Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1		 n/a 21,507
(2.72 %)		 60,050
(11.57 %)		 n/a 35.92
(99.97 %)		 2,344
(0.03 %)		 1,735
(100.00 %)		 430,950
(2.82 %)		 273,041
(3.10 %)		 4,895,011
(32.98 %)		 29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1		 71,407
(11.93 %)		 23,883
(3.45 %)		 59,407
(13.07 %)		 n/a 35.65
(99.64 %)		 710
(0.36 %)		 88
(100.00 %)		 430,287
(3.04 %)		 350,721
(4.29 %)		 3,875,064
(36.80 %)		 27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1		 40,475
(10.62 %)		 16,697
(3.71 %)		 47,542
(15.07 %)		 n/a 34.07
(96.37 %)		 21,264
(3.63 %)		 58,639
(96.37 %)		 257,290
(4.08 %)		 239,596
(6.43 %)		 2,925,469
(36.04 %)		 24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1		 50,883
(11.85 %)		 16,661
(3.75 %)		 45,945
(15.40 %)		 n/a 33.63
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 263,673
(3.52 %)		 264,113
(5.18 %)		 2,808,981
(37.65 %)		 20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1		 54,359
(4.64 %)		 16,693
(1.34 %)		 75,114
(9.09 %)		 n/a 37.42
(99.88 %)		 15,111
(0.12 %)		 14,905
(100.00 %)		 668,488
(2.42 %)		 511,720
(3.29 %)		 8,110,750
(42.79 %)		 50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1		 51,575
(5.06 %)		 16,948
(1.48 %)		 76,464
(9.29 %)		 n/a 37.21
(68.90 %)		 166,490
(31.14 %)		 202,468
(68.86 %)		 580,361
(3.63 %)		 445,124
(2.25 %)		 5,831,606
(30.77 %)		 75,576
(3.67 %)
7 African rice (2021)
GCF_000147395.1		 43,755
(15.95 %)		 16,224
(4.82 %)		 51,031
(25.64 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 178,763
(2.60 %)		 125,689
(4.18 %)		 1,761,585
(30.96 %)		 60,891
(21.37 %)
8 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1		 62,791
(10.08 %)		 25,423
(3.34 %)		 69,507
(14.55 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,087
(100.00 %)		 367,402
(2.31 %)		 175,862
(2.27 %)		 4,241,058
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
9 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2		 62,791
(10.08 %)		 25,443
(3.35 %)		 69,492
(14.56 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,085
(100.00 %)		 366,178
(2.25 %)		 175,852
(2.27 %)		 4,240,382
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
10 almond
GCF_902201215.1		 37,363
(19.64 %)		 14,509
(6.35 %)		 33,193
(24.70 %)		 n/a 37.65
(98.29 %)		 6,531
(1.72 %)		 1,700
(99.96 %)		 137,974
(2.59 %)		 100,386
(3.92 %)		 1,251,126
(26.07 %)		 10,893
(2.94 %)
11 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1		 47,801
(11.07 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
12 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2		 44,356
(10.99 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
13 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1		 73,172
(3.41 %)		 26,626
(1.10 %)		 228,260
(15.00 %)		 n/a 44.76
(99.87 %)		 31,919
(0.13 %)		 1,764
(100.00 %)		 639,429
(1.31 %)		 739,566
(3.57 %)		 6,976,583
(59.37 %)		 560,429
(28.70 %)
14 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1		 64,918
(11.39 %)		 22,530
(3.52 %)		 67,146
(16.22 %)		 n/a 38.04
(88.96 %)		 7,264
(11.05 %)		 807
(100.00 %)		 692,611
(50.77 %)		 322,556
(4.41 %)		 3,055,836
(35.69 %)		 25,923
(1.76 %)
15 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1		 n/a 16,583
(4.58 %)		 55,248
(25.46 %)		 n/a 43.36
(99.98 %)		 696
(0.02 %)		 615
(100.00 %)		 495,126
(50.28 %)		 124,567
(3.20 %)		 1,922,072
(32.59 %)		 65,220
(23.87 %)
16 Barbados nut
GCF_014843425.1		 33,622
(13.80 %)		 12,687
(4.63 %)		 26,511
(14.56 %)		 n/a 33.40
(99.60 %)		 2,151
(0.40 %)		 1,232
(100.00 %)		 281,490
(24.82 %)		 186,260
(5.65 %)		 2,028,357
(33.33 %)		 8,868
(1.38 %)
17 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1		 50,905
(14.29 %)		 16,712
(3.68 %)		 41,041
(14.51 %)		 n/a 33.43
(99.87 %)		 22
(0.13 %)		 42
(100.00 %)		 393,909
(27.89 %)		 175,427
(3.92 %)		 2,532,494
(37.64 %)		 3,384
(0.27 %)
18 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3		 48,865
(15.69 %)		 16,549
(3.99 %)		 40,316
(15.41 %)		 n/a 33.14
(94.48 %)		 8,785
(5.53 %)		 8,027
(94.47 %)		 366,709
(22.34 %)		 146,748
(2.80 %)		 2,549,499
(32.46 %)		 3,695
(0.65 %)
19 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1		 n/a 16,672
(3.96 %)		 40,032
(15.19 %)		 n/a 33.05
(99.32 %)		 107
(0.68 %)		 909
(100.00 %)		 381,065
(23.82 %)		 162,402
(3.97 %)		 2,490,028
(35.39 %)		 3,335
(0.34 %)
20 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1		 n/a 15,063
(1.43 %)		 65,125
(11.47 %)		 n/a 40.34
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 735,552
(11.30 %)		 567,295
(6.87 %)		 4,176,675
(45.56 %)		 66,834
(4.90 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1		 n/a 15,223
(1.43 %)		 65,769
(11.33 %)		 n/a 40.37
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 303
(100.00 %)		 744,623
(11.37 %)		 571,691
(7.15 %)		 4,217,655
(45.87 %)		 68,566
(4.96 %)
22 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1		 47,718
(9.45 %)		 11,911
(2.04 %)		 50,202
(16.78 %)		 n/a 35.86
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 42
(100.00 %)		 294,768
(3.41 %)		 341,699
(6.22 %)		 2,932,896
(35.20 %)		 25,364
(1.79 %)
23 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1		 45,481
(9.22 %)		 11,850
(2.05 %)		 49,071
(15.89 %)		 n/a 35.85
(94.03 %)		 3,200
(5.97 %)		 20
(100.00 %)		 290,870
(3.40 %)		 336,343
(5.76 %)		 2,901,079
(33.21 %)		 25,108
(1.67 %)
24 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1		 70,848
(2.17 %)		 15,922
(0.50 %)		 69,601
(2.75 %)		 n/a 34.91
(97.27 %)		 52,577
(2.73 %)		 81,202
(100.00 %)		 1,192,132
(1.94 %)		 1,097,384
(4.12 %)		 23,393,622
(47.64 %)		 19,517
(0.21 %)
25 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1		 n/a 13,887
(2.34 %)		 44,507
(14.12 %)		 n/a 37.97
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 2,350
(100.00 %)		 250,361
(2.10 %)		 231,118
(13.56 %)		 2,049,366
(44.58 %)		 22,527
(6.34 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2		 n/a 15,102
(2.62 %)		 47,553
(15.64 %)		 n/a 38.11
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 257,066
(2.22 %)		 226,514
(14.63 %)		 2,470,334
(38.37 %)		 21,415
(5.59 %)
27 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1		 57,539
(11.82 %)		 16,919
(2.98 %)		 64,687
(19.59 %)		 n/a 38.05
(99.97 %)		 1,625
(0.04 %)		 65
(100.00 %)		 236,645
(2.13 %)		 205,150
(5.19 %)		 2,202,942
(41.60 %)		 32,283
(3.44 %)
28 bitter melon
GCF_001995035.1		 31,725
(13.80 %)		 12,858
(4.62 %)		 30,539
(16.85 %)		 n/a 34.58
(92.32 %)		 109,310
(7.74 %)		 1,052
(100.00 %)		 162,837
(2.82 %)		 89,571
(2.03 %)		 1,951,167
(30.96 %)		 14,100
(2.00 %)
29 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1		 n/a 20,077
(4.66 %)		 43,061
(17.16 %)		 n/a 34.80
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 338
(100.00 %)		 267,110
(2.88 %)		 173,502
(6.32 %)		 2,366,759
(39.61 %)		 5,093
(4.11 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1		 n/a 19,804
(4.58 %)		 42,642
(17.03 %)		 n/a 34.85
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 132
(100.00 %)		 265,925
(2.85 %)		 174,688
(6.70 %)		 2,359,101
(40.07 %)		 4,963
(4.10 %)
31 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5		 59,542
(15.92 %)		 19,969
(4.99 %)		 41,581
(16.22 %)		 n/a 33.75
(99.85 %)		 59
(0.15 %)		 106
(99.85 %)		 257,833
(2.91 %)		 156,371
(4.50 %)		 2,423,627
(36.28 %)		 3,761
(0.66 %)
32 black tea
GCF_004153795.1		 101,253
(3.17 %)		 20,982
(0.66 %)		 156,999
(7.69 %)		 n/a 37.85
(92.12 %)		 79,329
(7.89 %)		 14,028
(100.00 %)		 1,926,995
(3.23 %)		 2,024,420
(8.06 %)		 17,959,098
(50.75 %)		 181,027
(2.79 %)
33 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2		 46,173
(12.87 %)		 15,187
(3.49 %)		 50,585
(20.61 %)		 n/a 40.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 72
(100.00 %)		 494,434
(48.54 %)		 220,571
(4.98 %)		 1,866,530
(29.09 %)		 59,325
(10.76 %)
34 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3		 n/a 46,431
(0.31 %)		 805,204
(7.93 %)		 n/a 46.09
(99.87 %)		 211,982
(0.14 %)		 70,316
(100.00 %)		 9,191,325
(44.14 %)		 5,086,953
(4.53 %)		 282,298
(99.86 %)		 3,241,124
(28.06 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1		 221,449
(1.62 %)		 n/a 763,380
(8.08 %)		 n/a 46.14
(98.27 %)		 214,799
(1.73 %)		 91,589
(100.00 %)		 8,660,189
(44.94 %)		 4,402,049
(3.94 %)		 306,386
(98.27 %)		 3,040,030
(27.48 %)
36 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1		 n/a n/a 751,576
(8.03 %)		 n/a 46.05
(98.12 %)		 693,028
(1.90 %)		 693,050
(98.10 %)		 8,420,935
(44.23 %)		 4,115,828
(3.69 %)		 693,050
(98.10 %)		 3,076,631
(26.41 %)
37 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1		 n/a n/a 773,766
(8.20 %)		 n/a 46.05
(100.00 %)		 1,407
(0.00 %)		 3,795
(100.00 %)		 8,703,192
(44.57 %)		 4,569,103
(5.20 %)		 5,202
(100.00 %)		 3,001,896
(28.00 %)
38 cacao
GCF_000208745.1		 34,727
(13.67 %)		 14,294
(4.65 %)		 29,216
(14.38 %)		 n/a 34.09
(94.31 %)		 11,787
(5.70 %)		 431
(100.00 %)		 206,049
(15.64 %)		 99,229
(2.66 %)		 1,933,579
(33.24 %)		 2,964
(0.34 %)
39 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1		 n/a 18,729
(3.22 %)		 57,374
(16.70 %)		 n/a 36.81
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 915
(100.00 %)		 421,731
(3.42 %)		 300,957
(5.54 %)		 2,794,242
(34.11 %)		 25,348
(3.39 %)
40 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1		 n/a 18,579
(3.26 %)		 56,295
(16.71 %)		 n/a 36.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 138
(100.00 %)		 414,129
(3.48 %)		 293,951
(5.95 %)		 3,055,420
(34.96 %)		 24,749
(4.05 %)
41 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1		 n/a 16,153
(1.86 %)		 68,653
(14.03 %)		 n/a 35.79
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 783,798
(4.17 %)		 456,025
(10.87 %)		 4,951,918
(40.76 %)		 21,783
(2.16 %)
42 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1		 n/a 15,836
(1.90 %)		 66,803
(13.99 %)		 n/a 35.77
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 762,029
(4.24 %)		 448,099
(10.97 %)		 4,784,968
(41.07 %)		 20,384
(2.28 %)
43 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1		 n/a 18,838
(1.94 %)		 71,211
(13.84 %)		 n/a 33.78
(99.91 %)		 8,772
(0.10 %)		 147
(100.00 %)		 643,488
(3.49 %)		 361,843
(3.63 %)		 4,074,440
(56.52 %)		 27,745
(1.31 %)
44 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1		 n/a 10,725
(1.71 %)		 41,537
(11.41 %)		 n/a 33.68
(100.00 %)		 n/a 11,110
(100.00 %)		 396,112
(4.11 %)		 221,932
(3.23 %)		 2,389,229
(59.21 %)		 17,045
(1.23 %)
45 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2		 39,696
(6.07 %)		 13,883
(1.80 %)		 50,556
(11.19 %)		 n/a 33.51
(84.07 %)		 843
(15.93 %)		 1,052
(84.07 %)		 496,648
(3.63 %)		 258,281
(2.28 %)		 3,594,433
(47.71 %)		 22,750
(1.69 %)
46 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2		 n/a 24,975
(1.79 %)		 113,252
(15.69 %)		 n/a 34.00
(100.00 %)		 n/a 3,372
(100.00 %)		 936,351
(4.13 %)		 520,230
(3.65 %)		 5,183,602
(58.66 %)		 47,327
(1.58 %)
47 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1		 n/a 15,253
(1.67 %)		 62,228
(12.57 %)		 n/a 34.08
(100.00 %)		 n/a 1,599
(100.00 %)		 595,917
(3.95 %)		 335,791
(3.38 %)		 3,478,519
(61.18 %)		 31,738
(1.57 %)
48 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1		 n/a 15,334
(1.80 %)		 60,140
(12.83 %)		 n/a 33.79
(99.92 %)		 2,496
(0.09 %)		 483
(100.00 %)		 567,458
(3.73 %)		 320,455
(3.12 %)		 3,403,771
(58.38 %)		 27,791
(1.48 %)
49 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1		 57,769
(2.07 %)		 16,114
(0.55 %)		 62,579
(2.93 %)		 n/a 34.94
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,799
(96.77 %)		 968,939
(3.15 %)		 948,741
(4.39 %)		 21,535,213
(46.15 %)		 16,685
(0.21 %)
50 carrot
GCF_001625215.1		 51,773
(15.95 %)		 16,649
(3.96 %)		 50,187
(20.50 %)		 n/a 34.79
(91.77 %)		 26,112
(8.24 %)		 4,826
(100.00 %)		 179,630
(2.41 %)		 166,060
(4.97 %)		 1,981,148
(31.51 %)		 8,564
(0.85 %)
51 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2		 60,116
(15.29 %)		 16,679
(3.49 %)		 51,607
(18.82 %)		 n/a 34.97
(99.99 %)		 554
(0.01 %)		 11
(100.00 %)		 195,035
(2.33 %)		 186,941
(8.11 %)		 2,018,050
(39.61 %)		 10,319
(1.14 %)
52 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1		 n/a 27,737
(2.70 %)		 78,774
(11.79 %)		 n/a 37.13
(76.51 %)		 36,478
(23.50 %)		 4,440
(100.00 %)		 584,617
(3.41 %)		 554,162
(3.52 %)		 4,126,060
(43.14 %)		 77,570
(1.78 %)
53 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2		 56,386
(9.38 %)		 18,790
(2.86 %)		 49,944
(11.73 %)		 n/a 37.52
(99.61 %)		 672
(0.39 %)		 758
(99.61 %)		 377,964
(3.52 %)		 356,023
(4.79 %)		 2,560,255
(56.85 %)		 52,506
(2.50 %)
54 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1		 33,377
(11.52 %)		 13,874
(4.00 %)		 33,656
(13.67 %)		 n/a 33.84
(96.11 %)		 23,313
(3.90 %)		 49,406
(96.10 %)		 207,850
(3.52 %)		 166,467
(10.85 %)		 1,676,921
(43.19 %)		 12,838
(2.54 %)
55 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1		 39,358
(13.36 %)		 13,841
(4.31 %)		 29,805
(14.24 %)		 n/a 33.03
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 140
(100.00 %)		 205,974
(3.02 %)		 128,354
(6.37 %)		 1,998,066
(39.24 %)		 7,216
(0.99 %)
56 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1		 n/a 3
(0.11 %)		 117
(7.42 %)		 n/a 39.35
(99.99 %)		 4
(0.01 %)		 35
(100.00 %)		 1,139
(3.04 %)		 1,677
(4.92 %)		 11,074
(10.60 %)		 76
(1.07 %)
57 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1		 n/a 6,487
(0.16 %)		 114,999
(4.12 %)		 n/a 37.82
(62.87 %)		 490,371
(37.15 %)		 1,116,784
(62.85 %)		 692,892
(1.67 %)		 790,165
(1.22 %)		 18,073,193
(31.20 %)		 24,414
(0.46 %)
58 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1		 53,262
(17.46 %)		 17,642
(4.97 %)		 49,474
(23.85 %)		 n/a 36.14
(99.81 %)		 3,756
(0.19 %)		 1,556
(100.00 %)		 156,083
(2.30 %)		 128,904
(3.10 %)		 2,112,137
(31.93 %)		 31,157
(5.92 %)
59 chickpea
GCF_000331145.1		 41,971
(9.82 %)		 15,685
(3.16 %)		 30,411
(8.82 %)		 n/a 31.04
(90.95 %)		 31,897
(9.07 %)		 39,024
(90.93 %)		 339,564
(10.51 %)		 318,439
(11.48 %)		 2,929,750
(43.82 %)		 3,488
(0.28 %)
60 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2		 66,337
(12.31 %)		 15,432
(2.83 %)		 67,569
(21.71 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 275,878
(2.26 %)		 229,333
(3.98 %)		 2,244,200
(35.17 %)		 37,317
(4.17 %)
61 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1		 n/a 23,898
(0.89 %)		 138,156
(8.52 %)		 n/a 40.10
(96.58 %)		 25,154
(3.42 %)		 35,781
(96.58 %)		 829,613
(1.78 %)		 1,793,985
(6.94 %)		 8,707,237
(62.53 %)		 317,707
(8.50 %)
62 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1		 54,029
(12.78 %)		 22,400
(4.38 %)		 57,140
(17.42 %)		 n/a 37.29
(97.86 %)		 24,384
(2.15 %)		 26,566
(97.85 %)		 368,808
(18.26 %)		 218,013
(4.36 %)		 2,456,496
(34.15 %)		 18,367
(1.88 %)
63 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1		 62,514
(13.83 %)		 22,289
(4.29 %)		 57,502
(17.16 %)		 n/a 37.35
(100.00 %)		 n/a 452
(100.00 %)		 290,077
(2.40 %)		 209,363
(3.56 %)		 2,519,627
(35.77 %)		 19,299
(1.84 %)
64 clementine
GCF_000493195.1		 36,454
(14.29 %)		 14,126
(4.66 %)		 32,820
(18.34 %)		 n/a 34.96
(97.94 %)		 7,564
(2.07 %)		 8,962
(97.93 %)		 178,443
(2.76 %)		 104,853
(5.57 %)		 1,933,079
(33.91 %)		 7,930
(3.80 %)
65 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1		 44,646
(5.40 %)		 15,784
(1.70 %)		 48,875
(7.66 %)		 n/a 35.83
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 347,467
(1.98 %)		 290,488
(4.50 %)		 6,293,084
(43.53 %)		 8,929
(0.83 %)
66 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4		 49,382
(28.03 %)		 11,312
(4.28 %)		 36,277
(36.82 %)		 n/a 45.22
(98.15 %)		 4,395
(1.86 %)		 5,152
(98.14 %)		 138,958
(36.90 %)		 77,054
(2.71 %)		 802,227
(32.19 %)		 34,479
(27.80 %)
67 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1		 n/a 6,316
(4.02 %)		 55,013
(41.57 %)		 n/a 44.70
(99.81 %)		 351
(0.00 %)		 106,265
(100.00 %)		 29,218
(1.24 %)		 29,377
(1.67 %)		 480,195
(13.66 %)		 19,392
(13.60 %)
68 coffee C.arabica
GCF_003713225.1		 80,738
(8.03 %)		 23,574
(2.02 %)		 85,662
(13.32 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 691
(0.21 %)		 2,833
(100.00 %)		 501,414
(2.11 %)		 386,209
(3.95 %)		 5,652,743
(41.66 %)		 36,398
(1.62 %)
69 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1		 43,829
(7.69 %)		 14,911
(2.02 %)		 57,408
(14.42 %)		 n/a 36.89
(97.92 %)		 3,482
(2.08 %)		 3,530
(100.00 %)		 312,360
(2.09 %)		 234,658
(3.24 %)		 3,464,594
(38.91 %)		 21,553
(1.54 %)
70 common bean
GCF_000499845.1		 32,720
(9.56 %)		 16,474
(3.53 %)		 45,055
(14.46 %)		 n/a 34.96
(90.70 %)		 40,860
(9.33 %)		 41,568
(90.67 %)		 233,709
(2.97 %)		 208,045
(3.61 %)		 2,886,693
(37.28 %)		 38,054
(5.05 %)
71 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1		 n/a 14,992
(4.28 %)		 36,350
(16.84 %)		 n/a 34.41
(99.99 %)		 394
(0.01 %)		 905
(99.99 %)		 475,247
(5.76 %)		 230,646
(4.36 %)		 2,425,030
(37.74 %)		 18,611
(3.41 %)
72 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1		 49,622
(12.72 %)		 14,929
(3.58 %)		 32,981
(12.20 %)		 n/a 33.07
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 525,520
(5.43 %)		 225,151
(3.91 %)		 2,463,587
(42.86 %)		 13,018
(1.79 %)
73 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1		 49,976
(13.24 %)		 16,949
(3.79 %)		 38,488
(13.47 %)		 n/a 33.40
(95.35 %)		 24,158
(4.67 %)		 28,947
(95.33 %)		 525,525
(5.37 %)		 246,475
(5.25 %)		 2,603,240
(38.46 %)		 13,597
(2.11 %)
74 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1		 51,464
(13.54 %)		 14,443
(3.56 %)		 31,633
(12.06 %)		 n/a 33.20
(100.00 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 516,010
(5.54 %)		 234,395
(5.05 %)		 2,319,259
(43.64 %)		 12,926
(2.66 %)
75 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1		 65,051
(8.85 %)		 26,142
(3.49 %)		 114,639
(23.87 %)		 n/a 44.17
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 243,799
(1.41 %)		 237,530
(2.79 %)		 4,477,357
(31.45 %)		 154,087
(19.32 %)
76 common sunflower
GCF_002127325.2		 133,319
(3.74 %)		 19,514
(0.59 %)		 166,187
(9.16 %)		 n/a 38.59
(97.94 %)		 2,384
(2.06 %)		 334
(100.00 %)		 1,263,836
(2.20 %)		 1,549,598
(4.15 %)		 12,728,097
(58.39 %)		 170,287
(2.39 %)
77 common tobacco
GCF_000715135.1		 100,805
(3.09 %)		 29,968
(0.80 %)		 184,998
(7.05 %)		 n/a 38.95
(97.11 %)		 292,325
(2.90 %)		 292,601
(97.11 %)		 1,134,202
(3.09 %)		 1,268,208
(4.45 %)		 24,013,710
(52.08 %)		 204,914
(1.84 %)
78 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2		 53,587
(7.04 %)		 17,804
(1.85 %)		 77,741
(13.65 %)		 n/a 35.35
(97.95 %)		 25,649
(2.05 %)		 22,642
(100.00 %)		 860,049
(3.78 %)		 485,854
(6.14 %)		 5,989,180
(36.35 %)		 20,674
(1.12 %)
79 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3		 56,406
(8.63 %)		 16,303
(2.05 %)		 63,990
(13.73 %)		 n/a 34.91
(95.70 %)		 26,066
(4.30 %)		 28,407
(95.70 %)		 743,470
(3.99 %)		 393,077
(5.53 %)		 4,897,193
(34.87 %)		 16,140
(0.90 %)
80 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1		 112,410
(5.51 %)		 35,047
(1.61 %)		 101,814
(6.75 %)		 n/a 34.45
(97.16 %)		 48,742
(2.84 %)		 57,884
(97.16 %)		 829,774
(2.69 %)		 808,839
(3.64 %)		 12,556,104
(52.01 %)		 31,946
(0.61 %)
81 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1		 154,180
(6.02 %)		 37,839
(1.61 %)		 107,764
(6.56 %)		 n/a 34.36
(99.87 %)		 5,708
(0.13 %)		 6,735
(99.87 %)		 996,701
(2.36 %)		 903,817
(3.56 %)		 13,123,355
(54.75 %)		 35,220
(0.59 %)
82 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1		 72,590
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 86,941
(18.36 %)		 n/a 33.22
(98.25 %)		 19,717
(1.76 %)		 20,751
(98.24 %)		 367,610
(3.53 %)		 300,200
(3.32 %)		 5,199,574
(40.83 %)		 10,926
(0.55 %)
83 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2		 48,519
(10.54 %)		 16,925
(3.30 %)		 44,689
(13.01 %)		 n/a 32.95
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 676
(100.00 %)		 344,688
(3.92 %)		 283,941
(8.14 %)		 3,091,888
(41.66 %)		 24,507
(2.34 %)
84 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1		 49,636
(19.79 %)		 18,863
(6.83 %)		 34,588
(19.24 %)		 n/a 36.43
(97.43 %)		 13,813
(2.58 %)		 3,500
(100.00 %)		 181,838
(3.12 %)		 140,936
(7.42 %)		 1,550,544
(33.30 %)		 13,714
(2.69 %)
85 cucumber
GCF_000004075.3		 37,079
(18.45 %)		 13,349
(5.61 %)		 23,889
(15.73 %)		 n/a 32.84
(99.98 %)		 89
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 158,454
(3.72 %)		 77,247
(3.20 %)		 1,739,467
(33.72 %)		 5,730
(1.35 %)
86 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1		 n/a 14,128
(1.63 %)		 42,460
(7.33 %)		 n/a 30.78
(99.98 %)		 2,018
(0.02 %)		 668
(100.00 %)		 377,357
(3.69 %)		 183,159
(2.82 %)		 5,560,199
(36.58 %)		 30,878
(2.75 %)
87 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1		 n/a 13,933
(1.63 %)		 40,035
(6.93 %)		 n/a 30.80
(99.98 %)		 1,977
(0.02 %)		 667
(100.00 %)		 373,612
(3.67 %)		 181,531
(2.84 %)		 5,483,268
(36.45 %)		 30,829
(2.75 %)
88 damask rose (2016)
GCA_001662545.1		 n/a 16,060
(1.87 %)		 117,610
(18.87 %)		 n/a 38.73
(97.06 %)		 101,982
(2.91 %)		 409,854
(97.09 %)		 329,911
(1.95 %)		 258,478
(2.82 %)		 3,747,902
(31.42 %)		 48,987
(3.05 %)
89 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1		 61,678
(8.40 %)		 18,582
(2.20 %)		 70,121
(14.29 %)		 n/a 40.29
(100.00 %)		 317
(0.00 %)		 2,391
(100.00 %)		 431,923
(8.92 %)		 371,389
(4.19 %)		 2,721,501
(44.16 %)		 89,481
(12.47 %)
90 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1		 48,949
(10.55 %)		 16,697
(2.99 %)		 64,523
(16.24 %)		 n/a 39.33
(91.22 %)		 64,723
(8.79 %)		 143,382
(91.21 %)		 284,003
(7.58 %)		 185,641
(2.23 %)		 2,574,645
(27.52 %)		 62,332
(7.21 %)
91 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1		 48,204
(8.04 %)		 15,110
(2.28 %)		 57,536
(14.48 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 606
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 445,970
(3.39 %)		 319,468
(5.39 %)		 3,687,072
(36.31 %)		 41,402
(3.02 %)
92 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1		 193,799
(12.81 %)		 52,060
(3.07 %)		 144,859
(15.37 %)		 n/a 39.78
(99.99 %)		 219
(0.01 %)		 1,085
(100.00 %)		 713,274
(2.40 %)		 840,280
(6.39 %)		 4,419,734
(51.60 %)		 203,906
(13.78 %)
93 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1		 63,294
(1.67 %)		 17,849
(0.43 %)		 260,921
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 291
(100.00 %)		 2,720,197
(55.13 %)		 1,726,335
(5.40 %)		 14,010,390
(72.58 %)		 732,834
(17.24 %)
94 durian
GCF_002303985.1		 68,467
(10.35 %)		 24,627
(3.34 %)		 48,130
(9.41 %)		 n/a 32.64
(99.58 %)		 3,044
(0.43 %)		 677
(100.00 %)		 490,482
(3.80 %)		 509,842
(12.92 %)		 4,397,155
(48.22 %)		 56,957
(6.23 %)
95 eggplant (2014)
GCA_000787875.1		 n/a 15,481
(1.92 %)		 48,974
(7.98 %)		 n/a 35.72
(95.30 %)		 118,249
(4.75 %)		 143,048
(95.25 %)		 317,711
(2.21 %)		 307,772
(4.55 %)		 6,006,653
(38.61 %)		 7,570
(0.50 %)
96 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1		 69,123
(8.58 %)		 15,792
(1.92 %)		 66,872
(14.31 %)		 n/a 35.68
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 773,652
(4.18 %)		 429,695
(8.87 %)		 4,823,216
(39.65 %)		 21,654
(2.15 %)
97 English walnut
GCF_001411555.2		 52,962
(10.18 %)		 18,927
(3.19 %)		 60,210
(17.37 %)		 n/a 36.21
(99.89 %)		 1,051
(0.11 %)		 24,757
(100.00 %)		 434,989
(3.86 %)		 303,673
(3.70 %)		 3,318,114
(33.94 %)		 24,028
(1.83 %)
98 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1		 42,218
(10.92 %)		 14,784
(3.18 %)		 46,293
(16.46 %)		 n/a 36.73
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 433,802
(3.92 %)		 270,411
(4.15 %)		 2,634,547
(36.26 %)		 29,535
(3.72 %)
99 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1		 47,822
(7.37 %)		 14,132
(1.76 %)		 52,606
(11.89 %)		 n/a 34.09
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 490,095
(3.26 %)		 291,432
(3.68 %)		 3,197,241
(60.23 %)		 29,385
(2.13 %)
100 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1		 54,052
(4.78 %)		 14,372
(1.33 %)		 80,776
(14.35 %)		 n/a 36.88
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 496,928
(2.45 %)		 491,703
(4.75 %)		 4,850,176
(50.53 %)		 57,897
(3.26 %)
101 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1		 45,049
(8.43 %)		 18,010
(3.03 %)		 54,840
(15.32 %)		 n/a 35.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 5,089
(100.00 %)		 397,210
(3.11 %)		 254,173
(4.10 %)		 3,228,435
(42.44 %)		 15,343
(0.97 %)
102 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1		 55,369
(16.07 %)		 19,591
(4.65 %)		 41,748
(16.14 %)		 n/a 34.95
(99.99 %)		 277
(0.01 %)		 21
(100.00 %)		 256,070
(2.83 %)		 178,940
(8.44 %)		 2,317,187
(40.87 %)		 3,317
(6.62 %)
103 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1		 62,563
(15.19 %)		 15,236
(3.45 %)		 60,387
(23.53 %)		 n/a 39.30
(99.95 %)		 1,014
(0.05 %)		 77
(100.00 %)		 226,730
(2.23 %)		 196,099
(4.12 %)		 1,632,269
(33.79 %)		 38,448
(5.69 %)
104 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2		 56,366
(12.92 %)		 20,853
(4.29 %)		 41,483
(12.40 %)		 n/a 32.05
(95.31 %)		 22,764
(4.70 %)		 32,266
(95.30 %)		 357,310
(3.64 %)		 246,638
(4.06 %)		 2,660,781
(43.22 %)		 2,691
(0.38 %)
105 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2		 77,682
(12.36 %)		 22,539
(3.42 %)		 67,761
(16.26 %)		 n/a 38.07
(99.99 %)		 101
(0.01 %)		 34
(100.00 %)		 309,302
(2.18 %)		 331,724
(5.06 %)		 2,996,468
(41.19 %)		 25,597
(2.08 %)
106 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1		 39,127
(13.03 %)		 15,600
(4.11 %)		 42,096
(18.23 %)		 n/a 35.90
(99.54 %)		 14,532
(0.48 %)		 12
(100.00 %)		 358,479
(3.69 %)		 179,807
(3.40 %)		 2,234,313
(32.05 %)		 12,963
(1.47 %)
107 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1		 72,613
(2.92 %)		 14,868
(0.56 %)		 135,918
(7.87 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 319
(100.00 %)		 1,077,704
(2.26 %)		 853,368
(5.27 %)		 13,477,464
(61.64 %)		 152,063
(4.18 %)
108 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1		 n/a 17,158
(0.86 %)		 191,202
(13.47 %)		 n/a 38.57
(86.69 %)		 530,762
(13.34 %)		 292,698
(86.67 %)		 770,031
(2.12 %)		 637,135
(3.75 %)		 13,484,203
(41.57 %)		 81,500
(2.36 %)
109 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1		 n/a 12,110
(0.01 %)		 960,545
(1.07 %)		 n/a 31.25
(100.00 %)		 6,368
(0.00 %)		 5,951
(100.00 %)		 61,111,090
(11.87 %)		 29,667,857
(2.75 %)		 11,464
(100.00 %)		 1,680,995
(2.36 %)
110 false flax
GCF_000633955.1		 123,030
(22.63 %)		 61,894
(13.77 %)		 113,219
(31.09 %)		 n/a 36.55
(92.99 %)		 74,428
(7.02 %)		 37,780
(99.99 %)		 346,267
(2.46 %)		 233,837
(5.56 %)		 3,452,066
(27.34 %)		 32,235
(2.62 %)
111 field mustard
GCF_000309985.2		 73,446
(34.56 %)		 30,193
(10.12 %)		 57,010
(25.57 %)		 n/a 36.83
(99.39 %)		 408
(0.61 %)		 1,100
(100.00 %)		 261,522
(15.13 %)		 196,553
(8.43 %)		 1,533,242
(38.01 %)		 24,895
(5.44 %)
112 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1		 n/a 30,000
(2.41 %)		 346,692
(27.97 %)		 n/a 45.34
(98.74 %)		 507,646
(1.30 %)		 1,033,269
(98.70 %)		 323,234
(1.19 %)		 394,943
(6.28 %)		 6,129,348
(33.00 %)		 325,103
(21.18 %)
113 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1		 63,465
(6.03 %)		 17,263
(1.31 %)		 78,564
(9.37 %)		 n/a 35.95
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 459
(100.00 %)		 982,341
(3.33 %)		 719,891
(7.87 %)		 6,810,592
(50.46 %)		 27,883
(2.10 %)
114 foxtail millet
GCF_000263155.2		 40,951
(13.47 %)		 17,758
(5.07 %)		 60,598
(30.59 %)		 n/a 46.14
(98.82 %)		 6,442
(1.19 %)		 6,779
(98.81 %)		 115,365
(1.46 %)		 116,980
(2.45 %)		 1,691,260
(29.31 %)		 78,297
(28.27 %)
115 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1		 45,159
(4.02 %)		 13,440
(1.02 %)		 85,207
(11.07 %)		 n/a 39.02
(97.02 %)		 47,391
(2.99 %)		 56,182
(97.01 %)		 427,496
(2.02 %)		 885,946
(8.32 %)		 6,075,356
(46.49 %)		 111,109
(6.80 %)
116 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4		 69,048
(2.69 %)		 16,407
(0.56 %)		 105,654
(5.75 %)		 n/a 37.92
(99.95 %)		 384
(0.05 %)		 93
(100.00 %)		 1,192,578
(2.37 %)		 1,282,344
(4.72 %)		 12,843,881
(61.50 %)		 160,781
(2.86 %)
117 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1		 74,264
(1.88 %)		 17,744
(0.43 %)		 129,692
(4.97 %)		 n/a 37.94
(99.73 %)		 826
(0.27 %)		 1,566
(100.00 %)		 1,517,586
(2.16 %)		 1,541,702
(5.89 %)		 13,206,825
(66.95 %)		 105,766
(0.97 %)
118 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1		 43,473
(2.84 %)		 13,544
(0.88 %)		 64,877
(5.24 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 596
(0.00 %)		 510
(100.00 %)		 1,556,970
(22.50 %)		 788,188
(5.25 %)		 10,081,845
(53.72 %)		 41,032
(1.09 %)
119 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1		 59,652
(8.73 %)		 18,917
(2.55 %)		 47,052
(9.22 %)		 n/a 32.09
(99.98 %)		 1,693
(0.02 %)		 2,266
(100.00 %)		 452,206
(3.00 %)		 195,931
(2.27 %)		 4,921,469
(39.63 %)		 9,731
(0.69 %)
120 ginger
GCF_018446385.1		 127,579
(4.07 %)		 33,995
(0.96 %)		 186,756
(7.79 %)		 n/a 39.16
(100.00 %)		 901
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,187,168
(2.18 %)		 2,088,683
(6.47 %)		 12,917,773
(61.42 %)		 398,512
(10.38 %)
121 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2		 42,106
(6.72 %)		 15,819
(2.23 %)		 49,753
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,402
(9.76 %)		 13,479
(99.93 %)		 394,793
(2.75 %)		 364,336
(3.37 %)		 4,190,750
(39.49 %)		 12,198
(0.64 %)
122 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1		 87,385
(2.18 %)		 17,963
(0.44 %)		 263,708
(10.29 %)		 n/a 46.32
(97.73 %)		 107,163
(2.27 %)		 109,126
(100.00 %)		 1,490,873
(15.60 %)		 1,415,562
(5.65 %)		 12,540,551
(71.59 %)		 881,849
(29.81 %)
123 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1		 69,195
(1.77 %)		 18,614
(0.43 %)		 300,274
(11.28 %)		 n/a 46.38
(100.00 %)		 n/a 68,537
(100.00 %)		 1,555,328
(15.65 %)		 1,485,488
(4.71 %)		 13,133,338
(73.17 %)		 928,327
(30.84 %)
124 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1		 69,722
(4.35 %)		 17,353
(1.01 %)		 81,347
(7.68 %)		 n/a 38.10
(99.95 %)		 1,565
(0.05 %)		 166
(100.00 %)		 816,909
(2.29 %)		 708,412
(4.09 %)		 8,106,901
(53.67 %)		 66,433
(1.82 %)
125 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1		 n/a 21,161
(2.89 %)		 55,843
(11.78 %)		 n/a 35.63
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 2,366
(99.99 %)		 423,518
(2.92 %)		 293,299
(3.76 %)		 4,466,312
(33.71 %)		 25,250
(1.74 %)
126 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1		 n/a 22,332
(3.88 %)		 51,709
(13.62 %)		 n/a 35.31
(96.44 %)		 25,521
(3.57 %)		 1,234
(100.00 %)		 347,035
(2.87 %)		 241,862
(4.11 %)		 3,578,217
(30.95 %)		 19,259
(1.41 %)
127 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1		 n/a 10,023
(7.00 %)		 16,353
(26.89 %)		 n/a 42.30
(92.78 %)		 89,257
(7.32 %)		 89,277
(92.68 %)		 80,787
(2.86 %)		 45,432
(1.93 %)		 786,155
(19.70 %)		 19,057
(20.99 %)
128 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4		 10,237
(66.85 %)		 988
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 37,284
(8.77 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 43
(99.34 %)
129 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1		 n/a 2,016
(0.62 %)		 31,585
(41.01 %)		 n/a 57.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,614
(100.00 %)		 183,076
(3.30 %)		 101,860
(5.85 %)		 972,524
(32.54 %)		 4,760
(98.23 %)
130 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1		 n/a 1,365
(1.08 %)		 11,070
(58.24 %)		 n/a 55.95
(98.44 %)		 780
(1.56 %)		 597
(100.00 %)		 25,537
(1.66 %)		 27,257
(3.92 %)		 365,387
(19.48 %)		 3,732
(86.39 %)
131 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1		 7,014
(37.71 %)		 966
(2.72 %)		 2,947
(70.38 %)		 n/a 63.54
(95.35 %)		 1,012
(4.66 %)		 1,386
(95.34 %)		 8,655
(1.88 %)		 3,803
(1.89 %)		 147,537
(20.31 %)		 604
(53.91 %)
132 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1		 7,852
(82.09 %)		 1,231
(6.04 %)		 4,460
(76.24 %)		 n/a 48.02
(99.76 %)		 20
(0.24 %)		 21
(100.00 %)		 17,900
(4.88 %)		 5,674
(1.75 %)		 113,699
(21.91 %)		 7
(0.01 %)
133 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1		 n/a 1,057
(0.55 %)		 9,735
(58.02 %)		 n/a 64.03
(100.00 %)		 n/a 17
(100.00 %)		 166,909
(9.00 %)		 120,034
(10.13 %)		 750,946
(37.60 %)		 166
(99.31 %)
134 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2		 19,527
(53.99 %)		 990
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 174,119
(17.13 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 92
(46.06 %)
135 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1		 9,839
(29.70 %)		 1,307
(1.78 %)		 8,108
(53.71 %)		 n/a 52.94
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 8,446
(0.85 %)		 5,471
(0.85 %)		 265,761
(14.34 %)		 11,329
(19.64 %)
136 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1		 9,780
(32.79 %)		 744
(1.00 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 64,770
(8.22 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 756
(45.48 %)
137 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1		 n/a 2,471
(1.78 %)		 14,771
(54.27 %)		 n/a 52.42
(98.98 %)		 2,081
(1.02 %)		 3,731
(98.98 %)		 10,051
(0.46 %)		 14,278
(1.14 %)		 388,120
(8.55 %)		 8,698
(83.31 %)
138 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2		 n/a 1,301
(4.51 %)		 5,667
(86.20 %)		 n/a 63.82
(100.00 %)		 n/a 19
(100.00 %)		 14,619
(3.58 %)		 8,937
(2.75 %)		 178,499
(27.69 %)		 10
(25.23 %)
139 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1		 16,734
(25.96 %)		 666
(0.47 %)		 12,122
(60.02 %)		 n/a 64.75
(96.59 %)		 5,358
(3.43 %)		 12,077
(96.57 %)		 73,343
(6.73 %)		 43,518
(3.04 %)		 568,630
(31.80 %)		 7,776
(96.69 %)
140 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2		 10,242
(66.86 %)		 990
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 36,818
(8.73 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 32
(47.70 %)
141 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1		 7,603
(72.01 %)		 1,064
(6.25 %)		 3,493
(72.08 %)		 n/a 60.44
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 11,026
(5.45 %)		 11,732
(3.90 %)		 107,661
(34.88 %)		 12
(61.27 %)
142 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3		 7,766
(82.33 %)		 1,131
(6.60 %)		 3,714
(76.22 %)		 n/a 59.21
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 22
(100.00 %)		 8,503
(3.84 %)		 4,946
(2.16 %)		 102,428
(27.87 %)		 16
(57.14 %)
143 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1		 14,436
(21.51 %)		 1,411
(0.77 %)		 13,095
(47.93 %)		 n/a 55.97
(91.15 %)		 12,014
(8.87 %)		 11,352
(91.13 %)		 175,729
(14.69 %)		 105,113
(5.10 %)		 667,226
(23.91 %)		 4,325
(42.65 %)
144 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1		 46,021
(16.54 %)		 14,632
(4.66 %)		 34,242
(19.36 %)		 n/a 33.53
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 293,800
(4.64 %)		 151,157
(7.38 %)		 1,732,880
(41.88 %)		 21,835
(6.05 %)
145 green foxtail
GCF_005286985.1		 47,022
(14.66 %)		 17,750
(5.12 %)		 60,106
(30.88 %)		 n/a 46.17
(99.85 %)		 61
(0.15 %)		 76
(99.85 %)		 116,493
(1.51 %)		 120,039
(2.72 %)		 1,676,017
(29.11 %)		 75,497
(29.44 %)
146 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1		 n/a 18,040
(5.19 %)		 61,671
(31.38 %)		 n/a 45.99
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 105,738
(1.38 %)		 87,424
(2.22 %)		 1,777,815
(26.85 %)		 74,932
(30.30 %)
147 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2		 n/a 11,944
(2.63 %)		 37,372
(13.64 %)		 n/a 35.58
(88.95 %)		 1,032,823
(11.31 %)		 21
(100.00 %)		 293,868
(3.21 %)		 174,614
(3.18 %)		 2,690,184
(32.53 %)		 15,323
(1.42 %)
148 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2		 n/a 16,562
(0.53 %)		 72,911
(2.91 %)		 n/a 34.88
(98.35 %)		 196,261
(1.66 %)		 87,978
(100.00 %)		 1,136,015
(1.95 %)		 1,019,921
(4.33 %)		 22,445,162
(47.06 %)		 20,737
(0.24 %)
149 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1		 88,183
(5.03 %)		 22,129
(1.02 %)		 118,243
(9.15 %)		 n/a 35.63
(99.98 %)		 3,486
(0.02 %)		 1,888
(100.00 %)		 1,001,308
(2.63 %)		 1,132,664
(5.72 %)		 8,340,755
(56.16 %)		 43,665
(1.21 %)
150 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1		 43,787
(9.63 %)		 17,635
(3.85 %)		 66,270
(23.98 %)		 n/a 46.87
(98.63 %)		 736
(1.37 %)		 1,027
(98.63 %)		 157,811
(1.55 %)		 119,571
(2.57 %)		 2,107,254
(45.30 %)		 102,278
(32.16 %)
151 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1		 40,307
(7.38 %)		 16,711
(2.29 %)		 50,292
(11.24 %)		 n/a 32.12
(99.95 %)		 858
(0.05 %)		 1,115
(100.00 %)		 439,789
(3.56 %)		 574,639
(8.97 %)		 4,147,814
(47.01 %)		 16,291
(1.13 %)
152 horseweed
GCF_010389155.1		 39,621
(11.54 %)		 14,718
(3.15 %)		 42,194
(16.23 %)		 n/a 34.08
(99.99 %)		 502
(0.01 %)		 357
(100.00 %)		 267,124
(2.84 %)		 155,729
(2.71 %)		 2,475,353
(36.48 %)		 5,205
(0.40 %)
153 Indian licorice
GCF_003935025.1		 44,610
(13.60 %)		 17,108
(4.95 %)		 34,097
(14.33 %)		 n/a 31.84
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 217,674
(3.40 %)		 106,243
(4.04 %)		 2,232,509
(38.91 %)		 5,438
(1.06 %)
154 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1		 n/a 16,184
(2.02 %)		 66,215
(14.16 %)		 n/a 35.37
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 689
(100.00 %)		 739,891
(4.58 %)		 435,389
(7.62 %)		 4,843,419
(38.03 %)		 13,298
(2.56 %)
155 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1		 n/a 15,832
(2.09 %)		 63,488
(14.36 %)		 n/a 35.19
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 358
(100.00 %)		 703,028
(4.29 %)		 399,798
(6.48 %)		 4,662,881
(36.96 %)		 12,534
(1.92 %)
156 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1		 n/a 15,893
(1.97 %)		 68,998
(15.27 %)		 n/a 35.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 156
(100.00 %)		 746,424
(4.43 %)		 451,117
(7.39 %)		 4,820,434
(38.55 %)		 20,367
(2.62 %)
157 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1		 n/a 15,880
(1.95 %)		 69,093
(15.25 %)		 n/a 35.97
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 274
(100.00 %)		 751,691
(4.60 %)		 457,914
(7.61 %)		 4,850,082
(38.95 %)		 20,561
(3.01 %)
158 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1		 50,504
(10.14 %)		 18,451
(3.41 %)		 55,094
(16.89 %)		 n/a 36.30
(99.18 %)		 54
(0.82 %)		 154
(100.00 %)		 411,290
(3.65 %)		 260,413
(3.49 %)		 3,023,907
(31.93 %)		 23,270
(1.88 %)
159 Japanese apricot
GCF_000346735.1		 32,312
(19.60 %)		 14,463
(6.46 %)		 33,049
(23.94 %)		 n/a 37.45
(92.82 %)		 15,597
(7.20 %)		 23,761
(92.80 %)		 118,757
(2.25 %)		 84,983
(4.53 %)		 1,374,244
(23.24 %)		 7,808
(1.87 %)
160 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1		 80,727
(1.01 %)		 14,175
(0.13 %)		 225,166
(3.69 %)		 n/a 36.42
(99.98 %)		 3,031
(0.02 %)		 2,699
(100.00 %)		 2,873,672
(2.01 %)		 4,198,037
(4.24 %)		 5,730
(99.98 %)		 71,102
(1.16 %)
161 Japanese morning glory
GCF_001879475.1		 58,978
(8.37 %)		 16,977
(2.14 %)		 77,626
(18.21 %)		 n/a 37.61
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 3,418
(100.00 %)		 641,896
(6.26 %)		 639,051
(8.97 %)		 3,622,236
(46.63 %)		 77,860
(10.47 %)
162 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1		 53,556
(17.24 %)		 16,804
(4.69 %)		 53,712
(24.95 %)		 n/a 43.57
(99.97 %)		 925
(0.03 %)		 58
(100.00 %)		 402,182
(39.07 %)		 138,035
(3.47 %)		 1,719,939
(33.46 %)		 63,485
(25.25 %)
163 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1		 55,725
(16.73 %)		 16,338
(4.37 %)		 54,077
(25.00 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 196,712
(2.76 %)		 141,936
(4.82 %)		 1,727,479
(35.05 %)		 63,894
(25.90 %)
164 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1		 n/a 16,562
(4.59 %)		 53,878
(24.77 %)		 n/a 43.61
(98.95 %)		 474
(1.05 %)		 476
(98.95 %)		 494,831
(50.75 %)		 141,079
(3.52 %)		 1,728,936
(33.69 %)		 64,216
(25.20 %)
165 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1		 44,669
(10.38 %)		 13,649
(2.41 %)		 38,664
(12.08 %)		 n/a 31.93
(99.74 %)		 2,496
(0.26 %)		 49
(100.00 %)		 270,085
(9.40 %)		 247,307
(22.95 %)		 2,428,999
(49.81 %)		 5,914
(1.27 %)
166 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1		 n/a 21,051
(6.88 %)		 57,023
(32.54 %)		 n/a 44.09
(96.75 %)		 14,848
(3.26 %)		 26,634
(96.74 %)		 101,349
(1.46 %)		 71,657
(2.17 %)		 1,693,252
(21.97 %)		 60,198
(24.06 %)
167 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1		 n/a 15,031
(1.06 %)		 140,751
(10.18 %)		 n/a 36.82
(99.85 %)		 n/a 876,110
(100.00 %)		 505,796
(3.85 %)		 318,171
(2.09 %)		 9,808,138
(33.85 %)		 30,057
(0.85 %)
168 lyrate rockcress
GCF_000004255.2		 44,525
(28.52 %)		 25,416
(19.36 %)		 34,938
(31.66 %)		 n/a 36.08
(88.90 %)		 2,950
(11.10 %)		 3,646
(88.90 %)		 141,441
(20.58 %)		 72,583
(3.25 %)		 1,012,438
(24.68 %)		 8,053
(2.48 %)
169 macadamia nut
GCF_013358625.1		 58,226
(8.43 %)		 16,723
(2.11 %)		 62,465
(13.23 %)		 n/a 39.13
(98.51 %)		 22,059
(1.50 %)		 2,644
(100.00 %)		 463,575
(3.09 %)		 304,057
(3.39 %)		 4,183,445
(34.36 %)		 18,956
(1.40 %)
170 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1		 n/a 13,013
(2.26 %)		 38,671
(8.42 %)		 n/a 33.59
(99.19 %)		 123,798
(0.85 %)		 203,100
(99.15 %)		 329,865
(3.57 %)		 244,018
(4.63 %)		 3,737,818
(40.09 %)		 4,827
(0.29 %)
171 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1		 69,307
(3.21 %)		 14,466
(0.72 %)		 84,219
(6.52 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 1,415,484
(14.07 %)		 1,154,832
(6.29 %)		 10,231,412
(50.86 %)		 107,342
(2.63 %)
172 maize
GCF_902167145.1		 76,921
(3.66 %)		 23,553
(1.55 %)		 154,773
(10.70 %)		 n/a 46.77
(99.83 %)		 708
(0.17 %)		 697
(100.00 %)		 1,340,549
(78.65 %)		 843,168
(5.20 %)		 5,886,498
(69.23 %)		 372,641
(31.10 %)
173 maize (2020)
GCA_905067065.1		 n/a 23,433
(1.61 %)		 150,853
(10.66 %)		 n/a 46.83
(98.14 %)		 56,163
(1.87 %)		 56,173
(98.13 %)		 581,502
(1.40 %)		 753,129
(3.49 %)		 5,867,216
(67.88 %)		 377,414
(31.33 %)
174 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1		 n/a 23,680
(1.58 %)		 153,453
(10.69 %)		 n/a 46.83
(99.71 %)		 1,223
(0.29 %)		 697
(100.00 %)		 593,292
(1.41 %)		 805,647
(4.47 %)		 5,887,178
(69.17 %)		 370,755
(32.34 %)
175 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1		 n/a 23,864
(1.57 %)		 154,358
(10.67 %)		 n/a 46.77
(99.88 %)		 551
(0.12 %)		 777
(100.00 %)		 1,341,834
(78.70 %)		 834,042
(5.01 %)		 5,916,520
(69.26 %)		 372,114
(32.08 %)
176 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2		 34,262
(16.98 %)		 15,545
(6.13 %)		 36,746
(24.10 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 140,519
(2.59 %)		 67,337
(3.89 %)		 1,493,779
(29.32 %)		 41,044
(18.43 %)
177 mango
GCF_011075055.1		 60,349
(16.06 %)		 20,653
(5.13 %)		 40,887
(15.20 %)		 n/a 32.71
(99.98 %)		 169
(0.02 %)		 250
(100.00 %)		 213,445
(3.09 %)		 125,929
(3.29 %)		 2,447,401
(32.63 %)		 7,059
(0.98 %)
178 monocots
GCF_002575655.2		 84,263
(2.17 %)		 17,888
(0.44 %)		 263,541
(10.26 %)		 n/a 46.33
(97.97 %)		 69,858
(2.04 %)		 109,197
(100.00 %)		 1,492,485
(15.65 %)		 1,422,870
(5.39 %)		 12,521,384
(71.80 %)		 881,939
(30.07 %)
179 mosses
GCF_000002425.4		 55,129
(11.87 %)		 8,425
(1.46 %)		 30,452
(12.55 %)		 n/a 33.69
(98.74 %)		 2,645
(1.27 %)		 359
(100.00 %)		 454,786
(48.35 %)		 241,826
(2.56 %)		 2,413,326
(52.52 %)		 22,664
(3.06 %)
180 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1		 29,893
(12.15 %)		 14,092
(4.40 %)		 37,376
(17.73 %)		 n/a 34.86
(94.92 %)		 15,541
(5.08 %)		 46,842
(94.92 %)		 317,532
(5.00 %)		 190,192
(6.25 %)		 2,095,631
(34.49 %)		 20,490
(3.43 %)
181 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1		 47,653
(11.89 %)		 16,644
(3.87 %)		 43,967
(14.67 %)		 n/a 33.18
(92.80 %)		 96,870
(7.24 %)		 2,465
(100.00 %)		 264,597
(3.31 %)		 198,963
(3.34 %)		 2,842,720
(34.86 %)		 13,975
(1.49 %)
182 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1		 46,975
(10.56 %)		 13,502
(2.95 %)		 32,332
(13.20 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 239
(0.01 %)		 1,310
(100.00 %)		 282,171
(3.23 %)		 229,959
(11.70 %)		 2,016,709
(43.94 %)		 18,232
(10.96 %)
183 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1		 35,384
(11.55 %)		 13,191
(3.74 %)		 28,295
(11.09 %)		 n/a 33.23
(89.51 %)		 29,172
(10.51 %)		 60,751
(89.49 %)		 239,295
(7.85 %)		 172,598
(3.17 %)		 2,304,858
(33.21 %)		 12,855
(1.38 %)
184 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1		 57,263
(9.83 %)		 22,097
(3.53 %)		 51,774
(13.22 %)		 n/a 33.46
(99.34 %)		 44,657
(0.68 %)		 55,107
(99.32 %)		 280,867
(4.25 %)		 210,750
(5.67 %)		 3,920,315
(38.10 %)		 6,462
(0.46 %)
185 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1		 44,477
(5.41 %)		 16,928
(1.94 %)		 77,682
(16.06 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 2,037
(0.00 %)		 1,289
(100.00 %)		 437,997
(2.33 %)		 266,149
(5.08 %)		 4,764,252
(34.25 %)		 20,667
(1.81 %)
186 opium poppy
GCF_003573695.1		 127,893
(4.57 %)		 25,532
(0.85 %)		 162,032
(9.31 %)		 n/a 37.28
(99.80 %)		 31,183
(0.20 %)		 34,381
(100.00 %)		 819,294
(1.49 %)		 1,050,181
(6.80 %)		 10,625,631
(55.85 %)		 67,521
(1.21 %)
187 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2		 39,386
(3.85 %)		 12,208
(0.99 %)		 72,906
(8.22 %)		 n/a 34.70
(96.03 %)		 25,751
(3.92 %)		 311,841
(96.08 %)		 506,361
(2.45 %)		 413,770
(3.23 %)		 8,074,114
(39.07 %)		 56,900
(2.34 %)
188 orchid P.equestris
GCF_001263595.1		 32,146
(3.36 %)		 11,541
(1.01 %)		 54,049
(6.11 %)		 n/a 34.46
(92.46 %)		 98,814
(7.56 %)		 188,398
(92.44 %)		 487,071
(2.96 %)		 511,903
(4.00 %)		 7,060,408
(42.20 %)		 31,179
(1.22 %)
189 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1		 120,534
(4.81 %)		 39,902
(1.95 %)		 276,967
(16.36 %)		 n/a 45.32
(99.56 %)		 4,932
(0.44 %)		 2,420
(100.00 %)		 764,083
(1.38 %)		 810,723
(3.95 %)		 11,118,925
(53.40 %)		 520,091
(23.03 %)
190 papaya
GCF_000150535.2		 29,883
(11.99 %)		 12,860
(4.47 %)		 24,403
(11.58 %)		 n/a 35.31
(73.55 %)		 29,719
(26.47 %)		 47,485
(73.53 %)		 260,082
(34.69 %)		 101,644
(3.59 %)		 1,640,647
(28.88 %)		 21,200
(2.95 %)
191 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1		 n/a 43,905
(2.21 %)		 174,920
(14.40 %)		 n/a 35.02
(93.97 %)		 170,266
(6.06 %)		 211,964
(93.94 %)		 1,021,699
(2.86 %)		 1,125,321
(8.02 %)		 9,388,626
(47.60 %)		 102,661
(4.26 %)
192 peach
GCF_000346465.2		 36,201
(20.87 %)		 14,368
(6.26 %)		 32,245
(24.09 %)		 n/a 37.51
(98.79 %)		 2,368
(1.22 %)		 2,531
(98.78 %)		 150,957
(10.06 %)		 96,381
(5.52 %)		 1,221,263
(28.72 %)		 7,885
(2.07 %)
193 peanut
GCF_003086295.2		 155,835
(5.15 %)		 31,810
(1.19 %)		 160,574
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,655
(0.15 %)		 385
(100.00 %)		 1,684,814
(3.52 %)		 1,488,297
(4.81 %)		 11,059,688
(62.32 %)		 140,570
(2.45 %)
194 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1		 n/a 31,065
(1.17 %)		 158,578
(8.79 %)		 n/a 36.33
(98.97 %)		 32,692
(1.04 %)		 29
(100.00 %)		 1,735,218
(3.66 %)		 1,490,806
(4.26 %)		 11,072,983
(61.75 %)		 138,890
(2.46 %)
195 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2		 n/a 17,949
(1.26 %)		 134,829
(14.30 %)		 n/a 47.95
(86.95 %)		 156,852
(13.08 %)		 52,033
(100.00 %)		 380,858
(1.16 %)		 466,997
(2.83 %)		 5,117,134
(56.89 %)		 380,989
(29.47 %)
196 pecan
GCF_018687715.1		 71,340
(9.93 %)		 18,671
(2.67 %)		 60,632
(15.16 %)		 n/a 36.30
(99.97 %)		 22
(0.03 %)		 39
(99.97 %)		 473,853
(3.66 %)		 367,846
(6.75 %)		 3,301,121
(39.03 %)		 27,274
(2.22 %)
197 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1		 89,789
(3.75 %)		 17,693
(0.79 %)		 174,787
(12.15 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 238
(0.00 %)		 1,677
(100.00 %)		 605,852
(1.36 %)		 760,915
(5.68 %)		 5,216,229
(69.24 %)		 542,998
(24.23 %)
198 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2		 72,518
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 52,295
(10.15 %)		 n/a 33.21
(98.25 %)		 19,685
(1.76 %)		 20,680
(98.24 %)		 404,885
(2.81 %)		 300,062
(3.31 %)		 5,198,170
(40.84 %)		 10,912
(0.59 %)
199 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1		 63,476
(8.67 %)		 20,265
(2.62 %)		 51,815
(10.02 %)		 n/a 33.24
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 405,385
(2.83 %)		 306,302
(3.81 %)		 5,192,105
(41.79 %)		 10,481
(0.65 %)
200 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1		 n/a 15,868
(1.22 %)		 104,104
(13.39 %)		 n/a 36.03
(91.65 %)		 318,321
(8.39 %)		 328,880
(91.61 %)		 810,727
(3.49 %)		 710,744
(4.84 %)		 7,339,863
(41.43 %)		 104,967
(3.98 %)
201 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2		 46,412
(9.42 %)		 17,396
(3.13 %)		 49,710
(12.66 %)		 n/a 32.76
(94.18 %)		 36,323
(5.83 %)		 67,834
(94.17 %)		 395,663
(3.40 %)		 306,602
(4.71 %)		 3,749,364
(39.19 %)		 26,504
(2.90 %)
202 pineapple
GCF_001540865.1		 43,024
(11.65 %)		 13,649
(3.36 %)		 38,917
(14.95 %)		 n/a 38.34
(98.23 %)		 25,542
(1.78 %)		 3,129
(100.00 %)		 352,802
(7.31 %)		 274,578
(4.75 %)		 2,360,455
(38.94 %)		 56,724
(11.73 %)
203 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1		 37,318
(33.25 %)		 22,836
(23.08 %)		 26,822
(33.93 %)		 n/a 35.63
(97.53 %)		 6,294
(2.49 %)		 7,067
(97.51 %)		 74,470
(2.42 %)		 42,509
(3.39 %)		 814,442
(24.99 %)		 5,817
(2.14 %)
204 pistachio
GCF_008641045.1		 47,948
(7.92 %)		 18,462
(2.58 %)		 62,898
(14.05 %)		 n/a 35.95
(99.84 %)		 16,367
(0.16 %)		 1,865
(100.00 %)		 363,793
(2.43 %)		 253,408
(4.08 %)		 4,200,417
(36.34 %)		 22,340
(1.78 %)
205 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2		 41,101
(10.95 %)		 11,576
(2.50 %)		 38,220
(15.70 %)		 n/a 38.61
(99.84 %)		 626
(0.16 %)		 1,409
(99.84 %)		 236,190
(2.95 %)		 153,746
(4.02 %)		 2,151,579
(26.72 %)		 24,561
(4.48 %)
206 pomegranate
GCF_007655135.1		 43,277
(14.87 %)		 14,635
(4.26 %)		 39,381
(19.97 %)		 n/a 40.38
(99.99 %)		 188
(0.01 %)		 474
(100.00 %)		 173,182
(2.28 %)		 174,872
(6.81 %)		 1,640,973
(32.89 %)		 26,506
(9.18 %)
207 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1		 43,670
(6.66 %)		 16,547
(2.25 %)		 54,186
(11.30 %)		 n/a 34.71
(88.41 %)		 37,060
(11.60 %)		 17,084
(100.00 %)		 321,938
(2.14 %)		 250,793
(4.04 %)		 5,136,691
(33.92 %)		 8,536
(0.30 %)
208 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1		 n/a 16,861
(1.98 %)		 58,882
(12.19 %)		 n/a 35.40
(99.95 %)		 4,397
(0.05 %)		 3,012
(100.00 %)		 774,417
(46.83 %)		 392,378
(8.45 %)		 5,068,449
(42.72 %)		 14,548
(1.32 %)
209 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1		 n/a 17,614
(2.86 %)		 45,684
(10.75 %)		 n/a 34.49
(83.57 %)		 10,041,161
(17.84 %)		 12
(100.00 %)		 606,573
(40.80 %)		 168,871
(2.58 %)		 5,508,800
(26.36 %)		 5,550
(0.22 %)
210 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1		 43,155
(20.86 %)		 16,423
(2.55 %)		 50,333
(11.79 %)		 n/a 34.83
(93.98 %)		 45,215
(6.04 %)		 60,069
(93.96 %)		 662,626
(43.42 %)		 212,315
(4.38 %)		 4,691,843
(34.91 %)		 9,851
(0.45 %)
211 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1		 n/a 16,415
(2.15 %)		 54,766
(12.48 %)		 n/a 35.21
(99.98 %)		 1,476
(0.02 %)		 25
(100.00 %)		 329,233
(2.28 %)		 285,101
(5.66 %)		 4,832,189
(40.28 %)		 12,944
(0.99 %)
212 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1		 n/a 16,694
(2.26 %)		 53,990
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,499
(0.02 %)		 28
(100.00 %)		 323,447
(2.25 %)		 283,098
(5.39 %)		 4,727,964
(39.87 %)		 12,316
(1.34 %)
213 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1		 n/a 16,713
(2.23 %)		 54,380
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,299
(0.02 %)		 27
(100.00 %)		 329,807
(2.31 %)		 282,372
(6.11 %)		 4,718,807
(40.25 %)		 11,812
(1.00 %)
214 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1		 n/a 16,640
(2.18 %)		 54,937
(12.38 %)		 n/a 35.18
(99.98 %)		 1,383
(0.02 %)		 26
(100.00 %)		 329,665
(2.30 %)		 285,993
(6.03 %)		 4,858,802
(40.32 %)		 12,792
(1.32 %)
215 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1		 n/a 16,312
(2.05 %)		 54,438
(12.18 %)		 n/a 35.23
(99.95 %)		 4,448
(0.05 %)		 12
(100.00 %)		 730,464
(46.17 %)		 338,389
(7.95 %)		 4,903,557
(41.90 %)		 12,226
(0.72 %)
216 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1		 35,762
(6.74 %)		 16,408
(2.54 %)		 48,924
(11.75 %)		 n/a 34.59
(99.55 %)		 1,612
(0.45 %)		 1,332
(100.00 %)		 297,683
(2.31 %)		 234,616
(4.68 %)		 4,308,149
(38.02 %)		 8,192
(0.47 %)
217 quinoa
GCF_001683475.1		 74,918
(7.49 %)		 22,914
(1.61 %)		 105,619
(12.97 %)		 n/a 36.87
(99.16 %)		 725
(0.84 %)		 3,487
(100.00 %)		 810,277
(3.58 %)		 762,903
(10.88 %)		 6,551,884
(49.49 %)		 93,630
(2.98 %)
218 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2		 80,563
(20.51 %)		 36,039
(9.58 %)		 74,081
(26.98 %)		 n/a 36.00
(99.94 %)		 2,853
(0.06 %)		 6,424
(100.00 %)		 224,524
(2.48 %)		 193,525
(5.49 %)		 2,234,480
(35.04 %)		 25,972
(4.13 %)
219 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1		 152,583
(19.25 %)		 57,668
(6.87 %)		 143,092
(23.51 %)		 n/a 37.13
(99.99 %)		 840
(0.01 %)		 3,167
(100.00 %)		 470,302
(2.29 %)		 578,281
(9.24 %)		 4,662,467
(42.41 %)		 64,287
(5.62 %)
220 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2		 144,997
(17.51 %)		 59,743
(7.71 %)		 146,391
(26.97 %)		 n/a 36.47
(92.96 %)		 32,639
(7.05 %)		 34,110
(92.95 %)		 449,257
(2.67 %)		 441,269
(5.84 %)		 4,867,601
(32.91 %)		 60,082
(3.53 %)
221 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1		 63,238
(17.01 %)		 17,857
(4.13 %)		 43,079
(17.27 %)		 n/a 33.71
(99.97 %)		 231
(0.03 %)		 90
(100.00 %)		 241,481
(2.65 %)		 187,674
(4.85 %)		 2,251,582
(37.03 %)		 6,474
(1.93 %)
222 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1		 62,516
(12.25 %)		 15,176
(2.61 %)		 67,175
(21.50 %)		 n/a 37.47
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 173
(100.00 %)		 377,231
(3.52 %)		 364,027
(5.05 %)		 2,679,528
(42.07 %)		 64,243
(6.17 %)
223 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2		 71,107
(1.58 %)		 18,911
(0.39 %)		 321,741
(10.16 %)		 n/a 45.91
(99.38 %)		 33,814
(0.62 %)		 10,205
(100.00 %)		 1,208,165
(1.25 %)		 1,319,817
(2.96 %)		 15,480,313
(71.93 %)		 975,234
(26.52 %)
224 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1		 62,168
(11.90 %)		 15,363
(2.73 %)		 54,203
(18.86 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 253,965
(2.10 %)		 235,379
(9.36 %)		 2,668,584
(34.08 %)		 31,789
(3.72 %)
225 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1		 38,736
(11.89 %)		 16,669
(4.18 %)		 43,369
(14.64 %)		 n/a 32.90
(93.47 %)		 20,717
(6.53 %)		 15,445
(100.00 %)		 233,635
(3.33 %)		 204,141
(4.85 %)		 2,682,022
(32.58 %)		 16,828
(2.07 %)
226 riverbank grape
GCF_004353265.1		 44,851
(10.22 %)		 15,302
(3.01 %)		 46,011
(14.96 %)		 n/a 34.32
(98.79 %)		 1,095
(1.21 %)		 175
(100.00 %)		 339,984
(3.03 %)		 233,259
(4.71 %)		 2,925,914
(35.27 %)		 11,055
(0.93 %)
227 rose gum (2021)
GCF_016545825.1		 54,676
(10.44 %)		 16,291
(2.42 %)		 69,492
(17.92 %)		 n/a 39.39
(99.97 %)		 1,712
(0.03 %)		 37
(100.00 %)		 358,171
(2.83 %)		 259,031
(3.65 %)		 3,353,128
(29.52 %)		 78,731
(7.66 %)
228 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1		 65,107
(11.08 %)		 16,389
(2.33 %)		 74,557
(18.16 %)		 n/a 39.28
(92.69 %)		 27,773
(7.32 %)		 32,724
(92.68 %)		 357,835
(2.50 %)		 266,806
(3.22 %)		 3,496,176
(27.34 %)		 79,393
(6.54 %)
229 rose of Sharon
GCF_006381635.1		 91,942
(5.18 %)		 44,363
(2.23 %)		 136,768
(10.14 %)		 n/a 34.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,789
(100.00 %)		 889,945
(2.72 %)		 968,890
(4.91 %)		 9,836,479
(51.73 %)		 42,560
(0.89 %)
230 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1		 71,175
(4.21 %)		 22,208
(1.24 %)		 63,302
(5.13 %)		 n/a 34.70
(91.68 %)		 1,428
(8.32 %)		 755
(100.00 %)		 1,078,590
(2.96 %)		 730,314
(3.70 %)		 6,031,831
(65.59 %)		 24,263
(0.70 %)
231 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1		 66,125
(5.23 %)		 22,033
(1.63 %)		 59,727
(6.42 %)		 n/a 34.84
(94.20 %)		 40,863
(5.81 %)		 7,453
(100.00 %)		 827,088
(3.02 %)		 565,394
(5.23 %)		 5,065,470
(61.59 %)		 13,573
(0.45 %)
232 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1		 94,413
(12.61 %)		 31,218
(3.57 %)		 108,219
(21.49 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,178
(100.00 %)		 360,314
(2.17 %)		 419,051
(4.85 %)		 3,875,932
(41.07 %)		 105,227
(10.14 %)
233 sacred lotus
GCF_000365185.1		 43,140
(7.01 %)		 15,920
(2.13 %)		 61,231
(13.11 %)		 n/a 38.30
(87.98 %)		 175,846
(12.06 %)		 58,428
(87.96 %)		 408,351
(2.83 %)		 275,384
(2.52 %)		 4,643,876
(30.20 %)		 40,599
(2.68 %)
234 saltwater cress
GCF_000478725.1		 38,705
(18.07 %)		 21,851
(11.68 %)		 39,487
(28.65 %)		 n/a 37.71
(98.09 %)		 3,020
(1.92 %)		 3,658
(98.08 %)		 102,162
(1.93 %)		 70,755
(3.25 %)		 1,162,538
(32.09 %)		 15,272
(3.87 %)
235 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1		 n/a 14,138
(0.74 %)		 125,370
(12.27 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 581
(100.00 %)		 655,331
(1.73 %)		 500,899
(4.88 %)		 7,172,490
(54.24 %)		 140,800
(5.87 %)
236 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1		 n/a 15,588
(0.93 %)		 117,831
(12.94 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 597,532
(1.81 %)		 430,194
(3.80 %)		 6,075,115
(49.91 %)		 129,512
(5.41 %)
237 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2		 94,251
(12.60 %)		 31,266
(3.58 %)		 108,141
(21.47 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,162
(100.00 %)		 357,482
(2.10 %)		 419,009
(4.86 %)		 3,874,047
(41.08 %)		 105,216
(10.11 %)
238 scented satinash
GCF_900635055.1		 42,531
(12.21 %)		 15,353
(3.67 %)		 53,811
(20.61 %)		 n/a 40.64
(89.65 %)		 11,862
(10.35 %)		 19,039
(100.00 %)		 179,421
(2.10 %)		 174,902
(3.34 %)		 1,785,894
(25.35 %)		 55,685
(7.69 %)
239 sesame
GCF_000512975.1		 38,693
(16.95 %)		 15,555
(5.41 %)		 35,316
(19.66 %)		 n/a 35.00
(98.34 %)		 9,940
(1.66 %)		 26,176
(98.34 %)		 161,123
(2.85 %)		 79,750
(3.97 %)		 1,807,029
(31.02 %)		 9,873
(1.80 %)
240 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1		 n/a 16,242
(4.30 %)		 39,583
(17.06 %)		 n/a 35.22
(98.66 %)		 2,946
(1.35 %)		 1,451
(100.00 %)		 253,228
(3.98 %)		 186,657
(9.89 %)		 1,792,662
(45.14 %)		 19,928
(3.29 %)
241 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1		 46,475
(12.62 %)		 17,469
(4.11 %)		 51,531
(21.75 %)		 n/a 40.30
(93.72 %)		 7,529
(6.28 %)		 15,781
(100.00 %)		 194,855
(2.07 %)		 116,828
(2.25 %)		 1,801,472
(25.38 %)		 44,191
(5.74 %)
242 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1		 43,419
(12.78 %)		 14,758
(4.01 %)		 41,180
(19.74 %)		 n/a 40.38
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 160,749
(1.91 %)		 114,741
(3.07 %)		 1,619,569
(28.25 %)		 43,290
(7.15 %)
243 silver poplar
GCF_005239225.1		 53,068
(14.65 %)		 20,299
(4.74 %)		 44,556
(16.36 %)		 n/a 33.75
(100.00 %)		 n/a 1,287
(100.00 %)		 309,097
(3.34 %)		 175,288
(4.77 %)		 2,457,634
(38.38 %)		 4,613
(0.67 %)
244 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1		 28,735
(15.21 %)		 13,143
(5.29 %)		 32,007
(22.39 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 89,958
(1.86 %)		 351,649
(15.29 %)		 884,646
(35.58 %)		 14,711
(4.52 %)
245 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3		 48,290
(8.57 %)		 17,901
(3.45 %)		 73,969
(19.64 %)		 n/a 43.88
(95.30 %)		 3,906
(4.70 %)		 4,775
(95.30 %)		 556,607
(65.39 %)		 177,271
(4.54 %)		 2,371,199
(48.20 %)		 110,115
(18.82 %)
246 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1		 n/a 18,138
(3.63 %)		 75,180
(20.67 %)		 n/a 43.67
(97.96 %)		 2,108
(2.04 %)		 308
(100.00 %)		 559,950
(63.17 %)		 156,952
(3.01 %)		 2,481,716
(46.70 %)		 109,923
(19.06 %)
247 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6		 88,003
(9.85 %)		 27,705
(3.08 %)		 77,033
(11.88 %)		 n/a 34.74
(97.36 %)		 8,918
(2.65 %)		 9,199
(97.35 %)		 848,398
(38.02 %)		 434,042
(5.29 %)		 5,346,884
(45.07 %)		 35,893
(1.55 %)
248 spider flower
GCF_000463585.1		 45,524
(22.00 %)		 21,103
(10.40 %)		 38,184
(27.17 %)		 n/a 39.40
(87.71 %)		 24,824
(12.32 %)		 37,073
(87.68 %)		 144,827
(3.22 %)		 103,970
(4.10 %)		 1,118,840
(31.64 %)		 29,313
(6.47 %)
249 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1		 41,494
(5.76 %)		 12,540
(1.38 %)		 68,522
(12.26 %)		 n/a 37.82
(95.53 %)		 137,086
(4.48 %)		 78,263
(100.00 %)		 374,336
(2.48 %)		 670,331
(6.78 %)		 3,213,561
(52.82 %)		 89,520
(4.54 %)
250 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1		 58,405
(7.11 %)		 12,431
(1.27 %)		 61,084
(11.35 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 246
(100.00 %)		 378,521
(2.27 %)		 722,814
(6.29 %)		 2,950,586
(58.17 %)		 92,256
(5.21 %)
251 spotted monkey flower
GCF_000504015.1		 34,441
(15.56 %)		 14,508
(4.41 %)		 34,904
(18.83 %)		 n/a 35.50
(93.50 %)		 15,528
(6.52 %)		 17,740
(93.48 %)		 227,143
(4.28 %)		 204,234
(11.85 %)		 1,776,879
(40.60 %)		 21,718
(3.89 %)
252 stiff brome
GCF_000005505.3		 47,531
(20.35 %)		 15,530
(6.01 %)		 45,735
(34.29 %)		 n/a 46.40
(99.84 %)		 27
(0.16 %)		 36
(99.84 %)		 108,976
(17.41 %)		 54,391
(1.94 %)		 1,197,052
(21.34 %)		 48,209
(34.43 %)
253 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1		 n/a 15,045
(1.35 %)		 164,045
(15.16 %)		 n/a 38.82
(94.24 %)		 89,898
(5.63 %)		 714,282
(94.37 %)		 278,640
(1.91 %)		 388,660
(6.94 %)		 3,639,568
(28.92 %)		 64,180
(3.80 %)
254 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1		 n/a 18,847
(4.51 %)		 76,529
(27.07 %)		 n/a 45.11
(99.96 %)		 1,423
(0.03 %)		 7,128
(99.97 %)		 258,594
(29.31 %)		 144,716
(2.51 %)		 1,976,510
(35.41 %)		 113,324
(26.96 %)
255 sweet cherry
GCF_002207925.1		 39,968
(19.06 %)		 15,007
(5.83 %)		 38,107
(23.61 %)		 n/a 37.72
(90.64 %)		 22,628
(9.39 %)		 10,148
(100.00 %)		 136,700
(2.47 %)		 104,376
(7.20 %)		 1,484,591
(25.20 %)		 9,956
(2.27 %)
256 sweet orange
GCF_000317415.1		 46,820
(15.94 %)		 14,390
(4.63 %)		 34,480
(18.04 %)		 n/a 34.07
(91.90 %)		 12,539
(8.11 %)		 17,383
(91.89 %)		 185,212
(2.95 %)		 104,182
(4.92 %)		 2,119,183
(29.53 %)		 6,540
(0.93 %)
257 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2		 n/a 23,319
(2.45 %)		 98,107
(18.19 %)		 n/a 35.14
(88.01 %)		 171,925
(12.06 %)		 28,461
(100.00 %)		 579,745
(3.87 %)		 473,175
(3.79 %)		 4,850,126
(32.44 %)		 52,715
(3.15 %)
258 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1		 n/a 22,279
(1.15 %)		 121,694
(10.54 %)		 n/a 35.34
(91.81 %)		 275,710
(8.22 %)		 314,564
(91.78 %)		 856,470
(2.64 %)		 970,252
(5.69 %)		 7,570,175
(42.39 %)		 29,072
(0.54 %)
259 switchgrass
GCF_016808335.1		 114,876
(10.54 %)		 31,534
(3.21 %)		 152,844
(27.54 %)		 n/a 46.79
(99.59 %)		 464
(0.41 %)		 1,091
(99.59 %)		 395,905
(1.77 %)		 323,173
(5.10 %)		 4,922,182
(39.47 %)		 213,249
(32.45 %)
260 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1		 n/a 15,605
(2.84 %)		 50,437
(14.57 %)		 n/a 38.53
(96.71 %)		 2,456
(3.29 %)		 7,020
(100.00 %)		 257,784
(2.74 %)		 211,756
(3.88 %)		 2,209,417
(41.80 %)		 54,125
(5.80 %)
261 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4		 53,928
(40.16 %)		 26,582
(34.47 %)		 11,416
(18.70 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 68,517
(16.50 %)		 27,064
(2.77 %)		 749,005
(22.64 %)		 4,601
(1.63 %)
262 thunder duke vine
GCF_013401445.1		 56,436
(17.59 %)		 20,174
(5.61 %)		 42,326
(19.85 %)		 n/a 37.58
(99.96 %)		 146
(0.04 %)		 321
(100.00 %)		 125,395
(2.23 %)		 102,179
(22.89 %)		 1,226,273
(38.50 %)		 6,893
(1.71 %)
263 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1		 50,668
(2.79 %)		 17,479
(0.82 %)		 117,543
(8.63 %)		 n/a 40.23
(88.38 %)		 119,817
(11.63 %)		 37,194
(100.00 %)		 622,838
(1.51 %)		 788,520
(3.46 %)		 11,822,060
(48.66 %)		 174,838
(3.17 %)
264 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2		 66,966
(3.67 %)		 17,141
(1.02 %)		 81,513
(6.82 %)		 n/a 38.89
(97.29 %)		 213,074
(2.72 %)		 215,609
(97.29 %)		 486,556
(1.53 %)		 669,040
(5.52 %)		 10,446,746
(53.83 %)		 118,807
(2.33 %)
265 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5		 45,847
(6.92 %)		 15,425
(2.15 %)		 38,319
(7.54 %)		 n/a 34.12
(90.19 %)		 19,539
(9.82 %)		 3,066
(100.00 %)		 311,852
(2.14 %)		 229,773
(3.18 %)		 5,390,626
(35.26 %)		 25,196
(1.27 %)
266 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1		 n/a 22,795
(3.47 %)		 67,418
(16.40 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 347,375
(3.07 %)		 304,988
(3.96 %)		 3,119,641
(40.22 %)		 30,300
(3.29 %)
267 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1		 n/a 22,897
(3.50 %)		 67,595
(16.43 %)		 n/a 38.12
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 118
(100.00 %)		 344,928
(2.90 %)		 299,566
(3.87 %)		 3,139,734
(39.86 %)		 30,533
(2.95 %)
268 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1		 69,030
(4.11 %)		 20,169
(1.21 %)		 55,515
(4.75 %)		 n/a 35.17
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 948
(100.00 %)		 618,195
(1.97 %)		 622,748
(3.28 %)		 8,002,633
(61.80 %)		 27,646
(0.67 %)
269 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1		 53,446
(3.92 %)		 20,707
(1.29 %)		 56,318
(5.01 %)		 n/a 35.03
(92.12 %)		 45,768
(7.88 %)		 121,185
(92.12 %)		 618,119
(2.07 %)		 589,954
(3.54 %)		 8,098,351
(55.57 %)		 28,949
(0.57 %)
270 trilobed morning glory
GCF_003576645.1		 49,472
(13.00 %)		 16,803
(3.58 %)		 50,448
(18.68 %)		 n/a 35.68
(94.76 %)		 31,256
(5.25 %)		 17
(100.00 %)		 333,211
(3.67 %)		 335,317
(10.66 %)		 2,341,085
(36.54 %)		 27,290
(3.24 %)
271 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2		 49,094
(16.30 %)		 14,451
(4.70 %)		 33,670
(18.59 %)		 n/a 34.22
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 184,421
(2.80 %)		 106,732
(3.28 %)		 1,996,057
(33.86 %)		 6,824
(1.28 %)
272 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2		 63,531
(8.16 %)		 16,883
(1.90 %)		 72,901
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,673
(0.23 %)		 2,002
(100.00 %)		 800,288
(3.71 %)		 460,119
(7.41 %)		 5,438,715
(37.84 %)		 19,628
(1.10 %)
273 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1		 n/a 13,357
(3.39 %)		 37,446
(17.24 %)		 n/a 37.56
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 244,573
(10.74 %)		 180,141
(13.98 %)		 1,184,686
(42.28 %)		 6,470
(2.86 %)
274 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1		 n/a 13,575
(3.44 %)		 38,113
(17.59 %)		 n/a 37.58
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 245,892
(11.25 %)		 158,855
(13.35 %)		 1,221,056
(41.58 %)		 6,436
(2.63 %)
275 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2		 48,839
(21.95 %)		 19,452
(7.44 %)		 35,987
(20.77 %)		 n/a 36.49
(94.38 %)		 49,199
(5.63 %)		 24,194
(100.00 %)		 181,473
(3.18 %)		 143,114
(7.42 %)		 1,614,901
(29.14 %)		 13,094
(2.48 %)
276 wax gourd
GCF_009727055.1		 40,406
(4.66 %)		 13,481
(1.43 %)		 43,071
(6.68 %)		 n/a 34.85
(98.39 %)		 24,524
(1.62 %)		 1,791
(100.00 %)		 481,638
(2.55 %)		 364,998
(3.11 %)		 6,236,506
(49.68 %)		 21,741
(0.93 %)
277 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1		 n/a 22,395
(3.96 %)		 101,555
(33.88 %)		 n/a 45.70
(99.78 %)		 2,245
(0.22 %)		 1,143
(100.00 %)		 206,645
(1.57 %)		 174,457
(2.79 %)		 2,244,665
(26.11 %)		 117,743
(29.88 %)
278 white fonio (2020)
GCA_902806635.1		 n/a 33,011
(5.39 %)		 109,615
(30.77 %)		 n/a 45.47
(97.23 %)		 29,136
(2.79 %)		 29,155
(97.21 %)		 215,374
(1.42 %)		 159,137
(1.91 %)		 2,776,488
(28.15 %)		 136,308
(27.74 %)
279 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1		 n/a 21,959
(3.77 %)		 51,652
(20.18 %)		 n/a 36.92
(99.73 %)		 1,764
(0.27 %)		 3,171
(99.97 %)		 215,169
(3.21 %)		 247,660
(10.71 %)		 2,556,478
(43.72 %)		 14,520
(10.46 %)
280 white yam
GCF_009730915.1		 43,902
(7.41 %)		 13,647
(2.09 %)		 49,877
(12.79 %)		 n/a 36.25
(99.19 %)		 4,760
(0.81 %)		 2,254
(100.00 %)		 391,299
(3.19 %)		 258,918
(3.96 %)		 3,588,023
(40.59 %)		 28,929
(2.37 %)
281 wild cabbage
GCF_000695525.1		 66,717
(15.60 %)		 31,142
(8.08 %)		 103,348
(35.10 %)		 n/a 36.11
(91.23 %)		 52,140
(8.80 %)		 33,760
(99.98 %)		 197,515
(3.12 %)		 214,463
(4.43 %)		 2,535,207
(31.20 %)		 29,995
(2.99 %)
282 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2		 n/a 31,163
(6.66 %)		 79,290
(25.04 %)		 n/a 36.57
(98.21 %)		 135
(1.79 %)		 140
(100.00 %)		 273,972
(2.76 %)		 284,806
(6.41 %)		 2,750,803
(38.77 %)		 33,071
(3.37 %)
283 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1		 29,804
(16.68 %)		 13,252
(5.90 %)		 22,247
(14.89 %)		 n/a 32.94
(94.65 %)		 119,056
(5.55 %)		 6,074
(100.00 %)		 107,979
(2.19 %)		 67,029
(6.76 %)		 1,525,353
(32.45 %)		 2,481
(0.48 %)
284 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2		 131,285
(1.34 %)		 n/a 567,570
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,589
(3.31 %)		 148,296
(100.00 %)		 2,573,102
(1.23 %)		 2,990,888
(3.37 %)		 492,885
(96.69 %)		 2,220,880
(25.34 %)
285 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2		 53,171
(14.87 %)		 18,878
(4.31 %)		 45,554
(18.36 %)		 n/a 38.87
(82.70 %)		 22,178
(17.31 %)		 24,423
(82.71 %)		 214,040
(7.81 %)		 136,453
(2.42 %)		 1,656,678
(31.15 %)		 53,687
(8.28 %)
286 wild olive
GCF_002742605.1		 67,081
(6.69 %)		 19,793
(1.69 %)		 68,749
(9.17 %)		 n/a 35.40
(90.41 %)		 47,638
(9.59 %)		 41,226
(100.00 %)		 425,922
(1.79 %)		 378,656
(18.98 %)		 5,982,070
(40.81 %)		 12,534
(0.42 %)
287 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3		 57,082
(6.20 %)		 17,102
(1.68 %)		 76,760
(11.48 %)		 n/a 35.80
(88.03 %)		 135,554
(12.02 %)		 1,589
(100.00 %)		 596,136
(3.37 %)		 499,251
(3.39 %)		 5,279,103
(45.94 %)		 48,556
(1.91 %)
288 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2		 78,441
(5.58 %)		 16,952
(1.26 %)		 89,380
(9.95 %)		 n/a 36.84
(92.91 %)		 122,617
(7.13 %)		 997
(99.67 %)		 777,978
(3.35 %)		 619,944
(3.82 %)		 5,823,472
(53.61 %)		 79,537
(2.58 %)
289 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1		 67,384
(5.06 %)		 16,850
(1.28 %)		 83,780
(9.77 %)		 n/a 36.78
(93.48 %)		 14,157
(6.52 %)		 30
(100.00 %)		 767,054
(3.15 %)		 754,355
(3.89 %)		 5,146,558
(56.74 %)		 71,885
(2.45 %)
290 wild soybean
GCF_004193775.1		 81,537
(9.20 %)		 27,977
(2.99 %)		 78,144
(11.64 %)		 n/a 34.88
(97.58 %)		 752
(2.42 %)		 1,120
(100.00 %)		 551,217
(2.79 %)		 450,287
(6.65 %)		 5,379,409
(46.22 %)		 37,183
(1.52 %)
291 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1		 36,435
(23.91 %)		 13,996
(6.63 %)		 46,505
(35.89 %)		 n/a 38.40
(94.27 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,460
(94.25 %)		 71,057
(1.51 %)		 74,581
(2.78 %)		 1,034,180
(21.44 %)		 14,806
(3.21 %)
292 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1		 n/a 67,698
(2.77 %)		 385,590
(22.40 %)		 n/a 44.92
(99.75 %)		 76,230
(0.26 %)		 15,303
(100.00 %)		 1,015,234
(1.60 %)		 910,932
(3.64 %)		 10,425,387
(46.78 %)		 637,314
(24.52 %)
293 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1		 46,114
(5.99 %)		 15,458
(1.87 %)		 42,907
(7.63 %)		 n/a 34.50
(92.34 %)		 41,684
(7.67 %)		 41,696
(92.33 %)		 363,460
(2.48 %)		 271,129
(4.15 %)		 6,330,153
(36.93 %)		 19,639
(1.20 %)
294 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1		 n/a 17,733
(2.85 %)		 55,354
(14.76 %)		 n/a 34.32
(99.33 %)		 780
(0.67 %)		 683
(100.00 %)		 586,981
(35.31 %)		 275,412
(4.57 %)		 3,561,395
(35.28 %)		 14,172
(0.96 %)
295 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1		 n/a 14,109
(3.33 %)		 40,033
(15.32 %)		 n/a 34.56
(97.67 %)		 9,429
(2.34 %)		 21
(100.00 %)		 410,680
(35.69 %)		 189,467
(4.45 %)		 2,405,053
(34.36 %)		 10,620
(1.04 %)
296 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1		 46,287
(10.68 %)		 14,823
(2.93 %)		 44,674
(15.11 %)		 n/a 35.08
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 310,377
(2.83 %)		 242,451
(9.17 %)		 2,706,407
(38.52 %)		 11,751
(1.05 %)
297 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3		 46,797
(11.01 %)		 14,907
(3.07 %)		 44,949
(15.02 %)		 n/a 34.56
(96.91 %)		 13,440
(3.10 %)		 14,644
(96.90 %)		 462,807
(35.59 %)		 222,647
(4.83 %)		 2,745,513
(34.80 %)		 11,591
(1.00 %)
298 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1		 n/a 22,511
(18.61 %)		 30,519
(28.94 %)		 n/a 35.60
(90.69 %)		 22,839
(9.35 %)		 30,649
(90.65 %)		 86,568
(2.39 %)		 44,616
(2.78 %)		 1,035,105
(23.86 %)		 6,701
(1.74 %)
299 winter squash
GCF_002738345.1		 49,714
(19.34 %)		 18,860
(6.74 %)		 33,884
(18.55 %)		 n/a 36.33
(97.81 %)		 17,224
(2.20 %)		 8,299
(100.00 %)		 169,605
(3.09 %)		 134,380
(10.82 %)		 1,493,623
(35.66 %)		 12,619
(2.64 %)
300 wood tobacco
GCF_000393655.1		 58,358
(2.93 %)		 17,332
(0.82 %)		 111,663
(7.17 %)		 n/a 39.09
(92.17 %)		 338,901
(7.84 %)		 392,998
(92.16 %)		 598,929
(1.44 %)		 776,240
(4.57 %)		 13,228,149
(49.11 %)		 100,864
(1.49 %)
301 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1		 n/a 56,069
(8.51 %)		 138,660
(27.88 %)		 n/a 36.22
(79.66 %)		 22,714
(20.35 %)		 9,746
(100.00 %)		 367,321
(2.38 %)		 303,381
(3.03 %)		 4,551,648
(26.34 %)		 50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 301

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 214 assemblies assembly stats track stats
Mammals 538 assemblies assembly stats track stats
Birds 358 assemblies assembly stats track stats
Fishes 391 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 222 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 723 assemblies assembly stats track stats
Plants 301 assemblies assembly stats track stats
Fungi 680 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 103 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 449 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 882 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats