VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769605.1
n/a 12,918
(1.90 %)
17,214
(2.53 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,836
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,983
(3.62 %)
2 American flamingo
GCA_009819775.1
n/a 13,081
(1.79 %)
22,162
(2.64 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,001
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
51,972
(4.83 %)
3 American shad
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
n/a 43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
4 Anna's hummingbird
GCA_003957555.2
n/a 12,249
(1.95 %)
14,848
(2.40 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,312
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
5 Asian bonytongue
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
16,528
(2.72 %)
76,597
(7.29 %)
72,696
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
505,816
(2.98 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,514
(10.63 %)
6 Atlantic cod
GCF_902167405.1
51,655
(11.92 %)
14,072
(2.62 %)
70,314
(9.10 %)
68,853
(9.51 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
804,201
(10.41 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
7 Atlantic halibut (refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
n/a 42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
8 Australian echidna
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
9 banded archerfish
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
n/a 41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
10 barn swallow
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
11 blackcap
GCA_009819655.1
n/a 12,367
(1.92 %)
17,080
(2.58 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,239
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,837
(2.32 %)
12 blue whale
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
13 blunt-snouted clingfish
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,502
(1.97 %)
51,211
(5.47 %)
60,993
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
739,980
(4.26 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
14 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
15 brown argus butterfly
GCF_905147365.1
23,611
(6.61 %)
4,734
(1.03 %)
24,265
(6.80 %)
n/a 36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
25
(100.00 %)
264,358
(2.90 %)
144,234
(3.35 %)
2,650,845
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
16 California sea lion
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
17 Canada lynx
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
18 carmine bee-eater
GCA_009819595.1
n/a 12,724
(1.82 %)
20,356
(2.83 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,923
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,884
(2.47 %)
19 channel bull blenny
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,477
(3.02 %)
42,362
(6.73 %)
60,811
(10.44 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
427,781
(5.47 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
20 climbing perch
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
15,243
(3.53 %)
22,714
(7.45 %)
64,006
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
325,346
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
21 common brushtail
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
22 common tern
GCA_009819605.1
n/a 13,094
(1.80 %)
17,911
(2.48 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,309
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,683
(3.53 %)
23 common yellowthroat
GCA_009764595.1
n/a 11,736
(1.82 %)
16,696
(2.52 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,046
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
24 common toad
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
n/a 44.49
(99.80 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
539,919
(4.45 %)
25 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
n/a 42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
26 denticle herring
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,567
(3.77 %)
58,823
(8.66 %)
72,751
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
408,046
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
27 East African grey crowned-crane
GCA_011004875.1
n/a 13,263
(1.84 %)
20,787
(2.66 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,859
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,610
(3.33 %)
28 eastern happy
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
15,359
(2.22 %)
52,466
(6.26 %)
42,580
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
960,962
(21.85 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
29 Egyptian rousette
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
30 electric eel
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
31 ermine
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
18,862
(1.65 %)
21,246
(1.48 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,560,766
(40.92 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,063
(2.27 %)
32 Eurasian red squirrel
GCA_902686455.1
n/a 21,292
(1.58 %)
21,930
(1.42 %)
36,836
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,961
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
33 Eurasian water vole (2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
34 European common frog
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
n/a 44.15
(99.36 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
641,799
(7.66 %)
35 European eel
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
130,346
(8.19 %)
36 European starfish
GCF_902459465.1
26,326
(11.67 %)
4,143
(0.84 %)
21,071
(8.48 %)
n/a 38.76
(99.96 %)
471
(0.04 %)
150
(100.00 %)
132,287
(1.42 %)
159,226
(7.04 %)
2,504,013
(37.40 %)
15,392
(1.50 %)
37 European turtle dove
GCA_901699155.1
n/a 12,398
(1.76 %)
18,558
(2.54 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,734
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,725
(2.57 %)
38 flier cichlid
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,440
(2.15 %)
51,452
(5.98 %)
n/a 41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,049,840
(17.13 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
39 Gabon caecilian
GCF_902459505.1
54,726
(1.72 %)
14,266
(0.51 %)
30,710
(1.49 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,315,377
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
40 gilthead seabream
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
15,415
(2.36 %)
56,395
(6.58 %)
73,317
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
533,781
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
41 golden eagle (2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
42 Goodes thornscrub tortoise
GCF_007399415.2
57,455
(51.33 %)
14,859
(1.00 %)
79,415
(2.33 %)
31,974
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,699,240
(13.65 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
71,687
(2.29 %)
43 great scallop
GCF_902652985.1
46,811
(9.29 %)
4,090
(0.36 %)
32,743
(7.09 %)
n/a 36.65
(99.92 %)
1,827
(0.08 %)
3,983
(100.00 %)
281,310
(1.71 %)
706,978
(26.84 %)
5,249,556
(32.64 %)
13,101
(0.87 %)
44 great white shark
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
n/a 45.21
(99.55 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
77,021
(1.94 %)
45 greater horseshoe bat
GCA_004115265.2
n/a 18,651
(1.96 %)
20,392
(1.68 %)
36,525
(2.28 %)
40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,017
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
46 greater pipefish
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
47 greater mouse-eared bat
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
48 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
49,025
(1.44 %)
49 gyrfalcon
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
50 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
51 hybrid cattle
GCA_003369685.2
n/a 19,100
(1.59 %)
21,093
(1.37 %)
52,201
(2.64 %)
41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,419
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
52 hybrid cattle
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,602
(1.56 %)
21,960
(1.36 %)
54,700
(2.65 %)
41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,458,622
(47.18 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
53 Indian glassy fish
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,354
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
60,337
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
349,914
(3.01 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,929
(1.44 %)
54 Indo-Pacific tarpon
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
n/a 43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
55 jewelled blenny
GCF_902148845.1
42,890
(8.61 %)
15,200
(2.40 %)
86,752
(9.03 %)
58,518
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
671,028
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,462
(9.27 %)
56 Kakapo
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,102
(1.92 %)
17,781
(2.51 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
517,233
(7.76 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,279
(1.79 %)
57 Korean giant-fin mudskipper (refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
58 Kuhl's pipistrelle
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
59 lance-tailed manakin
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,580
(1.91 %)
16,669
(2.52 %)
n/a 41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
494,225
(7.09 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,376
(1.95 %)
60 leatherback sea turtle (v3 2020)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
61 lesser kestrel
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
62 live sharksucker
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
14,989
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
56,376
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
449,887
(3.55 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
63 lumpfish (refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,794
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
64 mallard
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
n/a 42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
65 milkfish
GCF_902362185.1
30,825
(7.61 %)
16,880
(3.41 %)
42,123
(6.75 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
969,140
(8.12 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
66 mute swan (v2 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
n/a 41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
67 New Caledonian crow
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,735
(1.93 %)
17,289
(2.60 %)
n/a 42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
460,676
(6.16 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,907
(2.46 %)
68 New Zealand spotty (refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
n/a 40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
69 northern pike
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
n/a 42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
70 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
71 orbiculate cardinalfish
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,772
(1.50 %)
52,078
(3.82 %)
60,005
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,270,059
(5.42 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
72 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
73 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
74 pinecone soldierfish
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,756
(2.42 %)
53,616
(6.20 %)
57,173
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,066,671
(5.88 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
75 platypus (v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
76 prehistoric monster fish
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
n/a 41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
77 razorbill
GCA_008658365.1
n/a 12,776
(1.83 %)
16,521
(2.42 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,514
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,955
(2.90 %)
78 red-bellied piranha
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
n/a 40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
79 red-crested turaco
GCA_009769465.1
n/a 12,726
(1.75 %)
21,173
(2.64 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,882
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,046
(3.29 %)
80 red-legged seriema
GCA_009819825.1
n/a 13,220
(1.83 %)
19,960
(2.64 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,781
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,894
(2.67 %)
81 reedfish
GCF_900747795.1
40,558
(43.70 %)
13,160
(0.46 %)
48,082
(1.04 %)
34,872
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,852,335
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
88,254
(1.06 %)
82 river trout
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
27,433
(1.62 %)
110,789
(4.44 %)
122,381
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,488,597
(5.68 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
83 sand lizard
GCF_009819535.1
41,714
(3.65 %)
14,356
(1.48 %)
19,592
(2.50 %)
n/a 43.75
(99.75 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
1,019,541
(5.39 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
76,053
(2.68 %)
84 sea lamprey
GCF_010993605.1
41,254
(6.50 %)
7,662
(0.70 %)
36,337
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
2,075,622
(39.58 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
178,447
(30.55 %)
85 Siamese fighting fish (2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
n/a 45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
86 smalltooth sawfish
GCA_009764475.1
n/a 11,845
(0.66 %)
19,597
(1.63 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,018
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
87 southern grasshopper mouse
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
88 southern two-toed sloth
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
89 specked wood butterfly
GCF_905163445.1
21,720
(6.53 %)
4,713
(0.87 %)
17,001
(4.33 %)
n/a 35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
70
(100.00 %)
304,062
(2.97 %)
110,824
(4.09 %)
3,704,161
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
90 Swainson's thrush
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,005
(1.87 %)
18,005
(2.60 %)
30,197
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
493,073
(5.80 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
91 thorny skate (v2 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
92 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,346
(53.62 %)
14,572
(0.43 %)
88,603
(1.29 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,847,289
(1.60 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
414,828
(3.91 %)
93 torafugu
GCF_901000725.2
53,492
(18.31 %)
14,548
(4.79 %)
51,180
(11.72 %)
55,740
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
290,056
(10.32 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,973
(9.53 %)
94 tufted duck
GCF_009819795.1
29,505
(4.02 %)
12,959
(1.97 %)
16,252
(2.50 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
836,786
(8.36 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,883
(2.48 %)
95 two-lined caecilian
GCF_901001135.1
56,630
(53.09 %)
14,452
(0.38 %)
180,328
(2.13 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,273,617
(1.93 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
602,912
(6.66 %)
96 vaquita
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,607
(1.76 %)
20,488
(1.43 %)
35,398
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,010,529
(43.76 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
97 yellowfin seabream
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
98 Western terrestrial garter snake
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
13,072
(1.13 %)
19,161
(1.98 %)
n/a 40.95
(97.72 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,326,233
(7.79 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
81,829
(2.47 %)
99 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769525.1
n/a 12,693
(1.89 %)
18,187
(2.69 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,630
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,846
(2.19 %)
100 zebra finch (refseq 2021 Blue55 female)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
101 zig-zag eel
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
15,052
(3.35 %)
21,643
(6.89 %)
60,604
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
349,298
(2.86 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 101

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies