Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1		 n/a 21,507
(2.72 %)		 60,050
(11.57 %)		 n/a 35.92
(99.97 %)		 2,344
(0.03 %)		 1,735
(100.00 %)		 430,950
(2.82 %)		 273,041
(3.10 %)		 4,895,011
(32.98 %)		 29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1		 71,489
(11.95 %)		 23,883
(3.45 %)		 59,407
(13.07 %)		 n/a 35.65
(99.64 %)		 710
(0.36 %)		 88
(100.00 %)		 430,287
(3.04 %)		 350,721
(4.29 %)		 3,875,064
(36.80 %)		 27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1		 40,474
(10.62 %)		 16,697
(3.71 %)		 47,542
(15.07 %)		 n/a 34.07
(96.37 %)		 21,264
(3.63 %)		 58,639
(96.37 %)		 257,290
(4.08 %)		 239,596
(6.43 %)		 2,925,469
(36.04 %)		 24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1		 50,989
(11.87 %)		 16,661
(3.75 %)		 45,945
(15.40 %)		 n/a 33.63
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 263,673
(3.52 %)		 264,113
(5.18 %)		 2,808,981
(37.65 %)		 20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1		 54,359
(4.64 %)		 16,693
(1.34 %)		 75,114
(9.09 %)		 n/a 37.42
(99.88 %)		 15,111
(0.12 %)		 14,905
(100.00 %)		 668,488
(2.42 %)		 511,720
(3.29 %)		 8,110,750
(42.79 %)		 50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1		 51,575
(5.06 %)		 16,948
(1.48 %)		 76,464
(9.29 %)		 n/a 37.21
(68.90 %)		 166,490
(31.14 %)		 202,468
(68.86 %)		 580,361
(3.63 %)		 445,124
(2.25 %)		 5,831,606
(30.77 %)		 75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2		 61,514
(3.59 %)		 17,694
(0.94 %)		 82,131
(6.45 %)		 n/a 38.54
(93.07 %)		 37,524
(6.94 %)		 30
(100.00 %)		 930,885
(3.15 %)		 928,025
(5.06 %)		 6,719,901
(56.47 %)		 104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1		 43,826
(15.96 %)		 16,224
(4.82 %)		 51,031
(25.64 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 178,763
(2.60 %)		 125,689
(4.18 %)		 1,761,585
(30.96 %)		 60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1		 62,791
(10.08 %)		 25,423
(3.34 %)		 69,507
(14.55 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,087
(100.00 %)		 367,402
(2.31 %)		 175,862
(2.27 %)		 4,241,058
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2		 62,791
(10.08 %)		 25,443
(3.35 %)		 69,492
(14.56 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,085
(100.00 %)		 366,178
(2.25 %)		 175,852
(2.27 %)		 4,240,382
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1		 37,363
(19.64 %)		 14,509
(6.35 %)		 33,193
(24.70 %)		 n/a 37.65
(98.29 %)		 6,531
(1.72 %)		 1,700
(99.96 %)		 137,974
(2.59 %)		 100,386
(3.92 %)		 1,251,126
(26.07 %)		 10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1		 47,801
(11.07 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2		 44,356
(10.99 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1		 73,172
(3.41 %)		 26,626
(1.10 %)		 228,260
(15.00 %)		 n/a 44.76
(99.87 %)		 31,919
(0.13 %)		 1,764
(100.00 %)		 639,429
(1.31 %)		 739,566
(3.57 %)		 6,976,583
(59.37 %)		 560,429
(28.70 %)
15 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1		 64,916
(11.38 %)		 22,530
(3.52 %)		 67,146
(16.22 %)		 n/a 38.04
(88.96 %)		 7,264
(11.05 %)		 807
(100.00 %)		 692,611
(50.77 %)		 322,556
(4.41 %)		 3,055,836
(35.69 %)		 25,923
(1.76 %)
16 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1		 n/a 16,583
(4.58 %)		 55,248
(25.46 %)		 n/a 43.36
(99.98 %)		 696
(0.02 %)		 615
(100.00 %)		 495,126
(50.28 %)		 124,567
(3.20 %)		 1,922,072
(32.59 %)		 65,220
(23.87 %)
17 Barbados nut
GCF_014843425.1		 33,622
(13.80 %)		 12,687
(4.63 %)		 26,511
(14.56 %)		 n/a 33.40
(99.60 %)		 2,151
(0.40 %)		 1,232
(100.00 %)		 281,490
(24.82 %)		 186,260
(5.65 %)		 2,028,357
(33.33 %)		 8,868
(1.38 %)
18 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1		 50,906
(14.28 %)		 16,712
(3.68 %)		 41,041
(14.51 %)		 n/a 33.43
(99.87 %)		 22
(0.13 %)		 42
(100.00 %)		 393,909
(27.89 %)		 175,427
(3.92 %)		 2,532,494
(37.64 %)		 3,384
(0.27 %)
19 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3		 48,865
(15.69 %)		 16,549
(3.99 %)		 40,316
(15.41 %)		 n/a 33.14
(94.48 %)		 8,785
(5.53 %)		 8,027
(94.47 %)		 366,709
(22.34 %)		 146,748
(2.80 %)		 2,549,499
(32.46 %)		 3,695
(0.65 %)
20 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1		 n/a 16,672
(3.96 %)		 40,032
(15.19 %)		 n/a 33.05
(99.32 %)		 107
(0.68 %)		 909
(100.00 %)		 381,065
(23.82 %)		 162,402
(3.97 %)		 2,490,028
(35.39 %)		 3,335
(0.34 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1		 n/a 15,063
(1.43 %)		 65,125
(11.47 %)		 n/a 40.34
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 735,552
(11.30 %)		 567,295
(6.87 %)		 4,176,675
(45.56 %)		 66,834
(4.90 %)
22 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1		 n/a 15,223
(1.43 %)		 65,769
(11.33 %)		 n/a 40.37
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 303
(100.00 %)		 744,623
(11.37 %)		 571,691
(7.15 %)		 4,217,655
(45.87 %)		 68,566
(4.96 %)
23 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1		 47,727
(9.45 %)		 11,911
(2.04 %)		 50,202
(16.78 %)		 n/a 35.86
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 42
(100.00 %)		 294,768
(3.41 %)		 341,699
(6.22 %)		 2,932,896
(35.20 %)		 25,364
(1.79 %)
24 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1		 45,490
(9.22 %)		 11,850
(2.05 %)		 49,071
(15.89 %)		 n/a 35.85
(94.03 %)		 3,200
(5.97 %)		 20
(100.00 %)		 290,870
(3.40 %)		 336,343
(5.76 %)		 2,901,079
(33.21 %)		 25,108
(1.67 %)
25 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1		 70,848
(2.17 %)		 15,922
(0.50 %)		 69,601
(2.75 %)		 n/a 34.91
(97.27 %)		 52,577
(2.73 %)		 81,202
(100.00 %)		 1,192,132
(1.94 %)		 1,097,384
(4.12 %)		 23,393,622
(47.64 %)		 19,517
(0.21 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1		 n/a 13,887
(2.34 %)		 44,507
(14.12 %)		 n/a 37.97
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 2,350
(100.00 %)		 250,361
(2.10 %)		 231,118
(13.56 %)		 2,049,366
(44.58 %)		 22,527
(6.34 %)
27 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2		 n/a 15,102
(2.62 %)		 47,553
(15.64 %)		 n/a 38.11
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 257,066
(2.22 %)		 226,514
(14.63 %)		 2,470,334
(38.37 %)		 21,415
(5.59 %)
28 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1		 57,539
(11.82 %)		 16,919
(2.98 %)		 64,687
(19.59 %)		 n/a 38.05
(99.97 %)		 1,625
(0.04 %)		 65
(100.00 %)		 236,645
(2.13 %)		 205,150
(5.19 %)		 2,202,942
(41.60 %)		 32,283
(3.44 %)
29 bitter melon
GCF_001995035.1		 31,725
(13.80 %)		 12,858
(4.62 %)		 30,539
(16.85 %)		 n/a 34.58
(92.32 %)		 109,310
(7.74 %)		 1,052
(100.00 %)		 162,837
(2.82 %)		 89,571
(2.03 %)		 1,951,167
(30.96 %)		 14,100
(2.00 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1		 n/a 20,077
(4.66 %)		 43,061
(17.16 %)		 n/a 34.80
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 338
(100.00 %)		 267,110
(2.88 %)		 173,502
(6.32 %)		 2,366,759
(39.61 %)		 5,093
(4.11 %)
31 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1		 n/a 19,804
(4.58 %)		 42,642
(17.03 %)		 n/a 34.85
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 132
(100.00 %)		 265,925
(2.85 %)		 174,688
(6.70 %)		 2,359,101
(40.07 %)		 4,963
(4.10 %)
32 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5		 59,638
(15.94 %)		 19,969
(4.99 %)		 41,581
(16.22 %)		 n/a 33.75
(99.85 %)		 59
(0.15 %)		 106
(99.85 %)		 257,833
(2.91 %)		 156,371
(4.50 %)		 2,423,627
(36.28 %)		 3,761
(0.66 %)
33 black tea
GCF_004153795.1		 101,253
(3.17 %)		 20,982
(0.66 %)		 156,999
(7.69 %)		 n/a 37.85
(92.12 %)		 79,329
(7.89 %)		 14,028
(100.00 %)		 1,926,995
(3.23 %)		 2,024,420
(8.06 %)		 17,959,098
(50.75 %)		 181,027
(2.79 %)
34 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2		 46,173
(12.87 %)		 15,187
(3.49 %)		 50,585
(20.61 %)		 n/a 40.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 72
(100.00 %)		 494,434
(48.54 %)		 220,571
(4.98 %)		 1,866,530
(29.09 %)		 59,325
(10.76 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3		 n/a 46,431
(0.31 %)		 805,204
(7.93 %)		 n/a 46.09
(99.87 %)		 211,982
(0.14 %)		 70,316
(100.00 %)		 9,191,325
(44.14 %)		 5,086,953
(4.53 %)		 282,298
(99.86 %)		 3,241,124
(28.06 %)
36 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1		 221,450
(1.62 %)		 n/a 763,380
(8.08 %)		 n/a 46.14
(98.27 %)		 214,799
(1.73 %)		 91,589
(100.00 %)		 8,660,189
(44.94 %)		 4,402,049
(3.94 %)		 306,386
(98.27 %)		 3,040,030
(27.48 %)
37 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1		 n/a n/a 751,576
(8.03 %)		 n/a 46.05
(98.12 %)		 693,028
(1.90 %)		 693,050
(98.10 %)		 8,420,935
(44.23 %)		 4,115,828
(3.69 %)		 693,050
(98.10 %)		 3,076,631
(26.41 %)
38 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1		 n/a n/a 773,766
(8.20 %)		 n/a 46.05
(100.00 %)		 1,407
(0.00 %)		 3,795
(100.00 %)		 8,703,192
(44.57 %)		 4,569,103
(5.20 %)		 5,202
(100.00 %)		 3,001,896
(28.00 %)
39 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1		 n/a 47,400
(0.34 %)		 778,134
(8.33 %)		 n/a 46.11
(99.87 %)		 7,376
(0.13 %)		 7,398
(99.87 %)		 14,835,099
(85.31 %)		 4,570,540
(5.40 %)		 7,395
(99.87 %)		 2,994,427
(28.25 %)
40 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1		 79,194
(1.39 %)		 19,567
(0.31 %)		 119,910
(3.26 %)		 n/a 33.70
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 3,727,770
(5.18 %)		 3,762,751
(4.98 %)		 10,213,591
(82.37 %)		 54,254
(0.38 %)
41 cacao
GCF_000208745.1		 34,727
(13.67 %)		 14,294
(4.65 %)		 29,216
(14.38 %)		 n/a 34.09
(94.31 %)		 11,787
(5.70 %)		 431
(100.00 %)		 206,049
(15.64 %)		 99,229
(2.66 %)		 1,933,579
(33.24 %)		 2,964
(0.34 %)
42 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1		 n/a 18,729
(3.22 %)		 57,374
(16.70 %)		 n/a 36.81
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 915
(100.00 %)		 421,731
(3.42 %)		 300,957
(5.54 %)		 2,794,242
(34.11 %)		 25,348
(3.39 %)
43 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1		 n/a 18,579
(3.26 %)		 56,295
(16.71 %)		 n/a 36.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 138
(100.00 %)		 414,129
(3.48 %)		 293,951
(5.95 %)		 3,055,420
(34.96 %)		 24,749
(4.05 %)
44 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1		 43,175
(7.78 %)		 16,377
(2.29 %)		 43,559
(11.38 %)		 n/a 36.31
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 706
(100.00 %)		 341,665
(12.46 %)		 223,217
(36.36 %)		 2,388,236
(58.00 %)		 26,535
(3.98 %)
45 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1		 n/a 16,153
(1.86 %)		 68,653
(14.03 %)		 n/a 35.79
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 783,798
(4.17 %)		 456,025
(10.87 %)		 4,951,918
(40.76 %)		 21,783
(2.16 %)
46 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1		 n/a 15,836
(1.90 %)		 66,803
(13.99 %)		 n/a 35.77
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 762,029
(4.24 %)		 448,099
(10.97 %)		 4,784,968
(41.07 %)		 20,384
(2.28 %)
47 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1		 n/a 18,838
(1.94 %)		 71,211
(13.84 %)		 n/a 33.78
(99.91 %)		 8,772
(0.10 %)		 147
(100.00 %)		 643,488
(3.49 %)		 361,843
(3.63 %)		 4,074,440
(56.52 %)		 27,745
(1.31 %)
48 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1		 n/a 10,725
(1.71 %)		 41,537
(11.41 %)		 n/a 33.68
(100.00 %)		 n/a 11,110
(100.00 %)		 396,112
(4.11 %)		 221,932
(3.23 %)		 2,389,229
(59.21 %)		 17,045
(1.23 %)
49 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2		 39,696
(6.07 %)		 13,883
(1.80 %)		 50,556
(11.19 %)		 n/a 33.51
(84.07 %)		 843
(15.93 %)		 1,052
(84.07 %)		 496,648
(3.63 %)		 258,281
(2.28 %)		 3,594,433
(47.71 %)		 22,750
(1.69 %)
50 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2		 n/a 24,975
(1.79 %)		 113,252
(15.69 %)		 n/a 34.00
(100.00 %)		 n/a 3,372
(100.00 %)		 936,351
(4.13 %)		 520,230
(3.65 %)		 5,183,602
(58.66 %)		 47,327
(1.58 %)
51 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1		 n/a 15,253
(1.67 %)		 62,228
(12.57 %)		 n/a 34.08
(100.00 %)		 n/a 1,599
(100.00 %)		 595,917
(3.95 %)		 335,791
(3.38 %)		 3,478,519
(61.18 %)		 31,738
(1.57 %)
52 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1		 n/a 15,334
(1.80 %)		 60,140
(12.83 %)		 n/a 33.79
(99.92 %)		 2,496
(0.09 %)		 483
(100.00 %)		 567,458
(3.73 %)		 320,455
(3.12 %)		 3,403,771
(58.38 %)		 27,791
(1.48 %)
53 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1		 57,769
(2.07 %)		 16,114
(0.55 %)		 62,579
(2.93 %)		 n/a 34.94
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,799
(96.77 %)		 968,939
(3.15 %)		 948,741
(4.39 %)		 21,535,213
(46.15 %)		 16,685
(0.21 %)
54 carrot
GCF_001625215.1		 51,773
(15.95 %)		 16,649
(3.96 %)		 50,187
(20.50 %)		 n/a 34.79
(91.77 %)		 26,112
(8.24 %)		 4,826
(100.00 %)		 179,630
(2.41 %)		 166,060
(4.97 %)		 1,981,148
(31.51 %)		 8,564
(0.85 %)
55 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2		 60,116
(15.29 %)		 16,679
(3.49 %)		 51,607
(18.82 %)		 n/a 34.97
(99.99 %)		 554
(0.01 %)		 11
(100.00 %)		 195,035
(2.33 %)		 186,941
(8.11 %)		 2,018,050
(39.61 %)		 10,319
(1.14 %)
56 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1		 n/a 27,737
(2.70 %)		 78,774
(11.79 %)		 n/a 37.13
(76.51 %)		 36,478
(23.50 %)		 4,440
(100.00 %)		 584,617
(3.41 %)		 554,162
(3.52 %)		 4,126,060
(43.14 %)		 77,570
(1.78 %)
57 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2		 56,386
(9.38 %)		 18,790
(2.86 %)		 49,944
(11.73 %)		 n/a 37.52
(99.61 %)		 672
(0.39 %)		 758
(99.61 %)		 377,964
(3.52 %)		 356,023
(4.79 %)		 2,560,255
(56.85 %)		 52,506
(2.50 %)
58 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1		 33,377
(11.52 %)		 13,874
(4.00 %)		 33,656
(13.67 %)		 n/a 33.84
(96.11 %)		 23,313
(3.90 %)		 49,406
(96.10 %)		 207,850
(3.52 %)		 166,467
(10.85 %)		 1,676,921
(43.19 %)		 12,838
(2.54 %)
59 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1		 39,358
(13.36 %)		 13,841
(4.31 %)		 29,805
(14.24 %)		 n/a 33.03
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 140
(100.00 %)		 205,974
(3.02 %)		 128,354
(6.37 %)		 1,998,066
(39.24 %)		 7,216
(0.99 %)
60 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1		 89,565
(2.38 %)		 17,560
(0.48 %)		 115,390
(5.30 %)		 n/a 35.68
(99.73 %)		 4,633
(0.27 %)		 4,854
(100.00 %)		 1,247,170
(1.97 %)		 1,423,285
(4.75 %)		 11,041,078
(71.09 %)		 31,562
(0.31 %)
61 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1		 n/a 3
(0.11 %)		 117
(7.42 %)		 n/a 39.35
(99.99 %)		 4
(0.01 %)		 35
(100.00 %)		 1,139
(3.04 %)		 1,677
(4.92 %)		 11,074
(10.60 %)		 76
(1.07 %)
62 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1		 n/a 6,487
(0.16 %)		 114,999
(4.12 %)		 n/a 37.82
(62.87 %)		 490,371
(37.15 %)		 1,116,784
(62.85 %)		 692,892
(1.67 %)		 790,165
(1.22 %)		 18,073,193
(31.20 %)		 24,414
(0.46 %)
63 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1		 53,262
(17.46 %)		 17,642
(4.97 %)		 49,474
(23.85 %)		 n/a 36.14
(99.81 %)		 3,756
(0.19 %)		 1,556
(100.00 %)		 156,083
(2.30 %)		 128,904
(3.10 %)		 2,112,137
(31.93 %)		 31,157
(5.92 %)
64 chickpea
GCF_000331145.1		 42,036
(9.83 %)		 15,685
(3.16 %)		 30,411
(8.82 %)		 n/a 31.04
(90.95 %)		 31,897
(9.07 %)		 39,024
(90.93 %)		 339,564
(10.51 %)		 318,439
(11.48 %)		 2,929,750
(43.82 %)		 3,488
(0.28 %)
65 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2		 42,320
(9.82 %)		 15,593
(3.16 %)		 30,475
(8.82 %)		 n/a 31.03
(91.05 %)		 33,507
(8.98 %)		 6,446
(100.00 %)		 308,190
(3.39 %)		 318,609
(11.50 %)		 2,922,065
(43.86 %)		 3,472
(0.28 %)
66 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2		 66,337
(12.31 %)		 15,432
(2.83 %)		 67,569
(21.71 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 275,878
(2.26 %)		 229,333
(3.98 %)		 2,244,200
(35.17 %)		 37,317
(4.17 %)
67 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1		 n/a 23,898
(0.89 %)		 138,156
(8.52 %)		 n/a 40.10
(96.58 %)		 25,154
(3.42 %)		 35,781
(96.58 %)		 829,613
(1.78 %)		 1,793,985
(6.94 %)		 8,707,237
(62.53 %)		 317,707
(8.50 %)
68 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1		 n/a 13,666
(0.97 %)		 71,763
(9.04 %)		 n/a 35.33
(99.97 %)		 1,170
(0.03 %)		 1,621
(100.00 %)		 635,445
(2.92 %)		 599,600
(4.44 %)		 8,101,700
(44.90 %)		 75,475
(3.56 %)
69 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1		 54,029
(12.78 %)		 22,400
(4.38 %)		 57,140
(17.42 %)		 n/a 37.29
(97.86 %)		 24,384
(2.15 %)		 26,566
(97.85 %)		 368,808
(18.26 %)		 218,013
(4.36 %)		 2,456,496
(34.15 %)		 18,367
(1.88 %)
70 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1		 62,514
(13.83 %)		 22,289
(4.29 %)		 57,502
(17.16 %)		 n/a 37.35
(100.00 %)		 n/a 452
(100.00 %)		 290,077
(2.40 %)		 209,363
(3.56 %)		 2,519,627
(35.77 %)		 19,299
(1.84 %)
71 clementine
GCF_000493195.1		 36,454
(14.29 %)		 14,126
(4.66 %)		 32,820
(18.34 %)		 n/a 34.96
(97.94 %)		 7,564
(2.07 %)		 8,962
(97.93 %)		 178,443
(2.76 %)		 104,853
(5.57 %)		 1,933,079
(33.91 %)		 7,930
(3.80 %)
72 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1		 44,646
(5.40 %)		 15,784
(1.70 %)		 48,875
(7.66 %)		 n/a 35.83
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 347,467
(1.98 %)		 290,488
(4.50 %)		 6,293,084
(43.53 %)		 8,929
(0.83 %)
73 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4		 49,382
(28.03 %)		 11,312
(4.28 %)		 36,277
(36.82 %)		 n/a 45.22
(98.15 %)		 4,395
(1.86 %)		 5,152
(98.14 %)		 138,958
(36.90 %)		 77,054
(2.71 %)		 802,227
(32.19 %)		 34,479
(27.80 %)
74 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1		 n/a 6,316
(4.02 %)		 55,013
(41.57 %)		 n/a 44.70
(99.81 %)		 351
(0.00 %)		 106,265
(100.00 %)		 29,218
(1.24 %)		 29,377
(1.67 %)		 480,195
(13.66 %)		 19,392
(13.60 %)
75 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1		 80,737
(8.03 %)		 23,574
(2.02 %)		 85,662
(13.32 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 691
(0.21 %)		 2,833
(100.00 %)		 501,414
(2.11 %)		 386,209
(3.95 %)		 5,652,743
(41.66 %)		 36,398
(1.62 %)
76 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1		 119,626
(9.97 %)		 25,877
(2.06 %)		 97,184
(14.13 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 542,076
(2.06 %)		 445,020
(5.76 %)		 5,654,970
(44.41 %)		 38,607
(3.43 %)
77 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1		 43,829
(7.69 %)		 14,911
(2.02 %)		 57,408
(14.42 %)		 n/a 36.89
(97.92 %)		 3,482
(2.08 %)		 3,530
(100.00 %)		 312,360
(2.09 %)		 234,658
(3.24 %)		 3,464,594
(38.91 %)		 21,553
(1.54 %)
78 common bean
GCF_000499845.1		 32,720
(9.56 %)		 16,474
(3.53 %)		 45,055
(14.46 %)		 n/a 34.96
(90.70 %)		 40,860
(9.33 %)		 41,568
(90.67 %)		 233,709
(2.97 %)		 208,045
(3.61 %)		 2,886,693
(37.28 %)		 38,054
(5.05 %)
79 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1		 37,046
(18.67 %)		 14,152
(6.13 %)		 28,640
(19.48 %)		 n/a 37.74
(99.99 %)		 66
(0.01 %)		 76
(100.00 %)		 129,836
(2.97 %)		 80,188
(2.65 %)		 1,248,248
(29.88 %)		 22,935
(5.83 %)
80 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1		 n/a 14,992
(4.28 %)		 36,350
(16.84 %)		 n/a 34.41
(99.99 %)		 394
(0.01 %)		 905
(99.99 %)		 475,247
(5.76 %)		 230,646
(4.36 %)		 2,425,030
(37.74 %)		 18,611
(3.41 %)
81 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1		 49,622
(12.72 %)		 14,929
(3.58 %)		 32,981
(12.20 %)		 n/a 33.07
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 525,520
(5.43 %)		 225,151
(3.91 %)		 2,463,587
(42.86 %)		 13,018
(1.79 %)
82 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1		 49,976
(13.24 %)		 16,949
(3.79 %)		 38,488
(13.47 %)		 n/a 33.40
(95.35 %)		 24,158
(4.67 %)		 28,947
(95.33 %)		 525,525
(5.37 %)		 246,475
(5.25 %)		 2,603,240
(38.46 %)		 13,597
(2.11 %)
83 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1		 51,464
(13.54 %)		 14,443
(3.56 %)		 31,633
(12.06 %)		 n/a 33.20
(100.00 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 516,010
(5.54 %)		 234,395
(5.05 %)		 2,319,259
(43.64 %)		 12,926
(2.66 %)
84 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1		 65,051
(8.85 %)		 26,142
(3.49 %)		 114,639
(23.87 %)		 n/a 44.17
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 243,799
(1.41 %)		 237,530
(2.79 %)		 4,477,357
(31.45 %)		 154,087
(19.32 %)
85 common sunflower
GCF_002127325.2		 133,319
(3.74 %)		 19,514
(0.59 %)		 166,187
(9.16 %)		 n/a 38.59
(97.94 %)		 2,384
(2.06 %)		 334
(100.00 %)		 1,263,836
(2.20 %)		 1,549,598
(4.15 %)		 12,728,097
(58.39 %)		 170,287
(2.39 %)
86 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1		 116,106
(3.08 %)		 31,018
(0.77 %)		 176,913
(6.40 %)		 n/a 39.12
(100.00 %)		 712
(0.00 %)		 701
(100.00 %)		 1,205,229
(1.45 %)		 1,502,955
(6.71 %)		 24,316,152
(56.68 %)		 225,863
(1.93 %)
87 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1		 100,875
(3.08 %)		 29,968
(0.80 %)		 184,998
(7.05 %)		 n/a 38.95
(97.11 %)		 292,325
(2.90 %)		 292,601
(97.11 %)		 1,134,202
(3.09 %)		 1,268,208
(4.45 %)		 24,013,710
(52.08 %)		 204,914
(1.84 %)
88 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2		 53,587
(7.04 %)		 17,804
(1.85 %)		 77,741
(13.65 %)		 n/a 35.35
(97.95 %)		 25,649
(2.05 %)		 22,642
(100.00 %)		 860,049
(3.78 %)		 485,854
(6.14 %)		 5,989,180
(36.35 %)		 20,674
(1.12 %)
89 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3		 56,406
(8.63 %)		 16,303
(2.05 %)		 63,990
(13.73 %)		 n/a 34.91
(95.70 %)		 26,066
(4.30 %)		 28,407
(95.70 %)		 743,470
(3.99 %)		 393,077
(5.53 %)		 4,897,193
(34.87 %)		 16,140
(0.90 %)
90 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1		 112,410
(5.51 %)		 35,047
(1.61 %)		 101,814
(6.75 %)		 n/a 34.45
(97.16 %)		 48,742
(2.84 %)		 57,884
(97.16 %)		 829,774
(2.69 %)		 808,839
(3.64 %)		 12,556,104
(52.01 %)		 31,946
(0.61 %)
91 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1		 154,134
(6.02 %)		 37,839
(1.61 %)		 107,764
(6.56 %)		 n/a 34.36
(99.87 %)		 5,708
(0.13 %)		 6,735
(99.87 %)		 996,701
(2.36 %)		 903,817
(3.56 %)		 13,123,355
(54.75 %)		 35,220
(0.59 %)
92 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1		 72,590
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 86,941
(18.36 %)		 n/a 33.22
(98.25 %)		 19,717
(1.76 %)		 20,751
(98.24 %)		 367,610
(3.53 %)		 300,200
(3.32 %)		 5,199,574
(40.83 %)		 10,926
(0.55 %)
93 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2		 48,588
(10.55 %)		 16,925
(3.30 %)		 44,689
(13.01 %)		 n/a 32.95
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 676
(100.00 %)		 344,688
(3.92 %)		 283,941
(8.14 %)		 3,091,888
(41.66 %)		 24,507
(2.34 %)
94 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1		 49,636
(19.79 %)		 18,863
(6.83 %)		 34,588
(19.24 %)		 n/a 36.43
(97.43 %)		 13,813
(2.58 %)		 3,500
(100.00 %)		 181,838
(3.12 %)		 140,936
(7.42 %)		 1,550,544
(33.30 %)		 13,714
(2.69 %)
95 cucumber
GCF_000004075.3		 37,079
(18.45 %)		 13,349
(5.61 %)		 23,889
(15.73 %)		 n/a 32.84
(99.98 %)		 89
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 158,454
(3.72 %)		 77,247
(3.20 %)		 1,739,467
(33.72 %)		 5,730
(1.35 %)
96 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1		 n/a 14,128
(1.63 %)		 42,460
(7.33 %)		 n/a 30.78
(99.98 %)		 2,018
(0.02 %)		 668
(100.00 %)		 377,357
(3.69 %)		 183,159
(2.82 %)		 5,560,199
(36.58 %)		 30,878
(2.75 %)
97 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1		 n/a 13,933
(1.63 %)		 40,035
(6.93 %)		 n/a 30.80
(99.98 %)		 1,977
(0.02 %)		 667
(100.00 %)		 373,612
(3.67 %)		 181,531
(2.84 %)		 5,483,268
(36.45 %)		 30,829
(2.75 %)
98 damask rose (2016)
GCA_001662545.1		 n/a 16,060
(1.87 %)		 117,610
(18.87 %)		 n/a 38.73
(97.06 %)		 101,982
(2.91 %)		 409,854
(97.09 %)		 329,911
(1.95 %)		 258,478
(2.82 %)		 3,747,902
(31.42 %)		 48,987
(3.05 %)
99 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1		 61,678
(8.40 %)		 18,582
(2.20 %)		 70,121
(14.29 %)		 n/a 40.29
(100.00 %)		 317
(0.00 %)		 2,391
(100.00 %)		 431,923
(8.92 %)		 371,389
(4.19 %)		 2,721,501
(44.16 %)		 89,481
(12.47 %)
100 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1		 48,949
(10.55 %)		 16,697
(2.99 %)		 64,523
(16.24 %)		 n/a 39.33
(91.22 %)		 64,723
(8.79 %)		 143,382
(91.21 %)		 284,003
(7.58 %)		 185,641
(2.23 %)		 2,574,645
(27.52 %)		 62,332
(7.21 %)
101 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1		 48,290
(8.05 %)		 15,110
(2.28 %)		 57,536
(14.48 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 606
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 445,970
(3.39 %)		 319,468
(5.39 %)		 3,687,072
(36.31 %)		 41,402
(3.02 %)
102 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1		 193,799
(12.81 %)		 52,060
(3.07 %)		 144,859
(15.37 %)		 n/a 39.78
(99.99 %)		 219
(0.01 %)		 1,085
(100.00 %)		 713,274
(2.40 %)		 840,280
(6.39 %)		 4,419,734
(51.60 %)		 203,906
(13.78 %)
103 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1		 63,364
(1.67 %)		 17,849
(0.43 %)		 260,921
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 291
(100.00 %)		 2,720,197
(55.13 %)		 1,726,335
(5.40 %)		 14,010,390
(72.58 %)		 732,834
(17.24 %)
104 durian
GCF_002303985.1		 68,467
(10.35 %)		 24,627
(3.34 %)		 48,130
(9.41 %)		 n/a 32.64
(99.58 %)		 3,044
(0.43 %)		 677
(100.00 %)		 490,482
(3.80 %)		 509,842
(12.92 %)		 4,397,155
(48.22 %)		 56,957
(6.23 %)
105 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1		 n/a 32,523
(0.34 %)		 530,488
(8.17 %)		 n/a 46.01
(98.73 %)		 330,230
(1.28 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,723,974
(3.46 %)		 2,746,444
(3.02 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,108,395
(25.96 %)
106 eggplant (2014)
GCA_000787875.1		 n/a 15,481
(1.92 %)		 48,974
(7.98 %)		 n/a 35.72
(95.30 %)		 118,249
(4.75 %)		 143,048
(95.25 %)		 317,711
(2.21 %)		 307,772
(4.55 %)		 6,006,653
(38.61 %)		 7,570
(0.50 %)
107 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1		 n/a 34,754
(1.95 %)		 231,748
(22.13 %)		 n/a 46.97
(99.99 %)		 1,574
(0.01 %)		 1,588
(99.99 %)		 587,262
(1.41 %)		 551,392
(2.62 %)		 9,678,348
(46.32 %)		 398,884
(36.81 %)
108 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1		 n/a 57,092
(4.66 %)		 139,785
(17.31 %)		 n/a 33.78
(99.95 %)		 104
(0.05 %)		 182
(99.95 %)		 665,897
(3.33 %)		 561,368
(7.98 %)		 6,809,885
(45.67 %)		 31,360
(1.27 %)
109 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1		 69,211
(8.60 %)		 15,792
(1.92 %)		 66,872
(14.31 %)		 n/a 35.68
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 773,652
(4.18 %)		 429,695
(8.87 %)		 4,823,216
(39.65 %)		 21,654
(2.15 %)
110 English walnut
GCF_001411555.2		 52,962
(10.18 %)		 18,927
(3.19 %)		 60,210
(17.37 %)		 n/a 36.21
(99.89 %)		 1,051
(0.11 %)		 24,757
(100.00 %)		 434,989
(3.86 %)		 303,673
(3.70 %)		 3,318,114
(33.94 %)		 24,028
(1.83 %)
111 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1		 n/a 12,903
(3.20 %)		 33,445
(14.99 %)		 n/a 33.08
(99.96 %)		 983
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 891,822
(54.95 %)		 181,416
(3.89 %)		 2,376,097
(36.79 %)		 4,821
(0.53 %)
112 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1		 42,218
(10.92 %)		 14,784
(3.18 %)		 46,293
(16.46 %)		 n/a 36.73
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 433,802
(3.92 %)		 270,411
(4.15 %)		 2,634,547
(36.26 %)		 29,535
(3.72 %)
113 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1		 47,822
(7.37 %)		 14,132
(1.76 %)		 52,606
(11.89 %)		 n/a 34.09
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 490,095
(3.26 %)		 291,432
(3.68 %)		 3,197,241
(60.23 %)		 29,385
(2.13 %)
114 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1		 54,052
(4.78 %)		 14,372
(1.33 %)		 80,776
(14.35 %)		 n/a 36.88
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 496,928
(2.45 %)		 491,703
(4.75 %)		 4,850,176
(50.53 %)		 57,897
(3.26 %)
115 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1		 45,049
(8.43 %)		 18,010
(3.03 %)		 54,840
(15.32 %)		 n/a 35.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 5,089
(100.00 %)		 397,210
(3.11 %)		 254,173
(4.10 %)		 3,228,435
(42.44 %)		 15,343
(0.97 %)
116 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1		 51,602
(5.64 %)		 14,506
(1.52 %)		 55,054
(9.40 %)		 n/a 37.18
(100.00 %)		 411
(0.00 %)		 133
(100.00 %)		 397,610
(2.13 %)		 326,774
(3.20 %)		 4,120,854
(57.35 %)		 63,233
(2.52 %)
117 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1		 n/a 27,772
(0.99 %)		 128,971
(6.28 %)		 n/a 37.84
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 667
(100.00 %)		 4,744,181
(80.09 %)		 1,261,453
(5.53 %)		 18,063,531
(49.81 %)		 86,419
(1.62 %)
118 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1		 61,645
(7.70 %)		 19,490
(2.24 %)		 62,769
(12.34 %)		 n/a 37.11
(99.83 %)		 1,024
(0.17 %)		 1,225
(100.00 %)		 314,817
(1.84 %)		 291,276
(6.35 %)		 3,964,714
(53.25 %)		 61,424
(2.69 %)
119 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1		 55,830
(12.29 %)		 19,054
(3.86 %)		 48,657
(15.27 %)		 n/a 35.65
(97.46 %)		 31,613
(2.54 %)		 21,121
(100.00 %)		 195,798
(1.99 %)		 128,140
(2.47 %)		 2,568,483
(41.18 %)		 16,399
(1.28 %)
120 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1		 55,369
(16.07 %)		 19,591
(4.65 %)		 41,748
(16.14 %)		 n/a 34.95
(99.99 %)		 277
(0.01 %)		 21
(100.00 %)		 256,070
(2.83 %)		 178,940
(8.44 %)		 2,317,187
(40.87 %)		 3,317
(6.62 %)
121 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2		 48,620
(10.29 %)		 16,779
(3.20 %)		 47,438
(13.87 %)		 n/a 35.62
(98.95 %)		 566
(1.05 %)		 1,034
(98.95 %)		 245,672
(2.41 %)		 239,601
(4.78 %)		 2,887,505
(44.41 %)		 44,689
(7.20 %)
122 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1		 62,563
(15.19 %)		 15,236
(3.45 %)		 60,387
(23.53 %)		 n/a 39.30
(99.95 %)		 1,014
(0.05 %)		 77
(100.00 %)		 226,730
(2.23 %)		 196,099
(4.12 %)		 1,632,269
(33.79 %)		 38,448
(5.69 %)
123 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1		 n/a 29,137
(2.81 %)		 89,605
(14.72 %)		 n/a 35.15
(99.99 %)		 102
(0.01 %)		 596
(99.99 %)		 664,293
(2.97 %)		 503,960
(9.26 %)		 5,715,446
(39.21 %)		 22,264
(1.77 %)
124 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2		 56,366
(12.92 %)		 20,853
(4.29 %)		 41,483
(12.40 %)		 n/a 32.05
(95.31 %)		 22,764
(4.70 %)		 32,266
(95.30 %)		 357,310
(3.64 %)		 246,638
(4.06 %)		 2,660,781
(43.22 %)		 2,691
(0.38 %)
125 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1		 49,645
(7.87 %)		 15,653
(2.10 %)		 61,041
(13.43 %)		 n/a 35.42
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 595,120
(3.41 %)		 355,816
(4.98 %)		 4,680,964
(38.07 %)		 20,075
(1.41 %)
126 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2		 77,800
(12.38 %)		 22,539
(3.42 %)		 67,761
(16.26 %)		 n/a 38.07
(99.99 %)		 101
(0.01 %)		 34
(100.00 %)		 309,302
(2.18 %)		 331,724
(5.06 %)		 2,996,468
(41.19 %)		 25,597
(2.08 %)
127 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1		 39,203
(13.04 %)		 15,600
(4.11 %)		 42,096
(18.23 %)		 n/a 35.90
(99.54 %)		 14,532
(0.48 %)		 12
(100.00 %)		 358,479
(3.69 %)		 179,807
(3.40 %)		 2,234,313
(32.05 %)		 12,963
(1.47 %)
128 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1		 72,613
(2.92 %)		 14,868
(0.56 %)		 135,918
(7.87 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 319
(100.00 %)		 1,077,704
(2.26 %)		 853,368
(5.27 %)		 13,477,464
(61.64 %)		 152,063
(4.18 %)
129 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1		 n/a 17,158
(0.86 %)		 191,202
(13.47 %)		 n/a 38.57
(86.69 %)		 530,762
(13.34 %)		 292,698
(86.67 %)		 770,031
(2.12 %)		 637,135
(3.75 %)		 13,484,203
(41.57 %)		 81,500
(2.36 %)
130 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1		 n/a 12,110
(0.01 %)		 960,545
(1.07 %)		 n/a 31.25
(100.00 %)		 6,368
(0.00 %)		 5,951
(100.00 %)		 61,111,090
(11.87 %)		 29,667,857
(2.75 %)		 11,464
(100.00 %)		 1,680,995
(2.36 %)
131 false flax
GCF_000633955.1		 123,030
(22.63 %)		 61,894
(13.77 %)		 113,219
(31.09 %)		 n/a 36.55
(92.99 %)		 74,428
(7.02 %)		 37,780
(99.99 %)		 346,267
(2.46 %)		 233,837
(5.56 %)		 3,452,066
(27.34 %)		 32,235
(2.62 %)
132 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2		 73,442
(34.55 %)		 30,193
(10.12 %)		 57,010
(25.57 %)		 n/a 36.83
(99.39 %)		 408
(0.61 %)		 1,100
(100.00 %)		 261,522
(15.13 %)		 196,553
(8.43 %)		 1,533,242
(38.01 %)		 24,895
(5.44 %)
133 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1		 n/a 22,245
(5.38 %)		 51,310
(16.10 %)		 n/a 39.02
(99.92 %)		 1,923
(0.08 %)		 2,298
(100.00 %)		 172,036
(1.52 %)		 129,452
(6.55 %)		 2,388,667
(53.91 %)		 37,074
(4.98 %)
134 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1		 n/a 30,000
(2.41 %)		 346,692
(27.97 %)		 n/a 45.34
(98.74 %)		 507,646
(1.30 %)		 1,033,269
(98.70 %)		 323,234
(1.19 %)		 394,943
(6.28 %)		 6,129,348
(33.00 %)		 325,103
(21.18 %)
135 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1		 63,465
(6.03 %)		 17,263
(1.31 %)		 78,564
(9.37 %)		 n/a 35.95
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 459
(100.00 %)		 982,341
(3.33 %)		 719,891
(7.87 %)		 6,810,592
(50.46 %)		 27,883
(2.10 %)
136 foxtail millet
GCF_000263155.2		 40,951
(13.47 %)		 17,758
(5.07 %)		 60,598
(30.59 %)		 n/a 46.14
(98.82 %)		 6,442
(1.19 %)		 6,779
(98.81 %)		 115,365
(1.46 %)		 116,980
(2.45 %)		 1,691,260
(29.31 %)		 78,297
(28.27 %)
137 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1		 n/a 13,889
(0.88 %)		 71,188
(7.43 %)		 n/a 35.53
(99.95 %)		 1,481
(0.05 %)		 822
(100.00 %)		 671,921
(2.91 %)		 624,024
(4.46 %)		 7,792,634
(47.85 %)		 76,668
(3.16 %)
138 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1		 45,159
(4.02 %)		 13,440
(1.02 %)		 85,207
(11.07 %)		 n/a 39.02
(97.02 %)		 47,391
(2.99 %)		 56,182
(97.01 %)		 427,496
(2.02 %)		 885,946
(8.32 %)		 6,075,356
(46.49 %)		 111,109
(6.80 %)
139 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4		 69,048
(2.69 %)		 16,407
(0.56 %)		 105,654
(5.75 %)		 n/a 37.92
(99.95 %)		 384
(0.05 %)		 93
(100.00 %)		 1,192,578
(2.37 %)		 1,282,344
(4.72 %)		 12,843,881
(61.50 %)		 160,781
(2.86 %)
140 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1		 74,264
(1.88 %)		 17,744
(0.43 %)		 129,692
(4.97 %)		 n/a 37.94
(99.73 %)		 826
(0.27 %)		 1,566
(100.00 %)		 1,517,586
(2.16 %)		 1,541,702
(5.89 %)		 13,206,825
(66.95 %)		 105,766
(0.97 %)
141 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1		 43,473
(2.84 %)		 13,544
(0.88 %)		 64,877
(5.24 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 596
(0.00 %)		 510
(100.00 %)		 1,556,970
(22.50 %)		 788,188
(5.25 %)		 10,081,845
(53.72 %)		 41,032
(1.09 %)
142 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1		 59,652
(8.73 %)		 18,917
(2.55 %)		 47,052
(9.22 %)		 n/a 32.09
(99.98 %)		 1,693
(0.02 %)		 2,266
(100.00 %)		 452,206
(3.00 %)		 195,931
(2.27 %)		 4,921,469
(39.63 %)		 9,731
(0.69 %)
143 ginger
GCF_018446385.1		 127,579
(4.07 %)		 33,995
(0.96 %)		 186,756
(7.79 %)		 n/a 39.16
(100.00 %)		 901
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,187,168
(2.18 %)		 2,088,683
(6.47 %)		 12,917,773
(61.42 %)		 398,512
(10.38 %)
144 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2		 42,106
(6.72 %)		 15,819
(2.23 %)		 49,753
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,402
(9.76 %)		 13,479
(99.93 %)		 394,793
(2.75 %)		 364,336
(3.37 %)		 4,190,750
(39.49 %)		 12,198
(0.64 %)
145 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1		 87,385
(2.18 %)		 17,963
(0.44 %)		 263,708
(10.29 %)		 n/a 46.32
(97.73 %)		 107,163
(2.27 %)		 109,126
(100.00 %)		 1,490,873
(15.60 %)		 1,415,562
(5.65 %)		 12,540,551
(71.59 %)		 881,849
(29.81 %)
146 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1		 69,195
(1.77 %)		 18,614
(0.43 %)		 300,274
(11.28 %)		 n/a 46.38
(100.00 %)		 n/a 68,537
(100.00 %)		 1,555,328
(15.65 %)		 1,485,488
(4.71 %)		 13,133,338
(73.17 %)		 928,327
(30.84 %)
147 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3		 93,689
(2.58 %)		 18,524
(0.46 %)		 261,939
(10.44 %)		 n/a 46.35
(99.97 %)		 347
(0.03 %)		 1,115
(100.00 %)		 1,094,634
(1.42 %)		 1,403,604
(6.42 %)		 12,367,986
(72.90 %)		 849,453
(31.38 %)
148 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1		 69,808
(4.35 %)		 17,353
(1.01 %)		 81,347
(7.68 %)		 n/a 38.10
(99.95 %)		 1,565
(0.05 %)		 166
(100.00 %)		 816,909
(2.29 %)		 708,412
(4.09 %)		 8,106,901
(53.67 %)		 66,433
(1.82 %)
149 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1		 n/a 21,161
(2.89 %)		 55,843
(11.78 %)		 n/a 35.63
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 2,366
(99.99 %)		 423,518
(2.92 %)		 293,299
(3.76 %)		 4,466,312
(33.71 %)		 25,250
(1.74 %)
150 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1		 n/a 22,332
(3.88 %)		 51,709
(13.62 %)		 n/a 35.31
(96.44 %)		 25,521
(3.57 %)		 1,234
(100.00 %)		 347,035
(2.87 %)		 241,862
(4.11 %)		 3,578,217
(30.95 %)		 19,259
(1.41 %)
151 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1		 n/a 10,023
(7.00 %)		 16,353
(26.89 %)		 n/a 42.30
(92.78 %)		 89,257
(7.32 %)		 89,277
(92.68 %)		 80,787
(2.86 %)		 45,432
(1.93 %)		 786,155
(19.70 %)		 19,057
(20.99 %)
152 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1		 n/a 865
(2.16 %)		 3,109
(76.75 %)		 n/a 67.78
(100.00 %)		 n/a 55
(100.00 %)		 35,578
(6.99 %)		 19,197
(3.61 %)		 216,318
(31.95 %)		 54
(99.88 %)
153 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1		 n/a 748
(2.62 %)		 2,222
(71.29 %)		 n/a 64.15
(97.91 %)		 6,559
(2.25 %)		 19
(100.00 %)		 268
(0.10 %)		 2,320
(1.18 %)		 110,762
(22.64 %)		 29
(99.25 %)
154 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4		 10,237
(66.85 %)		 988
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 37,284
(8.77 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 43
(99.34 %)
155 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1		 n/a 1,000
(1.89 %)		 7,921
(69.96 %)		 n/a 62.97
(97.56 %)		 2,472
(2.45 %)		 3,774
(100.00 %)		 10,519
(1.96 %)		 4,558
(1.31 %)		 172,635
(22.08 %)		 3,978
(96.84 %)
156 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2		 n/a 1,087
(3.87 %)		 3,215
(73.44 %)		 n/a 61.27
(98.39 %)		 10,986
(1.68 %)		 46
(100.00 %)		 8,982
(1.85 %)		 3,745
(0.85 %)		 119,487
(14.35 %)		 79
(99.57 %)
157 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1		 n/a 928
(3.73 %)		 2,196
(76.87 %)		 n/a 73.37
(97.42 %)		 12,055
(2.67 %)		 27
(100.00 %)		 15,929
(5.38 %)		 7,990
(2.29 %)		 164,687
(38.62 %)		 30
(99.90 %)
158 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1		 n/a 2,016
(0.62 %)		 31,585
(41.01 %)		 n/a 57.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,614
(100.00 %)		 183,076
(3.30 %)		 101,860
(5.85 %)		 972,524
(32.54 %)		 4,760
(98.23 %)
159 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1		 n/a 869
(2.13 %)		 9,821
(78.63 %)		 n/a 67.62
(98.00 %)		 579
(1.95 %)		 7,535
(98.05 %)		 35,537
(6.91 %)		 19,692
(3.56 %)		 218,412
(30.60 %)		 6,958
(98.59 %)
160 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1		 n/a 1,365
(1.08 %)		 11,070
(58.24 %)		 n/a 55.95
(98.44 %)		 780
(1.56 %)		 597
(100.00 %)		 25,537
(1.66 %)		 27,257
(3.92 %)		 365,387
(19.48 %)		 3,732
(86.39 %)
161 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1		 7,014
(37.71 %)		 966
(2.72 %)		 2,947
(70.38 %)		 n/a 63.54
(95.35 %)		 1,012
(4.66 %)		 1,386
(95.34 %)		 8,655
(1.88 %)		 3,803
(1.89 %)		 147,537
(20.31 %)		 604
(53.91 %)
162 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1		 7,904
(82.34 %)		 1,231
(6.04 %)		 4,460
(76.24 %)		 n/a 48.02
(99.76 %)		 20
(0.24 %)		 21
(100.00 %)		 17,900
(4.88 %)		 5,674
(1.75 %)		 113,699
(21.91 %)		 7
(0.01 %)
163 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1		 n/a 1,057
(0.55 %)		 9,735
(58.02 %)		 n/a 64.03
(100.00 %)		 n/a 17
(100.00 %)		 166,909
(9.00 %)		 120,034
(10.13 %)		 750,946
(37.60 %)		 166
(99.31 %)
164 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2		 19,527
(53.99 %)		 990
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 174,119
(17.13 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 92
(46.06 %)
165 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1		 9,839
(29.70 %)		 1,307
(1.78 %)		 8,108
(53.71 %)		 n/a 52.94
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 8,446
(0.85 %)		 5,471
(0.85 %)		 265,761
(14.34 %)		 11,329
(19.64 %)
166 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1		 9,780
(32.79 %)		 744
(1.00 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 64,770
(8.22 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 756
(45.48 %)
167 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1		 n/a 2,471
(1.78 %)		 14,771
(54.27 %)		 n/a 52.42
(98.98 %)		 2,081
(1.02 %)		 3,731
(98.98 %)		 10,051
(0.46 %)		 14,278
(1.14 %)		 388,120
(8.55 %)		 8,698
(83.31 %)
168 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2		 10,137
(72.46 %)		 1,301
(4.51 %)		 5,667
(86.20 %)		 n/a 63.82
(100.00 %)		 n/a 19
(100.00 %)		 14,619
(3.58 %)		 8,937
(2.75 %)		 178,499
(27.69 %)		 10
(25.23 %)
169 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1		 16,734
(25.96 %)		 666
(0.47 %)		 12,122
(60.02 %)		 n/a 64.75
(96.59 %)		 5,358
(3.43 %)		 12,077
(96.57 %)		 73,343
(6.73 %)		 43,518
(3.04 %)		 568,630
(31.80 %)		 7,776
(96.69 %)
170 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2		 10,242
(66.86 %)		 990
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 36,818
(8.73 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 32
(47.70 %)
171 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1		 7,603
(72.01 %)		 1,064
(6.25 %)		 3,493
(72.08 %)		 n/a 60.44
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 11,026
(5.45 %)		 11,732
(3.90 %)		 107,661
(34.88 %)		 12
(61.27 %)
172 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3		 7,766
(82.33 %)		 1,131
(6.60 %)		 3,714
(76.22 %)		 n/a 59.21
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 22
(100.00 %)		 8,503
(3.84 %)		 4,946
(2.16 %)		 102,428
(27.87 %)		 16
(57.14 %)
173 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1		 14,333
(21.46 %)		 1,411
(0.77 %)		 13,095
(47.93 %)		 n/a 55.97
(91.15 %)		 12,014
(8.87 %)		 11,352
(91.13 %)		 175,729
(14.69 %)		 105,113
(5.10 %)		 667,226
(23.91 %)		 4,325
(42.65 %)
174 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1		 46,094
(16.56 %)		 14,632
(4.66 %)		 34,242
(19.36 %)		 n/a 33.53
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 293,800
(4.64 %)		 151,157
(7.38 %)		 1,732,880
(41.88 %)		 21,835
(6.05 %)
175 green foxtail
GCF_005286985.1		 47,022
(14.66 %)		 17,750
(5.12 %)		 60,106
(30.88 %)		 n/a 46.17
(99.85 %)		 61
(0.15 %)		 76
(99.85 %)		 116,493
(1.51 %)		 120,039
(2.72 %)		 1,676,017
(29.11 %)		 75,497
(29.44 %)
176 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2		 43,377
(14.56 %)		 17,909
(5.15 %)		 60,312
(30.80 %)		 n/a 46.17
(99.96 %)		 14
(0.04 %)		 40
(99.96 %)		 117,054
(1.49 %)		 121,212
(2.84 %)		 1,685,787
(29.32 %)		 75,777
(29.49 %)
177 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1		 n/a 18,040
(5.19 %)		 61,671
(31.38 %)		 n/a 45.99
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 105,738
(1.38 %)		 87,424
(2.22 %)		 1,777,815
(26.85 %)		 74,932
(30.30 %)
178 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2		 n/a 11,944
(2.63 %)		 37,372
(13.64 %)		 n/a 35.58
(88.95 %)		 1,032,823
(11.31 %)		 21
(100.00 %)		 293,868
(3.21 %)		 174,614
(3.18 %)		 2,690,184
(32.53 %)		 15,323
(1.42 %)
179 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2		 n/a 16,562
(0.53 %)		 72,911
(2.91 %)		 n/a 34.88
(98.35 %)		 196,261
(1.66 %)		 87,978
(100.00 %)		 1,136,015
(1.95 %)		 1,019,921
(4.33 %)		 22,445,162
(47.06 %)		 20,737
(0.24 %)
180 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1		 88,183
(5.03 %)		 22,129
(1.02 %)		 118,243
(9.15 %)		 n/a 35.63
(99.98 %)		 3,486
(0.02 %)		 1,888
(100.00 %)		 1,001,308
(2.63 %)		 1,132,664
(5.72 %)		 8,340,755
(56.16 %)		 43,665
(1.21 %)
181 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1		 43,787
(9.63 %)		 17,635
(3.85 %)		 66,270
(23.98 %)		 n/a 46.87
(98.63 %)		 736
(1.37 %)		 1,027
(98.63 %)		 157,811
(1.55 %)		 119,571
(2.57 %)		 2,107,254
(45.30 %)		 102,278
(32.16 %)
182 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1		 100,198
(3.70 %)		 41,058
(1.06 %)		 207,532
(8.30 %)		 n/a 37.08
(100.00 %)		 n/a 15,833
(100.00 %)		 2,024,684
(2.90 %)		 1,837,742
(5.29 %)		 17,556,257
(56.19 %)		 201,310
(3.34 %)
183 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1		 40,392
(7.39 %)		 16,711
(2.29 %)		 50,292
(11.24 %)		 n/a 32.12
(99.95 %)		 858
(0.05 %)		 1,115
(100.00 %)		 439,789
(3.56 %)		 574,639
(8.97 %)		 4,147,814
(47.01 %)		 16,291
(1.13 %)
184 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1		 n/a 11,782
(0.08 %)		 129,658
(1.42 %)		 n/a 36.91
(99.99 %)		 11,130
(0.01 %)		 150
(100.00 %)		 2,861,102
(1.57 %)		 2,476,232
(2.57 %)		 65,436,741
(53.97 %)		 157,149
(0.72 %)
185 horseweed
GCF_010389155.1		 39,622
(11.54 %)		 14,718
(3.15 %)		 42,194
(16.23 %)		 n/a 34.08
(99.99 %)		 502
(0.01 %)		 357
(100.00 %)		 267,124
(2.84 %)		 155,729
(2.71 %)		 2,475,353
(36.48 %)		 5,205
(0.40 %)
186 Indian licorice
GCF_003935025.1		 44,610
(13.60 %)		 17,108
(4.95 %)		 34,097
(14.33 %)		 n/a 31.84
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 217,674
(3.40 %)		 106,243
(4.04 %)		 2,232,509
(38.91 %)		 5,438
(1.06 %)
187 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1		 n/a 16,184
(2.02 %)		 66,215
(14.16 %)		 n/a 35.37
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 689
(100.00 %)		 739,891
(4.58 %)		 435,389
(7.62 %)		 4,843,419
(38.03 %)		 13,298
(2.56 %)
188 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1		 n/a 15,832
(2.09 %)		 63,488
(14.36 %)		 n/a 35.19
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 358
(100.00 %)		 703,028
(4.29 %)		 399,798
(6.48 %)		 4,662,881
(36.96 %)		 12,534
(1.92 %)
189 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1		 n/a 15,893
(1.97 %)		 68,998
(15.27 %)		 n/a 35.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 156
(100.00 %)		 746,424
(4.43 %)		 451,117
(7.39 %)		 4,820,434
(38.55 %)		 20,367
(2.62 %)
190 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1		 n/a 15,880
(1.95 %)		 69,093
(15.25 %)		 n/a 35.97
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 274
(100.00 %)		 751,691
(4.60 %)		 457,914
(7.61 %)		 4,850,082
(38.95 %)		 20,561
(3.01 %)
191 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1		 50,504
(10.14 %)		 18,451
(3.41 %)		 55,094
(16.89 %)		 n/a 36.30
(99.18 %)		 54
(0.82 %)		 154
(100.00 %)		 411,290
(3.65 %)		 260,413
(3.49 %)		 3,023,907
(31.93 %)		 23,270
(1.88 %)
192 Japanese apricot
GCF_000346735.1		 32,312
(19.60 %)		 14,463
(6.46 %)		 33,049
(23.94 %)		 n/a 37.45
(92.82 %)		 15,597
(7.20 %)		 23,761
(92.80 %)		 118,757
(2.25 %)		 84,983
(4.53 %)		 1,374,244
(23.24 %)		 7,808
(1.87 %)
193 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1		 80,727
(1.01 %)		 14,175
(0.13 %)		 225,166
(3.69 %)		 n/a 36.42
(99.98 %)		 3,031
(0.02 %)		 2,699
(100.00 %)		 2,873,672
(2.01 %)		 4,198,037
(4.24 %)		 5,730
(99.98 %)		 71,102
(1.16 %)
194 Japanese morning glory
GCF_001879475.1		 58,979
(8.37 %)		 16,977
(2.14 %)		 77,626
(18.21 %)		 n/a 37.61
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 3,418
(100.00 %)		 641,896
(6.26 %)		 639,051
(8.97 %)		 3,622,236
(46.63 %)		 77,860
(10.47 %)
195 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1		 55,725
(16.73 %)		 16,338
(4.37 %)		 54,077
(25.00 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 196,712
(2.76 %)		 141,936
(4.82 %)		 1,727,479
(35.05 %)		 63,894
(25.90 %)
196 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1		 n/a 16,562
(4.59 %)		 53,878
(24.77 %)		 n/a 43.61
(98.95 %)		 474
(1.05 %)		 476
(98.95 %)		 494,831
(50.75 %)		 141,079
(3.52 %)		 1,728,936
(33.69 %)		 64,216
(25.20 %)
197 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1		 53,454
(17.22 %)		 16,804
(4.69 %)		 53,712
(24.95 %)		 n/a 43.57
(99.97 %)		 925
(0.03 %)		 58
(100.00 %)		 402,182
(39.07 %)		 138,035
(3.47 %)		 1,719,939
(33.46 %)		 63,485
(25.25 %)
198 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1		 44,756
(10.39 %)		 13,649
(2.41 %)		 38,664
(12.08 %)		 n/a 31.93
(99.74 %)		 2,496
(0.26 %)		 49
(100.00 %)		 270,085
(9.40 %)		 247,307
(22.95 %)		 2,428,999
(49.81 %)		 5,914
(1.27 %)
199 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1		 n/a 21,051
(6.88 %)		 57,023
(32.54 %)		 n/a 44.09
(96.75 %)		 14,848
(3.26 %)		 26,634
(96.74 %)		 101,349
(1.46 %)		 71,657
(2.17 %)		 1,693,252
(21.97 %)		 60,198
(24.06 %)
200 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1		 n/a 27,668
(4.03 %)		 72,915
(18.34 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 136
(0.01 %)		 624
(99.99 %)		 382,061
(2.62 %)		 254,813
(8.31 %)		 3,593,274
(41.24 %)		 14,758
(7.59 %)
201 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1		 n/a 15,031
(1.06 %)		 140,751
(10.18 %)		 n/a 36.82
(99.85 %)		 n/a 876,110
(100.00 %)		 505,796
(3.85 %)		 318,171
(2.09 %)		 9,808,138
(33.85 %)		 30,057
(0.85 %)
202 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3		 n/a 16,254
(4.30 %)		 54,135
(24.00 %)		 n/a 43.62
(100.00 %)		 n/a 13
(100.00 %)		 204,282
(2.82 %)		 143,681
(3.92 %)		 1,729,033
(36.62 %)		 65,538
(25.47 %)
203 lyrate rockcress
GCF_000004255.2		 44,526
(28.52 %)		 25,416
(19.36 %)		 34,938
(31.66 %)		 n/a 36.08
(88.90 %)		 2,950
(11.10 %)		 3,646
(88.90 %)		 141,441
(20.58 %)		 72,583
(3.25 %)		 1,012,438
(24.68 %)		 8,053
(2.48 %)
204 macadamia nut
GCF_013358625.1		 58,226
(8.43 %)		 16,723
(2.11 %)		 62,465
(13.23 %)		 n/a 39.13
(98.51 %)		 22,059
(1.50 %)		 2,644
(100.00 %)		 463,575
(3.09 %)		 304,057
(3.39 %)		 4,183,445
(34.36 %)		 18,956
(1.40 %)
205 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1		 n/a 13,013
(2.26 %)		 38,671
(8.42 %)		 n/a 33.59
(99.19 %)		 123,798
(0.85 %)		 203,100
(99.15 %)		 329,865
(3.57 %)		 244,018
(4.63 %)		 3,737,818
(40.09 %)		 4,827
(0.29 %)
206 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1		 n/a 12,929
(2.13 %)		 34,499
(7.89 %)		 n/a 33.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 174
(100.00 %)		 560,407
(20.53 %)		 306,275
(8.15 %)		 3,716,838
(44.45 %)		 6,827
(0.40 %)
207 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1		 69,307
(3.21 %)		 14,466
(0.72 %)		 84,219
(6.52 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 1,415,484
(14.07 %)		 1,154,832
(6.29 %)		 10,231,412
(50.86 %)		 107,342
(2.63 %)
208 maize
GCF_902167145.1		 76,701
(3.66 %)		 23,553
(1.55 %)		 154,773
(10.70 %)		 n/a 46.77
(99.83 %)		 708
(0.17 %)		 697
(100.00 %)		 1,340,549
(78.65 %)		 843,168
(5.20 %)		 5,886,498
(69.23 %)		 372,641
(31.10 %)
209 maize (2020)
GCA_905067065.1		 n/a 23,433
(1.61 %)		 150,853
(10.66 %)		 n/a 46.83
(98.14 %)		 56,163
(1.87 %)		 56,173
(98.13 %)		 581,502
(1.40 %)		 753,129
(3.49 %)		 5,867,216
(67.88 %)		 377,414
(31.33 %)
210 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1		 n/a 23,680
(1.58 %)		 153,453
(10.69 %)		 n/a 46.83
(99.71 %)		 1,223
(0.29 %)		 697
(100.00 %)		 593,292
(1.41 %)		 805,647
(4.47 %)		 5,887,178
(69.17 %)		 370,755
(32.34 %)
211 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6		 n/a 23,511
(1.62 %)		 151,975
(10.84 %)		 n/a 46.87
(98.56 %)		 2,523
(1.44 %)		 3,128
(98.56 %)		 1,308,956
(78.59 %)		 771,560
(3.39 %)		 5,850,966
(67.94 %)		 367,973
(32.21 %)
212 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1		 n/a 23,864
(1.57 %)		 154,358
(10.67 %)		 n/a 46.77
(99.88 %)		 551
(0.12 %)		 777
(100.00 %)		 1,341,834
(78.70 %)		 834,042
(5.01 %)		 5,916,520
(69.26 %)		 372,114
(32.08 %)
213 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2		 34,262
(16.98 %)		 15,545
(6.13 %)		 36,746
(24.10 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 140,519
(2.59 %)		 67,337
(3.89 %)		 1,493,779
(29.32 %)		 41,044
(18.43 %)
214 mango
GCF_011075055.1		 60,349
(16.06 %)		 20,653
(5.13 %)		 40,887
(15.20 %)		 n/a 32.71
(99.98 %)		 169
(0.02 %)		 250
(100.00 %)		 213,445
(3.09 %)		 125,929
(3.29 %)		 2,447,401
(32.63 %)		 7,059
(0.98 %)
215 monocots
GCF_002575655.2		 84,334
(2.18 %)		 17,888
(0.44 %)		 263,541
(10.26 %)		 n/a 46.33
(97.97 %)		 69,858
(2.04 %)		 109,197
(100.00 %)		 1,492,485
(15.65 %)		 1,422,870
(5.39 %)		 12,521,384
(71.80 %)		 881,939
(30.07 %)
216 mosses
GCF_000002425.4		 55,044
(11.86 %)		 8,425
(1.46 %)		 30,452
(12.55 %)		 n/a 33.69
(98.74 %)		 2,645
(1.27 %)		 359
(100.00 %)		 454,786
(48.35 %)		 241,826
(2.56 %)		 2,413,326
(52.52 %)		 22,664
(3.06 %)
217 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1		 29,893
(12.15 %)		 14,092
(4.40 %)		 37,376
(17.73 %)		 n/a 34.86
(94.92 %)		 15,541
(5.08 %)		 46,842
(94.92 %)		 317,532
(5.00 %)		 190,192
(6.25 %)		 2,095,631
(34.49 %)		 20,490
(3.43 %)
218 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1		 47,653
(11.89 %)		 16,644
(3.87 %)		 43,967
(14.67 %)		 n/a 33.18
(92.80 %)		 96,870
(7.24 %)		 2,465
(100.00 %)		 264,597
(3.31 %)		 198,963
(3.34 %)		 2,842,720
(34.86 %)		 13,975
(1.49 %)
219 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1		 47,062
(10.58 %)		 13,502
(2.95 %)		 32,332
(13.20 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 239
(0.01 %)		 1,310
(100.00 %)		 282,171
(3.23 %)		 229,959
(11.70 %)		 2,016,709
(43.94 %)		 18,232
(10.96 %)
220 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1		 35,384
(11.55 %)		 13,191
(3.74 %)		 28,295
(11.09 %)		 n/a 33.23
(89.51 %)		 29,172
(10.51 %)		 60,751
(89.49 %)		 239,295
(7.85 %)		 172,598
(3.17 %)		 2,304,858
(33.21 %)		 12,855
(1.38 %)
221 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1		 35,080
(19.76 %)		 14,109
(6.33 %)		 27,978
(20.09 %)		 n/a 37.69
(100.00 %)		 n/a 15
(100.00 %)		 124,433
(3.10 %)		 69,868
(2.56 %)		 1,208,522
(27.94 %)		 21,007
(5.28 %)
222 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1		 57,263
(9.83 %)		 22,097
(3.53 %)		 51,774
(13.22 %)		 n/a 33.46
(99.34 %)		 44,657
(0.68 %)		 55,107
(99.32 %)		 280,867
(4.25 %)		 210,750
(5.67 %)		 3,920,315
(38.10 %)		 6,462
(0.46 %)
223 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1		 44,477
(5.41 %)		 16,928
(1.94 %)		 77,682
(16.06 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 2,037
(0.00 %)		 1,289
(100.00 %)		 437,997
(2.33 %)		 266,149
(5.08 %)		 4,764,252
(34.25 %)		 20,667
(1.81 %)
224 opium poppy
GCF_003573695.1		 127,893
(4.57 %)		 25,532
(0.85 %)		 162,032
(9.31 %)		 n/a 37.28
(99.80 %)		 31,183
(0.20 %)		 34,381
(100.00 %)		 819,294
(1.49 %)		 1,050,181
(6.80 %)		 10,625,631
(55.85 %)		 67,521
(1.21 %)
225 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2		 39,386
(3.85 %)		 12,208
(0.99 %)		 72,906
(8.22 %)		 n/a 34.70
(96.03 %)		 25,751
(3.92 %)		 311,841
(96.08 %)		 506,361
(2.45 %)		 413,770
(3.23 %)		 8,074,114
(39.07 %)		 56,900
(2.34 %)
226 orchid P.equestris
GCF_001263595.1		 32,146
(3.36 %)		 11,541
(1.01 %)		 54,049
(6.11 %)		 n/a 34.46
(92.46 %)		 98,814
(7.56 %)		 188,398
(92.44 %)		 487,071
(2.96 %)		 511,903
(4.00 %)		 7,060,408
(42.20 %)		 31,179
(1.22 %)
227 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1		 120,534
(4.81 %)		 39,902
(1.95 %)		 276,967
(16.36 %)		 n/a 45.32
(99.56 %)		 4,932
(0.44 %)		 2,420
(100.00 %)		 764,083
(1.38 %)		 810,723
(3.95 %)		 11,118,925
(53.40 %)		 520,091
(23.03 %)
228 papaya
GCF_000150535.2		 29,883
(11.99 %)		 12,860
(4.47 %)		 24,403
(11.58 %)		 n/a 35.31
(73.55 %)		 29,719
(26.47 %)		 47,485
(73.53 %)		 260,082
(34.69 %)		 101,644
(3.59 %)		 1,640,647
(28.88 %)		 21,200
(2.95 %)
229 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1		 n/a 43,905
(2.21 %)		 174,920
(14.40 %)		 n/a 35.02
(93.97 %)		 170,266
(6.06 %)		 211,964
(93.94 %)		 1,021,699
(2.86 %)		 1,125,321
(8.02 %)		 9,388,626
(47.60 %)		 102,661
(4.26 %)
230 peach
GCF_000346465.2		 36,201
(20.87 %)		 14,368
(6.26 %)		 32,245
(24.09 %)		 n/a 37.51
(98.79 %)		 2,368
(1.22 %)		 2,531
(98.78 %)		 150,957
(10.06 %)		 96,381
(5.52 %)		 1,221,263
(28.72 %)		 7,885
(2.07 %)
231 peanut
GCF_003086295.2		 155,835
(5.15 %)		 31,810
(1.19 %)		 160,574
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,655
(0.15 %)		 385
(100.00 %)		 1,684,814
(3.52 %)		 1,488,297
(4.81 %)		 11,059,688
(62.32 %)		 140,570
(2.45 %)
232 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1		 n/a 31,065
(1.17 %)		 158,578
(8.79 %)		 n/a 36.33
(98.97 %)		 32,692
(1.04 %)		 29
(100.00 %)		 1,735,218
(3.66 %)		 1,490,806
(4.26 %)		 11,072,983
(61.75 %)		 138,890
(2.46 %)
233 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3		 173,169
(5.54 %)		 31,897
(1.19 %)		 160,532
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,697
(0.15 %)		 443
(100.00 %)		 1,676,149
(3.49 %)		 1,489,126
(4.81 %)		 11,105,477
(62.30 %)		 140,609
(2.45 %)
234 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1		 48,939
(13.04 %)		 22,082
(4.44 %)		 56,235
(17.69 %)		 n/a 37.45
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 176
(99.99 %)		 289,539
(2.54 %)		 223,443
(3.84 %)		 2,308,351
(35.91 %)		 19,559
(2.15 %)
235 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2		 n/a 17,949
(1.26 %)		 134,829
(14.30 %)		 n/a 47.95
(86.95 %)		 156,852
(13.08 %)		 52,033
(100.00 %)		 380,858
(1.16 %)		 466,997
(2.83 %)		 5,117,134
(56.89 %)		 380,989
(29.47 %)
236 pecan
GCF_018687715.1		 71,340
(9.93 %)		 18,671
(2.67 %)		 60,632
(15.16 %)		 n/a 36.30
(99.97 %)		 22
(0.03 %)		 39
(99.97 %)		 473,853
(3.66 %)		 367,846
(6.75 %)		 3,301,121
(39.03 %)		 27,274
(2.22 %)
237 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1		 89,789
(3.75 %)		 17,693
(0.79 %)		 174,787
(12.15 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 238
(0.00 %)		 1,677
(100.00 %)		 605,852
(1.36 %)		 760,915
(5.68 %)		 5,216,229
(69.24 %)		 542,998
(24.23 %)
238 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2		 81,335
(3.75 %)		 17,678
(0.79 %)		 172,584
(12.06 %)		 n/a 44.29
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 610,404
(1.37 %)		 758,029
(5.51 %)		 5,039,192
(69.30 %)		 542,208
(23.92 %)
239 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2		 72,518
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 52,295
(10.15 %)		 n/a 33.21
(98.25 %)		 19,685
(1.76 %)		 20,680
(98.24 %)		 404,885
(2.81 %)		 300,062
(3.31 %)		 5,198,170
(40.84 %)		 10,912
(0.59 %)
240 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1		 63,582
(8.69 %)		 20,265
(2.62 %)		 51,815
(10.02 %)		 n/a 33.24
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 405,385
(2.83 %)		 306,302
(3.81 %)		 5,192,105
(41.79 %)		 10,481
(0.65 %)
241 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1		 n/a 15,868
(1.22 %)		 104,104
(13.39 %)		 n/a 36.03
(91.65 %)		 318,321
(8.39 %)		 328,880
(91.61 %)		 810,727
(3.49 %)		 710,744
(4.84 %)		 7,339,863
(41.43 %)		 104,967
(3.98 %)
242 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2		 46,412
(9.42 %)		 17,396
(3.13 %)		 49,710
(12.66 %)		 n/a 32.76
(94.18 %)		 36,323
(5.83 %)		 67,834
(94.17 %)		 395,663
(3.40 %)		 306,602
(4.71 %)		 3,749,364
(39.19 %)		 26,504
(2.90 %)
243 pineapple
GCF_001540865.1		 43,025
(11.65 %)		 13,649
(3.36 %)		 38,917
(14.95 %)		 n/a 38.34
(98.23 %)		 25,542
(1.78 %)		 3,129
(100.00 %)		 352,802
(7.31 %)		 274,578
(4.75 %)		 2,360,455
(38.94 %)		 56,724
(11.73 %)
244 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1		 37,318
(33.25 %)		 22,836
(23.08 %)		 26,822
(33.93 %)		 n/a 35.63
(97.53 %)		 6,294
(2.49 %)		 7,067
(97.51 %)		 74,470
(2.42 %)		 42,509
(3.39 %)		 814,442
(24.99 %)		 5,817
(2.14 %)
245 pistachio
GCF_008641045.1		 47,948
(7.92 %)		 18,462
(2.58 %)		 62,898
(14.05 %)		 n/a 35.95
(99.84 %)		 16,367
(0.16 %)		 1,865
(100.00 %)		 363,793
(2.43 %)		 253,408
(4.08 %)		 4,200,417
(36.34 %)		 22,340
(1.78 %)
246 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2		 41,223
(10.98 %)		 11,576
(2.50 %)		 38,220
(15.70 %)		 n/a 38.61
(99.84 %)		 626
(0.16 %)		 1,409
(99.84 %)		 236,190
(2.95 %)		 153,746
(4.02 %)		 2,151,579
(26.72 %)		 24,561
(4.48 %)
247 pomegranate
GCF_007655135.1		 43,277
(14.87 %)		 14,635
(4.26 %)		 39,381
(19.97 %)		 n/a 40.38
(99.99 %)		 188
(0.01 %)		 474
(100.00 %)		 173,182
(2.28 %)		 174,872
(6.81 %)		 1,640,973
(32.89 %)		 26,506
(9.18 %)
248 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1		 43,754
(6.67 %)		 16,547
(2.25 %)		 54,186
(11.30 %)		 n/a 34.71
(88.41 %)		 37,060
(11.60 %)		 17,084
(100.00 %)		 321,938
(2.14 %)		 250,793
(4.04 %)		 5,136,691
(33.92 %)		 8,536
(0.30 %)
249 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1		 n/a 16,861
(1.98 %)		 58,882
(12.19 %)		 n/a 35.40
(99.95 %)		 4,397
(0.05 %)		 3,012
(100.00 %)		 774,417
(46.83 %)		 392,378
(8.45 %)		 5,068,449
(42.72 %)		 14,548
(1.32 %)
250 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1		 n/a 17,614
(2.86 %)		 45,684
(10.75 %)		 n/a 34.49
(83.57 %)		 10,041,161
(17.84 %)		 12
(100.00 %)		 606,573
(40.80 %)		 168,871
(2.58 %)		 5,508,800
(26.36 %)		 5,550
(0.22 %)
251 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1		 43,158
(7.63 %)		 16,423
(2.55 %)		 50,333
(11.79 %)		 n/a 34.83
(93.98 %)		 45,215
(6.04 %)		 60,069
(93.96 %)		 662,626
(43.42 %)		 212,315
(4.38 %)		 4,691,843
(34.91 %)		 9,851
(0.45 %)
252 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1		 n/a 16,415
(2.15 %)		 54,766
(12.48 %)		 n/a 35.21
(99.98 %)		 1,476
(0.02 %)		 25
(100.00 %)		 329,233
(2.28 %)		 285,101
(5.66 %)		 4,832,189
(40.28 %)		 12,944
(0.99 %)
253 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1		 n/a 16,694
(2.26 %)		 53,990
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,499
(0.02 %)		 28
(100.00 %)		 323,447
(2.25 %)		 283,098
(5.39 %)		 4,727,964
(39.87 %)		 12,316
(1.34 %)
254 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1		 n/a 16,713
(2.23 %)		 54,380
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,299
(0.02 %)		 27
(100.00 %)		 329,807
(2.31 %)		 282,372
(6.11 %)		 4,718,807
(40.25 %)		 11,812
(1.00 %)
255 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1		 n/a 16,640
(2.18 %)		 54,937
(12.38 %)		 n/a 35.18
(99.98 %)		 1,383
(0.02 %)		 26
(100.00 %)		 329,665
(2.30 %)		 285,993
(6.03 %)		 4,858,802
(40.32 %)		 12,792
(1.32 %)
256 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1		 n/a 16,312
(2.05 %)		 54,438
(12.18 %)		 n/a 35.23
(99.95 %)		 4,448
(0.05 %)		 12
(100.00 %)		 730,464
(46.17 %)		 338,389
(7.95 %)		 4,903,557
(41.90 %)		 12,226
(0.72 %)
257 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1		 35,846
(6.75 %)		 16,408
(2.54 %)		 48,924
(11.75 %)		 n/a 34.59
(99.55 %)		 1,612
(0.45 %)		 1,332
(100.00 %)		 297,683
(2.31 %)		 234,616
(4.68 %)		 4,308,149
(38.02 %)		 8,192
(0.47 %)
258 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1		 69,821
(7.75 %)		 19,604
(2.27 %)		 61,800
(12.08 %)		 n/a 36.89
(99.89 %)		 1,710
(0.11 %)		 541
(100.00 %)		 310,321
(1.81 %)		 229,404
(3.84 %)		 4,409,199
(51.65 %)		 40,094
(1.87 %)
259 quinoa
GCF_001683475.1		 74,918
(7.49 %)		 22,914
(1.61 %)		 105,619
(12.97 %)		 n/a 36.87
(99.16 %)		 725
(0.84 %)		 3,487
(100.00 %)		 810,277
(3.58 %)		 762,903
(10.88 %)		 6,551,884
(49.49 %)		 93,630
(2.98 %)
260 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2		 80,681
(20.53 %)		 36,039
(9.58 %)		 74,081
(26.98 %)		 n/a 36.00
(99.94 %)		 2,853
(0.06 %)		 6,424
(100.00 %)		 224,524
(2.48 %)		 193,525
(5.49 %)		 2,234,480
(35.04 %)		 25,972
(4.13 %)
261 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1		 152,744
(19.27 %)		 57,668
(6.87 %)		 143,092
(23.51 %)		 n/a 37.13
(99.99 %)		 840
(0.01 %)		 3,167
(100.00 %)		 470,302
(2.29 %)		 578,281
(9.24 %)		 4,662,467
(42.41 %)		 64,287
(5.62 %)
262 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2		 144,991
(17.51 %)		 59,743
(7.71 %)		 146,391
(26.97 %)		 n/a 36.47
(92.96 %)		 32,639
(7.05 %)		 34,110
(92.95 %)		 449,257
(2.67 %)		 441,269
(5.84 %)		 4,867,601
(32.91 %)		 60,082
(3.53 %)
263 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1		 63,238
(17.01 %)		 17,857
(4.13 %)		 43,079
(17.27 %)		 n/a 33.71
(99.97 %)		 231
(0.03 %)		 90
(100.00 %)		 241,481
(2.65 %)		 187,674
(4.85 %)		 2,251,582
(37.03 %)		 6,474
(1.93 %)
264 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1		 62,715
(12.27 %)		 15,176
(2.61 %)		 67,175
(21.50 %)		 n/a 37.47
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 173
(100.00 %)		 377,231
(3.52 %)		 364,027
(5.05 %)		 2,679,528
(42.07 %)		 64,243
(6.17 %)
265 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2		 71,160
(1.59 %)		 18,911
(0.39 %)		 321,741
(10.16 %)		 n/a 45.91
(99.38 %)		 33,814
(0.62 %)		 10,205
(100.00 %)		 1,208,165
(1.25 %)		 1,319,817
(2.96 %)		 15,480,313
(71.93 %)		 975,234
(26.52 %)
266 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1		 62,168
(11.90 %)		 15,363
(2.73 %)		 54,203
(18.86 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 253,965
(2.10 %)		 235,379
(9.36 %)		 2,668,584
(34.08 %)		 31,789
(3.72 %)
267 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1		 38,736
(11.89 %)		 16,669
(4.18 %)		 43,369
(14.64 %)		 n/a 32.90
(93.47 %)		 20,717
(6.53 %)		 15,445
(100.00 %)		 233,635
(3.33 %)		 204,141
(4.85 %)		 2,682,022
(32.58 %)		 16,828
(2.07 %)
268 riverbank grape
GCF_004353265.1		 44,851
(10.22 %)		 15,302
(3.01 %)		 46,011
(14.96 %)		 n/a 34.32
(98.79 %)		 1,095
(1.21 %)		 175
(100.00 %)		 339,984
(3.03 %)		 233,259
(4.71 %)		 2,925,914
(35.27 %)		 11,055
(0.93 %)
269 rose gum (2021)
GCF_016545825.1		 54,676
(10.44 %)		 16,291
(2.42 %)		 69,492
(17.92 %)		 n/a 39.39
(99.97 %)		 1,712
(0.03 %)		 37
(100.00 %)		 358,171
(2.83 %)		 259,031
(3.65 %)		 3,353,128
(29.52 %)		 78,731
(7.66 %)
270 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1		 65,107
(11.08 %)		 16,389
(2.33 %)		 74,557
(18.16 %)		 n/a 39.28
(92.69 %)		 27,773
(7.32 %)		 32,724
(92.68 %)		 357,835
(2.50 %)		 266,806
(3.22 %)		 3,496,176
(27.34 %)		 79,393
(6.54 %)
271 rose of Sharon
GCF_006381635.1		 91,942
(5.18 %)		 44,363
(2.23 %)		 136,768
(10.14 %)		 n/a 34.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,789
(100.00 %)		 889,945
(2.72 %)		 968,890
(4.91 %)		 9,836,479
(51.73 %)		 42,560
(0.89 %)
272 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1		 71,258
(4.21 %)		 22,208
(1.24 %)		 63,302
(5.13 %)		 n/a 34.70
(91.68 %)		 1,428
(8.32 %)		 755
(100.00 %)		 1,078,590
(2.96 %)		 730,314
(3.70 %)		 6,031,831
(65.59 %)		 24,263
(0.70 %)
273 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1		 66,124
(5.23 %)		 22,033
(1.63 %)		 59,727
(6.42 %)		 n/a 34.84
(94.20 %)		 40,863
(5.81 %)		 7,453
(100.00 %)		 827,088
(3.02 %)		 565,394
(5.23 %)		 5,065,470
(61.59 %)		 13,573
(0.45 %)
274 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1		 94,414
(12.61 %)		 31,218
(3.57 %)		 108,219
(21.49 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,178
(100.00 %)		 360,314
(2.17 %)		 419,051
(4.85 %)		 3,875,932
(41.07 %)		 105,227
(10.14 %)
275 sacred lotus
GCF_000365185.1		 43,140
(7.01 %)		 15,920
(2.13 %)		 61,231
(13.11 %)		 n/a 38.30
(87.98 %)		 175,846
(12.06 %)		 58,428
(87.96 %)		 408,351
(2.83 %)		 275,384
(2.52 %)		 4,643,876
(30.20 %)		 40,599
(2.68 %)
276 saltwater cress
GCF_000478725.1		 38,705
(18.07 %)		 21,851
(11.68 %)		 39,487
(28.65 %)		 n/a 37.71
(98.09 %)		 3,020
(1.92 %)		 3,658
(98.08 %)		 102,162
(1.93 %)		 70,755
(3.25 %)		 1,162,538
(32.09 %)		 15,272
(3.87 %)
277 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1		 n/a 14,138
(0.74 %)		 125,370
(12.27 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 581
(100.00 %)		 655,331
(1.73 %)		 500,899
(4.88 %)		 7,172,490
(54.24 %)		 140,800
(5.87 %)
278 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1		 n/a 15,588
(0.93 %)		 117,831
(12.94 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 597,532
(1.81 %)		 430,194
(3.80 %)		 6,075,115
(49.91 %)		 129,512
(5.41 %)
279 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2		 94,251
(12.60 %)		 31,266
(3.58 %)		 108,141
(21.47 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,162
(100.00 %)		 357,482
(2.10 %)		 419,009
(4.86 %)		 3,874,047
(41.08 %)		 105,216
(10.11 %)
280 scented satinash
GCF_900635055.1		 42,531
(12.21 %)		 15,353
(3.67 %)		 53,811
(20.61 %)		 n/a 40.64
(89.65 %)		 11,862
(10.35 %)		 19,039
(100.00 %)		 179,421
(2.10 %)		 174,902
(3.34 %)		 1,785,894
(25.35 %)		 55,685
(7.69 %)
281 sesame
GCF_000512975.1		 38,693
(16.95 %)		 15,555
(5.41 %)		 35,316
(19.66 %)		 n/a 35.00
(98.34 %)		 9,940
(1.66 %)		 26,176
(98.34 %)		 161,123
(2.85 %)		 79,750
(3.97 %)		 1,807,029
(31.02 %)		 9,873
(1.80 %)
282 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1		 n/a 16,242
(4.30 %)		 39,583
(17.06 %)		 n/a 35.22
(98.66 %)		 2,946
(1.35 %)		 1,451
(100.00 %)		 253,228
(3.98 %)		 186,657
(9.89 %)		 1,792,662
(45.14 %)		 19,928
(3.29 %)
283 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1		 46,475
(12.62 %)		 17,469
(4.11 %)		 51,531
(21.75 %)		 n/a 40.30
(93.72 %)		 7,529
(6.28 %)		 15,781
(100.00 %)		 194,855
(2.07 %)		 116,828
(2.25 %)		 1,801,472
(25.38 %)		 44,191
(5.74 %)
284 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1		 43,419
(12.78 %)		 14,758
(4.01 %)		 41,180
(19.74 %)		 n/a 40.38
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 160,749
(1.91 %)		 114,741
(3.07 %)		 1,619,569
(28.25 %)		 43,290
(7.15 %)
285 silver poplar
GCF_005239225.1		 53,066
(14.64 %)		 20,299
(4.74 %)		 44,556
(16.36 %)		 n/a 33.75
(100.00 %)		 n/a 1,287
(100.00 %)		 309,097
(3.34 %)		 175,288
(4.77 %)		 2,457,634
(38.38 %)		 4,613
(0.67 %)
286 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1		 28,734
(15.21 %)		 13,143
(5.29 %)		 32,007
(22.39 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 89,958
(1.86 %)		 351,649
(15.29 %)		 884,646
(35.58 %)		 14,711
(4.52 %)
287 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3		 48,290
(8.57 %)		 17,901
(3.45 %)		 73,969
(19.64 %)		 n/a 43.88
(95.30 %)		 3,906
(4.70 %)		 4,775
(95.30 %)		 556,607
(65.39 %)		 177,271
(4.54 %)		 2,371,199
(48.20 %)		 110,115
(18.82 %)
288 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1		 n/a 18,138
(3.63 %)		 75,180
(20.67 %)		 n/a 43.67
(97.96 %)		 2,108
(2.04 %)		 308
(100.00 %)		 559,950
(63.17 %)		 156,952
(3.01 %)		 2,481,716
(46.70 %)		 109,923
(19.06 %)
289 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6		 88,006
(9.87 %)		 27,705
(3.08 %)		 77,033
(11.88 %)		 n/a 34.74
(97.36 %)		 8,918
(2.65 %)		 9,199
(97.35 %)		 848,398
(38.02 %)		 434,042
(5.29 %)		 5,346,884
(45.07 %)		 35,893
(1.55 %)
290 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1		 n/a 27,960
(2.93 %)		 77,762
(11.36 %)		 n/a 35.02
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 549,577
(2.73 %)		 453,208
(9.60 %)		 5,325,393
(48.31 %)		 36,641
(1.53 %)
291 spider flower
GCF_000463585.1		 45,524
(22.00 %)		 21,103
(10.40 %)		 38,184
(27.17 %)		 n/a 39.40
(87.71 %)		 24,824
(12.32 %)		 37,073
(87.68 %)		 144,827
(3.22 %)		 103,970
(4.10 %)		 1,118,840
(31.64 %)		 29,313
(6.47 %)
292 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1		 41,411
(5.75 %)		 12,540
(1.38 %)		 68,522
(12.26 %)		 n/a 37.82
(95.53 %)		 137,086
(4.48 %)		 78,263
(100.00 %)		 374,336
(2.48 %)		 670,331
(6.78 %)		 3,213,561
(52.82 %)		 89,520
(4.54 %)
293 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1		 58,433
(7.11 %)		 12,431
(1.27 %)		 61,084
(11.35 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 246
(100.00 %)		 378,521
(2.27 %)		 722,814
(6.29 %)		 2,950,586
(58.17 %)		 92,256
(5.21 %)
294 spotted monkey flower
GCF_000504015.1		 34,441
(15.56 %)		 14,508
(4.41 %)		 34,904
(18.83 %)		 n/a 35.50
(93.50 %)		 15,528
(6.52 %)		 17,740
(93.48 %)		 227,143
(4.28 %)		 204,234
(11.85 %)		 1,776,879
(40.60 %)		 21,718
(3.89 %)
295 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5		 52,765
(10.63 %)		 8,496
(1.48 %)		 30,423
(12.59 %)		 n/a 33.71
(99.04 %)		 1,794
(0.96 %)		 359
(100.00 %)		 293,130
(2.79 %)		 242,633
(2.68 %)		 2,405,680
(52.61 %)		 22,672
(3.11 %)
296 stiff brome
GCF_000005505.3		 47,531
(20.35 %)		 15,530
(6.01 %)		 45,735
(34.29 %)		 n/a 46.40
(99.84 %)		 27
(0.16 %)		 36
(99.84 %)		 108,976
(17.41 %)		 54,391
(1.94 %)		 1,197,052
(21.34 %)		 48,209
(34.43 %)
297 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1		 n/a 15,045
(1.35 %)		 164,045
(15.16 %)		 n/a 38.82
(94.24 %)		 89,898
(5.63 %)		 714,282
(94.37 %)		 278,640
(1.91 %)		 388,660
(6.94 %)		 3,639,568
(28.92 %)		 64,180
(3.80 %)
298 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1		 n/a 18,847
(4.51 %)		 76,529
(27.07 %)		 n/a 45.11
(99.96 %)		 1,423
(0.03 %)		 7,128
(99.97 %)		 258,594
(29.31 %)		 144,716
(2.51 %)		 1,976,510
(35.41 %)		 113,324
(26.96 %)
299 sweet cherry
GCF_002207925.1		 39,968
(19.06 %)		 15,007
(5.83 %)		 38,107
(23.61 %)		 n/a 37.72
(90.64 %)		 22,628
(9.39 %)		 10,148
(100.00 %)		 136,700
(2.47 %)		 104,376
(7.20 %)		 1,484,591
(25.20 %)		 9,956
(2.27 %)
300 sweet orange
GCF_000317415.1		 46,820
(15.94 %)		 14,390
(4.63 %)		 34,480
(18.04 %)		 n/a 34.07
(91.90 %)		 12,539
(8.11 %)		 17,383
(91.89 %)		 185,212
(2.95 %)		 104,182
(4.92 %)		 2,119,183
(29.53 %)		 6,540
(0.93 %)
301 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2		 n/a 23,319
(2.45 %)		 98,107
(18.19 %)		 n/a 35.14
(88.01 %)		 171,925
(12.06 %)		 28,461
(100.00 %)		 579,745
(3.87 %)		 473,175
(3.79 %)		 4,850,126
(32.44 %)		 52,715
(3.15 %)
302 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1		 n/a 22,279
(1.15 %)		 121,694
(10.54 %)		 n/a 35.34
(91.81 %)		 275,710
(8.22 %)		 314,564
(91.78 %)		 856,470
(2.64 %)		 970,252
(5.69 %)		 7,570,175
(42.39 %)		 29,072
(0.54 %)
303 switchgrass
GCF_016808335.1		 114,876
(10.54 %)		 31,534
(3.21 %)		 152,844
(27.54 %)		 n/a 46.79
(99.59 %)		 464
(0.41 %)		 1,091
(99.59 %)		 395,905
(1.77 %)		 323,173
(5.10 %)		 4,922,182
(39.47 %)		 213,249
(32.45 %)
304 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1		 n/a 15,605
(2.84 %)		 50,437
(14.57 %)		 n/a 38.53
(96.71 %)		 2,456
(3.29 %)		 7,020
(100.00 %)		 257,784
(2.74 %)		 211,756
(3.88 %)		 2,209,417
(41.80 %)		 54,125
(5.80 %)
305 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1		 65,925
(7.32 %)		 16,247
(1.53 %)		 76,786
(13.23 %)		 n/a 39.37
(100.00 %)		 n/a 1,338
(100.00 %)		 1,968,661
(26.22 %)		 626,214
(13.70 %)		 4,298,324
(45.52 %)		 32,932
(4.92 %)
306 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4		 53,852
(40.10 %)		 26,582
(34.47 %)		 11,416
(18.70 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 68,517
(16.50 %)		 27,064
(2.77 %)		 749,005
(22.64 %)		 4,601
(1.63 %)
307 thunder duke vine
GCF_013401445.1		 56,436
(17.59 %)		 20,174
(5.61 %)		 42,326
(19.85 %)		 n/a 37.58
(99.96 %)		 146
(0.04 %)		 321
(100.00 %)		 125,395
(2.23 %)		 102,179
(22.89 %)		 1,226,273
(38.50 %)		 6,893
(1.71 %)
308 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1		 50,668
(2.79 %)		 17,479
(0.82 %)		 117,543
(8.63 %)		 n/a 40.23
(88.38 %)		 119,817
(11.63 %)		 37,194
(100.00 %)		 622,838
(1.51 %)		 788,520
(3.46 %)		 11,822,060
(48.66 %)		 174,838
(3.17 %)
309 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2		 66,966
(3.67 %)		 17,141
(1.02 %)		 81,513
(6.82 %)		 n/a 38.89
(97.29 %)		 213,074
(2.72 %)		 215,609
(97.29 %)		 486,556
(1.53 %)		 669,040
(5.52 %)		 10,446,746
(53.83 %)		 118,807
(2.33 %)
310 tomato (2024)
GCF_036512215.1		 59,947
(8.20 %)		 15,474
(1.94 %)		 40,638
(7.50 %)		 n/a 35.17
(99.99 %)		 166
(0.01 %)		 14
(100.00 %)		 333,077
(2.31 %)		 259,232
(7.09 %)		 5,402,596
(43.04 %)		 31,740
(4.85 %)
311 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5		 45,958
(6.93 %)		 15,425
(2.15 %)		 38,319
(7.54 %)		 n/a 34.12
(90.19 %)		 19,539
(9.82 %)		 3,066
(100.00 %)		 311,852
(2.14 %)		 229,773
(3.18 %)		 5,390,626
(35.26 %)		 25,196
(1.27 %)
312 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1		 n/a 22,795
(3.47 %)		 67,418
(16.40 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 347,375
(3.07 %)		 304,988
(3.96 %)		 3,119,641
(40.22 %)		 30,300
(3.29 %)
313 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1		 n/a 22,897
(3.50 %)		 67,595
(16.43 %)		 n/a 38.12
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 118
(100.00 %)		 344,928
(2.90 %)		 299,566
(3.87 %)		 3,139,734
(39.86 %)		 30,533
(2.95 %)
314 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1		 69,134
(4.11 %)		 20,169
(1.21 %)		 55,515
(4.75 %)		 n/a 35.17
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 948
(100.00 %)		 618,195
(1.97 %)		 622,748
(3.28 %)		 8,002,633
(61.80 %)		 27,646
(0.67 %)
315 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1		 53,446
(3.92 %)		 20,707
(1.29 %)		 56,318
(5.01 %)		 n/a 35.03
(92.12 %)		 45,768
(7.88 %)		 121,185
(92.12 %)		 618,119
(2.07 %)		 589,954
(3.54 %)		 8,098,351
(55.57 %)		 28,949
(0.57 %)
316 trilobed morning glory
GCF_003576645.1		 49,472
(13.00 %)		 16,803
(3.58 %)		 50,448
(18.68 %)		 n/a 35.68
(94.76 %)		 31,256
(5.25 %)		 17
(100.00 %)		 333,211
(3.67 %)		 335,317
(10.66 %)		 2,341,085
(36.54 %)		 27,290
(3.24 %)
317 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1		 40,834
(13.17 %)		 18,067
(4.25 %)		 53,196
(20.85 %)		 n/a 37.76
(99.88 %)		 4,668
(0.12 %)		 7,139
(100.00 %)		 169,406
(2.24 %)		 191,181
(4.26 %)		 2,052,731
(28.24 %)		 50,044
(9.42 %)
318 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2		 49,199
(16.33 %)		 14,451
(4.70 %)		 33,670
(18.59 %)		 n/a 34.22
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 184,421
(2.80 %)		 106,732
(3.28 %)		 1,996,057
(33.86 %)		 6,824
(1.28 %)
319 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2		 63,531
(8.16 %)		 16,883
(1.90 %)		 72,901
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,673
(0.23 %)		 2,002
(100.00 %)		 800,288
(3.71 %)		 460,119
(7.41 %)		 5,438,715
(37.84 %)		 19,628
(1.10 %)
320 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1		 n/a 13,357
(3.39 %)		 37,446
(17.24 %)		 n/a 37.56
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 244,573
(10.74 %)		 180,141
(13.98 %)		 1,184,686
(42.28 %)		 6,470
(2.86 %)
321 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1		 n/a 13,575
(3.44 %)		 38,113
(17.59 %)		 n/a 37.58
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 245,892
(11.25 %)		 158,855
(13.35 %)		 1,221,056
(41.58 %)		 6,436
(2.63 %)
322 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2		 48,839
(21.95 %)		 19,452
(7.44 %)		 35,987
(20.77 %)		 n/a 36.49
(94.38 %)		 49,199
(5.63 %)		 24,194
(100.00 %)		 181,473
(3.18 %)		 143,114
(7.42 %)		 1,614,901
(29.14 %)		 13,094
(2.48 %)
323 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1		 n/a 19,879
(3.81 %)		 38,349
(12.06 %)		 n/a 38.10
(100.00 %)		 216
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 116,633
(1.34 %)		 123,546
(2.75 %)		 2,308,826
(51.78 %)		 20,598
(2.37 %)
324 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2		 n/a 13,387
(3.57 %)		 27,414
(10.73 %)		 n/a 33.57
(98.45 %)		 245
(1.55 %)		 113
(100.00 %)		 292,830
(3.56 %)		 169,773
(2.91 %)		 2,260,362
(43.24 %)		 14,898
(1.47 %)
325 wax gourd
GCF_009727055.1		 40,406
(4.66 %)		 13,481
(1.43 %)		 43,071
(6.68 %)		 n/a 34.85
(98.39 %)		 24,524
(1.62 %)		 1,791
(100.00 %)		 481,638
(2.55 %)		 364,998
(3.11 %)		 6,236,506
(49.68 %)		 21,741
(0.93 %)
326 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1		 n/a 22,395
(3.96 %)		 101,555
(33.88 %)		 n/a 45.70
(99.78 %)		 2,245
(0.22 %)		 1,143
(100.00 %)		 206,645
(1.57 %)		 174,457
(2.79 %)		 2,244,665
(26.11 %)		 117,743
(29.88 %)
327 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1		 89,156
(3.16 %)		 15,292
(0.51 %)		 135,024
(8.39 %)		 n/a 38.77
(98.57 %)		 827
(1.43 %)		 720
(100.00 %)		 1,158,845
(2.32 %)		 1,353,517
(6.28 %)		 10,836,475
(64.19 %)		 161,610
(4.19 %)
328 white fonio (2020)
GCA_902806635.1		 n/a 33,011
(5.39 %)		 109,615
(30.77 %)		 n/a 45.47
(97.23 %)		 29,136
(2.79 %)		 29,155
(97.21 %)		 215,374
(1.42 %)		 159,137
(1.91 %)		 2,776,488
(28.15 %)		 136,308
(27.74 %)
329 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1		 n/a 21,959
(3.77 %)		 51,652
(20.18 %)		 n/a 36.92
(99.73 %)		 1,764
(0.27 %)		 3,171
(99.97 %)		 215,169
(3.21 %)		 247,660
(10.71 %)		 2,556,478
(43.72 %)		 14,520
(10.46 %)
330 white poplar (2024)
GCF_005239225.2		 53,525
(15.07 %)		 20,195
(4.72 %)		 44,116
(16.35 %)		 n/a 33.73
(99.86 %)		 1,182
(0.14 %)		 97
(100.00 %)		 307,548
(3.27 %)		 174,946
(4.79 %)		 2,453,000
(38.39 %)		 4,493
(0.61 %)
331 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1		 n/a 19,540
(4.79 %)		 41,183
(15.85 %)		 n/a 34.67
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 21
(100.00 %)		 265,758
(2.98 %)		 150,154
(12.12 %)		 2,138,699
(41.34 %)		 3,578
(0.99 %)
332 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1		 n/a 19,599
(4.60 %)		 42,133
(16.21 %)		 n/a 35.05
(100.00 %)		 n/a 27
(100.00 %)		 268,999
(2.93 %)		 165,404
(12.23 %)		 2,153,763
(42.62 %)		 5,857
(2.24 %)
333 white yam
GCF_009730915.1		 43,902
(7.41 %)		 13,647
(2.09 %)		 49,877
(12.79 %)		 n/a 36.25
(99.19 %)		 4,760
(0.81 %)		 2,254
(100.00 %)		 391,299
(3.19 %)		 258,918
(3.96 %)		 3,588,023
(40.59 %)		 28,929
(2.37 %)
334 wild cabbage
GCF_000695525.1		 66,716
(15.60 %)		 31,142
(8.08 %)		 103,348
(35.10 %)		 n/a 36.11
(91.23 %)		 52,140
(8.80 %)		 33,760
(99.98 %)		 197,515
(3.12 %)		 214,463
(4.43 %)		 2,535,207
(31.20 %)		 29,995
(2.99 %)
335 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2		 n/a 31,163
(6.66 %)		 79,290
(25.04 %)		 n/a 36.57
(98.21 %)		 135
(1.79 %)		 140
(100.00 %)		 273,972
(2.76 %)		 284,806
(6.41 %)		 2,750,803
(38.77 %)		 33,071
(3.37 %)
336 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1		 29,804
(16.68 %)		 13,252
(5.90 %)		 22,247
(14.89 %)		 n/a 32.94
(94.65 %)		 119,056
(5.55 %)		 6,074
(100.00 %)		 107,979
(2.19 %)		 67,029
(6.76 %)		 1,525,353
(32.45 %)		 2,481
(0.48 %)
337 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2		 131,285
(1.34 %)		 n/a 567,570
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,589
(3.31 %)		 148,296
(100.00 %)		 2,573,102
(1.23 %)		 2,990,888
(3.37 %)		 492,885
(96.69 %)		 2,220,880
(25.34 %)
338 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2		 53,171
(14.87 %)		 18,878
(4.31 %)		 45,554
(18.36 %)		 n/a 38.87
(82.70 %)		 22,178
(17.31 %)		 24,423
(82.71 %)		 214,040
(7.81 %)		 136,453
(2.42 %)		 1,656,678
(31.15 %)		 53,687
(8.28 %)
339 wild olive
GCF_002742605.1		 67,081
(6.69 %)		 19,793
(1.69 %)		 68,749
(9.17 %)		 n/a 35.40
(90.41 %)		 47,638
(9.59 %)		 41,226
(100.00 %)		 425,922
(1.79 %)		 378,656
(18.98 %)		 5,982,070
(40.81 %)		 12,534
(0.42 %)
340 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3		 57,163
(6.21 %)		 17,102
(1.68 %)		 76,760
(11.48 %)		 n/a 35.80
(88.03 %)		 135,554
(12.02 %)		 1,589
(100.00 %)		 596,136
(3.37 %)		 499,251
(3.39 %)		 5,279,103
(45.94 %)		 48,556
(1.91 %)
341 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2		 78,441
(5.58 %)		 16,952
(1.26 %)		 89,380
(9.95 %)		 n/a 36.84
(92.91 %)		 122,617
(7.13 %)		 997
(99.67 %)		 777,978
(3.35 %)		 619,944
(3.82 %)		 5,823,472
(53.61 %)		 79,537
(2.58 %)
342 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1		 67,384
(5.06 %)		 16,850
(1.28 %)		 83,780
(9.77 %)		 n/a 36.78
(93.48 %)		 14,157
(6.52 %)		 30
(100.00 %)		 767,054
(3.15 %)		 754,355
(3.89 %)		 5,146,558
(56.74 %)		 71,885
(2.45 %)
343 wild soybean
GCF_004193775.1		 81,537
(9.20 %)		 27,977
(2.99 %)		 78,144
(11.64 %)		 n/a 34.88
(97.58 %)		 752
(2.42 %)		 1,120
(100.00 %)		 551,217
(2.79 %)		 450,287
(6.65 %)		 5,379,409
(46.22 %)		 37,183
(1.52 %)
344 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1		 25,210
(19.38 %)		 13,996
(6.63 %)		 46,505
(35.89 %)		 n/a 38.40
(94.27 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,460
(94.25 %)		 71,057
(1.51 %)		 74,581
(2.78 %)		 1,034,180
(21.44 %)		 14,806
(3.21 %)
345 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1		 n/a 67,698
(2.77 %)		 385,590
(22.40 %)		 n/a 44.92
(99.75 %)		 76,230
(0.26 %)		 15,303
(100.00 %)		 1,015,234
(1.60 %)		 910,932
(3.64 %)		 10,425,387
(46.78 %)		 637,314
(24.52 %)
346 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1		 46,114
(5.99 %)		 15,458
(1.87 %)		 42,907
(7.63 %)		 n/a 34.50
(92.34 %)		 41,684
(7.67 %)		 41,696
(92.33 %)		 363,460
(2.48 %)		 271,129
(4.15 %)		 6,330,153
(36.93 %)		 19,639
(1.20 %)
347 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1		 n/a 17,733
(2.85 %)		 55,354
(14.76 %)		 n/a 34.32
(99.33 %)		 780
(0.67 %)		 683
(100.00 %)		 586,981
(35.31 %)		 275,412
(4.57 %)		 3,561,395
(35.28 %)		 14,172
(0.96 %)
348 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1		 n/a 14,109
(3.33 %)		 40,033
(15.32 %)		 n/a 34.56
(97.67 %)		 9,429
(2.34 %)		 21
(100.00 %)		 410,680
(35.69 %)		 189,467
(4.45 %)		 2,405,053
(34.36 %)		 10,620
(1.04 %)
349 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1		 46,430
(10.71 %)		 14,823
(2.93 %)		 44,674
(15.11 %)		 n/a 35.08
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 310,377
(2.83 %)		 242,451
(9.17 %)		 2,706,407
(38.52 %)		 11,751
(1.05 %)
350 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3		 46,797
(11.01 %)		 14,907
(3.07 %)		 44,949
(15.02 %)		 n/a 34.56
(96.91 %)		 13,440
(3.10 %)		 14,644
(96.90 %)		 462,807
(35.59 %)		 222,647
(4.83 %)		 2,745,513
(34.80 %)		 11,591
(1.00 %)
351 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1		 n/a 22,511
(18.61 %)		 30,519
(28.94 %)		 n/a 35.60
(90.69 %)		 22,839
(9.35 %)		 30,649
(90.65 %)		 86,568
(2.39 %)		 44,616
(2.78 %)		 1,035,105
(23.86 %)		 6,701
(1.74 %)
352 winter squash
GCF_002738345.1		 49,714
(19.34 %)		 18,860
(6.74 %)		 33,884
(18.55 %)		 n/a 36.33
(97.81 %)		 17,224
(2.20 %)		 8,299
(100.00 %)		 169,605
(3.09 %)		 134,380
(10.82 %)		 1,493,623
(35.66 %)		 12,619
(2.64 %)
353 wood tobacco
GCF_000393655.1		 58,358
(2.93 %)		 17,332
(0.82 %)		 111,663
(7.17 %)		 n/a 39.09
(92.17 %)		 338,901
(7.84 %)		 392,998
(92.16 %)		 598,929
(1.44 %)		 776,240
(4.57 %)		 13,228,149
(49.11 %)		 100,864
(1.49 %)
354 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1		 n/a 56,069
(8.51 %)		 138,660
(27.88 %)		 n/a 36.22
(79.66 %)		 22,714
(20.35 %)		 9,746
(100.00 %)		 367,321
(2.38 %)		 303,381
(3.03 %)		 4,551,648
(26.34 %)		 50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 354

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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 699 assemblies assembly stats track stats
Birds 453 assemblies assembly stats track stats
Fishes 509 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 343 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1476 assemblies assembly stats track stats
Plants 354 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3961 assemblies assembly stats track stats
Viruses 14995 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2663 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21659 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats