VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,787
(3.82 %)
2 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1
n/a 12,344
(1.22 %)
17,320
(1.89 %)
n/a 41.00
(99.99 %)
908
(0.01 %)
1,256
(99.99 %)
3,221,370
(48.42 %)
681,209
(5.18 %)
6,734,253
(44.26 %)
99,366
(4.44 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1
n/a 2,101
(1.18 %)
5,350
(2.76 %)
n/a 43.70
(99.99 %)
3
(0.00 %)
4,811
(100.00 %)
103,373
(4.27 %)
58,480
(3.90 %)
895,535
(27.44 %)
10,399
(2.84 %)
4 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
49,122
(2.32 %)
5 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
49,261
(10.50 %)
6 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
68,531
(1.61 %)
7 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
76,453
(2.43 %)
8 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
50,852
(2.67 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,895
(5.89 %)
10 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
64,307
(2.75 %)
11 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
54,919
(1.33 %)
12 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
40,218
(2.14 %)
13 amphioxus (hap1 2024)
GCA_035149815.1
n/a 5,253
(0.98 %)
41,226
(12.64 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
81
(0.00 %)
65
(100.00 %)
126,311
(1.61 %)
178,951
(7.87 %)
2,137,821
(27.19 %)
44,152
(5.26 %)
14 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
15 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
92,057
(3.50 %)
16 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
52,135
(1.67 %)
17 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
24,867
(2.06 %)
18 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,546
(10.82 %)
19 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
50,264
(1.15 %)
20 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
37,174
(1.87 %)
21 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
22 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1
46,374
(1.72 %)
7,719
(0.19 %)
59,788
(2.68 %)
n/a 44.23
(99.94 %)
4,876
(0.06 %)
4,270
(100.00 %)
2,094,143
(3.54 %)
3,212,025
(29.83 %)
8,998,320
(75.15 %)
408,391
(12.65 %)
23 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
24 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
56,416
(3.08 %)
25 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1
n/a 11,960
(0.40 %)
25,618
(1.25 %)
n/a 42.94
(99.99 %)
1,633
(0.01 %)
1,412
(100.00 %)
7,453,535
(49.31 %)
686,063
(13.00 %)
19,985,605
(50.32 %)
86,138
(2.16 %)
26 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
74,348
(3.46 %)
27 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
70,515
(2.88 %)
28 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
2,388,998
(5.24 %)
29 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
13,787
(0.93 %)
30 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
93,198
(3.82 %)
31 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
58,008
(2.90 %)
32 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
30,305
(2.79 %)
33 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1
n/a 13,515
(0.42 %)
21,374
(1.06 %)
n/a 44.47
(99.99 %)
2,740
(0.01 %)
6,569
(99.99 %)
6,483,403
(66.87 %)
1,041,828
(9.99 %)
21,142,745
(50.24 %)
107,555
(1.88 %)
34 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
63,688
(2.22 %)
35 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
20,873
(2.13 %)
36 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
19,590
(2.16 %)
37 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
46,774
(0.90 %)
38 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
39 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
35,457
(2.90 %)
40 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
42,444
(3.62 %)
41 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
42,776
(4.88 %)
42 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
53,503
(4.48 %)
43 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
44 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
41,889
(2.32 %)
45 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
62,389
(1.68 %)
46 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
55,436
(1.85 %)
47 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
26,750
(2.02 %)
48 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
49 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
15,524
(1.02 %)
50 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
27,035
(4.16 %)
51 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
19,851
(1.40 %)
52 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2
n/a 19,761
(1.78 %)
20,268
(1.16 %)
n/a 40.95
(99.70 %)
10
(0.30 %)
33
(100.00 %)
5,201,908
(53.67 %)
980,696
(9.42 %)
15,105,351
(41.63 %)
41,454
(1.11 %)
53 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
31,102
(1.31 %)
54 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
26,416
(1.35 %)
55 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
60,067
(1.55 %)
56 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
43,764
(2.79 %)
57 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
71,016
(3.36 %)
58 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
33,981
(4.60 %)
59 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1
n/a 12,479
(1.04 %)
16,886
(1.81 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
172
(0.00 %)
41
(100.00 %)
1,249,920
(6.94 %)
941,401
(5.42 %)
8,402,482
(44.77 %)
37,299
(1.02 %)
60 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1
n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
61 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
15,255
(1.12 %)
62 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
44,467
(1.57 %)
63 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
39,099
(2.44 %)
64 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
113,936
(1.69 %)
65 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1
n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
66 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
67 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
30,593
(1.99 %)
68 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
21,151
(2.71 %)
69 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
25,664
(2.75 %)
70 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
27,781
(2.90 %)
71 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
72 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
19,653
(2.66 %)
73 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
24,413
(2.63 %)
74 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2
n/a 19,981
(1.80 %)
20,886
(1.18 %)
n/a 40.63
(99.83 %)
5
(0.17 %)
23
(100.00 %)
5,080,229
(48.83 %)
937,411
(11.36 %)
14,905,102
(42.22 %)
46,330
(1.11 %)
75 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
48,960
(1.19 %)
76 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
14,774
(0.81 %)
77 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
78 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
56,375
(2.45 %)
79 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1
n/a 13,999
(1.21 %)
18,145
(2.02 %)
n/a 44.85
(100.00 %)
286
(0.00 %)
827
(100.00 %)
844,126
(6.57 %)
462,086
(2.56 %)
8,237,807
(37.72 %)
30,098
(0.96 %)
80 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
81 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
82 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
49,141
(4.61 %)
83 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
24,010
(1.80 %)
84 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1
n/a 13,073
(0.44 %)
43,036
(1.95 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
14
(0.00 %)
12,033
(100.00 %)
1,489,788
(2.18 %)
2,621,157
(9.04 %)
17,154,926
(55.44 %)
581,115
(7.68 %)
85 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
26,285
(2.20 %)
86 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
25,210
(3.70 %)
87 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
50,430
(2.54 %)
88 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
30,917
(2.80 %)
89 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
26,979
(2.08 %)
90 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
18,864
(1.75 %)
91 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,352
(3.95 %)
92 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1
n/a 12,074
(0.39 %)
46,329
(1.82 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
156
(0.01 %)
24,351
(99.99 %)
1,186,360
(1.65 %)
2,279,941
(13.33 %)
14,665,548
(61.48 %)
405,097
(4.49 %)
93 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1
n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
61,931
(2.30 %)
94 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.2
n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
61,125
(2.28 %)
95 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1
n/a 13,838
(1.39 %)
19,262
(2.35 %)
n/a 44.17
(99.99 %)
734
(0.01 %)
825
(99.99 %)
815,808
(4.07 %)
494,366
(4.53 %)
6,739,651
(37.84 %)
113,458
(3.63 %)
96 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
94,019
(3.82 %)
97 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
98 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
181,626
(10.52 %)
99 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
27,693
(1.89 %)
100 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1
n/a 14,955
(0.23 %)
n/a n/a 45.61
(99.80 %)
2,431
(0.20 %)
5,958
(99.80 %)
20,007,151
(76.28 %)
5,951,819
(19.40 %)
5,958
(99.80 %)
991,009
(4.86 %)
101 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
41,821
(4.50 %)
102 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1
n/a 13,192
(1.36 %)
19,293
(2.32 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 1,936
(100.00 %)
808,341
(4.31 %)
467,532
(2.91 %)
6,418,809
(38.02 %)
107,080
(3.15 %)
103 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
10,612
(4.11 %)
104 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
45,694
(7.05 %)
105 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
17,129
(1.04 %)
106 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
38,398
(5.49 %)
107 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
62,910
(2.66 %)
108 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
109 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1
n/a 15,081
(1.08 %)
19,115
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.98 %)
127
(0.02 %)
59
(100.00 %)
4,093,707
(46.36 %)
404,046
(1.70 %)
11,113,266
(33.78 %)
111,129
(2.68 %)
110 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
39,164
(4.55 %)
111 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
30,055
(1.31 %)
112 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
24,105
(1.81 %)
113 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
29,828
(0.79 %)
114 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,323
(3.81 %)
115 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1
n/a 13,632
(0.43 %)
35,630
(1.52 %)
n/a 46.77
(99.99 %)
1,773
(0.01 %)
590
(100.00 %)
1,759,193
(1.98 %)
2,013,186
(16.21 %)
16,138,898
(60.55 %)
614,432
(5.85 %)
116 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
35,597
(4.37 %)
117 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
48,081
(7.49 %)
118 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1
n/a 12,650
(0.38 %)
20,614
(1.06 %)
n/a 42.75
(97.99 %)
3,552
(2.01 %)
4,000
(100.00 %)
9,489,793
(70.34 %)
976,827
(6.97 %)
21,183,330
(44.32 %)
42,917
(1.08 %)
119 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,139
(2.25 %)
120 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
121 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
122 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
35,630
(3.58 %)
123 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
35,759
(3.26 %)
124 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
57,737
(4.15 %)
125 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
21,942
(1.89 %)
126 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
127 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
27,057
(1.96 %)
128 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
14,146
(0.57 %)
129 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
50,909
(3.45 %)
130 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
36,828
(3.13 %)
131 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1
n/a 14,220
(1.16 %)
21,979
(2.19 %)
n/a 44.64
(99.68 %)
177
(0.32 %)
381
(100.00 %)
1,169,660
(6.57 %)
432,998
(2.45 %)
8,403,791
(39.55 %)
82,695
(2.80 %)
132 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
47,810
(2.50 %)
133 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
46,213
(3.27 %)
134 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
40,094
(3.66 %)
135 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1
n/a 14,971
(1.00 %)
20,099
(1.61 %)
n/a 44.79
(99.77 %)
130
(0.23 %)
156
(100.00 %)
1,536,611
(12.44 %)
471,903
(2.16 %)
11,129,943
(35.50 %)
138,047
(2.94 %)
136 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
22,977
(2.32 %)
137 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
32,162
(3.60 %)
138 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
77,009
(2.86 %)
139 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
17,629
(0.60 %)
140 European starfish (alternate hap 2019)
GCA_902459445.1
n/a 3,860
(0.82 %)
23,866
(8.36 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,969
(100.00 %)
123,986
(1.40 %)
146,247
(6.44 %)
2,404,792
(37.16 %)
14,304
(1.48 %)
141 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
29,692
(2.35 %)
142 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
20,865
(0.55 %)
143 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
37,413
(3.59 %)
144 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
75,215
(4.36 %)
145 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1
n/a 13,804
(1.42 %)
19,450
(2.39 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
795
(0.01 %)
937
(99.99 %)
782,998
(3.95 %)
448,089
(3.61 %)
6,735,032
(36.83 %)
81,312
(2.54 %)
146 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1
n/a 2,936
(0.15 %)
17,722
(1.38 %)
n/a 38.51
(100.00 %)
n/a 13,751
(100.00 %)
919,882
(3.50 %)
1,443,294
(10.50 %)
7,705,012
(57.28 %)
74,669
(1.25 %)
147 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1
n/a 14,224
(0.69 %)
22,406
(1.57 %)
n/a 40.75
(99.89 %)
1,383
(0.12 %)
914
(100.00 %)
1,300,452
(3.37 %)
1,495,355
(10.56 %)
13,385,401
(44.67 %)
64,121
(0.88 %)
148 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
149 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1
n/a 14,392
(0.90 %)
17,909
(1.50 %)
n/a 42.86
(99.84 %)
213
(0.16 %)
836
(99.84 %)
1,440,070
(7.19 %)
620,131
(2.54 %)
10,919,950
(45.21 %)
47,933
(1.03 %)
150 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
28,827
(2.28 %)
151 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1
n/a 12,821
(0.47 %)
30,612
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,595
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
235,170
(4.50 %)
152 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
26,594
(2.34 %)
153 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1
n/a 14,254
(0.94 %)
23,016
(2.00 %)
n/a 45.13
(99.95 %)
61
(0.05 %)
298
(100.00 %)
1,230,357
(13.08 %)
350,230
(2.85 %)
11,854,314
(33.03 %)
39,919
(1.95 %)
154 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1
n/a 12,198
(0.42 %)
23,127
(1.17 %)
n/a 42.85
(98.49 %)
1,742
(1.51 %)
1,558
(100.00 %)
7,431,472
(52.41 %)
716,951
(7.28 %)
19,456,793
(50.99 %)
91,414
(1.45 %)
155 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
156 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
27,767
(3.57 %)
157 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1
n/a 13,359
(0.95 %)
19,347
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,513
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
61,680
(2.32 %)
158 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1
n/a 13,758
(1.02 %)
16,909
(1.62 %)
n/a 41.53
(99.01 %)
19
(0.99 %)
52
(99.01 %)
1,069,189
(6.12 %)
410,262
(1.25 %)
11,390,195
(32.28 %)
60,835
(1.92 %)
159 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
24,879
(0.67 %)
160 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
38,976
(1.13 %)
161 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
32,293
(2.35 %)
162 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
63,610
(2.71 %)
163 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
29,548
(2.77 %)
164 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1
n/a 20
(0.30 %)
63
(2.06 %)
n/a 45.02
(99.98 %)
28
(0.02 %)
39
(100.00 %)
8,165
(60.43 %)
2,740
(27.09 %)
15,863
(31.63 %)
167
(5.51 %)
165 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
20,794
(2.09 %)
166 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
167 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,104
(12.82 %)
168 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
47,904
(17.47 %)
169 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
47,523
(15.60 %)
170 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
35,298
(1.94 %)
171 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2
n/a 13,635
(1.05 %)
19,414
(1.61 %)
n/a 44.16
(99.95 %)
60
(0.05 %)
6,797
(99.95 %)
3,221,668
(44.97 %)
275,275
(1.28 %)
9,802,895
(32.14 %)
45,469
(1.48 %)
172 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
73,507
(1.72 %)
173 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
90,235
(5.58 %)
174 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
11,838
(2.15 %)
175 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
58,446
(5.44 %)
176 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
23,288
(3.74 %)
177 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
36,143
(1.96 %)
178 hemichordates Saccoglossus (HW-2024a hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
20,511
(4.03 %)
179 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
48,164
(1.90 %)
180 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
53,781
(5.77 %)
181 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
34,408
(1.75 %)
182 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1
n/a 15,006
(0.28 %)
22,481
(0.80 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
2,781
(0.47 %)
2,532
(99.97 %)
1,344,546
(5.76 %)
2,364,825
(28.34 %)
5,088
(99.53 %)
89,340
(2.10 %)
183 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
37,293
(2.80 %)
184 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1
n/a 14,359
(0.89 %)
32,575
(2.67 %)
n/a 43.88
(95.18 %)
788
(4.82 %)
3,358
(95.18 %)
922,807
(2.38 %)
1,744,603
(15.45 %)
10,318,168
(48.47 %)
244,270
(5.02 %)
185 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
28,740
(2.98 %)
186 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
506
(0.31 %)
187 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
33,424
(2.42 %)
188 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
50,826
(1.08 %)
189 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
49,325
(1.10 %)
190 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
27,953
(3.83 %)
191 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
192 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
193 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1
n/a 17,858
(2.43 %)
32,738
(5.46 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,333
(100.00 %)
583,632
(3.71 %)
418,411
(3.74 %)
5,198,155
(21.50 %)
76,879
(3.71 %)
194 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1
n/a 13,696
(1.37 %)
19,278
(2.32 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
690
(0.01 %)
842
(99.99 %)
763,893
(4.21 %)
451,861
(6.69 %)
6,696,380
(38.71 %)
98,815
(3.65 %)
195 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1
n/a 14,833
(0.26 %)
30,853
(0.75 %)
n/a 47.12
(99.98 %)
5,953
(0.02 %)
5,626
(100.00 %)
1,238,549
(4.06 %)
2,718,867
(21.85 %)
11,579
(99.98 %)
518,286
(6.88 %)
196 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
197 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
129,990
(12.07 %)
198 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
32,592
(5.25 %)
199 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
200 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
57,347
(3.41 %)
201 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
86,907
(3.76 %)
202 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
203 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
24,909
(2.64 %)
204 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
205 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
31,611
(2.72 %)
206 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
88,759
(6.30 %)
207 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
9,678
(1.02 %)
208 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1
n/a 13,155
(1.15 %)
22,239
(2.06 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
1
(0.00 %)
6,800
(100.00 %)
1,155,093
(7.75 %)
707,777
(4.25 %)
7,071,611
(44.00 %)
104,556
(4.39 %)
209 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2
n/a 11,035
(1.05 %)
16,064
(1.50 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
7
(0.00 %)
9,006
(100.00 %)
2,685,200
(47.08 %)
208,060
(1.19 %)
7,184,246
(33.31 %)
25,133
(1.42 %)
210 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
211 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
36,176
(1.80 %)
212 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
213 lesser noctule (mNycLei1.hap2.1 2024)
GCA_964264895.1
n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
61,834
(2.95 %)
214 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
34,698
(5.69 %)
215 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
157,768
(4.38 %)
216 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
31,814
(1.79 %)
217 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
49,248
(4.19 %)
218 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
219 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1
n/a 13,653
(1.34 %)
19,764
(2.32 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
817
(0.01 %)
1,444
(99.99 %)
857,503
(4.68 %)
507,819
(4.16 %)
6,632,822
(39.41 %)
103,858
(4.10 %)
220 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1
n/a 13,817
(1.35 %)
21,024
(2.50 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
811
(0.01 %)
1,458
(99.99 %)
890,080
(4.42 %)
526,749
(3.38 %)
7,001,691
(37.94 %)
89,526
(2.96 %)
221 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1
n/a 13,759
(1.39 %)
19,452
(2.34 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
754
(0.01 %)
954
(99.99 %)
768,595
(5.31 %)
448,816
(5.54 %)
6,722,284
(37.88 %)
82,575
(2.83 %)
222 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2
n/a 13,828
(1.41 %)
19,048
(2.34 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,365
(0.02 %)
1,548
(99.98 %)
803,451
(4.16 %)
440,340
(2.30 %)
6,774,254
(37.14 %)
89,229
(3.04 %)
223 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
15,809
(1.43 %)
224 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
55,747
(4.41 %)
225 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
226 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
55,066
(5.20 %)
227 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
42,560
(7.71 %)
228 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
27,330
(3.35 %)
229 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
35,679
(3.13 %)
230 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
56,507
(2.83 %)
231 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
12,908
(3.26 %)
232 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
16,659
(1.74 %)
233 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1
n/a 10,549
(1.13 %)
20,171
(2.08 %)
n/a 41.02
(100.00 %)
12
(0.00 %)
9,587
(100.00 %)
889,533
(7.84 %)
565,831
(6.37 %)
5,968,624
(41.74 %)
73,632
(3.80 %)
234 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
22,186
(0.75 %)
235 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
65,597
(4.38 %)
236 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1
n/a 13,824
(0.44 %)
23,296
(1.27 %)
n/a 41.86
(99.99 %)
2,009
(0.01 %)
656
(100.00 %)
1,860,053
(2.17 %)
2,751,941
(10.76 %)
24,252,866
(53.00 %)
157,012
(1.21 %)
237 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1
n/a 15,425
(0.94 %)
20,005
(1.48 %)
n/a 44.46
(95.51 %)
1,790
(4.49 %)
4,782
(95.51 %)
1,404,726
(11.28 %)
453,302
(2.47 %)
11,996,092
(34.08 %)
77,167
(2.14 %)
238 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
239 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
69,852
(1.62 %)
240 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
13,856
(0.35 %)
241 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
25,667
(3.86 %)
242 Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
61,024
(2.68 %)
243 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
29,485
(4.55 %)
244 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,107
(2.52 %)
245 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
246 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
37,728
(3.88 %)
247 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
131,852
(2.78 %)
248 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
130,245
(2.79 %)
249 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
59,674
(9.19 %)
250 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
40,925
(1.35 %)
251 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
85,881
(1.90 %)
252 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
93,862
(1.92 %)
253 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
54,278
(9.43 %)
254 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
76,164
(3.52 %)
255 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
92,041
(3.01 %)
256 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
62,007
(1.94 %)
257 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
34,879
(3.83 %)
258 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
35,691
(4.26 %)
259 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
260 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
261 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1
n/a 13,421
(1.31 %)
17,659
(2.08 %)
n/a 40.15
(99.66 %)
93
(0.34 %)
158
(99.66 %)
733,358
(2.95 %)
403,552
(3.04 %)
7,746,871
(29.97 %)
34,363
(2.08 %)
262 orange-tipped seq squirt (alternate hap 2023)
GCA_963082865.1
n/a 167
(2.38 %)
431
(15.83 %)
n/a 36.74
(100.00 %)
n/a 70
(100.00 %)
885
(7.97 %)
855
(38.55 %)
9,941
(42.25 %)
24
(10.92 %)
263 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
264 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1
n/a 7,223
(0.52 %)
11,927
(1.11 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
76
(0.00 %)
4,081
(100.00 %)
988,792
(3.99 %)
1,766,202
(10.24 %)
9,974,001
(52.99 %)
64,462
(1.33 %)
265 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
67,718
(4.23 %)
266 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1
n/a 13,365
(1.26 %)
17,388
(1.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
99
(0.00 %)
279
(100.00 %)
726,428
(2.81 %)
331,756
(2.05 %)
7,184,711
(33.57 %)
51,973
(2.70 %)
267 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
64,543
(3.14 %)
268 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
49,469
(4.32 %)
269 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
26,313
(2.41 %)
270 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1
n/a 21,977
(1.55 %)
31,925
(2.52 %)
n/a 39.40
(99.99 %)
1,072
(0.01 %)
1,183
(100.00 %)
825,817
(1.86 %)
1,047,172
(7.89 %)
12,996,911
(44.48 %)
99,118
(1.26 %)
271 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
40,162
(1.31 %)
272 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1
n/a 19,859
(1.78 %)
20,597
(1.19 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
232
(0.00 %)
233
(100.00 %)
5,125,011
(53.00 %)
956,928
(9.12 %)
14,621,759
(41.68 %)
96,199
(1.55 %)
273 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
274 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
28,391
(3.74 %)
275 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2
n/a 10,906
(1.98 %)
19,820
(4.33 %)
n/a 40.04
(100.00 %)
n/a 1,516
(100.00 %)
390,896
(3.25 %)
482,493
(7.83 %)
4,361,670
(34.36 %)
52,508
(3.70 %)
276 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,538
(8.24 %)
277 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
30,478
(4.03 %)
278 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
78,151
(7.95 %)
279 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
280 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
50,527
(1.37 %)
281 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1
n/a 13,892
(0.57 %)
32,011
(1.64 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
685
(0.00 %)
843
(100.00 %)
1,042,636
(2.00 %)
1,430,690
(16.22 %)
14,621,029
(53.91 %)
503,166
(8.84 %)
282 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2
n/a 20,282
(1.77 %)
21,509
(1.17 %)
n/a 40.46
(99.84 %)
7
(0.16 %)
38
(100.00 %)
5,163,745
(50.07 %)
970,057
(12.58 %)
15,047,429
(42.91 %)
47,029
(1.08 %)
283 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
106,168
(2.78 %)
284 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,926
(2.91 %)
285 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
128,858
(2.07 %)
286 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
51,373
(2.26 %)
287 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
7,525
(1.31 %)
288 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
48,825
(5.37 %)
289 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,766
(3.41 %)
290 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
23,381
(1.81 %)
291 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,293
(2.86 %)
292 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
39,810
(3.37 %)
293 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
38,306
(3.37 %)
294 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3
n/a 11,382
(0.41 %)
28,399
(1.33 %)
n/a 39.39
(99.99 %)
17
(0.01 %)
17,099
(99.99 %)
6,708,926
(37.23 %)
883,916
(2.81 %)
16,745,782
(46.94 %)
74,951
(1.15 %)
295 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
74,971
(1.64 %)
296 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
297 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
15,730
(1.88 %)
298 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1
n/a 26,401
(0.36 %)
90,909
(1.63 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
19
(0.00 %)
14,096
(100.00 %)
4,036,529
(2.70 %)
6,299,339
(18.78 %)
14,096
(100.00 %)
1,426,030
(6.65 %)
299 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
50,614
(1.83 %)
300 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
60,229
(3.53 %)
301 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
36,810
(2.68 %)
302 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
303 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
304 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
19,210
(2.23 %)
305 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
46,071
(2.57 %)
306 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1
n/a 13,845
(0.96 %)
23,108
(1.86 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 1,128
(100.00 %)
2,008,682
(10.16 %)
1,718,408
(7.36 %)
9,467,451
(52.99 %)
140,557
(4.65 %)
307 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1
n/a 12,606
(0.83 %)
22,421
(1.62 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 3,543
(100.00 %)
2,080,172
(11.19 %)
1,814,619
(9.22 %)
8,889,119
(57.36 %)
145,328
(4.63 %)
308 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
66,952
(4.46 %)
309 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1
n/a 13,727
(0.84 %)
24,896
(2.06 %)
n/a 42.95
(99.51 %)
973
(0.49 %)
2,266
(100.00 %)
729,332
(2.15 %)
1,402,564
(24.45 %)
8,156,596
(55.96 %)
175,180
(3.64 %)
310 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
311 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
29,420
(2.47 %)
312 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
32,734
(4.25 %)
313 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1
n/a 14,039
(1.09 %)
19,528
(1.85 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
31
(0.00 %)
122
(100.00 %)
1,307,065
(5.31 %)
672,219
(3.50 %)
9,949,858
(39.30 %)
83,890
(3.97 %)
314 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1
n/a 14,226
(1.28 %)
25,396
(2.33 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,433
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
80,300
(2.76 %)
315 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1
n/a 14,077
(0.47 %)
36,608
(1.60 %)
n/a 43.86
(99.99 %)
2,097
(0.01 %)
2,802
(100.00 %)
1,819,971
(2.73 %)
2,865,173
(16.12 %)
15,335,602
(63.85 %)
651,438
(8.09 %)
316 Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
56,451
(2.93 %)
317 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1
n/a 6,180
(0.71 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,745
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
147,499
(35.87 %)
318 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
64,290
(4.16 %)
319 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1
n/a 12,603
(0.52 %)
23,419
(1.42 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,695
(0.01 %)
2,889
(99.99 %)
559,171
(2.08 %)
973,228
(15.01 %)
11,768,442
(55.69 %)
108,468
(3.25 %)
320 siamang (Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3
n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
87,907
(1.41 %)
321 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
87,907
(1.41 %)
322 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
74,259
(13.49 %)
323 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1
n/a 13,756
(1.40 %)
19,148
(2.33 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
783
(0.01 %)
127
(100.00 %)
790,266
(3.86 %)
448,558
(4.00 %)
6,780,108
(37.51 %)
86,165
(2.71 %)
324 slow loris (alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
35,720
(0.78 %)
325 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2
n/a 11,589
(0.31 %)
32,603
(1.10 %)
n/a 47.54
(100.00 %)
6
(0.00 %)
26,655
(100.00 %)
1,346,532
(1.83 %)
1,273,326
(5.35 %)
19,727,443
(51.55 %)
427,693
(8.25 %)
326 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
145,115
(7.59 %)
327 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1
n/a 9,086
(0.58 %)
20,468
(1.57 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,695
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
37,147
(1.43 %)
328 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1
n/a 11,975
(1.14 %)
16,941
(1.86 %)
n/a 41.42
(99.98 %)
1,674
(0.02 %)
2,176
(99.98 %)
1,088,721
(8.03 %)
743,110
(5.43 %)
7,446,281
(43.88 %)
96,764
(4.19 %)
329 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
62,524
(3.25 %)
330 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
331 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
14,473
(0.87 %)
332 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
59,907
(1.35 %)
333 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
51,339
(1.15 %)
334 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
70,803
(2.85 %)
335 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
27,299
(2.35 %)
336 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
28,905
(2.31 %)
337 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1
n/a 13,777
(1.63 %)
24,910
(4.29 %)
n/a 40.54
(100.00 %)
76
(0.00 %)
831
(100.00 %)
1,218,814
(33.09 %)
230,177
(10.66 %)
5,685,909
(34.46 %)
52,438
(3.69 %)
338 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1
n/a 10,920
(1.26 %)
14,403
(2.60 %)
n/a 43.46
(99.96 %)
2,088
(0.04 %)
1,042
(100.00 %)
3,325,883
(44.48 %)
604,780
(8.87 %)
5,926,808
(44.92 %)
64,249
(4.00 %)
339 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1
n/a 12,414
(0.43 %)
22,037
(1.15 %)
n/a 45.49
(99.98 %)
3,505
(0.02 %)
7,908
(99.98 %)
1,083,980
(2.93 %)
1,065,586
(9.57 %)
13,986,241
(53.49 %)
105,379
(3.46 %)
340 sterlet (paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
65,007
(2.74 %)
341 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
27,787
(3.58 %)
342 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
17,357
(1.25 %)
343 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
67,537
(3.57 %)
344 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
41,928
(1.16 %)
345 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
37,752
(3.68 %)
346 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1
n/a 14,713
(1.06 %)
18,602
(1.60 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
290
(0.00 %)
366
(100.00 %)
1,352,115
(12.17 %)
388,630
(1.94 %)
10,550,154
(33.42 %)
113,023
(3.09 %)
347 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
348 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
31,261
(3.21 %)
349 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
23,296
(2.08 %)
350 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1
n/a 14,405
(0.55 %)
41,584
(1.88 %)
n/a 44.89
(99.97 %)
6,023
(0.03 %)
2,779
(100.00 %)
1,770,524
(4.86 %)
3,429,564
(18.94 %)
15,718,939
(55.22 %)
441,543
(6.61 %)
351 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
12,393
(0.46 %)
352 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
22,424
(2.33 %)
353 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
27,952
(2.71 %)
354 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1
n/a 5,885
(0.35 %)
24,457
(1.45 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,415
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
159,552
(5.54 %)
355 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
75,434
(12.33 %)
356 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1
n/a 12,516
(0.44 %)
17,465
(1.05 %)
n/a 44.66
(99.65 %)
1,203
(0.35 %)
2,136
(99.65 %)
8,278,458
(59.68 %)
903,434
(18.42 %)
14,975,344
(48.25 %)
48,378
(1.60 %)
357 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1
n/a 12,197
(0.36 %)
33,747
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,442
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
326,452
(3.86 %)
358 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,936
(9.72 %)
359 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
17,191
(1.69 %)
360 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
27,070
(2.09 %)
361 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,920
(2.56 %)
362 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1
n/a 13,192
(0.88 %)
29,242
(2.52 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
507
(0.00 %)
819
(100.00 %)
736,700
(2.60 %)
1,165,044
(20.79 %)
8,671,642
(52.60 %)
207,553
(4.71 %)
363 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap2.1 2024)
GCA_964204955.1
n/a 3,537
(0.78 %)
12,938
(7.13 %)
n/a 36.53
(100.00 %)
26
(0.00 %)
269
(100.00 %)
91,318
(3.44 %)
79,330
(9.47 %)
2,208,574
(39.20 %)
6,157
(5.53 %)
364 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1
n/a 13,456
(0.33 %)
47,486
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,437
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
523,234
(6.59 %)
365 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
366 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
35,104
(4.08 %)
367 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
17,864
(2.58 %)
368 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
23,321
(0.97 %)
369 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2
n/a 20,265
(1.62 %)
40,901
(1.63 %)
n/a 40.53
(99.94 %)
2
(0.06 %)
24
(100.00 %)
5,171,525
(50.35 %)
1,002,906
(19.45 %)
15,064,682
(47.42 %)
64,337
(1.17 %)
370 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1
n/a 13,101
(0.94 %)
24,980
(1.75 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,212
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
91,606
(2.53 %)
371 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
64,365
(2.68 %)
372 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
20,481
(1.61 %)
373 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
56,325
(3.33 %)
374 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
25,275
(2.50 %)
375 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
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(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
34,573
(4.56 %)
376 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
15,669
(0.79 %)
377 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
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(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
36,133
(0.92 %)
378 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
38,582
(3.77 %)
379 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1
n/a 16,306
(0.23 %)
45,587
(0.94 %)
n/a 38.94
(99.99 %)
6,811
(0.01 %)
10,308
(99.99 %)
4,195,244
(3.50 %)
7,201,985
(14.20 %)
10,308
(99.99 %)
412,512
(1.53 %)
380 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
27,272
(1.79 %)
381 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
44,101
(6.72 %)
382 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
28,674
(0.68 %)
383 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
384 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
2,289
(2.07 %)
385 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
13,909
(0.83 %)
386 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
387 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
23,838
(2.47 %)
388 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3
n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,387
(2.57 %)
389 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
390 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
14,563
(1.98 %)
391 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
44,554
(2.12 %)
392 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
44,812
(2.09 %)
393 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a 1,204
(2.88 %)
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(99.99 %)
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(100.00 %)
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(3.19 %)
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(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
TOTALS:total assembly count 393

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies