Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,407
(11.93 %)
23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
27,794
(1.97 %)
2 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,883
(11.85 %)
16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
20,402
(2.60 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,475
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
4 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
50,821
(2.66 %)
5 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
6 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,755
(15.95 %)
16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
60,891
(21.37 %)
7 algarrobo blanco
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
8 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
9 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
10 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
11 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
12 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,918
(11.39 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
13 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
14 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
15 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
3,335
(0.34 %)
16 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,905
(14.29 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
17 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
66,834
(4.90 %)
18 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
68,566
(4.96 %)
19 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,718
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
20 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,481
(9.22 %)
11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
25,108
(1.67 %)
21 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
22 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
22,527
(6.34 %)
23 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
21,415
(5.59 %)
24 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
32,283
(3.44 %)
25 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
26 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
5,093
(4.11 %)
27 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
4,963
(4.10 %)
28 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,542
(15.92 %)
19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
3,761
(0.66 %)
29 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
30 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
59,325
(10.76 %)
31 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
32 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,449
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
33 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
34 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
25,348
(3.39 %)
35 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
24,749
(4.05 %)
36 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
21,783
(2.16 %)
37 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
20,384
(2.28 %)
38 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
39 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
17,045
(1.23 %)
40 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
41 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
42 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
43 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
44 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
45 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
46 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
47 chickpea
GCF_000331145.1
41,971
(9.82 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
48 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
49 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
317,707
(8.50 %)
50 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
51 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
52 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
53 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
8,929
(0.83 %)
54 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
55 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
19,392
(13.60 %)
56 coffee C.arabica
GCF_003713225.1
80,738
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
57 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
58 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
59 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
60 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
61 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
62 common tobacco
GCF_000715135.1
100,805
(3.09 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
63 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
20,674
(1.12 %)
64 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
65 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,180
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
66 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
67 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,519
(10.54 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
68 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
69 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
70 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
48,987
(3.05 %)
71 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
72 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
73 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,204
(8.04 %)
15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
41,402
(3.02 %)
74 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,294
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
75 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
76 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
7,570
(0.50 %)
77 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,123
(8.58 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
78 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
79 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,127
(13.03 %)
15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
12,963
(1.47 %)
80 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
81 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,413
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
82 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
2,691
(0.38 %)
83 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,682
(12.36 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
84 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
81,500
(2.36 %)
85 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
86 field mustard
GCF_000309985.2
73,446
(34.56 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
87 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
325,103
(21.18 %)
88 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
27,883
(2.10 %)
89 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
90 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
91 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
105,766
(0.97 %)
92 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
41,032
(1.09 %)
93 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
9,731
(0.69 %)
94 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
95 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
96 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
97 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
98 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,722
(4.35 %)
17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
66,433
(1.82 %)
99 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
19,259
(1.41 %)
100 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
19,057
(20.99 %)
101 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
102 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,852
(82.09 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
103 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
104 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
105 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
106 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
107 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
8,698
(83.31 %)
108 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
n/a 1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
109 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
110 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
111 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
112 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
113 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,436
(21.51 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
114 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,021
(16.54 %)
14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
21,835
(6.05 %)
115 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
116 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
15,323
(1.42 %)
117 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
43,665
(1.21 %)
118 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
119 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,307
(7.38 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
120 horseweed
GCF_010389155.1
39,621
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
121 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
122 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
13,298
(2.56 %)
123 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
12,534
(1.92 %)
124 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
20,367
(2.62 %)
125 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
20,561
(3.01 %)
126 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
127 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,978
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
128 Japanese rice
GCF_001433935.1
53,556
(17.24 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
129 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,669
(10.38 %)
13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
5,914
(1.27 %)
130 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
60,198
(24.06 %)
131 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
160,781
(2.86 %)
132 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
30,057
(0.85 %)
133 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,525
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
134 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
135 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
4,827
(0.29 %)
136 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
107,342
(2.63 %)
137 maize
GCF_902167145.1
76,921
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
138 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
139 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
140 monocots
GCF_002575655.2
84,263
(2.17 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
141 mosses
GCF_000002425.4
55,129
(11.87 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
142 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
143 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
144 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
46,975
(10.56 %)
13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
18,232
(10.96 %)
145 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
146 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
147 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
148 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
149 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
150 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
151 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
152 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
153 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
154 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
380,989
(29.47 %)
155 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
156 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
542,998
(24.23 %)
157 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
158 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,476
(8.67 %)
20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
10,481
(0.65 %)
159 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
160 pineapple
GCF_001540865.1
43,024
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
161 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
162 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
163 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,101
(10.95 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
164 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
165 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,670
(6.66 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
166 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
167 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,155
(20.86 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
168 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
169 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
170 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
171 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
172 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
173 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
174 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,762
(6.74 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
175 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
176 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,563
(20.51 %)
36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
25,972
(4.13 %)
177 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,997
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
178 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,583
(19.25 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
179 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
180 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,516
(12.25 %)
15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
64,243
(6.17 %)
181 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,107
(1.58 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
182 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
31,789
(3.72 %)
183 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
184 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
185 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
186 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
187 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
188 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,175
(4.21 %)
22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
24,263
(0.70 %)
189 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,125
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
190 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
191 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
192 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
140,800
(5.87 %)
193 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
129,512
(5.41 %)
194 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
105,216
(10.11 %)
195 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
196 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
197 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
198 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
199 silver poplar
GCF_005239225.1
53,068
(14.65 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
200 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,735
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
201 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
202 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
109,923
(19.06 %)
203 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,003
(9.85 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
204 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
205 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,494
(5.76 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
206 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,405
(7.11 %)
12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
92,256
(5.21 %)
207 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
208 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
209 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
64,180
(3.80 %)
210 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
211 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
212 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
52,715
(3.15 %)
213 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
214 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
54,125
(5.80 %)
215 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,928
(40.16 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
216 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
217 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
218 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
219 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,847
(6.92 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
220 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
30,300
(3.29 %)
221 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
30,533
(2.95 %)
222 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
223 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,030
(4.11 %)
20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
27,646
(0.67 %)
224 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
225 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,094
(16.30 %)
14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
6,824
(1.28 %)
226 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
227 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
6,436
(2.63 %)
228 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
6,470
(2.86 %)
229 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
13,094
(2.48 %)
230 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
231 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
232 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,717
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
233 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
234 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
235 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
236 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
237 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,082
(6.20 %)
17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
48,556
(1.91 %)
238 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
239 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
71,885
(2.45 %)
240 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
241 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
36,435
(23.91 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
242 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
243 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
244 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
10,620
(1.04 %)
245 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,287
(10.68 %)
14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
11,751
(1.05 %)
246 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
6,701
(1.74 %)
247 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
248 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
249 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 249

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Primates 200 assemblies assembly stats track stats
Mammals 474 assemblies assembly stats track stats
Birds 299 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 648 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
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