##maf version=1 scoring=roast.v3.3 a score=523041.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 0 2074 + 93321 gatcctttggaggagaagaggcgttctggtttttggaattttcagcctttttgctctggtttctctccatcttcatggatttatctacctgtggtttctgatgttggtgaccttctgatggggtcactgagtggctgtcctttttgttgatgttgatgctattcctttttgtttgttagttttccttctaacagtcaggcccctctgctgcaggtctgttggggtttgccctaggtctactctagaccctgtttgcctgggtatcaccagcagaggctggagaacagccaagattgctgcctgtttcttcctctggaagttttgtcccagaggggcacccaccagatgccagccagagctctcctgtatgaggtgcctgttggcacctactgggaggtgtctcccagtcaggatacacgggggtcagggacccacttgaggaggcagtctgacccttatcagagctcgaatactgtgctgggagatctgctgctctcttcagagccatcaggcttttcaaagatgctttaagtctgctgaagctgtgcccacagccgccctttcccctaggtgctctgttccagggagatgggggttttatctataggtctctgactggggctgctgcccttttttcagagatgccttgcccagagaggagaaatctagagaggcagtctggctgctgtggccttgctgagttgtggtgggctccacccagttcaaactttctggtggctttgtttacacagtgggggtaaaactgcctactcaagccttggc-aatgtggaagcccctccccccaccaagctctagtgtcctaggtcaacctcagactgctgtgcaagaatttcaag-ccagtggatcttagcttgctgggctctgtaggggtgggacccgccgagccagaccacttggctccctggcttcagccccctttccaggagagagaatggttctgtcttgttggc------------------------attccagttgccactgtggcat-----aaaaaaaaaaaacctcctgcagctagctcggtgtctgcccaaacagctgcctagttttgtgcttgaaacctagggccttggtggcagaggcactggagggaatctcctggtctgtggattgtgaagaccatgagaaaagcatagtttctgggtggagtgcaccgttcctcatggtacagtccctcggggcttcccttggctaggggagggaattcccccaaccccttgcacttcttgggtgaggcaacgccccattctgctttggctcaccctccgtgggctgcacccactgtccaaccagtcccagtgagatgaaccaggtacctcagttggaaatgcagaaatcacctgcattctgcattgatctcactgggagctgcagactggagctgttcctatttggccatgttgccagcAAATTCTGAGATTTTTTTCAAAAGTGCAAAGAAAGACATCTGAGGGGTGCTGACATATTCGGGTCACCTCAAGCCACATGCCAGCTTGCTTGCCCCTGTTGGATTCAGCAGAGGGAGATAGGCCTTGCCATACCTGTGGTGTCTGCCAAAGCTTCCTCCTGGCAATTCTTGGGAGTGCTGATACCTGGGCCACAGTTAGTCCAAGTTTATCACTGAAGATCCTATCAAAGTTTTGTCTGAAATTCCACTTTTGCCTTTTGTCCTAA--GTGGTTGTGGACATCTCCAGGGGCTGATACCAAGGACTAGGAACAGCTGAGAGAGGCAGAAAGGTTCAGAGTACATCTCTATTTACAGGGAACAGAACACCGGCCTCCGAGAGTCCATGGAGCAATGGGAAAATTGCAGTGATTACTCATCACTGTGAAACTTCTACTTTGAATACAGTATCTTCTGGCAAGCATAGGGGACTGCAGTCGACAATGCTGCTGAATATACCTGAGTACATAGTAAGACATTTGTTTGGTAAACAGTCAATGCATACAATAAATTACCTTGAGAGGGCCATCTGTGCTCCAGATGTGAGAGTTCATGTGAATAGAATGGCTGCAATTCAAAGAATCTTCACAGGAAAACAGGGCTCAGAGCTCATCCACAATGGACAGACA s panTro4.chrUn_GL393536 32187 2076 + 173658 gatcctttggaggagaagaggcgttctggttttcggaattttcagcctttttgctctggtttctctccatcttcatggatttatctacctgtggtttctgatgttggtgaccttctgatggggtcactgagtggatgtcctttttgttgatgttgatgctgttcatttttgtttgttagttttccttctaacagtcaggcccctctgctgcaggtctgttggggtttgccctaggtctactctagaccctgtttgcctgggtatcaccagcagaggctggaaaacagcaaagattgctgcctgtttcttcctctggaagttttgtcccagaggggcacccaccagatgccagccagagctctcctgtatgaggtgcctgttggcacctactgggaggtgtctcccagtcaggatacacggggttcagggacccacttgaggaggcagtctgacccttatcagagcttgaatactgtgctgggagatctgctgctctcttcagagccatcaggcttttcaaagatgctttaagtctgctgaagctgtgcccacagccgccctttcccctaggtgctctgttccagggagatgggggatttatctataggtctctgactggggctgctgcccttttttcagagatgccttgcccagagaggagaaatctagagaggcagtctggctgctgtggccttgctgagttgtggtgggctccacccagttcaaactttctggtggctttgtttacactgtgggggtaaaactgcctactcaggccttggc-aatgtggaagcccctccccccaccaagctcgagtgtactaggtcaacctcagactgctgtgcaagaatttcaag-ccagtggatcttagcttgctgggctctgtaggggtgttacccgccgagccagaccacttggctccctggcttcagtcccctttccaggagagagaatggttctgtcttgttggc------------------------attccagttgccactgtggcatg---aaaaaaaaaaaaaactcctgcagctagctcggtgtctgcccaaacagctgcctagttttgtgcttgaaacctagggccttggtggcagaggcactggagggaatctcctggtctgtggattgtgaagaccgtgagaaaagcatagtttctgggtggagtgcaccgttcctcatggtacagtccctcggggcttcccttggctaggggagggaattcccccaaccccttgcacttcccaggtgaggtgacgccccattctgctttggctcaccctccatgggctgcacccactgtccaaccagtcccagtgagatgaaccaggtacctcagttggaaatgcagaaatcacctgcattctgcattgatctcactgggagctgcagactggagctgttcctatttggccatgttgCCAGCAAATTCTGAGATTTTTTTTAAAAGTGCAAAGAAAGACATCTGAGGGGTGCTGACATATTCGGGTCACCTCAAGCCACATGCCAGCTTGCTTGCCCCTGTTGGATTCAGCAGAGGGAGATAGGCCTTGCCATACCTGTGGTGTCTGCCAAAGCTTCCTCCTGGCAATTCTTGGGAGTGCTGATATCTGGGCCACAGTTAGTCCAAGTTTATCACTGAAGATCCTATCAAAGTTTTGTCTGAAATTCCACTTTTGCCTTTTGTCCTAA--GTGGTTGTGGACATCTCCGGGGGCTGATACCAAGGACTAGGAACAGCTGAGGGAGGCAGAAAGGTTCAGAGTACATCTCTATTTACAGGGAATAGAACACCGGCCTCCAAGAGTCCATGGAGCAATGGGAAAATTGCAGTGATTACTCATCACTGTGAAACTTCTACTTTGAATACAGTATCTTCTGGCAAGCATAGGGGACTGCAGTCGACAATGCTGCTGAATATACCTGAGTACATAGTAAGACATTTGTTTGGTAAACAGTCAATGCATACAATAAATTACCTTGAGAGGGCCATCTGTGCTCCAGATGTGAGAGTTCATGTGAATAGAATGGCTGCAATTCAAAGAATCTTCACAGGAAAACAGGGCTTAGAGCTCATCCACAATGGACAGACA 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aggtggagattaGTTCACCATTTCCTCATAAGAAGGTAATAAATAGTTTGGTGAAATAAAATGGTAGTACTGAGTAATTGTGGGCTTCTGGATAGGCAGTCAGGTTGATTTCATGTTGCTACTGCTGGACTTGAGGGCTGTGCTTGGCTGTGGTGGCAGATGCAGCAGCAGCtcaggatgatggtgatggtccACACCAGCCAGAACC i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 20270214 208 + 24206276 AGGTGGAGGTTAGTTCACCACTTTCTCATAAGAAGGTAGTAAATAGTTTGGTGAAATAAAATGGTAGCACTGAGTAATTATGGACTTCTGGATAGGCAGTCAGGTTGATTTCATGTTGCTACTGCTGGACTTGAGGGCTGTGCTTGGCTGTGGTGGCAGATGCAGCAGCAGCTCAGGATGATGGTGATGGTCCACACCAGCCAGAACC i chlSab2.chr29 I 3992 C 0 a score=747368.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 2292 285 + 93321 ACCAATGTTCATAGTAGTAGTTACAACACTGAGACTGCCCATAGCAGTGTCCTGTTGTGTCACAGATGTAGCTTTGATTGTTGGTACACACACAGGCTTCCTTATCCTGTGGGGGTTCAGCCCTGGCTGACACAGGGCTGGGCAGTGCCTAGAGGTGCAAGAGCTCCATGCCACCCAGGAGTCTTCCC---TCCATACTCCTCCTGCTCCTCCGACCCAG-CGTGGGCACC-TCCCTCCACCCTTGCTGCACTTC-TCCTCTACCCTCTTCTTCCTTCTTTTGTTCTTTTC s panTro4.chrUn_GL393536 34481 284 + 173658 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s panTro4.chrUn_GL393536 34765 1085 + 173658 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i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr15 99113906 1084 + 99152023 Ctgtaatacgttttgaaatcagattgtgaggccttcagctttgttcttattgctcaagagtcctttagctattcagggtcttttgtgtttccatataaattttcaaattgttttttctatttctgtgaagaatgacattggaattttgataaatattgctttaaacatataaatcactttggacagtaaggacattttaagaatattaattcttcctacccatgaacataaaatatctttccatgcatttgtgtcatatacaattttttcatcaatgttttatagtgttcagaatacagatctttcacctccttggttaaatgtactcctaaatacaatcctaaatgtgctcctatac-aaaaaaatgcagtttt-tttgatgctattgtgaatgagattaatttctttatttttgtcatatagtttgttgtcagcat----aaactacagagttttgtacattgattttgagttctgcaattttattgaattcatttatcatttctagtagctttttggtggagtttttagggtttcctgtatataatatgttatcatcaaacagagacaactttaattcttccttttcaatttgaatatcttttatttctttatttggcttaattgctctggctaggacttccagaaataagttgaatagaagtagtgagaataaatatccttgtcttgttcttgatcttagaggaaaagatttcactttttcattgttgggtatgatgtgagctgtgagcttgttatatatgtcctgtttggtgttaaggtacatgccttctatgcccaatttgttgagaagttttgtcatgaaaggattttgaattttgtcaaatgcttttt-------------------------------ctgtatatatagagatagctat-ttttttatccttcattctgttaatgtggtttatcacatttgatttgtgtatgttgaaacatctggagggtaaatccactttctcatggtaaatgttctcctaatgtgttgttaaattctgtttgctagtac-tttttttgagcacttttgtatctatgttcatcagggatattgtttggcccatacttttcttatagtgtccttgtctgcctt i ponAbe2.chr15 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 99846701 1079 + 99891981 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i nomLeu3.chr17 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 81488532 1062 + 170124641 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i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 e rheMac3.chr7 81489595 870 + 170124641 I e papAnu2.chr7 76279130 814 + 162156779 I e macFas5.chr7 82995952 815 + 171882078 I e nomLeu3.chr17 99853659 2011 + 99891981 I e chlSab2.chr29 20271778 810 + 24206276 I a score=16100.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 17579 17 + 93321 ctacaaatccttatccc s panTro4.chrUn_GL393536 46327 17 + 173658 ctacaaatccttatccc i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s macFas5.chr7 82996767 17 + 171882078 ctacaaatccttatccc i macFas5.chr7 I 815 C 0 s papAnu2.chr7 76279944 17 + 162156779 CTACAAATCcttatccc i papAnu2.chr7 I 814 C 0 s chlSab2.chr29 20272588 17 + 24206276 ctacaaatccttatccc i chlSab2.chr29 I 810 C 0 e rheMac3.chr7 81489595 870 + 170124641 I e nomLeu3.chr17 99853659 2011 + 99891981 I a score=1652787.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 17596 1292 + 93321 tgatcaacacagatgtaaaaatactcaacaaaattctagcaaactgaagctaacaacacatcaaaaagataattcatcatgatcaagtgggctttattccaggggtgcttgaatggttcaaaatagacaaatcaataaacatgattcaccacataaatggaactgagaacaaaaaccctatgatcatctcattagatgcagaataagcatttgataaaatccaacatctgtttatgataaaaaccctcaacaatataggtatagatggagtatacctcaaaaaatgagtcatctatgacaaagccacagccaacatcatcctggatgggcaaaagttagaagtgttgcttctagaaactggaaaaaagcaaggatgttcaccttcatcattcctattcaatacagtactggaagtgctagccagaactatcagaaaggagaaagaaataaaaggtatacaaattag---aaaagaagtcaaatgatctctgctcactgatgacatgactgtaggcctagaaaaccctaaagtctt-cagaagactcctagacttgatacacgacttcagtaaagtcttgggataaa----caagccacaaaaatcagttgtatttctatacaccaaatacattcaagctgtttgaatgtttgttgagattaatttgttgagaaccaaattaagaactcaactgaatttacaatagccatgaaaaatacctaggaatgcataactatataaatgaaagatctctacaaggagaactacaaaatactaatgaaagaaattatagatgacataaacaaatgg---aaaaacatcccatgctcatggattagaaaaatcaatagctaaagtgaccatatcacccata-caatctatagagttaatgcaattcccatcaaattaccaacgttatttctcacaaaattaaaaaaaaatcctaaagttcacatggagccaaaaaaaga-tccctaatagccaaagcacttctaagcaaaaaacaaagcAAAACAAAACAAAGCCCCCAGAGCAAAAGACAAATATGGTTCCTACAAatgaagaccaatggtaatgcttatctgttcgtggtagaagtgtaaattggtaggattgttaaaaaaaatagtgtagcatttcatggtaatgttgaataactcaataattttacttttaaatatataccccagaggatatcttgcacatatgaaccaggtgatttacaaaagaatgttcatagcagcattgtttgtaatggttaaaaactggaaaaatttcaagtgttcatcaacaatagatctgag s panTro4.chrUn_GL393536 46344 1293 + 173658 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i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s rheMac3.chr7 81490465 1301 + 170124641 tgatgaacacagatgtaaaaatactcaatgaaattgtagctaactgaagccaacagcacatcaaaaagataattcatcatgatcgagtgggctttattcctgggatgcttgaatggtttaaaatccacaaatcaataagcatgattcaccacataaacagaactgagaacaaaaaccctatgatcaactcattagatgcagaatacgcatttgataaaatccaacatctatttatgataaaaaccctctacaatataggtatagatggaatatacctcaaaaaatgagtcctctatgacaaagccacagacaatatcatcctggatgggcaaaagttggaaatgttgcttctagaaactggagaaaagcaaggatgttcactttcatcattcctattcaacacagtgctggaagtgctagccagaactatcaggtaggagaaagaaataaaaggtatacgaattagaaaaaaagaagtcaaattatctctgttcactcatgacatgattgtatgcctagaaaatcctaaagtcttgcagaggactcccagacttgataagtgacttcagtaaagtctcgggataaaaaatcaagccaccaaaatcagttgtatttctatacaccaaaaacattcaagctgtttgaatgtttgttgagattaatttgttgagaacaaaattaagaactcaactgaatttacaataaccatgaaaaatacctaggaatacataactatataaatgaaagatctctacaagaagaactatagaacactaatgaaagaaattacagatgacataaataaatgg--aaaaaacatcccgtgctcatggattaaaaaaatgaatagctaaaatgaccatatcacccaaagcaatctatagagttaatgcaattcccatcaaattacgaacattatttttcacaaaatt-aaaaaaaattctgaagttcatatggagccaaaaaaata-tcccaaatagccaaagaacttctaagcaaaaaacaaagcaaaacaaaacaaaGGCCCCAGAACAAAAGACAAATATCATGCCTAaggatgaagagcaatggtaatgcttgtctgttcatggtagaagtgtaaatttgtaggattatttaaaaaaatactatagcatttcgtggtaatgttgaataactcaataattttacttttaaatatatactccagaggatatcttgcacatatgaaccaggtgatatacaaaagaatgttcatagcagcattgtttgtaatggttaaaaactggaaaaatttcaagtgttcatcaacaatagatttgat i rheMac3.chr7 I 870 C 0 s macFas5.chr7 82996784 1301 + 171882078 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i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 76279961 1298 + 162156779 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i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 20272605 1299 + 24206276 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i chlSab2.chr29 C 0 C 0 e nomLeu3.chr17 99853659 2011 + 99891981 I a score=525504.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 18888 313 + 93321 gaatgaagtctgacatattcttgtagtggaatatcatatagcaatacgaatggatgaattacaccaacat---tcaacaaggttgtaatatgcaaacttattattgaatcaaggtgaaagtaccttctgataaaggtgaaagaacttctacaaaataatttcatttatataagtttcaaagaaccaaactaaataatgcatcacttgagaaccattaaagtctattaaaaaacacatacaatgcaatggaaggacagtggtcatatccagcaggaaataaaggagaacacaattggcaaggagcacccaatgggcg s panTro4.chrUn_GL393536 47637 313 + 173658 gaatgaagtccgacatattcatgtagtggaatatcatatagcaatacgaatggataaattacggcaacat---tcaacaaggttgtaatatgcaaacttactattgaatcaaggtgaaagtaccttctgataaaggtgagagaacttctacaaaataatttcatttatataagtttcaaagaaccaaactaaataatgcatcacttgagaaccataaaagtctattaaaaaacacatacaatgcaatggaaggatagtggtcatatccagcaggaaatacaggagaacacaattggcaaggagcacccaatgggcg i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s nomLeu3.chr17 99855670 313 + 99891981 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gaatgaagtccgacatattcatgtagtagaatatcatttagcaatacgaatggatgaactacagcaacattcatcaacaaggttgtaatatgcaaacttatttttgaatcaaggtgaaagtaccttctgataaaggtgaaagaa---ctacaaaataatttcatgtatataagtttcaaagaaaaaaac----taatgcatcatttgagatccattaaagtctattaaaaaacgaatacaatggaatggaaggatagtggtcatatcaagtaggaaataaaggggaacacaattggcagggagcgctcaatgggca i macFas5.chr7 C 0 C 0 s papAnu2.chr7 76281259 309 + 162156779 GAATGAAGTCCGACATATTCATGTAGTAGAATATCATTTAGCAAGACGAATGGATGAACTACAGCAACATTCATCAACAAGGTTGTAATATGCAAACTTATTTTCGAATCAAGGTGAAAGTACCTTCTGATAAAGGTGAAAGAa---ctacaaaataatttcatttatataagtttcaaagaaaaaaac----taatgcATCATTTGAGATCcattaaagtctattaaaaaatgaatacaatggAATGGAAGGATAGTGGTCATATCCAGTAGGAAATAAAGGGGAACACAATTGGCAGGGAGCACCCAATGGACA i papAnu2.chr7 C 0 C 0 s chlSab2.chr29 20273904 308 + 24206276 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tctaaggcactagtaaatttcta-tttTGTTTCCAATCCTCCAAGACATCTAGttttttaattttttatttttctgagacatg----------gtggcccaggctggagtacaatagtgtgatcttggctcactgcaacctgtgtcctgggcttaagtgatcctcccacctcggcctcccaaagtactgggattacaggtgtgagccaccatggccagcaaatgttctatttCATATCctgtatggtggacacatagatgttctcttttttattattccttgaacactaagtatatgtttttttatattctctgtGGAATACCTCCTTATTTCTCAGTCAATTCAGGATACCTCCTTACCCCCATCCCCTTTTTACTTTTCATCATGTCATATAGTTTCTGAAATATAGAAAAGCTTACATATTATCCTGTCATCAGAGCGGCATGGAGGCATTTGGTAGAATAAATATTATTTGTTGATTattcatcctttcctttcactttacagagtcaatcaaacaccaggtcatgttaattttactgtcacgcacatatcttgaatttgcctccttatctctatttccactattcagttcagaccttgataatcactcatctgcgttgtagttgcatttttctaattattct----gtttctagtcttgttctaaaacctcttttcctcccacaatgcagctagagtggtcaatttaa i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr19 60657792 696 - 60714840 TCTAAGGCACTAGTAAGGTTCTA-TTTTGTTTCCAATCCTCCAAGACATCTAGtttttttatcttttatttttctgagacatg----------gtggcccaggctggagtgcaatggtgtgatctcagctcactgaaacctgtgtcctgggcttaagtgatcctcccacctcggcctcccaaagtgctgagattacaggtgtgaaacaccacagccggcaaatgttctatttCATATCCTGTATGGTGGACACATAGATGTTCACTTCGTTATTATTCCTTGAACACTAAGTATA--TTTTTTTATATTCTCTGGGGAATATCTCCTTATTTCTCAGGCAATTCAGGATACCTCCTTACCCTCACCCCCTTTTTACTTTTCCTCGTGTCATATAGGTTCTGAGATATAGAAAAGCTTACATATTAACCTGTCATCAGAGCGGCATGGACGCATTTGGTAGAATAAATATTATTTGTTGATTattcatcctttcccttcactttacagagtcaatcaaacactaggtcatgttaattttactttcacacacatttcttgaatttttctccttatctctgtttccactattcagttcagaccttgatcgtcactcatctgcattgtagttgcatttttctaattattct----gtttctagtctcgttctaaaatcttttttcctcctacaatgcagctagagtggtcaatttaa i ponAbe2.chr19 N 0 C 0 s nomLeu3.chr17 99855983 696 + 99891981 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TTTAGTCTGT-----GG----------------GGTTTTTTTTTGGTTGTTGTTTTGT--------GTTTGTGTGtgtgctattacaaaggaatgccagaggctgggtaatttta---aagagaggtttatttggctcacggt-ctggaggtgtgcaagaagcatggcaccactatctgctt-tggtgagggctttagactgtttccacccatggcagaaggggaagagaagctggaatgtgcagaggtcacatggagatagaggaaggggtttgtgccaggctcctgttaacaaccagctcttgtgggaattaagagagtaagaact i calJac3.chr19 C 0 I 327 e canFam3.chr7 46756218 175 - 80974532 I a score=2073753.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 29282 949 + 93321 aggtaggcacggtggcttacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaataccaaaaattagctgggcatagtggtgggtacctgtaatcctagctactctggaggctgacacaggagaatgggttgaacccgtgaggtggatgttgcagtgagccaagatcgcaccactacattccaacctgggcagcaagagtgaaactacatctcaaaaagaaaaaaa-------gagcgagcaagaactcactt--------ggatggcaccaagacattcgtgagaggtccacactcaggaccaaaacacctcccattaggccccacctccaacaatggggatcacatttcaacatgagtttggagtggtcaaatatccaaaccctagcagttcccttaaccctggaaagagacccttcattaaactctttctgcttaatcctttgagagtgcaacaatttcctgctaggaccctgacggataGAGGGACCATAC--AGATCactaaaatgctgaggaatttttcaaatgaactgcacccaacagacctccctgattctgaatatatcaaacttttattttttattttattttatttta-ttttttgagacggaatctcgccctgtcacccaggctggagtgcagtggtgcgatctcggctccctgcaacctccacctcctgggttcaagcgattctcctgccttagcctcccgagtagctgggactacaggcatccaccagcaggcccggctaattttttatttttagtagagatggggtttcaccatgttgaccgggctggtcttcaactcccgacttcatgatccacccaccttggcttccctaagtgcttggattacaggcgtgagccgctgcacccagccaaact-taaaaa s panTro4.chrUn_GL393536 59126 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panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6166699 950 + 229942017 aggtgggcacggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggcggatcacctgaggtgaggagtttgagaccaacctggccaacatggtgaaaccctgtctctaccaaaaataccaaaaattagctaggaatagtggcaggcacctgtaatcccagctactcaggaggctgacacaggagaatgggttgaacctgcgaggtgcaggttgcagtgagccaagatcacaccactgcacgccaacctgggcagcaagagtgaaactccatctcaaaaagaaaaaaa-aagagagagtgagcaagaactcactt--------ggatggcatgaagacattcacgagagggccacactcaggaccaaaacgcctcccattaggcgccccctccaacaatggggatcacatttcaacatgagtttggagtggtcaaatatctaaaccctagcagttcccttaaccctggaaagagacccttcattaaactctttctgcttaatcctatgagagtgcaacaatttcctgctaggaccctgacagataGAGGGACTATAC--AGACCactaaaatgctgaggaatttttcaaatgaactgcacccaacagacttccctgattctgaatatatcaaac-----tattttattttattttatttat-ttttttgagatggaatctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggtgcagtctcggctccctgcaacctccgcctcctgggttcaagcgattctcctgccttagcctcccgagtagctgggactacaggcgtccaccagcacgcccagctaattttttatttttagtagagatggggtttcaccatgttgaccaggctggtcctgaactcctgactttgtgatccgcccacctcagcttcccaaagtgcttggattacaggtgtgagccgctgcccccagtcaaact-ttttta i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s 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aggtgagcacggtggcttacgcctgtagtcccagcactttgggaggccaaggcgggcgaatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatac-aaaaattagctgggcatattggtgggcacccgtaatcccagctattcaggaggctgagacaggagaatgggttgaaccttggaggtggaggttgcagtgagccaagattgcaccattgcactccagtctgggcaacaagagcgaaactca--ctcaaaaaaaaaggag--agagagagagagcgagaactcactcatcaccaagggtggcaccaagacattcatgagaggtcctcactcatgcccacaacacctccccttaggccctgcctccaacaat-gggatcacatttcaacatgagtttggaatggtcaaatacccaaaccctagtagttcccttaaccctggtaagagacccttcatcaaactctttctacttaaccctttgagagtacaacaattttctgctaggaccctgacagataGAGGGACCAtac--agaccactaaaacgctgaggaagttttcaaatgaattgcacccaacagacct-cctgattctgaatatatcaaacttttagtttttattttatttg-------tatttttagatggagtctcacgctgtcgccaaggctggagtgcagtggtacaatctcagctcactgcaacctccgcctcccaggttcaagtgattctcctgcctcagcctcccgagtagctggtactacatgtgcatgtcaccacacctggctaattttttatttttagtagagactggatttcaccatattggccaggctggtcttgaactcctgacctcatgatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggatgacaggcatgagccaccgcgcccggccaaactgtttttt i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206110566 945 + 220367699 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chlSab2.chr25 5709287 952 - 85787240 aggcgagcatggtggctcgcgcctgtagtcccagcactttgggaggccaaggcaggcgaatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatac-aaaaattagctgggcatagtggtgggcacctgtaatcccagctattcaggaggctgagacaggagaatgggttgaaccctggaggtggaggttgcagtgagccaagattgcaccattgcactccagtctgggcaacgagagcaaaactca--ctcaaaaaaagaggag--agagagagagaatgagaactcactcatcaccaaggatggcaccaagacattcatgagaggtcctcactcatgcccacaacacctcccattaggccccgcctccaacaat-gggatcacatttcaacatgagtttggagtggtcaaatacccaaaccctagtagttcccttaaccctggtaagagacccttcatcaaactctttctacttaaccctttgagagtacaacaattttctgctaggaccctgacagataGAGGGACCAtac--agaccactaaaacgctgaggaagttttcaaatgaactgcacccaacagacct-cctgattctgaatatatcaaacttttagtttttattttatttg-------tatttttagatggagtctcactctgtcgccaaggctggagtgcagtgctacaatctcagctcactgcaacctccgcctcccaggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccgagtagctggtactacatgtgcatgtcaccacacctggctaattttttatttttagtagagactggatttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcatgatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggatgacaggcataagccaccacgtccggccaaactgtttttt i chlSab2.chr25 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46756218 175 - 80974532 I e calJac3.chr19 37761424 327 + 49578535 I a score=11464.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 30231 4 + 93321 aaaa s panTro4.chrUn_GL393536 60076 4 + 173658 aaaa i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6167649 4 + 229942017 aaac i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 116200 4 - 172226 aaaa i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215185976 4 + 229590362 aaaa i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6419684 4 + 227556264 aaaa i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206111511 4 + 220367699 aaaa i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5710239 4 - 85787240 aaaa i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37761751 4 + 49578535 aaaa i calJac3.chr19 I 327 C 0 e canFam3.chr7 46756218 175 - 80974532 I a score=464414.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 30235 142 + 93321 c--cccaa--atagtactttgaacttcacccgcagggagttattcaaattggttgt-cagccagttatttcaggttgttgagatcatctggctcttgattttattaatcatcttagccttccctttcaacaatttgccgactttgtg s panTro4.chrUn_GL393536 60080 144 + 173658 aaacccaa--atagtactttgaacttcacccgcagggagttattcaaattggttgt-cagccagttatttcaggttgttgagatcatctggctcttgattttattaatcatcttagccttccctttcaacaatttgccgactttgtg i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6167653 142 + 229942017 c--cccaa--atagtactttgaacttcacctgaagggagttattcaagttggttgt-cagccagttatttcaggttgttgagatcatctggctcttgattttattaatcatcttagccttcccttccaacaatttgccgactttgtg i ponAbe2.chr1 C 0 I 504 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 116204 141 - 172226 c-ccccaa--atagtactttgaacttcacctgcagggagttattcaagttggttgtccagccagttatttcaggttgttgagatcatctggctcttgattttattaatcatcttagccttcccttccaacaatttgcctacatt--- i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215185980 142 + 229590362 c--ccaaa--atagtactttgaacttctccagcagggagttattcaagttggttgt-cagccagttatttcaggttgttgagatcatctggcttttgattttattaatcatcttaaccttcccttccaacagtttgccaactttgtg i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6419688 142 + 227556264 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chlSab2.chr25 C 0 I 308 s calJac3.chr19 37761899 167 + 49578535 caaattttatta-------ctatgtgatctccaccttcatccaTGgagaggcagtata-gtatcatgaggaaaaataggctttggagtaagtagaaattaggtttgaattaccagccacatggcttgggaaacattacttaaactc--tcagcttctatttctttatctataaggta i calJac3.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr7 46756530 171 - 80974532 caaattttattagtatgTGATATGTGATCTCTACCTCTATCCATGgagaggcagtata-gtatcatcacgaaaaattgactttggagtagatcg-agttaggtttgaattact----atgtgactttggaaaaatcacttaaactttatgagtttcaatttcttcatctataagata i canFam3.chr7 C 0 C 0 a score=-11167.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 30546 66 + 93321 tagataCCTTACCTTTATCTATACCTTATAGATACctttatctataaggtatagatctttatctat s panTro4.chrUn_GL393536 60393 6 + 173658 -----------------------------------------------ggtata------------- i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6168465 6 + 229942017 -----------------------------------------------ggtata------------- i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 116507 6 - 172226 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papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5712867 34 - 85787240 GATTTCTTTTTGACATAGAATTATTTAAGATAAA i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37763811 33 + 49578535 GATTTCTTTTTGACATAGAATT-TTTAGGAAAAA i calJac3.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr7 46757468 29 - 80974532 GATTTCTTTTTGACATAAGA---ATTGAGAGA-- i canFam3.chr7 I 146 C 0 e panTro4.chrUn_GL393536 61461 42 + 173658 I a score=1681191.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 32244 533 + 93321 GCTTTTAAATTTCCATGCTGTAATTTCTAGTTTTGTTGTGTCATAATCAGAGAATATAATCTGTAGCATTTCTACATTCTCTACTTTGCTTAGA-TGTTTT-TAGGGTGGGG----TGTGTAATATGTACTGAATTTTGTAAACATTTTATGGACATACA-AATTTCAATGTTTACTTTTTCAGGCTATAGGCTTTGCTACATAATCTT---TGTGTAT--TTTTTGGTCC--TCATATAGATTTTTTAATTACCTTTTTGCTGTGATA-GAGATTAGAAGG---GTAAATTAATGTCTCATTTACCATCATTTTTCTTTCTGTATCTCTTTTCATTTCCTGATGCTTTGGCTTTATGAAATCTTTATGTAT-AAAAATTGTGCACACATATCTTTATGCACAGTGTTTTGGATTTTACCCTTCATAATGAGCTTTTT-------TCTCTCCTTTGAATTTGACCTGGCCTGGTGTTAACAGCCCAGGTGTAAAATTCCAGTGAGAAAGAAGTCTGATGAGGAGTCAGTAGGATCTTTGTGTTGCTGAGAACTGCTCAG s 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CTTTCAACATTTCTGCTGGGGCCTTGCATTGAGCAAATTCAACCGTAATATAGAGAGCAGGGACTCCTGAGTGGCACATTCAGTGGGAGTCAG i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215198142 93 + 229590362 CTTTCAACATTTCTGCTGGGGCCCTACATTGACCAAACTCACCCGTAATCTAGAGAGCAGGGACTCCTGAGTGGCACATTCAGTGGGAGTCAG i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6431884 93 + 227556264 CTTTCAACATTTCTGCTGGGGCCCTACATTGACCAAACTCACCCGTAATCTAGAGAGCAGGGACTCCTGAGTGGCACATTCAGTGGGAGTCAG i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206123807 93 + 220367699 CTTTCAACATTTCTGCTGGGGCCTTACATTGACCAAACTCACCCGTAATCTAGAGAGCAGGGATTCTTGAGTGGCACATTCAGTGGGAGTCAG i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5722457 93 - 85787240 CTTTCAACATTTCTGCTGGGGCCTTGCATCTACCAAACTCACCCGTAATCTAGAGAGCAGGGATTCCTGAGTGGCACATTCAGTGGGAGTCAG i chlSab2.chr25 I 321 C 0 s calJac3.chr19 37773019 91 + 49578535 CTTTCAACGTTTCCGCTGGGTCC-TGCAGCGACCAAACTCAACTGTAATCTAGACAGCAGAGAA-CCTGAGTGCCACATTCAGTGGGCGTCGG i calJac3.chr19 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46766839 51 - 80974532 I a score=731500.000000 s 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CTTCCTAgggaatcattcattcattcattcattcattcattcattcatttatttatgagacagagtcccgctctgtagcccaagctggaatacagtggtgtgatcttggctcactgcgacctccacctcccaggtccctgttcaagtaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcacgtgtcaccatgcccagctaatttgtgtatttttagtagagacagggtttcaccatgttggccaagctggtcttgaactcctgaccttgtgatccacccgcctcggcctcccaaattgctgggattacaggtgtgagccactgcgccctgg i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5722550 321 - 85787240 CTTCCTAGGGAATTAtttatttatttattt--------------------atttatgagacagaatcctgctctgtagcccaagctggaatgcagtggtgtgatcttggctcactgtgacctccacctcccaggtccctgttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcacgtgtcaccatgcccagctaatttgtgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttggccaagctggtcttgaactcctgaccttgtgatccacccaccttggcctcccaaattgctgggattacaggtgtgagccactgtgcccTGG i chlSab2.chr25 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46766839 51 - 80974532 I e calJac3.chr19 37773110 0 + 49578535 C a score=639235.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 41685 224 + 93321 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0 C 0 s ponAbe2.chr1 6179695 2 + 229942017 AT i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 128046 2 - 172226 AT i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215198783 2 + 229590362 AT i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6432525 2 + 227556264 AT i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206124464 2 + 220367699 AT i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5723094 2 - 85787240 AT i chlSab2.chr25 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46766839 51 - 80974532 I e calJac3.chr19 37773334 59 + 49578535 I a score=1017647.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 41911 395 + 93321 GGGGGGCCGGTAGTCCTCCTTTCAGACATCTTTTTTT--------------------------TCTCTGCCCCAACAAGTGGCCTTTCCATAGAAGACTGCCCAGAGAACCCTATGGCAAcc-ctaccctcttattccactttatttttcttcaaagtgtttattactccctgttgttatgttagactctatatttctgtatttgctgtcctccaacttgaaaagaacctctgagaggggagggactttcctggtcacattcactt---gtcccagcacctgcgatggtgcctgacatatctcaggggctccttaaatatttattgCTAGACAATGGGTATCATGGCTCAGCCTCCTCTGGGGTTACGAGGCTGGAGGAAAGAAACTTTAGCATGAGTGCAGTGAGAGTAAAAGAATTCAGCAGC s panTro4.chrUn_GL393536 71170 395 + 173658 GGGGGGCCCGTAGTCCTCCTTTCAGACATCTTTTGTT--------------------------TCTCTGCCTCAACAAGTGGCCTTCCCATAGAAGACTGCCCAGAGAACCCTATGGCAAcc-ctaccctcttattccactttatttttcttcaaagtgtttattactccctgttgttatgttagactctatatttctgtatttgctgtcctccaacttgaaaagaacctctgagaggggagggactttcctggtcacattcactt---gtcccagcacctacgatggtgcctgacatatctcaggggctccttaaatatttattgcttgaCAATGGGTATCATGGCTCAGCCTCCTCTGGGGTTAGGAGGCTGGAGGAAAGAAACTTTAGCATGAGTGCAGTGAGAGTAAAAGAATTCAGCAGC i panTro4.chrUn_GL393536 C 0 N 0 s ponAbe2.chr1 6179697 392 + 229942017 GGGGGGCCCATAGTCCTCCTTTCAGACATCTTTTGTT--------------------------TCTCTGCCCAAACAAGTGGCCTTCCCATAGAAGACTGCCCAGAGAACCCTACGGCAAcc-ctaccctcttattccacttcatttttcttcaaagtgtttattactccctgttgttatattagactctatatttctgtattttctgtcctccaactt---aagaacctctgagaggggagggactttcctggtcacattcactt---gtcccagcacctacaatggtgcctgacatacctcaggggctccttaaatatttgttgCTTGACAATGGGTATCATGGCTCAGCCTCCTCTGGGGTTAGGAGGCTGGAGGAAAGAAACTTTAGCACGAGTGCAGTGGGAGTGAAAGAATTCAGCAGC i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s 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CATCAGACATCTAGAACATAATAGTATTTTAAAATTCTGCAGGGACATCCACCAGGCTGAGGGGGACCAATTTTGTTTT-AAACATGTATCCTGAACTTggccgggcatggtggctcatgcctgtaatcgcagcactttgagaggccaaggtgggcagatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaatgtggcgaaatcctttgtctattaaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggtgtgtacctgtaatcccagctgctgggaaggctgaggcaggagaattgcttggaccggggaggtggaggttgcagtgaggtgagatcatgccactgcattccagcctggccaacaagagcaaaattccatctcaaaaaaaaaa-G-----------tatcccaaacttggaagtaaaaatagg-atgactgcacgtctttctaatgccatactggaaggttgcctaacaaaccaccaaag-------c--tttttttaactctcta i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6188507 499 + 229942017 CATCAGGCATCTAGAACATAATAGTATTTTTACATTCTGCAGGGACATCCACCAGGCTGAGGGGGACCAATTTTATTTT-AAAAATGTATCCTAAACTTggccgggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgagaggccaaggtgg-----ccacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacgtggtgaaatcctgtgtctattaaaaaatacaaaaattagccagatgtggtggtgtgtacctgtaatcccagctgccgggaaggctgaggcaggagaattgcttggactggggaggtggaggttgcagtgagctgagatcatgccactgcattccagcctggccaacaagagcaaaattccatctcaaaaaaaaaa-aaaaaaaaaaattatcccaaacttggaagtaaaaatagg-atgactgcacgtctttctaatgccatactggaaggttgcctaacaaaccaccaaag-------c--tttttttaactctcta i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 135120 496 - 172226 CATCAGGCATCTAGAACATAATAGTATTTTTACATACCGCAGGGACATCCACCAGGCTGAGGGGGACCAATTTTATTTCAAAAAATGTATCCTAAACTTggctgggcacggtggcttatgcctgtaatcccagcactttgagaggccaaggtgggcagatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggtcaacatggcgaaatcccgtgtctactaaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcgtgcacctgtaatcccagctgctgggaaggctgaggcaggagaattgcttggaccggggaggtagaggttgcagtgagctgagatcatgccactgcattccagtctggccaacaagagcaaaattccatctcaaaaaaaaaaTG-----------tatcccaaacttggaagtaaaaataggaatgactgcacgtctttctaatgccatactggaaggttgcctaacaaaccaccaacg-------c--ttttttcaactctcta i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215206258 491 + 229590362 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papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5733035 289 - 85787240 AAAGACCAAGGGTTGCTCACCAGAAGCCTGGGGCATTCAGGTGAAAGGCTGTTCTGCAGGGAAGGAGGGAAACAGAGCAGGCTGAGATGGACCGTCAACCTTGAAAGACCTTACACAGTCCCTGCCAGGATAATCTTTGCCTCTCCCTTCTACTGGGGAAAAGTCTGGATTGCTAAGACCAGGGTCTCTATAGCGGCATCTCTAACACTCAGGCCCAGTCTCACGGCTGGGTTCCTGTTCTTTTCATTTGCGTGTGCCCCTCAGTGGGATCCTCTGACTCAGCTCCTTT i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37783236 288 + 49578535 aaaGACCAGGGGTTGTTGACCAAAAGCCTGGAGCATTCAGGTGAAAGGCTGTTCTGCAGGGCAGGAGGGAAACAGAGCAGGGTGAGATGGACGGTCAACCTTGAAAGGCTTTACACAGTCCCTGCTAGGTTAGCCTTTGCCTCTCCTTTCTACTGGGGAAAAGTCTGGATTGCAAAGACCAGGGTCTCTATAGTGGCGTCTCAGACACGCAGGCCTGGCTTCACAGCTGGGTTCCTG-TTTCTTCATTTGCTCATGGCCCTCCGTGGTATCATCTGATGCAGCTCCTTT i calJac3.chr19 I 317 I 10 s canFam3.chr7 46782416 130 - 80974532 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i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37784180 1078 + 49578535 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- 228333871 ggaccacaggcatgcaccagcatgcccACCTAAACACAGTCTACCTTTACGTGTG--TGTGTCCATCCATCACCAGATGCTCACGGAAGGTAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATTTTTACCTTTGAAGAGTAATCTTAATGATAACCTAGCAGGTGCTCAGATACATCAGGTCGATTCACttcctatgact i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6193286 194 + 229942017 ggaccacaggcatgcaccaccatgcccacctaaACACAGTCTACCTTTACGTGTGCATGTGTCCATCCATCATCAGATGTTCATGGAAGGTAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATTTTTCCCTTTGAAGAGTAATCTTAATGATAACCTAGTAGGCGCTCAGATACATCAGGTtgattcacttcctatggct i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 139852 194 - 172226 ggatcacaggcatgcaccactgtgcccATCTAAACACAGTGTATCTTTACGTATGTGTGTGTCCATCCATCACCAGATGCTCATGGAAGGTAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATGTTTCCCTTTGAAGAGTAATCTTAATGATAACCTAGCAGGTGCTCAGATACATCAGGTCGATTCACttcctatggct i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215211173 192 + 229590362 ggaccacaggcatgcaccaccatgcccACCTAAATACAGTCTATCTTTATGTGTG--TGTGTTCATCCATCACCAGATGCTCATGGAAGGTAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATTTTTCCCCTCAAAGAGTCATCTTAATGATGACCTAGTACGTGCTCAGATACATCAGGTCGATTCACttcctatggct i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6446484 192 + 227556264 ggaccacaggcatgcaccaccatgcccacctaaATACAGTCTATCTTTATGTGTG--TGTGTTCATCCATCACCAGATGCTCATGGAAGGTAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATTTTTCCCCTCAAAGAGTCATCTTAATGATGACCTAGTATGTGCTCAGATACATCAGGTCGATTCACttcctatggct i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206136625 192 + 220367699 ggaccacaggcatgcaccaccatgcccacctaaacACAGTCtatctttatgtgtg--tgtgttcatccaTCACCAGATGCTCATGGAAGGTAGGgcagaaacattttgaaaaataatttttcccttcAAAGAGTCATCTTAATGATGACCTAGTATGTGCTCAGATACATCAGGTCGATTCACTTCCTATGGCT i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5735338 192 - 85787240 ggtccacaggcacgcaccaccatgcccACCTAAACACAGTCTATCTTTATGTGTG--TGTGTTCATCCGTCACCAGATGTTCATGGAAGATAGGGCAGAAACATTTTGAAAAATAATTTTTCCCTTTAAAGAGTCATTTTAATGATGACCTAGTAGGTGCTCAGATACATCAAGTCGATTCACTGCctatggct i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37785656 187 + 49578535 ggactgcaggcatgcactaccacgcccACCGAAACAC----TATCTTCATGTGTG--TGTGTCCTTCCATCACCAGATGCTCATGGAAGGTAGGGCAGAAAGATTTTGAAAAATCATTTTTTCCTTATAAGAGTCATCTTCATGAT-ACCTAGTGGGTTCTCTGATACATCAGGTAAATTCACTTCCTGTGGCT i calJac3.chr19 C 0 I 637 e canFam3.chr7 46784364 90 - 80974532 I e tupBel1.scaffold_144562.1-76688 9774 1673 - 76688 I a score=71994.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 52544 31 + 93321 gtgtaacaaattaccacaaacttggtgattt s panTro4.chr1 5953393 31 - 228333871 gtgtaataaattaccacaaacttggtgattt i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6193480 31 + 229942017 gtgtaacaaattaccacaaacttggtgattt i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 140046 31 - 172226 gtgtaacaaattaccacaaacttggtgattt i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215211365 31 + 229590362 gtgtaacaaagcaccacagacttggtgattt i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6446676 31 + 227556264 gtgtaacaaagcaccacagacttggtgattt i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206136817 31 + 220367699 GtgtaacaaagcaccacagactTGGTGATTT i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5735530 31 - 85787240 ctgtaacaaagcaccacagacttggtgattt i chlSab2.chr25 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46784364 90 - 80974532 I e calJac3.chr19 37785843 637 + 49578535 I e tupBel1.scaffold_144562.1-76688 9774 1673 - 76688 I a score=1312587.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 52575 456 + 93321 agagcaatgcccatttattatctcagggtttctataggtcagaagtttgggtgttgcatggctggattgtctgtttaggatctcacagggttgagatc-ggggtagccagggttgcttctcatctggggctccaagtcctctttgcaagctcactggttgtcagtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgctcccagcaactcaaggccactctcaggttgttgacacagggtgccaacatctatcttcaaaaccagtaggaggatttctcttgcactgaatctcttttgcatctctgacattctcagtctctgacctctagatccagatttaaagggttcacttgattctgtcagacccactcaggacaatTattttgttgt--------gcgtccc-tttttctgggaagtgggtctacc s panTro4.chr1 5953424 455 - 228333871 agagcaatgcccatttattatctcagggtttctataggtcagaagtttgggtgttgcatggctggattgtctgtttaggatctcacagggttgagatc-ggggtagccagggttgcttctcatctggggctccaagtcctctttgcaagctcactggttgtcagtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttctcagtctggggtgctcccagcaactcaaggccactctcaggttgttgacacagggtgctaacatctatcttcaaaaccagtaggaggatttctcttgcactgaatctcttttgcatctc-gacattctcagtctctgacctctagatccagatttaaagggttcacttgattctgtgagacccactcaggacaatTattttgttgt--------gcgtccc-tttttctgggaagtgggtccacc i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6193511 456 + 229942017 agagcaatgcccatttattatctcggggtttctataggtcagaagtttgggtgttgcatggctggattgtctgtttaggatgtcacagggctgagatc-ggggtagccaaggttgcttctcatctggggctccaagtcctctttgcaagctcactggttgtcagtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgctcccagttcctcaaggccactctcaggttgttgacacagggtgccaacatctatcttcaaaatcagtaggaggatttctcttgcactgcatctcttttgcatctctgacattctcagtctctgacttctagatccagatttaaagggttcatttgattctgtcagacccactcaggacaatTattttgttgt--------gcgtccc-tttttctgggaaatgggtccacc i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 140077 457 - 172226 aaaacaatgcccatttattatctcagggtttctataggttagaagtctgggcattgaatggctggattgtctgtttaggatctcatagggttgagatcaggggtagccagggttgcttctcatctggggctccaagtcctctttgcaagctcactggttgtcagtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgcttccagctcctcaaggccactctcaggttgttgacacagggtgccaacatctatcttcaaaaccagtaggaggatttctcttgcactgaatctcttttgcttctctgacattcacagtctctgacctctagatccagatttaaagggttcatttgattctgtcagacccactcaggacaatTattttgttgt--------gcatccc-tttttctgggaagtgggtccacc i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215211396 456 + 229590362 agaacaatgtccatttactatctcagggtttctataggtcagaagtttgggcactgcatggctggattgtctgttgaggatctcacagggctgagatcaggggta-ccagcgttgcttctcatctggggctccaagtcctctttccgagctcactggttgttggtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgctctcagctcctcaaggccactctcgggttgttgacacagggtgc---catccatcttcaaaaccagtaggaggatttctctggcactgaatctctttcgcatctctaacgttctcaggctctgacctctagatccagatttaaagggttcatttgattcggtgagacccactcgggacaatTATTTTGTTGTGCCTTTGGGCATCCC-TTTTTCTGGGAAGTGGGT----- i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6446707 457 + 227556264 agaacaatgtccatttactatctcagggtttctataggtcagaagtttgggcactgcatggctggattgtctgttgaggatctcacagggctgagatcaggggtagccagcgttgcttctcatctggggctccaagtcctctttccgagctcactggttgttggtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgctctcagctcctcaaggccactctcgggttgttgacacagggtgc---catccatcttcaaaaccagtaggaggatttctctggcactgaatctctttcgcatctctaacgttctcaggctctgacctctagatccagatttaaagggttcatttgattcggtgagacccactcgggacaatTATTTTGTTGTGCCTTTGGGCATCCC-TTTTTCTGGGAAGTGGGT----- i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206136848 457 + 220367699 AGAACAATGTCCATTTACTATCTCAGGGTTTCTATAGGTCAGAAGTTTGGGCACTGCATGGCTGGATTGTCTGTTGAGGATCTCACAGGGCTGAGATCAGGGGTAGCCAGCGTTGCTTCTCATCTGGGGCTCCAAGTCCTCTTTCCGAGCTCACTGGTTGTTGGTTGAATTCAGTTcctgtggttgtaggactgaggtccccaTATTCTTCTTGCTGTTTGTCAGTCTGGGGTGCTCTCAGCTCCTCAAGGCCACTCTCGGGTTGTTGACACAGGGTGC---CATCCATCTTCAAAACCAGTAGGAGGATTTCTCTGGCACTGAATCTCTTTCGCATCTCTGACGTTCTCAGGCTCTGACCTCTAGATCCAGATTTAAAGGGTTCATTTGATTCGGTGAGACCCACTCAGGACAATTATTTTGTTGTGCCTTTGGGCATCCC-TTTTTCTGGGAAGTGGGT----- i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5735561 457 - 85787240 agaacaatgcccatttactatctcagggtttctataggtcagaagtgtgggcgctgcatggctggattgtctgttgaggatctcacagggctgagatcaggggtagccagagttgcttctcatctggggctccaagtcctctttccaagctcattggttgtcggtagaattcagttcctgtggttgtaggactgaggtccccatattcttcttgctgtttgtcagtctggggtgctctcagctcctcaaggccactctcgggttgttgacacagggtgc---catccatcttcaaaaccagtaggaggatttctctggcactggatctctttcgcatctctgacgttctcagtctctgacgtctagatccagatttaaagggttcatttgatttggtgagacccactcaggaCCATTATTTTGTTGTGCCTTTGTGCATCCC-TTTTTCTGGGAAGTGGGT----- i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37786480 445 + 49578535 aaaaTaatgcacattttttatctcatggtttctgtaggttagaggtttgggcgttgcatggctggattgtctgtttaggatctcacagggttgaggtcagggctcagccaggtcgcttctcatctggggcaccaagtcctctttccaggctcacgggttgtgggtagaattcagttcctgtggctgtaggactgcggtccccatattcttcctgctgtttgtcagtctggggtgctctcagctcctcaaggccactctcaggttgttgacacagggt-----catctatcttcgaaaccagtgggatgatttctcttgcactgaatctcttttgcatctctggtgttctcagt--------------tccagatttaaagggttcatttgatttgatcagtcccactca-gACAATTATTTTG-TGTGCTGTTGTGTGTCCCTTTTTTCTTGGAAGTGGATCTACC i calJac3.chr19 I 637 C 0 e canFam3.chr7 46784364 90 - 80974532 I e tupBel1.scaffold_144562.1-76688 9774 1673 - 76688 I a score=1108081.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 53031 332 + 93321 acttctatcacgttcttaaaagggtctgggaATGTTCACCCATCACAGACATCCACACCAGGCCAGTTAAGTCAGAACTGCTGGAGATTCCACATTCTCCTGGGCAGCCTGGGTGGAGAACCACCTATgtggaaggaacactgggctccaaagataaggggccttgcattttatttcattaccagtgtctattggctctgagaccttacagaaatcactcaacttctcagggcctcatttgcaaacacggatgataatagtaagctccatctctc--acggttgttaggaggattaaaagtgtataaagatgctctgcaagctctgaagtatta s panTro4.chr1 5953879 332 - 228333871 acttctatcaggttcttaaaagggtctgggaATGTTCACCCATCACAGACATCCACACCAGGCCAGTTAAGTCAGAACTGCTGGAGATTCCACATTCTCCTGGGCAGCCTGGGTGGAGAACCACCTATgtggaaggaacactgggctccaaagataaggggcgttgcattttatttcattaccagtgtctattggctctgagaccttacagaaatcactcaacttctcagggcctcatttgcaaacacggatgataatagtaagctccatctctc--acggttgttaggaggattaaaagtgtataaagatgctctgcaagctctgaagtatta i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6193967 332 + 229942017 agttttatcaggttctcaaaagggtctgggaATGTTCACCCATCACAGACATCCACACCAGGCCAGTTAAGTCAGAACTGCTGGAGATTCCACATTCTCCTGGGCAGCCTGGATGGAGAACCACCTATgtggaaggaacactgggctccaaagataagggaccttgtgttttatctcattaccagtgtctattggctctgagaccttgcagaaatcactcaacttctcagggcctcatttgcaaacacggatgataatagtaagctccatctctc--atggttgttaggaggattaaaAGTCTATAAAGATGCTTTGCAAGCTCTGAAGTATTA i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 140534 332 - 172226 acttttatcaggttctcaaaagggtctgggaATGTTCACCCATCACAGACATCCACACCAGGCCAGTTAAGTCAGAACTGCTGGAGAGTCCACATTCTCCTGGGCAGCCTGTGtggagaagcacctatgtggaaggaacactgggctccaaagataaggggccttgggttttatctcattaccagtgtctactggctctgagaccttacagaaatcactcaacttctcaggccctcatttgcaaacacggatgataatagtaagctccatccctc--acggttgttaggagaattaaaagtatataaaggtgctttgcaagctctgaagtgtta i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 I 6 s rheMac3.chr1 215211852 326 + 229590362 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AATTTTATCGGGTTCTTAAAAGGGTCTGGGAATGTTCACCCATCACAGGCATCCACACCAGGCCAGTGAAATCAG-ACTGCTGGAGATTCCACATTCTCATGGGCAGCCTGGGTGGAGAACCACCTATgtggaaggcacactgggctccaaagataaggggccttgcgtttgatctcattaccagtgtctattagctctgagaccttat-ggaatcactcagcttctcagggccgcatttgcaagtgcagatgataatagtaagttccatctctcttacagttgttaggaggattataattatataaaggtgctttgcaagctctgaatcgtta i calJac3.chr19 C 0 I 6 s canFam3.chr7 46784454 297 - 80974532 ATTTTCATTGGATTCTCAAAAGGG--------TGTTCACCCAT--CAGACATCcataccagaacaattaaatcagaactgctgggggtagTATATTCTCTCGGGCAGCCCGGGTGGAGAACCATCGTTgtacaagaaacagtgggcttggaatataagtgaccttggtttttct-------------tctcttggccacaggaccttagagaaatca--------tgctgagcctcatgtgctgagggagataataatggtaaat----cctttc--acagttgttacaaggattaaaagtgtgtaaaagtgctttgcaaactgtgaagtgtta i canFam3.chr7 I 90 C 0 e tupBel1.scaffold_144562.1-76688 9774 1673 - 76688 I a score=13856.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 53363 4 + 93321 ------gcca s panTro4.chr1 5954211 4 - 228333871 ------GCCA i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6194299 4 + 229942017 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0 C 0 s calJac3.chr19 37787267 426 + 49578535 ACTGTCTTGTCAGTGTGAAGAGATACTGAAAAATG-GGTGGGATACAGCATTTTAAGTGAAAAAGAAGGTAGAGGTTTGGGCATTGCATATCCAGACTCCCAATCTAAGATCCAATGCTCTCCAGAATTCCATCTTTCCCTAACTTTATCAAAGTCAAATGTTAGATACTGTATACTTTGTAAAGTCTGttgctgctgaggaccaggcaaagtgctataaccttcctggaaggcaatttccc-ataaatatcagcgggttaaaaaatatctaag-ccattagaccctaagataatgtttctagggatttatcttaaggatttaatcaaggactcatacacagattATAGTAGTACAAAATTGAAGCCCATCTAACTA----TTTAACAATAAGGGATTGTTTAATTATACATGAAAAATTATGTAAAC-----CATTA i calJac3.chr19 C 0 I 317 s canFam3.chr7 46784761 366 - 80974532 CCTGTCTTATCAGTGTGAAGAGACACTGATAAGGG-AGTGGGAGA-AATATTTTGAGTGAAACAGAAGTCAGAAA---------------------------------------------------------------GTCACATCTATCAGAGTTAAATATTAGATACTATGTACTTT-CCAGGTCTGccgctgctg-ggactgagtaaattgtcataaccttcctgaaaggcaatttcccaatgtatataagatgtgtaaaaaatatccagg-ctctttgaccccaagataacatttctagggatttctcttaaggatttaattaaggacatgaactaagattatagtagtacaaaattggaaacaat----ctaaatttgtaacaataagggattgtctaatgataaatgaggtattatttaaacattagcattc i canFam3.chr7 C 0 C 0 a score=138015.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 53732 36 + 93321 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA s panTro4.chr1 5954580 36 - 228333871 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6194667 36 + 229942017 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 141237 36 - 172226 tattgcctttaaatatTTGAAATGGAAAGAAGCTTA i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215212548 36 + 229590362 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6447860 36 + 227556264 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206138002 36 + 220367699 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGCTTA i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5736713 36 - 85787240 TATTGCCTTTAAATATTTGACATGGAAAGAAGTTTA i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 37788010 36 + 49578535 TATTGCCTTTAAATATCTGACATGGAAAGAAGCTTG i calJac3.chr19 I 317 C 0 s canFam3.chr7 46785127 36 - 80974532 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0 C 0 s ponAbe2.chr1 6194787 5 + 229942017 GTAGG i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215212638 1 + 229590362 -C--- i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5736803 1 - 85787240 -C--- i chlSab2.chr25 C 0 C 0 e canFam3.chr7 46785163 675 - 80974532 I e calJac3.chr19 37788100 0 + 49578535 C e papAnu2.chr1 206138093 0 + 220367699 C e macFas5.chr1 6443748 4203 + 227556264 I e nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 141328 0 - 172226 C a score=1516482.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 53858 540 + 93321 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nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s macFas5.chr1 6449167 418 + 227556264 aaggcgggaccaaagagggagcagaggggtgcccccaggctataggtaaatttcagtgagtttgtctaaagacctgggatccatagaaaggaaatgttcaagttaagataaaagatggtggagaccaaggttcttttgacgtcttatagtggctgtcctcagagacaatagatgacaaatgtttcctattcagatctttaaaaggtgctagacttggccaggcatggtggctcacgcatgtaatcccagca------------caggtgggtgtggatcacaacctcaggagttcgagaccagcctggccaatatggcgaaactccgtctctactaaaaatataaaaattagccaggcatggttgcagccgcttgtagtcccagctactcaggaggctgaggaagaagaattgcttgaacccaggaggcg i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206139304 418 + 220367699 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85787240 I a score=87.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 55699 4 + 93321 --AAGT s panTro4.chr1 5956549 4 - 228333871 --AAGT i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6196640 4 + 229942017 --AAGT i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 143937 4 - 172226 --AAGT i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215214796 4 + 229590362 --AAGT i rheMac3.chr1 C 0 I 1959 s macFas5.chr1 6450094 4 + 227556264 --AAGT i macFas5.chr1 C 0 I 2232 s papAnu2.chr1 206142480 3 + 220367699 --aaa- i papAnu2.chr1 I 2251 C 0 s canFam3.chr7 46786069 4 - 80974532 CCAT-- i canFam3.chr7 C 0 C 0 e calJac3.chr19 37788952 977 + 49578535 I e chlSab2.chr25 5738936 734 - 85787240 I a score=950126.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 55703 350 + 93321 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TAAAATGGCCTTGCCTTCCTGTGCAGTCAGGTGGAGCACCCTCTTCCGTCATCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCCACACTGTGTGTCCCTTAGACCTTTCCTGAGACC----CAGCCTTTCCCCCAGTGGAAGGGAGAATTATTTGaaaagtgtggggtttggtgtcagacagactgggacccaggtctaggctactgaaccagtgagctttgtggctttgtgcatgctatttagacactctgagttttaatttcctaatctctaaTTGCCAGATAGGTTAGTTGGGAGGAACAGCTTAGATTGACCTATGAAAACGTTTGTAGACTCGGAAGTGTTCACATGG i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 143941 350 - 172226 TAAAATGGCCTTGCCTTCCTGCACAGTCAGGTGGCGCACCCCCTTCCTTCCTCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCCACACTGTGTGTCCCTTAGACCTTTCCTGAGACC----CAGCTCTTCCTCCAGTGGAAGGGAGAATTATTTGaaaagtgtggggtttggtgtcagacagactgggacccaggtctaggctactgaaccagtgagctgtgtggctttgtgcatgctatttagacgctctgagttttaatttcctaatctctaattaccagacaggttggttgggaggaacagcttagattgacctatgaaagcatttgtagacttggaagtgttCACATGG i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215216759 350 + 229590362 taaaatGGCCCTGCCTTCCTACGCAGTCAGGTAGAACACCCCCTTCCCTCATCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCTACACTGTGTGTCCCTTAGACTTTTCCTGAGACC----CAGCCCTTCCCCCAGTGGAAGGGAGAATTATTTGaaaagtgtggggttcggtgtcagacagaccgggacccaggtcttggctactgaagcagtgagctgtgtggctttgtgcatgctatttagacactctgagttttaatttcctaatctCTCATTGCCAGGCAAGTTGGTTGGGAGGAACAGCTTAGATTGACCTATGAAAGCATTTGTAGACTCAGACGTGTTCACATGG i rheMac3.chr1 I 1959 C 0 s macFas5.chr1 6452330 350 + 227556264 taaaatGGCCCTGCCTTCCTACGCAGTCAGGTAGAACACCCCCTTCCCTCATCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCTACACTGTGTGTCCCTTAGACTTTTCCTGAGACC----CAGCCCTTCCCCCAGTGGAAGGGAGAATTATTTGaaaagtgtggggttcggtgtcagacagaccgggacccaggtcttggctactgaagcagtgagctgtgtggctttgtgcatgctatttagacactctgagttttaatttcctaatctCTCATTGCCAGGCAAGTTGGTTGGGAGGAACAGCTTAGATTGACCTATGAAAGCATTTGTAGACTCAGACGTGTTCACATGG i macFas5.chr1 I 2232 C 0 s papAnu2.chr1 206142483 350 + 220367699 taaaatggcccTGCCTTCCTACGCAGTCAGGTAGAACACCCCCTTCCCTCATCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCTACACTGTGTGTCCCTTAGACTTTTCCTGAGACC----CAGCCCTTCCCCCAGTGGAAGGGAGAATTATTTGAAAAGTGTGGGATTTGGTGTCAGACAGACCGGGACCCAGGTCTTGGCTACTGAAGCAGTGAGCTGTGTGGCTTTGTGCATGCTATTTAGACACTCTGAGTTTTAATTTCCTAATCTCTCATTGCCAGGCAAGTTGGTTGGGAGGAACAGCTTAGATTGACCTATGAAAGCATTTGTAGACTCAGACGTGTTCACATGG i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5739670 350 - 85787240 taaaatGGCCCTGCCTTCCTACGCAGTCAGGTAGAACACCCCCTTCCCTCATCTGGG-CCTGCT-GAGCAGGG---TCTCACTGATCCCTACACTGCGTGTCCCTTAGACCTTTCCTGAGACC----CAGCCCTTCCCCCGGTGGAAGGGAGAATTATTTGAGCagtgtggggtttggtgccagacagaccgggacccatgtctaggctactgaagcagtgagctgtgtggctttgtgcacgctatttagacactctgagttttaatatcctaatctCTCATTGCCAGGCAGGTTGGTTGGGAGGAACAGCTTAGATTGACCTATGAAAGCATTTGTAGACTCAGAAGTGTTCACATGG i chlSab2.chr25 I 734 C 0 s canFam3.chr7 46786073 343 - 80974532 -GAGCACATCCTGCCTTCTGGTGTGGTCAGGTGGAGCAGCCCCTTGC--CAGCTGAGTCCTGCCAGAACTGGGTCCTCTCACTGATCACCATCCTCTGCACCCCTTCTCTTTCTCACGGAGCTGGAGGAGGTCTGCCCTCTGCTGAATTCGAAATGA-TTACAAGGTGTGGAGTTAGGCATAATGCAGACCAGGGCCCAGGTCTAGGCT----GACCAGTTAGCTGTGTGGCCTGATG------ATGGACATGCTCCAGGTTTTGGTTTCCTAATCTCTAGTTGCCAAACTCGTCAGTCGATTAGAATAGCTCAGATTGACCTAAGAA--CATTTGTGGACTTGGAAGTGTTCATATGG i canFam3.chr7 C 0 C 0 e calJac3.chr19 37788952 977 + 49578535 I a score=36940.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 56053 17 + 93321 ----CACTTTGGATGAAATC------------------------------------G s panTro4.chr1 5956903 17 - 228333871 ----CACTTTGGATCAAATC------------------------------------G i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6196994 20 + 229942017 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------GTTG i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 144291 20 - 172226 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------GTTG i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215217109 20 + 229590362 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------ACTG i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6452680 20 + 227556264 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------ACTG i macFas5.chr1 C 0 C 0 s papAnu2.chr1 206142833 20 + 220367699 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------ACTG i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5740020 20 - 85787240 ----CACTTTGGATCAAATC---------------------------------ATTG i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s calJac3.chr19 11788608 20 - 49578535 ----CACTTAGAATCAATTC---------------------------------ATTG i calJac3.chr19 n 977 C 0 s canFam3.chr7 46786416 57 - 80974532 aactttttttaaaaaagattttatttatttgagagagaaagagagagagagaaattg i canFam3.chr7 C 0 I 176 a score=211021.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 56070 62 + 93321 TTCCTGCTGCTTCAAACTACTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG s panTro4.chr1 5956920 62 - 228333871 TTCCTGCTGCTTCAAACTACTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6197014 62 + 229942017 TTCCTGCTGCTTCAAACTGCTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 144311 62 - 172226 TTCCTGCTGCTTCAAACTGCTGTGTGATGAGTTTTCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215217129 62 + 229590362 TTCCCGCTGCTTCAAACTGTTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i rheMac3.chr1 C 0 I 15 s macFas5.chr1 6452700 62 + 227556264 TTCCCGCTGCTTCAAACTGTTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i macFas5.chr1 C 0 I 4 s papAnu2.chr1 206142853 62 + 220367699 TTCCCGCTGCTTCAAACTGTTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCagg i papAnu2.chr1 C 0 I 4 s chlSab2.chr25 5740040 62 - 85787240 TTCCCGCTGCTTCAAACTGTTGTGTGATGAGTTTCCA----AAAATCATTGCCTGTGATCTGCAGG i chlSab2.chr25 C 0 I 15 s calJac3.chr19 11788628 61 - 49578535 TTCCTGCTTCTTCAAACAGCTGTGTGATGAGCTTCC-----AGAATCATTGCCTGAGATGGGCAGG i calJac3.chr19 C 0 C 0 s canFam3.chr7 46786649 64 - 80974532 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s hg38.chrUn_KI270748v1 56557 236 + 93321 CTGGGGTTGGGCCCTTCTCATTTCTGGATTTGTG------------ATACTTGT-----------------------------------------CTTGTATCCCC-TTTTATCA-TAGTGTGcttttgcttacaagtgaacaaaaacccaatccaaagtgatttaaacaaaaagagcacttattgtaaaagttca-gaataaactgccttcaggcatggcttgatccaggggcgcacactgtgttaccaggaggcagtttctctctgcctcctcac--------ttggctacatttttc s panTro4.chr1 5957407 236 - 228333871 CTGGGGTTGGGCCCTTCCCATTTCTGGATTTGTG------------ATATTTGT-----------------------------------------CTTGTATCCCC-TTTTATCA-TAGTGTGcttttgcttacaagtgaacaaaaacccaatccaaaatgatttaaacaaaaagagcacttattgtaaaagttca-gaataaactgccttcaggcatggcttgatccaggggcgcacactgtgttaccgggaggcagtttctctccgcctcctcac--------ttggctacatttttc i panTro4.chr1 C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 6197503 236 + 229942017 CTGGGGTTGGGCCCTCCCCATTTCTGGATTTGTG------------ATACTTGT-----------------------------------------CTCATATCCCC-TTTCatca-tagtgtgcttttgcttacaagtgaacaaaaacccaatccaaaatgatttaaacaaaaagagcacttattgtaaaagttca-gaataacctgccttcaggcatggcttgatccaggggcgcacactgtgttaccaggaggcagtttctctctgcctcctcac--------ttggctacatttttc i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random 144798 236 - 172226 CTGGGGTTGGGCCCTCCCCATTTTTGGATTTGTG------------ATACTTGT-----------------------------------------CTTGTATCCCC-TTTTATCA-TAGTGTGcttttgcttacaagtgaacaaaaacccaatccaaaatgatttaaacaaaaagagcacttactgtaaaagttca-gaatacactgccttcaggcatggcttgatccaggggcgcacactgtgttaccaagaggcagtttctctctgcctcctcac--------ttggctacatttttc i nomLeu3.chr7b_GL397639_2_random C 0 C 0 s rheMac3.chr1 215217618 289 + 229590362 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CTGGGGTTGGGCCCTCCCCATTTCTGGATTTGTG------------ATACTTGT-----------------------------------------CTTGTATCCCC-TTTTATCA-TAGTGTGCTTTTGCTTACAAGTCAACAAAAACCCAATccaaaatgatttaaataaaaagagcaCTTATTGTAAAAGTTCA-GAATAAACTGCCTTCAGGCACGGCTTGATCCAGGGGCGTACACTGTGTTACCAGGAGGCAGTTTCTCTCTGCCTCCTCAC--------TTGGCTACATTTTTC i papAnu2.chr1 C 0 C 0 s chlSab2.chr25 5740527 237 - 85787240 CTGGGGTTGGGCCCTCCCCATTTCTGGATTTGTG------------ATACTTGT-----------------------------------------CTTCTATCCCCTTTTTATCA-TAGTGTGcttttgcttgcaagtcaacaaaaacccaatccaaaatgatttaaataaaaagagcacttattgtaaaagttca-gaataaactgccttcaggcacggcttgatccaggggcatacactgtgttaccaagaggcagtttctctctgcctcctcac--------ttggctacatttttc i chlSab2.chr25 C 0 C 0 s canFam3.chr7 46787008 243 - 80974532 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tctcactcgtgcatcctgagccattcacagagctcgggaggatgagtgctctgatggagcagggtatggtggtggttagtgctatcaaaaatagaatgagataatgatatggctcagatgactggaggaacaccagggttcttggtctagcacacatttggacaaaacgacacggacacacctggagtggttttaaggagtgaaaagtttaatatacaagaaagaaggaaggaagaagaaaacagcttcactgtacagaga----gggagaggggatttgaacagagagaaaacccgaggggggag-gggggcatggggggaagggggtgtctgtg----gtgtaagcggctagttacatgaggagactggaggaggcggtgtctgacttgcatagaactcagaggattgatttgatcaggcatgtcattcacatagcctgcgaaaaaa------ctcccactctagccttttaagatgcaaatgcagggcgccatgatgttctaaacacgtagggatatgtgggggcagccatcttgccaggcacctgttggggccaggaagaaaagggctggaatctccatatttgggtggacccagtgtctaatggcctgcatttgcatgtcagggcttgctggtggctcttagagttggggctctcctgttagacaagaaaggtttctggatctgctttaaaagaaacaaaaacttcccaaggacctcttttcctctctgtctgcctaaaataatttctgaataactcctataacaataagggg i rheMac3.chr1 C 0 C 0 s macFas5.chr1 6453425 763 + 227556264 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tatcacacacagggactcacgcacagagggcatatgaacactacacacatgctctcacatagaacacaccccatcacacccacacacccacacgcttagacac--acacacCCTTACTCTGCAT--GCATCCTTGGCCTGGCGGACGGAAGATCGAGCGCTCTGGGCGGACTTAAGGCCACAGGAC-G-----GGGGCTGAGTCAGCAGCAAGGCTCCTCCAAGGCCCAGTGGG-CCCGCGCTGGCCCCGGCCACAGACGGCCACCTGCTGCA--------------NNNNNNNNNNGGTTCTGCAGCTGACCT-GGCCTCCAGGTCTCACCCATGAAACAGGCGTGAAACCTTTGGCCAGGTGAGCTAA-------------------ATGAGCCCCAGAATGTGCACGAAGGAAGAGAAAGCTGGGGGAGGTGGTGGGCTGGGTGGTGCAGAGTGGGCCTGAGCTCCGGCCTCCTCCCTGGACACCCTCCCGTGGCCACAGCCATCCCTGCACCCACTGGTGTGGCCTGACCCCTCCCCCTGAGCCCACCCTTCACAGCCCCTAGGGACCCTCAGGAAAGGCTG i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s nomLeu3.chr14 94942658 575 + 94967081 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catcacacatAGGGACTCACGCACAGAGAACATGCAAa---cacacgcacgtcctcacacagaacaccccacatcacgcccacac--------gcttagacac--acacatcctcacTCTGCAT--GCATCCTTGGCCTGGAGGACGGAAGATCGAGCGCTCTGGGTGGACTTTAGGCCGCAGGAC-G-----GGCGCAGAT---------ATGCTCCTCTGAGGCCCAGTGGGCTCCGTGCTGGCCCCGGCCGCAGATGGCCTCCTGCTGC---------------GTGTGCCCTGGGTTCTGTGGCTGACCT-GGCCTCCACGTCTCACCCATGAAACACGCATCGAA-GACTGACTAGGTTTGCTAAGTGGGACCACAGCAGAAGCGTGAGCCTCAGAATGTGCACGAAGGAAGAGAAAGCTGGGGGAAGTGGTGGGCTGGGTGCTGCAGTGTGGGCCTGAGTTCCGGCCTCCTCCCC-AACACCGTCCCGTGGCCACAGCCATCCCTGCACCCACTGGTGTGGCTTGACCCCTCACCCTGAGCCCACCCTTCACAGCCACTCGGGAACCTCAGGAAAGGCCG i papAnu2.chr16 I 1 I 15 s chlSab2.chr16 75109531 537 + 75148670 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catcatacacatgaactca--cacaGAGGACACAC-CACATCATACCCATGAACT--CAGAGAACACACGACATCACACCCACAC--------GTTTAGACACAAACACATCGTCACTCTGCAT--GCACCCTTGTCCTGGTGGAC-AAAAATCGAGCTCTCTGGGCAGAATTAGGAGCCCAGGAC-GAGGGTGGGGCAGATTGAACAGAAACACTCCTCCGAGGCCCAGTGGGTACCACGCTGGCCCTGGCTGTAGATGGCCTCCTGCTGCAGTGCTGGCTGCTGTGTGTGCCCTGGGTTCTGTGGCTGACCTGGGCTTCCACGTCTCACCCATGAAACAGGCATCAAA-GGCTGACCAGGGTGGCTAAGTGGGACCACAGCAGAAGCATCAGTCTTAGAACATGCA-GGAGGAATAGAAAGC-AGGGGAGGTGGTGGGGTGGGTGGTGCAGCATGGGCCTGAGCTCTGGCCTCCTCCCCAGACATCCTCCTGTGGCCACAGCCATCCCTGCAGCCACTAGTGTGGC-TGACCCCTCAGTCTAAGCCCACTTTTCACAGCCATTAGGGAACCTCAGGAGAGGATG i calJac3.chr5 C 0 I 5 a score=67669.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 68216 54 + 93321 ----------CCGCGGTGGGGT-----GGGCGGATTCCCCC--GGAGCAGGCCCAGGCCCCTGCTCCTGAG s panTro4.chr17_GL392646_random 108129 55 + 132219 ----------CCGCGGTGGGGT-----GGGCGGATTCCCCC-GGGAGCAGGCCCAGGCCACTGCTTCTGAG i panTro4.chr17_GL392646_random C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 229837990 54 + 229942017 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agaaaggagagggggatggagaggagaaaggagaggggggtggagagggagaaaggagagggggatagagaggagaaaggagagggggctagagaggagaaaggagagggagatggagagggggatggagagggggatggagaggagaaaggagacggggatggaggggggatggagagAAGAAAGGAGAGGAGGGTGGAGAG s ponAbe2.chr1 229845605 192 + 229942017 agaaaggagagggggatggagaggagaaaggagagggggatggagagg-agaaaggagagggggatggagaggagaaaggagagggggatggagaggagaaaggagagggggatggagaggagaaaggagagggggatggagaggagaaaggagagggggatggagaggg----------agaaaggagaggaggatggagag i ponAbe2.chr1 C 0 I 26 e calJac3.chr5 132438205 0 + 159171411 C e rheMac3.chr16 80880174 1 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622261 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 80964188 0 + 80997621 C e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75116962 4 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 115092 554 + 132219 I a score=0.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 76172 1 + 93321 C e calJac3.chr5 132438205 0 + 159171411 C e rheMac3.chr16 80880174 1 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 229845797 26 + 229942017 I e papAnu2.chr16 74622261 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 80964188 0 + 80997621 C e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75116962 4 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 115092 554 + 132219 I a score=1265.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 76173 38 + 93321 GACAGCTGCAGAGGGAGGCAGGGAGGCTGGCTGGGCGT s calJac3.chr5 132438205 23 + 159171411 GGCAGCTGCAGAGGGAGGCAGGG--------------- i calJac3.chr5 C 0 C 0 e rheMac3.chr16 80880174 1 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 229845797 26 + 229942017 I e papAnu2.chr16 74622261 0 + 74645514 C e macFas5.chr16 80964188 0 + 80997621 C e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75116962 4 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 115092 554 + 132219 I a score=300.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 76211 1 + 93321 G s macFas5.chr16 80964188 1 + 80997621 G i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 74622261 1 + 74645514 g i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e calJac3.chr5 132438228 0 + 159171411 C e rheMac3.chr16 80880174 1 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 229845797 26 + 229942017 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75116962 4 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 115092 554 + 132219 I a score=1187.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 76212 2 + 93321 GA s panTro4.chr17_GL392646_random 115646 2 + 132219 ga i panTro4.chr17_GL392646_random I 554 C 0 s ponAbe2.chr1 229845823 2 + 229942017 ga i ponAbe2.chr1 I 26 C 0 s macFas5.chr16 80964189 2 + 80997621 GG i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 74622262 2 + 74645514 gg i papAnu2.chr16 C 0 C 0 e calJac3.chr5 132438228 0 + 159171411 C e rheMac3.chr16 80880174 1 + 80904711 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75116962 4 + 75148670 I a score=213526.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 76214 107 + 93321 CAGCTGCAGAGGGAGGCAGGGGAGGCCGGCTGGGCATGGACGCTGCAGAGGGGACACAGCCACTCTGGCAACAGCAGCCAGTGGCGGATCTGCCTGGAATGCT-TTCC s panTro4.chr17_GL392646_random 115648 103 + 132219 cagctgcagagggagGCAGGGGAGGCCGGC-----ATGGACACTGCAGAGGGGACACAGCCACTCTGGGAACAGCAGCCAGTGGCAGATCTGCCTGGAATGCTGTTCC i 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rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 229846699 407 + 229942017 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 116843 39 + 132219 I a score=33978.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 77471 390 + 93321 tatattatacatatATGCAGATCAGAATGGACCCTGAGGTCCatatataatatatattatacatatataCagatcagaatggaccctgaggtggtcagttatagtcagatatgccagcaggaactcgtgtttacatgatacatatatacagatcagaatggaccctgaggtggtcggttacagtcagatatgccagcaggaactcgtgtttacatgatacttatatacagatCGgaatggaccctgaggtggtcagttatagtcagatatgccagtaggaactcgtgtttacatgatacatacatacagatcagaatggaccctgaggtggtcagttatagtcagatatgccagtaggaactcatgtttacatgatacatatatacagat s panTro4.chr17_GL392646_random 116882 390 + 132219 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rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 229846699 407 + 229942017 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 117272 1992 + 132219 I a score=12748.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 78021 173 + 93321 gaatgaaccctgaggtggtcagttatagtcagatatgccagtaggaaatcatgtttacatgatacatatatacagatCAGAATGGACCCTGAGGTGGTCGGTTACAGTCAGATATGCCAGTAGGAAGTTGTGTTTACATGATACATATATACagatcagaatggaccctgagg s ponAbe2.chr1 229847106 171 + 229942017 gaatggaccctcaggtggttggttatagtcagatatgccagtaggaactcgtgtttacataatacatatctacagaccagaaTGGACCCTGAGGTGGTCAGTTATAGTCAGATATGCCAGCA-GAACTCGTGTTTACATAATACATATCTACAGACCAGAATGGACCCTGA-G i ponAbe2.chr1 I 407 C 0 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e 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CGTGAGCTGCTGAGattgcaccgatgtgagtgtctcagtttctgcacgtgcatcattgctgtgtaagatgctcacattagaggaagctggtgaaagggtctgtgggaagttgtagtactgtctttgaaactcttctggacatctttgtttttt------aataaaacatttttaaCATGAAAATATTCAgggcacagtggctcgtacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggcggatcatgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagctgggtgtggtggcacgtgtctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgagccgatatcgcacccctgtactccagcctgagctacaaagca i ponAbe2.chr1 I 1867 N 0 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 117272 1992 + 132219 I a score=23935.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 82570 297 + 93321 agactccatctcaaaaaaaataaaggaaatatgcgtcgttggatgctgtatgacaatcaagctacttataacaaacaaaattgagaatgaaggtaaattaaaaataatttatagtctttaaaaagcaggaaCTACAAAATTTACATTTCTGAAAATGGCAGAAAAATCCCACATGGCTGTATATGTATGTGTGAGATTGTGTATGAATGAGCGCATGCATATATTTTTGTGTGTTTGGATTATATGTGTGACGGTGTGCATGAGTGTGTATATGATTTGGGGGTATGTGTGAGTGTG s ponAbe2.chr1 48204 293 - 229942017 agactccatctcaaaaaaattaaag-aaataagtgtcgttggatgctgtatgataatcaagctactt-caacaaacaaaattgagaatgaaagtaaattaaaa-tgatttatagtctt-aaaaagcaggaaCTACAAAACTTACATTTCTGAAAATGGCAGAAAAATCCCACATGGCtgtatatgtatgtgtgagattgtgtgtgaatgagcgcatgcatatatttttgtgtgtttggattatatgtgtgagggtgtgcatgactgtgtatatgatttgggggtatgtatgagtgtg i ponAbe2.chr1 N 0 I 42 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 117272 1992 + 132219 I a score=0.000000 s 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ATATGATTtgggtgtgtatgagtgtgaatgtgtgcacgagtgtgtgtacaatctgggtgtgtatgagtgagcatgaatgtgaacatgtgt i ponAbe2.chr1 I 42 C 0 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 117272 1992 + 132219 I a score=643.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 83360 5 + 93321 GCACG s ponAbe2.chr1 48629 5 - 229942017 gcaca i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s tarSyr2.KE949949v1 120660 5 - 899891 GCATT i tarSyr2.KE949949v1 N 0 N 0 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 117272 1992 + 132219 I a score=28794.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 83365 340 + 93321 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CTGAATATGTGGGAGTGAGCGTGAATGTGAACATGTTTGCACTTGTGTATATGATATGGGTGCATGTGTGGGtgtgtttgtgcaggtgcactgggagctttcagca-tgagtctgtgtggcatctaggcttttctggataatgtagaatcaaaccccataattaattccagtaacttagaaattttcgcttatgaatactaaattctcctcacctagcaactgactgagcaggttGAACAGCACCCTTCGCCGTTCTCCTGCAGAACCCCGTGGAGTGGGCCCTGCTTTCTCAGAGCGCTCCCAGCGGTGATGAGGGAGCCCAGCTCATTGCGGTTCGTGCAGAAGGCTGTGTGCCATCCTCGGGACTGCACGGAGAGGCGGAGGCTCAGGCGTGGGATCTGAGCCCAGTGGGCCCTTTAAGGACCGCTGCCTCCTTTCCTCCCTTTGGCACTCAGCATCGACTTATGATGGCTCCCAGTCACAGTCCTTGTCACTGCCTGGCATTACAcagggccacagtcccttaactgaaacccttgggaccagatgcattttggaattcggaatgtttcttgatttcggagagAGAAGAGGGGATGGACTGTTGGGCAGCCCTGATTAACCCTGCAGCGTCTTGGCTCTAGAGGGAGCCTGCACTGCTAGGAGGGTCTCGGCTCTAGAGAGGGGCCTGCACTGCTGGGAGCGTCTCGGCTCT--AGAGGGGCCTGCACTGCTGGGA i ponAbe2.chr1 C 0 I 19 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I a score=0.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 84443 1 + 93321 A e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e ponAbe2.chr1 49711 19 - 229942017 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I e panTro4.chr17_GL392646_random 119956 0 + 132219 C a score=7336.000000 s hg38.chrUn_KI270748v1 84444 31 + 93321 GCCTACACGGCTGGGAGCGTCTCGGCTCTAG s panTro4.chr17_GL392646_random 119956 27 + 132219 ----ACACGGCTGGGAGCGTCTCGGCTCTAG i panTro4.chr17_GL392646_random C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 49730 31 - 229942017 GCCTGCACTGCTGGGAGCGTCTCGGCTCTAG i ponAbe2.chr1 I 19 I 753 e calJac3.chr5 132439238 1637 + 159171411 I e rheMac3.chr16 80880315 222 + 80904711 I e papAnu2.chr16 74622406 217 + 74645514 I e macFas5.chr16 80964333 220 + 80997621 I e nomLeu3.chr14 94949028 1009 + 94967081 I e chlSab2.chr16 75117106 205 + 75148670 I a 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s panTro4.chr17_GL392646_random 119985 2016 + 132219 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i panTro4.chr17_GL392646_random C 0 C 0 s ponAbe2.chr1 50516 1999 - 229942017 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CTTGTTTCTTttttcttttttattgatgcataatagatgtacatagtttcaggatacatgtgatagtttaatgcattcatataattgtaaaaatcaaatcagcctacttggaa--------------------tgtctttgctttatgctagaaacattctgattcttctcttctagctattttgaaatatagagtagacaattgtcaactatgatctatgtaacactaggtcttattccttctatcaaaccatatatttgtaccctt i ponAbe2.chr1 C 0 C 0 s rheMac3.chr16 80884014 260 + 80904711 CTTAtttctttttt-------cttgatgcataatcgatgtacatattttcagggtacatgtgattgtttaatacattcatataattgtaaaaatcaaatcagcatactt-gaatatctatcaccttaaatatttgtctttgctttctgctagaaccattccgagtcttctcttctagctcttttgaaatacacggtagacaactgtcaactatgagctatgtaacactaggtcttattccttttatcaaaccatatatttgtaccttt i rheMac3.chr16 C 0 C 0 s macFas5.chr16 80968031 260 + 80997621 CTTAtttctttttt-------cttgatgcataatcgatgtacatattttcagggtacatgtgattgtttaatacattcatataattgtaaaaatcaaatcagcatactt-gaatatctatcaccttaaatatttgtctttgctttctgctagaaccattccgagtcttctcttctagctcttttgaaatacacggtagacaactgtcaactatgagctatgtaacactaggtcttattccttttatcaaaccatatatttgtaccttt i macFas5.chr16 C 0 C 0 s papAnu2.chr16 74626086 260 + 74645514 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ggctggagtgcagtggccggatctcggctcaccacaagctccgcctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggggcccgccaccatgcccagctaagtttttgtatttttagtagagacagggtttcaccgtgttggccaggctggtctcaaactcctgaccttgtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggaccacaggtgttagccaccatgccgggccccttttagttttttgaggagcctccatctgttctccatagtggtggtgctaattgacattcccacaacagtgtgtgcgggt-cccctttctctacatcctcgccagcatcccttattccccatctttttgatgaaagccattttaactgaggtgagataatacctcatcgtagttttttgatttgcatttctctgatgattagtgatgctgagcattttttcatatacctgccggtcatttgtccat i macFas5.chr16 C 0 C 0 s chlSab2.chr16 75121820 501 + 75148670 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