##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=92750.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 0 57 + 40176 aaactgtgcagcctctatggaaaacagtaccgtggttcctcaaaaaaattaagaaac s panTro4.chrUn_GL393550 74285 57 + 115532 aaactgtgcagcctctatggaaaacagtacggtggttcctcaaaaaaattaagaaag i panTro4.chrUn_GL393550 N 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 3353233 57 + 4212913 aaactgtgcagcctctatggaaaagagtacggtgattcctcaaaaaaattaagaaag i ponAbe2.chr21_random N 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42096591 53 - 86207423 aaactgtgcagcctctatggaaagcagtacggtggctcctcaaaaaaattaag---- i nomLeu3.chr21 N 0 C 0 s macFas5.chr2 152795 56 - 192460366 aaactgtgcagcctctatggaaaacagtatggtggttcctcaaaaaaa-taacaaag i macFas5.chr2 N 0 C 0 s papAnu2.chr2 99174 57 + 187378091 AAACTGTGCagcttctatggaaaacagtatggtggttcctcaaaaacattaagaaag i papAnu2.chr2 N 0 C 0 s chlSab2.chr22 47313 57 - 101219884 aaactgtgcagcctctatggaaaacagtatggtggttcctcaaaaacattaagaaag i chlSab2.chr22 N 0 C 0 a score=6552.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 57 2 + 40176 ta s panTro4.chrUn_GL393550 74342 2 + 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i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 48020 1048 - 101219884 g-taag--tttttttcaaggaattgaccctttcatccaagtaatgaaaattgctataaaatgtttcacaatattccattatcttgttagtgtctcttgtgtctacagctgcacaatgtcattaatccctgatatttgta------atttgcgttttcttttt--ctcacagaactaa-ttttggccatgttaattttcccccatgtctgttttctgtctcattgatttctaatttctgttttatttcctttcttctacttgttttgggcttaatttgctctcttgttttagattttctttttaaggtagaaaattagttcatttgttttgaacttctcttttttagaataagtatttatacaaaaattttattgtaggtttgcttaactttatcccacacattttgatatagtatatttttatttgtattcagttcaatgtattttaaggtgtgtcttatgatttcttccgtgagctaaacggcattttaaggtgtatttaaatctttcaatagtgtagacttttctggatagcttgtttttacccatttcaactcattttcattatggttagaaagcatactttctatgagtaaagtgttttgaagcttcttgagagatattttgtggtctatagtctattgataaatgtttcacatgtagtataatagaacatatattctatagtCTTGGTCAATATTGA---AGTCAAGCTATTGTCAAAATTATTTCATCTTAACTTTCTTTAGTTATTCTATCAGTTAGCAATATAGCAttacgtcttcataactacttgacattttatcattataaaatagccttctggtgtaatattgcttgtttggagatctacattttcttatattaatacggccacataagatttcttgtgattgttgtttccatggtatatttggaa---attttactctcaacttatctgtaccataatatttggcatgcaactcttacaggtgcttttat-----------------------------------------------------tatccagctggacaatctgtgttttgtttggagtgtttaaattacatttgaaataattattgataaggttggatttaagctta i chlSab2.chr22 C 0 C 0 e micMur1.scaffold_3530 70331 36194 - 180192 I e rhiRox1.KN295142v1 119265 3898 - 1702164 I a score=144428.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 1755 317 + 40176 ctatttttgcttttcttttttttttttttttcttttttt--------gagacggagtctggtcctgtcacccaggctggagtgcagtggcgggatctcggctcactgcaagctccgcctcccgggttcacgccattatcctgcctcagcatctggagtagctggtactacaggctcccgccgccatgcccggctaa-tttttgtatttttagtagagacggggtttcaccgtgttagccaggatagtctcgatctcctgacctcgtgatccacccgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggc-tgagccactgtacccagc s panTro4.chrUn_GL393550 76034 325 + 115532 ctatttttgctttttttttttttttttttttttttttttttttttttgagacggagtctggccctgtcacccaggctggagtgcagtggcgggatctcggctcactgcaagctccgcctcccgggttcacgccattttcctgcctcagcatccggagtagctgggactacaagcgcccgccactatgcccggctaa-tttttgtatttttagtagagatggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacccgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggc-tgagccaccgcgcccagc i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr21_random 3354984 306 + 4212913 cta-ttttgctttctttttttttttttt-------------------gagatggagtctcgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcgatcccagctcactgcaagctctgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcg-ccgccaccacacccgggtaattttttgtatttttagtagagacagggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacccgcctcggcctcccaaagtgctgggatgacaggcgtgagccactgcacccggc i ponAbe2.chr21_random C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42098364 322 - 86207423 ctt-ttttgctttttttttctttttttctttttttgtttttttt---tagacggagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcaggggcgtgatctcagctcactgcaagctccgcctcccaggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgcgactacaggtg-ccgccaccacgcctggctaattttttgtatttttagtagagacggggtttcaccgtgttagccaggatggtcttgatcccctgacctcgtgatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcctgagccaccgtacccggc i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 e micMur1.scaffold_3530 70331 36194 - 180192 I e rhiRox1.KN295142v1 119265 3898 - 1702164 I e chlSab2.chr22 49068 0 - 101219884 C e papAnu2.chr2 100928 0 + 187378091 C e macFas5.chr2 154544 0 - 192460366 C a score=1521244.000000 s 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1 C 0 s chlSab2.chr22 55652 10 - 101219884 TCGGGAGAAA--------- i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28786181 19 - 39895921 tagggTATAATGATCTCTT i canFam3.chr31 C 0 C 0 e mm10.chr16 22689391 7604 - 98207768 I e rheMac3.chr2 138562 7 + 192599291 I e otoGar3.GL873528 20745278 5786 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=39443.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 9961 25 + 40176 AAAAGTTTTGAGCAATTTTTCAGGC s panTro4.chrUn_GL393550 83973 25 + 115532 AAATGTGTTGGGCAATTTTTCAGGC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42393563 25 + 202140232 AAAAGTGTTGAGCAGTTTTTCAGGC i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42106247 24 - 86207423 AAACGTGTTGGGCA-CTTTTCAGGC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 138569 25 + 192599291 AAAAGTGTAGAGCAGTGTTTCAGGC i rheMac3.chr2 I 7 C 0 s macFas5.chr2 161075 25 - 192460366 AAAAGTGTAGAGCAGTGTTTCAGGC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 107691 22 + 187378091 ---AGTGTAGAGCAGTGTTTCAGGC i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 55662 22 - 101219884 ---AGTGTAGAGCAGTGTTTCAGGC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28786200 25 - 39895921 TATCTCTTTGGCTATTATTACTTGT i canFam3.chr31 C 0 I 61 e mm10.chr16 22689391 7604 - 98207768 I e otoGar3.GL873528 20745278 5786 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=138675.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 9986 68 + 40176 AGAGGAATATGTATACCAACCCAGGCATCAAGATAAGTGGAGGTCAGTTAAAAGATCAGGG-TGTGATT s panTro4.chrUn_GL393550 83998 68 + 115532 AGAGGAATATGTATGCCAATCCAGGCGGGAAGATAAGTGGAGGTCAGTTAAAAGATCAGTG-TGTGATT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42393588 68 + 202140232 AGAGGAATATGTATGCCAATCCAGGCAGCAAGATAAGTGGAGTTCAGTTAAAAGATCAGGT-TGTGATT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42106271 68 - 86207423 AGCGGAATATGTATGCCAATCCAGGCAGCAAGATAAGTGGAGGCCAGTTAAAAGATCAGGT-TGTGATT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 138594 69 + 192599291 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rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 162651 195 - 192460366 ATTTCATATGATAGCTAGCTGTATGTGTCTGCTCAACTGTGAATAGATATTTATGCTCTCTCTGAACTGGAGGTTATTGCTATTCTCTAAGGTATAGAAAAATTGTTCTTATGTGGCCAAGTGAGGTTGATATAGTTGTATCAGTCAGACAGTAATGATATTATA---ATCATGATAGTTTACATTTAACACAATTTA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 109264 195 + 187378091 ATTTCATATGATAGCTAGCTGTATGTGTCTGCTCAACTGTGAATAGATATTTATGCTCTCTCTGAACTGGAGGTTATTGCTATTCTCTAAGGTATAGAAAAATTGTTCTTATGTGGCCAAGTGAGGTTGATATAGTTGTATCAGTCAGACAGTAATGATATTATA---ATCATGATAGTTTACATTTAACACAATTTA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 57230 195 - 101219884 ATTTCATATGACAGCTAGCTGTGTGTGTCTGCTCAGCTGTGAATAGATATTTATGCTCTCTCTGAACTGGAGGTTATTGCTATTCTCTAAGATACAGAAAAATTGTTCTTATGTGGCCAAGTGAGGTTGATATAGTTGTATCAGTCAGACAGTAATGATATTATA---ATCATGATAGTTTACATTTAACACAATTTA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s nasLar1.chrUn_JMHX01037930v1 620 195 + 836 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agactgtgacatcaaatttcacctatgacactgattattt-ggaaactttgcaacttatt-ctg--tatatgactcagttttcttttctgtgcagagataaagttggtatatacctcatagattcattataaggattat-atgaaatgacacatgagaaggctttaaaaggacttggaaagcaataagcTTTTTTGTTC--------TCA-----TTTTTTAATAGGTTATCAGTGTTGTGAATGGATTATGAAAAATGACTTTGGGCTCAGTGAGTAACTGAAATGTTGATGCTTAATAGTGT---GCTTAATATTAACATAATAGTAGTAAACGTT i macFas5.chr2 C 0 I 3 s papAnu2.chr2 110117 321 + 187378091 AGACTGTGACATCAAATTTCACCTATGACACTGATTATTT-GGGAACTTTGCAACTTATT-CTG--TATatgactcagttttcttttctgtgcagaGATAAAGTTGGTATATACCTCATAGATTCATTATAAGGATTAT-ATGAAATGACACATGAGAAGGCTTTAAAAGGACTTGGAAAGCAATAAGCTTTTTTGTTC----TCAATCA-----TTTTTTAATAGGTTATCAGTGTTGTGAATGGATTATGAAAAATGACTTTGGGCTCAGTGAGTAACTGAAATGTTGATGCTTAATAGTGt---gcttaatattaatataatagtaataaatgtt i papAnu2.chr2 C 0 I 3 s chlSab2.chr22 58077 310 - 101219884 agactgtgacatcaaatttcacctatgacactgattatctggggaactttgcaacttatt-ctg--tatatgactcag-----ttttctgtacagagataaagtcagtatatacctcatggattcattataaggattat-atgaaatgacacatgagaaggctttaaaaggacttggaaagcaataagcTTTTTCTCAA--------TCA-----TTTTTTAACAGGTTATCAGTATTGTGAATGGATTATGAAAAATGACTTCGGGCTCAGTGAGTAACTGAACTGTTGATGCTTAATAGTGT---GCTtaatattaatataatagtaataaa---t i chlSab2.chr22 C 0 I 3 s mm10.chr16 22699331 302 - 98207768 ACACTGAGAAATAAAATTTCA--TATCAAATT--CTATCTTGGTAATATTGTCTCCTACTACTGTCTAGATAACTCAGTTTCTTTTCCCATGTTGCAATGAAGTTTGTATAT--CTTATACATTTCTTATAATGAGTATGATAAAATACCTACTGTAAAAGCTTAAAA-------GGCAAATCCTAAATTATTATTCAAAAGACTAATCAAGGATGTCAATAATAGTTTATCAGTGTTGTACATGGTTGATGTTAAATGAATTTGACCTA-------AACTGGAA-------------TAGAGT---TTTTGATATATTAATAGTGTTAATAATTGCA i mm10.chr16 I 561 C 0 s canFam3.chr31 28788391 311 - 39895921 atCCTGtgacttcaaatatcaacaatgtcactgattatccaagtgttattacaacttact-atc--tataagactcaattttcttctctgtggaattataaaatcagtatatatctcataaatttattataaggattgc-ataaaatcacacatgtaaaggctttagaaggaattagaagatggtaagctcttaT--------------------TTTCTCAATAGTATATCAATGTCATATACAGTTGATGTTAAGTGAGTTTTGGCTCAATAAATGAAT-AAATGTTAATGGTTAACAGTATTCAATGTATTATTAATATAACATTAATAAATG-- i canFam3.chr31 C 0 C 0 e otoGar3.GL873528 20745278 5786 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=8991.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 12670 3 + 40176 att s panTro4.chrUn_GL393550 86690 3 + 115532 ATT i panTro4.chrUn_GL393550 I 3 C 0 s ponAbe2.chr3 42397247 3 + 202140232 ATT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42108970 3 - 86207423 att i nomLeu3.chr21 I 3 C 0 s rheMac3.chr2 141314 3 + 192599291 ATT i rheMac3.chr2 I 3 C 0 s macFas5.chr2 163820 3 - 192460366 ATT i macFas5.chr2 I 3 C 0 s papAnu2.chr2 110441 3 + 187378091 att i papAnu2.chr2 I 3 C 0 s chlSab2.chr22 58390 3 - 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micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 7255 610 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=37070.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 12781 23 + 40176 GTACCAAATTT---AAGATATCTTGA s panTro4.chrUn_GL393550 86801 23 + 115532 GTACCAAATTT---AAGATATCTTGC i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42109081 23 - 86207423 GTACCAAATTT---AAGATATCTTGT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 141424 23 + 192599291 GTACCAAATTT---AAGATCTCTTGC i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 163930 23 - 192460366 GTACCAAATTT---AAGATCTCTTGC i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 110552 23 + 187378091 GTACCAAATTT---AAGATATCttgc i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 58665 23 - 101219884 GTACCAAATTT---AAGGTATCTTGC i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28788809 18 - 39895921 ------GATTTTTATAGGCATTTT-- i canFam3.chr31 C 0 C 0 e mm10.chr16 22699752 336 - 98207768 I e otoGar3.GL873528 20745278 5786 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 7255 610 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e ponAbe2.chr3 42397359 938 + 202140232 I a score=4912.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 12804 2 + 40176 AT s panTro4.chrUn_GL393550 86824 2 + 115532 AT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42109104 2 - 86207423 AT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 141447 2 + 192599291 AT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 163953 2 - 192460366 AT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 110575 2 + 187378091 at i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 58688 2 - 101219884 AT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s otoGar3.GL873528 20751064 2 + 38779656 AG i otoGar3.GL873528 I 5786 I 474 s canFam3.chr31 28788827 2 - 39895921 AT i canFam3.chr31 C 0 C 0 e mm10.chr16 22699752 336 - 98207768 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 7255 610 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e ponAbe2.chr3 42397359 938 + 202140232 I a score=1017686.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 12806 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tarSyr2.KE939969v1 7870 2124 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e ponAbe2.chr3 42397359 938 + 202140232 I a score=146896.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 13298 85 + 40176 ------------------------AAACAGTTCCCTATCCTAACCAGT----ATCATGCACAGAATCC---------------GTTTCCACCTCTTCATATGGAAGCTGCTCTGGGTGGACATCTAGA s panTro4.chrUn_GL393550 87316 84 + 115532 ------------------------AA-CAGTTCCCGATCCTAACCAGT----ATCATGCACAGAATCC---------------GTTTCCACCTCTTCATATGGAAGCAGCTCTGGGTGGACATCTAGA i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42109599 84 - 86207423 ------------------------AA-CAGTGCCCGAGCCTAACCAGT----GTCATGCACAGAATCC---------------GTTTCCACCTCTTCATATGGAAGTAGCTCTGGGTGGACGTCTAGA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 141944 84 + 192599291 ------------------------CA-CAGTGCCCCAGCCTAACTAGT----ATCATGCACAGAATCC---------------ATTTCCACCTCTTCTTATGGAAGGAGCGCTGGGTGAACATCTAGA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 164450 84 - 192460366 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papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 59269 102 - 101219884 AAGTTGGATAACCATTTATCACATATGATCTGCAGAGGGAGAGA-TTTATAAGAAAGTGCTAAATTTAATCCATAGGAAAGTCAAATT-GAAAATCAATGAATT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s mm10.chr16 22700088 99 - 98207768 AAGTTGGATGGATATTCATAGCATATGTTCTG---AGAAGGAGG-TTGCCAAGGATATGCTAAGCTCGAGTCAGAGAAATACCAAATC-AAAGGCTACTGCATT i mm10.chr16 I 336 I 1875 s canFam3.chr31 28789593 104 - 39895921 AAGTTAAGTGTATATAAATCATACATGACCTACAAAGGGAGATAGTTTAAAAGGAAGTGCTAAATTTAACCCAAAGGAATGCCCAACCAAAAAAACAATAAGCT i canFam3.chr31 C 0 C 0 e otoGar3.GL873528 20751683 5614 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 7870 2124 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e ponAbe2.chr3 42397359 938 + 202140232 I a score=605518.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 13485 311 + 40176 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0 C 0 s papAnu2.chr2 115746 23 + 187378091 TCTAAATAAATTTGAAGA---CTTCA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 64323 23 - 101219884 TCTAAATAAATTTGAAGA---CTTCA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s mm10.chr16 22704472 25 - 98207768 -CCCAATAGACATGAAGATAGCTTCA i mm10.chr16 C 0 C 0 e canFam3.chr31 28792242 548 - 39895921 I e otoGar3.GL873528 20751683 5614 + 38779656 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e ponAbe2.chr3 42400766 6617 + 202140232 I a score=75030.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 18030 62 + 40176 AATTCCAGGTACAATATAA-TTttttctatcctgtaatttgtcattcagtattttgtaatttg s panTro4.chrUn_GL393550 92066 63 + 115532 AATTCCAGGTACAATATAATTTTTTTCTATCCTGTGATTTGTCATTCAGTATTTTGTAATTTG i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42114232 62 - 86207423 AATTCCAGGTACAATATAA-TATTTTCTATCCTGTGATTTGTCATTCAGGATTTTGTAATTTC i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s macFas5.chr2 169147 62 - 192460366 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s panTro4.chrUn_GL393550 97332 1163 + 115532 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---------------AGTGATGACAACAAATTGGGTTCTCAGGGATTTTGGCCTCTGGCATC----ATCTCAGTTGTTTATGATTGAAGTTGGCTCTGATGAGAACTCAGCTTAGATGCATGGTTGGACTGCTGGACTTAAGGCTGGCCTGCCAGGAGGTTGCCTTGAGATGTAACTAGGCA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 117235 163 + 187378091 ---------------AGTGATGACAACAAATTGGGTTCTCAGGGATTTTGGCCTCTGGCATC----ATCTCAGTTGTTTATGATTGAAGTTGGCTCTGATGAGAACTCAGCTTAGATGCATGGTTGGACTGCTGGACTTAAGGCTGGCCTGCCAGGAGGTTGCCTTGAGGTGTAACTAGGCa i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 65815 163 - 101219884 ---------------AGTGATGACAACAAATTGGGTTCTCAGGGATTTTGGCCTCTGGCATC----ATCTCAGTTGTTTATAATTGAAGTTGGCTCTGAGGAGAACTCAGCTTAGATGCATGGTTGGACTGCGGGACTTAAGGCTGGCCTGCCAGGAGGTTGCCTTGAGGTGTAACTAGGCA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s mm10.chr16 22706432 140 - 98207768 -----------------TAATGAC-------CAGGATGCCAGTGCCTTTGTACTTGAGCAACTAGAGTCTCAG----TCATGATTCAAGTTGGCTATGATGAACATACAGCTTAACTGTATGAGTGGCTTG--------------GTTTTGCCCAGAGACTGTTCTGAAACGTATTTAGGTG i mm10.chr16 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28794413 172 - 39895921 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canFam3.chr31 28794585 10 - 39895921 AGGAGAGAGA i canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e mm10.chr16 22706572 0 - 98207768 C e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=1651.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 25700 10 + 40176 GAgtttattg s panTro4.chrUn_GL393550 99852 10 + 115532 GAgtttattg i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28794595 10 - 39895921 AGGTTGGTTG i canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e mm10.chr16 22706572 0 - 98207768 C e rheMac3.chr2 148358 0 + 192599291 C e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e chlSab2.chr22 65988 0 - 101219884 C e papAnu2.chr2 117408 0 + 187378091 C e macFas5.chr2 170789 0 - 192460366 C e nomLeu3.chr21 42115871 0 - 86207423 C e ponAbe2.chr3 42409920 0 + 202140232 C a 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panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e mm10.chr16 22706572 0 - 98207768 C e rheMac3.chr2 148358 0 + 192599291 C e canFam3.chr31 28794605 0 - 39895921 C e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I e chlSab2.chr22 65988 0 - 101219884 C e papAnu2.chr2 117408 0 + 187378091 C e macFas5.chr2 170789 0 - 192460366 C e nomLeu3.chr21 42115871 0 - 86207423 C e ponAbe2.chr3 42409920 0 + 202140232 C a score=1426.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 26077 8 + 40176 aaaagaaT s panTro4.chrUn_GL393550 100302 8 + 115532 aaaagaaG i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s mm10.chr16 22706572 8 - 98207768 AAGAGAAA i mm10.chr16 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e rheMac3.chr2 148358 0 + 192599291 C e canFam3.chr31 28794605 0 - 39895921 C e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 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86001 I e canFam3.chr31 28794605 0 - 39895921 C e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=283720.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 26102 104 + 40176 CCAACAATCTTCAACTATGAATTTTTA------TGAGTAGGGGCTTCCCACACCATCAGGCACTCCAAGTTGGAGAAACAAGGGATGTTGAATTGAAAGTTTAATTTT--TT s panTro4.chrUn_GL393550 100327 104 + 115532 CCAACAATCTTCAACTATGAATTTTTA------TGAGTAGGGGCTTCCCACACCATCAGGCACTCCAAGTTGGAGAAAGAAGGGATGTTGAATTGAAAGTTTAATTTT--TT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42409937 104 + 202140232 CCAACAATCTTCAATGATGAATTTTTA------TGAGTAGGGGCTTCCCACACCATCAGGCACTCCGAGCTGGAGAAACAAGGGATGTTGAATTGAAAGTTTAATTTT--TT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42115888 104 - 86207423 CCAACAATCTTCAACTATGAATTTTTA------TGAGTAGGGGCTTCCCACACCATCAGGCACTCTGAGCTGGAGAAACAAGGGATGTTGAATTGAATGTTTAGCTTT--TT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 148375 110 + 192599291 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0 I 258 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=513984.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 26206 197 + 40176 AGGCTTGGTAGTCAGATTAGGGAAGT-TTTGGGTACACCTTTCCCACTCTAGAGCCCTCTCCCTAACTCACGGCCAATTTGGGACATgggctcaatggaaaagag----tgccgagatcaattagaaatatccatcatgaacataggaggcaggCATTCTGG-CCAAGGGGTGCGTCTTCCCACTTTGTAATCCAGAGTGCGA s panTro4.chrUn_GL393550 100431 197 + 115532 AGTCTTGATAGTCAGATTAGGGAAGT-TTTGGGTACACCTTTCCCACTCTAGAGCCCTCTCCCTAACTCACGGCCAATTTGGGACATgggctcaatggaaaagag----tgccgagatcaattagaaatatccatcatgaacataggaggcaggCATTCTGG-CCAAGGGGTGCGTCTTCCCACTTTGTAATCCAGAGTGCGA i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42410041 197 + 202140232 AGGCTTGATAGTCAGATTAGGGAAAT-TTTGGGTACACCTTTCCCATTCTAGAGTCCTCTCCCTAACTCAGGGCCAACTTGGGACAtgggttcaatggaaaagag----tgccaagatcaattagaaatatccatcacgaacataggaggCAGGCATTCTGG-CCAAGGGGTGCGTCTTCCCACTTTGTAGTCCAGAGTGTGA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42115992 197 - 86207423 AGGCTTGATAGTCAGATTAGGGAAGT-TTTGGGTACACCTTTCCCACTCTAGAGTCCTCTCCCTAACTCAGGGCCAATTTGGGACATgggctcaatggaaaagag----tgccgagatcaattagaaatatccatcatgaacataggaggcaggCATTCTGG-CCAAAGGGTGTGTCTTCCCACTTTGTATTCCAGAGTGCGA i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 148485 192 + 192599291 AGGTTTGAT----AGATTAGGGAAGT-TTTGGGTAAACCTTTCCCTCCCTAGTGTCTTCTCCTTAACTTAGGGCCAACTTGGGACATGGGTTCAATGGAAAAGAG----TGCCAAGATTAATGAGAAATATCCATCATGAACACCGG-GGCAGACATTCTGG-CCAAGGGGTGCGTCTTCCCACTTTGTAATCCAGAGTGCGA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 170916 192 - 192460366 AGGTTTGAT----AGATTAGGGAAGT-TTTGGGTAAACCTTTCCCTCCCTAGTGTCTTCTCCTTAACTTAGGGCCAACTTGGGACATGGGTTCAATGGAAAAGAG----TGCCAAGATTAATGAGAAATATCCATCATGAACACCGG-GGCAGACATTCTGG-CCAAGGGGTGCGTCTTCCCACTTTGTAATCCAGAGTGCGA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 117535 192 + 187378091 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i canFam3.chr31 I 258 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 56343 2288 - 86001 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e rhiRox1.KN295142v1 123164 16199 - 1702164 I a score=366216.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 26403 124 + 40176 TTTCTTCTTGCTATCTGTC-CCTCCATAAATAAGCGTTGGGTGAAGGACAAGCTAGTTACAACTGAGGATGAAATGAG-ATTCTAGCAGAATTGCA-AAATGAACTGAGAGCCACGAAAGTGTTCCT s panTro4.chrUn_GL393550 100628 124 + 115532 TTTCTTCTTGCTATCTGTC-CCTCCGTAAATAAGCGTTGGGTGAAGGACAAGCTAGTTACAACTGAGGATGGAAAGAG-ATTCTAGCAGAATTGCA-AAATGAACTGAGAGCCACGAAAGTGTTCCT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42410238 124 + 202140232 TTTCTTCTTGCTATCTGTC-CCTCCATAAATAAGCGCTGGGTGGAGGACAAGCTGGTTACAGTTGAGGATGGAATGAG-ATTCTAGCAGAATTGCA-AAATGAACTGAGAGCCACAAAAGTGTCCCT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42116189 124 - 86207423 TTTCTTCCTGCTATCTGTC-CCTCCATAAATAAGCGTTGGGTGGAGAACAAGCTGGTTACAATCGAGGATGGAACGAG-ATTCTAGCAGAATTGCA-GAATGAACTGAGAGCCACCAAAGTGTGCCT i nomLeu3.chr21 C 0 C 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papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 68393 41 - 101219884 tcaaatgatctgcctgcctcagcctcccaaagtgttggTGA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 58632 3348 - 86001 I e mm10.chr16 22707828 3784 - 98207768 I e canFam3.chr31 28796502 5 - 39895921 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e ponAbe2.chr3 42411556 4548 + 202140232 M a score=591720.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 28462 277 + 40176 TGATTTTCATTTAATGGTGTTCTACAAAGTGAGTTTAGGCAATGAAAGCGCACATG---TCATCTATAGTTTACCAGAAAGTAGTACCAGTCACCAGCATTGAAGCATACTCCTAACACTGGAAAATTTCTTCAGCAGCCAGAATTAATCTCAGATTTTGAGACTGGAGCAAAGACTAATTTGGTATGTGTTCATTCAGATTAGTAAATCTCCATGGTGTTTGAACTGTATAATATCAAATCTAAAATAAGTCAAAAGAGTTGAACAATATCTCATCTCT s panTro4.chrUn_GL393550 102682 277 + 115532 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CAG-AAAAAAATGCATCATTTTCAAGAGATTTAAGATTGAAT-----------TTAAAATC-CAA----------------CTGCCTATTCCAGTGGATGTTTCTCCAGAATAAGGCCAAGCCCCACAAATTCTGGATAGTGTCCTCCAAGTTGTGTTTAAGTGATAATTGACAGATCTATGGTTTAGATACATATGGAATTCCATATAA i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 173400 181 - 192460366 CAG-AAAAAAATGCATCATTTTCAAGAGATTTAAGATTGAAT-----------TTAAAATC-CAA----------------CTGCCTATTCCAGTGGATGTTTCTCCAGAATAAGGCCAAGCCCCACAAATTCTGGATAGTGTCCTCCAAGTTGTGTTTAAGTGATAATTGACAGATCTATGGTTTAGATACATATGGAATTCCATATAA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 120033 182 + 187378091 cag-aaaaaaatgcatcattTTCAAGAGATTTAAGATTCAAT-----------TTAAAATCTCAA----------------CTGCCTATTCCAGTGGATGTTTCTCCAGAATAAGGCCAAACCCCACAAATTCTGGATAGTATCCTCCAAGTTGTGTTTAAGTGATAATTGACAGATCTATGGTTTAGATACATATGGAATTCCATATAA i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 68711 182 - 101219884 CAGAAAAAAAATGCATCATTTTCAAGAGATTTCAGATTGAAT-----------TTAAAATC-CAA----------------CTGCCTATTCCAGTGGATGTTTCTCCAGAATAAGGCCAAGCCCCACAAATTCTGGATAGTGTCCTCCAAGTTGTGTTTAAGTGATAATTGACAAATCTATGGTTTAGATACATATGGAATTCCATATAA i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28797021 206 - 39895921 aaa-aagaaTGTGTATCATTTTCAAGATATTTAAGAGTAAACTGCCTTAAATGTCAAAATCATAACAGTCTCCAGAGGGGCCTGCTTATCTTAGTGGAAGCTTCTATAG---AAGGCCAAACTTTTCAACCTCTAGATAGTATAATCTAAGTCAGCTTTAAGTAAGAATTGGTGAATCTCTGGTTTTAATACCCATGAGATTCCACATCA i canFam3.chr31 I 236 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 58632 3348 - 86001 I e mm10.chr16 22707828 3784 - 98207768 I e micMur1.scaffold_95409 4434 36194 - 4724 I e tarSyr2.KE939969v1 10005 11423 - 345090 I e ponAbe2.chr3 42411556 4548 + 202140232 M a score=-2925.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 28920 1 + 40176 -T s panTro4.chrUn_GL393550 103140 1 + 115532 -C i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42118649 1 - 86207423 -C i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 151152 1 + 192599291 -C i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 173581 1 - 192460366 -C i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 120215 1 + 187378091 -C i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 68893 1 - 101219884 -C i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s tarSyr2.KE939969v1 21428 1 - 345090 -T i tarSyr2.KE939969v1 I 11423 I 15169 s micMur1.scaffold_3530 106525 1 - 180192 -T i micMur1.scaffold_3530 I 36194 C 0 s canFam3.chr31 28797227 1 - 39895921 G- i canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 58632 3348 - 86001 I e mm10.chr16 22707828 3784 - 98207768 I e ponAbe2.chr3 42411556 4548 + 202140232 M a score=10152.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 28921 3 + 40176 TCT s panTro4.chrUn_GL393550 103141 3 + 115532 TCT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42118650 3 - 86207423 TCT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 151153 3 + 192599291 TCT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 173582 3 - 192460366 TCT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 120216 3 + 187378091 TCT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 68894 3 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TCGGTACCAAAAGTCTTCGT--------GTTATCAGGGTACCC-TGTAATAGTATCCATAACTCATTGCCCACTTGTCCGTTTTGATTTCTTTTTTTAAAAAGACAATTTT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s mm10.chr16 22711612 82 - 98207768 tcaattccaaatcactccttattgttaggTTATTAGAGTATTC-AATA-----------CACTCATTGGAACCTTCT--------ATTTT-TTCTTT--------AATTTT i mm10.chr16 I 3784 C 0 s canFam3.chr31 28797315 101 - 39895921 TTAGTACCAAAGCCCCTATTGGTACCAGGTTACCAGGGTACTCTTACCACAGTGCCCATAATTGGGTGTCCAATTAT---------TTCT-CTTTTTTAAAAGACAATTTT i canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 58632 3348 - 86001 I e micMur1.scaffold_3530 106529 4179 - 180192 I e tarSyr2.KE939969v1 21429 15169 - 345090 I e ponAbe2.chr3 42411556 4548 + 202140232 M a score=3027118.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 29105 1366 + 40176 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chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28805111 272 - 39895921 tccaaatttccttttattcc-----------tgagcaattggatctatggaacaaatcacaaaactcatgatcttctcccactgtaagtttatgactgagaatctcagcactgccaattagtcaatcaaactgcatatgccccaatccattcaccatttaatttgcctagatagcagtttcgcatcttatcctgtcttttaaacccccaacacttccccagaaatct---gtctctttttggttgctacttccctgaggacaattgaaacaacc-aaaagataattt i canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 63590 550 - 86001 I e mm10.chr16 22714237 3358 - 98207768 I e micMur1.scaffold_3530 106529 4179 - 180192 I e tarSyr2.KE939969v1 21429 15169 - 345090 I a score=4006.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 33036 3 + 40176 -cca s panTro4.chrUn_GL393550 107270 3 + 115532 -cta i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42416752 3 + 202140232 -cca i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42122992 3 - 86207423 -cca i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 155422 3 + 192599291 -cca i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 177851 3 - 192460366 -cca i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 124483 3 + 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cagactcctgaaaccattta-aactcactttcccatgtctacacccacatactctcccttttcacctattattatc-gtgaact-gctggcccctatctGTAT--ATTGTCTGATGATGATTTCTATATTACAGAT---GAAAATGAGAA i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42122995 130 - 86207423 cagactcctgaaacaattta-aactcactttcccatgtctatatccacatacacttccttttcatctattattatc-gtgaactaattggcccctgtctGTAT--ATTGTCTGATGATGATTTCTATATTACAG---------------- i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 155425 144 + 192599291 cagattcctgaaaccattta-aactcactttcccatgtctacacccacatactctcccttctcacc---tattatatgtgaactaactggcccctctctGTAT--ATTGTCTGatgatgatttctatatcacagatgaagaaaatgagaa i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 177854 144 - 192460366 cagattcctgaaaccattta-aactcactttcccatgtctacacccacatactctcccttctcacc---tattatctgtgaactaactggccCCTCTCTGTAT--ATTGTCTGATGATGATTTCTATATCACAGATGAAGAAAATGAGAA i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 124486 144 + 187378091 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gttagagctactttctcattataacatagcttagaatcaaacccatgcagtcCACCACTGAAAATGGGGTTCCAAATCAATGTATTTGGAGAAGGAGAGCTA-GTAGAAAAACAAGGATGAAAAGATCCAGGATGAAGCTTCCGATGGAAGAAAAGGACATTTTTGCTATTATGAGCCCCTTGAAG--TAGACCTT---AAGCATTCTCATCTGGA--CAAATATCCATCCATTCATCCACTCCAGTGAG-TGACTAAGTGTTAGGATTTTAAGGGTCAATGAACAATTATTCCTCATTCAGCAATCAAA----GGAGGATTAATATGAATGTTATCTTGAAGAAGTTTAATTTAAAACATATTTTATTGAT---------------------------------CTTTGGCAACTGTCTTCTATCAGATCATTACCAATCC--ATATGATTTGGGCGGAAGGGAGAAAACCCAAAACTTAATCAGATGCCTGAAGTTAGGGAACATTTTATAACCAACCCAGAGGGAAAAAAATGCTCAAAAAGGGAAAGATGAGGACATAGAAAATACATTTCAAAGATTTTAACTTTTTGACAAAA------TTCTGTGCAAGAAAA----ACTGATGATTGTGTGAATATAACT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 178002 590 - 192460366 GTTAGAGCTACTTTCTCGTTATAACATAGCTTAGAATCAAACCCATGCAGTCCACCACTGAAAATGGGGTTCCAAATCAATGTATTTGGAGAAGGAGAGCTA-GTAGAAAAACAAGGATGAAAAGATCCAGGATGAAGCTTCCGATGGAAGAAAAGGACATTTTTGCTATTATGAGCCCCTTGAAG--TAGACCTT---AAGCATTCTCATCTGGA--CAAATATCCATCCATTCATCCACTCCAGTGAG-TGACTAAGTGTTAGGATTTTAAGGGTCAATGAACAATTATTCCTCATTCAGCAATCAAA----GGAGGATTAATATGAATGTTATCTTGAAGAAGTTTAATTTAAAACATATTTTATTGAT---------------------------------CTTTGGCAACTGTCTTCTATCAGATCATTACCAATCC--ATATGATTTGGGCGGAAGGGAGAAAACCCAAAACTTAATCAGATGCCTGAAGTTAGGGAACATTTTATAACCAACCCAGAGGGAAAAAAATGCTCAAAAAGGGAAAGATGAGGACATAGAAAATACATTTCAAAGATTTTAACTTTTTGACAAAA------TTCTGTGCAAGAAAA----ACTGATGATTGTGTGAATATAACT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 124634 593 + 187378091 GTTAGAGCTACTTTCTCATTATAACATAGCTTAGAATCAAACCCACGCAGTCCACCACTGAAACTGCGGTTCCAAATCAATGTATTTGGAGAAGGAGAGCTA-GTAGAAAAACAAGGATGAAAAGATCCAGGATGAAGCTTCCGATGGAAGAAAAGGACATTTTTGCTATTATGAGCCCCTTGAAG--TAGACCTTAACAAGCATTCTCATCTGGA--CAAATATCCATCCATTCCTCCACTCCAGTGAG-GGACTAAGTGTTCGGATTTTAAGGGTCAATGAACAATTATTCCTCGTTCAGCAATCAAA----GAAGGATTAACATGAATATTATCTTGAAgaagtttaatttaaaacatatttcattgAT---------------------------------CTTTGGCAACTGTCTTCTATCAGATCATTACCAATCC--ACATGAtttgggaggaagggagaaaaccCAAAACTTAATCAGATGCCTGAAGTTAGGGAACATTTTATAACCAacccagagggaaaaaaaggctCAAAAAGGGAAAGATGAGGacatagaaaatacatttcaaagattttaactttttgacaAAA------TTCTGTGCAAGAAAA----ACTGATGATTGTGTGAATATAACT i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 73320 590 - 101219884 GTTAGAGCTACTTTCTCATTATAACATAGCTTAGAATCAAACCCACGCAGTCCACCACTGAAACTGGGGTTCCAAATCAATGTATTTGGAGAAGGAGAGCTA-GTAGAAAAACAAGGATGAAAAGATCCAGGATGAAGCTTCCGATGGAAGAAAAGGAAATTTTTGCTATTATGAGCCCCTTGAAG--TAGACCTT---AAGCATTTTCATCTGGA--CAAATATCCATCCATTCATCCATTCCAGTGAG-TGACTAAGTGTTAGGATTTTAAGGGTCAATGAACAATTATTCCTCATTCAGCAATCAAA----GAAGGATTAACATGAATATTATCTTGAAGAAGTTTAATTTAAAACATATTTCATTAAT---------------------------------CTTTGGCAACTGTCTTCTATCAGATCATTACCAATCC--ACATGATTTGGGAGGAAGGGAGAAAACCCAAAACTTAATCAGATGCCTGAAGTTAGGGAACATTTTATAACCAACCCAGAGGGAAAAAAAGGCTCAAAAAGGGAAAGATGAGGACATAGAAAATACATTTCAAAGATTTTAACTTTTTGACAAAA------TTCTGTGCAAGAAAA----ACTGATGATTGTGTGAATATAACT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s canFam3.chr31 28805531 615 - 39895921 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canFam3.chr31 C 0 C 0 e tupBel1.scaffold_136731.1-86001 64141 996 - 86001 I e mm10.chr16 22714237 3358 - 98207768 I e tarSyr2.KE939969v1 21429 15169 - 345090 I a score=13903.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 34008 4 + 40176 AATT s panTro4.chrUn_GL393550 108116 4 + 115532 CATT i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42417723 4 + 202140232 CATT i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 42123943 4 - 86207423 CATT i nomLeu3.chr21 C 0 C 0 s rheMac3.chr2 156389 4 + 192599291 CATT i rheMac3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr2 178818 4 - 192460366 CATT i macFas5.chr2 C 0 C 0 s papAnu2.chr2 125451 4 + 187378091 catt i papAnu2.chr2 C 0 C 0 s chlSab2.chr22 74138 4 - 101219884 CATT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s tupBel1.scaffold_136731.1-86001 65137 3 - 86001 -ATT i tupBel1.scaffold_136731.1-86001 I 996 N 0 s canFam3.chr31 28806606 4 - 39895921 CATT i canFam3.chr31 C 0 C 0 e mm10.chr16 22714237 3358 - 98207768 I e tarSyr2.KE939969v1 21429 15169 - 345090 I a score=130147.000000 s 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ggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggcaaatcacaaggtcagcagatcgggaccatcctggtcaacatggcgaaaccccatctctact---aaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaccatacaaaaagtagctgggcgtggtggcacgtgcctgtagtctcagctactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttggacctgggaggcggaggatgcagtgagctgagattgcgccactgcactccagcctggtgacagagagagactctgtctcaaaacaaaacaaaa i papAnu2.chr2 C 0 I 17 s chlSab2.chr22 74187 301 - 101219884 ggcgtggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggcaaatcaccaggtcagcagatcgggaccatcctggtcaacatggcgaaaccccatctctact------------aaaaaaaaaaaacaaccatacaaaaagtagctgggcgtggtggcacgtgcctgtagtctcagctactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttggacctgggaggcggaggatgcagtgagctgagattgcgccactgcactccagcctggtgacagagagagactctgtctcaaaacaaaacaaaa i chlSab2.chr22 C 0 I 37 e mm10.chr16 22714237 3358 - 98207768 I e canFam3.chr31 28806655 6 - 39895921 I e tarSyr2.KE939969v1 21429 15169 - 345090 I a score=46776.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 34349 33 + 40176 T-----CCCAGATTCTGAATTGAATCTCACAATAAGGA s panTro4.chrUn_GL393550 108457 33 + 115532 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s panTro4.chrUn_GL393550 108490 1803 + 115532 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GAATGGTAGGA-Tggga----aaactttgcctctgc-----------------------------------------------------------------cctctgaaagtatgataactgagtctatgaaataaacggataacaggcatgtcgaaagaagaaaaggtatacacatttattacatgcatgggggaatcacaggagaGAAAAT i chlSab2.chr22 C 0 C 0 s mm10.chr16 22719562 103 - 98207768 GAACGTAAAGGAAGGGACTAGGAACTTTCCTCCTAA-----------------------------------------------------------------CCTCTGAGGATTCCATGACCCAGCCTAGATAATAAGCTGACAAGAGGC-------------------------------------GCAAG--------ACAGGAAAGAAAAG i mm10.chr16 C 0 I 48 e canFam3.chr31 28809371 908 - 39895921 I a score=130055.000000 s hg38.chr1_KI270710v1_random 37946 71 + 40176 tggaatcaaaaacaaaacaaaacaaaacaaacaaaacaccaccaag-aaaaaaccccagtgagatttaggag s panTro4.chrUn_GL393550 112381 71 + 115532 tggaataaaaaacaaaacaaaacaaaacaaacaaaacaccaccaag-aaaaaaccccagtgagatttaggag i panTro4.chrUn_GL393550 C 0 C 0 s ponAbe2.chr3 42419990 56 + 202140232 tggatgcaaaaaca--------------aaacaaaacaccaccaag-aaaaaa-cccagtgagacttaggag i ponAbe2.chr3 C 0 C 0 s nomLeu3.chr21 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