Chromosome 6 - BAC End Pairs - Single Contig
Description of this page
Main Reports Page
Main Assembly Page
Main BAC End Pairs Page
Whole Chromosome
Single Contigs
Line color code:
White: lists number of confirming clone bridges for this accession
Blue: clone bridges two adjacent contigs
Green: clone bridges close contigs
Pink: multiple clones bridge distant regions on same chromosome
Red: multiple clones bridge regions on different chromosomes
NT_033125
NT_033164
NT_033126
NT_033128
NT_033144
NT_033156
NT_033142
NT_033120
NT_033135
NT_033151
NT_033162
NT_033163
NT_033143
NT_033124
NT_033129
NT_033138
NT_033159
NT_026313
NT_033155
NT_033173
NT_033140
NT_033153
NT_023442
NT_033146
NT_033136
NT_033149
NT_033154
NT_033160
NT_033134
NT_029317
NT_007592
NT_033137
NT_033139
NT_033147
NT_033158
NT_033161
NT_033145
NT_033141
NT_033123
NT_033130
NT_033127
NT_033122
NT_033152
NT_033121
NT_033148
NT_033171
NT_033132
NT_033943
NT_033172
NT_033948
NT_033131
NT_033946
NT_007540
NT_023463
NT_007158
NT_029990
NT_023399
NT_033133
NT_007299
NT_019424
NT_007563
NT_033944
NT_033947
NT_030710
NT_025741
NT_027046
NT_023451
NT_029991
NT_007422
NT_007302
NT_007627
NT_007583
NT_007299
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
99948489
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
99959682
3
AQ771299
-1
chr6
NT_023399
AL139274
99533723
3
AQ602091
1
CTD-2106O23
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
99960485
3
AQ198758
-1
chr6
NT_023399
AL139274
99558288
3
AQ198761
1
RP11-59L13
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
100002940
3
AQ788632
-1
chr6
NT_023399
AL139274
99564195
3
AQ673989
1
RP11-1050L19
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
100002792
3
AQ550257
-1
chr6
NT_023399
AL160258
99575706
3
AQ550240
1
RP11-419E1
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
100068050
3
B72904
-1
chr6
NT_023399
AL096817
99633864
3
B72905
1
RP11-10J23
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
100060308
3
AQ630634
-1
chr6
NT_023399
AL096817
99633930
3
AQ630631
1
RP11-484O16
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL049697
100034102
3
AQ196626
-1
chr6
NT_023399
AL096817
99690377
3
AQ196627
1
CTD-2385I21
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL451126
100089696
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL451126
100101904
3
AQ600884
-1
chr6
NT_023399
AL096817
99656825
3
AQ666434
1
RP11-893C1
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL451126
100122233
3
AQ539767
-1
chr6
NT_023399
AL096817
99690443
3
AQ539766
1
RP11-316E6
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL133211
100196296
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL356970
100278682
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL138919
100331666
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590392
100404101
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121942
100506112
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL138723
100588021
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL136096
100591603
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121835
100703715
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL139042
100820306
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL138719
100927951
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL139090
100928045
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL135779
101056413
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL133408
101130493
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL160403
101248965
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL096868
101262995
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL445530
101414656
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL079342
101470120
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL353135
101618661
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL353659
101746214
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121833
101780064
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL139804
101876487
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL138717
101878401
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL136971
101982610
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL159174
102065110
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL096678
102156390
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL158813
102294519
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL353692
102351503
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121787
102488587
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL158136
102595043
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL117342
102623683
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121941
102720666
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL159164
102782450
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590641
102844814
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL132996
102845590
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL591052
102944515
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL391559
102948027
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121964
103031793
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121837
103132687
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL135918
103218985
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
NT_007299 (cont)
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL445208
103329601
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL365335
103390243
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
22 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL663112
103551024
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL607079
103579198
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
29 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL449343
103721767
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL080284
103823254
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
34 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL512600
103983904
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
33 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL355351
104124976
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL132766
104166923
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
30 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590635
104311807
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL592428
104407721
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL603903
104492351
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590814
104528084
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL603751
104688624
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL596179
104720097
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL133457
104887256
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL591304
104970727
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
5 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590869
105005640
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590230
105005734
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL160265
105074850
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL359987
105077179
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
22 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL589947
105266449
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL356956
105410064
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL138731
105604228
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL354857
105676440
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL591036
105875563
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121966
105925816
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
16 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL591519
106036416
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590305
106134027
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL356094
106220386
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL391336
106375974
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL592217
106494205
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL356971
106564265
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL157378
106678841
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL139233
106771726
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
28 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL078595
106877222
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL135913
107001402
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL121724
107045308
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL513186
107158852
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL590670
107231804
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL365227
107267956
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL031446
107366433
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007299
AL135906
107478413
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1 confirm