTTTATTGATTAGTGTCCCTTCTCTTTTTACTTCATGGCATTTAGGTGCCGACACAGTGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85352541 167 - 162156779 CTTTAGATATGAGAAGACAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTGACAGAGATACCTCAGAGGAACATGTGACTTCCCAATTAATATGAGAGAAgtatttacttttattgattAGTGTCCCTTCTCTTTTTACTTCATGGCATTTAGGTGCCGACACAGTGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87682300 167 - 132174527 CTTTAGATATGAGAAGAAAGTATAAGAAGTAGCAACATTTAAGTTAATTGACAGAAATACTTCAGAGGAACATATGACTTCCCAATTAATATGAGAGAAGTATTTACCTTTATTGATTAGTATCCCTTCTATTTTTACTTTATGGTATTTAGGGGCTGACATACTGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17387524 150 + 64190966 CTTCAGATATGAG-AGAAAGAGCAAGAAGTGTCAGTATTTAGGTCAATTGAGTTAAATACTACAGAGGAACACGTGGCTCCCCAATTAATATGACACAAGTGTTTGGTTTCACTGATTCATGTCCC----ATTTTTACTTTA----ATTTATG--------TAGTAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=135092.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 334921 94 + 478999 -AGCTAAACACTCATGTGTGAGTGAATGCTCATACCAAGTGCTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGCCCTAGGACTACAGACATC---TG s panTro4.chrUn_GL393519 176095 94 + 413329 -AACTAAACACTCATGTGTGAGTGAATGCTCCTACCAAGTGCTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGCCCTAGGACCACAGACATC---TG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87953858 94 - 170124641 -AATTGAACACTCGTGTGTGAGTGAATGCTCCTACCAAGTGCTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGCCCTAGGACCACACACATC---TG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88231407 94 - 171882078 -AATTGAACACTCGTGTGTGAGTGAATGCTCCTACCAAGTGCTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGCCCTAGGACCACACACATC---TG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85352708 94 - 162156779 -AACTGAACACTCATGTGTGAGTGAATGCTCCTACGAAGTGCTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGCCCTAGGACCACACACATC---TG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87682467 97 - 132174527 -AACTAAACACTCATGTGGGAGTGAATGCTCACACCATGTATTGTGAAGTAGTTGAGGACATCAGGGATGTATGTCCTGGGACCATAGAAATCTTATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17387674 93 + 64190966 GACTAAAACACCTAAGTGAGACTGAGTGCTCATACCACATAGTGTGAAATGATCGAGAACATCAAGACTG--TGCCACAGGAACACAGGTCTT---TG i canFam3.chr15 C 0 T 59706 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=2551288.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 335015 2127 + 478999 TCTAAAAGCACACTTCCACTTTGAAAGACTATGGAGGAAAATGTTTATTCAGACCTTTATTATCACTTAATCATAATACTTAGAAACTCCTAAAACATAGCTTTGATCTTGTTGTCTGCTCCAAAAGCCATCAATGATTTCAAGTTCCCAAGTTctccacaaattgacttcaaattactttcctggtgttatctttccctactctcttttacagataaattagacagtagacagcatttcattctctgaataggttcagtttcctatgttctcttttttgtgatcattttctgtgtttggaattctatttatctccacctacacctgtaaaaaccctccttcaagatccagttcaaaagaca--ttttt----ccccccagaatgttttcccctcttcccctaagCAAAGCACCTTTTCCATCCTTGCAttttt--------ttttttt-ttttgagacatagtctcgttctgtccccaggctggaatgcagtggtgtgatctcagctcactgcaacctccgcctcctgggttcaaacaattctcctgcttcagcctcctgagtagctgggactacaggtgcacgccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtggagacagggtttcacaatgttggccaggatggtctctatctcttgaccttgtgatccacttgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagctaccatgcctggccCCATCCTTGAATTTTTATTTTACCATCTTTGTGTCTTTGTCATGATACTAATCATAAGCTGCCCTATatcaatgttcatccatgatattggcttgaagttttttcttgttgt------tgtgtctctaccaggttttggtatcaggatgatgctggcctcatagaatgagttggacag----------ttctcagttttttggaatcatttcagcaaaaatggtactggctcttctttgcatatctggtagaatttggctgtgaatccatctagtcctgagctttttaaaatatatatatattttggttggtaggctatttattactgatgcaattttggagcaggttattggtgtgtccaggaatttacccatctcttacaggttttctagtttgtgtgcatagaggtggttgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtggggtcagtggtaacatgacctttttcatttctagttgtgATGTTTCTTTCAAAAGATTAGAATG----GTAAAAATT----------------------ATATCTATTCTGATTAGGGCTTCTAGGCATTATTAAATGTTTACACCTTTAATTTACTCTGGTCAACAGTA-----TATTTTTGGGGACTTT-TTCTTAAATAATCT-------TGTCACTAAACCACT-TACTTTATAAACAGCCTGATTAAATGAACATGCATTTGAACATTAGACTCTGGATAGACAAGATTAATTAACCTTTGACACAAGAAGCTCACAGTACAACAGGCCACTCTGATAGGACAAAAGTCCTAGGAAGTCTATGTCGGCAAAATCCCACCTAAGGGCTAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCTAATTAAGTAAATATACTGCCATCCCATGCTGATAGTGATGAGCAGTCTCGGGGGAGTTTGACTTCTATAGGGAGGGAGGGAGG-CGATGTGTTTCTGCACTTTGCTTCTTCAGTCAGGCATTCTGTGACTTCTTCATTTCCTTCCACTCCTCTTCAAGCCCTGGTATGTTGGCTCAGAAGCACAAG-AGGGCAGGATAATCCTCACTGTCTCATTCACACTGACTGAAACCCTGGGCTTTGAAATACAGACTCACTCCTCCCAAGCTCTA--CTCTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAATGTTATCCAAAGTGACATTACCTAGATCACTAGGTTCTTTCTTTCACCCACCTCCAATCCTGCTGTTCTTTCACTTCTAAGTCAAGGAAACTCCAAGTTTACACTTTGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGGGGTTTCATATTGCACATCAAAACTATTTCTCACTGACCCAATCATCTATTAAAAATCTTGTTGAATTTCTGCCATTTTAATGG----C----TATCTGCCTTCATATGAAGTTCTTGGTATTATAATAGTCAGTGTGCTTCCAAATTAATCCCAATTCGTTTACTTTTACTTTAAGAT s panTro4.chrUn_GL393519 176189 2145 + 413329 TCTAAAAGCAAACTTCCACTTTAAGAGACTACAGAGGAAAACGTTTATTCAGACCTTTATTATCACTTAGTCATAATACTTAGAAACTCCTAAAACATAGCTTTGATCTTCTTGTCTGCTCCAAAAGCCATCAATGATTTCAAGGTCCCAAGTTctccacaaattgacttcaaatgactttcctggtgttatctttccctactctcttttacagataaattagacagtagacagcatttcattctctgaatagcttcagtttcctatgttctcttttttgtggtcattttctgtgtttggaattctatttatctccatctacacctgtaaaaaccctccttcaaggtccagttcaaaagaca--ttttttttcccccccagaatgttttcctctcttcccctaagCAAAGCACCTTTTCCATCCTTGCAttttt--------ttttttt-ttt-gagacatagtctcgttctgtccccaggttggaatgcagtggtgtgatctcagctcactgcaacctccgcctcctgggttcaaacaattctcctgcttcagcctcctgagtagctgggactacaggtgcgcgccaccacgcccagctaatttttgtacttttagtagagacagggtttcacaatgttggccaggatggtctctatctcttgaccttgtgatccacttgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggccCCATCCTTGAATTTTTATTTTACCATCTTTGTGTCTTTGTCATGATACTAATCATAAGCTGCCCTATatcaatgttcatccatgatattggcttgaagttttttgttgttgt------tgtgtctctaccaggttttggtatcaggatgatgctggcctcatagaatgagttggacagggg---ttcctcctcagttttttggaatcatttcagcaaaaacggtactggctcttctttgcatatctggtagaatttggctgtgaatccatctagtcctgagctttttaaaatatatatatattttggctggtaggctgtttattactgatgcaattttggagcaggttattggtgtgtccaggaatttacccatctcttacaggttttctagtttgtgtgcatagaggtgtttgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtggggtcagtggtaacatgacctttttcatttctagttgtgATGTTTCTTTCAAAAGATTAGAATGACTAGTAAAAATT----------------------ATATCTATTCTGATTAGGGCTTCTAGGCATTATTAAATGTTTACACCTTTAATTTACTCTGGTCAACAATA-----TATCTCTGGGGATTTT-TTCTTAAATAATCT-------TGTCACTAAACCACTATACTTTATAAACAGCCTGATTAAATGAACATACATTTGAACATTAGACTCTGGATAGACAAGATTAATTAACCTTTGACACAAGAAGCTCACAGTACAACAGGCCACTCTGATAGGACAAAAGTCCTAGGAAGTCTGTGTCGGCAAAATCCCACCTAAGGGCTAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCTAATTAAGTAAATATACTGCCATCTCATGCTGATAGTGATGAGCAGTCTCGGGGGAGTTTGACTTCTATAGGGAAG-AGGGAGG-GGATGTGTTTCTGCACTGTGCTTCTTCAGTCAGGCACTCTGTGACTTCTTCATTTCCTTCCTCTCCTCTTCAAGCCCTGGCATGTTGGCTCAGAAGCACAAG-AGGGCAGGATAATCCTCACTGTCTCATTCACACTGACTGAAACCCTGGGCTTTGAAATACAGACTCACTCCTCCCAAGCTCTA--CGCTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAATGTTATCCCAAGTGACATTACCTAGATCACTAGGTTCTTTCTTTCACCCACCTCCAATCCTGCTCTTCTTTCACTTCTAAGTCAAGGAAACTCCAAGTTTACACTTTGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGGGGTTTCATATTGCACATCAAAACTATTTCTCACTGACCCAATCATCTATTAAAAATCTTGTTGAATTTCTGCCATTTTAATGG----CCATCTATCTGCCTTCATATGAAGTTCTTGGTATTATAATAGTCAGTGTGCTTCCAAATTAATCCCAATTCATTTACTTTTACTTTAAGAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87953952 2150 - 170124641 TCTAAAAGCAAACTTCCACTTGGAGAGACTAAGGAGGAAAATGTTTATTCAGACCTTTATTATCACTTAGTCATAACACTTAGAAActcctaaaacatagctttgatcttgttgtctgct-caaaagccgtcaatgatttcAAGTTCCCAAGTTCTCCACAAATTGACTTCAAATTATTTTCCTGGTGTTATCTTTCCCTACTCTCTTTTACAGATAAACTAGACAGTCGACAACATTTCATTCTCTGAATAGCTTCAGTTTCCTATGTTCTCTTCTTTGTGACCATTTTCTGTATTTGGAATTCTATTTATCTCCATCTACACCTGTAAAAACCCTCCTTCAAGGTCCAGTTCAAAAGACA--TTTTTTTT-TCCCCTGGAATGTTTTCCCCTTTTCCCCTAACCAAAGCACCTTTTCCATCCTTGCAttt----------ttgttgt-tgttgagaaggagtttcgctctgtccccaggctggagtgcagtggcgtgatctcagctcacggcaacctccacctcccaggttcaaacaattctcctgcttcagcctcttgagtagctgggactacaggcatgtgccaccccgcccagctaatttttgtatttttagtagagacaggattttaccatgttggccaggatgatctctatctcttgacctcgtgatctgcctgcctcggcctcccaaagttctgggattacaggcgtgagccaccgcgcccggccCCATCCTTGCATTTTTATTTTACCATCTTTGTGTCTTTGTCATGATACTAATCACAAGCTGCCttacatcaatgtttatccatgatactggcttgccattttttcttgttgt------tgtgtctctactgggttttggtatcaggatgatgctggcctcatagaatgagttgcacaggggtccttcctcctcagttttgtggaatcatttcagcagaaatggtactggctcttctttgcatatctggtagaatttggctgtgaatccatctaatgctgagcttttaaaaatatatatattttttggttggtaggctatttattacggatgcaattttggagcacgttattggtgtgtccaggaagtgacccatctctcacaggttttctagtttgtgtgcgcagaggtgtttgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtggggtcagtggtaacatggcctttttcatttctaattgtgATGTTTCTTTCAAAAGATTAGAATAACTAGTAAAAATT----------------------ATATCTATTCTGAATATGGCTTCTAGGTATTATTAAATGTTTATGCCTTTAATTTACTCTGATCAACAATGTAAGTTATCTTTGGGGCTTTTGTTCTTAAATAATCT-------TGTCACTAAACCGCTACACGTAATAAACAGCCTGGTTAAATGAACATGCATTGGAACATTAGACTCTGGAGAGACGAGATTCATTAACCTTTGACACGAGAAGCTCACAGTGCAACAGGCCACTCCGATAGAACAAAAGTCCTAGGAAGTCTATGTCAGCAAAATCCTACCTAAGGACTAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCTAATTAAGTAAATACACTGCCATCCCATGCTGAGAGTGATGGGCAGTCTGGGGGGAGGTTGACTTCTATAGGGAGG-AGGGAGGAGGATGTGTTTCTGCACTTTGCTTCTTCAGTCAGGCACTCTGTGACTTCTTCATTTCCTTCCTCTCCTCTTCAAGCCCTGGCATATTGGCTCAGAAGCACAAGGGGGGCAGGATAATCCTCATTGTCTCATTCACACGGACTGAAGCCCCGGGCTTTGAAATACACACTCACTCCTCCCAAGCTCTACCCACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAATGTTGTCCAAAGTGACATTACCTAGATCACTAGGTTCTTTCTTTCACCCACCTCCAATCCTGCTGTTCTTTCAGTTCTAAGTCAAGGATACTCCAAGTTTACACTTTGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGGGGTTTCATACTGCACATCAAAACTATTTCTCACTAACTCAATCATCTATTAAAAATTCGGTTGAATTTCTGCCATTTTAATGG----C----TATCAGCCTTCATATGAACTTCTTGGTATTATAATAGTCAGTGTGCTTCCAAATTAA-TCCAATTTGTTTACTTTTATTTTAAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88231501 2158 - 171882078 TCTAAAAGCAAACTTCCACTTGGAGAGACTAAGGAGGAAAATGTTTATTCAGACCTTTATTATCACTTAGTCATAACACTTAGAAActcctaaaacatagctttgatcttgttgtctgct-caaaagccgtcaatgatttcAAGTTCCCAAGTTCTCCACAAATTGACTTCAAATTATTTTCCTGGTGTTATCTTTCCCTACTCTCTTTTACAGATAAACTAGACAGTCGACAACATTTCATTCTCTGAATAGCTTCGGTTTCCTATGTTCTCTTCTTTGTGACGATTTTCTGTATTTGGAATTCTATTTATCTCCATCTACACCTGTAAAAACCCTCCTTCAAGGTCCAGTTCAAAAGACATTTTTTTTTT-TCCCCTGGAATGTTTTCCCCTTTTCCCCTAACCAAAGCACCTTTTCCATCCTTGCAtttttgt----tgttgttgt-tgttgagatggagttttgctctgtccccaggctggagtgcagtggcgtgatctcagctcacggcaacctccacctcccaggttcaaacaattctcctgcttcagcctcttgagtagctgggactacaggcatgtgccaccccgcccagctaatttttgtatttttagtagagacaagattttaccatgttggccaggatgatctctatctcttgacctcgtgatctgcctgcctcggcctcccaaagttctgggattacaggcgtgagccaccgcgcccggccCCATCCTTGCATTTTTATTTTACCATCTTTGTGTCTTTGTCATGATACTAATCACAAGCTGCCttacatcaatgtttatccatgatactggcttgacattttttcttgttgt------tgtgtctctactgggttttggtatcaggatgatgctggcctcatagaatgagttgcacaggggtccttcctcctcagttttgtggaatcatttcagcagaaatggtactggctcttctttgcatatctggtagaatttggctgtgaatccatctagtgctgagcttttaaaaatatatatattttttggttggtaggctatttattacggatgcaattttggagcacgttattggtgtgtccaggaagtgacccatctctcacaggttttctagtttgtgtgcgcagaggtgtttgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtggggtcagtggtaacatggcctttttcatttctaattgtgATGTTTCTTTCAAAAGATTAGAATAACTAGTAAAAATT----------------------ATATCTATTCTGAATATGGCTTCTAGGTATTATTAAATGTTTATGCCTTTAATTTACTCTGATCAACAATGTAAGTTATCTTTGGGGCTTTTTTTCTTAAATAATCT-------TGTCACTAAACCGCTACACGTAATAAACAGCCTGGTTAAATGAACATGCATTGGAACATTAGACTCTGGAGAGACGAGATTCATTAACCTTTGACACGAGAAGCTCACAGTGCAACAGGCCACTCCGATAGAACAAAAGTCCTAGGAAGTCTATGTCAGCAAAATCCTACCTAAGGACTAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCTAATTAAGTAAATATACTGCCATCCCATGCTGAGAGTGATGGGCAGTCTGGGGGGAGGTTGACTTCTATAGGGAGG-AGGGAGGAGGATGTGTTTCTGCACTTTGCTTCTTCAGTCAGGCACTCTGTGACTTCTTCATTTCCTTCCTCTCCTCTTCAAGCCCTGGCATATTGGCTCAGAAGCACAAGGGGGGCAGGATAATCCTCATTGTCTCATTCACACGGACTGAAGCCCCGGGCTTTGAAATACACACTCACTCCTCCCAAGCTCTACCCACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAATGTTGTCCAAAGTGACATTACCTAGATCACTAGGTTCTTTCTTTCACCCACCTCCAATCCTGCTGTTCTTTCAGTTCTAAGTCAAGGATACTCCAAGTTTACACTTTGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGGGGTTTCATACTGCACATCAAAACTATTTCTCACTAACTCAATCATCTATTAAAAATTCGGTTGAATTTCTGCCATTTTAATGG----C----TATCAGCCTTCATATGAACTTCTTGGTATTATAATAGTCAGTGTGCTTCCAAATTAA-TCCAATTTGTTTACTTTTATTTTAAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85352802 2159 - 162156779 TCTAAAAGCAAACTTCCACTTGGAGAGACTAAGGAGGAAAACGTTTATTCAGACCTTTATTATCACTTAGTCATAACACTTAGAAACTCCTAAAACATAGCTTTGATCTTGTTGTCTGCT-CAAAAGCCATCAATGATTTCAAGTTCTCAAGTTCTCCACAAACTGACTTCAAATTAGTTTCCTGGAGTTATCTTTCCCTATTCTCTTTTACAGATAAATTAGACAGTAGACAACATTTCATTCTCTGAATAGCTTCAGTTTCCtatgttctcttctttgtgatCATTTTCTGTATTTGGAATTCTATTTATCTGCATCTACACCTGTAAAAACCCTCCTTCAAGGTCCAgttcaaaagaca--tttttttt-tcccccggaATGTTTTCCCCTCTTCCCCTAACCAAAGCACCTTTTCCATccttgcatttttgt----tgttgttgt-tgttgagatggagtttcgctctgt--ccaggctagagtgcagtggagtgatctcagctcactgcaacctccacctcccgggtttaaacaattctcctgcttcagcctcttgagtagctgggactacaggcgtgcgtcaccttgcccagctaatttttgtatttttagtagagacggggttttaccatgtgggccaggatgatctctatctcttgacctcgtgatctgcctgcctcggcctcccaaagatctgggattacaggcgtgagccaccgcgcccggccccatcctTGCGTTTTTATTTTACCATCTTTGCGTCTTTGTCATGATACTAATCACAAGCTGCCTTACATCAATGTTTATCCATGATACTGGCTTgacattttttcttgttgt------tgtgtGTCTActgggttttggtatcaggatgatgctggcctcatagaatgagttgcaCAGGGGTCCTTCCTCCTCAGTTTTGTGGAATCATTTCAGCAGAAATGGTACTGGCTCTTCTTTGcatatctggtagaattcggctgtgaatccatctagtgctgagcttttaaaaatatatatattttttggttggtaggctatttattacggATGCAATTTTGGAGCACGTTATTGGTGTGTCCAGGAAGTGACCCATCTCTtacaggttttctagtttgtgtgcgcagaggtgtttgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtggggtcagtggtaacacggtctttttcatttctgattgtgatGTTTCTTTCAAAAGATTAGCATAACTAGTAAAAATT----------------------ATATCTATTCTGAATATGGCTTCTAggtattattaaatgtttatgcCTTTAATTTACTCTGATCAACAATGTAAGTTATCTTTGgggctttttttcttaaataatct-------tGTCACTAAACTGCTACATATAATAAACAGCCTGGTTAAATGAACATGCATTGGAACATTAGACTCAGGAGAGACAAGATTCATTAACCTTTGACACAAGAAGCTCACAGTGCAACAGGCCACTCCGATAGAACAAAAGTCCTAGGAAGTCTATGTCAGCAAAATCCTACCTAAGGACTAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCTAATTAAGTAAATACACTGCCATCCCATGCTGAGAGTGATGGGCAGTCTGGGGGGAGGTTGACTTCTatagggagg-agggaggaggatgtGTTTCTGCACTTTGCTTCTTCAGTCAGGCACTCTGtgacttcttcatttccttcctctcctcttcaaGCCCTGGCATATTGGCTCAGAAGCACAAGCGGGGCAGGATAATCCTCATTGTCTCATTCACACTGACTGAAGCCCTGGGCTTTGAAATACACACTCACTCCTCCCAAGCTCTACCCACTGATGCTGGGAGCAATTTAGAGCAAATGTTGTCCAAGGTGACATTACCTAGATCACTAGGTTCTTTCTTTCACCCACCTCCAATCCTGCTGTTCTTTCAGTTCTAAGTCAAGGATACTCCAAGTTTATACTTTGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGGGGTTTCATACTGCACATCAAAACTATTTCTCACTGACCCAATCatctcttaaaatttttgttgaatttctgcCATTTTAATGGCTATC----TATCTGCCTTCCTATGAACTTCCTGGTATTATAATAGTCAGTGTGCTTCCAAATTAACCccaatttgtttacttttattttaagat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87682564 2153 - 132174527 TCTAAAATCAGACTTCCATTTTGAGAGACTATGGAGGAAAATGTTTATTAAGACCTTTATTATCACTTAGTCATAACACTTAGGAACTCCTAAAACATAGCTTTAATCTTGTTGTCTGTT-CAAAAGCCATCAATGATTTCAAGTTCTTAAGTTCTCCACAAATTGACTTCAAATAATTTTCCTGGTATTATCTTTCCCTACTCTCTTTTACAGATAAATTAGAAGGTAGACAGCATTTCGTTCTCTGAATAGCATCAACTTCCTATGTTCTGTTCTTTGTGATCATTTTCTGTATTTGGAATTCTATTTATCTCCATCTACACCTGTGAAAACCCTCCTTCAAGGTCCAGTTT-AAAGACA--TCTTTTTT----CCCATAATATTTTCCCCTCTTCCCCTAAACAAAGCACCTTTTCTATCCTTGCAGttttattttattttgttttgtttttggatggagtcttgctctgccaccaggctggagtgcagtggcacaatcttggctaactgcaacctctgcctctagggttcaagtgattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaggtgtgcgccaccacacccagctaatttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatattagccaggatggtcttgatctcttgatcttgtaatctgcctgtcttggcctcctaaaatgctgggattatagtcttgagccatcatatctggccCCCTCCTTGCATTTTTACTTTACCATCTTTGTGTCTTTGTCATGATACTATTCACAAGCTG--TGATatcaatgctcatctatgatattgtcctgaaattttcttttttttttctgtgtatgtctctatgaggttttggcatcaggatgatgctggcctcataaaatgagttgggcagaggtccctt-tcttcaattctttggaatcatttcagcagaaatggtactggctcttctttgtatatctggtataattcagctgtgaattcatctagtcctgaggttttacacat-------tttttttattggtaggctatttattactgatgcaagtttggagcacgttattggtgtgtccaggaacttatccatctcttataggttttctagtttgtgtgcatagaggtgtatgtagtagtttctgatggttattttttatttctgtgggttcagcggtaacatggcctttctcatttctaattttgATGTTTCTTACAAAAGATTAGGATGACTAGCCAAAATTATGTAATCTGAATATGTAAAAAATATGTAATCAGAATATGTCTTCTAGATATTATCAAATGTGTTTGCCTTTAATTTACTCTGGTCAACAATGTGAGTTATCTTTGGGGCTTTT-TTCTTAAATAATCTAAATAAATAATACTAAAGCACTATACTTAATAAACAGCCTTGTTAAATGAACATGCATTTGAGCATTAGACTCAGGAGAAACAAGATTAATTAACATTTGGCACAAGAAGCTCATAGTGCAACAAGCCACTCCAAT---------------GAGGGTCTATGTGAGTAAGATCCCACCTAAGGGTGAAACTTTAAGCTCTATTCACTTTTAGCAAATTAAGTAAATACACTGCAATCCTATGCTGATAGTGACGAGCAATCTGGGGGGATGTTGACTTTTATAGGGAGG-AGAGAGGAGGATGTGTTTCTGCACTTTGCTTCTTCAGTCCGGCACTCTGTGACGACTTTATTTCCTTCCTCTCCTCTTCAAGCCCTGGCATGTTGGCTCAG-AGCACAAG-GGGGCAGGATAACCCTCATTGCCTCATTCACGCTGACAGAAACCTTGGGGTTTGAAGTACACACTAGCTCCTCCCAGGCTCTACCCACTGATGCAGGGAGCAATTTA------------TCCAAAGTGGCATTACCTAGATCATTAGGTTCTTTCTTTTACCCACCCCCAATCCTGCTGTTCTTTCAGTTCTAAGTCAAAGATACTCCAAGTTTACACTTGGCAGGAGCCCCTGGAATATTTGAGGTTTCATACTGCACCTCAAAACTATTTCTCACAGACCCAATCATCTATTAAAAATTTTGTTGAATTTCTCCCATTTTAATGG----C----TATCTGTCTTCATATGAACTTCTTGGTATTATAATAGTCAGTGTACTTCCAAATTAATCCCAATTCATTTACTTTTATTTTAAGAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17387767 59706 + 64190966 T e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=240548.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 337142 327 + 478999 GAAATGTAggcagagcacagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcatgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatagtgaaaccctatctctactaaaaatag-aaaaaaaaaaaacagccaggcatcgtggcaggcacctgtaatcccagctacttgggattctgaggcaaggagagtcgtttgaacctgggaggtggaggttgcaatgagccgaagtcgcgccactgcactccagcctgggtgacagtgcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-------gaaGAA s panTro4.chrUn_GL393519 178334 331 + 413329 GAAATGTAggcagagcacagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcatgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaaaatagtgaaaccctgtctctacgaaaaatag-aaaacaaaa---tagccaggcatcgtggcaggcacctgtaatcccagctatttgggattctgaggcaaggagaatcgtttgaacctgggaggtggaggttgcaatgagctgaagtcgcgccactgcactccagcctgggtgacagtgcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaGAAGAAGAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87956102 306 - 170124641 GAAATGTAggccaggcatggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggctggtggatcatgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatagtgaaaccctg--tctactaaaaatac-aaaaaac-----tagccaggcatggtggtgggcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaaggagaatcgtttgaacctgggaggtggagattgcagtgagcagaagtcatgccactgcactctagcctgggtgacagggcgagactccgcctt----------aaaaaaaaaaaaaaaa-----------TT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88233659 309 - 171882078 GAAATGTAggccaagcatggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggctggtggatcatgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatagtgaaaccctg--tctactaaaaatac-aaaaaac-----tagccaggcatggtggtgggcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaaggagaatcgtttgaacctgggaggtggagattgcagtgagcagaagtcatgccactgcactctagcctgggtgacagggcgagactccgcctt-------aaaaaaaaaaaaaaaaaaa-----------TT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85354961 308 - 162156779 gaaatgtaggccaagcacggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggctggcggatcatgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatagtgaaaccgtgactctactaaaaatacaaaaaaac-----tagccaggcatggtggcggacacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaaggagaattgtttgaacttgggaggtagagattgcagtgagcagaagtcgtgctattgcactctagcctgggtgacagggcgagactccgcctt-----------aaaaaaaaaaaaaaa-----------tt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17387767 59706 + 64190966 T e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87684717 0 - 132174527 C a score=146922.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 337469 134 + 478999 GAAATGTAGCTTAGAAACCATTCTTCCATAAAACCAAAACCATATCTCCTTAAGAGGATGTTGGAAAATCAGCCTTTCTCGTAAAGTAGTTTTCCCCACAAGTTTAAACACATTACTCCACTATAAGTTTAGAG s panTro4.chrUn_GL393519 178665 134 + 413329 GAAATGTAGCTTAGAAACCATTCTTCCATAAAACCAAAAACATATCTCCTTAAGAGGATGCTGGAAAATCAGCCTTTCTCATAAAGTAGTTTTCCCCACAAGTTTAAACACATTACTCCACTATAAGTTTAGAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87956408 128 - 170124641 GAAGTGTAGCTTAGAAACCATTCTTCCATAAAAC------CATATCTCTTTAAGATGATGTTGGAAAATTAGCCTTTCTCATAAAGTAGTTTTTCCCACAAGTTTAAACACATTACTCTATTATAATTTTAGAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88233968 128 - 171882078 GAAGTGTAGCTTAGAAACCATTCTTCCATAAAAC------CATATCTCTTTAAGATGATGTTGGAAAATTAGCCTTTCTCATAAAGTAGTTTTTCCCACAAGTTTAAACACATTACTCCATTATAATTTTAGAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85355269 128 - 162156779 gaagtgtaGCTTAGAAACCATTCTTCCATAAAAC------CATATCTCTTTAAGAGGATGTTGGAAAATTAGTCTTTCTCATAAAGTAGTTTTCCCCACAAGTTTAAACACATTACTCCATTATAATTTtagag i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87684717 122 - 132174527 GAATTGTATCTCAGAAACATTTCTTTCATAAAAC------CATATCTCTTTAAGAGGATGTTGGAAAGTCCGCCTTTCTTATAG------TTTCCCTGTAAGTTTAAACATATTACTCCATTTTAAATTTAGAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17387767 59706 + 64190966 T e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=538797.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 337603 419 + 478999 ACTATT-TTAAAAAA--CTATTATGCTTCAGCTTTTCCTGCAGTTCTCTCTTTCTTGTCTC---TTACATACTTCTCTGTGATCTGGTCCAACAATTATTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTAGCAAGCTCATTGTCT--TCTGCCT---------------------------------------------------------------------------------TATTAAAC--TTTAATGGGTAACTAGT---AGACAGTAACACTCTGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAAATGTGCCAAGATAATCCTGAGCTCACT-ATTGTCAGGTAAGACAAAGTATTTTAGTGCAATAGCAAACAATTAATTAAACA----------AACAAAAACAAGAAACCTTTCTTGGGACAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCCACTCATTGAAACTAGGTCCTGATTGGGTTTCTGGATTTGACCACTGGGCAGAAACTA-----GGACCCAAAA s panTro4.chrUn_GL393519 178799 419 + 413329 ACTATT-TTAAAAAA--CTATTATGCTTCAGCTTTTCCTGCAGTTCTCTCTTTCTTGTCTC---TTACATACTTCTCTGTGATCTGGTCCAACAATTATTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTAGCAAGCTCATTGTCT--TCTGCTG---------------------------------------------------------------------------------TATTAAAC--TTTAATGGGTAACTAGT---AGACAGTAACACTCTGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAACTGTGCCAAGATAATCCTGAGCTCACT-ATTGTCAGGTAAGACAAAGTATTTTAGTGCAATAGCAAACAATTAATTAAACA----------AACAAAAACAAGAAACCTTTCTTGGGACAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCCACTCATTGAAACTAGGTCCTGATTGGGTTTCTGGATTTGACCACTGGGCAGAAACTA-----GGACCCAAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87956536 422 - 170124641 ACTATT-TAAAAAAAATCTATTATGCTTCAGCTTTTCCTGCAATTTTCTCTTTCTTATCTC---TTACATTCTTCTCTGTGTTCTGGTCCAACAATTATTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTAGCAAGCTCATTGTCT--TCCACCT---------------------------------------------------------------------------------TATTAAAC--TTTAATGGGTAGCTAGT---AGACAGTAACACTCTGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAAATGTGCCAAGATAATCCTGAGCTCACTCATTGTCAGGTAAGACAACGTATTTTAGTGCAATAGCAAACAATTAATTAAACA----------AACAAAAACAAGAAACCTTTCTTGGGCCAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCCACTCATTGAAACTAGGTCCTGACCGGGTTTCTGGATTTGACCACTGGGCAGAAACTA-----GGACCCAAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88234096 422 - 171882078 ACTATT-TAAAAAAAATCTATTATGCTTCAGCTTTTCCTGCAATTTTCTCTTTCTTATCTC---TTACGTTCTTCTCTGTGTTCTGGTCCAACAATTATTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTAGCAAGCTCATTGTCT--TCCACCT---------------------------------------------------------------------------------TATTAAAC--TTTAATGGGTAGCTAGT---AGACAGTAACACTCTGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAAATGTGCCAAGATAATCCTGAGCTCACTCATTGTCAGGTAAGACAACGTATTTTAGTGCAATAGCAAACAATTAATTAAACA----------AACAAAAACAAGAAACCTTTCTTGGGCCAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCTACTCATTGAAACTAGGTCCTGACCGGGTTTCTGGATTTGACCACTGGGCAGAAACTA-----GGACCCAAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85355397 423 - 162156779 acaattaaaaaaaaaaactattacacTTCAGCTTTTCCtgcaattttctctttcttatctc---ttACATCCTTCTCTGTGTTCTGGTCCAACAATTATTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTAGCAAGCTCATTGTCT--TCCGCCT---------------------------------------------------------------------------------TATTAAAC--TTTAATGGGTAGCTAGT---AGACAGTAACACTCTGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAAATGTGCCAAGATAATCCTGAGCTCACTCATTGTCAGGTAAGACAACGTATTTTAGTGCAATAACAGAcaattaattaaaca----------aacaaaaacaagaaaccttTCTTGGGCCAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCCACTCATTGAAACTAGGTCCTGACCGGGTTTCTGGATTTGACCACTGGGCAGAAACTA-----GGACCCAAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87684839 485 - 132174527 ACTATT-TAAAAAAA--CTATTATGCTTCAGTTTTTCCTGCAGTTTTCTCTTTCCTGTCTC---TTACATACTTCTCTGTGACATGGTCCAACAATCACTGCCATGGCAACAAAGGCTCTGTGACATCTCTATCAAGCTCATTGTCT--TCTGCCTTTAATAGCCATTAAAATGGGAGATATTCAACAAAATTTTTAATAGATGATTGGGTCTGTGAGAAATAGTTTTGAGGTGCAGTATTAAAC--TTTAATAGGTAGCTAGTCTCAGATAGTAACACTATGGGAGGGCTCAAACCACATAACCAAATGTGCCAAGGTAATCCTGAGCTCACCTATTGCCAGGTAAGACAAAGTATTTTAGTGCAATAGCAAACAATTAATTAAACA----------AACAAAACCAAGAAACCCTTCTTGGTCCAGGAAGCCATTAATTAGCTAAGCTCAGAGCCACTCATTGAAACTAGGTCCTGACTGGGCTTCTGGATTTGACCACAGG------------------------A i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46723519 399 - 64190966 ATTATT-ATTATTAA--TGATGATGATGATGTTTTTCTC----TCTTTTCTTTCCATTTTCTGGTTCCAT--TTCTTTGTGTTTTCTTCTTAGAGTTGGTGCCATAGCAACTGAGGTTCTGTGATATTTCCAGTAAACTCACTGCCTCATTTGTCT---------------------------------------------------------------------------------TATTCAGCAAATCAGTATGTAGCTGAGCTCATACAGTAAAGCCCTGG---------------------------GTTTGGATATCTCAGAGCT---TTAATGCCAGTTTGGAC-----ATCCCAGTATAAAGCTAAACGA-AAACCAAACAGGGCATTTTGATTATGAAGAGGAAATATCCTTTGGGTCTGGAAGTCTTTGCT----TGAGTTAGGAGTATCCAAGGCACACCAGGTCCTGATGAGATATTTGGATTCAAATTCTGAGGAGAAATCAGCTCTGGACCTGAAA i canFam3.chr15 T 72710 I 29385 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1697691.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 338022 1457 + 478999 CCAATTGGAATGAAATGGTCCGCAGATATTGTTTTCATGTAAGGATAGGTTTGGAAGTATCCAGACTTAGTGGTGGGCCAGGCCTCCCCTGCGAGCAGTACAGTTCAGGACACCTGGACTGCCCTTTCCCTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGAATG--GCTTAGTCTTTCGTGTTCTCAACTGTAACATGGAGGAGGAAGAGAAGAGCCTCACTGCACATATTGGGTCATTAAGAATGATCTTAGAGCCATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTGATTTTTACCACTCCACTACTCCTCTC--CCAATATGTTGTGCCAAATTGTAAGTAATTTGCAATTAGAACACATTGAAGACATATATTTGAGCTCCTCAGAGAGTCTCACCCACCTTTGTGGTAACTTTTTGTACTTCAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTGTTGGGTAGTGATAAAATTTTGATACATTGGGTAGTGATAAAATTTTAATTGCCTAAGTTTAGTAAATGGGGGACAGGCTTGCTTATCAACAGTCTTTGTGGCATTTTATGCTGAAAAAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGTTCTCTGCACTCCCTCCACTTCCCTTCTGTGCCTTTCATGTGTATCC---TTTACAGCAATTTTTTTTTGTGAGTTCTTTTCCTTTTTGAGATCTCTCTTAAGGTTAat---------ggtgtacagtagatatccagaacttattcatcccttttagctgaaacattgtaccctttgacaaatgtctccccatatccccTGGgcacaattttcaataggtagttagggaaagcctcaatgaaaaggttgggattttgggatgctgataacattcagtttctggaactaggtacctttacacaggag-tatcagttgataacaattcattgagcaatatacttaggatttgtgcactgtactttttgcat----------------gttatagatgaataaaaaattcagaaaTCTCATAaaggtgatatttggataaagacttgaaggaagtgtggaggcaacaaatataaacatctggggaaagagggttccaggcagaggagatggcatgtgtaggtgccacgaagcaggagcacgcctggcatgattgagacggcagggagtccTCATCTCTTCTTCACCT--------------------------ACGCTACATCTCTGAAATGGCCATTTC-AGAAAGCATGAAATTTATTTACATGAGTTTATTTTAACAAATGCTCACTTTTGATATTTTACAAGAGTAACTACAAGTTTATTATAGA--------------------AAAATTTGAGAAAACATACATATGCATGAGAATACAACATAACCATTTAACATTTAAAATTTTTCCTTTCATCACACttatattca-----taatgtttgtaattaagtgtaaaatttactatacatgtttatattatttatatttatatttTAATATTAAAAACTGattagttaattcaataataataatt s panTro4.chrUn_GL393519 179218 1427 + 413329 CCAATTGGAATGAAATGGTCCCCAGATATTGTTTTCATGTAAGGATAGGTTTGGAAGTATTCAGACTTAGTGGTGGGCCAGGCCTCCCCTGCGAGCAGTACAGCTCAGGACACCTGGACTGCCCTTTCCCTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGAATG--GCTTAGTCTTTCGTGTTCTCATCTGTAACATGGAGGAGGAAGAGAAGAGCCTCACTGCACATATTGGGTCATTAACAATGATCTTAGAGCCATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTGATTTTTACCATTTCACTACTCCTCTCTCCCAATATGTTGTGCCAAATTGTAAGTAATTTGCAATTAGAACACATTGAAGACATATATTTGAGCTCCTTAGAGAGTCTCACCCACCTTTGTGGTAACTTTTTGTACTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGTGTTGGGTAGTGATAAAATTTTGATACATTGGGTAGTGATAAAATTTTAATTGCCTAAGCTTAGTAAATGGGGGACAGGCTTGCTTATCAACAGTCTTTGTGGCATTTTATGCTGAAAAAGCCTTGAGGC-----------CCACAGTTCTCTGCACTCCCTCCACTTCCCTTCTGCGCCTTTCATGTGTATCC---TTTACAGCAATTTTTTTT-GTGAGTTCTTTTCCTTTTTGAGATCTCTCTTAAGGTTAat---------ggtgtacagtagatatccagaacttactcatcccttttagctgaaacattgtaccctttgacaaatgtctccccatatccccTGg-cgcaattctcaataggtagttagggaaagcctcaatgaaaaggttgggattttgggatgctgataacattcagtttcttgaactaggtacctttgcacaggag-tatcagttgataacaattcattgagcaatatacttaggatttgtgcactgtactttttgtat----------------gttatagatgaataaaaaattcagaaaTCTCATAaaggtgatatttggataaagacttgaaggaagtgtggaggcaacaaatataaacatctggggaaagagggttccaggcagaggagacggcatgtgtaggtgccacgaagcaggagcacgcctggcatgattgagacggcagggagtccTC-----TTTTTCACCT--------------------------CCACTACACCTCTGAAATGGCCATTTC-AGAAAGCATGAAATTTATTT--------------TAACAAATGCTCACTTTTGATATTTTACAAGTGTAACTACAAGTTTATTATAGA--------------------AAAATTTGAGAAAACATATATATGCACAAGAATACAACATGACCATTTAACACTTAAAATTTTTCCTTTCATCACACTTATATTCA-----TAATGTTTGTATTTAAGTGTAAAATTTACTATACATGtttatattatttatatttatattttaatattaaGAACTGattagttaattcaacaataatagtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87956958 1454 - 170124641 CCAATTGGAATGAAATGGTCCCCAGATATTGTTTCTATGTAAGAATAGGTTTGGAAGTATCCAGACTTACTGGTGGGCCAGGCCTCCCCTGTGAGCAGTACAGGTCAGGACACTTGGACTGCCCTTTCCCTCTACCTTCCCTCGGGTAATGTGAATG--GCTTAGTCTTTCGTGTTTCCGTCTGTAACTTGGAGGAGGAAGAGAAGAACCTCATTGCACATATTGGGTCGTTAAGAATGATCTTAGAGCCATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTGACTTTTACCATTCTACTACTCCTCTCTCCCAATATGTTTTGCCAGATTGTAAGTAACTTGCAATTAGAACACATTGAAGACATATATTTGAGCTCCTTAGAGATTCTCATCCACCTTTGAGGTAACTTTTTGTACTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGGGTTGGGCAGTAATAAAATTTTGATACAT-------------AAAGTTAATTGCCTAAGCTTAGTAAATGGGGGACAGGCTTGCTTATCAACAGTCTTTGTAGTATTTTATGCTGAAACAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGCTCTCTGCACTCCCTCCACCTCCCTTCTGCCCCTTTCATGTATAGCCTGTTTTACAGCAATTTTTCT--GTGAGTTCTTTTCCTTTTTGAGATCTCTCTTAAGGTTAATCTCTCTTAAGGTGTACAGT--------agaacttattcatcctttttagctgaaacattttaccctttgacaaatgcctccccatgtccccTGGgtggaattttcagtaggtagttagggaaagcctcactgaaaaggttgggattttgggatgctgataacattcagtttcttgaactgggtacctttacacaggagttatcagttgctaacaactcattgagcaatatacttatgatttgtacaatgtactttttgtat----------------gttatagatgaataaaaaattcagaaaTCTCATAaaggtgatatttggataaagacttgaaggaagtgtggaggcaagaaacataaacgtctggggaaagagggttccaggcagaggagacggcatgtataggtgccacaaagcaggagcacgcctggcatgattgagacagcagggagtccTCATCTCTTCCTCACCT--------------------------CCCCACCACCTCTGAAATGGCCATTTC-AGAAATTATGAAATTTATTTACGTACATTTATCTTAACAAATACTCACTTTTGATATTTTACAAGTGTTACTACAAGTTTATTATAGA--------------------AAAATTTGAGAAAACATACGTATCCACAAGAATACAATATAACCACTTAACATTTAAAATTTTTCCTTTCATCATACTTATATTCATAGAGTAGTATTGGCATTTAAGTATAAAATTTACTATACATGtttatattattcatatttatattttaatGTTCAGAACTGATTAGTTAATCCATCAATAACAATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88234518 1442 - 171882078 CCAATTGGAATGAAATGGTCCCCAGATATTGTTTCCATGTAAGAATAGGTTTGGAAGTATCCAGACTTACTGGTGGGCCAGGCCTCCCCTGTGAGCAGTACAGGTCAGGACACTTGGACTGCCCTTTCCCTCTACCTTCCCTCGGGTAATGTGAATG--GCTTAGTCTTTCGTGTTTCCGTCTGTAACTTGGAGGAGGAAGAGAAGAGCCTCATTGCACATATTGGGTTGTTAAGAATGATCTTAGAGCTATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTGACTTTTACCATTCTACTACTCCTCTCTCCCAATATGTTTTGCCAGATTGTAAGTAACTTGCAATTAGAACACATTGAAGACATATATTTGAGCTCCTTAGAGATTCTCATCCACCTTTGAGGTAACTTTTTGTACTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGGGTTGGGCAGTAATAAAATTTTGATACAT-------------AAAGTTAATTGCCTAAGCTTAGTAAATGGGGGACAGGCTTGCTTATCAACAGTCTTTGTGGTATTTTATGCTGAAACAGCCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGCTCTCTGCATTCCCTCCACCTCCCTTCTGCCCCTTTCATGTATAGCC---TTTACAGCAATTTTTCT--GTGAGTTCTTTTCCTTTTTGAGATCTCTCTTAAGGTTaat---------ggtgtacagt--------agaacttattcatcctttttagctgaaacattttaccctttgacaaatgcctccccatgtccccTGGgtggaattttcaataggtagttagggaaagcctcactgaaaaggttgggattttgggatgctgataacattcagtttcttgaactgggtacctttacacaggagttatcagttgctaacaactcattgagcaatatacttatgatttgtacaatgtactttttgtat----------------gttatagatgaataaaaaattcagaaaTCTCATAaaggtgatatttggataaagacttgaaggaagtgtggaggcaagaaacataaacgtctggggaaagagggttccaggcagaggagacggcatgtataggtgccacaaagcaggagcacgcctggcatgattgagacagcaggaagtccTCATCTCTTCCTCACCT--------------------------CCCCACCACCTCTGAAATGGCCATTTC-AGAAATTATGAAATTTATTTACATACATTTATCTTAACAAATACTCACTTTCGATATTTTACAAGTGTAACTACAAGTTTATTATAGG--------------------AAAATTTGAGAAAACATACGTATCCACAAGAATACAATATAACCACTTAACATTTAAAATTTTTCCTTTCATCatacttgtattcatagagtagtattggcatttaagtataaaatttactatacatgtttatattattcatatttatatttTAATGTTCAGAACTGATTAGTTAATCCATCAATAACAATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85355820 1438 - 162156779 CCAATTGGAATGAAATGGTCCCCAGATATTGTTTTCATGTAAGAATAGGTTTGGAAGTATCCAGACTTAGTGGTGGGCCAGGCATCCCCTGTGAGCAGTACAGGTCAGGACACTTGGACTGCCCTTTCCCTCTACCTTCCCTCGGGTAATGTGAATG--GCTTAGTGTTTCGTGTTCCCGTCTGTAacttggaggaggaagagaagagccTCATTGCACATATTGGGTCGTTAAGAATGATCTTAGAGCCATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTGACTTTTACCATTCTACTACTCCTCTCTCCCAATATGTTGTGCCAGATTGTAAGTAACTTGCAATTAGAACACATTGAAGACATATATTTGAGCTCCTTAGAGATTCTCATCCACCTTTGAGGTAACTTTTTGTACTTTAGGTTTTCTCAAGTCAGAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGGGTTGGGCAGTAATAAAATTTTGATACAT-------------AAAGTTAATTGCCTAAGCTTAGTAAATGGGGGACAGGCTTGCTTATCAACAGTCTTTGTAGTATTTTATGCTGAAACAGCCTTGAGGCTCAGACCCAGCCCACAGCTCTCTGCACTCCCTCCACCTCCCTTCTGCCCCTTTCATGTATAGCC---TTTACAGCAATTTTTCT--GtgagttcttttcctttttgagatcTCTCTTAAGGTTAAT---------GGTGTACAGt--------agaacttattcatcctttTTAGCTGAAACATTTTACCCTTTGACAAATGCCTCCCCATGTCCCCTGGGTGGAATTTTCAATAGGTAGTTAGGGAAAGCCTCACTGAAAAGGTTGGGATTTTGGGATGCTGATAACATTCAGTTTCTTGAACTAGGTACCTTTACACAGGAGTTATCAGTTGATAACAATTCATTGAGCAATATACTTATGATTTGTACAATGTACTTTTTGTAT----------------GTTATAGAtgaataaaaaattcagaaatctcataaaggtgatatttggatAAAGACTTGAAGGAAGTGTGGAGGCAAGAAACATAAACATCTGGGGAAAGagggttccaggcagaggagatGGCATGTATAGGTGCCACAAAGCAGGAGCACGCCTGGCATGATTGAGACTGCAGGGAGTCCTCATCTCTTCCTCACCT--------------------------CCCCTACACCTCTGAAATGACCATTTC-AgaaattatgaaatttatttacatacatttatcTTAACAAAT----ACTTTCGATATTTTACAAGTGTAACTACaagtttattataga--------------------aaaatttgagaaaacaTACGTATCCACAAGAATACAATATAaccatttaacatttaaaatttttcctttcatcATACTTATATTCATAGAGTAGTATTGGTATTTAAGTATAAAATGTACTATACATGTTTATagtattcatatttatattttaatgttcagAACTGATTAGTTAATCCATCAATAACAATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87685324 1479 - 132174527 CCAATTGGAATGAAATGGTCCCCAGATCCTGTTTTCATGTAAGAATAAGTTTGGAAGTATCCAGATTTGATGGTGGGCCAGGCCTCTCCTGTGAGCAGTA-AGTTCAGGAAACCTGAACTTCCCTTTCCCTCTGCCTTCCCTGGGGTAATGTGAATGCCTCTTAGTCTTCCATGTTCCTGTCTGTAACTTGGAGGAGGAAGAGAAGAGCCTCATTGCACATATTGGCCCATTTAGAATGATCTTAGACCCATAATTTACAATATTTTGAAGTTAGGTTTTATTTTTACCATTCCA-----CATATCTCCCAATATGTTGTGCCAGATTGTAAGTAATTTGCAATGAGAATATGTGGAAGACATATATTTGAACTCCTTAGAGAGTCTCACCCACCTTTGAGGTAAC--TTTGTATTTTAGGTTTTCTCAAGTCATAGTGTTGAGTCCTTAAATCAGAGTTGGGCAGTGATAAAATTTTGATACAT-------------AAAGTTAGTTGTCTAAGCTTAGTGAATGGGGGACAGGCTTGCTTATTAACAGTCTATGTGGCATTTTATGCTGACAAAACCTTGAGGCTCAGACTCAGCCCACAGCTCTCTGCACTCCCTCCACCTTCCTCCTGCCCCTCCCATGTATATCC---TTTACAGCAATTTTT----GTGAGTTCTTTTTC-TTTTGAGGTCTGTCTTAAGGTTAat---------ggtgtacagtagatatccagaacttactcatcctgtttagctgaaacattgtaccctttgac-aatgtctctccaCACCCGCTGGATGGAATTTTCAATAGTTGGTCAGggaaagcctcactgaaaa-----ggattttgcaatgctgataacact--gtttcctgaactaggtacctttacacaggag-tatcagttgataataattcaatgggcaatatacttatgatttgtccactgtactttttgtataGATGAATATACAAAAGATATAGATAAATTAAAAATTCAGAAATCTCATAaaggtgatatttggataaagacttgaagaaagtgtggaggcaagaaatataaacgtctggggaaagagggttccaggcagaggagatggcatgtataggtgccatgaggcagaagcatgcctggcatgattgagacagcagggagtccTTTTCTCTTTCTCACCTTCACTATATTTAAATATGGCTTCCACCCACCACACCTCTGAAATGGTCACTTCAAAAAATCATGAAATTTATTTACATAAATTTATCTT---AAAT----ACTTTTGATATTTTACAAGTATAACTACAC-TTTATTATAGAAAATATACACTTATTAAAGTAAAATTTGAGAAAACATATATAGCCACAAGAATACAATGTAAC----TAACATTTAAAGTTTTTCCTTTCATCATACTTATATTCA--GAGTAATATTTGTATTTAAGTGTAAAATTGATGATACA--TTTATATTATTCATATTTCTATTTTATTATTAAGAACTGATTAGTTAATTCAATAATAACAATT i calJac3.chr10 C 0 I 159 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=951251.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 339479 795 + 478999 gattgtgaatgttccagggactactctaaatgctcatgcacatagcagtgaacaaaatgtacaaaaattcctatgtggaacttatattccaaagggagacaacaggtgttaaataaataagtaaactata--gtatattagggagtgatgaggaaacgtggagaaaaattagaaacgtcaggtcaatagggagtgtgtgtgggagctggcagaggtgcattttaCCCC---------CAGCCTTACTAAGATGTAATTGACAAAAACAGTATACAGATTCACATGAGAAGAAAAAACAATTCACAGAACTAGCATT------------------------------TGACTGTTTGGTGAGACATTCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACGATTTTCCATAGGGAGCTACTCTGTCACTTGGGTCTTTTCCCAGTTAAG-------CAAGGCTACTTTCCATGGAATCATTATCCAGTATATGAGGCTCACTTGGCACTTGTTCAATATGCGCTTGCCTTATAATAGGTGATTGGAtatttttt--------attaaaa--aactatgcatttgtggcatacaagatgattttttg-atatgtatacatggtgaaatgattaattcaaactaattaacat--ttatcacttctacatactttcattttattg-tgtgagaacatttaaaa--tctcttctaaaaatttcaagtatacTTttggccctatgtttccatgagttccacattcaggcattcaaccaactggatagaaactatttgtacaaaaaacccaca-aaaaatacagtaaaagcaa-taaaaataaaaaaatgcagtataacaactacttat s panTro4.chrUn_GL393519 180645 837 + 413329 gattgtgaatgttccagggactactctaaatgctcatgcacatagcagtgaacaaaatgtacaaaaattcctatgtggaacttatattccaaagggagaaaagaggtgttaaataaataagtaaactatatagtatattagggagtgatgaggaaacgtggagaaaaattagaaatgtcaggtcaatagggagtgtgtgtgggagctggcagaggtgcattttaCCGC---------CAGCCTTACTAAGATGTAATTGACAAAAACAGTATATAGATTCACATGAGAGGAAAAAACAATTCACAGAACTAGCATTGTTCTACTTCTTTCTTTACAGAGATGTATTTGACTGTCTGGTGAGACATTCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACGATTTTCCATAGGGAGCTACTCTGTCTCTTGGGTCTTTTCCCAGTTAAG-------CAAGGCTACTTTCCATGGAATCATTATCCAGTATATGAGGCTCACTTGGCACTTGTTCAATATGCGCTTGCCTTATAATAGGTGATGGGATATTTttttattttatattaaaa--aactatgcatttgtggcatacaagatgattttttg-atatgtatacatggtgaaatgattaattcaaactaattaacatatttatcatttccacatactttcattttattg-tgtgagaacatttaaaa--tctcttctaaaaatttcaagtatacTTttggccctatgtttccatgagttccacattcaggcattcaaccaactggatagaaagtattagtacaaaaaacccaca-aaaaatacagtaaaagcaa-taaaaataaaaaaatgcagtataacaactatttat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87958412 838 - 170124641 GATTGTGAatgttccagggactactgtaaatgctcatgcacatagcagtgaagaaaatgtacaaaaattcctatgtggaacttacattccaaagggagaagacaggtggtaaataaataagtaaactatatagtatgttagggagtgatgagtaaacgtggtgaaaaattagaaatgtcaggtcaata-ggagtgtgtgtgggagCTGGCAGAGGTGCATTCCCCCCCGCCCC----CGGCCTTATTAAGATGTAATTGACAAAAACAGTATATAGATTCACATGAGAAGAAAAAACAATTCACAAAACTAGCATTGTTTTACTTCTGTCCTTACAGAGATATGTTTGACTGTTTGGTGAGACATTCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACAATTTTCCACAGGGAGCTACTCTGTCACTTGAGTCTTTTCCCATTTAAGCAAGGCTCAAGGCTACTTTCCATGGACTCATTATCCAGTATGTGAGGTTAGCTTGGCACTTGTTCAATACGTGCTTGCTTTATAATAGGTGATTGAGTATTtttt-attttatattaaaa--aactatgtatttgtggcatacaagatgattttttg-atatgtatatgtggtgaaatgattaattcaaactaattagcatatttatcacttccacatactttcattttactg-tgagagaacatttaaaa--tctcttttaacaatttcaagtatacttttggccttatgtttccatgagttccacattcaggcattcaaccaactggatagaaagcattagga-aaaaaacccaca-aaaaatacaataaaagcaa-taaaaaaaa--------agtataacaactatgtat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88235960 837 - 171882078 GATTGTGAatgttccagggactactgtaaatgctcatgcacatagcagtgaagaaaatgtacaaaaattcctatgtggaacttacattccaaagggagaagacaggtggtaaataaataagtaaactatatagtatgttagggagtgatgagtaaacgtggtgaaaaattagaaatgtcaggtcaata-ggagtgtgtgtgggagCTGGCAGAGGTGCATTCCCCCCC-CCCC----CCGCCTTATTAAGATGTAATTGACAAAAACAGTATATAGATTCACATGAGAAGAAAAAACAATTCACAAAACTAGCATTGTTTTACTTCTGTCCTTACAGAGATATGTTTGACTGTTTGGTGAGACATTCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACAATTTTCCACAGGGAGCTACTCTGTCACTTGGGTCTTTTCCCATTTAAGCAAGGCTCAAGGCTACTTTCCATGGACTCATTATCCAGTATGTGAGGTTAGCTTGGCACTTGTTCAATACGTGCTTGCTTTATAATAGGTGATTGAGTATTTTTT-ATTTTATATTAAAA--AACtatgtatttgtggcatacaagatgattttttg-atatgtatatgtggtgaaatgattaattcaaactaattagcatatttatcacttccacatactttcattttactg-tgagagaacatttaaaa--tctcttttaacaatttcaagtatacTTttggccttatgtttccatgagttccacattcaggcattcaaccaactggatagaaagcattagga-aaaaaacccaca-aaAAATACAATAAAAGCAA-TAAAAAAAA--------agtataacaactatgtat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85357258 842 - 162156779 GATTGTGAATGTTCCGGGGACTACTGTAAATGCTCATGCACATAGCAGtgaagaaaatgtacaaaaattccTATGTGGAACTTACATTCCAAAGGGAGAAGACAggtgataaataaataagtaaactataTAGTATGTTAGGGAGTGATGAGTAAATGTGGTGAAAAATTAGAAACGTCAGGTCAATA-GGAGTGTGTGTGGGAGCTGGCAGAGGTgcattccccccc-cccccccgccgccTTATTAAGATGTAATTGACAAAAACAGTATATAGATTCAcattagaagaaaaaacaattcacAAAACTAGCATTGTTTTACTTCTGTCCTTACAGAGATATGTTTGACTGTTTGGTGAGACATTCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACAATTTTCCACAGGGAGCTACTCTGTCACTTGGGTCTTTTCCCATTTAAGCAAGGCTCAAGGCTACTTTCCATGGACTCATTATCCAGTATGTGAGGTTAGCTTGGCACTTGTTCAATACGTGCTTGCTTTATAATAGGTGattgagtatttttt-attttatattaaaa--aactatGTATTTGTGGCATACAAGATGATTTTTTG-ATATGTATATGTGGTGAAATGATTAattcaaactaattaacatatttatcacttccacatactttcattttactg-tgagagaacatttaaaa--tctcttttaacaATTTCAAGTATACTTTTGGCCTTATGTTTCCATGAGTTCCACATTCAGGCATTCAACCAACTGGATAGAAAGCAttagga-aaaaaacccaca-aaaaatacaataaaagcaattaaaaaaaa--------agtataacaactatgtat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87686962 818 - 132174527 GATTGTGAatgttccagtgaccgctctaaatgctcttgcacatagcagtaaacaaaatgtatgaaaattcctatgtggaacttagattccaa----agaaggcaggtggtaaataaattagtaaactatatggtattttagggactgatgagtaaacatggagaaaaattagaaatgccaggtcaatagggagtgtgtgtgggagttggcaggggtgcattttCACCC---------CATCCTTATTAAGGTATAATTGACAAAAACAGTATATAGATTTACATGAGAAGTAAAAGCAATTCACAGAACTAGCATTGCTTTACTTCTGTCTTTTCAGAGATACATTTGGCTGTTTAGTGAGACATCCTGGAGTTTAAGCTGTCATTTAAACCAGTTACAGTTTTCCATAGGGAGCTAGTCTGTCACTTGGATCTTTTCCCAATTAAG-------CAAGACTACTTTCCATGGAATCACTATCCAGTATGTGAGGTTAACTTGGCGCTTATTCAATA--TGCCTGCTCTATAATAGGTAATTTTGTATT-----ATTTTGTATTAAAAATAACTA------tatggcatacaagatggttttttgaatacgtatacatggtgaaatgattagttcaaactaataaacatatttatcacttccacatacttttgttttactgttgtgagaacatttaaaattttttttttaacaatttcaagtatacTTTTGGGCATATgtatccatgagttccacattcaggcattcaaccaactggacagaaaatattagga-caaaaccccccacaaaaatacaataaaaataa-aaaacaata--------ccaatagcaactatttac i calJac3.chr10 I 159 I 308 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=3443736.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 340274 2815 + 478999 aaaacatttatattttattagtattataagtaatctatagatgatttaaagtgtatggaaaaatatgcgtaggttacatgcaaatataaaatgatatcattttatat-aagggacttgaacatcccaggattttggtgtccttggggagtcctggaacgaatcgcccccctgatattgCAGATATTTAGGGACAATGGtataacacatgactgttaactacagtcactatgctgtacagtagatctccaaaacttattcattctgtttagctgaaacattgtaccttttgaccaatatctctcaattccccTGAgtggaattttcaatagctagtcaggaaaggcctcaccgaaaaggtgatatttggtcaaagatttgaagggagtgttagggaaagaaatataaatatctgggaaaagagcattccaggcaaaggagatgacatgtatagggaccacaaggcaggagcatgcctgccatacttgagagacagtaaggaATCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTTCTCACCTCCAATATATTTAAATATGGCTTCCCCCCACCACACCCTTAAAATGGCCATTGCATAAATCACCAATAACATTtgtgttagtccattttacgttgctataaaggaatacctgagactgagtaatttataaagaaaagaggtttatttggctcatggtcctgcagtcaatacaagcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagcctaaggaaacttctactcattgaagaaagcaaagagggagcagttgtgtcacatggcaagaaagggagctaggtg---------gggagggggttgtcccatactctttttaaccatcagatctgatggtaactctactatgggtaaaatgcaaacccattcctgagggttgggttggataccatcaccatcccatgagggattcacctccataacacagacacctcccaccaggcaccccctctgacactggggatcacaattcagcctgagatttggagggTGcgttgaatataatgtgagctgtaggcttgtaatacatggtctttattatgttgaagtatatttcttctaaaccaactctgttgagaatcttttcatgaaacaatgttgaatttttcaaatgctatttctgcatctaattagatgattatataatttt-gggcttcattttgttaa---tgtatatcacatttatagatgtatgtatgttgatccaccttgtatccttggggtaaatccacttgagcatggtaagttatctttttaacgtgctgttgaattcagtgtgctagtatttgattgaggattctttcatctatgttcatcagggatattggcctataatttttcttttcttttcttttctttttcttgttcttgtctggctttggtgtcagagtaatgttggccacgtaaaaaaagtttgtaagtgaagtattccttcctcttagattttttttggaagagtttaaggattgctaattatttcagtgtttggtagaatacaacagtaaagctattctgggcttctctttgatgggagactttattacaattcaatcttcttactcatttttggtctgttcatactt----tttcttcatgattcagtcttggtatcttgcatgtatcttggaatttatttatttcttatactttattcaatttgttactgtacaatttttcatagtactctcttatgagctttttttt-cttatgagcttttatatttctatggtatcagttgtaatgtctcccttttcacttttgattgtattaatatttgagtcctttcttttttttccttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatccttctgaaaaaacactctttattacattgagttcttttctattgtagttttagtctctattttgtttatttctattcagatccttgttatttccttccttctgctgactttgggtttagtttgttctttttttattagttactagagttgtaatatcaggttgtttattttatattttcctttttaaatttttatgggtacacagtgactgtatatgtttatggggtacatgagatatttttctacaggcatacggtgtataataattacatcgcggtaaatgggatattcatcacttcaaacatttaccctttctttgtgttacaaacaatgcaattatgctcttttagttatttttaaatgtactataaat--tgtttggctatagtcaccttgttgttctatcaaatactagatcttacttattctatctaactgtatttttatgccgattatccattcctccccttaaccctactattcttcctagtctctggtaaccattactgtattctctatctccataaatccagttattttaagttttagctcccacaaataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtccctggcttattttatttaacgtaataacctccagttctatccatgttgttgcaaataacaggatctcattctttttcatggctgtatattactcgattgtgtacattaaccacattttctttatt----catctgttcatggacaaacaggttgcttccaaatcatgactattgtgaatagtgttgcaatatgcatgggagtgcaggtatctctcagatatcctgatttcctttcttttgtgtatatacctaccaatggcattgctgggtcatatggtagctctatttttgttttttttgagaaacctccaaactgttctccatagtgattgtactaatttacattcccaccaatagtgggttcccttttctccatatcctagcca s panTro4.chrUn_GL393519 181482 2797 + 413329 aaaacatttatattt-attagtattataagtaatctatagatgatttaaagtgtatggaaaaatatgcgtaggttacatgcaaatataaaatgatatcattttatat-aagggacttgaacatcccaggattttggtgtccttgggaagtcctgaaacgaatcgccccccagatattgCAGATATTTAGGGACAATGGtataacacatgactgttaactacagtcactatgctgtacagtagatctccaaaacttattcattctgtttaactgaaacattgtaccttttgaccaatatctcttatttccc--GAgtggaattttcaatagctagtcaggaaaggcctcactgaaaaggtgatatttggtcaaagatttgaagggagtgttggggaaagaaatataaatatctgggaaaagagcattccaggcaaaggagatgacatgtatagggaccacaaggcaggagcatgcctgccatacttgagagacagtaaggaATCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTTCTCACCTCCAGTATATTTAAATATGGCTTCCCCCCACCACACCCTTAAAATGGCCATTGCATAAATCACCAGTAACATTtgtgttagtccattttactttgctataaaggaatacctgagaccgagtgatttataaagaaaagaggtttatttggcttgtggtcctgcagtcagtacaagcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagcctaaggaaacttctactcattgaagaaagcaaagagggagcagttgcgtcacatggcaagaaagggagctaggtg---------gggagggggttgtcccatactctttttaaccatcagatctgatggtaactctactatgggtaaaatgcaaacccattcctgagggttgggttggataccatcaccatcccatgagggattcacctccataacacagacacctcccaccaggcaccccctctgacattggggatcacaattcagcctgagatttggagggTGcgttgaatataatgtgagctgtaggcttgtaatacatggtctttattatgttgaagtatatttcttctaaaccaactctgttgagaatcttttcatgaaacaatgttgaatttttcaaatgctatttctgcatctaattagatgattatataatttt-gggcttcattttgttaa---tgtatatcacatttatagatgtatgtatgttgatccaccttgtatccttggggtaaatccacttgagcacggtaagttatctttttaacgtgctgttgaattcagtgtgctagtatttgattgaggattctttcatctatgttcatcagggatattggcctgtaatttttcttttctttt----------tcttgttcttgtctggctttggtgtcagagtaatgttggccacgtaaaaaaagtttggaagtgaagtattccttcctcttagattttttttgga------------ttgctaattatttcagtgtttggtagaatacaacagtaaagctattctgggcttctctttgatgggagactttattacaattcaatcttcttactcatttttggtctgttcgtacttactttttcttcatgattcagtcttggtatcttgcatgtatcttggaatttatttatttcttctactttattcaatttgttactgtacaatttttcatagtactctcttatgagctttttttttcttatgagcttttatatttctatggt-tcagttgtaatgtctcccttttcacttttgattgtattaatatttgagtcctttctcttttttccttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatccttctgaaaaaacactctttattacattgagttcttttctattgtagttttagtctctattttgtttatttctattcagatccttgttatttctttccttctgctgactttgggtttagtttgttctttttttattagttactagagttgtaatatcaggttgtttattttatattttcctttttaaatttttatgggtacacagtgactgtatatgtttatggg-tacatgagatatttttctacaggcatacagtgtataataattacatcgcggtaaatgggatatccatcacttcaaacatttaccctttctttgtgttacaaacaatgcaattatgctcttttagttatttttaaatgtactataaat--tgtttggctatagtcaccttgttgttctatcaaatactagatcttacttattctatctaactgtatttttatgccaattatccattcctccccttaaccccactattcttcctagtctctggtaaccattactgtattctctatctccataaatccagttattttaagttttagctcccacaaataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtccctggcttattttatttaacataataacctccagttctatccatgttgttgcaaataacaggatctcattctttttcatggctgtatattactcgattgtgtacattaaccacattttctttatttactcatctgttcatggacaaacaggttgcttcgaaatcatgactattgtgaatagtgctgcaatatgcatgggagtgcaggtatctctcaggtatcctgatttcctttgttttgtgtatatacctaccaatggcattgctgggtcatatggtagctctatttttgttttttttgagaaacctccaaactgttctccatagtgattgtactaatttacattcccaccaatagtgggttcccttttctccatatcctagcca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87959250 2822 - 170124641 aaaacatttatattttatttgtattataaataatctatagatgatttaaagtatatggaagaatatgcataggttacatgcaaatataaaatgatatcattttatat-aagggacttgaacatcccagaattttggtgtccttggggagtcctggaaccaattg-cccccagatattgcagatatttagggacaatggtataacatatgactattaactacagtcaccatgctgtacaacagatctcc-aaatgtattcatcctgtttagctgaaacattgtatctttcaaccaatatctttcaattccccTGGgtggaattttcaatagctagtcaggaaaggcctcactgaaaaggtgatatttggtcaaagatttgaagggagtgtgggggaaagaaatataaatatctgggaaaagagcattccaggtagaggagatggcatgtataggggccacgaggcaggagcgtgcctgccatacttaaaagacagtaaggaATCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTCCTCACCTCCAATATATTTAAATATGGCTTCCCCCCACCACACCCTTAAAATGGCCATTGCATAAATCACCAATAACATTtgtgttagtccattttacattgatataaaggaatacctgagattgagtaatttataaagaaaagaggtttatttggctcatggtcctgcaggcagtacaagcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagcctaaggaagcttttactcatagaagaaagcaatggagaagcaggtgtgtcacatagcaagagagggagcaaggttgtgtgtgtggggggggtgttgttccatactctttttaaccatcagatctaatggtaactctactataggtaaaatacaaacctgttcatgagggttgggttggataccatcaccatccaatgagggattcacccccataacacagacacctcccaccaggcaccccatctgacattggggatcacaattaaacctgagatttggagggtacGttgagtataatgtgagctgtaggcttgtaatatatggtctttattgtgttgaagtatatttcttctaaaccaactctgttgagaatcttttcatgaaacaatgttgaatttttccaatgctatttctgcatctaattcgatgattatataattttggggcttcattttgttaatgttgtatgtcacatttatagatttatgtatgttgatccatcttgcatccttggggtaaatccacttgagcatggtaagttatctttttaatgtgctattgaattcagtgtgctagtatttgattgaggattcatgcatctacgttcatcagggatattgatctgtcatttttcttttctttt----------tcttgttcttgtctgtctttggtatcagagtaatgttggccatttaaaaaaagttgg-----gaagtattccttcctcttagatttttttgggaagagtttgaggattgctaattatttaaatgtttggtagaatacaacagtaaagctattctgggcttttctttgatgggagactttattacaattcaatcttattactcatttttgatctgttcatacttactatttcttcttgattcagtcttggtatctttcatgtatcttggaatttatttatttcttctactttattcaatttgttagtgtacaactgttcataatactttcttataagctttttttttcttatgagcttttatatttctatggtatcagttgtaatgtctcccttttcacttttgattgtattaatatttgagtcctttctctttttttcttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatccttctgaaaaaatactctttattacattgagttcttttctattatagttttagtctctattttgtttatttgcattctgatccttgttatttctttccttctgctgactttgggtttagtttgctttccttttattagtcacttgagttgtaatatcaggttgtttattttatattttccttttttaatttttatgggtacacagtgactgtatatgtttatggggtacatgagatattttgctacaggcatacagtgtataataattacatcatagtaaatgggatatccatcacttcaaacatttaccctttctttgtgttacaagcaatgcaattatgctcttttagttatttttaaatgtactatgaattatgtttggctaaattcaccttgttgtgctatcaaatactagatcttatttatcccatttaactgtatttttatacccattatccattcctccccttaaccctactattcttcctagtctctggtaaccattactctattctctatatccatgaatccagttattttaagttttagctcccacagataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtccctggcttattttgtttaacataataacctccagttctatctatgttgttgcaaataacaggatctcattctttttcatgactgtgtattactccattgtatatattaaccacattttctttatttattcatctgttcatgggcacacaggttgcttccaaatcatggctattgtgaatagtgcttcagtatgcttgggaatgcaggtatctctcagatatcctgatttcctttcttttatgtatatacctaccaatggcattgctgggtcatatggtagctctatttttgttttctttgagaaatctccaaactgttctccatagtgattgtacttatttatattcccaccaacagtgggttcccctttctccatatgctagcca i rheMac3.chr7 C 0 I 329 s macFas5.chr7 88236797 2821 - 171882078 aaaacatttatattttatttgtattataaataatctatagatgatttaaagtatatggaagaatatgcataggttacatgcaaatataaaatgatatcattttatat-aagggacttgaacatcccagaattttggtgtccttggggagtcctggaaccaattg-cccccagatattgcagatatttagggacaaTGGtataacatatgactattaactacagtcaccatgctgtacaatagatctcc-aaatgtattcatcctgtttagctgaaacgttgtatctttcaaccaatatctttcaattccccTGGgtggaattttcaatagctagtcaggaaaggcctcactgaaaaggtgatatttggtcaaagatttgaagggagtgtgggggaaagaaatataaatatctgggaaaagagcattccaggtagaggagatggcatgtataggggccacgaggcaggagcgtgcctgccatacttaaaagacagtaaggaATCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTCCTCACCTCCAATATATTTAAATATGGCTTCCCCCCACCACACCCTTAAAATGGCCATTGCATAAATCACCAATAACATTtgtgttagtccattttacattgatataaaggaatacctgagattgagtaatttataaagaaaagaggtttatttggctcatggtcctgcaggcagtacaagcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagcctaaggaagcttttactcatagaagaaagcaacggagaagcaggtgtgtcacatagcaagagagggagcaaggttgtgtgtgt-gggggggtgttgttccatactctttttaaccatcagatctaatggtaactctactataggtaaaatacaaacctgttcatgagggttgggttggataccatcaccatccaatgagggattcacccccataacacagacacctcccaccaggcaccccatctgacattggggatcacaattaaacctgagatttggagggtacGttgagtataatgtgagctgtaggcttgtaatatatggtctttattgtgttgaagtatatttcttctaaaccaactctgttgagaatcttttcatgaaacaatgttgaatttttccaatgctatttctgcatctaattcgatgattatataattttggggcttcattttgttaatgttgtatgtcacatttatagatttatgtatgttgatccatcttgcatccttggggtaaatccacttgagcatggtaagttatctttttaatgtgctattgaattcagtgtgctagtatttgattgaggattcatgcatctacgttcatcagggatattgatctgtcatttttcttttctttt----------tcttgttcttgtctgtctttggtatcagagtaatgttggccatttaaaaaaagttgg-----gaagtattccttcctcttagatttttttgggaagagtttgaggattgctaattatttaaatgtttggtagaatacaacagtaaagctattctgggcttttctttgatgggagactttattacaattcaatcttattactcatttttgatctgttcatacttactatttcttcttgattcagtcttggtatctttcatgtatcttggaatttatttatttcttctactttattcaatttgttagtgtacaactgttcataatactttcttataagctttttttttcttatgagcttttatgtttctatggtatcagttgtaatgtctcccttttcacttttgattgtattaatatttgagtcctttctctttttttcttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatccttctgaaaaaatactctttattacattgagttcttttctattatagttttagtctctattttgtttatttgcattctgatccttgttatttctttccttctgctgactttgggtttagtttgctttccttttattagtcacttgagttgtaatatcaggttgtttattttatattttccttttttaatttttatgggtacacagtgactgtatatgtttatggggtacatgagatattttgctacaggcatacagtgtataataattacatcatagtaaatgggatatccatcacttcaaacatttaccctttctttgtgttacgagcaatgcaattatgctcttttagttatttttaaatgtactatgaattatgtttggctaaattcaccttgttgtgctatcaaatactagatcttatttatcccatttaactgtatttttatacccattatccattcctccccttaaccctactattcttcctagtctctggtaaccattactctattctctatatccatgaatccagttattttaagttttagctcccacagataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtccctggcttattttgtttaacataataacctccagttctatctatgttgttgcaaataacaggatctcattctttttcatgactgtgtattactccattgtatatattaaccacattttctttatttattcatctgttcatgggcacacaggttgcttccaaatcatggctattgtgaatagtgcttcagtatgcttgggaatgcaggtatctctcagatatcctgatttcctttcttttatgtatatacctaccaatggcattgctgggtcatatggtagctctatttttgttttctttgagaaatctccaaactgttctccatagtgattgtacttatttatattcccaccaacagtgggttcccctttctccatatgctagcca i macFas5.chr7 C 0 I 2 s papAnu2.chr7 85358100 2821 - 162156779 aaaacatttatattttatttgtattataaataatctatagatgatttaaagtatatggaagaatatgcataggttacatgcaaatataaaatgatatcattttatat-aagggacttgaacatccCAGAATTTTGGTGTCCTtggggagtcctggaaccaattgcCCCCCAGATATTGCAGATATTTAGGGACAATGGTATAACATATGactattaactacagtcaccatgctgtacaatagatctcc-aaATGTATTCATCCTGTTTAGCTGAAACGTTGTATCTTTCGACCAATATCTTTCAATTCCCCTGGGTGGAATTTTCAATAGCTAGTCAGGAAAGGCCTcactgaaaaggtgatatttggtcAAAGATTTGAAGGGAGTGTGggggaaagaaatataaatatctgggaaaagagcattccaggtagaggAGATGGCATGTATAGGGGCCACGAGGCAGGAGCGTGCCTGCCATACTTAAAAGACAGTAAGGAATCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTCCTCACCtccaatatatttaaatatggcTTCCCCCCACCACACCCTTAAAATGGCCATTGCATAAATCACCAATAAcatttgtgttagtccattttacattaatataaaggaatacctcagattgagtaatttataaagaaaagaggtttatttggctcatggtcctGCAGGCAGTACAAGcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagcctaaggaagcttttactcatagAAGAAAGCAACGGAGAAGCAGGTGTGTCACatagcaagagagggagcaaggttgtgtgtgt-gtgggggtgttgTTCCATACTCTTTTTAACCATCAGATCTAATGGTAACTCTACTATAGGTAAAATACAAACCTGTTCATGAGGGTTGGGTTGGATACCATCACCATCCAATGAGGGATTCACCCCCATAACacagacacctcccaccaggcacccCATCTGACATTGGGGATCACAATTAAACCTGAGATTTGGAGGGTACGTTGAGTATAATGTGAGCTGTAGGCTTGtaatatatggtctttattgtgttgaagtatATTTCTTCTAAACCAACTctgttgagaatcttttcatgAAACAATGTTGAATTTTTCCAATGCTATTTCTGCATCTAATTCGATGATTATATAATTTTGGggcttcattttgttaatgttgtatatcacatttatagatTTATGTATGTTGATCCATCTTGCATCCTTGGGGTAAATCCACTTGAGCATGGTaagttatctttttaatgtgctattgaattCAGTGTGCTAGTATTTGATTGAGGATTCATGCATctacgttcatcagggatattgatctgtcatttttcttttctttt----------tcttgttcttgtctgtctttggtatcagagtaatgttggccatttaaaaaaagtttg-----gaagtattccttcctcttaGAtttttttGGGAAGAGTTTGAGGATtgctaattatttaaatgtttggtagaatacaACAGTAAAGCtattctgggcttttctttgatgggagactttatTACAATTCAATCTTATTACTCATTTTTGATCTGTTCATACttactatttcttcttgattcagtctTGGTGTCTTTCATGTAtcttggaatttatttatttcttctactttattCAATTTGTTAGTGTACAACTGTTCATAATACTTTCttataagc-ttttttttcttatgagCTTTTATGTTTctatggtatcagttgtaatgtctccctttTCACTTTTGATTGTATTAATATttgagtcctttctctttttttcttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatcCTTCTGAAAAAATACTCTTTATTACATTGAGTTCTTTTCTATTATAgttttagtctctattttgtttatttgcattctgatccttgttatttctttccttctgctgactttgggtttagtttgctttCCTTTTATTAGTCACTTGAGTTGTAATATCaggttgtttattttatattttccttttttaatttttatgggtacacagtgactgtatatgtttatggggtacatgagatattttgctaCAGGCATACAGTGTATAATAATTACATCATagtaaatgggatatccatcacttcaaacatcTACCCTTTCTTTGTGTTACGAGCAATGCAATtatgctcttttagttatttttaaatgtactatgAATTATGTTTGGCTAAAttcaccttgttgtgctatcaaatactagatcttatttatcccatttaactgtatttttatacccattatcCATTCCTCCCCTTAACCCTACTATTCTTCCTAGTCTCTGGGAACCATTACTCTATTCTCTATATCCATGAATCCAGTTATTTTAAGTTTTAgctcccacagataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtccctggcttattttgtttaacataataacctccagttctatttatgttgttgcaaataacaggatctcattctttttcatgactgtgtattactccattgtatatattaaccacattttctttatttattcatctgttcatgggcacacaggttgcttccaaatcatggctattgtgaatagtgcttcagtatGCATGGGAATGCAGGTATCTCTCAGAtatcctgatttcctttcttttatgtatatacctaccaatggcattgctgggtcatatggtagctctatttttgttttctttgagaaatctccaaactgttctccatagtgattgtacttatttatattcccaccaacagtgggttcccctttctccatatgctagcca i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s calJac3.chr10 87688088 2754 - 132174527 aaaacatttatattttactagtattataagtgatctatagatgatttaaaatatatgggagaatatgcataggttacatgcaaatataaaataatatcattttatgtcagggggcttgagcatcccaggatttgggcatccttggcgagtcctggaaccaattgaccccccgatatgacagatatttaggggcaaTGGtataacatatggttatgaactatagttgccctgctgtacagtagatcaccaaaactcattcatcctgtttagctgaaagattgta-cttttgaccaatgtctcttaattccccTGGgtggaatttccaatagctagccaggaaaggcctctctgaaaaggtgata-ctagtcaaggatttgaagggagtgtgggggaaagaaatatgaatatctgggaaaagagcattccaggcagaggaaatggcatgtataggggccatgaggcaggggcatgcctgtcatgcttaagagacagtaaggagTCTTCATCTTTTCCTCATGTCTTCCTCACCTCCAATATATTTAAATGTGGCTT-TCCCCACCACATCCTTAAAATGGCCGTTGCATAAATCACAAATAAGCTTtgtgttagtccattttacactgctataaaggaatacctgagatggaataatttataaagaaaagaagtttatttggcttatagtcctgcaggaggtacaagcatggcatcagcatctgcttagcttctgaagccccaggaagctttcactcactgcagaaagcaaagggagagcaggtgtgtcacatggcaagagagggagcaagatggg-------ggtggggggttgtcccatactctttttaattatcatgtctgatggtaactctaccctgggtaggataccaacccatccgtgagggttgggttggataccatcaccatcccatgagggatccacccccataacctggacacctccccctaggcaccctctctgatatggaagatcacaattcaacctgagatttggagggtaca-TGagtataatgtaagctgtaggcttgtcagagatggtctttattgtgttgaagtatatttcttctaaaccaactttgttgagaatcttttcatgaaacaatgttgaatttttcaaatgctatttctgcatctaattagatgattatataatttttgagcttcattttgttaatgttgtgtatcacattcatagacttatatatgttgatcctccttgtatccttggggtaaatccactcgagcatggtaaattatctttttaatgtgctattgaattcagtgtgctagtatttgattgaggattcttgcatctatgttcatcagggatattggcctgtaatttttcttttcttttcttt------tcttattcttgtctggctttgctatcagagtcatgttggccatataaaaaaagtgtg-----gaagtattttttcctcttagatttttt--ggaggagtttgaggattgctaattatttaaatgtttgatagaatacatcagtaaagctattctgggcttttctttgttgggaaactttattataattcaatattcttactcatttttggtctgttcagacttactattt-ttcatgattcagtcttggtatcttgtatgtatcttgga----atttatttcttctactttattcaatttgttagtatacaattgttcatagaaccctctgatgaac-ttttatttcttatgaccttttatatttctgtggtatcagttgtaatgtctcccttttcacttttgattgtattaatatttgagtcctttc--tttttttcttggtctggctaaaggtttgttgatttgtttatccttctgaaaaaccgctattt----cattgagttcttttctgttgtagttttagcctctattttatttatttctgttctgatccttattatttctttccttctgctgactttgggtttagtttgttcttcttttattagtcacttgaattgtaatatcagattg-ttattttatattttc--tTTAAAAATTTTAAAAAT------------------------------------tattttgctacaggcatacaatgtataataattacatcagggtaaatgggatatccattacctcaagcatttatcctttctttgtgttacaaaccatacaattatactcttttagttattgt---atgtactgtaaattatgtttggttatagtcaccctgtcatgccatcaaatactagatcttatttattccatctaactgtatttttataaccattatccattcttccccttaaccctagtattcttcccagtctctggtaaccatta-------ctctatctctatgagt-taattattttaaattttagctcccataaataagtgagaacatggaaaatttgtctttctgtctctggcttattttatttaacataataacctccagttctattcattttgttgcaaatgagaggatctcattctttttcatggctggatattactcctttgtgtgtatgaaccacattttctttatttattcatctgttcatagacacacaggttgcttctaaatcatggctattatgaatagtgctgcaatatgcatgggagtgcagatgcctctccaatatcctgattgcctttcttttgtgtatatacctagcaatggcatttctgggtcgtacagtagctctatttttagtttttatgagaaacctccaaactattctctgtagtggttgtactaatttacattcccatcaacagtgggctcccttttctccatatcctagcca i calJac3.chr10 I 308 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=-121.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 343089 2 + 478999 ct s panTro4.chrUn_GL393519 184279 2 + 413329 gt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87690842 2 - 132174527 gc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85360921 2 - 162156779 I e macFas5.chr7 88239618 2 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87962072 329 - 170124641 I a score=9690.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 343091 7 + 478999 atttctt s panTro4.chrUn_GL393519 184281 7 + 413329 atttctt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87962401 7 - 170124641 atttctt i rheMac3.chr7 I 329 C 0 s macFas5.chr7 88239620 7 - 171882078 atttctt i macFas5.chr7 I 2 I 3767 s papAnu2.chr7 85360923 7 - 162156779 atttctt i papAnu2.chr7 I 2 I 802 s calJac3.chr10 87690844 7 - 132174527 atttctt i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=152844.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 343098 317 + 478999 actgcctgtcttttggatataagccattttaactagggttagatgattcgtcttgtagttttggtttgcatttccctgatgagcaatgatgctgagcactttttcacatgcctgtttgccatttatgtgtc-----ttcttctgagcaagatcttttgcccatttttaaattggatgatcagaattttcctatagagttgtttgagttccttatatattctggttattaatcccttgccagatggatagtttacaaatattttctcctattttatgattgtc-ttttcaacatcaattgaaatgatcctatggtttttgtttt s panTro4.chrUn_GL393519 184288 317 + 413329 actgcctgtcttttggatataagccattttaactagggttagatgattcgtcttgtagttttggtttgcatttccctgatgagcaatgatgctgagcactttttcacatgcttgtttgccatttatgtgtc-----ttcttctgagcaagatcttttgcccatttttaaattggatgatcagaattttcctatagagttgtttgagctccttatatattctggttattaatcccttgccagatggatagtttacaaatattttctcctattttatgattgtc-ttttcaacatcaattgaaatgatcctatggtttttgtttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87962408 317 - 170124641 actgcctgtcttttggatataagccattttaactggggttagatgattcatcttgtagttttggtttgcatttctctgatgatcaatgatgttgagcactttttcacatgcctgtttgctatttatatgtc-----ttcctttgagcaagatcttttgcccattttaaaattagatgatcagatttttcctattgagttgtttgagctccttataaattctggttgttaatcccttgtcagatggatagtttacaaatattttctcctattttatggttgtctttttcaacatc-attgaaatgatcctatggtttctgtttt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87690851 323 - 132174527 accgcctgtcttttggatataagccattttaactggtgttaggtgattcctcttgtagtgctggtttgcatttctctgatcatcaatgatgttgagcaccttttcacatgcctgtttgccatttatatgtcttttttttttttgagaaagatcttttgtccatttttaaattggatgatcagacttttcctacagagttgtttgagctccttatatagtctggttattcatcccctgtcagatatatagtttacaaatattttctcctatcctatggttgtgtttttcaacattgattgaaatgatcctatagtttttgtttt i calJac3.chr10 C 0 I 1427 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85360930 802 - 162156779 I e macFas5.chr7 88239627 3767 - 171882078 I a score=122419.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 343415 477 + 478999 taactttatgtgatgaatcacatttattgatttgcatatgttgaatcatcctagcatttctagaataaaactcaatcgatcatggtgaattaaatttttaatgtgctgttggatttagtttgttagtattttgttgaggatttttgcagcagtgttcatcagggatattggtctgtagttttcttttgttgatatgtctctttctggttttatatcagagtaatactggcctaatagaatgaatttggatgtattctgtgttcctatattttttggaatagtttgaatagtgttggtattaattcctctat-aatatttggtaaaattcagcagagaagccaccatgtcctgggattttcttcgctgggagactttttattagggctttgatctcattacttgttattggtttgttcaggttttggatttcttcatggctcaaacctcataggttgtatgtatctaagaatttatcta s panTro4.chrUn_GL393519 184605 477 + 413329 taactttatgtgatgaatcacatttattgatttgcatatgttgaatcatcctagcatttctagaataaaactcaattgatcatggtgaattaaatttttaatgtgctgttggatttagtttgttagtattttgttgaggatttttgcatcagtgttcatcagggatattggtctgtagttttcttttgttgatatgtctctttctggttttgtatcagagtaatactggcctaatagaatgaatttggatgtattctgtgttcctatattttttggaatagtttgagtagtgttggtattaattcctctat-aatatttggtaaaattcagcagagaagccaccatgtcctgggattttctttgctgggagactttttattagggctttgatctcattacttgttattggtttgttcaggttttggatttcttcatggctcaaacctcgtaggttgtatgtatctaagaatttatcta i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87962725 478 - 170124641 taactttatgtgatgaattacatttattgatttgcatatgttgaatcatcctagcatttctggaataaaactcgcttgatcatggtgaattaattctttaatgtgatgttggatttagtttgctagtattttcttgaggatttttgcaccagtgttcatcagggatattggtctgtagttttcttttgttgatatgtctctttctggttttgtatcagagtaataatgtcctaatagaatgaatttagatgtattctgtgttcctatattttttggaatagtttgagtaggactggtattaattcttctatgggtatctggtaaaattcaacagagaagccatcatgtcctgggcttttctttgcggacagactttttattagggctttgatctcattacttgttattggtttgttcaggttttggatttcttcatagctcaaacttggtaggttgtatgtgtctaagaatttatcta i rheMac3.chr7 C 0 I 1 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85360930 802 - 162156779 I e macFas5.chr7 88239627 3767 - 171882078 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=1048030.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 343892 2098 + 478999 ttttatctggattttccggtttattggcatatggttgcaagtgatccttttaatttctgcagtattggttttatgtcttaattttatttatttgggtcttttcactttttctcttaggtaaagttttgttgattttgttcatcttttcaaaaaacaaacttttcactttgttgatcttctgtattgtatgctttgtttccatttcatttattactactctgatctttattatttattttctcctaataatttgggtttgtttgcttttgcttttttagtttttaaagatacatcactaggttatttgaaatttttctacttttttggtgtaggcacttgtagctataaactttcACttgccaggttttggtatcaaa-gagatgctggcttcatagaatgagttaggggggagtccattctcctcatttttgggaatagtttaagtagagttgatactagctcttctttgtatgcatggtagaatttggctgtgaaaccatctggtctaggacttttttggttggtagatttttattgctgcttctattttggaccttaatattggtcttttagggttttaatttctcccagattcaatcttgggaggttgtttccagaaattgatcaatttcctctagatttagtagtttgtgttcatagag--gtgttcctaatagtcttggaggatattctgtatttatcggatcatctgtaatgtcacctttgtcatttcttaatgtgattatttgaatcttctctctctcttcctcttgctctcgctctctctctgttactgtagctggcagcccatcaatcttgtttatccttttaaggaatcaacttttggtttcattgattcttggtattaattttctggtgtatttcaatcaggtctgctctggttttagttatttttttttctgctagctttgttttagcttttctagctattctgttggatgctaggtcattaatttgaggtatatctaactttctgcggtaattgtttggtgctataaacttttctcttaacactgcttttgctgcatcccagagatcttggcatattgtgtctctgttttcagttatttcaaagacttttttgatttctgccttaatttcattgttcacccagaagtcattcaggagcaagtcacttaatttccatgtagttgtgtagtgttgggtgatgtttttagtctttatttttatATGATATACTATTCTAAGCTGACAACAATCACAACTGTATGCTTTATTTGCCAACAACAACCGTACACTTTATTTCTCCTCTCCCACATTTTACGATTTTGATGTCAAAATATACATCATTTTCTTATGTGTATCCATTGACTATTTTTGCTCTATGTGTTTTAATAGATTTGTCTTTTAACCATTGTACTATAGG-AAAAAATTGCTTTACACATCATCATTACAGTCTTAGAATATTCTGGATATGACTTtgtatttcttatcccattgcatttgtgttctcatatgttttatatttttaattagcagccttttaattcagctcaaagaacttcctttagtaattctcttaagacatatttagtggtgatgaactctcatagcttttgtttgtctggaaaagtttttgcttttctctcatttgccaaggacaactttgctgggttaagtagacttgttggccttgttttttcccttcagcactttgaatacattatcctactctctcctggtctcctgagattttgttgagaaatccagtgacagctattttgatattcccttctatgtgatatgcttctaattacttgctgttttcaaaatgttttctttttctttaatttttggtatttgaattattgtacatcttggataactcctatttggcttaaacttgtttggataactctgcatttgctgtgtttagatgttagcaactttctccagatttggtagttctttagaatttcttcttcagatatgctttctggtctcttttctatttcttttctttctgaaaactcctattagatgaatattaggtcttaatagtttcccttcatatccagagtctgtctttattctttttcaatcttcttaattttttct s panTro4.chrUn_GL393519 185082 2092 + 413329 ttttatctggattttccggtttattggcatatggttgctagtgatccttttaatttctgcagtattggttttatgtcttaattttatttatttgggtcttttccctttttctcttaggtaaagttttgttgattttgttcatcttttcaaaaaacaaacttttcactttgttgatcttctgtattgtatgctttgtttccatttcatttattactactctgatctttattatttattttcttctaataatttgggtttgtttgcttttgcttttttagtttttaaagatacatcactaggttatttgaaatttttctacttttttggtgtaggcacttgcagctataaactttcACttgccaggttttggtatcaaaagagattctggcttcatagaatgagttaggggggagtccattctcctcatttttgggaatagtttcagtagagttgatactagctcttctttgtatgcatggtagaatttggctgtgaaatcatctggtctaggacttttttggttggtagatttttattgctgcttctattttggaccttaatattggtcttttagggttttaatttctcccacattcaatct-gggaggttgcttccagaaatttatcaatttcctctagatttagtggtttgtgttcatagag--gtgttcctaatagtcttggaggatattctgtatttatcggatcatctgtaatgtcacctttgtcatttcttaatgtgattatttgaatcttctctctctcaccttcttgctctcgctctctctctgttactgtagctggcagcccatcaatcttgtttatccttttaaggaatcaacttttggtttcattgattcttggtattaattttctggtgtatttcagtcaggtctgctctggttttagttatttttttt-ctgctagctttgttttagttgttctagctattctgttggatgctaggtcattaatttgagatatatctaactttctgcggtaattgtttagtgcaataaacttttctcttaacactgcttttgctgcatcccagagatcttggcatattgtgtctctgttttcagttgtttcaaagacttttttgatttctgccttaatttcattgttcacccagaagtcattcaggagcaagtcacttaatttccatgtagttgtgtagtgttgggtgatgtttttagtctttatttttatATGATATACTATTCTAAGCTGACAACAATCACAACTGTACGCTTTATTTGCCAACAACAACCGTACACTTTATTTCTCCTCTCCCACATTTTACGATTTGGATGTCAAAATTTACATCATTTTCTTATGTGTATCCATTGACTATTTTTGCTCTGAGTGttttaatagatttgtcttttaaccattgtactataag-aaaagattgctttacacatcatcattacagtcttagaataagagggatatgactttgtatttcttatcccattgcatttgtgttctcatatgttttatgtttttaattagcagccttttaattcagctcaaagaacttcctttagtaattctcttaagacatatttagtggtgatgaactctcatagcttttgtttgtctggaaaagtttttgcttt-----catttgccaaggacaactttcctgggttaagtagacttgttggccttgttttttcccttcagcactttgaatacattatcctactctctcctggtctcctgagattttgttgagaaatccagtgacagctattttgatattcccttctatgtgatatgcttctaattacttgctgttttcaaaatgttttctttttctttaatttttggtatttgaattactgtacatcttggataactcctatttggcttaaacttgcttggataactctgcatttgctgtgtttagatgttagcaactttctccagatttggtagttttttagaatttcttcttcagatatgctttctggtctgttttctatttcttttctttctcaaaagtcctattagatgaatattaggtcttaacagtttcccttcatatccagagtctttctttattctttttcaatcttcttaattttttct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87963204 2073 - 170124641 ttttctctggattttccagtttattggcatatggttgcaagtgatccttttaatttctgcagtattggttttatgtcttaattttatttatttgggtcttttccctttttctcttaggtaaagttttgttgattttgtttatcttttcaaaaaacaaacttttctctctgttgatcttctgtattgtatgttttgtttccatttcatttattactactctgacctttattatttattttcttctaataatttggatttgtttgcttttgcttttttagtttttaaagatacatcactaggttatttgaaatttttctacttctttggtgtaggcacttgtagctataaacttTTACttgccaggttttggtatcaaa-gagatg-tgccttcatagaatgagttagggaggagtccattctcatcatttttgggaatagtttcagtagaattggttctagctcttctttgtatatctggtagaatttggctgtgaaaccatctggtctaggacttttttggttggtagatttttattgttgcttctattttggaccttaatatttgtcttttagggttttaatctctcccagattcaatcttgggaggttatttccagaaatttatccatttcctctagatttagtagtttgtgttcatagaggtgtgttcctaatagtattggaggatattctgtattc-tgggatcatttgtaatgttacctttgtcatttcttaatgtggttatttgaatcttctctctct----------ctctctctctctctctcttactatagctggcagcccatcgatcttgtttatccttttaaggaatcaacttttggtttcattgattcttggcattaattttctggtctatttcattcagatctgctctggttttagttattttttttcctgctagctttgttttaatttttctagctcttctgtttgatgctaggtcattaatttgagatatatctaactttttgaggtaattgtttagtgctataaacttttcttttaacactgcttttgctgcatcccagagatcttggcatattttgtctctgttttcacttatttcaaagactttttttatttctgccttaatttcattgttcacccagaagttatccaggagcaagtcacttaatttccatgtacttatgtagtgttgggtgatgtttgtagtctttatttttatGTGATATACTATTCTAAGCTGACAGCAACAACAACTGTACAC--TATTTGccaacaacatctgtacactttatttctcctctcccacatttcatgtttttgatgtcaaaatttacatcatttt-taatgggtatccattgactatttttgctctatgtgttttaataggtttgtcttttaaccattgtactataggaaaaaaattgctttacacattgtcattacagtcttagaatattctggttatgactttgtatttcttataccaatgcgtttgcattctcatatgttttatgtttttaattagcagccttttaatttagctcaaataactccctttagtggttctcttaagatatatttagtggtaatgaactcccatagcttttgtttgtctggaaaagtttttttttt-ctctcatttgccaaggacaactttgctgggttaagtagtcttgttggc------------cttcagcactttgaatacattatcctactctctcctcgtctcctgggtttttgctgagaaatccagtgacagctattttggtattcccttgtatgtgatgtgcttctcattacttgctgttttcagaatgttttctttttctttaatttttgctattttgattactatacatcttggataattcctatttggcttaaacttgtttgcatacctctgcatttgttgtatttagatgttagcaactttctccagatttggtaattttttagaatttcttcttcaaatatgctttctggtctcttttctatttcttttctttctgaaaactcctattagatgaatattaggtcttaatagttttccttcatatccagagtctgtctttattcttttacattctttttatttttttct i rheMac3.chr7 I 1 I 570 s papAnu2.chr7 85361732 2078 - 162156779 ttttCTctggattttccagtttattggcatATGGTTGCAAGTGATCcttttaatttctgcagtattggttttatgtcttaattttatttatttgggtcttttccctttttctcttaggtaaagttttgttgattttgtttatcttttcaaaaaacaaacttttctctCTGTTGATCTTCTGTattgtatgttttgtttccatttcatttattactactctgacctttattatttattttcttctaataatttggatttgtttgcttttgcttttttagtttttaaagatacatCACTaggttatttgaaatttttctacttctttggtGTAGGCACTTGTAGCTATAAACTTTTacttgccaggttttggtatcaaa-gaGATG-TGccttcacagaatgagttagggaggagtccgtTCTCATCatttttgggaatagtttcagtagaattggttctagctcttctttgtatgtctggtagaatttggctgtgaaagCATCTGGTCtaggacttttttggttggtagattttTATTGTTGCTTCTATTTTGGAccttaatatttgtcttttaggGTTTTAATCTCTCCcagattcaatcttgggaggttatttccagaaatttatgcATTTCCTCTAGATTTAGTGGTTTGTGTTCATAGAGGTGTGTTCCTAATAGTATTGGAGGATATTCTGTATTC-TGGGATCATTTGTAATGttacctttgtcatttcttaatGTGGTTATTTgaacct----tctct----------ctctctctctctctctgttactaTAGCTGGCAGCCCATcgatcttgtttatccttttaaggaatcaacttttggtttcattgattcttGGCATTAATTTTCTGGTCTATTTCATTCAGATCTGCTctggttttagttattttttttcctgctagctttgttttaatttttctagctCTTCTGTTTGATGCTAGGTCATTAATTTGAGATATATCTAACTTTTTGAGGTAattgtttagtgctataaacttttcttttaacactgcttttgctgcatcccagagatctTGGCatattttgtctctgttttcagttatttcaaagactttctttatttctgccttaatttcattgttcacCCAGAAGTTATCCAggagcaagtcacttaatttccatgtacttaTGTAGTGTTGGGTGAtgtttttagtctttatttttatgtgatatACTATTCTAAGCTGACAGCAACAACAACTGTACAC--TATTTGCCAACAACATCTGTACACTTTATTTCTCCTCtcccacattttatgtttttgatgtcaaAATTTACATCATTTTCCAATGGGTATCCATTGACTATTTTTGCTCTATGTGTTTTAATAGGTTTGTCTTTTAACCATTGtactataggaaaaaaattgctttaCACATTGTCATTACAGTCTTAGAATATTCTGGTTATGACTTTGTATTTCTTATACCAATGCGTTTGTGTTCtcatatgttttatgtttttaattagcAGCCTTTTAATTTAGCTCAAATAACTCCCTTTAGTGGTTCTCTTAAGATATATTTAGTGGTAATGAACTCCcatagcttttgtttgtctggaaaagtttttttttt-ctctcatttgccAAGGACAACTTTGCTGGGTTAAGTAGTCTTGTTGgccttgttttttctcttcagcactttgaatacatTATCCTACTCTCTCTTCGTCTCCTgggtttttgctgagaaatccAGTGACAGCTATTTTGGTATTCCCTTGTATGTGATGTGCTTCTCATTACTTGCTgttttcagaatgttttctttttctttaatttttgttattttgattactatacaTCTTGGGTAATTCCTATTTGGCTTAAACTTGTTTGCATACCTCTGCATTTGTTGTATTTAGATGTTAGCAACTTTCTCCAGATTTGGTAAttttttagaattccttcttcaaatatgctttctggtctcttttctatttcttttctttctgaaaactcCTATTAGATGAATATTAGGTCTTAATAGTTTTCCTTCATATCCAGagtctttctttattcttttacattctttttattttt---- i papAnu2.chr7 I 802 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e macFas5.chr7 88239627 3767 - 171882078 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=5454.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 345990 26 + 478999 cttctgactgaattattttaaatgtt s panTro4.chrUn_GL393519 187174 26 + 413329 cttctgactgaattattttaaatgtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85363810 25 - 162156779 -ttctgactgaattattattattatt i papAnu2.chr7 C 0 I 558 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e macFas5.chr7 88239627 3767 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87965277 570 - 170124641 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=276967.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 346016 3141 + 478999 ttgtctctagcttattgattgtttcccttctgcttgattgagcctgttcttagagctttctattgcattttcatttcagtcattttattctttaagatttctatatttttattattcctattt----gtcaaacatgttatattgtttattatttttcaattttt--ttaattatctacccttatattattgtagttcactaaatttttttt-attatactttaagttttagagtacatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgcgctgcacccactaactcgtcatctagcattaggtatatctcccagtgctgtcgctcccccctccccccaccccacgacagtacctagagtgtgatgttcc-cttcctgtgtccatatgttctcattgttcagttcccacctatgagtgagaatatgtggtgtttggtgttttgttcttgcgatagtttactgagaatgatggtttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtctatcattgttggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaatagtgccgcaataaacgtacttgtgcatgtgtctttatagtaacatgatttatagtcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcgtttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgatcgccattctaactggtgtgagatgatatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatggtgagcattttttcatgtgttttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtcctttgcccaatttc-gatggggttgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcattgtagattctggatattagccctttgtcagatgagtaggttgtgaaaattttctcccattttgtgggtagcctgttgactctgatggtagtttcttttgctgagcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatgtaagtctttaatccatcttgaattgatttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagctttttacatatggctagccagttttcccagcaccatttattaaatagggaatcctttccccattgcttgtttttgtcaggtttgtcaaagatcagatagttgtagatatgcggcattatttctgagggctccgttctgttccattgatctatatctctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtagccttgtagtatagtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagctttgttcatttggcttaggattgacttggcaatgcgggctctttcttggttacatatgaactttaaagtagttttttccaattctgtgaagaaagtcattggtagcttgatggggatagcattgaatctataaattaccttgggcagtatggccattttcacaatattgattcttcctacccatgagcatggaatgttattccatttgtttgtatcctcttt-atttcattgagcagtgatttgtagttctccttgaagaggtccttcatgtcccttgtaagtggattcctaggtattttattctctttgaagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctctctgt----ctgttattcgtgtataagaatgcttgtgatttttgtacattcattttgtttcctgagactttgctgaagttgcttgtcagcttaaggagattttgggctgagacaatggggttttctagatatacaatcatgtcgtctgcaagcagggacaatttgacttcctcttttcctaattgaataccctttatttccttctcctgcctaattgccctggccagaacttccaacactatgttgaataggagtggtgagacagggcatccctgtcttgtgccagttttcaaagggaatgcttccagtttttgcccattcagtatgatat----tggctgtgggcttgtcatagatagctcttactattttgagatacgtcccatcaatacctaatttattgagagtttttagcatgaagg-ttgttgaattttgtcaaaggccttttctgcatctgttgagataatcatgtggtttttgtctttggttctgtttatatgctggattacatttattgatttgcgtatactgaagcagccttgcatcccagggatgaagcccacttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcctcaatgttcatcaaggatattggtctaaaattctcttttttggttgtgtctctgcctggctttggtatcaggatgatgctggcctcataaaatgagttagggaggattccctctttttctattgattggactagtttcagtaggaatggtaccagttcctccttgtacctctggtagaattcggctgtgaatccatctggtcctggactctttttggttggtaagctattgcttattgccacaatttcagctcctgttattggtctattcaaagattcaacttcttcctgttttagtcttgggagagtgtatgtgtcgaggaatttatccatttcttctagattttctagtttatttgcatagaggtgtttgtagtaatctctgatggtagtttgtatttctgtgggatcggtggtgatatcccctttatcattttttattgcgtctatttgattcttctctctttttttctttattggtcttgc-tagcagtctatcaattttgttgatcctttcaaaaaaccagctcct s panTro4.chrUn_GL393519 187200 3155 + 413329 ttgtctctagcttactgattgtttcccttctgcttgattgagcctgttgttagagctttctattgcattttcatttcagtcactttattctttaagatttctatatttttattattcctatttctttgtcaaacatcttatattgtttattatttttcactttttatttaattatctatccttatattatcgtagttcactaattttttttttattatactttaagttttagggtacatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgcactgcacccactaactcgtcatctagcattaggtatatctcccaatgctatccctcccccctccccccaccccacaacagtccctagagtgtgatgatcctcttcctgtgtccatatgttctcattgttcaattcccacctgtgagtgagaatatgcggtgtttggttttttgttcttgtgatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatgcagtctatcattgttggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaatagtgccacaataaacatacttgtgcatgtgtctttatagtaacatgatttatagtcctttgggtatgtacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttagtttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgatcgccattctaactggtgtgagatgatatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatggtgagcattttttcatgtgtgttttggctgcataaatgtcttctttcgagaagtgtctgttcatatcctttgcccactttttgatggggttgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcattgtagattctggatattagccctttgtcagatgagtaggttgcgaaaattttctcctgttttgtgggtagcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctcttgagtttaattagatcccatttgtcaattttgtcttttgttgccatcacttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatgtaagtctttaatccatcttgaattgatttttgtataagatgtaaggaagggatccagtttcagctttttacatatggctagccagttttcccagcaccatttattaaatagggaatcctttccccattgcttgtttttctcaggtttgtcaaagatcagatagttgtagacatgcggcattatttctgagggctctgttctgttccattgatctatatctctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtagccttatagtgtagtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagctttgttcttttggcttaggattgacttggtgatgcgggctctttcttggttacatatgaactttaaagtagttttttccaattctgtgaagaaagtcattggtagcttgatggggatggcattgaatctataaattaccttgggcagtatggccattttcatcatattgattcttcctacccatgagcatggaatgttcttccatttgtttgtatcctcttttgtttcattgagcagtgatttgtagttctccttgaagaggtccttcacgtcccttgtaagtggattcctaggtattttattctctttgaagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctctctgtttgtctgttattggtgtataagaatgcttgtgatttttgcacattgattttgtatcctgagacttttctgaagttgcttatcagcttaaggagattttgggctgagacaatggggttttccagatatacaatcatgtcgtctgcaagcagggacaatttgacttcctcttttcctaattgaataccctttatttccttctcctgcctaattgccctggccagaacttccaacactatgttgaataggagtggtgagagaaggcatccctgtcttgtgccagttttcaaagggaatgcttccagtttttgcccattcagtatgatatatattggctgtgggtttgtcatagatagctcttattattttgagatacgtcccattaatacctaatttattgagagtttttagcatgaagggttgttgaattttgtcaaaggccttttctgcatctattgagatgatcatgtggtttttgtctttggttttgttcatatgctggattacatttattgatttgcgtatactgaaccagccttgcatcccagggatgaagcccacttgatgatggtggataggctttttgatgtgcttctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcatcaatgttcatcaaggatattggtctaaaattctcttttttggttgtgtctctgcccggctttggtatcaggatgatgctggcctcataaaatgagttagggaggattccctctttttctattgattggaatagtttcagtaggaatggtaccagttcctccttgtacctctggtagaatttggctgtgaatccatctggtcctggactctttttggttggtaagctattgattattgccacaatttcagctcctgttattggtctattcagagattcaacttcttcctgttttagtcttgcgagagtgtatgtgtcgaggaatttatccatttcttctagattttctagtttatttgcatagaggtgtttgtagtaatctctgatggtagtttgtatttctgtgggatcggtggtgatatccccttcatcattt------gcatctatttgattcttctctctttttttctttattagtcttgcctagcggtctatcaattttgtcgatcctttcaaaaaaccagctcct i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85363835 558 - 162156779 I e macFas5.chr7 88239627 3767 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87965277 570 - 170124641 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=1362505.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 349157 1620 + 478999 ggactttttagaattctttgtcagtcattttgcaaatctccgttcctttagggtccattgttaagagttttattagtttattttggaggtgtcatcattcctcgattcttcacaatccttttgttcttgcactgctgtctgttcatttgaggaggtagctacctctttttataggtattagttggcagggatagactttcattatttagtctagcctttcattctagattggccaactggtaccaaccctgggaaagtagagcttgctttctgctttcaggttctccggatggctcagcttttgtctttgctctgagttcagttgggactactggctgggctctgatttttggtatgaccactaaatgagctatgcaatcagacaaaattgcttgctcggatggtgattgtctctgactgggccaggccacaggatgtatttcctggctggatggtaccactatttgagttctggagttgtatggggttgcaggcttactcataaagttaagtggggacactgctcaggatggagagaacagctactacacttggtgggaatgcacatttgatgtttgccttcctgactgggtagcaccttggggtgggctttgagatttgagccaaaccactgtttggattccttgttggggtgcatatagccctttcactttgccaaaatgcactgcggcaagtatctccatctctgagtgggctttggggatgattttgaggctgagttgaaccactgttagagtccccaggtaaggcatttctagaccctacactgtgctaataatgggctgtggtatgcatctccctgcctggctgggtccctgttgtgggttttgagactaagccaaaccactgtttgggcttctgagtggggcaggtctagcccttgtactttaccaaaatatgctgtggtcatctccccctctggacaaggctttgtggtaggatctggggctggcatggaggctgattgtctagggattcaagccaggtagaacttcctatttcccggggcaaccagcttgactttgttggtttgttaatactgttcgctaatgcccctaatcacataccactgctggtggttacatagacctaccaccaagatctgcatgtttgtcactatgagctttgccttcctgctctgtttctacctgaccacaggtagtctagccatgctattacccctatgctccttgcaaggtgagaccagagttggcttcctgggggaggtatcttggaacacagggaacgtgaatgtccacctctagttctcttttcctactgtagaaactgtgggcctagaaaaattctaagtggtgttgtgctgacttgggagaaagggagaggtgatgtggtcagagtgaggctattctttttacacttctcatgtggcattttgtttggttatttagttcacacaggtttctcaggcttaatcttgag-ttttgaagtgttcacataggagtttttgtctgtgtacagttgttaattgaacattctatgaagggtagggaaaactgggacctcctattcttcaatcttcctgatgtcaTAGagaatctgcattttgaaaagatccatacgtgatggtgattgatatgg s panTro4.chrUn_GL393519 190355 1613 + 413329 ggactttttggaattctttgtca----ttttgcaaatctccattcctttagggtccattgttaagagttttattagtttttattggaggtgtcatcattcctcgattcttcacaatccttttgttcttgcactgctgtctgttcatttgaggaggtagctacctctttttataggtattagttggcagggatagactttcattatttagtctagcctttgattctagattggccaactggtaccaaccctgggaaagtagagcttgctttctgctttcagattctccggatggctcagcttttgtctttgctctgagttcagttgggactactggttgggttctgatttttggtatgaccactaaatgagctatgcaatcagacaaaattgcttgcttggatggtgattgtctctgactgggccaggccacaggatgtatttcctggctggatggtaccactatttgagttctggagttgtatggggttgcaggcttactcacaaagttaagtggggacactgctcaggatggagagaacagctactacacttggtgggaatgcacatttgatgtgtgccttcctgactgggtaggacctcggggtgggctttgagatttgagccaaaccactgtttggattccttgttggggtgcatatagccctttcactttgccagaatgcactgcggcaaatatctccatctctgagtgggctttggggatgtttttgaggctgagttgaaccactgttagagtccccaggtaaggcagttctagaccctacactgtgctaataatgggctgtggtatgcatctccctgcctggctgggtccctgttgtgggttttgagactaagccaaaccactgtttgggcttctgagtgtggcaggtctagcccttgtactttaccaaaatgtgctgtggtcatctccccctctggacaaggctttgtggtaggatctggggctcacatggaggctgattgtctagggattcaagccaggtagaacttcctatttcccggggcaaccagcttgactttgttggtttgtta-tactgttcactaatgcccctaatcacataccactgctggtggttacatagacctaccaccaagatctgcgtgtttgtcactatgagctttgccttcctgctctgtttctacctgaccacaggtagtctagccatgctattacccctatgctccttgcaaggtgagaccagagtaggcttcctggg--aagtatcttgaaacacagggaacgtgaatgtccacctctagttctcttttcctactgtagaaactgtgggcctagaaaaattctaagtggtgttgtgctgacttgggagaaagggagaggtgatgtggtcagagtgaagctatttttttaatacttctcatgtggcgttttgtttggttctctagttcacacaggtttctcaggcttaatccggag-ttttgaagtgttcacataggagtttttgtctgtgtacagttgttaattgaacattctatgaagggtagggaaaactgggacctcctattcttcagtcttcctgatgtcacAGACaatctgcattttgaaaagatccataagtgatggtgattgatatgg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87965847 1581 - 170124641 ggacttttctgaattctttgtcagtcattttgcaaatctccatttctttagggttcattgtt-ggagttttattagtttattttggaggtgtcatcattccccaattcttcacaatccttgtattcttgcactggcatctgttcatttgagg--------------------aggtattagttggcagggatagactttcagtatttagtctagactttgattctagattggtcagctggtactaaccctgggaaagtagagcttgctttctgctttcaggttctcctgatggctcagcttttgtctttgctctgagttcagctggtactactggctgggctctgatttttggtaagaccactaaatgagctctgcaagcagacaaaattgcttgcttggatggtgattgcctctgactgggccaggccacaggatgtatttcctggctaaatgataccactatttgagttctgcagttgtttggggttgcaggcttattcacaaaattaggtggagacactgctcaagatggagagtaaaactactatacttggtgggaatgcacatttgatgtttgccttcctgcctgggtgggacattggggtgggctttgaga-ttgagccaaaccaccatttagattccttgttggggtatatatagccctttcactttgccaaaatgcactgtggcaggtatctctctctgtgagtgggctttggggatgattttgaggctgagttgaaccactgttcgagtccccaggtaaggcagttctagaccctacactgtgctaaaaatgggctgtgatatgcatctccctgcctggctgggtccctgttgtgggttttgagactaagccaaactactgtctgggcttctgagtggggcaggtctagcccttgtactttatcaaaatgtgctgtggtcatctcccctccctg----ggctttgtgatgggatctggggctggcatggaggctgattgtttagggattcaagccaggtagaacttcctatttccaggggcaaccagcttgactttgttggtttgtta-cactgttggctaatacccctaatcacataccactgatggccgttacatagagctaccaccaagatctgcatgtttgtcactatgagctctgccttcctgctctgtttctacctgaccata-gtagtctagccattttattacccc-atgctccttccaaggtgagaccagagtaggcttcctggg--aagtatcttggaatgcagggaacgtgaatgtccacctctagttctcttttcctactgtagaaactgtgggcctagaaaaattctaagtgg---tgtgctgacttgggagagagggagaggtgatgtggtcaaagtgagactattctttttacccttctcatgtggcattttgtttggttctttagttcacacaggtttctcaggcttaatcatgagtttttgaagtgttcatgtaggagtttttgtctgtgtacagttgctaattgaacattctatgaaggggagggaaaactgggacctcctattcttcaatcttcctgatgtcacAGagaatctgcgttttgaaaagatccata------ggtgattgatatgg i rheMac3.chr7 I 570 C 0 s macFas5.chr7 88243394 1580 - 171882078 ggacttttctgaattctttgtcagtcattttgcaaatctccatttctttagggttcattgtt-ggagttttattagtttattttggaggtgtcatcattccccaattcttcacaatccttgtattcttgcactggcgtctgttcatttgagg--------------------aggtattagttggcagggatagactttcagtatttagtctagactttgattctagattggtcagctggtactaaccctgggaaagtagagcttgctttctgctttcaggttctcctgatggctcagcttttgtctttgctctgagttcagctgggactactggctgggctctgatttttggtaagaccactaaatgagctctgcaagcagacaaaattgcttgcttggatggtgattgcctctgactgggccaggccacaggatgtatttcctggctaaatgataccactatttgagttctgcagttgtttggggttgcaggcttactcacaaaattaggtggagacactgctcaagatggagagtaaaactactatacttggtgggaatgcacatttgatgtttgccttcctgcctgggtgggacattggggtgggctttgaga-ttgagccaaaccaccatttagattccttgttggggtatatatagccctttcactttgccaaaatgcactgtggcaggtatctctctctgtgagtgggctttggggatgattttgaggctgagttgaaccactgttcgagtccccaggtaaggcagttctagaccctacactgtgctaaaaatgggctgtgatatgcatctccctgtctggctgggtccctgttgtgggttttgagactaagccaaactactgtctgggcttctgagtggggcaggtctagcccttgtactttatcaaaatgtgctgtggtcatctcccctccctg----ggctttgtgatgggatctggggctggcatggaggctgattgtttagggattcaagccaggtagaacttcctatttccaggggcaaccagcttgactttgttggtttgtta-cactgttggctaatacccctaatcacataccactgatggccgttacatagagctaccaccaagatctgcatgtttgtcactatgagctctgccttcctgctctgtttctacctgaccata-gtagtctagccattttattacccc-atgctccttccaaggtgagaccagagtaggcttcctggg--aagtatcttggaatgcagggaacgtgaatgtccacctctagttctcttttcctactgtagaaactgtgggcctagaaaaattctaagtgg---tgtgctgacttgggagagagggagaggtgatgtggtcaaagtgagactattctttttacccttctcatgtggcattttgtttggttctttagttcacacaggtttctcaggcttaatcatgag-ttttgaagtgttcatgtaggagtttttgtctgtgtacagttgctaattgaacattctatgaaggggagggaaaactgggacctcctattcttcaatcttcctgatgtcacAGagaatctgcgttttgaaaagatccata------ggtgattgatatgg i macFas5.chr7 I 3767 C 0 s papAnu2.chr7 85364393 1580 - 162156779 ggACTTTTCTGAATTCTTTGTCAGTCATTTTGCAAATCTCCATTTCTTTAGGGTTCATTGTT-AgagttttattagtttattttggaGGTGTCATCATTCCCCAATTCTTCACAATCCTTGTGTTCTTGCACTGGCGTCTGTTCATTTGAGG--------------------AGGTATTAGTTGGCAGGGATAGACTTTCAGTATTTAGTCTAGACTTTGATTCTAGATTGGTCAGCTGGTACTAACCCTGGGAAAGTAGAGCTTGCTTTCTGCTTTCAGGTTCTCCTGATGGCTCAGCTTTTGTCTTTGCTCTGAGTtcagctgggactactggctgGGCTCTGATTTTTGGTAAGACCACTAAATGAGCTCTGCAAGCAGACAAAATTGTTTGCTTGGATGGTGATTGCCTCTGACTGGGCCAGGCCACAGGATGTATTTCCTGGCTAAATGATACCACTATTTGAGTTCTGCAGTTGTTTGGGGTTGCAGGCTTACTTACAAAATTAGGTGGAGACACTGCTCAAGATGGAGAGTACAACTACTATACTTGGTGGGAATGCACATTTGATGTTTGCCTTCCTGCCTGGGTGGGACATTGGGGTGGGCTTTGAGA-TTGAGCCAAACCACCATTTAGATTCCTTGTTGGGGTATATATAGCCCTTTCACTTTGCCAAAATGCACTGTGGCAGGTATCTCTCTCTGTGAGTGGGCTTTGGGGATGATTTTGAGGCTGAGTTGAACCACTGTTCGAGTCCCCAGGTAAGGCAGTTCTAGACCCTACACTGTGCTAAAAATGGGCTGTGATATGCATCTCCCTGCCTGGCTGGGTCCCTGTTGTGGGTTTTGAGACTAAGCCAAACTACTGTCTGGGCTTCTGAGTGGGGCAGGTCTAGCCCTTGTACTTTATCAAAATGTGCTGTGGTCATCTCCCCTCCCTG----GGCTTTGTGATGGGATCTGGGGCTGGCATGGAGGCTGATTGTTTAGGGATTCAAGCCAGGTAGAACTTCCTATTTTCAGGGGCAACCAGCTTGACTTTGTTGGTTTGTTA-CACTGTTGGCTAATACCCCTAATCACATACCACTGATGGCCGTTACATAGAGCTACCACCAAGATCTGCATGTTTGTCACTATGAGCTCTGCCTTCCTGCTCTGTTTCTACCTGACCATA-GTAGTCTAGCCATTTTATTACCCC-ATGCTCCTTCCAAGGTGAGACCAGAGTAGGCTTCCTGGG--AAGTATCTTGGAATGCAGGGAACGTGAATGTCCACCTCTAGTTCTCTTTTCCTACTGTAGAAACTGTGGGCCTAGAAAAATTCTAAGTGG---TGTGCTGActtgggagagagggagaggtgaTGTGGTCAAAGTGAGACTATTCTTTTTACCCTTCTCATGTGGCATTTTGTTTGGTTCTTTAGTTCACACAGGTTTCTCAGGCTTAATCATGAG-TTTTGAAGTGTTCATGTAGGAGTTTTTGTCTGTGTACAGTTGCTAATTGAACATTCTATGAAGGGGAGGGAAAACTGGGACCTCCTATTCTTCAATCTTCCTGATGTCACAGAGAATCTGCGTTTTGAAAAGATCCATA------GGTGATTGATATGG i papAnu2.chr7 I 558 C 0 e canFam3.chr15 46723918 29385 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=97493.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 350777 91 + 478999 atattaaa-gttgagaactactAGGTTAAACATCT----GTTTTCATG--------TGAAACATGAAAAATAAGCTAGATTTTGAGTTGCAATTATAGGGTAAT s panTro4.chrUn_GL393519 191968 90 + 413329 atattaaa-gttgagaactactAGGTTAAACATCT----ATTT-CATG--------TGAAACATGAAAAATAAGCTAGATTTTGAGTTGCAATTATAGGGTAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87967428 90 - 170124641 atattaaa-gttgagaactactAGGTTAAACATCT----ATTT-CATG--------TGAAACGTGAAAAATAAGCTAGATTTCGGGTTGCAATTATAGAGTAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88244974 90 - 171882078 atattaaa-gttgagaactactAGGTTAAACATCT----ATTT-CATG--------TGAAACATGAAAAATAAGCTAGATTTCGGGTTGCAATTATAGGGTAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85365973 90 - 162156779 ATATTAAA-GTTGAGAACTACTAGGTTAAACATCT----ATTT-CATG--------TGAAACATGAAAAATAAGCTAGATTTCGGGTTGCAATTATAGGGTAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46753303 103 - 64190966 ataTTAAATTTTAAGAAATACTAGCTTAGACTCCTGTTAATTC-CATGTCCAAACATAAAAAATTAAAAATTAACTAGATTTTGAGTTGTAATTGCAAGGTAAC i canFam3.chr15 I 29385 I 209 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=301758.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 350868 279 + 478999 ACACATTTTTCAA------------CTTTTTCATCTTTAATCTTGTTCATAAGAGGCTGCAACTGATCCAAAAACAACTTATTCCCAGGCTATAGCAAAGGTTTTCAAACTCAAACAATGTAGAATTACAA-AATGTAGAGTTCACATCTTCTCTGGCTAAGATAATGTTGACTAATGAAAATAATGGTAGATTGGAAAATCTATTTGAGTTACTATAC-TTTCTTGTACCTAAGATAAAATACCCATATGATGATTATTGTTAATCCTCTACAGAAACATGATGAAAAGAAG s panTro4.chrUn_GL393519 192058 279 + 413329 ACACATTTTTCAA------------CTTTTTCATCTTTAATCTTGTTCATAAGAGGCTGCAACTGATCCAAAAACAACTTATTCCCAGGCTATAGCAAAGGTTTTCAAACTCAAACAATGTAGAATGACAA-AATGTAGAGTTCACATCTTCTCTGGCTAAGATAATGTTGACTAATGAAAATAATGGTAGATTGGAAAATCTATTTGAGTTACTATAC-TTTCTTGTACCTAAGATAAAATACCCATATGATGATTATTGTTAATCCTCTACAGAAACATGATGAAAAGAAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87967518 278 - 170124641 ACACATTTTTCAA------------CTTTTTCATCTTTACTGTTGTTCATAAGAGGCTGCAACTGATCC-AAGACAACTTATTCCCAGGTTATAGCAAAGGTTTTCAAACCCAAACAACACAGAATTACAA-AATGTAGAGTTCACATCTTCACTGGCTAAGATAATGTTGACTAATGAAAACAATGGTAGATTGAAAAACCTATTTGAGTTACTATAC-TTTCTTATACCTAAGATAAAATATCCATATGATGATTATTGTTAATCCTCTACAGAAACATGATGAAAAGAAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88245064 278 - 171882078 ACACATTTTTCAA------------CTTTTTCATCTTTACTCTTATTCATAAGAGGCTGCAACTGATCC-AAGACAACTTATTCCCAGGTTATAGCAAAGGTTTTCAAACCCAAACAACACAGAATTACAA-AATGTAGAGTTCACATCTTCACTGGCTAAGATAATGTTGACTAATGAAAACAATGGTAGATTGAAAAACCTATTTGAGTTACTATAC-TTTCTTATACCTAAGATAAAATATCCATATGATGATTATTGTTAATCCTCTACAGAAACATGATGAAAAGAAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85366063 278 - 162156779 Acacatttttcaa------------ctttttcatcTTTACTCTTGTTCATAAGAGGCTGCAACTGATCC-AAGACAACTTACTCCCAGGTTATAGCAAACGTTTTCAAACCCAAACAACACAGAATTACAA-AATGTAGAGTTCACATCTTCACTGGCTAAGATAATGTTGACTAATGAAAACAATGGTAGATTGAAAAACTTATTTGAGTTACTATAC-TTTCTTATACCTAAGATAAAATATCCATATGATGATTATTGTTAATCCTCTACAGAAACATGATGAAAAGAAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46753615 275 - 64190966 ACACatttttaaatctttttttttttttttttaCCTTTGCCCTTTTTCATAAAGGGTTGCAATTGATCCTAAGAAAATTTGTTTTCAGGCTGTATCAGAAGTTGTCAAACCCAATGAATGAGGAATCACAAGAATATAAGGTTCATGTCT---------------ATGCTGGCTAATGAAAGTGATGGCAGATCTGGAAATCT-TTTGAGTTACTAGACTTTTTTTATACCTACAAGAAAATATCTACATGGTTATTAATGTTACTCCTCTACAGAA--ATGAAGGAAAGCAg i canFam3.chr15 I 209 I 175 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=3640.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351147 4 + 478999 TTTT s panTro4.chrUn_GL393519 192337 4 + 413329 TTTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87967796 4 - 170124641 TTTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88245342 4 - 171882078 TTTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85366341 4 - 162156779 TTTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46753890 175 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=69987.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351151 67 + 478999 AGTTGAGCAGAGGAGATAGAAAGCAAGATCACAGGGGGTTGGGGAGTGAATATGAAATGAAGAAGTA s panTro4.chrUn_GL393519 192341 67 + 413329 AGTCGAGCAGAGGAGATAGAAAGCAAGATCACAGGGGGTTGGGGAGTGAATATGAAATGAAGAAGTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87967800 67 - 170124641 AGTCAAACAGAGGAGATAGAAAGCAAGATCATAGGGGGTTGGGGAGTGAATAAGAAATGAAGAAGTA i rheMac3.chr7 C 0 I 328 s macFas5.chr7 88245346 67 - 171882078 AGTCAAACAGAGGAGATAGAAAGCAAGATCATAGGGGGTTGGGGAGTgaataagaaatgaagaagta i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85366345 67 - 162156779 AGTCAAACAGAGGAGATAGAAAGCAAGATCATAGGGAGTTGGGGAGTGAATAAGAAATGAAgaagta i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46754065 64 - 64190966 AGCAGAGCAGAGTAAGTGGGAAGCCAGATCACAGGGGACAAAGAGGTACATGAGAGATGAAGTA--- i canFam3.chr15 I 175 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=1898.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351218 2 + 478999 GA s panTro4.chrUn_GL393519 192408 2 + 413329 GA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87968195 2 - 170124641 GA i rheMac3.chr7 I 328 C 0 s macFas5.chr7 88245413 2 - 171882078 gg i macFas5.chr7 C 0 I 320 s papAnu2.chr7 85366412 2 - 162156779 gg i papAnu2.chr7 C 0 I 324 s canFam3.chr15 46754129 2 - 64190966 GA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=30667.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351220 29 + 478999 GGTTGACTATAC-----TCTTTCATGTCACTtgg s panTro4.chrUn_GL393519 192410 29 + 413329 GGTTGCCTATAC-----TCTTTCATGTCACTtgg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87968197 29 - 170124641 GGTTGACTATGC-----TCTTTCATGTCACTTTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88245735 29 - 171882078 GGTTGACTATGC-----TCTTTCATGTCACTTTG i macFas5.chr7 I 320 C 0 s papAnu2.chr7 85366738 29 - 162156779 GGTTGACTATGC-----TCTTTCATGTCACTTTG i papAnu2.chr7 I 324 C 0 s canFam3.chr15 46754131 34 - 64190966 GGTAGACTATACACTGTTTTTTCATGTCATATAG i canFam3.chr15 C 0 I 1771 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=8935.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351249 10 + 478999 caccctccaa s panTro4.chrUn_GL393519 192439 10 + 413329 caccctccaa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87968226 10 - 170124641 CAccccccaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88245764 10 - 171882078 CAccccccaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85366767 10 - 162156779 CACCCCCCAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46754165 1771 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=469894.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351259 434 + 478999 agtaaaaggaatttg-atgtaatcaatttgccacccattgctggctggttttctcaaagattggtgccatattgagggcttaacattggtttctcatcgaggctgcatct-----------tcagtggctcagtgatttgtcaccaaccttggtaagataatgcctgtattttttggcacgtgcatattttccatttatacagctttctttatattcccttt-tataagctctgaggtgaatgaaatcagagctgactgacattt-ttagatgactcattcttttcacttag-ctattgagtgcctccactctggaggatactctc-taatgggcacagagttgagaaacaaagatctgcatactttgtgcttattctcataggcccatacataggcctccacctcaaatttcattaaatctgatttttct-----gtattttgaggggg-tttgc s panTro4.chrUn_GL393519 192449 434 + 413329 agtaaaaggaatttg-atgtaatcaatttgccacccattgctggctggttttctcaaagattggtgccatattgagggcttaacattggtttctcatcgaggctgcatct-----------tcagtggctcagtgatttgtcaccaaccttggtaagataatgcctgtattttttggcacgtgcatattttccatttatacaactttctttatattcccttt-tataagctctgaggtgaatgaaatcagagctggctgacattt-ttagatgactcattcttttcacttag-ctattgagtgcctccactctggaggatactctc-taatgggcacagagttgagaaacaaagatctgcatactttgtgcttattctcataggcccatacataggcctccacctcaaatttcattaaatctgatttttct-----gtattttggggggg-tttgc i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87968236 445 - 170124641 agtaaaagaaatttg-atgtaatcaatttgccacccattgctggctggttttctcaaagattgatgccatattgagggcttagtgttggtttctcatcaaggctgcatcttcagtggctcatcagtggctcagtgacttgtcaccaaccttggtaagagaatgcccatattttctggctcgtgcatattttccatgtataaaactttctttatattcccttt-tataagcactgaggtgaatgaaatcagagttgactgacattt-ttcgatgactcattcttttcacctag-ctattgagtgcctccactctggaggatactttc-taat-ggcacagagttgagaaacaaagatctgcacactttgtgcttattctcataggcccatacataggcctccacctcaagtttccttaaatctgatttttct-----gtatttttggggggctttgc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88245774 445 - 171882078 agtaaaagaaatttg-atgtaatcaatttgccacccattgctggctggttttctcaaagattgatgccatattgagggcttagtgttggtttctcatcaaggctgcatcttcagtggctcatcagtggctcagtgacttgtcaccaaccttggtaagagaatgcccatattttctggctcgtgcatattttccatgtataaaactttctttatattcccttt-tataagcactgaggtgaatgaaatcagagttgactgacattt-ttagatgactcattcttttcacctag-ttattgagtgcctccactctggaggatactttc-taat-ggcacagagttgagaaacaaagatctgcatactttgtgcttattctcataggcccatacataggcctccacctcaagtttccttaaatctgatttttct-----gtatttttggggggctttgc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85366777 445 - 162156779 AGTAAAAGAAATTTG-ATGTAATCAATTTGCCACCCATTGCTGGCTGGTTTTCTCAAAGATTGATGCCATATTGAGGGCTTAGTGTTGGTTTCTCATCAAGGCTGCATCTTCAGTGGCTCATCAGTGGCTCAGTGACTTGTCACCAACCTTGGTAAGAGAATGCCCATATTTTCTGGCTCGTGCATATTTTCCAtgtataaaactttctttatattccCTTT-TATAAGCACTGAGGTGAATGAAATCAGAGTTGACTGACATTT-TTAGATGACTCATTCTTTTCACCTAG-CTATTGAGTGCCTCCACTCTGGAGGATACTTTC-TAAT-GGCACAGAGTTGAGAAACAAAGATCTGCATACTTTGTGCTTATTCTCATAGGCCCATACATAGGCCTCCACCTCAAGTTTCcttaaatctgatttttct-----gtatttttggggGGCTTTGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46755936 441 - 64190966 aataaaagtaatttgaatgtaataaatttgttacctgctactgcttagttttcttaaaggatggtgccatattgagagtttagcattggtctatgactgaggctgcatcc-----------tcagcagctcagtggct--ttaccagccttggtaagagatggtccatattttgtggcttacatacagcctccatccataccactcactttatgggcactttgtgtaagcactaaggtgaaggatgtccgagccgcttgacatttcctggatgacttgttctttatatctggtttgttgaatgtctccattgtggaggatcctttcttgatgagcatcgatttgaggcacaaagatttgcata--ttgtgctcaatctcataggtccattcacatgctgcctcttcaaacttccttgactctgggttccctatctggttccttcaagatccttgac i canFam3.chr15 I 1771 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87691174 1427 - 132174527 I a score=368552.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351693 278 + 478999 ---ttagtgaaacttttttacaacaatcattatactacacatatccttatcttgcatagcaagctatttctcccaacat-tcaaagtggacaactaagtatattgctaccgaatcattggcttacgaggatttcctccaccactacattctatggctaccctggagaggcgttaagctgcagcattagtcagtttttatcttgtctaagtgtagattcagacaatccatttgtgatccaagcctgaggctc-tttcttcatttattagctggttgTGTGAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 192883 278 + 413329 ---ttagtgaaacttttttacaacaattgttattctacacatatccttatcttgcatagcaagctatttctcccaacat-tcaaagtggacaactaagtatattgctaccaaatcattggcttacgaggatttcctccaccactacattctatggctaccctggagaggcgttaagctgcagcattagttagtttttatcttgtctaagtgtagattcagacaatccatttgtgatccaagcctgaggctc-tttcttcctttattagctggttgtgtgaaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87968681 265 - 170124641 ---ttagtgaagcttttttacaacaatcattattcta-------------cttgcctagcaagctatttctcccaacat-tcaaagtggacaactaagtatattgctcccaaatcatgggtttgtgaggatttcctccatcactacattctatgattacccttgagaggcgttaagctgcagcattagtcaatattttccttgtccaagtatatattcagacaatccatttgtgagcgaagcctgaggctc-tttcctcctttattagttggttgtatgaaat i rheMac3.chr7 C 0 I 367 s macFas5.chr7 88246219 265 - 171882078 ---ttagtgaagcttttttacaacaatcattattcta-------------cttgcctagcaagctatttctcccaacat-tcaaagtggacaactaagtatattgctcccaaatcatgggtttgtgaggatttcctccatcactacattctatgattacccttgagaggcgttaagccgcagcattagtcaatgttttccttgtccaagtgtatattcagacaatccatttgtgagcgaagcctgaggctc-tttcctcctttattagttggttgtatgaaat i macFas5.chr7 C 0 I 355 s papAnu2.chr7 85367222 265 - 162156779 ---TTAGTGAAGCTTTTTTACAACAATCATTATTCTA-------------CTTGCCTAGCAAGCTATTTCTCCCAGCAT-TCAAAGTGGACAATTAAGTATATTGCTCCCAAATCATGGGTTTGTGAGGATTTCCTCCATCACTACATTCTATGATTACCCTTGAGAGGCGTTAAGCTGCAGCATTAGTCAATATCTTCCTTGTCCAAGTGTATATTCAGACAATCCATTTGTGAGCGAAGCCCGAGGCTC-TTTCCTCCTTTATTAGTTGGTTGTATGAAAT i papAnu2.chr7 C 0 I 356 s calJac3.chr10 87692601 274 - 132174527 ---ttaGTGAAGC-TTCCTACAACAATCATTATTCTACACATATTCTTATCttgcatagcaagctatttttcccaacat-tcaaattggacagctaggtatattgctcccaaattattggtttatgaagatttcctccaccgtt--agtctatggctatccttgagaggcattaagctgcagcattagtcaaattttttcttg-ccatgtatatattcagacaatccatttgtgagccaagcctgaggctc-tttcctcctttattagctggttgtaagaaat i calJac3.chr10 I 1427 I 9 s canFam3.chr15 46756377 273 - 64190966 caagcagtaaaactttt-------agtcattaggc-atgtatatcctcatcttgtgtagcaggctatttcgcccaccatataaaagtagacaaataagtgtatttctctcagcattttgctttatgagaatttcctctacccctacactctatggccacctgtgacaggggctataatgcaatggtaatgcatttctttcttacagtagcat-ttttcaggtaatctatttgtgaaccaagcctgaggctcttttccttttttgttagctggtt-tatgaaac i canFam3.chr15 C 0 I 8 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=3591.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351971 7 + 478999 ACCATGA s panTro4.chrUn_GL393519 193161 7 + 413329 accatga i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87692884 7 - 132174527 accatga i calJac3.chr10 I 9 C 0 s canFam3.chr15 46756658 7 - 64190966 accataa i canFam3.chr15 I 8 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85367487 356 - 162156779 I e macFas5.chr7 88246484 355 - 171882078 I e rheMac3.chr7 87968946 367 - 170124641 I a score=6499.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351978 13 + 478999 AGCCATAGGTATG s panTro4.chrUn_GL393519 193168 13 + 413329 agccataggtatg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88246839 12 - 171882078 agtcagagg-aCA i macFas5.chr7 I 355 C 0 s papAnu2.chr7 85367843 12 - 162156779 AGTCAGAGG-ACG i papAnu2.chr7 I 356 C 0 s calJac3.chr10 87692891 13 - 132174527 agctgtaggtgAG i calJac3.chr10 C 0 I 7 s canFam3.chr15 46756665 13 - 64190966 aatcataggtatg i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87968946 367 - 170124641 I a score=323220.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 351991 236 + 478999 AACTGAGGAAGAGATATTGTCACAATGAAGGCATGTTTGTATCTTATGGAAATGCTTTTTACTGTATCTAATAGTTTTCAATTCATTCTATCAAGTGCCAGCAAGCTCAATATGAGATAGAATTTAATATTGGTAAGATAAGATTGGTTAATGATCAATTTGAAGATAATTACAAATATGGGCACTGTGCACATTTATAACAGTTGAGATTATATTTTATTAAGAATTTCTATCA--T------- s panTro4.chrUn_GL393519 193181 236 + 413329 aactgaggaagAGATACTGTCACAGTGAAGGCATGTTTGTATCTTACAGAAATGCTTTTTACTGTATCTAATAGTTTTCAATTCTTTCTATCAAGTGCCAGCAAGCTCAATATGAGATAGAATTTAATATTGGTAAGATAAGATTGGTTAATGATCAACTTGAAGATAATTACAAATATGGGCACTGTGCACATTTATAACAGTTGAGATTATATTTTATTAAGAATTTCTATCA--T------- i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87969313 237 - 170124641 AACTGAGGAAGAGATACTGTCACAATGAAGGCATGTTTGTATCTTATGGAAATGCTTTTTACTGTATCAAATAGTTTGCCATTTTTTCTATCAGGTGCTAGCAAGCTCAATATGAGATAGAACTTAATATCGGTAAGATAAGATTAGTTAATGATTAACTTGAAGATAATTGCAAATATGGGCATGGTGCATGCTCATAACAATTGACATTATATTTTATTAAGAATTTCTATCCC-T------- i rheMac3.chr7 I 367 C 0 s macFas5.chr7 88246851 238 - 171882078 AACTGAGGAAGAGATACTGTCACAATGAAGGCATGTTTGTATCTTATGGAAATGCTTTTTACTGTATCAAATAGTTTGCCATTTTTTCTATCAGGTGCTAGCAAGCTCAATATGAGATAGAATTTAATATCGGTAAGATAAGATTAGTTAATGATTAACTTGAAGATAATTGCAAATATGGGCATGGTGCATGCTCATAACAATTGACATTATATTTTATTAAGAATTTCTATCCCTT------- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85367855 235 - 162156779 AACTGAGGAAGAGATATTGTCACAATGAAGGCATGTTTATATCTTATGGAAATGCTTTTTACTGTATCAAATAGTTTGCCATTTTTTCTATCAGGTGCTAGCAAGCTCAATATGAGATAGCATTTAATATTGGTAAGATAAGATTAGTTAATGATTAACTTGAAGATAATTGCAAATATGGGCACGGTGCATGCTCATAACAATTgac---atattttattaagaatttctattcctt------- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87692911 230 - 132174527 AACAAAGGAAGAGATATTGTCACAA--AAGGCATATCTGTATCTCATAGAAATGCTTTTTACTGTATCAAGTAGTTTTCAA----TTCTATCAAGTGCCAGCAAGCTCAGTATGAGATAGTATTTAATATTGATAAGATAAAATTGAGTAATGATGAACTTGAAGACATTTACAAATATGGGCCCTGTGCATGTTTATAATAATCGACATTGTATTTTATTAAGAATTTCTATCC--T------- i calJac3.chr10 I 7 I 2160 s canFam3.chr15 46756678 236 - 64190966 aactaaggaagaaatgttggtgcaataaaagtaggTCTATGCCTTAAGGATATGC-TCTTAATGTACCAAATAATTTGCAA----TTCTATCTAGTGGCAGCAAACTTAATATGAGGTAAAA--TAATATGGGTAAGGAAGATTTGGCTAATAACCAACTTGAAAGCAACTAAAAATACAGGCACTGTATATCTTCATAAAACTCAACTCAATATTTTATTAAGAATCACTAATT--TTTGTGAC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=675540.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 352227 473 + 478999 TTTTTCTCATATAATTAAGAAATATAAACAAAACTGGCATGG----------------ACAGGTGAAACTCAGTGTTAAATTTATCAGCACTTTAAAGAGATCCCACCGTTGAAGTCAGTTTGAATGAAGTTCTAAATTGTTTGTATTTTCTTCCTATATAAAAGAGGCTTTCAGGCAAGTATTTAGCTATTTAATTTACATTTCACATGTGAGGTATAATAAA-ACAACCACTCTTTTCCCCAGAACTCATATAAATCCTGCCTTTCAAACCCAGAAAATATTCTCAACTCAGCTTCCTTGTGACACAAAAACTAATTGCAGTTGCACCTCATTTTGTGGAGCAAATAGC-TATGATGGCTTACAAATTAAAACTCTGTAAACTACATTTCATATTGTGATTCCTTTTCATTAAGTTTTTGAGAGTTGTATTTG---AAAAAATGG-CATAGAACGAAACAAAAGTCA----AAATTAAAGCAAGATATTAGTCAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 193417 473 + 413329 TTTTTCTCATATAATTAAGAAATATAAACAAAACTGGCATGG----------------ACAGGTGAAACTCAGTGTTAAATTTATCAGCACTTTAAAGAGATTCCACCGTTGAAGTCAGTTTGAATGAAGTTCTAAATTGTTTGTATTTTCTTCCTATATAAAAGAGTGTTTCAGGCAAGTATTTAGCTATTTAATTTACATTTCACATGTTAGGTATAATAAA-ACAACCACTCTTTTCCCGAGAACTCACATAAATCCTGCCTTTCAAACCCAGAAAATATTCTCAACTCAGCTTCCTTGTGACACAAAAACTAATTGCAGTTGCACCTCATTTTGTGGAGCAAATAGC-TATGAAGGCTTACAAATTAAAATTCTGTAAACCACATTTCATATTGTGATTCCTTTTCATCAAGTTTTTGAGAGTTGTATTTG---AAAAAATGG-CATAGAACAAAACAAAAGTCA----AAATTAAAGCAAGATATTAGTCAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87969550 475 - 170124641 TTTTTCTCATATAATTAAGAAAGATAAACAAAACTGGCATGG----------------AAAGGTGAAACTCAGTGTTAAATTTGTCAGCACTTTAAAGAGAGGCCACCATTTAAGTCAGTTTGAATGAAGTTCTAAATTGTTTCTATTTTCTTCCTATATAAAAGAGTTTTTCAGGCAAGTATTTAGCTATTTAATTTACATTTCACATGTGAAGTATAATAAA-ACAACCACCCATTTCCCCAGGACTCATATAAATCCTGCCTTTCAAACCCAGAAAATATTCTCAACACAGGTTCTTTATGACACAAAAACTAATTGCAGCTGCACCTCATTTTGCGGAGCAAATAAC-TATGAGGGCTTACAAATTAAAATTCTGTAAATTACATTTCATATTGTGATTCCTTTTCATCATGTTTTTGAGAGTTGTATTTG--GAAAAAATGGCCATAGAACAAAGCAAAGATCA----AAATCAAAGCAATATGTTAGTCAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88247089 475 - 171882078 TTTTTCTCATATAATTAAGAAAGATAAACAAAACTGGCATGG----------------AAAGGTGAAACTCAGTGTTAAATTTGTCAGCACTTTAAAGAGAGGCCACCATTTAAGTCAGTTTGAATGAAGTTCTAAATTGTTTCTATTTTCTTCCTATATAAAAGAGTTTTTCAGGCAAGTATTTAGCTATTTAATTTACATTTCACATGTGAAGTATAATAAA-ACAACCACCCATTTCCCCAGGACTCACATAAATCCTGCCTTTCAAACCCAGAAAATATTCTCAACACAGGTTCTTTATGACACAAAAACTAATTGCAGCTGCACCTCATTTTGTGGAGCAAATAAC-TATGAGGGCTTACAAATTAAAATTCTGTAAATTACATTTCATATTGTGATTCCTTTTCATCATGTTTTTGAGAGTTGTATTTG--GAAAAAATGGCCATAGAACAAAGCAAAGATCA----AAATCAAAGCAATATGTTAGTCAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85368090 476 - 162156779 tttttctcatataattaagaaagataaacaaaactggcATGG----------------AAAGGTGAAACTCAGTGTTAAGTTTATCAGCACTTTAAAGAGAGGCCACCAGTTAAGTCAGTTTGAATGAAGttctaaattatttatgttttctttctatataaaaGAGTTTTTCAGACAagtatttatctatttaatttacatttcacatgtgaagtataataaa-acaacCACCCATTTCCCCAGGACTCACATAAATCCTGCCTTTCAAACCCagaaaatattctcaacacaGGTTCTTTATGACACAAAAACTAATTGCAGCTGCACCTCATTTTGCGGAGCAAATAAC-CATGAGGGCTTACAAATTAAAATTCTGTAAATTACATTTCATATTGTGATTCCTTTTCATCATGTTTTTGAGagttgtatttg-aaaaaaaatggccatagaacaaaacaaagatca----aaatTGAAGCAATATGTtagtcaaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87695301 440 - 132174527 TATTTCTCATGTAATTAAGAAAGAT----GAAACTGGCATGG----------------ACAGGTGAAACTT-GTGTTAAATTTATCAGCACTTTAAAGAGAGCCCACCATTGA----AGTTTGAATTAAGTTCTAAGTTGCTCATACTTTCTTCCTATATAAAAGAGTTTTCCTGGCAAGTATTTAGCTATTTAATTTACATTGCACATGTGAAGTATAATAAA-ACAGCCACCCTTTTCCCCAGAACTCACATAAATCCTGCCTTTCAAATCCAGAAAATATTCACAACTCAGGTTCTTTATGACACAAAAACTAACTGCA----------------------------C-TATGAGGGCTTACAAATTAAAGTTCTGTAAATTACATTTCATATCGTGATTTCTTTTCATTATGTTTTTGAAATTTGTATTTGAAAAAAAAATGACCATAGAACAAAACAGAAATCA----AAATCGAAGCAATATGTTAGTCAAAT i calJac3.chr10 I 2160 C 0 s canFam3.chr15 46756914 481 - 64190966 TTTTTCTTATATAATTAAGAAAGGTGAATGGATCTGGCATGAGCATTCTTTAAGCTCCACATATGAAAATCA--GTTAAAATTATTAGCACTTCA-----AGCCTACCATTGAAATTGGTTTGGATAAAGTTCCAAATGATTTATATTTTCTTCCAATATAAAGTAGTTTTT-AGGCAATTGTTCAGCTATTTAATTT--ATTGCCTATGTGAAGTAGGATAAAGATAGCCACTTCTTTTCC-AAAACTC--AGAAATCCTGCCTTTCAAGCTCAACAAATATTCTCAATCCAGGTTCTTTATGAAATAAAATCCAGTTGCTGTTTCACATCATTTTGTGGAGCAAATGACTTCTTGAAGTATACAAATTAAAATTCTGTAATTTACATTTTATATTATGATTTCCTTTAATTGCATTTTGGAGAGTCACACTTT----AAAAATGGCAAAAGAACAAAATAAAAGTCAAATTAAATAAAAGTCA-ATAAAAGTCAAAT i canFam3.chr15 C 0 I 1132 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=54630.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 352700 47 + 478999 ATTTTATAAAATGGATTTTAAGAGTTTTATTTTAGTACTGTCCAGCA s panTro4.chrUn_GL393519 193890 47 + 413329 ATTTTATAAAATGGATTTTAAGAGTTTTATTTTAGTACTGTCCAGCG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87970025 46 - 170124641 A-TTTATAAAATGGATTTTAAGAATTTTATTTTAGTACTGCCTAGCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88247564 46 - 171882078 A-TTTATAAAATGGATTTTAAGAATTTTATTTTAGTACTGCCTAGCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85368566 46 - 162156779 a-tttataaaatggattttaagaattttattttagtacTGCCCAGCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87695741 45 - 132174527 A-TTTATAAAATGGATTTTAAGAATTTTA-TTTAGTACTGCCCAGCA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46757395 1132 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=765819.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 352747 577 + 478999 GTACTCAAATAAGTCACACAGTATTAATACTAAATTAGTTATGGTATCAAATCCTG-TGTTTAAACTGGGTTTACAACAAAGAAAGCTATATCCTGAGTAATG--CTCACCTTTTTGTTTAGGTCTTTGCTGCACTATATTCCAGGTAACGAATCTGCTTTAAATTCCTAATTCTTG-GTTGTGTACTCTCTGAAAAAACACTGAATATCAAACTAAGGCTATTAGTCTATTTATATAATGTAAAGACCACTTGCTACATTTTGACAAGCTGGAC-TACTTAAAACTTGGCTCTTTTTCA---GCCAGTATCTCTTAGTGGATAATGATTGGATTATAGTGTTAATTGTGAGAGCAGTCTATGATATCTGTCACATGTGTTACCAATTGCTTTAGCTCAGTAATACAAAAAGGACGTCTGCATTCTTTTTAAAAAGTTGAGTTACATATACACGTTCTGATTAGCATAGA--CATAGAATTTTACATACGTATTATTCACTTCAACAGAAAATCTAATTCACTGTTGAAACATTCTT---AAATAAGACCACAGTAATGCAGATTGTGGTGAGTGGTGTTTAAGATGTTA s panTro4.chrUn_GL393519 193937 577 + 413329 GTACTCAAATAAGTCACACAGTATTAATACTAAATTAGTTATGATATCAAATCCTG-TGTTTAAACTGGGTTTACAACAAAGAAAGCTATATCCTGAGTAATG--CTCACATTTTTGTTTAGGTCTTTGCTGCACTATATTCCAGGTAACGAATCCGCTTTAAATTCCTAATTCTTG-GTTGTGTACTCTCTGAAAAAACACTGAATATCAAACAAAGGCTATTAGTCTATTTACATAATGTAAAGACCACTTGCTACATTTTGACAAGCTGGAC-TTCTTAAAACTTGGCTCTTTTTCA---GCCATTATCTCTTAGTGGATAATGATTGGATTATAGTGTTAATTGTGAGAGCAGTCTATGATATCTGTCACATGTGTTATCAATTGCTTTAGCTCAGTAATACAAAAAGGACGTCTGTATTCTTTTTAAAAAGTTGAGTTACATATACACGTTCTGATTAGCATAGA--CATAGAATTTTACATACTTATTATTCACTTCAACAGAAAATCTAATTCACTGTTGAAACATTCTT---AAATAAGACCACAGTAATGCAGATTGTGGTGAGTGGTGTTTAAGATGTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87970071 573 - 170124641 GTAC----ACAAGTCACAAAGTATTAATACTAAATTAATTATGATATCAAAACCTG-TGTTTAAACTGGGTTTACGGCAAAGCAAGCTATAGCCTGAGTAGTG--CTCACCTTTTTGTTTAGGTCTTACCTGCACTATATTCCAGGTAACTAAACTGCTTTAAATTCCTAATTCTTGTTTTGTGTACTCTCTGAAAAAACACTGAATATCAAACTAAGGCTATTAATCTATTTCCATAATGTAAAGCCCACTTGCTACATTTTGACAAGATGAAC-ATCTAAAAACTTGACTCTTTTTCA---GCCAGTATGTCCTGGTGGACAATTATGGAATTACAGTGTTAATTGTGGGAGCAGTCTACGATATCTGTTACATGTGTTATCAATTGCTTTAGCTCAGTAATACAAAATGGACATCTGTATTTTTTTTAAAAAGTTGAATTACATATAGAGGTTCTGATTAGCTTAGA--CACAGAATTTTACATGCTTTTTATTCACTTCAACACAAAATCTAATTCACCGTTGAAGCTTTCTT----CTTAAGACCATAGTATTGCAAATTATGGTTAGTGGTGTTTAAGATGTTA i rheMac3.chr7 C 0 I 128 s macFas5.chr7 88247610 573 - 171882078 GTAC----ACAAGTCACAAAGTATTAATACTAAATTAATTATGATATCAAAACCTG-TGTTTAAACTGGGTTTACGGCAAAGCAAGCTATAGCCTGAGTAGTG--CTCACCTTTTTGTTTAGGTCTTACCTGCACTATATTCCAGGTAACTAAACTGCTTTAAATTCCTAATTCTTGTTTTGTGTACTCTCTGAAAAAACACTGAATATCAAACTAAGGCTATTAATCTATTTCCATAATGTAAAGCCCACTTGCTACATTTTGACAAGATGAAC-ATCTAAAAACTTGACTCTTTTTCA---GCCAGTATGTCCTGGTGGACAATTATGGAATTACAGTGTTAATTGTGGGAGCAGTCTACGATATCTGTTACATGTGTTATCAATTGCTTTAGCTCAGTAATACAAAATGGACATCTGTATTTTTTTAAAAAAGTTGAATTACATATAGAGGTTCTGATTAGCTTAGA--CACAGAATTTTACATGCTTTTTATTCACTTCAACACAAAATCTAATTCACCGTTGAAGCTTTCTT----CTTAAGACCATAGTATTGCAAATTATGGTTAGTGGTGTTTAAGATGTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85368612 571 - 162156779 GTAC----ACAAGTCACACAGTATTAATACTAAATTAATTATGATATCAAAACCTG-TGTTTAAACTGGGTTTACGGCAAAGCAAACTATAGCCTGAGTAGTG--CTCACCTTTTTGTTTAGGTCTTACCTGCACTATATTCCAGGTAACTAAACTGCTTTAAATTCCTAATTCTTGTTTTGTGTACTCTCTGAAAAAACACTGAATATCAAACTAAGGCTATTAATCTATTTCCATAATGTAAAGCCCACTTGCTACATTTTGACAAGATGAAC-ATCTAAAAACTTGACTCTTTTTCA---GCCAGTATGTCC-GGTGGACAATTATGGAATTACAGTGTTAATTGTGGGAGCAGTCTACGATATCTGTTACATGTGTTATCAATTGCTTTAGCTCAGTAATACAAAATGGACatctgtattcttttt-aaaagttgaattacATATAGAGGTTCTGATTAGCTTAGA--CACAGAATTTTACATGCTTTTTATTCACTTCAACACAAAATCTAATTCACCATTGAAGCTTTCTT----CTTAAGACCATAGTATTGCAAATTATGGTTAGTGGTGTTTAAGATGTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87695786 578 - 132174527 GTACTCAAATAAGTCACACAGTATTAATGCTAAACTAATTATGATATCAAAACCTC-TGTTTAAACTGGGTTTACAACAAAGCAAGCTGTATCCTGAGTAGTG--CTCACCTTTTTGTTTAGGTCTTATCTGTACTATATCCCAGGTAACTAATCTGCTTTAAATTCATAATTCTAGTTTTGTGTA--CTCTGAAAAAACACTAAATATCAAACTAAGGTTATTAGTTTATTTCCACAATGTAAGGACCACTTGCTACATTTTGACAAGCTGGAC-TTCTTAAACCATATCTTTTTTGCA---GCCAGTATCTCCTACTGCACAATTACTGGATTACGGTGTTAATTGTGAGAGCAGTCTATATTATCTGTTACATGTGTTATCAATTACCTTAACTCAGTAATACAAAAAGGATATATGTATTCTTTTTAAAAAGTTGAAATACATATAGAGGTTCTGACTAGCTTAGA--CATAGAATTTTACATACTT-CTATTCATTTCAACACAAACTCTAATTCATTGTTGAAACACTCTTCTTAAATAAGACCACAGTATTACAAATTGTGGTGAGTGGTGTTTAAGATGTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46758527 552 - 64190966 GTATTAAAATAAATCTCACAGTACTAATACTAACCTCA-CATGGTACCGGAAGTTACTGTGTAAACTGGATTTACCCTAAGGTGAATTACATCTTGAGTCATGTCCTAGACTTTATGTTTAACTCCTATCTTTACTATGTTCTAGATAGCTAAGACACTTGAAATTCCTAATCCTTGTCTTGTACA--CTCTGAAAAGTCACT-AACACCCAGCTAGGGCTATTACTCTGTGTC-----TTTAAAGA-CACATGCTGCACTCTGAAAAGGTCTACTTTCCTCAAGTTTGAATCTTCTTTACTGGTCAGTATGTCTCAGTGGAGAATTACTGGCTTAAAGTGTTAATGCCCAAAGCAATCTATGATCTCTATTAC--------TGAGTTGC----ACTCAGTAATGCAAAATTGACTACTGTCTTTTT----AGAAATTGAATTATATAGAGAAATACTAATGGGCTTAGATTCCTAAAATTTCATTTACTTGATATTAACTTCAAAACAAAATTGAAGCCACTTGGTAATACATCTT----CTTAA----ATA----TGTATCTTGTGGTGAGTGGTGTTTAAGATGGTA i canFam3.chr15 I 1132 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1406.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 353324 5 + 478999 ATGGC s panTro4.chrUn_GL393519 194514 5 + 413329 ATGGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88248183 5 - 171882078 ATGGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85369183 5 - 162156779 ATGGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87696364 5 - 132174527 ATGAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46759079 2 - 64190966 AT--- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87970644 128 - 170124641 I a score=114803.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 353329 86 + 478999 TCATTATTATAGCAGTTCTTAAATAAAAC--AATAAATTTGTAGACAAATAT-----TCATGTATAATA-----AAGTTA-ATTTGATAAATGAAAAT--T s panTro4.chrUn_GL393519 194519 87 + 413329 TCATTATTATAGCAGTTCTTAAATAAAAC--AATAAATTTGTAGACAAATAT-----TCATGTATAATA-----AAGTTACATTTGATAAATGAAAAT--T i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87970772 89 - 170124641 TCATTATTATAGCAGTTCTTAAATAAAAC--AATGATTCTGTAGACAAATAT-----TCATGTCTAATT-----AAGTTCCATTTGATAAATGGAAATTAT i rheMac3.chr7 I 128 C 0 s macFas5.chr7 88248188 89 - 171882078 TCATTATTATAGCAGTTCTTAAATAAAAC--AATGATTCTGTAGACAAATAT-----TCATGTCTAATT-----AAGTTCCATTTGATAAATGGAAATTAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85369188 89 - 162156779 TCATTATTATAGCAGttcttaaataaaac--aatgattcTGTAGACAAATAT-----TCATGTCTAATT-----AAGTTCCATTTGATAAATGGAAATGat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87696369 88 - 132174527 TTATTATTATAGCAGTTCTTAAATAAAAC--AATGAATTTGTAGACAAATAT-----TCATGACTAATTA----AAGTTATATTTGATAAATGGAAAT--T i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46759081 86 - 64190966 -------------AGTTTCTTAATGAAACTTAATGAGTTTGTAGACAAATATATCACTCATGTTTTATTAAGGTAAGTTGCATTTGAGAGATGGAATT--T i canFam3.chr15 C 0 I 67124 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1321343.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 353415 912 + 478999 CTCTTATTTATATTTTATTAACATCTTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCCTCAGATAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATTAGAGGATTACAGAGTGGTGTTATCACAGAATAGAACAAGGTAATGATTTTT-TCATTTTTACT-GGGTGTGCTGATCCAGGACTAACATACATCACCAGGATAGAGCCATAAAATAAGGTGACAACTGCCAAATGAGAGGCACAAGTGGAGAAAGCTTTTCGTTTGCCAGCCTCTGAAGGCATCCGTATTATAGCCAGAATCACCAGAGCATAGGAACAAAGGAATAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGACAGAATTGAATGTGGAGTAAATGAGCTGGGTGATGATGATGTCTTCAGAACAGGACAGCATCTTCAATGGGACGGGATCACAAATAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTAGGATAGCTGTGAAATGAGAATCACCAGAGTTAGGAAGATTACAAAGACACATGACCATGCAAAAATGATGAGGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCATGGATAACGTAGAGGGCGGCAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCGTGATGCAAAGGAAGAAGCCCTCATCATACCCCAAAG---AGAA--GAAGTAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTTGTGGAGAGGAAGTTGGCCAGCAGTT------TAGTTGCAGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAAGAGGGTGTACATGGGAGTGTGAAGGTGCTGGTCCTACCACACAGCACAGACAATGGCTGCATTTCCCATCGGGGTGAGAGTATAGGCTACTGAGAAGAGACCGAAGTAGAGGAGCTGCATTTCTGGGCTTGAGGGAAAGCCCATGAGGATAA s panTro4.chrUn_GL393519 194606 916 + 413329 CTCTTATTTATATTTTATTAACATCTTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCCTCACAGAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATTAGAGGATTACAGAGTGGTGTTATCACAGAATAGAACAAGGTAATGATTTTTCTCATTTTTACTGGGGTGTGCTGATCCAGGACTAACATACATCACCATGATAGAGCCATAAAATAAGGTGACAGCTGCCAAATGAGAGGCACAAGTGGAGAAAGCTTTTCATTTGCCAGCCTCTGAAGGCATCCGTATTACAGCCAGAATCACCAGAGCATAGGAACAAAGG-CCAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGATAGAATTGAATGTGGAGTAAATGAGCTGGGTGATGATGATGTCTTCAGAACAGGACAGCATCTTCAATGGGACGGGATCACAAATAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTAGGATAGCTGTGAAATGAGAATCACCAGAGTTAGGAAGATTACAAAGACACATGACCACGCAAAGATGATAAGGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCATAGATAACGTAGAGGGAGGCAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCATGATGCAAAGGAAGAAGCCCTCATCATACCCCAAAGAGAAGAA--GAAGTAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTTGTGGAGAGGAAGTTGGCCAGCAGTT------TAGTTGTAGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAAGAGGGTGTACATGGGAGTGTGAAGGTGCTGGTCCTACCACACAGCACAGACAATGGCTGCATTTCCCATCAGGGTGAGAGTATAGGCTACTGAGAAGAGACCGAAGTAGAGGAGCTACATTTCTGGGCTTGAGGGAAAGCCCATGAGGATAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87970861 911 - 170124641 CTCTTATTTATA-------AACACCCTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCCTCAGAGAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATTAGAGGATTGCAGAGAGGTGTAATCACAGAATAGAATGAGGTAATGATTTTTTGCATTTTTACT-GTGTGTCCTGATCCAGGACTAACGTACATCACCACGATAGAGCCATAAAACAAGGTGACAACTGCCAAATGAGAAGCACAAGTGGAGAAAGCCTTTTGTTTGCCAGCCTCTGAGGACATCCGTATTACAACCAGAATCACCAGAACATAGGAACAAAGG-ATAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGACAGAATTGAATGTGGCGTAAATGAGCTGGG---TGATGATGTCTTCAGAACAGGACAACATCATCAATGGGACAGGATCACAAACAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTATGATAGCTGTGAAATGAGAATAACTGGAGTCAGGAAGATTACAAACCCACATGACCAGGCAAAGATAATAAGGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCGTGGATAATGTAGAGGGCGGCAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCATGATGCAAAGGAAGAAGCCCTCATCACACCCAAAAGAGAAGAA--GAAGTAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTCGTGGAGAGGAAGTTGGCCAGCATTTCAGGAACAGTTGTAGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAGGAGGATATACATGGGAGTGTGAAGGTGCCGGTCCCACCACACAGCACAGACAATGGCTGCATTTCCCATCAGGGTGAGAGTATAGGCTACTGAGAAGAGACTGAAGTAGAGGAGCTGCATTTCTGGGCTTGAGGGAAAGCCCATGAGGATAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88248277 911 - 171882078 CTCTTATTTATA-------AACACCCTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCCTCAGAGAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATTAGAGGATTGCAGAGAGGTGTAATCACAGAATAGAATGAGGTAATGATTTTTTGCATTTTTACT-GTGTGTCCTGATCCAGGACTAACATACATCACCACGATAGAGCCATAAAACAAGGTGACAACCGCCAAATGAGAAGCACAAGTGGAGAAAGCCTTTTGTTTGCCAGCCTCTGAGGACATCCGTATTACAGCCAGAATCACCAGAACATAGGAACAAAGG-ATAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGACAGAATTGAATGTGGCGTAAATGAGCTGGG---TGATGATGTCTTCAGAACAGGACAACATCATCAATGGGACAGGATCACAAACAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTATGATAGCTGTGAAATGAGAATAACTGGAGTCAGGAAGATTACAAACCCACATGACCAGGCAAAGATAATAAGGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCGTGGATAATGTAGAGGGCGGCAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCATGATGCAAAGGAAGAAGCCCTCATCACACCCAAAAGAGAAGAA--GAAGTAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTCGTGGAGAGGAAGTTGGCCAGCATTTCAGGAACAGTTGTAGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAGGAGGATATACATGGGAGTGTGAAGGTGCCGGTCCCACCACACAGCACAGACAATGGCTGCATTTCCCATCAGGGTGAGAGTATAGGCTACTGAGAAGAGACTGAAGTAGAGGAGCTGCATTTCTGGGCTTGAGGGAAAGCCCATGAGGATAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85369277 918 - 162156779 ctcttatttatattttatcaacaCCCTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCCTCAGAGAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATTAGAGGATTGCAGAGAGGTGTAATCACAGAATAGAATAAGGTaatgattttttgcatttttact-gtgTGTCCTGATCCAGGACTAACATACATCACCACGATAGAGCCATAAAACAAGGTGACAACCGCCAAATGAGAAGCACAAGTGGAGAAAGCCTTTTGTTTGCCAGCCTCTGAGGACATCCGTATTACAGCCAGAATCACCAGAACATAGGAACAAAGG-ATAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGACAGAATTGAATGTGGAGTAAATGAGCTGGG---TGATGATGTCTTCAGAACAGGACAACATCATCAATGGGACAGGATCACAAACAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTATGATAGCTGTGAAATGAGAATAACTGGAGTCAGGAAGATTACAAACCCACATGACCAGGCAAAGATAATAAGGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCGTGGATAATGTAGAGGGCAGCAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCATGATGCAAAGGAAGAAGCCCTCATCACAcccaaaagagaagaa--gaagtAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTCGTGGAGAGGAAGTTGGCCAGCATTTCAGGAACAGTTGTAGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAGGAGGATATACATGGGAGTGTGAAGGTGCCGGTCCCACCACACAGCACAGACAATGGCTGCATTTCCCATCAGGGTGAGAGTATAGGCTACTGAGAAGAGACTGAAGTAGAGGAGCTGCATTTCTGGGCTTGAGGGAAAGCCCATGAGGATAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87696457 918 - 132174527 ATCTCATTTATATTTTATTAACACATTTTCCAGTCCTGAAGATTTTCTTCAGAGAATCTTTCATCTCTTTGTTCCTGAGACTATATATCAGAGGATTGCAGAGAGGTGTTATCACAGAATAAAACAAGGTAATGATTTTTTGCATTTTTACT-GGGTGTCCTGATCCAGGACTAACATACATCATCATGATAGAGCCATAAAACAAGGTGACAACTGCCAAATGAGAAGTACAAGTGGAGAAAGCCTTTTGTTTGCCAGCCTCTGAGGGCACCTGCATTACAGCCAGAATCACCAGAGCATAGGAACAAAGG-ATAAAGAGAAAGGTGCCAATCATGAAGACAGAATTGAATGTGGAGTAAATGAGCTGGG---TGATAATGTCTTCAGAACAGGACAGCATCATCAGTGGGACAGGATCACAGACAAAATGGTTGATAATATTTGGGCCACAGTAGGATAGCTGTGAAATGAGAATAACTGGAGTTAGGAAGATTACAAACCCACAGGACCATGCAAAGACAATGAAGCCAGTGCATACTTGTTTAGTCATGATGCGTGGATAATGTAGAGGGCGGTAGATGGCAAGATACCTGTCAAAGGCCATGATACAAAGAAAGAAGCCCTCATCGTACCCAAAAGAGAAAAA--GAAGTAGAACTGTGCAAAACAACTCATGAATGAGATGGACTTGCTTGTGGAGAGGAAGTTGGCCAACGTTTTAGGAACAGTTGTGGTAACATAACATATTTCCAGGAGAGAGAAATTTCCCAAGAGAATATACATGGGAGTGTGAAGGCGCTGGTCCCACCATACAGAACAGACAATGGCCGCATTTCCCATCAGGGTGAGAATATAGGCTACTGAGAAGAGACTGAAGTAGAGGAGCTGCATTGCTGGACTTGAGGGAAAACCCATGAGGATAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46826291 852 - 64190966 CTTTTAAAGAAATTTTA-----AACTTTTCCAG-------GACTTTCCAGAGAGCAT-TTTCATCTCCTTATTCCTGAGACTGTAAATCAAAAGGTTGAAGAATGGAGTTATCATTGCATAGAACAAGGTCATGATCTTTGGCATCAGGGCA-GAGTGGTGGGATCCAGGGCTCTCATGCATCACCATAATGGTCCTGTAGAATAGCAACACCATTGACAAATGGGACCCACACACTGAAAAAGCCTTATGCCTAATGGATGCTGAGGGCAACCGAAGCACAGCAAGTAGAACCAGGGCACAGGAGATGAGG-ATGAAAAAGAAGCTAAGGAGGATGTTGAGGGAGCTTAGGGTACAGCTGATGAGCTTGG---ACATAGGGACAGGAGCACATGAAAGGGTCAGCAATGGGCCTGAGTCACATACAAAATGATCAATTGCATTAGGACCACAGAAAGGCAGTTGGGAGATGAGGATAACAGGTACCAGATAGCAGAGAAAGCCACAGGCCCAACAAGAGATCACTAAGTTGAAACAACGTTGTCCAGACATAATTGTGGCATAATACAGAGGATGGCAGATGGCAGAGTAGCAATCAAAGGCCATTGCTGAGAGAAAGAAGCACTCAGTGGAGCCCATGGAAAAGAAAGGAAGT------------------------------------------CTGAAAGGAAGTTGATCAGTGTGTTTGCAACAGTGAGATTGACATACCAGATCTCCAGGAATGCAAAATTCCCCAGCAGGATCTACATGGGGGTGTGGAGATGCTGGTCCCAACACACAGCACCAATAATAGCTCCATTTCCCATGAGAGTCAGG--ATAGGTGATTGAGAACA-----------ACAACTTGAATCTCCTTGCTGCAGGGAAAACCCAGAAGAATGA i canFam3.chr15 I 67124 T 67056 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=362454.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 354327 292 + 478999 GGCAGCTAACAAAATTGATAGTTTCCATGCTGAACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGGCAGAGGTAACTGAAACATGAAAGGGAGCGTGCTGTTTCTTCTTGGAAAC--------------------AACCAAAATTCTTCATCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTAGACTTT----TGTTTAAACAACAAAACTGTGACTTTCATGACTCAATTCCTACAC--GTTTATTTTAATAAATCACAACAAT----AGAAGGGAAAATATGAATTGTGGAGAGTTTTT---------TTT----CTTGCTAAGAACACTAGACTT s panTro4.chrUn_GL393519 195522 298 + 413329 GGCAGCTAACAAAATTGATAGTTTCCCTGCTGGACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGGCAGAGGTAACTGAAACATGAAAGGGAGCGTGCTGTTTCTTCTTGGAAAC--------------------AACCAAAATTCTTTACCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTAGACTTT----TGTTTAAACAACAAAACTGTGACTTTCATGACTCAATTCCTACACATATTTATTTTAATAAATCACAACAATAGAAAGAAGGGAAAATATGAATTTTGGAGAGTTTTT---------TTT----CTCGCTAAGAACACTAGACTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87971772 307 - 170124641 AGGAGCTAACAAAGTTGATAGTTTCTATGCTGGACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGGCAGAGGTAATTGAAACATGAAATGGAACATGCTGGTTCTTCTTGGAAAC--------------------AACCAAAATTCTTTATCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTGGACTTT----TGTTTAAACAACAAAAGTGTGACTTTCACGACTCAACTCCTACACATATTTATTTTAATAAATCACAACAATAAAAAGCAGGGAAAATATGAATTGTGGAGAGTTTTGTTTTTTTTTTTT----CTTGCTAAGACCACTAGACTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88249188 306 - 171882078 AGGAGCTAACAAAGTTGATAGTTTCTATGCTGGACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGGCAGAGGTAATTGAAACATGAAATGGAACATGCTGGTTCTTCTTGGAAAC--------------------AACCAAAATTCTTTATCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTGGACTTT----TGTTTAAACAACAAAAGTGTGACTTTCACGACTCAACTCCTACACATATTTATTTTAATAAATCACAACAATAAAAAGCAGGGAAAATATGAATTGTGGAGAGTTTTG-TTTTTTTTTTT----CTTGCTAAGACCACTAGACTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85370195 306 - 162156779 AGGAGCTAACAAAGTTGATAGTTTCTATGCTGGACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGGCAGAGGTAATTGAAATGTGAAATGGAACATGCTGGTTCTTCTgggaaac--------------------aacaaaaattctttATCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTGGACTTT----TGTTTAAACAACAAAAGTGTGACTTTCATGACTCAACTtctacacatatttattttaataaatcccAACAATAGAAAGCAGGGAAAATATGAATTGtggagagttttg-ttttttttttt----cttgctaagaCCACTAGACTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87697375 288 - 132174527 AGTAGCTAACAAAGTTGATAGTTTCTATGCTGGACACATTCATTAGTCTGGAAGACATGGAGATGACAGAGGTCACTGAAACATGAAATGTCGCACTCT----------GGAAAC--------------------ACCAAAAATT-TTTACCATGTATATTATAAAGTAGTAAACAATTAGACTTT----TGTTTAAACAACAAATCTATGACTTTCATGACTCAACTCCTAAACAGATTTATTTTATTAAATCACAACAATAGACAGCAGGGAAAATATGAATTGTGGAGAATTTCT--------TTTT----CTTGCTAAGAACACTAGACTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46760087 275 - 64190966 AGTGGCTAACGGAGTTGGTGGTTTCTGTGCTGGACGCATTCATTGGTCTGGAAGACATGGAGATGAT--------TTG-----------GTAACAATTTTTTCCTTCCTAAGAATGCTAGTCTAGATATTAGGAAAGCCAAATTTTATGATTGTGAATAATTACTTATATTAATC---TAGTCTTTCACCTGTTTG----------CTAGCACTTTTAATACTACATTTCTGTGTATGTGAAGTTC------TTTCAACAGT--------------CTATGAGTATTTGATTCTTTTT--------TTTTAAACCtttttaaaaagattttattt i canFam3.chr15 T 67056 I 145 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=23079.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 354619 17 + 478999 GAAACCAGGAATGCAAA s panTro4.chrUn_GL393519 195820 17 + 413329 GAAACCAGGAATGCAAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972079 17 - 170124641 GAAACCGGGAATGCAAA i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 88249494 17 - 171882078 GAAACCGGGAATGCAAA i macFas5.chr7 C 0 I 1 s papAnu2.chr7 85370501 17 - 162156779 GAAACCGGGAATGCAAA i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s calJac3.chr10 87697663 17 - 132174527 GAAACCAGGAATGCAAA i calJac3.chr10 C 0 I 1 e canFam3.chr15 46760362 145 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=182905.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 354636 105 + 478999 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGGGTCTACTCTTTCTTCTGTTTACCTGCATTATTGATACTGTATTTATCTGGGTATGTAGTTCTTTCAACAG s panTro4.chrUn_GL393519 195837 105 + 413329 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGAGTCTACCCTTTCTTCTGTTTACCTGCATTATTGATACTGTATTTATCTGGGCGTGTAGTTCTTTCAGCAG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18886581 104 + 108868599 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGAGTCTACTC-TTCTTCTGTTTACCTGCATTATTGATACTATATTTATCTGGGTATGAAGTTCTTTCAACAG i ponAbe2.chr14 N 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972097 105 - 170124641 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGAGTCTACCCTTTCTTCTGTCTACCTGCATTATTGATACTATATTTATCTGGGTATGAAGTTCTTTCAACAG i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 88249512 105 - 171882078 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGAGTCTACCCTTTCTTCTGTCTACCTGCATTATTGATACTATATTTATCTGGGTATGAAGTTCTTTCAACAG i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 85370519 105 - 162156779 TTTTGTGATTCCAATAAATTACCTATATACAATGAGTCTACTCTTTCTTCTGTCTACCTGCATTATTGATACTATATTTATCTGGGTATGAAGTTCTTTCAACAG i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s calJac3.chr10 87697681 99 - 132174527 TTTTGTAATTCCAATCAATTACCTGTATACAATTAGCCTACTCTTTCTTCTGTTTACCTGCATTATTGATA------TTATCTGGGTATGAAGTTCTTTCAACAG i calJac3.chr10 I 1 C 0 e canFam3.chr15 46760362 145 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1251523.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 354741 647 + 478999 TACTATGAATACCTGATTCATTA----TTATTAGTGGTATAAAAAT-AAAATACAAAACCAAGATAT-TTAAAAATACTCTTTCTCAATATAGTGCCATGCCAGGGCACAAATTAATATTTACTTTCAATTTCAGCTACTCCCGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAACTCTGTCATTAGAGAATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTGTACCAATGTTTAGCATA-AAAAATACATTCTTTCA-TTTTTAGGCAGCTGGATATGCTATATGCTGTGAGGAAGCGTGCCATACTTTGGCTCTTAAATTGCTCTGACTAAATATTTTTATATGCTTCCAGGTGAATGTAAGAACTTCATATGCCTATTATGAC-ATTGACCTTAGGGAGAACAGCTGGTCTGCGTGACTGTGGCCAAGTTCAATGTGCTTGTTTTTTGTTAATCATGGTCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGATAAAGTTTATAT----TACAAAAG-------TTTCCATG-------TTTTTTATTCACTGCTTTCTTCCACATGTTCC-TTTTCTTCCTTT------GACCTTTGGTGTTATTTTGCATCTCACTGTGGTTGTTTTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAATCCGAAACATAAAACTTTTC s panTro4.chrUn_GL393519 195942 647 + 413329 TACTATGAATACCTGATTCATTA----TTATTAGTGATATAAAAAT-AAAATACAAAACCAAGATAT-TTAAAAATACTCTTTCTCAATATAGTGCCATGCCAGGGCAGAAATTAATATTTACTTTCAATTTCAGCTACTCCAGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAACTCTGTCATTAGAGAATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTGTACCAATCTTTAGCATA-AAAAATACATTCTTTAA-TTTTTAGGCAGCTGGATACGCTATATGCTGTGAGGAAGTGTGCCGTACTTTGGCTCTTAAATTGCTCTGACTAAATATTTTTATATGCTTCCAGGTGAATGTATGAACTTCATATGCCCATTGTGAC-ATTGACCTTAGGGAGAAAAGCTGGTCTGCGTGACTGTGGCGAAGTTCAATGTGCTTGTTTTTTGTTAACCATGGTCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGGTAAAGTTTATAT----TACAAAAG-------TTTCCATG-------TTTTTTATCCATTGCTTTCTTCCACATGTTCC-TTTTTTTCCTTT------GACCTTTGGTGTTATTTTGCATCTCACTGTGGTTGTTCTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAATCCGAAACATGAAACTTTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18886685 649 + 108868599 TACTATAAATACCTGATTCATTATTATTTATTAGTGATATAAAAAT-AAAATACAAAACCAAGATAT-TTAAAAATACTCTTTCTCAGTATAGTGCCATGCCAAAGCACAAATTAA----TACATTCAATTTCAGCTACTCCAGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAACTCTTTCATTAGAGGATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTGTACCAATGTTTAGCATA-AAAAATACATTCTTTTA-TTTTTAGGCAGCTGGATACACTATATGCTGTGAGGAAGTGTGCCATACTTTGGCCCTTAAATTGCTCTGACTAAATATTTTTATACGCTTCCAGGTGAAGATATGAACTTCATATGCCCATTTTGAC-ATTGACCTTAGGGAGAACAGCTGGTCTGCATGACAGTGGCCAAGTTCAACTTGCTTGTTATTTGTTAACCATGGTCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGATAAAGTTTATAT----TATGAAAG-------TTTCCGTG------TTTTTTTATTCACCGCTTTCTTCCACATGTTCCTTTTTCTTCCTTT------GACCTTTGGTGTTATTTTGCATCTCACTGTGGTGGTTCTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAATCTGAAACATGAAACTTTTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972202 641 - 170124641 GACTATGAATACCTGATTCATTATGATTCATTAGTGATATAAAAAT-AAAATACAAAA-CAAGATAT-TTAAAAATACTCTTTCTCAATATAGTGCCATGCCAGGGCACAAATTAATATTTACTTTCAATTTCAGCTACTCCAGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAACTAGGTCATTAGAAGATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTCTACCAATGTTTAGCATA-CAAAATACA-----TTC-TTTTTAGGCAGCTGGATACACTATATGCCGTGAAGAAGTGTGCCACACTTTGGCCCTTAAATTGCT----CTAAATATTTTTATATGCTTCCAGGTGAATATATGAACTTCATATGCCCATTATGAC-ATTGAGGTTAGGGAGAGCAGCTGGTCTGAGTGAATGTGGCCAAGTTCAATGTGCTTGTTATTTGTTAACCATGACCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGATAAGGTTTATAT----TATGAATG--------TTCCATG-------TTTTTTATTCACTGCTTTCTTCCACATGTTCCTTTTTCTTTCTTT------GACCTTTGGTGCTATTTTGCATCTCACTGTGGTGGTTCTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAACCtgaaacatgaaacctttc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88249617 646 - 171882078 GACTATGAATACCTGATTCATTATGATTCATTAGTGATATAAAAAC-AAAATACAAAA-CAAGATAT-TTAAAAATACTCTTTCTCAATATAGTGCCATGCCAGGGCACAAATTAATATTTACTTTCAATTTCAGCTACTCCAGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAAGTAGGTCATTAGAAGATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTCTACCAATGTTTAGCATA-CAAAATACATTCTTTTC-TTTTTAGGCAGCTGGATACACTATATGCTGTGAAGAAGTGTGCCACACTTTGGCCCTTAAATTGCT----CTAAATATTTTTATATGCTTCCAGGTGAATATATGAACTTCATATGCCCATTATGAC-ATTGAGGTTAGGGAGAGCAGCTGGTCTGAGTGAATGTGGCCAAGTTCAATGTGCTTGTTATTTGTTAACCATGACCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGATAAGGTTTATAT----TATGAATG--------TTCCATG-------TTTTTTATTCACTGCTTTCTTCTACATGTTCCTTTTTCTTTCTTT------GACCTTTGGTGCTATTTTGCATCTCACTGTGGTGGTTCTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAACCTGAAACATGAAACGTTTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85370624 647 - 162156779 GACTATGAATGCCTGATTCATTATGATTCATtagtgatataaaaat-aaaatacaaaatcaagatat-ttaaaaatactctttctCAATATAGTACCATGCCAGGGCacaaattaatatttactttcaaTTTCAGCTACTCCAGGTTACTTGTAGTGTTTTAAAGTGGTAATAAGAAAGAACTCGGTCATTAGAAGATATATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCCCTACCAATGTTTAGCata-caaaatacattcttttc-tttttaggcaGCTGGATACGCTATATGCTGTGAAGAAGTGTGCCACACTTTGGCCCTTAAATTgct----ctaaatatttttatatgcttccAGGTGAATATATGAACTTCATATGCCCATTATGAC-ATTGAGGTTAGGGAGAGCAGCTGGTCTGAGTGAATGTGGCCAAATTCAATGTGCTTGCTATTTGTTAACCATGACCAAGTCAGCTGCAGGAAAATAAGAAAGGCAGATAAGGTTTATAT----TATGAATG--------TTCCATG-------TTTTTTATTCACTGCTTTCTTCCacatgttcctttttctttcttt------gacctTTGGTGCTATTTTGCATCTCACTGTGGTGGTTCTCTGAGGCCTTTCCTATCTAGGCAAACCTGAAACATGAAACGTTTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87697780 651 - 132174527 TACTATGAATACCTAATTCATTATGATTTGTTA-TGATATAAAAAT-AAAATACAAACTCAAGATAC-TTAAAAATACTCTTTCTCAATGTAGTGTCATGCCAGGACACAAATTAATATTTACTTTCAATTTCAGCTACTCCAAGTTACTTGTGGCGTTTTAAAGTGGTAATAAAAACGACCTCTGTCATTAGAAGATACATGGTCTTTTATGCTGTTTCATGTATCTGTACCAGTGTTTAGCATA--AAAATACATTCTTTTATTTTTTAGGCAGTTGGATACCCTATATGCTGTGAGGAAGTATGCCATACTTTGGCCCTTAAATTGCTCTGACTAAATATTTTTATATGCTTCCAGGTGAATATATGAACTACCTATGCCCATTATGGC-ATTGACCTTAGGGAGAACAGCTGGTCTGAGTGACTGTGGCCAAGTTCAATGTGCTTGTTATTTGTTAACCATGGTCAGGTCAGCTGCAGAAAAATAAGAAACGCAGATCAAGTTTATAT----TATGAAAG-------TTTCCATG-------TTTTTTATTCACTGCTTTCTTCCACATGTTCCTTTTTCTTCCTTT------GACTCTTGTTATCATTTTGCATCTCACTGTGGTGGTTCTCTGAGGCCTCTCCTATCGAGGCAGATATGAAATGTAAAACTTTTC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46760507 652 - 64190966 tgcccCGAGTATTTGACTCTTTATGATTTCTAACTGACATAATAATAAAAAAATCAAACCAAGACACGTTAAGAA---TCTGTTTAAATGTAGTGCCGTAACTGGACATAAACTAATATTCATTTTCATTTTCAGTTCCTCCAAGGTACTCATGGTGTTTTAAGGTGACAGTAAAATATACCTCTATCATTCCAGGA----------TTTATGTTACTAGATGTATTCACACCAATGTTTAGTATAAAAAAAGGCTTCCTTTCC-TTTTTAGGCAACTGAATGCACTATACACTGTGAGAAAGAGTCCTATACCCTGGCCTCTGAATTTCTCTGGCTGAATATTTCGATGTACTTCC-TGTGTATATGTGAACTAGATATGCCAATTATGGCAATTGACCTGAGGGAGAGTAGCTGGTCTGAGTGACTGTGACCAAGTTCAGTGTG--TGCTCCTT------CCTAGTCAAGTTGGCTGCAAGAAAAATGGAAAAATAGTTT-TGTTTTTATCTTCTATGAAAATAGAGGATTTTCATAGTCCTTTATTTTTTTTAACAGCCTTTTCCCATATGTTCCTTTTTCTCTATTTTAGGCAGACCGTTGGTATCTCTTTACATCTCACTA-AGCGCATCT---AGGCCTTTCCTATCTGGGAAAAT-TGAAACAAGCAACTTCTC i canFam3.chr15 I 145 I 1120 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=63621.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355388 36 + 478999 CCCTGATTACCCTCCGGTTAACTTCTAGCCCA---AATA s panTro4.chrUn_GL393519 196589 36 + 413329 CCCTGATTACTCTCCGGTTAACTTCTAGCCCA---AATA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887334 36 + 108868599 CCCTGATTACTCTCCGGTTAACCTCTAGCCCA---AATA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972843 36 - 170124641 ccctgatcactctctggttaacttctagccca---aata i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250263 36 - 171882078 CCCTGATCACTCTCTGGTTAACTTCTAGCCCA---AATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371271 36 - 162156779 CCCTGATCACTCTCTGGTTAACTTCTAGccca---aata i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698431 39 - 132174527 CCCTGATTACTCTCTGGTTAACTTCTAGCCCACATAACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46761159 1120 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=112618.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355424 57 + 478999 ACAACAAAAACAA---GAAAAAGTCATATGAGCTGAAGATTTTTGTTTCTTAAATAATAA s panTro4.chrUn_GL393519 196625 57 + 413329 ACAACAAAAACAA---GAAAAAGTCATATGAGCTGAAGATTTTTGTTTCTTAAATAATAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887370 57 + 108868599 ACAACAAAAACAA---GAAAAAGTCATATGAGCTGAAGATTTTTATTTCTTAAATAATAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972879 57 - 170124641 acaacaaaaataa---gaaaaagtcatacaagctgaagacttttgttgcttaaataataa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250299 57 - 171882078 ACAACAAAAATAA---GAAAAATTCATACAAGCTGAAGATTTTTGTTGCTTAAATAATAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371307 57 - 162156779 acaacaaaaataa---gaaaaagtcatACAAGCtgaagatttttgtttcttaaataataa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698470 57 - 132174527 ACAACAAAAACAA---GAAAAAGTCATACCAGATGAAGATTTTTGTTTCTCAAATAATAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46762279 60 - 64190966 ACAACAAAAACAACAGTAAAAACACAACATGGCTGAAAAGTTTTGTTACTTCAAAAAGAA i canFam3.chr15 I 1120 I 207 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=22416.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355481 14 + 478999 CTAATTTGTATAAT s panTro4.chrUn_GL393519 196682 14 + 413329 CTAATTTGTATAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887427 14 + 108868599 CTAATTTGTGTAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972936 14 - 170124641 gtAATTTGTATAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250356 14 - 171882078 GTAATTTGTATAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371364 14 - 162156779 gtaaTTTGTATAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698527 14 - 132174527 CTAATTTGTATAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46762339 207 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=395973.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355495 195 + 478999 ACCAAGTCTTATTAATGTAATGGAACTGAAAAATCAGTATTTGGGCTTAAGAAAGAAAATATTGCTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTGCTCACCAAGTAACAAAAATTACCAAAATATACCCTTCTCCAGCAATTCATCAGTTAATATACATCTTCACTTGAAATACTA----------------------TTCTTTTTG---------TATATATGGC s panTro4.chrUn_GL393519 196696 194 + 413329 ACCAAGTCTTATGAATGTAATGGAACTG-AAAATCAGTATTTGGGCTTAAGAAAGAAAATATTGCTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTGCTCACCAAATAACAAAAATTACCAAAATATACCCTTCTCCAGCAATTCATCAGTTAATATACATCTTCACTTGAAATACTA----------------------TTCTTTTTG---------TATATATGGC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887441 194 + 108868599 ACCAAGTCTTATTAATGTAATGGAACTG-AAAATCAGTATTTGGGCTTGAGAAAGAAAATATTGCTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTGCTCATCAAGTAACAAATATTACCAAAATATACCCTTCTCCAGCAATTCATCAGTTAATATACATCTTCACTTGAAATACTA----------------------TTCTTTTTG---------TATATATGGC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87972950 194 - 170124641 ACCAAGTCTTATTAATGTAATGGAACTG-AAAATCAGTATTTGGGCTTGAGAAAGAAAATATTGCTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTACTTACCAAGTAACAAAAATTATCAAAATATACCCTTCTCCATCAATTCATCAGTTAATATACATCTTCATTTGAAATCCTC----------------------TTCTTTTTG---------TATATGTGGC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250370 194 - 171882078 ACCAAGTCTTATTAATGTAATGGAACTG-AAAATCAGTATTTGGGCTTGAGAAAGAAAATATTGCTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTACTTACCAAGTAACAAAAATTACCAAAATATACCCTTCTCCATCAATTCATCAGTTAATATACATCTTCATTTGAAATCCTC----------------------TTCTTTTTG---------TATATGTGGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371378 193 - 162156779 ACC-AGTCTTATTAATGTAATGGAACTG-AAAATCAGTATTTGGgcttgagaaagaaaatattgctgGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTACTCACCAAGtaacaaaaattaccaaaatatacCCTTCTCCATCAATTCATCAgttaatatacattttcatttgaaatccTC----------------------TTCTTTTTG---------TATATGTGGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698541 192 - 132174527 ACCAAGTCTTATTAATGTAATGGAACTAAAAAAACAGTATTTGGGCTTAAGAAAAAA---ATCACTGGAAAGAGAAATATGCCATATTTCTTCTACTCACCAAGCAACAAAAATGACCAAAATATATCCGTCTCCAGCAATTCATCAGTTAGTATACATCTTCACTTGAAATTCTA----------------------TACTTTTTG---------TATATGTGGC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46762546 219 - 64190966 ACCAGGGCTCATTACCATAATGGAATTG-AAAAGTAATATTTGGGCTTGGGAAAGAAGCGATCTCCAG-AAGAGAGATTTGCCATATG-----TACTCACCAAGCAACAAAAATTATCAAAATAAATCCTTATCTAGAAATGTGTTAGTTAATATACATCTTCACTTGAAATCCTAAGACTCTTTGTATATCTCTTAtttttttttaatttttatttatttatgat i canFam3.chr15 I 207 I 162 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=165273.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355690 86 + 478999 TATTCATATTTTAAAGGGATATGAACCATAATTGGAAAATATTTTCCAGATTTCAGGGAAACAAGAAGAAAAACTTATATTTTTCA s panTro4.chrUn_GL393519 196890 83 + 413329 TATTCATATTTTAAAGGGATATGAACCATAATTGAAAAATATTTTCCAGAGTTCAGGGAAAC---AAGAAAAACTTATATTTTTCA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887635 86 + 108868599 TATTCCTATTTTAAAGGGATAAGAACCATAATTGAAAAATATCTTCCAGAATTCAGGGAAACAAGAAGAAAAACTTATATTTTTCA i ponAbe2.chr14 C 0 I 109 s rheMac3.chr7 87973144 86 - 170124641 TATTCATATTTTAAAGGGATATGAACCATAATTGAAAAATATCCTCCAGAATTCAGGGAAACAAGAAGAAGAACTTGTATTTTTCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250564 86 - 171882078 TATTCATATTTTAAAGGGATATGAACCATAATTGAAAAATATCCTCCAGAATTCAGGGAAACAAGAAGAAGAACTTGTATTTTTCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371571 86 - 162156779 TATTCATATTTTAAAGGGATATGAACCATAATTGAAAAATATCCTCCAGAATTCAGGGAAACAAGAAGAAGAACttgtatttttca i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698733 83 - 132174527 TATTCGTATTTTAAAGGGATATGAACCATAAATGGAAAATATCCCCCAGAATTTAGGGAAAC---AAGAAAAATGTATATTTTTCA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46762927 80 - 64190966 TATTGATCTTTTAGAGTGATAT--ACAAACAGTGAGAAATATCCTCCAGGACTCAGGGAAACAAG----GGAATTGATATTTTTAG i canFam3.chr15 I 162 C 0 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1420740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 355776 713 + 478999 GCTTCATTC-TTTGCCAGCTTTTCATTCTGA-GATATATTTTTAGTTTTCTCAAAGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATGA-TTTTTGCAAAAAA----AA-CTGGGTGACTCACATGTTATATACTTCCCATTCGCTCTTTGAGTGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGACAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCCCAGAGCCAAAGACATGTGAAGAACTTCCAAGAAATTGCATGATCCTGTTTGTTATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGCATATATTAATGGTCAAAATGCAAGCTCAAGTGAGTGTATTATATATATCTATTTACTTGCACTATAGCCTTTTGGGACTTGGAGCTCTGTCTCTCTTGGGATATTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATAACATTTTGAATTTTC--------ACAATCAAAAGCCAGTTCTTACTGTCCCCTAAAGAATAGTGAAAATGTAGAAGCAGATCTTATCTTTTCTTTCTTCTTTCGTGTTCATGTATTGTCAAAACTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATTTTAGCTACAGTGGTTAGCTTTACCATAATACTCTCTAGATCTATTTTGAAGAA----AAATCATTCTCTGGTCATCAAATATTTGTACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGAGCACAAGAAATT s panTro4.chrUn_GL393519 196973 716 + 413329 GCTTCATTC-TTTGCCAGCATTTCATTCTGA-GATACATTTTTAGTTTTCTCAAAGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATGA-TTTTTGCAAAAAA----AG--TGGGTGACTCACATGTTATATACTTCCCACTCGCTCTTTGAGTGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGACAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCCCAGAGCCAAAGACATGTGAAGAACTTCCAAGAAATTGCATGATCCTGTTTGTTATCTCTCATGGGTTGCAAAAAATAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGCATATATTAATGGTCAAAATGCAAGCTCAAGTGAGTGTATTATATATATCTATTTACTTGCACCATAGCCTTTTGGGACTTGGAGCTCTGTCTCTCTTGGGATATTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATAACATTTTGAATTTTC--------ACAATCAAAAGCCAGTTCTTACTATCCCCTAAAGAATAGTTAAAATGTAGAAGCAGATCTTATCTTTTCTTTTTTCTTTCGTGTTCATGTATTGTCAAAACTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCAATTTAGCTACAGTGGTAAGCTTTACCATAATACTCTCTAGCTCTATTTTGAAGAAAAAGAAATCATTCTCTGGTCATCAAATATTTGTACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGAGCACAAGAAATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18887830 709 + 108868599 GCTTCATTC-TTTGCCAGCATTTCATTCTGA-GATATATTCTTAGTTTTCTCAAAGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATGA-TTTTTGCAAAAAA----AC--TGGGTGACTCACATGTTATATACTTCCCAGTCGCTCTTTGAGTGAATGCTGAGAA---GGTCAGGTACAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCACAGAGCCAAAGACATGTGAAGAACTTCCAAGAAATTGCATGATCCTGTTTGTAATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGGATATATTAATGGTCGAAATGCTAGCTCAAGTGAGTCTGT--TATATATCTATTTACTTGCATCATAGCCTTTTGGGACTTGGCGCTCTGTCTCTCTTGTGATATTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATATCATTTTGAATTTTC--------ACAATCAAAAGCCAGTTCTTACTATGCCCTAAAGAATAGTGAAAATGTAGCAGCAG-----ATCTTTTCTTTTTTCTTTCATGTCCATGTATTGTCAAAGCTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATTATAGCTACAGTGGTAAGCTTTACCATAATACTCCCTATATCTATTTTGAAGAAAAAGAAATCATTCTCTGGTCATCAAATATTTGTACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGAGCACAAGAAATT i ponAbe2.chr14 I 109 C 0 s rheMac3.chr7 87973230 714 - 170124641 GCTTCATTC-TTTGCCAGCATTTCACTCTAA-GATATATTTTTAGTTTTCTCAAAGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATTA-TTTTTGAAAAAAA----AAACTGGGTGACTCACGTGTTATATACTTCCCACTCACTCTTTGAATGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGACAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCACAGAGCCAAAGACACGTGAAGAACTTCCAAGGAATTGCATGATCCTGTTTGTAATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGCATATATTAATGGTCAAAATGCAAGCTCAAGTGAGTGTATTATATATGTCTATTTACTTGCATCATAGCCTGTTGGGACTTGGAGCTCTGTCTCTCTTGTGATGTTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATATCATTTTGAATTTTC--------ACAGTCAAAAGCCAGTTCTTACTATCCCCTAAAGAATAGTGAAAATGTGGAAGCAGATCTTATCTTTTCTTTTTTCTTTTGTGTCCATGTATTGTCAAAGCTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATTATAGCTACAGTGGTAAGCTTTACCATAATACTCTCTATATCTATTTTGAAGAA----AAATCATTCTCTGCTCATCAAATATTTATACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGCGCACAAGAAATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88250650 714 - 171882078 GCTTCATTC-TTTGCCAGCATTTCACTCTAA-GATATATTTTTAGTTTTCTCAAAGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATTA-TTTTTGAAAAAAA----AAACTGGGTGACTCACGTGTTATATACTTCCCACTCACTCTTTGAATGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGACAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCACAGAGCCAAAGACACGTGAAGAACTTCCAAGGAATTGCATGATCCTGTTTGTAATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGCATATATTAATGGTCAAAATGCAAGCTCAAGTGAGTGTATTATATATGTCTATTTACTTGCATCATAGCCTGTTGGGACTTGGAGCTCTGTCTCTCTTGTGATGTTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATATCATTTTGAATTTTC--------ACAGTCAAAAGTCAGTTCTTACTATCCCCTAAAGAATCGTGAAAATGTGGAAGCAGATCTTATCTTTTCTTTTTTCTTTTGTGTCCATGTATTGTCAAAGCTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATTATAGCTACAGTGGTAAGCTTTACCATAATACTCTCTATATCTATTTTGAAGAA----AAATCATTCTCTGCTCATCAAATATTTATACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGCGCACAAGAAATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85371657 713 - 162156779 gcttcattc-ttTGCCAGCATTTCACTCtaa-gatatatttttagttttctcgaagacaagaagaaaacattttct-----atta-tttttg-aaaaaa----aaactggGTGACTCACGTGTTATATACTTCCCACTCACTCTTTGAATGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGAGAGGAGACAAAATATTATT-----------------------------CCACAGAGCCAAAGACACGTGAAGAACTTCCAAGGAATTGCATGATCCTGTTTGTAATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTTCCCCACCTTCAAAGCATATATTAATGGTCAAAATGCAAGCTCAAGTGAGTGTATTATATATGTCTATTTACTTGCATCATAGCCTGTTGGGACTTGGAGCTCTGTCTCTCTTGTGATGTTTTGATAGTGTTTGTTTAAAAGAG--GATATCATTTTGAATTTTC--------ACAATCAAAAGCCAGTTCTTACTATCCcctaaagaataatgaaaatgtggaagcagatcttatcttttcttttttcttttgtgtccaTGTATTGTCAAAGCTTCCTGAGGAATAA--------TTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATTATAGCTACAGTGGTAAGCTTTACCATAATACTCTCTATatctattttgaagaa----aaatcatTCTCTGCTCATCAAATATTTATACCTGCAG-AG-TTATTAGAGATATTTGAGTTGAATTTTATGTAGCACACAATAAATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87698816 721 - 132174527 GCTTCATTC-TTTGCCAGCATTTCATTCTGA-GATATACTTTTAGATTTCTCAATGACAAGAAGAAAACATTTTCT-----ATTATTTTTTGCAAAAAA----AACCTGGGTGACTCACATGTTATGTACTTCCCACTTGCTCTTTGAATGAATGCTGAGAA---GGTCAGGGACAGGAGATAAAATATTTTT-----------------------------CCACAGTGCCAAAGACAAGTGAAGAACTTCCAAGAAATTGCATGATCCTGTTTGTAATCTCTCATGGGTTGCAAAAAGTAAACCCTAAAAGA----TTTCTCCCACCTTTAAGGCATATGTTAATGGTCAAAATGCAAGCATGGGTGAGTGTATTATATATGTCTGTTTACATGCATCATAGCCTTTTGGGAGGTGGAGCTCTGTCTCTCTTGTAATTATTTGATAGCATTTGTTTAAAAGAG--GATCTCATTCTGAATTTTC--------ATAATCAAAAGCCAGTTCTTACTATCCCCTAAAGAATAGTCAAAGTGT---AGTAGATTTTATCTTTGCTTTTTTCTGTTGTGTTCATGTATTGTCAAAGCTTCCTGAGGAATAATTAAGTAGTTAAGTAGTAAAAGGGATTGTCATAATAGCCGCAGTGATAAGTTTTACCATAAGA----CGATATCTATTTTGAAGAAGAAGAAATCATTCTCTGCTCATCAAATATTTGTACCTGCAG-AGTTTATTAGAGATATTTAAGTTGAATTTTATGTAGAGCACAAGAAATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46763007 738 - 64190966 GCTTCATTTATTTGTCAGCATCTCATTCCAATGAAATATTTGCAGTTTTTTCCAAGATACAGAG---ACATTTTCTATAAAATTA-TTTTTGCAAAATATTTGAGCACATGTGGTTCACATGTTATACAGTTTCCACTTACTCCTTGGATGAATGCTGAGAAGAGGGTCAGAGTCAAGACATAAAATATTACTGGAGCAATGGAGCATGGGCATTTCACTGCCCATGGAGCAACAGGCATGTGAAAGATTTCCAAGAAATTGGATGATC---------------CATGGATTGCAATGAG-GAACCCTACAAGATATTTCTTCTCTGGTTTCAAAGCACATGTTTATGGTCAAAATGAAAGCCCAGATGATGGTATTATATATGTCTATTTCCTTGTACCATGACCTTTCAGAATCTGGGATTTATCCTCT----TGATAGTTTGA-AGTATTTGTTCAAAAGAGGTGATATT-TTTTGAATTTTCGCTTACATATAATAAAACACCAAATTTTAGTATTCTACAAGAAATGATCAAA-TATAGAACTTGATTCCTTCTTTTCTTTCTCCTCTTGTAGCCATGTACTGTTGAAGATTTTGGGGGACTAA--------GCAAGTCATAATAGGGATTGTCATAACAGCTACAATAGGAAACTCTACTGTTGGAT--------TCTATTTTGAAGAA---GAAATCATTCATTGATCATCAA--ATCTGTACTTGTAGTAGTTTGTTAGAGATATCTGAGGTGCATTTTGTGTAGAGCAGAAAGAATT i canFam3.chr15 C 0 I 72094 e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=97186.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 356489 58 + 478999 TGATTGACatttagttattccacagatatttactgaatgcctactggatacTCAAAca s panTro4.chrUn_GL393519 197689 58 + 413329 TGATTGGCatttggttattccacagatatttactgaatgcctactggatacttaaaca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18888539 58 + 108868599 TAATTGGCatttagttattccacaaatatttactgaatgcctactgtatacTTAAACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87973944 58 - 170124641 TAATTGGCatttagttattccacaaatatttactgaatgcctactgtAtacttaacca i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88251364 58 - 171882078 TAATTGGCatttagttattccacaaatatttactgaatggctactgtAtacttaacca i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85372370 58 - 162156779 TAATTGGCATTTagttattccacaaatatttactgaatgcctactgtATACTTAacca i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87699537 58 - 132174527 TAATTAGCatttacttattccacaaatagttgctgaatgcctggtgtatacttaaaca i calJac3.chr10 C 0 I 23800 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I a score=1274742.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 356547 1020 + 478999 tatactacatatatttttaattttttgaggaacctccatattgtttttcataatgactatacaaatttacattaccaccaacagtgtataaacgttcccttttctctgcattcttactgactattaccatcttttgtc----tgatcatgaacattctgactgggctgaggtgctatctcattgtggttttgatctgcatttacctgatgatcagtgatgctgaggattttttcatatgctttttggtcatttgcacgtcatattttaaaaaatatctagtcagg--ttttttgccc-acttttaaattgaattatttggtggtagtgttgttttttgctattgagttgcttgagttccttatatattttgaatattaaccccttatcagatgtataatttgcaaaaattttctcttattctgtaggtcattttttggttctgttgtttcttttgagcagaagctttttattttgatgtaacctcatttgtctatttttgtttttcttgccttagcttttgcctacatcaatgttgt-----------------------------gtagttttacagctttaggtctcatgttttagtgtttaaactattttttgttgattttttgtatatggtatgaagtaaggg--tataagttcggtcttctgcatatagatacccagttttccgaataccatttattgaaaagactgtcctttccccattgtgtgtgcttggcagcttcgtcaaaa---tattaggtgactgtgtatcacctgtggatttatttctgggctctgtattctattccattggtttatgcatctgattttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttacagtatactttgaggtcaggtagtatgatgcctccaactttgttcttttgggtcaagactgctttggctattccaggtcttttgtagattccatacgtattttaggattgttttttctatttctctgaaggatgtcattgttattttgataaatccatagcttgttttgggtagtgtgaacattttaacaat s panTro4.chrUn_GL393519 197747 1045 + 413329 tatactgTATAtatttttaattttttgaggaacctccatattgtttttcataatgtctgtacaaatttacattaccaccaacagtgtaaaaacgttcccttttctctgcattctc----actattaccatcttttgtc----tgatcatgaacattctgactgggctgaggtgctatctcattgtggttttgatttgcatttacctgatgatcagtgatgctgaggattttttcatatgctttttggtcatttgcacgtcatattttaaaaaatatctagtcagg--ttttttgccc-acttttaaattgaattatttgatggtagtgttgctttttgctattgagttgcttgagttccttatatattttgaatgttaaccccttatcagacgtataatttgcaaaaattttctcctattctgtaggtcattttttggttctgttgtttcttttgagtggaagctttttattttgatgtaacctcatttgtctatttttgtttttcttgccttagcttttgcctacatcaatgttgtgtagtttttctcttatgttttcccttctagtagttttacagctttaggtctcatgtttcagtgttgaaactatttttagttgattttttgtatatggtatgacataaggg--tataagttcgttcttctgcatatagatacccggttttcccaataccatttattgaaaagactgtccttaccccattgtgtgttcttggcagcttcctcaaaa---tattaggtgactgtgtatcacctgtggatttatttctgggctctgcattctattccattggtttatgcatctgattttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttacagtatactttgaggtcaggtagtatgatgcctccaactttgttcttttgggtcaagactgctttggctattccaggtcttttgtaggttccatacgtattttaggactgttgtttctatttctgtgaaggatgtcattgttattttgataaatccatagattgttttgggtagtgtgaacattttaacaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18888597 1054 + 108868599 TACACTATATAtatttttaattttttgaggaacctccatatggtttttcataatgactgtactaatttacgttaccaccaacagtgtataaacgttcccttttctctgcattctcaccaactattgccatcttttgtctgtttgaccatgaacattctgattgggctgaggtgctatctcactgtggttttgatttacatttacctgatgatcagtgatgctgaggactttttcataggctttttggtcatttgcatgtcatattttaaaaaatgtctagtcaggttttttttgcctgacttttaaattgaatta-ttggtggtggtggtgttttttgctattgagttgcttgagttcctcatatattttgaatatttaccccttatcatatgtatagtttgcaaaaattttctcccattctgtgggtcattttttggttctgttgtttcttttgagcagaagctttttattttgatgtaccctcatttgtatatttctgcttttcttgccttagcttttgcctacatcactgttgtgtagtatttctcttatgttttccgttctagtagttttgcagctttgggtcttatgtttcagtgtttaaactatttttagttgattttttgtatatggtatgaaataaggg--tataagttcattcttctccatatagatacccagttttctcaataccatttattgaaaagactcttctttccccattgtgtgttcttggcagctttgtcaaaa---tattaggtgactgtgtatcacctgtggattaatttctgggctctgtattctattccattggtttatgcatctgtttttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttaca-tatactttgaggtcaggtagtaggatgcctccaactttgttcttttgggtcaagactgctttggctattcaaggtcttttttaggttccatacaaattttaggattgttgtttctatttctgtgaaggatgtcattggtattttgataaatccatagattgttttgggtagtgtgaacattttaacagt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87974002 1045 - 170124641 tatactatatatatttttaattttttgaggaacct-catatcgtttttcataatgactgtactaatttgcattaccaccgacagtgtataaacattcccttttctcagcattctcaccaactattgccatcttttgtctgtttgatca---------tgattgggctgaggtgctatctcattgtggttttgatttgcatttacctgatgatcagtgatgctgaggattttttcatatgctttttggtcatttgcatgtcatatttttaaaaatgtctagtcagg--ttttttgcct-acttttaaagtgaattatttgatgatgttgctgatttttgctattgagttgcttgagttcctcatatattttgaatattaaccccttatcagatacatagtttgcaaaaattttctccaattctgtaggtcattttttggttctgtgatttcttttaagcagaagctttttattttgatgtaacctcctttgtctatttttgtttttcttgccttagcttttgcctacatcagtgttgcatagtttttctcttatgttttcccttctactagttttacagctttaggtcttatgtttcagtgtttaaactatttttagttgatttttt-tgtatggtatgaaataagggtttataagttcatttttctgcatatagatacaaagttttcccaataccatttattgaaaatactgacctttccccattgtgtgttcttggcagccttgtcaaaatattattaggtgac--tgtatcacctgtggatttatttctgggctctgtattctattccattggtttttgcatctgtttttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttatagtatactttcaggtcaggtagtgtgatgcctccaactttgttcttttgggtcaagactgctttggctattccaggtcttttgtaagttccatacaaattttaggattgttgtttctatttctgtgaagaatgtcattggtatttcgataaatccatagattgttttgggtagtgtgaacattttaacaat i rheMac3.chr7 C 0 I 53 s macFas5.chr7 88251422 1045 - 171882078 tatactatatatatttttaattttttgaggaacct-catatcgtttttcataatgactgtactaatttgcattaccaccgacagtgtataaacattcccttttctcagcattctcaccaactattgccatcttttgtctgtttgatca---------tgattgggctgaggtgctatctcattgtggttttgatttacatttacctgatgatcagtgatgctgaggattttttcatatgctttttggtcatttgcatgtcatgtttttaaaaatgtctagtcagg--ttttttgcct-acttttaaagtgaattatttgatgatgttgctgatttttgctattgagttgcttgagttcctcatatattttgaatattaaccccttatcagatacatagtttgcaaaaattttctccaattctgtaggtcattttttggttctgtgatttcttttaagcagaagctttttattttgatgtaacctcctttgtctatttttgtttttcttgccttagcttttgcctacatcagtgttgtatagtttttctcttatgttttcccttctactagttttacagctttaggtcttatgtttcagtgtttaaactatttttagttgatttttt-tgtatggtatgaaataagggtttataagttcatttttctgcatatagatacaaagttttcccaataccatttattgaaaatactgacctttccccattgtgtgttcttggcagccttgtcaaaatattattaggtgac--tgtatcacctgtggatttatttctgggctctgtattctattccattggtttttgcatctgtttttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttatagtatactttcaggtcaggtagtgtgatgcctccaacttttttcttttgggtcaagactgctttggctattccaggtcttttgtaagttccatacaaattttaggattgttgtttctatttctgtgaagaatgtcattggtatttcgataaatccatagattgttttgggtagtgtgaacattttaacaat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85372428 1045 - 162156779 tatactatatatatttttaattttttgaggaacct-catATCGTTtttcataatgactgtactaatttgcattacCACcgacagtgtataaacattcccttttctcagcATTCTCACCAACTATTGCCATCTTTTGTCTGTTTGATCA---------TGATTGGGCTGAGGtgctatctcactgtggttttgatttgcatttacctgatgatcagtgatgctgaggattttttcatatgctttttggtcatttgcatgtcatatttttaaaaatgtctagtcagg--ttttttgcat-acttttaaaatgaattatttgatgATGTTGCtgatttttgctattgagttgcttgagttcctcatatattttgaatattaaccccttatcagatacatagtttgcaaaaattttctccaattctgtaggtcaTTTTTTggttctgtgatttcttttaagcagaagctttttattttgatgtaacctcctttgtctatttttgtttttcttgccttagcttttgCCTACATCAGTGTTGTATagtttttctcttatgttttcccTTCTACTAGTTTTACAGCTTTAGGTCTTATGTTTCAGTGTTTAAActatttttagttgatttttt-tgtatggtATGAAATAAGGGTTTATaagttcatttttctgcatatagatacaaagttttcccaataccatttattgaaaatactgacctttccccattgtgtgttcttggcagcCTTGTCAAAATACTATTAGGTGAC--TGTATCAcctgtggatttatttctgggctctgtattctattccattggtttttgcatctgtatttatgccagtatcatgctgttttggttactatagctttatagtatactttcaggtcaggtagtgtgatgcctccaactttgttcttttgggtcAAGACTGCTTTGACTATTCCAGGTCTTTTGTaagttccatacaaattttaggattgttgtttctatttctgtgaagaatgtcattggtatttcgATAGATCcatagattgttttgggtagtgtgaacattttaacaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=13740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 357567 15 + 478999 attaattatttgaat s panTro4.chrUn_GL393519 198792 15 + 413329 attaattatttgaat i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18889651 15 + 108868599 attaattatttgaat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88252467 15 - 171882078 attaattatttgaat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85373473 15 - 162156779 attaattatttgaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87975047 53 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=951984.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 357582 773 + 478999 ccacgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaatttttttcataagtgttttatggcttcattataggtatctttcatatccttggttaaattaattcctaagaattatatttttttattttggagctattgtaaataagattgttatcttgaattcttttcagacagttgattattaccacataaaagtgctgctgatttttgtatgctgattttgtattctgcaacgttactgaattcacttatcacttctaagagttgtcttgataacgtttttatgtttttctctatataagatcatgtcatctgccatgagaaacaatttgacttcttcttttccaatttgaatgcgttttatttctttctcttgctgatactctggccaaaact-----------------------------------tccaatactatatgaaataggtgttgtgaaagtgagaatccttgtcgtttttcagttcttagaagaaggattttctgtttgtcctatgtcagtatgattttcactgtgagtttctgatatatggcctttattatgttgaggtatgctccttctatgcctaaatttgtttaatttttatcatgaagcaatgataaattttatcagatgc-tgtttttgtatctattgaaatgatcatacactttttgtcttttattctatcagtgtaatgtatcaaactttttgattcatttatactgaataacccttgaattcctggaataaaacccacttgggcgtggtgaactgtctttttaatgtgttattggattcagtt s panTro4.chrUn_GL393519 198807 772 + 413329 ccatgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaatttttttcataagtgttttatggcttcattataggtatctttcacatccttggtaaaattaattcctaagaattatatttttttattttggagctattgtaaataagattgttatcttgaattcttttcagacagttgattattaccacataaaagtgctgctgatttttgtatgctgattttgtattctgcaacgttactgaattcacttatcacttctaagagttgtcttgataacgtttttatgtttttctctgtataagatcatgtcatgtgcaatgagaagcaatttgacttcttcttttccaatttgaatgccttttatttctttctcttgctgattctctggccaaaact-----------------------------------tccagtactatattaaataggtgttgtgaaagtgagaatccttgtcgtttttcagttcttagaagaaggattttctgtttttcctacgtcagtatgattttcactgtgagtttatgatatatggcctttattatgttgaggtgtgctccttgtatgcctaaatttgtttaatttttatcatgaagcaatgataaattttatcagatgc-tttttttgcatctattgaaatgatcatatactttttgtcttttattctatcagtgtaatgtatcaaa-tttttgattcatttatactgaataacccttgaattcctggaataaaacccacttgggtgtggtgaactgtctttttaatgtgttgttggattcagtt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18889666 770 + 108868599 ccatgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaa-atttttcataaatgttttatggctttattgtagatatctttcacatccttggttaaattgattcctaagaattatatttttttattttggagctattgtaaataagattgttgtcttgaattcttttcagacagttgattattaccacataaaagtgctactgatttttgtatgttgattttgtattctgcaaccttactgtattcatttatcacttctaagagttgtcttgataatgtttttatgtttgtctctatataaggtcatgtcatctgcaatgagaaacaatttgactacttcttttccaattcgaatgccttttatttctttctcttgctgattctctggccaaaact-----------------------------------tccagtactatattaaataggtgttgtgaaagtgagcatccttgtcttttttcagttcttagaagaaggactt--tgtttttcctacgtcagtatgatttccactgtgagtttctgatatgtggcctttattatgttgaggtatgctccttctatgcctaaagtggtttaatttttatcatgaagcaatgataaattttatcagatgcttttttttgcatctattgaaatgatcctacagtttttgtcttttattctattggtgtaatgtatcaaagtttttga-tcatttatactgaatcacccttgcattcctggaataaaacccacttggttgtggtgaactgtttttttaatgtgttgttggattcagtt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87975100 803 - 170124641 ccatgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaa-ttttttcataaacattttatggcttcattgtagatatctttcacatccttggttaaattaattcctaagagttatatttttttattttgtagatattataaataagattgttatcttgaattcttttcagaca----attattaccacataaaagtgctacttatttttgtatgttgatttggtattctgcaaccttactgaattcatttatcacttctaagagttgtcttgataacgtttttatgtttttgtctatataagatcatgtcatctgcaatgagaaacaatttaacttcttcttttccaattcgaatgccttttatttctttctcttgctgattctctgtgtacaattaaattatgattgatgatagtcaccctcttgtgctattaaatactacattcaataggtgtggtgaaagtgagcatcctt-ccttttttctgttcttagaagaaggactttctgtttttcctatgtcagtatgattttcactgtgagtttctgatatatggcctttattatgttgaagtatgctccttctatgcctaaatttgttgaatttttatcatgaagcaaggataaattttatcagatgcttttttttgcatctattgaaatgattgtatagtttttgtcttttattctattagtgtaatgtatcaaactttttgattcacttgtactgattcactcttgcattcctggaataaaacccacttggttgtggtgaactgtctttttaatgtgttgttggattcagtt i rheMac3.chr7 I 53 I 1 s macFas5.chr7 88252482 769 - 171882078 ccatgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaa-ttttttcataaacattttatggcttcattgtagatatctttcacatccttggttaaattaattcctaagagttatatttttttattttgtagatattataaataagattgttatcttgaattcttttcagaca----attattaccacataaaagtgctacttatttttgtatgttgatttggtattctgcaaccttactgaattcatttatcacttctaagagttgtcttgataatgtttttatgtttttgtctatataagatcatgtcatctgcaatgagaaacaatttaacttcttcttttccaattcgaatgccttttatttctttctcttgctgattctctggccaaaact-----------------------------------tccagtactacattcaataggtgtggtgaaagtgagcatccttgtcttttttctgttcttagaagaaggactttctgtttttcctatgtcagtatgattttcactgtgagtttctgatatatggcctttattatgttgaagtatgctccttctatgcctaaatttgttgaatttttatcatgaagcaaggataaattttatcagatgcttttttttgcatctattgaaatgattgtatagtttttgtcttttattctattagtgtaatgtatcaaactttttgattcacttgtactgactcactcttgcattcctggaataaaacccacttggttgtggtgaactgtctttttaatgtgttgttggattcagtt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85373488 766 - 162156779 ccatgaatgcaggattatctttccatttatttctgtcttcaaa-ttttttcataaacattttatggcttcattgtagatatctttcacatccttggttaaattgattcctaagagttatatttttttattttgtagatattataaataagatTGTTATCTTGAATTCTTTTCAGACA----ATTATTACCACATAAAAgtgctacttatttttgtatgttgattttgtattctgcaaccttactgaattcatttatcactTCTAAGAGTTGTCTTGATAAcgtttttatgtttttgtctatataagatcatgtcatctgcaatgagaaacaatttaa---cttcttttccaattcgaatgccttttatttctttctcttgctgattcTCTGGCCAAAACT-----------------------------------TCCAGTACTACATTCAATAGgtgtggtgaaagtgagcatccttgtcttttttctgttcttagaAGAAGGACTTTCTGTTTTTCCTATGTCAGTATGATTTTCACTGTGAGTTTCtgatatatggcctttattatgttgaagtatgcTCCTTCTATGCCtaaatttgttgaatttttatcatgaagcaaGGATaaattttatcagatgcttttttttgcatctattgaaatgatcgtatagtttttgtcttttattctattaGTGTAATGTATCAAACTTTTTGATTCACTTGTACTGACTCactcttgcattcctggaataaaacccacttggTTGTGGTGAActgtctttttaatgtgttgttggattcagtt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=45127.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358355 56 + 478999 tgctagtattttgttgagaattttcgcatctaagatcatgttattgccttgtaatt s panTro4.chrUn_GL393519 199579 56 + 413329 tgctagtattttgttgagaatttttgcatctaagatcatgttattgccttgtaatt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18890436 56 + 108868599 tgctagtattttgttgagaatttttgcatctatggtcaagttattgccttgtagtt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88253251 56 - 171882078 tgctggtattttgttgagaatttttgcatctatggtcaagttattgccttgtagTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85374254 55 - 162156779 tgctggtattttgttgagaatttttgcatctatggtCAAGTTATTGCCTTGtagt- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=273.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358411 1 + 478999 t s panTro4.chrUn_GL393519 199635 1 + 413329 t i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18890492 1 + 108868599 t i ponAbe2.chr14 C 0 I 106 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85374309 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88253307 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=8049.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358412 65 + 478999 attttctttctt--ttcttttttctttctttctttttct-tttctttctttcttttctttctttcttt s panTro4.chrUn_GL393519 199636 68 + 413329 attttctttctttcttttcttttctttctttctttttttctttccttccttctgtcctttctttcttt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 I 38 s papAnu2.chr7 85374309 61 - 162156779 -ttctccttcct--tccttccttccttccttccttccctccttacttccttccttccttactta---- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e macFas5.chr7 88253307 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=2674.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358477 50 + 478999 cttttctttttctttttttctttccttccttccttcctttctttttactt s papAnu2.chr7 85374370 50 - 162156779 cttacttacttccttccttccttccttccctccttccttctttctttctt i papAnu2.chr7 C 0 I 5029 e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e macFas5.chr7 88253307 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e panTro4.chrUn_GL393519 199704 38 + 413329 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358527 161 + 478999 actttctttctctcttttccttcccttcccttcccttcccttcttttctttctttctctttctttctttctttctctctctcttttccttcccttcccttcccttcttttctttctttctctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttc e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e macFas5.chr7 88253307 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e panTro4.chrUn_GL393519 199704 38 + 413329 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=1176.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358688 26 + 478999 tttctttctttctctttctttctttc s macFas5.chr7 88253307 25 - 171882078 TCtccttccttc-cttccttccttcc i macFas5.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e panTro4.chrUn_GL393519 199704 38 + 413329 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=6279.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358714 47 + 478999 tttctttctttctttctttctttctttctctctctctctctttcttt- s panTro4.chrUn_GL393519 199742 45 + 413329 tttctttcttt--ttctgtctttctttttttctttctctctctctct- i panTro4.chrUn_GL393519 I 38 C 0 s macFas5.chr7 88253332 47 - 171882078 -ttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttc i macFas5.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3539725 1377 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=7977.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358761 17 + 478999 cttctttctttc-tgaca s panTro4.chrUn_GL393519 199787 17 + 413329 cttctttctttc-tgaca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88253379 18 - 171882078 cttctttctttcttgaca i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3541102 18 - 24206276 cttctttctttcttgaca i chlSab2.chr29 I 1377 C 0 e ponAbe2.chr14 18890493 106 + 108868599 I e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=455545.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 358778 548 + 478999 gagtttcgctcttgttgctcaagctggagtgcaatggtgccatctcagctcaatgcaacctccgcctcctgggttcaagtgattcttctgcctcagcctcccgagtggctgggattacaggtgcccaccaccat-gcccagct-a---tttttttgtgtgtgtg-tttttagtagagacggggttttatcatgttggccaggctgatcttgaactcctgacctcagttgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccgtgcctggctttttctttttttT----TAATTGACtttaaactttggtatgtatgtggtaggtgcatatatttattgagtacatgagatacttagatacaggcatgtaatgcataataatcacataatggtaaatggggtatccattcccctcaagcatttttatcctttgggttacaaacaattcaattacactcttttagttactttaaaatgtacaattaaattataatacacaatagtcatcctcttgtactattaaatactagattttattca s panTro4.chrUn_GL393519 199804 546 + 413329 gagtttcgctcttgttgctcaagctggagtgcaatggtgccatctcagctcattgcaacctccacctcctgggttcaagtgattcttctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgcccaccaccat-gcccagct-a---ttttttttttt-tgta-tttttagtagagacggggtttcatcatgttggccaggctggttttgaactcctgacctcagttgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccgtgcctggccttttctttttttT-----AATTTACTGTAAACCTTGGTATgtatgtggtaggtgcatatatttattgagtacatgagacacttagatacaggcatgcaatgcataataatcacataatggtaaatggggtatccattcccctcaagcatttttatcctttgggttacaaacaattcaattacactcttttagttactttaaaatgtacaattaaattataatacacaatagtcatcctcttgtactattaaatactagatgttattca i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18890599 551 + 108868599 gagtttcgctcttgttgctcaggctggagtgcaatggtgccatctcggctcattgcaacctccgcctccttggtccaagtgattcttctgcctcagcctcctgagtagctgggattacagatgcccaccaccat-gcccagct-a---ttttttttttt-tgta-tttttagtagagatggggtttcatcatgttggctaggctggtcttgaattcctgacttcagttgatccacctggctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccatgcctggccTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATTTATtttaaactttggtatgtacgtggtaggtgtatatatttattgagtacatgagatacttagatacaggcatgcagtgcataataatcacataatggtaaatggggtatccattcccctcaagcatttttatcctttgggttacaaacaattcagttatattcttttagttactttaaaatgtacaattaaattgtgattgacaatagtcaccctcttgtgctattaaatactagattttattca i ponAbe2.chr14 I 106 C 0 s macFas5.chr7 88253397 556 - 171882078 gagttttgctgttgttgctcaggctagagtgcaatggcaccatctgggctcactgcaacctgcgcctcctgggttcaagtaattcttctgccttagcctcctgagtagctgggattacaagtgcccactaccacggcccagct-aattttttttttttt-tgtattttttattagagacggggtttcattatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcagttgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccactgtgcctggccttttcttttctttttTAAAATTTATtttaaactttggtatgtacgtgggaggtgcatatatttattgagtacatgagatacttagatacaggcatgcaatgcataataatcacataatggtaaatggggtatccatccccctcaagcatttttatcctttgggttacaaacaattcaattacactcttttagttactttgaaatgtacaattaaattatgattgatgatagtcaccctcttgtgctattaaatactagattttattcg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3541120 557 - 24206276 gagttttgctgttgttgctcaggctggagtgcaatggcgccatctgggctcactgcaacctgcgcctcctgggttcaagtaattcttctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaagtgcccactaccatggcccagctaaattttttttttttt-tgtattttttattagagacggggtttcatcatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcagttgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccactgtgcctggccttttcttttcttTTTTAAAATTTATtttaaactttggtatgtatgtggtaggtgcatatatttattgagtacatgagatacttagatacaggcatgcaatgcataataatcacataatggtaaatggggtatccatcctcctcaagcatttttatcctttgggttacaaacaattcaattacactcttttagttactttgaaatgtacaattaaattatgattgatgatagtcaccctcttgtgctattaaatactagattttattca i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e rheMac3.chr7 87975903 1 - 170124641 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=298219.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 359326 230 + 478999 ttctttctaactactttttgtgcccattaaccatccctacctgccctcccatccccctaaccactatctttctcagtttctgataactttccttcgactctatatctccatgagttcaattgttttaatttttagctcccaca--------------------gtaggatttatcccagggatgcaagaatggttcaatatgtgcaaatcaatcaatatgataaacaataaacagtatgaaggagaataa s panTro4.chrUn_GL393519 200350 250 + 413329 ttctttctaactactttttgtgcccattaaccatccctacctgccctcccatccccctaaccaccatctttctcagtttctgataactttccttctactctatatctccatgagttcaattgttttaatttttagctcccacaaataaatgacaacatacaaagtAggatttatcccagggatgcaagaatggttcaatatgtgcaaatcaatcaatatgataaacaataaacagtatgaaggagaataa i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18891150 250 + 108868599 ttctttctaactactttttgtgcccattaaccatccttacctgtcctcccatccccccaaccagtatctttctcactttctggtaactttccttctactctatatctccatgagttcaattgttttaatttttagctcccataaataaatgacaacaAacaaagtaggatttatcacagggatgcaagaatggttcaatatgtgcacatcaatcaatatgataaacaatcaacagtatgaaggagaataa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87975904 246 - 170124641 ttctttctaactaccttttgtgcccattaactatccctacctgccttcccatccccccagccactatctttctcagtttctggtaaccttcc----actttatatctccatgagttcaattgttttaatttttagcttccacaagtaaatgacaacatacaaagtaggattgatcccagggatgcaagaatggttcagtaggtgaaaatcaatcaatatgatacacaatcaacagtgtgaaggagaataa i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 88253953 246 - 171882078 ttctttctaactaccttttgtgcccattaactatccctacctgccttcccatccccccagccactatctttctcagtttctggtaaccttcc----actttatatctccatgagttcaattgttttaatttttagcttccacaagtaaatgacaacatacaaagtAggattgatcccagggatgcaagaatggttcagtaggtgaaaatcaatcaatatgatacacaatcaacagtgtgaaggagaataa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3541677 246 - 24206276 ttctttctaactactttttgtgcccattaaccatccctacctgcctgcccatccccccagccactatctttctcagtttctggtaaccttcc----actttatatctccatgagttcaattgttttaatttttagcttccacaagtaaatgagaacatacaaagtAggattgatcccagggatgcaagaatggttcaataggtgaaaatcaatcaatatgatacacaatcaacagtgtgaaggagaataa i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e papAnu2.chr7 85374420 5029 - 162156779 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=463038.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 359556 253 + 478999 ccatatgatcatttcaactgatgctgaaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaattctaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagatagaattttgctgaatggaaagaaactgaaagcctttaatatctggagcacaacaagaatgccaacttttaccacttcattgactatagtactagaagtcctagctaaagcagtcagac s panTro4.chrUn_GL393519 200600 253 + 413329 ccatatgatcatttcaactgatgctgaaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaattctaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagatagaattttgctgaatggaaagaaactgaaatcctttaatatctggagcacaacaagaatgccaccttttaccacttcattgactatagtactagaagtcctagctaaagcagtcagac i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18891400 252 + 108868599 -catatgatcatttcaactgatgctgaaaaacttgataaagttcaacattcattcatcataacaattctaaaaaactcggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagatagaattttgctgaatggagagaaactgaaaacctttaatatctggagcacaagaagaatgccaacttttaccgctttatttactatagtactagaagtcctagctaaagcagtcagac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87976150 252 - 170124641 ccatctcatcatttcaactgatgctgaaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaa-tccaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagacagaattatgctgaatggagagaaactgaaagcctttaatatctggaacacaacaagaatgccaacttttaccactttatttactatagtattagaagtcctagctaaagcagtcagac i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88254199 252 - 171882078 ccatctcatcatttcaactgatgctgaaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaa-tccaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagacagaattatgctgaatggagagaaactgaaagcctttaatatctggaacacaacaagaatgccaacttttaccactttatttactatagtactagaagtcctagctaaagcagtcagac i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85379449 252 - 162156779 ccatctcatcatttcaactgatgctgtaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaa-tccaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagacAGAATTATGCTGAATGGAGAGAAACTGAAAGCCTTTAatatctggaacacaacaagaaTGCCAACTTTTACCACTTTATTTActatagtactagaagtcctagctaaagcagtcagac i papAnu2.chr7 I 5029 C 0 s chlSab2.chr29 3541923 252 - 24206276 ccatctcatcatttcaactgatgctgaaaaatttgataaagttcaacatccattcatcataaaaa-tccaaaaaactgggtatagaaggaacaaactgcaacataataaaagccatatatgacagacccacagatagaattatgctgaatggagagaaactgaaagcctttaatatctggaacacaacaagaatgccaacttttaccactttatttactatagtactagaagtcctagctaaagcagtcaaac i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I e calJac3.chr10 87699595 23800 - 132174527 I a score=5716438.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 359809 2559 + 478999 aagagaaagaaataaaaggcatccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagatgatgtgatcttgtattaggaaagacctaaaaactccaccaaaacactattagaactgataaacaaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaacatataaaagtcagtagcatctccatatgtcaacagtgaactgtctgaaaaacaaatcaagaaagtaatcccatttacaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaagtgaaa-atcactacaatgaaaacta----------taaaacattgacgaaagaaactaaagaagacacaaagaaacggaaagatattccatgttcattagctgaaacagtcattgttaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattcaatctctatcaaaataccaatgccattcttcacagaaatag--aaaaaacaatcctaaaattgatataa----ccaaatgacccagaatacccagagctatcctgaacaaataaaccaaaactggataaatcacattacctgactttaaactacactataaagctatggtaaccaaaacaacatggtactggcataaaaaacagaccc------ataggtcaatggaacagaatagagaacccagaagcaaatccgtacatcaacagtgagctcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtctcttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatgtattaaaggcttaaatctaagacctcaaaaaa-ttaaactactaaaaggaaacattgggggaaactctcttagatattggtctgggtaaagatttcttgagcaacactccacaaacacaggtcaccaaagcaaaaacggacaagtgggatcacatccagttaaaaagctgctgcacatccaaggaaaaacaatcaa---tgtgaagatcaaacccacagaatgggagaaaatatttgcaaactgcccatctgacaagggattaataacc----------aggaaacaactctatagg---aaaaaaccctaataatctaatttaaaaatgggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatacataaaaaggtgctcaaacaccattgatcatcagagaaatgttcctcaaagctacaatgaggtatcatctcaccccatttaaaatggcttttatccaaacacaggcaatagcaaatgctggtgaggaagaggagaaaagggaactctcatactctgtcagtgggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggagattcccccaaaaactaaatgtagagctactttacgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccgaaagaaaaaatagcagtataacaaagagttatctgcattctcatgtttgttttagctttgttcacaatagccaagatttggaaacaacctaagtttccatcaatagatgaatgaataatgaaaatgtggc--------------------acatacatatacaatagagtactattcagccataaaaaaaatcagatcatttgcaacaacatggacggaaatggggattattgtgttaagtgaaataagctaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttacttgtgggaactgaaaattaaaacgatcgaatcatgcagataaagagtagaatgatggttaccaaaaactgagaaggatggtggaggtgtgggatgtggaaaaatggggatagttatgggtacaaaaagatataaagaataaataatatttagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtcaataatgactcaattgt-catttaa--aaataaccaa-------------------------------------aagaatataattggattgtttgtaacacaaaggataaatgcttgaggggacgaataccccatttaccatgatgcgattattatgtattgtatgcctgtacccaaatatctcatactctataaatgtatacacctactctgtacccacagaaataaaaaATAACAAAACAAAA-----AACATTGTTTAGCAAGCCCAGCTAAGGGTCATCTGACTCTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTTACTATATATGAATTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGCTAGATGTTATAGAAAACTGCTACAttgtatctttttagtgtggtagaaaagataatcccaaagattaaggtcgtattgcccCTTTTTATAGCTGTATGAAAAAATATGAATATTTTTGTTATGT---TGATA-tttttaacttttaagttcagaggtacacgtgcaggtttgttatataggtaaatctgtgtcatgagacattaactggattacatcaaatttaacaattttattttagtgttcatttttttgctgtgattatgtaaaatcacacttttcatattctttttgga-------------------------------acggactttgttatcctgctatccctcatt s panTro4.chrUn_GL393519 200853 2571 + 413329 aagagaaagaaataaaaggcatccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagatgatgtaatcttgtattaggaaagacctaaaaactccaccaaaacactattagaactga--aacaaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaacatataaaagtcagtagcatctccatatgtcaacagtgaactgtctgaaaaccaaatcaagaaagtaatcccatttacaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaagtgaaa-atcactacagtgaaaacta----------taaaacgttgacgaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaagatattccatgttcatgagctgaaacagtcattgttaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattcaatctctatcaaaataccaatgccattcttcacagaaatag--aaaaaacaatcctaaaattgatataa----ccaaatgacccagaatacccagagctatcctgaacaaataaaccaaaactggataaatcacattacctgactttaaactacactataaagctatggtaaccaaaacaacatggtactggcataaaaaacagaccctaaaaaacaggtcaatggaacagaatagagaacccagaagcaaatccgtacatcaacagtgagctcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtatcttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatgtattaaaggcttaaatctaagacttcaaaaaaattaaactactaaaaggaaacattgggggaaactctcttagatattggtctgggcaaagatttcttgagcaacactccatgaacacaggtcaccaaagcaaaaacggacaagtgggatcacatccagttaaaaagctgctgcacatccaaggaaaaacagtcaacaatgtgaagatccaactcacagaatgggagaaaatatttgcaaactgcccatctgacaagggattaataacc----------aggaaacaactctatagg---aaaaaaccctaataatctaatttaaaaatgggcaaaggatcggaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatacataaaaaggtgctcaaacaccattgatcatcagagaaatgtacctcaaagctacaatgagatatcatctcaccccatttaaaatggcttttatccaaacatagggaataacaaatgctggtgaggaagaggagaaaagggaactctcatactctgtcagtgggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggagattcccccaaaaactaaatgtagagctactttacgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccgaaagagaaaatagcagtatagcaaagagttatctgcattctcatgtttgttttagctttgttcacaatagcgaagatttggaaacgacctaagtttccatcaatagatgaatgaataatgaaaatgtggc--------------------acatacatatacaatagagtactattcagccataaaaagaatgagatcatttgcaacaacatggacggaagtggggattattgtgttaagtgaaataagccaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttacttgtgggaactgaaaattaaaacgatcaaatcatgcagataaagagtagaatgatggttaccaaaaactgagaaggatggtggaggtgtgggatggggaaaaatggggatagttatgggtacaaaaa-atataaagaataaataatatttagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtcaataatgatttaattgt-catttaa--aaataaccaa-------------------------------------aagaatataattggattgtttgtaacaaaaaggataaatgcttaagggaatgaataccccatttaccatgatgcgattattatgtattatatgccagtacccaaatatctcatactctataaatatatacatctactctgtacccacagaaataaaaaATAACAAAACAAAACAAAAAACATTGTTTAGCAAGCCCAGCTAAGGGTCATCTGACTCTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTCACTATATATGAATTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGCTAGATGTTATAGAAAACGgctaaattgtatctttttagtgtggtagaaaagataatcccaaagattaaggtcttattgcccCTTTTTAGAGTTGTATGAAAGAATATGAATATTTTTGTTATGT---TGATA-tttttaacttttaagttcagaggtacacatgcaggtttgttatataggtaaatctgtgtcatgagacattaactggattacatcaaatttaacaattttattttagtgttcatttttttgctgtgattatgtaaaatcacacttttcatattctttttgga-------------------------------acggactttgttatcctgctatccctcatt i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18891652 2593 + 108868599 aagagaaagaaatgaaaggcatccaaattagaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagacgatgtgatcttatatttggaaagacctaaaaactccacaaaaacactattagaactgataaacaaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaac--ataaatgtcagtagcatttccatatgtcaacagtgaactgtctgaaaaacaagtcaagaaagtaatcccatttacaatagctacaaataaaattaaatacctaggtattaaccaaaaaagtgaaa-atctctacaatgaaaactataaaacattgtaaaacattgatgaaagaatctaaagaagacacacagaaatggaaagatattcca-------------aaacagtcattgttaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattcaacctctatcaaaatgccaatgccattcttcacagaaatag-aaaaaaacaatcctaaaattgatatggaagcccaaatgacctagaatacccagagctatcctgaacaaataaaccaaaactggatgaatcacattacctgactttaaactacactatagagctatggtaactaaaacagcatgatactggcataaaaaacagaccc------acatgtcagtggaacagaatagagaaccaagaagcaaatctgtacatcaacagtgaactcattttctacaaaagtgccaagaacatacattgaggaaagaacagtctcttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatggattaaaggcttaaatctaagacctcaaaaaa-ttaaactactaaaagaaaacattgggggaaactctcttagatattggtctgggcaaagatttattgagcaatactccatgaacacaggccaccaaagcaaaaacggaaaagtgggaccacatccagttaaaaagcttctgcacatccaaggaaaaacaatcaacaatgtgaatattcaatccacagaatgggagaaaatatttgcaaactacccatctgacaagggattaataacc----------aggaaacaactctatagg---aaagaaacctaataatttaatttaaaaatgggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccactgatcatcagagaaatgtacctcaaagctacaatgagatatcatctcaccccatttaaaatggcttttatccaaagacaggcaaaaataaatgctggtgaggaagaggagaaaagggaactctcatactctgtcagtgggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggaaattcccccaaaaattaaatatagagctactttatgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccaaaagaaaaaataacagtatatcaaagagttatctgcattctcatgtttgttttagctttgttcacaatagccaagatctggaaacaacctaagtttccatcaatagatgaatgaataaagaaaatgtggt--------------------acatacatatacaatagagtactattcagccataaaaagaatgagatcatttgcaacaacatggatggaaatggggattattgtgttaggtgaaataagccaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttatttgtcagaactaaaaattaaaacaattgaatcatgcagataaaaagtacaatgatggttaccaaaaactgagaaggatggtgaaggtgtgggacggggaaaaatggggatagttatgggtacaaaaa-atataaagaataaataatatctagtatttgatagcacaaaagggtgattatagtcaataatgatttaattgt-catttaa--aaataaccaa-------------------------------------aagaatataattggattgtttgtaacacaaaggataaatgcttgaggggatgaataccccatttaccacgatgtgattattatgtattatatgcctgtacccaaatatctcatactctataaatatatacacatactatgtacccaaagaaataaaaaATAACAGAACAAAACAAA-AACACTGTTTAGCAAGCCCAGCTAAGGGTCATCTGA--CTCTAGCAAATGTGATTTTATTTAACTTACTATATACAAATTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGctagatgttatagaaaactgctaaattgtatctttttagtgtggtagaaaagataaccccaaagattaaggtcatattgctcCTTTTTAGAGCTGTATGAAAGAATATTAATATTTTTGTCATTT---TGATAttttttaacttttaagttcagaggtacgcgtgaaggtttgttacatgggtaaatctgtgtcatgagACATTAACTGGATTACATCTAATTTAACAATTTTATTTTAGTGTTCA-TTTTTTGCTCTAATTATGTAAAATTACACTTTTCGTATTCTTTTTTGAATATGGGCTTTTTTGAATACGGGTTTTGAATATGGgctttgttatcctgctatccctcatt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87976402 2549 - 170124641 aagagaaagaaataaaaggcatccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagatgatgtggtcttatatttgaaaagacctaaaaactcaacaaaaacactattagaactgat----aaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaacacataatagtcagtagcatttctatatgtcaacagtgaa----ctgaaaaacaaaccaagaaagtaatcccatttgcaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaagtaaaa-atctctacaatg-aaacta----------taaaacattgatgaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaagatattccttgttcacgaattgaaacagttattgtcaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattgaatctctatcaaaataccaatgccactcttcacagaaatag--aaaaaacaatcctaaaattgatatggaagcccaaatgatccagaatacccagagctatcctgaacaaataaaccaaaactggatgaatcacattacctgactttaaactacactatagatctatggtaaccaaaacaccatggtactggcataaaaaacagaccc------ataggtcaatggaacagaatagagaacccagaagcaaatctgtacatcagcagtgaactcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtcttttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatggattaaaggcttaaatctaagaccttaaaaaa-ttaaactactaaaagaaaacattgggggaaactctcttagatattggtctggacaaagatttcttgagaaatagtccatgaacatgggccaccaaagcaaaaatggacaagtgggatcacatccagttaaaaagcttctgcacatccaaggaaaaacaatcaacaatgtggagagtcaacccacagaatgggagaaaatatttgcaaactacccatctgacaagggattaataacc----------aggaaacaactttatagg---aaaaaaacctaataatctaatttaaaactaggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccattgatcatcagagaaatgaacctcaaagctacaatgagataccatctcaccccatttaaaatggcttttatccaaagacaggcaataacaaatgctgatgaggatgaggagaaaagggaactgtcatactctgtcggtaggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggagattctcccca-----aaatatagagctactttatgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccaaaagaaaaaataacagtatatcaaagagttacctgcattctcatgtttgttttagctttgttcacaatagccaagatgtggaagcaacctaaatttccatcaatagatgaatgaagaaagaaaatgtggt--------------------acatatatatacaatagagtactattcagccataaaaagaatgagatcatttgcaacaacacagatggaaatggggattattgtgttaagtgaaataagccaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttatctgtgggaactaaaaattaaaacgattgaatcatgcagataaagagtagaatgatgattaccaaaaactgagatggatggtggaagtgtgggatggggaaaaatgggaatagttagggat--aaaaa-atataaagaacaaatagtatctagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtaaataatgatttaattgtacatttta--aaataacgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaat-----------------------------gataaatgcttgagtggttaaataccccatttaccacgatgtgattattatgtattatttgcctgtacccaaatatctcatactccataaatatatacacctactatgtaccaacagaaataaaaaaTAACAAAACAAAA-----ATCATTGTTTAGCAAGCCCAGCTAAGAGTCATCTGACTCTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTTATTATATATGAATTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGATAGATGTTATAGAAAACTGCAaaattgtatctttttagtgtggtagaaaagataatcccaaagattaaggtcttatttcccCTTTTTAGAGCTGTATGAAATAAAATGAATATTTTTGTCATGT---TGATAttttttaacttttaagttcagaggtacacgtgcaggtttgttatataggtaaatctgtgtcatgagACATTAACTGGATTACGTCT--------aattttattttagtgttca-ttttttgctctgattacgtaaaatcacacttttcatattcttttttga-------------------------------acaggttttgttatcctgctatccttcatt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88254451 2549 - 171882078 aagagaaagaaataaaaggcatccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagatgatgtggtcttatatttgaaaagacctaaaaactcaacaaaaacactattagaactgat----aaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaacatataatagtcagtagcatttctatatgtcaacagtgaa----ctgaaaaacaaaccaagaaagtaatcccatttgcaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaagtaaaa-atctctacaatg-aaacta----------taaaacattgatgaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaagatattccttgttcacgaattgaaacagttattgtcaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattgaatctctatcaaaataccaatgccactcttcacagaaatag--aaaaaacaatcctaaaattgatatggaagcccaaatgatccagaatacccagagatatcctgaacaaataaaccaaaactggatgaatcacattacctgactttaaactacactatagagctatggtaaccaaaacaccatggtactggcataaaaaacagaccc------ataggtcaatggaacagaatagagaacccagaagcaaatctgtacatcaacagtgaactcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtcttttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatggattaaaggcttaaatctaagaccttaaaaaa-ttaaactactaaaagaaaacattgggggaaactctcttagatattggtctggacaaagatttcttgagaaatagtccatgaacacgggccaccaaagcaaaaatggacaagtgggatcacatccagttaaaaagcttctgcacatccaaggaaaaacaatcaacaatgtggagagtcaacccacagaatgggagaaaatatttgcaaactacccatctgacaagggattgataacc----------aggaaacaactttatagg---aaaaaaacctaataatctaatttaaaactaggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccattgatcatcagagaaatgaacctcaaagctacaatgagataccatctcactccatttaaaatggcttttatccaaagacaggcaataacaaatgctgatgaggatgaggagaaaagggaactgtcatactctgtcggtaggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggagattctcccca-----aaatatagagctactttatgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccaaaagaaaaaataacagtatatcaaagagttatctgcattctcatgtttgttttagctttgttcacaatagccaagatgtggaagcaacctaaatttccatcaatagatgaatgaagaaagaaaatgtggt--------------------acatatatatacaatagagtactattcagccataaaaagaatgagatcatttgcaacaacacagatggaaatggggattattgtgttaagtgaaataagccaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttatctgtgggaactaaaaattaaaacgattgaatcatgcagataaagagtagaatgatgattaccaaaaactgagacggatggtggaagtgtgggatggggaaaaatgggaatagttagggat--aaaaa-atataaagaacaaatagtatctagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtaaataatgatttaattgtacatttta--aaataacgaa-------------------------------------aataatataattggattgtttgtaacatgaaggataaatgcttgagtggataaataccccatttaccacgatgtgattattatgtattatttgcctgtacccaaatatctcatactccataaatatatacacctactatgtaccaacagaaataaaaaaTAACAAAACAAAA-----ATCATTGTTTAGCAAGCCCAGCTAAGAGTCATCTGACTCTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTTATTATATATGAATTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGCTAGATGTTATAGAAAACtgctaaattgtatctttttagtgtggtagaaaagataatcccaaagattaaggtcttattacccCTTTTTAGAGCTGTATGAAATAAAATGAATATTTTTGTCATGT---TGATAttttttaacttttaagttcagaggtacacgtgcaggtttgttatataggtaaatctgtgtcatgagacattaactggattacgtctaatttaacaattttattttagtgttca-ttttttgctctgattatgtaaaatcacacttttcatattcttttttga-------------------------------acaggttttgttatcctgctatccttcatt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85379701 2552 - 162156779 aagagaaagaaataaaaggcatccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttacagatgatgtggtcttatatttgaaaagacctaaaaactcaacaaaaacactattagaactgat----aaatttagtaaagttgcaggatacaaaatcaacatataatagtcagtagcatttctatatgtcaacagtgaaccgtctgaaaaacaaaccaagaaagtaatcccatttgcaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaagtaaaa-atctctacaatgaaaacta----------taaaacattgatgaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaagatattccttGTTCACGAATTGAAACAGTTATTGCCAAAATGtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattgaatctctatcaaaataccaatgccactcttcacagaaatag--aaaaaacaatcctaaaattgatatggaagCCCAAATGATCCAGAATACCCAGAGCTATCCtgaacaaataaaccaaaactggatgaatcacattacctgactttaaactacaCTATagagctatggtaaccaaaacgccatggtactggcataaaaaacagACCC------ataggtcaatggaacagaatagagaacccagaaacaaatctgtACATcaacagtgaactcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtcttttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgcagaagaatgaaacaagacccctatctcttggcatatacaaaaatcaaattaaaatggattaaaggcttaaatctaagaccttaaaaaa-ttaaactactaaaagaaaacattgggggaaaCTCTCTTAGATATTGGTCtggacaaagatttcttgagaAATAGTCCATGAACACGGGCCACCAAAGC-AAAATGGACAAGTGGGATCACATccagttaaaaagcttctgcacatccAAGGAAAAACAATCAACAATGTGGAGagtcaacccacagaatgggagaaaatatttgcaaactacccatctgacaagggattaataacc----------aggaaacaactttatagg---aaaaaaacctaataatctaatttaaaactaggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccattgatcatcagagaaatgaacctcaaagctacaatgagataccatctcaccccatttaaaatggcttttatccaaagacaggcaataacaaatgctgatgaggatgaggagaaaagggaactgtCATACTCTGTCGGtaggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggagattctcCCCA-----AAATATAGAGCTACTTTATGATCTTGCAACCTCATTGCTAGATGTAgacccaaaagaaaaaataacagtataTCAAAGAGTTATCTGCATTCGCATGTTTGTTTTAGctttgttcacaatagccaagatgtggaagcaacctaaatttccatcaatagatgaatgaagaaagaaaatgtggt--------------------acatatatatacaatagagtactattcagccataaaaagaatgagatcatttgcaacaacacagatggaaATGGGGATtattgtgttaagtgaaacaagccaggcacagataGACAAACTTCCCAtattctcacttatctgtgggaactaaaaattaaaacgaTTGAATCATGCAGATAAAg-gtagaatgatgattaccaaAAACTGAGACGGATGGTGGAAGTGTGGGATGGGGAAAAATGGGAATAGTTAgggat--aaaaa-atataaagaacaaatagtatctagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtaaataatgatttaattgtacatttta--aaataacgaa-------------------------------------aataatataattggattgtttgtaacacgaaggataaatgcttgaggggataaaTACCCCATTTACCacgatgtgattattatgtattatttgcCTGTACCCAAATATCtcatactccataaatatatacacctactatgtaccaacagaaataaaaaataacaaaacaaaa-----atcattgtTTAGCAAGCCCAGCTAAGAGTCATCTGACTCTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTTATTATATATGAATTATGGCATCTCAGACATTGTATAATTACATATAGCTAGATGTTATAGAAAACTGCTAAATTGTATCTTTTTAGTGTGGTAGAAAAGATAATCCCAAAGATTAAGGTCTTATTACCCCTTTTTAGAGCtgtatgaaataaaatgaatatttttgtcatgt---tgatattttttaacttttaagttcagaggtacacgtgcaggtttgttatataggtaaatctGTGTCATGAGACATTAACTGGATTACGTctaatttaacaattttattttagtgttcA-TTTTTTGCTCTGATTATGTAAAATCAcacttttcatattcttttttga-------------------------------aCAGGGTTTGTTATCCTGCTATCCCTCATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3542175 2552 - 24206276 aagagaaagaaataaaaggcgtccaaattggaaaggaagaa-----gtcaaattatccttgtttgcagatgatgtggtcttatatttgaaaagacctaaaaactccac-aaaacactattagaactgataaacaaatttagtaaagttgcaggatacaaaattaacatataatagtcaatagcatttctatatgtcaacagtgaactgtctgaaaaacaaaccaagaaagtaatcccatttgcaatagctacaaataaaattaaatacctaggaattaaccaaaaaggtgaaa-atctctacaatgaaaacta----------taaaacattgatgaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaagatattccttgttcacgaattggaacagttattgtcaaaatgtta-----------tactaccaaaagcaatctacagattgaatctctatcaaaataccaatgccactcttcacagaaatagaaaaaaaaaaatcctaaaattgatatggaagcccaaatgatccagaatacccagagctatcctgaacaaataaaccaaaactggatgaaccacattacatgactttaaactacactatagagctatgataactaaaacagcgtggtactggcataaaaaacagaccc------ataggtcaatggaacagaatagagaacccagaagcaaatctgtacatcaacagtgaactcattttctacaaaagtgccaagaacatacattggggaaagaacagtctcttcaataaatggtgctgggaaaactggatatccatatgc---agaatgaaacaagacccctatctcttggcatat-taaaaatc-aatttaaatatattaaaggcttaaatctaagaccttaaaaaa-ttaacctactaaaagaaaacactgggggaaactctcttagatattggtctgggcaaagatttcttgagaaatactccacaaacacaggccaccaaagcaaaaacggacaagtgggatcacatccagttaaaaagcttctgcacat-cgaggaaaaacaatcaacaatatggagattcaactcacagaatgggagacaatatttgcaaactacccatctgacaagggattaataatc----------aggaaacaactttatagg---aaaaaaacctaataatctaatttaaaactaggcaaaggatctgaatagagatttctcaa---aagacaatacaaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccactgatcatcagagaaatgtacctcaaagctacaataagatatcatctcaccccatttaaaatggcttttttccaaagacaggcaataacaaatgctgatgaggat---gagaaaagggaactctcatactctgtcagtaggaatgtgaattagtacaaccactatggaaaacagtttggcgattccccccaaaattaaatatagagctactttatgatcttgcaacctcattgctagatgtagacccaaaagaaaaaataacagtataacaaagagttatctgcattctcatatttgttttagctttgttcacaatagccaagatgtgaaagcaaccgaagtttccatcaatagatgaacgaataaagaaaatgtggt--------------------acatacatatacaatagtgtactattcagccatgaaaagaatgagatcatttgcaacaacacagatggaaatggggattattgtgttaagtgaaaaaagccaggcacagatagacaaacttcccatattctcacttatttgtgggaactaaaaattagaacgattgaatcatgcagataaagactagaatgatggttaccaaaaactga---ggatggtggaggtgtgcaatggggaaaaatgggaatagttaggggt--aaaaa-atataaagaacaaatagtatctagtatttgatagcacaacagggtgaatatagtaaataatgatttaattgtacatttta--aaataaccaa-------------------------------------aagaatataattggattgtttgtaacacgaaggataaatgcttgaggggataaataccccgtttaccacgatgtgattattatgtattatttgcctgtacccaaatatctcatactccataaatgtatacacctactatgtaccaacagaaataaaaaaTAACAAAACAAAA-----aacattgtttagcaagcccagctaagagtcatctgactctctagcaaatgtgattttgtttaacttattatatatgaattatggaatctcagacattgtataattacatatagatagatgttatagaaaactgctaaattgtatctttttagtgtggtagaaaagataatcccaaagattaaggtcttattacccCTTTTTAGAGCTGTATGAAATAAAATGAATATTTTTGTCATGT---TGATAttttttaacttttaagttcagaggtacacgtgcaggtttgttatataggtaaatctgtgtcatgagacattaactggattacgtctaatttaacaattttattttagtgttca-ttttttgctctgattatgtaaaatcacacttttcatattcttttttga-------------------------------acaggctttgttatcctgctatccctcatt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87723395 2591 - 132174527 aaaagaaagaaataaaaaacatccaaattggaaaggaagaagtcaggtcaaattatccttgtttgcagattatgtaattttatgtttagaaaaacctaaaaactccacaaaaacactattacaactgat----aattttagtacagttgcagactacaaaatcaacatataaaagtcagcagcattttcatatgtcaatagtgaactatctgaa----aaattaagaaagtaatcccatttatgatagctataaataaaattaaatacctaggaattaaccagaaagatgaaacatctctacaatgaaaacta----------tagaacattgataaaagaaactaaagaagacacaaagaaatggaaag-tattccatgttcataatttgaaagaatcattgttaaaatgttaatatgacttggttatgttaaaaacaatctacagattcaatctctctcaaaataccaatgtcactcttcacagagaca---aaaaaaaaattctaaaatttatatggaaccccaaatgatccagaatagccagagatatcctgaacaaataaaccaaaactggatgaatcacattacctgctttcaaactataccat-gaggtataataacaaaaacaccatgataccagcataaaaaacagaccc------ataggctaatggaacagaatagaaaacccagaagcaaatccatatatcaacagtgaactcattttctacaaaagtaccaagaacatacattggggaaagaacagtctcttcaataaatggtgctagaaaaactggatatccatatgcagaataatgaaactaga-tcctatttcttggcatatacaaaaatcaaatcaaaatggattaaaggcttaaatctaagacctcaaacaa-----accactaaaagaaaatattggaggaaactctcttagacatttgtctgggcaaagatttcttaagaaatactccacaaacacaggccaccaaagcaaaaatggacaagtggg-tcacatccagctaaaaagcttctgcacatccaagg--aaacaatcaacaatgtaaaatttcaatctacagaatgggagaaaatacttgcaaactacccatctgacaaaggattaacaaccagaatatataaggaaacaactctacggggaaaaaaaactctaataat-taatttaaaaatgggcaaaggatctgaacagagatttctcaaaagaagacaatataaatagcaaacagatatataaaaaggtgctc-aacaccactgatcattagagaaatgtacatcaaaactgcaatgagatatcatctcaccccagttaaaatggtttttatttaaagacaggcaacagtaaatgctggtgaggatgtggagaaaagggaactctcagactctgttggtgggaatgtgaattagtacaaccactaaggaaaacagtttaagagttccccccaaaattaaatatagagcttctttatgatcttgcaaccttattgttagatatacatccaaaag----aataccagcatatcaaagaatcatctgcattctcatgtttgttgtagctctgttcacaatagctaagatttggaaacaacctaagtttccatcaatagatgaatgaataaagaaaatgtggtgtgtacacacacacacacacacacacacacacaatagaatactgttgaaccataaaaagaatgagatcgtttgcaaaaacatggat-gaaatggagatcattgtgttaagtgaaataagccaaggacagatagacaaactttccatgttctcacttatttgtgagaactaaaa--caaaatgattgaatcttgcagataaagagtagaatgatggttaccagaagctgaaaaggataatgtgagggtgggatggggaaaaatggggatggttatgtctacaaaaa-atataaaaaataaataatatctagtatttgatagcacaacagggcgaatacagtcaataatgatttaattatacatttaaagaaataaccaa-------------------------------------aagaatataattggattgtttgtaacacaaaggataaatgcttgaggggacaaatagccaatttttcatgatgtgattattatgtattatattcctgtacgcaaat-----atactccataaatatatacacctactatgcacccacagaaataaaaaCTAACAAAACAAAACAAAAATTATTGTTTAGCAAGGCCAGCTAAGGGTTATCAGATTTTCTAGCAAATGTGATTTTGTTTAACTTACTGTAT--GATTTATGGAATCTCAGACATTGTATAATTATGTATAGCTAGATGTTACAGAATATTGCTATATTGTATATTTTTAGTGTAGTAGAAAATGTAATCCCAAAGATTAAGATCATATCATCCCTTTTTATAGCTGTATGAAAGAATATTAATCTTTTTGTCATGTTGATGATAtttgttaacttttaagctcaggggtacatgtgtaagtttgttatataggtaagcccatgtcataagACATTAATTGGAttgtatctaatttaataattttattttagtgatca-atttgtgctctga-aatgtaaaatcacac--ttcatattcttttttga-------------------------------actggctttgttatccttttatccctcatt i calJac3.chr10 I 23800 C 0 e canFam3.chr15 46763745 72094 - 64190966 I a score=181026.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 362368 83 + 478999 aatta----aatacagtttttg-atgtgttcattatgtatttgtttgagaattatgttttatgatatttaaaaattag-act--ga----caGTC------ s panTro4.chrUn_GL393519 203424 85 + 413329 aattagttaaatacagtttttg-atgtgttcattatgtatttg----agaattatgttttatgatatttcaaaattag-actttga----caGTC------ i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18894245 89 + 108868599 aattagttaaatacagtttttg-atgtgttcaatatgtatttg----agaattatgtttcatgatatttaaaaattag-actttgacaGTCAGTC------ i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87978951 89 - 170124641 aattagttaaatacaggttttg-atgtgttcattatgtatttgtttgagaattatgttttatgatatttaaaaaatta-gatttga----caGTC------ i rheMac3.chr7 C 0 I 4 s macFas5.chr7 88257000 89 - 171882078 aattagttaaatacaggttttg-atgtgttcattatgtatttgtttgagaattatgttttatgatatttaaaaaatta-gatttga----caGTC------ i macFas5.chr7 C 0 I 4 s papAnu2.chr7 85382253 89 - 162156779 AATTAGTTAAATACAGGTTTTG-ATGtgttcattatatatttgtttgagAATTAtgttttatgatatttaaaaaatta-gatttga----CAGTC------ i papAnu2.chr7 C 0 I 475 s chlSab2.chr29 3544727 89 - 24206276 aattagttaaatacagggtttg-atgtgttcattatgtatttgtttgagaattatgttttatgatatttaaaaaatta-gatttga----caGCC------ i chlSab2.chr29 C 0 I 4 s calJac3.chr10 87725986 90 - 132174527 aattagttaaataccattttgacatgtgttcattatttatttgttggagaataatgttttatgatatttaaaaattgt-attttga----caGTC------ i calJac3.chr10 C 0 I 6 s canFam3.chr15 46835839 84 - 64190966 ----AGTTAAATACAATTTATG-ACATTTTCATC---TATTTG----AGAAATTTGTTT-ATAACATTCAAAAAATTATACTTTGA----CAGCAACAATT i canFam3.chr15 I 72094 C 0 a score=7644.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 362451 3 + 478999 TAT s panTro4.chrUn_GL393519 203509 3 + 413329 TAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18894334 3 + 108868599 TAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87979044 3 - 170124641 TAT i rheMac3.chr7 I 4 C 0 s macFas5.chr7 88257093 3 - 171882078 TAT i macFas5.chr7 I 4 C 0 s chlSab2.chr29 3544820 3 - 24206276 TAT i chlSab2.chr29 I 4 C 0 s calJac3.chr10 87726082 3 - 132174527 TAT i calJac3.chr10 I 6 I 1 s canFam3.chr15 46835923 3 - 64190966 TAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 85382342 475 - 162156779 I a score=456280.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 362454 183 + 478999 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACGATCTATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTTGAGG---TTTCAAGAAA-TCAGGTGTTGTATCAAGACACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATACCAAGCTATCCCTGGAATTATCTCAGAGATAAATACCTTAGGTTG s panTro4.chrUn_GL393519 203512 183 + 413329 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACGATCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTTGAGG---TTTCAAGAAA-TCAGGTGTTGTATCAAGACACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATATCAAGCTATCCCTGGAATTATCTCAGAGATAAATACCTTAGCTTG i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18894337 181 + 108868599 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACGATCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTTGAGG---TTTTAAGAGA-TCAGGTGTTGTGTCAAG--ACTCTATATTACTTTAAAGGATAAATACCAAGCTATCCCTGGAATTATCCCAGAGATAAATACCTTAGGTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87979047 181 - 170124641 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACACTCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTCGAGG---TTTCAAGAGA-TCAGGTGTTGTATCAAG--ACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATACTAAGCTATCCCTGGAATTATCCCAGAGATAAATACCTTAGCATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88257096 181 - 171882078 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACACTCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTCGAGG---TTTCAAGAGA-TCAGGTGTTGTATCAAG--ACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATACTAAGCTATCCCTGGAATTATCCCAGAGATAAATACCTTAGCATG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85382817 181 - 162156779 -aaaaagttaaattactaATGGCAACAGCTGTGTTTTCTGGATACACTCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTCGAGG---TTTCAAGAGA-TCAGGTGTTGTATCAAG--ACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATACTAAGCTATCCCTGGAATTATCCCAGAGATAAATACCTTAGCATG i papAnu2.chr7 I 475 C 0 s chlSab2.chr29 3544823 181 - 24206276 -AAAAAATTAAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACACTCCATGAATAAATGCC-AGTAGGTAAGCTGCTCGAGG---TTTCAAGAGA-TCAGGTGTTATATCAAG--ACTCTATATTACCTTAAAGGATAAATACTAAGCTATCCCTGGAATTATCCCAGAGATAAATACCTTAGCATG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87726086 179 - 132174527 -AACAAATTTAATTACTAATGACAACAGCTGTGTTTTCTGGATACAATCAATGAATAGATGCC-AATAGGTAAGCTGCTAAAAA---ATTCAAAAAA-CCAGGCATTATATGAAG--A--CTATATTACCTTAAAGGATAAATAACAAGCTACCCTTGGAATTACTCCAGGGATAAATATCATAGCTTG i calJac3.chr10 I 1 C 0 s canFam3.chr15 46835926 171 - 64190966 AAAAATATTCAATTACTAATGACAGCAGCTGTGTTTTCTGTATAAGATCCATACATAGACACCGATTAGATAAGATGCTTGAGGCATCATCAAGAGACTCAGGTGTCGTATGATG--GCTCTGTAACGCCTTGAAGGGAGAGTTT----CTGCTTCTATAGTT--TCCAGTGGTAACTG---------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=1669038.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 362637 567 + 478999 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCTACTTCAAGGAGCATGATTGAGATAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATTGAAAATGGATGGCATATACAAACAAATCAATGACAAATTACAAATAAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGTTCTGTTATGCAACAGGTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAACTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------CAGAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGTAGTGTTGTAAGAACCATAGCAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATAGGAGATATTTCCAGTTCATACAGCCAGCCGTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAGGAAGCAATTAAGACATGTGC-TGGGCAGCTGTGATGGTCACCTGAGGATTGTCCATTTTGCTGGCCTGAGGCTGAAGAGAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGATAACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT s panTro4.chrUn_GL393519 203695 567 + 413329 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCTACTTCAAGGAGTATGATTGAGATAAAAACCAGTGAGGAGACTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATTGAAAATGGATGGCATATACAAACAAATCAATGACAAATTACAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGTTCTGTTATGCAACAGGTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAACTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------CACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGTAGTGTTGTAAGAACCATAGCAACCTCAGATACAGATAGAGTCCTAGGGATAGGAGATATTTCCAGTTCATACAGCCAGCCGTCAATTAGGGCTTGGCTTATAAGGAAGCAATTAAGACATGTGC-TGGGCAGCTGTGATGGTCATCTGAGGATTGTCCATTTTTCTGGTCTGAGGCTGAAGAGAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGATAACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18894518 567 + 108868599 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCTACTTCAAGGAGCATGGTTGAGATAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATGGAAAATGGATGGCATATACAAACAGATCAATGACAAATTACAAATCAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGTTCTGTTATGCAACAGGTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAACTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------TACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGCAGTGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATAGCAGATATTTCCAGTTCATACAGCCAGCCCTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAGGAAGCAGTTAAGACATGTGC-TGGGCAGCTGCGATGGTCATCTGAGGATTGCCCATTTTGCTGGCCTGAGGCTGAAGAGAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGATAAAATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGACGTAGGTTTCTCAGATATGTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87979228 567 - 170124641 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCTACTTCAAGGAGCATGGTTGAGAGAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATGGAAAATGGATGGCATATACAAATAAATCAATGACAAATTACAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGTTCCGTTATGAAGCAGTTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAGCTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------TACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCTAGGGCTCATTAAGCTAAGCAGTGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATAGGAGATATTTCCAGTTCATACAGCCAGCCCTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAGGAAGCAGTTAAGACATGCAC-TGGGCAGCTGCGATGGTCATCTGAAGATTGCCCATTTTGCTGGCCTGAAGCTGAAGACAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGAAAACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88257277 567 - 171882078 GTAT-TTATCCTTTAGCTTCTGCTACTTCAAGGAGCATGGTTGAGAGAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATGGAAAATGGATGGCATATACAAATAAATCAATGACAAATTACAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGTTCCGTTATGAAGCAGTTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAGCTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------TACAACTCAAACAGCAGCAGCTTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGCAGTGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATCGGAGATATTTCCAGTTCATACAGCCAGCCCTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAGGAAGCAGTTAAGACATGCAC-TGGGCAGCTGCGATGGTCATCTGAAGATTGCCCATTTTGCTGGCCTGAAGCTGAAGACAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGAAAACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85382998 567 - 162156779 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCCACTTCAAGGAGCATGGTTGAGAGAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATGGAAAATGGATGGCAtatacaaataaatcaatgacAAATTACAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-CAAAATAAGTGGGTTCTGTTATGAAGCAGTTCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAGCTTCCTAGGAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------TACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGCAGTGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATAGGAGATATTTCCAGTTCATGCAGCCAGCCCTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAGTAAGCAGTTAAGACATGCAC-TGGGCAGCTGCGATGGTCGTCTGAAGATTGCCCATTTTGCTGGCCTGAAGCTGAAGACAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGAATACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3545004 562 - 24206276 GTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCTAC-----GGAGCATGGTTGAGAGAAAAACCAGTGAGAATCTTC-T---TCAGATACAGACTGAGGCATGGAAAATGGATGGCATATACAAATAAATCAATGACAAATTACAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGGGCTCTGTTATGAAGCAGGCCTAATTGCTTCAGAGCCTGCAGGTCCCAAGGTCAGTTTCCTAGCAAGAACTAAATTTAA--------------------------------------TACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAGCTAAGCAGTGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCTAGAGTCCTAGGGATAGGAGATATTTCCAGTTCATGCAGCCAGCCCTCAACTCGGGCTTGGCCTATAAAGAAGCAGTTAAGACATGCAT-TGGGCAGCTGCGTTGGTCATCTGAAGGTTGCCCATTTTGCTGGCCTGAAGCTGAAGACAGGGTTGGTAGGATGAATGGCAGGAAAACATCTTCCTTCC------TTGAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGATATATT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87726265 597 - 132174527 CTAT-TTATCCTTCAGCTTCTGCCACTTCAAGGAGCATGATTGAGATAAAAACCAGTGAGAATCGTC-T---TCAGATACAGACTAAGGCGTGAAAAATGGATGGCATATACAAATA-ATCAATGGCAAATTACCAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAATAAGTGCGATCTGTTACGCAACAGGTCTAACTGCTTCAGAGCTTGCAAGTCCCAAGGTCAGCTTCCTAGAAAGAACTAAATTTAATACAACTCAAACAGCAACAGTCTAGAGAATCCCAGGGCTACAACTCAAACAGCAGCAGCCTAGGG-AATCCCAGGGCTCATTAAATTAAGCAATGTTGTAAGAACCATAAAAACCTCAGATACAGCCAGAGTCCTAGGGACAGGAGATCTTTCCAGTTCATGCAGCCAGCCCTCAACTAGGGCTTGGCTTATAAATAAGAAGTTAAGGCATGTGT-GGGGCAGCTGCTATGGTCATC-------TGCCTATTTTGACTGCCTGAGACTGAAGAGAGAGCTGGTAGAATGAATGGGAGGATAATACCTTTCTTCC------TTAAAACCACATAGCTTCTGACAAGCAAAGATGTAGGTTTCTCAGTTATGTT i calJac3.chr10 C 0 I 2340 s mm10.chr14 74552968 549 - 124902244 GTGT-TGATACTTCGCCTTCTATCACCTTA-GGAAAATG-TTGAG-TTAAAACCACACAGGCTCTTCAT---TCAGGCAGAGAGTGAAACAGAGAAACTAGTTGATAGGTA----------------ACGTTCTAAATTAATTAATCCAAAGTGAGTTTTAAAAATTTGGCTGGCCTATGTCTCAGGCCTGAGTGTTTGGGAGCGTACAGATCTC-AGGTCAGCTCTCTAGCAATAAATGATATGCA--------------------------------------GTTAACTCAAACAACAGCAGCCCAGGG-AATCTCAGGGCTCATTAGGCTTAACAGTAGTGTAATGACCATAAGAATCTCATATAGAACCAGAGCCCTAGGGACAGGGGATG--TCTAATCTACACAGCCACTGTTTAATTAGAGATTGGCTTATAAGGAAGTGGTTAAGATGCAGTT-TTGGCAGCTGGAATGTCCATCTGAAGATTACT--TTTTCTTAGTCCTAGATTG-GGGGAACATAGGTGCAATGAACAGCAAGATACCACATTATTTTCATCACATTTCAAGCACGTTGTTGCCCATAAGCAATGATGTAAG-TTCACATACATGTT i mm10.chr14 N 0 C 0 s canFam3.chr15 46836097 542 - 64190966 GTATGTAATCGTTCAGCCTTGCCTACTTCA-GGGTCATGG-TGAGACAGAAAGCAGTGGCAATCCTT-TTTCTCAGGTACAGACTGACACATGGAAAAGTGTCAGCATAT----------------CAAGTGCCAAATTAATCAATCCAAAGTAAG-TAAAAGGGGTGAGCTGTGTTATGCAATAGGTCTGACTGTTCCAGAGCCTGCAGGTCT-GAGTTCAGCTTTTCGGCAAGACC-----------------------------------------------TGAGATTCAGACAACAGCAGTCTAGGGAAATCCCAAGGCTCATTAGGCTGAGCAGTAGTATGAGGACCATAA-AGCCTCAGACACATCCGGAGCCCTGGGGACAAGTGATCTTTCCCCTT-GTACAGCCAGCTCTCAACTAGGGCTTGACTTATAAGGAAGCAGTTAGGGTACAGACTTGGGCAACTATGATGGTCATCTGAGAACTTCTAATTTTGTTGGACTGAAACTC-TGACGGAATCTGTGGGATGAACAGTAGGGTAACATAGTATTTCC------TCGAACTCACATAGCTCCTGACATGCAGTCATGTAAGTTTCTCAGATGTCTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=358563.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363204 129 + 478999 TACTCAAAGCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTTCTCTATATACTCTGGCATTGATCATTTTTAAATTTAAGAGATCATTT s panTro4.chrUn_GL393519 204262 129 + 413329 TACTCAAAGCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTTCTCTATATATTCTGGCATTGATCATTTTTAAATTTAAGAGATCATTT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895085 129 + 108868599 TATTCAAATCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTTTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTTCTCTATATACTCTGGCATTGATCATTTTTAAATTTAAGAGATCATTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87979795 129 - 170124641 TATTCAAAGCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTTCTCTATATACTCTGGCATTGATCATTTTTACATTTAAGAGATCATTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88257844 129 - 171882078 TATTCAAAGCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTTACTCTTTTTCTCTATATACTCTGGCACTGATCATTTTTACATTTAAGAGATCATTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85383565 129 - 162156779 TATTCAAagctcccctccccttcc-tgctcCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTTCTCTATATACTCTGGCATTgatcatttttacatttaagagATCATtt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3545566 129 - 24206276 TATTCAAAGCTCCCCTCCCCTTCC-TGCTCCTCTGTCTGACTCTGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTCCTCACTCTTTTCCTCTATATACTCTGGCATTGATCATTTTTACATTTAAGAGATCATTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87729202 121 - 132174527 TATTCAAAGCTCCCCTTCTCTCCT-TGCTCCTCTGGCTG----TGATGCTATTTTTATGTTTACTGTTGTC----CTCTTTTTCTCTATATACCCTGGTATTGATTATTTTTAAATTTAAGAGATCATTT i calJac3.chr10 I 2340 C 0 s mm10.chr14 74553517 115 - 124902244 TATCAAACTATACCCACTCCT--C-TAGTCTCATTTCTGTTTTTGATGGTCTTAAAATGCATTTT----------CCATTTTAGTCTCTATACTCTGGTATTTATCATTTT--AATCTAAGAGAACAATT i mm10.chr14 C 0 I 123 s canFam3.chr15 46836639 100 - 64190966 TATTCAAAGCTCCACTTCCCTCCCTTGCTGGTCTTTCTGTCTTTGAAGCCATTTTTATACTT------------------------------CTCTGACAGTCGTAATCTTTAAATTTAAGAAATCGTTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=333939.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363333 126 + 478999 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACACTTAGAAACATTCACAGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGACAGTTGCAATATTTGGATACGATAGGACC s panTro4.chrUn_GL393519 204391 126 + 413329 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACACTTAGAAACATTCACAGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGATAGTTGCAATATTTGGATATGATAGGACC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895214 126 + 108868599 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACTCTTAGAAACATTCACAGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGATAGTTGCAGTATTTGGATAAGATAGGACT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87979924 125 - 170124641 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACTCTTAGAAACATTCACGGAACAGTGAACTTCCTATAGCATCAA-GAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGGTAGTTGCAAGATTTGGATAAGATAGGACC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88257973 126 - 171882078 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACTCTTAGAAACATTCACGGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGGTAGTTGCAAGATTTGGATAAGATAGGACC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85383694 126 - 162156779 gagttttgttgttttaaatt--tactcttAGAAACATTCACAGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCTAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGATAGTTGCAAGATTTGGATAAGATAGGACC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3545695 126 - 24206276 GAGTTTTGTTGTTTTAAATT--TACTCTTAGAAACATTCACAGAACAGTGAAATTCCTATAGCATCAAGGAATTCCAGGGCTAGTGGCATCTTAGAAGGTAGTTGCAAGATTTGGATAAGATAGGACC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87729323 114 - 132174527 GAGTTTCATTATTTTAAGCT--GACTCTTAGAAACATTCACAGAACAATGGCATTCCTATAGCATCAA-GAATTCTAAGGCTAGTGGTATCTTAGAAG-----------ATTTGGATAAGATAGGACC i calJac3.chr10 C 0 I 487 s canFam3.chr15 46836739 124 - 64190966 GAGTTTTGTTGTTCCAGGTTTATACATTTGGAAACACTCACAGAGCAATGACACTCTCATAGCATCAGGGAA--CTGGGGCCAGTGGTATA--GGAAGGGAATTACAAGGTATGGATAAGATAGGATC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74553632 123 - 124902244 I a score=120050.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363459 57 + 478999 AAATTTACATAACTGAAGGCACAGGTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTAcctaa s panTro4.chrUn_GL393519 204517 57 + 413329 AAATTTACATAACTGAAGGCACAGCTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTACCTAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895340 57 + 108868599 AAATTCACATAACTGAAGGCACGGGTTTCATGGCAATGTTGTCTTAAGACTACCTAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980049 57 - 170124641 AAATTCACATAACTGAAGGCAAGGGTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTACCTAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258099 57 - 171882078 AAATTCACATAACTGAAGGCACGGGTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTACCTAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85383820 57 - 162156779 AAATTCACATAACTGAAGGCACGGGTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTACCTAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3545821 57 - 24206276 AAATTCACATAACTGAAGGCACGGGTTTCATGGCAATATTGTCTTAAGACTACCTAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46836863 49 - 64190966 AACGTAATATAGCAGAAAGCACTGGATTCATGGCAGTATTGTCTCAGGA-------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74553632 123 - 124902244 I e calJac3.chr10 87729437 487 - 132174527 I a score=762235.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363516 312 + 478999 ttctgttatagtcccttctagattctgttttccatttctttaattattaaagtttctttttactaaaatcttctttacgttccacaggtacaatatagaatgcaatgtttcaaacaaggccaaagaa-gtttagaacagaaagattgtttctttCTCAATAGAGAATACCACTATAGGTACCATCTTCAACTAATG--GTGTCCACTTCTTGT-TTTTCAGGAGAAATTTAAAAATGCATCAAATGCGTCTAAAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTCCAGCTAGCCAATTATTTTCTATTGTTGAGATAGTCAA s panTro4.chrUn_GL393519 204574 309 + 413329 TTCTGTTATAGTCCCTTCTAGATTCTGTTTTCCATTTCTTTAATTATTAAAGTTTCTTTTTACTAAAA---TCTTTACATTCCACAGGTACAATATAGAATGCAGTGTTTCAAACAAGGCCAAAGAA-GTTTAGAACAGAAAGATTGTTTCTTTCTCAAGAGAGAATACCACTATAGGTACCATCTTCAACTAATG--GTGTCCACTTCTTGG-TTTTCAGGAGAAATTTAAAAATGCATCAAATGCATCTAAAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTTCAGCTAGCCAATCATTTTCTATTGTTGAGATAGTCAA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895397 314 + 108868599 TTCTGCTGTAGTCCCTTCTAGATTCTGTTTTCCATTTCTTTAATTATTAAAGTTTCTTTTTACTAAAATCCTCTTTATGTTCCACAGGTACCATATAGAATGCAATGTTCCAAACAAGGCCAAAGAA-GTTTAGAGCAGAAAGATTGTTTCTTTCTCAATAGAGAATACCACTCTAGGTACCATCTTCAACTAATGGTGTGTCCACTTCCTGG-TTTTCAGGAGAAATTTTAAAATGCATCAAATGTGTTTAAAAGGAATTCATATGCAATTGAAACTCCAGCTAGCCAATCATTTTCTATTGTTGAGATAGTCAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980106 307 - 170124641 TTCTGCTATAGTCCCTTCTAGATTCCGTTTTCCATTTCTTTAATTATTAAAGTTTCTTTTTACTAAAATCTTCTTTACTTTCCACAGGTGCAATATAGAATGCAATGTTTCAAACAAGGCCAAAGAA-GTTT-----AGAAAGATTGTTTCTTTCTCAATAGAGAATACCACTGTAGGTACCATCTTCAACTAATG--GTGTCCACTTCTTGG-TTTTCAGGAGAAATTTAAAAATGCATCAAATGCCTCCAGAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTCCAGCTAGCAAATCATTTTCTATTGTTGAGCTAGTCAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258156 307 - 171882078 TTCTGCTATAGTCCCTTCTAGATTCCGTTTTCCATTTCTTTAATTATTAAAGTTTCTTTTTACTAAAATCTTCTTTACTTTCCACAGGTGCAATATAGAATGCAATGTTTCAAACAAGGCCAAAGAA-GTTT-----AGAAAGATTGTTTCTTTCTCAATAGAGAATACCACTGTAGGTACCATCTTCAACTAATG--GTGTCCACTTCTTGG-TTTTCAGGAGAAATTTAAAAATGCATCAAATGCCTCCAGAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTCCAGCTAGCAAATCATTTTCTATTGTTGAGCTAGTCAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85383877 311 - 162156779 TTCTGCTATAGTCCCTTCTAGATTccgttttccatttctttaattattaaagtttctttttactaAAATCTTCTTTACTTTCCACAGGTGCAATATAGAATGCAATGTTTCAAACAAGGCCAAAGAA-GTTTACAGCAGAAAGATTGTTTCTTTCTCAATAGACAATACCACTGTAGGTACCATCTTCAAC-AATG--GTGTCCACTTCTTGG-TTTtcaggagaaatttaaaaatgcatcaaaTGCCTCCAGAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTCCAGCTAGCAAATCATTTTCTATTGTTGAGCTAGTCAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3545878 312 - 24206276 TTCTGCTATAGACCCTTCTAGATTCCGTTTTCCATTTCTTTAATTATTAAAGTTTCTTTTTACTAAAATCTTCTTTACTTTCCACAGGTGCAATATAGAATGAAATGTTTCAAACAAAGCCAAAGAA-GTTTAGAGCAGAAAGATTGTTTCTTTCTCAATAGAGAATACCACTGTAGGTACCATCTTCAACTAATG--GTGTCCACTTCTTGG-TTTTCAGGAGAAATTTAAAAATGCATCAAATGCCTCCAGAAGGAATTCATATGGAATTGAAACTCCAGCTAGCAAATCACTTTCTATTGTTGAGTTAGTCAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87729924 280 - 132174527 TTCAGTTACAATTCC---------------------------------AAAGTTTCTTTTTGCTAAAATCTTCTTTACTTTTCACAGGTGCAATATAGAATGCAGTGTTTCAAACAAGGCCAAAGAAGGTTTAGAGCAGAAAGATTGTTCCTTTCTCAATAGAGAATTCCCCTGTAGGTACCATGCTCAACTAATG--GTATCCACTTCTTTG-TTTTCAGAAAAAATGTAAAAATGTATCAAATACCTCTAAAATAAATTAATGTGGAATTGAAACTACAGCTAGCAAATCATTTTCTGTTGTTGAGATGGTCAG i calJac3.chr10 I 487 C 0 s canFam3.chr15 46836912 283 - 64190966 -------------CCTCCTAGATACTATCTTCCATTTCTTTATTTC----AGTTACTTCTTGATAAG---TTCTTCACTTCTCCCAAAAGAAATTTAAGGTGCAGTGTTTCAAACA---------AA-GATTAAAGCAGAAAGATGATGCCCTTCTCAGTAAGAAATACCTTCATGAGTATCACCTTCAACGAATG--GTGTCCATTTCTTGGAGTTTCAAGAAAAAT-TAGAATTACATCAGATACCCTCAAAACAAATTCACATGGCATTTAAGCTTCAAGTAGCAATCTTTTTTCTGTCATTGTTGTGGTCAC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74553632 123 - 124902244 I a score=355380.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363828 156 + 478999 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGCTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAAACATAATAGCAAAATATGGTATACTGTTATGCTT-AAAACACACACATGCACAAGTTACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCATATTTTCCTCAT s panTro4.chrUn_GL393519 204883 155 + 413329 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGCTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAGACATAATAGCAAATTATGGTGTACTGTTATGCTT-AAAACACACACATGCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCGTATTTTCCTCAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895711 155 + 108868599 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGCTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAAACATAATAGCAAAATATGGTATACTGTTATGCTT-AAAACACACACATGCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCATATTTTCCTCAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980413 155 - 170124641 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGTTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAAACATAATAGCAAAATATAGTATGCTATTATGCTT-AAAGCACACACATGCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTATTCTTCATATTTTCCTCAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258463 155 - 171882078 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGTTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAAACATAATAGCAAAATATAGTATGCTATTATGCTT-AAAGCACACACATGCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCATATTTTCCTCAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85384188 153 - 162156779 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGTTCCACAcagaccaaaataaatataagacaaaCATAATAGCAAAATATAGTATACTATTATGCTT-AAAGCACACAC--GCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCATACTTTCCTCAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3546190 155 - 24206276 ATTTCCTCCTCTAATAATGCATTTAGTTCCACACAGACCAAAATAAATACAAGACAAACATAATAGCAAAATATAGTATACTATTATGCTT-AAAGCACACACATGCACAAG-TACCAGGAGAAAAATTTTACTCCTTTTCTTCATATTTTCCTCAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87730204 153 - 132174527 ATTTTTTCCTCTAATAATGCTTTTAGTTCCACACAGACC-AAATAAATGC-AGACAAACATAATAGCAAAATATAGTATGCTA-TATGCTTAAAAACACACACATGCCCAAG-TTCCTGGAGAAAAACTTTCCTCCTTTGCTTCATATTTTTCTCAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74553632 123 - 124902244 I e canFam3.chr15 46837195 0 - 64190966 C a score=720529.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 363984 292 + 478999 AAACATCTC---------TGGTTCCTTGTTTAGAAAGACA----AGAGACCAGCTGCTCAGCTGTACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGTGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCTA---AGCAGGACCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTTTTTTGGCTCATTTTGTGTACTTAAAAATATTTTTATTGACTTTTTCACATTCTTAGGTTATTTTTAGGATATGAAACATGAAATGCTTGGTAGGGTCTGATCTTACTGCTAATGGGATAATGGAGCTGGTATTTTT s panTro4.chrUn_GL393519 205038 292 + 413329 AAACATCTC---------TGGTTCCTTGTTTAGAAAGACA----AGAGACCAGCTGCTCAGCTGTACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGTGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCTA---AGCAGGACCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTTTTTTGGCTCATTTTGTGTACTTAAAAATGTTTTTATTGACTTTTTCACATTCTTAGGTTATTTTTAGGATATGAAACATGAAATGCTTGATAGGGTCTGATCTTACTGCTAATGGGATAATGGAGCTGGTATTTTC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18895866 291 + 108868599 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAGAAAGAAG----AGAGACCAGCTGCTCAGCTGTACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGTGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCCA---AGCAGGACCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAAATTTTTTGGCTCATTTTGTGTACTT-AAAATATTTTTATTGACTTTTTCAAATTCTTAGGTTATTTTTAGGATATGAAACATGAAATGCTTGATAGGGTCTGATCTTACTGCTAATGGGATAATGGAGCTGATATTTTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980568 289 - 170124641 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAGAAAGACG----AGCGACCAGCTGCTCAGCTGCACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGAGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCAA---AGCAGGGTCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTATTTTGGCTCATTTTGTGTACTTAAAA---TTTTTATTGACTTTTTCACATTCTTAGGTTATTTTTAGGCTCTGAAACATGAAATGCTTGATAGGGCCTGATCTTACTGCTAATGGGGTAATGGAGCTGGTATTTTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258618 289 - 171882078 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAGAAAGACG----AGCAACCAGCTGCTCAGCTGCACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGAGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCAA---AGCAGGGTCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTATTTTGGCTCATTTTGTGTACTTAAAA---TTTTTATTGACTTTTTCACATTCTTAGGTTATTTTTAGGCTCTGAAACATGAAATGCTTGATAGGGCCTGATCTTACTGCTAATGGGGTAATGGAGCTGGTATTTTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85384341 289 - 162156779 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAGAAAGACG----AGCGACCAGCTGCTCAGCTGCACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGAGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCAA---AGCAGGGTCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTATTTTGGCTCATTTTgtgtacttaaaa---tttttattgactttttcacATTCTTAGGTTATTTTTAGGCTCTGAAACATGAAATGCTTGATAGGGCCTGATCTTACTGCTAATGGGGTAATGGAGCTGGTATTTTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3546345 289 - 24206276 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAGAAAGACG----AGTGACCAGCTGCTCAGCTGCACACAAGTAGCCTTTGATTATTTAAGGAGC-TTTAGT--TTGTCCTCTTCTCTCAA---AGCAGGGTCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTCTCAATTATTTTGGCTCATTTTGTGTACTTAAAA---TTTTTATTGACTTTTTCACATTCTTAGGTTATTTTTAGGCTCTGAAACATGAAATGCTTGATAGGGCCTGATCTTACTGCTAATGGGGTAATGGAGCTGGTATTTTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87730357 286 - 132174527 AAACATCTC---------TGGTTCCCTGTTTAG-AAGACA----AGAGACTAGCTGTTCAGCTGTATACAAATAGCCTGTGATTATTTAAGGAGC-TTAAGT--TTGTCCTCTTCCCTGCA---AGCAGGGCCCTTCCATAAAGACTTTCATTTTGCATTAAGCATTTTCAATTTCTTTGGCTCA-TTTGCGTACTTAAAAATACTTTTATTAATTTTTCTACATTCTTAGTTTATTCTTAGGATATGAAACATGAAGTGCTTGGTAGGGCTTGATCTTACTGATAATGGGACAATGGAG----TATTTTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74553755 288 - 124902244 aaacatctcttcagctcTTAGATCTCTGTTTAGGAAGATAGGTCAGAGACAAGCTGCCCAATGCTTAGTAAGTACCC--GGACCATTTGAAGAGCTTTTTGTTGTTGTTCTCTTTCCTTTATGGAGTGAGATTCTTCCCCAATCAC--ACATTTACTCTTAAAAGTTTTCA--TTCTATGATGTATTTTGTGAACTGAACA---TATTTGCTAACTTGTGAAAATTCTC--GTTATTCCCAGGGAATGTAGCATGAAATGACTGATAGG--CTGA----------AATGGAACAATGAAGCTGAAATCTTT i mm10.chr14 I 123 I 742 e canFam3.chr15 46837195 0 - 64190966 C a score=72128.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 364276 29 + 478999 GAATGTGGCTTTCCAAGCTCTGCAGGGCT s panTro4.chrUn_GL393519 205330 29 + 413329 GAATGTGGCTTTCCAAGCCCTGCAGGGCT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18896157 29 + 108868599 GAATGTGGCTTTCCAAGCTCTGCAGGGCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980857 29 - 170124641 GAATGTGGCTTTCCATGCTCTGCAGGGCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258907 29 - 171882078 GAATGTGGCTTTCCATGCTCTGCAGGGCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85384630 29 - 162156779 GAATGTGGCTTTCCATGCTCTGCAGGGCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3546634 29 - 24206276 GAATGTGGCTTTCCATGCTCTGCAGGGCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87730643 29 - 132174527 GAATGTGGCTTTCTAAGCCCTGCAGGGCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74554043 742 - 124902244 I e canFam3.chr15 46837195 0 - 64190966 C a score=264392.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 364305 110 + 478999 TTGGCAAGGGAAATTATATTGTGACTGGGGTTAGTTTTGGGATGTAGACATTCGTTCATGTTGTTGGGTGTATTGTTCTTTTTATTCTTTGCAGAACAGTGACAGGCTTA s panTro4.chrUn_GL393519 205359 110 + 413329 TTGGCAAGGGAAATTATATTGTGACTGGGGTTAGTTTTCGGGTGTAGACATTCCTTCATGTTGTTGGGTGTATTGTTCTTTTTATTCTTCACAGAACAGTGACAGGCTTA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18896186 110 + 108868599 TTGGCAAGGGAAATTATGTTGTGACTGGGGTTAGTTTTGGGATGTAGACATTCCTTCATGTTGATGAGTGTATTGTTCTTTTCATTGTTCACAGAACAGTCACAGGCTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980886 110 - 170124641 TTGGCAAGGGAAATTATGTTGTGATTGGGGGTAGTTTTGGGGTGTAGACATTCCTTCATGTTGATAGGTGTCGTGTTCTTTTCATTCTTCACAGAACAGTCACAGCCTTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88258936 110 - 171882078 TTGGCAAGGGAAATTATGTTGTGATTGGGGGTAGTTTTGGGGTGTAGACATTCCTTCATGTTGATAGGTGTCGTGTTCTTTTCATTCTTCACAGAACAGTCACAGGCTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85384659 110 - 162156779 TTGGCAAGGGAAATTATGTTGTGATTGGGGGTAGTTTTGGGGTGTAGACATTCCTTCATGTTGATGGGTGTCGTGTTCttttcattcttcacagaacagTCACAGGCTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3546663 110 - 24206276 TTGGCAAGGGAAATTATGTTGTGATTGGGGGTAGTTTTGGGGTATAGACATTCCTTCATGTTGATGGGTGTCGTGTTCTTTTCATTCTTCACAGAACAGTCACAGGCTTA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87730672 110 - 132174527 TTGACAAGGGAAATTATTCTGTGATTGGGGGTAGTTTTGGAGTGTAGACATTTTTTCATGTTGATGGGTATAGTGTTCTTTTCATTCTTTACAGAACAGTCCCAGGTCTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74554785 108 - 124902244 TTGGAGAGATAAAATATATTATAATGGAAGATAATCTTATTGC-TAACCATTCTTTCA-ATCAAAGAGGATAGTATAGTTTGTATCCTGAATAAAACACTCATAGTCTCG i mm10.chr14 I 742 C 0 e canFam3.chr15 46837195 0 - 64190966 C a score=895165.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 364415 365 + 478999 ATTTCCTACTGTGATCAGA---CTT--------CAGAAGCTGGGAGATGACTCAACCAAATGTG-GAAATGTTATTAAACCTAAAAGGGAGCTTTCTATATTGTTTAGTATTATG-TTTTATATTGTCTGAAGATTGCAAATTTACT--GTCATTAAAAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGGGCTGCCTATTTTTAACTTATGCAAGT----------GTAAAGATTTTTATATCATTATTAATC-AAAATCTTATCACAGTAATCACCTAGGAACTGTCCAGAATATTTATAGTGCTGAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCCATAAAATC s panTro4.chrUn_GL393519 205469 364 + 413329 ATTTCTTACTGTGATGAGA---CTT--------CAGAAGCTGGGAGATGACGCTACCAAATGTG-GAAATGTTATTTAACCTAAAAGGGAGCTTTCTATATTGTTTAGTATTATG-TTTTATATTGTCTGAAGATTGCAAATTTACT--GTCATT-AAAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGGGCTGCCTATTTTTAACTTCTGTAATT----------GTAAAGATTTTTATATCATTATTAATC-AAAATCTTATCACAGTAATCACCTAGGAACTGTCCAGAATATTTATAGTGCTGAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCCATAAAATC i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18896296 371 + 108868599 ATTTCTTACTGTGATCAGA---CTTCAGAAACACAGAAGCTGGGAGATGACTCTGCCAAATGTG-GAAATGTTATTAAACCTAAAAGGGAGCTTTCTATATTGTTTAGTATTATG-TTTCATATTGTCTGAAGATTGCAAATTTATT--GTCATT--AAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGGGCTGCCTATTTTTATCTTATGTAATT----------GTGAAGATTTTTATATCATTATTAATC-AAAATCTTATCAGAGTAATCACCTAGGAACTGTCCAGAATATTTATAGTACTGAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAGCAAGTAGGCCATAAACTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87980996 366 - 170124641 GTTTCTTACTGTGATCAGA---CTTCAGAAACACAGAAGCTGGGAGGTGACT--ACCAAATGTG-GAAATGTTATTCAACATAAAAGGAAGCTTTCTGTGTTGTTTAGTGTTATG-TTTCATATGGGCTGAAGATTGCAAATTTATT--GTCAGT--AAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGAGTTGCCTATTTTTATCTTAAGTAATT----------GTAAAGATTTTGAT---GTTTTTAATC-AAAATCTTATCAGAATAATCACCTAGGGACTGTCCAGAATATTTATAGTACTGAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCCATAAACTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88259046 366 - 171882078 GTTTCTTACTGTGATCAGA---CTTCAGAAACACAGAAGCTGGGAGGTGACT--ACCAAATGTG-GAAATGTTATTCAACCTAAAAGGAAGCTTTCTGTGTTGTTTAGTGTTATG-TTTCATATGGGCTGAAGATTGCAAATTTATT--GTCAGT--AAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGAGTTGCCTATTTTCATCTTAAGTAATT----------GTAAAGATTTTGAT---GTTATTAATC-AAAATCTTATCAGAATAATCACCTAGGGACTGTCCAGAATATTTATAGTACTGAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCCGTAAACTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85384769 365 - 162156779 GTTTCTTACTGTGATCAGA---CTTCAGAAACACAGAAGCTGGGAGGTGACT--ACCAAATGTG-GAAATGTTATTCAACCTAAAAGGGAGCTTTCTATATTGTTTAGTGTTATG-TTTCATATTGGCTGAAGATTGCAAATTCATT--GTCagt--aaaaaaaatccaagaat-------aaCCAGAATCCAGCGCTTACTTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGGGTTGCCTATTTTTATCTTAAGTAATT----------GTAAAGATtttgat---attattaat--aaaatcttaTCAGAATAATCACCTAGGGACTGTCCAGAATATTTATAGTACTAAAATTTCCTGATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCCGTAAACTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3546773 367 - 24206276 GTTTCTTACTGTGATCAGA---CTTCAGAAACACAGAAGCTGGGAGGTGACT--ACCAAATGTG-GAAATGTTATTCAACCTAAAAGGGAGCTTTCTATATTGTTTAGTGTTATG-TTTCATATTGGCTGAAGATTGCAAATTTATT--GTCAGT-AAAAAAAAATCCAAGAAT-------AACCAGAATCCAGCCCTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAC------TAACATACAGGGTTGCCTATTTTTATCTTAAGTAATT----------GTAAAGATTTTGAT---ATTATTAATC-AAAATCTTATCAGCGTAATCACCTAGGGACTGTCCAGAATATTTATAGTACTAAAATTTCCTAATATTAAATCTTACTTTAAACAAGTAGGCTGTAAACTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87730782 367 - 132174527 GTTTCTTACTGTGATCAGA---TTTCAGAAACACACAAACTGGGAGATGACTCTACCAAACGTG-GAAATGTTGTTAAACCTAAAGGAAAGCTTTCTATATTGTTTAGTATTACA-TTTTATATTGTCTAAAGATTGCCAATTTATT--GTCATT--AAAAAAGTTCCAGGAAT-------AATCAGAATCCAGCCTTTACCTTGATTAAAACTCAAATAAT------GAACATTCAGGGCTGCCTATTTTTGTCTTATGTAATT----------GTAAAGATTTTGATACCATAATTAATA-AAAATCTTATCAGAGTAATCACCTAGGAACTGTCCAAAGTATTTATAGTACTGAAATTCCCTAATATTAAAT----CTTTGAACAAGTAGGTCATAAACTC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74554893 366 - 124902244 TTTCCTTTCTGTGATTAGAGATTATCAGAAACATAGACACTAACAGACAGTTTTAGAAAACATGCTGATTATTATTAAATATTGAAAGTAG-TCTAGACATTG-TTGGCATTATG-TTTTATATTATCTGAAG--TCCATGTATGCC--TTGAAC--AAGCAAGAGCAAAAAATCTGTGAAATCCAAAACTTAGTGTTTATGTTAATGATAACTCAACTAACTGATAATAACTCAAATAATCAAATACTTACAACAGATGTTATTTTATTTTTAAGTATAAAATTTGATAGCATTCTTAGTC-AAAATGTTATTA---------------------TCTAAATATGAGCAGCATTGAAATTCCCTAATAATA-------CTTCAAAGAAGTATATCATTAACTC i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46837195 319 - 64190966 ATTTCTTACTGTGATCAGA-GTCTTCAGAAATGTAGAAGCTGG-ATGTATTTTTGCCAAGTGTG-GCAGT-TTATCAACACTGAGAGTGAGCTTTCCATAATAGTTGGCGTTATGTTTTCACATTATCTGAAGGCAGAATATTCCCCGAGTCAAT---AAAAAAATTTAAGAAT-------AACTGGAA-------------TTTATTACAACTCAAATATA------T---------GGTTTTCTATGTTTGTCTCATGAAAT-----------GTAAGGATTTTGATATCACCCTTCTCCTATTATGTTTTCACAGTAG-----------------GAAATAATCACATTG------TTTCTCAGTCATAAATT---------ACAGGAATGCTTTAGATTC i canFam3.chr15 C 0 I 350 a score=407999.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 364780 194 + 478999 AGGCTTATAAATGGTTTGTAGTAATTTGGC-TTATAACATATTTTACATATTCTTCTCTTATTTAATCTATCCTTCTGATTTATTTAATTTTAATATTGTCTGTTTTAATGTAA--TCTTTTCTTTCCCAACATATGTTCAGTGGAAATAACAAGTGTACCGTACACCCTTGGTATACTATGCCCTTCACATTAGGA s panTro4.chrUn_GL393519 205833 187 + 413329 AGGCTTATAAATGGTTTGTAGTAATTTGGG-TTATAACATATTTTACATATTCTTCTC--ATTTAATCTATCCTTCTGATTT-----ATTTTAATATTGTCTGTTTTAATGTAA--TCTTTTCTTTCTCAACATATGTTTGGTGGAAATAACAAGTGTACCATACACCCTTGGTATATTATGCCCTTCACATTAGGA i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18896667 189 + 108868599 AGGCTTATAAA----TTGTAGTAATTTGGG-TTATAACATATTTGACATATTCTTCTCTTATTTAATCTATCCTTCTGATTTATTTAATTTTAATATTGTCTGTTTTAATATAA--TCTTTTCTTTCTCAGCATATGTTGAGTGGAAAAAACAAGTGTACCATACACCCTTGGTATACTATG-CCTTCACATCAGGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87981362 191 - 170124641 AGGTTTATAAATTTACTGTAGTAATTTGGG-TTAAAACATGTTTTACATATTCTTCTCTTATTTAATCTATCCTTCTGATTTATTTAGTTTTAATATTGTCTGTTTTAATATAA--TCGTTTCTTTCTCAAC--ATGTTTGGTGGAAATAACAAGTGTACCATACGCCCTGGGTATACTATG-CCTTTACATTAGGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88259412 191 - 171882078 AGGTTTATAAATGTACTGTAGTAATTTGGG-TTAAAACATGTTTTATATATTCTTCTCTTATTTAATCTATCCTTCTGATTTATTTAGTTTTAATATTGTCTGTTTTAATATAA--TCGTTTCTTTCTCAAC--ATGTTTGGTGGAAATAACAAGTGTACCATACGCCCTGGGTATACTATG-CCTTTACATTAGGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85385134 193 - 162156779 AGGTTTATAAATGGACTGTAATAATTTGgg-ttaaaacatattttacatattcttcTCTTATTTAATCTATCCTTctgatttatttagttttaatattgTCTGTTTTAATATAA--TCGTTTCTTTCTCAACAAATGTTTGGTGGAAATAACAAGTGTACCATACACCCTGGGTATGCTCTG-CCTGTACATTAGGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3547140 187 - 24206276 AGGTTTATAAATGGACTGTAGTAATTTGGG-TTAAAACATATTTTACATATTCTTCTCTTATTTAATCTATCCTTCTGATGTATTTAGTTTTAATATTGTCTGTTTTAATATAA--TTGTTTCTTTCTCAACATATGTTTGGTGGAAATAACAAGTGTACCATACACCCTGGGTATA-------CTTTATATTAGGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87731149 174 - 132174527 AGTCTTATAAATGGTTTGTAGTAATTTAGG-TTATACTATATTTTACATATTCTTCtt--atttaatct------------tatttaattttaatattatCTGTTTTAATACAA--TCTTTTCTTTCTCAACATATGTTTGGTCGAAATAACAAGTGTACCATACACCCTTGGTATACTATG-CC-----ATTAGGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74555259 174 - 124902244 AGGCTTA-AAATACCTTGTAATCATATGGGTTTTTAACACATTT-ACACATTCTT-----ATTTAATCTATCACTGTGGATT----AATTTTAATTTTACCTACTTTAATACAAGGTCATCTCTCTGTTGAGATATACTT--TTGAAATA--TAATGTACTGT--------TATACATTACATCCTTCCTATAAGGA i mm10.chr14 C 0 I 436 e canFam3.chr15 46837514 350 - 64190966 I a score=369334.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 364974 167 + 478999 AATAATCACATTGTTTCTCAGCCATATTCTGAGACTAAATTATAACAGTGTGTAGGATTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAAAATAACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCCAAGATTA-TTTTAAAAAT s panTro4.chrUn_GL393519 206020 163 + 413329 AATAATCACATTGTTTCTCAGCCATATTCTGAGACTAAATTATAACAGTGTGTAGGATTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAAAATAACTTTGGTTTC----TCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCCAAGATTA-TTTTAAAAAT i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18896856 166 + 108868599 AATAATCACATTGTTTCTCAGCCATATTCTGAGACTAAATTATAACAGTGTGTAGGGTTATGTGTTCTCATTGTTTTCTGGTTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAAAA-AACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGATTTTTCCAGTTTCCCCAAGATTA-TTTTAAAAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87981553 168 - 170124641 AATAATGACATTGTTTCTCAGCCGTATTCTGAGACTAAATTATAACAGTACTTTAGACTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAATATAACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCCAAGATTATTTTTTAAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88259603 168 - 171882078 AATAATGACATTGTTTCTCAGCCGTATTCTGAGACTAAATTATAACAGTACTTTAGACTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAAAATAACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCCAAGATTATTTTTTAAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85385327 168 - 162156779 AGTAATCACATTGTTTCTCAGCCGTATTCTGAGACTAAATTATGACAGCACTTTAGATTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAaccttt-tttaa-ttaaaaaaataactttggtttctctttctcagactttttcagttttcccaagattattttttaaaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3547327 168 - 24206276 AATAATCACATAGTTTCTCAGCCGTATTCTGAGACTAAATTATAACAGTACTTTAGATTATGTGTTCCCATTGTTTTCTGGCTTCTAGAAACCTTT-TTTAA-TTAAAAAAATAACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCCAAGATTATTTTTAAAAAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87731323 169 - 132174527 AATAATCACATTGTTTCTCAGTCATATTGTGAGACTAAATTATAACAGTGAGTTAGATTATGTGTTTCCATTGTTTTCTGGTTTCTACAAACCTTTATTTAATTTTGAAAAATAACTTTGGTTTCTCTTTCTCAGACTTTTCCAGTTTTCCTAAGAATA-TGTTTAAAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I e canFam3.chr15 46837514 350 - 64190966 I a score=2255235.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 365141 880 + 478999 TAGATGCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATACA-----------------------TTTTAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGAACTTTACAATCCTTGGTGCATCCAAAAAAGATTAGAGAATTTCCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACACATAACAGCAAATCGTTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGGTTTATTTTCCAATTGACTCTAGAAAGTGA----GGTGATTCCTTCTATCAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACTTggctatataggtagatgaagaggatggtcacaatcatggtgtgacagaggcgtccaaatgtgacttgagccccaaatctctctctcactggcttatcttggaataataccc-tagagaaagttt--tcttgtcattagaggttttcatttttagaatttaagtacttttCTGCATTGTCTATGTAAATACCTGATATCTATTATGAAGGATTTTATTGGATAACATTCTCTGAATGACTTGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACAAAGCTTG------GAACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTATTTCATATTTTGTCTATAGCTGGTTCTAGATAAAAAAAAAT-----TCTAGACAGGGAGACATCTACTAATTTT----TACTGCAATGGAAGAAATGTATCAACATTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTGTCACCAAACATTGGGGATGAATATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATATATCTAACAATATCTTAGCAAATCTTTTATTTTCTT---ATGTATCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AACACAACTCTGGTTTCTCTTATTACTTTGTCCTGTAAAA-GGGTCATGGTG s panTro4.chrUn_GL393519 206183 879 + 413329 TA-ATGCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATACA-----------------------TTTTAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGCAATTTACAATCCTTGGTGCATCCAAAAAAGATTAGAGAATTTCCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACACATAACAGCAAATCGTTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGGTTTATTTTCCAATTGACTCTAGAAAGTGAG---GGTGATTCCTTCTATCAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACTTGGCTATACAGGCAGATGAAGACGATGGTCACAATCATGGTGTGACAGAGGCGTCCAAATGTGACTTGAGCCCCAAA----TCTCTCACTGGCTTATCTTGGAATAATACCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGAGGTTTTCATTTTTAGAATTTAAGTACTTTTCTGCATTGTCTATGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGATAACATTCTCTGAATGACTTGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACAAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTATTTCATATTTTGTCTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAAAAT-----TCTAGACAGGGAGGCATCTACTAATTTTTAACTACTGCAATGGAAGAAATGTATCAACATTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTGTCACCAAACATTGGGGATGAATATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCAAATCTTTTATTTTCTT---ATGTATCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AACACAACTCTGGTTTCTCTTATTACTTTGTCCTGTGAAA-GGGTcatggtg i panTro4.chrUn_GL393519 C 0 N 0 s ponAbe2.chr14 18897022 883 + 108868599 TAGATCCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATACA-----------------------TTTTAGATAACTGGAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGAAATTTACAATCTTTGGTGCATCCAAAAAAGATTAGAGAATTTTCAATTTAGCAGAGCTGAAGTAAGGCTGTACATATAGCAGCAAATCGTTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGTTTTATTTTCCAATTGATTCTAGAAAGTGA----GGTGATTCCTTCTATCAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCAGCTGTGCACTTGAATATATAGGCAGATGAAGAGGATGGTCACAAACATGGTATGACAGAGGCATCCAAAGGTGGCTTGAGCCCCAAATCTCTCTCTCACTGGCTTATTTTGGAATAACATCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGAGGTTTTCATTTTTAGAATTTAAGTACTTTCCTGCATCGTCTGTGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGATAACATTCTCTGAATGACTTGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACAAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTATTTCATATTTTGCCTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAAAAT-----TCTAGACAGAGAGGCATCTACTAATTTTTAACTACTTCAATGGAAGAAATGTATCAATGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTGTCACCAAACGTTGGGGATGAATATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATAGATCTAACAATATCTTAGCAAATCTTTTATTTTCTT---AAGTATCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AACACAACTCTGGTTTCTCTTATTACTCTGTCCTGTAAAA-GGGTGATGGTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87981721 870 - 170124641 TAGACCCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATGCA-----------------------TTTTAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGAAATTTGCAATCCTTGGTGCATGCAAAAAAGATTGGAGAATTTTCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACATATAATAGCAAATCGTTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGTTTTATTTTCCAATTGATTATAGAAAGTGA----GGTGATTCCTTCTATTAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACCTGGTTATATAGGCAGTTG--GAGGATGGTCACAAACATAGTGTGACAGAGGCATCCAAAGGTGGCTTGAGCCCTGAATCTCTCTCTTACTGGCTTATCTTGGAACAATATCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGGGGCTTTTATTTTTAGAATTTAAGTACTTTTCTGCATTGTCTTTGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGGTAACATTCTCTGAATGACTCGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACGAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTACTTCATATTTTGCTTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAATAT-----TCTAGACAGAGAAGCATCT-----------ACTACTTCAATGGAAGAAATGTATCAACGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTCTCACCAAACGTTGGGGATGAGTATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCAAATCCTTTATTTTCTT---ATGGATCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AATACAACTCTGATTTCTCTTGTTACTCTGTTTTATAAAA-GGGTCATGGTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88259771 870 - 171882078 TAGACCCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATGCA-----------------------TTTTAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTACTGAAATTTGCAATCCTTGGTGCATGCAAAAAAGATTGGAGAATTTTCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTATGTATAACAGCAAATCGTTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGTTTTATTTTCCAATTGATTATAGAAAGTGA----GGTGATTCCTTCTATTAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACCTGCTTATATAGGCAGTTG--GAGGATGGTCACAAACATAGTGTGACAGAGGCATCCAAAGGTGGCTTGAGCCCTGAATCTCTCTCTTACTGGCTTATCTTGGAACAATATCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGGGGCTTTTATTTTTAGAATTTAAGTACTTTTCTGCATTGTCTTTGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGGTAACATTCTCTGAATGACTCGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACGAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTACTTCATATTTTGCTTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAATAT-----TCTAGACAGAGAAGCATCT-----------ACTACTTCAATGGAAGAAATGTATCAACGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTCTCACCAAACGTTGGGGATGAGTATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCAAATCCTTTATTTTCTT---ATGGATCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AATACAACTCTGATTTCTCTTGTTACTCTGTTTTATAAAA-GGGTCATGGTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85385495 870 - 162156779 tagatccATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGTTAATTATGCA-----------------------TTTTAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGAAATTTGCAATCCTTGGTGCATCCAAAAAAGATTGGAGAATTTTCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACGTATAACAGCAAATCGTTCCCTAACttgtatttcttgttttgttttattttccaattgaTTCTAGAAAGTGA----GGTGATTTGATCTATTAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACCTGGTTATATAGGCAGTTG--GAGGATGGTCACAAACATAGTGTGACAGAGGCATCCAAAGGTGGCTTGAGCCCTGAATCTCTCTCTTACTGGCTTATCTTGGAACAATATCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGgggcttttatttttagaatttaagtACTTTTCTGCATTGTCTTTGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGGTAACATTCTCTGAATGACTCGATAGAACCAAGTGCAA-------CATGGATTACGAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTACTTCATATTTTGCTTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAATAT-----TCTAGACAGAGAAGCATCT-----------ACTACTTCAATGGAAGAAATGTATCAACGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAAGCCAAGTTACTGTCACCAAACGTTGGGGATGAGTATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCaaatcctttattttctt---atggaTCTATGGTTGTTGAAAAGTCCAGAAGC---------------------------AATACAACTCTGATTTCTCTTGTTACTCTGTTTTATAAAA-GGGTCATGGTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3547495 911 - 24206276 TAGATCCATAATTTTAATGAGACTTGACCCCTGttaattatgcattaaattaattatgttaattaattTTCAGATAACTGAAAAGAACATCAAAATGATGTTTTCTTATGGAAATTTGCAGTCCTTGGTGCATCCAAAAAAGGTTGGAGAATTTTCAATATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACGTATAACAGCAAATCATTCCCTAACTTGTATTTCTTGCTTTGTTTTATTTTCCAATTGATTCTAGAAAGTGA----GGTGATTCCTTCTATTAGTTATGAGATTATAGATTTAGATGCACCTGTGCACCTGGTTATATAGGCAGTTG--GAGGATGGTCACAAACATAGTGTGACAGAGGCATCCAAAGGTGGCTTGAGCCCTGAATCTCTCTCTCACCGGCTTATCTTGGAATAATATCC-TAGAGAAAGTTT--TCTTGTCATTAGGGGTTTTTATTTTTAGAATTTAAGTACTTTTCTGCATTGTCTTTGTAAATACCTGATATCTAGTATGAAGGATTTTATTGGGTAACATTCTCTGAATGACTCGATAGAACCAAGTGCAACATGGATCATGGATTACAAAGCTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTGTCTTACTTCATATTTTGCTTATAGCTGGTTCTAGAT-AAAAAATAT-----TCTAGACAGAGAAGCATCTACTGATTTTTAACTACTTCAATGGAAGAAATGTATCAACGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATCCAAGGTACTGTCACCAAACATTGGGGATGAGTATGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCAAATCCTTTATTTTCTT---ATGGATCTATGGTTGTTGAACAGTCCAGAAGC---------------------------AATACAACTCTGATTTCTCTTGTTACTCTGTTTTATAAAA-GGGTCATGGTG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87731492 879 - 132174527 TAGATTCATAATTTTAATGAGACTTGACCTCTATTAATTAGACA-----------------------TTTTAGGTAACTGAAAAGAGCATCCAAATGATGTTTTCTTATGAAAATTTATAATCTTTGATGTATCAAAAAAAGATTGGAAAATTTTCATTATAGCAGAGCTCAAGTAGGGCTGTACATATAACAGCAAATGTTTCCCTAAATTGTATTTCTTGCTTTGTTTTATTTTCTAGTTGATTCTAGAAAGTGA----GGTGCTTCCTTCTATTAATTATAAGATTATAGATTTAGATGCA-CTGTGAACCTGGCTATATAAGCAGATGAAGAGGATGGTCACAAACATGGTGTGATAGAGGCATCAAAAGGTGACTTGAACCCCAAATATCTTTCTCACTGGCTTATCTTGGAATAATGTCC-TAGAGAAAGTTTTGTTTTGTCATTAAGCattttaatttttaaaatttaaGTACTTCTCTGCATTGTCTATGTGAATATCTGATACCTAGTATGAATTATTTTATTGAATAATGTTCCCTGAATGACTTGATAGAACCAGGTACAA-------CATGGATTACATAACTTG------GGACA-CAAAATA-AAATCTTTTC----TTCATATTTTGCCAATAGCAGGTTCTAGAT-AAAAAATAC-----TATAGACAGAAAGCCATCTACTAATTTTTAACTACTCCAGTGGGAGAAATGTATCAGTGTTCTCTGATTTTCTGTTTGTAATACAAGGTACTGTCCCCAAACACT-GGGATGAGTGTGAGTGTAGAGCAGGGGAAAATGGATCTAACAATATCTTAGCAAATCCTTTATTTTCTT---ATGTACCTATGGTTGTTGAAAGGTCCAGAAGC---------------------------AATACAATTCTGGTTTCTCTTATAATTCTTTCTTATGAAA-GGGTCATGGTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46837864 845 - 64190966 TCGATGAAGAATTTTAATGAGAATTTGACCTGTCGAATTCAACA-----------------------TCTTGGATCATGGGAAAGAACATCAGAATGCAACTTCTATATGGAAATTCACAATCCTTGGTATATCCAAAGAAGATTGGAAAATCTCCATTGTATCAGAGCTCAAGTAGGGCTGGACATATGACAGCAATTGGTTTCC-----TGTATTTTTTGCTTTG-----TTTTCCAAATGATGCTAGAGAGGGAGGTAGGTGGTTCCTTCCATTATTAATCAGATTGTAGCATTAGATGCACCTGGGCACCTGAC--TCCAGgcaggtgaagagaatggtcacatatgtggtgtgaccaagacatccaaaatttccttgggccccaaatctctctctcacttgcttatcttgaaatactatatgtactgaaa--tt--tcttggtattaggaatttttctttttggAAT-------------------ATCTGAATAACTATCCGATAACT--------------------------TTCCCTGACTGATTTGAGAGAACCAAGTGCAA-------CATAGACTAGGTAACTAGGACTGAGGACAGAAAAATACAAATTTTGCCTGACTTAATATTTTACCAAGAGCTAGTTCTAGAT-TAAAAATATACTAATCTAGACAGAGAAACATCTACTAATTTTTCACTGCTT---TTTAAAAAA-------------------------TTTGTAATCTGGGATACTCCCACCCAATATTGGGAATGAATGTAAATGTAGAGCAGGAGAAAATGGATAAAACAATATTGTAGTGTAAACTTTATTTCTTTTAAATGAACCTATGGTTGTTGAAAATTCCAAAAGCAGAAGAATTCTAATTTCAAAAAAAAAAAAAAGAATTCTAATTTCCTTTATCATCCTCTTCTATGAAATGGGTCATGGTA i canFam3.chr15 I 350 C 0 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I a score=745718.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 366021 375 + 478999 ---GGCTTTTGTGCATGCCTCCACGATATGGGTCATGGCTCTTGGTCTCTTGTCTTGGTGATTGGTGTCTTTTAATCATTGTCCTACTCATCCCCAGTCTGATGCTTCCCTAAATCTTAAAGATTGAGACTGTTTCTTCTTACCTCATTTTTACAAACTTCCCAATTTCTGTAACCTGGGATAGTAAAGAC---AAAAAATATGAG--CTTTTTCAATCCTTCCTAAATGATTTGTTTCCTAATATATTTATTCACAGTAACTACTAAACTTTGTACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAAAACATTCttccttcgatttgataaattattgagcttctgctatgcagtaaatattgtgttgtggatacaaagatgagtaaga s ponAbe2.chr14 18897905 374 + 108868599 ---GGCTTTTGTGCATGCCTCCATGATATGGGTCATGGCTCTTGGTGTCTTCTCTTGGGGATTAGTGTCTTTTAATCATTGACCTACTCATCCCGAGTCTGATGCTTCCCTAAATCTTAAAGATTGAGACTATTTCTTCTCACCTCATTTTTACAAACTTCCCAATTTCTGTGACCTGGGATAGTAAAGAC---AAAAAATATGAGCTCTTTTTCAATCCTTCCTAAATGATTTATTTCCTAATGTATTTATTCATAGTAACTACTAACCTTTGTACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAAAACATTCTTCCTttgatttgataaattattgagcttctgctatgcagtaagtattgtgttgtggat---aagatgagtaaga i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87982591 378 - 170124641 ---GGCTTTTGTGCATGCCCCCATGATGTGGGTCATGGCCCCTGGTCTCTTCTCTTGGTGATTAGTGTCTTTTAATCATTGTCCTACTCATTCTGAGTCTGATGCTTTCCTATATCTTAAAGACTGAGACTATTTCTTCTTACCTCATTTTTACAAACTTCCCAATTTCTGTGACCTGGGATAGTAAAGAC--AAAAAAATATGAGCTCTTTTTCAATCCTTCCTAAATGGTTTGTTTCCTAATACGTTTATTCATAGTAACTACTAACCTTTGAACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAAAACATTCTTCCTttgatttgataaactattgagcttctgctatgcagtaagtattgtgctgtggttacaaagatgagtaaga i rheMac3.chr7 C 0 I 2 s macFas5.chr7 88260641 378 - 171882078 ---GGCTTTTGTGCATGTCCCCATGATGTGGGTCATGGCCCCTGGTCTCTTCTCTTGGTGATTAGTGTCTTTTAATCATTGTCCTACTCATTCTGAGTCTGATGCTTTCCTATATCTTAAAGACTGAGACTATTTCTTCTTACCTCATTTTTACAAACTTCCCAATTTCTGTGACCTGGGATAGTAAAGAC--AAAAAAATATGAGCTCTTTTTCAATCCTTCCTAAATGGTTTGTTTCCTAATACGTTTATTCGTAGTAACTACTAACCTTTGAACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAAAACATTCTTCCTttgatttgataaactattgagcttctgctatgcagtaagtattgtgctgtggttacaaagatgagtaaga i macFas5.chr7 C 0 I 2 s papAnu2.chr7 85386365 378 - 162156779 ---GGCTTTTGTGCATGCCCCCATGATGTGGGTCATGGCCCTTGGTCTCTTCTCTTGGTGATTAGTGTCTTTTAATCATTGTCCTACTCATTCTGAGTCTGATGCTTTCCTATATTTTAAAGACTGAGACTATTTCTTCTTACCTCATTTTTACAAACTTCCCAATTTCTGTGACCTGGGAtagtaaagac--aaaaaaatatgaGCTCTTTTTCAATCCTTCCTAAATGATTTGTTTCCTAATACGTTTATTCGTAGTAACTACTAACCTTTGAACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAAAACATTCTTCCTTTGATTTGATAAATTATTGAGCTTCTGCTATGCAGTAAGTATTGTGCTGTGgttacaaagatgagtaaga i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s chlSab2.chr29 3548406 378 - 24206276 ---GGCTTTTGTGCATGCCCCCTTGATGTGGGTCATGGCCCTTGGTCTCTTCTCTTGGTGATTAGTGTCTTTTAATCATTGTCCTACTCATTCTGAGTCTGATGCTTCCCTATATCTTAAAGACTGAGACTATTTCTTCTTACCTCATTTTTACAAACTTTCCAATTTCTGTGACCTGGGATACTAAAGAC--AAAAAAATATGAGCTCTTTTTCAATCCTTCCTAAATGATTTGTTTCCTAATACGTTTATTCATAGTAATTACTAACTTGTGAACAACATAGCAATTTGTTGTTTACAATACATTattcctttgatttgataaattattgggcttctgctatgcagtaagtattgtgctgtggttacaaagatgagtaaga i chlSab2.chr29 C 0 I 2 s calJac3.chr10 87732371 370 - 132174527 ---GGCTTTTGCGCATGTTTCCATGATATGGGTCATGACCCTTGGTCTCTT-TTTTGGTGATTAGTATCTTTTAATCATTGTCCTACTCATCCTGAGTCTGATGCTACCCTAAATCTTAAAGATTGAGACTATTTCTTCTTACCTCATCTTTACAAATTTTCCAATCTCTGTGACCTGGGA-AGTAAGG-----AAAAAATATGAGCTCTTTTTCAATCCTTTCTAAATGATTTGTTTCCTAATATATTTATT---AATAACTATTAACCTTTGTAAAATATAGCAAGTTTTTGTTTACAAAACATTCTTCCTttgatttgataaattactgagcttatgctatgcggtaagtattgtgttgtagatacaaagatgagtaagg i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46838709 361 - 64190966 AACCTCTTTTGTACCTG-CTCAGTGATATGGATCATGGCCCTTGGTCTTTTCTTTTGGTGATTAGTGTATTCCAGCTACTGTCCTACTCCTCTTGAGTCTGACGATTCCTTTAAAGATAAAGATT----TTATTTTCTCTTACCTAGTCTCTACAAACTCCCTAACCTCTGTAACCTGGGATAATAAATAAAGACAAGGACATGAGGTTCCTTTCA----TTCCTAAGTGATTTGCTTCCTAACATGTACATTCAGAATACCTGCTAACTGTGGTACAGTATAGCAATTTATAG--TATAAAGCATTCTCCTTTCAGCATCATAAATAAT-----------CACATAGTAATCACTGTGGCATGAGTACAAAGATGAATCAGA i canFam3.chr15 C 0 I 245 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I a score=848376.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 366396 442 + 478999 tatttcctcatcttgagagatct-AGTTTTTTTTTT-ATG------------GTGCACataggcattacatttgattctcagaacaatcttgggagatattattaactctgcattaaattgaataaccaaagaacaaaattcagagaggtttatttccttgcctgagagtactccattgg-taatggtggagctaggcattcgatctagatactccattccagaacttt---tgtccttAGAGGACATTATTCTGTCTATTAAAAGAAATGGAAAGATTA----GCACTTACCACCTCATGTCCAGGTCATTGT---GTTTCTTTCTAGTTTATTGTGAATGCAATTTAAAAGTAGTACAGGAATAAAGAGTTGGAAGAAGTGAACAAAATTCAATGTTCTATCAATAT--AAGACTACTGCCTATACTACCTCATAGAATTTGCTAAAataatttttatgtaatttat s ponAbe2.chr14 18898279 441 + 108868599 tatttcctcatcttgagagacct-AGTTTTTTTTTA-ATG------------GTGCACataggcattacatttgattctcaaaacaatcttgggagatatcattaactctgcattaaattgaataaccaaagaataaaattcagagaggtttatttccttgcctgagagtactccattga-taatggtggagctaggcattcgatctagatactccattccagaacttt---tgtccttAGAGGACATTATTCTGTCTATTAAAAGAAATGGAAAGATTA----GAACTTATCACCTCATGTCCAAGTCATTGT---GTTTCTTTCTAGTTTATTGTGAATGCAATTTAAAAGTACTACAGGAATAAAGAGTTGGAAGAAATGAACAAAATTCCTCGTTCTATCAATAT--GAGTGTACTGCCTATACTACCTCATAGAACTTGCtaaaataatttttatgtaattta- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87982971 448 - 170124641 tatttcctcatcttgagAGATct-agttattttttt-atg------------gtgctcaaaggcattacatttggttctcaaaacaatcttgggagatattactaactctgcattaaactgaatgaccaaataataaaactcagagaggtttatttccttgcctgagagtactccattgg-taatggtggagctgggcattggatctagatattccattccagaacttt---tgtccttaGAGGACATTATTCTGTCTATTAAAAGAAATGGAAAGATTAACATGCACTTATCACCTCATGTCCAGGTCATTGT---GTTTCTTTCTAGTTTACTGTTAATGCAATTTAAAAGTATTACAGAAATAAAGAGTTGGAAGAAACGAACAAAATTCCTTGTTCTATCAATGTAAGAGTGTACTGCCTATACTACCTCATAGATCTTGCGtaaataatttttatataatttat i rheMac3.chr7 I 2 I 14 s macFas5.chr7 88261021 448 - 171882078 tatttcctcatcttgagAGATct-agttattttttt-atg------------gtgctcaaaggcattacatttggttctcaaaacaatcttgggagatattactaactctgcattaaactgaatgaccaaataataaaactcagagaggtttatttccttgcctgagagtactccattgg-taatggtggagctgggcattggatctagatattccattccagaacttt---tgtccttaGAGGACATTATTCTGTCTTTTAAAAGAAATGGAAAGATTAACATGCCCTTATCACCTCATGTCCAGGTCATTGT---GTTTCTTTCTAGTTTACTGTTAATGCAATTTAAAAGTATTACAGAAATAAAGAGTTGGAAGAAACGAACAAAATTCCTTGTTCTATCAATGTAAGAGTGTACTGCCTATACTACCTCATAGATCTTGCGTAAATAATTTTTATATAATTTAT i macFas5.chr7 I 2 C 0 s papAnu2.chr7 85386745 446 - 162156779 TATTTCCTCATCTTGAGAGATCT-AGTTAttttttt-ATG------------GTGCTCAAAGGCATTACATTTGGTTCTCAAAACAATCTTGGGAGATATTATTAACTCTGCATTAAACTGAATGACCAAATAATAAAACTC--AGAGGTTTATTTCCTTGCCTGAGAGTACTCCATTGG-TAATGGTGGAGCTGGGCATTGGATCTAGATATTCCATTCCAGAACTTT---TGTCCTTAGAGGACATTATCCTGTCtattaaaagaaatggaaagattaaCATGCACTTATCACCTCATGTCCAGGTCATtgt---gtttctttctagtttactGTTAATGCAATTTAAAAGTATTACAGAAATAAAGAgttggaagaaaagaacaaaattcctTGTTCTATCAATGTAAGAGTGTACTGCCTATACTACCTCATAGATCTTGcgtaaataatttttatataatttat i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s chlSab2.chr29 3548786 448 - 24206276 tatttcctcatcttgagAGATCT-AGCTATTTTTTT-ATa------------gtgctcaaaggcattacatttggttctcaaaacaatcttgggagatattattaactctgcattaaactgaataaccaaataataaaactcagagaggtttatttccttgcctgagagtactccattgg-taatggtggagctaggcattggatctagatactccattccagaacttt---tgtccttAGAGGACATTATTCTGTCTATTAAAAGAAATGGAAAGATTAGCATGCACTTATCACCTCATGTCCAGGTCATTAT---GTTTCTTTCTAGTTTACTGTTAATGCAATTTAAAAGTATTACAGAAATAAAGAGTTGGAAGAAACGAACAAAATTCCTTGTTCTATCAATGTAAGAGTGTACTGCCTATACTACCTCATAGATCTTGCATAAATAATTTTTATATAATTTTT i chlSab2.chr29 I 2 C 0 s calJac3.chr10 87732741 424 - 132174527 tatttcctcatcttgagATACCT-AGTTGTTTTTTTAATG------------gtgctcataggcattacatttgattctcaaagcaatcttgggagatattattaa-tctgtattagatttaata----------------cagagaagtttatttctttgcctgagagtgctccattgg-taatggtggaggtaggcattggatctagatacttcattccagaacttt---tgtccttAGAGGATATTGTTCTGTATATTAAAAGAAATGGAAAGATTAGCATGCTCTTATCACCTCATGTCCAGA-CATTGT----TTTCCTTCTAGTTTATTATGAATGCAATTTAAAAGTATTACAGGAATAAAGAGTTGGAAGAAAT------AGTTCCTTGTTTTATCAATATAAGAGTGTACTGCCTATACTACCCCCTAGAACTTGCttaaataatttttatgttatttat i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46839315 452 - 64190966 TATCTCATTACTTTCAGGGACTTAAGTCATTTTTTT-ATGAAAGTGTATTTTGTTCTTAAAGAGTTTATattttattctcaaaacaatcttggaaggtattattatcttcatatta-attgaataaacaaagattaaaattc----aagtttgataccttgcctgaagtcactgcactggagagtgacagagttgagcattagatctagatagttcattccagaagtcttcctgcctttaGAGGTTTTAATTTTGTCTCTTAAA--AAATGGAATGATTTTCATCTTCTCATGACGCCATGCCCAGTTCCTTGTCTCCTTCCTCATTAGTTTGTTGTAAATTCAACTTAAAAGCATTATAGAAAGGAAGAGTTGGAAGGTATGCAAAATGTTCCTCATTCTATTTATACAGAAATGTA---TATTTCCTACCTCACAGAATTTGCTTAAGTTTTTTTTATCTT------ i canFam3.chr15 I 245 C 0 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I a score=-2479.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 366838 30 + 478999 -gtattacatactatatatatagtgtatatc---------- s ponAbe2.chr14 18898720 14 + 108868599 ------------taaatata-----tatatC---------- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88261469 20 - 171882078 --------ATActatctatcta---tctatc---------- i macFas5.chr7 C 0 I 10 s papAnu2.chr7 85387191 20 - 162156779 --------atactatctatcta---ttatcc---------- i papAnu2.chr7 C 0 I 26 s chlSab2.chr29 3549234 20 - 24206276 --------ATActatctatcta---tctatc---------- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87733165 20 - 132174527 --------atattatatatgta---tataat---------- i calJac3.chr10 C 0 I 6 s canFam3.chr15 46839767 38 - 64190966 GGAATATGATTCTataaacata---cagacatacacacaca i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I e rheMac3.chr7 87983419 14 - 170124641 I a score=10388.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 366868 56 + 478999 tatatctatctat---atagatagatagata--------cgtagatagatTGA-----TACCTTAAATCTCC s ponAbe2.chr14 18898734 14 + 108868599 ----------------------------------------------------------TACCTTAAATCTCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87983433 30 - 170124641 tctatctatctat---ATC---------------------------------------TACCTTAAATCTCC i rheMac3.chr7 I 14 C 0 s macFas5.chr7 88261499 30 - 171882078 tctatctatctat---ATC---------------------------------------TACCTTAAATCTCC i macFas5.chr7 I 10 C 0 s papAnu2.chr7 85387237 33 - 162156779 tctatctatctatctaatc---------------------------------------tacctTAAATCTCC i papAnu2.chr7 I 26 C 0 s chlSab2.chr29 3549254 28 - 24206276 --tatctatctat---ATC---------------------------------------TACCTTAAATCTCC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87733191 19 - 132174527 -----------at---GTC---------------------------------------TATCTTAAGTCTCT i calJac3.chr10 I 6 C 0 s canFam3.chr15 46839805 66 - 64190966 tatatatatatat---gtaGAGAGAGAGAGAGAATGAGGGGTGGGGAGAGAGAGCTTTTTGTCTGAATC--- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74555433 436 - 124902244 I a score=2961715.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 366924 1035 + 478999 CTTGTTCTGATTTAA--------TTCTTCTTTCTCTAGGTCACTTGATATTCTTGGCTTGATGAAAAAA-AACAAGATTCTAACGTGACAGAACTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTATTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGCCCATGCTCATCTGCTCCAATCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCTCTCTTTCATTGACCTATGCCTAAGCTGTGTTACTCTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGGGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGCCTGGCCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTTTGCTGACAGTTATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGCTACCTTATAAGTCATGAACCCCCAGCTGTGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGGTCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGATGATAGCCAACAGTGGTCTGCTCTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTGTCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCGGCCAGGGCCAGAACAAGTTCCTCTCTACCTGTGCTTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTCATGCCATGTATATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCATGTTTTACACAGTGATGACACCTATGTTGAGCCCCCTCATCTACACACTCAGAAATGCTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAGCTGAGGATAAAACCATGTGACATTCCATTTCCTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT s ponAbe2.chr14 18898748 1035 + 108868599 CTTGTTCTGATTTAA--------TTCTTCTTTCTCTAGGTCACTTGATATTCTTGGCTTGATGAAAAAAGAACAAGATTCTAACGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATCGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGCCCATGCTCACCTGCTCCAACTTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCTCTCTTTCATTGACCTAAGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGGGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGCCTGGCCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTCATGGCCTATGACAGGTAAGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGTTACCTTAC-AGTCATGAACCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGGTCATACGAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAACGAAGTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGATGATAGCCAACAGTAGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCTTCCAGGGCCAGAACAAGGCCCTCTCTACCTGTGCTTTTCATCTGACAGTGGTCAGCCTTATCTTCGTGCCATGCGTATTCATCTATCTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCTTGTTTTACACGGTGATTACGCCTATGTTGAACCCCCTCATCTACACACTCAGAAATACTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAGCTGACAATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCCTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT i ponAbe2.chr14 C 0 I 272 s rheMac3.chr7 87983463 1035 - 170124641 CTTGTTCTGATTTAA--------TTCTTCTTTCTCTAGGTCACTTGATATTCTTGGCTTGATGAAAAAAGAACAAGATTCCAACGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGTCCATGCTCACCTGCTCCAATCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCTCTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGAGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGTCTGACCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAATCCTTTGCGCTACCTTAC-AATCATGAATCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGATCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGATACCTATGTGGTAGAGGTGCTCATGATAGCCAATAGTGGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCCGCCAGGGCCAGAACAAGGTCCTCTCTACCTGTGCCTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTCATGCCATGTATATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCGTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGAACCCCCTCATCTACACACTCAGAAATGCTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAGCTGAGAATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCTTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88261529 1035 - 171882078 CTTGTTCTGATTTAA--------TTCTTCTTTCTCTAGGTCACTTGATATTCTTGGCTTGATGAAAAAAGAACAAGATTCCAACGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGTCCATGCTCACCTGCTCCAATCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCTCTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGAGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGTCTGACCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAATCCTTTGCACTACCTTAC-AATCATGAATCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGATCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTCATGATAGCCAATAGTGGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCCGCCAGGGCCAGAACAAGGTCCTCTCTACCTGTGCCTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTCATGCCATGTATATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGGTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCGTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGAACCCCCTCATCTACACACTCAGAAATGCTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAGCTGAGAATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCTTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85387270 1035 - 162156779 CTTGTTCTGatttaa--------ttcttctttctctagGTCACTTGATATTCTTGGCTTgatgaaaaaagaacaagattccAACGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCttcttactatttttgtttttttacattgcTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGTCCATGCTCACCTGCTGCAATCtcctatgtattattttttaggtCATCTCTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGAGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGTCTGACCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGCTACCTTAC-AGTCATGAATCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGATCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGATGCTGATGATAGCCAACAGTGGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGATCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCCGCCAGGGCCAGAACAAGGCTCTCTCTACCTGTACCTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTCATGCCATGTATATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCGTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGAACCCCCTCATCTACACATTCAGAAATGCTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAGCTGAGAATAAAACCATGTGGCATTCCGTTGCCTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3549282 1035 - 24206276 CTTGTTCTGATTTAA--------TTCTTCTTTCTCTAGGTCACTTGATATTCTTGGCTTAATGAAAAAAGAACAAGATTCCAACGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGTCCATGCTCACCTGCTCCAGTCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCTCTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGAGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGTCTGACCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGCTACCTTAC-AGTCATGAATCCCCAGCTATGCCTTTGGTTAGTTCTTGCCTGCTGGTGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGATCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGATGATAGCCAACAGTGGTCTCCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCCGCCAGGGCCAGAACAAAATCCTCTCTACCTGTGCCTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTCATGCCATGTGTATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGATATTCTCCGTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGAACCCCCTTATCTACACATTCAGAAATGCTGATATGAAGACAGCTATGAAGAAACTGAGAATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCCTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAGAGGTGA-------------------TTTGAAAAACATACTCTTTCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87733210 1035 - 132174527 CTTGATCTGATTTAA--------TTCTTTTTTATCTAGGTCACTTGATATTCTTGGTTTGATGGAAAAAGAACAAGATTCTAATGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCCTCTTCTCGGGAGCTGCAGCTATTTCTTTTCTTACTATTTTTGTTTTTTTACATTGCTATTCTACTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAAGCCAATTCTCACCTGCTCCAGTCTCCTATGTATTATTTTTTATGTCATCTCTCTTTCATTGACTTAAGCCTGAGCTGGGTTACTGTGCCAAAGATGTTAGGGGATTTCCTACAGCAGAGCAAGACCATCTCTTTTTCAGGATGCCTGGCCCAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGGCAGTGAGATGTTTCTGCTGACAGTTATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCACTACGTTAG-AGTCATGAACTCCCAGCTGTGCCTTCGGTTGGTTCTTGTCTGCTGGTGTGGGGGCTTTATCCACTCTATCATGCAGGTCATACTAGTCATCCAGCTGCCTTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGATGACAGCCAACAGTGGTCTGCTGTCTCTCGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATTCTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTTTGCCAGGGCCAGAACAAGGTCCTGTCTACCTGTGCCTCCCACCTGACAGTGGTCAGCCTGATCTTTGTGCCATGTGTATTCATCTATTTGAGACCTTTCTGCAGCTTCGCTGTGGATAAGATATTCTCCGTATTTTACACAGTGATCACACCTATGTTGAACCCCCTCATCTACACACTTAGAAATGCTGATATGAAGATAGCTATGAAGAAGCTGAGAATAAAACCATGTGGCATTTTGTTGCCTTGTTAAAGAATGA--GCA-GAAAAGGTGA-------------------TTTGAAAAGCATACTCTTTCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74555869 1055 - 124902244 CTTAGTCCAGTTTAA--------TTTTTCTTCCACTAGGTCGCTTGATACTCTTGGCTTGGAGAAAAACAAAAACAGCTCTGATGTGTCACGATTTGTGCTTCTGGGCCTGTCGTCTTCCTGGGAGCTCCAGTTGTTTCTCTTCTTCACATTTTTGTTGATTTACCTGGTTATTGTCCTGGGAAATCTTTTGATAGTGATGGTCGTCCAGGCTGATGCTCACCTGTTCCAGTCACCCATGTACTATTTTCTAAGCCATCTGTCTTTCATTGACCTTTGCCTGAGCTGTGTGGCTGTACCCAAAATGCTAGGAGATTTCCTACAGAAGGAGAAGACAATATCTTTTTCAGGATGCCTGGCCCAGGTATTCTTTCTTCACTTTCTTGGAGCCAGTGAGATGTTCCTGTTGACTGTTATGGCCTATGATAGGTATGTTGCCATATGCAACCCTTTGCACTACCTGAC-GGTCATGAATAACCACCTACGACTTCGGTTGGTGTTTGGCTGCTGGTGTGGAGGTTTCATTCACTCTATCACACAGGTCATGATTGTCATTCAGCTGCCTTTTTGTGGTCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCCCAGGTTGTCAAGCTGGCCTGCATGGACACTTACTTGGTTGAGGTGCTGATGGTCTCTAACAGTGGCATACTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCCTGCTCTTCTCCTATGCTCTCATCTTGATTACTCTGAGAACTCACCTCCACCGGGGCCAGAGCAAGGCACTGTCCACCTGTGCTTCTCACTTGACGGTGGTCAGCCTGATCTTTGTACCCTGTGTATTCATTTACTTGAGGCCTTTCTGTACCTTCTCTGTGGATAAAGTAGTCTCTGTGTTTTACACAGTGATCACACCTATGCTGAACCCCCTCATCTATACACTCAGAAATGCAGACATGAAGCAAGCCATAGAAAAGCTGAGAA-AGAAGCAAGTGGCATCCCACTGCTTTGCTAAAGGATGATGATA-GAGAATGTCAAAGTGTGTTAAAGTTATCTTTTCAAAAGAGTATGCTTTCT i mm10.chr14 I 436 C 0 s canFam3.chr15 46839871 1042 - 64190966 TTTCTTCCAATTTGGTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTTAGGTCACTTGATATTCTTGACTTGATGAAAAAAAGCAATGATTCTAAGGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCTATCATCCTCCTGGGAGCTACAGCTGTTTCTCTTCTTCATATTTTTATTGTTTTACATGACTGTTGTTCTGGGAAACCTGTTGATAATGGTAACAGTACGAGCTGATGCTCACCTGCTCCAATCTCCCATGTACTATTTTTTGGGTCATCTGTCTTTCATTGACCTATGCCTGGGCTGTGTTACCGTGCCCAAGATGTTAAGAGATTTTCTACAACGAGGCAAGATCATCTCTTTCTCAGGATGTTTGGCCCAGATCTACTTCCTGCACTTTCTGGGAGCCAGTGAGATGTTTCTGTTGACGGTCATGGCCTATGATAGGTATGTGGCCATATGTAATCCCTTGCACTACCTGAC-AGTCATGAACCGCCAGTTATGCTTTCAGTTGGTTTTTGCCTGTTGGTGTGGGGGTTTCATCCACTCTATCACACAGGTCATGCTGGTGATCCAGCTGCCCTTCTGTGGCCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGACGTCCCTCAGGTCATCAAGCTCGCGTGCATGGATACATATGTAGTAGAGGTGCTCATGGTCTCAAACAGTGGTCTGCTCTCTCTCATCTGTTTCTTGGTCTTGCTGTTCTCTTACGCCATCATCCTGACCACTCTGAGAACTCGCTTCCGCCAGGGCCGGAGCAAGGCACTCTCTACCTGTGCCTCTCACCTAACAGTGGTCAGCCTGATCTTTGTGCCATGTGTATTCATCTACCTGAGACCTTTCTGCAGCTTCTCTGTGGATAAGGTTTTCTCTGTCTTTTACACAGTGATCACACCTATGTTGAACCCTCTTATCTACACACTCAGAAATGCTGACATGAAGACAGCCATGAAAAAGCTAAGAA-AAAAGTATGCAGCATCCTTCTTCCATAGTAAAGGATGA--ACAGGAAGAAGTGA-------------------TTTAGAAAGCATGACCTTCT- i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=405622.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 367959 213 + 478999 TGGAAGA----CTCTTAACTCATCTTGTACAT--------GTCTAAAAACCATTTTGATGACTTTGGTATAAAAAAGAAGATAGCCTAAAGATTATAATAGATCACTCTTGATTACAATTTAAAAGCACAGGTGGCACTCTGGAAAGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGAGAACTCGGGAACTCAGTAGAATTTACTGGCC--ACAAATGATAACAAGCAT s ponAbe2.chr14 18900055 213 + 108868599 TGCAAGA----CTCTCAACTTATCTTGTACAT--------GTGTAAAAACCATTTTGATGTCTTTGGTATAAAAGAGAAGATAGCATAAAGATTATAATGGATCACTCTTGATTACAATTTAAAAGCATAGGTGGCACTCTAGAAAGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGAGAACTCAAGAACTCAGTAGAATTTACTGGCC--ACACATGTTAAAAAGAAT i ponAbe2.chr14 I 272 C 0 s rheMac3.chr7 87984498 213 - 170124641 TGGAAGA----CTCTTAACTCATCTTGTACAT--------GTGTAAAAACCATTTTGATGACTTTGGTATAAAAGAGAAGACAGTATACAGATTATAATGGATCACTCTTGATTACGATTTAAAAGCACAGGTGGCACTCTAGAACGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGGGAGCTCGGGAACTCAGGAGAATTTACTGGCC--ACAAATGATAACAAGCAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88262564 213 - 171882078 TGGAAGA----CTCTTAACTCATCTTGTACAT--------GTGTAAAAACCATTTTGATGACTTTGGTATAAAAGAGAAGACAGTATACAGATTATAATGGATCACTCTTGATTACGATTTAAAAGCACAGGTGGCACTCTAGAACGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGAGAACTCGGGAACTCAGGAGAATTTACTGGCC--ACAAATGATAACAAGCAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85388305 213 - 162156779 TGGAAGA----CTCTTAACTCATCTTGTAAAT--------GTGTAAAAACCATTTTGATGACTTTGGTATAAAAGAGAAGACAGTATACAGATTATAATGGATCACTCTTGATTATGATTCAAAAGCACAGGGGGCACTCTAGAAAGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGAGAACTCGGGAACTCAGGAGAATTTACTGGCC--ACAAATGATAACAAGCAt i papAnu2.chr7 C 0 I 846 s chlSab2.chr29 3550317 213 - 24206276 TGGAAGA----CTCTTAACTCATCTTGTACAT--------GTGTAAAAACCATTTTGATGACTTTGGTATAAAAGAGAAGACAGCATACAGATTATAATGGACCACTCTTGATTACGATTTAAAAGCACAGGTGGCACTCCAGAAAGCCACCTATGCCTTTTGACCATAATCAAGAGAACTCGGGAACTCAGGAGAATTTACTGGCC--ACAAATGATAAAAAGCAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87734245 210 - 132174527 TGGAACA----CTCTTAACTCATCTTATACAT--------GTTTAAAAACCACACTGGCGACTTTGGTATAAAAGAGAAGACAGCATAAAGATTACAATGGATCACTCTTGATTATGGTTTAAAAGCATAGGTGGCACTCTAGAAAGCCACTTATGTCTTTTGACTATG---AGGAGAACTCAGGAACTCAGGAGAATTTACTGTCC--ACAAATGATAACAAGGGA i calJac3.chr10 C 0 I 4 s mm10.chr14 74556924 190 - 124902244 TGAAAGAAATGTTCTTACTTTAATCCATGCAT--------ATGTGAAAGCCACTTTAGAGAC-TTGGTATCAAAGAGAAGACGGCATAAA-ATTATAAAACAGTGCATGCAATAGTAGTTGTGGGACATAGTTGGCTTTC--------------------TTGGGTGTTAACATGAGA---TTGTTACTCAGGAGCATTTACTGGCT-GACAAAGGAT---GTGCAT i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46840913 193 - 64190966 TGGGACA----TTCTTCGCTCATCCTGTACATGGCTATGAGCATGAAAACCAATTTGATGACTCTGGCATAA-----AAGCCAGCATAAAAATTATAATGTGT-GCTGTTGATTGCTACT--GAGGCATAG-TGGCTCTGTTGGGTG------------TTCAATATTAAGCA---------GGGAGGTCAGGAATGTTTATTGTCCCAGGAACTGAGTACCGGGTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=523300.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368172 352 + 478999 TAA-------------------------TTGAAAGATCAACTTTTCTATCTTCATGT-TCTAAGTACTCTTCATTTATTCaatttgttccacttttt-aatctattcaaatgaaacaaga---tat---gtctctttttgtgttcctttcctccagcatttaatgattcctagtgttaggaagttccttctgatg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtgtgaatttc-tttgttctgtta--taacaaagcctgagaagagtaacaacca-cctatgtagtaGTATTTACCTCAGAACTGTGTTCCACAGTGTCCCAAGTTTTAGAAATGTAGTCAGGC----ATCACTCTAATGAACATATGCTCTTAACAAAGTTTATGTGTGAGAG s ponAbe2.chr14 18900268 351 + 108868599 TAA-------------------------TTGAAAGATCAACTTTTCTATCTTTATGCCTCTAAGTACTCTTAATTTATTCAATTTTttccacttttt-aatctattcaaatgaaagaaga---tat---atctcttt--gtgttccgttcctccagcatttaatgattcctagtgttaggaagttccttctgatg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtgtgaatttc-tttgttctgtta--taacaaagccttagaacagtaacaacta-cctatgtagtagtatttacctcagaactgtGTTCCACAGTGTCCCAAGTTTTAGAAATGTAGTCAGGC----ATCACTCTAACGAACATATGCTCTCAACAAAGTTTATGTGTGAGAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87984711 381 - 170124641 TAattgagtcctaggattagaggacaccttgaaagatcaacttttctatctttatgtctctaaatactcttcatttattcaatttgttccactttttaaatctattcaaatgaaagaaga---tat---atctctttttgtgttccgttcctccagcgtttaatgattcctagtgttaggaagttccttctgagg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtgtgaatttc-tttgttctgtta-ttaacaaagcttgagaacagtaacaaccaccctatgtagtaGTATTTACCTTGGAACTATGTTCCATAGTGTCCCAAATTTTAGAAATGCAGTCAGGC----ATCACTCTAATGAACATAGGCTCTTAACAAAGTTTATGTGTGAGAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88262777 381 - 171882078 TAATTGAGTCCTAGGATTAGAGGACACCTTGAAAGATCAACTTTTCTATCTTTATGTCTCTAAATACTCTTCATTTATTCaatttgttccactttttaaatctattcaaatgaaagaaga---tat---atctctttttgtgttccgttcctccagcgtttaatgattcctagtgttaggaagttccttctgagg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtgtgaatttc-tttgttctgtta-ttaacaaagcttgagaacagtaacaaccaccctatgtagtaGTATTTACCTTGGAACTATGTTCCATAGTGTCCCAAATTTTAGAAATGCAGTCAGGC----ATCACTCTAATGAACATAGGCTTTTAACAAAGTTTATGTGTGAGAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3550530 381 - 24206276 TAATTGAGTCCTAGGATTAGAGGACACCTTGAAAGATCAACTTTCCTATCTTTATGTCTCTAAATACTCTTCATTTATTCaatttgttccactttttaaatctattcaaatgaaagaaga---tat---atctctttttgtgttccgttcctccagcgtttaatgattcctagtgttaggaagttccttctgagg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtgtgaatttc-tttgttctgtta-ctaacaaagcctgagaacagtaacaaccaccctatgtagtaGTATTTACCTTGGAACTATGTTCCATAGTGTCCCAAATTTTAGAAATGCAGTCAGGC----ATCACTCTAATGAACATAGGCTCTTAACCAAGTTTATGTGTGAGAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87734459 363 - 132174527 -----------TAGGGTTAGAAGACACCTTGAAAGATCAGCTTT---------ATGTCTTTAAGTACCCTTTATTTCTTCAatttgtttcactttttaattctattaaaatgaaagaaaaaattat---atctctttttgtgttccattccaccagggtttaatgattcctagtgttaggatgttccttctggtg-tctcatcagatcctcttctgaagtagtatgaattta-tttgttctgtta-caaaccaagctgggaaacagtaacaaccaccctgtgtactagtatttacctaggaactgtGTTCCATAATGTCCCAAATCTTAGAAATGTAGTCAAGC----ATCACTATAATAAACATATGCTCTTAACAAAGTTTAT-TGTGAGAG i calJac3.chr10 I 4 I 301 s mm10.chr14 74557114 349 - 124902244 TAATTTCATGACAGGGTCAGAGAATACCTAGAAAGATTAA-TTCTCTACACTTCTGTCTCCAGCATGTTTTCATTTCATTAATTTATCTTATTACTTTGCTTTATTCAAGTGGCAAAAGA---TAT--GATGTCCCTTTGTGTC---TTCCCCGA-----TAACAGTTCCTGCTGTGAGGACACACCTGCTGCTGATATTTTTGTAGTCTCTTTTGAAGAAGTGCTAGCTCC-TTTTCTCCACTCTCCAGCAAAGCCTGAAAACCTTAAAATC---CCACTGCA-CAGTGCTCAAAGGGAATTATTTTTTCACACTG--CCAAATTTTAAAAGCATA------T----ATCAATCTGATAAATGTTTAC--------------ATGTGTGTAGG i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46841106 363 - 64190966 ----------------CAAGAGGACACCTTGAAGGATCAACTCTTCTACCCTT-TGTCTATCACTAGTCTTCATTTACTTATGTcatttcacttttaaattctcttcaaatgaaagaagg---tattcaatctcctttt-tgt-ctgctcctctggtgtc-----acaactagtatcaggaggttccttctgatg-t-tcatcagagtcccctctgaagcagtgtgaatcccttttgtcctgtct-ctaagaaagcctgaaaacagcACTAAGCTTCCTATAGATGAATGTTCACCTAGACACTGTTTTATATATTGTGCCAAATTTTAGAAATGCACTTGAATTCAATTCATTTAAGCGAACA-GTGCTCTTAGAGAAGTTTACATGTGAAGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 85388518 846 - 162156779 I a score=226456.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368524 151 + 478999 AAAGGAAGTCCAGGAGTGCAGGGGTGATGGAAGCTGTTAGTATTCTGTT-------GTAGAGGCTTCTCAAGAAGAGGTACCCAGTTTCACATTGAGTTTTTCTTTGAGTGGAATTACAGTGAGGGTGAATAGGTAAGCTGGCTCTTCAACTGACCAT s ponAbe2.chr14 18900619 151 + 108868599 AAAGGAAGTCCAGGAGTGCCGGGGTGATGGAAGCTGTTAGTATTCTGTT-------GTAGAGGCTTCCCAAGAAGAGGTACCCAGTTTCACACTGAGTTTTTCTTTGAGTGGAGTTACAGTGGGGGTGAATAGATAAGCTGGCTCTTCAGCTGACCAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985092 151 - 170124641 AAAGGAAGTCCAGGAGTGCTGGGGTGATGGAAGCTGTCAGTATTCTGTT-------GTAGAGACTTCTCAAGAAGAGGTACCCAATTTCACATTGAGTTTCTCTTTGAGTGGAATTACAGTGGGGATGAATAGGTAAGCTGGCTCTTCAACTGACCAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263158 151 - 171882078 AAAGGAAGTCCAGGAGTGCTGGGGTGATGGAAGCTGTCAGTATTCTGTT-------GTAGAGGCTTCTCAAGAAGAGGTACCCAATTTCACATTGAGTTTCTCTTTGAGTGGAATTACAGTGGGGATGAATAGGTAAGCTGGCTCTTCAACTGACCAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3550911 151 - 24206276 AAAGGAAGTCCAGGAGTGCTGGGGTGATGGAAGCTGTCAGTATTCTGTT-------GTAGAGGCTTCTCAAGAAGAGGTACCCAATTTTACATTGAGTTTCTCTTTGAGTGGAATTACAGTGGGGGTGAATAGGTAAGCTGGCTCTTCAACTAACCAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735123 150 - 132174527 aaagaaAGTCCAGGAGTGCTGGGGTGATGGAAACTGTTAGTATTTTATT-------GTATAG-CTTCCCAAGAAGAGGTATCGAGTTTCACGTAGAGTTTATCTTTAAATGGAATTACAGTAGGGGCTAGTAGAGAAGCTGAATCTTTGACTGAACAT i calJac3.chr10 I 301 C 0 s mm10.chr14 74557463 115 - 124902244 ----------TAGGAATGCTTGGATGGTGGGAGGTACTAGCTTTCCTTTCTCTACGGTAGAGCCTTCTTTAGAAGCAACATCCTCTTTCACATGGAGTGCAAGTTGATGTGG---------------------------------TTCAGCTAATCAT i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46841469 147 - 64190966 CAAGGGAGCCTGGGAGT-TTTGGGTGATGGAAACCCTCAGTGTCCTGCT-------CTGGGGGCGTCTCTAGAAGAGATAGCT-CTTTGCCCTGGAGTT--GCTTGAAGGGGAGTTACAGCGGGATCAAGTATATAAGCTGGCTCTTCACCTGATCAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 85388518 846 - 162156779 I a score=13944.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368675 5 + 478999 AATGT s ponAbe2.chr14 18900770 5 + 108868599 AATGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985243 5 - 170124641 AATGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263309 5 - 171882078 AATGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389364 5 - 162156779 aatGT i papAnu2.chr7 I 846 C 0 s chlSab2.chr29 3551062 5 - 24206276 AATGT i chlSab2.chr29 C 0 I 18 s calJac3.chr10 87735273 5 - 132174527 AATGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74557578 5 - 124902244 ATTGT i mm10.chr14 C 0 I 7 s canFam3.chr15 46841616 5 - 64190966 AATAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=16915.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368680 17 + 478999 TTAAGAGTTTTAGCCTC------- s ponAbe2.chr14 18900775 17 + 108868599 TTAAGAGTTTTAACCTC------- i ponAbe2.chr14 C 0 I 5 s rheMac3.chr7 87985248 17 - 170124641 TTAAGAATTTTAACCTC------- i rheMac3.chr7 C 0 I 5 s macFas5.chr7 88263314 17 - 171882078 TTAAGAATTTTAACCTC------- i macFas5.chr7 C 0 I 5 s papAnu2.chr7 85389369 17 - 162156779 TTAAGAGTTTTAACCtc------- i papAnu2.chr7 C 0 I 5 s calJac3.chr10 87735278 17 - 132174527 TTAAGAGTTTTAAGCTC------- i calJac3.chr10 C 0 I 5 s mm10.chr14 74557590 7 - 124902244 TAAAGAA----------------- i mm10.chr14 I 7 C 0 s canFam3.chr15 46841621 24 - 64190966 TTTAGAGGTCTGACCAATAAGAGA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3551067 18 - 24206276 I a score=85753.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368697 38 + 478999 GAAAGGAGGAAGAAA-TGAACTGTGGTTGAAAGC-----ACTCA s ponAbe2.chr14 18900797 38 + 108868599 GAACGGAGGAAGAAA-TGAACTGTGGTTGAAAGC-----ACTCA i ponAbe2.chr14 I 5 C 0 s rheMac3.chr7 87985270 38 - 170124641 GAAAGGAGGAAGAAA-TGAACTGTGGTTGAaagc-----actta i rheMac3.chr7 I 5 C 0 s macFas5.chr7 88263336 38 - 171882078 GAAAGGAGGAAGAAA-TGAACTGTGGTTGAAAGC-----ACTTA i macFas5.chr7 I 5 C 0 s papAnu2.chr7 85389391 38 - 162156779 gaaaggaggaagaaa-tgaacTGTGGTTGAAAGC-----ACTTA i papAnu2.chr7 I 5 C 0 s chlSab2.chr29 3551085 38 - 24206276 GAAAGGAGGAAGAAA-TGAACTGTGGTTGAAAGC-----ACTTA i chlSab2.chr29 I 18 C 0 s calJac3.chr10 87735300 39 - 132174527 GAAAGGAGGAAGAAACTGGACTGTGGTCGACAGC-----ACTAG i calJac3.chr10 I 5 C 0 s mm10.chr14 74557597 43 - 124902244 GAGATAGAAGAAAAA-CAAACTGTGTTTTATAGCCCCTTCCCTA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46841645 38 - 64190966 AAAAAGATAAAGAAA-TGAACTATGGTTTAAAGT-----ACTCA i canFam3.chr15 C 0 I 5 a score=47840.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368735 25 + 478999 TTCTT-GAGATGCTCACAGTTATTAC s ponAbe2.chr14 18900835 25 + 108868599 TTTTT-GAGATACtcacagttattac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985308 25 - 170124641 ttctt-gagatgctcacagttattac i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263374 25 - 171882078 TTCTT-GAGATGCTCACAGTTATTAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389429 25 - 162156779 TTCTT-GAAATGCTCACAGTTATTAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551123 25 - 24206276 TTCTT-GAGATGCtcacagttattac i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735339 26 - 132174527 TTCTTGGGGATGttcacatttattac i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74557640 24 - 124902244 CTTTT-GAGGTACTTA-AGTTATGAC i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46841683 5 - 64190966 I a score=143392.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368760 68 + 478999 CTCTGAGTCTCAAACATG-TTTGAGGAATAAAT----TTACCTAACTTCATTTTTG-AA-AATAAACTCTGA---GTT s ponAbe2.chr14 18900860 69 + 108868599 ctctgagtctcaaacatgctttgaggaataaat----ttacctaacttcatttttg-ag-aatgaactcaga---gtt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985333 73 - 170124641 ctctgagtctcaaacatgctttgaggaataaataatgttacctaacttcatttttg-ag-aatgaactcaga---gtt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263399 73 - 171882078 CTCTGAGTCTCAAACATGCTTTGAGGAATAAATAATGTTACCTAACTTCATTTTTG-AG-AATGAACTCAGA---GTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389454 70 - 162156779 CTCTGAGTCTCAAACATGCTTTGAGGAATA---AATGTTACCTAACTTCATTTTTG-AG-AATGAACTcaga---gtt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551148 73 - 24206276 ctctgagtctcaaacatgctttgaggaataaataatattacctaacttcatttttg-ag-aatgaactcaga---gtt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735365 73 - 132174527 ttttgagtctc-aacatgtattgaggaacagataatattactaaactccatttttgaag-aatggactcaaa---gtt i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74557664 76 - 124902244 CTCTGAATTACAAAGATGCTTTGAGTCACAGGCAGTATTGTTT-ACTTCATTTCTT-AGAAATGATTTCAGGGCTGTT i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46841688 73 - 64190966 CTCTAAGTCTCTACGGTACTTTAAGAAGTAGGTAATATTATTCAGCTTCACTTTTA-CA-AATGAATTCAGA---ttt i canFam3.chr15 I 5 I 353 a score=69083.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368828 41 + 478999 AAGTGACTTGCCCATGACCACTTAGAAAA-AATGTAATCAAT s ponAbe2.chr14 18900929 41 + 108868599 aagtgacttacccatgaccacttagAAAA-AATGCAGTCAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985406 41 - 170124641 aagtgacttgccaacgaccacctagAAAA-AACGTAATCAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263472 41 - 171882078 AAGTGACTTGCCAACGACCACCTAGAAAA-AACGTAATCAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389524 41 - 162156779 aagtgacttgccaacGACCACCTAGAAAA-AATGTAATCAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551221 41 - 24206276 aagtgacttgccaacgaccacctagAAAA-AATGTAATCAAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735438 38 - 132174527 -agtgacttgccc-CAACCACTTAGAAAA-AAGGTA-TCATC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74557740 42 - 124902244 AAATAACTTGCTTGATACTAGTTACAAAATAGCATAATCAAT i mm10.chr14 C 0 I 1506 e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I a score=30239.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368869 22 + 478999 CAAGAAAGCTgcttgtaatccc s ponAbe2.chr14 18900970 22 + 108868599 CAAGAAAGCTATTtataatccc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985447 22 - 170124641 CAATAAAGCTgcttgtaatccc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263513 22 - 171882078 CAATAAAGCTgcttgtaatccc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389565 22 - 162156779 CAATAAagctgcttgtaatccc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551262 22 - 24206276 CAATAAAGCTgcttgtaatccc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735476 17 - 132174527 CAGGAAGG-----TATAATTCC i calJac3.chr10 C 0 I 224 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I a score=276646.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 368891 224 + 478999 agcactttgggaggccaaggagttcagatcatctgaagtcaggagtttgagaccagcttgaccaacatggagaaaccccatctctactaaaaatacaaaattagccgtgcatggtggcacatgcctgtaatcctgtaatcccagctactcaggaaggctgagtcaggagaatcacttgaacccgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcgcaccactgca s ponAbe2.chr14 18900992 216 + 108868599 agcactttgggaggccagggtgggcagatcatctgaagtcaggagtttgagaccagcttgaccaacatggagaaaccccatctctactgaaaatacaaaattagccgggcgtggtggtgcatg--------tctgtaatcccagctactcaggaaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcaaaggttgcagcgagctgagatcacaccactgca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985469 216 - 170124641 agcactttgggaggccgaggtgggcagatcgtctaaagtcaggagttcgagacccgcttgaccaacatggagaaactccatctctactaaaaatacaaaattaactgggtgtggtggcacgtg--------cctgtaatcccagctactcaggaaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggcagaagttgtagtgagctgagatcacaccactgca i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263535 216 - 171882078 agcactttgggaggccgaggtgggcagatcgtctaaagtcgggagttcgagaccagcttgaccaacatggagaaactccatctctactaaaaatacaaaattaactgggtgtggtggcacgtg--------cctgtaatcccagctactcaggaaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggcagaagttgtagtgagctgagatcacaccactgca i macFas5.chr7 C 0 I 121 s papAnu2.chr7 85389587 215 - 162156779 agcactttgggaggccgaggt-ggcagatcGTCtaaagtcgggagttcgagaccagcttgaccaacatggagaaactccatctctactaaaaatacaaaattaactgggtgtggtggcacatg--------cctgtaatcccagctactcaggaaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaagttgcagtgagctgagatcacaccactgca i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551284 216 - 24206276 agcactttgggaggccgaggtgggcggatcgtctaaagttgggagttcgagaccagcttgaccaacatggagaaactccatctctactaaaaatacaaaattaactgggtgtggtggcacgtg--------cctgtaatcccagctactcaggaaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaagttgcagtgagctgagatcacaccactgca i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I e calJac3.chr10 87735493 224 - 132174527 I a score=47324.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369115 37 + 478999 ctgcagcttgggcaacaagagcaaaactcggtctcaa s ponAbe2.chr14 18901208 37 + 108868599 ctccagcctgggcaacaagagcaaaactcggtctcaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985685 37 - 170124641 ctccagcctgggcaacaagagcaaaactctgtctcaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263872 37 - 171882078 ctccagcctgggcaacaagagcaaaactctgtctcaa i macFas5.chr7 I 121 C 0 s papAnu2.chr7 85389802 37 - 162156779 ctccagcctgggcaacaggagcaaaactctgtttcaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551500 37 - 24206276 ctccagcctgggcaacaagagaaaaactctgtctcaa i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I e calJac3.chr10 87735493 224 - 132174527 I a score=165667.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369152 124 + 478999 agaaaaaaaataa------aagaaaGCTAATAATTATATAATTAAGTTAATATTTTATTTCTCCTCAGAAAGTGTATTTATCCCAATTATACAGATTGCttctttctttc--tctttct-ttctgtgtctctt s ponAbe2.chr14 18901245 126 + 108868599 aaaaaaaaaaaaa------aagaaaGCTAGtaattatataattaagttaatattttatttCTCCCCAGAAAGAGTATTTATGCCAATTATACAGATTGCTTCGttctttctttctttct-ttccttctttctt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87985722 121 - 170124641 agaaaaaga--aa------aagaaaGGTTATAATTACATAATGAAGTTAATATTTTATTTCTCCTCAGAAAGAGTATTTATCCCAATTATACAGAt---ttctctttttctttctttct-ttatttctgtctg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88263909 121 - 171882078 agaaaaaga--aa------aagaaaGGTTATAATTACATAATGAAGTTAATATTTTATTTCTCCTCAGAAAGAGTATTTATCCCAATTATACAGAt---ttctctttttctttctttct-ttatttctgtctg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389839 121 - 162156779 agaaaaaga--aa------aagaaaggtaataattatataatgaagttaatattttatttctcctcagAAAGAGTATTTATCCCAATTAtacagat---ttctctttttctttctttct-ttctttatttctg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551537 121 - 24206276 agaaaaaga--aa------aagaaaGCTAATAATTATATAATGAAGTTAATATTTTATTTCTCCTCAGAAAGAGTATTTATCCCAATTATACAGAt---ttctctctttctttctttct-ttctttctttctt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87735717 123 - 132174527 agAAAAAAAGTAATCAATCAAGAAAGGtaataattacataa-----ttaatattttatttCTCCTCAGGAAGAGTATTTATCCCAATTATACAGAT---TGATTGCTTTGCTCCGTTCTGTTCTGtccctt-- i calJac3.chr10 I 224 I 779 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I a score=11983.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369276 8 + 478999 tctctctt s ponAbe2.chr14 18901371 8 + 108868599 tctttctt i ponAbe2.chr14 C 0 I 304 s rheMac3.chr7 87985843 8 - 170124641 tctttctt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264030 8 - 171882078 tctttctt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389960 8 - 162156779 tctgtctt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551658 8 - 24206276 tctttctt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87736619 8 - 132174527 cctccctt i calJac3.chr10 I 779 C 0 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I a score=499976.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369284 324 + 478999 tcttccttcc----------------------tttcttctttct--c----------------------------------tttctttctttttttttttttttgagacagagtcttactcttgtctcccaggctggagtgcagtggcatgattttggctcactgcaacctctgcctcccaggttcaagtgatcctcctgcctcagccttctaagtagctgggattacaggcaccggccaccatgcctggctagtttttgtatttttagtagagacagggtctctccgtgttggccaggctggtcttgaac-------------tcctaacctcaggtgatgtgcctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccacgacacc s ponAbe2.chr14 18901683 326 + 108868599 tctttctttc----------------------tttcttctttcttac----------------------------------tttctttcttcttttttttttttgagacagagtctcactcttgtctcccaggctggagtgaagtggcatgatcttggctcactgaaacctccgcctcccaggttcaagtgatcctcttgcctcagcctcccaagtagctgggattgcaggtgctggccaccatgcctggctaatttttgtatttttagtaaagacggggtttttccatgttggccaggctggtcttgaac-------------tcctgacctcaggtcatctgcctgcctcagcctctcaaactgctgggattacaggcatgagccatgacacc i ponAbe2.chr14 I 304 C 0 s rheMac3.chr7 87985851 311 - 170124641 tttttctttc-----------------------------------------------------------------------tttttttttttttttctttttttaagacagaatctcactcttgtctcccaggttggagtgcagtggcacgatcttggctcactacaacctccgcctcccaggttcaactgatcctcctacttcagcctcccaagtagctgagattacaggcaccggccaccatgcctggctgatttttgtgtttttagtagagacggggtttctccatgttggtcaggctggtcttgaac-------------tcctgacctcaggtgatctgcctgcctcggcctcccaaaatgctgggattacaggcgtgagccaccacacc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264038 354 - 171882078 tctttctttc----------------------ttttttctttct--cttcttttctttcttt----ctttctctcATGTCttttttttttttttttctttttttaagacagaatctcactcttgtctcccaggttggagtgcagtggcacgatcttggctcactacaacctccgcctcccaggttcaactgatcctcctacttcagcctcccaagtagctgagattacaggcaccggccaccatgcctggctgatttttgtgtttttagtagagacggggtttctccatgttggtcaggctgttcttgaac-------------tcctgacctcaggtgatctgcctgcctcggcctcccaaaatgctgggattacaggcgtgagccaccacacc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85389968 356 - 162156779 tctttctttc----------------------ttttttctttct--cttcttttctttctttcttgctttctctcatgt--cttttttttttttttctttttttaagacggaatctcactcttgtctcccaggttggagtgcagtggcacgatcttggctcactacaacctccgcctcccaggttcaactgatcctcctgcttcagcctcccaagtagctgagattacaggcaccggccaccatgcctggctgatttttgtgtttttagtagagacggggtttctccatgttggtcaggctggtcttgaac-------------tcctgacctcaggtgatctgcctgcctcggcctcccaaaatgctgggattacaggcgtgagccaccacacc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3551666 374 - 24206276 tctttctttctttctttctttgtctttctttcttttttctttct--cttcttttctttcttt-----tttctctcgtgtc-tttttttctttctttctttttttaagacagaatctcactcttgtctcccaggttggagtacagtggcacgatcttggctcactacaacctccgcctcccaggttcaactgatcctcctgcttcagcctcccaagtagctgagattacaggcaccggccaccatgcctggctgatttttgtgtttttagtagagacgggatttctccatgttggtcaggctggtcttgaac-------------tcctgacctcaggtgatctgcctgcctcggcctcccaaaatgctgggattacagacgtgagccaccacacc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87736627 338 - 132174527 ccttccttcc----------------------ttccttccttccttc----------------------------------cttccttccttccttccttccttcTgacagagtctcattcttgtctcccaggctggagtacactggtgtgatcccggctcactgcaacctccgtcttccaggttcaagtggtcctcctgcctgagccacccaagtagctaggattacatgtgcccaccaccatgccc-actaatttttatatttttagtagagatggcacttctccatgttggccagacttgtcttgaaccagtctgaactggtcttgaccacaggtgatcttcctgccttggcttccaaaagtgctgggattacaggcatgaactactgtgcc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I e canFam3.chr15 46841761 353 - 64190966 I a score=9042.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369608 5 + 478999 tggcT s ponAbe2.chr14 18902009 5 + 108868599 tggcc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986162 5 - 170124641 cggcc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264392 5 - 171882078 cggcc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390324 5 - 162156779 cggcc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552040 5 - 24206276 cggcc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87736965 5 - 132174527 aggcc i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46842114 5 - 64190966 TGACC i canFam3.chr15 I 353 C 0 e mm10.chr14 74557782 1506 - 124902244 I a score=180507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369613 79 + 478999 AGATTACTTAATTTCTATAATACCTGTATAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAACATTTAT s ponAbe2.chr14 18902014 79 + 108868599 AGATTATTTAATTTCTATGATACCTGTATAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAGCATTTAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986167 79 - 170124641 AGATTACTTAATTTCTATAATACCTGTGTAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAACATTTAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264397 79 - 171882078 AGATTACTTAATTTCTATAATACCTGTGTAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAACATTTAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390329 79 - 162156779 agattACTTAATTTCTATAATACCTGTGTAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAACATTTAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552045 79 - 24206276 AGATTACTTAATTTCTATAATACCTGTGTAGGAGCTTCAGAGCTGGAAGATCCCTAAAAAGGTTAACTT-AAACATTTAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87736970 80 - 132174527 AGATTACTTAATTTCTATAATACCTGTATAGGAGCTTCGGAGCTGTAAGATTCCTAAAAAGGTTAACTTAAAACATTTAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74559288 79 - 124902244 AAATTACTTGATTTCTATAGAATCATTTCAGAAGTTTCAAATCTATGAGTTACCTACAAATTTTCACTC-TAAACTTCAT i mm10.chr14 I 1506 I 227 s canFam3.chr15 46842119 78 - 64190966 TAATTGCATATTTTCTACTTTATCTATCGAGGAGCTCCAGAGCTAGGAGATCACTAAAAGCATGCACAC--AATGTTAGT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=10842.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369692 5 + 478999 ATTTA s ponAbe2.chr14 18902093 5 + 108868599 ATTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986246 5 - 170124641 GTTTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264476 5 - 171882078 GTTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390408 5 - 162156779 GTTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552124 5 - 24206276 GTTTA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87737050 5 - 132174527 ATTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46842197 5 - 64190966 ATTTA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74559367 227 - 124902244 I a score=169776.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369697 106 + 478999 AGATTATCTATCTCTGACAT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGCTATGAAAA-GTCTTTATTCTATTTACTATATAATAAGATAATGACAAATTTTT-ATAATGTTTT s ponAbe2.chr14 18902098 107 + 108868599 AGATTATCGATCTATGACAT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGCTATGAAAATGTCTTTATTCTATTTACTATATAATGAGATAATGACAAACTTTT-ACAATGTTTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986251 104 - 170124641 AGATTATCTATCTCTGATGT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGCTGTGAAAATGTCTTTATTCTATTTACTGTATA---AGATAATAACAAACTTTTAACAATG-TTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264481 104 - 171882078 AGATTATCTATCTCTGATGT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGCTGTGAAAATGTCTTTATTCTATTTACTGTATA---AGATAGTAACAAACTTTTAACAATG-TTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390413 104 - 162156779 AGATTATCTATCTCTGATGT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGctgtgaaaatgtctttattctattTACTATATA---AGATAATAACAAACTTTTaacaatg-ttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552129 104 - 24206276 AGATTATCTGTCTCTGATGT-AGGATCCTTGCAAT-ATTTTATGGCTATGAAAATGTCCTTATTCTATTTACTATATA---AGATAATAACAAACTTTTAACAATG-TTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87737055 72 - 132174527 AGGTTATCTATCTCTGACAT-AGGATCCTTGCAAC-ATTTCAT------------Gtttttatttt------tatttg-----------------tttttattttg-ttt i calJac3.chr10 C 0 I 1 s mm10.chr14 74559594 105 - 124902244 AGTTTGTTTAGTTCTGGCAC-AAAGTTCCTTTAGTCCTTTTCTGCATATGGGAGGGCATTTATTCAATTCACTAAATA---ATATAATGATAAACCTTTAGTAAAA-TAT i mm10.chr14 I 227 C 0 s canFam3.chr15 46842202 108 - 64190966 AGGTTATCTATTTCTGACAGAAGGATTTCTGCAAC-TTCTTATGTCTATGGGCAGGTGTTAATTCTGTTCAGTAAGTAATTATATAATGATGGGATTTTAGTGGCA-TTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=139838.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369803 89 + 478999 TTATATTTTGTCACTTTATCTCCTAATGAATTGCCATAGAGAGGTATTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ATACTTGTGAAAAAAA-GTC s ponAbe2.chr14 18902205 90 + 108868599 TTATATTTTGTCACTTTATCTCCTAATGAATTGCCACAGAGAGGCTTTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ATACCTTTGAATAAAATGTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986355 90 - 170124641 TTACATTTTGTCACTTTATCTCCTAATTAATTGACATAGAGAGGCTTTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ACACCTCTGAAAAAAATGTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264585 90 - 171882078 TTACATTTTGTCACTTTATCTCCTAATTAATTGACATAGAGAGGTTTTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ACACCTCTGAAAAAAATGTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390517 90 - 162156779 ttatattttgtcactTTATCTCCTAATTAATTGACATAGAGAGGCTTTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ACACCTCTGaaaaaaaTGTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552233 90 - 24206276 TTATATTTTGTCACTTTATCTCCTAATTAATTGACATAGAGAGGCTTTTATGATTACTT-AGCTGAAAAAT----ACACCTCTGAAAAAAATGTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s mm10.chr14 74559699 94 - 124902244 TTATATTTTCTTACCTTAAATTC-AATCAATATTAATAAAGAGGATTTGATCATTGCCTAAGCTTTCATATTTACATATCTTAGGAGGAAAGGTC i mm10.chr14 C 0 I 75 s canFam3.chr15 46842310 88 - 64190966 TTATATACGTTCAC-TTATTTTCTAATCAGTTGTAATGGAGAGGCCTTTTAAAGTAGTC-AGCTGAAAAAT----A-ACTCAGGACAAAAGTATC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e calJac3.chr10 87737127 1 - 132174527 I a score=66696.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369892 44 + 478999 TGAAACTCCATCTAATACTAGGATATACT-GGAAAATGCCAATAA s ponAbe2.chr14 18902295 44 + 108868599 TGAAACTCCATCTAATACTAGGATATACT-GGAAAATTGCAATAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986445 44 - 170124641 TGAAACTCCATCTAATCCTAGGATATACT-GGAAAATTGCGATAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264675 44 - 171882078 TGAAACTCCATCTAATCCTAGGATATACT-GGAAAATTGCGATAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390607 44 - 162156779 TGAAACTCCATCTAATCCTAGGATATACT-GGAAAATTGCGATAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552323 44 - 24206276 TGAAACTCCATCTAATCCTAGGATATACT-GGAAAATTGCGATAC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46842398 45 - 64190966 TGAAACTCCACCTAATATTAGGATTTACTCTTAAAATCCCAAAAG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74559793 75 - 124902244 I e calJac3.chr10 87737127 1 - 132174527 I a score=35635.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369936 20 + 478999 CCCTGGTCATGT----AAGAGCTT s ponAbe2.chr14 18902339 20 + 108868599 CCCTGGTCATGT----AAGAGCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986489 20 - 170124641 CCCTAGCCTTGT----AAGAGCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264719 20 - 171882078 CCCTAGCCTTGT----AAGAGCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390651 20 - 162156779 CCCTAGCCTTGT----AAGAGCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552367 20 - 24206276 CCCTAGCCGTGT----AAGAGCTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s mm10.chr14 74559868 24 - 124902244 TCCCAGTCATATTATAAAAAGCTT i mm10.chr14 I 75 C 0 s canFam3.chr15 46842443 18 - 64190966 --CTGGTCCCGT----AAGAGCTT i canFam3.chr15 C 0 I 148 e calJac3.chr10 87737127 1 - 132174527 I a score=25146.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369956 20 + 478999 TCTTGATATAGGGACAAAAA- s ponAbe2.chr14 18902359 20 + 108868599 TCTTGATATAGGGACAAAAG- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986509 20 - 170124641 TCTTGATATAGGGACAAAAA- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264739 20 - 171882078 TCTTGATATAGGGACAAAAA- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390671 20 - 162156779 TCTTGATATAGggacaaaaa- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552387 20 - 24206276 TCTTGATATAGGGACAAAAA- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s mm10.chr14 74559892 15 - 124902244 TT------TAGTGTCAGAAAA i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46842461 148 - 64190966 I e calJac3.chr10 87737127 1 - 132174527 I a score=375069.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 369976 215 + 478999 ATATATTTT---TATTTTTGTGTTGGGAGTTAATGACTTCATATTTAAGAAGCCAtatgtacgtatgtatatatg-----------------tatatatTGCTACAGAAGGACTCCTCACAGACTAGGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGTATGGGTGAGG-GTGAGAATGGCATACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTTCTTTTTTGCTTTACTCTGCTCTACACTTTT s ponAbe2.chr14 18902379 215 + 108868599 ATGAATTTT---TATTTTTGTGTTGGAAGTTAATGACTTTATATTTAAGAAGCCATACGTATGTATGTGTATATG-----------------TATATATTGCTACAGAAGGACTCCTCACAGACTAGGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGTATGGGTGAGG-GTGAGAATGGCATACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTTCTCTTTAGCTTCACTCTACTCAACATTTTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986529 210 - 170124641 ATGTATTTT---TATTTTTGTGTTGGGAGTTAATGACTTTATATTTAAGAAGCCAtatgtatgtatgtgtatatg-----------------tatatatTGCTACAGAAGGACTCCTCACAGACTAGGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGCATGGGTGAGG-GTGAGAATGAAACACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTCCTCTTTCGCTTCA-----CTCAACATTTTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264759 210 - 171882078 ATGTATTTT---TATTTTTGTGTTGGGAGTTAATGACTTTATATTTAAGAAGCCAtatgtatgtatgtgtatatg-----------------tatatatTGCTACAGAAGGACTCCTCACAGACTAGGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGCATGGGTGAGG-GTGAGAATGAAACACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTCCTCTTTCGCTTCA-----CTCAACATTTTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390691 210 - 162156779 atgtatttt---tatttttgtgttgggAGTTAATGACTTTATATTTAAGAAgccatatgtatgtatgtgtatatg-----------------tatatattgctaCAGAAGGACTCCTCACAGACTAGGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGCATGGGTGAGG-GTGAGAATGAAACACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTCCTCTTTCGCTTCA-----CTCAACATTTTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552407 210 - 24206276 ATGTATTTT---TATTTTTGTGTTGGGAGTTAATGACTTTATATTTAAGAAGCCAtatgtatgtatgtgtatatg-----------------catatatTGCTACAGAAGGACTCCTCACAGACTACGAACTAGGCTGCCATTTGGGAGATTTCTAAATAGCATGGGTGAGG-GTGAGAATGGCATACC------------------T-------GGAACATCATGTTCTCCTCTTTCGCTTCA-----CTCAACATTTTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87737128 237 - 132174527 atttatttt---tatttttGTGTTGGTAGTTAATGACTTTATATTTAAGAGGCCAtatgtatgtatgtatgtatgt-------------atatatatatTGCTACAGAAGGACTCCACAAAGGCTAGGAACTAGGCTGCTATTTGGGGGACTCTTAAATAGTATGAGTAAGG-GTGAGAATGGCATATCTCACCTGATGGTACATGAT-------GGTACATCATGTTCTCCTCTTTTGCATCACTCTACTCAGCATTTTC i calJac3.chr10 I 1 C 0 s mm10.chr14 74559907 227 - 124902244 GTACATTTTCCACATTTTGTCCTTGAGA---------TTTATACTTAAGAAAGTGTTTGTGTATATATGAATGTACCCATACATTATGAATATATGCACTGCTGTGGAAAGACTTTTCACACAACAGAAACAAAG-------TTGTAAGATTTGCAAGAAGGGTGATTGAGGTAGGAGAATAGTGCCCC------------------TATGACTAAAAACcctttcctctcctcctctcctctcctctcctctcctctcct i mm10.chr14 C 0 I 15102 e canFam3.chr15 46842461 148 - 64190966 I a score=207542.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 370191 132 + 478999 AGAG---TTTTTT-GCATACGTTGAATATCCTGAAGAGCAGTATGATATCCTGAAGGTAATATTTTGAATATCCTGAAGTGCAGGAAACTGCCCGAGAGTAGTGGGTGAGTTACCAGAAAGATTTGAGTGGTGCTA s ponAbe2.chr14 18902594 132 + 108868599 AGAG---TTTTTTTGCATACGATGAATACCCTGAAGAGCAGTATGATATCCCGAAGATAATATTTTGAATATCCTGAAGTGCAGGAAACTGCCCAAGAGTACTGTGTGAGTTAC-AGAAAGATTTGAGTGGTGCTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986739 132 - 170124641 AGAG---TTTTTT-GCATACAATGAATATCCCGAAAAGCAGTATGATATCCCAAAGATAGTATTTTGAACATCCTGAAGAGCTGGAAACTGCCCGAGAGTAGCGTGTGAGTTAACAGAAAGGTTTGAGTGGTGCTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88264969 132 - 171882078 AGAG---TTTTTT-GCATACAATGAATATCCCGAAAAGCAGTATGATATCCCAAAGATAGTATTTTGAACATCCTGAAGAGCTGGAAACTGCCCGAGAGTAGCGTGTGAGTTAACAGAAAGGTTTGAGTGGTGCTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85390901 132 - 162156779 AGAG---TTTTTT-GCATACAATGAATATCCCGAAGAGCAGTATGATATCCCAAAGATAGTATTTTGAACATCCTGAAGAGCTGGAAACTGCCCGAGAGTAGTGTGTGAGTTAACAGAAAGGTTTGAGTGGTGCTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552617 135 - 24206276 AGAGTTTTTTTTT-GCATACAATGAATATCCTGAAGAGCAGTATGATATCCCAAAGATAGTATTTTGAACATCCTGAAGAGCTGGAAACTGCCCGAGAGTAGTGTGTGAGTTAACAGAAAGGTTTGACTGGTGCTA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87737365 131 - 132174527 AGAG---TCCTTT-GCACATGATGAATATCCTGAGGAGCAGTATGATATTCTGAAGATAGCAGTATGATATTCCTGAAGTGCAGGAAACTG-CTGGGGGTAGTGTGTGAGTTAACAGAAAGATTTGAGTGGTTCTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842461 148 - 64190966 I a score=266728.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 370323 136 + 478999 GGGATTACCAGGCATGTTTCAAGAACATAGAGCTCCAGGCTTTCTCTTAGTATAAGCCGGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGCTC-TCTTTCATAGCAAAATGTATAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG s ponAbe2.chr14 18902726 134 + 108868599 GGGATTAGCAGGCATGTTTCAAGGACATAG--CTCCAGGCTTTCTCTTAGTATAAGCTGGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGTTC-TCTTTCATAgcaaaatgtatagtcgtgacaaatcattttaaatgtccag i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87986871 137 - 170124641 GGGATTACCAAGCATGTTTCAAGGACATAGAGCTCCAGGCGTTCTCTTAGTATAAGCCGGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGTTCTTCTTTCATAGCAAAATGTATAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88265101 137 - 171882078 GGGATTACCAGGCATGTTTCAAGGACATAGAGCTCCAGGCGTTCTCTTAGTATAAGCCGGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGTTCTTCTTTCATAGCAAAATGTATAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85391033 137 - 162156779 GGGATTACCAGGCATGTTTCAAGGACATAGAGCTCCAGGCGTTCTCTTAGTATAAGCCGGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGTTCTTCTTTCATAGCAAAATGTATAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552752 137 - 24206276 GGGATTACCAGGCATGTTTCAAGGACATAGAGCTCCAGGGGTTCTCTTAGTATAAGCCAGCTGCAACATCCCCTTTTTCTGATGTTCTTCTTTCATAGCAAAATGTATAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87737496 137 - 132174527 TGGATTACTAGGCATGTTTCGAGGACATAGAGCTCCAGCCTTTCTCTTAGTATAAGCTGGCTACAACATCCCCTTTTTCTGATGTTCCTCTGTAATAGCAAACTTTAGAGTCTTGGCAAATCATTTTAAATGTCCTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46842609 129 - 64190966 GGGGTCAGCAGGCAC-CTGCAGGGACCGGAAGCTCCCA-----CTCTGTACATTCGTGGGCTGCAACAT-CCCTTTCTCTAACGTTCCTCTTTCTTAGCAAAATTAAGTGTCTTGG-GAATCATTTGGATTGtgctg i canFam3.chr15 I 148 T 32655 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=143448.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 370459 77 + 478999 TTGATAGCTGGAATTGGTAGCGTTATTTTAAGAAAAGCAAGAGCGTTTTGTATTCCCTTTTGCATTTTCAAGTCTCT s ponAbe2.chr14 18902860 77 + 108868599 ttgacagctggaattggtagcattattttaagaaaagcaatagctttttgtattcccttttgcattttcaagtctct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87987008 77 - 170124641 TTGATAGCTGGAATTGGTAGCATTATTTTAAGAAAAGCAAGAGCTTTTTGTATTCCCTTCTGCATTTTCAAGTCTCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88265238 77 - 171882078 TTGATAGCTGGAATTGGTAGCATTATTTTAAGAAAAGCAAGAGCTTTTTGTATTCCCTTCTGCATTTTCAAGTCTCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85391170 77 - 162156779 TTGATAGCTGGAATTGGTagcattattttaagaaaagcaaGAGCTTTTTGTATTCCCTTCTGCATTTTCAAGTCTCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3552889 77 - 24206276 TTGATAGCTGGAATTGGTAGCATTATTTTAAGAAAAGCAAGAGCTTTTTGTATTCCCTTCTGCATTTTCAAGTCTCT i chlSab2.chr29 C 0 I 4268 s calJac3.chr10 87737633 77 - 132174527 TTGATAACTGAAATTGGTAGCATCATTTTAAGAAAAGCAAGAGCTTTTTGTATTCCCCTTTGCATTTTCAAGTCTCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T a score=11190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 370536 8 + 478999 CTTTGTtt s ponAbe2.chr14 18902937 8 + 108868599 cTTTGTtt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87987085 8 - 170124641 CTTTGTTT i rheMac3.chr7 C 0 I 4228 s macFas5.chr7 88265315 8 - 171882078 CTTTGTTT i macFas5.chr7 C 0 I 2765 s papAnu2.chr7 85391247 8 - 162156779 CTTTGTTT i papAnu2.chr7 C 0 I 2757 s calJac3.chr10 87737710 8 - 132174527 CTTTGTTT i calJac3.chr10 C 0 I 663 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T e chlSab2.chr29 3552966 4268 - 24206276 I a score=713971.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 370544 1622 + 478999 ccaggaacaaagcctacttgatcgtggtgaattaacttactgatgtgccgctgaatttggtttgctagtattgtgttgaggatttttgcatctatgttcatcaggatattggcctgatgttttctttctttgttttgtttctgccagattttggtattaggctgatgctagcttcatagaatgagttaggggggagcccttcctttttga--tttttttgggaatactttcagtaggattggtaccatttcttctttatatgtctggtagaattcaactgtgaattcctctggtcctgggctttttttggttagtagagttttttttttttttattactgattcaatttcagagcttgatattgacttattaaggattacagtctcttcctaattcaatcttaggagattgtgttgttccagggatttatccgtttcttccagattttctaatttgtgtgcatagagttgttcatagtattctctgaggatcttttgtatttctgtgggatcagttgtaatgtcatttttgtactttttgactgtactcatttggatcttctttt-tttttttttactatttttttaatctaactagcagtctaacaatcttattttttcaaaagactaactcttggtttcattgacgttttgtatagatttttgcacctcactttcattaagttgttctctaatttttgttatttcttttcttctgctagctatggagttggtttgtcctttattttctaattccttgaggtgCAAAGtgcaggaggatgaagctagacccttgcttttcagcatgtaagaaaattaacaggatagattaaagatttaaatgtaaggccacaaactatgaaaatcctagaccaaaatctaggagatatttttcttgacattggccttgggaaaaaaattagctaagtccccccaaagaaattgcaacaaaaccaaaaattgacaagtgggacctgggtaaacgaaagtgcttctgtacagaaaaagaaactatcaagaggggaaacagacaacttaccgaatgggagaaaatatttgcaaactgtgcatctgacaaaggtctaatatctcaaatgt-aaatagaacttaaacaatacaacagacaaaaaacaaatagccctattaataatgggaaaaggacacgaatagatccttctcaataaaaagacatgcaaggagccaacaaatatacaaaaaaatgcttatca---ctaatcatcagagaaattcataccaaaaccacaataagataccatctcatgccaatcagagtggctgttatgaaaaagtcaaaaaacaacagatgctggtgagcctgtag-aaaaaagggagtgcttgtacagagttgttgggaatgtaaattagttcagcctctgtgggcaaaattttggagacttctcaaatcacttagaacaaagctactatttgatccagcaatccTTTT--TTTTCctctctctctctctctctctctGTGTGTGTGTGTGtatatatatataaaatattttatatataatattttatatatatataatattttatatatatataatatataatattttatatatatataatattttatatatataaaatattttatatatatat s ponAbe2.chr14 18902945 1580 + 108868599 ccaggaaaaaagcctacttgatcgtggtgaattaacttattgatgtgccactgaatttggtttgctagtattgtgttgaggatttttgcatctatgttcatcaggatattggcctgatgttttctttctttgttttgcctctgccagattttggtattaggctgatgctagcttcatagaatgagttagggaggagcccttccttttcga--gttttttgggaatagtttcagtaggattggtaccatttcttctttacatgtctggtacaattcaactgtgaatccctctggtcctgggctttttttggttagtagagttttcttattta--attactgattcaatttcagagcttgatattgacttattaaggattacaatctctttctaattcaattttaggagattgtgttgttccaggaatttatcagtttcttccagattttctaatttgtgtgcatagagttgttcatagtattctctgaggatcttttgtatttctgtgggatcagttttaatgtcattattgtcctttttgactgtactcatttggatcttctttt-ttattatta-----ttatttaatctaactagcagtctaacaatcttattttttcaaaggactaactcttggtttcattgaccttttgtatagatttttgcacctcaatttcattcagttgttctctaatttttgttatttcttttcttctgctagctctggagttggtttgtcctttgttttctaattccttgaggtgCAAAGtgcaggaagatgaagctagacccttgcttttcagcatataagaaaattaacaggatagattgaagatttaaatataagaccacaaactatgaaaatcctagaccaaaatctaggagttacttttcttgacattggccttgggaaaaaaattagctaagtccccc-aaagaaattgcaacaaaaccaaaaattgacaagtgggacctaggtaaacgaaagtgcctctgtacagaaaaagaaactatcaagaagggaaacagacaacttactgaatgggagaaaatatttgcaaactatgcatctgacaaaggtctaatatcccaaatgt-aaatataacttaaataatacaacacacaaaaaacaaacagccctattaataatgggaaaaggacatgaatagatccttttcaataaaaagacatacaagcagccaacaaatatatgaaaaaatgcttatcatcactaatcatcagagaaattcataccaaaaccacaataagataccatcttatgccaatcagagtggctactatgaaaaagtccaaaaacaacagatactggagagcctgtag-aaaaaagggagtgcttgcacagagttgttcggaatgtatattagttcaacccctgtgggcagaattttggagacttctcaaatcacttagaacaaagctactatttgatccagcaatcctctt--t------ctctctctctctctgtcactgt------------atatatatatttaatat------------attttatatgtatataaaatct---ataaataaaatatatattatataatatat---taatagat-atatatataaaatatattttatatatat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88268088 1492 - 171882078 ccaggaacaaagcctacttgatcatagtgacttaacttattgatgtgctgctgaattcggtttgctagtatt-tgttgaggatttttgcatccatgtccatcaggatattggcctgatgttttctttctttgtttcgtctctgccagattttggcaataggctgatgttagctttatagaatgagttagggaggaacccttcgtttttgatttttttttgggaatagtttcagtaggattggtaccatttcttctttttatgtctggtagaattcaactgcgaatccctctggtcctgggctttttttggttagtagagtttcttttttta--attactgattcaatttcagagcttgatatttgtctattaaggattacaatctcttcctaattcaatcttaggagattgtgaggtttcaggaatttatcagtttcttccagattttctaatttatgtgcatggagttgttcacagtattctctgaggatcttttttatttctgtgggatcagttgtaatgtcatttttgtcctttttgactataatcattgggatcttctttt-ttattattt---------ttaatctaactagcagtctatcagtcttattttttcaaaagactaactcttggtttcattgaccttttgtatagatttttgcacctcaatttcattaagctgttctctaattttagttatttcttttcttctgctagctagggagttggtttgtcctttattttctaattccttgaggtgAAAAGtgcaagaggatgaagctagacccttgcttttcaccatataagaaaactaacaggatggattaaagatttaaatgtaagaccacaaactataaaaatcctagaccaaaacctaggagatattcttcttgacattgaccttgggaaaaaaattagctaagtccccc-aaagaaattgcaacaaaaccaaaaattgacaagtgggacttaggtgaactaaagtgcttctatacagaaagagaaactatcaagaagggaaacagacaacttacagaatgggagaaaatatttgcaaactatgcatctgacaaaggtctaatatcccaaatgt-aaatagaacttaaacaatacaatggacaaaaaacaaatagccctattaataatgggaaaaagacatgaatagatcattctcaataaaaagacatacaagcagccaacacacatatgaaaaaatgcttatcatcactaattgtcagagaaattcatatcaaaaacacaatgagataccatctcatgccaatcagaatggccattattaaaaagtc-aaaaacaacagatgcttgtgagcctatagaaaaaaaaggagtgcttatacagtgttgttgggaatgtaaattagttcg--ccccgtgggcagaattttggagacttctcaaatcacttagaacaaagctactatttgatccagcaatcctatt--t------ctctctctctctctatt-----------------acatatatac---atat-----------------atatatataaaa----------------------------------------------------------------------------- i macFas5.chr7 I 2765 C 0 s papAnu2.chr7 85394012 1495 - 162156779 ccaggaacaaagcctacttgatcatagtgaattaACTtattgatgtgctgctgaattcggtttgctagtatt-tgttgaggatttttgcgtccgTGTCCATCAGGATATTggcctgatgttttctttctttgtttcgtCTCTGCTAGATTTTGGCAATAGGCTGATGttagcttcatagaatgagttagggaggaacccttcctttttga-ttttttttgggaatagtttcagtaggattggtaccatttcttctttatatgtctggtagaattcaactgcgaatccctctggtcctgggctttttttggttagtagagtttcttttttta--attactgattcaatttcagagcttgataTTTGTCTATTAAGGATTACAATCTCTTTCTAATTCAATCTTAGGAGACTGTGATGtttcaggaatttatcagtttcttccagattttctaatttatgtgcatagagttgttcatagtattctctgaggatcttttttatttctgtgggatcagttgtaatgtcatttttgtcctttttgactatactcatttggatctttttttattattattt---------ttaatctaacTAGCAGTCTACCagtcttattttttcaaaagactAACTCTTGGTTTCATTGACCTTTTGTACAGATTTTTGCACCTCAATTTCATTAAGCTgttctctaattttagttatttcttctcttctgcttgcTAGGGAGTTGGTTTGTCCTTTATTTTCTGATTCCTTGAGGTGAAAAGTGCAAGAGGATGAAGGTAGACCCTTGCTTTTCACCATATAAGAAAATTGacaggatggattaaagatttaaatgtaagaccacaaactataaaaatcctagaccAAAACCTAGGAGATATTcttcttgacattggccttgggaaaaaaattagctaagtccccc-aaagaaattgcaacaaaaccaaaaattgacaagtgggacttaGGTGAACTAAAGTGCTTCTATACAGAAAGAGAAACTATCAAGAGGggaaacagacaacttacagaatgggagaaaatatttgcaaactatgcatctgacaaagttctaatatcccaAATGTAAAATAGAACTTAAACAATACAATGGACAAAAAACAAATAGCCCTACTAATAATGGGAAAAAGTCATGAATAGATCATTCTcaataaaaagacatacaagcagccaacacacatatgaaaaaatgcttatcatcactaatTGTCAGAGAAATTCatatcaaaaacacaatgagataccatctcatgccaatcagaatggctattattaaaaagtc-aaaaacaacagatgcttgtGAGCCTGTAG-aaaaaaaGGAGTGCTTATACAGtattgttgggaatgtaaattagttcagcccctgtggGCAGAATTTTGGAGACTTCTCAAATCACTTAGAACAAagctactatttgatccagcaatcctatttct------ctctctctctctctatt-----------------atatatatat---atat-----------------ataaaaatata------------------------------------------------------------------------------ i papAnu2.chr7 I 2757 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T e chlSab2.chr29 3552966 4268 - 24206276 I e rheMac3.chr7 87987093 4228 - 170124641 I e calJac3.chr10 87737718 663 - 132174527 I a score=126252.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 372166 98 + 478999 aatagattatGCCAAATAGATTATGCCAAAAAGaccaaaaagacacacacagttgtatgttcttttcagaactattcagcaaagacggaatcaaccta s ponAbe2.chr14 18904525 98 + 108868599 aatagattattccaaatagattatgccaaaaagaccaaaaaggcacatacacttgtatgttcttctcagcactattcagcaaagacagaaccatacta i ponAbe2.chr14 C 0 I 21 s rheMac3.chr7 87991321 98 - 170124641 aatagattatgacaaatagattatgccaaaaagaccaaaaagacacatacacttgtatgttcttctcagcactattcagtaaagacagaatcaaccta i rheMac3.chr7 I 4228 C 0 s macFas5.chr7 88269580 97 - 171882078 -atagattatgacaaatagattatgccaaaaagaccaaaaagacacatacacttgtatgttcttctcagcactattcagtaaagacagaatcaaccta i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85395507 98 - 162156779 aatagattatgacaaatagattatgccaaaaagaccaaaaagacacatacacttgTATGTTCTTCTCAGCACTATTCAGTAAAgacagaatcaaccta i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3557234 98 - 24206276 aatagattatgacaaatagattatgccaaaaagaccaaaaagacacatacacttgtatgttcttctcagcactattcagtaaagacagaatcaaccta i chlSab2.chr29 I 4268 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T e calJac3.chr10 87737718 663 - 132174527 I a score=35556.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 372264 40 + 478999 ggtgcccataaatggtagactagataaagaaaatatggta s rheMac3.chr7 87991419 40 - 170124641 ggtgcccataaatggtagactagataaagaaaatatggtt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88269677 40 - 171882078 ggtgcccataaatggtagactagataaagaaaatatggtt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85395605 40 - 162156779 ggtgcccataaatggtagactagataaagaaaatatggtt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3557332 40 - 24206276 ggtgcccatacatggtagactagataaagaaaatatggta i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18904623 21 + 108868599 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T e calJac3.chr10 87737718 663 - 132174527 I a score=513081.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 372304 411 + 478999 catacattatcagatactacgcaaccatacaaaaga--atgaaatcatgtcttttgcagcaacatgaatggagcttcaggcaataatcttaagcaaattcatgcaagaacagaaatccaaatactacatgttctcacgtaccagtgggagctaaacattaagcacacatggacatgtacatgggaacggtagacactgtggactacaaaaggtgtgatgaagggtgggggg-atgggttgggaaactacctgttgggtactatacttactaccttggtgcaataaacccacgtaacaaacctgcacatgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaattaaaaaaaGAATGAAAGGGAATGAATAAAGCTGATGTTTATAGGCCCTCCCAAAATTTCTGGCTCATAACATGC s ponAbe2.chr14 18904644 412 + 108868599 catac--tatcagacactatgcaaccaaaaaaaaaattatgaaatcacgtcttttgcagcaacatgaatgaagcttcaggcaataatcctaagaaaattaatgcaagaacagaaatccaaatactacatgttctcacttaccagtgagagctaaacattaagcacacatggacatgtacatgggaacaatagacactggggactacaagaggtgtgaggaagggtgggggggatgggttgggaaactacctgttgggtactatacttactaccttggtgaaataaacccacgtagcaaacctgcacatgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaattaaaaaaaaaATGAAAGGGAGCGAATAAAGCTGATGTTTATAGGCCCTCCCAAAATTTCTGGCTTATCACATGC i ponAbe2.chr14 I 21 C 0 s rheMac3.chr7 87991459 409 - 170124641 tatacattattagatactatgcaaccacaaaaaaga--atggaatcatgtcttttgcagcaacatgaatggagctacaggcaataatcctaagcaaattaattcgggaacagaaagtcaaatactacatgttctcacttaccagtgggagctaaacattaagcacacatggacatatacatgggaacaatagacactgcggactacaagaggtgtgaggaagggtggggg--atgggttgggaaactacctgttgaatactatacttactaccttggtgcaacaaatccacataacaaacctgcacatgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaattaaaaaaGGAATGAAAGGGAATGAATAAAGCAGATGTTTATAGGCCCTCCC-AAATTTCTGGCTTACAACATGC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88269717 409 - 171882078 tatacattattagatactatgcaaccacaaaaaaga--atggaatcatgtcttttgcagcaacatgaatggagctacaggcaataatcctaagcaaattaattcgggaacagaaagtcaaatactacatgttctcacttaccagtgggagctaaacattaagcacacatggacatatacatgggaacaatagacactgtggactacaagaggtgtgaggaagggtggggg--atgggttgggaaactacctgttgaatactatacttactaccttggtgcaacaaatccacataacaaacctgcacatgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaattaaaaaaGGAATGAAAGGGAATGAATAAAGCAGATGTTTATAGGCCCTCCC-AAATTTCTGGCTTACAACATGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85395645 408 - 162156779 taTACATTATCAGATACTATgcaaccacaaaaaaga--atggaatcatgtcttttgcagcaacatgaatggagctacAGGcaataatcctaagcaaattaattcgggaacagaaagtcaaatactacatgttctcacttaccagtgggagctaaacattaagcacacatggacatatacatgggaacaatagacactgcgGACTACAAGAGGTGTGAGGAAGGGTGGGGG--ATGGGTTGGGAAACTACCTGTTGAGTACTATACTTACTACCTTGGTGCAACAAacccacataacaaacctgcacgtgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaatt-aaaaaggaatgaaagggaATGAATAAAGCAGATGTTTATAGGCCCTCCC-AAATTTCTGGCTTACAACATGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3557372 405 - 24206276 tatacatgatcagatactatgcaaccacaaaaaaga--atggaatcatgtcttttgcagcaacatgaatggagctacaggcaataatcctaagcaaattaatttgggaacagaaagtcaaatactatatgtactcacttaccagtgggagctaaacattaagcacacatggacatacacatgggaacaatagacactgcggactacaagaggtgtgaggaagggtggggg--atgggttggg----tacctgttgagtactatacttactaccttggtgcaacaaatccacataacaaacctgcacatgtaccctctgtatctaaaataaaagttgaaaTTTAAAAAGGAATGAAAGGGAATGAATAAAGCAGATGTTTATAGGCCCTCCC-AAATTTCTGGCTTACAACATGC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46842738 32655 - 64190966 T e calJac3.chr10 87737718 663 - 132174527 I a score=102932.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 372715 68 + 478999 TTTGAAAGATTTTATAAAATCAtttttaaatttaataatttttaaaatttggaatggttatagattta s ponAbe2.chr14 18905056 68 + 108868599 TTTCAAAGATTTTATAAAATCAtttttaaatttaataatttttaaaatttggaatggttatagattta i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87991868 68 - 170124641 TTTCGAAGATTTTATAAAATCAtttttaaatttaataatttttaaaatttggaatagttacagattta i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88270126 68 - 171882078 TTTCGAAGATTTTATAAAATCAtttttaaatttaataatttttaaaatttggaatagttacagattta i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85396053 68 - 162156779 TTTCGaagattttataaaatcatttttaaatttaataatttttaaaatttggaatagTTACAGATTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3557777 68 - 24206276 TTTCGAAGATTTTATAAAATCATTTTTAAATTTAATAATTTTAAAAAtttggaatagttacagattta i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46810083 67 - 64190966 tttaaataattttatttttatttttTTAAtttaaataattttaaaaa-ttagaacagttttaaattta i canFam3.chr15 T 32655 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e calJac3.chr10 87737718 663 - 132174527 I a score=686886.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 372783 384 + 478999 cagaaatgttg----aatatcacataatataattatacctcatgctattttccttattgttatattactatggtacatttgtca-aac--------taatattgatacattactactaactacattgcacttttcat-------------------tcagatttcattagttctt----aATGAAACGGCTTACTCAAGTTGTCTATTT---TTT-ATTTATCATGGCAGTTATTTAATTTATTGCCGTTATGTCCTTTATATTCCCAAAAAACTTTTTGTAATTATTCTGTAAATAAATACTTGAAAATACTTGGTGAGCTTCCATTACTTACAGGAAATGGTGAAATCTATAACATAAAT----ACAGTGCAGTTCTAGTTTTTATCTTTTTAAGTGAATATTTGACTTCCCC-CCACCACTCTGTT s ponAbe2.chr14 18905124 387 + 108868599 cagaaatgttg----aatatcgcagagtataattatacctcatgctattttccttattgttatattactatggtacatttgtca-aacaaataaactaatattgatgcattattactaactaccttgcaactttaat-------------------tcagatttcattagttcttccttaatgAAATGGCTTACTCAAGTTGTCTATTT---TTT------TCATGGCAGTTATTTAATTTATTGCCATTATGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTCTTTGTACTTATTCTGTAAATAAATACTTGAAAATACCTGGTGAGCTTCCATTACTTAGAGGAAGTGGTGAAATCTATAACATAAAT----ACAGTGCAGTTCTTGTTTTTATCTCTTTAAGTGAATATT-GACTCCCCC-CCAC---TCTGTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87991936 389 - 170124641 cataaatgttg----gatatcacagaatataattacacctcatgctatttttcttattgttatattactatggtacatttgtca-aacaaataaaccaatattgatgcattattattaattacattgtaccttttat-------------------tcagatttcttttgttcttccttaaGGAAATGGCTTACTCATGTTGTCCACTT---TTT-ATTTAT-----CNNNNNNNNNNTTTATTGTCCTTATGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTTTTTGAAATTATTCTGTAAATAAATACTTGAAAATACTTGATGAGCTTCCATTACTTAGAGGAAATGGGGAAATCTATAACATAAAT----ACAGTGCAGTTCTAGTTTTTATCTCTTTAAGTGAACATTTGACTCCCCCTCCAC---TCTGCC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88270194 394 - 171882078 cataaatgttg----gatatcacagaatataattacacctcatgctatttttcttattgttatattactatggtacatttgtca-aacaaataaaccaatattgatgcgttattattaattacattgtaccttttat-------------------tcagatttcttttgttcttccttaaGGAAATGGCTTACTCATGTTGTCCACTT---TTT-ATTTATCATGGCAGTTATTTAATTTATTGTCCTTATGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTTTTTGAAATTATTCTGTAAATAAATACTTGAAAATACTTGATGAGCTTCCATTACTTAGAGGAAATGGTGAAATCTATAACATAAAT----ACAGCGCAGTTCTAGTTTTTATCTCTTTAAGTGAACATTTGACTCCCCCTCCAC---TCTGCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85396121 394 - 162156779 CATAAATGTTA----GATATCACAGAATATAATTATACCTCAtgctatttttcttattgttatatTACTATAGTACATTTGTCA-AACAAATAAACCAATattgatgcattattattaattacattgtaccttttat-------------------tcagatttcattaGTTCTTCCTTAAGGAAACAGCTTACTCATGTTGTCCACTT---TTT-ATTTATCATGgcagttatttaatttattgtcCTTATGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTTTTTGAAATTATTCTgtaaataaatacttgaaaatacCTGGTGAGCTTCCATTACTTAAAGGAAATGGTGAAATCTATAACATAAAT----ACAGTGCagttctagtttttatctctttAAGTGAACATTTGACTCTGCCTCCAC---TCTGCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3557845 394 - 24206276 cataaatgttg----gatatcacagaatataattatacctcatgctatttttcttattgttatattactatggtacatttgtca-aacaaataaaccaatattgatgcattattattaattacattgtaccttttat-------------------tcagatttcattagttcttccttaaGGAAATGGCTTACTCATGTTGTCCACTT---TTT-ATTTATCATGGCAGTTATTTAATTTATTGTCCTTATGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTTTTTGAAATTATTCTGTAAATAAATACTTGAAAATACCTGGTGAGCTTCCATTACTTAGAGGAAATGGTGAAATCTATAACATAAAT----ACAGTGCAGTTCTAGTTTTTATCTCTTTAAGTGAACATCTGACTCCCCCTCCAC---TCTGCC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87738381 386 - 132174527 caaaaaTGTTT----AATATAACAGAATATAATTATACATCATGCTATTTTCTGTATTGttgtattactatggtacatttgtca-aaggaataaaccaatattgatgcattattattaactacactggaccttttat-------------------tcagatttcattagttcttccttaatgAAATGGCTTACTCA---TGTCTATTT---TTTAATTTATCATGGCAG----TTAATTTATTGTCCTTAAGTTCTTTATGTTCCCAAAAAGCTTTTTGTAATTATTCTGTAAGTAAATACTTGAAAATACTTGTTGAGCTTCCATTACTTAGAGGAAATTCTGAAATCTATAACATAATT----ACAGTGCAGTTCTAGTTTTTATCTCTTTAAGTGAGCATTTGACTCTCC--CCAC---TCTGCC i calJac3.chr10 I 663 C 0 s canFam3.chr15 46810150 370 - 64190966 gagagaagttgcaaagatagtacagagt----ttttacattatact--------------------------gtgtatttgtcagaactagtgagccaatgctgatatattatgattacctaggctccatgttttatttggatttATTTTATTACATTAGATTTCAGCAGTTTTTCCTTAATGAATCAGTTTATCCAAGTTATCTATTTATGTTT-TATTGTCTTGCTAGTT-CTTGATTTATTGTCCTTATGCTCTTTATGTTCCCAAGAAGCTTTTTGTAATTGTCCCCAAAACAAAC-----AAGGCACCTTGCGAGATTCTTTTCCTTAGAGAAAATGGTGAAATCTATAATGTAAGCAGTAACAGTGCAG-TCTGCTTCCTCTC---TTAAGTGAAGA----ACTCTTTT-------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=224482.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 373167 133 + 478999 CACATCTGTGCATGGTTTCTTAtttatttatttgacatgtaaaacttgtatatatttgtcatgtaca---tgatgttttgaaataaatatgtctacatagtaaaatggctcagttgagttgattagcatatacatC s ponAbe2.chr14 18905511 136 + 108868599 CACATCTGTGAATGATTTCTTAtttatttatttgacatgtaaaacttgtaaatatttgtcatgtacaacatgatattttgaaataaatatgtctacatagtaaaatggctcagttgagttgattagcatatacatC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87992325 132 - 170124641 CACATCTGTGCGTGGTTTCTTAtttatttacttgacatgtaaaacatgtatatatttgtcatgtacaacatgatgttttg----aaatatgtctacatagtaaaatggctcagttgagtcaattaacatatacatC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88270588 132 - 171882078 CACATCTGTGCATGGTTTCTTAtttatttacttgacatgtaaaacatgtatatatttgtcatgtacaacatgatgttttg----aaatatgtctacatagtaaaatggctcagttgagtcaattaacatatacatC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85396515 132 - 162156779 CACATCTGTGCatggtttcttatttatttacttgacatgtaaaacatgtatatatttgtcatgtacaacatgatgttttg----aaatatgtctaCATAGTAAAATGGCTCAGTTGAGTCAATTAACATATACATC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3558239 129 - 24206276 CACATCTGTGCATGTTTTCTTAtttatttacttgacatgtaaaacatgtatatatttgtcatgtacaac---atgttttg----aaatatgtctacatagtaaaatggctcagttgagtcaattaacgtatacatC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87738767 136 - 132174527 CATATCTGTGCATCGTTTCTTAtttatttatttgtcatgtaaaacttgtatatatttgtcatgtacaacaggatgttttgaaataaatatgtctacatagtaaaatggctcaattgagtcaattaatatatacatC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46810520 0 - 64190966 C a score=717881.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 373300 380 + 478999 CTAGCCCTACCAGTCTCTCCCTCTTATTTCATCAAACCTATACTTTCTTGTTTGCATGTTCTATCCTGCCTCAGATTCTGATACACA------TATGAGATTCTGTAGGGGTGTAGGGTCTGCATGGTGATAAGAAAATCTAGGATAATAACTAAGATTTCTCATACTACAACACCACTCTACACCTTAGGCCTTGTTCTAGTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TtgcccagtcctgctccacagtttgaacttctgaactatgtgcagcttcctcatatttctatgtttctgaacatgctgctacttctgctggaattcttgaccaacttttcacctTCAATACTCTAATTAAAAGTGTTG s ponAbe2.chr14 18905647 380 + 108868599 CGAACCCTACCAGCCTCTCCCTCTTATTTCATTAAACCTATACTTTCTTGTTTGCATGTTCTATCCTACCTCAGATTCTGGTACACA------TATGAGATTCTGTAGGGGTACAGGGTCTGCATGGTGATAAGAAAATCTAGGATAATAACCAAGATTTCTCATACTACAACCCCACTCTACACCTTGGACCTTGTTCTACTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TTACccagtcctgttccactgtttgaacctctgaaccatgtgcagcttcctcatatttctatgtctctgaacatgctgctacttctgctggaatTATTGACCAACTTTTCACCTTCAATACTCTAATTAAAAGTCTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87992457 379 - 170124641 CTAGCCCTACCAGTCTCTCCCTCTTATTTCATCAAACCTATACTTTCTTGTTTCCGTGTTCTATCCTACCTCAGATTCTGGTACACA---TATTATGAGATTCTATCGGGGTATAGGTTCTGCATGGTGATAAGAAAATCTAGGATAA----TAATATTTCTCATACTACACCACCACTCTACACCTTAGGCCTTGTTCTAGTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TtgcccagtcctgttccactgtttgaacctctgaactatgtgcagtttcctcatatttctatgcctctgaacatgctgctgcttctgctggaaatattGACCAACTCTTCATCTTCAATACCCTAATTAAAAGCCTTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88270720 379 - 171882078 CTAGCCCTATCAGTCTCTCCCTCTTATTTCATCAAACCTATACTTTCTTGTTTCCGTGTTCCATCCTACCTCAGATTCTGGTGCACA---TATTATGAGATTCTATCGGGGTATAGGTTCTGCATGGTGATAAGAAAATCTAGGATAA----TAATATTTCTCATACTACACCACCACTCTACACCTTAGGCCTTGTTCTAGTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TtgcccagtcctgttccactgtttgaacctctgaactatgtgcagtttcctcatatttctatgcctctgaacatgctgctgcttctgctggaaatattGACCAACTCTTCATCTTCAATACCCTAATTAAAAGCCTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85396647 383 - 162156779 CTAGCCCTACCAGTCTCTCCCTCTTATTTCATCAAACCTATACTTTCTTGTTTCCGTGTTCTATCCTACCTCAGATTCTGGTACACA---TATTATGAGATTCTGTCGGGGTATAGGTTCTGCATGGTGATAAGAAAATCTAGGATAATAACTAATATTTCTCATACTACAACACCACTCTACACCTTAGGCCTTGTTCTAGTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TTGCCCAGTCCTTTTCCACTGTTTGAACCTCTGAACTGTGTGCAGCTTCCTCATATTTCTATGCCTCTGAAcgtgctgctgcttctgctggaAATATTGACCAACTCTTCATCTTCAATACTCTAATTGAAAGCCTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3558368 383 - 24206276 CTAGCCCTACCAGTCTCTCCCTCTTATTTCATCAAACCTATACTTTCTTGTTTCCATGTTCTATCCTACCTCAGATTCTGGTATACA---TATTATGAGATTCTATAGGGGTATAGGTTCTGCATGGTGATAAGAAAATGTAGGATAATAACTAATATTTCTCATACTAAAATACCACTCTACACCTTAGGCCTTGTTCTAGTAGAAAAACTTGTTCCAAGATCAATTATCAATCCTAATTCCAATTT--TTGCCCAGTCCTTTTCCACTGTTTGAACCTCTGAACTGTGTGCAGCTTCCTCATATTTGTATGCCTCTGAACATGCTGCTGCTTCTGCTGGAAACATTGACCAACTCTTCATCTTCAATACTCTAATTAAAAGCCTTA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87738903 384 - 132174527 CTAGCCCTACCAGTCTCTTCCCCTTATTTAATCAAATCTGTACTTTCTTGTTTGCATGTTCTATCCTACCTCAGATTCTGGTAGAAATATTATCATGAAATTCTGTAGGGGTATAGAGTCTGCATGGGGATAAGAAAATGTAGGATAATAACTAAGACTTTTCATACTACAGCACCATTCTACACCTTAGGCCTT-TTCTAATAGAAAAATTT-TTCTGAGATCAATTATCAATCCTCATTTCAATTT--GTGGTCAGGCCTGTTCCactgtttgaacctctgaactatgtgcagtttcctcaaacttctatgcctctgaacatgctgctgcttttgcttgaaTTATTGACGTGCTTTTCATCTTCAATACTCTAATTAAAAGTCTTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46810520 364 - 64190966 CTGTCCCTATCAGTCTCTTCCTC---TTTCTTCAGGTATGTAGCTTCTCATCTGCAAGTTCTCTCTTGTC-CTGACTCTGATACAAGTGTTATCATGGGAATCTGGAGGGTTA-AGGCTGTGCATGGGGAT-AGCAGACCTAGGGTAATCCACATGATTCACTGTGCTGTGGTAGCACTCTGAACCTTGGCTTCAGGTCTA-----------------AAGATT-ATGCTTGCTTCTGTTGCCCACTTACTGCCCCAGTGTTGTGCCATTGTTTGCGCCTTTGAACTGTTAgcagcttcctcatatccctgtgcctctgaagatgttgtttcctttgctggaattatggaccttctccttgccttcagtactcagattaagagtctta i canFam3.chr15 C 0 I 54508 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=2203129.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 373680 1165 + 478999 TTTTCAGCCAGCTTTCAGAATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCAC---CTCTGCCTAATCATATTCTCCAGCTGCTTACCCAATCACTTGTGCAGCATTTCTCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTGCGGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCATCCAGGAATGTAGAAGTC---TTTTGCATACCAAGGTTAGAAGCTATGGCATGGTTGTAAACTCATAAAATACTATCTTTGTgagggagag------agagagaggagagagagaaagagaAAACA---AACTCAAGACCACTTTTTAGACTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCATGTATATAAGAGAAGCATCATTATATAAATCT--GTCTTTTAGTGTGCGTATCTTGGTATCAATCACATTTTTATTTCA-AAGGCTTTTCTGATCC---AAGATCTCAGATTGTTCAAATCCATGAGGTGGGACCACACTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAATGATACCTT-AACCACCAGTGAAAGAAGCAAGGTCAATTTTCATTGATTCAAATTATATTCAAAGGTAAATTCTTTACTTCTGTAAATTATTCACCTGCTTTACAACGTCTGTTCTAGTAAT------TAATTTAAGAAATAGTATATTACAATTTAAAGTGTGTATCAATATAATTTCAGTtggaatttagtcctaggtttactaggtttaccaccatcagta-aacttagataatttaatt-ccctctcttgaccttatttgtttcccagtggttagatgagtgtgaaaaaatcaa----tctct-aaaatctcttATACATAGATAAGTATAGGACT----TAACA--AATTATGCTTCAGTCT-AAGATGATTTAAGGAGATCATTTAAAACTGCTGCTCTAAAATAAATGGTTTTATGTCAGGAATTGGGTCGTGCTCCTCGTTTTATATTCACAGTGCAGTACCAGACACAGATAATATGTTTAGTAAA----TATTAAGTGAAAAGATAAATTAATATTGGTACT-TAAGAAATAT---AACTCAAATAGATGATACCTTAAGCAATCTATATATTGTGCTATGCTAACTCATTTGCAGATTTTTTTCAA------------------TATTTATCCTTATATTTCAGCTCCACAAAGACTAGT-AATTGTTTCCTCAATTGGAGCCAATTAGAGGAACAGGAT---------------------------------------AGGATT s ponAbe2.chr14 18906027 1168 + 108868599 TTTTCAGCCAGCTTTCAGCATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCACTTTCTCTGCCTAATCATATTCTCCAACTGCTTACTCAATCACTTGTCCAGCATTTCCCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTGCTGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCAGCCAGGAATGTAGAAATC---TTT-GCATACCAAGGTTAGAAGCTATGGCGTGGTTGTAAACTCATAAAATACTATCTTTCTgagggagag------agagagag-------agaaagagaAAACA---AACTCAAGACTGCTTTTTAGGCTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCATGTAAATAAAAGAAGTATCATTATATAAATCTCAGTCTTTTAGTGTGCGTATCTTGTTATCAATCACATTTTTATTTCA-AAGGATTTTCTGATCC---AACATCTCGGGTTGTTCAAATCCATGCGGTGGGACCACACTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTGGAATGATACCTT-AACCACCAGTGAAAGAGGCAAGGTCAATTTTCATTGATTCAAATTATATTCAAAGGTAAATTATTTACTTCTGTAAATTCTTCACCTGCTTTACAACATCTGTTCTAGTAAT------TAATTTAAGAAATAGTGTATTACAATTTAAAGTGTGTATCAATATAATTTCAATtggaatttagtcctaggtttactagatttaccaccatcagta-aacttagataatttaatt-ccctctctggaccttatttgtttcccaatggttagataagtgtgaaaaaatcaaacaatctct-aaaatcctttATACATAGATAAGTATAGGACT----TAACATCAATTATGCTTCAGTCT-AAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACTACTGCTGTAAAATAAATGGTTTTATGTCAGGAATTGGGTCGTACTCCTCTTTTTATATTCACAGTGCAGTACCAGACACAGATAATATGTTTAGTAAG----TATTAAGTGAAAGGATAAATTAATAGTGGTACT-TATGAAATAT---AAATCAAATAGATGATACCTTAAGCAATCTATACATTGTGCTATGCTAACCCATTTGCAGATATTTTTCAA------------------TATTTTTCTTTATCTTTCAGCTCCACAAAGATTAGT-AATTATTTCCCCAATTGGGGCCAATTAGAGGAACAAGAG---------------------------------------GGGATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87992836 1142 - 170124641 TTTTCAGCCAGCTTTCAGCATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCACTTTCTCTGCCTAATCATATTCTCCAGCTGCTTACCCAATCACTTGTCCATCATTTCCCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTCCTGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCATCCAGGAACGTAGAAATC---TTTTGCATACCAAGATCAGAAGCTATGGCATGGCTGTAAACTCACAAAATACTATCTTTCTgagggagagacagcgagagaaagaagagagagaaagagaAAACA---AACTCAAGACCGCTTTTTAGGCTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCACGTATATAAGAGAAGCATCATTATATAAATCTCAGTCTTTTAGTGTGCGTATCTTGGTATCGATCACATTTTTATTTCA-AAGGCTTTTCTGATCC---AAGATCTTGGATTGTTCAAATCCATGCGGTGGGACCACACTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAATGATACCTT-AACCACCAGTGAAAGAGGCAAGGTCAGTTGTCATTGATTCAAATTACATTCGAAGATAAATTCTTTACTTCTATAAATTCTTCACCTGCTTTATAACGTCTGTTCTAGTAAT------TAATTTAAGAAATAGTATATTACAATTTAAAGTGTGTGTCAATATAATTTCAattggaattcagtcctaggtttactaggtttatcatcatcagta-aacttagataatttaattcccctctctgtaccttatttttttcccaatggttagatgagtgtgataaaatcaagcaatctct-aaaatcctttATACATAGATAAGTATAGGACT----TAACATAAATTATGCTTCAGTCT-CAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACTGCTGCTATAATATAAATGGTTTTATGTCAGGAATTGGGTCGCAT-----------------------------------------TAAGTTTAGTAAA----TATTAAGTAAAAGGATGCATTAATATTGGTACT-TATGAAATAT---AAATCAAATCGATGATACCTTAAACAATCTATACATTGTGCTATGCTAACTCATTTGCAGA-TTTTTTCAA------------------TATTTTTCCTTATCTTTCAGCTCCACAAAGATCAGTAAATTGTTTCCTCAATTGGGGCCGATTAGAGGAACAGGAT---------------------------------------AGGATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88271099 1146 - 171882078 TTTTCAGCCAGCTTTCAGCATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCACTTTCTCTGCCTAATCATATTCTCCAGCTGCTTACCCAATCACTTGTCCATCATTTCCCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTCCTGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCATCCAGGAACATAGAAATC---TTTTGCATACCAAGATCAGAAGCTATGGCATGGCTGTAAACTCACAAAATACTATCTTTCTgagggagagacagcgagagaaagaagagagagaaagagaAAACA---AACTCAAGACCGCTTTTTAGGCTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCACGTATATAAGAGAAGCATCATTATATAAATCTCAGTCTTTTAGTGTGCGTATCTTGGTATCGATCACATTTTTATTTCA-AAGGCTTTTCTGATCC---AAGATCTTGGATTGTTCAAATCCATGCGGTGGGACCACACTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAACGATACCTT-AACCACCAGTGAAAGAGGCAAGGTCAGTTGTCATTGATTCAAATTACATTTGAAGATAAATTCTTTACTTCTATAAATTCTTCACCTGCTTTATAACGTCTGTTCTAGTAAT------TAATTTAAGAAATAGTATATTACAATTTAAAGTGTGTGTCAATATAATTTCAATtggaattcagtcctaggtttactaggtttatcatcatcagta-aacttagataatttaattcccctctctgtaccttatttttttcccaatggttagatgagtgtgataaaatcaaacaatctct-aaaatcctttATACATAGATAAGTATAGGACT----TAACATAAATTATGCTTCAGTCT-CAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACTGCTGCTCTAATATAAATGGTTTTATGTCAGGAATTGGGTCGCAT-----------------------------------------TAAGTTTAGTAAATATTTATTAAGTGAAAGGATGCATTAATATTGGTACT-TATGAAATAT---AAATCAAATCGATGATACCTTAAACAATCTATACATTGTGCTATGCTAACTCATTTGCAGA-TTTTTTCAA------------------TATTTTTCCTTATCTTTCAGCTCCACAAAGATTAGTAAATTGTTTCCTCAATTGGGGCCGATTAGAGGAACAGGAT---------------------------------------AGGATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85397030 1150 - 162156779 TTTTCAGCCAGCTTTCAGCATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCACTTTCTCTGCCTAATCATATTCTCCAGCTGCTTACCCAATCACTTGTCCATCATTTCCCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTGCTGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCAGCCAGGAACGTAGAAATC---TTTTGCATACCGAGATCAGAAGCTATGGCATGGCTGTAAACTCACAAAATACTATCTTTCTgagggagagacagcgagagaaagaagggagagaaagagaaaaca---aactcaaGACCACTTTTTAGGCTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCACGTATATAAGAGAAGCATCATTATAtaaatctcagtcttttagtgTGCATATCTTAGTATcgatcacatttttatttca-aaggctTTTCTGATCC---AAGATCTTGGATTGTTCAAATCCATGAGGTGGGACCACGCTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAATGATACCTT-AACCACCAGTGAAAGAGGCAAGGTCAGTTGTCATTGATTCAAATTACATTCAAAGATAAATTCTTTACTTCTATAAATTCTTCACCTGCTTTATAACATCTGTTCCAGtaat------taatttaagaaatagtATATTACAATTTAAAGTGTGTGTCAATATAATTTCAATTGGAATTTAGTCCTAGGTTTACTAGGTTTACTACCATCAGTA-AACTTAGACAATTTAATTCCCCTCTCTGTaccttatttttttcccaatggTTAGATGAGTGTGATAAAATCAAACAATCTCT-AAAATCCTTTATACATAGATAAGTATAAACATAAGATAACATAAATTATGCTTCAGTCT-AAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACCGCTGCTCTAATATAAATGGTTTTATGTCAGGAA-TGGGTCGCAT-----------------------------------------TaagtttagtaaatatttattaagtgaaaggaTGCATTAATATTGGTACt-tatgaaatat---aaatcaaattgaTGATACCTTAAACAATCTAAACATTGTGCTGTGCTAACtcatttgcagatttttttcaa------------------tatttttccttatctttcaGCTCTACAAAGATTAGTAAATTGTTTCCTCAATTGGGACCGATTAGAGGAACAGGGT---------------------------------------AGGatt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3558751 1143 - 24206276 TTTTCAGCCAGCTTTCAGCATGGTTTTACAAGGAGTTATTTAGTAGAGACTACACTTGCACTTTCTCTGCCTAATCATATTCTCCAGCTGCTTACCCAATCACTTGTCTATCATTTCCCTCAGGGTTTTGATGATGCATAAAGATTGCTGAGAGTTTCTTCCCTTTGGCAGCCAGGAACGTAGAAATC---TTTTGCATACCAAGATCAGAAGCTATGGCATGGCTGTAAACTCACAAAATACTATCTTTCTGAGGGAGAGACAGCCAGAGAAAGA----AGAGAAAGAGAAAACA---AACTCAAGACCGCTTTTTAGGCTGTACAAG----------AGGAAATGTGGCACGTATATAAGAGAAGCATCATTATATAAATCTCAGTCTTTTAGTGTGCGTATCTTGGTATCGATCACATTTTTATTTCA-AAGGCTTTTCTGATCC---AAGATCTTGGATTGTTCAAATCCATGCGGTGGGACCACACTCAAGAAAAAGTCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAATGATACCTT-AACTACCAGTGAAGGAGGCAAGGTCAGTTGTCATTGATTCAAATTACATTCGAAGATAAATTCTTTACTTCTATAAATTCTTCACCTGCTTTATAACATCTTTTCTAGTAAT------TAATTTAAGAAATATTATATTACAATTTAAAGTGTGTGTCAATATAATTTCAATTGGAATTgagtcctaggtttactaggtttaccatcatcagta-aacttagataatttaattcccctctctgtaccttatttttttcccaatggttagatgagtgtgataaaatcaaacaatctct-aaaatcctttATACATAGATAAGTATAGGACT----TAATGTAAATTATGCTTCAGTCT-AAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACTGCTGCTCTAATATAAATGGTTTTATGTCAGGAATTGGGTCGCAT-----------------------------------------TAAGTTTAGTAAATATTTATTAAGTGAAAGGATGCATTAATATTGGTACT-TATGAAATAT---AAATCAAATAGATGATACCTTAAACAATCTATACATTGTGCTATGCCAACTCATTTGCAGATTTTTTTCAA------------------TATTTTTCCTTATCTTTCAGCTCCACAAAGATTAGTAAATTGTTTCCTCAATTGGGGCCGATTAGAGGAACAGGGT---------------------------------------AGGATT i chlSab2.chr29 C 0 I 16 s calJac3.chr10 87739287 1179 - 132174527 TTTTTGGCCAGCTTTCAATATGGTTTTACAAGAAGTTATTTAGCAGAGAATACACTTGTACTTTCTCTGCCTAATTATATTCTCCTGCTGCTTACCCAATCACTTGTCCATCAACTTCCTAAGGGCTTTGATGATGCATAAATATTGCTGAGAGTTTCTTCTCCTTGGCAGCCAGGAATGTAGACATT---TTTTGCATACTAAGATGAGAAGCTATGGCATGGGTGTAACCTCATAAAACATACCTTTTTTGAGGGAGAG------AGAGAAAGA----AGAGAAAAAGAAAACA---AACTCAAGGTTTCTTTTTAGGTTATAGAAG----------AGGAAATGTGGCACGCACATGAGAGAAGCATCATTATATAAATCTCAGTCTTTTAGTGTGCATATCTGGGTATTGATCACATTTTTATTTCA-GAGGCTTTTCTGATCC---AAGATCTTGGATTGTTCAAATCCATGTGGTGGGACCACACTCAAGAAAACGGCCAGGGTAAGCTTTCCATCTAGAGCGATGCCTTAAACCACGAGTGAAAGAGGCAAGGTTAATTTTCTTTGATTCAAATTATATTCAAAGATAAATTCTTTACTTCTGTAAATTCTTCACCCACTTTACAATATCTGTTCTAGTAAT--TAAATAATTTAGGAAATAGTGTATTACAATTTAAAGTGTGTATCAATATAATTTCAATtggaatttagtcctaggtttaccaggtttaccaccagcagta-aacttagataatttagtt-ccctctctgtaccttatttgtttccgaatggttaaatgagtgggataaagtaaaatgatctctaaaaatccttTATGCATAGGTAAGTATAGGACT----TAACATAAATTATGCTTCAGTCT-AAGATGATTTAGGGAGGTCATTTAAAACTGCTGCTCTAAAATAAATGGTTTTATGTTGGGAATTGGGTTGCATTCCTCTTTTTATATTCAcagtgcagtaccagacacaga---tgtgtttagtaaatatttattaagtgaaAGTGTAAATTAATATTGGTACT-TATGAAATAT---AAATCAAATAGATGATACCGTAAGCAATCCATACATTGTGCTATGCTAACTCATTTGCAGA-TTTTTTCAA------------------TATTTTTCCTTATCTTTTAGCTCTACAAAGATTGGTAAATTGTTTCCTCAACTGGGACCAGTTAGGAGAACAGGAT---------------------------------------AGGATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46865392 1218 - 64190966 TTACCAAGTAGCCTTCAATAAAGTTTTAAAAGGGGTTACCTAGTGGGAATTATACTTGCACTTTCTTTGTTTCACAATCCTCTCCAGATCGCTACC--------TGGCTAGCCATTCCCTC-GGGCTGGGATGATGCATACACATTGCTGACAGTTACT-----CTTGCAT-CAGGGATATAGAAATAGAGCCTTACA-ATCCAGATCAGAAGCCGAGGCATAGCTATAAGATCATAGAA---------TCTgagagagag------agagagaga---gattgagagagagaACAAATAATGTAGGACCCCTTCTCAGGCTCCAGGTGTAATCCTTCTGTGAAATGCGACACACACATAAGAGAAGCATCACTATACAGATTTTGGTCTTTTAGCGTGAATATATAACTAGAGATCCCAGTTTCATCTCAGAAAGCTTTATTGATCCAGGAAGATCTCCAGTTGCCCAAATCCATGTCGTGGGACCACACTCCAGAAGATGGCCAGAGTAAGTTTCCCATCTATAATGATCAATT-AACAACCAGGGAGACAGGTGAGGGCAACTTTCATTGATTCAAATCATATTCAAGGATAAA--AATGGAATGTTTAAAGTCTTCATCCACATAACAACATCTGTTCTAATAATTATAAGTAATTTAAGAAATAGTTTACTGTAGTTTAAAGTGTGTATCACTATTATTTCCATTGGAATTTAGTTCTAGCTTTAC----------ACGAACAGTGCAGCCTAGGTAATTCAGTT-TCCTCTGTGCAC----TACTTTCACCAGTGGTTAGGTGAGTGGAAGGAAGTCAGGTGATCACG-AAGGAATTTT-CATTTATATAAGGGTAGGATT----TTGTATAAGTTATGGCCCAGTCTAAAGAGGATTTGAGAACGTCTCTTCAAGGTATTTCTCTAA-ATAAATGGTTTTACGTCAGGTATTGGGTTTGATCTACCTTTTTATGTTCACAGCACGATACCAGATGCGGAGAATGTGCTCTACAAATTTTTATCAGTTGAAAGGATAAATAAATATTGGTGCTGTGTGAAATGTAGAAGATGATAGAGATGGTACCTTAAATAGTCTGT--GTTGTGTTACATCTATACATGTGCAGA-ATTTTTCAAGACTTTACCTACTCAATGTATTATTCCTTATCTCTCAGTTCCATAAA---TAGCAAGTTATTTCCTCAGTTGTGGACAATCAGAGGAACAGGATAAATTGGGACTTTAAGTGTTTCTATAAGTAAAAGTTCAAAGGGTT i canFam3.chr15 I 54508 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=72377.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 374845 44 + 478999 -AATAAGTAATAAAATAATGTCAGGTAACAAGAGACATAAAAACA s ponAbe2.chr14 18907195 44 + 108868599 -AATAAGTAATAAAATAATGTCAGGTAACAAGAGACATAAAAACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87993978 44 - 170124641 -AATAAGTAATAAAATAATGTCAGGTAACAAGAGACATAAAAGCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88272245 44 - 171882078 -AATAAGTAATAAAATAATGTCAGGTAACAAGAGACATAAAAGCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85398180 44 - 162156779 -aataagtaataaaataatgtcaGGTAACAAGAGACATAAAAGCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87740466 44 - 132174527 -AATATGTAATAAAATCATGTCAGGTGACAAGAGATATAAAAACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46866610 45 - 64190966 GACAGGGTAATAAAATGATGTCAAGTAACCAGAGACATGAAAACG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3559894 16 - 24206276 I a score=1720508.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 374889 852 + 478999 TGCACATGTGTTATAATGTCTCTATGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGCACGAAAAGTTTTCCATGAGATAGAACTTGCTGTTAGGAAAGAGATCTAGAATAGTATATGGCTGCCCTTTGTAAATCCCTCATGAGAGGAACTAAGAC--AGTCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAATTGTTCTATTGGAAATAATTTATGTAGGCTCATGGAGTTAAACAAAGGAGGAAACATTTTT----AACTACGCAAATCTTATTTCAACTAATATATATTCTTTAGCATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCACCCCATAGAGGCTCTGGTTCATAGAGTTCAGACGTCTGATACTGGTGTTCCTGAAATTCTACCACAAAAATGATCAAGAGTTAGTTTGGCAGATTGTTTATTGCTTTTTT-GTCCATTATCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATCTCACAGGGGAG---------ATTAGTAGATGCTAGAAAAATTATGTTAATGTTACACAGTCTG-AAGAGGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTCTATCTTTAAATCTTGTGCAGTTTCTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTGGGTCCTAGACTATGATTAATTTGATGAACTCCTCAGGAGGAGTCTAGATAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGAATAGATCAGCTTCCCAAACATCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTAAATACATCTATGCAAGAATATAGAATGTACTCTGTTGCTGCTCCAGTCAAAGGAGTATACTTGGGAGGGTAGGTGTGAGCAGTAGATA--C s ponAbe2.chr14 18907239 854 + 108868599 TGCACATGTGTTATAATGTCTCTACGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGCACGAAAAGTTTTCCATGAGATAGAACTTGCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAATAGTATATGGCTGCCCTTTGTAAATCCCTCATGAGAGGAACTAAGAC--AATCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAATTGTTCTATTGGAAATAATTTATGTAGGCTCATGGAGTTAAACAAAGGAGGAAACATTTTTCTTTAACTACGCAAATCTTATTTCAACCAATATATATTCTTTAGTATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCACCCCATAGAGGCTCTGGTTCA--GAGTTGAGATGTCTGATACTGGAGTTCTTGAAATTCTACCCCAAAAATGATCAAGAGTTAGCTTGGCAGATTGTTTATTGCTTTTTTTGTCCATTATCTAATTTTAGTTTTAC-CATGggtagcattatctcacagaggag---------gttaatagatgttagaaaaattatgttaatgttacacagcctg-aagaggcagagctg-tgag---------ttgttctatctttaaatcctgtgctgtttcTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTGGGTCCTAGACTATGATTAATTTGATGAAATCCTCAGGAGAAGGCTAGATAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGAATAGAGCAGCTGCTCAAACATCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTTAATACATCTATGCAAGGATATAGAATGTACTCTGTTGCTGCTCCAGTCAAAG-ACTCCTTTTGAGAGGGTAGGTGTGAGCAGTAGACA--C i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87994022 859 - 170124641 TGCACATGTGTCATAATGTCTCTATGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGTACGAAAAGTTTTCCATGAGATAGAACTTGCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAATAGTATATGGCTGCCCTTTGTAAATCTCTCAGGAGAGGGACTAAGAC--AATCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAGTTGTTCTATTGGAAATAATTTGTATAGGCTCATGGAGTTAAATAAACGAGGAAACTTTTTTCTTTAATTACACAAATCCCATTTTAACTAATATATATTCTTTAGCATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCATCCCATAGAGGCTCTGGTTCATAGAGTTCAGATGTCTGATACCGGTGTTCCTGAAATTCTACCACAAAAATGATCAAGAGTTAGTCTGGCAGATTGTTTATAGATTTTTTTGTCCATTGTCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATGTCACAGGGGAG---------GTTAATAGATGTTAGAAAAATTATGTTAATGTTACATAGCCTG-AAGAAGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTCTATCTTTAAATCCTGTGCTGTTTCTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTAAGTCCTAGACTTTGATTAATTTGATAAACTCCTCAGGAGGAGTCTAGATAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGAATACAGCAGCGGTCCAAATATCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTGAATACATCTGTGCAAGGATATAGAATGTACTCCGTTGCTGCTCCAGTGAAAGGAATATATTTGAGAGGGTGAGTGTGAGCAGTAGATACAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88272289 859 - 171882078 TGCACATGTGTCATAATGTCTCTATGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGTACGAAAAGTTTTCCATGAGATAGAACTTGCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAATAGTATATGGCTGCCCTTTGTAAATCTCTCAGGAGAGGGACTAAGAC--AATCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAGTTGTTCTATTGGAAATAATTTGTATAGGCTCATGGAGTTAAATAAACGAGGAAACTTTTTTCTTTAATTACACAAATCCCATTTTAACTAATATATATTCTTTAGCATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCATCCCATAGAGGCTGTGGTTCATAGAGTTCAGATGTCTGATACCGGTGTTCCTGAAATTCTACCACAAAAATGATCAAGAGTTAGTCTGGCAGATTGTTTATAGATTTTTTTGTCCATTGTCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATGTCACAGGGGAG---------GTTAATAGATGTTAGAAAAATTATGTTAATGTTACATAGCCTG-AAGAGGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTCTATCTTTAAATCCTGTGCTGTTTCTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTAAGTCCTAGACTTTGATTAATTTGATAAACTCCTCAGGAGGAGTCTAGGTAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGAATACAGCAGCGGTCCAAATATCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTGAATACATCTGTGCAAGGATATAGAATGTACTCCGTTGCTGCTCCAGTGAAAGGAATATATTTGAGAGGGTGAGTGTGAGCAGTAGATACAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85398224 859 - 162156779 TGCACATGTGTCAGAATGTCTCTATGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGTATGAAAAGTTTTCCATGAGATAGAACTTGCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAATGGTATATGGCTGCCCTCTGTAAATCCCTCAGGAGAGGGACTAAGAC--AATCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-GGAGTTGCATTCTTTGAAGTTGTTCTATTGGAAATAATTTGTGTAGGCTCATGGAGTTAAATAAACgaggaaacttttttctttaattacacAAATCCTATTTTAACTAATACATATTCTTTAGCATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCATCCCATGGAGGCTCTGGTTCATAGAGTTCAGATGTCTGATACCGGTGTTCCTGAAATTCTACCACAAAAATGATCAAGAGTTAGTCTGGCAgattgtttattgattttttggtcCATTGTCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATCTCACAGGGAAG---------GTTAATAGATATTAGAAAAATTATGTTAATGTTACATAGCCTG-AAGAAGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTCTATCTTTAAATCCTGTGCTGTTTCTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTAAGTCCTAGACTTTGATTAATTTGATAAACTCCTCAGGAGGAGTCTAGATAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGAATACAGCAGCGGCCCAAACATCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTGAATACATCTGTGCAAGGATATAGAATGTAGTCCGTTGCTGCTCCAGTCAAAGGAATATATTTGAGAGGGTAAGTGTGAGCAGTAGATACGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3559910 859 - 24206276 TACACATGTGTCATAATGTCTCTATGAGGGATATTGAAGTCAAGAACACTATTGTACGAAAAGTTTTCCATGAGATAGGACTTGCTGTTAGGGAAGAAATCCCGAATAGTATATGGCTGCCCTTTGTAAATCCCTCAGGAGAGGGACTAAGAC--AATCTCTTTCCCAGAAGATTCCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAGTTGTTCTATTGGAAATAATTTGTGTAGGCTCATGGAGTTAAATAAACGAGGAAACTTTTTTCTTTAATTACACAAATCCCATTTTAACTAATATATATTCTTTAGCATTGTCTTAGAGAGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCTGGGTAGACCAGTAGAAACAATCCATCCCATAGAGGCTCTGGTTCATAGAGTTCAGATGTCTGATACCGGTGTTCCTGAAATTCCACCACAAAAACGATCAGGAGTTAGTCTGGCAGATTGTTTGTTGATTTTTCTGTCCATTATCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATCTCACAGGGGAG---------GTTAATAGATGTTAGAAAAATTATGTTAATGTTACATAGCCTG-AAGAAGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTTTATCTTTAAATCCTGTGCTGTTTCTCCCAGCAAAGATAGCAAAAAGATCTTGAGTCCTAGACTTTGATTAATTTGATGAACTCCTCAGGAGGAGTCTAGATAAAGTTGAG-TTGTCACCACTCAGGGTGATTACAGCAGCGGTCCAAACGTCTTTGGGCATCCATGCTTGAACTCTTGAATACATCTGTGCAAGGATATAGAATGTAGGCCGTTGCTGCTCCAGTCAAAGGAACATATTTGAGAGGGTAAGTGTGAGCAGTAGATACAC i chlSab2.chr29 I 16 C 0 s calJac3.chr10 87740510 842 - 132174527 TGCACAAGTGTCATGATGTCTCTATGAAGGATATTGAAGTCAAGGACACCGTTACAGAAAAAGTTTTCCATGACATAGAGCTTGCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAATAGTGTATAGCTGCCCTTTGT-AATCCCTCATGAGAGGAACTAAGAT--AATATCTTTCTCAGAAGATACCA-AGAGTTGCATTCTTTGAAATGGTTCTATTGGAAATAATTTATATAGGCTCATGCAGTTAAATAAAGGAGGAAACTTTTTTCTTTAGCTACACAAATCCTATTTTAACTAATGCATATTCTTTAGCATTGTCTT----AGATCAAGTTTAACCT-AAGAACCCAGGTAGACCAGTAGAAACAGTCCATCCCATGGAGGCTCTTGTTCATAGAGTTCAGATGTCTGACTC-----TTCCTGAAATTCCACCA-AAAAATGATGAAGAGTTTGTCTGGCAAGTTGTTTATTGCTTTTTTTTTCT-TTATCTAATTTGAGTCTTAC-CATGGGTAGCATTATCTCACAGGGGAG---------ATTAGTAGATGTTAGAAAAATTATGTTAATGTTACACAGTCTG-AAGAGGCAGAGCTG-TGAG---------TTGTTCTATCTTTAAGTCTTGTGCTGTTTCTCCAAGCAAAGTTAGCAAAAAGATCCTGGGTCCTAGA--TTGATC--TTTGATGAACTCCTGAGGAGGATCATAGATAAAGTAGAG-TTGTCACCACTCATGGTGAATAGAGCAGCTACCCAAATATCTTTGGGCAT-TATGCTTGAACTTTTAAATACATCTAGGCAAGGATATCAAATGTACTCTGTTGCTGCTCCAGTCAGAAGAATATATTTGAGAGGGTAGGTGTGAGCAGTAGATACAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46866655 868 - 64190966 TGTACACGTGTCATAATGTCTCTGTGAGGAATATTGACGTCAAGGATGCTATGGCACAAAGAGTTTTCTGTGGGATGGAACTTCCTGTTAGGAAAGAGATCCAGAGTATTTGCTCTCCTCTCCTTGCATGTTGCTCACAGAGGAAATTAAGACTGAATCTGTTTCCCTGAGGATTTCAGGGAGCTTCAGTATTGATATTTGTTTTATTTGAAATAATTTAGTGGGGCTTATGGAGTCAAATAAGGGAGCAATCTTATTTCTTTAAC---------ACCAGTATCACTAGTATATGTTCTTTGGTGTTATCC--GAGAGACCGAATTTGACCTAAAGAACCTGGACAGACCTGTGGAAATGATCCATCCCATACAGGCCCTGGCCCACAGTGTTCAGACGTTTGATAGTGATGTTTCTGAAGTTCTTTCACTGAAATGATTATGACTTAGATTGACTGGTAACTTGTTgcttttat-gtccattaattaatttgatccttacatgggggcattattctttcccaggggaggactctgaagttaacagaagtgaggaaacttgtgttaggatgacacagcctgtaagagtcagagctgttgagtcaggcttattgttctatctttaagtcctgtgctctttcTCCCAGAGAAGATAGT-AGAAGATCTTGGGTCTTAGACTTGGATTAATTTTAAAGGCTCCCGAGGAG-ACCCCAGATAAAGTTGAGATTGTTACTATTCAGGAAGAATATAGCAGCTGCCCAAATATCTTTGGGTATCCTTGCCGGAACCCCTAAAGTGAGCCATTCAAAAATCTGGACTATCTTCTGGTACTACTCTAGCCCAAG-AACATATTTGAGAATGTGGGTGTCAGCACTAGATAC-- i canFam3.chr15 C 0 I 653 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=37632.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 375741 19 + 478999 AGTCTAAGATTTGGACAAG s ponAbe2.chr14 18908093 19 + 108868599 AGTCTAAGATTTGGACAAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87994881 19 - 170124641 AGTCTAAGATTTGGACAAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88273148 19 - 171882078 AGTCTAAGATTTGGACAAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85399083 19 - 162156779 AGTCTAAGATTTGGACAAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3560769 19 - 24206276 AGTCTAAGATTTGGACAAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87741352 19 - 132174527 AGTCTAAGATTTGGACAAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46867523 653 - 64190966 I a score=496008.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 375760 251 + 478999 CAT-AAGCATGCATATAGGTGAGAATCAGGAGATTAACATAGTAAGGAGGTTAGTGTTCTAAGATGACTCCTATCCAGGCTTCTGGCTCTCCTTCCAATCAACATTTTCTCTGATAGCAAAGATGGataatgataattatatatttgcttaaagtatgttatgcacataagtgctttatatgtaatatat--ttaatatgtataacactctatataaatgtactattcttatccacattttacacttgagaaaa s ponAbe2.chr14 18908112 253 + 108868599 CAT-GAGCATGCATGTAGGTGAGAATCAGGAGATTGACATAGTAAGGAGGTCAGTGTTCTAAGACGACTCCTATCCAGGCTTCTGTCTCTCCTTCCAATCAACATTTTCTCTGATAGCTAAGATGCataatgataattatatattcacttaaagtacattatgcacataagtcctttacatgtaatatatatttaatatgtataacactctatataaaggttctattcttatccacattttacacttgagaaaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87994900 253 - 170124641 CAT-GAGCATGCATATAGATGAGAATCAAGGGGCTAATATAGTAAGGAGGTTAGTGTTCTAAGATGACTCCTATCTAGGTGTCTGTCTCTCCTTCCAATCAGCATTTTCTCTGATAGCTAAGATGGataatgataattatatattcacttaaagtatgttatgcacgtaagtgctttatatgtaatatctatttaatatgtacaacactctatataaatgtactattcttatccacattttacacttgagaata i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88273167 253 - 171882078 CAT-GAGCATGCATATAGATGAGAATCAAGAGGCTAATATAGTAAGGAGGTTAGTGTTCTAAGATGACTCCTATCTAGGTGTCTGTCTCTCCTTCCAATCAGCATTTTCTCTGATAGCTAAGATGGataatgataattatatattcacttaaagtatgttatgcacataagtgctttatatgtaatatctatttaatatgtacaacactctatataaatgtactattcttatccacattttacacttgagaata i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85399102 253 - 162156779 CAT-GAGCATGCATATAGATGAGAATCAAGAGATTAACATAGTAAGGAGGTTAGTGTTCTAAGATGACTCCTATCTAGGTGTCTGTCTCTCCTTCCAATCAGCATTTTCTCTGATAGCTAAGATGGATAATGATAATTATATATTCACTTAAAGTATGTTATGCACATAAGTGCTTTATATGTAATATCTATTTAATATGTACAACACTCTATATAAATGTACTATTCTTATCCACATTTTACACTTGAGAATA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3560788 252 - 24206276 CAT-GAGCATGCATATAGATGAGAATCAAGAGATTAACATAGTAAGGAGGTTAGTGTTCTAAGATGACTCCTATCTAGGTGTCTGTCTCTCCTTCCAATCAGCA-TTTCTCTGATAGCTAAGATGGataatgataattatatattcacttaaagtatgttatgcacataagtgctttatatgtactatatatttaatatgtgcaacactctatataaatgtactattcttatccacattttacacttgagaata i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87741371 251 - 132174527 CATAAAGCATGCATGTAGGTGAGAATCAGGAGATGAATATAGTAAAGAGGTTCATGTTCTAAGATGACTCCTATCTGGGCTTCTGTCTCTTCTC---ATCAGCATGTTCTCTGGTAGCTAACATGGATAATGATAATGCTATATTTgcttagagtatgttatgcacataagtgttttatatgtaatatatatttactatgtgtaacactctatataagtgtactattcttacccacattttacatctgagaaaa i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46868176 239 - 64190966 CAT-GGAAATACATATACATGGAAATTAGGAGATGAACATAGCAAGGATTTTGGTGTCCTAGGATGACTCCTTCCCAGACTTCT--CCCTTCTTCCATTCAGCATGTTCTCCAGTCATGAAGATGGGTGATGATAATGATATATTCACTTATAGTGTGACATGTGCAT-AGTGCTTCACAGGTGATCCTTAT-----------ACCACTTAAATGGTGTGTACTATTCTTACCCACATTTAACCCTTGAGAAAA i canFam3.chr15 I 653 I 12 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=2219940.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 376011 1306 + 478999 ctgaggcaaagggaagtgaagtaacttgcctaaagtcataaagttagtaaatgctgaagct-gaaatttgaaagtagaccagttagggttccagGCATCTT---TTTCACAACTTCTCTCCCCCACCTTCCATCGCAGCTACTCTACTCCTGTGGCTG-GATCTTTCTTTATGGCACCCCAATTAAT------TCAATTGCTAACTTTTAAGCTTAACACACAAGActctgtaatctagacttgccttcttgtcagcctcatctcctgacactttcctatgtggattgtgtgctgaatcatactcaacttgctggcactccccaaagaggatggtgtaatgatttttaccttcac------atattctatttgctaggcctggaaagttcttcctgccctGTCTATTCTTTTGTGCCCACACCCTGCAATCCTCATCATCATCAGTTTAACTC-TAACTCATCTATCAGAATTCCACTCAGTGACAACGTTTGAAAAGGCAGTCCTGTCTCTCCTGGGCTTCCTTCCTGAGCCCCTTCACAGAGAACTGTCACAGTTTACATGTGGACCTCCTCCACTTGATTGAGAATACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATGAATGATCAGTATCACATCACTTGTTATTACATCCCCACTGTAAATTTAATTTGAGAAAAGTTGG-CACAGACTCTATGCTGTGATGATCTTGCTAGTTGCAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATAGTGTATATAATT--AAAAAAAACTTTTCATGATTAGAAGAAAAGGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTTAAGGCTTTCAAATGAGAAACATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCcaggatatgcatagtagttaggaaaatagatcctgaagactcattgcgtgggttcaaataccaactctgccaatcactagatctataaccttggggaagttacttactctttctgtgcttcagtttcctcatttctgaagtgggaatagtagtgatggactactttataagatcattgtgggagttaaatgagct---atatgtaaaacatctagaatcaaacttggcatatagtaagtacAAT----GTGTTTTCTGTTTACCTAAACATTTTTTCAGCCCTTATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGCGCAATTTGACTTTGCTGGTATAGGACGCCGATTATTTAAAGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGGAAGCAATTGTTTAAATTCAATTCTTTTTgtggtggcaggtgacagtaatcccagctacttgggaggc s ponAbe2.chr14 18908365 1307 + 108868599 ctgaggcaaagggaagtgaagtaact-gcctgaagtcataaacttagtaaatggtgaagcc-gaaatttgaacgtagacaagttggggttccaggcgtcttcttTTTCACAACTTCTCTCCCCCACCTTCCATCGCAGCTACTCTCCTCCTGTGACTG-GATCTTTCTTTATGGCACCCCAGTTAAT------TCAATTGCTAACTTTTAAGCTTAACACGCAAGACTTGGTAatctagacttgccttcttttcagcctcatctcctgacactttcctatgtgagttctgtgttgaaacatgttcaaattgctgacactccccaaagaggatggtgtaatgatttttaccttcac------atattctatttgctaggcctggaaagttcttcccgccctGTCTATTCTTCTGTGCCCACACCCTGCAATCCTCATCATCATCAGGTTAACTC-TAACTCATCTGTCAGAATTCCACTCAGTGACAGAGTTTGAAAAGGCAATCCTGTCTGTCCTGGGCTTCCTTCCTGAGCCCTTTCATGGAGAACTGTCACAGTTTACATGTGGACCTCCTCCACTTGATTGACAGTACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCAGTATCGCATCACTT---ATTACATCCCCACTGTAAATTTAATTTGAGAAAAGTTGGGTACAGACTGTATGCTGTGATGATCTTGCCAGTTGTAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATAGTGTATATAATT--AAAAAAA-CTTTTCATGATTAGAAGAAAAGGAGTCTTTTGATTAATGTAGAAAGTTTAAAGCTTTCAAATGAAAAAGATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCcaggatatgcatagtagttaggaaaatagatcctgaagacccattgcgtaggttcaaataccgactctgccaatcactagatctataaccttgggcaagttacttactctttctgtgcttcagtttcctcatttctgaagtggtaatagtagtgatagactactttataagatcattatgggagttaaatgagct---aaatttaaaacatctagaatcaaacttggcatacagtaagtacaatat--gtgttTTCTGTTTACCTAAACATTTTTTCAGCCCTTATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGCACAATTTGGCTTTGCTGGTATAGGGCACAGACTATTAAAAGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGAAAGCAATTGTTTAAATTCAGTTCTTTTTgtggtggcaggttcctgtaattccaactacttggggggc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87995153 1325 - 170124641 ctgaggcaaagggaagtgaagtaacttgcctaaagtcataaagttagtaaatggtgaagca-gaaatttgaacctagacaagttggggttccagGCATCTTCTTTTTTACAACTTCTCTTCCCCAGCTTCCATCGCAGCTACTTTCCTCCTGTGGCCATGATCTTTCTTTATGGCACCCCAATTAATTCAAGATCAATTGCTAACTTTTAAGCTTAACACACAAGActctgtaatctaggcttgccttcttttcagcctcatcttctgccacttttctatgtggattctgtgctgaatcatactcaacttgctggcactccccaaagaggatggtgtgatgatttttaccttcac------atattctatttgctaggcctgcaaagttcttcctgccctgtctactcttttgtgcccacaccctgcaatcctcctcctcatcaggttaactc-taactcatctatcagaattccacccagTGACAGCATTTGAAAAGGCAATCCTATCTCTCCTGGGCTTCCTTCTTGAGCCCTTTCCCAGAGAACTGTCACAGTTTACATGTGGACCTCCTCCACTTGATTGACAATACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCAGTATCCCATCACTTGTTATTACATCCCCACTGTAAATTTAATGTGAGAAGAGTTGGGCACAGACTCTATGCTGTGATGATCTTGCCAGTTGTAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATAGCATATATAATTAAAAAAAAAACTTTTCATGATTAGAAGAAAAAGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTGAAGGCTTTCAAATGAGAAACATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCTaggatatgcgtagtagttaggaaaataaatcatgaa-tcccattgcctaggttcaaataccaactctgccagtcactagctctatgaccttgggcaagttagttactctttctgtacttcagtttcttcatttctgaagtgggaataggagtgagatactactttataagatcattatgggcattaaatgagctataatatgtaaaacatctagaatcaaagttggtatatagtaagtacattataagtgttttctattTACCTAAGCATTTTTTCAACCCTAATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGCACAATTTGGCTTTGTTGGTAAGGGGCACAAACTATTCAATGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGAAAGCAATTGTTTAAATTCAGTTCTTTTTgtggtggcaagtgcctgtaatcccagctactcgggaggc i rheMac3.chr7 C 0 M 557 s macFas5.chr7 88273420 1326 - 171882078 ctgaggcaaagggaagtgaagtaacttgcctaaagtcataaagttagtaaatggtgaagca-gaaatttgaacctagacaagttggggttccagGCATCTTCTTTTTTACAACTTCTCTTCCCCAGCTTCCATCGCAGCTACTTTCCTCCTGTGGCCATGATCTTTCTTTATGGCACCCCAATTAATTCAAGATCAATTGCTAACTTTTAAGCTTAACACACAAGActctgtaatctaggcttgccttcttttcagcctcatcttctgccacttttctatgtggattctgtgctgaatcatactcaacttgctggcactccccaaagaggatggtgtgatgatttttaccttcac------atattctatttgttaggcctgcaaagttcttcctgccctGTCTACTCTTTTGTGCCCACACCCTGCAATCCTCCTCCTCATCAGGTTAACTC-TAACTCATCTATCAGAATTCCACCCAGTGACAGCATTTGAAAAGGCAATCCTATCTCTCCTGGGCTTCCTTCTTGAGCCCTTTCCCAGAGAACTGTCACAGTTTACATGTGGACCTCCTCCACTTGATTGACAATACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCAGTATCCCATCACTTGTTATTACATCCCCACTGTAAATTTAATGTGAGAAGAGTTGGGCACAGACTCTATGCTGTGATGATCTTGCCAGTTGTAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATAGCATATATAATTAAAAAAAAAACTTTTCATGATTAGAAGAAAAAGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTGAAGGCTTTCAAATGAGAAACATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCTaggatatgcgtagtagttaggaaaataaatcatgaactcccattgcctaggttcaaataccaactctgccagtcactagctctatgaccttgggcaagttagttactctttctgtacttcagtttcctcatttctgaagtgggaataggagtgagatactactttataagatcattatgggcattaaatgagctataatatgtaaaacatctagaatcaaagttggtatatagtaagtacattataagtgttttctattTACCTAAGCATTTTTTCAACCCTAATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGCACAATTTGGCTTTGTTGGTAAGGGGCACAAACTATTCAATGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGAAAGCAATTGTTTAAATTCAGTTCTTTTTgtggtggcaagtgcctgtaatcccagctactcgggaggc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85399355 1326 - 162156779 CTGAGGCAAAGGGCagtgaagtaacttgcctaaagtcataAAGTTAGTAAATGGTGAAGCC-GAAATTTGAACCTAGACAAGTTGGGGTTCCAGGCATCTTCTTTTTTACAACTTCTCTTCCCCACCTTCCGTCGCAGCTACTTTCCTCCCGTGGCCATGATCTTTCTTTATGGCACCCCAATTAATTCAAGATCAATTGCTAACTTTTAAGCTTCACACACAAGACTCTGTAATCTAGGCTTGCCTTCTTTTCAGCCTCATCTTCTGTCACTTTTCTATGTGGATTCTGTGCTGAATCATACTCAACTTGCTGGCACTCCCCAAAGAGGATGGTGTGATGATTTTTACCTTCAC------ATATTCTATTTGCTAGGCCTGCAAAATTCTTCCTGCCCTGTCTACTCTTTTGTGCCCACACCCTGCAATCCTCCTCCTCATCAGGTTAACTCTTAACTCATCTATCAGAATTCCACTCAGTGACAGCATTTGAAAAGGCAATCCTATCTCTCCTGGGCTTCCTTCTTGAGCCCTTTCTCAGAGAACTGTCACAGTGTACATGTGGACCTTCTCCACTTGATTGACAATACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCAGTATCCCATCACTTGTTATTACATCCCCACTGTAAATGTAATGTGAGAAGAGTTGGGCACAGACTCTATGCTGTGATGATCTTGCCAGTTGTAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATagcatatataatt-taaaaaaaacttttcatgATTAGAAGAAAAAGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTGAAGGCTTTCAAATGAGAAAGATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCTAGGATATGCGTAGTAGTTAGGAAAATAAATCCTGAACTCCCATTGCCTAGATTCAAATACCAACTCTGCCAGTCACTAgctctatgaccttgggcaagttagttACTCTttctgtacttcagtttcctcatttctgaAGTGGGAATAGGAGTGAGATACTACTTTATAAGATCATTATGGGCGTTAAATGAGCTATAATATGTAAAACATCTAGAATCAAAGTTGGTATATAGTAAGTACATTATAAGTGTTTTCTATTTACCTAAGCATTTTTTCAACCCTAATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGCACAATTTGGCTTTGTTGGTAAGGGGCACAAACTATTCAACGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGAAAGCAATTGTTTAAATTCAGTTCTTtttgtggtggcaagtgcctgtaatcccagctactcgggaggc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3561040 1324 - 24206276 ctgaggcaaagggaagtgaagtaacttgcctaaagtcataaagttagtaaatggtgaagct-gaaatttgaacctagacaagttggggttccagGCATCTTCTTTTTTACAACTTCTCTTCCCCACCTTCCATCGCAGCTACTTTCCTCCTGTGGCCATGATCTTTCTTTATGGCACCCCAATTAATTCAAGATCAATTGCTAACTTTTAAGCTTAACACACAAGActctgtaatctaggcttgccttcttttcagcctcatcttctgacacttttctatgtggcttctgtgctgaatcatactcaacttgctggcactccccaaagaggatggtgtgatgatttttaccttcac------atattctatttgctaggcctgcaaagttcttcctgccctgtctactcttttgtgcccacaccctgcaatcctcctcatcatcaggttaactc-taactcatctatcagaattccactcagTGACAGCATTTGAAAAGGCAATCCTATCTCTCCTGGGCTTCCTTCCTGAGCCCTTTCCCAGAGAACTGTCACAGTTTACATGGGGACCTCCTCCACTTGATTGACAATACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCAGTATCCCATCACTTGTTATTACATCCCCACTGTAAATTTAATGTGAGAAAAGTTGGGCACAGACTCCATGCTGTGATGATCTTGCCAGTTGTAGCTATAGTCTTTGTCTCTAAATAGCGTATATAATT-AAAAAAAAACTTTTCATGATTAGAAGAAAAGGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTGAAGGCTTTCAAATGAGAAAGATATTTGGTGGCTTTGATGCCATCAGACCTaggatatgcgtagtagttaggaaaataaatcctgaaatcccattgcctaggttcaaataccaactctgccagtcactagctctatgacctt-ggcaagttagttactctttctgtgcttcagtttcctcatttctgaagtgggaatagtagtgagagactactttataggatcattatgggcgttaaatgagctataatatgtaaaacatctagaatcaaagttggtatatagtaagtacaatataagtgttttctattTACCTAAATGTTTTTTCAACCCTAATGATTTTGCCAACTGGTGATGACTGAGAACAATTTGGCTTTGTTGGTAAAGGGCACAAACTGTTCAAAGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCAATTGAAGGACTTTGCACGATAAGAAAGCAATTGTTTAAATTCAGTTCTTTTTgtggtggcaagtgcctgtaatcccagctactcgggaggc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87741622 1309 - 132174527 ctgaggcaaaggaaagtgaagtaagttgcctaaagtcgtacagttagcaagcggtgaagccaaaaatttgaacct-----agctggggctccaggaatcttctttttcacaactTCTCTCACATACCTTCCATTG-AGCTACTCTCCTCCTGTGGTTGTGA----TCTTTATGGTACCCCAATTAATTCAAGATTAATTGCTAACTTTTAAGTGTAGCCTACATGATtctataatctaggcttgtcttcttttcagcctcatctcctgacactaccctatgtgggttctgtgctgaatcatattaaacctgttggcacttcccagagaggatggtgtaattatttatacctttacctttgtatattttatttgttaggcttggaaagtccttcctgccctGTCTACTCTTTTGTGCCGACATCCTGCAATCTTCATCATCATCAGGTTAACTC-TAACTCATCTATCAGAGTTCTACTCAGTGACAGCCTTTGAAAAGGAAATCCTATCTCTCCTGGGTCTCCTTCCTGAGCCCTTTCACA-AGAACTGTGATAATTTACATGCGGACCTCCTCCACTTGATTGGCAACACTTGCCAAATCAAATAATGACTGAATTAATGATCGGTATCACATCACTTGTTAGTATATCCCCACTGTAAACTTAATTTGAGAAAAGCTGGTCACAGACTCTATGCCTTGATGATCTTACCAGTTGTAGATATAGTCTTTGTCTCTAAGTAGTGTATATACTT--AAAAAAAACTTTCCGTTATTAGAAGAAAACGAGTCTTTTGATTATTGTAGAAGGTTTAAGGCTTTCAAATGAGAAAGATATTTGGTAGCTTTGATGCCATCAGACCCAGGgtatgcatagtagttaagaaaataaatcttgaagtcccattgcttaggttcacatgtcaactctgccagtcactagctctatgaccttgggcaag----ttactttttctgtgcttcagttttctcatttctgaactgggactaatagtggcagactgctttgtaagatcattatgggagttaaatgagctataatatgtaaaacacctagaatcgaacttggcacatagtaagtacaatgtaagtgttt----tttatCTAAACATTCTTTCAACCCTCATGATTTTGCCAAC---TGCTGACTGAGCACAGTTTGGCTTTGCTGGTATAGAGCATAGACAACACAAAGATTTTAGGAATGTGAAACATATTCTCCGATCGAAGCACTTTGCATGATAAAAAAACAATTATTTAAATTCAGTTCTTTTTAtggtggcaggtgtctgtaatctcagctacttgggaggc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46868415 12 - 64190966 I a score=166310.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 377317 165 + 478999 tgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcggagattgcagtgggccgagatcacgctgttgcactccagcctgggtgacacagtgacacttcctctccaaaaaaTAATAGTAATTAAAAAATAAAATAAAGAATAAGTTCAGTTCTGTTTATGAGAAattta s ponAbe2.chr14 18909672 157 + 108868599 tgaggcagcagaatcacttgaacccaggaggcggagattgcagtgggccgagatcgcgctgttttactccagcctgggtgacagagtgagacttcctctccaaaaaataatattaattaaaaaataa------taataaattCAGTTTT--TTATTGGAAattta i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88274746 164 - 171882078 cgaggcagaagaatcacttgaacccgggaggtggagcttgtagtgggccaagattgcaccactgcactccagcctgggcgacagagtgagacttcctttccaaaaaataataataacaataaaataaaaTAAATAATAAATTCAGTTCT-TTTATAAGAAattta i macFas5.chr7 C 0 I 124 s papAnu2.chr7 85400681 164 - 162156779 cgaggcagaagaatcacttgaacccgggaggtggaacttgtagtgggccaagattgcaccactgcactccagcctgggcgacagagtgagacttcctctccaaaaaataataataacaataaaataaaataaataataaattcagttCT-TTTATGAGAaattta i papAnu2.chr7 C 0 I 122 s chlSab2.chr29 3562364 161 - 24206276 cgaggcagaagaatcacttgaacctggaaggtggagcttgtagtgggccaagattgcaccattgcactccagcctgggcgacagagtgagacttcctctccaaaaaataatgat---aataaaataaaataaataataaATTCAGTTCT-TTTATGAGAAattta i chlSab2.chr29 C 0 I 80 s calJac3.chr10 87742931 159 - 132174527 tgagccaggagaatcactcaaacccaggaagtggaggttgcagtgggccgagatcacggcattttactccagcctgggcaacagagtgagactttgtctc--aataataataataataatataataa----aataataaaTTCAGTTCTTTTTATGAGAAACTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46868415 12 - 64190966 I e rheMac3.chr7 87996478 557 - 170124641 M a score=343514.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 377482 303 + 478999 tctatcta---------------atctttctatctacctatGATTTATTTAAGGATATGTCAGTTATGTGTGTTCTGGAGAAAGAATACCACAATT---ATACCAGTCCTTTCACGGAAAATTATAttgggcaatttgcctctttaatctttagtgct--actctgtaaaaaggagataataaaaattattatatttttgtgaggatggaattaaataacatatgc--agagtttagcacacgattctgcacatggtaaaatgctcagtaaatgttagcttctattaATGATATTTCTTTAATGGAGATTGGCAGATATT---ATAGC s ponAbe2.chr14 18909829 316 + 108868599 tctatctat-------ctatgtaatctttctatctacctatAATTTATTTAAGGATATGTAAGTTATGCGTGTTCTGCAAAAAGAATACCAGAATT---ATACCAGTCCTTTCGCTGAAAATTATAttgggcaatttgcctctttaatctttagtgctctgctccataaaatggagataataaaaattatgatagtgttgtgaagatggaattaagtaacatatgc--agagtttagcacacgattctgtgcatggtaaaatactcagtaaatgttagctactattaATGATATTTCTTTCATGGAGATTGGCACATATTTTTATAGC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88275034 307 - 171882078 tctatcta---------------atctttctatctacctatcatttatttaAGGATTTGTAAGTTAGGTGTGTtctggaataagaatactacaatt---ataccagccctttcactaaaaattatattgggcaatttgcttctttaatctttagtgctctgctctgtaaaatggagataataaaaattatgatattattgtgaggatggaatgaagtaacatacgcaaagagtttagcacacgattctgcacatggtaaaatgctcagtaaatgttagcaactattaATGATATTTCTTTAATGGATATGGGCAGATATT---ATAGC i macFas5.chr7 I 124 C 0 s papAnu2.chr7 85400967 305 - 162156779 tctatcta---------------atctttctatctacctatcATTTATTTAAGGATTTGTAAGTTAGGTGTGTTCTGGAATAAGAATACCACAATT---ATACCAGCCCTTTCACTAAAAATTATATTGGGCAATTTGCCTCTTTAATTTTTAGTGctctgctctgtaaaatggaaataataaaaattatgatattATTGTGAGGGTGGAATGAAGTAACAT--GCAAAGAGTTTAGCACATGATTCTGCACATGGTAaattgctcagtaaatgttagcaaCTATTAATGATATTTCTTTAATGGATATGGGCAGATATT---ATAGC i papAnu2.chr7 I 122 C 0 s chlSab2.chr29 3562605 303 - 24206276 tctatcta---------------a----tctatctacctatcatttatttaAGGATTTGTAAGTTAGGTGTGTtctggaataagaataccacaatt---atactagccctttcactgaaaattatattgggcaatttgcctctttaatctttagtgctctgctctgtaaaatggagataataaaaattatgatattattgtgaggatggaatgaagtaacatatgcaaagagtttagcacacaattctgcacatggtaaaatgctcagtaaatgttagcaactattaATGATATTTCTTTAATGGATATGGGCAGATATT---ATAGC i chlSab2.chr29 I 80 C 0 s calJac3.chr10 87743090 325 - 132174527 TCTGTCTATCGTCTACCTAGCTAATCTTTTTATCTACCTATCATTTACTTAGGGATATGTAAGTTAcgcgtgttctggaataagaataccacaattcaaattccagactttttgctgaaaattattttggacaatttgcctctttactctttagtgctctgctctgtaaaatggatataataaaaattatgatattgttgtgaggatggaatgaagtaacatatgcaaagagtttagcacatgattctgcacatggtaaaatgctcagtaaatgttaggtactattTATGGTATTTCCTTCATGGAGATGAGCAGATAAT---ATAGC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46868415 12 - 64190966 I e rheMac3.chr7 87996478 557 - 170124641 M a score=85822.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 377785 51 + 478999 TATTATCTCAGAAATAAAATTGTATATGTTTTTAATATTTTCTAGTAGTTA s ponAbe2.chr14 18910145 51 + 108868599 TATTATCTCAGAAATAAAATTGTATATGTTTTTAATATTTTCTAGTAGTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87997036 51 - 170124641 TATTATCTCAGAAATAAAATCATATATGTTTTTAATATTTTCTAGTAGTTA i rheMac3.chr7 M 557 C 0 s macFas5.chr7 88275341 51 - 171882078 TATTATCTCAGAAATAAAATCATATATGTTTTTAATATTTTCTAGTAGTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85401272 51 - 162156779 TattatctcagaaataaaattatatatgtttttaatattttctagtaGTTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3562908 50 - 24206276 TATTATCTCAGAAATAAAATTATATATGTTTTTAATA-GTTATAGTAGTTA i chlSab2.chr29 C 0 I 307 s calJac3.chr10 87743415 50 - 132174527 TATTATCTCAGAAATAAAATTATATACG-TTTTAATATTTTGTAGTAGTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46868415 12 - 64190966 I a score=2013838.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 377836 1187 + 478999 CATTATATAGCTTTTATATAATAACTAAATACACCAAATTACAAATTATGCTTACTAGAGAGATTCCACTTGATAGATTCTAATTAAAAGG-Aaacacctcataaattcaaaacatgttctataga---tctcatttgaattctgaaacagctttgtgaggtaaaaaattttatcattcgtcttctataggtgagaaaactgagatccagggaagataaatagatttacccaaagttataaagctgatgagggcactcaaacttacaccactcagcttctgggcagtgctctttctgctCTCCATGCAGAAAAGAGGTATTCTGAGTAAAGACGGAAAATAGCTAGTAATTTTCATATTTCAGAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTCAGATCT---TGTCTAATATTAATCTCCTTTAAGAA-TTTTTTCCTGATTATTTTTATCCATTATTTTTCTCTGTATGATGCAAGGATTCCTATTACAGTTTATAAAATGGCTTCAGACACTTATTTTT----------AAACTATCATTTATAACATTA---TCTGTATGATAAATTTCATTCCTAATTTTT-CCTGTGATCACAAGGACAGAGAGTTATCTGGGTCTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGGATGACAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGATGATAGGGAACTCAGT---AACTTTAAAATGTTTCAACTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTATTTCTCTGTATAAGTTGATCACTTCTCATGTATTCCTTACTGGCAAGCAAAATGGAATTTTCAAACTGCAGGTCCAGGCTTATGATTCAAATTTCCTCAATGTTGATTTATAAGCGCTAAAAATGACTTAATTTTTAATTGAATTGAGACTTTTAAT--CTAATTGAGAAATTGGAAACTGAGTCTTCCTCTCTTGATTAAATAAAATGTTAC-TTTTCTATAGGTGAGTAGCATACATTATATTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCTTATACTCTGACTTCATGCTTTTATTTACAGCCTCAAAAAATTAATTAATTTATT---TAAACAAAGTTCTCACTCCAAAGTAAATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGTGGGGGGAGAGAGAGCACTGATTAGGGAAAAACATTAAATTCAATAAAAAA-GACTCAGATTCTCTAGGTTCTTGTATGGAAAAGAGGAACTATAAGACT s ponAbe2.chr14 18910196 1191 + 108868599 CATTATATAGCTTTTATATAATAACTAAATGCACCAAATTACAAATTGTGCTTACTAGAGAGATTCCACTTGATAGATTCAAATTAAAAGG-Aaacacctcataaattcaaaacatgttctataga---tctcatttgaattctgaaacagctttgtgaggtaaaaaattttatcattcatcttctatagatgagaaaactgagatccagggaagataaatagatttacccaaagttataaagctgatgagggcactcaaacttacaccactcagcttctgggcagtgctctttctgctATCCATGCAGAAAAGAGGTATTCTGAGTAAAGACGGAAAATAGCTAGTAATTTTCATATTTCAGAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTCAGATCT---TGTCTAATATTAATCTCCTTTAAGAA-TTTTTTCCTGATTATTTCTATCCTTTATTTTTCTCTGTATGATGCAAGCATTCCTATTACAGTTTATAAAATGGCTTCAGACACTTATTTTT----------AAACTATCATTTCTAACATTA---TCTGTATGATAAATTTCATTCCTAATTTTT-CCTGTGATCACAAGGACAGAGAGTTATCTGTGTCTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGGATGACAGGGACCTACAAAGGGATTGAGGATGATAGGGAACTCAATGAGAAGTTTTAAATGTTTCAACTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTATTTCTCTGTATAAATTGATCACTTCTCATGTATTCCTTATTGGCAAGCAAAATGGAATTTTCAACCAGCAGGTCCAGGCGTATGATTCAAACTTCCTCAACGTTGATATATAAGCACTAAAAATGACTTAATTTTTACTTGAATTGAGACTTTTTTTTTCTAACTGAGAAATTGGAAACTGAGTCTTCCTTTCTTGATTAAACAAAATGTTAC-TTTTCCATAAGTGAGTAGTATATATTATACTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCATATACTCTGACTTCATGCTTTTATTTACAGCCTCaaaaaattaattaattaaat----aaaCAAAGTTTTCACTCCAAAGTAAATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGTGGGGGGAGGGAGAGCACTGATTAGGTAAAAACATTAAATTCAATAAAAAA-GACTCAGATTCTCTAGGTTCTTGTATGGAAGAAAGGAACTATAAGACT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87997087 1188 - 170124641 CATTATATAGCTTTTAAATAATAACAAAATAGACCAAATTATAAATTGTGCTTACTGGAGAGATTCCACTTGATAGATCCAAATTAAAAGG-Aaacacctcataaattcaaaacgtgttctataga---tctcatttgaattctgaaacagttttgtgaggtaaaaaattttatcattcatcttctatagatgagaaagctgagattcagggaagataaatagatttatccaaagttataaagctgatgagggcactcaaacttataccattcagcttctgggcagtgctctttctgctgtccatgcAGAAAAGAGGTATTCTGAGTAAAGACGGAAAATAGCTTGTAATTTTCATATTTCATAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTTAGATCT---TGTCTAATATTAATTTCCTTTAGGAA-TTTTTTCCTGATTATTTTTAAGCATTA-TTTTCTCTGTATGATGTAAGCATTCCTATTACAGTTTATAAAATGGCTTCAGACACTTATTTTT----------AAACTATCATTTATAACATTATCTTCTGTATGATAAATTTCATTCCTAATTTTTATCTATGATAACAAGGACAGAGAGTTATCTGGGTTTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGCATGACAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGATGATACGGAACTCAAT---AACTTTTAAATGTTTCAACTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTATTTCTCTGTGTAAGTTGATCACTTCTCATGTATTCCTTATTGGCAAGCAAAATGGAATTTTCAACCTGCAGATCAAGGTTTATGATTCAGACTTCCTCAATGTTGATTTATAAGCACCAAAAATGACTTAATTTTTAATTGAATTGAGACTTTCAAT--CTAATTGAGAAATTGGAATCTGAGTCTTCCTCTCTTGATTAAATAAAATGTTAC-TTTTCTATAGGTGAGTAGTATATATTATCTTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCTTATACTCTGACTTCATGCTTTTATTT--TGCCTCAAAAAATTAATTACTTAATTAAATAAACAAAGTTTTCACTCCAAAGCAAATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGT--GGGGAGAGAGAGCACTGATTAGGGAAAAACATTAAACTCAATAAAAAA--TCTCAGATTCTCTAGGTTCTTGTATGGAGAAAAGGAACTATAAGACT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88275392 1186 - 171882078 CATTATATAGCTTTTAAATAATAACAAAATCGACCAAATTATAAATTGTGCTTACTGGAGAGATTCCACTTGATAGATTCAAATTAAAAGG-Aaacacctcataaattcaaaacgtgttctataga---tctcatttgaattctgaaacagttttgtgaggtaaaaaattttatcattcatcttctatagatgagaaagctgagattcagggaagataaatagatttatccaaagttataaagctgatgagggcactcaaacttataccattcagcttctgggcagtgctctttctgctgtccatgcAGAAAAGAGGTATTCTGAGTAAAGACGGAAAATAGCTTGTAATTTTCATATTTCATAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTTAGATCT---TGTCTAATATTAATCTCCTTTAAGAA-TTTTTTCCTGATTATTTTTAAGCATTA-TTTTCTCTGTATGATGTAAGCATTCCTATTACAGTTTATAAAATGGCTTCAGACACTTATTTTT----------AAACTATCATTTATAACATTA---TCTGTATGATAAATTTCATTCCTAATTTTTATCTGTGATAACAAGGACAGAGAGTTATCTGGGTTTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGCATGACAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGATGATACGGAACTCAAT---AACTTTTAAATGTTTCAACTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTATTTCTCTGTATAAGTTGATCACTTCTCATGTATTCCTTATTGGCAAGCAAAATGGAATTTTCAACCTGCAGATCAAGGTTTATGATTCAGACTTCCTCAATGTTGATTTATAAGCACCAAAAATGACTTAATTTTTAATTGAATTGAGACTTTCAAT--CTAATTGAGAAATTGGAATCTGAGTCTTCCTCTCTTGATTAAATAAAATGTTAC-TTTTCTATAGATGAGTAGTATATATTATCTTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCTTATACTCTGACTTCATGCTTTTATTT--TGCCTCAAAAaattaattacttaattaaataaACAAAGTTTTCACTCCAAAGCAAATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGT--GGGGAGAGAGAGCACTGATTAGGGAAAAACATTAAACTCAATAAAAAA-GTCTCAGATTCTCTAGGTTCTTGTATGGAGAAAAGGAACTATAAGACT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85401323 1187 - 162156779 CATTATATAGCtttcaaataataacaaaatagaccaAATTATAAATTGTGCTTACTGGAGAGATTCCACTTGATAGACTCAAATTAAAAGG-AAACACCTCATAAATTCAAAACGTGTTCTATAGA---TCTCATTTGAATTCTGAAACAGTTTTGTGAGGTAAAAAATTTTATCATTCATCTTctatagatgagaaagctgagattCAGGGAAGATAAATAGATTTATCCAGAGTTATAAAGCTGATGAGGGCACTCAGACTTACACCATTCAGCTTCTGGGCAGTGCTCTTTCTGCTGTCCATGCAGAAAAGAGGTATTCTGAGTAAAGACGGAAAATAGCTtgtaattttcatatttcataaaagccatttttatttcaagaaactTTAGATCT---TGTCTAATATTAATCTCCTTTAAGaa-ttttttcctgattatttttaACCATTA-TTTTCTCTGTATGATGTAAGCATTCCTATTATAGTTTATAAAATGGCTTCAGacacttattttt----------aaactatcaTTTATAACATTA---TCTGTATGATAAATTTCATTCCTAATTTTTATCTATGATCACAAGGACAGAGAGTTATCTGGGTCTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGCATGACAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGATGATAGGGAACTcaat---aacttttaaatgtttcaacTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTATTTCTCTGTATAAGTTGATCACTTCTCATGTATTCCTTATTGGCAAGCAAAATGGAATTTTCAACCTGCAGATCAAGGTTTATGATTCAGACTTCCTCAATGTTGATTTATAAGCACCAAAaatgacttaatttttaattgaattgagACTTTCAAT--CTAATTGAGAAATTGGAATCTGAGTCTTCCTCTCTTGATTAAATAAAACGTTAC-TTTTCTATAGGTGAGTAGTATATATTATCTTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCTTATACTTTGACTTCATGCTTTTATTT--cacctcaaaaaattaattacttaattaaataaacaaagttTTCACTCCAAGGCAAATTTCTGACAAGAGAagttggaggt--ggggagagagagcaCTGATTAGGGAAAAAcattaaattcaataaaaaaagTCTCAGATTCTCTAGGTTCTTGTATGGAGAAAAGGAACTATAAGACT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3563265 1187 - 24206276 CATTATATAGCTTTTAAATAATAATAAAATAGACCAAATTATAAATTGTGCTTACTGGAGAGATTCCATTTGATAGATTCAAATTAAAAGG-Aaacacctcataaattcaaaacgtgttctataga---tctcatttgaattctgaaacagttttgtgaggtaaaaaattttatcattcatcttctatagatgagaaagctgagattcagggaagataaatagatttatccaaagttataaagctgatgagggcactcagacttacaccattcaactttt-ggcagtgctctttctgctgtccatgcAGAAAAGAGGTATTCTAAGTAAAGACGGAAAATAGCTTGTAATTTTCATATTTCATAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTTAGATCT---TGTCTAATATTAATCTCCTTTAAGAATTTTTTTCCTGATTATTTTTCACCATTA-TTTTCTCTGTATGATGTAAGCATTCCTATTATAGTTTATAAAATGGTTTCAGACACTTATTTTT----------AAACTATCATTTATAACATTG---TCTGTATGACAAATTTCATTCCTAATTTTTATCTATGATCACAAGGACAGAGAGTTATCTGGGTCTTTTTCAAGGCAAAGGGATTGAGCATGACAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGATGATAGGGAACTCAAT---AACTTTTAAATGTTTCAACTCTTCAGAGCAACATAGAAAAAAGTGTTTCTCTGTATAAGTTGATCACTTCTCATGTATTCCTTATTGGCAAACAAAATGGAATTTTCAACCTGCAGATCAAGGTTTATGATTCGGACTTTCTCAATGTTGATTTATAAGCACCAAAAATGACTTAATTTTTAATTGAATTGAGACTTTCAAT--CTAATTGAGAAATTGGAATCTGAGTCTTCCTCTCTTGATTAAATAAAATGTTACTTTTTCTATGGGTGAGTAGTATATATTATCTTTGAAGGATTCTGAAATTTTATACATCAGATCTTATACTCTGACTTCATGCTTTTATTT--CGCCTCAAAAaattaattacttaattaaataaACAAAGTTTTCACTCCAAAGCAAATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGT--GGGGAGAGAGAGCACTGATTAGGGAAAAACATTAAATTCAATAAAAAA-GTCTCAGATTCTCTAGGTTATGGTATGGAGAAAAGGAACTATAAGACT i chlSab2.chr29 I 307 C 0 s calJac3.chr10 87743465 1178 - 132174527 CATTATATAGCTTTAATATAAATGCTAAATAGATCAAATTGCAAATTGTGCTTACTAGAGAGATTCCATTGCATAGATTCAAATTAAAAGGAAaacacctcataaattaaaaacatgttatatagattgtctcattttaattctgaaacagcattgtgagataaaaaattttatcattca---tctatagatgagaaaactgggattcagggaagataaatagatttgcccaaagttataaggctgataagggcactcaaacttataccactcagcttctgggcagtgctctttctgctATCCATGCAGAAAAGGGGTATTCTGAGTAAAGATGGAGAATAGCTAGTAATTTTCATATTTCAGAAAAGCCATTTTTATTTCAAGAAACTTTATATCTCAATGTCTAA---TAATCTCCTTTAATG--TTTTTTTCTGATCATTTTTATCCAGTC------TCTGTATGACATTAGCATTCCAATTATAGTTTATAAAATTGCTTCAGACACTTTTTTTTTTGAGATGGAGAACTATCATTTATAACATTA---TCTGTATGTAAAATTTCATTCCTAATTTTTACCTATGATTACAAGGAC--AGGGTTATCTGGGTTTTTTTCAAGGCAAAAGGATTGAGGGTGATAGGGACCTGCAAAGGGATTGAGGGTGACAAGGAACTCAGT---AATTTTTAAACGTTTCAACTCTTTACAGCAACACAGAAAATAGTATTTCTCTGTGTAAGTTGTTTACTTCTTATGTATTCCTTATTGGCATGCAAAATGGAATTTTC-ACATGCAAGTCAAGGCTTATAATTCAAACTTCCTCAATGTTGATTTATAAGCACTAAAAATGACTTAATTTTTAATTGAATTGAGACTTTCAAT--CTAATTGAGAAATTGGAAACTGAGTCTTCCTCTCT--ATTAAATAAAATGTTAC-TTTTCTATAGCTGAGTAGTACATATTATATTTGAAGAATTCTGGAATTTTATACATCAGATCTTATACTCTAACTTCATGCATTTATTTAGAGCTTCAAAAAATTAATTAATT--------AAATGAAGTTTTCAC-CCAAAGC-AATTTCTGACAAGAGAAGTTGGAGGT-GGGGGAAAGAGAGCACTGATTAGGGAAAAATGTTGAATTCAATTGAAAA-GTCTCAGATTCTGTAGGTTCTTGTAT-GAAAAAAGGAACTGTAAGACT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46868415 12 - 64190966 I a score=2871389.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 379023 1231 + 478999 AATTATGAAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATAGTGTGGAAATCAAGCTAAAGACAAGAAAAATATTCATGAACTATGTTCAAGAAATATGAAGAACTTCCTCTACCATATTTAACATCATATAGG-TGTTTTCACAAGACTCTTACTGATAGGCTTTACTATGCTTACCATGGTTTATAAC--GTGTTTATTTTTGCAGAGAACCAGAGTCACTCCACGAGTCCTGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAATGCAATTGATGTTCTTTGTCTTATTTCTCCTCTTCTACGTCGTGATCATGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACTCCCGACTACACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGACATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGAAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAGATTTTTGTTTTGACTGTCATGGCTTTTGATCGCTATGCTGCTATCTGCCAATCCCTCCGTTACACTGTCATCATGAGTGCTAATGCTTATACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGGCCCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAATATGTTGGTGGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTCCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCAAAAACAGTCTGCAGAGAGCTGACACAAAGTTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTATAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCGTGTATCTTTATTTATC----TCCATCCACTACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACCACCATCACCCCAATGCTGAACCCACTCATCTATACTCTGAGGAATGAGGA-GTAAAGAATGCCATGAGGTGGCTATGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCACTGAATTAGTGGATACCTTCAATGATCCCTAATTTACTAATA s ponAbe2.chr14 18911387 1236 + 108868599 AATTATGAAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATAATGTGGAAATCAAGCTAATAACAAGAAAAATACTCATGAACTATGTTCAAGAAATATGAAGAACTTTCTCTACCATATTTAACATCATGTAGG-TATTTTCACAAGACTCTTACTGATAGGCTTTACCTTGCTTACAATGGTTTATAACATGTGTTTATTTTTGCAGAGAACCAGAGTCACTCCACCAGTCCTGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAACGCAATTGATGTTCTTTGTCTTATTTCTCCTCTTCTATGTCGTGATCGTGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACCCCCGACTACACACGCCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGACATTGCCTATTCCTCGGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTAGGTTGTGCTGAGATTTTTGTTTTGACTGTCATGGCTTTTGATAGCTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCTGTTACACTGTCATAATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGGCCCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACTCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAACATGCTGGTAGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTAGGGTGTTTCCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCGATGCAAAG--CTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTGCGTGTATCTTTATTTATCTCCATCCATCCACTACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACCACCATCACCCCAATGTTGAACCCACTCATCTATACTCTGAGGAATGAGGATGTAAAGAATGCCATGAGGCAGCTATGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCAGAGAATTAGTGGATACCTTCAATCATCCCTAATTTATTAATA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87998275 1238 - 170124641 AATTATGGAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATACTGTGGAAATAAAGCTAATAATAAGAAAAATATTCATGAACTATGCTCAAGAAATATGAAGAACTTTCCCTACCATATTTAACATCGTGTAGG-AATTTACACAAGACTCTTACTGTTAGGCTTTACCACGCTTACAATGATTTATAACATATATTTATTTTTGCAGAGAACCAGAGTCACTCCACCAGTCCTGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAATGCAATTGATGTTCTTTGTTTTATTTTTCCTCTTCTACGTTGTGATCGTGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACTCCCGACTGCACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGATATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTATTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAGATTTTTGTTTTGACCGTCATGGCTTTTGATCGTTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCCGTTACACTGTCATCATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGGCCCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAATATGTTGGTAGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTCCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCGACGTAAAGCTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCATGTATCTTTATTTATCTCCGTCCATCCACTACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACTACCATCACCCCAATGCTGAACCCACTCATCTATACGCTGCGGAATGAGGATGTAAAGAATGCCATGAGGCGGCTATGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCAGAGAATTAGTGGATACCTTCAATGATTCCtaatttattaata i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88276578 1238 - 171882078 AATTATGGAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATACTGTGGAAATAAAGCTAATAATAAGAAAAATATTCATGAACTATGCTCAAGAAATATGAAGAACTTTCTCTACCATATTTAACATCGTGTAGG-TATTTTCACAAGACTCTTACTGTTAGGCTTTACCATGCTTACAATGATTTATAACATATATTTATTTTTGCAGAGAACCAGAGTCACTCCACCAGTCCTGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAATGCAATTGATGTTCTTTGTTTTATTTTTCCTCTTCTACGTTGTGATCGTGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACTCCCGACTGCACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGATATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTATTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAGATTTTTGTTTTGACCGTCATGGCTTTTGATCGTTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCCGTTACACTGTCATCATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGGCCCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAATATGTTGGTAGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTCCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCGACGTAAAGCTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCATGTATCTTTATTTATCTCCGTCCATCCACTACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACTACCATCACCCCAATGCTGAACCCACTCATCTATACGCTGCGGAATGAGGATGTAAAGAATGCCATGAGGCGCCTATGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCAGAGAATTAGTGGATACCTTCAATGATCCCTAATTTATTAATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85402510 1238 - 162156779 AATTATGGAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATAATGTGGAAATAAAgctaataacaagaaaaatattcatgaacTATGCTCAAGAAATATGAAGAACTTTCTCTACCATATTTAACATCGTGTAGG-TATTTTCACAAGACTCTTACTGTTAGGCTTTACCATGCTTACGATGGTTTAgagcatgtatttatttttgcagagaacAAGAGTCACTCCACCAGTCCTGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAATGCAATTGatgttctttgttttatttctcctcttctaCGTTGTGATCATGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACTCCCGACTGCACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGATATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACTATTTCTTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTgctgagatttttgttttgacCGTCATGGCTTTTGATCGTTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCCGTTACACTGTCATCATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGACCTTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAATATGTTGGTAGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTCCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCAACGTAAAGCTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCATGTATCTTTATTTATCTCCGTCCATCCACTACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACTACCATCACACCAATGCTGAACCCACTCATCTATACGCTGCGGAATGAGGATGTAAAGAATGCCATGAGGCGGCTATGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCGGAGAATTAGTGGATACCTTCAATGATCcctaatttattaata i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3564452 1217 - 24206276 AATTATGGAAGAAATTCAAATGTGAGTCAATAATGTGGAAATAAAGCTAATAACAAGAAAAATATTCATGAACTATGCTCAAGAAATATGAAGAACTTTCTCTACCATGTTTGACATTGTGTAGG-TATTTTCACAAGACTCTTACTGTTAGGCTTTACCACGCTTACAATGGTTTATAACATGTATTTATTTTTGCAGAGAACCAGAGTCACTCCACCAGTCCAGCCTGGGGCCCCATGAAAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTCTGGAATGCAATTGATGTTCTTTGTTTTATTTCTCCTCTTCTACGTTGTGATCATGGTGGGAAATTTGCTCATTTTGCTTATGGTCTTTTCTGACTCCCGACTGCACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGATATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGTATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAGATTTTTGTTTTGACTGTCATGGCTTTTGATCGTTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCCGTTACACTATCATCATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCGCTGTCCTGGTTGGGGGCCTTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGGTTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCGGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACTCTGGTAAATATGTTGGTAGTTGCCAACAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTTCTCATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCGACATAAAGCTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGACTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCATGTATCTTTATTTATCTCCGTCCATCCACCACTTTCCCATTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACCACCATCACCCCAATGCTGAACCCACTCATCTACACGCTGCGGAATGAGGATGTAAAGAACGCCATGAGGCGGCTACGGAGTAGCAAGATCTCCTTGAAGGAAAAGCAGAGAGGATAGTTTGTCAGAATTGCAAAATCAGA---------------------GATCCCTAATTTATTCATA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87744643 1235 - 132174527 AATTATAAAAGAAATTCAAATGTGAGTTAATAATGTGGAAATAAAGTTAATGACAAGAAAAATATTCATGAACTATGTTCAAGAAATATGAAGAACTTTCTCTACTATATTTAACATCACATAGGTTATTTTCATGAGACTCTTATTGTTAGGCTTTACCATGCTTACAATGGTTTATAACATGCGTTTATTTTTGCAGAGAATCAGAGCCACTCCACCA---CTGCCTGGGGCCCCATGAGAGTGGCCAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTGGGACTTTCCCAAGATTTTGGAATGCAATTGATGTTCTTTGCCTTATTTCTCCTCTTCTACATCGTGATCATGGTGGGAAATTTCCTCATTTTGCTTATGGTTTTTTCTGACCCCCGACTACACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCTTTTGTGGACATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACTATTTCCTACTGGGGCTGCATAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAAATTTTTATTTTGACTGTCATGGCTTTTGATCGTTATGCTGCTATCTGCCAACCCCTCCGTTATACCGCCATCATGAGTGCTAATGCTTGTACTGTGCTGGCATCACTGTCCTGGTTGGGGGCCCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTCCAGCTGCCCTTCTGTAATGCTCAGATTATAGACCATTACTTTTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAACTTGCCTGTGCTGATACAACCCTGGTAAACATGTTGGTAGTTGCCAATAGTGGTCTCATCTCCCTGGGGTGTTTCCTTATTCTTTTGGCCTCCTACACAGTCATTCTGTTTAGTCTTCGAAAACAGTCTGCAGAGAGCCGACGCAAGGCTCTCTCTACCTGTGGATCTCATCTGATTGTAGTAACTTTCTTCTTTGTTCCATGTATCTTTATTTATCTCCGCACATCCACTACTTTCCCTTTGGATAAAGCTGTGTCTGTGTTCTATACCACCATCACCCCAATGCTGAACCCCCTCATCTATACGCTGAGGAATAAGGATGTAAAGAATGCCATGAGGCGTCTGTGGAATAGCAAGATCTCGTTGGAGGAAAAGCAGAAAGAATAGTTTGTCAGAATTGTAAAATCAGAGACTTAGTTGATA-CTTCAATGACCCCTAATTTATTAACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46868427 1205 - 64190966 AAGTGTAACAGAAAATCCAATGTGAGTCAATGATGTGGTAAGATAATTAATGGTGAGAAAAACATCCATTAACTGTGTACAAGAGATGCAAAAAGCTTCCTCTACTATATTTAGCATCCCTTAAG-TATTTCCATGAGACTGCTCCTG------CCCACCGTGCTTACAGTGGCTTACGATATTTATTTATTCTTGCAGAGAACCAGAGCCATCCAACCAGTATCACCTGGGTCCCCATGGAAGTGGCTAACAATGTCACTGAGTTTATATTCCTAGGCCTCTCCCAGGATCCTGGAATGCAGTTGATGTTCTTTGCCTTGTTCCTCTTCTTCTACATCGTGATCATGGTGGGAAACCTGCTCATTCTACTTACGGTCTTCTCTGATCCCCGGCTCCACACACCCATGTATTTCTTCCTCAGTAACCTGTCCTTTGTGGACATTGCCTATTCCTCAGCCACAGCACCCAAGATGATTGCAGACTTTGTTTCTGAGAAAAAGACCATTTCCTACTGGGGCTGTGTAACTCAGATGTTTACCTTCCACTTTTTTGGTTGTGCTGAGATTTTTGTCTTGACTGTTATGGCTTTTGACCGTTATGCTGCCATCTGCCAGCCTCTCCGTTATACGACCATCATGAGTGCCAATGCTTGTATCATGCTGGCATCACTGTCCTGGCTGGGAGCGCTGGGTCATTCCTTTGTTCAGACCCTCCTGACCTTTCAGCTGCCTTTCTGCCATAATCAGGTCATTGACCACTACTTCTGTGATGTCCACCCAGTCCTAAAGCTTGCCTGTGCTGATACAACCCTGGTAAATATGTTGGTGATTGCCAACAGTGGTCTCATCTCTTTAGGGTGCTTCCTCATTCTTCTGGCCTCCTACACTGTCATTCTCTTTAGTCTTCGCAAGAGGTCTTCAGAGAGCCGGCGCAAGGCTCTTTCTACCTGTGGGTCTCATTTCACTGTAGTAACGTTCTTCTTTGTCCCTTGTATCTTTATTTACCTCCGTCCATCCACTACTTTCCCCCTGGATAAGGCTGTGTCTGTGTTCTATACTACCATCACCCCAATGCTGAACCCGCTCATCTACACTCTGAGGAATGAGGATGTAAAGAATGCCATGAAACGCATATGGAATAACATGGTCTCCTTGAAGGAAAAGTAAAAGGGATAGGTCATCAGAATTGTAAAATCTGAGAATTAGCTAATA--------------------------- i canFam3.chr15 I 12 T 51804 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=72888.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 380254 49 + 478999 -ATT--AAAAAAACAGTTCCTAAAATGCAG----CTTTTATATTTTGTCTAACAGG s ponAbe2.chr14 18912623 48 + 108868599 -GTT--AAAAAAA-AGTTCCTAAAATGCAG----CTTTTATATTTTGTCTAAGAGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87999513 48 - 170124641 -att--aaaaaaattGTTCCT-AAATGCAG----CTTTTATGTTTTGTCTAACAGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88277816 48 - 171882078 -ATT--AAAAAAATTGTTCCT-AAATGCAG----CTTTTATGTTTTGTCTAACAGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85403748 49 - 162156779 -att-aaaaaaaattgttcct-aAATGCAA----CTTTTATGTTTTGTCTAACAGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3565669 48 - 24206276 -ATT--TTAAAAATTGTTCTT-AAATGCAG----CTTTTATACTTTGTCTAACAGG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87745878 51 - 132174527 -ATGAAAAAAAAATACTTCCGAAAATGCAG----CTTTTATATTTTGTCTAGCAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46817828 54 - 64190966 ATTT--TAAGAAATAGTTCCTAAAATTTAGCTATCTTGTACTTTTCACTTAACAGG i canFam3.chr15 T 51804 I 51750 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=396218.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 380303 206 + 478999 AAATAATTTGAGGCTATTTT--------------AGACGGGCTAAACTTAAACCTTTCCATACTTGGCAAGGTTTATTCTCT----CTTCTAGAGTACAAGAGTTAACACTCCTACTCAATATCTCATTTAACCTCGTTAAATCCCTTCTATTCACATCAAACTCTCTTAAGCTACCATTCAGTAATTTAGAGTGGGGTTATAAGAGAAAGATATCCCTGATCA s ponAbe2.chr14 18912671 206 + 108868599 AAATAATTTGAGGCTATTTT--------------AGACAGGCTAAACTTAAACCTTTCCATACTTGGCAAGGTTTATCTTCT----CTTCTAGAGTAAAAAAGTTAACACTCCTACTCAATATCTCATTTAACCTCGTTAGATCCCTTCTATTCACATCAAACTCTCTTAAGCTACCATTCAATAATTTAGAGTGGGGTTATAAGAGAAAGATATCCCTGATCA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87999561 210 - 170124641 AAATAATTTGAGGCTATTTT--------------AGACAGGCTAAACTTAAACTTTTCCATGCTTGGCAAGGTTTATCCTCTCTTACTTCTAGAGTAAAAGAATTAACGCTGCTACTCAATAGCTCATTTAACCTCGTTAGATCCCTTCTATCCACATCAAACTCTCTTAAGCTACAAATCAATAATTTAGAACGGGGTTATAAGAGAAAGATATTCCTGGTCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88277864 210 - 171882078 AAATAATTTGAGGCTATTTT--------------AGACAGGCTAAACTTAAACCTTTCCATGCTTGGCAAGGTTTATCCTCTCTTACTTCTAGAGTAAAAGAATTAACGCTGCTACTCAATAGCTCATTTAACCTCGTTAGATCCCTTCTATCCACATCAAACTCTCTTAAGCTACAAATCAATAATTTAGAACGGGGTTATAAGAGAAAGATATTCCTGGTCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85403797 210 - 162156779 AAATAATTTAAGGCTATTTT--------------AGACAGGCTAAACTTAAACCTTTCCATGCTTGGCAAGGTTTATCCTCTCTTACTTCTAGAGTAAAAGAGTTAACGCTGCTACTCAATAGCTCATTTAACCTCGTTAGATCCCTTCTATCCACATCAAACTCTCTTAAGCTACAAATCAATAATTTAGAACGGGGTTATAAGAGAAAGATATTCCTGGTCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3565717 209 - 24206276 AAATAATTTGAGGCTATTTT--------------AGACAGGCTAAACTTAAACCTTTCCATACTTGGCAAGGTTTATCCTCTCTTACTTCTAGAGTAAAAGAGTTAACGCTGCTACTCAATAGCTCATTTAACCTCGTTAGATCCCTTCTATCTACATCAAACTCTCTTAAGCTACAAATCAATAATTTAGAA-GGGGTTATAAGAGAAAGATATCCCTGATCA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87745929 199 - 132174527 AAATAATTTGAGACTATTTC--------------AGACAGTCTAAACTTAAACCTTTCAGTGCTTGGTAAGATTTATCCTCT----CTTCTAGAGTGAAAGGGTTAAC------ACTCAATATCTCACTTAACC-CGTTAGATTCCTTCTGCTCACATGAAATGCTCTTAAGCTACAATTCAGTAATTTAGAATGACGTTATAAGAGAAAGATATCCCGGATCA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46869632 206 - 64190966 AAATAATTTGAGTCTATTTTCTTTTTCTCTTATGAGGTGGACTAAACTTAGACCTTTCCATAAT--GTCAAGTCTATCTTGTCTCACTT------TAGGAGAGTAAACATGTCAACTCA---------TTAACTCTTTTAGATCCCTTCAATTCAAATTATGCTTTCTTAAGCTATAA-TGAATGATTTAGAATGAGGTTATGAGAGAAAGATATCTCTGAGAA i canFam3.chr15 I 51750 T 51733 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=15198.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 380509 9 + 478999 TATCTTCTC s ponAbe2.chr14 18912877 9 + 108868599 TATCTTCTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87999771 9 - 170124641 TATCTTCAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88278074 9 - 171882078 TATCTTCAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85404007 9 - 162156779 TATCTTCAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3565926 9 - 24206276 TATCTTCTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87746128 9 - 132174527 TATCTTCTC i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46869838 51733 - 64190966 T a score=523709.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 380518 302 + 478999 ACCATATCATGTCTCTTCAAAAAAGAGGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACC-T-----------------------------------------------TTTCCCTCCttcttttgttttctttttcgtccttctctagtcttttcttATACATATTGcaaaatctagtcagggaaacagatttgcaaggagataattacaatacaaTACAACAAATGCAG--------ACATAGAAATACATACTTCCTATAATGAAGAGGGTTAGTATAAATCAACAAATTGCCCAAAGGATGGTTTCTGTGC---AGGAAAAAAAAAAATAGAACTTTACATATTTTGAGGTGGACAGCAATTTCTT s ponAbe2.chr14 18912886 312 + 108868599 ACCATATCATGTCTCTTCAAAAAAGAAGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACC-TTGt----------------------------------tccctccttctttccttccttcttttattttctttttcttccttCTCTAgtcttttcctataaatattgcaaaatctagtcacggaaacagatttgcaaggagataattataatgcaatacaacaaatgcag--------acatagaaatataTATTTCCTACAATGAAGTGGGTTAGTATAAATCAACAAATTGCCCAAAGGATGGTTTCTGTGC---AGG---AGAAAAAATAGAACTTTACATATTTTGAGGTGGATAGCAATTTCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 87999780 294 - 170124641 ACCAGATCATGTCTCTTCGAAAAAGAAGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACTGTTGt----------------------------------tccctccttctttccttccttacttcattttctttttcttccttttctAATATTTTCCTATAAATATTGcaaaatctagttggggaaacagatttgcaaggagataattataatgcaatacaacaaatgcag--------acatagaaatatatacTTCCTAC-------------------AATCAATAAATTGCCTGAAGGATGGTTTCTGTAC---AGG---AAAGAAAATATAACTTTACATATTTTGAGGTGGACAGCAATTTCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88278083 294 - 171882078 ACCAGATCATGTCTCTTCGAAAAAGAAGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACTGTTGt----------------------------------tccctccttctttccttccttacttcattttctttttcttccttTTCTAGTATTTTCCTATAAATATTGcaaaatctagttggggaaacagatttgcaaggagataattataatgcaatacaacaaatgcag--------acatagaaatatatacTTCCTAC-------------------AATCAATAAATTGCCTGAAGGATGGTTTCTGTAC---AGG---AAAGAAAATATAACTTTACATATTTTGAGGTGGACAGCAATTTCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85404016 294 - 162156779 ACCAGATCATGTCTCTTCGAAAAAGAAGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACTGTtgt----------------------------------tccctccttctttccttccttccttcgttttctttttcttccttttctagtattttcctATAAATATTGCAAAATCTAGTTGGGGAAACAGATTTGCAAGGAGATAATTATAATGCAATACAACAAATGCAG--------ACATAGAAATATATACTTCCTAC-------------------AATCAATAAATTGCCTGAAGGATGGTTTCTgtac---agg---aaagaaaatataactttacATATTTTGAGGTGGGCAGCAATTTCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3565935 313 - 24206276 ACCAGATCATGTCTCTTCAAAAAAGAAGTCTAATTTACCAGAAGCTGCACTGTTGT----------------------------------TCCCTCcttctttccttccttatttcgttttctttttcttCCTTTTCTAGTATTTTCCTATAAATATTGCAAAATCTAGTTGGGGAAAGAGATTTTCAAGGAGATAATTATAATACAATACAACAAATGCAG--------ACATAGAAATATATACTTCCTACAATGAAGAGGGTTAGTATAAATCAATAAATTGCCTGAAGGATGGTTTCTGTAC---AGG---AAAGAAAATATAACTTTACATATTTTGAGGTGGACAGCAATTTCTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87746137 290 - 132174527 ACGAGATCATGTCTCTTCAAAACAGAAGTCTAATTTACTGGAAGCTGAACTCTTGT----------------------------------TCCCTCCTTC-----------------------TTTTCTTCCTTTCCTAGTCTTTTCCAATAAATATTGT--ACtctaggaaaggaaacagatttgcaaggagataattataatacaaTACAA-AAATACCG--------ACTTAGAAATATATACTTTCTATAATGAAAGGGGTTAGTATAAATCAACAAATTGCCCAAAGGATGGTTTTTGTAC---AGGAAAAAAAAAAATAGAACTTTACATATTTTGAGGTGCACAGCAAtttctt i calJac3.chr10 C 0 T 359 s canFam3.chr15 46818105 353 - 64190966 ATCAGACCATTTATGTTAAAAACAGAAGTGTAACTCCCCAGAAActgcctccttgtctccctgccatcctctctttcttctttctcttcctctcttgtcctttccctcttttcttcttttttcccatttttctttcctagtctttccCCAAAAATATCACATAATATGGTAGGGCATATGGATTCATAAAGAGGTAATGGAGATACAGAATAACAAATACAGAAATGATTACATAGAAATTTACACTATATACAATTAAGA-TGTTAGTGTAAATTCACAAACTGTCCAAAGAATGTTTTTTGTACAATAGG---GAAAAAGGGAACATTTTATATATTT---GGTGTGGAGCAATTTTT- i canFam3.chr15 T 51733 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=363957.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 380820 253 + 478999 CAAAGACCCTCTTGGAGAATTTGAATACTCTTCTACC-CATTACTATAATACTATCTTTACTGAAAGAAATCTTAC--TTTTTTGCCAATAAAA--ACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGGTATTTGTACCATTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTATTATAAATTTTTAGTTGAAC-TTGTCTTCAGTTCCTTAAAACAACAAAATGGAAtaagcacattttc-ttcttgtggtattcttagtaaagt s ponAbe2.chr14 18913198 256 + 108868599 TAAAAACTCTCTTGGAGAATTTGAATACTCTTCTACC-CATTACTATAATACTATCTTTACTGAAAGAAATCTTACT-TTTTTTGGCAATAAAATTACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGATATTTGTACCACTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTATTATAAATTTTTAGTTGAAC-TTGTCTTCAGTTCCATAAAACAACAAAATGGAATAAGCACATTTTC-TTTTTGTGGTATTCTTAGTAAAGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88000074 259 - 170124641 TAAAGACCCTCTTGGAAAATCTGAATACTCTTCTACTACATTACTATAATACTATTTTTACTGAAAGAAATCTTACTCTTTTTTGGCAATAAATACACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGATATTTGTACTATTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTGTTATAAATTTTTAGTTGAAC-TTGTCTTCAGTTCTTTAAAAGAACAAAATGGAATAAACACATTTTCTTTTTTGTGGTATTCTTAGTAAAGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88278377 259 - 171882078 TAAAGACCCTCTTGGAAAATCTGAATACTCTTCTACTACATTACTATAATACTATTTTTACTGAAAGAAATCTTACTCTTTTTTGGCAATAAATACACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGATATTTGTACTATTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTGTTATAAATTTTTAGTTGAAC-TTGTCTTCAGTTCTTTAAAAGAACAAAATGGAATAAACACATCTTCTTTTTTGTGGTATTCTTAGTAAAGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85404310 259 - 162156779 TAAAGACCCTCTTGGAAAATTTGAATACTCTTCTACTACATTACTATAATACTATTTTTACTGAAAGAAATCTTACTCTTTTTCGGCAATAAATACACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGATATTTGTACTATTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTGTTATAAATTTTTAGTTGAAC-TTGTCTTCAGttctttaaaagaacaaaatggaataaacacattttcttttttgtggtatTCTTAGTAAAGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3566248 258 - 24206276 TAAAGATCCTCTTGGAAAATTTGAATACTCTTCTACTACATTACTATAATACTATTTTTACTGAAAGAAATCTTACTCTTTTTTGGCAATAAATACACAGACTAG----ATTAAAGCAACTAAAATGAGTTGATATTTGTACTATTGAAATGACTAAGGAGATGTAATTCTGTTATAAATTTTTAGTTGAAC-CTGTCTTCAGTTCTTTAAAAGAACAAAATGGAATAAGCACATTTTC-TTTTTGTGGTATTCTTAGTAAAGT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46818458 238 - 64190966 TAATGAACATATTGGGAAAATGGAATACT-TTCTATTCTCCCAGTAGTATATTATTTTTGCTGAAAGTTATCCTTATTTATTTTTGCAACA----CACGGAATAGATTCATTAAAGAAACTAAAATGAATTCACATTTGAACTA-------AGCCAAGGAGATGTTCTTGTATTATACATTTTTGGTTAAACTTTATTTTCAATTTTTAAAAAGGACTAAATGG---------ATTCTC-TTTTCCATTTGGTCTTAG----GT i canFam3.chr15 C 0 I 51541 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e calJac3.chr10 87746427 359 - 132174527 T a score=535480.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 381073 408 + 478999 tgaaaaatagttAAGTATTCTCAGTATTCTGGAAAAGGCATTTTTCTTCTAAGAAATTTTCTTAGATCTTGTCTCATGACTGATGTTGTTCAAGAATTCTGCCCTGATTATTTTTGTTCAACATTTATTTTCTATATGCCTTAAGCAATCCTGTATGCAATTTATAAAA---TATCACTTACCTTT--------------------------------------------------------------------TTCTCTTTT--------TTAGTGGATTTTTATCTGAGATCTACAACTTATGAAGAATACAAATGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTTCATGTATGGACTAGAGGGGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAAAATCTGTTGATTGTAACTCCAATTTCTA------TTTTTTTCCTTAGTAATGGGGACCTGACATTATTCATGGTGGCCCAACTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGGCT s ponAbe2.chr14 18913454 409 + 108868599 TGAAAAATAGATAAGTATTCTCAGTATTCTGGGAAACGCATTTTTCTTCTGAGAAATTTTCTTAGATCTTGTCTCATGACTCATATTGTTCAAGAATTCTGCCCTGATAATTTTTATTCAACATTTATTTTCCATATGCCTTAAACAATCCTGTATGCAATTTATAAAA---TATCACTTACCTTT--------------------------------------------------------------------TTCTCTTTT--------TTAATGGATTTTTATCTGAGATCTACAACTTAGGAGGAATATAAGTGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTTCATGTATGGAATAGAGGTGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAAAATCTGTTGATTGTAACTCCAATTTCTAT-----TTTTTTTCCTTAGTAATGGGGAACTGACATTATTTATGGTGGCCCAACTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGGCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88000333 424 - 170124641 TGAAAAACAGATAAGTATTCTCAGTATTCCGGGAAAGGCATTTTTCTCCTGAGAAATTTTCTTAGTTCTTATCTCATGACTCATATTGTTCAAGAATTCTGCCCTGATTATTTTTATTCAACATTTATTTTCTATATGCCTTAAGCAATCCTGTATA-----------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------------------------TGGT-TCCACCACTTATGAAGAATATAAGTGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTCCATGTATGGAACAGAGGGGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAGAATCTGTTGATTATAACTCTAATTTCTAA-----TTTTTTTCCTTAGAAATAGTGACCTGACA-TATTTATGGTGGTCCAATTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88278636 409 - 171882078 TGAAAAACAGATAAGTATTCTCAGTATTCCGGGAAAGGCATTTTTCTCCTGAGAAATTTTCTTAGTTCTTATCTCATGACTCATATTGTTCAAGAATTCTGCCCTGATTATTTTTATTCAACATTTATTTTCTATATGCCTTAAGCAATCCTGTATATAATTTATAAAA---TATCACTTACTTTT--------------------------------------------------------------------TTCTCTTTT--------TTAATGGATTTTTAGCTGGTATCCACCACTTATGAAGAATATAAGTGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTCCATGTATGGAACAGAGGGGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAGAATCTGTTGATTATAACTCTAATTTCTAA-----TTTTTTTCCTTAGTAATGGGGACCTGACATTATTTATGGTGGTCCAATTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85404569 409 - 162156779 TGAAAAACAGATAAGTATTCTCAGTATTCCGGGAAAGGCATTTTTCTCCTGAGAAATTTTCTTAGTTCTTATCTCATGACTCATATTGTTCAAGAATTCTGCcctgattatttttattcaacatttattttctatatgccTTAAGCAATcctgtatataatttataaaa---tatcacttactttt--------------------------------------------------------------------ttctctttt--------ttaatggatttttagcTGGTATCCACCACTTATGAAGAATATAAGTGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTCCATGTATGGAACAGAGGGGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAGAATCTGTTGATTATAactctaatttctaa-----tttttttccttagtaaTGGGGACCTGACATTATTTATGGTGGTCCAATTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3566506 405 - 24206276 TGAAAAACAGATAAGTATTCTCTGTATTCTGGGAAAGGCATTTTTCTCCTGAGAAATTTTCTTAGTTCTTATCTCATGACTCATATTGTTCAAGAATTCTGCCCTG---ATTTTTATTAAACATTTATTTTCTATATGACTTAAGCAATCCTGTATATAATTTATAAAA---TATCACTTACTTTT--------------------------------------------------------------------TTGTCTTTG--------TTAATGGATTTTTATCTGAGATCCACCACTTATGAAGAATATAAGTGATGTATAT----TCTTTTCTACTCTCCATGTATGGAACAGAGGGGCTTGCACAGTAGGTACTTGTCAGAATCTGTTGATTATAACTCCAATTTCTAA-----ATTTTTT-CTTAGTAATGGGGACCTGACATTATTTATGGTGGTCCAACTAAAATATTGCATTGACTTGCCTCAGGTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46870237 390 - 64190966 tgacagccagctaggtgcccTCA----------------------------AGGAACTTTA-TAGATCTTGTTTCATGACTCATATCTTTCAAGAATTCTGCCCTGATTATTTTCATCCAAC----ATTTTCTGTATGCCTTAAGCACACTTCCATACAGTTTATAAAATAGTATCACTTATTTTT--------------------------------------------------------------------TTCTGGTTTTCGTTACCTTAGTGGA-TTTTATGTCATTTCTACAACTTATTAAGGATATAAATAATGCGTTTTACCTCCTTTCCACTCCCTGTATGTGGCACATAGCTGGATGCACAATGGATACTTGTGACAGTCTGCTTGTTCTTACCCCAGTGTCCATCCTTCCTTTTTTTCTTACTAGCAGAGATGTGACATTATTCATGGTGACCCCACGGAAATATTACATTTACCAGTCTC----- i canFam3.chr15 I 51541 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e calJac3.chr10 87746427 359 - 132174527 T a score=84166.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 381481 54 + 478999 CTTTTAAAATTCAATTCAATAATTTAGAATGACCTTATAAGAAAAAGATATTCC s ponAbe2.chr14 18913863 54 + 108868599 CTTTTAAATTTCAATTCAATAATTTAGAATGACCTTATAAGAAAAAGATATTCC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88000757 54 - 170124641 CTTTTAAACTTCAATTCAATAATTTAGAATGACCTTATAAGAAAAAGATATTCC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88279045 54 - 171882078 CTTTTAAACTTCAATTCAATAATTTAGAATGACCTTATAAGAAAAAGATATTCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85404978 54 - 162156779 CTTTTAAACTTCAATTCAATAATTTAGAATGACCTtataagaaaaagatattcc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3566911 54 - 24206276 CTTTTAAACTTCAATTCAATGATTTAGAATGACCTTATAAGAAAAAGATATTCC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87746068 54 - 132174527 CTCTTAAGCTACAATTCAGTAATTTAGAATGACGTTATAAGAGAAAGATATCCC i calJac3.chr10 T 359 I 609 s canFam3.chr15 46870627 3 - 64190966 -TCT-------------------------------------------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=93572.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 381535 65 + 478999 TTTTGAAGCCCA--GTGGACAATCTGATGTTAATAGTAGTTGGTTGGTGGGACTTTTGAAAAGTCTT s ponAbe2.chr14 18913917 65 + 108868599 TTTTGAAGCCAA--GTGGACAATCTGATGTTAATAGTAGTTTGTTGGTGGGGCTTTTGAAAAGTCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88000811 67 - 170124641 TTTTGAAGCCCAGTGTGGACAATCTGATATTAATAGTAGTTGGTTGGTGGCACTTTTGAAAAGTCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88279099 67 - 171882078 TTTTGAAGCCCAGTGTGGACAATCTGATATTAATAGTAGTTGGTTGGTGGCACTTTTGAAAAGTCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85405032 67 - 162156779 TTTTGAAGCCCAGTGTGGACAATCTGATATTAATAGTAGTTGGTTGGTGGCACTTTTGAAAAGTCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3566965 67 - 24206276 TTTTGAAGCCCAGTGTGGACAATCTGATATTAATAGCAGTTGGTTGGTGGCACTTTTGAAAAGTCTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46870630 65 - 64190966 TTTTCA--CTGGGAGTGGATACTATAATGTAGACAGTAGCTGCTGAGGGAGACTTTTGAAAACTGTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e calJac3.chr10 87746122 609 - 132174527 I a score=1124249.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 381600 623 + 478999 TAAAATGGTTTGTCTAC-TCCAGCCCTCTCAT-ACATGATCACCATTAACATTTTGATTATTAAAATTTCTTTATAGTTATTGCATGTCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--AAGGGTCATTCTATCCTTTTTTTAAACTCCTGATTTTTTAAGATAGACAACAAACCCACAAA--TTATATTAAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCTTTTCCCTCCTAAGAGCAAAGTAT-----------TAATAATAAAAATAACAACACTTGCAGTAAGAAaaaaatggctgagacccacaggaacaaag-aaacaggacaggagttagatgca---gagaagagatttcaacaaaagtttggaagaggtaagacaa-aaaagtagtaactgatttggcagggtcgggaaggctaagtctaaactcccaaca-agag--gaatagtgaggaaaaggggagagattcatttcctggaatccctacgatgattgggatg-caggatgccaggtcagcggga-ggtgaggttcagggCTGCTAAT--GAAGATTAAGAGAAAGGAACAGTTCAATCTTCTATCCTCTCT-------TTCTGCTCCCAGATGCTAACGGTAGCATCTGAGTCACAGACAGAACATTGGCACC s ponAbe2.chr14 18913982 613 + 108868599 TAAAATGGTTTGTCTAC-TCAAGCCCTCTCAT-ACATGATCACCATTAACATTTTGATGATTAAAATTTCCTTATAGTTATTGCATGTCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--CAGGGTCATTCTATCTTTT-----AACTCCTGATTTTTTAAGATAAACAACAAACACACAAA--TTATATTAAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCCTTTCCCTCCTAAGAGCAAAGTAT-----------TAACAAT---AACAACAACACTTGCTGTAGGAAaaaaatggcttagacccacaggaacaaag-aaacaggacagcagttagatgca---gagaagagatttcaacaaaagtttggaaaaggtaagataa-aaaagtagcaactgatttggcagggttgggaaggctaagtctgaattaccaaca-agag--gaaTAGTGAGGAAAAGGGGAGAGATTCACTTCCTGGAATCCCTACAATGACTGGGATG-CAGGATGCCAGGTCAGGGGGA-GGTGAGGTTCAGGGCTGCTAAT--GAAGATTAAGAGAATGGAGCAGTTCAGTCTTCCATC--CTCT-------TTCTGCTCCCAGATGCTAATGGTAGCCGATGAGTCACAGACAGAATATTGGCACC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88000878 626 - 170124641 TAAAATGGTTTGTCTAC-TCCAGCCGTCTCAT-ACATGATCACCATGAACATTTTGATGATTAAAATTTCCTTATAGTTACTGCATTGCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--AAGGGTAATTCTATCCTTTTTTT-AACTCCTGATTTTTTAAGATAAACAACAAACACACAAA--TTATATTTAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCTTTTTCCTCCTAAGAGTGAAGTATTATAATAACAATAACAATGACAACAACAACACTTGCAGTGAGAAaaaaatggcttagacccacaggaaca----aaacaggacaggagttagatgcc------aagacatttcaacaaaagtttggaaaatgtaagacaa-aaaagtagtaactgatttgacagcatcaggaaggctaagtctaaattaccaac--agag--gAATAGTGAGGAAAAGGGCAGAGATTCTCTTCCTGGAATCCCTATGATGATTGGGATGCCAGGATGCCAGGTC-GGGGGA-GATGAGGTTCAGGGCTGCTAAT--GAAGGTTAAGAGAAAGGAACAGTTCAATCTTCCATCCTCTCT-------TTCTGCTCCCAGATGCCATCGGTGGCATATGAGTCACAGACAGAATATTGGCACC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88279166 626 - 171882078 TAAAATGGTTTGTCTAC-TCCAGCCGTCTCAT-ACATGATCACCATGAACATTTTGATGATTAAAATTTCCTTATAGTTACTGCATTGCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--AAGGGTAATTCTATCCTTTTTTT-AACTCCTGATTTTTTAAGATAAACAACAAACACACAAA--TTATATTTAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCTTTTTCCTCCTAAGAGCGAAGTATTATaataacaataacaatgacaacaacaacaCTTGCAGTGAGAAaaaaatggcttagacccacaggaaca----aaacaggacaggagttagatgcc------aagacatttcaacaaaagtttggaaaatataagacaa-aaaagtagtaactgatttgacagcatcaggaaggctaagtctaaattaccaac--agag--gAATAGTGAGGAAAAGGGCAGAGATTCTCTTCCTGGAATCCCTATGATGATTGGGATGCCAGGATGCCAGGTC-GGGGGA-GATGAGGTTCAGGGCTGCTAAT--GAAGGTTAAGAGAAAGGAACAGTTCAATCTTCCATCCTCTCT-------TTCTGCTCCCAGATGCCATCGGTGGCATATGAGTCACAGACAGAATATTGGCACC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85405099 627 - 162156779 TAAAATGGTTTGTCCAC-TCCAGCCGTCTCAT-ACATAATCACCATGAACATTTTGATGATTAAAATTTCCTTATAGTTACTGCATTGCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--AAGGGTAATTCTATCCttttttt-AACTCCTGATTTTTTAAGATaaacaacaaacacacaaa--ttatatttaaaatgatagaatACATTaggtttcctttttcctcctaagAGCGAAGtattataataacaataacaatgacaacaacaacactTGCAGTGAGaaaaaaaTGGCTTAGACCCACAGGAACA----AAACAGGACAGGAGTTAGATGCC------AAGACATTTcaacaaaagtttggaaaatgtaagACAA-AAAAGTAGTAACTGATTTGACAGCATCAGGAAGGCTAAGTCTAAATTACCAAC--AGAG--GAATAGTGAGGAAAAGGGCAGAGATTCTCTTCCTGGAATCCCTATGATGATTGGGATGCCAGGATGCCAGGTCAGGGGGA-GGTGAGGTTCAGGGCTGCTAAT--GAAGGTTAAGAGAAAGGAACAGTTCAATCTTCCATCCTCTCT-------TTCTGCTCCCAGATGCCATCGGTGGCATATGAGTCACAGACAGAATATTGGCACC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3567032 623 - 24206276 TAAAATGGTTTGTCTAC-TCCAGCCATCTCAT-AAATGATCACCATGAACATTTTGATGATTAAAATTTTCTTATAGTTACTGCATTGCCTTATAGTTATTTTCATATTACTTTCCCTTTGCAA--AAGGGTAATTCTATCCTTTTTTT-AACTCCTGATTTTTTAAGATAAACAACAA--ACACAAA--TTATATTTAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCTTTTTCCTCCTAAGAGCGAAGTATTATaataacaataacaatgacaacaacaacaCTTGCAGTGAGaaaaaattggcttagacccacaggaaca----aaacaggacaggagttagatgcc------aagacatttcaacaaaagtttggaaaaggcaagacaa-aaaagtagtaactgatttgacagcatcgggaaagctaagtctaaattaccaac--agagacgaatagtgaggaaaaggacagagattcacttcctggaatccctatgatgattgggatgccaggatgccaggtcaggggga-ggtgaggttCAGGGCTGCTAAT--AAAGATTAAGAGAAAGGAACAGTTCGATCTTCCATCCTC-----------TCTGCTCCCAGATGCCATCGGTGGCATATGAGTCACAGACAGAATATTGGCACC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87746731 635 - 132174527 TAAAATGGTTTTTCTAC-TCCAGTCCTCTCATAACATGATTACCATTAACATTCTGATGATTAAAATTTTCTTATAGTTATTGTATTTTCTTATAGTTATTTTCATATTAATTTCCCTTTGCAA---AGGATCATTCTATTCTTTTTTTAAACTCCTGAGTTTTTAAGATAAACAACAAATACACAAA--TTATATTTAAAATGATAGAATACATTAGGTTTCCTTTTCTCTCCTATGAGCAAAGTATTATAATAACAGTGACAATAACAGTAACAACAATTGCAGCAAGAAaaaaatggtttagacccataggaacaaag-aaatagggcaggagttagatgca---gacaagagatttcaacaaaagtttggaaaaggtaagacaagaaaagtagtaactgatttggtagtatcgggaaggctaagtct-agtaaccaacagagag--aaatactgaagaaaaggccagagatttgcttcct-gaatccctacaatgattgggatgccaggataccaggtCAGGGGGT-TGTGAGGTTCAGGGCTGTTAAT--GAAGATTAAGAGAAAGGAACAGTCCAATCATCCATCCTCTCT-------TTCTGTTCCCAGATGCTAACAGTGGCATATGAGTCATAGACAGAATATTGGCACC i calJac3.chr10 I 609 I 258 s canFam3.chr15 46870695 580 - 64190966 TAAAATGGTTTCTCTGCATTCAGGCCTTCTAT-ACATGATGACTCCTGGCAT------------------------GTTGTTGCATTTCCTTTTAT---TTTTCATACTCCCTTTCCTCTGTAAAAAAGAATCATTCTATCCTTTAA---AAATACTTATCT---------GGAAAAAAATACGCTGACTTTATATTTCAAATTGTGGGCTAAATCGGTTTTCCCTTTTCCTCCTAAGGTCTAAATAA------------------GACAACAACAACAAAAACAGGGAGACAA-----GTTTAGATTCACAGTAACAAAGACAAGAGGACAGAAGTTAGATTCTACAGACAAAGGATTCCAACAAGTATTTGGAAAAGAGAAGGCAA-AGGTGTAGTCACTGATTTGTCTAC-TAGAAAAAGCTAATACT-------------AGAG-TAGATTCTGAAGAGAAATAGACAGATTTATCTCCCAGAATCCTTGACGTGTTTGAGATGCCAGGACACCACATAAGGAAGATGGTGGGGTTTAGAACTAGTAATAGGAAGATGAAGAGGAAGGAATTGTTCAGTCTCCCATCTTCTCTAATCTCCCATCACTCCCAGGTGCTCACACAGGCATACTCTTCACAAAGAAAATATTGACATC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=8572.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 382223 7 + 478999 TTTGTTT- s ponAbe2.chr14 18914595 7 + 108868599 TTTGTTT- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88001504 7 - 170124641 TTTGCTT- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88279792 7 - 171882078 TTTGCTT- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85405726 7 - 162156779 TTTGCTT- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3567655 7 - 24206276 TTTGCTT- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46871275 8 - 64190966 TTTGCATT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e calJac3.chr10 87747366 258 - 132174527 I a score=2971110.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 382230 1748 + 478999 AAGAAACTGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTTGGAGATTACAAATGAAATGGCTACCTTTCTACTGGAACCCTGACCAGAAGTCTGCCAGTTAGTAAG--CTGGCTTAAGAG-------------------ATCAATCTAA----------------------------------AATTTACATAAGGCTTTTG--------AAAAAAAGAAAAAAGTAAGTCTTTAAAAAAG-CCAAAAGGAAACTGGTGGAATTAGAGGTAATTCGTGGGGGGGGGGGGGGG-----GACTGTAAAAA--ACTG-TATCTTCTCATCAATGAAAGAAAATATTTGTAATCTTGAAATAAGAATATGATGTACTGAAAAAATATAGAAAAA-TTATTTTTGGAAGG----TAAAATC----AAAAAGAACAATAAA---CAAAATTAA----------T------------------------ATGGCATTAAAAGAAAT----AAAACAAGT--------------AGTCAAAGAAGTCATAA-AAGTACAGtctctatgaa--agtagaa---t--gaaaatgtcaaa----------gaaatag----------aaaacatgaaagataaaaac---aagaaacacaaggaatcaagttagggg-caaaccattcaactcacacatattccaggaggacaaattaaa---------------------------cagaaggatggatttaaaagaaacaatgaaaataaatttcttagaacagaaaagcttaa-ttttctcgatatgaaagatttactgaatgcccaccacaagatttaaaaaaaatcc---caaggcacgttattatgaaattttatcaccttaacgattgaaaatattgtaaaattattaagaa---a---aaaccatatagctcacgaatgaaca---gaaattcaaatggcatgagtatgctctgtagcaa-gctcatccttagaatacagtggaaaagtttctcacactgattttcaggctagaattctatacagaacaaatctatc--------aggaagatagaataaagcatatttaatcatacaaaaatttataaagtttacttcataagtactctctttttttgaaagtgtgggataatatatcccagc-aaaacaa-gaggaagaaatgagatcaataaactaatatatgcaatgcagg-gtggctaaagccacttt-----aaaaaaaatcccaatctcttttt-----------tctttcttcatgtgagtcaggtaatgtatatatgtcataaggtttgagggaggtacatttcacacaggagtgcaaaaactcagtcatcacgcttatgaactacgaagggatcaaaaggcacttttaagatgacagatgtacagtaggcataggagacaacagaaatggatgaaagcagaagatggaagccctccagg-------TTCATAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAATTTATATTATCTAATAT---ATTGAAGCATCTTAGTTGTAAAGGTACAGTCAATAAGATGAAACAAGTTGATACACTCAAGGAAGGATACATTTATAGAAAATTATATCATTTAGAGTTCCAAC-----AGGAAGTTAATGACACACTTAATATAGGATAATTTGATAA--ACATTTATTTAACGAGATGCTGTCTATGAATTTATAGGTATAGAGTA-CCACACAGGC------------CAGGGGTAAGATGGGGTGGAGCTGTTTACACCATTGTGCCTGAAGGGACTGAGAGAGGGAGGAAATACAGAAACCCC------AAAAAGAGATATTTATGATAGCCATTTGAAAGGAGGAATGACCTTCAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGCCACATGGTCTAGCTTATTCTCCTTCATTCCCCttt----------tccagttttattgaagtatatttgacaaataagaatcatacatatttaaatgtgcaacttgatgttttgaactacgtgtacactg s ponAbe2.chr14 18914602 1766 + 108868599 AAGAAACTGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTCAGAGATTACAAGTGAAATGGCTACTTTTCTACTGCAACCCTGACCAGAAGCCTGCCAATTAGTAAG--CTGGCTGAAGAG-------------------ATCAACCTAA----------------------------------AATTTACATAAGGCTTTtg--------aaaaaaagagaaaagtaagcctttaaaaaag-ccaaaaggaaactggtggaattataggtaattcagggggaaaaaaaaaaaaaaacaactgtaaaaa--actg-tatcttatcatgaatgaaagaaaatatttgtaatctttaaataagaatatgatgcatt-aaaaaatatagaaaaa-ttatttttggaaggtaaataaaatc----aaaaagaacaataaaaattaaaactaa----------t------------------------acaacattaaaagaaat--------caagt--------------agtcaaagaagtcataa-aagtattgtctctatgaa--agtagaa---t--gaaaatgtcaaa----------gaaacag----------aaaatatgaaagatgaaaac---aagaaacacaaggaatcaagttagggg-caaaccattcaactcacacatattccaggaggacaaattaaa---------------------------cagaaggatggatttaaaagaaacaatgaaattaaatttcttagaacagaaaagcttaa-ttttctcgatatgaaagatttactgaatgcccagcacaagatttttaaaaaatcc---caaggcaagttattatgaaattttatcacctcaacaattgaaaatattgtaaaatcattaagaa---a---aaaccacatagctcataaatgaaca---gaaattcaaatggcatgagtatgctctgtagcaa-actcatccttagaatacagtggaaaagtttctcacgctgattttcagcctagaattctatacagaacaaatctatc--------aggaagatagaataaagcatgtttaatcaggcaaaaatttataaagtttacatcataagtactctttttttttgaaagtgtgggataatgtatcccagc-aaaacaa-gagGAAGAAATGAGATCAATAAATTAATATATGCAATGCAGG-GTGGCTAAAGCCACTTT------ACAAAAATCCCAATCTCTTTTT-----------TCTTTTTtcatgtgagtcaggtaatatgtgtatgtcataagatttgagggagctacgtctcacacaggagtgcaaaaactcagtcatcatgcttatgaaccacaaagggatcAAAAGGCACTTTTAAGATGACAGATGTATAGTAGGCATAGGAGACAACAGAAATGGATGAAAGCAGAAGATGGAAGCCCTCCAGG-------TTCATAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAATTTATATTATCTAATAT---ATTGAAGCATCTTAGTTGTAAAGCTACAGTCAATAGGATGAAACAAGTTGATACACTCAAGGAAGGATGCATTTATAGAAAATtatatcatttagatttccaac-----aggaagttaatgacacacttaatataggataatttgataa--agatttatttaaagagatgctgtctatgagtttataggtatagagta-ccacacaggccagtgctataatcaggggtaagatgcggtggagatgtttacaccattgtgcctgaagggactgagagagggaggaaatacagaaaaccc------aaaaagaggtatttatcatagccatttgaaaggaggaatgaccttcagtgggaggtcaaccagcATGTGGCCACAAGTTCTAGCTTATTCTCCTTCATTCCCCttt----------tccagttttattgaagtataattgacaaataagaatcatacatatttaagtgtgcaacttgatgttttgaaatatgtatacactg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88001511 1738 - 170124641 AAGAAAATGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTTGGAGATTGCAAAAGAAATGGCTACCTTTCTACTGGAACCCTAACCAGAAGCCTACCA------------------------------------------ATAAATTAAA----------------------------------CATTTACATAAGGGTTTTG---------AAAAAAGAAAAAAGTCAGTCTTAaaaaaaa-ccaaaaggaaactggtagaattagaggtaattcaggg-----aaaaaaaa-----aactttaaaaa--gctg-tatcttctcatcaatgaaagaaaatatttgtaatctttaaataagaatacgatgcattgaaaaaatattgaaaaacttatttttggaaagtaaataaaatc----aaaaagaacaataaa---caaaattaaaataaattagt------------------------acggcattataagaaaa--------caagt--------------agtcaaagaagtcataa-aagtacagtctctatgaa--agtagag---t--aaaaatgtcaaa----------gaaatag----------aaaataggaaagataaaaac---aagaaacataagaagtcaagttggggg-caaaccattcaactcacacatattccaggaggac-----aaa---------------------------cagaaggatggatttaaaagaaacaatgaaaatgaatttctgagaacagaaaagcttaa-ttttctcaatacgaaagatttactgaatgcccagcacaagattt-aaaaaaatcc---caaggcacattactatgaaattttatcatcttaatgattgaaaatactgtaaaattattaagaa---a---aaaccacatagctcacaaatgagca---gaaattaaaatggcatgagtatgctctgtagcaa-actcatccttaggatacagtggaaaagttcgtcaaactgattttcatcctagaattctatatagaataaatctatc--------aggaagatagaataaagc---tttagtcacgcaaaaatttataaagtttacttcacaagtattctttgtttctgaaagtatgggataatgtgtcccagc-aaaacaa-gaggaagaaatgagatcaataaattaatatatgcaatgcagg-GTGGCTAAAGCTATTTT-----TTAAAAGATCCCAATCTCTTTTCTTTTTCCTTTATCTTTCTtcatgtgagtcaggtaa--tgtgcacgtcataaggtttgagggagatacatctcatgcaggagtgcaaaaactcagtcatcatgcttatgaaccacaaagggatc-AAAGGCACTCTTAAGATGACAGCTGTACAGTAGGCATAGGAGGCAACATAAATGGATGAAAGCAGAAGATGGAAGCCCCCCAGG-------TTCTTAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAATTTATATTATCTAATAT---ATTGAAGCATCTTAGTTGTAAAGGTACAGTCAGTAGTTTGAAACAAGTTTATACACTCAAGGAAGGATACATTTGTGGAAAATTGTATCATTTAGAGTTCCATC-----AGGAAGTTAATGACACACTTAATATAGGATA-----ATAA--AGATTTATTTAAAGAGATGCTGTCTGTGAGTTTATAGGCATAGAGTA-CCACACAGGCCAGTGCTATAATCAGAGGTAAGATGCGATGGAGCTGTTTAAACCATTGTGCCTGAAGGGACTGAGAGAGGGAGGAAATACAGAAACCCC------CAGAAGAGAGATTTATGATAGCCATTTGAAAGGAGGAATGACCTTTAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGCCACATGGTCTAGCTTATTCTCCATCATACCCCttt----------cccagttttattgaagtataattgacaaataagaattgtacatatttaagtgtgcaacttgatgttttgaaatatgtatacactg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88279799 1737 - 171882078 AAGAAAATGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTTGGAGATTGCAAAAGAAATGGCTACCTTTCTACTGGAACCCTAACCAGAAGCCTACCA------------------------------------------ATAAATTAAA----------------------------------CATTTACATAAGGGTTTTG---------AAAAAAGAAAAAAGTCAGTCTTAaaaaaaa-ccaaaaggaaactggtagaattagaggtaattcaggg------aaaaaaa-----aactttaaaaa--gctg-tatcttctcatcaatgaaagaaaatatttgtaatctttaaataagaatacgatgcattgaaaaaatattgaaaaacttatttttggaaagtaaataaaatc----aaaaagaacaataaa---caaaattaaaataaattagt------------------------acggcattataagaaaa--------caagt--------------agtcaaagaagtcataa-aagtacagtctctatgaa--agtagag---t--aaaaatgtcaaa----------gaaatag----------aaaataggaaagataaaaac---aagaaacataagaagtcaagttggggg-caaaccattcaactcacacatattccaggaggac-----aaa---------------------------cagaaggatggatttaaaagaaacaatgaaaatgaatttctgagaacagaaaagcttaa-ttttctcaatacgaaagatttactgaatgcccagcacaagattt-aaaaaaatcc---caaggcacattactatgaaattttatcatcttaatgattgaaaatactgtaaaattattaagaa---a---aaaccacatagctcacaaatgagca---gaaattaaaatggcatgagtatgctctgtagcaa-actcatccttaggatacagtggaaaagttcgtcaaactgattttcatcctagaattctatatagaataaatctatc--------aggaagatagaataaagc---tttagtcacgcaaaaatttataaagtttacttcacaagtattctttgtttctgaaagtatgggataatgtgtcccagc-aaaacaa-gagGAAGAAATGAGATCAATAAATTAATATATGCAATGCAGG-GTGGCTAAAGCTATTTT-----TAAAAAGATCCCAATCTCTTTTCTTTTTCCTTTATCTTTCTtcatgtgagtcaggtaa--tgtgcacgtcataaggtttgagggagatacatctcatgcaggagtgcaaaaactcagtcatcatgcttatgaaccacaaagggatc-AAAGGCACTCTTAAGATGACAGCTGTACAGTAGGCATAGGAGGCAACATAAATGGATGAAAGCAGAAGATGGAAGCCCCCCAGG-------TTCTTAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAATTTATATTATCTAATAT---ATTGAAGCATCTTAGTTGTAAAGGTACAGTCAGTAGTTTGAAACAAGTTTATACACTCAAGGAAGGATACATTTGTGGAAAATTGTATCATTTAGAGTTCCATC-----AGGAAGTTAATGACACACTTAATATAGGATA-----ATAA--AGATTTATTTAAAGAGATGCTGTCTGTGAGTTTATAGGCATAGAGTA-CCACACAGGCCAGTGCTATAATCAGAGGTAAGATGCGATGGAGCTGTTTAAACCATTGTGCCTGAAGGGACTGAGAGAGGGAGGAAATACAGAAACCCC------CAGAAGAGAGATTTATGATAGCCATTTGAAAGGAGGAATGACCTTTAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGCCACATGGTCTAGCTTATTCTCcttcataccccttt----------cccagttttattgaagtataattgacaaataagaattgtacatatttaagtgtgcaacttgatgttttgaaatatgtatacactg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85405733 1740 - 162156779 AAGAAAATGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTTGGAGATCACAAATGAAA-GGCTACCTTTCTACTGGAACCCTAACCAGAAGCCTAcca------------------------------------------ataaattaaa----------------------------------catttacataagggttttg---------aaaaaagaaaaaagtcagtctttaaaaaaa--caaaaggcaactGGTAGAATTAGAGgtaattcaggg-------aaaaaa-----aactttaaaaa--gctg-TATCTTCTCatcagtgaaagaaaatatttgtaatctttaaataagaatatgatacattgaaaaaatatagaaaaaattatttttggaaagtaaataaaatcaaataaaaagaacaataaa---caaaattaaaataaattagt------------------------atggaattataagaaaa--------caaGT--------------AGTCAAAGAAGTCATAA-AAGTGCAGTCTCTatgaa--agtagaa---t--aaaaatgtcaaa----------gaaatag----------aaaataggaaagataaaaac---aagaaacataaGGAGTCAAGTTAGGCG-CAAACCATTCAACTCACACATATTCTAGGAGGAC-----AAA---------------------------CAGAAGGATGgatttaaaagaaacaatgaaaatgaatttcttaGAACAGAAAAGCTTAA-TTTTCTCAATACGAAAGATTTACTGAATGCTCAgcacaagattt-aaaaaaatcc---caagGCACATTACTATGAAATTTTATCATCTTAATGAttgaaaatactgtaaaattattaagaa---a---aaaccACATAGCTCACAAATGAGCA---GAAATTAAAATGGCATGAGTATGCTCTGTAGCAA-ACTCATCCTTAGGATACAGTGGAAAAGTTTGTCAAACTGATTTTCATCCTAGAATTCTATATAGAATAAATCTATC--------AGGAAGATAGAATAAAGC---TTTAGTCATGCGAAAATTTATAAAGTTTACTTCacaagtattatttttttctgaaagtatgGGATAATGTGTCCCAGc-aaaacaa-gaggaagaaatgagatcaataaattaatatatgcaaTGCAGG-GTGgctaaagctatttt-----taaaaagatccaaatctcttttctttttcctttatctttcttcatGTGAGTCAGGTAA--TGTGCACATCATAAGGTTTGAGGGAGATACATCTCATGCAGGAGTGCAAAAACTCAGTCATCATGCTTATGAACCACAAAGGGATC-AAAGGCACTCTTAAGATGACAGCTGTACAGTAGGCATAGGAGGCAACATAAATGGATGAAAGCAGAAGATGGAAGCCCCCCAGG-------TTCTTAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAAtttatattatctaatat---attgAAGCATCTTAGTTGTAAAGGTACAGTCAGTAGTTTGAAACAAGTTTATACACTCAAGGAAGGATACATTTATAGAAAATTATATCATTTAGAGTTCCAAC-----AGGAAGTTAATGACACACTTAATATAGGAta-----ataaagagatttatttaaaGAGATGCTGTCTATGAGTTTATAGGCATAGAGTA-CCACACAGGCCAGTGCTATAATCAGAGGTAAGATGCGGTGGAGCTGTTTACACCATTGTGCCTGAAGGGACTGAGAGAGGGAGGAAATACAGAAACCCC------AAAAAGAGAGATTTATGATAGCCATTTGAAAGGAGGAATGACCTTTAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGCCACATGGTCTAGCTTATTCTCCTTCATACCCCTTT----------CCCAGTTTTactgaagtataattgacaaataagaattgtacatatttaagtgTGCAACTTGATGTTCtgaaatatgtatacactg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3567662 1741 - 24206276 AAGAAACTGA---ATGTTAA---------TGTCACA-TCTGCCTTTGGAGATCACAAATGAAA-GGCTACCTTTCTACTGGAACCCTAACCAGAAGCCTACCA------------------------------------------ATAAATTAAA----------------------------------CATTTGCATAAGGGATTTG---------AAAAAAGAAAAAAGTCAGTCTTTaaaaaaa-ccaaaaggaaactggtagaattagaggtaattcaggg------aaaaaaa-----aactttaaaaa--actg-tatcttctcatcaatgaaagaaaatatttgtaatctttaaataagaatatgatgcattgaaaaaatattgaaaaacttatttttggaaagtaaataaaatcaaataaaaagaacaataaa---caaaattaaaacaaattagt------------------------acggcattataagaaaa--------caagt--------------agtcaaagaagtcataa-aagtacagtctctatgaa--agtagag---t--aaaaatgtcaaa----------gaaatag----------aaaataggaaagataaaaac---aagaaacataaggagtcaagttagggg-caaaccattcaactcacacatattctaggaggac-----aaa---------------------------gagaaggatggatttaaaagaaacaatgaaaatgaatttcttagaacagaaaagcttaa-ttttctcaatatgaaagatttactgaatgcccagcacaagattt-taaaaaatcc---caaggcacattactatgaaattttgtcatcttaatgactgaaaatgctgtaaaattattaagaa---a---aaaccacatagctcacaaatgagca---gaaattaaaatggcatgagtatgctctgtagcaa-actgatccttggaatatagtggaaaagtttgtcaaactgattttcatcctagaattctatatagaataaatctatc--------aggaagatagaacaaagc---tttagtcacgcaaaaatttataaagtttacttcacaagtattctttgtttctgaaagtatgggataatgtgtcccagc-aaaacaa-gagGAAGAAATGAGATCAATAAATTAATATATGCAATGCAGG-GTGGCTAAAGCTATTTT-----AAAAAAGATCTCAATCTCTTTTCTTTTTCCTTTATCTTTCTtcatgtgagtcaggtaa--tgtgcacgtcataaggtttgagggagatacatctcacgcaggaatgcgaaaactcagtcatcatgcttatgaaccacaaagggatcAAAAGGCCCTTTTAAGATGACAGCTGTACAGTAGGCATAGGAGACAACAGAAATGGATGAAAGCAGAAGATGGAAGCCCCCCAGG-------TTCTTAAAACAGAAAGGAGAGGGTGAAAATTTATATTATCTAATAT---ATTGAAGCATCTTAGTTGTAAAGGTACAGTCAGTAGTTTGAAACAAATTTATACAGTCAAGGAAGGATACATTTATAGAAAATtatatcatttagagttccaac-----aggaagttaatgacacacttaatataggata-----ataa--agatttatttaaagagatgttgtctatgagtttataggcatagagta-ccatacaggccagtgctacaatcagaggtaagatgcggtggagctgtttacaccattgtgcctgaagggactgagagagggaggaaatacagaaacccc------aaaaagagagATTTATGATAGCTATGTGAAAAGAGGAATAACCTTTAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGCCACATAGTCTAGCTTATTCTCCTTCATTCCCGttt----------cccagttttattgacgtataattgacaaataagaattgtacatatttaagtgtgcaacttgatgttttgaaatatgtatacactg i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87747624 1790 - 132174527 aagaaaC--A---ATGTTAA-------------------AGCCTTTGGAGATTACAAATGAAATGGCTACCTCTCTCCTGGAACCTTGACCAGAAGCCTACCAAGTAGTAAG--CTGGCTTAAGAGATCAATCTTTTTGCCTTATGTAAATTAAA----------------------------------AATTTGCAT-----TTTTAATGTAAAAAGAAAAGGAAAAAAGTAGGCCTTTAAAAAAAGTCGaaaggaatctggtggaattataggtaattcagtg------aaaaaaa-----aatttttttaa--acta-tatcttctcctcaatgagat---atatttgtaatctttaaataagaatatgatgcact-gaaaaataaagaacaaattatttttggaaagtaaataaaata------aaaaaatagtaaa---caaaattaa-----attaat------------------------atgggattgcaagaaaa--------caagt--------------agtcaaagaagtcgtaa-aagtacagtctttatgga--agtagga---ttaaaaaaagtcaaa----------gaagtgg----------agaaaaggaaagataaaagc---aaggaacataaggtatcaagttggggg--aaaccatttaactgacatgtattccgaaaggacaaga-aaa---------------------------cagagagatgcattaaaaa--------ataaataaatttcttacaacagatatgcttaattttttttgatgtaaaaaatttcctgaatgcccaggacaagatta-aaaaaaatat---caaggcacatttttctgaaattttaccaccttaaagattgaaaatattgtagaattattaagaaaata---aaactacatagatcacaaatgagca---gaaattcaaatggcatgagtatgctttgtagcaa-actcatccctagaatatagtggaaaagttcttcaaactgattttcagcctagaattctatatagaacaaatatatcagt----taggcagatagaataaagcatttttagccatgcaaaaatttataaagtttactttacaagtattcttt-tttttgaaagtgtgggataatgtgtcccacc-aaaacaa-gaggaagaaatgagatcaagaaaTTAATATATGCAATGCAAC-GTGGCTAAACCCACTTTGTCTAAAAAAAAATCCTAATCTCTCTTCTTTTTCCTTTTTCTTTCTtcatgtgagtcaggtaatgtgcacatgtcataagatttgagggaggtacatctcacacaggagtgtgaaatctcagtcatcactcttatgaaccacaaagggatcAAAAGGCACTTTTAAGATTATGGCTGTACAGTAGGCATAGGAGACAACAGAAATGGTTGAAAGCAGAGGATGAAAACCC-CCAGC-------TTCATGAAACAGAAAGGAGAGGGTGGGAATTTATATTATCTAATAC---ATTGGAGCGTCTTAGTTGTAAAGGTAGAGTCAATAGGATGAAACAAGTTAATACACTCAAGGAAGGATACACTTATAGAAAATTATATCATTTAGAGTTCCAACTTCCATAAAAGTTAATGACATACTCAATATAGGCTAATTTGAAAA--AGATTTGTTTAACGAGATACTGTCTATGAGTTTATAGGTATAAAGTA-CCTTACAGGCTAGTGCTATAATCAGGGGTAAGAGGTGGCAGAATTGTTTACACCATTATGGCTGAAGGGACTGAGAGAGGGAGGAAATACAGAAGCCCCCACACACAAAAAAGAGATTTATGATAGTCATTTGAAAGGAGGATTGACATTCAGTGGGAGGTCAACCAGCATGTGGTCACATGGTCTAGCTTATTCTCCTTCATTCCCCttt----------tccagttttattgaggtataattgacaaataagaattgtacatatttaagtgtgcaacttgatagtttgaaatatgtgtatactg i calJac3.chr10 I 258 C 0 s canFam3.chr15 46871283 1662 - 64190966 AAGAAATTAAATTATGTTAGAGAAAAGTCTTTCATGTTCTGCCTTTGGAGATCACAAATAGAAAGGCTGCCTCTCTGCAAGAACCCTGACCAGAAGCCTACTGATTAGTAAGCCCTGGTCT------------------------ATCGATCCAGATCTTTTGGGCAAGATTTTGGTGCCAAACTCTTTAATACACATAAGGCAGTTA-------------AAATAAAAAGTGAGACTTTAGGAAGG-CCAAAGGGGATTTGGTGGAATCCTAGATAAAGCAGAA------AAAAATT-----CACTTTGAAAACCACTGATATCTCCGTATTGACCAGAGAGAATATTTGCAATCCTGAAATGAAAACATGATAC-TTAAAAAACCAATAAAAAG---CGTTTTGGAAACTAAAT----------AAAAAGAGTAATAAA---TAAAATTAAGTCAAATCAATAGAGGGCAATCCTGAGATGAGAACATGATATTTTCAGaaaaataaaaaaaaaatattttGGGGAACTAAATAAAAGAAAGAATAATGAATAaaatcaagacaaatcaatagagggtt--gaaagagtcaaaaatcttcaggaaagcagaattttttttaaaatgaagaaattaaaaatagaaaaaaatatgaaaaatcaagtcaagagttaaaacattcaactcatatttgttccaggagaac-----agagaagacagatgggagaatttttttttccagaggggagaatttaaaag-aacaatgaaagggaagctc-----ataggaaggtttaa-gtctccagatacaaaacgtgtactaagtacccattctagtgatg-agaaaacagtaagtaaggcacattattgtgcaattttattaccctagagattgagaagattttaaagtaattgagag---agacagaaaatataggccacaga-aagtatacaaaatccaaaagtcattagagaattcaataacaacactggaccattccacatggtagaaaggtgcctgaaaccggttttcagcctagaacactgtacagaacaaaaccatcaatcaggtatgaaagcagaataagatcttttcagtcatgccaagatttataaaattt-----ataaggacgctt--tctttgaaagtatgggagaatgtgttccagcaaaaACAACAAAGGGGAAAAGAGGGTGAAGAATT--------CAGTGTAGGTGTGGCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAAAGCACTTTC-AGATGAGAGCTAAACAGCAGGCATAGGCG-CAATAGAAATGGATGAAAGCAGAGGGTAGAAGCCCTGGAAAGGGAGACTTCAGAAAACAGAGAGAAGAGGGGGAG--TTTATATTATCTAAGATGAAAATGGAGCATCTTAGTTATAAGGGCATAG--AATGG------ACAAGTTGATGGGCTT----AAGGATATATTTATAGAAAATtgtatcatttaggacgctaac-----agaaaactgatgacacacacaaaatacaataattc-acaa--agggaaattcacagagggac--cctgtaaaactgtagatatggaggagtcacatggggcagtactataaccagaggttagaagcagtagagctgttatcaccattatgtctgaagggactggaggagagagtagatagaggaaacaa-----------------------------------aagGAGGA-------------------------------------------TAGATTTTTCTTTTTCCTTATTtttttaaattaagacttaattttcttaaagcagtctt--------agattcacagaaaattaaaggaaaagtacaaggattt------cctatacactg i canFam3.chr15 C 0 I 99 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=83925.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 383978 51 + 478999 tgaaatgatcatcacacttaagataattaacatatccattacctcacaggg s ponAbe2.chr14 18916368 51 + 108868599 tgaaatgatcatcacatttaagataattaacatatccattacctcacaggg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88003249 51 - 170124641 tgaagtgatgatcacatttaagatagttaacacatcccttacctcacaggg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88281536 51 - 171882078 tgaagtgatgatcacatttaagatagttaacacatcccttacctcacaggg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85407473 51 - 162156779 tgaagTGATGATCACATTTAAGATAATTAACACATCCCTTACCTCACAGGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3569403 51 - 24206276 tgaagtgatgatcacatttaagataatcagcacatcccttacctcacaggg i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87749414 51 - 132174527 tgaaatgattctcccatttaaaataattagcatatcaattacctcacaggg i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46872945 99 - 64190966 I a score=199353.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384029 114 + 478999 ttatgtttttctgtgtgtggtgtgaacccttaagatct--actcccttagtacatttcagttgtccaatacagtattgcattgtaatacagacaccatgttgtgcattaactctcc s ponAbe2.chr14 18916419 112 + 108868599 t--tgtttttgtgtgtgtggtgtgaacccttaagatct--actcccttagtacatttcagttgtccaatacagtattgcattgtaatacagacaccatgttgtgcattaactctcc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88003300 114 - 170124641 ttacctttttgtgtgtatggtgtgaacccttaagatct--actcccttagtacatttcagttgtccaatacagtattgcattgtaatacagacaccatgttgtgcattaactctcc i rheMac3.chr7 C 0 I 23 s macFas5.chr7 88281587 114 - 171882078 ttacctttttgtgtgtatggtgtgaacccttaagatct--actcccttagtacatttcagttgtccaatacagtattgcattgtaatacagacaccatgttgtgcattaactctcc i macFas5.chr7 C 0 I 15 s papAnu2.chr7 85407524 114 - 162156779 ttacctttttgtgtgtgtggtgtgaacCCTTAAGATCT--ACTCCCTTAGTACATTTCAGTTGTCCAATACAGTATTGCATTGTAATACAGACACCATGTTGTGCATTAACTCTCc i papAnu2.chr7 C 0 I 15 s chlSab2.chr29 3569454 114 - 24206276 ttacctttttgtgtgtgtggtgtgaacccttaagatct--actcccttagtacatttcagttgtccaatacagtattgcattgtaatacagacaccatgttgtgcattaactctcc i chlSab2.chr29 C 0 I 23 s calJac3.chr10 87749465 111 - 132174527 ttacctttttgtgtgtgtggtgagaacccttaagatct--a---tcttaggacatttcagttgtccaatccagtattacgttgtaatatagacaccatgttgtgcattaactcttc i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873044 99 - 64190966 ttatggtttactcttggtgttgtatattttgtaggtttggacatatgtatgacatgt----------atccatcattatattattatacagagtagtttccctgcacca------- i canFam3.chr15 I 99 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=1551.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384143 13 + 478999 agaactcactcat s ponAbe2.chr14 18916531 13 + 108868599 agaactcattcat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88281716 8 - 171882078 gaaattca----- i macFas5.chr7 I 15 C 0 s papAnu2.chr7 85407653 8 - 162156779 gaaattcA----- i papAnu2.chr7 I 15 C 0 s calJac3.chr10 87749576 12 - 132174527 agaactcattca- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873143 13 - 64190966 aaaattctctgtg i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3569568 23 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88003414 23 - 170124641 I a score=582419.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384156 365 + 478999 ttttgcataactgaaactttgtaacctttagtccattatctcctcatttctccctttcctttccactct-tggcaaccgccatcctaccttcagt--------ttgagtattttagattccacacataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtaagttgctttttaaaggctgaataatactcca--ttgcat--------------------------------atatatactaca-------a-ttttctcaggctttattgaggtatgatttacaaataaaatttgcatatatttagggtatatgcatacttacgaaatgattaccacaaccaagctaattaatatattcatcatgttacatcattaccatttgtg----tataatgtgtgtatgtg---tgtgtgttaacactt s ponAbe2.chr14 18916544 365 + 108868599 ttttgcataactgaaactttgtaacctttagtcca-tatctcctcatttctccctttcctttccacttc-tggcaaccaccattctaccttcagt--------ttgagtattttagattccacatataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtatcttgctttttaaaggctgaataatactcca--ttgcat--------------------------------atatatactaca-------atttttttcaggctttattgaggtatgatttacaaataaaatttgcatatatttagggtatatgcctacttatgaaatgattaccacaaccaagctaattaacacattcatcatgttacatcattaccatttgtg----tataatgtgtgtatatg---tgtgtgttaacactt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88003437 364 - 170124641 ttttgcataactgagactttgtaaactttaatcaa-tatttcctcatttctccctttcctttccaccccatggcaaccaccattccacctccagt--------ttgagtattttagattccacatataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtatcttgctttttaaaggctgaataata-tcca--ttgcat--------------------------------atatatactaca-------a-ttttttcaggcttcattgaggtatgatttacaaataaaatttgcatgtatttagggcatatgcatacttatgaaatgattaccacaaccaaattaattaacatattcatcatgttaaatgattatcatttgtg----tataatgtgtgtatgta---tgtgtgttaacactt i rheMac3.chr7 I 23 I 310 s macFas5.chr7 88281724 364 - 171882078 ttttgcataactgagactttgtaaactttaatcaa-tatttcctcatttctccctttcctttccaccccatggcaaccaccattacacctccagt--------ttgagtattttagattccacatataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtatcttgctttttaaaggctgaataata-tcca--ttgcat--------------------------------atatatactaca-------a-ttttttcaggcttcattgaggtatgatttacaaataaaatttgcatgtatttagggcatatgcatacttatgaaatgattaccacaaccaaattaattaacatattcatcatgttacatgattatcatttgtg----tataatgtgtgtatgta---tgtgtgttaacactt i macFas5.chr7 C 0 I 311 s papAnu2.chr7 85407661 362 - 162156779 TTTTGCGTAACTGAGACTTTGTAATCTTTAATCGA-TATTTCCTCATTTCTGCCTTTCCTTTCCACCCcatggcaaccaccattccaccTCCAGT--------TTGagtattttagattccacatataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtatcttgctttttaaaggctgaataatattccg--ttgcAT--------------------------------ATATATACTACA-------A-TTTTTTCaggctttattgaggtatgatttacaaataaaatttgcaTGTATTTAGGGCATATGCATACttatgaaatgattaccacaaccAAATTAATTAACATA---GTCATGTTACATGATTACCATTtgtg----tataatgtgtgtatgta---tgtgtgttaacactt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3569591 365 - 24206276 ttttgcataactgagactttgtaacctttaatcga-tatttcctcatttctccctttcctttccaccccatggcaaccaccattccacctccagt--------ttgagtattttagattccacatataagtgagatcatgcagtatttgtccttct---gtatcttgctttttaaaggctgaataatattcca--ttgcat--------------------------------atatatactaca-------a-ttttttcaggctttattgaggtatgatttacaaataaaatttgcatgtatttagggcatatgcatacttatgaaatgattaccacaaccaaattaataaacatattcatcatgttacatgattaccatttgtg----tataatgtgtgtatgta---tgtgtgttaacactt i chlSab2.chr29 I 23 C 0 s calJac3.chr10 87749588 385 - 132174527 ttttgcataactgaaactttgtaacctttaattga-tatctcctcatttctccctttcctttctacccc-tggcaaccaccattctactttcagt--------t------ttttagtttccacatgtgagtgagatcatgc-----ttgtccttct---gtatcttgcttTTTAAAGTGTGAATAATATTCCAATTTGCatgtgtatatatatatatatatatacacacacacatatatGCTACA-------A--tttttcaggctttattgatgtatgatttacaaataaaaattacatatatttagggtatttgcatatttatgaaatgattaccacaaccaagctaattaacatattcat-atattacatgattaccatttgca----t---atgtgtgtatgtgcattatgtgttaatactt i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873156 308 - 64190966 ctctgc----------cttttcatcct----tccc-tatctccac-cacctccctcacc---ccaagccctagcaaccactgatct--tttcaatgccttttcctgaatgtt-----------atatagttggaatcatatagtatgtagccctttcagatgggcttcttttc-----cttagtgata-tgca--tt---t--------------------------------aagtttcctccatttcCCTA-TCTttt----tttaattgatatgcaattgacacatg----ttacacttgtttcagg----tgtacactatagagat----------------ttcataagtctatacattatgcaactc--ttaccactagtgcagctatcagctgt----------catcttacaacat-- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=17302.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384521 12 + 478999 gagatctacttt--- s ponAbe2.chr14 18916909 12 + 108868599 gagatctacttt--- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88004111 12 - 170124641 gagatctacttt--- i rheMac3.chr7 I 310 C 0 s macFas5.chr7 88282399 12 - 171882078 gagatctacttt--- i macFas5.chr7 I 311 C 0 s papAnu2.chr7 85408023 12 - 162156779 gaaatctacttt--- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3569956 12 - 24206276 gaaatctacttt--- i chlSab2.chr29 C 0 I 5826 s calJac3.chr10 87749973 12 - 132174527 gaggtctacttt--- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873464 12 - 64190966 ---gattacaatgcc i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I a score=3974.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384533 3 + 478999 ctt s ponAbe2.chr14 18916921 3 + 108868599 ctt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88004123 3 - 170124641 ctt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88282411 3 - 171882078 ctt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85408035 3 - 162156779 ttt i papAnu2.chr7 C 0 I 6450 s calJac3.chr10 87749985 3 - 132174527 ctt i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873476 3 - 64190966 att i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I a score=62751.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384536 83 + 478999 agcaaatttgaagctactgtacatttggtctccagtacttactcatcttgtagctgaaagtttgta---------ccctttgaccaaca---tct s ponAbe2.chr14 18916924 82 + 108868599 agcaaatttgaagctactgtacatttggtctccagtactt----atcttgcagctgaaggtttgta---------ccctttgaccaacatcttct i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88004126 86 - 170124641 agcaaatttgaagctactgtacactgggtctccagtacttactcatcttgcagctgaaggtgtgta---------ccctttgaccaacatcttct i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88282414 86 - 171882078 agcaaatttgaagctactgtacactgggtctccagtacttactcatcttgcagctgaaggtgtgta---------ccctttgaccaacatcttct i macFas5.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87749988 83 - 132174527 aacaaattcgaagctactgtactttcactctccagtacttactcatcttgcagctaaaggtttgtg---------ccctttgaccaacatct--- i calJac3.chr10 C 0 I 943 s canFam3.chr15 46873479 90 - 64190966 gacgatattccctatgctttatcttttatccctgtgacttattcattccataactggaagcctatgtctcccaatctctttaatc--catct--- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85408038 6450 - 162156779 I a score=282545.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 384619 461 + 478999 tttt---cctggcatttcccagcccctgctaaccaccactctactgtccattgctatgagtttgatt----ttttaa---------------aatattgcacctgtatgggatatcat---gtagtatttgtcgttatgtatctggcttattgcacttagcataatgtcctccaggtttatccatgt---ggcaaatggcaggatttccttctttttaaggctgaataatccattg-tgtgtgtttgtaccacat-taaaaaaatctatgcatctgtagatgaacacttagtttgtttctatatcttggctagtgt-tacaatgctgcagtgaatttgagagtgcagatatctctttaagatagtggttttatttcttttgcatacatacctagaagtgggattgctgttattatatgagaa--------gtttatt----tt---ttttttgaggagcct-acatactgtcttcaataatggttgcactaatttatatctctaccaa s ponAbe2.chr14 18917006 471 + 108868599 tttt---cctggaatttcccagcccctgctaaccaccactctactgtccattgctatgagtttgatt----ttttta---------------aatattccacctgtatgggatatcat---gtagtatttgtcgttatgtgtctggctaattgtacttagcataatgtcctccaggtttatccatgttgcggcaaatggcaggatttccttcttttaaaggctgcataatccattg-tgtgtgtttgtaccacat-ttaaaaaatctatgcatctgtagatgaacacttaagttgtttctatatcttggctagtgt-tacaatgctgcagtaaatttgagagtgcagatgtgtctttaagatagtggttttatttcttttgtatacatacctagaagtaggattgctg-tattatatgagagatttatttatttatt----ta---ttttttgaggaggct-acatactgccttcaataatggttgcactaatttatatctctaccaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88004212 471 - 170124641 tttt---cctggcatttcctagcccctgctaaccaccactctactcttcattgctatgagtttgatt----ttttta---------------aagattccacctatatgcgatatcatatagtagtatttgtcgttatgcgtctggcttattgcacttagcataatgtcctccaggtttatccatgttgtagcaaatggcaggatttccttctttttaaggctgaataatccatta-tgtgtatttgtaccacat-ttaaaaaatctatgcatctgtagatgaacacttaagttgtttttatatcttggctagtgt-tataatactgcagagaatttgagagtgcagatatgtatttaagatagtggttttatttcttttgcatacacacccagaagtgggattgctg-tatcatatgggag--------gtttattattatt---tttttgggggagcctaacatactgccttcaataatggttgtactaatttatatctccaccaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88282500 470 - 171882078 tttt---cctggcatttcctagcccctgctaaccaccactctactcttcattgctatgagtttgatt----ttttta---------------aagattccacctatatgcgatatcatatagtagtatttgtcgttatgcgtctggcttattgcacttagcataatgtcctccaggtttatccatgttgtagcaaatggcaggatttccttctttttaaggctgaataatccatta-tgtgtatttgtaccacat-ttaaaaaatctatgcatctgtagatgaacacttaagttgtttttatatcttggctagtgt-tataatactgcagagaatttgagagtgcagatatgtatttaagatagtggttttatttcttttgcatacacacccagaagtgggattgctg-tatcatatgggag--------gtttattattatt---ttttttgaggagcct-acatactgccttcaataatggttgtactaatttatatctccaccaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46873569 486 - 64190966 tgtcaaacccccaacttcctcccttcaggcaacagtcacttttccccctgtatttatgggtctgtttctgctttttatttattcatgtgttttagattccacatgtgggtaaaatcat---gtggcatttgtctttc----tctgacttattccgctcagcataataccctccaggtccatccatgttgttgcaaagagcaagatctcattatttttatggctgagtagtattctattgtagatatataccacatcttttttaatccagtcatctatcagtggacacttgggttgcttccatatcttagctattggaaataatactgtaaaaaacttaagggtgcatatatctttttgaattagtagtttcattttctttgggtagatagccagtagcagaattactg-gatcatatggtat--------ttcgact----tttaattttctgagaaacct-ccatgctgtattacatagtggct-taccaatttacactcccatcaa i canFam3.chr15 C 0 I 11391 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85408038 6450 - 162156779 I e calJac3.chr10 87750071 943 - 132174527 I a score=1207287.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 385080 2389 + 478999 aagtttacaagggttttgtattagtccgttctcacactgctaataaagacatatctgagactaggtaatttatataggaaagaggtttaactgacccacatttcagcatggctgggaaggcctcaggaaacttatagtcacagtcatggtggaagaggaagcaaacatgtctttcttcacatggtggcaagagagagaagactgagaactgagtaaaggataaagccccaggtaaagtcatcagatcttgtaagaacttactcactatcacaagaatagcatgagaaaactgcccccatgattcaattacctttcactgggtctctcccatgacatgtgaggactacgggaactataattcaagatgggatttgggtggggacacagccaaaccatatcaggtttcctttacatccttgccaacacatgctatcactggactttttgataaaaggcaatctaacaggtggttggtgatatctcagtgaggttttgatttgccttgatgatttctgattttgagca-ttttttccatatacctgttggccatttgtgtatcttctttggaaaaatatctattcagatcctttgcccattttatgaaatcattttaaaaatatcttttgcccatttagaagcttgtttgtttgctatttggtagtataagttctgtatatattttggatattaactccttattggatgtgtggtatacaaatattttctccctttctgtagatttctctttcatcaaacaaataaagatgagaccaatgtccaggaacttttccccatgtttcctcctaggagtttatggggccgggtctt-atgttaagtctataatccactttgaattaacttttgtgattggaa-taagagaagcacggattctttgcatgtggatatccaatttcccaacatcatttatagacgagtctgtcctttacattgtatattcttggtaccttagttgaaaaaattagctgactgtaggtatgtgagtttagttctgagctttctattctgttttattggtatacatgtttttatgccagcaacatctgttttgattattacagttttgtaatggagttgaaatcaggaagtttaatacctctagctttgaacttatactcaagattgcttaagcttttcatgctcttttatggttgcatatgaatttcagaattattttttccattgctgtgaaaaatgttcattgccattttgatcgggattgcgttgaatgtacagatcattttcagtagtatggactttttaacaatattaattcttccagttcatgaatatgggatatgtttcacttatttttgtcttccacaatttatttcattaatcttttatacttttcagtgtacagatattctacctctttagttaaatttatttgtaagtattttattctttttgatgtgctcataatgataactttttcttgactttttctttctatagatcattattggtgtaaagaaatgcaactgaatttttctgttgattttg-tagtctgcaaaattactgaatttgcttattagttctaacagttttttagtggagtcttcaggattctttctacataggatcatgccatcttctaacagagacactaacttttttatttggatgcactttatttctttttcctaattactttggttatgacgtccagtactatgttgaatggaagtggggagagtggtcttgttcttgatcttagagggaaacatttcaatttctcatc---gagtataatgtttatcataggcttgtgatatacaggctttattgtgttgaggtacattccta----taatttgttgaaaattttgtattgtgaaagaatgttgaattttgtcaaatgatttttctgcatttgtttagatgatctcatggtttttatttcttattctgttaatgtggtgtagcacatttgttgattgtgtatgttggataattcttacatcccaggaataaatcctactttgtcgtgatgcaaaatctttttaatgtcctggtatatttggtttgccagtagtttgttgaggattgttggacctttgttcacaagggacattggcctataatctatatttcttgttggtgtccttatctgggtttggtatgaaggcagcgttggcattgtaaaatgagttttaaaatatcccctcctcttcaactttttggaaggattttagaaggataggtattagttcttttcaaaatatttggtagaattcaactatgaagccatcaggtcctaggattttctttgataggagattttattattgattcaatctccttactcattactgttaagattttctagctcttcatgattcagtcttgtaggctgtatgtgtctaggaatttat s ponAbe2.chr14 18917477 2387 + 108868599 aagtttacaagggttttgtattagtccgttctcacactgctaatagagacatatctgagactgggtcatttataaaggaaagaggtttaactgacccacatttcagcatggctgggaaggcctcaggaaacatacagtcacagtcatggtggaagaggaagcaaacatgtctttcttcacatggcggcaagagagagaagactgagaactgagtaaaggataaagccccatgtaaagtcatcagatcttgtgagaacttactcactatcacaagaatagcatgagaaaactgcccccatgattcaattacctttcactcggtctctcccatgacatgtgaggactacgggaactagaattcaagatgggattggggtggggacacagccaaaccatatcaggtttcctttacatccttgccaacacatgttatcactggactttttgataaaaggcaatctaacaggtcgttggtgatatctcagtgaggttttgatttgtcttgatgatttctgattttgagca-ttttttccatatacctgttggccatttgtgtgtcttctttggaaaaatatctattcagatcctttgcccattttatgaaatcatttttaaaatatcttttgcccatttagaagcttgtttgtttgccatttggtagtatgagttctgtatatattttggatattaactccttattggatgtatggtatacacatattttctccctttctgtagatttcccgttcaTCAAACAAATAAGGATGagaccaatgtccaggaacttttccccatgtttccttctaggagtttatggagccaggtcttaatgttaagtttataatccactttgaattaacttttgtgattggaattaagagaagcatggattctttgcatgtggatatccaatttcccaacatcatttatagaagagtctgtcctttacagtgtatattcttggtaccttagttgaaaaaattagctgactgtatgtatgtgagtttaattctgagctttcaattctgttttattggtctgtatgtttttatgccagcaacatctgtt----ttattacagttttgtaatggagttgaaatcaggaagtttaatacctccagctttgtacttatacttaagattgcttaagattttcatgctcttttgtggttgcatatgaatttcagaattattttttccattgctgtgaaaaatattcattgccattttgatagggattgcattgaatctacagatcattttcagtagtatggactttttaacaacattaattcttccagttcatgaatatgggatatgtttcacttatttgtgtcttccacaatttatttcattaatgttttatacttttcagtgtacagatattctacctctttagttaaatttatttgtaagtattttattgtttttgatgtgctcata---ataagtttttcttgattttttctttctataaatcattattggtgtaaagaaatgcaactgaatttttc---tgattttg-tagtctgcaaaattactgaatttgcttattagttctgacag-tttttagtggagtcttcaggattctttctacatagaatcacgccgtcttctaacagagacactaacttttttatttggatgcactttatttctttttcctaattactttggttatgacgtccagtactatgttgaatggaagtggggagagtggttttgttcttgatctttgagggaaacatttcaatttctcatcattgagtataatgtttatcataggcttctgatatacaggctttattgtgttgaggtacattcctataattaatttgttgaaaattttgtattgtgaaagaatgttgaattttgtctaatgatttttctgcatttgttttgattatctcatggtttttatttcttattccgttaatgtggtgtagcacatttgttgattgtgtatcttggataattcttacatcacaggaataaatcctactttgtcatgatgcaaaatctttttaatgtcctggtatgtttggtttgccagtagtttgttgaggatttttggaccttcgttcacaagggatattgacctataatctatttttcttgttggtgtccttatctgggtttggtatgaaggcaatgttggctttgtaaaatgagttttaaaatatcccctcctcttcaactttttggaaggatttcagaaggataggtattagttcttttcaaaatatttggtagaattcaactatgaagccatcgggtcctaggattttctttgataggagattttattattgattcaatctccttactcgttactgttaagattttctatctcttcatgattcagtcttgtaggctgtatgtgtctaggaatttat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88004683 2374 - 170124641 aagtttacaagggctttgtattagtctgttctcacagtgctaataaagacatatctgagactgggaaatttataaaggaaagaggtttaattgacctatatttcagcatggctgggaaggcctcaggaaacttacagtcacagtcatggtggaagaggaagcaaacatgtctttcttcacgtggtggcaagagagagaagattgagaactgagtgaaggataaagccccatataaagtcatcagatcttgtgagaacttactcaccatcagaagaatagcacgagaaaactgcccccatgattcaattacctttcagtgggtctctcccatgacatgtgaggactacggtaactacaattcaagatgggatttgggtggggacacagccaaaccatatcaggtttccgttacatccttgccaacacatgttatcactggattttttgatgaaaggcaatctaacaggtggtaggtgatatctcagtgaggttttgatttgccttgattatttctgattttgagcatttttttccatatacctgttggccatttgtgtatcttcttgggaaaaatgtctattcagatcctttgcccattttatgaaatcatttttaaaatatcttttgcctatttagaagcttgtttatttgctatttggttgtataagttctttatatatttttggtattaactccttattggatgtatagtatacaaatattttctcccattctgtagatttccctttcatcgaacaaataaagatgagaccaatgtccaggaacttttccccatgcttcctcctaggagtttatggggccaggtcct-atgttaagtctacaatccactttgaattaacttttgtgattggaa-taagagaggcatggattctttgcatatggatatcaaatttcccaacatcatttataga--agtctgtcatttacattgtatattcttggtgcctttgttgaaataattagttgactgtatgtatgtgagtttatttccacgctttctattctgttttattggtctgtgtgtttttatgccagcaacatctgttttgtttattacagttttgtaatggagttgaaatcaggacatttaatacctttagctttgtagttacactcaagattgctttagcttttcatgctcttttgtggttgcatatgaatatcagaattattttttctattgctgtgaaaaatgttcatt-ccattttgatagggattgcattgaatctacagatcattttgagtagtatggattttttaacaatactaattctttcagttcatgaatatgggatatgtttcacttatttgtgtcttccacaatttatttcattaatgttttatacttttcagtgtacagatattctacctctttagttaaatttattcctaagtattttattgtttttgatgtgctc------ataactttttcttgattt----tttctatagatcattattagtgtaaagaaatgcaactgaatttttctgttgattttgttagtctgcaaaatttctgaatttgcttattagttctaactgttttttagtagagtcttccggattctttctacacaggatcatgtca---tctaacagagacactaacttttttatttggatgcattttctttc-ttttcctaattactttggttatgactcccagtactatgttgaatggaagtagggagagtggtcttgttcttgatcttagagataaacatttcaatttttcatcattgagtttaatgtttatcataggcttgtgatatacaggctttattgtgttgaggtacattcctataatttatttgttgaaaattttgtattgtgaaagaatgttgaattttgtcaaatgctttttctgcatttgtttagatgatctcatggtttttatttcttattctgttaatgtggtgtagcacatttgttgattgtgtatgttggataattcttacatcccaggaataaatcctactttgtcatgatgcaatatctttttattgtcctggtatatttggtttgccagtagtttgttgaagatttttggacctttgttaataagggatattggcctataatttatttttcttgttggtgtccttatctggctttggtatgagggcaatgatggcattgtaaaatgag-tttaaaatatcccctcctcttcaatttttttgaaggattttagaaggattggtattagttcttttcaaaatatttggtggaattcaattatgaagccatcaggtcctaggattttctttgataggagattttattattgattcaatctccttactcattactgttaagattttctatttcttcatgattcagtcttgtaggc------tgtctaggaatttat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88282970 2380 - 171882078 aagtttacaagggctttgtattagtctgttctcacagtgctaataaagacatatctgagactgggaaatttataaaggaaagaggtttaattgacctacatttcagcatggctgggaaggcctcaggaaacttacagtcacagtcatggtggaagaggaagcaaacatgtctttcttcacgtggtggcaagagagagaagattgagaactgagtgaaggataaagccccatataaagtcatcagatcttgtgagaacttactcaccatcagaagaatagcacgagaaaactgcccccatgattcaattacctttcagtgggtctctcccatgacatgtgaggactacggtaactacaattcaagatgggatttgggtggggacacagccaaaccatatcaggtttccgttacatccttgccaacacatgttatcactggattttttgataaaaggcaatctaacaggtggtaggtgatatctcagtgaggttttgatttgccttgattatttctgattttgagcatttttttccatatacctgttggccatttgtgtatcttcttgggaaaaatgtctattcagatcctttgcccattttatgaaatcatttttaaaatatcttttgcctatttagaagcttgtttatttgctatttggttgtataagttctttatatatttttggtattaactccttattggatgtatagtatacaaatattttctcccattctgtagatttccctttcaTCGAACAAATAAAGATGagaccaatgtccaggaacttttccccatgcttcctcctaggagtttatggggccaggtcct-atgttaagtctacaatccactttgaattaacttttgtgattggaa-taagagaggcatggattctttgcatatggatatcaaatttcccaacatcatttataga--agtctgtcatttacattgtatattcttggtgcctttgttgaaataattagttgactgtatgtatgtgagtttatttccacgctttctattctgttttattggtctgtgtgtttttatgccagcaacatctgttttgattattacagttttgtaatggagttgaaatcaggacgtttaatacctttagctttgtagttacactcaagattgctttagcttttcatgctcttttgtggttgcatatgaatatcagaattattttttctattgctgtgaaaaatgttcatt-ccattttgatagggattgcattgaatctacagatcattttgagtagtatggattttttaacaatactaattctttcagttcatgaatatgggatatgtttcacttatttgtgtcttccacaatttatttcattaatgttttatacttttcagtgtacagatattctacctctttagttaaatttattcctaagtattttattgtttttgatgtgctc------ataactttttcttgattt----tttctatagatcattattagtgtaaagaaatgcaactgaatttttctgttgattttgttagtctgcaaaatttctgaatttgcttattagttctaactgttttttagtagagtcttcaggattctttctacacaggatcatgtca---tctaacagagacactaacttttttatttggatgcattttctttc-ttttcctaattactttggttatgactcccagtactatgttgaatggaagtagggagagtggtcttgttcttgatcttagagataaacatttcaatttttcatcattgagtttaatgtttatcataggcttgtgatatacaggctttattgtgttgaggtacattcctataatttatttgttgaaaattttgtattgtgaaagaatgttgaattttgtcaaatgctttttctgcatttgtttagatgatctcatggtttttatttcttattctgttaatgtggtgtagcacatttgttgattgtgtatgttggataattcttacatcccaggaataaatcctactttgtcatgatgcaatatctttttaatgtcctggtatatttggtttgccagtagtttgttgaggatttttggacctttgttaataagggatattggcctataatttatttttcttgttggtgtccttatctggctttggtatgagggcaatgatggcattgtaaaatgag-tttaaaatatcccctcctcttcaatttttttgaaggattttagaaggattggtattagttcttttcaaaatatttggtggaattcaattatgaagccatcaggtcctaggattttctttgataggagattttattattgattcaatctccttactcattactgttaagattttctatttcttcatgattcagtcttgtaggctgtatgtgtctaggaatttat i macFas5.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46874055 11391 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85408038 6450 - 162156779 I e calJac3.chr10 87750071 943 - 132174527 I a score=666680.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 387469 861 + 478999 ccatttcttctaggctatccaatcttttgacttgtaatggttcatagtattatcttatgattctttatattttttgtagcatcagttgtaatgtttcctttttcattttggcttttatttatttaag--------tctattttttctcagtgtagatcaagtattgttgattttacttatatttccaaaaatcaatcttagtttcatgatcttttctactgtttctctagtctcactttcattgatttcttttctaatctttgttatgtccttttttt---ctaactttaggcttagtttgttctttttttagttcattgagctgtaatgttaggttgttaatttgagacctttcgtc-ttt-tttttgtaaacatttattactatacatttctcccttaaaactacttttgctgcatcccatacctttttgtatgtcatgtccattttcatgtgtctcaagatatttttacatttaccttttgacttctttttttggcccattggtggttgtttaatttccatatgtacatgaattttccagttttcctgttattattgattttagtttcataccactatggtcagaaaatatatttgatatgatttcagtcttctgaaatttgttaagacttgtttgtggcttaacatacaatctgtccaggagaatattctgtgtaagcttgagaagaatgtgtgttctgctgttggatcaaatattccgtgtatgtctattagattcatttagtctgaagtagttcaagacaatgttttcttaataatattctttctggatgatttatccattgttgaaaatcagatattaaagttctctattaatattgcattgcagtctatctcttgctttagatttg s ponAbe2.chr14 18919864 847 + 108868599 ccatttcttctaggctatccagt-tattga-----------------tattatcttatgattctttatattttttgtagtatgagttgtaatgtctcctttttcattttggcttttatttatttaagtc-----ttctattttttctcagtgtagatcaagtattgttgattttatttatatttccaaaaatcagtcttagtttcatgatcttttctactgtttttctagtcccactttcattgatttcttttctaatctttcttatttccttttttt---ctaactttgggcttagtttgttccttttttagttcattcagctgtaatgttaggttgttaatttgagacctttcctctttt-tttttgtaaacatttattactatacatttctcccttaaaactgcttttgctgcatcccatacctttttgtatgtcatgtccgttttcatttgtctcaagatatttttacatttaccttttgatttctttttttggcccattggttgttgtttaatttccatatgtacatgaattttccagttttcctgttattattgattttagtttcataccattatggtcagaaaatatatttgatatgatttcagtcttctgaaatttcttaagacttgtttgtggcttaacacacaatctgtccaggagaatattctgtgtaagcttgagaagaatgtgttttctgctgttggatcgaagattttgtgtatgtctattagattcatttagtctgaagtagttcaagacaatgttttcttaataatatactttctggatgatttagccattgttgaaaatcagatatttaagttctctattaatattgcattgcagtctatctcttgctttagatttg i ponAbe2.chr14 C 0 M 6673 s rheMac3.chr7 88007057 821 - 170124641 ccatttcttttaggttatccaatcttttgactagtaatggttcatagcattatcttatgattctttatattttttgtagcattagttgtaatgtctcctttttcattttggcttttatttatttaaatctcctattttattttttctcagtgtagatcaagtattattgattttatttatatttccaaaaatcaatcttagtttcatgatcttttctactgtttctctagtctcaatttcattgatttcttttctaatctttgttatttcctttttttctactaactttgg-----ctttgttctttttttagttcattgagctgtaatgtttggttgttaatttgaggactttcctcttttatttttgtaaacatttattactatacatttctcccttaaaactacttttgctgcatcccaaacctttttgtatgtcatgtcca------------------------------------------------tttggcccattgatggttgtttaatttctatatgtacatgaattttccagttttcctcttattattgattttagtctcataccactatggtcagaaaatatatttgatatgattttagtcttctgaaatttgttaagacttgtttgtggcttaacatacaatctgtcctggagaatattctatgtgagcttgagaagaatgtgtgttctgctgttggattgaatattctgtgaatgtctgttagattcatttaggctgaagttgttcaagacagtgttttcttaataacattctttctggatgatttatccattgttgaaaataggatattaaagctctccattattgttgccttgctgtttatctcttgctttagatttg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88285350 821 - 171882078 ccatttcttttaggttatccaatcttttgactagtaatggttcatagcattatcttatgattctttatattttttgtagcattagttgtaatgtctcctttttcattttggcttttatttatttaaatctcctattttattttttctcagtgtagatcaagtattattgattttatttatatttccaaaaatcaatcttagtttcatgatcttttctactgtttctctagtctcaatttcattgatttcttttctaatctttgttatttcctttttttctactaactttgg-----ctttgttctttttttagttcattgagctgtaatgtttggttgttaatttgaggactttcctcttttatttttgtaaacatttattactatacatttctcccttaaaactacttttgctgcatcccaaacctttttgtatgtcatgtCCA------------------------------------------------TTTGGCCCATTGATGgttgtttaatttctatatgtacatgaattttccagttttcctcttattattgattttagtctcataccactatggtcagaaaatatatttgatatgattttagtcttctgaaatttgttaagacttgtttgtggcttaacatacaatctgtcctggagaatattctatgtgagcttgagaagaatgtgtgttctgctgttggattgaatattctgtgaatgtctgttagattcatttaggctgaagttgttcaagacagtgttttcttaataacattctttctggatgatttatccattgttgaaaataggatattaaagctctccattattgttgccttgctggttatctcttgctttagatttg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85414488 821 - 162156779 ccatttcttttaggttatcCAATCTTTTGACTAGTAATGGTTCATAGCATTATCTtatgattctttattttttttgtagcatgagttgtaatgtctcctttttcattttggctttaatttatttaaatctcctattttattttttctcagtgtagatcaagtattattgattttatttatgtttccaaAAATCAATCTTAGTTTCATGATCTTTTCTACTGTTTCTCTAGtctcaatttcattgatttcttttccaatctttgttatttcctttttttctactaactttgg-----ctttgttctttttttagttcATTGAGCTGTAATGTTTGGTTGTTAATTTGAGgactttcctcttttatttttgtaaacatttattaCTATACATTTCTCCCTTAAAactacttttgctgcatcccaaaCCTTTTTGTATGTCATGTCCA------------------------------------------------TTTGGCCCATTGgtggttgtttaatttctatatgtaaatgaattttccagttttcctcttattattgattttaGTCTCATACCACTatggtcagaaaatatatttgatatgattttagTCTTctgaaatttgttaagacttgcttGTGGCTTAACATACAATCTGTCCTGGAGAATATTCtgtgtgagcttgagaagaatgtgtgttctgctgtTGGATTGAATATTCTGTGTATGTCTGTTAGATTCATTTCGGCTGAAGTTGTTCAAGACaatgttttcttaataacattctTTCTGGATGATTTATCCATTGTTGAAAATAGGATATTAAAGCTCTCTATTATTGTTGCCTTGCTGTTTATCTCTTGCTTTagatttg i papAnu2.chr7 I 6450 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e canFam3.chr15 46874055 11391 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I e calJac3.chr10 87750071 943 - 132174527 I a score=1828755.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 388330 3534 + 478999 ttaatatttgctttatatatttaggtgctctgatgttgggtgtattcatatttataactgttctattatcttgatgaattgactttcttaccaatatctaatgaccttctttgtctcttgtgacagtatttaaagtctattttgtgtgatacacatgtaactgctactgctcttttttggttttcattttcatggaatatttttgttttttatccctttacttttagtctatgtgtgttattaaaggtgaagtgagtttcttgtaggcagcatttagttggatcttatttttataaatcaattcagccactttttgtcttttgattgacaaaatttgcttatttatagttggtaagtaaagatttattattgtcaatttattgttttctggttgctttgtaggtcctttattcctttattactcctttgttgttttcctttgtgatttgatcattttcct--cggtggtatgctttgattcttttctgtttatcttttgtgtatttactataggtttttaatttgtggttgccatgaggcttacataaatattcttattgttttaccaattcacttaaagacgataacatcttcactttgattgctaaagaagctctgtacttttacttcccttctcttacattgtgcttttgatgttacagtttacattttttatatgtcttaagaatttattatagctatagtcatttttcatacattcatcttataactttataatgatgttgtgatttacaccaccaccattatggtgcttgaatattctaaatttaaccatatatatactttaccagttagttttatatttttatatgttttaatgttactaattagctgccttttatttaatcttaaaaatccccctttagcatttcttgtaaggcaagcaatagtgaagactcactcaacttttctttttttttttctaaaaaagtctttatcttcttcatttctgaaggacagctttgctggcaaaatattgctggttggcagttttatttttcttccattgctttgaatatattatttcattctctcctgatcctcaaggttcctgctgagaaatccactgatagctttatttgggtccttttttatatgacatgattcttttctcttgctgcttacaagcttctctctttgtttttgatttttgccaggttgatgataatgtatgtttgtggattc------------tttttt------------------------tggttgaattgactggagaactttaggcttcatgcatctggatgctcatttctttcctgacatttgctaagtttcctatgattatttccttaaataagctttctatctaatgctctctctatttttcttctgaacctactataattctaatgttagctctcttgatagtattccatggcttctgtaggttttattcttttttt--tcttttatctccacttactggatgatttaaaatgctcggtctttgagttcacttatttttttattctgcttcacttagtctgatgttcaagcctctattaca---------tttttttagtttagctgttgtatttttcagctccaacatttctgtttggttctttttaaaatattttctgtctctttattgagcttctcattttgttcttggattgtcttcctgatttcattaaactatttatttgtgttctcttgtagttccccaagattccttaggcaattattttga-ttttttccaggcaatttatagatctccaattctttggggttggttactagaaattaattttgttcctttggtggtgtcatgttttcctgcttctttgtgatctttgggtgttgattttgtcagtgactAAACCTGCTGGAGTCCTCTGTGGAGTTAAATACTATAGTTTGTGCAATGATAATTGTGGGTTCCTTGGTAGTAAAAGCAGTGTGGTATGTGCAGCtgataatgacaggagacagacagattcctaggcagacagggataagtccctggtgaatcccaaccttcaagccaaagacaacctgaggcctgaaaaccaagccgccagttccaggtggagtccacgacccaactgagaacttcctcagtgccttttagtcaattaaatggtgctttttccaggcctgcccatgaaccaatcagcacagattcctccattctgagcccataaaaaccccagactcagcctcacagatggctctctgctttcagccccactcttacacagagggctgcccactttggctactctcttgttgtcaagagcttttctgctgctcaataaaaatctcatcagccttgctcactctgcggtgtctgcatgcttcattcctgttggttgcaggacaagaatccaggatccactgaacagtgggtgcgaaaagagctgtaagatacacctcctgttcaccaagctacagaagtg-aaaaaaaaatgctgggtgccacaagtccccaattgctgagctgtgggcagcaggactgaatgagctgtgacacatccccatttgctgaaactgccagcagtgagaacgaacaagagctgtaacacttcctgggggctcagaccttgactcccagagcaaaagctgtaacacctcttcgggctccacagttgctggcatctc-tgagtttttgggcactgctgcatcccccttatccagatgccagcgctcaaggcagaagtcagtcatagcatgcccaaaccaaccgtgggctgagcactgagctacggtgggtgtcatggcatctgggtgagtgagcatgagtggagcacagcctgccaggccaaatgagcaggacgagctcagagggcctgagtgaagcctcagcagaggctctgctggccatcgagatttccacttggcaaagtggccctcaaagaatcctgtgtcaCATCCATGAGGGCTGTTGAGGTCCTTGGTATAGAAGGCTACCAGAATTCCGCTCAGATCAGGCTACTGGGGACTGCATTGATTCCTACCACAGGACTGAtactgatagacctcatcatttctctttcttaccagcagtttacagatttctctcctatgttggtctccctagcaatctgggatgggtgaaacttaagctggttgtttgggcaatgctccagtaggctgggtaagatggttcactccactctccttttctctgcaaggggaacttgcaagctgagcagtgacctctccatactgagcactgccagcctgaggaagatgacgcaggcaaaatgaaactg-ttttttctacca---tttttttgtgttttttcttgaag-tttttct-gtctgctctgttgttttaacttctgaagtagattcctgatctctgctagatattttcatttgtggatatttacccagttgttgttcctt-taggaggaataaagactgagatcacctactctgccattctagctgatgtctaacacattttctttgttcatctgtctatggacttttaggctgtttccatatcttggcttttgtgaataatgctgtagtaaacatgggtgtgaaggtatctctttgaggttctgatttcaattcttttggacat s rheMac3.chr7 88007878 3549 - 170124641 ttagtatttgatttatatatttcggtgctctgatgttggatgtatttgtatttataactgttatattattttgaggaactgactttcttatcaatatctaatgaccttctttgtctcttgtgacagtgttttgagtctattttgtctgatatacatgtaactgctactgctcctttttggttttcattttcatggaatatttttgttttttgtccctttacttttagtctatgtgtgttattaaaggtgaagtgagtttcttgtaggcagcatttagttggatcttatttttataaatcaattcagccactctttgtcttttgattggcaaaatttgtttatttatagttggtaagtaaagatttactattgtcaatttattgttttctggttgttttgtagatcctttattcctttattactcctttgttgttttcctttttgatttgatccttttttttccagtggtgtgctttgattcctttctgtttatcttttgtgtatttactataggtttttaatatgtggttgccatgaggcttacataagtattcgtcttgttttacc-attcatttaaagatgataacatcttaactttgattgctaaagaagctctgtacttttacttcccttctcttacattttgcttttgatgttacagtttacattttttatgtgtcttaagaatttgttatagctatagtcatttttcatactttcaccttataactttataatgatggtgtgatttacaccaccaccattatagtatttgaatattctaaatttaaccatatatatactttcccagttagttttata-----------tttaaagttactaattatctgccttttatttaatcttaaaaatccccctttagaatttcttgtaaggcaggcaatagtgaagattcactcaactttta-tttttttttcctaaagaagtatttatcttcttcatttctgaaggacagctttgctggaaaaatattgccggatggcagttttatttttcttccatcactttgaatatattatttcattctctcctgatcctcaaggttcttgctgataaatccactgatagctttatttaggtccttttgtatatgacatgcttcttttctcttgctgcttacaagcttctctctttgtttttaatttttgccagtttgattataatgtatgtttgtgga---------------ttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggttgaattgactggagaactttaggcttcatgcaactggatgatcatttctttcctgatacttgctaagtttcccatgattattcccttaaataagctttctatctaatgctctctctatttttcttctgaacctactataattctgatgttagctctcttgatggtattccatggcttttgtaggttttattcattttttaaaattttatctccacttactggatgatttaaaatactctgtc-ttgagttcacttatttttttattctgcttcatttagtctgatgttcaagcctctattaca----ttttttttttttagtttagctgttgtatttttcagctccaacatttctgtttggttc-tttaaaaatattttctgtctctttattgagcttctcattttgttcttggattgtcttcctgatttcattaaactatttatttgtgttctcttgtagttccccaagattccttaggtaattattttga-ttttttccaggcaatttatagatctccaattctttggggttggtgactagaaattaattttgttcctttggcgatgtcatgttttcctgcttctttgtgatctttggatgttgattttgtcagtgactAAACCTGCTGGAGTCCTCTGTGGAGTTAAGTACTGTAGTTTGTGCAATTATCATTGTGGGTTCCCTGGTAGTGAAAGCAGTGTAGTATGTGCAGCtgataaaggcaggagacagacagatt-ctaggcagacagggatgagtccgtggtgaatcccaaccttcaagccaaagacaacctgaagcctgaaaaccgagctgccagttgcaggtggagtccacaaccgaactgagaagttcctcaatgccttttactgaatcgaatggtgttttttccaggcctgcccatgga-----cagcacagattcctccattctgagcccataaaaaccccagactcggcctcacagatggctctctgctttcagccccactctcacacagagggctacccactttggctactcccttgttgttacgagtttttctgccgctcaataaaaacctcatcagccttgctcactctgtggtgtctgcatgcttcattcctcttggttgtgggacaagaatccacaacccgctgaacagtgggtgtgaaaagagctgtaacacacg-ctcctgttcactaagctacaggagtg-aaaaaaaattgctgggtgccacacacccccagttgttgagctgtgggcagtaggactgaatgagctgtgacacacccccatttgctgaagctgctggtagtgagaacgaacaagaactgtaacacttcctgggggctcagaccttgactcccagagcaaaagctgtaacatctctttgggctccatggttgctggcatctcttgagtttttgggcactgctgcacccccctcatccagataccagtactcaaggtggaagtcagtcacagcacacccagaccagccatgggctgagcactgagctatggtgggtgtcatgggatctcggtgagtaagcataagtggagcatagcctgccaggccaagtgagtggaacgagttcagggggcctcagtgaagcctcagcagaggctctgctggccacggagatttccacttggcaaagtgtcactgaaagaatcctgtgtcaCATCCATGAGGACTGTTGAGGTTCTCAGTATAGAAGGCTACCAGAATTCTGCTCAGATCAGGCTATTGGGGACTGCATTGATTCCTACCACATGACTGAtactgatagacctcatcatttctctttgttaccagcagtctacagatttctcagctatgttggtctccctagcaatctgggatgggtgaaacttaagctggttgtttgggcaatgctccagtaggctgtgtaagatggttcaccccactctccttttctctgcaaggggaacttgcaagctgagcagtgccctctccatgctgagcactgccagcctgaaggagatgatgcaggcaaaatgaaacagtttttttctaccattttttttttgtggttattcttgtgg-tttttttggtctgctctattgtttaaacttcttaagtggattcctgatctcttctagttattttcatttgtggatatttgcccaattgttgttccttgtaggaggaataaagactgagatcacctactctgccattctagctgatgtctaacacattttctttgttcatctgactatggacatttaggctgtttccatatcttggcttttgtgaataatgctgcagtaaacatgggtgtgaaggtaactctttgaggttctgatttcatttcttttggacat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88286171 3540 - 171882078 ttagtatttgatttatatatttaggtgctctgaggttggatgtatttgtatttataactgttatattattttgaggaactgactttcttatcaatatctaatgaccttctttgtctcttgtgacagtgtttaaagtctattttgtctgatatacatgtaactgctactgctcctttttggttttcattttcatggaatatttttgttttttgtccctttacttttagtctatgtgtgttattaaaggtgaagtgagtttcttgtaggcagcatttagttggatcttatttttataaatcaattcagccactctttgtcttttgattggcaaaatttgtttatttatagttggtaagtaaagatttactattgtcaatttattgttttctggttgttttgtagatcctttattcctttattactcctttgttgttttcctttttgatttgatccttttttttccagtggtgtgctttgattcctttctgtttatcttttgtgtatttactataggtttttaatatgtggttgccatgaggcttacataagtattcttcttgttttacc-attcatttaaagatgataacatcttaactttgattgctaaagaagctctgtacttttacttcccttctcttacattttgcttttgatgttacagtttacattttttatgtgtcttaagaatttgttatagctatagtcatttttcatactttcaccttataactttataatgatggtgtgatttacaccaccaccattatagtatttgaatattctaaatttaaccatatatatactttcccagttagttttata-----------tttaaagttactaattatctgccttttatttaatcttaaaaatccccctttagaatttcttgtaaggcaggcaatagtgaagattcactcaactttta-ttttttttttctaaagaagtatttatcttcttcatttctgaaggacagctttgctggaaaaatattgccggatggcagttttatttttcttccatcactttgaatatattatttcattctctcctgatcctcaaggttcttgctgataaatccactgatagctttatttaggtccttttgtatatgacatgcttcttttctcttgctgcttacaagcttctctctttgtttttaatttttgccagtttgatgataatgtatgtttgtggattctttttttttttttttttt------------------------tggttgaattgactggagaactttaggcttcatgcaactggatgatcatttctttcctgatacttgctaagtttcccatgattattcccttaaataagctttctatctaatgctctctctatttttcttctgaacctactataattctaatgttagctctcttgatggtattccatggcttttgtaggttttattcattttttaaaattttatctccacttactggatgatttaaaatactctgtc-ttgagttcacttatttttttattctgcttcatttagtctgatgttcaagcctctattaca----ttttttttttttagtttagctgttgtatttttcagcgccaacatttctgtttggttc-tttaaaaatattttctgtctctttattgagcttctcattttgttcttggattgtcttcctgatttcattaaactatttatttgtgttctcttgtagttccccaagattccttaggtaattattttga-ttttttccaggcaatttatagatctccaattctttggggttggtgactagaaattaattttgttcctttggcgatgtcatgttttcctgcttctttgtgatctttggatgttGATTTTGTCAGTGACTAAACCTGCTGGAGTCCTCTGTGGAGTTAAGTACTGTAGTTTGTGCAATTATCATTGTGGGTTCCCTGGTAGTGAAAGCAGTGTAGTATGTGCAGCtgataaaggcaggagacagacagatt-ctaggcagacagggatgagtccgtggtgaatcccaaccttcaagccaaagacaacctgaagcctgaaaaccgagctgccagttgcaggtggagtccacaaccgaactgagaacttcctcaatgccttttactgaatcgaatggtgttttttccaggcctgcccatgga-----cagcacagattcctccattctgagcccataaaaaccccagactcggcctcacagatggctctctgctttcagccccactctcacacagagggctacccactttggctactcccttgttgttacgagtttttctgccgctcaataaaaacctcatcagccttgctcactctgtggtgtctgcatgcttcattcctcttggttgtgggacaagaatccacaacccgctgaacagtgggtgtgaaaagagctgtaacacacg-ctcctgttcactaagctacaggagtg-aaaaaaaattgctgggtgccacacacccccagttgttgagctgtgggcagtaggactgaatgagctgtgacacacccccatttgctgaagctgctggtagtgagaacgaacaagaactgtaacacttcctgggggctcagaccttgactcccagagcaaaagctgtaacatctctttgggctccatggttgctggcatctcttgagtttttgggcactgctgcatccccctcatccagataccagtactcaaggtggaagtcagtcacagcacacccagtccagccatgggctgagcactgagctatggtgggtgtcatgggatctcggtgagtaagcataagtggagcatagcctgccaggccaagtgagtggaacgagttcagggggcctcagtgaagcctcagcagaggctctgctggccacggagatttccacttggcaaagtgtcactgaaagaatcctgtgtcaCATCCATGAGGACTGTTGAGGTTCTCAGTATAGAAGGCTACCAGAATTCTGCTCAGATCAGGCTATTGGGGACTGCATTGATTCCTACCACATGACTGAtactgatagacctcatcatctctctttgttaccagcagtctacagatttctcagctatgttggtctccctagcaatctgggatgggtgaaacttaagctggttgtttgggcaatgctccagtaggctgtgtaagatggttcaccccactctccttttctctgcaaggggaacttgcaagctgagcagtgccctctccatgctgagcactgccagcctgaaggagatgatgcaggcaaaatgaaacagtttttttctaccattttttttttgtggttattcttgtgg-tttttttggtctgctctattgtttaaacttcttaagtggattcctgatctcttctagttattttcatttgtggatatttgcccaattgttgttccttgtaggaggaataaagactgagatcacctactctgccattctagctgatgtctaacacattttctttgttcatctgactatggacatttaggctgtttccatatcttggcttttgtgaataatgctgcagtaaacatgggtgtgaaggtaactctttgaggttctgatttcatttcttttggacat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85415309 3541 - 162156779 ttaatatttgctttatatatttaggtgctctgatgTTGGATGTATTCGTATTTATAACTGTTATATTATTTTGAGGAATTGACTTTCTTATCAATAtctagtgaccttctttgtctcttgtgacagtgtttaaagtctattttgtctgatatacaTGTAACTGCTActgcttctttttggttttcattttcatggaatatttttgttttttgcccctttacttttagtctatgtgtgttattaaaggtgaagtgagtttcttgtaggcagcatttagttggatcttatttttataaatcaattcagccactctttgtcttttgattggcaaaatttgtttatttatagttGGTAGGTAAAGATTTACTATTGTCAatttattgttttctggttgttttgtagatcatttatttctttattactcctttgttgttttcctttttgatttgatcctttttttt-CGGTGGtgtgctttgattcctttctgtttatcttttgtgtatttactataGGTTTTTAATATGTGGTTGCCATGAGGCTTACATAAGTATTATTCTTGTTTTACC-ATTCATTTAAAGATGATAACATCTTAACTTTGATTGCTAAAGAAGCTCTGTACTTTTACTTCCCTTCTCTTACATTTTGCTTTTGATGTTacagtttacattttttatgtgTCTTAAGAATTTGTTATAGCTATAGTCATTTTTCATACTTTCACCTTATAACTTTATAATGATGGTGTGATTTACACCACCACCATTATAGTATTTGAATATTCTAAATTTAACCATATATATACTTTCCCAGttagttttata-----------tttacagtTACTAATTATCTGccttttatttaatcttaaaaattcccctttagaatttcttgtaaggcaggcaaTAGTGAAGATTcactcaactttaattttttttttcctaaagaagtatttatcttcttcatttctgaaggacagcttTGCTGGAAAAATATTGCCAGATagcagtttcatttttcttccatcactttgaatatattatttcattctctcCTGATCCTCAAGGTTCTTGCTGATAAATCCACTGATAGCTTTATTTGGGTCCTTTTGTATATGacatgcttcttttctcttgctgcttacaagcttctctctttgtttttaatttttgccagttTGATGATAATGTATGTttgtggattcttttttttttt-tttttt------------------------tggttgaattGACTGGAGAACTTTAGGTTTCATGCAACTGGATGATCATTTCTTTCCTGATACTTGCTAAGTTTCCCATGATTATTCCCTTAAATAAGCTTTCTATCTAATGctctctctatttttcttctgaaCCTACTATAATTCTAATGTTAGCTCTCTTGATGGTATTCCATGGCTTTTgtaggttttattcattttttaaaattttatctccaCTTACTGGATGATTTAAAATACTCTGTC-TTGagttcacttatttttttattctgcttCATTTAGTCTGATGTTCAAGcctctattacatttttttttttttttttgtttaactgttgtatttttcagctccaacatttctgtttggttc-tttaaaaatattttctgtctctttattgagcttctcattttgttct----ttgtCTTCCTGATTTCATTAAActatttatttgtgttctcttgTATTTCCCCAAGATTCCTTAggtaattattttgatttttttccaggcAATTTATAGATCTCCAATTCTTTGGGGTTGGTGACTAGAAATTAATTTTGTTCCTTTGGCGATGTcatgttttcctgcttctttgtgATCTTTGGATGTTGATTTTGTCAGTGACTAAACCTGCTGGAGTCCTCTGTGGAGTTAAGTACTATAGTTTGTGCAATTATCATTGTGGGATCCCTGGTAGTGAAAGCAGTGTAGTATGTGCAGCTGATAAAGGCAGGAGACAGATAGATT-CTAGGCAGACAGGGATGAGTCTGTGGTGAATCCCAACCTTCAAGCCAAAGACAACCTGAAGCCTGAAAACCGAGCTGCCAGTTGCAGGTGGAGTCCACAACCCAACTGAGAACTTCCTCAATGCCTTTTACTGAATCGAATGGTGTtttttccaggcctgcccatggA-----CAGCACAGATTcctccattctgagcccataaaaaccccagactcggTCTCACAGATGGCTCTCTGCTTTCAGCCCCACTGTCACACAGAGGGCTACCCACTTTGGCTACTCCCTTGTTGTTACGAGTTTTTCTGCCGCTCAATAAAAACCTCATCAGCCTTGCTCACTCTGTGGTGTCCGCATGCTTCATTCCTCTTGGTTGTGGGACAAGAATCCACAACCCGCTGAACAGTGGGTGtgaaaagagctgtaacacatg-CTCCTGTTCACCAAGCTAcaggagtgaaaaaaaaattgctgggtgccACACACCCCCAGTTGTTGAGCTGTGGGGAGTAGGACTGAATGAGCTGTGATACACCCCCATTTGCTGAAGCGGCTGGTAGTGAGAACGAACAAGAACTGTAACACTTCCTGGGGGCTCAGACCTTGACTCCCAGAGCAAAAGCTGTAACATCTCTTTGGGCTCCATGGTTGCTGGCATCTCTTGAGTTTTTGGGCACTGCTGCATCCCCCTCATCCAGATACCAGTGCTCAAGGTGGAAGTCAGTCACAGCACACCCAGACCAGCCATGGGCTGAGCACTGAGCTATGGTGGGTGTCATGGGATCTCGGTGAGTAAGCATGAGTGGAGCAtagcctgccaggccaagtgagTGGAACGAGTTCAGGGGGCCTCAGTGAAGCCTCAGCAAAGGCTCTGCTGGCCACGGAGATTTCCACTTGGCAAAGTGTCACTGAAAGAATCCTGTGTCACATCCATGAGGACTGTTGAGGTCCTCAGTATAGAAGGCTACCAGAATTCTGCTCAGATCAGGCTATTGGGGACTTCCTTGATTCCTACCACATGACTGATACTGGTAGACCTCatcatttctctttgttaccagcAGTTTACAGATTTCTCAGCTATGTTGGTCTCCCTAGCAATCTGGGATGGGTGAAACTTAAGCTGGTTGTTTGGGCAATGCTCCAGTAGGCTGTGTAAGATGGTTCACTCCactctccttttctctgcaaGGGGAACTTGCAAGCTGAGCAGTGCCCTCTCCATGCTGAGCACTGCCAGCCTGAAGGAGATGATGCAGGCAAAATGAAACAGtttttttctacca-tttttttttgtggtcattcttgaggtttttttttgtctgcTCTATTGTTTAAACTTCTTAAGTGGATTCCTgatctcttctagttattttcatTTGTGGATGTTTGCCCAATTGTTGTTCCTTGTAGGAGGAATAAAGACTGAGACCACCTACTCTGCCACTCTAGCTGATGTctaacacattttctttgttcatctgactatggacatttaggctgtttccatatcttggcttttgtgaataatgctgcagtaaacatgggtgTGAAGGTAACTCTTTGAGgttctgatttcaattcttttggacaT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 46874055 11391 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3569968 5826 - 24206276 I e calJac3.chr10 87750071 943 - 132174527 I a score=397381.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 391864 462 + 478999 attcctaaaagtgggattgctgaatcatataataattttgtttttaatgttttgaggaactgacacattatttttcatagtgactgcaccattttctatttccaccaaaagtgtataggagtttcaattccctaaattctagccaacacttcttttgttttttgataatagccatgctaataggcatgaggcaatatctcattggtgtttggatatgcatttccttaacaactagtgatgctgaacatatttgcttatacctgttggccatttgtgtatttcctct-gagaaatgtcttcaagtttttcacccactttgaaattgcattattatcattattatttttgccatagtatgactgatttttaagtgcttcttatataATGGAGTTATTTCAATTTATTTTTTTCTGTTCATTATTTGCCTGTTAAATTTGTCTTTATTTTCTAGTAATTTTAAATT s rheMac3.chr7 88011427 462 - 170124641 attcctaaaagtgggactgctgaatcatataataactctgtttttaatgttttgaggaactgacatattatttttcatagtgactgcaccattttctgtttccactaacagtgtacaggagtttcaattccctaaattctagccaacgcttcttttgttttttgataataggcatgctaataggcatgaggcaatatctcattggtgtttggatatgcatttccttgatgactagtgatgctgaacatatttgcatatacctgttggccatttgtatattttctttagagaaatgtcttcaagtttttcgcccacttGGAAACTGCA-TATTATCATTATTATTTTTGCCATAGTAGGACTGATTTTTAAGTGCTTCTTATAAATTGGAGTTATTTAAATTTACTTTTTTCTATTTATTATTTTCCTGTTAAACTTGTCTTTATTTTCTAATAATTTTAAATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88289711 462 - 171882078 attcctaaaagtgggactgctgaatcatataataactctgtttttaatgttttgaggaactgacatattatttttcatagtgactgcaccattttctgtttccactaacagtgtacaggagtttcaattccctaaattctagccaacgcttcttttgttttttgataataggcatgctaataggcatgaggcaatatctcattggtgtttggatatgcatttccttgatgactagtgatgctgaacatatttgcatatacctgttggccatttgtatattttctttagagaaatgtcttcaagtttttcgcccaCTGGGAAACTGCA-TATTATCATTATTATTTTTGCCATAGTAGGACTGATTTTTAAGTGCTTCTTATAAATTGGAGTTATTTAAATTTACTTTTTTCTATTTATTATTTTCCTGTTAAACTTGTCTTTATTTTCTAATAATTTTAAATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85418850 462 - 162156779 ATTCctaaaagtgggattgctgaatcatataataactctgtttttaatgttttgaggaactgacatattatttttcatagtgactgcaccattttcta-ttccactaacagtgtacagGAGTTTCAATTCCCTAAATTCTAGCCAacgcttcttttgttttttgataatagGCATGCTAATAGGCATGAGGCAATATCTCATTGGTGTTTGGAtatgcatttccttgatgactagtgatgctgaacatatttgcatatacctgttggccatttgtatattttctttagagaaatgtcttcaAGTTTTTCACCCACTTTGAAACtgcattattatcattattatttttgccatAGTAGGACTGatttttaagtgcttcttatataatggagttatttaaatttacttttttctatttattatttgcctgttaaacttgtctttattttctaataattttaaatt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3575794 463 - 24206276 attcctaaaagtgggactgctgaatcatataataaccctgtttttaatgttttcaggaactgacatattatttttcatagtgactgcaccattttctatttccactaacggtgtacaggagtttcaattccctaaattctagccaacacttcttttgtttttcgataacaggcatgctaataggtatgagacaatatctcattggtgtttggatatccatttccttgatgactagtgatgctgaacatatttgcatatacctgttggccatttgtatattttctttagagaaatgtctttaagttttttgcccactttgaaactgcatttttatcattattatttttgccatagtaggactgatttttaagtgcttcttatataatggagttattTAAATTTACTTTTTTCTATTTATTATTTGCCTGTTAAACTTGTCTTCATTTTCTAATAATTTTAAATT i chlSab2.chr29 I 5826 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 46874055 11391 - 64190966 I e calJac3.chr10 87750071 943 - 132174527 I a score=333188.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 392326 278 + 478999 GTTTTAATTTCTAACA-TTTTCCCCTATATTTGTGTTTGCCATTGATAAATTTTAAATTTCATTATCAAATATGCTATAACTCTTTTCTTA-TTGTTTTTCCTTCATAGGGGCAGGATATACTTAAAAGTTTTTATTTATTCCAAAATAATTTAAATAGTCTCTCTATGTTTCTAGTAATTAAAAAAATTACTCCTTTGCAATTTATGTTAAGTATAAGTTATAAAATATAATTCTTTTAAAAAATCTGGTTAACCAGTTGTTCCAGCACAACTTATTGT s rheMac3.chr7 88011889 273 - 170124641 GTTTTAATTTCTAACA-TTTTCTCCTATATTTGTGTCTGCCATTGATAAGTTTTAAATTTCATTATCAAATATGCTATAACTCTTTTCCTA-TTGTTTTTCCTTCATAGGGGCAGGATATACTTAGAAGTTTTTATTCATTCCaaaataatttaaatag----tctatatttatagtaatt-aaaaaattaCTCCTTTGCAATTTATGTTAAGTATAAGTTATAAAATATAAATCTTTTAAAAAATCTGGTTAACTAGCTGTTCCAACACAACTTATTGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88290173 273 - 171882078 GTTTTAATTTCTAACA-TTTTCCCCTATATTTGTGTCTGCCATTGATAAGTTTTAAATTTCATTATCAAATATGCTATAACTCTTTTCCTA-TTGTTTTTCCTTCATAGGGGCAGGATATACTTAGAAGTTTTTATTCATTCCAAAATAATTTAAATAG----TCTATATTTATAGTAATT-AAAAAATTACTCCTTTGCAATTTATGTTAAGTATAAGTTATAAAATATAAATCTTTTAAAAAATCTGGTTAACTAGCTGTTCCAACACAACTTATTGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85419312 275 - 162156779 gttttaatttctaacacTTTCCCCCTATATTTGTGTCTGCCATtgataagttttaaatttcattatcaAATATGCTATAActcttttccta-ttgtttttccTTCATAGGGGCAGGATATACTTAGAAGTTTTTATTCattccaaaataatttaaatag----tctatatttatagtaattaaaaaaattactccTTTGCAATTTATGTTAAGTATAAGTTATAtaatataaatcttttaaaaaatctggttaACTAGCTGTTCCAACACAACTTATTGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3576257 274 - 24206276 GTTTTAATTTCTAACA-TTTTCCCCTATGTTTGTGTTTGCCATTGATAAGTTTTAAATTTCATTATCAAATATGCTATAACTCTTTTCCTA-TTGTTTTTCCTTTATAGGGGCAGGATATACTTAGAAGTTTTTATTCATTCCAAAATAATTTAAATAG----TCTATATTTATAGTAATTAAAAAAACTACTCCTTTGCAATTTATGTTAAGTATAAGTTATAAAATATAAATCTTTTAAAAAATCTGGTTAACTAGCTGTTCCAACACAACTTATTGT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87751014 271 - 132174527 GTTTTAATTTCTAACA-TTTTTCCCTGTATTTGTGCTTGCCAT---TAAGTTTTAAATTTCATTATCAAATATGCTATAACTCTTTTCCTATTTGCTTTTCTTTCATGGG----GGATATACTTAAAAAGTTGTATTTATTCCAAAATAAATTTAATAGTCTCTCTATATTTCTAGTAATT-AAAAAATTACTCCCTTGCAATTTGTGTTAAGTATAAGTTATAAAATATAATTCTTTTAAAAGGTCTGGTTAGCCAGTTGTTCAAACACAACTTATTGT i calJac3.chr10 I 943 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 46874055 11391 - 64190966 I a score=113766.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 392604 70 + 478999 GTCCTCTGGGACAATAGAATTGAAAATGCACGTCATACTCTAGAGAGCACATATTGTACATCGTAGCATT s rheMac3.chr7 88012162 70 - 170124641 GTCCTCTGGGACAATAGAATTGAAAATGCACATCATACTCTAGAGAACACATATTGTACATCGTAGCATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88290446 70 - 171882078 GTCCTCTGGGACAATAGAATTGAAAATGCACATCATACTCTAGAGAACACATATTGTACATCGTAGCATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85419587 70 - 162156779 GTCCTCTGGGACAATAGAATTGAAAATACACATCATACTCTAGAGAACACATATTGTACATCGTAGCATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3576531 70 - 24206276 GTCCTCTGGGACAATAGAATTGAAAATGCACATCATACTCTAGAGAACACATATTGTACATCGTAGCATT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87751285 70 - 132174527 GTCCTCTGAGACAGTAGGATTGAAAATGCACATCATACTCTAGAGAACACATATTGTAGATCATAACATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17328061 68 + 64190966 GTCCTTTGAGACTGCACAATTGGAAATACTCATCATAGTCTAGAGAG--CATACCATACACCATAACATT i canFam3.chr15 T 59706 C 0 e mm10.chr14 74560134 15102 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M a score=771749.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 392674 487 + 478999 TTCCACCCCTAATCCTGGGA-AATTCGCCATTTTTCTTACTTCTTCTGTGAAACTCAAAAGTTGTGTTTCTGTGCTCTTTGGATGAAGTGCAAATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTCCTACCTGGCTTCTCCTGGCCTCCAGAGGATTGAT-TTTTGTAGTTACAGCTCATGCTGCTAGTTAGTTTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATGCATACCAACATGTACCCAGGATAAAGTCCTCCACTGCGGGTGGTGGAAGAGGCTTCTTCTACCTCCTCCCCATAGTTCCTGAAGGCACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGG-TG---GAATGTTGTTATAACATTTACATAAACCATCCTATTTTTGAGACAGTAGGACAGATAATAATGATGGGAATAACTATGTAAAATGCTCAGAGATCAGTGGTAAGAAACAGAAAGC--------AGCATGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTGATG s rheMac3.chr7 88012232 476 - 170124641 TTCCACCCCTAATCCTGTAAGGATTCGCCATTTTT-------CTTCTGTGAAACTTAAAAGTTGTGTTTCTATGCTCTTTGGATGAAGCACAGATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTCCTACCTGGCTTCCCCTGGCCTCCAGAGGATTGATATTTTGTAGTTACACCCCATGCTGCTAGTTAGTCTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATACATACCAACATATA--GAGGATAAAGTCCTCCACAGTGGATGGTGGAAAACGCTTCTTCTACCTCCTCCCCATAGTTCCTGAATGCACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGG-TG---GAATGTTGTTATAAAGTTTACATAAACCATCCTATTTTTGAGACAGTAGGATAGAT-ATAATTATGGGAATAACTATGTAAAATGCGCAGAGATCAGTAGTAAGAAACAGAAAGC--------AGCATGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTG--- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88290516 476 - 171882078 TTCCACCCCTAATCCTGTAAGGATTCGCCATTTTT-------CTTCTGTGAAACTTAAAAGTTGTGTTTCTATGCTCTTTGGATGAAGCACAGATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTCCTACCTGGCTTCCCCTGGCCTCCAGAGGATTGATATTTTGTAGTTACACCCCATGCTGCTAGTTAGTCTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATACATACCAACATATA--GAGGATAAAGTCCTCCACAGTGGATGGTGGAAGACGCTTCTTCTACCTCCTCCCCATAGTTCCTGAATGCACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGG-TG---GAATGTTGTTATAAAGTTTACATAAACCATCCTATTTTTGAGACAGTAGGATAGAT-ATAATTATGGGAATAACTATGTAAAATGCGCAGAGATCAGTAGTAAGAAACAGAAAGC--------AGCATGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTG--- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85419657 480 - 162156779 TTCCACCCCTAATCCTATAAGGATTCGCCATTTTTCTTA---CTTCTGTGAAACTTAAAAGTTGTGTTTCTATGCTCTTTGGATGAAGCACAGATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTCTTACGTGGCTTCCCCTGGCCTCCAGAGGATTGATATTTTGTAGTTATACCCCATGCTGCTAGTTAGTTTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATACATACCAACATATA--GAGGATAAAGTCCTCCACAGTGGATGGTGGAAGATGCTGCTTCTACCTCCTCCCCATAGTTCCTGAATGCACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGG-TG---GAATGTCGTTATAAAGTTTACATAAACCATCCTATTTTTGAGACAGTAGGATAGAT-ATAATGATGGGAATAACTATGTAAAATGCGTAGAGATCAGTagtaagaaacagaaagc--------agcatGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTG--- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3576601 480 - 24206276 TTCCACCCCTAATCCTGTAAGGATTTGCCATTTTTCTTA---CTTCTGTGAAACTTAAAAGTTGTGTTTCTATGCTCTTTGGATGAAGCACAGATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTCCTACCTGGCTTCCCCTGGCCTCCAGAGGATTGATATTTTGTAGTTACGCCCCATGCTGCTAGTTAGTTTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATACATACCAACATATA--GAGGATAAAGTCCTCCACAGTGGATGGTGGAAGATGCTTCTTCTACCTCCTCCCCATAGTTCCTGAATGCACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGG-TG---GAATGTTGTTATAAAGTTTACATAAACCATCCTATTTTTGAGACAGTAGGATAGAT-ATAATGATGGGAATAACTATGTAAAATGTGCAGAGATCAGTAGTAAGAAACAGAAAGC--------AGCATGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTG--- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87751355 471 - 132174527 TTCCACTCA-AATCCTGGAA-AATTCATCATGTTT-------CTTCTGTGCAACTCAAAAGTTGTGTTTCTGTGCTCTTTGGATGAAGCACAAATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGGGCTTATGTTTCTACCTGGCTTCCCCTGGCCTCCAGAGAATTGAT-TTTTGTAGTTATAACCCATGGTGC---ATAGTTTACTGTTACATCAGGGCAGAAACTGATATATACCAACATATA--GAGGACAAAGTCCTCCACTGTGGATGGGGGAAGAGG---CTTCTACCTTCTCCCCATAGTTCCTGAATATACCAAGACTGTCA-CAGTAATTGGTAGGTTG---AAATGTTGTTATAATGTTCACATAAACCATCCTAATTTTGAGACAGTAGAATAGAT-ATAATGATGGGAATAGCTATGTGCAGTGCTCAGAGACGAGTGGTAAGAAACAGAAAGC--------AACATGTAAGGAAATGTCTTAGGGAA--------CTGTGATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74575236 479 - 124902244 TTCCATCCA-AAACCTGGGA-AACTAGCCAT-----------TTTCTGTGGA----GAAATATGAGTTTCTATTCTCAAC-AACGAACCATACACTAAC-TTTAAATTACCCCCTTTGGTGTTTTCTTCCTCCTTGGATATCACTAGACCCCAGAGAACTGAA-TTTTAGAGTTACATCCCATGGTGTTAGTTAGCATGTAGTTACATCAGGGCAAGACCTGATAAATACTAAAATATA--GACAATGCAGTCTTCTTTATGGGATTGAGG-AGAGACTTCTCCTATCTGTTATTTATAGGTTTTAATACTACACAGGCTGGCA-AAGTAGTTGGTAGG-TG-AAAAATACTGTTAAAATATTTATATAAATCACTTGAATTTTTAGACAGCATGA---AT-ATATTGATATAAGTAA-TGTTTAAAATTTTGTGAGAACCGTGTTACAAAACAGAAAACCTAAAGAAAGTATCTGGGGTAATGAATTGGGTGAGGTGGTATCTGTGATG i mm10.chr14 I 15102 I 1578 s canFam3.chr15 17328129 469 + 64190966 TTCTACTTCTAATCTAGGTA-AATGAGCCATTTTCCTTATTTGTTATGGGAAATTC---AGGTGCATTTCT-------TTGGGTGATGCACACATCAACTTTTAAATTATTCCCTCAGTGTTTTGATTCCTAGCTGGCTGGCCATGGACTCCAGAGAATTGGAATTCT-TAGTCATAACCCATGATGCTAGTTAGCTCATTGTTACATCAAGGAAGGAACTGATATATACCAGAAT-TA--GAAGACAAAGCTTTCTGTTGTAGATGGGGAAAGAGGCA-CCTCTATCCCCT--CTATAGTTCCTGACTATACCAGAACTCTCACCAGCAACTGGTAGG-TGGAAGAATGGCATTCTATTATTTACATAAACTAT----TTTTTGAGACAATGTGGTAGAC-GTAAAAATGGGAATAACTCTGTAAAATACTCAAAGAATAGTGTTAAGAAGTAG-AGGC--------TTCTGGTAAGGAAAGGTGTAAGGGAA--------ACATGATG i canFam3.chr15 C 0 I 6 e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M a score=368424.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 393161 267 + 478999 ATAGTATAGAGTAGGTTTTAGCTGTGGAGTGGGTGGACAAATTGTTTCTTTTCAGCCTTGGTCTCAATAATTAAAGCATTTTAAAG-TCAGGGTTGAGCAGGGCATTGAAGAGACAGCTTCATCATTTTATACTCATAGGATGAATCATTTCTAAGCAA----GCTCAGAGAAGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGCGTGACAGATTATTAAAATAAACGTCCAAAATTTTGAATC--------CTTTTACTCCTGGAAGAAAGACAGGAAAACC s rheMac3.chr7 88012708 254 - 170124641 -------------GGTCTTAGCTGTGCAGTGGATGGACAAATTGTTTCTTCTGTGCCTTGATCTCAATAATTAAAGCATTTTAAAG-TCAGGGTTGAACAGGGCATTGAGGAGACAGCTTGGTCATTTTATACTCATAGGATGAACCATTTGTAAACAA----GCTCAGAGAAGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGAGTGACAAATTATTAAAATAAACTTCCAAAATTTTGAATC--------CCTTTACTCCTGAAAGAAAGTCAGGAAAACC i rheMac3.chr7 C 0 I 12 s macFas5.chr7 88290992 254 - 171882078 -------------GGTCTTAGCTGTGCAGTGGATGGACAAATTGTTTCTTCTGTGCCTTGATCTCAATAATTAAAGCATTTTAAAG-TCAGGGTTGAACAGGGCATTGAGGAGACAGCTTGGTCATTTTATACTCATAGGATGAACCATTTGTAAACAA----GCTCAGAGAAGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGAGTGACAAATTATTAAAATAAACTTCCAAAATTTTGAATC--------CCTTTACTCCTGAAAGAAAGTCAGGAAAACC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85420137 254 - 162156779 -------------GGTCTTAGCTGTGCAGTGGATGGACAAATTGTTTCTTCTGTGCCTTGATCTCAataattaaagcattttaaaa-tcagggtTGAACAGGGCATTGAGGAGACAGCTTGGTCATTTTATACTCGTAAGATGAACCATTTGTAAACAA----GCTCAGAGACGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGAGtgacaaattattaaaataaacttccaaaaTTGTGAATC--------CCTTTACTCCTGAAAGAAAGTCAGGAAAACC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3577081 253 - 24206276 -------------GGTCTTAGCTGTGCAGTGGATGGACAAATTGTTTCTTCTGTGCCTTGATCTCAATAATTAAAGCATTTTAAAG-TCAGGGTTGAACAGGGCATTGAGGAGACAGCTTGGTCATTTTATACTTATAGGATGAACCATTTGTAAACAA----GCTTAGAGAAGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGTGTGACAAATTATTAAAATAAACTTCC-AAATTTTGAATC--------CATTTACTCCTGAAAGAAAGTCAGGAAAACC i chlSab2.chr29 C 0 I 12 s calJac3.chr10 87751826 267 - 132174527 ATAGTATATAGCAGGTCCTAGCTGTGGAGTGGGTGGACAAATTGTTTCTTCTTTGCCTTGATCTCAATAATTAAAGCATTTTAAAG-TCAGGGTTGAACAGGGCATTGAGGAGACAGTTTGGTTATTCTATATGCATAAGATGAACCATTTGTAAACAA----GCTCAGAGAAGGCTGTTTTGATTTATGGGTCTTCAGAGAGTAACAAATCATTAAAATAAACTTCCAAAATTTTGAATT--------CCTTTGTTCTTGAAAGAAAGTCTGGAAAATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17328604 234 + 64190966 ATCATATAGAGCAGACCTTAGCCAT------AGTGTACA--------------------------AATAGGTAAGGCATTTTTGAGCCCAAGGCTGAACAGGGCATTGAGAAGATAACTGGGTCATCTCATATTTACAGAATGAACCATTCTTAAACAGTTTCAATCAGAGAAGGTTCTTCTAATTTATGGGTCTTCAGAGAGTGCCAAATCATTAAAATAATCTTTCAAAATTTTGAATCTTGTCACTCCTtttttttttaaaga-------------- i canFam3.chr15 I 6 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M a score=3017.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 393428 27 + 478999 CCAAGATCTTTAGTTACTTCTTTTTAT s calJac3.chr10 87752093 27 - 132174527 TCAAGATCTTTAGTTACTTCTTATTAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17328838 20 + 64190966 -------ttttatttatttatttattt i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e chlSab2.chr29 3577334 12 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85420391 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88291246 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88012962 12 - 170124641 I a score=900.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 393455 24 + 478999 TTTTATtttattttatttttttat s canFam3.chr15 17328858 22 + 64190966 atttattt--atttatttatttat i canFam3.chr15 C 0 I 187 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e chlSab2.chr29 3577334 12 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85420391 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88291246 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88012962 12 - 170124641 I e calJac3.chr10 87752120 0 - 132174527 C a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 393479 3433 + 478999 actttaagttttagggtacatgtgcacattgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgccctgcacccactaactcgtcatctagcattaggtatatctcccagtgctatccctcccccctccccccaccccaccacagtccccagagtgtgatattccccttcctgtgtccatgtgatctcattgttcaattcccacctatgagtgagaatatgcggtgtttgcttttttgttcttgcgatagtttactgagaatgatgatttccagtttcatccatgtccctacaaaggatatgaactcatcattttttgtggctgcatagtattctatggtgtatatgtaccacattttcttaatccagtctatcattgttggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaataatgccgcaataaacatacgtgtgcatgtgtctttatagcagcataatttatagtcatttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggatgaactagtttacagtcccaccaacagtgtaaaagtgttcctatttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgattgccattctaactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgagcattttttcatgtgttttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtccttcgcccactttttgatggggttgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcattgtagattctggatattagccctttgtcagatgagtaggttgcaaaaattttctcccattttgtaggttgcctgttcattctgatggtagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttggtgttttggacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacgtttaaatctttaatccatcttgaattgatttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagcttcctacatatggctagccagttttcccagcaccatttattaaatagggaatcctttccccattgcttgtttttctcaggtttgtcaaagatcagatagttgtaggtacgcggcattatttctgagggctctgttctgttccattgatctatatctctgttttggtaccaataccatgctgttttggttactgtagccttgtagcatagtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagctttgttcttttggcttaggattgacttggcaatgcgggctcttttttggttccatatgaactttatagttttttccaattctgtgaagaaagtcattggtagcttgatggggatggcattgaatctgtaaattaccttgggcagtatggccattttcacgatattgattcttcctacccatgagcatgaaatgttcttccatttgtttgtatcctcttttatttccttgagcagtggtttgtagttctccttgaagaggtccttcacatcccttgtaagttggattcctaggtattttattctctttgaagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctctctgtttgtctgttgttggtgtataagaatgcttgtgatttttgtacattgattttgtatcctgagactttgctgaagttgcttatcagcttaaggagattttgggctgagacaatggggttttctagatatacaatcatgtcgtctgcaaacagggacaatttgacttcctcttttcctaattggataccctttatttccttctcttgcctaattgccctggccagaacttccaacactatgttgaataggagtggtgagagagggcatccctgtcttgtgccagttttcaaagggaatgcttccagtttttgcccattcagtatgatattggctgtgggtttgtcatagatagctcttattattttgaaatacgtcccatcaatacctaatttcttgagagtttttagcatgaagggttgttgaattttgtcaaaggctttttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttctgtttatatgctggattacatttattgatttgcgtatactgaaccagccttgcatcccagggatgaagcccccttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcctcaatgttcatcaaggatattggtctaaaattctcttttttggttgtgtctctgcccggctttggtatcagaatgatgctggcctcataaaatgagttaggaaggattccctctttttctattgattggaatagtttcagaaggaatggtaccagttcttccttgtacctctggtagaattcggctgtgaatccatctggtcctggactctttttggttggtaagctattgattattgccacaatttcagctcctgttgttggtctattcagagattcaacttcttcctggtttagtcttgggagagtgtatgtgtcgaggaatttatccatttcttctagattttctagtttatttgcgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttgtatgtctgtgggatcggtggtgatatcccctttatcattttttattgtgtctatttgattcttctctctttttttctttattagtcttgctagcggtctatcaattttgttgatcctttcaaaaaaccagctcctggattcgttgattttttgaagggttttttgtgtctctatttccttcagttctgctctgattttagttatttcttgccttctgctagcttttgaatgtgtttgctcttgcttttctagttcttttaattgtgatgttagggtgtcaattttggatctttcctgctttctcttgtgggcatttagtgctataaatttccctctacacactgctttgaatgcgtcccagagattctggtatgttgtgtctttgttctcgttggtttcaaagaacatctttatttctgccttcatttcgttatgtacccagtagtcattcaggagcaggttgttcagtttccatgtagttgagtggctttgagtgagattcttaatcctgagttctagtttgattgcactgtggtctgagagatagtttgttataatttctgttcttttacatttgctgaggagagctttacttccaactatgtggtcaattttggaataggcatggt e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17328880 187 + 64190966 I e chlSab2.chr29 3577334 12 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85420391 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88291246 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88012962 12 - 170124641 I e calJac3.chr10 87752120 0 - 132174527 C a score=2538.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 396912 9 + 478999 AGTTACTTC s macFas5.chr7 88291246 9 - 171882078 AGTTACTTC i macFas5.chr7 C 0 I 3 s papAnu2.chr7 85420391 9 - 162156779 AGTTACTTC i papAnu2.chr7 C 0 I 3 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17328880 187 + 64190966 I e chlSab2.chr29 3577334 12 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88012962 12 - 170124641 I e calJac3.chr10 87752120 0 - 132174527 C a score=910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 396921 1 + 478999 T s rheMac3.chr7 88012974 1 - 170124641 T i rheMac3.chr7 I 12 C 0 s macFas5.chr7 88291258 1 - 171882078 T i macFas5.chr7 I 3 C 0 s papAnu2.chr7 85420403 1 - 162156779 T i papAnu2.chr7 I 3 C 0 s chlSab2.chr29 3577346 1 - 24206276 T i chlSab2.chr29 I 12 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17328880 187 + 64190966 I e calJac3.chr10 87752120 0 - 132174527 C a score=4095.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 396922 3 + 478999 TAT s rheMac3.chr7 88012975 3 - 170124641 TAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88291259 3 - 171882078 TAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85420404 3 - 162156779 TAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3577347 3 - 24206276 TAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17329067 3 + 64190966 TAT i canFam3.chr15 I 187 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e calJac3.chr10 87752120 0 - 132174527 C a score=902701.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 396925 646 + 478999 AGTTCTTCAGGATGATCTCTGTGAAGAGGAAGGGAAAGGTGAGGCTTGAAATATTTCATTTCAAAGGGATTAGTGTTAGTAGTAGCAAAAACTTTGAAAATAAATAGAAAAGCAAAAAAGAAACTTAAAAGCAAAGAGACTCTTACTTGAAATAAATGTGGGTGAAATATGTATTTTAACAAAAAGGATTCCAAAAAGCAAAATTAGGAATTATGTAGCAGAGTAGGGAAAGAAGAAATGAATTAATAAAAACAA--TTAGATGTTGTGGTGTTTAATTTTTGTCAAAGTCTACTGATCTATTTATTCAATAAAAAATCCATGTAATCATC--------------------------------------------------------CCATCCatccatccatttaacaaacacatattgaagaccataacatgctaggaactactttaggcag----tagatatataaatgagacatactccatgacctcaaggagctcagagttcctgttatattttg--caaaatacaaactgaaaaattacaatgtaatgagttaaaatttgtactg---------------------ggggtgtaaac--agtactattatgggagcCATAAAAATATGACATTTTTATGGAACTTATATATACAAAATTCATACAAAATTTCAGGCATTTTAG---AAAACAAGCTTCTGAGAATAGCTGAAGGATTTAAAAATAGTGAT s rheMac3.chr7 88012978 702 - 170124641 AGTTCTTCAGGATGATCTCTGTGAAGGGGATGGGAAAGGTGAGGCCTCAAATGTTTCATTTCAAACGGATTAGTGTTAGTAGTAGTAAAAACTTTGAAAATAAATAGAAAAGCAAAAAAGAAACTTAAAAGCAACGAGACTCTTACTTGAAATAAATGTGGGTGAAATATGTATTTTAAATAAAAGGATTCTATAAAGCAAAATTAGGAATTATGTAGCAGAGTAGGGAAAGACTAAATGAATTAATAAAAACAA--TTAGATGTTGTGGTATTTAATTTTTTTCAAAGTCTAATGATTTATTTATTCAAT-AAAAATCCATATAATCATCccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatcTaacaaacacgtattgaagaccatagcatgctaggaactaccttaggcac----tagatatgtaaataagacatacttcatgacctcaagaagctcagagtttctgttatattttg--caaaatacaaactgaaaaattacaatgtaatgagttaaaattttta-tg---------------------gaggtgtaaacagagtactattatgggagccatagaaatagggcaTTACTGTGGAACTTATGTATACAAAATTCATTCAAAATTTCAGGCATTTTAG---AAAACAGCCTTCTGAGAATAGCTGAAGGATTTAAAAATAGTGAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88291262 678 - 171882078 AGTTCTTCAGGATGATCTCTGTGAAGGGGATGGGAAAGGTGAGGCTTCAAATGTTTCATTTCAAACGGATTAGTGTTAGTAGTAGTAAAAACTTTGAAAATAAATAGAAAAGCAAAAAAGAAACTTAAAAGCAACGAGACTCTTACTTGAAATAAATGTGGGTGAAATATGTATTTTAAATAAAAGGATTCTATAAAGCAAAATTAGGAATTATGTAGCAGAGTAGGGAAAGACTAAATGAATTAATAAAAACAA--TTAGATGTTGTGGTATTTAATTTTTTTCAAAGTCTAATGATTTATTTATTCAAT-AAAAATCCATATAATCATC------------------------ccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatttaacaaacatgtattgaagaccatagcgtgctaggaactaccttaggcac----tagatatgtaaataagacatacttcatgacctcaagaagctcagagtttctgttatattttg--caaaatacaaactgaaaaattacaatgtaatgagttaaaattttta-tg---------------------gaggtgtaaacagagtactattatgggagccatagaaatagggcaTTACTGTGGAACTTATGTATACAAAATTCATTCAAAATTTCAGGCATTTTAG---AAAACAGCCTTCTGAGAATAGCTGAAGGATTTAAAAATAGTGAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85420407 683 - 162156779 AGTTCTTCAGGATGATCTCTGTGAAGGGGATGGGAAAGGTGAGGCTTGAAATGTTTCATTTCAAACGGATTAGTATTAGTAGTagtaaaaactttgaaaataaatagaaaagcaaaaaagaaacttaaaagcaaagAGAttcttatttgaaataaatgtgggtgaaatatgtattttaaagaaaaggattctaaaaagtaaaattaggaaTTATGTAGCAGAGTAGGGAAagactaaatgaattaatgaaaacaa--TTAGATGTtgtggtatttaatttttttcaaagtctaatgatttatttattcaac-aaaaatccatataatcatc--------------------ccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatttaacAAACAGGTATTGAAGACCATAGCATGCTAGGAACTACCTTAGGCAC----TAGATATGTAAATAAGACATACTTCATGACCTCAAGAAGCTGAGAGTTTCTGTTATATTTTG--CAAAATACAAACTGAAAAATTACAATGTAATGAGTTAAAATTTTTACTG---------------------GAGGTGTAAACAGAGTACTATTATGGGAGCCATAGAAATAGGGCATTACTGTGGAACTTATGTATACAAAATTCATACAAAATTTCAGGCATTTTAG---AAAACAGCCTTCTGAGAATAGCTGAAGGATTTAAAAATAGTGAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3577350 678 - 24206276 AGTTCTTCAGGATGATCTCTGGGAAGGGGATGGGAAAGGTGAGGCTTGATATGTTTCATTTCAAATGGATTAGTGTTAGTAGTAGTACAAACTTTGAAAATAAATAGAAAAGCATAAAAGAAACTTAAAAGCGAAGACACTCTTACTTGAAATAAATGTGGGTGAAATATGTATTTTAAAGAAAAGGATTCTAAAAAGCAAAATTAGGAATTATGTAGCAGAGTAGGGAAAGACTAAATGAATTAATAAAAACAA--TTAGATGTTGTGGTATTTAATTTTTTTCAAAGTCTAATGATTTATTTATTCAAT-AAAAATCCATATAATCATC------------------------ccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatttaacaaacacgtattgaagaccatagcatgctaggaactaccttaggcac----tagatatgtaaataagacatacttcatgacctcaagaagctcagagtttctgttatattttg--caaaatacaaactgaaaaattacaatgtaatgagttaaaattttttctg---------------------gaggtgtaaacagagtactattatgggagccatagaaatagggcaTTACTGTGGAATTTATGTATACAAAATTCATACAAAATTTCAGGCATTTTAG---AAAACAGCCTTCTGAGAATAGCTGAAGGATTTAAAAATAGT-AT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87752120 636 - 132174527 AGTTCTTCA-GATGATCTCTATAAAAAGGCTGGGAAAGGTGGGGCTTGGGATGTTTTATTTCAAAGGGATTAGCGTTAGTAGTAGCAACAACTTTAAAAATAAATAGAAAAGCAAAAAAGAAACTTAAAAACAAAGAGACTCTAGCTTGAAAGAAATGTGGGTGAAATACGTATTTTAAA-AAAAGGATACCATACAGCAAAGTTACAAATCATGTAGCAGAGTAAGGAAAGACTAAATGAAGTAATAGAAAC------AGATGTTGTG--ATTTAATTTTTTTC--AGTCTATTGATTTATTTATTCAATTAAAAATCCATGTAATCATT------------------------------------------------Tcatctatccatccatccatccatttaacaaacatgtattgaagacaatatcatgctagaaactacctcaggcac----tagatagataaatgagacatactccatga-ctcagggagctcagagtttCTGTTATGTTTTA--CAAAATACAAACTGAAAAATTACAGTGTAATGAGTTAAAATATTTACTG---------------------GAGG---------GCTACTATTATGGGAAGCATAGAAATATGGCATTTCTATGGAACTAATTTATGCAAAATTCATACAAAATTTCAGGCATTTCAG---AAAAGAGGCTTCTGAGACTAGCTGAAGGATTTATTAATAGTGAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17329070 634 + 64190966 GGTTCCTCAAGATGACCACTGTGAAGAAGAAGGGGGAGATAGGACTTGTCATGTTTCATTTTGAACGGACTGGAGTTCATAGCAGCAACAGCTCTGGAAGTGAAT--------AAGGAAAAAACTTAAAAGCA--GAGACTCTTATTTGAAATTAATATAGATAAAATAGTCATCTTAAA-AAGACGACTGCAGGAAACAAA-TCAGGAATCATGAAGCAGGCTCAGGAAACACTAAATGTAATAAT-AAAACAATCTTAGAAGT-----------------------ATTTGATAATTTTTTCCTATAAT--------------GTCATC-----------------------------------------AACTAGTTTGTTCACTTACAAatccatccatccaacaaacacatattaaagaccataatgtgccagaagttctctcaggcactagatagatatctaagtgagacatgcttcatgtcttcacggggctcagagtttcagtTATATTTTGGCTAAAAGATAAACTGAAAAGCTACAAGGCAATGCATCAAgtttttttttgttttgttttgtttgttttTTTGAGTTGTGAACAGAGTATTACTATGAGAGCCC----------AGATTTCTCTGGTGTTTGT-TAGAAATTATTCATACAAAATTTCAGACATTTTGGGAAAAAAAGGCCTTCTCAGACTAGCTGGATGATTTAACAATAGTGAt i canFam3.chr15 C 0 I 694 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M a score=45015.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 397571 34 + 478999 ACATCAACAATGTAACAGGACTGTGGGTCTGGGA s rheMac3.chr7 88013680 34 - 170124641 ACATCAACAATGTAACAGGACTGTGGGTCTGGGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88291940 34 - 171882078 ACATCAACAATGTAACAGGACTGTGGGTCTGGGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85421090 34 - 162156779 ACATCAACAATGTAACAGGACTGTGGGTCTGGGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3578028 34 - 24206276 ACATCGACAATGTAACAGGACTGTGGGTCTGGGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87752756 34 - 132174527 ACACCAAAAACGTAACAGGACTGTGAGTCTGGGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17329704 694 + 64190966 I a score=211415.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 397605 247 + 478999 AAAATGTGGGGAGCATTATATGCAttaatcactacaatacctgtgaagtaggtactgttattatttccattgcactaatgaggcacactgaggc----agaggtaagtgagttgcccaggattacacagctagtaagtgctt-agctgtggttagaatgaaggcaCTGAGAAATAaaataaaaatgaaacccttagctccccaagctactgaatggaccctctcttggccaagggcaccccagagtaacctt s rheMac3.chr7 88013714 247 - 170124641 AAAATACGGGGAGCATTATATGCAttaatcactacaatacctatgaagtaggtactgtcattatttccattgcactaatcaggcacattgaggcagagagaggtaagtgagttgcccaggtttacacagctagtaagtggttcagctatggttagaacgaaggcaCtgag-----aaataaaaatgaaacccttagctccccaagctactgaatggaccctctcttggccaaggggacactagaataacctt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88291974 247 - 171882078 AAAATACGGGGAGCATTATATGCAttaatcactacaatacctatgaagtaggtactgtcattatttccattgcactaatcaggcacattgaggcagagagaggtaagtgagttgcccaggtttacacagctagtaagtggttcagctatggttagaacgaaggcaCtgag-----aaataaaaatgaaacccttagctccccaagctactgaatggaccctctcttggccaaggggacactagaataacctt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85421124 252 - 162156779 AAAATGCGGGGCACATCATATGCATTAATCACTACAATACCTATGAAGTAGATACTGTCATTATTTCCATTGCACTAATCAGGCACattgaggcagagagaggtaAGTGAGTTGCCCAGGtttacatagctagtaagtggttcAGCTGTGGTTAGAACAAAGgcactgagaaataaaataaaaatgaaaccctTAGCTCCCCAAGCTACTGAATGGACcctctcttggccaaggggacacCAGAGTAACCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3578062 252 - 24206276 AAAATGCGGGGAGCATTATATGCAttaatcactacaatacctatgaagtaggtactgtcattatttccattgcactaatcaggcacattgaggcagacagaggtaaatgagttgcccaggtttacatagctagtaagtggttcagctgtggttagaacgaaggcaCTGAGAAATAaaataaaaatgaaacccttagctccccaagttactgaatggaccctctcttggccaaggggacaccagagtaacctt i chlSab2.chr29 C 0 I 171 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17329704 694 + 64190966 I e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=593030.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 397852 686 + 478999 aaaagctgagttttcatccatgacaagatgggcggtcagaggtgccttcttacatccccgccctcacttaactaccattagactttcctacctaagtgctaaatagaaaccagctcttttgaaagactccactgctgatatcaacaaatcactgaagcagttcctctttttttgtggttttaacatggcaattaaccagcattccttcctgataagagaccaACtatatgctactcatgaaggggcatgaagcacaattgtgcatgtgcatggttgtcctttcataaatattcaagattcctcctatagcttattgagcatatgtatttggccacctcactcagtacatattccttttgtcactgtctcgaaatatttgtttctggctcctggccagaggctatatttcccagcctgtcataatagccacccttcaggctacaactctatgagaaataaaggtcctcctttccaaatttatgaaccccatcattcttcagttgataGCACTGACACCCCATATCTAAGTATATTAAAAGAGAAATAAGCTGCAaatatatataatat----------ataaatatgtaatatatgtaaatatatga-tat-atacatatttatatataatttatattatatataaaatatattttaatatactttaatatattcaagtaaattaaaagaatatattaa s rheMac3.chr7 88013961 697 - 170124641 aaaagctgagttttcagccatgacaagatgggcagtcagacgtgccttcttacatccccgccctcactgacctgccattagactttcctacctaagtgctaaatacaaacctgctcttttgaaagactccactgctgatatcaaccaaccactgaagctgtccctc-ttttttgtggttttaacacaacaattaaccagcattccttcctgacaagagaccaACTTTGTGTTactcatgaaggggcatgaagcacaattgtgcatgtacatggttctcctttcataaatattcatgactcctcctatagcttattgagcctatatatttggccatctcactcagtacatactccttttgacattccctcgaaatatttgtttctggctcctggccagaggctatatttcccagcctgtcataatagccaccctgcaggctgcaactctaagagaaataaaggtcctcctttccaaatttatgaacctcatcattcttcagttgacaCCACTAACATCCCATATCTAAGTATATTAAAAGAGAAATAAGCAGCAAatatatataatatatattataacataaatgtgtaatacatgtaaatatataattataatatatatttatatgtaatttatattatatataaaatatattttaatatactttaatatattaaagtaaattaaaagaatatattaa i rheMac3.chr7 C 0 M 166 s macFas5.chr7 88292221 697 - 171882078 aaaagctgagttttcagccatgacaagatgggcagtcagacgtgccttcttacatccccgccctcactgacctgccattagactttcctacctaagtgctaaatacaaacctgctcttttgaaagactccactgctgatatcaaccaaccactgaagctgtccctc-ttttttgtggttttaacacaacaattaaccagcattccttcctgacaagagaccaACTTTGTGTTactcatgaaggggcatgaagcacaattgtgcatgtacatggttctcctttcataaatattcatgactcctcctatagcttattgagcctatatatttggccatctcactcagtacatactccttttgacattccctcgaaatatttgtttctggctcctggccagaggctatatttcccagcctgtcataatagccaccctgcaggctgcaactctaagagaaataaaggtcctcctttctaaatttatgaacctcatcattcttcagttgacaCCACTAACACCCCATATCTAAGTATATTAAAAGAGAAATAAGCAGCAAatatatataatatatattataacataaatgtgtaatacatgtaaatatataattataatatatatttatatgtaatttatattatatataaaatatattttaatatactttaatatattaaagtaaattaaaagaatatattaa i macFas5.chr7 C 0 I 9 s papAnu2.chr7 85421376 692 - 162156779 AAAAGCTGAGTTTTCAGCCTTGACAAGATGGGCAGTCAGACATGCCTTCTTACATCCCCGCCCTCACTGAACTGCCATTAGACTTTCCTACCTAAGTGCTAAATGGAAACCTGCTCTTTTGAAAGATTCCACTGCTGATATCAACCAATCACTGAAGCTGTCCctc-ttttttgtggttttaatacAACAATTAACCAGCATTCCTTCCTGACAAGAGACCAGCTATGTGTTACTCATGAAGGGGCATGAAGCACAATTGTGCATGTACATGgttctcctttcataaatattcatgactcctcctaTAGCTTATTGAGCCTATGTATTTGGCCATCTCACTCAGTACATACTCCTTTTGACATTCCCTCGAAATATTTGTTTCTGGCTCCTGGCCAGAGGCTATATTTCCCAGCCTGTCATAATAGCCACCCTGCAGGCTGCAACTCTAAGAGAAATAAAGGtcctcctttccaaatttatgaaccacatcattcttcagttgacaCCACTAACACCCCATATCTAAGTACATTAAGAGAGAAATAAGcagcaaatatatataatatatattataacataaatgtgtaatacatgtaaatatataattataatatatatttatatgtaat-----ttatatataaaatatattttaatatactttaatatattaaagtaaattaaaagaatatattaa i papAnu2.chr7 C 0 I 9 s chlSab2.chr29 3578485 697 - 24206276 Aaaagctgagttttcagccatgacaagatgggcagtcaaacgtgccttcttacatccccgccctcactgacctgccattagactttcctacctaagtgctaaatagaaacctgctcttttgaaagactcggctgctgatatcaaccaaccactgaagctgtccctc-ttttttgtggttttaacacaacaattaaccagcattccttcctgacaagagaccaACTATGTGTTactcatgaaggggcatgaagcacaattgtgcatgtacatggttctcctttcataaatattcatgactcctcctacagcttattgagcatatgtatttggccacctcactcagtacatattccttttgacattccctcgaaatatttgtttttggctcctggccagaggctatatttcccagcctgtcataatagccaccctgcaggctgcaactctaagagaactaaaggtcctcctttccaaatttatgaacctcatcattcttcagttgacaGCACTAACACCCCATATCTAAGTATATTAAAAGAGAAATAAGCAGCAaatatatataatatgtattataacataaatgtgtaatacacataaatatataattataatatataagtatatataatttatattatatataaaatatattttaatatactctaatatattaaagtaaattaaaagaatatattaa i chlSab2.chr29 I 171 I 9 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17329704 694 + 64190966 I e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=30640.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 398538 83 + 478999 tagttgtatat-aaaataagtattttaatatacttta-----atgttaatgtata-tactatat----attttaatataatttaataac--attaa s macFas5.chr7 88292927 91 - 171882078 tagttgtatataaaaata---tttttaatatactttaataatatattaatgtatattactatatattaattttaacatatgttaataac--attaa i macFas5.chr7 I 9 C 0 s papAnu2.chr7 85422077 84 - 162156779 tgattgtatataaaaata---ttcttaatatactt---taatatattaatgtatattactatat----attttaacatattttaataac--attaa i papAnu2.chr7 I 9 C 0 s chlSab2.chr29 3579191 92 - 24206276 tagttgtatat-aaaata---tttttaatatactttaataatatattaatgtatattactatatattaattttaacatattttaataacatattaa i chlSab2.chr29 I 9 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e ponAbe2.chr14 18920711 6673 + 108868599 M e canFam3.chr15 17329704 694 + 64190966 I e rheMac3.chr7 88014658 166 - 170124641 M e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=20826.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 398621 31 + 478999 agtgtattattaaat---ataataatatattaa---a s ponAbe2.chr14 18927523 34 + 108868599 agtgtattattaaat---acaataaaataataataAA i ponAbe2.chr14 M 6673 C 0 s macFas5.chr7 88293018 34 - 171882078 agtatattattaaatataataataatatattaa---a i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422161 34 - 162156779 agtgtattattaaatataataataatatattaa---a i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579283 34 - 24206276 agtatattattaagtataataataatatattaa---a i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e canFam3.chr15 17329704 694 + 64190966 I e rheMac3.chr7 88014658 166 - 170124641 M e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=15691.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 398652 20 + 478999 gtatatTAAAAGAGAAATAA---- s ponAbe2.chr14 18927557 20 + 108868599 GCATATTAAAAGAGAAATAA---- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293052 20 - 171882078 gtatatTAAGACAGAAATAG---- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422195 20 - 162156779 gtatattaagagataaataG---- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579317 20 - 24206276 gtatattaaGAGAGAAATAG---- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17330398 24 + 64190966 GTCTATTTTAAGAGAAATGCACAA i canFam3.chr15 I 694 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e rheMac3.chr7 88014658 166 - 170124641 M e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=212582.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 398672 132 + 478999 GCAGCAAATGATCTTCAAAATAGTCTCAT--TGAGATCAGCCCTTCTCTTATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGGGCAACAATGCATACAGAAAATCAATGTAATAACTACATCTTGATATTTT s ponAbe2.chr14 18927577 133 + 108868599 GCGGCAG-TGATCTTCAAAATAGTCTAATACTGATATCAGCTCTTCTCTGATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGGGCAACAATGCATACAGAAAATCAATGTAATAACTACATCTTGATATTTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88014828 134 - 170124641 GCAGCAAATGATCTTCAAAATATTCTAATATTGAGATCAGCCCTCCTCTGATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGCACAACAATGCATACAGAAAATCAATGTAATTACTACATATTGATATTTT i rheMac3.chr7 M 166 C 0 s macFas5.chr7 88293072 134 - 171882078 GCAGCAAATGATCTTCAAAATATTCTAATATTGAGATCAGCCCTCCTCTGATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGCACAACAATGCATACAGAAAATCAATGTAATTACTACATATGGATATTTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422215 134 - 162156779 GCAGCAAATGATCTTCAAAATAGTCTAATACTGAGATCAGCCCTCCTCTGATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGCGCAACAATGCATAcagaaaatcaatgtaattacTACATATTGATATTTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579337 134 - 24206276 GCAGCAAATGATCTTCAAAATAGTCTAATATTGAGATCAGCCCTCCTCTGATCCTAATGGTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGCACAACAATGCATACAGAAAATCAATGTAATTACTACATATTGATATTTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17330422 125 + 64190966 GCAGCAAATGATTC---------TCTCATATTGAAATCAGCCCTTCTCCAATCCTAATGCTTTCTTCTTGCCTAGTTTACTGTGAGCCACAAAGCATATAGGAAATCAAGATACTTGCTACATTTTGGTATTCT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I e calJac3.chr10 87752790 0 - 132174527 C a score=749706.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 398804 375 + 478999 CTGCTACTGGTTTATTTATGACACTCGAGGTCCCTTGGCTACC-TATACCCATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCACCATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCCATATCCTAAAAATAGGAAAATTAATTT----TCATTCTTTCTAAG---TGTTGTATATATCCACAATGGTGATGATATCACTGTTTCTCCCTATTGCTACCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGAGAATTTTACTCTCAACCTACTTTTACTTTAACGgaatcataggattttagaggtagaacatttcttaaaattctagtt-aaaatccctccttttgctatgaagaaactgtcatagaggaagatctcacgacct---caacatca s ponAbe2.chr14 18927710 376 + 108868599 CTGCTACTCGTTTATTTATGACACTCGAGGTCCCCGGGTTTCC-TATACCCATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCACCATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCAATATCCTAAAAATAGGAAAATTAATTC----GCATTATTTCTAAGAAGTCTTGTATATATCCACAGTGGTGATTACATCACTGTTTCTCCCTATTGCTACCCAAATCTTTCTTAATATACCTTTCTGAGAATTTTACTCTCAACCTACTTTTACTTTAatggaatca--ggattttagaggtagaacaattcttaaaattctagtt-aaaatccctccttttgctatgaagaaactgtcatagaggaagatttcacaacct---caacatca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88014962 376 - 170124641 CTGCTACTGATTTATTTATGATATTCGAGGTCCTTGGGCGTCCATATGCCTATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCGCCATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCAATATCCTAAAAATAGGAAAATTAATTC----ACATTATTTCTAAG---TGTTGTATATACCCACAATGGTGATTACATCACTGTTTCTCCCTATTGCTACCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGATAATTTTACTCTCAACCTACTTTTACTTTAatggaatcataggattttagaggtagagcatttcttaaaattctagtt-aaaatcccttctgttgctacgaagaaactgtcatagaggAAGATTTCATGACCT---CAGCATCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293206 376 - 171882078 CTGCTACTGATTTATTTATGATATTCGAGGTCCTTGGGCGTCCATATGCCTATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCGCCATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCAATATCCTAAAAATAGGAAAATTAATTC----ACATTATTTCTAAG---TGTTGTATATACCCACAATGGTGATTACATCACTGTTTCTCCCTATTGCTACCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGATAATTTTACTCTCAACCTACTTTTGCTTTAatggaatcataggattttagaggtagagcatttcttaaaattctagtt-aaaatcccttctgttgctacgaagaaactgtcatagaggAAGATTTCATGACCT---CAGCATCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422349 376 - 162156779 CTGCTACTGATTTATTTATGACATTCGAGGTCCTTGGGCTTCCATATACCCATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCACCATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCAATAtcctaaaaataggaaaattaattc----aCATTATTTCTAAG---TGTTGTATATACCCACAATGGTGATTACATCACTGTTTCTCCCTATTGCTAGCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGATAATTTTACTCTCAACCTACTTTCACTTTAATGGAATCATAGGATTTTAGAGGTAgaacatttcttaaaattctaGTT-AAAATCCCTTCTGTTGCTACGAAGAAACTGTCATAGAGGAAGATTTCATGACCT---CAGCATCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579471 376 - 24206276 CTGCTACTGACTTATTTATGACATTCGAGGTCCTTGGGCTTCCATATACCCATCTATATGGTGAAGATGCTTCTGTATACTCCTTCCTCACTATCCCACAGAATAA-----GTGAGCTCAATATCCGAAAAATAGGAAAATTAATTC----ACATTATTTCTAAG---TGTTGTATATACCCGCAATGGTGATTACATCACTGTTTCTCCCTATTGGTACCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGATAATTTTACTCTCAACCTACTTTCACTTTAatggaatcataggattttagaggtagaacatttcttaaaattctagtt-aaaatcccttctgttgctatgaagaaactgtcatagaggAAGATTTCATGACCT---CAGCATCA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87752790 375 - 132174527 CTGCTACTGGTTTATTTAAGACACTTAAAGTCCCTGGGCTTCCATATACC-ATTTACATGGTGAAGATGCTTCTGTATAATTCTTCCTCACCATCCCGAAGAATAA-----GTGAACTCAATATCCTAAACATAGTAGCATTAATTC----ACATTATTTCTAAG---TGTTGTATCTATCCACAATGGTGATTACATCACTGTTTCCCCCTATTGATACCCAAATCATTCTTAATTTACCTTTCTGAGAATTTTATTCTCAACCTACTTTTAC-TTAatagaatcataggattttagaggtagaatatttctcaaaattctagttaaaaatccctcctgttgctatgaagaaactgtcatagaggaagatttcatgacct---cagtatca i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17330547 384 + 64190966 CTACTGCTGGTTTATTTGTGAGGCTCAAGATCCCTGGTCTGCA-CATATCCCTCTATATGGTG-AGATGCTTTCGTAAACTACCTCATCACTATCTTATCGAATAAGAGAGGTAAGCTTGATATCTTAGGAAGAGGAAAAGTGAATTTAAGATATTTATTTTACA---TGTTATGTATATCCACAGTGATGATTAAGTCACCATCCCTCCGCGTTGTCACTCACATTGTTCTTAATCTACCTTTCTGGGGCCTTCACTCTCAATCCACTTTCATCTtcatagaattctagaattatacagctaggttattcgttaaaattctagtt-gaaattccttatgctgccaggaagaaac--ttgtagagggaagatgaatgatcttcctaaggaca i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74575715 1578 - 124902244 I a score=1993.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399179 2 + 478999 cg s ponAbe2.chr14 18928086 2 + 108868599 cg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015338 2 - 170124641 CC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293582 2 - 171882078 CC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422725 2 - 162156779 CC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579847 2 - 24206276 CC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753165 2 - 132174527 ca i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577293 2 - 124902244 CA i mm10.chr14 I 1578 C 0 s canFam3.chr15 17330931 2 + 64190966 cg i canFam3.chr15 C 0 I 1143 a score=412881.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399181 170 + 478999 cagATTCTTGTTTTCTCCCAAAGCATTGCTTCTCTTGAGAAGATTTCACAGTTCACTCACCGACAGGGAATGCACCTGTACTCCTAGGTATTTCCATAGTCATCCTCTAGGTACTACATCCCTGTAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGATGTTGTTAAAAGAGGAG---------CAG s ponAbe2.chr14 18928088 170 + 108868599 cagATTCTTGTTTTCCCCCAAAGCATTGCTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTCACTCACCTACAGGGAATGCACCTGTACTCCTGGGTATTTCCATAGTCATCCTCTAGGTACTACGTCCCTGTAGATT-----A-----AGAGTGGGAATTTTCTAGATGTTGTTAAAAGAGGAG---------CAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015340 170 - 170124641 CAGATTCTTGTTTTCCCCCAAAGCATTGGTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTTACTCACCTACAGGGAATGCGCCTGTACTCCCTGGTATTTTCATAGTCATCCTCTAGGTACTATGTCCCTGCAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGATGTTGTTAAAAGAGGAG---------CAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293584 170 - 171882078 CAGATTCTTGTTTTCCCCCAAAGCATTGGTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTTACTCACCTACAGGGAATGCGCCTGTACTCCCTGGTATTTTAATAGTCATCCTCTAGGTACTATGTCCCTGCAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGATGTTGTTAAAAGAGGAG---------CAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422727 170 - 162156779 CAGATTCTTGTTTTCCCCCAAAGCATTGGTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTTACTCACCTACAGGGAATGCGCCTGTACTCCCTGGTATTTTCATAGTCATCCTCTAGGTACTATGTCCCTGCAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGATGTTGTTAAAAGAGGAG---------CAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3579849 167 - 24206276 CAGATTCTTGTTTTCCCCCAAAGCATTGGTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTTACTCACCTACAGGGAATGCACCTGTACTCCCTGGTATTTTCATAGTCATCCTCTAGTTACTATGTCCCTGCAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGAAGTTGTTAAAA---GAG---------CAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753167 166 - 132174527 cagATTATTGTTTTCCCCCAAAGCATTGGTTCTCTTGAGGAGATTTCACAGTTCACTCACCTCCAGGGAATGTCTCTGTACT---GGGTATTTCCACA-TAGTCCTCTAGGAACTATGTCTCTGCAGATT-----A-----AGAATGGGAATTTTCTAGATGTTGCTAAAAGAGGAG---------CAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577295 184 - 124902244 CAGAGTCTTATTTTTCCCCAAAGCAATGGTTCCCATGAGGAGGTCTCACAGTTCACTAACCTATGGGAAAGGACTTCATGTCCCTAGCTCTCTTCATAACCATCCTCTAGATAACACATCCCTGAAGATTAAATAA-----AGAATAGATGTTTGCTAAGTGCTTTCAAGAGGAGTGGGCTTTATTCAG i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17332076 172 + 64190966 CAGATTCTCGCTTTTCCCTAAAGCACTTGTTCCCTTGAGGTGAGTTCACAGTTCACTCACCTGTAGGGAGAGCCTTGATCCTTCTGGGTATCTCTGTAGTCATTCTCTAGATACTACATCCCTGCAGATT-----AAGCACAGAATGGGAATTCACTAGATGTT---AAAAGAGGAA---------CAg i canFam3.chr15 I 1143 I 541 a score=57375.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399351 27 + 478999 AAGCTTAGGAGGAGTAGGTGGGTGGAT s ponAbe2.chr14 18928258 27 + 108868599 AAGCTTAGGAAGAGTAGGTGGGTGGAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015510 27 - 170124641 AAGCTTAGGAGGAGTAGGTGGGTGGAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293754 27 - 171882078 AAGCTTAGGAGGAGTAGGTGGGTGGAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422897 27 - 162156779 AAGCTTAGGAGGAGTAGGTGGGTAGAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580016 27 - 24206276 AAACTTAGGAGGAGTAGGTGGGTGGAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753333 27 - 132174527 AAGCTTAGAAGGAGTAGGTAGGTAGAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577479 27 - 124902244 AAATTTGGGAAGTAGAAATGAGTGGAT i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17332248 541 + 64190966 I a score=40302.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399378 15 + 478999 GTAAGATGAAGTAAA s ponAbe2.chr14 18928285 15 + 108868599 GTAAGATGAAGTAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015537 15 - 170124641 GTAAGATGAAGTAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293781 15 - 171882078 GTAAGATGAAGTAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422924 15 - 162156779 GTAAGATGAAGTAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580043 15 - 24206276 GTAAGATGAAGTAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753360 15 - 132174527 ATGAGACGAAGTAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577506 15 - 124902244 ACAAGATGGAGGAAA i mm10.chr14 C 0 I 56 s canFam3.chr15 17332789 15 + 64190966 GCAGGATAAAGTAAA i canFam3.chr15 I 541 C 0 a score=87555.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399393 49 + 478999 -TCTTCTTAAGGAACTTATCCAACCACTGCTCTAAGAGTAAGGACTGATT s ponAbe2.chr14 18928300 49 + 108868599 -TCTTCTTAGGCAACTTATCCAACCACTGCTCTAAGAGTAAGCACTGATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015552 49 - 170124641 -TCTTCTTAAGCAACTTATGCAACCACTGCTCTAAGAATAAGCACTAATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293796 49 - 171882078 -TCTTCTTAAGCAACTTATGCAACCACTGCTCTAAGAATAAGCACTAATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422939 49 - 162156779 -TCTTCTTAAGCAACTTATGCAACCACTGCTCTAAGAGTAAGCACCGATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580058 46 - 24206276 -TCTTT---AGCAACTTATGCAACCACTGCTCTAAGAGTAAGCACTGATT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753375 49 - 132174527 -TCTTCTTAAGCAACTTACCCAATAACTGCTCTTAGAGTAAGCGCTGATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17332804 42 + 64190966 ACCCTCCTGACCAACT--------AGCTGCTCTAAGAGTAAGTGCTGGCT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74577521 56 - 124902244 I a score=473061.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399442 219 + 478999 TGGAATAGTCATCCCCTCCTCAATGGCAACCTTAGAAAAAAATGCCCTAAGTCAATCTTCATGAGTGGCTTATCTCCCCCAAGAATTTCCCATAAACATAATTGCTTGCTTTGGGTTTTTTTGGTACAATTCCCAGCTTTTCTTGGGGTGTTA-CAGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACGTGGTATGGGCTGGA s ponAbe2.chr14 18928349 215 + 108868599 TGAAATAGGCATCCCCTCCTCAATGGCAACCTTAGAAAAAAATGCCCTAAGTCAATCTTCATGAGTGGCTTATCTCCCCCAAGAATTTCCCATAAACATAATTGCTT----TGGGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCTTGGGGTGTTA-CAGAGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACGTGGTATGTGCTGGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015601 219 - 170124641 TGGAATAGACATCCCCTCCTAAATGGCAACCTTGGAAAAAAATGCCCTAAGTCAGTCTTCATGAGTGGCTTATCTCCCCCAAGAATTTCCCACAAACATAATTGCTTGCTTTGGGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCTTGGGGTGTTG-CCGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACCTGGAGTGTGCTAGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88293845 219 - 171882078 TGGAATAGACATCCCCTCCTAAATGGCAACCTTGGAAAAAAATGCCCTAAGTCAGTCTTCATGAGTGGCTTATCTCCCCCAAGAATTTCCCACAAACATAATCGCTTGCTTTGGGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCTTGGGGTGTTG-CCGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACCTGGAGTGTGCTAGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85422988 219 - 162156779 TGGAATAGACATCCCCTCCTAAATGGCAACTTTGGaaaaaaaTGCCCTAAGTCAGTCTTCATGAGTGGCTTATCTACCCCAAGAATTTCCCACAAACATAATTGCTTGCTTTGGGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCTTGGGGTGTTG-CAGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACCTGGAGTGTGCTGGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580104 219 - 24206276 TGGAATAGACATCCCCTCATAAATGGCAACCTTGGAAAAAAATGCCCTAAATCAGTCTTCACGAGTGGCTTATCTCCCCCAAGAATTTCCCACAAACATAATTGCTTGCTTTGGGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCTTGGGGTGTTG-CAGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTTAGCCCAATTT---TATTAAGGACCTGGAGTGTGCTGGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753424 217 - 132174527 TGGAATAGACATCCCCTCCTAAATGGCAACCTTGGAAAAAAATGTCCTAAGTCAGTCTTTATGAGTGGCTTATCTCCCCGAAGAATTTCTCACAAAC--AATTCCTTGCTTTGAGTTTTCTTGGCACAATTCCCAGCCTTTCCTAGGGTGTTA-CAGTGCATACCCAAGTATGTATAGTTTATTCAGCCCAATTT---TATTAAGGACCTGCAATATGCTAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577577 204 - 124902244 TGGAATAAA----TCATTCTATGTGACAGTCTGAGGAAGAAATGCCCTGAATTGGTATTCATGGGTGACTTATCTTCTACAA-AATTGTTCACACA-ATAATTCCTTGTTAGGGATCTTATTGGCACAGTGTCCAGACTTTCATAGACTACGG-TAG----------AGCATGAATATGTTTTATGGTAAGATCCAGGTACTAACAACTTGGTAAGTTGTG-- i mm10.chr14 I 56 C 0 s canFam3.chr15 17332846 211 + 64190966 TGGAATAGCAAATGCCTTCTAGATGGCAGCCTAGGAAGGAAATGCCCTAACTCAGCATCCATGGAGGGTTT------CCCA--GATTTCCCACAAACATAATTCCTTGCTCCAGATTATATTGGCACAATTCCAAACTTTTCTTAGAGCATGGACAAAACATTTCTAAATATTCAGGGCAGATTCATTCAAATTT---TATTAATAGTTTG-AATGTGCTGGA i canFam3.chr15 C 0 I 802 a score=51500.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399661 20 + 478999 TGAACCTCATTTTAGACACA s ponAbe2.chr14 18928564 20 + 108868599 TGAACCTCATTTTAGACACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015820 20 - 170124641 TGAGACTCATTTTAGACACA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88294064 20 - 171882078 TGAGACTCATTTTAGACACA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85423207 20 - 162156779 TGAGCCTCATTTTAGACACA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580323 20 - 24206276 TAAGCCTCATTTTAGACACA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753641 20 - 132174527 TGAACCTCATTTTAGACACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577781 14 - 124902244 ------TTGTTTTACACACA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17333859 20 + 64190966 TGAACCTCATTTTAGATACA i canFam3.chr15 I 802 I 2386 a score=733461.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 399681 418 + 478999 GAAGATAGGAAAACAATATTTTTAAA----TTGCCATTGTGGAGTTCAAATTCCAGCTGCCTTTGGTACTATGACAATAGCAACATATGATCCATTGATAAACCC------TGG------------AGTTGCATCTCCTAAATATTTTCTAAACAAATTATTATTCTCTTCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAGCCatata--tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatTCTTGTAATGttgtcttactctgat-ttattcacatagcagccagggtgatatttctaaattgcaaattgtattaagctattcTACCGAGT----------TTTATTGTAAAACATATTGAAAGAAAATTGGAAATCCAATTTTATTATTGTGGGCTACATTacttggtctttgactaactctttattttgtt-cttatgc s ponAbe2.chr14 18928584 400 + 108868599 GAAGATAGGAAAACAATATTTTTAAA----TTGCCATTGTGGAGTTCAAATTCCAGCTGCCTTTGGTAGTATGACAATAGCAACCTATGATCCATTGATAAATCC------TGCC-----------AGTTACATCTCCTGAATATTTTCTAAACAAATTATTATTCTCTCCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAGCCatata--tatacatatatatatttttattt-------------------ttCCTGTAATGttgtcttactccaat-ttattcacatagcagccagggtgatatttctaaattgcaaattgtacaataaaactctcctgagt----------tttattgtaaaacatattgaaagaaaattggaaatccaattttattattgtgggctacattacttggtctttgactaaatctttattttgtt-cttatgc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88015840 379 - 170124641 GAAGATAGAAAGACAATATTTTTAAA----TTGCCATTGTGGAGTTTAAATTCCAGCTGCCTTTGGTAGTATGACAATAGCAACATATGATCCACTGATAAATCC------TGCC-----------TGTTGCATCTCCTAAATATTTTCTAAACAAATTATTCCTTTCTCCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAGCCATGTA--TTTTT-------------------------------------TTCCTGCAATGttgtcttactccaat-ttattcacatagcagccagggtgatatttctaaattgcaaattgtattaagctattctcccaagt----------tttattgtaaaacatattgaaagaaaattggaaatccaattttattattgtgggttacattacttggtctttaactaactctttattctgtt-ctt---c i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88294084 379 - 171882078 GAAGATAGAAAGACAATATTTTTAAA----TTGCCATTGTGGAGTTTAAATTCCAGCTGCCTTTGGTAGTATGACAATAGCAACATATGATCCACTGATAAATCC------TGCC-----------TGTTGCATCTCCTAAATATTTTCTAAACAAATTATTCCTTTCTCCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAGCCATGTA--TTTTT-------------------------------------TTCCTGCAATGttgtcttactccaat-ttattcacatagcagccagggtgatatttctaaattgcaaattgtattaagctattctccCAAGT----------TTTATTGTAAAACATATTGAAAGAAAATTGGAAATCCAATTTTATTATTGTGGGTTACATTacttggtctttaactaactctttattctgtt-ctt---c i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85423227 375 - 162156779 GAAGATagaaagacaatatttttaaa----ttgccattgTGGAGTTTAAATTCCAGCTGCCTTTGGTAGTATGACAATAGCAACATATGATCCACTGATAAATCC------TGCC-----------CGTTGCATctcctaaatattttctaaacaaatTATTCCTTTCTCCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAgccatgta--ttttt-------------------------------------ttcctgcaatGTTGTCTTACTCCAAT-TTATTCACATAGCAGCCAGGGTGATATTTCTAAATTGCAAATTGTATTAAGCTATTCTCCCAAGT----------TTTATTGTAAAACATATtgaaagaaaattggaaatcCAATTTTATTATTGTGGGTTACATTACTTGGTCTT----taactctttattctgtt-ctt---c i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580343 367 - 24206276 GAAGATAGAAAGACAATATTTTTAAA----TTGCCATTGTGGAGTTTAAATTCCAGCTGCCTTTGGTAGTATGACAATAGCAACATATG------------ATCC------TGCC-----------AGTTGCACCTCTTAAATATTTTCTAAACAAATTATTCCTTTCTCCAAATAGTTATTGCTGTATTGTTAGTTTAAGCCATGTA--TTTTT-------------------------------------TTCCTGCAATGttgtcttactccaat-ttattcacatagcagccagggtgatatttctaaattgcaaattgtattaagctattctccCAAGT----------TTTATTGTAAAACATATTGAAAGAAAATTGGAAATCCAATTTTATTATTGTGGGTTACATTacttggtctttaactaactctttattctgtt-ctt---c i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87753661 394 - 132174527 GAACGCAGAAAGACAATTTTAAAAAA----TTGCCATTGTTGAGTTCAAATTCCAGCTGTCTTTGGAAGTATAACAATAGCAACATATGATCTACTGATAAATCG------TGTTTATCTCCTAAATATTGTATCTTCTCAATATTTTTTAAACAGATTATTCCTTTCTCCAAGTAGCTATTGCTGTATCATTAGTTTAAGCCACATAATTTTTT-------------------------------------TTTCTATAATGttgtctctctccaat-ttcttcacatagcaaccagagtgatatttctaaattgcaaattgtattaagctattcttc-AAGT----------TTTATTGTAAAACATATTGAAAGAAAATTGGAAATCCAATTTTATTATTGTGGACTGTATTACCTGGTTTTTGACTGTCTCTTTATTCTGTT-TTAATAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74577795 362 - 124902244 GAAGATACA-----GATCTTGTAAAA----TTGCTATTATGGCA-CCAAAACCCATCTAGCTTTGGTGGTATGATAGTAGTTATGATGAGTCCACTT-TAAATCC------TGAC-----------AGTTGTGTCTCCTAATTATCTTTGAAATAAAACATTTACTTTTCTGACTGGGTATTGCTATTTTCTATGTAACAGC----TT--CTATT-------------------------------------TTCCTGAAATGGTCTCCTACTCTAGTCTCGTTCACACAGTGCCTGGAGTGATGGACCTAAAATATAAACT-TATTAAGCAA-TCTCCCAGAG----------TTTATTATGAAGCACACTGGAGGCTA--TTAAAACTTAATTTCATTATTGAAAGCTACACAACTTGTTGTCTG-------TTATATTGTGTTGCTTGTGC i mm10.chr14 C 0 I 610 s canFam3.chr15 46885446 358 - 64190966 GAAGATATAAAGTTACATTTTTTAAATAGTTTTCCATTATGGTGCTCAAATTCCAAGTGGCTTTGGTACAATTGCAGCAATGAC-TACAATTCAGCAGTAAATCTAGCAGATGCC-----------AATTGCATCTCCTAAATATTTTCTAAAGAAAACATT----TCTCTTAATAAATGTTGC--------------------------TTTAT---------------------------------------------GTGTAATCCTACTTCAAT-TTATTTGCAAAGTGGCCA--GTGATATTTCTCAGTCACAAGTCTTGTTAAGCTA-TATTATAAGCCATATAACAATATGTTCCAAAATATATTAGAAGCTG--TTAAAACCTAATTTTGTTTTTATAGATCACATTACTTGGTcctcagct--ctctctactctgtt-cttgtgc i canFam3.chr15 I 11391 C 0 a score=14378.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 400099 8 + 478999 ttctacca s ponAbe2.chr14 18928984 8 + 108868599 ttctacta i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88016219 8 - 170124641 ttctacca i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88294463 8 - 171882078 ttctacca i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85423602 8 - 162156779 tTCTACCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580710 8 - 24206276 ttctacca i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87754055 8 - 132174527 TTCTACTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46885804 8 - 64190966 ttcaggaa i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74578157 610 - 124902244 I a score=902983.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 400107 471 + 478999 gttgtgggtctt-ctacagttcttagaaagtctttcgtgacacaaggccttttcatttactattctctattcctaaaatgcttttcttcaaactttcaaagttag-aaaaacgtcaccaactcagaa---ccttttctaaaatactccatcacacacataccactc-ccatcattattta--ctctaccattgcctt---tttatttcctgct-tgtcttttagcactagtagcaattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttattttatttttatttg-------tttacttgtttattgtctgtctatattttcagaat---ggaagtttgatgaggcagatattgagtgttc-------cttgttcattgttgtg-tctcagcaggtagcatat-------ggtagatactctctaaatgtttgcgggataaacaaatGAATAGTTTACAGAAGTGACACAGAAGCTATATATTTAGGAATAGACTTTTTAATATCACATGTAGA s ponAbe2.chr14 18928992 474 + 108868599 gttttgggtctt-ctacagttcttagaaactctttcatgacacaaggccttttcatttactattctctattcctaaaatgcttttcttcaaactttcaaagttag-aaaaatgtcaccaactcagaa---gcttttctaaaatactccgtcacacacataccaccc-ccatcatcattta--ctctaccattgccttgtttttatatcctgct-tgtcttttagcactagtagcaattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttattttatttgtatttg---cttgtttacttatttattgtctgtctttattttcagaat---ggaagtttgatgaggcagagattgattcttc--------ttgttcatttttgcg-tctcagcaggtagcatat-------agtagatactct--aaatatttgtgggataaacaaatGAATAGTTTATAGAAGTGACACAGAAGCTGTACATTTAGGAATAGACTTTT-AATATCACATGTAGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88016227 455 - 170124641 gttgcgggtctt-ctacagttcttagaaactctttcatgccacaaggccttttcaattactattctctcttcttaaaatgcttttcttcaaactttcaaagctag-caaaaggtcaccaactcagaa---ccttttctaaaatactccatcacacaca---------ccatcgtcattta--ctctaccgtcaccccctttttatttcctgct-tgtctttcagcactaagtagaattattt--tt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttatttt-----tatttg-------tttacttatttattgtctgtctatattttcagaat---ggaagtttgatgaggcagatattgaatcttc-------cttgttcattgttgtg-tctcagcaggtagcatat-------agtagatcctctctaaatgtttgtggaataaac----gaatAGTTTATAGAAGTGACACAGAGGCTCTATATTTAGGAATATACTTTTTACTATCACATGTAGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88294471 461 - 171882078 gttgcgggtctt-ctacagttcttagaaactctttcatgccacaaggccttttcaattactattctctcttcttaaaatgcttttcttcaaactttcaaagctag-caaaaggtcaccagctcagaa---ccttttctaaaatactccatcacacaca---------ccatcgtcattta--ctctaccgtcaccccctttttatttcctgct-tgtcttttagcactagtagcaattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttatttt-----tatttg-------tttacttatttattgtctgtctatattttcagaat---ggaagtttgatgaggcagatattgaatcttc-------cttgttcattgttgtg-tctcagcaggtagcatat-------agtagatcctctctaaatgtttgtggaataaacaaatGAATAGTTTATAGAAGTGACACAGAGGCTCTATATTTAGGAATATACTTTTTACTATCACATGTAGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85423610 461 - 162156779 GTTGCGGGTCTT-CTACAGTTCTTAGAAACTCTTTCATGCCACAAGGCCTTTTCAGTTACTATTCTCTCttcttaaaatgcttttcttcAAACTTTCAAAGCTAG-CAAAAGGTCACCAACTCAGAA---CCTTTTCTAAAATACTCCATCACACACA---------CCATCGTCATTTA--CTCTACTGTCACCCCCtttttatttcctgct-tgttttttagcactagtagcaattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttatttt-----tatttg-------tttacttatttattgtctgtctatattttCAGAAT---GGAAGTTTGATGAGGCAGATATTGAATCTTC-------CTTGTTAATTGTTGTG-TCTCAGCAGGTAGCATAT-------AGTAGATCCTCtctaaatgtttgtggaataaacaaatgaatagtTTATAGAAGTGACACGGAAGCGCTATATTTAGGAATAGACTTTTTACTATCACATGTAGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3580718 461 - 24206276 gttgcgggtctc-ctacagttcttagaaactctttcatgccacaaggccttttcagttactattctctcttcttaaaatgcttttcttcaaactttcaaagctag-caaaaggtcaccaactcagaa---ccttttctaaaatactccatcacacaca---------ccatcgtcattta--ctctaccgtcaccccctttttatttcctact-tgtcttttagcactagtagcaattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttatttt-----tatttg-------tttacttatttattgtctgtctatattttcagaat---ggaagtttgatgaggcagatattgaatcttc-------cttgttcattgttgtg-tctcagcaggtagcatat-------agtagatcctctctaaatgtttgtggaataaataaatGAATAGTTTATAGAAGTGACACGGAAGCTCTATATTTAGGAATAGACTTTTTACTATCACATGTAGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87754063 485 - 132174527 GTTGTGGGTCTTACTACAGTTCTTAGAAAGTCTTtcatgccagaaggccttttcattttctattctctattcctaaaatgcttttcttcaaactttcaaagtcag-caaaaggtcaccaactcagaaaacctttttaaaaaatactccatcacacacataccaccctctgtcatcatt-------taccatcgccccctttttatttccttct-tgtctcttagtactagtggtgattattttatt----------------------------------------------------------ttacttatttatattttattttattcttatttg---cttgtttacttatttagtatctgtctatatttttagaat---ggaagtttgatgaggcaaatattgagtcttcagtcttccttgttcattgctgtg-tctcagcaggtagcgtat-------ggtagatactccctaaatgtctgttggataaacaaaGGAATAGTTTATAGAAGTGACACAGAAGGTATATATCTAGGAATAGACTTTTTAATATCATATGTAGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74578767 516 - 124902244 GTTTTGTGTATG-TTATAGTAATTGAAAACACTTTTCTCCTGAGGGGCATTTTTATTCATTTTTC---ATTACTAAAATGCTTTTCTCTTGAATTTTAA--------------TCACCAAACCAGAG-ACATGTTTCTGGAACACCCACTTCTATACT---------ACAATACAATGTATTCTCTGTCAGAATTCCATTTCTATTACATTCT-TGTCTCTTTTTACTA-TGGGAATGActcccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttcctttcttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcATTTACTGTCTATTTTTGTATAATAGAAGAAGTTTGGTGTGGTTGAAGCTG--TGTTC-------TGTGTCTTTTAT---------AACAATTGGTACACAAGAATAAATATTTATTCCCTAAATATTTATTTAATACACAAATGAACAACTTATAGAAATTATAT--AAACTATGTATCTGGGAATATCATGTTAAATATTATATGTAGA i mm10.chr14 I 610 C 0 s canFam3.chr15 46885812 457 - 64190966 attgcaggtctt-ctatagttcctagaaacttttccctatcacgggacttttgtatttgctcttctctgttcctaaaatgcttttctcctg-ctttcaaagttaattgacatgtcatcagttcaaag-atgcttctcatcactacccc------catg---------cctctactatgtattacctatcttctttccctctttacttccctctctttctcttgttaatagcggtaattattt-att----------------------------------------------------------ttgcttatttacagttcatttgtttattgtttg-------tttactaatttgttgtctgtctatatttttaaaat---gaaagttcagtgaggcagaaactg--tcttc-------tttgtccattgttgtgttcttagcagttagcacag-------agtagctgttccctaaatagttgttgaataaat----gaatA--TTATAGAAGTGATGCAGAAGCTATATACTTTGGGATAAAGCTTTCAATGTCATGTGTAAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=712664.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 400578 415 + 478999 TAGCTTTGTTTTGACATGTGTTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAAGAATtgttgcgtcatttatggtattttaggtaatggttatgttaatgtAGGGAAACTAGGTGCTTGTTCTTCCTTGA---AGTGACATGG--TGTAGTGgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgATGAGTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGTA-GGGGGTTTGATTGGCTGCCTGAC----TATTGGATTGAGATGCTCCAGCAAAATATTTCTTTTCCACTTGACACTTGTGAAGGGTGGAGGACAGAGACACTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATGAATCCTTTGTATTTTTGTCCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTTCTTAATGCAAAGTATA s ponAbe2.chr14 18929466 397 + 108868599 TAGCTTTGTTTTGACATGCTTTAAATG-CAAGTGCTGGACAGAATAAGAATTGTTGCATCATTTATGGTGTTTTAGGTAATGGTTATGTTAATGTAGGGAAACTAGGTGTTTGTTCTTCCTTGAGGAAGTGACATGG--TGTAGTGGCgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtT--------------------ATGAGTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGTA-GGGGGTTTGATTGGCTGCCTGAC----TATTGGATTGAGATGCTCCAGCAAAATATTTCTTTTCCACTTGACACTTGTGAAGGGAGGAGGACAGAGACACTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATGAATCCTTTGTATTTTTGTCCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTTCTTAATGAAAAGTATA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88016682 398 - 170124641 TAGCTTTGTTTTGACATGCGTTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAAGAATTGTTGCGTCTTTTATGGTATTTTAGGTCATGGTTATGTTAATGTAGGGAAACTAGGTGTTTGTTCTTCCTTGAGGAAGTGAAATGG--TGTAGTGgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtT--------------------ATGAGTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGTA-GAGGGTTTGACTGGCTGCCTGAC----TATCGGATTGAGATGCTCCAGCAAAATATTTCTTTTCCACTTCACACTTGTGAAGGGTAGAGGAGAGAGACATTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATGAATCCTTTGTATTTTTGTCCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTTCTTAATGCAAAGTATA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88294932 396 - 171882078 TAGCTTTGTTTTGACATGCGTTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAAGAATTGTTGCGTCTTTTATGGTATTTTAGGTCATGGTTATGTTAATGTAGGGAAACTAGGTGTTTGTTCTTCCTTGAGGAAGTGAAATGG--TGTAGTG--gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtT--------------------ATGAGTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGTA-GGGAATTTGACTGGCTGCCTGAC----TATCGGATTGAGATGCTCCAGCAAAATATTTCTTTTCCACTTCACACTTGTGAAGGGTAGAGGAGAGAGACATTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATGAATCCTTTGTATTTTTGTCCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTTCTTAATGCAAAGTATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85424071 398 - 162156779 TAGCTTTGTTTTGACATGCGTTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAAGAATTGTTGCGTCTTTTATGGTATTTTAGGTCATGGTTATGTTAATGTAGGGAAACTAGTTGTTTGTTCTTCCTTGAGGAAGCGAAATGG--Tgtagtg----gggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtt--------------------atgagTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGTA-GGGGGTTTGACTGGCTGCCTGACTCAATCTCGGATTGAGATGCTCcagcaaaatatttcttttccactTGACACTTGTGAAGGGTGGAGGAGAGAGACATTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATgaatcctttgtatttttgtcCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTTCTTAATGCAAAGTATA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3581179 398 - 24206276 TAGCTTTGTTTCGACATGCGTTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAAGAATTGTTGCATCTTTTATGGTATTTTAGGTCATGGTTATGTTAATGTAGGGAAACTAGTTGTTTGTTCTTCCTTGAGGAAGTGAAATGg--tgtagtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg--------------------ATGAGTAGTGGCTGAGCATTACTAGCTTTGGGAGCA-GGGGGTTTGACTGGCTGCCTGAC----TATCGGATTGAGATGCTCCAGCAAAATATTTCTTTTCCACTTGACACTTGTGAAGGGTGGAGGAGAGACACATTCATCAAGGAGTGTGGAGGGATGAATCCTTTGTATTTTTGTCCTAAGGAATAAATGTGGTTGATTTTGGTCCTTAATGCAAAGTATA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87754548 378 - 132174527 TAGCTTT-TTTTGACATGTATTAAATGACAAGTGCTGGACAGAATAATAATTGTTGCGTGTTTTATGATATTTTAGGTCATGGTCATGTTAATGTAGGGAAAATAGGTGTTTGTTTTTCCTTGAGAAAGTGACATGG--TATAGTG------------------GCGTGTGTGTATATGTT--------------------ATAAGTAGTGGCTGAGCATTCCTAGCTTGGGGACTA-GGGAGTTTGATTGGCTGCCTGAC----TATTGGATTGAGATGCTCCAGTAAAATATTTCTTTTCCTC-TGACAGTAGTGAAGGGTGGAGGAGAGAGACATTCATCAAGGAGTGCGGAGGGATGAATCCTTTGCATTTCTGTCCAAAGGAATAAATGACGTTAATTTTGGTTCTTAATGCAAAGTATA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74579283 342 - 124902244 GA-TTTTGTTTTGACATGTGTAATTTAAAATATTCTGGTTTCAATCAGAATTG----------TACATTTTCTGAGGCTATGGTTGAAACAACAGAGGAGATGAACGTATCAGTCTTTTGCTGAAGAAGTACCATGGCTTATCATG--------GCCATTTTGTGCATGCATATGTAAGTA--------------------GTAGGTAGCTGCTGAGCATTTTTGTTTTGATGAATACCATTGTTATGTTGGCTACCTGCC----TACTGGAGTGAGATA---GAGCAGAATACATTTCTT--------------------------------GACAGATATCTGGCAGTGATGAGACATTGATCCTCTGTACTTCTTTCCTGAGGAATAACCA-GATTAGTTT---TTCTT-ATATAAAATATA i mm10.chr14 C 0 I 213 e canFam3.chr15 46886269 0 - 64190966 C a score=1007336.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 400993 572 + 478999 TACATCATTAGTTTCTAATTTTATGTCATATGTTGAACACTGAGGTACAAAAGAAAATCTCTTTGACACTTTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCATAATACCTGATGTATGTCTGTCTTTTCAAGACATCAACACTCATTCACCCAAATTCTTTCTAGATTAGTGCCATTTTCTACTTCTGTTTTGGTGGAATGGGTATGGAGTAAAGCAGAGGAAGAAGGGGTGATTTGTGTGACGACACTCAGAATCATTGCATCATGTCCCCATAATAATAAAAAA--GCATATGATCTTGTAATGGTATTTACTGCTTTAAAATATTCATCTCCTTTCAATAATAAAGGGACAATTATTTACTTAGGAACAAATAATCGCCTCCATCTGGTCAAAAACTACATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAGTAATCATAATATTTCAGATGCTTTTGTTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTATATAACTAGCTCATAGCCCTCATAACTAATAACACAA-------------------------TGTTGTGTTAT s ponAbe2.chr14 18929863 599 + 108868599 --CATCATTAGTTTCTAATTTTATGACATATCTTGAACACTGAGGTACAAAAGAAAATCTCTTTGACACTTTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTCAAGATTCCATAATACCTGATGTATGTTTGTCTTTTCAAGACATCAACACTAATTCACCTAAATTCTTTCTAGATTAGTGCCATTTTCTACTTCTGTTTTCGTGGAATGGGTATGGAGTAGAGCAGAGGAGGCAGGGGTGTTTTGTGTGACGACACTCAGAATCATTGCATCATGTCCCCATAATAATAAAAAAAAGCATATGGTCTTGTAATGGTATTTACCGCTTTAAAATATTCATTTCCTTTCAATAATAAAGGGACAATTATTTACTTAGGAACAAATAATCACTTCCATCTCGTCAAAAACTACATAGCATAATAGCAAAATATATAAATGAGGTGAGTAATCATAATATTTCAGATGTTTTTGGTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTACACAACTAGCTCATAGCCCTCATAACTAATAACACAGCAAGTATATAATTATAAGCTATACTTGTTGTGTTAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88017080 594 - 170124641 --CATCATTGGTTTCTAATTTTATGTCATATCTTGAACACTGAGGTACAAAAGAAAA--TCTTTGACAC-TTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCATAATACCTGATGTATGTTTGTCTTTTCAAGACATCAACACTCATTCACCTCAATTCTTTCTAGATCAGTGCCATTTTCTACTTGTGTTTTGGTGGAATGGGTACGGAGCAGAGCAGAGGAGGAAGGGGTGATTTGTATGACGACACTCAGAATCACTGTATCATGTCCCCATAATAATAAAAAAAAGCATATGGTCTTGTAATGGTATTTACTGCTTTAAAATATTCATCTCCTTTCAATAATAAAGGGGCAATTATTTACTTAAGAACAAATAATCACTTCCATCTGGTCAAAAACTACATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAGTAATTGTATTATTTCAGATGCCTTTGGTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTATATAACTAGCTCATAACCCTCATAACTAATAACACAACAAGTATATAATTATAAGCTATACCTGTTGTGTTAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88295328 594 - 171882078 --CATCATTGGTTTCTAATTTTATGTCATATCTTGAACACTGAGGTACAAAAGAAAA--TCTTTGACAC-TTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCATAATACCTGATGTATGTTTGTCTTTTCAAGACATCAACACTCATTCACCTCAATTCTTTCTAGATCAGTGCCATTTTCTACTTGTGTTTTGGTGGAATGGGTACGGAGCAGAGCAGAGGAGGAAGGGGTGATTTGTATGACGACACTCAGAATCACTGTATCATGTCCCCATAATAATAAAAAAAAGCATATGGTCTTGTAATGGTATTTACTGCTTTAAAATATTCATCTCCTTTCAATAATAAAGGGGCAATTATTTACTTAAGAACAAATAATCACTTCCATCTGGTCAAAAACTACATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAGTAATTGTATTATTTCAGATGCCTTTGGTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTATATAACTAGCTCATAACCCTCATAACTAATAACACAACAAGTATATAATTATAAGCTATACCTGTTGTGTTAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85424469 594 - 162156779 --CATCATTGGTTTCTAATTTTATGTCATATCTTGAACACTGAGGtacaaaagaaaa--tctttgaCAC-TTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCATAATACCTGATGTATGTTTGTCTTTTCAAGACATCAACACTCATTCACCTAAATTCTTTCTAGATCAGTGCCATTTTCTACTTGTGTTTTGGTGGAATGGGTATGGAGTAGAGCAGAGGAGAACGGGGTGATTTGTATGATGACACTCAGAATCACTGTATCATGTccccataataataaaaaaaagcatATGGTCTTGTAATGGTAtttactgctttaaaatattcatctCCTTTCAATAATAAAGGGGCAATTATTTACTTAAGAACAAATAATCACTTCCATCTGGTCAAAAACTACATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAGTAATTGTATTATTTCAGATGCCTTTGGTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCagtgaatgtaaatgaattagtATATAACTAGTTCATAACCCTCATAACTAATAACATAACAAGTATATAATTATAAGCTATACCTGTTGTGTTAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3581577 594 - 24206276 --CATCATTGGTTTCTAATTTTATGTCATATCTTGAACACTGAGGTACAAAAGAAAA--TCTTTGACAC-TTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCATAATACCTGATGTATGTTTGTCTTTTCAAGACATCAACACTCATTCAGCTAAATTCTTTCTAGATCAGTGCCATTTTCTACTTGTGTTTTGGTGGAATGGGTGTGGAGTAGAGCAGAGGAGGAAGGGGTGATTTGTATGATGACACTCAGAATCACTGTATCATGTCCCCATAATAATAAAAAAAAGCATATGGTCTTGTAATGGTATTTACTGCTTTAAAATATTCATCTCCTTTCAATAATAAAAGGGCAATTATTTACTTAAGAACAAATAATCACTTCCATCTGGTCAAAAACGACATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAGTAATTGTATTATTTCAGATGCCTTTGGTAGAAATTTATTTGATTGTTGGAACCTCATAGTTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTATATAACGAGCTCATAACCCTCATAACTAATAGCACAACAAGTATATAATTATAAGCTATACCTGTTGTGTTAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87754926 571 - 132174527 --TATAATTAGTTTCTAATTTTATGTCATATCTTGAACATTGAGGTATAAAAGAAAATCTCTTCAATAC-TTTTTCTGGTAAAATCACCCTTTC--TATTCCACAATACCTGATGTAT------------AAGACATCAACACTCATTCACCTAAATTCTTTCTAGATTAGTGCCATTTTCTACTTCTGCTTTAGTGGAATGAGTGTGGAATAGAGCAGAGGAGGAAGGCGTGATTTGTGTGACAACAATCAGAATCACTTCATCATGTCCCCATAATAATAAAAAA-AGCATATGATCATGTAATGGTATTTTCTGCTTGAAAATATTCATCTCCTTTCAATAATAAAGGGACAATTATTTACTTAAGAATGAATAATCACTTCTATCTGGTCAGAAACTGCATAGCATAATAGCAAAATATGTAAATGAGCTGAATAATCA---CATTTGAGATGCTTGTGGTAGAA----AATTGATTGTTGGAACCTCATAGGTGACTTATCAGTGAATGTAAATGAGTTAGTATATAACTATCTTATGGCCTTCATAACTAATAGCATAACAAGTATATA-----TAGTTATGCCTGTTGTGTTAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I e canFam3.chr15 46886269 0 - 64190966 C a score=1049654.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 401565 560 + 478999 TAGTTATGAGGGCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAATAAGATCATTGTTTCTTGGAATGTTAGGAAATATTTCATTCTGGATAACCTT-----------------------------------ATTATCTTTCTTTTGATTAAAATCT-------------------------------------TCCTAAACCAAATTTTAAATTTTTCAATCTTATTAAATA----TGCTTCATTAACTCACTGAGGTCCACACTGGGCAATTTATGGACAAGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTATTCA-ATTTCTGAGTATTTTTACCTTTCTTCCGCTTGCTACCAGATTCCTGGAAAACACTGGT-TTTATGTGTGTGTGTCTGCTTGTAGTAAGCCATCCCTTTTTCAAAATACAATGCTTCTATAAGATATTGAA--AGTCATTTATCTATGTTTGTTAAAATTATGTATAAATTGAGTCAGTAGGTTCCAA-----AAATGGCGCATTTAATTTCTTTTCTCAGTAGTATACGTAGTGCCCATAAGTGTTTGGACACAGCCACATCTATTTGGTTTTACAGAACCTTAACTTTTTAAAAATTCCTTTTCATATTTAATTTTTTTAAG s ponAbe2.chr14 18930462 563 + 108868599 TAGTTATGGGGGCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAATAAGATCATTGTTTTTTGGAATCTTAGGAGATGTGTCATTCTGGATAACCTT-----------------------------------ATTATCTTTCTTTTGATTAAAATCT-------------------------------------TCCTAAACCaaattttaaatttttcaatcttattaaataaatatGCTTAATTAACTCACTGAGGTCCACACTGGGCAATTTATGGACATGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTACTCA-ATTTCTGAGTATTTTTACCTTTCTTCCGCTTGCTACCAGATTCCTGGAAAACACTGTT-TTTTTTTGTGTGTGTCTGCTTGTAGTAAGCCATCCCTTCTTCAAAATACAATGCTTCTATAAGATACTGAA--AGTCATTTATCTATGTTTGTTAAG-TTATGTATAAATTGAGTCAGTAGGTTCCAA-----AAATGGTGCATTTAATTTCTTTTCTCAGTAGTATACAGAGTGCCCATAAGTGTTTGGACACAGCCACATCTATTTGGTTTTACAGAACCTTAACTTTTTAAAAATTCCTTTTCATATGTAATTTTTTTAAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88017674 555 - 170124641 TAGTTATGGGGGCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAGTAAAATCATTGTTTTGTGGAATCTCAGGAAATATGTCATCCTGGATAAACTT-----------------------------------ATTATCTTTCTTTTGATTAAAATCT-------------------------------------TCCTAAGTCAAATTTAAAATGTTTCTATCTTACTAAATA----TGCTTAATTAACTCAGTGAGGTCCACTCTGGGCAATTTATGGACATGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTACTCA-CTTTCTGAATATTTTTACCTTTCTTCCTCTTGCTACCAGATTCCTGGAAAACACTGGTCTTTTTTTCTTTGTGTCTGCTTGTAGTAAGCCATCCCCTCTTCAAAATGCAATGCTTCTATAAGATACTGAA--GGTCATTTATCTA----TGTTAAAATTATGTACAAATTGAGTCAGTAGGTTCTGA-----AAATGGCACACTTAATTTCTTTACTCAGTAGTATACATAGTGCCAATAAGTGTTTGGACACAGCCACAT-TGTTTGGTATTACAGAACCTTAACTTTTTAAATATTCTTTTTTATGTTTAACTTTTTAAG- i rheMac3.chr7 C 0 I 343 s macFas5.chr7 88295922 555 - 171882078 TAGTTATGGGGGCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAGTAAAATCATTGTTTTGTGGAATCTCAGGAAATATGTCATTCTGGATAAACTT-----------------------------------ATTATCTTTCTTTTGATTAAAATCT-------------------------------------TCCTAAGTCAAATTTAAAATGTTTCTATCTTACTAAATA----TGCTTAATTAACTCAGTGAGGTCCACTCTGGGCAATTTATGGACATGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTACTCA-CTTTCTGAATATTTTTACCTTTCTTCCTCTTGCTACCAGATTCCTGGAAAACACTGGTCTTTTTTTCTTTGTGTCTGCTTGTAGTAAACCATCCCTTCTTCAAAATGCAATGCTTCTATAAGATACTGAA--GGTCATTTATCTA----TGTTAAAATTATGTACAAATTGAGTCAGTAGGTTCTGA-----AAATGGCACACTTAATTTCTTTACTCAGTAGTATACATAGTGCCAATAAGTGTTTGGACACAGCCACAT-TGTTTGGTATTACAGAACCTTAACTTTTTAAATATTCTTTTTTATGTTTAACTTTTTAAG- i macFas5.chr7 C 0 I 358 s papAnu2.chr7 85425063 555 - 162156779 TAGTTATGGGGTCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAGTAAAATCAttgttttgtggaatctcaggAAATATGTCATTCTGGATAAactt-----------------------------------attatctttcttttgattaaaatcT-------------------------------------TCCTaagtcaaatttaaaatttttgtatcttaCTAAATA----TGCTTAATTAACTCAGTGACATCCATTCTGGGCAATTTATGGACATGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTACTca-ctttctgaatatttttatctttcttcctcttgctACCAGATTCCTGGAAAAcactggtctttttttctttgtgtctgcTTGTAGTAAGCCATCCCTTCTTCAAAATGCAATGCTTCTATAAGATATTGAA--GGTCATTTATCTA----TGTTAAAATTATGTACAAATCGAGTCAGTAGGTTCTGA-----AAATGGCACACTTAATTTCTTTACTCAGTAGTATACATAGTGCCAATAAGTGTTTGGACACAGCCATAT-TGTTTGGTATTACAGAaccttaactttttaaatattcttttttatgtttaactttttaag- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3582171 554 - 24206276 TAGTTACGGGGGCTATGAGCTGCCTCCTCCAGGTAAGTACAGTAAAATCATTGTTTTGTGGAATCTCAGGAAATATGTCATTCTGGATAAACTT-----------------------------------ATTATCTTTCTTTTGATTAAAATCT-------------------------------------TCCTAAGTCAAATTTAAAATTTTTCTATCTTACTAAATA----TGCTTAATTAACTCAGTGAGGTCCA-TCTGGGCAATTTATGGACATGGGGAAATTGATCCCTTTTCTAAATAGTCCCACACTACTCA-CTTTCTGAATATTTTTACCTTTCTTCCTCTTGCTACCAGATTCCTGGAAAACACTGGTCTTTTTTTCTTTGTGTCTGCTTGTAGTAAGCCATCCCTTCTTCAAAATGCAATGCTTCTGTAAGATACTGAA--GGTCATTTATCTA----TGTTAAAATTATGTACAAATTGAGTCAGTAGGTTCTGA-----AAATGGCACACTTAATTTCTTTACTCAGTAGTATACATAGTACCAATAAGTGTTTGGACACAGCCATAT-TGTTTGGTATTACAGAACCTTTACTTTTTAAATATTCTTTTTTATGTTTAACTTTTTAAG- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87755497 559 - 132174527 TAGTTATGGGG-CCATGAGCTGCTTCCTTCAGGTAAGTATAGTAAAATAATTGTTTTTTGGAATCTTAGGAAATATGTCATTCTAGATAACCTT-----------------------------------ATTACCTTTCTTTTGATTCAAATCT-------------------------------------TCCTAAATCAAATTTTAAATTTTCCTATCTTACTAAATG----TGCTTAATTAACTCACTGAGGTCCACACTGGGCAATTTATGGACATGGGGAGATTTATCCCTTTTCTAAATAGTTCCACACTGCTCA-CTTTCTGAGTATTTTCACTTTTCTTCCTCTTGCTGCCAGATTCCTGGAAAATACTGCTCCTTTTTCCTTTGTGTCTGTTTGTGGCAAGCCATCCCTTCTTCAGAACACAATGACTCTATAAGATACTGAA--AGTCATTTATCTATATTTGTTAAAATTATGTACAAACTGAGCCAGTAGTTTCCAA-----AAATGGTGCATTTAGTTTCTTTACTCAGTAGTGTACATAGTGCCCATAGGTGTTTGGACACAGTCACATCTATTTGGTTTTACAGAACTTTAACtttttaaaaattatttttcatatttaattttttaag- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46886269 619 - 64190966 GTTTTATGGAGGCTATTAGGAACCTTCTTCGGGTAAATAAGGTAAAACCATTGCTTTCTGGATTTCTAGGAAATATGTCAATCTGGATAAGTGTGCTTTTAAGAAAGTTGAGGATTGAAAACTGGCAGCATTATCTTTCTCTTGACTAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAAAGACTATTGACTAAAATTTTAAACAGAATTTTAAATTTCTTTATCTTACTAAACA----TGATTGATTAAATCACTGAGACCtaccctgggctattcatggacataggaatatttacccttttgctaaatagtcccataatgctgagctttctgagtgtttttatattt-tgccttttG-TGTCAGGTTGCTGGCAAGGACCGTT-TTTTTCTTAGTGTGTCTGTTTGTAGGGAACCATCTCTTCTTTATG----AATGATTC-ATAACATATTAGATCAGGAAGTAGCCTACGTTTGTTAAAATTATTCACAAATTGAGTCA-TAGGTTGCAAGGCAGAAACAAGAGATTTCCTTTCGTCAGTTAATAGTATATCTAA-GCT--TTAGTGCCTGGATGCTGTTCCATCTGTTTGGCTTTACAGAATGGTAACTTT------GTTTTTCTCTATGCTGACCTTCTC---- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I a score=11980.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402125 7 + 478999 TAATAGG s ponAbe2.chr14 18931025 7 + 108868599 TAATAGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88018572 7 - 170124641 taaTAAG i rheMac3.chr7 I 343 C 0 s macFas5.chr7 88296835 7 - 171882078 TAATAAG i macFas5.chr7 I 358 C 0 s papAnu2.chr7 85425618 7 - 162156779 taaTAAG i papAnu2.chr7 C 0 I 353 s chlSab2.chr29 3582725 7 - 24206276 TAATAAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756056 7 - 132174527 taataaa i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46886888 3 - 64190966 ----AGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I a score=12579.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402132 5 + 478999 AGAGG s ponAbe2.chr14 18931032 5 + 108868599 AGAGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88018579 5 - 170124641 AGAGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88296842 5 - 171882078 AGAGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85425978 5 - 162156779 agagg i papAnu2.chr7 I 353 C 0 s chlSab2.chr29 3582732 5 - 24206276 AGAGG i chlSab2.chr29 C 0 I 355 s calJac3.chr10 87756063 5 - 132174527 aaaGG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46886891 5 - 64190966 AGAGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I a score=33425.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402137 24 + 478999 CAATATCATAAAATATCACATCAA s ponAbe2.chr14 18931037 24 + 108868599 CAATATCATAAAATATCACATCAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88018584 24 - 170124641 CAATACCAAAAAATATCACATCAG i rheMac3.chr7 C 0 I 8 s macFas5.chr7 88296847 24 - 171882078 CAATACCAAAAAATATCACATCAG i macFas5.chr7 C 0 I 8 s papAnu2.chr7 85425983 24 - 162156779 caataccaaaaaatatcacatcag i papAnu2.chr7 C 0 I 8 s calJac3.chr10 87756068 23 - 132174527 CACTATCATAAAATATCACGTCG- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46886896 24 - 64190966 CAGTATTATAAAATAGCACATCAG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3582737 355 - 24206276 I a score=194648.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402161 109 + 478999 CAGAAAAGAA-ACAACTCTCTTGTATTTGCTGTTGGTTACAACAAA-ACTT-ACTTTGGTGTGGCAGTTTTTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATATTTGGTAA---TGTGAACTG s ponAbe2.chr14 18931061 109 + 108868599 CAGAAAAGAA-ACAACCCTTTTGTATTTGATGTTGGTTACAACAAA-ACTT-ACTTTGGTGTGGCAGTTTTTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATATTTGGTAA---CGTGAACTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88018616 109 - 170124641 CAGAAAAGAA-ACAACTCTCTTATATTGGCTGTTGGTTACAACAAA-ACTT-ACTTTGGTGGGGCAGTTTGTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATGTTTGGTAA---TGTGAATTG i rheMac3.chr7 I 8 C 0 s macFas5.chr7 88296879 109 - 171882078 CAGAAAAGAA-ACAACTCTCTTATATTGGCTGTTGGTTACAACAAA-ACTT-ACTTTGGTGGGGCCGTTTGTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATGTTTGGTAA---TGTGAATTG i macFas5.chr7 I 8 C 0 s papAnu2.chr7 85426015 110 - 162156779 cagaaaagaa-acaaCTCTCTTATATTGGCTGTTGGTTACAACAAA-ACTTAACTTTGGTGGGGCAGTTTTTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATATTTGCTAA---TGTgaattg i papAnu2.chr7 I 8 C 0 s chlSab2.chr29 3583092 110 - 24206276 CAGAAAAGAA-ACAACTCTCTTATATTGGCTGTTGGTTACAACAAA-ACTTAACTTTGGTGGGGCAGTTTTTAACCTTACTTAAAGAAAAGCATATTTGGTAA---TGTGAATTG i chlSab2.chr29 I 355 C 0 s calJac3.chr10 87756091 110 - 132174527 CAGAAAAAAACCCAACACTCTTGTATTGGCTATTGGTTAGAGCAAA-ACTT-ACTTTGGTGTGACAGTTTTTAACCTTACCTAAAGAAAAGCATATTTGGTAA---CGTGAGCTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46886920 108 - 64190966 GAGAATTGAA-ACAACTCTTCAATATTGGCTGTTGATTGTAAGAACTGCTT-ATTTTCATGGGCAGGTTTTATACTATTAACAGAGGAAA-CATATGTGGTAAATGGGTGA---- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74579625 213 - 124902244 I a score=603327.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402270 295 + 478999 TT-ATTTCATTTTTATTTGACAAGTTTTGTGCTACTTAGTG--GTGTCAGATTCAAT--ACAGGGCAGTAAGCAAAATTTTAAAAATAATATTATTCCCATTGTCACCTTGAAACAGCAGAGCAGATCAGC---TCAGAATCAAATTGGGTAGCAAGCATACTCATTTCTCAGATCAGTACAC---C---TACTTACG----TTCCTGCTGTGGTGAGCAAATTTTATACTCAATGTAGTATCAGGTATTGATGAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AATTTTTTATATAGGGCCTTGCATAGCTGTATGTTGTGG s ponAbe2.chr14 18931170 295 + 108868599 TA-ATTTCATTTTTATTTGACAAGTTTTGTTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGAGCAGTAAGCaaaattttaaaaataatattattCCCATTGTCACCTTGAAACAGCAGAGCAGATCAGC---TCAGAATCAAATTGGGTAGCAAGCATACTCATTTCTCAGATCACTACAC---C---TACTTATG----TTCCTGCAATGGTGAGCAAATTTTATACTCAATGTAGTATCAGGTATTGATGAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AATTTTTTATATAGGGCCTTGCATAGCTGTATATTGTGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88018725 294 - 170124641 TT-ATTTCATTTTTATTTGACAAGTTTTGCTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGGGCAGTAAGCaaaattttaaaaataatattattCCCATTGTCACCTTGAAACAGCAGAGCAGATCAGC---TCAGTATCAAATTGGGTAGCAAGCATACCCATTTCTCAGATCACTACAC---C---CACTTACA----TTCCTGCAATGTTGAGAAAATTTTATAGTCAGTGTAGTATCCAGTATTGATAAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AA-TTTTTATATAGGGCTTTGCATAGCTGTAGATTGTGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88296988 294 - 171882078 TT-ATTTCATTTTTATTTGACAAGTTTTGTTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGGGCAGCAAGCAAAATTTTAAAAATAATATTATTCCCATTGTCACCTTGAAACAGCAGAGCAGATCAGC---TCAGTATCAAATTGGGTAGCAAGCATACCCATTTCTCAGATCACTACAC---C---CACTTACA----TTCCTGCAATGTTGAGAAAATTTTATAGTCAGTGTAGTATCCAGTATTGATAAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AA-TTTTTATATAGGGCTTTGCATAGCTGTAGATTGTGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426125 294 - 162156779 tt-atttcatttttatttgacaaattttGTTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGGGCagtaagcaaaattttaaaaataatattattcccATTGTCACCTTGAAACAGCAAAGCAGATCAGC---TCAGTATCAAATTGGGTAGCAAGCATACCCATTTCTCAGATCACTACAC---C---CACTTACG----TTCCTGCAATGGTGAGAAAATTTTATAGTCAGTGTAGTATCCGGTATTGATAAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AA-TTTTTATATAGGGCCTTGCATAGCTGTAGATTGTGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583202 294 - 24206276 TT-ATTTCATTTTTATTTGACAAGTTTTATTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGGGCAGTAAGCAAAATTTTAAAAATAATATTATTCCCATTGTTACCTTGAAACAGCAGAGCAGATCAGC---TCAGTATCAAATTGGGTAGCAAGCATACCCATTTCTCAGATCACTATAC---C---CACTTACG----TTCCTGCAATGGTGAGAAAATTTTATAGTCAGTGTAGTATCCGGTATTGATAAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AA-TTTTTATATAGGGCCTTGCATAGCTGTAGATTGTGG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756201 297 - 132174527 TTCATTTCATTTTTATTTGACAACTTTTGTTCTACTTAGTG--GTGTCAGGTTCAAT--ACAGGGCAAT-AGCAAAATTTTAAGAATAATATTATTCTTATTGTCACCTTGAAACAGCAGAGCTGATCAGC---TCAGGGTCAAATTGGGTAGCAAGCATACCCATTTCTCAGATCACTACACCTTC---TACTTACT----TTCCTGAAATGGTAAGCGAATTTCATAGTCAGGGTAGTATCAGGTATTGATGAATCTGGTCACAGCTAGAAG----AA-TTTTTTTATAGGGCCTTGCATAGCTATATATTGTGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74579838 298 - 124902244 TT-GTTTCCTGTTTATTTAATGGGTATTCTTTTACTTAGTG--GTGCTGCATTTAAT--ATTGAATCTTAAACAAAAATATTAGGGTAA---TCTTCTTACTTTCTTTTGGAAATGGTAGAACTAATCAGTATAATAGGATGTGCTACAATGGCAAGCATCCCTAGTTCTCAGATGGCCGTTC---C---TTCTTTCAGTCTTTTCTAAAGCAGTACATCAAATTCACAGTTAATGTAATGATAAGCAAAGA-GGGTTTGAGAGCAAGCAGAGGatttaa-tttttatttaaatttttatat---tatatattttGA i mm10.chr14 I 213 I 290 s canFam3.chr15 46887028 280 - 64190966 TT-ATCTTATTTTTATTGGATGGGCTTTATTCTATTTAATACTGGGGTAGGTTCAATTAATAGGAC-TTGAGTAAAAGTTTCGCAAAAACCTTATTCCCACTGTCCCCTTGAAGTGGCAGGAGGGGTCAGC--------------TTGGACGGCAAGCACACCCGCTCGTCAAATCACTGTAT---CTCGTCCCCACC----TTCCTGGAACAGTGGCTAAGATGCAAGGCCAGGG-------GGGTAATGAT--ATTTGGTCACGGCCTGAAA----AG-TTCTCACGTACAGCCTTGCACTGTTGCATCTCGTGT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=190477.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402565 96 + 478999 ----CTGGTTACCTGTTACCAAGGATTAAGCTGTACAGGTTTTGGTTACAGTTATGGAAAAATATGTCCCTTCACTACTTATGAAGCCTTGGGATCTCTT s ponAbe2.chr14 18931465 96 + 108868599 ----CTGGTTACCTGTTACCAAGGATTAAGCTGTACAGGTTTTGGTTACGGTTATGGAAAAATATGTCCATTCACTACTTATGAAGCCTTGGGATCTCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019019 90 - 170124641 ----CTGGTTGCCTGTTACCAAGGATCGAGCTGTACAGGTTT------CAGTTATGGAAAAATATGTCCATTCACTACTCATGAAGCCTTGGGACCTCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297282 90 - 171882078 ----CTGGTTGCCTGTTACCAAGGATCGAGCTGTACAGGTTT------CGGTTATGGAAAAATATGTCCATTCACTACTCATGAAGCCTTGGGACCTCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426419 90 - 162156779 ----CTGGTTGCCTGTTACCAAGGATTGAGCTGTACAGGTTT------CGGTTATGGAAAAATATGTCCATTCACTACTTATGAAGCCTTGGGACCTCTT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583496 90 - 24206276 ----CTGGTTGCCCGTTACCAAGGATCGAGCTGTACAGGTTT------CGGTTATGGAAAAATATGTCCATTCACTACTCATGAAGCCTTGGGACCTCTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756498 90 - 132174527 ----CTGGTTACCTGCTACCAAGGATCAAGCTGTACAGGTTT------TAGTTATGGAAAAATATGTCCATTCATTACTCATGCTGCTTTGGGATTTCTT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74580426 77 - 124902244 ----CTGTTTACCTGTTACCAGGGATTAATCAGGA-AAATTT------CCATTA------------TTTATTCACTATATATAAAATCATAGGGTCCGTT i mm10.chr14 I 290 I 229 s canFam3.chr15 46887308 93 - 64190966 GTGGAGGCTTGCGTGCTGCCAAGGAGTCTGCTGTGCAGGCTT------CGGTGAAGGAGGAA-ATGTCCCCTCACTCCATTCGAAGCCCCGGCATCTTTT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=73640.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402661 42 + 478999 TTCTGTATCACAACTAAAGTACTGCTAGATCTGTGTGTGTGC s ponAbe2.chr14 18931561 42 + 108868599 TTCTGTATCACAACTAAAATACTGCTAGATCTGTATGTGTGC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019109 42 - 170124641 TTCTGTATTACAACTAAAATACTGCTAGATCTATATGTGTAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297372 42 - 171882078 TTCTGTATTACAACTAAAATACTGCTAGATCTATATGTGTAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426509 42 - 162156779 TTCTGTATTACAACTAAAATACTGCTAGATCTATATGTGTAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583586 42 - 24206276 TTCTATATTACAACTAAAATACTGCTAGATCTATATGTGTAC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756588 42 - 132174527 TCATGTATTACAACTAAAATACTGCTAGATCTGGATATGTGC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46887401 27 - 64190966 TTAAAGATTAAAATGAAAATACTGCCA--------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74580503 229 - 124902244 I a score=667761.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 402703 321 + 478999 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTTTCCAGGTTGGCAAGATTTCCCAAC----AAAAAAAA-AGATATAGAAAAAAGAGGCCACAT---CTCTGATTGCCAGTCTAAAATTTGGCTACACTCAGAAGTAGCTTCACATATTGCTTACTAATGTAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGCCAA---ATTTCAGAAAAAGTA-AG-TTTT-TAACATTAACAAGCTGAGATTTGAGTTTCAA--------------------------------ATATATGCCACACTTCATATAGTTTTAATGTTTCCAATTTATAACTTCATCACATACTCTCTCCC--TCTTGGTTTATCAGATATAAAATGGGCAA- s ponAbe2.chr14 18931603 321 + 108868599 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTTTCCAGGTTGGCAAGATTTTGCAAC----AAAAAAAA--GATCTAGAAAAAAGAGGCCACAC---CTCTGATTGCCAGTCTAAAATTTGGCTACACTAAGAAGTACTTTCACATATTGCTTACTAATGTAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGCCGA---ATTTCAGAAAAAGTA-AGATTTT-TAACATTAACAAGCTGAGATTTGAGTTTCAA--------------------------------ATATATGCCACACTTCATATAGTTTTAATGTTTCCAATTTATAAGTTCATCACATACTCTCTCCC--TCTTGGTTTATCAAATATAAAATGGGCAA- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019151 320 - 170124641 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTGTGCAGGTTGGCAAGATTTCACAAT----AAAAAAA---GATCTAGAAAAAAGAGGCCACAT---CTCTGATTGCCAGTCTAAAATTTGGCTACACTCAGAAGTAGCTTCACATATTTCTTACTAACGCAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGCCGA---ATTTCACAAAAAGTA-AGATTGT-TAACATTAACAAGCTGAGATTTGAATTTCAA--------------------------------ATACATGCCACACTTCATATAGTTTTAATGTTTCCAATTTATAAGTTCATCATATACTCTCTCCC--TCTTGGTTTATCAAATATAAAATGGGAAA- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297414 320 - 171882078 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTGTGCAGGTTGGCAAGATTTCACAAT----AAAAAAA---GATCTAGAAAAAAGAGGCCACAT---CTCTGATTGCCAGTCTAAAATTTGGCTACACTCAGAAGTAGCTTCACATATTTCTTACTAACGCAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGCCGA---ATTTCACAAAAAGTA-AGATTGT-TAACATTAACAAGCTGAGATTTGAATTTCAA--------------------------------ATACATGCCACACTTCATATAGTTTTAATGTTTCCAATTTATAAGTTCATCATATACTCTCTCCC--TCTTGGTTTATCAAATATAAAATGGGAAA- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426551 318 - 162156779 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTGTGCAGGTTGGCAAgatttcacaat-----aaaaaa---gatCTAGAAAAAAGAGGCCACAT---CTCTGATTGCCAATCTAAAATTTGGCTACACTCAGAAGTAGCTTCACATATTGCTTACTAACGTAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGACGA---ATTTCACAAAAAGTA-AGATTGT-TAACATTAACAAGCTGAgatttgaatttcaa--------------------------------atacat-CCACACTTCATATAGTTTTCATGTTTCCAATTGATAAGTTCATCATATACTCTCTCCC--TCTTGGtttatcaaatataaaatgggaaa- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583628 320 - 24206276 TATTAGAATGCAAGCCTAAGTGTGCAGGTTGGCAAGATTTCACAAT----AAAAAAA---GATCTAGAAAAAAGAGGCCACAT---CTCTGATTGCCAGTCTAAAATTTGGCTACACTCAGAAGTAGCTTCACATATTGCTTACTAACGTAGATGTTTGGGGGAAGAAGTAGTGCATTGCCGA---ATTTCACAAAAAGTA-AGATTGT-AAACATTAACAAGCTGAGATTTGAATTTCAA--------------------------------ATACATGCCACACTTCATATAGTTTTAATGTTTCCAATTTATAAGTTCATCATATACTCTCTCCC--TCTTGGTTTATCAAATATAAAATGGGAAA- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756630 318 - 132174527 TATTAGACTGCAAGCCTAAGTTTTCAGGTTGGCAAGATTTCTCAAC----AAAAAAA---GATCTAGAAAAAA-AGCCTACAT---CTCTGATAACTAG-CCAAAATTTGGCTATACTCAGAAGTAGCTGCACATATTTCTCACTAATGTAGATGTTTGGGGGAAGAATTAGTGCATTGCCGA---ATTTCATGAAAAGTA-ACATTTT-TAACATTAACAAGCTGAGATTTGAGTTTCAA--------------------------------ATATATGCCACACTTCACATAGTTTTAATGTTTCTAATTCACAAGTTCATCACATATTCTCTCCC--TCCTGGTGTATCAAATATAAAATGGGCAA- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74580732 325 - 124902244 TATTGAAAGATCAGTATAAGCTTATA--TTAGCAAGATTGCCCAGCCCCCCCCCAAT---GATCTAGACAGAAGAGTCTGCAT---TTACAATTATCAGTCTGAATATCAGATAACTACAAAAGTCAGTA--------------TAGGGTAAATATTTGAAGAAA--------ATATTGCCAATGGATTTTGTAAAAATTA-ACATTTTACAGAATTAACAAGCTAATATTTGGCTTTCAGGTGTGTGGCATAGTCTTGAAGTAAGCTTTTACATGTATGGCATATCTCAGATCATTTCAGTATGTATAGTTTATGAGTTCATCACttatttt-------------ttaattaaatataaaatGGAGAA- i mm10.chr14 I 229 I 222 s canFam3.chr15 46887428 327 - 64190966 --TTAGACCACAATCACGTGTTTCCAAGTTGGCTAGATTTCTCAAC----AACAACAACAAATCTAGAAAGAACAGGCTGCTTTTCCTCCCATTCCCCGTGTACAATTTGGTTTCTCTCCTAAGTAGCTGCACACATTGCTTGCTAAGGTAGATATACAGGGACAGGATTAACGCACTGCTGA---GTTTCATAAAAAGTAGAAATTAA-TAACATTAATACATCGGGATTTTGGTTTCAG--------------------------------ACACGTGCCACGCTGCATATGGTTTCAGTGTTTCTAATT-GTCGGGTCACCACTTACTCTTTCCCTATCTTGGCTTATCAGACCTCAAATGGGACGC i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=16240.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 403024 7 + 478999 CCAAATG s ponAbe2.chr14 18931924 7 + 108868599 CCAAATG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019471 7 - 170124641 CCAAATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297734 7 - 171882078 CCAAATG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426869 7 - 162156779 CCAAATG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583948 7 - 24206276 CCAAATG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756948 7 - 132174527 CCAAATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46887755 7 - 64190966 TCAAAGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74581057 222 - 124902244 I a score=158326.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 403031 67 + 478999 TATCCTCGTGTAATCTGTTAGTGACA----GGGAACGTATGACAATTTTGAAAGCAGTGATATAACTCTAG s ponAbe2.chr14 18931931 67 + 108868599 TATCCTCGTGTAACCTGTTAGTGACA----GGGAACGTATGACAATTTTGAAAGCAGTGATATAACTCTAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019478 67 - 170124641 TATCCTCATGTAATCTGTTAATGACA----GGGAACATATGACAATTTTGAAAGCAGTGATATAACTCTAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297741 67 - 171882078 TATCCTCATGTAATCTGTTAATGACA----GGGAACATATGACAATTTTGAAAGCGGTGATATAACTCTAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426876 67 - 162156779 TATCCTCATGTAATCTGTTAATGACA----GGGAACATATGACAATTTTGAAAGCGGTGATATAACTCTAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3583955 67 - 24206276 TATCCTCATGTAATCTGTTAATGACA----GGGAACATATGACAATTTTGAAAGCGGTGATATAACTCTAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87756955 67 - 132174527 TATCCTTATGCAATCTGTTAATGACT----GGGAACATAAGACAATTTGGAAAGCAGTGATACAACTCTAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74581279 66 - 124902244 taccccTGTGTAATCTATTAATGAT-----GCAAATATATTATAATTTTGAAAATAGTGATATAGCTCTAG i mm10.chr14 I 222 C 0 s canFam3.chr15 46887762 71 - 64190966 TATCCTAATACAGTGTCTTAATGATAATACAGACCAATCTGCTGATTTCAGCAGCAGTAAAATAAATCTAG i canFam3.chr15 C 0 I 2783 a score=3347512.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 403098 1195 + 478999 GTAAATGCTATGTCTACTAATTATAGTTTCTT-A-ATTTTCATAGCTATATTATGAAAAGAGTAAATTGAAGAAATGGAAACTGCAAATTACACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCCAGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTACCAGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGTCTAGACCCTCATCTGACCTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTGAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCTTTTGATGGATGCATTGCACAGCTCTTCTTCTTACACTTTGCTGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCTCTACACTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCAACGTCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGAGGGGGGGCTTCATTCATTCTATCATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATTGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGTAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTGATTGCTCTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTTCTGGCCTTGCTCAAGAAACTTTCAGGCTCAGGTGAGAATACCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCGTTTTCCCTAGATAAAGTGGTGTCTGTGTTCAATACTTTAATATTCCCTTTACGTAATCCCATTATTTACACATTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGCAGCCATGAGGAAGTTGGTCACCAAATATATTTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAAATTATACATTTTATAGTTCCCCTGAGGATCATTGTCCTAAAGCAGGAAGTATTTGCAGTAATAATGCTGCATTGACTTCCTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TATTAAAATTTTA-------------------CTATAA---------------------------TTTTTCTCT-----ATTCA------TTCCTCTTTATATTG----------AAAAAATAGAGGCATTAAGATGAAAATAAAT s ponAbe2.chr14 18931998 1195 + 108868599 GTAAATGCTATGTGGACTAATTATAGTTTCTTTA-ATTTTCATAGCTATATTATGAAAAGAGTAAATTGAAGAAATGGAAACTGCAAATTACACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTGTCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATTCTTCTATTTGTTCATCCTACCAGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGGCTAGACCCTCATCTGACTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGCATTGCACAGCTCTTCTTCTTACACTTTGTTGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCCACATCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGATGGGGGGCTTCATTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATTGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGTAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTTACTGCTCTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTTCTGGCCTTGCTCAAGAAACATTCAGGCTCAGGTGAGGATACCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCATTTTCCCTAGATAAAGTGGTGTCTGTGTTTCATACTATAATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACATTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGCAGCCATGAGAAAGTTGGTCACCAAATATATTTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAGATTATACATTTTATAGTCCTCCTGAGGATCATTGTCCTAAAGCAGGAAGTATTTGCAGTAATAATGCTGCATTCACTTCTTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTAAAATTTTA-------------------CTATAA---------------------------TTTTTCTCT-----ATTAA------TTCCTCTTTATATTG-----------AAAAATAGAGGCATTAAGATGAAAATAAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88019545 1196 - 170124641 TTAAATACTATGTGGACTAATTATAGTTTCTTTA-ATTTTCATAGCTATATTATGAAAAAAGTAAGTTGAAGAAATGGAAACTGCAAATTACACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTAGCGGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGGCTTGACCCTCATCTGACTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGCATTGCACAGCTGTTCTTCTTACACTTTGTTGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCGACGTCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGATGGGCGGCTTCATTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATCGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTCATTGCTCTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTTCTGGCCATGCTCAAGAAACATTCAGGCTCAGGTGAGAATACCAACAGGGCCACGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCTTTTTCCCTAGATAAAGTGATATCTGTGTTTCATACTGTAATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACACTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGTAGCCATGAGGAAGTTGGTCACCAAATATATCTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAAATTATACATTTTATAGTCCTCCTGAGGATCGTTGTCCTAAAGCAGGAAGTATTTGCAGTAATAATGCTGCATTCACTTCCTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTTAAATTTTA-------------------CTATAA---------------------------TTTTTCTCT-----ATTAA------TTCCTCTTTATATTG----------AAAAAATAGAGGAATTAAGATGAACATAAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88297808 1196 - 171882078 TTAAATACTATGTGGACTAATTATAGTTTCTTTA-ATTTTCATAGCTATATTATGAAAAAAGTAAGTTGAAGAAATGGAAACTGCAAATTACACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTACCGGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGGCTTGACCCTCATCTGGCTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGCATTGCACAGCTGTTCTTCTTACACTTTGTTGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCGACGTCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTTTCCTGGATGGGGGGCTTCATTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATCGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTCATTGCTCTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTTCTGGCCATGCTCAAGAAACATTCAGGCTCAGGTGAGAATACCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCTTTTTCCCTAGATAAAGTGATATCTGTGTTTCATACTGTAATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACACTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGTAGCCATGAGGAAGTTGGTCACCAAATATATCTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAAATTATACATTTTATAGTCCTCCTGAGGATCGTTGTCCTAAAGCAGGAAGTATTTGCAGTAATAATGCTGCATTCACTTCCTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTTAAATTTTA-------------------CTATAA---------------------------TTTTTCTCT-----ATTAA------TTCCTCTTTATATTG----------AAAAAATAGAGGAATTAAGATGAACATAAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85426943 1195 - 162156779 TTAAATACTATGTGGACTAATTatagtttcttta-attttcatagcTATATTATGAAAAAAGTAAGTTGAAGAAATGGAAACCGCAAATTACACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTACCGGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGGCTTGACCCTCATCTGACTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTTCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGCATTGCACAGCTGTTCTTCTTACACTTTGTCGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCGACGTCTCTGCAGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGATGGGGGGCTTCGTTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTTATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATTGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTCATTGCTCTGTTAATGTCCTACACCTTCCTTCTGGCCATGCTCAAGAAACATTCAGGCTCAGGTGAGAATATCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAAAGTTTGGGCCATCCATCTACATTTGTGCTCGCCCATTTGACTCTTTTTCCCTAGATAAAGTGGTATCTGTGTTTCATACTGTAATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACACTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGCAGCCATGAGGAAGTTGGTCAcgaaaaatattttgtgtaaagagaagtgaaagataaatgatacattttatagtCCTCCTGAGGATCATTGTCCTAAAGCAGGAAGCATTTGCAGTAATAATGCTGCATTCACTTCCTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTtaaatttta-------------------ctataa---------------------------tttttctct-----attaa------ttcctctttatattg----------aaaaaata-aggcattaagatgaaaataaat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3584022 1196 - 24206276 TTAAATACTATGTGGACTAATTAGAGTTTCTTTA-ATTTTCATAGCTATATTATGAAAAAAGTAAGTTGAAGAAATGGAAACTGCAAATTATACCAAGGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTACCGGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAGGCTTGACCCTCATCTGACTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCCTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGCATTGCACAGCTGTTCTTCTTACACTTTGTTGGGGCTTCGGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACCATCATGAATCGTCATCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGATGGGGGGCTTCATTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATTGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTGTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTGGTGTGTTTCATTGCTCTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTTCTGGCCACGCTCAAGAAACATTCAGGCTTAGGTGAGAATACCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCTTTTTCCCTAGATAAAGTGGTATCTGTGTTTCATACTGTAATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACACTGAGAAACAAGGAAGTAAAGGCAGCCATGAGGAAGTTGGTCACCAAATATATTTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAAATGATACATTTTATAGTCCTCCTGAGGATCATTGTCCTAAAGCAGGAAGTATTTGCAGTAATAATGCTGCATTCACTTTCTCCT------------------------------------------------------------------TTCATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTTAAATTTTA-------------------CTATAA---------------------------TTTTTCTCT-----ATTAA------TTCCTCTTTATATTG----------AAAAAATAGAGGCATTAAGATGAAAATAAAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87757022 1196 - 132174527 TTAAATGCTATGTGGGCTAATTATAGTTTCTTTA-ATTTTCGTAGCTATATTATGAAAAAAGTTAATTGAAGAAATGGCAACTGCAAATTACACCACAGTGACAGAATTTGTTCTCACTGGCCTATCCCAGACTCGGGAGGTCCAACTAGTCCTATTTGCTATATTTCTATCCTTCTATTTGTTCATCCTACCAGGAAATATCCTTATCATTTGCACCATCAAGCTTGACCCTCATCTGACTTCTCCTATGTATTTCCTGTTGGCTAATCTGGCTTTCCTTGATATTTGGTACTCTTCCATTACAGCCCCTAAAATGCTCATAGACTTCTTTGTGGAGAGGAAGATAATTTCCTTTGGTGGATGTATTGTACAGCTCTTCTTCTTACACTTTGTTGGGGCATCAGAGATGTTCTTGCTCACAGTGATGGCCTTTGACCGTTACGCTGCTATCTGCCGACCCCTCCACTATGCTACTATCATGAATCGACGTCTCTGCTATATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGATGGGAGGCTTCATTCATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTTCCTTTCTGTGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGACATCACACAGGTTGTCCGGATTGCCTGTGCCAACACCTTCCCAGAGGAGTTAGTGATGATCTTTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTGATGTGTTTCATTGCTTTGTTAATGTCCTATGCCTTCCTGCTGGCCATGCTCAAGAAACTCGGAGGCTCAGGTGAGAATACCAACAGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATTACCATTGTGGTGCTAATGTTTGGGCCATCCATCTATATTTATGCTCGCCCATTTGACTCTTTTTCCCTAGATAAAGTGGTGTCTGTGTTTCATACTGTGATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATTTACACATTGAGAAACAAGGAAGTAAAGACAGCCATGAGGAAGCTGATCACCAAATATATTTTGTGTAAAGAGAAGTGAAAGATAAATAATAGATCTTACAGTCCTCCTAAGGATCATTGTTGTAAAGCAGGAAGTATTTGTAGTAATAATGCTGCATTTACTTCCTCCT------------------------------------------------------------------TTGATTTGTGT-------------------------------------------------------------------------------------------TCTTAAAATTTTA-------------------CTATAC---------------------------GTTTTCTCT-----ATTAA------TTCCTCTTTATATGG----------ACAAAATAGAGGCACTAAGATGAAAATAAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74581345 1391 - 124902244 ttaattattatttgtagtaattataat---ttta-ttttCCATAGCCATA--ATGACAAA--TTAATTGAAGAAATGGAACCTGCAAATGATACCACCGTGACCGAATTTATTCTCACTGGTCTATCTCAGACTCGGGAAGTGCAGCTAGTCTTGTTTGTTATATTTTTATCCTTTTATTTATTCATACTTCCAGTGAATATCCTTATTATCTGCACAATCAGGCTTGATTCCCATTTGAGTTCTCCCATGTATTTCCTGCTGGCTAATCTAGCCTTCCTTGATATTTGGTATTCCTCTATCACAGCGCCTAAGATGCTTGTAGACTTCTTTGTGGAAAGGAAGATAATATCCTTTGGTGGGTGTATTGCTCAACTCTTCTTCTTGCACTTTGTCGGGGCCTCTGAGATGTTCCTGCTGACAGTGATGGCTTTTGACCGCTACGCTGCCATCTGCCGCCCTCTCCACTATGCTACCATCATGAACCGCCGGCTCTGTTGTATCTTAGTGGCCCTCTCCTGGACAGGGGGCTTCGTACATTCTATAATACAGGTGGCTCTCATTGTTCGACTCCCATTTTGTGGGCCCAATGAACTAGACAATTATTTTTGTGACATCACTCAGGTTGTCCGGATTGCTTGTGCCAATACTTTCCTGGAAGAAATGGTCATGATCTTTAGCAGTGGCCTGATCTCTGTGGTATGCTTCATTGCTCTGCTAATGTCCTACGCCTTTCTTCTGACCATGCTTAAGAAACACTCAAGCTCAGGTGAGAGCACCAGCAGGGCTATATCCACTTGTTATTCCCACATCACCATAGTGGTGCTAATGTTTGGACCATCCATCTACATTTATGCTCGCCCATTTGACTCGTTTTCTCTAGATAAGGTGGTGTCTGTGTTTCATACTGTGATATTCCCTTTACTCAACCCCATCATCTATACATTGAGAAACAAGGAAGTGAAGGCAGCCATGAGAAAGCTGGTGAATAGATATATTTTTTGCAAAGAAAAGTGAAAAGTAAATGATATATTTTA----------------CATTGTTCTAACACAGGAAGT------GGTGGTAATGTCACATTTACTTTCTCTTATTTGAACTCTGTTTTAAGGTTTAtttatttttattttgtatgtataaatgtataaatgttttttcttcatctgtttatgtgtatcatatgtatgcctggtgcctatagaggtcagaaggtggccttgaatcccatggagctggagttaatagagagttgtgagtcaatatttaggttttgggaacaaaatctgggtctcctataaaaataacaagtatccttaagcactgagtacttctctcAGGGATTAAACTCATCTCTTTTCTATACTTCTTCTAAGGTGAAGCACAAACATATTAAAGTGGAAACAAAT i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17336265 1178 + 64190966 ATAAGTGCTATTTGGAATAATTGTAATTTCTTTATTTTTTTATAGCCATATTCTTTTACA---CAAGCGAAGAAATGGAACCTGCAAATTACACTAGGGTGACGGAATTTGTTCTCACTGGCTTATCCCAGACTCGAGAGGTACAACTAGTCCTATTTGTTATATTTCTGTCCTTCTATCTGTTCATCCTCCCAGGAAATGTTCTTATTATTTGCACCATCAGGCTGGACCCTCACCTGACCTCACCCATGTATTTCCTGCTGGCTAACCTGGCCTTCCTTGACATTTGGTACTCCTCCATCACGGCCCCTAAAATGCTCGTAGACTTCTTTGTGGAAAGAAAGAGGATTTCTTTCGGTGGGTGCATTGCACAGCTCTTCTTTTTGCACTTCGTTGGGGCCTCCGAGATGTTCCTGCTCACAGTAATGGCCTTTGACCGCTATGCTGCTATCTGCCGCCCTCTCCACTATGCTACTATCATGAATCGACGTCTCTGCTGTATCCTGGTGGCTCTCTCCTGGTTGGGGGGCTTCATTCATTCTATAATACAAGTGGTCCTCATCGTCCGACTTCCCTTCTGCGGGCCCAATGAGTTAGACAGTTACTTCTGTGATATCACGCAGGTCGTCCGCATTGCCTGTGCCAATACCTTCCCCGAGGAGTTAGTGATGATTTTTAGCAGTGGTCTGATCTCTGTAGTATGCTTCATTGCTCTCCTAATGTCCTATGCCTTCCTCCTGGCCATGTTGAGGAAACACTCAGGCTCAGGTGAGAGTACCAGTCGGGCCATGTCCACCTGCTATTCCCACATCACGATTGTGGTGTTCATGTTTGGACCATCTATCTACATTTATGCTCGACCATTTGACTCGTTTTCCCTCGATAAGGTTGTGTCTGTGTTCCATACTGTGATATTCCCTTTACTTAATCCCATTATCTACACCTTGAGAAATAAAGAAGTAAAGACGGCCATGAGGAAGTTGGTCAACAGATATATTTTATGT--AGAGAAGTGAAAGATAAGTGACATACTCTACAACCTTTCTGAGG-TCATTGTCCTAAAGTAGGAAGCATTTCCAGCAGTAATAATGCCTTCA-TTACTTCT------------------------------------------------------------------CTCATTTGAGT-------------------------------------------------------------------------------------------TTTTAAATTCTCA-------------------CCACAC---------------------------TCTCCCCCT-----ATTTG------------------GTG----------AAAACACAAAGAAATTAAGATGGAAATAAAT i canFam3.chr15 I 2386 I 1 a score=746096.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 404293 428 + 478999 TTACTCACACCTACCCTGAAATTCCCAACAGATCATTATTAGAA-TTTGAGAT---ATAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATTGTTTATTGAGTA----CTCTGCAGAGGCTCTGGCTTTGACGGGAA--CATGTTGAGAAAAA------TAAAT---AAGAC-ATGGAGACGTGTCCATTACAAATATGAAGTAAATGGCAAGCATATGGATGCAGCTAGCTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTTTTGTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTCAA-CATCTTGCTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTATTTCCAGAGTTGATG--GAAAATGAGGATTTTCCATCAACTTATAAACTGAAATACCTTATA-AAGGTATTTCAGTTTATATTTCAGGTGGTGTCTATTCAACAGT- s ponAbe2.chr14 18933193 410 + 108868599 TTACTCACACCTACCCTGAAATTCCTGACAGATCATTATTAGAA-TTTGAGATATAATAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATTGTTTATTGAGTAACTGCTCTGCAGAGGCTCTGGCTTTGAGGGGAA--CATGTTGAGAAAAA------TAAAT---AAGAC-ATGGAGACGTGTCCATTACAAATATGAAGTAAATGGCAAGCATATGGATGCAGCTAGCTTCAAGTTGGCAAA-TAAATATTGTTGTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTAAA-CATCTTGCTGGGTCTG--AAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTATTTCCAGAGTTGATG--GAAAATGAGGATT---CAT---------------------TTATACAAGGTATTTCAGTTTATATTTCAGGTGATGTCCATTCAACAGT- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88020741 413 - 170124641 TTACTCACACCCACCCTGAAATTCCTGGCAGATCATTATTAGAATTTTGAGATATAATAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATTGTTAATTGAGTAACTATTCTGCAGAGGCTCTGACTTTGAGGAGAA--CGTGTTGAGAAAAA------TAAAT---AAGAC-ATGGAGACGTGTCCATTAAAAATATGAAGTAAACGGCAAGCATATGAATGTAGCTAACTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTGTTTTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTAAA-CATCTTGCTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTGTTTCCAGAGTTGATG--GAAAATGAGGATT---CAT---------------------TTATACAAGGTATTTCAGTTTATATTTCAGGTGGTGTCCACTCAACAGT- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88299004 413 - 171882078 TTACTCACACCCACCCTGAAATTCCTGGCAGATCATTATTAGAATTTTGAGATATAATAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATTGTTAATTGAGTAACTATTCTGCAGAGGCTCTGACTTTGAGGAGAA--CGTGTTGAGAAAAA------TAAAT---AAGAC-ATGGAGACGTGTCCATTAAAAATATGAAATAAACGGCAAGCATATGAATGTAGCTAACTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTGTTTTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTAAA-CATCTTGCTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTGTTTCCAGAGTTGATG--GAAAATGAGGATT---CAT---------------------TTATACAAGGTATTTCAGTTTATATTTCAGGTGGTGTCCACTCAACAGT- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85428138 410 - 162156779 ttactcaCACCCACCCTGAAATTCCCGGCAGATCATTATTAGAA-TTTGAGATACAGTAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATTGTTTATTGAGTAACTATTCTGCAGAGGCTCTGACTTTGAGGAGAA--Cgtgttgagaaaaa------taaat---aagac-atggaGACGTGTCcattaaaaatatgaagtaaatGGCAAGCATATGAATGTAGCTAGCTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTG--TTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTAAA-CATCTTGCTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTGTTTCCAGAGTTGATG--GAAAATGAGGATT---CAT---------------------TTATACAAGGCATTTCAGTTTATATTTCAGGTGGTGTCCACTCAACAGT- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3585218 415 - 24206276 TTACTCACACCCACCCTGAAATTCCCGGCAGATCATTATTAGAA-TTTGAGATATAATAATAATCTGCTAAAG--TACATTTTAACTAATGATTTATTGAGTAACTATTCTGCAGAGGCTCTGACTTTGAGGAGAA--CGTGTTGAGAAAAA------TAAATAAGAAGAC-ATGGAGACGTGTCCATTAAAAATATGGAGTAAATGGCAAGCATATGAATGTAGCTAGCTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTGTTTTCATGTTTCAGTGTTGGCTCAGTGGAATGGTATCTGGTAAA-CATCTTACTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTGTTTCCAGAGTTGATG--GAAAATCAGGATT---CAT---------------------TTATACAAGGCATTTCAGTTTATATTTCAGGTGATGTCCACTCAACAGT- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87758218 411 - 132174527 T--CTCACACCCACCCTGAAATTCCCACCAGATCATTATTAGAA-TTTGAGCTATAATAATGATCTGCTAAAG--TGCATTTTAAC-AATTGTTTATTGAGTAAC-ACTCTGCAGAGGCTTTGCCTCTGAGGAGAT--TGTGTTGAGAAATA------AAAAT---AAGAC-CTGGAGACATGTTCATCATAAATATGAAGTAAATAGCAAGCATATGAATGAAGCTAGCTTCAAGTTAGCAAA-TAAATATTGTTGTCATGTTTTAGTGTTGGCTCAGTGGAATTGTATCTGGTAAACCATCTTGCTGGGTCTGGAAAAA--CAGATTATTTGTCCTTTATCTCCTCTTGTTGCCAGAGTTAATAATGGAAATGAGGACT---CAT---------------------TTATATAAGGTATTTCAGTTTATATTTCAGCTGGTGTCCATTCAACAGT- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74582736 399 - 124902244 T----------CACTGTGAAATGTCAAGCAGCCTGTTATTGGAA-TTT-AGATTTAATAACTGTCTCCTTAAGCACACATATTCACTACTTGTTCACTGAATATCTATTCCATAGCAGGTCTG----TGAGGAGAATGCATGTTGTGAAATAAGAAGGTAAAT---GAGACTTTGGAGATATTTTCATTATGCACTTAAAG-GAGTGGCTAGCAAGTAAACA----TAATTTCA---TACCAAATTAAGTATTGGTG---TGTTTCATTTTTCGTTCAATAGGA--GTATTTGGCAAACTTTCTTTCTGAGCCTGGAAAAAGTTGTTTTCTTTGTCCCTTATTTCCAACT-CTCCCAGACTTGATA--GAACCTGGAGATT---CTG---------------------TTCTATACGCCACCTCAACTCCTGTGTCAGGCAGCTCAGATTGACTAGTA i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17337443 1 + 64190966 I a score=1396558.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 404721 678 + 478999 TTGGAGACAGAACTCAAAATTTTATCACATTATGAAAACAATTTTTATGAATTCAAAGCAGAG-TATAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAATTTTTGTAGCCAGTCCCT-ACTT---ACATCCTTCAGAGTGAAAGCAGCCTTGG-GGAG-AAAGCTTCTAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTAGCCGTGT-AA--TTTTTTTCTAAACTATCATCTCCTTTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATAATTGCTAATTCTGCCTCTCATGTTAAACTTAAATTGGTAGAGTGCTGT--------TTTCG----TTAGTGCT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAT-------------------------TGACAGACCTAGACGTATTGGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TAGAGAATT----ATTAGGGACTGATTTCCTATTCTCAAGCACTAAAAACTC----ACTCTCCAAGCTTCAGAATGTAA-----------GAGGTAGATTAGAACATTTGATTTTATAGGTTATGTT-TTTTACTTAAATTTATTAGTTTTTAATTTCAAAACTAGGGAATCTTTTCATTGAAGGG-----CAAGAATGCATTGGGTATATTAATC----TTTAGTCTTCTTTTTTAAATTTGATAATGTAATATGGACTAAATTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTGGGAATGA-ATATATAGA-AACAAAT s ponAbe2.chr14 18933603 679 + 108868599 TTGGAGACAGAACTCAAAATTTTATCACATTATGAAAACAATTTTTATGAATTCAAAGCAGAG-TATAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAATTTTTATAGCCAGCCCCT-ACTTACAACATCCTTCAGAGTGAAAGCAGGCTTGG-GGAG-AAATCTTCTAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTAGCCGTGT-AA--TTTTTTTCTAAACTATCATCTGCTTTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATAATTGCTAATTCTGCCTCTCATGTTAGACTTAAATTGGCAGGGTGCTGT--------TTTTG----TTAGTACT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAC-------------------------TGAGACACCTAGATGTATTCGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TAGAGAATT----ATTAGGGACTGATTTCCTGTTCTCAAGCACTAAAAACTC----ACTCTCCAAGCTTCAGAATGTAA-----------GAGGTAGATTAGAACATTTGattttatatgt--tttt-tttaacttaaatttattagttttttatttCAAAACTAGGGAATCTTTTCATTGAAAGG-----CAAGAATGCATTGGGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTATTTTTTAAATTTGATAATGTAATATGGACTAAATTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTGGGAATGA-ATACATAAA-AATAAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88021154 679 - 170124641 TTGGAGACACAACTCAAAATTTTATCACATTATGAAAACATTTTTTATGAATTCAAAGCAGAG-TGTAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAATTTTTATAGCCAGTCCCT-ACTT---ACATCCTTCAGAGTGAAAGTAGGCTTGG-GGAG-AAAGCTTCCAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTAGCTGTGTAAATTTTTTTTTCTAAACTATCATCTCATCTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATGATTGCTAATTCTGCCTCCCATG------TTAAATTGGTAAGCTGCTGC--------TTTTG----TTAGCACT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAT-------------------------TGAGAGACCTAGATGTATTGGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TAGAAAATT----GTTAGGGATTGATTTCCTATTCTCAGGCACTAAAAACTCAGTTACTCTCCAAGTTTCAGAATGTAA-----------AAGGTAGATTAGAACATTTGATTTTATAGGTTATGTTGTTTTACTTAAATTTATTAGTTTTTAATTTCAAAGCTAGGGAATCTTTTCATTGAAGGG-----CAAGAATGCATTGGGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTCTTTTTTGAATTTGATAATGTAATATGGACTAAACTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTAGGAATGA-ATATATAAA-AATAAA- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88299417 678 - 171882078 TTGGAGACACAACTCAAAATTTTATCACATTATGAAAACATTTTTTATGAATTCAAAGCAGAG-TGTAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAATTTTTATAGCCAGTCCCT-ACTT---ACATCCTTCAGAGTGAAAGTAGGCTTGG-GGAG-AAAGCTTCCAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTAGCTGTGT-AATTTTTTTTTCTAAACTATCATCTCATCTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATGATTGCTAATTCTGCCTCCCATG------TTAAATTGGTAGGGTGCTGC--------TTTTG----TTAGCACT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAT-------------------------TGAGAGACCTAGATGTATTGGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TAGAAAATT----GTTAGGGATTGATTTCCTATTCTCAGGCACTAAAAACTCAGTTACTCTCCAAGTTTCAGAATGTAA-----------AAGGTAGATTAGAACatttgattttataggttatgttgttttacttaaatttattagtttttaatttCAAAGCTAGGGAATCTTTTCATTGAAGGG-----CAAGAATGCATTGGGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTCTTTTTTGAATTTGATAATGTAATATGGACTAAACTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTAGGAATGA-ATATATAAA-AATAAA- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85428548 671 - 162156779 TTGGAGACACAACTCAAAATTTTATCacattatgaaaacattttttatgaatTCAAAGCAGAG-TGTAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATtccagatgaagcctccag-------gcaATTTTTATAGTCAGTCCTT-ACTT---ACATCCTTCAGAGTGAAAGTAGGCTTGG-GGAG-AAAGCTTCCAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTagctgtgt-aatttttttttctaaactatcATCTCATCTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATGATTGCTAATTCTGCCTCCCATG------TTAAATTGGTAGGGTGCTGC--------TTTTG----TTAGTACT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAT-------------------------TGAGAGACCTAGATGTATTGGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TAGAAAATT----ATTAGGGATTGATTTCCTATTCTCAGGCACTAAAAACTCAGTTACTCTCCAAGTTTCAGAATGTAA-----------AAGGTAGATTAGAACATTTGATTTTATAGGTTATGTTGTTTTACTtaaatttattagtttttaatttcaaaactaGGAAATCTTTTCATTGAAGGG-----CAAGAATGCATTGAGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTCTTTTTTGAATTTGATAATGTAATATGGACTAAATTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTaggaatga-atatataaa-aataaa- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3585633 678 - 24206276 TTGGAGACACAACTCAAAATTTTATCACATTGTGAAAACATTTTTTATGAATTCAAAGCAGAG-TATAATTTGGCTGATACATGAGA-TTCATGTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAATTTTTATAACCAGTCCCT-ACTT---ACATCCTTCAGAGTGAAAGTAGGCTTGG-GGAG-AAAGCTTCCAGGTTGACTGGGATTGGTAGACATCTAGCTGTGT-AATTTTTTTTTCTAAACTATCATCTCATCTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATGATTGCTAATTCTGCCTCCCATG------TTAAATTGGTAGGGTGCTGC--------TTTTG----TTAGCACT-TAATTCAGAGTTCTTTCCCAT-------------------------TGAGAGACCTAGATGTATTGGTTCCC----ATGATCCCT--------------------------TGGAAAATT----ATTAGGGATTGATTTCCTATTCTCAGGCACTAAAAACTCAGTTACTCTCCAAGTTTCAGAAAGTAA-----------AAGGTAGATTAGAACatttgattttataggttatgttgttttacttaaatttattagtttttaatttCAAAACTAGGAAATCTTTTCATTGAAGGG-----CAAGAATGCATTGAGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTCTTTTTTGAATTTGATAATGTAATATGGACTAAATTTTAAGTGAATTAGATCCTTGTCAACATTAGGAATGA-ATATATAAA-AATAAA- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87758629 712 - 132174527 TTGGAGACAAAACTCAAAATTTTATCACATTACTGAAACAATTTTTATGAATTCAAATCAGAGTTGTAATTTGCTTGCTACACAAGA-TTGATCTCATTCCAGATGAAGCCTCCAGGCAACTAGCAGTTTTTGTAGCCAGTCCCT-ACTT---AAATCCTTCAGAGTGAAAGTAGGCTTGG-GGAGAAAAGATTCTAGGTTGACTGGGATTGGTAGACACTTAGCTGTGT-AA----TTTTTAAAAACCATTATCTCCTTTGCCACTTTTGTATGTTTTCCATAATTGCTAATTCTGCCTCTCATGTTAAA-CTTAATTGGTAGGGTGCTGC--------TTTTG----TTAGCACT-TAATTCTGAGTTCTTTCCCATGA-ACCA--TTTTTTAGTGCACATAGAAGAGACCTAAAAGTTTTGGTTCCC----ATGATTCCT--------------------------TAGAGAATT----ATTAAGGATTGAGTTCCTATTCTCAGGCACTAAAAACTCATTTACTCTCTATGCTTCAGAACGTAAAATTAGAACAGAATGTAGATTAGAACATTTGATATAATAGGTTATGTT-TATTACTTAAATTTA--AGTTTTTAATTTCAAAACTAGGTATTCTTTTCATGGAAGGG-----CAAGAATACATTGGGTGTATTAAGC----TTTAGTCTTCTTTTTTAAATTTGATAATGTAATATGGGCTAAATTTTAAATTAATTTGATTCTTGTCAACATTAGGAATGA-ATATATAAA-AATAAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74583135 700 - 124902244 TTGCTGACAAATCTGAAGCCTTTACCA-ACTATGGAAATGGTATTTATGCATCCAGAGCACAA-TATGTTTTGTTTGCTATAAGATT-TCC---CCATTTCAAATGTATTCACCAATCAACT--CAGTTTTTATAG------CCT-ACAT--AATAACCTTCAGAGGAAAGCCTGGTATGA-AGGA-AATGGCTCTGTGCTGACAGGGATCAGCAGACATGTATCTGCAT-GC-TTTAAATTCAAACCTTCTATCTCCTTTGCCA---TTGTTTGTTTCCCATGGTTGATACTTTCATGTGTCATA------TTAATTTGAATAGATTTAGCATAATAAATGTTGAAATATAACACTATAATTC--AATTATTTTCCAT-------------------------TAAA----TTATGTTTTTTAGTTTATATAGATGATACCTACTTAAATATGACATACTTCAGGGGCTAGTAAATTGCTCATTATGGGGTAATTT-TTATATTCGGATACTTAGAACTCAACTAATAACCGTGTTTCAGAATATAA-----------AAGGTAAGTATAAATATCTGATTTCACAAGAAATTCTAATTTGCTTAAA--TGTTAATGTTTAATTTTAAAACAAAGAAGTC--TCCATGAAAGGAGTTCTCAACTATGT-----GTATGCTGAGCTCAATTTAGTCTTTTACTTTATATT-----ATATAATAT-GACTAGATATTGAAAAAGATAAATTTCTGTCAGCATCAAGAAAAATATAAATGAATAACAAAA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17337444 693 + 64190966 TTGGTGACAGACCCCAGG-TTTTGTCACATCTTAGGAGCAATTTTTATGAATTCACAGCAGAG------TTTGGTTACTAAATGAGACCTCCTCTCATTCCAGAGGAAGTTTCCAGCCGAATAGCGGTTTTCATAGCCCGTCTCTAACTT---ATATCCTCCAGTGTGAAAGCAGACTTGGAGGAA-AGGGATTCTAGGTTGA-TGGAATCAATAGACATCTAGTTGTGT-GA---TTTTAAAAAGATTATTATCTCCTTTGCCATTTTTGTGTGTTTTCTGTATTTGCTAATTCTGCTT---ATGTTAAAATTATGTTAGTAGGATGCTGC--------TTTTG----TTAGTCGTATAATTCAGAGTTCTTTTCCATTACACCATTTTTTTTAGTACACATAAAGAAGAGCTGGATATATTGGCTGTC----ATGATCCTT--------------------------TGGTGAATTATTTATTAGATATCCACTGACTATTCCCTGACATTAAGAACTCTATTACTGACTGTGATTCAGAATATAA-----------AAGTTAGAGTAGAATATTTGAGTTCATAAAT----TT-ATTTACTTAAATTAGC---TTTTCAATTTCAAAACTAGG-ATTCTATCCATTAAAGAG-----CTAGAGCATTTCGTATGCTCAGAGC----TTTAGTCTTATGTTTT--CTTTGATAACATATTGT-AATTAGACTTTGAGGGGAATAGATTTCTATCAGCATCAGAAATTA-ATACGCATA-AATGAAT i canFam3.chr15 I 1 I 19 a score=138448.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 405399 83 + 478999 GGT------ATAACTATTCCTAGAGTTACTATTTATTTACAGAGATATTATTTATTAATTGAGGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTGT s ponAbe2.chr14 18934282 83 + 108868599 GGT------ATAACTATTCCTAGAGTTACTATTTATTTACAGAGATTTTATTTATTAATTGAGGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88021833 77 - 170124641 ----------TAACTATTCCTAGACTTACTATTTATT--TAGAGATTTTATTTATTAATTGAGGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88300095 77 - 171882078 ----------TAACTATTCCTAGACTTACTATTTATT--TAGAGATTTTATTTATTAATTGAGGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85429219 79 - 162156779 ----------taactattccTAGACTTACTAGTTAtttataaagattttatttattaattgagGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3586311 75 - 24206276 --------------TATTCCTAGACTTACTAGTTATTTATAGAGATTTTATTTATTAATTGAGGAGGTAATTTGTGCCAGACCCAGTGT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87759341 82 - 132174527 GGT------ATAACTATTCCTAGAGTTACTATTCATTTACAGAGATTTTATTTATTAATCAAGGAGGTAA-TTGTGCCAGACCCAGTGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74583835 88 - 124902244 GGTCCTCCAGAGATCATATGTATTATTATTACTTACTTGCAAAGGTA-CATTTCTTAGTTTAGGAAATAATTCATGCCTGGCCCAGTGT i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17338137 19 + 64190966 I a score=769294.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 405482 388 + 478999 ATCTCAGATGCACAGGATGGAATGGTGGTACACAAAGCTTGTTT-TTTGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCTTCTTCGATCTTCAATGCT--AT-GTTGCTTCTCTTCTAGGAACCCAAAGGCACAGATTGACGTTATAAGTCCTGATTTTTGACTTGACTTCTCA---TCACCTGGAAGTGAATAAAGCAGTAGACTTC---TCTAACATTTTGTAACACAGCATGAAAA----aatat----------------------------------------------------------------------------------agagtacaaaag--atatatatatataatat-------------------------gataaaatGATGAGTTACGTTTCTAAATCTTTTATCATCTTACTGT----------CATTTCTCTATATTTGGTCTAGCCAGACTTCTATTCA-------------TTTTGTCACTTAT-CTTTCATCAAACTAGGGCTGATGCTCTT---GGGA s ponAbe2.chr14 18934365 387 + 108868599 ACCTCGGATGCACAGGATGGAATGGTGGTACACAAAGCTTGCTT-TTCGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCCTCTTCGATCTTCAATGCT--GT-GTTACTTCTTTTCTAGGAACCCAAAGGCACGGATTGATGTTATGAGTCCTGATTTTTGAGTTGACTTCTCA---TCACCTGGAAGTGAATAAAACAGTAGACTTC---TCTAACATTTTGTAACACAGCATGaaaa----aatat----------------------------------------------------------------------------------aaagtaaaaaag--atttatatatataaaat--------------------------ataaaatGATGAGTTATGTTTCTAAATCTTTTATCATCTTACTGT----------CATTTCTCTGTATTTGATCTAGCTAGACTTCTATTCA-------------TTTTGTCACTTGT-CTTTCATCAAACTAGGACTGATGTTCTT---GGGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88021910 396 - 170124641 ACCTCGGATGCATAGGATGGAATGGTGGTACACAAAGCTTGTTT-CCTGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCTTCTTCCATCTTCAATGCT--AC-CTTACTTCTCTTCTAGGAACGGAAAGGCACGGACTGACATTATGAGTCCTGA-TTTTGAGTTGACTTCTCA---TCACCTGGAAGTGAATAAAACAGTAGACTTC---TCTAATGTTTTGTAACATAGCACGAAAA----AATAT----------------------------------------------------------------------------------GAAGTACAAAAGATATATATATACACACACA--------------------------ATAAAATGAT--GTTATGTTTCTAAATCTTGTATCATCTTATTATATCCTTATATCCTTTCTCTGTATTTGATCTAGCCAGACTTCTATTCC-------------TTTTGTCACTTAT-CTTCCATCAAATTAGGACTGATGTTCTT---GGGA i rheMac3.chr7 C 0 I 1314 s macFas5.chr7 88300172 394 - 171882078 ACCTCGGATGCATAGGATGGAATGGTGGTACACAAAGCTTGTTT-CCTGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCTTCTTCCATCTTCAATGCT--AC-CTTACTTCTCTTCTAGGAACGGAAAGGCACGGACTGACATTATGAGTCCTGA-TTTTGAGTTGACTTCTCA---TCACCTGGAAGTGAATAAAACAGTAGACTTC---TCTAATGTTTTGTAACATAGCACGAAAA----AATAT----------------------------------------------------------------------------------GAAGTACAAAAG--ATATATATACACACACA--------------------------ATAAAATGAT--GTTATGTTTCTAAATCTTGTATCATCTTATTATATCCTTATATCCTTTCTCTGTATTTGATCTAGCCAGACTTCTATTCC-------------TTTTGTCACTTAT-CTTCCATCAAATTAGGACTGATGTTCTT---GGGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85429298 394 - 162156779 ACCTCGGATGCATAGGATGGAATGGTGGTACACAGAGCTTGTTT-CCTGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCTTCTTCCATCTTCAGTGCT--AC-CTTACCTCTCTTCTAGGAACGGAAAGACACGGACTGACATTATGAGTCCTGA-TTTTGAGTTGACTTCTCG---TTACCTGGAAGTGAATAAAACAGTAGACTTC---TCTAATGTTTTGTAACATAGCACGAAAA----AATAT----------------------------------------------------------------------------------GAAGTacaaaag--atatatatacacacaca--------------------------ataaaatgAT--GTTATGTTTCTAAATCTTGTATCATCTTATTATATCCTTATATCCTTCCTCTGTATTTGATCTAGCCAGACTTCTATTCC-------------TTTTGTCACTTAT-CTTTCATCAAATTAGGACTGATGTTCTT---GGGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3586386 389 - 24206276 ATCTCGGATGCATAGGATGGAATGGTGGTACACAGAGCTTGTTT-CCTGCTTTGGGA--ATTTTTCCTTATGGTGACCTTCTTCCATCTTCAGTGCT--AC-CTTACTTCTCTTCTAGGAACGGAAAGGCACGGACTGACATTATGAGTCCTGA-TTTTGAGTTGACTTCTCG---TCACCTGGAAGTGAATATAACAGTAGACTTC---TCTAA-----TGTAACACAGCACGAAAA----AATAT----------------------------------------------------------------------------------GAAGTACAAAAG--ATATATATACACACACA--------------------------ATAAAATGAT--GTTATGTTTCTAAATCTTGTATCATCTTATTATATCCTTATAGCCTTTCTCTGTATTTGATCTAGCCAGACTTCTATTCC-------------TTTTGTCACTTAT-CTTTCATCAAATTAGGACTGATGTTCTT---GGGA i chlSab2.chr29 C 0 I 1334 s calJac3.chr10 87759423 493 - 132174527 ACCTTGGATGCATAGAATGGAATGGTGGTACACAAAGCCTATTT-TTTGCATTGGGA--ATTTTTCCTTATGATAACCTTCTTCTATCTTCAATATT--AT-GTTACTTTTCCTCTGGGAACCCAAAGGCATGGTTTGATGTTATGAGTCCTGATTTTTGAGTTGACTTCTCA---TCACCTGGAAGTGAATAAAACAGTAGACTTC---TCTAATGTTTTATGACATAGCATGAGAA----AAGatatatatatgtatatatatgatacattttatcatatatgtacgtatatatgatacattttatcatatatatgtatatatgataaaatgataaaag--atatatatacatatatatGATAAAATGATGTATCATATATATGATAAAATGATGAGTGATATTTTTAAATC-TATGTCATCTTATTGT----------CATTTCTCTATATGTGATCTAGCCAGACTTCTATTCA-------------TTTTGTCACTTAT-CTTTCATCAAACTAGG-CTGATATTGTT---GAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74583923 394 - 124902244 ATCTC--------AAGGTGGAGTGGTGGTACATTTATGTTGATTGTTTGCCTTAAACTTGTTTTTTCTTATATTGAACTTCCTTCATCTTCTGTGCTCAAC-ATGACTTCTTTTCTAGGGATGCAATGACACAGACTACACTTCTGATTCCTGAATATTGAG-TGACACCTCA---TCACCTGGAACTGAATAAAACAGTACATTTTGAATTCTATACATTTTAAAACAGTTTTAAAA----ACATG----------------------------------------------------------------------------------AAAATTCAAAAC--ACATACACATACATAAT-----------------------------AAATAATGCATTATGGTTCCAGATTTTGTATTACTTCATTGT----------TTTTCTTTAATATCAGAAGCAGCTA-ATATATATTCAGAAGTTGCTTGTGTTTTATAACTTATGCTTGTGTC--ATTATTAATAATATTACT---TGAA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17338156 395 + 64190966 ACTTCAGGTAAACAGGATGGCCTGATGGTGAAAAAATTTTATTC-TTTTCTTTGGTA--ATTTTTCTCTCTGATGACCCTCTTTCATCTTCAAAGCT--ACAATGACTTCTCTTCTAAGAACTCAAATATTCTGATTGAAATTATGATTCCTAAATTTTGAGTTGACTTTTCATTTTCATTTGGAAATGAACAAAATGGTAGACTTC---TCTAATATTTTATAAGAGAGCATGAAAATAATCATCT----------------------------------------------------------------------------------AACATACAAAAG--GCTTATATATACACATA--------------------------ATAAAA--ATGAGTTATGTTTCTAGATTTTAAGTTTCCTTATTGT----------TCTTTCTCTGCATCTTAGCCAGGCAGACTTCTACTCG-------------TTTTGTCACTTAT-CCTTCATTTAGCTAGGATTAATGTTTTTTTAGGG- i canFam3.chr15 I 19 C 0 a score=9104.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 405870 3 + 478999 AAG s ponAbe2.chr14 18934752 3 + 108868599 AAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88023620 3 - 170124641 AAG i rheMac3.chr7 I 1314 C 0 s macFas5.chr7 88300566 3 - 171882078 AAG i macFas5.chr7 C 0 I 1314 s papAnu2.chr7 85429692 3 - 162156779 aag i papAnu2.chr7 C 0 I 1333 s chlSab2.chr29 3588109 3 - 24206276 AAG i chlSab2.chr29 I 1334 C 0 s calJac3.chr10 87759916 3 - 132174527 AAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584317 3 - 124902244 AAG i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17338551 3 + 64190966 AAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=189013.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 405873 90 + 478999 GGACCACTGATTTGATATGCTCTTCAAACACCAGCACACTGTACTATATAGAAAGATATTCACTGAAAATACTGAAGCTAGTAATACAAA s ponAbe2.chr14 18934755 88 + 108868599 AGACCACTGATTTGATATGCTCTTCAAACACCAGCACACTGTAC--TATAGAAGGATATTTACTGAAAATATTGAAGCTAGTAATACAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88023623 88 - 170124641 GGACCACTGATTTGCTATGCTCTTCGAACACCAGCACACTGTAC--TATAGGAGGATATTTACTGAAAACATTGAAGCTGGTAATACAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88301883 88 - 171882078 GGACCACTGATTTGCTATGCTCTTCGAACACCAGCACACTGTAC--TATAGGAGGATATTTACTGAAAACATTGAAGCTGGTAATACAAA i macFas5.chr7 I 1314 C 0 s papAnu2.chr7 85431028 88 - 162156779 GGACCACTGATTTGCTATGCTCTTGGAACACCAGCACACTGTAC--TATAGAAGGATATTTACTGAAAACATTGAAGCTGGTAATACAAA i papAnu2.chr7 I 1333 C 0 s chlSab2.chr29 3588112 88 - 24206276 GGACCACTGATTTGATATGCTCTTCAAACACCAGCACACTGTAC--TATAGAAGGATATTTACTGAAAACACTGAAGCTAGTAATACAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87759919 88 - 132174527 AGATCACTGATTTGATATGCTCTTCAAACACCAGCACACTGTGC--TATAGAAGGATATTTACTGAAAATATGGAAGCTAGTAATACACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584320 76 - 124902244 TGCCTGTTAACTTTTTGTGGTTTTCAAACACCAG------------TGTA--AGAATATTTGCTGAACATATCTAAGCTAATAATGTAAA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17338554 81 + 64190966 AGACTACTGCCTCAGGATGCTCTCCAAG-------GCATTATAC--TGTGACTATATATTTGTTGAAAACATTGATGCTAGGAATAAGAA i canFam3.chr15 C 0 I 29 a score=206640.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 405963 137 + 478999 G--GAAAAAGGCATAAAAA---TAGTGTGATAACTAATTGCTTACTTAAGAATATTATCTGAAATTAGAAACTAATATCAATGAAG-AAAAGGGGAACTT-----------------TT------------------------GGCAAACTCT-AGTAAGTAATAACTGAGCCTGATTCATGGAG s ponAbe2.chr14 18934843 141 + 108868599 G--GAAAAAGGCATAAAAATAGTAGTGTGATAACTAATTGCTTACTTAGGAATATTATCTGAAATTAGAAATTAATATCAGTAAAGAAAAAGGGGAACTT-----------------TT------------------------GGCAAACTCT-AGTAAGTAATAACTGAGCCTGATTCATGGAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88023711 130 - 170124641 G--GAAAAAGGCATACAAA---TAGTGTGATAACTAATTGCTTACTTAGGAATATTATCTGAAATTAGAAACTAATGTCAATGAAG-AAAAGGGGAACAT-----------------TT------------------------GGCAAACTC--------TAATAACTGAGCCTGATTCATGGAG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88301971 130 - 171882078 G--GAAAAAGGCATACAAA---TAGTGTGATAACTAATTGCTTACTTAGGAATATTATCTGAAATTAGAAACTAATGTCAATGAAG-AAAAGGGGAACAT-----------------TT------------------------AGCAAACTC--------TAATAACTGAGCCTGATTCATGGAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85431116 130 - 162156779 g--gaaaaaggcatacaaa---tagtGTGATAACTAATTGCTTACTTAGGAATATTATCTGAAACTAGAAACTAATATCAATGAAG-AAAAGGGGAACAT-----------------TT------------------------GGCAAACTC--------TAATAATTGAGCCTGATTCACGGAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3588200 133 - 24206276 G--GAAAAAAGTATACAAA---TAGTGTGATAACTAATTGCTTACTTAGGAATATTAGCTGAAATTAGAAACTGATATGAATGAAG-AAAAGGGGAACAT-----------------TT------------------------GGCAAACTCT-----AGTAATAACTGAGCCTGATTCATGGAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760007 184 - 132174527 GGAGAAAAAGGCATAAAAATAGTAGTGTGATAGCTAGTTGCTTACTTAGGAATATTATCTGAAATGATAAACTAATATCAATGAAG-AAAAGGGGAACTTAGGAATATTATCTGAAATTATAAACTAATATCAATGAAGAAGAGGTGAACTTCTATTAAGTGATAACTGAGCCTGATTCATGGAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584396 109 - 124902244 G---------------AAG---CAGTG-GAACACTAATTGTTTACTTTGAA----------AAATATAAAGTTAATATTGAC--AG-GGAGGGGTATTCT-----------------TT------------------------GACAAGCT---ACTGAGTCATGACCTATCCTGACTCGTGGAG i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17338635 29 + 64190966 I a score=1500.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406100 1 + 478999 G s ponAbe2.chr14 18934984 1 + 108868599 G i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88023841 1 - 170124641 G i rheMac3.chr7 C 0 I 94 s chlSab2.chr29 3588333 1 - 24206276 G i chlSab2.chr29 C 0 I 89 s calJac3.chr10 87760191 1 - 132174527 G i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584505 1 - 124902244 G i mm10.chr14 C 0 C 0 e canFam3.chr15 17338635 29 + 64190966 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C a score=9145.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406101 35 + 478999 CCATAATTGGAATAAGGactgagagcaatttcacc s ponAbe2.chr14 18934985 35 + 108868599 ACATAATTGGAATAAGGactgagagcattttcacc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760192 35 - 132174527 ACATGATTGGAATAAAGactgagagcaatttcact i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584506 35 - 124902244 AAATAATCAAGTAAAATTTGGGGATCCATTTTGCC i mm10.chr14 C 0 I 28 e canFam3.chr15 17338635 29 + 64190966 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=132703.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406136 585 + 478999 ccttggaggacatttggaagtgcccagagacatttttggtggtcacaactgaggacatatattggcatcttgtactgtttagacatcttacaatgcacaggacagcccccagcccctgactcccacatggattatctggcccaaaatgtcaatagtgccaagaataaagaactcCATCAGGTTGAGAAACTCTGACTTAAATAATGGGCAGGGATAAGGCAGGTTAGTGTAGAAGAAATAGGTGTTAACCTCATATGCAATCTTGTCTCATTGAATATTGTTTCCAAATAGCTCAGGATCCTCAGCAGTCAAATACAAAATATGATTCAGGACTCCTTTTCCCTATATAACTCCTATATTTTCTTTCAGTTACTTTTAAATGTCTTTTAATCTCTTTTTTTTT-CTTTCAGTCTCTCCTACTCC-TCTTTCTTTCAAAACTGCTGCTGAGCTACTATGTTTAAAATCAGCAATATCTCGGTTGAGTATATTATCTTTAGCTCAGTATTGTGATTATACTTTCAATTATACACTGACTTGTGTGAGACTTTAGAACCCAAGTCCC---------ATTCATCTTCTGGCTTTTTGCTA s ponAbe2.chr14 18935020 584 + 108868599 ccttggaggacatttggaagtgcccagagacatttgtggtggtcacaactgaggacgtatatt-gcatcttgtactatttagacatcttacaatgcacaggacagcccgcagcccctgactcccacatgaattatctggcccaaaatgtcaatagtgctgagaataaagaactcCATCAGGCTGAGAAACCCTGACTTAAATAATGGGCAGGGATAAGGCAGGTTAGTGTAGAAGAAATAGGTGCTAACCTCATATGCAACACTGTCTCATTGAATATTGTTTCCAAATAGCTCAGTATCCTCAGCAGTCAAATACAAAATATGTCTCAGGACTCCTTTTCCCTATATAACTCCTACATTTTCTTTCAGTTAC-TTTAAATGTCTTTTAATCTCTTTTTTTTTCCCTTCAGTCTCTCCTACTCC-TCCTCCTTTCAAAACTGCCGCTGAGCTACTATGTTTAAAATCAGCAACATCCCGATTGAGTAAATTATCTTTAATTCAGTATTGTGATTATACTTTCAATTATACACTGACTTGTGTGAGATTTCAGAACCCAAATCCC---------ATTCATCTTCTGGCTTTTTGCTC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760227 587 - 132174527 ggttggagaacatttggaagttcccagagacatttttggtggtcacaactgagtatgtatattggcatcttgtactatttagacatcttacaatgcacaggacagcccccagcccctgacacccacatgaattatctggccccaaatgtcgatagtgctgagaataaagaactctgTCAGGTTGAGAACCTCTGACTGAAATAATAAACAGGGATAAGGCAGGTTAGTGTAGAAGAAATAGGTGTTAACCTCATATGCAATCTTATCTCATTGAATATTGTTTCCAAATAGTTCAGTATTCTCAGCAGTCAAATACAAAATCTGTTTCAGGATTCCTTTTCCCTATATAATGCCTACATTTTATTTCGGTTAT-TTTAAATGTCTTTTAATCTCTTTTTTTTT----TCCGTCTCTCCTACTCCACCTTCCTTTCAAAACTGCTGCTTAGC-AGTA-GTTTAAAATCAGCAATATCTTGATTGAGTAAATTATCTTTAGCACTATATTGGGATTATACTTTC-ATTAT-CACTGATTTGTGTGAGACTTTAGAATCCAAGTCTCAGAAGATGGATGTATCTCCTGGCTTTTTGCTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584541 28 - 124902244 I e canFam3.chr15 17338635 29 + 64190966 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=7458.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406721 21 + 478999 ATCTCAATATTAACCAG---AACT s ponAbe2.chr14 18935604 21 + 108868599 ATCTCAATATTAACCAG---AATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760814 24 - 132174527 ATTTCAGTATTAACAAGATAAATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17338664 24 + 64190966 ATCTCAATATTAACAAGATGGACT i canFam3.chr15 I 29 C 0 e mm10.chr14 74584541 28 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=55752.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406742 121 + 478999 TTATTATTATATCTGGTTAAAAGA--GAGCTTTATTGCTCAAACAAA-ATTA---AAGTTCTTCTGTTTTTTTAATTACTAAAATAATATATATTCATTAAAAGTTAAAAACATATGAATATATAAA s ponAbe2.chr14 18935625 120 + 108868599 TTATTATTACATCTGGTTAAAAAA--GAGCTTTATTGCTCAAACAAA-ATTA---AAGAT-TTTTGTTTTTTTAATGACTAAAATAATATATATGCATTAAAAGTTGAAAACATATGAATATACAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760838 120 - 132174527 TTATTATTATATCTGGTTAAAAAA--TAGCTTTATGGCTCAAAGAAA-ATTA---AAGTTCTTTTG-ttttttaattactaaaataatatatattcattaaaagttaaaaacatatgaatatataaa i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74584569 120 - 124902244 TTTTTAATAGATCTGACAAAAATCCTTACCTTTATTTTCCAAACAAATGTTACATAACATTTTTCCCACTTTTAGTCACAAAA-------GAGTTCATTAGAAGTTCAAAATGTATGACCACATAAA i mm10.chr14 I 28 I 15809 s canFam3.chr15 17338688 120 + 64190966 ATGCTGTTACATTTGGTTAAAAAA--AATCTTCATTATCCAAACAAA-AATA---AAGTTCTTCTG-tttttaaattactaaaacaatatatgttcatttaaaaataaaaatatatGAATACATAAG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=8005.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406863 33 + 478999 GAACAAGACAAGTATCACTGGCAATCTCTTTTC-- s ponAbe2.chr14 18935745 33 + 108868599 GAACAAAACAAGTATCACTGGTAATCTTTTTTC-- i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760958 33 - 132174527 GAAAAAACCAAGTATCATTGGCAATGTTTTTTC-- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 17338808 31 + 64190966 -TACAA---AGACATTACTGGCAATATATTTTTCC i canFam3.chr15 C 0 n 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=39824.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406896 97 + 478999 TCAGGGATTTTCTTTAACAAAGTTTATAAAGTCTCACCCCTCCAACTCCATTGGAAGCAGACCAGTTGGCCTATCATGCATTGTTCCAAAATATAAT s ponAbe2.chr14 18935778 97 + 108868599 TCAGGGATTTTCTTTAACAAGGTTTATAAAGTCTCACCCCTCCAGCTCCATTGTAAGCAGGCCAGTTGGCCTATCATGCATTGTTCCAAAATATAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87760991 97 - 132174527 TCAGGGATTTTCTTTAACAAGGTTTATAAATTCTTCCCCCTCCACCTCCATTGGAAGCAGGCCAGTTGGCTTATCATGCATTGTTCCAAAATATAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46890616 96 - 64190966 TTAGAGTTTTTGGGTAACAAAGTTGGTAAAGTCCCATCCATCCAGCTCCATTGGAAGCAGGCCAGTTTGGCTGTC-TGCATCGCTGTAAAATATAAT i canFam3.chr15 I 2783 I 47852 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=33857.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 406993 152 + 478999 TACCATTAAATAGAGGTCCAGGTGAAGACAAGctacaacatgc-ttacataaataagtataaccctcagattttatatcccacaaaactggcatttaaataagcaggccacaaagttttaaatatgcaacaaaaatctgtgaatgttgttttt s ponAbe2.chr14 18935875 153 + 108868599 TACCACTAAATAGAGGTCCAGGTGAAGACAAGctacaacatgctttacataaataagtgtaaccatcagattttatatcccacaaaactggcatttaaataaaaagaccacgaagttttaaatatgcaacaaaaatctgagaatgttgttttt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87761088 152 - 132174527 TACCATTAAATAGATGTCCAGGTGAAGATAAGctacaaattcc-ttacataagtacgtgtaaccctcagattttatatgctgcaaaactggcatttaaataaaaaggccacgaaattttaaatatgcaacaaaaatctgagcttttttttttt i calJac3.chr10 C 0 I 2753 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I a score=393.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407145 11 + 478999 aagacctc-ttt s ponAbe2.chr14 18936028 12 + 108868599 aagaactctttt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85431246 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88302101 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I e calJac3.chr10 87761240 2753 - 132174527 I a score=32871.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407156 168 + 478999 gatgaaattatcagagaacaaattacagtcaaacatgtgactaggacaaaaggctggGTTTCTGacacacacacacacacacacatatatatacatatatatacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataCAC s ponAbe2.chr14 18936040 105 + 108868599 gatgaaattaccagagaacaaattacattcaaacatgtgactaggacaaaaggctgggt-----atacacacacacacacacac------------------acacacacacacac----------------------------------------atatatatacac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88302101 102 - 171882078 GATATAATTATCAGAGAACAAATTTCAGTCAAACATGTGACTAGGACAAAAGGTTGGGT-----ATacacacacacacacacac------------------acacacacaTATAT----------------------------------------ATAATTATA--- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85431246 88 - 162156779 GATATAATTATCAGAGAACAAATTTCAGTCAAACATGTGACTAGGACAAAAGGttgggt-----at--------------acac------------------acacacacatatat----------------------------------------ataattata--- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3588334 89 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88023842 94 - 170124641 I e calJac3.chr10 87761240 2753 - 132174527 I a score=706993.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407324 571 + 478999 Acagtagtcctcttttatccataggagatatgttccaagacacctgtggatgcctgaaaccatggatagtaccaaatcctatatataccatgtttttcttatacatatatgcctatgataaagtttaattcataaattagacacagtaacagatttataacaaccaataatagaatagaacaattacaacaatatgccaacattactactcttgcactttggggccattattaaatagaataaggattacttgaacacaagcactgtgatgctgtgtctaactgataaccaagttggctactaagtga-taacgtgcaggtggcatgtataacatggatacactggacaaagggatgactcatgtccctggaaggatggagaaggacagcttgagatttcatcctgctacttagaatggggcataatttaaagcttatgaattgtttgctgctggaatgttccatttaacattttttggactgaagttgaccatggacaacagaaactacagaaagca-acac--tgggtaagagggggctactgTATTTAATCTAGTATTAGGCTTATTAAACT s ponAbe2.chr14 18936145 575 + 108868599 acagtagtcctcttttatccataggagatatgttccaagacacctgtggatgcttgaaaccatggatagtaccaaaccctatatatactctgtttttcttatacatacatgcctatgataaagtttaatttataaattaggcacagtaacagatttataacaactaataataaaataggacaattataacaatatgccaacattactactattgcactttggggccattattaaatagaataaggattacttgaacacaagcactgtgatgctgtgtctaactgataaccaaggtggctactaagttactaacatgcaggtggcatgtataacatggatacactggacaaagggatgactcatgtccctagaagaatggagaaggaaagcttgatatttcatcatgctacttagaatggggcataatttaaaacttacgaattgtttgctgctggaatgttccatttaacattttttggactgaagttgaccatggacaacagaaactacagaaagtagacactgtggataggagggggctactgtatttaatctaatattaggcttattaaact i ponAbe2.chr14 C 0 I 1854 s rheMac3.chr7 88023936 565 - 170124641 Acagtagtcttcttttatccataggagatatgttccgagacacctgtggatgcctgagacagtggatagtaccaaaccctatatatactatttttttcctatacatacatgtctatgataa-----aatttataaattaggcacagtaacagatttataacaac---taataaaatagaacaattataacaatatgccggcattactacttttgcactttggagccattattaaataggaaaaggattacttgaacagaagcactgtgatgctgtgtctaactgataaccaaggtggctactaagtgactaaagtgcaggtggcatgtacaacgtggatacactggacaaagggatgactcatgtccctggaaggatggagaaggacagcttgagatttcatcatactacttagaatggggcataatttaaaacttatgaattgtttgttgctggaattttccatttaacattttttggacggaagttgaccatggacaacagaaactacagaaagca-acactat-gataagagggggctactgTATTTAATCTAATATTAGGCTTATTAAACT i rheMac3.chr7 I 94 I 1951 s macFas5.chr7 88302203 552 - 171882078 -cagtagtcttcttttatccataggagatatgttccgagacacctgtggatgcctgagacagtggatagtaccaaaccctata------------ttcctatacatacatgtctatgataa-----aatttataaattaggcacagtaacaaatttataacaac---taataaaatagaacaattataacaatatgccggcattactacttttgcactttggagccattattaaataggaaaaggattacttgaacagaagcactgtgatgctgtgtctaactgataaccaaggtggctactaagtgactaaagtgcaggtggcatgtacaacatggatacactggacaaagggatgactcatgtccctggaaggatggagaaggacagcttgagatttcatcatactacttagaatggggcataatttaaaacttatgaattgtttgttgctggaattttccatttaacattttttggacggaagttgaccatggacaacagaaactacagaaagca-acactat-gataagagggggctactgTATTTAATCTAATATTAGGCTTATTAAACT i macFas5.chr7 C 0 I 1952 s papAnu2.chr7 85431334 563 - 162156779 -cagtaGTCTTCTTTTATCCATAGGAGATATGTTCCAAGACACCTGTGGATGcttgaaaccatggatagtaccgAACcctatatataccatgtttttcctatacatacatgcgtatgataa-----aatttataaattaggcacagtaacaGATTTATAACtac---taataaaatagaacaattataacaatatgcc-gCATTACTACTTTTGCACTTTGGAGCCATTATTAAATAGGAAAAGGATTACTTGAACAGAAGCACTGTGATGCTGTGTCTAACTGATAACCAAggtggctactaagtgactaaagTGCAGGTGGCATGTACAAcatggatacactggacaaagggatgactcATGTCCCTGGAAGGATGGAGAAGGACAGCTTGAGATTTCATCATACTACTTAGAATGGGgcataatttaaaacttatgaattgtttgttgctggaattttccatttaacattttttggaCGGAAGTTGACCATGGACAACAGAAACTACAGAAAGCA-ACACTAT-GATAAGAGGGGGCTACTGTATTTAATCTAATATTAGGCTTATTAAACA i papAnu2.chr7 C 0 I 1950 s chlSab2.chr29 3588423 567 - 24206276 Acagtagtcttcttttatccataggagatatgttccaagacacctgtggatgcctgaaaccatggatagtaccaaactctatatataccaagtttttcctatacatacatgcctatgataaaatttaatttataaattaggcacagtaac--atttataacaac---taataaaatagaaaaattataacaatatgccggcattactactcttgcactttggagccattattaaatagaaaaaggattacttgaacagaagcactgtgatgctgtgtctaactgataaccaaggtggctactaagtgactaaagtgcaggtggcatgtacaacatggatacactggacaaagggatgactcatgtccctggaaggatggagaaggacag-ttgagatttcatcatactacttagaatggggcataatttaaaacttacgaattgtttgttgctggaattttccatttaacattttttggactgaagttgaccatggagaacagaaactacagaaagca-acactat-gataagagggggctactgTATTTAATCTAATATTAGGCTTATTAAACT i chlSab2.chr29 I 89 I 1930 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e calJac3.chr10 87761240 2753 - 132174527 I a score=115568.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407895 66 + 478999 ATAAAGACAACTAAGCAGACGTTGAAAACGGAGATCGTCTTCAAGGGAAAGGCAGTCAGGATAATA s ponAbe2.chr14 18938574 66 + 108868599 ataaagacaattaagcagatgttgaaagtagAGATCATCTTCAAGGGAAAGGCAGTCAGGATAGTA i ponAbe2.chr14 I 1854 C 0 s rheMac3.chr7 88026452 66 - 170124641 ataaagacaactaagcagatgtggaaagcagAGCTCATCTTCAAGGGAAAGGCAGTCAGGATAATA i rheMac3.chr7 I 1951 C 0 s macFas5.chr7 88304707 66 - 171882078 ataaagacaactaagcagatgtggaaagcagAGCTCATCTTCAAGGGAAAGGCAGTCAGGATAATA i macFas5.chr7 I 1952 C 0 s papAnu2.chr7 85433847 66 - 162156779 ATAAAGACAACTAAGCAGATGTGGAAAGCAGAGCTCATCTTCAAGGGAAAGGCAATCAGGATAATA i papAnu2.chr7 I 1950 C 0 s chlSab2.chr29 3590920 66 - 24206276 ataaagacagctaagcagatgttgaaagcagAGCTCATCTTCAAGGGAAAGGCAGTCAGGATAATA i chlSab2.chr29 I 1930 C 0 s calJac3.chr10 87763993 66 - 132174527 ATAAAGACAACCAAGCAGATTTTAAAAGCAGAGCTCATCTTCAAGGGAAAGGCAGTAAGGATAATA i calJac3.chr10 I 2753 I 209 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=15792.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407961 12 + 478999 --TCTCACTGGTTT s ponAbe2.chr14 18938640 12 + 108868599 --TCTCACTGGTtt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88026518 12 - 170124641 --TTTCACTGGTtt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88304773 12 - 171882078 --TTTCACTGGTtt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85433913 12 - 162156779 --TTTCActggttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3590986 12 - 24206276 --TCTCACTGGTtt i chlSab2.chr29 C 0 I 467 s calJac3.chr10 87764268 14 - 132174527 TCcctccctccctc i calJac3.chr10 I 209 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=42142.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407973 26 + 478999 CCTTCCTTCCTTCtttcctttttttt s ponAbe2.chr14 18938652 26 + 108868599 ccttccttccttccttccTTTTCTTT i ponAbe2.chr14 C 0 I 22 s rheMac3.chr7 88026530 26 - 170124641 ccttccttccttcttttcttttcttt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88304785 26 - 171882078 ccttccttccttattttcttttcttt i macFas5.chr7 C 0 I 229 s papAnu2.chr7 85433925 26 - 162156779 cctttcttccttcttttcttttcttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3591465 26 - 24206276 ccttccttccttctttccttttcttt i chlSab2.chr29 I 467 C 0 s calJac3.chr10 87764282 26 - 132174527 cctccctttcttctttccttctttcc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=3225.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 407999 2 + 478999 tc s ponAbe2.chr14 18938700 2 + 108868599 tc i ponAbe2.chr14 I 22 C 0 s rheMac3.chr7 88026556 2 - 170124641 tc i rheMac3.chr7 C 0 I 219 s macFas5.chr7 88305040 2 - 171882078 tc i macFas5.chr7 I 229 C 0 s papAnu2.chr7 85433951 2 - 162156779 tc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3591491 2 - 24206276 tc i chlSab2.chr29 C 0 I 9 s calJac3.chr10 87764308 2 - 132174527 tt i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=1600.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408001 2 + 478999 ct s ponAbe2.chr14 18938702 2 + 108868599 tt i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88305042 2 - 171882078 ct i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85433953 2 - 162156779 ct i papAnu2.chr7 C 0 I 374 s chlSab2.chr29 3591502 2 - 24206276 ct i chlSab2.chr29 I 9 I 1 s calJac3.chr10 87764310 2 - 132174527 cc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88026558 219 - 170124641 I a score=603713.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408003 383 + 478999 ----ttttttttttttttta-agcagagtctcactct--gtgtcccaggctccagggcagtggctcgatctcggttcactaaagtcttcgcctcccgggttcaagcagttctcctgcttcagcttcttgagtagctgggattacaggtccatgccaccatgctcgagtaatttttgtatatttagtacagaaggggttttgctatgttggccaggatggttttgaactcccggcctcaaatgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctggg---acaggcatgagccacgggacccggcTGATCTCTTTTCTTTAACAACAAAAAAGTAAACCAGTGAAGAGTTATATTATGACAAGAGAAAAGAGTTTTTATCTCAGTGAAAATATAAT s ponAbe2.chr14 18938704 386 + 108868599 ----tttttttttttttttgtagtagagtctctctctctgtatctcatgctccagggcagtggctcgatctcggttcactaaagccttcacctcccaggttcaagcggttctcctgcctcagcctcttgagtagctgggattacaggcccatgcctccatgcttgagtaatttttgtatttttagtagagaaggggtttcgctatgttggccaggctggtcttgaactcctggcctcaagtgatccacccgccccggcctcccaaagtgctggg---acaggcaggagccaccacacccgAGTGATCTCACTTCTTTAACAACAAAAATGTAAACCAGTGAAGAGTTATATTATGACAAGGGAAAATAGTTTTTATCTCAGTGAAACTATAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88026777 386 - 170124641 -----ttttttttttttttgaaacagagtcttactct--gtagcccaggctccggggcagtggcttgatcttggttcgctaaagcctacgcctcccaggttcaagcagttctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcccgtgccaacatactcgagtaatttttgtatttttagtagagaaggggtttcactatgttggccaggctggtcttgaatgattggcctcaaatgatccacctcccttggtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgtgcccggcTGATCACACTTCTTTAACAACAAAAATGTAAACCAGTGAAGATTTATATTATGACAAGAGAAAATAGTTTTCATCTCTGTGAAAATATAAT i rheMac3.chr7 I 219 C 0 s macFas5.chr7 88305044 386 - 171882078 -----ttttttttttttttgaaacagagtcttactct--gtagcccaggctccggggcagtggcttgatcttggttcgctaaagcctacgcctcccaggttcaagcagttctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcccgtgccaacatactcgagtaatttttgtatttttagtagagaaggggtttcactatgttggccaggctggtcttgaatgattggcctcaaatgatccacctcccttggtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcgcccggcTGATCACACTTCTTTAACAACAAAAATGTAAACCAGTGAAGAGTTATATTATGACAAGAGAAAATAGTTTTCATCTCTGTGAAAATATAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85434329 386 - 162156779 -----ttttttttttttttgaaacagagtcttactct--gtagcccaggctccagggcagtggcttgatcttggttCGCTAAagcctacgcctcccaggttcaagcagttctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcccgtgccaaCATGCtcgagtaatttttgtatttttagtagagaaggggtttcactatgttggccaggctggtcttgaatgattggcctcaaatgatccacctcccttggtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagacgcTGCGCCCGGCTGATCACACTTctttaataacaaaaatgtaaagcaGTGAAGAGTTATATTATGACAAGAGAAAATAGTTTTCCTCTCTgtgaaaatataat i papAnu2.chr7 I 374 C 0 s chlSab2.chr29 3591505 386 - 24206276 -----ttttttttttttttaaaacagagtcttacact--gtagctcaggctccagggcagtggcttgatctcggttcgttaaagcctacgcctcccaggttcaagcagttctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcccgtgtcaacatgttcgagtaatttttgtatttttagtagagaaggagtttcactatgttggtcaggctggtcttgaatgattggcctcaaatgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcgcctggcTGATCACACTACTTTAACAACAAAAATGTAAACCGGCGAAGAGTTATATTATGACAAGAGAAAATAGTTTTAATCTCTGGGAAAATATAAT i chlSab2.chr29 I 1 I 3420 s calJac3.chr10 87764312 374 - 132174527 ttcTCTTGCTTGCtttcttgatgtggagtctcactct--gtagcc----ctcccg-------------tcttggcctactgaagacttcgcctcccaagtttaagtgattctattgcctcagcctcctgagtagctgggattataggcctgtgccaccacactcgagtaattcttgtatttttactagagaaggggtttcactatgttggccaagctggtcttggactcctggcctcaagtgatccacccacctcatcctcccaaagttttggggttacaggcatgagccatcacacctggcTGATCTCACTTCTTTAACAACAAAAATGTAAACCAGTGAAGAGTTATATTATGACAATAGAAAATAGTTTTCATCTCTGTGAAAATATAAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=18100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408386 17 + 478999 CAAATAAGAGCATCttc s ponAbe2.chr14 18939090 17 + 108868599 CAAATaaaagcatcttc i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88027163 17 - 170124641 Caaataaaagcatcttc i rheMac3.chr7 C 0 I 2590 s macFas5.chr7 88305430 17 - 171882078 Caaataaaagcatcttc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85434715 17 - 162156779 caaataaaatcaTCTTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87764686 13 - 132174527 ----Caaaagcatcgtc i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3591891 3420 - 24206276 I a score=1422.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408403 2 + 478999 ag s ponAbe2.chr14 18939107 2 + 108868599 ag i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88305447 2 - 171882078 ag i macFas5.chr7 C 0 I 2594 s papAnu2.chr7 85434732 2 - 162156779 GG i papAnu2.chr7 C 0 I 2900 s calJac3.chr10 87764699 2 - 132174527 ag i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3591891 3420 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88027180 2590 - 170124641 I a score=1911.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408405 1 + 478999 a s ponAbe2.chr14 18939109 1 + 108868599 a i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88029770 1 - 170124641 a i rheMac3.chr7 I 2590 C 0 s macFas5.chr7 88308043 1 - 171882078 a i macFas5.chr7 I 2594 C 0 s papAnu2.chr7 85437634 1 - 162156779 A i papAnu2.chr7 I 2900 C 0 s chlSab2.chr29 3595311 1 - 24206276 a i chlSab2.chr29 I 3420 C 0 s calJac3.chr10 87764701 1 - 132174527 a i calJac3.chr10 C 0 I 444 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I a score=1307897.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 408406 1022 + 478999 gctggattatactcctaaatgtagtaactagaaatataaagtatctagaagaaaacacagaataatatatttgcttacacaattggaataagcaatgatatcttaagcagcacaaaagcaggtgtaataataaaaagtgatcaaatgaacctcaaaaaattaaaaattactgctcgtcaa-gatacactatcatcaaattattaaggaaatcatacactgggaggaaaatttggtctctcttaatctccctgtttctctctgtcttcaagtaaagaaaaatcagcaaaaaatttgaacagacactccagaaaagaagatacagaagtgatcagcaagttcacgaaaagatgcacgtcattactcagcagggaaTGGTCCACAACACACGATCAA--GTGTTCAGGCAGAGCGCTCTCCCACTACTCTGAGG---------AACAGAACAAAATAGCAGAGAAGGAAAAGAGGAAGGGGTTTATCAAGTGCCCCAGGAACATATAACATACTGGAGACTAGACACGTCCATAAAAATGACTCAGTTTCCCCATTGCTTGTTAGTGCTGCCTGGTCAGTGGGCCAGATTCAT-CCATGGCACTAGGAAGGCAGTCAGTTCTCATCCCCTTCGGACGAATCTTTCTAGAAACTGATATAGCCAATTACCAATACATCCTCACCCTCACGTGCTCTCTCCTGGACTCCGGATGCTCTACCAACATGAAGAAATATATTGAGTGCCTCCAGGTGCTCAGTCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATGCAGCAGCGCTGGGAGGACTCAGCTTTCCGAGCTCCACAATTTTATGTTGGGAGCCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAATGTAGCTGCCATCAAGATGTAGTTCTTGTCTGCTGCAC----tgttttaaaggtgcccggtatttattttaatctggaatggtaagacacactgtcatggaaatgactgtcatgaaggaagaagtttttagactcacaaatccctagaaataagaggttggttaggtgagtggggaaa s ponAbe2.chr14 18939110 1025 + 108868599 gctgaattatactcctaaatgtagtaactagaaatataaagtatctagaagaaaacatagaagaatatatttgcttacaaaattggaataagtaatgatttattaagcagcataaaagcagctataatcataaaaagtgatcaagtgaacctcaaaaaattaaaaattactgctcgtcaaagatacactatcatcaaattaataaggaaatcatacactgggaggaaaattttgtctctcttaacctccctgtttctctctgtcttcaagtaaagaaaaatcagcaaaaaatgtgaacagacattccagaaaagaagatacagaagtgattagcaagttcacgaaaagatgcacatcattactcagcagggaaTGGTCCACAACACACGATCAA--GTGTTCAGGCAGAGCACGCTCCCACTACTCTGAGG---------AACAGGACAAAATAGAAGAGAAGGAAAAGAGGAAGGGGTTTATCAAGTGCCCCAAGAACATATAACATATTGGAGACTAGACACGTCCATAAAAATGACT--GTTTCCCCATTGCCTGTTATTGCTGCCTGGTCAGTGGACCAGATTCAT-CCATGGCACTAGGAAGGCAGTCAGTTCTCATCCCCATCAGAGGAATCTTTCTAGAAGCTTATATAGCCAATTACCAATACATCCTCACCATCACGTGCTCTCTCCTGGACCCCGGATGCTCTACCAACATGGAGAAATATATTGAGTGCCTCCAGGTGCTCAGTCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATACAGCAGCGCTGGGAGGACTCAGCTTTCCGAGCTCCACAATTTTATGTTGGGAGTCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAATGTAGCTGCCATCAAGATGTAGGCCTTGTCTGCTGCACCAATtgttttaaaggtgcctggtatttattttaatcgggaatggtaagacacacagccatggaaatgactgtcacgaaggaagaagtttttagactcacaaatcccTACAAATAGTAggttggttaggtgagtggggaaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88029771 1026 - 170124641 gctggattatactcctaaatgtagtaactagaaatataaagtatctagaagaaaacatagaagaatatatttgcttacaaaattagaataagtaatgatttcataagcagcataacagcagctgtaatcattaaaagtgatcaaatgaacctcaaaaaattaaaaatcactgctcatcaa-aatacactatcatcaaattaataagcaaatcatacactgggaagaaaatttggtctctcttaatctccctgtttctctctctcttcaagtaaagaaaaatcagcaaaaaatttgaacagacactccagaaaagaagatatacaagtgattagcaagttcacgaaaagatgcacatcattactcagcagggaaTGGTCCAGAACACAGGATCAA--GTGTTCAGGCAGAGCACGCTCCCACTACTCTGAGG---------AACAGGACAAAATAGCTTAGAAAGAAAAGAGGAAGAGGTTTATGAAGTGCCTAAGGAACATATAACATGTTGGAGATGAGACACTTTCATAAAAATGACTCAGTTTCCCCATTGCTTGTTAGTGCTGCCTGGTCAGTGGACCAGATTCATCCCATGGCACTAGCAAGGCCATCAGTTCTCATCCTCTTTGGAGGAATCTTTCTAGAAGCTGATATAGCCAATTACCAATACACCCTCACCCTCACTTGCTCTCTCCTGGACCCC-GATGCTGTACCAACCTGGAGAAATATGTTGAGTGCCTCTAGGTGCTCTGTCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATGCAGCAGTGCTGGGAGAACTCAGCTTTCCGAACTCCACAGTTTTATGTCGGGAACCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAATGCAGCCGCCATCAAGGCGTAGGCCTTGTCTGCTGCACCAATtgttttaaaggtgcccggtatttattttaatcaggagtggtaagacacacagtcatggaaatgactgtcatgaaggaagaagtttttagactcacaaattcctagaaacaggaggctggttaggtgagtggggaaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88308044 1026 - 171882078 gctggattatactcctaaatgtagtaactagaaatataaagtatctagaagaaaacatagaagaatatatttgcttacaaaattagaataagtaatgatttcataagcagcataacagcagctgtaatcataaaaagtgatcaaatgaacctcaaaaaattaaaaatcactgctcatcaa-aatacactatcatcaaattaataagcaaatcatacactgggaagaaaatttgGTCTCTCTTAATCTCCCTGTTTCTCTCTCTCTTCAAGTAAAGaaaaatcagcaaaaaatttgaacagacactccagaaaagaagatatacaagtgattagcaagttcacgaaaagatgcacatcattactcagcagggaaTGGTCCAGAACACAGGATCAA--GTGTTCAGGCAGAGCACGCTCCCACTACTCTGAGG---------AACAGGACAAAATAGCTTAGAAAGAAAAGAGGAAGAGGTTTATGAAGTGCCTAAGGAACATATAACATGTTGGAGATGAGACACTTTCATAAAAATGACTCAGTTTCCCCATTGCTTGTTAGTGCTGCCTGGTCAGTGGACCAGATTCATCCCATGGCACTAGCAAGGCCATCAGTTCTCATCCTCTTTGGAGGAATCTTTCTAGAAGCTGATATAGCCAATTACCAATACACCCTCACCCTCACTTGCTCTCTCCTGGACCCC-GATGCTGTACCAACCTGGAGAAATATGTTGAGTGCCTCTAGGTGCTCTGTCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATGCAGCAGTGCTGGGAGAACTCAGCTTTCCGAACTCCACAGTTTTATGTCGGGAACCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAATGCAGCCGCCATCAAGGCGTAGGCCTTGTCTGCTGCACCAATtgttttaaaggtgcccggtatttattttaatcaggaatggtaagacacacagtcatggaaatgactgtcatgaaggaagaagtttttagactcacaaattcctagaaacaggaggctggttaggtgagtggggaaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85437635 1028 - 162156779 GCTGGATTATACTCCTAAATGTAGTAACTAGAAATATAAAGtatccagaagaaaacatagaagaatatATTTGCTTACAAAATTAGAATAAGTAATGATTTCGTAAGCAGCATAACAGCAGCTGTAATCATAGAAAGTGATCAAATgaacctcaaaaaattaaaaatcactgctcatcaa-aagacactatcatcAAATTAATAAGCAAATCATACACTGGGAGGAAAATTTGGTCTCTCTTAATCTCCCTGTATCTTTCTCTCTTCAAgtaaagaaaaatcagcaaaaaatttgaacagacactccagaaaagaagatatacaagtgatTAGCAAGTTCACGAAAAGATGCACATCATTACTCAGCAGGGAATGGTCCACAACACACGATCAAGTGTGTTCAGGCAGAGCACGCTCCCACTACTCTGAGG---------AACAGGACAAAATagcttagaaagaaaagaggaagaggttTATGAAGTGCCTGAGGAACATATAACATGTTGGAGATGAGACACTTTCATAAAaatgtctcagtttccccattgcttgttagTGCTGCCTGGTCAGTGGACCAGATTCATCCCATGGCACTAGCAAGGCCGTCAGTTCTCATCCTCTTTGGAGGAATCTTTCTAGAAGCTGATATAGCCAATTACCAATACACCCTCACCCTCACTTGCTCTCTCCTGGACCCC-GATGCtgtaccaacatggagaaatatgTTGAGTGCCTCCAGGTGCTCAGTCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATGCAGCAGCGCTGGGAGAACTCAGCTTTCCGAACTCCACAGTTTTATGTCGGGAACCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAACGCAGCCGCCATCAAGGTGTAGGCTTTGTCTGCTGCACCAATTGTTTTAAAGGTGCCcgatatttattttaatcaggAGTGGTAAGACACACAGTCATGGAAATGACTGTCATGAAGGAAGAAGTTTTTAGACtcacaaattcctagaaacaggaGGCTGGTTAGGTGAGTGGGGAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3595312 1035 - 24206276 gctggattatactcctaaatgtagtaactagaaatataaagtatccagaagaaaacatagaagaatatatttgcttataaaattagaataagtcatgatttcgtaagcagcataacagcagctgtaatcatagaaagtgatcaaatgaacctcaaaaaattaaaaatcactgctcatcaa-aatacactatcatcaaattaataagcaaatcatacactgggaggaaaatttgGTCTCTCTTAATCTCCCTGTATCTTTCTCTCTTCAAGTAAAGaaaaatcagcaaaaaatttgaacagacactccagaaaagaagatatacaagtgattagcaagttcacgaaaagatgcgcatcattactcagcagggaaTGGTCCACAACACACGATCAA--GTGTTCAGGCAGAGCACGCTCCCACTACTCTGAGGAACAGGACAAACAGGACAAAATAGCTTAGAGGGAAAAGAGGAAGAGGTTTATGAAGTGCCCGAGGAACATATAACATGCTGGAGATGAGATACTTTCATAAAAATGACTCAGTTTCCCCATTGCTTGTTAGTGCTGCCTGGTCAGTGGACCAGATTCATCCCATGGCACTAGCAAGGCTGTCAGTTCTCATCCTCTTTGGAGGAATCTTTCTAGAAGCTGATATAGCCAATTACCAATACACCCTCACCCTCACTTGCTCTCTCCTGGACCCT-GATGCTGTACCAACATGGAGAAATATGTTGAGTGCCTCCAGGTGCTCCATCCCAGGCACTTGACACTCTAGACTATGCAGCAGCGCTGGGAGAACTCAGCTTTCCGAACTCCACAGTTTTATGTCGGGAAGCTGTGGCAACTACTGACAAAAACAATGCAGCCGCCATCAAGGTGTAGGCCTTGTCTGCTGCACCAATtgttttaaaggtgcccggtatttattttaatcaggaatggtaagacacacagtcatggaaatgactgtcattaaggaagaagtttttagactcataaattcctagaaacagcaggctggttaggtgagtggggaaa i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e calJac3.chr10 87764702 444 - 132174527 I a score=2607729.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 409428 1462 + 478999 tgagaaaaatgtgggtaagagcctttatcatggtttctctggaaataaatggatggggcaggataagcaggtttaggattggctagattgaataattccagtgggctctggaggataggggctgtctctaagtgtctggcacttggccctggggtgattagggaaggcaaatagtggcctggagtgtaatagcgctataggtgcctgataaaagaagtggctggagtgtggtttctagattggttgcaagtgaggcttttaccatctctaggaattggctagccataagagggatagttcctccagtgttaggaaggcacaagacatcaaagcattagaaatgcagaaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacaccaaatgttggtgaattaattgttggagtaacttgaactctcatacattgatgttgggaatttacaatggctaaccactctgaaaaacttaatagaaacttcaggtaatttcaggtagatgtaaacaaacagctaccttatgacctgataatcccattcgtgtttagctaagacatgtctatgaaatgatttaaattcgcatgctaatgaaaaccttattggtggcctaagatttgaaacaacccaaatgtccataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatataatgaaacattagtccgcagtaaaaagaaacaactacagaaaatgcaacaatacgcatgaatctctaaatcgtaatgctgagtttaaaagccagatacaaaataacacatgtcatatgcttctgtttttataaaatccaagaaaaggtaaaactaatctatgctattaggaattaaaagatgaaagctcattatgatgttagatggtgggggtggatggcaaagatcacaagaaacctttctggagtgacggaaatattctttatcttgtttagaatactagtttctaaagtgcatatatttaacac--aagttactacgttgaacacttaaatgtgtgtattttaatgtatatacattgtattctaagaaaTACAACCAAGAATTTATTTTCatgcttgcttgtaaatacagataaatttcttgaaggatacaaaaattaatattagcttccagttttgaggtatggggtgaaatggacatataggggacagatataagaaggaaatttctcactgtatgaattatttttttatttaaaaatgtaaatatattacctattcaaaaattaaataCATTTTTTAAGTCAAGTATATTTAAAGTACACTGCCTAATTTCCAACCTTATGGTAATGCCATTAAAAATTCTGAGTTATtcttgcttccatacctctcatatgcagtccttcaataagtcccattga-ttatctctccaaagtttatctttggtataaat----tcttctgtcttcttttttacctcttatcctaacctaccaacatctcttatttatat s panTro4.chr14 18733523 1463 + 106544938 TGAGTaaaatgtgggtaagagcctttatcatagtttctgtggaaataaatggatggggcaggataagcaggtttaggattggctagattgaataattccagtgggctccggaggataggggctgtctctaagtgtctggcacttggccctggggtgattaaggaaggcaaatagtggcctggagtgtaatagcgctataggtgcctgataaaagaagtggctggagtatgggttctggattggttgcaagtgaggcttttaccatctctaggaattggctagccataggagggacagttcttccagtgttaggaaggcacaagatattaaagtattagaaatgcagaaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacaccaaatgttggtgaattaattgttggagtaacttgaactctcatacattgatgttgggaatttacaatggctaaccactctgaaaaacttaatagaaacttcaggtaatttcaggtagatgtaaacaaacagctaccttatgacctgataatcccactcgtgtttagccaagacatgtctatgaaatgatttaaattagcatgctaatgaaaaccttattggtggcctaagatttgaaataacccaaatgtccataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatataatgaaacattagtccgcagtaaaaagaaacaactacagaaaatgcaacaacgcacatgaatctctaaatcataatgctgagtttaaaagccagatacaaaataacacat--catatacttctgtttttataaaatccaagaaaaggcaaaactaatctatgttattaggaattagaagatgaaagctcattaaggtgatagatgggtggggtggatggcaaagatcacaagaaacctttctggagtgatggaaatattctttatcttgtttggaatagtagtttctaaagtgcatatatttaagag--aagttaccaagttggacacttagatatgtgtattctaatgtatataaattatattctaagaaaTAAAACCAAGAATTTATTTTCatgcttgcttgtaaatgcacataaatttcttgaaggacacaaaaattaatattagcttccaattttgaggtatggggtgaaatgggcatataggggacagatataagaaggaaatttctcactgtatgaattatttttt-atttaaaaatgtgaatatgttacctattaaaaaatttaataCATTTTTAAAGTCAAGTATGTTTAAAGCACACTGCCTAATTTCCAACCTTATGGCTATACCATTAAAAATTCTGAGTTATGcttgcttccacacctctcatatgcagtccttcaataagtcccattaa-ttatgtctccaaaggttctctttggtataaatactttcttctgtcttcttttttacctcttaacctaacctaccatcatctgttatttatat i panTro4.chr14 N 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18940135 1464 + 108868599 tgggaaaaatgcaggtaagaacctttatcatggtttctgtggaaataaatggatggggcacgatcagcatgttcagaattggctagactgaataattccagtgggctccggaggttaggggctgtctctaagtgtctggtacttggccctggggtgattagggaagggaaatagtggcctggagtgtaatagctctataggtgcctgataaaagaagtggctggagtataggttctggatcggttgcaagtgaggcttttaccatctctaggaattggctagccataggagggacagttcctccagtgttaggaaggcacaagacatcaaagcgttagaaatgcagaaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacagcaaatgctggtgaattaattgttggagtaacttgaactctcatacattgatgttgggaatttacaatggctaaccactctgaaaaacttaatagaaacttcaggtaatttcaggtagatgtaaacaaacagctaccttatgacctgataatcccactcgtgtttagccaagacatgtctatgaaatgatttaaattagcatgttaatgaaaaccttattggtggcataagatttgagacaacccaaatgtccataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatataatgaaacattagtccacagtaaaaagagacaactacagaaaatgcaacaacgcacatgaatctctaaatcacaatgctgagtttaaaa-ccagatacaaaataacacatgtcatatacttctgtttttataaaatccaagaaaaggcaaaactaatctatgctattaggaattagaagatgaaagctcattaagatgatagatgggtggggtggatggcaaagatcacaagaaacctttctggagggatggaaatattcttcatcttgtttggaatactagtttctaaagtgcatctatttaacag--aagttaccaagttgaacacttaaatatgtgtattttaatgtatatacattatattctaagaaaTACAACCAAGAATTTATTTTCATGCTTGCTTGTAAATACACATAAATTTCTTGAAGGATACAAAAATTAATATTAGCTTCCAATTTTGAGGTATGGGGTGAAATGGGCAGGTAAGGGACAGATATAAGAAGGAAATTTCTCACTGTATGtattatttttt-atttaaaaatGTGAATATGTTAGGTATTCAAAAATTAAATACATTTTTAAAGTCAAGTATGTTTAAAGCACACTGCCTAATTTCCAACCTTATGGTTATGCCATTAAAATTTCTGAGTTActcttgcttccatacctctcatatgcagtccttcaataagtcccattca-tcatctctccaaagtttatctttggtataaattctttcttctgtcttcttttttacctcttatcctaacctaccatcatctcttatttatat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88030797 1457 - 170124641 tgggaaaaacttgggtaagagcctttatcatggtttctgtggaaagaaatagatgggacaggataagcgggtttaggattggctaaattgaataattccagtgggctctggaggataggcactgtctctaagtg--tgttacttggccctggggtgattagggaagggaaatagtggcctggagtgtaatagctctatgggcacctgataaaagaagtagctggagtatgggttctggattggttgcaagtgagacttttacaatctctaggaattggctagccataggagggacagttccttcagtgttaggaaggcacaaggt--------attagaaatgcaggaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacaccaaatattgatgaattaattggtggagtaactcgaactctcatacattgatattgggaatttacaatgactaaccactctgaaaaactgaatagaaacttcaggtaatttcaggtagatgtaaacaaacagctaccttatgaccggacaatcccatttgtgtttagccaagacatgtctatgaaatgatttaaattggcatgttaatgaaaaccttattgatggcctaagatttgaaacaacccaaatgtcgataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatatagtgaaacattagtcagcagtaaaaaggaacaactacagaaaatgcaacaacacacatgcatctctaaatcataatgctgggtttaaaagccagatacaaaatagcacaggtcatatacttctgtttttataaaatcctagaaaaggcaaaactaatctatgctattaggaattagaagatgaaagctcattatgatgatagatgggtggggtggatgtcaaagatcacaagaaacctttctggagtgatggaaatattctttatcttgtttggaatagtagtttctaaagtgcatatatttaacagaaaagttaccaagttgaacacttagatatgtgtattttaatgtatgtaaattatattctaagaaaTACAACCAAGAATTTATTTTCatgcttgcttgtaaatacacgtcaatttcttgaaggacacaaaaattaatattagcttccaattttgaggtatggggtgaaatgggcatataggggacagatataagaaggaaatttctcaccatatgtattatttttt-gtttaaaaatgtggatatattacctattcaaaaattaaataCATTTTTAAAGTCAAGTATGTTTAAAGCACACCTCCTGATTTCCAACCTTATGGTAATGCCATTAAAAATTCTGAGTTATtcttgcttccatacctctcatatgcagtccttcaataagtcccattga-ttatctctccaaagtttatctttggtataaattctttcttctgtcttcttttttacctcttaacctaacctaccatcatctcttatttatat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88309070 1457 - 171882078 tgggaaaaacttgggtaagagcctttatcatggtttctgtggaaagaaatagatgggacaggataagcgggtttaggattggctaaattgaataattccagtgggctctggaggataggcactgtctctaagtg--tgttacttggccctggggtgattagggaagggaaatagtggcctggagtgtaatagctctatgggcacctgataaaagaagtagctggagtatgggttctggattggttgcaagtgaggcttttaccatctctaggaattggctagccataggagggacagttccttcagtgttaggaaggcacaaggt--------attagaaatgcaggaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacaccaaatattgatgaattaattggtggagtaactcgaactctcatacattgatgttgggaatttacaatgactaaccactctgaaaaactgaatagaaacttcaggtaatttcaggtagatgtaaacaaacagctaccttatgaccggacaatcccatttgtgtttagccaagacatgtctatgaaatgatttaaattggcatgttaatgaaaaccttattgatggcctaagatttgaaacaacccaaatgtcgataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatatagtgaaacattagtcagcagtaaaaaggaacaactacagaaaatgcaacaacacacatgcatctctaaatcataatgctgggtttaaaagccagatacaaaatagcacaggtcatatacttctgtttttataaaatcctagaaaaggcaaaactaatctatgctattaggaattagaagatgaaagctcattatgatgatagatgggtggggtggatgtcaaagatcacaagaaacctttctggagtgatggaaatattctttatcttgtttggaatagtagtttctaaagtgcatatatttaacagaaaagttaccaagttgaacacttagatatgtgtattttaatgtatgtaaattatattctaagaaaTACAACCAAGAATTTATTTTCatgcttgcttgtaaatacacgtcaatttcttgaaggacacaaaaattaatattagcttccaattttgaggtatggggtgaaatgggcatataggggacagatataagaaggaaatttctcaccatatgtattatttttt-gtttaaaaatgtgaatatattacctattcaaaaattaaataCATTTTTAAAGTCAAGTATGTTTAAAGCACACCTCCTGATTTCCAACCTTATGGTAATGCCATTAAAAATTCTGAGTTATtcttgcttccatacctctcatatgcagtccttcaataagtcccattga-ttatctctccaaagtttatctttggtataaattctttcttctgtcttcttttttaccacttaacctaacctaccatcatctcttatttatat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85438663 1465 - 162156779 TGGGAAAAACTTGGGTAAGAGCCTTTATCATGGTTTCTGTGGAAAGAAATGGATGGGGCAGGATAAGCGGGTTTAGGATTGGTTAGATTGAATAATTCCAGTTGGCTCTGGAGGATAGTCACTGTCTCTAAGTG--TGTTACTTGGCCCTGGGGTGATTAGGGAAGGGAAATAGTGGCCTGGAGTGTAATAGCTCTATGGGTACCTGATAAAAGAAGTAGCTGGAGTATGGGTTCTGGATAGGTTGCAAGTGAGGCTTTTACCATCTCTAGGGATTGACTAGCCATAGGAGGGACAGCTCCTTCAGTGTTAGGAAGGCACAAGGTATTAAAgcattagaaatgcagaaaatataaTGGCATAAGTAAAACACAACACCAAATATTGATGAATTAATTGGTGGAGTAACTTCAACTCTCATACATTGATGTTGGGAATTTACAATGACTAACCACTCTGAAAAACTGAATAGAAACTTCAGGTAATTTCAGGTAGATGTAAACAAACAGCTGCCTTATGACCGGACAATCCCATTTGTGTTTAGCCAAGACATGTCTATGAAATGATTTAAATTAGCATGTTAATGAAAACCTTATTGGTGGCCTAAGatttgaaacaacccaaatgtcgataaaaggataaaatgataataaacaaaCCTAGGGTTAAGTATATAGTAAAACATTAgtcagcagtaaaaaggaacaaCTACAGAAAATGCAACAACACACGTGCATCTCTAAATCATAATGCTGGGTTTAAAAGCCAGATACAAAATAGCACAGGGCATATacttctgtttttataaaatcctagaaaaggcaaaactaatctatgctATTAGGAATTAGAAGATGAAAGCTCATTATGATGATAGATGGGTGGGGTGGATGTCAAAGATCACAAGAAACCTTTCtggagtgatggaaatattctttgTCTTGTTTGGAATAGTAGTTTCTAAAGTGCATATATTTAACAGAAAAGTTACCAAGTTGAACACTTAGATATgtgtattttaatgtatataaattatattctaagaaatacaaccaagaatttattttcatgcttgcttgtaaatacatgtaaatttCTTGAAGGACACAAAAATTAATATTAGCTTCCAATTTTGAGGTATGGGGTGAAATGGGCATATAGGGGACAGATATAAGAAGGAAATTTCTCACcgtatgaattatttttt-atttaaaaatgtgaatatattacctattcaaaaattaaatacatttttaaagtcaaGTATGTTTAAAGCACACCTCCTGATTTCCAACCTTATGGTAATGCCATTAAAAATTCTGAGTTATTCTTGCTTCCATACCTCTCATATGCAGTCCTTCAATAAGTCCCATTGA-TTCTCTCTCCAAAGTTTATCTTTGGtataaattctttcttctgtcttcttttttaccTCTTAACCTAACCTACCATCATCtcttatttatat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3596347 1464 - 24206276 tgggaaaaacttgggtaagagcctttatcatggtttctgtggaaagaaatagatgggacaggataagcgggtttaggattggctaaattgaataattccagtgggctctggaggataggcactgtctctaagtg--tgttacttggccctggggtgattagggaagggaaatagtggcctggagtgtaatagctctatggacacctgataaaagaagtagctggagtatgggttctggactggttgcaagtgaggcttttaccatgtctagggattggctagccataggagggacagttccttcagtgttaggaaggcacaaggtattaaagcattagaaatgcagaaaataTAATGGCATAAGTAAAACacaacaccaaatgttgatgaattaattggtggagtaacttgaactctcatacattgatgttgggaatttacaatgactaaccactctgaaaaactgaatagaaacttcaggtaatttcaggtaaatgtaaacaaacagctaccttatgactggacaatcccatttgtgtttagccaagacatgtctatgaaatgatttaaattggcatgttaatgaaaaccttattgatggcctaagatttgaaaaaacctaaatgtcgataaaaggataaaatgataataaacaaacttagggttaagtatatagtgaaacattcgtcagcagtaaaaaggaacaactacagaaaatgcaacaacacacatgaatttctaaatcataatgctgggtttaaaagccagatacaaaatagcacaggtcatatacttctgtttttataaaatcctagaaaaggcaaaactaatctatgctattaggaattagaagatgaaagctcattatgatgatagatgggtggggtggatgtcaaagatcacaagaaaccttactggagtgatggaaatattctttatcttgtttggaatagtagtttctaaagtacatatatttaacagaaaagttaccaagttgaacacttagatatgtgtattttaatgtatataaattatattctaagaaaTACAACCAAGAATTTATTTTCatgcttgcttgtaaacgca--tcaatttcttgaaggacacaaaaattaatattagcttccaattttgaggtatggggtgaaatgggcatatagggaacagatataagaaggaaatttctcactgtatgaattatttttt-atttaaaaatgtgaatatattacctactcaaaaattaaataCATTTTTAAAGTCAAGTATGTTTAAAGCACACCTCCTGATTTCCAACCTTATGGTAATGCCATTAAAAATTCTGAGTTATTCTTGCTTCCATAACTCTCATACGCAGTCCTTCAATAAGTCCCATTGATTTATCTCTCCAAAGTTTATCTTTGGTATAAATTCTTTCTTCTGTCTTCTTTTTTACCTCTTAACCTAACCTACCATCATCTGTTATTTATAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e calJac3.chr10 87764702 444 - 132174527 I a score=720507.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 410890 565 + 478999 taatagttcttcaaatgctccctactgttccccttgcctccacttcttgcattttatagcccgtttttcacttagtacctggcacaacattttaaacatgtaaatcaggtaggaacactcctctgcctgttacatctcacacatagtatgttgaccgattgccatttggcccatatcggctctacctctctatcttcccttacaattttttccatttgctcactactgtcttgccacactagcctcctttctgcttctcaatgcaccagtctctcccttaatgagctttcaacaagtctatcttcagatcttcccagagacggtgtagttctgtcattcagatcttagttgaaatgttgccaccttgtcagaaaggccctccctggccagctcacttggaatagtagtctcttccgctttctcttatatttttatcatagtgctcattacaatcagttgttttctctctggtatgtttgtttgttgtctgtttccatgctttaggatgtaaaatccccaggaacagggatatttt-ctgtcttgttcggtgctgcattgcagacac s panTro4.chr14 18734986 566 + 106544938 gaatagtacttcaaatgcctcctactgttccccttgcctccacttcttgcattctatagcccgtttttcactcagtagccagcacaacattttaaacatgtaaatcagataggaacactcctctgcctgttacatctcacacatagtatgttgaccgattgccatttggcctatatcagttctacctctctaatttcccttacacttttttccatttgctcactactgtcttgccacactagactcctttctgcttctcaatgcactagtctcttccttcatgagctttcaacaagtctatcttcagatcttcacagagatggtgtagttttgtcattcagatcttagctgaaatgttgtcaccttgtcagaaaggccctccctggccagctcacttggaatagtagtctcttcccctatctcttacacttttatcatagcactcattacaatcagttgttttctctcgggtgtgtttgtctgttgtctgtttccatgcattaggatgtaaaatccccaggaacagggacatttttctgtcttgttcggtgctgcattgtagacac i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18941599 565 + 108868599 taatagtacttcaaatgctccctactgttccccttgcctccacttcttgcattctatagcccgtttttcactcagtagccagcgcaacattttaaacatgtaaatcagataggaacactcctctgcctgttacctcgcacacatagtatgttgaccgattgccatttggcctatatcagctctacctctctatcttccctaacaattttttccatttgctcactactgtcttgccacgctagcctcctttctgcttctcaatgcaccagtctctcccttcatgagctttcaacaaatctatcttcagatcttcccagagacggtgtagttctgtcattcagatcttaactgaaatgttgtcaccttgtcagaaaggccttctctggccagctcacttggaatagtagtctattctgctatctcttatatttttatcatagcactcattacaatcagttgttttctctctggtatgtttgttcgttgtctgtttccatgctttaggatgtaaaatccccaggaacagggatatttt-ctgtcttgttcggtgctgcattgtagacac i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88032254 560 - 170124641 taatagtacttcagatgctccctcctgttccccttgcctccacttcttgcattctgtagcccgtttttcactcagtagccggcataacgttttaaacatgtaaatcagataggaacactcctctgcctgttacatctcacacatagtatgttaactgattgccacttggcctatatcggctctacctctctatcttcccttacacttttttccatttgctcactactgtcttgccacactagcctcctttctgcttctcaatgcaccagtctctcccttcatgagctttcaacaagtctatct-----tcttcacagagatggtgtagttttgtcattcagatcttagttgaaatgttgtcaccttgtcagaaaggccctccctggctagctcacttggaatagtagtctcttcccccatctcttgtatttttagcatagcactcattacaatcagttgttttctctctggtatgtttgtttattgtctgtttccatgcattaggatgtaaaatccccaggaacagggacacttt-ctgtcttgtttggtgctgcattgcagacag i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88310527 560 - 171882078 taatagtacttcagatgctccctcctgttccccttgcctccacctcttgcattctgtagcccgtttttcactcagtagccggcataacgttttaaacatgtaaatcagataggaacactcctctgcctgttacatctcacacatagtattttaactgattgccacttggcctatatcggctctacctctctatcttcccttacacttttttccatttgctcactactgtcttgccacactagcctcctttctgcttctcaatgcaccagtctctcccttcatgagctttcaacaagtctatct-----tcttcacagagatggtgtagttttgtcattcagatcttagttgaaatgttgtcaccttgtcagaaaggccctccctggctagctcacttggaatagtagtctcttcccccatctcttgtatttttagcatagcactcattacaatcagttgttttctctctggtatgtttgtttattgtctgtttccatgcattaggatgtaaaatccccaggaacagggacacttt-ctgtcttgtttggtgctgcattgcagaaag i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85440128 560 - 162156779 taatagtaCTTCAGATGCTCCCTACTGTTCCCCTTGCCTCCACCTCTTGCATTCTGTAGCCCGTTTTTCACTCAGTAGCCGGCATAACGTTTTAAACATGTAAATCAGATAGGAACACTCCTCTGCCTGTTACATCTCACACATAGTATGTTGACTGATTGCCACTTGGCCTATATCAGCTCTACCTCTCTATCTTCCCTTACACTTTTTTCCATTTGCTCACTACTGTCTTGCCACACTAGCCTCCTTTCTGCTTCTCAATGCACCAGTCTCTCCCTTCATGAGCTTTGAACAAGTCTATCT-----TCTTCACAGAGATGGTGTAGTTTTGTCATTCAGATCTTAGTTGAAATGTTGTCACCTTGTCAGAAAGGCCCTCCCTGGCTAGCTTACTTGGAATAGTAGTCTCTTCCCCCATCTCTTGTATTTTTAGCATAGCACTCATTACAATCAGTTGTTTTCTCTCTGGTatgtttgtttattgtctgtttccaGGCATTAGGATGTAAAATCCCCAGGAACAGGGACACTTT-CTGTCTTGTGTGGTGCTGCATTGCAGACAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3597811 0 - 24206276 C e calJac3.chr10 87764702 444 - 132174527 I a score=900689.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 411455 526 + 478999 tacaatacagcctggtacatggtTTTAGTTTCTAAGATAGTCTAGGGAGACAAATCTTTCCTAGCAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATTAGACTATCTTCACTTTAAGTATTGTGGAAAACATTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTACAATTATGAAAAAATCATATTTTAAAAAATCTTTGGTAGCAAGAAAGACTATAATATACTCAAAAATGGGAATGTTTTTCCATGT--GtttctttacttatatcacttcttttctgtttcttttAAGAAAGTAAACACTACACTTTTTAGTTTATTTGGTGTATATAGTTTTACAAAATATGAATTTTTGTGCCT----GGC--TTTTTATTTCCTATTATTCCATTACTGTCTTTGCATTTGTTCCTGTTCTTGCATTTCTCCCCCCCG---GTTTTTTTACCTTTATGATTTTGTGTATCTCTTTCTCCCTTTTTCTCTTTTCCCCATGTTCCATTTTTCCCACTTA-TTATTTTCTGAATTGGACA s panTro4.chr14 18735552 528 + 106544938 tacaatacagcttggttcatggtTTTAGCTTCTAAGATAGTCTAGGGAGACAAATCTTTCCTAGCAGGAATAACAAGCCTCCATTCTGAGGATTAATTTAGATCATCAGACTACCTTCATTTTAAGTATTGTGGAAAACATTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTATGAAAAAATCGTATTTTAAAAAGTCTTTGGTAGCAAGAAAGACTGTAATATACTCTAAGATGGGAATGTTTTTCCACATACGTTTCTTTACTTATATCACTTGTTTTCTGTTTCTTTTAAGAAAGTAAACACTGTGTTTTTTAGTTTATTTGGTACATACAGTTTTGCAAAATATGCATTTTCATGCCtctttgtc--tcttcatttcctattattccattactgtctttgcatttgttcttattcttgcatttctcccccctc----tttttttacctttatgattttgtgtatctctttctctctctttctcttttccccattttccatttttcccacttc-tt---ttctGAATTGGACA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18942164 533 + 108868599 tacaatacagcctggttcatggtTTTAGCTTCTAAGATAGTCTAGGGAGACAAATCTTTCCTAGCAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATCAGACTATCTGCATTTTAAGTATTGTGGAAAACATTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTATGAAAAAATCATATTTCAAAAAGTCTTCGGTAGCAAGAAAGACTGTAATATACTCAAAGACGGGAATGTTTTTCCATGT--GTTTCTTTACTTATATCACTTGTTTTCTGTTTCTTTTAAGAAAGTAAACACTGCATTTATTAGTTTATTTGGT--ATATAGTTTTGCAAAATATGCATTTTTGTGCCTCTCTGTCTTTTTTTATTTCCTGTTATTCCATTACTGTCTTTGCATATGTTCCTGTTCTTGCATTCCTCCCGCCCATTTTTTTTTTTACCTTTATGATTTTGTGTATCTCTTTCTCCCTTTTTCTTTTTTCCCCATGTTCCATTTTTCCCACTTA-TTATTTTCTGAATTGGACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88032814 527 - 170124641 tacgatacaacctggttcatggtTTTAGCTTCTAAGATAGTCTAAAGAGACAGATCTTTCCTGGTAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATCGGGCTACCTTCATTTTAAGTATTGTGGAAAACACTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTATGAAAAAATCATATTTTAAAAAGTCTTTGGC-TCAAGAAAGACTATAATATACTCTAAAATGGGAATGTTTTCCCAC----GTTTCTTTACTTATATCACTTGTTTTCTGTTTCTTTTAAGAAAGTAAACACTGTGTTTTTTAGTTTATTTGGTACATATAATTTTGCAAAATATGCATTTTTGTGCCTCTCTGTC--TTTTTAGTTCCTATTATTCCATTACTCTCTTTGCATTTATTCCTGTTGTTGCATTTCTCCCCACCC----TTTTTTGACCTTTATGATTTTGTGTATCTCTTTCTCCCTTTTTCTCTTTTTCCCATTTTCCATTTTTCCCACTTATTTTTTTTCTGAATTGGACA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88311087 525 - 171882078 tacgatacaacctggttcatggtTTTAGCTTCTAAGATAGTCT--AGAGACAGGTCTTTCCTGGTAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATCGGGCTACCTTCATTTTAAGTATTGTGGAAAACACTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTATGAAAAAATCATATTTTAAAAAGTCTTTGGC-TCAAGAAAGACTGTAATATACTCTAAAATGGGAATGTTTTCCCAC----GTTTCTTTACTTATATCACTTGTTTTCTGTTTCTTTTAAGAAAGTAAACACTGTGTTTTTTAGTTTATTTGGTACATATAATTTTGCAAAATATGCATTTTTGTGCCTCTCTGTC--TTTTTAGTTCCTATTATTCCATTACTCTCTTTGCATTTATTCCTGTTGTTGCATTTCTCCCCACCC----TTTTTTGACCTTTATGATTTTGTGTATCTCTTTCTCCCTTTTTCTCTTTTTCCCATTTTCCATTTTTCCCACTTATTTTTTTTCTGAATTGGACA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85440688 527 - 162156779 TACGATACAACCTGGTTCATGGTTTTAGCTTCTAAGATAGTCTAGGGAGACAGATCTTTCCTGGTAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATCGGGCTACCTTCATTTTAAGTACTGTGGAAAACACTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTatgaaaaaatcatattttaaaaagtctttggc-CTAAGAAAGACTGTAATATACTCTAAAATGGGAATGTTTTCCCAC----GTTTCTTTACTTATAtcacttgttttctgtttcttttaagaaagtaaacactgtgttttttagtttatttggtacatataattttgcaaaatatgcatttttgtGCCTCTCTGTC--TTTTTAGTTCCTATTATTCCATTACTGTCTTTGCATTTATTCCTGTTCTTGCAtttctccccaccc----ttttttgacctttatgattttgtgtatctctttctccctttttctctttttcccattttccatttttcccacttattttttttctgaattggaCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3597811 528 - 24206276 TACGATACAACCTGGTTCATGGTTTTAGCTTCTAAGATAGTCTAGGGAGACAAATCTTTCCTGGTAGGAATAACAAGCCTTCATTCTAAGGATTAATTTAGATCATCGGGCTACCTTCATTTTAAGTACTGTGGAAAACACTAGGAAGCAAAGTCCCTAATTATGTCTATAATTATGAAAAAATCATATTTTAAAAAGTCTTTGGC-TCAAGAAAGACTGTAATATACTCTAAGATGGGAATGTTTTCCCACAT--GTTTCTTTACTTACATTACTTGTTTTCTGTTTCTTTTAAGAAAGTAAACACTGTGTTTTTTAGTTTATTTGGTACATATAATTTTGCAAAATATGCATTTTTGTGCCTCTCTGTC--TTTTTATTTCCTATTATTTCATTACTGTCTTTGCATTTATTCCTGTTCTTGCATTTCTCCCCACCC----TTTTTCAACCTTTATGATTTTGTGTATCTCTTTCTCCCTTTTTCTCTTTTTCCCATTTTCCATTTTTCCCACTTA-TTATTTTCTGAATTGGACA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e canFam3.chr15 46890712 47852 - 64190966 I e calJac3.chr10 87764702 444 - 132174527 I a score=279764.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 411981 148 + 478999 TAAATTAGAACAAAATATTATTGATTATGCATTATATTTGTTGAAAAA-------CTGTTTAGTATATTAATTTTTAAAATAA----AAAATCT-----TTTTAAAATAAAAATAAATCTACTGAAATTT-AATTATATTGTGTTCTACTATGTGATTCTTAATT s panTro4.chr14 18736080 147 + 106544938 TAAGTTAGAACAAAATATTTTTGAATATGCATTATATTTGTTGAAAAA-------TTGTTTAGtattttaatttttaaaataa----aaaatct-----ttttaaa-taaaaataaatCTACTGAAATTT-AACTATATTTTGTTCTACTATATGATTCTTAATT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18942697 147 + 108868599 TAAATTAGAACAAAATATTTTTGATTATGCATTATGTTTGTTGAAAAA-------TTGTTTAGtattttaatttttagaataa----aaaatct-----tttgaaa-taaaaataaatCTACTGAAATGT-AATTATATTGTGTTCTACTCTAGGATTATTAATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88033341 148 - 170124641 TAAATTAGGACAAAACATTTTTGATTATGCATTATATTTGTTGAAAAA-------TTGTTTAGTGttttaatttttaaaataa---gaaaatct-----ttttaaa-taaaaataaatCTACTGAAATTT-AATTATATTGTGTTCTACCATATGATTCTTAAGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88311612 148 - 171882078 TAAATTAGGACAAAACATTTTTGATTATGCATTATATTTGTTGAAAAA-------TTGTTTAGTGTTTTAATTTTTAAAACAA---GAAAATCT-----TTttaaa-taaaaataaatctactgaaattt-aattatattGTGTTCTACTATATGATTCTTAAGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85441215 148 - 162156779 TAAATTAGGACAAAACATTTTTGATTATGCattatatttgttgaaaaa-------ttgtttagtgttttaatttttaaaataa---gaaaatct-----ttttaaa-taaaaataaatctactgaaattt-aattaTATTGTGTTCTACTATATGATTCTGAATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3598339 143 - 24206276 TAAATTAGGACAAAATATTTTCGATTATGCATTATATTTGTTGAAAAC-------TTATTTAGTGTTTTAATTTttaaaataa---aaaaatc------ttttaaa-taaaaataaatctactgaaattt-aattatattGTGTTCTACTACATGATTCT----T i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46938564 161 - 64190966 tatatGAGAATGAAATGTCTTTTATTATGTACTGTATTCTTTAACAAAACATTTTATGTCTAGtattttaatttttaaaatattttGAAATTCTTTCTCTTTAAAA-CAAAATCAGATCTACTAAAATTTAAATTATGTTGCCTTCTAC---ATGATTCTTAATT i canFam3.chr15 I 47852 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I e calJac3.chr10 87764702 444 - 132174527 I a score=949749.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 412129 423 + 478999 ACTTTTCTTCTGTCTAGTAATATTTA-CTT---AAAAAAATAG-TT----GTCTTTGCTTTAGTGGAACATAGGAGACACTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAAGGCCAAGACCACAATAGGGTGTATTTAAGAATACATCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAATATGCAGTTCTCGTCTCCAAGAAGGATTATGCCAAAGAGTCTTTGTGAACATCATTTATTTT-TCTTTGCCTATTTCTTTGTCATCAGAAAT-ATGTTGAATTTACCA----TACTACCTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCTTTTCTTGATCTATCAATGATTTCCTATTA--TACACTTTTT-----TAAAAAAAAAAAGTAACGTAAGAAATAAAATAACCTCTTTTGGCTTT-CTGCCCACATGGACCTAGTAAACATGCTGACTATTCTGTAATATGT s panTro4.chr14 18736227 423 + 106544938 ACTTTTCTTCTGTTTAGTAATATTTAGCTT---AAAAACATAG-TT----GATATTGCTTTAGTGGAACATAGGAGACACTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAAGGCCAAGACCACAATAGGGTGTATTTAAGAATACATCCCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAACATGCATTTCTCCTCTCCAAGAAGGATTATGCCAAAGAGTCTTTGTGAACATCATTTATTTT-TCTTTGCCTGTTTCTTTGTCACCAGAAAG-ATACTGAATTTAACA----TACTACCTACTCTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGTTATATCAGTGATTTCCtatta--tatatttttt-----taaaaaaata--GTAACGTAAGAAATAAAATAACCTCTTTCGGCTTT-CTGCCTACATGGACCTAATAAACATGCTGGCTATTCTGTAATGTCT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18942844 423 + 108868599 ACTTTTCTTCTGTTTAGTAATATTTAGCTT--AAAAAACATAG-TT----GTCATTGCTTTAGTGGAACATAGGAAACATTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAATGCCAAGACCACAATAAGATGTATTTAAGAATACATCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAACATGCAGTTCTCCTCTCCAAGAAGGATTATGCCAAAGAGTCTTTGTGAACATCGTTTATTTT-TCTTTGACTGTTTCTTTGTCACCAGAAAG-ATACTGAATTTAACA----TACTACTTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATCTATCAATGATTTCCTATTA--TATACTTTTA-----AAAAAAAATA--GTAACATAAGAAATAAAATAACCTCTTTCGGCTTT-CTGCCCACATGGACCTAATAAACATGTTGGCTATTCTGTAATCTCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88033489 419 - 170124641 ACTTTTCTTCTGTTTAGtaatattta-att---aaaaaaataGTTT----GTCAATGC-TTAGTGGAACATAGGAGACACTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAATGCCAAGACCACAACAGGGTGTATTTAAGAGTACCTCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAAAGTGCAGTTCTCTTCTCCAAGAAGGATTATTCCCAAGAGTCTTTGTGAACATCATTTAGTTT-TCTTTGCCTGTTTCTTTGTCACCACAAAT-ATATTGAATTTAATA----TACTACCTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATATAGCAATGATTTCCTATTA--TATACTTTT-------AAAAAAATA--GTAATGTAAGAAATAAAATAACCTCTTTTGGCTTT-CTGCCCACATGGACCTAATAAACATGCTGGCTATTCTGTAATCTCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88311760 418 - 171882078 ACTTTTCTTCTGTTTAGTAATATTTA-ATT---AAAAAAATAG-TT----GTCAATGC-TTAGTGGAACATAGGAGACACTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAATGCCAAGACCACAACAGGGTGTATTTAAGAGTACCTCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAAAGTGCAGTTCTCTTCTCCAAGAAGGATTATTCCCAAGAGTCTTTGTGAACATCATTTAGTTT-TCTTTGCCTGTTTCTTTGTCACCACAAAT-ATATTGAATTTAATA----TACTACCTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATATAGCAATGATTTCCTATTA--TATACTTTA-------AAAAAAATA--GTAATGTAAGAAATAAAATAACCTCTTTTGGCTTT-CTGCCCACATGGACCTAATAAACATGCTGGCTATTCTGTAATCTCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85441363 421 - 162156779 ACTTTTCTTCTGTTtagtaatattta-att--aaaaaaaatag-tt----gtcaTTGCTTTAGTGGAACATGAGAGACACTTATtcctaaaatgaaaacaacaaatgcCAAGACCACAATAGGGTGTATTTAAGAGTACCTCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTTCAAAGTGCAGTTCTCTTCTCCAAGAAGGATTATGCCAAAGAGTCTTTGTGAACATCATCTAGTTT-TCTTTGCCTGTTTCTTTGTCACCAGAAAT-ATATTGAGTTTAATA----TACTACCTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATATATCAATGATTTCCTACTA--TATGCTTTC-------AAAGAAAta--gtaatttaagaaataaaataacctcTTTTGGCTTTCCTGCCCATATGGACCTAATAAACATGCTGGCTATTCTGTAATCTCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3598482 420 - 24206276 ACTTTTCTTCTGTTTAGTAATATTTA-ATT--AAAAAAAATAG-TT----GTCATTTCTTTAGTGGAACATAGGAGACGTTTATTCCTAAAATGAAAACAACAAATGCCAAGACCACAATAGAGTGTATTTAAGAGTACCTCTCTTTGTGAGGAATTAGTTCTTCAAAGTGCAGTTCTCTTCTCCAAGAAGGATTATGCCAAAGAATCTTTGTGAACATCATTTAGTTT-TCTTTGCCTGTTTCTTTGTCACCAGAGGT-ATATTGAATTTAATA----TGCTACCTAC-CTGATCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATATATCAATGATTTCCTATTA--TATACTTTT-------AAAAATATA--GTAATGTAAGAAACAAAATAACCTCTTTTGACTTT-CTGCCCACATGGACCTAACAAACATGCTGGCTATTCTGTAATCTCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87765146 371 - 132174527 ACTTTTCTTCTTTATAGTAATATTTA-ATT----AAAAAATAG-TT----------------------------------TTGTT--------------AACAAATGCCAAGACCACAATAGAGTATATTTAAGAATATATCTCTTTGTGAGGAATTAGTCCTACAACACGCAGTTTGTCTTTCTAAGAAGGAATATGTCAAAGGGTATTTGTGAATATTATTTACTTT-TCTTTGCCTATATCTTTGTCACTAGAAAT-ATATTGAATTTAACA----TACTACCTAC-CTGACCACATTAC--------------TTCCTTTCTTGATATATCAATGATTTCCTATTA--TATACT----------TAAAAAATA--GTAATGTAAGAAATAAAACAACCTCTTTTGGCTTT-CTGTCCACATGAAACTAAAAAACATGCTGGCTGTTCTGTAATCTCT i calJac3.chr10 I 444 C 0 s canFam3.chr15 46938725 413 - 64190966 ATTTTCCTTCTGTTTAT---TATTTA-GTTGAAAAAGAAATAG-TTCTTCGTTATTGTTTTAGCAGGGCATAGGAGACAATTATGTCTAAAAAGAAAACAACAAATACCAAGGGTATAACAGGATCTAGTT-GGAGAACATCC--------------------------------TCTCTTTACATGGAAGGACTATGTAAAGGAGACTTTACGAGTATAATTTATTTTGTCCTTGCCTATCTTCTTGTTACCAGAAATAATGATGAATCTAATGTATTTACCACCTAC-ATGACCACAATATTTTTTCCTACAATATTTTTTCCTATGTATTGCAATGATTTACTATCAATTATACTATTTTTCTCTTTTTGAATT--GCATTATAA-----AATATAATTTCCTGTGGCTTT-CTATC-ACTGAGACCTAATAAATATGTTCGCCATTGCATTATCTCT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74584689 15809 - 124902244 I a score=105842.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 412552 31 + 478999 GTCACTGATAGAATGTTGATTTTAAAACTTA s panTro4.chr14 18736650 31 + 106544938 GTCACTGATAGAATGTTGATTTTAAAACTTA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943267 31 + 108868599 GTCACTGACAGAATGTTGATTTTAAAACTTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88033908 31 - 170124641 GTCACTGATAGAATGTTGATTTTGAAACTTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88312178 31 - 171882078 GTCACTGATAGAATGTTGATTTTGAAACTTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85441784 31 - 162156779 GTCACTGATAGAatgttgattttaaaactta i papAnu2.chr7 C 0 M 164 s chlSab2.chr29 3598902 31 - 24206276 GTCACTGATAGAATGTTGATTTTAAAACTAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87765517 31 - 132174527 GTCACTGATTGAATGTTGATTTTAAAACTTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74600498 31 - 124902244 GTCAGTGACAGAATATTTGTTTTTGAACCCA i mm10.chr14 I 15809 C 0 s canFam3.chr15 46939138 31 - 64190966 GTCACTGATGGAATGTTGATTTTAAGTCCCA i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=527272.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 412583 230 + 478999 GAAGTGACATAGTGACT-TTTAAATCATATATACTTCACTATTTATATATAACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTGTTGGCATTTTAACAATTCCCTTTGAAAGTGTTT-GCAGCTTTGTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCACAAATTGGTTGCA------------TAAGAGATTCCTCTGTGAGAAGAGATATTTAACAATGAAGTCAGGAAAAA s panTro4.chr14 18736681 240 + 106544938 GAAGCGACATAGTGACT-TTTAAATCATATATACTTCACTATTTATATATAACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTGATGGCATTTCCACAATT------GAAAGTGTTTTGCAGCTTTTTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTGTATTATTCTCCATTGCATCACAAATTGATTGCAGATTTCAAAGTGTAAGATATTCCTCTTTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAGTCAGGAAAAA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943298 246 + 108868599 GAAGTGACATAGTGACT-TTTAAATCATATATACTTCACTATTTATATATAACATGTTTCTAATCTCATTCTCTGACTATATTTTGTTGGCATTTCCACAATTCCCATTGAAAGTGTTTTGCAGCTTTTTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTGTATTATTCTCCATTGCATCACAAATTGATTGCATATTTCAAAGTGTAAGATATTCCTCTTTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAATCAGGAAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88033939 242 - 170124641 GCAGTGACATAGCGACT-TTTAAATCATAT-TACTTGACTGTTTATATATAACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTGTTGGCATTTCAACAATTCCCATCGAAAGTGTTTTGCAGCTTTCTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCACAGATTGGTTGCATATTTCAAAGTGTAAGAGATTCCCCAGTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAGTCAGGAAAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88312209 242 - 171882078 GCAGTGACATAGTGACT-TTTAAATCATAT-TACTTGACTGTTTATATATAACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTGTTGGCATTTCAACAATTCCCATCGAAAGTGTTTTGCAGCTTTCTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCACAGATTGGTTGCATATTTCAAAGTGTAAGAGATTCCCCAGTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAGTCAGGAAAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3598933 242 - 24206276 GCAGTGACATAGTGACT-TTTAAATCATAT-TACTTGACTGTTTATATATGACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTGTTGGCATTTCAACAACTCCCATCGAAAGTATTTTGCAGCTTTCTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCACAGATTGGTTGCATATTTCAAAGTGTAAGAGATTCCCCAGTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAGTCAGGAAAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87765548 243 - 132174527 GAAGTGACATAGTGACT-TTAAAATTATATCTACTTGACTATTTATGTATAACATGTTTCTAGTCTCATTCTTTGACTATATTTTCTTGGCGTTCCAACAATTCCCATGGAAAATGTTTTGCAGTTTCGTTAGCCTTCCAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCACAAATTGGTTGCATATTTCAAAGAGTAAGAGATTCCTCTGTGAGAAGAGATATTTAAGAATGAAGTCAGGAAAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74600529 225 - 124902244 CTGCTTACATTGCAAAT-CTTGGCTTATATATATTTGGACATTTATATGAACTAAACCCCTACTTTCATTCTTTGTCCATTACCTGTTGGCATTTGGACAGTCCCCACAGGAATTCTTT-GGAGT----TTAGACTTCAAATTCCCAAAGCCCATT---CTCCATTGCATCATAAATT--------ACATCAAACTGTAAACAGCCCCTCTGATATAAAAAA----TTAATATTAAGTTGTAACAA- i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46939169 243 - 64190966 GAAGTGATACAGTATCTGTTTAACTGATTTGTATTTGAATGTTTGTACATAACAGATCTCAAGTATAA-TCTCTGATTATATCTTGTTGGCATTCTAATAATTCCCATTGAAAGCATTCTATGCCTTTGTTAGCCTTCAAATTCCCAAAGTACATT---CTCCATTGCATCATAAATTGGCTATGTATTTCAAAGTGTAAGAAGCTCCTCTGTGAGAAGAGATATTTAAGAACAGAGGTAGGAATAA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 85441815 164 - 162156779 M a score=723559.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 412813 286 + 478999 TTAGTTATTGTTCCTTCTATTAGAAGGA---GGTGATATCTGCTGTTTGACAGGAGCATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT--CCATTCTCCATATTTATAAGGAACAT----AAGGAAGAAATGGAAACA--TATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTATAGTGATTATATAGGTTATGGGTTTCAAACTAGAAATAGATTAATATGTTTAATCTGAATTCAGTAATACAGTAGCACCTTTTACCTGGTCTTAATAATATAG s panTro4.chr14 18736921 262 + 106544938 TCAGTTATTGTTCCTTCTATTAGAAGGA---GGTTATATCTGCCATATGAGAAGAGCTTTAGATTA-CTAAAGACGTAAATGTTTTT-GCCATTCTCCGTATTTATAAGGAACAT----AAGGAAGAAATGGAAACAGATATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAAAATTATA--------------------------ACT-GACGTAGATTAATATGTTGAATCTGAATTTGGTAACACAGTAGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943544 266 + 108868599 TCAGTTATTGTTCCTTCTATTAGAAGGA---GGTTATATCTGCTGTCTGAGAAGAACATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT-GCCATTCTCTGTACTTATAAGGAACATAAAGAAGGAAGAAATGGAAACAGATATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAAAATTATA--------------------------ACA-GAAATAGATTAATATGTTGAATCTGAATTCAATAACACAGTGGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88034181 266 - 170124641 TCGATTATTGTTCCTTCTATTATAAGGA---GGTGATATCTGCTGTCTGAGAAGAACATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT-GTCATTCTCCATATTTATAAGGAACATAAAGAAGGAAGAAATAGAAATGGATATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTATA--------------------------ACA-GAAATAGATTAATATGTTGAATCTGAATTCAATAATACAGTAGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAA i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 88312451 266 - 171882078 TCGATTATTGTTCCTTCTATTATAAGGA---GGTGATATCTGCTGTCTGAGAAGAACATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT-GCCATTCTCCATGTTTATAAGGAACATAAAGAAGGAAGAAATGGAAACGGATATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTATA--------------------------ACA-GAAATAGATTAATATGTTGAATCTGAATTCAATAATACAGTAGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAA i macFas5.chr7 C 0 I 34 s papAnu2.chr7 85441979 266 - 162156779 tCAATTATTGTTCCTTCTATTATAAGGA---GGTGATCTCTGCTGTCTGAGAAGAACATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT-GCCATTCTCCATGTTTATAAGGAacataaagaaggaagaaatggaaacgGATATTGTAACACCTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTACA--------------------------ACA-GAAATAGATTAATATGTTGAATCTGAATTCAATAATACAGTAGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAG i papAnu2.chr7 M 164 C 0 s chlSab2.chr29 3599175 266 - 24206276 TCAATTATTGTTCCTTCTATTATAAGGA---GGTGATATCTGCTGTCTGAGAAGAGCATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTT-GCCATTCGCCATGTTTATAAGAAATATAAAGAAGGAAGAAATGGAAATGGATATTGTAACACTTCAGGTGGGACATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTATA--------------------------ACA-GAAATAGATTAGTATGTTGAATCTGAATTCAATAATACAGTAGCACCTTTTACCTGTTCTTAATAATATAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87765791 267 - 132174527 TCAGTTATTGTTCCTTCTGTTAGAGGGA---GGTGATATCTGCTGTGTGAGAGGAGCATTAGATTA-CTAGAGAGGTAAATGTTTTTTGCCATTCTTCATATTTATGAGGAACATAAATAAGGAAGAAATGGAAACAGATATTGCAACATCTCAGGTGGGGCATCTGCTGCCTTGAAATGCAAAGATCAGAATTATA--------------------------ACA-GAAATAGATTAATATGTTAAATCTGAATTAAATAATACAATAGCACTTTTTACCTGTTCTTAATAATATAG i calJac3.chr10 C 0 I 2 s mm10.chr14 74600754 214 - 124902244 TTAGGTGTTGCCTATTTCATTTGAGGGGAATGGGGATGTTTGCTCTGT---AAGAATATTGGTGCAGTTATTGAGGTAAGTGTTCTT-ACTATTCTTCACATTTATAAAGAAT------AAAACAAACATGCAAA-----AATATAATTCCTTAGGTTGTATACTTACTATCTTG-AATGCA-----CAGAATGATT--------------------------TAT-GA-----------ATGTCAAATTTAAATGCA-------------------------TTCTCACTAATATAG i mm10.chr14 C 0 I 2 s canFam3.chr15 46939412 257 - 64190966 ACAGTAATTGTTCCTTCCATTAT---GT---GGTAATGTCTGCTGTGTGAGAGTAGTATTGGATTG-CTAGAGAAGTAAATGTTTTT-G----TCTTCATATTTGTGAAGAATAGAAAGAAGGAATAAATGGAAACA--TATTACAATTCTTCAGATGGGGCATTTGCTGTCATGGTCTACAATGGTCAAAATTATA--------------------------GTA-GAAAGAGACTAATATATGAGGTTTTAATTTAGTGATACAGCAACACATTTTATCTGTTCTCAAAAATATAG i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=-9679.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 413099 3 + 478999 --CCC s panTro4.chr14 18737183 3 + 106544938 --CTC i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943810 3 + 108868599 --CTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88034448 2 - 170124641 --AT- i rheMac3.chr7 I 1 I 31 s papAnu2.chr7 85442245 2 - 162156779 --CT- i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s chlSab2.chr29 3599441 2 - 24206276 --CT- i chlSab2.chr29 C 0 I 1 s calJac3.chr10 87766060 1 - 132174527 --C-- i calJac3.chr10 I 2 C 0 s mm10.chr14 74600970 1 - 124902244 --C-- i mm10.chr14 I 2 I 3 s canFam3.chr15 46939669 3 - 64190966 CTC-- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e macFas5.chr7 88312717 34 - 171882078 I a score=4375.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 413102 4 + 478999 CAGT s panTro4.chr14 18737186 4 + 106544938 CAGT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943813 4 + 108868599 CAGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85442248 4 - 162156779 CAGT i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s chlSab2.chr29 3599444 4 - 24206276 CAGT i chlSab2.chr29 I 1 C 0 s calJac3.chr10 87766061 4 - 132174527 CAGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74600974 1 - 124902244 C--- i mm10.chr14 I 3 C 0 s canFam3.chr15 46939672 4 - 64190966 TAGT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e macFas5.chr7 88312717 34 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88034450 31 - 170124641 I a score=327541.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 413106 115 + 478999 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTGGGAATATATAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACCTATAG-----CTATTAACTGAAAGACGTGAGG s panTro4.chr14 18737190 115 + 106544938 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTAGGAATGTATAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACCTATAT-----CTATTAACTGAAAGGCACGAGG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943817 115 + 108868599 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTAGGAATATATAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTAGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACCTATAT-----CTGTTAACTGAAAGACATGCAG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88034481 115 - 170124641 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTGGGAATATACAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTGAACCTATAT-----CTATTAACTGAAAGACGTGAGG i rheMac3.chr7 I 31 C 0 s macFas5.chr7 88312751 115 - 171882078 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTGGGAATATACAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTGAACCTATAT-----CTATTAACTGAAAGACGTGAGG i macFas5.chr7 I 34 C 0 s papAnu2.chr7 85442252 115 - 162156779 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTGGGAATATATAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACTTATGT-----CTATTAACTGAAAGATTTGAGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3599448 115 - 24206276 TTCTCCTAATATTTAGAATTAATTTATTGGGAATATATAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACCTATAT-----CTATTAACTGAAAGATGTGAGG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87766065 115 - 132174527 TTCTCCTAATATTTAGAATTCATTTATTGGGAATATGTAAAGCCTTTATTAAC--------ATTGCCTTGGGAATGTTTATACTTGGTCCTAAACCTATAT-----CTATTAACTGAAAGATGCGAGG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74600975 106 - 124902244 TTCTTCAGATATTT--GATTGTTTTATTAGGATTGCATAGTGTTTAAAATATA--------GTTTTTC------TCTTTGCCCTTAGGCATAACTTTATAC-----CTACCAAC-AAAACAAGTAAGA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46939676 128 - 64190966 TCTTCCTGATGTTTAAAATTACTTTTTGGGGGATATGCAAAGCCTTTTTTTTTTAATACCAATAGTCTTGGGGATGTTAATACTTGGTGTTAAATTTATATACCACATATTAGTTGAGAGAAGTGAGG i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=661747.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 413221 302 + 478999 GAACAG-AAGTCATATCCAATGCAGAAATGCTA-------GGCTGCAGAAGAAATCTTCACCAACTTCACGATTTTGCAGGAGACTAGCTCTGTC-TAGTTCCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTTTACAAAGAGTCTTACCATATACCAATCTGGGGCTTTGACAGCTGGCTGAAATGAAGCCTTCATAAATTCTTTTCTAGTAATTTCTTACATTAACATAGCTACCTTTACCCCAGCAACTCATTTCAAAGGCAGGGACAGAGGATCTATATTATA--TATTTACTTCTTAGAAACTAAAGCCCCT s panTro4.chr14 18737305 302 + 106544938 GAACAG-AAATCATATCCAATGCAGAAATGCCA-------GAGTGCAGAGAAAATCTTCACCAACTTCACGATTTTGCAGGAGACTAGCTCTGTC-TAGTTCCCACACCTGCAGGGATGAGAGGTT---CTTTTACAAATAGTCTTACCATATACCAATCTGGGACTTTGAGAGCTGGCTGAAGTGAAGCCTCCATAAATTATTTTCTTGTAATCTCTTAAATTTATGTAGCTACCATTACCCTAGTGACTCATTTCAAAGGCAGGGACAGAGGATCTATTTTATA--TATTTACTTCTTAGAAACTAAAGGCCCT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18943932 287 + 108868599 GAACAG-AAATCATATCCAATGCAAAAATGCCA-------GAGTGCAGAGAAAATCTTCACCAACTTCATGATTTTGCAGGAGACTAGCTCTGTC-TAGTTCCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTCTACAAATAGTCTTACCATATACCAAT---------------CTGGCTGAAGTGAAGCCTCCATAAATTCTTTTCTTGTAATCTCTTAAATTTACATAGCTACCATTACCCTAGTAACTCATTTCAAAGGCAGTGACAGAGGATCTATATTATA--TATTTACTTGTTAGAAAGTAAAGGCCCT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88034596 295 - 170124641 GAACAG-AAATCGTAACCAATGCAGAAATGCTA-------GACTGCAGAGAAAATCTTCACCAACTTCACGATTTTGGAGGACACTTGCTCTGAC-TAGCTCCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTTCATAAATAGTCTTACCATATACCAAT-CGGGGCTTTGACAGCTGGCTGAAGTGGGGCCTCCATAAATTCTTTTCTTGTAAGCTCTTAAATTTAC------ACCTTTACCCCAGCGACTCATTTCAAAGGCAGGGACAGAAGATCTATATAATA--TATTTACTTCTTAGAAACTAAAGCTCCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88312866 295 - 171882078 GAACAG-AAATCGTAACCAATGCAGAAATGCTA-------GACTGCAGAGAAAATCTTCACCAACTTCACGATTTTGGAGGACACTTGCTCTGAC-TAGCTCCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTTCATAAATAGTCTTACCATATACCAAT-CGGGGCTTTGACAGCTGGCTGAAGTGGGGCCTCCATAAATTCTTTTCTTGTAAGCTCTTAAATTTAC------ACCTTTACCCCAGCGACTCATTTCAAAGGCAGGGACAGAAGATCTATATAATA--TATTTACTTCTTAGAAACTAAAGCTCCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85442367 296 - 162156779 GAACGGAAAATTGTAACCAATGCAGAAATGCTA-------GACTGCAGAGAAAATCTTCACCAACTTCACGATTTTGCAGGACACTTGCTCTGAC-TAGCTCCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---cttttataaatagtcttacCATATACCGGT-CGGGGCTTTGACAGTTGGCTGAAGTGGGGCCTCCATAAATTCTTTTCTTGTAATCTCTTAAATTTAC------ACCTTTACCCCAGTGACTCATTTCAAAGGCAGGGGCAGAAgatctatataata--tatttacTTCTTAGAAACTAAAACTCCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3599563 295 - 24206276 GAACAG-AAATCGTAACCAATGCAGAAATGCTA-------GACTGCAGAGAAGATCTTCACCAACTTCACGATTTTGCAGGACACTTGCTCTGAC-TAGCTTCCACACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTTTATAAATAGTCTTACCATATACCAAT-CGGGGCTTTGACAGCTGGCTGAAGTGGGGCCTCCATAAATTCTTTTCTTGTAATCCCTTAAATTTAC------ACCTTTAACCCAGCGACTCATTTCAAAGGCAAGGACAGAAGATCTATATAATA--TATTTACTTCTTAGAAACTAAAGCTCCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87766180 299 - 132174527 AAACAG-AAATCATAACCAATGCAGAAATGCTA-------GAATGCAAAGAAAATCTTTACCAACTTCATGATTTTCCAGGAGACTAGCTCTGAC-T-GTTTGCATACCTGCTGGGATGAGAGGTT---CTTTTGCAAATAGTCTTTCCATATACCAAT-CGGG-CTTTGACAGCTGGCTGAAGTGAAACTTCCATAAATTATTTTCTTATAATCTCTTACATTTACACAGCTACCTTTACCCCAGAAACTCATTTCAAAGGCAGGGACAGAGGATCTATGTTATG--CATTTACTTCTTAGAAACTAAAGTTCCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74601081 310 - 124902244 GAATTT-AACTAATAATTAGTATGGAAATGTTATATTGAGAATTGAAAAGAAACTATTTTTTTGGATCCTTGTTTTGAAAAGGAGCAACTCCGACATGGTTTCCTACACAGCTGGGAAAAGAGGTTCTCCTTGTACAAGTAATACTGTTGAACACTGATCTGCGGCTTTG-CATTAGGCTGAAGTTAAACATATGAAAGTTTTGATTTTATAA--TCTTAGATTTATGAAGTTAACA--AATGCAACAATTTGAGTCTAAAATTAAAAAAGAAAATCTGTGTCACACTTATTTATTTCTCAGAGCTTATAATACCT i mm10.chr14 C 0 I 253 e canFam3.chr15 46939804 0 - 64190966 C a score=2984593.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 413523 1361 + 478999 CTTAATATCTACATTTTTTCCTTGTTTAGTTTTGGTTTAGTCAGACTTCAATATGCTACTTATTGCTATCATTCTCA---TATTATATTCATAAATCAACACAGTGAGATAAAATAACTCAGGCTAAAGAAGA----TGACCTTCCCAAGATCTCACGGTTAAAAAAATTGCACAATGAAGAACTTAAACCCAGATA----GATGCCCAAACGAGGGCTTTTTAAATGACATCCATTACTTTGCCTAGAAATCATGGCATTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTGATGATACTC--TAACTTTATCCACATTTCTCAGAACACACAAAAAATTAGTGATTATATAGGTTATGGGTTACAAACTAGATAGCACATATTAATAGACATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGAACATTTCTAAAATGT------------------------------GTTTTTGCTGGTAGGGTGGATTAATGAGAAATTTCTTTCAAGCAGAAAGGTGAATAGTGCCACTTTTATTAAGATCAGTTATAAACAGACAAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTATTTACACAGTATATTTTAAGTAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTACTGAAAGATGGGTTAGGTATTTTTAACCCTTACAAAAATTGGAGTGAAGAAACTTCATGTGCTGTCCTTACTACTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAACATGAGATCTAATAAAGGAGAAATGAATAGAGAAGA-------AGAGAGTGG--AAAAATATTGGAAACTGCAAGAACATTGAGAAGTAAAAACAACAAAGGAGAAAAA-ATAGAAGAGAT----AAGAGAAAAGCAAGGGGAATCATTAGAGAACAAATACgagagagaaa----gagaagat-aaaatagagaaagagaAACCAACTTAA--GTAAAAGTATAACTTAAAAAATGAAGTGTAGAAATATTTAGCGAGATGGGAGGGGAAGATAATAAAATAAATATTTTAAAAGGAGGCATGAGGAAATATAAAGAAA----AATGAGTGAATTAGTGCCTGTGGATGGGAATCAAATCTCCAAATACCTGCTCCATG-AACTTTCTAACAAGAGCCTGGACTCTAAACGTGA-------ACAGTGCATAGCGCAGCCTTTATCTGGAATGTGTGTGTGCCCCCACCCATCACTCTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGGAACAGATGAAATTTTGTTTCTGTTGAAATTGAAATATAGGATAGAGGGAGTGGCAGTCATTCAGATTTCTATTTCAGCTTCCACTGACAGTGATCCTTCTAACATTGTTATGTTCTTCT-AATATAGTTAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGAATTTCTGTG s panTro4.chr14 18737607 1375 + 106544938 CTTAATATCTACATTTTTTCCTTGTTTATTTTTGGTTTAGTCGGACTTCAATATGCTAATTATTGCTATAATTCTCATCTTATTATATTCATAAATCAACACAGTGagataaaataactcaggct-agggaga----tgaccttcccaagatctcagggttaaaaaaattgcaggatgaagaatttaaacccagata----gatgcccaaatgagggctttttaaatggcatccattactttgCCTAGAAATCATGGCATTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTGATAATACTCTTTAACTTTATCCACATTTTTCAGAACACACAAAAAATTAGTGATTATTTAGGTTATGGGTTACAAACTAGATAGCACATATTAATAGACATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGGACATTTATAAAATGT------------------------------GTTTTTGCTGGTAGGGTGGATTAATGAGAAATTTCTTTCAAGCATAAAGGTGAATAGTGCCACTTTTATTAAGATCAGTTATAAACAGACAAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTATTTACAGAGTATATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTACTGAAAGGTGGGTTAGTTATTTTTAACTCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGAAACTTCATGTGCTGTCTTTACTATTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAATATGAGATCTaataaaggagaaatgaatagagaagacaagaagagagagtgg--aaaaatattggaaactgcaaggacattgagaaataaaagtaacaaaggagaaaaa-atagaagagaa----atgagaaaagcaaggggaatcattagaggacaaatatgagagagaaaaagggagaagataaaaatagagaaaaagaaaTCAACTTAA--GTAAAAGTGTAACTTAAAAAATGAAGTGTAGAAATATTTAGTGAGACAGGAGTGGAAGGCCATAAAATAAATATTTTAAAAGGAGGTATGAGGAAATATAAAGAAA----AATGAGTGAATTAGTGCCTGTGGATGGGAATCAAGTCTCCAAACACCTGCTCCATG-AATTTTCTAACAAGAGCCTGGACACTAAACGTGA-------ACAGTGCATAGGGCAGCCTTTAGCTGGAA--TGCGTGTGCCGCCACCCATTACTCTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGGAGCAGATGAAAGTTTGTTTCTGTTGAAATTGAAATATAGGATAGAGGGAATGGCAGTCATTCAGATTTCTATTTCAGTTTCCACTGACAGTGATCCTTCTAATATAGTTATGTTCTTCT-AATATAGTTAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGAATTTCTGTG i panTro4.chr14 C 0 I 26511 s ponAbe2.chr14 18944219 1385 + 108868599 CTTAATATCTACATTTTTTCCTTGTTTATTTTTGGTTTAGTTGGACTTCAATATGCTAATTATTGCTATCATTCTCATCTTATTATATTCATAAATCAACGCAGTGAGATAAAATAACTCAGGCT-AGGGAGA----TGACCTTCCCAAGATCTCAGGGTTAAAAAAATTGCAGAATGAAGAATTTAAAACCAGATAGACCGATGCCCAAATGAGGGCTTTTTAAATGACATCCATTACTTTGCCTAGAAATCATGGCATTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTCATGATACTCTTTAACTTTATCCACATTTCTCAGAACACACAAAAAATTAGTGATTATATAGGTTATGGGTAACAAACTAGATAGCACATATTAATAGGCATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGAACATTTATAAAATGT------------------------------GTTTTTGCTGGTAGGGTGGATTAATGAGAAATTTCTTGCAAGCATAAAGGTGAATAGTGCCACTTTTATTAAGATCAGTTATAAACAGACAAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTATTTACAGAGTATATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTACTGAAAGGTGGGTTAGTTATTTTTAACTCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGAAACTTCATGTGCTGTCCTTACTATTGTTTCAAAATAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAATATGAGATCTAATaaaggagaagtaaatagaggagacaagaagagagagtgg--agaaatattagaaactgcaagaacattgagaaataaaagcaacaaaggagaaaaatagaagagagat----aagaggaaagcaaggggaataattagagaacaaatatgagagagaaaaagcgagaagataaaaatagagaaaaAGGAATCAACTTAA--GTAAAAGTGTAACTTAAAAAATGAAGTGTAGAAATATTTAGTGAGATGGGAGTGGAAGGCCATAAAATAAATATTTTAAAAGGAGGTATGAGGAAGTATAAAGAAA----AATGAGTGAATTAGTGCCTGTGGATGGGAATCAAGTCCCCAAATACCTGCTCCATG-AATTTTCTAACAAGAGCCTAGACTCTAAGCATGAGTACAGGGCAGTGTACAGGGCAGCCTTTAGCTGGAATGCATGTGTGCCCTCACCCATTACTCTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGGAACAGATGAAAGTTTGTTTCTGTTGAAATTGAAATATAGGATAGAGAAAATGGCAGTCATTCAGATTTCTCTTTCAGCTTCCACTGACAGTGATCCTTCTAATATATTTATGTTCTTCT-AATA----TAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGAATTTCTGTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88034891 1364 - 170124641 CTTGATATGTACATTTTTTCCTGGTTTAGTTTTGGTTGAGTCAGACTTCAATACGCTACTTATTGCTATCATTCTCA-----TGATATCCATAAATCAACACAGTGagataaaataactcaggctaaggaaga----tgaccttcccaagatctcagggttaaaaaaattgcaggacgaagaacttaaacccagataggcagatgcccaaattagggctttttAAATGACATCCATTACTTTGCCTAGAAATCATGGCCTTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTGATGATACTCTTTAACTTTATTCACATTTCTCAGAACACACAAAACATTAGTAATTAAATAGGTTATGGGTTACAAACTAGATAGCACATATTAATAGACATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGGACATTTATTAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------------------------------NTTTCAAGTATAAAGGTGAGTAGTGCCACTTTTATTAAGATCAGTTACAAACAAATAAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTGTTCACACAGTGTATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTAC-AAAAGGGGGGTTAGGTATTTTTAACCCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGGAACTTCATGTGCTGTCCTTACTATTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAAC---AGATCTaataaaggagaaatgaatagagaagacaaga--agagagtgg--aaaaatactggaaactgcaagaacattgagaaataaaagcaacaaaggagaaaaa-ataaaag--ag-----agataaaagcaaggggaatcattagagaacaaatatgagagagaaaaagagagaagat-aaaatagagaaagagaaACCAACTTAA--GGAAAAGTATAACTTAAAAAATGAAGTGTAGAAATATTTGACAAGATGGGAGTGGAAGATAATAAAAGAAATATTTTAAAAGGAGGCATGAGGAAATATAAAGAAAAATGAATGAATGAATTAGTGCCTGAGGATGGGAATCAAGTCTCGAAATACCTGCTCCATG-AACTTTCTAACAAGATCCTGGACTCTAAACATGA-------ACAGTGCATAGGGCAGCCTTTAGCTGGAACGTGTGTGTGCCCCCAGCCATCACTGTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGAAACAGATGAAATTTTGTTTCTGTTGAAACTGAAATAGAGGATAGAGGGAGTGGCAGTCATTCAGATTTCTATATCAGCTTCCACTGA---GGATCCTTCTAATATAGTTATGTTTTTCT-AATACAGTTAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGGATTTCTGTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88313161 1370 - 171882078 CTTGATATGTACATTTTTTCCTGGTTTAGTTTTGGTTGAGTCAGACTTCAATACGCTACTTATTGCTATCATTCTCA-----TGATATTCATAAATCAACACAGTGagataaaataactcaggctaaggaaga----tgaccttcccaagatctcagggttaaaaaaattgcaggacgaagaacttaaacccagatAGGCAGATGCCCAAATTAGGGCTTTTTAAATGACATCCATTACTTTGCCTAGAAATCATGGCCTTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTGATGATACTCTTTAACTTTATTCACATTTCTCAGAACACACAAAACATTAGTAATTAAATAGGTTATGGGTTACAAACTAGATAGCACATATTAATAGACATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGGACATTTATTAAATGT------------------------------ATTTTTGCTGGTAGCGTGGATTAATGAGCAATTTCTTTCAAGTATAAAGGTGAGTAGTGCCACTTTTATTAAGATCAGTTACAAACAAATAAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTGTTCACACAGTGTATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTAC-AAAAGGGGGGTTAGGTATTTTTAACCCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGGAACTTCATGTGCTGTCCTTACTATTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAAC---AGATCTAATAAAGGAGAAATGAATAGAGAAGACAAGA--AGAGAGTGG--AAAAATACTGGAAACTGCAAGAACATTGAGAAATAAAAGCAACAAAGGAGAAAAA-ATAAAAGACAG-----AGATAAAAGCAAGGGGAATCATTAGAGAACAAATATgagagagaaaaagagagaagat-aaaatagagaaagagaAACCAACTTAA--GGAAAAGTATAACTTAAAAAATGAAGTGTAGAAATATTTGACAAGATGGGAGTGGAAGATAATAAAAGAAATATTTTAAAAGGAGGCATGAGGAAATGTAAAGAAAAATGAATGAATGAATTAGTGCCTGAGGATGGGAATCAAGTCTCGAAATACCTGCTCCATG-AACTTTCTAACAAGATCCTGGACTCTAAACATGA-------ACAGTGCATAGGGCAGCCTTTAGCTGGAACGTGTGTGTGCCCCCAGCCATCACTGTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGAAACAGATGAAATTTTGTTTCTGTTGAAACTGAAATAGAGGATAGAGGGAGTGGCAGTCATTCAGATTTCTATATCAGCTTCCACTGA---GGATCCTTCTAATATAGTTACGTTTTTCC-AATATAGTTAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGGATTTCTGTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85442663 1372 - 162156779 CTTGATATGTAcattttttcctggtttagttttggttGAGTCAGACTTCAATATGCTACTTATTGCTATCATTCTCA-----TGATATTCATAAGTCAACACAGTGAGATAAAATAACTCAGGCTAAGGAAGA----TGACCTTCCCAAGATCTCAGGGTTaaaaaaaTTGCAGGATGAAGAACTCAAACCCAGATAGGCAGATGCCCAAACGAGGGCTTTTTAAATGACATCCATTACTTTGCCTAGAAATTATGGCATTATAAACATTTGTATCAGTTAATGATTTGATGATACTCTTTAACTTTAtccacatttctcagaacacacaaaaaattagtaattaaatAGGTTATGGATTACAAACTAGATAGCGCATATTAATAGACATCacattcttattcttattttggggacatttattaaatgt------------------------------atttttgctgGTAGGGTGGATTAATGAGCAATTTCTTTCAAGTGTAAAGGTGAGTAGTGCCACTTTTATTAAGATCAgttacaaacaaataaaatatttgaggtaatgggaaataatttaaaagtgttCACACAGTGTATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTAC-AAAAGGGGGGTTAGGTATTTTTAACCCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGGAACTTCATGTGCTGTCCTTactattatttcaaaagaaaacaatagtgATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAAC---AGATCTAATAAAGGAGAAATGAATAGAGAAGACAAGAAGAGAGAGTGg--aaaaatactggaaactgcaagaacattgagaaataaaagcaacaaaggagaaaaa-ataaaagacag-----agataaaagcaaggggaatcattagagaacaaatatgagagagaaaaagagagaagat-aaaatagagaaagagaaaccaacttaa--ggaaaagtataacttaaaaaaTGAAGTGTAGAAATATTTGACAAGATGGGAGTGgaagataataaaagaaatattttaaaaggaggcatgaggaaatataaagaaaaatgaatgaatgaattagtgccTGAGGATGGGAATCAAGTCTCGAAACACGTGCTCCATG-AACTTTCTAACAAGATCCTGGACTCTAAACACGA-------ACAGTGCATAGGGCGGCCTTTAGCTGGAACGTGTGTGTGCCCCCAGCCAtcactgtttcctcttctgtgctGCTCCAGCATTGTCAGGAACAGAtgaaattttgtttctcttgaaaCTGAAATAGAGGATAGAGGGAGTGGCAGTCATTCAGATTTCTATATCAGCTTCCACTGA---GGATCCTTCTAATATAGTGATGTTTTTCT-AATATAGTTAGACAAGACCAAGCTTGTCTTTGCAGGGAtttctgtg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3599858 1371 - 24206276 CTTGATATGTACATTTTTTCCTGGTTTAGTTTTGGTTTAGTCAGACTTCAATATGCTACTTATTGCTATCATTCTCA-----TGATATTCATAAGTCAACACAGTGagataaaataactcaggctaaggaaga----tgaccttcccaagatcacagggttaaaaaagttgcaggatgaagaacttaaacccagataagcagatgcccaaatgagggcttttttaatgacatcCATTACTTTGCCTAGAAATCATGGCATTATAAACATTGGTATCAGTTAATGATTTGATGATACTCTTTAACTTTATCCACATTTCTCAGAACACACAAAAAATTAGTAATTAAATAGGTTATGGGTTACAAACTAGATAGCGCATATTAATACACATCACATTCTTATTCTTATTTTGGGAACATTTATTAAATGT------------------------------ATTTTTGCTGGTAGGGTGGATTAATGAGCAATTTCTTTCAAGTATAAAGGTGAATAGTGTCACTTTTATTAAGATCAGTTACAAAC----AAAATATTTGAGGTAATGGGAAATAATTTAAAAGTATTCACACAGTGTATTTTAAGGAGGATACTATTCAAGGAAAGTAATTTAGTAC-AAAAGGGAGGTTAGGTATTTTTAACCCTTAGAAAAATTGGAGTGAAGGAACTTCATGTGCTGTCCTTACTATTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGGAAGGCAAACATGAGATCTAATAAAGGAGAAATGAATAGAGAAGACAAGAAGAGAGAGTGG--AAAAATACTGGAAACTGCAAGAAAATTGAGAAATAAAAGCAACAAAGGAGAAAAA-ATAAAAGATAGACATAAGAGAAAAGCAAAGGGAATCATTAGAGAACAAATATGAGAGAGAAAAAGAGAGAAGAT-AAAATAGAGAAAAAGAAACCAACTTAA--GTAAAAGTATAACTTAAAAAATGAAGTATAGAAATA-TTGACCAGATGGGAGTGGAAGATAATAAAATAAATATTTTAAAAAGAGGCATGAGGAAATATAAAGAAA----AATGAATGAATTAGTGCCTGTGGATGGGAATCAAGTCTCCAAACACCTGTTCCATG-AACTTTCTAACAAGAGCCTGGACTCTAAACACGA-------ACAGTGCATAGGGCAGCCTTTGGCTGGAATGTGTGTGTGTCCCCAGCCATCACTCTTTCCTCTTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGGAACAGATGAAATTTTGTTTCTGTTGAAACTGAAATATAGGATAGAGGGAGTGGCAGTCATTCAGATTTCTATATCAGCTTCCACTGA---GGATCCTTCTAATATAGTTATGTTTTTCT-AATATAGTTAGACAAGACCAAGTTTGTCTTTGCAGGGATTTCTGTG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87766479 1371 - 132174527 CTTAATATCTACG-TTTTTCCTGATTTGATTTTGGTTTAGTCAGATTTCAATATGCTACTTATTG-TATCATTCTCATCTTATTATATTTGTAAATCAACACAGTGagataaagtaactcaggctaatgaagatgagtgaccttcccaagatctcagggttaaaaaaattgcaggatgaagaacttaaactcagatagacagatgcttaaacaagggctttttctaTGATGTCCATTAC--------GAAATTGTGGCATTATAAAATTTGGTATCTGTCAATGATTTGATAACGCTCTTTAACTTTATCCATATTTCTCAGAACACA-AAAAAATTAGAAATTATATA-CTTATGGGTTACAAACTAGATAGCATGTATTAATATACATCATATTCTTATTCTTATTTTGGGGATGTTTATAAAATAT------------------------------ATTTTTGCTGGTAGGGTAGATTAATGAGAAATTTCTTTCAAGCATAAAGGTAAATATTGCCACTTTTATTAAGATTAGTTACAAACAGACAACATACTTGAGGTAGTGGGAAATAATTTAAAAGTGTTCATACAGTATATTTTAAAGAGGATACTATTTAAGGAAAGTAATTTAGTACTAAAAGGTGAGTTAGTGATTTTTGACCCTTAAAACAATTGGAGTGAAGAAACTTCATGTGCTGTCCTTACTATTGTTTCAAAAGAAAACAATAGTGATGCTTCTCAGAATTAATGGTAAGGCAAGCATGAGATCTaataaaagagaaat-----gagaagacaagaagaatgagtggaaaaaaatactggaaactacaagaacattcaaaaataaaagcaacaaagcagaaaa--ataaaagagat----aagagaaaaacaaggggaatcattagagaacaaatatgacagcaaaaaagagagaagat-aaaatagagaaaaagaaaCCAACTCAAGTGTAAAAGTATAACTTAAAAAATGAAGTATAGAAATATTTAGTGAGACAGGAATGGaaaataataaaatattttttttaaaaGGAAGCATGAGGAAATATAAAGAAA----AATAAGTGAATTAGTGCCTGTGGATGGGAATCAAGCCTCCAAACACCTGCTTCATGAAACTTTCCAACAAGAGCCTGGACTCTAAGCATGA-------ACAGTACATAGAGCAGCAGTTAGCTGGAACATGTGTGCGCC-CCACCCATCACTCTTTCCTCCTCTGTGCTGCTCCAGCATTGTCAGTGCCAGATAAAATTTTGTTTCCGTTGAAATTGAAATATTGGGTAGAGAGAGTGGCAGGCATTCAGATTTCTATTTCGGCTTCCACTGACAGTGGTCCTTCT-ATACAGTTAGGTCCTTCTAAATATAGTTAGACAAGACCAAACTTGTCTTTGCAGGAATTTCTGTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e canFam3.chr15 46939804 0 - 64190966 C a score=269663.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 414884 160 + 478999 CTTTTATTTTGCTAGGACTTACTTCATTTTACCTAGAGGAATGTCCACCTTATGA--ATATATATATTTGGTTTCTGGATCCATAATGAGCATGATGTGAGCACTATCCATATAACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGCACACAAAGGGAACACAGTGAATCAAA s ponAbe2.chr14 18945604 160 + 108868599 CTTTTATTTTGCTAGGACTTAATTCATTTTACCTAGAGAAATGTCCACCTTATGA--ATATATATATTTGGTCTCTGGATCCATAATGAGCATGATGTGAGCACTGTTGGTATAACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAACACAGTGAATCAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88036255 157 - 170124641 CTTTTATTTTGCTAGGACTTAATTCATTTTACCTAGAGGAATGT---CCTTATGA--ATATATATATTTGGTCTCTGGATCCATAATGAGCATAATGTGAGCACTATCGGTATAACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAACACAGTGAATAACA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88314531 157 - 171882078 CTTTTATTTTGCTAGGACTTAATTCATTTTACCTAGAGGAATGT---CCTTATGA--ATATATATATTTGGTCTCTGGATCCATAATGAGCATAATGTGAGCACTATCGGTATAACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAACACAGTGAATAACA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444035 157 - 162156779 cttttattttgCTAGGACTTAATTCATTTTACCTAGAGGAATGT---CCTTATGA--ATCTATATATTTGGTCTCTGGATCCATAATGAGCATGATGTGAGCACTATCGGTATAATAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAACACAGTGAATAACA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601229 156 - 24206276 CTTTTATTTTGCTAGGACTTAATTCATTTTACCTAGAAGAATGT---CCTTATGA--ATATATATATTTGGTCTCTGGATCCATAATGAGCATGATGTGAGCACTATCAGTATAACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAACACAGTGAATGAC- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87767850 162 - 132174527 TTTTTATTTTGCTGAGAGTTACTTCATTTTACCTAGAGGAATGTCTATCTTGTGAATATATATATATTTGGTCTCTGGATCTATAATGAGCCTGGTGTGAGCAGTATCAGTATGACAAAAGAGCTTAGAGGGAAGTACACAAAGGGAGCACAGTGAATCAGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e canFam3.chr15 46939804 0 - 64190966 C e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=355239.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415044 194 + 478999 GATATTTGATGGTAGAGGGTTCCAGATGTTACAGAGTCAGTAGGAGAACAGAAGTGGATAACAGGGAATAAAATGCAAGGTACAGTGCAAGAACCTGAAACTCCCAATCTCAGAGATACTTGAAAGTTTCTCCTATGACCCAAATACATCCTCAATTTTTGAAAGAGTATGAAATAACCAACTGCATAATAACA s ponAbe2.chr14 18945764 194 + 108868599 GATATTTGGTAGTAGTGGGTTCCAGATGTTACAGAGTCAGTAGGAGAACAGAAGTGGATGATAGAGAATAAAATGCAAGGTACAGTGCAAGAACCTGAAACTCCCAATCTCAGAGATACTTGAAAGTTTCTCCTATGACCCAAATACATCCTCAGTTTTTGGAAGAGTGTGAAATAAACAACTGCATAATAACA i ponAbe2.chr14 C 0 I 446 s rheMac3.chr7 88036412 192 - 170124641 GATATTTGATGGTAGTGGGTTCCAGATATTACAGAGTCAACAGGAGAACAGAAGTGGATGATAGGGAATAAAATGCAAGGTATAGTGCAAGAACCTATAACTCCCAATCTGAGAGATACTTAAAAGTTGCTCCTGTGACTCAAATATATCCTCAAATTTTGTA--AGTGTGAAATAACAAACTGCATAATAATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88314688 192 - 171882078 GATATTTGATGGTAGTGGGTTCCAGATATTACAGAGTCAACAGGAGAACAGAAGTGGATGATAGGGAATAAAATGCAAGGTATAGTGCAAGAACCTATAACTCCCAATCTGAGAGATACTTAAAAGTTGCTCCTGTGACTCAAATATATCCTCAAATTTTGTA--AGTGTGAAATAACAAACTGCATAATAATG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444192 192 - 162156779 GATATTTGATGGTAGTGGGTTCCAGATATTACAGAGTCAACAGGAGAACAGAAGTGGATGATAGGGAATAAAATGCAAGATATAGTGCAAGAACCTATAACTCCCAATCTGAGAGATACTTAAAAGTTGCTCCTATGACTCAAATATATCCTAAAATTTTGAA--AGTGTGAAATAACACACTGCATAATAATG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601385 191 - 24206276 -ATATTTGATGGTAGTGGGTTCCAGATATTACAGAGTCAACAGGAGAACAGAAGAGGATGATAGGGAATAAAATGCAAGGTATACTGCAAGAACCTATAACTCCCAATCTGAGAGATACTTAAAAGTTGCTCCTATGACTCAAATATATCCTCAAATTTTGAA--AGTGTGAAATAACAAACTGCATAATAATG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768012 193 - 132174527 GATATTTGATGGTAGTAAGTTCCAGGTGTGACCGAGTCAATAGGAGAACAGAAGTGGATGCTAG-GAATGAAATGCAAGGTACAATGCAAGAACCTATAACTTCCAATCTCAGAGATACTTAAAAGTTTCTCCTATGACCCAAATACATCCTCAGTTTTTGAAAGAGTGTAAAATAACCAACTACATTATAATG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46939804 172 - 64190966 GATGTTAGATGGTAATGAATCCCATCTGTTAAAGGGCTAATAGAAAAACAGAAGTTTATGATAGGAAATAAAACACAGAATATAGTGGAAGAGCCTGCAGCT-CTAACTTTAGAGCTACTTAAAGTTTTCTTCTTTCTATGAAAGATAGCAT-------------AGTAAG--------CACTGTATAATAGTG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=356293.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415238 186 + 478999 TGCAAGATGTACACAACTTAAGAGTAAGCAGAGAGGGATTCCCG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACAGAAAGACTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGCCAAGTGCC----aaaaaaaaaaaaaaagaa-------------------aaga----------aGGGTATGATATGTAAAATTTTATGCTTCTGTTTTGGTTAGGATACG-----T s ponAbe2.chr14 18946404 204 + 108868599 TGCAAGATGCACACAACTTAAGAGTAAGCAGAGAGCGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACAGAAAGACTGATAAATATGAAGGTCAATAAATGGCCAAGTGCC----aaaaaaaaaaaaaaaaaagaaa------taagaaaagaaga----------aGAGTATCATATGTAAAATTTTATGCTTCTGTTTTGGTTAGGATACAATACAT i ponAbe2.chr14 I 446 C 0 s rheMac3.chr7 88036604 205 - 170124641 TGCAAGATGCACACAACTTAAGAGTAAGCAGAGAGGGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACAGAAAGACTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGCCAAGTACC----aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggaaataagaaaagaaga----------aGGGTACCATATGTAAAAGTCTATGCTTCTGTTTTGGTTAGGATACAA----- i rheMac3.chr7 C 0 I 9 s macFas5.chr7 88314880 209 - 171882078 TGCAAGATGCACACAACTTAAGAGTAAGCAGAGAGGGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACAGAAAGACTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGCCAAGTACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGGAAATAAGAAAAGAAGA----------AGGGTACCATATGTAAAAGTCTATGCTTCTGTTTTGGTTAGGATACAA----- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444384 202 - 162156779 TGCAAGATGCACACAACTTAGGAGTAAGCAGAGAGGGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACAGAAAGACTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGccaagtacc----aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaag---taagaaaagaaga----------agggtaccatatgtaaaattttatgctTCTGTTTTGGTTAGGATAcaa----- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601576 197 - 24206276 TGCAAGATGCACACAACTTAAGAGTAAGCAGAGAGGGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTATATGCACA-AAAGACTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGCCAAGTACC----aaaaaataaataaataagaaa-------taagaaaagaaGA----------AGGGTACCATATGTAAAATTTTATGCTTCTGTTTTGGTTAGGATACAA----- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768205 191 - 132174527 TGCAAGATGCATACAACTTAAGGATAAGCAGAGAGGGATTCCTG----ACTTTTCTATTAGCAGGTTTTACATGCACAGAAGGAGTGATAAATATTAAGGTCAATAAATGGCCAAGTGCC----AAAAAACAAAAATA--------------TAACAAAAGAAGA----------AGGATATCATATGTAAATTTTTATGCTTCTGCTTTGGTTAGGACAtgt----- i calJac3.chr10 C 0 I 12 s canFam3.chr15 46939976 210 - 64190966 TGAAAGATGCACACTACTTAGGAGTTAATATAGAAAGATCCCTGATTCATTTTTCTAACAGCAGGTTTT--ATGAACAGAAAGAAAGACAAATATTGAAGCCAATGAATGCAGAAG--------GAGAACagggagggaagaatggagggaggaaggaagggagAACTGATTTGGATGATGCCAT-TATAAATTTCTGTGCTTCAATTTTGCTTAGGAAAC------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=2323.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415424 16 + 478999 -GTGTTTGCGTGTATTT s ponAbe2.chr14 18946608 16 + 108868599 -GTGTTTGTGTGTATTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88315089 9 - 171882078 ------TACatgtgt-- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444586 9 - 162156779 ------tacgtgtgt-- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601773 9 - 24206276 ------TACGTGTGT-- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768408 14 - 132174527 -gtgtttttgtgtct-- i calJac3.chr10 I 12 I 2 s canFam3.chr15 46940186 15 - 64190966 tgcatgtgtgtgtgt-- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e rheMac3.chr7 88036809 9 - 170124641 I e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=67190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415440 35 + 478999 ATTTGTGTCTGTGTG---ATGTACATACA--------TGTGATGTA s ponAbe2.chr14 18946624 35 + 108868599 ATGTGTGTCTATGTG---ATGTACATACA--------TGTGATGTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88036818 35 - 170124641 ATGTGTGTCTGTGTG---ATATACATACA--------TGTGATGTA i rheMac3.chr7 I 9 C 0 s macFas5.chr7 88315098 35 - 171882078 atgtgtgtctgtgtg---atgtacataca--------tgtgatgtA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444595 35 - 162156779 atgtgtgtctatgtg---atGTACATACA--------TGTGAtgta i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601782 35 - 24206276 ATGTGTGTCTATGTG---ATGTACATACA--------TGTGATGTA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768424 41 - 132174527 atgtgtatctgtatg---atgtacatacatgtgtc--tgtgATGTA i calJac3.chr10 I 2 C 0 s canFam3.chr15 46940201 44 - 64190966 --gtgtgtgcgcgtgcacacatgcatatatgtgcctttgtgATGTA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=407564.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415475 264 + 478999 AGATACt-t-------ttttttgtttgagacagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtacaatatggactcactgcaacctccacctcccaggttcaagcgactctcatgcttcagcctctgaagtagctgggac-tacaggctcctgccaccacgcccagctaatttttatatttttagtagagtcagggttttgcca-ggctggtctcgaactcttggcctcaagtgatccacctgctttggcctccaaaaagggtgggat s ponAbe2.chr14 18946659 261 + 108868599 AGATACt-t-------tttttt---tgagacagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcgatatgggctcactgcaactgccacctcccggattcaagcgactctcatgcttcagcctgggaagtgtctgggac-tacaggctcctgccaccacacctagctaatttttatatttttagtagagacagagtttcgcca-ggctggtctcgaactcttggcctcaagtgacccacctgccttggcctcccaaaagggtgggat i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88036853 261 - 170124641 AGATACA-t-------tttttt-ttggagagagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgc-atatggactcactgcaactgccacctcccatgttcaagcgactctcatacttcagcctctgaagtagatttgac-tacaggctcctgtcaccacgtccagctaatttttatatttttagtagagacaggatttcg-ca-ggctggtctcgaactcttgacctcaagtgatccacgtagcttggcctcccaaaagggtgggat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88315133 261 - 171882078 AGATACA-t-------tttttt-ttggagagagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgc-atatggactcactgcaactgccacctcccatgttcaagcgactctcatacttcagcctctgaagtagatttgac-tacaggctcctgtcaccacgtccagctaatttttatatttttagtagagacagggtttcg-ca-ggctggtctcgaactcttgacctcaagtgatccacgtagcttggcctcccaaaagggtgggat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444630 262 - 162156779 agatacatt-------tttttt-ttggagagagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgc-acatggactcactgcaactgccacctcccatgttcaagagaCTCTCAtacttcagcctctgaagtagaTTTGAC-TACAGGCTCctgtcaccacgtccagctaatttttatatttttagtagagacagggtttcg-ca-ggctggtctcgaactcttgacctcaagtgatccacgtagcttggcctcccaaaagggtgggat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3601817 261 - 24206276 AGATACA-t-------tttttt-ttggagagagagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgc-atatggactcactgcaactgccacctcccatgttcaagcgactcttatgcttcagcctctgaagtagatttgac-tacaggctcctgagaccacgtccagctaatttttatatttttagtagagacagggtttcg-ca-ggctggtctcgaactcttgacctcaagtgatccacgtagcttggcctcccaaaagggtgggat i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768465 268 - 132174527 AGGTACt-ttttttgctttttt-tttgagacagagtcatgctctattgcctaggctggagtgcagtggtgtgatctgg-ctcattgcaacctccctctcctgggttccagtgactttcatgcttcagcctctggagtagctggcacatacaggctcctgccaccacaccta-ctaaattttgta-ttttagtagaaatggggtttcg-cagggctggtcttgaactcttgacctcaagtgatccacctgccttgacctctcaaaatggtgggat i calJac3.chr10 C 0 C 0 e mm10.chr14 74601391 253 - 124902244 I e canFam3.chr15 46940245 0 - 64190966 C e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=57258.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415739 28 + 478999 tacaggtgtgggccacagtgcctggccT s ponAbe2.chr14 18946920 28 + 108868599 tacaggtgtgagccacagtgcctggccT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88037114 28 - 170124641 tgcaggtgtgagccacagtgcctggccT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88315394 28 - 171882078 tgcaggtgtgagccacagtgcctggccT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444892 28 - 162156779 tgcaggtgtgagccacagtgcctggcct i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3602078 28 - 24206276 tgcaggtgtgagccacagtgtctggccT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768733 28 - 132174527 aacaggtgtgagccacagtgcccggccT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74601644 28 - 124902244 tacatgtgtatgtatgtgtgtctgGTCT i mm10.chr14 I 253 C 0 e canFam3.chr15 46940245 0 - 64190966 C e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=551465.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 415767 265 + 478999 AG-GTACTTCTTTCATAATTCCCAATTCTGACC-----ATACCTGAAAACCTCTGCTATTAATTAATATATT--------------AGGATTAGATATATTTTGA-----------------AAAGCATATCTTTTGATGTTTTAAATAGATGTGCCATTATAAATATTTTCTTTGATTTCTTAA-TTCGGGACTTTATTGTTTTTGTTTC----CCTCTCTTCTTACACACCGACTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTAC-----GCTTCATAGTCC---ACATTA-------TTTTAAAACAAATGT s ponAbe2.chr14 18946948 274 + 108868599 AA-GTACTTCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATACCTGAAAACCTCTGCTATTAATTAATACATT--------------AGGGTTAGATATATTTTAA-----------------AAAGCATATCTTTTGATGTTTCAAATAGATGTGCCATTATAAATATTTTCTTTGATTTCTTAA-TTTTGGACTTCATTGTTTTTGTTTCTTTCCCTCTCCTCTTACACACTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTACTCTGCACTTCATATTCC---ACATTA-------TTTTAAAACAAATGT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88037142 274 - 170124641 AG-GTACTTCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATAACCGAAAACCTCTGCTATTAACTAATGTATC--------------AGGGTTAGATACATTTTAG-----------------AAAGCATGTCTTTTGATGTTTCAAATAGATGTGCCATTATAAATGTTTTCTTTGATTTCTTAA-TTTGGAACTTTATTGTTTTTGTTTCTTTCCCTCTCCTTTTACATGCTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTACTCTACACTTCATATTCC---ACATTA-------TTTTAAAACAAATGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88315422 274 - 171882078 AG-GTACTTCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATAACCGAAAACCTCTGCTATTAATTAATGTATC--------------AGGGTTAGATACATTTTAG-----------------AAAGCATGTCTTTTGATGTTTCAAATAGATGTGCCATTATAAATGTTTTCTTTGATTTCTTAA-TTTGGAACTTTATTGTTTTTGTTTCTTTCCCTCTCCTTTTACATGCTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTACTCTACACTTCATATTCC---ACATTA-------TTTTAAAACAAATGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85444920 274 - 162156779 ag-gtACTTCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATAACCGAAAACCTCTGCTATTAATTAATGTATC--------------AGGGTTAGATACATTTTAG-----------------AAAGCATGTCTTTTGATGTTTCAAATAGATGTGccattataaatgttttctttgatttcttaa-tttggaactttattgtttttgtttctttccctctccttttacATGCTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTACTCTACACTTCATAttcc---acatta-------ttttaaaacaaatgt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3602106 274 - 24206276 AG-GTACTTCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATAACTGAAAACCTCTGCTATTAATTAATGTATC--------------AGGGTTAGATATATTTTAG-----------------AAAGCATGTCTTTTGATGTTTCAAATAGATGTGCCATTATAAATATTTTCTTTGATTTCTTAA-TTTGGAACTTTATTGTTTTTGTTTCTTTCCCTCTCCTTTTACATGCTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--C--CTCTTT--CCCTCTACTCTACACTTCATATTCC---ACATTA-------TTTTAAAACACATGT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87768761 268 - 132174527 AG-CTACTGCTTTCATAATTCCCAATTTTGACC-----ATATCTGAAAACCTCAGCTATTAATTAATCTATT--------------AGTATTAGATATATTTTAA-----------------AAAGCATATTGTTTGATGTTTC-AATAGATGTGTCATTATAAATATTTTCTTTGATTTCTTAA-TTTGGGACTTTATGATTTT--TTCCTTTCCCTCTC-----ACATGCTGTCTCCTCATTCAGT--TAGTTAATGAA--CTTTTCTTT--CCCTCTAGTCTACATTTCATATTCC---ACATTA-------TTTAAAAACAAATGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74601672 304 - 124902244 AATGTGCTAATTCTAT-------AATTTTAACCCAAGAATATATGGAAACATAT--CATTATTAAATATATCAATAAAAGGACAGAAGAGACAGCTGTATTATAAATGAATAAAATAGAAACAGAGAAGATC-TTGGACATCT--AAAAGAGGTAAAAGTTTAAATATTTGAACTGATTT-TTAA-TTTGAGAGACTTGCCCTTTTACTCCTTT---TTTCCTCTTCCAATCTGTTTCTT--TCCAGTTGTAGATAATGAAGCC--CTCTTT--ACTTCAACTATATTTTCCACTTTCA---ATGATGTTACCATTTTTTAAAAAAATGC i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46940245 274 - 64190966 AA-GTACCTCTTTTAT----TCCTATTTAGACT-----ATACATGGAAACCTCTGCTACCAATTATTCTATC-------------TAGGTTTAGACATA---CAA-----------------AAAGCAGCTATTTTGATGTTTTGAATAGATGTGTCATTGTAAAAATTTCCTTTGGTTTCTCAAGTTTGGAACTTTATTGCTTTTCTCTTCCATCTTTCCCTCTTTAAATCCATCTCATCTTACATT--TAGTTAGTGAA--C--CCTTTTTGCTCTCCTCTCTACACTCCATATTCCACAACACTA-------TTTAAAAACAAGTGT i canFam3.chr15 C 0 I 411 e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=2035849.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 416032 1025 + 478999 GCTGTGTAACAGAAG----C-ATATGAAATATTTTTCTGTATCACATTGTAGTATTTTGTTCTAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTAAATTTTTTT-ATTTCAACCACAAACCATtttttgaacatgcaccaaaaacatacgtatcttctttatgca--tttcatatccaattacatcatgattctatataaa-tgtaaaatgttc-aaaaataaaacttcaaacaataggatacaataatgtaagtgtagaaattctcctattattgctttcataccaataaattatcatgcacatccccaagcatgagcacagtctcaatttggaagccactgTACAGAGAAGCCTCAGATCTTGTTTTCTCCAGAGTGACTGAGAG-CTTTTTATTTAGACCAGTTCATTTGGTTGATGTTCTATAGAGAAAAGGGAATTA----TTTCTGGTAAGTACAGTTGCCTTTATAAAAGtttttagataaacattcctaaggtagcatttatat----aaaataaattgtactaattgctgtatagttcaata-ctcaataaattttgaca--aaaatagatacatat--aaccatt-----ataattaaaa-acggaacatttctgtccccttgaaaagttctgtcattcttctttgctgtcaatc-ccAGCTCATCTTCCATTCAAAGCAAAACATGAAGACCTCAAT------AACTGGGGTTAAGTTTTTTCT-CAGTCAGAAAAATTTTCATATGCCTCATACA--AATCAGGAACAAATTCAGAGCAGTAACATCC--AAGTCTCACATGAGTGAACACTTAAACAGAAGCACAGGACTGAAACAGAAGAAAGAGTGTGGCTTCAGGACCAGGGTGTTGG-CTATCATGAAATGAGGAAGCATAAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------AGGTTGTTGAGATAGATAGAATAATATAAATGTGGCATACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACACCTGAAAATAAACTCT---TT--TATTGATATTCTACAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAACACAGTAGTGAC s ponAbe2.chr14 18947222 1028 + 108868599 GCCATGTAACAGAAG----C-ATATGAAATATTTTTCTGTATCACATTGTAGTGTTTTGTTCTAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTAAATTTTTTTTACTTCAACCACAAACCATtttttgagcatgcatcaaaaacatatgtatcttctttatgca--tttcatatttaattataccatgattctatataaactgtaaaatgttc-aaaaataaaacttcaaagaataggatacaataatgtaattgtagaaattctcctattattgctttcatagcaataaattatcatgcacatccccaagcgtgagcacagtctcaatttggaggccactgTACAGAGAAGCCTCAGATCTTGTTTTCTCCAGAGTGACCAAGAGTCTTTTTATTTAGACGAGTTCATTTGGTTGATATTCTATAGAGAAAAGGGAATTAATTACTTCTGGTAAGTACAGTTGCCTTTATAAAAGtttttagataaacattcctaaggtagcatttatat----aaaataaattttactaattgctgtatagtttaata-ctcaataagttttgaca--aaaatagatacatat--aacaatt-----ataattaaaa-atggaacatttctgtccccttgaaaagctctgtcattcttctttgctctcaatc-ccAGCTCATCTTCCATTCAAAGTAAAACATGAAGACCTCAAT------AACTAGGGTTAAGTTTTTTCT-CAGTCAGAAAAATTTTCATATGCCTCATACA--AATCAGGACCAAATTCAGAGCAGAAGCATCC--AAGTCTCACATGAGTGAGCACTGGAACAGAAGCACAGGACTGAAACGGAAGGAAGAGTGTGGCTTCAGGACCCGGGAGCTGG-CCATCACGAAATGAGGAAGCATAAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------AGGTTGCTGAGATAGA----ATGATATAAATGTGGCACACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACGCCTGAAAATAAACTCT---TT--TATTGATATTCTACAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAACACAGTAGTGAC i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88037416 1022 - 170124641 GCCATGTAACAGAAG----C-ATATGAAATATTTTTCCATATCACATTGTAGTGTTTTGTTCTAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTATTTTTTTTT-ATTTCAACCACAAACCatttttc-agcatgcaccaaaaacatacatatcttctttatgca--tttcatattcaattataccatgattctatataaactgtaaaatgttcaaaaaataaaacttcaaaccataggatataataatgtaagtgtagaaattctcctattattgctttcataccaataaattatcacacacat-cccaaacgggagcacagtctcaatttggaggccactgTACAGAGAAGTCTCAGATCTTGTTTGCTCCAGAGTGACCAAGAGTCTTTATATTTAGACCAGTTTGTTCGGTTGATGTTCTATAGAGAAAAGGGAATTA----TTTCTGGTAAGTACAGTTGCTTTTATAAAAGtttttagattaacattcctaaggcatcatttatat----aaaataaattgtactaattgctatatagtgcaata-ctcaataagttttgaca--aaaatagatacatat--aaccatt-----ataattaaaa-atgaaacatttctgtccccttgaaaagctctgtcattcttctttgctgtcaatc-ccAGCTCATCTTCCATTCAAAGCAAAACATGAAGACCTCGAT------AACTGGGGTTAAATTTTTTCT-CAGTAAGAAAAATTTTCCTGTGCCTCATACA--AATCAGGAACACATTCAGAGCAGTAGCATCC--AAGTCGCACATGAGTGAACACTTAAACAGAAGCTCAGGACTGAAACAGAAGGAAGAATGTGGCTTCAGGACCAGGGTGTTAG-CCATCATGACACGAGGAAGCATAAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------GGGTTGTTAAGACAGATAGAATAATATAAATGTGGCATACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACACATGAAAATAAACTCT---------TTGATATTCCATAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAATACAGTAGTGAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88315696 1022 - 171882078 GCCATGTAACAGAAG----C-ATATGAAATATTTTTCCGTATCACATTGTAGTGTTTTGTTCTAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTATTTTTTTTT-ATTTCAACCACAAACCATTTTTC-AGCATGTACCAAAAACATACGTATCTTCTTTATGCA--TTTCATATTCAATTATACCATGATTCTATATAAACTGTAAAATGTGC-AAAAATAAAACTTCAAACCATAGGATATAATAATGTAAGTGTAGAAATTCTCCTATTATTGCTTTCATACCAATAAATTATCACACACATCCCCAAACGGGAGCACAGTCTCAATTTGGAGGCCACTGTACAGAGAAGTCTCAGATCTTGTTTGCTCCAGAGTGACCAAGAGTCTTTATATTTAGACCAGTTTGTTCGGTTGATGTTCTATAGAGAAAAGGGAATTA----TTTCTGGTAAGTACAGTTGCTTTTATAAAAGtttttagattaacattcctaaggtatcatttatat----aaaataaattgtactaattgctatatagtgcaata-ctcaataagttttgaca--aaaatagatacatat--aaccatt-----ataattaaaa-atgaaacatttctgtccccttgaaaagctctgtcattcttctttgctgtcaatc-ccAGCTCATCTTCCATTCAAAGCAAAACATGAAGACCTCGAT------AACTGGGGTTAAATTTTTTCT-CAGTAAGAAAAATTTTCCTGTGCCTCATACA--AATCAGGAACACATTCAGAGCAGTAGCATCC--AAGTCGCACATGAGTGAACACTTAAACAGAAGCTCAGGACTGAAACAGAAGCAAGAATGTGGCTTCAGGACCAGGGTGTTAG-CCATCATGACATGAGGAAGCATTAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------GGGTTGTTAAGACAGATAGAATAATATAAATGTGGCATACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACACATGAAAATAAACTCT---------TTGATATTCCATAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAATACAGTAGTGAC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85445194 1021 - 162156779 gcCATGTAACAGAag----c-atatgaaatatttttccgtATCACATTGTAGTGTTTTGTTCTAGCTCAAGatcttt--agctt--tta-tttttttt-atttcaaccaCAAACCATTTTTC-AGCATGCACCAAAAACATACGTATCTTCTTTATGCA--TTTCATATTCAATCATACCATGATTCTATATAAACtgtaaaatgttc-aaaaataaaacttcaaaccATAGGATATAATAATGTAAGTGTAGAAATTCTCCTATTATTGCTTTCATACCAATAAATTATCACACACATCCCCAAACGGGAGCACAGTCTCAATTTGGAGGCCACTGTACAGAGAAGTCTCAGATCTTGTTTGCTCCAGAGTGACCAAGAGTCTTTATATTTAGACCAGTTTGTTCAGTTGATGTtctatagagaaaagggaatta----ttTCTGGTAAGTACAGTTgcttttataaaagtttttaGATTAACATTCCTAAagtatcatttatat----aaaataaattgtactaATTGCTATATAGTGCAATA-CTCAATAAGTTTTgaca--aaaatagatacatat--aaccatt-----ataattaaaa-atgaaacatttctgtCCCCTTGAAAAGCTCTGTCATTCTTCTTTGCTGTCAATC-CCAGCTTATCTTCCATTCAAAGCAAAACATGAAGACCTCGAT------AACTGGGGTTAAATTTTTTCT-CAGTCAGAAAAATTTTCCTGTGCCTCATACA--AATCAGGAACACATTCAGAGCAGTAGCATCC--AAGTCGCACATGAGTGAGCACTTAAACAGAAGCTCAGGACTGAAACAGAAGGAAGAATGTGGCTTCAGGACCAGGGTGTTAG-CCATCATGACATGAGGAAGCATAAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------GGGTTGTTAAGACAGATAGAATAATATAAATGTGGCATACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACACATGAAAATAAACTCT---------TTGATATTCCATAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAATACAGTAGTGAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3602380 1018 - 24206276 GCCATGTAACAGAAG----C-ATATGAAATATTTTTCTGTATCACAATGTAGTGTTTTGTTCTAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTATTTTTTTTT-ATTTCAACCACAAACCatttttc-agcatgcaccaaaaacatacgtatcttctttatgca--tttcatattcaattataccatgattctatataaactgtaaaatgttc-aaaaataaaacttcaaaccataggatataataatgtaagtgtagaaattctcctattattgctttcataccaataaattatcacacacatccccaaacgggagcacagtctcaatttggaggccactATACAGAGAAGTCTCAGATCTTGTTTGCTCCAGAGTGACCAAGAGTCTTTATATTTAGACTAGTTTGTTCAGTTGATGTTCTATAGAGAAAAGAGAATTA----TTTCTGGTAAGTACAGTTGCTTTTATAAAAGtttttagattaacattcctaaggtatcatttatat----aaaataaattgtactaattgctatatagttcaata-ctcaataagttttgaca--aaaatagatacatat--aactatt-----ataattaaaa-atgaaacatttctgtccccttgaaaagctctgtcattcttctttgctgtcaatc-ccagctcatcctccattcAAAGAAAAACATGAAAACCTCGAT------AACTGGGGTTAAGTTTTTTCT-CAGTCAGAAAAATTTTCCTATG----ATACA--AATCAGGAACACATTCAGAGCAGTAGCATCC--AAGTTGCACATGAGTGAACACTTAAACAGAAGCTCAGGACTGAAACAGAAGGAAGAATGTGGCTTCAGGACCAGGGTGTTAG-CCATCATGACATGAGGAAGCATAAA--CAGTAGAAGTGATTTCTT--------GGGTTGTTAAGACAGATAGAATAATATAAATGTGGCATACCTTGTGTTTAGTTCAAGAACTATAATCTAGATGTAACACATGAAAATAAACTCT---------TTGATATTTCATAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAATACAGTAGTGAC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87769029 1001 - 132174527 ACCATGTAACAGAAG----C-ACATGAAAAATTTTTCTGTATCAAATTGTAGTGTTTTGTTACAGCTCAAGATCTTT--AGCTT--TTAAATTTTTTT-ATTTCAGCCATAAACCATTTTTTGAGC-----------------------------TGTA--TTTCATATTCATTTATACTATGATTCTATATAAACTGTAAAATGTTA-AAAAACAAAACTTCAAACAATAGgatacaataatatatgtgtagaaattctcctattattgcttttataccaataaattatcatgcacatccccaggcatgagtgcagtctcaatttggaggctgctgTACATAGAAGCCTCAGCTCTTGTTTTCTCCAGCATTACCGAGATTCTTTTTATTTAGTCCAGCTTGTTTAGCTGATGCTCTATAGAGAAAAGGGAATTA----TTTCTGGTAAGCATAGTTGCTTTTATCAAAGTTTTTAGATAAAAACTCCtaaggtatcatttatat----aaaataatttgtactaattgctgtatagttcaatagctcaatcagttttgaca--aaaatagatacatat--aaccatt-----ataattaaaa-atggaacatttctgttccctcaaaaagctctgtcattcttctttgctgtcaatc-tcagctcatcctccattctaagcAAAACATGAAGACCTCGAT------AACTGGGGTTAAGTTTTCCTT-TAGTCAGAAAATTTTTCCTATGCCTCATACA--AATCAGTAAC--ATTCAGAACAGTAGCATTC--AAGTCTCACATGAGTGAACACTTAAACAGAAGCACAGGACTGAAACAGAAGGAAGAGTGTGGCTTCAGGACCAGAGTGTTGG-CCATCATGAAATGAGGAAGCGTAAA--GGGTAGAAATGATTTCTTCTTTGAAATTGTTGTTGAGATAGA----ATAATATAAATGTGGCATATCTTGTGTTTAGTTTAAGAACTATAATCTAGATGTAACACATGAAAATAAACTCT---TT--GATTGATAATCTATAGGCAGAGGAAATGAAGATAGAAAAACAGCGAGTAGTGAC i calJac3.chr10 C 0 C 0 s mm10.chr14 74601976 990 - 124902244 ATTTTGGAAGGAAGA----CGGTGTAAAACAATCTC---TATAAGATTGAATTATTTCTATGTAATATAGGAGCCTT--TGTTTACTCAAATTTT----ACCTTACTCACAACCTCTTTGTG----ATAAAACAAATAGCTTAAAGATTTCTTTGTGTAGTTGTAGTTGTCAACAAGAGAATGATGTTATTAAAACTATAAAA----C-TGAAAGATATCTTCAAAATCTTCTATATA--AATACATGCAGTGAAAT-----TGCTGCAACTATGATAACATCAAAATGACAGATTTATTCTCATATA-GAGCACACTCCTCAGAAGGAGATTTTCATCCAGAAAAGCATCAGTT----TCTTCTTCAGC-TGCCCAAAACTTTCTGTATCCACATTTGATTAATAGCTACATCTTCACTAAGGAAAAA-----TA----TCCTCAGAAAATG-AGGGATTTTTTTGTGGTTACTTAGAGAAAAGTTTTTAAGCCATAACTGATGTCTAGAAAACAAA---TATCAACTG----ATAATATAA-A-TTCAAT-AGTTTTGATA--AATAAATACACATATGAAACAATTACTTCATAGTTAAGACATAGA--ATTTATG----------------TATCATCCCTCTTAACTAGAAATC-TTTATTGATTTCCTTGAAAAATATATACATGAAGACTTAAATCCATACAGGTAAGGTTGTCTTCTTTATACAATAACCAAACCAAACCAATTTCTTTTAGGGCAATTAGAAATAAACCCAAAACAACAGAATC------TTTTACTTCATATAATAGTCAAATAGAAGTTCTGGACTAATGCTGAGACAAAGGTGTGGCTTAAAGAGTAAGATGTTTGTCCATTATGAAATGTAGAAGCTAAAGGTCAGAAGAGGTGGTTTTAT--------ATAT-----AGAGAGATGAGATAATACACCAGTGTCTAACTATGCTTCTAGAATAATAGCTATGTTCTAGTTAGAAGAGGCATAAAGAATTGTTTTATT--TGTTGATGTTGTATAGGGACTGGCGATGGAGACAGAAAACAGGACAGTTGTCAC i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46940930 1004 - 64190966 actgtgccacccaggaaccc-cTGTGAAATATTATTTTAAATCAC----TAGCATTTTTCTCTAATTCCAATGTTTTCAAGCTT--TTAAATTTTTTC-ATTTTAGTAATGAACCATTTTG--AATATGCACAAGTAACATCTATATTTTATTTGTATA--TTTTATGTTCAATTATACCATGACTCTACATAAAGTATAAAATTTTC-AAAAATAGAACTTCAAGGAATGGGATATAAAAACATACGAATATAAATTC---TATTATTATTTTCATACCAATAAATTATCATATGTGTT-----GGGCAACCACATTCCCAGTTTAGAGGCCATTGTACAGATAAACCTCAGATCTC-TTTTCTCCAGAGTAACCAGGAATTTTT---TTTAGATCATGTGAATGAGTTGATATTATATACAGGAAAAGGAAATA----GTTCAAGTAAAT--AGTTTTTTTTTT--AACTTCTTACatcagcatgactaagttataatttgcat----aaattaaa-tgtaccaacttttgtatagtttagta--------agttttggtgatagaatgaatacttgt--aaccatt-----acagtcaagatatgcaaattttctgttaccttaaaaaactctgtcattcctctgtgctggaagtctccagctctactcccaTTCAAATAAAAACCTGAAGAACTTGAT------AACAGAGGTTAAGTTTTTTCT-CAATCACTGACCTTTTCTTATGCCTCATGCA--AATCATAAACAAGTCCAGGG-AGGGGCATTCCAGAGTCCCATGTGAGAGAACAGTGAAATAGAAGCACAGGAA-GAAGCAGAAGAAG----GTGGCTGCAA-ACCAGGGTGTTGGTAGATAACGAAATGTAGAAGAAGAAT--GATTAGAAAAGATTTCTT--------AGGT-GATGGGGAAGTGATGGTGTAACAGATGTGACATACGCTGCTTTTAGTTTTAGAACTATGAGCTACATGCAAGAAATGAAATTAAATTAT---CTACCTCTGATATTCTATAGGCAGAGGAGATGGAGGCAGAAAATAGCACAGTGGTGAA i canFam3.chr15 I 411 C 0 e panTro4.chr14 18738982 26511 + 106544938 I a score=127349.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 417057 38 + 478999 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATA s panTro4.chr14 18765493 38 + 106544938 AGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCAAGATA i panTro4.chr14 I 26511 C 0 s ponAbe2.chr14 18948250 38 + 108868599 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCGAGATA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88038438 38 - 170124641 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88316718 38 - 171882078 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85446215 38 - 162156779 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3603398 38 - 24206276 AGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87770030 38 - 132174527 AGAATTTATCCTCCGGGGTTTGACCCAGTCTCAAGATA i calJac3.chr10 C 0 I 11880 s mm10.chr14 74602966 38 - 124902244 AGAATTCATCTTCACAGGACTGACAGAGTCACTTGACA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46941934 38 - 64190966 AGAATTCATCCTTCTTGGTCTAACCCAGTCTCGAAATA i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=3057340.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 417095 829 + 478999 TTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCTTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGGCAGCTTCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCATGTGCACCACTCGTGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACATGTGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGATGGTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA s panTro4.chr14 18765531 829 + 106544938 TTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAAGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCCGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGCGAAGAAGATAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCTACTGTCATGAACCCTAGAACCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCGACACATTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACGTGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAA i panTro4.chr14 C 0 T 27378 s ponAbe2.chr14 18948288 830 + 108868599 TTCGGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATCCTCCCCGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAGTCAGACCCTGGCCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCGTCATTGCGGCTCCCCGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGCGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCGACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTCGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACACATTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGGCAGCTTCTGAAGCGAGGAACAAGGCCATGTCCACGTGCACCACTCATGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACACACGCCCCTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGGTGGTTTCTTTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTTGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88038476 829 - 170124641 TTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATTCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAGTCAGATCCTGGTCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCAGCCTCTGCACTATTTAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTAGAGCTTCTGATAGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGACAGCTGCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCATCACTCATGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGGTGGTTTCTTTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88316756 829 - 171882078 CTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATTCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAGTCAGATCCTGGTCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCACTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCAGCCTCTGCACTATTTAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGCAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGACAGCTGCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCATCACTCATGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGGTGGTTTCTTTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85446253 829 - 162156779 TTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATTCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAGTCAGATCCTGGTCTCACAGCCcccctctatttctttctgggCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCCTACACTTCcttggaggaggggagggattACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACATTTGTGGTAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGACAGCTGCTGAAAGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCATCACTCATGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGgtggtttctttctttcacacAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3603436 829 - 24206276 TTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATTCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAGTCAGATCCTGGCCTCACAGCTCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTTCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGCGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGTAATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCACTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTTATCCTCTGCCATGTTCGTAGGACAGCTTCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCATGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGGTGGTTTCTTTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCGGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87781948 829 - 132174527 TGCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACTTTATCATCCTTCCTGGTAATTTCCTCATCGTTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCACTCTACTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCTTCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGCTTGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTTTACACTATTCAACTGTTATGAACCCTAGAGCCTGTTATGCAATGTTGTTGGCTTTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTGTCCAGGTGGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCGACACGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCTTGTGCTTCCTGGGGCTTCTGACCTCCTATGCAGTCATTCTGTGTCGTATACGGGGGTCTTCCTCTGAGGGGAAAAACAAGGCCGTGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATGTTCCTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATTTACACACGCCCCTTCCGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACTGTGATCTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAA i calJac3.chr10 I 11880 C 0 s mm10.chr14 74603004 829 - 124902244 TTCAACGCTTGGTCTTTGTTCTGAGCTTAATTTTCTACATCATCATTTTGCCTGGAAATGTCTTCATCATCCTCACCATCATATCAGACCCTGGACTTACTGCCCCTCTTTATTTATTCCTGGGAAATTTGGCCTTCCTGGATGCCTCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCTAGGATGTTGATAGACATCTTCTCTGAGAAGAAGATAATCTCCTACAAAGCCTGCATCACTCAGCTATTTTTTTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAATTTTTACTACTGGTTGTAATGGCCTTTGACCGCTACATTGCCATCTGCAGGCCTTTGTATTACTCCACTGTCATGAATCCCAGAGTCTGCTATGTGATGTTGTTGGCTCCCTGGCTTGGAGGATTTATTCACTCCATTATTCAGGTTGTCCT-CATCCTCCGCTTGCCCTTCTGTGGTCCAAATCATCTAGATAATTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTAGCCTGTACAGACACCTTTGCAGTCGAGATCCTTATGATCTTCAATAGTGGCCTGCTTACCCTTGTGTGCTTTCTTGGTCTTCTGACTTCCTATGCAGTTATTTTATGCCATGTTCACAGGTCAGCTTCTGAAGGAAAAAACAAAGCTATATCTACATGTACCACTCATGTTATCATTATATTTCTTATGTTTGGACCTGCAATTTTTATTTATACACGTCCATTCACTGCTCTATCAGCTGACAAAGTGGTTTCTTTCTTCCATACAGTAATATTTCCCTTATTGAATCCTGTTATTTATACCCTTCGAAACCAGGAAGTAAAAACTTCCATGAA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46941972 829 - 64190966 TTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATCTTCTATTTCATCATCCTCCCTGGAAACTTCCTCATCATCCTCACCATCAGAACAGATCCTGGCCTCACAGCCCCCCTCTACTTCTTTCTGGGCAACTTGGCTTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGCTGGTGGACTTCCTTTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGGGGTTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAAGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATTGCCATCTGTCGGCCTTTACACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCCTTGCTATTGGCTCTGTGGCTTGGAGGCTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGCCCT-CATCCTCCGCTTGCCCTTCTGTGGCCCAAACCGACTGGATAACTTCTTCTGTGATGTGCCGCAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACAGACACCTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAATAGTGGTCTGCTCACTCTCCTGTGCTTCTTGGGGCTCTTGTCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTACATGGGTCTGCTTGTGAAGGGAAGAGCAAAGCAGTGTCCACGTGTACCACTCATGTCATGATTATACTTCTCATGTTTGGGCCTGCCATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCTTTATCAGCTGACAAGGTAGTTTCCTTCTTTCACACTGTGATCTTTCCTTTGTTGAATCCTGTGATTTATACCCTTCGCAACCAAGAAGTGAAAACTTCCATGAG i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=336444.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 417924 176 + 478999 GAGGTTATTGAGTCGACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGAATTCTGGCTGGAATTCAT-------------Atcattcattta---acaagtcctgtttttcactgagtacctcccatttgccaggtaccattgtaggca-atggagGAGAGTTATGCATAATGAGAGA s ponAbe2.chr14 18949118 176 + 108868599 GAGGTTATTGAGTCAACATGTAGTCTGTCAAGCGGACTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGAATTCTGGCTGGAATTCAT-------------Atcattcattta---acaagtcctgtttttcactgagtacctcccatttgccaggtaccattgtaggca-atggagGAGAGTTACGCATAATGAGAGA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88039305 176 - 170124641 GAGGTTATTGAGTCGGCATGTAGTCTGTCAAGTGGACTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGACTTCTGGCTGGAATTCAT-------------Atcactcattta---acaagtcctgtttttcactgagtacctcccatttgccaggtactattgtaggca-atggggGAGAGTTATGCATAATGAGAGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88317585 176 - 171882078 GAGGTTATTGAGTCGGCATGTAGTCTGTCAAGTGGACTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGAATTCTGGCTGGAATTCAT-------------ATCGCTAATTTA---ACAAGTCCTGTTTttcactgagtacctcccatttgccaggtactattgtaggca-atggggGAGAGTTATGCATAATGAGAGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85447082 176 - 162156779 GAGGTTATTGAGTCGGCATGTAGTCTGTCAAGTGGACTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGAATTCTGGCTGGAATTCAT-------------ATCACTCATTTA---ACAAGTCCTGTTTTTCATTGAGTACCTCCCATTTGCCAGGTACTATTGTAGGCA-ATGGGGGAGAGTTATGCATAATGAGAGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3604265 176 - 24206276 GAGGTTATTGAGTCGGCATGTAGTCTGTCAAGTGGACTTTATAATAAGAAACTGAGAAG-----GAGGAATTCTGGCTGGAATTCAT-------------Atcactcattta---acaagtcctgtttttcactgagtacctcccattttccaggtactattgtaggca-atggggGAGAGTTATGCATAATGAGAGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87782777 190 - 132174527 AAAGGTGTTTAATAAGCACATGGCCTGAAAAAAGGGC---AAAATAAAAGAATAAAAAAAGACTGTAGAATTTTATCTGAAATTGATTTGTTTATGGAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGTACTG-CAATCATTGAACACATCCCATTTGTCAGG-ACTATCCTAGGAACAGAAAAAAGAAATATG---AATGAGAGA i calJac3.chr10 C 0 T 12312 s mm10.chr14 74603833 171 - 124902244 AAAGTTATTTATTCGTCAAGTAATTTGTTAATTGGGTTTTTAAAGAATCAATCAGGCAG-----GAAAGATTTGACATGGTATTTAT--------------TAAGTTATATA---ATAATTTATGTTCT----TGATTAGATCTTGTTTTTCAGATACTATTATATGCA-ACTTGATGCGTTTATACATAGCAAGAGA i mm10.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46942801 173 - 64190966 GAGGTTATTGAGTCGGCATGTGGTCTGCTGAA-AGATTTAATAATAGGAAGTCAAGAGA-----GA-GAATTCTTATTGTAAATAat-------------a-cattcactta---acaaatactgttcttcactgagtacctctcatttgtcaggtactgttgtaggca-atgaggtagagttatgcataaTTAGGGC i canFam3.chr15 C 0 C 0 e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T a score=412265.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418100 249 + 478999 ATAAACTTATTAtatttaaagaatataaaggaaaccccagagtg---gttgaagtataatgagtaagtgtgagaaatttaagggttaagttttatgtgactgcaagggtc--------------tttcagtctgaggtaagaattttttcatattttaattgtggtaagaac-ccattttaatgttttaagcaaaggag--CAGTTCATCTACAATGCTTTCCTCTACTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCAGAGATTAAT s ponAbe2.chr14 18949294 248 + 108868599 ATTAACTTATTAAAtttaaagaatataaaggaaaccccagagtg---gttgaagtataatgagtaagtgtgagaaatttaggggttaagtcttatgtgactgcaagggtc--------------ttttagtctgaggtaagaa-tttttcatattttaattgtggtaagaac-ccattttaatgttttaagcaaaggag--CAGTTCATCTACAATGCTTTCCTCTATTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCAGAGATTAAT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88039481 249 - 170124641 ATAAACTTACTAtgtttaaagaatataaaggaaaccccagagtt---gttgaagtataatgagtaagtgtgagaaatttaggggttaagttttatgtgactgcaagggtc--------------ttttagtctgaggtaagaaatttttcgtattttaattgtggtaagaat-ccattttaatgttttaagcaaaggag--CAGCTCATCTACAATGCTTTCCTCTATTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCCGAGATTAAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88317761 249 - 171882078 ATAAACTTATTATGTTTAAAGAATATAAAGGAAACCCCAGAGTT---GTTGAAGTATAATGAGTAAGTGTGAGAAATTTAGGGGTTAAGTTTTATGTGACTGCAAGGGTC--------------TTTTAGTCTGAGGTAAGAAATTTTTCGTATTTTAATTGTGGTAAGAAT-CCATTTTAATGTTTTAAGCAAAGGAG--CAGCTCATCTACAATGCTTTCCTCTATTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCCGAGATTAAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85447258 249 - 162156779 ATAAACTTATTATGTTTAAAGAATATAAAGGAAACCCCAGAGTT---GTTGAAGTATAATGAGTAAGTGTGAGAAATTTAGGGGTTAAGTTTTATGTGACTGCAAGGGTC--------------TTTTAGTCTGAGGTAAGAAATTTTTCGTATTTTAATTGTGGTAAGAat-ccattttaatgttttaagcaaaGGAG--CAGCTCATCTGCAATGCTTTCCTCTATTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCAGAGATTAAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3604441 249 - 24206276 ATAAACTTATTATGTTTAAAGAATATAAAGGAAACCCCAGAGTT---GTTGAAGTATAATGAGTAAGTGTGAGAAATTTAGGGGTTAAATTTTATGTGACTGCAAGGATC--------------TTTTAGTCTGAGGTAAGAAATTTTTCATATTTTAATTGTGGTAAGAAT-CCATTTTAATGTCTTAAGCAAAGGAG--CAGCTCATCTACAATGCTTTCCTCTATTGGTTAGAGCAACAT--CAGCAAGATTTTAGGCAGAGATTAAT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s mm10.chr14 74604004 256 - 124902244 TTAAAATTGT----CTTAAAGGATGTGAAAGAATGAATAGATTT---ATCTAAGTACAATAGATAAGTGTGATAGTTATATGGATTAAATTTTATATCA-TGTGTGGGTTAATACACTTAAGGGCTTTATGCTAAAGTCAGTA-GTTTCAGTATCTCCATAGCAGTAGTAATACCATCTTTGTAT-TCAAGCATCAGAA--CAAGTAACTGACAGTTCT---ATCTGTTGTGTAATGAAACATGACTGTAAGATTCTATGAAGAGATCCAT i mm10.chr14 C 0 N 0 s canFam3.chr15 46942974 260 - 64190966 ATAAACTTGATATGTTTAAAGATTATAAAATAAACATCCATTTCTCAGCTGGAGTATGATGAATAATTGTGAGAGATTTAGGGGATAAAT-TTATATTATGGTAAGATTCAAATCACTAAGGTGTGTTAGGCTTAGATAAAGAGTTT----TATTCTAATTGCTGTAAGAAT-GTTTGTTAATATTTTAAGCAAGAGAGTCTCACTCATTCACAACTGTTTCTTCTATGGTTTAGAGCAATGT--CAG---GATTCTGGCCAGAGATCAAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=130918.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418349 139 + 478999 AAACTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTATGAAAAAGACta------tagtattttatatatata---aatat-att-aaaattatatatattttaatgtttttatatatattttatatatatgtatatttaca s ponAbe2.chr14 18949542 134 + 108868599 AAGTTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTGTGAAAAAGACTA------TAGTCttt----tatata---aatat-attaaaaattatacatattttaatGTTTT--tatatattttataaatatgtatatttaca i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88039730 143 - 170124641 AAGCTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTGTGCAAAAGACtatatatgtagtct----tatatatatataatataattaaaaattatata-attttaatgttta--tatatattttataaatatctatatttaca i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88318010 143 - 171882078 AAGCTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTGTGCAAAAGACtatatatgtagtct----tatatatatataatataattaaaaattatata-attttaatgttta--tatatattttataaatatctatatttaca i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85447507 146 - 162156779 AAGCTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTGTGTAAAAGACtatatatgtagtcttttatatatatataaaatataatt-aaaattacata-attttaatgttta--tatatattttataaatatgtatatttaca i papAnu2.chr7 C 0 I 1080 s chlSab2.chr29 3604690 147 - 24206276 AAGCTGTAAAATATC---AAAAACCAAATGT-ATGTTGCAAGTATGTTGTGCAAAAGACtatatatgtagtcttatatatatatacataatataattaaaaattatata-attttaatgttta--tatatattttataaatatgtatatttaca i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46943234 60 - 64190966 AAACTGCAAAACACCATTAAGAGCCAAATGTAATTCTGTAGACTTGTTTTG---ATGCCTCTA------------------------------------------------------------------------------------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=1365.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418488 1 + 478999 t s ponAbe2.chr14 18949676 1 + 108868599 t i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88039873 1 - 170124641 t i rheMac3.chr7 C 0 I 1041 s macFas5.chr7 88318153 1 - 171882078 t i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85448733 1 - 162156779 t i papAnu2.chr7 I 1080 C 0 s chlSab2.chr29 3604837 1 - 24206276 t i chlSab2.chr29 C 0 I 1083 e canFam3.chr15 46943294 0 - 64190966 C e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=906.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418489 3 + 478999 ata s ponAbe2.chr14 18949677 3 + 108868599 ata i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88318154 3 - 171882078 gtg i macFas5.chr7 C 0 I 1087 s papAnu2.chr7 85448734 3 - 162156779 ata i papAnu2.chr7 C 0 I 2 e canFam3.chr15 46943294 0 - 64190966 C e chlSab2.chr29 3604838 1083 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88039874 1041 - 170124641 I e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=4029.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418492 37 + 478999 tataaaataagtaatatatttttatatatttataaat s ponAbe2.chr14 18949680 10 + 108868599 cat---ataagta------------------------ i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88319244 37 - 171882078 tataaaatatgtaatatatttttatatatttataaat i macFas5.chr7 I 1087 C 0 s papAnu2.chr7 85448739 37 - 162156779 tataaaatatgtaatatatttttatatatttataaat i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s canFam3.chr15 46943294 20 - 64190966 ---------------ATATTATTCTCTCTCCCTAA-- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr29 3604838 1083 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88039874 1041 - 170124641 I e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=319397.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418529 256 + 478999 atatatttttatatatttataaatatatatttt-tatatatttaatcaatatataaataaatatatatTTCCCCCCCAAAATTTGGTGGTGAGATAAGAAAGGAAGCCAATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATGAAATTATTCCACTTA-TTTTTTCTTCAGAGCTTCACGATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------ATTAGATATTTAGTACTTCAGATTGTATTATAGATTacataaatcactccagttattttcaacatagtgaa s ponAbe2.chr14 18949690 250 + 108868599 --acatttttatatatttataaatatatattttatatatatttaatcaatatataaataaatatatattCCCCCCCC-AAATTTGGTGGAGAGATAAGAAAGAAAGCCAATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATGAAATTATTTCACTTA-TTTTTTCTTCAGAGCTTCACGATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------AT----TATTTAGTACTACAGATTGTATTATAGATTACATAAATCATTCCAGTTATTTTCAACATAGTGTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88040915 256 - 170124641 atatatttttatatatttataaatatatattttatatatatttaatcaatatataaataaatatatatTTGCCCCCC-AAATTTGGTAGAGAGAGAAGAAAGGAAGCCAATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATGAAATTATTTCACTTA-TTTTTTCTTTAGAGCTTCACAATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------ATTAGATGCTTAGTACTACAGATTATAttgtagattacataaatcactccaggtatttccaacatagtgaa i rheMac3.chr7 I 1041 C 0 s macFas5.chr7 88319281 232 - 171882078 ------------------------atatattttatatatatttaatcaatatataaataaatatatatTTGCCCCCC-AAATTTGGTAGAGAGAGAAGAAAGGAAGCCAATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATGAAATTATTTCACTTA-TTTTTTCTTTAGAGCTTCACAATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------ATTAGATACTTAGTACTACAGATTATAttgtagattacataaatcactccaggtatttccaacatagtgaa i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85448776 232 - 162156779 ------------------------atatattttatagatatttaatcaatatataaataaatatatatttgcccCCC-AAATTTGgtagagggagaagaaaggaagccaATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATgaaattatttcacttatttttttctttagagctTCATGATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------ATTAGATATTTAGTACTACAGATTATATTGTAGATTACAGAAATCACTCCAGTT-TTTTCAACATAGTGAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3605921 255 - 24206276 atatatttttatatatttataaatatatatttcatatatatttaatcaatatataaataaatatatatTTGCCCCCC-AAATTTGGTAGAGAGAGAAGAAAGGAAGCCAATTTGTTTCATGGTAAAATGTCATGAAATTATTTCACTTA-TTTTTTCTTTAGAGCTTCATGATGATTA-------------------------------TTAGACATT-----------------------------ATTAGATATTTAGTACTACAGATTATTttgtagattacataaatcactccagtt-ttttcaacatagtgaa i chlSab2.chr29 I 1083 C 0 s canFam3.chr15 46943314 264 - 64190966 ------------------------------TGCACATATATTT-----------------ATTTATTCCTCACCCCC-AAATTTGTCAAATGGGTAAGAAAAGAAGATAATTGGCTTTAGAGAAAAATGTTGTGAAATTACTTCATTTG-ATTATTTTGCAGAGCTTCATGATTATTACTAATGGGTGTTTACAAATCTTCCTTGTATGTTAAACCTTGCCTTCAATTGATTTCACTCATGATGATAATCAGTTATTTGGTAGTATAGATTCTATTAGAGATTACATAAAT-----tagttattttaaatataatggg i canFam3.chr15 C 0 C 0 e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=766369.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 418785 587 + 478999 gcagcttcgttgtctggggaaatacctgcagttcgttgtcttgtgctgtgccgattaatgacacagactcacacacggagtgggttaaggaacagaaagtttattaggcaagaaggaagagaagagcttccccatacagagggagaaggactctgaatggagtaaccccacttgtggggaaagcagtcagttatattgggaggctcagggaggtagtgtctgatttgcatagggcccaggggattcctttgaccaggtg----tgtcattcacacaacccatgaaaagactggccctcccaccctaatcttttattctgcaaatgcggcttctacctggctgtcgccatgatgcctgcacatgtggctttacttggctggtgccatgacaactgcacatgtggcaacaaaggaaagtgagcgggaacagtcatattgagtggacctggctcttagccacctgcatttacttctccaagcctgtaatttacatacctatgcttccagcatggcttttcaggctgctttctgttagaaaagaaatggtttgggggctgcttttttattaaaaggaaaagcctttctgaggact s ponAbe2.chr14 18949940 586 + 108868599 Gcagcttcgttgtctggggaaatacctgcggttcgttgtctcatgttgtgcagattaatgacacggactcacacacggagtgggttaaggagcagaaagtttattaggcaagagggaagagaagagcttccccatacagagggagaagggctctgaatggagtatccccacttgtggggaaagcagtcagttatattgggaggttctaggaggtagtgtctgatttgcatagggcccaggggattcctttgaccaggtg----tgtcattcacacaacccatgaaaagactggtcctcccaccctaatcttttattctgcaaatgcagcttctatctggctgtcgccatgatgcctgcacatgtggctttgcttggctggtgccatgacatctgcacatgtggcaataaagggaagtgagcgggaacagtcatattgagtggacctggctgttagccacctgcatttacttctgcaagcctgtaatttacatacctatgcttccagcatggcttttcaggctgctttctgttagaaaagaaatggttt-ggggctgcttttttattaaaaggaaaagcctttcttaggact i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88041171 588 - 170124641 gcagcttcgttgtctggggaaatacctgcagttctttgtcttgtgctgtgcagattaacgacacggactcacacacggagtgggttatggagcagaaagtttaataggcaagaaagaagagaagagctcccccatacagagggagaagggctttgaatggaatagccccacttgtggggaaagcggtcagttatattgggaggctcagagaggtggtgtctgatttgcatagggcccaggggattcatttgaccaggtgtgtctgtcattcacacaacccatgaaaagactggccctcccaccctaatcttttattctgcaaatgcggcctctacctggctgtcgccatgatgcctgtacatgtggctttactgggctggtaccatgacaccggcacatgtggcaacaaaggaaagcgagcgggaacagtcatattgagtggacctggctcttagccacctgcatttacttctgcaagcctgcaatttacatatctatgcttgtagcatggcttttcaggccgctttctgttagaa---aaatggtttggaggctgcttttttattaaaaggaaaagcctttctgaggact i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88319513 588 - 171882078 gcagcttcgttgtctggggaaatacctgcagttctttgtcttgtgctgtgcagattaacgacacggactcacacacggagtgggttatggagcagaaagtttaataggcaagaaagaagagaagagctcccccatacagagggagaagggctttgaatggaatagccccacttgtggggaaagcggtcagttatattgggaggctcagagaggtggtgtctgatttgcatagggcccaggggattcatttgaccaggtgtgtctgtcattcacacaacccatgaaaagactggccctcccaccctaatcttttattctgcaaatgcggcctctacctggctgtcaccatgatgcctgtacatgtggctttactgggctggtgccatgacaccggcacatgtggcaacaaaggaaagcgagcgggaacagtcatattgagtggacctggctcttagccacctgcatttacttctgcaagcctgcaatttacatatctatgcttgtagcatggcttttcaggccgctttctgttagaa---aaatggtttggaggctgcttttttattaaaaggaaaagcctttctgaggact i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85449008 591 - 162156779 GCAGCTTTGTTGTCTGGGGAAATATCTGCAGTTCTTTGTCTTGTGCTGTGCAGATTAACGACACGGACTCACACACGGAGTGGGTTATGGAGcagaaagtttaataggcaagaaagaagagaagagctcCCCCATACAGAGGGAGAAGGGCTTTGAATGGAATAGCCCCACTTGCGGGGAAAGCAGTCAGTTATAttgggaggctcagagaggtggtgtctgatttgcatagggcccaGCAGATTCATTTGACCAGGTGTGTCTGTCATTCACACAACCCAAGAAAAGACTGGCCCTCCCACCCAAATCTTTTATTCTGCAAATGCGGCTTCTACCTGGCTGTCGCCATGATGCCTGTACATGTGGCTTTACTTGGCTGGTGCCATGACACTGGCACATGTGGCAACAAAGGAAAGTGAGCGAGAACAGTCATATTAAGTGGACCTGGCTCTTAGCCACCTGCATTTACTTCTGCAAGCCTGCAATTTACATATCTATGCTTGTAGCATGGCTTTTCAGGCTGctttctgttagaaaagaaatggtttgggggctgcttttttattaaaaggaaaagccTTTCTGAGGACT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3606176 591 - 24206276 gcagcttcgttgtctggggaaatacctgtggttctttgtcttgtgctgtgcagattaatgacacggactcacacacggagtgggttatggagcagaaagtttaataggcaagaaagaagagaagagctcccccatacagagggagaagggctttgaatggaatagccccgcttgcggggaaagcagtcagttatattgggaggctcggagaggtggtgtctgatttgcatagggcccaggggattcatttgaccaggtgtatctgtcattcacacaacccatgaaaagactggccctcccaccctaatcttttattctgcaaatgcagcctgtacctggctgtcgccatgatgcctgtacatgtggctttacttggctggtgccatgacaccggcacatgtggcaacaaaggaaagagagcgggaacagtcatattgagtggatctggctcttagccacctgcatttacttctgcaagcctgcaatttacatatctatgcttgtagcatggcttttcaggctgctttctgttagaaaagaaatggtttgggggctgcttttttattaaaaggaaaagcctttctgaggact i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46943578 0 - 64190966 C e panTro4.chr14 18766360 27378 + 106544938 T e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=34523.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 419372 19 + 478999 cttttaccctttctagctg s panTro4.chr14 18738982 19 + 106544938 cttttaccctttctacctg i panTro4.chr14 T 27378 C 0 s ponAbe2.chr14 18950526 19 + 108868599 attttaccctttctagctg i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88041759 19 - 170124641 cttttaccctttctagctg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320101 19 - 171882078 cttttaccctttctagctg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85449599 19 - 162156779 CTTTTACCCTTTCTAGCTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3606767 19 - 24206276 tttttaccctttctagctg i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46943578 0 - 64190966 C e calJac3.chr10 87782967 12312 - 132174527 T a score=95471.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 419391 41 + 478999 cctaaaaataatttcttaataactcctgtattaatagtggg s panTro4.chr14 18739001 41 + 106544938 cctaaaaataatttcttaataactcctgtattaATAGTggg i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18950545 41 + 108868599 cctaaaaataatttcttaataactcctGTATTAATAGTGGG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88041778 41 - 170124641 cctaaaagtaatttcttaataagtcctgtattaatagtggg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320120 41 - 171882078 cctaaaagtaatttcttaataagtcctgtgttaatagtggg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85449618 41 - 162156779 CCTAAAAGTAATTTCTTCATAACTCCTGTATTAATAGTGGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3606786 41 - 24206276 cctaaaaataatttctcaataactcctgtattaatagtggg i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87770655 41 - 132174527 CCCAAAAATAATGTCTTAATAACTTCTGTATTAATAGTgga i calJac3.chr10 T 12312 C 0 e canFam3.chr15 46943578 0 - 64190966 C a score=759197.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 419432 296 + 478999 gtctaatgtgagaaattaggtacttataaaatt-tttcaa-gtatagaagaccattatttatgctgggcatctattatagaaattgttaccagaaaaacactgtagaactaacctgctaagtgacctatccctgccataaccaggagactgagaggacaagaagccactttcccagctcttggctcagggaacacatcAATCAGCCATGGTCTGGCATGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGTTATTGTCTC------TCTAATTA-TTTTTTCTAAATT-AAATTTTGTATGAGTATATT s panTro4.chr14 18739042 286 + 106544938 gtctaatgtgagaaattaggtacttataaaatt-tttcaa-gtatagaagaccattatttatgctgggcatctattacagaaattgttgccagaaaaacactgtagaactaacctgctaggtgacctatccctgcaataaccaggaggccgagaggacaaga-gccact---------cttggctcaaggaacacatcAATCAGCCATGGTCTGGCATGAACTGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGTTATTGTCTC------TCTAATTA-TTTTTTCTAAATT-AAATTTTGTATGAGTATATT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18950586 296 + 108868599 GTCTAATGTGAGAAATTAGGTACTTATAAAATT-TTTCAA-GTATAGAAGACCATTATTTATGCTGGGCATCTATTATAGAAATTGTTGCCAGAAAAACATTGTAAAACTAACCTGCTAAGTGACCTATCCCTGCAATAACCAGGAGACCGAAAGGGCAAGAAGCCACTTTCCCAGCTCTTGGCTCAAGGAACACATCAATCACCCACGGTCTGGCATGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGTTATTGTCTC------TCTAATTA-TTTTTTCTAAGTT-AAATTTTGTATGAGTATATT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88041819 296 - 170124641 gtctaatgtgagaaattaggtacttataaaatt-gttcaa-gtgtagaagaccattatttatgctgggcatctattatagaaattgttgccagaaaaacaccgtagaactaacctgctaagtgatctatccctgcaataaccaggagaccaagaggacaagaagccactttcccagctcttggctcaaggaacacatcAATCAGCCATGGTCTGGCATGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGGTATTGTCTCTCTCTCTCTAATTA-CTTTTTCTAAATT-AAATTTC------GTATATT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320161 296 - 171882078 gtctaatgtgagaaattaggtacttataaaatt-gttcaa-gtgtagaagaccattatttatgctgggcatctattatagaaattgttgccagaaaaacaccgtagaactaacctgctaagtgatctatccctgcaataaccaggagaccaagaggacaagaagccactttcccagctcttggctcaaggaacacatcAATCAGCCATGGTCTGGCACGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGGTATTGTCTCTCTCTCTCTAATTA-TTTTTTCTAAATT-AAATTTC------GCATATT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85449659 296 - 162156779 GTCTAATGTGAGAAATTAGGTACTTATAAAACT-GTTCAA-GTGTAGAAGACCATTATTTATGCTGGGCATCTATTATAGAAATTGTTTCCAGAAAAACACCGTAGAACTAACCTGCTAAGTGATCTATCCCTGCAATAACCAGAAGACCAAGAGGACAAGAAGCCGCTTTCCCAGCTCTTGGCTCAAGGAACACATCAATCAGCCATGGTCTGGCACGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGgtattgtctctctctctctaatta-ttttttctaaatt-aaatttc------GTATATT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3606827 295 - 24206276 gtctaatgtgag-aattaggtacttataaaatt-gttcaa-gtatagaagaccattatttatgctgggcatctattatagaaattgttgccagaaaaacaccatagaactaacctgctaggtgatctatccctgcaataaccaagagaccgagaggacaagaagccactttcccagctcttggctcaaggaacacatcAATCAGGCATGGTCTGGCATGAAGAGAATTGTAGAGAGCACCTCTCATGGTATTGTCTCTCTCTTTCTAATTA-TTTTTTCTAAATT-AAATTTC------ATATATT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87770696 291 - 132174527 gtttaatgtgagaagttaggtgcttataaaattatttcaa-gtatagaagaccattattcatgctgggcatctattatagaaattgttgccagaaaaacactgtagaactaacctgctaagtgactgatccctgcaataaccaggaG------AGGGCAAGAAG-CACTTTCCCAGGTCTTGGCTCAGGGAACG-ATCAATCAGCCATGGTCTGTCATGAAGAGAATTGTAGAGAGTGCCTCTCATGTTATTCTCTCTC----TTTCATTA-TTTTTTCTAAATT-AGATTTTGCATGAGTATATT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46943578 298 - 64190966 gtttaatgttagaaattaggtacttgcaaaatc-ttttaaggtatagaagattattttctatgctaggcatt-----cagacatgattgccagaaaaacagtataaaaataacctgccaagtgatctattgctgcaataatcaggggagtggggaaacaagaagtcATTTTGCCAGTTTCTGACTGAAGGCCGATATCAATAAGCCATGGTCTGGGAATGGGAGGATGATATAGAATACCTTTAGTGTTACTGCTTCTCTC--TCCAATTATTTTTTTCTAAATTCAAGTTTTACAGGAGTACATT i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=401472.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 419728 203 + 478999 TGA----TAGAATCTGTAATGGTAGTGGCAAAAGTCTTTGACAAACCTGTCTGTGTGTTGACAGCTTCTTCAGAAAGCAAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGAAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATGTATTAAATCTTGATATCTGCTACATATTTTG s panTro4.chr14 18739328 203 + 106544938 TGA----TAGAATCTGTAGTGCTAGTGGCAAAAGTCTTTGACAAACCTGTCTATATGCTGACAGCTTCTTCAGAAAACAAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGAAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATATATTAAATCTTGATGTCTTCTACATATTTTG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18950882 199 + 108868599 TGA----TAGAATCTGTAATGCTAGTGGCAAAAGTCTTCAACAAACCTGTCTATATGTTGACAGCTTCTTCAGA----AAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGAAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATATATTAAATCTTGATATCTTCTACATATTTTG i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88042115 203 - 170124641 TGA----TAGAATCTGTAATGCTAGTGGCAAAAGTTTTCGACAAACCTGTCTATATGTTGACAGCTTCTTCAGAAAACAAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGATGTGAGAAAGGCCATTGCAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATACATTAAATCTTGATATCTTCTACATATTTTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320457 203 - 171882078 TGA----TAGAATCTGTAATGCTAGTGGCAAAAGTTTTCGACAAACCTGTCTATATGTTGACAGCTTCTTCAGAAAACAAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGCAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATACATTAAATCTTGATATCTTCTACATATTTTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85449955 203 - 162156779 TGA----TAGAATCTGTAATGCTAGTGGCAAAAGTTTTCGACAAACCTGTCTATATGTTGACAGCttcttcagaaaacaaa------------caaaaatggtggTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGCAGtttgacaaagaaaatgaaaatgaaaagatatattaAATCTTGATATCTTCTACATATTTtg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607122 203 - 24206276 TGA----TAGAATCTGTAATGCTAGTGGCAAAAGTTTTCAACAAACCTGTCTATATGTTGACAGCTTCTTCAGAAAACAAA------------CAAAAATGGTGGTAAAATATAGGATAAAAAGTTTGCAATCTTGGAGGTGAGAAAGGCCATTGCAGTTTGACAAAGAAAATGAAAATAAAAAGATATATTAAATCTTGATATCTTCTACATATTTTG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46943876 188 - 64190966 TGATACTTAGAATTTGGAAC-CTTGACACAAAGATCCTAGAAGAACCTGT-----------CAGCTTTATTGGAAAACAGAATAAAATAAAGCCAATAATAGTGATAAAATGTAGG--TACAGTTTTACAATCTTGGAGGTAAGAAAGATCAGTGAAGTATCATGTAAAAATAGTAAATAAAAAGA-----AAAATAGTTACATTTG------------ i canFam3.chr15 C 0 C 0 e calJac3.chr10 87770987 0 - 132174527 C a score=433538.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 419931 171 + 478999 ATATGTAAAAATGAAAAAAGTTTATATGGGCAAAAGGCAGAAAAACGCTGAAAATATTTCTATGGCA-TATAGATGTGGAGATTATTTTCTGCATGATTATAA-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTTTCCCTACTCCAAGATTGTATGAGAGGGCATCCATGaat-aaaaa s panTro4.chr14 18739531 171 + 106544938 ATATGTAAAAATGAAAAAAGTTTATATGGGCAAAAGGCAGAAAAATGCTGAAAATATTTCTATGGCA-TATAGATGTGGAGATTATTTTCTGCACGATTATAA-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCCAAGACTGTATAAGAGGGCAACCATGCat-aaaaa i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18951081 171 + 108868599 ATATGTAAAAATGAAAAAAGTTTATATGGGCAAAAGGCAGAAAAACGCTGAAAATATTTCTATGGCA-AATAGATGTGGAGATTATTTTCTGCACGATTATAA-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCCAAGATTGTGTAAGAGGGCATCCATGCat-aaaaa i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88042318 170 - 170124641 ATATGTAAAAATG-AAAAAGTTTATATGGGCAAAAGGCAGAAAAATGCTGAAAATATTTCTATTACA-TATAGATGTGAAGATTATTTTCTGCACGATTATAG-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCCAAGATTGTATAAGAGAGCATCCATGCAT-ACaaa i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320660 170 - 171882078 ATATGTAAAAATG-AAAAAGTTTATATGGGCAAAAGGCAGAAAAATGCTGAAAATATTTCTATTACA-TATAGATGTGAAGATTATTTTCTGCACGATTATAG-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCCAAGATTGTATAAGAGAGCATCCATGCAT-ACAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85450158 170 - 162156779 atatgtaaaaatg-aaaaagtttatacgggcaaaaggcagaaaaatgctgaaaatatttctatCACA-TATAGATGTGAAGATTATTTTCTGCACGATTATAG-GGTTTGCATGTaaattgaat--attttctccctacTCCAAGATTGCATAAGAGAGCATCcatgcat-aaaaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607325 170 - 24206276 ATATGTAAAAATG-AAAAAGTTTATACGGGCAAAAGGCAGAAAAATGCTGAAAATATTTCTATCACA-TATAGATGTGAAGATTATTTTCTGCACGATTATAG-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCCAAGATTGTATAAGAGAGCATCCATGCAT-AAAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87770987 170 - 132174527 ATATGTAAAAATAAAAAATGTTTATGTGGGTAAAAGACAGAAAAATGCTGAAAATATGTCTATCATA-GATAGATGTGGAGATTATTTTCTGCACAATTAAAA-GGTTTGCATGTAAATTGAAT--ATTTTCTCCCTACTCAAAGATTATATAAGA--GCATCCATGCATAAAAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46944064 165 - 64190966 ACATGCTAA-----AAAATATATTTGTAGGCAAAAGATA-AAGTATGATGAAAATCTGTCTGCCACATTATGGATGTGCAG---ATTTTCGCTACAATTATAGAGGCTTGCATGGAAATTGAACTGAATACCTCCTTACTCC-AGATGGTACAAGGTAGCATCCATGCAT-TAAAA i canFam3.chr15 C 0 I 2215 a score=131387.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 420102 68 + 478999 ttaaaataaaaattact--aaaaatcgatataaacgataaaa-atttatctaatacataaataatTTGCTT s panTro4.chr14 18739702 68 + 106544938 ttaaaataaaaattact--aaaaattgatataaataataaaa-atTTATCTAATACATAAAGAATTTGCTT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18951252 68 + 108868599 ttaaaataaaaattatt--aaaaattgatataaacgataaaa-atttatttaatacataaaaaatttGCTT i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88042488 64 - 170124641 ttaaaataaaaattatt--aaaaattgatataaatgataaaa-attGATCTAATACAT----AATTTGCTT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320830 64 - 171882078 TTAAAATAAAAATTATT--AAAAATTGATATAAATGATAAAA-ATTGATCTAATACAT----AATTTGCTT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85450328 65 - 162156779 ttaaaataaaaattatt-aaaaaattgatataaatgataaaa-atttatctaatacat----aatttgctt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607495 65 - 24206276 TTAAAATAAAAAGTATT-AAAAAATTGATATAAATGATAAAA-ATTTATCTAATACAT----AATTTGCTT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87771157 71 - 132174527 TTAAAGTAAAAAGTATTAAAGAAATGGATATAAATGATAAAATGTTTATTTAATACATAAATAATTTGCCT i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46944229 2215 - 64190966 I a score=18932.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 420170 6 + 478999 AAATGA s panTro4.chr14 18739770 6 + 106544938 AAATGA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18951320 6 + 108868599 AAATga i ponAbe2.chr14 C 0 I 33159 s rheMac3.chr7 88042552 6 - 170124641 AAATGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320894 6 - 171882078 AAATGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85450393 6 - 162156779 aaatga i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607560 6 - 24206276 AAATGA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87771228 6 - 132174527 AAATGA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46946444 6 - 64190966 aaataa i canFam3.chr15 I 2215 C 0 a score=339750.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 420176 179 + 478999 ATATGAAATAGGTACATA--GAAGGAAATGTGGGCAATGAACAAAGGAAAAAAACGAAAAGGCTTATAAGCATGAAAGTAAGCTTACCCTTAAAAATCAACCACAGAAATGAAAACCACTGATTTTGATTAGCATGTAGGATAATGTTGCTCATGTATTAT---CAATAAAAAAGTACAGAATA s panTro4.chr14 18739776 178 + 106544938 ATATGAAATAGGTACATA--GAAGGAGATGTGGGCAATGAACAAAGG-AAAAAATGAAAAGGCTTATAAGCATGAAAGTAAGCTTACCCTTAAAAATCAACCACAGAAATGAAAACCACTGATTTTGATTAGCATGTAGGATAACGTTGTTCATGTATTAT---CAATAAAAAAGTACAGAATA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88042558 174 - 170124641 ATATGAAATAGGTACATA--GAAGGAAATGTGGGCAATGAACAAAGG-AAAAAACGAAAAGGCTTATAAACATGAAAGTAAGCTTACCGTTAAAAATCAACCACAGAAATAAAAACCACTGATTTTGATTGCCAT-TAG---AATGTTGCTCATGTATTAT---CAATCAAAAAGTACAGAATA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88320900 174 - 171882078 ATATGAAATAGGTACATA--GAAGGAAATGTGGGCAATGAACAAAGG-AAAAAACGAAAAGGCTTATAAACATGAAAGTAAGCTTACCGTTAAAAATCAACCACAGAAATAAAAACCACTGATTTTGATTGCCAT-TAG---AATGTTGCTCATGTATTAT---CAATCAAAAAGTACAGAATA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85450399 174 - 162156779 atatgaaataGGTACATA--GAAGGAAATGTGGGCAATGAACAAAGG-CAAAAACGAAAAGGCTTATAAACATGAAAGTAAGCTTACCCTTAAAAAtcaaccacagaaataaaaaccacTGATTTTGATTGGCAT-TAG---AATGTTGCTCATGTATTAT---CAATCAAAAAGTACAGAATA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607566 174 - 24206276 ATTTGAAATAGGTACATA--GAAGGAAATGTGGGCAATGAACAAAGG-AAAAAACGAAAAGGCTTATAAACATGAAAGTAAGCTTACCGTTAAAAATCAACCACAGAAATAAAAACCACTGATTTTGATTGCCAT-TAG---AATGTTGCTCATGTATTAT---CAATCAAAAAGTACAGAATA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87771234 178 - 132174527 ATATGAAATAGGTAGATA--GAAGGAAATATGAGCAATGAACAAAGG-AAAAAATAAAAAGGCTTATAAACATGAAAATAATTTTATCCTTAAAAATCAACCATAGAAATAAAAACCACTGATTTTGATTAGCATGTAGAAAAATGTTGCTCATGTATTAT---CAGTCAAAAAGTACGGAATA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46946450 178 - 64190966 atttattataaaaaaataataaaGAAACTATAGTTAATTAACAAAGGGGAAAAATGAAAAAATTTATAAACA------TAAGCATATTCTCAAAAACAAATCATGAGACTACAGAGTACTGATGGTGGTTAGCTTGTAGAAGAATGTTGCTCATGTATAATAAACAACAGAAAAGTGCAAAACA i canFam3.chr15 C 0 I 7107 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I a score=1832805.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 420355 1073 + 478999 GGGTGAGGTGccagaagcagctatcatgtgccactcatggagagggagacagggtggt--gagtaaacactagctcttcacatggatcgtccatgaggccatgttaggattcaccaaggaagcaactgcaatcgatggacagcagaaaggggccaggcaggaaagcagtccacccaggattggcatagagccaggtgaggctccctaccatagggaaagggtgaataagaacctcctg----ggacccacacttctgccatgggcctttgcaatcctggcacaggagatctcccgtgaccccgaggggcttccagaccaacacagagaggttactggagtctgggcagagctgcagctagggtcacctggagccccatgagccgtggggccctgagcaccttggtgccagctgccatagccacaccaacaagggaggccagctctctcgcatgcccctagaataggggctgcatccacggtgctgaggagcagactgaccgcagg--ccccgcttgcttcatcaagccaggcaaagcccactggcctgggtcgcccacgcagccaccccactcccacctgagcactcaggccagtca-ggctctccatttctttggaaaggaactcccagaggtaaccaataggcctgagatttctggtactgtggtctcccacatgccgccctcaggctggggagggatcgaag--agcgcaggaactatcctagaccttcagcaagg-------catacgaacagctgtcatacggaaaagtggccagattattttccacgtgggtccctgtcccagctactcctcactgggcagggcctccgagcctggggtcccagcacagctgccccacccccacccgttctttcatttggcggtggccctaagtttctctggggtagagctcccagagacaaccggcaggctctgtg----ccacccctagctgagtgtaaggtccttccttgctccccgcaggctaggtagggaacaaagagcctgactgcagctgtcctagggagagaaggccagattgtcttccttgcgagcccctgaccccggctactcttcaccagacacgg-cc s panTro4.chr14 18739954 1082 + 106544938 GGGAGAGGTGccagaagcagctatcatgtgccactcatggagagggagacagggtggt--aagtaaacactagctcttcaagtggctcatccatgaggtcatgttaggattcatcaaggaagcaactgcaatcgatggacagcagaaaggggccaggcaggaaagcagtccacccaggatcggcatagagccaggtgaggctccctaccatagggaaagggtgaataagaacctcctg----ggacccacacttctgccatgggcctttgcaatcctggcacaggagatctcccgtgaccccggggggcctccagaccaacacagagagattactggagtctgggcagagctgcagctaggctcacctggagccccatgagccttggggccctgagcaccttggtgccggctgccatagccccaccaacaagggaggccagctctcttgcatgcctctagaataggggctgcatccacggtgctgaggagcagactgactgcagg--ccccacttgctttagcaagccaggcaaaacccactagcctgggtcgcccacgcagccaccccactcccacctgaacactcaggccagtcagggctctccatttctttgggaaggaactcccagaggtaaccaataggcctgagatttctggtactgtgatctcccacatgctgccctcaggctggggagggatcgaag--agcacaggaactgtcctagaccttcagcaaggcagctgtcatacgaagagctgtcatacagaaaagcggccagattattttccacgtgggtccctgtcccagctactcctcactgggcagggcctcccggcctggggtcccagcacaactgccccacccccacttgatctttcatttggcagtggccctgagtttctctggggtagagctcccagagacaaccggcaggctctgtg----ccatcaccagctgagtgtaaggcccttccttgctccccgcaggctacacagggaacaaagagcctgactgcagctgtcctagggagagaaggccagattgtcttccttgcgagcccgtgacccctgctactcttcaccagacatggccc i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88042732 1080 - 170124641 GGGAGAGGTGccagaaggagctatcatgtgccactcatggagagggagacaaggtggt--gagtaaacactagctcttcaagtggctcctccatgaggccatgttaggattcatcaaggaagcaactgcaatccaccgacagcagaaaggggccaggcaggaaagcaggccacccaggattggcatagagccaggggaggctccctaccatggggaaagtgtgaataagaacctcctg----ggacccacacttctgccatgggccattgcagtcctggcacaggagatctccggtgaccccggggggcctccagaccaacacagagagattactggagtctgggcagagctgcagctaagctcacccggagccccatgagccctggggccctgagcaccctggtgccagctgccatagccccaccaacgagggaggccagctctcttgcatgcccctagaatagggactgcatccatggtgctgaagagcagactgactgcggg--ccccacttgcttcatcatgccaggcaaagcccaccgccctgggtcgcccacgcagccacccgagtcccacctgagcactcaggccagtcagggctctccatttctttgggaaggaactcccagaggtaaccaataggcctgagatgtctggtactgtggtctgccacgtgctgccctcaggctggggagggatc-aag--agcacaggagctatcctaaaccttcagcaaggcagctgtcaaacaaacagctgtcatacggaaaagcggccagattattttccacgtggttccccgtcccagctactcctcactgggcaaggccttct-gcctgcggtcccagcacaactgccccacccccacctgatctttcatttggcggtggccctgagtttctctggggtggagcttccagagacaaccggcaggctctgtg----ccatcaccagctgagcgtaaggcccttccttgctcctcgcaggctaggtagggaacaaagagcctgactgcagctgtcctagggagagaaggccagattgtcttccttgcgggcccctgacccccgctgctcttcaccagacagggccc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88321074 1080 - 171882078 GGGAGAGGTGccagaaggagctatcatgtgccactcatggagagggagacaaggtggt--gagtaaacactagctcttcaagtggctcctccatgaggccatgttaggattcatcaaggaagcaactgcaatccaccgacagcagaaaggggccaggcaggaaagcaggccacccaggattggcatagagccaggggaggctccctaccatggggaaagtgtgaataagaacctcctg----ggacccacacttctgccatgggccattgcagtcctggcacaggagatctccggtgaccccggggggcctctagaccaacacagagagattactggagtctgggcagagctgcagctaagctcacccggagccccatgagccctggggccctgagcaccctggtgccagctgccatagccccaccaacgagggaggccagctctcttgcatgcccctagaatagggactgcatccatggtgctgaagagcagactgactgcggg--ccccacttgcttcatcatgccaggcaaagcccaccgccctgggtcgcccacgcagccacccgagtcccacctgagcactcaggccagtcagggctctccatttctttgggaaggaactcccagaggtaaccaataggcctgagatgtctggtactgtggtctgccacgtgctgccctcaggctggggagggatc-aag--agcacaggagctatcctaaaccttcagcaaggcagctgtcaaacaaacagctgtcatacggaaaagcggccagattattttccacgtggttccccgtcccagctactcctcactgggcaaggccttct-gcctggggtcccagcacaactgccccacccccacctgatctttcatttggcggtggccctgagtttctctggggtggagcttccagagacaaccggcaggctctgtg----ccatcaccagctgagcgtaaggcccttccttgctcctcgcaggctaggtagggaacaaagagcctgactgcagctgtcctagggagagaaggccagattgtcttccttgcgggcccctgacccccgctgctcttcaccagacagggccc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85450573 1082 - 162156779 GGGAGAGGTGCCAGAAGGAGCTATCATGTGCCAGTCATGGAGAGGGAGACAAGGTGGT--GAGTAAACACTAGCTCTTCAAGTGGCTCGTCCATGAGGCCATGTTAGGATTCATCAAGGAAGCAACTGCAATCCACGGACAGCAGAAAGGGGCCAGGCAGGAAAGCAGTCCACCCAGGATTGGCATAGAGCCAGGGGAGGCTCCCTACCGTAGGGAAAGTGTGGGGCCCACACTTCTGCCATGGGCCCACACTTCTGCCATGGGCCATTGCAATCCTGGCACAGGAGATCTCCCGTGACCCCGGGAGGCCTCCAGACCAACACAGAGAGATTACTGGAGTCTGGGCAGAGCTGCAGCTAGGCTCACCTGGAGCCCCATGAGCCCTGGGGCCCTGAGCACCCTGGTGCCAGTTGCCATAGCCCCACCACCAAGGGAGGCCAGCTCTCTTGCATGCCCCTAGAATAGGGACTGCATCCATGGTGCTGAAGAGCAGACTAACTGCAGGccccccccTTGCTTCATCATGCCAGGCAAAGCCCACCGGCCTGGGTCGCCCACGCAACTGCCCCAGTCCCACCTGAGCACTCAGGACAGTCACGGCTCTCCATTTCTTTGGGAAGGAACTCCCAGAGGTAACCAATAGGCCTGAGATGTCCGGTACTGTGGTCTGCCACATGCTGCCCTCAGGCTGGGGAGGGATC-AAG--GGCACAGGAGCTATCCTAGACCTTCAGCAAGGCAGCTGT----CAAACAGCTGTCATACGGAAGAGCGGCCAGATTATTTTGCACGTGGGtccctgtcccagctactcctcaCTGGGCAAGGCCTTCT-GCCTGGGGTCCCAGCACaactgccccacccccacctgatCTTTCATTTGGCAGTGGCCCTGAGTTTCTCTGGGGTGGAGCTTCCAGAGACAACCGGCAGGCTCTGTG----CCATCACCAGCTGAGTGTAAGGCCCTTCCTTGCTCCCCGCAGGCTAGGTAGGGAACAAAGAGCCTGACTGCAGCTGTCCTAGGGAGAGGCGGCCAGATTGTCTTCCTTGCGGGCCCCTGACCCCCGCTGCTCTTCACCAGACAGGGCCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3607740 1061 - 24206276 GGGAGAGGTGccagaaggagctatcatgtgccactcatggagaaggagacaaggtggt--gagtaaacactagctcttcaagtggctcctccatgaggccatgttaggattcatcaaagaagcaactgcaatccacggacagcagaaaggggccaggcaggaaagcagtccacccaggattggcatagaaccagggaaggctccctaccatggggaaagtgtgaataagaacctcctg----ggacccacacttctgccatgggccattgcagtcctggcacaggagatctccagtgaccccgggtggcctccagaccaacac----agattactggagtctgggcagagctgctgctaagctcacctggagccccatgagctctggggccctgagcaccctggtgccagctgccatagccccaccaacaagggaggccagctctcttgcatgcccctagaatagggactgcatccatggtgctgaagagcagactgactgcagg--ccccactggcttcatcatgccaggcaaagcccaccggcctgggtcgcccacgcagccacccgagtcccacctgagcactcaggccagtcagggctctccatttctttgggaaggaactcccagaggtaaccaataggcctgagatgtctggtactgtggtctcccacatgctgccctcaggctggggagggatc-aag--agcacaggagctatcctagaccttcagcaaggcagctgt---------------catacggaagagcggccagattattttccacgtgggtccccgtcccagctactcctcactgggcaaggccttct-gcctggggtcccagcacaactgccccacccccacctgatctttcatttggtggtggccctgagtttctctggggtggagcttccagagacaactggcaggctctgtg----ccatcaccagctgagtgtaaggcccttccttgttccccgcaggctaggtagggaacaaagagcctgactgcagctgtcctagggagagaaggccagattgtcttccttgcgggcccctgacccccgctgctcttcaccagacagggccc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87771412 1082 - 132174527 GAGAGAGGTGccagaagcagctatcatgtgccactcatggagagggagacac-gtggtgagagtaaacactagctcttctagtggattgtccatgaggccatgttaggatacatcaaggaagcaaccgcaatccatggacagcagaaaggagccatgcaggaaagcagtccacccagggttggcatagagccaggagaggctcccaaacataagaaggggatgagtaagaacctcttg----ggacccacacctctgccatgggccttagcaatcctagcacaggagatctcccatgagcccggagggcctccagaccaacacagagagatgactggagtttgggcagagctgcagctaggcctacctggagctccatgggccttggggccctgagcacgttggtgccagctgctatagtctcaccagcaagacaggtcagctctctcgcctgtccctagaataggggctgtatacatggtgctgaggagcggactgactgcagg--ccctgcttgcttcatcgctccaggcaaagcccactggccggggttccccacacagccaccctgcttccacctgaacacccaggccagtcagaggtctctatttcttcgggaaggaactcccagctgtcaacaataggcctgagatttctggtgctgtggtct-ccacatactgttctgtggctggggagagatccaagatagcacaggagctatcctagaccttccgcattgcagctgtcatacggacagctgtcacagagaaaagcggccacactg-tttccacgcgggtccctgtcccagctactcctcactgggcagggcctcccagcctgaggtctcaccacaactgccccacctgtacctgatctttcattctgtggtggccccgagtttctctggggtagagctcccagaaacaaccgacaggctctctggcgtcaatcatcacctcagtgtagggc----ccttgttccccccaggctaagtagggaacaaagagcctgaccgcagccgtccgagggagagaaggccagattgtcttccctgcaaacctctgacccctgctgttcttcactagacagggcc- i calJac3.chr10 C 0 I 1262 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I a score=1866190.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 421428 1491 + 478999 ggctttggcccacaacacagccgccccacccctggatccttcaccttagcagtagc----agtagctctgggtggagttgccagaggcagctgacaggccctctgccactgctgccacccccagggctagggagggaacaaagagcctgcttgctgtgcttgcacatccagcatgccacagctgcactacggagaggaggtcagacagtccccc--caacaag-cccccg-atccctctgctctccaccagggagggccctgggcttgcgcccacagcacaaacgtcccatcccgggctgatcattctggttggcagcggctctgaatttctctggggtggagtt-cccagagacaactgacaagccctctgccaccgacaccgccaaggtccccttccctgctcccccaagcaggggagggaataaaaagcccgaactcgccccaggtccaacactagagcgggaagagaaacccacactcccagagcaccgagaggggtaaccgcatgagttcctgggctgctgtgggagcggggcgcgcctccctctgcaggaggagcctggaaaaggtgtggcctatctccctgcggtggcctctgcctgagggagccccgcagcctggaacacctagcaaaagaaatgatggtgcagtgctagtgatcggagggggtt-cccccaaggctcaggagctgacctggtgagggggtcacttctttccccgctgtacgggagaccaggctgtagatgtgaggaagtacaaaggaaccacaggcctgagcaagagtgtatttaccgtccattactcttaagcgacatctactggattgcagccaaaactgctacaacaccaaaaatattttgctaatatcccccagtgaaatcaaaggcaagaatccagccacaaataaagaccctgcacaaagccttggctatctgaaaacattcagaaacaaagccaagtgactatactcaaattacaccacaggtaaaggaacgccaatgcttccagatgagaaagaatcagtgcaagaactctgacaattcaaaaagccagtttccccatacctccagatgagtccaccagaccccaagcaatg-----attt-----------------tttttatttgctttccttatttgtttgcttgtttgGAGATACCTTTTACttttttaattttaattttttaat-----ttttaggttcagttatacatgtgcagatttgttatataggt-aaattgcttgtcattggggtttggtgaacagatttatcacccaggtaataggcatagtacctgataggcagttttctgatcctcacccttttcccacagtccaatctcaactatgcccaagtatgtattgttcccttctttgtgttcatgtgtattcaaggtttatctcaaatttgtaagtaagaacatgtagtgtttagttttttgttcctatgttggttcactcaggaaaatggcctccagctccatgcatgttgctgcaaaggatatgatctcattc-ttttt s panTro4.chr14 18741036 1479 + 106544938 ggcttgggcccacagcacagcctccccacccctggatccttccccttggcagtagc----agtagctctgggtggagttgccagaggcagctgacaggccctctgccactgctgccaccccccaggctagggagggaacaaagagcctgcttgctgtgcttgtgcatccagcatgccacagctgctctatggagaggaggccagacagtccccg--caacaag-cccccg-atccctctgctctccaccagggagggccctgggcttgggcccacagcacaaacgtcccatcccgggctggtcattctgattggcagcggctctgaatttctctggggtggagtt-cccagagacaaatgacaagccctctgccactgacaccgccaaggtcccgtcccctgctcccccaagctggggagggaataaaaagcccgagctcaccccaggtcccacactagagcgggaagagaaacccacactctcagagcactgagaggggtaaccgcgtgggttcctcggctgctgtgggagcagggtac-------------------gcctggaaaacatatggcctatctccctgcggtggcctctgcctgagggagccccgcagcctggaacacctagcaaaagaaatgatggtgcagtgctactgatcggaggggctt-cccccaaggctcaggagcggacctggtgagggggtcacttctttccccgctgtaccggagaccaggctgtagatgtgaggaagtacaagggaaccacaggcctgagcaagagcctatctactgtccattactcttaagcgacgtctactggattgcagccaaaactgctacaacaccaaaaatattttgctaatatcccccagtgaaatcaaaggcaagaatccagccacaaataaagacgctgcacaaagccttggctatctgaaaacattcagaaacaaagccaagtgactatactcaagttacaccacaggtaaaggaacgccaatgcttccagatgagaaagaaccagtgcaagaactctgacaattcaaaaagccagtttccccatacctccaaatgagtccaccagaccccaagcaatgatAATATTT-----------------TTTTTATTTGCTTTCCTTATTTGTCTGCTTGTTTTGGGATAACTTTTACttttttaattttaattttttaac-----ttttaggttcagttatacatgtgcagattttttatataggtaaaattgcttgtcacaggggtttggtgaacagatttatcacccaggtaataagcatagtacctgatagtcagttttctgaccctcacccttttgccaccatccaatctcaactgtgcccaagtatttgttgttcccttctttgtgtttatgtgtattcaacgtttatctccaatttataagtaagaacatgtagtatttagttatttgttcctatgttagttcactcaggaaaatagcctccagctccatgcatgttgctgcaaaagctatgatctcattctttttt i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88043812 1510 - 170124641 gccttgggcccacagaacaaccgcgtcgcccctggatccttcccctgggcagtagctctgcgtttctctgggtggagttgccagaggcagctggcaggccctctgccactgctgccaccctc-aggctaggaagggaacaaacagcctgcttgctcagcttgcatatccagcacgccacagctgccctatggagaggaggcccgacagtcccccc-caacaagcccccccgatccctctgctcttcaccagggatggcccccggcttgggcccacagcacaaacgtcccatcccgggctgatcattctgcctggcagcggctctgaatttctttggggtggagttccccaaagacgactgacaagtcctctgccattgccaccgccaaggtcccaacccctactcccccaagctggggagggaatacaaagcccgagttcgccccaggtccaacaccagagcgagaagagaaacccacactctcagagcactgagaggggtaaccgcgtgggttcccgggctgctgtgggagcagggtaggcctccctcggcaggacgagcctcgaagaggtgtggcctctctccctgcggtggcctctgcctgagcgagtcccgcagcctggaacacctagcaaaagaaatgagggtgcagtgctagtgaccagagggggtt-cccccaaggctcaggagcggacctggtgagggagtcacttctttccccactgtcccggataccaggctgtagatgtgaggaagcacaaaggaaccacaggcctgagcaagagcttatctacagtccattactcttaagcgacatctactggattgaagccaaaactgctacaacaccaaaaatagtttgctaatatccctcagtgaaatcaaaggcaagaatccagccacaaataaagaccctgcaccaagccttggctatctgaaaacattcagaaaccaagccaactgactatactcaaattataccacaggtaaaggaacgcaggtgtttccagatgagaaagaatcagtgcaagaactctgacaattcaaaaagccagtgtccccttactttcaaatgagtccaccagaccccaagcaatg-----attt-----tttgtttgtttgttttttgttgctttccttatttatttgcttgtttTGGGATAACTTTTACTTTTTGTATTTTAAttttttaacttttattttaggttcaggtatacacgtgcggatttgttatataggt-aaattgcttgtcatgggggtttagtgaacggatttatcacccaggtaatacgcatagtgcctgataggcagttttctgatcctcacccttttcccaccatccattctcaacaatgcccaagtatttgttgttcccttcttcgtgttcatgtgtattcaacgtttatctccaattta----taagaacatgtagtatttag-tttttgttcctatgttagttcactcaggaaaatggcctccagctccatgcatgttgctgcaaaggatatgttctcattc-ttttt i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 88322154 1508 - 171882078 gccttgggcccacacaacaaccgcgtcgcccctggatccttcccctgggcagtagctctgcgtttctctgggtggagttgccagaggcagctggcaggccctctgccactgctgccaccctc-aggctaggaagggaacaaacagcctgcttgctcagcttgcatatccagcacgccacagctgccctatggagaggaggcccgacagtcccccc-caacaag-ccccccgatccctctgctcttcaccagggatggcccccggcttgggcccacagcacaaacgtcccatcccgggctgatcattctgcctggcagcggctctgaatttctttggggtggagtt-cccaaagacgactgacaagtcctctgccattgccaccgccaaggtcccaacccctactcccctaagctggggagggaatacaaagcccgagttcgccccaggtccaacaccagagcgagaagagaaacccacactctcagagcactgagaggggtaaccgcgtgggttcccgggctgctgtgggagcagggtaggcctccctcggcaggacgagcctggaagaggtgtggcctctctccctgcggtggcctctgcctgagcgagtcccgcagcctggaacacctagcaaaagaaatgagggtgcagtgctagtgaccagagggggtt-cccccaaggctcaggagcggacctggtgagggagtcacttctttccccactgtcccggataccaggctgtagatgtgaggaagcacaaaggaaccacaggcctgagcaagagcttatctacagtccattactcttaagcgacatctactggattgaagccaaaactgctacaacaccaaaaatagtttgctaatatccctcagtgaaatcaaaggcaagaatccagccacaaataaagaccctgcaccaagccttggctatctgaaaacattcagaaaccaagccaactgactatactcaaattataccacaggtaaaggaacgcaggtgtttccagatgagaaagaatcagtgcaagaactctgacaattcaaaaagccagtgtccccttactttcaaatgagtccaccagaccccaagcaatg-----attt-----tttgtttgtttgttttttgttgctttccttatttatttgcttgtttTGGGATAACTTTTACTTTTTGTATTTTAAttttttaacttttattttaggttcaggtatacatgtgcggatttgttacataggt-aaattgcttgtcatgggggtttagtgaacggatttatcacccaggtaatacgcatagtgcctgataggcagttttctgatcctcacccttttcccaccatccattctcaacaatgcccaagtatttgttgttcccttcttcgtgttcatgtgtattcaacgtttatctccaattta----taagaacatgtagtatttag-tttttgttcctatgttagttcactcaggaaaatggcctccagctccatgcatgttgctgcaaaggatatgttctcattc-ttttt i macFas5.chr7 C 0 I 1 s papAnu2.chr7 85451655 1503 - 162156779 GCCTTGGGCCCACAGAACAACCGCGTCGCCCCTGGATCCTTCCCCTGGGCAGTAGCTCTGCGTTTCTCTGGGTGGAGTTGCCAGAGGCAGCTGGCAGGCCCTCTGCCACTGCTGCCACCCTC-AGGCTAGGAAGGGAACAAACAGCCTGCTTGCTCAGCTTGCATATCCAGCACGCCACAGCTGCCCTATGGAGAGGAGGCCAGACAGTcccccc-cAACAAG-CCCCCC-ATCCCTCTGCTCTTCACCAGGGACGGCCCCCGGCTTGGGCCCACAGCACAAACGTCCCATCCCGGGCTGATCATTCTGCCTGGCAGCGGCTCTGAATTTCTTTGGGGTGGAGTT-CCCAGAGACGACTGACAAGTCCTCTGCCATTGCCACCGCCAAGGTCCCAACCCCTACTCCCCCAAGCTGGGGAGGGAATACAAAGCCCGAGTTCGCCCCAGGTCCAACACcagagcaagaagagaaacccACACTCTCAGAGCACT--GAGGGGTAACCGCGTGGGTTCCCGGGCTGCTGTGGGAGCAGGGTAGGCCTCCCTCGGCAGGACGAGCCTGGAAAAGGTGTGGCCTCTCTCCCTGCGGTGGCCTCTGCCTGAGCGAGTCCCGCAGCCTGGAACACCTAGCAAAAGAAGTGAGGGTGCAGTGCTAGTGACCGGAGGGGGTTCCCCCCAAGGCTCAGGAGCGGACCTGGTGAGGGAGTCACTTCTTTCCCCACTGTCCCGGATACCAGGTTGTAGATGTGAGGAAGCACAAAGGAACCACAGGCCTGAGCAAGAGCTTATCTACAGTCCATTACTCTTAAGCGACATCTACTGGATTGAAGCCAAAACTGCTACAACACCAAAAATAGTTTGCTAATATCCCTCAGTGAAACCAAAGGCAAGAATCCAGCCACAAATAAAGACCCTGCACCAAGCCTTGGCTATCTGAAAACATTCAGAAACCAAGCCAACTGACTATACTCAAATTATACCACAGGTAAAGGAACGCAGGTGtttccagatgagaaagaatcagtgcaagaactctgacaaTTCAAAAAGCCAGTGTCCCCTTACTTTCAAATGAGTCTACCAGACCCCAAgcaatg-----attt---------tttgtttgttttttgttgctttccttatttatttgcttgttttgggataacttttactttttgtattttaattttttaacttttattttaggttcaggtaTACATGTGcggatttgttatataggt-aaattgcttGTCATGGGGGTTTAGTGAACGGatttatcacccaggtaatacgcatagtacctgataggcaGTTTTCTGATCCTCACCCTTTTCCCACCATCCAATCTCAACAATGCCCAAGTATTTGTTGTTCCCTTCTTCGTGTTCATGTGTATTCAACGTTTATCTCCAATTTa----taagaacatgtagtatttagttttttgttcctatgttagttcactcaggaaaatggcctccagctccatgcatgttgctgcaaaggatatgttctcattc-ttttt i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s chlSab2.chr29 3608801 1510 - 24206276 accttgggctcacagaaccaccgcgtcgcccctggatccttcccctgggcagtagctctgcgtttctctgggtggagttgccagaggcagctggcaggtcctctgccactgctgccaccctc-aggctaggaagggaacaaacagcctgcttgctctgcttgcatatccagcacgccacagctgccctatggagaggaggccagacagtccccccacaacaag-cccct--gtccctctgctcttcaccagggacggcccccggcttgggcccacagcacaaacgtcccatcccgggctgatcattctgcctggcagcggctctgaatttctttggggtggagtt-cccggagacgactgacaagtcctctgccattgccaccgccaaggtcccaacccttactcccccaagctagggagggaatacaaagcccgagttcgccccaggtccaacaccagagcgagaagagaaacccacactctcagagcactgagaggggtaaccgcgt-ggttcccgggctgc-gtgggagcagggtaggcctccctcggcaggacgagcctggaaaaggtgtggcctctctccctgcggtggcctctgcctgagcgagtcccgcagcctggaacacctagcaaaagaaatgagggtgcagtgctagtgaccggagggggtt-cccccaaggctcaggagcagacctggtgagggagtcacttctttccccactgtcccggataccaggctgtagatgtgaggaagcacgaaggaaccacaggcctgaggaagagcttatctacagtccattaatcttaagcaacatctactggattgcagccaaaactgctacaacaccaaaaatagtttgct-atatccctcagtgaaatcaaaggcaagaatccagccacaaataaagaccccgcaccaagccttggctatctgaaaacattcagaaaccaagccaactgactatactcaaattacaccacaggtaaaggaacgcgagtgcttccagatgagaaagaatcagtgcaagaactctgacaattcaaaaagccagtgtccccttactttcaaatgagtccaccagaccccaagcaatg-----atttttttgtttgtttgtttgttttttgttgctttccttatttatttgcttgtttTGGGATAACTTTTACTTTTTGTATTTTAAttttttaacttttattttaggttcaggtatacatgtgcggatttgttatataggt-aaattgcttgtcatgggggtttagtgcacagatttatcacccaggtaatacgcatagtacctgataggcagttttctgatcctcacccttttcccaccatccaatctcaacaatgcccaagtatttgttgttcccttcttcgtgttcatgtgtattcaacgtttatctccaattta----taagaacatgtagtatttagttttttgttcctatgttagttcactcaggaaaatggcctccagctccatgcatgttgctgcaaaggatatgttctcattc-ttttt i chlSab2.chr29 C 0 I 3750 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=555837.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 422919 656 + 478999 atgactgcatagtattccatagtatatttgtaccatattttctttatcaagttcaccattgatgggcatctaggttgattccatgacattgctattgtgaatattgctacgatgaaggtacttgtgcatgtgtctttatggtagaatgatttatatttctttgggtatatgcccaataatgggattgctgggttgaatgctactttggttttaagtactttgtgaaatcaccacactgctacccataatggctgaactaatttatattcccaccagcaatgcataaacattccgttttctctgcaaacttgccagcatgatctatgattttttgactttttaataatagcccatctgactggtgtgagatggtatctcattgtgcttttgatgtgcatttctctaatgattagtgatgttgagcattttttttcatatgcttcttggccaagtgtatgtcttA------tttattttttttgagatgcagtttcactcttgtcacccaggctggagtgcaatggtgcaatctcggcccactgcaacctctacctcctgggttcaagagattctcctgcctcagcttccccaatagctgggattacaggcacctgccaccatgcctggctaatttttgttatttttagtagagatggggtttc s panTro4.chr14 18742515 660 + 106544938 atgactgcatagtattccatagtatacttgtaccacattttctttatcaagttcaccattgatgggcatctacgttgattccatgacattgctattgtgaatacgcctgtgatgaacatacttgtgcatatgtttttatggtacaatgatttatattcctttgggtatatacccaataatgggattgctgggttgaatgctactttggttttaagtactttgtgaaatcgccacactgctttccataatggctgaaccaatttatattcccaccagcaatgcataagcattcccttttctctgcaacctcgccagcatgatctattattttttgactttttaacaacagcccatctgactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatgtgcatttctctaatgattagtgatgttcagca-tttttttcatatgcttcttggcaaagtgtatgtcttAttttattttattttttttgagatggagtttcactcttgtcacccaggctggagtgcagtggtgtgatctcggctcactgcaacatccacctcctaggttcaagagattctcctgcctcagcctccccagtagctgggattacaggcacctgccaccatgcctggctaatttttg-tatttttagtagagacagggtttc i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88045323 653 - 170124641 atgactgcatagtattccatagtatatttgtaccacatcttctttatcatgttcaccattgttgggcatccaggttgattccatgacattgctattgtgaatactgctacgatgaacatacgtgtgcctgtgtctttgtggtagaatgatttatatttctttgagtatatacccaacaatgggattgctgggttgaatgctac-ttggttttaagtactttgtgaaatcgccacactgtttcccataatggctgaactaatttatattcccaccagcaatgcataagcattcccttttctctgcaacctcaccagcatgatctattattttttgatttttcaataatagcccatctaacttgtgtgagatggtatctcattgtggttttgatgtgcatttctctaatgattagtgatgttgagca-tttttttcatatgcttcttggccatgtgtatgtcttc------tttttcttttttgagatggagtttcactcttgtcacccaggctggagtgcagtggtacgatctcggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagagattctcctgcctaagtctccccagtagctgggattacaggcgcccaccaccatgcctggctaatttttg-tatttttagtagagacggggtttc i rheMac3.chr7 I 1 I 2644 s macFas5.chr7 88323663 653 - 171882078 atgactgcatagtattccatagtatatttgtaccacatcttctttatcatgttcaccattgttgggcatccaggttgattccatgacattgctattgtgaatattgctacgatgaacatacgtgtgcctgtgtctttgtggtagaatgatttatatttctttgagtatatacccaacaatgggattgctgggttgaatgctac-ttggttttaagtactttgtgaaatcgccacactgtttcccataatggctgaactaatttatattcccaccagcaatgcataagcattcccttttctctgcaacctcaccagcatgatctattattttttgatttttcaataatagcccatctaacttgtgtgagatggtatctcattgtggttttgatgtgcatttctctaatgattagtgatgttgagca-tttttttcatatgcttcttggccatgtgtatgtcttc------tttttcttttttgagatggagtttcactctcgtcacccaggctagagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagagattctcctgcctcagtctccccagtagctgggattacaggcgcccaccaccatgcctggctaatttttg-tatttttagtagagacggggtttc i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 85453159 653 - 162156779 atgactgcatagtattccacagtatatttgtaccacatcttctttatcatGTTCACCATTGTTGGGCatccaggttgattccatgacattgctattgtgaatattgctacgatgaacatacgtgtgcctgtgtctttgtggtagaatgatttatatttctttgagtatatacccaacaatgggattgctgggttgaatgctAC-TTGGTTTTAAGTACTTTgtgaaatcgccacactgttttccataatggctgaactaatttatattcccaccagcaatgcataagcattcccttttctctgcaacctcaccagcatgatctattattttttgatttttccatAATAGCCCAtctaacttgtgtgagatggtatctcattgtggttttgatgtgcattcctctaatgattagtgatgttgagca-tttttttcatatgcttcttggccatgtgtatgtcttc------tttttcttttttgagacagagtttcactcttgtcacccaggctggagtgcagtggcgcgatctcggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagagattctcctgcctcagtctccccagtagctgggattacaggcgcccaccaccatgcctggctaatttttg-tatttttagtagagatggggtttc i papAnu2.chr7 I 1 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=748746.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 423575 1506 + 478999 accatgttggccaagctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacccgccttggcttcccaaagtgctgggattaccggcgtgagctactgcgcccagccTTGACTACTCtttttttttttttttttttttttgatggagtctcactctgtcaccaggctggagggcagtggtgcgggctcggctcactgcaacctttgcctcctgggttcaagcaattttcctgcctcagcgtcccgagtagctgggactacaggcgtgcAtttgcaaatactttaacctattctataggttgtctgtttactctgttgataatttattttgctgtgcagaagctttttaggttaattaggtcacatttattaatttttgcttttgtcatctttgtcatgaaatctttgtcaggggctatgctgagaatggaatttcctaggttgtcttccagggtttttatagtttggggtttcacatttaagtctttaatcca-gttggattgattttcatatatggtataagggaggggttcagtttccattttttgcatatggctacctagttatctcagcaccatttattgaatagggagtgcttttcccattgcttgtttttgtcagccttgttgaagattagatggtttttgtttttagttctgtttatgtggtgaatcacatttactaatttgcatatgctgaaccaaccttgtgttccagggataaaccctacttgattgtgttggagtagagttttaatgtgctgctggattcagtttgctagtattttctttttttcttttctttttttttttttttttttttttttgctagttttctttttttgttgtatctctgccaggttttggtatcagaatgatgttggcttcatagaataaattagggaggagtccttcctcctcaaattttcagaatagtttcag-aggaaaggtaccagctcttctttatgcatctggtagaactcagctgtgaattcctctgatcctgggctttttctggttggtaggctttttattattaacacagtcttggaacttgttattagtctgttcagagtttcagtttcttcctagttcaatcttaggaggttgtatgtttccaataatttattaatttcttctagtttgtgtgcataaagttgttcatagtagtctctgagggtttttaaaaaat---------atttctttggggttggtggtaatgtttcctttgtcatttctgactgtgtttatttttatctcttctcttttttgctttattagtctagctagtgctctatcaatctgatgtgttattctgaagcaacaaaacctggatttgtttatcttttgtatggttttttgcatctcaatttctttcagttcagctctgatttcagttatttcccttctcttgctagctttgggactgatttgcttttgtttctctagttcctcttggtgtgatgttaggatgttaatttgaaatctttccaatattttgatgtagttttttttttt s panTro4.chr14 18743175 1470 + 106544938 gccatgttggccaagctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacccgccttggcttcccaaagtgctgggattacaggcgtgagctactgtgcccagccTTGACTAC------tttttttttttttttttttgacggagtctcgctctgtcaccaggctggagggcagtggtgcggcctcggctcactgcaacttttgcctcctgggttcaagcaattctcctgcctcagcgtcccgagtagctgggactacaggcatgcAtttgcaaatattttatcctattctataggttgtctgtttactctgttgatagtttattttgctgtgcagaagctttttatgttaattagttcacatttattaatttttgcttttgtcatctttgtcatgaaatctttgtcaggggctatgctgagaatggaatttcctaggttatcttccagggtttttatagttttgggtttcacatttaagtctttaatccatgttggatttattttcatatatggtataagggaggggttcagtttccattttttgcatatggctgtctagttatctcagcaccatttattgaatagggagtgcttttcccattgcttgtttttgtcagccttgttgaagattagacggtttttgtttttagttctgcttatgtggtgaatcacatttactaatttgcatatgttgaaccaaccttgtgttccaaggataaagcctacttgattgtggtggattagagttttaatgtgctgctggattcagtttgctagtattttc------------------------------ttttttttgctagttttctttttttgttgtatctctgccaggttttggtatcagaatgatgttggcctcatagaataaattagggaggagtccttcctcctcaaattttcagaatagtttcag-aggaaaggtactagctcttctttatgcatctggtagaactcagctgtgaattcctgtgatcctgggctttttctggttggtaggctttttattactaacacaatcttggaacttgttattagtctgttcagggtttcaatttcttcctagttcaatcttaggaggttttatgtttccaataatttattaatttcttctagtttgtgtgcatagagttgttcatagtagtctctgagggtttttaaaaaat---------atttctttggggttggtggtaatgttccctttgtcatttctgactgtgtttatttttctctcttctcttttttgctttattagtctagccaatgctctatcaatctgatgtgttattctgaagaaacaaaacctggatttgttaatcttttgtatgggtttttgcatctcaatttctttcagttcagctctgatttcagttgtttcctttatcttgctagctttgggactgatttgcttttgtttctctagtttctttcggtgtgatgttaggatgttaatttgaaatctttccaatcttttgatgtag-ttttttcttt i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88324316 1466 - 171882078 ccaatgttggccaaggtggtctcgaactcctgaccttaggtgatccacccgcctcggcttcccaaagtgctgggattacaggcatgatctactgtgcccagccTTGACTAC--------tttttttttttttttttgacggagtctcactctgtcaccaggctggagggcagtggtgtgggctcagctcactgcaaactttgcctcccaggttcaagcaattctcctgcctcagtgtcctgagtagctgggactacaggcgtgcAtttgcaaatattttatcctattctataggttgtctgtttactgtattgatagtttattttgctgtgcagaagctttttaggttaattaggtcacatttattaatttttgcttttgtcacctttgtcatgaaatctttgtcaggggctatgctgacaatggaatttcctaggttatcttccagggtttttatagttttgggtttcatatttaagtctttaatccacgttggattgattttcatatgtggtataagggaggggttcagtttcaattttttgcatatggctacctagttatctcagcaccatttattgaatagggaatgcttttcccattgcttgtttttgtcagccttgttgaagattagatggtttttgtttttagttctgcttatgtagtgaatcacatttactaatttgcatatgttgaaccaaccttgtgttccagggataaagcctacttgattgtggtggattagagttttaatgtgctgttggattcaatttgctagtattttc-------------------------------tttttttgctagttttctttttttgttgtgtctctgccaggttttggtatcagaatgatgttgacctcatagaataaattagggaggagtccttcctccttaaattttcagaatagtttctgtaggaaaggtaccagctcttctttatgaatatggtagaactcagctgtgaatccttctggtcctggactttttctggttggtaggctttttattactaacacaatcttgaaacttgttattagtctgttcagggtttcaatttcttcctagttcaatcttaggaggttgtatgtttccaataatttattcatttcttctagtttgtgtgcatagagttgttc---gtagtctctgagggttttt------t--ttttttaatttatttgggattggtggtagtgttccctttgtcatttctgactgtatttatttttatctcctctcttttttgctttattagtctagctagtgctcaatcaatctggtttgttattttgaagaaacaaaacccggatttgttaatcttttgtatgggtttttgcatctcaatttctctcagttcagctctgatttcagttatttcctttctcttgctagctttgggactgatttgcttttgtttctctagttcctcttggtgtgaagttaggatgttaatttgaaaactttctaa-cctttgatgtagatttttttttt i macFas5.chr7 C 0 I 1587 s papAnu2.chr7 85453812 1478 - 162156779 ccaatgttggccaaggtggtctcgaactcctgacctcaggtgatccacccacctcggcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagctactgtgcccagccttgactac-ttttttttttttttttttttttttgacggagtctcactctgtcaccaggctggagggcagtggtgtgggctcggctcactgcaaactttgcctcccaggttcaagcaattctcctgcctcagtgtcctgagtagctgggactacaggcgtgcatttgcaaatattttatcctattctataggttgtctgtttactgtatTGATAGTTTatattgctgtgcagaagctttttaggtTAATTAggtcacatttattaatttttgcttttgtcacctttgtcatgaaatctttgtcaggGGCTATGCTGAGAATGgaatttcctaggttatcttccagggtttttatagttttgggtttcatatttaagtctttaatccacgttggattgattttcatatgtggTATAAGggaggggttcagtttcaattttttgcatatggctacctagttatctcagcaccatttattgaatagggaatgcttttcccattgcttgtttttgtcagccttgttgaagattagatggtttttgtttttagttctgcttatgtagtgaatcacatttactaatttgcatatgttgaaccaaccttgtgttccagggataaagcctacttgattgtggtggattagagttttaatgtgctgttggattcaatttgctagtattttc-------------------------------tttttttgctagttttctttttttgttgtgtctctgccaggttttggtatcagaatgatgttgacctcatagaataaattagggaggagtccttcctccttaaattttcagaatagtttcagtaggaaagGTACCAGCTCTTCTTCGTGCATCTGGTAGaactcagctgtgaatccttctggtcctggactttttctggttggtaggctttttattactaaCACAATCTTGaaacttgttattagtctgttcagggtttcaatttcttcctagttcaatcttaggaggttgtatgtttccaataatttattcatttcttctagtttgtgtgcatagagttgttcgtagtagtctctgagggttttt------ttattttttaatttatttgggaTTGGTGGTAAtgttccctttgtcatttctgactgtatttatttttatctcctctcttttttgctttattagtctagctagtgctCAATCAATCTGGTTTGTTATTTTGAAGAAACAAAACCCGGATTTGTTAATCTTTTGTCTGGGTTTTTGCATCGCAATTTCtctcagttcagctctgatttcagttatttcctttctcttgctagCTTTGGGACtgatttgctcttgtttctctagttcctcttGGTGTGAAGTTAGGATGTTAATTTGAAAACTTTCTAA-CCTttgatgtagatttttttttt i papAnu2.chr7 C 0 I 3 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=316772.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 425081 1320 + 478999 agtgatataaactttcctcttaatactgctttatctgtgtcccagagattttgatacgtagtatgtttgttctcattagtttcaaagaatttcttgacttctgcccgaatttcgttgtttacccaaaagtcattgaggagaaggttggttaattttcacgtatgcttttgatgtattttattgtattgatttcaatgtttattgcattgtaatctgagaaagtgtggtttgtatgattttggattttttgaatttcctgaaaattgttttatgattgattgtgtcgttgattttagagtatgtgccatgtgcagatgagaagaatgtataatattctaatgtttttgggtggagagtactgtagatgtctgttaggaccattttgtcaaatgttgagctcagtcccgaatctctttgttcattttctgtctcaatgctctaatattgtcagtgggttgttgaagtctcccagtagtattgtgtggttatcaaagtctcttcaaaggtctctaagaacttcctttataagtctgggtacttctgtgttagatgtatatattcttaggattgttaggttttcttgttgagtttaaccctttaccatcatgaaataccc----ttgtcttttttgattgttattggtttatagtctattttgtctgaaattagaatcagaccatttgctcttttctgttttc-tttggcttggtctattttttctccatccctttattttgagcccctggatatcactgcatgtgagatgggtctcttgcagagagaatacagttgggtcttgcttctttatctgacttgccactctatgccttttaaatgccttgaagcatttaacccatttacattcaaggtcaCTCAAGGTTAGATTGTGTCTttcccagcaatgattcctaaaccataagaaattactgaaatgagagacatagaattcaggatctggatgtcatggaagctcattgagattcaggacaaatttgaaatccaatccatggaatccagtaaaatgacagaagagctgaaagacaaaatagccactttaagaaagaaccaaactgaaactctcgagttaaaaattcactagaagaagttcataatacagttagaagtattaacagcaaaatagaccaagctaaggaaaatatctctgagctcaaagactggttctttgaattaacactgtgagacaaaaataaagaaaaaacaatttt-aaaagtgaacaaaacttctgagaaagattatataaagagaccaaatctacaactcattgccattactgagagagaaggacagagaataaacaacttgg s panTro4.chr14 18744645 1317 + 106544938 agtgatataaacttacctcttaatactgctttatatgtgccccagggattttgatatgtagtatgtttgttctcattagtttcaaagaatttcttgacttctgcctgaatttcgttgtttacccaaaagtcattcaggagaaggttggttaattttcacatatgcttttgatgtattttattgtattgatttcaatgcttattgcattgtaatctgagaaagtgtggtttgtatgattttggattttttgaatttgctgaaaattgttttatgatcgattgtgtggctgattttagagtatatgccatatgcagatgagaataatgt---atattctaatgttcttgggtggagagtagtgtagatgtctgttaggaccattttgtcaaatgtcgagctcagtcccgaatctctttgttcattttctatctcagtgctctaatactgtcagtggggtgttgaagtctcccagtagtattgtgtggttattaaagtctcttcaaaggtctctaagaacttcctttataagtctgggtacttctgtgttggatgtatatattctcaggattgttagttcttcttgttgagtttaaccctttaccttcatgtaatacccttctttgtctttttcgattattattggtttatagtctattttgtctgaaattagaatcagaccatttgcttttttctgttttctttttgcttggtctattttttctccatccctttattttgagcccctggatgtcattgcatgtgagatgggtctcttgtagagagaatacagttgggtcttgcttctttatccgacttgccactctatgccttttaa-----ttgaagcatttaactcatttacattcaaggtcattcaaggttagattgtgtgtttcccagcaatgattcctaacccataagaaattactgaaatgacagacatagaattcaggatctggatgtcatggaagctcattgagattcaggacaaatttgaaatccaatccatggaatccagcaaaatgacagaagagctgaaaggcaaaataaccactttaagaaagaaccaaagtgaaactctagagttaaaaattcactagaagaacttcataatacagttggaaatattaacagcaaaatagaccaagctaaggaaaatatctctgagctcaaagaccggttctttgaattaacactgtgagacaaaaataaagcaaaaacaatttt-aaaagtgaacaaaacttctgagaaatattacataaagagaccaaatctacaactcattaccattactgagagagaaggacagagaatgaacaacttgg i panTro4.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85455293 1282 - 162156779 agtgatataaactttcctcttaatactacTTTACCTGTGTGCCAGAGATTTTGATATGTAGTatgtttgttctcattagtttcaaagattTTATTGACTTCTGCCTAAATTTCGTTGTTcactcaaaagtcattcaggagaaggttggTTCATTTTCACGTATgcttttgatgtattttattgtattgattTCAATGTTTATTGCATTGTGATCTGAGAAAGTGTAGTTTGtatgattttggattttttgaatttgctgaaaATTGTTTTATGATCGATAGTGTGGTTGACTTTAGAGTACATGCCatatgcagatgagaagaatgt---atattctaatgtttttgggtggagagtacTGTAGATGTTTGTTAGGACTGTTTTGTCAAATGTTGAGCTCAGTCCTGAatctctttgttcattttctgtctcagtgctctaatactgtcagtggggtgttgaagtctcccagtAGTATTGT---GTCATCACAGTCTCTTcaaaggtctctaagaacttcctTTATAAGTCTGGGCACTTCTgtgttgtatgtatgtattcttaGGAttgttaggtcttcttgttgagttTAACTCTTtgt------------cctttctttgtctttttcgaTTGTTAATGGTTTACAgtc--ttttgtctgaaattagaatcaGATCACTTGCTTCT-----------TTTTGCTTGGtcta-tttttctccatccctttattttgaacccctggatgtcactgcatgtgagatgggtctcttgtaGAGAGAatacagttgggtcttgcttctttatccaacttgccactttatgccttttaa-----ttgaggcatttaatccatttacattcaaggtcacTCAAGGTTTGATTGTGTATTTCCCAGCAATGATTCCTAACCCATAGGAAATtactgaaatgacagacatagaacTCAGGATCTGGATGTCATGGAAGCTCATTGAGATTCAGGACATATTTGAAATCCAAT-TATGGAATCCAGTAAAATGATAGAAGGGTTGAAAGACAAATTAGCCACCttaagaaagaatcaaactgAAACTCTAGAGTTAAAAATTCACTAGAAGAACTTCATAATACAGTtggaagtattaacagcagaatagaccaagctaaGGAAGATATGTCTGAGCTCAAAGACTGGTTCTTTTAATTAACACTGtgtgacaaaaataaagaaaaaacaattttaaaaagtgaacaaaacttCTGAGAAAGATTACATAAAGGGACAAAATCTACAACTTATTGCCATTACTGAGAG---AGGACAGAGAATA---AACTTGG i papAnu2.chr7 I 3 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e macFas5.chr7 88325782 1587 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=355825.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 426401 4189 + 478999 aaaataaattcgactatatagtccatgaaaatcttcctaatcttgctagagaggatgatatgcaaatccaagaaatacagagaatcctggctagatattgtacaagatttacaaggcacataatcttcagattcaccatagttaatgcaaaagaaaagggatctagaaagaaaggtcgggttatgtatgaagggaactccatcaggctagcagcagacctttcagcagaaactttatcagccagaaaaaattaggggcctatttttagtattcttaaagaaaataaactccaaccaagaatttcatatccca-ccaaacttagcttcataagtgaaggaaaaataaaatccttctcagaaaataaaatgctaaggtaatacatttcaacttagctagccttataacaggtccttaagggagtgctaaacacgtgaacaaaagaacagcatctgctgccacaaaaacacgcttaagcacatagcccatagacactatgaagcactacacagtcaagtctataaaacagccagctaacaacatgatgacaggatcaaaatctgacatatcaatattaatcttaaatgtaagttatctaaatgccctacttaaaaggcatagagtggtaagttggataaaaaggcaagacaccactgtctgctgtcttgaagagaccaatctcatatgtaatgaaacccacagggtcaaagtaaagggatgcagaaagatttgtcatgtaaacaaaaaacaaac---aaaaaatagtaggggtcactatttcttatagcgtataaaacaaaccaacaacaattaccaaggacaaagaagggcattacataatgataaagggttcagttcaacaagaagactttatcctaaatgtatacacactgaacattggagcaccc-gactcataaaacaagtttttcttggcctacaaaaagacttagacaatcatacaataatactgggagacttcactgctccactgatggttt----tagatcgttaaggcagaagacgaacaaagaaattctggacttaaatttgacacttgactaattggacttaataaacatctacagaacactccatccaacaaccatagaatattcattctcatctacacatggaacatattgtaagatcaaccacacgcttcgtcagaaagcaagtctgaatacattcaaaaacactgaaatcatcccaggcacattcttgaaccacagtgcaataaaattagaaataaacgtcaagaaggtctctcaaaagtacacaaattcatggaaagtaaacaacttgctcctgagtaactcatgggtccacactgaaattaggcaaaaatcaaaaaaattctttgaaattaaaacagggacacaactaaccaaaatctctgaaatgaagctaaagcaggaaataaa-actttttatataaataagtaaataagataataagaggaaagattatagcactaaataccttcatcaagaagttagaaaaatctgaatttaataatccaactttgtacctaaaggaactag--aaaaaaaaaagctcaaagctagcagaagaacagatataactacaaatagagaaaaacttaatgaaagtgagatgcaaaaatatgtacaaaaggtcagcgaaaccaataattggtccttcaaaataaaaataaacaaaattggtagattgctagctagattaacatagaaaaaaagctgaagacccaaatgagtacaatcagaaataacaaaaatgatgttgcaactgatcccacagaaatacaaaagatactcaaagaatactataagcaactttatgcatacaaattagaaaatctagaagaaatggataaattcatggaaacacacaatctcccaagattgaatccctggaagagattgaaaccctgattagaccaacatcaagctgtgaaacagaatcaataataaaaaaacctaccaaccaaagtaagtcctgggccagatagattcacagctgaattctaccagagtt-aaaaaaagaactctaccaattttattgaaactattccaaaaaattgaggagtaggagctcctccctaactcattctatgaagccagtatcatcctgataccaaaacctggcagggacagaacaaaaaacaaatcatcagggcaatatcccttatgaatacagatgcaaatatcatcgacaaaatattagctaattgaatccatcagcacatcaaaaagttaacacactgtgatcaagtaggtactattcccgagaggtaaggctgattcaatgtatgcaaatcaataaatgtgattcatcacataaacataataagagacaaaaaccacatgatcatctcaatagatgcagaaaaagcattcaataatatccaacatcccttcatgataaaaacccttaacagactagattttgaaggaatatacctcaaaacaataagagccatctatgacagacccacagccaacatgatactgaatgggcaaaagctggaagtattccccttaagaactggtaaaggacaaggatgtacattctcaccacacttcttcaacagagtacttgaagtcctagccacagcaattatgcaaaagaaagaaataaaagatatccaaataggaaaataagaagtcaaactatttctattcactgatgatataattctatacttagaaaa--ctagctttcacaaaaaggcaactagaactgacatacaattttaggaaggtttcaggacatgaaatcattgtataaaaatcaatagcatttccatacatcaataatgtccaggctgagagtgaaatcaaggacacaatcccatttacaataggcacaaagaaaattaaataccttggaatacagttaaccagaaaaccctctacaaaattaatggcaaaaacactgctgacagaaatcagagatgacagaaataaatggaaaaacattccatactaatagattacaagaatcaatatagttaaaatggccacactgcccaaagcaatcaacagtttaatggtattcctatctcaccaccaacaccattcttctcagaattagaaaaaaagatagaaaattcatacagagccaaaaaagcctgaatagtcaaaacaatcccatgcaaaatgtaccacatgaacatatgcacctactctgt-acccagaaaaattg--aaaaaaatgtaaaaagaatgaaactagaggcatcacactactcaaactataaggccattgtaaccaaaacagtatgctactggtacagaaacagacacatagacccatagaacagaatagaaaacccagaaataaatccatgcacttacaaccatcagctcttcaacaaggcagacaaaaataagcaatggagaaaagactctctgtttagaagcccctactgaggaaagttgtgggcttgagtctggagcctaagaacattcaaccaagctaactctcaggtctctctattcaataaatggtgctgggataactggctagtcagatac------aaaaaaaagtgaaacttgacccttatttttcaccatatacaaaaatcaactcaaaatcgattacagatttaaatttaagacctcagcctatagaaatcctagaagaaaacctaggaaatactcttctcagccacagccttggcagagaatttttggctgagtcctcaaaggtaattgcaacaaaaactagagttgacaagtgggacctcattaaacaaaagagcttctgcacagcaaaaggaactatcaatagagtaagcagaaaacctacagaatgggagaaaatactcacaagctatgcttccaaacaaaggtctaatatccagaaagtataaagaacttaaacaaagcaacaagcaaaaaaacaaaacaaaaaaaatccacttaaaaatgggcaaaTaaggcaatcctaagcaaaaaagaacaaagctggaggcatcatattacccaacctcaaactatactacaaggctacagtaaccaaaacagcatgatactggtacaaaaacagacacataaaccaatggaacataatgagaggccagaaatagtgctgcacacctataaccatctgaactttcacaaagaggatacaaacaagcagtagggaaaggactttctattcaataaatggtgctgggataatgggcaagccacatgcaaaagactgaaatgtaaccccttctt s panTro4.chr14 18745962 4183 + 106544938 aaaataaattcgaatatatagtccatgaaaatcttcctaatcttgctagagaggatgatatgcaaatccaagaaatagagagaaccctggctagatatcgtacgagatgtacaaggcacataatcttcagattcaccacagttaatgcaaaagaaaagggatctagaaagaaaggtcaggttatgtatgaagggaaccccatcaggctagcagcagacctttcagcagaaactttataagccagaaaaaattgggggcctaattttagtattcttaaagaaaatcaattccaactaagaatttcatatcccacccaaacttagcttcataagtgaaggaaaaataaaatccttctcagaaaataaaatgccaaggtaatacatttcaacttagctagcattacaacaggtccttaagggagtgctaaacacgtgaacaaaagaacaacatctgctgccacaaaaacacacttaagcacatagcccatagacactataaagcgctacacagtcaagtctataaaacatccagctaacagcatgatgacaggatcaatatctgacatatcaatattaatcttaaatgtaagttattgaaatgccctacttaaaaggcatagagtggtaagttggataaaaaggcaagacaccactgtctgctgtcttgaagagaccaatctcatatgtaatgaaacccacagggtcaaagtaaagggatgcagaaagatttgtcatgtaaacaaaaaacaaacaaaaaaaaatagtaggggtcacta-ttcttatagcatatgaaacaagccaacaacaattaccaaggacaaagaaaggcattacataatgataaagggttcaattcaacaagaagactttatcctaaatgtatacacactgaacattggagcacccagactcataaaacaagtttttcttggcctaccaaaagacttagacaatcctacaataatactgggagacttcaatgctccactgatggtattagatagatcattaaggcagaacactaacaaagaaattctggacttaaatttgacacttgactaattggacctaataaacatctacagaacactccacccaacaaccatggaatattccttctcatctgcacatggaacatattgtaagatcaaccacatgcttgatcagaaagcaagtctcaatacattcaaaaacactgaaatcatcccaggcacattcttgaaccacagtgcaataaaattagaaataaacatcaagaagatctctcaaaagtacacaaattcatggaaagtaaacaacttgctcctgaataactcatgggtgcacactgaaattaggcaaaaatcaaaaaaattctttgatattaaaacagggacacaactaaccaaaatctctgaaatgaagctaaagcaggaaataaatattttttaaataaataagtaaataagataataagaggaaagattatagcattaaataccttcatcaagaagttagaaaaatctgaatttaataatccaactttgcacctaaaggaactagaaaaaaaaaaaagctcaaagctagcagaataacagatataactacaaacagagagaaacttaatgaaattgagatgcaaaaatatgtacaaaaggtcagtgaaaccaataattggtccttcaaaataaaaataaataaaactgatagattgctagctagattaacatagaaaaaaagcagaagacccaaatgagtacaatcagaaat---aaaaatgatgttgcaactgatcccacagaaatacaaaagatactcaaagaatactataagcaactctatgcatacaaattagaaaatctagaagaaatggacaaattcatggaaacacacaatctcccaagattgaatccctggaagagattgaaaccctgattagaccaacatcaagctgtgaaacagaatcaataataaaaaagcctatgaaccaaagtaagtcctgggccagatagattcacagctgaattctatcagatttaaaaaaaagaactctaccaattttattgaaactattccaaaaaattgaggaggaggagctcctccttaactcattctatgaagccagtatcatcctgataccaaaacctggcagggacagaacaaaaaacaaatcatcaggccaatatccctgatgaatacagatgcaaatatcatcaacaaaatgttagctaattgaatccatcggcacatccaaaagttaacgcactgtgatcaagtaggtactattccggagatgtaaggctgattcaatgtatgcaaatcaataaatgtgattcatcacataaacataataagagacaaaaaccacatgatcatctcaacagatgcagaaaaagctttcaataacatccaacatcccttcatgataaaaacccttaacagactagattttgaaggaatacacctcaaaataataacagccatctatgacagacccacagccaacatgatactgaat-ggcaaaagctggaagtattccccttaagaactggaaaaggacaaagatgtacattctcaccactcttcttcaatataggacttgaagtcctagccatagcaattatgcaaaagaaagaaataaaagacatccaaatagaaaaataagaagtcaaactatttctattcactgatgatataattatatacttagaaaaccctaactttcacaaaaaagcaactagaactgatatacagttttaggaaggtttcaggacatgaaatcactctacaaaaatcagtagcatttccatacatcaataatgtccaggctgagagtgaaatcaaggacacaatcccatttacaatagcaacaaagaaaattaaatcccttggaatacagttaaccagaaaa--gtctacaaaattaatggc-aaaacactgctgacagaaatcagagatgacagaaatgaatggaaaaaaattccatactaatagattataagaatcaatgttgttaaaatggccacactgcccaaagcagtctacagtttaatggtatttctatctcactaccaacaccattcttctcagaattag-aaaaaagatctaaaattcatacagagccaaaaaagcctgaatagtcaaaacaatcccatgcaaaatgtaccacatgaacatatgcacctactctgtaacccagaaatattgaaaaaaaaatgtaaaaaaaatgaaactagaggcatcacactattcaaactataaggccactgtaaccaaaacagcatgctactggtacagaaacagacacattgacccatagaacagaatagaaaacccagaaataaatccatgcacttacaaccatctgctcttcaacaaggctgacaaaaacaagcaatggagaaaaga--ctctgtttagaagcccctactgaggaaagttgtgggcttgagtctgtagcctaagaacattcaaccaagctaactctcaggtctctctattcaataaatggtgctgggataactggctagccagatacaaaaaaaaaaaaaaatgaaacttgacccttatttttcaccatatacaaaaatcaactcaaaatcgattaaagatttaaatttaagacctcagcctataaaaatcctagaagaaaacctaggaaatactcttctcagccacagtcttggcggagaatttttggctgagtcctcaaaggtaattgcaaccaaaaccagagttgacaagctgggcctaattaaacaaaagagcttctgcacagcaaaagaaactatcaatagagt--------aacctacagaatgggagaaaatactcacaagctatgattccaaacaaaggtctaatatccagaaactataaggaactt----aaagcaacaaacaaacaaac-------aaaaaatccacttaaaaatgggcaaaTaaggcaatcctaagcaaaaaagaacaaagctggaggcatcacattacccaacctcaaactatactataaggctacagtaaccaaaacaggatggtactggtacaaaaacagacacataaaccaatggaacataatgagaggccagaaatagtgctgcacacctataactatctgaactttcacaaagaggataaaaacaagcaatagggaaagggctttctattcaataaatggtgctgggataatgggcaagccacatgcaaaagactgaaatgtaaccccttctt i panTro4.chr14 C 0 I 8341 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85456575 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88325782 1587 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 430590 1984 + 478999 tcttttccatttgttttattttattttattttgttactattatactttaagttttagggtacacgtgcacaacgtgcaggttttgttacacatgtatacatgtgccatgttggtgtgctgcaccctacaaaaatcagttcaacatggattggagaattaaatgtaaaaccgcaaactataaaaaccccaggagataacttaggaaattccattctcaaataggccctggctagtatttcatggtgaagacaccaaaaacattgaccacaaaaaccagaaattgacaaatgagacctaagtaaactaaagagcttctgcagagcagaatgaactgtcaacagagtcaacagacaacccacaaaatgggataaaatatttgcaaactatgcacccaacaaaggtctaatatccagaatctacaaggaacttaaatgatcgagcaaaaaacaatctctttaaaaattgggcaaaggacatgaacaaaggcttttcaaagacctacatgcagccaagaagcatatgaaaaaatgctcgacatcgctaagcacatcaaaaccacaacgagataccaactcacagcagtcagaatggttattattaaaaagtcaaaaaataacatgctagtgaggtttcagagaagagggaacacttatacgctgctggtgggaatgtaaattagttcagccattgtggaaagcagcgtggcaatttctcaaagaaattaaaagagaattatcatttaacctagcaatctcattattgggcacatatccaaaggaatataaatcattttaccataaagacatatgcacacatatgttcaacacagtactattctcaatagcaaagttgccatcaatggtaaactgtataaagaaaatgtggtacacagacacaatggaatactatgtagtcataaaaagaatgagatcatgtcctttgcaagaaagagataaaaggaaaagagtcaaaattaatgaaacataaagtagacaaacattagaaaaaaatttaaaagccaaaaattggtattttgaaatgattaccaaaattgataaacccctagtagaatgatgaattttaaaagagaaacacacaaactaccaacattaagaataacaagagaagcactattagtcctaaagaaactgaagggataataagggaatatgaagaatagcaatatgacaaaacacatttgccaaaactggcacatcaagatatacaaaatctaaataggaatatattttaaaaggaaatgaatgtagagctgaaaactttctactaagaaaattccaggttcatatggctcaaccagggagttttctaaaatatgtaagaaacgggtaatgccaattgtatctaaactcgttcataaaatagaagaaaggataccattgcccaactttctttatgaggtcagtataaccctgataccaaaatctgacacaggattttgcattgcaaggattttgcattacaagaaaagatgatttctcaaaaacatacacatacaattttatttttatttttttgagacggactctgactctgtcacccaggctggagtgcagtcgtgcgatctcggctcactgcaagctccacctcccgggttcatgccattctcctgcctcagtctcccaaatagctgagactacaggcgcccaccaccaagcccggctaattttttgtattttcagtagagacggggtttcaccgtcttagccaggatggtctcgatctcctgacctcatgattcgccctcctcggcctcccaaagtggtgggattacaagcgtgagccaccctgcccggctacacataaaattttaaaacaaagcattagcaatccgaacatgacaatacataaaaagttgtgaccagatgggatgtatcccaaaaacgcatagttggcttaacatttgaaaatcaatcaagttaattgctatattcactgaatgaaggtggaaaaatgatatgatctt e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85456575 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88325782 1587 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e panTro4.chr14 18750145 8341 + 106544938 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=90744.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 432574 1070 + 478999 gccaatagaggcagaaaatcatctgttttaacatccattcatgtctgtaaaaaattctaagtacattggaaatgaaagggaacctctccagtccaataaagggcaattatgaaaaacctatagcaaccattataacatatgataaaatcttgaatgcatgcccccttaagattaggaagaatgcaagtatccatgctctcaccacttctattcaacatgtgctaaccactgaaataaagttttttttaaaggtattaatattaggaagaaaaaaataaaaatctatttattcatagaagaaatgtatgtgtagagcatactatggtgtctttaaagaactagaatttacaaggaaatttatcaagggttgcaggatacaagatcaacatttaaaaactaaATCTTGGTGAGAATGTGAAACAACTATTAACTCTGAAAAACGAAACAAAGTAAACTTAAATGTTATTATTCTTCTTCCTTTGATTTTTTTGTATAAAGTGTTAAGGATATAAAAATACTAGAAGTCATGCCATAAAAGTAAAAAAAGAAAAAAAAATTCTCTTTGAATTTTTATTTTTTGACTTTTCTTTttttttcttttcttttttttttttttttttgagacggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcgatctcggctcactgcaagctgcgcctcccaggttcacgccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgcccgccaccacgcccaggtaatttttttttt-------------tgtattttttattacagacggggtttcaccgtgttagccagaatggtctcgatctcctgacctcgtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctgggattataggcgtgagccaccgtgcccagccattctttgactttttaataatagtccttctgactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaatagtcaagctgagcattttttttttcatatgcttattggccgtatacatgttttcttttgggaagtatcttttcatatA s panTro4.chr18 74694952 1061 - 76611499 gccaatagaggcagaaaatcatttgttttaacatccattcatgtctgtaaaaaattctaagtacattggaaatgaaagggaacctctccagtccaataaagggcaattatgaaaaacctatagcaaccattataacatatgataaaatcttgaatgcatgcccctttaagattaggaagaatgcaagtattcatgctctcaccacttctattcaacatgtgctaaccactgaaataaagttttttttaaaggtattaatattaggaagaaaaaaataaaaatctatttattcatagaagaaatgtatgtgtaaagcatactatggtgtctttaaagaactataatttacaaggaaatttatcaagggttgcaggatacaacatcaacatttaaaaatcaaATCTTGGTGAGAATGTGAAACAACTATTAACTCTGAAAAATGAAACAAAGTAAACTTAAATGTTCTT---CTTCTTCCTTTG-TTTTTTTGTATAAAGTGTTAAGGATATAAAAATATTAGAAGTCATGCCATAAAAGTAAAAAAAGAAAAAAAAATTCTCTTTGAATTTTTATTTTTTGACttttcttttttttt-------------tttttttttttgagacggagtctcgctctgtcgcccaggctg-agtgcagtggtgtgatctcggctcactgcaagctccacctcccgggttcaggccattctcctgcctcagcctcctaagtagctgggactacaggcgcccgccaccacgcccagctaattttttttttgtatttttttttttgtattttttattagagacggggtttcaccgtgttagccagaatggtctcaatctcctgacctcgtgatctgcccaccttggcctcccaaagtgctgggatttaaggtgtgagccactgtgcccagccattttttgactttttaataacagtccttctgactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatg----gtcaagctgagcattttttttttcatatgcttattggccgtatacatgttttcttttgggaagtatctgttcatatA i panTro4.chr18 n 8341 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3610311 3750 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85456575 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 88325782 1587 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=10370.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 433644 12 + 478999 AAAAGTGGTCAT s panTro4.chr18 74696013 12 - 76611499 AAAAGTGGTAAT i panTro4.chr18 C 0 I 1 s macFas5.chr7 88327369 12 - 171882078 aaaaGTGGTAAT i macFas5.chr7 I 1587 I 1 s papAnu2.chr7 85456575 12 - 162156779 AAAAGTGgtaat i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s chlSab2.chr29 3614061 12 - 24206276 aaaaGTGGTAAT i chlSab2.chr29 I 3750 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88045976 2644 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=185251.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 433656 156 + 478999 TTTTTTGAGAAAAAAATGAATAAATTCAGAGACAAACTCTT--GTTGGTTAAA---AATAATATT---GAATATatacatgtcaatgcataaatagaatacaatttaataaaatacCAGTAATACTTTTCATTGTAAAATTAATTCAAGATTATCTAGAAGA-GA s panTro4.chr18 74696026 162 - 76611499 TTTTTTGAGAAAAAAATGAATAAATTCAGAGACAAACTCTTCTGTTGGTTAAA---AGTAATATTATTGAATATATACATGCCAATTCATAAATTGAATACAATTTAATAAAATACCAGTAATACTTTTCATTGTAAAATTAATTCAAGATTATCTAGAGGAAGA i panTro4.chr18 I 1 C 0 s rheMac3.chr7 88048620 158 - 170124641 TTTTTTGAGAAAAAAATGAATAAATTCAGAGACAAACTCTTTTGTTGGATAAA---AATGTTATT---GAATATATACATATCAATGCATAAATTGAATGCAATTTAATAAAATACCAGTAATACTTTTCATTGTAAAATTAATTCAAGATTATCTGAAAGA-AA i rheMac3.chr7 I 2644 C 0 s macFas5.chr7 88327382 158 - 171882078 TTTTTTGAGAAAAAAATGAATAAATTCAGAGACAAACTCTTTTGTTGGATAAA---AATGTTATT---GAATATATACATATCAATGCATAAATTGAATGCAATTTAATAAAGTACCAGTAATACTTTTCATTGTAAAATTAATTCAAGATTATCTGAAAGA-AA i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 85456588 158 - 162156779 ttttttgagaaaaaaatgaataaattcagagACAAACTCTTTTGTTGGATAAA---TATGttatt---gaatatatacatatcaaTGCATAAATTGAATACAATTTAATAAAGTACCAGTAATACTTTTCATtgtaaaattaattcaagattatctgaaaga-aa i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s chlSab2.chr29 3614073 154 - 24206276 TTTTTTGAGAAAAAAATGAATAAATTCAGAGACAAACTC--TTGTTGGATAAAAATAATGTTATT---GAATATATACATGTCAATGCATAAATTGAATAC-----AATAAAATACCAGTAATACTTTTCATTGTAAAATTAATTCAAGATTATCTGGAAGA-AA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46946628 7107 - 64190966 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=429309.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 433812 317 + 478999 AAATCTATCCAAGGTGA-TAAAACTTTCCTAGAAGGATTAAAAAGTCTCCATTTTGAGGACTATTTTAGATCTTCAGATTAATTTTATCTTATCTATTAGAGTGAACATTAAGAGGTGAGTAAGATCCTGGATTATATGCACAATTAT-GAAAAAAAATCATGTTTTTAAAAGT-TTTGGTGGCAAG--ACTAACCTACTCCAAGATGGGGTTGTTATTCCACTTA-----AGAACGTATCTA--------------ACCTCATTCATTTTGC-TTCCTTTCTCTATTTTCCTCTGTGCAGCTCTCTTTATCATTGT--TTTCTTTTTATGGTTATATGGATTT s panTro4.chr18 74696188 316 - 76611499 AAATCTATCCAAGGTGA-TAAAACTTTCCTAGAAGGTTTAAAAAGTCTCCATTTTGAGGACTATTTTAGATCTTCAGATTAATTTTATCTTATGTATTAGAGTGAACATTAAGAGGTGAGTAAGATCCCGGATTATATGCACAATTAT-GAAAAAAA-TCATGTTTTTAAAAGT-TTTGGTGACAAG--ACTAACCTACTCCAAGATGGGGTTATTATTCCACCTA-----AGAATGTATCTA--------------ACCTCATTCATTTTGC-TTCCTTTCTCTATTTTCCTTTGTGCAGCTCTCTTTATCATTGT--TTTCTTTTTGCGGTTATATGGATTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88048778 310 - 170124641 AAATCTATCCAAGGTGA-TAAAACTTTCCTAGAAGGGTTAAAAAGTCTCCATTTTAAGGACTATTTTAGGTCTTCAGGTTAATTTTATCTTATGTATTAGAGTGAATAATA---GGTGAGTAAGATCCTGGGTTATATTCACAATTAT-GAGAAAAA-TCATTTTTTTAAAAGT-TTTGGTGGCAGG--ACCAAACCACTCCAAGAAGGGGTTGTTATTCCACTTA-----AAAACGTATCTA--------------ACCTCATGCATTT----TTTCTTTCTCTATTTTCCTCTATGTAACTCTCTCTATCATTGT--TTTCTTTTTGTGGTTATATGGATTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88327540 310 - 171882078 AAATCTATCCAAGGTGA-TAAAACTTTCCTAGAAGGGTTAAAAAGTCTCCATTTTGAGGACTATTTTAGGTCTTCAGGTTAATTTTATCTTATGTATTAGAGTGAATAATA---GGTGAGTAAGATCCTGGGTTATATTCACAATTAT-GAGAAAAA-TCATTTTTTTAAAAGT-TTTGGTGGCAGG--ACTAAACCACTCCAAGAAGGGGTTGTTATTCCACTTA-----AAAACGTATCTA--------------ACCTCATGCATTT----TTTCTTTCTCTATTTTCCTCTATGTAACTCTCTTTATCATTGT--TTTCTTTTTGTGGTTATATGGATTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85456746 310 - 162156779 aaatctatCCAAGGTGA-TAAGACTTTCCTAGAAGGGTTAAAAAGTCTCCATTTTGAGGACTATTTTAGGTCTTCAGGTTAATTTTATCTTATGTATTAGAGTGAATAATA---GGTGAGTAAGATCCTGGGTTATATTCACAATtat-gagaaaaa-tcatttttttaaaagt-tttggtgGCAGG--ACTAAACTACTCCAAGAAGGGGTTGTTACTCCACTTA-----AAAACGTATCTA--------------ACCtcatgcattt----tttctttttctattttcctctatgtaactctctttatcattgt--tttctttttgtggttaTATGGATTC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3614227 309 - 24206276 AAATCTATCCAAGGTGA-TAAAACTTTCCTAGAAGAGTTCAAAAGTCTCCGTTTTGAGGACTATTTTAGGTCTTCAGGTTAATTTTATCTTATGTATTAGAGTGAATATTA----ATAGGTAAGACCCTGGATTATGTTCACAATTAT-GAAAAAAG-TCATATTTTTAAAAGT-TTTGGTGGCAAG--ACTAAACTACTCCAAGAAGGGGTTGTTATTCCACTTA-----AGAATGTATCTA--------------ACCTCATGCATTTTTCCTTCCTTTCTCTATTTTCCTCTATGTAACTC----TATCACTGT--TTTCTTTTTGTGGTTATATGGATTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46953735 334 - 64190966 AAGTCTGTCTAACATGACCCAAGCTTTCTCAGCTGGGTTAAAAAGCCTCTACTCTGAG--CTAGTTTAGATCTTCTGATTAATTTTATCTTACGTATTGGGGTAAATATTAAAAAGTGAGAAAG-TCTCAGATTATGCTCCTAATTACAGAAAAATA-TCCTATTTTTAAGAGTCTTTTGTGGCAGGACACTAACCTAGTTCAAGACGGGGCTAATACTCCACATATGtttataatatatatatattataaataattGCCTT-TCCATTT----GTGTCTCCTTTATGTTTTCTTGTTCTA-TATTTTGATCATTCTAGCTTTCTTTTGTGTGTGTGTATATtt i canFam3.chr15 I 7107 I 2893 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=615976.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434129 502 + 478999 GTAGACTGTG-CATTTATATGGACtgccatgcgagctgtcacagcccagacagtggagtgtggttggcttgtgggtagtaagaagaatttaccaacaactgtatagatttgaaaaggaaagttgtattagatggaaagaacgctgcagaggagtgcagcagggctcctcagcaagagaggactgaggacgccactgcagtagatttttccttagggtatttatggaccttaaagtgggagcttaagggtaatttttaccatattagccacataggtcatggtaaacaattacatttatagacattttggtgccttgatgtcagcagggattgcacaatgagtttagaatacatgcattccagagatgcatagaaattctggttactcacaa--atttttggaaaagaaatctcataccagatgccagctttacataatagggatgtctaattacttctgaattccttggataaggagttttgcctctggatggtctTGCTCTCCT s panTro4.chr18 74696504 502 - 76611499 GTAGACTGTG-CATTTATATGGACtgccatgcgagctgtcacagcccaggcagtggagtgtggttggcttgtgggtagtaagaagaatttaccaacaactgtatagatttggaaaggaaagctgtattagatggaaagaacgctgcagaggagtgcagcagggctcctcagcaagagaggactgagtacgccactgcggtagatttttccttagggtatttatggaccttaaagtgggagcttaagggtaatttttaccatattagccacataggtcatggtaaacaattacatttatagacattttggtgccttgatgtcagcaagggttgcacaatgagtttagaatacatgcattccagagatgcatagaaattctggttactcacaa--atttttggaaaagaaatctcataccagatgccagctttacataatagggatgtctaattacttctgaattccttggataaggagttctgcctctggatggtctTGCTCTTCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88049088 502 - 170124641 GTAGACTGTGCCATTTATATGGACtgccatgtgagctgtcagagcccagatagtggagtgtgattggcttatggatattaagaagaatttaccaacaactgtatagatttgaaaaagaaagttgtattagatggaaagaatgctgcagaggagtgcagcagggcgcctcagcaagacaggactgagtacaccactgc---agatttttccttagagtatttatggaccttaaagtgggagcttaagggtaatttgagccatattggccacatagttcatggtaaacgattacatttacagacattttggtgccttgatgtcagcaagggttgcacaatgagttgagaatacatgcattccggcgatgtatagaaattctacttattcacaagtatttttggaaaagaaatctgataccagatgctggctttacacaatagggatgtctaataaattctgaattcatctgataaggagttttgcctctgaacggtctTGCTCTCCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88327850 495 - 171882078 GTAGACTGTACCATTTATATGGACtgccatgtgagctgtcagagcccagatagtggagtgtgattggcttatggatattaagaagaatttaccaacaactgtatagatttgaaaaagaaagttgtattagatggaaagaatgctgcagaggagtgcagcagggcgcctcagcaaga-------gagtacaccactgc---agatttttccttagagtatttatggaccttaaagtgggagcttaagggtaatttgagccatattggccacatagttcatggtaaacgattacatttacagacattttggtgccttgatgtcagcaagggttgcacaatgagttgagaatacatgcattccggcgatgtatagaaattctacttattcacaagtatttttggaaaagaaatctgataccagatgctggctttacacaatagggatgtctaataaattctgaattcatctgataaggagttttgcctctgaacggtctTGCTCTCCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85457056 502 - 162156779 GTAGACTGTACCATTTATATGGACTGCCATGTGAGCTGTCAGAGCCCAAATAGTGGAGTGTGATTGGCTTATGGATATTAAGAAGAATTTACCAACAACTGTAtagatttgaaaaagaaagttgTATTAGATGGAAAGAATGCTGCAGAGGAGTGCAGCAGGGCGCCTCAGCGAGAGAGGACTGAGTACACCACTGC---AGATTTTTCCTTAGAGTATTTATGGACCTTAAAGTGGGAGCTTAAGGGTAATTTGAGCCATATTGGACACATAGTTCATGGTAAACGATTACATTTACAGACATTTTGGTGCCTTGATGTCAGCAAGGGTTGCACAATGAGTTGAGAATACATGCATTCCGGCGATGTATAGAAATTCTACTTATTCACAAgtatttttggaaaagaaatcTGATACCAGATGCTGGCTTTACACAATAGGGATGTCTAATAAATTCTGAATTCATCTGATAAGGAGTTTTGCCTCTGAACGGTCTTGCTCTCCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3614536 498 - 24206276 GTAAACTGTG-CATTTATATGGACtaccatgtgagctatcacagcccagacagtggagtgtgattggcttacgggtattaacaagaatttaccaacaactgtatagttttgaaaaagaaagttgtattagatggaaagaatgctgcagaggagtgcagcagggtgcctcagcaagacaggactgagtacaccactac---agatttttccttagagtatttatggaccttaaagtggaagcttaagggtaatttgaaccatattggccacataggtcatggtaaacgattacattaacagacattttggtgccttgatgtcagcaagggtttcacaatgagttgagaatacatgcattccagagacgtatagaaattctacttattcataagtatttttggaaaagaaatctgataccagatgctagctttacataatagggatgtc---taaattctaaattcatttgataaggagtttggcctctgcatgatctTGCTCTCCT i chlSab2.chr29 C 0 I 1507 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46954069 2893 - 64190966 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=30312.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434631 40 + 478999 CATGGACTAGTATCTCTCTGTCTCTTCACCATTTGTTTTT s panTro4.chr18 74697006 40 - 76611499 CGTGGACTAGTATCTCTCTGTCTCTTCACCTTTTTTTTTT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88049590 38 - 170124641 CATGGGCTAGTA--TCTCTGTCTCTTCACCTTTTTTTTTT i rheMac3.chr7 C 0 I 2183 s macFas5.chr7 88328345 38 - 171882078 CATGGGCTAGTA--TCTCTGTCTCTTCACCtttttttttt i macFas5.chr7 C 0 I 1554 s papAnu2.chr7 85457558 38 - 162156779 CATGGGCTAGTA--TCTCTGtctcttcacctttttttttt i papAnu2.chr7 C 0 I 1553 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46954069 2893 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3615034 1507 - 24206276 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=413.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434671 5 + 478999 --AAGTC s panTro4.chr18 74697046 7 - 76611499 TTAAGTC i panTro4.chr18 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46954069 2893 - 64190966 I e chlSab2.chr29 3615034 1507 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85457596 1553 - 162156779 I e macFas5.chr7 88328383 1554 - 171882078 I e rheMac3.chr7 88049628 2183 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=77466.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434676 87 + 478999 ATACGACTATCTTTCCATTTATGTCTCTGCTAGTCtttcttttcccttttctcttgatttttattttgattattGTAACTTTTTCTG s panTro4.chr18 74697053 87 - 76611499 ATACGACTATCTTTCCATTTATGTCTCTGCTAGtctttcttttcccttttctcttgatttttattttgattattgtaactttttctg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88329937 87 - 171882078 ATACGACTGTCTTTTCATTTATGTCTTTGCTAGtctttcttttcccttttctcttgatctttattttgattattgtaactttttctg i macFas5.chr7 I 1554 C 0 s papAnu2.chr7 85459149 87 - 162156779 ATACCACTGtcttttcatttatgtctttgctagtctttcttttcccttttctcttgatctttattttgattattgtaactttttctg i papAnu2.chr7 I 1553 C 0 s chlSab2.chr29 3616541 87 - 24206276 ATACGACTGTCTTTTCATTTATGTCTTTGCTAGTCTTTCTTTTCCCTTTTCTCTTGATTTTTATTTTGATTATTGTAACTTTTTCTG i chlSab2.chr29 I 1507 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46954069 2893 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88049628 2183 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=159792.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434763 173 + 478999 TACTtctctctctctcctttcttctttctttcctttttctactctTAC-ACTTTGTTTTTGAACTGTGAAATAAATTAAAACAAAT--GTATTTGGTGATAAATTAT-GTTTATTACCCCCAAATC----TGTGTTCTTATTTCACTTGTAAAGTGACCCATAAACTCAGTGTTTTCTTTA s panTro4.chr18 74697140 170 - 76611499 tacttctctctctctcctttcttctttctttcctttttctactcttAC-ACTTTGTTTTTGAACTGTGAAATAAATTAGAACAAAT--ATATTTGGTGCTAAATTAT-GTTTATTACCCCCAAATC----TGTGTT---ATTTCACTTGTAAAGTGACCCATAAACTCAGTGTTTTCTTTA i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330024 167 - 171882078 tact--tctctctctcctttcttctttcttTCCTTTTTATACTCTCAC-ACTTTGTTTTTGAACTGTGAAATAAATTAGAACAAAT--ATATTTGGTGATAAATTAT-GTTTATTACCCCCTAATC----TGTGTT---ATTTCGCTTGTAAAGTGA-ACATAAACTCAGTGTTTTCTTta i macFas5.chr7 C 0 I 5 s papAnu2.chr7 85459236 169 - 162156779 tacttctctctctctcctttcttctttctttcctttttatactttcac-actttgtttttGAACTGTGAAATAAATTAGAACAAAT--ATATTTGgtgataaattat-gtttattacCCCCAAATC----TGTGTT---ATTTCGCTTGTAAAGTGA-ACATAAACTCAGTGTTTTCTTTA i papAnu2.chr7 C 0 I 321 s chlSab2.chr29 3616628 158 - 24206276 TACT----TCTCTCTCCTTTCTTCTTTCTTTCCTTTTTCTACTCTTAC-AC------TTTGAACTGTGAAATAAATTAGAACAAAT--ATATTTGGTGATAAATTAT-GTTTATTACCCCCAAATC----TGTGTT---ATTTCCCTTGTAAAGTGA-CCATAAACTC-GTGTTTTCTTTA i chlSab2.chr29 C 0 I 5 s canFam3.chr15 46956962 172 - 64190966 taactttctcttTACCTCTTTTTTTCTCTCTCCTTTTTCTACTTTTTCTACTGTATTTTTAAGCTG-AAAATAGATTAGGACAAATACATATTTTATTATGAATTATAGTTTACAA-----AAATAGGAGTGCATT---ATTTCAACTGTAAAGTGACTCCTAAATTCAGAATTCCCCTTA i canFam3.chr15 I 2893 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88049628 2183 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=36988.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434936 49 + 478999 AAGCAAAAGATTAAACTAATTTTTAAATAAAATTAATAAAATTAATTTG s panTro4.chr18 74697310 40 - 76611499 AAGCAAAAGattaaaataattttaaaataaaattaat---------ttg i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330196 49 - 171882078 aaataaaagattaaaatattttaaaaataaaattaataaaattaaCTTG i macFas5.chr7 I 5 C 0 s papAnu2.chr7 85459726 49 - 162156779 aaataaaagattaaaatatttaaaaaataaaattaataaaattaatttg i papAnu2.chr7 I 321 C 0 s chlSab2.chr29 3616791 49 - 24206276 AAAGAAAAGATTAAAATATTTTAAAAATAAAATTAATAAAATTAATTTG i chlSab2.chr29 I 5 C 0 s canFam3.chr15 46957134 43 - 64190966 AAACAAAAGAATAAAA------ACAGATATAAAAAACAGAACCAACTTG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88049628 2183 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=19124.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434985 14 + 478999 CATTTATTTTTTCT s panTro4.chr18 74697350 12 - 76611499 catttatttttt-- i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88051811 14 - 170124641 catttaatttttct i rheMac3.chr7 I 2183 C 0 s macFas5.chr7 88330245 14 - 171882078 CATTTAATTTTTCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85459775 14 - 162156779 catttaatttttct i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3616840 14 - 24206276 CATTTAATTTTTCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46957177 14 - 64190966 CATTTAATTGCTCT i canFam3.chr15 C 0 I 482 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=7230.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 434999 5 + 478999 GACTC s panTro4.chr18 74697362 5 - 76611499 gactc i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88051825 5 - 170124641 gaCTC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330259 5 - 171882078 GACTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85459789 5 - 162156779 gactc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3616854 5 - 24206276 GACTC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46957191 482 - 64190966 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=111773.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 435004 74 + 478999 AAATAATTTT---TAAAATTAATAATCTTTAATGGA------AAAATGTTTTTCATCCTTGTTTTAGTTGAGCAGAGTGAAAG s panTro4.chr18 74697367 74 - 76611499 aattaatttt---taaaattaataatCTTTAATGGA------AAAATGTTTTTCATCCTTGTTTTAGTTGAGCAGAGTGAAAG i panTro4.chr18 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88051830 74 - 170124641 aattaatttt---taaaattaataatCTTTAATGGA------AAAATGTTTTTCATCCTTGTTTTAGTTGAGCATAGTGAAAG i rheMac3.chr7 C 0 I 4540 s macFas5.chr7 88330264 68 - 171882078 AATTAATTTT---TAAAATTAATAATCTTTAATGGA------AAAATGTTTTTCATCCTTGTTTTAGTTGAGCATAG------ i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85459794 74 - 162156779 aattaatttt---taaaattaataatctttaatgga------aaaatgtttttcatcCTAGTTTTAGTTGAGCATAGTGAAAG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3616859 74 - 24206276 AATTAATTTT---TAAAATTAATAATCTTTAATGGA------AAAATGTTTTTCATCGTTGTTTTAGTTGAGCATAGTGAAAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46957673 83 - 64190966 aaataattttatGAAAAAATAATAATCTGTAATGAAAGCAATAAAAAGTTATTCGTTTTTGTTTTTGCTGAGCAGAGTAAAAG i canFam3.chr15 I 482 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=148469.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 435078 156 + 478999 GGAACAAATTACAAATACCAAGAGCATGACACATCTTTT--CATGC-TATGTAGGAGATCACCTTCCCTTTAGCAATTGTTCTATCCTATACTAAGAAACTATTTTCTCTAAGAAGAATTATG---CAGCAGTATTCATGAGC-TTTTCAATATTTCCTTTGC s panTro4.chr18 74697441 156 - 76611499 GGAACAAATTACAAATACCAGGATCATGACACATCTTTT--CATGC-TATGTAGGAGGTCACCTTCCCTTTAGCAATTGTTCTATCCTATACCAAGAAACTATTTTCTCTAAGAAGAATTATG---CAACAGTATTCATGAGC-TTTTCAATATTTCCTTTGC i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330332 156 - 171882078 GGAACAAATGACAAATACAAAGATCATGACACATCTTTT--CATCCTTTTTTAGGAGGTCACCTTCCCTTTAGCAATTGTTCTATCCTAT-CCAAGAAACTATTTTCTCTAAGAAGAATTATG---TAACAGTATTCATGAGT-TTTTTAATATTTCCTTTGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85459868 156 - 162156779 GGAACAAATGACAAATACAAAGATCATGACAtatctttt--catccttttttaggAGATCACCTTCCCTTTAGCAATTGTTCTATCCTAT-CCAAGAAACTATTTTCTCTAAGAAGAATTATG---TAACAGTATTCAtgagt-tttttaatatttcatttgc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3616933 157 - 24206276 AGAACAAATGACAAATACAAAGATCATGACACATCTTTT--CGTCCTTTTTTAGGAGGTCACCTTCCCTTTAGCAATTGTTCTATCCTATACCAAGAAACTATTTTCTCTAAGAAGAATTATG---TAACAGTATTCATGAGT-TTTTTAGTATTTCCTCTGC i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46957756 143 - 64190966 TGAATAAACAACAAATACTGAGATCATGATATATCTTTTCACATCC-TATTTGAGAAGTCATTTTCCCTTAAGGAAACGGT-------------------TCTTCTGTCTAAGAAGGATTATGCCTTCAAAGTCTTCATGAGCATTATTTATATTTTTTCTGC i canFam3.chr15 C 0 I 71 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88051904 4540 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=22749.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 435234 27 + 478999 TAATGTCCTTATCACCGTCAACATCCT s panTro4.chr18 74697597 27 - 76611499 TAATGTCCTTATCACCGTCAACATCCT i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330488 27 - 171882078 TAATATCCTTATCACTGGCAACATCCT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85460024 27 - 162156779 tAATATCCTTATCACTGGCAACATCCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3617090 27 - 24206276 TAATATCCTTATCACCGGCAACATCCT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46957899 71 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88051904 4540 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=231713.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 435261 241 + 478999 ACAACTgagtaaggtgcttatcttgcatgcaaaatttaaaggcgtgcccaaa---------aactcaatagtagagataaac---atttaaatcaatatt--ttgagaaatcaaaattaattttaaaatttgtgat----aaagta----ccaaattttaagcaaaggcaggatcagcaactgccatgttgagccatgttggaacctgaggcaacaggaaaaataaataatattggtgaagtcttttttaaaaattatacttt s panTro4.chr18 74697624 241 - 76611499 ACAACTgagtaaggtgcttatcttgcatgcaaaatttaaaggcgtgcccaaa---------aactcaatagtagagataaac---attttaatcaatatt--ttgagaaatcaaaattaattttaaaatttgtgat----aaagta----ccaaattttaagcaaagtcaggatcagcaactgccatgttgagccacgttggaacctgaggcaacaggaaaaataaataatattggtgaagtcttttttaaaaattatacttt i panTro4.chr18 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88330515 233 - 171882078 ACAACTgagtaaggtgcttatcttgcatgcaaaatttaaaggcatgcccaaa---------aactcagtagtaga---------------aatcaatatt--ttgagaaatcaaaattaattttaaaatttgtgataaacaaaata----ccaaattttaagcaaaggcaggatcagcaactgccatgttgagctatgttggtacctgaggcaacaggaaaaataaataatattggtgaagccttttttaaaaattatacttt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85460051 233 - 162156779 ACAACTGAGTAAGGTGCTTATCTTGCATGCAAAATTTAAAGGCATGCCCAAA---------AACTCAGTAGTAGA---------------AATCAATATT--TTgagaaatcaaaattaattttaaaatttgtgataaaCAAAATA----CCAAATTTTAAGCAAAGGCAGGATCAGCAACTGCCATGTTGAGCTATGTTGGTACCTGAggcaacaggaaaaataaataatattggtgaagccttttttaaaaattatacttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3617117 245 - 24206276 ACAACTgagtaaggtgcttatattgcatgtgaaatataaaggcatgcccaaa---------atctcagtagtagaaatcaac---attttaatcaatatt--ttgagaaatcaaaattaattttaaattttgtgataaacaaaata----ccaaattttaagctaaggcaggatcagcaactgccatgttgagctatgttggtacctgaggcaacaggaaaaataaataatattggtgaagccttttttaaaaattatacttt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46957970 259 - 64190966 acaa-tgag-aaagcacttgccttgagtgtaaaatctaagggagtgaccaaaaaaaaaaccaacttagtaataaagataaacaatattttaattaatatttcttaaaaaatcaaatctttttaaaaaatccacagtgaggaaagtaaatgccaaactttaaataaagatatgatcagcgagtgttatgctgagccatagtgggatttcacacaaaaggaaatatctgtaattttaat--attttgatttaaaaatttcatttt i canFam3.chr15 I 71 I 159 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88051904 4540 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=2184029.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 435502 2597 + 478999 aagttctgggatacatgcgtagaatatgcaggtttgttacataggtaaatatgtgccatggtggtttgctgcacccatcaacctgtcacctacattaggtatttctcctaatgctatccttcccctagccccccaccctgtgacaggcccccgtgtgggatattcccctccctgtgtccctgtgttctcactgttcaactcccacttaagagtaagaacatgtggtgtttggttttctgttcctgtgttagtttgctgagaatgatggtttctagcttcatccatatccctgcaaatgacatgaactcatccttttttatggctgcatagtattccataaagtatatgtgacccattttctttatccag-tctatgattgatgggcatttgggttggttcaaagtctttgctattgtgaacagtgccacagtaaacatacatgtgcatgtgtctttatagtagaatgatatataattctttgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaatggtatttctggttctacatccttgaggaatcgctacactgtcttctacaatggttgaactaatttaccctcccaccaacagtgtaaaagggttcctatttctccacatcctctccagcatctgctgtttcctgaccttttaatgatcaccattctaactggcatgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagcttttttttcatatgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatcctttgttcactttttgatagggttgt----t--ttttttcttgtaaatttgtttaagttccctgtagatgctagatattag----------ccctttgtcagctggatagattgcaaaaatttcctctcattctgtaggttgactgtccactctgatgagaggtttttttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttttttgctgtgcagaagctctttagtttaattagatctcatttgtcaattttggcttttgttgccattggttttggtgttttagtcatgaagtctttgcccatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggttttccatttactcctttaatccatcttgagttaattttg-tataaggtgtaaggaaggggttcagtttcagttttctgcatatgtctagccagttttcacaacaccatttattaaatagggaatccttttcccattgcttgcttttgtcaggcttgttaaagaccagatggttgtagatgtgtggcattatttctaaggcctcttttctgttccattggtctatatatctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgcggccttgtagtatagttcgaagtcaggtagtgtgatgcctct-------ttctttttgcttaggattgtcttggctatacaggctcttttttggttctgtatgaaatttaaagttgttttttctaattctgtgaagaaaatcaatggtagcttgatggggatagcattgaatctgtaaattactttgggcagtatggccattttcatgatattgattcttcctatccatgagcacagaacgtttttcca----tttgtgtcctctc-tttttccttgagcagtggtttgtaattctccttgaagaggtccttcatatcccttgttagttgtattcgtaggtatttcattctctttgtagcagttgtgaatgggagttcactcatgatttggctgtttatctattaatggtatataggaatgtttgtaatttttgcacattgattttgtatcctgagactttgctgaagttgcttatgagcttaaggagattttgggctaagatgatggggttttctaaatatacaatcatgtcatctgcaaactttgacaatttacctccctctcttcctatttgaatacgctttatttctttctcttccctgattgccctggccagaacttccaatgctgtgttgaataagaatggtgagaaaaggcatccttgtcttgtgctggttttcaaagagaatgcttccagcttttgcccattcggtatgatattggctgtgggtgtgtcataaatagctcttattattttcagatacgttccatcaatacctagtttatttagagtttttagcatgaaggggtgaattttactgaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtgatgtttgtcattggttctgtttatgtgatggattatgtttactgattgggtatgttgaaccagccttgcattccagggatgaagccaacttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcattgatgttcatcagggatattggcctgaaattttcttttt--tatgtgtgtctctgccaggttttggtatcaggatgatgctggcctcataaaatgagttagggaggagtccctctttttctattgtttgtaatagtttctgaaggaatggtaccagctcctctttgtacctctggtagaatttgg s panTro4.chr18 74697865 2586 - 76611499 aagttctgggatacatgtgtagaatatgcaggtttgttacataggtaaatatgtgccatggtggtttgctgcacccatcaacctgtcacctacattaggtatttctcctaatgctatccttcccctagccccccaccctgtgacaggcccccgtgtgggatgttcccctccctgtgtccctgtgttgtcattgttcaactcccacttaagagtgagaacatgtggtgtttggttttctgttcctctgttagtttgctgagaatgatggtttctagcttcatccatgtccctgcaaaggacatgaactcatccttttttatggctgcatagtattccataatgtatatgtgacccattttctttatccag-tctatgattgatgggcatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaacagtgccgcagtaaacatacatgtgcatgtgtctttatagtagaatgatatataattctttgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaatggtatttctggttctacatccttgaggaatcgctacactgtcttccacaatggttgaactaatttaccctcccaccaacagtgtaaaagggttcctatttctccacatcctctgcagcatctgttgtttcctgaccttttaatgatcaccattctaactggcatgagatagtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagcttttttttcatatgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatcctttgttcactttttgatggggttg-----t--ttttttcttgtaaatttgtttaagttccctgtagatgctagatattag----------ccctttgtcagatggatagattgcaaaaatttcctctcattctgtaggttgactgtccactctgatgagagtttttttttt---------------------ttttttttctgtgcagaagctctttggtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattggttttggtgttttagtcatgaagtctttgcccatgcctatgtcctgagtggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggttttccgtttaagcctttaatccatcttgagttaattttg-tataaggtgtaaggaaggggttcagtttcagttttctgcatatatctagccagttttcacaacatcatttattaaatagggaatccttttcccattgcttgcttttgtcaggcttgttaaagatcagatggttgtaggtgtgtggcattatttctaaggcctctttcctgttccattggtctatatatctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgcggccttgtagtatagtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagatttgttctttttgcttaggattgtcttggctatacaggctcttttttggttccatatgaaatttaaagttgttttttctaattctgtgaagaaagtcaatggtagcttgatggggatagcattgaatctgtaaattactttaggcagtatggccattttcatgatattgattcttcctatccatgagcacagaacatttttccatttgtttgtgtcctctc-tttttccttgagcagtggtttataattctccttgaagaggtccttcatatcccttgttagttgtattcctaggtattttattctgtttgtagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctgtttatctattaatggtgtataggaatgtttgtaatttttgcacattgattttgtatcccgagactttgctgaagttgcttatcagcttaaggagattttgggctaagatgatggggttttctaaatatacaatcatgtcatctgcaaactttgacaatttacctccctctcttcctatttgaatacgctttatttctttctcttccctgattgccctggccagaacttccaacgctgtgttgaataagaatggtgagaaagggcatccttgtctcgtgctggttttcaaacagaatgcttccagcttttgcccattcggtatgatattggctgtgggtgtgtcataaatagctcttattattttcagatacgttccatcaataccttgtttatttagagtttttagcatgaaggggtgaattttatcgaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtgatgtttgtcattggttctgtttatgtgatggattatgtttactgactgggtatgttgaaccagccttgcatccgagggatgaagccaacttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggaatcggtttgccagtattttattgaggatttttgcattgatgttcatcagggatattggcctgaaattttcttttt--tatgtgtgtctctgccaggttttggtatcaggatgatgctggcctcataaaatgagttagggaggagtccctctttttctattgtttgtaatagtttctgaaggaatggtaccagctcctctttgtacctccggtagcattTGG i panTro4.chr18 C 0 n 0 s macFas5.chr7 88330748 2595 - 171882078 caattctgggatacatgtgtagaatgtgcaggtttgttacataggtatacatgtggcatggtggtttgctgcacccatcaacctgtcacctacattaggtatttctcctaatgctatcctccccctagccctccactccgtgacaggcccctgtatggggtgttcccctccctgtgtccctgtgttctcattgttcagctcccacttatgagtgagaacatgtggtgtttggttttcagttcctgtgttagtttgctgagaattatggtttccagtttcatacatgtccctgcaaatgacatgcactcatccttttttatggctgcatagtattccataatgtatatgtgacacattttctttatccagttctatgattggtgggcatttgggttggttccaagtctttgctattgtcaacagtgccacaataaaaatacatgtgcatgtgtctttatagtagaatgatttatgattctttgggtatatacccagtaatgggatcgctgggtcaaatggtatttctggttctacatccttgaggaatcgccacactgtcttccacaatggttgaactgatttacactcccaccaacagtgtaaaagcattcctatttctctacatcatctccagcatctgttgtttccttaccttttaatgatcaccattctaactggcaagagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagctcttttttcatatgtttgttggccacataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtcctttgttcactttttgatggggttgtttg-ttattttttcttgaaaatttgtttaagttccttgtagaagctagatattagccctttgtcaccctttgtcagatggatagattgcaaaaatttcctctcattctgtagattgactgttcactctgatgagaggttttcttttcttttc---------------ttttttttctgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttggtgttttagtcatgaagtcttttcctatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtttcatgtttaagcctttaatccatcttgagttaatttttctgtaaggtgtaagaaagggtttcagtttcagttttctacatatgtttagccagttttcacaacaccatttattaaatagggaatccttttaccattccttgtttttgtcaggcttgttaaagttcagatggttgtagatgtgtggcattatttctaaggcctcttttctgtttcattcgtctatatatctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtggccttgtagtatagtttgaagtcagataatgtgatgcctccagctttgttctttttgcttaggattgtcttggctatacaggctctgttttggttccatatgaaatttaaagtagttttttctaattctgtgaagaaagtcaatggtagcttgatggggatagcattgaatctataaattactttgggcagtatggccattttcatgatattgattcttcctgtccatgagcacggaatgtttttccatttgtttgtgttctctcttttttccttgagcagtggtttgtaattctccttgaagaggtcattcatatccctcgttagttgtattcctaggtattttattctctttaaagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctgtttgtctattaatggtgtataggaatgtttgtaatttttgcacattgattttgtatcccgagactttgctgaagttgcttatcagcttaaggagattttgggctaagatgatggggttttctaaata-ataatcatgtcatctgtaaactttgacaatttacctccctctcttcctatttgaatac-ctttatttttttcccttccctgattgccctggccagaacttccattactgtgttgaataagagtggtaagaaagcgaatcattgtcttgtgctggttttcaaagagaatgcttccagctttcacccattcgatatgatattggctgtgggtgtgtcataaatagctcttattattttgagataaattccatcaatacctagtttattgagagtttttagcatgaaggagtgaattttattgaaggcc-tttctgcatctattgagataatcatgtggtgtttgtcattggttctgtttatgtgatgga-------------ttgggtatgttgaaccagccttgcatcccagggatgaagccagcttgattgtggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcatcaatgttcatcagggatattggcctgaaattttcctttttgtgtgtgtgtctctgcca-gttttggtatcaggatg-tgctggtctagtaaaatgagttaggaaggagttcctctttctctattgttgggaatagtttcagaaggaatggtaccagctcctctttgtacctctggtagaatttga i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85460284 2605 - 162156779 caattctgggatacatgtgtagaatgtgcaggtttgttacataggtatacatgtggcatggtggtttgctgcacccatcaacctgtcacctacattaggtatttctcctaatgctatcctcccCCTAGCCCTCCACTCCGTGACAGGCCCCTGCATggggtgttcccctccctgtgtccctgtgttctcattgttcagctcccacttatgagtgagaacatgtggtgtttggttttcagttcctgtgttagtttactgagaattatggtttccagtttcacacatgtccctgcaaatgacatgcactcatccttttttatggctgcatagtattccataatgtatatgtgacacattttctttatccagttctatgattggtgggcatttgggttggttctaagtctttgctattgtcaacagtgccacaataaaaatacatgtgcatgtgtctttatagtagaatgatttatgattctttgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaatggtatttctggttctacatccttgaggaatcgccacactgtcttccacaatggttgaactgatttacactcccaccaacagtgtaaaagcattcctatttctctacatcatctccagcatctgttgtttcctgaccttttaatgatcaccattctaactggcaagagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctaatgaccagtgatgatgagctcttttttcatatgtttgttggccacataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtccttcgttcactttttgatggggttgtttg-ttattttttcttgtaaatttgtttaagttccttgtagaagctagatattagccctttgtcaccctttgtcagatggatagattgcaaaaatttcctctcattctgtagattgactgttcactctgatgagaggttttcttttcttttcttttcttttt-----ttttttttctgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaatattggcttttgttgccattgcttttggtgttttagtcatgaagtcttttcctatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggttttatgtttaagcctttaatccatcttgagttaatttttctgtaaggtgtaagaaaggggttcagtttcagttttctacatatgtttAGCCAGTTTtcacaacaccatttattaaatagggaatccttttcccattccttgtttttgtcaggcttgttaaagttcagatggttgtagatgtgtggcattatttctaaggcctcttttctgtttcattcgtctatatatctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtggccttgtagtatagtttgaagtcagataatgtgatgcctccagctttgttctttttgcttaggattgtcttggctatacaggctctgttttggtaccatatgaaatttaaagtagttttttctaattctgtgaagaaagtcaatggtagcttgatggggatagcattgaatctataaattactttgggcagtatggccattttcatgatattgattcttcctgtccatgagcacggaatgtttttccatttgtttgtgttctctcttttttccttgagcagtggtttgtaattctccttgaagaggtcattcATATCCCtcgttagttgtattcctaggtattttattctctttaaagcaattgtgaatgggagttcactcatgatttggctgtttgtctattaatggtgtataggaatgtttgtaatttttgcacattgattttgtatcccgagactttgctgaagttgcttatcaggttaaggagattttgggctaagatgatggggttttctaaata-ataatcatgtcatctgtaaaatttGACAATTTacctccctctcttcctatttgaatac-ctttatttttttcccttccctgattgccctggccagaacttccattactgtgttgaataagagtggtaagAAAGCGAATcattgtcttgtgctggttttcaaagagaatgcttccagctttcacCCATTCgatatgatactggctgtgggtgtgtcataaatagctcttattattttgagataaattccatcaatacctagtttattgagagtttttagcatgaaggagtgaattttattgaaggcc-tttctgcatctattgagataatcatgtggtgtttgtcattggttctgtttatgtgatgga-------------ttgggtatgttgaaccagccttgcatcccagggatgaagccagcttgattgtggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcatcgatgttcatcaggaatattggcctgaaattttcctttttgtgtgtgtgtctctgcca-gttttggtatcaggatg-tgCTGGTCtagtaaaatgagttaggaaggagttcctctttctctattgttgggaatagtttcagaaggaatggtaccagctcctctttgtacctctggtagaatttga i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3617362 2590 - 24206276 aagttctgggatacatgtgtagaatgtgcaggtttgttacataggtatacacgtgccatggtggtttgctgcacccatcaatctgtcacctacattaggtatttctcctaatgctatccttcccctagccctccaccccgtgacaggcccccatatgggatgttcccctccctgtgtccctgtgttctcattgttcaactcccacctatgagcgagagcatgtggtgtttggttttctgttcctgtgttagtttgctgagaattatggtttccagcttcatacatgtccctgcaaatgacatgaactcatcctttcttatggctgcatagtattccataatgtatatgtgacacattttctttatccag-cctatgattggtgggcatttgggttggttccaagtctttgctattgtcaacagtgccacaataaacatacatgtgcatgtgtctttatagtagaatgatttgtaattctttgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaatggtatttctgattctacatccttgaggaatcgccacactgtcttccacaatggttgaactgatttacactcccaccaacagtgtaaaagcattcctatttctccacatcctctccagcatctgttgtttcctgaccttttaatgatcaccattctaactggcaagagatggtatctcactgtggttttgatttgcatttctctaatgactagtgatgatgagcttttttttcatatgtttgttggccacataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatgtccttcgttcactttttgatggggctgtttgttttttttttcttgtaaatttgtttaacttccttgtagaagctggatattagccctttgtcaccctttgtcagatggatagattgcaaaaatttcctctcattttgtagattgactattcactctgatgagaggtgtttttgtgtgt-----------------gtgtgtgtgtgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttggtgttttagtcatgaagtcttttcctatgcctatgtcctgaatggtattgcctaggttttcttctagggattttatggttttaggttttacgtttaagcctttaatccatcttgagttaatttttctgtaaggtgtaagaaaggggttcagtttcagctttctacatatgtctaaccggtttttacaacaccatttattaaatagggaatcattttcctattccttgtttttgtcaggcttgttaaagttcagatggttgtagatgtgtggcattatttctaaggcctcttttccgtttcattggtctatatatctgttttgataccagcaccatgctgttttggttactgtggccttgtagtactgtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagctttgttctttttgcttaggattctcttggctatacaggctctgttttggttctatatgaaatttaaagtagttttttctaattctgtgaagaaagtcaatggtagctcgatggggatagcattgaatctataaattactttgggcagtatggcgattttcatgatattgattcttcctatccatgagcacggaatgtttttccatttgtttgtgttctctcttttttccttgagcagtggtttgtaattctccttgaagaggtcattcatatccctcgttagttgtattcctaggtattttattctcgttaaagcaatcgtaaatgggagttcactcacgatttggctgtttgtctattaatggtgtataggaatgtttgtaatttttgcacattgattttgtatcctgagactttgctgaagttgcttatcagcttaaggagattttgggctaagatgatggggttttctaaatatacaatcatgtcatctgtaaactttgacaatttacctccctctcttcctatttgaatac-ctttatttctttcccttccctgattgccctggccagaacttccaatactatgttgaataagagtggtaagaaagctaatcattgtcttgtgctggttttcaaagagaatgcttccagcttttgcccattcgatatgatattggctgtgggtgtgtcataaatagctcttattattttgaggtaaattccatcaatacctagtttattgagagtttttagcataaaggggtgaattttattgaaggcc-tttctgcatctattgagataatcatgtggtgtttgtcattggttctgtttatgtgatggattacgtttactggttgggtatgttgaaccagccttgcatcctagggatgaagccaacttgattgtggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttacatcgatgttcatcagggat------------------tttgtgtgtgtgtgtctctgcca-gttttggtatcaggatgatgctggtctagtaaaatgaattaggaaggagttcctctttctctattgttgggaataatttctgaaggaatggtaccagctcctctttgtacctccagtagaatttga i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88051904 4540 - 170124641 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=1218315.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 438099 2328 + 478999 ctgtgaatctgtctggtcctggacttttttttggttggtaggctattaattactgcctcgatttcagaacttgttatttgtctattcagggatttgacttcttcctggttcagtcttgggagggtgtatgtgcccaggaatttatccatttcttgtagattttctagtttatttgtgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttgtatttctatgggatcagtggtgata-cccctttatcattttctattgtgtctatttgattcttctttcttttcttc---attagtctggttagtggtctatttattttgttaatgttttcaaaaaaccagctcctggatgcattgattttttgaaggg-ttttttgtgtctctatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttgtcttctgctagcttttgaatttgtctgctcttacttctctag-ttcttttaattgtaatgttagggtgttgattttagatctttgctgctttaagctgttggcatttagtgctataaattttcctgtaaacactgcattagctgtgtcccagagattctcgtacattgtgtctttgttctcattggtttcaaagaacttatttatttctgcctaaatttcgttatttacccagtagtcattcaggagcaggttgttcagtttccatgcagttgtgcagttttgagtgagtttcttaatcctgagttctaatttgattgcactgtgatctgagagactatttgttatgatttctgttcttttgcatttgctgaggagtgttttacttccaattatgtggtcaattttataataagtgtgatgtggtgctgaaaagaatgtatattctgttgatttggggtggagagttttgtagatgtctattagttctgcttggtccagagctgagttcaagtcctgaatgtccttgttaattttctgtctc-ttgatctgtctaatattgacagtggggtgttaaagtctcccactattattgtgtgggaatgtaagtctctttgtatatctctaaggacttgctttatgaatatgggtgctcctgtattaggtgcatacatatttgggatagttagcttttcttgttgcattgatccgtttaccattatgtaatgcccttttttgtcttttttgatctttgttggtttaaagtctgttttatcagagactaggattgcaacccctgcttttttttggctttcaatatgcttggtaaatcttcctccatcccttcattttgagcctatgtgtgtctttgcacgtgagatgggtctcctgaatacagcacaccaatgggtcttgagtctctatccaatttaccagtctgtgtattctaactggggacttaacccatttacatttaaggttaacattgttatgtgtgaatttgatcctgtcattatgatgttatctggttattttgcctgttagttgatgcagttttttcatagcttcaatagtctttacaatttggtatgtttttgcagtggctggtaccagtttttctttccatatttggtgcttccttctggaggtcttgtaaggcaggcctggtggtgacaaaaatctgttagtattttcttatctgtaaaggattttatttctccttcatctatgaaactttgtttggctggatattaaattctggtttgaaaattcttttctttaagaacgttgaatattggcccccacttctttctggcttgtagggtttctgcagagagatccactgttagtctgatggacttccctttgtgggtaactacttgacctttcttcctggctgaccttaacattttttccttcatttcaaccttggtgaatctgacaattatgtttcttggggttgctcttctcgaggagtatctttgtggtgttctctgtatttcctgaatttgaatgctggcctgtcttgctaggttgggaaagttctcctggataatatcctgaagagtg--ttttccaacttggttccattctccccgtcactttcaggtacaccaatcaaacgtaggtttggtcttttcacatagtcccatatttcttggaggatttgttcattccttttcaatcttttttctccaatcttgtcttcacgctttatttcattaagttgatcttcaatccctggtatcctttcatccactcaattgatttggctattgatacttgtgtatgcttcatgaagttctcgtgctgtgtttctcagctccatcaggttatttatgttcttttctaaggtggttattttagttatcaattcctctaacctttttcaaggttcttagcttccttgttttgg s macFas5.chr7 88333343 2334 - 171882078 ctgtgaatctgtctggtcctggac-tgtttttggttggtaggctattaattactgcctcaatttcagaacttgttatttgtctattcagggattcaacttcttcttggttcagtcttgggagggtatatgtacccagggatttgtccatttcttgtagattttctagtttatttgtgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttgtatttctgtaggatcagtggtgatatcccctttatcattttttattgtgtctattcaattcttctctcttttcttctttattagtctggctagtggtctattta-tttgttaatgttttcaaaaacccacctcctggattcattgattttttgaagggtttttttgtgttgctatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttgtcttctgctagtttttgaatttatctgctcttccttctctagttttttttaattgtaatgtcagggtgtcgattttagatctttcctgctttaagctgttggcatttagtgctataaattttcctctaaacactgcattagctgtgtcccagagattctggtacattgtatctttgttgtcattggtttcaaagaacttatttatttctgcctaaattttgttatttaacctgtagtcattcaggagcaggttgttcagtttccatgtagttttgtggttttgagtgagtttcttaatcctgagttctaatttgattgcactgtggtctgagagactatctgttatgatttctgttcttttgcatttgctgaggactgttttactttcaattatgtggtcaattttataataagtgtgatgtggtgctgagaagaatgtatattctgttgatttggggtggggagttttgtagaagtctattaggttcactttgtccagagctgagttcaagtcctgaatatccttgttaattttctgtctcattgatctgtctaatattgacagtgaggtgttaaagtctcccactattattgtgtgggaatgtaagtctctttgcatgtctctaaggacttgctttatgaatatagatgcttctgtagtaggtgcacatgtattttggatagttagcttatctcgttgcattgaaccctttaccattatgtaatgcccttctttgtcttttttaatctttgttggtttaaagcctgttttatcagagactaggattgcaacccctgcttttttttggctttcaatttgcttggtaaatcttctgccatcccttcattttgagcctatgtgtgtctttgcatgtgagatgggtctcctgaatacagcacaccaatgggtcttgagtcactatccaatttgccagtctgtgtattctaattggggacttaacccatttacatttaaggttaacattgttatgtgtgaatttgatcctgtcattatgatgttagctggttattttgcccgttagttgatgcagtttcttcatagtgtcgatggtgtttacaatttggtatgtttttgcagtggctggtaccggtttttctttccgtatttagtgcttccttctagagctcttgtaaggcaggcctggtggtgacaaaaatctcttagcattttcttatctgtaaaggattttatttctccttcgcttatgaagcttagtttggctggatattaaattctggtttgaaaattcttttctttaagaatgttgaatattggcccccacttctttctggtttgtagggtttctgcagagagatccagtgttagtctgatgggcttccctttgtgggtaattacttgacctttctttctggctgttcttaacattttttccttcatttcaaccttggtgaatctgatgattatgtgtcttgaggttgttctt-tcgaggagtatctttgtggtggtctctgtatttcctgaatttgaatgttggcctgtcttactagggtggggaagttcccctggataatatcctgaagagtgttttttttgacttggttccattcttcctgtcactttcaggtacatcaatcaaatgtaggtttggtcttttcacatagtcccatatttcttggaggatttgttcattccttttcaatcttttttctccaatcttgtcttcgtgctttatttcattaagttgatcttcaatctctaatatcctttcttctgctcaatcgatttggctattaatacttgtgtatgcttcatgaagttctcgtgctgtgtttttcagctccatcaggttatttatgttcttttctaaagtggttattctagttatcaattcctctaacctttttcaaggttcttagcttccctgtgttgt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85462889 2331 - 162156779 ctgtgaatctgtctggtcctggac-tgtttttggttggtaggctattaattactgcctcaatttcagaacttgttatttgtctattcagggattcaacttcttcttggttcagtcttgggagggtatatgtacccagggatttgtccatttcttgtagattttctagtttatttgtgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttttatttctgtaggatcagtggtgacatcccctttatcattttttattgtgtctattcaattcttctctcttttcttctttattagtctggctagtggtctattta-tttgttaatgttttcaaaaacccacctcctggattcattgattttttgaagggtttttttgtgttgctatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttgtcttctgctagtttttgaatttatctgctcttccttctctag-tttttttaattgtaatgtcagggtgtcgattttagatctttcctgctttaagctgttggcatttagtgctataaattttcctctaaacaccgcattagctgtgtcccagagattctggtacattgtatctttgttgtcattggtttcgaagaacttatttatttctgcctaaattttgttatttaaccTGTAGTCATacaggagcaggctgttcagtttccatgtagttttgtggttttgagtgagtttcttaatcctgagttctaatttgattgcactgtggtctgagagactatctgttatgatttctgttcttttgcatttgctgaggactgttttactttcaattatgtggtcaattttataataagtgtgatgtggtgctgagaagaatgtatattctgttgatttggggtggggagtttTGTAGAAGTCTATTAGGTTCACtttgtccagagctgagttcaagtcctgaatatccttgttaattttctgtctcattgatctgtctaatattgacagtgaggtgttaaagtctcccactattattgtgtgggaatgtAAGTCTCTTTGcatgtctctaaggacttgctttatgaatatagatgcttCTGTAGTAGGTGCACATGTATTTTGGATAGTTAGCTTATCTCGTTgcattgaaccctttaccattatgtaatgcccttctttgtctttttaaatctttgttggtttaaagcctgttttatcagagactaggattgcaacccctgcttttttttggctttcaatttgcttggtaaatcttctgccatcccttcattttgagcctatgtgtgtctttgcatgtgagatgggtctcctgaatacagcacaccaatgggtcttgagtcactatccaatttgccagtctgtgtattCTAATTGGGGacttaacccatttacatttaaggttaacattgttatgtgtgaatttgatcctgtcattatgatgttagctggttattttgcccgttagttgatgcagtttcttcatagtgtcgatggtgtttacaatttggtatgtttttgcagtggctggtaccggtttttctttccgtatttagtgcttccttctagagctcttgtaaggtaggcctggtggtgacaaaaatctcttagcattttcttatctgtaaaggattttatttctccttcgcttatgaagcttagtttggctggatattaaattctggtttgaaaattgttttctttaagaatgttgaatattggcccccacttctttctggtttgtagggtttctgcagagagatccagtgttagtctgatgggcttccctttgtgggtaattacttgacctttctttctgactgttcttaacattttttccttcatttcaaccttggtgaatctgatgattatgtgtcttgaggttgttctt-tcgaggagtatctttgtggtggtctctgtatttcctgaatttgaatgttggcctgtcttactagggtggggaagttcccctggataatatcctgaagagtg--ttttttgacttggttccattcttcctgtcactttcaggtacatcaatcaaatgtaggtttggtctttccacatagtcccatatttcttggaggatttgttcattccttttcaatcttttttctccaatcttgtcttcatgctttatttcattaagttgatcttcaatctctaatatcctttcttctgctcaaTCGATTtggctattaatacttgtgtatgcttcatgaagttctcgtgctgtgtttttcatctccatcaggttatttatgttcttttctaaagtggttattctagttatcaattcctctaacctttttcaaggttcttagcttccctGTGTtgt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3619952 2329 - 24206276 ctgtgaatctgtctggtcctggac-tgtttttggttggtaggctattaattacggcctcaatttcagaacttgtta-ttgtctattcaggaattcgacttcttcttggttcagtcttgggagggtgtatgtacccagggatttgtccatttcttgtagattctctagtttatttgtgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttgtatttctgtaggatcagtggtgatatcccctttatcattttttactgtgtctattcgattcttctctcttttcttctttgttagtctggctagtggtctattta-tttgttaatgttttcaaaaacccagctccttggttgattgattttttgaagtgtttttttgtgtcgctatctccttcagttctgtgctgatcttagttatttcttgtcttctgctagcttttgaatttatctgctcttccttctctag-ttcttttaattgtaatgtcagggtgtcgattttagatctttcctgctttaagctattggcatttagtgctataaattttcctctaaacactgcattagctgtgtcccagagattctggtacattgtatctttgttgtcattggtttcaaagaacttatttatttctgcctaaattttgttatttacccagtagtcattcaggagcaggttgttcagtttccatgtagttttgtggttttgagtgagtttcttaatcctgagttctaatttgattgcactgtggtctgagagagtatttgttatgatttctgttcttttgcatttgctgaggactgttttacttccaattatgtggtcaattttatactaagtgtgatgtggtgctgagaagaatgtatattctgttgatttggggtggggagttttgtagaagtctattaggttcactttgtccagagctgagttcaagtcctgaatatccttgttaattttctgtctcattgacctgtctaatattgacagtgaggtgttaaagtctcccactattattgtgtgggaatgtaagtctctttgcatgtctctaaggacttgctttatgaatatagatgcttctgtagtaggtgcacatgtattttggatagttagcttatctcgttgcattgagccctttaccattatgtaatgcccttctttgtcttttttaatctttgttggtttaaagcctgttttatcagagactaggattgcaacccctgctttttttt-gttttccatttccttggtaaatcttctgccatcccttcattttgagcctatgtgtgtctttgcatgtgagatgggtctcctgaatacagcacaccaatgggtcttcagtcactatccaatttgccagtctgtgtattctaattggggacttaacccatttacatttaaggttaacattgttatgtgtgaatttgatcctgtcattatgatgttagctggttattttgcccgttagttgatgcagtttcttcatagtgtcgatggtgtttacaatttggtatgtttttgcagtggctggtaccggtttttctttccgtatttagtgcttccttctacagctcttgtaaggcgggcctggtggtgacaaaaatctcttagcattttcttatctgtaaaggattttatttctccttcacttatgaagcttagtttggctggatattaaattctggtttgaaaattcttttctttaagaatgttgaatattggtccccacttctttctggtttgtagggtttctgcagagagatccagtgttagtctgatgggcttccctttgtgggtaattacttgacctttctttctggccattcttaacattttttccttcatttcaaccttggtgaatctgatgattatgtgtcttgaggttgttctt-tcgaggagtatctttgtggtggtctctgtatttcctgaatttgaatgttggcctgtcttactagggtggggaagttcccctggataatatcctgaagagtg--ttttttgacttggttccattcttcctgtcactttcaggtacatcaatcaaatgtaggtttggtcttttcacatagtcccatatttcttggaggatttgttcattccttttcaatcttttttctccaatcttatcttcatgctttatttcattaagttgatcttcaatctctaatatcctttcttctgctcaatcgatttggctattaatacttgtgtatgcttcacgaagttcttgtgctgtgtttttcagctccatcaggttatttatgttcttttctaaagtggttattctagttatcaattcctctaacctttttcaaggttcttagcttccctgtgttgt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88051904 4540 - 170124641 I e panTro4.chr18 74700451 0 - 76611499 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=528422.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 440427 598 + 478999 gttagaacatgctcctttagctcagaggagtttgttactacccatctttggaagcctacttctgtcaacttgtcaaactcattctccatccagttttgctcccttgctggcaaggagttgtgatactttggaggagaagaggtgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctggtttttcctcatcttcttggacctatctaactttgttctttgatgttggtgaccttcagttggtgtttttgggtggacatcctttttgttgatgttgatgctatttctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggcccttctgctgcaggtctgctggagtttgctgcgggtccactccagaccctgtttacctgggtgtcatc-gc-----------agatgctgcagaacagcaaagactactgcctgttccttcttctggaagctttgtcccagaggggcaccagccagatgccagctggagatctcccgtatgaggtgtctgtcaacccctgctaggaggtgtctcccagtcaggaggcacaggcatcagggagccacttgaggaggcagtctgtcccttagcagagttcaagcgctttgc s rheMac3.chr7 88056444 610 - 170124641 gttagaacatgctcctttagctcagaggtgtttgttactacccatctttggaagcctagttctgtcaactcatcaaactcattctccatccggttttgttcccttgctggcagggagttgtaatcctttggaggagaagaaatgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctggtttttcctcacctttgtggacctatctaattttgttctttgatgttggtgaccttcagatggggtttttgggtggatgtcctttttgttgatgttgatgctacttctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggaccctcagctgcagatgtgctggagtttgctggaggtccactccagaccctgtttgcctgggtatcgccagtggagactgcagagatactgcagaacagcaaagattactgcctgttctttcttctggaagctttgtcccggaggggcaacagccaggtgccagctggagctctcctgtatgaggtatctgtcgacccctgctgggaggtgtctcccagtcaggaggcacagacatcagggagccactttaggaggcagtctgtcccttagcagaattcaagtgctttgc i rheMac3.chr7 I 4540 C 0 s macFas5.chr7 88335677 599 - 171882078 gttagaacatgctcctttagctcagaggtgtttgttactacccatctttggaagcctacttctgtcaactcatcaaactcattctccatccggttttgttcccttgctggcagggagttgtaatcctttggaggagaagaaatgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctggtttttcctcacctttgtggacctatctaattttgttctttgatgttggtgaccttcagatggggtttttgggtggatgtcctttttgttgatgttgatgctacttctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggaccctcagctgcagatgtgctggagtttgctggaggtccactccagaccctgtttgcctgagtatcatcagt-----------agatgctgcagaacagcaaagattactgcctgttctttcttctggaagctttgtcccagaggggcaacagccaggtgccagctggagctctcctgtatgaggtatctgtcgacccctgctgggaggtgtctcccagtcaggaggcacagacatcagggagccactttaggaggcagtctgtcccttagcagaattcaagtgctttgc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85465220 599 - 162156779 gttagaacatgctcctttagctcagaggtgTTTGTTACTACCCATCTTtggaagcctacttctgtcaactcatcaaactcattctccatccggttttgttcccttgctggcaggGAGTtgtaatcctttggaggagaagaagtgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctGGTTTTTCCTCACCTTTGTGGACCTAtctaattttgttctttgatgttggtgaccttcagatggggtttttgggtggatgtcctttttgttgatgttgatgctacttctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggaccctcagctgcagatgtgctggagtttgctggaggtccactccagaccctgtttgcctgagtatcatcAGT-----------AgatgctgcagaacagcaaagattactgcctgttccttcttctggaagctttgtcccagaggggcaacAGCCAggtgccagctggagctctcctgtatgaggtgtctgtcgacccctgctgggaggtgtctcccagtcaggaggcacagacATCAGGGAgccacttgaggaagcagtctgtcccttagcagagttcAAGTGCtttgc i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3622281 597 - 24206276 gttagaacatgctcctttagctcagaggtgtttgttacta--catctttggaagcctacttccgtcaactcgtcaaactcattctccgtccggttttgttcccttgctggcagggagttgtgatcctttggaggagaagaagtgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctggtttttcctcacctttgtggacctatctaactttgttctttgatgttggtaaccttcagatggggtttttgggtggatgtcctttttgttgatgttgatgctacttctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggaccctcagctgcagatgtgctggagtttgctggaggaccactccagaccctgtttgcctgagtatcatcagt-----------agatgctgcagaacagcaaagattactgcctgttccttcttctggaagctttgtcccagaggggcaacagtcaggtgccagctggagctctcccgtatgaggtgtctgtcgacccctgctgggaggtgtctcccagtcaggaggcacagacatcagggagccacttgaggaggcagtctgtcccttagcagagttcaagtgctttgc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I e panTro4.chr18 74700451 0 - 76611499 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=499044.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 441025 410 + 478999 tgggagatctgctgctcccttcagagatggcaggcaggaac------------------------------atttaagtctgctgaagctgtgcccacagccgcccttccccccaggtgctctgtcccagggagatgggatttttatctataagcccctgactggggacgctgcctttctttcagagataccctgcccagagaggagaaatctagagaagcagtctggctatagctgctttgctgggttgcagtgggctctgcccagttcaaacttcctggtggttttatttacactgtgaagagaaaagtgcctactcaagcctcagtaatggcggatgcccctaccccaaccaagctcgagtgtcccaggtcaacttcagagtgctgtgctggcagcaagaatttcaagccagtggatcttagcttgctgggctccat s panTro4.chr14 18758486 409 + 106544938 tgggagatctgctgctctcttcagagatggcaggcaggaac------------------------------atttaagtctgctgaagctgtgcccacagccacccttccccc-aggtgctctgtcccagggagatgggacttttatctataagcccctgactggggacgctgcctttctttcagagataccctgcccagagaggagaaatctagagaagcagtctggctatagctgctttgctgggttgtggggggctctgcccagttcaaacttcctggtggctttgtttacactgtgaagggaaaagtgcctactcaagcctcagtaatggcagatgcccctaccccaaccaagctcgagtgtcccaggtcaacttcagagtgctgtgctggcagcaagaatttcaagccagtggatcttagcttgctgggctccac i panTro4.chr14 I 8341 C 0 s rheMac3.chr7 88057054 405 - 170124641 tgggagatctgctgctctcttcagagccagcaggcaggaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------------------------------nnnnnnnnnngtgctctgtcccagggagatgggagttttatctaaaagcacctgactggggatactgccattctttcagagatgccctgcccagcgaggaggaatctagagaagcagtctggctatagctgctttgctgggttgtgatgggctctgcccagttcaaacttcctggtggctttatttacactgtgaagggaaaagtgcctactcaagcctcaatagtggcagattctcctacccccaccaagctcgagtgtcccaggtcgacttcagagtgctgtgctgacagtgagaacttcaagccagtggatcttagcttcctgggctccat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88336276 410 - 171882078 tgggagatctgctgctctcttcagagccagcaggcaggaac------------------------------atttaagcctgctgaagctgtgcccacaaccgccctttcccccaggtgctctgtcccagggagatgggagttttatctaaaagcacctgactggggatgctgccattctttcagagatgccctgcccagcgaggaggaatctagagaagcagtctggctatagctgctttgctgggttgtgatgggctctgcccagttcaaacttcctggtggctttatttacactgtgaagggaaaagtgcctactcaagcctcaatagtggcagattcccctacccccaccaagctcgagtgtcccaggtcgacttcagagtgctgtgctgacagtgagaatttcaagccagtggatcttagcttcctgggctccat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85465819 410 - 162156779 tgggagatctgctgctctcttcagagccagcaggcaggaac------------------------------atttaagtctgctgaagctgtgcccacaacCGCCCTTTCCCCCAGGttctctgtcccagggaggtgggagttttatctataagcacCTGACTGGGGATGCTGCcattctttcagagatgccctgcccagcgaggaggaatctagagaagcagtctggctatAGCTGCTTTTCTGGGTTGCgatgggctctgcccagttcaaacttcctggtggctttatTTACACTGTGAAGGGAAAagtgcctactcaagcctcaataGTGGCAGATCCCTCTACCCCCACCAAGCTCGAgtgtcccaggtcgacttcagagtgctgtgctggcaatgagaatttcaagccagtggatcttagcttgctgggcttcAT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3622878 410 - 24206276 tgggagatctgctgctctcttcagagccagcaggcaggaac------------------------------atttaagtctgctgaagctgtgcccacaaccgccctttcccccaggttctctgtcccagggaggtgggagttttatctataagcacctgactggggatgctgccattctttcagagatgccctgcccagtgaggaggaatctagagaagcagtctggctatagctgcttttctgggttgcgatgggctctgcccagttcaaacttcctggtggctttatttacactgtgaagggaaaagtgcctactcaagcctcaatagtggcagatccctctacccccaccaagctcgagtgtcccaggtcgacttcagagtgctgtgctggcagtgagaatttcaagccagtggatcttagcttgctgggcttcgt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I e calJac3.chr10 87772494 1262 - 132174527 I a score=906452.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 441435 563 + 478999 gggggtgggatccactgagatagaccacttgactccctggcttcagccccatttccaggggagtgaatcgttctatcttgctggcattccgggtgccactggggtatg-----------------------aaaaaaa-ctcctgcttctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctagttttgtgcttgaaacccagggccctggtggtgtaggcacccaagggaatctcctggtctgcaggttgcaaaaaccatgggaaaagcctagtatgtggatcagaatccaccattcctcttggcacagtctctcatggcttcccttggcc-ggggagggagttccctgaacccttccacttcccgggtgaggtgatg----ccccaccctgctttggctcatcctccgtaggctgaacccactgtctaaccagtcccaatgagatgagccgggtacctcagttggaaatgcagaaatc-------acccaccttctgcgttggtcttgctgggagctgcagactggagttgctcttatctggccatctt----gccagccaccCTCTAAAGTTTGGTGAAGCCTTTAATTGAAAAATTTGAGTCT s panTro4.chr14 18758895 571 + 106544938 gggggtgggatccactgagatagaccacttgaatccctggcttcagccccatttccaggggagtgaacagttctatcttgctggcattccaggtgccactggggtatg-----------------------aaaaaaaactcctgcatctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctagttttgtgcttgaaacccaaggccctggtggtgtaggcacctgagagaatctcctggtctgcaggttgcaaaaaccatgggaaaagcctagtatctggatcagaatgcacctttcctctcggcacagtctctcacggcttcccttggct-ggggagggagttccctgaacccttccacttcccgggtgatgtgatg----ccccaccctgctttggctcaccctccgtgggctgcacccactgtctaaccagtcccaatgagatgagctgggtacctcagttggaaatgcagaaatcttctgcgactaaccttctgcattggtcttgctgggagctgcagaccagagttgctcttatttggccatctt----gccagccaccCTCTAAAGTTTGGTGAAGCCTTTAATTGAAAAATTTGAGTCT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88057459 582 - 170124641 gggggtgggatcccctgagatagaccacttgacaccctggcttcagccccgtttccaggggagtgaatatttctgtcttgctggcattccaggtgccgctggggtattaaaaaaaaa-----------aacaaaaaaaactcctgcatctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctagttttgtgcttgatacccagggccctggtggtgtaggcacccgagggaatctcctggtctgcaggttg-gaaaaccttgggaaaagcctagtatttgggttggaatgcactgttcttctcagcacagtctctcatggcttcctttggctaggggagggagttccctgaacccttccacttcccgggtgaggtgatg--ccccctaccctgctttggctcaccctcagtgggctgcagtcactgtctaaccagtcccaatgagatgagctgggtgcctcagttggaaatgcagaagtc-------acccaccttctgcattggtctgactgggagctgcaggctgcagctattcttatttgaccatcttgccagccGGCCACCCTCTACAGTTTGGTGAAGACTTTAATTGAAAAATTTGAGTCT i rheMac3.chr7 C 0 I 48 s macFas5.chr7 88336686 589 - 171882078 gggggtgggatcccctgagatagaccacttgacaccctggcttcagccccgtttccaggggagtgaatatttctgtcttgctggcattccaggtgccgctggggtatgaaaaaaaaaaaacaaaaaacaaaaaaaaaaactcctgcatctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctagttttgtgcttgatacccagggccctggtggtgtaggcacccgagggaatctcctggtctgcaggttg-gaaaaccttgggaaaagcctcgtatttgggttggaatgcactgttcttctcggcacagtctctcatggcttcccttggctaggggagggagttccctgaacccttccacttcccgggtgaggtgatg--ccccctaccctgctttggctcaccctcagtgggctgcagtcactgtctaaccagtcccaatgagatgagctgggtgcctcagttggaaatgcagaagtc-------acccaccttctgcactggtcttgctgggagctgcagactagagttgctcttatttggccatctt----gccggccaccCTCTACAGTTTGGTGAAGACTTTAATTGAAAAATTTGAGTCT i macFas5.chr7 C 0 I 2 s papAnu2.chr7 85466229 565 - 162156779 AGGGGTGGGATCCCCTGGGATAGAGCACttgactccctggcttcagccccgtttccaggggagtgaacagttttGTCT---TGGCATTCCAGGTACcgctggggtatg-----------------------aaaaaaaacttctgcatctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctaGTTTTGTGCTTGATACCCAGGGCCCTGGTGTtgtaggcacccgagggaatctcctggtctgcaggttg-gaAAACCTTGGGAAAAGCCTAGTATTTGGGTTGGAATACACCGTTCTTCTCGGCACAgtctctcatggcttcccttggccaggggagggagttccctgaacccttccacttcccgggtgaggtgatgccccccccaccctgctttggctcaccctcagTGGGCTGCAgtcactgtctaaccagtcccaatgagatgagctgggtgcctcagttggaaatgcagaagtc-------atccaccttctgcgttggtcttgctgggagctgcagactggagttgctcttatttggccatctt----gccagccaccctcTACAGTTTGGTGAAGCCTTTAACTGAAAAATTTGAGTCT i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s chlSab2.chr29 3623288 563 - 24206276 aggggtgggatcccctgagatagagtacttgactccctggcttcagccccgtttccaggggagtgaacagttttgtct---tggcattccaggtgccgctggggtatg-----------------------aaaaaaaactcctgcatctacctcagtgtctgcccaaatggctgcctagttttgtgcttgatacccagggccctggtgttgtaggcacccgagggaatctcctggtctgcaggttg-gaaaaccttgggaaaagcctagtatttgggttggaatgcactgttcttctcggcacagtctctcatggcttcccttggccaggggagtgagttccctgaacccttccacttcctgggtgaggtgata--ccccccaccctgctttggctcaccctcagtgggctgcagtcactgtctaaccagtcccaatgagatgagctggatacctcagttggaaatgcagaagtc-------acccaccttctgcgttggtcttgctgggagctgcagactggagttgctcttatttggccatctt----gccagccaccCTCTACAGTTTGGTGAAGCCTTTAATTGAAAAATTTGAGTCT i chlSab2.chr29 C 0 I 2 s calJac3.chr10 87773756 572 - 132174527 gaaggtagaatcccctaagcttgaccacttagctctctggcttcagccccctttctagggaagtgaatggttctgtcttgctggccttccaggcaccactggggtatgaaaaaaaaaaaaa----------aaaaaaacctcctgcagctacctcagtgtctgcccaaatggctgcccagttttgtgcttgaaacccagagctctggtggtgtaggcacctgagaaaatctcctggtctgcgggttgtaaagaccatggt-aaagtgcagtatttgggccagaatgcaccatttctc-aagcacagtccctcacggcttcctttggctaggggagggagttccccaaccccttgtgcttcctggg-gaagtgaca----ccccaccctgcttctgcttgcccttcct-tgttgcacccactgtctaaccagtcccagtgaaatgagccgggtacctcatttggatatgcagaaatc-------acctgccatctgcattggtctcactgggagttacagaccgaaactattcctattcgatcatctt----gccagcaacACTCTAAAGTTTGGTGAAGCCTTTAACTGAAAAATTtgtgt-- i calJac3.chr10 I 1262 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I a score=1401.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 441998 6 + 478999 -AGTCat s panTro4.chr14 18759466 6 + 106544938 -AGTCat i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88337277 5 - 171882078 -AGTC-T i macFas5.chr7 I 2 C 0 s papAnu2.chr7 85466796 5 - 162156779 -agtc-t i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s chlSab2.chr29 3623853 5 - 24206276 -AGTC-T i chlSab2.chr29 I 2 C 0 s calJac3.chr10 87774328 6 - 132174527 gtgtg-t i calJac3.chr10 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e canFam3.chr15 46958229 159 - 64190966 I e rheMac3.chr7 88058041 48 - 170124641 I a score=14138.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 442004 56 + 478999 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatGTAA- s panTro4.chr14 18759472 24 + 106544938 atatatatatat--------------------------------gtatatatgtat- i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88337282 41 - 171882078 GTATacacacac------acacacac-----cacacacacacacacacGTAT----- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85466801 50 - 162156779 gtatacacacac------acacacacacatacacacacacacacacatatatgtat- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3623858 50 - 24206276 GTATacacacac------atacacacacacacacacacacacatatatatatatac- i chlSab2.chr29 C 0 I 12 s calJac3.chr10 87774334 50 - 132174527 gtgtgtgtgtgt------gtgtgtgtgtgtATAATTAGACTCAAATATATATATAT- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46958388 49 - 64190966 --ACATCtatat------atctatatctatatatatctatggaaatatatatgtata i canFam3.chr15 I 159 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88058041 48 - 170124641 I a score=2693541.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 442060 1379 + 478999 TTTTTGCCTCATCCTACCCCTGCTTGCTTTTGTGGTACAAAGCAATAATCTCTCATCATTTATTTAATATTTTTCTCCTTTTGAATTTT-ATTATAACATGTAAATTTACTTCTCTCAAACTTCTATTTACTTCTGGACTAAAAAGTATGCTTCTGAATAGGGTTCTGTCTT----TTTCACAGTAGAATTTTTGTTTTAGAACTAGAAAGGAAGTCAGCTTGGCATTATGTAGCACATTTAAAAAAAATTAGTTCTTGCAAAGCTCTGGTATTTTTCTTTGCCTTATTTAGTTGATAACTAATATAGTTTGCCTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCACGGTAGTCTCAAATCTCAAAAGCACTTTCTCCATTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAAGGTTCCTCATGTGGCAATGAACATTTATGAACAATGGCAAAATTGGTTAGTCTTACTAGGAGAGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAAGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAGCTCTTCATATATATACAAGAAACAAGAAGAAAGAGACAATAGAAAAAA---TATTGCAACTATTTTACTTGTTCACCTGATATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGAGTATTAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTGTGTATTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATGCTTGGGATTACTTTACTGGTGAACTAAACCTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCAAGAGAATTGACATCTGGTGTTAAAAAACAAAAAATCATACAAATGACTGATATGTATCATTTTCCTTATTAAATATGGAAGAAAGGGGAGGAGGATGCAGAAATGGTTGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCGGAAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTATGAAAGTTTCTTCTGTTACATATGGTTCTATCATTCATT--CATAGAATTTTGAC--AGAAAGCTGTAGAACTGAAAAAAAGCTTGATATACAAACTACTAGCTGTATTGGCAATTTTACATGAAGGCATTACTGACCCTCCACAGCTTCTTTCTATTAACCATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAGGGGTTACTC-AAAGACATTGACAAAAGATCTAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-CTTTTAACATCTAAATATTTTCAGGATTAACTTTGGTTGAAGCATACTTGAATGAATTACATATT--AATACCATcatcacctcatttgatcctcatgttacccccatcagacccaaagagtcaatacattaaactatttggtagatg s panTro4.chr14 18759496 1378 + 106544938 TTTTTGCCTCATCCTACCCCTGCTTGCTTTCGTGGTACAAAGCAATAATCTCTCATCATTTATTTAATATTTTTCTCCTTTTGAATTTT-ACTATAACATGTAAATTTACTTCTCTCAAACTTCTGTTTATTTCTGGACTACAAAATATGCTTCTGAATAGGGTTCTGTCTT----TTTCACAATATAATTTTTGTTTTAGAACTAGAAAGTAAGTCAGCTTGGCATTATGTAGCACATTTAAAAAAATTTAGTTCTTGCAAAGCTCTGGTATTTTTCTTTGCCTTATTTAGTTGATAACTAATATAGCTTGCCTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATGGTAGTCTCAAATCTCAAAAGAACTTTCTCCATTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAAGGTTCCTCATGTGACAACGAACATTTATGAACAATGGCAAAACTGGTTAGTCTTACTAGGAGAGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAAGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAGCTCTTCATATATATACAAGAAACAAGAAGAAAGGGACAATAGAGAAAA---TATTGCAACTATTTTACTTGTTCACCTGATATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGGGTATTAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGTACTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATGCTTGGGATTACTTTACTGGTGAACAAAACCTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCAAGAGAAGTGACATCTGGTGTTAAAAACCAAAAA-TCATACAAATGACTGGTATGTATCATTTTCCTTATTAAATATGGAAGAAAGGGGAGGAGGATGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGAAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTATGAAAGTTTCTTCTGTTGCATGTGGTTATATCATTCATT--CTTAGAATTTTGAC--AGAAAGTTGTAGAACCGAAAAAAAGCTTGATATACAAACCACTAGCTGTACTGGCAATTTTACATGAAGGCATTACTGACCCTCCACAACTTCTCTCTATTAACTATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAGGGGTTACTC-AAAGACATTGACAAAAGATCTAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-CTTTTAACATCTAAATATTTTCAGGATTAACTTTGGTTGAAGTGTACTTGAATGAATTACATATT--AATACCATcatcacctcatttgatcctcatgttatccccatcagacccaaagagtcaatacattaaactatttggtagatg i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88058089 1370 - 170124641 TTTTTGTCTCATCCTACCTCTGCTTGTTTTTGTGGTACAAAGCAATAATCTCTCATCATTTATTTAATATTTTTCTCCTTTTGAATTTTAATTATAATGTGTAAATTGACTTCTCTCAAACTTCTATTTACTTCTGGACTAATAAACATGCTTCTGAATAGGGTTCTGTCTT----TTTCACAATAGGATTTTTGTTTTAGAACTAGAAAGTAAGTCAGCTGGGCATTATGCAGCACATTT-AAAAAATTTAGTTCTTGCAAAGCTCTGGTATTTTTCTTTGCCTTATTTAGTTGATAACTAATATAGTTTGCCTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATGGTAGTCTCAAATCTCAAAAGCACTTTCTCCATTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAAGGTACCTCATGTGGCAACCAACATTTATGAACAATGGCAGAATTGGTTAGTCTTACTTGGAGGGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAGGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAGCTCTTCATATATATATAAGAAACAAGAAGAAAGGGACAATAGAAAAAA---TATTGCAACTATTTTACTTGTTTACCTGGTATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGAGTAATAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGTATTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATGCTTGGGATTGCTTTACTGGT-AACAAAACTTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCGAGAGAATTGACATCTGGTGTTAAAAACCAAAGA-TCATACAAGTGACTGATATGTATCATTTTCCTTATTGAATATGGAAGAAAAGGGAGGAGGATGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGGAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTACGAAAGTTTCTTCTATTGCATATGGTTCTATCATTCATT--CACAGAATTTTGAC--AGAAAGTTGTAGAACTG-AAAAAAGCTTGATATACAAACCACTAGCTGCACTGGCAATTTTA--------CGTTACTGATCCTCCACAATTTGTCTCTATTAACTATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAGGGGTTACTC-AAAGACATTGACAGGAGATCCAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-CTTTTAACATCTAAATATTTTCAGGATTAACTTTGGTTGAAGCATACTTGAATGAATTCCTCAGTTGATCCTCATcatcacttcatttggtcatcatgttacccacatcagacccaaagagtcaatatattaatctatttgctagatg i rheMac3.chr7 I 48 C 0 s macFas5.chr7 88337323 1371 - 171882078 TTTTTGTCTCATCCTACCTCTGCTTGTTTTTGTGGTACAAAGCAATAATCTCTCATCATTTATTTAATATTTTTCTCCTTTTGAATTTTAATTATAATGTGTAAATTGACTTCTCTCAAACTTCTATTTACTTCTGGACTAATAAACATGCTTCTGAATAGGGTTCTGTCTT----TTTCACAATAGGATTTTTGTTTTAGAACTAGAAAGTAAGTCAGCTTGGCATTATGCAGCACATTTAAAAAAATTTAGTTCTTGCAAAGCTCTGGTATTTTTCTTTGCCTTATTTAGTTGATAACTAATATAGTTTGCCTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATGGTAGTCTCAAATCTCAAAAGCACTTTCTCCATTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAAGGTTCCTCATGTGGCAACCAACATTTATGAACAATGGCAGAATTGGTTAGTCTTACTTGGAGGGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAGGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAGCTCTTCATATATATATAAGAAACAAGAAGAAAGGGACAATAGAAAAAA---TATTGCAACTATTTTACTTGTTTACCTGGTATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGAGTAATAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGTATTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATGCTTGGGATTGCTTTACTGGT-AACAAAACTTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCGAGAGAATTGACATCTGGTGTTAAAAACCAAAGA-TCATACAAGTGACTGATATGTATCATTTTCCTTATTGAATATGGAGGAAAAGGGAGGAGGATGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGGAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTACGAAAGTTTCTTCTATTGCATATGGTTCTATCATTCATT--CACAGAATTTTGAC--AGGAAGTTGTAGAACTG-AAAAAAGCTTGATATACAAACCACTAGCTGCACTGGCAATTTTA--------CGTTACTGATCCTCCATAATTTGTCTCTATTAACTATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAGGGGTTACTC-AAAGACATTGACAGGAGATCTAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-CTTTTAACATCTAAATATTTTCAGGATTAACTTTGGTTGAAGCATACTTGAATGAATTCCTCATTTGATCCTCATcatcacctcatttggtcatcatgttacccacatcagacccaaagagtcaatatattaatctatttgctagatg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85466851 1371 - 162156779 tttttgcctCATCCTACCCCTGCTTGTTTTTGTGATACAAAGCAATAATCtctcatcatttatttaataattttctccttttgaattttaattataaCATGTAAATTTACTTCTCTCAAACTTCTATTTACTTCTGGACTAATAAACATGCTTCTGAATAGGGTTCTGTCTT----TTTCACAAtaggatttttgttttagaaCTAGAAAGTAAGTCAGCTTGGCATTAtgtagcacatttaaaaaaatttagttctTGCAAACCTCTGGtatttttctttgccttatttAGTTGATAACTAATATAGTTTGCTTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATGGTAGTCTCAAATCTCAAAAGCACTTTCTCCATTACAAT-----------agagagattttaaaatctaAGGTTCCTCATGTGGCAACCAACATTTATGAACAATGGCAGAATTGGTTAGTCTTAGTTGGAGGGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAGGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAgctcttcatatatatataagaaacaagaagaaagggacaatagaaaaaa---tattgcaACTATTTTACTTGTTTACCTGATATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGAGTAATAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGTATTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATCCTTGGGATTACTTTTCTGGTGAACAAAACTTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCGAGAGAATTGAAATCTGGTGTTAAAATCCAAAGA-TCATACAAGTGACTGATATGTATCATTTTCCTTATTGAATAtggaagaaaagggaggaggatGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGGAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTATGAACGTTTCTTCTGTTGCATATGGTTCTATCATTCATT--CACAGAATTTTGAC--AGAAAGTTGTAGAACTG-AAAAAAGCTTGATATACAAACCACTAGCTGCATTGGCAATTTTA--------CGTTACTGACCCTCCACAGTTTGTCTCTATTAACTATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAGGTGTTACTC-AAAGACATTGACAGGAGATCTAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-Cttttaatatctaaatattttcagg-ttaactttggttGAAGCATACTTGAAGGAATtcctcatttgatcctcatcaTCACCTCATTTGATCATCATGTTACCCCCATTAGACCCAAAGAGTCAATACATTAATCTATTTGGTAGATA i papAnu2.chr7 C 0 I 335 s chlSab2.chr29 3623920 1371 - 24206276 TTTTTGCCTCATCCTACCCCTGCTTGTTTTTGTGATACAAAGCAATAATCTCTCATCATTTATTTAATAATTTTCTCCTTTTGAATTTTAATTATAACATGTAAATTTACTTCTCTCAAACTTCTATTTACTTCTGGACTAATAAACATGCTTCTGAATAGGGTTTTGTCTT----TTTCACAATAGGATTTTTGTTTTAGATCTAGAAAGTAAGTCAGCTTGGCATTATGTAGCACATTTAAAAAAATTTAGTTCTTGCAAACCTCTGGTATTTTTCTTTGCCTTATCTAGTTGATAACTAATATAGTTTGCTTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATAGTAGTCTCAAATCTCAAAAGCACTTTCTCCATTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAAGGTTCCTCATGTGGCAACCAACATTTATGAACAATGGCAGAATTGGTTAGTCTTAGTTGGAGGGGGAGGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAGGATCCCTGAAGGCTTAAATTTC-------TGGAGCTCTTCATATATATATAAGAAACAAGAAGAAAGGGACAATAGAAAAAA---TATTGCAACTATTTTACTTGTTTACCTGATATCTTAGATTGCAGTTGAATAGACAGGTCAGAGTAATAGCAGGAATAGCCACAGGCTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGTATTCTCTCTCCTAATAGATCTCCATCTGCATTTAATCCTTGGGATTACTTTTCTGGTGAACAAAAATTTTAATTCTATTAT-------------AATTTTCCATAGACTCGAGAGAATTGAAATCTGGTGTTAAAATCCAAAGA-TCATACAAGTGACTGATATGTATCAATTTCCTTATTGAATATGGAAGAAAAGGGAGGAGGATGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCCAGAGAAAAA----CTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGGAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACATTCAGCAGGTATGAAAGTTTCTTCTGTTGCATATGGTTCTATCATTCATT--CACAGAATTTTGAC--AGAAAGTTGTAGAACTG-AAAAAAGCTTGATATACAAACCACTAGCTGCATTGGCAATTTTA--------CGTTACTGACCCTCCACAGTTTGTCTCTATTAACTATTCAGATTTATGCAACTACCATTATCCCAAGGGTTACTC-GAAGACATTGACAGGAGATCTAGCAGCATTCTGTCCATTCAATATAACTA-CTTTTAATATCTAAATATTTTCAGG-TTAACTTTGGTTGAAGCATACTTGAAGGAATTCCTCATTTGATCCTCATcatcacctcatttgatcatcatgttaaccccatcagacccaaagagtcaatacattaatctatttggtagata i chlSab2.chr29 I 12 C 0 s calJac3.chr10 87774384 1370 - 132174527 --TTTCCGTCATCCTAGCCCTG-TTGCTTTTTTGGTACAAAGCAATAACCTCTCATTTTTAAATT--TATTTTTCTCCTTTTGCATTTT-ATTATAACATGTAAATTAACTTACTCACAACTTCTGTTTACTTCTGGACTAATAAATATGTTTCTGAATAGGGTTCTGTTTT----ATTAACAATAGGGTGTTTGTTTTGGAACTAGAAAGTAACTCAGCTTGACGTTATGTGGCACATTTAAAAGAGTTTAGTTGTTGCAGAGCTCTGGTACTTTTCTTTCCCTTATTTAGTTGATAACGAATATAGTTTACCTAATAACTCCCTTTGGAAGCATTCAGT-GGGTCATGGTAGTCTCAAATCCCAAAAGCACTTTCTTCTTTACAAT-----------AGAGAGATTTTAAAATCTAACTTTCCTCATGTGACAGCGAACATTTATGAACAGTGTCAAAAATGATCAGTCTTACTAGGAGGGGGAAGATGGCTACTTTGTGAGAGTAACATAAGATCGCCGAAGACTTAAATTTC-------TGGAGGTCTTC--ATACTTACAAGAAACAAAAAGAAAGGGACAATAGAAAAAAAACTATTGCAACTATTTTACTTGTTCACCTGATATCTTAAATTGCAGTTGAATAGATTGGTCAGAGTTTTATCAGGAATAGCCAAAGACTAAGGTCTAAATTCAGCAGTGGGGCACTATGCACTCTCTCTTCTGATAGATCTCCATCAGCTTTTAATGCTTGGGATTACTTTAATGGTGAACAAAGCCTTTAATTCTGTTAT-------------AA-TTTCAGTAGCCTCTAGAGAGTTGACATCTGGTAT--AAAACCAAATA-TCACACAAATGACTGATATGTATTATTTTCCTTATTAAATATGGAAGAAAAGAGAGGCAGATGCAGAAATGGTAGGCTAAAAGCTCTAGAGAAAAG----CTTAACTGATTTTATGATTTTGCAGAAGGTAAGTCCTTGACCTCTTCATTTTCACACTCAGAAAGTATGAAGGTTTCTTCTGTTGCACCCGATTCTATCATTCATT--CATAGAATTTTGAC--AAAAAGTTGTAGAAGTG-AAAGAAGGTTGATATACAAACCACTGGCTGCAATGGCAATTTTAAATGAAGGCATTACTGACCTTCTGCAACTTCTCTCTATTAACTACTCAGATTCATGCAACTACCATTATCCCAGGGTTTACCC-AAAGACATTGACAAAAGATCTAGTAGCATTCTGTCCATTCAATCTAACTA-CTTTTAACATCTAAATATTTTCAGGATCAACTTTGGTTGAAGCACACTTGAATGAATTACATGTT--AATACCATcatcatttcatttgatcgtcatgttacccccatcagacccaaagagtcaatacattgatctatttggcaaatg i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46958437 1273 - 64190966 ----------------------------------------------aatatTTCATCATTTATTTA-----------CATTTGAGGGGTTATTATAA-GTATAAA-TGAGTTTTCTTAACCTTCTATTTACTTTTGACCTAATAAACATGCTTCCAGATAGGTTTCTATTATCTCATTTACCAATAGGACTTTGATTTTAGAATTCAGAATTAACCCAGTGTGGCACTATATGACATATTTTAAAATATTTATCCCTTCCAAAGCTCTGGTATTTCCATATGCCTAATTTAGCTCACA-------------TTCTAACAGCTCCCTCTGGAAATATTCAGTAGGGTCTTGGCAGTCCC-AGTCCCCAAAGCACTTTCTCCGTTGTATTGTAAAGTGTTAAAGGAGATCTCAAAACCTAAGGTTCC-----------------TTTGTGA---------------------------------GGAAGGATGGCTAC-TTGTGAGAATTACATAAAACCCCTGGAGACTCAAATTTCCAAGGAATGGAGTAATATTCATATTTACCAGAAACAAGGAGA---GGACAACAGAGAAGA---TATCACAGCTATTCTACTGTTTCATCTGCTGCATTGGAATACAATGGAATAGA--GGTCAGAGTTTCAGTAGGAATAG-CAGAGGCAAAAACCTAAATTCAGCAGTGTGGCATTTTCTACCCTCCACCCTAATAGATTTCTA-ATGCTCTTGATGTTTGGAATTACTTTAATGGTGGACAAAACTTTC-ATTCTCTTATCATAATTAAGTAGAATTATCAAGAGCCTTCACAGAATTGACATCTGGTATT-AAAATCAAGGA-ACATAAGAATGAATGATATGTTTTATTATTCTTATAAAATATGGATGAAA-GGGAGAAAGATACAGAAA-GTTAGGCTAAAGCTTCCAGAGAAAAAAAAGCTTAACAGATTTTATGATTTTGCAGA---TTAGTCC-AGATCTCTTAATATCCATACTCAGTAAATTTGAGAGTTTCTTCTCTTGCCTATGGTTCTATTATTCAACAACACAAAGCTTTGATAGAGAAAGTTGTAAAACTG-AGAAAAGCTTGATAT-CAAATGATTGACTGCATTGGCAGTTTTACATGAAAGCTTTACTGCACCGCCACAATTTCTC-CTATTAATCACTCCAATTTTTGTTGCCACCATCA-CCCAGGGTTTACCCTAGAGCCATTGACAAAGGATCTCATGGCAATATATCTATTTAGTAGAGCTACCTCTTAACATCTACATATTTGCAGAGTTCACTTTGGTTTAAACATACttaaataaatta-ttatt--attaCCTTCTTCCTTAtatatcatgatccttgtatccctgtc--------agagtcaacacgttattctatgtgaaagatg i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I a score=930238.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 443439 492 + 478999 aaaactcaggcttctgaaagctaag-----tgactttgccagaatcacacagtaagttaattgctcagtc-------------------aaggcatgagagtcagataaatgattcccaaaccagggatccttttatgttattacattgcctAAAAAACTGGCATTCAAATGGAATTTAGAGGGCATTTAATCTGGCCATCTCATTTGATTGATGAATAAATTTTCTGGCTAAGAATCTACACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTCAGCATCAGCATCAGTATAAATTAAATTTTCTATTATGTTC-TCAGCCTGATTCACACTTTTTAGAAAATATAAAACTTATT------TCATACTCAAATAATTTACTAACCTTGTGTAGTTAGTAAATTATT----ACTACTAATATTACATCTCTATTTTTGAAA-TTTACATTCAATATATTTATTTCATTAGGATGCTACTAATGAAATTAACTTTTTTTT------AAAAAAAAGGTGAATCATCTCATTTTTATCAGGTTCA s panTro4.chr14 18760874 501 + 106544938 acaactcaggcttctgaaagctaag-----tgactttcccagaatcacacaataagttaattgctcattc-------------------aaggcatgagagtcagataaatgattcccaaaccagggatcattttatgttattacattgcctAAAAAACTGGCATTCAaatggaatttagaggccatttaatctggccatctcatttgattgatgaataaattTTCTGGCTAAGAATCTATACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTCATCAGCAGCATCAGCATAAATTAAATTTTCTATTATGTTC-TCAGCCTGATTCAAACTTTTTAGAAAATATAAAACTTATTAT---TTCATACTCAAATAATTTACTAACCTTGCATCATTAGTGAGCTATT----ACTACTAATATTACATCCCTATTTTTGAAA-TTTGTATTCAATATATTTATTTCATTAGGATGCTACTAATGAAATTAACTTCTTTTTTTTAAAAAAAAAAAGGTGAATCATCTCATTTTTATCAGGTTCA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88059459 497 - 170124641 aaaactcaggcttctgaaagctaag-----taactttccaagaatcacacaataagttaattgctaagtc-------------------aaggcatgagagtcagatatttgattcccaaaccagggatccttttatgttattatattgcctAAaaagctggcattcaaatggaatttagaggtcatttaatctggccatctcatttgattgatgaataaattTTCTGGCTAAGAATCTATACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTCATCATCAGCATTAGTATAAATTAAATTTTCTGTTATATCC-TTAGCCTGATTCACACTTTTTAGAAAATGCAAAACTTATTAT---TTCATACTTAAATAATTTACTAACCTTGTGTAGTTAGTAAGTTATTACTAACTACTAATATTACATCCCTAGTTTTGAAA-TTTTTATTCAATATATTTATTTCATTAGGATGCTACTCATGAAATTAACTTCTTTTTT-----TAAAAAAA---GAATTATCTCATTTTTATCAGTTTCA i rheMac3.chr7 C 0 I 205 s macFas5.chr7 88338694 497 - 171882078 aaaactcaggcttctgaaagctaag-----taactttccaagaatcacacaataagttaattgctaagtc-------------------aaggcatgagagtcagatatttgattcccaaaccagggatccttttatgttattatattgcctAAaaagctggcattcaaatggaatttagaggtcatttaatctggccatctcatttgattgatgaataaattTTCTGGCTAAGAATCTATACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTCATCATCAGCATCAGTATAAATTAAATTTTCTGTTATATCC-TCAGCCTGATTCACACTTTTTAGAAAATGCAAAACTTATTAT---TTCATACTTAAATAATTTACTAACCTTGTGTAGTTAGTAAGTTATTACTAACTACTAATATTACATCCCTAGTTTTGAAA-TTTTTATTCAATATATTTATTTCATTAGGATGCTACTCATGAAATTAACTTCTTTTTT-----TTAAAAAA---GAATTATCTCATTTTTATCAGTTTCA i macFas5.chr7 C 0 I 8 s papAnu2.chr7 85468557 492 - 162156779 aaatctcAGGCTTCTGAAAGCTAAG-----TGACTTTCCAAGAATCACACAATACGTTAATTGCTAAGCC-------------------AAGGCATGAGAGTCAGATACATGATTCCCAAACCAGGGATCCTTTTATGTTATTACATTGCCTAAAAAGCTGGCATTCAAATGGAATTTAGAGGTCATTTAATCTGGCCATGTCATTTGATTGACGAATAAATTTTCTGGCTAAGAATCTATACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTTATCATCAGCATTagtataaattaaattttctattatGTTC-TCAGCCTGATTCACactttttagaaaacataaaacttaTTAT---TTCATACT----TAATTTACTAACCTTGTATAGTTAGTAAGTTATTACTAACTACTAATATTACATccctatttttgaaattttttattcagTATATTT-----ATTAGGATGCTACTAATGAAATTAACTTCCttttt-----ttAGAAAAGGGGAATAATCTCATTTTTATCAGTTTCA i papAnu2.chr7 I 335 I 8 s chlSab2.chr29 3625291 497 - 24206276 aaatctcaggcttctgaaagctaag-----tgactttccaagaatcacacaatacgttaattgctaagcc-------------------aaggcatgagagtcagatacatgattcccaaaccagggatccttttttgttattacattgcctAAAAAGCTGGCATTCAAATGGAATTTAGAGGTCATTTAATCTGGCCATGTCATTTGATTGACGAATAAATTTTCTGGCTAAGAATCCATACATTTGTTTAGTGCTTTATATACTCATCATCAGCATTAGTATAAATTAAATTTTCTATTATGTTC-TCAGCCTGATTCACACTTTTTAGAAAATATAAAACTTATTAT---TTCATACT----TAATTTACTAACCTTGTGTAGTTAGTAAGTTATTACTAACTACTAATATTACATCCCTATTTTTGAAATTTTTTGTTCAGTACATTTATTTCATTAGGATGCTACTAATGAAATTAACTTCCTTTTT-----TTAAAAAAGGTGAAAAATCTCATTTTTATCAGTTTCA i chlSab2.chr29 C 0 I 1 s calJac3.chr10 87775754 495 - 132174527 aaaactcaggcttctgaaagctaag-----tgactttccgagaatcacac-gtaagttaattgttaagcc-------------------aaggaatgatagtcagataaatgattcccaaaccaggaatccttttatgttattacattgcctAAAAAACTGGCATTCAAATCGAATTTAGAAGTTGTTTAATCTGGCCATCCCATTTTATTGATGAATAAATTTTCTGGCTAAGAAGTTATATATTTGCTTAGTGCTTTATACACTCATCATCAGCATCAGTATAAATTAAATATTTGATTATGTTC-TCAGCCTGATTCACACTTTTTAGAACATATAAAACTTATTAT---TCTATACTTAAATAACTTACTAACTTTGAGCAGTTACTAACTTACTACTGACTACTAATATTATAATCCTATTTTTGGAA-CATTTATTCAATATATTTATTTTATTAGAATGCTGCTAATAGAATTTACTTCTTTTTT---------AAAAACTGAATCATCTCATTTTTATCAGGTTCA i calJac3.chr10 C 0 I 23 s canFam3.chr15 46959710 496 - 64190966 aaaagccaaccttctgaaagcaaagctagatgactttcccaggatcaaacatttagtgaattgctgagccaacactTACTCATTCTACAAAAGCATTAGAATCACATAAAAGGTTTCCAAAGTAAGGATAGTTCTATCTTATTACATTGCTTAAAAAGTTAG---------GAAATTTAGAAGTAATTTAA----ACCATCTAATTTTACTGATGAAAGAATTTCCTGGCTGAATACCTATATATTTGTTTAGTGCTTTATATGTTTATCAATAGCATCAGTACCAATTAAATCTTTGATTATGTTCTTTAGCTTGATCCACATTTTT---AATATGTAAAACTTACTACTAATTTATCCTTAAATAACTTATAAACTT----CAATCAATATGCTG---------ACAGAAATTACACTCAGATTTTTGGAA-ACTTTGTTGAACAATTTCATTTCTTTAGAATGATATTAAAGAGATTTACCTTTATTTT-----ATAAAGAG---AAAGCATCTTTTTTTTATCAGATTCA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I a score=-3888.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 443931 2 + 478999 -CT s panTro4.chr14 18761375 2 + 106544938 -CT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339199 1 - 171882078 -C- i macFas5.chr7 I 8 I 1 s papAnu2.chr7 85469057 1 - 162156779 -c- i papAnu2.chr7 I 8 I 1 s chlSab2.chr29 3625789 1 - 24206276 -T- i chlSab2.chr29 I 1 I 37 s calJac3.chr10 87776272 1 - 132174527 -T- i calJac3.chr10 I 23 C 0 s canFam3.chr15 46960206 2 - 64190966 CT- i canFam3.chr15 C 0 I 12 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88059956 205 - 170124641 I a score=8453.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 443933 12 + 478999 ACATATATATGA s panTro4.chr14 18761377 11 + 106544938 -TACAAGTATGA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339201 12 - 171882078 atatatatgtgt i macFas5.chr7 I 1 I 52 s papAnu2.chr7 85469059 12 - 162156779 atatatatatgt i papAnu2.chr7 I 1 I 22 s calJac3.chr10 87776273 12 - 132174527 ACATATATATTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960220 12 - 64190966 AAATATATATGA i canFam3.chr15 I 12 I 10 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e chlSab2.chr29 3625790 37 - 24206276 I e rheMac3.chr7 88059956 205 - 170124641 I a score=41100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 443945 64 + 478999 AGTAGTTGATAAATGACTCAGCGTTGGCCAATTGC---AAGAATACCACTTAAAAGTAAATGGTTAT s panTro4.chr14 18761388 64 + 106544938 AGTAGTTGATAAGTGACTCAGCGTTGGCCAACTGC---AAGAATATCACTTAAAAGTAAATGGTTAT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339265 64 - 171882078 AGTAATTGATAAGTGACTCAGAGTTGGCCAATTGC---AAGAATACCACTTAAAAGTAAATGGTTAT i macFas5.chr7 I 52 C 0 s calJac3.chr10 87776285 67 - 132174527 TAAAATTGATAAGTGACTCAGATTTGGCCAATTGCAAGAAGAATACCACTTAAAAGTAAACGGTTAT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960242 67 - 64190966 AGTAATTAATGAGTGGTTCAGATTTGGTAAACTATAAGAAGGATACTACTCAAGAGAAAATGATTAG i canFam3.chr15 I 10 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e chlSab2.chr29 3625790 37 - 24206276 I e papAnu2.chr7 85469071 22 - 162156779 I e rheMac3.chr7 88059956 205 - 170124641 I a score=4955.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 444009 5 + 478999 TACTG s panTro4.chr14 18761452 5 + 106544938 TACTG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339329 5 - 171882078 TACTG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3625827 5 - 24206276 tacat i chlSab2.chr29 I 37 C 0 s calJac3.chr10 87776352 5 - 132174527 TACTG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960309 5 - 64190966 TACTG i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e papAnu2.chr7 85469071 22 - 162156779 I e rheMac3.chr7 88059956 205 - 170124641 I a score=74547.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 444014 51 + 478999 AAGAGTGAATTATATATTTTCATTTTGTAGACTTAACATTTAAAATGGAAG s panTro4.chr14 18761457 51 + 106544938 AAGAGTGAATTATATATTTTCATTTTGTAGACTTAATATTTAAAATGGAAG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339334 51 - 171882078 AAGAGTGAATTATACATTTTCATTTTGTAGACTTAATATTTAAAATGGAAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85469093 51 - 162156779 atgagtgaattataaattttcattttgtagacttaatatttaaaatgaaag i papAnu2.chr7 I 22 C 0 s chlSab2.chr29 3625832 51 - 24206276 atgAGTGAATTATAAATTTTCATTTTGTAGACTTAATATTCAAAATGAAAG i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87776357 51 - 132174527 AAGAGTAAATTATACATTTTCATTTTGTAGACCAAATATGCAAAATGGAAG i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960314 49 - 64190966 AAGACTGAATTATAAATTT--ATTTTATAGACCAACTGTTAAGAATGGAAT i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I e rheMac3.chr7 88059956 205 - 170124641 I a score=384713.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 444065 211 + 478999 ATGGTGGGAAGCACACACATTTCTCAGTCTTGTTGGAAAAGCAAATGACAACGAGATTTTC------TGTTTCTTGTTTCGTTTTGTTTTT-AGATGCATTAGCAAGACAGGTGTGGG-TAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGACAAAAAGTGGAGAGAGTGAAAACATATCAGAGTGAAAA-AACATAGATAAATGTAAGGGAGAAGAAAGAAAAAAA-- s panTro4.chr14 18761508 212 + 106544938 ATGGTGGGAAGCACACACATTTCTCACTCTTGTTGGGAAAGAAAATGACAATAAGATTTTC------TGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTT-AGATGTATTAGCAAGACGGGTGTGGGGTAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGACGAAAAGTGGAGAGAGTGAAAACATATCAGAGTGaaaa-aacatagataaatgtaagggagaagaaagaaaaaat-- i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88060161 210 - 170124641 ATGGTAGGAAGCACACACATTTCTCAGTCTTGTTGGGAAAGAAAATGACAATGAGATTttc------tgtt--ttgttttgttttgttttT-AGATGTATTAGCAAGACAGGCGTGGGGTAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGAGGAAAAGTGGAGAGAGTGAAAACATTTTGGAGTGAAAA-AACATAGATACATTTAAGGGAGaagaaagaaaaaat-- i rheMac3.chr7 I 205 C 0 s macFas5.chr7 88339385 210 - 171882078 ATGGTAGGAAGCACACACATTTCTCAGTCTTGTTGGGAAAGAAAATGACAATGAGATTTTC------TGTT--TTGTTTTGTTTTGTTTTT-AGATGTATTAGCAAGACAGGCGTGGGGTAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGAGGAAAAGTGGAGAGAGTGAAAACATTTTGGAGTGAAAA-AACATAGATACATTTAAGGGAGAAGAAAGAAAAAAT-- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85469144 205 - 162156779 atggTGGGAAGCACACATATTTCTCAGTCTTGTtgggaaagaaaatgacaatgagattttc-------------tgttttgttttgttttt-agatgtatTAGCAAGACAGGTGTAGGGTAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGAGGAAAAGTGGAGACAGTGAAAACATTTTGGAGTGAAAA-AACATAGATACATTTAagggataagaaagaaaaaat-- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3625883 216 - 24206276 ATGGTGGGAAGCACACATATTTCTCAGTCTTGTTGGGAAAGAAAATGACAATGAGAttttctgtttttgtt--ttgttttgttttgttttt-AGATGTATTAGCAAGACAGGTGTGGGGTAGAATGGAGTAGCCATGAACATAGAGGAAAAGTGGAGACAGTGAAAACATTTTGGAGTGAAAA-AACATAGATACATTTAAGGGATAAGAAAGAAAAAAT-- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87776408 198 - 132174527 ATGGTGAGAAACAGATACATCTCTCAGTCTTGTTGGGAAAGAAAATGACAGTGAGATTTTT------------TTGTT---TTTTATTTTT-AGATGTATTAGCAAGATGGGCATGGGGTAGAATGGAGTAGTAATGAACATAGAGGAAAAGTGGAGAGGGTGAAAACATTTCAGAGTGAAAA-AACATGGATAAATTTAAGGGAGAAGAAAGAA------- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960363 197 - 64190966 ATGGTGGGAAGTGTACTTATCACTCATTTTTGTTTG-AAAGGAACCAACAATAGGGTTTTT-------------------GTTTTGTTTTTAAAATATAATGGCAAGACAGACATGGGCTATAGTGGAGTGGCAATGAACA-AGAGGACAAAC--AGAGAATGAAAAAATTTCAGATAGAAAAGAATATGAATAAATGATAGGAAGAAG--AGAAAATGTTA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18951326 33159 + 108868599 I a score=2006454.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 444276 839 + 478999 AATAAAGAACAATATTTAAAGAGAACAAAATAAATAGAGCCAGAAAGAAACAGAGA-AGGGGAAAAGAACAGGCAACAAATTAACA-GGGAAAAGAA-ATCACAACC--AGAA-AAAAAAA----GAAAATGAACTGCTTATTGATGAA-TAAAGAAAGAGAGAAAAAG----AAA----AATAAGGAAGGA------------------------GGCGGAGTAAGCACATAAGATCTCTAAACACTTGGCTCCAGCAGCCCATCTGACCACA-CTCAGACTCCAGGCATGCACACACAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTGTGTCTCCACCTTGCAAATGTGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTTCCCTATTTCTGCAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATCAATCCACGAATTAGCTGAAGTGGCAAGAACGATTAGAGATACAGTGAGGAAGGTATGG--------TACAGA--G---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGGCTAAAATAGAACA-CTTTACTCTGATGACGTC---ATCATTTATGGATTTTTTTTTTTTGGTAGAAACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTCATCT----GATTAGTCTCCGCGTCTATTC--CAACCACAATTTAGAGA----AGGTAGAGATAATTCAAAGATGGAAGTGGGACAGGGAAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACAGTGGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACAGGCAGAATGGAAGAGCTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAATGTCTCAGGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACCTCACTCTATGTTAGCATGTGGGATGCATAAAA s panTro4.chr14 18761720 837 + 106544938 aataaagaacaatatttaaagagaacaaaataaatagagccagaaagaaacagaga-aggggaaaagaacaggcaacaaattaaca-gggaaaagaa-atcacaacc--agaa-aaaaaaa---agaaaataaactgcttattgatgaa-taaagaaagagagaaaaag----aaa----aataaggaagga------------------------GGTTGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACTTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACCACA-CTCAGACTCCAGGCATGCACACACAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTGTGTCTCCACCCTGCAAATGTGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTTCCCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATCAATCCACGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAGGGTATGG--------TACAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGCCTAAAATAGAACG-CTTTACTCTGATGATGCC---ATCATTTATGGATTTTTTTTT---GGTAGAAACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTCATCT----GATTAGACTCTGCGTCTATTC--CAACCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGATAATTGAAAGATGGAAATGGGACAGGGAAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACAGTGGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACAGGCAGAATGGAAGAGCTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAATGTCTCAGGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACCTCACTGTATGTTAGCATGTGGGATACATAAAA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18984485 836 + 108868599 AATAAAGAAAAATATTTaaagagaacaaaataaatagagccagaaagaaacagaga-ttgggaaaagaacaggcaacaaattaaca-gggaaaagaa-atcacaata--agaa-aaaaaaa--aagaaaatgaactgcttattgatgaa-taaagaaagagagaaaacg----aaa----aataaggaagga------------------------GGGGGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACTTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACCACA-CTCAGACTCCAGGCATGCACACACAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTGTGTCTCCACCCTGCAAATGCGGTGAACCCTT---CTTCATCTTCCCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATCAATCCACGAATTAGCTAAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAGGGTATGG--------TACAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGGCTAAAATGGAACA-CTTTACTCTGATGATGCC---ATCATTTATGGATTTTTTTTT--TGGTAGAAACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTCATCT----GATTAGTCTCTGCGTCTATTC--CAACCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGATAATTCAAAGATGGAAATGGGACAGGGAAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGCACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACAGTGGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACAGGCAGAATGGAAGAGCTTACAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAATGTCTCAGGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACCTCACTGTATGTTAGCATGTGGGATGCATAAAA i ponAbe2.chr14 I 33159 C 0 s rheMac3.chr7 88060371 836 - 170124641 aataaagcacaatatttaaagagaataaaataaataaaaccagaaagatacagaga-ggggaaaaagagcaggcaacaaattaaca-gggaaaagaa-agcacaacc--agaa-aaaaaaa---agaaaatgaattgcttattgatgaa-taaagaaagagagaaaaag----aaa----aataagaaaGGA------------------------GATGGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACCTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACCACAGTTCGGACTCCAGCCATGCACACATAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTCTGTCTCTACCCTGCAAATGTGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTT-CCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATGAATCTGTGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAGGGTATGG--------TACAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGGCTAAAATAAAATA-CTTTACTCTGATGATGCC---GTCATTTATGGA-TTTTTTTT---GGTAGACACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTCATCT----GATTAGTCTCTGTGTCTATTC--CAACCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGCTGATTCAAAGATGGAAATGGGACAGGGCAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACGGTAGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACACACAGAATGGAAGAGTTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAAAGTCTCAGGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACCCCACTCTATGTGAGCATGTGGGATGCATAAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88339595 836 - 171882078 AATAAAGCACAATATTTAAAGAGAATAAAATAAATAAAACCAGAAAGATACAGAGA-GGGGAAAAAGAGCAGGCAACAAATTAACA-GGGAAAAGAA-AGCACAACC--AGAA-AAAAAAA---TGAAAATGAATTGCTTATTGATGAA-TAAAGAAAGAGAGAAAAAG----AAA----AATAAGAAAGGA------------------------GATGGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACCTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACCACAGTTCGGACTCCAGCCATGCACACATAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTCTGTCTCTACCCTGCAAATGTGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTT-CCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATGAATCTGTGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAGGGTATGG--------TACAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGGCTAAAATAAAATA-CTTTACTCTGATGATGCC---GTCATTTATGGA-TTTTTTTT---GGTAGACACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGTTCATCT----GATTAGTCTCTGTGTCTATTC--CAACCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGCTGATTCAAAGATGGAAATGGGACAGGGCAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACGGTAGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACACACAGAATGGAGGAGTTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAAAGTCTCAGGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACCCCACTCTATGTGAGCATGTGGGATGCATAAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85469349 836 - 162156779 aataaagcacaatatttaaagagaacaaaataaatgaagccagaaagacacagaga-ggtgAAAAAGAGCAGGCAACAAATTAACA-GGGAAAAGAA-ATCACGAcc--agaataaaaaaa---tgaaaatgaa-cgcttattgatgaa-taaagaaagagagaaaaag----aaa----aataagaaagga------------------------gaTGGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACCTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACTACAGTTCAGACTCCAGCCATGCACACATAGAGTTGCCTGGAGATGTTTCTCTGTCTCCACCCTGCAAA--TGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTTCCCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATGAATCTGTGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGAAGGGTATGG--------TATAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTggctaaaataaaaca-ctttattcTGATGATGCC---Gtcatttatggattttttttt---ggtagaaacttattttattttgcttagagGAAGGCTCATCT----GATtagtctctgtgtctcttc--caaCCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGATACTTCAAAGATGGAAATGGGACAGGGCAGAAAGTT------GATCAAGATGCCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACAGTAGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACACGCAGAATGGAAGAGCTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAAAGTCTCCAGGATATTGTTAAATGCTAACACATCAAGAAATACTTCATTCTATGTGAGTATGTGGGATGCATAAAA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3626099 838 - 24206276 AATAAAGCACAATATTTAAAGAGAACAAAATAAATGAAGCCAGAAAGACACAGAGA-GGTGAAAAAGAGCAGGCAACAAATTAACA-GGGAAAAGAA-ATCACGACC--AGAAAAAAAAAA---TGAAAATGAA-CGCGTATTGATGAA-TAAAGAAAGAGAGAAAAAG----AAA----AATAAGAAAGGA------------------------GATGGAGTAAGCACATAGGATCTCTAAACACCTGGCTCCAGGAGCCCATCTGACCACAGTTCAGACTCCAGCCATGCACACATAGAGTTGCCTGCAGATGTTTCTGTGTCTCCACCCTGCAAATGTGGTGAACCCTTCTCCTTCATCTTCCCTATTTCTGTAGTGTGTCATCATGGCCAGAAACTGATGAATCTGTGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAGGGTATGG--------TACAGA--C---TTTTGACAGAACTTTCTCTACTAATTTGGCTAAAATAAAACA-CTTTAATCTGATGATGCT---GTCACTTATGGATTTTTTTTT---GGTAGACACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTCATCT----GATTAGTCTCTGTGTCTATTC--CAACCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGCTGATTCAAAGATGGAAATGGGACAGGGCAGAAAGTT------GATCAAGATGTCAAGTAGTACAGAATCCCATCTG-TTAAGAAACGGTAGAAAAATAACAGTG-----AGGCTGGGACACATGCAGAATGGAAGAGTTTATAACCTTCAGTTTCAAAGTCCTTCAGAAATCCTCAAAAGTCTCAGGGATATTGTTAAATGTTAACACATCAAGAAATACCCCACTCTATGTGAGCATGTGGGACGCATAAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87776606 813 - 132174527 AATAAAGAACAGTATTTAAAGATAATAACA-----AGAGCCAGAAAGAAACAGAGACGAGGGATAAGAAAAGGCAACAAATTAACA-GGGAAAAAAATATCATAACC--AGAA-------A-----AAAATGAACTGCTTATTGCTGAATTAAAAAAAAAGAGAAAATG----AAAAAAGAAAAATAAAGGA------------------------GGAGGAGTGTGCACATAGGATCTCTAAACACCTGACGCCAGGAGCGGGTCTGACCACAGCTCAGACTCCAGGCAGGCACTCACAGAGTTGCCTGGAGATGTTG-TGTGTCTCTACCCTGTGAATGTGGTGAACCCTTCTCTTTCATCTTCCCTGTTTCTGTAGTGTGCCATCATGGCCAG-------CCAATCTATGAATTAGCTGAAATGGCAAGAAGGATTAGAGATACAGTGAGGAAGATGTGG--------TACAGACTC---TTTTGACTCAACTTTCCCTACTAATTTGGCTAAAATAGAACA-CTTTACTCTGATGATGCC---ATCTTATATGGA--TTTTTTT---GGTAGAAACTTATTTTATTTTGCTTAGAGGAATGCTTATCT----GATTAGTCTCTCCATCTATTCAAAAATCACCATTTAGAGA----AGGTAGAGATAGCTCAAAGGTGGGAATGGGACAGGGAAGAAAGTTAAAAAAAAAAAAGATGTCAAGTAGTACTGAATCCCATCTG-TTAAGAAACAGTGGAAAAATAACCGTA-----AGGCTGGGACACAGACAGAGT-GAAAAGTTTATAACCTTCAATTTCAAAGTCCTTCAGACATTTTCAAATGTCTCAGGGATATTGTT------------------AAATACCTCACTCTATGTGAGCATGTGGAACATATAAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46960560 847 - 64190966 -AAGAAAAGTGAGATTTAAGGTAAGCAACGTAAATAGGGAAAGAAAATTA-------GGGGAAAATGAGT--TCAGTAAATTAAAAGGGGAAAAGAA-ACCATAAACTTATAA-AAATAAATTAGGAAAATGAA-GACTTGGTGATGAA-TAAAAGGGGAGATAAAGAGGACAGAA----CATAAGGAAGAAAAGGAGTGAATGTTTCAAAGAGATAGGGAAGTAAGGCCCTTGGGTCTCTAAACACCTGGCTCGAGAGGCTGGTCTGAC--CAGTTTACACTCCAGATATGCAC------AGTTTGCTGGTAGTGTT--TGTGTCTCCACCCTAAAAATGAAG-GCAGCCCTCTCCTTTGCCTTCCCTACTTCTCTACTGTATCCTCATTGCCACAGAGAGAAGAATCTATGAATTAGCTGAAA-GGCAAGGAAGATTGGAAATACAGTGGTGAGGATTTAGATGCTCATTTCAGC--CTCTTTTTGACAACACTTTTCCCATGAA-TTGGCTGAAATCGGATATTTTTATTCTGAAAAAGGCCATATAATCTGTAAAATTTTTTCC-----CAGAAATTTGTTTTATTTTACCTAGAAAAATGATCATCTCACACACAATTCTCTGGATTTACGT--GAGCTACCATTTCAGAATCACAGGTAGAGAGGATACATAGATGAGAAGGGGATAG-------------------------TGTCAGGTAGTATCTTATAACATCTGTTTAGGTAATAGTTAAAAA--AACAGAGATGAAAGACTGGAA-ATAGGTGGAGTGGAG--GCTAATAAGCCTTAATCATAAATACCTTCAGAAAGCCTC---TGTCTCAGAGATGTCATTAAACACTAACAC--CATGAAATAATACACTCAGATTGAGCTTGTAGGATTCAAGAAA i canFam3.chr15 C 0 I 5 a score=1009232.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 445115 443 + 478999 CATATAAGTAAGTAcagttgactccagaaaaacatgggtttgaaccacacgtgtccacttatatgtggattttcttccacctctgccacccctgagacagcaaaacgaacccttccttttccttctcctc---agcctactcagtgggaagacgacaacgataagaactttatgatgatttgcttccacttaatgaacagtatttatatcttcctttccttatgattttgttatattttattttctgtagcttaatttattgtaggaatatagtatataatacataaaaca--aaaatatttgttattcaactgtttatgttaccagcaaagcttctgatcaacagtaatc-gttagaagctaagtttttagggagtcagggtatgtgctaattttttattgcacaggggatctgcccccttaactcctgcattgttcaattgtcaact s panTro4.chr14 18762557 444 + 106544938 CACATGAGTAAGTAcagttgaccccagaaaaacatgcgtttgaaccacacaggtccacttacatgtggattttcttccacctctgccacccctgacacagaaaaatgaacccttccttttccttctcctcctcagcctactcagtgggaagacaacaacgatacgaactttatgatgatgcatttccacttaatgaacagtatttatatcttcctttccttatgattttgttatattttattttctgtagcttagtttattgtaggaatatagtatataatacataaaacataaaaatatttgttattcaact----atgttaccagcaaaacttcagatcaacagtaatc-attagaagctaagtttttagggagtcaaggtatgtgctaattttttattgcacagggggtctgcccccttaactcctgcattgttcaagcgtcgact i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18985321 445 + 108868599 C--ATGAGTAAGTAcagttgaccccagaaaaacatgggtttgaaccacacaggtccacttatatgtggactttcttccacctctgccacccc-gagacagaaaaacaaacccttccttttccttctcctcctcagattactcagtgggaagacaacaacggtaagaactttatgatgatccacttccacttaatgaacagtatttatatcttcctttccttatgattttgttttattttattttctgtagcttagtttattgtaggaatatagtatataatacataaaacataaaaatatttgttattcaactgtttatgttaccagcaatgcttctgatcaacagtaatc-actagaagctaagtttttagggagttaaggtatgtgctaattttttattgcacagggggtctgcccttttaactcctgcattgttcaagcatcgact i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88061207 448 - 170124641 CATAAGAGTAAGTAcagttgaccccagaaaaacatgggtttgaaccacatgggtccactttcatgtgaattttcttccacctctgccacccctgagacaacaaaacgaacccttcctcttccttcccctcctcagtctgctcagtgggaagatgacaaggattataactttatgatgatccacttccacttagtgaacagtatttatatcttcctttccttatgattttgttatattttattttctgtagcttattttattgtaggaatatagtatataatacataaaacataaaaatatttgttattcaactgtttatgttaccagcaaagcttctgatcaacaggaatc-attagaagctaagtttttagggagtcaaggtatatgttaattttttattgcacaggggttctgcccccttaactcctgcattgtttaagggtcgact i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88340431 448 - 171882078 CATAAGAGTAAGTAcagttgaccccagaaaaacatgggtttgaaccacatgggtccactttcatgtgaattttcttccacctctgccacccctgagacaacaaaacgaacccttcctcttccttcccctcctcagtctgctcagtgggaagatgacaaggataagaactttatgatgatccacttccacttagtgaacagtatttatatcttcctttccttatgattttgttatattttattttctgtagcttattttattgtaggaatatagtatataatacataaaacataaaaatatttgttattcaactgtttatgttaccagcaaagcttctgatcaacaggaatc-attagaagctaagtttttagggagtcaaggtatatgttaattttatattgcacaggggttctgcccccttaactcctgcattgttcaagggtcgact i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85470185 448 - 162156779 CATACGAATAAGTACAGTTGATCCCAGAAAAACATGGGTTTGAACCacatgggtccacttatatgtggattttcttccacctctgccacccctgagacaacAAAACgaacccttcctcttccttcccttcctcagcctactcagtggGAAGATGACAAGGATAAGaactttatgatgatccacttccacttagtgAATAGTATTTGTATCTTCCTTTCCTTatgattttgttatattttattttctgtagcttattttattgtaggaatatagtatataatacataaaacataaaaatatttgttattcaaCTGTTTATGTTACCAGCAAAGCTTCTGATCAACAGGAATC-ATTAGAAGCTAAGTTTTTAGGGAGTCAAggtatatgttaattttttattgcacAGGGGTTCTGCCCCCTTAACTCCTGCATTGTTCAAGTGTCGACT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3626937 448 - 24206276 CATAAGAGTAAGTAcagttgaccccagaaaaacatgggtttgaaccacatgggtccactttcatgtgaactttcttccacctctgccacccctgagacaacaaaacgaacccttcctcttccttcccctcctcagtctgctcagtgggaagatgacaaggataagaactttatgatgatccacttccacttagtgaacagtatttattttttcctttccttatgattttgttatattttattttctgtagcttattttattgtaggaatatagtatataacacataaaacataaaaatatttgttattcaactgtttatgttaccagcaaagcttctgatcaacaggaatc-attagaagctaagtttttagggagtcaaggtatatgttaattttttattgcacaggggttctgcccccttaactcctgcattgttcaagggtcaact i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87777419 446 - 132174527 CATACAAGTAAGTAcagttgaccccagaacaacatgggtttgaaccacatgggtccacttatatgtggattttcttctacctctgccacccctgtgacagcaaaaccaactctttctcttccttctcctc---agcctactcagtgggaatatgacaaggataagaactttatgatgatccactttcacttaatgaacagtatctatattttcctttccttatgattttgttacattttcttttctgtagcttagtttgttgtaggaacatagtatataattcataaaacataaaaatatatgttattcaattctttttgtaaccagcaaaacttgtgatcaacagtaggctattagaaactaagtctttagggagtcaagttatatgctatttttttatggcacagggggtctgccccactaacgcctgcattgttcaagggtcaacA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46961407 5 - 64190966 I a score=346938.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 445558 131 + 478999 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG-AAAAGGTTAAGACATGAGCAGAAAAGCTCATTTGAA-GGATCTACAAAA s panTro4.chr14 18763001 132 + 106544938 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGAAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGTTCAAAGGTTAAGACATGAGCAGGAAAGCTCATTTGAA-GGAACTACAAAA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18985766 130 + 108868599 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------AGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG--AAAGGTTAAGGCATGAGCAGAAAAGCTCATTTGGA-GGAACTACAAAA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88061655 131 - 170124641 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG-GAAAGGTTAAGACAGGAGAAGAAAAGCTCATTTGAA-GGACCCACAAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88340879 131 - 171882078 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG-GAAAGGTTAAGACAGGAGAAGAAAAGCTCATTTGAA-GGACCCACAAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85470633 131 - 162156779 GTAGAAGGGGCTCTTGatttaa------ggaaatatttatatAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG-GAAAGGTTAAGACAGGAGAAGAAAAGCTCATTTGAA-GGacccacaaaa i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3627385 131 - 24206276 gTAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAAAGGGGG-GAAAGGTTAAGACAGGAGAAGAAAAGCTCATTTGAA-GGACCCACAAAA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87777865 132 - 132174527 AGAGAAGGGGCTCTTGATTTAA------GGAAATATTTATATAGGCAGATAGTAGAATAAATGTTGAGACAAATGGCTGGCAATGGGGG-TAAAGATTAAGACATGAGGAGAAAAGCTCATTTGGATGGACTTACAAAA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46961412 131 - 64190966 GTAAAAGGGGGCTTTGACTTACATTCCTGAATATATTTTTATAGGCAGTTGATGGAATGAATGTTGAGACAAATGGCTTCCTAAATGCT-AA-----CAAGAAGTGAGTAGAGAAGCTAATTTAAA--GAGCTACAAAA i canFam3.chr15 I 5 I 842 a score=39571.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 445689 17 + 478999 TATTTTTTCCTATTACA s panTro4.chr14 18763133 17 + 106544938 TATTTTTTCCTATTACA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18985896 17 + 108868599 TATTTTTTCCTATTACA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88061786 16 - 170124641 TA-TTTTTCCTATTACA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88341010 17 - 171882078 TATTTTTTCCTATTACA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85470764 17 - 162156779 tattttttcctgttaca i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3627516 17 - 24206276 TATTTTTTCCTATTACA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87777997 17 - 132174527 TATTTTTTCCTATTACA i calJac3.chr10 C 0 C 0 e canFam3.chr15 46961543 842 - 64190966 I a score=671100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 445706 265 + 478999 ATTTTGCATGTGTTTGTATGT----GTGTGCATACGTGTGTGTTCATGTGGTATTTGCATATGTATATATGATGATGTGTTAAAATATGACTTTCATAAATTCCACATGTGGCTGCCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCCACTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCCTAAGATGACACTATATAGATGTGCtgtctgtcttttggtgtttgtttgcttgtttgtttg s panTro4.chr14 18763150 267 + 106544938 ATTTtgtgtgtgtttgtatgtatttgtgtgcatacgtgtgtgttcatgtggtatttgcatatgtatatatgATGATGTGTCAAAGTATGACTTTCATAAATTCCACATGTGGCTGCCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCCATTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATACGTACC-TAAGATAACACTATATAGATGttctgtctgtcttttggtgtttgtttgcttgtttgttt- i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18985913 269 + 108868599 ATTTtgtgtgtgtttgtatgtatttgtgtgcatatgtgtgtgtTCATGTGGTATTTGCATATGTATATATGATGATGTGTTAAAGTATGACTTTCATAAATTCCACATGTGGCTGCCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCCATTCTAGGGATACATAAAGCAGATAATTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCCTAAGATGACACTGTATAGATGTGCTGTCTGTCTTTTGGTGTTTGTTTGCTTGTCTGTTTG i ponAbe2.chr14 C 0 I 1497 s rheMac3.chr7 88061802 263 - 170124641 A-TTAGtgtgtgtttgtacgtatttgtgtgcatatgtgtgtattcatgtggtatttgcatatgtatatatgATGATGTGTTAAAGGATGACTTTCATAAATTCCACCTGTGACTGTCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCTGCTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCTTAAGATGACACTATATAGATGCA----CTGTCTTTTGGTGTTTGCTTGCTTGTTTGTTT- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88341027 263 - 171882078 A-TTAGTGTGTGTTTGTACGTATTTGTGTGCATATGTGTGTATTCATGTGGTATTTGCATATGTATATATGATGATGTGTTAAAGGATGACTTTCATAAATTCCACCTGTGGCTGTCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCTGCTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCTTAAGATGACACTATATAGATGCA----CTGTCTTTTGGtgtttgcttgcttgtttgttt- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85470781 263 - 162156779 A-TTAgtgtgtgtttgtacgtatttgtgtgcatatgtgtgtattcatgtggtatttgcatatgtatatatgatgatgtgtTAAAGGATGACTTTCATAAATTCCGCCTGTGGCTGCCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCTGCTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCTTAAGATGACACTATATAGATGCA----CTGtcttttggtgtttgcttgcttgtttgttt- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3627533 263 - 24206276 A-TTAgtgtgtgtttgtacgtatttgtgtgcatatgtgtgtgtTCATGTGGTATTTGCATATGTATATATGATGATGTGTTAAAGGATGACTTTCATAAATTCCACCTGTGGCTGCCAGTAACACCCAGAAATTTCTGTATTAACCACTCTATTCTGCTCTAGGGATACACAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATATGTACCTTAAGATGACACTATATAGATGCA----CTGTCTTTTGGTGTTTGCTTGCTTGTTTGTTT- i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87778014 268 - 132174527 ATTTtgtgtatgtttgtatgtatttgtgtgcatatgtgtgtgttcatgtggtatttgcatatgtatatatgATGATGTGTTAAAATATGACTTTCATAAATTCCACTTGTGGCTTCTAGTAACACCCAGAAATTTCTGTGTTAACTACTCTATTCAGTTCTAGGGATACATAAAGCAGATAGTTTTAATGCTTCTTAAAATAAGTACCCTAACATGACACTATATAGATATGCAGTCTGTGTTTTGGTATTTGCTTGCTTGTTTTTTT- i calJac3.chr10 C 0 I 1 s canFam3.chr15 46962385 227 - 64190966 ACTTTCCCTGTGTGTGTGTCTAGT-ATTTGTATATATGTGTATAC----------TGTGTATATATACTGATTAATATGTGAAATCATGACTTTCATAAATTCCACCTGTGGCTTGGAGTGAAACATGGAAACTTGTATATTA-----TCTATTCAGCTCCAGAGATACTTAAAACATATATTTTTAATGTTTCCTAAAATATGTATCCTAACAATGAACTATATAGACTTA----Ctgt---------------------tttgttt- i canFam3.chr15 I 842 C 0 a score=183846.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 445971 140 + 478999 cttgtttggtgtttgtttgCCTGattttctatttctctcttctttc-ttccctcatcc-tctatcttcttgtctttcttttctaGGTACTGTTGCAGTAGCATTTTCTGTCAAAGATTTTCCCTTCCTTCCGTACCCCATGT s panTro4.chr14 18763417 119 + 106544938 ---------------------tgattttctatttctctcttctttc-ttccctcatcc-tctatcttcttgtctttctttTCTAGGTACTATTGCAGTAGCATTTTCTGTCAAAGATTTTCCCCTCCTTCCATACCCCATGT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88062065 119 - 170124641 ---------------------TGATTTTCTATTTCTTTCTTCTTTC-TTCCCTCATAC-TCTATCTTCCAGTCTTTCTTTTCTAGGTACTGTCACAGTAGCATTTTCCGTCAAAGATTTTCCCTTCCTTCTGCACCCCATGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88341290 119 - 171882078 ---------------------tgattttctatttctttcttctttc-ttccctcatac-tctatcttccagtctttcttTTCTAGGTACTGTCACAGTAGCATTTTCCGTCAAAGATTTTCCCTTCCTTCTGCACCCCATGT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85471044 119 - 162156779 ---------------------tcattttctatttctctcttttttc-ttccctcatac-tctatcttccagtctttcttttctAGGTACTGTCACAGTAGCATTTTCCGTCAAAgattttcccttccttctgcaCCCCATGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3627796 119 - 24206276 ---------------------TGattttctatttctctcttctttc-ttccctcatac-tctatcttccagtctttcttttctaGGTACTGTCACAGTAGCATTTTCCGTCAAAGATTTTCCCTTCCTTCTGCACCCCATGT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87778283 109 - 132174527 -----------------------CTTGTCTGTTTCTCTTTTCTTCCTTTCCCTAGTTC-TCTATCTTCTTGTCTTTCTTTTCTAGGTAATGTCACAGTAGCATTTTCTGTCAAAGATT---------TTCTGCACCCCATGT i calJac3.chr10 I 1 C 0 s canFam3.chr15 46962612 69 - 64190966 --tgttttgtttt--------TACTTTTCTATTTATCTCCTTTAT--TTCCATCACCCTTTTCTCTTCCAGTCTTTCATTC------------------------------------------------------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18986182 1497 + 108868599 I a score=341360.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 446111 332 + 478999 GCTAGAGC----AC------------ttatttatttatttatttatttatttatttatttattttgagacagagtctcgctctgtcacccaggctggagtgcagtggcatgatctcggctcactgaaagctctgcctcccgggttcacaccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcaaccaccaccac-tacggctaatttgtttgtatttttttagtagagacggggtttcaccatgttagccaagatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacccgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcataagccaccacgcccggcc s panTro4.chr14 18763536 337 + 106544938 GCTAGAGCTCttat------------ttatttatttatttatttatttatttatttatttattttgagacggaatcttgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcacgatctcggctcactgcaagctccgcctcccgggttcacaccatcctcctgcctcagcctcctgagtagttaggactacaggcaaccaccaccacgtccagctaatttttttgtaattttttagtagagacagggtttcaccgtgttagccaagatggtctcgatctcctgacctcgtgatccagccacctaggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagtcaccgtgcccggcT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88062184 316 - 170124641 GCTAGAGC----AC----------------------------ttatttatttatttatttattttgagatggagtctcgctctgtctcccaggctagagtgcagtggctcgatctcagctcactgcaagctctgcctcctgggttcacgccattctcctgcctcagactcctgagtagctgggactacaggcgcccaccaccatgcccggctaatttttttgtatttttttag-agagagggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcaatatcctgaccttgtgatctacctgcctcggcctcccaaagtactgggattacaggcatgagccaccgtgccctgcc i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88341409 324 - 171882078 GCTAGAGC----AC--------------------ttatttatttatttatttatttatttattttgagatggagtctcgctctgtctcccaggctagagtgcagtggctcgatctcagctcactgcaagctctgcctcctgggttcacgccattctcctgcctcagactcctgagtagctgggactacaggcgcccaccaccatgcccggctaatttttttgtatttttttag-agagagggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcaatatcctgaccttgtgatctacctgcctcggcctcccaaagtactgggattacaggcatgagccaccgtgccctgcc i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85471163 316 - 162156779 GCTAgagc----ac----------------------------ttatttatttatttatttattttgagatggagtctcgctgtgtctcccaggctagagtgcagtggctcgatctcagctcactgaaagctctgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagactcctgagtagctgggactacaggcgcccaccaccatgcccggctaatttttttgtatttttttag-agagaaggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcaatatcctgaccttgtgatctacctgcctcggcctcccaaagtactgggattacaggcatgagcaaccgtgcccTGCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3627915 344 - 24206276 GCTAGAGC----ACttatttatttatttatttatttatttatttatttatttatttatttattttgagatggagtctcgctctgtctcccaggctggagtgcagtggctcgatctcagctcactgcaagctctgcatcccgggttcacgccattctcctgcctcaggctcctgagtagctgggactacaggcgcccaccaccatgcccggctaatttttttgtatttttttag-agagagggggtttcaccatgttagccaggatggtctcaatatcctgaccttgcgatctacctgcctcagcctcccaaagtactgggattacaggcatgagccaccgtgccctgcc i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46962681 64 - 64190966 -----------------------------------------------TAATTACTTACTCATT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGCATTTTCTGTCAAATATTTTCCCTTTTTTGGT-----------------------------------------------ACCCTATATTCCAC------------------------------------------------------- i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18986182 1497 + 108868599 I e calJac3.chr10 87778392 0 - 132174527 C a score=1125324.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 446443 614 + 478999 GCTAGAGCACTTATTTAAAA-CAAATACACTGTTTAGTTAAATCATATTAAGA---------------ATATCCTTTTATATTACAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAACAATTTTCAAACTTAAAAAA---TTTACTCCCCT---AAGACATtttttgaatatataaccttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatataaaccattgtac---tatgttatccattataaatattaaaaagtgaatttagaaaagaatgaaat---gtagtgatacatataaa-at-----gttatacactgactaaatatagataaattactatgttctttctatacttcagtggattatcatgtgcaccttctggaatgagtataccccaTGAAAACAATCTGAATTTTAAATATGAATTTTCTTCA---------------CAATGGACATTGTTTTTCTTTTTATTTAAACAAGGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATACGG--GAGTGA-TTTTAGACTAGCAATATTATCTTTAGTTATTCAGATGCA-CAAAAAGAACATTCATTCATTGAAGCTGTGATTAAAAAATTCTTTATCTATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCATTATCCTACTACTTATC--AAGCAGAGCAAAAAATAAAACT s panTro4.chr14 18763873 614 + 106544938 GCTAGAGCGCTTATTTAAAA-CAAATACACTGTTTAGTTAAATCATATTAAGA---------------ATATCCTTTTATATTACAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAGTAATTTTCAAACTTAAAAAA---TTTATTCCCCT---AAGACATtttttgaatatataaccttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatataaaccattgtgc---tatgttatccattataaatattaaaaagtgaatttagaaaacaacaaaat---gtagtgatacatataaa-at-----gttatacactgactaaatatagataaattactatgttctttctatacttcagtggattatcatgtgcaccttctggaatgagtatgccccaTGAAAACAATCTGAATTTTAAATATGAATTTTCTTCA---------------CAATGCACATTGTTTTTCTTTTTATTTAAACAAGGTTGGACTTACAAATCAAAGCAATATGG--GAGTGA-TTTTAGACTAACAATATTATTTTTAGTTATCCAAATGCA-CAAAAAGAACATTCATTCATTGAAGCTGTGATTAAAAAATTCTTTATCTATTTAAACCGAAGAGTATACACTTGCATTATCCTGCTACTTATC--AAGCAGAGCAAAAAATAAAACT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88062500 629 - 170124641 GCTGAAGCACTTATTTAAAA-C-AATACACTGCTTAGTTAAATCATGTGAAGA---------------ATATCCTTTCATATTATAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAGCAATTTTCAAACTTAAAAAA---TTTATTCCCGT---AAGACATtttttgactatataaccttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatatcaaccattgtactaatatgttatccattataaatgttaaaaagtgaatttagaaaagaataaaat---attgtgatatgtataaa-at-----attatacatctactaaatatagataaattactatgctcttcctgtacttcagtggattattatgtgcaccttctggaatgagtatacaccaTG-AAACAATCTGAATTTTAAATATGAATTTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTG-TTTTCTTTTTATTTAAACAAAGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATATGG--GAGTGA-TTTTAGACTAGCAATATTATTTTTAGTTATTCAAATGCA-AAAAAAGAACATTCATTCATTAAAGCTGTGATTAAAAAATTCTTTATCTATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCCTTATCCTATTACTTATC--AAGCAGAGCAAAAAATAAAACT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88341733 614 - 171882078 GCTGAAGCACTTATTTAAAA-C-AATACACTGCTTAGTTAAATCATGTGAAGA---------------ATATCCTTTCATATTATAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAGCAATTTTCAAACTTAAAAAA---TTTATTCCCGT---AAGACATtttttgactatataaccttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatatcaaccattgtactaatatgttatccattataaatgttaaaaagtgaatttagaaaagaataaaat---attgtgatatgtataaa-at-----attatacatctactaaatatggataaattactatgctcttcctgtacttcagtggattattatgtgcaccttctggaatgagtatacaccaTG-AAACAATCTGAATTTTAAATATGAATTTTATTCA---------------CAAGGCACATTG-TTTTCTTTTTATTTAAACAAGGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATATGG--GAGTGA-TTTTAGACTAGCAATATTATTTTTAGTTATTCAAATGCA-AAAAAAGAACATTCATTCATTAAAGCTGTGATTAAAAAATTCTTTATCTATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCCTTATCCTATTACTTATC--AAGCAGAGCAAAAAATAAAACT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85471479 615 - 162156779 GCTGAAGcacttatttaaaa-caaatacaccGCTTAGTTAAATCATGTGAAGA---------------ATATCCTTTCATATTATAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAGCaattttcaaacttaaaaaa---tttattccCAT---AAGACATTTTTTGACTATATAACCttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatatcAACCATTGTACTAATATGTTATCcattataaatgttaaaaagtgaatttagaaaagaataaaat---attgtgatatgtataaa-at-----attatacatctACTAAATATAGATAAATTACTATGCTCTTCCTATACTTCAGTGGATTATTATGTGCACCTTCTGGAATGAGTATACACCATG-AAAcaatctgaattttaaatatgaattttattca---------------CAAtgcacattg-ttttctttttatttaaacaagGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATATGG--GAGTGA-TTTTAGACTAgcaatattatttttagttattcaaatgca-aaaaaagaacattcattcattaaagctgtgattaaaaaattctttatctATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCCTTATCCTATTACTTATC--AAgcagagcaaaaaataaaact i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3628259 614 - 24206276 GCTGAAGTGCTTATTTAAAA-CAAATATACTGCTTAGTTAAATCATGTGAAGA---------------ATAGCCTTTCATATTATAGTTTGTATTTTGTTGTAGGCCAGCAATTTTCAAACTTAAAAAA---TTTATTCCCAT---AAGACATtttttgactatataaccttaaatgtatgcatatttatttataaagtatatatcaa-cattgtactaatatgttatccattataaatgttaaaaagtgaatttagaaaagaacaaaat---attgtgatatgtataaa-at-----attatacatctactaaatatagataaattactatgctcttcctatacttcagtggattattatgtacaccttctggaatgagtatacaccaTG-AAACAATCTGAATTTTAAATATGCATTTTATTCA---------------CAATGCACATTG-TTGTCTTTTTATTTAAACAAGGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATATGG--GAGTGA-TTTTAGACTAGCAATATTATTTTTAGTTATTCAAATGCA-AAAAAAGAACATTCATTCATTAAAGCTGTGATTAAAAAATTCTTTATCTATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCCTTATCCTATTACTTATC--AAGCAGAGCAAAAAATAAAACT i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87778392 608 - 132174527 GCTAGAGAACTTATTTAAAA-CAAATAAACTGTTTAGTTAAATTATATGAAAA---------------ATATCCTTTTATATTACAGTTCGTATTTTGTTGTAGGTCAGCAATTTTCAAGCTGAAAAAA---TTTATTCCCGT---AAGACATTTTTT-AGTGTGTAACCTTAAATGTATGCATATTTATTTTTAAAGTATATATAAACTATTGTAT--------TATCCATTATAAATATTAAACAGTGAACTTTGAAAAGAATCAAGT---GTAGTGATATGTATAAA-AT-----GTTAAACATTTACTAAATATAGATAAATCACTATGTTCTTTCTATACTTCCGTGGATTATCATATGCACCTTCCGGAATGAGTATACTCCATG-AAAAAATATGAATGTTAAATATGAGTTTTCTTCA---------------CAAAGCACGTTGTTTTTCTTTTTATTTAAACAAGGTTGAACTTACAAATCAAAGCAATACAG--AAGTGATTTTTAGACTGGCAATATTATTTTAAGTTATTCAACTGCACAAAAAAGAGCACTCATTCATGAAAGCTGTGATTAAAATATTCTTTATCCATTTAAACTGAATAGTATACACTTGCATTGTCCTACTACTTATCAAAAGAAGAGAAAAAAATAAA--- i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46962745 590 - 64190966 -----AGAGCTTACTTAAAAGCAACTGTGCTATTTAGTTAAATAGTATAGAGGAGCATATATATTGGTATATACTGGTATATATTGCATTATATTTTTCTGTAGATTAGCAATATTCAAACTCTAAGAATATTTCATACCTATGACAAAACATTTTTT-AAGATGT-ACCTTAAGTATATGCA-ATTTATTTATAAGT---------ACCATTATAT------------CAATATATATATCAAAAATAGTATTTTGAAAAGAATAAAATTAAAGCACAATATGTACAAATATGCACAATTATATACTTGTTATATATATAT-----ACTATATTCTGTTCACTCCTCAATGAATCATCATGTGTCCCTTCTTTAATGAGCATACCCCACTTTAATAGCCTGTGCCTTAAGTCTGTATTTTTCCCA---------------CAA------------------TAACTTAGA-AAGGTTCATCTTCTAATTTTAGGCTCTATAAATGAGTGATTTTTAGACTATCAATATTATTT----TTATTTAAGTACACAAAAAAGAATATCCACTGATTAAGGCTGAG-TTAGTAATTTCTTT----ATTTAAATGAAATAGAACACACTTGCATTCTTCCACTACTGGTC--AATCAGAACCAAAGAGAAAACT i canFam3.chr15 C 0 I 208 e ponAbe2.chr14 18986182 1497 + 108868599 I a score=119808.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 447057 63 + 478999 CACTCTAAACTTAAGTAATATAACTACAGG------TTAtttctcatctttgaaatggaagaataacac s panTro4.chr14 18764487 63 + 106544938 CACTCTAAACTTAAGTAATATAACTACAGG------TTAtttctcatctttgaaatggaagaataacac i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88063129 69 - 170124641 CACTCTAAACTTAAGTAATATAACCACAGgagcttttgttttctcatctttgaaatggaagaataagac i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88342347 69 - 171882078 CACTCTAAACTTAAGTAATATAACCACAGgagcttttgttttctcatctttgaaatggaagaataagac i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85472094 69 - 162156779 cactCTAAACTTAAGTAATATAACCACAGGagcttttgttttctcatctttgaaatggAAGAATAAGAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3628873 69 - 24206276 CACTCTAAACTTAAGTAATATAACCACAGgagcttttgtttgctcatctttgaaatggaagaataagac i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87779000 64 - 132174527 -ACTCTAAACT----TAATATAACTACAGGAGCTTTTGTTTTCTCATCTTAGAAATGGAAGAATAAGAC i calJac3.chr10 C 0 I 1927 s canFam3.chr15 46963543 64 - 64190966 CATTCTAAACTTAGG-----TAACCACGGTAACCTTAGTTTTCTTATCTTAGAGAGGAATTTGCTAAAC i canFam3.chr15 I 208 C 0 e ponAbe2.chr14 18986182 1497 + 108868599 I a score=630392.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 447120 348 + 478999 ---tacagtatctttatggctacttacagtgtatctatgctatgatcttatgaGTTGAGATAA-TGATATTTTAAAGTTTTATACTTGCAAATTTTATATTGTAG-----CATATTTTTTGTTAAAGGGCT----------GTATCTTGGGTGTCATACTTGGAA-CAGAGAAAGAAATGTGTTGTGAGTTTATTAGTATTTGAAACTCAAAAAGTGCTAAATAAGCTGCATG---CAGGTGTGGAGTGGCCACAGGAGTGGTGTTCAAACAGAGTTACAGCTGGAGCACTGTGCCTGTGTTAGGTCAAAAGTGGAGCTATAGCTTGGGATTCTCGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATTCAAGGATATCA s panTro4.chr14 18764550 348 + 106544938 ---tacagtatctttatggctacttacagtgtatctatgctatgattttatgaGTTGAGATAA-TGATATTTTAAAGTTTTATACTTGCAAATTTTATATTGTAG-----CATATTGTTTGTTAAAAGGCT----------GTATCTTGGGTGTCACACTGGGAA-CAGAGAAAGAAATGTGTTGTGAGTTTATTAATATTTGAAACTCAAAAAGTGCTAAATAAGCTGCATG---CAGGTGTGGAGTGGCCACAGGAGTGGTGCTCAAACAGAGTTACAGCTGGAGCACTGTGTCTGTGTTAGGTCAAAAGTGGAGCTATAGCTTGGGATTCTCGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAGGATATCA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88063198 344 - 170124641 ---tacagtatctttatgggtacttacagtgtatctatgctatgattttatgaGTTGAGATAA-TGACATTTTGATGTTTTATATTTGCAAATTTTATATTGTAG-----CATATTGTTTGTTAAAAGGCT----------CTGTCTTGGGTGTCATACTGGGAA-GAGAGAAAGAAATGCGT--TGAGTTTATTAGTGTTTGAAACTC-AAAAGTGCTAAATAAGCTGCATG---CAGGTGTGGAGTGGCCACAGGAGTGGTGCTCAAACAGAG-TATGGCTGGAGCACTATGTCTGTGTTAGGTCAAAAGTGGAGCTACAGCTTGGGATTCTGGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAAGATATCA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88342416 344 - 171882078 ---tacagtatctttatgggtacttacagtgtatctatgctatgattttatgaGTTGAGATAA-TGACATTTTGATGTTTTATATTTGCAAATTTTATATTGTAG-----CATATTGTTTGTTAAAAGGCT----------CTGTCTTGGGTGTCATACTGGGAA-GAGAGAAAGAAATGCGT--TGAGTTTATTAGTGTTTGAAACTC-AAAAGTGCTAAATAAGCTGCATG---CATGTGTGGAGTGGCCACAGGAGTGGTGCTCAAACAGAG-TATGGCTGGAGCACTATGTCTGTGTTAGGTCAAAAGTGGAGCTACAGCTTGGGATTCTGGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAAGATATCA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85472163 333 - 162156779 ---TACAGTATCTTTATGGGTACTTACAGTGTATCTATGCTATGATTTTATGAGTTGAGATAA-------------GttttatatttgcaaattttatatTGTAG-----CATATTGTTTGTTAAAAGGCT----------CTGTCTTGGGTGTCATactgggaa-gagagaaagaaatgtgt--tGAGTTTATTAGTATTTGAAACTCAAAAAGTGCTAAATAACCTGCATG---CAGGTGTGGAGTGGCCACAGGAGTGGTGCTCAAACAGAG-TATGGCTGGAGCACTATGTCTGTGTTAGGTCAAAAGTGGAGCTACAGCTTGGGATTCTGGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAGGATATCA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3628942 342 - 24206276 ---tacagtatctttatgggtacttacagtgtatctatgctatgattttatgaGTTGAGATAA-TGACATTTTGAAGTTTTATATTTGCAAATTTTATATTGTAG-----CATATTGTTTGTTAAAAGGCT----------CTGTCTTGGGTGTCATACTGGGAA-CAGAGAAAGAAATGTGT--TGAGTTTATTAGTATTTGAAACTCAAAAAGTGCTAAATTAGCTGCATG---CAGGTGTGGTGTGGCCACAAGAGTGGTGCTCAGA---GT-TATGGCTGGAGCACTATGTCTGTGTTAGTTCAAAAGTGGAGCTACAGCTTGGGATTCTGGTGAACAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAGGATATCA i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87780991 347 - 132174527 ---taCAGTATCTTTATGGCTCCTTATGGTGTATCTATGCTGTAATTTTGTGAGTTGAAATCA-TGACA-TTTAAAGTATTATACTTGCAAATTTTATATTGTAGCATATCATATTGTTTGTTGAAAGGCT----------CTA-CATGGGTGTGATACTGGGAA-CAGAGAAATAAATGTATTGTGAGTTTATTAGTATTTGAAACTCAAAAAGTGCCTAATAAGCTCCATG---CAGGTGAGGAGTAGCCATAGGAGTGGTGCTCAGATT----TATAGCTGGAGTACTATGTTTGTATTAGGTGAAAAGTGGAGCTATAGCTTGGGATTCTGGTGAATAGTCTGGGAAAAGAGT-ATACAAGGATGTCT i calJac3.chr10 I 1927 C 0 s canFam3.chr15 46963607 365 - 64190966 TGTAATAGGATCTTTATTGTTACTCCTATCTATTCTATGCTATGATTTTATGCATTGACATAACTTATTTTTTAAAATGGTATATTGGAAAATTTTGTATTGCAG-----TGTATTGTTTGTTGAAAGGCTAAAGGCTCTCCTCCCTTGACTGTTACAACGGACATCAGAGAATTAAGGATACCGAAAGTATAGAAGTAACTGAGATTTAGATAGTGTTAATTAAGCTGCATGAACAAGGTATGGAG-GGCTACATAAGTGGTATTTAACCAGGAATATAACTATGTGAATGTAACTAAGTTACATGGAAAGTAGAGTTATCA-TTGGAATCCTGATTATCAGTTTGGAGTCAGGGTAATAGAAGGACACCA i canFam3.chr15 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18986182 1497 + 108868599 I a score=648970.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 447468 266 + 478999 GACCAAAAGGAGTATAGTAAGAAGTAAATTAGATGATAAGACAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGGAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAACTGTCTAGGAAAATTTGGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAATCCCAAGAAAAGAACTAACCCTCAAGCATAGTATATCCA-AAAAACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTCTCCATTAGGAAA---CTTAC-ATGATTTAGGAATGT s panTro4.chr14 18764898 267 + 106544938 GACCAAAAGGAGTATAATAAGAAGTAAATTAGATGATAAGACAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGGAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTAGGAAAATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAATCCCAAGAAAAGAGCTAACCCTCAAGCATAGTATATCCACAAAAACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTCTCCATTAGGAAA---CTTCC-ATGATTTAAGAATGT i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18987679 267 + 108868599 GACCAAAAGGAGTATAATAAGAAGTAAATTAGATGATAAGAGAAAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGGAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTAGGAAAATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAGTCCCAAGAAAACAGCTAACCCTCAAGCATAGTATATCCACAAAAACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTCTCCATTAGGAAA---CTTAC-ATGATTTAAGAATGT i ponAbe2.chr14 I 1497 C 0 s rheMac3.chr7 88063542 266 - 170124641 GACCAGAAGGAGTATAATAAGAAGTACATTAGATGATTAGTCAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGAAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTA-GAAGATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAATCCCAAGAAAAGAGCAAAGCCTCAAGCACAGTATATCCACAACAACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTTTCCATTAGGAAA---CTTGA-ATGATTTAAGAATGT i rheMac3.chr7 C 0 I 159 s macFas5.chr7 88342760 266 - 171882078 GACCAGAAGGAGTATAATAAGAAGTACATTAGATGATTAGTCAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGAAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTA-GAAGATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAATCCCAAGAAAAGAGCAAAGCCTCAAGCACAGTATATCCACAACAACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTTTCCATTAGGAAA---CTTGA-ATGATTTAAGAATGT i macFas5.chr7 C 0 I 138 s papAnu2.chr7 85472496 264 - 162156779 GACCAGAAGGAGTATAAT---AAGTACATTAGATGATTAGTCAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGAAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTAGGAAGATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAATCCCAAGAAAAGAGCTAAGCCTCAAGCACAGTATATCCACAAAAACTCAAAGACTTTCAGATTCAAAGTTAGGCTGTGTCTCCATTAGGAAA---CTTGA-ATGATTTAAGAATGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3629284 264 - 24206276 GACCAGAAGGAGTATAATAAGAAGTACATTAGATGATTAGTCAGAGGGCAAGGAAGAGAGTTACCAGCTAGGAACTGGAAATTACACAGGAATTG--AGGGAAGAAAATGTCTAGGAAAATTTTGGGGTGGTGTGGACAAGGAGAAAAAGGGTCTAGTCCCAAGAAAAGAGCTAAGCCTCAAGCACAGTATATCCAC---AACTCAAAGACCTTCAGATTTGAAGTTAGGTTGTGTTTCCATTAGGAAA---CTTGA-ATGATTTAAGAATGT i chlSab2.chr29 C 0 I 23 s calJac3.chr10 87781338 254 - 132174527 GACCAG-AGGAGTATAA-ATGAAGCAGATCAGATGATAAGACAGAAGTCAAGGAAGAGAGTTACTATATATGAACTGGGAATTACACAAAAACTG--AGGGAAGAAAATGTCTAGCAAAATTTTGGGGTTGTGTGGACAAGTATAAAAAGGGTC-AATCCCAAGAAAAGAGCTAAGACTCAAACACAGTATATCCACAGAAACTCAAAGACC-----------AGTTAGGTTGTTTATCCATCAGGAAA---CTTAATGTGATTTAAGAATGT i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46963972 257 - 64190966 GACTAGAGGAGGTTCATAGAAGAATTAATAAGAGAAT---ACAGAGGGCAAGGCAGAGAGTTAGTAGGCAAGAAGGAGGAACTCCACAGAAATGGGAAAAAAAGGAAATACTTAGGAAAAAAATGGACTTGAATGA--------AAAAAAGGTATAATTACAAGAAAATAGCTAAGTCTCAAGCACAGTATAACCATAAAAATGCAAAGATCTTAA----TAGAGTTATGTTGTATCTCAAATAGGAAACTTCTTAT-ATGACTTAGGAAGGC i canFam3.chr15 C 0 C 0 a score=484015.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 447734 198 + 478999 AGGAATCCCAACGTGGAGGATACCAGACTCCTAACATGGAAAATGATTCTGTAGAAGCACATGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACCATATTTTGTTTTCATTTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----CAGAGTTTCCCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA s panTro4.chr14 18765165 198 + 106544938 AGGAATCCCAACGTGGAGGATACCAGACCCCTAACATGGAAATTGATTCTGTAGAAGCACATGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACCATATTGTGTTTTCATTTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----TGGAGTTTCCCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18987946 197 + 108868599 AAGAATCCCAACGTGGAGGATACCAGACTCCTAACATGGAAAATTATTCTGTAGAAGCACATGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACCATATTTTGTTTTCATTTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----TGGAGTTT-CCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88063967 185 - 170124641 AGGAATCCCAGCGTGGAGGATGCCAGACTCCTGACATGGAAAATGATTCTGTAGAAGCACGTGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACTGTATTTTG-------TTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----------TTACCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i rheMac3.chr7 I 159 C 0 s macFas5.chr7 88343164 185 - 171882078 AGGAATCCCAGCGTGGAGGATGCCAGACTCCTGACATGGAAAATGATTCTGTAGAAGCACGTGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACTGTATTTTG-------TTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----------TTACCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i macFas5.chr7 I 138 C 0 s papAnu2.chr7 85472760 191 - 162156779 AGGAATCTCAGCAGGGGGGATGCCAGACTCCTAAGGTGGAAAGTGATTCTGTAGAAGCACGTGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGaactgtattttg-------ttttcattttaaatttggaGAAATTAAGGTAA----TGGAGTTTACCCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3629571 185 - 24206276 AGGAATCCCAGCGTGGAGGATGCCAGACTCCTGACATGGAAAATGATTCTGTAGAAGCACGTGGTTGAATGGGAATAAAACTGTAGCTTTGAGAACTGTATTTTG-------TTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----------TTACCCAGAATA--GGAGAGGGGTGGGAAGTGTTGTTTTTAGCTGAAGTA i chlSab2.chr29 I 23 C 0 s calJac3.chr10 87781592 188 - 132174527 AGGAATCCCAACATGGAGGATGCCAGACTCCTAAAGTGGAAAATGATTCTGTAGAAGCATGTGGTTGAATGGGAATAAAATTGTAGCTTTGAGAACAGTATTTTG-------TTTTCATTTTAAATTTGGAGAAATTAAGGTAA----TGGAGTTTACTCAGAATA--GGAGAGGGATGGGAAA---TGTTTTTAGCTGAAGTA i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46964229 200 - 64190966 AGGAATCCCAAGGTGCAGGATTCCAAATTCTTAAAGTAGAGAGCAATTCTATAGAAGTGCATGGTTGGATGGGAATAAGAGTTGTGGTATGAAAGCAGTATTTTTGTTGGGTTGCCTGCTTTAAATTTGGAT--CTTAACAGAAGGTTTGGAGTTTACCTAAGATGTTGGAGAGGGTTGAGAGACG--ATTTTTAACTGATGTG i canFam3.chr15 C 0 I 166 a score=3401327.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 447932 1167 + 478999 CTATATGTGCCAAATATTTTT--TAGCTGTAGAACTAGTATCTAGTTGGA--------AGACATAGCAATAACAATTAATTCTGCTTCTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTCGTTTGACCCAGTTTCGAGATATTTAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCTTCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACTGCTACATCACCATCTGCCTGCCTCTGCAGTATTCAACTGTCATGAACTCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCATCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAATAGTGGCCTGATGACACTCATGTGCTTTCTGGGACTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGCGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGTGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCCGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTCTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCATAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAACACATAGCCTGAAAAA--------GGGCaaaaaaaaaaaaaagaataaaaaT---AGACTGTAGAATTTTATCT------------------GAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGTACTGCAAtcattgaatacctcccatttgtcaggactattctaggaactgaagaaagaa-----------------------------------------------------------agtattga s panTro4.chr14 18765363 1164 + 106544938 CTGTATGTGCCAAATATTTTT--TAGCTGTATAACTAGTATCTAGTTGGA--------AGACATAGTAACAACAATTAATTCTGCTTCTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCAAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAAGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCCGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGCGAAGAAGATAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCTACTGTCATGAACCCTAGAACCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCGACACATTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACGTGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATAGCCTGAAAAA--------GGGCAAAAAAAAAAAAAAGAATAAAAAT---AGAC--TAGAATTTTATCT------------------GAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGTACTGCAAtcactgaatacctcccatttgtcaggactattctgggaactgaagaaagaa-----------------------------------------------------------atta-cga i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18988143 1163 + 108868599 CTGTATGTGCCAAATACTTTT--TAGCTGTAGAACTAGTATCTAGTTGGA--------AGACATAGTAATAAC----AATTTTGCTTCTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTGGTTTGACCCAGTCTCGAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTACTATTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGCCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCATCATTGTGGCTCCCCGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGTGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCGACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTCGGGGGTTTTGTCCACTGCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACACGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTCGTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCGAAAAACAAGGCCATGTCCACGTGCACCAACCGTATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTTTCTTCCACACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATAGCCTGAAAAA--------GGGCAAAAAAAAAAAAAAGAATAAAAAT---AGACTGTAGAATTTTATCT------------------GAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGTACTGCAAtcattgaatacctcccatttgtcaggactattctaggaactgaagaaagaa-----------------------------------------------------------attactga i ponAbe2.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88064152 1160 - 170124641 CTGTATGTGCCAAATATTTTT--TAGCAGTAGAACTAGTATCTAGTTGGAAGACAAAGAGACATAGTAATAACAATTAATTCTGCTTGTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACGGAACAGTGATAACAGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTTGAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATTTTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGACTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCAGCCTCTGCACTATTTAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTTCACTCCATTATCCAGGTGGTCTTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGCGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCGAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCATACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTACACTCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATAGCCTGAAAAA--------GGG---------------GGGGAAAAAT---AGAGTGTAGAATTGTATCT------------------GAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGCACTGCAATCCttgaatacctcccatttgtcaggactattctgggatctgaagaaagaa-----------------------------------------------------------attaatga i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88343349 1160 - 171882078 CTGTATGTGCCAAATATTTTT--TAGCAGTAGAACTAGTATCTAGTTGGAAGACACAGAGACATAGTAATAACAATTAATTCTGCTTGTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACGGAACAGTGATAACAGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCGAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATTTTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGACTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCAGCTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTTCACTCCATTATCCAGGTGGTCTTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGCGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCGAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACATGCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCATACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTACACTCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATAGCCTGAAAAA--------GGG---------------GGGGAAAAAT---AGAGTGTAGAATTGTATCT------------------GAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGCACTGCAATCCttgaatacctcccatttgtctggactattctaggatctgaagaaagaa-----------------------------------------------------------attaatga i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85472951 1156 - 162156779 CTGTATGTGCCAAATATTTTT--TAGCAGTAGAACTAGTATCTAGTTGGAAGACACAGAGACATAGTAATAACAATTAATTCTGCTTGTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACGGAACAGTGATAACAGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCGAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGctagttttaattttctacttcATCATCCTCCCTGgaaattttctcattattttcaccATAAGGTCAGACCCTGGACTCACAGCCcccctctatttctttctgggCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCgttggaggaggggagggattACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTTCACTCCATTATCCAGGTGGTCTTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAATCAACTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTAGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGCGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCGAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGCGCCCTTTCAGG------------GACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCATACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTACACTCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATAGCCTGAAAaaggcgggggggg---------------gggtggaAAT---AGAGTGTAGAATTGTATCT------------------GAAattgatttgtttatttccaAGCACTGCAATCATTGAATACCTCCCATTTGTCAGGACTATTCTAGGatctgaagaaagaa-----------------------------------------------------------attaatga i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3629756 1161 - 24206276 CTATAGGTGCCAAATATTTTT--TAGCAGTAGAACTAGTATCTAGTTGGAAGACACAGAGACATAGTAATAACAATTAATTCTGCTTGTTAATGTACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCGAGAACGGAACAGTGATAACAGAGTTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCGAGATATTCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATTTTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGACTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCACTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGACGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTACACTTCCTTGGAGGCGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCACCATCTGCCGGCCTTTGCACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGACCCTGCTATGCAATGTTGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTTCACTCCATTATCCAGGTGGTCTTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAATCAACTGGATAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCAACACGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTTCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTCTTTGTCGCATACGAGGGTCTTCTTCTGAGGCGAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTTATCTACACGCGCCCC-TCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCATACAGTGATTTTTCCTTTGTTGGATCCTGTCATTTACACTCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGTACATAGCCTGAAAAA------GAGGG---------------GAAAAAAAAT---AGAGTGTAGAATTGTATCT------------------GAAATTGATCTGTTTATTTCCAAGCACTGCAAtcattgaatacctgccatttgtcaggactattctaggatctgaagaaagaa-----------------------------------------------------------attaatga i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87781780 1240 - 132174527 CTATATGTGCCAAATATTTTT--TAGCTGTAGAACTAGTATCTAGTTGGA--------AGACATAGTAATAACAATTAATTCTGCTTGTTCATATACTGCAGGCCAGGGAAATGGAAAGCAAGAACAGAACAGTGATAACAGAATTCATCCTTCTTGGTCTGACCCAGTCTCGAGATATGCAGCTCCTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACTTTATCATCCTTCCTGGTAATTTCCTCATCGTTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCACTCTACTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCTTCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGCTTGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTTTACACTATTCAACTGTTATGAACCCTAGAGCCTGTTATGCAATGTTGTTGGCTTTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTGTCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCGACACGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCTTGTGCTTCCTGGGGCTTCTGACCTCCTATGCAGTCATTCTGTGTCGTATACGGGGGTCTTCCTCTGAGGGGAAAAACAAGGCCGTGTCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATGTTCCTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATTTACACACGCCCCTTCCGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACTGTGATCTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAGCACATGGCCTGAAAAA--------AGG----GCAAAATAAAAGAATAAAAAA---AGACTGTAGAATTTTATCTGAAATTGATTTGTTTATGGAAATTGATTTGTTTATTTCCAAGTACTGCAATCATTGAACACATCCCATTTGTCAGGACTATCCTAGGAACAGAAAAAAGAAATATGAATGAGAGATAAGTTCTGTCTGCTATCCAAGTGATTCAACCTAGTAAAAGAaacattgaaaa i calJac3.chr10 C 0 C 0 s canFam3.chr15 46964595 1158 - 64190966 ccagATATGTCAAATATTTTTAGTTGGAGAAGAGTGAGGATCTAGCTGGA--------AGAAATAGTAATAACAATGAAATCTGCTTCTTGATGTACTGCAGGCAGAGGAGATGGAAAATAACAACAGTACGGTGGTGAAAGAATTCATCCTTCTTAGTCTAACCCAGTCTCGAAATATTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATCTTCTATTTCATCATCCTCCCTGGAAACTTCCTCATCATCCTCACCATCAGAACAGATCCTGGCCTCACAGCCCCCCTCTACTTCTTTCTGGGCAACTTGGCTTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGCTGGTGGACTTCCTTTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGGGGTTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAAGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATTGCCATCTGTCGGCCTTTACACTATTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCCTTGCTATTGGCTCTGTGGCTTGGAGGCTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGCCCTCATCCTCCGCTTGCCCTTCTGTGGCCCAAACCGACTGGATAACTTCTTCTGTGATGTGCCGCAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACGGACACCTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAATAGTGGTCTGATGACCCTCTTGTGCTTCCTGGGCCTTCTGGCCTCATATGCAGTGATCCTCTGCCGTGTACATGGGTCCTCCTCTGAGGGGAAGAACAAGGCAGTATCCACATGCACCACCCATATCATTGTTATATTTCTTATGTTTGGGCCCGGCATCTTCATCTACACTCGCCCCTTCAGAGCCTTCCCAGCTGACAAAGTGGTTTCTCTTTTTCACACAGTGATCTTTCCTTTGTTGAATCCTGTGATTTATACCCTTCGTAACCAGGAAGTAAAAGCTTCTATGAAGAGGCTATTTAATCAGAATAGAGCCTAATTAT--------GGG--------AAAAAAAGAATAAAAATTCAAGACCAGAGAATTTTCTTT------------------GAAATTAATATATTCATTTCTAAACACTGCATTTATTGAGCAT------TTCATGGGGGCTATTTTAGACAATGGGAGAGATA-----------------------------------------------------------GCTATTAA i canFam3.chr15 I 166 N 0 a score=1049471.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 449099 447 + 478999 ggcagataaggtctatctgctctc------------caagagatacaacctagtaaaaatagaccgccgttaaggtagaaaat-aaacagcatagtttcaggaagagatactgctctgtaaaaactaaaacgaaaagtgaaatgataaactgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataataaaaaaaggc---cttgaagagctgacattttggatcatatctggataaactgaagaagccaaacatgcaaacatttgtggctatagtatggtagacagagggcacaggcagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttggtatatttgaagaatacaataaagtccatgttaccaagaatatagtaatttaatgtgaaaatgattaaacttaaagttagagatactggtagtgtcaaaaacatat-ggtctacatagtaaatgtgagttt s panTro4.chr14 18766527 447 + 106544938 ggcagataaggtctatctgctctc------------caagagatacaacctagtaaaaatagaccgccattaaggtagaaaat-aaacagcatagtttcaggaagagatactgctctgtaaaaactgaaaagaaaagtgaaatgataaattgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataatcaaaaaaggc---cttgaagagctgacgttttggatgatatctggataaactgaagaagacaaacatgcaaacatttgtggttatagtaatctagacggagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttggtatatttgaagaatacaataaagtccatgttacccggaatatagtaatttaatgtgaaaatgattaaacttaaagttggagatactggtagtgtcaaaaacatat-ggtctacatagtaaatatgagttt i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18989306 447 + 108868599 ggcagataaggtctatcttctctt------------caagagatacaacctagtgaaaatagaccaccgttaagatagaaaat-aaacagcatagtttcaggaagagatactgctctgtaaaaactaaaaagaaaagtgaaatgataaattgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataatcaaaagaggc---cttgaagagctgacattttggatcatatctggataaactgaagaagccaaacatgcaaacatttgtggctataatattctagacagagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttgatatatttgaagaatacaataaagtccatgttaccctgaatatagtaattcaatgtgaagatgattaaacttgaagttggagaTACTGGTAGTGTC-AAGACATATGGGTCTACATAGTAAATATGAGTTT i ponAbe2.chr14 C 0 I 733 s rheMac3.chr7 88065312 459 - 170124641 ggcagataaggtctatctgctctctaagagatataacaagagatataacctagtaaaaatagaccaccattaaggtagaaaat-aaacagcatagtttcaggaagagatattgctctgtaaaaactaaaaagaaaagtgaaatgataaattgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataatcaaaaaaggc---cttgaggagctgacgttttggatcatatctagataaactgaagaagccaaacatgcaaacatttggggctatagtattctagacagagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttggtatatttgaggaatatgattaagtccatgttacccagaatatagtaatttaacgtgaaaatgattagatttaaagttggagatactggtagtgtcaaaaacatat-ggtctacatagtaaatatgagttt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88344509 459 - 171882078 ggcagataaggtctatctgctctctaagagatataacaagagatataacctagtaaaaacagaccaccattaaggtagaaaat-aaatagcatagtttcaggaagagatattgctctgtaaaaactaaaaagaaaagtgaaatgataaattgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataatcaaaaaaggc---cttgaggagctgacgttttggatcatatctagataaactgaagaagccaaacatgcaaacatttggggctatagtattctagacagagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttggtatatttgaggaatatgattaagtccatgttacccagaatatagtaatttaacatgaaaatgattagatttaaagttggagatactggtagtgtcaaaaacatat-ggtctacatagtaaatatgagttt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85474107 459 - 162156779 gGCAGATAAGGTCTATCTGCTCTCTAAGAGATATAACAAGAGATATAACCTAGTAAAAATAGACCACCATTAAGGTAGAAAAT-AAACAGCATAGTTTCAGGAAGAGATATTGCTCTgtaaaaactaagaagaaaagtgaaatgatAAATTGTGACTCTGGATTGGGAGTAACCAATTTGTGTTTAATAATCAAAAAAGGC---CTTGAGGAGCTGACGTTTTGGATCATATCTAGATAAACTGAAGAAGCCAAACATGCAAACATTTGGGGCTATAGTATTCTAGACAGAGGGCACAGGTAGTGCAAAAACTCAAAGATGATGATGAACTTGGTATATTTGAGGAATATGATTAAGTCCATGTTACCCAGAATATAGTAATTTAAGGTGAAAATGATTAGATTTAAAGTTGGAGATACTGGTAGTGTCAAAAACATAT-GGTCTACATAGTAAAtatgagttt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3630917 459 - 24206276 ggcagataaggtctatctgctctccaagagatataacaagagatataacctagtaaaaatagaccaccattaaggcagaaaat-aaacagcatagtttcaggaagagatattgctctgtaaaaactaaaaagaaaagtaaaatgataaattgtgactctggattgggagtaaccaatttgtgtttaataatcaaaaaaggc---cttgaggagctgacattttggatcatatctagataaactgaagaagccaaacatgcaaacatttggggctatagtattctagacagagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatgatgatgaacttggtatatttgaggaatatgattaagtccgtgttacccagaatatagtaatttaatgtgaaaatgattagatttaaagttggagatactggtagtgtcaaaaacatat-ggtctacatagtaaatatgagttt i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87783020 446 - 132174527 gacggatgaggtttgtctgctctc------------caagagatacaacctagtaaaaatag----ccgttaaagtagaaaataaaacagcatagtttcaggaggagatactgctctgtaaaaatgaaaaagaaaagtgaaatgatagattgtgactctgaattgggagtaaccagtttgcatttaatcatcaaaaaaggccttcttgaggagctgacattttggatcatatctggataaactgaaggag-taaacatgcaaacatttgagtctatagtattctagacagagggcacaggtagtgcaaaaactcaaagatggtaatgaacttggtatatttgagggatgcaataaagttcaagttacctggaatatagtaatttaatgtgaaaatgattagacttaaatttggagatactggtagtgtctaaaacatat-ggtctacatagtaattatgagttt i calJac3.chr10 C 0 C 0 a score=730931.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 449546 429 + 478999 tcattttattacaattacaataagaagccattc--tgtggctttaagcaaaagagtgaTTCCTCTACTGAAGGGTCATAAATGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCAGATATCAAAGAGTTGAAAAATATCATTAAGAGGAAAATATTATATTTGTAAGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTACATACATAAGCAGAGAGTGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTACTGAAAAAGATCA-AAAAAAATTTTAC--T--TTTTTTTTCTGGAGCTTCATTATTAATCCTAGCAAATTTTTATGACTTTTAGCTGTATGTTTGACCTTATTGCCAATTGATTTCACTGTAAGTTTAATAATGACAGTCTTTTCATAGaccaatcaggattttgtgtcagagagaagaaaccattccag s panTro4.chr14 18766974 430 + 106544938 tcattttattacaattacaataagaagccattc--tgtggcattaagcaaaagagtgaTTCCTCTACTGAAGGGTCATAAACGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCGGATATCAAAGACTTGAAAAATATCATTAAGAGGAAAATATTATATTTGTAAGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTACATAAATAAGCAGAGAGTGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTACTGAAAAAGATCACAAAAACATTTTAC--T--TTTTTTTCCTGAAGCTTCATTATTAATCCTAGCAAATTTTTATGACTTTTAGCTGTATGTTTGACCTTATTGCCAATTGATTTCACTCTAAGTTTAATAATGACAGTCTTTTCATAGACcaatcaggattttgtgtcagagagaagaaaccattctag i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88065771 428 - 170124641 taatttt------attacaataagaagtcattctttgtggctttaagcaaaagagtgaTTCCTCTACTGAAGGTTCATAAATGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCAGATATCAAAGAGTTTAAAAATATCATTAAGAGGAAAATATTATATTTGTAAGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTCCATAAATAAGCGGAGAGTGGCAAAAGAAAGTTGATTACTTTTATTGAAAAAGGTCACAAAAACATTTTACTTT--TTTTTTTTCTAGAGCTTCATTATTAATGCTAGCAAATTTTTATGACTTTTAGCTGTATGTTTGACCTTATCGCCAATGGATTTCACTCTAAGTTTAATAATGATAGTCCTTTGGTAGACcaatcaggattttgtgtcagagagaagaaaccattctag i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88344968 424 - 171882078 taatttt------attacaataagaagccattc--tgtggctttaagcaaaagagtgaTTCCTCTACTGAAGGTTCATAAATGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCAGATATCAAAGAGTTTAAAAATATCATTAAGAGGAAAATATTATATTTGTAAGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTCCATAAATAAGCAGAGAGTGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTATTGAAAAAGGTCACAAAAACATTTTAC-TT--TTTTTTTTCTAGAGCTTCATTATTAATCCTAGCAAATTTTTATGA-TTTTAGCTGTATGTTTGACCTTATCGCCAATGGATTTCACTCTAAGTTTAATAATGATAGTCCTTTGGTAGACcaatcaggattttgtgtcagagagaagaaaccattctag i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85474566 425 - 162156779 taatttt------attacaataAGAAGCCATTC--TGTGGCTTTAAGCAAAAGAGTGATTCCTCTACTGAAGGTTCATAAATGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCAGATAccaaagagtttaaaaatatcattaagaggaaaatattatatttgtaaGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTCCATAAATAAGCAGAGAGTGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTATTGAAAAAGGTCacaaaaacattttac-tt--ttttttttctagagcttCATTATTAATCCTAGcaaatttttatgacttttagCTGTATGTTTGACCTTATCGCCAATGGATTTCACTCTAAGTTTAATAATGATAGTCCTTTGGTAGACCAATCAGGATTTTGTGTCAGAGAGAAGAAACCATTCTAg i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3631376 425 - 24206276 taatttt------attacagtaagaagccattc--tgtggttttaagcaaaagagtgaTTCCTCTACTGAAGGTTCATAAATGACTTAGGGCTGTAAACTCAAGATTCTATGCAGATATCAAAGAGTTTAAAAATATCATTAAGAGGAAAATATTATATTTGTAAGTGCACTTTGAAAGATATTAAACTACCAATTTTTCTTCCATAAATAAGCAGAGAGTGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTATTGAAAAAGGTCACAAAAACATTTTAC-TT--TTTTTTTTCTAGAGCTTCATTATTAATCCTAGCAAATTTTTATGACTTTTAGCTGTAGGTTTGACCTTATCGCCAATGGATTTCACTCTAAGTTTAATAATGATAGTCCTTTGGTAGACcaatcaggattttgtgtcagagagaagaaaccattctag i chlSab2.chr29 C 0 C 0 s calJac3.chr10 87783466 430 - 132174527 taattttattacagttgaaataagaaatcattc--tgttactttaagcagaagaatgaTTCCTCTACTGAAGGTTCATAAATGACTCAGGGCTACAAACTCAAGATTCTGTGCAGATATCAAAGCATTGAAAAATATCATTGAGAGG-AAATATTATACTTGTAAGTATACTTTGAAAGGTATTAAACTACCAATATTTCTTCCATAAATAAGCAAAGAATGGCAAAAGAAAGCTGGTTACTTTTATTGAAAAAGGTCACAAAATCATTTTAC-TTCGTTTTTTTTCTAGAGTGTCATTATTAATCCTAGCAAATTTATATGACTTTCAGCTGTATGTTTGATCTTATTGCCAGTTGATTTCACTATAAGTACAATGATGACTGTCCTTTGGTAGACCAATTAGGATTCTGTGTC--AGAGAAGAAATCATTCTAG i calJac3.chr10 C 0 I 238 e ponAbe2.chr14 18989753 733 + 108868599 I a score=5595.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 449975 4 + 478999 ctat s panTro4.chr14 18767404 4 + 106544938 ctat i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88066199 4 - 170124641 ctat i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88345392 4 - 171882078 ctat i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85474991 4 - 162156779 ctat i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3631801 4 - 24206276 ctat i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e ponAbe2.chr14 18989753 733 + 108868599 I e calJac3.chr10 87783896 238 - 132174527 I a score=50566.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 449979 30 + 478999 tttaaacaaaacatcatttaatatcaagag s panTro4.chr14 18767408 30 + 106544938 tttaaacaaaacatcatttaatatcaagag i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88066203 30 - 170124641 tttaaacaaaacatcatttaatatcgagag i rheMac3.chr7 C 0 I 2 s macFas5.chr7 88345396 30 - 171882078 tttaaacaaaacatcatttaatatcgagag i macFas5.chr7 C 0 I 2 s papAnu2.chr7 85474995 30 - 162156779 tttaaacaaaacatcaTTTAATATCGAGAG i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s chlSab2.chr29 3631805 30 - 24206276 tttaaacaaaacatcatttaatatcgagag i chlSab2.chr29 C 0 I 2 s calJac3.chr10 87784134 29 - 132174527 tttaaacaaaa-attatttaatatagggaa i calJac3.chr10 I 238 I 2 e ponAbe2.chr14 18989753 733 + 108868599 I a score=6317567.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 450009 2829 + 478999 aggtgttcacaaaatcactgccaagtctagaagagcagactataggctggaca-cccagagatgacttacagactaacacaggtgacctatgttgtcagggaagttgttcttgctacaatcTTAGCCATCTGTTGTCTG--AAAAACACTACAATTTTAGCCATGTGCCTGGGATCAAGTTGATGATCCGGAATCACTTTGGACCTAACAAATCGCCCCTAGTATAACAGAAGCCTATCCTACTGCCTCCCT--TTAACTAGCTTACTACATAttcaaatctcaaatgagtgcattaaatgggcagcatccaaaacatctggaaccccaaatgcaagggggtcaaaaattgagttttAAAATATTTT-----------------------------------ATTTTTGATAAAAACCAAAGTTTATACTTAGGAATATAAATTTTGTACATGGTAAAAATATTC--AGACTATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctctattatcactctgtttattgtgttgcttcctgttttactgagaaaggtaacaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactataca---acctgcatctgtgattaagtttcctttaacttctcctgaaactgggtgacctgatcctgctcctacagaagtaaacccttccacctgtgcaccagattccatcccg-tcctctctactaaaggcaattactctgg----taactctcctttctctcacc----tataacatgaactttgtcctccctattgggtgtaacctttagcgtgtaaccgcatttattccctcctaaataaaaccttcttgccaccttttcccctgtccatgtcacttcatgagtctttgtgtctccacatgaattttaggatttttaaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgtattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatattttaacaatattaattgttctattccattaacacagaaagtctttccgtttatttccatctgctttaatttctttcatcaatgttttacag-tttaagtgtacaagtctttcacctctttgtttaagtttactcctaaatattttattttttggttctaatggaaatgagattaatttcttaatttcccttttagatagttcttttttattgtatag-aattgaaatgatttgtttcttttgtaGAtttttaaatttataaatatttaattgacacataaagatcaaatatattcaaggtatatgaaatgataatttgatatacatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacaca-ttaatcaccatccatgttgtacattagttaccaagaatgtgtttatcttagggctgaaagtttgtaccatttgaccaacatattccccttttctctgac-----ttcaaaaccctctgacaaccactgttctactctctccttcaatgagcttttttttttttttttcagattctacatgtaagtgagatcatatagtgtctgtctttctgtgtctggcttatttcacctaccgtaatgtctattaggtttatctatgttgctgcaaagg-gcaaaacttccttctttctttggctggatgataatctatcacatatatgtaccacaatttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggttgtttccatattttggctatagtgaatgatgctgcagtgaacatagcagtatagttatcttttagagatacttatttcatttcctttgggtatatatctagaagtgagattgctggaacatatggaagttttatttttta-ttttttgaagaacatctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattcccatcaatactgtgaaagggttcccttttctccacatccttaccaacacttgttatcatgtgtcttctcataatggccattacagtaggtatgaggtgatgtttcattgcgg-ttttaattt-cattttcccaatggttgatgatgttgagcaccttttcatatacatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatgtctgttaaaatctttgccaattgtaaaaatcaggttgtttgttgttttactgttgacttgcgtacttcctaatatattatgagtattaaccccttatcatacatatggtttactaatattttctcccattcgataggttaccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggcgcagtggaatttttag-ttgatatagtcccacttgttta-ttttttgttgcctgtgcttttgtggtcatatccaaaaaatgattgccaagactgttgtcaaggtg-ttttttccttatgttttcttctggtagttttacagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccagttagttttagtatatgtcataagacaagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttacaacagcattt--------------------------------------------------------attaaatagacttttcttttcccattgtgtattattggcacccttgtcaaatcttagttggccatatatgtgtgaattta-tttttgggctccctactgtgttccattgttatgtgtcatgtttttatagtaccatactgttttaattaatatggctttgtagtagagtttgaagcagtgag----tgtgatgcttccagctttgttcctttttctcaaaattactttggctatttagagtcttgtacaagtacatacaaatttggttttgttttttccatttctatgatgaatgccatcggaattttaatagggacttgatagaatctgtaggtaatttaattattt s panTro4.chr14 18767438 2808 + 106544938 aggtgttcacaaaatcgctgcaaagtctaaaagagcaaactataggctggaca-cccagagatgacttacagactaacacaggtgacctatgttgtcagggaagttgttcttgctacaatcTTAGCCATCTGTTGTCTGAAAAAAACACTACAATTTTAGCCATGTGCCTGAGATCAAGTTGATGATCCGGAATCACTTTGGACCTAACAAATCGCCCCTAGTATAACAGAAGCCTATCCTACTGCCTCCCT--TTAACTAGCTGACTACATAttcaaatctcaaatgagtacattaaatgggcagcatccaaaacatctggaaccccaaatgcaagggggtcaaaaattgagttttAAAATATTTT-----------------------------------ATTTTTGATAAAAACCAAAGTTTATACTTAGGAATATAAATTTTGTACATGGTAAAAATATTC--AGACTATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctctgttatcactctgtttattgtgttgcttcctgttttactgagaaaggtaacaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactataca---acctgcatctgtgattaag-----------ttcgcctgaaactgggtgacctgatcctgctcctacagaagtaaacccttccacctgtgcaccagattccatcccactcctctccactaaaggcaattactctgg----taactctcctttctctcacc----tataacatgaactttgtcctccctattggatgtaacctttagcatgtaaccgcatttcttccctcctaaataaaaccttcttgccaccttttcccctgtccatgtcacttcatgagtctttgtgtctccacatgaattttaggatttttaaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatattttaacaatattaattgttctattccattaacatagaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttctttcatcaatattttacag-tttaagtgtacaagtctttcacctccttgtttaagtttactcctaaatattttattttttggttctaatggaaatgagattaatttcttaatttcccttttagatagttcttttttattgtatag-aattgaaatga----tttcttttgtagatttttaaatttataaaaatttaattgac----aaaggtcaaatatattcaaggtatatgaaatgataatttgatatgcatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacaca-ttaatcaccatccatgttgtacattagttaccaagaatgtgtttatcttatggctgaaagttggtaccatttgaccaacatattccctttttctctgac-----ttcaaaaccctctgacaaccactgttctactctctacttcgatgagc---tttttttttttttcagattctacatgtaagtgagatcatatagtgtctgtctttctgtgtctggcttatttcacctaccgtaatgtctattaggtttatctatgttgctgcaaatg-gcaaaacttccttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatatatgtaccacagtttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggttgtttccatattttggctatagtgaatgatgctgcagtgaacatagcagtaaagttatcttttagagatactgatttcatttcctttgggtatatatctagaagtgagattgctggaacatatggaagttttatttttta-ttttttgaagaacatctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattgccatcaatagcgtaaaagggttcccttttctccacatcctgaccaatacttgttatcatgtgtcttctcataatagccatttcagcaggtatgaagtgatgtctcattgtgg-ttttaatttgcattttcccaatggttgatggtgttgagcaccttttcatatgcatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatagctgttaaaatctttgccaattgtaaaaatcacattgtttgttgttttactgttgacttgtgtacttcctaatatattatgaatattaaccccttatcatacatatggtttactaatattttctcccattcgataggttgccttttaatttggttgattgtttcttttgtggtgcagtggaatttttag-ttgatatagtcctacttgttta-ttttttgttgcctgtgcttttgtggtcatatccaaaaaatgattgccaagactgttgtcaaggtg-ttttttccttatgttttcttctggtagttttacagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccagttagttttagtatatgtcataagacaagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttccaacagcattt--------------------------------------------------------attaaatagacttttcttttcccattgtgtattattggcacccttgtcaaatcttagttggccatatatgtgtgaattta-tttttgggctccctactctgttccattgttatgtgtcatgtttttatagtaccatactgttttaattaatatggctttgtagtagagtttgaagcagtgag----tgtgatgcttccagctttgttcctttttctcaaaattactttggctatttggagtcttttacaagtacatacaaatttgggt---tttttttcatttctatgatgaatgccattggaattttaatagggactggattgaatctgtaggtaatttaattattt i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18990486 2821 + 108868599 AGGTGTTCACAAAATCGCTA-GAAGTCTGAAAGAGCAGACTATAGGCTGGACATCCCAGAGATG-CCTACAGACTAACACAGG-GACCTATGTTGTCAGGGAAGTTGTTCTTGCTACAATCTTAGCCATCTGTTGTCTGAAAAAAACACTACAATTTTAGCCATGCGCCTGGGATCAAGTTGATGATCCGGAATCACTTTGGACCTAACGAATTGCCCCTAGTATAACAAAAGCCTCTCCTACTGCCTCCCT--TTAACTAGCTTACTACATATTCAAATCTCAAGTGAGTACATTAAATGGGCATCATCCAAAACATCTGGAACCCCAAATGCAAGGGGGTCAAAAATTGAGttttaaaatatttt-----------------------------------atttttgataataaCCAAAGTTTATACTTAGGAATATAAATTTTGTACAT-GTAAAAATATTC--AGACTATGGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctctattctcactctgtttattgtattgcttcctgttttactgagaaaggtagcaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactataca---acgtgcatctgtgattaagtttcctttaacttctcctgagactgggtgacctgaacctgctcctacagaagtaaacccttccacctgtgcaccagattccatcccc-tcccctttactaaaggcaattactccgg----taactctcctttctctcatctgtatgtaacatgagctttgtcctccctattgggtgtaacctttagcatgtaaccacatttcttccctcctaaataaaaccttcttgccaccttttcccctgtccatgtcacttcatgagtctttgtgtctccacatgaattttaggatttttaaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatattttaacaatattaattattctattccattaacacagaaagtatttccatttatttacatctgctttaatttctttcatcaatgttttacag-tttaagtgtacaagtctttcacctcc----ttaagtttactcctaaatattttattttttggttctaatggaaatgagattaatttcttaatttcccttttagatagttcttttttattgtatag-aattgaaatga----tttcttttgtagatttttaaatttataaatatttaattgacaaataaagatcaaatatattcaagatatatgaaatgataatttgatatacatatacattgtataatgattactacaatcaaattaacaca-ttaatcaccatccatgttgtacattagttaccaagaatgtgtttatcttatggctgaaagtttgtaccatttgaccaacatattccccttttctctgac-----ttcaaaaccctctgacaaccactgttctactctctccttcgatgagc------ttttttttttcagatgctacatgtaagtgagatcatatagtgtctgtctttctgtgtctggcttatttcacctaccataatgtctattaggtttatctatgttgctgcaaatg-gcaaaacttccttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatatatgtaccacaatttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggttgtttccatattttggctatagtgaatgatgctgcagtgaacatagaagtatagttatcttttagagatacagatttcatttcctttgggtatatatctagaagtgagactgctggaacatatggaagttttatttttta-ttttttgaagaacatctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattcccatcaatagtgtaaaagggttcccttttctccacatccttaccaacacttgttatcatgtgtcttctcataatagccattccagtatgtatgaggtgatgtctcattgtgg-ttttaatttgcattttcccaatggttgatgatgttgagcaccttttcatacacatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatgtctgttaaaatctttgccaattgtaaaaatcaggttgtttgttgttttactgttgacttgtgtacttcctgatatattatgaatattaaccccttatcatacatatggtttgctaatattttctcgcattcgatagattgccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggtgcagtggaatttttag-ttgatatagtcccacttgtttatttttttgttgcctgtgcttttgtggtcatatccaaaaattgattgccaagactgttgtcaaggtgtttttttccttatgttttcttctggtagttttacagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccagttagttttagtatatgtcataagacaagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttccaacagcattt--------------------------------------------------------attaaatagacttttcttttcccattgtgtattattggcatccttgtcaaatcttagttggccatatatgtgtgaattta-tttttgggctccctactgtgtttcattgttatgtgtcatgtttttatagtaccatactgttttaattaatatggctttgcagtagagtttgaagcagtgag----tgtgatgcttccagctttgttcctttttctcaaaattactttggctatttggagtcttttacaagtatatacaaatttggttttgttttttccatttctatgatgaataccattggaattttaatagggacttgatagaatctgtaggtaatttaattattt i ponAbe2.chr14 I 733 C 0 s rheMac3.chr7 88066235 2901 - 170124641 aggtgttcacaaaatctctggaaagtctaaaagagtagactatcggctggaca-tccagagacgccttacagactaacacaggtgacctatgtcgtcagggaagttgttcttgctacaatcTTAACCATCTGTTGTCTG--TAAAACATTACCACTTTAGCCATGTGCCTGGGATCAAGTTAATGATCCAGAATCACTCTGGACCTATCAAATCACCCCTAGTACAACAGAAGACTCTCCTACTACCTCCCTGCCTAACTAGCTTACTACAAATTCAAATCTCATATGAGTACATTAAATGGTCAGCATCAGAAAAATCTGGAACCCCAAATGCAAGGAGGTCTAAAACTGAGTTTTAAAATATTTTGTTTTTGATAACCAAAGTTTATACTTATGAATATAATTTTTGATAATAACCAAAGTTTATACTTATGAATATAAATTATGTACATGGTAAAAATATTCATAGAATATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctccattctcactctgtttattgtgttgcttcctgttttactgagaaaggtagcaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactatatg---acctgcatctgtgattaagtttcctttaacttctcctgagactgggtgacctgctcctgctcctacagaagtaaactcttccacttgtgccccagattccatcccc-tcctctctactaaaggcaattactctgg----taactctcctttctctcatc----tataacatgaactttgtcctccctattgggtgtaacctttagcatgtaaccacatttcttcgctcctaaataaaacCTTCTTGCCACCTttttccctctccatgtcactt--------------------catgaattttaggatttttgaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatatttaaacaatattaattgttctattccattaacatagaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttcttccatcaatgttttatag-tttaagtgtacaagtctttcatctccttggttaagtttactcctaaatattttatattttggttctaatggaaatgagataaatttcttaatttccattttagatagttctttgttgttgtacagaaattgaaatgatttatttctttggtagatttttaaatttataaatatttaattgac----aaagatcaaatatattcaaagcatatgaaatgataatttgatacacatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacaca-ttaatcaccattcatgttgtacattagttacccagaatgtgttcatcttatggatgaaaatttgtaccctttgaagaacatattccccttttctctcccnnnnnnnnnnnn-nctctgacaaccactgttctactttctccttgtatgagc--ttttttttttttttcagattctacatgtaagtgagattatatagtatc--tctttctgtgtctggcttatttcacctaccataatgtctattaggtttatctacattgctgcaaatgaacaaaacttccttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatacatgtaccacaatttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggctgtttccatattttggctattgtgaataatgcagcagtgaacatagcagtagagttatcttgtagagatactgatttcatttcctttgggtatatatctagatgtgagattgctggaacatatggaagttttaatttttatttttttgaggaacttctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattcccatcaatcgtgtaaaaaggttcccttttctccacatcttcaccaacacttgttatcatgtgtcttctcatagtagccatttcagtaggtatgaggtgatgtctcattgtggtttttaatttgcattttcccagtggttaatgatgttgagcaccttttcatatacatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatgtctgttaaaatcttttccagttgtaaaaattaggttgtttgttgttttgctgttgacttgtgtacttcc-----tattatgaatattaaccccttatcatacatatggtttactaacattttctcccatttggtaggttgccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggtgcagtggaatttttagtttgatatagtcccacttgtttatttttttgttgccagtgcttttgtggtcatatccgaaaagtgatagccaagactattgtcagggag-ttttttcctgatgttttcttctggtagtttt-cagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccagttagttttagcatatgttataagacaagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttccaacaccatttattaaatagactttcctttttccattgcgtattattggcacccttgtcaaatcttagttaaatagactttcctttttccattgtgtattattggcacccttgtcaaatcttagttggccgtatatgtgtgaatttattttttgggctccctactctgttccattggtatgtgtcatgtttttatggcaccacactgttttaattaatatggctttgtaatagagtttgaaacagtgag----tgtgatgcttccaggtttgttcctttttcttaaaattactttggctatttggagtcttttatgaatacatacaaatttggttttg-tttttccatttctgtgatgaatgccattgaaatttcgatagggactgcattgaatctgtaggtaatctaattattt i rheMac3.chr7 I 2 C 0 s macFas5.chr7 88345428 2805 - 171882078 aggtgttcacaaaatctctggaaagtctaaaagagtagactatcggctggaca-tccagagacgccttacagactaacacaggtgacctatgtcgtcagggaagttgttcttgctacaatcTTAGCCATCTGTTGTCTG--TAAAACATTACCACTTTAGCCATGTGCCTGGGATCAAGTTAATGATCCAGAATCACTCTGGACCTATCAAATCACCCCTAGTACAACAGAAGACTCTCCTACTACCTCCCTGCCTAACTAGCTTACTACAAATTCAAATCTCATATGAGTACATTAAATGGGCAGCATCAGAAAAATCTGGAACCCCAAATGCAAGGAGGTCTAAAACTGAGTTTTAAAATATTTT-----------------------------------ATTTTTGATAATAACCAAAGTTTATACTTATGAATATAAATTATGTACATGGTAAAAATATTCATAGAATATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctccattctcactctgtttattgtgttgcttcctgttttactgagaaaggtagcaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactatatg---acctgcatctgtgattaagtttcctttaacttctcctgagactgggtgacctgctcctgctcctacagaagtaaactcttccacttgtgccccagattccatcccc-tcctctctactaaaggcaattactctgg----taactctcctttctctcatc----tataacatgaactttgtcctccctattgggtgtaacctttagcatgtaaccacatttcttcgctcctaaataaaaccttcttgccacctttttccctctccaTGTCACTT--------------------Catgaattttaggatttttgaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatatttaaacaatattaattgttctattccattaacatagaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttcttccatcaatgttttatag-tttaagtgtacaagtctttcatctccttggttaagtttactcctaaatattttatattttggttctaatggaaatgagataaatttcttaatttccattttagatagttctttgttattgtacagaaattgaaatgatttATTTCTTTGGTAGAtttttaaatttataaatatttaattgac----aaagatcaaatatattcaaagcatatgaaatgataatttgatacacatatacattttataatgattaccacaatcaaattaacaca-ttaatcaccattcatgttgtacattagttacccagaatgtgttcatcttatggatgaaaatttgtaccctttgatgaacatattccccttttctctcac-----ttcaaaa-cctctgacaaccactgttctactctctccttgtatgagc--ttttttttttttttcagattctacatgtaagtgagattatatagtatc--tctttctgtgtctggcttatttcacctaccataatgtctattaggtttatctatattgctgcaaatgaacaaaacttccttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatatatgtaccacaatttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggctgtttccatattttggctattgtgaataatgcagcagtgaacatagcagtagagttatcttttagagatactgatttcatttcctttgggtatatatctagatgtgagattgctggaacatatggaagttttaatttttatttttttgaggaacttctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattcccatcaatagtgtaaaaaggttcccttttctccacatcttcaccaacacttgttatcatgtgtcttctcatagtagccatttcagtaggtatgaggtgatgtctcattgtggtttttaatttgcattttcccagtggttaatgatgttgagcaccttttcatatacatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatgtctgttaaaatcttttccagttgtaaaaatcaggttgtttgttgttttgctgttgacttgtgtacttcc-----tattatgaatattaaccccttatcatacatatggtttactaactttttctcccattcggtaggttgccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggtgcagtggaatttttagtttgatatagtcccacttgtttatttttttgttgccagtgcttttgtggtcatatccgaaaagtgatagccaagactattgtcagggag-ttttttcctgatgttttcttctggtagtttt-cagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccagttagttttagcatatgttataagacaagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttccaacaccattt--------------------------------------------------------gttaaatagactttcctttttccattgtgtattattggcacccttgtcaaatcttagttggccgtatatgtgtgaatttattttttgggctccctactctgttccattggtatgtgtcatgtttttatggcaccacactgttttaattaatatggctttgtaatagagtttgaaacagtgag----tgtgatgcttccaggtttgttcctttttcttaaaattactttggctatttggagtcttttatgaatacatacaaatttggttttg-tttttccatttctgtgatgaatgccattgaaatttcgatagggactgcattgaatctgtaggtaatctaattattt i macFas5.chr7 I 2 C 0 s papAnu2.chr7 85475027 2801 - 162156779 AGGTGTTCACAAAATCTCTGGAAAGTGTAAAAGAGTGGACTATAGGCTGGACA-TCCAGAGAAGCCTTACAGACTAACACAGGTGACCTATGTCGTCAGGGAAGTTGTTCTTGCTACAATCTTAGCCATCTGTTGTCTG--TAAAACATTACCACTTTAGCCATGTGCCTGGGATCAAGTTAATGATCCAGAATCACTCTGGACCTATCAAATCACCTTTAGTACAACAGAAGACTCTCCTACTACCTCCCTGCCTAACTAGCTTACTACAAATTCAAATCTCATATGAGTACATTAAATGGGCAGCATCAGAAAAATCTGGAACCCCAAGTGCAAGGAGATCtaaaactgagttttaaaatatttt-----------------------------------atttttgataataaccaAAGTTTATacttatgaatataaattatgtaCATGGTAAAAATATTCATAGAATATAGAAAAAGTGGTCTGAATCTTCAAATAATCCTTCTCCATTCTCACTCTGTTTATTGTGTTGCTTCCTGTTTTACTGAGAAAGGTAGCAGGTGAGATTTCCTTAATCTCCCATCACTACCACTATATG---ACCTGCATCTGTGATTAAGTTTCCTTTAACTTCTCCTGAGACTGGGTGACCTGCTCCTGCTCCTACAGAAGTAAACTCTTCCACTTGTGCCCCAGATTCCATCCCC-TCCTCTCTACTAAAGGCAATTACTCTGG----TAACTCTCCTTTCTCTCATC----TATAACATGAACTTTGTCCTCCCTATTGGGTGTAACCTTTAGCATGTAACCACATTTCTTCGCTCCTAAATAAAACCTTCTTGCCACCTTTTCCCCTCTCCGTGTCACtt--------------------catgaattttaggatttttgaaaatttctttaaaaaatgatgttgggATTTTcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaGGTAgtgtggatattttaacaatattaattgttCTATTCCATTAATATAGaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttctttcatcaatgttttatag-tttaagtgtacaagtctttcacctccttggttaagtttactgctaaatattttatattttggttctAATGGAAATGAGataaatttcttaatttccattttagATAGTTCTTTGTTATTGTACAGAAAttgaaatgatttatttctttggtagatttttaaatttataaatatttaattgac----aaagatCAAATATATTCAAAGCATATGAAATGATAatttgatacacatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacaCA-TTAATCACCATTCATGTTGTACATTAGTTACCCAGAATGTGTTCATCTTATGGATGAAAATTTGTACCCTTTGATGAACATATTCCCCTTTTCTCTCAC-----TTCAAAA-CCTCTGACAACCACTGTTTTACTCTCTCCTTGtatgagc-----tttttctttttcagattctacatgtaagtgagattaTATAGtatc--tctttctgtgtctggcttatttcacctaccATAATGTCTATTAGGTTTATCTATATTGCTGCAAATGAGCAAAACTTCCTTCTTTCTGTGGCTGAATGACAGTCTATCacatatatgtaccacaattttTATACTCATTCATCAATTGATGTACACTTGggctgtttccatattttggctattgtgaataacgcaGCAGTGAACATAGCAGTAGAGTTATCTTGtagagatactgatttcatttcctttgggtatatatctagatGTGAGATTGCTGGAACATatggaagttttaatttttatttttttgaggaacttctatattgttttccataatgcctctgccaatttacattcccatcaatagtgtaaaaaggttcccttttctccacatcttcaccaacacttgttatcatgTGTCTTCTCATAGTAGCCATTTCAGTAGGTATgaggtgatgtctcattgtgg-ttttaatttgcattttcccagtggttaatgatgttgagcaccttttcatatacatgttggCTATTTCTATGTCTGTTTTGGGAATATGTCTGTTAAAATCTTTTCCAGTTGTAAAAATcaggttgtttgttgttttgctgtTGACTTGTGTACTTCC-----TATTatgaatattaaccccttatcataCATATGGTTTActaacattttctcccatttggtaggTTGCCTTTTAATTTGGTCAATTGTTTCTTTTGTGGTGCAGTGgaatttttagtttgatatagtcccacttgtttatttttttgttgccaGTGCTTTTGTGGTCATATTCGAAAAGTGATAGCCAAGACTATTGTCAGGGag-ttttttccttatgttttcttctggtagtttt-cagtttcaggttttacatttaaatctttaattcatttccaGTTAGTTTTAGCATATGTTATAAGACAagacttcagtttctttcttttgcatgtggatatttagcttttccaacaccattt--------------------------------------------------------gttaaatagactttcctttttccattgcATATtattggcacccttgtcaaatcTTAGTTGGCCGtatatgtgtgaatttattttttgggCTCCTTACTCTGTTCCATCGGTATGTGTCATGTTTTTATGgcaccacactgttttaattaataTGGCTTTGTAATAGAGTTTGAAACAGTGAG----TGTGATGCTTCCaggtttgttcctttttcttaaaattactttggctatttggagtcttttaTGAATACATAcaaatttggttttg-tttttccatttctgtgatgAATGCCATTGAAATTTCGATagggactgcattgaatctgtaggtaatctaattattt i papAnu2.chr7 I 2 C 0 s chlSab2.chr29 3631837 2822 - 24206276 aggtgttcacaaaatctctggaaagtctaaaagagtagactataggctggaca-tccagagacgccttacagactaacacaggtgacctatgtcatcagggaagttgttcttgctacaatcTTAGCCATCTGTTGTCTG--TAAAACATTACCACTTTAGCCATGTGCCTGGGATCAAGTTAATGATCCAGAATCACTCTGGACCTATCAAATCACTCCTAGTATAACAGAAGACTCTCCTACTACCTCCCTGCCTAACTAGCTTACTACAAATTCAAATCTCATATGAGTACATTAAATGGGCAGCATCAAAAAAATCTGGAACCCCAAATGCAAGGAGGTCTAAAACTGAGTTTTAAAATATTTT-----------------------------------ATTTTTGATAATAACCAAAGTTTATACTTATGAATATAAATTATGTACATGGTAAAAATATTCATAGAATATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatccttctccattctcactctgtttattgtgttgcttcctgttttacggagaaaggtagcaggtgagaattccttaatctcccatcactaccactatatg---acctgcatctgtgattaagtttcctttaacttctcctgagactgggtgacctgctcctgctcctacagaagtaaactcttcaacttgtgccccagattccatcccc-tcctctctactaaaggcaattactctgg----taactctcctttctctcatc----tataacatgaactttgtcctccctattgggtgtaacctttagcatgtaaccacatttctttgctcctaaataaaaccttcttgccacctttttccctctccatgtcacttcatgagtctttgtgcctccacatgaattttaggatttttgaaaatttctttaaaaaatgatgttgggattttcacagaga-ttgcattgaatctatagattgcttcaggtagtgtggatattttaacaatattaactgttctattccgttaacatagaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttctttcatcagtgttttatag-tttaagtgtacaagtctttcacctccttggttaagtttattcctaaatattttatattttggttctaatggaaatgagataaatttcttaatttccattttagatagttctttgttattgtacagaaattgaaatgatttATTTCTTTGGTAGATTTTTAAATTTGTAAATATTtaattgac----aaagatcaaacatattcaaagcatatgaaatgataatttgatacacatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacacatttaatcaccatccatgttgtacgttagttacccagaatgtgttcatcttatggatgaaaatttgtaccctttgaccaacatattccccttttctctcac-----ttcaaaa-cccatgacaaccactgttctgctctctccttgtatgagc----ttttatttttttcagattctacatgtaagtgagattatatagtatc--tctttctgtgtctggcttatttcacctaccataatatctattaggtttatctatattgctgcaaatgaacaaaacttccttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatatatgtaccacaatttttatactcattcatcaattgatgtacacttgggctgtttccatattttggctattgtgaataatgcagcagtgaacatagtagtagagttatcttttagagatactgatttcatttcctttgggtatatatctagatgtgagattgctggaacatatggaagttttaatttttatttttttgaggaacttctatattgttttccataatgcctgtgccaatttacattcccatcaatagtgtaaaaaggttcccttttctccacatcctcaccaacgcttgttatcatgtgtcttctcatagtagccatttcagtaggtatgaggtgatgtctcattgtgg-ttttaatttgcattttcccagtggttactgatgttgaggcccttttcatatacatgttggctatttctatgtctgttttgggaatatggctgttaaaatcttttccagttgtaaaaatcaggttgtttgttgttttgctgttgacttgtgcacttcc-----tattatgaatattaaccccttatcatacatatggtttactaacattttctcccattcggtaggttgccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggtgcagtggaatttttagtttgatatagtcccacttgtttatttttttgttgccagtgcttttgtggtcatatccgaaaagtgatagccaagactattgtcagggag-ttttttccttatgttttcttctggtagtttt-cagtttcaggttttacatttaaatctttagtttatttccagttagttttagcatatgttataagataagacttcagtttctttctttcgcatgtggatatttagcttttccaacaccattt--------------------------------------------------------attaaatagactttcctttttccattgtatattattggcacccttgtcaaatcttagttggccgtatatgtgtgaatttattttttgggttccctactctgttccattggtatgtgtcatgtttttatggcaccacactgttttaattaatatggctttgtaatagagtttgaaacagtgag----tgtgatgcttccaggtgtgttcctttttcttaaaattactttggctatttggagtc-tttatgaatacacacaaatttggttttg-tttttccatttctgtgatgaatgccattgaaatttcgatagggactgcattgaatctgtaggtaatctaattattt i chlSab2.chr29 I 2 C 0 s calJac3.chr10 87784165 2791 - 132174527 aagtattcacaaaatagctggaaactctaaaagagcagactacaggctgga---ttgacagatgcctcacagactaacacaggagacctatgttgtcagggaagttgttcttgctgcaatGTTAGCCATTTGTTGTCTG--AAAAACACT---------GTCATGTGCCTGGTATGTAGTTGATGATCCAGAACCACTGTGGACCTATCAAATCGCCCCTAGTGCAACAGAAGTCTCTCCTACTACTTCTCTGCCTAACTAGCTTACTACAAAttcaaatctcttatgagtatattaaatggtcagcatccaaaacatctggaaccccaaatgcaagggagtctaaaagtgatttttaAAATATTTT-----------------------------------ATTTCTGATAATAACCAAAGTTTATATTTATGAATATAAATTACGTACATGGTAAAAATATTC--AGGCTATAGAAAAAGTGGTCTGaatcttcaaataatcctttttcattcttactctgtttattatgttgctttctgttttactgagaaagttagcaggtgagaattcctcaatctcgtgtcactaccactacctatacacctccatctgggactaagtttcctttaacttctcctgagactgggtgacctgatcctgcatctacagaagtaaacccttcttcctgtgtaccaggttccgccccc-tcctctctactaaaggcaatgactctggcaactaactcttctttctctcatc----tataacatgaactctgtcctccctattgagtgtaacatttaggaggtagccacagttcttccctcctaaataaaaccttcttgccaccttttcccctctccaTGTGACTTCATgagtctttgtgccttcacatgacttttaggatttaaaaaaatttctttaaaatatgatgttgggattttcacagttatttgcattgaatctatgcattgcttcaggtagtgtggatattttaacaatattaattgttcta-----ttaagaaagaaagtctttccatttatttgcatctgctttaatttctttcatcaatgtttcattgttttaagtgtacaagtctttcacctccctggttaagtttactattaattattttat-ttttgtttctattggtaatgatattaatttcttaatttcccttttaga----tcttttttagtacatagaaatgtaaatgacttATTTCTTTTATAGATCTTTAAATTTATAAATATTtaattgac----aaagatcagatatattcaaggtatataaaatgataatttaacatacatatacattgtataatgattaccacaatcaaattaacaca-ttaatcaccatccatgttttatattagttacccaaaatgtgtttatcttatggctgaaagtttataccctttgattaatatatttgccttttctttcac-----ttcaaaa-cccctgacaaccactgttctactctctctttctataagc-----cttttttttttcagattctacatgtaaatgagatcatacagtatctgtctttctgtgtctgacttattttacctatcgtaatgtc-attaggttcatctatgttgctgcaaatg-gcaaaa----cttctttctgtggctgaatgacagtctatcacatatatgtaccacaacatatatacctgtacatccattgatgtacatttgggttgtttccatattttggctactgtgaataatgttgcagtgaacatcgaagtgtagttatcttttagagatagtgatttcatttcctttatgtatatatctagaagtgagattgctggaacatattgaagttttatctttta-ttttgggaggaactcctgtattgttttccataatacctgtaccaatttacattcccaccagtagtgtaaaatggttcccctttctccacatccttaccaacacttgatatcatgtgtcttctcatagcagccatcccagtagatatgaggtgatgtctcattgtgg-ttttaatttgca-tttcccaatggttaatgatgttgagcatcttttcatatacatgttgactatttctatatctgttttgggaatatgtctattcaaatctttgccaattgtaaaaattaagttgtttgttgttttgctattgacttgtgtactttctaatgtatcatgaatatcaactccttatcatacatataatttactaatattttctcccatttggtagattgccttttaatttggtcaattgtttcttttgtggtgcagtggaaattctagtttgatatagtctcacttgttta--tttttgttacttgtgcttttgtggtcatatccaaaatatgattgctaagactattgtcagggag-ttttttcctcatgttttcttctggtagttttacagtttcaggttttaaatttatatctttaattcatttcctgttagttttggtat-----ataagacaagacttaagtttttttcttttgcatgtggatatttagttttttcaacaccactt--------------------------------------------------------attaaatagatttttcttttcccactgtgtattattggcacccttgtcaaatcttagttgttcatatatgtgtgaattta-tttttggcctccttactctgttccattggtatgtgtcatg-ttttatggtatcatactgttttaattactatggctatgtaatagagtttgaaatagtgagtgaatgtgatgcttccagctttgttcctttttctcaaa------------atttggagtcttttatgaatacatacaaatttgtttttgttttttccatttctgtgatgaatgccattggaatttcaatagggactgcatttaatctgtaggtaatcttttttttt i calJac3.chr10 I 2 N 0 a score=286002.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 452838 177 + 478999 tagatattttaacaatattaattttttaaaattaatgtacataggtatatttacttttaattctctttttccatttatttcatcaatgtattatagttttcagtgtacagagattaaacctcc-tggttgaatttattcctaagtattttgttttaa-ttttttatagttataaatggg s panTro4.chr14 18770246 178 + 106544938 tagatattttaacaatattaatttttt-aaattaatgtacacagatatatttacttttaattctctttttccatttatttcatcaatgtattatagttttcagtgtacagagctttcacctccttggttgaatttattcctaagtattttgttttaatttttttatagttataaatggg i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr14 18993307 177 + 108868599 tagatattttaacaatattaatttttttaaattaatgtacatagatatgtttacttttaattctctttttccatttatttcatc-atgtattatagttttcagtgtacagagctttcacctccttggatg-atttattcctaagtattttgttttaatttttttatagttataaatggg i ponAbe2.chr14 C 0 N 0 s rheMac3.chr7 88069136 174 - 170124641 tgggtattttaacgatattaatttttt-aaattcatgtacata--tatatttacttttaattctctttttccatttattttgtcaatgtattatagttttcagtgtatagagctttcacctccctggttaaatttattcctaagtattttgttttaa--tttttgtagttataaatggg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88348233 174 - 171882078 tgggtattttaacgatattaatttttt-aaattcatgtacata--tatatttacttttaattctctttttccatttattttgtcaatgtattatagttttcagtgtacagagctttcacctccctggttaaatttattcctaagtattttgttttaa--tttttgtagttataaatggg i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85477828 174 - 162156779 tgggtattttaatgatattaatttttt-aaattcatgtacata--tatatttacttttaattctctttttccatttattttgtcaatgtattatagttttcagtgtacagagctttcacctccttggttaaatttattcctaagtattttgttttaa--tttttgtagttatAAATGGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3634659 174 - 24206276 tgggtattttaatgatattaattttaa-aaattcatgtacata--tatatttacttttaattctctttttccatttattttgtcaatgtattacagttttcagcatacagagctttcacctccttggttaaatgtattcctaagtattttgttttaa--tttttgtagttataaatggg i chlSab2.chr29 C 0 C 0 a score=645669.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 453015 513 + 478999 attgttttcttgacttccttttcagataattcattgttactgttcagagataccactagtttttgtatgttcattttttaatctgcagcttta-tgaactcacttattctagaaggtttttttgaggacatctttaggattttctcgatataagatcacgtcatctgcaaacagacaattttacttcttcttttgcaatttggttgccttttatttcttacctacttactctagctagtactttcagtaatatattgagtagactcggtgagagtgggcatccttattttctttctgatcttagaaggaaagctttcaatttttcaccattgaatatgatgttagctgtgcgattgtaatatgtggcatttatcactgtggtaggttccttctaagcatag------------tttttatgatgaaggatgttgaattttgtcaatgccttttctgcatctattgaggtaaccatatggtttttgcctttcattctgccaatgt-ggtatatcacatttattgattt s panTro4.chr14 18770424 525 + 106544938 attgttttcttgacttccttttcagataattcattgttagtgtttagagatcccactggtttttgtatgttcattttttaatctgcagcttta-tgaactcatttattctaaaaggtttttttgaggacatctttaggattttctcgatataagatcacatcatctgcaaacagataattttacttcttcttttccaatttggttgccttttatttcttacctacttactctagctagtactttcagtaatattttgaatagactcggtgagagtggacatccttattgtctttctgatcttagaaggaaagctttcaatttttcaccattgaatatgatgttagctgtgtgcttgtcatatgtggcatttatcactgtggtaggctccttctaagcaaaatttgctggaatttttttatcatgaaggatgttgaattttgtcaatgccttttctgcatctattgaggtgatcatatggtttttgcctttcattctgccaatgt-ggtatatcacatttattgattt i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 88069310 523 - 170124641 atggttttcttgacttccttttcagataattcattgttagtgtatagagataccactagtttttgtatgttcattttttaatctgcagctttactgaaatcattcattctaaa--ttttttttgatgacgtctttaggattttctctatataagatcacgtcatctgcacacagacaattttacttcttcttttccaatttggttgccttttatttcttacctacttactcta-ctagtcctttcagtaatatattgagtagatgtagtaagagtgggcatccttattttctttctgatcttagaaggaaagttttcagtttttcaccgttgaatgtaatgttagctgtgggcttgtcatatgtggcatttatcgctaaggtaagttccttctaagtgtaatttattggaag-tttttatcatgaaggatgtttaattttgtcagtgccttttctgcttctattgaggtgatcatatggtttttgcctttcattttgctaatgtgggtatatcacatttattgattt i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 88348407 523 - 171882078 atggttttcttgacttccttttcagataattcattgttagtgtatagagataccactagtttttgtatgttcattttttaatctgcagctttactgaaatcattcattctaaa--ttttttttgatgacgtctttaggattttctctatataagatcacgtcatctgcaaacagacaattttacttcttcttttccaatttggttgccttttatttcttacctacttactcta-ctagtcctttcagtaatatattgagtagatgtagtaagagtgagcatccttattttctttctgatcttagaaggaaagttttcagtttttcaccattgaatgtaatgttagctgtgggcttgtcatatgtggcatttatcgctaaggtaagttccttctaagtgtaatttattggaag-tttttatcatgaaggatgttgaattttgtcagtgccttttctgcttctattgaggtgatcatatggtttttgcctttcattttgctaatgtgggtatatcacatttattgattt i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 85478002 523 - 162156779 ATGGTTTTCTTGACTTCCTTTTCAGAtaattcattgttagtgtatagagaTACCACTAgtttttgtatgttcattttttaatctgcAGCTTTACTGAAATCAttcattctaaa--ttttttttgatgacgtctttaggattttctctatataagatcacgtcatctgcaaacagacaattttacttcttcttttccaatttggttgCCTTCTATTTCTTACCTACTTACTCTA-CTAGTCCTTTCAGTAATATATTGAGTAGATGtagtaagagtgggcatccttattttctttctgatcttagaaggaaagttttcagtttttcaccgTTGAAtgtaatgttagctgtgggcttgtcatatgtGGCATTTATCGCTAAGGTAAGTTCCTTCTAAGTGTAATTTATTggaaa-tttttatcatgaaggatgttgaattttgtcagtgccttttctgcttctattgaggtgatcatatggtttttgcctTTCATTTTGCCAATGtaggtatatcacatttattgattt i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 3634833 523 - 24206276 attgttttcttgacttccttttcagataattcattgttagtgtatagagataccactagtttttgtatgttcattttttaatctgcagctttactgaaatcattcattctaaa--ttttttttgatgacgtctttaggattttatctatataagatcatgtcatctgcaaacagacaattttacttcttcttttccaatttggttgccttttatttcttacctacttactcta-ctagtcctttcagtaatatattgagtagatgtagtaagagtgggcatctttattttctttctgatcttagaaggaaagttttcagtttttcaccattgaatgtaatgttagctgtgggcttgtcatatgtggcatttatcgctaaggtaagttccttctaagtgtaatttattggaag-tttttatcatgaaggatgttgaattttgtcagtgccttttctgcttctattgaggtgatcatatggtttttgcctttcattttgccaatgtgggtatatcacatttatttattt i chlSab2.chr29 C 0 N 0 a score=3566460.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 453528 4320 + 478999 gcatatgttcaaatatcactgtgcttgctaaccatgaattatccttttaatgtgctgccagatttaatgtgttagtattctggcatttatgttcatcagagacactggattgaacttttcttttagtatccacctgtggcttaggtatcagagtaatgcaggccttctaaaatgagta------------tgcctattcaatttc-------------aataaattggtattagttctttttcaaatgtttggtaaaatttaaaacagaatccattaggtcctgggcttttctttgctgtgagatttttgaaactattgattcaattttattccttattgatcggttaagattttttatttcctcttaatttaattttgacaaattgtgtccagaaatttatctatttcttcaaggttattcaatttgttgtagtatagttgttAAAACTTACACAAATTAA--GTTTTttctataatttttgacatatttataatatcatgtattcatttctacagcattagaaagaataatttcttcaccctaaattgttcttcaacttaaattattccactcttctttcttctccttgtactcttggtaaccaccagtcttttactgtctctatagttttaatttttctagaatgtcatacaattggagtcatacagtatataacctttcaaaactggcttctttcagctagcattatgcatttaagattcattcatgcttttttatggcttggtagttaatgacctttttattgctgaataacattctattgtaaatatagcacagtttgtttattcatacactcgttgaagaacattgtgattgtctccaatttttggctgttagggaatgaagttgctgtaaacattcatgactgggtttttgtgtacacatgtttcaaatcagttgggtaagtgcctgggagtgtgatcatatggtaaggctatgctcagctttgtaagaaacttccaaTTTggtcaagatgtctgactagttgcagacagatagaacagctgtcactgtgggactgggatgactggcacagtcctaacaggtcctcaagacacaaaagctgggcagaag-------------------ctgggtggggctaccgtgcaatgggactcgttcctcacccccaagaactttgggggaatgggtgagttgaactggcaagaagcaacctactcttgccacaagcctctggaatcccaccgggaggagacccctcaaccactacagacacagagttggcaggg-gaagtgcttagaggagtggtaggagcagcatggtagccgatatggagcccagagggtttgttgcaggaacatctatagcagagcacggccagggatacccatctctccagacttgacttgcctccataggagactttagccctag-----gggaactgtcagatatgaattctgcagggcagtctt-cccatcagatggggcagatccaacct-------------------------------------tagtaccccctggtctgctgacctctcccagtgctccagcctggtttttttctgcttgcagtacagactcaggttccctggggacccgcatcttagcttctgcaatggcagaccatatctaattggtggagagctccagcggggtggcccctagggccatgcaccaacctgcctgctccctccctctgctgcagcttcttccaagcccatggccaaccacccctgccccctgacatcatttggctggcttgtatgtgtgcaggtggattttcccttcccttcaccaccagcttgtgtgagcacgtgtacgctgccctgcctctgctgccagcaggagtgcactctgctccccttcctcggccatactaccattgcagtcagagctgtagtgggcacagagcccaccagtcctgcctctgtcagtgacctgcccctgtgccaacactgccaccagaatgaaactaggcactgaaaacaatgaaccct-cccctgccctgagtagccacagagggtgcacacacacctgaacccaccagtgtcctgcccccatactaacaccaccatcagtgcaccaatgcacacagtcaccaatgggggcctgctgaccccccaagttatgctgactctacccctgctgtcaatgccttcatggaggcaggcatctcagcacctgctagcagtctgctgcagctgacaagcatgcatcctgatttaatactgctggttctggtgctgctgagggcacctgtgaatgaggacaga-ccccccccccctactgccaccacactacaaaaccctttgactagcaccattccatcaacgtgtagtgaccagcagtccaggagcaccttagc--acccccatcacagtctgttcataatcttgagaagtcagagaacaaagtagggtaggatataagtcccccagaattaaaacatgcagctggggagatgacagctgaaccttggtcccc-aaaatcttccagaaataaagccagttgactgaacccactttataacacaatcaaactctcaaagtcatctaataagat---aaaaaaaa-atccaaaggacaagagcttcaaagattgaaaaaacactagcccacaaaaatgagaaaaaaa-cagtgcaagaactctgacaagtcaaaaagccagcatgctgtctttcctccgaatgcctccaccagctctccaccaaaagtttttaactgaactgggttggctgaagtgacacaaatagaatttggagtatggatagaaatgaagagcaacaaggtacaggagtatgttgaaacccaatccaaggaagctaagaatcacaataaaacaatgcaggagctgacagacaaaatagacagtatagaaaagaacataactgacctgatagaactgaaaaacacactgcaaaaatttcatgatgcaatcacaactattaacagcagaatagaccaagcagaagaaatgatattagtgctttaagactggcattctgaaacaagacaggcagacaagaatagagaaaaaagaatgaaaaggaagaaacaaaacctctgataaatat--gtttatgtaaagagaacaaatctatgattcactggtgtccctgaaggagatggggagaatggcagcaacttggaaaacatattccaggatatcattcatgagaacttcctcaacctagctagagaggctaacattcaaattcagaaaataca-aaaacccatttaaggtacttcacaggaagatcacctccaggacacataattatcagattttccaaggttgaaatgaaagaaaaaaatgcaaaaggcagccagagagaaaggtcaggtcacctacaaagggaagcccataagacta--agcagacctctcaacaaaaactctacaaaccagaagaggttgggggccaatattcaagattcttaaag-aaaagaaattccaaactagaatcttacatctagccaaactatgcttcataagtgaaggagaaataagatccttttcagacaagcaaatgctgagggaatttgttactaccagactgacctgccttacaagagctcctgaaggaagcactaaataagaaaaggaaatatcattaccaaccacttcaaaaatacactgaagtacatagaccaatgacactagaaagcagccacacaaacaagtatgtatggtaaccaactaacagcatgatgacaggatcaaatctacacatatcaatactaactttgaatgtaaaaggggtaaatgccccaattaaaaggcacagagtgataagctggataaaaaagcaagacccaatggtatgctgtc-tcaagagacatgcagtgacacgcataggctcacatgcaatgacacgcataggctcacatgcaatgacacacataggctcacatgcaatgacacccataggctcatatgcaatgacacccatagcctcaaaataaagggatggaggaaaatctactaagtaaatagaaaacataaaaaatacagagattgtaatcctaatttcagacaaaacagactttaaaccaacaaagataaaaaaagacaaaaaagggtaatgacataatggcaaagggttcaattcaacaagtagtgctaactatcctaaatatacgcgcacttaacacaggagcaccctg-ttcaaacaaattcttagaaacctacaaagagacttagactcacacacaataataatgagagacttcaacaccctactgacagtattagacacatcacttaggcagaaaattagcaaagatattcaggaccttaactcagcactggatcaaatggacctgatagatgtttacagaactctccaccaaaaagcaacagaatatacattcttctcatcaccccatggcacatattctgaa s panTro4.chr14 18770949 4317 + 106544938 gcatatgttcaaatatcactgtgcttgataacagtgaattatccttttaatgtgctgccagatttaatgtgttagtattttggcatttatgttcatcagagatactggattgaacttttattttagtatccatctgtggcttaggtatcagagtaatgcaggccttctaaaatgagtatggaagtgttcctgcctcttcaatatttggaagagtttggaataaattggtattagttctttttcaaatgtttggtaaaatttaaaagagaatccattaggtcctgggcttttctttgctgggagatttttgaaagtattgattcaattttattccttactgatcggttaagattttttatttcttcttaatttaattttgacaaattgtgtccagaaatgtatctatttcttcaaggttattcaatttgttgtagtatagttgttAAAACTTACACAAATTAA--GTTTttt-tatagtttttgacatatttataatgtcatgtattcgtttctacagtattagaaagaataatttcttcaccctaaattgttcttcaacttaaattattcgactcttctttcttctccttgtactcttggtaaccaccagtcttttactgtctctatagttctaatttttctagaatgtcatataattggagtcatacagtatataacctttcaaaactggcttctttcagctagcattatgcatttaagattcattcacgcttttttatggcttggtagttaatgccctttttattgctgaataacattctattgtaaatatagcacagtttgtttattcatacactcgttgaagaacattgtgattgtctccaatttttggctgttagggaatgaaattgctgtgaacattcatgactgggtttttgtgtacac--gtttcaaatcagttgggtaagtgcctgggagtatgatcatatggtaaggctatgctcagctttgtaagaaacttccaaTTTggtcaagatgtctgactagttgcagccaggtagaacagctgtcactgtgggactgggatgactggcacagtcctaacaggtcctcaagacacaaaagctgggcagaag-------------------ctgggtggggctacagtgcaatgggactcgttcctcacccccaagaactttgggggaatgggtgagttgaactggcaagaagcaacctactcttgccacaagcctctggaatcccaccgggaggagacccctcaaccactacagacacagagttggcaggg-gaggtgcttagaggagtggtaggagcagcacgctagccgatatggagcccagagtgtttgttgcaggaacatctatagcagagcatggccagggatgcccatccttccagacttgacttgctttcataggagactttagccctag-----gggaactgtcggacatgaattcggcagggcagtctt-cccatcagatagggcagatacaacct-------------------------------------tagtaccccctggcctgctgacctctcccagtgctccagcctggttttttcctgcttgcagtgcagactcaggttccctggggacccgcatcttagcttctgcaatggcagaccatatctgattggtggagagttccaatggggtggcccctagggccatgcaccaacctgcctgctccctccctctgctgcagcttcttccaagcccatggccaaccgcccctgccccctgacatcatttggctggcttgtatgtgtgcaggtggattttcccttcccttccccaccagcttgtgtgagcacgtgaaccctgccctgcctctgctgccagcaggagtgcactctgctccccttcctctgccatactgccattgcagtccgagctgtagtgggcacagaacccaccagtcctgcctctgtcagtgacctgcccctgtgccaacactgccaccagaatgaaactaggcactgaaaacaatgaaccctccccctgccctgagtagccacagagggtgaacacacacctgcacccaccagtgtcctaaccccatactaacaccatcatcagtgcaacaatgcacacagtcaccaatggggtcctgctgaccccccaagttatgctgactctacccctgctgtcaatgccttcatggaggcaggcatctcagcacctgctagcagtctgctgcagctgacaagcatgcatcctgatttaatactgctggtgctggtgctgctaagggcacctgtgaacgaggacaga-tccc--------actgccaccacactacaaaaccctttgactagcaccattccatcaacatgtagtgaccagcagtccaggagcaccttagc--acccccatcacagtctgttcataatcttgagaagttagagaacaaagtagggtaggatacaagtcccccagaattaaaacatgcagttggggagatgacagctgaaccgtggtcccc-aaaatcttccagaaatgaagccagttgactgaacccattttataacacaatcaaactctcaaagtcatctaacaggattaaaaaataaa-acccaaaggacaggaacgtcaaagattgaaaaaacactagcccacaaaaatgagaaaaaaa-cagtgcaagagctctgacaagtcaaaaagccagcataccttctttcctctgaatgcctccaccagctctccaccaaaagtttttaactgaactaggatggctgaagtgacacaaatagaatttagagtatggatagaaatgaagagcatcaaggtacaggagtgtgttgaaacccaatccaaggaagctaagaatcacaataaaacaatgcaggagctgacagacaaaatagacagtatagaaaagaacataactgacctgatagaactgaaaaacacactgcaaaaatttcataatgcaatcacaaccattaacagcagaatagatcaagcagaagaaatgatattagtgctttaagactggcgttctgaaacaagacaggcagagaagaatagagaaaaaagaatgaaaacgaacaaacaaaacctctgagaaatataagtttatgtgaagagaacaaatctgtgattcattggtgtccctgaaggagatggggagaatagcagcaacttggaaaacatattccaggatatcatccatgagaacttcctcaacctagctagagaggctaacattcaaattcagaaaataca-aaaacccatgtaagacacttcacaagaagatcacctccagcacacataattatcagattttccaaggttgaagtgaaagaaaaaaatgcaaaaggcagctagagagaaaggtcaggtcacctacaaagggaagcccatcagacta--aacatacctctcaacaaaaactctacaaaccagaagaggttgggggccaatattcgagattcccaaagaaaaagaaattccaacccagaattttacatctggccaaactatgcttcataagtgaaggagaaataagatccttttcagacaagcaaatgctgagggaatttgttactaccagactgacctgccttacaagagctcctgaaggaagcactaaataagaaaaggaaatatcattaccaaccacttcaaaaatacactgaaatacacagaccaatgacactataaagcaaccacacaaataagtatgtatggtaaccaactaacagcatgaccacaggatcaattctacgcatatcaatactaaccttgaatgtaaaaggggtaaatgccccaattaaaaggcacagagtgataagctggataaaaaagcaagacccaatggtatactgtcttcaagag------------------------acatgcaatgacacccataggctcacatgcaatgacagccataggctcatatgcaatgacacccataggctcatatgcaatgacacccataggctcaaaataaagggatggaggaaaatctactaagtaaatagaaaacataaaaaat--agagatcgtaatcctaatttcatacaaaacagactttaaaccaacaaagataaaaaaggacaaaaaagggtaatgacataatggcaaagggttcaattcaacaagtagtgctaactatcctaaatatacatgtacttaacacagtagcaccctgattcaaacaaattcttagaaacctacaaagagacttagactcacacacaataataatgagagatttcaacaccctactgacagtattagacacatcactgaggcagaaaattagcaaagatattcaggaccttaactcagcactggatcaaatggacctgagagatgtttacagaactctccaccaaaaagcaacagaatatacattcttctcatcaccacatggcacatattctgaa i panTro4.chr14 C 0 N 0 s rheMac3.chr7 88069833 4309 - 170124641 gcatatgttcaaatatcattgtgcttgataacagtgaatgatccttttaatgtgctgtcagatttagtgtgtttgtattttggcatttatgttcatcagagatactggattgaacctttcttttagtatccatctgtggcttagatatcagagtaatacaggacttataaaatgagtatggaagtgttcccacctcttcaatttttggaagagtttggagtaaattgatattagctctttttcacatgtttggtaaaatttaaaagagaatccattaggtcctgggcttttctttgctg-------------------gattcaattttattccttacagatctgttaagattttttatcttttcttcatttaattttgataagttgtgtccagaaatttatctatttcttccagattattcaatttattatagtatagttgttAAAACTTACACGAAGTAA--GTTTTttatatagtttttgacatatttataatgtcatgtattaatttctacagtattacaaagaataatttctccactctaaattgttcttcaacttaaattattcgactcttctttcttctccttttactcttggtaaccagcagtcttttactgtctctatagttttaatttttccaaaatgtcatatatttggagttatacagtatataacctttcaaaactggcttctttcagctggcattatgcatgtaagattcattcatgcctttttatggcttggtagttaatgccctttttattgctgaataacattctattgtaaatatagcacagttagtttattcatacactcgttgaataacattgtggttttctccaatttttgtctgttagggaatgaagttgctgtaaacattcatgactgagtttttgtgtacacatgtttcaaatcagttgggtaaatgcctaggagtatgatcatatggtaaggctatgcttagctttgtaagaaacttccaaTTTggtcaagatgtctgactagatgcagccaggtagaatagctgtcactgtgggactaggatgactggcacactcctaacaggtcctaaagacacaaaaactgggcagaagagagaggaagctgggaactctgggtggggctactgtgcaatgggactcattcctggcccccaagaactttgggggaatggatgagttgaactggcaaggagcaacccactcttgccacaagcctctggaatcccaccaggaggagacccctcaaccatcagagacacagagttggcagggagagctgcttagaggagtggtaggagcagcatgctagccgatatggagcccagagggtttgttgcagcaatatctatagcagagcacagccagggatgcccatccctccaggcttgacttgcttccataggagactttagccctagccctaggggactgttggacatgaattctgcagggcagtcttgctcatcagatggggcagatccaaccttagtaccccctaatctgctgacccctcccagtgctcctagtacccgctaatctgctgacccctcccagtgctccagccgggcttttttctgcttgcagtgcagactcagcttccctggggacccacatcttagtttctgcactggcagaccatatctgattggtggagagctctggtggggtggcccctagggccatgtacctgcctgcctgctccctccctctg-tgtggcttcttccaagcccatggctaaccgcccctgcccactgatatcatttggctggcttgtatgtgtgcaggtggattttctcttccctgcctcaccagcttgtgtaagcacatgcacc-tgtcctgcctctgctgccagcaggagtgcactctgctctccttcccctgccatactgccgttacagtcaaagctgtactgggcacagagcccaccagtcctgcctctgtcagtgacctgcccctgtgccaacactgccaccagaatgaaactaggcactgaaaacaatgaaccct-ccccttccctgagcagccacagagggtgcacacacacctgcacccaccagtgtcctgcccccatactagcaccaccatcagtgcaacaatgcacacagtcaccaat-ggggcctgctgacctcccgagttatgctgactctactcctgctgtcaatgctttcatggagccaggcatctcagcacctgctagcagtctactgcagctgacaagcatgcatgctgatttaatactg------ctggtgctgctgagggcacctgtgaacaaggacaga-tccc--------actaccactaccctacaaaacactttg----gcacca-tccatcaatgtgtagtgaccagcagtccaggagcaccttagccaccccccatcagagtctgttcataaccttgagaagtcagagaacaaagtagggtaggatacaagtccaccagaattaaaacatgcagttggggagatgacagctgaaccttggtccccaaaaatcttccagaaatgaagccagttgactgactccaccttataacacaatcaaactctcaaagtcatccaacaggataaaagaaaaaacatccaaaggacaggaacttcaaagattgaaaaaacattagcccacaaaaatgaggaaaaaaccagtgcaagaactctgataagtcaaaaagccagcgtgctttctttccttcaaatgcctccaccagctctccaacaaaaatttttaactgagctgggatggctgagatgacacaaatagaatttagagtatggatagaaattacgagcatcaaggtgcaggagtacgttgaaacccaatccaaggaagctaagaaccacaataaaacaatgcaggagctgacagacaaaatagacggtatagaaaagaacataactgacctgatagaactgaaaaacacgctacaaaaatttcataatgcaatcacaactattaacagcagaatagaccaagcagaagaaatgatattagtgctttaagactggctttctgaaacaacacaggcagacaagaatagagaaaaaagaatgaaaaggaagaaatgaaacctctgagaaatacgagtttatgtaaagagaacagatctgtgattcattggtgtccctgaaagacatggggagaatggcagcaacttggaaaacatatttcaggatatcatcgatgagaactttctcaacctagctagcgatgctaacattcaaattcagaaaatacagaaaacccatgtaagacacttcacaggaagatcatctccaggacacataattatcagattttccaaggttgaaacgaaagaaaaaaatacaaaaggcagctagagagaaaggtcaggtcacctacaaagggaagcccatcagactaacagcagacctctcaacaaaaactctacaaaccagaagaggttgggggccaatattcaagattcttaaag-aaaagaaattccaacccagaattttacatctggccaaactatgcttcataagtggaggagaaataagatccttttcagacaggcaaattcttagagaatttgttactaccagactgacctgccttgcaagagctcctgaaggaagcactaaataagaaaaggaaagatcattaccaaccacttcaaaaatatgctgaagtacacagaccaatgacactatgaagcaaccacacaaacaagtatgtatggtaactaactaacagcatgatgacaggatcaaatccacatgtatcaatactaaccttgaatgtaaatgggctaaatgccccaattaaaaggcacagagtgataagctggaaaaaaaagcaagacccaatggtatgctgtcttcaagag------------------------------------------------------------------------acattcaatgacacccatatgctcacatgcaatgacacccataggctcaaaataaaaggagggaggaaaatccactaagtaaatagaaaacataaaaaatacagagattgtaatcctaatttcagacaaaacagactttagaccaacaaaaataaaaaaagacaaaaaaggg-gattacataacggcaaagggttcaattcaacgagtagtgctaactatcctaaatatatgtgcacccaacacaggagctccctgattcaaacaagttcttagaaacctacaaagaaacttagactcacacacaataataatgagagacttcaataccctactgacagtattagacagatcactgaggcagaaaattaataaagatatttaggaccttaactcagcactggatcaaatggacctgatagatgtttacagaactctccaccaaaaagcaacataatatacattcttctcatcaccacatggcacatattctgaa i rheMac3.chr7 C 0 N 0 s macFas5.chr7 88348930 4262 - 171882078 gcatatgttcaaatatcattgtgcttgataacagtgaatgatccttttaatgtgctgtcagatttagtgtgtttgtattttggcatttatgttcatcagagatactggattgaacctttcttttagtatccatctgtggcttagatatcagagtaatacaggccttataaaatgagtatggaagtgttcccacctcttcaatttttggaagagtttggagtaaattgatattagctctttttcacatgtttggtaaaatttaaaagagaatccattaggtcctgggcttttctttgctg-------------------gattcaattttattccttacagatctgttaagattttttatcttttcttcatttaattttgataagttgtgtccagaaatttatctatttcttcaagattattcaatttattatagcatagttgttAAAACTTACACGAAGTAA--GTTTTttatatagtttttgacatatttataatgtcatgtattaatttctacagtattacaaagaataatttctccactctaaattgttcttcaacttaaattattctactcttctttcttctccttttactcttggtaaccagcagtcttttactgtctctatagttttaatttttccaaaatgtcatatatttggagtcatacagtatataacctttcaaaactggcttctttcagctggcattatgcatgtaagattcattcatgcctttttatggcttggtagttaatgccctttttattgctgaataacattctattgtaaatatagcacagttagtttattcatacactcgttgaataacattgtggttttctccaatttttgtctgttagggaatgaagttgctgtaaacattcatgactgagtttttgtgtacacatgtttcaaatcagttgggtaaatgcctaggagtatgatcatatggtaaggctatgcttagctttgtaagaaacttccaaTTTggtcaagatgtctgactagatgcagccaggtagaatagctgtcactgtgggactaggatgactggcacactcctaacaggtcctaaagacacaaaaactgggcagaagagagaggaagctgggaactctgggtggggctactgtgcaatgggactcattcctggcccccaagaactttgggggaatggatgagttgaactggcaaggagcaacccactcttgccacaagcctctggaatcccaccaggaggagacccctcaaccatcagagacacagagttggcagggagagctgcttagaggagtggtaggagcagcatgctagccgatatggagcccagagggtttgttgcagcaatatctatagcagagcacagccagggatgcccatccctccaggcttgacttgcttccataggagactttagccctagccctaggggactgttggacatgaattctgcagggcagtcttgctcatcagatggggca-----------------------------------------------tagtacccgctaatctgctgacccctcccagtgctccagccgggcttttttctgcttgcagtgcagactcagcttccctggggacccacatcttagtttctgcactggcagaccatatctgattggtggagagctctggtggggtggcccctagggccatgtacctgcctgcctgctccctccctctg-tgtggcttcttccaagcccatggctaaccgcccctgcccactgatatcatttggctggcttgtatgtgtgcaggtggattttctcttccctgcctcaccagcttgtgtgagcacatgcacc-tgtcctgcctctgctgccagcaggagtgcactctgctctccttcccctgccatactgccgttacagtcaaagctgtactgggcacagagcccaccagtcctgcctctgtcagtgacctgcccctgtgccaacactgccaccagaatgaaactaggcactgaaaacaatgaaccct-cccctgccctgagcagccacagagggtgcacacacacctgcacccaccagtgtcctgcccccatactagcaccaccatcagtgcaacaatgcacacagtcaccaat-ggggcctgctgacctcccgagttatgctgactctactcctgctgtcaatgctttcatggagccaggcatctcagcacctgctagcagtctactgcagctgacaagcatgcatgctgatttaatactg------ctggtgctgctgagggcacctgtgaacaaggacaga-tccc--------actaccactaccctacaaaacactttg----gcacca-tccatcaatgtgtagtgaccagcagtccaggagcaccttagccaccccccatcagagtctgttcataaccttgagaagtcagagaacaaagtagggtaggatacaagtccaccagaattaaaacatgcagttggggagatgacagctgaaccttggtccccaaaaatcttccagaaatgaagccagttgactgactccaccttataacacaatcaaactctcaaagtcatccaacaggataaaagaaaaaacatccaaaggacaggaacttcaaagattgaaaaaacattagcccacaaaaatgaggaaaaaaccagtgcaagaactctgataagtcaaaaagccagcgtgctttctttccttcaaatgcctccaccagctctccaacaaaagtttttaactgagctgggatggctgagatgacacaaatagaatttaaagtatggatagaaattacgagcatcaaggtgcaggagtacgttgaaacccaatccaaggaagctaagaaccacaataaaacaatgcaggagctgacagacaaaatagacggtatcgaaaagaacataactgacctgatagaactgaaaaacacgctacaaaaatttcataatgcaatcacaactattaacagcagaagagaccaagcagaagaaatgatattagtgctttaagactggctttctgaaacaacacaggcagacaagaatagagaaaaaagaatgaaaaggaagaaatgaaacctctgagaaatacgagtttatgtaaagagaacagatctgtgattcattggtgtccctgaaagacatggggagaatggcagcaacttggaaaacatatttcaggatatcatcgatgagaactttctcaacctagctagagaggctaacattcaaattcagaaaatacagaaaacccatgtaagacacttcacaggaagatcatctccaggacacataattatcagattttccaaggttgaaacgaaagaaaaaaatacaaaaggcagctagagagaaaggtcaggtcacctacaaagggaagcccatcagactaacagcagacctctcaacaaaaactctacaaaccagaagaggttgggggccaatattcaagattcttaaag-aaaagaaattccaacccagaattttacatctggccaaactatgcttcataagtggaggagaaataagatccttttcagacaggcaaattctgagagaatttgttactaccagactgacctgccttgcaagagctcctgaaggaagcactaaataagaaaaggaaagatcattaccaaccacttcaaaaatatgctgaagtacacagaccaatgacactatgaagcaaccacacaaacaagtatgtatggtaactaactaacagcatgatgacaggatcaaatccacatgtatcaatactaaccttgaatgtaaatgggctaaatgccccaattaaaaggcacagagtgataagctggaaaaaaaagcaagacccaatggtatgctgtcttcaagag------------------------------------------------------------------------acattcaatgacacccataggctcacatgcaatgacacccataggctcaaaataaaaggagggaggaaaatccactaagtaaatagaaaacataaaaaatacagagattgtaatcctaatttcagacaaaacagactttagaccaacaaaaataaaaaaagacaaaaaaggg-gattacataacggcaaagggttcaattcaacgagtagtgctaactatcctaaatatatgtgcacccaacacaggagcaccctgattcaaacaagttcttagaaacctacaaagaaacttagactcacacacaataataatgagagacttcaataccctactgacagtattagacagatcactgaggcagaaaattaataaagatatttaggaccttaactcagcactggatcaaatggacctgatagatgtttacagaactctccaccaaaaagcaacataatatacattcttctcatcaccacatggcacatattctgaa i macFas5.chr7 C 0 N 0 s papAnu2.chr7 85478525 4268 - 162156779 gcatatgttcaaaTATCATTGTGCTTGATAACagtgaatgatccttttaatgtgctgtcaGATTTAGTGTGTTAGTATTTtggcatttatgttcatcagagatactggatTGAACCTTTCTTTTAGTATCCATCTGTGGCTTAGATATCAGAGTAATAcaggccttataaaatgagtatGGAAGTGTTCCCACCTCTtcaatttttggaagagtttggagtaAATTGATATTAGCTCTTTTTCAcatgtttggtaaaatttaaaagaaaatccattaggtcctgggcttttctttgctg-------------------gatttaattttattccttacagatctgttaagattttttatcttttcttcatttaattttgataagttgtgtccagaaatttatctatttcttccagATTATTCAATTTATTATAGTATAGTTGTTAAAACTTACACGAAGTAAGTgttttttatatagtttttgaCATATTTATAATGTCATGTATTAATTTCTACAGTATTACAAAGAATAATTTCTCCACTCTAAATTGTTCTTCAACTTAAATTATTCgactcttctttcttctccttttactCTTGGTAACCAGCAGtcttttactgtctctatagttttaatttttccaaaatgtcatatatttGGAGTCATACAGTATATAACCTTTCAAAACTGGCTTCTTTCAGCTGGCATTATGCATGTAAGATTCATTCATGCCTTTTTATGGCTTGGTAGTTAATgccctttttattgctgaataacattCTATTGTAAATATAGCACAGTTAGTTTATTCATACACTCGTTGAATAACATTGTGGTTTTCTCCAATTTTTGTCTGTTAGGGAATGAAgttgctgtaaacattcatgACTGGGTTTTTGTGTACACATGTTTCAAATCAGTTGGGTAAATGCCTAGGAGTATGATCATATGGTAAGGCTATgcttagctttgtaagaaacttccAATTTGGTCAAGATGTCTGACTAGATGCAGCCAGGTAGAATAGCTGTCACTGTGGGACTGGGATGACTGGCACACTCCTAACAGGTCCTCAAGACACAAACGCTGGGCAGAAgggagaggaagctgggaaccctggGTGGGGTGACCGTGCAATGGGACTCACTCCTGGCCCCCAAGAACTTTGGGGGAAAGGGTGAGTTGAACTGGCAGGGAGCAACCCACTTTTGCCATAAGCCTCTGGAATCCCACCAGGAGGAGACCCCTCAACCACCACAGACACAGagttggcagggagagctgcttagaaGAGTAGTAGGAGCAGCATGCTAGCCGATATGGCGCCCAGAGGGTTTGTTGCAGGAATATCTATAACAGAGCACGGCTAGGGATGCCCATCCCTCCAGGCTTGAGTTGCTTCCATGGGAGACTTTTGCCCTAG-----GGGAACTGTCGGACATTAATTCTGCAGGGCAGTCTTGCCCATCAGATAGGGCAGATCCAACCT-------------------------------------TAGTACCCCCTGATCTGCTGACCCCTCCCAGTGCTCCAGCCTGGCTTTTTTCTGCTTGCAGTGCAGACTCAGGTTCCCTGGGGACCCACATCTTAGTTTCTGCACTGGCAGACCATATGTGATTGGTGGAGAGCTCCAGTGGGGTGGCCCTGAGGGCCATGCACCTGCTTGCGTGCTCCCTACCTCTGCTGCAGCTTCTTCCAAGCCCATGGCTATCTGCCCCTGCCCCCTGACATCATTTGGCTGGCTTGTATGTGTGCAGGTGGATTTTCCCTTCCCTGCCTCACCAGCTTGTGTGAGCATGTGCACCTTGCCCTACCTTTA-TGCCAGCAGGAGTGCACTCTGCTCCCCTTCCTCTGCCATACTGCCATTGCAGTCAGAGTTGTACTGGGCACAGAGCCCACCAGTCCTGCCTCTGTCAGTGACCTGCCCCTGTGCCAACACTGCCACCAGAATGAAACTAGGCACTGAAAACAATGAACCCT-CCCCTGCCCTGAGCAGCCACAAAGGGTGCACACACACCAGCACCCACCAGTGTCCTGCCCCCATACTAACACCACCATCAGTGCGACAATGCACACAGTCACCAATGGGGGCCTGCTGACTCCCCAAGTTATGCTGACTCTACCCCTGCTGTCAATGCCTTCATGGAGGCAGGCATCTCAGCACCTGCTAGCAGTCTGCTGCAGCTGACAAGCATGCATGCTGATCTAATACTG------CTGGTGCTGATGAGGGCACCTGTGAACAAGGACAGAttccc--------actgccaccaccctaCAAAACACTTTG----GCACCA-TCCATCAACATGTAGTGACCAGCAGTCCAGGAGCACCTTAACC-CCCACCATCACAGTCTGTTCATAACCTTGAGAAGTCAGAGAA-AAAGTAGGGTAGGATACAAGTCCCCCAGAATTAAAACATGCAGTTGGGGAGATGACAGCTGAACCTTGGTCCccaaaaatcttccagaaatgaagccagttgactGACCCCACATTATAACACAATCAAATTCTCAAAGTCATCcaataggataaaagaaaaaacatccaaAGGACAGGAACTTCAAAGATTGATAAAACACTAgtccacaaaaatgagaaaaaaaccagtgcaagaactctgacaaGTCGAAAAGCCAGTATGCCTTCTTTCCTCCAGATGCCTCCACCAGCTCTCCACCAAAAGGTTTTAACTGAGCTGGGATGACTGAAATGACACAAATATAATTTAGAGTATGGATAGAAATGAAGAGCATCAAGGTGCAGGAGtatgttgaaacccaatccaa-gaagCTAAAAGTCACaataaaacaatgcaggagctgacagacaaaatagatggtatagaaaagaacataactgacctgatagaactgaaaaacacactacaaaaatttcataatgcaatcataactattaacagcagaatagaccaagcagaagaaatgatATTTGTGCTttaagactggctttctgaaacaagacaggcagacaagaatggagaaaaaagaatgaaaaggaacaaatgaaacctctgaaaaaTATGAGTTTATGTAAAGAGAACAGATCTATGATTCATTGGTGTCcttgaaagagatggggagaatggcagtaacttggaaaacatatttcaggatatcatccatgagaactttctcaacctagctagagaggctaacattcaaattcagaaaatacagaaaacccaTGTAAGATACTTCACAGGAAGATCATCTCcaggacacataattgtcagattttctaaggttgaaatgaaagaaaaaaatacaaaaggcagctagagagaaaggtcaggacacctacaaagggaagcccatcagactaacagcagacctctcaacagaaactctacaaaccagaagaggttgggggccaatattcaatattcttaaag-aaaagaaattccaacccagaattttacaTCTGGCCAAACtatgcttcataagtgaaggagaaataagatccttttcagacaagcaaattctgagggaatttgttactacCAGActgacctgccttacaagagctcctgaaggaagcact-aataagaaaaggaaagatcaTTACCAACCGCTTCAAAAatacactgaagtacacagaccaatgacactgtaaagcaaccacacaaacaagtatGTATGGTAACCAACTAAcagcatgatgacaggatcaaatccacacatatcaatactaaccttgaatgtaaatgggctaaatgccccaattaaaaggcacagagtgataagctggataaaaaagcaagacccaatggtatgctgtcttcaagag------------------------------------------------------------------------acatgcaatgacacccataggctcacatgcaatgacacccataggctcaaaataaagggagggaggaaaatctactaagtaaatagaaaacataaaaaatacagagattgtaatcctaatttcagacaaaacagactttaaaccaacaaaaataaaaaaagacaaaaaaggg-gattacataatggcaaagggttcaattcaacaagtagtgctaactatcctaaatatatgtgcatccAGCACAGGAGCACCCTGATTCaaacaagttcttagaaacctacaaagaaacttagactcacacacaataataatgagagacttcaacaccctactgacagtattagacagataattgaggcagaaaattaataaagatattcaggaccttaactcagcactggatcaaatggacctgatagatgtttacagaactctccaccaaaaagcaacataatatacattcttctcatcaccacatggcacatattCTGAA i papAnu2.chr7 C 0 N 0 a score=541894.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 459385 6340 + 478999 ATGGTCTATAATT-GGGACACGTATCTAGACTCAACGATGCCTGGATGGAAA-ATGTGCAGGCTGCTCCACTGATGTCAGCTGTTTCATCACAGTTTTATGATTTAATAAAAGTCATATTTTTTTTCATTTTTGCACATCAAATTTTTTTCTGTGATCCATATTCCTAAGCCCATCTTTGAGCTCACAGCCCTTTCCCAAGAAATCAACATCTAGACCTCCCTCTTCTCGGGGCTCCGAGGTGA-TTCCTGAGTGGCATCCTCTCCACCTCCCTGCTGGGAACAGAGCCAGTTGCAGGGCTCACGGGCAGCCTTAGAATGTCTGCTCCTCCGGGGTGTCCCCCTGCTTCTCACTGGAGAAGAGGCCTCTGGGGTGGTCACAGCCTCTTTCTCCACATGAACCCTGAGAGTTCTTCCTGAGCTACACAGCTGGGGGAAGACTGCCCTAAGAGACGTGAAAAGAGAGACATGGGAAGTGAGGTGTCTCAGCTCTTGTCTCCCCTGGGTGGTGtggcctgacctcaccagagccccagcctaacccacctgacctgtccCCAGGAGCTGTACTGAGCGATGGCTGCACCTGCTCAGTTACCTGTGGGGCCCAGTGCCTCTGAGAGAGGTGCCCAGTGAGGGCTCTGCAGGGCTCCCCCCGAGCAGGAGCTGGGCTGAGGGAAATCAGCAGGAGGTAGGGGCTGCCCAGGCCCTGGGGAGGCAGGCAGCGTGGAGAGGACACAGAGGTGCACTGGGAGGGCGCAAGCCAGTCAGGACCACCCTCTCAGCTCTGAGAAATGAGCTATGCTCACGGAATGCTCACAGTCAAATCCTGCTGGGAGGGCCATCCTCTGCTCGGGTTCTCTACTGTCCAGGGCAGGAATGACTCATGTGGCCATTCAGAGGCGAGGCCCCACCAGGAAGCATCCACTGACTGCCCAAGGCTGTGCATCCCCATAGCGCTGAGCTCATGTCCCTGACCTGTGGCCTCTGGGCCCACACTCTGCTCAAAGTTCCCTCAGGGGGATGAAGGGAGAGGCGGGCCCTAGGGCAAGGGTGCCCAGGAGGAGAGAAGGAAAAGGCAAGCATGTCTTCATCAGTGGGGTTTTCTCCTGAGAGCAGAATTCATTTCCACACCTTCCAAGTTCCCTCTTGTGGCTGGCACTTCTCTGACCTGGAGCCCCAGATGGCGGGGCACTCAGAAGAGGGAGGGTCATTCCTGGGAGCAGATAAGGCCTCCTCCTTCTCCAGCTCCTGAATCAGAAACTGAGGCCTCCCCTGGACCTTCCCTGCTTATGACTGAGGCCTCCCACGTGCAAAGCACACCTTCATCTTGCACTGAAGTCTCAGGACCTGGAGAGCACCTCCACACGGGGGGCTGGATCCTCCTGGAACTGTAAGCCTTGCCCAGAAAGCCCTGAAGGGGAGCAGGGAGGCGGCAGCAGCACAGCCTTCTTCAgcttccaggggaagggatgagggaggcgggtggacgagcttccaaccggcatggcatgggatgctgaaaaacgcgatgggctctggcctattggagccatctctccttgtcctgtacctgcccctt-gggggtttagggcagaggaaatgttggcttgttgtgtgagtcagataaacaggtggggagaatgggcccgtatgccctggtttgcacaggaaaggtgtgctcaccagcaagtgtttcttcta--------gaaattaagtaatcctgggacaggcttttcctccccagttccacaagactccaagatgtcagagtatcataaacacggagaataaggacacaggattaaCCCAACCCAACCTCTGATGGTTTCATGTCATGTGAAGGAATTTTTGGAGTGTTGATGCtgaagagtttacagagtgtggctacatcagttgccctaaaggatatagaaaacattttactgtgagagtagagaggaggaacacaagtagaagtatcaagagtcgctgccagccagcccataaataggtttcccatttgtatgacagccaagaaacctggtctgagacagctggggtcgcaaacaatgtcttggtgcagttataAATTTCTTTATGCAT---------GTAtttttctaacaataatattttggtgtctttcttgggtcaaggtggcaggtcctctagtcacattgttggagtgcatggatggatgggttagtaaattatttctcaagattagtggta----------atcaaaaggtggaagtgttggtggtggtcgtagttcagagatgcgggttgggagtgggaaaagttactggggagtgggtggttctctcctcatggtgtcaaagggttgatggatatgaggcaggttcctttgtgtgcagcaatgacctctgctgattttcagactgacagagatggtagtaaccactatcagatttctctgtatgaacagaaatgtagtgtagcatgttgtggcaaacagcaaggagtgcact-gggatcctggaccaaatggacagcaagctcagggagcacaataggatccctagtatccaagggacaaaagcaaggcatgtccaatgccttattgtttcattgagagacttcccaggccatgactggtgttaaggtttagggcacaactgtctccagctcgccggggaaaagccaaagccacctccagctttgagccctgggccaggccgatgtgctctaggatggggtactagggtgtcctttccaggtgggcaTGTGCTCAAGCGGACTGACTGGCTAtcagcacttgccgtgtttggttgaagtgatggcctatttggaggtttctgccctttggattataacaaataagtccacaatacaagcagccacatggacaatggtgagaccagcagtcaacagaggggtgcttggctgcagttggcaggtgttgatgttgttttcatttgttttttgaGTTTgtttttgtgga--------------------------actttacgttcaaatgggctcatatcagatgagcagccgactgacccac------------------------------------------------------------------------------gggaccctctatggctaatcatccgaggagagtttttaccctcaataggttctccagcccttatgagataagagcaacatcaaacatttgtaaagatatggaaataatattttaaatagcctcaataatgcaatgaatataagcctataagtatctcaaagggtgatggagaagtcctgaaagctgggatgagggcgactcagctaagagccttgaatttagggagagttagttctacagaagttggagatccattgggtgtccatttactggagtggaatttgaaggaattgtttgaggagatcagtatgtctctgagttaaaccagcccataattaagttctattgaatggggcctaagaggcatgaagttctatcaagtggctttttctgtatccagcattgtgtgttttgaaaagtaaaatgtgtgacttggttactgtcagcaaagtatgcaattttgaaggacattagtgtcccaccaaagcctcgtattgtgaacttattatgtgcagagatatgagccacttgatttatattttcagtgtctgggaggcaagagactttcagatttccttaccctgaagacagctcttaaacaacgtctgagctgtttataataaatgtggaaatggagccattggttcgatagggcacccaatgctggtgtgactgcctgatgtctgcctaattttgggg-atccccagccccatcctttgttgggacatatggccaagagagggagagcagaagcatgccccaagccccatcacttgtcatccttgcagcccgcaaatgccagtcactgtccactcagtgagtcccagcgttcttcccatgtggccgagaggtggcctcctccagcacttgggcacctgccaggtgactgtggatataggaagccagtcctgctgcaagcagaaatgacagagggcctgggtgttgctttatcctgtcttaagaaggcctctggagccatgctaagtgtgtggggtgctgttcccgtgaccccaaacacaatagttagctggatgtgtcca-aatagtccaggttgtagacagcaatgttcagttgaatgatttatagtccaaggccaaagggagcagttacttgccttggaaactgtcgagcatcttaaggccacattgatcgcccagagacaccaggaggcatgagaagggtttgccaagtttctttagtgaaggagtttctgaggatactaacagaagagcctgttgattttaaattaggcacactgttgagccttttgttgaaggaaatttcatttaggggaggtgatttataagtagcaacaacagcgaggctagttgaaatttatgggtgaggaatatgttgcaccagaacccacaaggaacagcaggatgtggcatttgtatgtccttaatgaaagtatggggagcatctcctcagaggaggtgtcagcagtgctgcggaggaaggcagatgcagtgaggagccagcctgcgaagctctcatgtggtggccacgccgctgaggtgcccgcgtatcctgagaagggtgtccttcccaggcaaagacaatctgcagctaaggggctgctgagatgggcgctgagtacaaccaattagacacatctggaagagcaaagtctgcactggctgttggttaaagccagtcgttttgagaacattgggagtatggggccctaatgggtggggccacggcatgaaagttgtgacaatccaacatagggcaaccttcatgctattgtcttttcttcttcaccggtttaagaacaggcaagatttggctgtgaaatagagaagcaatgggaaaaatcacctctttattgattagatttgtataatagtttttaatcttcgaaggtccattttcacttctgttggaatatattaactacataaactggaactctttgagttccattttatcaagccaatgcacaagtgccaaacacctcattccattttaatttaattcattgtgtcagagtgtatgcccaatatgagatattttaggacaaaggacattatgatcatgtgaaatctaggcaaggcaaccgctaaagtgcggtgtgtctatttcttcttccaaatatattgatttctatttaattatcttaagttcacatgggatacatgtttaaatcttgaaatctaatgaatttcctaggtatagctattattggagccctggtattgatcacaaagtttgccaattggtgcaatcccaaaaatgctaaagtgaaattacaaTGGACCAGTAtacagttccaaggtcagagtctggaaggcgtttcacagaactaaagacttgagcaccagccatgctgcttccttctagagttatctgggagaatctatctcttgcctttgccagctcctaggggcgcctgcgttccccggctggtggctgtgtgactgacctccgcttccatcccacacctccccagtcttggactctgctgctcctctttctcctcatcaggaccccagggcatatggcatgcacaggccagggtgactgtaacatccaagggcctctatcacgtcagcccagtccctttggccctgcaggtgatgtctttgtagagccccaggactatggcatgggcatctttggggggcattcttctgcctgctgcaGGATCTAGATTCCCCTCTCTAGAACCTGTAGTGTAGAGGGGCACGAAGCCAACCAGCTTCATTTTCAATTTTTGTCTTAGAAGTTATTTCAGTACAGAATTTTGTATATAAACTTTGGATTTCTAATTGGTCAAATGATGGACATTTATTTAAATTTAGTTATATATATA--CATTATATATACCAAAGTGATATATAATTATATAAATAATTATAATACTGTTATAATTATATAAATAATTATAATACTGTCATAATTATATTAGAAATATACTATTATAATTTTATAATAATTACATTTATATAAAATATCTATATGTAGTTTCATGATTATTTAGTTCCTTTTCATTTTTGGAACCTATGCTAATATTTCCCCTCTATTGCTCCTCTTTCCCTAAGGTCTCGAGTTCCTCTGAGCCTGATGATGAGCCAGGACAGGAAGGGGCCTGGGCCTCCAGGCAGCAGCATCTCTCCAGGATGCCCCCAGCCACAGCATAAGGAATTCCTACACTTTTGTTATCTTAAACAAAACCTTCTAGAATTCCTTCTAACTCTAGGAGACTGAAATGTATTTTTCTTTCTTTCAACTGTCTCCTGTCTGTCCCTGACTCCCTCACTCCGTTTTTTAATGTTTGGCCATTTATCtcatgagcttactaaaaataaattgtatactcagcaatggataacatagaagaaatggataaattcctagatatgtaca s ponAbe2.chr15 18701918 6388 + 99152023 ATGGTCTATAATTTGGGACAAGTGTCTAGACTCAGAGATGCCTGGATGGAAATATGTACAGGCTGCTCCACTAATGTCACCTGTTTCATCACAGTTTTATGATTTAATAAAAGTCAT-CTTTTTTTCATTTTTGCACATCAATTTTTTTTCTGTGATCCATATTCCTAAGCCCATCTTTGAGCTCATAGCCCTTTCCCAAGAAATCAACATCTAGACCTCCCTCTTCTCAGGGCTCCGAGGTGACTTCCTTAGTGGCATCCTCTCCACCTCCCTGCTGGGAACAGAGCCAGTCGCAGGGCTCACGGGCAGCCTTAGAATGCCTGCTGCTCCTGGGTGCCCCCCTGCTTCTCACTGGAGAAGAGGCCTCTGAGGTGGTCACAGCCTCTTTCTCCACATGAACCCTGAGAGTTCTTCCTGGGCTACACAGCTTGGGGAAGACTGCCCTAAGAGACATGAAAAGAGAGACATGGGAAGTGGGATGTCTCAGCTCTTGTCTCCCCTGGGTGGTGTGGCCTGACCTCACCAGCGCCCCAGCCTAACCCACCTGACCTGTTCCCAGGAGCTGTACTGAGCGATGGCTGCACCTGCTCAGTTACCTGTGGGGCCCATTGCCTCTGAGAGAGGTGCCCAGTAAGGGCTCTGCAGGGCTCCCCCCGAGCAGGAGCTGGGCTGAGGGAAATCAGCAGGAGGGAGGGGCTGCCCAGGCCCTGGGGAGGCAGGCAGCGTGGAGAGGACACAGAGGCGAACTGGGAGGGAGCAAGCCAGTCAGGACCACCCTCTCAGCTCTGAGAAATGAGCTGTGCTCACGGAATGCTCACAGTCAAATCCTGCTGGGAGGGCCATCCTCTGCTTGGGTTCTCTACTGTCCAGGGCAGGAATGACTCATG--GCCATTCAGAGGCGAGGCCCCACCAGGAAGCATCCACTGACTGCCCAAGGCTGTGCATCCCCATAGTGCTGAGCTCATGTCCCTGACCTGCGGCCTCTGGGCCCACACTCTGCTCAAAGTTCCCTCAGGGGGATGAAGGGAGAGGCGGGCCCTAGGGCAAGGGTGCCCAGGAGGAGAGAAGGAAAAGGCAAGCATGTCTTCGTCAGTGGGGGTTTCTCCTGAGAGCAGAATTCATTTCCACACCCTCCAAGTTCCCTCTCATGGCTGGCACTTCTCTGACCTGCAGCCCCAGGTGGCGGGGCACTCAGAAGAGGGAGGGTCATTCCTGGGAGCAGATAAGGCCTCCTCCTTCTCCAGCTCCTGAATCAGAAACTGAGGCCTCCCCTGGACCTTCCCTGCTTATGACTGGGGCCTCCCACGTGCAAAGCACACCTTCATCTTGCACTGAAGTCTCAGGACCTGGAGAGCACCTCCACACGGGGG-CTGGATCCTCCTGGAACTGTAAGTCTTGCtcagaaagccccgagggggagcagggaggcagcagcagcacagccttcttcagcttccaggggaagggatgagggaggcgggtggacgagcttccaaccggcatggcatgggatgctgaaaaacgcgatggactctggcctattagagccatctctccttgtcctgtacctgcccctcagggggtttagggcagagggaatattggcttgctgtgtgagtcagaaaaacaggtggggagaatgggcccatatgcactggtttgcacaggaaaggtgtgctcaccagcaagtgtttcttctattcttctagaaattaagtaatcctgggacaggactttcctccccagttctgcaagactccaagatgtcagagtatcataaacatggagaataaggacacaggattaaCCCAACCCAACCTCTGATGGTTTCATATCATGTGAAGGAATCTTCAGAGTGTTGATGCtgaagagtttacagagtgtggctacatcagttgccctaaagggtatagaaaacattttactgtgagagtagagaggaggaacacaagtcaaagtatcaacagttgctgccaaccagcccataaataggtttcccatttgattgacagccaagaaacctggtctgagacagctgggctcgcaaacaatgtcttggtgcagttatacatttctttatccattttctttatgtatttttctaacaataatattttggtgtctttctcgggtcaaggtggcaggtcctctagtcatgttgttggaggtcatggacggatgggttagtaaattatttctcaagattagtggtatctatgtgtaatcaagaggtgggagtgtttgtggtggtcgtagttcagagacacaggttgggagtgggaaaagttactggggagtgggtggttctctcctcatggtgtcaaagagttgatggatatgaggcgggttcctttgtg--------------------------------------atggtagtaaccgctatcagatttCTCTGTATGAACAGAAGTGTAGTGTAGCATGTTGTGGCAAACAGCAAGGAGTGTACCCGGGATCCTGGGCCACATGGACAGCAAGCTCAGGGAGCACAATAGGATCCCTAGTATCCAAGGGACAAAAGCAAGGCGTGTCCAATGCCTTATTGTTTCCTTGAGAGACTTCCCAGGCCATGACTGGTGTTAAGGTTTAGGGCACAACTGTCTCCAG-TCGCAGGGGAAAAGCCAAAGCCACCTCCAGCTTTGAGCCCTGGGCTAGGCCGATGTGCTCTAGGATGGGGTAATGGGGTGTCCTTTCCAAGTGGGCGTGCGCTCAAGTGGACTGACtgggtatcagcgcttgccgtgtttggttgaagtggtggcctatttggagggttctgccctttggattataagaaataagtccacaatacaagcagccacatggacagtggcgagaccaacagtcaacagaggggtgctcggctgcagctggcaggtgttgatgttgttttcatttgttttttgaTTTTGTTTTtgtggacaaaatgtggacaaaatgtTCAGTGGACAAAACGTTCAAATGGGCTCATATCAGATGAGCAGCCAACTGACCCATTTGGctggggagtgggtggttctctcctcatggtgtcaggagttgatggatatgaggcaggttcctTTGTGTGCAGCAgggatcctctatggctaatcatcggaggagagtttttaccctcaataggttctccagcccttatgagataagagcaacatcaaacatttgtaaagatatggaaataatattttaaatagcctcaataatgCAATGAATATACGCCTATAAATATCTCAAAAGGTGAtggaaaagtcctgaaagctgggatgagggcgactcagctaagagccttgaatttagggagagttagttctacagaagatggagatccattgggtgtccatttactggactggaatttgaaggaattgtttgaggagatcagtatgtctctaagttaaaccagcccataattaaattctattgattggggcctaagaggcatgaagttctatctggtggttttttctggatccagcattgtgcgttttgaaaagtgaaatgtgtgacttggttactatcagcaaagtatgcaattctgaaggacattagtgccccgccaaagccttgtattgtgaacttattatgtgcagagatatgagccacttgatttatattttcagtatctgggaggcaagagactttcagatttccttaccctgaagacagctcttatacagcatctgagctgtttataataaacgtgaaaatggagccattggttcgatagggcacccaatgctggtgtgactgcctgacatctgcctaattttgggggatcgccagccccatcctttgttggaacatatggccaagagagggagagcagaagcatgccccaagctccatcacttgtcatccttgcagcccgcaaatgccagtcactgtccactcagtgagtcccagcgttcttcccacgtggccaagaggtggcctcctccagcacttgggcacctgccaagtgactgcggatatgggaagccagtcctgctgcaagcagaaataatagagggcctggatgtggctttatcctgtcttaggaaggcctctggagccatgctgagtgtgtggggtgctgttcccctgaccccaaacacaatagtcagctgggtgtgtccagaacagtccaggttgtggacagcaatcttcacttgaatgatttacagtccaatgccaaagggagcagttacttgccttggaaactgtcgagcatcttaaggccacattgattgcccagagacaccaggaggcatgagaaggggttgccaagtttctttagtgaaggagtttctgaggatactaacagaagagcctgttgattttaatttaggcacattgtagagccttttgttgaaggaaatttcatttaggggaggtgatttataagtagcaacaacagtgaggctagttgaaatttatgggtgaggaatatgttgcaccagaacccacaaggaacagcaggatgtggcatttgtatgtccttaatgaaagtatggggagcatctcctcagaggaggtatcagcagtgCTGCGGAGGAAGGCAGATGCAGTGAG-AGCCGGCCTGCGAAGCTCTCGTGTGGTGGCCAAGCTGCTGAGC-----------------AAGGgtgtccttcccaggcgaagacaatctgcagctaaggggctgctgagatgggtgctgagtatgaccagttagacacatctggaagagcaaagtctgcactggctgttgattaaagccggtcgttttaagaacattgggagtacggagccctaatgggtggggccacggcatgaaggttgtgacaatccaacatagggcaaccttcatgctattgtcctttcttcttcactggtttaaggacaggcaagatttggctgtgaaacagagaagcaatgggaaaaatcgcctctttattgattagatttgtataatagtttttaatcttcgaaggtccattttcacttctgttggaatacattaactacataaactgggactctttgagttccattttatcaagccaatgcacaagtgccaaacacctcattccattttaatttaattcattgtgtcagagtgtatgcccaatatgacttactttaggacaaaggacattatgatcatgtgaaatctgggcaaggcaaccgctaaagtgcagtgtgtctatttcttcttccaaatatattgatttctatttaattattttaaggtcatatgggatacatgtttaaatcttgaaatctaatgaatttcctaggtatagctattattggagccccggtattgatcacaaagtttgccaattggtgcaatcccgaaaatgctaaagttaaattacaaTGGACCAGTAtacagttccggggtcagagtctggaaggcgtttcacagaactaaagact-gagtgccagccatgctgcttccttctagagttatctgggagaatccatcccctgcctttgccagctcctaggggcgcctgcattccccggctggtggctgtgtgactgacctctgcttccatcccacacctccccggtcttggattctgctgctcctctttctcctcatcggaaccccagggcatatggcatgcacaggccagggcgactgtaacatccaagggcctccatcaggtcagcccagtccctttggccctgcaggtgatgtctttgtagagccccaggactatggcatgggcatctttggggggtattcttttgcctgccgcaGGATCTAGATTCCCCTCTCTAGAACCTGTAGTGTAGAGGGGCACGAAGCCAACCAGCTTCATTTTCAATTTTTGTCTTAGAAGTTGTTTCAGTACAGACTTTTGTATATAAACTTTGGATTTCTAATTGGTCAAATGATGGacatttatttaaatttagttatatatatatacattatatatatcaaagtgatatataattatataaataattataatactgttataattatat-----------------------------tagaaatatactattataattatataataattacatttatataaaatatctatatataGTTTCATGATTATTTAGTTCCTTTTCATTTTTGGAAACTATGCTAATATTTCCCCTCTATTGCTCCTCTTTCCCTAAGGTCTCGAGTTCCTCTGAGCCTGATGATGAGCCAGGACAAGAAGGGGCCTGGGCCTCCAGGCAGCAGCATCTCTCCAGGATGCCCCCAGCCACAGCATAAGGAATTCCTACACTTTTGTTATCTTAAACAAAACCTTCTAGAATTCCTTCTAACTCTAGGAGACTGAAATGTACTTTTCTTTCTTTCAATTGTCTCCTGTCTGTCCCTGACTCCCTCACTCCGTTTTTTAATGTTTGGTCATTTATCtcatgagcttactaaaaataaattgtgtgctcagcaatggataacatagaagaaatggataaattcctag-tatgtaca i ponAbe2.chr15 N 0 C 0 a score=738.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 465725 5 + 478999 atctt s ponAbe2.chr15 18708306 5 + 99152023 atctt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 122508 5 - 162156779 ACCTg i papAnu2.chr7 N 0 C 0 a score=2344432.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 465730 2894 + 478999 ccaagattgaatcttgaaaaagtagaaacagaactattactagtaaaagactgaatcagtaatcgaaagcgagcttggaaccacttccaaaagtttttttgtttgtttgtttgtttgttttttgagatggagtctcgctctgttgcccaggctggagtgca-tggcatgatctctgctcactgcaagctccacctctcaggttcacgccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggatgacaggtgcccaccaccatgcccggcta-----attttttgtatttttagtagagatggggtttcaccttgttagccaggatggtctcgatctccagaccttgtgatccacccatctcgacctcccaaaagttttaagatgaagaaatacttctaaacttattttataaagtcagcattgccctgaaatcaaaaccaggcaaacaccaaattaacataaattacagaccactcttactgaaacacaaagatgcaaaaagtactcaacaaaatattggcaaatcaaactgaacagcacattacaaggatcatttgccatgatccagtggaatgtctctctggaatattgggatggtgcaacatctaaacatcactgaatctgatggaccacattaacataatgaaagactaaaatattatc------------tcatcagatgcataaaaatcatttgacaaatttcaacatctttccatgataaaacctcttaacaaactacaaataaagggaaattatctggacatattgaaagccatatttaaaagcccacagttagcatcatagccaatgctgaaacactgaacaagcttccacttagatgatggagaagacaaggatgccctatctcaccaattctgttctacatagtattgtaagtcctagtcagagaacttaggcaagaaaa---agtta-ctaaatcagaaagagaggagtaaaggtgtcactgtttacagatgacatgtcttgtatgtagaaaatcctaaaaattgccccccaaaaTCAAAACAAAACCAAAACAAAACAGCTGTAagttgctaatttgtgtgtataaaattggtgttctgcaagatgaataagttctggagactggatgcacagaatcctgagtctagataacttgactgcacagtacactt-aaaaatttgctgagagagtgtatctcatggtaggtattcttatcacaatacaaactttaaaagttgtatatgaggACATTGGTACTGCTTTCATATTATTTATTATGAATGAATTTCCAAAAAAAGTGTTATCAGTAATGAGTTGAGGTAATGAGTAATTCATATACAGGAATAGCCTCAAGAGAACAAGAGGAAGAGATGCATTTAGAGTAGAAATCCTCACACTTTAGATGCATTTTAAATGTCTGGATAATGGAGTACTTAAAAAGGGATGTGTCTGTCTCTTCCCCCAACTATTGAGAATTAGTTCCTGAGTAAATCAAAGAACATTATTTTATCCAGCCCCGGTAGGTCCTGAGGTCCTTGTCTCTGGCATCACAGAATGGGTTAGAGTGCAGGGCTGGCGTAGAGCTCCTGAGACAGTAATGTGATGTTGTCCAAAGCTCCATGGGTGAGGAGAGCCACACCACAGGTGGGACCCAAGGAAAGAGCCCAGGAGCTGTGCTGGGCTCAGCACTGAGGAAGCAAGACCTGGGCCTGTGGATAGGGGGAGCTGCGCTAGAAACAAGGAAGGGCAGGAGGGAAGAGGGGTTGGAAGGAAAGTAGCCCTGGGATCAGAATGGCAGGGCTGTCCTTTGCCTATTCCCATTTGTCTCGCAGACCAAGTGTCCTCCAACCACCAAATGTCAAGTGACATGCGTGCCACATGAGTTTAGGAGGAAAGGCACTCTACACAACGCTCAACTACCAGGAGGTAGGGGCCATATCTTAA--CTTTTCTACTTATAAAAAGAGTCAGCTAggctgggcacggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggccgaggcagacagatcacatgaggtcaggagtttgagaccagcctggctaagtgacaaaaccctgtctctactaaaattacaaaaattagtcaggcatgctgctgggcacctgtaatcccagctactagggaggctgaggcaggagaatcgcttcaacccgggagaaagaggttgtagtgagccgagattgcaccaccgcactccagcctgggcgacagagcgagactctgtctctaaataaataaataaataaaT------------AGTCATCCACCCCGTGTAATTTTTTGTTTTAGCTCTGGGGTAAAATCCACCCCTGGGCTGTGGAAGCATCCAGTCACTTCTCAGACTGGGACGGTGTCTCTGGGGAAGACAAAGGTGGGTTCAGAAGAAGATGAGATTGCTGGGCCTTCTCCTGTGCCTGCTGACACCTCCCGAAGGTGAGCATCTCAGAGGCCAGACACGGGCTGTGGCAATAactgtgatgtcccatgactgacagggactgactgttcttgttcccagctgtcctgtcccaggtgcagcagcaggAGTGAGGCTCAAGACTGGAGAAGCCGTGGCTGCCCCCTTCCTCACCTGGCACGACTCCGGATTCTCCATCACAGCCAGTGGTTACTGCGGAGGCCCGGTCCACCGGCCCCTAGACAAGGGGTTGCACTGGCTGAGGAGCATCGATTATAAGAGAAACACGAACAACCGCCGCCTCTCAAGAGCCTCATCTCCATCCAGAGACTCATC----------------------------------------CAACAAGCAGCGCTCCCTGCGGCGGAGCTCCAGGAACCCACAGGACAGCCAGGTATTCCTGTGGGAGACACAGTGAGGGGATGCCGTGTGAACCCAGACAGGACCCTCCCTCCTGGGGGCCTGAGATGTGCAGGATGCACTCGACACTTGGGTCC s ponAbe2.chr15 18708311 2937 + 99152023 ccaagattgaatcatgaaaaagtagacacagaactattactagtaaaagactgaatcggtaatcgaaagcaagcttggaaccacttccaaaagttttt--gtttgtttgtttgtttgttttttgagatggagtctcgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcatgatctccgctcactgcaagctccacctctcaggttcacaccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggacgacaggtgcccaccaccatgcctggcta-----attttttgtatttttggtagagatggggtttcaccttgttagccaggatggtctggatctccagacctcgtgatccaccctcctcggcctcccaaaagttttaagatggagaaatacttctaaacttattttataaagtcagcattgtcttgaaatcaaaaccaggcaaacaccaagagaacataaattacagaccactcttactgaaacacaaagatg-gaaacgtactcaacaaaatactggcaaactaaactgaacagcacattacaaggatcatttgccatgatccagtggaatgtccctctggaatattaggatggtacaacatctaaacatcactgaatctgatggaccacattatcataatgaaggactaaaatattatc------------tcatcagatgcataaaaatcatttgacaaatttcaacatctttccatgataaaacctcttaacaaactacaaataaagggaaattatctggacatattgaaagccatatttaaaaacccacagttagcatcacagccaatgctgaaaaactgaacatgcttccacttagatgatggagaagacaaggatgccctatctcaccaattctattcgacatagtgttgtaagccctagccagggaaattaggcaggaaaa----gtta-ctaaattagaaagagaggagtaaaggtgtcactgtttacagatgac-tgtcttgtatgtagaaaatcctaaaaaccgccaccccaaatcAAAGCAAAACCAAAACAAAACAGCTGTAagttgctaatttgcgtgtatgaaattggtgttctgtaagatgagttagttctggagactggatgcacagactcctgagtctagataacttgactgcaccgtacactt-aaaaatttgttgagagagtatatctcatggtaggtattcttaccacaacacaaaTTTTAAAAGTTGTATATGAGGACATTGGTACTGCTTTCATATTATTTATTATGAATGAGTATCCAAAAAAAGTGGTATCAGTAATTAGTC-------TCTCCCCCCCCCACTGAGGAATAGCCTCAAGAGAACAAGAGGAAGAGATGCATTTAGATTAGAAATCCTCACATTTTAGATGCATTTTAAATGTCTGGATAATGGAGTACTTATAAAGGGATGTGTCTGTCTCTTCCCCCAACTATTGAGAATTAGTTCCTGAGTAAATCAAAGAACCTCATTTTATCCAGTCCTGGTAGGTCCTGAGGTCCTTCTCTCTGGCATCACAGAATGGGTTAGAGGGCAGGGCTGGCCTAGAGCTCCTGAGACAGTAATGTGATGATGTCCAAAGCTCCATGGGAGAGGAGAGCCACACCACGGGTGGGACCCAAGGAAAGAGCCCAGGAGCTGTGCTGGGCTCAGCACTGAGGAAGCAAGACCTGGGCATGTGGATAGAGGGAGCTGTGCTAGAAACAAGGAAGGGCAGGAGGGAAGAGGGGTTGGAAGGAAAGTAGCCCTGGGGTCAGAATGGCGGGGCTGTCCTTTGCCTGTTCCCATTTGTCTCGCAGACCAAGTGTCCTCCAACCTCCAAATGTCAAGTGACATGTGTGCCACATGAGTTTAGGAGGAAAGGCACCCTACACAACCCTCAACTACCAGGAGGTAGGGGCCGTATCTTAACTCTTTTCTACTTATAAAAAGAGTCAGCTAggctgcgcacggtggctcatgcctataataccagcactttgggaggctgaggcagacagatcacatgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaagtgacaaaaccctgtctctactaaaattacaaaaattagtcaggcgtgctgctgggcacctgtaatcccagctacttgggaagctgaggcaggagaatcgcttcaacccgggaggaagaggttgcagtgagccgagattgcaccacctcactccagcctgggcaacagagcaagactctgtctcaaaataaataaataaataaataaataaataGAGAGTCATCCACCCTGTGTAATTTTTTGTTTTAGCTCTGGGGTAAAATCCACCCCCGGGCTGTGGAAGCAACCAGTCACTCCTCAGACTGGGACGGTGTCTCTGGGGAAGACAGAGGTGGGTTCAGAAGAAGATGAGATTGCTGGGCCTTCTCCTGTGCCCGGTGACAGCTCCCGAAGGTGAGCATCTCAGAGGCCAGACATGGGCTGTGGCAATAactgtgatgtcccatgattgacagggactgattgttcttgttcccagttgtcctgtcccaggtgcagcagcaggAGTGAGGCCCAAGACTGGAGAAGCCCTGGCCGCCCCCTCCCTCACCTGGCACAACTCCGGATTCTCCATCACAGCCAGCGGTTACTGAGGAGGCCGGGTCCACCGGCCCCTAGATAAGGGGCTGCACTGGCTGAGGAGCATCGATTGTAAGGGAAACATGAACCACCACCGCCTCTCAAGAGCCTCATCTCCATCCAGAGACTCATCATCCATCCAGATGGAGACTCATCTCCATCCAGAGACTCATCAACAAGCAGCGCTCCCTGCGGCCGAGCTCCAGGAACGCACAGGACAGCCGGGTATTCCTGTGGGAGACACAGGAAGGGGATGCCGTGTGAACCCGGACAGGACCCGCCCTCCTGAGGGCCTGAGATGTGCAGGACGCACTCCACACTTGGGTCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 211753 2876 - 170124641 ccaagattgaatcatgaaatagtagaaacagaactattactagtaaaagactgaatcgataatcaaaaacGAGCTTGGAACCACTTCCAAAAGtttgt-----tgtt--gttgtttttattttgaga-ggagtctcgctgtgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcgatcttggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcacccaccaccacatccagcta--ttttttttttgtatttctagtaaagacaggatttcactgtgttagccaggatggtctcgatcttctgacctcgtgatccgcc-----tggcctcccaaaagttttaagatgaggaaatacttctaaatgtattttataaagccaacattgccctgaaatcaaaaccaggcaaacaccaaaagaatgtaaatcacagaccactcttcctgaaacacaaagatg-caaaagtactcaacaaaatactggtaaaccaaactgaacagcacattgcaaggatcatttgcaatgatccagtggaatgtctgtctggaatattaggacggtacaacatctaaacatccctaaatctgatggatcacattaacataacgaaggactaaaatattatctcatcagatgcatcatcagatgcataaaaatcatttgacaaatttcaacatctttccatgataaaacctcttaacaaactacaagtaaagggaaattatctggatatattgaaggccctatttaaaaacccacagttagcatcatacccgatggtgaaaaactgaacatgcttccactcaaatgatgaagaagacaaggatgccctatctcaccaattctattctacatagtattctaagtcctagccagagaaattaggcaagaaaaaaaagttgtctaaattagaaagagaggagtaaaagtgtcactggttacagatgacatgtcttgtatatagaaaatcctaaaaactgccccccaaCATCAAAGCAAAACCAAAACAAAACAGCTCTAagttgctaatttgtgtgtataaaattggtgttatgcaagatgaataagttctggagattggatgcacagaatcccgactctagataacttgactgcacagtacacttcaaaaatttgttaagagagtaaatctcatggtaggtattcttatcacaCTGCAAACTTTAGAAGTTGTATATTAGGACCTTGTTACCACTTTCTTGTTATTTATTTTGAATGAGTTTCAAAAAGAAGTG------GCAATGAGT--------TGAGGAATTCGTATGCAGGAATAGCCTCAAGAGAACAAGAGGAGGAGATGCATTTAGGTTAGAAATCCTCACATTTTAGATGCGTTTTAAATGCCTAGATAATGGGACACTTAAAAAGGGGTGTGTCTGTCTCTTCCCTCAACTATTGAGAATTAGTTCCAGAGTAAATCACAGAACATCGTTTTAGCCAGTCCCGGGAGGTCCTGAGGTCCTTGTCTCTGGCATCACAGAATGGGTTAGTGTGCAGGGCTCGCCTAGAGCTCCTGAGACAATAATGTGATGATGTCTGAAGCTCCACAGGTGAGGAGAGCCACGCCACAGGCGGGGCCCAAGGAAAGAGCACAGAAGCTGTGCTGGGCTCAGCACTGATGAAGCAAGACCTGGGCCTGTGGATGGGGAGAGCTGCGCTAGAAACAAGGAAGGGCAGGAGGGAGGAGGGGTTGGAAGGAAAGTAGCCCTGGGATCAGAATGGCGGGGCCATCCTTTACCCATTCCCATCGGCCTCGCAGACAAGGTGTCCTCCAAACACA-----------GACATGCGTGCCACATGAGTGTAGGAGGAAAGACAC-CTGCACAACCCTCAACTACCAGGATGT-GGGGCCGTATCTCAACTCTTTTCTACTTACAAAAAGAGTCACCTAggctgggcgcggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggctgaggcaggcagatcacttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccacatggcaaaatcctgtctctactaaaattacaaaaatcagtcatgcatgctgctgggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttcaaacaagtagaaggagcttgcagtgagccgagattgcaccactgcactccagcctgagtgacagagcgagactccgcctcaaaataaataaataaataaaG------------AGTCATCCACCCTGTGTAATTTTTTCTTTCAGCTCTGGGGTAAAATTCACCCCTGGGCTGTGGAAGCGTCCAGTCACTCCTCAGACTGGGATGGTGTCTCTGGGGAAGACAGAGGTGGGTTCAGAAGAAGATGAGATTGCTGGGCCTTTTCCTGTGCCTGGAGACAGCTCCCGAAGGTAAGCATCTCAGATGCCAGACATGGGCTGTGGCGATAactgtgatgtcccatgactgacagggaccgattgttcttgtttccagctgtcctgtcccaggtgcagcagcaggAGTGAGGCCCAAGACTGAAGAAGGCCTGGCCGCCCCCTCCCTCACCTGGAACGACTCCGGATTCTCCATCACAGCCAGTGGTTACTGAGGAGGCCAGGTCCACCGGCCCCTAGATGAGGGGCTACACTGGCCAAGGAGCATCGATTGTAAGGGAAGCACAAACCACTGCCGCCTCTCAAGAGCCTCATCTCCATCCAGAGACTCATC----------------------------------------CAACAAGCAGCGCTCCCTGAGGCCGAGGTCCAGGACCGCACAAGACAGCCGGGTATTCCTGTGGGAGACACAGTGAGGGGATGCGGTGGGAGCCCAGACAGGACCCTTCCTCCTGGGGACCTGAGATGTGCAGGACGCACTGGACACTTGGGTCC i rheMac3.chr7 N 0 C 0 s papAnu2.chr7 122513 2875 - 162156779 ccaagattgaatcatgaaaGAGTAGAAACAGAACTATTACTAGTAAAAGACTGAATCGGTAATCAAAAACGAGCTTGGAACCACTTcc--aagtttgt-----tgtt--gttgtttttattttgaga-ggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcgatcttggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcacccaccaccacatccagctattttttttttttgcatttctagtagagacaggatttcactgtgttagccaggatggtctcgatcttctgacctcgtgatccgcc-----tggcctcccaaaagttttaagatgaggaaatacttctaaatgtattttataaagccAACATTGCCCTGAAATCAAAACCAGGCAAACAGCAAAAGAACGTAAATCACAGACCACTCTTCCTGAAACACAAAGATG-CAAAagtactcaacaaaatactggtaaACGAAACTGAACAGCACATTGCAAGGATCATTTGCCATGATCCAGTGGAACCTCTGTCTGGAATATTAGGACGGTACAACATCTAAACATCCCTAAATCTGATGGATCACCTTAACATAACGAAGGACTAAAATATTATCtcatcagatgcatcatcagatgcataaaaatcatttgacaaatttCAACATCTTTCCATGATAAAACCTCTTAACAAACTACAATTAAAGGGAAATTATCTGGATATATTGAAGGCCCTATTTAAAAACCCACAGTTAGCATCATAcccaatggtgaaaaactgaacatgcttccactcaaatgatgaagaagacaaggatgccctatCTCACCAATTCTATTCTACATAGTATTctaagtcctagccagagaaattaggcaagaaaaaaaagttatctaaATTAGAAAGAGAGGAGTAAAAGTGTCACTGGTTACAGATGACAtgtcttgtatatagaaaatcctaaaaactgccccccaacgtcaaagcaaaaccaaaacaaaacagctctAAGTTGCTAATTTGTGTGTATAAAATTGgtgttatgcaagatgaataagttctggagattggaTGCACAGAATCCCGACTCTAGATAACTTGACTGCACAGTACACTtcaaaaatttgttaagagagtAAATCTCATGGTAGGTATTCTTATCACACTGCAAACTTTAGAAGTTGTATATTAGGACCTTGTTACTgctttcttgttatttattttgaatgagTTTCAAAAAGAAGTG------GCTATGAGT--------TGAGGAATTCATATGCAGGAATAGCCTCAAGAGAACAAGAGGAGGAGATGCATTTAGGTTAGAAATCCTCACATTTTAGATGCGTTTTAAATGCCTAGATAATGGGATACTTAAAAAGGGGTGTGTCTGTCTCTTCCCTCAACTATTGAGAATTAGTTCCAGAGTAACTCACAGAACATCGTTTTAGCCAGTCCCGGTAGGTCCTGAGGTCATTGTCTCTGGCATCACAGAATGGGTTAGCGTGCAGGGCTCGCCTAGAGCTCCTGAGACAATAATGTGATGATGTCTGAAGCTCCACAGGTGAGGAGAGCCACGCCACAGGCGGGGCCCAAGGAAAGAGCACAGAAGCTGTGCTGGGCTCAGCACTGATGAAGCAAGACCTGGGCCTGTGGATGGGGAGAGCTGCGCTAGAAACaaggaagggcaggagggaggaggggttgGAAGGAAAGTAGCCCTGGGATCAGAATGGCGGGGCCATCCTTTACCCATTCCCATCGGCCTCGCAGACAAGGTGTCCTCCAAACACA-----------GACATGCGTGCCACGTGAGTGTAGGAGGAAAGACAC-CTGCACAACCCTCAACTACCAGGATGT-GGGGCCGTATCTCAACTCTTTTCTACTTACAAAAAGAGTCACCTAGGCTGGGCgcgg-ggctcatgcctataatcccagcactttgggaggccgaggcaggcagatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccacgtggcaacatcctgtctctactaaaattacaaaaattagtcatgcatgctgctgggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttcaacccagtagaaggaggttgcagtgagccgagattgcaccaccgcactccagcctgagtgacagagcgagactctgcctcaaaataaataaataaataaag------------agtcaTCCACCCtgtgtaattttttctttcagctctggGGTAAAATTCACCCCTGGGCTGTGGAAGCGTCCAGTCACTCCTCAGACTGGGATGGTGTCTCTGGGGAAGACAGAGGTGGGTTCAGAAGAAGATGAGATTGCTGGGCCTTTTCCTGTGCCTGGAGACAGCTCCCGAAGGTAAGCATCTCAGATGCCAGACATGGGCTGTGGCGATAACTGTGATGTCCCATGACTGACAGGGACCGATTGTTCTTGTTTCCAGCTGTCCTGTCCCAGGTGCAGCAGCAGGAGTGAGGCCCAAGACTGAAGAAGGCCTGGCCGCCCCCTCCCTCACCTGGAACGACTCCGGATTCTCCATCACAGCCAGTGGTTACTGAGGAGGCCGGGTCCACCGGCCCCTAGATGAGGGGCTACACTGGCCGAGGAGCATCAATTGTAAGAGAAGCACAAACCACTGCCGCCTCTCAAGAGCCTCATCTCCATCCAGAGACTCATC----------------------------------------CAACAAGCAGCGCTCCCTGAGGCCGAGCTCCAGGACCGCACAGGACAGCCGGGTATTCCTGtgggagacacagtgaggggaTGCGGTGGGAGCCCAGACGGGACCCTCCCTCCTGGGGACCTGAGATGTGCAGGACGCACTGGACACTTGGGTCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1137308 2870 - 84932903 ccaagattgaatcatgaaatagtagaaacagaactattactagtaaaagactgaatcggtaatcaaaaacGAGCTTGGAACCACTTCCAAAAGtttgt-----tgtt--gttgtttttattttgaga-ggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcgatcttggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcacccaccaccacatccagcta-----tttttttgtatttctagtagagacaggatttcactgtgttagccag------ctcgatcttctgacctcgtgatccgcctgccttggcctcccaaaagttttaagatgaggaaatacttctaaatgtattttacaaagccaacattgccctgaaatcaaaaccaggcaaacaccaaaagaacgtaaatcacagaccactcttcctgaaacacaaagatg-caaaagtactcaacaaaatactggtaaaccaaactgaacagcacattgcaaggatcatttgccatgatccagtggaatgtctgtctggaatattaggacggtacaacatctaaacatccctaaatctgatggatcacattaacataatgaaggactaaaatattatctcatcagatgcatcatcagatgcataaaaatcatttgacaaatttcaacatctttccatgataaaacctcttaacaaactacaattaaagggaaattatctggatatattgaaggccctatttaaaaacccacagttagcatcatacccaatggtgaaaaactgaacatgcttccactcaaatgatgaagaagacaaggatgccctatctcaccaattctattctacatagtattctaagtcctaaccagagaaattaggcaagaaaaaaaagttatctaaattagaaagagaggagtaaaagtgtcactggttacagatgacatgtcttgtatatagaaaatcctaaaaactgccccccaaCATCAAAGCAAAACCAAAACAAAACAGCTCCAagttgctaatttgtgtgtataaaattggtgttatgcaagatgaataagttctggagattggatgcacagaatcccgactctagataacttgactgcacagtacacttcaaaaatttgttaagagagtaaatctcatggtaggtattcttatcacaCTGCAAACTTTAGAAGTTGTATATTAGGACCTTGTTACCGCTTTCTTGTTATTTATTTTGAATGAGTTTCAAAAAGAAGTGGTATCAGCAATGAGT--------TGAGGAATTCATATGCAGGAATAGCCTCAAGAGAACAAGAGGAGGAGACGCATTTAGGTTGGAAATCCTCACATTTTAGATGCGTTTTAAATGCCTAGATAATGGGATACTTAAAAAGGGGTGTGTCTGTCTCTTCCCTCAACTATTGAGAATTAGTTCCAGAGTAAATCACAGAACATCGTTTTAGTCAGTCCCGGTAGGTCCTGAGGTCCTTGTCTCTGGCATCACAGAATGGGTTAGCGTGCAGGGCTCGCCCAGAGCTCCTGAGACAGGAATGTGATGATGTCTGAAGCTCCACAGGTGAGGAGAGCCACACCACAGGCGGGGCCCAAGGAAAGAGCACAGAAGCTGTGCTGGGCTCAGCACTGATGAAGCAAGACCTGGGCCTGTGGATGGGGAGAGCTGCGCTAGAAACAAGGAAGGGCAGGAGGGAGGAGGGGTTGGAAGGAAAGTAGCCCTGGGATCAGAATGGCGGGGCCATCCTTTACCCAATCCCATCGGCCTCGCAGACAAGGTGTCCTCCAAACACA-----------GACA----TGCCACATGGGTGTAGGAGGAAAGACAC-CTGCACAACCCTCAACTACCAGGATGT-GGGGCCGTATCTCAACTCTTTTCTACTTATAAAAAGAGTCACCTAggccgggcgtggtggctcatgcctataatcccagcactttgggaggccgaggcaggcagatcacttgaggtcaggagttcgagaccagcctggccacgtggaaacatcctgtctctactaaaattacaaaaattagtcatgcatgctgctgggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttcaacccagtagaaggaggttgcagtgagccgagattgcaccactgcactccagcctgagtgacagagcgagactctgcctca----aaataaataaataaaG------------AGTCATCCACCCTGTGTAATTTTTTCTTTCCGCTCTGGAGTAAAATTCACCCCTGGGCTGTGGAAGCGTCCAGTCACTCCTCAGACTGGGATGGTGTCTCTGGGGAAGACAGAGGTGGGTTCAGAAGAAAATGAGATTGCTGGGCCTTTTCCTGTGCCTGGAGACAGCTCCCGAAGGTAAGCATCTCAAATGCCAGACATGGGCTGTGGCGATAACTGTGATGTCCCATGACTGACAGGGACCAATTGTTCTTGTTTCCAGCTGTCCTGTCCCGGGTGCAGCAGCAGGAGTGAGACCCAAGACTGAAGAAGGCCTGGCCGCCCCCTCCCTCACCTGGAACGACTCCAGATTCTCCATCACAGCCAGTGGTTACTGAGGAGGCCGGGTCCACCGGCCCCTCGATGAGGGGCGACACTGGCCGAGGAGCATCGATTGTAAGGGAAGCACAAACCACTGCCGCCTCTCAAGAGCCTCATCTCCATCCAGAGACTCATC----------------------------------------CAACAAGCAGCGCTCCCTGAGGCCGAGGTCCAGGACCGCACAGGACAGCCGGGTATTCCTGTGGGAGATACAGTGAGGGGATGCGGTGGGAGCCCAGACAGGACCCTCCCTCCTGGGAACCTGAGATGTGCAGGACGCACTGGACACTTGGGTCC i chlSab2.chr24 N 0 C 0 a score=513090.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 468624 406 + 478999 ACTGAAGAGCAGGCTCAGATGGGAAGTGGCGAGGACTTCTCCTTAGAATCTGAGGCTTTCTTTTCT---CTAATTCTCAGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCTGTGGCTCTGATTTCCCCCTTTCTCACTGCAGGCAAAAAAGGATGAAATAACTTTCTCCACTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATAGAAACCTTCCCTTCATCCGGCTCCCACGTGGTCTGCTTTTTCCTTCATCTGCTTCCATGTGGTCTGCTTTCCTTCCTGAAAAACAGGTCATGTTCAGGATTC----ACACTTGCTCGAGAAATTCTTCCCTCAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTCTCCCACATCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCATGAGATGACCCCACCTGTCCCCA s ponAbe2.chr15 18711248 375 + 99152023 ACTGAAGAGCAGGCTCAGATCGGAAGTGGCAAGGACTTCTCCTTAGAATCTGAGGCTTTCTTTTCT---CTAATTCTCAGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCTGTGGCTCTGATTTCCCCCTTTCTCACTGCAGGCAAAAAAGGATGAAATAACTTTCTCCACTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATAGAAACCTTCCCTTCATCCGGCTCCCAC-------------------------------GTGGTCTGCTTTCCTTCCTGAAAAACAGGTCATGTTCAGGATTC----ACACTTGCTCGAGAAACTCTTCCCTTAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTTTCCCACATCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCATCAGATGACCCCACCTGTCCCCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 214629 413 - 170124641 ACTGAAGAGTACGCTCAGATGGGAAGCGGTGAGGACTTCTCTTTAGAGTCTGAGGCTTTCTTTCCTCTGCTAATTCTCAGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCCATGGCTCTGATTTCCCCCATTCTCACTGCAGGCAAAAAAAGATGAAATAACTTTCTCCACTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATAGAAACCTTCCCTTCATCCGGCTCCCACGTGGTCTGCTTTTTCCTTCATCTGCTCCCATGTGGTCTTCTTTCCTTCCTGAAAAACAAGTATTGTTCAGGATTCTCAAACACTTGCTGGAGAAGTTCTTCCCTCAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTCTCCCACCTCTGTCCCCACGTTGACCTTTCCATGAGATGAGCCCACCTGTCCCCA i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 510294 413 - 171882078 ACTGAAGAGTACGCTCAGATGGGAAGCGGTGAGGACTTCTCTTTAGAGTCTGAGGCTTTCTTTCCTCTGCTAATTCTCAGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCCATGGCTCTGATTTCCCCCATTCTCACTGCAGGCAAAAAAAGATGAAATAACTTTCTCCACTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATAGAAACCTTCCCTTCATCCGGCTCCCACGTGGTCTGCTTTTTCCTTCATCTGCTCCCATGTGGTCTTCTTTCCTTCCTGAAAAACAAGTATTGTTCAGGATTCTCAAACACTTGCTGGAGAAGTTCTTCCCTCAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTCTCCCACCTCTGTCCCCACGTTGACCTTTCCATGAGATGAGCCCACCTGTCCCCA i macFas5.chr7 N 0 I 1 s papAnu2.chr7 125388 413 - 162156779 ACTGAAGAATACGCTCAGATGGGAAGTGGTGAGGACTTCTCTTTAGAATCTGAGGCtttttttCCTCTGCTAATTCTCAGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCCATGGCTTTGATTTCCCCCATTCTCACTGCAggcaaaaaaagatgaaataacttTCTCCATTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATAGAAACCTTCCCTTCATCCGGCTCCCACGTGGTCTGCTTTTTCCTTTATCTGCTCCCATGtggtcttctttccttcctgaaaaACAGGTATTGTTCAGGATTCTCAAACACTTGCTGGAGAAGTTCTTCCCTCAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTCTCCCACCTCTGTCCCCACGTTGACCCTTCCATGAGATGAGCCCACCTGTCCCCA i papAnu2.chr7 C 0 I 1 s chlSab2.chr24 1140178 413 - 84932903 ACTGAAGAGTACGCTCAGATGGGAAGTGGTGAGGACTTCTCTTTAGAATCTGGGGCTTTCTTTCCTCCGCTAATTCTCGGATGTCCTCAGGGACATTTCATTCTCTTCTCCATGGCTCTGATTTCCCCTATTCTCGCTGCAGGCAAAAAAAGATGAAATAGCTCTCTCCACTGGCAGATAGGCTGTTTCAATTTCATGGAAGCCTTCCCTTCATCCGGCTCCCACGTGGTCTGCTTTTTCCTTCATCTGCTCCCACGTGGTCTTCTTTCCTTCCTGAAAAACAGGTATTGTTCAGGATTCTCAAACACTTGCTGGAGAAGTTCTTCCCTCAAACTCCAGTTCAGACCAGGCACACCCTCTCCCACCTCTGTCCCCACGTTGACCCTTCCATGAGATGAGCCCACCTGTCCCCA i chlSab2.chr24 C 0 I 1 a score=100.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469030 1 + 478999 G s ponAbe2.chr15 18711623 1 + 99152023 G i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr24 1140591 1 - 84932903 I e papAnu2.chr7 125801 1 - 162156779 I e macFas5.chr7 510707 1 - 171882078 I e rheMac3.chr7 215042 1 - 170124641 I a score=30537.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469031 26 + 478999 GTGGACCCTTCCCTCAGACGAGCACA s ponAbe2.chr15 18711624 26 + 99152023 GTGGACCCTTCCCTCAGACGAGCACA i ponAbe2.chr15 C 0 I 257 s rheMac3.chr7 215043 26 - 170124641 GTGGTCCCTTCTCTCAGATAAGCACA i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 510708 26 - 171882078 GTGGTCCCTTCTCTCAGATAAGCACA i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 125802 26 - 162156779 GTGGTCCCTTCTCTCAGATAAGCTCA i papAnu2.chr7 I 1 C 0 s chlSab2.chr24 1140592 26 - 84932903 GTGGTCCCTTCTCTCAGATACGCACA i chlSab2.chr24 I 1 C 0 a score=94653.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469057 78 + 478999 CCTGTCCCCAGGTGGACCCTTCCCTCAAACAAGCACACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCTCTGAGAGGAGCACACCTG s ponAbe2.chr15 18711907 78 + 99152023 CCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTCAAATGAGCACACCTGTCCCTACGTAGACCCTTCTCTGAGAGGAGCACACATG i ponAbe2.chr15 I 257 C 0 s rheMac3.chr7 215069 78 - 170124641 CGTGTCCCCAGGTGGACCCTTCCCTCAGATGAGCTCACCTGTCCCCAGGAGGACTCTTCCCTGAGACAAGCACACCTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 510734 78 - 171882078 CGTGTCCCCAGGTGGACCCTTCCCTCAGATGAGCTCACCTGTCCCCAGGAGGACTCTTCCCTGAGACAAGCACACCTG i macFas5.chr7 C 0 I 152 s papAnu2.chr7 125828 78 - 162156779 CCTGTCCCCAGGTGGACCCTTCCCTCAGATGAGCTCACCTGTCCCCAGGAGGACTCTTCCCTGAGACAAGCACACCTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1140618 78 - 84932903 CCTGTCCCCAGATGGACCCTTCCCTCAGATGAGCTCACCTGTCCCCAGGAGGACTCTTCCCTGAGACAAGCACACCTG i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=71561.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469135 75 + 478999 TCCCCACGTGGATCCTTCCTTCAGATGAGCACATCTGTCCCCACGTGCACCCTTCCCTGAGACAAGGACACCTGT s ponAbe2.chr15 18711985 75 + 99152023 TCCTTAAGTGGACCCTTCCCTGAGTCAAGCACACCTGTCCCCAGGTGGAACCTTCCTCCACAGGAGCTCACCTGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215147 74 - 170124641 -CCCCATGTGGACCCTTCCCTCAGACAAGCTCATCTGCTACCAAATGGACCCTTCCCTGAGACAAGTACACCTGT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 510964 75 - 171882078 TCCCCAAGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCGCACGTGTCCCCACATGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGT i macFas5.chr7 I 152 T 227 s papAnu2.chr7 125906 74 - 162156779 -CCCCATATGGACCCTTCCCTCAGACGAGCTCACCTGCTACCAAATGGACCCTTCCCTGAGACAAGTACACCTGT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1140696 75 - 84932903 TCCCCATGTGGACCCTTCCCTCAGACGAGCTCACCTGCTACCAAATGGACCCTTCCCTGAGACAAGTACACCTGT i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=29222.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469210 24 + 478999 CCCCACGTGGATCCTTCCTTCAGA s ponAbe2.chr15 18712060 24 + 99152023 CCCCACGTGGACCCTTCTCTGAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215221 24 - 170124641 CCCCACTTGGACCCTTCCCTCAGA i rheMac3.chr7 C 0 I 42 s macFas5.chr7 510812 24 - 171882078 CCCCATGTGGACCCTTCCCTCAGA i macFas5.chr7 T 227 C 0 s papAnu2.chr7 125980 24 - 162156779 CCCCACTTGGACCCTTCCCTCAGA i papAnu2.chr7 C 0 I 301 s chlSab2.chr24 1140771 24 - 84932903 CCCCACTTGGACCCTTCCCTCAGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=939.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469234 2 + 478999 TG s ponAbe2.chr15 18712084 2 + 99152023 GG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215287 2 - 170124641 TG i rheMac3.chr7 I 42 C 0 s macFas5.chr7 510836 2 - 171882078 CG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126305 2 - 162156779 CG i papAnu2.chr7 I 301 C 0 s chlSab2.chr24 1140795 1 - 84932903 -G i chlSab2.chr24 C 0 I 117 a score=33538.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469236 35 + 478999 AGCCCCCCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTCAAA s ponAbe2.chr15 18712086 35 + 99152023 AGCGCATCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215289 35 - 170124641 AGCACACCTGTCCCCAAGTGCACCCTTCTCTCAGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 510838 35 - 171882078 AGCTCATCTGCTACCAAATGGACCCTTCCCTGAGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126307 35 - 162156779 AGCACCTCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAGA i papAnu2.chr7 C 0 T 296 s chlSab2.chr24 1140913 35 - 84932903 AGCACACCTGTCCCTACGTGGACCCTTTCTTAAGA i chlSab2.chr24 I 117 C 0 a score=50072.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469271 54 + 478999 TGAGTACACCTGTCCCCACGTAGACCCTTCTCTGAGAGAAGCACACATGTCCCC s ponAbe2.chr15 18712121 54 + 99152023 AGAGCGCACCTGTCCCCACATGGATCCTTCCTTCAGATGAGCTCACCAGTCCCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215324 54 - 170124641 TGAGCGCACGTGTCCCCACATGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGTCCCT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 510873 54 - 171882078 CAAGTACACCTGTCCCCACTTGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCACAGCTCTTCCC i macFas5.chr7 C 0 I 227 s papAnu2.chr7 126046 54 - 162156779 TGAGCACACCTGTCCCCAAGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCGCACGTGTCCCC i papAnu2.chr7 T 296 C 0 s chlSab2.chr24 1140948 54 - 84932903 CTAGCACACCTGTCCCCACGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCACACCTGTCCCC i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=71727.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469325 74 + 478999 AAGTGGACCCTTCCCTGAGTCAAGCACACTTGTCCCCAGGTGGAACCTTCCTCCACACGAGCACACCTGTCCCC s ponAbe2.chr15 18712175 74 + 99152023 ACATGGACCCTTCTCTGAGAGGAGCACACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAAACGAGCTCACCTGTCCCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215378 74 - 170124641 ACGTGGACCCTTTCTTAAGACTAGCACACCTGTCCCCACGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCACACCTGTCCCC i rheMac3.chr7 C 0 T 185 s macFas5.chr7 511154 74 - 171882078 ATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTGGTCCCTTCCCTGAGACGAGCTCACCTGTCCCT i macFas5.chr7 I 227 C 0 s papAnu2.chr7 126100 74 - 162156779 ATGTGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGTTCCCACCTGGACCCTTCCTTCACACAAGCTCACCTGTCCCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141002 74 - 84932903 ATGTGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGTTCCCACCTGGAGCTTTCCTTCACACAAGCTCACCTGTCCCC i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=1740.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469399 2 + 478999 AC s ponAbe2.chr15 18712249 2 + 99152023 AC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215267 2 - 170124641 AG i rheMac3.chr7 T 185 C 0 s macFas5.chr7 511228 2 - 171882078 AC i macFas5.chr7 C 0 T 296 s papAnu2.chr7 126174 2 - 162156779 AC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141076 2 - 84932903 AC i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=180366.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469401 166 + 478999 GTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCACGTGGACATTTCCCTCAGAGGGGCACACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTGAGACAAGAACACCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTTGGAGGAGCACACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAGA s ponAbe2.chr15 18712251 166 + 99152023 GTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCACATGGGCCTTTCCCTCAAAGGGGCACAACTGTCCCCACGTGGACCTTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGGACCCTTCCTTCAGACAAGCACACCTGTCTCCATGTGGACTCTTTGCTCAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215269 166 - 170124641 GTGGACTCTTCCCTGAGGTGAGCACACCTGTCCCCAAGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCGCACGTGTCCCCACATGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGTCCCTACGTGGACCCTTTCTTAAGACTAGCACACCTGTCCCCACGTGCACCCTTCTCTCAGA i rheMac3.chr7 C 0 I 394 s macFas5.chr7 510934 166 - 171882078 GTGGACTCTTCCCTGAGGTGAGCACACCTGTCCCCAAGTGCACCCTTCTCTCAGATGAGCGCACGTGTCCCCACATGCACCCTTCCCTGGGACAAGCACACCTGTCCCTACGTGGACCCTTTCTTAAGACTAGCACACCTGTCCCCACGTGCACCCTTCTCTCAGA i macFas5.chr7 T 296 I 296 s papAnu2.chr7 126176 166 - 162156779 ATGGACCCTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTGGTCCCTTCCCTGAGACGAGCTCACCTGTCCCTACATGGATTTTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141078 166 - 84932903 ATGGACCCTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTGGTCCCTTCCCTGAGACGAGCTCACCTGTCCCTACGTGGATTTTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=13356.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469567 24 + 478999 CAAGCACACCTGTCTCCATGTGGA s ponAbe2.chr15 18712417 24 + 99152023 GGAGAACAGGTGTACCCATGTGGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511396 24 - 171882078 CAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGA i macFas5.chr7 I 296 C 0 s papAnu2.chr7 126342 24 - 162156779 CAAGCTCACCTGTCCCCACATGGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141244 24 - 84932903 CAAGCTCACCTGTCCCCGCATGGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e rheMac3.chr7 215435 394 - 170124641 I a score=80847.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469591 87 + 478999 CTCTTTGCTCAGAGGAGCACAGGTGTACCCATGTGGACCCTTCCCTGAGACAAACACACCTGTCCCCACGTGGCCCCTTCCCTGAGA s ponAbe2.chr15 18712441 87 + 99152023 CCCTTCCCTCAGATGAGCACACTTGTCCCCATGTGGACCCTACCCTGAGACAAACACACCTGTCCCCACGTGGCCCCTTCCCTGAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215829 87 - 170124641 CACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCATGAGGACCCTTCCTTGAGACAAGCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGA i rheMac3.chr7 I 394 C 0 s macFas5.chr7 511420 87 - 171882078 TTCTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTGGACACTTATCTCAGA i macFas5.chr7 C 0 T 407 s papAnu2.chr7 126366 87 - 162156779 CCCTTCCCTGAGACTAGCACATCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAACTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141268 87 - 84932903 CCCTTCCCTGAGACTAGCACATCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTATGTAGATTCTTGCCTTAGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=2892.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469678 9 + 478999 TGAGCTCAT s ponAbe2.chr15 18712528 9 + 99152023 TGAGCTCAT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215916 9 - 170124641 GGAGCTCAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141355 9 - 84932903 TGAGCACCT i chlSab2.chr24 C 0 I 74 e papAnu2.chr7 126453 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 511507 407 - 171882078 T a score=2892.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469687 5 + 478999 CTGTC s ponAbe2.chr15 18712537 5 + 99152023 CTGTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215925 5 - 170124641 CTGTC i rheMac3.chr7 C 0 T 495 s chlSab2.chr24 1141438 5 - 84932903 CTGTC i chlSab2.chr24 I 74 C 0 e papAnu2.chr7 126453 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 511507 407 - 171882078 T a score=1073.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469692 13 + 478999 ----------CTCTTCCCCAAGG s ponAbe2.chr15 18712542 13 + 99152023 ----------CTATTCCCCAAGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141443 23 - 84932903 CCTACGTAGATTCTTGCCTTAGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 126453 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 511507 407 - 171882078 T e rheMac3.chr7 215930 495 - 170124641 T a score=111131.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469705 106 + 478999 CGAGCACACCTGTCCCCACGTGGACCTTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCATAACTGTCCCCATGTGGACCCTTCCT s ponAbe2.chr15 18712555 106 + 99152023 CGAGCACGCCTGTCCCCACGTGGACCTTTCCCTGAGAGAAGCACACATGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCATAACTGTCCCCATGTGGACCCTTCCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215435 106 - 170124641 TGAGCACACCTGTCCCCATGTGGACCCTTCCCCGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTGGTCCCTTCCC i rheMac3.chr7 T 495 C 0 s macFas5.chr7 511100 106 - 171882078 TGAGCACACCTGTCCCCATGTGGACCCTTCCCCGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTGGTCCCTTCCC i macFas5.chr7 T 407 C 0 s papAnu2.chr7 126453 106 - 162156779 CAAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141466 106 - 84932903 CGAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTGGACACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCACGAGGACCCTTCAT i chlSab2.chr24 C 0 T 407 a score=62789.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469811 65 + 478999 TCAGATAAACTCACCTGTCACCACGTGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCACACC-------------------------------------AGTCCCCATGTGG s ponAbe2.chr15 18712661 102 + 99152023 TCAGACGAACTCACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCACACCTGTCCCCACGTGGATCCTTCCCTCAGAGGAGCACACCGGTCCCCATGTGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215541 65 - 170124641 TGAGACGAGCTCACCTGTCCCTACGTGGATTTTTGCCTTAGATGAACACCTC-------------------------------------TGTCCCCACGTGG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511206 65 - 171882078 TGAGACGAGCTCACCTGTCCCTACGTGGATTTTTGCCTTAGATGAACACCTC-------------------------------------TGTCCCCACGTGG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126559 65 - 162156779 TGAGACAAACTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACAAGCACCTC-------------------------------------TGTCCCCACATGG i papAnu2.chr7 C 0 T 296 s chlSab2.chr24 1141165 65 - 84932903 TGAGACGAGCTCACCTGTCCCTACGTGGATTTTTGCCTTAGACGAGCACCTC-------------------------------------TGTCCCCACGTGG i chlSab2.chr24 T 407 C 0 a score=25271.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469876 20 + 478999 ACCCATCCTTCAGACAAGCT s ponAbe2.chr15 18712763 20 + 99152023 ACCCATCCTTCAGACGAGCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215606 20 - 170124641 ACCCTTCCTTTAGACAAGCT i rheMac3.chr7 C 0 I 185 s macFas5.chr7 511271 20 - 171882078 ACCCTTCCTTTAGACAAGCT i macFas5.chr7 C 0 I 239 s papAnu2.chr7 126328 20 - 162156779 ACCCTTCCTTCAGACAAGCT i papAnu2.chr7 T 296 C 0 s chlSab2.chr24 1141230 20 - 84932903 ACCCTTCCTTCAGACAAGCT i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=11152.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469896 12 + 478999 CACCTGTCCCCA s ponAbe2.chr15 18712783 12 + 99152023 CACCTGTCCCCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215811 12 - 170124641 CACCTGTCCCCA i rheMac3.chr7 I 185 I 42 s papAnu2.chr7 126348 12 - 162156779 CACCTGTCCCCA i papAnu2.chr7 C 0 I 2 s chlSab2.chr24 1141250 12 - 84932903 CACCTGTCCCCG i chlSab2.chr24 C 0 I 2 e macFas5.chr7 511291 239 - 171882078 I a score=1213.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469908 3 + 478999 TGA s ponAbe2.chr15 18712795 3 + 99152023 TGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126362 3 - 162156779 TGG i papAnu2.chr7 I 2 I 259 s chlSab2.chr24 1141264 3 - 84932903 TGG i chlSab2.chr24 I 2 C 0 e macFas5.chr7 511291 239 - 171882078 I e rheMac3.chr7 215823 42 - 170124641 I a score=12038.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469911 9 + 478999 ACCCTTCCC s ponAbe2.chr15 18712798 9 + 99152023 ACCCTTCCC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215865 9 - 170124641 ACCCTTCCT i rheMac3.chr7 I 42 C 0 s macFas5.chr7 511530 9 - 171882078 ACCCTTCCT i macFas5.chr7 I 239 C 0 s papAnu2.chr7 126624 9 - 162156779 ACCCTTCCC i papAnu2.chr7 I 259 C 0 s chlSab2.chr24 1141267 9 - 84932903 ACCCTTCCC i chlSab2.chr24 C 0 I 296 a score=75609.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469920 64 + 478999 TGAGACAAGCACACCTGTCCCTACATGGACCCTTCTCTCGGATGAGCACACCTGTCCCCATGTG s ponAbe2.chr15 18712807 64 + 99152023 TGAGACAAGCACACCTGTCCCTACGTGGATCCTTCTCTCAGACGAGCACACCTGTCCCCATGTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215874 64 - 170124641 TGAGACAAGCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCACCTGTCCCCACGTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511539 64 - 171882078 TGAGACAAGCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCACCTGTCCCCACGTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126633 64 - 162156779 TGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGCTCACCTATCCCCATGTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141572 64 - 84932903 TGAGACAATCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCACCTGTCCCCACGTA i chlSab2.chr24 I 296 T 296 a score=14822.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 469984 21 + 478999 GGCCCTTCCCTGAGACTACCA s ponAbe2.chr15 18712871 21 + 99152023 GGCCTTTCCCTGAGACTAGCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215938 21 - 170124641 GACCCTTCCCTGAGACAAGCA i rheMac3.chr7 C 0 T 333 s macFas5.chr7 511603 15 - 171882078 GACCCTTCCCTGAGA------ i macFas5.chr7 C 0 T 327 s papAnu2.chr7 126697 21 - 162156779 GTCCCTTCCCTGAGACGAGCT i papAnu2.chr7 C 0 I 37 s chlSab2.chr24 1141340 21 - 84932903 GATTCTTGCCTTAGATGAGCA i chlSab2.chr24 T 296 C 0 a score=253546.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470005 234 + 478999 CACCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTGAGACAAGCACACCTGTCCCCACTTCGATGCTTCTCTCAGATAAGCACAACTCGCCCCACCTGGACCCCTCCCTGAGACGAACTCACCTGTCGCTACGTGGATTCTTGCCTTAGACAAGCACCTCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTGAGGGAATCACACCTGTCCCCAGGTGGACCCTTACCTCAGACAAGCATGCCTGTCCCCA s ponAbe2.chr15 18712892 234 + 99152023 CACCTGTCCCCACGTGGAGCCTTCCTTGAGACAAGCACACCTGTCCCCACTTCGACGCTTCTCTCAGATGAGCACAACTGTCCCCACCTGGAGCCTTCCTAGAGATGAGCTCACCTGACCCTACGTGGATTCTAGCGTTAGACAAGCACATCTGTCCCCACGTGGATCCTTCCATGAGAGAAGCACACCTGTCCCCAGGTGGACCCTTACCTCAGACAAGCATGCCTGTCCCCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215626 234 - 170124641 CACCTGTCCCCGCATGGACCCTTCCCTGAGACTAGCACATCTGTCCCTACGTGGACTCTTCTCTCAGACGAGCACACCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTAGACACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCA i rheMac3.chr7 T 333 C 0 s macFas5.chr7 511291 234 - 171882078 CACCTGTCCCCGCATGGACCCTTCCCTGAGACTAGCACATCTGTCCCTACGTGGACTCTTCTCTCAGACGAGCACACCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTGGACACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCA i macFas5.chr7 T 327 T 259 s papAnu2.chr7 126755 234 - 162156779 CCTCTGTCCCCACGTGGACCCTTCCTTCAGACAAGCTCACCTGTCCCCTCATGGACCCTTCCCTGAGACCAGCACATCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACAAGCACCTCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTGGACACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCA i papAnu2.chr7 I 37 C 0 s chlSab2.chr24 1141361 197 - 84932903 CCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTG-------------------------------------AGACGAGCTCACCTGTCCCCAGCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTAGATTCTTGCCTTAGACGAGCACCTCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGACATGCTCACCTGTCCCCAGGTGGACACTTATCTCAGACAAGCCCACCTGTCCCCA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=9294.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470239 37 + 478999 GGTCAATCCTTCCCTCAAAAGAGCACACCTGTCCACG s ponAbe2.chr15 18713126 35 + 99152023 GGTCGACCCTTCCCTCAAA--AGCACACCTGTCCACA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511266 37 - 171882078 CGTGGACCCTTCCTTTAGACAAGCTCACCTGTCCCCG i macFas5.chr7 T 259 I 222 s chlSab2.chr24 1141558 37 - 84932903 CGAGGACCCTTCATTGAGACAATCACTCCTATCCCCA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e papAnu2.chr7 126989 0 - 162156779 C e rheMac3.chr7 215860 0 - 170124641 C a score=76112.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470276 65 + 478999 TGAGGACCCTTCCTTGAGACAAGCACTCCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGACGAGCTCAC s ponAbe2.chr15 18713161 65 + 99152023 TGAGGACCCTGCCTTGAGACAAGCACTCCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGACGAGCTCAC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215860 65 - 170124641 TGAGGACCCTTCCTTGAGACAAGCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCAC i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511525 65 - 171882078 TGAGGACCCTTCCTTGAGACAAGCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCAC i macFas5.chr7 I 222 C 0 s papAnu2.chr7 126989 65 - 162156779 CGAGGACCCTTCCTTGAGACAATCACTCCTATCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCAC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141595 65 - 84932903 CATGGACCCTTCCCTCAGAGGAGCTCACCTGTCCCCACGTAGACCCTTCCCTGAGACAAGCACAC i chlSab2.chr24 C 0 T 296 a score=38134.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470341 28 + 478999 CTGTCCCCATGTGGACCCTTCCCTGAGA s ponAbe2.chr15 18713226 28 + 99152023 CTGTCCCCACGTGGACCCTTCCCTGAGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215925 28 - 170124641 CTGTCCCCACGTAGACCCTTCCCTGAGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511590 28 - 171882078 CTGTCCCCACGTAGACCCTTCCCTGAGA i macFas5.chr7 C 0 T 296 s papAnu2.chr7 127054 28 - 162156779 CTGTCCCCACGTAGACCCTTCCCTGAGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141364 28 - 84932903 CTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTGAGA i chlSab2.chr24 T 296 C 0 a score=53710.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470369 59 + 478999 CAAGCACAGCTGTCTCCATGTGGAA---------------------------------TCTTCCTTCAGACAAGCACACCTGTCCCCACATG s ponAbe2.chr15 18713254 92 + 99152023 CAAGCACACCTGTCTCCATGTGGAACCTTCAGGCAAGCACACCTGTCCCCACATGGACCCTTCCCTCAGACGAGCTCACCTGTCCCCATGTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215953 59 - 170124641 CAAGCACACTTGTCTCCATGTGGAA---------------------------------CCTTCCTTGAGACAAGCACACCCATCCCCATGTG i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511322 59 - 171882078 CTAGCACATCTGTCCCTACGTGGAC---------------------------------TCTTCTCTCAGACGAGCACACCTGTCCCCACCTG i macFas5.chr7 T 296 C 0 s papAnu2.chr7 127082 59 - 162156779 CAAGCACACTTGTCTCCATGTGGAA---------------------------------CCTTCCTTGAGACAAGCACACCCGTCCCCACGTG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141392 59 - 84932903 CGAGCTCACCTGTCCCCAGCTGGAC---------------------------------CCTTCCCTGAGACAAGCTCACCTGTCCCTACGTA i chlSab2.chr24 C 0 I 185 a score=12332.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470428 10 + 478999 GACCCTTCCC s ponAbe2.chr15 18713346 10 + 99152023 GACCCTTCCT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216012 10 - 170124641 GACTCTTCCT i rheMac3.chr7 C 0 T 592 s macFas5.chr7 511381 10 - 171882078 GACCCTTCCC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 127141 10 - 162156779 GACTCTTCCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141636 10 - 84932903 GACCCTTCCC i chlSab2.chr24 I 185 C 0 a score=4738.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470438 9 + 478999 TCAGATGAG s ponAbe2.chr15 18713356 9 + 99152023 TGGGACAAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215430 9 - 170124641 TCAGATGAG i rheMac3.chr7 T 592 C 0 s macFas5.chr7 511391 9 - 171882078 TGAGACAAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 127151 9 - 162156779 TCACCTGCG i papAnu2.chr7 C 0 T 370 s chlSab2.chr24 1141646 9 - 84932903 TGAGACAAG i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=939.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470447 2 + 478999 CT s ponAbe2.chr15 18713365 2 + 99152023 CA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215439 2 - 170124641 CA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511400 2 - 171882078 CT i macFas5.chr7 C 0 I 216 s papAnu2.chr7 126790 2 - 162156779 CT i papAnu2.chr7 T 370 C 0 s chlSab2.chr24 1141655 2 - 84932903 CA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=69840.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470449 73 + 478999 CACCTGTCCCCATGTGGACCCTTCCCTGAGACAAGCACGCCTGTCCCCATGTAGACCCTTCCTTCAGAGGAGC s ponAbe2.chr15 18713367 73 + 99152023 CATCTGTCTCCATGTGGAACCTTCCCTGAGACAAGCACACCTGTCGCCATGTAGACCCTTCCTTCAGAAGAGC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 215441 73 - 170124641 CACCTGTCCCCATGTGGACCCTTCCCCGAGACAAGCACACCTGTCCCCATGTGAACCCTTCTCTCAGATGAGC i rheMac3.chr7 C 0 I 508 s macFas5.chr7 511618 63 - 171882078 CACTTGTCTCCATGTGGAACCTTCCTTGAGACAAGCACACCCATCCCCATGTGGACTCTTCCT---------- i macFas5.chr7 I 216 C 0 s papAnu2.chr7 126792 73 - 162156779 CACCTGTCCCCTCATGGACCCTTCCCTGAGACCAGCACATCTGTCCCCACCTGGACCCTTCCCTGAGACAAGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141657 66 - 84932903 CACTTGTCTCCATGTGGAACCTTCCTTGAGACAAGCACACCCGTCCCCATGTGGACTCTTCCTTCA------- i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=8529.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470522 8 + 478999 TCACCTGT s ponAbe2.chr15 18713440 8 + 99152023 TCACCTGT i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216022 8 - 170124641 TCACCTGC i rheMac3.chr7 I 508 C 0 s macFas5.chr7 511681 8 - 171882078 TCACCTGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 126865 8 - 162156779 TCACCTGT i papAnu2.chr7 C 0 I 287 s chlSab2.chr24 1141723 5 - 84932903 ---CCTGC i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=6211.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470530 20 + 478999 GCTCAGACACCACCA-----------------------------------------------------------GGGTC s ponAbe2.chr15 18713448 79 + 99152023 GCTCAGACACCACCAGGGGGGCTCGGACACTAATAGGGTGACTCAGACACTAATTAGGGGCTCAGGCACCATCGGGGTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216030 20 - 170124641 GCTCAGACACCACCAGG---------------------------------------------------------GGG-- i rheMac3.chr7 C 0 I 1 s macFas5.chr7 511689 20 - 171882078 GCTCAGACACCACCAGG---------------------------------------------------------GGG-- i macFas5.chr7 C 0 I 1 s chlSab2.chr24 1141728 20 - 84932903 GCTCAGACACCACCAGG---------------------------------------------------------GGG-- i chlSab2.chr24 C 0 I 1 e papAnu2.chr7 126873 287 - 162156779 I a score=15080.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470550 11 + 478999 CTCAGACACTA s ponAbe2.chr15 18713527 11 + 99152023 CTCAGACACTA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216051 11 - 170124641 CTCAGACACTA i rheMac3.chr7 I 1 C 0 s macFas5.chr7 511710 11 - 171882078 CTCAGACACTA i macFas5.chr7 I 1 C 0 s papAnu2.chr7 127160 11 - 162156779 CTCAGACACCA i papAnu2.chr7 I 287 C 0 s chlSab2.chr24 1141749 11 - 84932903 CTCAGACACTA i chlSab2.chr24 I 1 I 77 a score=18003.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470561 42 + 478999 ATAGGGTGGCTCAGACACTAATAGGGTGGCTCAGACT--CTAAG s ponAbe2.chr15 18713538 42 + 99152023 ATAGGGTGGCTCAGACACTACGAGGGGGGCTCAGACA--CCACC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216062 40 - 170124641 GCAGAGGTGCTCAGACACCACCAGGGAGGATCAGACA--CAA-- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511721 40 - 171882078 GCAGAGGTGCTCAGACACCACCAGGGAGGATCAGACA--CAA-- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 127171 42 - 162156779 CCAGGGGGCCTCAGACACTAATAGGGTGGCTCAGACAGTCAT-- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e chlSab2.chr24 1141760 77 - 84932903 I a score=4991.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470603 15 + 478999 AGGGGG----------------------------------------------------------GCTCAGAAA s ponAbe2.chr15 18713580 73 + 99152023 AGGGGGCTCAGACACTAGCAGGGGCGTTCAGACACCACCAGCAAGGATCAGACACAAGGGGGTTGCTCAGAAA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216102 15 - 170124641 GGTGGG----------------------------------------------------------GCTCAGAAA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511761 15 - 171882078 GGTGGG----------------------------------------------------------GCTCAGAAA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 127213 15 - 162156779 AGGGGG----------------------------------------------------------GCTCAGACA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141837 15 - 84932903 AGGGGG----------------------------------------------------------TCTCAGGCA i chlSab2.chr24 I 77 C 0 a score=38144.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470618 23 + 478999 CCACCAGAAGGGCTCAGACACCA s panTro4.chr14 105670884 23 + 106544938 CCACCAGAGGGGCTCAGACACCA i panTro4.chr14 N 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713653 23 + 99152023 CCACCAGAGGGGCTCAGACACCA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216117 23 - 170124641 CCACCAGCGGGGCTTAGACACCA i rheMac3.chr7 C 0 I 57 s macFas5.chr7 511776 23 - 171882078 CCACCAGCGGGGCTTAGACACCA i macFas5.chr7 C 0 I 37 s papAnu2.chr7 127228 23 - 162156779 CCACCAGGGGGCCTCAGACACTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141852 23 - 84932903 CCATCAGAGGGGCTGAGACACCA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=9655.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470641 10 + 478999 CCAGAGGGCG s panTro4.chr14 105670907 10 + 106544938 CCAGAGGGCG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713676 10 + 99152023 CCAGAGGGCG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 511836 10 - 171882078 CCAGAGGGCG i macFas5.chr7 I 37 I 10 s papAnu2.chr7 127251 7 - 162156779 GCAGAGG--- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1141875 10 - 84932903 CCAGAGGGCG i chlSab2.chr24 C 0 I 10 e rheMac3.chr7 216140 57 - 170124641 I a score=8835.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470651 35 + 478999 CCCAGCAACCACGGAATGCTCAGAACCTACCG-GGG s panTro4.chr14 105670917 36 + 106544938 CCCAGCAACCACGGGATGCTCAGAACCTACAGAGGG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713686 35 + 99152023 CCCAGCAACCACGGGATGCTCAGAACCTACGG-GGA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 171377695 15 + 171882078 ------------------CTCAGACACCA--G-GGG i macFas5.chr7 n 10 C 0 s papAnu2.chr7 127258 19 - 162156779 ----------------TGCTCAGACACCACCA-GGG i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e chlSab2.chr24 1141885 10 - 84932903 I e rheMac3.chr7 216140 57 - 170124641 I a score=7581.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470686 14 + 478999 GCGCTCAGGACCTA s panTro4.chr14 105670953 14 + 106544938 GCACTCAGGACCTA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713721 14 + 99152023 GCGCTCAGGACCTA i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s macFas5.chr7 171377710 14 + 171882078 ACGATCAGCACCAG i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 162041500 14 + 162156779 ACGATCAGCACCAG i papAnu2.chr7 n 0 C 0 e chlSab2.chr24 1141885 10 - 84932903 I e rheMac3.chr7 216140 57 - 170124641 I a score=45099.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470700 24 + 478999 CAGGGGTCGCTCAAGACCTGGCTC s panTro4.chr14 105670967 24 + 106544938 CAGGGGTTGCTCAGGACCTGGCTC i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713735 24 + 99152023 CAGGGGTCGCTCAGGACCTGGCTC i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 169920393 24 + 170124641 CAGGGGGCGCTCAGGACCTGGCTC i rheMac3.chr7 n 57 C 0 s macFas5.chr7 171377724 24 + 171882078 CAGGGGGCGCTCAGGACCTGGCTC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 162041514 24 + 162156779 CAGGGGGCGCTCAGGACCTGGCTC i papAnu2.chr7 C 0 I 26 s chlSab2.chr24 83802928 24 + 84932903 CAGGGGGCGCTCAGGACCTGGCTC i chlSab2.chr24 n 10 C 0 a score=35553.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470724 26 + 478999 AGGAGCAGATGCAAAGTGAAGCTGAG s panTro4.chr14 105670991 26 + 106544938 AGGAGCAGATGCAAAGTGAAGCTGAG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713759 26 + 99152023 AGGAGCAGATGCAAAGAGAAGCTGAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 169920417 26 + 170124641 AGGAGTAGATGAGAAGTGAAGCTGAT i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 171377748 26 + 171882078 AGGAGTAGATGAGAAGTGAAGCTGAT i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 127277 26 - 162156779 AGGATCAGGCACAAGGTGGGGCTCAG i papAnu2.chr7 C 0 I 82 s chlSab2.chr24 83802952 26 + 84932903 AGGAGTAGATGAGAAGTGAAGCTGAT i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=325328.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470750 190 + 478999 GTTTCCGTTTTCTCTTTGGGGATTCCTTGTCCTGCCCTGCAAAAGCCTTGCTCAGCAGCTATTATTGTTTCTTCCCTGGAATTCCCCAGTTCCTCTCATCTGAAAAGG----ACTTAGAGCAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAG---TGATATTTCAGTAAAATATTAATAAG s panTro4.chr14 105671017 190 + 106544938 GTTTCCGTTTTCTCTTTGGGGATTCCTTGTCCTGCCCTGCAAAAGCCTTGCTCAGCAGCTATTATTGTTTCTTCCCTGGAATTCCCTAGTTCCTCTCATCTGAAAAGG----ACATAGAGCAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAG---AGATATTTCAGTAAAATATTAATAAG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713785 190 + 99152023 GTTTCCGTTTACTCTGTGGGGATTCCTTGTCCTGCCCTGCAAAAGCCTTGCTCAGCAGCTGTTATTGTTTCTTCCCTGGAATTCCCTAGTTCCTCTCATCCGAAAAGG----ACTTAGAGCAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAG---CGATATTTCAGTAAAATATTAATAGG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 169920443 196 + 170124641 GTTTCCTTTTTCTCCTTGGTGATTCCTTGTCCTGTCCTGCAAAAGTCTTGCTCAGCAG-TATTATTGTTTCTCCCCTGTAACTCCTTAGTTCCTCTCATCTGAAAAGGACTAACTTAGAATAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAGAAATAATATCTCAGTAAAATTGTAATAAG i rheMac3.chr7 C 0 n 0 s macFas5.chr7 171377774 193 + 171882078 GTTTCCTTTTTCTCCTTGGTGATTCCTTGTCTTGTCCTGCAAAAGTCTTGCTCAGCAGCTATTATTGTTTCTCCCCTGTAACTCCTTAGTTCCTCTCATCTGAAAAGG----ACTTAGAATAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAGAAATAATATCTCAGTAAAATTGTAATAAG i macFas5.chr7 C 0 I 1746 s papAnu2.chr7 162041564 197 + 162156779 gtttcctttttctccttggtGATTCCTTGTCCTGTCCTGCAAAAGTCTTGCTCAGCAGCTATTATTGTTTCTCCCCTGTAACTCCTTAGTTCCTCTCATCTGAAAAGGACTAACTTAGAATAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCTTTCTAGAAATAATATCTCAGTAAAATTGTAATAAG i papAnu2.chr7 I 26 I 1746 s chlSab2.chr24 83802978 197 + 84932903 GTTTCCTTTTTCTCCTTGGTGATTTCTTGTCCTGTCCTGCAAAAGTCTTGCTCAGCAGCTATTATTGTTTCTCCCCTGTAACTCCTTAGTTCCTCTCATCTGAAAAGGACTAACTTAGAATAGAAATCCCATTTAACTTTTCACACTTCATTTTCAGTCTCCTTCTAGAAATAATATCTCAGTAAAATTGTAATAAG i chlSab2.chr24 C 0 n 0 a score=3088753.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 470940 1745 + 478999 AAATAATGAAGCCACAGTCCAAATGTTAGCACCATGCAAAGATTCGTGTGTCTTCTCCACTCTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTCTTCTCTCAATCCACTGCTCAGTGTACACTATGGCATTGTGTTTTCTTCTTTGCTTTCATCTGCTTTGCAGGGAAATGAAGCACCATTTATTGGGACGTGTCCTCCATTTCTGATGGGCTCCCCGTGGTCTCCACCTCAGATGGTTTTGCCACCATCTTTAATCCGTTAATGCCTTCAATCGCCCTCACCATCCATGTAATGAAGCAATGAATGCCTTTACTTCATCTACTTGTGTCTCCATCAGTCAGTTCACTTCTCTCCATTCTCACAAAGGACAGCCA-------CCCACTACTTCAGAGCCTCCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCTGCTGTTTAGAAAGGGTGtgtattggaaacttaatcccaaattccatagtgtccagaggtgagaatgttaagaaatgattaggccgagagggctctgccctcatgaagcaattaatgccattatcatcagagtaggttacttattgtggtagcagattagttactacaggcctgggttcctcattaaaaaatgagtttagccccctttccatcctttgcacatgctctcctgccttccacatgggcatcacagcaagaaggctcttgccagatgctagcaccttgacatt-gacttcccagcctctagagctgggagaaaataaatttcttttccttacacattagccagtgtgtggtattcactcattgcac--cacaaagtggactaagacaAAaaatcagtatcaagaggtggggctgttgtgataacaaatatcccaaaatgtagaagtggaagtagtaatgcacagagactggaataatttggaggatcaggttataaaaagtctagattgccatgactagaacactaggggt-attcttttgaggactcagaagaagacagctgtgaggaaattctgaaacttcttagagattatttaggtgatgatcattagaatgttggtagaaccgtggacaataaaggccgttctgatgaggtctcaggagaaaaagaagaatagctcatcggaaaatggagcaaaggccatccttcccttaaagtggcaaggaatgtggctgaattgtgctcatccctaggtctttctgtaaagtggaagttcagagccatgagtgaggatatatggtg---ggagaaatttgaagcaaatctat--------------------------------------ggcctcacttctagcaggcactttaggactctgttccctgtgtccaggcacagcactccttggctgcccatgatgtggctcaggaggacctaggtgtggctcaagc---catcactttaatggtacaagtcatcaacttccatggcatccatgtattgctaattctgcaggtgtgcagaat------accacgagggcatggctttctccacctagatttcaaagaatgctgt----------------------------ggacagcctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagac-agagtcaccacagtggacccttagcacaatgccaagcagaaatatgggtttggaggcaccacaaagagtttccagtcagcctaggagagctagaggcctgagagtcccacctgtgagaggggctgagtggactgaacccagaaaatccatagaggcaagactgctggaggccttgggggcccttccccctccccagtgtgcacaagatgccgtcaaagaggatgattttc s panTro4.chr14 105671207 1787 + 106544938 AAATAATTAAGCCACAGTCCAAATGTTAGCATCATGCAAAGATTTGTGTGTCTTCTCCACTCTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTCTGCTCTCAATCCACTGCTCAGTGTACACTATGATGTTGTGTTTTGTTCTTTGCTTTCATCTGCTTTGCAGGGAAATGAAGCACCATTTATTGGGACGTGTCCTCCATTTCTGATGGACTCCCCGTGGTCTCCACCTCAGACGGTTTTGCCACCATCTTTAATCCGTTAATGCCTTCAATCGACCTCACCATCCATGTAATGAAGCAATGAATGCCTTTACCTCATCTACTTGTGTCTCCATGAGTCAGTTCACTTCTCTCCATTCTCACAAAGGACAGCCAACCTCAGGCCACTGCTTCAGAGCCTCCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCTGCTGTTTAGAAAGAATGtgtattggaaacttaatcccaaattccataatgtccagaggtgagaatgttaagaaatgattaggccaagagggctctgccctcatgaagcaatgaatgccattatcgtcatagtaggttactcattgtggtagcagattggttactacaggcctgggttcctcattaaaaaatgagtttagccccctttccatccttcgcacatgctctcctgccttccacatgggcatcatagcaagaaggctcttgccagatgctaacaccttgatatt-gacttcccagcctctagagctgcgagaaaataaatttcttttccttatacattagccagtgtgtggtattcactcattgcac--cacaaagtggactaagacGAgaaatcagtatcaagaggtggggctgttgcgataacaaataccccaaaatgtagaagtgggtgtagtaatgcacaaagactggaataatttggaggatcagactataaaaagtctagattgccctgaatagaacactagaggtgattcttttgaggactcagaagaagagagctgtgaggaaattctgaaacttcttagagattatttaggtgatgaccattagaatgtcggtagaaccgtggacaataaaggccattctgatgaggtctcaggagaaaaagaaaaatagctcatcggaaaatggagcaaaggccatccttgccataaagtggcaaagaacgtggctgaattgtgctcatccctaggtccttctgtaaggtggaagttcagagccatgaacgaggttatatggta---ggagaaatttgaagcaaaTCTAT--------------------------------------CGCCTCACTTCTAGCAGGCACTTTAGGACTCTGTTCCCGGTGTCCAGGCACAGCACtccttggctgcccatgctgtggctcaggaggacctaggtgtggctcaagc---catcactttaatggtacaagtcatcaacttccatggcatccatgtgttgttaattctgcaggtgtgcagaatacaagaaccacgagggcatggctttctccacctagatttcaaagagtgccgtggacagcctaaggtctcgggcagcctaaggacagcctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagac-agagtcaccacactgggcccttagcacaatgccaagcagaaatgtgggtttggaggtaccacaaagagtttccagtcagcctaggagagctagaggcctgagagtcccacctgtgagagcggctgagtggactgaacccagaaaatccatagaggcaagactgccggaggccttgggggcccatctccctccccagtgtgcacaagatgccgtcaaagaggatgattttc i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18713975 1758 + 99152023 AAATAATGAAGCCACAGTCCAAATGTTAGCATCATGCAAAGATTCGTGTGTCTTCTCCACTCTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTCTTCTCTCAATCCACTGCTCAGTGTACACTATGGCGTTGTGTTTTGTTCTTTGCTTTCATCTGCTTTGCAGGGAAATGAAGCACCATTTATTGGGACATGTCCTCCATTTCTGATGGGGTCCCCGTGGTCTCCACCTCAGATGGTTTTGCCACCATCTTTAATCCGTTAATGCCTTCAATCGCCCTCACCATCCATGTAATGAAGCAATGAGTCCCTTTACTTCATCTACTTGTGTCTCCATGAGTCAGTTCACTTCTCTTCATTCTCACAAAGGACAGCCACCCTCAGGACACTACTTCAGAGCCTCCTGCAGCCTTGGGTGGTAAATCTATTAAAAAGCCCCTGCTGTTTAGAAGGAGTGtgtattggaaacttaatcccaaattccatagtgtccagaggtgggaatgttaagaaatgattaggccatgagggctctgccctcataaagcaattaatgctgttatcgtcagagtagcttacttattgtggtagcagattagttactacaggcctaggttcctcattacaaaatgagtttagccccctttccatcctttgcacatgctctcctgccttccacatgggcatcacagcaagaaggctcttgccagatgctaacaccttgatatt-gacttcccaccctctagagctgtgagaaaataaatttcttttccttatacattagccagtgtgtggtattcactcattgcac--cacaaagtggactaagacGAAaaatcagtatcaagaggtggggctgttgcgataacaaatatcccaaaatgtagaagtggaagtagtaatgcacagagactggaataatttggaggatcaggttataaaaagtctagattgccatgactagaacactaggggt-attcttttgaggactcagaagaagagaactgtgaggaaattctgaaacttcttagagattattcaagtgatgaccattagaatgttggtagaactgtggacaataaaggccgttctgatgaggtctcaggagaaaaagaagaatagctcatcagaaaatggagcaaaggccatccttgccataaagtggcaaagaatgtggctgaattgtgctcatccctaggtctttctgtaaaatggaagtgcagagccatgaacgaggatatatggtg---gaagaaatttgaagcaaatccat--------------------------------------ggcctcacttctagcaggcacttcaggactctgttccctgtgtccagacacagcactccttggctgcccatgctgtggctcaggaggacctaggtgtggctcaagccatcatcactttaatggtacaagtcatcaactaccatggcatccatgtgttgttaattctgcaggtgtgcagaatacaagaaccacgagggcatggctttctccacctagatttcaaagaatgctgt----------------------------ggacagcctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagac---agtcaccacactgggcccttagcacaatgccaagcagaaatatgggtttggaggcaccacaaagggtatccagtcagcctaggagagctagaggcctgacagtcccacctgtgagagtggctgagtggactgaacccagaaaatccatagaggcaagactgccggaggcctt-ggggcccatccccctccccagtgtgcacaagatgccatcaaagaggatgattttc i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 216197 1796 - 170124641 AAATTATGAAGCCACAGTCCAAATCTTAGCACCTGGCAAAGATTCGTGTGTCTTCTCAACTTTGTCAGTTATGCTTTAGGAAACTCTTCCCTCAATCCACTGCTCAGTATACACTATGGCGTTGTGTTTTGTTCTTTCCTTTCTTCTGCTTTGCAAGGAGATGAAGCATCATTTATTGGGATGTGTCCTCCATTTCTGAAGGTCTCCCCGTAGTCTCCACCTCAGACGGTTTTGCCACCA--ATTAACCCATTAATGCCTTCAATCGCCCTCACTATCCATGTAATGAAGCGATGAGTCCCTTTACTTCATCTACTTGTGCCTCGATAAGTCAGTTCACTTTTCTCCATTCTTGCAAACTACAGTCACCCTCAGGCCACTGCTTCAGAGCCTTCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCCACTATTTAGAAAGGATGtgtattggaaacttaatcccaaattccatagtgtccagaagtgggaatgttaagaaatgattcggtcatgaggggtctgccgtcatggagcaattaatgccattaccatcagagtaggttacttattgcgggagtggattagttactgtaggcctgggttcctcattaaaaaatgagtttagccccctttccatcctttgcacatgctctcctgccttccacttgggcatcacagtaagaaggctcttgccagatgttaacaccttgatattggacttcccagtctctagaactgtgagaaaataaatttattttacttatacattagccagactgtggtattctctcattgcac--cacaaagtggactaagacaAAAAAACATtatcaagaggtaggagtgttgctgtaacaaataccccaaaatgtagaaatggaagtagtaatgcacagagactggaataatttggaggatcaggctataaaaagtctagattgccctgaatagaacaggagggtg-attcttttgaggactcagaagaagagagctgtgaggaaatt-tgaaacttcttagagattatttaagtggtgaccattagaatgttggtagaactgtggacaataaaggccgttttgatgaggtctcaggagaaaaggaagaacagctcatcggaaaatggagcaaa-gccatctttgctataaagtggcaaagaacatggctgaattgttctcatccctaggtctttctgtaaggtggaagttcagagccatgaacgaggatatatggtggaagaaGAAATTTGAAGTAAATCTATGGCCTCACTTCTGGCATGCACTTTAGGATTCCTGTGTCggcctcacttctggcatgcactttaggactctgttccctgtgttcaggcacagcactccttgactgcccatgctgtggctcaggaggacctaggagtggctcaagc---catcactttaatggtacaaatcatcaacttccatggcatccaagtgttgttaattttgcaggtgtgcagaatacaagaaccgtgagggcacggctttctccacctagatttcaaagaatgctgt----------------------------ggacagcctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagac-agagtcaccacactgggcccttagcaccatgccaagctgaaatgtgggtttggaggcaccacaaagagtttccagtcagcctaggagagctagagggatgagagtcccacctgtgggaacagctgagtggactgaacccagcaaatccatagagacaagactgccggaggccttgggtgaccatccccgacccaagtgtgcacaagatgcagtcaaggaggatgattttc i rheMac3.chr7 I 57 C 0 s macFas5.chr7 511856 1768 - 171882078 AAATTATGAAGCCACAGTCCAAATCTTAGCACCTGGCAAAGATTCGTGTGTCTTCTCAACTTTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTCTTCCCTCAATCCACTGCTCAGTATACACTATGGCGTTGTGTTTTGTTCTTTCCTTTCTTCTGCTTTGCAAGGAGATGAAGCATCATTTATTGGGATGTGTCCTCCATTTCTGAAGGTCTCCCCGTAGTCTCCACCTCAGACGGTTTTGCCACCATCATTAACCCATTAATGCCTTCAATCGCCCTCACTATCCATGTAATGAAGCGATGAGTCCCTTTACTTCATCTACTTGTGCCTCCATAAGTCAGTTCACTTTTCTCCATTCTTGCAAAGTACAGTCACCCTCAGGCCACTGCTTCAGAGCCTTCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCCACTATTTAGAAAGGATGtgtattggaaacttaatcccaaattccatagtgtccagaagtgggaatgttaagaaatgattcggtcatgaggggtctgccctcatggagcaattaatgccattaccatcagagtaggttacttattgcgggagtggattagttactgtaggcctgggttcctcattaaaaaatgagtttagccccctttccagcctttgcacatgctctcctgccttccacttgggcatcacagtaagaaggctcttgccagatgttaacaccttgatattggacttcccagcctctagaactgtgagaaaataaatttattttacttatacattagccagactgtggtattctctcattgcac--cacaaagtggacaaagacaAAAAAACATtatcaagaggtaggagtgttgctgtaacaaataccccaaaatgtagaaatggaagtagtaatgcatagagactggaataatttggaggatcaggctataaaaagtctagattgccctgaatagaacaggagggtg-attcttttgaggactcagaagaagagagctgtgaggaaatt-tgaaacttcttagagattatttaagtggtgaccattagaatgttggtagaactgtggacaataaaggccgttttgatgaggtctcaggagaaaaggaagaatagctcatcggaaaatggagcaaaggccatctttgctataaagtggcaaagaacatggctgaattgttctcatccctaggtctttctgtaaggtggaagttcagagccatgaacgaggatatatggtggaagaaGAAATTTGAAGTAAATCTAT--------------------------------------GGCCTCACTTCTAGCAtgcactttaggactctgttccctgtgtccaggcacagcactccttgactgtccatgctgtggctcaggaggacctaggagtggctcaagc---catcactttaatggtacaagtcatcaacttccatggcatccatgtgttgttaattttgcaggtgtgcagaatacaagaaccgtgagggcacggctttctccacctagatttcaaagaatgctgtggacag----------------------ggacagcctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagacaagagtcaccacactgggcccttagcaccatgccaagctgaaatgtgggtttggaggcaccacaaagagtttccagtcagcctaggagagctagaggcatgagagtcccacctgtgagagcggctgagtggactgaacccagaaaatccatagagacaagactgccggaggccttgggtgaccatccccgacccaagtgtgcacaagatgcagtcaaggaggatgattttc i macFas5.chr7 I 10 C 0 s papAnu2.chr7 127385 1762 - 162156779 AAATTATGAAGCCACAGTCCAAATCTTAGCACCTGGC-AAGATTCGTGTGTCTTCTCAACTTTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTTTTCCCTCAATCCACTGCTCAGTATACACTATGGCGTtgtgttttgttctttcctttcttctgctttgcaAGGAGATGAAGCACCATTTATTGGGATGTGTCCTCCATATCTGAAGGTCTCCCCGTAGTCTCCACCTCAGACGGTTTTGCCACCATCATTAACCCATTAATGCCTTCAATCGCCCTCACTATCCGTGTAATGAAGCGATGAGTCCCTTTACTTCATCTACTTGTGCCTCCATAAGTCAGTTCACTTTTCTCCATTCTTGCAAAGTACAGTCACCCtcaggccactgcttcagagCCTTCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCCACTATTTAGAAAGGATGtgtattggaaacttaatcccaaaTTCTATAGTGTCCAGAAGTGGGAATGTTAAGAAATGATTCGGTCATGAGGGGTCTGCCCTCATGGAGCAATTAATGCCATTACCATCAGAGTAGGTTACTTATTGCGGGAGTGGATTAGTTACTGTAGGCCTGGGTTGCtcattaaaaaatgagtttaGCCCCCTTTCCATCCTTTGCACATGCTCTCCTGCCTTCCACTTGGGCATCACAGTAAGAAGGCTCTTGCCAGATGTTaacaccttgatattggacttcccaacctctagaactgtgagaaaataaatttcttttacttATACATTAGCCAGACTGTGGTATTCTCTCATTGCACCACACAAAGTGGACTAAGACaaaaaaaCATTATCAAGAGGTAGGcgtgttgctgtaacaaatacccCAAAATGTAGAAATGGAAGTAGTAATGCGTAGAGACTGGAATAATTTGCAGGATCAGGCTATAAAAAGTCTAGATTGCCCTGAATAGAACAGGAGGGTG-ATTCTTttgaggactcagaagaagagagCTGTGAGGAAATT-TGAAACTTCTTAGAGATTATTTAAGTGATGACCATTAGAATGTTGGTAGAACTGTGGACAATAAAGGCCGTTTTGATGAGGTcttaggagaaaaggaagaagagctcATCGGAAAATGGAGCAAAGGCCATCCTTGctataaagtggcaaagaacaTGGCTGAATTGTTCTCATCCCTAGGTCTTTCTGTAAGGTGGAAGTTCAGAGCCATGAACGAGGATATATGGTGGAAGAAGAAATTTGAAGTAAATCTAT--------------------------------------GGCCTCACTTCTAGCATGCACTTTAGGACTCTGTTCCCTGTGTCCAGGCACAGCACTCCTTGACTGCCCATGCTGTGGCTCAGGAGGACCTAGGAGTGGCTCAAGC---CATCACTTTAATGGTACAAGTCATCAACTTCCATGGCATCCATGTGTTGTTAATTTTGCAGGTGTGCAGAATACAAGAACCGTGAGGGCACAGCtttctccacctagatttcaaagaatGCTGT----------------------------GGACAGGCTAAGGTCTTGGGCAGTGAGTTGTTGCAGAGAC-AGAGTCACCACACTGGGCCCTTAGCACCATGCCAAGCTGAAATGTGGGTTTGGAGGCACCGCAAAGAGTTTCCAGTCAGCCTAGGAGAGCTAGAGGCATGAGAGTCCCACCTGTGAGAGCGGCTGAGTGGACTGAACCCAGAAAATCCATAGAGACAAGGCTGCCGGAGGCCTTGGATGCCCATCCCCGACCCAAGTGTGCACAAGATGCAGTCAAGGAGGATGATTTTC i papAnu2.chr7 I 82 C 0 s chlSab2.chr24 1141895 1760 - 84932903 AAATTATGAAGCCACAGTCCAAATCTTCGCACCTGGCAAAGATTCGTGTGTCTTCTCAACTTTGTCAGTTACGCCTTAGGAAACTCTTCCCTCAATCCACTGCTCAGTATACACTATGGCGTTGTGTTTTGTTCTTTCCTTTCTTCTGCTTTGCAAGGAGATGAAGCACCATTTATTGGGATGTGTCCTCCATTTCTGAAGGTCTCCCCGTAGTCTCCACCTCAGACGGTTTTGCCACCATCATTAACCCATTAATGCCTTCAATCGCCCTCACTATCCATGTAATGAAGCGATGAGTCCTTTTACTTCATCTACTTGTGTCTCCATAAGTCAGTTCACTTTTCTCCATTCTTGCAAAGTACAGTCACCCTCAGGCCACTGCTACAGAGCCTTCTGCAGCCTTGGGTGGTAAACCTATTAAAAAGCCCCCACTATTTAGAAAGGATGtgtattggaaacttaatcccaaattccatagtgtccagaagtgggaatgttaagaaatgattcggtcttgaggggtctgccctcatggaacaattaataccattaccatcagagtaggttacttattgcgggagtggattagttactgtaggcctgggttcctcattaaaaaatgagtttagccccctttccatcctttgcacatgctctcctgccttccacttgggcatcacagtaagaaggctcttgccagatgttaacaccttgatattggacttcccagcctctagaactgtgagaaaataaatttcttttacttatacattagccagactgtggtattctctcattgcac--cacaaagtggactaagacaAAaaatcattatcaagaggtaggagtgttgctgtaacaaataccccaaaatgtagaaatggaagtagtaatgcatagagactggaataatttggaggatcaggctataaaaagtctagattgccctgaatagaacaggagggtg-attcttttgaggactcagaagaagagagctgtgaggaaatt-tgaaacttcttagagattatttaagtgatgaccattagaatgttggtagaactgtggacaataaaggccgttttgatgaggtctcaggagaaaaggaagaatagctcatcggaaaatggagcaaaggccatccttgctataaagtggcaaagaacatggctgaattgttctcatccctaggtctttctgtaacgtggaagttcagagccatgaacgaggatatatggtggaagaaGAAATTTGGAGTAAATCTAT--------------------------------------GGCCTCACTTCTAGCAtgcactttaggactctgttccctgtgtccaggcacagcactccttgactgcccatgctgtggctcaggaggacttaggtgtggctcaagc---catcactctaatggtacaagtcatcaacttccatggcatccatgtgttgttaattttgcaggtgtgcagaatacaagaaccacgagggcacggctttctccacctagatttcaaagaatgctgt----------------------------ggacaggctaaggtctcgggcagtgagttgttgcagagac-agagtcaccacactgggcccttagcaccatgccaagctgaaatgtgggtttggaggcaccacaaggagtttccagtcagcctaggagagctagaggcatgagagtcccacctgtgagagcgactgagtggactgaacccagaaaatccataggggcaagactgccggaggccttgggtgtccatccccaacccaactgtgcac-agatgcagtcaaggaggatgattttc i chlSab2.chr24 I 10 C 0 a score=12835.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 472685 11 + 478999 cagctataaga s ponAbe2.chr15 18715733 11 + 99152023 cagctgtaaga i ponAbe2.chr15 C 0 I 14 s rheMac3.chr7 217993 11 - 170124641 cagctttaagg i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 171379713 11 + 171882078 cagctttaagg i macFas5.chr7 I 1746 C 0 s papAnu2.chr7 162043507 11 + 162156779 CAGCTTTAAGG i papAnu2.chr7 I 1746 C 0 s chlSab2.chr24 1143655 11 - 84932903 cagctttaagg i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e panTro4.chr14 105672994 0 + 106544938 C a score=1910.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 472696 2 + 478999 ct s rheMac3.chr7 218004 2 - 170124641 ct i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 171379724 2 + 171882078 ct i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 162043518 2 + 162156779 CT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1143666 2 - 84932903 ct i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18715744 14 + 99152023 I e panTro4.chr14 105672994 0 + 106544938 C a score=3153.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 472698 26 + 478999 tttttttattatact--ttaagttttag s macFas5.chr7 171379726 28 + 171882078 taatgttgttttccctgttagattttgg i macFas5.chr7 C 0 n 0 s papAnu2.chr7 162043520 28 + 162156779 TAATGTTGTTTTCCCTGTTAGATTTTGG i papAnu2.chr7 C 0 n 0 e ponAbe2.chr15 18715744 14 + 99152023 I e chlSab2.chr24 1143668 0 - 84932903 C e rheMac3.chr7 218006 0 - 170124641 C e panTro4.chr14 105672994 0 + 106544938 C a score=0.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 472724 604 + 478999 ggtgcatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgtgtgcacccattaactcgtcatttagcattaggtatatctcctaaagctatccctcccccctcaccccaccccacaacagtcccccgagtgtgatgttccctttcctgtgtccatgtgttctcattgttcagttcccacctatgagtgagaatatgcggtgtttggttttttgttcttgcgatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtctatcgttgttggacatttggattggttccaagtctttgctattgtgaatagtgctgcgataaacatatgtgtgcatgtgtctttatagcagcatgatttatagtcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcaccacaaggacttctacaatggttgaactagttcaaaacccaacaagggaaaaaaacattaagtct e ponAbe2.chr15 18715744 14 + 99152023 I e chlSab2.chr24 1143668 0 - 84932903 C e papAnu2.chr7 162043548 0 + 162156779 n e macFas5.chr7 171379754 0 + 171882078 n e rheMac3.chr7 218006 0 - 170124641 C e panTro4.chr14 105672994 0 + 106544938 C a score=6033.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 473328 13 + 478999 cagctataagact s panTro4.chr14 105672994 13 + 106544938 cagctataagact i panTro4.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr7 513624 13 - 171882078 cagctttaaggct i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 129147 13 - 162156779 CAGCTTTAAGGCT i papAnu2.chr7 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18715744 14 + 99152023 I e chlSab2.chr24 1143668 0 - 84932903 C e rheMac3.chr7 218006 0 - 170124641 C a score=15779.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 473341 15 + 478999 taatgtttttttcct s panTro4.chr14 105673007 14 + 106544938 taatgtttttttcc- i panTro4.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 218006 14 - 170124641 taatgttgttttcc- i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 513637 14 - 171882078 taatgttgttttcc- i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 129160 14 - 162156779 TAATGTTGTTTTCC- i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1143668 14 - 84932903 taatgttgttttcc- i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e ponAbe2.chr15 18715744 14 + 99152023 I a score=2093591.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 473356 1210 + 478999 ctgttgggttttgaactaggcactgctttctccttccctgtctctgagctttggaatgggaatttctatcccatacctgccccattgttcactgtatttgaaagtagataacttgttttgactttataggctcacagatggaaaaaatttatatcaggctaaattgtgccttgagtcacactcacatctgatttagatgagactttagacttcagacttttgcactgatgctggataagac--tttggagacaattgggatggaatgaatgtagtttgcattgtgataaggacataaattttgATATTAGGAATGGAAtgctatgacttaaatgtgtctcccaaagtttaggatttggaaaaaatctttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttattatgtgattaggtcatgaaggctctgtcctcatgaatggattaatgtcactgtcattggagtgggttagttattacaggagtgaatttctaataaaagatagtctcctttctctcgtggacaaatgatctcttgctcacccacctctgctgtgagacgacacagtgagaaggcccttgtgagatgtcagtgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagtataaattccttttctttagaaattgcccagtctctggtattcggttatagtaacacaaagacagactgagacTAagccattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgagcatttga--ctctttatgttaagtgaaataagccaggtataaaaaattactccataatctcacttacacatgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagaagaatggtgccaaccaggggctggtgtcaggggcatgtgaaagctgaggcattggtgaaagggtacagagttttggtttgacagaaggaattagtttgaagatctattgcacagcagggtgacttccatggtactaatgtactatatacttgaaaactgataatagagtagattttacacgtttacaccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatgggcatgtttatttacttgatttaataatttcacaatgcctgcatat---gtcaaaacatcacgtcataccaccataatatatgaaatAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA s panTro4.chr14 105673021 1209 + 106544938 ctgttgggttttgaactaggcaccgctttctgcttgcctatctctgagctttggaatgggaatttctatcccatacctgccccattgttcactgtatttgaaagtagataacttgttttgactttataggctcgcagatggaaacaatttatatcaggctaaattgtgcctcgagtcacactcatatctgatttagatgagactttggacttcagacttttgcactgatgctggataagac--tttggagacaattgggatggaatgaatgtagtttgcattgtgataaggacataaattttgATATTAGGAATGGAAtgttatggtttaaatgtgtctcccaaagtttaggatctggaaaaaatctttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttattatgtgatcaagtcatgaaggctctgtcctcatgaatggattactgtcactatcattggagtgggttagtttt---aggagtgaatttctaataaaagatggtctcctttctctcatggacaaatggtctcttgctcacccacctctgctgtgagatgaggcagggagaaggcccttgtgagatgccagtgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagcataaattccttttctttaggaattgcccagtctctggtatttggatatagtaacacaaagacagactgagacTAagccattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggctttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgagtgtttgaatgtctttatgttgagtgaaataagccaggtataaaaaattactccatgatctcacttacacatgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagtagaatggtgccaaccaggggctggcgtcaggggcatgtgaaagctgagacgttggtgaaagggtacagagtttttgttagacagaaggaattcgtttgaagatctattgcacagcatggtgacttccttgatactaatgtactatatacttgaaaactgataagagagtagattttacacgtttataccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatggacatgtttatttacttgatttaataatttcacaatgcccacatat---gtcaaaacatcacgtcatatccccataatatatgaaatAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18715758 1208 + 99152023 ctgttgggttttgaactaggcacc-ccttctccttgcctatctctgagctttggaatgggaatttctgtcccatacctgccccattgttcactgtatttgaaagtagataacttgttttgactttataggctcacaggtagaaacaatttatatcaggctaaattgtgctttgagtcacactcatatctgatttagatgagactttggacttcagacttttgcactgatgctggataagac--tttggagacaattgggatggaatgaatgtagtttgtattgtgataaggacataaattttgATATTAGGAATGGAAtgctatggtttaaatgtgtctcccaaagcttaggatttggaaaaaatctgtaatgctacagtgttgagaagtggga-ctttactatgtgattaggtcatgaaggctctgtcctcatgaatggattaatgccactatcattggagtgggttagttattacaggagtgaatttctaataaaagatggtttcctttctcttgtggacaaatggtctcttgctcatccacctctgctgtgagatgacgcagtgagaaggcccttgtgagatgccagtgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagtataaattccttttctttagaaattgcccagtctctggtattcggttatagtaacagaaagacagactgagacGAagccattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgagcatttGA--CTCTttatgttgagtgaaataagccaggtgtaaaaaattactccatgatctcactgacacatgcaatccaaaaatgttgaactcagaggagtagagagaagaatggcgcctaccaggggctggcgtcaggggcatgtgaaagctgaggcgctggtgaaagggtacagagttttggttagacagaaggaattcatttgaagatctattgcacagcatggtgccttccatgatactaatgtactatatacttgaaaactgataagagagtagattttacaagtttataccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatggacatgtttatttatttgatttaataatttcactatgcccgcatat---gtcaaaacatcacgtcatacccccataatatatgaaatAGGATATGTTTTTCTAGTAAGCGTGA i ponAbe2.chr15 I 14 C 0 s rheMac3.chr7 218020 1202 - 170124641 ctgttgggttttgcactaggcacccctttctccttgcctatctctcccctttgaaatgggaatttctatcccatacctgccccatcgttcactgtatttgaaagtagataactcgttttgactttataggctcacagatggaaacaatatgtatcaggctaaattgtgccttgagtcacactcatatctgatttagatgagactttggacttcagacttttgcactgatgctggataagactctttggagacacttgggatggaatgaatatagtttgcattgtgataaggtcgtaaattttggTATTAGGAATGAAAtgctatggtttaaatgtgttgcccaaaagttaggatttggaaaaaatctttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttattatgtgatcaggtcatgaagtctctgtcctcatgaatggattaatgtcactatcattggagtgggttagttattacaggattgagtttctaataaaaattggcctcctttctctcacggacaaatggtttcttgctcatcca-ctttgctgtgagatgatacagcgagtgggcccttgtcagatgccagcgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagtagcaattctttttctttagaaattgcctagtctctggtattctgttatagcaacacaaagacagactgagacTAaggcattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgaaggtttgaatgtctttatgttgagtgaaataagcctggtataaaaaattactcc---atctcacttatacatgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagtagaatgttgcctaccagggactggcatcaggaggatgagaaatctgagacgttggtgaaagggtacagagtt----------agaaggaattcatttgaagatctgctgcacagcatagtggcttcagtgatactaacgtactatacacttgaaaactgagaagagagtagcttttacacatttacaccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatggacatgtttatttacttgatttaataatttcacaatgcacgcatgtatcatcaaaacatcatgttgta-ccccataatatatgaaatAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 513651 1194 - 171882078 ctgttgggttttgcactaggcacccctttctccttgcctatctctccgctttgaaatgggaatttctatcccatacctgccccatcgttcactgtatttgaaagtagataactcgttttgactttataggctcacagatggaaacaatttgtatcaggctaaattgtgccttgagtcacactcatatctgatttagatgagactttggacttcagacttttgcactgatgctggataagactctttggagacacttgggatggaatgaatatagtttgcattgtgataaggtcgtaaattttggTATTAGGAATGAA-----atggtttaaatgtgttgcccaaaagttaggatttggaaaaaatctttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttattatgtgatcaggtcatgaagtctctgtcctcatgaatggattaatgtcactatcattggagtgggttagttattacaggattgagtttctaataaaaattggcctcctttctctcacggacaaatggtttcttgctcatcca-ctttgctgtgagatgatacagcgagtgggcccttgtcagatgccagcgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagtagcaattctttttctttagaaattgcctagtctctggtattctgttatagcaacacaaagacagactgagacTAaggcattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgaAGGTTTGAATGTCTttatgttgagtgaaataagcctggtataaaaaattactcc---atctcacttatacatgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagtagaatgttgcctaccagggactggcatcaggaggatgagaaatctgagacgttggtgaaagggtacagagtt----------agaaggaattcatttgaagatctgctgcacagcatagtggcttcagtgatactaacgtactatacacttgaaaactgagaagagagtagcttttacacatttacaccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatggacatgtttatttacttgatttaataatttcacaatgcacgcatgt---atcaaaacatcatgttgta-ccccataatatatgaaatAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 129174 1200 - 162156779 CTGTTGGGTTTTGCACTAGGCACCCCTTTCTCCTTGCCTATCTCTCCCCTTTGAAATGGGAATTTCTATCCCATACCTGCCCCATCGTTCACTGTATTTGAAAGTAGATAACTCGTTTTGACTTTATAGGCTCACAGATGGAAACAATATGTATCAGGCTAAATTGTGCCTTGAGTCACactcatatctgatttagatgagactttggacttcagACTTTTGCACTGATGCTGGATAAGACTCTTTGGAGACACTTGGGATGGAATGAATATAGTTTGCATTGTGATAAGGTCGTAAATTTTGGTATTAGGAATGaaatgctatggtttaaatgtgttgCCCAAAAGTTAGGATTTGGAAAAAATCTttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttatTATGTGATCAGGTCATGaaggctctgtcctcatgaatggattaatgtcactATCATtggagtgggttagttattacAGGATTgagtttctaataaaaattgGCCTCCTTTCTCTCATGGACAAATGGTTTCTTGCTCATCCA-CTTTGCTGTGAGATGATACAGTGAGAGGGCCCTTGTCAGATGCCAGCGCCTTGATATTAGACTTCTCTGACTCAAGCACCATAAAGtagcaattctttttctttagaaattgcctagtctctggtattctgttatagcaacacaaagacAGACTGAGACTAAGGCATTGTGAcatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagtggaTGTTGAAGGTTTGAATGTctttatgttgagtgaaataagcctggTATAAAAAATTACTCC---ATCTCACTTATACATgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagtagaatgttgCCTACCAGGGACTGGCATCAGGAGGATGAGAAATCTGAGACGTTGGTGAAAGGGTACAGAGTT----------AGAAGGAATTCATTTGAAGATCTGCTGCACAGCATAGTGGCTTCAGTGATACTAACGTACTATACACTTGAAAACTGAGAAGAGAGTAGCTTTTACACATTTACaccataaaaaaataagtatgtgaggtgatggacatGTTTATTTACTTGATTTAATAATTTCACAATGCAcgcatat---atcaaaacatcacgttGTA--CCCATAATATATGAAATAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1143682 1199 - 84932903 ctgttgggttttgcactaggcacccctttctccttgcctatctctcccctttgaaatgggaatttctatcccatacctgccccatcgttcactgtatttgaaagtagataactcgttttgactttataggctcacagatggaaacaatgtatatcaggctaaattgtgccttgagtcacactcatatctgatttagatgagactttggacttcagacttttgcactgatgctggataagactttttggagacacttgggatggaatgaatgtagtttgcattgtgataagatcgtaaattttggTATTAGGAATGAAAtgctatggtttaaatgtgttgcccaaaagttaggatttcgaaaaaatctttaatgcaacagtgttgagaggtgggacctttattatgtgatcaggtcatgaaggctctgtcctcatgaatggattaatgtcactatcattggagtgggttagttattacaggattgagtttctaataaaaattggcctcctttctctcacggacaaatggtttcttgctcatcca-ctttgctgtgagatgatacagcgagagagcccttgtcagatgccagcgccttgatattagacttctctgactcaagcaccataaagtagcaattctttttctctagaaattgcctagtctctggtattctgttataacaacacaaagacagactgagacTAaggcattgtaacatgtgtgaggtgatatctcatcgtggttttaatttgcatttccctgatgattagt-gatgttgaAGGTTTGAATGTCTttatgttgagtgaaataagcctggtataaaaaattactcc---atctcacttatacatgcaatctaaaaatgttgaactcagagaagtagagagtagaatgttgcctaccagggactggcatcaggaggatgagaaatctgagacgttggttaaaggatacagagtt----------agaaggaattcatttgaagatctgctgcacagcatagtggcttcagtgatactaacgtactatacacttgaaaactgagaagagagtagcttttacacatttacaccat-aaaaaataagtatgtgaggtgatggacatgtttatttacttgatttaataatttcacaatgcacgcatat---atcaaaacatcacgttgta-tcccataatatatgaaatAGAATATGTTTTTCTAGTAAGTGTGA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 a score=182096.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 474566 725 + 478999 TGCCT----------CTGTTTCTCTTTTTTTTTT-GGAACAAAACAATAAACACCTTTATTACATGGGTGAAGACAAAACAAGGATTTATTTGCCCTTCCGGGCCTTGATTTTCCTAAGATAGAACTCCAACTCTTTGCCCTCTAGCACATACCCATCTGCTCAGCCACACTGTCCTGGCCTTGAAGCAATGCATGCAAGAAGCTTGCCCTGCTGGAACTGCTCCCCCAGGAGACTGCTGATTTTGGCATTCTTTTTCCTTTCATGATATTTCTTCTGAATTTTTTTAGATCGCTTTTTGTTCAAAATCTCTTCTTCCTCAGGAGTCAGCTTGGCTCCCTTCTTGCAGCCCAGGGGCGGCGCATAGTGGGACTCGTACCACTGTCGGTACAGTGTGCTGTCAATGAGCACAATGCAATTCTTCACCAGGGTCTTGGGACGAACCAGCTCGTTATTAGATGCATTGTAGACAACATCGATGATCGTTGTTTTATGAGCACAACATTCTGAGCCCCAGGAGAAATTCCTCACGTCCAGCCTCAGGGCACAGTATTTCTTGTTACCTCCC------CACACACGGACTGTGTGGATGCGGCGGGGGCCAGTCTTGGTGTTGGCAGCTGGGTGCCCCAACTCATACTTCCGCTTCTTGTGGTAGGGCTTTCTCTTGTCCCTGGTTTTGTGGCACTTGTGCCAGTTGTCCCAAGAGATGTCCATCGCTCGGCACTGGCTGGAAAGAG s panTro4.chr14 105674230 742 + 106544938 TGCCTGtttctttttctttttctttttttttttttGGAACAAAACAATAAACACCTTTATTACATGGGTGAAGACAAAACAAGGATTTATTTGCCTTTCTGGGCCTTGATTTTCCTAAGATAGGACTCCAACTCTTTGCCCTCTAGCACATAGCCATCTGCTTGGCCACACTGTCCCGGCCTTGAAGCCATGCACGCAAGAAGCTTGCCCTGCCGGAACTGCTCCCCCAGGAGACTGCTCATTTTGGCATTCTTTTTCCTTTCATCATATTTCTTCTGAAATTTTTTAGATTGTTTTTTGTTTAAAATCTCTTCTTCCTCAGGAGTCAGCTTGGCTCCCTTCTTGCGGCCCAGGGGCAGTGCACAGTGGGACTCGAACCACTGTCGGTAGGGCGTGCTGTCGATGAGCACGATGCAATTGTTCACCAGGGTCTTGGGATGAACCAGCTCGTTATTAGATGCATTGTAGACAACATCGATGATCCTTGTTTTACGAGCACAGCATTCTGAGCCCCAGGAGAAATTCCCCACGTCCAGCCTCAGGGCACAGTATTTCTTGTTACCTCCCCCCACACGCACACGGACTGTGTGGATGTGGCGCGGGCCAGTCTTGGTGTTGGCCGCTGGGAGCCCCAACTCATACTTCCGCTTCTTGTGGCAGGGCTTTCTCTTGCCCCCGGTTTTGCGGCGCTTGTGCCAGTTGTCCCGAGAGGTGCCCATCGCTCGGCGCTGGCTGGAAAGAG i panTro4.chr14 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 18716966 735 + 99152023 TGCCTCTGtttctttttttcttttttttttttttttGAACAAAACGATAAACACCTTTATTACATGGGTGAAAACAAAACGAGGATTTATTTGCCTTTCCGGGCCTTGATTTTCCTAAGCTAGAACTCCAACTCTTTGCCCTCTAGCCCATAGCCATCTGCTTGGCCACACTGTCCCGGCCTTGAAGCGATGCACGCAAGAAGCTTGCCCTGTTGGAACTGCTCCTCCAGGAGACTGCTGATTTTGGCATTCTTTTTCCTTTCATCATATTTCTTCTGAATTTTTTTAGATCATTTTTTGTTTAAAATCTCTTCTTCCTCAGGAGTCAGCTTGGCTCCCTTCTTGCAGCCCAGGGGCAGCGCATAGTGGGACTCGTACCACTGTCGGTACGGTGTGCTGTCAATGAGCAC-ATGCAATTCTTCACCAGGGTCTTGGTACGAACCAGCTCGTTATTAGATGCATTGTAGACAACATCGATGATCCTTGTTTTACGAGCACAACATTCTGAGCCCCAGGAGAAATTCCCCACGTCCAGCCTCAGGGCACAGTATTTCTTGTTACCTCCC------CGCACATGGACTGTGTGGATGCGGTGGGGGCCATTCTTGGTGTTGGCAGCTGGGCGCCCCAAATCATACTTCCGCTTCTTGTGGTAGGCCTTTCTCTTGCACCCGGTTTTGCGGCACTTGTGCCAGTTGTCCCGAGAGATGCCCGTCGCTCGGCGCTGGCTAGAAAGAG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 e chlSab2.chr24 1144881 0 - 84932903 C e papAnu2.chr7 130374 0 - 162156779 C e macFas5.chr7 514845 0 - 171882078 C e rheMac3.chr7 219222 0 - 170124641 C a score=1428511.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 475291 822 + 478999 GGCCTCTGTTTCTTTAACAACAGTTTCTGGAGATTGTTTTTCCCTTGAACAATGTTTCCTctctgctgtctttacacagttttcctttcccaagggttgatttaagacagtgacaatttatctattctgtatctggtagtttcatggagaaatttaatgaatagccacttgaaaccatgtggtgctactgagacaccatctgaaggagacagattttctgagtgtaggccacaaccatatgttaacacattttaaattcaaaatcagggtttaaattttgatattttacaatggcttctttgattccttcccaagatctaaccattgagcgtgtgaaaagggctgggactcagtttactgctgtgcttggcatgatgatgtcctgcagaaattcctttggctttctacatgtagctcagcctccatatcagccagctcgcttggaggtcagagtacttctcaaagatcctcagtgtgttgtttcattttgagaggtttccagcccttgtgagacaccccttggttttacaatcatcgcaaagttgtttacgattccaaaaacatacctgccatctgtccatatgtttgttctgcagcttttgatttcctaaaatgctgtagtaactgcaataagttctaccatctggattaattttcacctcagatggaagagtatattttaagataaagataaagtagtaacagtatattctcctcggtaatatccatttctatattttgagctatggtccatcaataaataatgttctgtcaggctcctcaatggagtgcctgaacatctaaggaaggtacagaaggtAC s panTro4.chr14 105674972 819 + 106544938 GGCCTCTGTTTCTTTAACAACACTTTCTGGAGATTGTTTTTCCCTTGAGCAATGTTTCCTCTCTGCTGTATTT--ACAGTTTTCCTTTCCCATGGGGtgatttaagacagtgacaatttatttattctatgtcttgtaatttcactgagaaacttaacgaatagccacttgaaaccatctggtgccactgagaaaccatctgaaggacacagattttctgagtgcaggccacaaccatattttaacactttttaaattcaaaatcggggtttaaattttgatattttactgtggcttctttgattccctcccaagatctaaccattgagtgtgtgaaaagggctgggacccaggttacggctgtgcttggcatgatgacgtcctgcagaaattcctttggctttctacatggagctcagcctccgtatcagccagctcgccaggaggtcagagtacttctcaaagatcctccgtgtgttgtttcattgtgagaggtttccagccttcgtgagacaccccttggttttacaatcatcacgaacttgtttatgattccgcaaacagacctgccgtccgtccgtatgtttgttctgtggcttctgatttgct-aaatgctgtagtaactgcaataagttctaccatctggattaattttcacctcagatggaagagcgcattttaagataaagataaaatagtaatagtatatcctccttggtaatatccagttctatattttgagctatggtccgtcaataaataatgttatgtcagggtcctcagtggAGTGCCTGAACATCTAAGGAAGGTACGGAAGGTTC i panTro4.chr14 C 0 I 5 s ponAbe2.chr15 18717701 822 + 99152023 GGCCTCTGTTTCTTTAACAACAGTTTCTGGAGATTGTTTTTCCCTTGATCAATGTTTCCTctctgctgtctttacacagttttcctttcccaagggttgatttaagacagtgacaatttatctattctgtatctggtagtttcatggagaaacttaacgaatagccacttgaaaccatctggtgccaccaagaaaccatctgaaggacacagattttctgagtgtaggccacaaccatattttaacactttttaaattcaaaatcggggtttaaattttgatattttacaatggcttctttgattccctcccaagatctaactgttgagcatgtgaaaagggctgggacccaggttatggctatgcttggcatgaaggtgtcctgcagaaattcctttggctttctacatggagctcagcctctgtatcagccagctcactaggatgtcagagtacttctcaaagatcctcagtgtgttgtttcatttttagaggtttccagccatcatgagacgtgctttggttttaaaatcatcacaaagttgtttacgattccaaaaacatacctgccatctgtccatatgtttgttctgtggcttttgatttgctaaaatgctgtagtaactgcagtaagttctaccgtctggattaattttcacctcagatggaagagtatattttaagataaagataaagtagtaacagtatattctccttggtaatatccagttctatattttgagctatggtcagtcaataaataatgttatgtcagggtcctcaatggagtgcctgaacatctaaggaaagtacagaagtttc i ponAbe2.chr15 C 0 I 5 s rheMac3.chr7 219222 820 - 170124641 GGCCTCTGATTCTTTAACAACAGTTTCTGGAAATTGTTTTTCCCTCAAGCAATGGTTCCTCTCTGCTGTCTTTATACAGTTTTCCTTTCTCAAGGGttgatttaagatagtgacagtttatctattatgtatctggtagtttcact-aggaacttaacaaacagccacttgaaaccatctggtgccaccgagaaaccatctgaaggacacagattttctgagtgtaggccacaagtatattttaacactttttaaattcaaaatcagaatttaaattttgatattttacaatggtttctttgattccctcccaagatctaaccattgagtgtgtgaaaagggctgggacccaggttatggctgtgcttggcatgacggtttcctgcagaaattcctttgtctttctacatggagctcagcctctgtatcagtcagttcgctaggaggtcagagtacttctcaaagatcctcagtgtgttgtttcattttgagaggtttccagctcttgtgagacaccccttggttttacaatcatcacaaacttgtttatgattccaaaaacatacctgctatctgtccatatgtttgttctgtggcttttgatttgctaaaatgctgtaataactgcaataagttgtaccatctggattaattttcacctcagatggaagagtgtattttaagacaaagataaaatagtaatagtacattctccttgtt-atatccagttctatattttgagctatggtccgtcaataaatcatgttatgtcagggtccttaatggagtgtctgaacatctaagaaaggtacagaagtttc i rheMac3.chr7 C 0 I 5 s macFas5.chr7 514845 820 - 171882078 GGCCTCTGATTCTTTAACAACAGTTTCTGGAAATTGTTTTTCCCTCAAGCAATGGTTCCTCTCTGCTGTCTTTATACAGTTTTCCTTTCTCAAGGGttgatttaagatagtgacagtttatctattatgtatctggtagtttcact-aggaacttaacaaacagccacttgaaaccatctggtgacaccaagaaaccatctgaaggacacagattttctgagtgtaggccacaagcatattttaacactttttaaattcaaaatcagaatttaaattttgatattttacaatggtttctttgattccctcccaagatctaaccattgagtgtgtgaaaagggctgggacccaggttatggctgtgcttggcatgacggcgtcctgcagaaattcctttgtctttctacatggagctcagcctctgtatcagtcagttcgctaggaggtcagagtacttctcaaagatcctcagtgtgttgtttcattttgagaggtttccagctcttgtgagacaccccttggttttacaatcatcacaaagttgtttatgattccaaaaacatacctgctatctgtccatatgtttgttctgtggcttttgatttgctaaaatgctgtagtaactgcaataagttgtaccatctggattaattttcacctcagatggaagagtgtattttaagacaaagataaaatagtaatagtacattctccttgtt-atatccagttctatattttcagctatggtccgtcaataaatcatgttatgtcagggtccttaatggagtatctgaacatctaagaaaggtacagaagtttc i macFas5.chr7 C 0 I 3 s papAnu2.chr7 130374 819 - 162156779 GGCCTCTGATTCTTTAACAACAGTTTCTGGAAATTGTTTTTCCCTCAAGCAATGGTTCCTCTCTGCTGTTTTTATACAGTTTTCCTTTCTCAAGGGTTAATTTAAGATAGTGACAGTTTATCTATTCTGTATCTGGTAGTTTCACTGAGGAACTTAACAAACAGCCACTTGAAACCATCTGGTGCCACCGAGAAACCATCTGAAGGACACAGATTTTCTGAGTGTAGGCCACAAGcatattttaacactttttaaattcaaaatcagaatttaaattttgatattttacaaTGGTTTCTTTGATTCCCTCCCAAGATCTAACCATTGAGTGTGTGAAAAGGGCTGGGA-CCAGGTTATGGCTGTGCTTGGCATGACGGCGTCCTGCAGAAATTCCTTTGCCTTTCTACATGGAGCTCAGCCTCTGTATCAGTCAGTTCGCTAGGAGGTAAGAGTACTTCTCAAAGATCCTCAGTGTGTTGTTTCATTTTGAGAGGTTTCCAGCTCTTGTGAGACACCACTTGGTTTTACAATCATCACAAAGTTGTTTATGATTCCAAAAACATACCTGCTATCTGTCCATATGTTTGTTCTGTGGCTTTTGATTTG-GAAAATGCTGTGATAACTGCAATAAGTTCTACCGTCTGGATTAATTTTCACTTCAGATGGAAGAGTGTATTTTAAGATAAAGATAAGATAGTAATAGTACATTCTCCTTGTT-ATATCCAGTTCTATATTTTCAGCTATGGTCTGTCAATAAATCATGTTATGTCAGGGTCCTTAATGGAGTATCCGAACATCTAAGAAAGGTACAGAAGTTTC i papAnu2.chr7 C 0 I 3 s chlSab2.chr24 1144881 821 - 84932903 GGCCTCTGATTCTTTAACAACAGTTTCTGGAAATTGTTTTTCCCTCAAGCAATGGTTCCTCTCTGCTGTCTTTATACAGTTTTCCTTTCTCAAGGGttgatttaagatagtgacagtttatctattctgtatctggtagtttcactgaggaacttaacaaacagccacttgaaaccatctggtgccaccaagaaaccatctgaaggacacagattttctgagagtaggccacaagtatattttaacactttttaaattcaaaatcagaatttaaattttgatattttacaatggtttctttgattccctcccaagatctaaccattgagtgtgtgaaaagggctgggacccaggttatggctgtgcttgccatgacggcgtcctgcagaaattcctttgcctttctacatggagctcagcctctgtatcagtcagttcgctaggaggtcagagtacttctcaaagatccttagtgtgttgtttcattttgagaggtttccagctcttgtgagacaccccttggttttacaatcatcacaaagttgtttatgattccaaaaacatacctgctatctgtccatatgtttgttctgtggcttttgatttgctaaaatgctgtaataactgcaataacttgtaccatctggattaattttcacctcagagggaagagtgtattttaagataaagataaaatagtaatagtacattctccttgtt-atatccagttctatattttgagctatggtccgtcaataaatcatgttatgtcagggtccttaatggagtatctgaacatctaagaaaggtacagaagtttc i chlSab2.chr24 C 0 I 5 a score=-734.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 476113 10 + 478999 AAAACAGAAG s macFas5.chr7 515668 2 - 171882078 -------aa- i macFas5.chr7 I 3 C 0 s papAnu2.chr7 131196 2 - 162156779 -------AA- i papAnu2.chr7 I 3 C 0 e ponAbe2.chr15 18718523 5 + 99152023 I e chlSab2.chr24 1145702 5 - 84932903 I e rheMac3.chr7 220042 5 - 170124641 I e panTro4.chr14 105675791 5 + 106544938 I a score=597551.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 476123 359 + 478999 TTAAGGTACAAACCATGGTGAACACAAGCTTGCTATGCTCCCATGTCTCCTGTCTGTCTTACTGTGCACCTGACACTCATTTTAACCTCACCAGGAAGTCAGTTAACTCTC-AATCAGTTTATTGTAATGCCTCTAGGTAATTATATGTGGCAGTTTCA-GCAGAAATGAAGAAACAACTTCAC-------------------------------------------------------TAGAGAATCTAATACAGAAGAATGCAAGTGGCCCTGGGCTTGTTTTCATAAAAGCAGCATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGTCGGCACTGA-ACACTCAGCATGCTGGCTTCGTCCCCTAAATAAGCTTCATCATGCATGGATAGGCTGGCAGCAATCCCGAGGCCATATGC s panTro4.chr14 105675796 362 + 106544938 TTAAGGTACAAACCATGGTGAGCACAAGCTTGCTAGGCACCCATGTCTCCGGTCTGTCTTACTGTGCACCTGACACTCATTTTAACCTCACCAGGAAGTCAGTTAACTTCCAAATCAGTTTATTGTAATGCTTCTAGGTAATTATATGTGGCAATTTCAGGCAGAAATGAATAAAAATCTTCAC-------------------------------------------------------CAGAGAATCTAATACAGAAGAATGCAAGAGGCCCTGGGCTTGTTTTCATAAAAGCATCATACACCAGGCAGTTGATTCTTTCAGCTGTCGGCACTGGCACACCCAGCATGCCGGCTTCGTCCCCTAAATAAGCTTCATCCTGCATGGATAGGCTGGCAGCAAGCCCGAGGCCATATGC i panTro4.chr14 I 5 I 21 s ponAbe2.chr15 18718528 358 + 99152023 ttaaggtac-aaccatGGTGAACACAAGCTTGCTATGCACCCATGTCTCCGGTCTGTCTCACTATGTACCTGACACTCATTTTAACCTCACCAGGAGGTCAGTTAACTTTC-AATCAGTTTATTGTAATGCCTCTAGGTAATTATATGTGGCAATTTCA-GCAGAAATGAAGAAAAAACTTCAC-------------------------------------------------------CAGATAATCTAACACAGAAGAATGCAAGTGGCCCGGGGCTTGGTTTCACAAAAGCAACATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGTCAGCACTGG-ACACCCAGCATGCTGCCTTCATCCCCTAAATAAACTTCATGATGCCTGGATAGGCTGGCAGCATTCCCGAGACCATATGC i ponAbe2.chr15 I 5 C 0 s rheMac3.chr7 220047 361 - 170124641 ttaagataCAAACCATGGTGAACACAAGCTTGCTATGCACCCATGTCTCCTGTCTGTCTCGCTGTACACCTGAAACTCATTTTAACCTCACCAGGAAGTCAGTGAAGTCTCAGATCAGTTTATTGTAATGCCTCTAGGTAACTATGTGTGGCAGTTTTA-ACAAAAATGAAGAAACAGCTTCAT-------------------------------------------------------CAGAGAATCTAATACAGAAGAAAGCAAGTGACCCTGGGCTTGCTTTCATAAAAGCAGCATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGTTGGCACTGGCACAACCAGCATGCCACCTTCATCCCCTAAATAAGCTACATCATGCGTGGATAGGCTAGCAGCATTCCCGAGGTCATATGC i rheMac3.chr7 I 5 C 0 s macFas5.chr7 515670 361 - 171882078 ttaagataCAAACCATGGTGAACACAAGCTTGCTATGCACCCATGTCTCCTGTCTGTCTCGCTGTACACCTGAAACTCATTTTAACCTCACCAGGAAGTCAGTGAAGTCTCAGATCAGTTTATTGTAATGCCTCTAGGTAACTATGTGTGGCAGTTTTA-ACAAAAATGAAGAAACAGCTTCAT-------------------------------------------------------CAGAGAATCTAATACAGAAGAAAGCAAGTGACCCTGGGCTTGCTTTCATAAAAGCAGCATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGCCAGCACTGGCACAACCAGCATGCCGCCTTCATCCCCTAAATAAGCTTCATCATGCGTGGATAGGCTAGCAGCATTCCCGAGGCCATATGC i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 131198 417 - 162156779 TTAAGATACAAACCATGGTGAACAAAAGCTTGCTATGCACCCATGTCTCCTGTCTGTCTCACTATGCACCTGACACTCATTTTAACCTCACCAGGAAGTCAGTGAAGTCTCAGATCAGTTTATTGTAATGCTTCTAGGTAACTATGTGTGGCAATTTcaggcagaaacaaagaaaaatcttcaCCAGAGAATCTaatacagaagaaagagaatttaATACAGAAGAATTAGATTTTCAACAGAGAATCTAATACAGAAGAAAGCAAGTGACCCTGGGCTTGCTTTCATAAAAGCAGCATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGTCGGCACTGGCACACCCAGCATGCCGCCTTCATCCCCTAAATAAGCTACATCATGCGTGGAGAGGCTGGCAGCATTCCCGAGGCCATATGC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1145707 361 - 84932903 ttaagataCAAACCATGGTGAACACAAGCTTGCTATGCACCCATGTCTCCTGTCTGTCTCACTGTACACCTGAAACTCATTTTAACCTCTCCAGGAAGTCAGTGAAGTCTCAGATCAGTTTATTGTAATGCCTCTAGGTAACTATGTGTGGCAATTTTA-ACAAAAATGAAGAAACAGCTTCAT-------------------------------------------------------CAGAGAATCTAATACAGAAGAAAGCAAGTGACCCTGGGCTTGGTTTCATAAAAGCAGCATGCACCAGGCAGTTGATTCTCTTGGCTGTCGGCACTGGCACACCCAGCATGCCGCCTTCATCCCCTAAATAAGCTTCATCATGCGTGGATAGGCTGGCAGCATTCCCGAGGCCATATGC i chlSab2.chr24 I 5 C 0 a score=124691.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 476482 114 + 478999 AGATACACAGCCAACTGGGAAATGGGA----CACAATTCTTCTCCACTCCTCCTCTGAAGAATGGTCTGACAATGCCCTCTTCAGTTCCTTCCCTCTGCCACCCTGACCAGGACTATG s ponAbe2.chr15 18718886 114 + 99152023 CGATACACAGCCGACTGGTAAATGGGA----CACAATTCTTCTCCACTCCTCCTCTGAAGAATGGTCTGACAATACCCTCTTCAGTTCCTTCCCTCTGCCACCCTGACCAGGATTGTG i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 220408 118 - 170124641 AGATGCAAGGCCAACAGGTAAATGGGAAGACTGCAATGCTTCTTCTCTCCTCTGCTGAAGAATGGCTCAAGAATGGCTTCTTCAGATCCTCCCCTCTGCCGCCCTCACCAGCACTGTA i rheMac3.chr7 C 0 C 0 s macFas5.chr7 516031 118 - 171882078 AGATGCAAGGCCAACAGGTAAATGGGAAGACTGCAATGCTTCTTCTCTCCTCTGCTGAAGAATGGCTCAAGAATGGCTTCTTCAGATCCTCCCCTCTGCCGCCCTCACCAGCACTGTA i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 131615 118 - 162156779 AGATGCAAGGCCAACAGGTAAATGGGAAGACTGCAattcttcttctctcctctgctGAAGAATGGCTCAAGAATGGCTTCTTCAGATCCTCCCCTCTGCCGCCCTCACCAGCACTGTA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr24 1146068 118 - 84932903 AGATGCAAGGCCAACAGGTAAATGGGAAGACTGCAATTCTTCTTCTCTCCTCCTCTGAAGAATGGCCCAAGAATGCCCTCTTCAGATCCTCCCCTCTGCCGCCCTCACCAGCACTGTA i chlSab2.chr24 C 0 C 0 e panTro4.chr14 105676158 21 + 106544938 I a score=2695578.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 476596 1570 + 478999 CCATATGTGCACAGAGACACAAAATTCCTGATGGGAAGAATGAGGCTGGATCAACCAGACTAGCGGTTTCTCACTGAGGTAATGTGAGGTCAACTTCTAGGGTGGACAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATTGATGGCTATGGGAAAATGAACCACTGAGATGAGTAATTACTTATATTCCATTATTCCATGTGAGAAACAGACATCACAGTTCACCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTAAATTTCTTCCTACATCTTCACTTAAGAATTTTTAACCATGAATGTGTCTTACCTATATTCCCAATATTTAAAATTGGGCTGTCAAGAGAGTCTAGAGAATTCGAGAACTAAGAACAGTGAAACTCCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAATATTCCCCAGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCACAAATCATGCTTGTGTATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCATCAAACATTTGGCCTCCCCTTTCTCCAC-TCCCCTCCATTCATACATTATACTCTCAGCTCTGTCTAGGGTATCATAAAAGCCAGCAGACGGACCCTCCTGATCTCCTGAACGTGAAACCTAACACTATCATGCGATCGGCTCCTCTTGGCATAGTGACCTTCAAAGGCATCTCATTTGAATAATTACC--TTTTTT-TCCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATAAGCATTTTAACATAATTTACTGTCCGACTACAGTTATTAATACACACAAATGCCACAACCTCTTTCTAGCCCAGGAGACCTGATTAATTCTTCTCTGGGGATGAGCACACCCTAGAAACACAT-CCCATTCACATAAACACGGGCACAACGATGACATGTTCTT------------GAGTCTACACCATTCTCCGTCCAACTCC-ACGAGCCCCTGAAGACCAAGACAGGCTCTTTCATGCCTGTGCAAGCT---------------CTGGCCCAGGGACAGCCTGCTGAGGAATGGGCTCAGCTGGGTCTGGGT----GCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAACAGGAGTGTCCAGGTTTGTCTGGCCATCCGACTTTTTCAATGTATAGAAGCTCTCCTATTACCTACtgtattcattttatagggcttt-tatgacaaaataccacagatcggatggcttacaatacaaaaccaatttcctcacacttatggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagctgggtgggtttcctctgaggtctcgctccctggcgtgcagatggcgccttctcgctgttctgtggtaacatggccgtccctcggggcgtgtgcaccccccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattagggccccactccaggaatctcactttaacttatttagctctttaaaagacactaatccaagtatgatttcattctgaaggaccaagggttgggacttcagcacatgaatttaggagggacacagtCTCCCCTAGCAGCCTCCTCCAGGGATgtcaaata s panTro4.chr14 105676179 1571 + 106544938 CCACATGTCCACAGAGATACAAAATCCCTGATGGGAAGAACGAGGCTGGATCAATGGGACTGGCAGTTTCTCACTGAGGAAATGTGAGGTCAGCTTCTATGGTGGGCAATTCAGGAAATTACTTAGCAGTTTTGTAATTGATGGTTATGGAAAAATGAACCGTTGAGATGACTAATGACTTACATTCCATTATTCCAAGTAAGAAACGGACATCACAGTTCGCCGTAACTAAATTTTCATAACCTAAATGGATTACTTTAAATTTCTTCCTACGTCTTCTCTTAATAATTTTTAATAACGAATGTGTCTTACCTATATTCCCAATATTTAAAACTGGGCTGTCAAGAGAGTCTAGAGAATTTGAGAACTAAGAACAGTGAAACTCCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAATATTCCCCAGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCATAATTCATGCTTGTGTATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCACCAAACATTTGGCCTCCCCTCTCTCCACGTCCCCTCCATTCATACATTATAGTCTCAGCTCTGTCTAGGGTGTCATAAAAGCCAGCAGATGGACCCTCCTGATCTCCTGAACGTGAAAGCCAGCACTATCACGTGATCGGCTCCTCTTGGCATGGTGACCTTCAAAGGCATCTCATTTAAATAATCACC-ATTTTTT-TTCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATAAGCATTTAAACATAATTTACTGTCCGACCACAGTTATTAATACACACAAATGCCACAACCTCTTTCTAGCCCAAGAGACCTGATTAATTCTTCTTTGGGGATGAGCACGCCCTAGAAACACAT-CCCATTCACATAAACACGGGCACACCGATGACGTGTTCTT------------GAGTCTACACCATTCTCTGTCCAGCTCC-ACGAGCCCCTGAAGACCAAGACAGGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCT---------------CCGGCCCAGGGACGGCCTGCTGAGGAATGGGCTCAGCTGTGTCTGTGT----GCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAACAGGAGTGTCTAGGTTTGTCTGGCCATCCGA-TTTTTCAATGTATAGAAGCTCTCCTATTACCTACtgtattcattttatagggcttt-tataacgaaataccacagatcagatggcttacaatacaaaaccaatttcctcacacttatggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagctgggtgggtttcctctgaggtctcactccctggcgtgcagatggcgccttctcactgttctgtggtaacatggccgtccctcggggcctgtgcaccctccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattagggccccactccaggaatctcactttaacttattcacctctttaaaagacactaatccaagtatgatttcattctgaaggaccaaggattgggacttcagcacatgaatttaggagggacacagtCTCCCCTAGCAGCTTCCTTCAGGGATGTCAAGTA i panTro4.chr14 I 21 C 0 s ponAbe2.chr15 18719000 1584 + 99152023 CCACGTGTGCACAGAAACACAAAATCCCTGATGGGAAGAACGAGGCTGGATCAACCGGACTAGCGGTTTCTTACTGAGGAAATGTGAGGTCAACTTCTAGGGTGGACAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATTGATGGCTATGGAAAAATGAGCCTCTGAGATGAGTAATTACTTATATTCCATTATTCCATGTGAGAAACGGACATCACAGTTCACCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTAAATTTCTTCCTACATCTTCACTTAAGAATTTTTAATTGTGAATGTGTCTTACCTATATTCCCAATATTTAAAATTGGGCTTTCAAGAGAGTCTAAAGAATTTGAGAACTAAGAACAGTGAAACTCCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAATATTCCCCAGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCATAATTCATGCTTCTATATTTCCTAATGGCTCCAACAGTGACCCCCCATTCCCACCAAACATTTAGCCTCCCCTTTCTCCACATCCCCTCCATTCATAGATTATACTCTCAGCTCTTTCTAGGGTATCAAAAAAGCCAGCAGACGGACCCTCCTGATCTCCTGAACATGAAACCCAGCACTATCATGTGATCGGCTCCTCTTGGCACGGTGACCTTCAAAGGCATTTCATTTAAATAATTACCTTTTTTTT-TTCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATAAGCATTTTAACATAATTTACTGTCCGACCACAGTTATTAATACACACAAATGCCACAACCTCTTTCTAGCCCTAGAGACCTGATTAATACTTCTTTGGGGACGAGCACACCCTAGAAACACAT-CCCATTCACATAAACACGGGCACAACGATGATGTGTTCTTCTGTGTAAGCAAGAGTTTACACCATTCTCTGTCCAACTCC-ACGAGCCCCTGAAGACCAAGACAGGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCT---------------CTGGCCCAGGGACGGCCTGCTGAGGAATGGGCTCAGCTGGATCTGGGT-----CTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAACAAGAGTGTCCAGGTTTGTCTGGCCATCCGACTTTTTCAATGTATAGAAGCTCTCCTATTACCTACtgcattcatttcgtaggacttt-tataacaaaataccacagatcggatggcttacaatacaaaaccaatttcctcacagttatggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagctgggtgggtttcctctgaggtctcgctccctggcgtgcagacggcaccttttcgctgttctgtggtaacgtggctgtccctcggggcgtgtgcaccctccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattagggccccactccaggaacctcactttaactttttcacctctttaaaagacactaatccaagtacgatttcattctgaaggaccaagggttgggacttcagcacatgaatttaggagggacacagtGTCCCCTAGCAGCCTCCTTCAGGGATgtcaaata i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 220526 1582 - 170124641 CCATGGGTCCACAGAGATACAAAATCCCTGATGGGAAAAACGAGTCTGGATCAATGGG-CTGGAGGTTTCTCACTGAGGAAATGTGAGGTCAGCTTCTAGGATGGGCAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATCGATGGCTATGGAAAAATGAGCCATTGAGATGATTAATGACTCACATTCCATTATTCCAAGTGAGAAACGGACATCACAGTTCGCCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTACATTTCTTCCTACATCCTCTCTTAAGAATTTTTAACCGTGAATGTGTCTTACCTACATTCCCAATATTTAAAACTGGGCTTTCAAGAGATTCTAGAGAATTCGAGGACTAAGAACAGTGAAACTTCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAGAATTACCCAGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCATAATTCA-GCTTCTATATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCATCAAACATTTGGCCTCCCCTTTCTCTACGTGCCCTCCATTCATAAATTATACTCTCAGCTCTTTCT-GAGTATCCTAAAAGCCAGCAGACGGACACTCCTGATCTCCTGAACATGAAACCCAGCACTCTCATGTGATCGGCTCCTCTCGGCGCGGTGA-CTCCAAAGGCATCTCATTTAAATAATTACC--ATTTTT-TCCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATGAGCATTTTAATGTAATTTATGGTCCAGCCACAGATTTTAATACACACAAATGCCACAACCTCCTTCTAGTCCTAGAGACCTGATTAATTCTTCTTTGGGGATGAGCACACCCAGGAAACACATCCCCATTCACATAAACACGGGCACAGCGATGACGGGTTCTT--CTGTGAGCGAGAGTTTACAGCATCCTCCCTCCAACTCCAACGGGCCCCTGAAGGCCAAGACACGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCTCCGGCCCAGCGACGGCCGGCCCAGCGACGGCCTGCTGAGGAAT-GGCTCACCTGGGTCCAGGT----GCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAAGAGGAGGGTTCAGGTTTCTCTGGCCATCCGACTTTTTCAGTGTATAGAAGATCTCCTG-TACCTACtgtattcatttta----------tataacaaaataccacatattgaatggcttacaatacaaaaccgatttcctcacagttgtggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagct-ggtgggtttcctctgaggtcttgctccctggtgtgcagacggtgccttcccgctgttctgtggtaacatgaccatccgtcggggcgtgtgcaccctccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattagggccccactccagaaatatcactttaacttattcatctctttaaaagacactcatccaggtatgatttcattctgaacgaccaagggttgggacttcaacacatgaatttaggagggacacagtctcccatagcaGAATTCTTCAGGGAGGTCAAATA i rheMac3.chr7 C 0 N 0 s macFas5.chr7 516149 1582 - 171882078 CCATGGGTCCACAGAAATACAAAATCCCTGATGGGAAAAACGAGTCTGGATCAATGGG-CTGGCGGTTTCTCACTGAGGAAATGTGAGGTCAGCTTCTAGGGTGGGCAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATCGATGGCTATGGAAAAATGAGCCGTTGGGATGATTAATGACTCACATTCCATTATTCCAAGTGAGAAACGGACATCACAGTTCGCCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTACATTTCTTCCTACATCCTCTCTTAAGAATTTTTAACCGTGAATGTGTCTTACCTACATTCCCAATATTTAAAACTGGGCTTTCAAGAGATTCTAGAGAATTCGAGGACTAAGAACAGTGAAACTTCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAGAATTACCCAGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCATAATTCA-GCTTCTATATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCATCAAACATTTGGCCTCCCCTTTCTCTACGTGCCCTCCATTCATAGATTATACTCTCAGCTCTTTCT-GAGTATCGTAAAAGCCAGCAGACGGACACTCCTGATCTCCTGAACATGAAACCCAGCACTCTCATGTGATCGGCTCCTCTCGGCGCGGTGA-CTCCAAAGGCATCTCATTTAAATAATTACC--ATTTTT-TCCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATGAGCATTTTAATGTAATTTATGGTCCAGCCACAGATTTTAATACACACAAATGCCACAACCTCCTTCTAGTCCTAGAGACCTGATTAATTCTTCTTTGGGGATGAGCACACCCAGGAAACACATCCCCATTCACATAAACACGGGCACAGTGATGACGGGTTCTT--CTGTGAGCGAGAGTTTACAGCATCCTCCCTCCAACTCCAACGGGCCCCTGAAGACCAAGACACGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCTCCGGCCCAGCGACGGCCGGCCCAGCGACGGCCTGCTGAGGAAT-GGCTCACCTGGGTCCGGGT----GCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAAAAGGAGGGTCCAGGTTTCTCTGGCCATCCGACTTTTTCAGTGTATAGAAGATCTCCTG-TACCTACTGTATTCATTTTA----------Tataacaaaataccacatattgaatggcttacaatacaaaaccgatttcctcacagttgtggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagct-ggtgggtttcctctgaggtcttgctccctggtgtgcagacggtgccttcccgctgttctgtggtaacatgaccatccgtcggggcgtgtgcactgtccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattagggccccactccagaaatatcactttaacttattcatctctttaaaggacaatcatccaagtatgatttcattctgaacgaccaagggttgggacttcaacacatgaatttaggagggacacagtctcccatagcaGCCTCCTTCAGGGAGGTCAAATA i macFas5.chr7 C 0 N 0 s papAnu2.chr7 131733 1569 - 162156779 CCATGGGTCCACAGAGATACAAAATCCCTGACGGGAAAAACGAGTCTGGATCAACGGGACTGGCGGTTTCTCACTGAGGAAACGTGAGGTCAGCTTCTAGGGTGGGCAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATTGACGGCTATGGAAAAATGAGCCGTTGGGATGATTAATGACTCACATTCCATTATTCCAAGTGAGAAACGGACATCACAGTTCGCCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTACATTTCTTCCTACATCCTCTCTTAAGAATTTTTAACCGTGAATGTGTCTTACCTACATTCCCAATATTTAAAACTGGGCTTTCAAGAGATTCTAGAGAATTCGAGGACTAAGAACAGTGAAACTTCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAGAATTACCCAGGAACACTGTTCTGTGCCTCAGCATAATTCA-GCTTCTATATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCATCAAACATTTGGCCTCCCCTTTCTCTACGTGCCCTCCATTCATAGATTATACTCTCAGCTCTTTCT-GAGTATCGTAAAAGCCAGCAGACGGACACTCCTGATCTCCTGAACATGAAACCCAGCACTCTCATGTGATCGGCTCCTCTCGGCGCGGTGA-CTCCAAAGGCATCTCATTTAAATAACTACC--ATTTTC-TCCCTTCTGTAACAAAGTGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATGagcattttaatgtaatttatggTCCAGCCACAGATTTTAATACACACAAATGCCACAACCTCCTTCTAGTCCTAGAGACCTGATTAATTCTTCTTTGGGGATGAGCACACCCAGGAAACACATCCCCATTCACATAAACACGGGCACAGCGATGACGGGTTCTT--CTGTGAGCGAGAGTTTACAGCATCCTCCCTCCAACTCCAATGGGCCCCTGAAGACCAAGACACGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCT---------------CCGGCCCAGCGACGGCCTGCTGAGGAAT-GGCTCACCTGGGTCCGGGT----GCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCAGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAAAAGGAGGGTCCAGGTTTGTCTGGCCATCCGACTTTTTCAATGTATAGAAGATCTCCTGTTACCTactgtattcatttta----------tataacaaaataccacatattgaATGGCTTACAATACAAAACCGATTTCCTCACAGTTGTGGAGGATGAAAGCCTAAGATCAAGCTGCCAGCT-GGTGGGTTTCCTCTGAGGTCTCGCTCCCTGGTGTGCAGACGGTGCCTTCCTGCTGTTCTGTGGTAACATGACCATCCGTCGGGGCGTGTGCACGCTtcctcctgcttccccttcttATAACAACAGTCAGATTGCATTAGGGCCCCACTCCAGAAATCTCACTTTAACTTATTCATCTCTTTAAAAGACACTCATCCAGGTATGATTTCATTCTGAAGGACCAAGGGTTGagacttcaacacatgaatttagGAGGGACACAGTCTGCCATAGCAGAATTCTTCAGGGAGGTCAAata i papAnu2.chr7 C 0 N 0 s chlSab2.chr24 1146186 1589 - 84932903 CCATGGGTCCACAGAGATACAAAATCCCTGATGGGAAAAACGAGGCTGGATCAATGGGACTGGTGGTTTCTCACTGAGGAAATGTGAGGTCAGCTTCTAGGGTGGGCAATTCAGGAAATTATCCAGCAGTTTTGTAATTGATGGCTATGGAAAAAT----------GATGATTAATGACGCACATTTCATTATTCCAAGTGAGAAACGGACATCACAGTTCGCCATAACTAAATTTTCATAACCTAAATTGATTACTTTACATTTCTTCCTACATCCTCTCTTAAGAATTTTTAACCGTGAATGTGTCTTAGCTACATTCCCAATATTTAAAACTGGGCTTTCAAGAGATTCTAGAGAATTCGAGGACTAAGAAGAGTGAAACTTCTGTATGTTCAGCAGCTCCCAAAGCAACACAGAATTACCCGGGAACACTGTTCTGTGCTTCAGCATAATTCA-GCTTCTATATTTCCTAATGGCTCCAATAGTGACCCTCCATTCCCATCAAACATTTGGCCTCCCCTTTCTCTACGTGCCCTCCATTCACAGATTATACTCTCAGCTCTTTCT-GAGTATCGTAAAAGCCAGCAGACAGACACTCCTGATCTCCTGAACATGAAACCCAGCACTCTCATGTGATCGGCTCCTCTCGGCGCAGTGA-CTCCAAAGGCATCTCATTTAAATAATTACC--ATTTTTCCCCCTTCTGTAACAAAATGTTTCTTTCCATTGTGCCTTCCCATGAGCATTTTAATGTAATTTATGGTCCAGCCACAGATTTTAATACACACAAATGCCACAACCTCTTTCTAGCCCTAGAGACCTGATTAATTCTTCTTTGGGGATGAGCACACCCTGGAAACACATCCCCATTCACATAAACACGGGCACAGCAATGACGGGTTCTT--CTGTGAGCGAGAGTTTACAGCATCCTCCCTCCAACTCCAACGGGCCCCTGAAGACAAAGACACGCTCTTTCACACCTGTGCAAGCTCCGGCCCAGCGACGGCCGGCCCAGCGACGGCCTGCTGAGGAAT-GGCTCACCTGGGTCTGGGTGCTGGCTGGGTTCATCTCTTCCCCTCTCCTGTCCCAAAGCGGGTCCATCACCCTGCTCAGGTCTGAAAAGGAGGGTGCAGGTTTGTCTGGCCATCTGACTTTTTCAATTTATAGACGCTCTCTTATTACCTACtgtattcattttatagggctttttataacaaaataccacatattgaatggcttacaatacaaaaccaatttcctcacagttgtggaggatgaaagcctaagatcaagctgccagct-ggtgggtttcctctaaggtcttgctccctggtgtgctgacggtgccttcctgctgttctgtggtaacatgaccatccgtcggggcgtgtgcacgctccctcctgcttccccttcttataacaacagtcagattgcattaaggccccactccagaaatatcactttaacttattcatctctttaaaagacactcatccaggtatgatttcattctgaaggaccaagggttgagacttcaacacatgaatttaggagggacacagtctcccatagcaGCCTCCTTCAGGAAGGTCAAATA i chlSab2.chr24 C 0 N 0 a score=220865.000000 s hg38.chr15_KI270852v1_alt 478166 833 + 478999 aaaggaataaaaggacactgatgctccagagggccttgaaagcttgcagctgctttgttgtggtgggacat-------------------------gggtaagcccgcaccttatctatgatggcagatggaatgactttagttttaccaaaccagatgacaccaactatttgactgataagcctggaccctggattttgtctgtattaacctcccatcctctgttcagcaagtgagacagcaagacaggggctgcaatttataagctgaaaaaagactcagaagttaccatgataacaccaatgtagtggaaaacatgtatcccctttgggtcagcccatcaactgaggttggaggtcactaggctgtgagagttgggctgtgtaaatatccctggaacaagacagtaaaagtccattgttctttttaggttaatgcaaattgatcttgaatgtggggcagcagaaatgctgaagaaggtattgactaaact------gataacgaaatgctatgtggctaacacctctcctattctcgtcagactggaggagatattaggaacagctgcattcactcgggagaccaccttatttaactcccagtaatctactgtcattctccatgtcccaactggcctctgcatgggccatgcaggtctgttgtaggaactgtgcagtggcctcctaatgcctacctgggctaactccttaacaatcttcatgattggatcatcttcccctccccagggcgggtggtgttgctccagctgtgggactccccatgggttggcagctctaccggcatccagtttgccttctgcttggtcacatgcgtcaccactttaactctcagttggaattC s panTro4.chr14 105677750 839 + 106544938 AAAggaataaaaggacactgatgctccagaaggccttgagagcttgcagctgctttgttgtggtgggacgt-------------------------gggtaggcctgcaccttatctatgatggcagatggaatgactttagttttacccaaccagatgacaccaactatttgactgataaacctggaccctggattttgtctgtattaacctcccatcctctgttcagcaagtgagacagcaagacaggggctgcaatttataagctgaaaaaacactcagaagttatcatgataacaccaatgtagtggaaaacatgtatcccctttgggtcagcccatcgactgaggttggaggtcactaggctgtgagatttgggctgtgtaaatatccctggaacaagacagtaaaagtccattgttctttttaggttaatgcaaattgatcttgactctggggcaacagaaatgcttaagaaggtattgactaaactgataaagataacgaaatgctacgtggcaaacacctctcctattctcgtcagactggaggagatattaggaacagctgcattcacccgggagaccaccttatttaactcccagtaatctactgtcattctccatgtctcaactggcctctgcatgggccatgcaggtctgttgtaggaaccgtgcagtggcctcctaatgcctacctgggctagctccttaacaatcttcatgattggatcatcttcccctccccagggcgggtggtgttgctccagctgtgggactccccatgggttggcagctctacgggcatccagtttgccttctgcttggtcacatgtgtcaccactttaactctcagttggaattc i panTro4.chr14 C 0 N 0 s ponAbe2.chr15 18720584 858 + 99152023 aaaggaataaaaggacactgatgctccagaaggccttgaaagcttgcagctgctttgttgtggtgggacgtgggtaggcccgcactttatgatggcgggtaggcccgcactttatctatgatggcagatggaatgactttagttttatccaaccagatgacaccaactatttgactgataagcctggaccctggattttgtctgtattaacctcccatcctctgttcagcaagtgagacagcaagacaggggctgcaatttataagctgaaaaaagactcagaagttatcacgataacgccaatgtagtggaaaacgtgtatcccctttgggtcagcccatcgactgaggttggaggtcactaggccgtgagagttgggctatgtaaatatccctggaacaagacagtaaaagtccattgttctttttaggttaatgcaaattgatcttgactctggagcaacagaaatgctgaagaaggtattgactaaact------gataacaaaatgctatgtggccaatacctctcctattctcgtcacactggaggagatattaggaacagctgcattcactcgggagaccaccttatttaactcccagtaatctactgtcattctccatgtcccatctggcctctgcatgggccatgcaggtctgttgtaggaactgtgcagtggcctcctaatgcctacctgagctaactccttaacagtcttcatgattggatcatcttccctgccccagggcaggtggtgttactccagctgtggaactccccacgggttggcagctcaaccggcatccagtttgccttctgcctggtcacatgcgtcaccactttaactctcagttggaattc i ponAbe2.chr15 C 0 N 0