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VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics
This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)
See also: hub access, assembly statistics
Data resource links
NOTE: Click on the column headers to sort the table by that columnThe link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
| count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Abyssinian ground-hornbill GCA_009769605.1 |
n/a | 12,918 (1.90 %) |
17,214 (2.53 %) |
n/a | 43.30 (99.29 %) |
204 (0.71 %) |
112 (100.00 %) |
401,836 (5.61 %) |
145,540 (0.78 %) |
6,556,090 (19.22 %) |
40,983 (3.62 %) |
| 2 | American flamingo GCA_009819775.1 |
n/a | 13,081 (1.79 %) |
22,162 (2.64 %) |
n/a | 43.27 (99.31 %) |
280 (0.69 %) |
90 (100.00 %) |
538,001 (7.73 %) |
183,346 (0.79 %) |
7,056,270 (20.92 %) |
51,972 (4.83 %) |
| 3 | American shad GCF_018492685.1 |
70,400 (9.39 %) |
16,145 (2.29 %) |
60,087 (6.26 %) |
n/a | 43.18 (99.45 %) |
1,639 (0.55 %) |
74 (100.00 %) |
1,297,174 (9.39 %) |
1,245,221 (12.59 %) |
3,857,267 (39.43 %) |
42,699 (2.23 %) |
| 4 | Anna's hummingbird GCA_003957555.2 |
n/a | 12,249 (1.95 %) |
14,848 (2.40 %) |
n/a | 41.49 (98.48 %) |
429 (1.52 %) |
160 (100.00 %) |
535,312 (7.95 %) |
262,056 (1.51 %) |
6,092,351 (20.84 %) |
17,130 (1.48 %) |
| 5 | Aristotle's catfish (2022 VGP) GCA_946808225.1 |
n/a | 15,455 (2.53 %) |
40,077 (4.90 %) |
n/a | 38.90 (99.98 %) |
795 (0.02 %) |
241 (100.00 %) |
n/a | 669,975 (11.72 %) |
4,638,765 (42.07 %) |
28,277 (1.93 %) |
| 6 | Asian bonytongue GCF_900964775.1 |
50,328 (9.13 %) |
16,528 (2.72 %) |
76,597 (7.29 %) |
72,696 (8.52 %) |
44.16 (99.99 %) |
145 (0.01 %) |
72 (100.00 %) |
505,816 (2.98 %) |
216,136 (1.69 %) |
4,323,242 (26.50 %) |
88,514 (10.63 %) |
| 7 | Asiatic elephant (2022 VGP) GCF_024166365.1 |
61,202 (2.60 %) |
18,887 (1.13 %) |
21,194 (1.06 %) |
n/a | 41.14 (99.90 %) |
126 (0.10 %) |
64 (100.00 %) |
4,358,470 (31.27 %) |
663,094 (4.56 %) |
16,261,778 (48.66 %) |
69,120 (1.32 %) |
| 8 | Atlantic cod GCF_902167405.1 |
51,655 (11.92 %) |
14,072 (2.62 %) |
70,314 (9.10 %) |
68,853 (9.51 %) |
45.64 (96.48 %) |
1,216 (3.52 %) |
227 (100.00 %) |
804,201 (10.41 %) |
855,327 (13.06 %) |
2,851,161 (33.38 %) |
97,133 (7.82 %) |
| 9 | Atlantic halibut (refseq) GCF_009819705.1 |
52,130 (11.46 %) |
14,961 (3.19 %) |
45,365 (7.48 %) |
n/a | 42.21 (99.43 %) |
290 (0.57 %) |
57 (100.00 %) |
428,321 (4.16 %) |
256,153 (3.73 %) |
3,725,981 (24.13 %) |
31,325 (2.25 %) |
| 10 | Atlantic horse mackerel (2021 VGP) GCA_905171665.2 |
n/a | 15,262 (2.42 %) |
51,857 (6.86 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
153 (100.00 %) |
n/a | 384,609 (4.72 %) |
4,338,083 (32.80 %) |
56,553 (3.08 %) |
| 11 | Australian echidna GCF_015852505.1 |
42,938 (2.28 %) |
14,891 (1.01 %) |
19,714 (1.45 %) |
n/a | 45.30 (98.61 %) |
524 (1.39 %) |
310 (100.00 %) |
7,814,876 (42.89 %) |
1,219,764 (6.93 %) |
9,488,325 (55.68 %) |
78,364 (2.73 %) |
| 12 | banded archerfish GCF_017976425.1 |
42,399 (11.11 %) |
15,310 (3.17 %) |
41,147 (7.01 %) |
n/a | 41.11 (99.82 %) |
98 (0.18 %) |
96 (100.00 %) |
463,524 (3.35 %) |
271,913 (9.55 %) |
3,355,326 (28.08 %) |
15,089 (0.96 %) |
| 13 | barbel (2022 VGP) GCA_936440315.1 |
n/a | 32,462 (3.30 %) |
85,063 (5.65 %) |
n/a | 37.89 (100.00 %) |
108 (0.00 %) |
92 (100.00 %) |
n/a | 646,636 (4.57 %) |
8,240,279 (42.13 %) |
71,384 (3.04 %) |
| 14 | barn swallow GCF_015227805.1 |
43,374 (5.14 %) |
12,385 (1.88 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
579,928 (6.20 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,546 (2.82 %) |
| 15 | black rhinoceros (2021 VGP) GCA_020826845.1 |
n/a | 18,774 (1.38 %) |
22,346 (1.26 %) |
n/a | 41.59 (99.95 %) |
215 (0.05 %) |
1,075 (100.00 %) |
n/a | 548,030 (8.34 %) |
14,347,639 (40.14 %) |
43,525 (1.14 %) |
| 16 | blackcap GCA_009819655.1 |
n/a | 12,367 (1.92 %) |
17,080 (2.58 %) |
n/a | 42.00 (98.88 %) |
413 (1.12 %) |
189 (100.00 %) |
506,239 (6.14 %) |
330,354 (2.12 %) |
6,410,567 (19.76 %) |
26,837 (2.32 %) |
| 17 | Blainville's beaked whale ( 2022 VGP) GCA_025265405.1 |
n/a | 19,042 (1.52 %) |
20,766 (1.27 %) |
n/a | 41.70 (99.97 %) |
97 (0.03 %) |
73 (100.00 %) |
n/a | 765,957 (8.74 %) |
12,128,162 (41.78 %) |
70,851 (1.80 %) |
| 18 | blue whale GCF_009873245.2 |
58,750 (2.71 %) |
19,162 (1.80 %) |
20,576 (1.41 %) |
n/a | 40.88 (98.91 %) |
886 (1.09 %) |
106 (100.00 %) |
3,986,870 (44.21 %) |
579,629 (1.22 %) |
12,858,384 (34.60 %) |
67,032 (1.73 %) |
| 19 | blunt-snouted clingfish GCF_900634775.1 |
47,312 (7.12 %) |
14,502 (1.97 %) |
51,211 (5.47 %) |
60,993 (6.13 %) |
38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
441 (100.00 %) |
739,980 (4.26 %) |
471,620 (4.92 %) |
5,974,002 (42.88 %) |
29,050 (1.48 %) |
| 20 | Boeseman's rainbowfish GCF_017639745.1 |
51,238 (8.77 %) |
15,174 (2.24 %) |
51,552 (6.21 %) |
n/a | 39.65 (99.63 %) |
440 (0.37 %) |
93 (100.00 %) |
542,278 (3.15 %) |
303,669 (4.77 %) |
5,189,645 (29.11 %) |
18,525 (1.10 %) |
| 21 | bonti-bonti (T.bonti 2022 VGP) GCA_933228915.1 |
n/a | 14,929 (1.93 %) |
55,343 (5.90 %) |
n/a | 41.66 (99.97 %) |
1,329 (0.03 %) |
146 (100.00 %) |
n/a | 443,155 (22.40 %) |
4,319,947 (40.01 %) |
34,018 (4.16 %) |
| 22 | brown argus butterfly GCF_905147365.1 |
23,611 (6.61 %) |
4,734 (1.03 %) |
24,265 (6.80 %) |
n/a | 36.86 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
25 (100.00 %) |
264,358 (2.90 %) |
144,234 (3.35 %) |
2,650,845 (48.44 %) |
35,431 (4.56 %) |
| 23 | butterfish (2021 G10K VGP) GCF_020382885.2 |
52,828 (14.10 %) |
15,261 (3.43 %) |
40,580 (7.38 %) |
n/a | 41.49 (99.70 %) |
77 (0.30 %) |
48 (100.00 %) |
413,775 (3.11 %) |
160,299 (1.55 %) |
3,420,994 (21.24 %) |
15,574 (1.13 %) |
| 24 | California sea lion GCF_009762305.2 |
70,801 (3.05 %) |
20,915 (1.77 %) |
20,179 (1.40 %) |
n/a | 41.40 (99.23 %) |
185 (0.77 %) |
47 (100.00 %) |
4,525,652 (43.65 %) |
590,246 (1.24 %) |
13,263,648 (33.76 %) |
51,899 (1.50 %) |
| 25 | Canada lynx GCF_007474595.2 |
50,142 (2.69 %) |
18,273 (1.65 %) |
19,264 (1.35 %) |
n/a | 41.70 (99.88 %) |
842 (0.12 %) |
54 (100.00 %) |
5,011,165 (43.72 %) |
904,525 (1.75 %) |
13,467,551 (34.19 %) |
66,799 (2.48 %) |
| 26 | carmine bee-eater GCA_009819595.1 |
n/a | 12,724 (1.82 %) |
20,356 (2.83 %) |
n/a | 42.88 (99.47 %) |
269 (0.53 %) |
109 (100.00 %) |
556,923 (7.87 %) |
213,180 (1.09 %) |
6,641,077 (21.58 %) |
30,884 (2.47 %) |
| 27 | channel bull blenny GCF_900634415.1 |
40,788 (11.04 %) |
14,477 (3.02 %) |
42,362 (6.73 %) |
60,811 (10.44 %) |
40.96 (99.58 %) |
445 (0.42 %) |
322 (100.00 %) |
427,781 (5.47 %) |
320,518 (6.91 %) |
3,394,846 (28.67 %) |
20,453 (1.39 %) |
| 28 | climbing perch GCF_900324465.2 |
42,759 (13.53 %) |
15,243 (3.53 %) |
22,714 (7.45 %) |
64,006 (10.45 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
51 (100.00 %) |
325,346 (2.66 %) |
130,249 (1.89 %) |
3,325,009 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
| 29 | common brushtail GCF_011100635.1 |
37,674 (1.80 %) |
18,653 (0.80 %) |
15,375 (0.86 %) |
n/a | 39.48 (99.44 %) |
1,796 (0.56 %) |
212 (100.00 %) |
7,598,116 (38.90 %) |
1,259,434 (1.97 %) |
22,071,306 (40.56 %) |
17,762 (0.38 %) |
| 30 | common cuckoo (VGP 2021) GCA_017976375.1 |
n/a | 13,179 (1.84 %) |
25,859 (2.41 %) |
n/a | 42.18 (99.58 %) |
296 (0.42 %) |
151 (100.00 %) |
521,043 (9.61 %) |
310,469 (2.36 %) |
6,712,849 (21.76 %) |
25,267 (1.71 %) |
| 31 | common pipistrelle (2020 VGP) GCA_903992545.1 |
n/a | 17,216 (1.82 %) |
19,202 (1.79 %) |
n/a | 42.55 (99.97 %) |
1,546 (0.03 %) |
323 (100.00 %) |
n/a | 805,142 (2.83 %) |
9,964,846 (34.69 %) |
57,295 (2.83 %) |
| 32 | common swift (bApuApu2 2021 VGP refseq) GCF_020740795.1 |
39,986 (4.95 %) |
12,292 (1.88 %) |
20,379 (2.16 %) |
n/a | 41.95 (99.84 %) |
256 (0.16 %) |
110 (100.00 %) |
499,695 (6.70 %) |
199,749 (1.12 %) |
6,354,003 (21.19 %) |
20,393 (1.74 %) |
| 33 | common tern GCA_009819605.1 |
n/a | 13,094 (1.80 %) |
17,911 (2.48 %) |
n/a | 43.03 (99.16 %) |
205 (0.84 %) |
123 (100.00 %) |
570,309 (7.91 %) |
216,895 (1.04 %) |
7,043,151 (20.98 %) |
45,683 (3.53 %) |
| 34 | common toad GCF_905171765.1 |
45,085 (1.10 %) |
14,240 (0.38 %) |
46,470 (1.68 %) |
n/a | 44.49 (99.80 %) |
4,199 (0.20 %) |
1,306 (100.00 %) |
1,658,204 (1.79 %) |
3,099,513 (13.49 %) |
19,236,510 (62.70 %) |
539,919 (4.45 %) |
| 35 | common yellowthroat GCA_009764595.1 |
n/a | 11,736 (1.82 %) |
16,696 (2.52 %) |
n/a | 42.01 (98.73 %) |
1,479 (1.27 %) |
278 (100.00 %) |
476,046 (6.38 %) |
367,108 (3.16 %) |
6,576,957 (20.43 %) |
25,004 (2.02 %) |
| 36 | convict blenny (chichlid 2021 VGP) GCA_020510985.1 |
n/a | n/a | 134,417 (1.50 %) |
n/a | 44.52 (99.13 %) |
2,580 (0.87 %) |
512 (100.00 %) |
n/a | 2,097,650 (2.66 %) |
3,092 (99.13 %) |
568,042 (10.14 %) |
| 37 | copperband butterflyfish GCF_017976325.1 |
35,291 (10.46 %) |
15,210 (3.03 %) |
44,916 (6.99 %) |
n/a | 42.57 (100.00 %) |
60 (0.00 %) |
29 (100.00 %) |
406,118 (2.95 %) |
199,450 (2.10 %) |
3,861,745 (21.57 %) |
29,106 (1.85 %) |
| 38 | cunner (2021 VGP) GCA_020745685.1 |
n/a | 15,178 (2.69 %) |
43,564 (6.38 %) |
n/a | 41.31 (99.41 %) |
283 (0.59 %) |
64 (100.00 %) |
n/a | 243,024 (4.81 %) |
4,334,690 (27.65 %) |
17,974 (1.06 %) |
| 39 | dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 VGP) GCF_021462225.1 |
56,220 (7.59 %) |
15,422 (1.71 %) |
50,084 (4.18 %) |
n/a | 40.18 (99.46 %) |
409 (0.54 %) |
72 (100.00 %) |
369,606 (1.86 %) |
176,954 (1.87 %) |
6,142,638 (38.35 %) |
32,973 (1.28 %) |
| 40 | denticle herring GCF_900700375.1 |
59,645 (12.74 %) |
16,567 (3.77 %) |
58,823 (8.66 %) |
72,751 (10.66 %) |
43.69 (99.18 %) |
464 (0.82 %) |
460 (100.00 %) |
408,046 (3.23 %) |
224,282 (4.61 %) |
2,948,671 (28.79 %) |
64,661 (9.49 %) |
| 41 | downy woodpecker (VGP 2020) GCA_014839835.1 |
n/a | 12,405 (1.70 %) |
23,073 (2.18 %) |
n/a | 45.31 (99.66 %) |
187 (0.34 %) |
181 (100.00 %) |
1,008,118 (21.51 %) |
378,537 (3.38 %) |
5,846,717 (32.04 %) |
26,005 (1.75 %) |
| 42 | East African grey crowned-crane GCA_011004875.1 |
n/a | 13,263 (1.84 %) |
20,787 (2.66 %) |
n/a | 42.38 (99.61 %) |
144 (0.39 %) |
105 (100.00 %) |
548,859 (7.06 %) |
187,966 (0.97 %) |
7,004,597 (21.19 %) |
36,610 (3.33 %) |
| 43 | eastern happy GCF_900246225.1 |
57,628 (9.59 %) |
15,359 (2.22 %) |
52,466 (6.26 %) |
42,580 (8.31 %) |
41.07 (99.87 %) |
490 (0.13 %) |
364 (100.00 %) |
960,962 (21.85 %) |
217,915 (1.89 %) |
4,547,443 (30.78 %) |
33,005 (1.88 %) |
| 44 | Egyptian rousette GCF_014176215.1 |
65,163 (4.76 %) |
17,642 (2.07 %) |
22,317 (1.84 %) |
n/a | 40.05 (98.59 %) |
242 (1.41 %) |
29 (100.00 %) |
2,821,248 (33.05 %) |
434,414 (1.02 %) |
12,031,597 (26.52 %) |
53,573 (4.84 %) |
| 45 | electric eel GCF_013358815.1 |
48,958 (12.10 %) |
15,950 (3.66 %) |
48,976 (7.25 %) |
n/a | 42.49 (98.20 %) |
227 (1.80 %) |
89 (100.00 %) |
567,625 (7.41 %) |
564,286 (10.86 %) |
2,935,360 (24.79 %) |
44,501 (3.93 %) |
| 46 | emu (2020) GCA_016128335.1 |
n/a | 13,181 (1.74 %) |
24,708 (2.10 %) |
n/a | 42.41 (100.00 %) |
512 (0.00 %) |
802 (100.00 %) |
504,527 (4.38 %) |
259,276 (2.59 %) |
7,105,965 (19.15 %) |
41,784 (5.52 %) |
| 47 | ermine GCF_009829155.1 |
74,345 (3.19 %) |
18,862 (1.65 %) |
21,246 (1.48 %) |
n/a | 41.56 (99.12 %) |
199 (0.88 %) |
94 (100.00 %) |
4,560,766 (40.92 %) |
714,174 (1.30 %) |
13,845,904 (33.42 %) |
56,063 (2.27 %) |
| 48 | Eurasian badger (2021 VGP) GCA_922990625.1 |
n/a | 19,332 (1.42 %) |
22,424 (1.40 %) |
n/a | 42.47 (100.00 %) |
27 (0.00 %) |
726 (100.00 %) |
n/a | 801,232 (4.02 %) |
13,893,672 (37.73 %) |
65,806 (4.13 %) |
| 49 | Eurasian nightjar GCA_907165065.1 |
n/a | 13,040 (1.86 %) |
22,823 (2.21 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
153 (0.00 %) |
121 (100.00 %) |
595,803 (8.38 %) |
248,128 (1.78 %) |
6,744,611 (22.18 %) |
24,805 (1.90 %) |
| 50 | Eurasian red squirrel GCA_902686455.1 |
n/a | 21,292 (1.58 %) |
21,930 (1.42 %) |
36,836 (1.54 %) |
40.08 (94.33 %) |
1,177 (5.67 %) |
638 (100.00 %) |
4,680,961 (35.76 %) |
704,218 (1.42 %) |
14,991,981 (31.49 %) |
48,159 (1.04 %) |
| 51 | Eurasian river otter (2020 VGP) GCF_902655055.1 |
67,145 (2.95 %) |
18,842 (1.54 %) |
20,178 (1.40 %) |
n/a | 41.59 (100.00 %) |
185 (0.00 %) |
44 (100.00 %) |
4,259,294 (33.39 %) |
713,721 (1.36 %) |
13,626,048 (34.37 %) |
57,073 (1.82 %) |
| 52 | Eurasian water vole (2021) GCF_903992535.2 |
45,544 (2.51 %) |
19,733 (1.78 %) |
19,053 (1.47 %) |
n/a | 42.15 (99.74 %) |
873 (0.26 %) |
215 (100.00 %) |
3,993,912 (25.74 %) |
1,088,163 (2.91 %) |
12,853,770 (32.42 %) |
19,000 (0.58 %) |
| 53 | European common frog GCF_905171775.1 |
51,633 (1.57 %) |
13,864 (0.46 %) |
39,978 (1.88 %) |
n/a | 44.15 (99.36 %) |
1,860 (0.64 %) |
554 (100.00 %) |
1,804,642 (3.42 %) |
2,925,830 (9.39 %) |
18,921,726 (55.43 %) |
641,799 (7.66 %) |
| 54 | European eel GCF_013347855.1 |
64,143 (9.57 %) |
17,054 (2.22 %) |
34,278 (5.56 %) |
n/a | 43.64 (99.61 %) |
640 (0.40 %) |
54 (100.00 %) |
831,037 (5.48 %) |
786,521 (8.15 %) |
5,700,890 (27.40 %) |
130,346 (8.19 %) |
| 55 | European golden plover GCA_017639485.1 |
n/a | 12,984 (1.78 %) |
22,854 (2.04 %) |
n/a | 42.70 (99.01 %) |
268 (0.99 %) |
107 (100.00 %) |
558,587 (8.35 %) |
180,400 (0.83 %) |
7,132,381 (21.18 %) |
40,661 (3.41 %) |
| 56 | European robin GCA_903797595.2 |
n/a | 12,344 (1.85 %) |
23,934 (2.37 %) |
n/a | 42.10 (99.97 %) |
990 (0.03 %) |
1,119 (100.00 %) |
532,973 (5.96 %) |
401,820 (3.43 %) |
6,320,210 (21.42 %) |
30,391 (2.60 %) |
| 57 | European starfish GCF_902459465.1 |
26,326 (11.67 %) |
4,143 (0.84 %) |
21,071 (8.48 %) |
n/a | 38.76 (99.96 %) |
471 (0.04 %) |
150 (100.00 %) |
132,287 (1.42 %) |
159,226 (7.04 %) |
2,504,013 (37.40 %) |
15,392 (1.50 %) |
| 58 | European turtle dove (v1.2 2021 VGP) GCA_901699155.2 |
n/a | 12,391 (1.76 %) |
23,333 (2.17 %) |
n/a | 41.84 (99.67 %) |
940 (0.33 %) |
311 (100.00 %) |
550,895 (7.50 %) |
227,532 (1.16 %) |
6,767,530 (21.05 %) |
34,682 (2.57 %) |
| 59 | European woodmouse (2022 VGP) GCA_947179515.1 |
n/a | 19,960 (1.65 %) |
19,954 (1.25 %) |
n/a | 41.23 (99.99 %) |
1,129 (0.01 %) |
498 (100.00 %) |
n/a | 1,795,997 (8.95 %) |
13,681,786 (40.58 %) |
23,961 (0.53 %) |
| 60 | flier cichlid GCF_007364275.1 |
43,842 (8.12 %) |
15,440 (2.15 %) |
51,452 (5.98 %) |
n/a | 41.23 (98.19 %) |
744 (1.81 %) |
188 (100.00 %) |
1,049,840 (17.13 %) |
287,035 (2.21 %) |
5,305,890 (30.67 %) |
24,130 (1.26 %) |
| 61 | freshwater garfish (fXenCan1 2020 VGP) GCA_014839995.1 |
n/a | 14,625 (2.57 %) |
52,879 (6.72 %) |
n/a | 41.41 (98.98 %) |
1,373 (1.02 %) |
410 (100.00 %) |
n/a | 318,631 (5.94 %) |
3,977,536 (27.41 %) |
32,390 (2.33 %) |
| 62 | Gabon caecilian GCF_902459505.1 |
54,726 (1.72 %) |
14,266 (0.51 %) |
30,710 (1.49 %) |
n/a | 43.24 (99.85 %) |
433 (0.15 %) |
164 (100.00 %) |
1,315,377 (1.64 %) |
1,364,597 (3.83 %) |
19,589,802 (52.85 %) |
270,923 (4.52 %) |
| 63 | garden warbler GCA_014839755.1 |
n/a | 12,520 (1.95 %) |
23,459 (2.46 %) |
n/a | 42.08 (99.82 %) |
134 (0.18 %) |
176 (100.00 %) |
491,810 (6.09 %) |
376,746 (2.55 %) |
6,461,292 (20.23 %) |
27,799 (2.40 %) |
| 64 | gilthead seabream GCF_900880675.1 |
59,040 (10.97 %) |
15,415 (2.36 %) |
56,395 (6.58 %) |
73,317 (7.97 %) |
41.94 (99.96 %) |
1,050 (0.04 %) |
176 (100.00 %) |
533,781 (3.04 %) |
305,809 (3.03 %) |
4,701,694 (25.69 %) |
47,327 (2.41 %) |
| 65 | golden eagle (2021) GCF_900496995.4 |
60,920 (5.98 %) |
13,334 (1.84 %) |
23,261 (2.12 %) |
n/a | 42.16 (99.58 %) |
228 (0.42 %) |
144 (100.00 %) |
544,341 (5.93 %) |
186,461 (0.80 %) |
7,090,610 (20.01 %) |
38,495 (3.10 %) |
| 66 | golden spiny mouse (2020 VGP) GCF_903995435.1 |
36,997 (1.96 %) |
20,006 (1.91 %) |
19,132 (1.50 %) |
n/a | 42.51 (99.65 %) |
880 (0.35 %) |
623 (100.00 %) |
4,785,907 (32.61 %) |
1,305,613 (3.34 %) |
12,958,061 (32.33 %) |
20,760 (0.59 %) |
| 67 | Goodes thornscrub tortoise GCF_007399415.2 |
57,455 (51.33 %) |
14,859 (1.00 %) |
79,415 (2.33 %) |
31,974 (1.80 %) |
44.14 (98.71 %) |
562 (1.29 %) |
383 (100.00 %) |
1,699,240 (13.65 %) |
387,796 (2.00 %) |
11,572,827 (33.36 %) |
71,687 (2.29 %) |
| 68 | gray squirrel (2020 VGP) GCF_902686445.1 |
58,884 (2.46 %) |
20,752 (1.49 %) |
21,107 (1.31 %) |
n/a | 40.06 (99.98 %) |
1,824 (0.02 %) |
752 (100.00 %) |
4,605,578 (34.50 %) |
728,192 (1.65 %) |
15,467,412 (33.91 %) |
51,878 (1.11 %) |
| 69 | gray wolf (2021 VGP) GCA_905319855.2 |
n/a | 19,474 (1.55 %) |
20,394 (1.40 %) |
n/a | 41.49 (100.00 %) |
166 (0.00 %) |
82 (100.00 %) |
n/a | 1,063,944 (3.96 %) |
13,588,117 (34.74 %) |
51,996 (2.15 %) |
| 70 | great potoo GCA_013368605.1 |
n/a | 13,116 (1.77 %) |
23,657 (2.10 %) |
n/a | 42.67 (99.51 %) |
243 (0.49 %) |
191 (100.00 %) |
514,142 (9.71 %) |
210,381 (1.13 %) |
6,501,989 (23.95 %) |
35,785 (2.69 %) |
| 71 | great scallop GCF_902652985.1 |
46,811 (9.29 %) |
4,090 (0.36 %) |
32,743 (7.09 %) |
n/a | 36.65 (99.92 %) |
1,827 (0.08 %) |
3,983 (100.00 %) |
281,310 (1.71 %) |
706,978 (26.84 %) |
5,249,556 (32.64 %) |
13,101 (0.87 %) |
| 72 | great white shark GCF_017639515.1 |
49,865 (1.46 %) |
13,010 (0.37 %) |
19,263 (0.92 %) |
n/a | 45.21 (99.55 %) |
2,645 (0.45 %) |
719 (100.00 %) |
1,046,023 (4.00 %) |
1,584,100 (21.25 %) |
23,278,563 (52.42 %) |
77,021 (1.94 %) |
| 73 | greater horseshoe bat GCA_004115265.2 |
n/a | 18,651 (1.96 %) |
20,392 (1.68 %) |
36,525 (2.28 %) |
40.54 (99.64 %) |
158 (0.36 %) |
135 (100.00 %) |
3,301,017 (34.99 %) |
564,790 (1.35 %) |
12,217,069 (29.39 %) |
32,445 (1.06 %) |
| 74 | greater pipefish GCF_901709675.1 |
47,335 (18.32 %) |
13,477 (5.26 %) |
42,380 (12.01 %) |
n/a | 43.46 (100.00 %) |
43 (0.00 %) |
87 (100.00 %) |
193,407 (3.05 %) |
125,716 (4.25 %) |
1,676,004 (25.93 %) |
46,327 (10.97 %) |
| 75 | greater mouse-eared bat GCF_014108235.1 |
70,930 (3.43 %) |
19,052 (1.84 %) |
21,498 (1.73 %) |
n/a | 43.11 (98.55 %) |
538 (1.45 %) |
93 (100.00 %) |
3,088,083 (26.27 %) |
753,124 (2.84 %) |
10,383,466 (35.84 %) |
61,023 (2.69 %) |
| 76 | green sea turtle (v2 2021) GCF_015237465.2 |
84,366 (4.63 %) |
14,725 (1.06 %) |
17,444 (1.56 %) |
n/a | 44.01 (99.44 %) |
298 (0.56 %) |
93 (100.00 %) |
1,701,640 (14.83 %) |
304,306 (1.25 %) |
11,135,147 (31.96 %) |
49,025 (1.44 %) |
| 77 | gyrfalcon GCF_015220075.1 |
47,961 (5.90 %) |
13,016 (1.82 %) |
21,266 (2.02 %) |
n/a | 42.20 (99.55 %) |
635 (0.45 %) |
133 (100.00 %) |
484,104 (5.60 %) |
186,430 (0.85 %) |
7,162,723 (18.83 %) |
24,760 (2.03 %) |
| 78 | Hawaiian crow (2021 refseq VGP) GCF_020740725.1 |
51,593 (6.18 %) |
12,739 (1.83 %) |
23,664 (2.30 %) |
n/a | 43.30 (99.84 %) |
294 (0.16 %) |
188 (100.00 %) |
409,129 (0.00 %) |
304,680 (5.73 %) |
5,953,375 (23.59 %) |
46,118 (3.85 %) |
| 79 | honeycomb rockfish GCF_015220745.1 |
57,752 (9.94 %) |
15,244 (2.44 %) |
47,034 (5.98 %) |
n/a | 40.77 (99.83 %) |
215 (0.17 %) |
138 (100.00 %) |
524,161 (3.79 %) |
422,265 (6.20 %) |
4,827,148 (36.22 %) |
37,878 (1.84 %) |
| 80 | human (WGS:JACSEX01 2021 VGP) GCA_016695395.2 |
n/a | 20,401 (1.92 %) |
20,682 (1.21 %) |
n/a | 40.87 (99.64 %) |
1,217 (0.36 %) |
950 (100.00 %) |
5,350,025 (52.32 %) |
1,006,502 (4.68 %) |
15,969,368 (38.50 %) |
50,826 (1.08 %) |
| 81 | hybrid cattle GCA_003369685.2 |
n/a | 19,100 (1.59 %) |
21,093 (1.37 %) |
52,201 (2.64 %) |
41.99 (99.75 %) |
277 (0.25 %) |
1,435 (100.00 %) |
5,290,419 (47.51 %) |
478,946 (1.94 %) |
12,568,313 (41.15 %) |
45,850 (1.37 %) |
| 82 | hybrid cattle GCF_003369695.1 |
63,234 (2.88 %) |
19,602 (1.56 %) |
21,960 (1.36 %) |
54,700 (2.65 %) |
41.83 (99.94 %) |
302 (0.06 %) |
1,250 (100.00 %) |
5,458,622 (47.18 %) |
459,928 (1.40 %) |
13,208,799 (41.21 %) |
41,359 (1.10 %) |
| 83 | Indian glassy fish GCF_900634625.1 |
44,096 (12.32 %) |
15,354 (3.60 %) |
44,099 (8.47 %) |
60,337 (10.41 %) |
42.38 (98.08 %) |
1,523 (1.92 %) |
156 (100.00 %) |
349,914 (3.01 %) |
163,522 (3.00 %) |
2,755,229 (25.07 %) |
17,929 (1.44 %) |
| 84 | Indo-Pacific tarpon GCF_013368585.1 |
41,583 (6.91 %) |
18,302 (2.47 %) |
29,762 (5.45 %) |
n/a | 43.02 (99.97 %) |
63 (0.03 %) |
207 (100.00 %) |
603,558 (3.71 %) |
433,446 (4.32 %) |
5,341,985 (22.07 %) |
78,561 (3.69 %) |
| 85 | jewelled blenny GCF_902148845.1 |
42,890 (8.61 %) |
15,200 (2.40 %) |
86,752 (9.03 %) |
58,518 (6.97 %) |
44.34 (98.69 %) |
602 (1.31 %) |
203 (100.00 %) |
671,028 (4.21 %) |
442,004 (5.09 %) |
4,388,570 (26.54 %) |
121,462 (9.27 %) |
| 86 | Kakapo GCF_004027225.2 |
49,757 (5.76 %) |
13,102 (1.92 %) |
17,781 (2.51 %) |
n/a | 41.97 (99.08 %) |
373 (0.92 %) |
89 (100.00 %) |
517,233 (7.76 %) |
208,178 (1.08 %) |
6,258,087 (20.50 %) |
22,279 (1.79 %) |
| 87 | Korean giant-fin mudskipper (refseq) GCF_009829125.1 |
29,517 (6.48 %) |
14,243 (2.37 %) |
44,144 (5.80 %) |
n/a | 40.22 (99.05 %) |
700 (0.95 %) |
124 (100.00 %) |
423,274 (4.48 %) |
551,472 (7.22 %) |
4,887,142 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
| 88 | Kuhl's pipistrelle GCF_014108245.1 |
63,293 (2.96 %) |
17,918 (1.89 %) |
20,819 (1.86 %) |
n/a | 42.57 (99.31 %) |
394 (0.69 %) |
202 (100.00 %) |
2,897,422 (23.58 %) |
797,420 (2.76 %) |
10,057,100 (34.56 %) |
55,965 (2.99 %) |
| 89 | lance-tailed manakin GCF_009829145.1 |
46,366 (5.56 %) |
12,580 (1.91 %) |
16,669 (2.52 %) |
n/a | 41.97 (99.70 %) |
206 (0.30 %) |
93 (100.00 %) |
494,225 (7.09 %) |
247,189 (1.64 %) |
6,498,294 (20.04 %) |
25,376 (1.95 %) |
| 90 | lanner falcon (2022 VGP) GCA_023638135.1 |
n/a | 12,862 (1.69 %) |
21,562 (1.92 %) |
n/a | 43.03 (99.83 %) |
158 (0.17 %) |
397 (100.00 %) |
n/a | 203,640 (6.96 %) |
6,921,438 (23.57 %) |
32,398 (2.65 %) |
| 91 | largescale foureyes (2020 VGP) GCA_014839685.1 |
n/a | 14,774 (2.18 %) |
42,858 (4.83 %) |
n/a | 38.54 (99.96 %) |
107 (0.04 %) |
33 (100.00 %) |
n/a | 305,170 (2.13 %) |
6,194,879 (29.85 %) |
17,881 (0.94 %) |
| 92 | Lataste's viper (rVipLat1 2022 VGP) GCA_024294585.1 |
n/a | 13,350 (1.17 %) |
18,904 (1.93 %) |
n/a | 40.96 (99.78 %) |
769 (0.22 %) |
56 (100.00 %) |
n/a | 762,735 (5.06 %) |
7,424,674 (44.80 %) |
110,631 (4.07 %) |
| 93 | leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K VGP) GCF_009764565.3 |
73,318 (3.97 %) |
14,610 (1.03 %) |
16,358 (1.45 %) |
n/a | 43.35 (99.74 %) |
668 (0.26 %) |
40 (100.00 %) |
1,694,449 (14.90 %) |
304,773 (1.14 %) |
11,121,962 (34.21 %) |
35,485 (1.36 %) |
| 94 | lesser Egyptian jerboa (2021 VGP) GCF_020740685.1 |
51,730 (1.99 %) |
20,129 (1.24 %) |
22,089 (1.24 %) |
n/a | 42.00 (99.52 %) |
561 (0.48 %) |
160 (100.00 %) |
7,346,291 (41.25 %) |
1,187,587 (2.92 %) |
14,222,177 (44.13 %) |
34,688 (0.86 %) |
| 95 | lesser kestrel (v2 2021 VGP) GCF_017639655.2 |
47,420 (5.64 %) |
13,098 (1.80 %) |
22,203 (2.07 %) |
n/a | 42.30 (99.66 %) |
298 (0.34 %) |
291 (100.00 %) |
516,499 (5.58 %) |
210,234 (1.26 %) |
7,133,934 (19.19 %) |
27,558 (2.21 %) |
| 96 | live sharksucker GCF_900963305.1 |
40,268 (11.91 %) |
14,989 (3.53 %) |
40,908 (7.56 %) |
56,376 (9.51 %) |
41.43 (99.89 %) |
140 (0.11 %) |
38 (100.00 %) |
449,887 (3.55 %) |
146,353 (1.65 %) |
3,204,476 (21.79 %) |
16,807 (1.33 %) |
| 97 | longspined bullhead (2021 VGP) GCA_910589615.1 |
n/a | 15,027 (3.10 %) |
51,137 (7.71 %) |
n/a | 42.22 (99.99 %) |
242 (0.01 %) |
27 (100.00 %) |
n/a | 417,308 (9.63 %) |
3,262,282 (28.51 %) |
55,527 (4.38 %) |
| 98 | lumpfish (refseq) GCF_009769545.1 |
41,612 (11.11 %) |
14,752 (3.31 %) |
49,223 (8.10 %) |
52,794 (8.34 %) |
42.83 (98.22 %) |
347 (1.78 %) |
48 (100.00 %) |
478,386 (6.02 %) |
421,632 (11.07 %) |
2,928,619 (27.99 %) |
53,321 (5.09 %) |
| 99 | maguari stork (2021 VGP) GCA_017639555.1 |
n/a | 12,905 (1.81 %) |
22,204 (2.01 %) |
n/a | 42.12 (98.21 %) |
232 (1.79 %) |
153 (100.00 %) |
485,318 (6.35 %) |
184,992 (0.78 %) |
7,064,965 (19.56 %) |
31,653 (3.02 %) |
| 100 | mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U) GCF_015476345.1 |
59,854 (7.33 %) |
12,988 (1.87 %) |
23,709 (2.20 %) |
n/a | 42.27 (99.64 %) |
905 (0.36 %) |
756 (100.00 %) |
803,558 (8.04 %) |
417,575 (5.02 %) |
6,627,843 (24.59 %) |
35,030 (3.06 %) |
| 101 | meadow viper (2022 VGP) GCA_947247035.1 |
n/a | 13,282 (1.16 %) |
18,653 (1.90 %) |
n/a | 40.93 (99.98 %) |
1,819 (0.02 %) |
384 (100.00 %) |
n/a | 762,639 (6.28 %) |
7,428,147 (45.35 %) |
101,007 (3.95 %) |
| 102 | Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022 VGP) GCF_025201925.1 |
62,007 (3.15 %) |
14,883 (0.96 %) |
18,524 (1.48 %) |
n/a | 44.69 (96.36 %) |
1,866 (3.64 %) |
621 (100.00 %) |
1,372,189 (11.32 %) |
472,501 (3.42 %) |
11,362,604 (34.69 %) |
73,700 (2.04 %) |
| 103 | Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022 VGP) GCA_025201965.1 |
n/a | 15,425 (0.94 %) |
20,005 (1.48 %) |
n/a | 44.46 (95.51 %) |
1,790 (4.49 %) |
4,782 (95.51 %) |
n/a | 453,302 (2.47 %) |
11,996,092 (34.08 %) |
77,167 (2.14 %) |
| 104 | milkfish GCF_902362185.1 |
30,825 (7.61 %) |
16,880 (3.41 %) |
42,123 (6.75 %) |
n/a | 41.53 (99.36 %) |
112 (0.64 %) |
31 (100.00 %) |
969,140 (8.12 %) |
731,733 (9.10 %) |
3,702,024 (26.31 %) |
22,089 (1.27 %) |
| 105 | monito del monte (2021 VGP) GCF_019393635.1 |
47,034 (2.02 %) |
18,399 (0.80 %) |
15,519 (0.85 %) |
n/a | 39.11 (99.91 %) |
260 (0.09 %) |
17 (100.00 %) |
9,107,968 (41.08 %) |
1,249,635 (2.12 %) |
21,135,324 (42.80 %) |
16,598 (0.36 %) |
| 106 | mute swan (v2 2021) GCF_009769625.2 |
59,524 (6.76 %) |
12,983 (1.98 %) |
22,400 (2.22 %) |
n/a | 41.92 (99.13 %) |
451 (0.87 %) |
171 (100.00 %) |
700,051 (7.55 %) |
301,579 (1.34 %) |
6,791,838 (21.30 %) |
31,278 (3.07 %) |
| 107 | New Caledonian crow GCF_009650955.1 |
50,821 (6.95 %) |
12,735 (1.93 %) |
17,289 (2.60 %) |
n/a | 42.57 (97.41 %) |
289 (2.59 %) |
105 (100.00 %) |
460,676 (6.16 %) |
231,546 (1.70 %) |
6,265,995 (19.54 %) |
31,907 (2.46 %) |
| 108 | New Zealand spotty (refseq) GCF_009762535.1 |
45,555 (9.06 %) |
14,609 (2.22 %) |
43,259 (5.33 %) |
n/a | 40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
467 (100.00 %) |
517,755 (4.63 %) |
393,328 (5.54 %) |
4,522,224 (33.34 %) |
18,299 (0.85 %) |
| 109 | northern pike GCF_011004845.1 |
63,733 (9.28 %) |
16,618 (2.41 %) |
55,784 (5.64 %) |
n/a | 42.22 (99.89 %) |
112 (0.11 %) |
53 (100.00 %) |
984,415 (29.15 %) |
524,708 (7.32 %) |
4,691,096 (32.91 %) |
42,910 (2.52 %) |
| 110 | Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2 |
99,139 (4.10 %) |
21,526 (1.86 %) |
19,266 (1.33 %) |
n/a | 41.99 (99.19 %) |
581 (0.81 %) |
757 (99.19 %) |
5,029,005 (45.44 %) |
1,514,974 (3.57 %) |
13,450,428 (35.83 %) |
19,244 (0.46 %) |
| 111 | orbiculate cardinalfish GCF_902148855.1 |
46,571 (5.47 %) |
15,772 (1.50 %) |
52,078 (3.82 %) |
60,005 (3.98 %) |
37.90 (99.73 %) |
1,844 (0.27 %) |
340 (100.00 %) |
1,270,059 (5.42 %) |
979,214 (8.64 %) |
6,386,731 (48.59 %) |
29,320 (0.87 %) |
| 112 | pale spear-nosed bat GCF_004126475.2 |
54,932 (3.31 %) |
18,171 (1.69 %) |
20,025 (1.62 %) |
n/a | 42.38 (99.28 %) |
884 (0.72 %) |
77 (100.00 %) |
3,069,141 (30.00 %) |
385,664 (0.81 %) |
12,050,232 (30.57 %) |
63,905 (3.75 %) |
| 113 | Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1 |
48,421 (2.20 %) |
18,667 (1.61 %) |
21,915 (1.59 %) |
n/a | 42.35 (97.95 %) |
349 (2.05 %) |
60 (100.00 %) |
3,863,217 (32.76 %) |
624,933 (1.88 %) |
11,572,319 (37.09 %) |
79,984 (2.45 %) |
| 114 | peladilla (galaxoid fish 2021 VGP) GCA_017639675.1 |
n/a | 13,829 (3.83 %) |
41,932 (8.64 %) |
n/a | 45.01 (98.24 %) |
1,158 (1.77 %) |
41 (100.00 %) |
n/a | 660,569 (13.71 %) |
2,316,198 (27.66 %) |
41,023 (4.40 %) |
| 115 | peregrine falcon (2022 VGP) GCA_023634155.1 |
n/a | 13,025 (1.67 %) |
24,167 (2.02 %) |
n/a | 42.65 (99.69 %) |
232 (0.31 %) |
124 (100.00 %) |
n/a | 335,214 (8.05 %) |
7,038,700 (24.65 %) |
26,085 (2.25 %) |
| 116 | pinecone soldierfish GCF_902150065.1 |
40,770 (8.72 %) |
15,756 (2.42 %) |
53,616 (6.20 %) |
57,173 (6.14 %) |
41.83 (99.78 %) |
253 (0.22 %) |
87 (100.00 %) |
1,066,671 (5.88 %) |
646,820 (4.30 %) |
4,938,857 (28.11 %) |
41,636 (2.04 %) |
| 117 | platypus (v4 2020) GCF_004115215.2 |
51,392 (3.07 %) |
14,778 (1.26 %) |
18,888 (1.63 %) |
n/a | 46.14 (99.18 %) |
515 (0.82 %) |
322 (100.00 %) |
5,071,089 (51.34 %) |
578,614 (2.89 %) |
9,113,848 (48.93 %) |
87,796 (6.47 %) |
| 118 | plumbeous ibis (2021 VGP) GCA_020745775.1 |
n/a | 13,028 (1.84 %) |
22,722 (2.10 %) |
n/a | 42.37 (99.81 %) |
104 (0.19 %) |
88 (100.00 %) |
488,030 (6.66 %) |
188,606 (1.01 %) |
6,982,793 (20.08 %) |
32,920 (3.37 %) |
| 119 | prehistoric monster fish GCF_902500255.1 |
45,404 (2.55 %) |
14,664 (0.76 %) |
72,609 (2.41 %) |
n/a | 41.99 (99.49 %) |
2,554 (0.51 %) |
464 (100.00 %) |
1,310,663 (2.79 %) |
786,401 (3.65 %) |
9,901,286 (59.90 %) |
172,199 (5.45 %) |
| 120 | razorbill GCA_008658365.1 |
n/a | 12,776 (1.83 %) |
16,521 (2.42 %) |
n/a | 42.67 (99.70 %) |
227 (0.30 %) |
95 (100.00 %) |
543,514 (7.16 %) |
212,546 (1.12 %) |
6,930,708 (20.10 %) |
38,955 (2.90 %) |
| 121 | ring-tailed lemur (2021 VGP) GCF_020740605.2 |
55,883 (2.78 %) |
18,659 (1.98 %) |
20,542 (1.50 %) |
n/a | 41.36 (99.84 %) |
210 (0.16 %) |
185 (100.00 %) |
3,432,734 (37.67 %) |
518,071 (6.84 %) |
12,916,577 (32.91 %) |
50,626 (1.88 %) |
| 122 | red deer (2021 VGP) GCF_910594005.1 |
68,992 (2.68 %) |
20,470 (1.48 %) |
22,563 (1.32 %) |
n/a | 42.98 (100.00 %) |
40 (0.00 %) |
144 (100.00 %) |
5,501,063 (44.60 %) |
503,301 (12.23 %) |
13,102,622 (44.55 %) |
88,756 (1.66 %) |
| 123 | red-bellied piranha GCF_015220715.1 |
54,818 (7.05 %) |
16,817 (1.87 %) |
52,672 (4.24 %) |
n/a | 40.58 (99.17 %) |
303 (0.83 %) |
55 (100.00 %) |
817,566 (5.40 %) |
689,236 (8.30 %) |
7,296,459 (35.73 %) |
33,087 (1.38 %) |
| 124 | red-crested turaco GCA_009769465.1 |
n/a | 12,726 (1.75 %) |
21,173 (2.64 %) |
n/a | 42.60 (97.89 %) |
344 (2.11 %) |
140 (100.00 %) |
551,882 (8.95 %) |
176,530 (0.80 %) |
6,805,042 (22.19 %) |
43,046 (3.29 %) |
| 125 | red-fronted tinkerbird GCA_015220805.1 |
n/a | 12,345 (1.60 %) |
23,206 (2.02 %) |
n/a | 45.96 (99.53 %) |
307 (0.47 %) |
253 (100.00 %) |
1,082,064 (22.90 %) |
378,866 (4.28 %) |
6,003,548 (35.88 %) |
26,519 (1.76 %) |
| 126 | red-legged seriema GCA_009819825.1 |
n/a | 13,220 (1.83 %) |
19,960 (2.64 %) |
n/a | 42.20 (99.59 %) |
194 (0.41 %) |
110 (100.00 %) |
483,781 (6.50 %) |
160,481 (0.73 %) |
6,960,060 (19.71 %) |
32,894 (2.67 %) |
| 127 | reedfish GCF_900747795.1 |
40,558 (43.70 %) |
13,160 (0.46 %) |
48,082 (1.04 %) |
34,872 (1.34 %) |
39.44 (93.75 %) |
5,614 (6.25 %) |
1,885 (100.00 %) |
1,852,335 (2.79 %) |
1,018,031 (2.36 %) |
20,081,632 (44.56 %) |
88,254 (1.06 %) |
| 128 | rifleman (VGP 2021) GCA_016904835.1 |
n/a | 12,620 (1.92 %) |
24,568 (2.61 %) |
n/a | 42.41 (99.61 %) |
195 (0.39 %) |
206 (100.00 %) |
495,673 (9.14 %) |
253,008 (2.04 %) |
5,936,177 (19.93 %) |
20,145 (1.83 %) |
| 129 | river trout GCF_901001165.1 |
102,785 (6.02 %) |
27,433 (1.62 %) |
110,789 (4.44 %) |
122,381 (5.28 %) |
43.36 (96.90 %) |
3,941 (3.10 %) |
1,441 (100.00 %) |
1,488,597 (5.68 %) |
1,789,507 (15.87 %) |
9,819,761 (52.37 %) |
70,821 (1.77 %) |
| 130 | rock gunnel (2021 VGP) GCA_910591455.2 |
n/a | 15,065 (3.27 %) |
44,153 (7.53 %) |
n/a | 42.31 (99.98 %) |
418 (0.02 %) |
101 (100.00 %) |
n/a | 269,467 (4.88 %) |
3,358,709 (24.69 %) |
36,987 (3.02 %) |
| 131 | Saker falcon (2022 VGP) GCA_023634085.1 |
n/a | 12,971 (1.67 %) |
23,351 (2.02 %) |
n/a | 43.15 (99.70 %) |
258 (0.30 %) |
282 (100.00 %) |
n/a | 201,482 (8.55 %) |
7,030,761 (24.94 %) |
31,791 (2.57 %) |
| 132 | sand lizard GCF_009819535.1 |
41,714 (3.65 %) |
14,356 (1.48 %) |
19,592 (2.50 %) |
n/a | 43.75 (99.75 %) |
379 (0.25 %) |
29 (100.00 %) |
1,019,541 (5.39 %) |
425,414 (1.76 %) |
7,135,165 (34.49 %) |
76,053 (2.68 %) |
| 133 | sea lamprey GCF_010993605.1 |
41,254 (6.50 %) |
7,662 (0.70 %) |
36,337 (4.06 %) |
n/a | 48.31 (98.62 %) |
930 (1.38 %) |
1,434 (100.00 %) |
2,075,622 (39.58 %) |
1,194,165 (21.47 %) |
5,320,620 (50.50 %) |
178,447 (30.55 %) |
| 134 | Siamese fighting fish (2020) GCF_900634795.3 |
54,864 (17.78 %) |
14,745 (4.20 %) |
56,808 (10.87 %) |
n/a | 45.30 (99.99 %) |
328 (0.01 %) |
70 (100.00 %) |
255,550 (3.51 %) |
184,269 (4.62 %) |
2,010,934 (23.88 %) |
72,126 (13.08 %) |
| 135 | smalltooth sawfish GCA_009764475.1 |
n/a | 11,845 (0.66 %) |
19,597 (1.63 %) |
n/a | 42.38 (99.09 %) |
698 (0.91 %) |
173 (100.00 %) |
405,018 (1.14 %) |
391,531 (1.52 %) |
11,282,302 (38.19 %) |
45,398 (1.34 %) |
| 136 | South Island takahe (VGP primary 2021) GCA_020800305.1 |
n/a | 12,942 (1.69 %) |
23,221 (2.13 %) |
n/a | 43.74 (99.58 %) |
327 (0.42 %) |
174 (100.00 %) |
577,553 (9.77 %) |
259,017 (5.20 %) |
6,430,968 (25.90 %) |
23,810 (2.02 %) |
| 137 | southern bluefin tuna (2021 VGP) GCF_910596095.1 |
58,429 (11.06 %) |
15,626 (2.56 %) |
42,730 (5.74 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
184 (0.00 %) |
58 (100.00 %) |
554,276 (3.42 %) |
247,764 (2.94 %) |
5,176,851 (26.85 %) |
14,097 (0.88 %) |
| 138 | southern grasshopper mouse GCF_903995425.1 |
47,152 (2.39 %) |
19,356 (1.68 %) |
18,821 (1.36 %) |
n/a | 41.81 (98.94 %) |
2,143 (1.06 %) |
2,949 (100.00 %) |
4,850,460 (28.64 %) |
1,195,836 (2.72 %) |
13,540,762 (32.73 %) |
18,046 (0.54 %) |
| 139 | southern tamandua (2022 VGP) GCA_023851605.1 |
n/a | 20,639 (1.21 %) |
22,196 (1.13 %) |
n/a | 39.48 (99.44 %) |
961 (0.56 %) |
201 (100.00 %) |
n/a | 593,019 (1.17 %) |
18,033,833 (40.56 %) |
65,039 (1.33 %) |
| 140 | southern two-toed sloth GCF_015220235.1 |
63,054 (2.39 %) |
21,998 (1.29 %) |
23,177 (1.18 %) |
n/a | 39.89 (97.48 %) |
1,243 (2.52 %) |
146 (100.00 %) |
4,559,690 (39.66 %) |
577,607 (1.02 %) |
16,594,630 (40.50 %) |
51,430 (1.14 %) |
| 141 | specked wood butterfly GCF_905163445.1 |
21,720 (6.53 %) |
4,713 (0.87 %) |
17,001 (4.33 %) |
n/a | 35.99 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
70 (100.00 %) |
304,062 (2.97 %) |
110,824 (4.09 %) |
3,704,161 (44.42 %) |
28,108 (2.75 %) |
| 142 | stone loach (2022 VGP) GCA_947034865.1 |
n/a | 16,701 (3.97 %) |
40,677 (7.21 %) |
n/a | 39.69 (99.97 %) |
825 (0.03 %) |
100 (100.00 %) |
n/a | 143,170 (9.30 %) |
3,000,881 (34.30 %) |
30,130 (3.71 %) |
| 143 | Suruca trogon (2021 VGP) GCA_020746105.1 |
n/a | 12,884 (1.85 %) |
23,805 (2.23 %) |
n/a | 42.80 (99.12 %) |
253 (0.88 %) |
182 (100.00 %) |
539,771 (9.26 %) |
181,564 (1.14 %) |
6,538,228 (22.49 %) |
41,376 (3.37 %) |
| 144 | Swainson's thrush (v2 2020 VGP) GCF_009819885.2 |
40,121 (5.41 %) |
13,004 (1.87 %) |
24,795 (2.41 %) |
n/a | 42.48 (98.86 %) |
429 (1.14 %) |
160 (100.00 %) |
493,071 (5.80 %) |
589,858 (4.32 %) |
6,708,638 (22.44 %) |
49,404 (3.53 %) |
| 145 | thorny skate (v2 2020) GCF_010909765.2 |
45,968 (2.40 %) |
11,437 (0.60 %) |
26,341 (1.72 %) |
n/a | 44.30 (92.54 %) |
3,753 (7.46 %) |
957 (100.00 %) |
888,163 (2.58 %) |
1,176,348 (3.79 %) |
9,964,038 (52.25 %) |
242,676 (4.73 %) |
| 146 | tiny Cayenne caecilian GCF_901765095.1 |
41,346 (53.62 %) |
14,572 (0.43 %) |
88,603 (1.29 %) |
n/a | 44.01 (98.99 %) |
2,452 (1.01 %) |
1,081 (100.00 %) |
1,847,289 (1.60 %) |
1,670,443 (3.30 %) |
22,207,145 (52.43 %) |
414,828 (3.91 %) |
| 147 | torafugu GCF_901000725.2 |
53,492 (18.31 %) |
14,548 (4.79 %) |
51,180 (11.72 %) |
55,740 (14.38 %) |
45.67 (99.04 %) |
402 (0.96 %) |
128 (100.00 %) |
290,056 (10.32 %) |
178,921 (5.32 %) |
1,642,756 (20.86 %) |
49,973 (9.53 %) |
| 148 | tufted duck GCF_009819795.1 |
29,505 (4.02 %) |
12,959 (1.97 %) |
16,252 (2.50 %) |
n/a | 41.66 (99.16 %) |
163 (0.84 %) |
105 (100.00 %) |
836,786 (8.36 %) |
411,356 (1.71 %) |
6,691,445 (22.36 %) |
29,883 (2.48 %) |
| 149 | two-lined caecilian GCF_901001135.1 |
56,630 (53.09 %) |
14,452 (0.38 %) |
180,328 (2.13 %) |
n/a | 44.40 (99.36 %) |
3,573 (0.64 %) |
1,330 (100.00 %) |
2,273,617 (1.93 %) |
2,036,108 (4.34 %) |
29,400,958 (44.09 %) |
602,912 (6.66 %) |
| 150 | vaquita GCF_008692025.1 |
60,106 (3.00 %) |
18,607 (1.76 %) |
20,488 (1.43 %) |
35,398 (2.22 %) |
41.36 (99.66 %) |
212 (0.34 %) |
64 (100.00 %) |
4,010,529 (43.76 %) |
602,407 (1.34 %) |
12,468,582 (35.55 %) |
66,806 (1.79 %) |
| 151 | warty frogfish (2020 VGP) GCA_013358685.1 |
n/a | 14,494 (3.34 %) |
45,310 (7.77 %) |
n/a | 41.86 (99.87 %) |
219 (0.13 %) |
155 (100.00 %) |
n/a | 290,313 (6.11 %) |
3,010,996 (29.71 %) |
36,840 (4.18 %) |
| 152 | yellowfin seabream GCF_904848185.1 |
63,974 (13.26 %) |
15,178 (2.82 %) |
46,332 (6.73 %) |
n/a | 42.09 (100.00 %) |
149 (0.00 %) |
66 (100.00 %) |
499,939 (3.43 %) |
254,361 (2.64 %) |
4,420,217 (22.81 %) |
31,005 (1.79 %) |
| 153 | Western terrestrial garter snake GCF_009769535.1 |
33,492 (3.42 %) |
13,072 (1.13 %) |
19,161 (1.98 %) |
n/a | 40.95 (97.72 %) |
1,518 (2.28 %) |
365 (100.00 %) |
1,326,233 (7.79 %) |
979,057 (4.48 %) |
8,396,200 (42.63 %) |
81,829 (2.47 %) |
| 154 | whiskered treeswift (2021 VGP) GCA_020745705.1 |
n/a | 12,681 (1.84 %) |
21,784 (2.14 %) |
n/a | 42.12 (99.13 %) |
218 (0.87 %) |
146 (100.00 %) |
520,200 (9.32 %) |
170,778 (0.83 %) |
6,455,910 (21.44 %) |
24,061 (1.62 %) |
| 155 | white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 VGP 2021) GCF_016700215.2 |
83,834 (10.16 %) |
13,005 (2.32 %) |
23,329 (2.48 %) |
n/a | 42.16 (99.57 %) |
409 (0.43 %) |
685 (99.57 %) |
536,869 (6.00 %) |
268,230 (2.28 %) |
5,845,184 (20.93 %) |
24,409 (2.60 %) |
| 156 | yellow-throated sandgrouse GCA_009769525.1 |
n/a | 12,693 (1.89 %) |
18,187 (2.69 %) |
n/a | 42.40 (99.62 %) |
242 (0.38 %) |
89 (100.00 %) |
510,630 (7.10 %) |
213,742 (1.12 %) |
6,627,716 (21.17 %) |
28,846 (2.19 %) |
| 157 | yellowfin tuna (2021 VGP) GCF_914725855.1 |
57,835 (11.36 %) |
15,616 (2.53 %) |
42,750 (5.72 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
70 (0.00 %) |
68 (100.00 %) |
569,665 (3.53 %) |
259,656 (3.34 %) |
5,175,692 (27.05 %) |
14,420 (0.88 %) |
| 158 | zebra finch (refseq 2021 Blue55 female) GCF_003957565.2 |
49,311 (7.41 %) |
12,747 (1.97 %) |
24,009 (2.47 %) |
n/a | 41.86 (99.66 %) |
352 (0.34 %) |
199 (100.00 %) |
544,577 (9.57 %) |
458,903 (3.33 %) |
6,338,748 (20.92 %) |
29,202 (2.47 %) |
| 159 | zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020 VGP) GCA_903684865.1 |
n/a | 17,573 (2.49 %) |
44,169 (3.34 %) |
n/a | 36.57 (99.99 %) |
712 (0.01 %) |
1,252 (100.00 %) |
n/a | 927,173 (7.78 %) |
8,621,517 (50.27 %) |
44,554 (2.12 %) |
| 160 | zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020 VGP) GCA_903684855.2 |
n/a | 17,654 (2.50 %) |
43,578 (3.27 %) |
n/a | 36.56 (99.99 %) |
1,352 (0.01 %) |
755 (100.00 %) |
n/a | 936,258 (7.76 %) |
8,732,369 (50.44 %) |
44,812 (2.09 %) |
| 161 | zebrafish (WGS:CALUEM01 2022 VGP) GCA_944039275.1 |
n/a | 18,065 (2.46 %) |
44,526 (3.30 %) |
n/a | 37.08 (99.99 %) |
381 (0.01 %) |
73 (100.00 %) |
n/a | 954,645 (10.72 %) |
8,694,743 (51.88 %) |
44,936 (2.02 %) |
| 162 | zig-zag eel GCF_900324485.2 |
45,001 (12.01 %) |
15,052 (3.35 %) |
21,643 (6.89 %) |
60,604 (9.39 %) |
40.66 (97.76 %) |
238 (2.24 %) |
123 (100.00 %) |
349,298 (2.86 %) |
157,728 (2.01 %) |
3,180,025 (23.44 %) |
12,807 (1.08 %) |
| TOTALS: | total assembly count 162 | |||||||||||
| Alternate sets of VGP assemblies | NCBI Refseq | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Index pages: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |
| Assembly statistics: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |
| Track statistics: | primary assembly | alternate/haplotype | trio mat/pat | legacy/superseded | other NCBI Refseq assemblies |