Chromosome 12 - BAC End Pairs - Single Contig
Description of this page
Main Reports Page
Main Assembly Page
Main BAC End Pairs Page
Whole Chromosome
Single Contigs
Line color code:
White: lists number of confirming clone bridges for this accession
Blue: clone bridges two adjacent contigs
Green: clone bridges close contigs
Pink: multiple clones bridge distant regions on same chromosome
Red: multiple clones bridge regions on different chromosomes
NT_037806
NT_009759
NT_033253
NT_009731
NT_035206
NT_024397
NT_009714
NT_035211
NT_009700
NT_035212
NT_033254
NT_033255
NT_024371
NT_024380
NT_024352
NT_009781
NT_009526
NT_026397
NT_024417
NT_009782
NT_009609
NT_030118
NT_009458
NT_009509
NT_009441
NT_009711
NT_035222
NT_009616
NT_029419
NT_009540
NT_009528
NT_024381
NT_024460
NT_024375
NT_015310
NT_009551
NT_019546
NT_024356
NT_009538
NT_025864
NT_037807
NT_030122
NT_019555
NT_009513
NT_009575
NT_009681
NT_009743
NT_037808
NT_035235
NT_009770
NT_009775
NT_037809
NT_037810
NT_009487
NT_009438
NT_009464
NT_033248
NT_037811
NT_009755
NT_009534
NT_024376
NT_009523
NT_035242
NT_009482
NT_035243
NT_027131
NT_024477
NT_009455
NT_009781
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC087897
38777242
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC087897
38791540
3
AQ458611
-1
chr12
NT_024352
AC126613
38648223
3
AQ403504
1
RP11-639N23
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC087897
38826497
3
AQ040768
-1
chr12
NT_024352
AC126613
38712359
3
AQ040769
1
CTD-2336K12
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC087897
38857543
3
AQ836193
-1
chr12
NT_024352
AC126613
38717651
3
AQ830435
1
RP11-1127I23
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC087897
38933645
3
AQ508806
-1
chr12
NT_024352
AC126613
38743007
3
AQ508804
1
RP11-281N24
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC023795
38942215
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC069442
39102049
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
21 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC067735
39168990
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC018448
39268741
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
28 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC084373
39434789
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC090668
39617664
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC121334
39728838
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
23 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC125491
39912686
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC121335
40021946
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC121336
40098855
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC117403
40268453
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079630
40375935
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC084290
40552326
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC107023
40606026
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC024935
40754457
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC074030
40854558
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
28 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC016144
41016257
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC129108
41131992
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC015540
41142566
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
21 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC024900
41274349
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
27 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC021651
41446116
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC073607
41513059
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
29 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC090531
41677943
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC018698
41880566
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
23 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC090630
42018033
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
25 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC006197
42185538
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC078871
42305415
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC023513
42331153
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC020629
42447094
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079684
42589896
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079601
42685389
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079600
42779586
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
21 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC089982
42935940
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC119794
43107759
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC068802
43110058
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC012038
43237410
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079319
43310560
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079603
43462793
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC107018
43592176
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC120104
43695542
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC090525
43803504
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
22 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC016143
43975408
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC093012
44028090
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC076972
44144658
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC024934
44304196
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
28 confirm
NT_009781 (cont)
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC073653
44497097
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC025030
44504696
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
29 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC025253
44675411
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
25 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC018923
44835359
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
22 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC090012
44987963
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079825
45126192
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079033
45161325
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
27 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC089986
45309444
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC008127
45321066
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC009248
45459693
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC009778
45628191
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
21 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC063924
45711054
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079950
45740280
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC008124
45873403
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
27 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC009777
46054789
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC009464
46055139
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC000015
46200137
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC084878
46264913
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC016254
46352814
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
28 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC025031
46515143
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC121337
46711482
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC008035
46820487
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC008014
46922483
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC080136
47088372
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC079906
47137073
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004010
47315761
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC119044
47397350
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC008083
47475610
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC003670
47665657
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC003686
47705579
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004486
47818823
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004486
47874215
3
AQ828029
1
chr12
NT_009526
AC004466
48093029
3
AQ818105
-1
RP11-830B9
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004486
47882871
3
AQ053080
1
chr12
NT_009526
AC004466
48063173
3
AQ053083
-1
RP11-49O17
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004486
47910954
3
B88369
1
chr12
NT_009526
AC004466
48063005
3
B91696
-1
RP11-19H5
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC021658
47911346
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC021658
47915810
3
AQ080549
1
chr12
NT_009526
AC004466
48063041
3
AQ080546
-1
CTD-2363L18
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC021658
47916321
3
AQ216365
1
chr12
NT_009526
AC004466
48098279
3
AQ221958
-1
CTD-2189M11
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004241
47923848
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004241
47926069
3
AQ513251
1
chr12
NT_009526
AC004466
48104184
3
AQ613333
-1
RP11-691D17
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004241
47931579
3
AQ383431
1
chr12
NT_009526
AC004466
48093134
3
AQ383430
-1
RP11-152E14
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_009781
AC004241
48028043
3
AQ042642
1
chr12
NT_009526
AC004466
48168600
3
AQ028886
-1
CTD-2326K9