##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=85040.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 0 195 + 188024 gaattctgatctagcttctctaaaagttactgtggaggattaaagataccaaattggcagagaagcaattctgcctgcatatttaggggacagtatgcactttgcagcacaattgtgaattgactgatagcctgagagggaaagtttcctctagagtaaagcttgggtggcaccttatatttatatatcatgtct s panTro4.chr19 41263488 195 - 63644993 gaattctgatctagcttctctaaaagttactgtggaggattaaagataccaaattggcagagaagcaattctgcctgcatatttaggggacagtatgcactttgcagcacaattgtgaattgactgatagcctgagagggaaagtttcctctagagtaaagcttgggtggcaccttatatttatatatcatgtct i panTro4.chr19 N 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38656236 195 - 60714840 gaattctgatctagcctctctaaaagttattgtggaggattaaagataccaaattggcagagaagcaattctgcctgcatatttaggggacagcaagctctctgcagcacaactgtgagttgactgatagcctgagagggaaagtttcctctacagtaaagcttgggtgggaccttatatttatatatcatgtct i ponAbe2.chr19 N 0 C 0 s papAnu2.chr3 52978288 193 + 180432695 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0 s rheMac3.chr19 42166272 946 - 64156825 ggtaaactgcctgagctcaggagttcaagaccagcctaaacaacatggaaaaaccccatctcaacaacaaatacaagaagaaaaattagctgggcttggtggcacacacctgtagtaccagctgcttggggactgaggtagaagaactgcttgagcctgggaggttgaggctgcagtaagccgagatcacgccactatactacagcctgggtgacagagtgagacccagtctccaaaaataagtaaaataaaataaaataaaagatttaatagaaacaaaatatggtacataaacatcatggaatactgtgttgccataaaaagtgaccaagattatgttatttgcagcaacatggatggagctggagactattatccttagaaaactaatgcagaaagagaaagtcaaatgcatgttctcatttattagtaagagctaaataag---aacacatgggcac-aaagagggtaacaacagacactgagttctagttaagggtggaagatggaaaacaaagaggatcagaaaaataatacctgtgtagtactgtgcttaatacctcagtgacaagatattctgcacaccaaccccccgacacaattttacctatataacaaacctgcacatgtactcctgaatcaaaaataaaagtcaaaacaaaAGAACTCGCCggccaggcacagtggctggctcacacctataatcccagcagtttgggaggccaacacaggctgatcacgaggtcaggagtttgagaccatcctggccaacacagtaaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcaggcgcctgtagtcgcagcttctcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaaaccagaaggccgaggttgcagtgagctgagattgtgtcactgcactctagcctaggcaacaagagtgaaa--c i 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papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30581619 146 - 50890351 ctcaaaagcaaaaggacaaaaaacaaaaGCAAACAAACAAAAAAAACAAAGAACTCTATGGGTTGGGG-AGAGTGCAATGCAGGTGTGGAAGGACTGGTTTGTGCTACAAAGAGTGGCCCAGGTATGACTCTACTCTGATTAATTTC i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28213000 126 - 49145316 --------cccatgaacaaaaaataaaattttaaagaaaAAAAA----------TCTATGAGTTTGAG-AGAAAGCAATGTAG--GTGATAGGACTGGTTTGTGCTACAGATAGTGGCCCAAGTGTGACTCTGCTCTAATTTATTTC i calJac3.chr22 I 5036 I 10 e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=442907.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 9037 206 + 188024 TGGGTCCATGCAGGCAGATGAGATTATGAACAGGTTGTC-------CAGAACCCCAGGTTGGTGGAGAAAACAGGTTGCTGCTGCAGATTCAGTGTCTGGGGGTTGGGATATGCCAGGAGACTTGTAGACACTTTTGTGAGTTTTTGGC----AAGAAACGCTAGGATCAAAAATGCCGTAGTGAAATTGCTGGGGGTGGTACCTATTCCTACGAGG s panTro4.chr19 41272529 206 - 63644993 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rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36706438 39 - 59248254 -TTTTCCAACATAAATCTAACTTTGTTT-TACCTTACAAAG i macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30583014 40 - 50890351 TTTTTCCAACATAAATCTAACTTTGTTT-TACCTTACAAAG i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28214895 41 - 49145316 tttttttaacataaatctaactttgtttatattttacaAAG i calJac3.chr22 I 1209 C 0 e papAnu2.chr3 52986136 1450 + 180432695 I e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=549817.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 10308 263 + 188024 TCTAGAAACTACCACAAAACAATAACAATTTCATCTTCAGTAAGACCCTCCCAATCCCCTTTCATCTTAACCTTAACTGCATCTGGCTGTGGGTCCCCAACTTTCCAAGGCTATGTAGTTTCTCTCAGGATAAAGGCGTCTTCCATGGCTGGGGTGAGCAGGCTGGAATATCTGCAGAGAAGACTCCCCAGAAAAAA-CTAAGTGGTCCTTTAATAACTT------CCTTTTGCAGGCTCAGTATTAGCCTTAGC----TTAGAGTCACTAGGC s panTro4.chr19 41273801 263 - 63644993 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TATTTTTTCATTATATTTCTTTCACTATTGTTCTGCCCCCTTAGAGAATGCAGGGGGCAGAAATTATTTCAATGT-TTTTCCCG--CAATACCAGCAACTGATTGGCTGACCAG---------------------------CAAGAAATGGAAGCTGGGTTGGGTGAAGACAATCTTAATGTCTCAAGG-GTTAGCTTTTGGAAGGAAGAGTAAGCCAGGAGATTCCTCTCAACCCCAGGGCATCCCCC-TGCTTCCTTGAAAGGCTACACTCCATACCTCAGATTGTCCCA--CAGGAGAAAATGA----CCAGGAGCTGATATTCACTAGACACTCTAGCAGACATAGCCATGGGGGATATTTCAGTTAATTCCCAGACAGTACTGAAACCCAGGACCAGGAAAAAAA-GTGAAGAATGTCTGAAAACACATCATTCCATAAAGTTTTCAAAG---------CCTTTA-CCCCAAAACATTCTGATAAAATCTGT-GGGCCT-A-GGAGG----AAAAACAAAAAA-------------------ACAAAAAATAATCAGGGGATTATT-TTTGCTTTCTTCTCATGGGAAATATTTACAAACAGAAAACAAATATTAGGAAAAGTGCCATCCAATGCTTTGttaaaa--aaataattaaaataaGGTATCAAAAATGTACACTAAAG i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36707996 612 - 59248254 TATTTTTTCATTATATTTCTTTCACTATTGTTCTGCCCCCTTAGAGAATGCAGGGGGCAGAAATTATTTCAATGT-TTTTCCCG--CAATACCAGCAACTGATTGGCTGACCAG---------------------------CAAGAAATGGAAGCTGGGTTGGGTGAAGACAATCTTAATGTCTCAAGG-GTTAGCTTTTGGAAGGAAGAGTAAGCCAGGAGATTCCTCTCAACCCCAGGGCATCCCCC-TGCTTCCTTGAAAGGCTACACTCCATACCTCAGATTGTCCCA--CAGGAGAAAATGA----CCAGGAGCTGATATTCACTAGACACTCTAGCAGACATAGCCATGGGGGATATTTCAGTTAATTCCCAGACAGTACTGAAACCCAGGACCAGGAAAAAAA-GTGAAGAATGTCTGAAAACACATCATTCCATAAAGTTTTCAAAG---------CCTTTA-CCCCAAAACATTCTGATAAAATCTGT-GGGCCT-A-GGAGG----AAAAACAAAAAA-------------------ACAAAAAATAATCAGGGGATTATT-TTTGCTTTCTTCTCATGGGAAATATTTACAAACAGAAAACAAATATTAGGAAAAGTGCCATCCAATGCTTTGTTAAAA--AAATAATTAAAATAAGGTATCAAAAATGTACACTAAAG i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 52989486 623 + 180432695 tactttttttttttttttctttcacaaat----------ctTACAGAATCCTGGGGACAGAAATAATTTTGGTGT-TTTCCTCC--CAATACCAGTATCTGATGGGCTGACCAGCAA----------------TGTTTCTCCAAGAAATGAAAGCTGGGTAGAGTGAAGACAATCTTAATATCTCAAGGAGTAAGCTTTTCAAAGGAAGAGTAGTCCAGGAGATGCCTCTCGGTCCCAGGGCATCCACC-TGCTCCCTTGAGAGGCTACATTCCATACTTCAGGTTGTTCTA--CGAGAGAAAATGA---CCCAGGAGCTGATATTTACTAGACGCTCTAGCAAACATTGCCATGGAAGGTATCTTG------CCCCAGACAGTACTGA--------------AAAATAA-CTGAAGGGTGGCTGAGAACACATCACCCCCTAAAGTTTCCAAAGGGAAAGCAATCATGA-CCCAAAAACATTCTGATAAGATCACT-GTGCCtaa-ggaag----ataaaaagaaaagaggcacaGAGA----TTTACAATACAATGTTAGCGGattattctttgctttcttctcataGGAGATATTTACAAACAGGAAACAAATCTTTTAAAACGTGCCATCCAATGCTTTGTCAAAAGTGATTAATTAAAATACGGCATTGAAAATGTACACTAAAG i papAnu2.chr3 I 232 C 0 s chlSab2.chr6 30584548 615 - 50890351 TATTTTTTCATTATATTTCTTTCACTATTGTTCTGCCCCCTTAGAGAACGCAGGGGGCAGAAATTATTTCAATGT-TTTTCCCGCTCAATACCAGCAACTGATTGGCTGACCAG---------------------------CAAGAAATGGAAGCTGGGTTGGGTGAAGACAATCTTAATGTCTCAAGG-GTTAGCTTTTCAAAGGAAGAGTATGCCAGGAGATTCCTCTCAACCCCAGGGCATCCGCC-TGCTTCCTCGAAAGGCTACACTCCATACCTCAGGTTGTCCCA--CAGGAGAAAATGA----CCAGGAGCTGATATTCACTAGACACTCTAGCAGACATAGCCATGGGGGATATTTCAGTTAATTCCCAGACAGTACTGAAACCCAAGACCAGGAAAAAAA-CTAAAGAATGTCTGAAAACACATCACTCCATAAAGTTTTCAAAGGAAAA----CCTTTA-CCCCAAAACATTCTGATAAAATCTGT-GGGCCT-A-GGAGG----AAAAACAAAAAA-------------------GCAG-----TGCCAGGGGATTATTTTTTGCTTTCTTCTAAAGGGAAATATTTACAAACAGAAAACAAACATTAGGAAAAGTGCCATCCAATGCTTTGTTAAAA--AATAATTAAAAATAAGGTATCAAAAATGTACACTAAAG i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28217303 628 - 49145316 AAATTTTTCACTATTTTCATTTCACTATTTCTCTGGCCACTTAGGGAATCTAGGGAGCAGAAATTATTTCTGTGT-TTT-------C--TACCAGCATCTCTTTGGTTTAACAGAAA----------------TGGGTCTCTAAGAAATGGAAGCTGGGTTGGGTGAAGACAATCTTAACGTCCTCAAA-------------AAAGAAGGACAG--CAGCAGACTACTCTCAGTCCTGAGGCAGCCACCTTTTTTTCTTAAAAGGCTACACTCTGTAAGTCAGGTTGTGCTATTTAAAAAAAAACAAAGACCCAGAAGCTGATATCCACTAGACACTCTAGCAGATAGAGCCATGGTGGATATCTTTGTTTTTCCACAGACAGTACTGAAGCCCAGGACCAAGAATAAAA-CTAAAGGCGGT---AGAATACATCGCACCTCATAATTTTCAAAGGGAAA----TTTTGA-CCCAAAAACAT--TGTTAAGATCTCT-GTGCCT-ACAGAAG----ATAAAAACAGAAGAGAAACAAAAATTGTTTTACACTACAGTGTCAGGGAATTATACATTGCTTTCTTCTTAT-GGAAGTATTTACAAACAGAAAACAAATCTTTTTAAA-GTGCCATCCAATGCTTTGTCAAAA--AAATGATTAAAATATGGCATAAAAAATGCAGACTAAAG i calJac3.chr22 C 0 C 0 e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=17427.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 12512 10 + 188024 GACAAATAGT s panTro4.chr19 41276011 10 - 63644993 GACAAATAGT i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52573261 10 + 106955855 GACAAATAGT i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42170760 10 - 64156825 GACAAATAGT i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36708608 10 - 59248254 GACAAATAGT i macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30585163 10 - 50890351 GACAAATAGT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28217931 10 - 49145316 GATGAACAGT i calJac3.chr22 C 0 C 0 e papAnu2.chr3 52990109 0 + 180432695 C e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=465727.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 12522 294 + 188024 Aggctgggcacggtgactcacgcctgtaatcccagcactttgggaagctgaggcgagcagatcacaaggtcaggagttcgagaccagcctggccaacatagtgaaactctgtctctactaaaaata---------caaaaagtagccaggcatggtggcacatgcctgtagtcccagctactcaggaggttgaggcaggagaattgcttgaacccggaaggcggaggttgtggtgagccaagatcaggacaccacactccaggttgggcaac-agagcgagactccatctc------------------aaaaaaaaaaaaa--- s panTro4.chr19 41276021 298 - 63644993 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Aggccaggcacggtggctcacgcctgtaatcctagcaccttgggaggctgaagcgggcagatcacaaggtcaggagttcgagactagcctggccaacatagtgaaattctgtctctactaaaaata---------caaaaattagccaggcatggtggtgaacgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgctttaacccaggaggtggaggtcgtggtgagtcgagatcaggccactgcactccaggttgggcaac-agagcaagattccgcctc------------------aaaaaaaaaaaaa--- i chlSab2.chr6 C 0 I 11 s calJac3.chr22 20906849 325 + 49145316 AggccgggcgcggtggctcacgtctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcgggtggatcatgacgtcaagagacagagaccatcctggtcaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaaaaaaaaaatgcaaaaaattagctgggcatggtggcgcgtgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcgggagaattgcctgaacccaggaggcggaggttgcggtgagttgagatcatgccattgcactccagcctgagtaacaagagcgaaactccgtctGGGGTGGTGGCGGGGGCGGGGGGGAATGTACACTA i calJac3.chr22 I 1280 C 0 e papAnu2.chr3 52990109 0 + 180432695 C e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=15966.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 12816 9 + 188024 aaGGACAAA s panTro4.chr19 41276319 9 - 63644993 aaGGACAAA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52573574 9 + 106955855 aaGGACAAA i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42171068 9 - 64156825 aaaGGCAAA i rheMac3.chr19 I 5 C 0 s macFas5.chr19 36708917 9 - 59248254 aaaGGCAAA i macFas5.chr19 I 5 C 0 s papAnu2.chr3 52990109 9 + 180432695 AAACACAGT i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30585478 9 - 50890351 aaGGGCAAA i chlSab2.chr6 I 11 C 0 s calJac3.chr22 20907174 9 + 49145316 AAGGACAAA i calJac3.chr22 C 0 I 1082 e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=135388.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 12825 74 + 188024 TAGTAATGTGAATCAGAGAGGAAAAAATTGACATTTGGGAAGGTAACAATGAACTGGAAATTTTA---TATTTTACT------------- s panTro4.chr19 41276328 74 - 63644993 CAGTAATGTGAATCAGAGAAGAAAAAATTGACATTTGGGAAGGTAACAATGAACTGGAAATTTTA---TATTTTACT------------- i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52573583 76 + 106955855 TAGTAATGTGAATCAGAGAGG-AAAAATTGACATTTGGGAACGTAGCAATGAACTGGAAAttttattttattttatt------------- i nomLeu3.chr10 C 0 I 175 s rheMac3.chr19 42171077 73 - 64156825 TAGTAATGTGAATCAGAGAGG-AAAAATTGACATTTGGGAAGGTAAGAATGAACTGGAAATTTTG---TATTTTACT------------- i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36708926 73 - 59248254 TAGTAATGTGAATCAGAGAGG-AAAAATTGACATTTGGGAAGGTAAGAATGAACTGGAAATTTTG---TATTTTACT------------- i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 52990118 73 + 180432695 TGATAATGCGAATTAGGGAGG-GTAAGTAGGCATTTGGGAATGTCAGAAGGACCTGGAAATTTAG---TATTTTACT------------- i papAnu2.chr3 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30585487 73 - 50890351 TAGTAATGTGAATCAGAGAGG-AAAAATTGACATTTGGGAAGATAAGAATGAACTGGAAATTTTA---TATTTTACT------------- i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28217941 86 - 49145316 TGATAATGTGAATTAGAGAGG-GAAAACTGGCATTTAGGAATGTCAGAGGAAACTGAAATTTTAG---TATTTTATTATTTACTATTTTT i calJac3.chr22 C 0 C 0 e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=53750.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 12899 42 + 188024 GCAAGCCAGAGATAGGCTGCAGGAAT------GGGGGTTTGGGAGTAC s panTro4.chr19 41276402 42 - 63644993 GCAAGCCAGAGATAGGCTGCAGGAAC------GGGGGTTTGGGAGTAC i panTro4.chr19 C 0 C 0 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ACATAATactctccttgggatacctgtaaaaaatgcaaggg--aaaaaaaaaaatcagtcctctgaggagtgtgaaaataattaagaataattaagtggcaggcaattagactgag---gtggctctagtccctgatatctactttttaaaaaatctaattcg i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52573834 154 + 106955855 ACATAATATTATTTttgggatacttttaaaaaatgcaaggg------aaaaaaatcagtcttatgcggagtgtgaaaataattaagaataattaagtggcaggcaattaggaagag---ttgggagtagtccctgatatctactttttgaaaaatctaatttg i nomLeu3.chr10 I 175 C 0 s rheMac3.chr19 42171193 156 - 64156825 ACATAATactctccttgggatacctgtaaaaaatgcagggg-gggaaaaaaaaattagtcctctgaggagtgtgaaaataattaag---aattaagtggcaggcaattagaatgag---gtggctctagtccctgatatctactttttaaaaaatctaagttg i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36709042 156 - 59248254 ACATAATactctccttgggatacctgtaaaaaatgcagggg-gggaaaaaaaaattagtcctctgaggagtgtgaaaataattaag---aattaagtggcaggcaattagaatgag---gtggctctagtccctgatatctactttttaaaaaatctaagttg i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr3 52990233 140 + 180432695 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gccgagcgcagcggctcacccccgtaaacccagca-tcaaggaggccgaggaggatggatcacctgaggtcgggagttcaagaccagcatgaccaaaaatggagaaaacccccgtctctactaaaaatacaa-aattaggcgggagtggtggcacatgccagtaatcccagctactcaggaagctgaggtaggagaatcgcttgaacccgggaggcggaggttgcactgagaggagatcgcgctattgcactccagcctgggcaacaagagcaaaactccgtctcaaaaaaagaaa---gaaaaaaaaa i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42171349 300 - 64156825 gccgggaccagtggctcacacctgtaatcccagcactttaggaggccgaagagtgcggatcacctgaggtcggaagttcgagaccagcctgacc-aaaatgga--aaaaccccgtctctactaaaaattcaa-aatcagcccggcgtggtggcacatgcctgtaatccccgctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgcactgagaggagatcgcgctcttgcactccagcatgggcaacaagagcaaaactccgtctcaaaaaaaa--a---agaaaaaaaa i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36709198 300 - 59248254 gccgggaccagtggctcacacctgtaatcccagcactttaggaggccgaagagtgcggatcacctgaggtcgggagttcgagaccagcctgacc-aaaatgga--aaaaccccgtctctactaaaaattcaa-aatcagcccggcgtggtggcacatgcctgtaattccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgcactgagaggagatcgcgctattgcactccagcatgggcaacaagagcaaaactccgtctcaaaaaaaa--a---agaaaaaaaa i macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30585760 303 - 50890351 gccgggcccagtggctcacacctgtaattccagcactttaggaggccgaagagtgcggatcacctgaggtcgggagtttgagaccaccctgacc-aaaatgga--aaaaccccgtctctactaaaaattcaa-aattagcccggcgtggtggcacatgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgcactgagaggagattgtgctattgcactccagcatgggcaacaagagcaaaactccgtctcaaaaaaaa--aaagaaaaaaaaaa i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28218157 253 - 49145316 ---------------------------------------cagaggcccaggcaggcggatcacctaaggttagaagttgaagaccagcctggtc-aacgt-----gaaaccttgtatctactaaaaatacaataattagcgaggtgtggtagcacacgcatgtaatctcagctactcaggaggctgagggaggagcatctcttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagctgaaatcacacccctgcactccagcctgggtgac-agagtga-----tttctcaaaaaaga--a---gaaagaaaga i calJac3.chr22 C 0 I 1449 e papAnu2.chr3 52990373 0 + 180432695 C e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=14124.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 13402 9 + 188024 tctaattca s panTro4.chr19 41276904 9 - 63644993 tctaattca i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52574292 9 + 106955855 tctaattca i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42171649 9 - 64156825 tctaattcg i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36709498 9 - 59248254 tctaattcg i macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30586063 9 - 50890351 tctaaatcg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 20908265 9 + 49145316 tccaattca i calJac3.chr22 I 1082 C 0 e papAnu2.chr3 52990373 0 + 180432695 C e ponAbe2.chr19 38664220 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agtgca--tttttttttttttttttg----------------taaatta-tacattgggggaaacaaagctcaggtttaaccaactataaacta-caattaacctctgattatataaacggaaaatttccatcttgattgtacaaactgagaaactacgtaactgtacataaccaattactgaatttggttttcttcattgtgcaccttaaaaaaatctttccgtcaaatcccttccatagaccataaactacaaac--catagctgggtgctctacaatttttgaatcactttttgattaaattatttattactttagtgg---tgactgccataaatttttaatagaagaaaagagggactggaaacctcactggaccaAAGCTCTTCCCGTATTCATGAA-CCCGCACCCGGAGTCAGGATTCTCCCCTGACGCCCCTCCCGTGGTCCCTGCACAATCTGGGAGAGACGCGGCCATGCGGGTGCAGAGCGGCCCAGAGAGGGCTCCAGGCCAGGGCACAGTCACAGCGCATGGAGGAGACAGGTCGCCCGGGGTCCC-GCAGTCAGCGCAGCCGCCATCTTGTGGCTGAAGGAGACTGA-GGCCGAGATG-AGCAAGAAG--AACTCCAGGCGCAAATTGCGGAGCTGACTGCAGGAAAGGCCTTGAGTCCCGCCAC-TCCACTTCCCACCAGTTCCAATCAGCCCCTTCCCCT-TTTCGGGATGTCGGACC i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42171658 695 - 64156825 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i papAnu2.chr3 I 3 N 0 e rheMac3.chr19 42173258 315 - 64156825 I e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e chlSab2.chr6 30587707 311 - 50890351 I e macFas5.chr19 36711118 308 - 59248254 I e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=84006.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 19050 322 + 188024 CAGAATAATGGATTTTTAAAAAATTATcagataatttcctcatgcttttttccagatgattttattctctaccagaggtgtttttcttttt--aatcattggttcattttgcttgacatcatacaatacgtattattttatttcaagcttgtcttatctggcaggtttatgagatatatccaggttgtgtgatttagtagttcatttttttctatggctgggtggtattctcttgtatgaatgagatataatttgttcatctatatttctagcgatggatatttaggctgttccctgctttaagctattatgactaaaagctct s panTro4.chr19 41281610 322 - 63644993 CAGAATAATGGATTTTAAAAAAATTATcagataatttcctcatgcttttttccagatgattttattctctactagaggtgtttttcttttt--aatcattggttcattttgcttgacatcatacaatacgtattattttatttcaagcttgtcttatctggcaggtttatgagatacatccaggttgtgtgatttagtagttcatttttttctatggctgggtggtattctcttgtatgaatgagatataatttgttcatctatatttctagcgatggatatttatgctgtttcctgctttaagctattatgactaaaagctct i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52579656 324 + 106955855 CAGAAAAATGGATTTTTAAAAAATTATcagataatttcctcatgcttttttccagataattttactctttaccagaggtgttttttttttttaaatcattggttcattttgcttgacatcatacaatacatattattttatttcaagcttgtcttatctggcaggtttatgagatacatccaggttgtgtgatttagtagttcatttttttctatggctgggtagtattctgttgtatgaatgagatacaatttgttcatctatttttctagcaatggatatttaggctgttccctgctttaagctattatgactaaagtctct i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42173258 315 - 64156825 I e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e chlSab2.chr6 30587707 311 - 50890351 I e macFas5.chr19 36711118 308 - 59248254 I e ponAbe2.chr19 38664220 30000 - 60714840 M a score=2937.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 19372 6 + 188024 ataaac s panTro4.chr19 41281932 6 - 63644993 ataaac i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52579980 6 + 106955855 ataaac i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36711426 6 - 59248254 ataaat i macFas5.chr19 I 308 I 1 e rheMac3.chr19 42173258 315 - 64156825 I e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e 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aaatagtatttATAAATATTTGGAGATGGATACTTTGGGGCTATTACTTTGGGGCGatttat i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38694220 62 - 60714840 AAATAGTATTTATAAATATTTGGAGGTAGATACTTTGGGGCTATTACTTTGGGGCTACTTat i ponAbe2.chr19 M 30000 C 0 s nomLeu3.chr10 52580296 62 + 106955855 aaatagtATATATAAATATCTGGAGGTAGATACTTTGGGGCTATTAGTTTGGGGCTACTTat i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42173879 61 - 64156825 aaatagtgtttATAAATATTTGGAGGTAGACATTTTGGCGCTATTACTTT-GGGCTATTTAT i rheMac3.chr19 C 0 I 309 s macFas5.chr19 36711741 61 - 59248254 aaatagtgtttATAAATATTTGGAGGTAGACATTTTGGCGCTATTACTTT-GGGCTATTTAT i macFas5.chr19 C 0 I 309 s chlSab2.chr6 30588322 61 - 50890351 aaatagtgtttataaatatttggaggtagatatttTGGCGCTATTACTTT-GGGTTatttat i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I a score=405989.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 19746 249 + 188024 aaatatttgaggcagatactttggggctaacagaaacactgtttctcctttaaattttatccacaatgtttgcatttttaagtacatcttgtctacagtaattattactgtggtgtcttagtggtgattttctattttgcattatcttctacattgattagtatacttggaattttctaaagaaaatttttttc---ttttttctactgctttct-ttctt--tctttctttctttctttctttct--------------------ttctttctt s panTro4.chr19 41282310 270 - 63644993 aaatatttggggcagatactttggggctaacagaaacactgtttctcctttaaattttatccacaatgtttgcatttttaagtacatcttgtctacagtaattattactgtggtgtcttagtggtgattttctattttgcattatcttctacattgattagtatacttggaattttgtaaagaaaaaatttttctctttttttctactattttct-ttctt--tctttctttctttctctctctctctc--tctctctctctctccctctctctc i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38694282 252 - 60714840 aaatatttggggcagatactttggggctaacagaaacactgtttctcctttaaattttacccacaatgtttgcgtttttaagtacatcttgtctacagtaattattactgtggtgtcttagtggtgattttctattttgcattaacttctatgtggattag--tacttggaattttgaaaagaaaaattttttctctttttttctacttctttct-ttctc--tctctctctctgtctctctctctct------------------ttctttctc i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52580358 272 + 106955855 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i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38694534 976 - 60714840 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i rheMac3.chr19 I 52 C 0 s macFas5.chr19 36712416 957 - 59248254 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i macFas5.chr19 I 55 C 0 s papAnu2.JH685057 9167 946 - 61834 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i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52583952 839 + 106955855 T e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e chlSab2.chr6 30591841 14396 - 50890351 I e macFas5.chr19 36717035 15746 - 59248254 I e papAnu2.JH685057 13704 19294 - 61834 I e panTro4.chr19 41288014 6046 - 63644993 I a score=225851.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 30338 862 + 188024 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i ponAbe2.chr19 I 229 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52583952 839 + 106955855 T e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e chlSab2.chr6 30591841 14396 - 50890351 I e macFas5.chr19 36717035 15746 - 59248254 I e papAnu2.JH685057 13704 19294 - 61834 I a score=829965.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 33251 1615 + 188024 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s panTro4.chr19 41296969 1615 - 63644993 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i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38708298 1615 - 60714840 ttgttcattcctttttattcttttttctctaatcttgtctgcctgccttatttcagcaagatagttttcaagctctgatattctttcttctgcttgattgctttggctactgatagctgtgtatactttacaaagttcttgtgctgtgtttttcagctccatcaggtcatttatgtttctctctaaactggttattccagttagcaactcctgtaatcttttatcatgattcttatcttctttgcattgagttaggacatgcatctttacctccttgaagtttgttattacccactttctgaagcccacttctgtcaattcatcagtcttttctctgttcagatctgtgcccttgctggagaggtgttgtgatcatttagagaagaattactctggtcttttgtgtgttcagcaattttttgttgattctttctcatcttcatgagtttgtccagttttgatctttgaggctgctgactcttagctgaggtttttgtggggac---tttttttttttcaagatggagtcttgctctgtcactccagctagagtgcagtggcatgctctcagctcactgcaacctccacctcctggcttcaagcaattctgctgcctcagcctcctgagtagctgggattacacgtgcccagcatggcacctggctcatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatcttgaccaggctggtctcaaactcctgacctcgtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctaggattacagttgtgagccaccatgctcagcctttgtggggactttttttgttgacattgttgctgtagccttttgtttgtttttctttcaataagcatgttcctcttctgtaaggctacagtggtttgctgggggttcacttcaggcctattcatctgggtcactcctgcacctggagatgcccacagagaaagctggagaatagcaaagatgggtgcctcctccttcttctgggatttctgacctcgagggacagtgacctaatgtcaggaggaatgctcctgtataaagtgtctggagacctctattgggggtctcacacagttgagggcatgggaaccaggaaccatttaaggaagcattttggctgtcccttggtggagtgggtgtgctgtgctggagggaaacccactcatctgggctgcctgaattctgcagagctagcaagaggaaagactaagtctgccggtccatggagactatggcaacctctccccatagggggtcaggcccaggaagatcaaggttttgtccctgagctcccagctggagttgttggcgtttctgcagggaggccccactcagtgagaagggatggatgaaggtctggcctaaagagagagtcaggccattgtctgcaacagctggtgtgctgtgccatggggaatgccccttgggaccaagcggtctaacctccttggctccaacaggggaacagcatggcctggagctatagtgatggctgccaccctcccctgcaccccaggggcttagtgtctttggtagttagcagctgcagagatggctgctgcccctccccaagggagttcagatgacttagacaACAGGCA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30606237 1615 - 50890351 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i chlSab2.chr6 I 14396 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52583952 839 + 106955855 T e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e macFas5.chr19 36717035 15746 - 59248254 I e papAnu2.JH685057 13704 19294 - 61834 I a score=3386.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 34866 4 + 188024 GCCA s panTro4.chr19 41298584 4 - 63644993 GCCA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38709913 4 - 60714840 GCCA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52583113 4 + 106955855 gtca i nomLeu3.chr10 T 839 C 0 s chlSab2.chr6 30607852 4 - 50890351 GCCA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e macFas5.chr19 36717035 15746 - 59248254 I e papAnu2.JH685057 13704 19294 - 61834 I a score=303278.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 34870 289 + 188024 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macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30609402 204 - 50890351 caactatttatatatatatatatattttttttttgagacggagtcttgctctgtctcccaggctggagcgcagtggtgcgatctcgactcactgcaagctccgcctcccaggttcacgccattctcctgccccagcctccggtgtagctgggactgcaggcgcccgccaccacacccggctatttttttaaagtttatttttag i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52583407 23949 + 106955855 I e calJac3.chr22 20909344 19209 + 49145316 I e papAnu2.JH684925 23555 0 + 157876 C a score=56161.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 36612 116 + 188024 tagagacggggtttcactgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatcctgcccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacgcccagc s panTro4.chr19 41300326 116 - 63644993 tagagatggggtttcactgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatcctgcccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacgcccagc i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38711650 116 - 60714840 tagagacaaggtttcactgtgttagccaggatggtctcgatctcctgaccttgtgatcctgcccgccttggcctcccaaaatgctgggattacaggtgtgagccaccgcacccagt i ponAbe2.chr19 C 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AATTCTACCTAAAATTAGTAAAgtgaaccccaaagtatctgagacaggtctcaatttagaaagtttattttgccaagattaaagacacacccgtgacacaccctcaggaggtcgtgacaacgcgggcctaaggtggttgggtcacagct i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.JH684925 26953 149 + 157876 aattctACCTAAAATTAGTAAAGTGAACTccaaagtatctgagacaggtctcaatttagaaaatttattttgccaagattaaggacatacctgtgacacagcctcaggaggtcgcGACAACGCGTGCCCAAGGTGATTGGGGCACAgct i papAnu2.JH684925 C 0 I 315 s chlSab2.chr6 30613478 149 - 50890351 AATTCTACCTAAAATTAGTAAAgtgaaccccaaagtatctgagacaggtctcaatttagaaagtttattttgccaagattaaagacacacccgtgacacaccctcaggaggtcgtgacaacgggggcctaaggtggttgggtcacagct i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28371703 148 - 49145316 ATTTCTACCTGAAATTACTAATTtaaacccaaaagcatctgagacagagctcaacttagaaa-tttatttcacccaggctaaggacacatctgtaacagagtctcaggaggttgtgacaatgtgtgcctaaggttgttggggcacaggt i calJac3.chr22 n 19209 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I a score=33225.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 39430 15 + 188024 tgattttatacattt s panTro4.chr19 41303053 15 - 63644993 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tagggagacaggtgacattcgtcactatatgtaaggtatacattgtccaggaaggtaagacaatgcaaagtgaggtgggagcttccaggttata----------ggacaaatagttaaagtgtttctgaGTTTCTAATTACCCTTCTATTGGGTTATTTCCAGGTGTGTCTTTCCTAAGCCT--CCAAGAAAAACTTGACTCCAAGTTTGTAGAGTTTTAATCTATTTTGGCCAATTTTCTGTCTACTTTATAACATTCAACAGCAGGTGATTTAACCAAAACCCTTATGGTTTTCTAGCACA-----ATTATAAGCTACACATGTATTCTTAGCAAGGCAAA---AACAGAAACCATGATGATTACAATAACAACCCTTCTGTGCATGAATAG--CCCTTCAACTGGTGACATCACACAGCccactgtggagtttctgaatcctacacccaaaggcagtcaaaagttggaaaattgacttgc i calJac3.chr22 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I a score=168709.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 39918 221 + 188024 acacatggatctggtttacaggctggttgttgactctcacaccatgactcagcaaacctgtaaggctgtgactttactaagaagacaaagtttgcaggaagaatagaggctttgatgcagtctactgttgagattgtgactcatgtacttagactcaacattcaggaggtgttgaccctcatacctagaactgggacatgtgtggaattattatta---tcatT s panTro4.chr19 41303540 221 - 63644993 acacatggatctggtttacaggttggttgttgactctcacaccatgactcagcaaacctgtaaggctgtgactttactaagaagacaaagtttgcaggaagaatagaggctttgatgcagtctactgttgagattgtgactcatgtacttagactcaacattcaggaggtgttgaccctcatacctagaactggggcatgtatggaattattatta---tcatT i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52609107 220 + 106955855 acacatggatctggtttacaggttggttgttgactctcacgccatgattcagcaaacctgtaaggctgtgactttattaagaagacaaagttt-caggaggaatagaggctctgatgcagtccactgctgagattgtgactcatacacttagactcaacattcaggaggtgttcaccctcgtacctagaactgggacatgtgtagaattattatta---tcatT i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684925 27911 224 + 157876 ACACATAGATCTGATTTACAGGTTGGTTGTTGACTCTCACACCATGATTCAGCAAACCTGTAAGGTTGTGACTTTACTGAAAAGACAAAGTTTGCAGGAAGAATAGAGGCTCTGATGCAGTCCACTGTTGAGATTGTGACTCGTGTACTCAGACTCAACATTCAGGAGGTGTTGACCCTCATACCTAGAACTGGGAGGTGtgtggaattattattattttcctt i papAnu2.JH684925 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28372327 221 - 49145316 acacatagatctggtccataggtagattggtgactcccacaccatgattcagcacacccatgaaatggtgactttgctaagaagataaagtttacaggaggaataaaggttctcacgcagtccactgttgagattgtgactcatatacttagactcaacattcaggaggtttttacacagatacctaaaactgggacatttatgaaattgttaatc---tcact i calJac3.chr22 C 0 n 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I e ponAbe2.chr19 38715019 343 - 60714840 M a score=12351.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 40139 28 + 188024 Attttctttctttttttgagatggactg s panTro4.chr19 41303761 28 - 63644993 Attttctttctttttttgagatggactg i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52609327 28 + 106955855 Atttcctttctttttttgagatggagtg i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684925 28135 28 + 157876 tttttttttttttttttgagatggagtc i papAnu2.JH684925 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I e ponAbe2.chr19 38715019 343 - 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papAnu2.JH684925 C 0 I 2880 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I a score=68473.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 40444 136 + 188024 TATTAGATGCTGGCCACCGCTGGGCAGGGGTTGGGCTCAGCTGACACCCTACATCCACCACCAGATTCCAGCCTCTGACTTTGGGGAATCTGGCCGGGACCTGGGGTCTGGGGCCAGAACTGTGGACACCCTGCCA s panTro4.chr19 41304066 135 - 63644993 TATTAGATGCTGGCCACCGCTGGGCAGGGGTTAGGCTCAGCTGACACCCTACATCCACCACCAGATTCCAGCCTCTGACTTTGGCGAATCTGGCCGGGACCTGGGGTCTGGGGCCGGAACTGTGGACACCGTG-TA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38715640 136 - 60714840 TATTAGATGCTGGCCACCGCTGGGCGGGGGCTGGGCTCAGCTGACACCCTATATCCACCACCAGATTCCAGCCTCTGACTTTGGTGAATCTGGCCGGGACCTGGGGTCTTGGGCCAGGACTGTGGACACCCTGCCA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52609632 136 + 106955855 TATTAGATGCTGGCCACCACTCGGCAGGGGCTGGGCTCAGCTGACACCCTACATCTGCCTCCATATTCCAGCCTCTGACTTTGGCGAATCTGGCCAGGACCTGGGGTCTGGGGCCGGGACTGTGGACACCCTGCCA i nomLeu3.chr10 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i ponAbe2.chr19 N 0 I 7015 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52617705 51942 + 106955855 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 32161 86889 + 157876 I a score=415825.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 60974 4673 + 188024 cctacctatgagagtcacagaagattatgacacttatggaaattacataaagccctctggcagtccaaagttttatcccagggcccagtatgcaagtgagattgtgactttaatacgcagacaaagctaacacttagtattgtcaccttcacatataaacagagcccactggtgaggttctaaatctcacacaccaaaaaaattcacagtttggggcaggcacagtggcttacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggcggatcatgaggtcaggagattgagaccatcctggctaacacacggtgaaaccctgtctctagttaaaatacaaaaaaaaattagccgggcatggtggcgggtgcctgtagtcctagctactcgggaggctgaggcaggagttgcagtgagcccagatcgtgccactgcacttcagcctgggtgacacagcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcacagttggaattgtgactgtgatatgtgaatctgcccacaggtagaatgctgactcatttctggattcagcttagaaaaatggtgatgactgtttcacctggactcagccaaatggagagatgttgactctcttaactaggtgtggtggttaatactgtgtgtcaacgtgactggattgaaggatacaaagtattaatcctggatgtgtctgtgagggtgttgccaaaggagattaacaactgagtcagttggctggaaaaggcagactcacccttaatctggatgggcacaatctaatcaactgccaacgtggccagaatataagcaggcagaaaaatgtgaaaagaaagactggcctagtctcccagcctacatctttctcctgtgctggatgcttcctgcccttgaacatcagactccaagttcttcagttttggaacttggagtggctctccttgattctcagcctacagatggcctgttgtgagatctagtgattgtgtgagttaatacttaattaacatatatgtatatatacgcacaccattagttctgtccctctggagaaccctgactaatacagattttggtaacaggagtggttctagaggaacagaatattaaggatggagttctttttttgattctggtgtttcgggggttggctgcttaatatgattagacccaaaaatgctaaggactctacttctaatagtgtggagaacactgatagtcctagggatgaactgtttagagagttatgtaaaataaatgcatttgacactcctgatttatcactcttgagaggcaaggagtttagtgactctatacatacctttcaccagctgagcatggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggggtgctgaggcaggtggatcacgagttcaggagttcaagaccagcctggtcaagatggtgaaaccccctctctactgaaaatacaaaaattagccgggtgtgtcgatgagtgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcagagaattgcttgaaactgggaggtggaggtttgaccatatgtggagaaccaaggaacataatgaagctggttgtcctaagttcaatggacaaagtgatgatagaaaatgatgaactcaggcattctatcttttggcttcagaagcagttactgagcctcaaatctgctaagattgccctgtgtgagagtctcatctcctgtagatgaaattgtggaaaaacacacacaaactcttattatgttagtgactgacctgcaatgaaagatgtatgcacagcctcaccaggtgtctactgttaaagtgaggacactgattggaaaagaatgggaccctgccacttggaatggggacgtatgggaggaccctgatgaagctaggggctctgagtttgtaaactctgatgagctttttgtcagaaaaaacagcttccccatccccagtagtggcaacatcccctttctgatgcatgctgccatcagcctttccacctttgtctgagataaaccctgcactgcctgaggcaactgtgatggcctcccctgagaaagttgccaggcaaaataatgttgattcttctcaggacccaccctcaacacccctgtttgcttctaggcatataagtagactaaagtcccagcggccccctagaggtgagtttgagagtgtgccccatgaggaggtacactacactcagaaagaactgcttgagttttctaatttatataaacagatatctggagaacaggcttggggatgaatattaagggtgtgggattatggtggaaggaacatagagttgaaccaggctgaatttatttatttggacccactaagtaggaatactgcatttaatgttgcagcttggggagttaaaaaagcttctaatagtttatttgcttggttagctgaaatatggattaaaagatggcccccctgtgagtgagctggaaatgcctgatgccccttggcttaatgtagagggaggaatcaaaaggcttaggcacattgggatactggagtggattagtcactttagacctactaattccagcatggaaagtccagaagatatacccttgaccactgactt-caaaatagatttgtgaaagcagcacctgaatctttaaagaaccttgtaattacttttctctgcatgtcagatctaacagtgggaaccgtggtctctcaactacaaaatttaaatacagtgggaataattggatcccatgatggcaggggccaagtggtggcactcaaccatcaaaggcaaggtgggcatagctactgtaatggacagcagaggctaaacggcaatcagaatagtctgacttctgtagagttccagcattggctgattcatcacagtgatcttagaagtaaaattgataggaaacctactacattcctgcttaatttatacaagcagaaaacttctaggtcaaatggaaaaaagactaattttaaatataaaaacagagaatcatggcccctcaatcaatttccagacttgagccagtttacagacccagaactccttgaataaaggagaggccagattcccttgaggaacgagcccactacactaatgacaatttatgcagtgaatctttctcccatctttccccaaggagatctctggccttttatggggtaactgtgcattggggaaagggaaatgattggacattttggggactattaaacactggctctgaggtgacattgattccaggggacccaaaacatcactgtggtcctccagttaaagtagaggcttatggaggtcatgtacttaatagaaatttagctcaggtccaacttacagttgatcaagtgggtcccaagactcactctgtggtcatttccccagttccagaatgcaaaattggcatagacatacttagcagatggcagaactcctacattggctccctgagtagtagggtgagggctattagggtgggaaaagccaaatggaagccattagagctgcctctacctgggaaaatagtaaatcaaaaccaatattgcatccgtggagggatttcagagattagtgccaccattaaggactaaaaagacgcaaaggtggtgattcctaccacatccccattcaactctttcatttggcagaagacagatggattttggagaatgacagtggattatcgtaagcttaaccaagtgatgactccaattgcagctgccatactagatgtagtttcattgcttgagcaaattaccacatctcctggtacctggtatgcagacattgacttagcaaatgcccttttctctgttcctgtccataaggcccaccagaagcaatttgctttcagctggcaaggccagcaatacacctttactgtcctacctgatggatatattaactctctggctttgtgtcataatcttattcaaagagacctctatcgctttttgcttttgcaaatatcacagttgtccattgcattgatgacattatgctgatcgaatccagtgagcaagaaatagcaaacacaccagacttattcatgagacatttgcatgccagaggatggaaaataagtctgactaaaatttagggaccttctagctcagtaaaatttccaggggtccagtggtccagggcctgtcaagatattccttctaaggtaaaaggtaagttgctgcatttggcccatcctacaaccaagaaagaggcacaatgtctagtgggcctatttgggttttggaggcaacctattcctcatttgggtgtgttactctggcccatttattgagtgacccaaaaagctgccagttctgagtgtggtccagaaaagaagaaggctctgcaacaggtccaggctgctgtgcaagctgctctgc------------cacttgggccatattacccaggagatccaatggatcttgaggtgtcggtgaaaaataaagatgctatttgcagcctttggcaagccttctcaggtgaatcacagcagaggcctctagagttttTttctttctttctttccttccttccttccttccttccttccttcctgccttcctgccttcctgacttccttcttcctgccttcctgccttcctgacttccttcttcctgcctttctgccttccttcTtttcttttctttctttctttc s panTro4.chr19 41325845 4586 - 63644993 cctacctatgagagtcacagaaaattatgacacttatggaaattacataaagccctgtggcagtacaaagttttatcccagggcccagtatgcaagtgagattgtgactttaatacgcagtcaaagctaacacttagtattgtcaccttcacatataaacagagcccactggtgaggttctaaatctcacacaccaaaaaaattcacagtttggggcaggcacagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggcggatcatgaggtcaggagattgaggccatcctggctaacacacggtgaaaccctgtctctagttaaaatacaaaaaaaa-ttagccaggcgtggtggcgggtgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcaggagttgcagtgagccgagattgtgccactgcacttcagcctgggtgacacagtgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaa-----ttcacagttggaattgtgactgtgatatgtgaatctgcccacaggtggaatgctgactcatttctggattcagcttagaaaaatggtgatgactgtttcacctggactcagccaaatggagagatgttgactctcttaactaggtgtgatggttaatactgagtgtcaacttgactggattgaaggatacaaagtattaatcctgggtgtgtctgtgagggtgttgccaaaggagattaacaactgagtcagatggctggaaaaggcagacacacccttaatctggatgggcacaatctaatcaactgccaatgtggccagaatataagcaggcagaaaaatgtgaaaagaaagactggcctagtctcccagcctacatctttctcctgtgctggatgcttcctgcccttgaacagcagactccaagttcttcagttttgggacttggagtggctctccttgattctcagcctacagatggcctattgtgagatctagtgattgtgtgagttaatacttaattaacatatatatata----------ccattagttctgtccctctggagaaccctgactaatacagattttggtaacaggagtggttctagaggaacagaatattaaggatggagttctttttttgattctggtgtttctggagttggctgcttaatatgattagacccaaaaatgctaaggactctacttctaatagtgtggagaacactgatagtcctagggatgaactgtttagagagttatgtaaaataaatgcatttgacactcctgatttatcactcatgagaggcaaggagtttagtgactctatacatacctttgaccagctgggcatggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggggtgctgaggcaggtggatcacgagttcaggagttcaagaccagcctggtcaagatggtgaaaccccctctctactgaaaatacaaaaattagccgggtgtgttggtgagtgcctgtaatcccagctactcaggaggctgaggcagagaattgcttgaaactgggaggtggaggtttgaccatatgtggagaaccaaggaacataatgaagctggttgtcctaagttcaatggacaaagtgatgatagaaaatgatgaactcagggattctatcttttggcttcagaagcagttactgagcctcaaatctgttaagattgccctgtgtgagagtctcatctcctgtagatgaaattgtggaaaaacacacacaaactcttattatgttagtgactgacctgcaatgaaagatgtatgcacagcctcaccaggtgtctactgttaaagtgagggcattgattggaaaagaatgggaccctgccacttggaatgaggacatatgggaggaccctgatgaagctaggggctctgagtttgtaaactctgatgacctttttgtcagaaaaaacagcttccccatccccagtagtggcaacatcccctttctgatgcatgctgccatcagcctttccacctttgtctgagataaaccctgcactgcctgaggcaacagtgatggcctcccctgagaaagttgccaggcaaaataatgttgattcttctcaggacccaccctcaacacccctgtttgcttctaggcatataagtagagtaaagtcccagcggacccctagaggtgagtttgagagtgtgccccatgaggaggtacactacactcagaaagaactgcttgagttttctaatttatataaacagatatctggagaacaggcttggggatgaatattaagggtgtgggattatggtggaaggaacatagagttgaacaaggctgaatttatttatttggacccactaagtaggaatactgcatttaatgttgcagcttggggagttaaaaaaggttctaatagtttatttgcttggttagctgaaatatggattaaaagatggcccccctgtgagtgaactggaaatgcctgatgccccttggcttaatgtagagggaggaatcaaaaggcttaggcacattgggatactggagtggattagtcactttagacctactaattccagcatggaaagtccagaagatatacccttgaccactgacttgcaaaatagatttgtgaaagcagcacctgaatctttgaagaatcttgtaattacttttctctgcatgtcagatctaacagtgggaaccgtggtctctcaactacaaaatttaaatacagtgggaataattgggtcccatgatggcaggggccaagtggtggcactcaaccatcaaaggcaaggtgggcatagctactgtaatggacagcagaggctaaacggcaatcagaatagtctgacttcggtagagttccagcattggctgattcatcacagtgatcttagaagtaaaattgataggaaacctactacattcctacttaatttatacaagcagaaaacttctaggtcgaatggaaaaaagactaatttgaaatataaaaacagagaatcatggcccctcaatcaatttccagacttgagccagtttacagacccagaactccttgaataaaggagaggccggattcccttgaggaacgagcccactacactaatgacaatttatgcagtgaatctttctcccatctttccccaaggagatctctggccttttatggggtaactgtgcattggggaaagggaaatgattggacattttggggactattaaacactggctctgaggtgacattgattccaggggacccaaaacatcactgtggtcctccagttaaagtagaggcttatggaggtcaggtacttaatagaaatttagctcaggtccaacttacagttgatcaagtgggttccaagactcactctgtggtcatttccccagttccagaatgcaaaattggcatagacatacttagcagatggcagaactcctacattggctccctgagtagtagggtgagggctattagggtgggaaaagccaaatggaagccattagagctgcctctacctgggaaaatagtaaatcaaaaccaatattgcatccgtggagggatttcagagattagtgccaccattaaggactaaaaagacgcaaaggtggtgattcctaccacatccccattcaactctttcatttggcagaagacagatggattttggagaattacagtggattattgtaagcttaaccaagtgatgactccaattgcagctgctgtaccagatgtagtttcattgcttgagcaaattaccacatctcctggtacctggtatgcagacattcacttagcaaatgcccttttctccgttcctgtccataaggcccaccagaagcaatttgctttcagctggcaaggccagcaatacacctttactgtcctacctgaaggatatattaactctctggctttgtgtcataatcttattcaaagagacctctatcactttttgcttttgcaaatatcacagttgtccattgcattgatgacattatgctgatcgaatccagtgagcaagaaatagcaaacacaccagacttattcatgagacatttgcatgccagaggatggaaaataagtctgactaaaatttagggaccttctagctcagtaaaatttccagaggtccagtggtccagggcctgtcaagatagtccttctaaggtaaaaggtaagttgctgcatttggcccgtcctacaaccaagaaagaggcacaatgtctagtgggcctatttgggttttggaggcaacctattcctcatttgggtgtgttactctggcccatttattgagtgaccaaaaaaactgccagttctgagtggggcccagaaaagaagaaggctctgcaacaggtccaggctgctgtgcaagctgctctgcaagctgctctgccacttgggccatattacccaggagatccaatggatcttgagatgtcagtgaaaaataaagatgctatttgcagcctttggcaagccttctcaggtgaatcacagcagaggcctctagagtttttttctttctttc----------------cttccttccttccttcctgc--------------------------------ttcctgccttcct------------------------------------tcttttctttctttctttc i panTro4.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52617705 51942 + 106955855 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 32161 86889 + 157876 I e ponAbe2.chr19 38960441 7015 - 60714840 I a score=12065.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 65647 44 + 188024 tttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttc s panTro4.chr19 41330431 44 - 63644993 tttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttc i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38967456 44 - 60714840 tttctttctttctctctttctttctttctttctttctttctttc i ponAbe2.chr19 I 7015 N 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52617705 51942 + 106955855 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30613642 23391 - 50890351 I e macFas5.chr19 36738174 35467 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 32161 86889 + 157876 I a score=104938.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 65691 417 + 188024 tttctttctttctcttgctttctttctttctttccttctttTTGgatggagtcttgctcttgtcatccaggctagagtgcaatggcattaacttgcctcactgcaacctccacctcccaggttcaagcaatctcctgcctcagcctcctgagtagctaggattacaggcacccaccactacgtctggctaatttttgtatatttagtagacttggggtttcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatctgtttgcctcggcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacctggcAgcctctaggattttggagcaaagccctgccattttctgcagataactactctccttttgagagacaactcttggcctgttactgggctttggt s panTro4.chr19 41330475 396 - 63644993 tttcttt---------------------tctttccttctttTTGgatggagtcttgctcttgtcatccaggctagagtgcaatggcattcacttgcctcactgcaacctccacctcccaggttcaagcaatctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcacccaccaccacatctggctaatttttgtatatttagtagacttggggtttcatcatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatctgcttgcctcagcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacctggcagcctctaggattttggagcaaagccctgccattttctgcagataactactctccttttgagagacaactcttggcctgttactgggctttggt i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38758872 415 - 60714840 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chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e macFas5.chr19 36774074 14458 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=330802.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 78864 668 + 188024 atagtagaatgatttataatctttcgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcaaatggtatttctgattctagatccttgaggaattgtcacattgtcttccacaatggttgaactgatttacactccccccaacagtgtgaaagtgttcctatttctcctcatcctccccagcatatgttgttttctgactttttaatgattacattctaactgttgtgagatggtatctcattgtgattttgatttacatttctctcatgactagtgacagtgagctttttttcatatgtttgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcttatcctttgcccactttttgatgg----ggttgcttttctcttgtaaatttgtttaagttctttgtagagcctggatattagccctttgtcagatggatagattgcaaaatttttctcccattccataggttgcctgttcactctgatgatagtttcttttgctgtgcagaagctcttgagtttaattaggtcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttgctgttttagtcatgaagtctttgcccatgcctatgccctgaatggcattgcctaggttttcttctagggtttttatggtttggggtgttacatttaagtct s panTro4.chr19 41335430 668 - 63644993 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s panTro4.chr19 41336463 1346 - 63644993 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i nomLeu3.chr10 C 0 I 692 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30641873 185 - 50890351 I e macFas5.chr19 36774074 14458 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=21341.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 81240 83 + 188024 gcatctatttgattcctctctcttttcttctttattagtctggctagcagtctatctattttgtagatcttttcaaaaaacca s panTro4.chr19 41337809 83 - 63644993 gcatctatttgattcctctctcttttcttcttcattattctggctagcggtctatctattttgttgatcttttcaaaaaacca i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38766772 83 - 60714840 gcatctatttgattcctctctcttttcttctttattagtctggctagtggtctatctattttgttgatcttttcaaaaaagca i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52675833 692 + 106955855 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30641873 185 - 50890351 I e macFas5.chr19 36774074 14458 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=4805.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 81323 13 + 188024 gctcctggaatta s panTro4.chr19 41337892 13 - 63644993 gctcctggattca i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38766855 13 - 60714840 gctcctggattca i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52676525 13 + 106955855 gcacccagactca i nomLeu3.chr10 I 692 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30641873 185 - 50890351 I e macFas5.chr19 36774074 14458 - 59248254 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=2319.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 81336 4 + 188024 ttaa s panTro4.chr19 41337905 4 - 63644993 ttaa i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38766868 4 - 60714840 ttga i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52676538 4 + 106955855 ttca i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36788532 4 - 59248254 ttga i macFas5.chr19 I 14458 C 0 e rheMac3.chr19 42178578 56967 - 64156825 I e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30641873 185 - 50890351 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=584453.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 81340 499 + 188024 ttttttgaagggtgttttgtgtctctatctccttcagttctgctctaatcttagttatttcttgtcttctgccagcatttgaatttgtttgctcttgcttctctagttctgttaattgtgattttaggatgttgattttagacctttcctgctttctcttgtgagcatttagtgctataaatttccctctaagcactgctttgtctgtgacccagagattctggtacattgtgtcatcattcttattggtttcaaagaacttacttatttctgccttcatttcattatttccccagta--gtcattctggagcatgttgttctgtttccatgtagttgagtggttttgagtgagttactt-atccagagttttaatttgattgcactgtggtatgagagactgtttgttatgatttccattcttttgcatttgctgatgagtgttttacttccaattatgtggtcaattttagaataagtgggatgcttttcagcattcttt s panTro4.chr19 41337909 499 - 63644993 ttttttgaagggtcttttgtgtctctatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttgtcttctgccagcatttgaatttgtttgctcttgcttctctagttctgttaattgtgattttaggatgttgattttagacctttcctgctttctcttgtgagcatttagtgctataaatttccctctaagcactgttttgtctgtgacccagagattctgttacattgtgtcatcattcttattggtttcaaagaacttacttatttctgccttcatttcattatttccccagta--gtcattctggagcatgttgttctgtttccatgtagttgagtggttttgagtgagttactt-atccagagttttaatttgattgcactgtggtctgagagactgtttgttatgatttccattcttttgcatttgctgatgagtgttttacttccaattatgtggtcaattttagaataagtgGGATGCTTTTCAGCATTCTTT i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38766872 499 - 60714840 ttttgtgaagggtcttttgtgtctctatctccttcagttctgctctgatcttagttatttcttgtcttctgctagcatttgaatttgttttctcttgcttccctagttctgttaattgtgattttagggtgttgattttagacctttcctgctttctcttgtgagcatttcatgctataaatttccctctaatcactgctttgtctgtgtcccagagattctggtatattgtgtcatcgttcttatcggtttcaaagaacttatttatttctgccttcatttcattatttccccagta--gtcattctggagcaggttgttcagtttccatgtagttgagtggttttgagtgagttactt-atccagagttttaatttgattgcactgtggtctgagagactgtttgttatgatttccattcttttgcatttgctgaggagtgttttacttccaattatgtggtcaattttagaataagtgGGATGGTTTTCAGCATTCTTT i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52676542 499 + 106955855 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ttttttgaagggtgttttgtgtctttatctacttcagttctgctctgatcttggttatttcttgtgttctgctagcatttgaatttatttgctcttgcttctctagttcttttaattatgattttagggtgtcgatttt-gaccctccctgctttctcttgtgagcatttagtgctataaatttccctctaaacacggctttgtgtgtgtccgagagatgctggtacgttgtgtcattgttctcattggtttcaaagaacttacttatttctgccttcatttcattatatacccagtagtgtcattcagtagcagattgttcagtttccatgtagttgtgtggttttgaatgaatttcttaatcctgagttctaaattgattgcactgtggtctgagagactgttttttatagtttccattgttttgtgtttgccaaggagtgttttacttccaattatgtggtcaatttCAG----------------------------- i rheMac3.chr19 I 56967 I 79 s macFas5.chr19 36788536 500 - 59248254 ttttttgaagggtcttttgtgtctttatctacttcagttctgctctgatcttagttatttctcatctactgctagtatttgaatttgtttgctcttgcttctctagttcttttcattattattttaggatgtcaattttagaccttccctgctttctcttgtgagcatttagtgctataaatttccctctaaacactgctttgtgtgtgtcccagagattctggtacattgtgtcattgttctcattggtttcaaagaacttatttgtttctgccttcatttcatgatttacccagta--ggcattctggagcaggttgttcaatttccatgtagttgtgtggttttgagtgagtttcttaattcagagttttaatttgattgcactgtggtctgagagactgagtgttatgatttccattgttttgcacttgctgaggagtgttttacttccaattatgtggtcaatttcagaataagtgggatACTTTTCAGCATTCTTT i macFas5.chr19 C 0 C 0 e calJac3.chr22 28372548 0 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30641873 185 - 50890351 I e papAnu2.JH684925 120456 10100 + 157876 I a score=32912.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 81839 40 + 188024 atagggcatatgcagtgccagtatgctctttcaaaatttg s panTro4.chr19 41338408 40 - 63644993 ATAGGGCATATGCAGTGTCAGTATGCTTTTTCAAAATTTG i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38767371 40 - 60714840 ATAGGGCATATGCAGTGTCAGTATGCTTTTTAAGAATTTG i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52677041 40 + 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aaatattatttaacattttaaaatttgattattaactataactagccaaacacccatgaaaaagaggaggtaataaactttcccatttcaaaacatattaaaagctataataaaagcaatgtagtactgacacaaagacagataaacagatgataaatcagaatagagagcccagaaatgaacccttctgtaaat-aatgatcttacacaaagctgccatgagcacacaatagagaaaagataatatcttcaaaaattaattctgaaaactgaatatctatactgataaagctggattctttccttgaaccataggc--aaaaaaa-tttatataaaatacttagatataaaaagtagctaataaatgtctt--taaaaaacatggagaaaagacatgacattggccttggaatcattttcttagatgacattaaacgcataagcaacaatgaaaagaacagaaaaatttaactgaaatatacttcaaaatttttgcacatcaaaaaaaa i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38768014 505 - 60714840 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CAATGCAATGCAAAACTATATTGTCcccattgtcaatgcttctactttaacataaccctggaagtacgtggcagaagaactaggc----aaaa--aaattgtttaaagccattgaaattgaagacaaataaataaaaagttgctgtttgcaaatcatttaatcttatatatt--aaaaaaaacataaaCAGTACATTTAAggccaggcacagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggcagatcacctgaggtcaggagtttgaaaccagcctggccaatatggtgaaaccttgtttctactaaaaaacacaaaaattagccatgcgtggtggcaggtgcctgcagtcccagctactcgggagtctgaggcaggagaatcacttgag-ccaggaggtggaggttgcaagtgagccaagatcacaccgctgcactccagcttgggtgacagagtgagactccatctcaaagaaaaaaaa---a-atattttagcctaaaatgttagttctgtgcttcagaagtataaattttcttgtttcacctaagttgtccctta i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38771833 558 - 60714840 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caacgcaatgcacaattatattgtctccattgccaatgcttctaatttaacgtaaccctggaagtatgtggcagaagaattaggcaaaaaaaa--aaaaggtttaaagccattgaaattgaagacaaataagtacaaagttgctgtttgcaaatcatataatcttatatact--gaaaaaAACATAAACAGTACATTTAAggccaggtgcggtggctcacacctgtaatcctagcactttgggagaacgaggcaggcacatcacctaaggtcaggagtttgaaatcagcctggccaatatggtgaaaccttgtttctact-aaaaacataaaaattagccatgcgtggtagtgggtgcctgcagtcccagctactcgggagtctgaggcaggagaatcacttgag-ccaggaagtggaggttgc-agtgagccaagatcacaccactgcactccagcttgggcaacagagtgagactccatctcaaataaaaaaaa---G-atattttagcctaaaatgttagttccgtgcttcagaaatataaatgttcttgtttcacctaagttatccctta i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42240578 559 - 64156825 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CAATGTAATGCAAAACTATATTATCTccattgtcaatgcttctattttaacataaccctggaagtatgtggcagaagaattacgc----aaaa--aaattgtttaaagccattgaaattgaagataaataagtaaaaagtttctgtttgcaaatcatataatcttatatatt--aaaaaAAAAATAAACAGTACATTTAAggccaggcatggtggctcacacctgtaatcccagcactttggcaggccaaggcaggcagatcacccaaggtcaggtgtttgaaaccagcctggccaatatggtgaaaccttgtttctact-aaaagcagaaaaattagccatgcgtggtggtgggcgcctgcggttcctgctactcaagagtttgaggcaggagaatcacttgaa-ctgggaggcggaggttgc-agtgagccaagatcatgccactgcactccagcttgggtaacacagcgagactccatctcaaagaaaaaaaa-----aTTTtttagcctgaactgttagttctgtgcttcagaaatataaattttcttgtttcacctaagttgtcccttA i macFas5.chr19 I 401 I 6137 s papAnu2.JH684925 133888 564 + 157876 cAATGCAAAGCAAAACTATATTGTGCCCATTGTCAATGTTTCCATTTTAACATAACCCTGGAAGTATGTAGCAGAAGAGTTAGGc----aaaaatacattgtttaaagCCATTGAAATTGAAGACAAGTAAGTAAAGAGTTGCTGTTTGCAGatcatataatattatatatttttaaaaaaccataaacggtaaatttaaggccaggcatggtggctcatgtccgtaatcccaacacttggggaggccaaggcaggcagatcacctgaggttaggaattcggaaccagactggccaatatggtaaaaccttgtttctact-gaaaacagaaaaattagccacgcatggtggcgggcgcccacagtcccagctactcaagagtctgaggcaggagaatcacttgaacctgggaggcagaggttgc-agtgagccaagatcacgccactgcactccagcttgggcaatagagtaagactccatctcaaagaaaaagaa---t-atattttagcCTAAAATATTAACTCCATGtttcagaaatataaattttcttgTTTCACCTAAGTTGTACCTTA i papAnu2.JH684925 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30644769 561 - 50890351 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i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.JH684925 134452 1129 + 157876 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i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38777664 1013 - 60714840 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ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52689222 449 + 106955855 TCTGTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAGATCCACACCTAAGTCGCCAGGATCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGTGAGTGTGCTGGGTCAGACATACTGTGAGAGTGGCCGGGGCTGGTTGGAACCGGCGGGAAGTGGCTGTGGTGGGACTCAAGCCTACGCGCAGTCAGCTCCACA------------AGTT--CTCCTTGCCTAG--CGACCTCAGTCCCCTTCAGCCATAAGATGGCGGCTGCGCTGACCGCCGGGCCGCCACGCGTCCTCTCTCTTCCCTGCGCTGTGTTTGTGCGCTAGCCTGGAGCCCTCTTGGGGCAGCTCTGCACCCGCAGCGCGGAGTCTCTCACAGATTGTGCAGGGACCACGGGAGGGTAGTCAGAGGAGAATCCTGACTTGGGGTGGGGGTTCATGAATGCGAAGAGCTTTGGTCCGTGAGGCTCTCAGTTCCTGTTTTCT i nomLeu3.chr10 C 0 M 1332 s rheMac3.chr19 42251724 458 - 64156825 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macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31235614 457 - 51301725 TCTGCGGCCCTGTGACCTGCAGGTGTTGGGAGATCCACAACTAAGTCGCCAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGTGAGTGTGCCGGGTCCGACATCCCGAGAGAGTGGCCGGGGCTGGTTGGAACTGGCGGGAAGTGGCTGTGGCGGGACTCTGGCCTCCCCGCAGTCAGCTCCACA-TCTGCGCCCCGAGTT--CTCCTTGCTTAGCTGGACCT--GTCCCCTTCAGCAGTAAGATGGCGGCAGCGCCGACAGCCGG--CCCCGGGCGTCGTGTCTCTTCCCTGCGCTGTAATTGTGCCCTGGCCTGGAGCCCTCTTGGAGTAGCTCTGCACCCGCAGCGCGGAGTCTCTCCCAGA-TGTGCAGGGACCCTGGGAGGGTAGTCAGAGGAGAATCCTGACTCGGGGTGTGGGTTCATGAATGGGAAGAGCTTTGGTCCGTGAGGTTCCCAGTTCCTGTTTCct i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30655138 459 - 50890351 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calJac3.chr22 28236735 190 - 49145316 cctgttaaaaatttatgaaagtcgccgcagaaatattaaagaatttaatcaaagagcgattctaaaattgtagagcactcagctatgggttgtaatttatggtctattgaaggggtttgactgaaaaagttttataaggtgaataatggtgaaaaccaaattcaataattgg----gtacagttacgtagtttc i calJac3.chr22 C 0 C 0 e nomLeu3.chr10 52689671 1332 + 106955855 M a score=-1849.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 93816 4 + 188024 ctgg- s panTro4.chr19 41350413 3 - 63644993 ctg-- i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38779396 3 - 60714840 ctg-- i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31236253 3 - 51301725 cta-- i papAnu2.chr19 C 0 I 1 s calJac3.chr22 28236925 4 - 49145316 tta-a i calJac3.chr22 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42252375 853 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52689671 1332 + 106955855 M e chlSab2.chr6 30655791 0 - 50890351 C e macFas5.chr19 36805103 0 - 59248254 C a score=2885.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 93820 3 + 188024 ttt s panTro4.chr19 41350416 1 - 63644993 --t i panTro4.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52691004 3 + 106955855 ttt i 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chlSab2.chr6 I 331 C 0 s calJac3.chr22 20928555 270 + 49145316 ttttttgagatggagttttgctcttgttacccaggctgaagtgcaatggcgcgatcttggctcaccgcaacc----tcggcctcctgggttcaagcaattcttcctgcctcagcctc----------aggactataggcgcgcaccaccatgcccagctaa-tttttgta-tttttggtagagatggtg-ttcaccttgttgaccaggatggtctcgatctcttgacctcatgatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattataggagtgggccaccgca i calJac3.chr22 C 0 I 7879 a score=7232.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 96172 11 + 188024 cacggAC----------tttt s panTro4.chr19 41352805 11 - 63644993 cacggAC----------tttt i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38782094 12 - 60714840 cccggAC---------ttttt i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52693326 11 + 106955855 cctggAC----------tttt i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42255784 21 - 64156825 cccggcctttttttttttttt i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36807892 20 - 59248254 cccggcc-ttttttttttttt i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31239241 17 - 51301725 cccg----tcattttttttta i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30658552 20 - 50890351 cccggct-ttttttttttttt i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e calJac3.chr22 20928825 7879 + 49145316 I a score=289474.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 96183 114 + 188024 ttgttttagacagtgttttcctctgtcgcccaggctggagtgcggtggtgcaatctcggctcactgcaacctctgcatcccaagttcaagtgattctcatgcctcagcctccca s panTro4.chr19 41352816 114 - 63644993 ttgttttagacagtgttttcctctgtcgcccaggctggagtgcagtggtgcaatctcggctcactgcaacctctgcatcccaagttcaagtgattctcatgcctcagcctccca i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38782106 114 - 60714840 tttttttagacagtgttttcctctgtcgcccaggctggagtgcagtggtgcagtctcggctcactgcaacctctgcatcccaagttcaagtgattctcatgcctcagcctccca i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52693337 112 + 106955855 t--ttttagacagtgttttcctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagctcactgcaacctctgcatcccaagttcaagtgattctcatgcctcagcctccca i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42255805 109 - 64156825 ttttttaagatagtgttttcctctgtcccccaggctggagtgcagtggtgcaatctc-----actgaaacctcctcattccgagttcaagtgtttctcatgcctcagcctcccg i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36807912 109 - 59248254 ttttttaagatagtgttttcctctgtcccccaggctggagtgcagtggtgcaatctc-----actgaaacctcctcattccgagttcaagtgtttctcatgcctcagcctcccg i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31239258 114 - 51301725 ttttttgagatagagtttcattctgtcacctaggctgcagtgccgtggcacgatctctgctgactgcaacctccacctcccgggttcaagcagttcttctgcctcagcctcccg i papAnu2.chr19 C 0 I 428 s chlSab2.chr6 30658572 106 - 50890351 tttttttaaagactgttttcctctgtcccccaggctggagtgcagtggtgcaatctc-----actgaaacct---cattccaagttcaagtgattctcatgcctcagcctcccg i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28239372 114 - 49145316 ttgttttagaccgtgttttcctctctctcccaggttggagtgcagtggtgcaatctcggctcactgcaacctctgtgtcccgagttcaagtgattctcatgcctcagcctcccc i calJac3.chr22 C 0 C 0 a score=962073.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 96297 357 + 188024 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agtagctgggactacaggtgtctgccaccatacctggctactttttgtatttttagtagagatgggggtttgccatgttgaccaggctgtgtGA-GCTCAAAATTCGGACCTCAAGT-----AATCtcctc------------------gccttggcctcccaaagtgctgggattgcaggtgtgagccactgtgcccgactgaCCTCAGTTTTTTAACTGTACATTGCATTTTATTAGTAGGTCTTGAAAGGTAAGAAGATATTTACAAAGGATGTAAAAAAGGtgagtttcaaaaaaaatatatctaattatatattttatttgttgaa-gttctcattcacct-ttttttttctc---agtgaatttaagagttttttcagg i papAnu2.chr19 I 428 I 2 s chlSab2.chr6 30658678 355 - 50890351 agtagctgggactacaggtgtccgccaccatacctggctactttttgtatttttagtagagctgggggtttgccatgttgactaggctgtgtga-gttcaaaattctgacctcaagt-----aatctgccc------------------gccttggcctcccaaagtgctgggactgcaggtgtgagccactgtgcccgacTGACCTCAGTTTTTTAACTGTACATTGCATTTTATTAGTAGGGCTTGAAAGGTAAGAAAATATTTACAAAGGATGTAAAAAAGGTGAGTTTCAAAAAAAA-ATATCTAATTATATATTTTATTTGTTGAA-GTTCTCATTTACCT-TTTTTTTTCTC---AGTGAATTTAAGAGTTTTTTCAGG i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28239486 370 - 49145316 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cttttctttttcttt-------------------------ttcttttttttttctttgagacagagtctcgctctgtctcccaggctggagtgcagtggtgggatcttggttcactgcaagctccacctcccaggttcacaccattctcctgcttcagccttccaagtagctggggctacaagcgcctgccaccaca----------------------cccagctaatttttttgtatttttagtagagacggtgtttcaccatgttagccaggatggtcttgatttcctgacctcatgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcgccctgctCTCAGGTGTG- i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52693816 299 + 106955855 ctttt-------------------------------------------------tttgagacagagtctctctctgttgccctggctggagtgcagtggtgggatcttggctcactgcaagctccacctcccgggttcacaccattctcctgcttcagcctcccaagtagctgggactacaggtgcccgccaccaca----------------------cccagctaatttttgtgtatttttagtagagacggtgtttcactgtgttagccaggatgctcttga-ttcctgacctcatgatccacctgcctcggcctccaaaagtgctgggattacaggcgtgagccactgtgccctgccCTCAGGTGTG- i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36808374 349 - 59248254 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CAATTAA----ttct-tttttttttttttgaaatggagtttcaatcttgttgctcaagctagagtgcaatg----aatctcggctcactgcaacctctgcctcctgggttcaagcaattctcctggctcagcctcccaagtagctaggattacaggcatgcatcaccatgcctggctaattttgtgtttttagtagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcaaactcccaacctcaggttatctgcctgcctca-gcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccatgcctggcACAC---- i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42273948 307 - 64156825 --ATTAA----TTCC-tttttttttttttgaaatggagtttcgctaatgttgcccgagctggagtgcaatggtgtgatctcggctcaccgcagcctccacctcccggattcaagtgattctcctacctcagcctcctgagtagctaggattacaggcatatgccaccacgactggctaattttgtgtttttagtagagac----tttctccacgttggtcaggctggtctcgaactcccaacgtcaggtgatctgcccgcctca-gcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccatgcctggcACACAATT i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36825948 308 - 59248254 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--ATTAA----TTCC---tttttttttttgagatggagttttgctaatgttgcccaagctggagtgcaatggtgcgatctcggctcaccgcaacctccatctcccaggttcaagtgattctcctacctcagcctcccgagtagctaggattacaggcatatgccaccacgactggctaattttgtgtttttagtagagac----tttctccatgttggtcaggctggtctcaaacttccaacgtcaggtgatctacctgcctcaggcctcccaaagtgctgggattacagacatgagccaccatgcctggcACACAATT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e calJac3.chr22 28266039 3 - 49145316 I a score=1427728.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 111836 489 + 188024 AATTCTGTATGATGTAAATATAGCACTCAAAATTGTACATGTTAGTGTTTTTGCCCTCAATTTTATACTTTATTATCTAGAAAAATATTACATATACACAGATGTTATGGATCTTATACCACTTTCTTTTCTCAGAGTTAGAGAATACATTAGTGAACATTTCTGTGTTGAAAACTATTTTATTGAATAATTTCAGTCATTCATATAAGTCAGAACCAGCTCTCTCTACTCTCTCCATTTTACCTTGAGTCACATTAAAAGTTCTGCCCATGACCAATTGGTAAATATATGTGTTTGTGTGTGTTTTCCAGGGAGCATTGACATTTAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAGTGGCAATGCCTGGATTCTACACAGCAGAATTTATATAGGAATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGGTGAGAATAACTTTAATACGCA--------ATTCCTAGTATATACTACAGGTTTCATTT s panTro4.chr19 41368488 489 - 63644993 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TGCTGCAGACCTTATTGGACTGAACAAAGGAGGATGAACGCGAGAATAAATGCAAagacaaaagagtatatttggaagaaggggtcagggggctccttgcttctagtgaACAAGCGACCTGAGCTT-CTATAGCCCTTCATATTTATGGAGTAAAGGAGACAGGGAGCAGAAGGAGGTTGTGGTCAGCCGCTTGACTTAATGCAGGCCTGCATGAC--TATTCTTTGAACAGTACTCTCCAGATGTTCCAGTAGATAACCACAAGGAGCATGGCACCAGGGGGTGACTGCCCTCAGTGTACCTTCTGGTGGCAGGAGCAGATGCGAGTTTGCCCACATTCTGCATTCATTATAAACAGTTTACTGTTTGATCATATTCCCTTCAGTGGAATG--------------ACCCTCAGAATTTCAGCTCCTAACATTTCCCCCTTTCTGTTTATGCATTAATCGAATAAATGTAAGGTCAGGTTGGGCAGCTGTCATTTTCTGATTGCTGGTCCATCCAATTTTACAGACTATGAACAGAAAACAGAGACAGAACAGCATTACCCCAAGAACTACATATGAGATTTTA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30675062 568 - 50890351 tgctgcagacctttttggactgaacaaaggaggatgaatgcgagaataaaggcaaagacaaaagaatatatttggaagaagcggtcagggggctccttgcttctagtgaacaagtgacctgagctt-ctatagcccttcgtatttatggagtaaaggagacagggagaagaaggaggttgtggtcagctgcttgacttaatgcaggcctgcatgactatattctttgaacaatactctccagatattccagtagataaccacaaggagcatggcacca-ggggtgactgccctcagtgtaccttctggtggtaggagcagatgcgagtttgcccacattctgcattcatgataaacagtttactgtttgaccatatagcctccagtggaatg--------------accctcagagtttcagctcctaacaTTtccccctttctgtttatgcattaatcgaatgaatgtaaggccaggttgggcagctgtcattttctgattgctggtccatccgattttacagactatgaacagaaaacagagacagaacagcattactccaagaactacatatgagatttta i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e calJac3.chr22 28266539 319 - 49145316 I a score=652806.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 112904 275 + 188024 gtgtggtgctttagataggtccaaggattgaggctctccaggccttgctggaattcggtccagtcttctaaagaaggctgaaactcttgagtttgcttatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccagtatcaaaggtgatgttgggtgtgaaagctccccgcaaatgggctttcacaaggtcccatggatactcgctttggttatattctacgttggttacacatatatgagtgtgatttaaatgatagcacaattgctctttcaattg s panTro4.chr19 41369556 275 - 63644993 gtgtggtgctttagataggtccaaggattgagcctctccaggccttgctggaattcggtccagtcttctaaaggaggctgaaactcttgagtttgcttatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccaatatcaaaggtgatgttgggtgtgaaagctccctgcaaatgggctttcacaaggtcccatggatactcgctttggttatattttacgttggttacacatatatgagtgtgatttaaatgatagcacaattgctctttcaattg i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38805046 275 - 60714840 atgtggtgctttagataggtccaaggattgaggttctccaggccttgctggaattcggtccagtcttctaaagaaggctgaaactcttgagtttgcttatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccaatatcaaaggtgatgttgggtgtgaaagctccctgcaaatgggctttcacaaggtcccatggatactcactttggttatattccaagttggttacacatatatgagtgtgatttaagtgacagcacaattgctctttcaattg i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52710416 275 + 106955855 atgtggtgctttagataggtccaaggattgaggctctccaggctttgctggaattcagtccagtcttctaaagaaggctgaaactcttgagttttcttatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccagtatcaaaggtgatgttgggcgtgaaagctccctgcaaataggctttcacaaggtcccatggatactcactttggttatattctaagttggttacagaaatatgagtgtaatttaaatgacagcacaattgctgtttcaatta i nomLeu3.chr10 I 309 C 0 s rheMac3.chr19 42275310 273 - 64156825 atgtggtgctttagataggtccaaggattgaggctctccaagcctttctggaattcggtccagtcttctaaagaatgctgaaactcttgagtttacctatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccagtgtcaaaggtgatgttggatgtgaaagttccctgcaaatgggctctcataagttcccatggatactcactttggttatattctaagttggttacacaaatatga--gtgatttaaatgacaacacaattgctgttgcaattg i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36827311 275 - 59248254 atgtggtgctttagataggtccaatgattgaggctctccaagcctttctggaattcggtccagtcttctaaagaaggctgaaactcttgagtttacctatttaaatcaagaattttgttttgtaattcaccagtgtcaaaggtgatgttggatgtgaaagttccctgcaaatgggctctcacaagttcccatggatactcactttggttatattctaagttggttacacaaatatgagtgtgatttaaatgacaacacaattgttgttgcaattg i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31256513 275 - 51301725 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s panTro4.chr19 41369870 2391 - 63644993 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i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52710730 2350 + 106955855 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i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42275615 3772 - 64156825 I e calJac3.chr22 28266539 319 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30675905 3761 - 50890351 I e macFas5.chr19 36827624 3713 - 59248254 I e papAnu2.chr19 31256826 3569 - 51301725 I a score=9463.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 115609 23 + 188024 cataacgtttttcttcaacagac s panTro4.chr19 41372261 23 - 63644993 cataacgtttttcttcaacagac i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38807750 23 - 60714840 cataacgtttttcttcaacagac i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36831337 22 - 59248254 cataaacctttttcccaacGTT- i macFas5.chr19 I 3713 C 0 s papAnu2.chr19 31260395 22 - 51301725 CATAAACCTTTTTCCCAACGTT- i papAnu2.chr19 I 3569 C 0 e rheMac3.chr19 42275615 3772 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52713080 0 + 106955855 C e calJac3.chr22 28266539 319 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30675905 3761 - 50890351 I a score=1692.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 115632 3 + 188024 aTG s panTro4.chr19 41372284 3 - 63644993 aTG i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38807773 3 - 60714840 aTG i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28266858 3 - 49145316 ATG i calJac3.chr22 I 319 C 0 e rheMac3.chr19 42275615 3772 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52713080 0 + 106955855 C e chlSab2.chr6 30675905 3761 - 50890351 I e macFas5.chr19 36831359 0 - 59248254 C e papAnu2.chr19 31260417 0 - 51301725 C a score=960829.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 115635 345 + 188024 TTATAATTTAGTATTTTGGGATAAATGTATTAGAATATTCTATTACATCCTCTTTACTGAGCACATTACTAAGTTGGTAATTGGAGAATATGAGCAAGATGGATGTTGTTCATTTTTAATAAAACAGGTATTGCTGCCTTTAAGCCAGACCTGATCATTTTTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATATGAAGAGACATGAGATGGTGGAAGAACCCCCAGGTAGGTGAGAGTGAATAC---AGACAACATGAATGAGAAGTCCAAAGTCAATGAGGAAGCCAGTCCTTAAAGTCATTTGGGAAGCTGTGTTCCAAAAGTAGTTGTTTCTGGAAAG-CTAATTTTTA s panTro4.chr19 41372287 345 - 63644993 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----------------------------------------taTTACATCCTCTTTACTGAGCACATTACTAAGTTGGTAATTGGAGAATATGAGCAAGATGCATATTGTTCATTTTTAATAAAACAGATATTGCTGCCTTTAAGCCAGACCTGATCATTTTTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATATGAAGAGACATGAGATGGTGGAAGAACCCCCAGGTAGGTGAGAGTGAATAC---AGACAACATGGATGAGAGGTCCAAAGTCAAGGAGGAAGCCAGTCCTTAAAGTGATTTGGGAAGTTGTGTTCCAAAAGAAGTAGTTTCTGGAAAGCCTAATTTTTA i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42279387 347 - 64156825 TTATAGTTTAGTATTTTGGGATAAATGTATTAGAATATTCTATTACATCCTCTTTACTGAGCACATTACTAAGTTGGTAATTGGAGAATATGAGCAAGATACATGTTGTTCATTTTTAATAAAACAGGGATTGCTGCCTTTAAGCCAGACCTGATCATTTTTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATGTGAAGAGATATGAGATGGTGGAAGAACCCCCAGGTAGGTGAGAATGAATACAATAGATGACATGCATGAGAGGTCCAAGGTCAAGGAGAAAGCCAGTCCTTAAAGTGATAC-GGAAGCTGTGTTCCAAA-TAAATAGTTTCTGGAAAGCCtaattttta i rheMac3.chr19 I 3772 C 0 s macFas5.chr19 36831359 347 - 59248254 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TTATAATTTAGTATTTTGGGATAAATGTATTAGAATATTGTATTACATCCTCTTTACTGAGCACATTACCAAGTTGGTAATTGGAGAATATGAGCAAGATGCATGTTGTTCATTTTTAATAAAACAGGTATTGCTGCCTTTAAGCCAGATCTGATCATTTTTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATGTGAAGAGATATGAGATGGTGGAAGAACCCCCAGGTAGGTGAGAATGAATACAATAGACGACATGCATGAGAGGTCCAAGGTCAAGGAGAAAGCCAGTCCTTAAAGTGATAC-GGAAGCTGTGTTCCAAAATAAATAGTTTCTGGAAAGCCTAATTTTTA i chlSab2.chr6 I 3761 C 0 s calJac3.chr22 28266861 335 - 49145316 TTATAAATTGGTATTTGGGGATAAATGTATTCGAATATTCTATTACATCCTCTTTACTGAGCACATTACTGAGTTGGTAATTGGTGATTATGAGCAAGATGCATGTTACTCATTTTTAATAAAACAGGTATTGCTGTCTCTAAGCCAGATCTGATCACCTTTCTGGACCAAGAAAAAAAGCCCTGGAATATAAAGAGACGTGAGATGGTGCCCAAACCCTCAGGTAGGTGAGAGTGAATACAACAGGCAACCTGGATGAGAGATCCAAAGTCAAAGAGAAAGCC---------AGTGATTTGGGAAGCCACATTC--AAAGAAATAGTTTCTGGAAAGCC---TTTTTA i calJac3.chr22 C 0 I 311 a score=14189.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 115980 7 + 188024 TTTTTAT s panTro4.chr19 41372632 7 - 63644993 tttttat i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38808122 7 - 60714840 tttttat i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52713386 7 + 106955855 TTTTTAT i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42279734 6 - 64156825 ttttta- i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36831706 7 - 59248254 TTTTTAT i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31260764 7 - 51301725 tttttat i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30680014 7 - 50890351 TTTTTAT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e calJac3.chr22 28267196 311 - 49145316 I a score=891035.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 115987 330 + 188024 TTTTTA-ATTTT-CTCTCACACAGGGGCATCTTCTAACTTATGCTTTTAAAATTTCTAAGAATTCTTCTTTCCCTTAAGTAATTTTCCTTCAAGTTTACAG-TGATAGCCAAA-GTACTGTTCATGGCATACAAGAGAGTG--CAATCTGACTTTTT----TTTG-TTTTTGTGGACACATAGATATCCGCGTAATTTTAAGGTACTCCATGTTAAACTATC-TTTTAAGTTCTCTTTTTCCATCATCTCTGAAGTGTGTGAGAGTAGTGGTttctgtatcattggggtttttttggttcatttttctgcacatttcattctgtttttattac--tatagtctt s panTro4.chr19 41372639 334 - 63644993 ttttta-atttt-CTCTCACACAGGGGCATCTTCTATCTTATGCTTTTAAAATTTCTAAGAATTCTTCTTTCCCTTAAGTAATTTTCCTTCAAGTTTACAG-TGATAGCCAAA-GTACTGTTCATGGCATACAAGAGAGTG--CAATCTGACTTTTTTTTGTTTG-TTTTTGTGGACACATAGATATCCGCGTAATTTTAAGGTACTCCATGTTAAACTATC-TTTTAAGTTCTCTTTTTCCATCATCTCTGAAGTGTGTGAGAGTAGTGGTttctgtatcattggggtttttttggttcatttttctgcacatttcattctgtttttattac--tatagtctt i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38808129 336 - 60714840 ttttta-atttt-CTCTCACACAGGGGCATCTTCTGTCATATGCTTTTAAAATTTCTAAGAATTTTTCTTTcccttcagtaattttccttcaagtttacag-tgacagccaaa-gtactgttcatggcatacaagagagtgcacaatctgACTTTTTTTTGTTTG-TTTTCGTGGACACACAGATATCTGCGTAATTTTAAGGTACTCCATGTTAAACTACC-TTTTAAGTTCTCTTTTTCCATCATCTCTGAAGTGTGTGAGAGTAGTGGTttctgtatcattggggttttttttgttcatttttctgcacatttcattctgtttttattac--tataatctt i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52713393 338 + 106955855 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gaaatatagtttgaaagtataaagtatgatgtc---ctgcttt-tttctttttcttcaagattgctttgcctattcac--tttcttgtagtttcatgtaaattttatgattgtattttttattactgtgaa--aaaaaaactgtaatattgatagagagttcattgaatctggagatcattttggataatatggcattttaacatttattctttgaattgatagacctaaaatatatttaaatttatttgtgttctc-----atttttcattgataagtctttcacttgaaaactttttcagctcgtcagttaaatttgttctcagatatttattattttagtgctattgtaaataa i rheMac3.chr19 C 0 I 45 s macFas5.chr19 36832039 347 - 59248254 gaaatatagtttgaaagtataaagtatgatgtc---ctgcttt-tttctttttcttcaagattgctttgcctattcac--tttcttgtagtttcatgtaaattttatgattgtattttttattactgtgaa--aaaaaaactgtaatattgatagagagttcattgaatctggagatcattttggataatatggcattttaacatttattctttgaattgatagacataaaatatatttaaatttgtttgtgttctcat--tatttttcattgataaatatttcacttgaaaactttttcagctcctcagttaaatttgttctcagatatttattattttagtgctattgtaaataa i macFas5.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30680348 346 - 50890351 gaaatatagtttgaaagtataaagtatgatgtc---ctgcttt-tttctttttctacaagattgctttgcctattcac--tttcttgtagtttcatgtaaattttatgattgtattttttattactgtg-a--aaaaaaactgtaatattgatagagagttcattgaatctggagatcattttggataatatggcattttaacgtttattctttgaattgatagacataaaatatatttaaatttgtttgttttctcat--tatttttcattgataaatatttcactttaaaactttttcagcttctcagttaaatttgttctcagatatttattattttagtgctattgtaaataa i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28267826 341 - 49145316 gaaatatagtttgaaat--tagagtatgatgtt---ctgctttgttttctttttcttaagattgctttgactattcatagtttattatagtttcttataaattttaggattatattttttatttctgtgaaa-aaagtcactggaattttgatactgactttattgaatctacagatcacttagaataatatggcactttaacattttttctttgaattgataaacataaaatatatttaaatttatttgtgttatc----tatttttcactgataaatcttttacttgaaagttttttgagttacttggttaaatttgttctgaaat------tattttagtgctattgtaaataa i calJac3.chr22 C 0 C 0 e papAnu2.chr19 31261099 1283 - 51301725 I a score=20779.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 116660 15 + 188024 gatggttttcttttt s panTro4.chr19 41373316 15 - 63644993 gatggttttctttct i panTro4.chr19 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a i papAnu2.chr19 I 1283 C 0 s chlSab2.chr6 30681022 1 - 50890351 a i chlSab2.chr6 C 0 I 339 s calJac3.chr22 28268495 1 - 49145316 a i calJac3.chr22 C 0 C 0 e macFas5.chr19 36832514 6078 - 59248254 I a score=57802.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 117003 48 + 188024 aact---ggtttcagagggt-aaaaatcttcttttttggggcccccagggtg s panTro4.chr19 41373659 48 - 63644993 aact---ggtttcagagggt-aaaaatcttcttttttggggcccccagggtg i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38809143 48 - 60714840 aact---ggtttcagagggt-aaaaatcttcttttgttgggcccccagggtg i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52714416 49 + 106955855 aact---ggtttcagagggtaaaaaatcttcttttgttgggcccccagggtg i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42280790 48 - 64156825 agtttaaggtttcagagggt-aaaag---tcttttgttgggcccctagggtg i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31262383 45 - 51301725 aatt---agtttcaaaGGAT-AAAAA---TCTTTTGTTGGGCCTCCAGCGGA i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28268496 44 - 49145316 aact---gatttaagaaagt-aaaaa---tctttggt-gagcccccagggtg i calJac3.chr22 C 0 C 0 e chlSab2.chr6 30681023 339 - 50890351 I e macFas5.chr19 36832514 6078 - 59248254 I a score=348270.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 117051 148 + 188024 atagaatgccctctgggtttgtagtagagtggggttgtagcttggtcacaaggctgctggctctgcactagggttggcttattacaaggggcttgggcagttgtaattcccattttatttttggacagagtaaatatccttcaggacg s panTro4.chr19 41373707 148 - 63644993 atagaatgccctctgggtttgtagtagagtggggttgtagcttggtcacaaggctgctggctctgcactagggttggcttattacaaggggcttgggcagttgtaattcccattttatttttggacagagtaaatatccttcaggacg i panTro4.chr19 C 0 I 5593 s ponAbe2.chr19 38809191 148 - 60714840 atagaatgacctctgggtttgtagtagagcggggttgtagcttggtcacagggctgctggctctgcactagggttggcttattacaactggcttgggcagttgtaattcccattttatttttggacagagtaaatatccttcaggact i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52714465 148 + 106955855 atagaatgccctctgggtttgtagtagagtggggttgtagcttggtcacaagcctgctggatctgcactagggttggcctattataaggggcttgggcagttgtaattcccattttatttttggacagaataaatatccttcaggact i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42280838 148 - 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TTGCTCAGTAGGATAAACACTAGGGCAGGTTTCTG--GTCGAGTGtgcatatggtgggctttatattaggatgtggattagtatgacttt-cactgagtaccagagaggatttctgaggtcactatgggtttctacgtaggcagagctggccgtgaactgtggcttaggaagctggaactgagtcatgaaactggttttgggaacacggtaaggaccgaggtctgaaggcctgccggcatggCTATAAATTCGTATCTTTCTCCAGGCCTCTGGAAGAG-CAAAACCTTTCACAGAATGTGGCTAAAAGGAGTTTGGGATGATTACAGAGTAAGTTTAAAATTCTCAATTGGACCAAGTTGGATGGGACATTTTATA------TAGTCAAGAGCAGGGGTCCTGTAGTTTGCCACCTGAATGAAAGCCTGCTTTCTGAAAAGGATGCTTCTCTATTTTTGGC----------TTTCACA-----------GAGTCTCAAAGCTCTTTTAAAGGCACTTA-ttttgagatggggtgtcgctccataacccaggatgatcgtaaaattttggcctgaagcagttctccaaccATACTGTACCATGTAGTTGTTATTTACAGGTATTAGCCATAATACCTGGTTCTCTCATTAAGACATTTTTGTCATTAATGATTGACAAATTTTCTTGCTGGATAAGGAAGGATAAGGAAATAGGGCAC------CTTTTAAAACAAAAttctgtttctaagagtgtgactgctttataggcatctatcccatacaatcttggtcttttttgtggctgactcatttcattttgcataatttcaccaagttttatctttgtaatttggagaatattttctgcttttttaaaactgagtgatattccagtatttttatatttcaaattatatttactaaatgattttgtgag--aaatctggattgcctttactttttagcttatagtaataactattggaatgtaaatgACTCCTCATATGACCATATATGTTAAAGTTTGTAT--------------------------------ATGTGTTGCATTCTATTTTTATTAGTTTACTTTTTCATCCTTATACTCATACCAGATTCTGGTTTTAATT 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i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38816998 5685 - 60714840 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atgagtctttgacttaagatttagcttgtgtaatattattttgacctcctctgctcttacttgactaatatttgcatgaaatgtctacttccatcttgccacttt--gtctttttaacattagatttcatctgactcttgtagaaaggcaagttggatcttgatatttaaaatttttt-aatagcctcggcaaagtgcctcatgcctgtaatcccagcactttgtgaggctgaggcaggtagataacctgaagtc--gggagctcaagaccagcctggccaacattgtgaaacctcgtctctactaaaaatacataaattagctggtagtgttggtggacttttgtaatcccagctactcgggagtgtgaggcaggagaattgct i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36839214 381 - 59248254 atgagtccttgactaaaaatttagcttgtgtaatattattttgacttattctactctcatttgattaatatttgcatgaaatgtctacttccatcttgctactttgagcctttttaatattagatttcaactgatccttgtagaaaggcaagttggttcttgATATTTAAAATATTT--ACTAggccatgcacagtgactcatgcctgtaatcctagcacttcaggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtc--aggggttccagaccaccctggccaacattgtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtgttggtggactttggtaatcccagctacttgggaatctgaggcaggagaatttct i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31269873 381 - 51301725 atgagtCCTTGACTAAAAATTTAGCTTGTGTAATATTATTTTGACTTATTCTACTCTCATTTGATTaatatttgcatgaaatgtctACTTCCATCTTGCCACTTTGAGCCTTTTTAATATTAGATTTCAACTGACCCTTGTAGAAAGGCAAGTTGGttcttgatatttaaaatattt--aataggccatgcacagtgactcatgcctgtaatcctagcacttcaggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtc--agggggtccggaccaccctggccaacattgtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtgttggtggactttggtaatcccagctacttgggaatctgaggcaggagaatttct i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30687001 380 - 50890351 atgagtccttgactaaaaatttagcttgtgtaatattattttgacttattccactctcatttgattaatatttgcatgaaatgtctacttccatcttgccactttgagcctttttaatattagatttcaactgacgcttgtag-aaggcaagttggttcttgATATTTAAAATATTT--AATAggccatgcacagtgactcatgcctgaaatcctagcacttcaggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtg--aggggttccagaccaccctggccaacattgtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaactagctgggcgtgttggtggactttggtaatcccagctacttgggaatctgaggcaggagaatttct i chlSab2.chr6 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42282330 7435 - 64156825 I e nomLeu3.chr10 52722444 100 + 106955855 M e calJac3.chr22 28269750 10394 - 49145316 I a 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ttaataaatc----tattaaa---attctgttgatttgaaagttaattttccatatatttaaataattttctgaaagtaaaggagttac---ttttattttattacctattctatttaattcttgcat-cttgtccctcattttctctttctgtcttcctt---------------------------------------------------------------------tgtttctttctggttttcgtattgatatgttttcat---tttcttatttttct--tttgtgtatgtatacaga---tttt-tttgtgtggtatcttggggattacataaaacctctaaaa-ataaaacaatatat-tttaatcaggtgaaaaattaactgcagttgcataaaaaagtcctccttattatgtctgctcttaaatttttcactgatgttgctaagtttatctat i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38823766 370 - 60714840 ttaataaatc----tattaaa---aatctgttgatttgaaagttaattttccatatatttaaataatttactgaaagtaaaggagttac---ttttattttattaactattctatttatttcttgcat-cttgtccttcattttctctttctgtcttcctt---------------------------------------------------------------------tgtttctttctgatttttgtattgataggctttcat---tttcttattttttttgtgtgtgtatgtatacaga---tttt-tttttgtggtaccttgaggattacataaaacctctaaag-ataaaacaatatat-tttaatcaggtgaaaaattaacttcagttgcataaaaaaGTCCTC---ATTATGTCTGCTCTTAAGTTTTTCACTGATGTTGCTAAGTTTATCTAT i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52722640 341 + 106955855 TTAATGAATC----TATTAAA---AATCTGTTGATTTGAAAGTTA--------------------------------TAaaggagttac---ttttattttattacctattctatttgtttcttccat-cttgtccctcattttctctttctgtcttcctt---------------------------------------------------------------------tgtttctttctgatttttgtattgatacactttcat---tttcttatttttat--tctgtgtatgtatacagattttttt-tttttgtggtaccttggggatta-ataaaacctctaaaa-atacaacaatatat-tttaatcaggtgaaaaattaactttggttgcataaaaaattcctccttATTATGTCTGCCCTTAAATTTGTCACTGATGTTGCTCAGTTTATCTAT i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36839691 372 - 59248254 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papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30687477 369 - 50890351 TTAATAAATC----TATAAAA---AAtctgttgatttgaaagttaattttccatatatttaaatacattttggaaagtgaaggcattac---ttttattttattacctattctatttgattcttgca----tgtccctcattttctctctctgtcttcctt---------------------------------------------------------------------tgtttctttctgatttttgtattgatatgctttcac---tttcttatttttct--tttgtatatgtatatagt---ttttatgtgtgtggtatcttggggattacataaaacctctaaaa-atacaacaGCATAT-TTTAATCAGGTGAAAAATTAACTTTGGTTGCATAAAAAATTCTTCCTGATTATGTCTGCCCTTAAATTTGTCACTGATGTTGCTAAGTTTATCTAT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 20963569 447 + 49145316 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AACACAAGGTAATTCATACCAGAGAGAAACTCTACAAATATAAAGAACATGGCAAAGCCTTCAGCTGGTCCTCAAACCTTTCTAAGCACAAGAGAATTCATGCTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAACAATGTGGCAAAAGC i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 20966042 143 + 49145316 AACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCAACCAATGTGAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAACTGGTCTTCATACCTTACTGAACATAAGAGAGTCCATACTAGAGAGAAGCCCTACAAATGTGATGAATGCTGCAAAGCC i calJac3.chr22 C 0 C 0 e macFas5.chr19 36841648 2300 - 59248254 I e ponAbe2.chr19 38826012 731 - 60714840 I e panTro4.chr19 41389961 1397 - 63644993 I a score=132132.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 127940 110 + 188024 TTTAGTAGCGT--CTCAACCCTTAATACACATAAGGCAATTCATGCTGAAGAGAAGCCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTCCAACTCGTCCTCAAAGCTCATGGA s ponAbe2.chr19 38826743 110 - 60714840 TTTAGTAAGGT--CTCAACCCTGAATACACATAAGGCAATTCATGCTGAAGAGAAGCCTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTCCAACTCGTCCTCAAAGCTTATGGA i ponAbe2.chr19 I 731 I 457 s nomLeu3.chr10 52725298 110 + 106955855 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attcatactggagagaaaccttacaaatgtgaagaatgtggcaaaacctGTAAGTGGTCCTCAACCCTTAGTTTTCATAAGA-AAATTCATGCTGCAGAGAAatcttacaaatgtgaagaatgtggtaaAGCCTTCGGCTGTTTCTCAGTCTTTAGTAACCATAaggtaattcatactggagagaaaccctataaatgtgaagaatgtggcaaagacTTTACTACGTTCTCAATCTttactaaacataagaaaattcatactggagagaaaccctataaatgtgaagaatgtggtaaAGTCTTCAGCTCTTTCTCAGTCTTTGGTAACCATAaggtaattcatactggagagaaactctacaaa i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30690400 363 - 50890351 AATCATACTGGAGAGAAATCTTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCTTCGGCTGTTTCTCAGTCTTTAGTAACCATAAGT-TAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGACTTTACTACATTCTCAATCTTTACTAAACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGTCTTCAGCTCTTTCTCAGTCTTTGGTAACCATAAGGTAATTCATACTGGAGAGAAGCTCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGTCTATAAGTGGCCCTCAACCCTTAGTTATCATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACTCTACAAA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 20966725 359 + 49145316 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GTCATCCTCAACCATTAGTTATCATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAATCCCTAAAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTCAATTGATTCT--GTCTTTAGTAAACGTAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAAATTTACAAAGGTGAAGAATGTGACAAAGCTTTTAAACAGTCCTCAACCTTTATTACATGTAAGAAAATTCATGCT-GGAGAGAAA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52726453 216 + 106955855 GTCATCCTCAACCATTAGTTATCATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAATCCCTAAAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGTCTTCAGCTGGTTCTCAGTCTTTAGTAAACATAAGAAAATTCATGCTGGAGATAAATTCTACAAATATGAAGAATGTGGCAAACCTTTT-AACAGTCCTCAACCTTTATTACACGTAAGAAAATTCATGCT-GGAGAGAAA i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s rheMac3.chr19 42293375 213 - 64156825 GTGGCCCTCAAACCTTAGTTATCACAAGAAAATTTACACTGGAGAGAAACTCTACAAATTTGAAGAATGTGGCAAAGGGTTTAGTATGTTCTCAATCCTTACTAAACATAAGGTAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTAAGTTCTCAGTCCTTACTAAACACAAGGTAATTCATACT-AGAAA---- i rheMac3.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31273682 217 - 51301725 GTGGCGCTCAACCCTTAGTTatcataagaaaattcatactggagagaaactctaCAAATgcgaagaatgtggcaaagcctatAACTGGCCCTCAACCCTTAGTTatcataagaaaattcatactggagagaaaccctacaaatgtgaagaatgtggcaaaggctTTAGTACGTTCTCAATCTttactaaacataagaaaattcatact-ggagagaaa i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30690789 217 - 50890351 CTGGCCCTCAACCCTTAGTTATCATAAGAAAATTCATACTAGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGGCTTTAGTACGTTCTCAGTCTTTACTAAACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCTGGGCCTCAAGCCTTAGTAAACACAAGAGAATTCATGCT-TGAGAGAAA i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 20967110 129 + 49145316 ---------------------CCAT---------------------------------------------------------------TCCTCAAACCTTACTAAACAT-----AATGCACATTGGAGAAAAACTCTACAAATGTGAAAAATGTGTCAAAGCTTTTAATTGTTCCTCAATTCTTGCTAAACATAAAGGAATTCATAATAAGAGAGAAA i calJac3.chr22 C 0 C 0 e macFas5.chr19 36841648 2300 - 59248254 I a score=182234.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 129084 169 + 188024 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i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 e rheMac3.chr19 42294299 268 - 64156825 I e calJac3.chr22 28289578 660 - 49145316 I e chlSab2.chr6 30692150 23 - 50890351 I e macFas5.chr19 36843983 303 - 59248254 I e papAnu2.chr19 31275279 0 - 51301725 C e ponAbe2.chr19 38828671 17 - 60714840 I a score=110943.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 138293 215 + 188024 agattgcatcagagtaaccagtataacatgattctggtacaaaaatatacatatagaccaatgaaatggaagagacagtcctgaattaagctatactttacaaccaggttatttttacaaagccaacagaattaaatccctattcagtaaataatactgggaaaacttgttagtcatatgtggaagaaaactggagtcctacctttttctatata------------ s panTro4.chr19 41401141 227 - 63644993 agattgcatcggagtaaccagtataacatgattctggtacaaaaatatacatatagaccaatgaaatggaagagacagtcctgaattaagctatactttacaaccaggttatttttacaaagccaacagaattaaatccctattcagtaaataatactgggaaaactcgttagtcatatgtggaagaaaactggagtcctacctttttctatatatattttttctat i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38828688 217 - 60714840 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atttcaatatagtttagaaatatatattaaaa----tttttttCTAACAAGTGAAGGAAATCATTTATTTAAAAACTT-----AGAATTTTACTGTAAACTGTTGCTTTAGAGACTGTC--TTAAAGTACtatattattttgaatattaaaaatcaacagcct i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52755551 159 + 106955855 ATTTCAATATGGTTTAAAAATATATATTAAAA----TTTTTTTCTAACAAGTGAAGGAAATCATTTATTTAAAAATTTAAGAGAGAATTTTACTGTAAACAGTTGCTTTAGAGTCTGTCTTTTAAAGTACTATATTACTTTGAACATTAAAAATCAACAGTCT i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31275303 158 - 51301725 atttcaatatagtttaaaaatataaattaaaa----attttttctaaaaagtgaaggaaatcgttcatttaaaaatttagag-agAATTTTACTCTAAACAGTTGCTTTAGAGTCTGTCTTTTAAAGTACTATACTATTTTGAACATTAAAAATCAACAGTCT i papAnu2.chr19 C 0 C 0 s chlSab2.chr6 30692173 158 - 50890351 ATTTGAATATAGTTTAAAAATATAAATTAAAA----ATTTTTTCTAAAAAGTGAAGGAAATCGTTTATTTAAAAATTTAGAG-AGAATTTTACTCTAAACAGTTGCTTTAGAGTCTGTCTTTTAAAGTACTATACTATTTTGAACATTAAAAATCAACAGTCT i chlSab2.chr6 I 23 C 0 s calJac3.chr22 28293816 136 - 49145316 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----AAGAAGCTTCTGATTAAATTGGTCAGCAtataattttgtgaaattttacttttttaatct-----ttaaactGCTCTATTGCCagaaaaggtattttaaata-----tatattattttactctATTTAAATTCTTCAGAAAAACTAAGTTGACAAAGTATGCACtcacatttttttgaaaattaaaaatgctt---aaatattttttacagaatctaaaact---aaatatttttagtttgttaGAGAACATCTCTGAAATACTTCAAGTTACCTTCTTCTGACa------gtagatatatatttttctatattgctATAATACAGCTTTGG----CTGTCTTTTGTGGTCAACTCcctcatttttattcta-----ttctacaGTATTTATgctatgcattttatatttt i papAnu2.chr19 C 0 I 283 s chlSab2.chr6 30696246 396 - 50890351 AAGAAAGAAGCTTTTGATTAAATTGGTCAGCATATAATTTTGTAAAATTTTACTTTTTTAATCT-----TTAAACTGCTCTATTACCAGAAAAGGTATTTTAAATATATAGTATTTTACTCTATTATATTTAAATTCTTCAGAAAAACTAAGTTGACAAAGTATGCACTCACATTTTTTTGAAAATTAAAAATGCTT---AAATATTTTTTACAGAATCTAAAACT-AAAAATATTTTTAGTTTGTTAGAGAACATCTCTGAAATACTTCAAGTTACCTTCTTCTGACA------GTAGATATATATTTTTCTATATTGCTATAATACAGCTTTGG----CTGTCTTTTGTGGTCAGCTCCCTCATTTTTATTCTATTTTCCTCTGCAGTATTTATGCTATGCATTTTATATTTT i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28297721 398 - 49145316 AAAAAAGAGGCTTCTGATTAAATTGAGCAGCATATAATTTTGTAAAATTTTACTTTTTTAGTCTAAAAATTAAACTGCTCTATTACCAG----GTTATTTCTAATATGTATTATTTTACTC----ATATTTACATTCTTCAGAAAAACGAAGCTGACAAAAAATGCACTCaaaaatttttttaaattaaaaatGT-----AAACATTTTTTACAAATTCTAGAAGTAAAAAATATTTTTAGATTCTTAGAGAACATCTCTGAAATGCTTCCAGTTACCTTCTTTTGACAatatatatatatatatatatTTTAATGTTGCTATAATACAGCTTTCG----CTATCCTTTGTGGTCAACTCCATCATTTTAATTCTATTTTCTTGTGCAGTATTCATGTTATGGATTGTATAtttt i calJac3.chr22 I 2261 C 0 e rheMac3.chr19 42295435 10280 - 64156825 I a score=2548.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 144870 1 + 188024 A s panTro4.chr19 41407748 1 - 63644993 A i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38836618 1 - 60714840 A i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s nomLeu3.chr10 52759179 1 + 106955855 A i nomLeu3.chr10 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36845637 1 - 59248254 A i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31280391 1 - 51301725 a i papAnu2.chr19 I 283 C 0 s chlSab2.chr6 30696642 1 - 50890351 A i chlSab2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr22 28298119 1 - 49145316 a i calJac3.chr22 C 0 N 0 e rheMac3.chr19 42295435 10280 - 64156825 I a score=1356734.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 144871 829 + 188024 AAAGTTGTAGACCATGCAATGTAATCTTCAAACAATTGACAAATGTTTTTCCATGTATAACTCTTTGCTTAATCCGCAGTCACTTTATTTTCACTCCCCG-----ATTTTTACTGCCTGAAAAGCAAAGGGATCATTCAAGTGAGTGTGCTGAGCTGGTCTTCTCCAGTGTCAGTCTATTCACGTTCACAAAAGTATTCTTCTGGTGAAAGAGGGTGCACTTCAACAGTATTGTAACAGCAATGTGGAAAAGATGTAATAGAATAAAATGTGAATCACAGCCTCCTATGAAAATAAGTTAATTTTTCTTTTTCTGTATATGTGAGTATGTGGTATTTGTAAGGTTGGGAGTTGAGATTAACATGAGAGAGAAGAGCACTTCACATGAGTAGCACAAGAAGGTCCTATGCAACCTTCTTGTTTGTCAAACATACCTGGAATGATTTTATGAAGTATGATGTTGCTGTATTCATCATTTATTAGACTCTGATGGTCATTTTTTACTTTATAAATTGAAATATGCACTTATCATCATCCAGGACCCTGTCCTTGATGCTTAAGTGTGCAGACATAAAACGATTAAAATATTGGTGAAAGATGAGtttttttttt----------cttaagactgagtcttgctctgttgcccaggct-----------ggagtgtaatggtgtgatc-----tcactgcaccctccacctcccaggttcaagcaattctcatgcctcagcctcctgagtcactaggattacaggtgtgtgccattatgctgggctTGGTGGAtatgtagttatgatgcactgacccatgggttgggtgctctccagggacccttcccttgctgtctaccttag s panTro4.chr19 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AAAGTTGTAGACCATGCAATGTAATCTTCAAACAATTGACAAATATTTTTCTATGTATAACTCTTTGCTTAATCTGCAGTCACTTTATTTTCACTCCCCG-----ATTTTTACTGCCTGAAAAGCAAAGGGATCATTCAAGTGAGTGTGCTGAGCTGGTCTTCTCCAGTGTCAGTCTATTCACATTCACAAAAGTATTCTTCTGGTGAAAAAGGATACACTTCAACAGTATTATAGGAGCAATGTGGAAAAGGTGTAATAGAATAAAATGTGAATCACAGCCTTCTAAGAAAATAAGTTAATTTTTCTTATTCTGTGTATGTGAGTATGTGGTAGTTGTAAGGTTGGGAGTTGAGATTAAAGTGAGAGAGAAGAACACTTCATATGAGTAGCACAAGAAGGTCCTATGCAACCTTCTTGTTTGTCAAACATACCTGGAATGATATTATGAAGTATTATGTTGCTGTATTCATCATTTATTAGACTCTGATGGTCATTTTTTACTATATAAATTGAAATATGCACTTATCATCATCCAGGGTCCTGTCCTTGATGCTTAAGTGTGCAGACATAAAACTATTAAAATATTGGTGAAAGATGAGttttttttt-----------cttgagactgagtcttgctctgttgcccaagtgtaatgtgtaaaggagtgtaatggtgtgatctcagttcactgcaacctctgcctcccaggttcaagcaattctcatgcctcagcctcctgagtcactgggattacaggtgtgtgccattatgctcggctTGGTGGGtatgtggttatgagatactgactcatgggttgggggctctccagggacccttcccttgctgtctaccttag i ponAbe2.chr19 C 0 I 9963 s nomLeu3.chr10 52759180 835 + 106955855 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i chlSab2.chr6 C 0 I 5906 e rheMac3.chr19 42295435 10280 - 64156825 I e macFas5.chr19 36846885 8695 - 59248254 I e papAnu2.chr19 31282281 7241 - 51301725 I e ponAbe2.chr19 38837463 9963 - 60714840 I a score=1142038.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 147785 4558 + 188024 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i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38847426 4624 - 60714840 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i ponAbe2.chr19 I 9963 C 0 e chlSab2.chr6 30707258 28544 - 50890351 I e macFas5.chr19 36856998 51932 - 59248254 I e papAnu2.chr19 31289895 47862 - 51301725 I a score=3090.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 175935 7 + 188024 taaAAAA s panTro4.chr19 41438827 7 - 63644993 taaAAAA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38852050 7 - 60714840 TGAAAAA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36908930 7 - 59248254 TAAAGAA i macFas5.chr19 I 51932 I 5 e chlSab2.chr6 30707258 28544 - 50890351 I e papAnu2.chr19 31289895 47862 - 51301725 I a score=32392.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 175942 38 + 188024 CAAAGCTTTTAACTGGTCCTGAGAACTAACTAGACATA s panTro4.chr19 41438834 38 - 63644993 CAAAGCTTTTAACTGGTCCTGAGAACTAACTAGACGTA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38852057 38 - 60714840 CAAAGCTTTTAACTGGTCCTAAGAACTAACTAGACATA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36908942 38 - 59248254 CAAAGCTTTTAACTGGTCCTGAGAACTAACTACACATA i macFas5.chr19 I 5 I 844 s papAnu2.chr19 19775074 38 + 51301725 CGAAGCTTTTAACTGGTTTTGAGAACTAACTAGACATA i papAnu2.chr19 n 47862 T 1840 e chlSab2.chr6 30707258 28544 - 50890351 I a score=170718.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 175980 644 + 188024 GTCACAGAGATCTGTTATATTTGTTTATATTTGTTAGAATatttccttatttttgaaaactgagtgaattttcaatgtatttatctttctaattgtctctactgaatgatttggtgacagaaatttgcattgcttttgcctattggcttacaataacaatgcttcaataactatgggtatgcaaataactgttcagattaccatatatgtgaaaatttatgtatgtgttgcattttattttattagtctacttttttttacctttacactcattcaaattgttttaattctttagctttataatgttttttgaaatcaggaactgtaatgcctccgatttg-tttttttaaaaatattttttggtacattattgtctcttgcaat-ttcatatacttttgcatttgctgtttttgtctctttaaaaatgcaatgagaaattttaaaaacattgcattaaatctgtagattacattgggcagtataaacatcttcacaatattaattatttcaaCTTTTCACCAAGAGCAtgctcaagagtgtattgtttaatttgtagatatttgtgaatttttcaggtttcttctgttgtttatatattcttattcaattttggttataagaagtaatccacacaattttagttt s panTro4.chr19 41438872 644 - 63644993 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gccaggtgtggtgggtcacacctgtaatcccagcaccttgggaggctgaggcaggctgatcatctgaggtcgggagtttgagaccag-ctgaccaacctggagaaacttcgtctcttctaaaaatatatatatataaattagccgggtgtggtggcgcatgcctgtaatcccagctactcaagaaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggcagacattgcggtgagccgagattgcgccactgcactccaacctgggcaataagagcaaaactgggtctc-----aaaaaaaaaaaagaaatatctttatgtgaatcctagtttgtttgttgagcttcttcatttctacatcacactttattacttttaaaa-attttcagttatttcGCTTT--------------GTATTTTTACCTTCATAATTTCTAGGGTTTATTGATATTTTAAATATTTTTGTTGTTATTCTTT----TTTTAATTGCATTTATTTTAATGCTGAATTTACTCACAGGCCATAAGTTTGTGTTTCTTCAGTTTTTTCTGGGACACCTTTTTTTTCTGGGTAATGTCCTTTTTTGGTTTAGGAACAATTTGTTCCTTTTCAGTAAAGATCATCTTT i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 19773272 617 + 51301725 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rheMac3.chrUn_JH291705 37597 281 - 79485 ACATAAGAAAATTTATACTGGAGAAAAACCCTACAAACATGAAGAATGTGGCAGAGCTTTTAATCAGTCCTCAAACCATATTGAATGTGAAATAATTCATACTGGAGACAAACCCTACAAATGTG-AAAAATGTAACAAAGTCTTTAACTGGTCTTCAACTCTTACTGAACATCAGAGAATTTATACAAGATATAAAGCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGGCTTTAACTTTTGAACTCTTATTACACATAGGATACTTCATACTGGAGAGAAATTCT i rheMac3.chrUn_JH291705 N 0 C 0 s papAnu2.chr19 31337761 281 - 51301725 ACATAAGAAAATTTATACTAGAGAAAAACCCTACAAACATGAAGAATGTGGCAGAGCTTTTAATCAGTCCTCAAACCATATTGAATGTGAAATAATTCATACTGCAGacaaaccctacaaatgtg-aaaaatgtaaCAAAGTCTTTAACTGGTCTTCAACTCTTACTGAACATCAGAGAATTTATACAAGATATAAAGCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGGCTTTAACTTTTGAACTCTTATTACACATAGGAtacttcatactggagagaaattcT i papAnu2.chr19 C 0 I 328 s chlSab2.chr6 30745085 279 - 50890351 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panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38860754 151 - 60714840 tagcgaggcatggtggctcaggcttatactctcagctacttgggaggctgaggtaagagaatcacttgaacccagaaggtggaggttgcagtgaaccgaaatcgtgccactgcgcttcagcctgggtggccgaccaagatggcctcaaaaa i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36915152 151 - 59248254 tagccaggcatggtggcgcatgcttatagtctcagctacttgggaggctgaggtaggagaatcgcttgaaccccgaaggtggaggttgcagtgaaccgagattgtgcctctgcacttcagcctgggtggccgaccaatatggcctcaaaaa i macFas5.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31344391 151 - 51301725 tagccaggcatggtggcgcatgcttatagtctcagctacttgggaggctgaggtaggagaatcgcttgaaccccgaaggtggaggttgcagtgaaccgagattgtgcctctgcacttcagcctgggtggccgACCAATATGGCctcaaaaa i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chrUn_JH291705 42924 338 - 79485 I e chlSab2.chr6 30750361 1660 - 50890351 I a score=3438.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 184794 6 + 188024 GCAACA s panTro4.chr19 41451018 6 - 63644993 GCAACA i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38860905 6 - 60714840 GCAACA i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s macFas5.chr19 36915303 6 - 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AGAggccgggcgcggtggctcacgcctgtaatccgagcatttttggaggccgaggtgggcggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctgactaacacggtgaaaccccgtctctattaaaaatacaaaaaattagccgggcgtggtggcgggcgcctgtagtcccagctactccggaggctgaggcaggagaatgacttgaacccaggaggcggagcttgcagtgagccgagatagcgccactgcactccagcctgggtgacagagagagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaGaacaacaacaacaacaaaa i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chrUn_JH291705 42924 338 - 79485 I e chlSab2.chr6 30750361 1660 - 50890351 I e macFas5.chr19 36915309 0 - 59248254 C e papAnu2.chr19 31344542 0 - 51301725 C a score=3909.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 185120 8 + 188024 gcaacaag s panTro4.chr19 41451339 8 - 63644993 gcaacaag i panTro4.chr19 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 38861232 8 - 60714840 gcaacaag i ponAbe2.chr19 C 0 C 0 s papAnu2.chr19 31344542 8 - 51301725 gcaacaac i papAnu2.chr19 C 0 C 0 e rheMac3.chrUn_JH291705 42924 338 - 79485 I e chlSab2.chr6 30750361 1660 - 50890351 I e macFas5.chr19 36915309 0 - 59248254 C a score=910.000000 s hg38.chr19_GL383576v1_alt 185128 1 + 188024 a s 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