VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1		 n/a 12,926
(1.90 %)		 23,453
(2.26 %)		 n/a 43.30
(99.29 %)		 204
(0.71 %)		 112
(100.00 %)		 401,839
(5.61 %)		 145,540
(0.78 %)		 6,556,090
(19.22 %)		 40,986
(3.65 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1		 n/a 15,735
(2.44 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 203
(100.00 %)		 1,781,283
(37.65 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,080
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
5 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3		 n/a 20,986
(2.01 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,532,782
(33.95 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,916
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
6 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1		 n/a 19,463
(1.58 %)		 20,378
(1.42 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 77
(100.00 %)		 4,513,580
(32.16 %)		 1,008,611
(2.91 %)		 13,570,452
(33.71 %)		 50,954
(2.21 %)
7 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1		 70,988
(5.69 %)		 14,024
(1.60 %)		 24,944
(1.95 %)		 n/a 44.34
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 710,321
(8.33 %)		 473,161
(7.22 %)		 5,692,215
(24.23 %)		 46,493
(8.90 %)
8 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
9 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
10 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
11 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1		 n/a 18,949
(1.23 %)		 21,655
(1.08 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 401
(100.00 %)		 6,218,266
(57.31 %)		 470,437
(3.04 %)		 15,241,157
(48.91 %)		 37,124
(0.86 %)
12 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
13 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1		 n/a 19,828
(1.45 %)		 20,376
(1.31 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 503
(100.00 %)		 4,030,880
(35.35 %)		 566,770
(2.63 %)		 14,198,970
(35.24 %)		 24,454
(0.96 %)
14 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1		 n/a 13,100
(1.79 %)		 23,372
(2.04 %)		 n/a 43.27
(99.31 %)		 280
(0.69 %)		 90
(100.00 %)		 538,004
(7.73 %)		 183,346
(0.79 %)		 7,056,270
(20.92 %)		 52,012
(5.96 %)
15 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1		 n/a 19,203
(1.43 %)		 22,174
(1.33 %)		 n/a 42.39
(99.98 %)		 2,957
(0.02 %)		 435
(100.00 %)		 4,188,829
(30.04 %)		 802,295
(5.81 %)		 14,041,290
(37.98 %)		 65,430
(2.64 %)
16 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
17 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
18 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1		 n/a 5,217
(0.97 %)		 41,736
(12.73 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 128,505
(1.65 %)		 182,123
(8.03 %)		 2,157,899
(27.45 %)		 44,261
(5.21 %)
19 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
20 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1		 n/a 18,528
(1.65 %)		 22,359
(1.64 %)		 n/a 42.89
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 3,531,044
(35.70 %)		 555,304
(2.07 %)		 11,439,853
(36.03 %)		 102,112
(3.75 %)
21 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1		 31,091
(4.24 %)		 12,257
(1.95 %)		 14,633
(2.35 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 159
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,055
(1.51 %)		 6,092,276
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
22 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1		 n/a 16,678
(0.56 %)		 151,361
(4.03 %)		 n/a 44.57
(99.91 %)		 15,113
(0.09 %)		 5,983
(100.00 %)		 12,251,532
(51.73 %)		 3,521,157
(17.69 %)		 10,051,020
(68.37 %)		 494,595
(10.52 %)
23 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
24 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
25 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1		 n/a 22,376
(1.44 %)		 97,559
(4.71 %)		 n/a 43.37
(99.97 %)		 3,235
(0.03 %)		 4,404
(99.97 %)		 999,920
(4.22 %)		 1,630,911
(26.08 %)		 7,875,105
(58.08 %)		 70,947
(2.59 %)
26 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1		 n/a 20,255
(1.35 %)		 21,401
(1.44 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 694
(0.00 %)		 2,530
(100.00 %)		 4,287,108
(25.85 %)		 895,123
(5.96 %)		 15,722,314
(36.45 %)		 34,781
(0.82 %)
27 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
28 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,315
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
29 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
30 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
31 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1		 54,426
(12.09 %)		 15,720
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 119
(100.00 %)		 1,608,682
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,078
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
32 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
33 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
34 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
35 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1		 34,357
(8.10 %)		 15,289
(2.56 %)		 43,205
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 665
(100.00 %)		 1,496,240
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,726
(29.93 %)		 13,308
(0.75 %)
37 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
38 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1		 n/a 14,247
(3.16 %)		 47,091
(7.94 %)		 n/a 42.17
(99.99 %)		 867
(0.02 %)		 478
(100.00 %)		 352,705
(4.33 %)		 432,013
(10.15 %)		 2,954,922
(28.67 %)		 41,876
(4.47 %)
39 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
40 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1		 n/a 18,773
(1.50 %)		 21,069
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,034
(0.01 %)		 900
(100.00 %)		 3,975,427
(35.64 %)		 1,054,000
(10.27 %)		 12,281,095
(41.92 %)		 79,762
(4.08 %)
41 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1		 n/a 15,534
(2.50 %)		 39,464
(5.26 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 552
(100.00 %)		 498,493
(3.22 %)		 271,314
(7.61 %)		 4,161,752
(38.16 %)		 9,637
(0.93 %)
43 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
44 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1		 48,592
(12.09 %)		 15,140
(2.66 %)		 43,304
(6.14 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 946
(99.98 %)		 1,221,797
(30.10 %)		 290,736
(7.79 %)		 4,164,799
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
45 band-tailed pigeon (hap1 2025)
GCF_037038585.1		 53,396
(5.03 %)		 13,483
(1.56 %)		 27,248
(2.08 %)		 n/a 44.11
(99.81 %)		 137
(0.19 %)		 360
(100.00 %)		 559,611
(7.44 %)		 512,210
(15.22 %)		 4,524,890
(33.96 %)		 44,009
(7.81 %)
46 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1		 36,326
(4.04 %)		 13,317
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 452
(100.00 %)		 700,166
(13.18 %)		 457,543
(13.85 %)		 4,522,973
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
47 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
48 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1		 n/a 15,122
(1.44 %)		 65,809
(4.50 %)		 n/a 41.23
(99.74 %)		 293
(0.26 %)		 331
(100.00 %)		 2,545,429
(50.53 %)		 451,939
(5.50 %)		 5,807,705
(42.18 %)		 94,695
(3.92 %)
49 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
50 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2		 41,925
(5.13 %)		 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
51 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
52 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1		 n/a 15,938
(3.00 %)		 52,921
(7.52 %)		 n/a 43.38
(99.98 %)		 752
(0.02 %)		 327
(100.00 %)		 993,554
(11.81 %)		 755,389
(11.75 %)		 3,469,352
(30.25 %)		 68,008
(5.51 %)
53 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
54 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1		 n/a 15,950
(2.82 %)		 53,175
(7.04 %)		 n/a 42.97
(99.99 %)		 481
(0.01 %)		 846
(100.00 %)		 1,017,817
(12.34 %)		 764,426
(15.65 %)		 3,524,564
(32.87 %)		 60,800
(4.43 %)
55 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
56 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2		 78,636
(2.63 %)		 19,459
(1.36 %)		 21,150
(1.33 %)		 n/a 43.91
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 3,963,383
(22.89 %)		 826,353
(11.67 %)		 12,918,743
(46.86 %)		 52,254
(10.67 %)
57 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1		 n/a 16,025
(2.63 %)		 53,351
(6.76 %)		 n/a 42.47
(99.98 %)		 699
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 995,401
(9.22 %)		 626,617
(9.80 %)		 4,302,378
(31.80 %)		 38,231
(2.50 %)
58 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1		 n/a 18,686
(0.72 %)		 17,238
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 609
(100.00 %)		 6,263,094
(27.34 %)		 2,223,995
(5.89 %)		 23,994,844
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
59 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1		 n/a 13,007
(1.87 %)		 23,375
(2.27 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 439
(0.01 %)		 592
(100.00 %)		 467,217
(6.83 %)		 273,604
(2.43 %)		 6,154,114
(21.83 %)		 23,203
(2.12 %)
60 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1		 n/a 12,731
(2.42 %)		 22,580
(2.63 %)		 n/a 41.64
(99.99 %)		 330
(0.01 %)		 191
(100.00 %)		 520,888
(5.33 %)		 274,030
(2.07 %)		 5,360,112
(20.48 %)		 19,673
(2.18 %)
61 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1		 n/a 20,713
(0.64 %)		 21,469
(0.64 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 770
(0.00 %)		 470
(100.00 %)		 3,860,121
(14.52 %)		 1,230,113
(2.81 %)		 21,600,460
(65.53 %)		 49,878
(0.73 %)
62 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
63 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1		 n/a 15,257
(2.73 %)		 47,477
(6.62 %)		 n/a 42.03
(100.00 %)		 n/a 24
(100.00 %)		 488,582
(3.19 %)		 254,655
(4.13 %)		 4,385,401
(24.08 %)		 32,461
(1.90 %)
64 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1		 56,255
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
65 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1		 44,388
(4.96 %)		 13,738
(1.81 %)		 26,691
(2.34 %)		 n/a 42.41
(99.92 %)		 404
(0.08 %)		 307
(100.00 %)		 730,165
(12.91 %)		 566,529
(6.51 %)		 6,499,984
(24.36 %)		 42,650
(2.59 %)
66 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1		 46,133
(4.67 %)		 13,243
(1.58 %)		 24,048
(1.89 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 462
(0.01 %)		 728
(100.00 %)		 516,346
(4.84 %)		 268,169
(14.83 %)		 5,880,218
(31.31 %)		 45,313
(4.92 %)
67 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1		 51,115
(5.11 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
68 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
69 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1		 31,610
(4.74 %)		 12,379
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 190
(100.00 %)		 582,016
(10.36 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,626
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
70 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1		 n/a 15,085
(2.21 %)		 48,479
(5.71 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 499,447
(3.15 %)		 285,392
(5.12 %)		 5,443,017
(30.00 %)		 23,550
(1.23 %)
71 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1		 n/a 17,486
(2.97 %)		 46,833
(5.41 %)		 n/a 38.79
(99.99 %)		 720
(0.01 %)		 413
(100.00 %)		 2,165,269
(36.18 %)		 490,692
(17.84 %)		 4,251,333
(47.54 %)		 42,744
(2.37 %)
72 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,540
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
73 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
74 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1		 n/a 13,064
(1.75 %)		 25,241
(2.27 %)		 n/a 43.65
(99.99 %)		 393
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 727,985
(19.18 %)		 342,327
(5.00 %)		 5,822,377
(25.13 %)		 40,586
(3.99 %)
75 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
76 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1		 n/a 13,097
(2.93 %)		 55,097
(8.76 %)		 n/a 45.82
(99.88 %)		 3,055
(0.12 %)		 3,832
(100.00 %)		 1,337,604
(32.27 %)		 749,185
(17.27 %)		 2,363,606
(35.06 %)		 78,815
(8.25 %)
77 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1		 n/a 12,919
(1.77 %)		 22,770
(2.15 %)		 n/a 42.69
(99.92 %)		 107
(0.08 %)		 246
(100.00 %)		 711,670
(17.55 %)		 242,430
(5.04 %)		 5,545,074
(24.84 %)		 25,153
(2.06 %)
78 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
79 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
80 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
81 Bolivian squirrel monkey (mSaiBol1 primary hap 2025)
GCA_048565385.1		 n/a 20,765
(1.92 %)		 20,951
(1.28 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 5,214,762
(46.97 %)		 990,724
(4.68 %)		 14,779,707
(38.32 %)		 38,916
(1.05 %)
82 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
83 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1		 n/a 17,715
(2.98 %)		 44,183
(4.64 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 613,768
(4.88 %)		 440,668
(11.76 %)		 5,264,302
(45.25 %)		 39,351
(3.96 %)
84 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2		 92,658
(2.98 %)		 20,708
(1.74 %)		 21,361
(1.14 %)		 n/a 40.88
(99.75 %)		 8
(0.25 %)		 26
(100.00 %)		 5,544,151
(54.41 %)		 1,072,960
(9.60 %)		 16,187,641
(42.16 %)		 43,604
(1.09 %)
85 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
86 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
87 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1		 55,474
(7.85 %)		 13,848
(1.83 %)		 27,055
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 953,492
(13.69 %)		 387,699
(7.91 %)		 4,552,359
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
88 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
89 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
90 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1		 n/a 13,202
(1.80 %)		 24,416
(2.14 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 569
(100.00 %)		 832,469
(7.06 %)		 531,644
(7.37 %)		 6,294,434
(28.49 %)		 34,786
(3.61 %)
91 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1		 n/a 13,406
(4.62 %)		 41,458
(10.33 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 205,224
(2.93 %)		 217,943
(13.58 %)		 1,368,592
(36.56 %)		 48,018
(12.44 %)
92 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
93 brown argus butterfly (refseq 2021)
GCF_905147365.1		 23,611
(6.61 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,265
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 264,358
(2.90 %)		 144,234
(3.35 %)		 2,650,845
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
94 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
95 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1		 32,026
(4.32 %)		 13,239
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 864
(100.00 %)		 538,374
(10.19 %)		 279,504
(3.12 %)		 5,874,531
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
96 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,828
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
97 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
98 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
99 Canada goose (primary hap 2025)
GCA_965231335.1		 n/a 13,367
(1.74 %)		 24,033
(2.05 %)		 n/a 44.13
(99.99 %)		 531
(0.01 %)		 614
(100.00 %)		 686,641
(5.40 %)		 437,049
(11.66 %)		 6,060,316
(29.86 %)		 41,213
(4.57 %)
100 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
101 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
102 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
103 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1		 n/a 12,740
(1.82 %)		 28,031
(2.77 %)		 n/a 42.88
(99.47 %)		 269
(0.53 %)		 109
(100.00 %)		 556,926
(7.87 %)		 213,180
(1.09 %)		 6,641,077
(21.58 %)		 30,881
(2.41 %)
104 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1		 n/a 12,708
(1.72 %)		 24,978
(2.26 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 573
(0.01 %)		 467
(100.00 %)		 495,590
(3.15 %)		 493,628
(13.34 %)		 6,163,336
(28.37 %)		 39,042
(6.25 %)
105 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
106 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1		 38,623
(10.62 %)		 15,604
(3.07 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 1,224,649
(24.57 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,926
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
107 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2		 134,453
(3.48 %)		 20,832
(1.77 %)		 22,081
(1.17 %)		 n/a 40.57
(99.84 %)		 5
(0.16 %)		 26
(100.00 %)		 5,408,047
(49.94 %)		 1,021,513
(10.88 %)		 15,986,329
(42.21 %)		 49,727
(1.09 %)
108 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1		 n/a 15,739
(1.88 %)		 46,290
(4.42 %)		 n/a 39.31
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 663,559
(2.79 %)		 371,107
(3.14 %)		 7,519,173
(32.84 %)		 17,824
(0.70 %)
109 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
110 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
111 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
112 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
113 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
114 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
115 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
116 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
117 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,207
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
118 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1		 n/a 18,114
(2.63 %)		 66,549
(6.11 %)		 n/a 38.62
(99.99 %)		 685
(0.01 %)		 215
(100.00 %)		 2,639,968
(48.46 %)		 659,243
(7.55 %)		 5,950,358
(40.47 %)		 62,337
(3.61 %)
119 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
120 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1		 n/a 13,512
(1.75 %)		 24,417
(2.13 %)		 n/a 43.17
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 546
(100.00 %)		 439,018
(4.62 %)		 244,865
(6.73 %)		 6,778,625
(23.94 %)		 43,400
(4.80 %)
121 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1		 50,206
(6.30 %)		 13,190
(1.85 %)		 24,284
(2.29 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 150
(100.00 %)		 566,161
(11.56 %)		 310,430
(2.36 %)		 6,712,791
(21.76 %)		 25,268
(1.73 %)
122 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
123 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1		 n/a 18,484
(2.43 %)		 69,931
(5.95 %)		 n/a 39.03
(99.98 %)		 1,202
(0.02 %)		 876
(100.00 %)		 938,148
(4.74 %)		 828,944
(9.34 %)		 5,833,273
(42.65 %)		 78,182
(4.87 %)
124 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1		 n/a 13,374
(1.90 %)		 24,308
(2.28 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 544
(100.00 %)		 751,865
(6.78 %)		 400,294
(3.80 %)		 6,184,781
(24.97 %)		 35,712
(2.66 %)
125 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
126 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1		 n/a 12,976
(1.68 %)		 23,758
(2.12 %)		 n/a 44.70
(99.99 %)		 603
(0.01 %)		 845
(100.00 %)		 499,923
(5.57 %)		 250,214
(7.38 %)		 6,350,978
(25.68 %)		 27,790
(2.32 %)
127 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1		 n/a 12,560
(1.73 %)		 23,740
(2.16 %)		 n/a 42.32
(99.80 %)		 435
(0.20 %)		 455
(100.00 %)		 395,254
(5.40 %)		 937,774
(11.00 %)		 6,145,808
(28.07 %)		 32,293
(3.87 %)
128 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
129 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
130 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1		 n/a 13,505
(1.83 %)		 24,961
(2.21 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 474
(0.01 %)		 870
(100.00 %)		 833,892
(8.17 %)		 576,230
(8.04 %)		 6,149,355
(27.84 %)		 34,089
(2.69 %)
131 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1		 n/a 15,435
(2.40 %)		 54,036
(6.66 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 576
(100.00 %)		 495,544
(2.96 %)		 454,601
(9.69 %)		 4,614,163
(29.34 %)		 29,859
(1.71 %)
132 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
133 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
134 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1		 39,986
(4.95 %)		 12,292
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 110
(100.00 %)		 499,695
(6.70 %)		 199,749
(1.12 %)		 6,354,003
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
135 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1		 n/a 13,103
(1.81 %)		 24,044
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.16 %)		 205
(0.84 %)		 123
(100.00 %)		 570,312
(7.91 %)		 216,895
(1.04 %)		 7,043,151
(20.98 %)		 45,694
(3.73 %)
136 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
137 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2		 n/a 18,311
(1.71 %)		 19,456
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,767,071
(28.35 %)		 431,575
(3.90 %)		 11,286,853
(32.63 %)		 71,506
(2.50 %)
138 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
139 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1		 n/a 29,103
(1.36 %)		 124,287
(3.94 %)		 n/a 43.87
(99.96 %)		 5,995
(0.04 %)		 11,150
(100.00 %)		 1,655,140
(4.68 %)		 1,843,550
(17.63 %)		 9,367,555
(61.56 %)		 112,654
(3.84 %)
140 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1		 n/a 11,741
(1.82 %)		 22,382
(2.29 %)		 n/a 42.01
(98.73 %)		 1,479
(1.27 %)		 278
(100.00 %)		 476,049
(6.38 %)		 367,108
(3.16 %)		 6,576,957
(20.43 %)		 25,004
(2.02 %)
141 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 20,502,207
(74.78 %)		 568,042
(10.14 %)
142 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
143 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
144 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
145 Cory's shearwater (hap1.2 2024)
GCA_964195595.2		 n/a 13,703
(1.71 %)		 25,586
(2.06 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 362
(100.00 %)		 478,943
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,061
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
146 crab-eating macaque (582-1 2024)
GCF_037993035.1		 100,896
(3.93 %)		 20,528
(1.79 %)		 21,741
(1.19 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 5,357,498
(52.90 %)		 1,017,190
(8.58 %)		 15,617,344
(40.74 %)		 94,759
(1.56 %)
147 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1		 n/a 17,935
(1.34 %)		 104,307
(6.12 %)		 n/a 44.53
(99.96 %)		 2,975
(0.04 %)		 2,930
(100.00 %)		 5,608,839
(57.44 %)		 1,825,932
(20.35 %)		 6,375,759
(51.18 %)		 149,374
(4.78 %)
148 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1		 n/a 13,656
(1.49 %)		 27,669
(2.31 %)		 n/a 44.30
(100.00 %)		 164
(0.00 %)		 544
(100.00 %)		 765,672
(26.88 %)		 431,376
(14.19 %)		 5,221,201
(33.63 %)		 63,565
(10.48 %)
149 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1		 n/a 14,740
(2.96 %)		 58,554
(8.04 %)		 n/a 44.56
(99.96 %)		 1,180
(0.04 %)		 793
(100.00 %)		 711,944
(7.44 %)		 537,707
(8.17 %)		 3,418,045
(29.92 %)		 95,750
(8.49 %)
150 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
151 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1		 n/a 19,467
(1.76 %)		 18,734
(1.43 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 4,718,848
(32.83 %)		 1,327,449
(6.80 %)		 12,893,458
(34.03 %)		 21,236
(0.61 %)
152 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
153 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1		 n/a 13,044
(1.66 %)		 30,275
(2.65 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 271
(0.00 %)		 295
(100.00 %)		 603,184
(8.76 %)		 324,082
(7.37 %)		 6,147,876
(25.10 %)		 44,051
(8.95 %)
154 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
155 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
156 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1		 n/a 18,610
(1.67 %)		 19,098
(1.39 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,077,286
(41.85 %)		 754,689
(2.64 %)		 11,873,386
(36.16 %)		 48,137
(1.04 %)
157 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1		 n/a 13,457
(1.72 %)		 25,299
(2.10 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 390
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 660,747
(14.47 %)		 294,268
(5.22 %)		 6,840,996
(24.63 %)		 39,705
(5.14 %)
158 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
159 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
160 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
161 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
162 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
163 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1		 n/a 13,401
(1.75 %)		 24,999
(2.15 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 930
(0.01 %)		 819
(100.00 %)		 685,992
(5.59 %)		 452,303
(8.91 %)		 5,976,185
(28.48 %)		 43,672
(4.38 %)
164 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1		 45,512
(7.65 %)		 16,797
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 103
(100.00 %)		 871,278
(4.83 %)		 805,806
(14.65 %)		 5,615,217
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
165 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1		 25,483
(3.24 %)		 12,410
(1.70 %)		 22,416
(2.11 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 180
(100.00 %)		 1,259,627
(26.52 %)		 378,533
(3.38 %)		 5,846,661
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
166 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
167 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1		 n/a 13,276
(1.84 %)		 25,393
(2.30 %)		 n/a 42.38
(99.61 %)		 144
(0.39 %)		 105
(100.00 %)		 548,862
(7.06 %)		 187,966
(0.97 %)		 7,004,597
(21.19 %)		 36,626
(3.69 %)
168 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1		 38,171
(5.79 %)		 12,559
(1.96 %)		 23,642
(2.48 %)		 n/a 42.01
(99.99 %)		 582
(0.01 %)		 587
(100.00 %)		 599,051
(9.46 %)		 453,954
(3.77 %)		 6,287,657
(20.75 %)		 27,831
(2.52 %)
169 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
170 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1		 n/a 15,554
(2.13 %)		 55,328
(6.30 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 31
(100.00 %)		 933,060
(24.43 %)		 252,509
(4.84 %)		 4,460,314
(32.70 %)		 34,184
(2.09 %)
171 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
172 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
173 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
174 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
175 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
176 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1		 n/a 16,358
(2.62 %)		 62,068
(6.39 %)		 n/a 41.74
(99.75 %)		 49
(0.25 %)		 460
(100.00 %)		 701,679
(6.15 %)		 756,011
(21.53 %)		 2,660,355
(42.28 %)		 50,381
(3.85 %)
177 elegant crested-tinamou (YG026_01 primary hap 2025)
GCA_047922985.1		 n/a 13,193
(1.91 %)		 25,746
(2.48 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 299
(0.00 %)		 397
(100.00 %)		 486,339
(4.61 %)		 408,335
(8.96 %)		 5,589,546
(25.37 %)		 51,487
(9.83 %)
178 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1		 54,479
(5.65 %)		 13,972
(1.59 %)		 25,695
(1.97 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 271
(100.00 %)		 713,839
(12.11 %)		 418,774
(7.08 %)		 5,668,105
(24.04 %)		 51,137
(7.32 %)
179 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2		 n/a 13,213
(1.74 %)		 24,562
(2.10 %)		 n/a 42.41
(99.99 %)		 539
(0.01 %)		 767
(100.00 %)		 567,285
(7.79 %)		 258,030
(2.59 %)		 7,108,005
(19.16 %)		 41,752
(6.24 %)
180 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
181 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,332
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
182 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,138
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
183 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1		 n/a 13,292
(1.69 %)		 25,387
(2.13 %)		 n/a 41.80
(99.99 %)		 696
(0.01 %)		 2,451
(100.00 %)		 489,065
(4.78 %)		 331,025
(13.58 %)		 6,196,233
(29.98 %)		 37,567
(3.51 %)
184 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1		 n/a 13,457
(1.70 %)		 24,519
(2.05 %)		 n/a 44.24
(99.99 %)		 593
(0.01 %)		 754
(100.00 %)		 516,462
(4.57 %)		 262,941
(8.12 %)		 5,356,948
(26.79 %)		 48,488
(7.36 %)
185 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1		 n/a 13,239
(1.66 %)		 24,512
(2.02 %)		 n/a 43.98
(99.99 %)		 785
(0.01 %)		 1,834
(100.00 %)		 600,399
(6.45 %)		 616,756
(7.75 %)		 5,607,190
(28.35 %)		 39,863
(3.53 %)
186 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
187 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1		 n/a 13,040
(1.86 %)		 22,823
(2.21 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 121
(100.00 %)		 595,803
(8.38 %)		 248,128
(1.78 %)		 6,744,611
(22.18 %)		 24,805
(1.90 %)
188 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
189 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,145
(2.95 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
190 Eurasian spoonbill (hap1.1 2025)
GCA_965183815.1		 n/a 13,660
(1.73 %)		 24,623
(2.04 %)		 n/a 43.62
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 669
(100.00 %)		 956,977
(14.04 %)		 311,174
(4.10 %)		 5,758,263
(23.26 %)		 48,161
(5.09 %)
191 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
192 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
193 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
194 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
195 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
196 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1		 48,969
(12.45 %)		 14,751
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 108
(100.00 %)		 1,160,781
(27.06 %)		 251,983
(5.23 %)		 3,353,086
(26.00 %)		 37,129
(2.79 %)
197 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1		 n/a 12,984
(1.78 %)		 22,854
(2.04 %)		 n/a 42.70
(99.01 %)		 268
(0.99 %)		 107
(100.00 %)		 558,587
(8.35 %)		 180,400
(0.83 %)		 7,132,381
(21.18 %)		 40,661
(3.41 %)
198 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
199 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
200 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
201 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1		 n/a 18,085
(1.69 %)		 19,509
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 1,056
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 2,569,380
(23.32 %)		 565,465
(2.18 %)		 10,506,666
(33.68 %)		 46,367
(3.09 %)
202 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
203 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,468
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
204 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
205 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
206 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2		 n/a 12,344
(1.85 %)		 23,934
(2.37 %)		 n/a 42.10
(99.97 %)		 990
(0.03 %)		 1,119
(100.00 %)		 532,973
(5.96 %)		 401,820
(3.43 %)		 6,320,210
(21.42 %)		 30,391
(2.60 %)
207 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1		 n/a 13,203
(1.74 %)		 22,959
(2.04 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 436,838
(4.84 %)		 471,070
(3.20 %)		 6,601,537
(22.79 %)		 37,247
(3.95 %)
208 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
209 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1		 46,762
(14.07 %)		 15,639
(3.79 %)		 50,238
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,007
(100.00 %)		 1,648,428
(31.34 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,793
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
210 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
211 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
212 European starfish (2020)
GCF_902459465.1		 26,326
(11.67 %)		 4,121
(0.84 %)		 21,080
(8.48 %)		 23,775
(14.13 %)		 38.76
(99.96 %)		 471
(0.04 %)		 150
(100.00 %)		 131,898
(1.43 %)		 159,226
(7.04 %)		 2,504,013
(37.40 %)		 15,392
(1.50 %)
213 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1		 n/a 20,075
(1.28 %)		 20,274
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 1,436
(0.01 %)		 502
(100.00 %)		 4,357,247
(31.78 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,882,486
(41.66 %)		 39,275
(0.88 %)
214 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2		 n/a 12,391
(1.76 %)		 23,333
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 940
(0.33 %)		 311
(100.00 %)		 550,895
(7.50 %)		 227,532
(1.16 %)		 6,767,530
(21.05 %)		 34,682
(2.57 %)
215 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,114
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
216 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1		 n/a 20,072
(1.51 %)		 22,668
(1.37 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 1,369
(100.00 %)		 4,623,335
(34.75 %)		 475,143
(7.51 %)		 13,000,703
(41.56 %)		 112,581
(2.00 %)
217 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1		 75,958
(3.31 %)		 18,718
(1.50 %)		 20,982
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 438
(100.00 %)		 3,958,926
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,061
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
218 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1		 n/a 15,762
(0.77 %)		 16,035
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 1,915
(99.99 %)		 5,302,372
(24.47 %)		 1,450,220
(3.79 %)		 20,870,654
(44.26 %)		 24,585
(0.65 %)
219 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
220 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1		 n/a 19,491
(1.21 %)		 22,538
(1.06 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 1,516
(0.01 %)		 2,612
(100.00 %)		 4,598,236
(35.34 %)		 1,716,315
(24.14 %)		 12,260,919
(52.40 %)		 82,683
(1.47 %)
221 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,238
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
222 flatback sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152275.1		 n/a 15,046
(1.09 %)		 18,089
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 4,516,775
(43.62 %)		 319,645
(1.38 %)		 10,785,223
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
223 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1		 n/a 15,528
(2.10 %)		 55,124
(6.16 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 946,588
(24.66 %)		 252,409
(5.14 %)		 4,403,110
(33.26 %)		 35,478
(2.07 %)
224 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
225 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
226 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
227 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
228 frog A.baeobatrachus (hap1 2025)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
229 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
230 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1		 n/a 12,520
(1.95 %)		 23,459
(2.46 %)		 n/a 42.08
(99.82 %)		 134
(0.18 %)		 176
(100.00 %)		 491,810
(6.09 %)		 376,746
(2.55 %)		 6,461,292
(20.23 %)		 27,799
(2.40 %)
231 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1		 n/a 19,320
(1.74 %)		 21,940
(1.65 %)		 n/a 42.55
(99.99 %)		 1,540
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 3,707,500
(37.60 %)		 733,107
(7.78 %)		 10,515,474
(39.35 %)		 60,200
(2.41 %)
232 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
233 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1		 n/a 15,652
(1.85 %)		 56,048
(5.08 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 176
(100.00 %)		 640,534
(2.88 %)		 384,479
(4.59 %)		 6,438,939
(33.27 %)		 28,221
(1.10 %)
234 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
235 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
236 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
237 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4		 60,920
(5.98 %)		 13,334
(1.84 %)		 23,261
(2.12 %)		 n/a 42.16
(99.58 %)		 228
(0.42 %)		 144
(100.00 %)		 544,341
(5.93 %)		 186,461
(0.80 %)		 7,090,610
(20.01 %)		 38,495
(3.10 %)
238 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
239 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1		 n/a 13,156
(1.63 %)		 23,633
(1.97 %)		 n/a 43.34
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 216
(100.00 %)		 515,745
(6.36 %)		 283,125
(12.39 %)		 4,289,389
(30.87 %)		 27,612
(1.85 %)
240 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
241 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025)
GCA_048772815.1		 n/a 20,967
(0.89 %)		 24,137
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,087
(100.00 %)		 5,547,018
(29.30 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,898
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
242 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,442
(3.17 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
243 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
244 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1		 n/a 19,291
(1.73 %)		 20,301
(1.41 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 1,130
(0.01 %)		 171
(100.00 %)		 4,245,582
(34.81 %)		 600,624
(2.16 %)		 13,240,803
(34.28 %)		 56,932
(1.78 %)
245 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
246 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 58,884
(2.46 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
247 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
248 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1		 46,253
(5.46 %)		 13,432
(1.76 %)		 23,419
(2.08 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 493
(0.01 %)		 350
(100.00 %)		 556,733
(10.18 %)		 303,277
(3.45 %)		 6,599,550
(22.65 %)		 38,340
(5.45 %)
249 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
250 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2		 n/a 18,051
(1.56 %)		 19,955
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 2,841,143
(26.67 %)		 379,430
(5.52 %)		 11,651,542
(35.11 %)		 72,337
(2.76 %)
251 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1		 33,115
(3.89 %)		 13,120
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 190
(100.00 %)		 610,506
(15.46 %)		 210,373
(1.13 %)		 6,501,918
(23.95 %)		 35,788
(2.78 %)
252 great scallop (2019)
GCF_902652985.1		 46,811
(9.29 %)		 4,090
(0.36 %)		 32,743
(7.09 %)		 n/a 36.65
(99.92 %)		 1,827
(0.08 %)		 3,983
(100.00 %)		 281,310
(1.71 %)		 706,978
(26.84 %)		 5,249,556
(32.64 %)		 13,101
(0.87 %)
253 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
254 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
255 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
256 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
257 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
258 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1		 n/a 18,582
(1.55 %)		 20,954
(1.35 %)		 n/a 42.46
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 4,158,629
(40.30 %)		 696,150
(4.67 %)		 12,702,667
(41.11 %)		 257,446
(3.38 %)
259 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
260 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1		 55,259
(2.53 %)		 18,321
(1.40 %)		 21,048
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 256
(100.00 %)		 4,247,145
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,157
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
261 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
262 greater scaup (hap1 2025)
GCA_965140915.1		 n/a 13,410
(1.86 %)		 25,527
(2.30 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,290
(100.00 %)		 944,720
(17.84 %)		 522,593
(6.27 %)		 6,100,900
(26.44 %)		 33,827
(2.73 %)
263 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
264 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
265 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1		 49,276
(1.90 %)		 19,295
(1.38 %)		 21,790
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 703
(100.00 %)		 4,116,894
(35.85 %)		 966,064
(16.74 %)		 12,154,101
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
266 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
267 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1		 47,961
(5.90 %)		 13,016
(1.82 %)		 21,266
(2.02 %)		 n/a 42.20
(99.55 %)		 635
(0.45 %)		 133
(100.00 %)		 484,104
(5.60 %)		 186,430
(0.85 %)		 7,162,723
(18.83 %)		 24,760
(2.03 %)
268 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1		 n/a 17,856
(1.76 %)		 20,604
(1.75 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 3,697,250
(33.21 %)		 842,827
(8.27 %)		 10,094,062
(38.40 %)		 61,715
(2.96 %)
269 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1		 33,578
(1.54 %)		 18,528
(1.58 %)		 20,582
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 1,405
(99.99 %)		 3,760,713
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,181
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
270 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1		 51,641
(5.08 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
271 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1		 51,593
(6.18 %)		 12,739
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 188
(100.00 %)		 409,129
(0.00 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,375
(23.59 %)		 46,118
(3.85 %)
272 hawksbill sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
273 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
274 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v2 hap1 2025)
GCA_040954625.2		 n/a 4,887
(1.28 %)		 35,452
(15.87 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 221
(0.01 %)		 100
(100.00 %)		 87,343
(1.66 %)		 120,271
(13.20 %)		 1,311,438
(29.26 %)		 21,344
(4.17 %)
275 herring gull (hap1 2024)
GCA_964417175.1		 n/a 13,382
(1.61 %)		 25,785
(2.15 %)		 n/a 44.80
(99.99 %)		 559
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 535,852
(5.32 %)		 233,906
(10.46 %)		 5,597,180
(29.50 %)		 46,309
(7.00 %)
276 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
277 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1		 n/a 13,089
(1.50 %)		 29,621
(2.22 %)		 n/a 45.56
(100.00 %)		 268
(0.00 %)		 683
(100.00 %)		 610,333
(22.07 %)		 252,997
(12.56 %)		 5,154,598
(31.67 %)		 58,754
(5.54 %)
278 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
279 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
280 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
281 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
282 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
283 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1		 43,228
(5.71 %)		 12,702
(1.83 %)		 24,568
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 296
(0.98 %)		 184
(100.00 %)		 440,384
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,138
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
284 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
285 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1		 75,216
(7.36 %)		 12,832
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 204
(0.00 %)		 335
(100.00 %)		 647,402
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,561
(30.36 %)		 36,193
(2.91 %)
286 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1		 n/a 13,233
(1.67 %)		 23,010
(1.93 %)		 n/a 43.91
(99.92 %)		 253
(0.08 %)		 136
(100.00 %)		 610,144
(11.51 %)		 214,393
(5.75 %)		 6,069,916
(25.74 %)		 33,172
(3.38 %)
287 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1		 n/a 19,463
(1.32 %)		 22,424
(1.19 %)		 n/a 42.05
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 1,355
(100.00 %)		 4,164,459
(34.02 %)		 1,281,751
(18.33 %)		 12,412,281
(48.28 %)		 82,412
(1.67 %)
288 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
289 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
290 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
291 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
292 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
293 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,583
(6.91 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
294 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1		 n/a 19,123
(1.40 %)		 21,508
(1.26 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 31
(100.00 %)		 3,982,368
(23.76 %)		 650,129
(7.44 %)		 12,858,872
(44.33 %)		 99,144
(2.87 %)
295 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1		 n/a 18,239
(1.76 %)		 20,378
(1.53 %)		 n/a 41.40
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 2,195
(100.00 %)		 3,438,644
(42.82 %)		 584,006
(9.54 %)		 12,207,998
(35.49 %)		 34,491
(1.02 %)
296 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
297 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
298 jackdaw (hap1.1 2025)
GCA_965178545.1		 n/a 13,233
(1.72 %)		 30,094
(2.51 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 648
(0.01 %)		 733
(100.00 %)		 532,540
(3.59 %)		 553,881
(6.97 %)		 5,338,663
(26.88 %)		 54,918
(4.96 %)
299 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1		 n/a 17,882
(1.68 %)		 19,103
(1.41 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 4,622,385
(41.25 %)		 893,297
(1.89 %)		 12,851,116
(33.53 %)		 61,319
(2.55 %)
300 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
301 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
302 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
303 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1		 n/a 13,042
(1.63 %)		 24,142
(2.01 %)		 n/a 45.07
(99.96 %)		 300
(0.04 %)		 148
(100.00 %)		 563,851
(12.90 %)		 270,861
(12.36 %)		 6,191,106
(28.24 %)		 54,426
(4.92 %)
304 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2		 49,757
(5.76 %)		 13,110
(1.92 %)		 22,782
(2.26 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 89
(100.00 %)		 507,148
(7.85 %)		 208,178
(1.08 %)		 6,258,087
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
305 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,470
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
306 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1		 n/a 13,641
(1.52 %)		 24,293
(1.78 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 484,661
(3.34 %)		 252,569
(16.01 %)		 5,595,734
(32.51 %)		 77,942
(3.59 %)
307 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
308 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
309 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
310 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1		 n/a 13,529
(1.69 %)		 23,672
(1.98 %)		 n/a 43.50
(99.85 %)		 259
(0.15 %)		 232
(100.00 %)		 491,653
(3.53 %)		 349,011
(9.83 %)		 5,955,030
(26.51 %)		 32,237
(2.61 %)
311 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1		 46,366
(5.56 %)		 12,594
(1.91 %)		 22,763
(2.31 %)		 26,057
(3.91 %)		 41.97
(99.70 %)		 206
(0.30 %)		 93
(100.00 %)		 485,121
(7.13 %)		 247,189
(1.64 %)		 6,498,294
(20.04 %)		 25,377
(1.97 %)
312 lancelets B.floridae x B.belcheri (bbbf 2021)
GCA_019207075.1		 n/a 5,191
(1.10 %)		 42,331
(14.51 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 108
(0.12 %)		 79
(100.00 %)		 132,673
(2.15 %)		 174,485
(7.81 %)		 1,945,047
(28.91 %)		 42,166
(6.02 %)
313 lancelets B.floridae x B.japonicum (bjbf 2020)
GCA_015852565.1		 n/a 5,384
(0.92 %)		 47,467
(13.75 %)		 n/a 41.37
(99.98 %)		 168
(0.02 %)		 341
(100.00 %)		 146,622
(1.62 %)		 202,162
(9.26 %)		 2,291,900
(27.75 %)		 44,443
(4.78 %)
314 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1		 48,561
(5.70 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
315 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
316 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
317 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
318 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1		 n/a 15,790
(2.31 %)		 50,332
(5.65 %)		 n/a 40.87
(99.96 %)		 672
(0.04 %)		 202
(100.00 %)		 464,845
(2.71 %)		 255,513
(3.69 %)		 5,124,388
(29.65 %)		 25,920
(1.67 %)
319 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
320 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
321 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1		 n/a 19,085
(1.11 %)		 23,074
(1.09 %)		 n/a 43.54
(99.98 %)		 2,938
(0.02 %)		 3,189
(100.00 %)		 4,687,333
(25.05 %)		 908,610
(10.98 %)		 12,922,050
(49.64 %)		 68,749
(2.22 %)
322 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
323 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1		 n/a 14,961
(2.55 %)		 52,234
(6.83 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 409
(0.01 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,233,052
(39.33 %)		 366,741
(18.98 %)		 3,296,338
(36.77 %)		 44,712
(2.85 %)
324 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,120
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
325 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1		 n/a 13,333
(1.68 %)		 24,731
(2.05 %)		 n/a 44.40
(99.99 %)		 537
(0.01 %)		 1,382
(100.00 %)		 509,160
(5.11 %)		 266,609
(9.64 %)		 6,827,304
(27.15 %)		 44,108
(6.34 %)
326 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
327 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1		 n/a 18,484
(1.87 %)		 24,356
(1.84 %)		 n/a 41.88
(97.91 %)		 866
(2.09 %)		 617
(99.68 %)		 3,419,622
(36.65 %)		 663,182
(2.53 %)		 11,508,574
(30.58 %)		 84,174
(4.85 %)
328 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1		 n/a 19,031
(1.88 %)		 21,003
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,133,745
(33.46 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,720,176
(32.32 %)		 35,414
(1.75 %)
329 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2		 47,420
(5.64 %)		 13,098
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,499
(5.58 %)		 210,234
(1.26 %)		 7,133,934
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
330 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2		 n/a 18,342
(1.54 %)		 22,974
(1.62 %)		 n/a 43.04
(100.00 %)		 302
(0.00 %)		 588
(100.00 %)		 4,258,096
(37.31 %)		 1,289,911
(11.51 %)		 9,694,758
(42.52 %)		 65,974
(2.80 %)
331 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1		 39,024
(4.18 %)		 13,360
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 180
(100.00 %)		 674,149
(6.73 %)		 329,124
(5.34 %)		 6,820,245
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
332 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1		 53,210
(2.49 %)		 18,323
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 168
(100.00 %)		 4,224,344
(28.69 %)		 1,030,576
(2.60 %)		 12,591,989
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
333 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
334 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
335 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
336 light-bulb sea squirt (2022)
GCA_947623445.1		 n/a 3,318
(1.37 %)		 10,846
(10.58 %)		 n/a 35.93
(99.99 %)		 58
(0.01 %)		 105
(100.00 %)		 34,121
(1.61 %)		 31,117
(17.32 %)		 1,008,995
(33.48 %)		 4,203
(2.12 %)
337 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
338 little owl (hap1.1 2025)
GCA_965140245.1		 n/a 13,385
(1.67 %)		 23,822
(2.00 %)		 n/a 43.44
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 717
(100.00 %)		 653,518
(17.99 %)		 588,381
(7.88 %)		 5,739,624
(25.13 %)		 34,531
(9.97 %)
339 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
340 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
341 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
342 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
343 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
344 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
345 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
346 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
347 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
348 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
349 loggerhead turtle (hap1 2025)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
350 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2		 61,447
(2.80 %)		 18,725
(1.51 %)		 20,946
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 2,076
(99.99 %)		 4,125,452
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,170
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
351 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1		 n/a 13,329
(1.88 %)		 23,888
(2.25 %)		 n/a 42.30
(99.99 %)		 544
(0.01 %)		 272
(100.00 %)		 784,647
(6.78 %)		 501,860
(7.36 %)		 6,388,957
(26.13 %)		 34,028
(3.04 %)
352 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2		 n/a 12,322
(2.02 %)		 20,234
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 140
(0.37 %)		 77
(100.00 %)		 497,376
(5.06 %)		 265,823
(1.51 %)		 6,044,278
(20.09 %)		 15,921
(1.43 %)
353 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
354 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
355 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1		 n/a 13,082
(1.73 %)		 27,150
(2.44 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 669,243
(14.71 %)		 211,387
(6.69 %)		 6,514,716
(27.07 %)		 47,331
(8.09 %)
356 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1		 n/a 12,905
(1.81 %)		 22,204
(2.01 %)		 n/a 42.12
(98.21 %)		 232
(1.79 %)		 153
(100.00 %)		 485,318
(6.35 %)		 184,992
(0.78 %)		 7,064,965
(19.56 %)		 31,653
(3.02 %)
357 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1		 n/a 15,501
(2.18 %)		 54,090
(6.20 %)		 n/a 41.17
(99.99 %)		 422
(0.01 %)		 82
(100.00 %)		 1,727,328
(38.16 %)		 259,351
(4.71 %)		 4,381,278
(33.25 %)		 35,281
(1.93 %)
358 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1		 n/a 13,680
(1.77 %)		 26,845
(2.33 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 571
(0.01 %)		 936
(100.00 %)		 941,876
(15.92 %)		 570,703
(9.50 %)		 6,169,980
(28.67 %)		 41,791
(3.18 %)
359 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1		 59,854
(7.33 %)		 12,988
(1.87 %)		 23,709
(2.20 %)		 86,787
(8.80 %)		 42.27
(99.64 %)		 905
(0.36 %)		 756
(100.00 %)		 803,558
(8.04 %)		 417,575
(5.02 %)		 6,627,843
(24.59 %)		 35,030
(3.06 %)
360 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
361 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1		 n/a 25,281
(0.80 %)		 18,740
(0.87 %)		 n/a 37.80
(99.99 %)		 196
(0.01 %)		 889
(99.99 %)		 6,538,990
(26.08 %)		 1,450,668
(2.40 %)		 21,374,371
(47.19 %)		 17,923
(0.30 %)
362 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1		 n/a 13,064
(1.72 %)		 22,269
(1.98 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 407
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 459,578
(3.87 %)		 315,686
(6.19 %)		 6,650,507
(22.84 %)		 36,076
(2.82 %)
363 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1		 n/a 13,133
(1.81 %)		 23,396
(2.19 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 358
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 511,156
(7.05 %)		 238,915
(5.05 %)		 5,764,523
(25.19 %)		 24,675
(1.70 %)
364 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
365 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
366 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1		 n/a 18,172
(1.67 %)		 20,736
(1.60 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 2,998,913
(29.48 %)		 418,833
(1.07 %)		 11,783,716
(32.96 %)		 65,956
(4.38 %)
367 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
368 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
369 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1		 112,768
(4.40 %)		 19,582
(1.52 %)		 20,911
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 4,598,813
(31.70 %)		 1,102,136
(4.40 %)		 13,591,364
(35.18 %)		 53,470
(2.24 %)
370 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
371 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
372 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
373 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
374 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
375 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
376 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2		 59,524
(6.76 %)		 12,983
(1.98 %)		 22,400
(2.22 %)		 33,839
(5.17 %)		 41.92
(99.13 %)		 451
(0.87 %)		 171
(100.00 %)		 700,051
(7.55 %)		 301,579
(1.34 %)		 6,791,838
(21.30 %)		 31,278
(3.07 %)
377 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3		 n/a 18,681
(1.79 %)		 19,816
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 101
(100.00 %)		 3,618,235
(37.24 %)		 612,229
(1.52 %)		 12,641,632
(35.02 %)		 60,518
(1.78 %)
378 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1		 n/a 18,001
(1.75 %)		 21,219
(1.77 %)		 n/a 42.26
(99.98 %)		 1,836
(0.02 %)		 1,062
(100.00 %)		 3,664,854
(32.90 %)		 906,692
(8.55 %)		 10,164,440
(37.98 %)		 56,705
(2.75 %)
379 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2		 n/a 19,475
(1.82 %)		 22,424
(1.68 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 212
(100.00 %)		 3,841,654
(38.99 %)		 801,041
(5.78 %)		 10,278,311
(38.66 %)		 64,639
(2.57 %)
380 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1		 31,033
(4.42 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
381 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1		 50,821
(6.95 %)		 12,747
(1.94 %)		 23,372
(2.37 %)		 30,299
(3.60 %)		 42.57
(97.41 %)		 289
(2.59 %)		 105
(100.00 %)		 452,690
(6.21 %)		 231,546
(1.70 %)		 6,265,995
(19.54 %)		 31,909
(2.48 %)
382 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
383 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1		 34,506
(4.09 %)		 13,358
(1.72 %)		 24,851
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 806
(100.00 %)		 705,074
(18.28 %)		 342,297
(9.55 %)		 6,410,054
(28.06 %)		 38,589
(9.40 %)
384 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2		 72,174
(2.47 %)		 21,051
(1.11 %)		 24,418
(1.07 %)		 n/a 41.00
(99.67 %)		 793
(0.33 %)		 546
(100.00 %)		 5,412,063
(53.31 %)		 738,320
(2.02 %)		 19,755,423
(43.69 %)		 142,597
(2.85 %)
385 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1		 57,816
(15.11 %)		 14,598
(3.83 %)		 49,473
(9.87 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 174
(100.00 %)		 599,085
(14.68 %)		 186,746
(10.27 %)		 2,273,889
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
386 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1		 n/a 15,762
(2.12 %)		 43,732
(4.51 %)		 n/a 38.98
(100.00 %)		 180
(0.00 %)		 278
(100.00 %)		 1,071,044
(5.64 %)		 581,680
(6.16 %)		 6,228,783
(39.01 %)		 42,159
(2.70 %)
387 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
388 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
389 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
390 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1		 39,806
(3.75 %)		 13,668
(1.52 %)		 25,226
(1.90 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 408
(100.00 %)		 713,264
(8.42 %)		 603,930
(6.25 %)		 5,379,069
(27.65 %)		 50,913
(9.74 %)
391 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
392 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
393 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1		 n/a 18,933
(1.44 %)		 23,629
(1.50 %)		 n/a 42.60
(100.00 %)		 113
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 4,027,155
(30.73 %)		 712,278
(5.22 %)		 12,003,034
(41.58 %)		 96,116
(3.02 %)
394 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
395 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1		 n/a 14,295
(2.22 %)		 50,623
(6.07 %)		 n/a 42.09
(99.99 %)		 466
(0.01 %)		 892
(100.00 %)		 1,941,831
(49.35 %)		 650,256
(17.85 %)		 3,210,410
(44.77 %)		 55,251
(4.79 %)
396 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1		 n/a 13,477
(1.77 %)		 23,613
(2.08 %)		 n/a 42.44
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 474,930
(4.45 %)		 237,604
(2.75 %)		 5,847,260
(21.07 %)		 30,873
(3.03 %)
397 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2		 n/a 13,527
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 455
(100.00 %)		 511,000
(3.76 %)		 325,992
(9.82 %)		 5,542,342
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
398 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1		 n/a 16,996
(1.51 %)		 21,787
(1.66 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 3,293,772
(27.51 %)		 602,403
(3.02 %)		 11,827,700
(30.64 %)		 44,220
(1.55 %)
399 northern lapwing (hap1.1 2025)
GCA_965231255.1		 n/a 13,331
(1.54 %)		 24,472
(1.83 %)		 n/a 44.53
(99.99 %)		 936
(0.01 %)		 2,408
(100.00 %)		 863,726
(25.27 %)		 320,840
(14.03 %)		 5,397,999
(32.53 %)		 69,579
(4.22 %)
400 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,733
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
401 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1		 61,479
(7.27 %)		 13,217
(1.88 %)		 23,886
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 631
(0.01 %)		 394
(100.00 %)		 734,760
(5.74 %)		 422,946
(7.08 %)		 6,491,116
(25.88 %)		 34,601
(2.98 %)
402 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1		 n/a 18,475
(1.82 %)		 19,990
(1.56 %)		 n/a 40.72
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 3,507,612
(39.92 %)		 711,081
(2.15 %)		 11,788,205
(32.17 %)		 35,670
(1.25 %)
403 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
404 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1		 n/a 12,592
(1.89 %)		 24,002
(2.35 %)		 n/a 42.94
(99.48 %)		 1,602
(0.52 %)		 1,695
(100.00 %)		 466,546
(6.40 %)		 235,283
(1.98 %)		 6,371,421
(20.17 %)		 34,247
(3.02 %)
405 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1		 n/a 13,787
(3.68 %)		 60,819
(10.07 %)		 n/a 45.42
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 108
(100.00 %)		 259,874
(3.38 %)		 94,885
(3.76 %)		 2,302,967
(21.04 %)		 58,433
(13.25 %)
406 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1		 32,231
(8.81 %)		 15,382
(3.41 %)		 41,015
(7.24 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 1,143,877
(18.90 %)		 219,801
(2.87 %)		 3,652,133
(23.09 %)		 19,721
(1.34 %)
407 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
408 orange-tipped seq squirt (primary hap 2023)
GCA_963082875.1		 n/a 3,120
(1.99 %)		 3,357
(8.53 %)		 n/a 31.55
(99.96 %)		 244
(0.04 %)		 106
(100.00 %)		 56,509
(6.44 %)		 43,313
(12.97 %)		 962,614
(51.07 %)		 1,079
(6.77 %)
409 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
410 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1		 n/a 15,600
(2.30 %)		 54,714
(6.21 %)		 n/a 43.99
(99.99 %)		 1,132
(0.01 %)		 184
(100.00 %)		 1,505,689
(14.07 %)		 1,691,834
(17.30 %)		 4,407,291
(38.23 %)		 38,205
(2.14 %)
411 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
412 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
413 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
414 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
415 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
416 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
417 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
418 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1		 n/a 16,917
(1.64 %)		 72,190
(5.85 %)		 n/a 42.91
(99.96 %)		 2,729
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 4,976,327
(35.08 %)		 1,258,755
(18.52 %)		 6,268,804
(48.21 %)		 81,193
(3.23 %)
419 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
420 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
421 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
422 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
423 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1		 n/a 17,996
(2.00 %)		 89,591
(7.93 %)		 n/a 45.22
(99.94 %)		 3,299
(0.06 %)		 1,177
(100.00 %)		 2,828,457
(30.93 %)		 1,676,413
(19.87 %)		 4,137,400
(48.69 %)		 78,669
(4.37 %)
424 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1		 49,100
(5.64 %)		 13,021
(1.66 %)		 21,794
(1.95 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 241
(0.31 %)		 125
(100.00 %)		 586,320
(11.83 %)		 335,218
(8.05 %)		 7,038,851
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
425 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
426 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
427 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1		 n/a 13,816
(3.52 %)		 52,689
(9.01 %)		 n/a 43.48
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 300
(100.00 %)		 223,762
(3.25 %)		 105,291
(6.28 %)		 2,579,336
(24.55 %)		 41,114
(5.50 %)
428 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
429 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1		 n/a 18,525
(1.46 %)		 19,792
(1.29 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 4,084,482
(28.40 %)		 1,424,314
(5.35 %)		 12,927,595
(39.56 %)		 81,967
(2.96 %)
430 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 refseq)
GCF_043159975.1		 103,003
(4.05 %)		 20,760
(1.76 %)		 21,155
(1.14 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 5,396,194
(53.53 %)		 1,039,569
(9.75 %)		 15,407,787
(41.73 %)		 99,854
(1.52 %)
431 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
432 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1		 n/a 13,140
(1.85 %)		 25,111
(2.31 %)		 n/a 42.27
(99.99 %)		 509
(0.01 %)		 143
(100.00 %)		 488,313
(5.48 %)		 331,962
(3.50 %)		 6,243,204
(22.87 %)		 36,343
(3.63 %)
433 pink sea squirt (2022)
GCA_947561715.1		 n/a 3,449
(1.48 %)		 14,588
(13.45 %)		 n/a 39.19
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 18,369
(1.83 %)		 33,783
(9.73 %)		 1,032,597
(26.20 %)		 7,713
(4.85 %)
434 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1		 n/a 13,275
(1.76 %)		 24,103
(2.11 %)		 n/a 43.68
(99.98 %)		 1,137
(0.02 %)		 715
(100.00 %)		 792,215
(9.76 %)		 471,286
(10.34 %)		 6,448,623
(29.48 %)		 49,485
(4.41 %)
435 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
436 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
437 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
438 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1		 n/a 13,028
(1.84 %)		 22,722
(2.10 %)		 n/a 42.37
(99.81 %)		 104
(0.19 %)		 88
(100.00 %)		 488,030
(6.66 %)		 188,606
(1.01 %)		 6,982,793
(20.08 %)		 32,920
(3.37 %)
439 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
440 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
441 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
442 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
443 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
444 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2		 95,418
(4.20 %)		 21,182
(1.74 %)		 23,352
(1.22 %)		 n/a 40.43
(99.84 %)		 6
(0.16 %)		 31
(100.00 %)		 5,436,203
(50.57 %)		 1,021,767
(12.45 %)		 15,964,628
(43.17 %)		 48,818
(1.07 %)
445 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 56,261
(2.22 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
446 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1		 95,289
(4.22 %)		 19,385
(1.31 %)		 22,631
(1.31 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 221
(100.00 %)		 4,099,586
(21.20 %)		 1,062,900
(3.78 %)		 13,416,814
(41.72 %)		 116,523
(2.66 %)
447 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1		 n/a 15,639
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 365
(100.00 %)		 1,655,350
(30.53 %)		 511,512
(12.09 %)		 2,015,264
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
448 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1		 n/a 15,661
(1.94 %)		 54,906
(5.30 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 386
(100.00 %)		 591,994
(2.64 %)		 396,424
(6.16 %)		 6,144,028
(31.24 %)		 24,792
(1.05 %)
449 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1		 n/a 12,787
(1.83 %)		 22,839
(2.13 %)		 n/a 42.67
(99.70 %)		 227
(0.30 %)		 95
(100.00 %)		 543,517
(7.16 %)		 212,546
(1.12 %)		 6,930,708
(20.10 %)		 38,960
(3.02 %)
450 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
451 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2		 n/a 19,622
(1.57 %)		 20,371
(1.38 %)		 n/a 41.34
(99.98 %)		 1,845
(0.02 %)		 461
(100.00 %)		 4,519,485
(31.91 %)		 1,018,114
(2.59 %)		 13,810,284
(32.99 %)		 52,053
(2.31 %)
452 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
453 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1		 n/a 13,231
(1.68 %)		 24,060
(2.00 %)		 n/a 43.15
(99.98 %)		 1,269
(0.02 %)		 660
(100.00 %)		 440,963
(5.78 %)		 187,847
(3.22 %)		 6,601,610
(24.99 %)		 54,002
(5.24 %)
454 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1		 n/a 13,234
(1.92 %)		 23,753
(2.26 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 714
(0.01 %)		 141
(100.00 %)		 772,537
(6.34 %)		 437,831
(4.05 %)		 6,488,340
(24.52 %)		 31,577
(2.49 %)
455 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1		 n/a 12,744
(1.75 %)		 25,706
(2.29 %)		 n/a 42.60
(97.89 %)		 344
(2.11 %)		 140
(100.00 %)		 551,885
(8.95 %)		 176,530
(0.80 %)		 6,805,042
(22.19 %)		 43,051
(3.40 %)
456 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1		 44,843
(4.51 %)		 12,341
(1.60 %)		 23,205
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 252
(100.00 %)		 981,758
(15.82 %)		 378,855
(4.28 %)		 6,003,474
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
457 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1		 n/a 13,229
(1.84 %)		 25,580
(2.35 %)		 n/a 42.20
(99.59 %)		 194
(0.41 %)		 110
(100.00 %)		 483,784
(6.50 %)		 160,481
(0.73 %)		 6,960,060
(19.71 %)		 32,899
(2.77 %)
458 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1		 25,173
(3.02 %)		 13,216
(1.71 %)		 24,050
(2.10 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,185
(100.00 %)		 544,422
(8.81 %)		 223,672
(5.77 %)		 6,669,433
(23.63 %)		 38,305
(3.37 %)
459 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1		 29,994
(3.93 %)		 12,687
(1.75 %)		 25,287
(2.30 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 516
(100.00 %)		 785,960
(17.62 %)		 522,256
(9.27 %)		 6,371,580
(25.40 %)		 32,643
(2.66 %)
460 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,479
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
461 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
462 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1		 52,442
(2.57 %)		 19,577
(1.52 %)		 22,283
(1.38 %)		 n/a 41.89
(99.99 %)		 682
(0.01 %)		 267
(100.00 %)		 3,294,672
(23.89 %)		 527,436
(2.98 %)		 13,137,581
(39.89 %)		 57,436
(1.81 %)
463 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
464 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1		 n/a 12,620
(1.92 %)		 24,568
(2.61 %)		 n/a 42.41
(99.61 %)		 195
(0.39 %)		 206
(100.00 %)		 495,673
(9.14 %)		 253,008
(2.04 %)		 5,936,177
(19.93 %)		 20,145
(1.83 %)
465 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
466 ring-tailed lemur (primary hap 2021)
GCF_020740605.2		 55,883
(2.78 %)		 18,659
(1.98 %)		 20,542
(1.50 %)		 n/a 41.36
(99.84 %)		 210
(0.16 %)		 185
(100.00 %)		 3,432,734
(37.67 %)		 518,071
(6.84 %)		 12,916,577
(32.91 %)		 50,626
(1.88 %)
467 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1		 n/a 18,825
(1.58 %)		 20,986
(1.29 %)		 n/a 42.25
(99.99 %)		 1,138
(0.01 %)		 1,150
(100.00 %)		 4,405,513
(43.51 %)		 1,342,544
(11.28 %)		 12,274,096
(41.76 %)		 76,936
(4.65 %)
468 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
469 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
470 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
471 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1		 70,874
(7.24 %)		 13,145
(1.66 %)		 25,462
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 869
(100.00 %)		 656,963
(11.76 %)		 412,665
(12.92 %)		 6,047,535
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
472 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1		 51,619
(7.29 %)		 12,832
(2.31 %)		 23,047
(2.56 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 165
(100.00 %)		 526,839
(5.87 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,345
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
473 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1		 32,256
(9.05 %)		 15,283
(3.03 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 1,115,191
(21.73 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,073
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
474 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
475 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1		 n/a 18,254
(2.38 %)		 68,852
(5.71 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 759
(100.00 %)		 2,854,977
(51.13 %)		 754,287
(11.81 %)		 5,942,764
(44.17 %)		 72,686
(4.52 %)
476 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
477 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2		 46,014
(2.36 %)		 18,616
(1.49 %)		 20,618
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 1,598
(99.99 %)		 4,020,525
(35.99 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,758
(42.64 %)		 66,188
(3.91 %)
478 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1		 50,290
(5.75 %)		 12,973
(1.67 %)		 21,670
(1.90 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 283
(100.00 %)		 548,090
(7.21 %)		 201,488
(8.55 %)		 7,030,877
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
479 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1		 n/a 15,661
(2.59 %)		 68,929
(8.14 %)		 n/a 45.02
(99.96 %)		 1,365
(0.04 %)		 2,987
(100.00 %)		 2,234,544
(43.47 %)		 1,192,255
(16.84 %)		 3,383,827
(41.37 %)		 108,808
(9.86 %)
480 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1		 27,528
(4.03 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
481 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
482 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
483 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
484 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,701
(3.64 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
485 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1		 48,146
(9.15 %)		 16,069
(2.33 %)		 64,178
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 240
(100.00 %)		 1,503,108
(11.74 %)		 1,507,022
(15.48 %)		 4,027,614
(37.52 %)		 68,873
(3.56 %)
486 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
487 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1		 n/a 12,986
(1.66 %)		 27,028
(2.29 %)		 n/a 43.66
(99.78 %)		 249
(0.22 %)		 110
(100.00 %)		 464,600
(3.28 %)		 681,402
(9.28 %)		 6,314,744
(26.92 %)		 39,406
(5.26 %)
488 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2		 n/a 18,109
(2.10 %)		 21,263
(1.89 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 2,812,261
(34.39 %)		 457,565
(5.58 %)		 10,220,083
(31.02 %)		 59,522
(2.81 %)
489 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
490 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1		 n/a 14,310
(4.44 %)		 47,336
(10.19 %)		 n/a 44.83
(99.99 %)		 241
(0.01 %)		 38
(100.00 %)		 446,827
(13.86 %)		 192,599
(8.52 %)		 2,033,160
(22.85 %)		 61,012
(13.03 %)
491 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1		 n/a 12,858
(1.52 %)		 25,777
(2.02 %)		 n/a 44.04
(99.85 %)		 365
(0.15 %)		 501
(100.00 %)		 580,376
(4.24 %)		 636,266
(12.18 %)		 4,804,433
(34.52 %)		 48,871
(4.18 %)
492 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1		 n/a 19,292
(1.27 %)		 21,865
(1.14 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 1,179
(0.01 %)		 2,572
(100.00 %)		 4,525,289
(42.25 %)		 1,097,216
(21.14 %)		 12,203,884
(50.47 %)		 80,128
(1.58 %)
493 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
494 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
495 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1		 n/a 15,800
(1.77 %)		 51,791
(4.52 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 777,839
(3.19 %)		 459,791
(3.90 %)		 7,958,604
(35.17 %)		 21,711
(0.94 %)
496 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1		 n/a 19,388
(1.42 %)		 21,612
(1.28 %)		 n/a 43.17
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 5,311,536
(44.06 %)		 653,238
(7.29 %)		 12,937,231
(44.10 %)		 63,230
(6.03 %)
497 siamang (v2.1 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.3		 105,374
(3.05 %)		 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
498 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,278
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
499 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1		 n/a 16,906
(1.39 %)		 115,931
(7.77 %)		 n/a 44.10
(99.96 %)		 3,365
(0.04 %)		 5,504
(100.00 %)		 4,606,608
(53.63 %)		 1,428,326
(25.54 %)		 4,395,832
(51.22 %)		 166,807
(7.52 %)
500 silver-eye (hap1.1 2025)
GCA_965231275.1		 n/a 13,156
(1.86 %)		 25,666
(2.48 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 427
(100.00 %)		 484,761
(3.51 %)		 588,871
(4.76 %)		 6,251,918
(22.33 %)		 33,754
(2.58 %)
501 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
502 slow loris (primary hap 2022)
GCF_027406575.1		 67,211
(2.59 %)		 22,193
(1.49 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 84
(100.00 %)		 4,625,872
(39.88 %)		 579,983
(1.59 %)		 14,405,367
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
503 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
504 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
505 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
506 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
507 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1		 41,069
(3.95 %)		 12,946
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 299
(0.07 %)		 353
(100.00 %)		 515,851
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,851
(39.23 %)		 47,268
(3.90 %)
508 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
509 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1		 n/a 12,942
(1.69 %)		 23,221
(2.13 %)		 n/a 43.74
(99.58 %)		 327
(0.42 %)		 174
(100.00 %)		 577,553
(9.77 %)		 259,017
(5.20 %)		 6,430,968
(25.90 %)		 23,810
(2.02 %)
510 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
511 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
512 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
513 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
514 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
515 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1		 n/a 19,471
(1.39 %)		 22,951
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 1,095
(0.01 %)		 1,604
(100.00 %)		 4,307,839
(34.31 %)		 825,475
(10.97 %)		 11,375,945
(45.31 %)		 76,527
(3.10 %)
516 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1		 n/a 15,554
(1.75 %)		 58,641
(5.19 %)		 n/a 40.59
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 682,449
(3.01 %)		 409,809
(4.43 %)		 7,114,584
(28.98 %)		 37,214
(1.53 %)
517 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1		 37,067
(4.23 %)		 12,815
(1.76 %)		 23,175
(2.17 %)		 n/a 42.29
(99.52 %)		 161
(0.48 %)		 191
(100.00 %)		 572,944
(12.88 %)		 256,368
(3.55 %)		 5,868,966
(23.42 %)		 27,158
(2.30 %)
518 speckled wood butterfly (refseq 2021)
GCF_905163445.1		 21,720
(6.53 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,001
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 304,062
(2.97 %)		 110,824
(4.09 %)		 3,704,161
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
519 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
520 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
521 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1		 n/a 15,425
(3.14 %)		 43,414
(6.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 n/a 109
(100.00 %)		 447,804
(3.49 %)		 241,876
(3.25 %)		 3,757,088
(26.25 %)		 23,346
(2.49 %)
522 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1		 n/a 15,188
(0.80 %)		 15,406
(0.90 %)		 n/a 36.07
(99.97 %)		 151
(0.03 %)		 157
(99.97 %)		 4,933,924
(23.65 %)		 1,239,006
(2.76 %)		 20,612,787
(41.98 %)		 21,700
(0.64 %)
523 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
524 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,154
(7.62 %)		 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
525 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1		 n/a 19,605
(1.80 %)		 20,075
(1.48 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 80
(100.00 %)		 4,110,913
(40.46 %)		 838,212
(2.48 %)		 11,938,168
(33.52 %)		 40,424
(1.32 %)
526 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
527 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,860
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
528 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
529 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2		 102,148
(3.49 %)		 20,870
(1.72 %)		 21,383
(1.14 %)		 n/a 40.88
(99.75 %)		 11
(0.25 %)		 30
(100.00 %)		 5,567,810
(54.83 %)		 1,092,396
(10.36 %)		 16,195,884
(42.80 %)		 44,397
(1.13 %)
530 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1		 n/a 12,884
(1.85 %)		 23,805
(2.23 %)		 n/a 42.80
(99.12 %)		 253
(0.88 %)		 182
(100.00 %)		 539,771
(9.26 %)		 181,564
(1.14 %)		 6,538,228
(22.49 %)		 41,376
(3.37 %)
531 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
532 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2		 40,121
(5.41 %)		 13,004
(1.87 %)		 24,795
(2.41 %)		 n/a 42.48
(98.86 %)		 429
(1.14 %)		 160
(100.00 %)		 493,071
(5.80 %)		 589,858
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
533 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1		 29,544
(4.27 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
534 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1		 68,379
(7.95 %)		 13,715
(1.90 %)		 24,704
(2.28 %)		 n/a 43.07
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 780,603
(10.80 %)		 463,894
(5.65 %)		 6,593,404
(24.63 %)		 41,265
(4.48 %)
535 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1		 50,082
(5.09 %)		 12,974
(1.75 %)		 22,545
(2.07 %)		 n/a 42.67
(99.82 %)		 186
(0.18 %)		 367
(100.00 %)		 541,918
(6.97 %)		 347,387
(6.90 %)		 5,657,314
(26.08 %)		 25,816
(2.01 %)
536 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
537 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1		 73,219
(3.07 %)		 17,615
(0.77 %)		 15,415
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 272
(100.00 %)		 5,866,314
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,480
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
538 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1		 n/a 15,725
(0.77 %)		 16,721
(0.92 %)		 n/a 36.17
(99.49 %)		 1,514
(0.51 %)		 1,521
(99.49 %)		 5,222,976
(23.42 %)		 1,357,438
(3.95 %)		 21,705,122
(42.26 %)		 24,443
(0.70 %)
539 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1		 52,057
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
540 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1		 n/a 13,321
(1.76 %)		 24,102
(2.15 %)		 n/a 42.35
(99.83 %)		 203
(0.17 %)		 1,038
(100.00 %)		 593,409
(10.51 %)		 202,463
(9.29 %)		 6,160,173
(27.65 %)		 25,785
(2.35 %)
541 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1		 n/a 13,204
(1.60 %)		 23,981
(1.99 %)		 n/a 42.70
(99.70 %)		 281
(0.30 %)		 212
(99.85 %)		 443,228
(4.74 %)		 272,738
(10.86 %)		 5,812,837
(27.42 %)		 30,602
(2.52 %)
542 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
543 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
544 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
545 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1		 n/a 14,939
(3.72 %)		 56,284
(10.07 %)		 n/a 44.71
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 133
(100.00 %)		 573,569
(20.53 %)		 206,699
(9.01 %)		 2,335,009
(27.29 %)		 84,009
(12.41 %)
546 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
547 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
548 tourmaline sunangel (hap1 2024 refseq)
GCF_036169615.1		 50,562
(5.87 %)		 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,200
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,721
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
549 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
550 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
551 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
552 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2		 n/a 17,256
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 597
(100.00 %)		 2,407,631
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,418
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
553 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1		 n/a 18,871
(1.79 %)		 20,351
(1.55 %)		 n/a 40.66
(99.99 %)		 397
(0.01 %)		 136
(100.00 %)		 3,580,957
(40.75 %)		 683,947
(2.19 %)		 11,464,418
(33.39 %)		 37,175
(1.31 %)
554 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1		 n/a 19,530
(1.21 %)		 24,576
(1.13 %)		 n/a 42.48
(99.99 %)		 1,240
(0.01 %)		 2,757
(100.00 %)		 4,847,855
(34.88 %)		 949,927
(20.01 %)		 10,981,914
(51.51 %)		 91,880
(2.74 %)
555 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1		 n/a 14,730
(2.84 %)		 50,956
(7.07 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 179
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 548,208
(5.35 %)		 356,364
(7.30 %)		 3,448,877
(26.01 %)		 26,685
(1.80 %)
556 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1		 29,492
(4.02 %)		 12,972
(1.98 %)		 22,757
(2.27 %)		 n/a 41.66
(99.16 %)		 163
(0.84 %)		 105
(100.00 %)		 826,451
(8.47 %)		 411,356
(1.71 %)		 6,691,445
(22.36 %)		 29,882
(2.41 %)
557 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1		 n/a 13,371
(1.77 %)		 23,897
(2.09 %)		 n/a 45.04
(99.99 %)		 540
(0.01 %)		 608
(100.00 %)		 745,129
(5.82 %)		 484,265
(9.62 %)		 6,249,520
(28.78 %)		 46,110
(11.14 %)
558 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
559 tunicate A.aspersa (primary hap 2024)
GCA_963924565.1		 n/a 3,379
(0.93 %)		 17,530
(9.16 %)		 n/a 37.03
(99.98 %)		 393
(0.02 %)		 75
(100.00 %)		 67,051
(2.43 %)		 80,550
(6.04 %)		 2,322,081
(35.06 %)		 18,716
(4.75 %)
560 tunicate A.turbinatum (primary hap 2021)
GCA_918807975.1		 n/a 4,108
(0.57 %)		 18,445
(6.84 %)		 n/a 37.60
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 104,021
(0.79 %)		 186,953
(6.27 %)		 2,895,772
(42.71 %)		 23,070
(1.74 %)
561 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap1.1 2024)
GCA_964204865.1		 n/a 3,512
(0.79 %)		 12,277
(7.12 %)		 n/a 36.05
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 83,928
(2.38 %)		 78,714
(9.97 %)		 2,178,959
(38.34 %)		 5,872
(4.08 %)
562 tunicate T.clinides (primary hap 2023)
GCA_963675345.1		 n/a 3,900
(0.35 %)		 20,903
(5.18 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 200
(100.00 %)		 132,343
(0.70 %)		 116,603
(1.88 %)		 5,956,725
(36.56 %)		 17,996
(2.20 %)
563 tunicate T.democratica (hap1.1 2025)
GCA_965202585.1		 n/a 3,181
(0.26 %)		 8,354
(2.15 %)		 n/a 25.37
(99.99 %)		 412
(0.01 %)		 1,833
(100.00 %)		 408,834
(2.66 %)		 227,187
(6.88 %)		 7,546,269
(60.01 %)		 12,208
(0.89 %)
564 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
565 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
566 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
567 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
568 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1		 44,961
(5.49 %)		 12,817
(1.94 %)		 24,245
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 177
(100.00 %)		 616,746
(11.96 %)		 411,917
(3.57 %)		 6,385,057
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
569 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1		 n/a 2,176
(1.79 %)		 7,719
(4.37 %)		 n/a 49.74
(100.00 %)		 n/a 1,939
(100.00 %)		 136,312
(29.31 %)		 157,341
(15.03 %)		 648,725
(34.67 %)		 15,490
(8.23 %)
570 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
571 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
572 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
573 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1		 n/a 12,775
(2.33 %)		 22,516
(2.50 %)		 n/a 41.49
(99.98 %)		 973
(0.02 %)		 318
(100.00 %)		 518,194
(5.54 %)		 276,294
(2.21 %)		 5,866,033
(21.12 %)		 21,287
(2.50 %)
574 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
575 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3		 n/a 21,010
(1.59 %)		 50,695
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 26
(100.00 %)		 5,456,271
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,225
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
576 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
577 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2		 n/a 19,504
(1.78 %)		 22,272
(1.73 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 1,566
(0.02 %)		 533
(100.00 %)		 3,046,246
(25.06 %)		 753,151
(4.86 %)		 10,596,418
(37.62 %)		 66,785
(2.55 %)
578 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1		 n/a 12,681
(1.84 %)		 21,784
(2.14 %)		 n/a 42.12
(99.13 %)		 218
(0.87 %)		 146
(100.00 %)		 520,200
(9.32 %)		 170,778
(0.83 %)		 6,455,910
(21.44 %)		 24,061
(1.62 %)
579 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2		 83,834
(10.16 %)		 13,005
(2.32 %)		 23,329
(2.48 %)		 72,360
(9.39 %)		 42.16
(99.57 %)		 409
(0.43 %)		 685
(99.57 %)		 536,869
(6.00 %)		 268,230
(2.28 %)		 5,845,184
(20.93 %)		 24,409
(2.60 %)
580 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,982
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
581 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1		 55,558
(6.99 %)		 12,807
(1.82 %)		 23,359
(2.28 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 696
(100.00 %)		 429,643
(4.10 %)		 293,428
(3.59 %)		 6,059,402
(21.89 %)		 29,574
(2.42 %)
582 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1		 n/a 12,487
(1.71 %)		 29,990
(2.73 %)		 n/a 43.26
(100.00 %)		 176
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 427,385
(3.06 %)		 507,421
(10.23 %)		 5,759,740
(27.66 %)		 36,849
(5.10 %)
583 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1		 52,797
(5.74 %)		 13,736
(1.76 %)		 24,846
(2.12 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 585,279
(12.89 %)		 291,297
(6.10 %)		 6,474,102
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
584 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1		 29,618
(3.60 %)		 12,854
(1.79 %)		 23,825
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 658
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 431,531
(3.38 %)		 345,532
(10.59 %)		 5,840,421
(26.59 %)		 29,711
(3.56 %)
585 white-throated sparrow (hap1 2025)
GCA_047830755.1		 n/a 12,983
(1.65 %)		 33,925
(3.13 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 180
(100.00 %)		 449,053
(3.16 %)		 631,898
(8.80 %)		 6,189,242
(27.24 %)		 40,133
(2.67 %)
586 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
587 white-tufted-ear marmoset (240 primary hap 2025)
GCA_049354715.1		 n/a 21,911
(1.84 %)		 21,599
(1.26 %)		 n/a 40.84
(99.99 %)		 3
(0.01 %)		 27
(99.99 %)		 5,159,459
(47.46 %)		 852,115
(5.34 %)		 15,179,157
(39.68 %)		 37,686
(0.94 %)
588 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 refseq)
GCF_011100555.1		 104,419
(4.84 %)		 21,801
(1.88 %)		 21,467
(1.27 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,233
(100.00 %)		 5,036,591
(47.71 %)		 842,846
(3.26 %)		 15,161,534
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
589 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1		 55,408
(5.57 %)		 13,574
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 930
(100.00 %)		 616,300
(10.57 %)		 211,558
(2.90 %)		 6,785,192
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
590 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1		 n/a 12,848
(1.71 %)		 24,293
(2.19 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 773
(0.01 %)		 1,510
(100.00 %)		 688,169
(20.12 %)		 440,901
(9.03 %)		 5,858,667
(26.62 %)		 39,419
(4.07 %)
591 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1		 n/a 15,666
(1.88 %)		 53,049
(5.01 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 620,903
(2.64 %)		 305,809
(5.18 %)		 6,707,330
(33.41 %)		 45,863
(1.88 %)
592 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1		 55,299
(2.52 %)		 19,502
(1.44 %)		 20,297
(1.34 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 813
(100.00 %)		 4,038,893
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,633
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
593 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
594 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1		 n/a 13,169
(1.63 %)		 23,545
(1.98 %)		 n/a 43.42
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 1,679
(100.00 %)		 579,903
(8.32 %)		 295,345
(9.90 %)		 4,361,776
(30.37 %)		 28,647
(1.82 %)
595 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1		 n/a 13,396
(1.62 %)		 25,176
(2.03 %)		 n/a 44.64
(99.99 %)		 500
(0.01 %)		 618
(100.00 %)		 521,539
(5.15 %)		 267,365
(11.68 %)		 5,827,639
(29.76 %)		 44,532
(6.28 %)
596 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
597 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1		 n/a 12,697
(1.89 %)		 25,289
(2.53 %)		 n/a 42.40
(99.62 %)		 242
(0.38 %)		 89
(100.00 %)		 510,633
(7.10 %)		 213,742
(1.12 %)		 6,627,716
(21.17 %)		 28,848
(2.23 %)
598 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
599 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
600 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1		 n/a 18,352
(1.71 %)		 20,233
(1.46 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,530
(100.00 %)		 3,466,695
(41.95 %)		 934,524
(8.81 %)		 11,690,112
(36.30 %)		 35,257
(5.20 %)
601 zebra finch (bTaeGut7 maternal hap 2025)
GCA_048771995.1		 n/a 12,949
(1.86 %)		 26,010
(2.49 %)		 n/a 42.68
(99.97 %)		 9
(0.03 %)		 42
(100.00 %)		 411,962
(3.12 %)		 511,516
(6.75 %)		 5,958,859
(23.49 %)		 35,953
(3.51 %)
602 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2		 49,311
(7.41 %)		 12,747
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 544,577
(9.57 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,748
(20.92 %)		 29,202
(2.47 %)
603 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
604 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
605 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 605

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies