Primates Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of primates only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Angolan colobus
GCF_000951035.1
42,929
(2.28 %)
20,358
(1.94 %)
18,701
(1.25 %)
47,034
(1.83 %)
40.80
(90.25 %)
184,001
(9.77 %)
197,124
(90.23 %)
5,089,134
(49.30 %)
752,280
(2.06 %)
15,645,270
(32.03 %)
59,852
(0.82 %)
2 aye-aye
GCA_004027145.1
n/a 20,687
(1.84 %)
25,007
(1.35 %)
37,179
(1.61 %)
39.96
(99.96 %)
2,527
(0.01 %)
344,978
(99.99 %)
4,030,997
(43.30 %)
358,965
(0.72 %)
15,568,152
(32.48 %)
36,248
(1.03 %)
3 babakoto
GCA_004363605.1
n/a 23,765
(1.47 %)
45,432
(1.22 %)
n/a 41.26
(99.89 %)
4,885
(0.02 %)
1,248,425
(99.98 %)
4,664,535
(39.88 %)
529,666
(1.21 %)
16,469,880
(32.15 %)
71,607
(1.62 %)
4 black snub-nosed monkey (Rb0 v2 refseq 2016)
GCF_001698545.2
59,194
(2.48 %)
21,210
(1.88 %)
22,226
(1.22 %)
n/a 40.93
(94.12 %)
149,839
(5.89 %)
103,881
(100.00 %)
5,531,353
(50.33 %)
991,662
(2.45 %)
16,353,330
(34.27 %)
80,076
(1.15 %)
5 black-handed spider monkey
GCA_004024785.1
n/a 25,398
(1.69 %)
39,133
(1.17 %)
36,843
(0.90 %)
40.69
(99.91 %)
9,415
(0.03 %)
878,490
(99.97 %)
5,570,166
(47.38 %)
971,371
(2.96 %)
16,050,074
(38.92 %)
35,079
(0.81 %)
6 Bolivian titi
GCA_004027715.1
n/a 25,728
(1.58 %)
43,866
(1.11 %)
n/a 41.02
(99.91 %)
7,382
(0.02 %)
1,041,365
(99.98 %)
5,701,983
(47.08 %)
971,231
(2.78 %)
16,165,964
(39.80 %)
58,357
(1.13 %)
7 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.1 BCM 2021)
GCF_016699345.2
53,017
(2.41 %)
20,575
(1.98 %)
21,201
(1.34 %)
n/a 40.96
(99.56 %)
1,073
(0.44 %)
2,786
(99.56 %)
5,041,616
(47.75 %)
946,197
(3.04 %)
14,604,089
(36.98 %)
37,271
(1.03 %)
8 Bornean orangutan (AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
52,294
(2.02 %)
9 brown lemur
GCA_004027275.1
n/a 25,130
(1.40 %)
50,986
(1.20 %)
n/a 41.37
(99.87 %)
3,706
(0.01 %)
1,697,619
(99.99 %)
4,981,207
(40.80 %)
1,645,565
(2.98 %)
15,859,279
(37.12 %)
71,873
(1.66 %)
10 chimpanzee (Clint C0471 2018)
GCF_002880755.1
102,471
(3.40 %)
20,506
(1.82 %)
22,412
(1.23 %)
n/a 40.71
(98.96 %)
715
(1.04 %)
5,254
(98.96 %)
5,367,697
(53.49 %)
996,217
(7.30 %)
16,057,940
(39.54 %)
46,151
(0.97 %)
11 chimpanzee (AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
61,901
(2.29 %)
12 Coquerel's mouse lemur
GCA_004024645.1
n/a 24,097
(1.75 %)
40,335
(1.41 %)
n/a 40.86
(99.92 %)
10,667
(0.05 %)
451,546
(99.95 %)
4,093,701
(41.14 %)
571,851
(1.36 %)
14,292,721
(33.40 %)
70,569
(2.29 %)
13 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 refseq)
GCF_000956105.1
29,369
(2.19 %)
19,298
(2.12 %)
21,783
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,070
(74.47 %)
3,419,964
(39.32 %)
304,035
(0.59 %)
13,333,892
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
14 crab-eating macaque (2020 cy0333)
GCA_011100615.1
n/a 20,178
(1.86 %)
20,316
(1.21 %)
66,582
(2.60 %)
41.01
(98.70 %)
560
(1.30 %)
1,496
(98.70 %)
5,424,163
(51.37 %)
894,914
(3.04 %)
16,026,015
(36.93 %)
72,765
(1.24 %)
15 crab-eating macaque CE1976F Keio U/RIKEN 2021
GCF_012559485.2
87,255
(3.15 %)
20,054
(1.91 %)
20,456
(1.23 %)
n/a 40.98
(99.99 %)
605
(0.01 %)
401
(100.00 %)
5,272,147
(51.07 %)
941,877
(2.83 %)
15,772,147
(37.48 %)
90,103
(1.40 %)
16 De Brazza's monkey
GCA_004027615.1
n/a 26,901
(1.31 %)
46,619
(0.90 %)
n/a 41.18
(99.85 %)
7,534
(0.02 %)
2,126,734
(99.98 %)
6,751,052
(54.69 %)
1,804,857
(10.22 %)
16,954,884
(44.26 %)
104,630
(1.53 %)
17 drill
GCF_000951045.1
42,567
(2.25 %)
20,205
(1.90 %)
18,407
(1.23 %)
n/a 40.73
(88.91 %)
233,234
(11.12 %)
246,054
(88.88 %)
5,166,355
(49.05 %)
834,739
(2.92 %)
15,970,905
(31.27 %)
42,242
(0.62 %)
18 Francois's langur
GCF_009764315.1
80,215
(2.83 %)
20,478
(1.87 %)
20,685
(1.19 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
766
(0.00 %)
1,016
(100.00 %)
5,471,638
(52.57 %)
928,320
(2.95 %)
15,652,774
(38.76 %)
129,321
(1.71 %)
19 gelada
GCF_003255815.1
59,570
(2.42 %)
20,532
(1.90 %)
21,017
(1.20 %)
n/a 40.96
(98.37 %)
27,860
(1.63 %)
15,308
(100.00 %)
5,467,919
(51.71 %)
982,616
(2.99 %)
15,865,443
(36.88 %)
93,504
(1.36 %)
20 golden snub-nosed monkey (2019 Northwest U)
GCF_007565055.1
64,150
(2.41 %)
21,162
(1.81 %)
20,993
(1.14 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
2,832
(0.01 %)
3,257
(100.00 %)
5,619,018
(53.60 %)
1,226,902
(6.20 %)
15,833,648
(40.58 %)
99,771
(1.51 %)
21 gray mouse lemur
GCF_000165445.2
74,341
(3.53 %)
20,032
(1.90 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,364
(4.06 %)
50,983
(95.94 %)
4,083,660
(41.60 %)
582,431
(1.47 %)
14,808,653
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
22 green monkey 1994-021 (2014 refseq)
GCF_000409795.2
76,050
(3.13 %)
19,995
(1.95 %)
50,732
(6.99 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,940
(1.35 %)
163,018
(98.65 %)
5,266,458
(49.55 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,224
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
23 green monkey WHO RCB 10-87
GCF_015252025.1
73,115
(2.94 %)
20,320
(1.83 %)
21,251
(1.19 %)
n/a 41.07
(99.75 %)
8,419
(0.25 %)
6,872
(100.00 %)
5,517,731
(51.10 %)
1,158,729
(3.95 %)
16,622,084
(37.82 %)
67,267
(1.70 %)
24 Hanuman langur
GCA_004025065.1
n/a 27,338
(1.54 %)
46,486
(1.04 %)
n/a 41.28
(99.89 %)
13,786
(0.05 %)
1,077,535
(99.95 %)
6,409,019
(52.08 %)
1,008,391
(1.92 %)
16,519,816
(39.37 %)
95,794
(1.26 %)
25 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
52,702
(1.17 %)
26 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
52,377
(1.20 %)
27 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
52,502
(1.20 %)
28 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
50,988
(1.20 %)
29 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
52,411
(1.14 %)
30 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a 19,963
(1.85 %)
21,514
(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
5,185,516
(53.08 %)
1,065,657
(8.25 %)
15,183,778
(40.61 %)
50,883
(1.20 %)
31 human (HG00733.mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
53,216
(1.22 %)
32 human (HG00733.pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
15,964,663
(40.46 %)
53,315
(1.19 %)
33 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a 20,688
(1.84 %)
22,080
(1.23 %)
233,237
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
299
(100.00 %)
5,391,900
(53.13 %)
1,050,251
(7.66 %)
16,052,188
(40.43 %)
52,436
(1.14 %)
34 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a 20,674
(1.84 %)
22,283
(1.25 %)
233,363
(4.94 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
244
(100.00 %)
5,406,821
(53.15 %)
1,060,553
(7.74 %)
16,051,646
(40.51 %)
52,343
(1.14 %)
35 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a 20,654
(1.85 %)
22,309
(1.25 %)
233,294
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 297
(100.00 %)
5,410,814
(53.14 %)
1,059,472
(7.72 %)
16,043,406
(40.45 %)
52,535
(1.14 %)
36 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a 20,657
(1.85 %)
22,458
(1.25 %)
233,356
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
289
(100.00 %)
5,397,570
(53.08 %)
1,046,743
(7.55 %)
16,021,887
(40.41 %)
52,164
(1.20 %)
37 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a 20,742
(1.86 %)
22,169
(1.25 %)
233,386
(4.98 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 236
(100.00 %)
5,380,815
(52.80 %)
1,031,609
(7.04 %)
16,008,178
(39.99 %)
52,233
(1.13 %)
38 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1
n/a 20,694
(1.84 %)
22,451
(1.25 %)
232,969
(4.90 %)
40.75
(100.00 %)
1
(0.00 %)
330
(100.00 %)
5,420,540
(53.42 %)
1,100,044
(8.26 %)
15,926,032
(40.73 %)
52,706
(1.14 %)
39 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1
n/a 20,635
(1.85 %)
22,311
(1.24 %)
233,162
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
272
(100.00 %)
5,394,949
(53.13 %)
1,045,161
(7.68 %)
15,896,292
(40.33 %)
52,604
(1.18 %)
40 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1
n/a 19,939
(1.84 %)
21,482
(1.25 %)
227,418
(4.97 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 284
(100.00 %)
5,199,262
(53.10 %)
1,073,766
(8.08 %)
15,085,301
(40.44 %)
51,050
(1.19 %)
41 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a 20,638
(1.84 %)
22,373
(1.25 %)
233,201
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,405,239
(53.13 %)
1,058,194
(7.69 %)
15,910,496
(40.38 %)
53,236
(1.22 %)
42 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1
n/a 19,870
(1.85 %)
21,659
(1.26 %)
227,481
(4.98 %)
40.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
473
(100.00 %)
5,197,395
(52.95 %)
1,071,566
(7.99 %)
15,109,996
(40.28 %)
51,315
(1.20 %)
43 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1
n/a 20,643
(1.86 %)
22,373
(1.25 %)
233,154
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
340
(100.00 %)
5,382,379
(52.86 %)
1,029,500
(7.16 %)
15,979,100
(40.07 %)
52,346
(1.15 %)
44 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a 20,631
(1.86 %)
22,210
(1.24 %)
233,273
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,391,322
(52.85 %)
1,041,900
(7.14 %)
15,985,878
(40.09 %)
52,630
(1.16 %)
45 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1
n/a 20,587
(1.84 %)
22,094
(1.24 %)
232,602
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
3
(0.00 %)
315
(100.00 %)
5,397,845
(53.20 %)
1,069,444
(7.79 %)
15,978,901
(40.45 %)
51,968
(1.14 %)
46 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a 20,651
(1.85 %)
22,302
(1.25 %)
233,105
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 365
(100.00 %)
5,401,789
(53.10 %)
1,061,956
(7.62 %)
16,016,635
(40.44 %)
52,440
(1.16 %)
47 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a 20,701
(1.85 %)
22,327
(1.24 %)
232,970
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 345
(100.00 %)
5,384,218
(53.11 %)
1,029,835
(7.61 %)
15,997,541
(40.37 %)
52,287
(1.16 %)
48 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a 19,886
(1.86 %)
21,597
(1.26 %)
227,249
(5.00 %)
40.90
(100.00 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,188,879
(52.80 %)
1,041,178
(7.85 %)
15,168,227
(40.25 %)
51,387
(1.26 %)
49 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a 20,652
(1.85 %)
22,270
(1.25 %)
233,297
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
5,421,505
(53.06 %)
1,070,796
(7.57 %)
15,904,078
(40.29 %)
52,952
(1.24 %)
50 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a 19,899
(1.85 %)
21,663
(1.25 %)
227,048
(4.98 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
5,179,894
(52.93 %)
1,053,273
(8.01 %)
15,211,574
(40.34 %)
50,868
(1.15 %)
51 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a 20,620
(1.85 %)
22,173
(1.24 %)
232,988
(57.14 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
5,408,314
(53.13 %)
1,082,369
(7.68 %)
15,986,592
(40.42 %)
52,497
(1.15 %)
52 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a 19,983
(1.85 %)
21,787
(1.25 %)
227,373
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
5,212,793
(53.10 %)
1,073,348
(8.29 %)
15,098,284
(40.47 %)
51,706
(1.21 %)
53 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a 20,709
(1.85 %)
22,220
(1.24 %)
233,019
(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 295
(100.00 %)
5,400,880
(53.06 %)
1,072,673
(7.57 %)
15,970,600
(40.36 %)
52,279
(1.19 %)
54 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a 20,643
(1.86 %)
22,265
(1.25 %)
233,156
(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
5,389,985
(52.82 %)
1,039,540
(7.07 %)
15,972,086
(40.01 %)
52,246
(1.17 %)
55 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a 20,644
(1.86 %)
22,204
(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
5,394,888
(53.00 %)
1,057,773
(7.41 %)
16,010,248
(40.29 %)
52,761
(1.18 %)
56 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a 20,737
(1.84 %)
22,422
(1.25 %)
233,650
(4.94 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
427
(100.00 %)
5,403,741
(53.18 %)
1,044,828
(7.78 %)
15,926,586
(40.45 %)
52,966
(1.19 %)
57 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a 20,608
(1.85 %)
22,133
(1.24 %)
232,837
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
n/a 244
(100.00 %)
5,393,247
(53.12 %)
1,066,426
(7.67 %)
15,949,983
(40.40 %)
51,940
(1.16 %)
58 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a 19,872
(1.85 %)
21,396
(1.24 %)
226,741
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
5,191,849
(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
15,216,610
(40.53 %)
50,940
(1.18 %)
59 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
233,578
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 307
(100.00 %)
5,393,904
(52.87 %)
1,041,237
(7.18 %)
15,894,360
(39.98 %)
52,866
(1.21 %)
60 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 378
(100.00 %)
5,181,545
(52.95 %)
1,053,224
(8.07 %)
15,149,369
(40.47 %)
51,292
(1.24 %)
61 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a 20,711
(1.84 %)
22,195
(1.24 %)
233,223
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 247
(100.00 %)
5,415,439
(53.41 %)
1,076,389
(8.28 %)
16,001,461
(40.83 %)
52,688
(1.16 %)
62 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
5,424,250
(53.38 %)
1,090,520
(8.17 %)
15,938,736
(40.68 %)
52,674
(1.19 %)
63 human (HG02055.mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a 20,668
(1.86 %)
22,497
(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
5,394,664
(52.96 %)
1,054,907
(7.31 %)
16,015,246
(40.18 %)
52,182
(1.14 %)
64 human (HG02055.pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
227,271
(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
1,083,360
(8.82 %)
15,156,062
(40.89 %)
51,291
(1.20 %)
65 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a 20,633
(1.85 %)
22,288
(1.24 %)
233,237
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
5,403,587
(53.12 %)
1,056,798
(7.68 %)
15,880,598
(40.28 %)
52,572
(1.21 %)
66 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
233,357
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
(52.99 %)
1,056,100
(7.39 %)
15,866,266
(40.12 %)
52,798
(1.20 %)
67 human (HG02109.mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a 20,672
(1.85 %)
22,359
(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
1,059,138
(7.38 %)
15,909,866
(40.16 %)
52,821
(1.21 %)
68 human (HG02109.pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a 20,726
(1.85 %)
22,416
(1.25 %)
233,280
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
5,415,046
(53.08 %)
1,053,373
(7.55 %)
15,926,813
(40.27 %)
52,917
(1.18 %)
69 human (HG02145.mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,340
(1.25 %)
233,065
(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
5,406,959
(53.08 %)
1,055,638
(7.58 %)
15,881,847
(40.24 %)
52,888
(1.19 %)
70 human (HG02145.pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a 19,971
(1.84 %)
23,489
(1.40 %)
227,332
(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
5,210,152
(53.01 %)
1,080,455
(8.52 %)
14,936,162
(40.43 %)
52,745
(1.32 %)
71 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a 20,675
(1.85 %)
22,449
(1.25 %)
233,621
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
n/a 487
(100.00 %)
5,408,728
(53.04 %)
1,060,811
(7.55 %)
15,818,402
(40.19 %)
52,717
(1.23 %)
72 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a 20,622
(1.85 %)
22,230
(1.24 %)
233,267
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
n/a 423
(100.00 %)
5,415,368
(53.22 %)
1,083,752
(7.85 %)
16,009,690
(40.54 %)
52,324
(1.14 %)
73 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a 20,636
(1.85 %)
22,298
(1.24 %)
233,236
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
5,409,203
(53.10 %)
1,060,311
(7.60 %)
16,026,213
(40.43 %)
52,647
(1.16 %)
74 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a 20,659
(1.84 %)
22,252
(1.23 %)
233,332
(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
n/a 306
(100.00 %)
5,414,841
(53.29 %)
1,077,125
(7.99 %)
15,891,119
(40.53 %)
52,638
(1.18 %)
75 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,072
(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
5,409,820
(53.15 %)
1,075,146
(7.68 %)
15,995,649
(40.44 %)
52,593
(1.16 %)
76 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a 20,047
(1.86 %)
21,511
(1.24 %)
227,472
(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
5,191,769
(53.10 %)
1,044,947
(8.26 %)
15,239,696
(40.62 %)
51,172
(1.16 %)
77 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a 20,748
(1.85 %)
22,425
(1.25 %)
233,661
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
1,067,279
(7.64 %)
15,944,107
(40.38 %)
53,297
(1.22 %)
78 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
1,048,556
(7.39 %)
16,015,449
(40.28 %)
52,834
(1.17 %)
79 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
5,435,641
(53.28 %)
1,076,981
(7.96 %)
15,851,923
(40.45 %)
53,410
(1.21 %)
80 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
15,068,577
(40.69 %)
51,312
(1.19 %)
81 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a 20,669
(1.84 %)
22,455
(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
53,535
(1.26 %)
82 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
1,062,842
(7.81 %)
15,934,809
(40.46 %)
52,975
(1.21 %)
83 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
53,746
(1.28 %)
84 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
15,990,876
(40.53 %)
54,101
(1.32 %)
85 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
1,079,483
(7.87 %)
15,854,981
(40.43 %)
53,155
(1.21 %)
86 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
51,815
(1.21 %)
87 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
1,062,881
(7.52 %)
15,861,495
(40.19 %)
52,733
(1.19 %)
88 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
53,133
(1.23 %)
89 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
1,061,348
(7.77 %)
15,879,759
(40.38 %)
52,992
(1.18 %)
90 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
1,044,887
(7.21 %)
16,011,018
(40.13 %)
52,793
(1.17 %)
91 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
15,956,661
(40.38 %)
53,701
(1.29 %)
92 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
53,652
(1.26 %)
93 human (HG03098.pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,201,143
(53.24 %)
1,083,861
(8.56 %)
15,069,721
(40.64 %)
51,389
(1.21 %)
94 human (HG03098.mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
52,417
(1.18 %)
95 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a 20,710
(1.84 %)
22,595
(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
1,094,451
(7.82 %)
15,990,282
(40.60 %)
53,318
(1.27 %)
96 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
15,795,098
(40.40 %)
53,149
(1.21 %)
97 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
1,069,864
(7.46 %)
15,951,020
(40.27 %)
53,338
(1.19 %)
98 human (HG03486.pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
53,143
(1.26 %)
99 human (HG03492.mat 2021)
GCA_018505845.1
n/a 20,677
(1.85 %)
22,401
(1.25 %)
233,402
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
495
(100.00 %)
5,393,586
(52.97 %)
1,050,402
(7.38 %)
15,875,935
(40.07 %)
52,994
(1.18 %)
100 human (HG03492.pat 2021)
GCA_018505835.1
n/a 19,970
(1.85 %)
21,672
(1.25 %)
227,277
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 618
(100.00 %)
5,202,430
(53.00 %)
1,069,560
(8.18 %)
15,071,476
(40.33 %)
51,291
(1.19 %)
101 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a 20,766
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 320
(100.00 %)
5,437,541
(52.96 %)
1,084,729
(7.35 %)
16,097,675
(40.30 %)
52,953
(1.18 %)
102 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a 20,820
(1.84 %)
22,672
(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
5,451,270
(53.44 %)
1,086,645
(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
53,435
(1.18 %)
103 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a 20,665
(1.84 %)
22,566
(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
1,105,174
(8.06 %)
15,931,296
(40.72 %)
53,436
(1.26 %)
104 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a 20,724
(1.83 %)
22,627
(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
5,449,110
(53.39 %)
1,087,677
(8.16 %)
15,936,844
(40.79 %)
53,859
(1.30 %)
105 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a 20,702
(1.85 %)
22,327
(1.25 %)
233,403
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
1,075,620
(7.56 %)
15,928,710
(40.31 %)
53,423
(1.24 %)
106 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
51,622
(1.24 %)
107 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
53,511
(1.32 %)
108 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
52,546
(1.35 %)
109 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
53,581
(1.32 %)
110 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
52,653
(1.34 %)
111 human (NA24631.mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
53,731
(1.31 %)
112 human (NA24631.pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
53,164
(1.35 %)
113 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
15,871,098
(40.43 %)
53,290
(1.27 %)
114 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
15,888,465
(40.19 %)
53,328
(1.24 %)
115 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
52,529
(1.17 %)
116 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
53,106
(1.23 %)
117 human (NA20129.mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
53,011
(1.20 %)
118 human (NA20129.pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
52,911
(1.18 %)
119 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
52,479
(1.17 %)
120 human (NA21309.pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
52,798
(1.17 %)
121 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2
n/a 19,667
(1.95 %)
20,065
(1.23 %)
n/a 40.96
(99.60 %)
1,172
(0.40 %)
994
(100.00 %)
5,086,372
(51.37 %)
932,450
(3.67 %)
15,152,141
(37.48 %)
49,325
(1.10 %)
122 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2
n/a 20,401
(1.92 %)
20,682
(1.21 %)
n/a 40.87
(99.64 %)
1,217
(0.36 %)
950
(100.00 %)
5,350,025
(52.32 %)
1,006,502
(4.68 %)
15,969,368
(38.50 %)
50,826
(1.08 %)
123 lesser dwarf lemur
GCA_004024725.1
n/a 22,605
(1.80 %)
35,000
(1.46 %)
93,377
(1.59 %)
40.49
(99.93 %)
7,529
(0.03 %)
555,280
(99.97 %)
3,959,297
(40.17 %)
448,919
(1.48 %)
14,173,023
(34.36 %)
59,165
(1.83 %)
124 Ma's night monkey
GCF_000952055.2
55,061
(2.59 %)
21,075
(1.93 %)
22,284
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,930
(5.15 %)
112,851
(94.85 %)
5,110,193
(47.72 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,219
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
125 mantled howler monkey
GCA_004027835.1
n/a 26,541
(1.65 %)
40,210
(1.16 %)
41,017
(1.17 %)
40.83
(99.88 %)
16,130
(0.05 %)
1,152,695
(99.95 %)
6,216,031
(48.47 %)
1,428,462
(4.68 %)
16,106,098
(41.41 %)
41,196
(0.86 %)
126 northern white-cheeked gibbon (2019 U. Washington)
GCF_006542625.1
60,700
(2.64 %)
20,360
(1.92 %)
21,533
(1.26 %)
n/a 41.03
(99.47 %)
510
(0.53 %)
2,762
(99.47 %)
5,237,782
(51.76 %)
902,578
(4.06 %)
15,431,824
(38.31 %)
71,450
(1.25 %)
127 olive baboon (2019 UCSF)
GCF_008728515.1
93,385
(3.84 %)
20,382
(1.88 %)
21,115
(1.19 %)
n/a 40.89
(99.92 %)
4,098
(0.08 %)
11,145
(100.00 %)
5,514,823
(51.36 %)
937,126
(2.31 %)
16,410,891
(37.14 %)
77,919
(1.22 %)
128 Panamanian white-faced capuchin
GCF_001604975.1
68,109
(2.82 %)
21,215
(2.01 %)
21,494
(1.35 %)
48,384
(2.19 %)
40.71
(96.08 %)
152,704
(3.94 %)
140,597
(96.06 %)
4,992,577
(47.59 %)
760,554
(1.72 %)
15,071,867
(33.72 %)
30,688
(0.83 %)
129 Pere David's macaque
GCF_024542745.1
74,798
(3.50 %)
20,233
(1.92 %)
20,671
(1.23 %)
n/a 41.00
(99.99 %)
367
(0.01 %)
623
(100.00 %)
5,363,770
(51.19 %)
1,033,990
(2.95 %)
15,744,042
(37.44 %)
90,119
(1.42 %)
130 Philippine tarsier
GCF_000164805.1
35,786
(1.36 %)
21,606
(1.23 %)
25,636
(1.04 %)
n/a 40.96
(98.61 %)
155,714
(1.39 %)
492,903
(98.61 %)
6,462,952
(48.20 %)
1,062,043
(2.47 %)
18,768,491
(40.02 %)
78,629
(1.04 %)
131 pig-tailed macaque
GCF_000956065.1
90,971
(3.40 %)
20,184
(1.89 %)
21,096
(1.24 %)
n/a 40.98
(96.27 %)
84,363
(3.74 %)
94,057
(96.26 %)
5,479,257
(50.37 %)
936,458
(2.35 %)
16,932,843
(34.70 %)
82,528
(1.29 %)
132 proboscis monkey
GCA_004027105.1
n/a 26,778
(1.60 %)
43,314
(1.07 %)
n/a 41.01
(99.89 %)
18,289
(0.06 %)
942,104
(99.94 %)
6,402,701
(53.25 %)
1,093,958
(2.69 %)
16,752,195
(39.70 %)
90,071
(1.21 %)
133 pygmy chimpanzee (Ulindi refseq 2015)
GCF_000258655.2
59,345
(2.62 %)
19,943
(1.95 %)
18,807
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,134,959
(50.88 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,598
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
134 pygmy chimpanzee (Mhudiblu Carbone 601152 2020)
GCF_013052645.1
85,047
(3.05 %)
n/a 21,403
(1.16 %)
n/a 40.57
(98.80 %)
683
(1.20 %)
4,976
(98.80 %)
4,937,695
(46.41 %)
960,717
(8.41 %)
15,846,875
(40.31 %)
45,540
(0.95 %)
135 pygmy chimpanzee (NHGRI 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
n/a 1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
53,329
(1.37 %)
136 red guenon
GCA_004027335.1
n/a 26,554
(1.40 %)
43,056
(0.94 %)
n/a 41.19
(99.83 %)
13,075
(0.04 %)
2,577,035
(99.96 %)
7,718,970
(56.55 %)
2,223,871
(8.85 %)
18,186,363
(47.01 %)
109,358
(1.37 %)
137 red shanked douc langur
GCA_004024825.1
n/a 25,296
(1.59 %)
37,062
(1.07 %)
n/a 41.05
(99.87 %)
14,638
(0.05 %)
1,445,731
(99.95 %)
6,884,034
(54.54 %)
1,201,033
(2.95 %)
16,938,986
(42.00 %)
84,642
(1.12 %)
138 Rhesus monkey (2019 U. Washington)
GCF_003339765.1
86,719
(3.15 %)
20,455
(1.85 %)
21,565
(1.21 %)
n/a 41.00
(98.84 %)
248
(1.16 %)
3,268
(98.84 %)
5,469,991
(52.68 %)
993,786
(5.32 %)
16,005,457
(38.50 %)
86,250
(1.31 %)
139 ring-tailed lemur (2021)
GCF_020740605.2
55,883
(2.78 %)
18,659
(1.98 %)
20,542
(1.50 %)
n/a 41.36
(99.84 %)
210
(0.16 %)
185
(100.00 %)
3,432,734
(37.67 %)
518,071
(6.84 %)
12,916,577
(32.91 %)
50,626
(1.88 %)
140 siamang (Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
95,573
(1.75 %)
141 Sclater's lemur (Harlow 2015)
GCA_001262665.1
n/a 19,832
(2.09 %)
23,882
(1.58 %)
n/a 40.77
(99.01 %)
254,375
(1.01 %)
292,741
(98.99 %)
3,621,134
(39.99 %)
434,393
(1.73 %)
13,470,199
(29.03 %)
47,664
(1.66 %)
142 silvery gibbon (HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
80,124
(1.26 %)
143 slow loris (mNycCou1 primary hap 2022)
GCF_027406575.1
67,211
(2.59 %)
22,193
(1.49 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
218
(0.14 %)
84
(100.00 %)
4,625,872
(39.88 %)
579,983
(1.59 %)
14,405,367
(40.78 %)
38,257
(0.77 %)
144 small-eared galago
GCF_000181295.1
38,532
(2.11 %)
20,477
(1.82 %)
19,107
(1.43 %)
n/a 41.11
(93.67 %)
192,447
(6.36 %)
200,099
(93.64 %)
4,369,204
(39.41 %)
454,913
(1.11 %)
13,579,820
(30.37 %)
21,834
(0.62 %)
145 sooty mangabey
GCF_000955945.1
76,860
(3.18 %)
20,065
(1.92 %)
21,156
(1.27 %)
n/a 40.92
(97.87 %)
65,329
(2.14 %)
76,752
(97.86 %)
5,287,418
(49.49 %)
908,575
(2.58 %)
16,543,149
(35.26 %)
70,987
(1.22 %)
146 Sumatran orangutan (AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
55,799
(2.08 %)
147 Sumatran orangutan (Susie 2018 refseq)
GCF_002880775.1
58,185
(2.32 %)
20,151
(1.79 %)
21,000
(1.15 %)
n/a 40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,814
(99.30 %)
5,483,266
(54.37 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,624
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
148 tamarin
GCA_004024885.1
n/a 27,243
(1.48 %)
39,487
(1.07 %)
n/a 40.80
(99.88 %)
8,881
(0.03 %)
1,675,070
(99.97 %)
6,528,752
(48.25 %)
1,388,724
(3.61 %)
16,922,829
(45.18 %)
38,319
(0.73 %)
149 tufted capuchin
GCF_009761245.1
80,991
(3.26 %)
21,426
(1.96 %)
22,733
(1.32 %)
n/a 40.84
(98.69 %)
43,216
(1.31 %)
59,885
(98.69 %)
5,056,660
(48.03 %)
783,505
(2.08 %)
15,052,178
(35.96 %)
32,890
(0.86 %)
150 Ugandan red Colobus (RC106 v5 2019)
GCF_002776525.5
63,486
(2.54 %)
21,357
(1.88 %)
22,980
(1.19 %)
n/a 40.87
(97.07 %)
56,505
(2.93 %)
32,287
(100.00 %)
5,425,300
(50.81 %)
949,826
(2.73 %)
16,126,286
(36.98 %)
71,044
(1.10 %)
151 western lowland gorilla (Kamilah 2019)
GCF_008122165.1
61,950
(2.48 %)
20,030
(1.78 %)
20,511
(1.13 %)
n/a 40.65
(98.49 %)
859
(1.51 %)
6,345
(98.49 %)
5,311,418
(50.53 %)
928,667
(8.55 %)
15,660,901
(40.30 %)
44,578
(0.92 %)
152 western lowland gorilla (KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
76,432
(1.35 %)
153 white-faced saki
GCA_004026645.1
n/a 24,422
(1.69 %)
35,685
(1.16 %)
n/a 40.61
(99.91 %)
11,316
(0.04 %)
903,646
(99.96 %)
5,716,344
(47.85 %)
1,234,286
(3.25 %)
16,179,207
(39.57 %)
41,862
(0.89 %)
154 white-fronted capuchin
GCA_004027755.1
n/a 27,984
(1.50 %)
47,384
(1.05 %)
n/a 41.14
(99.86 %)
13,723
(0.04 %)
1,552,889
(99.96 %)
6,023,876
(46.47 %)
1,002,459
(2.29 %)
16,673,880
(41.02 %)
37,693
(0.79 %)
155 white-tufted-ear marmoset (cj1700 2020)
GCF_009663435.1
107,273
(3.59 %)
21,782
(1.87 %)
21,450
(1.28 %)
n/a 40.85
(98.69 %)
380
(1.31 %)
1,429
(98.69 %)
5,135,344
(49.42 %)
823,949
(3.69 %)
15,140,752
(38.06 %)
36,875
(0.90 %)
156 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1
n/a 21,684
(1.92 %)
21,053
(1.29 %)
n/a 40.97
(99.58 %)
1,068
(0.42 %)
216
(100.00 %)
5,099,933
(50.01 %)
797,450
(2.45 %)
15,059,591
(37.67 %)
36,133
(0.92 %)
157 white-tufted-ear marmoset (paternal 2020)
GCA_011100535.1
n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
35,222
(0.94 %)
158 white-tufted-ear marmoset (paternal X 2020)
GCA_011100555.1
n/a 21,709
(1.91 %)
21,245
(1.29 %)
70,349
(2.24 %)
40.95
(99.53 %)
959
(0.47 %)
353
(100.00 %)
5,123,971
(49.94 %)
785,181
(2.64 %)
15,163,086
(37.93 %)
36,768
(0.93 %)
159 white-tufted-ear marmoset (mCalJac1 2021)
GCF_011100555.1
104,419
(4.84 %)
21,801
(1.88 %)
21,467
(1.27 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
1,165
(0.48 %)
1,233
(100.00 %)
5,036,591
(47.71 %)
842,846
(3.26 %)
15,161,534
(38.08 %)
37,603
(0.93 %)
TOTALS:total assembly count 159

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 159 assemblies assembly stats track stats
Mammals 407 assemblies assembly stats track stats
Birds 270 assemblies assembly stats track stats
Fishes 269 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 113 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 533 assemblies assembly stats track stats
Plants 229 assemblies assembly stats track stats
Fungi 544 assemblies assembly stats track stats
Viruses 259 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 64 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 321 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 445 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats