Primates Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of primates only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Angolan colobus
GCF_000951035.1
42,929
(2.28 %)
20,358
(1.94 %)
18,701
(1.25 %)
47,034
(1.83 %)
40.80
(90.25 %)
184,001
(9.77 %)
197,124
(90.23 %)
5,089,134
(49.30 %)
752,280
(2.06 %)
15,645,270
(32.03 %)
59,852
(0.82 %)
2 Assam macaque (KIZ-2021_13 2022)
GCA_023783095.1
n/a 20,012
(1.94 %)
20,934
(1.27 %)
n/a 40.98
(100.00 %)
n/a 1,153
(100.00 %)
5,181,961
(49.79 %)
884,735
(2.46 %)
15,449,956
(37.02 %)
80,386
(1.30 %)
3 aye-aye (BS11 Broad 2019)
GCA_004027145.1
n/a 20,687
(1.84 %)
25,007
(1.35 %)
37,179
(1.61 %)
39.96
(99.96 %)
2,527
(0.01 %)
344,978
(99.99 %)
4,030,997
(43.30 %)
358,965
(0.72 %)
15,568,152
(32.48 %)
36,248
(1.03 %)
4 aye-aye (KIZ-2021_6 2022)
GCA_023783475.1
n/a 18,996
(1.93 %)
20,400
(1.40 %)
n/a 39.89
(100.00 %)
n/a 2,701
(100.00 %)
3,755,381
(42.51 %)
324,667
(0.59 %)
15,231,943
(30.90 %)
32,342
(1.05 %)
5 babakoto
GCA_004363605.1
n/a 23,765
(1.47 %)
45,432
(1.22 %)
n/a 41.26
(99.89 %)
4,885
(0.02 %)
1,248,425
(99.98 %)
4,664,535
(39.88 %)
529,666
(1.21 %)
16,469,880
(32.15 %)
71,607
(1.62 %)
6 Bengal slow loris (KIZ-2021_18 2022)
GCA_023898255.1
n/a 21,573
(1.47 %)
19,515
(1.17 %)
n/a 40.65
(99.99 %)
966
(0.01 %)
3,383
(100.00 %)
4,593,886
(40.08 %)
630,409
(3.44 %)
14,431,317
(40.72 %)
25,083
(0.65 %)
7 Bennett's brown lemur (Redbay 2024)
GCF_041146395.1
47,054
(2.18 %)
19,230
(1.89 %)
21,438
(1.47 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
33
(0.00 %)
647
(100.00 %)
3,630,885
(40.90 %)
990,359
(8.87 %)
13,169,326
(35.96 %)
54,189
(2.02 %)
8 black crested mangabey (KIZ-2021_11 2022)
GCA_023783235.1
n/a 20,337
(1.86 %)
21,431
(1.22 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
n/a 4,389
(100.00 %)
5,435,251
(50.92 %)
1,045,972
(5.40 %)
16,182,435
(38.30 %)
89,767
(1.34 %)
9 black snub-nosed monkey (Rb0 v2 refseq 2016)
GCF_001698545.2
59,207
(2.48 %)
21,210
(1.88 %)
22,226
(1.22 %)
n/a 40.93
(94.12 %)
149,839
(5.89 %)
103,881
(100.00 %)
5,531,353
(50.33 %)
991,662
(2.45 %)
16,353,330
(34.27 %)
80,076
(1.15 %)
10 black-handed spider monkey (BS17 Broad 2019)
GCA_004024785.1
n/a 25,398
(1.69 %)
39,133
(1.17 %)
36,843
(0.90 %)
40.69
(99.91 %)
9,415
(0.03 %)
878,490
(99.97 %)
5,570,166
(47.38 %)
971,371
(2.96 %)
16,050,074
(38.92 %)
35,079
(0.81 %)
11 black-handed spider monkey (KIZ-2021_1 2022)
GCA_023783555.1
n/a 20,598
(1.97 %)
20,597
(1.30 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
n/a 2,723
(100.00 %)
4,899,911
(47.20 %)
777,720
(4.23 %)
15,012,553
(36.30 %)
32,917
(0.89 %)
12 black-shanked douc langur (KIZ-2021_22 2022)
GCA_023764695.1
n/a 20,233
(1.82 %)
19,753
(1.14 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
n/a 3,753
(100.00 %)
5,372,784
(51.34 %)
910,290
(4.72 %)
15,892,070
(38.54 %)
46,118
(0.88 %)
13 blue monkey (Sample3913 2023)
GCA_028627265.1
n/a 23,087
(1.63 %)
28,535
(1.07 %)
n/a 40.90
(99.15 %)
60,547
(0.77 %)
1,396,160
(100.00 %)
6,282,612
(48.44 %)
1,088,988
(2.43 %)
18,272,192
(35.96 %)
58,284
(1.03 %)
14 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.1 BCM 2021)
GCF_016699345.2
53,030
(2.41 %)
20,575
(1.98 %)
21,201
(1.34 %)
n/a 40.96
(99.56 %)
1,073
(0.44 %)
2,786
(99.56 %)
5,041,616
(47.75 %)
946,197
(3.04 %)
14,604,089
(36.98 %)
37,271
(1.03 %)
15 Bolivian squirrel monkey (mSaiBol1 primary hap 2025)
GCA_048565385.1
n/a 20,765
(1.92 %)
20,951
(1.28 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
73
(0.00 %)
63
(100.00 %)
5,214,762
(46.97 %)
990,724
(4.68 %)
14,779,707
(38.32 %)
38,916
(1.05 %)
16 Bolivian titi
GCA_004027715.1
n/a 25,728
(1.58 %)
43,866
(1.11 %)
n/a 41.02
(99.91 %)
7,382
(0.02 %)
1,041,365
(99.98 %)
5,701,983
(47.08 %)
971,231
(2.78 %)
16,165,964
(39.80 %)
58,357
(1.13 %)
17 bonobo (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_029289425.2
95,418
(4.20 %)
21,182
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
6
(0.16 %)
31
(100.00 %)
5,436,203
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,628
(43.17 %)
48,818
(1.07 %)
18 Bornean orangutan (KIZ-2021_21 2022)
GCA_023767775.1
n/a 19,901
(1.88 %)
22,760
(1.27 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,442
(100.00 %)
5,274,756
(51.44 %)
957,490
(4.99 %)
15,869,735
(38.59 %)
38,783
(1.01 %)
19 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2
n/a 19,761
(1.78 %)
20,268
(1.16 %)
n/a 40.95
(99.70 %)
10
(0.30 %)
33
(100.00 %)
5,201,908
(53.67 %)
980,696
(9.42 %)
15,105,351
(41.63 %)
41,454
(1.11 %)
20 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 genbank)
GCA_028885625.2
92,658
(42.57 %)
20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
8
(0.25 %)
25
(100.00 %)
5,544,145
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,593
(42.16 %)
43,604
(1.09 %)
21 Bornean orangutan (v2 AG05252 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885625.2
92,658
(2.98 %)
20,708
(1.74 %)
21,361
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
8
(0.25 %)
26
(100.00 %)
5,544,151
(54.41 %)
1,072,960
(9.60 %)
16,187,641
(42.16 %)
43,604
(1.09 %)
22 brown lemur
GCA_004027275.1
n/a 25,130
(1.40 %)
50,986
(1.20 %)
n/a 41.37
(99.87 %)
3,706
(0.01 %)
1,697,619
(99.99 %)
4,981,207
(40.80 %)
1,645,565
(2.98 %)
15,859,279
(37.12 %)
71,873
(1.66 %)
23 Burmese snub-nosed monkey (KIZ-2021_23 2022)
GCA_023764705.1
n/a 20,284
(1.81 %)
20,291
(1.15 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
n/a 4,623
(100.00 %)
5,410,232
(52.26 %)
1,050,727
(6.93 %)
15,721,056
(39.86 %)
58,087
(1.00 %)
24 chimpanzee (Clint C0471 2018 refseq)
GCF_002880755.1
102,458
(3.40 %)
20,447
(1.83 %)
21,467
(1.18 %)
n/a 40.71
(98.96 %)
715
(1.04 %)
5,254
(98.96 %)
5,444,680
(53.75 %)
996,217
(7.30 %)
16,057,940
(39.54 %)
46,151
(0.97 %)
25 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2
n/a 19,981
(1.80 %)
20,886
(1.18 %)
n/a 40.63
(99.83 %)
5
(0.17 %)
23
(100.00 %)
5,080,229
(48.83 %)
937,411
(11.36 %)
14,905,102
(42.22 %)
46,330
(1.11 %)
26 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 genbank)
GCA_028858775.2
134,453
(48.11 %)
20,831
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
5
(0.16 %)
25
(100.00 %)
5,408,044
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,286
(42.21 %)
49,727
(1.09 %)
27 chimpanzee (v2 AG18354 primary hap 2024 refseq)
GCF_028858775.2
134,453
(3.48 %)
20,832
(1.77 %)
22,081
(1.17 %)
n/a 40.57
(99.84 %)
5
(0.16 %)
26
(100.00 %)
5,408,047
(49.94 %)
1,021,513
(10.88 %)
15,986,329
(42.21 %)
49,727
(1.09 %)
28 common marmoset (240 primary hap 2025)
GCA_049354715.1
n/a 21,911
(1.84 %)
21,599
(1.26 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
3
(0.01 %)
27
(99.99 %)
5,159,459
(47.46 %)
852,115
(5.34 %)
15,179,157
(39.68 %)
37,686
(0.94 %)
29 Coquerel's mouse lemur
GCA_004024645.1
n/a 24,097
(1.75 %)
40,335
(1.41 %)
n/a 40.86
(99.92 %)
10,667
(0.05 %)
451,546
(99.95 %)
4,093,701
(41.14 %)
571,851
(1.36 %)
14,292,721
(33.40 %)
70,569
(2.29 %)
30 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 refseq)
GCF_000956105.1
29,382
(2.19 %)
19,298
(2.12 %)
21,783
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,070
(74.47 %)
3,419,964
(39.32 %)
304,035
(0.59 %)
13,333,892
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
31 cotton-top tamarin (B95-8 2023)
GCA_031835075.1
n/a 23,539
(1.72 %)
23,067
(1.20 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
34
(0.00 %)
447
(100.00 %)
5,808,669
(48.92 %)
1,120,340
(7.96 %)
15,375,687
(43.53 %)
37,293
(0.89 %)
32 crab-eating macaque (2020 cy0333)
GCA_011100615.1
n/a 20,178
(1.86 %)
20,316
(1.21 %)
65,343
(2.60 %)
41.01
(98.70 %)
560
(1.30 %)
1,496
(98.70 %)
5,424,163
(51.37 %)
894,914
(3.04 %)
16,026,015
(36.93 %)
72,765
(1.24 %)
33 crab-eating macaque (582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
94,759
(1.56 %)
34 crab-eating macaque CE1976F Keio U/RIKEN 2021
GCF_012559485.2
87,268
(3.15 %)
20,054
(1.91 %)
20,456
(1.23 %)
n/a 40.98
(99.99 %)
605
(0.01 %)
401
(100.00 %)
5,272,147
(51.07 %)
941,877
(2.83 %)
15,772,147
(37.48 %)
90,103
(1.40 %)
35 De Brazza's monkey
GCA_004027615.1
n/a 26,901
(1.31 %)
46,619
(0.90 %)
n/a 41.18
(99.85 %)
7,534
(0.02 %)
2,126,734
(99.98 %)
6,751,052
(54.69 %)
1,804,857
(10.22 %)
16,954,884
(44.26 %)
104,630
(1.53 %)
36 drill (KB7577 Baylor 2015)
GCF_000951045.1
42,567
(2.25 %)
20,205
(1.90 %)
18,407
(1.23 %)
n/a 40.73
(88.91 %)
233,234
(11.12 %)
246,054
(88.88 %)
5,166,355
(49.05 %)
834,739
(2.92 %)
15,970,905
(31.27 %)
42,242
(0.62 %)
37 drill (KIZ-2021_15 2022)
GCA_023783495.1
n/a 20,480
(1.89 %)
23,070
(1.28 %)
n/a 40.89
(98.32 %)
37,125
(1.69 %)
66,385
(98.31 %)
5,269,129
(50.29 %)
919,725
(3.55 %)
16,051,151
(36.57 %)
56,450
(1.02 %)
38 Eastern hoolock gibbon (KIZ-2021_9 2022)
GCA_023748175.1
n/a 19,896
(1.91 %)
19,642
(1.17 %)
n/a 41.13
(100.00 %)
53
(0.00 %)
2,969
(100.00 %)
5,269,435
(50.46 %)
908,964
(4.57 %)
15,559,847
(37.92 %)
51,887
(1.09 %)
39 Francois's langur
GCF_009764315.1
80,215
(2.83 %)
20,478
(1.87 %)
20,685
(1.19 %)
39,950
(1.50 %)
41.12
(100.00 %)
766
(0.00 %)
1,016
(100.00 %)
5,471,638
(52.57 %)
928,320
(2.95 %)
15,652,774
(38.76 %)
129,321
(1.71 %)
40 gelada
GCF_003255815.1
59,583
(2.42 %)
20,532
(1.90 %)
21,017
(1.20 %)
n/a 40.96
(98.37 %)
27,860
(1.63 %)
15,308
(100.00 %)
5,467,919
(51.71 %)
982,616
(2.99 %)
15,865,443
(36.88 %)
93,504
(1.36 %)
41 golden lion tamarin (Coari 2023)
GCA_028533165.1
n/a 22,271
(1.84 %)
23,146
(1.16 %)
n/a 41.06
(99.29 %)
58,924
(0.69 %)
342,831
(100.00 %)
5,350,617
(47.06 %)
1,060,421
(2.75 %)
16,004,031
(37.43 %)
34,561
(0.83 %)
42 golden snub-nosed monkey (2019 Northwest U)
GCF_007565055.1
64,163
(2.41 %)
21,162
(1.81 %)
20,993
(1.14 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
2,832
(0.01 %)
3,257
(100.00 %)
5,619,018
(53.60 %)
1,226,902
(6.20 %)
15,833,648
(40.58 %)
99,771
(1.51 %)
43 golden-brown mouse lemur (RMR55 2019)
GCA_008750975.1
n/a 26,464
(1.54 %)
54,472
(1.31 %)
n/a 40.98
(99.97 %)
814
(0.00 %)
334,832
(100.00 %)
4,188,541
(40.59 %)
597,399
(1.53 %)
14,651,061
(32.28 %)
76,716
(2.17 %)
44 gorilla (v2.1 KB3781 2024 refseq)
GCF_029281585.2
98,428
(2.94 %)
21,013
(1.59 %)
50,697
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,462,311
(50.79 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,229
(47.77 %)
69,745
(1.19 %)
45 gray mouse lemur
GCF_000165445.2
74,354
(3.53 %)
20,032
(1.90 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,364
(4.06 %)
50,983
(95.94 %)
4,083,660
(41.60 %)
582,431
(1.47 %)
14,808,653
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
46 greater bamboo lemur (KIAN8.4 2018)
GCA_003258685.1
n/a 19,563
(2.02 %)
23,129
(1.54 %)
n/a 40.83
(92.61 %)
82,304
(7.39 %)
210,900
(92.61 %)
3,715,845
(39.74 %)
509,680
(1.94 %)
14,012,100
(27.69 %)
54,553
(1.48 %)
47 green monkey 1994-021 (2014 refseq)
GCF_000409795.2
76,050
(3.13 %)
19,995
(1.95 %)
50,732
(6.99 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,940
(1.35 %)
163,018
(98.65 %)
5,266,458
(49.55 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,224
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
48 green monkey WHO RCB 10-87
GCF_015252025.1
73,115
(2.94 %)
20,320
(1.83 %)
21,251
(1.19 %)
n/a 41.07
(99.75 %)
8,419
(0.25 %)
6,872
(100.00 %)
5,517,731
(51.10 %)
1,158,729
(3.95 %)
16,622,084
(37.82 %)
67,267
(1.70 %)
49 grivet (KIZ-2021_4 2022)
GCA_023783515.1
n/a 20,163
(1.90 %)
23,239
(1.31 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
n/a 2,565
(100.00 %)
5,282,136
(50.09 %)
1,128,849
(3.92 %)
15,914,826
(37.76 %)
64,915
(1.62 %)
50 hamadryas baboon (KIZ-2021_19 2022)
GCA_023781915.1
n/a 20,269
(1.76 %)
20,902
(1.16 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
n/a 3,047
(100.00 %)
5,615,229
(52.09 %)
1,010,666
(6.83 %)
16,542,749
(39.79 %)
96,913
(1.36 %)
51 Hanuman langur
GCA_004025065.1
n/a 27,338
(1.54 %)
46,486
(1.04 %)
n/a 41.28
(99.89 %)
13,786
(0.05 %)
1,077,535
(99.95 %)
6,409,019
(52.08 %)
1,008,391
(1.92 %)
16,519,816
(39.37 %)
95,794
(1.26 %)
52 Horsfield's tarsier (2022)
GCA_027257055.1
n/a 20,200
(1.48 %)
22,821
(1.21 %)
n/a 41.17
(100.00 %)
n/a 6,942
(100.00 %)
5,175,266
(44.51 %)
750,825
(1.82 %)
16,115,126
(39.41 %)
90,999
(1.90 %)
53 human (HG00438 2024)
GCA_018471515.2
n/a 20,671
(1.85 %)
21,293
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.94 %)
17
(0.06 %)
76
(100.00 %)
5,413,418
(53.02 %)
1,053,786
(7.42 %)
15,871,681
(40.11 %)
52,548
(1.23 %)
54 human (HG00438 2024)
GCA_018472595.2
n/a 20,617
(1.85 %)
21,211
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.97 %)
11
(0.03 %)
75
(100.00 %)
5,432,537
(53.01 %)
1,068,169
(7.42 %)
15,919,085
(40.15 %)
52,424
(1.24 %)
55 human (HG00621 2024)
GCA_018472575.2
n/a 19,878
(1.85 %)
20,568
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
10
(0.01 %)
73
(100.00 %)
5,191,978
(52.95 %)
1,042,590
(7.98 %)
15,173,624
(40.36 %)
51,002
(1.25 %)
56 human (HG00621 2024)
GCA_018472605.2
n/a 20,592
(1.85 %)
21,408
(1.21 %)
n/a 40.86
(99.99 %)
4
(0.01 %)
56
(100.00 %)
5,404,042
(53.00 %)
1,044,267
(7.40 %)
15,840,566
(40.08 %)
52,228
(1.22 %)
57 human (HG00673 2024)
GCA_018472565.2
n/a 20,681
(1.85 %)
21,270
(1.21 %)
n/a 40.84
(99.96 %)
16
(0.04 %)
62
(100.00 %)
5,401,341
(52.97 %)
1,049,789
(7.29 %)
16,040,092
(40.20 %)
52,090
(1.16 %)
58 human (HG00673 2024)
GCA_018472585.2
n/a 19,940
(1.85 %)
20,755
(1.21 %)
n/a 40.82
(99.98 %)
16
(0.02 %)
89
(100.00 %)
5,223,856
(53.16 %)
1,070,752
(8.25 %)
15,136,453
(40.52 %)
50,664
(1.21 %)
59 human (HG00706 2024)
GCA_046116005.1
n/a 20,687
(1.85 %)
21,176
(1.20 %)
n/a 40.86
(99.93 %)
9
(0.07 %)
88
(99.96 %)
5,421,316
(53.11 %)
1,049,327
(7.61 %)
15,926,568
(40.27 %)
52,532
(1.21 %)
60 human (HG00706 2024)
GCA_046116065.1
n/a 19,878
(1.85 %)
20,446
(1.19 %)
n/a 40.81
(99.81 %)
14
(0.19 %)
101
(99.91 %)
5,209,280
(53.09 %)
1,081,085
(8.05 %)
15,083,495
(40.34 %)
50,832
(1.24 %)
61 human (HG00733.mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
53,216
(1.22 %)
62 human (HG00733.pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
15,964,663
(40.46 %)
53,315
(1.19 %)
63 human (HG00735 2024)
GCA_018472715.2
n/a 20,605
(1.85 %)
21,531
(1.22 %)
n/a 40.82
(99.96 %)
12
(0.04 %)
82
(100.00 %)
5,403,814
(53.04 %)
1,049,739
(7.45 %)
16,059,465
(40.32 %)
52,397
(1.17 %)
64 human (HG00735 2024)
GCA_018472765.3
n/a 20,625
(1.85 %)
21,413
(1.20 %)
n/a 40.80
(99.93 %)
9
(0.07 %)
84
(100.00 %)
5,405,744
(53.14 %)
1,053,434
(7.66 %)
16,023,704
(40.43 %)
52,196
(1.16 %)
65 human (HG00741 2024)
GCA_018471095.2
n/a 20,690
(1.84 %)
21,124
(1.18 %)
n/a 40.82
(99.99 %)
19
(0.01 %)
73
(100.00 %)
5,426,834
(53.37 %)
1,068,633
(8.13 %)
15,925,687
(40.60 %)
52,420
(1.19 %)
66 human (HG00741 2024)
GCA_018471105.2
n/a 20,630
(1.84 %)
21,346
(1.20 %)
n/a 40.88
(99.95 %)
23
(0.05 %)
80
(100.00 %)
5,412,193
(53.11 %)
1,049,405
(7.61 %)
15,876,779
(40.27 %)
52,461
(1.25 %)
67 human (HG01071 2024)
GCA_018472685.2
n/a 20,668
(1.85 %)
21,337
(1.20 %)
n/a 40.86
(99.99 %)
16
(0.01 %)
76
(100.00 %)
5,400,941
(52.94 %)
1,038,921
(7.27 %)
15,901,417
(40.08 %)
52,422
(1.21 %)
68 human (HG01071 2024)
GCA_018472725.2
n/a 20,648
(1.84 %)
21,210
(1.19 %)
n/a 40.77
(99.94 %)
32
(0.06 %)
74
(100.00 %)
5,427,567
(53.28 %)
1,086,014
(7.93 %)
15,921,231
(40.52 %)
52,448
(1.21 %)
69 human (HG01106 2024)
GCA_018471075.2
n/a 19,884
(1.84 %)
20,587
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.95 %)
14
(0.05 %)
80
(100.00 %)
5,214,854
(53.16 %)
1,080,289
(8.12 %)
15,116,061
(40.49 %)
50,816
(1.21 %)
70 human (HG01106 2024)
GCA_018471345.2
n/a 20,599
(1.85 %)
21,145
(1.19 %)
n/a 40.83
(99.95 %)
15
(0.05 %)
84
(100.00 %)
5,399,469
(53.04 %)
1,046,841
(7.45 %)
16,018,488
(40.34 %)
52,123
(1.19 %)
71 human (HG01109 2024)
GCA_018504365.2
n/a 20,626
(1.85 %)
21,202
(1.19 %)
n/a 40.86
(99.93 %)
16
(0.07 %)
121
(100.00 %)
5,410,357
(53.07 %)
1,047,632
(7.50 %)
15,899,295
(40.20 %)
52,884
(1.22 %)
72 human (HG01109 2024)
GCA_018504645.2
n/a 19,890
(1.85 %)
20,664
(1.21 %)
n/a 40.82
(99.96 %)
11
(0.04 %)
122
(100.00 %)
5,202,257
(52.86 %)
1,065,139
(7.71 %)
15,235,668
(40.28 %)
50,942
(1.22 %)
73 human (HG01123 2024)
GCA_018469665.2
n/a 20,682
(1.86 %)
21,381
(1.21 %)
n/a 40.85
(99.97 %)
17
(0.03 %)
58
(100.00 %)
5,404,707
(52.94 %)
1,031,923
(7.27 %)
16,040,530
(40.19 %)
52,124
(1.17 %)
74 human (HG01123 2024)
GCA_018469695.2
n/a 20,591
(1.86 %)
21,283
(1.20 %)
n/a 40.87
(99.97 %)
16
(0.03 %)
79
(100.00 %)
5,407,115
(52.90 %)
1,044,211
(7.21 %)
16,016,509
(40.14 %)
52,386
(1.20 %)
75 human (HG01175 2024)
GCA_018471065.2
n/a 20,594
(1.84 %)
21,411
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.99 %)
14
(0.01 %)
69
(100.00 %)
5,411,998
(53.13 %)
1,060,888
(7.65 %)
16,031,241
(40.46 %)
52,407
(1.17 %)
76 human (HG01175 2024)
GCA_018471085.2
n/a 20,593
(1.84 %)
21,310
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.98 %)
15
(0.02 %)
59
(100.00 %)
5,424,443
(53.18 %)
1,073,369
(7.72 %)
16,053,068
(40.52 %)
52,249
(1.18 %)
77 human (HG01243 2024)
GCA_018504045.2
n/a 19,924
(1.85 %)
20,609
(1.21 %)
n/a 40.90
(99.89 %)
17
(0.11 %)
101
(99.90 %)
5,207,468
(52.85 %)
1,049,846
(7.86 %)
15,222,178
(40.29 %)
51,084
(1.29 %)
78 human (HG01243 2024)
GCA_018504375.2
n/a 20,628
(1.85 %)
21,488
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.84 %)
18
(0.16 %)
93
(100.00 %)
5,389,462
(53.12 %)
1,030,233
(7.60 %)
15,977,879
(40.31 %)
52,349
(1.17 %)
79 human (HG01243 John Hopkins 2021)
GCA_018873775.2
n/a 20,695
(1.80 %)
21,215
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
n/a 89
(100.00 %)
5,500,678
(53.98 %)
1,144,246
(8.84 %)
16,158,123
(41.58 %)
52,048
(1.37 %)
80 human (HG01258 2024)
GCA_018469405.2
n/a 20,625
(1.84 %)
21,375
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.93 %)
9
(0.07 %)
92
(100.00 %)
5,434,669
(53.15 %)
1,081,250
(7.69 %)
15,926,529
(40.41 %)
52,440
(1.29 %)
81 human (HG01258 2024)
GCA_018469675.2
n/a 19,842
(1.85 %)
20,547
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.96 %)
15
(0.04 %)
67
(100.00 %)
5,189,466
(52.99 %)
1,051,712
(8.05 %)
15,186,721
(40.42 %)
50,664
(1.20 %)
82 human (HG01358 2024)
GCA_018469865.2
n/a 20,558
(1.84 %)
21,435
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.90 %)
16
(0.10 %)
81
(100.00 %)
5,422,313
(53.21 %)
1,083,846
(7.79 %)
15,862,927
(40.32 %)
52,331
(1.20 %)
83 human (HG01358 2024)
GCA_018469965.2
n/a 19,932
(1.84 %)
20,735
(1.20 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
9
(0.00 %)
83
(100.00 %)
5,226,780
(53.18 %)
1,077,859
(8.36 %)
15,127,675
(40.58 %)
50,900
(1.26 %)
84 human (HG01361 2024)
GCA_018469685.2
n/a 20,696
(1.84 %)
21,218
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.96 %)
18
(0.04 %)
87
(100.00 %)
5,426,468
(53.20 %)
1,084,289
(7.80 %)
15,865,010
(40.38 %)
52,172
(1.24 %)
85 human (HG01361 2024)
GCA_018469705.2
n/a 20,634
(1.85 %)
21,330
(1.20 %)
n/a 40.89
(99.90 %)
22
(0.10 %)
85
(100.00 %)
5,411,531
(52.93 %)
1,043,758
(7.23 %)
15,895,215
(40.00 %)
52,387
(1.24 %)
86 human (HG01891 2024)
GCA_018467155.2
n/a 20,670
(1.85 %)
21,482
(1.21 %)
n/a 40.81
(99.93 %)
14
(0.07 %)
89
(100.00 %)
5,402,556
(52.99 %)
1,056,902
(7.37 %)
16,013,424
(40.23 %)
52,448
(1.18 %)
87 human (HG01891 2024)
GCA_018467165.2
n/a 20,623
(1.84 %)
21,541
(1.21 %)
n/a 40.86
(99.86 %)
22
(0.14 %)
104
(100.00 %)
5,402,057
(53.21 %)
1,043,039
(7.77 %)
15,897,064
(40.38 %)
52,279
(1.21 %)
88 human (HG01928 2024)
GCA_018472695.2
n/a 20,582
(1.84 %)
21,056
(1.19 %)
n/a 40.81
(99.86 %)
15
(0.14 %)
71
(100.00 %)
5,417,362
(53.18 %)
1,070,292
(7.73 %)
15,858,320
(40.29 %)
52,210
(1.21 %)
89 human (HG01928 2024)
GCA_018472705.2
n/a 19,876
(1.85 %)
20,445
(1.19 %)
n/a 40.86
(99.98 %)
10
(0.02 %)
71
(100.00 %)
5,209,399
(53.05 %)
1,068,684
(8.11 %)
15,085,592
(40.34 %)
50,870
(1.23 %)
90 human (HG01952 2024)
GCA_018471545.2
n/a 20,611
(1.85 %)
21,293
(1.21 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
12
(0.05 %)
67
(100.00 %)
5,399,862
(52.95 %)
1,038,697
(7.27 %)
15,891,836
(40.02 %)
52,526
(1.23 %)
91 human (HG01952 2024)
GCA_018471555.2
n/a 19,899
(1.85 %)
20,436
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
8
(0.01 %)
81
(100.00 %)
5,195,641
(53.00 %)
1,056,834
(8.06 %)
15,167,450
(40.51 %)
50,707
(1.27 %)
92 human (HG01975 2024)
GCA_045999905.1
n/a 20,651
(1.85 %)
21,147
(1.19 %)
n/a 40.82
(99.94 %)
13
(0.06 %)
92
(100.00 %)
5,426,477
(53.24 %)
1,082,658
(7.87 %)
15,852,291
(40.40 %)
52,165
(1.24 %)
93 human (HG01975 2024)
GCA_046000135.1
n/a 20,571
(1.86 %)
21,588
(1.21 %)
n/a 40.85
(99.89 %)
15
(0.11 %)
88
(100.00 %)
5,404,186
(52.88 %)
1,043,090
(7.15 %)
16,003,919
(40.07 %)
52,444
(1.20 %)
94 human (HG01978 2024)
GCA_018472845.2
n/a 20,634
(1.84 %)
21,216
(1.19 %)
n/a 40.85
(99.98 %)
10
(0.02 %)
83
(100.00 %)
5,420,852
(53.20 %)
1,066,894
(7.79 %)
15,859,827
(40.38 %)
52,477
(1.24 %)
95 human (HG01978 2024)
GCA_018472865.2
n/a 20,623
(1.84 %)
21,417
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
18
(0.05 %)
97
(100.00 %)
5,427,749
(53.32 %)
1,081,851
(8.01 %)
15,918,480
(40.59 %)
52,584
(1.27 %)
96 human (HG02055.mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a 20,668
(1.86 %)
22,497
(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
5,394,664
(52.96 %)
1,054,907
(7.31 %)
16,015,246
(40.18 %)
52,182
(1.14 %)
97 human (HG02055.pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
227,271
(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
1,083,360
(8.82 %)
15,156,062
(40.89 %)
51,291
(1.20 %)
98 human (HG02080 2024)
GCA_018504055.2
n/a 20,581
(1.85 %)
21,609
(1.22 %)
n/a 40.85
(99.97 %)
12
(0.03 %)
91
(100.00 %)
5,417,994
(53.03 %)
1,061,466
(7.44 %)
15,894,427
(40.20 %)
52,586
(1.27 %)
99 human (HG02080 2024)
GCA_018504085.2
n/a 20,602
(1.84 %)
21,347
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
16
(0.01 %)
104
(100.00 %)
5,416,169
(53.17 %)
1,064,250
(7.74 %)
15,904,811
(40.39 %)
52,459
(1.28 %)
100 human (HG02109.mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a 20,672
(1.85 %)
22,359
(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
1,059,138
(7.38 %)
15,909,866
(40.16 %)
52,821
(1.21 %)
101 human (HG02109.pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a 20,726
(1.85 %)
22,416
(1.25 %)
233,280
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
5,415,046
(53.08 %)
1,053,373
(7.55 %)
15,926,813
(40.27 %)
52,917
(1.18 %)
102 human (HG02145.mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,340
(1.25 %)
233,065
(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
5,406,959
(53.08 %)
1,055,638
(7.58 %)
15,881,847
(40.24 %)
52,888
(1.19 %)
103 human (HG02145.pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a 19,971
(1.84 %)
23,489
(1.40 %)
227,332
(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
5,210,152
(53.01 %)
1,080,455
(8.52 %)
14,936,162
(40.43 %)
52,745
(1.32 %)
104 human (HG02148 2024)
GCA_018471525.2
n/a 20,623
(1.85 %)
21,875
(1.22 %)
n/a 40.88
(99.93 %)
14
(0.07 %)
91
(100.00 %)
5,412,663
(53.07 %)
1,054,082
(7.56 %)
15,843,917
(40.20 %)
52,279
(1.27 %)
105 human (HG02148 2024)
GCA_018471535.2
n/a 20,625
(1.85 %)
21,702
(1.21 %)
n/a 40.81
(99.96 %)
14
(0.04 %)
71
(100.00 %)
5,415,674
(53.17 %)
1,073,403
(7.70 %)
16,005,955
(40.45 %)
52,129
(1.16 %)
106 human (HG02257 2024)
GCA_018466835.2
n/a 20,634
(1.84 %)
21,246
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
9
(0.01 %)
79
(100.00 %)
5,416,303
(53.12 %)
1,062,880
(7.61 %)
16,028,149
(40.43 %)
52,179
(1.19 %)
107 human (HG02257 2024)
GCA_018466845.2
n/a 20,680
(1.84 %)
21,598
(1.20 %)
n/a 40.79
(99.97 %)
13
(0.03 %)
113
(100.00 %)
5,428,326
(53.31 %)
1,082,417
(8.01 %)
15,908,184
(40.56 %)
52,544
(1.22 %)
108 human (HG023922024)
GCA_046043145.1
n/a 20,564
(1.85 %)
21,211
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.76 %)
18
(0.24 %)
101
(99.84 %)
5,419,402
(53.02 %)
1,078,290
(7.46 %)
15,933,683
(40.18 %)
52,075
(1.28 %)
109 human (HG023922024)
GCA_046043155.1
n/a 19,954
(1.85 %)
20,597
(1.20 %)
n/a 40.86
(100.00 %)
8
(0.00 %)
90
(100.00 %)
5,229,665
(53.07 %)
1,066,580
(8.22 %)
15,183,725
(40.56 %)
51,004
(1.30 %)
110 human (HG02486 2024)
GCA_018467005.2
n/a 19,973
(1.85 %)
20,581
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
16
(0.08 %)
59
(100.00 %)
5,190,996
(53.17 %)
1,043,511
(8.31 %)
15,240,496
(40.67 %)
50,784
(1.19 %)
111 human (HG02486 2024)
GCA_018467015.2
n/a 20,632
(1.84 %)
21,351
(1.20 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
9
(0.00 %)
58
(100.00 %)
5,421,758
(53.20 %)
1,077,659
(7.76 %)
16,018,659
(40.52 %)
52,296
(1.18 %)
112 human (HG02559 2024)
GCA_018466855.2
n/a 20,662
(1.85 %)
21,352
(1.20 %)
n/a 40.87
(99.91 %)
6
(0.09 %)
66
(100.00 %)
5,407,064
(53.03 %)
1,043,868
(7.41 %)
15,887,901
(40.09 %)
52,617
(1.20 %)
113 human (HG02559 2024)
GCA_018466985.2
n/a 20,656
(1.85 %)
21,165
(1.19 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
7
(0.00 %)
70
(100.00 %)
5,407,630
(53.10 %)
1,057,048
(7.59 %)
15,911,001
(40.30 %)
52,556
(1.21 %)
114 human (HG02572 2024)
GCA_018470435.2
n/a 19,849
(1.85 %)
20,851
(1.21 %)
n/a 40.86
(99.89 %)
12
(0.11 %)
64
(100.00 %)
5,195,172
(53.14 %)
1,054,544
(8.33 %)
15,171,727
(40.56 %)
50,650
(1.20 %)
115 human (HG02572 2024)
GCA_018470445.2
n/a 20,689
(1.84 %)
21,324
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
15
(0.05 %)
81
(100.00 %)
5,422,894
(53.22 %)
1,063,294
(7.80 %)
15,920,535
(40.44 %)
52,812
(1.24 %)
116 human (HG02602 2024)
GCA_046000055.1
n/a 20,674
(1.85 %)
21,347
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.94 %)
10
(0.06 %)
63
(100.00 %)
5,410,490
(53.00 %)
1,048,451
(7.36 %)
16,055,466
(40.30 %)
52,224
(1.18 %)
117 human (HG02602 2024)
GCA_046000095.1
n/a 19,915
(1.83 %)
20,880
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.95 %)
13
(0.05 %)
100
(100.00 %)
5,225,710
(53.36 %)
1,083,783
(8.65 %)
15,120,086
(40.72 %)
50,831
(1.20 %)
118 human (HG02622 2024)
GCA_018469875.2
n/a 20,627
(1.84 %)
21,439
(1.20 %)
n/a 40.86
(99.98 %)
12
(0.02 %)
113
(100.00 %)
5,449,739
(53.23 %)
1,091,086
(7.81 %)
15,917,910
(40.46 %)
52,776
(1.27 %)
119 human (HG02622 2024)
GCA_018469925.2
n/a 20,606
(1.84 %)
21,504
(1.21 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
14
(0.05 %)
100
(100.00 %)
5,419,063
(53.19 %)
1,061,605
(7.74 %)
15,897,527
(40.36 %)
52,407
(1.22 %)
120 human (HG02630 2024)
GCA_018469945.2
n/a 20,664
(1.83 %)
21,485
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.88 %)
27
(0.12 %)
134
(100.00 %)
5,448,050
(53.39 %)
1,100,289
(8.09 %)
15,919,887
(40.60 %)
52,760
(1.24 %)
121 human (HG02630 2024)
GCA_018469955.2
n/a 20,589
(1.84 %)
21,606
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.99 %)
28
(0.01 %)
111
(99.99 %)
5,426,367
(53.11 %)
1,066,893
(7.62 %)
15,937,739
(40.39 %)
52,779
(1.30 %)
122 human (HG02717 2024)
GCA_018469935.2
n/a 20,675
(1.84 %)
21,885
(1.23 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
9
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,429,166
(53.32 %)
1,080,554
(8.02 %)
15,890,595
(40.58 %)
52,702
(1.23 %)
123 human (HG02717 2024)
GCA_018470425.2
n/a 19,871
(1.84 %)
20,957
(1.21 %)
n/a 40.83
(99.90 %)
20
(0.10 %)
86
(100.00 %)
5,223,345
(53.32 %)
1,086,042
(8.62 %)
15,105,363
(40.69 %)
51,300
(1.23 %)
124 human (HG02723 2024)
GCA_018504065.2
n/a 20,700
(1.85 %)
21,236
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.85 %)
12
(0.15 %)
65
(100.00 %)
5,418,458
(53.09 %)
1,061,446
(7.57 %)
15,884,296
(40.18 %)
52,181
(1.22 %)
125 human (HG02723 2024)
GCA_018504075.2
n/a 20,683
(1.84 %)
21,646
(1.22 %)
n/a 40.81
(99.97 %)
23
(0.03 %)
82
(100.00 %)
5,425,354
(53.23 %)
1,075,616
(7.83 %)
15,775,628
(40.28 %)
52,311
(1.22 %)
126 human (HG02738 2024)
GCA_046056425.1
n/a 20,657
(1.85 %)
21,348
(1.20 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
14
(0.01 %)
65
(100.00 %)
5,414,899
(53.09 %)
1,051,546
(7.60 %)
15,942,336
(40.27 %)
52,107
(1.20 %)
127 human (HG02738 2024)
GCA_046056435.1
n/a 19,889
(1.85 %)
20,725
(1.21 %)
n/a 40.86
(99.88 %)
12
(0.12 %)
86
(100.00 %)
5,191,939
(53.05 %)
1,042,065
(8.06 %)
15,222,081
(40.53 %)
51,007
(1.26 %)
128 human (HG02818 2024)
GCA_018503575.2
n/a 20,626
(1.86 %)
21,677
(1.23 %)
n/a 40.86
(99.87 %)
26
(0.13 %)
89
(99.99 %)
5,398,731
(52.87 %)
1,036,561
(7.13 %)
16,004,722
(40.03 %)
52,245
(1.19 %)
129 human (HG02818 2024)
GCA_018503585.2
n/a 20,560
(1.84 %)
21,491
(1.21 %)
n/a 40.77
(99.87 %)
43
(0.13 %)
112
(100.00 %)
5,413,359
(53.31 %)
1,065,817
(7.92 %)
15,907,056
(40.46 %)
52,246
(1.17 %)
130 human (HG02886 2024)
GCA_018470455.2
n/a 20,655
(1.84 %)
21,580
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.96 %)
18
(0.04 %)
112
(100.00 %)
5,436,421
(53.07 %)
1,068,710
(7.51 %)
15,822,103
(40.13 %)
52,979
(1.26 %)
131 human (HG02886 2024)
GCA_018470465.2
n/a 20,677
(1.85 %)
21,526
(1.22 %)
n/a 40.85
(99.98 %)
19
(0.02 %)
98
(100.00 %)
5,432,863
(53.07 %)
1,071,456
(7.50 %)
15,920,534
(40.29 %)
52,490
(1.28 %)
132 human (HG03098.mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
52,417
(1.18 %)
133 human (HG03098.pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,201,143
(53.24 %)
1,083,861
(8.56 %)
15,069,721
(40.64 %)
51,389
(1.21 %)
134 human (HG03453 2024)
GCA_018472855.2
n/a 20,643
(1.84 %)
21,380
(1.19 %)
n/a 40.82
(99.74 %)
36
(0.26 %)
135
(100.00 %)
5,439,760
(53.25 %)
1,091,024
(7.84 %)
15,941,638
(40.43 %)
52,952
(1.25 %)
135 human (HG03453 2024)
GCA_018473305.2
n/a 20,639
(1.84 %)
21,421
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.84 %)
19
(0.16 %)
132
(100.00 %)
5,418,473
(53.35 %)
1,055,734
(8.06 %)
15,921,686
(40.55 %)
52,629
(1.19 %)
136 human (HG03486 2024)
GCA_018503525.2
n/a 20,707
(1.85 %)
21,578
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
28
(0.02 %)
115
(100.00 %)
5,429,235
(53.07 %)
1,067,398
(7.49 %)
15,952,691
(40.29 %)
52,701
(1.21 %)
137 human (HG03486.pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
53,143
(1.26 %)
138 human (HG03492.mat 2021)
GCA_018505845.1
n/a 20,677
(1.85 %)
22,401
(1.25 %)
233,402
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
495
(100.00 %)
5,393,586
(52.97 %)
1,050,402
(7.38 %)
15,875,935
(40.07 %)
52,994
(1.18 %)
139 human (HG03492.pat 2021)
GCA_018505835.1
n/a 19,970
(1.85 %)
21,672
(1.25 %)
227,277
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 618
(100.00 %)
5,202,430
(53.00 %)
1,069,560
(8.18 %)
15,071,476
(40.33 %)
51,291
(1.19 %)
140 human (HG03516 2024)
GCA_018469415.2
n/a 20,650
(1.85 %)
21,571
(1.21 %)
n/a 40.86
(99.96 %)
14
(0.04 %)
72
(100.00 %)
5,422,029
(52.95 %)
1,061,642
(7.25 %)
16,039,428
(40.20 %)
52,596
(1.21 %)
141 human (HG03516 2024)
GCA_018469425.2
n/a 20,630
(1.84 %)
21,644
(1.21 %)
n/a 40.85
(99.99 %)
15
(0.01 %)
74
(100.00 %)
5,429,458
(53.26 %)
1,061,480
(7.88 %)
15,925,209
(40.51 %)
52,673
(1.22 %)
142 human (HG03540 2024)
GCA_018473295.2
n/a 20,616
(1.84 %)
21,603
(1.21 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
20
(0.01 %)
100
(100.00 %)
5,441,691
(53.32 %)
1,096,362
(8.00 %)
15,897,014
(40.60 %)
52,816
(1.27 %)
143 human (HG03540 2024)
GCA_018473315.2
n/a 20,592
(1.83 %)
21,534
(1.20 %)
n/a 40.83
(99.81 %)
17
(0.19 %)
130
(100.00 %)
5,425,552
(53.41 %)
1,066,838
(8.15 %)
15,813,532
(40.53 %)
52,851
(1.27 %)
144 human (HG03579 2024)
GCA_018472825.2
n/a 20,669
(1.84 %)
21,826
(1.24 %)
n/a 40.82
(99.93 %)
8
(0.07 %)
104
(100.00 %)
5,432,153
(53.13 %)
1,079,868
(7.64 %)
15,922,453
(40.31 %)
52,664
(1.24 %)
145 human (HG03579 2024)
GCA_018472835.2
n/a 19,901
(1.84 %)
20,510
(1.19 %)
n/a 40.82
(99.85 %)
20
(0.15 %)
82
(100.00 %)
5,212,749
(53.27 %)
1,079,985
(8.48 %)
15,090,949
(40.60 %)
50,698
(1.25 %)
146 human (HG03816 2024)
GCA_046116015.1
n/a 20,645
(1.85 %)
21,583
(1.23 %)
n/a 40.83
(99.99 %)
10
(0.01 %)
71
(100.00 %)
5,411,379
(52.98 %)
1,056,420
(7.38 %)
15,848,592
(40.05 %)
52,314
(1.21 %)
147 human (HG04187 2024)
GCA_045999925.1
n/a 20,658
(1.86 %)
21,440
(1.21 %)
n/a 40.83
(99.99 %)
13
(0.01 %)
104
(100.00 %)
5,408,169
(52.84 %)
1,048,862
(7.11 %)
15,889,771
(39.97 %)
52,537
(1.27 %)
148 human (HG04187 2024)
GCA_046000115.1
n/a 19,879
(1.85 %)
20,575
(1.20 %)
n/a 40.89
(99.92 %)
13
(0.08 %)
112
(100.00 %)
5,190,187
(52.82 %)
1,037,382
(7.80 %)
15,127,505
(40.20 %)
51,134
(1.32 %)
149 human (HG06807 2024)
GCA_046332005.1
n/a 20,644
(1.86 %)
21,241
(1.19 %)
n/a 40.83
(99.95 %)
8
(0.05 %)
24
(100.00 %)
5,406,406
(52.90 %)
1,049,507
(7.17 %)
16,038,939
(40.10 %)
52,115
(1.14 %)
150 human (HG06807 2024)
GCA_046332035.1
n/a 20,640
(1.85 %)
21,274
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.92 %)
9
(0.08 %)
32
(99.92 %)
5,398,273
(53.04 %)
1,047,187
(7.45 %)
15,988,404
(40.21 %)
52,197
(1.13 %)
151 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
50,826
(1.08 %)
152 human (NA12878 2018)
GCA_002077035.3
n/a 20,167
(1.92 %)
20,287
(1.19 %)
n/a 40.87
(92.33 %)
1,124
(7.67 %)
3,663
(92.33 %)
5,377,551
(52.07 %)
998,908
(3.46 %)
15,892,349
(35.13 %)
49,940
(0.97 %)
153 human (NA188792024)
GCA_046000005.1
n/a 19,834
(1.83 %)
20,566
(1.19 %)
n/a 40.85
(99.96 %)
13
(0.04 %)
92
(100.00 %)
5,228,358
(53.42 %)
1,070,191
(8.85 %)
15,068,184
(40.81 %)
51,111
(1.31 %)
154 human (NA18906 2024)
GCA_018503255.2
n/a 20,616
(1.85 %)
21,609
(1.21 %)
n/a 40.89
(99.97 %)
20
(0.03 %)
97
(100.00 %)
5,435,209
(53.04 %)
1,062,849
(7.43 %)
15,916,366
(40.22 %)
52,764
(1.31 %)
155 human (NA18906 2024)
GCA_018503285.2
n/a 20,634
(1.85 %)
21,489
(1.21 %)
n/a 40.85
(99.98 %)
13
(0.02 %)
129
(100.00 %)
5,433,903
(53.08 %)
1,079,573
(7.55 %)
15,936,640
(40.31 %)
52,673
(1.28 %)
156 human (NA18940 2024)
GCA_046332455.1
n/a 19,855
(1.86 %)
20,341
(1.19 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
38
(0.00 %)
39
(100.00 %)
5,166,016
(52.99 %)
1,045,377
(7.98 %)
15,259,333
(40.62 %)
49,995
(1.12 %)
157 human (NA18940 2024)
GCA_046332495.1
n/a 20,510
(1.87 %)
21,025
(1.20 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
60
(0.00 %)
39
(100.00 %)
5,366,250
(52.73 %)
1,023,252
(6.96 %)
15,872,050
(39.89 %)
51,435
(1.13 %)
158 human (NA18943 2024)
GCA_046332475.1
n/a 20,631
(1.85 %)
21,151
(1.19 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
14
(0.00 %)
45
(100.00 %)
5,410,717
(53.07 %)
1,052,590
(7.49 %)
15,895,361
(40.21 %)
52,188
(1.21 %)
159 human (NA18943 2024)
GCA_046332485.1
n/a 19,911
(1.85 %)
20,280
(1.19 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
20
(0.00 %)
65
(100.00 %)
5,201,531
(53.06 %)
1,055,531
(8.19 %)
15,119,598
(40.40 %)
50,689
(1.22 %)
160 human (NA18944 2024)
GCA_046332355.1
n/a 20,658
(1.84 %)
21,106
(1.19 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
23
(0.00 %)
87
(100.00 %)
5,422,912
(53.33 %)
1,079,271
(7.99 %)
15,875,472
(40.59 %)
52,277
(1.25 %)
161 human (NA18944 2024)
GCA_046332435.1
n/a 19,874
(1.85 %)
20,405
(1.19 %)
n/a 40.86
(100.00 %)
25
(0.00 %)
59
(100.00 %)
5,218,614
(53.15 %)
1,071,902
(8.41 %)
15,092,691
(40.51 %)
50,736
(1.27 %)
162 human (NA18945 2024)
GCA_046332365.1
n/a 20,600
(1.86 %)
21,160
(1.19 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
13
(0.00 %)
60
(100.00 %)
5,400,980
(52.83 %)
1,040,584
(7.09 %)
16,003,888
(40.05 %)
52,248
(1.17 %)
163 human (NA18945 2024)
GCA_046332375.1
n/a 19,928
(1.85 %)
20,422
(1.19 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
58
(100.00 %)
5,203,496
(52.98 %)
1,057,465
(8.10 %)
15,206,491
(40.39 %)
50,822
(1.17 %)
164 human (NA18948 2024)
GCA_046332305.1
n/a 20,606
(1.84 %)
21,227
(1.19 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
30
(0.00 %)
86
(100.00 %)
5,429,214
(53.36 %)
1,068,530
(8.05 %)
15,946,076
(40.67 %)
52,336
(1.26 %)
165 human (NA18948 2024)
GCA_046332325.1
n/a 19,891
(1.86 %)
20,474
(1.20 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
19
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,203,815
(52.89 %)
1,066,857
(7.80 %)
15,148,561
(40.29 %)
50,609
(1.25 %)
166 human (NA18959 2024)
GCA_046332235.1
n/a 20,658
(1.82 %)
21,278
(1.18 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
38
(0.00 %)
88
(100.00 %)
5,463,539
(53.51 %)
1,105,407
(8.32 %)
15,989,028
(40.82 %)
52,683
(1.26 %)
167 human (NA18959 2024)
GCA_046332285.1
n/a 19,878
(1.85 %)
20,600
(1.21 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
32
(0.00 %)
84
(100.00 %)
5,198,531
(52.97 %)
1,061,914
(7.96 %)
15,143,480
(40.39 %)
50,476
(1.24 %)
168 human (NA18960 2024)
GCA_046332185.1
n/a 19,886
(1.84 %)
20,501
(1.19 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
17
(0.00 %)
64
(100.00 %)
5,213,076
(53.30 %)
1,069,449
(8.42 %)
15,124,381
(40.76 %)
51,026
(1.27 %)
169 human (NA18960 2024)
GCA_046332225.1
n/a 20,643
(1.86 %)
21,057
(1.19 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
24
(0.00 %)
78
(100.00 %)
5,399,105
(52.89 %)
1,035,797
(7.21 %)
15,854,527
(40.00 %)
52,347
(1.27 %)
170 human (NA18967 2024)
GCA_046332145.1
n/a 20,612
(1.86 %)
21,186
(1.21 %)
n/a 40.86
(100.00 %)
30
(0.00 %)
83
(100.00 %)
5,396,897
(52.98 %)
1,043,595
(7.42 %)
15,907,664
(40.17 %)
52,065
(1.22 %)
171 human (NA18967 2024)
GCA_046332195.1
n/a 19,910
(1.82 %)
20,536
(1.17 %)
n/a 40.76
(100.00 %)
24
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,235,999
(53.68 %)
1,113,428
(9.17 %)
15,158,714
(41.24 %)
50,976
(1.19 %)
172 human (NA18970 2024)
GCA_046332065.1
n/a 20,692
(1.84 %)
21,336
(1.20 %)
n/a 40.86
(100.00 %)
18
(0.00 %)
64
(100.00 %)
5,426,343
(53.11 %)
1,053,561
(7.51 %)
15,842,021
(40.20 %)
52,355
(1.29 %)
173 human (NA18970 2024)
GCA_046332135.1
n/a 19,851
(1.85 %)
20,393
(1.19 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
9
(0.00 %)
53
(100.00 %)
5,182,473
(53.15 %)
1,045,263
(8.29 %)
15,140,005
(40.60 %)
50,307
(1.23 %)
174 human (NA18982 2024)
GCA_046332015.1
n/a 20,592
(1.85 %)
21,241
(1.19 %)
n/a 40.87
(100.00 %)
19
(0.00 %)
69
(100.00 %)
5,418,000
(52.88 %)
1,067,106
(7.21 %)
16,004,757
(40.25 %)
52,206
(1.32 %)
175 human (NA18982 2024)
GCA_046332025.1
n/a 19,857
(1.82 %)
20,381
(1.18 %)
n/a 40.79
(100.00 %)
27
(0.00 %)
63
(100.00 %)
5,242,333
(53.63 %)
1,120,557
(9.06 %)
15,139,401
(41.19 %)
50,943
(1.28 %)
176 human (NA191592024)
GCA_046056445.1
n/a 20,655
(1.84 %)
21,496
(1.19 %)
n/a 40.85
(99.95 %)
15
(0.05 %)
83
(100.00 %)
5,443,244
(53.30 %)
1,081,069
(7.89 %)
15,844,530
(40.47 %)
52,630
(1.31 %)
177 human (NA191592024)
GCA_046056495.1
n/a 20,655
(1.86 %)
21,548
(1.21 %)
n/a 40.85
(99.90 %)
10
(0.10 %)
75
(99.91 %)
5,424,391
(52.86 %)
1,073,429
(7.16 %)
15,860,016
(39.94 %)
52,355
(1.31 %)
178 human (NA19240 2024)
GCA_018503265.2
n/a 20,736
(1.85 %)
21,366
(1.20 %)
n/a 40.85
(99.95 %)
32
(0.05 %)
79
(99.96 %)
5,432,037
(53.11 %)
1,068,751
(7.57 %)
15,927,055
(40.30 %)
52,483
(1.27 %)
179 human (NA19240 2024)
GCA_018503275.2
n/a 20,678
(1.85 %)
21,384
(1.21 %)
n/a 40.83
(99.95 %)
23
(0.05 %)
72
(99.96 %)
5,399,522
(52.96 %)
1,040,689
(7.31 %)
16,026,901
(40.22 %)
52,149
(1.17 %)
180 human (NA20129.mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
53,011
(1.20 %)
181 human (NA20129.pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
52,911
(1.18 %)
182 human (NA205032025)
GCA_046629205.1
n/a 20,562
(1.85 %)
21,096
(1.19 %)
n/a 40.81
(99.97 %)
14
(0.03 %)
38
(100.00 %)
5,375,032
(52.92 %)
1,016,653
(7.22 %)
16,026,063
(40.23 %)
51,635
(1.07 %)
183 human (NA205032025)
GCA_046629565.1
n/a 20,605
(1.85 %)
21,220
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.96 %)
21
(0.04 %)
43
(100.00 %)
5,401,119
(53.02 %)
1,044,571
(7.41 %)
16,013,078
(40.22 %)
52,203
(1.10 %)
184 human (NA207522024)
GCA_045999885.1
n/a 20,622
(1.84 %)
21,482
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.93 %)
20
(0.07 %)
89
(100.00 %)
5,441,275
(53.20 %)
1,080,520
(7.75 %)
15,988,567
(40.62 %)
52,820
(1.36 %)
185 human (NA207522024)
GCA_046000145.1
n/a 19,881
(1.85 %)
20,667
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.94 %)
9
(0.06 %)
78
(100.00 %)
5,200,746
(52.92 %)
1,056,828
(7.88 %)
15,216,722
(40.40 %)
50,957
(1.30 %)
186 human (NA207622025)
GCA_046629215.1
n/a 19,658
(1.84 %)
20,101
(1.18 %)
n/a 40.78
(99.97 %)
17
(0.03 %)
32
(100.00 %)
5,176,548
(53.05 %)
1,048,439
(7.99 %)
15,220,163
(40.56 %)
49,591
(1.10 %)
187 human (NA207622025)
GCA_046629575.1
n/a 20,637
(1.86 %)
21,110
(1.19 %)
n/a 40.81
(99.97 %)
25
(0.03 %)
36
(100.00 %)
5,393,307
(52.97 %)
1,043,417
(7.38 %)
15,874,460
(40.13 %)
51,848
(1.10 %)
188 human (NA20806 2025)
GCA_046629235.1
n/a 19,818
(1.86 %)
20,467
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.98 %)
12
(0.02 %)
31
(100.00 %)
5,163,304
(52.73 %)
1,023,894
(7.51 %)
15,223,590
(40.21 %)
50,681
(1.12 %)
189 human (NA208062025)
GCA_046629225.1
n/a 20,671
(1.84 %)
21,216
(1.19 %)
n/a 40.84
(99.99 %)
9
(0.01 %)
35
(100.00 %)
5,437,209
(53.37 %)
1,071,550
(8.04 %)
16,086,249
(40.70 %)
52,357
(1.10 %)
190 human (NA208272025)
GCA_046629265.1
n/a 20,639
(1.85 %)
21,357
(1.20 %)
n/a 40.80
(99.95 %)
24
(0.05 %)
40
(100.00 %)
5,404,455
(53.14 %)
1,053,146
(7.66 %)
15,986,535
(40.33 %)
52,056
(1.11 %)
191 human (NA21309 2024)
GCA_018504655.2
n/a 20,624
(1.84 %)
21,546
(1.20 %)
n/a 40.84
(99.91 %)
25
(0.09 %)
84
(100.00 %)
5,414,141
(53.25 %)
1,047,693
(7.83 %)
15,944,641
(40.45 %)
52,384
(1.21 %)
192 human (NA21309.pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
52,798
(1.17 %)
193 human (NA24385 2024)
GCA_018852605.3
n/a 19,911
(1.84 %)
20,386
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.74 %)
4
(0.26 %)
27
(99.74 %)
5,196,876
(53.37 %)
1,083,107
(8.63 %)
15,221,623
(40.81 %)
50,567
(1.11 %)
194 human (NA24385 2024)
GCA_018852615.3
n/a 20,672
(1.86 %)
21,183
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,318
(53.04 %)
1,041,890
(7.44 %)
16,039,468
(40.04 %)
52,111
(1.11 %)
195 human (NA24631.mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
53,731
(1.31 %)
196 human (NA24631.pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
53,164
(1.35 %)
197 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
49,325
(1.10 %)
198 lesser dwarf lemur
GCA_004024725.1
n/a 22,605
(1.80 %)
35,000
(1.46 %)
93,377
(1.59 %)
40.49
(99.93 %)
7,529
(0.03 %)
555,280
(99.97 %)
3,959,297
(40.17 %)
448,919
(1.48 %)
14,173,023
(34.36 %)
59,165
(1.83 %)
199 liontail macaque (KIZ-2021_14 2022)
GCA_023807365.1
n/a 20,076
(1.92 %)
21,253
(1.27 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
n/a 1,809
(100.00 %)
5,224,024
(50.13 %)
966,236
(2.84 %)
15,526,314
(37.59 %)
95,662
(1.45 %)
200 Ma's night monkey (86115 2017)
GCF_000952055.2
55,074
(2.59 %)
21,075
(1.93 %)
22,284
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,930
(5.15 %)
112,851
(94.85 %)
5,110,193
(47.72 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,219
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
201 Ma's night monkey (86718 primary hap 2023)
GCF_030222135.1
68,130
(2.77 %)
21,473
(1.75 %)
22,864
(1.27 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,279
(100.00 %)
6,068,780
(50.14 %)
1,323,878
(14.77 %)
14,791,453
(44.23 %)
39,298
(0.97 %)
202 mandrill (KIZ-2021_16 2022)
GCA_023783085.1
n/a 19,791
(1.87 %)
20,371
(1.22 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
n/a 2,118
(100.00 %)
5,243,719
(50.36 %)
887,893
(4.65 %)
15,735,772
(37.47 %)
56,250
(1.08 %)
203 mantled guereza (KIZ-2021_5 2022)
GCA_021498455.1
n/a 20,513
(1.82 %)
19,660
(1.13 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
1,497
(0.01 %)
1,657
(100.00 %)
5,461,121
(51.32 %)
883,213
(4.71 %)
16,070,936
(39.09 %)
88,240
(1.32 %)
204 mantled howler monkey
GCA_004027835.1
n/a 26,541
(1.65 %)
40,210
(1.16 %)
41,017
(1.17 %)
40.83
(99.88 %)
16,130
(0.05 %)
1,152,695
(99.95 %)
6,216,031
(48.47 %)
1,428,462
(4.68 %)
16,106,098
(41.41 %)
41,196
(0.86 %)
205 Midas tamarin (KIZ-2021_24 2022)
GCA_021498475.1
n/a 22,338
(1.81 %)
21,018
(1.21 %)
n/a 40.83
(99.99 %)
2,202
(0.01 %)
1,785
(100.00 %)
5,279,304
(49.24 %)
891,690
(5.38 %)
15,489,304
(40.20 %)
33,273
(0.87 %)
206 Mittermeier's mouse lemur (MBB011 2019)
GCA_008750955.1
n/a 29,260
(1.35 %)
67,847
(1.24 %)
n/a 41.40
(99.97 %)
5
(0.00 %)
519,784
(100.00 %)
5,222,743
(40.21 %)
829,392
(2.00 %)
18,470,705
(32.22 %)
114,172
(2.72 %)
207 Moholi bushbaby (KIZ-2021_8 2022)
GCA_023783435.1
n/a 21,770
(1.69 %)
22,699
(1.34 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
n/a 11,899
(100.00 %)
4,165,183
(35.88 %)
517,791
(1.28 %)
14,030,905
(35.05 %)
24,950
(0.68 %)
208 mongoose lemur (Sample1262 2023)
GCA_028534055.1
n/a 21,099
(1.77 %)
26,747
(1.35 %)
n/a 41.07
(99.28 %)
50,948
(0.64 %)
1,055,658
(100.00 %)
4,281,042
(38.54 %)
463,179
(0.85 %)
15,648,643
(29.74 %)
60,222
(1.53 %)
209 northern giant mouse lemur (DLC2301 2019)
GCA_008750895.1
n/a 24,310
(1.79 %)
41,143
(1.48 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
8,621
(0.01 %)
150,551
(99.99 %)
3,988,204
(40.75 %)
558,305
(1.67 %)
14,391,423
(31.84 %)
69,842
(2.42 %)
210 northern rufous mouse lemur (RMR71 2019)
GCA_008750935.1
n/a 26,930
(1.57 %)
53,040
(1.36 %)
n/a 41.19
(99.96 %)
21,784
(0.02 %)
367,864
(99.98 %)
4,447,327
(40.51 %)
735,909
(2.38 %)
15,424,516
(33.03 %)
91,576
(2.46 %)
211 northern white-cheeked gibbon (2019 U. Washington)
GCF_006542625.1
60,700
(2.64 %)
20,360
(1.92 %)
21,533
(1.26 %)
50,062
(2.05 %)
41.03
(99.47 %)
510
(0.53 %)
2,762
(99.47 %)
5,237,782
(51.76 %)
902,578
(4.06 %)
15,431,824
(38.31 %)
71,450
(1.25 %)
212 olive baboon (2019 UCSF)
GCF_008728515.1
93,398
(3.84 %)
20,382
(1.88 %)
21,115
(1.19 %)
56,345
(1.82 %)
40.89
(99.92 %)
4,098
(0.08 %)
11,145
(100.00 %)
5,514,823
(51.36 %)
937,126
(2.31 %)
16,410,891
(37.14 %)
77,919
(1.22 %)
213 Panamanian white-faced capuchin
GCF_001604975.1
68,109
(2.82 %)
21,215
(2.01 %)
21,494
(1.35 %)
48,384
(2.19 %)
40.71
(96.08 %)
152,704
(3.94 %)
140,597
(96.06 %)
4,992,577
(47.59 %)
760,554
(1.72 %)
15,071,867
(33.72 %)
30,688
(0.83 %)
214 Pere David's macaque
GCF_024542745.1
74,792
(3.50 %)
20,233
(1.92 %)
20,671
(1.23 %)
56,171
(2.40 %)
41.00
(99.99 %)
367
(0.01 %)
623
(100.00 %)
5,363,770
(51.19 %)
1,033,990
(2.95 %)
15,744,042
(37.44 %)
90,119
(1.42 %)
215 Phayre's leaf monkey (KIZ-2021_27 2022)
GCA_023762245.1
n/a 20,209
(1.84 %)
19,385
(1.14 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
n/a 2,946
(100.00 %)
5,406,430
(51.05 %)
923,398
(4.93 %)
15,879,389
(38.48 %)
53,257
(0.95 %)
216 Philippine tarsier
GCF_000164805.1
35,799
(1.36 %)
21,606
(1.23 %)
25,636
(1.04 %)
n/a 40.96
(98.61 %)
155,714
(1.39 %)
492,903
(98.61 %)
6,462,952
(48.20 %)
1,062,043
(2.47 %)
18,768,491
(40.02 %)
78,629
(1.04 %)
217 pig-tailed macaque
GCF_000956065.1
90,971
(3.40 %)
20,184
(1.89 %)
21,096
(1.24 %)
n/a 40.98
(96.27 %)
84,363
(3.74 %)
94,057
(96.26 %)
5,479,257
(50.37 %)
936,458
(2.35 %)
16,932,843
(34.70 %)
82,528
(1.29 %)
218 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 refseq)
GCF_043159975.1
103,003
(4.05 %)
20,760
(1.76 %)
21,155
(1.14 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
260
(0.00 %)
361
(100.00 %)
5,396,194
(53.53 %)
1,039,569
(9.75 %)
15,407,787
(41.73 %)
99,854
(1.52 %)
219 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1
n/a 19,859
(1.78 %)
20,597
(1.19 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
232
(0.00 %)
233
(100.00 %)
5,125,011
(53.00 %)
956,928
(9.12 %)
14,621,759
(41.68 %)
96,199
(1.55 %)
220 pileated gibbon (KIZ-2021_10 2022)
GCA_021498465.1
n/a 19,878
(1.87 %)
19,755
(1.17 %)
49,811
(2.04 %)
41.16
(100.00 %)
824
(0.00 %)
743
(100.00 %)
5,336,929
(51.61 %)
960,136
(5.35 %)
15,409,711
(39.22 %)
93,447
(1.65 %)
221 proboscis monkey
GCA_004027105.1
n/a 26,778
(1.60 %)
43,314
(1.07 %)
n/a 41.01
(99.89 %)
18,289
(0.06 %)
942,104
(99.94 %)
6,402,701
(53.25 %)
1,093,958
(2.69 %)
16,752,195
(39.70 %)
90,071
(1.21 %)
222 pygmy chimpanzee (maternal 2024)
GCA_028858845.2
n/a 21,057
(1.75 %)
23,202
(1.22 %)
n/a 40.39
(99.88 %)
5
(0.12 %)
32
(100.00 %)
5,376,557
(50.39 %)
977,561
(12.42 %)
15,866,049
(43.26 %)
48,064
(1.07 %)
223 pygmy chimpanzee (Mhudiblu Carbone 601152 2020)
GCF_013052645.1
85,034
(3.05 %)
n/a 21,403
(1.16 %)
n/a 40.57
(98.80 %)
683
(1.20 %)
4,976
(98.80 %)
4,937,695
(46.41 %)
960,717
(8.41 %)
15,846,875
(40.31 %)
45,540
(0.95 %)
224 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2
n/a 20,282
(1.77 %)
21,509
(1.17 %)
n/a 40.46
(99.84 %)
7
(0.16 %)
38
(100.00 %)
5,163,745
(50.07 %)
970,057
(12.58 %)
15,047,429
(42.91 %)
47,029
(1.08 %)
225 pygmy chimpanzee (Ulindi refseq 2015)
GCF_000258655.2
59,332
(2.62 %)
19,943
(1.95 %)
18,807
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,134,959
(50.88 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,598
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
226 pygmy chimpanzee (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_029289425.2
95,418
(45.95 %)
21,181
(1.74 %)
23,352
(1.22 %)
n/a 40.43
(99.84 %)
6
(0.16 %)
30
(100.00 %)
5,436,198
(50.57 %)
1,021,767
(12.45 %)
15,964,580
(43.17 %)
48,818
(1.07 %)
227 red guenon (BS28 Broad 2019)
GCA_004027335.1
n/a 26,554
(1.40 %)
43,056
(0.94 %)
n/a 41.19
(99.83 %)
13,075
(0.04 %)
2,577,035
(99.96 %)
7,718,970
(56.55 %)
2,223,871
(8.85 %)
18,186,363
(47.01 %)
109,358
(1.37 %)
228 red guenon (KIZ-2021_7 2022)
GCA_023783455.1
n/a 20,288
(1.73 %)
20,892
(1.15 %)
n/a 40.85
(100.00 %)
n/a 4,898
(100.00 %)
5,459,763
(52.49 %)
1,156,816
(8.57 %)
16,254,962
(40.87 %)
61,197
(1.47 %)
229 red shanked douc langur
GCA_004024825.1
n/a 25,296
(1.59 %)
37,062
(1.07 %)
n/a 41.05
(99.87 %)
14,638
(0.05 %)
1,445,731
(99.95 %)
6,884,034
(54.54 %)
1,201,033
(2.95 %)
16,938,986
(42.00 %)
84,642
(1.12 %)
230 reddish-gray mouse lemur (RMR66 2019)
GCA_008750995.1
n/a 28,284
(1.38 %)
64,198
(1.25 %)
n/a 41.32
(99.96 %)
16,590
(0.01 %)
496,470
(99.99 %)
4,941,897
(40.30 %)
757,406
(1.81 %)
17,239,695
(32.13 %)
109,156
(2.79 %)
231 Rhesus monkey (2019 U. Washington)
GCF_003339765.1
86,732
(3.15 %)
20,455
(1.85 %)
21,565
(1.21 %)
n/a 41.00
(98.84 %)
248
(1.16 %)
3,268
(98.84 %)
5,469,991
(52.68 %)
993,786
(5.32 %)
16,005,457
(38.50 %)
86,250
(1.31 %)
232 Rhesus monkey (MMU2019108-1 2025)
GCA_049350105.1
n/a 20,446
(1.75 %)
21,348
(1.15 %)
n/a 41.09
(100.00 %)
n/a 23
(100.00 %)
5,386,517
(53.62 %)
1,035,925
(10.10 %)
15,388,350
(41.80 %)
94,931
(1.71 %)
233 ring-tailed lemur (KIZ-2021_28 2022)
GCA_023759835.1
n/a 18,759
(2.14 %)
21,046
(1.64 %)
n/a 40.84
(99.28 %)
377
(0.72 %)
141
(100.00 %)
3,366,830
(38.74 %)
358,575
(0.94 %)
13,276,207
(29.01 %)
48,332
(1.71 %)
234 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1
n/a 18,683
(1.98 %)
21,178
(1.55 %)
n/a 41.29
(100.00 %)
1
(0.00 %)
312
(100.00 %)
3,400,356
(36.84 %)
511,707
(7.13 %)
13,027,744
(33.21 %)
50,614
(1.83 %)
235 ring-tailed lemur (primary hap 2021)
GCF_020740605.2
55,896
(2.78 %)
18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
50,626
(1.88 %)
236 ruffed lemur (Sample0354 2023)
GCA_028533085.1
n/a 21,372
(1.82 %)
26,571
(1.36 %)
n/a 41.08
(99.19 %)
45,655
(0.74 %)
984,208
(100.00 %)
4,143,503
(38.33 %)
474,523
(1.05 %)
15,408,098
(29.48 %)
61,201
(1.54 %)
237 Sclater's lemur (Harlow 2015)
GCA_001262665.1
n/a 19,832
(2.09 %)
23,882
(1.58 %)
n/a 40.77
(99.01 %)
254,375
(1.01 %)
292,741
(98.99 %)
3,621,134
(39.99 %)
434,393
(1.73 %)
13,470,199
(29.03 %)
47,664
(1.66 %)
238 siamang (KIZ-2021_26 2022)
GCA_023761135.1
n/a 20,252
(1.97 %)
19,183
(1.17 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,409
(100.00 %)
5,185,231
(50.44 %)
853,966
(2.06 %)
15,282,516
(37.75 %)
86,013
(1.38 %)
239 siamang gibbon (v2.1 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.3
105,374
(3.05 %)
20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
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(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
240 siamang gibbon (v3 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3
n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
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(55.54 %)
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(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
87,907
(1.41 %)
241 silvery gibbon (v3 HMO894 2021 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.3
71,182
(2.77 %)
20,473
(1.95 %)
21,198
(1.20 %)
42,343
(1.45 %)
41.02
(97.81 %)
25,102
(2.19 %)
43,501
(97.81 %)
5,238,212
(50.30 %)
857,561
(2.26 %)
15,565,288
(36.84 %)
80,124
(1.26 %)
242 slender loris (KIZ-2021_12 2022)
GCA_023783135.1
n/a 21,119
(1.53 %)
20,944
(1.30 %)
n/a 40.33
(100.00 %)
n/a 3,586
(100.00 %)
4,366,787
(38.90 %)
712,115
(1.34 %)
14,063,325
(39.26 %)
23,070
(0.64 %)
243 slow loris (alternate hap 2022)
GCA_027406535.1
n/a 21,660
(1.50 %)
22,771
(1.32 %)
n/a 40.88
(100.00 %)
n/a 6,485
(100.00 %)
4,275,926
(39.13 %)
533,324
(1.57 %)
13,459,597
(39.86 %)
35,720
(0.78 %)
244 slow loris (primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,213
(2.59 %)
22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
38,257
(0.77 %)
245 small-eared galago
GCF_000181295.1
38,532
(2.11 %)
20,477
(1.82 %)
19,107
(1.43 %)
n/a 41.11
(93.67 %)
192,447
(6.36 %)
200,099
(93.64 %)
4,369,204
(39.41 %)
454,913
(1.11 %)
13,579,820
(30.37 %)
21,834
(0.62 %)
246 sooty mangabey
GCF_000955945.1
76,860
(3.18 %)
20,065
(1.92 %)
21,156
(1.27 %)
n/a 40.92
(97.87 %)
65,329
(2.14 %)
76,752
(97.86 %)
5,287,418
(49.49 %)
908,575
(2.58 %)
16,543,149
(35.26 %)
70,987
(1.22 %)
247 southern white-cheeked gibbon (KIZ-2021_17 2022)
GCA_023783065.1
n/a 19,823
(1.91 %)
20,366
(1.23 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
1,118
(0.00 %)
2,647
(100.00 %)
5,227,312
(50.63 %)
931,266
(5.19 %)
15,489,839
(38.00 %)
68,528
(1.21 %)
248 Sumatran orangutan (Susie 2018 refseq)
GCF_002880775.1
58,185
(2.32 %)
20,151
(1.79 %)
21,000
(1.15 %)
47,843
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,814
(99.30 %)
5,483,266
(54.37 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,624
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
249 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2
n/a 19,884
(1.79 %)
20,383
(1.18 %)
n/a 40.95
(99.75 %)
10
(0.25 %)
48
(100.00 %)
5,192,176
(53.57 %)
950,166
(9.22 %)
15,240,038
(41.74 %)
41,928
(1.16 %)
250 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 genbank)
GCA_028885655.2
102,148
(44.55 %)
20,870
(1.72 %)
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(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
11
(0.25 %)
29
(100.00 %)
5,567,804
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,828
(42.80 %)
44,397
(1.13 %)
251 Sumatran orangutan (v2 AG06213 primary hap 2024 refseq)
GCF_028885655.2
102,148
(3.49 %)
20,870
(1.72 %)
21,383
(1.14 %)
n/a 40.88
(99.75 %)
11
(0.25 %)
30
(100.00 %)
5,567,810
(54.83 %)
1,092,396
(10.36 %)
16,195,884
(42.80 %)
44,397
(1.13 %)
252 Sykes' monkey (KIZ-2021_3 2022)
GCA_023783535.1
n/a 20,020
(1.91 %)
21,417
(1.26 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
n/a 3,544
(100.00 %)
5,194,608
(49.70 %)
1,130,857
(4.69 %)
15,669,171
(37.68 %)
62,090
(1.70 %)
253 tamarin
GCA_004024885.1
n/a 27,243
(1.48 %)
39,487
(1.07 %)
n/a 40.80
(99.88 %)
8,881
(0.03 %)
1,675,070
(99.97 %)
6,528,752
(48.25 %)
1,388,724
(3.61 %)
16,922,829
(45.18 %)
38,319
(0.73 %)
254 tufted capuchin (KIZ-2021_25 2022)
GCA_023762875.2
n/a 20,999
(1.92 %)
21,502
(1.28 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
n/a 4,172
(100.00 %)
5,167,318
(47.46 %)
855,869
(5.15 %)
15,361,132
(37.38 %)
33,858
(0.88 %)
255 tufted capuchin (Saskatoon/1434 2019)
GCF_009761245.1
80,991
(3.26 %)
21,426
(1.96 %)
22,733
(1.32 %)
41,366
(1.58 %)
40.84
(98.69 %)
43,216
(1.31 %)
59,885
(98.69 %)
5,056,660
(48.03 %)
783,505
(2.08 %)
15,052,178
(35.96 %)
32,890
(0.86 %)
256 Ugandan red Colobus (RC106 v5 2019)
GCF_002776525.5
63,486
(2.54 %)
21,357
(1.88 %)
22,980
(1.19 %)
n/a 40.87
(97.07 %)
56,505
(2.93 %)
32,287
(100.00 %)
5,425,300
(50.81 %)
949,826
(2.73 %)
16,126,286
(36.98 %)
71,044
(1.10 %)
257 western lowland gorilla (Kamilah 2019)
GCF_008122165.1
61,950
(2.48 %)
20,030
(1.78 %)
20,511
(1.13 %)
n/a 40.65
(98.49 %)
859
(1.51 %)
6,345
(98.49 %)
5,311,418
(50.53 %)
928,667
(8.55 %)
15,660,901
(40.30 %)
44,578
(0.92 %)
258 western lowland gorilla (maternal KB3781 2024)
GCA_028885495.2
n/a 20,949
(1.58 %)
61,054
(2.07 %)
n/a 40.52
(99.94 %)
5
(0.06 %)
225
(100.00 %)
5,421,917
(50.94 %)
1,053,588
(20.37 %)
15,761,557
(48.26 %)
74,868
(1.19 %)
259 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2
n/a 20,265
(1.62 %)
40,901
(1.63 %)
n/a 40.53
(99.94 %)
2
(0.06 %)
24
(100.00 %)
5,171,525
(50.35 %)
1,002,906
(19.45 %)
15,064,682
(47.42 %)
64,337
(1.17 %)
260 white-faced saki (BS33 Broad 2019)
GCA_004026645.1
n/a 24,422
(1.69 %)
35,685
(1.16 %)
n/a 40.61
(99.91 %)
11,316
(0.04 %)
903,646
(99.96 %)
5,716,344
(47.85 %)
1,234,286
(3.25 %)
16,179,207
(39.57 %)
41,862
(0.89 %)
261 white-faced saki (KIZ-2021_20 2022)
GCA_023779675.1
n/a 20,493
(1.97 %)
19,054
(1.21 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
n/a 1,360
(100.00 %)
4,973,394
(47.65 %)
847,663
(1.77 %)
15,296,297
(36.49 %)
42,149
(0.99 %)
262 white-fronted capuchin (BS31 Broad 2019)
GCA_004027755.1
n/a 27,984
(1.50 %)
47,384
(1.05 %)
n/a 41.14
(99.86 %)
13,723
(0.04 %)
1,552,889
(99.96 %)
6,023,876
(46.47 %)
1,002,459
(2.29 %)
16,673,880
(41.02 %)
37,693
(0.79 %)
263 white-fronted capuchin (KIZ-2021_2 2022)
GCA_023783575.1
n/a 21,215
(1.84 %)
21,192
(1.25 %)
n/a 40.84
(100.00 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
5,245,303
(48.38 %)
857,966
(4.71 %)
15,838,894
(37.91 %)
34,161
(0.89 %)
264 white-tufted-ear marmoset (220 alternate hap 2025)
GCA_049354675.1
n/a 21,815
(1.86 %)
21,774
(1.27 %)
n/a 40.83
(99.98 %)
16
(0.02 %)
39
(99.98 %)
5,129,888
(47.53 %)
824,075
(5.08 %)
15,081,381
(39.51 %)
36,707
(0.91 %)
265 white-tufted-ear marmoset (220 primary hap 2025)
GCA_049354665.1
n/a 21,835
(1.85 %)
21,653
(1.27 %)
n/a 40.81
(99.98 %)
9
(0.02 %)
32
(99.98 %)
5,124,845
(47.45 %)
822,962
(5.19 %)
15,096,857
(39.61 %)
36,962
(0.90 %)
266 white-tufted-ear marmoset (240 alternate hap 2025)
GCA_049354655.1
n/a 20,992
(1.89 %)
20,825
(1.29 %)
n/a 40.93
(99.99 %)
7
(0.01 %)
29
(99.99 %)
4,874,970
(46.96 %)
792,611
(5.17 %)
14,189,375
(39.15 %)
35,398
(0.93 %)
267 white-tufted-ear marmoset (cj1700 2020)
GCF_009663435.1
107,273
(3.59 %)
21,782
(1.87 %)
21,450
(1.28 %)
n/a 40.85
(98.69 %)
380
(1.31 %)
1,429
(98.69 %)
5,135,344
(49.42 %)
823,949
(3.69 %)
15,140,752
(38.06 %)
36,875
(0.90 %)
268 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
5,099,933
(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
36,133
(0.92 %)
269 white-tufted-ear marmoset (paternal X 2020)
GCA_011100555.1
n/a 21,709
(1.91 %)
21,245
(1.29 %)
70,349
(2.24 %)
40.95
(99.53 %)
959
(0.47 %)
353
(100.00 %)
5,123,971
(49.94 %)
785,181
(2.64 %)
15,163,086
(37.93 %)
36,768
(0.93 %)
270 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 refseq)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
21,801
(1.88 %)
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(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
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(47.71 %)
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(3.26 %)
15,161,534
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37,603
(0.93 %)
271 white-tufted-ear marmoset (v1.2 paternal 2021)
GCA_011100535.2
n/a 21,014
(1.91 %)
20,671
(1.30 %)
n/a 41.00
(99.58 %)
994
(0.42 %)
1,217
(100.00 %)
4,785,940
(47.16 %)
804,242
(3.32 %)
14,427,732
(38.00 %)
36,057
(0.95 %)
TOTALS:total assembly count 271

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Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 271 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 433 assemblies assembly stats track stats
Fishes 493 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 317 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1177 assemblies assembly stats track stats
Plants 320 assemblies assembly stats track stats
Fungi 922 assemblies assembly stats track stats
Viruses 703 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 318 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 663 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1179 assemblies assembly stats track stats