VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of primary assemblies)

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769605.1		 n/a 12,918
(1.90 %)		 17,214
(2.53 %)		 n/a 43.30
(99.29 %)		 204
(0.71 %)		 112
(100.00 %)		 401,836
(5.61 %)		 145,540
(0.78 %)		 6,556,090
(19.22 %)		 40,983
(3.62 %)
2 American flamingo
GCA_009819775.1		 n/a 13,081
(1.79 %)		 22,162
(2.64 %)		 n/a 43.27
(99.31 %)		 280
(0.69 %)		 90
(100.00 %)		 538,001
(7.73 %)		 183,346
(0.79 %)		 7,056,270
(20.92 %)		 51,972
(4.83 %)
3 American shad
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 n/a 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
4 Anna's hummingbird
GCA_003957555.2		 n/a 12,249
(1.95 %)		 14,848
(2.40 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,312
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
5 Asian bonytongue
GCF_900964775.1		 50,328
(9.13 %)		 16,528
(2.72 %)		 76,597
(7.29 %)		 72,696
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 505,816
(2.98 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,514
(10.63 %)
6 Atlantic cod
GCF_902167405.1		 51,655
(11.92 %)		 14,072
(2.62 %)		 70,314
(9.10 %)		 68,853
(9.51 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 804,201
(10.41 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
7 Atlantic halibut (refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 n/a 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
8 Australian echidna
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
9 banded archerfish
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 n/a 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
10 barn swallow
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
11 blackcap
GCA_009819655.1		 n/a 12,367
(1.92 %)		 17,080
(2.58 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,239
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,837
(2.32 %)
12 blue whale
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 n/a 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
13 blunt-snouted clingfish
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 14,502
(1.97 %)		 51,211
(5.47 %)		 60,993
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 739,980
(4.26 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
14 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
15 brown argus butterfly
GCF_905147365.1		 23,611
(6.61 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,265
(6.80 %)		 n/a 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 264,358
(2.90 %)		 144,234
(3.35 %)		 2,650,845
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
16 California sea lion
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 n/a 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
17 Canada lynx
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
18 carmine bee-eater
GCA_009819595.1		 n/a 12,724
(1.82 %)		 20,356
(2.83 %)		 n/a 42.88
(99.47 %)		 269
(0.53 %)		 109
(100.00 %)		 556,923
(7.87 %)		 213,180
(1.09 %)		 6,641,077
(21.58 %)		 30,884
(2.47 %)
19 channel bull blenny
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,477
(3.02 %)		 42,362
(6.73 %)		 60,811
(10.44 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 427,781
(5.47 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
20 climbing perch
GCF_900324465.2		 42,759
(13.53 %)		 15,243
(3.53 %)		 22,714
(7.45 %)		 64,006
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 325,346
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
21 common brushtail
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
22 common tern
GCA_009819605.1		 n/a 13,094
(1.80 %)		 17,911
(2.48 %)		 n/a 43.03
(99.16 %)		 205
(0.84 %)		 123
(100.00 %)		 570,309
(7.91 %)		 216,895
(1.04 %)		 7,043,151
(20.98 %)		 45,683
(3.53 %)
23 common yellowthroat
GCA_009764595.1		 n/a 11,736
(1.82 %)		 16,696
(2.52 %)		 n/a 42.01
(98.73 %)		 1,479
(1.27 %)		 278
(100.00 %)		 476,046
(6.38 %)		 367,108
(3.16 %)		 6,576,957
(20.43 %)		 25,004
(2.02 %)
24 common toad
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 n/a 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
25 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 n/a 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
26 denticle herring
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 16,567
(3.77 %)		 58,823
(8.66 %)		 72,751
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 408,046
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
27 East African grey crowned-crane
GCA_011004875.1		 n/a 13,263
(1.84 %)		 20,787
(2.66 %)		 n/a 42.38
(99.61 %)		 144
(0.39 %)		 105
(100.00 %)		 548,859
(7.06 %)		 187,966
(0.97 %)		 7,004,597
(21.19 %)		 36,610
(3.33 %)
28 eastern happy
GCF_900246225.1		 57,628
(9.59 %)		 15,359
(2.22 %)		 52,466
(6.26 %)		 42,580
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 960,962
(21.85 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
29 Egyptian rousette
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
30 electric eel
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 n/a 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
31 ermine
GCF_009829155.1		 74,345
(3.19 %)		 18,862
(1.65 %)		 21,246
(1.48 %)		 n/a 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,560,766
(40.92 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,063
(2.27 %)
32 Eurasian red squirrel
GCA_902686455.1		 n/a 21,292
(1.58 %)		 21,930
(1.42 %)		 36,836
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,961
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
33 Eurasian water vole (2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
34 European common frog
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 n/a 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
35 European eel
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
36 European starfish
GCF_902459465.1		 26,326
(11.67 %)		 4,143
(0.84 %)		 21,071
(8.48 %)		 n/a 38.76
(99.96 %)		 471
(0.04 %)		 150
(100.00 %)		 132,287
(1.42 %)		 159,226
(7.04 %)		 2,504,013
(37.40 %)		 15,392
(1.50 %)
37 European turtle dove
GCA_901699155.1		 n/a 12,398
(1.76 %)		 18,558
(2.54 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,734
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,725
(2.57 %)
38 flier cichlid
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,440
(2.15 %)		 51,452
(5.98 %)		 n/a 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,049,840
(17.13 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
39 Gabon caecilian
GCF_902459505.1		 54,726
(1.72 %)		 14,266
(0.51 %)		 30,710
(1.49 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,315,377
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
40 gilthead seabream
GCF_900880675.1		 59,040
(10.97 %)		 15,415
(2.36 %)		 56,395
(6.58 %)		 73,317
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 533,781
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
41 golden eagle (2021)
GCF_900496995.4		 60,920
(5.98 %)		 13,334
(1.84 %)		 23,261
(2.12 %)		 n/a 42.16
(99.58 %)		 228
(0.42 %)		 144
(100.00 %)		 544,341
(5.93 %)		 186,461
(0.80 %)		 7,090,610
(20.01 %)		 38,495
(3.10 %)
42 Goodes thornscrub tortoise
GCF_007399415.2		 57,455
(51.33 %)		 14,859
(1.00 %)		 79,415
(2.33 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,699,240
(13.65 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
43 great scallop
GCF_902652985.1		 46,811
(9.29 %)		 4,090
(0.36 %)		 32,743
(7.09 %)		 n/a 36.65
(99.92 %)		 1,827
(0.08 %)		 3,983
(100.00 %)		 281,310
(1.71 %)		 706,978
(26.84 %)		 5,249,556
(32.64 %)		 13,101
(0.87 %)
44 great white shark
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
45 greater horseshoe bat
GCA_004115265.2		 n/a 18,651
(1.96 %)		 20,392
(1.68 %)		 36,525
(2.28 %)		 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,017
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
46 greater pipefish
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
47 greater mouse-eared bat
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
48 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
49 gyrfalcon
GCF_015220075.1		 47,961
(5.90 %)		 13,016
(1.82 %)		 21,266
(2.02 %)		 n/a 42.20
(99.55 %)		 635
(0.45 %)		 133
(100.00 %)		 484,104
(5.60 %)		 186,430
(0.85 %)		 7,162,723
(18.83 %)		 24,760
(2.03 %)
50 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
51 hybrid cattle
GCA_003369685.2		 n/a 19,100
(1.59 %)		 21,093
(1.37 %)		 52,201
(2.64 %)		 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,419
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
52 hybrid cattle
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,602
(1.56 %)		 21,960
(1.36 %)		 54,700
(2.65 %)		 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,458,622
(47.18 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
53 Indian glassy fish
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 15,354
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 60,337
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 349,914
(3.01 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 17,929
(1.44 %)
54 Indo-Pacific tarpon
GCF_013368585.1		 41,583
(6.91 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
55 jewelled blenny
GCF_902148845.1		 42,890
(8.61 %)		 15,200
(2.40 %)		 86,752
(9.03 %)		 58,518
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 671,028
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,462
(9.27 %)
56 Kakapo
GCF_004027225.2		 49,757
(5.76 %)		 13,102
(1.92 %)		 17,781
(2.51 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 89
(100.00 %)		 517,233
(7.76 %)		 208,178
(1.08 %)		 6,258,087
(20.50 %)		 22,279
(1.79 %)
57 Korean giant-fin mudskipper (refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
58 Kuhl's pipistrelle
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
59 lance-tailed manakin
GCF_009829145.1		 46,366
(5.56 %)		 12,580
(1.91 %)		 16,669
(2.52 %)		 n/a 41.97
(99.70 %)		 206
(0.30 %)		 93
(100.00 %)		 494,225
(7.09 %)		 247,189
(1.64 %)		 6,498,294
(20.04 %)		 25,376
(1.95 %)
60 leatherback sea turtle (v3 2020)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
61 lesser kestrel
GCF_017639655.2		 47,420
(5.64 %)		 13,098
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,499
(5.58 %)		 210,234
(1.26 %)		 7,133,934
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
62 live sharksucker
GCF_900963305.1		 40,268
(11.91 %)		 14,989
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 56,376
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 449,887
(3.55 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
63 lumpfish (refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,794
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
64 mallard
GCF_015476345.1		 59,854
(7.33 %)		 12,988
(1.87 %)		 23,709
(2.20 %)		 n/a 42.27
(99.64 %)		 905
(0.36 %)		 756
(100.00 %)		 803,558
(8.04 %)		 417,575
(5.02 %)		 6,627,843
(24.59 %)		 35,030
(3.06 %)
65 milkfish
GCF_902362185.1		 30,825
(7.61 %)		 16,880
(3.41 %)		 42,123
(6.75 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 969,140
(8.12 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
66 mute swan (v2 2021)
GCF_009769625.2		 59,524
(6.76 %)		 12,983
(1.98 %)		 22,400
(2.22 %)		 n/a 41.92
(99.13 %)		 451
(0.87 %)		 171
(100.00 %)		 700,051
(7.55 %)		 301,579
(1.34 %)		 6,791,838
(21.30 %)		 31,278
(3.07 %)
67 New Caledonian crow
GCF_009650955.1		 50,821
(6.95 %)		 12,735
(1.93 %)		 17,289
(2.60 %)		 n/a 42.57
(97.41 %)		 289
(2.59 %)		 105
(100.00 %)		 460,676
(6.16 %)		 231,546
(1.70 %)		 6,265,995
(19.54 %)		 31,907
(2.46 %)
68 New Zealand spotty (refseq)
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 n/a 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
69 northern pike
GCF_011004845.1		 63,733
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 n/a 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
70 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 n/a 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
71 orbiculate cardinalfish
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,772
(1.50 %)		 52,078
(3.82 %)		 60,005
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,270,059
(5.42 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
72 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 n/a 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
73 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
74 pinecone soldierfish
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,756
(2.42 %)		 53,616
(6.20 %)		 57,173
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,066,671
(5.88 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
75 platypus (v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
76 prehistoric monster fish
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 n/a 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
77 razorbill
GCA_008658365.1		 n/a 12,776
(1.83 %)		 16,521
(2.42 %)		 n/a 42.67
(99.70 %)		 227
(0.30 %)		 95
(100.00 %)		 543,514
(7.16 %)		 212,546
(1.12 %)		 6,930,708
(20.10 %)		 38,955
(2.90 %)
78 red-bellied piranha
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 n/a 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
79 red-crested turaco
GCA_009769465.1		 n/a 12,726
(1.75 %)		 21,173
(2.64 %)		 n/a 42.60
(97.89 %)		 344
(2.11 %)		 140
(100.00 %)		 551,882
(8.95 %)		 176,530
(0.80 %)		 6,805,042
(22.19 %)		 43,046
(3.29 %)
80 red-legged seriema
GCA_009819825.1		 n/a 13,220
(1.83 %)		 19,960
(2.64 %)		 n/a 42.20
(99.59 %)		 194
(0.41 %)		 110
(100.00 %)		 483,781
(6.50 %)		 160,481
(0.73 %)		 6,960,060
(19.71 %)		 32,894
(2.67 %)
81 reedfish
GCF_900747795.1		 40,558
(43.70 %)		 13,160
(0.46 %)		 48,082
(1.04 %)		 34,872
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,852,335
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
82 river trout
GCF_901001165.1		 102,785
(6.02 %)		 27,433
(1.62 %)		 110,789
(4.44 %)		 122,381
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,488,597
(5.68 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
83 sand lizard
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,356
(1.48 %)		 19,592
(2.50 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 1,019,541
(5.39 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
84 sea lamprey
GCF_010993605.1		 41,254
(6.50 %)		 7,662
(0.70 %)		 36,337
(4.06 %)		 n/a 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 2,075,622
(39.58 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,447
(30.55 %)
85 Siamese fighting fish (2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 n/a 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
86 smalltooth sawfish
GCA_009764475.1		 n/a 11,845
(0.66 %)		 19,597
(1.63 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,018
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
87 southern grasshopper mouse
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
88 southern two-toed sloth
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 n/a 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
89 specked wood butterfly
GCF_905163445.1		 21,720
(6.53 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,001
(4.33 %)		 n/a 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 304,062
(2.97 %)		 110,824
(4.09 %)		 3,704,161
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
90 Swainson's thrush
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,005
(1.87 %)		 18,005
(2.60 %)		 30,197
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 493,073
(5.80 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
91 thorny skate (v2 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
92 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,346
(53.62 %)		 14,572
(0.43 %)		 88,603
(1.29 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,847,289
(1.60 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
93 torafugu
GCF_901000725.2		 53,492
(18.31 %)		 14,548
(4.79 %)		 51,180
(11.72 %)		 55,740
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 290,056
(10.32 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,973
(9.53 %)
94 tufted duck
GCF_009819795.1		 29,505
(4.02 %)		 12,959
(1.97 %)		 16,252
(2.50 %)		 n/a 41.66
(99.16 %)		 163
(0.84 %)		 105
(100.00 %)		 836,786
(8.36 %)		 411,356
(1.71 %)		 6,691,445
(22.36 %)		 29,883
(2.48 %)
95 two-lined caecilian
GCF_901001135.1		 56,630
(53.09 %)		 14,452
(0.38 %)		 180,328
(2.13 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,273,617
(1.93 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
96 vaquita
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,607
(1.76 %)		 20,488
(1.43 %)		 35,398
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,010,529
(43.76 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
97 yellowfin seabream
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
98 Western terrestrial garter snake
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,072
(1.13 %)		 19,161
(1.98 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,326,233
(7.79 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
99 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769525.1		 n/a 12,693
(1.89 %)		 18,187
(2.69 %)		 n/a 42.40
(99.62 %)		 242
(0.38 %)		 89
(100.00 %)		 510,630
(7.10 %)		 213,742
(1.12 %)		 6,627,716
(21.17 %)		 28,846
(2.19 %)
100 zebra finch (refseq 2021 Blue55 female)
GCF_003957565.2		 49,311
(7.41 %)		 12,747
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 544,577
(9.57 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,748
(20.92 %)		 29,202
(2.47 %)
101 zig-zag eel
GCF_900324485.2		 45,001
(12.01 %)		 15,052
(3.35 %)		 21,643
(6.89 %)		 60,604
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 349,298
(2.86 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 101

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies