Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
15 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
16 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
65,220
(23.87 %)
17 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
18 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
19 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
20 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
3,335
(0.34 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
66,834
(4.90 %)
22 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
68,566
(4.96 %)
23 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
24 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
25,108
(1.67 %)
25 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
22,527
(6.34 %)
27 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
21,415
(5.59 %)
28 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
32,283
(3.44 %)
29 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
5,093
(4.11 %)
31 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
4,963
(4.10 %)
32 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
3,761
(0.66 %)
33 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
34 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
59,325
(10.76 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
3,241,124
(28.06 %)
36 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
37 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
3,076,631
(26.41 %)
38 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
39 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
2,994,427
(28.25 %)
40 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
54,254
(0.38 %)
41 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
42 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
25,348
(3.39 %)
43 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
24,749
(4.05 %)
44 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
26,535
(3.98 %)
45 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
21,783
(2.16 %)
46 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
20,384
(2.28 %)
47 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
27,745
(1.31 %)
48 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
17,045
(1.23 %)
49 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
50 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
51 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
31,738
(1.57 %)
52 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
27,791
(1.48 %)
53 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
54 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
55 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
10,319
(1.14 %)
56 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
77,570
(1.78 %)
57 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
58 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
59 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
60 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
31,562
(0.31 %)
61 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
76
(1.07 %)
62 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
24,414
(0.46 %)
63 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
64 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
65 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
3,472
(0.28 %)
66 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
67 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
317,707
(8.50 %)
68 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
75,475
(3.56 %)
69 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
70 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
71 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
72 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
8,929
(0.83 %)
73 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
74 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
19,392
(13.60 %)
75 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
76 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
38,607
(3.43 %)
77 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
78 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
79 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
22,935
(5.83 %)
80 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
18,611
(3.41 %)
81 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
82 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
83 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
12,926
(2.66 %)
84 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
154,087
(19.32 %)
85 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
86 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
225,863
(1.93 %)
87 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
88 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
20,674
(1.12 %)
89 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
16,140
(0.90 %)
90 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
91 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
92 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
93 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
94 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
95 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
96 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
30,878
(2.75 %)
97 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
30,829
(2.75 %)
98 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
48,987
(3.05 %)
99 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
100 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
101 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
41,402
(3.02 %)
102 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
203,906
(13.78 %)
103 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
104 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
105 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
2,108,395
(25.96 %)
106 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
7,570
(0.50 %)
107 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
398,884
(36.81 %)
108 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
31,360
(1.27 %)
109 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
110 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
111 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
4,821
(0.53 %)
112 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
29,535
(3.72 %)
113 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
29,385
(2.13 %)
114 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
57,897
(3.26 %)
115 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
15,343
(0.97 %)
116 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
63,233
(2.52 %)
117 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
86,419
(1.62 %)
118 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
61,424
(2.69 %)
119 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
16,399
(1.28 %)
120 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
3,317
(6.62 %)
121 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
44,689
(7.20 %)
122 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
38,448
(5.69 %)
123 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
22,264
(1.77 %)
124 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
2,691
(0.38 %)
125 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
20,075
(1.41 %)
126 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
127 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
12,963
(1.47 %)
128 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
152,063
(4.18 %)
129 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
81,500
(2.36 %)
130 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
1,680,995
(2.36 %)
131 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
132 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
133 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
37,074
(4.98 %)
134 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
325,103
(21.18 %)
135 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
27,883
(2.10 %)
136 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
137 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
76,668
(3.16 %)
138 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
139 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
160,781
(2.86 %)
140 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
105,766
(0.97 %)
141 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
41,032
(1.09 %)
142 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
9,731
(0.69 %)
143 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
144 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
145 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
146 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
147 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
849,453
(31.38 %)
148 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
66,433
(1.82 %)
149 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
25,250
(1.74 %)
150 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
19,259
(1.41 %)
151 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
19,057
(20.99 %)
152 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
43
(99.34 %)
153 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
4,760
(98.23 %)
154 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
3,732
(86.39 %)
155 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
156 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
157 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
158 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
159 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
160 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
161 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
8,698
(83.31 %)
162 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
163 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
164 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
165 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
166 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
167 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
168 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
21,835
(6.05 %)
169 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
170 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
75,777
(29.49 %)
171 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
74,932
(30.30 %)
172 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
15,323
(1.42 %)
173 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
20,737
(0.24 %)
174 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
43,665
(1.21 %)
175 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
176 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
177 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
157,149
(0.72 %)
178 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
179 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
180 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
13,298
(2.56 %)
181 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
12,534
(1.92 %)
182 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
20,367
(2.62 %)
183 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
20,561
(3.01 %)
184 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
185 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
186 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
71,102
(1.16 %)
187 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
188 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
63,894
(25.90 %)
189 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
64,216
(25.20 %)
190 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
191 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
5,914
(1.27 %)
192 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
60,198
(24.06 %)
193 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
14,758
(7.59 %)
194 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
30,057
(0.85 %)
195 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
65,538
(25.47 %)
196 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
197 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
198 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
4,827
(0.29 %)
199 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
107,342
(2.63 %)
200 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
201 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
377,414
(31.33 %)
202 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
370,755
(32.34 %)
203 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
367,973
(32.21 %)
204 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
372,114
(32.08 %)
205 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
206 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
207 monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
208 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
209 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
210 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
211 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
18,232
(10.96 %)
212 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
213 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
21,007
(5.28 %)
214 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
215 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
216 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
217 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
218 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
219 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
520,091
(23.03 %)
220 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
221 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
102,661
(4.26 %)
222 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
223 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
224 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
138,890
(2.46 %)
225 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
140,609
(2.45 %)
226 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
19,559
(2.15 %)
227 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
380,989
(29.47 %)
228 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
229 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
542,998
(24.23 %)
230 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
542,208
(23.92 %)
231 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
232 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
10,481
(0.65 %)
233 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
104,967
(3.98 %)
234 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
235 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
236 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
237 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
238 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
239 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
240 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
241 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
242 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
243 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
244 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
245 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
246 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
247 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
248 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
249 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
250 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
40,094
(1.87 %)
251 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
252 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
25,972
(4.13 %)
253 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
254 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
255 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
256 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
64,243
(6.17 %)
257 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
258 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
31,789
(3.72 %)
259 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
260 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
261 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
262 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
263 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
264 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
24,263
(0.70 %)
265 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
266 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
267 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
268 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
269 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
140,800
(5.87 %)
270 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
129,512
(5.41 %)
271 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
105,216
(10.11 %)
272 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
273 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
274 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
19,928
(3.29 %)
275 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
276 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
277 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
278 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
279 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
280 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
109,923
(19.06 %)
281 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
282 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
36,641
(1.53 %)
283 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
284 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
285 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
92,256
(5.21 %)
286 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
287 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
22,672
(3.11 %)
288 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
289 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
64,180
(3.80 %)
290 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
113,324
(26.96 %)
291 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
292 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
293 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
52,715
(3.15 %)
294 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
29,072
(0.54 %)
295 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
296 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
54,125
(5.80 %)
297 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
298 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
299 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
300 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
301 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
31,740
(4.85 %)
302 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
303 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
30,300
(3.29 %)
304 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
30,533
(2.95 %)
305 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
27,646
(0.67 %)
306 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
307 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
308 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
50,044
(9.42 %)
309 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
6,824
(1.28 %)
310 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
311 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
6,470
(2.86 %)
312 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
6,436
(2.63 %)
313 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
13,094
(2.48 %)
314 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
20,598
(2.37 %)
315 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
14,898
(1.47 %)
316 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
317 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
117,743
(29.88 %)
318 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
161,610
(4.19 %)
319 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
136,308
(27.74 %)
320 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
14,520
(10.46 %)
321 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
4,493
(0.61 %)
322 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
3,578
(0.99 %)
323 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
5,857
(2.24 %)
324 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
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(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
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(3.96 %)
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(40.59 %)
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(2.37 %)
325 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
326 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
33,071
(3.37 %)
327 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
328 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
329 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
330 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
331 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,163
(6.21 %)
17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
48,556
(1.91 %)
332 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
333 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
71,885
(2.45 %)
334 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
335 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
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(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
336 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
637,314
(24.52 %)
337 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
338 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
14,172
(0.96 %)
339 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
10,620
(1.04 %)
340 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,430
(10.71 %)
14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
11,751
(1.05 %)
341 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
342 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
6,701
(1.74 %)
343 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
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(2.64 %)
344 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
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(0.82 %)
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(7.84 %)
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345 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a 56,069
(8.51 %)
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n/a 36.22
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(100.00 %)
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TOTALS:total assembly count 345

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Invertebrates 1365 assemblies assembly stats track stats
Plants 345 assemblies assembly stats track stats
Fungi 948 assemblies assembly stats track stats
Viruses 710 assemblies assembly stats track stats
Archaea 757 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21350 assemblies assembly stats track stats
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CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1965 assemblies assembly stats track stats