Chromosome 6 - BAC End Pairs - Single Contig
Description of this page
Main Reports Page
Main Assembly Page
Main BAC End Pairs Page
Whole Chromosome
Single Contigs
Line color code:
White: lists number of confirming clone bridges for this accession
Blue: clone bridges two adjacent contigs
Green: clone bridges close contigs
Pink: multiple clones bridge distant regions on same chromosome
Red: multiple clones bridge regions on different chromosomes
NT_033125
NT_033164
NT_033126
NT_033128
NT_033144
NT_033156
NT_033142
NT_033120
NT_033135
NT_033151
NT_033162
NT_033163
NT_033143
NT_033124
NT_033129
NT_033138
NT_033159
NT_026313
NT_033155
NT_033173
NT_033140
NT_033153
NT_023442
NT_033146
NT_033136
NT_033149
NT_033154
NT_033160
NT_033134
NT_029317
NT_007592
NT_033137
NT_033139
NT_033147
NT_033158
NT_033161
NT_033145
NT_033141
NT_033123
NT_033130
NT_033127
NT_033122
NT_033152
NT_033121
NT_033148
NT_033171
NT_033132
NT_033943
NT_033172
NT_033948
NT_033131
NT_033946
NT_007540
NT_023463
NT_007158
NT_029990
NT_023399
NT_033133
NT_007299
NT_019424
NT_007563
NT_033944
NT_033947
NT_030710
NT_025741
NT_027046
NT_023451
NT_029991
NT_007422
NT_007302
NT_007627
NT_007583
NT_007540
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC067915
72967100
1
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL049551
72974727
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73039964
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73096454
3
AQ266189
-1
chr6
NT_033943
AC069484
71468024
1
AQ266188
1
CTD-2502N4
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73099261
3
B47823
-1
chr6
NT_033943
AC069484
71483189
1
B47824
1
RP11-2L6
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73099103
3
AQ314335
-1
chr6
NT_033943
AC069484
71486840
1
AQ314336
1
RP11-94C4
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73067975
3
AQ345085
-1
chr6
NT_033943
AC069484
71496573
1
AQ345088
1
RP11-126A5
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73096223
3
AQ532888
-1
chr6
NT_033943
AC069484
71507100
1
AQ532886
1
RP11-374O9
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73067975
3
AQ345085
-1
chr6
NT_033948
AC025144
72395275
1
AQ345088
1
RP11-126A5
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73099103
3
AQ314335
-1
chr6
NT_033948
AC025144
72417289
1
AQ314336
1
RP11-94C4
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73096223
3
AQ532888
-1
chr6
NT_033948
AC025144
72418108
1
AQ532886
1
RP11-374O9
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73047642
3
B55449
-1
chr6
NT_033948
AL590544
72504306
2
B55448
1
CTC-387E19
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73096454
3
AQ266189
-1
chr6
NT_033948
AC025144
72399637
1
AQ266188
1
CTD-2502N4
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356135
73099261
3
B47823
-1
chr6
NT_033948
AC025144
72413638
1
B47824
1
RP11-2L6
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL049544
73108691
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL049544
73121130
3
AQ456140
-1
chr6
NT_033948
AL590544
72476390
2
AQ409722
1
RP11-671H6
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL391644
73212201
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL133459
73277714
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL355347
73377280
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590202
73463478
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL360220
73466969
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL161440
73574913
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL138882
73656593
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
Z93021
73732005
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL589682
73848590
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL451108
73902100
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL355375
73945839
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL589736
74149240
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL121931
74202631
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590645
74336282
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
5 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590558
74405931
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590558
74443914
3
AQ428021
1
chr12
NT_009654
AC040911
116694895
1
AQ428019
1
CTD-2566D21
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590558
74489660
3
AQ390532
1
chr12
NT_009654
AC040911
116695202
1
AQ390533
1
CTD-2545N19
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL359675
74504759
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450346
74613660
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450346
74651646
3
AQ059939
1
chr12
NT_009654
AC040911
116691391
1
AQ059942
1
CTD-2349N12
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590456
74782027
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL121949
74821865
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL121949
74846116
3
AQ545481
-1
chr12
NT_009654
AC040911
116676181
1
AQ545478
-1
CTD-2613D16
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL121949
74880716
3
AQ785319
-1
chr12
NT_009654
AC040911
116671706
1
AQ805372
-1
CTD-3214G5
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL390854
74962052
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL135905
74988411
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL513043
75106750
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL445676
75147731
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL050329
75161139
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL445677
75247693
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL354913
75332325
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
18 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590546
75438458
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590784
75509420
2
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL603767
75666639
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
NT_007540 (cont)
Links
Contig1
Acc1
Start1
Phs
BAC End Acc1
Or1
Chr2
Contig2
Acc2
Start2
Phs
BAC End Acc2
Or2
Clone
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL078597
75760516
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
20 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL357375
75896725
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL356454
75946957
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
24 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL355357
76121190
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450324
76237351
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL137007
76339097
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL109922
76444776
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450394
76539261
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL353669
76578249
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL133322
76600594
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
26 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL365217
76773118
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL589916
76877975
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
6 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL132767
76910150
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL109612
76929647
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL353153
77035820
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450319
77131150
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL451055
77255930
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL391500
77279606
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
22 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL513492
77448826
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL049842
77560503
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL132793
77639340
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC002485
77759775
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
21 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450164
77907300
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
13 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL139334
78032251
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL450336
78134161
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
8 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590673
78259568
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
17 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590995
78382704
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590678
78494066
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL590874
78641915
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL591004
78658007
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
12 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL592081
78815852
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL591605
78817846
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
11 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL365503
78953340
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
14 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL049860
79056997
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AL512368
79153364
3
 
 
 
 
 
 
 
 
 
15 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79300983
1
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79314140
1
AQ750899
1
chr6
NT_007592
AL590363
59116058
3
AQ750362
1
RP11-1149N15
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79380749
1
AQ126650
1
chr6
NT_007592
AL590363
59134863
3
AQ129380
1
CTD-3045G6
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79376947
1
B36836
1
chr6
NT_007592
AL590363
59138639
3
B36837
1
CTC-824G7
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79492755
1
AQ388762
-1
chr6
NT_007592
AL031178
59394337
3
AQ388765
-1
RP11-144K16
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79336641
1
AQ566832
-1
chr6
NT_007592
AL031178
59396471
3
AQ572066
-1
CTD-2107N2
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79376576
1
AQ474001
-1
chr6
NT_007592
AL512347
59427801
3
AQ474000
-1
CTD-2573L11
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79306225
1
AQ479111
-1
chr6
NT_007592
AL512347
59452303
3
AQ479108
-1
RP11-254O13
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79353959
1
AQ466182
-1
chr6
NT_007592
AL512378
59495582
3
AQ498922
-1
RP11-730O11
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79477038
1
AQ372147
-1
chr6
NT_007592
AL512378
59499914
3
AQ372149
-1
RP11-155P7
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC025085
79375331
1
AQ818503
-1
chr6
NT_007592
AL512378
59517468
3
AQ800079
-1
RP11-826K14
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC073300
79358723
1
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm
S
/
G
/
Y
/
R
/
B
/
O
NT_007540
AC108669
79486483
1
 
 
 
 
 
 
 
 
 
0 confirm