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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)
count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Abyssinian ground-hornbill GCA_009769605.1 |
n/a | 12,926 (1.90 %) |
23,453 (2.26 %) |
n/a | 43.30 (99.29 %) |
204 (0.71 %) |
112 (100.00 %) |
401,839 (5.61 %) |
145,540 (0.78 %) |
6,556,090 (19.22 %) |
40,986 (3.65 %) |
2 | Aeolian wall lizard (rPodRaf1 primary hap 2022) GCF_027172205.1 |
57,514 (4.49 %) |
14,340 (1.37 %) |
20,053 (2.31 %) |
n/a | 43.81 (100.00 %) |
30 (0.00 %) |
27 (100.00 %) |
832,937 (4.17 %) |
474,203 (4.04 %) |
7,020,288 (38.29 %) |
94,745 (2.70 %) |
3 | African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1 |
n/a | 18,845 (1.07 %) |
22,426 (1.10 %) |
n/a | 41.34 (99.85 %) |
169 (0.15 %) |
1,253 (99.85 %) |
4,406,744 (29.55 %) |
925,868 (4.71 %) |
15,966,881 (50.49 %) |
68,531 (1.61 %) |
4 | American alligator (2023 genbank) GCA_030867065.1 |
n/a | 14,487 (0.97 %) |
20,444 (1.61 %) |
n/a | 45.04 (99.81 %) |
136 (0.19 %) |
806 (99.81 %) |
3,380,365 (43.12 %) |
560,127 (2.00 %) |
12,524,244 (32.47 %) |
50,852 (2.67 %) |
5 | American alligator (2023 refseq) GCF_030867095.1 |
60,799 (4.33 %) |
14,383 (0.98 %) |
18,600 (1.45 %) |
n/a | 45.01 (99.30 %) |
161 (0.70 %) |
195 (100.00 %) |
3,322,624 (43.19 %) |
478,208 (1.77 %) |
12,316,424 (32.01 %) |
49,792 (2.45 %) |
6 | American flamingo GCA_009819775.1 |
n/a | 13,100 (1.79 %) |
23,372 (2.04 %) |
n/a | 43.27 (99.31 %) |
280 (0.69 %) |
90 (100.00 %) |
538,004 (7.73 %) |
183,346 (0.79 %) |
7,056,270 (20.92 %) |
52,012 (5.96 %) |
7 | American shad GCF_018492685.1 |
70,400 (9.39 %) |
16,145 (2.29 %) |
60,087 (6.26 %) |
76,974 (8.55 %) |
43.18 (99.45 %) |
1,639 (0.55 %) |
74 (100.00 %) |
1,297,174 (9.39 %) |
1,245,221 (12.59 %) |
3,857,267 (39.43 %) |
42,699 (2.23 %) |
8 | Anna's hummingbird GCA_003957555.2 |
n/a | 12,258 (1.95 %) |
20,580 (2.26 %) |
n/a | 41.49 (98.48 %) |
429 (1.52 %) |
160 (100.00 %) |
535,315 (7.95 %) |
262,056 (1.51 %) |
6,092,351 (20.84 %) |
17,130 (1.48 %) |
9 | Antarctic lanternfish (primary hap 2023) GCA_951216825.1 |
n/a | 17,342 (1.44 %) |
78,914 (5.48 %) |
n/a | 43.57 (99.96 %) |
3,179 (0.04 %) |
1,901 (100.00 %) |
5,980,457 (37.18 %) |
1,633,782 (21.76 %) |
6,279,725 (52.83 %) |
104,688 (3.57 %) |
10 | Aristotle's catfish (2022) GCA_946808225.1 |
n/a | 15,455 (2.53 %) |
40,077 (4.90 %) |
86,346 (8.45 %) |
38.90 (99.98 %) |
795 (0.02 %) |
241 (100.00 %) |
2,045,691 (38.70 %) |
669,975 (11.72 %) |
4,638,765 (42.07 %) |
28,277 (1.93 %) |
11 | Asian bonytongue GCF_900964775.1 |
50,315 (9.13 %) |
16,526 (2.73 %) |
38,780 (6.64 %) |
72,662 (8.52 %) |
44.16 (99.99 %) |
145 (0.01 %) |
72 (100.00 %) |
504,673 (3.06 %) |
216,136 (1.69 %) |
4,323,242 (26.50 %) |
88,517 (10.73 %) |
12 | Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1 |
61,202 (2.60 %) |
18,887 (1.13 %) |
21,194 (1.06 %) |
n/a | 41.14 (99.90 %) |
126 (0.10 %) |
64 (100.00 %) |
4,358,470 (31.27 %) |
663,094 (4.56 %) |
16,261,778 (48.66 %) |
69,120 (1.32 %) |
13 | Atlantic cod GCF_902167405.1 |
51,642 (11.92 %) |
14,055 (2.62 %) |
36,761 (8.42 %) |
68,438 (9.50 %) |
45.64 (96.48 %) |
1,216 (3.52 %) |
227 (100.00 %) |
790,946 (10.54 %) |
855,327 (13.06 %) |
2,851,161 (33.38 %) |
97,133 (7.82 %) |
14 | Atlantic halibut (refseq) GCF_009819705.1 |
52,130 (11.46 %) |
14,961 (3.19 %) |
45,365 (7.48 %) |
69,662 (10.94 %) |
42.21 (99.43 %) |
290 (0.57 %) |
57 (100.00 %) |
428,321 (4.16 %) |
256,153 (3.73 %) |
3,725,981 (24.13 %) |
31,325 (2.25 %) |
15 | Atlantic horse mackerel (2021) GCA_905171665.2 |
n/a | 15,262 (2.42 %) |
51,857 (6.86 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
153 (100.00 %) |
1,454,219 (18.25 %) |
384,609 (4.72 %) |
4,338,083 (32.80 %) |
56,553 (3.08 %) |
16 | Atlantic stingray (hap1 2023 genbank) GCA_030144855.1 |
n/a | 12,545 (0.38 %) |
29,428 (1.34 %) |
n/a | 43.35 (99.99 %) |
1,648 (0.01 %) |
2,990 (100.00 %) |
8,579,105 (49.81 %) |
831,224 (15.75 %) |
21,718,213 (51.79 %) |
105,821 (2.42 %) |
17 | Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1 |
42,938 (2.28 %) |
14,891 (1.01 %) |
19,714 (1.45 %) |
n/a | 45.30 (98.61 %) |
524 (1.39 %) |
310 (100.00 %) |
7,814,876 (42.89 %) |
1,219,764 (6.93 %) |
9,488,325 (55.68 %) |
78,364 (2.73 %) |
18 | banded archerfish GCF_017976425.1 |
42,399 (11.11 %) |
15,310 (3.17 %) |
41,147 (7.01 %) |
62,990 (9.37 %) |
41.11 (99.82 %) |
98 (0.18 %) |
96 (100.00 %) |
463,524 (3.35 %) |
271,913 (9.55 %) |
3,355,326 (28.08 %) |
15,089 (0.96 %) |
19 | barbel (2022) GCA_936440315.1 |
n/a | 31,876 (3.30 %) |
85,063 (5.65 %) |
n/a | 37.89 (100.00 %) |
108 (0.00 %) |
92 (100.00 %) |
4,839,533 (52.47 %) |
646,636 (4.57 %) |
8,240,279 (42.13 %) |
71,384 (3.04 %) |
20 | Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq) GCF_015227805.2 |
41,925 (5.13 %) |
12,395 (1.89 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
664,757 (13.92 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,548 (2.85 %) |
21 | barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021) GCA_015227805.3 |
n/a | 12,395 (1.89 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
664,757 (13.92 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,548 (2.85 %) |
22 | black goby (primary hap 2023) GCA_951799975.1 |
n/a | 14,455 (2.06 %) |
56,488 (6.31 %) |
n/a | 42.10 (99.99 %) |
636 (0.01 %) |
298 (100.00 %) |
n/a | 494,440 (10.43 %) |
4,359,169 (40.46 %) |
81,684 (4.81 %) |
23 | black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1 |
56,255 (2.28 %) |
18,774 (1.38 %) |
22,348 (1.26 %) |
n/a | 41.59 (99.95 %) |
215 (0.05 %) |
1,076 (100.00 %) |
4,200,390 (36.22 %) |
548,030 (8.34 %) |
14,347,693 (40.14 %) |
43,525 (1.14 %) |
24 | black-capped chickadee (bPoeAtr1 2023) GCF_030490865.1 |
44,388 (4.96 %) |
13,738 (1.81 %) |
26,691 (2.34 %) |
n/a | 42.41 (99.92 %) |
404 (0.08 %) |
307 (100.00 %) |
730,165 (12.91 %) |
566,529 (6.51 %) |
6,499,984 (24.36 %) |
42,650 (2.59 %) |
25 | black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq) GCF_028500815.1 |
51,115 (5.11 %) |
13,211 (1.67 %) |
24,108 (1.99 %) |
n/a | 44.40 (99.94 %) |
283 (0.06 %) |
716 (100.00 %) |
521,275 (5.36 %) |
236,727 (8.62 %) |
5,684,588 (26.70 %) |
45,318 (4.71 %) |
26 | black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023) GCA_028501385.1 |
n/a | 12,650 (1.68 %) |
22,959 (2.02 %) |
n/a | 44.62 (99.95 %) |
223 (0.05 %) |
733 (100.00 %) |
483,413 (5.25 %) |
221,284 (9.35 %) |
6,264,499 (27.26 %) |
42,776 (4.88 %) |
27 | blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023) GCA_028021495.1 |
n/a | 15,274 (2.92 %) |
51,453 (7.45 %) |
n/a | 43.07 (99.99 %) |
373 (0.01 %) |
461 (100.00 %) |
1,239,364 (29.69 %) |
354,703 (9.63 %) |
3,006,556 (30.35 %) |
53,503 (4.48 %) |
28 | blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023) GCA_028022725.1 |
n/a | 15,043 (2.96 %) |
50,860 (7.54 %) |
n/a | 42.98 (99.99 %) |
366 (0.01 %) |
109 (100.00 %) |
1,210,142 (29.44 %) |
340,820 (9.19 %) |
2,986,750 (29.89 %) |
52,010 (4.20 %) |
29 | blackcap GCA_009819655.1 |
n/a | 12,378 (1.92 %) |
22,970 (2.37 %) |
n/a | 42.00 (98.88 %) |
413 (1.12 %) |
189 (100.00 %) |
506,242 (6.14 %) |
330,354 (2.12 %) |
6,410,567 (19.76 %) |
26,838 (2.34 %) |
30 | Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022) GCA_025265405.1 |
n/a | 19,042 (1.52 %) |
20,766 (1.27 %) |
n/a | 41.70 (99.97 %) |
97 (0.03 %) |
73 (100.00 %) |
3,964,035 (35.29 %) |
765,957 (8.74 %) |
12,128,162 (41.78 %) |
70,851 (1.80 %) |
31 | blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2 |
58,750 (2.71 %) |
19,162 (1.80 %) |
20,576 (1.41 %) |
36,291 (1.99 %) |
40.88 (98.91 %) |
886 (1.09 %) |
106 (100.00 %) |
3,986,870 (44.21 %) |
579,629 (1.22 %) |
12,858,384 (34.60 %) |
67,032 (1.73 %) |
32 | blue-and-yellow macaw (hap1 2023) GCA_028858755.1 |
n/a | 12,919 (1.77 %) |
22,770 (2.15 %) |
n/a | 42.69 (99.92 %) |
107 (0.08 %) |
246 (100.00 %) |
711,670 (17.55 %) |
242,430 (5.04 %) |
5,545,074 (24.84 %) |
25,153 (2.06 %) |
33 | blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank) GCA_900634775.2 |
n/a | 14,499 (1.97 %) |
51,213 (5.47 %) |
n/a | 38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
442 (100.00 %) |
731,731 (4.21 %) |
471,623 (4.92 %) |
5,974,055 (42.88 %) |
29,052 (1.48 %) |
34 | Boeseman's rainbowfish GCF_017639745.1 |
51,238 (8.77 %) |
15,174 (2.24 %) |
51,552 (6.21 %) |
n/a | 39.65 (99.63 %) |
440 (0.37 %) |
93 (100.00 %) |
542,278 (3.15 %) |
303,669 (4.77 %) |
5,189,645 (29.11 %) |
18,525 (1.10 %) |
35 | bonti-bonti (T.bonti 2022) GCA_933228915.1 |
n/a | 14,929 (1.93 %) |
55,343 (5.90 %) |
n/a | 41.66 (99.97 %) |
1,329 (0.03 %) |
146 (100.00 %) |
998,246 (14.90 %) |
443,155 (22.40 %) |
4,319,947 (40.01 %) |
34,018 (4.16 %) |
36 | Brauer's lanternfish (primary hap 2023) GCA_963280865.1 |
n/a | 17,865 (1.56 %) |
76,506 (5.59 %) |
n/a | 42.15 (99.96 %) |
2,704 (0.04 %) |
676 (100.00 %) |
6,391,921 (39.62 %) |
1,227,487 (11.70 %) |
6,669,558 (49.73 %) |
76,828 (3.96 %) |
37 | brown argus butterfly GCF_905147365.1 |
23,611 (6.61 %) |
4,734 (1.03 %) |
24,265 (6.80 %) |
24,237 (6.16 %) |
36.86 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
25 (100.00 %) |
264,358 (2.90 %) |
144,234 (3.35 %) |
2,650,845 (48.44 %) |
35,431 (4.56 %) |
38 | butterfish (2021 G10K) GCF_020382885.2 |
52,828 (14.10 %) |
15,261 (3.43 %) |
40,580 (7.38 %) |
n/a | 41.49 (99.70 %) |
77 (0.30 %) |
48 (100.00 %) |
413,775 (3.11 %) |
160,299 (1.55 %) |
3,420,994 (21.24 %) |
15,574 (1.13 %) |
39 | California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2 |
70,801 (3.05 %) |
20,915 (1.77 %) |
20,179 (1.40 %) |
44,926 (2.10 %) |
41.40 (99.23 %) |
185 (0.77 %) |
47 (100.00 %) |
4,525,652 (43.65 %) |
590,246 (1.24 %) |
13,263,648 (33.76 %) |
51,899 (1.50 %) |
40 | Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2 |
50,142 (2.69 %) |
18,273 (1.65 %) |
19,264 (1.35 %) |
n/a | 41.70 (99.88 %) |
842 (0.12 %) |
54 (100.00 %) |
5,011,165 (43.72 %) |
904,525 (1.75 %) |
13,467,551 (34.19 %) |
66,799 (2.48 %) |
41 | carmine bee-eater GCA_009819595.1 |
n/a | 12,740 (1.82 %) |
28,031 (2.77 %) |
n/a | 42.88 (99.47 %) |
269 (0.53 %) |
109 (100.00 %) |
556,926 (7.87 %) |
213,180 (1.09 %) |
6,641,077 (21.58 %) |
30,881 (2.41 %) |
42 | channel bull blenny GCF_900634415.1 |
40,788 (11.04 %) |
14,472 (3.02 %) |
24,012 (6.59 %) |
60,720 (10.43 %) |
40.96 (99.58 %) |
445 (0.42 %) |
322 (100.00 %) |
420,697 (5.49 %) |
320,518 (6.91 %) |
3,394,846 (28.67 %) |
20,453 (1.39 %) |
43 | chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022) GCA_027408225.1 |
n/a | 13,037 (2.20 %) |
23,550 (2.37 %) |
n/a | 42.31 (99.81 %) |
460 (0.19 %) |
252 (100.00 %) |
681,166 (12.04 %) |
381,093 (7.09 %) |
5,610,806 (24.65 %) |
25,664 (2.75 %) |
44 | chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023) GCA_027557775.1 |
n/a | 12,855 (2.22 %) |
23,147 (2.37 %) |
n/a | 42.15 (99.74 %) |
566 (0.26 %) |
246 (100.00 %) |
672,973 (12.00 %) |
342,156 (6.53 %) |
5,690,712 (23.98 %) |
24,413 (2.63 %) |
45 | Chinese pangolin (mManPen7 2023) GCF_030020395.1 |
71,445 (2.98 %) |
18,379 (1.34 %) |
21,837 (1.29 %) |
n/a | 41.07 (99.77 %) |
383 (0.23 %) |
661 (100.00 %) |
3,318,871 (34.65 %) |
618,193 (3.68 %) |
12,009,669 (39.02 %) |
47,708 (1.22 %) |
46 | chub mackerel (fScoJap1 primary hap 2022) GCF_027409825.1 |
34,390 (6.95 %) |
15,348 (2.35 %) |
46,858 (6.07 %) |
n/a | 40.01 (99.92 %) |
1,572 (0.08 %) |
360 (100.00 %) |
1,669,322 (28.44 %) |
638,340 (11.55 %) |
4,613,373 (32.38 %) |
16,290 (0.85 %) |
47 | climbing perch (v1.3 2021) GCA_900324465.3 |
n/a | 15,241 (3.53 %) |
39,067 (7.54 %) |
67,055 (11.68 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
51 (100.00 %) |
633,883 (15.28 %) |
130,249 (1.89 %) |
3,325,008 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
48 | clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1 |
81,219 (3.62 %) |
18,300 (1.65 %) |
20,361 (1.39 %) |
n/a | 41.79 (99.94 %) |
181 (0.06 %) |
33 (100.00 %) |
4,224,269 (34.84 %) |
992,668 (2.08 %) |
13,618,866 (34.42 %) |
67,830 (2.45 %) |
49 | North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1 |
n/a | 18,699 (1.61 %) |
20,354 (1.28 %) |
n/a | 41.64 (99.84 %) |
385 (0.16 %) |
947 (100.00 %) |
3,815,900 (43.46 %) |
718,935 (11.38 %) |
11,928,210 (42.25 %) |
85,881 (1.90 %) |
50 | common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1 |
37,674 (1.80 %) |
18,653 (0.80 %) |
15,375 (0.86 %) |
n/a | 39.48 (99.44 %) |
1,796 (0.56 %) |
212 (100.00 %) |
7,598,116 (38.90 %) |
1,259,434 (1.97 %) |
22,071,306 (40.56 %) |
17,762 (0.38 %) |
51 | common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq) GCF_017976375.1 |
50,206 (6.30 %) |
13,190 (1.85 %) |
24,284 (2.29 %) |
n/a | 42.18 (99.58 %) |
296 (0.42 %) |
150 (100.00 %) |
566,161 (11.56 %) |
310,430 (2.36 %) |
6,712,791 (21.76 %) |
25,268 (1.73 %) |
52 | common myna (bArcTri1 primary hap 2023) GCA_027559615.1 |
n/a | 12,560 (1.73 %) |
23,740 (2.16 %) |
n/a | 42.32 (99.80 %) |
435 (0.20 %) |
455 (100.00 %) |
395,254 (5.40 %) |
937,774 (11.00 %) |
6,145,808 (28.07 %) |
32,293 (3.87 %) |
53 | common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1 |
n/a | 17,216 (1.82 %) |
19,202 (1.79 %) |
n/a | 42.55 (99.97 %) |
1,546 (0.03 %) |
323 (100.00 %) |
2,953,532 (23.94 %) |
805,142 (2.83 %) |
9,964,846 (34.69 %) |
57,295 (2.83 %) |
54 | common sole (primary hap 2023) GCF_958295425.1 |
55,359 (12.02 %) |
14,844 (2.94 %) |
42,832 (6.93 %) |
n/a | 40.87 (99.99 %) |
373 (0.01 %) |
242 (100.00 %) |
1,149,243 (19.12 %) |
342,238 (9.71 %) |
3,906,753 (32.84 %) |
27,772 (2.71 %) |
55 | common swift (bApuApu2 2021 refseq) GCF_020740795.1 |
39,986 (4.95 %) |
12,292 (1.88 %) |
20,379 (2.16 %) |
n/a | 41.95 (99.84 %) |
256 (0.16 %) |
110 (100.00 %) |
499,695 (6.70 %) |
199,749 (1.12 %) |
6,354,003 (21.19 %) |
20,393 (1.74 %) |
56 | common tern GCA_009819605.1 |
n/a | 13,103 (1.81 %) |
24,044 (2.16 %) |
n/a | 43.03 (99.16 %) |
205 (0.84 %) |
123 (100.00 %) |
570,312 (7.91 %) |
216,895 (1.04 %) |
7,043,151 (20.98 %) |
45,694 (3.73 %) |
57 | common toad GCF_905171765.1 |
45,085 (1.10 %) |
14,240 (0.38 %) |
46,470 (1.68 %) |
37,594 (0.91 %) |
44.49 (99.80 %) |
4,199 (0.20 %) |
1,306 (100.00 %) |
1,658,204 (1.79 %) |
3,099,513 (13.49 %) |
19,236,510 (62.70 %) |
539,919 (4.45 %) |
58 | common yellowthroat GCA_009764595.1 |
n/a | 11,741 (1.82 %) |
22,382 (2.29 %) |
n/a | 42.01 (98.73 %) |
1,479 (1.27 %) |
278 (100.00 %) |
476,049 (6.38 %) |
367,108 (3.16 %) |
6,576,957 (20.43 %) |
25,004 (2.02 %) |
59 | convict blenny (chichlid 2021) GCA_020510985.1 |
n/a | n/a | 134,417 (1.50 %) |
n/a | 44.52 (99.13 %) |
2,580 (0.87 %) |
512 (100.00 %) |
9,062,541 (49.33 %) |
2,097,650 (2.66 %) |
3,092 (99.13 %) |
568,042 (10.14 %) |
60 | copperband butterflyfish GCF_017976325.1 |
35,291 (10.46 %) |
15,210 (3.03 %) |
44,916 (6.99 %) |
61,755 (8.99 %) |
42.57 (100.00 %) |
60 (0.00 %) |
29 (100.00 %) |
406,118 (2.95 %) |
199,450 (2.10 %) |
3,861,745 (21.57 %) |
29,106 (1.85 %) |
61 | Cretan wall lizard (primary hap 2023) GCA_951804945.1 |
n/a | 14,249 (1.37 %) |
19,304 (2.27 %) |
n/a | 43.87 (100.00 %) |
47 (0.00 %) |
55 (100.00 %) |
882,564 (4.30 %) |
511,174 (3.24 %) |
7,094,363 (38.65 %) |
117,222 (3.18 %) |
62 | crucian carp (primary hap 2023) GCF_963082965.1 |
90,094 (6.75 %) |
29,386 (2.81 %) |
88,291 (5.37 %) |
n/a | 38.31 (99.99 %) |
832 (0.01 %) |
277 (100.00 %) |
3,481,382 (45.81 %) |
802,773 (6.54 %) |
8,190,783 (44.41 %) |
83,696 (3.82 %) |
63 | cunner (2021) GCA_020745685.1 |
n/a | 15,192 (2.74 %) |
43,564 (6.38 %) |
n/a | 41.31 (99.41 %) |
283 (0.59 %) |
64 (100.00 %) |
1,419,667 (30.50 %) |
243,024 (4.81 %) |
4,334,690 (27.65 %) |
17,974 (1.06 %) |
64 | Dalmatian pelican (primary hap 2023) GCA_030463565.1 |
n/a | 13,457 (1.72 %) |
25,299 (2.10 %) |
n/a | 43.41 (99.99 %) |
390 (0.01 %) |
311 (100.00 %) |
660,747 (14.47 %) |
294,268 (5.22 %) |
6,840,996 (24.63 %) |
39,705 (5.14 %) |
65 | dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022) GCF_021462225.1 |
56,220 (7.59 %) |
15,422 (1.71 %) |
50,084 (4.18 %) |
n/a | 40.18 (99.46 %) |
409 (0.54 %) |
72 (100.00 %) |
369,606 (1.86 %) |
176,954 (1.87 %) |
6,142,638 (38.35 %) |
32,973 (1.28 %) |
66 | Daubenton's bat (primary hap 2023) GCF_963259705.1 |
64,558 (3.32 %) |
19,141 (1.72 %) |
22,133 (1.66 %) |
n/a | 43.18 (99.99 %) |
1,099 (0.01 %) |
121 (100.00 %) |
3,040,232 (24.03 %) |
796,911 (6.38 %) |
10,478,180 (38.84 %) |
64,920 (2.51 %) |
67 | denticle herring (v2 2020) GCA_900700375.2 |
n/a | 16,559 (3.78 %) |
58,823 (8.66 %) |
74,128 (10.47 %) |
43.69 (99.18 %) |
464 (0.82 %) |
461 (100.00 %) |
403,512 (3.23 %) |
224,284 (4.61 %) |
2,948,738 (28.79 %) |
64,661 (9.49 %) |
68 | diamondback terrapin (rMalTer1 2023) GCF_027887155.1 |
50,318 (3.53 %) |
15,109 (1.08 %) |
19,280 (1.62 %) |
n/a | 44.46 (99.92 %) |
141 (0.08 %) |
76 (100.00 %) |
4,088,064 (46.33 %) |
403,943 (1.72 %) |
11,014,504 (33.74 %) |
110,838 (2.71 %) |
69 | dorado (hap1 2023) GCA_030448965.1 |
n/a | 16,788 (2.12 %) |
50,338 (4.68 %) |
n/a | 41.27 (98.12 %) |
641 (1.88 %) |
182 (100.00 %) |
2,709,759 (34.74 %) |
798,364 (14.84 %) |
5,418,190 (36.02 %) |
30,055 (1.31 %) |
70 | downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020) GCF_014839835.1 |
25,483 (3.24 %) |
12,410 (1.70 %) |
22,416 (2.11 %) |
n/a | 45.31 (99.66 %) |
187 (0.34 %) |
180 (100.00 %) |
1,259,627 (26.52 %) |
378,533 (3.38 %) |
5,846,661 (32.04 %) |
26,005 (1.75 %) |
71 | dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1 |
n/a | 18,354 (1.22 %) |
20,434 (1.08 %) |
n/a | 40.65 (100.00 %) |
96 (0.00 %) |
198 (100.00 %) |
4,458,084 (33.00 %) |
444,499 (1.79 %) |
15,031,940 (47.42 %) |
29,863 (0.83 %) |
72 | East African grey crowned-crane GCA_011004875.1 |
n/a | 13,276 (1.84 %) |
25,393 (2.30 %) |
n/a | 42.38 (99.61 %) |
144 (0.39 %) |
105 (100.00 %) |
548,862 (7.06 %) |
187,966 (0.97 %) |
7,004,597 (21.19 %) |
36,626 (3.69 %) |
73 | eastern happy (v3 2021) GCA_900246225.5 |
n/a | 15,552 (2.29 %) |
52,465 (6.26 %) |
86,437 (9.40 %) |
41.07 (99.87 %) |
490 (0.13 %) |
364 (100.00 %) |
1,309,350 (35.93 %) |
217,916 (1.89 %) |
4,547,434 (30.78 %) |
33,005 (1.88 %) |
74 | eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023) GCA_027917425.1 |
n/a | 13,882 (0.43 %) |
35,323 (1.46 %) |
n/a | 46.78 (99.99 %) |
1,745 (0.01 %) |
1,002 (100.00 %) |
1,769,293 (1.99 %) |
2,023,109 (16.33 %) |
16,148,710 (60.55 %) |
618,204 (5.89 %) |
75 | Egyptian rousette (2020) GCF_014176215.1 |
65,163 (4.76 %) |
17,642 (2.07 %) |
22,317 (1.84 %) |
n/a | 40.05 (98.59 %) |
242 (1.41 %) |
29 (100.00 %) |
2,821,248 (33.05 %) |
434,414 (1.02 %) |
12,031,597 (26.52 %) |
53,573 (4.84 %) |
76 | electric eel GCF_013358815.1 |
48,958 (12.10 %) |
15,950 (3.66 %) |
48,976 (7.25 %) |
54,541 (8.42 %) |
42.49 (98.20 %) |
227 (1.80 %) |
89 (100.00 %) |
567,625 (7.41 %) |
564,286 (10.86 %) |
2,935,360 (24.79 %) |
44,501 (3.93 %) |
77 | emu (v2 ZJU1.0 2023) GCA_016128335.2 |
n/a | 13,213 (1.74 %) |
24,562 (2.10 %) |
n/a | 42.41 (99.99 %) |
539 (0.01 %) |
767 (100.00 %) |
567,285 (7.79 %) |
258,030 (2.59 %) |
7,108,005 (19.16 %) |
41,752 (6.24 %) |
78 | epaulette shark (sHemOce1 2021) GCA_020745735.1 |
n/a | 12,439 (0.39 %) |
19,520 (1.06 %) |
n/a | 42.76 (98.05 %) |
3,716 (1.95 %) |
1,963 (100.00 %) |
9,211,963 (69.93 %) |
935,037 (6.51 %) |
20,660,613 (43.88 %) |
41,682 (1.08 %) |
79 | ermine (2020) GCF_009829155.1 |
74,332 (3.19 %) |
18,855 (1.65 %) |
20,667 (1.43 %) |
44,584 (2.07 %) |
41.56 (99.12 %) |
199 (0.88 %) |
94 (100.00 %) |
4,647,934 (41.44 %) |
714,174 (1.30 %) |
13,845,904 (33.42 %) |
56,065 (2.25 %) |
80 | Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1 |
n/a | 19,332 (1.42 %) |
22,424 (1.40 %) |
n/a | 42.47 (100.00 %) |
27 (0.00 %) |
726 (100.00 %) |
4,362,536 (31.74 %) |
801,232 (4.02 %) |
13,893,672 (37.73 %) |
65,806 (4.13 %) |
81 | Eurasian minnow (primary hap 2023) GCA_949152265.1 |
n/a | 17,661 (3.01 %) |
58,218 (6.54 %) |
n/a | 39.21 (99.98 %) |
881 (0.02 %) |
125 (100.00 %) |
2,346,939 (44.27 %) |
502,415 (11.23 %) |
4,890,830 (40.45 %) |
60,482 (4.22 %) |
82 | Eurasian nightjar GCA_907165065.1 |
n/a | 13,040 (1.86 %) |
22,823 (2.21 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
153 (0.00 %) |
121 (100.00 %) |
595,803 (8.38 %) |
248,128 (1.78 %) |
6,744,611 (22.18 %) |
24,805 (1.90 %) |
83 | Eurasian red squirrel (2019) GCA_902686455.1 |
n/a | 21,298 (1.58 %) |
21,024 (1.36 %) |
36,645 (1.54 %) |
40.08 (94.33 %) |
1,177 (5.67 %) |
638 (100.00 %) |
4,680,964 (35.76 %) |
704,218 (1.42 %) |
14,991,981 (31.49 %) |
48,159 (1.04 %) |
84 | Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2 |
n/a | 21,309 (1.58 %) |
21,026 (1.36 %) |
n/a | 40.08 (94.33 %) |
1,177 (5.67 %) |
639 (100.00 %) |
4,677,412 (35.73 %) |
704,218 (1.42 %) |
14,992,063 (31.49 %) |
48,159 (1.04 %) |
85 | Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1 |
67,145 (2.95 %) |
18,842 (1.54 %) |
20,178 (1.40 %) |
n/a | 41.59 (100.00 %) |
185 (0.00 %) |
44 (100.00 %) |
4,259,294 (33.39 %) |
713,721 (1.36 %) |
13,626,048 (34.37 %) |
57,073 (1.82 %) |
86 | Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2 |
45,544 (2.51 %) |
19,733 (1.78 %) |
19,053 (1.47 %) |
36,935 (2.27 %) |
42.15 (99.74 %) |
873 (0.26 %) |
215 (100.00 %) |
3,993,912 (25.74 %) |
1,088,163 (2.91 %) |
12,853,770 (32.42 %) |
19,000 (0.58 %) |
87 | European chub (primary hap 2023) GCA_949319135.1 |
n/a | 18,028 (2.64 %) |
64,206 (6.04 %) |
n/a | 38.73 (99.99 %) |
588 (0.01 %) |
106 (100.00 %) |
2,649,943 (48.88 %) |
666,129 (9.08 %) |
5,751,610 (41.56 %) |
58,471 (3.64 %) |
88 | European common frog GCF_905171775.1 |
51,633 (1.57 %) |
13,864 (0.46 %) |
39,978 (1.88 %) |
57,578 (1.85 %) |
44.15 (99.36 %) |
1,860 (0.64 %) |
554 (100.00 %) |
1,804,642 (3.42 %) |
2,925,830 (9.39 %) |
18,921,726 (55.43 %) |
641,799 (7.66 %) |
89 | European eel GCF_013347855.1 |
64,143 (9.57 %) |
17,054 (2.22 %) |
34,278 (5.56 %) |
79,684 (7.37 %) |
43.64 (99.61 %) |
640 (0.40 %) |
54 (100.00 %) |
831,037 (5.48 %) |
786,521 (8.15 %) |
5,700,890 (27.40 %) |
130,346 (8.19 %) |
90 | European flounder (primary hap 2023) GCA_949316205.1 |
n/a | 14,753 (3.17 %) |
47,618 (7.81 %) |
n/a | 42.59 (99.98 %) |
482 (0.02 %) |
109 (100.00 %) |
1,160,784 (27.06 %) |
251,985 (5.23 %) |
3,353,121 (26.00 %) |
37,130 (2.79 %) |
91 | European golden plover GCA_017639485.1 |
n/a | 12,984 (1.78 %) |
22,854 (2.04 %) |
n/a | 42.70 (99.01 %) |
268 (0.99 %) |
107 (100.00 %) |
558,587 (8.35 %) |
180,400 (0.83 %) |
7,132,381 (21.18 %) |
40,661 (3.41 %) |
92 | European mink (mMusLut2 primary hap 2023) GCF_030435805.1 |
69,556 (3.13 %) |
18,706 (1.46 %) |
21,193 (1.37 %) |
n/a | 41.85 (100.00 %) |
39 (0.00 %) |
25 (100.00 %) |
4,237,791 (30.90 %) |
792,897 (2.69 %) |
13,417,195 (36.59 %) |
67,132 (2.54 %) |
93 | European plaice (primary hap 2022) GCF_947347685.1 |
46,468 (10.51 %) |
14,818 (2.71 %) |
51,453 (7.41 %) |
n/a | 42.51 (99.97 %) |
1,072 (0.03 %) |
355 (100.00 %) |
476,314 (3.63 %) |
520,729 (13.27 %) |
3,283,360 (33.55 %) |
47,050 (4.45 %) |
94 | European pond turtle (hap1 rEmyOrb1 2023) GCA_028017835.1 |
n/a | 14,802 (0.99 %) |
19,772 (1.60 %) |
n/a | 44.74 (99.86 %) |
148 (0.14 %) |
106 (100.00 %) |
1,526,737 (12.44 %) |
460,562 (2.12 %) |
11,130,580 (35.42 %) |
136,002 (2.92 %) |
95 | European robin GCA_903797595.2 |
n/a | 12,344 (1.85 %) |
23,934 (2.37 %) |
n/a | 42.10 (99.97 %) |
990 (0.03 %) |
1,119 (100.00 %) |
532,973 (5.96 %) |
401,820 (3.43 %) |
6,320,210 (21.42 %) |
30,391 (2.60 %) |
96 | European shag (primary hap 2023) GCA_949628215.1 |
n/a | 13,203 (1.74 %) |
22,959 (2.04 %) |
n/a | 43.10 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
356 (100.00 %) |
436,838 (4.84 %) |
471,070 (3.20 %) |
6,601,537 (22.79 %) |
37,247 (3.95 %) |
97 | European shrew (mSorAra2 primary hap 2023) GCF_027595985.1 |
44,643 (2.60 %) |
17,479 (1.26 %) |
21,293 (1.37 %) |
n/a | 43.24 (99.46 %) |
1,427 (0.54 %) |
65 (100.00 %) |
2,474,584 (15.18 %) |
1,107,884 (3.28 %) |
13,638,467 (41.72 %) |
79,785 (2.86 %) |
98 | European snow vole (primary hap 2023) GCF_950005125.1 |
47,025 (2.69 %) |
19,592 (1.78 %) |
21,173 (1.56 %) |
n/a | 41.98 (100.00 %) |
197 (0.00 %) |
160 (100.00 %) |
5,048,186 (44.12 %) |
998,537 (5.14 %) |
12,204,053 (34.97 %) |
20,725 (0.63 %) |
99 | European starfish GCF_902459465.1 |
26,326 (11.67 %) |
4,121 (0.84 %) |
21,080 (8.48 %) |
23,775 (14.13 %) |
38.76 (99.96 %) |
471 (0.04 %) |
150 (100.00 %) |
131,898 (1.43 %) |
159,226 (7.04 %) |
2,504,013 (37.40 %) |
15,392 (1.50 %) |
100 | European turtle dove (v1.2 2021) GCA_901699155.2 |
n/a | 12,391 (1.76 %) |
23,333 (2.17 %) |
n/a | 41.84 (99.67 %) |
940 (0.33 %) |
311 (100.00 %) |
550,895 (7.50 %) |
227,532 (1.16 %) |
6,767,530 (21.05 %) |
34,682 (2.57 %) |
101 | European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1 |
54,114 (2.24 %) |
19,959 (1.65 %) |
19,953 (1.25 %) |
n/a | 41.23 (99.99 %) |
1,129 (0.01 %) |
497 (100.00 %) |
4,863,650 (37.41 %) |
1,795,997 (8.95 %) |
13,681,732 (40.58 %) |
23,961 (0.53 %) |
102 | fire-bellied toad (aBomBom1 primary hap 2023) GCF_027579735.1 |
38,238 (0.68 %) |
15,452 (0.21 %) |
47,500 (0.88 %) |
n/a | 38.98 (98.02 %) |
7,009 (1.99 %) |
2,467 (100.00 %) |
4,258,941 (3.44 %) |
7,150,261 (12.27 %) |
9,476 (98.01 %) |
n/a |
103 | flier cichlid GCF_007364275.1 |
43,842 (8.12 %) |
15,434 (2.15 %) |
26,448 (5.90 %) |
64,657 (6.60 %) |
41.23 (98.19 %) |
744 (1.81 %) |
188 (100.00 %) |
1,014,141 (16.95 %) |
287,035 (2.21 %) |
5,305,890 (30.67 %) |
24,130 (1.26 %) |
104 | Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023) GCA_030035715.1 |
n/a | 14,392 (0.90 %) |
17,909 (1.50 %) |
n/a | 42.86 (99.84 %) |
213 (0.16 %) |
836 (99.84 %) |
1,440,070 (7.19 %) |
620,131 (2.54 %) |
10,919,950 (45.21 %) |
47,933 (1.03 %) |
105 | freshwater garfish (fXenCan1 2020) GCA_014839995.1 |
n/a | 14,625 (2.57 %) |
52,879 (6.72 %) |
n/a | 41.41 (98.98 %) |
1,373 (1.02 %) |
410 (100.00 %) |
492,828 (4.29 %) |
318,631 (5.94 %) |
3,977,536 (27.41 %) |
32,390 (2.33 %) |
106 | Gabon caecilian GCF_902459505.1 |
54,713 (1.72 %) |
14,269 (0.51 %) |
29,026 (1.40 %) |
n/a | 43.24 (99.85 %) |
433 (0.15 %) |
164 (100.00 %) |
1,310,970 (1.64 %) |
1,364,597 (3.83 %) |
19,589,802 (52.85 %) |
270,923 (4.52 %) |
107 | Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank) GCA_902459505.2 |
n/a | 14,269 (0.51 %) |
29,026 (1.40 %) |
n/a | 43.24 (99.85 %) |
433 (0.15 %) |
164 (100.00 %) |
1,331,879 (1.68 %) |
1,364,597 (3.83 %) |
19,589,806 (52.85 %) |
270,923 (4.52 %) |
108 | garden warbler GCA_014839755.1 |
n/a | 12,520 (1.95 %) |
23,459 (2.46 %) |
n/a | 42.08 (99.82 %) |
134 (0.18 %) |
176 (100.00 %) |
491,810 (6.09 %) |
376,746 (2.55 %) |
6,461,292 (20.23 %) |
27,799 (2.40 %) |
109 | Gharial (hap1 2023) GCA_030020385.1 |
n/a | 14,254 (0.94 %) |
23,016 (2.00 %) |
n/a | 45.13 (99.95 %) |
61 (0.05 %) |
298 (100.00 %) |
1,230,357 (13.08 %) |
350,230 (2.85 %) |
11,854,314 (33.03 %) |
39,919 (1.95 %) |
110 | giant manta (hap0 2023) GCA_030028105.1 |
n/a | 12,432 (0.38 %) |
24,821 (1.16 %) |
n/a | 43.26 (99.23 %) |
1,810 (0.77 %) |
4,715 (100.00 %) |
7,913,208 (49.68 %) |
969,352 (14.22 %) |
20,235,210 (54.42 %) |
110,678 (1.74 %) |
111 | gilthead seabream (v2 2021) GCA_900880675.2 |
n/a | 15,752 (2.45 %) |
56,395 (6.58 %) |
n/a | 41.94 (99.96 %) |
1,050 (0.04 %) |
176 (100.00 %) |
1,474,134 (29.50 %) |
305,809 (3.03 %) |
4,701,691 (25.69 %) |
47,327 (2.41 %) |
112 | golden eagle (2021) GCF_900496995.4 |
60,920 (5.98 %) |
13,334 (1.84 %) |
23,261 (2.12 %) |
n/a | 42.16 (99.58 %) |
228 (0.42 %) |
144 (100.00 %) |
544,341 (5.93 %) |
186,461 (0.80 %) |
7,090,610 (20.01 %) |
38,495 (3.10 %) |
113 | golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1 |
36,997 (1.96 %) |
20,006 (1.91 %) |
19,132 (1.50 %) |
n/a | 42.51 (99.65 %) |
880 (0.35 %) |
623 (100.00 %) |
4,785,907 (32.61 %) |
1,305,613 (3.34 %) |
12,958,061 (32.33 %) |
20,760 (0.59 %) |
114 | Goodes thornscrub tortoise GCF_007399415.2 |
57,442 (3.17 %) |
14,852 (1.00 %) |
18,125 (1.49 %) |
31,841 (1.80 %) |
44.14 (98.71 %) |
562 (1.29 %) |
383 (100.00 %) |
1,630,271 (13.86 %) |
387,796 (2.00 %) |
11,572,827 (33.36 %) |
71,687 (2.29 %) |
115 | Grand Cayman blue iguana (hap1 2023) GCA_030412105.1 |
n/a | 14,094 (1.03 %) |
17,875 (1.65 %) |
n/a | 41.62 (99.95 %) |
28 (0.05 %) |
30 (100.00 %) |
1,100,228 (6.21 %) |
423,695 (1.33 %) |
11,521,828 (32.55 %) |
62,978 (2.00 %) |
116 | gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1 |
73,383 (3.04 %) |
16,637 (0.72 %) |
16,036 (0.85 %) |
n/a | 37.92 (99.11 %) |
2,255 (0.89 %) |
13 (100.00 %) |
5,562,359 (25.40 %) |
1,096,620 (2.60 %) |
22,322,748 (43.37 %) |
28,894 (0.57 %) |
117 | gray squirrel (2020) GCF_902686445.1 |
58,884 (2.46 %) |
20,752 (1.49 %) |
21,107 (1.31 %) |
32,732 (1.45 %) |
40.06 (99.98 %) |
1,824 (0.02 %) |
752 (100.00 %) |
4,605,578 (34.50 %) |
728,192 (1.65 %) |
15,467,412 (33.91 %) |
51,878 (1.11 %) |
118 | gray wolf (2021) GCA_905319855.2 |
n/a | 19,474 (1.55 %) |
20,394 (1.40 %) |
72,806 (4.12 %) |
41.49 (100.00 %) |
166 (0.00 %) |
82 (100.00 %) |
4,550,524 (31.76 %) |
1,063,944 (3.96 %) |
13,588,117 (34.74 %) |
51,996 (2.15 %) |
119 | great potoo GCA_013368605.1 |
n/a | 13,116 (1.77 %) |
23,657 (2.10 %) |
n/a | 42.67 (99.51 %) |
243 (0.49 %) |
191 (100.00 %) |
514,142 (9.71 %) |
210,381 (1.13 %) |
6,501,989 (23.95 %) |
35,785 (2.69 %) |
120 | great scallop GCF_902652985.1 |
46,811 (9.29 %) |
4,090 (0.36 %) |
32,743 (7.09 %) |
n/a | 36.65 (99.92 %) |
1,827 (0.08 %) |
3,983 (100.00 %) |
281,310 (1.71 %) |
706,978 (26.84 %) |
5,249,556 (32.64 %) |
13,101 (0.87 %) |
121 | great white shark GCF_017639515.1 |
49,865 (1.46 %) |
13,010 (0.37 %) |
19,263 (0.92 %) |
46,152 (1.30 %) |
45.21 (99.55 %) |
2,645 (0.45 %) |
719 (100.00 %) |
1,046,023 (4.00 %) |
1,584,100 (21.25 %) |
23,278,563 (52.42 %) |
77,021 (1.94 %) |
122 | greater argentine (primary hap 2023) GCA_951799395.1 |
n/a | 16,553 (3.15 %) |
51,766 (7.37 %) |
n/a | 44.75 (99.95 %) |
1,752 (0.05 %) |
1,085 (100.00 %) |
1,674,762 (26.07 %) |
900,455 (18.62 %) |
2,849,256 (39.22 %) |
26,022 (2.30 %) |
123 | greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020) GCA_014108255.1 |
n/a | 18,531 (1.97 %) |
20,309 (1.67 %) |
n/a | 40.52 (99.19 %) |
292 (0.81 %) |
50 (100.00 %) |
3,284,473 (35.00 %) |
559,653 (1.29 %) |
12,043,562 (29.15 %) |
32,047 (1.05 %) |
124 | greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2 |
53,353 (3.13 %) |
18,641 (1.97 %) |
20,359 (1.68 %) |
n/a | 40.54 (99.64 %) |
158 (0.36 %) |
134 (100.00 %) |
3,218,744 (34.52 %) |
564,789 (1.35 %) |
12,217,020 (29.39 %) |
32,445 (1.06 %) |
125 | greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1 |
70,930 (3.43 %) |
19,052 (1.84 %) |
21,498 (1.73 %) |
n/a | 43.11 (98.55 %) |
538 (1.45 %) |
93 (100.00 %) |
3,088,083 (26.27 %) |
753,124 (2.84 %) |
10,383,466 (35.84 %) |
61,023 (2.69 %) |
126 | greater pipefish GCF_901709675.1 |
47,335 (18.32 %) |
13,477 (5.26 %) |
42,380 (12.01 %) |
37,563 (15.76 %) |
43.46 (100.00 %) |
43 (0.00 %) |
87 (100.00 %) |
193,407 (3.05 %) |
125,716 (4.25 %) |
1,676,004 (25.93 %) |
46,327 (10.97 %) |
127 | greater pipefish (v2 2023 genbank) GCA_948146105.1 |
n/a | 13,412 (4.76 %) |
45,946 (11.50 %) |
n/a | 44.34 (99.99 %) |
95 (0.01 %) |
251 (100.00 %) |
494,547 (20.10 %) |
204,804 (10.66 %) |
1,444,044 (34.08 %) |
47,904 (17.47 %) |
128 | greater sand-eel (primary hap 2023) GCA_949357725.1 |
n/a | 15,028 (2.35 %) |
50,436 (6.30 %) |
n/a | 41.10 (99.97 %) |
1,188 (0.03 %) |
1,568 (100.00 %) |
2,688,222 (39.74 %) |
549,362 (7.60 %) |
3,564,661 (40.05 %) |
37,043 (1.94 %) |
129 | green sea turtle (v2 2021) GCF_015237465.2 |
84,366 (4.63 %) |
14,725 (1.06 %) |
17,444 (1.56 %) |
n/a | 44.01 (99.44 %) |
298 (0.56 %) |
93 (100.00 %) |
1,701,640 (14.83 %) |
304,306 (1.25 %) |
11,135,147 (31.96 %) |
49,025 (1.44 %) |
130 | grey whale (mEscRob2 primary hap 2023) GCA_028021215.1 |
n/a | 19,288 (1.38 %) |
21,791 (1.21 %) |
n/a | 41.74 (100.00 %) |
279 (0.00 %) |
704 (100.00 %) |
4,116,900 (35.85 %) |
966,065 (16.74 %) |
12,154,173 (46.39 %) |
77,011 (1.59 %) |
131 | gudgeon (primary hap 2023) GCA_949357685.1 |
n/a | 17,136 (1.90 %) |
63,611 (4.50 %) |
n/a | 39.74 (99.99 %) |
1,046 (0.01 %) |
233 (100.00 %) |
5,662,029 (68.75 %) |
825,757 (11.99 %) |
6,236,024 (55.15 %) |
99,559 (5.68 %) |
132 | gyrfalcon GCF_015220075.1 |
47,961 (5.90 %) |
13,016 (1.82 %) |
21,266 (2.02 %) |
n/a | 42.20 (99.55 %) |
635 (0.45 %) |
133 (100.00 %) |
484,104 (5.60 %) |
186,430 (0.85 %) |
7,162,723 (18.83 %) |
24,760 (2.03 %) |
133 | Harpy eagle (bHarHar1 2022) GCF_026419915.1 |
51,641 (5.08 %) |
13,412 (1.70 %) |
24,002 (2.05 %) |
n/a | 43.39 (99.80 %) |
342 (0.20 %) |
322 (100.00 %) |
456,476 (3.62 %) |
260,495 (7.70 %) |
5,658,773 (24.81 %) |
60,606 (5.66 %) |
134 | Hawaiian crow (2021 refseq) GCF_020740725.1 |
51,593 (6.18 %) |
12,739 (1.83 %) |
23,664 (2.30 %) |
n/a | 43.30 (99.84 %) |
294 (0.16 %) |
188 (100.00 %) |
409,129 (0.00 %) |
304,680 (5.73 %) |
5,953,375 (23.59 %) |
46,118 (3.85 %) |
135 | hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1 |
n/a | 18,620 (1.42 %) |
22,403 (1.38 %) |
n/a | 41.73 (99.99 %) |
1,805 (0.01 %) |
214 (100.00 %) |
6,063,911 (41.66 %) |
1,593,657 (4.46 %) |
12,229,281 (43.98 %) |
71,058 (1.88 %) |
136 | hippopotamus (mHipAmp2 2023) GCF_030028045.1 |
64,153 (2.73 %) |
20,331 (1.62 %) |
20,633 (1.37 %) |
n/a | 41.60 (100.00 %) |
226 (0.00 %) |
357 (100.00 %) |
3,783,440 (35.17 %) |
567,797 (3.38 %) |
13,462,531 (35.48 %) |
48,365 (1.91 %) |
137 | hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1 |
n/a | 20,391 (1.63 %) |
20,668 (1.37 %) |
n/a | 41.62 (100.00 %) |
83 (0.00 %) |
545 (100.00 %) |
3,778,764 (35.17 %) |
563,345 (3.63 %) |
13,524,869 (35.56 %) |
48,164 (1.90 %) |
138 | hoatzin (hap1 2023) GCA_030867145.1 |
n/a | 13,089 (1.50 %) |
29,621 (2.22 %) |
n/a | 45.56 (100.00 %) |
268 (0.00 %) |
683 (100.00 %) |
610,333 (22.07 %) |
252,997 (12.56 %) |
5,154,598 (31.67 %) |
58,754 (5.54 %) |
139 | honeycomb rockfish GCF_015220745.1 |
57,752 (9.94 %) |
15,244 (2.44 %) |
47,034 (5.98 %) |
63,546 (8.88 %) |
40.77 (99.83 %) |
215 (0.17 %) |
138 (100.00 %) |
524,161 (3.79 %) |
422,265 (6.20 %) |
4,827,148 (36.22 %) |
37,878 (1.84 %) |
140 | hourglass treefrog (maternal 2023) GCA_027789725.1 |
n/a | 14,359 (0.89 %) |
32,575 (2.67 %) |
n/a | 43.88 (95.18 %) |
788 (4.82 %) |
3,358 (95.18 %) |
922,807 (2.38 %) |
1,744,603 (15.45 %) |
10,318,168 (48.47 %) |
244,270 (5.02 %) |
141 | house finch (bHaeMex1 primary hap 2022) GCA_027477595.1 |
n/a | 12,700 (1.83 %) |
24,567 (2.38 %) |
n/a | 42.91 (99.02 %) |
295 (0.98 %) |
183 (100.00 %) |
440,379 (3.17 %) |
463,164 (6.37 %) |
6,300,100 (23.47 %) |
30,897 (2.53 %) |
142 | house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1 |
n/a | 22,351 (1.96 %) |
19,629 (1.26 %) |
n/a | 41.38 (100.00 %) |
101 (0.00 %) |
179 (100.00 %) |
4,774,018 (45.31 %) |
1,620,102 (10.50 %) |
13,181,250 (40.47 %) |
23,955 (0.54 %) |
143 | human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021) GCA_016695395.2 |
n/a | 20,401 (1.92 %) |
20,682 (1.21 %) |
n/a | 40.87 (99.64 %) |
1,217 (0.36 %) |
950 (100.00 %) |
5,350,025 (52.32 %) |
1,006,502 (4.68 %) |
15,969,368 (38.50 %) |
50,826 (1.08 %) |
144 | Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022) GCA_027474245.1 |
n/a | 13,233 (1.67 %) |
23,010 (1.93 %) |
n/a | 43.91 (99.92 %) |
253 (0.08 %) |
136 (100.00 %) |
610,144 (11.51 %) |
214,393 (5.75 %) |
6,069,916 (25.74 %) |
33,172 (3.38 %) |
145 | hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2 |
n/a | 19,096 (1.59 %) |
20,674 (1.34 %) |
n/a | 41.99 (99.75 %) |
277 (0.25 %) |
1,435 (100.00 %) |
5,290,422 (47.51 %) |
478,946 (1.94 %) |
12,568,313 (41.15 %) |
45,850 (1.37 %) |
146 | hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1 |
63,234 (2.88 %) |
19,601 (1.57 %) |
21,699 (1.34 %) |
n/a | 41.83 (99.94 %) |
302 (0.06 %) |
1,250 (100.00 %) |
5,524,454 (47.57 %) |
459,928 (1.40 %) |
13,208,799 (41.21 %) |
41,359 (1.10 %) |
147 | Indian glassy fish (v2 2020) GCA_900634625.2 |
n/a | 15,339 (3.60 %) |
44,099 (8.47 %) |
57,867 (10.10 %) |
42.38 (98.08 %) |
1,523 (1.92 %) |
157 (100.00 %) |
346,399 (3.02 %) |
163,524 (3.00 %) |
2,755,274 (25.07 %) |
17,931 (1.47 %) |
148 | Indo-Pacific tarpon GCF_013368585.1 |
41,583 (6.91 %) |
18,302 (2.47 %) |
29,762 (5.45 %) |
74,968 (7.01 %) |
43.02 (99.97 %) |
63 (0.03 %) |
207 (100.00 %) |
603,558 (3.71 %) |
433,446 (4.32 %) |
5,341,985 (22.07 %) |
78,561 (3.69 %) |
149 | jewelled blenny GCF_902148845.1 |
42,877 (8.61 %) |
15,188 (2.40 %) |
41,262 (7.86 %) |
58,418 (6.97 %) |
44.34 (98.69 %) |
602 (1.31 %) |
203 (100.00 %) |
667,122 (4.21 %) |
442,004 (5.09 %) |
4,388,570 (26.54 %) |
121,464 (9.36 %) |
150 | John dory (primary hap 2023) GCA_960531495.1 |
n/a | 14,906 (2.33 %) |
72,029 (6.72 %) |
n/a | 43.92 (99.98 %) |
887 (0.02 %) |
191 (100.00 %) |
1,609,654 (22.82 %) |
897,264 (13.58 %) |
4,548,467 (39.80 %) |
129,147 (11.75 %) |
151 | kagu (bRhyJub1 primary hap 2023) GCA_027574665.1 |
n/a | 13,042 (1.63 %) |
24,142 (2.01 %) |
n/a | 45.07 (99.96 %) |
300 (0.04 %) |
148 (100.00 %) |
563,851 (12.90 %) |
270,861 (12.36 %) |
6,191,106 (28.24 %) |
54,426 (4.92 %) |
152 | kakapo (Jane v2 2020 refseq) GCF_004027225.2 |
49,757 (5.76 %) |
13,110 (1.92 %) |
22,782 (2.26 %) |
n/a | 41.97 (99.08 %) |
373 (0.92 %) |
89 (100.00 %) |
507,148 (7.85 %) |
208,178 (1.08 %) |
6,258,087 (20.50 %) |
22,278 (1.77 %) |
153 | killer whale (2022) GCF_937001465.1 |
78,470 (3.76 %) |
18,710 (1.51 %) |
21,101 (1.30 %) |
34,448 (1.49 %) |
41.91 (100.00 %) |
123 (0.00 %) |
448 (100.00 %) |
3,955,401 (36.81 %) |
844,672 (9.94 %) |
12,233,568 (41.63 %) |
77,307 (3.08 %) |
154 | Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023) GCF_009829125.3 |
33,236 (8.44 %) |
14,601 (2.46 %) |
44,145 (5.80 %) |
n/a | 40.22 (99.05 %) |
701 (0.95 %) |
122 (100.00 %) |
1,755,227 (42.93 %) |
551,482 (7.22 %) |
4,887,087 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
155 | Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1 |
63,293 (2.96 %) |
17,918 (1.89 %) |
20,819 (1.86 %) |
n/a | 42.57 (99.31 %) |
394 (0.69 %) |
202 (100.00 %) |
2,897,422 (23.58 %) |
797,420 (2.76 %) |
10,057,100 (34.56 %) |
55,965 (2.99 %) |
156 | lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023) GCA_028022735.1 |
n/a | 13,529 (1.69 %) |
23,672 (1.98 %) |
n/a | 43.50 (99.85 %) |
259 (0.15 %) |
232 (100.00 %) |
491,653 (3.53 %) |
349,011 (9.83 %) |
5,955,030 (26.51 %) |
32,237 (2.61 %) |
157 | lance-tailed manakin GCF_009829145.1 |
46,366 (5.56 %) |
12,594 (1.91 %) |
22,763 (2.31 %) |
26,057 (3.91 %) |
41.97 (99.70 %) |
206 (0.30 %) |
93 (100.00 %) |
485,121 (7.13 %) |
247,189 (1.64 %) |
6,498,294 (20.04 %) |
25,377 (1.97 %) |
158 | lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq) GCF_023638135.1 |
48,561 (5.70 %) |
12,862 (1.69 %) |
21,562 (1.92 %) |
n/a | 43.03 (99.83 %) |
158 (0.17 %) |
397 (100.00 %) |
439,975 (3.77 %) |
203,640 (6.96 %) |
6,921,438 (23.57 %) |
32,398 (2.65 %) |
159 | large-eye snaggletooth (primary hap 2023) GCA_949987555.1 |
n/a | 16,376 (2.19 %) |
82,947 (7.99 %) |
n/a | 46.31 (99.94 %) |
2,631 (0.06 %) |
1,522 (100.00 %) |
3,333,323 (43.58 %) |
1,553,932 (25.91 %) |
3,393,507 (46.78 %) |
99,668 (6.39 %) |
160 | largescale foureyes (2020) GCA_014839685.1 |
n/a | 14,774 (2.18 %) |
42,858 (4.83 %) |
58,247 (6.94 %) |
38.54 (99.96 %) |
107 (0.04 %) |
33 (100.00 %) |
506,950 (2.73 %) |
305,170 (2.13 %) |
6,194,879 (29.85 %) |
17,881 (0.94 %) |
161 | Lataste's viper (rVipLat1 2022) GCA_024294585.1 |
n/a | 13,350 (1.17 %) |
18,904 (1.93 %) |
n/a | 40.96 (99.78 %) |
769 (0.22 %) |
56 (100.00 %) |
1,209,793 (7.69 %) |
762,735 (5.06 %) |
7,424,674 (44.80 %) |
110,631 (4.07 %) |
162 | leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K) GCF_009764565.3 |
73,318 (3.97 %) |
14,610 (1.03 %) |
16,358 (1.45 %) |
n/a | 43.35 (99.74 %) |
668 (0.26 %) |
40 (100.00 %) |
1,694,449 (14.90 %) |
304,773 (1.14 %) |
11,121,962 (34.21 %) |
35,485 (1.36 %) |
163 | lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1 |
51,730 (1.99 %) |
20,129 (1.24 %) |
22,089 (1.24 %) |
40,414 (1.76 %) |
42.00 (99.52 %) |
561 (0.48 %) |
160 (100.00 %) |
7,346,291 (41.25 %) |
1,187,587 (2.92 %) |
14,222,177 (44.13 %) |
34,688 (0.86 %) |
164 | lesser kestrel (v2 2021) GCF_017639655.2 |
47,420 (5.64 %) |
13,098 (1.80 %) |
22,203 (2.07 %) |
n/a | 42.30 (99.66 %) |
298 (0.34 %) |
291 (100.00 %) |
516,499 (5.58 %) |
210,234 (1.26 %) |
7,133,934 (19.19 %) |
27,558 (2.21 %) |
165 | lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023) GCA_028389875.1 |
n/a | 13,358 (1.72 %) |
23,870 (2.13 %) |
n/a | 42.45 (99.89 %) |
128 (0.11 %) |
179 (100.00 %) |
674,141 (6.73 %) |
329,122 (5.34 %) |
6,820,211 (22.78 %) |
45,073 (5.83 %) |
166 | lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023) GCA_027579695.1 |
n/a | 15,841 (0.90 %) |
85,700 (3.30 %) |
n/a | 42.44 (99.43 %) |
334 (0.57 %) |
38 (100.00 %) |
5,905,868 (49.76 %) |
1,126,468 (6.51 %) |
7,609,180 (62.74 %) |
166,630 (4.38 %) |
167 | lesser sand-eel (primary hap 2023) GCA_949987685.1 |
n/a | 13,908 (2.19 %) |
50,634 (6.50 %) |
n/a | 41.22 (99.97 %) |
1,017 (0.03 %) |
701 (100.00 %) |
2,698,640 (39.19 %) |
577,328 (8.51 %) |
3,615,231 (39.17 %) |
33,251 (1.82 %) |
168 | limp eelpout (primary hap 2023) GCA_949748355.1 |
n/a | 15,060 (2.89 %) |
50,064 (7.31 %) |
n/a | 41.88 (99.98 %) |
589 (0.02 %) |
534 (100.00 %) |
1,116,427 (28.18 %) |
315,489 (13.14 %) |
2,598,812 (33.21 %) |
50,192 (3.82 %) |
169 | live sharksucker (v2 2021) GCA_900963305.2 |
n/a | 14,975 (3.53 %) |
40,908 (7.56 %) |
n/a | 41.43 (99.89 %) |
140 (0.11 %) |
38 (100.00 %) |
772,309 (14.49 %) |
146,353 (1.65 %) |
3,204,473 (21.79 %) |
16,807 (1.33 %) |
170 | long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022) GCA_023637945.1 |
n/a | 12,328 (2.02 %) |
20,312 (2.34 %) |
n/a | 41.00 (99.63 %) |
141 (0.37 %) |
211 (99.63 %) |
497,506 (5.06 %) |
265,815 (1.51 %) |
6,045,702 (20.10 %) |
15,922 (1.43 %) |
171 | longspined bullhead (2021) GCA_910589615.1 |
n/a | 15,027 (3.10 %) |
51,137 (7.71 %) |
n/a | 42.22 (99.99 %) |
242 (0.01 %) |
27 (100.00 %) |
452,844 (4.81 %) |
417,308 (9.63 %) |
3,262,282 (28.51 %) |
55,527 (4.38 %) |
172 | lumpfish (refseq) GCF_009769545.1 |
41,612 (11.11 %) |
14,752 (3.31 %) |
49,223 (8.10 %) |
52,721 (8.34 %) |
42.83 (98.22 %) |
347 (1.78 %) |
48 (100.00 %) |
478,386 (6.02 %) |
421,632 (11.07 %) |
2,928,619 (27.99 %) |
53,321 (5.09 %) |
173 | maguari stork (2021) GCA_017639555.1 |
n/a | 12,905 (1.81 %) |
22,204 (2.01 %) |
n/a | 42.12 (98.21 %) |
232 (1.79 %) |
153 (100.00 %) |
485,318 (6.35 %) |
184,992 (0.78 %) |
7,064,965 (19.56 %) |
31,653 (3.02 %) |
174 | mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U) GCF_015476345.1 |
59,854 (7.33 %) |
12,988 (1.87 %) |
23,709 (2.20 %) |
86,787 (8.80 %) |
42.27 (99.64 %) |
905 (0.36 %) |
756 (100.00 %) |
803,558 (8.04 %) |
417,575 (5.02 %) |
6,627,843 (24.59 %) |
35,030 (3.06 %) |
175 | marbled rockcod (primary hap 2023) GCA_949606895.1 |
n/a | 15,070 (1.79 %) |
71,367 (6.50 %) |
n/a | 41.46 (99.92 %) |
4,157 (0.08 %) |
943 (100.00 %) |
1,717,591 (42.63 %) |
474,348 (12.30 %) |
4,011,319 (44.93 %) |
59,531 (2.83 %) |
176 | Mauritius kestrel (primary hap 2023) GCA_963210335.1 |
n/a | 13,064 (1.72 %) |
22,269 (1.98 %) |
n/a | 42.67 (99.99 %) |
407 (0.01 %) |
316 (100.00 %) |
459,578 (3.87 %) |
315,686 (6.19 %) |
6,650,507 (22.84 %) |
36,076 (2.82 %) |
177 | Mauritius parakeet (primary hap 2023) GCA_963264785.1 |
n/a | 13,133 (1.81 %) |
23,396 (2.19 %) |
n/a | 42.66 (99.99 %) |
358 (0.01 %) |
172 (100.00 %) |
511,156 (7.05 %) |
238,915 (5.05 %) |
5,764,523 (25.19 %) |
24,675 (1.70 %) |
178 | meadow viper (2022) GCA_947247035.1 |
n/a | 13,282 (1.16 %) |
18,653 (1.90 %) |
n/a | 40.93 (99.98 %) |
1,819 (0.02 %) |
384 (100.00 %) |
1,187,501 (7.72 %) |
762,639 (6.28 %) |
7,428,147 (45.35 %) |
101,007 (3.95 %) |
179 | Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022) GCF_025201925.1 |
62,007 (3.15 %) |
14,883 (0.96 %) |
18,524 (1.48 %) |
n/a | 44.69 (96.36 %) |
1,866 (3.64 %) |
621 (100.00 %) |
1,372,189 (11.32 %) |
472,501 (3.42 %) |
11,362,604 (34.69 %) |
73,700 (2.04 %) |
180 | Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022) GCA_025201965.1 |
n/a | 15,425 (0.94 %) |
20,005 (1.48 %) |
n/a | 44.46 (95.51 %) |
1,790 (4.49 %) |
4,782 (95.51 %) |
1,404,726 (11.28 %) |
453,302 (2.47 %) |
11,996,092 (34.08 %) |
77,167 (2.14 %) |
181 | milkfish GCF_902362185.1 |
30,812 (7.61 %) |
16,869 (3.41 %) |
21,377 (6.58 %) |
n/a | 41.53 (99.36 %) |
112 (0.64 %) |
31 (100.00 %) |
958,774 (8.18 %) |
731,733 (9.10 %) |
3,702,024 (26.31 %) |
22,089 (1.27 %) |
182 | minke whale (primary hap 2023) GCF_949987535.1 |
61,711 (2.51 %) |
19,550 (1.49 %) |
21,499 (1.26 %) |
n/a | 41.55 (99.99 %) |
1,177 (0.01 %) |
1,374 (100.00 %) |
4,006,927 (35.92 %) |
1,058,105 (12.08 %) |
12,708,103 (42.66 %) |
72,756 (1.59 %) |
183 | monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021) GCF_019393635.1 |
47,034 (2.02 %) |
18,399 (0.80 %) |
15,519 (0.85 %) |
n/a | 39.11 (99.91 %) |
260 (0.09 %) |
17 (100.00 %) |
9,107,968 (41.08 %) |
1,249,635 (2.12 %) |
21,135,324 (42.80 %) |
16,598 (0.36 %) |
184 | mute swan (v2 2021) GCF_009769625.2 |
59,524 (6.76 %) |
12,983 (1.98 %) |
22,400 (2.22 %) |
33,839 (5.17 %) |
41.92 (99.13 %) |
451 (0.87 %) |
171 (100.00 %) |
700,051 (7.55 %) |
301,579 (1.34 %) |
6,791,838 (21.30 %) |
31,278 (3.07 %) |
185 | Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq) GCF_027579445.1 |
31,033 (4.42 %) |
12,385 (1.72 %) |
24,339 (2.24 %) |
n/a | 43.01 (99.57 %) |
215 (0.43 %) |
77 (100.00 %) |
479,994 (3.33 %) |
443,098 (9.18 %) |
6,350,593 (25.82 %) |
31,693 (3.88 %) |
186 | New Caledonian crow GCF_009650955.1 |
50,821 (6.95 %) |
12,747 (1.94 %) |
23,372 (2.37 %) |
30,299 (3.60 %) |
42.57 (97.41 %) |
289 (2.59 %) |
105 (100.00 %) |
452,690 (6.21 %) |
231,546 (1.70 %) |
6,265,995 (19.54 %) |
31,909 (2.48 %) |
187 | New Zealand spotty (refseq) GCF_009762535.1 |
45,555 (9.06 %) |
14,609 (2.22 %) |
43,259 (5.33 %) |
60,241 (8.02 %) |
40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
467 (100.00 %) |
517,755 (4.63 %) |
393,328 (5.54 %) |
4,522,224 (33.34 %) |
18,299 (0.85 %) |
188 | nine-banded armadillo (mDasNov1 2023) GCF_030445035.1 |
69,043 (2.70 %) |
20,516 (1.05 %) |
n/a | n/a | 41.00 (99.68 %) |
771 (0.32 %) |
539 (100.00 %) |
4,656,325 (32.86 %) |
726,574 (1.99 %) |
19,585,522 (43.65 %) |
140,990 (2.86 %) |
189 | nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023) GCA_030445055.1 |
n/a | 19,429 (1.06 %) |
22,396 (1.07 %) |
n/a | 40.96 (99.27 %) |
845 (0.73 %) |
594 (100.00 %) |
4,369,568 (32.83 %) |
673,707 (1.55 %) |
18,586,102 (42.41 %) |
131,852 (2.78 %) |
190 | ninespine stickleback (primary hap 2023) GCA_949316345.1 |
n/a | 14,600 (3.83 %) |
49,927 (9.98 %) |
n/a | 44.12 (99.97 %) |
738 (0.03 %) |
175 (100.00 %) |
599,088 (14.68 %) |
186,747 (10.27 %) |
2,273,942 (28.36 %) |
70,136 (9.39 %) |
191 | North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1 |
n/a | 18,102 (1.58 %) |
20,073 (1.40 %) |
n/a | 41.03 (100.00 %) |
277 (0.00 %) |
116 (100.00 %) |
4,958,089 (41.64 %) |
719,163 (1.59 %) |
13,867,662 (33.89 %) |
51,299 (1.36 %) |
192 | northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1 |
n/a | 18,636 (1.75 %) |
21,446 (1.68 %) |
n/a | 43.32 (99.99 %) |
1,423 (0.01 %) |
207 (100.00 %) |
1,259,729 (2.95 %) |
905,676 (6.25 %) |
10,554,535 (38.21 %) |
77,656 (3.27 %) |
193 | northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1 |
n/a | 19,073 (1.44 %) |
20,821 (1.21 %) |
n/a | 41.81 (99.99 %) |
1,098 (0.01 %) |
757 (100.00 %) |
3,997,911 (34.76 %) |
769,275 (14.94 %) |
12,133,820 (44.83 %) |
67,258 (2.00 %) |
194 | northern gannet (hap1 2023) GCA_031468805.1 |
n/a | 13,367 (1.65 %) |
24,403 (2.00 %) |
n/a | 42.94 (100.00 %) |
263 (0.00 %) |
829 (100.00 %) |
498,574 (4.51 %) |
273,984 (5.20 %) |
5,544,122 (27.29 %) |
34,879 (3.83 %) |
195 | northern goshawk (bAccGen1 v2 2022 genbank) GCA_929443795.2 |
n/a | 13,527 (1.65 %) |
24,595 (1.99 %) |
n/a | 43.78 (100.00 %) |
183 (0.00 %) |
455 (100.00 %) |
511,000 (3.76 %) |
325,992 (9.82 %) |
5,542,342 (27.30 %) |
43,070 (4.44 %) |
196 | northern pike GCF_011004845.1 |
63,733 (9.28 %) |
16,618 (2.41 %) |
55,784 (5.64 %) |
82,941 (8.82 %) |
42.22 (99.89 %) |
112 (0.11 %) |
53 (100.00 %) |
984,415 (29.15 %) |
524,708 (7.32 %) |
4,691,096 (32.91 %) |
42,910 (2.52 %) |
197 | Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2 |
99,139 (4.10 %) |
21,526 (1.86 %) |
19,266 (1.33 %) |
54,530 (2.79 %) |
41.99 (99.19 %) |
581 (0.81 %) |
757 (99.19 %) |
5,029,005 (45.44 %) |
1,514,974 (3.57 %) |
13,450,428 (35.83 %) |
19,244 (0.46 %) |
198 | olive python (hap1 2023) GCA_030867105.1 |
n/a | 13,448 (1.31 %) |
17,745 (2.07 %) |
n/a | 40.20 (99.98 %) |
73 (0.02 %) |
116 (99.98 %) |
741,052 (2.98 %) |
411,477 (3.31 %) |
7,668,994 (30.14 %) |
34,560 (2.18 %) |
199 | one-colored caecilian (2021) GCA_901765095.2 |
n/a | 14,569 (0.43 %) |
30,498 (1.16 %) |
n/a | 44.01 (98.99 %) |
2,452 (1.01 %) |
1,081 (100.00 %) |
1,894,383 (1.68 %) |
1,670,443 (3.30 %) |
22,207,143 (52.43 %) |
414,828 (3.91 %) |
200 | orange-tipped seq squirt (primary hap 2023) GCA_963082875.1 |
n/a | 3,120 (1.99 %) |
3,357 (8.53 %) |
n/a | 31.55 (99.96 %) |
244 (0.04 %) |
106 (100.00 %) |
56,509 (6.44 %) |
43,313 (12.97 %) |
962,614 (51.07 %) |
1,079 (6.77 %) |
201 | orbiculate cardinalfish GCF_902148855.1 |
46,571 (5.47 %) |
15,761 (1.50 %) |
31,563 (4.00 %) |
59,905 (3.98 %) |
37.90 (99.73 %) |
1,844 (0.27 %) |
340 (100.00 %) |
1,257,250 (5.57 %) |
979,214 (8.64 %) |
6,386,731 (48.59 %) |
29,320 (0.87 %) |
202 | painted frog (primary hap 2022) GCA_027410445.1 |
n/a | 14,522 (0.54 %) |
21,861 (1.14 %) |
n/a | 39.52 (98.39 %) |
3,681 (1.61 %) |
1,318 (100.00 %) |
1,928,844 (4.34 %) |
3,684,477 (13.44 %) |
19,091,818 (55.21 %) |
127,760 (1.34 %) |
203 | pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2 |
54,932 (3.31 %) |
18,171 (1.69 %) |
20,025 (1.62 %) |
42,786 (3.39 %) |
42.38 (99.28 %) |
884 (0.72 %) |
77 (100.00 %) |
3,069,141 (30.00 %) |
385,664 (0.81 %) |
12,050,232 (30.57 %) |
63,905 (3.75 %) |
204 | Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1 |
48,421 (2.20 %) |
18,667 (1.61 %) |
21,915 (1.59 %) |
n/a | 42.35 (97.95 %) |
349 (2.05 %) |
60 (100.00 %) |
3,863,217 (32.76 %) |
624,933 (1.88 %) |
11,572,319 (37.09 %) |
79,984 (2.45 %) |
205 | pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023) GCA_027942865.1 |
n/a | 15,242 (2.07 %) |
60,994 (6.53 %) |
n/a | 41.51 (99.99 %) |
282 (0.01 %) |
189 (100.00 %) |
975,354 (15.76 %) |
315,625 (10.49 %) |
3,601,904 (35.09 %) |
49,121 (3.07 %) |
206 | pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023) GCA_027942885.1 |
n/a | 15,317 (2.02 %) |
61,647 (6.35 %) |
n/a | 41.37 (99.99 %) |
135 (0.01 %) |
469 (99.99 %) |
981,519 (15.40 %) |
319,637 (12.45 %) |
3,706,473 (36.77 %) |
50,353 (2.98 %) |
207 | peladilla (galaxoid fish 2021) GCA_017639675.1 |
n/a | 13,829 (3.83 %) |
41,932 (8.64 %) |
n/a | 45.01 (98.24 %) |
1,158 (1.77 %) |
41 (100.00 %) |
930,246 (18.49 %) |
660,569 (13.71 %) |
2,316,198 (27.66 %) |
41,023 (4.40 %) |
208 | peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq) GCF_023634155.1 |
49,100 (5.64 %) |
13,021 (1.66 %) |
21,794 (1.95 %) |
n/a | 42.65 (99.69 %) |
241 (0.31 %) |
125 (100.00 %) |
586,320 (11.83 %) |
335,218 (8.05 %) |
7,038,851 (24.65 %) |
26,085 (2.25 %) |
209 | Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022) GCA_027409185.1 |
n/a | 20,384 (1.64 %) |
22,124 (1.29 %) |
n/a | 40.24 (100.00 %) |
116 (0.00 %) |
131 (100.00 %) |
4,492,423 (39.31 %) |
627,842 (4.79 %) |
15,561,515 (36.57 %) |
45,336 (1.27 %) |
210 | pinecone soldierfish GCF_902150065.1 |
40,770 (8.72 %) |
15,738 (2.42 %) |
26,691 (5.69 %) |
57,069 (6.14 %) |
41.83 (99.78 %) |
253 (0.22 %) |
87 (100.00 %) |
1,063,888 (5.90 %) |
646,820 (4.30 %) |
4,938,857 (28.11 %) |
41,636 (2.04 %) |
211 | pink pigeon (primary hap 2023) GCA_963082525.1 |
n/a | 13,140 (1.85 %) |
25,111 (2.31 %) |
n/a | 42.27 (99.99 %) |
509 (0.01 %) |
143 (100.00 %) |
488,313 (5.48 %) |
331,962 (3.50 %) |
6,243,204 (22.87 %) |
36,343 (3.63 %) |
212 | plains spadefoot toad (aSpeBom1 primary hap 2022) GCF_027358695.1 |
41,009 (4.67 %) |
13,912 (2.00 %) |
25,745 (4.50 %) |
n/a | 40.45 (99.61 %) |
102 (0.39 %) |
17 (100.00 %) |
497,976 (3.84 %) |
645,915 (10.08 %) |
5,232,342 (36.26 %) |
72,598 (4.35 %) |
213 | platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2 |
51,392 (3.07 %) |
14,778 (1.26 %) |
18,888 (1.63 %) |
n/a | 46.14 (99.18 %) |
515 (0.82 %) |
322 (100.00 %) |
5,071,089 (51.34 %) |
578,614 (2.89 %) |
9,113,848 (48.93 %) |
87,796 (6.47 %) |
214 | plumbeous ibis (2021) GCA_020745775.1 |
n/a | 13,028 (1.84 %) |
22,722 (2.10 %) |
n/a | 42.37 (99.81 %) |
104 (0.19 %) |
88 (100.00 %) |
488,030 (6.66 %) |
188,606 (1.01 %) |
6,982,793 (20.08 %) |
32,920 (3.37 %) |
215 | pollack (primary hap 2023) GCA_949987615.1 |
n/a | 14,126 (2.81 %) |
61,907 (8.75 %) |
n/a | 45.67 (99.94 %) |
1,810 (0.06 %) |
616 (100.00 %) |
753,034 (10.17 %) |
850,189 (15.72 %) |
2,888,555 (33.70 %) |
80,883 (8.43 %) |
216 | prehistoric monster fish GCF_902500255.1 |
45,404 (2.55 %) |
14,664 (0.76 %) |
72,609 (2.41 %) |
57,391 (2.04 %) |
41.99 (99.49 %) |
2,554 (0.51 %) |
464 (100.00 %) |
1,310,663 (2.79 %) |
786,401 (3.65 %) |
9,901,286 (59.90 %) |
172,199 (5.45 %) |
217 | pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1 |
56,261 (2.22 %) |
18,496 (1.55 %) |
20,718 (1.32 %) |
n/a | 42.05 (99.81 %) |
143 (0.19 %) |
581 (100.00 %) |
3,817,659 (34.51 %) |
758,297 (7.42 %) |
12,196,998 (39.96 %) |
101,353 (2.90 %) |
218 | pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1 |
n/a | 18,550 (1.51 %) |
20,491 (1.29 %) |
n/a | 42.18 (99.99 %) |
138 (0.01 %) |
391 (100.00 %) |
3,860,112 (33.83 %) |
820,375 (9.58 %) |
12,159,196 (41.59 %) |
106,168 (2.78 %) |
219 | razorbill GCA_008658365.1 |
n/a | 12,787 (1.83 %) |
22,839 (2.13 %) |
n/a | 42.67 (99.70 %) |
227 (0.30 %) |
95 (100.00 %) |
543,517 (7.16 %) |
212,546 (1.12 %) |
6,930,708 (20.10 %) |
38,960 (3.02 %) |
220 | red deer (2021) GCF_910594005.1 |
68,992 (2.68 %) |
20,470 (1.48 %) |
22,563 (1.32 %) |
n/a | 42.98 (100.00 %) |
40 (0.00 %) |
144 (100.00 %) |
5,501,063 (44.60 %) |
503,301 (12.23 %) |
13,102,622 (44.55 %) |
88,756 (1.66 %) |
221 | red-bellied piranha GCF_015220715.1 |
54,818 (7.05 %) |
16,817 (1.87 %) |
52,672 (4.24 %) |
76,011 (5.65 %) |
40.58 (99.17 %) |
303 (0.83 %) |
55 (100.00 %) |
817,566 (5.40 %) |
689,236 (8.30 %) |
7,296,459 (35.73 %) |
33,087 (1.38 %) |
222 | red-crested turaco GCA_009769465.1 |
n/a | 12,744 (1.75 %) |
25,706 (2.29 %) |
n/a | 42.60 (97.89 %) |
344 (2.11 %) |
140 (100.00 %) |
551,885 (8.95 %) |
176,530 (0.80 %) |
6,805,042 (22.19 %) |
43,051 (3.40 %) |
223 | red-fronted tinkerbird GCA_015220805.1 |
n/a | 12,345 (1.60 %) |
23,206 (2.02 %) |
n/a | 45.96 (99.53 %) |
307 (0.47 %) |
253 (100.00 %) |
1,082,064 (22.90 %) |
378,866 (4.28 %) |
6,003,548 (35.88 %) |
26,519 (1.76 %) |
224 | red-legged seriema GCA_009819825.1 |
n/a | 13,229 (1.84 %) |
25,580 (2.35 %) |
n/a | 42.20 (99.59 %) |
194 (0.41 %) |
110 (100.00 %) |
483,784 (6.50 %) |
160,481 (0.73 %) |
6,960,060 (19.71 %) |
32,899 (2.77 %) |
225 | red-throated loon (hap1 2023) GCA_030936125.1 |
n/a | 13,357 (1.64 %) |
29,603 (2.35 %) |
n/a | 43.54 (100.00 %) |
260 (0.00 %) |
3,225 (100.00 %) |
549,694 (8.44 %) |
246,171 (10.46 %) |
5,258,356 (27.36 %) |
39,810 (3.37 %) |
226 | reedfish (2021) GCF_900747795.2 |
44,479 (2.01 %) |
13,108 (0.46 %) |
23,157 (1.29 %) |
n/a | 39.37 (99.18 %) |
1,431 (0.82 %) |
169 (100.00 %) |
8,636,520 (39.34 %) |
1,069,643 (2.91 %) |
19,980,572 (47.52 %) |
89,023 (1.13 %) |
227 | Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1 |
n/a | 19,396 (1.48 %) |
21,693 (1.26 %) |
n/a | 41.62 (97.80 %) |
131 (2.20 %) |
1,039 (100.00 %) |
3,973,936 (35.55 %) |
987,571 (11.66 %) |
12,473,459 (42.11 %) |
74,971 (1.64 %) |
228 | rifleman (2021) GCA_016904835.1 |
n/a | 12,620 (1.92 %) |
24,568 (2.61 %) |
n/a | 42.41 (99.61 %) |
195 (0.39 %) |
206 (100.00 %) |
495,673 (9.14 %) |
253,008 (2.04 %) |
5,936,177 (19.93 %) |
20,145 (1.83 %) |
229 | ring-tailed lemur (2021) GCF_020740605.2 |
55,883 (2.78 %) |
18,659 (1.98 %) |
20,542 (1.50 %) |
n/a | 41.36 (99.84 %) |
210 (0.16 %) |
185 (100.00 %) |
3,432,734 (37.67 %) |
518,071 (6.84 %) |
12,916,577 (32.91 %) |
50,626 (1.88 %) |
230 | river trout (v2 2021) GCA_901001165.2 |
n/a | 27,928 (1.66 %) |
110,791 (4.44 %) |
n/a | 43.36 (96.90 %) |
3,941 (3.10 %) |
1,441 (100.00 %) |
4,690,842 (57.30 %) |
1,789,507 (15.87 %) |
9,819,763 (52.37 %) |
70,821 (1.77 %) |
231 | roach minnow (primary hap 2023) GCA_951802725.1 |
n/a | 18,132 (2.65 %) |
63,523 (6.01 %) |
n/a | 38.80 (99.99 %) |
471 (0.01 %) |
86 (100.00 %) |
2,613,900 (48.90 %) |
625,102 (8.21 %) |
5,738,444 (41.24 %) |
65,328 (3.68 %) |
232 | rock gunnel (2021) GCA_910591455.2 |
n/a | 15,181 (3.34 %) |
44,153 (7.53 %) |
51,135 (7.40 %) |
42.31 (99.98 %) |
418 (0.02 %) |
101 (100.00 %) |
1,121,704 (25.48 %) |
269,467 (4.88 %) |
3,358,709 (24.69 %) |
36,987 (3.02 %) |
233 | rock ptarmigan (2022) GCF_023343835.1 |
51,619 (7.29 %) |
12,832 (2.31 %) |
23,047 (2.56 %) |
n/a | 41.57 (99.99 %) |
210 (0.01 %) |
165 (100.00 %) |
526,839 (5.87 %) |
268,431 (2.63 %) |
5,885,345 (21.73 %) |
21,346 (2.37 %) |
234 | Rosablanca catfish (hap1 2023) GCA_030014385.1 |
n/a | 15,802 (1.97 %) |
47,186 (4.62 %) |
n/a | 40.27 (100.00 %) |
198 (0.00 %) |
349 (100.00 %) |
2,616,870 (40.73 %) |
658,784 (9.71 %) |
5,197,126 (48.95 %) |
48,344 (2.62 %) |
235 | royal ground snake (hap1 2023) GCA_031021105.1 |
n/a | 13,327 (0.96 %) |
20,347 (1.68 %) |
n/a | 41.25 (99.99 %) |
1,391 (0.01 %) |
400 (100.00 %) |
1,983,903 (10.40 %) |
1,698,731 (7.29 %) |
9,084,707 (53.44 %) |
130,852 (4.47 %) |
236 | saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_949987515.1 |
n/a | 18,625 (1.49 %) |
20,451 (1.28 %) |
n/a | 42.06 (99.99 %) |
968 (0.01 %) |
631 (100.00 %) |
4,020,682 (35.99 %) |
1,259,549 (13.09 %) |
12,359,818 (42.64 %) |
66,179 (3.91 %) |
237 | Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq) GCF_023634085.1 |
50,290 (5.75 %) |
12,973 (1.67 %) |
21,670 (1.90 %) |
n/a | 43.15 (99.70 %) |
258 (0.30 %) |
283 (100.00 %) |
548,090 (7.21 %) |
201,488 (8.55 %) |
7,030,877 (24.94 %) |
31,791 (2.57 %) |
238 | saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887145.1 |
27,528 (4.03 %) |
12,832 (1.69 %) |
25,514 (2.23 %) |
n/a | 43.50 (99.76 %) |
363 (0.24 %) |
282 (100.00 %) |
541,958 (3.43 %) |
566,692 (13.38 %) |
6,205,274 (28.98 %) |
35,549 (5.05 %) |
239 | sand lizard GCF_009819535.1 |
41,701 (3.64 %) |
14,350 (1.48 %) |
19,231 (2.45 %) |
32,804 (4.14 %) |
43.75 (99.75 %) |
379 (0.25 %) |
29 (100.00 %) |
975,474 (5.32 %) |
425,414 (1.76 %) |
7,135,165 (34.49 %) |
76,053 (2.68 %) |
240 | Sardinian treefrog (aHylSar1 2023) GCF_029499605.1 |
108,406 (1.98 %) |
13,959 (0.46 %) |
n/a | n/a | 43.90 (99.99 %) |
2,297 (0.01 %) |
3,474 (100.00 %) |
1,903,654 (2.85 %) |
2,970,691 (16.56 %) |
15,354,577 (64.31 %) |
652,708 (8.36 %) |
241 | sea lamprey GCF_010993605.1 |
41,241 (6.50 %) |
7,638 (0.70 %) |
36,336 (4.06 %) |
83,714 (10.03 %) |
48.31 (98.62 %) |
930 (1.38 %) |
1,434 (100.00 %) |
1,920,851 (39.36 %) |
1,194,165 (21.47 %) |
5,320,620 (50.50 %) |
178,590 (35.88 %) |
242 | shanny (primary hap 2023) GCA_963383615.1 |
n/a | 15,032 (2.44 %) |
62,625 (6.97 %) |
n/a | 42.07 (99.98 %) |
598 (0.02 %) |
847 (100.00 %) |
967,197 (11.85 %) |
498,286 (8.15 %) |
4,397,828 (28.96 %) |
65,744 (4.06 %) |
243 | Siamese fighting fish (2020) GCF_900634795.3 |
54,864 (17.78 %) |
14,745 (4.20 %) |
56,808 (10.87 %) |
69,466 (16.34 %) |
45.30 (99.99 %) |
328 (0.01 %) |
70 (100.00 %) |
255,550 (3.51 %) |
184,269 (4.62 %) |
2,010,934 (23.88 %) |
72,126 (13.08 %) |
244 | Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023) GCF_900634795.4 |
59,278 (19.85 %) |
14,594 (4.32 %) |
55,265 (10.96 %) |
n/a | 45.31 (99.99 %) |
321 (0.01 %) |
36 (100.00 %) |
384,203 (19.38 %) |
175,898 (4.39 %) |
1,946,630 (23.16 %) |
70,331 (13.13 %) |
245 | slow loris (mNycCou1 primary hap 2022) GCF_027406575.1 |
67,211 (2.59 %) |
22,193 (1.49 %) |
21,345 (1.28 %) |
n/a | 40.82 (99.86 %) |
218 (0.14 %) |
84 (100.00 %) |
4,625,872 (39.88 %) |
579,983 (1.59 %) |
14,405,367 (40.78 %) |
38,257 (0.77 %) |
246 | smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank) GCA_902713615.2 |
n/a | 12,587 (0.36 %) |
23,986 (1.08 %) |
n/a | 47.65 (98.48 %) |
7,146 (1.52 %) |
645 (100.00 %) |
1,451,634 (1.94 %) |
1,448,619 (6.25 %) |
20,884,741 (51.41 %) |
456,658 (8.18 %) |
247 | smalleye Pacific opah (fLamInc1 2023) GCF_029633865.1 |
34,018 (4.17 %) |
13,617 (1.10 %) |
74,639 (4.12 %) |
n/a | 44.94 (99.96 %) |
3,115 (0.04 %) |
544 (100.00 %) |
4,603,649 (53.23 %) |
1,009,241 (18.00 %) |
5,236,063 (51.65 %) |
143,632 (7.43 %) |
248 | smalleye Pacific opah (hap1 2023) GCA_029633845.1 |
n/a | 13,661 (1.11 %) |
75,418 (4.21 %) |
n/a | 45.01 (99.96 %) |
3,120 (0.04 %) |
1,059 (100.00 %) |
4,634,757 (53.53 %) |
1,006,319 (17.13 %) |
5,273,732 (51.16 %) |
145,115 (7.59 %) |
249 | smalltooth sawfish (v2.1 2019 refseq) GCF_009764475.1 |
40,257 (2.94 %) |
12,157 (0.69 %) |
18,627 (1.55 %) |
n/a | 42.38 (99.09 %) |
698 (0.91 %) |
172 (100.00 %) |
4,824,261 (54.91 %) |
391,531 (1.52 %) |
11,282,260 (38.19 %) |
45,398 (1.34 %) |
250 | soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1 |
n/a | 18,056 (1.78 %) |
21,158 (1.79 %) |
n/a | 42.67 (100.00 %) |
161 (0.00 %) |
249 (100.00 %) |
2,899,535 (21.64 %) |
853,717 (7.80 %) |
10,162,216 (37.72 %) |
63,256 (3.06 %) |
251 | South Island takahe (primary hap 2021) GCA_020800305.1 |
n/a | 12,942 (1.69 %) |
23,221 (2.13 %) |
n/a | 43.74 (99.58 %) |
327 (0.42 %) |
174 (100.00 %) |
577,553 (9.77 %) |
259,017 (5.20 %) |
6,430,968 (25.90 %) |
23,810 (2.02 %) |
252 | southern bluefin tuna (2021) GCF_910596095.1 |
58,429 (11.06 %) |
15,626 (2.56 %) |
42,730 (5.74 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
184 (0.00 %) |
58 (100.00 %) |
554,276 (3.42 %) |
247,764 (2.94 %) |
5,176,851 (26.85 %) |
14,097 (0.88 %) |
253 | southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1 |
47,152 (2.39 %) |
19,356 (1.68 %) |
18,821 (1.36 %) |
n/a | 41.81 (98.94 %) |
2,143 (1.06 %) |
2,949 (100.00 %) |
4,850,460 (28.64 %) |
1,195,836 (2.72 %) |
13,540,762 (32.73 %) |
18,046 (0.54 %) |
254 | southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1 |
n/a | 20,058 (1.26 %) |
22,196 (1.13 %) |
n/a | 39.48 (99.44 %) |
961 (0.56 %) |
201 (100.00 %) |
4,037,291 (46.02 %) |
593,019 (1.17 %) |
18,033,833 (40.56 %) |
65,039 (1.33 %) |
255 | southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1 |
63,054 (2.39 %) |
21,998 (1.29 %) |
23,177 (1.18 %) |
45,345 (1.69 %) |
39.89 (97.48 %) |
1,243 (2.52 %) |
146 (100.00 %) |
4,559,690 (39.66 %) |
577,607 (1.02 %) |
16,594,630 (40.50 %) |
51,430 (1.14 %) |
256 | specked wood butterfly GCF_905163445.1 |
21,720 (6.53 %) |
4,713 (0.87 %) |
17,001 (4.33 %) |
29,238 (7.81 %) |
35.99 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
70 (100.00 %) |
304,062 (2.97 %) |
110,824 (4.09 %) |
3,704,161 (44.42 %) |
28,108 (2.75 %) |
257 | speckled mousebird (hap1 2023) GCA_028858725.1 |
n/a | 11,956 (1.78 %) |
25,177 (2.60 %) |
n/a | 42.38 (99.48 %) |
143 (0.52 %) |
189 (100.00 %) |
523,056 (12.47 %) |
243,547 (3.72 %) |
5,408,003 (23.43 %) |
25,552 (2.34 %) |
258 | sterlet (fAciRut3.2 2022) GCA_902713435.2 |
n/a | 24,717 (1.73 %) |
40,151 (4.13 %) |
74,807 (5.54 %) |
40.09 (99.99 %) |
475 (0.01 %) |
1,517 (100.00 %) |
1,844,596 (9.77 %) |
1,119,340 (9.88 %) |
9,372,934 (41.58 %) |
65,007 (2.74 %) |
259 | sterlet (maternal fAciRut3.2 2022) GCF_902713425.1 |
110,154 (7.62 %) |
25,364 (1.76 %) |
40,715 (4.06 %) |
n/a | 40.11 (100.00 %) |
433 (0.00 %) |
1,731 (100.00 %) |
4,055,215 (43.14 %) |
1,124,096 (10.13 %) |
9,426,172 (41.81 %) |
64,522 (2.85 %) |
260 | stone loach (2022) GCA_947034865.1 |
n/a | 16,419 (3.98 %) |
40,677 (7.21 %) |
n/a | 39.69 (99.97 %) |
825 (0.03 %) |
100 (100.00 %) |
1,324,513 (39.84 %) |
143,170 (9.30 %) |
3,000,881 (34.30 %) |
30,130 (3.71 %) |
261 | striped catfish (fPanHyp1 primary hap 2022) GCF_027358585.1 |
53,860 (11.99 %) |
16,033 (2.86 %) |
41,619 (5.48 %) |
n/a | 38.99 (99.49 %) |
236 (0.51 %) |
58 (100.00 %) |
1,870,234 (37.80 %) |
605,570 (6.82 %) |
5,059,429 (32.43 %) |
17,919 (1.29 %) |
262 | striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1 |
n/a | 18,595 (1.48 %) |
20,637 (1.29 %) |
n/a | 42.18 (99.99 %) |
993 (0.01 %) |
639 (100.00 %) |
4,097,623 (35.88 %) |
1,442,973 (13.60 %) |
12,327,244 (43.08 %) |
68,498 (4.29 %) |
263 | Suruca trogon (2021) GCA_020746105.1 |
n/a | 12,884 (1.85 %) |
23,805 (2.23 %) |
n/a | 42.80 (99.12 %) |
253 (0.88 %) |
182 (100.00 %) |
539,771 (9.26 %) |
181,564 (1.14 %) |
6,538,228 (22.49 %) |
41,376 (3.37 %) |
264 | Swainson's thrush (v2 2020) GCF_009819885.2 |
40,121 (5.41 %) |
13,004 (1.87 %) |
24,795 (2.41 %) |
n/a | 42.48 (98.86 %) |
429 (1.14 %) |
160 (100.00 %) |
493,071 (5.80 %) |
589,858 (4.32 %) |
6,708,638 (22.44 %) |
49,404 (3.53 %) |
265 | swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018845.1 |
29,544 (4.27 %) |
12,375 (1.75 %) |
24,577 (2.31 %) |
n/a | 43.08 (99.89 %) |
236 (0.11 %) |
40 (100.00 %) |
419,473 (3.09 %) |
439,909 (7.61 %) |
6,077,743 (24.47 %) |
32,064 (3.27 %) |
266 | tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023) GCA_028372415.1 |
n/a | 17,652 (0.77 %) |
15,774 (0.88 %) |
n/a | 38.73 (99.81 %) |
515 (0.19 %) |
315 (100.00 %) |
5,836,160 (26.14 %) |
1,193,709 (2.72 %) |
22,682,658 (39.52 %) |
23,629 (0.48 %) |
267 | tarantolino (rEulEur1 2023) GCF_029931775.1 |
24,643 (2.02 %) |
14,238 (1.16 %) |
21,782 (2.17 %) |
n/a | 44.68 (99.77 %) |
153 (0.23 %) |
591 (100.00 %) |
1,174,615 (6.99 %) |
436,937 (2.95 %) |
8,308,817 (39.80 %) |
83,089 (2.82 %) |
268 | tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023) GCA_028020825.1 |
n/a | 13,321 (1.76 %) |
24,102 (2.15 %) |
n/a | 42.35 (99.83 %) |
203 (0.17 %) |
1,038 (100.00 %) |
593,409 (10.51 %) |
202,463 (9.29 %) |
6,160,173 (27.65 %) |
25,785 (2.35 %) |
269 | thorny skate (v2 2020) GCF_010909765.2 |
45,968 (2.40 %) |
11,437 (0.60 %) |
26,341 (1.72 %) |
n/a | 44.30 (92.54 %) |
3,753 (7.46 %) |
957 (100.00 %) |
888,163 (2.58 %) |
1,176,348 (3.79 %) |
9,964,038 (52.25 %) |
242,676 (4.73 %) |
270 | tiny Cayenne caecilian GCF_901765095.1 |
41,333 (1.27 %) |
14,569 (0.43 %) |
30,499 (1.16 %) |
n/a | 44.01 (98.99 %) |
2,452 (1.01 %) |
1,081 (100.00 %) |
1,835,191 (1.59 %) |
1,670,443 (3.30 %) |
22,207,145 (52.43 %) |
414,828 (3.91 %) |
271 | torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank) GCA_901000725.3 |
n/a | 14,527 (4.79 %) |
51,181 (11.72 %) |
n/a | 45.67 (99.04 %) |
402 (0.96 %) |
128 (100.00 %) |
325,077 (14.03 %) |
178,921 (5.32 %) |
1,642,754 (20.86 %) |
49,975 (9.63 %) |
272 | trahira (hap1 2023) GCA_029633855.1 |
n/a | 16,039 (2.06 %) |
44,287 (4.38 %) |
n/a | 40.99 (92.91 %) |
867 (7.09 %) |
597 (100.00 %) |
2,228,831 (30.95 %) |
687,495 (13.85 %) |
5,309,097 (36.70 %) |
27,070 (2.09 %) |
273 | tufted duck GCF_009819795.1 |
29,492 (4.02 %) |
12,972 (1.98 %) |
22,757 (2.27 %) |
n/a | 41.66 (99.16 %) |
163 (0.84 %) |
105 (100.00 %) |
826,451 (8.47 %) |
411,356 (1.71 %) |
6,691,445 (22.36 %) |
29,882 (2.41 %) |
274 | two-lined caecilian GCF_901001135.1 |
56,617 (1.50 %) |
14,448 (0.38 %) |
40,572 (1.31 %) |
n/a | 44.40 (99.36 %) |
3,573 (0.64 %) |
1,330 (100.00 %) |
2,263,606 (1.94 %) |
2,036,108 (4.34 %) |
29,400,958 (44.09 %) |
602,912 (6.66 %) |
275 | two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank) GCA_901001135.2 |
n/a | 14,449 (0.38 %) |
40,573 (1.31 %) |
n/a | 44.40 (99.36 %) |
3,573 (0.64 %) |
1,330 (100.00 %) |
2,274,606 (1.91 %) |
2,036,107 (4.34 %) |
29,400,957 (44.09 %) |
602,911 (6.66 %) |
276 | vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1 |
60,106 (3.00 %) |
18,611 (1.76 %) |
20,103 (1.39 %) |
35,176 (2.22 %) |
41.36 (99.66 %) |
212 (0.34 %) |
64 (100.00 %) |
4,067,454 (44.25 %) |
602,407 (1.34 %) |
12,468,582 (35.55 %) |
66,806 (1.79 %) |
277 | village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq) GCF_026979565.1 |
44,961 (5.49 %) |
12,817 (1.94 %) |
24,245 (2.44 %) |
n/a | 42.23 (99.98 %) |
458 (0.02 %) |
177 (100.00 %) |
616,746 (11.96 %) |
411,917 (3.57 %) |
6,385,057 (20.91 %) |
37,940 (2.83 %) |
278 | village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022) GCA_026979555.1 |
n/a | 2,176 (1.79 %) |
7,719 (4.37 %) |
n/a | 49.74 (100.00 %) |
n/a | 1,939 (100.00 %) |
136,312 (29.31 %) |
157,341 (15.03 %) |
648,725 (34.67 %) |
15,490 (8.23 %) |
279 | warty frogfish (2020) GCA_013358685.1 |
n/a | 14,494 (3.34 %) |
45,310 (7.77 %) |
n/a | 41.86 (99.87 %) |
219 (0.13 %) |
155 (100.00 %) |
413,753 (4.95 %) |
290,313 (6.11 %) |
3,010,996 (29.71 %) |
36,840 (4.18 %) |
280 | western capercaillie (primary hap 2023) GCA_951394365.1 |
n/a | 12,775 (2.33 %) |
22,516 (2.50 %) |
n/a | 41.49 (99.98 %) |
973 (0.02 %) |
318 (100.00 %) |
518,194 (5.54 %) |
276,294 (2.21 %) |
5,866,033 (21.12 %) |
21,287 (2.50 %) |
281 | western European hedgehog (primary hap 2023 genbank) GCA_950295315.1 |
n/a | 18,126 (1.16 %) |
21,345 (1.28 %) |
n/a | 42.00 (99.97 %) |
3,760 (0.03 %) |
1,175 (100.00 %) |
4,891,344 (19.68 %) |
1,507,933 (3.81 %) |
12,571,193 (54.50 %) |
32,667 (0.90 %) |
282 | Western terrestrial garter snake GCF_009769535.1 |
33,492 (3.42 %) |
13,074 (1.13 %) |
18,807 (1.93 %) |
31,660 (2.61 %) |
40.95 (97.72 %) |
1,518 (2.28 %) |
365 (100.00 %) |
1,271,255 (7.73 %) |
979,057 (4.48 %) |
8,396,200 (42.63 %) |
81,829 (2.47 %) |
283 | whiskered treeswift (2021) GCA_020745705.1 |
n/a | 12,681 (1.84 %) |
21,784 (2.14 %) |
n/a | 42.12 (99.13 %) |
218 (0.87 %) |
146 (100.00 %) |
520,200 (9.32 %) |
170,778 (0.83 %) |
6,455,910 (21.44 %) |
24,061 (1.62 %) |
284 | white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 2021) GCF_016700215.2 |
83,834 (10.16 %) |
13,005 (2.32 %) |
23,329 (2.48 %) |
72,360 (9.39 %) |
42.16 (99.57 %) |
409 (0.43 %) |
685 (99.57 %) |
536,869 (6.00 %) |
268,230 (2.28 %) |
5,845,184 (20.93 %) |
24,409 (2.60 %) |
285 | white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_949774975.1 |
n/a | 18,737 (1.57 %) |
20,767 (1.34 %) |
n/a | 41.91 (99.99 %) |
1,070 (0.01 %) |
410 (100.00 %) |
3,820,566 (36.21 %) |
922,103 (8.43 %) |
12,304,360 (39.74 %) |
68,551 (3.58 %) |
286 | white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022) GCA_947461875.1 |
n/a | 13,735 (1.76 %) |
28,993 (2.53 %) |
n/a | 43.15 (99.99 %) |
424 (0.01 %) |
188 (100.00 %) |
585,276 (12.89 %) |
291,289 (6.10 %) |
6,474,027 (23.66 %) |
54,851 (4.05 %) |
287 | white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1 |
40,430 (1.81 %) |
17,575 (1.21 %) |
21,880 (1.35 %) |
47,496 (1.55 %) |
39.81 (99.57 %) |
1,010 (0.43 %) |
147 (100.00 %) |
2,846,063 (18.57 %) |
1,252,362 (3.89 %) |
13,776,063 (46.50 %) |
24,589 (0.78 %) |
288 | white-tufted-ear marmoset (mCalJac1 2021) GCF_011100555.1 |
104,419 (4.84 %) |
21,801 (1.88 %) |
21,467 (1.27 %) |
n/a | 40.92 (99.52 %) |
1,165 (0.48 %) |
1,233 (100.00 %) |
5,036,591 (47.71 %) |
842,846 (3.26 %) |
15,161,534 (38.08 %) |
37,603 (0.93 %) |
289 | whooping crane (bGruAme1 2023) GCF_028858705.1 |
55,408 (5.57 %) |
13,574 (1.81 %) |
24,739 (2.19 %) |
n/a | 43.07 (99.63 %) |
262 (0.37 %) |
930 (100.00 %) |
616,300 (10.57 %) |
211,558 (2.90 %) |
6,785,192 (22.11 %) |
42,795 (4.66 %) |
290 | yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1 |
n/a | 17,610 (1.00 %) |
20,322 (1.04 %) |
n/a | 40.80 (100.00 %) |
276 (0.00 %) |
62 (100.00 %) |
3,295,935 (23.58 %) |
389,907 (6.37 %) |
19,525,382 (45.90 %) |
31,831 (0.63 %) |
291 | yellow-throated sandgrouse GCA_009769525.1 |
n/a | 12,697 (1.89 %) |
25,289 (2.53 %) |
n/a | 42.40 (99.62 %) |
242 (0.38 %) |
89 (100.00 %) |
510,633 (7.10 %) |
213,742 (1.12 %) |
6,627,716 (21.17 %) |
28,848 (2.23 %) |
292 | yellowfin seabream GCF_904848185.1 |
63,974 (13.26 %) |
15,178 (2.82 %) |
46,332 (6.73 %) |
84,160 (11.62 %) |
42.09 (100.00 %) |
149 (0.00 %) |
66 (100.00 %) |
499,939 (3.43 %) |
254,361 (2.64 %) |
4,420,217 (22.81 %) |
31,005 (1.79 %) |
293 | yellowfin tuna (2021) GCF_914725855.1 |
57,835 (11.36 %) |
15,616 (2.53 %) |
42,750 (5.72 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
70 (0.00 %) |
68 (100.00 %) |
569,665 (3.53 %) |
259,656 (3.34 %) |
5,175,692 (27.05 %) |
14,420 (0.88 %) |
294 | zebra finch (refseq 2021 Blue55 female) GCF_003957565.2 |
49,311 (7.41 %) |
12,747 (1.97 %) |
24,009 (2.47 %) |
n/a | 41.86 (99.66 %) |
352 (0.34 %) |
199 (100.00 %) |
544,577 (9.57 %) |
458,903 (3.33 %) |
6,338,748 (20.92 %) |
29,202 (2.47 %) |
295 | zebra shark (sSteTig4 primary hap 2023) GCF_030684315.1 |
58,105 (2.61 %) |
12,291 (0.48 %) |
16,769 (1.14 %) |
n/a | 43.41 (99.47 %) |
1,159 (0.53 %) |
835 (100.00 %) |
8,087,543 (64.92 %) |
798,373 (9.17 %) |
14,838,773 (42.39 %) |
45,284 (1.67 %) |
296 | zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020) GCA_903684865.1 |
n/a | 17,535 (2.50 %) |
44,169 (3.34 %) |
n/a | 36.57 (99.99 %) |
712 (0.01 %) |
1,252 (100.00 %) |
3,891,854 (61.07 %) |
927,173 (7.78 %) |
8,621,517 (50.27 %) |
44,554 (2.12 %) |
297 | zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020) GCA_903684855.2 |
n/a | 17,692 (2.51 %) |
43,578 (3.27 %) |
n/a | 36.56 (99.99 %) |
1,352 (0.01 %) |
755 (100.00 %) |
3,937,397 (60.86 %) |
936,258 (7.76 %) |
8,732,369 (50.44 %) |
44,812 (2.09 %) |
298 | zebrafish (WGS:CALUEM01 2022) GCA_944039275.1 |
n/a | 18,065 (2.46 %) |
44,526 (3.30 %) |
n/a | 37.08 (99.99 %) |
381 (0.01 %) |
73 (100.00 %) |
4,804,769 (44.04 %) |
954,645 (10.72 %) |
8,694,743 (51.88 %) |
44,936 (2.02 %) |
299 | zig-zag eel (v1.3 2021 genbank) GCA_900324485.3 |
n/a | 15,036 (3.35 %) |
40,234 (7.28 %) |
n/a | 40.66 (97.76 %) |
238 (2.24 %) |
123 (100.00 %) |
671,614 (20.98 %) |
157,728 (2.01 %) |
3,180,040 (23.44 %) |
12,807 (1.08 %) |
TOTALS: | total assembly count 299 |
Alternate sets of VGP assemblies | NCBI Refseq | ||||
---|---|---|---|---|---|
Index pages: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |
Assembly statistics: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |
Track statistics: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |