# Assembly name: ASM1413842v1 # Organism name: Rufibacter quisquiliarum (CFB group bacteria) # Infraspecific name: strain=DSM 29854 # Taxid: 1549639 # BioSample: SAMN12025055 # BioProject: PRJNA546791 # Submitter: DOE Joint Genome Institute # Date: 2020-08-10 # Assembly type: na # Release type: major # Assembly level: Contig # Genome representation: full # WGS project: JACJIQ01 # Assembly method: SPAdes v. 3.13.0 # Expected final version: no # Genome coverage: 268.0x # Sequencing technology: Illumina # Relation to type material: assembly from type material # RefSeq category: Reference Genome # GenBank assembly accession: GCA_014138425.1 # RefSeq assembly accession: GCF_014138425.1 # RefSeq assembly and GenBank assemblies identical: yes # ## Assembly-Units: ## GenBank Unit Accession RefSeq Unit Accession Assembly-Unit name ## GCA_014138445.1 GCF_014138445.1 Primary Assembly # # Ordered by chromosome/plasmid; the chromosomes/plasmids are followed by # unlocalized scaffolds. # Unplaced scaffolds are listed at the end. # RefSeq is equal or derived from GenBank object. # # Sequence-Name Sequence-Role Assigned-Molecule Assigned-Molecule-Location/Type GenBank-Accn Relationship RefSeq-Accn Assembly-Unit Sequence-Length UCSC-style-name Ga0373294_01 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000001.1 = NZ_JACJIQ010000001.1 Primary Assembly 679388 na Ga0373294_02 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000002.1 = NZ_JACJIQ010000002.1 Primary Assembly 456235 na Ga0373294_03 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000003.1 = NZ_JACJIQ010000003.1 Primary Assembly 361096 na Ga0373294_04 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000004.1 = NZ_JACJIQ010000004.1 Primary Assembly 343801 na Ga0373294_05 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000005.1 = NZ_JACJIQ010000005.1 Primary Assembly 340079 na Ga0373294_06 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000006.1 = NZ_JACJIQ010000006.1 Primary Assembly 328696 na Ga0373294_07 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000007.1 = NZ_JACJIQ010000007.1 Primary Assembly 271320 na Ga0373294_08 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000008.1 = NZ_JACJIQ010000008.1 Primary Assembly 252231 na Ga0373294_09 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000009.1 = NZ_JACJIQ010000009.1 Primary Assembly 240112 na Ga0373294_10 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000010.1 = NZ_JACJIQ010000010.1 Primary Assembly 190810 na Ga0373294_11 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000011.1 = NZ_JACJIQ010000011.1 Primary Assembly 188615 na Ga0373294_12 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000012.1 = NZ_JACJIQ010000012.1 Primary Assembly 168356 na Ga0373294_13 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000013.1 = NZ_JACJIQ010000013.1 Primary Assembly 167811 na Ga0373294_14 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000014.1 = NZ_JACJIQ010000014.1 Primary Assembly 166028 na Ga0373294_15 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000015.1 = NZ_JACJIQ010000015.1 Primary Assembly 164837 na Ga0373294_16 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000016.1 = NZ_JACJIQ010000016.1 Primary Assembly 131673 na Ga0373294_17 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000017.1 = NZ_JACJIQ010000017.1 Primary Assembly 124594 na Ga0373294_18 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000018.1 = NZ_JACJIQ010000018.1 Primary Assembly 109394 na Ga0373294_19 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000019.1 = NZ_JACJIQ010000019.1 Primary Assembly 103989 na Ga0373294_20 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000020.1 = NZ_JACJIQ010000020.1 Primary Assembly 103432 na Ga0373294_21 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000021.1 = NZ_JACJIQ010000021.1 Primary Assembly 91959 na Ga0373294_22 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000022.1 = NZ_JACJIQ010000022.1 Primary Assembly 84549 na Ga0373294_23 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000023.1 = NZ_JACJIQ010000023.1 Primary Assembly 75213 na Ga0373294_24 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000024.1 = NZ_JACJIQ010000024.1 Primary Assembly 57747 na Ga0373294_25 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000025.1 = NZ_JACJIQ010000025.1 Primary Assembly 51608 na Ga0373294_26 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000026.1 = NZ_JACJIQ010000026.1 Primary Assembly 47762 na Ga0373294_27 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000027.1 = NZ_JACJIQ010000027.1 Primary Assembly 42822 na Ga0373294_28 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000028.1 = NZ_JACJIQ010000028.1 Primary Assembly 41981 na Ga0373294_29 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000029.1 = NZ_JACJIQ010000029.1 Primary Assembly 38066 na Ga0373294_30 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000030.1 = NZ_JACJIQ010000030.1 Primary Assembly 36903 na Ga0373294_31 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000031.1 = NZ_JACJIQ010000031.1 Primary Assembly 35044 na Ga0373294_32 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000032.1 = NZ_JACJIQ010000032.1 Primary Assembly 22263 na Ga0373294_33 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000033.1 = NZ_JACJIQ010000033.1 Primary Assembly 13707 na Ga0373294_34 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000034.1 = NZ_JACJIQ010000034.1 Primary Assembly 8885 na Ga0373294_35 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000035.1 = NZ_JACJIQ010000035.1 Primary Assembly 7460 na Ga0373294_36 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000036.1 = NZ_JACJIQ010000036.1 Primary Assembly 5993 na Ga0373294_37 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000037.1 = NZ_JACJIQ010000037.1 Primary Assembly 5343 na Ga0373294_38 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000038.1 = NZ_JACJIQ010000038.1 Primary Assembly 5091 na Ga0373294_39 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000039.1 = NZ_JACJIQ010000039.1 Primary Assembly 4814 na Ga0373294_40 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000040.1 = NZ_JACJIQ010000040.1 Primary Assembly 3804 na Ga0373294_41 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000041.1 = NZ_JACJIQ010000041.1 Primary Assembly 2338 na Ga0373294_42 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000042.1 = NZ_JACJIQ010000042.1 Primary Assembly 2067 na Ga0373294_43 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000043.1 = NZ_JACJIQ010000043.1 Primary Assembly 1709 na Ga0373294_44 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000044.1 = NZ_JACJIQ010000044.1 Primary Assembly 1656 na Ga0373294_45 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000045.1 = NZ_JACJIQ010000045.1 Primary Assembly 1640 na Ga0373294_46 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000046.1 = NZ_JACJIQ010000046.1 Primary Assembly 1509 na Ga0373294_47 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000047.1 = NZ_JACJIQ010000047.1 Primary Assembly 1476 na Ga0373294_48 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000048.1 = NZ_JACJIQ010000048.1 Primary Assembly 1274 na Ga0373294_49 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000049.1 = NZ_JACJIQ010000049.1 Primary Assembly 1127 na Ga0373294_50 unplaced-scaffold na na JACJIQ010000050.1 = NZ_JACJIQ010000050.1 Primary Assembly 1049 na