Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adzuki bean
GCF_001190045.1
40,475
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
2 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
3 algarrobo blanco
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
4 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
5 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
6 annual mercury (2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
7 apple
GCF_002114115.1
64,918
(11.39 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
8 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
9 barrel medic (2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
10 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,905
(14.29 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
11 beet (EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,718
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
12 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
13 black cottonwood
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
14 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
15 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
16 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,449
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
17 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
18 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
19 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
20 capsicum
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
21 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
22 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
23 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
24 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
25 eudicots chia (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
26 chickpea
GCF_000331145.1
41,971
(9.82 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
27 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
28 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
29 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
30 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
31 club-mosses
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
32 coffee C.arabica
GCF_003713225.1
80,738
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
33 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
34 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
35 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
36 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
37 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
38 common tobacco
GCF_000715135.1
100,805
(3.09 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
39 cork oak
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
40 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
41 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,180
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
42 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
43 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,519
(10.54 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
44 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
45 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
46 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
47 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
48 domesticated barley
GCF_904849725.1
63,294
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
49 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
50 East African water lily (v2 Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,101
(10.95 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
51 English oak (2022)
GCF_932294415.1
69,123
(8.58 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
52 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
53 eudicots bell pepper (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
54 eudicots J.microcarpa x regia (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
55 eudicots S.splendens huo1 (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,413
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
56 Euphrates poplar
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
57 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,682
(12.36 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
58 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
59 field mustard
GCF_000309985.2
73,446
(34.56 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
60 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
61 garden asparagus
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
62 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
63 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
64 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
65 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
66 green algae A.protothecoides 0710
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
67 green algae B.prasinos RCC1105
GCF_002220235.1
7,852
(82.09 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
68 green algae C.reinhardtii CC-503 cw92 (v2 2018)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
69 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
70 green algae C.subellipsoidea C-169
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
71 green algae C.variabilis NC64A
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
72 green algae M.commoda RCC299
GCF_000090985.2
n/a 1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
73 green algae M.neglectum SAG 48.87
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
74 green algae M.pusilla CCMP1545
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
75 green algae O.lucimarinus CCE9901
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
76 green algae O.tauri RCC4221
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
77 green algae V.carteri Eve
GCF_000143455.1
14,436
(21.51 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
78 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
79 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
80 eudicots Himalayan balsam
GCF_907164915.1
40,307
(7.38 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
81 horseweed
GCF_010389155.1
39,621
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
82 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
83 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
84 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,978
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
85 Japanese rice
GCF_001433935.1
53,556
(17.24 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
86 eudicots lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
117,703
(2.02 %)
87 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,525
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
88 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
89 maize
GCF_902167145.1
76,921
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
90 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
91 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
92 monocots
GCF_002575655.2
84,263
(2.17 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
93 mosses
GCF_000002425.4
55,129
(11.87 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
94 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
95 mung bean
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
96 muskmelon
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
97 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
98 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
99 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
100 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
101 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
102 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
103 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
104 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
105 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
106 eudicots Peruvian cotton
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
107 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
108 pineapple
GCF_001540865.1
43,024
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
109 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
110 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
111 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
112 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,670
(6.66 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
113 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
114 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,155
(20.86 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
115 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
116 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
117 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
118 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
119 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
120 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
121 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,762
(6.74 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
122 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
123 radish
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
23,381
(2.80 %)
124 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,997
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
125 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,583
(19.25 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
126 eudicots red clover (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
127 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,107
(1.58 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
128 eudicots rice bean (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
129 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
130 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
131 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
132 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
133 rubber tree
GCF_001654055.1
66,125
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
134 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
135 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
136 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
137 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
138 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
139 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
140 silver poplar
GCF_005239225.1
53,068
(14.65 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
141 silverweed (2022)
GCF_933775445.1
28,735
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
142 sorghum
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
143 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,003
(9.85 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
144 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
145 spinach
GCF_002007265.1
41,494
(5.76 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
146 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
147 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
148 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
149 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
150 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
151 thale cress
GCF_000001735.4
53,928
(40.16 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
152 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
153 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
154 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
155 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,847
(6.92 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
156 tree cotton
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
157 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
158 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
159 vegetable marrow
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
160 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
161 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
162 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,717
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
163 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
164 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
165 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
166 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
167 wild peanut A.duranensis
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
168 wild peanut A.ipaensis
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
169 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
170 wild strawberry
GCF_000184155.1
36,435
(23.91 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
171 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
172 wine grape
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
173 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
174 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
TOTALS:total assembly count 174

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 59 assemblies assembly stats track stats
Mammals 357 assemblies assembly stats track stats
Birds 175 assemblies assembly stats track stats
Fishes 195 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 76 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 470 assemblies assembly stats track stats
Plants 174 assemblies assembly stats track stats
Fungi 463 assemblies assembly stats track stats
Viruses 254 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 14 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 295 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 242 assemblies assembly stats track stats