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aagaaatagaaatgttaaaGTATGAAAGTAGATCCTAGACCCAGACTGCGTAGGTTCAGATCTCAGCTCTGCTACTTATGTAagggcaaatgcaaattaaaaattggAGGCTTAATTCTTCGTcttaaaaataagggaaaagatTTCTACCCCttcccttttcttagagcatttactttagaaaacttgtaattgcacattctttatctctttgaaatctatatacatctttttaaaaactaaataaggTTCTTGTGAGTTCTATGACCCAGGAATATCTTTCTCAAGGATCAGAGAACCAAGAACCATCTTTTTGAAATGCAA---GCAAG---GAAGATAGTGTCCCTATCTTCCAGTTTTTGTGGGAGGGTAGCAGCCTAACTTCAGTGGGGGATTCTTAGTTCCTAAATTACCTTCTGTCATAGAGATAGGAGAAGttaa-tttttcctttgggtaaagcCAATTAGTAACACAGATGGTCACCCCAATACTAGGCTAATTTAGGATGAACTGTGCATGAAAAATGGTGCT--GTCAAGTCCCCT-----------------------------------------------------------TCCTTGAGGACTAG-----------TCATTG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1866893 560 - 91010382 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cccatggtctttcttgcctctg--ctgttttatagcacttgtcactgtctgaagtccttgtctgtgtttgctaaatctgtgtttaccaa-aagtaagtttcatgagag-ctgggctttctttgctaaatctctgcttcctagttcggtgcctggagcataataacatctcaataaggattgcatgaattagtgagtGAATAAAATAAGCTATTCTTATCAACTAGTCCTTGACTGATTTAACAGATATTTGTTGAGTAGCTCATACACTACATACTGA-GGAGATTCAGCATTTTCCATCTAAGC----CTACCTAT---TAGTGTTAAGACATATGT-AT-GAGCTTTAAAAATATAGTA--------ATAAAGCTATAAGGAAAAAGTAGAAAATGAAAATATCATTAAAGAGGAAagca--tttt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112504715 406 + 204313951 cccatgctctttctcacctctg--ctgttttatagcacttgtcactatccaaggttctcatctgtgtttgctgaatccgtgtttactga-aagtaagtttcatgagagcatgggccttctttgctaaatctctgcttcctagttcagcgtctggagcataacaacatctcagtaaggattgcatgaattagtgagtGAAAAAAATAAGCTATTCCTCTCAACTAGTCTTTGACTAATTTAAAAGATATTTGTC-AGTAGCTCATACACTACATACTGA-GAAGATTCATCATTGTCCATATAAGC----CTACCTATTAGTAGTATTAAGACATACAT-GT-GAGCTTTAAAAATATAATC--------ATAAAGCTATAAGTAAAAAGTAGAAAATGCAAATATTGTTAAAAAGGGAAGCA---TTT i calJac3.chr2 C 0 I 865 s canFam3.chr3 14288027 398 + 91889043 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Ttgtgctaagtattgttctaggcatttcacataagttattctgtttaaattgtactcaagaacgcttccatttttatatcattgtattcatttttatagaggaggaaaagaaatccaaaagttaaataactggcttacagttgcccagctaggatgtggatggaccaaaattcaaacttatatcagcctgactctgaatcttatttt i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88041867 207 - 183952662 Ttgcgctaagtattgttctaggcatttcacataagttattctgtttaaattgtactcaagaacgcttccatttatatatcattgtattcatttttatagaggaggaaaagaaatccaaaagttaaataaccggcttacagttgcccagctaggatgtggatggaccaaaattcaaacttatatcagcctgactctaaatcttatttt i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53770925 206 - 163208435 Ttgtgctaagtattgttctaggcatttcacataagttattctgtttaaattatactgaagaacgcttccatttatatatcattagattcatttttatagaggagt-aaagaaatctaaaagttaaataactggcttacagttgcccagctaggatgtggatggaccaaaattcaaacttatatcagcctgactctaaatcttatttt i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88054982 207 - 180491593 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ttgtgctaagtattgttctaggcatttcacataaattattttgtttaaattgtactcaagaacgcttccatttatataccattatattcatttttatagaggaggaaaagaaacccaaaagttaaataactggcttacagttgcccagctaggatatggatggaccaaaattcaaacttatattagcctgactctaaatcttatttt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14288425 147 + 91889043 GTTTGATAAGCA-TATGCTAG------CACA---------------AAATTTCA--------------CATTTATGTGTTGTTA----CATTTTTATAGAAGAAGAAAAGGCCTTAAGAAGTTAAGTAATT--------------------GTGAATAGATGGGTCAAAATTCAAACTTGTATTGGTCAGACTCAAAATATTATTTT i canFam3.chr3 C 0 I 187 e mm10.chr13 76427229 373 + 120421639 I e calJac3.chr2 112505121 865 + 204313951 I a score=517420.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 3962 191 + 101241 ctttgcattatactaAACATAAAAACCGTCTCCTCTCCTCtgtcaaaaactgtgaagggtctgaaatgttattatacttgcaagctaaccagttagccaccacagtttcatgtatactgacacacaacacgaagttcctggattagaaacaaaggactttatgattcctgacataacaataatatgagctt s panTro4.chr5 20101764 191 + 182651097 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s panTro4.chr5 20102471 2481 + 182651097 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i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53776408 1167 - 163208435 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ATTACATTTAATAAagggaggcattatcc-ttaggagactgtacattaaaaatatcttctctctactctgtagggagatactctctctgtcttttaaggttgcactgtataaacatcctagagatgattttctagaa---------caccggcatccagttagtgtcaatatgt-gaaaggcgaggcaccagtggagaattgtcttctaataCTCTCTATCTgtgtttcctcttacagtaaatggtatcaccattgtcttggttgcccaagacagaaagctggtcatcttgtttagttctcattctttattcattcatctctttatttaacttagtcttaactttccctgcttgccacttccaatccatcaccaaattcttcccatcttaccttttt--aatatctcttggactcattcacctttttattcagcagcaaccttggttttcagtccctgtcatctc--gagtggattactaaaatggtgtctctctctccagttttgtgttatctaacgtgttctccaactagagtcagaattttcttttctcctgctttcttaaaatgtcactgattcctcattgctctcaggacaaagtctaacgtccctgtaatgacatattagaccctttgtggtctggc----tcctacctatcttatttctcaacac-tacttcctcagactctatgctccattcatgctgtggttccccaggttccgtgatgactcttttcagagtgctgaacatctccctctgggatgcacttcctctttttcctcacatgtctacctctttctcctctttaagtctcagcctaaatatcacttcttctaA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88048459 819 - 183952662 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ATTACATTTAATAAagggaggcattatct-ttaggagactgtacattaaaaataccttctctctactctgtagggatatactct---tgtcttttaaggttgcactgtataaacatcctagaaatgatgttctagaacacaggcatcacaggcatccaattagtgccaatatgcagaaagccgaagcaccagtggagaattgtcttctaataCTCTCTGTCTGTGTTTCTGCTTACAGTAAATGGTATTGCCATTATCTT-GTTGCCCAAGACAGAAAGCTGGTTATTTTGTTTAGTTCTCATTCTTTGTTCATTCATCTCTTTATTTAACTTAGTCTTAACTTTGCCTCCTTAccacttccaattcatcaccaaattcttcccatcttaccttttt--aatatctctcggattcgttcacctttttatccagcagcaaccttggttttaagtccctgtcatctcttgagtggattactaaaatggtgtctgtctctccagttttgtcttatctaacatgttctccaactagagccagaattttcttttcttctgctttcttaaaatgtcactgattcctcattgctctcaggacaaagtctaaagtccctatcatgacatattagagtctttatggtctggc----tcctacctacctcatttctcaacac-ttcttcctcagactctatgctccattcctactgtggtttcccaggttccatgatgactcttttcagagtgctgaatgtctccctctgggatgcacttcctccttttcctcacatgtctaactctttctcccctttaagtcttagcctaaatatcacctcttctaA i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87909323 826 - 181584905 ATTACATTTAATAAagggaggcattatct-ttaggagactgtacattaaaaataccttctctctactctgtagggatatactct---tgtcttttaaggttgcactgtataaacatcctagaaatgatgttctagaacacaggcatcacaggcatccaattagtgccaatatgcagaaagccgaagcaccagtggagaattgtcttctaataCTCTCTGTCTGTGTTTCTGCTTACAGTAAATGGTATCCCCATTGTCTT-GTTGCCCAAGACAGAAAGCTGGTTATTTTGTTTAGTTCTCATTCTTTGTTCATTCATCTCTTTATTTAACTTAGTCTTAACTTTGCCTCCTTAccacttccaatccatcaccaaattctttccatcttaccttttt--aatatctctcggattcgttcacctttttatccagcagcaaccttggttttaagtccctgtcatctcttgagtggattactaaaatggtgtctgtctctccagttttgtcttatctaacatgttctccaactagagccagaattttcttttcttctgctttcttaaaatgtcactgattcctcattgctctcaggacaaagtctaaagtccctatcatgacatattagagtctttatggtctggc----tcctacctacctcatttctcaacac-ttcttcctcagactctatgctccattcctactgtggtttcccaggttccatgatgactcttttcagagtgctgaatgtctccctctgggatgcacttcctccttttcctcacatgtctaactctttctcccctttaagtcttagcctaaatatcacctcttctaA i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85152192 826 - 174439528 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i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112507841 1256 + 204313951 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AAAGTACCCCC---------------------------------------------------------CCAAAATTAGAATATCTGGTTGGTTTATAATAAAGTATG----ATAAT-TTTATACTATAAAATA--TCTCAC----TAGGATATTTTTAAGTATGGAGTC i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14294278 160 + 91889043 ATAGCATCTCCTTGGATTTGCGAAACTTGATCAAGAATCTCTATTTAAGAACGAAATGCCAAAAAAAATTAAAAATGGAATATCTGGTTGATTTGGAATCAAGTAAAATAAATAATACTTAGAAGATAAAATA--TCCTAG----TAGGATATTTTCTAGCATTAA--- i canFam3.chr3 I 150 C 0 e mm10.chr13 76430528 175 + 120421639 I a score=84638.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 13537 60 + 101241 TCTCTCAATTAAAATGAAGAAAA-GAGGTG--------------GGTGgagagagagaggg--------------agagagagagaga--a s panTro4.chr5 20111893 62 + 182651097 TCTCTCAATTAAAATGAAGAAAA-GAGGTG--------------GGTGgagagagagaggg--------------agagagagagagagaA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88051691 62 - 183952662 TCTCTCAATTAAAATGAAGAAAA-GAGGTG--------------GGTGgagagagagagag--------------ggagagagagagagaA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53780811 50 - 163208435 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CTGTTGCAGAGAATGTACTGG------------------TCAGATCCCTGTGTCAGGTATGCTTTCCC-ATCAGTTCAGCAGCCACATGTGTggtgtgtggagacaatcaggttctgggccagcagaggtgagaacaaggctctgggccatgggaggttcaccaaggtTTACAGCACT-TTCTTAGGC-----TGC------------AGCTCTCCCATGGGCTGTCACGGTGATGCCTCTCACAGTCCACTTTCCTTCCAGTTTCTACA--TCTCACTAAATATTTCACAGAGTAAATC-------------------------AGAAGGAAAGGCCGAGACCAGAAGAAACT-AGTTTTAAAAAGGAAATACTAAGCATTGTAATTATAAAAATTCTTAAAGAGGGAGCATTTACTAT-------------GAGCTTAAC------------------ATTGTGTGTTTT--TCAACCTTGTATTCCACTGAGGTTTTGCCAAGAAAATAAAGTGGAATA--TCTCCT-CCTTGGAAGCCTGCttttttttttttttttttttttcttttCCCTCCCTGTGAAACAGCAGCCACAACTTGTAGTAGAAGCTGAATTATGTAGGCAGAGAACAGCCAACAAGGGACTTAGCTATCAGGCCTCCTACCTTGGTCATGCCTAGAGGAGCTGAAACAGTTCCTTTACTCACAGATTTTGGGTCCATCCTACCAGAGGTCTTCTCTTCTGGGTG------GTGCTCCA--ACTCACTG---TATCCCTAATGGC------C----------------------------------TATTATGAAGCCACCTCAGGAGGTGTTTCTGGG-AACTTCAGTGTGGGCTCAGCAGTGGTGCCCACTGGTTCTGGGGAGAGTTTAAGGGGCAGAGAGGTGGCAGCCAGCATTTCCTCTAGACTGCCTGTG-TATGGGTACCTT-----------------GCTTGACAGAGTGCCACCTTGCCAATCCTTCGAGGATCTTTGGGATTTCTG---- i canFam3.chr3 I 201 C 0 a score=140509.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 17383 40 + 101241 AAGAATAGGCTGAAAAGAGGGA----CTGGAGGTTACTGCCACA s panTro4.chr5 20115734 40 + 182651097 AAGAATAGGCTGAAAAGAGGGA----CTGGAGGTTACTGCCACA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88055538 40 - 183952662 AAGAATAGGCTGAAAAGAGGGA----CTGGAGGTTACTGCCACA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53784613 40 - 163208435 AAGAATAGGCTAAAAAGAGGGA----CTGGAGGTTACTGTCACA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88065186 40 - 180491593 aagaaTAGGCTGAAAAGTGGGA----CTGGAGGTTACCGCCACA i rheMac3.chr6 I 312 C 0 s macFas5.chr6 87916742 40 - 181584905 AAGAATAGGCTGAAAAGTGGGA----CTGGAGGTTACCGCCACA i macFas5.chr6 I 337 C 0 s papAnu2.chr6 85159293 40 - 174439528 AAGAATAGGCTGAAAAGTGGGA----CTGGAGGTTACCGCCACA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1877967 40 - 91010382 AAGAATAGGCTGAAAAGCGGGA----CTGGAGGTTACCACCACA i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112515331 38 + 204313951 AAAAATAGGCTGAAAAGAGGGA----CTGGAGGTTATG--CACA i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76436886 44 + 120421639 AGGAACGGGCTGCAATGAGTGAGGTGCCCAAGATGATTGCCACA i mm10.chr13 I 1 I 3204 s canFam3.chr3 14300198 38 + 91889043 --GAACATGCCAAGAAGAGGGA----CTATGGATAATTACTATA i canFam3.chr3 C 0 C 0 a score=1077502.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 17423 319 + 101241 TAGCCAAGCATTCCTGGGAACTTTCTGGGAATGTGAACTGATATGAAAATGGCTTAGACTACAAGAATTATAGGGaaatatcagaatacccacctaaaaatggcttaaataagaaggccattttaaagcttacttcatgaggaattttgaaataggcagttccagggtcagtttggctgctcaacagagtcttcaaggacggaggcactcttcataattctcttctgccatcatcaggat-tcagtgaaatctccctctatggtcacaggatgactccagcagttcTGATTATCCTGGGTTCCTGGATGTGTTATGTGCA-------------------------------------------------------------------------- s panTro4.chr5 20115774 316 + 182651097 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TCTTTATAAATGTTTTTGTGATTTTTCGGAGGGAGACAAATAGCAGACAACTCAGCCCATATCTACAATTT-------GTGGAATGTTCCCATT---ATCACCCAACAGGCTTCATCTTAGGTATTTTTGGTCAGAACTAAATTGCATATTGACTTTTTATACAATAATCAGCAAAGACTATATA-TAACCTCTATCTAGACCAATCACAATTGACCTTCTGGGGATAAGCATATAGCTTCTAGACAGTCCTCACAAGAAGTAAGGGAGAAGacataa-aggaagatggccagctat--taactatgttttccaagatctgaaa--agaaaactgggttaaatt------------------------------------------------------acactaa--agaatttaggatggcttttagg-aagaaagtgcaaacaagaaagtggtattgtactctggatcacattattgaacttgtacataaatatattccct----a---tcg-tctaaaaacagaatgaatagattt---------tgagtagga-cttaattcagccttgcttggagcttggaagatgcagtaaattaccttaaagcattttcTTCATGATGTTGATA--AG--AGAATATCATCAGCAAGGAATTAGTTAAGAATTGTATTAAAATTGTTGTAAAAATGGGCATGGCCTCTTCT--- i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85159651 613 - 174439528 tctttataaatgtttttgtgatttttcggAGGGAGACAAATAGCAGACAACTCAGCCCATATCTACAATTT-------GTGGAATGTTCCCATT---ATCACCCAACAGGCTTCATCTTAGGTATTTTTGGTCAGAACTAAATTGCATATTGACTTTTTATACAATAATCAGCAAAGACTATGTA-TAACCTCTATCTAGACCAATCACAATTGACCTTCTGGGGATAAGCATATAGCTTCTAGACAGTCCTCACAAGAAATAAGGGAGAAGACATAA-AGGAAGATGGCCAGCTAT--TAACTATGTTTTCCAAGATCTGAAA--AGAAAACTGGGTTAAATT------------------------------------------------------ACACTAA--AGAATTTAGGATGGCTTTTAGG-AAGAAAGTGCAAACAAGAAAGTGGTATTGTACTCTGGATCACATTATTGaacttgtacataaatatatTCCCT----A---TCG-TCTAAAAACAGAATGAATAGATTT---------TGAGTAGGA-CTTAATTCGGCCTTGCTTGGAGCTTGGAAGATGCAGTAAATTACCTTAAAGCATTTTCTTCATGATGTTGATA--AG--AGAATATCATCAGCAAGGAATTAGTTAAGAATTGTATTAAAATTGTTGTAAAAATGGGCATGGCCTCTTCT--- i papAnu2.chr6 C 0 I 2804 s chlSab2.chr4 1878325 613 - 91010382 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macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85163699 52 - 174439528 ttatttatttttctttccttattctgCTGGCTTAAACTTCCAGAAAAATACT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1879569 52 - 91010382 ttatttgtttttctttccttatcctgctggcttaaacttccagaaaaatact i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112517930 52 + 204313951 ttatttcttttgctttccttactgtgctggtttaaacttccagaaaaatact i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76441096 716 + 120421639 I e nomLeu3.chr2 53786210 100 - 163208435 M a score=982266.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 19059 342 + 101241 gaatagaagtgataagaatgcacgtccttttc-ttttgctaatcttaggaaaaaagcatttagtctctcttcattatgatgttagctgctggtttttataatgtcttttattaaattgagggagtttctttttattatttgtttggtgagagtttttatcaggaataaatgctga-ttttttgtcaagtgctttttctgcatctattgaaattattatgtggattttatttttgtgtttgttgatatagtgaattacattgatttttgaaattaatgttaaatgaacctggcatttctgaggaaaacactgcctgataataatattaattttatatattgttta s panTro4.chr5 20117406 342 + 182651097 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s panTro4.chr5 20117896 1134 + 182651097 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rheMac3.chr6 88068635 154 - 180491593 ggccagatgtggtggctcatgcctgtaatcccagcactttggaaggccgaggcaggcggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaatatggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaaattagctgggcgtggtggtagg i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87920191 154 - 181584905 ggccagatgtggtggctcatgcctgtaatcccagcactttggaaggccgaggcaggcggatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaatatggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaaattagctgggcgtggtggtagg i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85165549 154 - 174439528 ggccaggtgtggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggagaccgagaggggcggatcacgaggtcaggagattgggaccatcctggctaatatggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaaattagctgggcgtggtggcgag i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1881410 154 - 91010382 ggccaggtgtggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggcagatcacgaggtcaggagatcgagaccatcctggctaatatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaaattagctggacgtggtgccggg i chlSab2.chr4 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76441096 716 + 120421639 I e calJac3.chr2 112519722 965 + 204313951 I e 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ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88070594 281 - 180491593 ctggtattaCCACTggctctgttacagctaatccacattgtgctgtggtgtagaatcactcatggcagtaaactgagtcaaatgtagggcctactttgtatatttcttattttttggatatgactgtcttttgttgcctgatgtcattgacttaaaaactatagattcacatcatagatttagtctgtttttgtttttgtggctgttgttgtttcaaatgagaaggtaaatctgattcctgttaccccagtttgttgagaagcaaaagtctcTCTCTC--------------TCT i rheMac3.chr6 C 0 I 3 s macFas5.chr6 87922155 281 - 181584905 ctggtattaCCACTggctctgttacagctaatccacattgtgctgtggtgtagaatcactcatggcagtaaactgagtcaaatgtagggcctactttgtatatttcttattttttggatatgactgtcttttgttgcctgatgtcattgccttaaaaactatagattcacatcatagatttggtctgtttttgtttttgtggctattgttatttcaaatgagaaggtaaatctgattcctgttaccccagtttgttgagaagcaaaagtctcTCTCTC--------------TCT i macFas5.chr6 C 0 I 3 s papAnu2.chr6 85167498 276 - 174439528 CTGGTATTACCACTGGCTCTGCCACAGCTAATCCACATTGTGCTGTGGTGTAGAATCACTCATGGCAGTAAAC--AGTCAAATGTAGGGCCTACtttgtatatttcttattttttgcatATGACTGTCTTTTGTTGCCTGATGTCATTGCCTTAAAAACTATAGATTCACATCATAGAtttggtctgtttttgtttttgtggc---tgCTGTTTCAAATGAGAAGGTAAATCTGATTCCTGTTACCCCAGTTTGTTGAGAAgcaaaagtctctctctc--------------tct i papAnu2.chr6 C 0 I 6 s chlSab2.chr4 1883382 277 - 91010382 ctggtattaCCACTggctctgctacagctaatccacattgtactgtggtgtagaatcactcatggcagtaaactgagtcaaatgtagggcctactttgtatatttcttattttttggatattattgtcttttattgcctgatgtcattgccttaaaaactatagattcacatcatagatttggtctggtttt-tttttgtggc---tgttgtttcaaatgagaaggtaaatctgattcctgttaccccaatttgttgagaagcaaaagtctcTCTCTC--------------TCT i chlSab2.chr4 C 0 I 6 s calJac3.chr2 112521431 274 + 204313951 ctgatattaCCACTggctctgctgcagctactccacattgtgctgtggcgtagaatcactcatggtagtaagttgagtcaaatatagggcctgctttgtatatgttctattttttggatgttactgtcttttgttgcctgatgtcattgtcttaaaaactatagatttacatcagagatttggtctgttcttgtttttgtggc---tgttatttcatatgaaaaggtaaatctgattcctgctaccccagtttgttgagaagcaaaagtccatatat------------------ i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76441096 716 + 120421639 I e nomLeu3.chr2 53790103 153 - 163208435 I a score=513661.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 23140 178 + 101241 atatatatatatatCCTTATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATTAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCATCTTTATTACCATAAATGTGTGAAGATATTCTaagtgtatagagctgtttatgcactaaatggccctacat s panTro4.chr5 20121486 176 + 182651097 ATATATATATAT--CCTTATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATTAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCATCTTTATTACCATAAATGTGTGAAGATGTTATaagtgtatagagctgtttatgcactaaatggccctacat i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88064307 176 - 183952662 atatatatatAT--CCTTATCCATCAGTCTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATTAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCATCTTTATTACTATAAATGTGTGAAGATGTTATaagtgtatagagctgtttatgcactaaatggccctacgt i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53790256 176 - 163208435 acacaTATATAT--CCTTATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGAATTTGGCTTCAAATTGCTATTAGTTACTTAGGTGTTATACATGATATTCATGATCATTAAAATCATCTTTATTACTATAAATGTGTGAAGATGTTATaggtgtatagagctgtttatacactaaatggccctacgt i nomLeu3.chr2 I 153 C 0 s rheMac3.chr6 88070878 170 - 180491593 -TATATATATA---CCTTATCTATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATCAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCA----TATTACTATAAATGTCTGAAGATGTTATAAGTATATAGAGCTGTTTATGCACTAAATGGCCCTATGT i rheMac3.chr6 I 3 C 0 s macFas5.chr6 87922439 171 - 181584905 -TATATATATAT--CCTTATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATCAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCA----TATTACTATAAATGTCTGAAGATGTTATAAGTATATAGAGCTGTTTATGCACTAAATGGCCCTATGT i macFas5.chr6 I 3 C 0 s papAnu2.chr6 85167780 170 - 174439528 atatatatatat--ccttatcCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATCAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCA----TATTACTATAAATGTCTGAAGATGTTATAAGTATATAGAGCTGTT--TGCACTAAATGGCCCTATGT i papAnu2.chr6 I 6 C 0 s chlSab2.chr4 1883665 172 - 91010382 ATATATATATAT--CCTTATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATTGCTATTAGTTACTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATTAAAATCA----TATTACTATAAATGTCTGAAGATGTTATaagtgtatagagctgtttatgcactaaatggccctatat i chlSab2.chr4 I 6 C 0 s calJac3.chr2 112521705 168 + 204313951 --atatATATGT--CCTCATCCATCAGTTTTCTTATGAGTGGATTTGGCTTCAAATCGCTATTAGTTATTTAGGTGTTATACATAATATTCATGATCATCAAAATCT------TTACTATAAATGTGTGAAGATGTTATAAGTATACAGGGCTGTTTATATACTAAATGGCCCTATGT i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76441096 716 + 120421639 I a score=613483.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 23318 195 + 101241 tactccactttttgaattattTTTATTTAAAAATTTTCAGTCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTCCCAGTGTTCACTGTATGCAAAAAGCAATAAAATGATTACTGAAAACAATATTGTCCCTTGCTATTGGTAAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGCCATTTCCATCCTCTACC---TCTATTTGCATTCTC s panTro4.chr5 20121662 195 + 182651097 tactccactttttgaattattTTTATTTAAAAATTTTCAGTCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTCCCAGTGTTCACTGTATGCGAAAAGCAATTATATGATTACTGAAAACAATATTGTCCCTTGCTATTGGTAAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGCCATTTCCATCCTCTACC---TCTATTTGCATTCTC i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88064483 194 - 183952662 tactccactttttgaattatttttatttaaaacttttcagtctTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGTGTTCACTGTATGCAAAAAGCAATTATATGATTACTGAAAACAATATCGTCCCTTGCTATTGGTAAAACTTGTCTAACAGCAATGTCAATAGCCTTTTCCATCCTCTA-C---TCTATTTGCATTCTC i ponAbe2.chr5 C 0 I 61 s nomLeu3.chr2 53790432 195 - 163208435 tactccactttttcagttgttTTTATTTAAAAATTTTCAGTCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGTGTTCACTGTATGCAAAAAGCAATTATATGATTACTGAAAACAATATTGTCCCTTGCTATTGGTAAAACTTCTCTAACAGCAatctcaatagccatttccatcctctacc---tctatttgcattctc i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88071048 194 - 180491593 TACTCTAC-TTTTGaattatttttatttaaaaattttCAATCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGTGTTCACTGTATGCAAAGAGCAATTATATGATTACTGAACACAATATTGTCCCTTGCTATTGGTGAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGCCATTTCCATCTTCTACC---TCTATTTGCATTCTC i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87922610 194 - 181584905 TACTCTAC-TTTTGAATTATTTTTATTTAAAAATTTTCAATCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGTGTTCACTGTATGCAAAGAGCAATTATATGATTACTGAACACAATATTGTCCCTTGCTATTGGTGAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGccatttccatcttctacc---tctatttgcattctc i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85167950 194 - 174439528 TACTctac-ttttgaattatttttatttaaaaattttcaatcttTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGTGTTCACTGTATGCAAAGAGCAATTATATGATTACTGAACACAATACTGTCCCTTGTTATTGGTGAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGCCATTTCCATCTTCTACC---TCTATTTGCATTCTC i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1883837 194 - 91010382 tactctac-ttttgaattattttgATTTAAAAATTTTCAATCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCAGCGTTCACTGTATGCAAAGAACAATTATATGATTACTGAACACAATATTGTCCCTTGCTATTGGCGAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGccatttccatcttctacc---tctatttgcattctc i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112521873 194 + 204313951 TACTCTAGTTTTTAGattatttttatttaaaatttttCAGTCTTTCAGTGACATTTAGGAAATGTTCCA-TGTTTACTGTATGCAAAAACAATTTATATGATTACTGAAAACAATACTGTCCCTTGCTATTGGTAAAACTTCTCTAACAGCAATGTCAATAGCCATTTCCATCCTCTACC---CCTATTTCCATTCTC i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76441812 172 + 120421639 TATTCCAGTTTTTGAATTATGTTTA---------TTTTAGTCTTTAAATGACATTTCGGAAATGTGCAAATGCCTACTATGTGCAAAGATAAATAA---AGTTCCTGAAGAGAACA---TCTTTTGTCATTGTT-ACGTTCCTTAAGAAGCAGCATC--CAGACA--TCTATTCCTTACCAATTTTTTTTAC------ i mm10.chr13 I 716 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I a score=731165.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 23513 270 + 101241 CATGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTA-TTAAGAGCAACATTTCCACATAAGATT-AAAAATCTAAACGATGGGAA-GTTTTTTTCAGCATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTTTAAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTCACGTCAAATTCA---CTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATGTATTTCTTGTGGATATACCGATTAAA-----------ACccatatatgcctagtgtt s panTro4.chr5 20121857 270 + 182651097 CATGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTA-TTAAGAGCAACATTTCCACATAAGATT-AAAAATCTAAACGATGGGAA-GTTTTTTTCAGCATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTTTAAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTATAGCTGTCAGTGTCAATTCACATCAAATTCA---CTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATGTATTTCTTGTGGATATACCGATTAAA-----------ACccatatatgcctagtgtt i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53790627 271 - 163208435 catGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTA-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATT-AAAAATCTAAATGATGGGAAGGTTTTTTCCAGCATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTTTAAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTCACATCAAATTCA---CTTCACTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATGTATTTCTTGTGGATATACCGATTAAA-----------ACccatatatgcttagtatt i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88071242 272 - 180491593 CATGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTG-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATT-AAAAATCTAAATGATGGGAA-GTTTTTTTCAGTATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTT-AAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTGACATCAAATTCACTTCTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATGCATTTCTTTTGCATATACCGATTAAA-----------ACccatgtatgcctagtgtc i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87922804 272 - 181584905 catGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTG-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATT-AAAAATCTAAATGATGGGAA-GTTTTTTTCAGTATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTT-AAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTGACATCAAATTCACTTCTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATGCATTTCTTTTGCATATACCGATTAAA-----------ACccatatatgcctagtgtc i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85168144 271 - 174439528 CATGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTG-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATC-AAAAATCTAAATGATGGGAA-GtttttttCAGTATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATagaatttcagtt--aaaaaaaggTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTGACATCAAATTCACTTCTTCATTGAAGTttaagtttttcagaaaatgcatttcttttgcaTATACCGATTAAA-----------ACCCATATATGCCTAGTGTC i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1884031 283 - 91010382 catGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTG-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATT-AAAAATCTAAATGATGGGAA-TTTTTTTTCAGTATGTGCTAATGGGAAATTATGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTT-AAAAAAAAGATGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGTCAGTGTCAATTGACATCAAATTCACTTCTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAATATATTTCTTTTGCATATACCGATTAAAACCCATATATGACccatatatgcctagtgtc i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112522067 272 + 204313951 CATGAACTGTTTGAAATGTTCCTTCTA-TTAAGAGCAACATTTCCAGATAAGATTAAAAAATCGAAATGATGATAA-GTTTTTTTCAGCATGTGCTAATGGGAAATTCTGAACGAACTAAGTATAGAATTTCAGTT-AAAAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGTTGTCAGTGTCAATTCACATCAAATTCACTTCTTCATTGAAGTTTAAGTTTTTCAGAAAAT-TATTTCTTGTGTATATAGTGATTAAA-----------ACccatatatacctagtatt i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76441984 268 + 120421639 CACAAACATTTTGAAAGTTTGCTTCTATTTAAGATCAACATTTCCAAGTGACATT---AAATCCAAGTTATGGTGA-GAATTTCTCATCACATGTCAATGAGAGATTACGAA--GATTAAATATAGAATTTCAGCT-TAGAAAAAGGTGTGTGGGGATGTTCTTACAGCTGACAGTGTCAGTTTGCATCAAGTTCACTCCTTAAGTAAAATTTAAG-TTTTCAGAAACTGTGTTTTTTGCACATATGCTGATTAGA-----------AGTGAGATTTGGGTACTTTT i mm10.chr13 C 0 I 186 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e ponAbe2.chr5 88064677 61 - 183952662 I a score=369322.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 23783 164 + 101241 ccattatcagaacgctaaacatgtgggagttatttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgactgcaaaaattcaaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTATGGCCAGGGAGCCTGAGAGTC-CCATATT s panTro4.chr5 20122127 164 + 182651097 ccattatcagaacgctaaacatatgggagttacttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgactgcaaaaattcaaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTATGGCCAGGGAGCCTGAGAGTC-CCATATT i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53790898 164 - 163208435 ccattatcagaacgctaaacatgtgggagttatttatatcctgatgctcgaggtcattgccaaggtctgactgcaaaaattaaaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTATGGCCAGGGAGCCTGAGAGTC-CCATATT i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88071514 163 - 180491593 ccattattggagcactaaacatataggagttatttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgattgcaaaaattcgaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTCTGGCCAGGGAGCCT-AAGGTC-CCATATT i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87923076 163 - 181584905 ccattattggagcactaaacatataggagttatttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgattgcaaaaattcgaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTCTGGCCAGGGAGCCT-AAGGTC-CCATATT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85168415 163 - 174439528 CCATTATTGGAGTGCTAAACATataggagttatttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgattgcaaaaattcgaAAAATTGCAGCCTCAGGCA-AACTAGGTTAAGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTCTGGCCAGGGAGCCT-GAGGTC-CCATATT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1884314 163 - 91010382 ccattattggagcgctaaacatgtaggagttatttatatcctgctgctcaaggtcattgccaaggtctgattgcaaaaattcaaaaaattgcagcctcaggca-aactgggTT-AGAGTGAGATTTTGCTAGTCCTATGGCCAGGGAGCCTGAAAGTC-CCATATT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112522339 166 + 204313951 tcattattggaatgctaagcatgtgggtgttatttatgtcctgctgctcatggtcattgtcaagatctgattttgaaaattcaaaaaattacagcctcaggcataaatgggTTAAGAGTAAGATTTTACTAGTCCTATGGCCAGGGAGACTCAGAGTCTCTATATT i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76442252 186 + 120421639 I e ponAbe2.chr5 88064677 61 - 183952662 I a score=356791.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 23947 121 + 101241 GTGTCCTTTCCATCTCCATTCCTTCCAACCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGAGAATaaagatggagcacaaggcagtggttaaaagtgggaa s panTro4.chr5 20122291 121 + 182651097 GTGTCCTTTCCATCTTCATTCCTTCCAACCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGAGAATaaagatggagcacaaggcagtggttaaaagtgggaa i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88064738 121 - 183952662 GTGTCCTTTCCATCTCCATTCCTTCCAACCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTTATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATTAGAGTAAGGATGcagcacaaggcagtggttaaaagtgggaa i ponAbe2.chr5 I 61 C 0 s nomLeu3.chr2 53791062 121 - 163208435 GCGTCCTTTCCATCTCCATTCCTTCCAACCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGAGAATAAAgatgcagcacaaggcagtggttaaaagtgggaa i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88071677 120 - 180491593 GTGT-CTTTCCATCTCCATTCCTTCCAGCCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGGGAATAAAGATGcagcacaaggcaatgtttaaaagtgggga i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87923239 120 - 181584905 GTGT-CTTTCCATCTCCATTCCTTCCAGCCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGGGAATAAAGATGcagcacaaggcaatgtttaaaagtgggga i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85168578 120 - 174439528 GTGT-CTTTCCATCTCCATTCCTTCCAGCCCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGGGAATAAAGATGCAGCACAAGGCAATGTTTAAAAGTGGGGA i papAnu2.chr6 C 0 M 487 s chlSab2.chr4 1884477 120 - 91010382 GTGT-CTTTCCATCTCCATTCCTTCCAGCTCTCCCACAGGGCTCACTA-GAAGTCATATTTTAAGGACCAAAAGCAGAATGGGAATAAAGATGcagcacaaggcagtgtttagaagtgggga i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112522505 120 + 204313951 GTGTCCTTTCCATCTATGTTCCTCCCAATCCTCTCAAAGGGCTTACTA-GAAGTCATGTTTTAAGGACCAGAGGCAGAATGGGAATAAAGATGcagcac-aggcagtatttaaaagtgtgga i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76442438 104 + 120421639 gtctcagctccttctccagca---ccacacctgtcactgtgatgattacggagtaatcctttgaaactgtaagccagcccgcaatta--ggtgtAgc-------------taaaagcgtggg i mm10.chr13 I 186 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I a score=629524.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 24068 360 + 101241 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183952662 ttctgggataggttggctggtttcatatcagccccgtaacctacataccttaggcaagtcacttaactttgtattgccccagtttcctcatctgtaaaacagggttaatagtaagacctatttcattaggttgttatgagggttaaattatat-atata--gtatgtgtgcatgtgtgtg----------------------------tatatatacacac----------------------ac--------------------------------------atatgtatgtgta---tatgtgtgtgtat---------------------------------------------ttgtGAG-TGTATGTTTCATTACCTGTCACATAGAAAATGGTTTATAAGAGTTTGCT-AACTAAAGAAAGGTACCTTCCTCTTTATTATATTCTGC i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53791183 318 - 163208435 ttctgggacaggttgcctggtttcatatcagccccgaaacctacataccttaggcaagtcacttaactttgtattgccccagtttcctcatctgtaaaacagggttaatagtaagacatatttcattgggttgttgtgagggttaaattatat-atata--gtgtgtgTGCATGTGTGTG----------------------------tatatat--------------------------------------------------------------------atatacacacaca---cacatatatgtgt------------------------------ata-tatgtgtgtatTTGTGAG-TGTATGTTTCATTACCTGTCACATAGAAAATGGTTTGTAAGAGTTTGTT-AACTAAAGAAAGGTACTTTTCTCTTTATTATATTATGC i nomLeu3.chr2 C 0 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i chlSab2.chr4 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14301556 4682 + 91889043 I e mm10.chr13 76443018 49 + 120421639 I e calJac3.chr2 112523284 0 + 204313951 C a score=1436738.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 25018 448 + 101241 TCTCATCAATAAGGCAGAATAAGACCCAAGGAAAGGAATGGTGGCAGTACTTGCAAATGC-TTTGGG--GTATCTTAGAGGAGAAATTGTAGATATACTGTCCAAGATTTTAGTAGAAAACTAATCGAGTT-GGGGTCACTATCTGGGA--TATAGTTCATTAGTGTTTTAGGTCAGCAGTTAG-C-CTGAAATTCTGtcaagtcacctcattgctgaaaaattttcagtggctccacattgccttttggataaaacctagactccttaGTAAGAATCACAGATCTCTGCACCTCATCCAAATTGTATCCTTGTAAATAT--CTCT-----TGCCAGTGTTAGGTAAAATTGCTTGTTCTGGCTTCGGTCAGCTATTGGTGTCCTCCAAGCTTCCTGTGTTTTTTGGCT-TTCATTTATTAAAGCATATCA-AGTGCTCATCTATGACACCCTCTGTTTTCTTCT s panTro4.chr5 20123319 448 + 182651097 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ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53792089 447 - 163208435 TCTCATCAATAAGGCAGAATAAGACCCAAGGAAAGGAATGGTGGCAGTACTTGCAAATGCTTTTGGG--GTATCTTAGAGGAGAAATTGTAGATATCCTGTCCAAGATTTTAGTAGAAAACTAATCGAGTT-GGGGTCGCTATCTGGGA--TATAGTTCATTAGTGTTTTAGGTCAGCAGTTAG-C-GTGAAAT--TGtcaagtcacctcattgctgaaaaattttcagtggctccacattgccttttggataaaacctagactccttaGTAAGAATCACGGATCTTTGCACCTCATCCAAATTGTATGCTTGTACATAT--CTCT-----TGCCAGTGTCAGGTAAAATTGCTTGTTCTGGCTTTGGTCAGCTATCGGTGTCCTCCAA-CTTCCTGTGTTTTTTGTCT-TTCATTTATTAAAGCACATCAGAGTGCTCATCTATGACACCCTCTGTTTTCTTCT i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88072848 448 - 180491593 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macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85169789 448 - 174439528 TCTCATCAGTGAGGCAGAATAAGACCCAAGGAAAGGAATGGTGGCAGTACTTGCAAATGC-TTTGGG--GTATCTCAGAGGAGAAATTGTAGCTATACTGTCCAAGATTTTAGTAGAAAACTAATCGAGTT-GAGGTCACTACCTGGGA--TATAGTTCATTAGTGTTTTAGGTCAACAGTTAG-C-CTGAAATTCTGTCAAGTCACCTCATTGCTGAAAAATTTTCAGTGGCTCCACATTGCCTTTTGGATAAAACCTAGGTTCCTTAGTAAGAATCACGGATCTCTGCACCTCATCTAAATTGTATCCTTGAAAATAG--CTCT-----TGCCAGTGTCAGGTAAAATTGCTTGTTCTGGCTTCGGTCAGCTATTGGTGTCCTCCAAACTTCCTGTGttttttggct-ttcgttttttAAAGCACATCAGAGTGCTCATCTATGacaccttct-ttttcttct i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1885648 448 - 91010382 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panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88067573 276 - 183952662 GAAAGGAAATAATATTACTCAGAGACAATTGTACATGTGCCGTGATTCTAGAAGATGTTATAAACTA-TTTGTTATGATTCCTATGATTCCTGTAAAGTTGGCTTTTAGCTAATACCAAGTCTGTCTCAGATGGAAATCTGATCTCTCCTTGACTGCTCTC----ATTTCTCCCCTTTGTCTTTTCTGAATTCTGGAGGCTGTTTAGGTTCTGAGCTTTGTCTTGGGTTTCATCGTGAAATGGGTGATGATTGATTCTATTAGGGC---TAGAAAAATAGCTTA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53793879 276 - 163208435 GAAAGGAAATAATATTACTCTGAGACAATTGTACATGTGCCCTGATTCTGGAAGATGTTATAAACTA-TTTGTTATGATTCCTATGATTCCTATAAAGTTGGCTTTTAGCTAATACCAAGTCTGTCTCAGATGGAAATCTGATCTCTCTTTGACTGCCCTC----ATTTCTCCCCTTTGTCTTTTCTGAATTCTGGAGGCTGTTTAGGTTCTGAGCTTTGTCTTGGGTTTCATTGTGAAATGGGTGATGATTGATTCTATTAGGGC---TAGAAAAATAGTTTA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88074583 270 - 180491593 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TCCATAGTTGTCAAGTT-------------AAAAAATAAAA---------------------------------------------------AAAGGTGTTCTGAGAGAGCAGTAAATTGTGAGAGAGGGCTTAGTTAACTGGTAGAGGAATTGCAGAAAGCAT------TGGCAGTGGATGTAC-GGTCACTT-ACCAAGATTGACTCTGAGGATGAAAAATCCTGCACCTGTCGCACAGAGATTCTTCATACTATTTTTGCTCACTTAAATAGTTTTGCTCATTTAAATATTCTCTGGTATTGC-TTAGTGGACTAGAATACATGTTCAAGGCACAGGGAGGTGAACTCAAAAGAGAAGAGGAGGTTCTCTTTCAATTAAATAATT-AAAAAATTGGCATAGCTATGATACTCTATTTAAATATATACAACATGCTTTCCCC----AAAAGAACAAGAACAAACACATTAACAGTAAACAT-CCTTGGGCCCAGATTATGGCCAGATTAGAGAGGAGGGGTAAAGAAGG--GTGAGaat i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112526784 431 + 204313951 TTCATAGTTGTCAAGTT-------------AAAAAAAAAAA----------------------------------------------------AAGGTGTCTGGAGAGAGCAGTAAATTGTGAGAGAGGGCTTAGTTAACTGGA-----------AGAAAGCAT------TGAGAGTAGATCTGC-AGTCACTTAACTAGGATTGAC---------------TCCTGCACCCATTGCACAGAGATTCCTCTTACTATTTCTGCTCACTTAAATAGTTTTGCTCATTTAAATATTCTTTGGTATTGC-TTAGTGGATGAGAATACATGTTCAAGCCAGAGGGAAACGAACTCAAAAGAGAAGAGGAGA----CTCTCAGTTAAATACTT-TAAAAAATAACACAGCTATGATGCTCTATTTAAATATATACAACATGCTTTACCC----TGAAAACCAAGAACAAACACATTAACAGTAAACAT-CTTTGGGTCCAGATTATGGCCAGGTTAGAGAGGTGGGGTAGAGAGGA-AGGGAGaat i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14307999 508 + 91889043 TCGATACATGTTGAGTTTTGAGGGTATGGCAAAAGAAAAAAAGTTTTGAGGGTGTGACAAATGGTAAGGGAGGGTTTTGAGGGCGTGGCAAAAAAAAAGTTTTGAGGGTGTGACAAATGGTAAGGGAGGGATTAGTTAAC----GGAATAACTATGGAAGGTAT------TTATTATGGACATATGGGCCACTG-ACTGAAATCCACTCCAAGCAAGAAAAGGCCTGCATATGTCACACAGAAATTC-TCAAGCTTTTTGTGCTTATTTGA-CAGCCT------GCAGAATATTTGTTGGTGTTGCTTTGGTGGACTGGAATATTTGTTTAATAAGGCAGGAGGTG--------------GTAAAGGTTCTCTTCCAATTAAATAACTATAAAAAATGATATAGCAGTGATACTCTACTCAAATATATAGAACATACTTTCCTAAAGGCAAAATTTAAGAGCAAACATATTAATAATAAATATGTCTCAGGTCCAGGGGATGACCCAGTAACAGTGGTAGAGAAAAGAGGGAAGGGAAGAT i canFam3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr13 76446006 1137 + 120421639 I a score=1029956.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 28322 377 + 101241 ggactttggggacttgggaggaaatggtgggaagggggtgagggataataaaaggctacaaattgggttcagt------------ggtgatgggtgcaccaaaatctcacaagtcaccgcgaaaga----acttatgtaaccaaataccacttgttcccccaacacctgtggaaatt--t-aaaaaaTAAAATTAGAGATGATATACTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAACAGGTCATGCATCAGAAAAAAATTAAGAGCAAATTATCTAATGATTCTGGAATCTCTCTCCCCTCATTTTAATGAAATACATATTTACATTAAAATA---TCTTCTAAAGTC-------------AAACAAAAGGGAGGGAGGAAGGGAGATGGAGAGAAGAGGGTATGGG s panTro4.chr5 20126618 377 + 182651097 ggactttggggacttgggaggaaatggtgggaagggggtgagggataataaaaggctacaaattgggttcagt------------ggtgatgggtgcaccaaaatctcacaagtcaccgcgaaaga----acttatgtaaccaaataccacttgttcccccaacacctgtggaaatt--t-aaaaaaTAAAATTAGAGATGATATACTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAACGGGTCATGCATCAGAAAAAAATTAAGAGCAAATTATCTAATGATTCTGGAATCTCTCTCCCCTCATTTTAATGAAATACATATTTACATTAAAATA---TCTTCTAAAGTC-------------AAACAAAagggagggaggaagggagatggagagaagagggtatggg i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88069060 384 - 183952662 ggactttggggacttgagaggaaatggtgggaaggaggtgagggataagaaaaggctacaaattaggttcagt------------ggtgatgggtgcaccaaaatctcacaagtcaccatgaaagaacttacttatgtaaccaaataccacatgttcccccaacacctatggaaatt--taaaaaaaTAAAATTAGAGATGATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAACAGGTCATGCATCAGAAAAAAATTAAGAGCAAATTATCTAATGATTCTGGAATCTCTTCCCCCTCATTTTAATGAAATACATATTTACATTAAAATC---TCTTTTAAAGTC--------AAAAAAAAAAAAAGGGACAGAGAAAGGGAGATGGAGGGAA---GGTATGGG i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53795384 384 - 163208435 ggactttggggacttgggaggaaatggtgggaagggggtgagggataataaaaggctacaaattgggttcagt------------ggtgatgggtgcaccaaaatctcacaagtcaccattaaaaaacttacttatgtaaccaaataccacttgttcccccaacacctatggaaatt--taaaaaaGTAAAATTAGAGATGATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAACAGGTCATGCATCAGAAAAAAATTAAGAGCAAATCATCTAATGATTCTGGAATCTCTCTCCCCACATTTTAATGAAATACATACTTACATTAAAATC---TCTTTTAAAGTC-----------AAAAAAAAAAGGGAGGGAGGAAGGGAGATGGAGAGAAGAAGGTGTGGG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88076314 393 - 180491593 ggactttgggg-----------aagggtgggaagggggtgagggataataaaaggctacaaattgggttcagtgtatactgctcgggtgatgggcacaccaaaatctcacaagtcaccactgaagaacttacttatgtaaccaaatacgacttattcccccaaaacctatggaaatt--aaaaaaAATAAAATTAGAGATGATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAA-ATCTCATGCATCAGAAAAAATTTAAGAGCAAATTATCTAATGATTTTGGGATCTCTCTCTCCTCATTTTAATGGAATACatatttacattaaaattaaaatttttaaagtc-----aaaaaaaaaaaaGAAAGAAAGGTATGAAGGGAGATGGAGAGAAGAGGGTATGGG i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87927951 391 - 181584905 ggactttgggg-----------aagggtgggaagggggtgagggataataaaaggctacaaattgggttcagtgtatactgctcgggtgatgggcacaccaaaatctcacaagtcaccactgaagaacttatttatgtaaccaaatacgacttattcccccaaaacctatggaaatt--aaaaaaAATAAAATTAGAGATGATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAA-AACTCATGCATCAGAAAAAATTTAAGAGCAAATTATCTAATGATTTTGGGATCTCTCTCTCCTCATTTTAATGGAATACATATTTACATTAAAATC---TCTTTTAAAGTC----AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGTATGAAGGGAGATGGAGAGAAGAGGGTATGGG i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85173761 395 - 174439528 GGACTttgggg-----------aagggtgggaagggggtgagggataataAAAGGccacaaattgggttcagtgtatactgctcgggtgatgggcacaccaaaatctcacaagtcaccactgaagaacttacttatgtaaccaaatacgacttgttcccccaaaacctatggaaatt--aaaaaaaataaaattagagatgataTGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAA-AACTCATGCATCAGAAAAAATTTAAGAGCAAATTATCTAATGATTCTGGGATCTCTCTCTCCTCATTTTAATGGaatacatatttacattaaaatc---tcttttaaagtcaaaaaaaaaaaaaaaaagaaagaaagggatgaagggagatggagagaagagggtatggg i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1889185 391 - 91010382 ggactttgggg-----------aagggtgggaagggggtgcgggataataaaaggctacaaattgggttcagtgtatattgctcaggtgatgggcacaccaaaatctcacaagtcaccactgaagaacttacttatgtaaccaaatacgacttgttcccccaaaacctatggaaattaaaaaaAAAATAAAATTAGAGATGATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAA-AACTCATGCATCAGAAAAAAATTAAGAGCAAATTATCTAATGATTCTGAGATCTCTCTCTCCTCATTTTAATGGAATACATATTTACATTAAAATC---TCTTTTAAAGTC------aaaaaaaaaaaaaaagaaaGGGATGAAGGGAGATGGAGAGAAGAGGGTATGGG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112527215 393 + 204313951 ggactttgagg--acgaggggaaggggtggaaaggggatgagggat----aaaggctacaaattgggatcagtatatactgcttgggtaatgggggtaccaaaatctcacaggtcaccactaaagaacttacttatgtaaccacacacgacttgtttccccaaaacctatgaaaatcgaaagaaaAATACAATTAGAGATTATATGCTTTCATCCATCTCTTAGGGAATAGGGTCACAAAACAGGTCTTGTTTCAGAAAAAAATTAAGAGCACATGATCTAATGATTCTGGAATCTCTCTCCTCTCATTTTAATGAAATACATATTTACATTAAAATC---TTTTTTAAAGTA---------aaaaaaaaaaaaaggagggaagaagggaggtggagagaagagggtac-ag i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14308507 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76446006 1137 + 120421639 I a score=27215.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 28699 13 + 101241 GACAGACTAGG--TG s panTro4.chr5 20126995 13 + 182651097 gacagactagg--tg i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88069444 13 - 183952662 GACAGACTAGG--TG i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53795768 13 - 163208435 GACAGACTATG--TG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88076707 12 - 180491593 GACAGACTGGG---G i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87928342 12 - 181584905 GACAGACTGGG---G i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85174156 12 - 174439528 gacagactggg---g i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1889576 12 - 91010382 GACAGACTAGG---G i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112527608 13 + 204313951 gacagacgaaa--gg i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76447143 15 + 120421639 GACAGATCAGAGAGG i mm10.chr13 I 1137 C 0 e canFam3.chr3 14308507 0 + 91889043 C a score=913834.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 28712 265 + 101241 GGAGGGAA-------TGGAGAGGGAAATGTCCTTAGACACAAAG--G-------AAAACCCA------------GAACG-GAGCAAGA-AGATGTAAAGGAGAGAG-------------ATGAAACCCTGAGGAAAGACGGGAAGGCAGCAGCAAGCACTGTAACCTCTCAGTGGAATGTAAAGTGGAAGGGGAAGAGTAAAATGTTCTTTCCCACTTGAACTTGGGACATTGACCA-TTCTTGGAATCTTAAGGCCTACATAATAGTATAG-----------GAC-AATG-GATATATAT-TCTTTATTTTCATTAT--------TCATT s panTro4.chr5 20127008 265 + 182651097 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GGAGGGAA-------TGGAGAGGGGAATGCCCTTAGACACAAAG--G-------AAAACCTG------------GAACA-GAGCAAGA-AGATGTAAAGGAGAGAG-------------ATGAAACCCTGAGGAAAGACGGGAAGGCAGCAGCCAGCACTGTAAAATCTCAGTGGAATGTAAAGTGGAAGGGGAAGAGTAAAATATTCTTTCCCACTTGAACTTGGGACATTGACCA-TTCTTGGAATCTTAAGGCCTAAATAATAGTATAG-----------GAC-AATG-GATATATAT-TCTTTATTTTCATTAT--------TCATT i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88076719 265 - 180491593 GGAGGAAA-------TGAAGAGGAGAATGCCCTTAGACACAAAG--G-------AAAACCCA------------GAACG-GAGCAAAA-AGATGTAAAGGGGAGAG-------------ATGAAACCCTGAGGAAAGATGGGAAGGCAGCGGCAAGCACTGTAACCTCTCAGTGGAATGTGAAGTGGAAGGGGAAGAGTAAAATGTTCTTTCCCACTGGAACTTGGGACATGGACCA-TTCTTGGAATCTTAAGGCCTAAATAATAGTCTAG-----------GAC-AATG-GATATATAT-TCTTTATTTTCATTAT--------TCATT i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87928354 265 - 181584905 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GGAGGAAA-------TGAAGAGGGGAATGCCCTTAGACACAAAG--G-------AAAACACA------------GAACA-GAGCAAAA-AGATGTAAAGGGGAGAG-------------ATGAAACCCTGAGGAAAGACGGGAAGGCAGCGGCAAGCACTGTAACCTCTCAGTGGAATGTGAAGTGGAAGGGGAAGAGTAAAATGTTCTTTCCCACTGGAACTTGGGACATGGACCA-TTCTTGGAATCTTAAGGCCTAAATAATAGTCTAG-----------GAC-AATG-GATATATAT-TCTTTATTTTCATTAT--------TCATT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112527621 273 + 204313951 gaagggaa-------tggagagaggaATGCTCTCAGATACAAAG--GGAAACATGAAACCCA------------GAACG-GAGCAAGG-AGATGTGAAGGATAGAG-------------ATGAAACTCTGCGGAAAGATGGTAAGGCAGCAGCAAGCACTGTAACTGCTCAGTGGAATGTAAAGTGGAAGACGAAGGGTAAAGTGTTCTTTCCCACTTGAACGTGGGACACTGACCA-TTCTTGGACTCTTAAGGCCTAATTAATAGTATCG-----------AAT-GATGTGATATATAT-TCTTTATTTTCATTAT--------TCATT i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76447158 286 + 120421639 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TGCTCCTGGTTTG-GGAAGGGTATGCATATTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAGCTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTATGTTGCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAGATGTCCAATTTATTATGAAAA----TGTTAAGAGTGAAATCAGCTG----AATTATTCTAACACCTCTAAGGCCTATATTGCTGACACCTGTGTCAGGTCATGAATAA-ATGATTTTTTAACTGCCATGTTTTT-----------------------------------------AGAAGATTC i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53796046 259 - 163208435 TGCTCCTGGTTTG-GGAAGGGTATGCATATTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAGCTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTGTGTTCCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAGATGTCCAATTTATTATGAAAA----TGTTAAGAGGGAAATCAGCTG----AATTATTCTAACATCTCTGAGGCCTATACTGCTGACACCTGTGTCAGGTAATGAATAA-ACGATTTTTTAACTGCCATGTTTTT-----------------------------------------AGAAGATTC i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88076984 259 - 180491593 TGCTTCTGGTTTG-GGAAGCGTGTGCATATTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAACTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTATGTTCCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAAATGTCCAATTTATTATGAAAA----TGTTAAGAGGGGAATCAGCTG----AATTATTCTAACATCTCTAAGGCCTATACTGCTGACACCTGTGTCAGTCAATGAATAA-ATGATTTTTTAACTGTCATGTTTTT-----------------------------------------AGAATATTC i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87928619 259 - 181584905 TGCTTCTGGTTTG-GGAAGCGTGTGCATATTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAACTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTATGTTCCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAAATGTCCAATTTATTATGAAAA----TGTTAAGAGGGGAATCAGCTG----AATTATTCTAACATCTCTAAGGCCTATACTGCTGACACCTGTGTCAGTCAATGAATAA-ATGATTTTTTAACTGTCATGTTTTT-----------------------------------------AGAATATTC i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85174433 259 - 174439528 TGCTTCTGGTTTG-GGAAGAGTGTGCATATTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAACTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTATGTTCCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAGATGTCcaatttattatgaaaa----tgttaagaGGGGAATCAGCTG----AATTATTCTAACATCTCTAAGGCCTATACTGCTGACACCTGTGTCagtcaatgaataa-atgattttttaactgtcatgttttt-----------------------------------------agaatattc i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1889853 259 - 91010382 TGCTTCTGGTTTG-GGAAGAGTATGCATTTTTGTTAGCATCTAATCTCTTTTGGAACTGGTATTGTAAAGTTCCTTGTATGTTCCCATAGCCTGGGTCAGAAGCCATTACT--GTCTGGAGTTGGGAGATGTCCAATTTATTATGAAAA----TGTTAAGAGGGGAATCAGCTG----AATTATTCTAACATCTCTAAGGCCTATACTGCTGACACGTGTGTCAGTCAATGAATAA-ATGATTTTTTAACTGTCATGTTTTT-----------------------------------------AGAATATTC i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112527894 258 + 204313951 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chlSab2.chr4 1899073 205 - 91010382 ATAAAAGAGTTAATTTATGTATAATATGTTTAACAAACATTTAAACATCAAAGAAAGTAAACTTTTAGTTTTTCAAATAAAGA-----AATATCTT--AATT--------------------------------GCTG----------------------TTCACAGATGTCAAGCAAATATTGAATTGTTTCAA-AATGTTATCCCTTTAGATAGAATAAAGGTTTTCTCATTTGTGTAT-------TTTTTGTTTTGAATTCTTTAGGTATT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112536709 214 + 204313951 ATAAAAGAGTTAATTTATTTATAATATGTTTAACAAACATTTCAACATCAAAGAAAGCAAACTTTTAGTTTTTCAAATAAAGA-----AAAATCTTAAAATT--------------------------------CGTG----------------------TTCATAAACATTAAGCAAATATCGAATTATTTCAA-AATGTTATCCCTTTAGATAGAATAAAGATTTTTGGGTTTATGTATTTTTTTGTTTTTGTTTTGAATTCTTTAGGTATT i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14320504 257 + 91889043 ATCAAAGAGTTAACCTATTGGTGACTTGTTT-----CCATTC--AGATCAAAGAAGGTAGATTCTTGGTTTATCAAATTGAGAGGCatattatttt--aattatattaataagctagtatattaaatatattaatCTGAAAGTTATTGGAAATGTTTAATTTCAAAGACATCAAGAAAATATTGAATTGTTCCAATAATGTTATCCCTTCAGGTAGTGTAAAAGTTTTTGTGCTTTT-TGT-------TTTTGCTTTTTAATTCTTTAGGTAtt i canFam3.chr3 C 0 I 1135 e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I a score=194581.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 38589 65 + 101241 AAAAGTGTGTAGAGGCTAATGTTAGTCAAAGTGTCTGTGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA s panTro4.chr5 20136882 65 + 182651097 AAAAGTGTGTAGAGGCTCATGTTAGTCAAAGTGTCTGTGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88079302 65 - 183952662 AAAAGTGTGTACAGGCTAATGTTAGTCAAACTGTCTGTGTTTAGAACTCTCTCCCACAAACTAGA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53807237 65 - 163208435 AAAAGTGTGTACAGGCTAATGTTAGTCAAAGTGTCTGCGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88086411 65 - 180491593 AAAGGTGTGTACAGGCTAATGTTAGTCAAAGTGTCTGTGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87938049 65 - 181584905 AAAGGTGTGTACAGGCTAATGTTAGTCAAAGTGTCTGTGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85183889 65 - 174439528 AAAGGTGTGTACAGGCTAATGTTAGTCAAAGTGTCTGTGTTTAGAACTCCCTCCCACAAACTAGA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1899278 65 - 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i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88080185 5693 - 183952662 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s panTro4.chr5 20143466 2271 + 182651097 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i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53813842 2273 - 163208435 cagcactttgggaggccaagatgggcagattacctgaggtcaggaattcgagaacagcctcgccaacctggtgaaacccgtctctactaaaaatacaaaaactagccaggcgtggtggcacaagcctgtaatcccagctactcgggaggttgaggcaggagaattgcttgatcctgggagatggaggttgcagtgagtcaacatcatgccactgtacttcagcctggccgacagagcaagactctgtctcaaataaataaataaatgaa----agtggagggatgaagttaaggtgtagagcttttatcagttttctttttacttttttatgcaaacagtattaggttgttatcaacttaaaatgatagattataagatagtatttgcaagccttatgctaacctcacataaaaaaatacaatagatatgcaaaacataagaagcaagaaattaaaccatattaccagagaaaaccaccttcactaaatagaggacaggaagaaaggaaaa----aggaaaagaccacaaaacaaccagaaaacaaataacaaaatggaaggagtaagtctttatttatcgataataacattaatgcaaatggactaaactctccaatcaaaagacatagaatggctcaatggattaaaaaaaaccaagacccagtgatctgctgcctgcaataaatgcactttacttgtaaagataaatatagactgaaagtaaggggatggaaaaagacattccgtgccaatggaaaccaaaaaagagcaggattagcaatacttagatcagaaaaaatagaattcaagacaaaacattaagaagagacaaagtaaggtcactgtataatgataaaggggtcaattcagcaggaggatatgattattgtaaatatatatgcatccaacactggggcacccagatacataaagcaaatattattagagctaaagagaaagatagattccaatacaataatagctggagacttcaacaccccactttcagcattggacagattttctagagagaaaatcaaccaagaaacattggacttaatctgcactatagatcaaatgaatctaatagatatttacagaacatttcatccaacagctacagaaaacacattcttttcttcagtacatggatcgttctcaaggatggatca-tatgttaggtcacaaaacaagtcttagaacattcaaaaacttgaaataatatcaagcatgttctctgaccacaatggaataaactagaaatcaacaacaagaggaattttggaaactatacaaacacatggaaattaaacaatatgctcctgaatgaccagtgggtcaatgaagaaattaaggaggaaattgaaaaatttctttaaacaaatgatataatagaaacacaacataccaaaacctatgggacacagtgaaaacaatgcagagagggcagctgatagctctaagtgtctacatcaaaaaagaagaaaaacttcaaataaataacctaaagatgcattttaaggaattagagaagcaagaggaaatttgaacccaaaaattagtagaagaaaaagaaataataaaaatcaaagcagaaataaaatgaatttgaaatgaagaaattaatacaaaagatcaataaaataaaagttggttttttaaaaagacgaaaacaatttgtaaaactttagccagactagtaagaaaaaaga---aagatccaaaaagataaaattagagttgaaaaagcagacattacaactgatactgcagaaattgaaaggatcattagtggctactgtgagcaactatatgccagtaaattggaaaatctagaagaaatgagtaaatttctagatacatacaaccttccaagattgaaccatgaagaaatccaaaatatgaacagaccaataacaagtagtgagatcaaagctgtaataaaaagcctgctatcaacaataagcccaggacccgaaggcttcactgctgaatctaccaaatatATATTTAAAtttttttatttccataggttattggggaacaggttgtgattggttacatgagtaagttgtttagtggtgatttgtgagattttggtgcacccatcactcaagcagtatTGAAGtggattgaagaattaatattgctaaaatgtccatattacttaaagcaatagacaagtttaatgcaattcctatccagataccaaGTGTGcaagtctcacccaggttgctgtgaacgccattaattcattcctttctatggatgagtagtattccat i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I e calJac3.chr2 112537767 3709 + 204313951 I e chlSab2.chr4 1900159 6162 - 91010382 I e papAnu2.chr6 85184769 6033 - 174439528 I e macFas5.chr6 87938929 6046 - 181584905 I e rheMac3.chr6 88087291 6792 - 180491593 I e ponAbe2.chr5 88085878 7912 - 183952662 I a score=38451.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 47443 446 + 101241 tatatatatataatgttttatatatTACATAATATTTTTATATataatatttcatatatattttatatatat-------------------atcattttctttatccactcattaaatgatgggcttttgattggttccacatttttgcaattgagaattgtgatgctataaacatgcatgtgtaggtatctttttcgtataattacttcttttacactgcactcaatttgtagtcttttatccctca----------------------------------------------cccctttccaccctttcctcctgagtccccaaagtccattgcatcattcttatgcctttgcatcctcatagcttagctcccacatataagtgagaacatatgatgtttggttttccattcctgagttacttcacttagaataatagtctccagtctcacccaggttgctgtgaatgccattaattcattcctttctatggatgagtagtattccatt s panTro4.chr5 20145737 511 + 182651097 tttatatatataatgttttatatattacataatatttttatatataatatttcatatatattttatatatatcatattttatattatatatatcattttctttatccactcattaaatgatgggcttttgattggttccacatttttgcaattgagaattgtgatgctataaacatgcatgtgtaagtatctttttcgtataattacttcttttacactgcactcaatttgtagtcttttatccctcaATTACTTcagttacacggcactcaatttgtagtcttttatccctcacccctttccaccctttcctcctgagtccccaaagtccattgcatcattcttatgcctttgcatcctcatagcttagctcccacatatgagtgagaacatatgatgtttggttttccattcctgagttacttcacttagaataataggctccagtctcacccaggttgctgtgaatgccattaattcattcctttctatggatgagtagtattccatt i panTro4.chr5 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I e calJac3.chr2 112537767 3709 + 204313951 I e chlSab2.chr4 1900159 6162 - 91010382 I e papAnu2.chr6 85184769 6033 - 174439528 I e macFas5.chr6 87938929 6046 - 181584905 I e rheMac3.chr6 88087291 6792 - 180491593 I e nomLeu3.chr2 53816115 0 - 163208435 C e ponAbe2.chr5 88085878 7912 - 183952662 I a score=214449.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 47889 829 + 101241 atttat-atgtatataaaatatatattttatctaatatatatatatttaattttctttatccactcattaaatgatgggcttttgattggttccacattttttgcaattgagaattgcggtgctataaacatgcatgtgcaagtatctttttcgtataattacttcttttcctctgggtagacacctagtagtgggactgctggatcaaatggtagttctacttttagttctttaaggaatctccatacttttccacagtggctgtactagtttacattcccaccagtagtgtaa---------ctgttcaccgcattcacgccaacatcttttattttttt-aattttttgattatggccattcttgtaagagtaaagtggtattgcattgtggttttgatttgcatttctctaatcattagtgatgttgagcattttttatatatttgtggctcatttgtatatcttctcttaagaattgtcaattcatgttcttagcccactttttgatgcgattgtttgctttttcttgataatttgagttcattgtagattctagatattagtcctttgtcagatgtatagtgaatctaccaaatatttaaagaagaactaataccaatcttattcaagctattttgaaaaaggaagaggagggaatacatccaaactcattatatgaggccagtattacctgataccaaaatcagacaaaggcacataaaaaa-tcactacaggccaatatatttgatgaaaattgacataaaaatcttcaagaaaatattagcaaactgaattcaacaatacattaaaaagatcattcatcatgaccaagtgag s panTro4.chr5 20146248 840 + 182651097 atttat-gtgtatataaaatatatattttatctaatatatatatatttaattttctttatccactcattaaatgatgggcttttgattggttccacattttttgcaattgagaattgcgatgctataaacatgcatgtgcaggtatctttttcgtataattacttcttttcctctgggtagacgcctagtagtgggactgctggatcaaatggtagttctacttttagttctttaaggaatctccatacttttccacagtggctgtactagtttacattcccaccagtagtgtagaagtgttccctgttcaccgcattcacgccaacatctttttttttttttaattttttgattatggccattcttgtaagagtaaagtggtattgcattgtggttttgatttgcatttccctaatcattagtgatgttgagcattttttatatatttgttgctcatttgtatatcttcttttaagaattgtcaattcatgttcttagcccactttttgttgcgattgtttgctttttcttggtaatttgagttcattgtagattctagatattagtcctttgtcagaggtatagtgaatctaccaaatatttaaagaagaactaataccaatcttattcaagctattttgaaaaaggaagaggagggaatacatccaaactcattatatgaggccagtattacctgataccaaaatcagacaaaggcacataaaaaaatcactacaggccaatatatttgatgaaaattgacataaaaatcttcaagaaaatattagcaaactgaattcaacaatacattaaaaagatcattcatcatgaccaagtgag i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53816115 837 - 163208435 atttataaggtatataaaatatatattttatctaatatatata----taattttctttatccactcattatatgatgggcttttggttggttccacattttttgcaattgagaattgtggtgctgtaaacatgcatgtacaagtatctttttcgtataattacttcttttcctctgggtagacacctagtagtgggattgctggatcaaatggtagttctacttttagttctttaaggaatctccatacttttctatagtggctgtactagtttacattcccaccagtagtgtagaagtgttccctgttcaccgcattcatgccaacatctatttttttggggggttttattattatgaccattcttgtaggactaaggtggtattgcattgtggttttgatttgcatttccctaatcattagtgatgttgagcattttttatatatttgttgctcgtttgtatatcttcttttaagaattgtcaattcatattcttagcccactttttgatgcgattgtttgctttttcttgataatttgagttcattgtagattctagatattagttctttgtcagatgtatagTAAAtctaccaaatatttaaagaagaactaataccaatcttattcaagctattttggaaaaggaagaggagggaatacatccagactcattatatgagtccagtattacctgataccaaaatcagacaaaggcacataaaaaaatcactacaggccaatgtatttgatgaaaatttatataaaaatcttcaagaaaatattagcaaactgaattcaacaatacattaaaaagatcattcatcatgatcaagtgag i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I e calJac3.chr2 112537767 3709 + 204313951 I e chlSab2.chr4 1900159 6162 - 91010382 I e papAnu2.chr6 85184769 6033 - 174439528 I e macFas5.chr6 87938929 6046 - 181584905 I e rheMac3.chr6 88087291 6792 - 180491593 I e ponAbe2.chr5 88085878 7912 - 183952662 I a score=1446.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 48718 3 + 101241 att s panTro4.chr5 20147088 3 + 182651097 att i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53816952 3 - 163208435 att i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87944975 3 - 181584905 ata i macFas5.chr6 I 6046 C 0 s papAnu2.chr6 85190802 3 - 174439528 ata i papAnu2.chr6 I 6033 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I e calJac3.chr2 112537767 3709 + 204313951 I e chlSab2.chr4 1900159 6162 - 91010382 I e rheMac3.chr6 88087291 6792 - 180491593 I e ponAbe2.chr5 88085878 7912 - 183952662 I a score=443492.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 48721 346 + 101241 tatcccagggatgtgaggatggttctacattcacaaatcagtcaatgtgataaatcaaaacaacagaatgaagaacaaaa---accatatgatcatttcaatgaatgctgaaaaagcatttgataaaactcaacatcccttcatgataaaatccccaaaaagtaactgggtatagaaggaacatacctcaacacaatcaaagacatatatgacagacccatagctggcatcatattgaatggggaaaagctgaaagcctttcctctaagatcttgaacatgacaaggatacccactttcaccaccgttattcaacatagtactggaagtcttagctagagaaatcagac s panTro4.chr5 20147091 346 + 182651097 tatcccagggatgtgaggatggttctacattcacaaatcagtcaatgtgatacatcagaacaacagaatgaagaacaaaa---accatatgatcatgtcaatgaatgctgaaaaagcatttgataaaactcaacatctcttcatgataaaaaccccaaaaagtaactgggtatagaaggaacatacctcaacacaatcaaagacatatatgacagacccatagctggcatcatattgaatggggaaaagctgaaagcctttcctctaagatcttgaacatgacaaggatacccactttcaccaccgttattcaacatagtactggaagtcttagctagagaaatcagat i panTro4.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53816955 346 - 163208435 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tatccCAGAGGTGTGAAGATGGTTCTACATTCACACATCAGTCAATGTGATACATCAGAACAACATAATGAAATACAAAAAccaccatatgatcatttcaatgaatgctgaaaaagcatttgataaaactcaacatcgcttcatgataaaaaccccaaaaagtaactgggtatagaaggaacatacctcaacaaaATCAAAGACGTGTATGACAGACCTATAGCTGgcatcatattgaatggggaaaagctgaaagcctttcctgtaagatcttgaacatgacaaggatgccctctttcaccaccgGTATTCTACATAGTGCTGGAAGGCTTAGCTAGATAAATCAGAT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1906321 349 - 91010382 tatcccagaggtgtgaagatggttctacattcacacatcagtcaatgtgatacatcagaacaacataatgaaatacaaaaaccaccatatgatcatttcaatgaatgctgaaaaagcatttgataaaactcaacatcgcttcatgataaaaaccccaaaaagtaactgggtatagaagggacatacctcaacaaaatcaaagacgtgtatgagagacctatagctggcatcatattgaatggggaaaagctgaaagcctttcatgtaagatcttgaacatgacaagaatgccctctttcaccaccagtattcaacatagtactggaaggcttagctagataaatcagat i chlSab2.chr4 I 6162 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I e calJac3.chr2 112537767 3709 + 204313951 I e rheMac3.chr6 88087291 6792 - 180491593 I e ponAbe2.chr5 88085878 7912 - 183952662 I a 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gagaaggaaataagggcc-tccaaact-gaaaggaag-aatcaaattatcc-tgttggcagatgatgtgatcttatatttcaaaaacct--aagactcacc-aaaaaactactagaacagataagcaaattcagtaaag-tgtaagatacaaaatcaacacacaaaaatcagtagcatttccatgtgccaacagtgaacaatctgaaaagaaaatcaagaaagtaatcttatttacagtagttac-----aaataaaataaaatacgttaggaattaaccaaagaagtgaaagatctctataatgacaactaaaatatattgatacaagaaattgaagaggacacacaaaaactggaaagatactgcatgttcatggattgaagaattaatattg i ponAbe2.chr5 I 7912 C 0 s nomLeu3.chr2 53817301 390 - 163208435 gagaaagaaataaaggccatccaaacaggaaaggaagaaatcaaattatccttgtttgcagatgatgtgatcttatatttctaaaaacctaaagactcaccaaaaaaactactagaacagataagcaaattcagtaaagttgtaagatacaaaatcgacatacaaaaatcagtagcatttccatttgccaacagtgaacaatctgaaaaggaaatcaagaaagtaatcttatttacagtagttac-----aaataaaataaaatatattaggaattaaccaaagaagtgaaagatctctataatgaaaactaaaatatattgatataagaaattgaagaggacacacaaaaactggaaagatactccatgttcatggattgaagaattaatattg i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87945327 390 - 181584905 gagtaagaaataaaggccatccaaactggaaaggaagaaatcaaattatccttgtttgcagatgatgtgatcttatatttcaaaaaacctaaagactccaccaaaaaactactagaacagataagcaaattcagtaaagttgtaagatacaaaattaacatacaaaaatcagtagcatttccatgtgccaacagtgaacagtctgaaaaagaaatcaagaaaataatcttatttacagtagttac-----aaataaaataaaatatattaggaattaaccaaagaagtgaaagatctctatagtgaaaactaaaaaatattgatataagaaattgaagaggacacacaaaaaatggaaagatacgccatgttcatagattgaagaattaatattg i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85191154 390 - 174439528 GAGTAAGAAATAAAGgccatccaaactggaaaggaagaaatcaaattatccttgtttgcagatgatgtgatcttatatttcaaaaaacctaaagactccaccaaaaaactactagaacagataagcaaattcagtaaagttgtaagatacaaaattaacatacaaaaatcagtagcatttccatgTGCCAACAGTGAacagtctgaaaaagaaatcaagaaaataatcttatttacagtagttac-----aaataaaataaaatatattaggaattaaccaaagaagtgaaagatctctatagtgaaaactaaaaaatattgatataagaaattgaagaggacacacaaaaaatggaaagatacgccatgttcatagattgaagaattaatattg i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1906670 395 - 91010382 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panTro4.chr5 20147825 342 + 182651097 ctaaaatgtccatattacctaaagcaatagacaagtttaatgcaatccctatccaaataccaatgatttggatctaccaatctatttcttattcacagaaatagaaaaaacaattctaaaatttatataaaaccacaaaacatcctgaatagccaaagctatcctaagcaaaaagaacaaaactggaggaatcacattacctgactttaaattatactacaaagctatagtaaccaaaatggcatgatactggcataaaaacaaacacataaatcagtggaacagaatagataacccagagataaatccatacatatacagtgaacttaattttgacagagg i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88094172 321 - 183952662 ctaaagtgtccatattacctaaagcaatagacaagtttaatgcaatccctatccaaataccaacga--------------------cattattcacagaaatagaaaaaa-aattctaaaatttatataaaaccacaaaatatcctgaatagccaaagctatcctaagcaaaaagaacaaaactggaggaatcacattacctgactttaaattatactacaaagctatagtaaccaaaatggcatggtactggcataaaaacaaacacataaatcagtggaacagaatagagaacccagagataaatccatacatatacagtgaacttatttttgacagagg i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53817691 322 - 163208435 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i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112541476 1742 + 204313951 tgcctggaacatacattgggaaaaggaccatctcttcaataaacagtgctgggaaaactggatatccatatgcaagaaaatgaaactagaccctatctctcactgtataaaaaaatcaaataaaaatggattaaagacttaagtccaagacctcaaactgtgaaaatactaaaagagaacattggggaaac-tttccaggacatccgactaggtaaagatttcttaagcagtacctcacaaacacaggcaaccaaagcaaaaatggacaaatgggatcacatcaagtgaaaaagcttctgaacagcaaaggaaacaatgaacaaaatgaagagacaacctacagaatgggagaaaacatttgcaaactatccatctgacaagtgattaataaccagaatatata-----ctcaaactactccataggaaaaaaaa---cataatttgaatttaaaaag---------atcttaatagacatttctcaaaagaagacatacagatggaaagt--gtgctcaacatcattgatcatcacagaaatgcaaatcaaaactacagcgagacaccatctcacttcagttagaatggcttttatcccaaagtcaggcaattgcaaatgctggcgatg-atatggagaaaagggaattctcatacactcttgatggtagtgtaaa--------------------------------tcagtaaaatcactatggaaa--agtttggtggtttctcaaaaaggtgagaatagagctacgatatgattcagcaatcccactgctgagtatataccccc-caaaaaggagagcagtatattgaagagatagctgcactcccatgttaactgcagcactattcaaagtagccaagattgggaagcaatc-tcagggtctattaactga-tgaatggataaagaaaatatggtgcatatacagagtggagtactaatcagccatgaaaaagaatgagatcctgtcatttgcaacaatatgaatggaactgcctgatttatttgatgaaaattacctcataagccaaactcaaccttagatagtttcattttgttaaatgaaataagctgggcacagaagaacacacttcatatcttctaatttatttgtgggagctaaaaatgaaaataattta---catagagaatagaaggttggttaccagaggctgggaagagtagttggcgagtgggcagggtggaagtggggatggttaatgggtacaaaaaa----tagaaagaatgaataagacccagtatttgctagcacaacagggtgactacagtaaaataatttgtgtacatttaaaaataact-aaaagagtatcattgaattgtttgtaacacaaaggataaatgcttggtatgaagactatcctgtttatcctgatatgattattattcattgcatgcctgtatcaaaatattttatgtaacccataaatatagacacctactatctacctacaaaaattaacaaTAAAATAATAAAATAAAATTGAGTGGAACCAG----CCATGACTTAAGATACAGATGGCAAAGGAGGATCAGGGGAATGACTGTCTGCCCTTCCTCCTCTTTCTACTCCATCATC-CTATTTCAGTTCTTTCCATCTTGGACCCAAATGACTCATAGATCCCTCTGCCGACTCCTTAGCTAATAGTTTGTTCCATTGTTTTCATATACACCAAAACTCCGCTATATGTGACC---TTGTATTCTCAGCAGTCCAAAATGTAAATGTCTTATTTAAAATTTAGAATAAATATTGGACTCAGTTGCTGTC i calJac3.chr2 I 3709 I 49 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 235 + 120421639 I a score=91396.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 51494 40 + 101241 C-AAAAATTCTAGGGTCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA s panTro4.chr5 20149865 40 + 182651097 C-AAAAATTCTAGGGTCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88096229 41 - 183952662 CAAAAAATTCTAGGTTCAAATGAAAAATATCTATACAAAAA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53819715 40 - 163208435 C-AAAAATTCTAGGGTCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88096117 40 - 180491593 C-AAAAATTCTAGAAGCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87947755 40 - 181584905 C-AAAAATTCTAGAAGCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85193581 40 - 174439528 C-AAAAATTctagaagcaaatgaaaaagatctatacaaaaa i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1909103 40 - 91010382 C-AAAAATTCTAGAAGCAAATGAAAAAGATCTATACAAAAA i chlSab2.chr4 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14322655 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76462437 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---TTTTTTTATAACTGTTTCTTTGCGAAGTA-----------------------------------------------CACGGTAAA--GAGGGAGCTGTATTGGATACTTAAATTTGATTGTTA-CATAGAATTGTTGGAGTAGCATGAATCAACCTTCATTA-AATCCAAGTT i mm10.chr13 I 235 C 0 s canFam3.chr3 14322659 111 + 91889043 GTATTTCTTT---A-------------AAAAG-----------------------------------------------TAGAATGGTTGGAGAGAACTGTGTCAGATACTCAGATCTGATTTTTA-TATAGCATTA-TGGAGAAGCATGAAGGAATCCAAATTATACTCTAAGAG i canFam3.chr3 C 0 C 0 e calJac3.chr2 112543218 49 + 204313951 I a score=105431.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 51649 36 + 101241 AAACTCTAATCCTTAAAGTCTGAAAAAGAGTAGAAA------------------------------------------- s panTro4.chr5 20150020 36 + 182651097 AAACTCTAATCCTTAAAGTCTGAAAAAGAGTAGAAA------------------------------------------- i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88096385 36 - 183952662 AAACTCTAATCCTTAAAGTCTGAAAAAGAGTAGAAA------------------------------------------- i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53819870 36 - 163208435 AAACTCTAATCCTTAAAGTCTGAAAAAGAGTAGAAA------------------------------------------- i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88096316 36 - 180491593 AAATTCTAATCCTTAAGGTCTGAAACAAAGTAAAAA------------------------------------------- i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87947909 36 - 181584905 AAATTCTAATCCTTAAGGTCTGAAACAAAGTAAAAA------------------------------------------- i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85193732 36 - 174439528 AAATTCTAATCCTTAAGGTctgaaaaaaggtaaaaa------------------------------------------- i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1909254 36 - 91010382 AAATTCTAATCCTTAAGGTCTGAAAAAAAGTAAAAA------------------------------------------- i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112543267 30 + 204313951 AAGCTCTAATCCTTAAGGTCTGAAAAAGAA------------------------------------------------- i calJac3.chr2 I 49 C 0 s mm10.chr13 76462794 36 + 120421639 AAGCTCTACACCTTATGCTGAGAAAATGGATAGCAA------------------------------------------- i mm10.chr13 C 0 I 91 s canFam3.chr3 14322770 79 + 91889043 AAGCTCTAATTCTTAATATCTGAAAAAGAAGGAAACTCATCACTCAATGAAGCCTCCATCGACAGCTACTTAATAGGCA i canFam3.chr3 C 0 C 0 a score=216935.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 51685 72 + 101241 TAGCCCAT-------CTCG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTTATCGCCGTCCTGGAATAGG s panTro4.chr5 20150056 72 + 182651097 TAGCCCAT-------CTCA-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTTATTGCTGTCCTGGAATAGG i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88096421 70 - 183952662 TAGCCCAT-------CTCG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCT--GTTTTTAGG--------TGATTTATCACCTTCCTGGAATAGG i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53819906 72 - 163208435 TAGCCCAT-------CTCG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTTATCGCCTTCCTGGAATAGG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88096352 69 - 180491593 TATCC----------CTTG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTCATTGCCTTCCTGGAATAGG i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87947945 69 - 181584905 TATCC----------CTTG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTCATTGCCTTCCTGGAATAGG i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85193768 69 - 174439528 tatcc----------CTTG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTCATTGCCTTCCTGGAATAGG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1909290 69 - 91010382 TATCC----------CTTG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTCATTGCCTTCCTGGAATAGG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112543297 71 + 204313951 -AGCCCAT-------CTCG-----TTCGAGGCCATCCTAGAATTTTCTAAGTTTTTAGG--------TGATTTGCTGCCTTCCTGGAATAGA i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14322849 91 + 91889043 TTTCCCGTTTCTATACTCATTATCTTTCAGGCTATTTT-GAATTTTCTAAGTTTTTAGGGTAATGTATATTTCATTACCTTCCTAGAACATA i canFam3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr13 76462830 91 + 120421639 I a score=1883258.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 51757 584 + 101241 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cttttatttttatgtaCTGTTGGGAAACTTTCTTGTGCTTTCTTGACAAAAG--AAAGTTAGTTTGGCA-AACTGTTTTTTTTTTTTTTCTGATTT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s mm10.chr13 76466473 78 + 120421639 CTTTCATTTTTATCCACTGTTGAGATTATTTCTTATGCTGTTGGGACAAAGG--GAG-----------A-AATTA----GCTATTTTTCTTGATCC i mm10.chr13 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14326717 91 + 91889043 TTCTCATTTTCATGCACTGCTAAGATATTTTCTTGTGCTCT-TTGGCAAAGGGAGAAGTTAGCATAGCACAACTA----TTTTTTTTTTCTGACCT i canFam3.chr3 C 0 C 0 e calJac3.chr2 112546680 0 + 204313951 C e papAnu2.chr6 85197263 50 - 174439528 M a score=469946.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 55275 163 + 101241 CATTTTATTTT----AAAAAAATGCTTAGTGTTTTTGTAGCATCAAAGTGGCAAAAATAG---AATTTGAATTCATATTTGTAGGGTCTGTGGCAGGTCTAGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAATTGTAGGTCATTTAGGGAAATGGAGTTGACG-AAGTCAGGC s panTro4.chr5 20153642 164 + 182651097 CATTTTATTTTA---AAAAAAATGCTTAGTAGTTTTGTAGCATCAAAGTGGCAAAAACAG---AATTTGAATTCATATTTGTAGGGTCTGTGGCAGGTCTAGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAATTGTAGGTCATTTAGGGAAATGGAGTTGACG-AAGTCAGGC i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88100019 163 - 183952662 CATTTTATTTT----AAAAAAATGCTTAGTGTTTTTGTAGCATCAGAGTGGCAAAAATAG---AATTTGAATTCATATTTATAGGGTCTGTGGCATGTCTAGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAATCGTAGGTCATTTAGGGAAATGGGGTTGACG-AAGTCAGGC i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53824277 163 - 163208435 CATTTTATTTA----AAAAAAATGCTTAGTGTTTTTGTAGCATCAAAATGGCAAAAATAG---AATTTGAATTCATATTTATAGGGTCTGTGGCAGGTCTGGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAATTGTAGGTCATTTAGGGGAATGGAGTTGACA-AAGTCAGGC i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88099930 163 - 180491593 CATTTTATTCTT---TAAAAAATGCTTAGTG-TTTTGTAGCATCAAAGTGGCAAAAACAG---AATTTGAATTCATATTTATAGAGTCTGTGGCAAGTCTAGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAACTGTAGGTCATTTAGGGAAATGGCGTTGAGG-AAGTCAGGC i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87951525 163 - 181584905 CATTTTATTCTT---TAAAAAATGCTTAGTG-TTTTGTAGCATCAAAGTGGCAAAAACAG---AATTTGAATTCATATTTATAGAGTCTGTGGCAAGTCTAGAAAACAACCCT-AGCACACAAGTCAGAAACTGTAGGTCATTTAGGGAAATGGCGTTGAGG-AAGTCAGGC i macFas5.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1912882 164 - 91010382 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s panTro4.chr5 20154476 5260 + 182651097 ttttttt--aatattattgtactttaagttttagggtacatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatgctggtgcgctgcacccactaactcgtcatctagcattaggtatatctcctaatgctatccct--ccaccctcaccccaccccacaacagtccccagaatgtgatgttccccttcccgtgttcatgtgttctcattgttcagttcccatctatgagtgagaacatgcggtgtttggttttttgtccttgcgatagtttactgagaatgatgatttccgatttcatccatgtccctacaaaggacataaactcatcattttttatggctgcatagtattccatggtgtatacgtgccacgttttcttaatccagtctatcattgctggacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaatagtgccgcaataaacatacgtgtgcatgtgtctttatagcagcatgatttataatcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttgtagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagtttacagtgccaccaacagtgtaaaagtgttcctatttctccacatcctctccagcagctgttgtttcctgacttttgaatgatcgccattctaactggtgtgagatggtatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccagaaatgatgagcatcttttcatgtgtcttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatccttcacccacttgtagatggggttgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcattatagattctggatattagccctttgtcaaatgagtaggttgcaaaaattttctcccattctgtcggttgcctcttcactctgatggtggtttcttttgttgtgcagaagctctttagtttgattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatttaagtctttaatccatcttgagttaatttttgtataaggtgtaaggaagggttccagtttcagctttctacatatggctagccagttttcttagcaccatttattaaatagggaatcctttccccatttcctgtttttctcaggtttgtcaaagatcagatagttgtagacgtgtggtagtatttctgagggctctgttctgttccattggtttatatctctgttttggtaccagtaccatgctgttttggttactgtagccttgtagtatagtttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagctttgttcttttggcttaggattgacttggtgatgcgggctcttttttggttccatatgaactttaaagtagttttttccaattctgtgaagaaagtcattgggagcttgacggggatggcattgaatctataaattacctcgggcagtatggccattttcacgatattgattcttcctacccatgagcatggaatgttcttccatttgtttgtatcctcttttgtttcgttgagcagtggtttgtagttctccttgaagaggtctttcacgtcctttgtaagttggattcctaggtattttattctctttgaagcaattgtgaatgggagttccctcatgatttggctctctgtttgtctgttactggtgtataagaatgcttgtgatttttgcacattgattttatatcctgagactttgctgaagttgcttatcagcttaaggagatttggggctgagacgatggggttttctagatatacaatcatgtcatctgcaaacagggacaatttgacttcctcttttcctaattgaataccctttatttccttctcctgcctaattgccctggccagaacttccagcactatgttgaataggagtggtgagagagggcatccctgtcttgtgccacttttcaaagggaatgctaccagtatttgcccatttagtatgatattggcagtgggtttgtcatagatagctcttattattttgagatacgtcccatcaatacctaatttattgagagattttagcatgaagggtt-ttgaattttgtcaaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtggtttttgtctttggttctgtttatatgctggattacatttattgatttgcgtatattgaaccagccttgcatcccagggatgaagcccacttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaggatttttgcatcaatgttcatcaaggatattggtctaaaattctcttttttggttgtgtctctgcccggctttggtatcagtatgatgctggcctcataaaatgagttagggaggattccctctttttgtattgattggaatagtttcagaaggaatggtaccagttcctccttgtacctctggtagaattcagctgtgaatccatctggtcctggactctttttggttggtaagctgttgattattgccacaatttcagatcctgttactggtctattcagagattcaacttcctcctggtttagtcttgggagagtgtatgtgtcgaggaatttatccatttcttctagattttctagtttatttgcgtagaggtgtttgtagtattctctgatggtagtttgtatttctgtgggatcggtggtgatgtcccctttatcattttttattgcgtctatttgatttttctctctttttttctttattagtcttgctagcggtctatcaattttgttgatcctttcaaaaaaccagctcctggattcattaattttttgaagggttttttgtgtctgtatcttctttagttctcctctgattttagttatttcttgccttctgctaggttttgaatgtgtttgctcttgcttttctagttcttttaattgtgatgttaacctctagcaaactccaacagacctgcagctgagggtcctgtctgttagaaggaaaactaacaaacagaaaggacatccacaccaaaaacccatctgtacatcaccatcatcaaagaccaaaagtagataaaaccacaaagatggggaaaaaacagagcagataaaactggaaactctaaaaagtagagtgcctctcctcctccaaaggaatgcagttcctcaccagcaacagaacaaagctggacggagaatgactttgacaagttgagtgaagaaggcttcagatgatcaaactactccgagctacaggaggaaattcaaaccaaaggcagagaagttgaaaactttgaaaagaatttagacgaatgtataactagaataaccaatacagagaagtgcttaaaggagctgatggagctgaaagccaaggctcgagaactatgtgaagaatgcagaagcctcaggagccgatgtgatcaactggaagaaagggtatcagtgatggaagatgaaatgaattaaatgaagcgagaagggaagtttagagaaaaaagaataaaaagaaatgaacaaagcctccaagaattatgggactatgtgaaaagaccaaatctacgtctgattggtgtacctgaaagtgacagggagaatggaaccaagttggaaaacattctgcaggatattatccaggagaacttccccaatctagcaaggcaggccaacattcagattcaggaaatacagagaatgccacaaagatactcctcgagaagagcaactccaagacacataattgtcagattcaccaaagttgaaatgaaggaaaaaatgttaagggcagccagagagaaaggtcgggttacccacaaagggaagcccatcagactaacagcggatctctcggcagaaactctacaagccagaagagagtgggggccaatattcaacattcttaaagaaaagaattgtcaacccagaatttcatatccagccaaactaagcttcataagtgaaggagaaataaaatcctttacagacaagcaaatgctgagagattttgtcaccactaggcctgccctaaaatagctcctgaaggaagcactaaacgtggaaaggaacaaccagtaccagccacttcaaaatcatgccaaaatgtaaagaccatcgagactaggaagaaactgcatcaactaacgagcaaaataaccagctaacatcataatgacaggatcaaattcacacatagcaatattaactttaaatgtaaatggactaaatgcttcaattaaaagacacagactggcaaattggataaagagtcaagacccatcagtgtgctgtattcaggaaacccatctcttgtgcagagacacacataggctcaaaataaagggatggaggaagatctaccaagcaaatggaaaacaaaaaacggcaggggttgcaatcctagtctctgataaagcaggctttaaaccaacaaagatcaaaagagacaaagaaggccactacctaatggtaaagggatcaattcaacaagaagagctaactatcctaaatatatatgcacccaatacaggagcacccagattcataaagcaagtcctgagtgacctacaaagagacttagactcccacacaataataatgggagaccttaacaccccactgtcaacattagacagatcaacgagacagaaagttaaaaggatacccaggaattttactcaactctgcaccaagtggacctaatagacatctacagaactctccaccccaaatcaacagaatataaatttttttcagcaccacaccacacctattccaaaattgaccacatacttcgaagtaaagctctcctcctcagcaaatgtaaaagaacagaaattataacaaac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tcaaataatccagttttagaggaaatggacttttaggggaaattactctttactaaaagagtaaattgagacccggatcatggatggcattgaaggttatgctatggaatctggacttcattctgtggattatggggattctctgcaagttttt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112547582 153 + 204313951 TCAAATAATCCAGTATTAGGGGAAATGGACTTTTAGGGGAAATTACTCTTTCCTAAAAAAGGAAATTgaga-ccggatcatggacagtattgaaggttgtgctatggaatctggacttcattctgtggattatggggattctctgaaagttttt i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14327946 112 + 91889043 TCAAATAATCCATATTTTGG-----------------------------------------TAAATTGATG-CCAGACTATGCAAAGGGTTGAAGGCTGTGCTGAGGAATCTGGACTTTATTTTGTGAATATTGGGGATTCTCTGAAGGCTTTT i canFam3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr13 76467825 0 + 120421639 C a score=299822.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 61645 99 + 101241 GAGTATAGGAATAATC--TTTAAGAGCAATAACT-CTGCTAACAGTAGAAAAACTGTAGGTGTGACAGAAGGAGAGAGGGAGGAAA-AGAG-AGGGGCCAGGCA s panTro4.chr5 20160033 99 + 182651097 GAGTATAGGAATAATC--TTTAAGAACAATAACT-CTGCTACCAGTAGAAAAACTGTGGGTGTGACAGAAGGAGAGAGGGAGGAAA-AGAG-AGGGGCCAGGCA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s 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aagggaaatatttcttaggaaaatacaagtagttcagag----actatggactaagttgaga--ctattgataagaaagaatttctgagttatgtaactggtgtctcatggctgattggcc-----agggaagg--------ggaaaagaggtaaagaggaggtggcaaaactttctcccctcaatgtttcgacttagttactggaagaatagtgatgccattagccaaagtcaagaatgttggaagacaattgggggtgacacaattcccttttgatcatgctaTA--TG------AGGATTAGTGGGATGTTCTTGTGAGGAAATCAAGCTCAAG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88101116 310 - 180491593 aatggaaatatttcttaggaaaatacaagtagttcagag----accacggactaagttgaga--ctgttgataagaaagaatttctgagtaatataactggtatctcatggctgattgtcc-----agggaagg--------ggaaaagaggaaaagaggaggtggcaaaactttctcccctcaatgttttgacttagttactggaaggatagtgatgctattagccaaagtcaagaatgttggaaggcaattggggatgatacaattcccttttggtcatgttaTA--TG------AGGATTAGTGGGATCTTCTTGTGGGGAAATCAAGCTCAAG i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87952712 310 - 181584905 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ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53825780 277 - 163208435 AGTTGTGGTGGAAATAAGAGTGATAAAGGTCTG-TATATGTTGTGTCTTCATACATTT--GTGTCTTCATACATTTGAAGGAAACAC----AT--GTGGAGCAATTGCAGGAGAAGAAAGGCAA---AGATGAC--AGA--ACAG---GGACATGAgaagaaacagattaaagaaggaaggaatggtaaacagtgttggatgctagaggttagaaaagtggattga-agattgagaattctttggctttgctgattaatggatcattggtgactttcaagaAGATGATTTCTAGATA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88101426 265 - 180491593 AGTTGTGGTGGAAGTAAGAGTGATAAAGGTCTA-TATATG----------------TT--GTGTCTTCATACATTTGAAGGAAACACAT--AT--GTGGAGCAATTGCAGGAAAAGAAAGGCAAA-GAGATAAC--AGA--ACAG---Ggtcatgagaagaaacagattaaagaaggaaggaatggtaaacagtgttggatgatatagattagagaagtggattga-aaattgagaattctttggctttgctgattagtggatcattggtgactttcaagaaagtgatttcTAGATA i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87953022 265 - 181584905 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gatataattcgcatactat-acaatt--------cactcataacccccaaaagaaaccctgtacccattaccattcagtctctattac-ctccagtcccctgaaccctaggcaactactaatctatgttctgtcactattgttt--------ttctgaacatttaatataaatggaattatacagtatgtaatcttttgtgtctg---------acttagcatgatgttttcagggttcatctatgttataatgtgtattagtacttcattaatttttattgccaaataatattcc-ttatatgaatataccatattttatttattcactcattgatttatgagcatttgaattattgcca--------cttttatgaattatagtgttactatgaacatttgtgttcatttgtacatatgtttttatttctgttgggcatataaccaggagtggaattgctggatcatatggaaactctatgtttagctttttaaagaacttccagactgttttccaaagtggatatactatattatattcccaccagcagtgtatgaatatcccagtttttccacatccttgtcaacacttgttattttccattttcttaatt---gtcatgttagtgagtgtgaaatattatttcattgtggtcttgatttgcatttccctaatggataatgatgttgatcttcttttcatgtgcttattggccatgtgtttatc-t i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88104219 710 - 180491593 gatgtaattcacatactat-ac-att--------cactcataacccccaaaagaaaccctgtacccattaccactcagtctctattat-ctccagtcccctgaaccctaggcaaccgctaatctatgttctgtcactattgtttttcttttattctgaacatttaatataaatggaattatgcagtatgtaatcttatgtgtctgactttgttaacttagcatcatgttttcagggttcatctatgttataacaagtattagtacttcattaatttttattgccagataatattcc-ttatatgaatataccatgttttatttactcactcattgatttatgagcatttgaattgttgtca--------cttttatgaattatagtattactatgaacatttgtgttcatttgtacatatgtttttatttctcttggacatataaccaggagtgaaattgctggatcatatggaaactctatgtctagctttttaaagaacttccagcctattttccaaagtggatatactattttatattcccaccagcagtgtatgagtatctcagtttttacacatccttgtcaacacttgttattttccgttttcttgattgtagtcatgttagtgagtgtgaaatattctttcattgtggtcttgattttaatttccccagtggataatgatgttgatcttcttttcatgtgcttattggccatgtgtttatctt i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87955834 709 - 181584905 gatgtaattcacatactat-ac-att--------cactcataacccccaaaagaaaccctgtacccattaccactcagtctctattat-ctccagtcccctgaaccctaggcaaccgctaatctatgttctgtcactattgtttttcttttattctgaacatttaatataaatggaattatgcagtatgtaatcttatgtgtctgactttgttaacttagcatcatgttttcagggttcatctatgttataacaagtattagtacttcattaatttttgttgccagataatattcc-ttatatgaatataccatgttttatttactcactcattgatttatgagcatttgaattgttgtca--------cttttatgaattacagtattactatgaacatttgtgttcatttgtacatatgtttttatttctcttggacatataaccaggagtgaaattgctggatcatatggaaactctatgtctagctttttaaagaacttccagcctattttccaaagtggatatactattttatattcccaccagcagtgtatgagtatctcagtttttacacatccttgccaacacttgttattttccgttttcttgattgtagtcatgttagtgagtgtgaaatattctttcattgtggtcttgattttaatttccccagtggataatgatgttgatcttcttttcatgtgcttattggccatgtgtttatc-t i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85201490 705 - 174439528 gatataattcacatactat-ac-atT--------CACTCAtaacccccaaaagaaaccctgtacccattaccACTCAGTCTCTATTAT-CTCCAGTCCCCTGAACCCTAGGCAACCGCTAATCTATGTTCTGtcactattgtttttcttttattctgaacatttaatataaatggaattatgcagTATGTAATCTTATGTGTCTGACTTTgttaacttagcataatgttttcagggttcatctatGTTATAACAAGTATTAgtacttcattaatttttattgccAGATAATATTCC-TTATATGAATATACCATGTTTTATTT----ACTCATTGATTTATGAGCATTTGAATTGTTGTCA--------CTTTTATGAATTATAGTattactatgaacatttgtgttcatttgtacatatgtttttatttctcttggacaTATAaccaggagtgaaattgctggatcatatggaaaCTCTATGTCTAGCTTTTTAAAGAACTTCCAGcctattttccaaagtggatatactattttatattcccaccagcagtgtatgagtatCTCAGTTTTtacacatccttgtcaacacttgttattttccgtTTTCTTGATTGTAGTCATGTTAGTGAGTGGGAAATATTCtttcattgtggtcttgattttaATTTCCCCAGTGGATAATGATGTTGAtcttcttttcatgtgcttattggccatgtgTTTATc-t i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1916949 709 - 91010382 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ttcttggagaaatgtctgttcatatcctttgccaatttttaaattggctCATTAGTTTTTACATTATTTAgcttttattattg-----aat----------------------------tgtaaaggttcctt---acatattctagatacaagtcccttgtcaaacatgatttgcaaatagtttttcccattctgtggggtgccttttcactttcttgttgGTATCCTTTGAAACGCAAattatttcacataaattttgatgaagtaccattattttttcttttcttgctgtgCTTTCTGTGTC-------AGAAACCATTGTCTAATTCAAGTTCCTGGAGAATTacacctgtgttttcttctaagagttttatagctttagcttttacctttagttctttgatgtattttgagttaattttt-ttatataatgtGTGGTAGGAATCCAACTTTATTCTTGTTTATGAAGATATACAATT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1917658 437 - 91010382 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ttcttagagaaatatctattcagatcctttgcctattttt-acttggctcatta-tctttctattatttggtttttattattg-----agt----------------------------tataaagtttttttttaatatatcttaggaacaagttccttaccaaacaagatctataaatatcttttcttgttctgtgggttatcttttcactttcttgatgggatcttttgaaagacaaaagatttt-----aagtttgatgaagtacc-ttatttttcttctgttgcttgtacttttgatgtcctatgtaagaaacc--taagaaatctaaggtcatgatgatctatacctgggctttcttcaaagagttttatagttctagctcttacctttaggtatgtgatccattttgaattaa-ttttgttatataatgtgaggtagaggtacaattttatccttttgtctataggtatctggtt i canFam3.chr3 I 125 C 0 e mm10.chr13 76468460 10897 + 120421639 I e calJac3.chr2 112551822 320 + 204313951 I a score=448597.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 65841 137 + 101241 -ttcccagttgtcccaaccatatgttgaa-agactattttttccccattttattttcttggcacctttgtcaaaaattaattgaccataagtgttaggctttactcatggactctcagttctattccatttatctgtat s panTro4.chr5 20164146 137 + 182651097 -ttcccagttttcccaaccatatgttgaa-agactattttttccccattttattttcttggcacctttgtcaaaaattaattgaccataagtgttaggctttacttatggactctcagttctattccatttatctgtat i panTro4.chr5 C 0 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papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1918095 137 - 91010382 -ttcccagttgtcccaaccatatgttgaa-agactattttttccccattttattttcttggcacctttgtcaaaaataaattgaccataagtgttagggtttacttatggattctcagttctattccatttatctgtat i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112552142 137 + 204313951 -TTCccagttgtcccagccatatgttgaa-agactattttatccccattttattttcttgacacccttgtcaaaaattaattgaccataagtgttagggcccacttttgaactctcagttctattccatttatctatat i calJac3.chr2 I 320 C 0 s canFam3.chr3 14331672 100 + 91889043 gctcctg--------catcttttgttaagcagactatttttccctc---------------------tgttgaaaat----------taaatgtgagggtttatctctagactctcaggtctgttgcattTCATCATAT i canFam3.chr3 C 0 C 0 e mm10.chr13 76468460 10897 + 120421639 I a score=2386284.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 65978 822 + 101241 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nomLeu3.chr2 I 1052 C 0 s rheMac3.chr6 88108308 1 - 180491593 a i rheMac3.chr6 I 1077 C 0 s macFas5.chr6 87959916 1 - 181584905 a i macFas5.chr6 I 1070 C 0 s papAnu2.chr6 85205621 1 - 174439528 A i papAnu2.chr6 I 1079 C 0 s chlSab2.chr4 1921020 1 - 91010382 a i chlSab2.chr4 I 1068 C 0 s calJac3.chr2 112554738 1 + 204313951 a i calJac3.chr2 I 759 C 0 s canFam3.chr3 14332629 1 + 91889043 A i canFam3.chr3 C 0 I 721 e mm10.chr13 76468460 10897 + 120421639 I a score=3600.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 67691 1 + 101241 C s panTro4.chr5 20167343 1 + 182651097 c i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88108126 1 - 183952662 c i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53832345 1 - 163208435 c i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88108309 1 - 180491593 c i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87959917 1 - 181584905 c i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85205622 1 - 174439528 C i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1921021 1 - 91010382 c i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112554739 1 + 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ctaattcatgagggtctcatctcaagatgcttaccttaattatattttcaaagg-cctattccaaataaggt--cactctgaggttctggggacaca i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85205623 94 - 174439528 CTAATTCATGAGGGTCTCATCTCAAGATGCTTAccttaattatattttcaaagg-cctattccaaataaggt--cactcTGAGGTTCTGGGGACACA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1921022 94 - 91010382 ctaattcatgagggtctcatctcaagatccttaccttaattatattttcaaagg-cctattccaaataaggt--cactctgaggttctggatagaca i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112554740 95 + 204313951 ctaattcacaaggatctcatttcaaaatccttaccttaattacatcttcaaaggccctattccaaataaggt--cactctgacgttctgggTAGACA i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14333351 89 + 91889043 ctaatccagattagcctcatat--------ttaccttaattacatcttgaaagacctttttcaaaaaaaggttatattctgaggttccaggTGAACT i canFam3.chr3 I 721 C 0 e mm10.chr13 76468460 10897 + 120421639 I a score=1052594.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 67787 299 + 101241 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tgtcttttggggtcaacaattcaatccatTATAGAAAC--ATAGCACAGGAATGGAAAACATGAGAGCAAAAGTGTTTAAGGACCCAAAGCATAAATCCACTTGgaagtaacattcaaaatatttacctacatgtatgacataggcacagactgatcaaaatggaagccatccaATCAGAATTATTGTTCAGTCAGGTGAATGTTAGTCCAAGATTCTAAAGCAGAGAATAGGAGTGGtggagcagaggaaataatcaaagaaaaagtagaagaaagtttttacaggtttaagaaagatta i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53832441 299 - 163208435 tatcttttggggtcaacaattcaatccattatagaaac--ataacacagggatggaaaatatgagagcaaaagtgtttaaggacccaaagcataaatccagTTGgaagtaacattcaaaatatttacctatgtgtatgacataggcacagactgatcaaaatggaagccatccaATCAGAATTATTGTTCAGTCAGGTGAATGTTAGTCCAAGAttctaaagcagagaatagaaatggtggagcagaggaaataatcaaagaaagagtagaagaaaatttttacaggcttaagaaagatta i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88108404 299 - 180491593 tatcttttggggtcaacaattcaatccgtTATAGAAAC--ATAGCACAGGAATGGAAAACATGAGAGCAAAAGTATTTAAGGACCCAAAGCATAAATCCAGTTGgaagtaacaatcaaaatatttaactacttttatgacatagacacagactgattaaaatggaagccatccaGTCAGAATTATTGTTCAGTCAGGTGAATGTTAGtctaatattctaaagcagagaatagaagtggggcagcagaggaaataatcaaagaaagagtagaagaaaatttttacaggcttaagaaagatta i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87960012 299 - 181584905 tatcttttggggtcaacaattcaatccgtTATAGAAAC--ATAGCACAGGAATGGAAAACATGAGAGCAAAAGTATTTAAGGACCCAAAGCATAAATCCAGTTGgaagtaacaatcaaaatatttaactacttttatgacatagacacagactgattaaaatggaagccatccaGTCAGAATTATTGTTCAGTCAGGTGAATGTTAGtctaatattctaaagcagagaatagaagtggggcagcagaggaaataatcaaagaaagagtagaagaaaatttttacaggcttaagaaagatta i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85205717 299 - 174439528 TATCTTTTGGGGTCAACAATTCAATCCGTTATAGAAAC--ATagcacaggaatggaaaacatgAGAGCAAAAGTATTTAAGGACCCAAAGCATAAATCCAGTTGGAAGTAACAATCAAAATATTTAACTACTTTTATGACATAGACACAGACTGATTAAAATGGAAGCCATCCAGTCAGAATTATTATTCAGTCAGGTGAATGTTAGTCTAATATTCTAAAGCAGAGAATAGAAGTGGGGCAGCAGAGGAAATAATCAaagaaagagtagaagaaaatttttacaggcttaagaaagatta i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1921116 294 - 91010382 tatgttttggggtcaacaattcaatccatTATAGAAAC--ATAGCACAGAAATGGAAAACATGAGAGCAAAAGTGTTTAAGGACCCAAAGCATAAATCCAGTTGgaagtaacattcaaaatatttaactacttgtatgacataggcacagactgattaaaatggaagccatccatTCAGAATTATTGTTCAGTCAGGTGAACGTTAGTCCAATATTCTaaagcag-----agaagtggtgcagcagaggaaataatcaaagaaagagtagaagaaaatttttacaggcttaagaaagatta i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112554835 292 + 204313951 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TATCTTCT--------------CATCTACTACAGAAAC--ATATGACAGAAATGGAAAATATGAGATCAGAAGTCTTTAAGGAACAAAAGAATAAATCCAGTCGAAATTACCATCCAAAATATTTAACCCATGGTGTGGCATAGCCATAAATTGATCAAAATGGAAGCTCTCCAGTCAGAAtttt-------ttaagattttatttattcatgagagacacacagag---agaggcagag-acaagaggaaat----aaagaactagcagaagaaaaTATCTTGAGGCTTAAGAAAGGTTA i canFam3.chr3 C 0 C 0 a score=13466.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 68086 5 + 101241 attct s panTro4.chr5 20167738 5 + 182651097 ATTCT i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88108521 5 - 183952662 attct i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53832740 5 - 163208435 attct i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88108703 5 - 180491593 attct i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87960311 5 - 181584905 attct i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85206016 5 - 174439528 attct i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112555127 5 + 204313951 ATTAT i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76479640 5 + 120421639 CTTGT i mm10.chr13 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14333710 5 + 91889043 AATCT i canFam3.chr3 C 0 I 163 e 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agccgggagtggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggagcctgaggtgggtggatcacccgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccgtctgtaccaaagatac-aaaaaattagtcgggcctggtggcactcacctgtagtcccagctactcaggaggctg----aggagaatctcttgagcctaggaggtggtggttgcagtgagctgagattgcg-------------------------------------------------------------------------ctactgtactccagcctgggcaacagagcaagactctatctc-aaaaaaagaaaaaaagaaaaaagagaaagatta i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53832746 308 - 163208435 agccaggagtggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggagcctgaggtgggtggatcacccgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctgtaccaaaaatac-aaaaaagtagtcgggcctggtggcactcacctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatctcttgagcctgggaggcggcggttgcagtgagctgagattacg-------------------------------------------------------------------------ccattgcactccagcctgggcaacagagcaagactccatctc-aaaaaaagaaaaaa--------gagaaagatta i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88108709 308 - 180491593 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i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53834476 1102 - 163208435 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i papAnu2.chr6 I 309 I 25 s chlSab2.chr4 1923130 1119 - 91010382 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Atacaatgggattccgacctgataaatcctgataaggtgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaataccatagcttaacctagtctaccttaaacatgcttagaaca-ttacattagtctacaattgggcaaaattgtctaacacaaagcctactttatattaaagtatggaatatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttacagtatggtttctactgaatgtgtatcatttttacaccattttaaagtcaaaaaactgtaaaccaaaccatta-aagttggagaccat i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88113549 331 - 183952662 atacaatgggattctgacctgataaatcctgataaggtgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaataccatagcttaacctagtctaccttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaattgggcaaaattgtctaacacaaagcctactttatattaaagtatggaatatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttacagtatggtttctactgaatgtgtatcatttttacaccattttaaagtcaaaaaattgtaaactaaatcattataagttggagactat i ponAbe2.chr5 I 118 C 0 s nomLeu3.chr2 53837249 331 - 163208435 acacaatgggattccgacctgataaatcctgataaggtgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaataccatagcttaacctagtctacgttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaattgggcaaaattgtctaacacaaagcctactttatattaaagtatggaatatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttgcagtatggtttctgatgaatgtgtatcatttttataccattttaaagccaaaaaattgtaaactaaaccattataagttggagaccat i nomLeu3.chr2 I 116 C 0 s rheMac3.chr6 88113321 331 - 180491593 atacaatgggattctgacctgataaatcctgataagctgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaatgccatagcttaacctagtctaccttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaattgggcagaatcatctaacacaaagcctactttataataaagtatggaacatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttgcagtatggtttctactgaatgtgtatcacttttacatcattttaaagtcaaaaaattgtaaattaaaccattgtaagttggagaccat i rheMac3.chr6 I 120 C 0 s macFas5.chr6 87965165 331 - 181584905 atacaatgggattctgacctgataaatcctgataagctgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaatgccatagcttaacctagtctaccttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaattggtcaaaatcatctaacacaaagcctactttataataaagtatggaacatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttgcagtatggtttctactgaatgtgtatcacttttacatcattttaaagtcaaaaaattgtaaattaaaccattgtaagttggagaccat i macFas5.chr6 I 118 C 0 s papAnu2.chr6 85210864 331 - 174439528 ATACAATGGGATTCTGACCTGATAAATCCTGATAagctgaaaatgcatttaatccACCTAACCTACTAAATGCCATAGCTTAACCTAGTCTACCTTAAACATGcttagaacacttacattagtcTACAATTGGTCagaatcatctaacacaaagcctactttataataaagtatggaacatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatGGTTGTGTGGATACTTgcagtatggtttctactgaatgtgtatcacttttacatcattttaaagtcaaaaaattgtaaattaaaCCATTGTAAGTTGGAGACCAT i papAnu2.chr6 I 118 C 0 s chlSab2.chr4 1925935 331 - 91010382 atacaatgggattctgacctgataaatcctgataagctgaaaatgcatttaatccacctaacctactaaatgccatagcttaacctagtctaccttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaattggtcaaaatcatctaacacaaagcctactttataataaagtatggaacatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaagtgaaaaacaggatggttgtgtggatacttgcagtatggtttctactgaatgtgtatcacttttacatcattttaaagtcaaaaaattgtaaattaaaccattgtaagttggagaccat i chlSab2.chr4 I 120 C 0 s calJac3.chr2 112557771 329 + 204313951 atacgatgggattctgacctgataaattctgataagctgaaaatgcatttaatctacctaacctactaaataccatagcttagcctagtctactttaaacatgcttagaacacttacattagtctacaaatgggcaaaatcatctaacacaaagcctactttataataaagtatggaaaatctcatgtaatttatttaattctgtactaaaggtaaaaaacaggatgattgtgtggatacttgaagtatggtttccactgaatgtgtatcac--ttacaccattttaaagtcaaaaaattgtaaattaaactattgtaagttggagaccat i calJac3.chr2 I 111 C 0 e canFam3.chr3 14334073 442 + 91889043 I e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I a score=258604.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 72810 89 + 101241 ctgTATAAGTAATATGGAAATTCATTATTTTT-------------------ACAGCAATAAAGTAATGAGAACAGAGAAAGTTTCCATAAATGCTATCCTCAATCCTA s panTro4.chr5 20172521 89 + 182651097 ctgTATAAGTAATATGGAAATTCATTATTTTT-------------------ACAGCAATAAAGTAATGAGAACAGAGAAAGTTTCCATAAATGCTATCCTCAATCCTA i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88113880 89 - 183952662 ccgTATAAGTAATATAGAAATTCATTATTTTT-------------------ATAGCAATAAAGTAATGAGAACAGAGAAAGTTTCCATAAATGCTATCCTCAATCCTA i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53837580 89 - 163208435 ctgTATAAGTAATATAGAAATTCATTATTTTT-------------------ACAGCAATAAAGTAATGAGAACAGAGAAAGCTTCCATAAATGCTATTCTCAATCCTA i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88113652 93 - 180491593 ctgTATAAGTAATATAGAAATTCATTATTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------AATGAGAACAA--AAAGTTTCCTTAAATGCTATCCTCAATCCCA i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87965496 87 - 181584905 ctgTATAAGTAATATAGAAATTCATTATTTTT-------------------ATAGCAATAAAGTAATGAGAACAA--AAAGTTTCCTTAAATGCTATCCTCAATCCCA i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85211195 87 - 174439528 CTGTATAAGTAATAtagaaattcattattttt-------------------atagcaataaagTAATGAGAACAA--AAAGTTTCCTTAAATGCTATCCTCAATCCCA i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1926266 89 - 91010382 ctgTATAAGTAATATATAAATTCATTATTTTT-------------------ACAGCAATAAAGTAATGAGAACAAAGAAAGTTTCCTTAAATGCTATCCTCAATCCCA i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112558100 83 + 204313951 ctgTATAAGTAATATGGAAATTCA-TATTTTT-------------------ACAG-----AAATAATGAGAACAGAGAAAATTTCCCTAAATGCTACCCTCAATCCCA i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14334515 88 + 91889043 CTATACAAGTAATGTAGACATTCATTATTTTT-------------------GTAGAAATAAGTAAATGGGACAGCTAAAGGTTCCTTTGAATTCT-TCCCTAGTCCCA i canFam3.chr3 I 442 C 0 e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I a score=227417.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 72899 85 + 101241 ATCTCTATGCatttagatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatatat--acacacacatatatatgtata s panTro4.chr5 20172610 85 + 182651097 GTCTCTATGCATTTAGatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatatat--acacacacatatatatgtata i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88113969 83 - 183952662 ATCTCTATGCATTTAGatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatatat--acacacac--atatatgtata i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53837669 85 - 163208435 ATCTCTATGCatttagatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatatat--acacacacatatatatGTGTA i nomLeu3.chr2 C 0 M 708 s rheMac3.chr6 88113745 85 - 180491593 ATCTCTATGCATTTAGatatgcatttatatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatagat--acacacacacatatatatgta i rheMac3.chr6 C 0 I 2 s macFas5.chr6 87965583 85 - 181584905 ATCTCTATGCatttagatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatagat--acacacacacatatatatgta i macFas5.chr6 C 0 I 2 s papAnu2.chr6 85211282 87 - 174439528 ATCTCTATGCATTTAGATatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtatagatacacacacacacatatatatgta i papAnu2.chr6 C 0 I 2 s chlSab2.chr4 1926355 85 - 91010382 ATCTCTATGCatttagatatgcatttacatatatatttatgtgtgtgtgcatatatgtacagat--acacacacatatatatatgta i chlSab2.chr4 C 0 I 2 s calJac3.chr2 112558183 57 + 204313951 ATCTCTATGCATTTAGatatgcatttacatatatatctatgtgtgt----atatatgtata-------------------------- i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14334603 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I a score=22771.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 72984 9 + 101241 taggtatgt s panTro4.chr5 20172695 9 + 182651097 taggtatgt i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88114052 9 - 183952662 taggtatgt i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88113832 9 - 180491593 taGGTATGT i rheMac3.chr6 I 2 C 0 s macFas5.chr6 87965670 9 - 181584905 taggtatgt i macFas5.chr6 I 2 C 0 s papAnu2.chr6 85211371 9 - 174439528 taggtatgt i papAnu2.chr6 I 2 C 0 s chlSab2.chr4 1926442 9 - 91010382 taggtatgt i chlSab2.chr4 I 2 C 0 s calJac3.chr2 112558240 9 + 204313951 taggtatat i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14334603 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I e nomLeu3.chr2 53837754 708 - 163208435 M a score=648568.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 72993 216 + 101241 aagtcagccctctgtatccgtggattccgcatctgtgaaatcaaagagccatggatcaaaaatactcttaaaaaaccttgtgtctgtactaaacacgtacagacatttttttcttgtcattattccctaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatgtgtaatctagagatgatgtcaagtacgtaggag s panTro4.chr5 20172704 213 + 182651097 aagtcagccctctgtatccgtggattccgcatctgtgaaatcaaagagccatggatcaaaaatactctttaaaaaccttgtgtctgtactaaacacatacagacatttttttcttgtcatt---ccctaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatgtgtaatctagagatgatgtcaagtacgtaggag i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88114061 216 - 183952662 aagtcagccctctgtatctgtggattccgcatctgtgaaatcaaagagccatggatcaaaaatactcttaaaaaaccttgtgtctgtactaaacacatacagacatttttttcttgtcattattccctaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattttgtgtaatctggagatgatgtcaactatgtaggag i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53838465 216 - 163208435 Aagtcagccctctgtatctgtggattctgcatctgtgaattcaaagagccatggatcaaaaatattcttaaaaaagcttgtgtctgtactaaacatgtacagacatttttttcttgtcattattccctaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattgtgttaggtattatatgtaatctggagatgatgtcacatacgtaggag i nomLeu3.chr2 M 708 C 0 s rheMac3.chr6 88113841 216 - 180491593 Aagtcagccctctgtatccatggattccgcatctgtgaattcaaagagtcatggatcaaaaatactcttaaaaaaccttgtgtctgtactaaacacgtacagacatatttttcttgtcattattcccgaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatatgtaatctccagatgatttcaagtacgtaggag i rheMac3.chr6 C 0 I 221 s macFas5.chr6 87965679 216 - 181584905 aagtcagccctctgtgtccatggattccgcatctgtgaattcaaagagtcatggatcaaaaatactcttaaaaaaccttgtgtctgtactaaacacgtacagacatatttttcttgtcattattcccgaaacaatagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatatgtaatctccagatgatttcaagtacgtaggag i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85211380 216 - 174439528 aagtcagccctctgtatccatggattCCGCATCTGTGAATTCAAAGAGTCATGGATCAAAAATACTCTTAAAAAACCTTGTGTCTGTACTAAACACGTACAGAcatatttttcttgtcattattcccgaAACAAtagagtataacaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatatgtAATCTCCAGATGATTTCAAGTACGTAGGAG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1926451 216 - 91010382 aagtcagccctctgtatccatggattccgcatctgtgaattcaaagagtcatggatcaaaaatactcttaaaaaaccttgtgtctgtactaaacatgtacagacatatttttcttgtcattattcccgaaacaatagagtatagcaactatttacatgtgtttacattatattaggtattatatgtaatctccagatgatttcaagtacgtaggag i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112558249 216 + 204313951 aagtcagccctctgtatctgttgattctgcatctgtgaattcaaagacccatggatcaaaaatattcttagaaaaccttatgtctatactgaacatgtacagacatttttttcttgtcattattccctaaacaatagagtataacaactctttacatgagtttacattatattagatattttatataatatgaaaatgatttcaagtatgtaggag i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14334603 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I a score=17728.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 73209 10 + 101241 aatgtacacg s panTro4.chr5 20172917 10 + 182651097 aatgtgcacg i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88114277 10 - 183952662 aacatacacg i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53838681 10 - 163208435 aacatacacg i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87965895 10 - 181584905 gacatacaca i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85211596 10 - 174439528 GACATACaca i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1926667 10 - 91010382 gacatacaca i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112558465 10 + 204313951 aacatacata i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14334603 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I e rheMac3.chr6 88114057 221 - 180491593 I a score=520021.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 73219 167 + 101241 gattatatgtaaatactacactgttttgtatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggaactggaaccaatcccacgtggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatggataaagagagctatgtacataaatataatatagagag s panTro4.chr5 20172927 167 + 182651097 gattatatgtaaatactacactgttttgtatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggaactggaaccaatcccacgtggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatggataaagagagctatgtacataaatataatatagagag i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88114287 167 - 183952662 gattatatgtaaatactacactgttttgtatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggtactggaaccaatcccacgtggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatGGATAAAGAGAGCtatgtacataaatataatatagagag i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53838691 160 - 163208435 gattatatgtaaatactacactgttttgtatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggcactggaaccaatcccacgtggataccaagggacaactgtatatgcatgcatatatggataaagaaagtgatgtacataaatat-------agag i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88114278 167 - 180491593 gattatatgcaaatactacactgttttatatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggtactggaaccaatcccacatggataccaagggacaactCtatatgcatgcatatatggataaagagagctatgtacataaatataatatagagag i rheMac3.chr6 I 221 C 0 s macFas5.chr6 87965905 167 - 181584905 gattatatgcaaatactacactgttttatatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggtactggaaccaatcccacatggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatggataaagagagctatgtacataaatataatatagagag i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85211606 167 - 174439528 gattatatgcaaatactacactgtTTTATATCAGGCACTTGAGCATCtgtagattttggtatctgtgggaggTACTGGAACCAATCCcacatggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatggaTAAAGAGAGCtatgtacataaatataatatagatAG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1926677 167 - 91010382 gattatatgcaaatactacactgttttatatcaggcacttgagcatctgtagattttggtatctgtgggaggtactggaaccaatcccacatggataccaagggacaactctatatgcatgcatatatagataaagagagctatgtacataaatataatatagagag i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112558475 167 + 204313951 ggttatatgcaaatactacactattttctattagggacttaagcatctgtggattttggtatctgtgggaggtactggaaccaatcccacatggataccaagggacaattctatatgcacaaatatgtggataaagagagatatgtacataagtataatataaagag i calJac3.chr2 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14334603 0 + 91889043 C e mm10.chr13 76479646 2004 + 120421639 I a score=2463009.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 73386 746 + 101241 atatctacaaa-aacttatgtatatatgtatatatCTCTCCTTTGtatgcatatgt-gtatatata------------------------------tgtgatttggtg---------------------tgagtg-tgtgatg-ttctacacagttgatgttttatcatacatttttagcaatttgattttttttcattaatatgtcgtagagatcttactgtgttagtccatacagattgacctcattgtcaattcgtaggctaaacaggatacctatttagctattgctcaattgatgatgatctatgttgcttccagcttttgcttttacaaatata--ctgcactgaacatccttgtacatgcttcatcatgcccacctaagtggggatttctatagaata--------aacgctgaatagtcagattattatgggttatacaatgtttaggttttcttagatacttctaaactgcTAAATTAATTTGTTTA-GCAGATATAATCTTATCAGTATTACAAAGTATTAAATCTTAACAAGTTGGCTTTGTGAAAAATAACTTGTTTTTGCTCAGTTTAATTTCCTCAGTGACAAACTGTAGCCCTGTAGATAAGGAAGAAGAAAGAAGGGCAATATATTTGAAGTGAAGATTTGGATTTGAATTATAGAAGTTTCTTGC-TAATGAACCTGGGAAAACTGCTTTGAAATATACGATGATCAGATACCCAATTAACTAGAGTACTAAAAACAAAAGCCAGTAATTAAAACCTTACCATCAACCTGA-GGGTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT s panTro4.chr5 20173094 746 + 182651097 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atatctacaaa-aacttatgtatatatgcatatatctctcctttgtatgcatatgt-gcatatata------------------------------tgtGATTTGGTG---------------------TGAGTG-TGTGATG-TTCTACACAGTTGATGTTTTATCATACATTTTTAGCAATTTGATTTTTTTTCATTAATATGTCATAGAACTCTTACTGCGTTAGTCCACACAGATTGACCTCATTGTCAATTAGTAGGCTAAACAGGATACCtatttaactgttgctcaattgatgatcatctgtgttccttccagcttttgcttttacaaaaata--ctgcactgaacatccttgtacatgcttcatcatgcccacctaagtggggatttctatagaata--------aacactgaatagtcagattattatgggctatacaatgtttaggttttcttagatacttctaaactgCTAAATTAATTTGTTTA-GCACATATAATCTTATCAGTATTACAAAGTATTAAATCTTAACAAGTGGGCTTTGTGAAAAATACCTTGTTCTTGCTCAGTTTAATTTCCTCAGTGACAAACTGTAGCCCTGTAGATAAGGAAGAAGAAAGGAGGGCAATATATTTGAAGTGAAGATTTGGATTTGAATTATGGAAGTTTCTTGC-TAATGAACCTGGGAAAACTGCTTTGAAATATATGATGATCAGATACCCAATTAACTAGAGTACTAAAAACAAAAGCCAGTAATCAATAACTTACCATCAACCTGA-GGGTCTTTATTGAAGCTCTTATGGT i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53838851 744 - 163208435 agatctacaaa-aacttatgtatatatgtatatatCTCTCCTTTGtatgtatatgt-gtacatata------------------------------tgtgatttggtg---------------------tgagtg-tgtgata-ttctacacagttgatgttttatcatacatttttagcaatttga-tttttttcattaatgtgtcatagagatcttactgtgttagtccatacagattgacctcattgtcaattcgtaggctaaacaggatacctatttaactgttgctcaattgatgatcatctatgttgcttccagcttttgcttttacaaaaata--ctgcactgaacatccttgtacatacttcatcatgcccacctaagtggggatttctatagaata--------aacagtgaatagtcagactattatgggttatacaatgtttaggttttcttagatacttctaaactgcTAAATTAATTTGTTTA-GCAAATATAATCTTATCAGTATTACAAAGTATTAAATCTTAACAAGTGggctttgtgaaaaataacttgttcttgctcagtttaatttcctcagtgacaaactatagccctgtagataaggaagaagaaagaagggcaatatatttggagtgaagatttggatttgaattatagaagtttcttgc-taatgaacctgggaaaattgcttcgaaatatacgatgatcagatacccaattaactagagtgct-aaaacaaaagccagtaatcaataacttaccatcaacctga-gggTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88114445 750 - 180491593 atatctataaa-aacttgtgtatatatgtgtgtatctctcttttatatgtatgtgt-gtatatata------------------------------tgtGATTTGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------------ACACAGTTGATGTTTTATCATACATTTTTAAcaatttgattttttttcattaatatgtcttagagatcttactgtgttagttcatacagattgacctcattgtgaattcgtaggctaaacaggatacctatttaactgttgcttaattgatgatcatctatgttgcttccagcttttactcttacaacaata--ctgcattgaacatccttgtacatgcttcattgtgcctacctaagtggagatttctatagaata--------aacactgaatagtcagattattatgggttatac-atgtttaggttttcttagatacttctaaactgcTAAATTAATTTGTTTAGGTAGATATAATCTTATCAGTATTACAGAGTATTAAATCTTAACAAGTGggctttgtgaaaaataacttgttcttgctcagtttaatttcctcagtgacaaactgtagccctgtagataaggaagaagaaagaagggcaatatatttgaaatgaagctttggatttgaattatagaagttccttgc-taatgaacctgggaaaactgctttgaaatatacgatgatcagatacccaattagctagagtgctaaaaacaaaagctggtaatcaataacttaacatcaatctga-gggTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87966072 743 - 181584905 atatctataaa-aacttgtgtatatatgtgtgtatctctcttttatatgtatgtgt-gtatatata------------------------------tGTGATTTGGtg---------------------tgagtgatgt-----ttctacacagttgatgttttatcatacatttttaacaatttgattttttttcattaatatgtcttagagatcttactgtgttagttcatacagattgacctcattgtgaattcgtaggctaaacaggatacctatttaactgttgcttaattgatgatcatctatgttgcttccagcttttgctcttacaacaata--ctgcattgaacatccttgtacatgcttcattgtgcccacctaagtggagatttctatagaata--------aacactgaatagtcagattattatgggttatac-atgtttaggttttcttagatacttctaaactgcTAAATTAATTTGTTTAGGTAGATATAATCTTATCAGTATTACAGAGTATTAAATCTTAACAAGTGggctttgtgaaaaataacttgttcttgctcagtttaatttcctcagtgacaaactgtagccctgtagataaggaagaagaaagaagggcaatatatttgaaatgaagctttggatttgaattatagaagttccttgc-taatgaacctgggaaaactgctttgaaatatacgatgatcagatacccaattagctagagtgctaaaaacaaaagctggtaatcaataacttaacatcaatctga-gggTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85211773 743 - 174439528 atatctataaa-aacttgtgtatatatgtatgcatctctcttttatatgtatgtgt-gtatatata------------------------------tgtgatttGGTG---------------------TGAGTGATGT-----TTCTACACAGTTGACGTTTTATCatacatttttaacaatttgattttttttcattaatatgtCTTAGAGATCTTACTGTGTTAGTTCATACAGATTGACCTCATTGTGAATTCATAGGCTAAAGAGGATACCTATTTAACTGTTGCTTAATTAATGATCATCTAtgttgcttccagcttttgctcttACAACAATA--CTGCATTGAACATCCTTGTACATGCTTCATTGTGTCCACCTAAGTGGAGATTTCTATAGAATA--------AACACTGAATAGTCAGATTATTATGGGTTATAC-ATGTTTAGGTTTTCTTAGATACTTCTAAACTGCTAAATTAATTTGTTTAGGTAGATATAATCTTATCAGTATTACAGAGTATTAAATCTTAACAAGTGGGCTTTGTGAAAAATAACTTGTTCTTGCTCAGTTTAATTTCCTCAGTGACAAACTGTAGCCCTGTagataaggaagaagaaagaagggcaatatatttgaaatgaagCTTTGGATTTGAATTATAGAAGTTCCTTGC-TAATGAACCTGGGAAAACTGCTTTGAAATATACGATGATCAGATACCCAATTAGCTAGAGTGCTAAAAACAAAAGCAGGTAATCAATAACTTAACATCAATCTGA-GGGTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1926844 743 - 91010382 atatctataaa-aacttgtgtatatttgtatgtatctctcttttatatgtgtgtgt-gtatatata------------------------------tGTGATTTAGtg---------------------tgagtgatgt-----ttctacacagttgatgttttatcatacattgttaacaatttgattttttttcattaatatgtcttagagatcttactgtgttagttcatacagagtgacctcattgtgaattcgtaggctaaacaggatacatatttaactgttgcttaattgatgatcatctatgttgcttccagcttttgctcttacaacaata--ctgcattgaacatccttgtagatgcttcattgtgcccacctaagtggagatttctatagaata--------aacactgaatagtcagattattatgggttatac-atgtttaggttttcttagatacttctaaactgcTAAATGAATTTGTTTAGGTAGATATAATCTTATCAGTATTACAGAGTATTAAATCTTAACAAGTGggctttgtgaaaaataacttgttcttgctcagtttaatttcctcagtgacaaactgtaggcctgtagataaggaagaagaaagaagggcaatatatttgaaatgaagctttggatttgaattatagaagtttcttgc-taatgaacctgggaaaactgctttgaaatatacgacaatcagatacccaattagctagagagctaaaaacaaaagccgttaatcaataacttaacatcaatctga-gggTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112558642 740 + 204313951 atatgtactaa-aatatatgtatatatgtatgtatCTCTTTTTTGTATGTATGTGT-GTATATATA------------------------------CGTGATTTGGTG---------------------TGAATG-TGTGATGTTTCTGCACAATGTATGTCTTATCATACATTTTTAGCAATTTTATTTT------TTATTATGTTTTACAGACCTTACTGTGTTAGCCCATATAGATTGACCTCATTGTCAATTTGTAGGCTAAACAGGGTACCtatttaactattgctcaactgatgatcatctatgttgcttccgg-ttttgctcttacaacaata--ctgcattgggcatccttgtacatgcttcatcatgcctacctaaggggggatttctataaaata--------aacactgaatagtcagattattatgggttatacaata-ttatgttttcttagatacttctaaactgctAAATTAATTTGTTTAGGTAGATACAATCTTATCAGTCTTACAGAGTATTAAATCTTAACAAGTGggctttgtgaaaaataacttgttcttgatcagtttaatttcctcagtgatgaactgcagccctgtagataaggaagaagagagaagggcaatatatttgaagtgaagctttggatttgaattatagaactttcttgc-tgatgaacttgggaaaattgctttgaaatatacgatgatcagatacccaattagttagagtgctaaaaacaaaagccactaatcaataatttagcatcaatctga-tggTCTTTATTGAAGCTCTTCTGGT i calJac3.chr2 C 0 C 0 s canFam3.chr3 14334603 754 + 91889043 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TTaatactcttaattttttttaaaaaaatcaatccatTGAATGTATTAA-------------------------------------------------------------------------ACAGCTGGCTTAATGAAATCTGAAGATAGCTTAAGAATAATGAGAAACTTGGGCTTATTTTGAAAAGTGACCATTAAAACTAGAGT-CTTCCTTATC--GGTGATTCTATTCAGTGATTCAGTCCACTGATGTTTAGAATAGATTCAATCAGCTGGTAAAAGGCACTTCATCGGGATGGACACTTTCCCCCTGCAGCTATCCTCAGC-CCTCATGCCAATCAGACTGCTCCTTTTAAGG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1927587 283 - 91010382 TTAATACTCTTAA-TTTTTTTAAAAAAATCAATCCATTGAATGTATTAA-------------------------------------------------------------------------ACAGCTGGCTTAATAAAATCTGAAGATAGCTTAAGAATAATGAGAAACTTGGGCTTATTTTGAAAAGTGACCATTAAAACTAGAGT-CTTCCTTATT--GGTGATTCTATTCAGTGATTCAGTCCACTGACGTTTGGAATAGATTCAATCAGCTGGTAAAAGGCACTCCTTCGGGATGGACACTTCCCCCCTGCAGCTATCCTCAGC-CCTCATGCCAACCAAACTGCTCCTTTTAAGG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112559382 281 + 204313951 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ATCTATATGCATATTATTCTTAT-GCATCTGGACTT----TGATAAAAGACT---TTTTTTTTTTGCTACTATT----------------------CTGTACATTAATCTT-----------------------GCCTTTAT-TCTCTACTTGTA---TGCACCTTGTATGTTTGTCCATGTTAATGGTTTGTAGTTTGTCCCAGAGAACAGTGCTGTATACAAATGTTACCTAAT i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112562543 180 + 204313951 ATGCATATGCATATTACTCTTAT-GCATCTGGGCTTTGACTGATAAAAGAC------AATTTTTTGCTACTATT----------------------ATGTACATTAATCTT-----------------------GCCTTTAT-TCTCTACTTATA---TGCTCCTTGTATGTTTGCCCATGTTAATGGTTTGTAGTTTATCCCAGGGAACAGCACACCATACAAATGTTACCTAAT i calJac3.chr2 C 0 C 0 s mm10.chr13 76485559 228 + 120421639 ATTTATCTGTGTgatagtgttagagcccctggaattggaattacagacaat-------tgtggttgctgggatttgaactcagttcctctggaagaatagtcagtgctcttaaccactgagccatctctttccagcccTCATGTTTTTAATTTTAATCTGCTCATTGTGTG-TGGTCTAAATCAATGGTTCATAAGGAATACCAGAGCAAAACACTCCACCCAGGTGTTACCTAAT i mm10.chr13 I 260 I 3 s canFam3.chr3 14338241 165 + 91889043 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ATCAGGCTGTTTTAACT------CTATTTGTATAGTTAGTCCATTTGTTAACCTCATCCCATACTTTTTAATGTGATTATAATCTGTTTTCTCAGAATGAtgaagcttgaatgagataatctataaatgaaagtatgttgtaaatagaaaagtgccatgcaaatataaAATATGTTAGTAATAAGTAACCTTATGGAGTCACAAAACAGTGTGTTATCGTTGGGTGAAAATAAGG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88118790 225 - 180491593 GTCAGGCTTT----ACT------CTATTTGTTTATTTAGTTCATTTGTTAACCTCATCCCATGCTTTTTAATGTGATTATAATCTGTTTTCTCAGAATGAtgaagcttgaatgagataatctataaatgaaagtgtgttgtaaatacaaaagtgccatgcaaatataaAATATATTAGTAATAAATAACCTTACAGAGTCACAAGACAGTGTGTTATCTTTGGGTGAAAATAAGG i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87970317 229 - 181584905 GTCAGGCTGTTTTAACT------CTATTTGTTTATTTAGTTCATTTGTTAACCTCATCCCATGCTTTTTAATGTGATTATAATCTGTTTTCTCAGAATGAtgaagcttgaatgagataatctataaatgaaagtgtgttgtaaatacaaaagtgccatgcaaatataaAATATATTAGTAATAAATAACCTTACAGAGTCACAAGACAGTGTGTTATCTTTGGGTGAAAATAAGG i macFas5.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1931025 229 - 91010382 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papAnu2.chr6 C 0 I 17 s chlSab2.chr4 1936903 67 - 91010382 gaggtcaggagatcacgaccatcctgactaacacggtgaaaccccatctctactaaatatacaaaaa i chlSab2.chr4 C 0 I 11 e canFam3.chr3 14345007 3729 + 91889043 I e calJac3.chr2 112568594 13003 + 204313951 I e rheMac3.chr6 88124675 67 - 180491593 I a score=1800156.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 83529 797 + 101241 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s panTro4.chr5 20184093 2662 + 182651097 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i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88125508 2634 - 183952662 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cagcatttgttatgtctggaaaagactgtatctttccttcatttatgaagcctagtttctctggataaaaaattcttggttgataattgtttcgtttaaggaggctaaaataggaccccaattactctagcttgtatggtttctgctaagaaatctattagtctgataggtttccctttataggttacctgatgcttttgcttcacagcttttaagattctttccaccatcttgactttagataacctgatgactgtatgcctaggtgatgatctttttgtaatgaatttcccggatgttctttgagctactcgtatttggatatctagatctcttgcaaggccagaggagatttccttgattattccctcaaatgtgttttccagacttttagatttcttttcttcctcaggaa---caccagttattcttaggtttggatgcctaacatagtcccagacttctaacatagtcccagacttctaacatagtcccaaacttcttggaggctttgttcatttttaaatattttttgtctttg-tctttgtcagattgggttaattcaaaagctttgtcttcgatctctgaagttctttcttctgatcattttattctattgctgagactttccaatgcattttgcatttctctaagtgtatccttgatttccagaagttgtgattgttttttatttatgctatctatttcactgaagatttttcctctcatattgtgtatcatatttttgatttctttaaggtggagttcacctttctctagtgcctc i ponAbe2.chr5 I 20 C 0 s rheMac3.chr6 88130718 721 - 180491593 cagcatttgttatgtctagaaaagactatatctttc---------------ctagtttctctggataaaaaattcttggttgataattgttttgtttaaggaggctaaaataggaccccaattcctctagcttgtagggttgctgctaagaaatctgttaatctgataggctttcctttataggttacctgatgcttttgcctcacagatttt-agattctttccttcatcttgactttagataacctgatgactatgtgcctagacgatgatctttttgcgatgaatttcccagatcttctttgagctattcgtatttggatatctagatctcttgcaaggccaggggagatttccttgattattctctcaaatgtgttttccagacatttagatttctcttcttcctcaggaa---caccagttagtctcaggtttggatgc--------------------------------------ctaac--agtcccaaacttcttggagactttgttcatttttaa--agttttttttcttg-tctttgtcagattgggttaattcaaaagctttgtctttgaactctgaagttctttctttggatcattttattctattgctgagactttgcaatgcattttgcatttctctaagtgtatccttgatttccagaagttctgattgttttttatttatg----ctatgtcactgaagatttttcctctcatattgcatgtcatgtttttgatttctttaagttggagttcacctttctctagtgcctc i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87982142 721 - 181584905 cagcatttgttatgtctagaaaagactatatctttc---------------ctagtttctctggataaaaaattcttggttgataattgttttgtttaaggaggctaaaataggaccccaattcctctagcttgtagggttgctgctaagaaatctgttaatctgataggctttcctttataggttacctgatgcttttgcctcacagatttt-agattctttccttcatcttgactttagataacctgatgactatgtgcctagacgatgatctttttgcgatgaatttcccagatcttctttgagctattcgtatttggatatctagatctcttgcaaggccaggggagatttccttgattattctctcaaatgtgttttccagtcatttagatttctcttcttcctcaggaa---caccagttagtctcaggtttggatgc--------------------------------------ctaac--agtcccaaacttcttggagactttgttcatttttaa--agttttttttcttg-tctttgtcagattgggttaattcaaaagctttgtctttgaactctgaagttctttctttggatcattttattctattgctgagactttgcaatgcattttgcatttctctaagtgtatccttgatttccagaagttctgattgttttttatttatg----ctatgtcactgaagatttttcctctcatattgcatgtcatgtttttgatttctttaagttggagttcacctttctctagtgcctc i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85227815 721 - 174439528 cagcatttgttatGTCtagaaaagactgtatctttc---------------ctagTTTCTCTGGATAAAAAATTCTTggttgataattgttttgtttaaggaggctaaaataGGACCCCAATTCCTCTAGCTTGTAGGGTTGCTGCTAAGAaatctgttaatctgataggctttcctttataggttacctgatgcttttgcctcacagatttt-agattctttccttcatcttgactttagataacctgatgactatgtgcctagacgatgatctttttgtgatgaatttcccagatcTTCTTTGAGCTATTCGTACTTGGATATCTAGATCTCTTGCAAGGCCAGGGGAGATTTCCTTGATTATTCTCTCAAATGTCTTTTCCAGacatttagatttctcttcttcctcaggaa---caccagttAGTCTCAGGTTTGGATGC--------------------------------------CTAAc--agtcccaaacttcttggagactttgttcatttttaa--agttttttttcttg-tctttgtcagattgggttaattcaaaagcttTGTCTTTGAactctgaagttctttttttggatcattttattctattgctgagactttgcaatgcattttgcatttctctaagtgtatccttgatttccagaagttctgattgttttttatttatg----ctatgtCACTGAAGATTTTTCCTCTCATATTGCATgtcatgtttttgatttctttaagttggagTTCACCTTTCTCTAGTGCCTC i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1942877 720 - 91010382 cagcatttgttatgtctggaaaaggctatatctttc---------------ctagtttctctggataaaaaattctcggttgataattgttttgtttaaggaggctaaaataggaccccaattcctctagcgtgtggggtttctgctaagaaatctgttaatctgataggctttcctttataggttacctgatgcttttgcctcacagatttt-agattctttccttcatcttgactttagataacctgaagactatgtgcctagacgatgatctttttgtgatgaatttcccacatcctctttgagctactcgtatttggatatctagatctcttgcaaggccaggggagatttccctgattattccctcaaatgtgttttccagacatttagatttctcttcttcctccggaa---caccagttagtctcaggtttggatgc--------------------------------------ctaac--agtcccaaacatcttggagactttgttcatttttaa--agttttttttttttctctttgtcagattgggttaattcaaaagctttggctttgagctctgaagt--tttctttggatcgttttattctactgctgagactttgcaatgcattttgcatttctctaagtgtatccttgatttccagaagttctgcttgttttttatttgtg----ctatgtcactgaagatttttcctctcatatcgcgtatcatgtttttgatttctttaagttggagttcacctttctctagtgcctc i chlSab2.chr4 C 0 C 0 e canFam3.chr3 14345007 3729 + 91889043 I e calJac3.chr2 112568594 13003 + 204313951 I e nomLeu3.chr2 53855535 100 - 163208435 I a score=2545663.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 92216 1136 + 101241 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cttgattagcttaataatggaccttctgaattctttttctggcaattcagaaatttcatcttggtttggatccattactggtgagctggtgtggtcttttgggga-tgttaaagaaacttgttttatcgtaataccagaattatttttctgattccttctcatttggataggctatgtcagagggaagatctggaactcaagtgctgctgttcagattcttttgctccatggggtgctcctttgatgtggtgttctcccccttcccctagggatggggcttcctgagaggcgaactgcagtgattgcttttgctcttctggg-tctagtcacccagcagagcctaccaggctctgagctggtcctaaggagtgtctgcaaagtgaaatagactctgtgtgggtccttgcttgtatttttctttagtgtgctggttttgtgttggttggccttcagccaggaa-------------------------------------------------gtggcattttccagagcgtatcagctgcagctgtataagcaggatcaggcagtaggtggggttatagagctcccaagagattatgttctttgtcttcagctgccagggcaggcagagaaagaccactaggtggggacaagg---ataggcctgtctgatctc----------agagtctccttgggtgggccttgctgcagctgctgtgggggatgggagtgtggttctcagcccaatggaggtatgttcacagggggattatggctgcctttgctgagtcacaca---ggtcaccagggaagtaggggaaagacggcagtcacaggcctcacccagttcccacATAGCCTGCAGTCCACttaggagcatgctgaccaaagtcaagagtttccccattctcaaaacactacagaaatttgatttgtaggcactacattttctt-gctttcccaccacctcactgactgctttatcgtaatctcttttactaaattt----ttcctattttacctctacaatttgggatcccacctggtatagtacttaacttcctcctgttttctgtctagtaattccttatatgatctcaaccagcttgggttttaaataGACacaagcaaaattccaattttggttaccagtcagt i panTro4.chr5 C 0 C 0 s ponAbe2.chr5 88133428 1090 - 183952662 cttgattagcttaataatcgaccttctgaattctttttctggcaattcagaaattttgtcttggtttggatccattactggtgagctggtgtggtcttttgggga-tgttaaagaaacttgttttgttgtaataccagaattatttttctggttccttctcatttggatagactatgtcagagggaagatctggaactcaagtgctgctgttcacattcttttgccccatggggtgctcccttgatgtggtgttctcccccttcccctagggatggggcttcctgagaggcgaactgcagtgattgtttttgctcttctggg-tctagtcacccagcagagcctaccaggctctgagctggtactgaggagtgtctgcaaagtgaaatagactctgtgggggtccttgcttgtatttttctttagcgtgctggttttttgttggttggcctccagccaggaa-------------------------------------------------gtggcattttccagagcgtatcagctgcagctgtataagcaggatcaggcagtgggtggggctatagagcaaccaagagattatgtcctttgtcttcagcagccagggcacgtagagaaagaccactaggtggggacaagg---ataggcctgtctgatctc----------agagtctccttgagtgggccttgctgcagctgctgtgggggatgggagcgtcgttctcagcccaatggaggtatgttcacagggggattatggctgcctctgctgagtcacaccagtggtcaccagggaagtgggggaaagacggcagtcacaggcctcacccagttcccacacaGCCTGCAGTCCACttaggagcatgctgaccaaagtggagagtttccccattctcaaaacactacagaaatttgatttgtaggcactacattttctt-gctttcccaccacctcactggctgctttatcgtaatctcttttactaaattt----ttcctattttacctctacaatttgggatcccacctggtatagtacttaacttcctcctgttttctatctagtaattctttatatgatctcaaccagcttgggttttaaataGACacaagcaaaattccaattttggttaccagtcagt 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cttcattagcttaataatcgaccttctgaattctttttctggcaattcagagattttgtcttggtttggatccattactggtgagctggtgtggtcttctggggg-taataaagaaacttgttttgttgtaattccagaattatttttctggttccttctcctttggatagactatgtctgagggaagatctggaactaacgtgctggtgttcagattcttttgccccatgggatgttcccttgatgtggtgttctcccacttcccctagggatggggcttcctgagaggcaaactgcagtgattgtttttgctcttttggg-tctagtcacccagcggagcctaccaggctctgaactggtactggggagtgtctgcaaagtgaaatagagtctgtgtgggaccttgcttgtatttttctttagtgtgctggttttgtgttgactggcctctagccaggaa-------------------------------------------------gtggcattttccagagtgtatcagctgcagctgtataggtaggatcaggcagtgggtggggctatagagctcccaagagattatgtcctttgtcttcagcagctggggcaggtagagaaagactactaggtggggataagg---ataggcctgtctgatctc----------agagtctccttggatgggccttggtgcagctgctgtgggggatgggggtgtggttctcagcccaatggaggtatgttcacagggggattatggctgcctctgctgagtcacaca---ggtcaccagggaagtgggggaaagacggtggtcgcaggcctcacccagctcccacatagcctgcaGTCCACttaggagcattctgaccaaagtcaagagtttacccattctcaaaacactacagaaatttgatttctaggcactacattttctt-gctttcccaccacctcactggctgctttatcataatctcttttactaaattt----ttcctattttacctctacaatttgggatcccacctggtgtagtccttaacttcctcctgttttctatctagtaattccttatatgatctcaaccagcttggattttaaataGACAGAAGCAAAATTTCaattttggttaccagtcagt i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87982863 1087 - 181584905 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i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85228536 1087 - 174439528 CTTCATTAGCTTAATAatcgaccttctgaattctttttctggcaattcagagattttgtcttggtttggatccattacTGGTGAGCTGGTGTGGTCTTCTGGGGG-TATTAAAGAAACTTGTTTTGTTGTAattccagaattatttttctggttccttctcatttggatagaCTATGTCTGAGGGAAGATCTGGAACTCAAgtgctgctgttcagattcttttgccCCATGGGAtgttcccttgatgtggtgttctcccacttcccctagggatggggcttcctgagaggcaaactgcagtgattgtttttgctcttttgGG-TCTAGTCACCCAGCGGAGCCTACCAGGCTCTGaactggtactggggagtgtctgcaaagtgAAATAGAGTCTGTGTGGGACCttgcttgtatttttctttagtgtgctggttttgtgTTGACTGGCCTCTAGCCAGGAA-------------------------------------------------GTGGCATTTTCCAGAGTGTATCAGCTGCAGCTGTATAGGTAGGATCAGGCAGTGGGTGGGGCtgtagagctcccaagagattatgtcctttgtcttcagcAGCtggggcaggtagagaaagactACTAGGTGGGGATAAGG---ATAGGCCTGTCTGATCTC----------AGAGTCTCCTTGGGTGGGCcttggtgcagctgctgtgggggatgggggtgtggttctCAGCCCAATGGAGGTATGTTcacagggggattatggctgcctctgctgagtcacaca---ggtcaccagggaagtgggggaaagacGGCGGTcgcaggcctcacccagctcccatatAGCCTGCAGTCCACTTAGGAGCATTCTGACCAAAGTCGAGAGTTTACCCATTCTCAAAACACTACAGAAATTTGATTTCTAGGCACTACATTTTCTT-GCTTTCCCACCACCTCACTGGCTGCTTTATCATAATCTCTTTTActaaattt----ttcctattttacctTTACAATTTGGGATCCCACCTGGTATAGTCCTTAACTTCCTCCTGTTTTCTATCTAGTAATTCCTTATATGATCTCAACCAGCTTGGATTTTAAATAGACAGAAGCAAAATTTCAATTTTGGTTACCAGTCAGT i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1943597 1083 - 91010382 cttgattaacttaataatcgaccttctgaattctttttctgtcaattcagagattttatcttggtttggatccattactggtgagctggtgtggtcttctggggg-tatt----aaacttgttttgttgtaataccagaattatttttctggttccttctgatttggatagactatgtctgagggaagatctggaactcaagtgctgctgttcagattcttttgccccatggggtgttcccttgatgtggtgttctcccccttcccctagggatggggcttcctgagaggcaaactgcagtgattgtttttgctcttttggg-tctagtcacccagcggagcctaccaggttctgaactggtactggggagtgtctgtaaagtgaaatagactctgtgtgggaccttgcttgtatttttctttagtgtgctggtttggggttgatgggcctccagccgggaa-------------------------------------------------gtggcattttccagagtgtatcagctgcagctgtataagtaggatcaggcagtgggtggggctatagagctcccaagagattatgtcctttgtcttcagcagctggggcaggtagagaaagactactaggtggggataagg---ataggcctgtctgatctc----------agagtctccttgggtgggccttggtgcagctgctgtgggggatgggggtgtggttctcagcccaatggaggtatgttcacaaggcgattatggctgcctctgctgagtcacaca---ggtcaccagggaagtgggggaaagacggcggtcgcaggcctcacccagctcccacAGAGCGTGCAGTTCACttaggagcattctgaccaaagtcgagagtttacccattctcaaaacactacagaaatttgatttctaggcactacattttctt-gctttcccagcacctcactggctgctttatcataatctcttttactaaattt----ttcctattttatctctacaatttgggatcccacctggtatagtccttaacttcctcctgttttctatctagtaattccttatatgatctcaaccagtttggattttaaataGACACAAGCAAAATTTCaattttggttaccagtcagt i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112581597 1100 + 204313951 cttgattagcttaataattgacgttctgaattctttttctggcaattcagagattttgtcttgatttggatccattactggtgagctagtgtgatcttttgggggatgttaaagaaccttgttttgttgtaataccagaattatatacctggttccttctcatttggatagactatgtcagagggaagatctggaactcaaatgctgctgttcagattcttttgccccagggggtgctcccttgatgtggtgttctccccctttccctaaggatggggctttctgaagggcaaactgcaatgattatttttgctgttctggtctctagccacccagcagag-ctactgggctctgggctggtagtggggagtgtctgcaaagtgaaatggactctgt--gggtccttggttttatttttcttcagtgtgctggttttgcgttggtggacctctagccaacaa-------------------------------------------------atggcattttccagagcttatcagctgcagctgtataggcaagagcaggcagttggtggggctatagagctcccaagagattatgtcctttgtcctcaataaccagggcaggtagagaaagaccaccaggtgaggacaaggataataggcatgtctgatctcatgcacaaggataggcatgtctgatgggccttgctgcaggtgctgtgggggatgggagtgtggttctcaggccaacagatgtatgttcacagagggattatggctgcccctactgagacatacc---agtcaccagggaagtgggggaaagattgcagtcacaggcctcacccagctcccacacaGCCTGCAGTCCACttaggagcattctgaccaaagtcgagagtttccccattctcaaaacactacagaactttgatttctaggcactacatttttttggtttttctacctcccaactgactgctttttcataatctcctttactaattttttactttctatttcacctctacaatttgagatctcacctggtataatccttaatttcctcctgttttctatctagtaattccttatgtgatatcaaccaatttgggttttaaataGACACAAGCAATAttccagttttggttac----cagt 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ttttctcctacttttcacatacaaaaatgtctcagctattgca----------tggttaatagttctggtccaaggaatagtt----ttaaaatttgaagacgtgattcttttgacttctagcttctaatatttctttgagaaattcaagccattttggtttctgattctctgtacttgacctgatttt-gctcttg-gtttaggatttttactttatctctgattctgaaatttcatgatcatgggcatcggt-----gtgaagatttt--tcatagttgggctcattggtttgtgggccatttcacatgatggatgctcttcatctttggaaa----tgttccgttcttcttttgcttctattgctagctctctg--ttccctttggaacattcacttatttgttcaacaaatatagttattaagcatcttctctgtgccaggcattgggatgctgtgctggaggtggcagcagtg---aaagcattgttctcactgagcaagttagtcagacattgggccttctcaactgagcctttaa-----tt---ttctttttattgtattcctcctttggttcatctactttgctctgttttctgaaagatgtctattgctttgtattccagatctcctaactgattaatttttaatttcaattcttttatttt---tttccagttgttccttcttattctctga-ttgtttcttttttatagtatcctgtggtttgtttttttcttctctgtctctgaggaaattaaccaaaac i canFam3.chr3 I 1321 C 0 a score=1334695.000000 s hg38.chr5_GL383530v1_alt 97255 400 + 101241 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ttttg-----------tttttttttaagta-ttctccattcccttcatagtctctattaactccagatt-cctttgtgg-ttatttatttgggtctcttttatgttggtggctttccctaaatgtctgatgattcttgtc--tctgtgctcatacttaagagttaagcactaaaatactgattaaatttgctgcctgcatgtgtgAATATATACTCTGGTAAATTGCTCTAAACGTC-ATTATGTGGCCAGGAGGT----AAAGGGAGG-AGAAAGTGGAATTGAGACTGGATGTAATTGTTAGGATCAGAATGTAGCATGCTTTGCCTACCAAGGTAAGCAGTTTAACCTTTACTTTATAAACACTGAGGAGCTAGATGATGGCTATACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCTTGTAG i ponAbe2.chr5 C 0 C 0 s nomLeu3.chr2 53859368 402 - 163208435 ttttg-----------tttttttttaagta-ttctccgttcccttcatagtctctattaactccagatt-cctttgtgg-ttgtttatttgggtctcttttatgttggtggctttccctaaatgtctgatgattcttgtc--tctgtgctcatacttaagagttaagcattaaaatactgattaaatttgctgcctgcatgtgtgAATATATACTCTGGTAAATTGCTCTAAaggtcaattaggtggctgggaggt----aaagggagg-agaaagtggaattgatactggatgtaattgttaggatcagaatgtagcatgccttgcctaccaaggtaagcagtttaacctttactttATAAACACTGAGGAGCTAGATGATGGCTATACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCTTGTAG i nomLeu3.chr2 C 0 C 0 s rheMac3.chr6 88136264 404 - 180491593 ttttg--------ttttttttttttaaata-ttct-cgttcccttcatagtctctattaactccagatt-cctctgtgg-ttgtttatttgagtctctttcatgttggtggctttccctaaatgtctgatgattctggtc--tctgagctcatacttaagagttaagcactaaaatactgattaaatttgctgcctgcatgtgtgAATTTATACTCTGGTAAGTTGCTCTAAAGGGCAATTATGTGGCCAGGAGGT----AAAAGGAGG-AGAAAGTAGAATTGAGACTGGATGTAATTGTTAGGATCAGAGTGTAGCATGCCTTGCCTACCAAGGTAAGCAGTTTAACCTTTACTTTATAAACACTGAGGAGCTGGATGATGGCTGTACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCCTGTAG i rheMac3.chr6 C 0 C 0 s macFas5.chr6 87988477 404 - 181584905 ttttg--------ttttttttttttaaata-ttct-cgttcccttcatagtctctattaactccagatt-cctctgtgg-ttgtttatttgagtctctttcatgttggtggctttccctaaatgtctgatgattctggtc--tctgagctcatacttaagagttaagcactaaaatactgattaaatttgctgcctgcatgtgtgAATTTATACTCTGGTAAATTGCTCTAAAGGGCAATTATGTGGCCAGGAGGT----AAAAGGAGG-AGAAAGTAGAATTGAGACTGGATGTAAATGTTAGGATCAGAGTGTAGCATGCCTTGCCTACCAAGGTAAGCAGTTTAACCTTTACTTTATAAACACTGAGGAGCTGGATGATGGCTGTACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCCTGTAG i macFas5.chr6 C 0 C 0 s papAnu2.chr6 85233467 405 - 174439528 ttttgt-------ttttttttttttaaata-ttct-cgTTCCTTTCATAGTCTCTATTAACTCCAGATT-CCTCTGTGG-TTGTTTATTTGAGTCTCTTTCATGTTGGTGGCTTTCCCTAAATGTCTGATGATTCTGGTC--TCTGAGCTCATACTTAAGAGTTAAGCACTAAAATACTGATTAAATTTGCCGCCTGCGTGTGTGAATTTATACTCTGGTAAATTGCTCTAAAGGGCAATTATGTGGCCAGGAGGT----AAAAGGAGG-AGAAAGTAGAATTGAGACTGGATGTAATTGTTAGGATCAGAGTGTAGCATGCCTTGCCTACCAAGGTAAGCAGTTTAACCTTTACTTTATAAACACTGAGGAGCTGGATGATGGCTGTACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCCTGTAG i papAnu2.chr6 C 0 C 0 s chlSab2.chr4 1948414 402 - 91010382 ttttg----------ttttttttaaaaata-ttct-cgttcccttcatagtctctattaactccagatt-cctctgtgg-ttgtttatttgagtctctttcatgttggtggctttccctaaatgtctgatgattctggtc--tctgagctcatacttaagagttaagcactaaaatactgattaaatttgctgcctgcatgtgtgAATTTATACTCTGGTAAATTGCTCTAAAGGTCAATTATGTGGCCAGGAGGT----AAAAGGAGG-AGAAAGTGGAATTGAGACTGGATGTAATTGTTAGGATCAGAGTGTAGCATGCCTTGCCTACCAAGGTAAGCAGTTTAACCTTTACTTTATAAACACTGAGAAGCTGGATGATGGCTGTACTTGAGGTGAGTTATTAGGAGTCTCTCCCTGTAG i chlSab2.chr4 C 0 C 0 s calJac3.chr2 112586801 395 + 204313951 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