##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=685347.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 0 295 + 235827 TTTTAGAAAtatttatttaggccgggtgtggtggctcacgcctgtaatcgcagcacttt-gggaggccgaggcaggcggatcacctgaggtca---gttcaagacaaacctggccaacatggtgaaactccatctctattaaaaatacaaaaattagctgggcatagtggcgggtgcctgtaat-ccagctattctggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggtggaggctgcagtgagtcgagattgtaccattgcactccagccttggcaataagaacaaaactccat s panTro4.chr17 70396769 295 + 82630442 TTTTAGAAATATTTATTTAggccgggtgtggtggctcacgcctgtaatcgcagcacttt-gggaggccgaggcaggcggatcacctgaggtca---gttcaagacaaacctggccaacatggtgaaactccatctctattaaaaatacaaaaattagctgggcatagtggcgggtgcctgtaat-ccagctactctggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggtggaggttgcagtgagccgagattgtaccattgcactccagccttggcaataagaacaaaactccat i panTro4.chr17 N 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61442335 295 + 73212453 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chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43483666 42 - 61074082 aATAATTATTTTCAGATGAGGAGTTGATTTTATTAGAAATTC i canFam3.chr9 I 178 I 143 e mm10.chr11 112313082 119 + 122082543 I e calJac3.chr5 119985517 639 + 159171411 I e ponAbe2.chr17 61443040 1112 + 73212453 M a score=86484.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 1384 44 + 235827 caaaaggttctgttgaaaatatattagaattaa--AGTATTCAGTG s panTro4.chr17 70398071 44 + 82630442 caaaaggttctgttgaaaatatattagaattaa--agtattcagtg i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41606350 44 - 94967081 caaagggttctattgaaaatatattagaattaa--AGTATTCAGTG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 68982630 44 + 80904711 caaaatgttctgttgaaaatatattagaattaa--AGTATTCAGTG i rheMac3.chr16 C 0 M 126 s macFas5.chr16 68729579 44 + 80997621 caaaatgttctgttgaaaatatattagaattaa--AGTATTCAGTG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 62992951 43 + 74645514 caaaatgttcTGTTGAAAATATATTAGAATTAA--AGTATTCAGG- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25093241 44 - 75148670 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acacagacacacacacag--acacacacacacacacacacacCTTTAAACTCAAGATTATAGACAATTTCACTTTTGTTAGGATTGGTATGATGTGTACAGTTTATGGTTTTTCAGTAACATAGCAACATGTGCTATGTGTGTAATAACAGCATCTAAAATAACATAATAAAAAAAGAATTATCTGCGATTAGAAGTGAACTGTTAAAACTACTCTGGTCAGTGCCAAAAATCTAGGGAGTTTATTAGCATTTCAGTAGCTGCAGTGAAAAGCCCCTCTGGGTGCCTAGAAAATCCACCCCCTTAAGCTTTCCACCCATCCTCCTCACTGACATG-TAATGGGCTTTGTCAAATTCAAAGACAGTTACGTCAGCAATTTGTGGCCTCTCCTGGGTTTTCCAGGCCTATAAAGCACACAAATTATACCCAAATATTGGCCTGAAAAATTAGTAAGCTATAGGGTGTGTGTTATTTTAGCCAAG-CTTTACTGATGTAAAAGAAACCTAGGGACCTGAAAACTCGGTAGTTTCTTTGCCACTTTATTATTTTCTTTTATGGTGGGCTGACTCTGA--TACGCTAATACTGC------ttttttttc-- i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=109358.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 16335 103 + 235827 ATCATTAT---TACATTATTTTTTAT-TATTTTGTCTTGTGTGTTAA---TACT------------TTTTTTTGCTTCATTATTAATTTTTTATTATTTTGTCTTGCGTGTTAATACTGTT----------------------------------------------------------------------------------G s panTro4.chr17 70410400 103 + 82630442 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aggtgactgaagagcaaagtcacatcttacacggtggcaggcaagagagtgtatgcaggggaactcccctttataaaaccatcagatctcatgagacttattcactatcatgagaacagcacaggaaacacccacccatataattcaattacctcccatgtgatttctcccatgaaccgtggggattattac-aattcaaggtg i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63009659 203 + 74645514 AGGTGACtgaagagcaaagtcacatcttacacggtggcaggcaagagactgtatgcaggggaactcccctttataaaaccatcagatctcatgagacttactcactatcatgagaacagcacaggaaacacCCACCCatataattcaattacctcccatgtGATTTCTCCCATGAaccgtggggattattac-aattcaaggtg i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25110285 204 - 75148670 aggtgactaaagagcaaagtcacatcttacacagtggcaggcaagagagtgtatgcaggggaactcccctttataaaaccatcagatctcatgagacttattcactatcacgagaacagcacaggaaacacccacccacataattcatttacctcccatgtgatttctcccatgaaccgtggggattattactaattcaaggtg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112330448 299 + 122082543 I e canFam3.chr9 43499815 244 - 61074082 I e calJac3.chr5 120003446 0 + 159171411 C a score=339554.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 18607 108 + 235827 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ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41630358 40 - 94967081 TATTTCTTTATTTTGAAACCCATAGTTATCTATTTTGATG i nomLeu3.chr14 I 6283 C 0 s rheMac3.chr16 69000525 40 + 80904711 TATTTCCTTATTTTGAAATCCATAGTTATCTATTTTGATG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68747527 40 + 80997621 TATTTCCTTATTTTGAAATCCATAGTTATCTATTTTGATG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63010234 40 + 74645514 tatttcCTTATTTTGAAATCCATAGTTACCTATTTTGATG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25110861 40 - 75148670 TATTTCCTTATTTTGAAATCCATAGTTATCTATTTTGATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120003818 40 + 159171411 TATTTCCTTATTTTGAAATCCACAGTTATCTATTTTGATG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43500309 40 - 61074082 TCCTTTCCTAGGCTGAAATCCATGGTTACCTCTTTTGATG i canFam3.chr9 C 0 I 4 e mm10.chr11 112330811 1447 + 122082543 I a score=2021736.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 18995 579 + 235827 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AAGACAGTACTTGT-AGCCATTCAGACTTTAATTGTTTAATTCACTCTTTAACTTTTCTATCCAGTCTCCAGAATTATGGAATCATCATAGTGTCTC-CACACTTGTCTATTCCTTTCCATTCCCATTCAGCCACCCCCAAATAGCACCTTAGCATCTCATCTTTTGAACTTCTCTGGCAGCCTTTGAATTTATCATACTGCTTCCATACAGTCCCCTTTTCTAACACATCTTGCTCATCATTCCCACATTAATCTTATATATGTTTGT---------------------AATT i canFam3.chr9 I 123 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I a score=44800.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 22956 14 + 235827 ATAAAGACATTTTT s panTro4.chr17 70417033 14 + 82630442 ATAAAGACATTTTT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465106 14 + 73212453 ataaaGACATTTTT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633361 14 - 94967081 ataaagacattttt i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69004553 14 + 80904711 ATAAAGACATTTTT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68751511 14 + 80997621 ATAAAGACATTTTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63014276 14 + 74645514 ataaagacattttt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25114907 14 - 75148670 ATAAAGACATTTTT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120007854 14 + 159171411 ataatGACATTTTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C a score=329012.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 22970 140 + 235827 Aggctgggcacagtggcccatgcctgtagtcctggtcctttgggaggtcaaggtggggatcacctgaggtcaggaattcgagaccagcctggccaacatggcaaaacctcatttctactaaaaacacaaaaactagccag s panTro4.chr17 70417047 140 + 82630442 Aggctgggcacagtggcccatgcctgtagtcctggtcctttgggaggtcaaggtggggatcacctgaggtcaggaattcgagaccagcctggccaacatggcaaaacctcatttctactaaaaacacaaaaactagccag i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465120 140 + 73212453 Aggctgggcacggtggcccatgcctgtaatactggcactttgggaggtcaacgtggggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatggcaaaacctcatttctactaaaaccacaaaaactagccag i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633375 140 - 94967081 aggctgggcatggtggcccgtacctgtaatcctggcactttaggaggtcaaggcggggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggcaaaaccttatttctactaaaaatataaaaactagccag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 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papAnu2.chr16 63014430 147 + 74645514 gcgtggtggcaggcacctgtaatcctgctacttgggaggctgaggcaagagaattgcttgaacctgggaggcggaggtcgaggttgcagtgagccgagatcgcaccactgcactctagcctgggagacaagagcaaaactcagtctc i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25115061 147 - 75148670 gcgtggtggtaggcgcctgtaatcctgctacttgggaggctggggcaagagaattgcttgaacctggggggcggaggtcgaggttgcagtgagccaagatcgcaccactgcactctagcctgggagacaagagcaaaactcagtctc i chlSab2.chr16 C 0 I 79 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I a score=-4173.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 23251 34 + 235827 TCTCTCTCTCTCTCTCCATATATATATATATAAA- s panTro4.chr17 70417328 34 + 82630442 TCTCTCTCTCTCCatatatatatatatatatata- i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465401 34 + 73212453 TCTCTCTCTCTCTCtatatatatatatatataaa- i ponAbe2.chr17 C 0 I 46 s nomLeu3.chr14 41633654 4 - 94967081 ------------------------------tgaa- i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68751812 17 + 80997621 ------------------caaaaaaaaaaaaaaaa i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63014577 12 + 74645514 ------------------c-----aaaaaaaaaaa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I a score=9889.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 23285 15 + 235827 AATATATATATAAAT s panTro4.chr17 70417362 15 + 82630442 aatatatataaatat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633658 15 - 94967081 aatacatatatatat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68751829 15 + 80997621 aaaaCATATATATAT i macFas5.chr16 C 0 I 2 s papAnu2.chr16 63014589 15 + 74645514 aatacacatatatat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I e ponAbe2.chr17 61465435 46 + 73212453 I a score=11171.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 23300 25 + 235827 ATATGTAGATATATAAATATATATA s panTro4.chr17 70417377 25 + 82630442 ataaatatatatataaatatatata i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633673 25 - 94967081 atatatatatatatatatatatata i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63014604 25 + 74645514 atatatatatatatatatatatata i papAnu2.chr16 C 0 I 29 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e macFas5.chr16 68751844 2 + 80997621 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I e ponAbe2.chr17 61465435 46 + 73212453 I a score=311.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 23325 2 + 235827 GA s panTro4.chr17 70417402 2 + 82630442 aa i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633698 2 - 94967081 ga i nomLeu3.chr14 C 0 I 51 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 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e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e papAnu2.chr16 63014629 29 + 74645514 I e macFas5.chr16 68751844 2 + 80997621 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I e nomLeu3.chr14 41633700 51 - 94967081 I e ponAbe2.chr17 61465435 46 + 73212453 I e panTro4.chr17 70417614 66 + 82630442 I a score=1465.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26052 16 + 235827 atatatatatatctat s panTro4.chr17 70417680 16 + 82630442 atatatatatatctat i panTro4.chr17 I 66 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e papAnu2.chr16 63014629 29 + 74645514 I e macFas5.chr16 68751844 2 + 80997621 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I e nomLeu3.chr14 41633700 51 - 94967081 I e ponAbe2.chr17 61465435 46 + 73212453 I a score=51475.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26068 223 + 235827 atatatatctatatatatatagagagagagagagagagaTATTTTTGggggactacaagaagggggagggagagaggaggacaagggtagagaaactacctattgggtattatgctcactatctgggtgatgggtttaattataccccaaatgtcagcatcatacaatatatccatataaaaaaaaccctgcacatgtaccctctgaatctaTATATATACAC-------------------- s panTro4.chr17 70417696 219 + 82630442 atatagatagatatatatataGAGAGAGAGAGAGA----TATTTTTGggggactacaagaaggcggagggagagaggaggacaagggtagagaaactacctattgggtattatgctcactatctgggtgatgggtttaattataccccaaatgtcagcatcatacaatatatccatataaaaaaaaccctgcacatgtaccctctgaatctaTATATATACAC-------------------- i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465481 237 + 73212453 atatatatatatatatatagagagagagagagagagagagaTTTTGGggggactacaagaagggggagggagagaggaggacaagggtagaaaaactacctattgggtattatg----ctatctgggtgatgggtttaattataccccaaacatcagcatcatacaatatatccatataaaaaaa--cctgcacacgtaccctctaaatctaTATATATATATATATagagagagagagagag i ponAbe2.chr17 I 46 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25115208 79 - 75148670 I e papAnu2.chr16 63014629 29 + 74645514 I e macFas5.chr16 68751844 2 + 80997621 I e rheMac3.chr16 69004707 190 + 80904711 I e nomLeu3.chr14 41633700 51 - 94967081 I a score=10696.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26291 4 + 235827 AGAG s panTro4.chr17 70417915 4 + 82630442 AGAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465718 4 + 73212453 agag i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633751 4 - 94967081 AGAG i nomLeu3.chr14 I 51 C 0 s rheMac3.chr16 69004897 4 + 80904711 agag i rheMac3.chr16 I 190 C 0 s macFas5.chr16 68751846 4 + 80997621 AGAG i macFas5.chr16 I 2 C 0 s papAnu2.chr16 63014658 4 + 74645514 agag i papAnu2.chr16 I 29 C 0 s chlSab2.chr16 25115287 4 - 75148670 agag i chlSab2.chr16 I 79 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e canFam3.chr9 43505001 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C a score=17434.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26295 11 + 235827 -AGAGATTTTTA s panTro4.chr17 70417919 11 + 82630442 -AGAGAATTTTA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465722 11 + 73212453 -agagaTTTTTA i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41633755 11 - 94967081 -AGAGATTTTTA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69004901 10 + 80904711 -agagattttt- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68751850 10 + 80997621 -AGAGATTTTT- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63014662 10 + 74645514 -agagattttt- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25115291 10 - 75148670 -agagaTTTTT- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43505001 11 - 61074082 AAGGGTTTTGG- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I e calJac3.chr5 120007868 0 + 159171411 C a score=79897.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26306 31 + 235827 --GAGTTATACAATAATTTATTATC------------TACACAGC s panTro4.chr17 70417930 31 + 82630442 --GAGTTATACAATCATTTATTATC------------TACACAGC i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61465733 31 + 73212453 --GAGTTATGCAATAATTTATTATC------------TACACAGC i ponAbe2.chr17 C 0 M 130 s nomLeu3.chr14 41633766 31 - 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0 s nomLeu3.chr14 41633845 287 - 94967081 TGTAGAGCTGGAGGTTTAGAGTTCTCTTACCTTACTAAGAAAACTAAACATCAAACCCATGTTGAGTTTATTAACCTTCATGATGCAGAATCCCAA--TTTTGTATATGAAACTATGAGTTCTCTTACGGCCGGAATTATGATTTCTGCTATTTTCTCACATACTCTCAAACTCTATGTGTCGCTGTAGAAGGTGCCC-ACAAATGCTGAGCCGATTTTTAATGGTTTGAGAAATACAGGAGTGACATATTTTTGATTTAGGAAACATGTTAGATTTTTCTGTTATATTA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69005000 287 + 80904711 CGTAGAGCTGGAGGTTTGGATTTCTCTTACCTTACTAAGAAAACTAAACATCAAACCTATGTTGAGCTTATTAACCTTCATGATGCAGAATCCCAA--TTTTCTATATGAAACCTTGAGTTCTTTTATGGCAGGAGTTGTGATTTCTGCTCTTTTCTCACATACTCTCAAATTCTATGTGTCTTTGTACAAGGTACCC-ACAAATGCAAAACCAATTTTTAATAGTTTGAGAAATATAGGAGTGACGTATTTTTTATTTAGGAAGCACGTTAGGTGTTTCTGTTATATTA i rheMac3.chr16 I 11 C 0 s macFas5.chr16 68751949 287 + 80997621 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TGTAGAGCTGGAGGTTTGGATTTCTCTTACCTTACTAAGAAAACTAGACATCAAACCTATGTTGAGCTTATTAACCTTCATGATGCAGAATCCCAA--TTTTCTATATGAAACTATGAGTTTTTTTATGGCAGGAGTTGTGATTTCTGCTCTTTTCTCACATATTCTCAAACTCTACGTGTCTCTGTAGAAGGTACCC-ACAAATGCTGAGCCAATTTTTAATAGTTTGAGAAATACAGGAGTGACGTATTTTTTATTTAGGAAGCACGTTAGGTATTTCTGTTATATTA i chlSab2.chr16 I 11 C 0 s calJac3.chr5 120007959 287 + 159171411 TGTAGAACTGGAGGTTTATATTTCTCTTAACTTTGTAAGAAAACTAAACATCAACTCATTGTTGAGTTTATTGACCTTCATGATGCAGAATCCCAA--TTTTCAATATGAAATTATGAGTTCTCTTGTGGAAAGAGGTATGATTTCTGCTTTTGTCTCACATACTCTCAAACTCTATGTGTTGCTGTAGAAGGTGCCC-GCAAATGCTGAGCTAGTTTTTAATAGTTTGAGAAATACAGGAGTGACGTATTTTAGATTTAGGAAGTATGTTAGGTGTTTCTGTTACATTA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43505089 263 - 61074082 TGCAGAACTGAAGTTTCAGATTCCTTTTGAAATTCTGAGTCAATTCAAAATTAAACCAAGGCCGAGTTTATT-CCTTTCACAATTCAGAATCCTGA--T-----------GCATCTAGGTTCTCTTATGATAGGAGCTATGATCTTTGCTATTGTCTCACATAATCTCAAACTCTGTGCTTTGGTGCACATGATACCTAAAAAATGTTGCACTGACAC-----------AGAAATACAGCAGTGATGTACTC--GATCTGGGAAGCATGTTAGGTGCCTCTGTTGTATTA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112332833 520 + 122082543 I a score=373282.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26672 111 + 235827 TCTCACTGGGAAGTGTACCACATTGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAAAT--ATGTGTTCCGTC---AGAAAGTTAACAGAGAACTAACCTGAAAGAAACTTC s panTro4.chr17 70418296 111 + 82630442 TCTCACTGGGAAGTGTACCACATTGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAAAT--ATGTGTTCCGTC---AGAAAGTTAACAGAGTACTAATCTGAAAGAAACTTC i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61466183 111 + 73212453 TCTCACTGGGAAGCATACCACATCGTGAACAAATTGTTGTTTTGCCTATTACTCATGAAAAAT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAACAGAGAACTAACCTGAAAGAAAGTTC i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41634132 111 - 94967081 TCTCATTGAGAAGTGTACCACATCGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAAAT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAACAGAGAACTAACCTGAAAGAAACTTC i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69005287 110 + 80904711 TCTCACTGAGAAGCGTACAACATCGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAATT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAAC-GAGAACTAACCTGAAAGAAACTTC i rheMac3.chr16 C 0 I 170 s macFas5.chr16 68752236 110 + 80997621 TCTCACTGAGAAGCGTACAACATCGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAATT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAAC-GAGAACTAACCTGAAAGAAACTTC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63015048 110 + 74645514 TCTCACTGAGAAGTGTACAACATCGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAATT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAAC-GAGAACTAATCTGAAAGAAACTTC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25115677 110 - 75148670 TCACACTGAGAAGTGTACAACATCGTGAACAAATTGTTATTTTGCCTATTACTCATGAAAAAT--ATGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAAC-AAGAACTAACCTGAAAGAAACTTC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120008246 105 + 159171411 TCTCACTGAAAAGTGTACTACATCATGAACAAAT--TTCTTTTGCCTATTAGTCATAAAAAAT--ACGTGTTCCCTC---AAAAAGTTAACAGAGGGCTAACCT----GAAACTTC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112333353 113 + 122082543 TCTCATTGAGAAAGGGTTCACACCCTAACAAGGTACTTCTTTTTTATATTAGTCAGAAAAAAGAAACATGTCCACCT---TAAAACTTATTACAACATTAACACAAAGGAAACCTC i mm10.chr11 I 520 C 0 s canFam3.chr9 43505352 112 - 61074082 TCTCACTGAGAAAGGAACCACATC-TGAACAAACTATTCTTCCACCT-TTAGTTACGAAAAAT--AGATGTCCACCCCAAAAAAAGTTAACATAGGGTTAACTTGGGAGAAACTTT i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=2012926.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 26783 572 + 235827 AGCACCAGCAATTTTAAT--AAGATAAATA-----AAAAAT--AGAGATTCAATCTTATCTACTC-----CTACTGTGTCA-TTCTGAAAAGAGATGAAAGAAA--AAATAATGAAAAC---ACATTTTCTTAGTGAATTTACCCTC-CCTCCAGCCCCAACACAT--------ATTTAATTGGTTCCATGATTTATGTAGTGTGTTTTACACTCTTTTTTCCACCCACTCACAATATTACAAATATTAATCATTTTTCCTTGGTCAATTATA-GGAATTAAGGCTTGGTGTTGTGTTTGTTCATAGGTAATATGACATCAGATAAAACCATGCTCTACTTTTTGTTCTC-CCCACCCCCAACCCCAGCTGTTCATATACCATTTTCTGCTTTCTAAGAGAAAGAATAAAATTACCTTGGTAAAGAGCTATGTT--------Caacaaacaaacaaaaagaaaagaaaaaaaaa--CCTATTTTGGAAAATACCTAAGAATGCGAG-AAGCTCCCAGAGATTGAAAATGTTTTTCACACATGGAC---------AGATT------ATCAGAGGATAATCTTACATATTGAAGTTGCTGAAAT-AAAGAAGGCAGTAGCTGAGAACCTACC s panTro4.chr17 70418407 574 + 82630442 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i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41640603 1117 - 94967081 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canFam3.chr9 43511313 421 - 61074082 CTCTTATGG---TGTGCTTCACTGGGC-AGGATGCCTACAGTG--AGGGCAAAACATCAAAGCAGTATCCCTGAGAC---GTTAAGA----GAGGAACTT-GAAAAAGCTTGACA-----TCAGGTG-ATTTTTT---TAATTGCCACAGTATATTGTCATCACCATTATGGGCATGTTTTAAAGAGGAAGGAATACATGGGGCTTTCCAGAGAGTCAAATTTCATTACCC-AAAACAATTTCTGAGTCAATTTTTATACTTCTATCAAAACCACTTAAAATAAAT-GTGGTCTCATAAACAAACTTTTACCTGGATTACCAAGAGGGTGTCAGTGTGAGGATGGGGAGTGTGGTTCA----GGGGTCATACCCCAGGAAAGGGTGGAAAGGAAG--GAGAAGGAATCTCCTTTAAAGTTTTGAA-TAATCTTTATCCCCAAAAAAGTGAGAC i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=219953.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 36274 58 + 235827 TTAGTCAACTGTGGGCTAGGAGTCTCCAGAA---GCAGCCGGAGCTAACTTCTTACATCTC s panTro4.chr17 70427894 58 + 82630442 TTAGTCAACTGTGGGCTAGGAGTCTCCAGAA---GCAGCCGGAGCTAACTTCTTACATCTC i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61475507 58 + 73212453 TTAGTCAACTGTGGGCTAGGAGTCTCCAGAG---GCAGCCAGAGCTAACTTCTTACATCTC i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41643457 58 - 94967081 TTAGTCAACTGTGGGCTAGGAGTCTCCAGAG---GCAGCCGGAGCTAACTTCTTACATCTC i 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TTATAAAAAG-CCACTCCTGGCCATTACTGCAGGGAAAAGTCCCACAGAGCTGAGCAGTCATGATGTGT--GACTTCACCGAGGACCAGACTGCAGAGTTCAAGGAGGCCTTCCAGCTGTTTGACCAAACAGGTGATGGCAAGAT-CCTGTACAACCAATATGGGGATGTGATGAGGGCACTGGGTCAGAACCCCACCAACACTGAGGTGCTCAAGGTTCTGTGGAACCCCAAGAGTAA-TGAGATGAACGTGAAGGTGCTAGACTTTGAGTACCTTCTGCCCATACTGCAGACGGTGGCCAAGAACAAGGACCAGGGCACCTGTGAAGATTATGTAGAAGGACTTCAGGTGTTTGACAAGGAAGTAAATGGCACCATCATGGGTGTTGAATTCTGGCTTGTTCTTGTCACACTGGGTGAGAAGATAACAGAGGAAGAGGTAGAGGTGCTGGTGGCAGGGAATGAGGGCAGCAATGGTTGTATCGACTATGAAGCATTTGTGAGGCACATCCTGTCGGGGTGACAGGCCCATGGGGC--AGCTCATCCTTACGGTGCTGAATGACTGAGGACCTTCCCAGTCTCCCATAGCCCA---CGTCTCCCCCTGGTGAGATTTTCTATCTATCCTGAAGGCTTCCTAGGTTCTCTTATCACAGTGCCTTTCCCGTGTTGTCTTTCTTGGAT----ATTTACCATTAGCATTCACCAAATAAACTTGCTCTCTGTGCC--------CCTCC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120015927 737 + 159171411 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CCAAAAGAAGCCACTCCTATACTCATAC--CTGCCATCACCACGT---------AGAACACCCTTGTTGCTCAGAAGCATCTAAATAAGACACTCTCTATACACACGCATGCACACATACAC--------------------GAGAGAATAGAAATTTATCCCATATCCTCTCTACTTCCTCAAACCTGTGAT-GAACACACACTGGCAGTGCCACAGATTCTAGAACT-TAAATACTATTAAGTCATTTTGATATCACCAGAG-TCAAAAGTGAAAAAAATATTGAGAGACAAGTGGCTTTAAGGATCCTTTGATGGCCCCTAAATCATCTGTTTATTTCAAAAAGCGTTGCCAATGGTAAAAAGAAACTTCTTCAGTTGAAATTAGGTTTGGTTTCCAAAGTATTCTTTCAAAT-AAAA-GAATCAAATTGTCAACCTAATTTAAAAAGCTACTATATACACATGTGTACATACATTCCACT----TATGGGTTTATGTGTGTT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69015637 471 + 80904711 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C-AAAAAAAGTCACTCCTATACTCACAC--CTGCCATCGCCACGT---------AGAACATCCTTGTTGCTCAGAAGCTTCTGAATAGGACACTCTCTATGCACACGCATGCACATATACAT--------------------AAGATAATAGAAATGTATCCCATATCCTCTCTACTTCCTCAAACCTGTGAT-GAACAAACACTGGCAGTGCCCAAGATTCTGGAACT-TAAATAC--------AATTTTGATATCATCAGAG-TCAAAAGTAAAAAAAAAATTGAGAGACAAGTGGCTTTAAAGATCCTTTCAGGGTCCCTAAGTCATCCATTTATTTCAAGGAGTGTTGCCAATGGTAAAAAGAAACTTCTTGAGTTGAAATTAAGTTTGGTTTCCAAAGTATTCTTTCAAATAAAAA-GAATCAAATTATCAACCTAATTTAAAAAGCTACTATAGACACATGTGTACATGCATTCCACTTATGTATGTGTTCATGTGTGTT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120016664 452 + 159171411 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i papAnu2.chr16 I 267 C 0 s chlSab2.chr16 25127121 270 - 75148670 ----gacagagtctagctctgtcacccaggctagagagtgcagaggtgtgatctgggctcactgcaacctctacctcctggcttcaagcg---attctcctgcctcagcttcctgagtagctgggattgcacgtgcctgccaccatgcccgactaatttttgtatttttagtagggacagggttttgctatgttggtcaggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatcctcctgcctcagcatcccaaagtgctgggattacaggcctgagtca i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120017963 268 + 159171411 ----gacagagtctagctctgtcacccaggctggagaatgtagcggta-gagtttgattcactgcacactccccatcctgggttcaagca---attctcctgcctcagctttccaagcagctaggattgca-gggcctgccaccatgcccagctaatttttgtattttcagtagaggtggagttttgctatgttggtcagactggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacagacatgagcta i calJac3.chr5 C 0 I 14 e mm10.chr11 112341546 1628 + 122082543 I e canFam3.chr9 43513204 35 - 61074082 I a score=774688.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 38782 341 + 235827 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catatgaaaggaagtatctgcaactgggcacaacgactcgtgcctataatcccagcactttcggagacagaggtgggcagatcacctgaagccaggagtttgagaccacattgaccaacatggtgaaaccctatctctactaaaaatacaaaaattagccaggtgtggtggcacacacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggtgaatgacttgaacccgggagacagaggttgcagcgagctgagactgtgccactgaactccagcgtgggctacagggtgagactttgtctcaaa----acataaataaataaataaataaataaataaataaataaataaa-tCA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112341546 1628 + 122082543 I e canFam3.chr9 43513362 6 - 61074082 I e calJac3.chr5 120018231 14 + 159171411 I e panTro4.chr17 70431064 2386 + 82630442 M a score=180025.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 39645 83 + 235827 aaaaaagtctttgcagatgtgaagtcagggaccttgatatggagagattatccttgatcacaagggtccttataaaggaaagg s ponAbe2.chr17 61478870 83 + 73212453 aaaaaagtctttgcagatgtgaagtcagggaccttgatatggagagattatccttgatcacaagggtccttataaaggaaagg i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41646807 83 - 94967081 aaaaaagtctttgcagatgtgaagtcagggaccttgatatggagagattatccttgatcacaagggtccttataaaggagagg i nomLeu3.chr14 C 0 M 1174 s 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caggagggtgagagtcaaagcagg--agatgtgaggatgtaagtagaggtcaaagtgatgtaagaaaacatgctgcaagccaaggaatgcagggggcttctggaaattggaaaagacaaagaattaaaatctcccctggaacctccagaagaaatacagtcctgctgacaccttgattttaggacgtatgacttccaga s ponAbe2.chr17 61478953 197 + 73212453 caggagggtgagagtcaaagcagg--agatgtgaggatgtaagtagaggtcaaaatgatgtaagaaaacacgccgcaaaccaaggaaggcagggggcttctggaaattggaaaagacaaagaattaaaatctgccctggaacctccagaagaaatacagtcctgctgacaccttgattttaggacttatgacttccaga i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69018272 197 + 80904711 gaggcgggtgagagtcaaagcagg--agatgtgagcatgtaagtagaggtcaaggtaatgtaagaaaacaagccacaagccaaggaacgcagggggcttctggaaattggacaaggcaaagaaatgaaatttcccctagaacctccagaagaaatatagtcctgctgacaccttgattttaggacttatgacttccaga i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68765080 197 + 80997621 gaggcgggtgagagtcaaagcagg--agatgtgagcatgtaagtagaggtcaaggtaatgtaagaaaacaagccacaagccaaggaacgcagggggcttctggaaattggacaaggcaaagaaatgaaatttcccctagaacctccagaagaaatatagtcctgctgacaccttgattttaggacttatgacttccaga i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63030066 197 + 74645514 GAGGCGGGTGAGAGTCAAAGCAGG--AGATGTGAGCATGTAAGTAGAGGTCAAGGTAATGTAAGAAAAcaagccacaagccaaggaacgcaGGGGGCTTCTGGAAATTGGACAaggcaaagaaatgaaatttccCCTAGAACCTTCAGAAGAAATAtagtcctgctgacaccttgattttaggacTTATGACTTCCAGA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25128405 197 - 75148670 caggcgggtgagagtcaaagcagg--agatgtgagggtgtacgtagaggtcaaggtaatgtaagaaaacaagccacaagccaaggaatgcagggggcttctggaaattggacaaggcaaagaaatgaaatttcccctagaacctccagaagaaatatagtcctgctgacaccttgattttaggacttatgacttccaga i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43513449 190 - 61074082 ------catgagggtcagagcagaatagatgtgaggaagggagcagaact-gaagtgctatgagaaag-ggaccacagg-tgaggaatacaggagacctatagaagctggaaaagacaggggaatgaatccccccctagaaccttcagaatgaatgcagtcctgtcaacaccttggttttaagacttctgacttccaga i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112341546 1628 + 122082543 I e calJac3.chr5 120018231 14 + 159171411 I e nomLeu3.chr14 41646890 1174 - 94967081 M e panTro4.chr17 70431064 2386 + 82630442 M a score=142903.000000 s 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tataTAGTGAAATTTTAAAAACTCATTCTCTCAAAATGGTCTTAACAACAGACACATCT---AGGATCCTGCC-ACATATTCTAACCCTTTAGGAAAGTATCTGA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63030342 101 + 74645514 CAtatagtgaaattttaaaaactcattctcTCAAAATGGTCTTAACAACAGACACATCT---AGGATCCTGCC-ACATATTCTAACCCTTTAGGAAAGTATCTGA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25128680 101 - 75148670 tacaTAGTGAAATTTTAAAAACTCATTCTCTCAAAATGGTCTTAACAACAGACACATCT---AGGATCCTGCC-ACATATTCTAACCCTTTTGGAAAGTATCTGA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s mm10.chr11 112343174 103 + 122082543 TACCCTGGAGATTCATAAAAATTCACACATTCAAAA-AGTTTTGGCAGTAGATACATGTAGGAGGATTCAGCT-ACATATCTGAACCTCTTCATAAATTATCTGG i mm10.chr11 I 1628 I 445 s canFam3.chr9 43513716 41 - 61074082 --tataGAGGGATTTAAAAAAAATCATCCTTTAAAATGGTCTC-------------------------------------------------------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e calJac3.chr5 120018231 14 + 159171411 I e panTro4.chr17 70431064 2386 + 82630442 M a score=12318.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 40104 7 + 235827 TAAGTCC s ponAbe2.chr17 61479329 7 + 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AACTgtggtggctcatgtatgtaatctcagcactttgggaggccaaggtggg-aggatcacttgagctcagacgtttgagaccagcctgggcaacatgaggaaactctgtctctacaaaa-aatacaaaaat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69018656 130 + 80904711 AACTgtggtggctcatgcatgtaatctcagcactttgggaggccatggtggg-aggattgcttgagctcagaagtttaagaccagcctgggcaacatcgggaaactctgtctctacaaaa-aatacaaaaat i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68765464 130 + 80997621 AACTgtggtggctcatgcatgtaatctcagcactttgggaggccatggtggg-aggattgcttgagctcagaagtttaagaccagcctgggcaacatcgggaaactctgtctctacaaaa-aatacaaaaat i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63030450 130 + 74645514 aactgtggtggctcatgcatgtaatctcagcactttgggaggccatggtggg-aggattgcttgagctcagaagtttaagaccagcctgggcaacatcaggaaactctgtctctacaaaa-aatacaaaaat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25128788 130 - 75148670 AACTgtggtggctcatgcatgtaatctcagcactttgggaggccatggtggg-aggattacttgagctcagaagtttaacaccagcctgggcaacatcaggaaactctgtctctacaaaa-aatacaaaaat i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120018245 132 + 159171411 AAATgtggtggctcatgcctgtaatctcagcactttgggaaaccaaggtgggaaaaatcacttgagctcaggggttcgagaccagcctcagcaacatggggaaactctgtctctacaaaacaattcaaaagt i calJac3.chr5 I 14 C 0 s canFam3.chr9 43513757 57 - 61074082 -------GTGGTT-----------------------------ACAGGATGAA-AACATCCTTTAAA--------------------ATAGGCA-----------------TTCCTAAAAA-AAAAAAAAAAT i canFam3.chr9 C 0 I 41 e mm10.chr11 112343277 445 + 122082543 I e panTro4.chr17 70431064 2386 + 82630442 M a score=376130.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 40240 174 + 235827 tagctgagcctggtggttcatgcttgtagcc---ccttctactcaggaggctgagctgggaggaccacttgagcccaggaggttgaggctgctgtgagccatgatagagccactgtactccagtctgggtaacagagtgagaccctgtctcaaacaaagaaaaagaaaaaaa------------aaaag s ponAbe2.chr17 61479466 184 + 73212453 tagctggacctggtggttcatgcttgtagac---ccttctactcaggaggctgagctgggaggaccacttgagcccaggaggttgaggctgctatgagccgtgatagagccactgtactccagtctgggtaatagaatgagaccctgtctcaaaaaaagaaaaagaaaaaaa--aaaagaaaagaaaag i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41648388 167 - 94967081 tagctgggcctggtggttcatgcttgtagcc---cctcctactcaggaggctgagctgggaggaccacttcagcccaggaggttgaggctgctgtgagccatgatagaaccactgtactccagtctgggtaacagagtgagaccctgtctcgaaaaaaaaaaaag-------------------gaaag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69018786 186 + 80904711 tagttgggtctggtggttcacgattgtagcc---ccttctactcaggaggctgagctgggaggaccacttgagcccaggaggttgaggctgctgtgaaccgtggtagagccactatattccagtctgggtaacagagtgagaccctgtctcaaaaaaagaaaaagaaaaaaagaaaaagaaAAGAAAAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68765594 186 + 80997621 tagttgggtctggtggttcacgattgtagcc---ccttctactcaggaggctgagctgggaggaccacttgagcccaggaggttgaggctgctgtgaaccgtggtagagccactatattccagtctgggtaacagagtgagaccctgtctcaaaaaaagaaaaagaaaaaaagaaaaagaaAAGAAAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63030580 183 + 74645514 tagctgggtctggtggttcACGATTGTAGCC---CcttctactcaggaggctgagctgggaggaccacttgagcccaggaggttgaggctgctgtgaacaGTGGTAGAGCCACTAtattccagtctgggtaacagagtgagaccctgtctcaaaaaaagaaaaagaaaaaaaggaaaagaaaagaa--- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25128918 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ACCCAGAGAAGTTTCTTACCTTTTTTCTACTACATGTTGATACAATGAGAAGGCAAGGGTTTGCAATCCAGAAGAGGGCCTTCACTACattggcaccctgatctcagccTTTCAGCCCCCAGAAATATgatgaataaatttctgttgtttataagacaCCCAGGCTACtgtagtttgttatagcagccggAACTAAGATACATTCTGCCTTCAATATCTAGAAAACTGAATATAATACACAAGGAAACAG-TTTTTAGACATTGAAAAACTGGTAGC-ACAGTACTGTGATTCCCAAGAGAGGGGACACAAATGAGGTGAGTCTCATAATTTCTTCCAGAACTGACCGGAAGTGGTT---------------TATATACCTACCACAAGGACCATCCCAAACATAGCATGGTGGTTTCACTGAGTTAAGTAAAGATTGATGTTCAGCCAGACTCAGGTGGCTGTAATTTTCAGGGTGGAGTATTAAAAAGGAAGGAGGTTGCTACAAATggaattgtgtcccctcaaaattcatatgttgaagttttAACCCCAATGTAATGCTGGAAATGGAGCATTTGGGAGGTAACCAGAGTTAGAAGAGGTCATGAAGGTGGGGTCTCCATGTTGGGattggtgtccttgtaagaagggGAAGACAGAG----CTCTCT--TTCTATATCATgtaaagacacagcaagaaggctacAACTCAAG--------------------------------GCACCTTGACCCTGGACTTCCCAAccttcagagctgtgagaaatttct-----------------gtttatagtattttgttatatagCCCAAGTTGACTAAGACAAAGTTGTATAGAGCAAGAACTCTCAGAAATCATAATATGGTCCATTTGAATCTGTTATTAATACAAAATTGCACATACATGTATGCTAGGAAACTATGCAAGACAGTGTACCAGGGAAACACAAGTTACATAAAGCAGAATGCCAGGGAAAT-------------------------------------------------------------------ATATGCT--AAACAATTAGCAGAGTTCACACAGGGCTGGAAAATGCCCTAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25130128 980 - 75148670 acccagagaagtttcttaccttttttctactacatgttgatacaacgagaaggcaagggtttgcaatccagaagagggccttcactacattggcaccttgatctcagcctttcagcccccagaaatatgatgaataaatttctgttgtttataagacacccaagctatggtagtttgttatagcagctggaacTAAGATAccttctgccttcaatagctagaaaactgaatacaatacacaaggaaacagttttttagacattgaaaaactggtagc-acagtactgtgattcccaagagaggggacacaaaggaggtgagtctcataatttcttccagaactgaccggaagtggtt---------------tatatacctatcacaaggaccatctcaaacatagcatggtagtttcactgagtgaagtaaagattgatgttcagccagactcaggtggctgtaattttcagggtggagtattaaaaaggaaggagGTtgctacaaatagaattgtgtcccctcaaaattcatatgttgaagccttaaccccaatgtaatgttggaagtggagcatttgggaggtaaccagagttagaagaggtcatgaaggtgggctctccatgttgggattggtgtccttataagaacaggaagacagag----ctctct--ctctctatcatgtaaagacacagcaagaaggctacaactcaag--------------------------------gcaccttgaccctggacttcccaaccttcagagctgtgagaaatttct-----------------gtttatagtattttgttatatagcccaagttgactaagacaAAGGTGTGTAGAGCAAGAACTCTCAGAAATCATAATATGGTCC------ATCTGTTATTAATACAAAATTGCACATACATGTATGCTAGGAAACTATGCAAGACAGTGTACCAGGGAAATACAAGTTACATAAAGCAGAATGCCAGGGAAAT-------------------------------------------------------------------ATATGCT--AAACAATTAGCAGAGTtcacacagggctagaaaatgccctag i chlSab2.chr16 C 0 I 10 s calJac3.chr5 120019578 1096 + 159171411 gcccagagaagtttcttacctttcttccaccacatgttgatacaatgagaaggcaagagtttgcaattcaaaagagggcctttactatattagcaccctgatttcagcctttcagcccccagaagtgtgaggaataaagttctattgtttataagacacccaggctatggttggttgttacagcagcctgaaTTAAGATATAttctgcctccaatagctataaaactgaatacaatacatgaggaaacaa-cgtttagatattgaaaaactggcagcaacagtactatgattcctgagagagggcacacaaatgaggtgagtcccatgatttcttccagacctgactggaagtggtttatacaccacagaggtatagacctattgcaaggatcatcccaaacacaacatggtggtttcc-----ttaagtaaacactgatggtcagcaagactcaggtggctataattttcaggatggagtaccaaaaaggaaggaggtgtc-----------------cccttcaaaattcatgtgttgaaaccttaacagcaatgtaatgctgaaggcggagtctttgggaggtaatcagaattagaggaggtcacgaaggtggagtctccatgttgggattggcgtcctcataggaatgagaagacagagctctctctct--ttgtctatc-tgtgaagacatagcaaggaggctacaaatcaaggagagagccctgaccagacaccaactctgctagcaccttgaccttgaacttcctgaccttcagagctgtgagaaatttcggctgtttgagccacctagttgatagtattttgttatatagcccaaggtgactaagacaAAGGGGTGTAGAGCAAGAACTCTCAGAAATCATCAGGTGGTCCATTTGAATCTGTTATTAATGCAAAATTACA----CATGTAAGCTATGAAACTACGTAAGGCAGTGTACCAGGAAAATACAAGTTACATAAAGCAGAATACCAGGGAGATAGCAGAGTTCACACAGGACAGGAAAATGTCCTAAAAACAATTAGCAGAGTTCACGCAGGACAGGAAAATGTCCTAAAAACAATTAGCAGAGTtcacgcaggacaggaaaatgccctaa 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panTro4.chr17 70434613 141 + 82630442 attcaccaaaatgcag---agtcctcatggaatacctggactttagatggtgatcccaggaaagtcacaccttagtagtgactcaaactttgccttagagtaaagagtactctaaacccatcatgacaaagcttaaaaacaagc i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61481745 141 + 73212453 attcaccaaaatgcag---agtcctcatggaatacctggacattagatggtgatcccaggaaagtcacaccttagtagcgactcaaagtttgccttagaataaagagtactgtaaacccatcatgacaaagcttaaaaacaaac i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41650657 135 - 94967081 attcaccaaaatgcag---agtcctcatggaatacctggacattagatggtgatgccaggaaagtcacacctta-tagtgactcaaaatttgcct-----taaagagtactctaaacccatcatgacaaagcttaaaaacaaac i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69021019 144 + 80904711 attcaccagaatgcagtcaagtcctcatggaatacctggacattagatggtgatcacaggaaagtcacaccttcgtagtgactcaaaatttgccttagaataaagagtactctttacctatcatgacatagcttaaaaacaaac i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68767827 144 + 80997621 attcaccagaatgcagtcaagtcctcatggaatacctggacattagatggtgatcacaggaaagtcacaccttcgtagtgactcaaaatttgccttagaataaagagtactctttacctatcatgacatagcttaaaaacaaac i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63032809 144 + 74645514 ATTCACCAGAGTGCAGTCAAGTCCTCATGGAATACCTGGACATTAGATGGTGATCACAGGAAAGTCACACCTTCGTAGTGACTCAAAATTTGCCTTAGAATAAAGAGTACTCTTTACCCATCATGacaaagcttaaaaacaaac i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25131118 144 - 75148670 attcaccagaatgcagtcaagtcctcatggaatacctggacattagatggtgatcacaggaaagtcacaccttcatagtgactcaaaatttgtcttagaataaagagtactctttacccatcataacaaagcttaaaaacaaac i chlSab2.chr16 I 10 C 0 s calJac3.chr5 120020679 141 + 159171411 attcaccagaatgcag---agtcctcatggcatacctggacactagatggtgaccccaggaaagtcgaaccttagtagtgactcaaaagttgccttagaataaagactactctaaacccatcatgacaaagcttaaaaacaaac i calJac3.chr5 C 0 I 1615 e mm10.chr11 112344552 118 + 122082543 I e canFam3.chr9 43514049 805 - 61074082 I a score=517371.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 42669 227 + 235827 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TACATTCCAAAACTTAAGAgaaaattaagcagcaccttttcgaataacatatgaataaaataataaatcaaaaccaaagttataaaatatgcttcactgagaagaaattttaaaatacacatcaaaatttgtggaatagagctaaaagggcttagagaacaattcatag-------cattaaaattttatattagaaaagatctaaaatcaatgatctaaccctccactatgaaaaataacctagattaaagagaacacattaaatgtcacatacatagaaatgaaaaaatactaatgaaaaatgtgcaagtcaatgaaatagaaaatgaacaaataatagaaaaaataaataaaacc-aaaattttattcttgttacagagcagtaaactggtagacttaaagctctagagagaaagaggagaagggaaaaggagaaaaaaagggtgggagatggg--------------------------------------------gagaaagagagacagacagagagtaacagaga----gaataaacaaattatcaaattaccaacatcaggaataaaagtggggacatcactagagatgccacagagactaaaataataagggaat----------------atttcaaacaacttc---ataataaatttgaccacttagataaaactaaaaaataccttgaaaatcataaattaagaaaactgactgatgaagagatagaaaatttgaatgattaatgccaatgaaagatactgaatttgtaagtaaaaatcttcttagaaagaaaattccagtcccagatggctttattggtTTtggccaatagtattttccaaatatagttgcattaatatcttttatcacacatgctcttttgaagccttgtcacactccataaagaaacgtaatatgat---tcttttttttttgtatctgagtgattgtaggacttgcttttaattaatagaatgtagtagaattacactgcttaacttccaactctagttataaaagGTGATTCCAATATATAACAATGAGAAGATATGGGAAAGCTACCCATATATCTTTTGgttgagagccagcatcaaccaccagacatgtgagttgagtctggtcctcagatatcaagtgactttagcctttgaat 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CATATTCCAAAACTTAa-----aattaagcagcatcttttcgaataacatatgaataaaataataaatcaaaaccaaagttataaaatatgcttcactgagaagaaattttaaaatacacatcaaaatttgtggaatagagctaaaagggcttagagaacaattcatag-------cattaaagttttatattagaaaagatctaaaatcaatgctctaaccctccactacgaaaaaaaacctagattaaagagaacacattaaatgtcacatacatagaaatgaaaaaatactaatgaaaaatgtgcaagtcaatgaaatagaaaatgaacaaataatagaaaaaataaataaaacc-aaaattttattcttgttacagagtagtaaactggtagacttaaagctctagagagaaagaggaggagggaaaaggagaaaaaaaaggtgggagatggg--------------------------------------------gagaaagagagacagacagagagtaacagaga------ataaacaaactatcaaattaccaacatcaggaataaaagtggggacatcactagagatgccacagagactaaaataataagggaat----------------atttcaaacaacttc---ataataaatttgaccacttagataaaactaaaaaataccttgaaaatcagaaattaacaaaactgactgatgaagagatagaaaatttgaatgattaatgccaatgaaagatactgaatttgtaagtaaaaatcttcttagaaagaaaattccagtcccagatggctttgttggtTTtggccaatagtattttccaaatatagttgcattaatatcttttatcacacatgctcttttgaagccttgtcacactccataaagaaacgtaatat--------tcttttttttgtatctgagtgattgtaggacttgcttttaattaatagaatgtagtagaattacactgcttaacttccaactctagttataaaagGTGATTCCAATATATAACAATGAGATGATATGGGAAAGCTACCCACATATCTTTcggttgagagccagcatcaaccaccagacatgtgagttgagtctggtcctcagatatcaagtgactttagcctttgaat 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TATATGccaaaacttaagaggaaattaagcagcatcttttcaaataacatatgaataaaataataaatcaaaagcaaagttataaaatatgcttcactgagaagaaattttaaagtacacatcaaaatttgtggaatagagctaaaagggcttagagaacaatttatag-------cattaaagttttatattagaaaaggtctaaaatcaatgatctaaccttccactatgaaaaataacctagattaaagagaacacattaaacttcacatacatagaaatgaaaaaatagtaaggaaaaatgtgcaagtcaatgaaatagaaaatgaacaaataatagaaaaaataaataaaacc-aaaattttattcttgttacagagcagtaaactggtagacttaaagctctagagagaaagaggaggagggaaaaggagaaaaaaagggagggagatggggag----------------------------------aaagaacgagaaagagagagagacagagagtaacagagagagagaataaacaaattatcaaattaccaacatcaggaataaaagtggggacatcactagagatgtcacagagactaaaataataagggaat----------------attttaaacaacttc---ataataaatttgaccacttagataaaactaaaaaataccttgaaagtcacaaattaacgaaactgactgacgaagaaatagaaaatctgaatgattaatgccaatgaaagatactgaatttgtaagtaaaaatcttcttagaaagaaaattccagtcccagatggctttattggtTTtggccaattgtattttccaaatacagttgcattaatatcttttatcacacatgctcttttgaagccttgtcacactccataaag-aatgtaatgtg-------atttttttttgaatc--ggtgattgtaggacttgc-tttaattaattgaatgtagtagaattacactgcttaacttccaactctagttataaaagGTGATTCCAATATATAACAATGAGATGATATGGGAAAGCTACCCATATGTCTTTTGgttgagagccagcatcaaccactagacatgtgagttgagtccggtcctcagatatcaagtgactttagcctttgaat 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TATATTACAAAACTTAAGAgaaaattaagcagcatcttttcgaataac--gcgaataaaacaataaatcaaaagtaaagttataaaatatgcttcactgagaagaaattttaaaatacacatcaaaatttgtggaatagagctaaaacagcttagagaacaatttattaaacaacttattaaagttttatattagaaaagatctaaaatcaatgatctaaccctccactatgaaaaataacctagattaaagagaacacattaaatttcacatacgtagaaatgaaaaaatactaaggaaaaatgtgccagtcaatgaaatagaaaatgaacaaataatagaaaaaataaataaaacc-aaaattttattcttgttacagagcagcaaactggtagacttaaagctctagagagagagagg---agggaaaaggagaaaaaaagagagggagatggggagaaaaagggagaaagatggggagaaagagggagaaaaagagagagaaagagagagagatagagagtaacagaga----gaataaacaaattatcaaattaccaacatcaggaataaaagtggggacatcactagagatgccacagagactaaaataatacgggaat----------------attttaaacaacttc---ataataaatttgaccgcttagataaaactaaaaaataccttgaaaatcacaaattaacaaaactgactgacgaagagatagaaaatctgagtgattaatgccaatgaaagacactgaatttgtaagcaaaaatcttcttagaaagaaaattccagtcccaggtggctttattggCTTtggccaattgtattttccaaatacagttgcattaatatcttttatcacacatgctctttagaagccttgtcacactccataaagaaatgtaatatgat-----tcttttttttgaatctgagtgattgtaggacttgcttttaattaatagaatgtggtagaattacactgcttaacttccaactctagttataaaagGTAATTCCAATATTTAACAATGAGATGATATGGGAAAGCTACCCATATATCTTTTGgttgagagccagcatcaaccaccagacatgtgagttgagtctggtcctcagatatcaagtgacttcagcctttgaat 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TATATTCAAAAACTTAAGAGAAAATTAAGCAGCATCTTTTTGaataac--atgaataaaataataaatcaaaagcaAAGTTATAAAATATGCTTCActgagaagaaattttaaaatacacatcaaaatttgtggaataGAGCTGAAAAGGCTTAGAGAAAATTTTATAG-------CATTAAagttttatattagaaaagatctaaaatcaatgaTCTAACCCTCCACTATGAAAAATAATCTAGATTAAAGAGAACACATTAAACTTCACatacatagaaatgaaaaaatagtaaggaaaaatgtgcaagtcagtcaaatagaaaatgaacaaagaatagaaaaaataaataaaacctaaaattttatTCTTGTTACAGAGCAGTAAACTGGTAGACTTAAAGCtctagagagaaagaggaggagggaaaaggagaaaaacagggacggagatggggag----------------------------------aaagaatgagaaagagagagagacagagagtaacagaca----gaaTAAACAAGTTATCAAATTACCAAGATGAGGAATAAAAGAGGGGACATCACTAGAGATGCCACAGACAGTAAAATAATAAGGGAAT----------------ATTTTAAACAACTTCAGGATAATAAATTCAACCACtcagataaaactaaaaaatacctggaaaatcacaaattaccaaaactgactGACGAAGAGATAGAAAATCTGAGTGATTAATGCCAATGAAAGATATTGAATTTGTAAGTAAAAATCTTCTTAGAAAGAAAATTCCAGTCCCAGATGGCTTTATTGGTTTTGACCAATTGTATGTTCCAAATATAGTTTCATTAATATCTTTTATGACACATGCTCTTTTGAAGCCTTGTCACACTCCATAAAGaaatgtgattcttttttttttttttttttgaatctgagTGATTGTACGACTTGCTTTTAATTAATAGAATGTAGTAGAATTACACTGCTTAACTTCCAACTCTAGTTAGAAAAGGTGATTCCAATGTATAACTATGAGATGATATGAAAAAGCTACCCACATATCTTTTGGTTGAGAGCCAGCATCAACCACCAGACATGTGAGTCGAGTCTGGTCCTCAGATATCAAGTGACTTTAGCCTTTGAAT 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papAnu2.chr16 63034284 447 + 74645514 CAAAGTTTGATAGCTATTCATGATTCATGTTTTCAGAAATTAGGAATAGAATGAATTTTCCCTAGTCACTGAAGGGTTTTGATGAAAAAACAAGCTAACATAATactaacattatatttaatagtaAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTGAGACTAGGAACAAGATAATAGTATCTactcttttcatttctattcaacattgtgctACAGATCCTTTTCaattcaataacaaaataataataagtaa--aaggCATACATATTGGGATGAAAAAAGTTAGACATCCTTTTTTGAAAGATGACATGATCATCTATCTAAAAATTC----CAATctacaaaataagataaaacgCACTAGGTAAGTTTATAAAATGTATgcaaatataaattg-ttttttatatgCCACCAATGAagcattagaaattaaaattttaaaaataccattacaattgca i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25132589 450 - 75148670 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gaattccatgcatac---tgttgcccgtaacagtaaatcaacctttctgttgcttagtaatattccatttttcaagtacaccacaattttttttttattcattcacatcccgatgtacatttgagttttctccattttgggactgttatgaattcatatgttataagcattctgatacaagtcttcttgtgcacatctgttttcatttctcttgggaaccatacctaggagtggactcattggatcacttaataagggtgtaggtaactataa----gaactactgTGAATAAGAGTTCCACTTGCTCCTTGCCTT-----TTGCTAATAATGGCAAAACTTTAAAATGTGTGTTCTTAGGGATTAAAATGGCAAGCATTTCCAAGC-AAAAACACATACCCTAACTTGGGT-TCACTTCTTGAATTATT--------CATATTGTTCT------------------------------------------------------------------A--------------------------------------ACTTTTAATTATGCTTGCATTTCTACATTTCCTAT--CTTGTTTTCAGATAAAAATATTTTCCTTGGACTTCCATTTAACAAAC-ATATGCC-TTTAGAGATGGCTG----AAATGTACTGTTTTTTTTTCCAATTCAGGTAATGTTACCATAGATTAGGGTCAGCATAC--ATTCTCTGA------ i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112347590 1058 + 122082543 I a score=70781.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 52006 25 + 235827 gccagatagtttaggctttgctggc s panTro4.chr17 70444054 25 + 82630442 gccagatagtttaggctttgctggc i panTro4.chr17 C 0 C 0 s 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tgccagattcagccaatgggctgtagtctaccATTGAAATAGAATACTT-TTTTGT-ATAATGTAACAATGCTCAGAGTTTTACA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63042342 83 + 74645514 TGCCAGATTCAGCCAATGGGCTGGAGTCTACCATTGAAATAGAATACTT-TTTTGT-ATAATGTAACAATGCTCAGAGTTTTACa i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25140739 83 - 75148670 tgccagattcagccaatgggctgtagtctaccATTGAAATAGAATACTT-TTTTGT-ATAATGTAACGATGCTCAGAGTTTTACA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120030654 84 + 159171411 ggccagattcagccaatgggctgtagtctacTATTGAACTAGAATATGA-TTTTTTAATAATGTAACAATGCTCAGAGTTTTACA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43521624 21 - 61074082 ----------------------------------------------------------------TGCCATGCTCAGAGTTTTCTA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112347590 1058 + 122082543 I e ponAbe2.chr17 61491424 2860 + 73212453 I a score=141821.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 52227 48 + 235827 TATTGTTTCTTTAAAAATACTG----AACATGAATCAATCTGACATCATAAT---- s panTro4.chr17 70444274 48 + 82630442 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rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68777973 77 + 80997621 gatccacccgccttggccttccaaagtactgggattacaggtgtgaaccaccatgcccagcagcaaatactttttat i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63043007 77 + 74645514 gatccacccgccttggccttccaaagtactgggattacaggtgtgaaccaccatgcccagcagcaaatactttttat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25141611 77 - 75148670 gatccacccgccttggccttccaaagtactgggattacagttgtgaaccaccatgcccagcagcaaatactttttat i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120031213 68 + 159171411 gatccacctgccttggcctcccaaag---------tacaggtgtgaaccaccatgcctggcAGCAAATACTTTTTAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43521906 10 - 61074082 GATTTACCTG------------------------------------------------------------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112347590 1058 + 122082543 I a score=1846970.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 52787 551 + 235827 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ttgtccatacaaccctgatctcagacatctagcctccagaacagtaagaaataaatttctgttg--tgtataagccatccagtctctggtattttattatagcagccaaattgactaatacaGTAACTCATAC-TTCTTCTGCATAAAGTTGATACTTAGTTGATGCTTTTGTAG-----AGAtgtagtggtcacgcggacgcaatgaccagatattacttcaaggaagactctgctataaagtgagtt---tgtggacagtctctatctgccgcatctttgggatctactgcaacattcacattgaggccattctttccctgagctactcttggtcaattaggagg-atagaac---------------attatttctgcctaatgtgcaacacttgtaatggataatctttgtgttgggactacccatcaatctggctggcccagcctttctcagagctatgttgtagcctgaggctcttcctactcaga----------------tctccttccacaagcat i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68781144 482 + 80997621 ttgtccatacaaccctgatctcagacatctagcctccagaacagtaagaaataaatttctgttg--tgtataagccatccagtctctggtattttattatagcagccaaattgactaatacaGTAACTCATAC-TTCTTCTGCATAAAGTTGATACTTAGTTGATGCTTTTGTAG-----AGAtgtagtggtcacgcggacgcaatgaccagatattacttcaaggaagactctgctataaagtgagtt---tgtggacagtctctatctgccgcatctttgggatctactgcaacattcacatcgaggccattctttccctgagctactcttggtcaattaggagg-atagaac---------------attatttctgcctaatgtgcaacacttgtaatggataatctttgtgttgggactacccatcaatctggctggcccagcctttctcagagctatgttgtagactgaggctcttcctactcaga----------------tctccttccacaagcat i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63046184 482 + 74645514 TTGTCCATATAACCCTGATCTCAgacatctagcctccagaacagtaagaaataaatttctgttg--tgtataagccatccagtctctggtattttattatagcagccaaattgactaatacagtaaCTCATAC-TTCTTCTGCATAAAGTTGATACTTAGTTGATGCTTTTGTAG-----AGATGTAGTGGTCATGCGGATGCAATGATCAGATATTACTTTAAGGAAGACTCTGCTATAAAGTGAGTT---TGTGGACAGTCTCTATCTGCCGCATCTTTGGGATCTACTGCAACATTCACATCGAGGCCATTCTTTCCCTGAGCTACTCTTGGTCAATTAGGAGG-ACAGAAC---------------ATTATTTCTGCCTAACGTGCAACACTTGTAATGGATAATCTTTGTGTTGGGACTACCCATCAATCTGGCTGGCCCAGCCTTTCTCAGAGCTATGTTGTAGCCTGAGGCTCTTCCTACTCAGA----------------TCTCCTTCCACAAGCAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25144793 498 - 75148670 ttgtccatacaaccctaatctcagacatctagcctccagaacagtaagaaataaatttctgttg--tgtataagccatctagtctctggtattttattatagcagccaaattgactaatacaGTAACTCATAC-TTCTTCTGCATAAAGTTGATACTTAGTTGATGCTTTTGTAG-----AGAtgtagtggtcatgcggacgcaatgaccagatattacttcaaggaagactctgctataaagagagtt---tgtggacagtctctatctgccgcatctttgggatctactgcaacattcacatcgaggccattctttccctgagctactcttggtcaattaggagg-atagaac---------------attatttctgcctaatgtgcaacacttgtaatggataatctttgtgttgggactacccatcaatctggctggcccagcctttctcagagctatgttgtagcctgaggctcttcctactcaaatctccttccttctctctctccttccacaagcat i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43524540 488 - 61074082 ctggtc------ctctgatcttggacttccagcctccagaactatgagaaaaaaatttctattgcttctgtaagccatccagtccatggt---------------ccaaactgactaagacaGTAACTAATACTTTCTTTTACATAAAGTTGGTACTCGAT--ACTTTCTCACAGAGCAGAGAtatggtgaccatgggcaagtactgaccagatattccttcaagacagactctgctacaaggagtgttgtaggctgacagcctccatgtgcttcatctctctgacttgtcacaatgttccca----------actccccatgggcttttttcaaccaatgactgaacacagcacagataatgaagcaagaccactactgcctgacatgcaactcttctaatgggcaatctcagtgttaaaactgcctaccagc----ctgaccaagcttttctcagagctgtgtcgcatcaagagtctcatcttactcaaagttccttccttccctctgtcctttcacaaacat i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112349412 1468 + 122082543 I e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=2344536.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 56102 930 + 235827 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panTro4.chr17 70448157 919 + 82630442 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panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61498101 934 + 73212453 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ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41664469 938 - 94967081 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nomLeu3.chr14 I 311 C 0 s rheMac3.chr16 69034789 923 + 80904711 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rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68781626 924 + 80997621 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papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25145291 929 - 75148670 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chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43525028 937 - 61074082 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canFam3.chr9 C 0 I 393 e mm10.chr11 112349412 1468 + 122082543 I e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=745570.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 57032 336 + 235827 AGACAAAATATGCAAGTaaaaaaaaaa---aa--aaaaaaaagcaagtgaataaaaactaagcaagtag---------------acaggtgactaaatgaagagaattt------attattttcaaagagataagaagtgtatttatgcaaagaagaagtgaatgctagaggaaaggtatctttgttgaattaaaaaaatgctttttgaaattaaaaatacaagagcagaaatttttgaaaaattcaatataaagtgtgaagg----ataaagttgaggagatcagaaac-----------agaaaacaaataaaatagtaggaatcatagaaaggaaataatcacatgaaaatttcaaaacaacatcccccc-ccaa s panTro4.chr17 70449076 322 + 82630442 agacaaaatatgcaagcaaaaaaaaaa---aa------------aggtgaataaaaactaagcaagtag---------------acaggtgact-----aagggaattt------attattttcaaagagataagaagtgtatttatgcaaagaaaaagtgaatgctagaggaaaggtatctttgttgaattaaaaaaatactttttgaaattaaaaatacaagagcagaaattttagaaaaattcaatataaagtgtgaaag----ataaagttgaggagatcagaaac-----------agaaaacaaataaaatagtaggaatcatagaagggaaataatcacatgaaaatttcaaaacaacatccccccaccaa i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61499035 337 + 73212453 AGACAAAATATGCAAGCAAaaaaaaaa---aaaaaaaaaaaagcaggtgaataaaaactaagcaagtag---------------acaggtgactaaattaagagaattt------attattttcaaagagataagaagtgtatttatgcaaagaaaaagtgaatgctagaggaaaggtatctttgttgaattaaaaaaatgctttttgaaattaaaaatacaagagcagaaatttttgaaaaattcaatataaaatgtgaaag----ataaagttgaggagatcagaaac-----------agaaaacaaataaaatagtaggaatcatagaaaggaaataatcacacgaaaatttcaaaacaacatcccaa--aaag i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41665407 321 - 94967081 agacaaaatgtgcaagcaaaaaaaaaa---aa--------aagcaggtgactaaaaactaagcaagtag---------------ataggtgactaaattaagagaattt------attattttcaaagagataagaagtgtatttatgcaaagaa-aagtgaatgctagaggaaaggtatctttgttgaattaaaaaaatgctttctgaaattaaaaatacaagagcagaaatttttgaaaaattcaatataaagtgtgaaag----ataaagttgaggagatcagaaac-----------agaaaac----aaaaTAGTAGGAATCATAGAAAGGAAATAATCACATGAAAATTTCAAAACAACATTCCAAA----- i nomLeu3.chr14 C 0 I 683 s rheMac3.chr16 69035712 313 + 80904711 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aagtaaaatattaaaataaaaaataaatataa------------aaataggtacaaaataagcaagcaggagacatttggtggtataagtatttggagtaataaaaaatagcaaaaatattttcaaagaggtaa----tatatctaaaaaaaaag-aacagaattctagaagaaaagtatcttcagagtaca--taaaagggttttggaaataaaaaa------agaatgaattttttaaaacttcagtataaagtctgggag----atgaagtcggtgaaataaaaaaagagaaagagagagacaacagataaaatggtaacaatagtagaaagggaataatcagataaacattccaagacaacatcctcaa----- i canFam3.chr9 I 393 C 0 e mm10.chr11 112349412 1468 + 122082543 I e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=1548518.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 57368 617 + 235827 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aaaaaagataggttttacagttttaaaatatccagagagtccacaggacaatggatgaaagtggatctattccgagacacaacattgtaaaatctctactcttgcaact-----aagatcccataattttgtag-----aaaaatggattttatataata--------------------------------------------aggttctgaaatctatgattatattttctttcaatagtacctgtagataccaaaatactgtagagaaatatcttcaacattgttaaaaaaaagtatttccaaagtaaaaattatacatcctgctaaattcccaactcattgtgaaagcagagtcaagacatctttagatgtataaggtgtcaaaactttactcccccatacctactatcacagcatccatgcagaaaaaataagacatgaattctgggaaataggaaaccagcttggaa-agatgaaggaaatcaagatgatggttaagagaaatcccagggcagcagctgtgcagc-------------------------------------------------------------------------------------------------taatatagac-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaatccaccttgactagagtatgttagaaagtttcagaagaccaggtcagaaggcaacgatgatagattatcgaacatctataatcttactgagaaac--agacagagctgaagcaaagattcagcttaaatt i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61499372 661 + 73212453 aaaaaagataggttttatagttttaaaatatccagagtgtccacaggacaacagatgaaagtggatctgttccaagacacaacattgtaaaatgtcTACTCTTGCAACT-----GAGATCCCATAATTTTGTAG-----AAAAGTGGATTT--TATAATAAGGTTCTGAAATCTATGATTATATTTCCTTTCAATAGTACCTGTAGGTTCTGAAATCTATGATTATATTTTCtttcaatagtacctgtaggtaccaaaatactgtagagaaatatcttcaacattgttagaaaaaagtatttccaaagtaaaaattatacatcctgctaaattcccaattcattgtgaaggcagagtcaagacatctttagatgtataaggtgtcaaaactttactcccccatacctactatcacagcatccatgcagaaaaaataagacatgaattctgggaaataggaaaccagcttggaa-agatgaaggaaatcaagatgatggttaagagaaatcccagggcagcagctgtgcagc-------------------------------------------------------------------------------------------------taatatagag-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaatccaccctgactagagtatgttagaaagtttcagaagaccaggtcagagggcaacgttgatagattatcaaatgtctataatcttactgagaAAC--AGACAGAGCTGAAGCAAAGATTCGGCTTGATTT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41666411 617 - 94967081 aaaaaaGATAGGTTTTATAGTTTTAAAATATCCAGAGAGTCTACAGGACAACGGATGAAAGTGGATCTATTCCAAGACACAACATTGTAAAATGTCTACTCTTGCAACTAACAAAAGATCCCATAATTCTGTAG-----AAAAATGGATTT--TATAATA--------------------------------------------AGGTTCTGAAATCTATGATTATATTTTCTTTCAATAGTACCTGtagataccaaaatactgtagagaaatatcttccacattgtt-----aaagtatttccaaagtaaaaattatacatccttctaaattcccaattcattgtgaaagcagagtcaagacatctttagatgtataatgtgtcaaaactttacttccccatacctactatcacagcatccatgcagaaaaaataagacatgaattctgggaaataggaaaccagcttggaa-agatgaaggaaatcaagatgatggttaagagaaatcccagggcagcagctgtgcagc-------------------------------------------------------------------------------------------------taatatagag-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaattcacctggcctagagtatgttagaaggtttcagaagaccaggtcagaaggcaacattgataaattatcaaacatctataatcttactgagaaac--agacagagctgaagaaaagattcagcataattt i nomLeu3.chr14 I 683 C 0 s rheMac3.chr16 69036025 622 + 80904711 aaaggagataggttttatagttttaaaatatccagagagtccacaggacagcagatgaaagtggatctattctgagacacaacattgcaaaatgtccactcttgcaactaacaaaagattccatcattttgtag--aaaaaaaatggattt--tatagaa--------------------------------------------aggttctgaaatctatgatgataattt-tttcaatagtacttgtagatagcaaaagactgtagagaaatgtcttcaacattgttagaaaaaagtattcccaatgtaaaaattatacatcctgctaaattccccattcattgtgaaagcatagtcaagacatctttagatgtacaaggtgtcaaaactttactcccccatacatactatcacagcattcatgcagaaaaaataagacatgggttctgagaaataggaaaccaacttggaa-agacgaaggaaatcaagatgatggttaggagaaatcccagggcagcagttgtgcaac-------------------------------------------------------------------------------------------------taacgtagag-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaatcaaccttgactagagtatgttagaatgtttcagaagaccaggtcagaaggcaacattgatagattatcaaatgtctataatcatagtgagaaac----atagagctgaagcaaagattcagcttgaatt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68782863 623 + 80997621 aaaggagataggttttatagttttaaaatatccagagagtccacaggacagcagatgaaagtggatctattctgagacacaacattgcaaaatgtctactcttgcaactaacaaaagattccatcattttgtag-aaaaaaaaatggattt--tatagaa--------------------------------------------aggttctgaaatctatgatgataattt-tttcaatagtacttgtagatagcaaaagactgtagagaaatgtcttcaacattgttagaaaaaagtattcccaatgtaaaaattatacatcctgctaaattccccattcattgtgaaagcatagtcaagacatctttagatgtacaaggtgtcaaaactttactcccccatacATACTATCACAGCATTCATGCagaaaaaataagacatgggttctgagaaataggaaaccaacttggaa-agatgaaggaaatcaagatgatggttaggagaaatcccagggcagcagttgtgcaac-------------------------------------------------------------------------------------------------taacgtagag-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaatcaaccttgactagagtatgttagaatgtttcagaagaccaggtcagaaggcaacattgatagattatcaaatgtctataatcatagtgagaaac----atagagctgaagcaaagattcagcttgaatt i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63047907 622 + 74645514 aaaggagataggttttatagttttaaaatatccagAGAGTCCACAGGACAGCAGATGAAAGTGGATCTATTCTGAGACACAACATTGCAAAATGTCTACTCTTGCAACTAACAAAAGATTCCAtcattttgtag--aaaaaaaatggattt--tataGAA--------------------------------------------AGGTTCTGAAATCTATGATGAAAATTT-TTTCAATAGTACTTGTAGATAGCAAAAGACTGTAGAGAAATGTCTTCAACATTGTTAGAAAAAAGTACTCCTAATGTAAAAATTATACATCCTGCTAAATTCCCAATTCATTGTGAAAGCATAGTCAAGACATCTTTAGATGTACAAGGTGTCAAAACTTTACTCCCCCATACATACTATCACAGCATTCATGCagaaaaaataagacatgggTTCTGAGAAATAGGAAACCAACTTGGAA-AGACGAAGGAAATCAAGATGATGGTTAGGAGAAATCCCAGGGCAGCAGTTGTGCAAC-------------------------------------------------------------------------------------------------TAACGTAGAG-----------------------------------------------------------------------------------------------AGCAATCAACCTTGACTAGAGTATGTTAGAATGTTTCAGAAGACCAGGTCAGAAGGCAACATTGATAGATTATCAAATGTCTGTAATCATAGTGAGAAAC----ATAGAGCTGAAGCAAAGATTCAGCTTGAATT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25146531 622 - 75148670 aaaggagataggttttatagttttaaaatatccagagagtccacaggacagcagatgaaagtggatctattctgagacacaacattgcaaaatgtctactcttgcaactaacaaaagattccaacattttgtag--aaaaaaaatggattt--tatagaa--------------------------------------------aggttctgaaatctatgatgataattt-tttcagtagtacttgtagataccaaaagactgtagagaaatgtcttcaacattgttagaaaaaagtattcccaatgtaaaaattatacatcctgctaaattcccaattcattgtgaaagcatggtcaagacatctttagatgtacaaggtgtcaaaactttactcccccatacATACTATCACAGCATTCATGCagaaaaaataagacatgggttctgagaaataggaaaccaacttggaa-agacgaaggaaatcaagatgatggttaagagaaatcccagggcagcagctgtgcaac-------------------------------------------------------------------------------------------------taacatagag-----------------------------------------------------------------------------------------------agcaatcaatcttgactagagtatgttagaatgtttcagaagaccaggtcagaaggcaacattgatagattatcaaatgtctataatcatagtgagaaac----atagagctgaagcaaagattcagcttgaatt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43526702 748 - 61074082 ataggagatccatctccagacttagaaggattcaga--gtccacagaatagtgactgaaa-tggacccatacctaaatataccattgtgaaatgtcaactcttatgaccagcaaaaaatcctataattttgtagtaagaaaaagtgagttt--tatataa--------------------------------------------atgtcatgaagtctgtgataatagatt-ttccaacactacctctaaatg-caggagactatgaaaaaatgtcttcacaattttttgaaaaaattatctcgacaataaaatttatacatcgtactaaattttaaatttagtgttaaaggagagtcaagacatctt---------------------------------------------------------------------GATTtgagttctagagaatagaaaacaaacttggaagaggtgagggaaaccaagatgatgtttaagaaaatttttaatatagcagctgtgcaccagtatagttagcaatcTTTttttcttaaattattttggaggagagaggggcagagaaagagagagagagaatgagaatctgaagcaggctccatgtgtagtgtagaacctgacactagttcagtctcacaaccctgagatcatgacctgagccaaaaccaaaagtcagatgcttgactgactgaacaatcaggcaccGCAATagcaatcaatcttgattagagtatgtcagaatgttttggaagatcatgtcagaagatgaaattaacagattatcaaatgtctataatcatattgagaatcttatacagacctgagacaaaaattgggcttgaatt i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112349412 1468 + 122082543 I e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=420538.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 57985 148 + 235827 aataatcagtacaaagaaatcaaaaaaggaataaggcaattatcatcaacaaaaacttttaaaggaaaaatgattataatatactatatgactcagctgtgactaaggttttcatagttataatatcatacagaaatgaatgttgatg s panTro4.chr17 70450017 148 + 82630442 aataatcagtacaaagaaatcgaaaaaggaataaggcaattatcatcaacaaaaacttttaaaggaaaaatgattatagtatactatatgactcagctgtgactaaggttttcatacttatgataccatatagaaatgaatgttgatg i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61500033 148 + 73212453 AATAATCAGAACAAAGAaagcaaaaaaggaataaggcaattatcatcaacaaaaacttttaaaggaaaaatgattatagtacactatatgatttagctgtgactaaggttttcatagttataataccatatagaaatgaatattaatg i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41667028 148 - 94967081 aataatcagtacaaagaaagcaaaaaaggaataaggcaattatcatcaacaaaaagttttaaaggaaaaatgattatagtataatatatgactcagctgtgactaaggttttcatagttgtaataccatatagaaatgaatattgatg i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69036647 145 + 80904711 aataatcagtacaaagaaagcaaaaaaggaataaagcaattat---caacaaaaaattttaaaggaaaaatgattatagtatactacatgactcagccatgactaaggttttcataattataatactatatagaaaagaatattgatc i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68783486 145 + 80997621 aataatcagtacaaagaaggcaaaaaaggaataaagcaattat---caacaaaaaattttaaaggaaaaatgattatagtatactatatgactcagccgtgactaaggttttcataattataatactatatagaaaagaatattgatc i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63048529 148 + 74645514 AATAATCAGTAcaaagaaggcaaaaaaggaataaagcaattatcaacaacaaaaaattttaaaggaaaaatgattatAGTATACTATATGACTCAGCCGTGACTAAGGTTTTCATAATTATAATACTATATAGAAAGGAATATTGATC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25147153 144 - 75148670 aataatcagtacaaagaaggcaaaa----aataaagcaattatcaacaacaaaaaattttaaaggaaaaatgattatagtatactatatgactcagccgtgactaaggttttcataattataatactatatagaaaagaatattgatc i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s mm10.chr11 112350880 139 + 122082543 AATAATTAGCAAAAATACTATTAAAAACAAA-----CAATGGT---AAACAAAAAG-CATAAAGGAGAAGTAACCACAGTGTACTATATAGATCTGATGTGACCAACATTTTCATGGCTACAATACTCTATAAAAGTGAATAGTGATC i mm10.chr11 I 1468 C 0 s canFam3.chr9 43527450 137 - 61074082 ----atcaaaacaaaggaaaaaaataaagaaaatggctgtcacca-----aaaaaattataaaggaaaaatgaacatagtatactatatgactcagctgtgactaatattttca--gttatgatgggatatagaaatgaatattgggg i canFam3.chr9 C 0 I 190 e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=437389.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 58133 171 + 235827 taataacaattaccaaattactcccttctaaagaagagttgataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagccaactctccatcttcta-taatagtagtttaagaaataatt-tttaaagcaaagttttttt-aaatagtgatattatcaaacattaattagagat s panTro4.chr17 70450165 171 + 82630442 taataacaattaccaaattactcccttctaaagaagagttgataagattc----ctgtagaaaa---ggagtaaggaaaaga-tagccaactctccatcttcta-taatagtagtttaagaaataatt-tttaaagcaaaaatttttt-aaatagtgatattatcaaacatcaattagagat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61500181 171 + 73212453 taataacgattaccaaattactcccttctaaagaagagttgataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagccagctctccatcttcta-tagtagtagattaagaaataatt-tttaaaGCAAAAATTTTTT-AAATAGTGATATTATCAAACATTAATTAGAGAT i ponAbe2.chr17 C 0 I 2313 s nomLeu3.chr14 41667176 171 - 94967081 taataacaattaccaaattactcccttctaaagaagagtagataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagccaactctccatcttcta-tagtagtagtttaagaaataatt-tttaaagcaaaaatttttt-aaatagtgatattatcaaacattaattagagat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69036792 171 + 80904711 taataacaattatcaaattactcccttctaaagaagaggtgataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagacaaatctccaccttcta-cagtattagtttaagaaataa-t-tttaaagcaaaaactttttaaaatagtgatattatcaaacatgaattagagat i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68783631 171 + 80997621 taataacaattatcaaattactcccttctaaagaagaggtgataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagacaaatctccaccttcta-cagtattagtttaagaaataa-t-tttaaagcaaaaactttttaaaatagtgatattatcaaacatgaattagagat i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63048677 171 + 74645514 TAATAACAATTATCAAATTACTCCCTTCTAAAGAAGAGGTGATAAGATTC----CTATAGacaa---ggagtaaggaaaaga-taGACAAATCTCCACCTTCTA-CAGTATtagtttaagaaataa-t-tttaaagcaaaaactttttaaaatagtgatattATCAAACATGAATTAGAGAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25147297 172 - 75148670 taataacaattatcaaattactcccttctaaagaagaggtgataagattc----ctgtagacaa---ggagtaaggaaaaga-tagacaaatctccaccttcta-cagtattagtttaagaaataatt-tttaaagcaaaaactttttaaaatagtgatattatcaaacatgaattagagat i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s mm10.chr11 112351019 130 + 122082543 TATTAACAATTATCACATAATTCTCCTGGAAAGAAG---TGGTAGGATTCACTTCTTaaaacaaaacaaaacaaaacaaaGA--------------ATATTATC-TAACAATAAGTTGatatatatgt---------------------atatataaatat------atatgtat------- i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43527777 168 - 61074082 tagtaataaataccaaatca-tctcctggaacaaagagaagataggattc----tt-tagtcta---aggataaggaaaagaataatcaaattaccatattccatttataagagttcaagaaataattcttcaaaatgaaaaag-----gaatagtgatattttcaaacattaactggaaat i canFam3.chr9 I 190 C 0 e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I a score=377558.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 58304 228 + 235827 atgtacataaatgttgaaagaatctgctgaaaaa--gtt---------aggaaggattgccttg--gggagCAG--------------AACAGCTGTCTTCTGCAACAAGACAAAA-------------------------------------------------------------------------------------GTACAGGCAGA-------------------------------------------------------------------------AAATCAACACC--------------------------------------CGCCCCC--AACACACA-CAATATTATTTTCTTAATAATAATATCATCATCCCTATAATTTAATTGTCCAATCAAGTTTGCCAAAGAAACCCAGCTCTAGGACAATCTTGCT-------------------------------------------ATACTATC s panTro4.chr17 70450336 230 + 82630442 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ATGTAGATACATATTGAAACAATCTGCTGAAAAA--GTT---------GAGAAGAATTACCTTG--GGGAGCAG--------------AACAGCTATCGTCTGCGACAAGACAAAA-------------------------------------------------------------------------------------GTACAAGCAGA-------------------------------------------------------------------------AAATCAACACC--------------------------------------CCCTCCT--------CC-CAATACTATTTTCTCAATAATAATATCATCATCTCTATAATTTAATTGGCCAATCAAGTTTTCCAAAGAAACCCAGCTCTGGGACAATCTTGCT-------------------------------------------ACACTATC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25147469 200 - 75148670 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ponAbe2.chr17 I 2313 C 0 s nomLeu3.chr14 41667932 291 - 94967081 tCTcaacagcat-aacaaaaaagacctcatgaaaaccccatccaaaggtcagcagcctcaaagatcaaagctagataaacctcatgaagattagaaa-aatcaatgaaaaaacactgaaaactcaaaaagccagattgcttcttctcctccaaataatcacaacacttctccaacaagggcatagaattgggcagaggctgagatggatgaattgacaaaagtgggctttgaaggtgggtaataacaaactttgctgagctaaaggagcatgttctaacctaatgcaaagaag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 e mm10.chr11 112351594 186 + 122082543 I e canFam3.chr9 43528816 105 - 61074082 I e calJac3.chr5 120034279 319 + 159171411 I e chlSab2.chr16 25147926 318 - 75148670 I e papAnu2.chr16 63049327 306 + 74645514 I e macFas5.chr16 68784281 3134 + 80997621 I e rheMac3.chr16 69037442 4370 + 80904711 I a score=1966.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 59274 5 + 235827 -ctaag s panTro4.chr17 70451152 5 + 82630442 -ctaag i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61502954 5 + 73212453 -ctaag i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41668223 5 - 94967081 -ctaag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s canFam3.chr9 17545375 5 + 61074082 CTTAA- 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i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41670858 1353 - 94967081 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i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68787415 1338 + 80997621 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i macFas5.chr16 I 3134 C 0 s papAnu2.chr16 63052120 1362 + 74645514 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i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25150722 1358 - 75148670 aataaaatactggcaaactaaatccagcagcacatgaaaaatcttatccaccatgatcaagttggcttcaaccccaggatacaaggctggttcaaaatccacaaatcaataaatataattcatcatataaacagaactaaaaacgaaaatcacatgattatctcaatagacaaagaaaagacctttgataaaattcaaca-cctttcatgttaaaaactcaataaactggatattaatggaacataccttaaaataataaaagccacttatgacaaacctgtagccagtatcagactgaatgggcaaaggctggaagcattccccttg-aaaatcggcacaaaacaagaatgccctctctcaccacttcacttcaacatagtattggaagttctggccagggcaattggacaagagaaagaaataaagggtatttgactaggaagggaggaagtcaagctgtctgtttgcagatggcatgatcctatatctagaaaaccccatcgtctcagcccaaaagcttcttaagctgatatgcaacttcagcaaagtctcaggatacaaaatcactgtgcaaaaatcacaagcattcctatacaacaacaacagacaagcagagagccaaatcatgaatgaactctcattcataattgctacaaatagaataaaatacctaggaatacagctaacaagggaagtgaggaacctctttaagaagaactacaaaccactgctcaaggaaactagagaaaat----acaaatagaaaaatattccatgctcatggataggaggaatcaatattgtgaaaatggccatactgtccaaagtaatttatagattaaatggtattcccattaaacgaccattgacattcttcatataattagaaaaaactactttaaaattcatatggaaccaaaaaagagcccttatatcc-aagacaatcataagcaaaaagaacaaagctggatgcatcaggctagttgactccaaactatattgcaagtctacagtaaactaaacagcatggtactggtacaaaaacaaacacatagaccaatggaacagaatagagatctcagaaataagaccacacatctataaccatctgacctttgataaacctgacaaacacaagtaatggggaaaggattctctatttaataaatgatgctgggagaactggcttgccatacacagaaaactgaaactggaccccttccttacaccttacacaaaaattaactcaagacagattaaagacttaaatgtgaaatacaaaacaaccaaaaccctagaataaaatccaagcaataccattcaagacataagcatgggcaaagacttcatgaataaaacacc 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chlSab2.chr16 25152080 441 - 75148670 aaaagcaattccaacaaaagcaaaaat---------tgacaaatgggatctaattaaactaaagaacttctgcacagcaaaataaactatcatcagaataaacagacaacttacaggatgggagaaaatttttgcaatctaaccatctgacaaaggtctaatatccagaatctataaggaatttaaacagatttacaagaaaagaaaaagaaa-caaccccattaaaaagtgagcaaaggacatgaacagatacttctcaaaagaagacatttatgcagccaacaaacacatg-aaaaaaactcaacatcactgattattagagaaatgcaaatcaaaaccacaatgagataccatttcacaccaatcagaaaggagattattaaaaagtcaagaaacaacagatgctggtgaggatgtggagaaatagaaatgcttttacactgttggtgg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120034598 438 + 159171411 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rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68790709 5 + 80997621 TGctt i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63055455 5 + 74645514 tgctt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154046 5 - 75148670 TGctt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43529791 5 - 61074082 TGCTC i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112352309 219 + 122082543 I e calJac3.chr5 120036557 0 + 159171411 C a score=354785.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 65234 157 + 235827 actgttcaattcccacctatgagtgagaacacacgttgtttggttttctgtccttgcgatagtttgcAatggcacatgtatacatatgtaacaaagctacacgttgcgcacatgtaccctagaacttaaagtataatt-aaaaaaa-------gaaaGAAAACTG s panTro4.chr17 70457114 158 + 82630442 actgttcaattcccacctatgagtgagaacacacgttgtttggttttctgtccttgcgatagtttgcAatggcacatgtatacatatgtaacaaagctacacgttgtgcacatgtaccctagaacttaaagtataatttaaaaaaa-------gaaaGAAAACTA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61508909 158 + 73212453 gctgttccattcccacctatgagtgagaacacacgttgtttggttttctgtccttgcgatagtttgcAatggcacatgtatacatatgtaacaaagctacacgttgtgcacatgtaccctagaacttaaagtataattaaaaaaaa-------gaaaGAAAACTA i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41674168 165 - 94967081 actgttcaattcccacctgtgagtgagaacatgcggtgtttggttttctgtccttgcgatagtttgcAatggcacctgtatgcatacgtaacaaagctacacgttgtgcacatgtaccctagaacttaaagtataataaaaaaaaaaaGAAAGGAAAGAAAACTA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69043337 165 + 80904711 attgttcaattcccacctatgagtgagaacatgcagtgtttggtgttctgtcctcatgatagtctgcAatggcacaagtatacatatgtaacaaagctacacattgtgcatatgtaccctagaacttaaagtataattaaaaaaaaaaagaaaGAAAGAAAACTA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68790714 165 + 80997621 attgttcaattcccacctatgagtgagaacatgcagtgtttggtgttctgtcctcgtgatagtctgcAatggcacaagtatacatatgtaacaaagctacacattgtgcatatgtaccctagaacttaaagtataatttaaaaaaaaaagaaaGAAAGAAAACTA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63055460 158 + 74645514 attgttcaattcccacctatgagtgagaacatgca--gtttggttttctgtccttgtgatagtctgcaatggcacatgtatacatatgtaacaaagctacacattgtgcatatgtaccctagaacttaaagtataatttaaaaaa-----aaagaaagaaaacta i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154051 160 - 75148670 attgttcaattcccacctatgagtgagaacatacagtgtttggtgttctgtccttgtgatagtctgcaatggcacaagtatacatatgtaacaaagctacacattgtgcatatgtaccctagaacttaaagtatcatttaaaaaa-----aaagaaagaaaacta i chlSab2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112352309 219 + 122082543 I e canFam3.chr9 43529796 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120036557 0 + 159171411 C a score=13786.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 65391 6 + 235827 TGCTGT s panTro4.chr17 70457272 6 + 82630442 TGCTGT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61509067 5 + 73212453 TGC-GT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41674333 6 - 94967081 TGCTGT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69043502 6 + 80904711 TGTTGT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68790879 6 + 80997621 TGTTGT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63055618 6 + 74645514 tgttGT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154211 6 - 75148670 tgttgt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120036557 6 + 159171411 TGCTGT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112352309 219 + 122082543 I e canFam3.chr9 43529796 0 - 61074082 C a score=326114.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 65397 90 + 235827 CCCCATTCACCATCCCACCCTATTACCACAGACACATCTAGAGGGAAAATAAGAAATAACCAGACAACATTTCTGAGCTAACATTATGTT s panTro4.chr17 70457278 90 + 82630442 CCCCATTCACCATCCCACCCTATTGCCACAGACACATCTAGAGGGAAAATAAGAAATAACCAGACAACATTTCTGAGCTAACATTATGTT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61509072 90 + 73212453 CCCCATTCACCATCCCACCCTATTACCACAGACACACCTAGAGGGAAAATAAGAAATAAGCAGACAACATTTCTGAGCTAACATTATGTT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41674339 90 - 94967081 CCCCATTCACCATCCCACCCTATTACCACAGACACATCTAGAGGGAAAATAGGAAATAACCAGACAACATTTCTGAGCTAACATTATGTT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69043508 90 + 80904711 CCCCATTCACCATCCCACCCTATTACCACAGACACATCTAGAGGAAAAATAAGAAATAATCAGACAACATTTCTGAGCTAACATTATGTT 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TATACTTATTACAAATCAGAATTGGGAAACTTTGGAACTTTCCataaattaaaaaaa---aaataaaaGAGAATAAGAAAAATGCATCAATGTCGATCTAAATTTCTAAGATGCAGGGCTCCTAAGGGGGTCAAAGTGCCAGGACCCTCTCCCATTCTATGAAGGAATCAAGCCCTTCTACGTGGCGCTGGGAAACTGTTCCTTCTCCAATAGAATAGAACTGTGCTCCATGGAAGATATGATATCAGCCTTTTGTTATGACATCAGCCTCTGGTTTCTGAA---GAAGATGAGTGGAATATGCAGCCTAGTAATTATTTTGCTGTGAATTTTCAGTGAAGATGCTCTTATCCTAAGTATTCCACTGATTAATACAGTGAGGTTTGGG-GTTGAAAATAATAATGAAGAAAAAGCTCAGTTTATTCTCATTTGGCAAATTTACC i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41674429 440 - 94967081 TACACTTATTACAAATCAGAATTGGGAAACTTTAGAACTTTCCATaaattaaaaaaa---aaataaaagagaataagaaaaaCGCATCAATGTCGATCTAAATTTCTAAGATGCAGGGCTCCTAAGGGGGTCAAAGTGCCAGGACCCTCTCCCGTTCTATAAAGGAATCAAGCCCTTCTACGTGGCACTGGGAAACTGTTCCTTCTCCAGTAGAATAGAACCGTGCTCCATGGAAGATATGACATCAGCCTTTTGTTATGACATCAGCCTCTGGTTTCTGAAGAAGATGATGAGTGGAATATGCAGCCTAGTAATTATTTTGCTGTGAATTTTCAGTGAAGATGCTCTTATCCTAAGTATTCCACTGATTAATACAGTGAGGTTTGGG-GTTGAAAATAATAATGAAGAAAAAGCTCAGTTTATTCTCGTTTGGCAAATTTACC i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 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0 s papAnu2.chr16 63055714 416 + 74645514 TATACTTATTACAAATCAGAACtgggaaactttggaactttccataagttaaaaaaatatatataaaagggaaTAAGAAAAACGCATCAATGTCGATCTAAATTTCTAAGATGCAGGGCTCCTAAGGTGGTCAAAGTGCCAGGACGCTCTCCCATTCTATGAAGGAATCAAGCCCATCTACGTGGCACTGGGAAACTGTTCCTTCTCCAATAAAATAGAACCATGCTCCATGGAAGA-------------------TATGACATCAGCCTCTGGTTTCCGAA---GAAGATGAGTAGAATACGCAGCCTAGTAATTATTTTGCTGTGAATTTTCAATAAAGATGCTCTTATCCTAAGTATTCCACTGATGGATACAATGAGGTTTGGG-Gttg-----aataatgaagaaaaagcTCCGTTTATTCTCATTTGGCAAATTtgcc i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154307 415 - 75148670 TATACTTATTACAAATCAGAACTGGGAAACTCTGGAACTTTCCATAAGTTAAAAAAATATATATAAAAGGGAATAAGAAAAACGCATCAATGTCGATCTAAATCTCTAAGATGCAGGGCTCCTAAGGTGGTCAAAGTGCCAGGACCCTCTCCCATCCTATGAAGGAATCAAGCCCATCTACGTGGCACTGGGAAACTGTTCCTTCTCCAATGCAATACAACCATGCTCCGTGGAAGA-------------------CATGACATCAGCCTCTGGTTTCCGAA---GAAGATGAGTGGAATACGCAGCCTAGTAATTATTTTGCTGTGAATTTTCAATAAAGATGCTCTTATCCTAAGTATGCCACTGATTGATACAATGA-GTTTGGG-GTTG-----AATAACGAAGAAAAAGCTCCGTTTAATCTCATTTGGCAAATTTGCC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120036653 417 + 159171411 TATTCTTATTACAAATCAGAATTGAGAAACTCTGGAACTTTCtataaattaaaaaaa----tataaaaGAGAGTAAGAAAAATTCATCAATGTCGATCTAGATTTCTAAAATGCAGAGCTCCTAAGGGGGTCAAAGTGCCAGGACCCTCTCCCATTCTATGAATGAGTCAAGCCCTTCTACATGGCACTGAGAAACTGTTCCTTCTCCAATAGAATAGTTCCACCTTCCATGTAAGA-------------------TATGACATCAGCCTCTAGTTTCTGAA---GAAGATGAGTAGAATACGCAACCTAGTAATTACTTTGCTGTGAATTTTCAATAAAGATGTTCTTATCCTAAGTATTCCACTGATTGACACAATGAGTTTTGCA-GTTGAAAGTAGTAATGAAGAAAAAGCTTGGTTTATTCTCATTTGGCAAATTTATC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112352528 377 + 122082543 tatgtgtgttataatactgaaatagaaaatctTGGAAC--ACCATCAATTAAAAAGT-----ATAAGGGAATATAAG-AAAACAATTCAATGTCAACCAAAGTGACCAAGATTCGGAGCCTCTA---GCACCAAAGTCTC---ATCTTCCTACAATCCA--------TCAAGCCTGCC------------AGAAAGTG----TTTTCCTATAAAGCAG-TCCACCCTCCAGGTGAGA-------------------TGAAACATTAGCCTCTAACTATGTCA---GAAA--GACTGGAGTATATGATATCATAGTTTGTTTCATGTACATTTTTCATAAGGGTTTTCTTACACTAAGTACTCTCC---TTGTCACAATAAAATTGGGA-GGCAGGAATCCTGATCAAGGAAAAGTTTCGATTATTCTTCTTTGATAATTTCCCC i mm10.chr11 I 219 C 0 s canFam3.chr9 43529882 411 - 61074082 CATATTTATTATATATCTGAATTGGGAAGCCTTGAAACTTTCTATAAATTAAAAAAA-------ATAAGAGAATAAG-AAAATTTGTCAATGGTTACCTCAGTTTCTAAGATGCAGAGCTCCTCAGGT-ATCACAGTGCTGGGACCCTCTCCCCGCCTATGTATGAGTCAAGCCCTTTTATACAACACTGGGAAAC--ATCCTTCTCTAATCAAGTGGACCCACCCCCCACAGATGA-------------------TGCAGCATTAGCCTTTAGTTACCCCAAAAGAAAGTAAATGGAATATGCAGTGTACTAATT-TTTTACTGTCAATTTTCCATAAAGTTTCTCTTATCCTGAGTATTCTACTGACTGATATAATGAGGTTTTGATTTTGAAAATGATGATCAGGAAAAGA--TGGTGTATCCTCCCTTGACTAATTTGCC i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=47088.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 65929 13 + 235827 ----AATGAAACAAAAT s panTro4.chr17 70457810 13 + 82630442 ----AATGAAACAAAAT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61509599 13 + 73212453 ----AATGAAACAAAAT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41674869 13 - 94967081 ----AATGAAACAAAAT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69044014 13 + 80904711 ----AATGAAACAAAAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68791391 13 + 80997621 ----AATGAAACAAAAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63056130 13 + 74645514 ----aatgaaacaaaat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154722 13 - 75148670 ----AATGAAACAAAAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120037070 13 + 159171411 ----AATGAAAGAAATT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112352905 17 + 122082543 CCTTATTGAAACAAAAT i mm10.chr11 C 0 I 68 e canFam3.chr9 43530293 0 - 61074082 C a score=785108.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 65942 271 + 235827 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ATCAggcagggtgcagtggctcaagcctgtcatctcagcactttgggaggccaaagcagatggactgcttgaagtcagaagtttgagaccagcctggccaacatggcaaaaccccatctcttttaaaaatacaaaaatgtacctggatgtggtggcacatgcctgtaatcccagctactcaggaggctgagactggagaatcagttgaacctgggaggcggagtttgcagtgagccgagatcgagcccctgtactccagcctggatgaaag i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69044027 270 + 80904711 ATCAggcagggcgcagtggctcacacctattatttcagcactttgggaggccaaagcaggtggattgcttgaagtcagaactctgagaccagcctggccaacatggcgaaaccccatctcttttaaaaatacaaaaat-cagctgggtgtggtggcacatgcctgaaatcccagatactcgggaggctgaggctggagaatcccttgaacctgggaggcggagtttgcagtgagccaagatcgagccactgtactccagcctggatgaaag i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68791404 270 + 80997621 ATCAggcagggcgcagtggctcacacctattatttcagcactttgggaggccaaagcaggtggattgcttgaagtcagaactctgagaccagcctggccaacatggcgaaaccccatctcttttaaaaatacaaaaat-cagctgggtgtggtggcacatgcctgaaatcccagatactcgggaggctgaggctggagaatcccttgaacctgggaggcggagtttgcagtgagccaagatcgagccactgtactccagcctggatgaaag i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63056143 270 + 74645514 atcagacggggcgcagtggctcacacctattatttcagcactttgggaggccaaagcaggtggattgcttgaagtcagaactctgagaccagcctggccaacatggcgaaaccccatctcttttaaaaatacaaaaat-cagctgggtgtggtggcacatgcctgaaatcccagatactcgggaggctgaggctggagaatcccttgaacctgggaggcggagtttgcagtgagccaagatcgagccactgtactccagcctggatgaaag i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25154735 270 - 75148670 ATCAggcggggcgcagtagctcacacctattatttcagcactttgggaggccaaagcaggtggattgcttgaagtcagaactctgagaccagcctggccaacatggcgaaaccccatctctttttaaaatacaaaaat-cagctgggtgtggtggcacatgcctgaaatcccagatacttgggaggctgaggctggagaatcccttgaacctgggaggcagagtttgcagtgagccaagatcgagccactgtactccagcctggatgaaag i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120037083 268 + 159171411 ATCAggttgggcgcagcggctcacgcctataatctcagcactttgggaggccaaggaaggtggactgcttgaggtcagaagtttgagaccagcctgtccaacatgtcaaaa--ccatgtctattaaaaatacacaaat-tagctgggcatagtggcacatacctctaatcctagctactcaggaggctgaggttatagaatcacttcaacccaggaggctgagtctgcagtgacctgagatcgagccactgtattccagcctggatgacag i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112352922 68 + 122082543 I e canFam3.chr9 43530293 0 - 61074082 C a score=367902.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 66213 139 + 235827 agtgagac--tgtctcgaaa----a-aaaaaaaaaaaa---TCTATTAAGTATGCATCATTTCTGTTTTCTAATGCAATCTCTATGTTTATGAACAAAAAGCAAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTTCTCC-AAAAAAATCTCTGGAC s panTro4.chr17 70458094 141 + 82630442 agtgagac--tgtctcgaaa----a-aaaaaaaaaaaa-aaTCTATGAAGTATGCATCATTTCTGTTTTCTAATGCAATCTCTATGTTTATGAACAAAAAGGAAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTCCAAA-AAAAAAATATCTGGAC i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61509883 134 + 73212453 agtgagac--tgtctcgaaa----a-aaaaaaa--------TCTATTAAGTATGCATCATTTCTGTTTTCTAATGCAATCTCTATGTTTATGAACGAAAAAGAAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTCCTCC-AAAAAAATATCTGGAC i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41675153 142 - 94967081 agtgagac--tgtctcaaaa----a-aaaaaaaaaaaaaaaTCTATTAAGTATGCATCATTTCTGTTTTCTAATGCAATCTCTATGTTTATGAATAAAAAAGAAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTCCTCC-GAAAAAATATCTGGAC i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69044297 138 + 80904711 agtgagac--tgtcccgggg-------gaaaaaaaaaaaaaTCTATTAAGTATACATCATTTCTGTTTTCTAATGCAA--TCTATGTTTATGAACAAAAAAGAAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTCCTTG-AAAAAAAGATCCAGAC i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68791674 140 + 80997621 agtgagac--tgtctcgggg----a-aaaaaaaaaaaaaaaTCTATTAAGTATACATCATTTCTGTTTTCTAATGCAA--TCTATGTTTATGAACAAAAAAGAAATTGAACTCTTCATTATAC-CTCCTCCTTG-AAAAAAAGATCCAGAC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63056413 145 + 74645514 agtgagac--tgtctcgggggaaaa-aaaaaaaaaaaaaaatctattaagtatacatcatttctgttttctaatgcAA--TCTATGTTtatgaacaaaaaagaaattgaactCTTCATTATAA-CTCCTCCTTGaaaaaaaaGATCTGGAC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25155005 138 - 75148670 agtgagac--tatctcgggg-------ggaaaaaaaaaaaaTCTATTAAGTATACATCATTTCTGTTTTCTAATGCAA--TCTATGTTTATGAACAAAAAAGAAATTGAACTTTTCATTATAA-CTCCTCCTTG-AAAAAAAGATCTGGAC i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120037351 140 + 159171411 agtaagactttgtttcaaaa----ataataaaaataaaaaaTTCATTAAGTATGCATCATTTCTGTTTTCTAATGTAC--TTTCTGTTTATGTACAAAA---AAATTGAACTCTTCATTATAA-CTCCTCCTCC-AAGGAAAGATCGGGAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43530293 118 - 61074082 ---------------------------AATGAGACAAATTATCTACTAAGTATGCATCATTTCTGCTTCCTAATGCAA--TACCTGTTTACCTACAGAG---AAACAGAATTCCTAATTACAGTCCCTTCCCCC-AAGTAAAGATCTGGAA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112352922 68 + 122082543 I a score=2814040.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 66352 650 + 235827 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ACAAGTGCTTCAAATCAGTAACCTTTCC-------CCGCATTACCCTTACCCTAATTAATGACCATAATGACAC-AGGACTGGGACTC-TTGCCA---ATTATTAGCTTCATCTCTGTGTTCTGTTTCTCAACATAGATTCAATAAACAACTCAAGACTTGCTGGAGTTTGAAAGTA-AAAACCAAAGCCAAAACCCCGTGTATATTAAAACCATTCCTGCAACAATAAACTCCGACTGGGAAATGAACTAATCATTCCTGTTG-TTCAACTAAGCTCCCAACTGAAGAGGCT-GAAATCACAGCCCCCTCA-AAGAGGAAGCTCTGGCTTAACTAACAAGGAAAAAACATTGACTGACCTTCAGGTACCCTTTGTTTC-TGGGCTTCTCTGACATACCCTCTTTTTCTGCACCACATGCCTCTCATTCCTCCAGGCCAGCGTTTGATAGTTGAGCTTAGGATGGTGAATGGTGATGGGTGACTCATAACCCACCATTTATATTCCATTAGGGGAAAATAAGCAAGATAGAGTGTCTAGTAACATGCTCTTAGACAAATAGTTTTCAATG---------TTTTCTCTTAGCGACATTTTTTAAAGGCACCAACCAGGAGAAAGTGAGAGTTCTGTTTAGGAATTGATGAATCTATCTGTGGCTAAAACCACTATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120037491 650 + 159171411 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canFam3.chr9 C 0 I 210 e calJac3.chr5 120040737 0 + 159171411 C a score=167184.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 70025 54 + 235827 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAGCTGAGCTA-----TTGCCA s panTro4.chr17 70461909 54 + 82630442 GAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAGCTGAGCTA-----TTGCCA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61513708 54 + 73212453 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAGCTGAGCTA-----TTGCCA i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41678975 54 - 94967081 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAGCTGAGCTA-----CTGCCA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69048366 54 + 80904711 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAACTGAGCTA-----TTGCCA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68795829 54 + 80997621 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAACTGAGCTA-----TTGCCA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63060253 54 + 74645514 CAGCACCTTCTTTAGATCACCTTGGCTATGAGGGATGGAACTGAGCTA-----TTGCCA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25158835 54 - 75148670 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calJac3.chr5 120040737 0 + 159171411 C a score=313561.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 70248 125 + 235827 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTACATTAGTCCATTATGTATtgtattagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga s panTro4.chr17 70462132 125 + 82630442 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTGTAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTACATTAGTCCATTATGTATtgtattagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61513931 125 + 73212453 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACAGAGAGTGAATATATATTACATTAGTCCATTATGTATtgtattagtccattctcagattgctataaagaatactacctgaga i ponAbe2.chr17 C 0 I 684 s nomLeu3.chr14 41679198 125 - 94967081 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTACATTAGTCTATTATGTATtgtattagtccattctcacactgctataaaaaatactacctgaga i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69048588 125 + 80904711 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTGCATTAGTCCATTATGTATtgtgttagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68796051 125 + 80997621 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTGCATTAGTCCATTATGTATtgtgttagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63060475 125 + 74645514 CACAGAGAGACTAGGGTCTCTATAGGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTGCATTAGTCCATTATgtattgtgttagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25159057 125 - 75148670 CTCAGAAAGACTAGGGTCTCTATAAGTCAATGGATATTGGAACACAGAGTGAATATATATTGCATTAGTCTATTATGTATTCtattagtccattctcacactgctataaagaatactacctgaga i chlSab2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534439 23 - 61074082 I e calJac3.chr5 120040737 0 + 159171411 C a score=16044.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 70373 11 + 235827 ggccgcgtgca s panTro4.chr17 70462257 11 + 82630442 ggccgcgtgca i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41679323 11 - 94967081 ggctgggtgca i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69048713 11 + 80904711 ggccaggtgca i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68796176 11 + 80997621 ggccaggtgca i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63060600 11 + 74645514 ggccaggggca i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25159182 11 - 75148670 ggccaggtaca i chlSab2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534439 23 - 61074082 I e calJac3.chr5 120040737 0 + 159171411 C e ponAbe2.chr17 61514056 684 + 73212453 I a score=452051.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 70384 230 + 235827 gtggctcacacctgtaatctcagcatttttgggaggccgaggtgggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaacatggtgag--------tagactaaaaatataaaaattagccagacatggtggtgcatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtgtaatcgttacaggcatgcaccaccattcttggctaatttttgggaggctgaggctaat s panTro4.chr17 70462268 230 + 82630442 gtggctcacacctgtaatctcagcatttttgggaggccgaggcgggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaacatggtgag--------tagactaaaaatataaaaattagccagacatggtggtgcatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtgtaatcgttacaggcatgcaccaccattcttggctaatttttgggaggctgaggctaat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41679334 230 - 94967081 gtggctcatacctgtaatctcagcattttggggaggccaaggcaggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaacatggtgag--------tagactaaaattataaaaattagccagacatggtgatgcatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtataatccttacaggcatgcaccaccattcttggctaatttttgggaggctgaggctaat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69048724 216 + 80904711 gtgactcacacctgtaatctcagcatttttgggaggctgaggcaggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaatatggtgaaactctgtctctactaaaaatataaacattagccaggcatggtggtgaatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtataatccttacaggcatgcaccaccacgcctggctaa---------------------- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68796187 216 + 80997621 gtgactcacacctgtaatctcagcatttttgggaggctgaggcaggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaatatggtgaaactctgtctctactaaaaatataaacattagccaggcatggtggtgaatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtataatccttacaggcatgcaccaccacgcctggctaa---------------------- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63060611 216 + 74645514 gtgactcacacctgtaatctcagcatttttgggaggctgaggcaggtggatcacatgaggccaggaggttgagaccagcctggccaatatggtgaaactctgtctctactaaaaatataaacattagccaggcatggtggtgaatgcctgtaaagattaaattagccaggcatggtggtataatccttacaggcatgtaccaccacgcctggctaa---------------------- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25159193 216 - 75148670 gtggctcacacctgtaatcttagcatttttggaaggctgaggcaggtgaatcacatgaggccaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaacctctgtctctgctaaaaatataaacattagccaggcatggtggtgaatgcctgtaaggattaaattagccaggcatggtggtataatccttacaggcatgcaccaccacgcctggctaa---------------------- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120040737 222 + 159171411 gtgcctcatgcctgtaatctcagcactctc-aaagcctgaggcaggtggatcacttgaagccaggagttcgagaccagcttagacaatatggcaaa-ctccgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggtatggtagtgcatgcctgtaaGGATTAACTTAGCCAGGCAGGGTGGTATAATTCTTA--------------CACGCCTGGCTAATTTATGGGAAGATGAGACTAAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534439 23 - 61074082 I e ponAbe2.chr17 61514056 684 + 73212453 I a score=1283059.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 70614 485 + 235827 tttttgggaggctgaggctaa-ctttggggaagctgaggcacaagaatcagttgaaccgggaggcagaggttgaggtgagctgagattgcgccactgcactccagcctgggcaacaaagtaagactctgtctaaaaaaaaaa-----aaaaaaaaaaaaaaagaaaga-aagaaaaaag--------------aaaaaaaaaaggatactacctcagactgggtaattataaaggaaaggggattaattggctcacagttctgcatggctggggaggcctctggaaacttacaatcatggctgaaggggaaacagtcaccttcttcacaaggcagcaggaaagagagtgaatgctagcccaggaaaaacttccatttttaaaaccatcagatcttgtgacactcactcaccatcacgagaaaagtatgggggaaactgcccccataatccaattacaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacacaaagccagactatat s panTro4.chr17 70462498 491 + 82630442 tttttgggaggctgaggctaa-ctttggggaagctaaggcacaagaatcagttgaaccaggaggcagaggttgaggtgagctgagattgcgccactgcactccagcctgggcaacaaagtaagactctgtctaaaaaaaaaaaaaagaaaaaagaaaagaaagaaaga-aagaaaaaag-------------aaaaaaaaaaaggatactacctcagactgggtaattataaaggaaagaggattcattggctcacagttctgcatggctggggaggcctctggaaacttacaatcatggctgaaggggaaacaggcaccttcttcacaaggcagcaggaaagagaatgaatgctagcccaggaaaaacttccatttttaaaaccatcacatcttgtgacactcactcaccatcacgagaaaagtatgggggaaaccgcccccataatccaattacaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacacaaagccagactatat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61514740 499 + 73212453 TTTTTGGGAGGCTGAGGCTAATTTTttgggaggctgaggtacaagaatcagttgaaccgggaggcagaggttgaggtgagctgagattgcgccactgcactccagtctgggcaacagagtaagactctgtctttaaaaaaa------aaaaaaaaaaaaaaagaaaga-aagaaaaaagaaaagaaaagaaaaaaaaaaaaaaggatactacctcagactgggtaattataaaggaaagcggattaattggctcacagttctgcatggctggggaggcctccagaaacttacaatcatggcagaaggggtaacaggcaccttcttcacaaggcagcaggaatgagaatgaatgcgagcccaggaaaaacttccatttttaaaaccatcagatctcatgagactcactcaccatcacgagaaaagtatgggagaaactgcccccataatccaattacaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacacaaagccagactatat i ponAbe2.chr17 I 684 C 0 s nomLeu3.chr14 41679564 485 - 94967081 tttttgggaggctagggctaa-ctttggggaggctgaggcacaagaatcagttgaaccaggaggcagaggttgaggtaagctgagattgcaccactgcactccagcctgggcaacagagtaagactctgtctaaaaaaaa-------aaaaaaaaaaagaaagaaagacaaaagaaaag-------------aaaaaaaaaaaggatactacctcagaccgggtaattataaaggaaagaggattaatttgctcacagttctgcatggctggggaggcctccagaaacttgcaatcatggcagaagaggaaacagacaccttcttcacaaggcagcaggaaagagaatgaatgcgagcccaggaaaaacttccatttttaaaagcatcagatctcgtgagactcactcaccatcacgagaaaagtatgggggaaaccgcccccataatccaattacaattacaattcaaggtaagatttgggtggggacacaaagtcagactataC i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69048940 460 + 80904711 tttttgggaggctaaggctaa-ctttggggaggctgagacatgagaatcagttgaaccaggaggcagaggttgaggtcagctgaaattgtgccactgcactccagcctggacaacagagtaagactcggtccaataaaaag----------------------------aaaaaaaaag-----------------aaaaaaaggatactacctcagactgggtaattacaaaggaaagaggattaattgactcacagttctgcatggctggggaggcctccggaagcttaacatcatggcagaaggggaaacagtcaccttcttcacaaggcagcagaaaagagaatgaatgtgagccaaggaaaaacttccacttttaaaaccatcagacctcgtgagactcactcaccatcaccagaaaagtatggaggaaaccacccccataatctaattacaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacacagagccagactatat i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68796403 460 + 80997621 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tttttgggaggctaaggctaa-ctttggggaggctgaaacacgagaatcagttgaaccaggaggcagaggttgaggtgagctgaaattgtgccactgcactccagcctggaccacagagtaagactctgtccaataaaaag------aaa-------------------aaaaaaaaag-----------------aaaaaaaggatactacctcagactgggtaattacaaaggaaagaggattaattgactcacagttctgcatggctggggaggcctccggaAACTTaacatcatggcagaaggggaaacagtcaccttcttcacaaggcagcagaaaagagaatgaatgcGAGCCAAGGAAAAACttccacttttaaaaccatcagacctcgtgagaCTCACTCACCATCACCAGAAAagtatggaggaaaccacccccataatctaATTAcaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacacagagccagactatat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25159409 460 - 75148670 ttttggggaggctaaggctaa-ctttggggaggctgaggcatgagaatcagttgaacctggaggcagaggttgaggtgagctgaaagtgtgccactgcactccagcctgggcaacagagtaagactctgtccaataaaaag----------------------------aaaagaaaaa-----------------aaaaaaaggatactacctcagactgggtaattacaaaggaaagaggattaattgactcacagttctgcatggctagggaggcctccggaaacttaacatcatggcagaaggggaaacagtcaccttcttcacaaggcagcagaaaagagaatgaatgcgagccaaggaaaaacttccacttttaaaaccatcagacctcgtgagactcactcaccatcaccagaaaagtatggaggaaaccacccccataatctaattacaattacaattcaaggtgagatttgggtggggacagagagccagactatat i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120040959 415 + 159171411 ATTTTGGAAGGCTAAGGCTAA-TTTTGgggaggctgaggggcaagaatcacttgaactgggaggcagaagttacagtaagctgagattgtgccactgaactccagcctgagcaacagagcaagactctgtctcaaaaaaaa----------------------------aaaaaaaaaG------------------------------------------------------------Cggattaatcgactcacagttctgtagggctggagaggccttaggaaactgacagtcatggcagaaggggaaacaggcaccttcttcacaaggaggcagggaagagaataattgcgagctcaagaaaaacttctatttttaaaaccatcacatcttgtgagactcactcccc--cacgagaacagtatgggggaaactgcttccataatccaattacaattacaattcaaggagaggtctgagtggggacacagagccagcctatgt i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534439 23 - 61074082 I a score=483829.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 71099 144 + 235827 AATATATAGACAGAAGACACTGAATTTAGAAGACAACAAGATGAAT-----AATCTTTCTCACCTCAAAAAGACCCAGGTATTAACCATCCATCTTCTGGCTGGGGAGGGGTTGATAGTGTCTTGTTTTGTCCTGCCATTCAGATATCA s panTro4.chr17 70462989 144 + 82630442 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TCTTCTAAGGGCCTATGCTCACCTCCATATACTTTCTTTCTTC-------C----TTtttttttttttttttttt------ttgagagagagagagacaaggtctcactctatcacccaggctagagtggggtggcgtgatcacagcacatactgggctcaaactcccgggctc--------aagggattctccttcctcatcctcctgagtagctgtgaatacacgcatgcaccaccatgctcagctaattttttttttcta-----cagagatagtatcatctcactatctcactcaggctgatctcaaacacttggcctccagtgatcctcctaccttggtctcccaaagtgttgggattacaggcatgagccaccacaccaggcc i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120041523 334 + 159171411 TCCTCTAAAGGCCTGTGCTGATATGCCTATACtttctttcttc-------t----tttttt---------------------------agaaagagacaaggtctcgctctatcacccaggcttgagtggagtggtatgatcacagctcactaaagcctcaaactcctgggctc--------aagggattctccttccttaacttcctgagtagatgtgaatacagacatgtaccaccacgcctggataatttttttttcta------tagagatag---catctcatgatgccactcaggctggtctcaaacccttggcctccagtgatcctccggccttggtttcccaaagtgctgggattataggcataagccaccgcacaaggcc i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534604 14 - 61074082 I a score=179151.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 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rheMac3.chr16 69049947 0 + 80904711 C e nomLeu3.chr14 41680622 0 - 94967081 C e ponAbe2.chr17 61515812 0 + 73212453 C a score=0.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 71818 2 + 235827 ag e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534690 1378 - 61074082 I e calJac3.chr5 120041935 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25160428 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 63061848 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 68797420 0 + 80997621 C e rheMac3.chr16 69049947 0 + 80904711 C e nomLeu3.chr14 41680622 0 - 94967081 C e ponAbe2.chr17 61515812 0 + 73212453 C e panTro4.chr17 70463702 882 + 82630442 I a score=23812.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 71820 261 + 235827 ccatccctcccccttccctccaccccacaacagtctgcagagtgtgatgttccccttcctgtgtccatgtgttctcattgttcaatccaacctacgagtgagaagatgcggtgtttggttttttgttcttgtgatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttctcaatccagtctatc s panTro4.chr17 70464584 261 + 82630442 ccatccctcccccttccctccaccccacaacaatccccagagtgtgatgttccccttcctctgtccatgtgttctcatcgttcaatccaacctatgagtgagaagatgcggtgtttggttttttgttcttgtgatagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttctcaatccagtctatc i panTro4.chr17 I 882 C 0 e mm10.chr11 112357313 493 + 122082543 I e canFam3.chr9 43534690 1378 - 61074082 I e calJac3.chr5 120041935 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25160428 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 63061848 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 68797420 0 + 80997621 C e rheMac3.chr16 69049947 0 + 80904711 C e nomLeu3.chr14 41680622 0 - 94967081 C e ponAbe2.chr17 61515812 0 + 73212453 C a score=1933.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 72081 11 + 235827 attgttggaca s panTro4.chr17 70464845 11 + 82630442 attgttggaca i panTro4.chr17 C 0 C 0 s mm10.chr11 112357806 11 + 122082543 ATTTCTGGATG i mm10.chr11 I 493 C 0 e canFam3.chr9 43534690 1378 - 61074082 I e calJac3.chr5 120041935 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25160428 0 - 75148670 C 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calJac3.chr5 120041935 0 + 159171411 C a score=112579.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 72109 40 + 235827 gttttg-----taaatTCTGGGGGACTACTAACATG--TTGGTGATG s panTro4.chr17 70464873 40 + 82630442 gttttg-----taaatTCTGGGGGACTACTAACATG--TTGGTGATG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61515829 40 + 73212453 GTTTTG-----TAAATTCTGGGGGACTACTAACATG--TTGGTGATG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41680639 40 - 94967081 GTTTTG-----TAAATTCTGGGGGACTACTAACATG--TTGGTGATA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69049964 45 + 80904711 GTTTTGTTTTATAAATTCTGAGGGACTACTAATATG--TTGATGATG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68797437 45 + 80997621 GTTTTGTTTTATAAATTCTGAGGGACTACTAATATG--TTGATGATG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63061865 45 + 74645514 gttttgttttataaattctgaGGGACTACTAATACG--TTGGTGATG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25160445 45 - 75148670 GTTTTGTTCTTTAAATTCTGGGGGACTACTAATATG--TTGGTGATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120041935 40 + 159171411 GCTTTT-----TAAATTCTGGGGGACTGCTAACATG--TTACTGATG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112357837 37 + 122082543 ---------TCTCAATTCTG-GGGACTTTTAGCATAGTTTTTTAACA i mm10.chr11 C 0 C 0 e canFam3.chr9 43534690 1378 - 61074082 I a score=446466.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 72149 117 + 235827 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCATTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---ACACCTAATTT s panTro4.chr17 70464913 117 + 82630442 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCATTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---ATACCTAATTT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61515869 117 + 73212453 TAGAAAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCGTTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATCGTGTT---AAG----AAAAGGA---ATACCTAATTT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41680679 117 - 94967081 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCGTTATC-----GTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGCT---AAG----AAAAGGA---ACACCTAATTT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69050009 117 + 80904711 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCGTTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---ACACCTAATTT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68797482 117 + 80997621 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCGTTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---ACACCTAATTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63061910 117 + 74645514 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCGTTATC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---ACACCTAATTT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25160490 117 - 75148670 TAGAGAAGCATCCATCTTTCAAGCTATTCTAGGCATTATC-----CTTTATGGAGGAGGACTTTGGGGTCCTT-CTCTGTAGGGGGAATTAAAGATTGTGTT---AAG----AAAAGGA---GCACCTAATTT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120041975 119 + 159171411 TAGAGAAGCA-CCATCTTTCAAGTTATTCTAGGCATTACC-----CTTTATGGAAGAGGACTTTGGAGTCCTT-CTCTATAGGGGGAATTAAAAATTATGTTAAGAAG----AAAAGGA---ATATCTAATTT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112357874 116 + 122082543 TAGAGACACATCATTC----------TTCTAGACTTTATCCTAAACTTTATGAAAGAGAACTTAAGAACCACT-CTCTGTAGGTGTAATTAAGGGATGTACT---AGGAGGAAAAAGGA---ATATATAGCTT i mm10.chr11 C 0 I 1722 s canFam3.chr9 43536068 114 - 61074082 TGGTGAAGGTTCTATCTTT-----TATTCTAGACACT--C-----TTTTATGGTAGAGAACTTAGGGGTCCTTCCTCTGCAGGAGGCATTAAGGATTATGTT---AGG----AAGAGAAAGTACACATTATTG i canFam3.chr9 I 1378 C 0 a score=1417774.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 72266 391 + 235827 GTTGATAGACCTTTACCTTGACTCAGCAAAATGCCTACATTGGAGGCCAAAACAAGTTCCATCTCTCAGCTCTCTGGCCTAATGACCCATTGT---TTTAGCATGAAATCATAATGGGACAAAATTTAAAGAAAGCCTGGGTGAC--CCTAATATTGTCAACAAAACTGGAT-GTAATTTCTAAGATGTAGACAAACCTCAAAACTTCTCCACC-CACACAAACATATACCAGATCTCATTCTTTTGGAGAATGTTGACTATTTCATAAATTTGAAAACAAAACTG---AAAAAAATTGTTGATTTATCTTTTCCAGCCCAGAAATGGACAGGTACCTTACACCTAAAGGGTT---TCCACTGCAAATCATTGACCTAACAAGTCCA--------GGA---------TTCCTGTATGG------------------------------------------------------ATG s panTro4.chr17 70465030 391 + 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canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=3245693.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 89346 847 + 235827 AAGGCATCTAACTTCACTTTAGCACCTGTAATTTGTCATTATTATTTAGCCATGAAATGAAAAGGTGAGCCAAATGGTATGTGCCTTCCAGTGGTAAGTTTATGTTGGAATGAGATATTGGGCCACCGGAGCTGCTAAAATATGTTTTAATGAATTCATAAAGAAAATCCAGACACTTAAAAAAATAACAAGGCCTACAACAGTGTATTTCAACA-G-GTTTGCTAAAGGGGAATCAATATTTTTCCTTGAGCCTTACTTCCTCTGATTCTGTATTGCAAATATAGACATTGTAAAATGAAGAGATCATTGGTTCCATCTTAAATACTAATGagtcaaaggccag-agttttaaatttaaggcctagatttgtgatagagctg-cttctcatacaggcgactttacctcatacattccagattgtgcatcaacaggaa-ttatttTTCATATGCTCCCTAAGTAAATAGAATGACAAATATACACAAAAACTTTGTCACAAAGTTAAAGAATTATCACAGCTCTGAATAAATTACTATAATCACATAAAATTATTATAACTGCAAAGATGTATTTTTTTATTAAACTTCATGTGACAATGGTTAATGATTGTCCTG-AAAAAAAATGCTAGGTGATACAGCT---ACTAAT---------------------------------------AATATTaataacagtctacactttacttttacca-----tgtttactat---ggacagtattctttgttacaatgcatccaatcctcctaacagccccaggaagaatgtattatta-ttttctccattttggaggtgagataatcaaggtacagaca-gtttaaattgttgccaaggtc--atttagctagtaaatggcaTGGTTTCTTTTCATAAG s panTro4.chr17 70482095 846 + 82630442 AAGGGATCTAACATCACTTTAGCACCTGTAATTTGTCATTATTATTTAGCCATGAAATGAAAAGGTGAGCCAAATGGTATGTGCCTTCCAGTGGTAAGTTTATGTTGGAATGAGATATTGGGCCACCGGAGCTGCTAAAATATGTTTTAATGAATTCATAAAGAAAATCCAGACACTTAAAAAAATAACAAGGCCTACAACAGTGTATTTCAACA-G-GTTTGCTAAAGGGGAATCAATATTTTTCCTTGAGACTTACTTCCTCTGATTCTGTATTGCAAATATAGACATTGTAAAATGAAGAGATCATTGCTTTCATCTTAAATACTAATGagtcaaaggccagaagttttaaatttaaggcctagatttgtgatagagctg-cttctcatacaggcgactttacctcatacattccagattgtgcatcaacaggaa-ttatttTTCATATGCTCCCTAAGTAAATAGAATGACAAATATACACAAAAACTTTGTCACAAAGTTAAAGAATTATCACAGCTCTGAATAAATTACTATAATCACATAAAATTATTATAACTGCAAAAATGTA-TTTTTTATTAAACTTCATGTGACAATGGTTAATGACTGTCCTG--AAAAAAATGCTGGGTGATACAGCT---ACTAAT---------------------------------------AATATTaataacagtctacactttacttttacca-----tgtttactat---ggacagtattctttgttacaatgcatccaatcctcataacaaccccaggaagaatgtattatta-ttttctccattttggaggtgagataatcaaggtacagaca-gtttaaattgttgccaaggtc--atttagctagtaaatggcaTGGTTTCTTTTCATAAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61532982 843 + 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atattcacattcccaggtctgtgttgtctgccctctgtacaattaacaccaatacatgaatgtgtgagaagcatccaggaagcttcttactttaacctgaccaaaacctatgctttttttcccctttacatgtgctctttccccagtcattcc---------------tattaatagtgc---agatc---atggtccactcaatttaatcaagtaaaaagtctgcatattacccttgattcctctcttattttcttacctcatatcaaatccattaatgaaacatatcttctaaacttcaaaatatagaccaactcagctaatcacatccagcaacagaattctcaagat----cctttcctgtgtta------------ccacaagactccaacttatatttt--------------------------------------------gcc-------------------------------------------ttcactcttacctacaattctttcccta-caaagag--------------------------------------------------ccaaaat---tatatttt-----------------------------------------------------------aagaacaagaaccatatcaggtcactcctttgttc-aagaccctccaaaagcttccatactatttaaaacaaaatccaaattccctaccctgacctcaaaagtcatatacgatcaacctcatttctcttcaagtctatcctgcc-ttactctgcagcaggcatgaccgccttctggttc---ctcaaacttaccagtgtgtttactcttgca i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43562859 846 - 61074082 atattcatattcccaggactgagctgtatgtcctttgtgtaattaatatcaatacctagatgtgccatatgtattttgtaagcttcttacattaacctgaccctaaattacga---tatttgcctccaaatctgcacttttctcaatcattcccatcaatcagtcatgtatcaatagtgctttaggactgtactatccactcaacttgattaagtcaacgatctgcactttaacc-----tccactcttg---tcttacctcacatcaaatctatgaatgggccatgtttccttaaattcctcaaatttccccacc------acaaaatcctccaacctaactccc---ac----tctcactcctattaACAGTCTCTTCTCCACAAAAAGCCAACCTGTATTTTAAGAACATGAATCAgggaggcttgggtggctcagtcagttaagcgcctgactcttgattcggctcaggtggtgatctcagagttatgagatccagccccacatacagctctgtgctcagcccagagtctgcttaggtttctctctccttctgcctctccctctgcactctctgtctctAaaataaataaatctctaaataaataaataaataaataaataaataaatagataaatagataaataaataaataaaagaacacgaactagatcaggtcattcccctctttgaaggtcttccaaaatcttccatattgtgaagaatgaaacctaaaagcactgtgctggtcactaaggccatccacgaccaatctactttgttttcactgctctcctgcctttataccacagctggctagggtgttttctgcctctttctcaaacaggccaatgcgtttgttcctgcc i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112390181 102 + 122082543 I e calJac3.chr5 120071037 1303 + 159171411 I e ponAbe2.chr17 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tcagatcttttTTTTTTTTTttttttaatttccataggtttttgaggaacaggtggtgtttggtcacacgagcacattctttcgtggtgatttgtgagattttggtgagcccatcacctaaacagtatacattttacccaatttgtagtcttttatccctcaacttcctcccagcctttcccccgtgtccccagagtccattgtattatttttatgcctttgaatcctcatagcttagctcccacttatgagtgagaacatacgatatttgc-tttttcattcctgagttaattcacttagaataatggtctccaattccattcaggttgctacaaatgtcattccatgcttttttatggctgaatagtattccatggt i macFas5.chr16 C 0 I 4 s papAnu2.chr16 63091603 372 + 74645514 tcaga------tttttttttttttttaatttccataggtttttgaggaacaggtggtgtttggtcaCACGAGCACATTCttttgtggtgatttgtgagattttggtgagcCCATCACCTAAACagtatacattgtacccaatttgtagtcttttatccctcaacttcctcccaccctttcccccgtgtccccagagtccattgtattatttttatgcctttgaatcctcatagcttagctcccacttatgagtgagaacacacgatgtttgc-tttttcattcctgagttaattcacttagaataatggtctccaattccattcagGTTGCTACAAATGTCATTTCatgcctttttatggctgaatagtattccatggt i papAnu2.chr16 C 0 I 10 s chlSab2.chr16 25189783 378 - 75148670 tcagatcttctTTTTTTTTTttttttaatttccataggtttttgaggaacaggtggtgtttggtcacacaagcacattctttcgtggtgatttgtgagattttggtgagcccatcacctaaacagtatacattgtacccaatttgtagtcttttatccctcaacttcctcccaccctttcccccgtgtccccaaagtccattgtattatttttatgcctttgaatcctcatagcttagctcccacttatgagtgagaacatacaacgtttgc-tttttcattcctgagttaattcagttagaataatggtctccaattccattcaggttgctacaaatgtcatttcatgccttttcatggctaaatagtattccatggt i chlSab2.chr16 C 0 I 284 e mm10.chr11 112390181 102 + 122082543 I e canFam3.chr9 43563705 0 - 61074082 C e calJac3.chr5 120071037 1303 + 159171411 I e ponAbe2.chr17 61543796 9595 + 73212453 I a score=39874.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 101379 227 + 235827 ----atatatta---tatatatatatatatatataatatactatagaatatata-----acttat-------tctatata--aaatatatttaatatatttatata--ttatattatataattatattt-----atatatattatacatataattttaaatatattttatatataattttaaatatctt--ttacatacatattaa-aatatgtttttaatata--taaataaattatatattaaactatataatac-------ata s panTro4.chr17 70495557 218 + 82630442 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gtct-aactggatagaaagttattgatggtct-aatctatttcacttaaggtgcatattcatacatgtagctgc--aaaattgctaaggtgtttgattatggg--TCCTCTCACCCAAATCTCTACTTCCTGAAAAGTCCCTGTGGCAAcagtttctttgcccaatagcaacagtcgttaccattttattcag--tgctttttcagagataa--gcatttggatgaaaatatgactagatatttttctacacaaatgtagcacac---------ac----------tatacacacacacatttctgcaacttt-tttt--cacttaacaatatatcatgg----------acatcaataaaacttagctttcccaattattttcttacagtcttattttacttattttactatatg--tgtgtcat-atttatttagccagtccc--atttatagatattttaattattttcaatactttgctatcgtaaatgatgTACCAGAGCTCATAT---CAGACATAGCTGTGCGataaataatt----agaaaaataatccaggaaaatgggcaaaggatattaacagataatgcacatgaaagaaaatgcaaatatct--tttCTTATTGATTT--------CACACTTCTTATAGATTTTATATA----------------TTCACAGGAAGTAT-----CAATATATTACAGAAATTAAGCCTTTGTCTCTGACATGTTTTACAAACATATTTT------------------------------------------------CCCAATTT-------------------------TCAACT----TGACATTGGACTTT---------ACTTATG--------------------------GTATTTTTATAAGA--------------------------------AGTTGTTATAACTTTT---------------------------------------ATGTAATCAAATTGTTGACCTTTTTGTAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120073552 704 + 159171411 gcct-aaatgaaaagaaagttattggtggtct-aatctatttcacttatggtgcatattcacatgtatagttgcaaaaaattgttaaggtgtttgattatggg--TAATCTCACCCAAATCTCTTCTTCCTGAAAACCCCCTGTGGCAACTGTTTCCTTACGCAATAGCAACAGTCCTTACCATTTTATTCTG--TTCTGTTTCAGAGATAA--GCATTTGGATGCAAATATGACTAGTTATTTTGCTGCACAAATGTAGCACATACTAC----ATACACAC-ACATGCAAACACacacatttctgcaaactt-ttta--cactta-----atatcgtgg----------acatcagtacacactagctcacccaattattttcttatag---------acttgttttactatatgaatgtgtcataatttatttagctagcctc--atttatagatatttgagttattttcaatgcttt-ctactgaaaatgatgTACCAAAGCTCATATGTCCAGACACAGCTGTAC-------AATT----AGAAAACTAACCCAGAAAAACTGACA------------AGATTATGGGCATT-----ATCTGTTAATATCC--TTTATTA--------------------------------------------------------------ACAGTAT-----GAATAAATTAGAGAAATTAAGCCCTTGTCTCTGACATGCTTCACATACATATTTT------------------------------------------------CTCAATTT-------------------------CCAACT----TGACATTGGACTTT---------ATTTATG--------------------------GTATTTTTATAAGA--------------------------------GTGTGTTATAACTTTT---------------------------------------ATGTAATCAAATCATTGG---ttttatat 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gcctaaaatggatatgcggttatttatagctt-tacctttttcacttactgtgaatatttctatgttcagctgc--aaaatcactaaagtgtttgattatgggTATagtctcactcaa--------ctcccagacagtccctatgcatctagtttccttacccaa----aacagtgattaccatttttttctaattttttttccagaggtacatggatttagaagcatatatgaataagaactttt-tatgcagatgtagcccac----t----agaaatacttcacacacatacatacataatggtgacttt-ttttcccactta---atgtatcatagatatcattttatatcaataaaaa-tggcctgctgaact---------cagt---------agtattttattatatggatgtttgataattt-tttagctagtcccctgtttataaatatttcaattatttccagtattctgctattataaaT-------------TCATATGTCCGGGTATATCTGTCAAATAATTACTTACAAAGGAAAACAACCTA-AAACATGGGAAAGGGATATTAACAGATAATTGACATAAAGGAAAATAAAAATATCTTCTTTCTTATTGATTTATAAAAGATACAAATATTAAAGAAATTAAACCTTTGTCTCTGAACTGCTTTACA-AATCTATTTCCTCAATTTATTACTTGACTTTTGACTTTGTTTATAGCAT-TTTTATAAGAATTTGTT------------------------------------------------GAAACTTTATGCAACCAGGGATgcctgactggctcaactggtatagcatgtgactcttgatctccaggttatgagacagagccccatgttgtgcacAGAGTCTACTTAGAAAATAAAAAATAAAAGGCCCAACCTTGTATGCTAGGGTTAGTAAAATTTTTTTTTTTTTTAGGGTTAGTAAAATTTTAAGAAAAAAAATCAGGTAATCAAATTGTTGACGtttttattt 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0 s nomLeu3.chr14 41717468 189 - 94967081 CT-------------------TCCCACTCAAAAATAATTGATATAAAATGATTCCATGTTTTGTTTTCTATGCTGATACATATCTATTTACATTCAAATTTTCATTTT--TGGGTGTCTTTTTG---------GCTAAGAGGCCTGGCATGAT------CCAGTTTTCACCCTGGAAGCTACCCAGTATTTATTCTCAATACCATTTATTAAGTAATCTTTTGTT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69082555 208 + 80904711 CTTCCCACCAAAAATAATTGATCCCACTCAAAAATAATTGATATAAAATGATTCCATGTTTTATTTTCTATACTGATACATATCTACTTACATTCAAATTTTGATTTG--GGGGTATCTTTTTG---------GCTAAGAGGCCTGGTGTGAT------CCAGTTTTCAGCCTGGAAGCTCCCTAGTATTTATTCCCAATACCATTTATTAAGTAATAttttgtt i rheMac3.chr16 C 0 I 34 s macFas5.chr16 68830526 189 + 80997621 CT-------------------TCCCACTCAAAAATAATTGATATAAAATGATTCCATGTTTTATTTTCTATACTGATACATATCTACTTACATTCAAATTTTGATTTG--GGGGTATCTTTTTG---------GCTAAGAGGCCTGGTGTGAT------CCAGTTTTCAGCCTGGAAGCTCCCTAGTATTTATTCCCAATACCATTTATTAAGTAATATTTTGTT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63094227 189 + 74645514 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aataaaaataaaatTTTTGAGGAAGTTATTCTTT-TTATCATTGCA-GTTATTTTTTA---ATGTGACTATTGAGGCCTCTGTAATTAAAGCTAAAAAACAGTTGTA--GTATGTGCATCTTACTTTATAAAGCAAGTTATGTTTCTATCTTTAACCAGACATTTTGAATTGTTTGATTAAAACTTTCTAGTTGGTAAATTCTACCAGGAATGCATTCATTCAATTAATAAAATCCCCAAGTATTTTCTAT-TACAATTTATTCTACTCAAGGATGTGAAAGACTCATAAATAAAGATGATAAGGTCTCATTTCATCCTGGCTTT--CTGGCATAGTTTAGCCAGAACAGACAGTAGCAGAACATATTCTTTACAGGG-GCAGGAAACACCTGGAAAACAAAATAGAATGTGATAAATGTTGCCATAAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63094807 419 + 74645514 aataaaaataaaatttttgaggaAGTTAATCTTT-TTATCATTGCA-Gttctttttta---atgtgactaTTGAGGCCTCTGTAATTAAAGCTAATAAACAGTTGTA--TTATGTGCATCTTACTTTATAAAGCAAGTTATGTTTCTATCTTTAACCAGACATTTTGAATTGTTTGATTAAAACTTTCTAGTTGGTAAATTCCACCAGGAATGCATTCATTCAATTAATAAAATCCCTGAGTATTTTCTAT-TACAATTTATTCTACTCAAGGATGTGAAAGACTCACAAATAAAGATGATAAGGTCTCATTTCATCCTGGCTTT--CTGGCATCGTTTAGCCAGAACAGACAGTAGCAGAACATATTCTTTACAGGG-GCAGGAAACACCcggaaaacaaaatagaatgtgATAAATGTTGCCATAAAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25192988 419 - 75148670 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AAGTCTATCTTTaaaatacatagggcggtattaatagcatattaaacaccgaagtttaaaaaagggaacttgaaaccatagcaacaaaaacaatgcaatatcagacaGGAA---AAGGACAGAAGTAGTCTCTTGACCATC---AGtggaatcccagaagagtaggaagggaattgaaaggggagaaa--gaaaaacaatagttgaaagaatgatgctcagtaattctctaaatttgataaaagctataaacattcaaatccaaaaactcagtgaacctgtacaatcatgcaatggtacttcataatcaaattgctaaacaccagtgataaagagaagactcttaaaggaatctacagtcaaaacgcacaacatggagggaacaaaagtaaga-at----tgccataggtttcttggtcagaaactatgta i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69093298 421 + 80904711 AAGTCTATCTCTaaaatacatggggcggtattaagagcatattaaacaccgaaggttaaaaaagtgaacctgaaaccatggccacaaaagcaatccaatatcagacagaaa---aaagacagtagcagtctcataatcatc---aatggaatcccagaagagtaggagaggaattgaagggagagagagagaaaaaaaatagttcaaagaataatggtgagtaattctctaaatttgataaaaacgataaacatacaaatccaaaaactcagtgaacctgcacaagcatgcaatgatacttcctaatcaaattgctaaacaccagtgatgaagcgaagactcttaaaggaatctagagtcaagacgcacaacatggggggaacaaaagtaagacaa----tgccatagatatcttggtcagaaactatgca i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68841151 421 + 80997621 AAGTCTATCTCTaaaatacatggggcggtattaagagcatattaaacaccgaaggttaaaaaagtgaacctgaaaccatggccacaaaagcaatccaatatcagacagaaa---aaagaCAGTAGCAGTCTCATAATCATC---AAtggaatcccagaagagtaggagaggaattgaagggagagagagagaaaaaaaatagttcaaagaataatggtgagtaattctctaaatttgataaaaacgataaacatacaaatccaaaaactcagtgaacctgcacaagcatgcaatgatacttcctaatcaaattgctaaacaccagtgatgaagcgaagactcttaaaggaatctagagtcaagacgcacaacatggggggaacaaaagtaagacaa----tgccatagatatcttggtcagaaactatgca i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63104818 421 + 74645514 AAGTCTATCTCTAAAATACATGGGGTGGTATTAAGAGCATATTAAACACTGAAGGTTAAAAAAGTGAACCTGAAACCATGGCCACAAAAACAATCCAATATCAGACAGAAA---AAAGACAGTAGTAGTCTCATAATCATC---AATGGAATCCCAGAAGAGTAGGAGAGGAattgaagggagagagagaaaaaaaaaatagttcaaagAATAATGGTGAGTAATTCTCTGAATTTGATAAAAACCATAAACATACAAATCCAAAAACTCAGTGAACCTGCACAATCATGCAATGATACTTCATAATCAAATTGCTAAACACCAGTGATGAAGAGAAGACTCTTAAAGGAATCTAGAGTCAAAACGTACAACATGGGGGGAACAAAAGTAAGACAA----TGCCATAGATTTCTTGGTCAGAAACTATGCA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25203798 407 - 75148670 AAGTCTATCTCTAAAATACATGGGGCGGTA------------TAAACACCGAAGGTTAAAAAAGTGAACCTGAAGCCATGGCCACAAAAACAATCCAATGTCAGACAGAAA---AAAGACAGTAGTTGTCTCATAATCATC---AAtggaatcccagaagagtaggagaggaactgaagggggagacagag--aaaaaatagttcaaagaataatggtgagtaattctctaaattcgataaaaactataaacatacaaatccaaaaactcagtgaacctgcacaatcatacaatgatacttcataatcaaattgctaaacaccggtgatgaagagaagactcttaaaggaatctacagtcaaaacgcacaacatggggggaacaaaagtaagataa----tgtcatagatttcttggtcagaaactatgta i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43577940 341 - 61074082 aagtcattctc-------------------------------------------------------------------------aaaaaacaat-caaaatcagagggaaaaacaaaGAAAGAAATGGTATCaca--catctggaattagaacccaggcaagtgaaagggtggcaaaaagaagagagaaaaaaaatacatatttgaagtaataatgaccaaattttttacacatttgatgaaaactctaaacacacaaatccaaaaactcaatgaacccaagtgaccatacaatggtacttcataatccaactgctaaaaaccaatgataaggagaaaaatcttaaaacaatctagggtaaaaacatat-tcatgcagaggaacatgacaaga-attacctaccacatacttcttggcc------------ i canFam3.chr9 I 72 C 0 e mm10.chr11 112395508 3041 + 122082543 I e calJac3.chr5 120080808 1135 + 159171411 I a score=641481.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 114936 211 + 235827 tgccagaggacaatggagagacatctttaaaatactgaaag--tt--aaaaaaaaaaaaaaaagg----------cagtgaatataatgtttaataataaaggtgaaaaaaaTTAACAACTATGCTAATAGCAAAAATATTAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTGAAGAAGACCTAAGTAAACAAATAATTATTCCAAG s panTro4.chr17 70509236 209 + 82630442 tgccagaggacaatggagagacatctttaaaatactgaaag--tt--aaaaaaaaaaaaaa--ga----------cagtgaatataatgtttaataataaaggtgaaaaaaaTTAACAACTATGCTAATAGCAAAAATATTAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTGAAGAAGACCTAAGTAAACAAATAATTATTCCAAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61567778 211 + 73212453 tgccagaggacaatggagagacatctttaaaatactgaaag--tt--aaaaaaaaaaaaaaaaga----------cagtgaatataatgtttaacaataaaggtgaaaaaaaTTAACAACTATGCTAATAGCAAAAATATCAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTGAAGATGACCTAAGTAAATAAATAATTATTCCAAG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41728482 203 - 94967081 tgccagaggacaacggagagacatctttaaaatactgaaag--tt--aaaaaaaA--------GA----------CAGTGAATATAATGTTTAATAATAAAGGTGAAAAGAATTAACAACTATGCTAATAGCAAAAATATCAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATATAATTGATTAGAGAAACTGAAGAAGACGTAAGTAAATAAATAATTATTCCAAG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69093719 210 + 80904711 tgccagaggacagtggagagacagctttaaaatactgaaag--tt---aaaaaaaAAAAAAAAGA----------CAGTGAATATAAAGTTTAATAATAAAGGTGAAAAAAATGAACAACTATACTAATAGCAAAAATATAAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTCAAGAAGACCTAAGTAAATAAATAATTATGCCAAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68841572 211 + 80997621 tgccagaggacagtggagagacagctttaaaatactgaaag--tt--aaaaaaaaaAAAAAAAGA----------CAGTGAATATAAAGTTTAATAATAAAGGTGAAAAAAATGAACAACTATACTAATAGCAAAAATATAAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTCAAGAAGACCTAAGTAAATAAATAATTATGCCAAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63105239 213 + 74645514 TGCCAGAGGACAATGGAGAGAcatctttaaaatactgaaag--ttaaaaaaaaaaaaaaaaaaga----------cagtgaatataaagtttaataataaaggtgaaaaaaattaacaactatactaatagcaaaaatataaaaatatttagggtatatacctaacaaaaTGTAATTGATTAGAGAAACTCAAGAAGacctaagaaaataaataattattccaAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25204205 206 - 75148670 tgccagaggacaatggagagacatcttcaaaatactgaaag--tt---aaaaaaaaaAAAAAAGA----------CAGTGAATACAATGTTTAATAATAAAGGTGAAAAAAATGAACAACTATACTAATAGCAAAAATATAAAAATATTTAGGGTATATACCTAACAAAATGTAATTGATTAGAGAAACTCAAGAAGACCTAAG----TAAATAATTATTCCAAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120081943 198 + 159171411 TGCCAGAGGACAATAAAGAGACATCTTTAAAATACAGAAA---TT--AAAAAGAGAAA-----GT----------CAATGAATATAAGGTTTAAAACGAAAGGTAAAAAACAT-------TATGATAATAGCAAAAATATCAAAATATTTAGGGCGTATAGCTAACCAAATGTAActgattagagaaactgaagaagacctaagtaaataaataattattccaag i calJac3.chr5 I 1135 C 0 s canFam3.chr9 43578281 207 - 61074082 ---------ataacgggaaaatatctttaaaatactgaaaaattt--ttaaaaagccaactcagaattctctatccagtgaatataa--ctcatgaacaaaggtgacaaaaa---gcagttacaaaagcaataaaaaaat-GATACACTTA-GGCATACAGCTAACAAAATATAATTGAGGAGAGAAAtgaaagagcatctaaacaaataaagaattactccaag i canFam3.chr9 C 0 I 5750 e mm10.chr11 112395508 3041 + 122082543 I a score=2335555.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 115147 909 + 235827 TTTACGGTATGtactatggtctcagagtttatgctccctc-caaatttatatgttaaaacctaatcaccaacatgg----tagtatcaggaggtagggcctgtggtaggacattaggtaatgaggacatccataaatgtcctcccaaacacactcagaaataatgtttaaccaaatatctgggcatctcttgacccactcaatttgacacataaggttaataatcaATAACtctatcctttgtcaatttggcatcccctgcacatagatctccctaaaccacacttaatctctaattaagacaataacatcattattctgcctaatatgatataactatccagtagacaaccagaaacacgctaacctcttcaccagaagagggggtaaagtctttgagtgatgtttac---ttttgatatcctatagcttaaattactatgatgtaaaattaacaatacgtaaatactatggtattaatagaacagataaaacaa---acatgatcaccacaattgatgcagaaaagcatt-tgacagaatccaacactatttcatgacaaaaacactcagaaaactaggattagaagagatcttcctcaatatgat---gaactttataaaaattccacaagtaatatcatactcaatagtg-aagactgaaagatgtccttctaagaatcgga-------------------aacaaggcaagaatgcctgctttcagcaccactattc--catggtgtattagaagttctagtcagagctattagtcaagaaaaagaaacaaaagcatctcaattggggga-----aaaaa----gtaagattatgtctatttgtagatgacaaaaatctacataaag-----tccgataaatccacaaaaaaattcttTAATATACACATTACTATACAccagtaatatgcaatccagaatgaatgaaaatttaa s panTro4.chr17 70509445 909 + 82630442 TTTACGGTATGtactatggtctcaaagtttatgctccctc-caaatttatatgttaaaacctaatcaccaacatgg----tagtatcaggaggtagggcctgtggtaggacattaggtaatgaggacAtccataaatgtcctcccaaacacactcagaaataatgtttaaccaaatatctgggcatctcttgacccactcaatttgacacataaggttaataattaATAACtctatcctttgtcaatttggcatcccctgcacatagatctccctaaaccacacttaatctctaattaagacaataacatcattattctgcctaatatgatataactgtccagtagacaaccaaaaacacgctaacctcttcaccagaagagggggtaaagtctttgagtgatgtttac---ttttgatatcctatagcttaaattactatgatgtaaaattaacaatatgtaaatactatggtattaatagaacagataaaacaa---acatgttcaccacaattgatgcagaaaagcatt-tgacagaatccaacactatttcatgacaaaaacactcagaaaactaggattagaagagatcttcctcaatatgat---gaacttcataaaaattccacaagtaatatcatactcaatagtg-aagactgaaagatgtccttctaagaatcgga-------------------aacaaggcaagaatgcctgctttcagcaccactattc--catggtgtattagaagttctagtcagagctattaggcaagaaaaagaaacaaaagcatctcaattggggga-----aaaaa---agtaagattatgtctatttgtagatgacaaaaatctacacaaag-----tccgataaatccacaaaaaaattcttTAATATACACATTACTATACAccagtaatatgcaatccagaatgaatgaaaatt-aa i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61567989 910 + 73212453 TTTATGGTATGtactatggtctcaaagtttatgctccctc-caaatttgtatgttaaaacctaatcaccaacatgg----tagtatcaggaggtcgggcctgtggtaggacattaggtaatgaggacAtccataaatgtcctcccaaacacactcagaaataatgtttaaccaagtatctgggcataccttgacccactcaatttgacacgtaagtttaataatcaATAACtctaccctttgtcagtttggcatcccctgtacatagatctccctaaaccacacttaatctctaattaagacaataacatcattattctgcctaatatgatataactgtccagtagacaaccagaaacacgctaacctctttaccagaaaagggggtaaagtctttgagtgatgtttac---ttttgatatcctatagcttaaattactatgatgtaaaattaacaatacttaaatactatgGtattaatagaacaaataaaacaa---acatgatcactgcaattgatgcagaaaagcatt-tgacagaatccaacactatttcgtgacaaaaacactcagaaaactaggattagaagagatcttcctcaatacgatgaagaactttctaaaaattccacaagtaatatcatactcaatagtg-aagactgaaagatgtc---ctaagaatcgga-------------------aacaaggcaagaatgcctgctttcagcaccactattc--catggtgtattagaagttctcgtcagagctattaggcaagaaaaagaaacaaaagcatctaaattggggga-----aaaaa---agtaagattatgtctatttgtagataacaaaaatctatataaag-----tccgataaatccacaaaaaaattcttTAATATACACATTACTATACACCAGTAATGTGCAAtccagaatgaatgaaaattaaa i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41728685 905 - 94967081 TTTATGGTATGtactatggtctcaaagtttatgctccctc-caaatt----tgttaaaacctaatcaccaacatgg----tagtatcaggaggtagggcctgtggtaggacatcaggtaatgaggATAtccataagtgtcctcccaaacacagtcagaaataatgtttaaccaaatatctgggcatctcttgacccactcaatttgacacataagtttaataatcaATAACtctatccttggtcaatttggcatcccctgcacatagatctccttaaaccatacttaatctctaattaagacaataacatcattattctgcctaatatgatataactgtccagtagacaagaggaaacacactaacctcttcaccagaagagggggtaaaatctttgagtgatgtttac---tcttgatatcctatagcttaaattactatgatgtaaaattaacaatacttaaatactatgatattaatagaacagataaaacaa---acatgatcactgcaattgatgcagaaaagcattatgacagaatccaacacgatttcatgacaaaaacactcagaaaactaggattagaagagatcttcctcaatatgaa---gagctttataaaaattccacaagtaatatcatactcaatagtg-aagactgaaagatgtccttctaagaattgga-------------------aacaaggcaagaaggcctgcttttagcaccactattc--catggtgtattagaagttctagtcagagcaattaggcaagaaaaag----acaagcatccaaactgggggg-----aaaagaaaagtaagattgtgtctatttgtagattacaaaaatctacataaag-----tccgaagaatccac-aaaaaaTTCTTTAACGTACACATTACTAAACACCAGTAATGTGCAATCCAGAATGAATGAAAACTTAa i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 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TTTATCGTGTGTACGatggtctcaatgtttatgctccccc-caaatttatatgttaaaacctaatcaccaacatgg----tagtatcaagaggtagagcctgtggtaggacattaggtcatgaggacATccataaatgtcctcccaaacacactcagaaata---tttaaccaaatagatgggcaccttttgacccactcaagttgacacataaatttaataatcaATAACTCTATCCTTTGTCAATTTGGCATCCCCTACATGTATATCTCC--------------------------------------------ccgcctaatatgatacaactgtcctgtagacaaccagaaacacactaaccccttcaccagaagaggaggtaaagtctttgagtgatgtttactcttcttgatacgctgtagcgtaaatcactatgatgtaaaattaacaatacttaaatgctatgGtattaatagaacagataaaatgaactacataaccacctcaactgatgcagaaaagcatt-tgacagaatccaacactatttcatgacaaaaacactcagaaaactaggattagaagagatcttcctcaatatgatgaagaactttataaaaattccacaaataataccatacgcaatagtgaaagactgaaagacgtccttctaaaaatcaga-------------------aacaagataagaatgcctgctttcagcaccactattt--catggtgtattggaagttgtagtcagaacaattaggcaagaaaaggaaataaaagcatccaaactgaggggcgggtgggag---aggaagattatgtctatttgtagacgacaaaaatctacataaag-----tccgaagaatccac-aaaaaTTTATTTAATGTACACATTACTATACACCAGTAATGTGCAAtccagaatgaatgaaaatttaa i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 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calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112395508 3041 + 122082543 I e canFam3.chr9 43578488 5750 - 61074082 I a score=261953.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 116056 86 + 235827 aaa---aaaatgaagatcagtggttgccaaggttcagggatgtgggagggaatttattgcaaattgatataagaaataatttggggtga s panTro4.chr17 70510354 86 + 82630442 aaa---aaaataaagatcagtggttgccaaggttcagggatgtgggagggaatttattgcaaattgatataagaaataatttggggtga i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61568899 86 + 73212453 aaa---aaaataaagatcagtggttgccaaggttcagggatgtgggagggaatttattgcaaattgatattagaaataatttggggtga i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41729590 80 - 94967081 aaa---------aagaccagtgtttgccaaggttcggggatgtgggagggaatttattgcaaattgatataagaaataatttggggtga i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69094808 85 + 80904711 aaa----atataaagatcagtggttgccaaggttcagggatatgggagggaatttattgcaaattgataaaggaaataatttggggtga i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68842660 85 + 80997621 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ACAGAATAAATGTTAGC-CATCAAGAAAGATGAAAGTTGGAAGAATAGAATTACAAAACTAAGACTAGCTCAAA---------CA----------CAGACCAGATTGAAATTCTAGCAGTGGTAATCTAGTTTTGGAGAGGCAATAGGAAACACATCTAACAGATTAGGTTAACAGATAAGGAACTGA---TTACCCCAG---------GTGAA--GACGGCGGCTGAAGAATAAATATAGGTAGAGTTGACAAGCTCATGGATAAACGCACAGACTCTCAATCCATAGTAAATGGTTTAAGCTAACGTATTCTAATTCTACCATCATGGACAGT------CCTTTGGAGAACTTCCTTAAGTATCTggacaaaataaaactaaaaagaacttCCATGG------------------------------GTG-GACTG-TTACTATATA---------ACAAGCAC-----------------CATGTACATATACAT-------------------TATCTCTAGTCTAAATTAAATACCCCAATTTACCTACGAGTTTGTGTTAGTTGAAACAATCGGCAGAAATCTTTATAGTAAGTAAAT---AGAGCAAGGCTCAAATTTCAATCTTTTCCAG-TGAAAATCCCAGGCTCTTTCCAGTCTCATGCATTCCTCCACTCCCACCAACACTTAGCTGAGAAAACAGGAGTCTGAC i papAnu2.chr16 C 0 I 3 s chlSab2.chr16 25206198 596 - 75148670 ACAGAATAAATGTTAGC-CATCAAGAAAGACGAAAGTTGGAAGAATAGAATTACAAAACTAAGACTAGCTCAAA---------CA----------CAGACCAGACtgaaattctagcagtggtaatctagttttggagaggcaataggaaacacatctaacagattaggtaaaaagataaggaactga---ttaccccag---------gtgaa--gacggcggctgaagaataaatacaggtagagttgagaaactcatggataaACGCACAGACTCTCAATCCGTAGTAAATGGTTTAAGCAAATGTATTCTAATTCTACCATCATGGACAGT------CCTTTGGAGCACTTCCTTAAGTATTTGGACAAAATAAAACTAAAAAGAACTTCCACGG------------------------------GTG-GAGTG-TTACTATATA---------ACAAGCAC-----------------CGTGTATATATACAT-------------------TATCTCTAGTCTAAATTAAATACCCCAATTTACCTACGAGTTTGTGTTAGTTGAAACAATTGGCAAAAATCTTTACAGTAAGTAAAT---AGAGCAAGGCTCAAATTTCAATCTTTTCCAG-TGAAAATCCCAGGCTCTTTCCAGACTCATGCATTCCTCCACTCCCACCAACACTTAGCTGAGAAAACAGGAGTCTGAC i chlSab2.chr16 C 0 I 3 s calJac3.chr5 120083906 652 + 159171411 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ponAbe2.chr17 61570678 83 + 73212453 -GTAATGTCATCTGGCTCAGAATCAGTATAGCTATGACaaacaggaatagtaattcctgttccacagggtggtaagaattcagt i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41731361 82 - 94967081 -GTAATGTCATCTGGCTCAGAATCAGTCTAGCTATGACaaacaggaatagtaattcctgttccacagggtggtaagaattc-gt i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69096577 83 + 80904711 -GGAATGTCATCTGGCTCAGGATCAGTCTAGCTATGACaaacaggaataataattcctgttccacaggatggtaagaattcagt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68844429 83 + 80997621 -GGAATGTCATCTGGCTCAGGATCAGTCTAGCTATGACaaacaggaataataattcctgttccacaggatggtaagaattcagt i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63108104 83 + 74645514 -ggaatgtcATCTGGCTCAGGATCAGTCTAGCTATGACAAACAGGAATAATAATTCCTGTTCCACAGGATGGTAAGAATTCAGT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25207064 83 - 75148670 -GTAATGTCATCTGGCTCAGGATCAGTCTAGCTATGACaaacaggaataataattcctgttccacaggatggtaagaattcagt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120084820 83 + 159171411 -GTAATGTCATCTGGCTCATGACCAGTCTAGATATGACATTCAggaataatgattcctgttctacaaggtggtaagaattcagt i calJac3.chr5 C 0 I 302 s canFam3.chr9 43586054 82 - 61074082 aattatttcctctagctcagtattcatctatgtataa--aatcgggataagaatatctgctccataaaatggtaagaattcagt i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112400543 493 + 122082543 I a score=755476.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 118454 229 + 235827 tacacaa--acttttgaagtactcagcacgaggctgacacataataggtcatcaggttatggtatttattactAATGTTGCTTTCATCCCTTAGTGTCTGATAGGACAATCAATGTGACAGTTGTTT-GAGAAGTCCCCATGGAGG-----------GTAACTATCAGAGGGACCTGGCTCAGTGGACCTGATACTCCTGCTATT-----CCTATCTCCCACTATGTCATATTTCATCCCAGTAGTGA s panTro4.chr17 70512220 229 + 82630442 tacacaa--acttttaaagtactcagcacgaggctgacacataataggtcatcaggttatggtatttattactAATGTTGCTTTCATCCCTTAGTGTCTGATAGGACAATCAATGTGACAGTTGTTT-GAGAAGTCCCCATGGAGG-----------GTAACTATCAGAGGGACCTGGCTCAGTGGACCTGATACTCCTGCTATT-----CCTATCTCCCACTATGTCATATTTCACCCCAGTAGTGA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61570761 229 + 73212453 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rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68848395 12 + 80997621 gagcttcccaac i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63112036 12 + 74645514 GAGCCTCCCAAC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25211014 12 - 75148670 gagcttcccaac i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120088458 12 + 159171411 GAGCTTCCGAAG i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112403133 7603 + 122082543 I e canFam3.chr9 43592416 0 - 61074082 C a score=2380858.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 123192 767 + 235827 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i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41735956 793 - 94967081 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i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63112917 66 + 74645514 ACC-AGAAAAGAGTATCCCAGCTAGACTCATCCaggaaggcttcatggaag-aAATAGGAATGGTGGT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25211885 66 - 75148670 aca-agaaaagagtatcccagctagacgcatccaggaaggcttcatagaag-aaataggaatggtggt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120089508 67 + 159171411 ACCAagaaaagggtatcccagctaggttcatccaggaaggcttcagggaag-aaatagcgatggtggt i calJac3.chr5 I 259 C 0 s canFam3.chr9 43593396 67 - 61074082 ACCAAGGAAAAAGTCT-TCAGACAGATTCATCAAGGAAGGCTTCACAGAAGAAAAGAGCATTGCTGGT i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112403133 7603 + 122082543 I a score=574723.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 124080 172 + 235827 ggactttggagaattggaaggcttttaacagtgcaaagacattccagacagagggacaaggtaagcacaggcttcaggaaaggaaatacactgcgccctcctggaattgcagggagtgctgcatgcctgCTGTTTGCAGAAGGACTTTTCCATAGGCCTATTCTCTTTCATA----------------- s panTro4.chr17 70517512 172 + 82630442 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s canFam3.chr9 43593463 182 - 61074082 AGACCACAGAGAATGAGAAGGCTTTATACAGTGGAAAAACTTTCCAGAT--AGGGACAAGATCAGTAAAAGTTGG-GAAAAGGAAATACA-TGTACT-TCCTAGAACTGCA--GAGTCCTGCATGCCTGGTTGCTGCAAAAGAATTTTTCCATAGGTCCATTCTCTTTTACAAAAAAAAAAAAAAAata i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112403133 7603 + 122082543 I a score=2888936.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 124252 927 + 235827 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i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61580655 927 + 73212453 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i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41737042 926 - 94967081 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i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69101631 926 + 80904711 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i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68849496 926 + 80997621 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i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63113155 928 + 74645514 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i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120089746 933 + 159171411 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i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61582510 1479 + 73212453 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gaaggatcaacatatcaggaagatataacacttataaacatatattcacctaacaacagagccaccaaaatgcataaa--gcaaacaatgacagtattgaagggagaatagataatccaac----atgattagagacttcaatatgtactttcaataatgggtgaaacaactagacagaagatagacaatgtcattgaagacctg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr9 43604644 201 - 61074082 gaaagatcaatctatcaggaatatat-acaattataaatatatgtgtgcctaacaagagagcc-tcaaaatgcatgacatgaaaaaaatgatagaattgaaggg-gaaaaaacagttcaacaataatagttggagacttcaatatctg-ttcaaatagtgagtaaaacagtttggcaggagatcaacaatgttatagaagacctg i canFam3.chr9 C 0 I 220 e mm10.chr11 112416507 1553 + 122082543 I e calJac3.chr5 120101468 2 + 159171411 I a score=832294.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 136594 325 + 235827 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calJac3.chr5 C 0 I 324 s mm10.chr11 112421246 867 + 122082543 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panTro4.chr17 70540889 608 + 82630442 ctttccttcccttccttccGTTGTGCTTTGT-AAAAAaattgtggtaaaataca----acacaaaatttgccattt-aaccatttttcaaatatacacttcaaagacatcaagtacattcatgtcgttgtacagccatcagcaccatccatgtcaagaacgtgcttttacctttctaaattgaaatgccatacccattaaacaataac-cccattgtcc-tttc-accagcccttgcccatcaccattctactttctgtctctacaaatctgactac-----c-ctagaagcctcacataagtagaatcatacaatatctatcattttgttactggcttatttcacctagcataatgtctccaagattgatccat-ttgtagcatatgtcagcatttcctttctttttaaggctgaataatattccgttgtatacatggtccacagtttgtttatccattcacctactgatggacatttggagtgcttctgccttttggctattatgaataatgctgctaagaaacacgggtatat-aatatctgttcaagtc-ctgctttcaattcttttttaaattattttgttttactttttcaacttttattttcaattcagagggtacatg i panTro4.chr17 I 834 C 0 s ponAbe2.chr17 61601823 607 + 73212453 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ponAbe2.chr17 61606678 396 + 73212453 ctgtggaccaaatccagtttgccacctgtttttgtgtggcccacaaactaggaatatcttttacgttgttaaatgctt-tggaaaaaaaa---gcaaaaaaa--at------tt-atgat-acacaaaaattatatgaaatttaaattttagaattca----taaaatattaatgcaacaca-------ttactcatttgtatattgtctatagctgcatttgtgctgcaatggaagagttctcagttgtaacagacaccacaagacttccaaaggctgaagaattcac----tggttatttacagaaaaagat-gttgacccttCTTCTAGGCAG-AGACAACTCTTCTAGAAAATATCTTATACAATAAAG-ATTGACTATCACATTGTTTAGTGTGTAATT-CATGTGTTCTCAAAATTTTCCTTA i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41760385 398 - 94967081 ctgtggaccaaatccagtttgccacctg-gtttgtgtggcccacaaactaggagtatcttttacgttgttaaatgctt-tgggaaaaaaaagcaaaaaaaaa--at------tt-atgat-acacaaaaattatatgaaatttaaattttagcattca----taaaatattaatgcaacaca-------ttactcatttgcatattgtctatagctgcatttgtgctgcaatggaagagttctcagttgcaacagacaccacaagacttccaaaggctgaagaattcac----tggttatttacagaaaaagat-gttgacccttCTTCTAGGCAG-AGACAACTCTTCTAAAAAATATCTCATACAATAAAG-ATTGACTATCACATTGTTTAGTGTGTAATT-CATGTGTTCTCAAAATTTTCCTTA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s 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i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120122297 1241 + 159171411 AGACAGCAACGTAAAGCACTACATTC-TAAAAGGATTTAAGTCACTTTTAAAAAATTTCTAGGAAGATTTAAAAGTATCAGTTAGATAA-------ATTGTAACCC--CAATTTGTTCT-CTAGGCATTGTTATTCAATTTATTTTTCGTGCAT-----TATATTTATGAACTTGATATTGAATATCTAAAAATGCCATAAgacattgatctgagcaagtaacatgtgactaagaccccaaatgcaaatgcaacagcaacagaaa---------------caaact-aaaagggttctgtacagcagaagaaataaccaac------acagatgacatgcaggaagggagaaaatgtctgtgaactatacatctgacagagggtcaatatccaaagtctatactaaacccaaagaaactatcaag-aaataataaaataatcccattaaaaattgggcaaatactgtgaacagacacttttcaaaaaaggatatacaaatggccaatgaacatatg-aaaaaatgctcaacaccact-----------------------------aatcatcagggaaatagaaattaaaaccacaatgcgataccacctcaccccagtcagaagagcaattattaaaaagtc-aaaagaccaatggatgttggcacagaggtggtg-aaaaggaaacactt-attttctgttggtgggcatgcaaattagtacaacctataaggagaatagtcatatttctaaatacgagttctaaggagagttctaaaaaatactaaaagtggatctaccatttaattccacaaatccactactggatatctactcaaagaaaaagaagtcattacattaaaaagacacctgcactcccatgtttatcacagcacaattcacaactgcaaagataggaaatcaacttaagtgcccgtcaaccaataggtggatagataaaatgcggt------------------acacacacacacac----acaccccatggaatactactcag------ctataaaaagaatgagataatatctcctgcagcaatttggatggaattagaggccatgatcctaagtgaagtaactcaggaatggaaacacaaatactgcacatgttcccagcggtataatgaacattgcagactagaaggggagagggtaaggggagaatatgagatg-aaaaactacctactggggacaatgtacactatttgggtgatgagtacaccgaaagcctagacttcaccactatacaattcattcatgtaaccaaaaaccacttgcatccctaaaggtattgaaataaattttttaaa i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I e canFam3.chr9 7953307 27 + 61074082 I a score=295.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159233 1 + 235827 t s ponAbe2.chr17 61620851 1 + 73212453 a i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69136371 1 + 80904711 a i rheMac3.chr16 C 0 I 11 s macFas5.chr16 68884101 1 + 80997621 a i macFas5.chr16 C 0 I 11 s papAnu2.chr16 63148027 1 + 74645514 a i papAnu2.chr16 C 0 I 11 s chlSab2.chr16 25246566 1 - 75148670 a i chlSab2.chr16 C 0 I 7 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I e canFam3.chr9 7953307 27 + 61074082 I e calJac3.chr5 120123538 0 + 159171411 C e nomLeu3.chr14 41771995 0 - 94967081 C e panTro4.chr17 70556035 215 + 82630442 I a score=35037.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159234 17 + 235827 aataataata----aaaATAA s panTro4.chr17 70556250 17 + 82630442 aataataata----aaaataa i panTro4.chr17 I 215 C 0 s ponAbe2.chr17 61620852 21 + 73212453 attaataaaataataaaataa i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41771995 14 - 94967081 ---aaTAATA----AAAATAA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69136383 17 + 80904711 taaaataatc----aaaataa i rheMac3.chr16 I 11 C 0 s macFas5.chr16 68884113 17 + 80997621 TAAAATAATA----AAAATAA i macFas5.chr16 I 11 C 0 s papAnu2.chr16 63148039 17 + 74645514 taaaataata----aaaataa i papAnu2.chr16 I 11 C 0 s chlSab2.chr16 25246574 17 - 75148670 TAAAATAATA----AAAATAA i chlSab2.chr16 I 7 C 0 s calJac3.chr5 120123538 13 + 159171411 ----ataata----aaaataa i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I e canFam3.chr9 7953307 27 + 61074082 I a score=566533.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159251 162 + 235827 AAGTGCCATAGATTTGTCACTAATTGTTTAATCATGGTC--CATTTGTTCCTAAAGTAGCTGGGCTACTCACAGCTACCAGAGAGTGGAGACCTAATAAGACCTCGGTGGCAG-AATGCAATTATTCC--TATTAGAG----GTAAGAATGAGTCCAACCATAACATCGTT s panTro4.chr17 70556267 162 + 82630442 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AAGTGCCATAGATTTGTCACTAATTGTTTAATCATGGTG--CATTTGTTCCTAAAGTAACTGGGCTACTCACAGCTACCAGATAGTGGAGACCTAGTAAGACCTCAGTGGCAG-AATGCAATTATTCC--TATTAGAG----ATAAGAATGATTCCAATCATAACATCATT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63148056 162 + 74645514 aagtgccaTAGATTTGTCACTAATTGTTTAATCATGGTG--CATTTGTTCCTAAAGTAACTGGGCTACTCACAGCTACCAGATAGTGGAGACCTAGTAAGACCTCAGTGGCAG-AATGCAATTATTCC--TATTAGAG----GTAAGAATGATTCCAATCAtaacatcatt i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25246591 162 - 75148670 AAGTGCCATAGATTTGTCACTAATTGTTTAATCATGGTG--CATTTGTTCCTAAAGTAACTGGACTACTCACAGCTACCAGATAGTGGAGACCTAGTAAGACCTCAGTGGCAG-AATGCAATTATTCC--TATTAGAG----GTAAGAATGATTCCAACCATAACATCATT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120123551 163 + 159171411 aaGTGCCATGGGTTTGTCACTCATTGTTTTTTCACGGTG--CATTTGTTCCTAAAGAAGCTGGGTTACTCATGGCTACCAGAGAGTGAAGACCTAGTAACACCTTGGTGGCAATAATGCAGTTATTCC--TACTAGAG----TTAAGAATGAGTCCAACCATAATATCATT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7953334 169 + 61074082 AAATACCATAGATTTGTCACTGATTGTTTACTCCCAGTG--CATCTGTCCCCAGAGTGGCCAGGCTGCTCACAGCTACCAGATAGTATAGACCTAGTAGAACCCTGGTGGCAGCAGTGCAATTGTCCCCTTGGTAAAGTTATATAAGAATGACCCCAACTATAACATCATT i canFam3.chr9 I 27 I 8 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I a score=941237.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159413 327 + 235827 TTAAAATATAggccagacgcggtggctcacagctgtaatcccagcactttgggaggttgaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctacccaaa-atacaaaaattagccaggcatggtgtacagtacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgagatcaccccactgcaccctactctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaatgaataaagaaataaaaTA-----TAGTGGAGAAT s panTro4.chr17 70556429 332 + 82630442 TTAAAATATAggccagacgcggtggctcacagctataatcccagcactttgggaggctgaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagatcagcctggccaacatggtgaaaccccatctctacccaaa-atacaaaaattagccaggcatggtgtacggtgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgagatcaccccactgcaccctagtctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaatgaataaagaaataaaataaaaTATAGTGGAGAAT i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61621034 332 + 73212453 TTAAAATATCggccagacgcggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggtcaacatggtgaaaccccatctctacccaaa-atacaaaaattagccaggcacggtgtatggtgcctgtaatcccagctacttggaaggctgaggcaggagaattacttgaacgcaggaggcagaggttgcagtgagccaagatcatgccactgtaccctagcctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaataaataaagaaataaaataaaaTATAGTGGAGAAT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41772173 332 - 94967081 TTAAAATATAggccagatgcggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaagcccaagtgggtggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctatccaaa-atacaaaaattagccaggcatggtggatggtgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcaggccactgcaccctagcctaggtgacagagcaagactttatttc-aaaaataaataaagaaataaaataaaaTATAGTGGAGAAT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69136562 323 + 80904711 TTTAAATATAgggcagacgcggtggctcacgcctgcaatcccagcattttaggaggccaaagtgggcggatcacttgaggtcagaagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctaccaaaa-atacaaaaattagccaggcatggtagacggtgcctgtaatcccagatacttgggaggctgaggcaggagaatcactcgaacccagcaggcagaggttgcagtgagccgagatcacgccactgcaccctagcctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaataaag---------aaataaaaTATAGTGGAGAAT i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68884292 323 + 80997621 TTTAAATATAgggcagacgcggtggctcacgcctgcaatcccagcattttaggaggccaaggtgggcggatcacttgaggtcagaagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctaccaaaa-atacaaaaattagccaggcatggtggacggtgcctgtaatcccagatacttgggaggctgaggcaggagaatcactcgaacccagcaggcagaggttgcagtgagccgagatcacgccactgcaccctagcctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaataaag---------aaataaaaTATAGTGGAGAAT i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63148218 328 + 74645514 tttaaatatagggcagacgtggtggctcacgtctgcaatcccagcattttaggaggccaaggtgggcggatcacttgaggtcagaagttcgagaccagcctggccaacatggtgaaatcccatctctaccaaaa-atacaaaaattagccaggcatggtggacggtgcctgtaatcccagatacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccagcaggcagaggttgcagtgagccgagatcacgccactgcaccctagcctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaataaag----aaataaaataaaatatagtggaGAAT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25246753 326 - 75148670 TTAAAATATAGGGCAAAcgtagtggctcacgcctgcaatcccagcattttaggaggccaaggtgggcggatcacttgaggtcagaagttcgagaccagcctggccaacatggtgg---cccatctctaccaaaa-atacaaaaattagccaggcatggtggacggtgcctgtaatcccagatacttgggaggctgaggcagaagaatcacttgaatccagcaggcagaggttgcagtgagccaagatcacgccactgcaccctagcctgggtgacagagcaagactttgtttc-aaaaataaaga---aaataaaataaaaTATAGTGGAGAAT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120123714 325 + 159171411 TTAAAATATAggccaggcacagtggctcacgcctgtaatcccagcattttaggaggctggggtgggcagattacttgagatcaagagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctaccaaaacgtataaaaattagtcaggcatggaggcatatgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctgggagacagaagttgcagtgagccaagatcgagccacttctccctagcctgggtaacagagcaagactttgtttcaaaaaataaat---------aaataaaaTATAGCGGAGAAT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I e canFam3.chr9 7953503 8 + 61074082 I a score=340934.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159740 102 + 235827 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papAnu2.chr16 63148546 102 + 74645514 TATGATATTTTTGTGGGGCAAT----------GGCTAATTGATAAACTCCCTCCCACCTCGTATATGATCACATTATGTTAATTATCAGTGTGCTAAATACTAATTCCCACA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25247079 101 - 75148670 TATCATATTTTTGTGGGGCAAT----------GGCTAATCGATAAACTCCCTCCCACCTCGTATATGATCACATTATGTTAATT-TTAGTGTGCTAAATACTAATTCCCACA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120124039 98 + 159171411 TGTA----TTTTGTGGAGCACC----------AGCTAACTGATAAACTCACTCCCACCTCATATATGATCACTTTATGTTAATTCTCAGTGTGCCAAACACTAATTCCCACT i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7953511 111 + 61074082 TATTATA-TTTAGTGGGACAATATGAAGCCACAGTTAACTGATAAACTCTTGCCCACCCCATATATAATTTTTTTCTGTTAATTCTCCGTGTGCTAAATATTCCTTTCCACA i canFam3.chr9 I 8 C 0 e mm10.chr11 112434575 2455 + 122082543 I a score=3273061.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 159842 840 + 235827 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ctct-tattatc----------agtagta----------gtaagaatacttagcatataatctacacttttag-------taaatttctaagtatataatac------------aatgttaa----------ctataggca---cctatactgtacagtagatc i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120128995 104 + 159171411 ctct-tat----------------tagta----------gtaggaagacttagcatatgtctt---cttttag-------aaactttctaagaatataatac---------aatgatgttag----------ctatgggca----ctatactgtacagcagatc i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112439804 152 + 122082543 CTCTGTATTATTTTAAACCATGAGCATTATTTTTATTCTGTCAAAATCACCATTAATTGTTTTAAAATCTTTGAACTATTAAAATCTATATGTAGCTAATATCTACACCTTGATAAAGTTCAACATATCTTCCTAAAAAcatcatccatacc------------ i mm10.chr11 C 0 C 0 e canFam3.chr9 7958334 18 + 61074082 I e rheMac3.chr16 69141714 558 + 80904711 I a score=620060.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 164636 294 + 235827 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tctaggaattatttatctggtataaccaaaactttgtaccctttggctaatatc------------------------------------------tgtttgttttcccctcctccctatcccctggcaa-ccactattccattgtgtgcttctatgagtttgacaattttagatttttcatataagtagtatcatgtagtatttgtt-cgtctgtgcctgtcttattttacttggcataatgtcctccaagtttatccatgctgttgcacctggcatgatttccttc--ttttttaggccagataat-ttatatatatatatatatatatatatatatata i ponAbe2.chr17 C 0 I 2509 s nomLeu3.chr14 41777406 283 - 94967081 tctaggacttatttatcttgtataaccaaaactttgtaccctttggctaatatc------------------------------------------tgtctgttttcccctcctccccatcccctggcaa-ccactattccattgtgtgcttctttgagtttgacaattttagatttttcatataagtagtatcatgtagtatttgct-cgtctgtgc----cttattttacttggcataatgtcctccaactttatccatgctgttgcacctggcatgatttcc------tttttaggtcagataat-acatacatacatacatacatatatataca---- i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68889502 330 + 80997621 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i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=1429726.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 167468 432 + 235827 tgcaatgtagaaaacattaaataaaggcttacctttttattATTAATAGTATTACCTCTTCTA--ACTTTGTTGTATCACTTT-------------ACTCT----TTTCTTTCTCTATGGCTACATATTTTT-GACAATAGATATTACACATTAGTTGAGTAGCAACCTTGTAGAAACATTCCCAGATATATGTTAAAATAT---AATGTTGCAAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGCTGCCAGTTTTTCT----CTATTGCTAATATTTTATCTTTATCTAGGCTTTTGATTTGCAATAATTATTCTTTTATG-Tttgctatcttctcacttattatgaccatgtttccctttaagtccttgatcataagtataatagctgctttaaaagtcttgcctgattattttcagttctgggtcatcttgagatcagtctcca-tcaattgattaatt s panTro4.chr17 70565049 432 + 82630442 tgcaatgtagaaaacattaaataaaggcttacctttttattATTAATAGTATTACCTCTTCTA--ACTTTGTTGTATCACTTT-------------ACTCT----TTTCTTTCTCTACGGCTACATATTTTT-GACAATAGATATTACACATTAGTTGAGTAGCAACCTTGTAGAAACATTCCCAGATATATGTTAAAATAT---AATGTTGCAAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGCTGCCAGTTTTTCT----CTATTGCTAATATTTTATCTTTATCTAGGCTTTTGATTTGCAATAATTATTCTTTTATG-Tttgctatcttctcacttattatgaccatgtttccctttaagtccttgatcataagtataatagctgctttaaaagtcttgcctgattattttcagttctgggtcatcttgagatcagtctcca-tcaattgattaatt i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61631472 449 + 73212453 tgcaacgtagaaaacattaaataaaggcttacctttttattATTAATAGTATTACCTCTTCTA--ACTTTGTTGTACCACTTTGTTATATCACTTAACTCTTTTCTTTCTTTCTCTACGGCTGCATATTATT-GACAATAGATATTACACATTAGTTTAATACCAACCTTGTAGAAACATTCCCAAATATATGTTAAAATAT---AATGTTGCAAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGCTCCCAGTTTTTCT----CTATTGCTAATATTTTATCTTTATCTAGGCTTTTGATTTGGAATAATTATTCTTTTATG-Tttgctatcttctcatttattatgaccatgtttccctttaagtccttaatcataagcataatagctgctttaaaagtcttgcctgattattttcagttctgggtcatcttgagatcagtctcca-ttaactgattaatt i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41780075 431 - 94967081 tgcaatgtagaaaacattaaataaaggcttacctttttattATTAATAGTATTACCTCTTCTA--ACTTTGTTGTATCACTTT-------------ACTC-----TTTCTTTCTCTATGGCTACATATTTTT-GACAATAGATATTACACATTAGTTGAGCACCAGCCTTGTAGAAACATTCCCAAATATATGTTAAAATAT---AATGTTGCTAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGCTCCCAGTTTTTCT----CTATTGCCAATATTTTATCTTTATCTAGGCTTTTGACTTGGAATAATTATTCTTTTATG-Tttgctatcttctcatttattatgaccatgtttccctttaagtccttgatcataagtatagtagctgctttaaaagtcttgcctgattattttcagttctgggtcatcttgagatcagtctcca-ttaattaattaatt i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69144645 436 + 80904711 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macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63156296 441 + 74645514 TGCAATGCAGAAAACATTAAATACAggcttacatttttattattaatagtattacCTCTTCTAACACTTTGTTGTATCACTtt-------------actcttttccttctttctctacagctacatattttt-gacaaTAGGTATTACACGTTAGTTGAATACCAACTTTGTAGAAACATTCccaaatatatgttaaaatattataatgttGCAAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGCTCCCAGTTTTTCT----CTACtgctaatattttatctttatctaGGCTTTTGATTTGgaataattattcttttatg-tttGCTATCTTCTCATTTACTACAACCATGTTTCCCTTTAAGCCCTTAATCATAAGTATAACAGCTGCTTTAAAAGTCTTGCCAGATTATTTTCAGTTCTGGGTCACCTCAAGATCAGTCTCCA-TTAATTGATTAATT i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25254967 439 - 75148670 tggaaggcagaaaacattaaatacaggcttacatttttattattAATAATATTACCTCTTCTA--ACTTTGTTGTATCACTTT-------------ACTCTTTTCCTTCTTTCTCTATGGCTACATATTTTT-GACAATAGGTATTACACGTTAGTTGAATACCAACCTTGTAGAAACATTCCCAAATATATGTTAAAATATTATAATGTTGCAAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATTTGTTCCAAGTTTTTCT----CTACTGCTAATATTTTATCTTCATCTAGGCTTTTGATTTGGAATAACTATTCTTTTATG-TTCActatcttctcatttattacaaccatgtttccctttaagcccttgatcataagtataacagctgctttaaaagtcttgccagattattttcagttctgggtcacctcaagatcagtctcca-ttaattgattaatt i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120131778 429 + 159171411 tgcaatgtagcaaacattaaataaatggttatatttttattactAATAGTATTAGCTCTTCTA--ACTT-----TATCATTTT-------------ACTCT--CCTTTCTTTCTCTATGGCTACATATTTTT-GACAATAGGTATTACACATTAGTTGAGTACCAACCTTGTATAAACATTCCCAAATATATGT--AAATATTATAATGCTCCCAATAA--GCTTGATGAAGAAATGTGAAATGTGCTCCCAGTTTTTCT----CTATTGCTAATATTTTCTCTTTATCTAGGCTTTTGATCTGGAATAATTA--CTTTTATG-TttgctatctcctcattcattatgaccatgtttcccttcaagtccttgatcataagtataatagctgctttaaaagtcttgcctagttattttcagttctggatcatccggagATCAGTCCCCACTTAATTGATTAATT i calJac3.chr5 C 0 I 598 s canFam3.chr9 7960405 430 + 61074082 TAAAAGGTAACAAAC----AATACATGTTTACATTGTTATTATTAGTAGTATTACTTCCTCTA--ACTTTGTTCTATCAGTTT-------------ATTCT----TCTCTCTCTCTACTGCTGCATATTTTCAGACAGTAGGCATT-TACTTTA-CTGAGTACTCATCTTGTGTAAACATTCCCAAATACATATT-AAATATTGTAATTCCACAAATAGCTTCTTGGTGAATAAACCTGTGATTTATG---AGTTTTTGTTCTCCTATTACTAGTATTTT---TTTATCTAGGCTTTTGATTTAGTATAGtttttcttctatgatttgctatcatctttttcattatgagcatcttttcctttaagtccttgatcaaaagtataacagccacttaagaattcttgtctgattattcccacttctgaaccatcttggtagtagtctcca-ctgatttttttatt i canFam3.chr9 C 0 I 1 e mm10.chr11 112442984 705 + 122082543 I a score=187745.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 167900 88 + 235827 tcctc-cccaccaccacttgggaatcatataca--tttttt-----cttcatatataaagtaattttggtttgtgccctgaa-aatatatatata--ta s panTro4.chr17 70565481 88 + 82630442 tcctc-cccaccaccacttgggaatcatataca--tttttt----tcttcatatataaagtagttttggtttgtgccctgaa-aatATATATATA--T- i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61631921 90 + 73212453 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nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69145754 44 + 80904711 gtaaaaatagtaaactaaccctatgtgctgtcatcatctttcaa i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68893466 44 + 80997621 gtaaaaatagtaaactaaccctatgtgctgtcatcatctttcaa i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63157414 44 + 74645514 GTAAAAATAGTAAACTAACCCTATGTGCTGTCATCATCTTTCAA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25256083 44 - 75148670 gtaaaaataggaaactaaccctatgtgctgccatcgtctttcaa i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120133274 41 + 159171411 gt-aaaataggaaactcacccta--cgctgccatcatctttcaa i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112442984 705 + 122082543 I e canFam3.chr9 7961498 41 + 61074082 I a score=704759.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 168592 303 + 235827 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aagaaaagagagagacataagggattgcccacaaaaagagaaaagaccatgtgagaactcagagtcaa-gg----gggccacctgcaagctcaggagaggggc-------ct-aggggcaaccagaccttctggcaccttgatcttcaacttccagcctccagaac---------acaaatgtctgttgttgaagccatgcagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaacacaCAGA-AGGTTCATAAGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACATCAAAAAGACACC----AAAGTGTGCAAAAATACCAAAACAC s panTro4.chr17 70570431 304 + 82630442 aagaaaagagagagacataagggattgcccacaaaaagagaaaagaccatgtgaggactcagagtcaa-gg----gggccacctgcaagctcaggagaggggc-------ct-aggggcaaccagaccttctggcaccttgatcttcaacttccagcctccagaac---------acaaatgtctgttgttgaagccatgcagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaacacaCAGA-AGGTTCATAAGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACATCAAAAAGACACC----AAAGTGTGCAAAAATACCAAAACAC i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61636547 304 + 73212453 aagaaaagagagagatataagggattgcccacaaaaagagaaaagaccatgtgagaactcagagtcaa-gg----gggccacctgcaagctcaggacaggggc-------ct-acgggcaaccagaccttctggcaccttgatcttcaacttccagcctccagaac---------acaaatgtctgttgttgaagccatgcagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaacacaCAGA-AGGTTCATAAGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACATCAAAAAGATGCC----AAAGTGTGCAAAAATACCAAAACAC i ponAbe2.chr17 C 0 I 14 s nomLeu3.chr14 41785098 303 - 94967081 aagaaaagagagagacataa-ggattgcccacaaaaagagaaaagaccatgtgagaactcagagtcaa-gg----ggggcacctgcaagctcaggagaggggc-------cc-agggacaaccagaccttctggcaccttgattttcaacttccagcctccagaac---------acaaatgtctgttgttgaagccatgaagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaacacaCAGA-AGGTTCATAAGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACATCAAAAAGACACC----AAAGTGTGCaaaaataccaaaacac i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69149866 304 + 80904711 cagaaaacaaagagacataaggaattgcccacaaaaagagaaaagaccctgtgagaactcagagtcaa-gg----gggccacctgcaagccaaggagaggggc-------ctcaggggcaaccagaccttctggcaccttgatcttcaacttccagcctccagaac---------ataaaagtctgtggctgaagccatgcagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaat-TACAGA-AGGTTCATACGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACACCAAAAAGACAAC----AAAGTGTGCAAAATTACTGAAACAC i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68897769 304 + 80997621 cagaaaagtaagagacataaggaattgcccacaaaaagagaaaagaccctgtgagaactcagagtcaa-gg----gggccacctgcaagccaaggagaggggc-------ctcaggggcaaccagaccttctggcaccttgatcttcaacttccagcctccagaac---------ataaaagtctgtggctgaagccatgcagtctgtggtattttgttatgacagccctagcaaactaat-TACAGA-AGGTTCATACGATGTGGTGACAATTGTGACCAAAAGCACACCAAAAAGACAAC----AAAGTGTGCAAAATTACTGAAACAC i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63161720 303 + 74645514 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aagaaaaaagaaagacaagaaaaatagcccacaaaaacagaaaagaccatatgagaatgcagagtgaaggg----gggccacccgcaagccaaaaagaggggc-------ttcaggagcagccaaacctgctggcaccttga---tcaacttccagcctccggaactctgaggaaataaacgcctgttgttgaagccacacagtctgtggtattttgctatgacagtcctagcaaactaacacaCAGAGGGGTTCATAAGATGAGGTGATAATTGTGATCAAAAGCACGTCAAAAAGACACC----AAAGGGTACAAAAATACCAAAACAC i calJac3.chr5 I 322 C 0 s canFam3.chr9 7965288 288 + 61074082 ---------------------------------------aaagagaccatatgaggacacggagagaa-ggcagccagccatcttcaagccaaggagagagccaaggtttcttaccagaaaccaaacctgatagcataaagatcttggacttccagcctccagaactgtaaggagataaatttctgttgttcaagccactcagtctatggtattttgttactgtagtcccagcaaactat--tgcaGA-GGGTTTATCAAATGAAGTGCTTATCATGACCAAAAACACCTAGGAAAGAAACCCAAGGAAGTTTGCAAACAAACAAAAACCC i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112444976 5019 + 122082543 I a score=11860.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 173169 6 + 235827 CAAAAA s panTro4.chr17 70570735 6 + 82630442 CAAAAA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41785401 6 - 94967081 caaaaa i nomLeu3.chr14 C 0 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----attatatattaatatattataatgat----tatattata------aattatatgatataattactataattatattatcata-------atatattaatattgatatattacaatatattaatatatgacaatatattttgttatac---atatgttgtatgtttttattgtcaattatgttacatacaat-tatatattatattatacatact------atacagtatgttaaatatat------------------------------------------------------------acaacatacaatatatac-tatatac------------------------------atattacacatataatata-tat---------aatacattgtctatatatccatattatacatattacacatattagaatatgtataattttata-at-tataatgtat i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e mm10.chr11 112450781 1035 + 122082543 I e canFam3.chr9 7967078 0 + 61074082 C e calJac3.chr5 120139230 299 + 159171411 I e chlSab2.chr16 25262335 817 - 75148670 I e rheMac3.chr16 69151913 792 + 80904711 I a score=62259.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 175189 91 + 235827 agaatat-gtatatatacaatatata-atatacatacctata--------------------tatac-----aatat-tgtatat---atacaa----------------catgtattattgtatat-------------atacaatacat s panTro4.chr17 70572752 107 + 82630442 AGAatat-gtatatatacaatatata-atatacatacctata--------------------tatac-----aatat-tgtatat---atacaatacatgtattatacaacatgtattattgtatat-------------atacaatacat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61638855 91 + 73212453 agaatat-gtatatatacaatatata-atatacatatgtgta--------------------tatac-----aatat-tgtatat---ataCAA----------------CATGTATTACTGTTTAT-------------ATACAATACAT i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41787436 138 - 94967081 atggtat-atatacatattatatgta-atatgtat-tgtatatatgatacactatgtattattatat-----attat-tgtatatataatacaa----tatgtattacaatatgtattattgtatattattgtatatataatacaatacgt i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68900547 90 + 80997621 ATAATACAATATGTATATGATACATA-TTGTACATA--TATG--------------------TATAA-----TATGT-GGTATAT---ATACAA----------------TATGTATTATacaatac-------------atattatatat i macFas5.chr16 C 0 I 1 s papAnu2.chr16 63164381 88 + 74645514 ataatacaatatg--tatgatacata-ttgtacata--tatg--------------------tataa-----tatgt-agtatat---atacaa----------------tatgtattatacaatac-------------atattatatat i papAnu2.chr16 C 0 I 1 s calJac3.chr5 120139529 100 + 159171411 aaaatat-atatatatat-atatatatatatatatatatata--------------------tatGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT---ATAAAA----------------CACACAATATATTATACTAT----------ATACTATACAT i calJac3.chr5 I 299 C 0 e mm10.chr11 112450781 1035 + 122082543 I e canFam3.chr9 7967078 0 + 61074082 C e chlSab2.chr16 25262335 817 - 75148670 I e rheMac3.chr16 69151913 792 + 80904711 I a score=51758.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 175280 22 + 235827 ---------attatatatata-atatgttaga s panTro4.chr17 70572859 22 + 82630442 ---------atTATatatata-atatgttaga i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61638946 22 + 73212453 ---------ATTATatatata-atatgttaga i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41787574 20 - 94967081 ---------a-tataCA-ata-atatgttaga i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69152705 22 + 80904711 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gtgataactgatatgtggaaa---------aataaagctagctataggattaggaagtgttg-gggaatgggctgcattttcctacggggtattcagagtcatcctcgctgaaaagataaagcggtggaaggttgggcaaagcaggtgccccagagcagtgtgttccagggagagcgaggagcaagggcaaaaaccatgagcagg--tgtgggggtt--gataaa---------------gcagctggagtgaagtgaggga-atcctggaaggtggaagacaagaccccaccca i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63164492 265 + 74645514 GTGATAACTGATATGTGGAAA---------AATAAAGCTAGCTATAGGATTAGGAGGTGTTG-GGGAATGGGCTGCATTTTCCTATGGGGTATTCAGAGTCATCCTCACTGAAAAGATAAAGCGGTGGAAGGTTGGGCAAAGCAGGTACCCCAGAGCAGTGTGTTCCAGGGAGAGCGAGGAGCAAGGGCAAAAACCATGAGCAGG--TGTGGGGGTT--GATAAA---------------GCAGCTGGAGTGAAGTGAGGGA-ATCCTGGAGGGTGGAAGATAAGACACCACTCa i papAnu2.chr16 C 0 M 75 s chlSab2.chr16 25263174 265 - 75148670 gtgataactgatatgtggaaa---------tataaagctagctataggattaggaagtgttg-gggaatgggctgcattttcctatggggtattcagagtcatcctcactgaaaagataaagtggtggaaggttgggcaaagcaggtaccccagagcagtgtgttccagggagagggaggagcaagggcaaaaaccatgagcagg--tgtgggggtt--gataaa---------------gcagctggagtgaagtgaggga-atcctggagggtggaagataagacaccaccca i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120139661 267 + 159171411 gtaataaccgatatgtggaaa---------aataaggctagttacaggattagaaaatgttg-gggaaggggttgcattttcctgtgggatattcagagtcgtcctcactgaaaagacaaaggggtggaaggctggggaaagcaagtatcctaaagaagtgtattcaagggagagggaggagcaagggcaaaaaccatgagtata--tgtgggggttgggataaa---------------gcagctggagtggactgagaga-attctggagagtggtagataagacgccaccca i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7967078 271 + 61074082 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gggaccagaggaagaagacattaccaggcactgagcttttgcagtgaagg i macFas5.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25263439 50 - 75148670 gggaccagaggaagaagacattaccaggcactgagcttttgcagtgaagg i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120139928 50 + 159171411 gggaccagaggatgaggacgttatcaggcactgagctttcgtactgaagg i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7967349 50 + 61074082 gagaccagattacgaggatattgtcagacattgagcttttatactgaagg i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112450781 1035 + 122082543 I e papAnu2.chr16 63164757 75 + 74645514 M a score=111075.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 175617 31 + 235827 agatggagagtctccaagggtttgagtacat s panTro4.chr17 70573196 31 + 82630442 agatggagagtctccaagggtttgagcacat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61639283 31 + 73212453 agatggagagtctccaagggtttgagcacat i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41787909 31 - 94967081 agacggggagtctccaagggtttgagcacat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69153042 31 + 80904711 agatggggagtctccaagggtttgagcacat i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 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chlSab2.chr16 C 0 I 13 s calJac3.chr5 120141406 394 + 159171411 TCCACACAAATTCACTCTTACATAAAGAATTTTGAAGAAGAATGGCAACTCATCTCTGTCCAGTTACTAACATTTTTTATGAGGATGTAATACATTCCCAAAACTTCTATGTTCTAGAAAACAGAGAAGTATAAATATTTACTTTGCATTCATTTTTAGTCATGAATATTATCTTTAAAAAGCTCTGAATCAATGACAGGACAAGAGACACAAACAATGCCCTTTCT-ACCTTCTGGTTTTTGTATGTATAAATTCAGTGTCATACTTTATTGAATATTAGTGACTTCAAAGATATATTGGATTCTGTTATTCTGTATTTCAGC-TGGTAACCA-TAGGGCAAAAGGTTGA-------------------------------AATATTTTTTCTTTTGGTAGCT-GGAACTTTTAAGAGTTGAC--ACAAC i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7968826 380 + 61074082 -TGAAACAAATGTACATTTACCTAAAAAACTTTAAAG---AATAGCAACTTATCTCTGCCCAGTCACTTATA--TTTTGTGAGTGTGGAGCATATACCCCAA------ATGAAC-AGAAAACATGGGAATACAGATATTTTCTTTGCATTCCTTTTTCATAATGACTATTACCTTCAAGAGGCCATGAATTCATGACAGGATAAAGGACATTAACAATAATTCTTCT-ATTTCTTGCTATGTGTAGATATGAATTCATTGGTGCAGTATATTGAATATTAATGACTTCTAAAATATGTTAGATTCTATTGTTTCATG--TCATC-AGATAGGCA-TCAGAGCAAAGGCCAA-------------------------------AACACTTTTCTTATTGGTATCTGGGACCCTTTAAGAAGTAAT--ACAAC i canFam3.chr9 C 0 I 114 e mm10.chr11 112453362 944 + 122082543 I a score=411084.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 177473 127 + 235827 TTTTTTTTT----TAATGCAGTAGTCTCAGTCCTCAAAAATGATAGCAAATCAACCCTGATTCAGAAGCCATT---TAAGGGGTCTTAATATTTCAAGAAATTCCAAAATAAATGTATG-TTTTTAAAAAAGTAG s panTro4.chr17 70575053 127 + 82630442 TTTTTTTTT----TAATGCAGTAGTCTCAGTCCTCAAAAATGATAGCAAATCAACCCTGATTCAGAAGCCATT---TAAGGGGTCTTGATATTTCAAGAAATTCCAAAATAAATGTATG-TTTTTTAAAAAGTAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61641160 131 + 73212453 TTTTCTAATAAAATAATGCAGTAGTCTCAGTCCTCAAAAATCATAGCAAATCAACCCTGATTCAGAAGCCATT---TAAGGGGTCTTGATATTTCAAGAAATTCCAAAATAAATGTATG-TTTTTAAAAAAGTAG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41789752 129 - 94967081 TTTTTTTTT--TTTAATGCAGTAGTCTCAGTCTTCAAAAATCACAGCAAATCAACTCTGATTCAGAAGCCATT---TAAGGGGTCTTGATATTTCAAGAAATTCCATAATAAATGTGTG-TTTTTAAAAAAGTAG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69154887 128 + 80904711 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ponAbe2.chr17 61642184 143 + 73212453 caggtgatcctcccacctcagcatcccaagtagttggaaccatgt-ggtagctggaaccatgtgccactacccccagctaattttgtttattttgaagagatgggggtctcattatgttgcccaagcttgtttcaaactgtgct i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41790775 129 - 94967081 caggtgatcctcccacctcagcctcccaagtagttggaaccatgt-ggtagctg--------------tacgcccagctaattttgtttattttgaagagatgggggtctcattatgtttcccaagcttgtttcaaactggact i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120143131 125 + 159171411 caggagagcctcccacttcagcctcccaagtagctggaaccatgt------------------gccactatgcccagctaattttctttattttatagagat-agggtctcattatgttgcccaggctggtttcaaactgggct i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7971403 37 + 61074082 -----GCTCTTCCTCGTTTAGCCTCACA--------------------------------------------------TAATTTT---------------------------------------AGTTTGT------------- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112453362 944 + 122082543 I e chlSab2.chr16 25266360 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 63167687 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 68903833 0 + 80997621 C e 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panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61643052 405 + 73212453 TGCCCCTTGAACAGTATTATGGT-AAAAGAATGCAGTTTATGACACTTAATCGAGAAATAATTTAATGATTCCTATGTTCCCAAATGTCTTTTACCCTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATAAGCTGTGCAGTTATGACTATTTTTCAAGAGCAGAGTAAAAGCAAG-AAAAAGTAAAACCAAATT-GGGTTTAGATCTTCACTAAAATGCCCAATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCACAGTACTCTTGAGTAGCAACCATTCCTTTTGCCCGCAGGTGAC--AAACTCTGAGGTGCACTCAGGAAGGTACATTAT---------------ACTTCGCCTGTT----------CTGGGGAAACTAGACACAAACTCCTGGGTACTATTAGGGCCTCTGTGGGTTACCATAGTGAATTCCAAGTAACAATG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41791633 415 - 94967081 TTCCCCTTGAACAGCATTACAGTAAAAAAAATGCAGTTTATGACACTT----GAGAAATAATTTAATGATTCCTACATTCCCAAATGTCTTTTACCCTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATGAGCTGCGCAGTTATGACTATTTCTCAAGAGCAGAGTAAAAGCAAG-AAAAAGTAAAACCAAATT-GGATTTAGGTCTTCACTAAAATGCCCGATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCATAGT-CTCTTGAGTAGCAACCATTCCTTTTGCCCACAGGTGACTTAAACTCTGAGGTGCAGTCAGGAAGGCACATTA---ACTGTGGTGGGTGACTTCGCCTGTT----------CTGGGCAAACTAGATACAAACTCCTGGGTACTATTAGGGCCTCTGTGGGTTACCACACTGAATTCCAACTAACAATG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69156608 422 + 80904711 TGCCCCTTGAACAGTATTACGGT-AAAAGAATGCAGTTTATGACACTTAATTGAGAAATAGTTTAATGATTCCTACGTTCCCAAATGTCTTTTACCTTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATAAGCTGTGCAGTTATGACGATTTTTCAAGAGCAGACTAAAAGCAAG-AAAAAGTAAAACCAAATT-GGGTTTAGGTCTTCACTAAAATGCCCAATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCATAGTACTCTTGAGTAGCAGCCGTTCCTTTTGCACACAGGTGACTTAAACTCTGAGGTGCACTCAGGAAGCTACATTATTAACTGTGGTGGGTGACTTGGCCTGTT----------CTGGGGAAACTAGATACAAACTCCTGGGTACTATTAGAGCCTCTGTGGGTTACCATAGTGAATTCCAACTAACAATG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68904552 422 + 80997621 TGCCCCTTGAACAGTATTACGGT-AAAAGAATGCAGTTTATGACACTTAATTGAGAAATAGTTTAATGATTCCTACGTTCCCAAATGTCTTTTACCTTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATAAGCTGTGCAATTATGACGATTTTTCAAGAGCAGACTAAAAGCAAG-AAAAAGTAAAACCAAATT-GGGTTTAGGTCTTCACTAAAATGCCCAATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCATAGTACTCTTGAGTAGCAGCCGTTCCTTTTGCACACAGGTGACTTAAACTCTGAGGTGCACTCAGGAAGCTACATTATTAACTGTGGTGGGTGACTTGGCCTGTT----------CTGGGGAAACTAGATACAAACTCCTGGGTACTATTAGAGCCTCTGTGGGTTACCATAGTGAATTCCAACTAACAATG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63168409 422 + 74645514 TGCCCCTTGAACAGTATTACGGT-AAAAGAATGCAGTTTATGATACTTAATTGAGAAATAGTTTAATGATTCCTacgttcccaaatgtcttttaCCTTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATAAGCTGTGCAGTTATGACGATTTTTCAAGAGCAgactaaaagcaag-aaaaagtaaaaccaaatt-GGGTTTAGGTCTTCACTAAAATGCCCAATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCATAGTACTCTTGAGTAGCAGCCGTTCCTTTTGCGCACAGGTGACTTAAACTCTGAGGTGCACTCAGGAAGCTACATTATTGAACGTGGTGGGTGACTTGGCCTGTT----------CTGGGGAAACTAGATACAAACTCCTGGGTACTATTAGGGCCTCTGTGGGTTACCATAGTGAATTCCAACTAAcaatg i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25267081 403 - 75148670 TGCCCCTTGAACAGTATTACGGT-AAAAGAATGCAGTTTATGACACTTAATTGAGAAATAATTTAATGATTCCTACGTTCCCAAATGTCTTTTACCTTTTATTGTTATGTAGACCTCCTAGATAAGTTGTGCAGTTATGACGATTTTTCAAGAGCAGAGTAAAAGCAAG-GAAAAGTAAAACCAAATT-GAGTTTAGGTCTTCACTAAAATGCCCAATTCACCCTCAGTTTCAGTCACTTTCATAGTACTCTTGAGTA---------------GCGCACAGGTGACTTAAACTCTGAGGTGCACTCAGGAAGTTACATTATTAACTGTGGTGGGTGACTTGGCCTGTT----------CTGGGGAAACTAGATACAAACTCCTGGGTACTATTAGGGCCTCTGTGGGTTACCATAGTGAATTCC----AACAATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120146200 421 + 159171411 TGCCCCTTGAACAGTATTATGGT-AAAAGAATGCAGCTTATGACACTTAATTGAGAAATAATTTAATGATTCATATGTTCCCAAATGAC--TTACCTTTTATTGTTATGTAAACCTCCTAGATAAGCTGTGCAGTTATGACTATTTTTCAAGAGCAGAGTAAAAGCAAGAAAAAAATAAAAGGAAATTGGGGTTGAGGTTTTCACTAACATGCCAGATTCACCCTCAGTTTCAGACACTTTCACAGTACTC-TGAATAGCAACCATGCCTTTTGCCCACAGGTGACTTAAACTCTGAGGAGAACTCAGTAAGGTAGATTATTAACTGTGAAGGGTGACTTCACCTGTT----------CTGGGGAAACTAGATGCAAACTCTTGAGTACTACTGGAACCTCTGTGAATTACTATAGTGAATTTCAATTAACAATG i calJac3.chr5 M 738 C 0 s canFam3.chr9 7972556 423 + 61074082 TGCCCCTTGAACAGAGCTATGGT-ACAACACTGAAGTTTGTGACACCTAATTGAGAAATAATTTAATGATTCACACACTCACAAATGTCTTTTACCTTTCAAGGTTGCCTAGACCTCCTAGGTAAG-TGTACAGGTGTGAGGATATTTCAAAGGTAGTGTAAAAGCAAT-GGAAAGCAAATCCAAATC-CAGTTTCCATCTTATCTAAGATACTAAAATCATTCT-GTTTTTAGTCACAT---CAGCGTCACTGAGTAGGAATCATTTCTTT-GCCTACGGATGAGCTGGAATCTCAGA---ACTCTGGAGAGCAGGCCATTAACTCTGGCAAGTGATTCTCATTGTTTCTATTCTAACTGTAGAAACTAGATACAAATTCTTGAGTTCCATTAGAAGCTTTGTGAGCCACCACAGTAAACTCAATGTGACAATG i canFam3.chr9 C 0 I 74 e mm10.chr11 112453362 944 + 122082543 I a score=1077003.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 179778 385 + 235827 tatattagtctgttttcacactgctgataaagacatacccaagactgggtaatttataaagaaaaataggtttaatggactcacagttccatgtggctggggagtctgcacaatcatg-------------------------------------------------gcagcaagcaaagaga----gagaaccaagtgaaaggggtttctccttataaaactatcagctctcttgagacttattcactaccacaagaacagtat-gggggaaccgcccccatgattcaattatctcccacctag-------------------tccctcccacaacacgtgggaattatgggagctataattcaagatgagatttgggtagggacacaaccaaatcatatcaCAATGTGTGGCAAAAGTCATTCACCTGGTAGCTTGTCTT----ACAGCACAAGATCAGT s panTro4.chr17 70577358 384 + 82630442 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ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41792048 393 - 94967081 tatattagtctgttttcacgctgctgataaagacatacccaagactgggtaatttataaagaaaaataggtttaatggactcacagttccacgtggctggggaggcctcaaaatcatg-------------------------------------------------gcagcaagcaaagagagaacgagaacgaagtgaaaggggtttctccttataaaactatcagctctcatgagacttattcactaccacaagaacagtat-gggggaaccggccccatgattcaattatctcccaccagg-------------------tccctcccacaacacgtgggaattatgggagctacaattcaagatgagatttgggtggggacacaaccaaatcatatcaCAATGTGTGGCAAAAGTCATTCACCTGGTACCTTGTCTTACACACAGCACAAGATCAGT i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69157030 390 + 80904711 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macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63168831 390 + 74645514 tgtattagtctgttttcacgctgctgataaagacatacccaagattgggtaatttacaaagaaaaagaggtttaatggactcacagttccatgtgactggggaggcctcacaatcatg-------------------------------------------------gcagcgAGCAAGGAGAAAATGAGAAGCAAACGAAAGGACTTTctccttataaaactatcagctctcacgagactcattcactaccacaggaacagtatggggggaactgcccccatgcttcaattatctcccaccagg-------------------tccctcccacaacacgtgggaattatgggagctacaattcaagatgagatttgggtggggacacaaccaaaccatatcacaatgTGCGGCAAAAGTCATTCACCTGGTACCTTGTCTT----AAAGCACAGAATCAGC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25267484 390 - 75148670 tgtattagtctgttttcacgctgctgataaagacatacccaagattgggtaatttacaaagaaaaagaggtttaatggactcacagttccatgtcactgggaaggcctcacaatcatg-------------------------------------------------tcagcgagcaaggagagaatgagaagcaaatgaaaggactttctccttataaaactatcagctctcatgagactcattcactaccacaggaacagtatggggggaactgcccccatgcttcaattatctcccaccagg-------------------tccctcccacaacacatgggaattacaggagctacaattcaagatgagagttgggtggggacacaactaaaccatatcaCAATGTGTGGCAAAAGTCATTCACCTGGTACCTTGTCTT----AAAGCACAGAATCAGT i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120146621 456 + 159171411 tgtattcgtctgttttcatgctgctgataaagacatacccaaggctgggaaatttataaagaaaaatagattaattggactcacagtttcacatagttcagtaggcctcacaatcacggaggaaggcggaaagcagaaggcagaagctgaaaggcaaaactcacacagcagcaggcaaagagaaaatgagaaccaagtgaaaggggttgctccttataaagctatcagatctcgtgagacttactcaccaacgcgagaacagtag-ggaggaaccg-cctgatgattcaattatctcccaccgggagataagtcaattatctcctccctcccacaacacgtgggaatttcaggaactacaattcaagatgcgatttaggtggggatacagccaaaccacatcaCAATTCGTGGAAGAAGTCACCCACCTGGTACCTTGTCTT----AAAGCACAAGATTGGT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112453362 944 + 122082543 I e canFam3.chr9 7972979 74 + 61074082 I a score=1250070.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 180163 407 + 235827 ACTGCAGAAATCCCAAGAAGAAAGAGCCCCACCGATTGCAAAGACTAACACACTTAAATGTACTCCCACTTTT-CAAATAC-ACATGCTAATGGAAGTGCATGGTTTAGCTT-GAGCTCCCTAGTTTTCCTGGATAGCAGCAGAAACCTGCTTT------GCTGCACA--GTGGCTACGTAGAAGAGCTGCTTCTCTTCCTAGTCTCAGTCTTGGGTACATGTTAGTC---CAAAATCCCAGCTGTGTTCTACGTAAAGAGCATCATCATATTTCTTCACCTATGTGAAACCAGCCCCATAAGCTATTTGGGGCCAAAGGGTTTGTGATTATTACACAGGATGTTATATTTTAGTCACCAAGTGATGCACCTTTTATGAACAAAATAACTAGAAAATTTTTCTTTTATTTTCTAAGAAACA s panTro4.chr17 70577742 407 + 82630442 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ACTGCAGAAATCCCAAGAAGAAAGAGCCCCACCCATTGCAAAGACTACCACACTTAAATATACTCCCACCTTT-CAAATAC-CCATGCAAAAGGAAGTGCATGATTCAGCTT-GAGCTCCCTAGTTTTCTTGGATAGCAGCAGAAACCTGCTTT------GCTGCATA--GTGGCTAAGTAGAAGAGATGCTTCTCTTCCTAGTCT--GTCTTGGGTA-ATGTTAATC---CAAAATCCCAGCCGTATTCTACGTAAAGAGCATCATCATATTTCTTCACGTATGTGACACCAGCCCCATAAGCTATTTTGGGTCGAAGGGTTTGTGGTTATTACACAGGATGTTATATTTTAATTGCCGAGTGATACAATTTTTATGAACAAACTAACTAGAAAATTGTTCTTGTATTATCTAAGAAACA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120147077 392 + 159171411 ACCGCAGAAATCCCAAGAAGAAATAGCCCCCCAGATTGCAAAGAGTGCCACACT----------------TTT-CAAATACACCATGCAAATTGAAGTGTGTGATTTAGCTC-GAGCTTCCTAGTTTTCTTGGATAGCAGCAGAAACCTGCTTT------GGTGCATAGTGTGGTTAAGTAGAAGAGCTATTTCTCTTCCCAGTCTCAGTCCTGGGCACACATCAGTC---CAAAATCCCAGCTGTATTCTATGTAAAGAGC-TTACCATATTTCATCACCTATCTGACACCAGTCCCATAAACTATTTTGGA-CAAAGGGCttgtgattattacatgggacttcatattttaattgctgaatgatgtactttttatgaacaaaataactagaaaatttttcttttattatctaaggaaca i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7973053 389 + 61074082 -------------------------ACTGCATTGATCACAAAATCAAATAGACCTAAACATACTAACACTTTTCCACATGCACTATGCAAGTAGACATGTATGATTTAGCTTGGGGCTTCCTATTTTTCTTGGATAGCAGTAGGAACTTAGTTTTCGGGGGGGGGAGG--GTTAAAAAGAAGAGGAGCTGCTTCTATTTTTAGTCGTGTTCCTAAGTTCCTATTGGTTATAAAAAATCCCAGCCGAATTCCA--TAAAAAGCATCATTAC-TTTCTTAACTTGTATGCCACCAGCAACGTAAACTATTTTGGG-AGAAGAGATTGTGACCATCACACAAGACTCCATAGTTTAACTTCCCAATGACCTACTTTTTGTGAACAAAATAACCA-CAAGCTCTTCTTTTATTATCTGAGAAACA i canFam3.chr9 I 74 I 6 e mm10.chr11 112453362 944 + 122082543 I a score=1112886.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 180570 381 + 235827 CACATACACCTCTTAGGATATGCCTGAGATTCCATTTCAAGAGAAGAAAAGTATGATACCCACAGTGTGCATTTAAACAGAAAGAGGAAATTCAGTTATTTTCTTCTTGAACTAATATGCTCAATGTAGTGACTACAACTTAAGTGGAAGAGGATAGACATTATTAGTATCCTGTACCCACAAATGACACAACTGAGGCACCTAGAGTTGATTGAAACAATCCAGACAAATAAATATTTTCAGGATTGAGATTTGAATGCAAGTCCAATGTTCACACTTCCTGGCTTTCAGGGGCTG-CCCAACCATTTGGTACTTTAAATCC----TGTTAGAACTTGAATGCA-------------------------------------------CACACACATTAAGGGCTTAACAAGTAAGTTTTGTTCTTCAG s panTro4.chr17 70578149 381 + 82630442 CACATACACCTCTTAGGATATGCCTGAGATTCTATTTAAAGAGAAGAAAAGTATGATACCCACAGTGTGCATTTAAACAGAAAAAGGAAATTCAGTTATTTTCTTCTTGAACTAATATGCTCAATGTAGTGACTACAACTTAAGTGGAAGAGGATAGACATTATTAGTATCCTGTACCCACAAATGACACAACTGAGGCACCTATAGTTGATTGAAACAATCCAGACAAATAAATATTTTCAGGATTGAGGTTTGAATGCAAGTCCAATGTTCACACTTCCTGGCTTTCAGGGGCTG-CCCAATCATTTTGTACTTTAAATCC----TGTTAGAACTTGAATGCA-------------------------------------------CACACACATTAAGGGCTTAACAAGTAAGTTTTGTTCTTCAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61644243 378 + 73212453 CACATACACCTCTTAGGATATGCCTGAGATTCCATTTAAAGAGAAGAAAAGTGTGATACCCACAGTATGCATTTAAACAGAAAGAGGAAATTCAGTTATTTTCTTCTTGAACTAATATGCTCAATGTAGTGACTACAACTTAAGTGGAAGAGGATAGACATTGTTAGTATCCTGTACCCACAAATGACACAACTGAGGCACTTAGAGTTCATTGAAACAATCCAGACAAATAAATATTTTCAAGACTGAGGTTTGAATGCATTTCCAATGTTCACACTTCCTGGCCTTCAGGGGCTGCCCCAATCATTTTGTACTTTAAATCC----TGTTAGAACTTGAATGCA-------------------------------------------CACACACATTAAGGGCTTAAC----AAGTTTTGTTCTTCAG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41792840 378 - 94967081 CACATGCACCTCTTAGGATATGCCTGATATTCCATTTAAGGAGAAGAAAAGTGTGATACCCGCAGTGTGCATTTGAACAGAAAGAGGAAATTCAGTTATTTTCTTCTTGAACTAATATGCTCAATGTAGTGACTACAACTTAAGTGGAAGAGGATAGACATGATTAGTATCCTGTACCCACAAATGACACAACTGAATCACCTACAGTTGATTGAAACAATCCAGAC----AAATATTTTCAGGATTGAGGTTTGAATGCAAGTCCAATGTTCACACTTCCTGGCTTTCAGGGGCTGCCCCAATCATTTTGTACTTTAAATCC----TGTTAGAACTTGAATGCA-------------------------------------------CACACACATTAAGGGCTTAACAAGTAAGCTTTGTTCTTCAG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69157826 406 + 80904711 cacatgcacctcttaggatatgcctgagattccatttaaggagaagaaaagtgtgatacccacagtgtgcatttgaacagaaagaggaaATTGAGTGATTTTCTTCTTGAATTAATACGCTCAATGTAGTGACTACAACTTAAGTGGAAGAGGATAGACAGTATTAGTATCCTGTACCCACAAATGACACAACTGAGGCACCTAGAGTTGACAGAAACAATCCAGACAAATAAATACTTTCAGGACTGAGGTTTGAATGCAAATCCAGTGTTCACACTTCCTGACCTGCAGGGGCTGCCCCAATCGTTTTATACTTTAAATCC----TGTTAGAACTTGAATGCG-------------------cacacatgcacatgcacacacacacagacacacaAAGGGCTTAACAAGTAAGTTTTGTTCTTCAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s 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i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120162651 898 + 159171411 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acatggtggcaggcaagacagaatgaacgccaagtgaaaggggaaaccccttataaaaccgtcagatcttatgagacttattcactaccccGAGAAGAGTATGggagaaactgtccccatgattccattatatCCCaacaggtccttcccacaacacgtgggagtTATGGGacctacaatttaagatgagatttgagtgaagacacagccaaatcataccA i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25288622 221 - 75148670 acatggtggcaggcaagagagaatgagagccaagtgaaaggggaaaccccttataaaaccgtcagatcttatgagacttattcactaccccgagaagggtatgggagaaactgtccccatgattccattatatcccaacaagtccttcccacaacacgtgggagttatgggacctacaatttaagatgagatttgagtgaagacacagccaaatcatatca i chlSab2.chr16 I 78 C 0 s calJac3.chr5 120169854 221 + 159171411 acatggtggtaggcaagagagaatgagagccaagtgaaaggggaaaccccttatacaaccatcagacctcgtgaaacttattcactaccacgagaacagtatgggagaaactgcccccatgattcaattctatcccaccaggtcccacccacaacatgtggaaattatgggaggtaccattcaagatgagatttggttgaagacaaggccaaattatatta i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112464215 1399 + 122082543 I e canFam3.chr9 7988284 17 + 61074082 I a score=211561.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 201797 62 + 235827 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CTGCCTCTGGCCATTGGCAAAGTTTGGGTTTTTGTGTTAATGTCACCTTGCTATCTGGGAGG i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112465614 60 + 122082543 GTTTCTCTGGCACTTCTTAATGTTTGTG-ATTTGTGGGAATATCATGTGGTTGTCT-GGACA i mm10.chr11 I 1399 C 0 e canFam3.chr9 7988284 17 + 61074082 I a score=1114725.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 201859 328 + 235827 TGGGAGTGGGAGTTGATGTGTCTAATCATTTTTCATTCATTTGCACTCTGGTCCATTGGGAATATCTCTGCTATCCCGTCTGTCACTATG-TGCTATAGCTCTTTACCTGTTGTTCTCTCTCCCTGCCTGATTCCTTGAAGCTGAAAGCCA-TATGGTA---CTCTCTGCATCTCTG------ACTGCTCTCAGAAG--ACAAAACACATGGAAAGTACTCATTATATATTGAATGAATCAAAACTACATGCACATTCCCCTGTTGCTCCTTCTCTTAGCCTTTTGTCAGTCTTCATGAAGACTTTCAG------------TAATCAGAAaataacaaatactatttattgag s panTro4.chr17 70607360 328 + 82630442 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GGGGAGTGGGAGCTGATGTGTCTAATCATTTTTCATTCAtgtgcactctggtacactgggaatatctctgctatcccctttatcagtatg-tgctatagctctttacctattgttctctccccctgcctgactccttgaagctgaaaacca-tacagtactcctctctgcatctctg------actgctctcagaag--acagaacacatggaaagtactcattatacattgaatgaatcaaAACTACATGCACATTCCCCTGTTGCTCCTTCTCTTAGCCTTTTATCAGTTTTCATGAAGACTTTCag------------taaccagaaaataac----------tattgag i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120170137 328 + 159171411 TGGGAGTGGGAGCTGATGTGTCTAATCATTTTTCATTCATTAGCATTCTGGCACATTGGGA--ATCTCTGCTGTCCTGTCT-TCACCAAG-TGCTATAGctgtttacctgctgctgtctctccctgcctgattccttgaagctgaaagcca-tatgatactcctctctgcatctctg-------ctgctctcagaagacacagaatacatagaaagtattcattagacattggatgaatcaaAACTACATACACATTCCCTT-TTGCTCCGTCTCTTAGCCCTTTGTCAGTCTTCATGAAGACTTTCAG------------TAATCAGAAAACAACaactactatttattgag i calJac3.chr5 C 0 C 0 s mm10.chr11 112465674 314 + 122082543 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TGCCCATTATAGACCAGGCTCTGTTGTAAATTCTTTATATTACTAACTAAATGTCCA i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112465988 826 + 122082543 I a score=707406.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 202242 193 + 235827 aaatgtttttatgagatagatagctgaggaaacagatggtcac--agatgaaagt-----gctggcttttcatcac-atgactactagtgaaggaaccagaactgagaccagataccttctcttaactcccaagctgaagtgcttcccTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTCACATTCTTAAAACTTTA s panTro4.chr17 70607743 193 + 82630442 aaatgtttttatgagatagatagctgaggaaacagatggtcac--agatgaaagt-----gctggcttttcatcac-atgactactagtgaaggaaccagaactgagaccagataccttctcttaactcccaagctgaagtgcttcccTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTCACATTCTTAAAACTTTA i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61668524 193 + 73212453 aaatgtttttatgagatagatagctgaggaaacagatggtcac--ggatgcaagt-----gctggcttttcattac-atgactactagtgaaggaaccagaaatgagaccagataccttctcttaactcccaagcTGAAGTGCTTCCGTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTCACATTCTTAAAACTTTA i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41814080 193 - 94967081 aaatgtttttatgagatagatagccaaggaaacagatggtcac--agatgcaagt-----gctgtctcttcatcac-atgactattagtgagggaaccagaactgagaccagataccttctcctaactcccaagctgaagtgcttcccTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCACCCAGTCACATTCTTAAAACTTTA i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69178931 193 + 80904711 aaatgtttttatgagatagatcgctgaggaagcagatggtcac--agattaaagt-----cctggctcttcaacac-acgactattagtgaaggaaccagaactgagaccagataccttctcttaactcccaagttgaagtgcttcccTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTTACATTCTTAAAATTTTA i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68926864 193 + 80997621 AAATGTTTTTATGAGATAGATCGCtgaggaagcagatggtcac--agattaaagt-----cctggctcttcaacac-acgactattagtgaaggaaccagaactgagaccagataccttctcttaactcccaagttgaagtgctTCCCTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTTACATTCTTAAAATTTTA i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63190651 193 + 74645514 AAGTGTTTTTATGAGATAGATCGCTGAGGAAGCAGATAGTCAC--AGATTAAAGT-----CCTGGCTCTTCAACAC-ACGACTATTAGTGAAGGAACCAGAACTGAGACCAGATACCTTCTCTTAACTCCCAAGTTGAAGTGCTTCCCTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGttacattcttaaaatttta i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25289281 193 - 75148670 aaatgtttttatgagatagatcgctgaggaagcagatggtcac--agattaaagt-----cctggctcttcaacac-acgactattagtgaaggaaccagaactgagaccagataccttctcttaactcccaagttgaagtgctTCCCTGGAGAGCCTTGTCTAGGTCAGCATTGCATCCAGTCACATTCTTAAAACTTTA i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120170519 184 + 159171411 aaaca-ttttatgagatagatggctgagaaaacagatggtcac--agattaaagt-----gctgtctcttcctcac-ataactattagtgaaggagccagaactaagaccaggt--------ttaactcctaagctgaagtgctcctCTGGAGAGTCCTGTCCAGGTCAGCATTGCATCAAGTCACAGTCTTAAAACTTTA i calJac3.chr5 C 0 I 308 s mm10.chr11 112466814 196 + 122082543 AAATACTTTTATAAGAGACATGGTTGAGAAGACCAGTGTGCAC--ATACACATGTAGATCGCTAACTCTTTGCCCCTTTGACAATAAGCAGCAGAGCCAGAGTTGATCACAGAGGGAGCTATTGAACTCCCAAGCTAAATGGCTTGACTGGAAATCCCCATCTGGTCCAGTGTTGCA---AGCCTCGTCTTTGAGATATTG i mm10.chr11 I 826 I 1 s canFam3.chr9 7988657 195 + 61074082 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calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7996841 204 + 61074082 ----------aagtcctca-------------------------------------------------------------------------GCTTCCTCACTGTgctcccagcgtacctttgctctgactcttccctttgccgaatgttcttcccctagaagatcatagatagtcctttcaccttcacctccctcccaagtctctgctcaaaagtcccatcgtcagaaacctcttcccaagtctgactaccca-tcagcttctattctattacccagtgtcatattt i canFam3.chr9 C 0 C 0 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I e panTro4.chr17 70618247 1741 + 82630442 M a score=695057.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213109 260 + 235827 taccctggtacttactgtcacctctatgtacataa--tgtttgtttgattctatatgtcttcacttcctgtcccccccttaccacc----accactagaatgtcagctctgg---gagagcatggacagtatacagtttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatgacaact-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGTAAGTGAAT-------AGAAAAGAAAGCAGGGAGGTGGACAGGGAAGGAGGTGGACAGGGAAGGAGG s panTro4.chr17 70620021 259 + 82630442 TAccctggtacttactgtcacctctatgtacataa--tgtttgtttgattctatatgtcttcacttcctgtcccccc-ttaccacc----accattagaatgtcagctctgg---gagagcatggacagtatacagtttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatgacagct-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGTAAGTGAAT-------AGAAAAGAAAGCAGGGAGGTGGACagggaaggaggtggacagggaaggagg i panTro4.chr17 M 1741 C 0 s ponAbe2.chr17 61679404 259 + 73212453 taccctggtacttactgtcacctctatgtacataa--tgtttgtttgattctatatgtcttcacttcctgtcccccc-ttaccacc----accactagaatgtcagctctgg---gagggcatggacagtatagagtttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatgacagct-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGTAAGTGAAT-------agaaaagaaagcaggtaggtggacagggaaggaggtggacagggaaggagg i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41831927 229 - 94967081 taccctggtacttgctgtcacctctgtgtacataa------tgtttgattcgatatgtcttcacttcctgtcccccc-ttaccacc----ac---tagaatgtcagctctga---gagggcatggacagtatacagcttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatggcagct-cataattagcactcaaatatattgtaaaatATGTAAGTGAAT-------AGAAAAGAAAGCagggaggtggacaggg----------------------- i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69189698 231 + 80904711 caccctggtagttactatcacctctatgtacataa------tgtttgattctatatgtctttacttcctgtccccac-ttaccacc----accactagaatgtcagttctgggctgcgggaatggacagtatacagtttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatgacagct-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGTAAGTGAAT-------agaaaagaaagcagggaggtggac--------------------------- i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68937631 231 + 80997621 caccctggtacttactatcacctctatgtacataa------tgtttgattctatatgtctttacttcctgtccccac-ttaccacc----accactagaatgtcagttctgggctgtgggaatggatagtatacagtttactgctcttatatatcaagcctcaacaaatgacagct-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGTAAGTGAAT-------AGAAAAGAAAGCAGGGAGGTGGAC--------------------------- i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63201430 231 + 74645514 CACCCTGGTACTTACTATCACCTCTATGTACATAA------TGTTTGATTCTATATGTCTTCACTTCCTGTCCCCAC-TTACCACC----ACCACTAGAATGTCAGTTCTGGGCTGTGGGAATGGACAGTATACAGTTTACTGCTCTTATATATCAAGCCTCAACAAATGACAGCT-CATAATTAGCACTCACATATATTGTTAAATATGTAAGTGAAT-------agaaaagaaagcagggaggtggac--------------------------- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25300014 231 - 75148670 taccctggtacttactatcacctctatgtacataa------tggttgattctatatgtcttcacttcctgtccccac-ttaccacc----accactagaatgtcagttctgggctgggggaatggatagtatacagtttactgctcttatatatcaagtctcaagaaatgacagct-cataattagcactcaaatatattgttaaatATGCAAATTAAT-------AGAAAAGAAAGCAGGGAGATGGAC--------------------------- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120182198 213 + 159171411 taccctggtacttactgtcacctccatgtacataa------tgtttcattctctacgtcttcacttcctgtcccccc-ttaccacc----accactagaatatcagctctgg---gaggacatggacAGTATACACTTT-------------------CCTCAACAAACGACAGCT-TACAATTAGCACTCAAATATATTGTTAAATATGTAAGAGAAT-------AGAAAAGAAAGCAGGTAGGTGGACAGAG----------------------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7997045 259 + 61074082 caccattgctcttattgcca-ctgtatgtatggaacatgtttatttggttca--------ttacttcttgcccct---ttcccacccaatgcccctagagtgtcagctctgt---gagagcagagacagcacacggtttagtg-tgagacatgcaatgtctcaacaaatgactgctacataactagcattcaaacatactgttgatgatataaatgaatAAGACTAAGGAAGAAAAAGACTGAGGTAGACAGCATGGGAAGGAAAGAGAGAGAGG-- i canFam3.chr9 C 0 I 3 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I a score=3516.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213369 16 + 235827 TGGACAGGGAAGGAGG s panTro4.chr17 70620280 16 + 82630442 tggacagggaaggagg i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61679663 16 + 73212453 ggaagagggaaggagg i ponAbe2.chr17 C 0 I 253 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I e canFam3.chr9 7997304 3 + 61074082 I e calJac3.chr5 120182411 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25300245 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 63201661 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 68937862 0 + 80997621 C e rheMac3.chr16 69189929 0 + 80904711 C e nomLeu3.chr14 41832156 0 - 94967081 C a score=673.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213385 7 + 235827 TGGACAG s panTro4.chr17 70620296 7 + 82630442 tggacag i panTro4.chr17 C 0 C 0 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I e canFam3.chr9 7997304 3 + 61074082 I e calJac3.chr5 120182411 0 + 159171411 C e chlSab2.chr16 25300245 0 - 75148670 C e papAnu2.chr16 63201661 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 68937862 0 + 80997621 C e rheMac3.chr16 69189929 0 + 80904711 C e nomLeu3.chr14 41832156 0 - 94967081 C e ponAbe2.chr17 61679679 253 + 73212453 I a score=1101158.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213392 414 + 235827 GGAAGGAGGTGGACAGGGAAGGAGG----------------GGAAGAGGGAAGGAGAGAAGGTCATtgatatggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcacgttgaattgtagctcccataatttccatgtgtcatgggagggacctgggtgggaggtaattgaatcacggggcagagtctttcctacactgttctcatgatagtgaataagtctcagaagatccgatggtttt-ataaaggggagttcccctgcacaaactctcccatctgccactatgtaagatgtgactttgctcctcagtcaccttcagacatgattatgaggcctccccagccatgtggaactgtgagtccattaatccttcttactttataaattacccagtctcaggtatgtcttcattaacagcatgaggacagactaatat s panTro4.chr17 70620303 429 + 82630442 ggaaggaggtggacagggaaggaggtggacagggaaggaggggaagagggaaggagagaaggTCATtgatatggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcacattgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggagggacctgg-tgggaggtaattgaatcacgggggcgagtctttcctacactgttctcatgatagtgaataagtctcacaagatccgatggtttt-ataaaggggagttcccctgcacaaactctctcgtctgccactatgtaagatgtgactttgctcctcactcaccttcaaacatgattatgaggcctccccagccatgtggaactgtgagtccattaatccttcttactttataaattacccagtctcaggtatgtcttcattaacagcatgaggacagactaatat i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61679932 413 + 73212453 ggaaggaggggaagagggaaggagg----------------ggaagagggaaggagagAGGGTCATtgatatggtttggctgtat--ccccacccaaatctcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggagggacctgg-tgggaggtaattgaatcacgggggcgagtctttcctacactgttctcatgatagtgaataagtctcacaagatccgatggtttt-ataaaggggagttcccctgcacaaactctgtcatctgccactatgtaagatgtgactttgctcctcagtcaccttcagccatgattgtgaggcctccccagccatgtagaactgtgagtccattagtccttctttctttataaattacccagtctcaggtatgtcttcattaacagcatgaggacagactaatat i ponAbe2.chr17 I 253 C 0 s nomLeu3.chr14 41832156 411 - 94967081 --aaggaggggaagagggaaggagg----------------ggaagagggaaggagagaggATCACtgatagggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggaaggacctgg-tgggaggtaattgaatcacgagggcaagtctttcctacactgttctcatgatagtgagtaagtctcagaagatccaatggtttt-ataaaggggagatcccctgcacaaactctcccatctgccactatgtaagacgtgactttgctcctcagtcaccttcagccatgattgtgaggcctccccagccgtgtggcactgtgagtccattaatcctttttactttataaattacccagtctcaggtatgtcttcattagcagcatgaggacagactgatat i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69189929 398 + 80904711 --------------agggaaggagg----------------ggaagagggaaggagagagggCCATtgatatggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggacggacctgg-tgggaggtaattgaatcacggaggctagtctttcctacactgttctcataatagtgaataagtctcgcaagatcctatggttttaataaaggggagttcccctgcacaaactctctcatctgccactatgtaagatgtgactttgctcctcactcaccttcagcca-gaatgtgaggcttccccagccatgtggaacggtgagtccattaatctcttttacttta-aaaagacccagtctcaggtatgtcttcattagcagcatgagaacaaatcaatac i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68937862 398 + 80997621 --------------AGGGAAGGAGG----------------GGAAGAGGGAAGGAGAGAGGGCCATtgatatggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggacggacctgg-tgggaggtaattgaatcatggaggcaagtctttcctacactgttctcataatagtgaataagtctcacaagatcctatggttttaataaaggggagttcccctgcacaaactctctcatctgccactatgtaagacgtgactttgctcctcagtcaccttcagcca-taatgtgaggcctccccagccatgtggaacggtgagtccattaatcccttttacttta-aaaagacccagtctcaggtatgtcttcattagcagcatgagaacaaatcaatac i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63201661 398 + 74645514 --------------agggaagaagg----------------ggaagagggaaggagagagggtcattgatatggtttggctgtgt--ccccacccaaatctcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggacggacctgg-tgggaggtaattgaatcacggaggcAAGTCTTTCCTACActgttctcgtaatagtgaataagtctcacaagatcctATGGTTTtaataaaggggagttcccctgcacaaactctctcatctgccactatgtaagatgtgactttgctcctcagtCACCTTCAGCCA-gaatgtgaggcctccccagccatgtggaactgtgagtccattaatcccttttacttta-aaaagacccagtctcaggtatgtcttcattagcagcatgagaacagatcaATAC i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25300245 382 - 75148670 ----------------------------------------------AGGGAAGGAGAGAGGGTCATtgatatagtttggctgtat--ccccacccaaatttcaccttgaattgtagctcccataattcccatgtgtcatgggacggacctgg-tgggaggtaattgaatcacggaggcaagtctttcctacactgttctcataatagtgaataagtttctcaagatcctatggttttaataaaggggagttcccctgcacaaactctctcatctgccactatgtaagacgtgactttgcttctcagtcaccttcagtca-gaatgtgaggcctccccagccatgtggaacggtgagtccattaatcccttttacttta-aaaagacccagtctcaggtatgtcttcattagcagcatgagaatagaccaatac i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120182411 374 + 159171411 ------------------AAGGAGG----------------AGAAGAGGGAAGGAGAGAGGGTCATtgatatggttttgctgcattcccccacttaaatctcattttgaattgcccctcccataattcccacttgccatgggagacacccgg-tgggaggaaattgaatcatgggggcatgtctttcctgtgctgttctcatgatattgaataagtctcatgagagcagatggtttt-ataaaggggagttcccctgtacaaactctcttgcctgtcaccatgtaagatgtgacttggctcctctgtcacct-----------------------ccagccatgtggaactgtgagtcaattaaacgcttttctttcataaattacccagtctcaggtatgtcttcattggcagcatgagaacagactaataT i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I e canFam3.chr9 7997304 3 + 61074082 I a score=153637.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213806 48 + 235827 aGTCATTTACCGCTTGTGGATCAGCTTACTTAAAATAATTTCACCTAG s panTro4.chr17 70620732 48 + 82630442 aGTCATTTACCGTTTGTGGATCAGCTTACTTAAAATAATTTCACCTAG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61680345 48 + 73212453 aGTCATTTACCGCTTGTGGATCAACTTACTTAAAATAATTTCACCTAG i ponAbe2.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41832567 48 - 94967081 aGTCATTTATTGCTTGTGGATCAACTTACTTAAAATAATTTCACCTAG i nomLeu3.chr14 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 69190327 48 + 80904711 aGTCATTTATCACTTGTGGATCAGCTTACTTAAAAGAATTTCACCTAG i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68938260 48 + 80997621 aGTCATTTATCGCTTGTGGATCAGCTTACTTAAAAGAATTTCACCTAG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63202059 48 + 74645514 AGTCATTTATCGCTTGTGGATCAGCTTACTTAAAAGAATTTCACCTAG i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25300627 48 - 75148670 aGTCATTTATCGCTTGTGGATCAGCTTACTTAAAAGAATTTCACCTAG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120182785 44 + 159171411 GGTTA-TTATCGC---TGGATCAGTTTACTTAAAATAATTCTACCTAA i calJac3.chr5 C 0 C 0 s canFam3.chr9 7997307 48 + 61074082 AGTCATTCATGACTAGAGCAACAGTTTATTGAAAAGGATTTCACCTGG i canFam3.chr9 I 3 I 228 e mm10.chr11 112475620 1417 + 122082543 I a score=898947.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 213854 299 + 235827 ATGCAGGCTCAGTCTTCCTTTTATACACAGCTATGGCCTGGCTAGCAGATGTGTGAGCTACTTGGTCCTTTACGTTAAGA---ACGCTGAAAGGCAAGGCAACAGGAAGCCAATGGCCCCACCACAGCACACTTACATCAGGCTCTGCAGTATCATATGGGAAAAGCAGATAAATCACAGGTGGATCATGGACATTACATAGAAAGCCACTGCTGCAGTCCAAGGCCACTCCAATCCTTAATGTCTTCTCTGTACTAGTGTTTCTCAAGCTCCACTAATagctatcagtcacttaacacaat s panTro4.chr17 70620780 299 + 82630442 ATGCAGGCTCAGTCTTCCTTTTATACACAGCTATGGCCTGGCTAGCAGATGTGTGAGCTACTTGGTCCTTTACGTTAAGA---ACGCTGAAAGGCAAGGCAACAGGAAGCCAATGGCCCCACCACAGCACACTTACATCAGGCTCTGCAGTATCATATGGGAAAAGCAGAGAAATCACAGGTGGATCATGGACATTACATAGAAAGCCACTGCTGCAGTCCAAGGCCACTCCAATCCTTAATATCTTCTCTGTACTAGTGTTTCTCAAGCTCCACTAATAGCTATCAGTCACTTAAAACATT i panTro4.chr17 C 0 I 16 s ponAbe2.chr17 61680393 297 + 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aggccaggcatggtggctcacgcctataatcccaacactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggggttcaagaccaaccaggccaacatagtgaaaccccatctttactaaaaatacaaaaatcagccaggcatggtagcacacgactgtagtcccagctacttgggaggc----tgaggcaggagaactgcttgaacccgggagatggagggtgcagtgagccgaggtcatgccact i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25302424 246 - 75148670 Aggccaggcacggtggctcacgcctataaccccaacactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggggttcaagaccaaccaggccaacatagtgaaaccccatctttactaaaaatacaaaaatcagccaggcatgctggcacatgactgtagtcccagctacttgggaggc----tgaggcaggagaactgcttgaacccgggagatggagggtgcagtgagccgaggtcgtgccact i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120184881 200 + 159171411 Agaccaggcacggtggctcacgcctataaacccagcaccttgggaagctgaggcaggtggatca--------------------------------------------------ttctactaaaaatacaaaaatgaacgtggcatggtggcacatgcctgtagccccagctacttaggaggctaagtgaggcaggagaattgcttgaaaccaggaggtggaggtatcaatgagccaagatcacgctgct i calJac3.chr5 C 0 C 0 e mm10.chr11 112478384 78 + 122082543 I e canFam3.chr9 7998186 71 + 61074082 I a 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atgT-GTTAGG----CCATTCAttctgttgctata---aagaaataccatgCTTTCCATAAAGCCTGCAGAACGTGaagaatt--------------------------aaacc-----tctttataaattaataatatattaataacttactaatttacaaagaaaagaggtttaattttttaataaagaaaagaggtttaattcttCACATTCTGCAGGCTCTATGGAaagtatggtgctggcatctgctcggcttctggggaggcctcagggagcttttactcctGGCAGAAGACGAAGCTGGAGTGGCACATCACATGGCGAAAGCAGCAGCAAGCAGCGAGGGAAGAGGTTCCACACTATTTCAaccaaccagatcttgtgagaactcactatcatgaggacagcaccaagccatgagggatccgcccccatgacccaatcacctcccaccaggccccacctccaacatggggGATTATactttaacatgagatttggatgggacaaatattcaaaccatatca i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25310182 493 - 75148670 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s panTro4.chr17 70631543 992 + 82630442 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i panTro4.chr17 C 0 C 0 s ponAbe2.chr17 61691543 995 + 73212453 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i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 68949107 985 + 80997621 agcagcccattcttatcacagacctctgagatcctagctgt--gagaccccac--cacccccatggacatttgagttgacaggaagaactgcctagagtcttggcagagacagaattccaggcagcatggagctcatagggtttggtgcaggaacaactgcaatggagcatggccatggacacccatcccccaagactcaccatactcctttaggtgggttgagagtttgttagcagctggactgggaaagagcagggctgtcttacccatgtgatgaagccagtcttatctgaacaacctcatctgctggcctctcccaggatccctgccttgccacacatatttgcagaacagcctcagctgccctgctgaaatgcttgccagtggccaccaccata--gttccttcactgacag--cccccaccttcctgttggagcacctttgcagatgaacctccaccaggatgcctccacccacaccctttccccaccagcacacactcacctgcaacctcccACTGCTTCCCCACTGGTAAG--------------CACACATACACA-------GAAACGAGCTGCCACCTCACCAGCACACACAAGCTGTGGCCTACCTCTGCAACCttgctggtacacacacatgag--gacccatcgccatcccaccagggtgtacacgcctgcagcct-cctcaccatcccattggtgcacacacacccatgggccccaacctactgccacacaagtggctccccagcctactcactggtgcacgtttgcctgcagca-ccccccaacacccactgcagcacactct-ccatggactcctgctacctcgctacggcactttttgctggtaacccccatagaagtattgttgtcattggactgggaacaacttggcccctccagtgaagcaggt-tttgacctcgaagggccagaaaacaaagctacaggtctggtcctaggtcctgagggttagaacacacaaaccaggagtgttgagctgagcctta i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 63212835 985 + 74645514 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i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25311432 988 - 75148670 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tcttaagttctctgagccttaggttcttcatctgtaaaaaggggataataatagtacctacctcaggattgttattaggatgaaatgtgt--atat------agtacacgcagcaatccctgacacagagtaagtgctTCTTAACAACAACAGTAATAACAAAAA-------CCCACTAATTA--TTAC---------------TA-CCCTACTCTAAAATCTCTGCAAATTTAAAG--TTTCTGTTTCTGTGAAATGATTT---AGTCTCCGGCTATGTTCCTTCCACCTAC-TCAAATCTCCCTAAAACCAAGAAGAATTTTTAACACTTAGAGCAAAAACTACCAATT i canFam3.chr9 C 0 C 0 a score=329384.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 232535 129 + 235827 TAATATTTATGAACAAAAGAATTCACAGTATTCTTTCCAAATCTCCAGTGACCCACCTACCCATTCACTGAGTCCCTCAGTGAT-AAAGAACATTTGTC------------------------------CAGG-TGGCGATGG------CAA------GGCATTTTGGGGATG s panTro4.chr17 70639445 129 + 82630442 taaaatttatGAACAAATGAATTCACAGTATTCTTTCCAAATCTCCAGTGACCCACCTACCCATTCACTGAGTCCCTCAGTGAT-AAAGAACATTTGTC------------------------------CAGG-TGGCGATGG------CAA------GGCATTTTGGGGATG i panTro4.chr17 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 41851520 127 - 94967081 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AAAAATTTATGAACAAAAGAATTCACAGTATTCTGTCCAAATCTCCAGTGACCCACCTACTCATACACTGAGTCCCTCAGTGATAAAAAAACATTTGTC------------------------------CAGG-TGGCAATGG------CAA------GGCATTTTGGAGATG i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120200328 130 + 159171411 AAAATTGTATGAACAAAAGAATTCACAGTA-TCTTTCCAAATCTCCAGTGACCCACCTACCCATACACTGAGTCCCTCAGTGAT-AAGGAACATTTGTC------------------------------CAAG-TGACAATGGTAAGGCCAA------GGCATTTTGTG---- i calJac3.chr5 C 0 I 7 s mm10.chr11 112491840 138 + 122082543 --------TTGAA-------ATTCA------------CAAATCCCCTGTAGTATACCTGCAAATGCACATTGTGCCTTAGTGAT--GAGAAtgtctgtctgtctgtctgtctatctgtctgtctgtctgCAGGCTGGTGACTG------CAAACCCTTATCCTTATGGGGACA i mm10.chr11 C 0 C 0 s canFam3.chr9 8007234 130 + 61074082 CAAAATTTATAAAGGAAAAAATTCACACTATGCTTTTGAAATTTCCGAAGAGACGCTCACCCATACACCAAGTCCCTTAGTGAT--AAGAACATTCGCC------------------------------CAGG-TGAAGATGG-GAAGCTAA------GACATGATGGGG--- i canFam3.chr9 C 0 C 0 e ponAbe2.chr17 61699425 1636 + 73212453 I a score=1586235.000000 s hg38.chr17_KI270858v1_alt 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AACACAGCTGAGCAGGGTCAGAGTTTACTTTATCTTAATATCTCTTTGtctcaatttag---aaaaaaagaaaaggtcccAGCTTCCAGACAgccatgaaaacaaaataaacaggcaTGTAAATGAGATGTGTTTTGGATGTGAGTTTATATATATTGGCAGGAAGGGCAGTGAAACTTATGACTC--tactttcttattctttattc---------------------tttctcctgTCCCACTTGGTGCCAaaggagttatttttaaaagcatgggtTCATGTTTTTGATCATAATGTTATGGCAAAAGGGGAGATGACCTTTTACATTTAGCTAGTAGCTGTTATAAGATCAGGAAGCTCCAAATGGTAACACTTCAGGTTTGGTCACC----A--- i papAnu2.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 25319160 366 - 75148670 AACACAGCTGAGCAGGGTCAGAGTTTACTTTATCTTAATATCTCTTTGTCTCAATTTAG---AAAAAAAGGAAAGGTCCCAGCTTCCAGACAGCCATGAAAACAAAATAAACAGGCATGTAAATGAGATGTGTTTTGGATGTGAGTTTATATATATTGGCAGGAAGGGCAGTGAAACTTATGACTC--TACTTTCTTATTCTTTATTC---------------------TTTCTCCTGTCCCACTTGGTGCCAAAGGAGTTATTTTTAAAAGCATGGGTTCATGTTTTTGATCATAATGTTATGGCAAAAGGGGAGATGACC-TTTACATTTAGCTAGTAGCTGTTATACGATCAGGAAGCTCCAAATGGTAACACTTCAGGTTTGGTCACC----A--- i chlSab2.chr16 C 0 C 0 s calJac3.chr5 120200465 370 + 159171411 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