Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adzuki bean
GCF_001190045.1
40,475
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
2 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
3 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
4 algarrobo blanco
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
5 apple
GCF_002114115.1
64,918
(11.39 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
6 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
7 barrel medic (2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
8 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,905
(14.29 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
9 beet
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
10 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
11 black cottonwood
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
12 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
13 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
14 cannabis
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
15 capsicum
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
16 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
17 cassava
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
18 castor bean
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
19 chickpea
GCF_000331145.1
41,971
(9.82 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
20 China rose
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
21 Chinese white pear
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
22 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
23 club-mosses
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
24 coffee C.arabica
GCF_003713225.1
80,738
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
25 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
26 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
27 common jujube
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
28 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
29 common tobacco
GCF_000715135.1
100,805
(3.09 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
30 cork oak
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
31 cotton G.hirsutum
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
32 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
33 cowpea
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
n/a 32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
34 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
35 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
36 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
37 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
38 East African water lily
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
39 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
40 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
41 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
42 Euphrates poplar
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
43 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
44 field mustard
GCF_000309985.2
73,446
(34.56 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
45 flowering plants
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
46 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
47 garden asparagus
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
48 globe artichoke
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
49 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
50 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
51 green algae C.reinhardtii
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
52 green algae O.lucimarinus
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
53 green algae C.variabilis
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
54 green algae V.carteri
GCF_000143455.1
14,436
(21.51 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
55 green algae O.tauri
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
56 green algae M.pusilla
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
57 green algae C.subellipsoidea
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
58 green algae M.neglectum
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
59 green algae A.protothecoides
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
60 green algae B.prasinos
GCF_002220235.1
7,852
(82.09 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
61 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
62 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
63 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
64 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
65 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,978
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
66 Japanese rice
GCF_001433935.1
53,556
(17.24 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
67 lettuce
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
68 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,525
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
69 malo sina
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
70 maize
GCF_902167145.1
76,921
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
71 mosses
GCF_000002425.4
55,129
(11.87 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
72 mung bean
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
73 muskmelon
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
74 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
75 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
76 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
77 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
78 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
79 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
80 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
81 pigeon pea
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
n/a 32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
82 pineapple
GCF_001540865.1
43,024
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
83 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
84 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
85 potato
GCF_000226075.1
43,155
(20.86 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
86 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
87 radish
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
23,381
(2.80 %)
88 rape
GCF_000686985.2
144,997
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
89 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
90 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
91 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
92 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
93 rubber tree
GCF_001654055.1
66,125
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
94 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
95 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
96 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
97 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
98 silver malletwood
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
99 silver poplar
GCF_005239225.1
53,068
(14.65 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
100 sorghum
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
101 soybean
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
102 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
103 spinach
GCF_002007265.1
41,494
(5.76 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
104 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
105 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
106 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
107 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
108 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
109 thale cress
GCF_000001735.4
53,928
(40.16 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
110 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
111 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
112 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
113 tomato
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
114 tree cotton
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
115 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
116 valley oak
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
117 vegetable marrow
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
118 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
119 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
120 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
121 wild emmer wheat (Zavitan)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
122 wild strawberry
GCF_000184155.1
36,435
(23.91 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
123 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
124 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,717
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
125 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
126 wild peanut A.ipaensis
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
127 wild peanut A.duranensis
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
128 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
129 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
130 wine grape
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
131 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
132 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
TOTALS:total assembly count 132

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 31 assemblies assembly stats track stats
Mammals 132 assemblies assembly stats track stats
Birds 80 assemblies assembly stats track stats
Fishes 110 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 41 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 229 assemblies assembly stats track stats
Plants 132 assemblies assembly stats track stats
Fungi 355 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 189 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 22 assemblies assembly stats track stats