Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1		 n/a 21,507
(2.72 %)		 60,050
(11.57 %)		 n/a 35.92
(99.97 %)		 2,344
(0.03 %)		 1,735
(100.00 %)		 430,950
(2.82 %)		 273,041
(3.10 %)		 4,895,011
(32.98 %)		 29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1		 71,407
(11.93 %)		 23,883
(3.45 %)		 59,407
(13.07 %)		 n/a 35.65
(99.64 %)		 710
(0.36 %)		 88
(100.00 %)		 430,287
(3.04 %)		 350,721
(4.29 %)		 3,875,064
(36.80 %)		 27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1		 40,475
(10.62 %)		 16,697
(3.71 %)		 47,542
(15.07 %)		 n/a 34.07
(96.37 %)		 21,264
(3.63 %)		 58,639
(96.37 %)		 257,290
(4.08 %)		 239,596
(6.43 %)		 2,925,469
(36.04 %)		 24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1		 50,883
(11.85 %)		 16,661
(3.75 %)		 45,945
(15.40 %)		 n/a 33.63
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 263,673
(3.52 %)		 264,113
(5.18 %)		 2,808,981
(37.65 %)		 20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1		 54,359
(4.64 %)		 16,693
(1.34 %)		 75,114
(9.09 %)		 n/a 37.42
(99.88 %)		 15,111
(0.12 %)		 14,905
(100.00 %)		 668,488
(2.42 %)		 511,720
(3.29 %)		 8,110,750
(42.79 %)		 50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1		 51,575
(5.06 %)		 16,948
(1.48 %)		 76,464
(9.29 %)		 n/a 37.21
(68.90 %)		 166,490
(31.14 %)		 202,468
(68.86 %)		 580,361
(3.63 %)		 445,124
(2.25 %)		 5,831,606
(30.77 %)		 75,576
(3.67 %)
7 African rice (2021)
GCF_000147395.1		 43,755
(15.95 %)		 16,224
(4.82 %)		 51,031
(25.64 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 178,763
(2.60 %)		 125,689
(4.18 %)		 1,761,585
(30.96 %)		 60,891
(21.37 %)
8 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1		 62,791
(10.08 %)		 25,423
(3.34 %)		 69,507
(14.55 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,087
(100.00 %)		 367,402
(2.31 %)		 175,862
(2.27 %)		 4,241,058
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
9 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2		 62,791
(10.08 %)		 25,443
(3.35 %)		 69,492
(14.56 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,085
(100.00 %)		 366,178
(2.25 %)		 175,852
(2.27 %)		 4,240,382
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
10 almond
GCF_902201215.1		 37,363
(19.64 %)		 14,509
(6.35 %)		 33,193
(24.70 %)		 n/a 37.65
(98.29 %)		 6,531
(1.72 %)		 1,700
(99.96 %)		 137,974
(2.59 %)		 100,386
(3.92 %)		 1,251,126
(26.07 %)		 10,893
(2.94 %)
11 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1		 47,801
(11.07 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
12 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2		 44,356
(10.99 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
13 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1		 73,172
(3.41 %)		 26,626
(1.10 %)		 228,260
(15.00 %)		 n/a 44.76
(99.87 %)		 31,919
(0.13 %)		 1,764
(100.00 %)		 639,429
(1.31 %)		 739,566
(3.57 %)		 6,976,583
(59.37 %)		 560,429
(28.70 %)
14 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1		 64,918
(11.39 %)		 22,530
(3.52 %)		 67,146
(16.22 %)		 n/a 38.04
(88.96 %)		 7,264
(11.05 %)		 807
(100.00 %)		 692,611
(50.77 %)		 322,556
(4.41 %)		 3,055,836
(35.69 %)		 25,923
(1.76 %)
15 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1		 n/a 16,583
(4.58 %)		 55,248
(25.46 %)		 n/a 43.36
(99.98 %)		 696
(0.02 %)		 615
(100.00 %)		 495,126
(50.28 %)		 124,567
(3.20 %)		 1,922,072
(32.59 %)		 65,220
(23.87 %)
16 Barbados nut
GCF_014843425.1		 33,622
(13.80 %)		 12,687
(4.63 %)		 26,511
(14.56 %)		 n/a 33.40
(99.60 %)		 2,151
(0.40 %)		 1,232
(100.00 %)		 281,490
(24.82 %)		 186,260
(5.65 %)		 2,028,357
(33.33 %)		 8,868
(1.38 %)
17 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1		 50,905
(14.29 %)		 16,712
(3.68 %)		 41,041
(14.51 %)		 n/a 33.43
(99.87 %)		 22
(0.13 %)		 42
(100.00 %)		 393,909
(27.89 %)		 175,427
(3.92 %)		 2,532,494
(37.64 %)		 3,384
(0.27 %)
18 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3		 48,865
(15.69 %)		 16,549
(3.99 %)		 40,316
(15.41 %)		 n/a 33.14
(94.48 %)		 8,785
(5.53 %)		 8,027
(94.47 %)		 366,709
(22.34 %)		 146,748
(2.80 %)		 2,549,499
(32.46 %)		 3,695
(0.65 %)
19 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1		 n/a 16,672
(3.96 %)		 40,032
(15.19 %)		 n/a 33.05
(99.32 %)		 107
(0.68 %)		 909
(100.00 %)		 381,065
(23.82 %)		 162,402
(3.97 %)		 2,490,028
(35.39 %)		 3,335
(0.34 %)
20 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1		 n/a 15,063
(1.43 %)		 65,125
(11.47 %)		 n/a 40.34
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 735,552
(11.30 %)		 567,295
(6.87 %)		 4,176,675
(45.56 %)		 66,834
(4.90 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1		 n/a 15,223
(1.43 %)		 65,769
(11.33 %)		 n/a 40.37
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 303
(100.00 %)		 744,623
(11.37 %)		 571,691
(7.15 %)		 4,217,655
(45.87 %)		 68,566
(4.96 %)
22 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1		 47,718
(9.45 %)		 11,911
(2.04 %)		 50,202
(16.78 %)		 n/a 35.86
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 42
(100.00 %)		 294,768
(3.41 %)		 341,699
(6.22 %)		 2,932,896
(35.20 %)		 25,364
(1.79 %)
23 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1		 45,481
(9.22 %)		 11,850
(2.05 %)		 49,071
(15.89 %)		 n/a 35.85
(94.03 %)		 3,200
(5.97 %)		 20
(100.00 %)		 290,870
(3.40 %)		 336,343
(5.76 %)		 2,901,079
(33.21 %)		 25,108
(1.67 %)
24 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1		 70,848
(2.17 %)		 15,922
(0.50 %)		 69,601
(2.75 %)		 n/a 34.91
(97.27 %)		 52,577
(2.73 %)		 81,202
(100.00 %)		 1,192,132
(1.94 %)		 1,097,384
(4.12 %)		 23,393,622
(47.64 %)		 19,517
(0.21 %)
25 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1		 n/a 13,887
(2.34 %)		 44,507
(14.12 %)		 n/a 37.97
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 2,350
(100.00 %)		 250,361
(2.10 %)		 231,118
(13.56 %)		 2,049,366
(44.58 %)		 22,527
(6.34 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2		 n/a 15,102
(2.62 %)		 47,553
(15.64 %)		 n/a 38.11
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 257,066
(2.22 %)		 226,514
(14.63 %)		 2,470,334
(38.37 %)		 21,415
(5.59 %)
27 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1		 57,539
(11.82 %)		 16,919
(2.98 %)		 64,687
(19.59 %)		 n/a 38.05
(99.97 %)		 1,625
(0.04 %)		 65
(100.00 %)		 236,645
(2.13 %)		 205,150
(5.19 %)		 2,202,942
(41.60 %)		 32,283
(3.44 %)
28 bitter melon
GCF_001995035.1		 31,725
(13.80 %)		 12,858
(4.62 %)		 30,539
(16.85 %)		 n/a 34.58
(92.32 %)		 109,310
(7.74 %)		 1,052
(100.00 %)		 162,837
(2.82 %)		 89,571
(2.03 %)		 1,951,167
(30.96 %)		 14,100
(2.00 %)
29 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1		 n/a 20,077
(4.66 %)		 43,061
(17.16 %)		 n/a 34.80
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 338
(100.00 %)		 267,110
(2.88 %)		 173,502
(6.32 %)		 2,366,759
(39.61 %)		 5,093
(4.11 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1		 n/a 19,804
(4.58 %)		 42,642
(17.03 %)		 n/a 34.85
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 132
(100.00 %)		 265,925
(2.85 %)		 174,688
(6.70 %)		 2,359,101
(40.07 %)		 4,963
(4.10 %)
31 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5		 59,542
(15.92 %)		 19,969
(4.99 %)		 41,581
(16.22 %)		 n/a 33.75
(99.85 %)		 59
(0.15 %)		 106
(99.85 %)		 257,833
(2.91 %)		 156,371
(4.50 %)		 2,423,627
(36.28 %)		 3,761
(0.66 %)
32 black tea
GCF_004153795.1		 101,253
(3.17 %)		 20,982
(0.66 %)		 156,999
(7.69 %)		 n/a 37.85
(92.12 %)		 79,329
(7.89 %)		 14,028
(100.00 %)		 1,926,995
(3.23 %)		 2,024,420
(8.06 %)		 17,959,098
(50.75 %)		 181,027
(2.79 %)
33 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2		 46,173
(12.87 %)		 15,187
(3.49 %)		 50,585
(20.61 %)		 n/a 40.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 72
(100.00 %)		 494,434
(48.54 %)		 220,571
(4.98 %)		 1,866,530
(29.09 %)		 59,325
(10.76 %)
34 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3		 n/a 46,431
(0.31 %)		 805,204
(7.93 %)		 n/a 46.09
(99.87 %)		 211,982
(0.14 %)		 70,316
(100.00 %)		 9,191,325
(44.14 %)		 5,086,953
(4.53 %)		 282,298
(99.86 %)		 3,241,124
(28.06 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1		 221,449
(1.62 %)		 n/a 763,380
(8.08 %)		 n/a 46.14
(98.27 %)		 214,799
(1.73 %)		 91,589
(100.00 %)		 8,660,189
(44.94 %)		 4,402,049
(3.94 %)		 306,386
(98.27 %)		 3,040,030
(27.48 %)
36 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1		 n/a n/a 751,576
(8.03 %)		 n/a 46.05
(98.12 %)		 693,028
(1.90 %)		 693,050
(98.10 %)		 8,420,935
(44.23 %)		 4,115,828
(3.69 %)		 693,050
(98.10 %)		 3,076,631
(26.41 %)
37 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1		 n/a n/a 773,766
(8.20 %)		 n/a 46.05
(100.00 %)		 1,407
(0.00 %)		 3,795
(100.00 %)		 8,703,192
(44.57 %)		 4,569,103
(5.20 %)		 5,202
(100.00 %)		 3,001,896
(28.00 %)
38 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1		 n/a 47,400
(0.34 %)		 778,134
(8.33 %)		 n/a 46.11
(99.87 %)		 7,376
(0.13 %)		 7,398
(99.87 %)		 14,835,099
(85.31 %)		 4,570,540
(5.40 %)		 7,395
(99.87 %)		 2,994,427
(28.25 %)
39 cacao
GCF_000208745.1		 34,727
(13.67 %)		 14,294
(4.65 %)		 29,216
(14.38 %)		 n/a 34.09
(94.31 %)		 11,787
(5.70 %)		 431
(100.00 %)		 206,049
(15.64 %)		 99,229
(2.66 %)		 1,933,579
(33.24 %)		 2,964
(0.34 %)
40 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1		 n/a 18,729
(3.22 %)		 57,374
(16.70 %)		 n/a 36.81
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 915
(100.00 %)		 421,731
(3.42 %)		 300,957
(5.54 %)		 2,794,242
(34.11 %)		 25,348
(3.39 %)
41 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1		 n/a 18,579
(3.26 %)		 56,295
(16.71 %)		 n/a 36.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 138
(100.00 %)		 414,129
(3.48 %)		 293,951
(5.95 %)		 3,055,420
(34.96 %)		 24,749
(4.05 %)
42 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1		 43,175
(7.78 %)		 16,377
(2.29 %)		 43,559
(11.38 %)		 n/a 36.31
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 706
(100.00 %)		 341,665
(12.46 %)		 223,217
(36.36 %)		 2,388,236
(58.00 %)		 26,535
(3.98 %)
43 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1		 n/a 16,153
(1.86 %)		 68,653
(14.03 %)		 n/a 35.79
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 783,798
(4.17 %)		 456,025
(10.87 %)		 4,951,918
(40.76 %)		 21,783
(2.16 %)
44 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1		 n/a 15,836
(1.90 %)		 66,803
(13.99 %)		 n/a 35.77
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 762,029
(4.24 %)		 448,099
(10.97 %)		 4,784,968
(41.07 %)		 20,384
(2.28 %)
45 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1		 n/a 18,838
(1.94 %)		 71,211
(13.84 %)		 n/a 33.78
(99.91 %)		 8,772
(0.10 %)		 147
(100.00 %)		 643,488
(3.49 %)		 361,843
(3.63 %)		 4,074,440
(56.52 %)		 27,745
(1.31 %)
46 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1		 n/a 10,725
(1.71 %)		 41,537
(11.41 %)		 n/a 33.68
(100.00 %)		 n/a 11,110
(100.00 %)		 396,112
(4.11 %)		 221,932
(3.23 %)		 2,389,229
(59.21 %)		 17,045
(1.23 %)
47 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2		 39,696
(6.07 %)		 13,883
(1.80 %)		 50,556
(11.19 %)		 n/a 33.51
(84.07 %)		 843
(15.93 %)		 1,052
(84.07 %)		 496,648
(3.63 %)		 258,281
(2.28 %)		 3,594,433
(47.71 %)		 22,750
(1.69 %)
48 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2		 n/a 24,975
(1.79 %)		 113,252
(15.69 %)		 n/a 34.00
(100.00 %)		 n/a 3,372
(100.00 %)		 936,351
(4.13 %)		 520,230
(3.65 %)		 5,183,602
(58.66 %)		 47,327
(1.58 %)
49 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1		 n/a 15,253
(1.67 %)		 62,228
(12.57 %)		 n/a 34.08
(100.00 %)		 n/a 1,599
(100.00 %)		 595,917
(3.95 %)		 335,791
(3.38 %)		 3,478,519
(61.18 %)		 31,738
(1.57 %)
50 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1		 n/a 15,334
(1.80 %)		 60,140
(12.83 %)		 n/a 33.79
(99.92 %)		 2,496
(0.09 %)		 483
(100.00 %)		 567,458
(3.73 %)		 320,455
(3.12 %)		 3,403,771
(58.38 %)		 27,791
(1.48 %)
51 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1		 57,769
(2.07 %)		 16,114
(0.55 %)		 62,579
(2.93 %)		 n/a 34.94
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,799
(96.77 %)		 968,939
(3.15 %)		 948,741
(4.39 %)		 21,535,213
(46.15 %)		 16,685
(0.21 %)
52 carrot
GCF_001625215.1		 51,773
(15.95 %)		 16,649
(3.96 %)		 50,187
(20.50 %)		 n/a 34.79
(91.77 %)		 26,112
(8.24 %)		 4,826
(100.00 %)		 179,630
(2.41 %)		 166,060
(4.97 %)		 1,981,148
(31.51 %)		 8,564
(0.85 %)
53 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2		 60,116
(15.29 %)		 16,679
(3.49 %)		 51,607
(18.82 %)		 n/a 34.97
(99.99 %)		 554
(0.01 %)		 11
(100.00 %)		 195,035
(2.33 %)		 186,941
(8.11 %)		 2,018,050
(39.61 %)		 10,319
(1.14 %)
54 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1		 n/a 27,737
(2.70 %)		 78,774
(11.79 %)		 n/a 37.13
(76.51 %)		 36,478
(23.50 %)		 4,440
(100.00 %)		 584,617
(3.41 %)		 554,162
(3.52 %)		 4,126,060
(43.14 %)		 77,570
(1.78 %)
55 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2		 56,386
(9.38 %)		 18,790
(2.86 %)		 49,944
(11.73 %)		 n/a 37.52
(99.61 %)		 672
(0.39 %)		 758
(99.61 %)		 377,964
(3.52 %)		 356,023
(4.79 %)		 2,560,255
(56.85 %)		 52,506
(2.50 %)
56 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1		 33,377
(11.52 %)		 13,874
(4.00 %)		 33,656
(13.67 %)		 n/a 33.84
(96.11 %)		 23,313
(3.90 %)		 49,406
(96.10 %)		 207,850
(3.52 %)		 166,467
(10.85 %)		 1,676,921
(43.19 %)		 12,838
(2.54 %)
57 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1		 39,358
(13.36 %)		 13,841
(4.31 %)		 29,805
(14.24 %)		 n/a 33.03
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 140
(100.00 %)		 205,974
(3.02 %)		 128,354
(6.37 %)		 1,998,066
(39.24 %)		 7,216
(0.99 %)
58 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1		 n/a 3
(0.11 %)		 117
(7.42 %)		 n/a 39.35
(99.99 %)		 4
(0.01 %)		 35
(100.00 %)		 1,139
(3.04 %)		 1,677
(4.92 %)		 11,074
(10.60 %)		 76
(1.07 %)
59 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1		 n/a 6,487
(0.16 %)		 114,999
(4.12 %)		 n/a 37.82
(62.87 %)		 490,371
(37.15 %)		 1,116,784
(62.85 %)		 692,892
(1.67 %)		 790,165
(1.22 %)		 18,073,193
(31.20 %)		 24,414
(0.46 %)
60 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1		 53,262
(17.46 %)		 17,642
(4.97 %)		 49,474
(23.85 %)		 n/a 36.14
(99.81 %)		 3,756
(0.19 %)		 1,556
(100.00 %)		 156,083
(2.30 %)		 128,904
(3.10 %)		 2,112,137
(31.93 %)		 31,157
(5.92 %)
61 chickpea
GCF_000331145.1		 41,971
(9.82 %)		 15,685
(3.16 %)		 30,411
(8.82 %)		 n/a 31.04
(90.95 %)		 31,897
(9.07 %)		 39,024
(90.93 %)		 339,564
(10.51 %)		 318,439
(11.48 %)		 2,929,750
(43.82 %)		 3,488
(0.28 %)
62 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2		 66,337
(12.31 %)		 15,432
(2.83 %)		 67,569
(21.71 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 275,878
(2.26 %)		 229,333
(3.98 %)		 2,244,200
(35.17 %)		 37,317
(4.17 %)
63 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1		 n/a 23,898
(0.89 %)		 138,156
(8.52 %)		 n/a 40.10
(96.58 %)		 25,154
(3.42 %)		 35,781
(96.58 %)		 829,613
(1.78 %)		 1,793,985
(6.94 %)		 8,707,237
(62.53 %)		 317,707
(8.50 %)
64 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1		 n/a 13,666
(0.97 %)		 71,763
(9.04 %)		 n/a 35.33
(99.97 %)		 1,170
(0.03 %)		 1,621
(100.00 %)		 635,445
(2.92 %)		 599,600
(4.44 %)		 8,101,700
(44.90 %)		 75,475
(3.56 %)
65 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1		 54,029
(12.78 %)		 22,400
(4.38 %)		 57,140
(17.42 %)		 n/a 37.29
(97.86 %)		 24,384
(2.15 %)		 26,566
(97.85 %)		 368,808
(18.26 %)		 218,013
(4.36 %)		 2,456,496
(34.15 %)		 18,367
(1.88 %)
66 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1		 62,514
(13.83 %)		 22,289
(4.29 %)		 57,502
(17.16 %)		 n/a 37.35
(100.00 %)		 n/a 452
(100.00 %)		 290,077
(2.40 %)		 209,363
(3.56 %)		 2,519,627
(35.77 %)		 19,299
(1.84 %)
67 clementine
GCF_000493195.1		 36,454
(14.29 %)		 14,126
(4.66 %)		 32,820
(18.34 %)		 n/a 34.96
(97.94 %)		 7,564
(2.07 %)		 8,962
(97.93 %)		 178,443
(2.76 %)		 104,853
(5.57 %)		 1,933,079
(33.91 %)		 7,930
(3.80 %)
68 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1		 44,646
(5.40 %)		 15,784
(1.70 %)		 48,875
(7.66 %)		 n/a 35.83
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 347,467
(1.98 %)		 290,488
(4.50 %)		 6,293,084
(43.53 %)		 8,929
(0.83 %)
69 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4		 49,382
(28.03 %)		 11,312
(4.28 %)		 36,277
(36.82 %)		 n/a 45.22
(98.15 %)		 4,395
(1.86 %)		 5,152
(98.14 %)		 138,958
(36.90 %)		 77,054
(2.71 %)		 802,227
(32.19 %)		 34,479
(27.80 %)
70 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1		 n/a 6,316
(4.02 %)		 55,013
(41.57 %)		 n/a 44.70
(99.81 %)		 351
(0.00 %)		 106,265
(100.00 %)		 29,218
(1.24 %)		 29,377
(1.67 %)		 480,195
(13.66 %)		 19,392
(13.60 %)
71 coffee C.arabica
GCF_003713225.1		 80,738
(8.03 %)		 23,574
(2.02 %)		 85,662
(13.32 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 691
(0.21 %)		 2,833
(100.00 %)		 501,414
(2.11 %)		 386,209
(3.95 %)		 5,652,743
(41.66 %)		 36,398
(1.62 %)
72 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1		 43,829
(7.69 %)		 14,911
(2.02 %)		 57,408
(14.42 %)		 n/a 36.89
(97.92 %)		 3,482
(2.08 %)		 3,530
(100.00 %)		 312,360
(2.09 %)		 234,658
(3.24 %)		 3,464,594
(38.91 %)		 21,553
(1.54 %)
73 common bean
GCF_000499845.1		 32,720
(9.56 %)		 16,474
(3.53 %)		 45,055
(14.46 %)		 n/a 34.96
(90.70 %)		 40,860
(9.33 %)		 41,568
(90.67 %)		 233,709
(2.97 %)		 208,045
(3.61 %)		 2,886,693
(37.28 %)		 38,054
(5.05 %)
74 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1		 n/a 14,992
(4.28 %)		 36,350
(16.84 %)		 n/a 34.41
(99.99 %)		 394
(0.01 %)		 905
(99.99 %)		 475,247
(5.76 %)		 230,646
(4.36 %)		 2,425,030
(37.74 %)		 18,611
(3.41 %)
75 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1		 49,622
(12.72 %)		 14,929
(3.58 %)		 32,981
(12.20 %)		 n/a 33.07
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 525,520
(5.43 %)		 225,151
(3.91 %)		 2,463,587
(42.86 %)		 13,018
(1.79 %)
76 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1		 49,976
(13.24 %)		 16,949
(3.79 %)		 38,488
(13.47 %)		 n/a 33.40
(95.35 %)		 24,158
(4.67 %)		 28,947
(95.33 %)		 525,525
(5.37 %)		 246,475
(5.25 %)		 2,603,240
(38.46 %)		 13,597
(2.11 %)
77 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1		 51,464
(13.54 %)		 14,443
(3.56 %)		 31,633
(12.06 %)		 n/a 33.20
(100.00 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 516,010
(5.54 %)		 234,395
(5.05 %)		 2,319,259
(43.64 %)		 12,926
(2.66 %)
78 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1		 65,051
(8.85 %)		 26,142
(3.49 %)		 114,639
(23.87 %)		 n/a 44.17
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 243,799
(1.41 %)		 237,530
(2.79 %)		 4,477,357
(31.45 %)		 154,087
(19.32 %)
79 common sunflower
GCF_002127325.2		 133,319
(3.74 %)		 19,514
(0.59 %)		 166,187
(9.16 %)		 n/a 38.59
(97.94 %)		 2,384
(2.06 %)		 334
(100.00 %)		 1,263,836
(2.20 %)		 1,549,598
(4.15 %)		 12,728,097
(58.39 %)		 170,287
(2.39 %)
80 common tobacco
GCF_000715135.1		 100,805
(3.09 %)		 29,968
(0.80 %)		 184,998
(7.05 %)		 n/a 38.95
(97.11 %)		 292,325
(2.90 %)		 292,601
(97.11 %)		 1,134,202
(3.09 %)		 1,268,208
(4.45 %)		 24,013,710
(52.08 %)		 204,914
(1.84 %)
81 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2		 53,587
(7.04 %)		 17,804
(1.85 %)		 77,741
(13.65 %)		 n/a 35.35
(97.95 %)		 25,649
(2.05 %)		 22,642
(100.00 %)		 860,049
(3.78 %)		 485,854
(6.14 %)		 5,989,180
(36.35 %)		 20,674
(1.12 %)
82 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3		 56,406
(8.63 %)		 16,303
(2.05 %)		 63,990
(13.73 %)		 n/a 34.91
(95.70 %)		 26,066
(4.30 %)		 28,407
(95.70 %)		 743,470
(3.99 %)		 393,077
(5.53 %)		 4,897,193
(34.87 %)		 16,140
(0.90 %)
83 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1		 112,410
(5.51 %)		 35,047
(1.61 %)		 101,814
(6.75 %)		 n/a 34.45
(97.16 %)		 48,742
(2.84 %)		 57,884
(97.16 %)		 829,774
(2.69 %)		 808,839
(3.64 %)		 12,556,104
(52.01 %)		 31,946
(0.61 %)
84 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1		 154,180
(6.02 %)		 37,839
(1.61 %)		 107,764
(6.56 %)		 n/a 34.36
(99.87 %)		 5,708
(0.13 %)		 6,735
(99.87 %)		 996,701
(2.36 %)		 903,817
(3.56 %)		 13,123,355
(54.75 %)		 35,220
(0.59 %)
85 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1		 72,590
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 86,941
(18.36 %)		 n/a 33.22
(98.25 %)		 19,717
(1.76 %)		 20,751
(98.24 %)		 367,610
(3.53 %)		 300,200
(3.32 %)		 5,199,574
(40.83 %)		 10,926
(0.55 %)
86 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2		 48,519
(10.54 %)		 16,925
(3.30 %)		 44,689
(13.01 %)		 n/a 32.95
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 676
(100.00 %)		 344,688
(3.92 %)		 283,941
(8.14 %)		 3,091,888
(41.66 %)		 24,507
(2.34 %)
87 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1		 49,636
(19.79 %)		 18,863
(6.83 %)		 34,588
(19.24 %)		 n/a 36.43
(97.43 %)		 13,813
(2.58 %)		 3,500
(100.00 %)		 181,838
(3.12 %)		 140,936
(7.42 %)		 1,550,544
(33.30 %)		 13,714
(2.69 %)
88 cucumber
GCF_000004075.3		 37,079
(18.45 %)		 13,349
(5.61 %)		 23,889
(15.73 %)		 n/a 32.84
(99.98 %)		 89
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 158,454
(3.72 %)		 77,247
(3.20 %)		 1,739,467
(33.72 %)		 5,730
(1.35 %)
89 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1		 n/a 14,128
(1.63 %)		 42,460
(7.33 %)		 n/a 30.78
(99.98 %)		 2,018
(0.02 %)		 668
(100.00 %)		 377,357
(3.69 %)		 183,159
(2.82 %)		 5,560,199
(36.58 %)		 30,878
(2.75 %)
90 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1		 n/a 13,933
(1.63 %)		 40,035
(6.93 %)		 n/a 30.80
(99.98 %)		 1,977
(0.02 %)		 667
(100.00 %)		 373,612
(3.67 %)		 181,531
(2.84 %)		 5,483,268
(36.45 %)		 30,829
(2.75 %)
91 damask rose (2016)
GCA_001662545.1		 n/a 16,060
(1.87 %)		 117,610
(18.87 %)		 n/a 38.73
(97.06 %)		 101,982
(2.91 %)		 409,854
(97.09 %)		 329,911
(1.95 %)		 258,478
(2.82 %)		 3,747,902
(31.42 %)		 48,987
(3.05 %)
92 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1		 61,678
(8.40 %)		 18,582
(2.20 %)		 70,121
(14.29 %)		 n/a 40.29
(100.00 %)		 317
(0.00 %)		 2,391
(100.00 %)		 431,923
(8.92 %)		 371,389
(4.19 %)		 2,721,501
(44.16 %)		 89,481
(12.47 %)
93 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1		 48,949
(10.55 %)		 16,697
(2.99 %)		 64,523
(16.24 %)		 n/a 39.33
(91.22 %)		 64,723
(8.79 %)		 143,382
(91.21 %)		 284,003
(7.58 %)		 185,641
(2.23 %)		 2,574,645
(27.52 %)		 62,332
(7.21 %)
94 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1		 48,204
(8.04 %)		 15,110
(2.28 %)		 57,536
(14.48 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 606
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 445,970
(3.39 %)		 319,468
(5.39 %)		 3,687,072
(36.31 %)		 41,402
(3.02 %)
95 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1		 193,799
(12.81 %)		 52,060
(3.07 %)		 144,859
(15.37 %)		 n/a 39.78
(99.99 %)		 219
(0.01 %)		 1,085
(100.00 %)		 713,274
(2.40 %)		 840,280
(6.39 %)		 4,419,734
(51.60 %)		 203,906
(13.78 %)
96 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1		 63,294
(1.67 %)		 17,849
(0.43 %)		 260,921
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 291
(100.00 %)		 2,720,197
(55.13 %)		 1,726,335
(5.40 %)		 14,010,390
(72.58 %)		 732,834
(17.24 %)
97 durian
GCF_002303985.1		 68,467
(10.35 %)		 24,627
(3.34 %)		 48,130
(9.41 %)		 n/a 32.64
(99.58 %)		 3,044
(0.43 %)		 677
(100.00 %)		 490,482
(3.80 %)		 509,842
(12.92 %)		 4,397,155
(48.22 %)		 56,957
(6.23 %)
98 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1		 n/a 32,523
(0.34 %)		 530,488
(8.17 %)		 n/a 46.01
(98.73 %)		 330,230
(1.28 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,723,974
(3.46 %)		 2,746,444
(3.02 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,108,395
(25.96 %)
99 eggplant (2014)
GCA_000787875.1		 n/a 15,481
(1.92 %)		 48,974
(7.98 %)		 n/a 35.72
(95.30 %)		 118,249
(4.75 %)		 143,048
(95.25 %)		 317,711
(2.21 %)		 307,772
(4.55 %)		 6,006,653
(38.61 %)		 7,570
(0.50 %)
100 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1		 n/a 34,754
(1.95 %)		 231,748
(22.13 %)		 n/a 46.97
(99.99 %)		 1,574
(0.01 %)		 1,588
(99.99 %)		 587,262
(1.41 %)		 551,392
(2.62 %)		 9,678,348
(46.32 %)		 398,884
(36.81 %)
101 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1		 n/a 57,092
(4.66 %)		 139,785
(17.31 %)		 n/a 33.78
(99.95 %)		 104
(0.05 %)		 182
(99.95 %)		 665,897
(3.33 %)		 561,368
(7.98 %)		 6,809,885
(45.67 %)		 31,360
(1.27 %)
102 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1		 69,123
(8.58 %)		 15,792
(1.92 %)		 66,872
(14.31 %)		 n/a 35.68
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 773,652
(4.18 %)		 429,695
(8.87 %)		 4,823,216
(39.65 %)		 21,654
(2.15 %)
103 English walnut
GCF_001411555.2		 52,962
(10.18 %)		 18,927
(3.19 %)		 60,210
(17.37 %)		 n/a 36.21
(99.89 %)		 1,051
(0.11 %)		 24,757
(100.00 %)		 434,989
(3.86 %)		 303,673
(3.70 %)		 3,318,114
(33.94 %)		 24,028
(1.83 %)
104 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1		 n/a 12,903
(3.20 %)		 33,445
(14.99 %)		 n/a 33.08
(99.96 %)		 983
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 891,822
(54.95 %)		 181,416
(3.89 %)		 2,376,097
(36.79 %)		 4,821
(0.53 %)
105 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1		 42,218
(10.92 %)		 14,784
(3.18 %)		 46,293
(16.46 %)		 n/a 36.73
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 433,802
(3.92 %)		 270,411
(4.15 %)		 2,634,547
(36.26 %)		 29,535
(3.72 %)
106 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1		 47,822
(7.37 %)		 14,132
(1.76 %)		 52,606
(11.89 %)		 n/a 34.09
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 490,095
(3.26 %)		 291,432
(3.68 %)		 3,197,241
(60.23 %)		 29,385
(2.13 %)
107 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1		 54,052
(4.78 %)		 14,372
(1.33 %)		 80,776
(14.35 %)		 n/a 36.88
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 496,928
(2.45 %)		 491,703
(4.75 %)		 4,850,176
(50.53 %)		 57,897
(3.26 %)
108 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1		 45,049
(8.43 %)		 18,010
(3.03 %)		 54,840
(15.32 %)		 n/a 35.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 5,089
(100.00 %)		 397,210
(3.11 %)		 254,173
(4.10 %)		 3,228,435
(42.44 %)		 15,343
(0.97 %)
109 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1		 n/a 27,772
(0.99 %)		 128,971
(6.28 %)		 n/a 37.84
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 667
(100.00 %)		 4,744,181
(80.09 %)		 1,261,453
(5.53 %)		 18,063,531
(49.81 %)		 86,419
(1.62 %)
110 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1		 55,369
(16.07 %)		 19,591
(4.65 %)		 41,748
(16.14 %)		 n/a 34.95
(99.99 %)		 277
(0.01 %)		 21
(100.00 %)		 256,070
(2.83 %)		 178,940
(8.44 %)		 2,317,187
(40.87 %)		 3,317
(6.62 %)
111 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2		 48,620
(10.29 %)		 16,779
(3.20 %)		 47,438
(13.87 %)		 n/a 35.62
(98.95 %)		 566
(1.05 %)		 1,034
(98.95 %)		 245,672
(2.41 %)		 239,601
(4.78 %)		 2,887,505
(44.41 %)		 44,689
(7.20 %)
112 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1		 62,563
(15.19 %)		 15,236
(3.45 %)		 60,387
(23.53 %)		 n/a 39.30
(99.95 %)		 1,014
(0.05 %)		 77
(100.00 %)		 226,730
(2.23 %)		 196,099
(4.12 %)		 1,632,269
(33.79 %)		 38,448
(5.69 %)
113 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1		 n/a 29,137
(2.81 %)		 89,605
(14.72 %)		 n/a 35.15
(99.99 %)		 102
(0.01 %)		 596
(99.99 %)		 664,293
(2.97 %)		 503,960
(9.26 %)		 5,715,446
(39.21 %)		 22,264
(1.77 %)
114 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2		 56,366
(12.92 %)		 20,853
(4.29 %)		 41,483
(12.40 %)		 n/a 32.05
(95.31 %)		 22,764
(4.70 %)		 32,266
(95.30 %)		 357,310
(3.64 %)		 246,638
(4.06 %)		 2,660,781
(43.22 %)		 2,691
(0.38 %)
115 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2		 77,682
(12.36 %)		 22,539
(3.42 %)		 67,761
(16.26 %)		 n/a 38.07
(99.99 %)		 101
(0.01 %)		 34
(100.00 %)		 309,302
(2.18 %)		 331,724
(5.06 %)		 2,996,468
(41.19 %)		 25,597
(2.08 %)
116 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1		 39,127
(13.03 %)		 15,600
(4.11 %)		 42,096
(18.23 %)		 n/a 35.90
(99.54 %)		 14,532
(0.48 %)		 12
(100.00 %)		 358,479
(3.69 %)		 179,807
(3.40 %)		 2,234,313
(32.05 %)		 12,963
(1.47 %)
117 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1		 72,613
(2.92 %)		 14,868
(0.56 %)		 135,918
(7.87 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 319
(100.00 %)		 1,077,704
(2.26 %)		 853,368
(5.27 %)		 13,477,464
(61.64 %)		 152,063
(4.18 %)
118 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1		 n/a 17,158
(0.86 %)		 191,202
(13.47 %)		 n/a 38.57
(86.69 %)		 530,762
(13.34 %)		 292,698
(86.67 %)		 770,031
(2.12 %)		 637,135
(3.75 %)		 13,484,203
(41.57 %)		 81,500
(2.36 %)
119 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1		 n/a 12,110
(0.01 %)		 960,545
(1.07 %)		 n/a 31.25
(100.00 %)		 6,368
(0.00 %)		 5,951
(100.00 %)		 61,111,090
(11.87 %)		 29,667,857
(2.75 %)		 11,464
(100.00 %)		 1,680,995
(2.36 %)
120 false flax
GCF_000633955.1		 123,030
(22.63 %)		 61,894
(13.77 %)		 113,219
(31.09 %)		 n/a 36.55
(92.99 %)		 74,428
(7.02 %)		 37,780
(99.99 %)		 346,267
(2.46 %)		 233,837
(5.56 %)		 3,452,066
(27.34 %)		 32,235
(2.62 %)
121 field mustard
GCF_000309985.2		 73,446
(34.56 %)		 30,193
(10.12 %)		 57,010
(25.57 %)		 n/a 36.83
(99.39 %)		 408
(0.61 %)		 1,100
(100.00 %)		 261,522
(15.13 %)		 196,553
(8.43 %)		 1,533,242
(38.01 %)		 24,895
(5.44 %)
122 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1		 n/a 30,000
(2.41 %)		 346,692
(27.97 %)		 n/a 45.34
(98.74 %)		 507,646
(1.30 %)		 1,033,269
(98.70 %)		 323,234
(1.19 %)		 394,943
(6.28 %)		 6,129,348
(33.00 %)		 325,103
(21.18 %)
123 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1		 63,465
(6.03 %)		 17,263
(1.31 %)		 78,564
(9.37 %)		 n/a 35.95
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 459
(100.00 %)		 982,341
(3.33 %)		 719,891
(7.87 %)		 6,810,592
(50.46 %)		 27,883
(2.10 %)
124 foxtail millet
GCF_000263155.2		 40,951
(13.47 %)		 17,758
(5.07 %)		 60,598
(30.59 %)		 n/a 46.14
(98.82 %)		 6,442
(1.19 %)		 6,779
(98.81 %)		 115,365
(1.46 %)		 116,980
(2.45 %)		 1,691,260
(29.31 %)		 78,297
(28.27 %)
125 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1		 45,159
(4.02 %)		 13,440
(1.02 %)		 85,207
(11.07 %)		 n/a 39.02
(97.02 %)		 47,391
(2.99 %)		 56,182
(97.01 %)		 427,496
(2.02 %)		 885,946
(8.32 %)		 6,075,356
(46.49 %)		 111,109
(6.80 %)
126 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4		 69,048
(2.69 %)		 16,407
(0.56 %)		 105,654
(5.75 %)		 n/a 37.92
(99.95 %)		 384
(0.05 %)		 93
(100.00 %)		 1,192,578
(2.37 %)		 1,282,344
(4.72 %)		 12,843,881
(61.50 %)		 160,781
(2.86 %)
127 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1		 74,264
(1.88 %)		 17,744
(0.43 %)		 129,692
(4.97 %)		 n/a 37.94
(99.73 %)		 826
(0.27 %)		 1,566
(100.00 %)		 1,517,586
(2.16 %)		 1,541,702
(5.89 %)		 13,206,825
(66.95 %)		 105,766
(0.97 %)
128 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1		 43,473
(2.84 %)		 13,544
(0.88 %)		 64,877
(5.24 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 596
(0.00 %)		 510
(100.00 %)		 1,556,970
(22.50 %)		 788,188
(5.25 %)		 10,081,845
(53.72 %)		 41,032
(1.09 %)
129 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1		 59,652
(8.73 %)		 18,917
(2.55 %)		 47,052
(9.22 %)		 n/a 32.09
(99.98 %)		 1,693
(0.02 %)		 2,266
(100.00 %)		 452,206
(3.00 %)		 195,931
(2.27 %)		 4,921,469
(39.63 %)		 9,731
(0.69 %)
130 ginger
GCF_018446385.1		 127,579
(4.07 %)		 33,995
(0.96 %)		 186,756
(7.79 %)		 n/a 39.16
(100.00 %)		 901
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,187,168
(2.18 %)		 2,088,683
(6.47 %)		 12,917,773
(61.42 %)		 398,512
(10.38 %)
131 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2		 42,106
(6.72 %)		 15,819
(2.23 %)		 49,753
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,402
(9.76 %)		 13,479
(99.93 %)		 394,793
(2.75 %)		 364,336
(3.37 %)		 4,190,750
(39.49 %)		 12,198
(0.64 %)
132 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1		 87,385
(2.18 %)		 17,963
(0.44 %)		 263,708
(10.29 %)		 n/a 46.32
(97.73 %)		 107,163
(2.27 %)		 109,126
(100.00 %)		 1,490,873
(15.60 %)		 1,415,562
(5.65 %)		 12,540,551
(71.59 %)		 881,849
(29.81 %)
133 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1		 69,195
(1.77 %)		 18,614
(0.43 %)		 300,274
(11.28 %)		 n/a 46.38
(100.00 %)		 n/a 68,537
(100.00 %)		 1,555,328
(15.65 %)		 1,485,488
(4.71 %)		 13,133,338
(73.17 %)		 928,327
(30.84 %)
134 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1		 69,722
(4.35 %)		 17,353
(1.01 %)		 81,347
(7.68 %)		 n/a 38.10
(99.95 %)		 1,565
(0.05 %)		 166
(100.00 %)		 816,909
(2.29 %)		 708,412
(4.09 %)		 8,106,901
(53.67 %)		 66,433
(1.82 %)
135 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1		 n/a 21,161
(2.89 %)		 55,843
(11.78 %)		 n/a 35.63
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 2,366
(99.99 %)		 423,518
(2.92 %)		 293,299
(3.76 %)		 4,466,312
(33.71 %)		 25,250
(1.74 %)
136 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1		 n/a 22,332
(3.88 %)		 51,709
(13.62 %)		 n/a 35.31
(96.44 %)		 25,521
(3.57 %)		 1,234
(100.00 %)		 347,035
(2.87 %)		 241,862
(4.11 %)		 3,578,217
(30.95 %)		 19,259
(1.41 %)
137 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1		 n/a 10,023
(7.00 %)		 16,353
(26.89 %)		 n/a 42.30
(92.78 %)		 89,257
(7.32 %)		 89,277
(92.68 %)		 80,787
(2.86 %)		 45,432
(1.93 %)		 786,155
(19.70 %)		 19,057
(20.99 %)
138 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4		 10,237
(66.85 %)		 988
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 37,284
(8.77 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 43
(99.34 %)
139 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1		 n/a 2,016
(0.62 %)		 31,585
(41.01 %)		 n/a 57.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,614
(100.00 %)		 183,076
(3.30 %)		 101,860
(5.85 %)		 972,524
(32.54 %)		 4,760
(98.23 %)
140 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1		 n/a 1,365
(1.08 %)		 11,070
(58.24 %)		 n/a 55.95
(98.44 %)		 780
(1.56 %)		 597
(100.00 %)		 25,537
(1.66 %)		 27,257
(3.92 %)		 365,387
(19.48 %)		 3,732
(86.39 %)
141 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1		 7,014
(37.71 %)		 966
(2.72 %)		 2,947
(70.38 %)		 n/a 63.54
(95.35 %)		 1,012
(4.66 %)		 1,386
(95.34 %)		 8,655
(1.88 %)		 3,803
(1.89 %)		 147,537
(20.31 %)		 604
(53.91 %)
142 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1		 7,852
(82.09 %)		 1,231
(6.04 %)		 4,460
(76.24 %)		 n/a 48.02
(99.76 %)		 20
(0.24 %)		 21
(100.00 %)		 17,900
(4.88 %)		 5,674
(1.75 %)		 113,699
(21.91 %)		 7
(0.01 %)
143 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1		 n/a 1,057
(0.55 %)		 9,735
(58.02 %)		 n/a 64.03
(100.00 %)		 n/a 17
(100.00 %)		 166,909
(9.00 %)		 120,034
(10.13 %)		 750,946
(37.60 %)		 166
(99.31 %)
144 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2		 19,527
(53.99 %)		 990
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 174,119
(17.13 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 92
(46.06 %)
145 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1		 9,839
(29.70 %)		 1,307
(1.78 %)		 8,108
(53.71 %)		 n/a 52.94
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 8,446
(0.85 %)		 5,471
(0.85 %)		 265,761
(14.34 %)		 11,329
(19.64 %)
146 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1		 9,780
(32.79 %)		 744
(1.00 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 64,770
(8.22 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 756
(45.48 %)
147 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1		 n/a 2,471
(1.78 %)		 14,771
(54.27 %)		 n/a 52.42
(98.98 %)		 2,081
(1.02 %)		 3,731
(98.98 %)		 10,051
(0.46 %)		 14,278
(1.14 %)		 388,120
(8.55 %)		 8,698
(83.31 %)
148 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2		 n/a 1,301
(4.51 %)		 5,667
(86.20 %)		 n/a 63.82
(100.00 %)		 n/a 19
(100.00 %)		 14,619
(3.58 %)		 8,937
(2.75 %)		 178,499
(27.69 %)		 10
(25.23 %)
149 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1		 16,734
(25.96 %)		 666
(0.47 %)		 12,122
(60.02 %)		 n/a 64.75
(96.59 %)		 5,358
(3.43 %)		 12,077
(96.57 %)		 73,343
(6.73 %)		 43,518
(3.04 %)		 568,630
(31.80 %)		 7,776
(96.69 %)
150 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2		 10,242
(66.86 %)		 990
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 36,818
(8.73 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 32
(47.70 %)
151 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1		 7,603
(72.01 %)		 1,064
(6.25 %)		 3,493
(72.08 %)		 n/a 60.44
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 11,026
(5.45 %)		 11,732
(3.90 %)		 107,661
(34.88 %)		 12
(61.27 %)
152 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3		 7,766
(82.33 %)		 1,131
(6.60 %)		 3,714
(76.22 %)		 n/a 59.21
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 22
(100.00 %)		 8,503
(3.84 %)		 4,946
(2.16 %)		 102,428
(27.87 %)		 16
(57.14 %)
153 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1		 14,436
(21.51 %)		 1,411
(0.77 %)		 13,095
(47.93 %)		 n/a 55.97
(91.15 %)		 12,014
(8.87 %)		 11,352
(91.13 %)		 175,729
(14.69 %)		 105,113
(5.10 %)		 667,226
(23.91 %)		 4,325
(42.65 %)
154 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1		 46,021
(16.54 %)		 14,632
(4.66 %)		 34,242
(19.36 %)		 n/a 33.53
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 293,800
(4.64 %)		 151,157
(7.38 %)		 1,732,880
(41.88 %)		 21,835
(6.05 %)
155 green foxtail
GCF_005286985.1		 47,022
(14.66 %)		 17,750
(5.12 %)		 60,106
(30.88 %)		 n/a 46.17
(99.85 %)		 61
(0.15 %)		 76
(99.85 %)		 116,493
(1.51 %)		 120,039
(2.72 %)		 1,676,017
(29.11 %)		 75,497
(29.44 %)
156 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1		 n/a 18,040
(5.19 %)		 61,671
(31.38 %)		 n/a 45.99
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 105,738
(1.38 %)		 87,424
(2.22 %)		 1,777,815
(26.85 %)		 74,932
(30.30 %)
157 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2		 n/a 11,944
(2.63 %)		 37,372
(13.64 %)		 n/a 35.58
(88.95 %)		 1,032,823
(11.31 %)		 21
(100.00 %)		 293,868
(3.21 %)		 174,614
(3.18 %)		 2,690,184
(32.53 %)		 15,323
(1.42 %)
158 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2		 n/a 16,562
(0.53 %)		 72,911
(2.91 %)		 n/a 34.88
(98.35 %)		 196,261
(1.66 %)		 87,978
(100.00 %)		 1,136,015
(1.95 %)		 1,019,921
(4.33 %)		 22,445,162
(47.06 %)		 20,737
(0.24 %)
159 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1		 88,183
(5.03 %)		 22,129
(1.02 %)		 118,243
(9.15 %)		 n/a 35.63
(99.98 %)		 3,486
(0.02 %)		 1,888
(100.00 %)		 1,001,308
(2.63 %)		 1,132,664
(5.72 %)		 8,340,755
(56.16 %)		 43,665
(1.21 %)
160 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1		 43,787
(9.63 %)		 17,635
(3.85 %)		 66,270
(23.98 %)		 n/a 46.87
(98.63 %)		 736
(1.37 %)		 1,027
(98.63 %)		 157,811
(1.55 %)		 119,571
(2.57 %)		 2,107,254
(45.30 %)		 102,278
(32.16 %)
161 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1		 40,307
(7.38 %)		 16,711
(2.29 %)		 50,292
(11.24 %)		 n/a 32.12
(99.95 %)		 858
(0.05 %)		 1,115
(100.00 %)		 439,789
(3.56 %)		 574,639
(8.97 %)		 4,147,814
(47.01 %)		 16,291
(1.13 %)
162 horseweed
GCF_010389155.1		 39,621
(11.54 %)		 14,718
(3.15 %)		 42,194
(16.23 %)		 n/a 34.08
(99.99 %)		 502
(0.01 %)		 357
(100.00 %)		 267,124
(2.84 %)		 155,729
(2.71 %)		 2,475,353
(36.48 %)		 5,205
(0.40 %)
163 Indian licorice
GCF_003935025.1		 44,610
(13.60 %)		 17,108
(4.95 %)		 34,097
(14.33 %)		 n/a 31.84
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 217,674
(3.40 %)		 106,243
(4.04 %)		 2,232,509
(38.91 %)		 5,438
(1.06 %)
164 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1		 n/a 16,184
(2.02 %)		 66,215
(14.16 %)		 n/a 35.37
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 689
(100.00 %)		 739,891
(4.58 %)		 435,389
(7.62 %)		 4,843,419
(38.03 %)		 13,298
(2.56 %)
165 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1		 n/a 15,832
(2.09 %)		 63,488
(14.36 %)		 n/a 35.19
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 358
(100.00 %)		 703,028
(4.29 %)		 399,798
(6.48 %)		 4,662,881
(36.96 %)		 12,534
(1.92 %)
166 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1		 n/a 15,893
(1.97 %)		 68,998
(15.27 %)		 n/a 35.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 156
(100.00 %)		 746,424
(4.43 %)		 451,117
(7.39 %)		 4,820,434
(38.55 %)		 20,367
(2.62 %)
167 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1		 n/a 15,880
(1.95 %)		 69,093
(15.25 %)		 n/a 35.97
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 274
(100.00 %)		 751,691
(4.60 %)		 457,914
(7.61 %)		 4,850,082
(38.95 %)		 20,561
(3.01 %)
168 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1		 50,504
(10.14 %)		 18,451
(3.41 %)		 55,094
(16.89 %)		 n/a 36.30
(99.18 %)		 54
(0.82 %)		 154
(100.00 %)		 411,290
(3.65 %)		 260,413
(3.49 %)		 3,023,907
(31.93 %)		 23,270
(1.88 %)
169 Japanese apricot
GCF_000346735.1		 32,312
(19.60 %)		 14,463
(6.46 %)		 33,049
(23.94 %)		 n/a 37.45
(92.82 %)		 15,597
(7.20 %)		 23,761
(92.80 %)		 118,757
(2.25 %)		 84,983
(4.53 %)		 1,374,244
(23.24 %)		 7,808
(1.87 %)
170 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1		 80,727
(1.01 %)		 14,175
(0.13 %)		 225,166
(3.69 %)		 n/a 36.42
(99.98 %)		 3,031
(0.02 %)		 2,699
(100.00 %)		 2,873,672
(2.01 %)		 4,198,037
(4.24 %)		 5,730
(99.98 %)		 71,102
(1.16 %)
171 Japanese morning glory
GCF_001879475.1		 58,978
(8.37 %)		 16,977
(2.14 %)		 77,626
(18.21 %)		 n/a 37.61
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 3,418
(100.00 %)		 641,896
(6.26 %)		 639,051
(8.97 %)		 3,622,236
(46.63 %)		 77,860
(10.47 %)
172 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1		 55,725
(16.73 %)		 16,338
(4.37 %)		 54,077
(25.00 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 196,712
(2.76 %)		 141,936
(4.82 %)		 1,727,479
(35.05 %)		 63,894
(25.90 %)
173 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1		 n/a 16,562
(4.59 %)		 53,878
(24.77 %)		 n/a 43.61
(98.95 %)		 474
(1.05 %)		 476
(98.95 %)		 494,831
(50.75 %)		 141,079
(3.52 %)		 1,728,936
(33.69 %)		 64,216
(25.20 %)
174 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1		 53,556
(17.24 %)		 16,804
(4.69 %)		 53,712
(24.95 %)		 n/a 43.57
(99.97 %)		 925
(0.03 %)		 58
(100.00 %)		 402,182
(39.07 %)		 138,035
(3.47 %)		 1,719,939
(33.46 %)		 63,485
(25.25 %)
175 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1		 44,669
(10.38 %)		 13,649
(2.41 %)		 38,664
(12.08 %)		 n/a 31.93
(99.74 %)		 2,496
(0.26 %)		 49
(100.00 %)		 270,085
(9.40 %)		 247,307
(22.95 %)		 2,428,999
(49.81 %)		 5,914
(1.27 %)
176 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1		 n/a 21,051
(6.88 %)		 57,023
(32.54 %)		 n/a 44.09
(96.75 %)		 14,848
(3.26 %)		 26,634
(96.74 %)		 101,349
(1.46 %)		 71,657
(2.17 %)		 1,693,252
(21.97 %)		 60,198
(24.06 %)
177 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1		 n/a 15,031
(1.06 %)		 140,751
(10.18 %)		 n/a 36.82
(99.85 %)		 n/a 876,110
(100.00 %)		 505,796
(3.85 %)		 318,171
(2.09 %)		 9,808,138
(33.85 %)		 30,057
(0.85 %)
178 lyrate rockcress
GCF_000004255.2		 44,525
(28.52 %)		 25,416
(19.36 %)		 34,938
(31.66 %)		 n/a 36.08
(88.90 %)		 2,950
(11.10 %)		 3,646
(88.90 %)		 141,441
(20.58 %)		 72,583
(3.25 %)		 1,012,438
(24.68 %)		 8,053
(2.48 %)
179 macadamia nut
GCF_013358625.1		 58,226
(8.43 %)		 16,723
(2.11 %)		 62,465
(13.23 %)		 n/a 39.13
(98.51 %)		 22,059
(1.50 %)		 2,644
(100.00 %)		 463,575
(3.09 %)		 304,057
(3.39 %)		 4,183,445
(34.36 %)		 18,956
(1.40 %)
180 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1		 n/a 13,013
(2.26 %)		 38,671
(8.42 %)		 n/a 33.59
(99.19 %)		 123,798
(0.85 %)		 203,100
(99.15 %)		 329,865
(3.57 %)		 244,018
(4.63 %)		 3,737,818
(40.09 %)		 4,827
(0.29 %)
181 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1		 69,307
(3.21 %)		 14,466
(0.72 %)		 84,219
(6.52 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 1,415,484
(14.07 %)		 1,154,832
(6.29 %)		 10,231,412
(50.86 %)		 107,342
(2.63 %)
182 maize
GCF_902167145.1		 76,921
(3.66 %)		 23,553
(1.55 %)		 154,773
(10.70 %)		 n/a 46.77
(99.83 %)		 708
(0.17 %)		 697
(100.00 %)		 1,340,549
(78.65 %)		 843,168
(5.20 %)		 5,886,498
(69.23 %)		 372,641
(31.10 %)
183 maize (2020)
GCA_905067065.1		 n/a 23,433
(1.61 %)		 150,853
(10.66 %)		 n/a 46.83
(98.14 %)		 56,163
(1.87 %)		 56,173
(98.13 %)		 581,502
(1.40 %)		 753,129
(3.49 %)		 5,867,216
(67.88 %)		 377,414
(31.33 %)
184 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1		 n/a 23,680
(1.58 %)		 153,453
(10.69 %)		 n/a 46.83
(99.71 %)		 1,223
(0.29 %)		 697
(100.00 %)		 593,292
(1.41 %)		 805,647
(4.47 %)		 5,887,178
(69.17 %)		 370,755
(32.34 %)
185 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1		 n/a 23,864
(1.57 %)		 154,358
(10.67 %)		 n/a 46.77
(99.88 %)		 551
(0.12 %)		 777
(100.00 %)		 1,341,834
(78.70 %)		 834,042
(5.01 %)		 5,916,520
(69.26 %)		 372,114
(32.08 %)
186 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2		 34,262
(16.98 %)		 15,545
(6.13 %)		 36,746
(24.10 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 140,519
(2.59 %)		 67,337
(3.89 %)		 1,493,779
(29.32 %)		 41,044
(18.43 %)
187 mango
GCF_011075055.1		 60,349
(16.06 %)		 20,653
(5.13 %)		 40,887
(15.20 %)		 n/a 32.71
(99.98 %)		 169
(0.02 %)		 250
(100.00 %)		 213,445
(3.09 %)		 125,929
(3.29 %)		 2,447,401
(32.63 %)		 7,059
(0.98 %)
188 monocots
GCF_002575655.2		 84,263
(2.17 %)		 17,888
(0.44 %)		 263,541
(10.26 %)		 n/a 46.33
(97.97 %)		 69,858
(2.04 %)		 109,197
(100.00 %)		 1,492,485
(15.65 %)		 1,422,870
(5.39 %)		 12,521,384
(71.80 %)		 881,939
(30.07 %)
189 mosses
GCF_000002425.4		 55,129
(11.87 %)		 8,425
(1.46 %)		 30,452
(12.55 %)		 n/a 33.69
(98.74 %)		 2,645
(1.27 %)		 359
(100.00 %)		 454,786
(48.35 %)		 241,826
(2.56 %)		 2,413,326
(52.52 %)		 22,664
(3.06 %)
190 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1		 29,893
(12.15 %)		 14,092
(4.40 %)		 37,376
(17.73 %)		 n/a 34.86
(94.92 %)		 15,541
(5.08 %)		 46,842
(94.92 %)		 317,532
(5.00 %)		 190,192
(6.25 %)		 2,095,631
(34.49 %)		 20,490
(3.43 %)
191 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1		 47,653
(11.89 %)		 16,644
(3.87 %)		 43,967
(14.67 %)		 n/a 33.18
(92.80 %)		 96,870
(7.24 %)		 2,465
(100.00 %)		 264,597
(3.31 %)		 198,963
(3.34 %)		 2,842,720
(34.86 %)		 13,975
(1.49 %)
192 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1		 46,975
(10.56 %)		 13,502
(2.95 %)		 32,332
(13.20 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 239
(0.01 %)		 1,310
(100.00 %)		 282,171
(3.23 %)		 229,959
(11.70 %)		 2,016,709
(43.94 %)		 18,232
(10.96 %)
193 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1		 35,384
(11.55 %)		 13,191
(3.74 %)		 28,295
(11.09 %)		 n/a 33.23
(89.51 %)		 29,172
(10.51 %)		 60,751
(89.49 %)		 239,295
(7.85 %)		 172,598
(3.17 %)		 2,304,858
(33.21 %)		 12,855
(1.38 %)
194 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1		 57,263
(9.83 %)		 22,097
(3.53 %)		 51,774
(13.22 %)		 n/a 33.46
(99.34 %)		 44,657
(0.68 %)		 55,107
(99.32 %)		 280,867
(4.25 %)		 210,750
(5.67 %)		 3,920,315
(38.10 %)		 6,462
(0.46 %)
195 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1		 44,477
(5.41 %)		 16,928
(1.94 %)		 77,682
(16.06 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 2,037
(0.00 %)		 1,289
(100.00 %)		 437,997
(2.33 %)		 266,149
(5.08 %)		 4,764,252
(34.25 %)		 20,667
(1.81 %)
196 opium poppy
GCF_003573695.1		 127,893
(4.57 %)		 25,532
(0.85 %)		 162,032
(9.31 %)		 n/a 37.28
(99.80 %)		 31,183
(0.20 %)		 34,381
(100.00 %)		 819,294
(1.49 %)		 1,050,181
(6.80 %)		 10,625,631
(55.85 %)		 67,521
(1.21 %)
197 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2		 39,386
(3.85 %)		 12,208
(0.99 %)		 72,906
(8.22 %)		 n/a 34.70
(96.03 %)		 25,751
(3.92 %)		 311,841
(96.08 %)		 506,361
(2.45 %)		 413,770
(3.23 %)		 8,074,114
(39.07 %)		 56,900
(2.34 %)
198 orchid P.equestris
GCF_001263595.1		 32,146
(3.36 %)		 11,541
(1.01 %)		 54,049
(6.11 %)		 n/a 34.46
(92.46 %)		 98,814
(7.56 %)		 188,398
(92.44 %)		 487,071
(2.96 %)		 511,903
(4.00 %)		 7,060,408
(42.20 %)		 31,179
(1.22 %)
199 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1		 120,534
(4.81 %)		 39,902
(1.95 %)		 276,967
(16.36 %)		 n/a 45.32
(99.56 %)		 4,932
(0.44 %)		 2,420
(100.00 %)		 764,083
(1.38 %)		 810,723
(3.95 %)		 11,118,925
(53.40 %)		 520,091
(23.03 %)
200 papaya
GCF_000150535.2		 29,883
(11.99 %)		 12,860
(4.47 %)		 24,403
(11.58 %)		 n/a 35.31
(73.55 %)		 29,719
(26.47 %)		 47,485
(73.53 %)		 260,082
(34.69 %)		 101,644
(3.59 %)		 1,640,647
(28.88 %)		 21,200
(2.95 %)
201 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1		 n/a 43,905
(2.21 %)		 174,920
(14.40 %)		 n/a 35.02
(93.97 %)		 170,266
(6.06 %)		 211,964
(93.94 %)		 1,021,699
(2.86 %)		 1,125,321
(8.02 %)		 9,388,626
(47.60 %)		 102,661
(4.26 %)
202 peach
GCF_000346465.2		 36,201
(20.87 %)		 14,368
(6.26 %)		 32,245
(24.09 %)		 n/a 37.51
(98.79 %)		 2,368
(1.22 %)		 2,531
(98.78 %)		 150,957
(10.06 %)		 96,381
(5.52 %)		 1,221,263
(28.72 %)		 7,885
(2.07 %)
203 peanut
GCF_003086295.2		 155,835
(5.15 %)		 31,810
(1.19 %)		 160,574
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,655
(0.15 %)		 385
(100.00 %)		 1,684,814
(3.52 %)		 1,488,297
(4.81 %)		 11,059,688
(62.32 %)		 140,570
(2.45 %)
204 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1		 n/a 31,065
(1.17 %)		 158,578
(8.79 %)		 n/a 36.33
(98.97 %)		 32,692
(1.04 %)		 29
(100.00 %)		 1,735,218
(3.66 %)		 1,490,806
(4.26 %)		 11,072,983
(61.75 %)		 138,890
(2.46 %)
205 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1		 48,939
(13.04 %)		 22,082
(4.44 %)		 56,235
(17.69 %)		 n/a 37.45
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 176
(99.99 %)		 289,539
(2.54 %)		 223,443
(3.84 %)		 2,308,351
(35.91 %)		 19,559
(2.15 %)
206 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2		 n/a 17,949
(1.26 %)		 134,829
(14.30 %)		 n/a 47.95
(86.95 %)		 156,852
(13.08 %)		 52,033
(100.00 %)		 380,858
(1.16 %)		 466,997
(2.83 %)		 5,117,134
(56.89 %)		 380,989
(29.47 %)
207 pecan
GCF_018687715.1		 71,340
(9.93 %)		 18,671
(2.67 %)		 60,632
(15.16 %)		 n/a 36.30
(99.97 %)		 22
(0.03 %)		 39
(99.97 %)		 473,853
(3.66 %)		 367,846
(6.75 %)		 3,301,121
(39.03 %)		 27,274
(2.22 %)
208 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1		 89,789
(3.75 %)		 17,693
(0.79 %)		 174,787
(12.15 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 238
(0.00 %)		 1,677
(100.00 %)		 605,852
(1.36 %)		 760,915
(5.68 %)		 5,216,229
(69.24 %)		 542,998
(24.23 %)
209 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2		 72,518
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 52,295
(10.15 %)		 n/a 33.21
(98.25 %)		 19,685
(1.76 %)		 20,680
(98.24 %)		 404,885
(2.81 %)		 300,062
(3.31 %)		 5,198,170
(40.84 %)		 10,912
(0.59 %)
210 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1		 63,476
(8.67 %)		 20,265
(2.62 %)		 51,815
(10.02 %)		 n/a 33.24
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 405,385
(2.83 %)		 306,302
(3.81 %)		 5,192,105
(41.79 %)		 10,481
(0.65 %)
211 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1		 n/a 15,868
(1.22 %)		 104,104
(13.39 %)		 n/a 36.03
(91.65 %)		 318,321
(8.39 %)		 328,880
(91.61 %)		 810,727
(3.49 %)		 710,744
(4.84 %)		 7,339,863
(41.43 %)		 104,967
(3.98 %)
212 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2		 46,412
(9.42 %)		 17,396
(3.13 %)		 49,710
(12.66 %)		 n/a 32.76
(94.18 %)		 36,323
(5.83 %)		 67,834
(94.17 %)		 395,663
(3.40 %)		 306,602
(4.71 %)		 3,749,364
(39.19 %)		 26,504
(2.90 %)
213 pineapple
GCF_001540865.1		 43,024
(11.65 %)		 13,649
(3.36 %)		 38,917
(14.95 %)		 n/a 38.34
(98.23 %)		 25,542
(1.78 %)		 3,129
(100.00 %)		 352,802
(7.31 %)		 274,578
(4.75 %)		 2,360,455
(38.94 %)		 56,724
(11.73 %)
214 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1		 37,318
(33.25 %)		 22,836
(23.08 %)		 26,822
(33.93 %)		 n/a 35.63
(97.53 %)		 6,294
(2.49 %)		 7,067
(97.51 %)		 74,470
(2.42 %)		 42,509
(3.39 %)		 814,442
(24.99 %)		 5,817
(2.14 %)
215 pistachio
GCF_008641045.1		 47,948
(7.92 %)		 18,462
(2.58 %)		 62,898
(14.05 %)		 n/a 35.95
(99.84 %)		 16,367
(0.16 %)		 1,865
(100.00 %)		 363,793
(2.43 %)		 253,408
(4.08 %)		 4,200,417
(36.34 %)		 22,340
(1.78 %)
216 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2		 41,101
(10.95 %)		 11,576
(2.50 %)		 38,220
(15.70 %)		 n/a 38.61
(99.84 %)		 626
(0.16 %)		 1,409
(99.84 %)		 236,190
(2.95 %)		 153,746
(4.02 %)		 2,151,579
(26.72 %)		 24,561
(4.48 %)
217 pomegranate
GCF_007655135.1		 43,277
(14.87 %)		 14,635
(4.26 %)		 39,381
(19.97 %)		 n/a 40.38
(99.99 %)		 188
(0.01 %)		 474
(100.00 %)		 173,182
(2.28 %)		 174,872
(6.81 %)		 1,640,973
(32.89 %)		 26,506
(9.18 %)
218 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1		 43,670
(6.66 %)		 16,547
(2.25 %)		 54,186
(11.30 %)		 n/a 34.71
(88.41 %)		 37,060
(11.60 %)		 17,084
(100.00 %)		 321,938
(2.14 %)		 250,793
(4.04 %)		 5,136,691
(33.92 %)		 8,536
(0.30 %)
219 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1		 n/a 16,861
(1.98 %)		 58,882
(12.19 %)		 n/a 35.40
(99.95 %)		 4,397
(0.05 %)		 3,012
(100.00 %)		 774,417
(46.83 %)		 392,378
(8.45 %)		 5,068,449
(42.72 %)		 14,548
(1.32 %)
220 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1		 n/a 17,614
(2.86 %)		 45,684
(10.75 %)		 n/a 34.49
(83.57 %)		 10,041,161
(17.84 %)		 12
(100.00 %)		 606,573
(40.80 %)		 168,871
(2.58 %)		 5,508,800
(26.36 %)		 5,550
(0.22 %)
221 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1		 43,155
(20.86 %)		 16,423
(2.55 %)		 50,333
(11.79 %)		 n/a 34.83
(93.98 %)		 45,215
(6.04 %)		 60,069
(93.96 %)		 662,626
(43.42 %)		 212,315
(4.38 %)		 4,691,843
(34.91 %)		 9,851
(0.45 %)
222 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1		 n/a 16,415
(2.15 %)		 54,766
(12.48 %)		 n/a 35.21
(99.98 %)		 1,476
(0.02 %)		 25
(100.00 %)		 329,233
(2.28 %)		 285,101
(5.66 %)		 4,832,189
(40.28 %)		 12,944
(0.99 %)
223 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1		 n/a 16,694
(2.26 %)		 53,990
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,499
(0.02 %)		 28
(100.00 %)		 323,447
(2.25 %)		 283,098
(5.39 %)		 4,727,964
(39.87 %)		 12,316
(1.34 %)
224 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1		 n/a 16,713
(2.23 %)		 54,380
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,299
(0.02 %)		 27
(100.00 %)		 329,807
(2.31 %)		 282,372
(6.11 %)		 4,718,807
(40.25 %)		 11,812
(1.00 %)
225 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1		 n/a 16,640
(2.18 %)		 54,937
(12.38 %)		 n/a 35.18
(99.98 %)		 1,383
(0.02 %)		 26
(100.00 %)		 329,665
(2.30 %)		 285,993
(6.03 %)		 4,858,802
(40.32 %)		 12,792
(1.32 %)
226 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1		 n/a 16,312
(2.05 %)		 54,438
(12.18 %)		 n/a 35.23
(99.95 %)		 4,448
(0.05 %)		 12
(100.00 %)		 730,464
(46.17 %)		 338,389
(7.95 %)		 4,903,557
(41.90 %)		 12,226
(0.72 %)
227 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1		 35,762
(6.74 %)		 16,408
(2.54 %)		 48,924
(11.75 %)		 n/a 34.59
(99.55 %)		 1,612
(0.45 %)		 1,332
(100.00 %)		 297,683
(2.31 %)		 234,616
(4.68 %)		 4,308,149
(38.02 %)		 8,192
(0.47 %)
228 quinoa
GCF_001683475.1		 74,918
(7.49 %)		 22,914
(1.61 %)		 105,619
(12.97 %)		 n/a 36.87
(99.16 %)		 725
(0.84 %)		 3,487
(100.00 %)		 810,277
(3.58 %)		 762,903
(10.88 %)		 6,551,884
(49.49 %)		 93,630
(2.98 %)
229 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2		 80,563
(20.51 %)		 36,039
(9.58 %)		 74,081
(26.98 %)		 n/a 36.00
(99.94 %)		 2,853
(0.06 %)		 6,424
(100.00 %)		 224,524
(2.48 %)		 193,525
(5.49 %)		 2,234,480
(35.04 %)		 25,972
(4.13 %)
230 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1		 152,583
(19.25 %)		 57,668
(6.87 %)		 143,092
(23.51 %)		 n/a 37.13
(99.99 %)		 840
(0.01 %)		 3,167
(100.00 %)		 470,302
(2.29 %)		 578,281
(9.24 %)		 4,662,467
(42.41 %)		 64,287
(5.62 %)
231 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2		 144,997
(17.51 %)		 59,743
(7.71 %)		 146,391
(26.97 %)		 n/a 36.47
(92.96 %)		 32,639
(7.05 %)		 34,110
(92.95 %)		 449,257
(2.67 %)		 441,269
(5.84 %)		 4,867,601
(32.91 %)		 60,082
(3.53 %)
232 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1		 63,238
(17.01 %)		 17,857
(4.13 %)		 43,079
(17.27 %)		 n/a 33.71
(99.97 %)		 231
(0.03 %)		 90
(100.00 %)		 241,481
(2.65 %)		 187,674
(4.85 %)		 2,251,582
(37.03 %)		 6,474
(1.93 %)
233 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1		 62,516
(12.25 %)		 15,176
(2.61 %)		 67,175
(21.50 %)		 n/a 37.47
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 173
(100.00 %)		 377,231
(3.52 %)		 364,027
(5.05 %)		 2,679,528
(42.07 %)		 64,243
(6.17 %)
234 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2		 71,107
(1.58 %)		 18,911
(0.39 %)		 321,741
(10.16 %)		 n/a 45.91
(99.38 %)		 33,814
(0.62 %)		 10,205
(100.00 %)		 1,208,165
(1.25 %)		 1,319,817
(2.96 %)		 15,480,313
(71.93 %)		 975,234
(26.52 %)
235 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1		 62,168
(11.90 %)		 15,363
(2.73 %)		 54,203
(18.86 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 253,965
(2.10 %)		 235,379
(9.36 %)		 2,668,584
(34.08 %)		 31,789
(3.72 %)
236 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1		 38,736
(11.89 %)		 16,669
(4.18 %)		 43,369
(14.64 %)		 n/a 32.90
(93.47 %)		 20,717
(6.53 %)		 15,445
(100.00 %)		 233,635
(3.33 %)		 204,141
(4.85 %)		 2,682,022
(32.58 %)		 16,828
(2.07 %)
237 riverbank grape
GCF_004353265.1		 44,851
(10.22 %)		 15,302
(3.01 %)		 46,011
(14.96 %)		 n/a 34.32
(98.79 %)		 1,095
(1.21 %)		 175
(100.00 %)		 339,984
(3.03 %)		 233,259
(4.71 %)		 2,925,914
(35.27 %)		 11,055
(0.93 %)
238 rose gum (2021)
GCF_016545825.1		 54,676
(10.44 %)		 16,291
(2.42 %)		 69,492
(17.92 %)		 n/a 39.39
(99.97 %)		 1,712
(0.03 %)		 37
(100.00 %)		 358,171
(2.83 %)		 259,031
(3.65 %)		 3,353,128
(29.52 %)		 78,731
(7.66 %)
239 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1		 65,107
(11.08 %)		 16,389
(2.33 %)		 74,557
(18.16 %)		 n/a 39.28
(92.69 %)		 27,773
(7.32 %)		 32,724
(92.68 %)		 357,835
(2.50 %)		 266,806
(3.22 %)		 3,496,176
(27.34 %)		 79,393
(6.54 %)
240 rose of Sharon
GCF_006381635.1		 91,942
(5.18 %)		 44,363
(2.23 %)		 136,768
(10.14 %)		 n/a 34.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,789
(100.00 %)		 889,945
(2.72 %)		 968,890
(4.91 %)		 9,836,479
(51.73 %)		 42,560
(0.89 %)
241 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1		 71,175
(4.21 %)		 22,208
(1.24 %)		 63,302
(5.13 %)		 n/a 34.70
(91.68 %)		 1,428
(8.32 %)		 755
(100.00 %)		 1,078,590
(2.96 %)		 730,314
(3.70 %)		 6,031,831
(65.59 %)		 24,263
(0.70 %)
242 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1		 66,125
(5.23 %)		 22,033
(1.63 %)		 59,727
(6.42 %)		 n/a 34.84
(94.20 %)		 40,863
(5.81 %)		 7,453
(100.00 %)		 827,088
(3.02 %)		 565,394
(5.23 %)		 5,065,470
(61.59 %)		 13,573
(0.45 %)
243 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1		 94,413
(12.61 %)		 31,218
(3.57 %)		 108,219
(21.49 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,178
(100.00 %)		 360,314
(2.17 %)		 419,051
(4.85 %)		 3,875,932
(41.07 %)		 105,227
(10.14 %)
244 sacred lotus
GCF_000365185.1		 43,140
(7.01 %)		 15,920
(2.13 %)		 61,231
(13.11 %)		 n/a 38.30
(87.98 %)		 175,846
(12.06 %)		 58,428
(87.96 %)		 408,351
(2.83 %)		 275,384
(2.52 %)		 4,643,876
(30.20 %)		 40,599
(2.68 %)
245 saltwater cress
GCF_000478725.1		 38,705
(18.07 %)		 21,851
(11.68 %)		 39,487
(28.65 %)		 n/a 37.71
(98.09 %)		 3,020
(1.92 %)		 3,658
(98.08 %)		 102,162
(1.93 %)		 70,755
(3.25 %)		 1,162,538
(32.09 %)		 15,272
(3.87 %)
246 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1		 n/a 14,138
(0.74 %)		 125,370
(12.27 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 581
(100.00 %)		 655,331
(1.73 %)		 500,899
(4.88 %)		 7,172,490
(54.24 %)		 140,800
(5.87 %)
247 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1		 n/a 15,588
(0.93 %)		 117,831
(12.94 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 597,532
(1.81 %)		 430,194
(3.80 %)		 6,075,115
(49.91 %)		 129,512
(5.41 %)
248 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2		 94,251
(12.60 %)		 31,266
(3.58 %)		 108,141
(21.47 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,162
(100.00 %)		 357,482
(2.10 %)		 419,009
(4.86 %)		 3,874,047
(41.08 %)		 105,216
(10.11 %)
249 scented satinash
GCF_900635055.1		 42,531
(12.21 %)		 15,353
(3.67 %)		 53,811
(20.61 %)		 n/a 40.64
(89.65 %)		 11,862
(10.35 %)		 19,039
(100.00 %)		 179,421
(2.10 %)		 174,902
(3.34 %)		 1,785,894
(25.35 %)		 55,685
(7.69 %)
250 sesame
GCF_000512975.1		 38,693
(16.95 %)		 15,555
(5.41 %)		 35,316
(19.66 %)		 n/a 35.00
(98.34 %)		 9,940
(1.66 %)		 26,176
(98.34 %)		 161,123
(2.85 %)		 79,750
(3.97 %)		 1,807,029
(31.02 %)		 9,873
(1.80 %)
251 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1		 n/a 16,242
(4.30 %)		 39,583
(17.06 %)		 n/a 35.22
(98.66 %)		 2,946
(1.35 %)		 1,451
(100.00 %)		 253,228
(3.98 %)		 186,657
(9.89 %)		 1,792,662
(45.14 %)		 19,928
(3.29 %)
252 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1		 46,475
(12.62 %)		 17,469
(4.11 %)		 51,531
(21.75 %)		 n/a 40.30
(93.72 %)		 7,529
(6.28 %)		 15,781
(100.00 %)		 194,855
(2.07 %)		 116,828
(2.25 %)		 1,801,472
(25.38 %)		 44,191
(5.74 %)
253 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1		 43,419
(12.78 %)		 14,758
(4.01 %)		 41,180
(19.74 %)		 n/a 40.38
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 160,749
(1.91 %)		 114,741
(3.07 %)		 1,619,569
(28.25 %)		 43,290
(7.15 %)
254 silver poplar
GCF_005239225.1		 53,068
(14.65 %)		 20,299
(4.74 %)		 44,556
(16.36 %)		 n/a 33.75
(100.00 %)		 n/a 1,287
(100.00 %)		 309,097
(3.34 %)		 175,288
(4.77 %)		 2,457,634
(38.38 %)		 4,613
(0.67 %)
255 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1		 28,735
(15.21 %)		 13,143
(5.29 %)		 32,007
(22.39 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 89,958
(1.86 %)		 351,649
(15.29 %)		 884,646
(35.58 %)		 14,711
(4.52 %)
256 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3		 48,290
(8.57 %)		 17,901
(3.45 %)		 73,969
(19.64 %)		 n/a 43.88
(95.30 %)		 3,906
(4.70 %)		 4,775
(95.30 %)		 556,607
(65.39 %)		 177,271
(4.54 %)		 2,371,199
(48.20 %)		 110,115
(18.82 %)
257 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1		 n/a 18,138
(3.63 %)		 75,180
(20.67 %)		 n/a 43.67
(97.96 %)		 2,108
(2.04 %)		 308
(100.00 %)		 559,950
(63.17 %)		 156,952
(3.01 %)		 2,481,716
(46.70 %)		 109,923
(19.06 %)
258 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6		 88,003
(9.85 %)		 27,705
(3.08 %)		 77,033
(11.88 %)		 n/a 34.74
(97.36 %)		 8,918
(2.65 %)		 9,199
(97.35 %)		 848,398
(38.02 %)		 434,042
(5.29 %)		 5,346,884
(45.07 %)		 35,893
(1.55 %)
259 spider flower
GCF_000463585.1		 45,524
(22.00 %)		 21,103
(10.40 %)		 38,184
(27.17 %)		 n/a 39.40
(87.71 %)		 24,824
(12.32 %)		 37,073
(87.68 %)		 144,827
(3.22 %)		 103,970
(4.10 %)		 1,118,840
(31.64 %)		 29,313
(6.47 %)
260 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1		 41,494
(5.76 %)		 12,540
(1.38 %)		 68,522
(12.26 %)		 n/a 37.82
(95.53 %)		 137,086
(4.48 %)		 78,263
(100.00 %)		 374,336
(2.48 %)		 670,331
(6.78 %)		 3,213,561
(52.82 %)		 89,520
(4.54 %)
261 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1		 58,405
(7.11 %)		 12,431
(1.27 %)		 61,084
(11.35 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 246
(100.00 %)		 378,521
(2.27 %)		 722,814
(6.29 %)		 2,950,586
(58.17 %)		 92,256
(5.21 %)
262 spotted monkey flower
GCF_000504015.1		 34,441
(15.56 %)		 14,508
(4.41 %)		 34,904
(18.83 %)		 n/a 35.50
(93.50 %)		 15,528
(6.52 %)		 17,740
(93.48 %)		 227,143
(4.28 %)		 204,234
(11.85 %)		 1,776,879
(40.60 %)		 21,718
(3.89 %)
263 stiff brome
GCF_000005505.3		 47,531
(20.35 %)		 15,530
(6.01 %)		 45,735
(34.29 %)		 n/a 46.40
(99.84 %)		 27
(0.16 %)		 36
(99.84 %)		 108,976
(17.41 %)		 54,391
(1.94 %)		 1,197,052
(21.34 %)		 48,209
(34.43 %)
264 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1		 n/a 15,045
(1.35 %)		 164,045
(15.16 %)		 n/a 38.82
(94.24 %)		 89,898
(5.63 %)		 714,282
(94.37 %)		 278,640
(1.91 %)		 388,660
(6.94 %)		 3,639,568
(28.92 %)		 64,180
(3.80 %)
265 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1		 n/a 18,847
(4.51 %)		 76,529
(27.07 %)		 n/a 45.11
(99.96 %)		 1,423
(0.03 %)		 7,128
(99.97 %)		 258,594
(29.31 %)		 144,716
(2.51 %)		 1,976,510
(35.41 %)		 113,324
(26.96 %)
266 sweet cherry
GCF_002207925.1		 39,968
(19.06 %)		 15,007
(5.83 %)		 38,107
(23.61 %)		 n/a 37.72
(90.64 %)		 22,628
(9.39 %)		 10,148
(100.00 %)		 136,700
(2.47 %)		 104,376
(7.20 %)		 1,484,591
(25.20 %)		 9,956
(2.27 %)
267 sweet orange
GCF_000317415.1		 46,820
(15.94 %)		 14,390
(4.63 %)		 34,480
(18.04 %)		 n/a 34.07
(91.90 %)		 12,539
(8.11 %)		 17,383
(91.89 %)		 185,212
(2.95 %)		 104,182
(4.92 %)		 2,119,183
(29.53 %)		 6,540
(0.93 %)
268 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2		 n/a 23,319
(2.45 %)		 98,107
(18.19 %)		 n/a 35.14
(88.01 %)		 171,925
(12.06 %)		 28,461
(100.00 %)		 579,745
(3.87 %)		 473,175
(3.79 %)		 4,850,126
(32.44 %)		 52,715
(3.15 %)
269 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1		 n/a 22,279
(1.15 %)		 121,694
(10.54 %)		 n/a 35.34
(91.81 %)		 275,710
(8.22 %)		 314,564
(91.78 %)		 856,470
(2.64 %)		 970,252
(5.69 %)		 7,570,175
(42.39 %)		 29,072
(0.54 %)
270 switchgrass
GCF_016808335.1		 114,876
(10.54 %)		 31,534
(3.21 %)		 152,844
(27.54 %)		 n/a 46.79
(99.59 %)		 464
(0.41 %)		 1,091
(99.59 %)		 395,905
(1.77 %)		 323,173
(5.10 %)		 4,922,182
(39.47 %)		 213,249
(32.45 %)
271 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1		 n/a 15,605
(2.84 %)		 50,437
(14.57 %)		 n/a 38.53
(96.71 %)		 2,456
(3.29 %)		 7,020
(100.00 %)		 257,784
(2.74 %)		 211,756
(3.88 %)		 2,209,417
(41.80 %)		 54,125
(5.80 %)
272 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4		 53,928
(40.16 %)		 26,582
(34.47 %)		 11,416
(18.70 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 68,517
(16.50 %)		 27,064
(2.77 %)		 749,005
(22.64 %)		 4,601
(1.63 %)
273 thunder duke vine
GCF_013401445.1		 56,436
(17.59 %)		 20,174
(5.61 %)		 42,326
(19.85 %)		 n/a 37.58
(99.96 %)		 146
(0.04 %)		 321
(100.00 %)		 125,395
(2.23 %)		 102,179
(22.89 %)		 1,226,273
(38.50 %)		 6,893
(1.71 %)
274 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1		 50,668
(2.79 %)		 17,479
(0.82 %)		 117,543
(8.63 %)		 n/a 40.23
(88.38 %)		 119,817
(11.63 %)		 37,194
(100.00 %)		 622,838
(1.51 %)		 788,520
(3.46 %)		 11,822,060
(48.66 %)		 174,838
(3.17 %)
275 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2		 66,966
(3.67 %)		 17,141
(1.02 %)		 81,513
(6.82 %)		 n/a 38.89
(97.29 %)		 213,074
(2.72 %)		 215,609
(97.29 %)		 486,556
(1.53 %)		 669,040
(5.52 %)		 10,446,746
(53.83 %)		 118,807
(2.33 %)
276 tomato (2024)
GCF_036512215.1		 59,947
(8.20 %)		 15,474
(1.94 %)		 40,638
(7.50 %)		 n/a 35.17
(99.99 %)		 166
(0.01 %)		 14
(100.00 %)		 333,077
(2.31 %)		 259,232
(7.09 %)		 5,402,596
(43.04 %)		 31,740
(4.85 %)
277 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5		 45,847
(6.92 %)		 15,425
(2.15 %)		 38,319
(7.54 %)		 n/a 34.12
(90.19 %)		 19,539
(9.82 %)		 3,066
(100.00 %)		 311,852
(2.14 %)		 229,773
(3.18 %)		 5,390,626
(35.26 %)		 25,196
(1.27 %)
278 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1		 n/a 22,795
(3.47 %)		 67,418
(16.40 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 347,375
(3.07 %)		 304,988
(3.96 %)		 3,119,641
(40.22 %)		 30,300
(3.29 %)
279 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1		 n/a 22,897
(3.50 %)		 67,595
(16.43 %)		 n/a 38.12
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 118
(100.00 %)		 344,928
(2.90 %)		 299,566
(3.87 %)		 3,139,734
(39.86 %)		 30,533
(2.95 %)
280 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1		 69,030
(4.11 %)		 20,169
(1.21 %)		 55,515
(4.75 %)		 n/a 35.17
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 948
(100.00 %)		 618,195
(1.97 %)		 622,748
(3.28 %)		 8,002,633
(61.80 %)		 27,646
(0.67 %)
281 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1		 53,446
(3.92 %)		 20,707
(1.29 %)		 56,318
(5.01 %)		 n/a 35.03
(92.12 %)		 45,768
(7.88 %)		 121,185
(92.12 %)		 618,119
(2.07 %)		 589,954
(3.54 %)		 8,098,351
(55.57 %)		 28,949
(0.57 %)
282 trilobed morning glory
GCF_003576645.1		 49,472
(13.00 %)		 16,803
(3.58 %)		 50,448
(18.68 %)		 n/a 35.68
(94.76 %)		 31,256
(5.25 %)		 17
(100.00 %)		 333,211
(3.67 %)		 335,317
(10.66 %)		 2,341,085
(36.54 %)		 27,290
(3.24 %)
283 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2		 49,094
(16.30 %)		 14,451
(4.70 %)		 33,670
(18.59 %)		 n/a 34.22
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 184,421
(2.80 %)		 106,732
(3.28 %)		 1,996,057
(33.86 %)		 6,824
(1.28 %)
284 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2		 63,531
(8.16 %)		 16,883
(1.90 %)		 72,901
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,673
(0.23 %)		 2,002
(100.00 %)		 800,288
(3.71 %)		 460,119
(7.41 %)		 5,438,715
(37.84 %)		 19,628
(1.10 %)
285 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1		 n/a 13,357
(3.39 %)		 37,446
(17.24 %)		 n/a 37.56
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 244,573
(10.74 %)		 180,141
(13.98 %)		 1,184,686
(42.28 %)		 6,470
(2.86 %)
286 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1		 n/a 13,575
(3.44 %)		 38,113
(17.59 %)		 n/a 37.58
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 245,892
(11.25 %)		 158,855
(13.35 %)		 1,221,056
(41.58 %)		 6,436
(2.63 %)
287 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2		 48,839
(21.95 %)		 19,452
(7.44 %)		 35,987
(20.77 %)		 n/a 36.49
(94.38 %)		 49,199
(5.63 %)		 24,194
(100.00 %)		 181,473
(3.18 %)		 143,114
(7.42 %)		 1,614,901
(29.14 %)		 13,094
(2.48 %)
288 wax gourd
GCF_009727055.1		 40,406
(4.66 %)		 13,481
(1.43 %)		 43,071
(6.68 %)		 n/a 34.85
(98.39 %)		 24,524
(1.62 %)		 1,791
(100.00 %)		 481,638
(2.55 %)		 364,998
(3.11 %)		 6,236,506
(49.68 %)		 21,741
(0.93 %)
289 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1		 n/a 22,395
(3.96 %)		 101,555
(33.88 %)		 n/a 45.70
(99.78 %)		 2,245
(0.22 %)		 1,143
(100.00 %)		 206,645
(1.57 %)		 174,457
(2.79 %)		 2,244,665
(26.11 %)		 117,743
(29.88 %)
290 white fonio (2020)
GCA_902806635.1		 n/a 33,011
(5.39 %)		 109,615
(30.77 %)		 n/a 45.47
(97.23 %)		 29,136
(2.79 %)		 29,155
(97.21 %)		 215,374
(1.42 %)		 159,137
(1.91 %)		 2,776,488
(28.15 %)		 136,308
(27.74 %)
291 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1		 n/a 21,959
(3.77 %)		 51,652
(20.18 %)		 n/a 36.92
(99.73 %)		 1,764
(0.27 %)		 3,171
(99.97 %)		 215,169
(3.21 %)		 247,660
(10.71 %)		 2,556,478
(43.72 %)		 14,520
(10.46 %)
292 white yam
GCF_009730915.1		 43,902
(7.41 %)		 13,647
(2.09 %)		 49,877
(12.79 %)		 n/a 36.25
(99.19 %)		 4,760
(0.81 %)		 2,254
(100.00 %)		 391,299
(3.19 %)		 258,918
(3.96 %)		 3,588,023
(40.59 %)		 28,929
(2.37 %)
293 wild cabbage
GCF_000695525.1		 66,717
(15.60 %)		 31,142
(8.08 %)		 103,348
(35.10 %)		 n/a 36.11
(91.23 %)		 52,140
(8.80 %)		 33,760
(99.98 %)		 197,515
(3.12 %)		 214,463
(4.43 %)		 2,535,207
(31.20 %)		 29,995
(2.99 %)
294 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2		 n/a 31,163
(6.66 %)		 79,290
(25.04 %)		 n/a 36.57
(98.21 %)		 135
(1.79 %)		 140
(100.00 %)		 273,972
(2.76 %)		 284,806
(6.41 %)		 2,750,803
(38.77 %)		 33,071
(3.37 %)
295 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1		 29,804
(16.68 %)		 13,252
(5.90 %)		 22,247
(14.89 %)		 n/a 32.94
(94.65 %)		 119,056
(5.55 %)		 6,074
(100.00 %)		 107,979
(2.19 %)		 67,029
(6.76 %)		 1,525,353
(32.45 %)		 2,481
(0.48 %)
296 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2		 131,285
(1.34 %)		 n/a 567,570
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,589
(3.31 %)		 148,296
(100.00 %)		 2,573,102
(1.23 %)		 2,990,888
(3.37 %)		 492,885
(96.69 %)		 2,220,880
(25.34 %)
297 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2		 53,171
(14.87 %)		 18,878
(4.31 %)		 45,554
(18.36 %)		 n/a 38.87
(82.70 %)		 22,178
(17.31 %)		 24,423
(82.71 %)		 214,040
(7.81 %)		 136,453
(2.42 %)		 1,656,678
(31.15 %)		 53,687
(8.28 %)
298 wild olive
GCF_002742605.1		 67,081
(6.69 %)		 19,793
(1.69 %)		 68,749
(9.17 %)		 n/a 35.40
(90.41 %)		 47,638
(9.59 %)		 41,226
(100.00 %)		 425,922
(1.79 %)		 378,656
(18.98 %)		 5,982,070
(40.81 %)		 12,534
(0.42 %)
299 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3		 57,082
(6.20 %)		 17,102
(1.68 %)		 76,760
(11.48 %)		 n/a 35.80
(88.03 %)		 135,554
(12.02 %)		 1,589
(100.00 %)		 596,136
(3.37 %)		 499,251
(3.39 %)		 5,279,103
(45.94 %)		 48,556
(1.91 %)
300 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2		 78,441
(5.58 %)		 16,952
(1.26 %)		 89,380
(9.95 %)		 n/a 36.84
(92.91 %)		 122,617
(7.13 %)		 997
(99.67 %)		 777,978
(3.35 %)		 619,944
(3.82 %)		 5,823,472
(53.61 %)		 79,537
(2.58 %)
301 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1		 67,384
(5.06 %)		 16,850
(1.28 %)		 83,780
(9.77 %)		 n/a 36.78
(93.48 %)		 14,157
(6.52 %)		 30
(100.00 %)		 767,054
(3.15 %)		 754,355
(3.89 %)		 5,146,558
(56.74 %)		 71,885
(2.45 %)
302 wild soybean
GCF_004193775.1		 81,537
(9.20 %)		 27,977
(2.99 %)		 78,144
(11.64 %)		 n/a 34.88
(97.58 %)		 752
(2.42 %)		 1,120
(100.00 %)		 551,217
(2.79 %)		 450,287
(6.65 %)		 5,379,409
(46.22 %)		 37,183
(1.52 %)
303 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1		 36,435
(23.91 %)		 13,996
(6.63 %)		 46,505
(35.89 %)		 n/a 38.40
(94.27 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,460
(94.25 %)		 71,057
(1.51 %)		 74,581
(2.78 %)		 1,034,180
(21.44 %)		 14,806
(3.21 %)
304 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1		 n/a 67,698
(2.77 %)		 385,590
(22.40 %)		 n/a 44.92
(99.75 %)		 76,230
(0.26 %)		 15,303
(100.00 %)		 1,015,234
(1.60 %)		 910,932
(3.64 %)		 10,425,387
(46.78 %)		 637,314
(24.52 %)
305 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1		 46,114
(5.99 %)		 15,458
(1.87 %)		 42,907
(7.63 %)		 n/a 34.50
(92.34 %)		 41,684
(7.67 %)		 41,696
(92.33 %)		 363,460
(2.48 %)		 271,129
(4.15 %)		 6,330,153
(36.93 %)		 19,639
(1.20 %)
306 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1		 n/a 17,733
(2.85 %)		 55,354
(14.76 %)		 n/a 34.32
(99.33 %)		 780
(0.67 %)		 683
(100.00 %)		 586,981
(35.31 %)		 275,412
(4.57 %)		 3,561,395
(35.28 %)		 14,172
(0.96 %)
307 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1		 n/a 14,109
(3.33 %)		 40,033
(15.32 %)		 n/a 34.56
(97.67 %)		 9,429
(2.34 %)		 21
(100.00 %)		 410,680
(35.69 %)		 189,467
(4.45 %)		 2,405,053
(34.36 %)		 10,620
(1.04 %)
308 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1		 46,287
(10.68 %)		 14,823
(2.93 %)		 44,674
(15.11 %)		 n/a 35.08
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 310,377
(2.83 %)		 242,451
(9.17 %)		 2,706,407
(38.52 %)		 11,751
(1.05 %)
309 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3		 46,797
(11.01 %)		 14,907
(3.07 %)		 44,949
(15.02 %)		 n/a 34.56
(96.91 %)		 13,440
(3.10 %)		 14,644
(96.90 %)		 462,807
(35.59 %)		 222,647
(4.83 %)		 2,745,513
(34.80 %)		 11,591
(1.00 %)
310 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1		 n/a 22,511
(18.61 %)		 30,519
(28.94 %)		 n/a 35.60
(90.69 %)		 22,839
(9.35 %)		 30,649
(90.65 %)		 86,568
(2.39 %)		 44,616
(2.78 %)		 1,035,105
(23.86 %)		 6,701
(1.74 %)
311 winter squash
GCF_002738345.1		 49,714
(19.34 %)		 18,860
(6.74 %)		 33,884
(18.55 %)		 n/a 36.33
(97.81 %)		 17,224
(2.20 %)		 8,299
(100.00 %)		 169,605
(3.09 %)		 134,380
(10.82 %)		 1,493,623
(35.66 %)		 12,619
(2.64 %)
312 wood tobacco
GCF_000393655.1		 58,358
(2.93 %)		 17,332
(0.82 %)		 111,663
(7.17 %)		 n/a 39.09
(92.17 %)		 338,901
(7.84 %)		 392,998
(92.16 %)		 598,929
(1.44 %)		 776,240
(4.57 %)		 13,228,149
(49.11 %)		 100,864
(1.49 %)
313 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1		 n/a 56,069
(8.51 %)		 138,660
(27.88 %)		 n/a 36.22
(79.66 %)		 22,714
(20.35 %)		 9,746
(100.00 %)		 367,321
(2.38 %)		 303,381
(3.03 %)		 4,551,648
(26.34 %)		 50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 313

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Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 223 assemblies assembly stats track stats
Mammals 678 assemblies assembly stats track stats
Birds 431 assemblies assembly stats track stats
Fishes 472 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 312 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1155 assemblies assembly stats track stats
Plants 313 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 421 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 121 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 558 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1186 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 974 assemblies assembly stats track stats