Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1		 n/a 11,948
(1.86 %)		 22,509
(2.24 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 n/a 3,527
(100.00 %)		 361,147
(5.36 %)		 125,372
(0.75 %)		 5,917,083
(18.51 %)		 38,787
(3.82 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1		 n/a 12,926
(1.90 %)		 23,453
(2.26 %)		 n/a 43.30
(99.29 %)		 204
(0.71 %)		 112
(100.00 %)		 401,839
(5.61 %)		 145,540
(0.78 %)		 6,556,090
(19.22 %)		 40,986
(3.65 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1		 n/a 12,415
(1.42 %)		 23,266
(1.78 %)		 n/a 46.76
(99.99 %)		 1,555
(0.01 %)		 2,294
(100.00 %)		 1,077,039
(17.72 %)		 548,450
(13.79 %)		 4,965,697
(43.00 %)		 29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1		 n/a 11,832
(1.45 %)		 22,508
(1.87 %)		 n/a 46.81
(99.99 %)		 1,317
(0.01 %)		 4,491
(99.99 %)		 980,493
(17.23 %)		 496,946
(14.39 %)		 5,155,337
(42.38 %)		 28,236
(3.22 %)
5 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCF_026170545.1		 41,049
(4.47 %)		 11,830
(1.45 %)		 22,522
(1.87 %)		 n/a 46.81
(99.99 %)		 1,317
(0.01 %)		 4,489
(99.99 %)		 980,471
(17.23 %)		 496,933
(14.40 %)		 5,155,020
(42.38 %)		 28,236
(3.22 %)
6 Adelie penguin
GCF_000699105.1		 17,651
(3.05 %)		 11,763
(1.71 %)		 10,671
(1.99 %)		 n/a 41.51
(95.58 %)		 95,110
(4.45 %)		 114,374
(95.55 %)		 360,323
(4.64 %)		 126,490
(0.70 %)		 6,900,013
(18.31 %)		 27,176
(0.96 %)
7 African ostrich
GCF_000698965.1		 29,013
(4.42 %)		 12,011
(1.64 %)		 17,852
(1.82 %)		 34,707
(3.37 %)		 41.05
(96.74 %)		 72,649
(3.29 %)		 79,564
(96.71 %)		 321,765
(3.17 %)		 152,444
(0.82 %)		 7,196,207
(17.79 %)		 33,542
(1.33 %)
8 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1		 70,988
(5.69 %)		 14,024
(1.60 %)		 24,944
(1.95 %)		 n/a 44.34
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 710,321
(8.33 %)		 473,161
(7.22 %)		 5,692,215
(24.23 %)		 46,493
(8.90 %)
9 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1		 n/a 13,036
(1.56 %)		 32,740
(2.89 %)		 n/a 45.71
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 651,979
(9.34 %)		 459,653
(10.08 %)		 4,547,348
(28.27 %)		 49,261
(10.50 %)
10 American crow
GCF_000691975.1		 36,379
(6.32 %)		 12,151
(1.86 %)		 11,346
(2.24 %)		 n/a 41.85
(96.40 %)		 79,099
(3.62 %)		 89,646
(96.38 %)		 416,990
(6.08 %)		 224,964
(1.60 %)		 6,343,680
(18.42 %)		 20,148
(0.77 %)
11 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1		 n/a 12,384
(1.73 %)		 23,611
(2.05 %)		 n/a 43.35
(100.00 %)		 n/a 3,529
(100.00 %)		 496,877
(7.22 %)		 162,522
(0.74 %)		 6,684,675
(20.14 %)		 51,895
(5.89 %)
12 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1		 n/a 13,100
(1.79 %)		 23,372
(2.04 %)		 n/a 43.27
(99.31 %)		 280
(0.69 %)		 90
(100.00 %)		 538,004
(7.73 %)		 183,346
(0.79 %)		 7,056,270
(20.92 %)		 52,012
(5.96 %)
13 American kestrel (FMNH 100283 2023)
GCA_034782035.1		 n/a 12,381
(1.73 %)		 24,701
(2.09 %)		 n/a 42.11
(85.58 %)		 492,459
(14.58 %)		 507,420
(85.42 %)		 366,772
(2.72 %)		 158,507
(0.60 %)		 6,543,446
(15.57 %)		 31,184
(1.76 %)
14 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1		 n/a 11,084
(1.90 %)		 19,321
(2.14 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,803
(100.00 %)		 475,493
(7.41 %)		 223,791
(1.37 %)		 5,585,250
(20.30 %)		 14,903
(1.46 %)
15 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1		 31,091
(4.24 %)		 12,257
(1.95 %)		 14,633
(2.35 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 159
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,055
(1.51 %)		 6,092,276
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
16 bald eagle
GCF_000737465.1		 26,869
(3.49 %)		 13,007
(1.88 %)		 15,874
(2.35 %)		 n/a 41.68
(98.38 %)		 30,862
(1.63 %)		 31,786
(98.37 %)		 355,319
(3.99 %)		 119,526
(0.44 %)		 6,923,742
(18.48 %)		 33,353
(1.97 %)
17 band-tailed pigeon (hap1 2025)
GCF_037038585.1		 53,396
(5.03 %)		 13,483
(1.56 %)		 27,248
(2.08 %)		 n/a 44.11
(99.81 %)		 137
(0.19 %)		 360
(100.00 %)		 559,611
(7.44 %)		 512,210
(15.22 %)		 4,524,890
(33.96 %)		 44,009
(7.81 %)
18 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1		 36,326
(4.04 %)		 13,317
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 452
(100.00 %)		 700,166
(13.18 %)		 457,543
(13.85 %)		 4,522,973
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
19 band-tailed pigeon (v2 hap2 2025)
GCA_036971685.2		 n/a 12,277
(1.73 %)		 24,050
(2.22 %)		 n/a 43.61
(99.61 %)		 64
(0.39 %)		 441
(100.00 %)		 468,593
(5.54 %)		 342,626
(9.43 %)		 5,110,790
(27.39 %)		 38,807
(6.05 %)
20 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1		 15,393
(2.18 %)		 11,432
(1.52 %)		 23,733
(1.98 %)		 n/a 41.38
(99.58 %)		 50,921
(0.42 %)		 105,649
(99.58 %)		 386,871
(6.20 %)		 142,825
(0.82 %)		 6,474,942
(19.87 %)		 18,662
(0.63 %)
21 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1		 46,583
(5.22 %)		 13,036
(1.82 %)		 22,849
(2.14 %)		 n/a 41.65
(95.89 %)		 259
(4.11 %)		 70
(100.00 %)		 610,994
(5.59 %)		 254,870
(1.12 %)		 7,109,716
(19.00 %)		 38,384
(2.94 %)
22 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3		 n/a 11,132
(1.94 %)		 20,993
(2.40 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,476
(100.00 %)		 550,072
(10.78 %)		 282,378
(2.00 %)		 5,634,117
(20.43 %)		 30,305
(2.79 %)
23 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2		 41,925
(5.13 %)		 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
24 Bengalese finch
GCF_005870125.1		 32,857
(5.06 %)		 12,604
(1.98 %)		 23,707
(2.41 %)		 n/a 41.59
(97.06 %)		 37,862
(2.95 %)		 2,015
(100.00 %)		 507,898
(7.97 %)		 424,913
(2.80 %)		 6,456,852
(20.03 %)		 29,692
(2.46 %)
25 Bengalese finch (primary hap 2025)
GCA_050655825.1		 n/a 13,048
(1.63 %)		 34,019
(2.92 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 446,796
(3.15 %)		 574,311
(13.28 %)		 5,624,976
(30.52 %)		 44,020
(6.45 %)
26 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1		 n/a 13,007
(1.87 %)		 23,375
(2.27 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 439
(0.01 %)		 592
(100.00 %)		 467,217
(6.83 %)		 273,604
(2.43 %)		 6,154,114
(21.83 %)		 23,203
(2.12 %)
27 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1		 n/a 12,101
(1.93 %)		 21,258
(2.30 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 344
(0.01 %)		 525
(100.00 %)		 412,944
(6.30 %)		 232,333
(2.21 %)		 5,715,517
(21.35 %)		 20,873
(2.13 %)
28 bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023)
GCF_031753505.1		 53,868
(5.67 %)		 12,992
(1.79 %)		 25,575
(2.33 %)		 n/a 43.43
(99.99 %)		 431
(0.01 %)		 1,370
(100.00 %)		 437,810
(3.71 %)		 484,607
(8.45 %)		 5,614,533
(25.04 %)		 45,374
(4.99 %)
29 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1		 n/a 12,607
(2.39 %)		 22,429
(2.59 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 425
(100.00 %)		 521,486
(5.26 %)		 266,418
(2.40 %)		 5,305,054
(20.63 %)		 19,590
(2.16 %)
30 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1		 n/a 12,731
(2.42 %)		 22,580
(2.63 %)		 n/a 41.64
(99.99 %)		 330
(0.01 %)		 191
(100.00 %)		 520,888
(5.33 %)		 274,030
(2.07 %)		 5,360,112
(20.48 %)		 19,673
(2.18 %)
31 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1		 46,130
(4.40 %)		 13,292
(1.73 %)		 24,384
(2.16 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 993
(100.00 %)		 514,287
(6.54 %)		 355,123
(8.64 %)		 5,531,059
(27.22 %)		 28,362
(1.86 %)
32 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1		 42,284
(5.19 %)		 12,694
(1.84 %)		 25,490
(2.39 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 339
(0.00 %)		 3,792
(100.00 %)		 398,368
(3.10 %)		 569,232
(5.31 %)		 6,675,899
(23.29 %)		 31,995
(2.37 %)
33 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2		 41,434
(4.72 %)		 13,027
(1.98 %)		 22,616
(2.25 %)		 n/a 41.96
(99.99 %)		 130
(0.01 %)		 568
(100.00 %)		 636,501
(5.67 %)		 297,964
(1.45 %)		 6,820,083
(21.47 %)		 31,725
(3.49 %)
34 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1		 44,401
(4.96 %)		 13,738
(1.81 %)		 26,691
(2.34 %)		 n/a 42.41
(99.92 %)		 404
(0.08 %)		 307
(100.00 %)		 730,165
(12.91 %)		 566,529
(6.51 %)		 6,499,984
(24.36 %)		 42,650
(2.59 %)
35 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1		 n/a 11,495
(1.90 %)		 22,202
(2.49 %)		 n/a 42.77
(99.94 %)		 240
(0.06 %)		 157
(100.00 %)		 560,436
(11.20 %)		 441,102
(7.11 %)		 5,126,888
(23.42 %)		 35,457
(2.90 %)
36 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1		 n/a 12,902
(1.75 %)		 23,180
(2.09 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 498,044
(5.37 %)		 199,557
(4.44 %)		 6,843,616
(23.12 %)		 42,444
(3.62 %)
37 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1		 n/a 13,244
(1.58 %)		 25,111
(1.96 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 462
(0.01 %)		 729
(100.00 %)		 516,350
(4.84 %)		 268,175
(14.83 %)		 5,880,256
(31.31 %)		 45,313
(4.92 %)
38 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1		 46,133
(4.67 %)		 13,243
(1.58 %)		 24,048
(1.89 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 462
(0.01 %)		 728
(100.00 %)		 516,346
(4.84 %)		 268,169
(14.83 %)		 5,880,218
(31.31 %)		 45,313
(4.92 %)
39 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1		 51,115
(5.11 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
40 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1		 n/a 12,650
(1.68 %)		 22,959
(2.02 %)		 n/a 44.62
(99.95 %)		 223
(0.05 %)		 733
(100.00 %)		 483,413
(5.25 %)		 221,284
(9.35 %)		 6,264,499
(27.26 %)		 42,776
(4.88 %)
41 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1		 n/a 12,249
(1.86 %)		 23,692
(2.34 %)		 n/a 42.36
(99.99 %)		 970
(0.01 %)		 600
(100.00 %)		 491,914
(6.04 %)		 365,884
(2.89 %)		 6,453,998
(20.73 %)		 30,076
(2.44 %)
42 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1		 n/a 11,586
(1.87 %)		 22,618
(2.41 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,566
(100.00 %)		 473,456
(5.97 %)		 308,518
(2.29 %)		 5,987,640
(19.64 %)		 25,451
(2.38 %)
43 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1		 31,610
(4.74 %)		 12,379
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 190
(100.00 %)		 582,016
(10.36 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,626
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
44 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1		 n/a 13,064
(1.75 %)		 25,241
(2.27 %)		 n/a 43.65
(99.99 %)		 393
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 727,985
(19.18 %)		 342,327
(5.00 %)		 5,822,377
(25.13 %)		 40,586
(3.99 %)
45 blue jay (hap2 2024)
GCA_046129645.1		 n/a 12,260
(1.70 %)		 24,683
(2.22 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 333
(0.01 %)		 309
(100.00 %)		 878,243
(23.54 %)		 375,593
(6.42 %)		 4,946,505
(29.07 %)		 43,182
(4.25 %)
46 blue tit
GCF_002901205.1		 42,986
(5.81 %)		 12,162
(1.76 %)		 16,442
(2.29 %)		 n/a 41.18
(92.58 %)		 24,797
(7.42 %)		 29,297
(100.00 %)		 486,455
(6.02 %)		 423,142
(2.68 %)		 6,777,615
(18.84 %)		 26,565
(0.98 %)
47 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1		 n/a 12,919
(1.77 %)		 22,770
(2.15 %)		 n/a 42.69
(99.92 %)		 107
(0.08 %)		 246
(100.00 %)		 711,670
(17.55 %)		 242,430
(5.04 %)		 5,545,074
(24.84 %)		 25,153
(2.06 %)
48 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1		 n/a 13,216
(1.69 %)		 23,855
(2.07 %)		 n/a 43.30
(99.92 %)		 130
(0.08 %)		 274
(100.00 %)		 746,174
(21.96 %)		 291,116
(9.91 %)		 5,424,976
(28.69 %)		 26,750
(2.02 %)
49 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1		 42,586
(5.25 %)		 12,442
(1.93 %)		 16,972
(2.49 %)		 n/a 41.74
(97.93 %)		 22,456
(2.07 %)		 23,501
(97.93 %)		 470,567
(6.92 %)		 226,975
(1.27 %)		 6,395,476
(19.17 %)		 24,084
(1.85 %)
50 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1		 n/a 12,250
(1.92 %)		 19,607
(2.10 %)		 n/a 41.72
(93.42 %)		 3,560,856
(6.92 %)		 1,498
(100.00 %)		 559,187
(10.05 %)		 144,509
(0.66 %)		 5,883,053
(17.90 %)		 18,581
(1.17 %)
51 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1		 n/a 12,339
(1.91 %)		 20,350
(2.13 %)		 n/a 41.72
(93.49 %)		 3,559,082
(6.85 %)		 3,232
(100.00 %)		 501,831
(8.21 %)		 144,313
(0.66 %)		 5,882,906
(17.92 %)		 18,584
(1.17 %)
52 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1		 43,924
(4.72 %)		 13,092
(1.91 %)		 23,195
(2.31 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 1,864
(100.00 %)		 469,079
(6.31 %)		 205,954
(1.49 %)		 5,911,944
(20.89 %)		 22,555
(1.70 %)
53 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1		 n/a 13,202
(1.80 %)		 24,416
(2.14 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 569
(100.00 %)		 832,469
(7.06 %)		 531,644
(7.37 %)		 6,294,434
(28.49 %)		 34,786
(3.61 %)
54 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1		 n/a 12,578
(1.76 %)		 23,066
(2.06 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 720
(100.00 %)		 773,452
(7.75 %)		 522,491
(10.88 %)		 5,592,104
(31.80 %)		 33,981
(4.60 %)
55 bronzed cowbird (106 2024)
GCF_037042795.1		 30,276
(4.54 %)		 12,775
(1.77 %)		 24,737
(2.30 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 528
(100.00 %)		 410,661
(3.03 %)		 498,610
(9.50 %)		 6,332,690
(26.06 %)		 33,278
(2.51 %)
56 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1		 n/a 13,027
(2.37 %)		 22,748
(2.48 %)		 n/a 41.03
(98.67 %)		 114,232
(1.35 %)		 2,408
(100.00 %)		 523,649
(0.00 %)		 228,783
(1.17 %)		 6,134,418
(20.24 %)		 19,702
(2.00 %)
57 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2		 31,884
(5.31 %)		 12,561
(1.89 %)		 24,218
(2.41 %)		 n/a 42.40
(99.99 %)		 318
(0.01 %)		 692
(99.99 %)		 598,355
(12.36 %)		 420,712
(3.73 %)		 6,496,704
(21.26 %)		 28,568
(2.41 %)
58 brown kiwi
GCF_001039765.1		 26,121
(3.23 %)		 12,909
(1.54 %)		 23,267
(1.91 %)		 n/a 41.28
(86.08 %)		 368,297
(13.97 %)		 24,718
(100.00 %)		 367,446
(2.94 %)		 316,602
(7.36 %)		 7,164,456
(14.67 %)		 59,756
(2.40 %)
59 brown roatelo
GCF_000695765.1		 16,756
(2.26 %)		 12,208
(1.55 %)		 27,079
(2.12 %)		 n/a 41.32
(99.66 %)		 51,602
(0.35 %)		 119,122
(99.65 %)		 345,102
(5.17 %)		 194,444
(1.21 %)		 6,441,258
(19.39 %)		 19,018
(0.67 %)
60 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1		 n/a 12,659
(1.89 %)		 22,063
(2.28 %)		 n/a 41.89
(94.20 %)		 388
(5.80 %)		 930
(100.00 %)		 504,677
(9.95 %)		 268,616
(3.12 %)		 5,481,198
(20.78 %)		 20,278
(1.55 %)
61 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1		 32,025
(4.32 %)		 13,239
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 864
(100.00 %)		 538,374
(10.19 %)		 279,504
(3.12 %)		 5,874,531
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
62 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1		 n/a 13,127
(1.94 %)		 22,492
(2.30 %)		 n/a 41.84
(98.98 %)		 737
(1.02 %)		 330
(100.00 %)		 505,478
(9.66 %)		 231,633
(2.15 %)		 5,778,405
(20.30 %)		 20,205
(1.61 %)
63 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1		 25,525
(4.05 %)		 12,188
(1.82 %)		 15,819
(2.26 %)		 n/a 41.25
(97.26 %)		 51,022
(2.75 %)		 70,863
(97.25 %)		 465,974
(9.37 %)		 127,353
(0.54 %)		 5,864,264
(19.05 %)		 15,886
(0.88 %)
64 burrowing owl
GCF_003259725.1		 30,559
(4.30 %)		 11,741
(1.72 %)		 10,976
(2.04 %)		 n/a 40.92
(98.92 %)		 33,737
(1.09 %)		 445
(100.00 %)		 492,320
(6.21 %)		 182,281
(0.73 %)		 6,811,984
(19.35 %)		 22,840
(1.08 %)
65 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1		 n/a 11,551
(1.57 %)		 22,390
(2.09 %)		 n/a 44.21
(99.99 %)		 1,672
(0.01 %)		 3,563
(100.00 %)		 465,417
(6.39 %)		 218,050
(11.40 %)		 4,588,632
(30.42 %)		 22,622
(2.16 %)
66 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1		 n/a 12,725
(1.54 %)		 24,572
(2.13 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 319
(0.00 %)		 964
(100.00 %)		 522,782
(6.36 %)		 226,563
(14.09 %)		 5,497,483
(32.27 %)		 24,529
(1.77 %)
67 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2		 27,527
(3.38 %)		 12,653
(1.75 %)		 21,924
(1.97 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 434,141
(3.82 %)		 177,389
(0.88 %)		 7,171,770
(20.32 %)		 34,918
(3.00 %)
68 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1		 n/a 12,948
(1.71 %)		 24,838
(2.01 %)		 n/a 43.36
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,359,516
(35.69 %)		 599,039
(11.78 %)		 3,454,101
(36.94 %)		 36,496
(2.55 %)
69 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1		 n/a 12,718
(2.12 %)		 23,363
(2.40 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 287
(0.00 %)		 608
(100.00 %)		 881,563
(19.85 %)		 308,707
(5.50 %)		 5,409,060
(25.34 %)		 25,268
(2.42 %)
70 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1		 28,823
(3.21 %)		 12,791
(1.50 %)		 26,511
(2.06 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 n/a 627
(100.00 %)		 473,712
(3.18 %)		 586,987
(10.80 %)		 4,965,312
(32.86 %)		 48,369
(2.73 %)
71 Canada goose (primary hap 2025)
GCA_965231335.1		 n/a 13,367
(1.74 %)		 24,033
(2.05 %)		 n/a 44.13
(99.99 %)		 531
(0.01 %)		 614
(100.00 %)		 686,641
(5.40 %)		 437,049
(11.66 %)		 6,060,316
(29.86 %)		 41,213
(4.57 %)
72 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1		 n/a 13,061
(1.95 %)		 24,149
(2.23 %)		 n/a 42.13
(98.37 %)		 15,389
(1.64 %)		 28,876
(98.36 %)		 715,113
(7.61 %)		 319,386
(1.67 %)		 6,810,836
(21.27 %)		 40,389
(4.15 %)
73 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1		 n/a 12,381
(1.76 %)		 28,865
(2.78 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 3,296
(100.00 %)		 542,765
(7.77 %)		 204,389
(1.06 %)		 6,415,832
(21.53 %)		 31,638
(2.54 %)
74 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1		 n/a 12,740
(1.82 %)		 28,031
(2.77 %)		 n/a 42.88
(99.47 %)		 269
(0.53 %)		 109
(100.00 %)		 556,926
(7.87 %)		 213,180
(1.09 %)		 6,641,077
(21.58 %)		 30,881
(2.41 %)
75 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1		 n/a 12,708
(1.72 %)		 24,978
(2.26 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 573
(0.01 %)		 467
(100.00 %)		 495,590
(3.15 %)		 493,628
(13.34 %)		 6,163,336
(28.37 %)		 39,042
(6.25 %)
76 chestnut-breasted malkoha (KB17595 2023)
GCF_032191515.1		 36,882
(4.04 %)		 13,316
(1.67 %)		 25,480
(2.15 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 587
(100.00 %)		 486,715
(8.57 %)		 476,696
(11.88 %)		 6,153,538
(29.89 %)		 33,146
(2.23 %)
77 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1		 n/a 11,740
(2.36 %)		 21,473
(2.56 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 2,263
(100.00 %)		 551,116
(10.78 %)		 241,638
(4.43 %)		 4,973,260
(21.77 %)		 21,151
(2.71 %)
78 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1		 n/a 13,037
(2.20 %)		 23,550
(2.37 %)		 n/a 42.31
(99.81 %)		 460
(0.19 %)		 252
(100.00 %)		 681,166
(12.04 %)		 381,093
(7.09 %)		 5,610,806
(24.65 %)		 25,664
(2.75 %)
79 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6		 62,183
(8.40 %)		 13,099
(2.32 %)		 18,797
(2.76 %)		 73,407
(9.29 %)		 42.23
(99.08 %)		 952
(0.92 %)		 2,380
(99.08 %)		 684,052
(12.74 %)		 307,144
(2.92 %)		 5,863,131
(21.16 %)		 24,405
(2.72 %)
80 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2		 n/a 13,405
(2.26 %)		 24,435
(2.45 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 704,190
(12.54 %)		 502,701
(5.74 %)		 5,731,097
(23.50 %)		 27,781
(2.90 %)
81 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1		 n/a 11,339
(2.33 %)		 20,588
(2.51 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,684
(100.00 %)		 537,847
(10.84 %)		 217,964
(3.81 %)		 4,879,985
(21.43 %)		 19,653
(2.66 %)
82 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1		 n/a 12,855
(2.22 %)		 23,147
(2.37 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 566
(0.26 %)		 246
(100.00 %)		 672,973
(12.00 %)		 342,156
(6.53 %)		 5,690,712
(23.98 %)		 24,413
(2.63 %)
83 chicken (Silkie 2023)
GCA_034509865.1		 n/a 13,116
(2.18 %)		 24,675
(2.43 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 1,100
(100.00 %)		 539,764
(6.24 %)		 361,584
(6.68 %)		 5,543,095
(24.80 %)		 27,013
(3.08 %)
84 chicken (Wuding W17 2024)
GCA_030914275.2		 n/a 13,176
(2.39 %)		 23,363
(2.52 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 311
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 499,477
(5.56 %)		 293,096
(1.94 %)		 6,026,265
(20.73 %)		 23,340
(2.53 %)
85 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2		 84,120
(9.95 %)		 13,128
(2.33 %)		 23,484
(2.48 %)		 72,013
(9.34 %)		 42.20
(99.68 %)		 463
(0.32 %)		 677
(99.68 %)		 697,827
(12.53 %)		 290,892
(2.63 %)		 5,887,021
(21.30 %)		 24,469
(2.59 %)
86 Chilean tinamou
GCF_003342845.1		 24,894
(4.16 %)		 12,545
(2.09 %)		 18,167
(2.87 %)		 n/a 42.04
(98.74 %)		 1,226,739
(1.39 %)		 2,217
(100.00 %)		 496,518
(5.43 %)		 290,573
(1.50 %)		 5,870,743
(19.53 %)		 44,640
(5.21 %)
87 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2		 15,969
(2.53 %)		 12,045
(1.82 %)		 18,580
(2.07 %)		 n/a 41.40
(96.00 %)		 65,471
(4.02 %)		 84,174
(95.98 %)		 469,979
(5.99 %)		 194,781
(2.21 %)		 6,361,618
(19.70 %)		 12,438
(0.41 %)
88 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2		 17,193
(2.21 %)		 12,092
(1.49 %)		 28,685
(1.89 %)		 n/a 40.76
(99.62 %)		 56,333
(0.39 %)		 125,214
(99.61 %)		 516,189
(5.36 %)		 202,882
(1.12 %)		 6,588,198
(20.47 %)		 8,029
(0.24 %)
89 collared flycatcher
GCF_000247815.1		 28,373
(4.07 %)		 12,200
(1.78 %)		 14,028
(2.24 %)		 33,113
(3.87 %)		 44.22
(98.57 %)		 11,403
(1.43 %)		 30,843
(98.57 %)		 559,053
(7.88 %)		 597,207
(11.39 %)		 6,656,400
(23.61 %)		 29,879
(1.50 %)
90 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024 refseq)
GCF_964188355.1		 47,259
(5.02 %)		 13,511
(1.75 %)		 24,417
(2.13 %)		 n/a 43.17
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 1,014
(99.99 %)		 438,903
(4.62 %)		 244,861
(6.73 %)		 6,778,359
(23.94 %)		 43,399
(4.80 %)
91 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1		 n/a 13,593
(1.72 %)		 24,541
(2.09 %)		 n/a 43.49
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 929
(99.99 %)		 439,011
(4.19 %)		 247,629
(8.40 %)		 6,711,875
(25.06 %)		 49,141
(4.61 %)
92 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1		 32,998
(4.99 %)		 12,248
(1.89 %)		 15,910
(2.38 %)		 n/a 42.17
(98.21 %)		 47,138
(1.81 %)		 3,536
(100.00 %)		 477,249
(6.30 %)		 313,951
(2.10 %)		 6,525,604
(19.58 %)		 25,722
(1.90 %)
93 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1		 41,403
(5.57 %)		 12,314
(1.93 %)		 23,133
(2.37 %)		 n/a 42.36
(99.95 %)		 1,055
(0.05 %)		 685
(100.00 %)		 553,077
(10.89 %)		 322,311
(2.75 %)		 6,543,183
(20.47 %)		 26,268
(2.31 %)
94 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1		 n/a 12,464
(1.91 %)		 24,623
(2.50 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 505,582
(10.93 %)		 292,484
(2.48 %)		 6,061,828
(21.38 %)		 24,010
(1.80 %)
95 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1		 50,206
(6.30 %)		 13,190
(1.85 %)		 24,284
(2.29 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 150
(100.00 %)		 566,161
(11.56 %)		 310,430
(2.36 %)		 6,712,791
(21.76 %)		 25,268
(1.73 %)
96 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1		 n/a 13,374
(1.90 %)		 24,308
(2.28 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 544
(100.00 %)		 751,865
(6.78 %)		 400,294
(3.80 %)		 6,184,781
(24.97 %)		 35,712
(2.66 %)
97 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1		 n/a 12,976
(1.68 %)		 23,758
(2.12 %)		 n/a 44.70
(99.99 %)		 603
(0.01 %)		 845
(100.00 %)		 499,923
(5.57 %)		 250,214
(7.38 %)		 6,350,978
(25.68 %)		 27,790
(2.32 %)
98 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1		 n/a 12,745
(1.75 %)		 23,052
(2.18 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 931
(99.99 %)		 483,812
(5.59 %)		 210,131
(3.30 %)		 6,332,994
(22.33 %)		 26,285
(2.20 %)
99 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1		 n/a 10,692
(1.77 %)		 20,925
(2.29 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,221
(100.00 %)		 328,602
(4.16 %)		 604,057
(8.02 %)		 5,233,128
(25.06 %)		 25,210
(3.70 %)
100 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1		 n/a 12,560
(1.73 %)		 23,740
(2.16 %)		 n/a 42.32
(99.80 %)		 435
(0.20 %)		 455
(100.00 %)		 395,254
(5.40 %)		 937,774
(11.00 %)		 6,145,808
(28.07 %)		 32,293
(3.87 %)
101 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1		 n/a 13,505
(1.83 %)		 24,961
(2.21 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 474
(0.01 %)		 870
(100.00 %)		 833,892
(8.17 %)		 576,230
(8.04 %)		 6,149,355
(27.84 %)		 34,089
(2.69 %)
102 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1		 n/a 12,828
(1.96 %)		 23,534
(2.35 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 405
(0.01 %)		 767
(99.99 %)		 725,169
(7.34 %)		 472,156
(5.81 %)		 5,786,296
(25.35 %)		 30,917
(2.80 %)
103 common starling
GCF_001447265.1		 28,711
(4.57 %)		 12,585
(2.01 %)		 17,785
(2.59 %)		 n/a 41.49
(97.70 %)		 23,392
(2.31 %)		 22,666
(97.69 %)		 427,543
(5.30 %)		 310,445
(1.74 %)		 6,482,337
(19.49 %)		 23,883
(1.99 %)
104 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1		 n/a 11,653
(1.89 %)		 19,731
(2.20 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,697
(100.00 %)		 443,384
(6.09 %)		 185,968
(1.18 %)		 5,916,553
(20.88 %)		 18,864
(1.75 %)
105 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1		 39,999
(4.95 %)		 12,292
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 110
(100.00 %)		 499,695
(6.70 %)		 199,749
(1.12 %)		 6,354,003
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
106 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1		 n/a 12,773
(1.79 %)		 24,751
(2.23 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 n/a 2,235
(100.00 %)		 549,460
(7.58 %)		 204,051
(1.02 %)		 6,880,566
(20.70 %)		 47,352
(3.95 %)
107 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1		 n/a 13,103
(1.81 %)		 24,044
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.16 %)		 205
(0.84 %)		 123
(100.00 %)		 570,312
(7.91 %)		 216,895
(1.04 %)		 7,043,151
(20.98 %)		 45,694
(3.73 %)
108 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1		 n/a 10,611
(1.77 %)		 21,125
(2.21 %)		 n/a 41.77
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,976
(100.00 %)		 422,889
(5.99 %)		 294,928
(2.71 %)		 5,928,421
(19.76 %)		 21,397
(1.91 %)
109 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1		 n/a 11,741
(1.82 %)		 22,382
(2.29 %)		 n/a 42.01
(98.73 %)		 1,479
(1.27 %)		 278
(100.00 %)		 476,049
(6.38 %)		 367,108
(3.16 %)		 6,576,957
(20.43 %)		 25,004
(2.02 %)
110 Cory's shearwater (hap1.2 2024)
GCA_964195595.2		 n/a 13,703
(1.71 %)		 25,586
(2.06 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 362
(100.00 %)		 478,943
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,061
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
111 Cory's shearwater (hap2.2 2024)
GCA_964196065.2		 n/a 12,808
(1.80 %)		 23,455
(2.11 %)		 n/a 43.33
(99.99 %)		 478
(0.01 %)		 759
(99.99 %)		 415,430
(4.64 %)		 280,099
(4.96 %)		 6,158,105
(23.65 %)		 43,892
(4.58 %)
112 crested eagle (hap1 2024)
GCA_045345505.1		 n/a 12,782
(1.65 %)		 24,376
(2.35 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 548
(100.00 %)		 675,525
(20.31 %)		 325,345
(11.43 %)		 5,483,869
(28.16 %)		 52,371
(8.51 %)
113 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1		 n/a 13,656
(1.49 %)		 27,669
(2.31 %)		 n/a 44.30
(100.00 %)		 164
(0.00 %)		 544
(100.00 %)		 765,672
(26.88 %)		 431,376
(14.19 %)		 5,221,201
(33.63 %)		 63,565
(10.48 %)
114 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1		 17,147
(2.52 %)		 12,801
(1.77 %)		 14,062
(2.19 %)		 n/a 41.83
(97.20 %)		 70,475
(2.81 %)		 130,030
(97.19 %)		 395,055
(4.53 %)		 182,744
(0.97 %)		 7,244,849
(18.69 %)		 39,156
(2.06 %)
115 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1		 16,484
(2.21 %)		 12,195
(1.53 %)		 24,940
(1.96 %)		 n/a 41.82
(99.74 %)		 56,010
(0.27 %)		 113,170
(99.73 %)		 349,912
(4.65 %)		 131,678
(0.66 %)		 6,778,773
(18.46 %)		 35,090
(1.44 %)
116 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1		 n/a 13,157
(1.67 %)		 30,413
(2.59 %)		 n/a 43.53
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 609,076
(8.83 %)		 331,584
(6.01 %)		 5,966,458
(23.99 %)		 45,694
(7.05 %)
117 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1		 n/a 13,044
(1.66 %)		 30,275
(2.65 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 271
(0.00 %)		 295
(100.00 %)		 603,184
(8.76 %)		 324,082
(7.37 %)		 6,147,876
(25.10 %)		 44,051
(8.95 %)
118 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1		 n/a 12,766
(1.68 %)		 26,055
(2.18 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 7,284
(100.00 %)		 607,561
(13.23 %)		 239,649
(4.41 %)		 6,086,519
(23.21 %)		 38,398
(5.49 %)
119 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1		 16,438
(2.13 %)		 11,927
(1.44 %)		 25,409
(1.84 %)		 n/a 41.39
(99.65 %)		 57,580
(0.36 %)		 121,562
(99.64 %)		 394,453
(5.19 %)		 159,315
(0.83 %)		 6,832,864
(19.52 %)		 25,648
(0.91 %)
120 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1		 n/a 13,457
(1.72 %)		 25,299
(2.10 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 390
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 660,747
(14.47 %)		 294,268
(5.22 %)		 6,840,996
(24.63 %)		 39,705
(5.14 %)
121 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1		 n/a 13,401
(1.75 %)		 24,999
(2.15 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 930
(0.01 %)		 819
(100.00 %)		 685,992
(5.59 %)		 452,303
(8.91 %)		 5,976,185
(28.48 %)		 43,672
(4.38 %)
122 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1		 n/a 12,473
(1.84 %)		 22,849
(2.21 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 1,135
(99.99 %)		 594,136
(5.06 %)		 375,813
(7.54 %)		 5,497,978
(26.76 %)		 39,164
(4.55 %)
123 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1		 n/a 11,732
(1.74 %)		 22,080
(2.25 %)		 n/a 45.44
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,342
(100.00 %)		 921,959
(20.95 %)		 334,804
(3.26 %)		 5,352,773
(31.27 %)		 24,105
(1.81 %)
124 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1		 25,483
(3.24 %)		 12,410
(1.70 %)		 22,416
(2.11 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 180
(100.00 %)		 1,259,627
(26.52 %)		 378,533
(3.38 %)		 5,846,661
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
125 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1		 16,274
(2.23 %)		 12,032
(1.55 %)		 26,131
(1.84 %)		 n/a 41.21
(99.65 %)		 58,359
(0.36 %)		 111,850
(99.64 %)		 374,845
(4.51 %)		 130,655
(0.66 %)		 6,753,184
(18.86 %)		 26,202
(0.96 %)
126 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1		 n/a 11,799
(1.88 %)		 22,122
(2.30 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 457,930
(6.40 %)		 150,544
(0.85 %)		 6,074,490
(20.16 %)		 33,323
(3.81 %)
127 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1		 n/a 13,276
(1.84 %)		 25,393
(2.30 %)		 n/a 42.38
(99.61 %)		 144
(0.39 %)		 105
(100.00 %)		 548,862
(7.06 %)		 187,966
(0.97 %)		 7,004,597
(21.19 %)		 36,626
(3.69 %)
128 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1		 38,171
(5.79 %)		 12,559
(1.96 %)		 23,642
(2.48 %)		 n/a 42.01
(99.99 %)		 582
(0.01 %)		 587
(100.00 %)		 599,051
(9.46 %)		 453,954
(3.77 %)		 6,287,657
(20.75 %)		 27,831
(2.52 %)
129 elegant crested-tinamou (YG026_01 alternate hap 2025)
GCA_047922975.1		 n/a 12,085
(2.00 %)		 23,151
(2.57 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 359
(100.00 %)		 416,542
(4.17 %)		 324,013
(7.62 %)		 5,021,818
(23.94 %)		 44,588
(10.08 %)
130 elegant crested-tinamou (YG026_01 primary hap 2025)
GCA_047922985.1		 n/a 13,193
(1.91 %)		 25,746
(2.48 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 299
(0.00 %)		 397
(100.00 %)		 486,339
(4.61 %)		 408,335
(8.96 %)		 5,589,546
(25.37 %)		 51,487
(9.83 %)
131 emperor penguin
GCF_000699145.1		 20,055
(3.28 %)		 12,513
(1.77 %)		 11,986
(2.13 %)		 n/a 41.62
(94.30 %)		 72,501
(5.72 %)		 83,173
(94.28 %)		 478,239
(5.68 %)		 200,181
(2.24 %)		 7,154,684
(17.95 %)		 31,615
(1.38 %)
132 emu (2018)
GCF_003342905.1		 36,047
(5.11 %)		 12,857
(1.77 %)		 17,727
(2.32 %)		 n/a 41.63
(99.02 %)		 1,408,082
(1.11 %)		 2,778
(100.00 %)		 440,224
(4.29 %)		 175,539
(0.70 %)		 7,218,815
(17.59 %)		 43,752
(4.64 %)
133 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1		 54,479
(5.65 %)		 13,972
(1.59 %)		 25,695
(1.97 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 271
(100.00 %)		 713,839
(12.11 %)		 418,774
(7.08 %)		 5,668,105
(24.04 %)		 51,137
(7.32 %)
134 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1		 n/a 12,839
(1.57 %)		 24,113
(1.98 %)		 n/a 44.40
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 242
(100.00 %)		 657,460
(14.23 %)		 397,600
(8.84 %)		 4,824,789
(26.94 %)		 48,081
(7.49 %)
135 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2		 n/a 13,213
(1.74 %)		 24,562
(2.10 %)		 n/a 42.41
(99.99 %)		 539
(0.01 %)		 767
(100.00 %)		 567,285
(7.79 %)		 258,030
(2.59 %)		 7,108,005
(19.16 %)		 41,752
(6.24 %)
136 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1		 n/a 13,292
(1.69 %)		 25,387
(2.13 %)		 n/a 41.80
(99.99 %)		 696
(0.01 %)		 2,451
(100.00 %)		 489,065
(4.78 %)		 331,025
(13.58 %)		 6,196,233
(29.98 %)		 37,567
(3.51 %)
137 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1		 n/a 13,051
(1.80 %)		 24,815
(2.25 %)		 n/a 42.33
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 584
(100.00 %)		 482,819
(5.02 %)		 292,761
(7.61 %)		 6,282,928
(25.46 %)		 35,630
(3.58 %)
138 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1		 n/a 13,457
(1.70 %)		 24,519
(2.05 %)		 n/a 44.24
(99.99 %)		 593
(0.01 %)		 754
(100.00 %)		 516,462
(4.57 %)		 262,941
(8.12 %)		 5,356,948
(26.79 %)		 48,488
(7.36 %)
139 Eurasian curlew (bNumArq3.hap1.1 2024)
GCF_964106895.1		 25,833
(3.19 %)		 13,237
(1.66 %)		 24,506
(2.02 %)		 n/a 43.98
(99.99 %)		 785
(0.01 %)		 2,603
(99.99 %)		 600,297
(6.45 %)		 616,755
(7.75 %)		 5,606,958
(28.35 %)		 39,862
(3.53 %)
140 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1		 n/a 13,239
(1.66 %)		 24,512
(2.02 %)		 n/a 43.98
(99.99 %)		 785
(0.01 %)		 1,834
(100.00 %)		 600,399
(6.45 %)		 616,756
(7.75 %)		 5,607,190
(28.35 %)		 39,863
(3.53 %)
141 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1		 n/a 12,728
(1.78 %)		 23,645
(2.18 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,504
(99.99 %)		 544,959
(6.24 %)		 393,773
(4.49 %)		 5,839,698
(24.52 %)		 35,759
(3.26 %)
142 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1		 n/a 12,266
(1.90 %)		 22,091
(2.30 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 2,502
(100.00 %)		 458,278
(5.64 %)		 212,205
(1.54 %)		 6,032,224
(21.16 %)		 21,942
(1.89 %)
143 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1		 n/a 13,040
(1.86 %)		 22,823
(2.21 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 121
(100.00 %)		 595,803
(8.38 %)		 248,128
(1.78 %)		 6,744,611
(22.18 %)		 24,805
(1.90 %)
144 Eurasian spoonbill (hap1.1 2025)
GCA_965183815.1		 n/a 13,660
(1.73 %)		 24,623
(2.04 %)		 n/a 43.62
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 669
(100.00 %)		 956,977
(14.04 %)		 311,174
(4.10 %)		 5,758,263
(23.26 %)		 48,161
(5.09 %)
145 Eurasian spoonbill (hap2.1 2025)
GCA_965183785.1		 n/a 12,564
(1.79 %)		 22,613
(2.13 %)		 n/a 43.52
(99.99 %)		 604
(0.01 %)		 1,012
(99.99 %)		 595,219
(12.96 %)		 265,149
(4.02 %)		 6,214,797
(22.29 %)		 41,397
(4.95 %)
146 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1		 43,477
(5.70 %)		 12,550
(1.95 %)		 24,541
(2.43 %)		 n/a 42.02
(99.82 %)		 4,765
(0.18 %)		 18,975
(100.00 %)		 464,973
(6.08 %)		 492,684
(3.98 %)		 6,663,773
(20.49 %)		 28,741
(2.30 %)
147 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1		 n/a 12,984
(1.78 %)		 22,854
(2.04 %)		 n/a 42.70
(99.01 %)		 268
(0.99 %)		 107
(100.00 %)		 558,587
(8.35 %)		 180,400
(0.83 %)		 7,132,381
(21.18 %)		 40,661
(3.41 %)
148 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2		 n/a 11,359
(1.98 %)		 21,437
(2.45 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 3,668
(100.00 %)		 346,477
(2.88 %)		 283,542
(2.49 %)		 5,597,130
(19.71 %)		 22,977
(2.32 %)
149 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2		 n/a 12,344
(1.85 %)		 23,934
(2.37 %)		 n/a 42.10
(99.97 %)		 990
(0.03 %)		 1,119
(100.00 %)		 532,973
(5.96 %)		 401,820
(3.43 %)		 6,320,210
(21.42 %)		 30,391
(2.60 %)
150 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1		 n/a 11,681
(1.64 %)		 22,195
(2.04 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,752
(100.00 %)		 363,092
(4.61 %)		 347,630
(2.63 %)		 5,664,392
(21.56 %)		 32,162
(3.60 %)
151 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1		 n/a 13,203
(1.74 %)		 22,959
(2.04 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 436,838
(4.84 %)		 471,070
(3.20 %)		 6,601,537
(22.79 %)		 37,247
(3.95 %)
152 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2		 n/a 12,391
(1.76 %)		 23,333
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 940
(0.33 %)		 311
(100.00 %)		 550,895
(7.50 %)		 227,532
(1.16 %)		 6,767,530
(21.05 %)		 34,682
(2.57 %)
153 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,210
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,334
(100.00 %)		 426,785
(4.89 %)		 182,446
(0.97 %)		 6,038,491
(20.24 %)		 29,692
(2.35 %)
154 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1		 n/a 11,836
(1.83 %)		 21,119
(2.12 %)		 n/a 42.78
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,147
(100.00 %)		 443,887
(6.00 %)		 149,233
(0.76 %)		 6,328,128
(20.72 %)		 37,413
(3.59 %)
155 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1		 n/a 12,359
(1.95 %)		 23,228
(2.46 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 n/a 775
(100.00 %)		 485,213
(6.08 %)		 333,505
(2.21 %)		 6,358,327
(19.87 %)		 26,594
(2.34 %)
156 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1		 n/a 12,520
(1.95 %)		 23,459
(2.46 %)		 n/a 42.08
(99.82 %)		 134
(0.18 %)		 176
(100.00 %)		 491,810
(6.09 %)		 376,746
(2.55 %)		 6,461,292
(20.23 %)		 27,799
(2.40 %)
157 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4		 60,920
(5.98 %)		 13,334
(1.84 %)		 23,261
(2.12 %)		 n/a 42.16
(99.58 %)		 228
(0.42 %)		 144
(100.00 %)		 544,341
(5.93 %)		 186,461
(0.80 %)		 7,090,610
(20.01 %)		 38,495
(3.10 %)
158 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2		 n/a 9,172
(1.85 %)		 16,917
(2.12 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,855
(100.00 %)		 377,153
(8.49 %)		 117,959
(0.78 %)		 4,418,970
(18.34 %)		 27,767
(3.57 %)
159 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1		 n/a 13,156
(1.63 %)		 23,633
(1.97 %)		 n/a 43.34
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 216
(100.00 %)		 515,745
(6.36 %)		 283,125
(12.39 %)		 4,289,389
(30.87 %)		 27,612
(1.85 %)
160 golden parakeet (hap2 2024)
GCA_045519325.1		 n/a 12,035
(1.69 %)		 21,430
(2.05 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 267
(100.00 %)		 447,782
(6.26 %)		 211,075
(11.12 %)		 4,868,563
(29.39 %)		 24,821
(1.87 %)
161 golden pheasant
GCA_003413605.1		 n/a 12,891
(2.28 %)		 21,429
(2.37 %)		 n/a 40.87
(97.55 %)		 51,170
(2.47 %)		 65,464
(97.53 %)		 541,931
(8.01 %)		 249,405
(2.01 %)		 6,173,989
(19.98 %)		 22,227
(1.31 %)
162 golden-collared manakin
GCF_001715985.3		 27,575
(4.33 %)		 11,806
(1.85 %)		 13,267
(2.32 %)		 n/a 41.42
(97.44 %)		 20,874
(2.57 %)		 3,619
(100.00 %)		 447,084
(7.00 %)		 197,843
(1.19 %)		 6,198,932
(18.50 %)		 18,804
(1.03 %)
163 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1		 15,472
(2.07 %)		 11,547
(1.44 %)		 22,727
(1.73 %)		 n/a 41.28
(99.25 %)		 98,475
(0.77 %)		 162,787
(99.23 %)		 324,530
(4.59 %)		 144,409
(1.43 %)		 6,724,538
(18.06 %)		 14,330
(0.42 %)
164 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1		 n/a 13,434
(1.76 %)		 30,619
(3.17 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 493
(0.01 %)		 351
(100.00 %)		 556,740
(10.18 %)		 303,279
(3.45 %)		 6,599,611
(22.65 %)		 38,341
(5.45 %)
165 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1		 46,253
(5.46 %)		 13,432
(1.76 %)		 23,419
(2.08 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 493
(0.01 %)		 350
(100.00 %)		 556,733
(10.18 %)		 303,277
(3.45 %)		 6,599,550
(22.65 %)		 38,340
(5.45 %)
166 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1		 n/a 11,630
(1.85 %)		 20,866
(2.20 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 1,395
(100.00 %)		 421,187
(9.08 %)		 159,172
(0.96 %)		 5,602,689
(22.75 %)		 29,548
(2.77 %)
167 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1		 n/a 13,116
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 191
(100.00 %)		 514,142
(9.71 %)		 210,381
(1.13 %)		 6,501,989
(23.95 %)		 35,785
(2.69 %)
168 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1		 33,115
(3.89 %)		 13,120
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 190
(100.00 %)		 610,506
(15.46 %)		 210,373
(1.13 %)		 6,501,918
(23.95 %)		 35,788
(2.78 %)
169 great tit
GCF_001522545.3		 46,214
(6.78 %)		 12,250
(2.00 %)		 16,577
(2.52 %)		 n/a 41.37
(98.24 %)		 24,615
(1.76 %)		 24,044
(98.24 %)		 447,566
(5.89 %)		 249,384
(1.36 %)		 6,330,291
(19.11 %)		 23,876
(1.88 %)
170 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1		 20,607
(2.63 %)		 12,184
(1.76 %)		 21,560
(2.12 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 556
(0.00 %)		 1,452
(100.00 %)		 804,583
(12.49 %)		 291,451
(3.14 %)		 5,887,349
(28.34 %)		 19,623
(1.55 %)
171 greater prairie chicken
GCA_001870855.1		 n/a 12,923
(2.36 %)		 24,062
(2.50 %)		 n/a 41.23
(99.63 %)		 48,408
(0.39 %)		 60,594
(99.61 %)		 544,139
(7.50 %)		 214,682
(0.99 %)		 6,153,628
(19.86 %)		 23,154
(2.26 %)
172 greater rhea
GCA_003343005.1		 n/a 12,895
(1.81 %)		 20,976
(2.06 %)		 n/a 40.79
(98.79 %)		 2,075,293
(1.40 %)		 2,162
(100.00 %)		 509,589
(0.00 %)		 196,258
(0.73 %)		 6,982,184
(18.70 %)		 41,811
(3.95 %)
173 greater sage-grouse
GCF_019232065.1		 36,656
(5.50 %)		 12,419
(2.36 %)		 21,319
(2.40 %)		 n/a 41.16
(96.34 %)		 9,894
(3.66 %)		 1,502
(100.00 %)		 574,006
(8.05 %)		 196,630
(0.72 %)		 5,996,002
(19.65 %)		 18,807
(1.81 %)
174 greater scaup (hap1 2025)
GCA_965140915.1		 n/a 13,410
(1.86 %)		 25,527
(2.30 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,290
(100.00 %)		 944,720
(17.84 %)		 522,593
(6.27 %)		 6,100,900
(26.44 %)		 33,827
(2.73 %)
175 greater scaup (hap2 2025)
GCA_965140925.1		 n/a 12,299
(2.00 %)		 22,405
(2.37 %)		 n/a 41.92
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 1,031
(99.99 %)		 790,499
(12.43 %)		 402,414
(3.15 %)		 5,715,255
(22.73 %)		 29,339
(2.75 %)
176 green peafowl
GCA_016647715.1		 n/a 12,897
(2.25 %)		 23,427
(2.41 %)		 n/a 41.73
(98.15 %)		 32,668
(1.85 %)		 2,446
(100.00 %)		 481,865
(6.04 %)		 188,685
(1.04 %)		 6,268,032
(20.57 %)		 22,330
(1.85 %)
177 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1		 n/a 13,159
(1.57 %)		 41,528
(2.68 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 4,777
(0.03 %)		 54,154
(99.97 %)		 525,535
(7.07 %)		 222,932
(1.16 %)		 6,301,005
(19.38 %)		 28,978
(2.14 %)
178 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1		 41,746
(4.05 %)		 13,173
(1.89 %)		 24,269
(2.31 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 n/a 8,090
(100.00 %)		 468,845
(6.23 %)		 261,918
(2.42 %)		 5,956,005
(21.98 %)		 25,573
(1.77 %)
179 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1		 n/a 6,534
(1.74 %)		 12,152
(1.97 %)		 n/a 42.70
(100.00 %)		 n/a 8,370
(100.00 %)		 179,674
(3.19 %)		 76,165
(0.79 %)		 2,908,228
(16.85 %)		 11,838
(2.15 %)
180 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1		 47,961
(5.90 %)		 13,016
(1.82 %)		 21,266
(2.02 %)		 n/a 42.20
(99.55 %)		 635
(0.45 %)		 133
(100.00 %)		 484,104
(5.60 %)		 186,430
(0.85 %)		 7,162,723
(18.83 %)		 24,760
(2.03 %)
181 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1		 n/a 11,838
(1.64 %)		 24,014
(2.16 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,969
(100.00 %)		 405,109
(3.51 %)		 220,222
(6.17 %)		 4,708,177
(25.30 %)		 58,446
(5.44 %)
182 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1		 51,641
(5.08 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
183 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1		 n/a 7,477
(1.92 %)		 14,094
(2.40 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 n/a 2,762
(100.00 %)		 296,732
(12.20 %)		 135,408
(4.08 %)		 3,123,655
(20.92 %)		 23,288
(3.74 %)
184 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1		 51,606
(6.18 %)		 12,739
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 188
(100.00 %)		 409,129
(0.00 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,375
(23.59 %)		 46,118
(3.85 %)
185 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1		 55,448
(7.96 %)		 12,866
(2.29 %)		 18,391
(2.68 %)		 n/a 41.73
(98.08 %)		 15,598
(1.93 %)		 2,739
(100.00 %)		 486,655
(7.97 %)		 173,056
(0.98 %)		 6,144,176
(20.18 %)		 26,577
(2.39 %)
186 herring gull (hap1 2024)
GCA_964417175.1		 n/a 13,382
(1.61 %)		 25,785
(2.15 %)		 n/a 44.80
(99.99 %)		 559
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 535,852
(5.32 %)		 233,906
(10.46 %)		 5,597,180
(29.50 %)		 46,309
(7.00 %)
187 herring gull (hap2 2024)
GCA_964417125.1		 n/a 12,602
(1.69 %)		 23,925
(2.13 %)		 n/a 44.52
(99.99 %)		 456
(0.01 %)		 989
(99.99 %)		 483,098
(5.09 %)		 245,440
(9.57 %)		 6,076,469
(27.75 %)		 42,842
(5.92 %)
188 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1		 14,928
(2.31 %)		 11,454
(1.65 %)		 11,717
(2.07 %)		 n/a 42.42
(94.92 %)		 99,371
(5.11 %)		 109,627
(94.89 %)		 360,821
(6.34 %)		 145,440
(1.01 %)		 6,679,356
(18.72 %)		 40,581
(1.42 %)
189 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1		 n/a 13,089
(1.50 %)		 29,621
(2.22 %)		 n/a 45.56
(100.00 %)		 268
(0.00 %)		 683
(100.00 %)		 610,333
(22.07 %)		 252,997
(12.56 %)		 5,154,598
(31.67 %)		 58,754
(5.54 %)
190 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1		 n/a 12,349
(1.54 %)		 27,206
(2.21 %)		 n/a 45.91
(100.00 %)		 212
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 529,757
(21.69 %)		 235,999
(14.32 %)		 4,845,810
(31.86 %)		 53,781
(5.77 %)
191 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6		 42,799
(6.57 %)		 11,856
(1.93 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 458,399
(8.32 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
192 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1		 n/a 12,027
(1.89 %)		 23,973
(2.49 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 385,230
(3.05 %)		 398,497
(5.70 %)		 5,772,203
(22.69 %)		 28,740
(2.98 %)
193 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1		 43,241
(5.71 %)		 12,702
(1.83 %)		 24,568
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 296
(0.98 %)		 184
(100.00 %)		 440,384
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,138
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
194 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1		 n/a 12,831
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 202
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 647,396
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,524
(30.36 %)		 36,193
(2.91 %)
195 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1		 75,216
(7.36 %)		 12,832
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 204
(0.00 %)		 335
(100.00 %)		 647,402
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,561
(30.36 %)		 36,193
(2.91 %)
196 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1		 n/a 12,201
(1.59 %)		 24,721
(2.19 %)		 n/a 44.46
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 629,688
(12.73 %)		 644,409
(14.12 %)		 5,103,050
(31.93 %)		 33,424
(2.42 %)
197 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1		 n/a 11,806
(1.66 %)		 21,429
(1.97 %)		 n/a 43.73
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,343
(100.00 %)		 508,803
(10.25 %)		 162,918
(5.44 %)		 6,029,969
(24.67 %)		 27,953
(3.83 %)
198 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1		 n/a 13,233
(1.67 %)		 23,010
(1.93 %)		 n/a 43.91
(99.92 %)		 253
(0.08 %)		 136
(100.00 %)		 610,144
(11.51 %)		 214,393
(5.75 %)		 6,069,916
(25.74 %)		 33,172
(3.38 %)
199 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2		 n/a 12,424
(1.21 %)		 43,440
(2.06 %)		 n/a 41.86
(99.95 %)		 1,098
(0.00 %)		 260,829
(100.00 %)		 497,886
(5.29 %)		 184,967
(0.96 %)		 6,167,538
(20.22 %)		 33,529
(1.55 %)
200 jackdaw (hap1.1 2025)
GCA_965178545.1		 n/a 13,233
(1.72 %)		 30,094
(2.51 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 648
(0.01 %)		 733
(100.00 %)		 532,540
(3.59 %)		 553,881
(6.97 %)		 5,338,663
(26.88 %)		 54,918
(4.96 %)
201 jackdaw (hap2.1 2025)
GCA_965178535.1		 n/a 12,364
(1.84 %)		 25,990
(2.48 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 571
(0.01 %)		 1,744
(99.99 %)		 441,993
(3.39 %)		 436,100
(6.66 %)		 4,938,426
(24.63 %)		 47,080
(4.82 %)
202 jackdaw (S_Up_J01 2020)
GCA_013407035.1		 n/a 12,072
(1.93 %)		 20,925
(2.08 %)		 n/a 42.15
(99.72 %)		 511
(0.28 %)		 41
(100.00 %)		 428,760
(6.13 %)		 173,436
(1.02 %)		 6,231,317
(19.25 %)		 26,177
(2.17 %)
203 Japanese quail
GCF_001577835.2		 49,197
(7.77 %)		 12,864
(2.54 %)		 22,540
(2.69 %)		 37,604
(4.36 %)		 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 559,601
(7.91 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
204 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1		 n/a 8,732
(1.74 %)		 16,473
(2.17 %)		 n/a 45.10
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,819
(100.00 %)		 314,902
(10.49 %)		 133,061
(10.84 %)		 3,656,435
(25.68 %)		 32,592
(5.25 %)
205 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1		 n/a 13,042
(1.63 %)		 24,142
(2.01 %)		 n/a 45.07
(99.96 %)		 300
(0.04 %)		 148
(100.00 %)		 563,851
(12.90 %)		 270,861
(12.36 %)		 6,191,106
(28.24 %)		 54,426
(4.92 %)
206 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1		 n/a 3,256
(1.65 %)		 6,220
(1.98 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 3,728
(100.00 %)		 127,817
(7.83 %)		 53,447
(1.21 %)		 1,502,789
(18.09 %)		 5,487
(1.71 %)
207 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2		 49,757
(5.76 %)		 13,110
(1.92 %)		 22,782
(2.26 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 89
(100.00 %)		 507,148
(7.85 %)		 208,178
(1.08 %)		 6,258,087
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
208 kea
GCF_000696875.1		 15,953
(2.35 %)		 11,985
(1.66 %)		 22,107
(2.01 %)		 n/a 41.09
(99.60 %)		 51,381
(0.42 %)		 93,561
(99.58 %)		 368,226
(5.60 %)		 138,157
(0.75 %)		 5,905,331
(18.06 %)		 7,218
(0.22 %)
209 killdeer
GCF_000708025.1		 16,480
(2.43 %)		 12,356
(1.72 %)		 12,853
(2.15 %)		 n/a 41.88
(97.24 %)		 63,995
(2.78 %)		 79,162
(97.22 %)		 424,095
(5.93 %)		 167,406
(0.94 %)		 7,070,701
(19.44 %)		 37,082
(1.57 %)
210 king quail (bCotChi1hap2 2024)
GCF_039878825.1		 38,976
(5.65 %)		 12,731
(2.42 %)		 22,580
(2.63 %)		 n/a 41.64
(99.99 %)		 330
(0.01 %)		 191
(100.00 %)		 520,844
(5.33 %)		 274,030
(2.07 %)		 5,359,922
(20.48 %)		 19,673
(2.18 %)
211 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1		 n/a 13,641
(1.52 %)		 24,293
(1.78 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 484,661
(3.34 %)		 252,569
(16.01 %)		 5,595,734
(32.51 %)		 77,942
(3.59 %)
212 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1		 n/a 12,764
(1.49 %)		 23,033
(1.77 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 128
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 432,536
(3.01 %)		 230,315
(20.91 %)		 4,960,923
(35.56 %)		 86,907
(3.76 %)
213 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1		 n/a 10,584
(1.75 %)		 19,112
(2.09 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 2,892
(100.00 %)		 363,564
(3.53 %)		 235,220
(7.22 %)		 5,072,834
(23.83 %)		 24,909
(2.64 %)
214 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1		 n/a 13,529
(1.69 %)		 23,672
(1.98 %)		 n/a 43.50
(99.85 %)		 259
(0.15 %)		 232
(100.00 %)		 491,653
(3.53 %)		 349,011
(9.83 %)		 5,955,030
(26.51 %)		 32,237
(2.61 %)
215 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1		 46,366
(5.56 %)		 12,594
(1.91 %)		 22,763
(2.31 %)		 26,057
(3.91 %)		 41.97
(99.70 %)		 206
(0.30 %)		 93
(100.00 %)		 485,121
(7.13 %)		 247,189
(1.64 %)		 6,498,294
(20.04 %)		 25,377
(1.97 %)
216 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1		 n/a 12,282
(1.85 %)		 23,867
(2.36 %)		 n/a 42.20
(100.00 %)		 n/a 4,269
(100.00 %)		 472,384
(7.01 %)		 237,680
(1.65 %)		 6,121,661
(19.48 %)		 25,589
(2.05 %)
217 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1		 n/a 12,458
(1.70 %)		 22,259
(2.05 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 n/a 3,090
(100.00 %)		 413,301
(3.46 %)		 189,449
(5.28 %)		 5,962,597
(22.07 %)		 31,611
(2.72 %)
218 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1		 48,561
(5.70 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
219 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1		 n/a 13,333
(1.68 %)		 24,731
(2.05 %)		 n/a 44.40
(99.99 %)		 537
(0.01 %)		 1,382
(100.00 %)		 509,160
(5.11 %)		 266,609
(9.64 %)		 6,827,304
(27.15 %)		 44,108
(6.34 %)
220 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1		 n/a 12,578
(1.83 %)		 22,257
(2.16 %)		 n/a 42.51
(98.97 %)		 258
(1.03 %)		 551
(100.00 %)		 431,717
(3.61 %)		 201,876
(1.38 %)		 6,620,060
(19.16 %)		 27,552
(2.26 %)
221 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2		 47,420
(5.64 %)		 13,098
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,499
(5.58 %)		 210,234
(1.26 %)		 7,133,934
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
222 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1		 51,352
(6.92 %)		 12,689
(2.35 %)		 22,377
(2.51 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 58
(0.00 %)		 206
(100.00 %)		 498,179
(5.36 %)		 218,390
(1.80 %)		 6,038,211
(20.76 %)		 20,648
(2.33 %)
223 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1		 n/a 13,105
(1.81 %)		 25,654
(2.45 %)		 n/a 40.86
(98.66 %)		 1,039,616
(1.43 %)		 3,019
(100.00 %)		 522,333
(5.61 %)		 208,867
(0.79 %)		 7,080,214
(19.15 %)		 42,016
(4.35 %)
224 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1		 n/a 10,465
(1.71 %)		 19,083
(2.16 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 910
(100.00 %)		 520,125
(6.78 %)		 251,547
(4.21 %)		 5,321,207
(21.53 %)		 34,698
(5.69 %)
225 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1		 39,024
(4.18 %)		 13,360
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 180
(100.00 %)		 674,149
(6.73 %)		 329,124
(5.34 %)		 6,820,245
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
226 little egret
GCF_000687185.1		 25,856
(3.55 %)		 12,162
(1.73 %)		 10,954
(2.03 %)		 n/a 42.25
(95.99 %)		 88,871
(4.04 %)		 100,662
(95.96 %)		 490,997
(6.84 %)		 165,380
(1.23 %)		 6,955,585
(18.98 %)		 31,136
(1.15 %)
227 little owl (bAthNoc1.hap1.1 2025)
GCF_965140245.1		 41,965
(4.34 %)		 13,383
(1.67 %)		 23,822
(2.00 %)		 n/a 43.44
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 1,288
(99.99 %)		 494,359
(4.39 %)		 588,378
(7.88 %)		 5,739,588
(25.13 %)		 34,531
(9.97 %)
228 little owl (hap1.1 2025)
GCA_965140245.1		 n/a 13,385
(1.67 %)		 23,822
(2.00 %)		 n/a 43.44
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 717
(100.00 %)		 653,518
(17.99 %)		 588,381
(7.88 %)		 5,739,624
(25.13 %)		 34,531
(9.97 %)
229 little owl (hap2.1 2025)
GCA_965140185.1		 n/a 13,316
(1.72 %)		 23,607
(2.06 %)		 n/a 42.88
(99.99 %)		 552
(0.01 %)		 1,212
(99.99 %)		 673,616
(14.62 %)		 427,083
(4.58 %)		 6,784,709
(22.52 %)		 33,432
(6.74 %)
230 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1		 n/a 13,329
(1.88 %)		 23,888
(2.25 %)		 n/a 42.30
(99.99 %)		 544
(0.01 %)		 272
(100.00 %)		 784,647
(6.78 %)		 501,860
(7.36 %)		 6,388,957
(26.13 %)		 34,028
(3.04 %)
231 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1		 n/a 12,264
(2.01 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 40.99
(100.00 %)		 n/a 230
(100.00 %)		 498,393
(5.07 %)		 266,700
(1.49 %)		 6,131,743
(20.45 %)		 15,809
(1.43 %)
232 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2		 n/a 12,322
(2.02 %)		 20,234
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 140
(0.37 %)		 77
(100.00 %)		 497,376
(5.06 %)		 265,823
(1.51 %)		 6,044,278
(20.09 %)		 15,921
(1.43 %)
233 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1		 15,790
(2.21 %)		 11,632
(1.52 %)		 24,790
(1.96 %)		 n/a 41.10
(99.68 %)		 56,130
(0.33 %)		 115,823
(99.67 %)		 391,856
(4.80 %)		 148,075
(0.90 %)		 6,682,530
(20.03 %)		 27,675
(1.15 %)
234 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1		 n/a 13,082
(1.73 %)		 27,150
(2.44 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 669,243
(14.71 %)		 211,387
(6.69 %)		 6,514,716
(27.07 %)		 47,331
(8.09 %)
235 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1		 n/a 11,814
(1.80 %)		 23,161
(2.38 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 586,864
(13.28 %)		 184,036
(5.91 %)		 5,606,205
(25.25 %)		 42,560
(7.71 %)
236 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1		 n/a 10,658
(1.74 %)		 18,941
(1.98 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 4,278
(100.00 %)		 326,479
(4.02 %)		 141,715
(0.74 %)		 5,600,372
(19.59 %)		 27,330
(3.35 %)
237 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1		 n/a 12,905
(1.81 %)		 22,204
(2.01 %)		 n/a 42.12
(98.21 %)		 232
(1.79 %)		 153
(100.00 %)		 485,318
(6.35 %)		 184,992
(0.78 %)		 7,064,965
(19.56 %)		 31,653
(3.02 %)
238 mallard (CAU_Wild1.0 2019)
GCA_008746955.1		 n/a 13,260
(1.85 %)		 25,071
(2.17 %)		 n/a 42.41
(99.90 %)		 318
(0.10 %)		 1,665
(100.00 %)		 849,782
(8.18 %)		 438,622
(5.10 %)		 6,729,782
(25.03 %)		 34,670
(3.03 %)
239 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1		 n/a 13,680
(1.77 %)		 26,845
(2.33 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 571
(0.01 %)		 936
(100.00 %)		 941,876
(15.92 %)		 570,703
(9.50 %)		 6,169,980
(28.67 %)		 41,791
(3.18 %)
240 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1		 n/a 12,715
(1.89 %)		 24,338
(2.42 %)		 n/a 42.70
(99.99 %)		 485
(0.01 %)		 972
(99.99 %)		 795,168
(13.44 %)		 445,147
(7.71 %)		 5,728,430
(26.21 %)		 35,679
(3.13 %)
241 mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1		 n/a 12,871
(1.94 %)		 25,038
(2.26 %)		 n/a 41.42
(95.05 %)		 25,623
(4.96 %)		 21,442
(100.00 %)		 760,634
(7.52 %)		 360,866
(1.37 %)		 6,710,465
(20.25 %)		 32,823
(2.15 %)
242 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1		 59,854
(7.33 %)		 12,988
(1.87 %)		 23,709
(2.20 %)		 86,787
(8.80 %)		 42.27
(99.64 %)		 905
(0.36 %)		 756
(100.00 %)		 803,558
(8.04 %)		 417,575
(5.02 %)		 6,627,843
(24.59 %)		 35,030
(3.06 %)
243 mallard (Pekin duck ZD024472 2025)
GCF_047663525.1		 68,191
(7.26 %)		 13,389
(1.80 %)		 24,673
(2.19 %)		 n/a 42.76
(100.00 %)		 n/a 42
(100.00 %)		 785,501
(5.94 %)		 515,879
(8.26 %)		 6,238,340
(27.60 %)		 40,229
(3.05 %)
244 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1		 54,114
(7.47 %)		 12,199
(1.86 %)		 15,363
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.77 %)		 71,703
(0.26 %)		 2,150
(100.00 %)		 770,322
(8.16 %)		 357,617
(3.09 %)		 6,587,406
(21.92 %)		 29,913
(2.33 %)
245 Mariana crow
GCF_017639235.1		 48,460
(7.00 %)		 12,506
(1.97 %)		 22,580
(2.35 %)		 n/a 42.14
(98.94 %)		 10,579
(1.06 %)		 1,443
(100.00 %)		 434,280
(5.91 %)		 169,629
(0.82 %)		 6,323,058
(18.94 %)		 27,390
(2.04 %)
246 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1		 n/a 4,774
(1.89 %)		 8,695
(2.32 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 n/a 2,259
(100.00 %)		 135,092
(3.67 %)		 112,042
(8.63 %)		 1,739,144
(22.50 %)		 12,908
(3.26 %)
247 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1		 n/a 13,064
(1.72 %)		 22,269
(1.98 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 407
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 459,578
(3.87 %)		 315,686
(6.19 %)		 6,650,507
(22.84 %)		 36,076
(2.82 %)
248 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1		 n/a 8,873
(1.81 %)		 16,175
(2.24 %)		 n/a 42.92
(100.00 %)		 n/a 2,130
(100.00 %)		 331,293
(6.89 %)		 161,393
(5.94 %)		 3,516,196
(24.86 %)		 16,659
(1.74 %)
249 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1		 n/a 13,133
(1.81 %)		 23,396
(2.19 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 358
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 511,156
(7.05 %)		 238,915
(5.05 %)		 5,764,523
(25.19 %)		 24,675
(1.70 %)
250 medium ground-finch
GCF_000277835.1		 22,226
(4.24 %)		 11,887
(1.83 %)		 11,438
(2.19 %)		 n/a 41.61
(97.77 %)		 68,589
(2.25 %)		 95,828
(97.75 %)		 433,244
(5.91 %)		 322,831
(2.24 %)		 6,548,136
(19.49 %)		 18,135
(0.69 %)
251 monk parakeet
GCA_017639245.1		 n/a 13,067
(1.85 %)		 n/a n/a 42.29
(99.99 %)		 352
(0.01 %)		 291
(100.00 %)		 582,436
(9.49 %)		 253,709
(2.79 %)		 5,820,920
(22.52 %)		 23,101
(1.75 %)
252 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1		 28,327
(3.95 %)		 12,793
(2.29 %)		 22,305
(2.47 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 521
(100.00 %)		 458,084
(6.03 %)		 243,493
(3.14 %)		 5,553,010
(22.13 %)		 22,147
(2.41 %)
253 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2		 n/a 10,145
(1.98 %)		 18,617
(2.30 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 5,640
(100.00 %)		 533,330
(9.11 %)		 213,518
(1.29 %)		 4,813,886
(20.16 %)		 25,667
(3.86 %)
254 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2		 59,524
(6.76 %)		 12,983
(1.98 %)		 22,400
(2.22 %)		 33,839
(5.17 %)		 41.92
(99.13 %)		 451
(0.87 %)		 171
(100.00 %)		 700,051
(7.55 %)		 301,579
(1.34 %)		 6,791,838
(21.30 %)		 31,278
(3.07 %)
255 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1		 n/a 11,687
(1.78 %)		 24,169
(2.43 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 n/a 2,834
(100.00 %)		 414,780
(3.26 %)		 491,012
(10.03 %)		 5,570,475
(26.24 %)		 29,485
(4.55 %)
256 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1		 31,033
(4.42 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
257 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1		 n/a 11,097
(1.99 %)		 20,436
(2.45 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 n/a 894
(100.00 %)		 377,050
(6.03 %)		 178,064
(1.53 %)		 5,305,126
(19.49 %)		 26,107
(2.52 %)
258 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1		 50,821
(6.95 %)		 12,747
(1.94 %)		 23,372
(2.37 %)		 30,299
(3.60 %)		 42.57
(97.41 %)		 289
(2.59 %)		 105
(100.00 %)		 452,690
(6.21 %)		 231,546
(1.70 %)		 6,265,995
(19.54 %)		 31,909
(2.48 %)
259 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1		 n/a 13,359
(1.72 %)		 24,921
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 705,078
(18.28 %)		 342,299
(9.55 %)		 6,410,095
(28.06 %)		 38,589
(9.40 %)
260 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1		 34,506
(4.09 %)		 13,358
(1.72 %)		 24,851
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 806
(100.00 %)		 705,074
(18.28 %)		 342,297
(9.55 %)		 6,410,054
(28.06 %)		 38,589
(9.40 %)
261 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1		 n/a 13,270
(1.84 %)		 24,753
(2.28 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 118
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 675,092
(12.72 %)		 313,111
(3.64 %)		 6,547,843
(23.22 %)		 37,728
(3.88 %)
262 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1		 48,921
(5.26 %)		 12,986
(1.89 %)		 22,892
(2.24 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,593
(100.00 %)		 487,881
(6.13 %)		 259,865
(3.37 %)		 5,961,641
(22.88 %)		 24,673
(1.77 %)
263 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1		 n/a 13,670
(1.52 %)		 33,383
(2.64 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 409
(100.00 %)		 713,271
(8.42 %)		 603,937
(6.25 %)		 5,379,113
(27.65 %)		 50,913
(9.74 %)
264 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1		 39,806
(3.75 %)		 13,668
(1.52 %)		 25,226
(1.90 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 408
(100.00 %)		 713,264
(8.42 %)		 603,930
(6.25 %)		 5,379,069
(27.65 %)		 50,913
(9.74 %)
265 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1		 n/a 13,664
(1.44 %)		 37,696
(2.80 %)		 n/a 44.42
(100.00 %)		 155
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 760,455
(8.84 %)		 626,528
(6.85 %)		 5,029,822
(30.45 %)		 54,278
(9.43 %)
266 northern bobwhite
GCA_008692595.2		 n/a 12,584
(2.37 %)		 22,327
(2.53 %)		 n/a 41.41
(99.04 %)		 33,134
(0.97 %)		 39,169
(99.03 %)		 460,369
(4.63 %)		 213,800
(1.34 %)		 5,813,961
(19.54 %)		 22,156
(2.37 %)
267 northern fulmar
GCF_000690835.1		 16,383
(2.20 %)		 11,965
(1.51 %)		 24,294
(1.87 %)		 n/a 41.17
(99.50 %)		 54,825
(0.51 %)		 112,214
(99.49 %)		 330,541
(3.74 %)		 146,735
(0.83 %)		 6,838,937
(18.42 %)		 24,859
(0.79 %)
268 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1		 n/a 13,367
(1.65 %)		 24,403
(2.00 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 829
(100.00 %)		 498,574
(4.51 %)		 273,984
(5.20 %)		 5,544,122
(27.29 %)		 34,879
(3.83 %)
269 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1		 n/a 13,477
(1.77 %)		 23,613
(2.08 %)		 n/a 42.44
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 474,930
(4.45 %)		 237,604
(2.75 %)		 5,847,260
(21.07 %)		 30,873
(3.03 %)
270 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1		 n/a 12,115
(1.73 %)		 22,764
(2.15 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,484
(100.00 %)		 417,395
(3.68 %)		 231,908
(7.24 %)		 5,424,533
(24.05 %)		 35,691
(4.26 %)
271 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2		 n/a 13,527
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 455
(100.00 %)		 511,000
(3.76 %)		 325,992
(9.82 %)		 5,542,342
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
272 northern lapwing (hap1.1 2025)
GCA_965231255.1		 n/a 13,331
(1.54 %)		 24,472
(1.83 %)		 n/a 44.53
(99.99 %)		 936
(0.01 %)		 2,408
(100.00 %)		 863,726
(25.27 %)		 320,840
(14.03 %)		 5,397,999
(32.53 %)		 69,579
(4.22 %)
273 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1		 n/a 13,218
(1.88 %)		 23,888
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 631
(0.01 %)		 395
(100.00 %)		 734,763
(5.74 %)		 422,947
(7.08 %)		 6,491,165
(25.88 %)		 34,601
(2.98 %)
274 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1		 61,479
(7.27 %)		 13,217
(1.88 %)		 23,886
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 631
(0.01 %)		 394
(100.00 %)		 734,760
(5.74 %)		 422,946
(7.08 %)		 6,491,116
(25.88 %)		 34,601
(2.98 %)
275 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1		 n/a 12,592
(1.89 %)		 24,002
(2.35 %)		 n/a 42.94
(99.48 %)		 1,602
(0.52 %)		 1,695
(100.00 %)		 466,546
(6.40 %)		 235,283
(1.98 %)		 6,371,421
(20.17 %)		 34,247
(3.02 %)
276 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1		 43,838
(4.59 %)		 13,232
(1.76 %)		 18,641
(2.35 %)		 n/a 41.52
(98.49 %)		 696,987
(1.57 %)		 4,120
(100.00 %)		 482,272
(4.98 %)		 178,540
(0.70 %)		 7,407,982
(18.33 %)		 43,081
(4.88 %)
277 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1		 n/a 12,953
(1.76 %)		 25,275
(2.07 %)		 24,636
(2.89 %)		 41.70
(98.42 %)		 42,691
(1.58 %)		 151,517
(98.42 %)		 494,677
(6.28 %)		 222,654
(1.07 %)		 7,211,171
(19.25 %)		 41,048
(2.24 %)
278 Oriental stork (2023)
GCF_034638445.1		 48,452
(4.91 %)		 13,561
(1.84 %)		 23,874
(2.12 %)		 n/a 42.45
(99.99 %)		 149
(0.01 %)		 281
(100.00 %)		 416,480
(4.26 %)		 256,558
(1.47 %)		 7,177,204
(20.57 %)		 34,358
(3.65 %)
279 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1		 n/a 12,529
(1.75 %)		 24,654
(2.25 %)		 n/a 42.72
(100.00 %)		 n/a 2,745
(100.00 %)		 517,204
(7.95 %)		 218,606
(4.15 %)		 6,216,533
(21.16 %)		 26,313
(2.41 %)
280 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1		 49,100
(5.64 %)		 13,021
(1.66 %)		 21,794
(1.95 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 241
(0.31 %)		 125
(100.00 %)		 586,320
(11.83 %)		 335,218
(8.05 %)		 7,038,851
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
281 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1		 37,506
(5.42 %)		 12,670
(1.80 %)		 11,311
(2.11 %)		 n/a 41.77
(98.44 %)		 76,069
(1.58 %)		 83,081
(98.42 %)		 437,234
(5.32 %)		 170,160
(0.93 %)		 7,157,857
(18.38 %)		 22,325
(0.89 %)
282 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1		 41,783
(4.96 %)		 12,712
(1.86 %)		 24,157
(2.37 %)		 n/a 42.69
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 484
(100.00 %)		 641,523
(14.11 %)		 414,142
(6.03 %)		 6,230,412
(23.70 %)		 49,402
(3.94 %)
283 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1		 n/a 10,425
(1.96 %)		 20,219
(2.49 %)		 n/a 42.52
(100.00 %)		 n/a 1,277
(100.00 %)		 344,711
(4.99 %)		 225,902
(3.41 %)		 4,563,425
(21.61 %)		 28,391
(3.74 %)
284 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1		 n/a 13,140
(1.85 %)		 25,111
(2.31 %)		 n/a 42.27
(99.99 %)		 509
(0.01 %)		 143
(100.00 %)		 488,313
(5.48 %)		 331,962
(3.50 %)		 6,243,204
(22.87 %)		 36,343
(3.63 %)
285 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1		 n/a 13,275
(1.76 %)		 24,103
(2.11 %)		 n/a 43.68
(99.98 %)		 1,137
(0.02 %)		 715
(100.00 %)		 792,215
(9.76 %)		 471,286
(10.34 %)		 6,448,623
(29.48 %)		 49,485
(4.41 %)
286 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1		 n/a 11,774
(1.90 %)		 20,857
(2.20 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 749
(100.00 %)		 356,053
(4.37 %)		 157,695
(0.93 %)		 5,995,637
(19.60 %)		 30,478
(4.03 %)
287 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1		 n/a 13,028
(1.84 %)		 22,722
(2.10 %)		 n/a 42.37
(99.81 %)		 104
(0.19 %)		 88
(100.00 %)		 488,030
(6.66 %)		 188,606
(1.01 %)		 6,982,793
(20.08 %)		 32,920
(3.37 %)
288 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2		 n/a 12,000
(1.69 %)		 22,393
(2.01 %)		 n/a 41.66
(74.61 %)		 137,572
(25.41 %)		 200,284
(74.59 %)		 536,198
(8.55 %)		 200,698
(0.96 %)		 5,147,882
(14.30 %)		 14,572
(0.41 %)
289 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1		 n/a 12,787
(1.83 %)		 22,839
(2.13 %)		 n/a 42.67
(99.70 %)		 227
(0.30 %)		 95
(100.00 %)		 543,517
(7.16 %)		 212,546
(1.12 %)		 6,930,708
(20.10 %)		 38,960
(3.02 %)
290 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1		 n/a 12,937
(1.75 %)		 24,253
(2.09 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 3,309
(100.00 %)		 562,549
(7.14 %)		 210,852
(1.04 %)		 7,264,995
(20.26 %)		 40,926
(2.91 %)
291 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1		 29,040
(5.08 %)		 12,371
(2.00 %)		 24,297
(2.42 %)		 n/a 41.70
(96.94 %)		 3,337,637
(3.40 %)		 10,634
(100.00 %)		 349,349
(2.76 %)		 398,866
(2.71 %)		 6,299,092
(18.40 %)		 27,078
(2.11 %)
292 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1		 n/a 13,231
(1.68 %)		 24,060
(2.00 %)		 n/a 43.15
(99.98 %)		 1,269
(0.02 %)		 660
(100.00 %)		 440,963
(5.78 %)		 187,847
(3.22 %)		 6,601,610
(24.99 %)		 54,002
(5.24 %)
293 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1		 n/a 11,989
(1.71 %)		 21,527
(2.03 %)		 n/a 43.19
(99.98 %)		 1,072
(0.02 %)		 1,572
(99.98 %)		 383,852
(5.39 %)		 164,123
(3.45 %)		 5,859,520
(24.45 %)		 48,825
(5.37 %)
294 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1		 n/a 13,234
(1.92 %)		 23,753
(2.26 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 714
(0.01 %)		 141
(100.00 %)		 772,537
(6.34 %)		 437,831
(4.05 %)		 6,488,340
(24.52 %)		 31,577
(2.49 %)
295 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1		 n/a 11,247
(1.70 %)		 23,705
(2.27 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 n/a 3,476
(100.00 %)		 482,817
(8.51 %)		 153,169
(0.81 %)		 5,919,109
(21.87 %)		 39,766
(3.41 %)
296 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1		 n/a 12,744
(1.75 %)		 25,706
(2.29 %)		 n/a 42.60
(97.89 %)		 344
(2.11 %)		 140
(100.00 %)		 551,885
(8.95 %)		 176,530
(0.80 %)		 6,805,042
(22.19 %)		 43,051
(3.40 %)
297 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1		 n/a 11,434
(1.65 %)		 21,710
(2.11 %)		 n/a 46.12
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 2,748
(100.00 %)		 859,899
(15.52 %)		 319,622
(3.85 %)		 5,367,970
(34.63 %)		 23,381
(1.81 %)
298 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1		 n/a 12,345
(1.60 %)		 23,206
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 253
(100.00 %)		 1,082,064
(22.90 %)		 378,866
(4.28 %)		 6,003,548
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
299 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1		 44,843
(4.51 %)		 12,341
(1.60 %)		 23,205
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 252
(100.00 %)		 981,758
(15.82 %)		 378,855
(4.28 %)		 6,003,474
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
300 red-legged partridge
GCA_019345075.1		 n/a 12,441
(2.23 %)		 20,933
(2.29 %)		 n/a 41.44
(96.96 %)		 18,534
(3.05 %)		 29,132
(96.95 %)		 543,702
(6.02 %)		 222,583
(0.97 %)		 5,978,744
(20.17 %)		 19,970
(0.97 %)
301 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1		 n/a 10,131
(1.78 %)		 19,775
(2.21 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,840
(100.00 %)		 366,591
(6.01 %)		 117,928
(0.90 %)		 5,340,048
(18.90 %)		 26,293
(2.86 %)
302 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1		 n/a 13,229
(1.84 %)		 25,580
(2.35 %)		 n/a 42.20
(99.59 %)		 194
(0.41 %)		 110
(100.00 %)		 483,784
(6.50 %)		 160,481
(0.73 %)		 6,960,060
(19.71 %)		 32,899
(2.77 %)
303 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1		 15,842
(2.14 %)		 11,589
(1.46 %)		 22,840
(1.76 %)		 n/a 41.12
(99.40 %)		 64,882
(0.61 %)		 126,713
(99.39 %)		 293,224
(3.50 %)		 123,593
(0.80 %)		 6,849,573
(18.22 %)		 17,100
(0.51 %)
304 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1		 n/a 13,357
(1.64 %)		 29,603
(2.35 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 3,225
(100.00 %)		 549,694
(8.44 %)		 246,171
(10.46 %)		 5,258,356
(27.36 %)		 39,810
(3.37 %)
305 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1		 25,173
(3.02 %)		 13,216
(1.71 %)		 24,050
(2.10 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,185
(100.00 %)		 544,422
(8.81 %)		 223,672
(5.77 %)		 6,669,433
(23.63 %)		 38,305
(3.37 %)
306 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1		 30,007
(3.93 %)		 12,687
(1.75 %)		 25,287
(2.30 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 516
(100.00 %)		 785,960
(17.62 %)		 522,256
(9.27 %)		 6,371,580
(25.40 %)		 32,643
(2.66 %)
307 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1		 15,595
(2.24 %)		 11,495
(1.55 %)		 25,766
(1.88 %)		 n/a 42.65
(98.44 %)		 118,543
(1.60 %)		 180,800
(98.40 %)		 271,331
(3.93 %)		 134,645
(1.25 %)		 6,383,631
(17.75 %)		 24,531
(0.79 %)
308 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1		 n/a 9,867
(1.89 %)		 19,635
(2.52 %)		 n/a 42.54
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 2,879
(100.00 %)		 394,769
(10.00 %)		 186,556
(1.91 %)		 4,428,687
(19.09 %)		 15,730
(1.88 %)
309 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1		 n/a 12,620
(1.92 %)		 24,568
(2.61 %)		 n/a 42.41
(99.61 %)		 195
(0.39 %)		 206
(100.00 %)		 495,673
(9.14 %)		 253,008
(2.04 %)		 5,936,177
(19.93 %)		 20,145
(1.83 %)
310 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1		 33,234
(6.38 %)		 13,027
(2.35 %)		 19,960
(2.74 %)		 n/a 41.21
(99.22 %)		 19,995
(0.78 %)		 39,678
(100.00 %)		 586,827
(8.20 %)		 291,437
(1.68 %)		 6,237,616
(20.77 %)		 22,365
(2.11 %)
311 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1		 52,382
(6.40 %)		 12,577
(1.87 %)		 14,272
(2.42 %)		 n/a 41.48
(98.13 %)		 85,176
(1.90 %)		 100,099
(98.10 %)		 480,221
(6.94 %)		 268,561
(1.86 %)		 6,408,260
(19.42 %)		 29,801
(1.43 %)
312 rock pigeon (Tarim TR01 2023)
GCA_032719375.1		 n/a 14,202
(1.82 %)		 26,634
(2.26 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 79
(100.00 %)		 560,932
(5.87 %)		 388,710
(3.61 %)		 6,986,404
(22.52 %)		 37,664
(3.11 %)
313 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1		 70,874
(7.24 %)		 13,145
(1.66 %)		 25,462
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 869
(100.00 %)		 656,963
(11.76 %)		 412,665
(12.92 %)		 6,047,535
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
314 rock pigeon (v2 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.2		 n/a 12,450
(1.75 %)		 23,660
(2.21 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
315 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1		 n/a 12,090
(2.36 %)		 21,910
(2.57 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,212
(100.00 %)		 585,577
(10.45 %)		 202,342
(1.61 %)		 5,390,780
(20.38 %)		 19,210
(2.23 %)
316 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1		 51,632
(7.29 %)		 12,832
(2.31 %)		 23,047
(2.56 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 165
(100.00 %)		 526,839
(5.87 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,345
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
317 ruddy duck
GCF_011077185.1		 50,326
(5.76 %)		 13,124
(1.98 %)		 23,592
(2.23 %)		 n/a 41.82
(97.27 %)		 18,437
(2.73 %)		 28,026
(97.27 %)		 808,998
(7.97 %)		 389,509
(1.34 %)		 6,722,581
(21.16 %)		 34,567
(3.30 %)
318 ruff
GCF_001431845.1		 34,257
(4.61 %)		 12,979
(1.79 %)		 15,969
(2.42 %)		 n/a 42.45
(96.26 %)		 30,404
(3.75 %)		 34,157
(96.25 %)		 308,688
(1.08 %)		 337,661
(3.70 %)		 7,220,063
(20.45 %)		 27,939
(1.42 %)
319 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1		 35,381
(4.92 %)		 12,603
(1.95 %)		 24,965
(2.42 %)		 n/a 42.00
(99.80 %)		 5,524
(0.20 %)		 24,055
(100.00 %)		 514,274
(6.32 %)		 411,146
(2.77 %)		 6,584,761
(19.85 %)		 29,372
(2.28 %)
320 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1		 40,472
(5.86 %)		 12,903
(1.96 %)		 23,477
(2.35 %)		 n/a 42.26
(99.87 %)		 181
(0.13 %)		 1,692
(100.00 %)		 439,625
(4.09 %)		 338,042
(2.23 %)		 6,366,832
(20.27 %)		 28,572
(2.11 %)
321 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1		 45,898
(5.06 %)		 12,908
(1.86 %)		 21,103
(2.48 %)		 n/a 42.28
(99.01 %)		 15,342
(0.99 %)		 38,089
(100.00 %)		 496,308
(7.14 %)		 333,391
(1.97 %)		 6,646,625
(20.87 %)		 32,671
(2.19 %)
322 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1		 n/a 16,893
(1.07 %)		 43,426
(1.70 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 43,047
(100.00 %)		 1,180,596
(3.55 %)		 1,932,696
(16.57 %)		 6,340,063
(43.85 %)		 66,996
(3.45 %)
323 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1		 n/a 12,804
(1.50 %)		 25,425
(1.97 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 1,339
(100.00 %)		 699,755
(3.36 %)		 1,030,540
(15.69 %)		 5,226,748
(36.13 %)		 36,539
(2.71 %)
324 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1		 n/a 12,258
(1.66 %)		 25,579
(2.30 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,162
(100.00 %)		 506,343
(6.77 %)		 182,589
(7.22 %)		 5,435,776
(23.60 %)		 29,420
(2.47 %)
325 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1		 36,497
(5.34 %)		 12,572
(1.79 %)		 10,629
(2.08 %)		 27,857
(3.09 %)		 41.71
(98.00 %)		 70,035
(2.03 %)		 75,898
(97.97 %)		 433,484
(5.29 %)		 166,251
(1.03 %)		 7,121,848
(18.23 %)		 19,927
(0.72 %)
326 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1		 50,303
(5.75 %)		 12,973
(1.67 %)		 21,670
(1.90 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 283
(100.00 %)		 548,090
(7.21 %)		 201,488
(8.55 %)		 7,030,877
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
327 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1		 n/a 12,826
(1.74 %)		 26,019
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 n/a 3,054
(100.00 %)		 482,850
(3.37 %)		 523,437
(10.15 %)		 6,386,315
(26.20 %)		 32,734
(4.25 %)
328 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1		 27,528
(4.03 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
329 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1		 n/a 16,954
(1.37 %)		 46,692
(2.27 %)		 n/a 43.66
(99.99 %)		 1,822
(0.01 %)		 31,565
(99.99 %)		 680,766
(3.36 %)		 930,904
(8.76 %)		 7,502,726
(27.96 %)		 56,390
(5.99 %)
330 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1		 n/a 12,665
(1.79 %)		 25,654
(2.40 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 339
(0.00 %)		 337
(100.00 %)		 428,675
(3.22 %)		 588,040
(7.38 %)		 6,466,447
(24.39 %)		 33,599
(4.75 %)
331 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1		 n/a 12,986
(1.66 %)		 27,028
(2.29 %)		 n/a 43.66
(99.78 %)		 249
(0.22 %)		 110
(100.00 %)		 464,600
(3.28 %)		 681,402
(9.28 %)		 6,314,744
(26.92 %)		 39,406
(5.26 %)
332 scrub jay (FSJ_1873_10779 2024)
GCF_041296385.1		 51,624
(5.10 %)		 13,318
(1.64 %)		 26,496
(2.22 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 660
(100.00 %)		 879,188
(16.59 %)		 506,206
(7.16 %)		 5,626,321
(29.85 %)		 44,942
(4.68 %)
333 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1		 n/a 12,858
(1.52 %)		 25,777
(2.02 %)		 n/a 44.04
(99.85 %)		 365
(0.15 %)		 501
(100.00 %)		 580,376
(4.24 %)		 636,266
(12.18 %)		 4,804,433
(34.52 %)		 48,871
(4.18 %)
334 silver-eye (hap1.1 2025)
GCA_965231275.1		 n/a 13,156
(1.86 %)		 25,666
(2.48 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 427
(100.00 %)		 484,761
(3.51 %)		 588,871
(4.76 %)		 6,251,918
(22.33 %)		 33,754
(2.58 %)
335 silver-eye (hap2.1 2025)
GCA_965231245.1		 n/a 12,304
(1.89 %)		 23,352
(2.47 %)		 n/a 42.57
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 818
(100.00 %)		 440,985
(3.45 %)		 570,391
(6.24 %)		 5,725,429
(23.52 %)		 33,401
(2.67 %)
336 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1		 30,090
(4.91 %)		 12,645
(1.95 %)		 17,146
(2.49 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 185
(0.01 %)		 1,527
(99.99 %)		 457,266
(6.02 %)		 477,426
(4.49 %)		 6,482,932
(22.03 %)		 27,271
(2.40 %)
337 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1		 n/a 12,662
(1.93 %)		 23,695
(2.34 %)		 25,763
(3.61 %)		 42.49
(99.99 %)		 224
(0.01 %)		 1,951
(99.99 %)		 458,154
(6.01 %)		 482,974
(4.97 %)		 6,466,067
(22.21 %)		 27,890
(2.42 %)
338 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1		 n/a 15,672
(1.16 %)		 40,690
(1.82 %)		 n/a 45.19
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 34,693
(100.00 %)		 1,068,703
(34.46 %)		 796,004
(19.02 %)		 6,315,990
(40.22 %)		 57,647
(3.95 %)
339 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1		 n/a 12,580
(1.53 %)		 24,737
(2.00 %)		 n/a 44.45
(100.00 %)		 323
(0.00 %)		 501
(100.00 %)		 697,818
(28.44 %)		 510,301
(17.90 %)		 5,319,400
(34.64 %)		 36,632
(3.59 %)
340 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1		 n/a 12,940
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 299
(0.07 %)		 354
(100.00 %)		 515,857
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,880
(39.23 %)		 47,269
(3.90 %)
341 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1		 41,069
(3.95 %)		 12,946
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 299
(0.07 %)		 353
(100.00 %)		 515,851
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,851
(39.23 %)		 47,268
(3.90 %)
342 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1		 n/a 12,655
(1.70 %)		 n/a n/a 43.63
(99.16 %)		 238
(0.84 %)		 178
(100.00 %)		 554,912
(9.42 %)		 230,808
(4.34 %)		 6,406,358
(24.83 %)		 22,941
(1.98 %)
343 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1		 n/a 12,942
(1.69 %)		 23,221
(2.13 %)		 n/a 43.74
(99.58 %)		 327
(0.42 %)		 174
(100.00 %)		 577,553
(9.77 %)		 259,017
(5.20 %)		 6,430,968
(25.90 %)		 23,810
(2.02 %)
344 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1		 15,894
(2.09 %)		 11,566
(1.44 %)		 25,387
(1.84 %)		 n/a 40.95
(99.65 %)		 44,462
(0.35 %)		 114,650
(99.65 %)		 345,458
(6.87 %)		 154,693
(1.27 %)		 6,152,475
(19.42 %)		 7,821
(0.23 %)
345 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1		 37,067
(4.23 %)		 12,815
(1.76 %)		 23,175
(2.17 %)		 n/a 42.29
(99.52 %)		 161
(0.48 %)		 191
(100.00 %)		 572,944
(12.88 %)		 256,368
(3.55 %)		 5,868,966
(23.42 %)		 27,158
(2.30 %)
346 speckled mousebird (v2 hap2 2023)
GCA_028858625.2		 n/a 12,332
(1.76 %)		 22,895
(2.24 %)		 n/a 42.74
(99.53 %)		 136
(0.47 %)		 242
(100.00 %)		 521,023
(11.26 %)		 304,406
(7.39 %)		 5,319,571
(25.46 %)		 27,299
(2.35 %)
347 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1		 n/a 12,217
(1.73 %)		 25,261
(2.32 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 957
(100.00 %)		 423,239
(3.30 %)		 362,061
(4.83 %)		 4,954,262
(27.09 %)		 42,188
(4.05 %)
348 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1		 n/a 12,789
(1.82 %)		 24,509
(2.35 %)		 n/a 43.18
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 352
(100.00 %)		 413,598
(3.28 %)		 318,919
(3.99 %)		 5,977,564
(23.65 %)		 33,675
(3.21 %)
349 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1		 n/a 12,871
(1.88 %)		 22,508
(2.20 %)		 n/a 42.01
(96.97 %)		 578,921
(3.08 %)		 1,570
(100.00 %)		 554,367
(10.05 %)		 180,644
(0.89 %)		 6,158,602
(21.14 %)		 21,695
(1.62 %)
350 sunbittern
GCF_000690775.1		 15,772
(2.11 %)		 11,564
(1.45 %)		 25,522
(1.98 %)		 n/a 42.33
(99.55 %)		 52,471
(0.46 %)		 115,170
(99.54 %)		 346,556
(5.38 %)		 117,881
(0.88 %)		 6,391,987
(18.82 %)		 32,970
(1.31 %)
351 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1		 n/a 11,628
(1.91 %)		 21,635
(2.31 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 1,535
(100.00 %)		 421,231
(6.57 %)		 146,070
(1.11 %)		 5,727,350
(21.91 %)		 37,752
(3.68 %)
352 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1		 n/a 12,884
(1.85 %)		 23,805
(2.23 %)		 n/a 42.80
(99.12 %)		 253
(0.88 %)		 182
(100.00 %)		 539,771
(9.26 %)		 181,564
(1.14 %)		 6,538,228
(22.49 %)		 41,376
(3.37 %)
353 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,669
(2.52 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 704,976
(13.16 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
354 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2		 40,121
(5.41 %)		 13,004
(1.87 %)		 24,795
(2.41 %)		 n/a 42.48
(98.86 %)		 429
(1.14 %)		 160
(100.00 %)		 493,071
(5.80 %)		 589,858
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
355 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1		 n/a 12,160
(1.83 %)		 24,622
(2.46 %)		 n/a 43.37
(100.00 %)		 n/a 862
(100.00 %)		 383,634
(3.06 %)		 527,550
(8.40 %)		 5,916,654
(24.97 %)		 31,261
(3.21 %)
356 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1		 29,544
(4.27 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
357 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1		 68,379
(7.95 %)		 13,715
(1.90 %)		 24,704
(2.28 %)		 n/a 43.07
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 780,603
(10.80 %)		 463,894
(5.65 %)		 6,593,404
(24.63 %)		 41,265
(4.48 %)
358 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1		 62,741
(8.50 %)		 12,903
(1.98 %)		 21,943
(2.24 %)		 n/a 41.68
(97.40 %)		 63,061
(2.62 %)		 64,863
(97.38 %)		 590,350
(4.68 %)		 253,525
(1.38 %)		 6,926,961
(19.71 %)		 40,011
(3.69 %)
359 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1		 n/a 12,965
(1.97 %)		 25,182
(2.35 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 716
(0.01 %)		 2,119
(100.00 %)		 650,271
(7.44 %)		 270,668
(1.26 %)		 6,776,820
(21.19 %)		 35,560
(4.27 %)
360 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1		 43,215
(5.89 %)		 12,148
(1.89 %)		 19,386
(2.07 %)		 29,870
(3.24 %)		 41.36
(96.87 %)		 84,351
(3.16 %)		 91,944
(96.84 %)		 481,707
(5.57 %)		 230,143
(1.26 %)		 6,665,312
(19.42 %)		 38,930
(2.06 %)
361 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1		 50,082
(5.09 %)		 12,974
(1.75 %)		 22,545
(2.07 %)		 n/a 42.67
(99.82 %)		 186
(0.18 %)		 367
(100.00 %)		 541,918
(6.97 %)		 347,387
(6.90 %)		 5,657,314
(26.08 %)		 25,816
(2.01 %)
362 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1		 n/a 11,928
(1.78 %)		 20,879
(2.12 %)		 n/a 42.78
(99.75 %)		 122
(0.25 %)		 413
(100.00 %)		 481,463
(6.65 %)		 359,572
(7.59 %)		 5,094,615
(26.27 %)		 23,296
(2.08 %)
363 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1		 n/a 11,432
(1.95 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 911
(100.00 %)		 470,125
(9.51 %)		 140,846
(3.57 %)		 5,002,695
(22.08 %)		 22,424
(2.33 %)
364 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1		 n/a 13,321
(1.76 %)		 24,102
(2.15 %)		 n/a 42.35
(99.83 %)		 203
(0.17 %)		 1,038
(100.00 %)		 593,409
(10.51 %)		 202,463
(9.29 %)		 6,160,173
(27.65 %)		 25,785
(2.35 %)
365 Tawny owl (bStrAlu1hap1 2023)
GCF_031877795.1		 49,317
(4.59 %)		 13,203
(1.60 %)		 23,223
(1.95 %)		 n/a 42.70
(99.70 %)		 281
(0.30 %)		 202
(100.00 %)		 443,128
(4.74 %)		 272,732
(10.86 %)		 5,812,627
(27.42 %)		 30,602
(2.52 %)
366 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1		 n/a 13,204
(1.60 %)		 23,981
(1.99 %)		 n/a 42.70
(99.70 %)		 281
(0.30 %)		 212
(99.85 %)		 443,228
(4.74 %)		 272,738
(10.86 %)		 5,812,837
(27.42 %)		 30,602
(2.52 %)
367 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1		 n/a 12,367
(1.72 %)		 21,445
(2.03 %)		 n/a 42.53
(99.88 %)		 206
(0.12 %)		 184
(100.00 %)		 392,959
(4.59 %)		 235,300
(7.72 %)		 6,437,772
(24.82 %)		 27,952
(2.71 %)
368 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1		 40,939
(5.96 %)		 12,510
(1.84 %)		 24,378
(2.37 %)		 n/a 42.64
(99.99 %)		 378
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 384,533
(3.09 %)		 345,667
(4.24 %)		 6,199,979
(21.86 %)		 33,587
(2.53 %)
369 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1		 28,749
(4.57 %)		 12,828
(2.02 %)		 17,743
(2.65 %)		 n/a 41.69
(98.76 %)		 21,646
(1.24 %)		 27,052
(98.76 %)		 443,797
(5.51 %)		 346,281
(2.29 %)		 6,423,932
(19.90 %)		 27,086
(2.31 %)
370 tourmaline sunangel (hap1 2024 refseq)
GCF_036169615.1		 50,562
(5.87 %)		 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,200
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,721
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
371 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1		 n/a 11,697
(2.00 %)		 19,544
(2.34 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 370
(0.01 %)		 200
(100.00 %)		 480,724
(5.14 %)		 292,213
(3.66 %)		 5,608,823
(21.79 %)		 17,191
(1.69 %)
372 tree swallow (Ithaca 2401-50270 2024)
GCA_007636935.2		 n/a 13,272
(1.53 %)		 31,390
(2.16 %)		 n/a 42.14
(98.29 %)		 2,123,840
(1.89 %)		 2,173,118
(98.11 %)		 581,418
(3.41 %)		 593,688
(3.21 %)		 7,518,639
(20.56 %)		 40,631
(3.03 %)
373 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1		 n/a 12,203
(1.76 %)		 25,216
(2.40 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 450
(100.00 %)		 430,792
(3.25 %)		 542,908
(5.67 %)		 5,289,916
(24.99 %)		 36,805
(3.52 %)
374 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 refseq)
GCF_023055355.1		 47,580
(6.11 %)		 12,866
(1.81 %)		 26,109
(2.43 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 428,951
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,642
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
375 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1		 29,505
(4.02 %)		 12,972
(1.98 %)		 22,757
(2.27 %)		 n/a 41.66
(99.16 %)		 163
(0.84 %)		 105
(100.00 %)		 826,451
(8.47 %)		 411,356
(1.71 %)		 6,691,445
(22.36 %)		 29,882
(2.41 %)
376 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1		 n/a 12,117
(2.03 %)		 21,464
(2.36 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 780
(100.00 %)		 732,317
(7.82 %)		 353,660
(1.57 %)		 6,119,549
(21.70 %)		 27,920
(2.56 %)
377 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1		 n/a 13,371
(1.77 %)		 23,897
(2.09 %)		 n/a 45.04
(99.99 %)		 540
(0.01 %)		 608
(100.00 %)		 745,129
(5.82 %)		 484,265
(9.62 %)		 6,249,520
(28.78 %)		 46,110
(11.14 %)
378 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3		 38,427
(6.01 %)		 13,095
(1.96 %)		 23,974
(2.27 %)		 30,549
(3.14 %)		 41.35
(96.83 %)		 65,045
(3.16 %)		 250,220
(96.84 %)		 609,750
(9.03 %)		 243,534
(1.26 %)		 6,043,889
(21.06 %)		 31,818
(1.42 %)
379 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1		 n/a 12,910
(2.37 %)		 23,038
(2.58 %)		 53,269
(6.57 %)		 41.12
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 618,023
(8.91 %)		 227,783
(1.43 %)		 6,123,721
(21.03 %)		 20,379
(2.19 %)
380 Ural owl (ZFMK-TIS-50842 2025)
GCF_047716275.1		 49,893
(4.74 %)		 13,319
(1.64 %)		 23,503
(2.00 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 203
(0.00 %)		 511
(100.00 %)		 440,187
(4.80 %)		 349,384
(10.47 %)		 5,857,826
(27.02 %)		 30,398
(2.59 %)
381 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1		 n/a 12,819
(1.94 %)		 24,247
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 178
(100.00 %)		 616,749
(11.96 %)		 411,917
(3.56 %)		 6,385,102
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
382 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1		 44,961
(5.49 %)		 12,817
(1.94 %)		 24,245
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 177
(100.00 %)		 616,746
(11.96 %)		 411,917
(3.57 %)		 6,385,057
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
383 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1		 n/a 2,176
(1.79 %)		 7,719
(4.37 %)		 n/a 49.74
(100.00 %)		 n/a 1,939
(100.00 %)		 136,312
(29.31 %)		 157,341
(15.03 %)		 648,725
(34.67 %)		 15,490
(8.23 %)
384 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1		 n/a 12,732
(1.51 %)		 23,395
(1.91 %)		 n/a 44.28
(99.99 %)		 668
(0.00 %)		 4,450
(100.00 %)		 526,500
(5.75 %)		 269,598
(14.29 %)		 4,825,913
(32.19 %)		 27,465
(2.18 %)
385 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1		 n/a 12,760
(1.53 %)		 23,262
(2.16 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 1,299
(100.00 %)		 497,104
(5.09 %)		 271,530
(15.72 %)		 5,291,065
(32.37 %)		 24,669
(1.78 %)
386 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1		 n/a 11,226
(2.33 %)		 20,526
(2.54 %)		 n/a 41.53
(100.00 %)		 n/a 5,463
(100.00 %)		 436,894
(5.48 %)		 209,008
(1.73 %)		 4,790,071
(20.27 %)		 17,864
(2.58 %)
387 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1		 n/a 12,775
(2.33 %)		 22,516
(2.50 %)		 n/a 41.49
(99.98 %)		 973
(0.02 %)		 318
(100.00 %)		 518,194
(5.54 %)		 276,294
(2.21 %)		 5,866,033
(21.12 %)		 21,287
(2.50 %)
388 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1		 n/a 12,480
(1.72 %)		 22,915
(2.17 %)		 n/a 44.29
(100.00 %)		 168
(0.00 %)		 1,631
(100.00 %)		 394,733
(2.99 %)		 364,498
(6.04 %)		 4,803,453
(27.52 %)		 42,022
(4.90 %)
389 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1		 n/a 13,128
(1.62 %)		 25,648
(2.11 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 272
(0.00 %)		 1,393
(100.00 %)		 449,314
(3.08 %)		 505,129
(6.52 %)		 4,634,925
(31.99 %)		 51,884
(4.81 %)
390 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1		 n/a 11,632
(1.83 %)		 20,659
(2.18 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,405
(100.00 %)		 553,633
(11.80 %)		 147,999
(0.81 %)		 5,825,472
(20.55 %)		 20,481
(1.61 %)
391 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1		 n/a 12,681
(1.84 %)		 21,784
(2.14 %)		 n/a 42.12
(99.13 %)		 218
(0.87 %)		 146
(100.00 %)		 520,200
(9.32 %)		 170,778
(0.83 %)		 6,455,910
(21.44 %)		 24,061
(1.62 %)
392 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2		 83,834
(10.16 %)		 13,005
(2.32 %)		 23,329
(2.48 %)		 72,360
(9.39 %)		 42.16
(99.57 %)		 409
(0.43 %)		 685
(99.57 %)		 536,869
(6.00 %)		 268,230
(2.28 %)		 5,845,184
(20.93 %)		 24,409
(2.60 %)
393 white wagtail
GCF_015832195.1		 47,145
(6.80 %)		 12,127
(1.86 %)		 22,301
(2.31 %)		 n/a 42.72
(99.92 %)		 906
(0.08 %)		 619
(100.00 %)		 479,546
(6.15 %)		 349,751
(5.62 %)		 6,384,256
(22.41 %)		 28,008
(2.68 %)
394 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1		 53,728
(6.26 %)		 12,981
(1.91 %)		 23,916
(2.40 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 n/a 643
(100.00 %)		 417,020
(3.98 %)		 366,209
(3.55 %)		 5,992,950
(21.48 %)		 28,964
(2.22 %)
395 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1		 n/a 12,807
(1.82 %)		 25,568
(2.46 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 697
(100.00 %)		 429,646
(4.10 %)		 293,431
(3.59 %)		 6,059,494
(21.89 %)		 29,574
(2.42 %)
396 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1		 55,558
(6.99 %)		 12,807
(1.82 %)		 23,359
(2.28 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 696
(100.00 %)		 429,643
(4.10 %)		 293,428
(3.59 %)		 6,059,402
(21.89 %)		 29,574
(2.42 %)
397 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1		 n/a 12,135
(1.94 %)		 21,591
(2.38 %)		 n/a 42.49
(99.99 %)		 307
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 375,468
(3.93 %)		 263,979
(3.93 %)		 5,786,346
(21.36 %)		 25,275
(2.50 %)
398 white-plumed antbird (INPA30051 2025)
GCF_047495875.1		 37,839
(4.99 %)		 12,030
(1.76 %)		 22,066
(2.17 %)		 n/a 42.67
(99.85 %)		 415
(0.15 %)		 53
(100.00 %)		 409,029
(4.70 %)		 301,324
(5.91 %)		 5,956,577
(23.63 %)		 22,947
(2.01 %)
399 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1		 45,894
(5.34 %)		 12,730
(1.91 %)		 19,044
(2.50 %)		 n/a 41.81
(99.24 %)		 13,527
(0.76 %)		 9,068
(100.00 %)		 489,252
(7.14 %)		 246,346
(1.38 %)		 6,500,956
(19.79 %)		 25,941
(1.84 %)
400 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1		 n/a 12,487
(1.71 %)		 29,990
(2.73 %)		 n/a 43.26
(100.00 %)		 176
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 427,385
(3.06 %)		 507,421
(10.23 %)		 5,759,740
(27.66 %)		 36,849
(5.10 %)
401 white-rumped munia (paternal hap 2024)
GCA_046129705.1		 n/a 12,130
(1.67 %)		 29,443
(2.72 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 228
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 420,085
(3.06 %)		 494,379
(10.27 %)		 5,496,878
(27.56 %)		 36,269
(5.17 %)
402 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1		 34,717
(4.88 %)		 12,599
(1.97 %)		 24,083
(2.44 %)		 n/a 42.03
(99.81 %)		 4,869
(0.19 %)		 11,576
(100.00 %)		 502,151
(6.20 %)		 449,641
(3.22 %)		 6,554,257
(20.25 %)		 28,891
(2.32 %)
403 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1		 20,744
(2.82 %)		 11,490
(1.49 %)		 22,258
(1.77 %)		 n/a 40.90
(99.56 %)		 60,579
(0.45 %)		 111,484
(99.55 %)		 325,669
(3.74 %)		 116,707
(0.60 %)		 6,725,133
(18.14 %)		 11,615
(0.32 %)
404 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1		 n/a 7,755
(1.71 %)		 16,331
(2.39 %)		 n/a 43.66
(100.00 %)		 n/a 4,971
(100.00 %)		 304,566
(13.21 %)		 116,307
(6.64 %)		 3,407,853
(22.91 %)		 34,573
(4.56 %)
405 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1		 52,797
(5.74 %)		 13,736
(1.76 %)		 24,846
(2.12 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 585,279
(12.89 %)		 291,297
(6.10 %)		 6,474,102
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
406 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1		 39,072
(5.37 %)		 12,919
(2.36 %)		 23,624
(2.48 %)		 n/a 41.37
(97.63 %)		 10,501
(2.38 %)		 7,343
(100.00 %)		 587,593
(8.19 %)		 231,665
(1.12 %)		 6,007,601
(20.08 %)		 21,298
(2.05 %)
407 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1		 16,342
(2.18 %)		 12,040
(1.50 %)		 26,704
(1.97 %)		 n/a 41.51
(99.50 %)		 65,286
(0.51 %)		 132,071
(99.49 %)		 353,892
(5.61 %)		 125,195
(0.74 %)		 6,873,137
(19.59 %)		 41,005
(1.45 %)
408 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1		 n/a 12,856
(1.79 %)		 23,827
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 658
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 431,536
(3.38 %)		 345,533
(10.59 %)		 5,840,462
(26.59 %)		 29,711
(3.56 %)
409 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1		 29,618
(3.60 %)		 12,854
(1.79 %)		 23,825
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 658
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 431,531
(3.38 %)		 345,532
(10.59 %)		 5,840,421
(26.59 %)		 29,711
(3.56 %)
410 white-throated sparrow (bZonAlb1hap1 2025)
GCF_047830755.1		 52,088
(6.40 %)		 12,981
(1.65 %)		 26,992
(2.26 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 449,050
(3.16 %)		 631,897
(8.80 %)		 6,189,205
(27.24 %)		 40,133
(2.67 %)
411 white-throated sparrow (hap1 2025)
GCA_047830755.1		 n/a 12,983
(1.65 %)		 33,925
(3.13 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 180
(100.00 %)		 449,053
(3.16 %)		 631,898
(8.80 %)		 6,189,242
(27.24 %)		 40,133
(2.67 %)
412 white-throated sparrow (hap2 2025)
GCA_047774235.1		 n/a 12,395
(1.71 %)		 31,476
(3.12 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 246
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 412,959
(3.07 %)		 653,654
(9.08 %)		 5,548,210
(27.13 %)		 38,640
(2.84 %)
413 white-throated sparrow (Tan morph 2013)
GCF_000385455.1		 31,167
(5.71 %)		 11,241
(1.81 %)		 13,429
(2.26 %)		 n/a 41.52
(95.61 %)		 41,460
(4.40 %)		 37,661
(95.60 %)		 439,216
(5.96 %)		 364,202
(2.52 %)		 6,300,584
(19.09 %)		 15,091
(0.85 %)
414 white-throated tinamou
GCF_000705375.1		 18,997
(2.72 %)		 12,287
(1.75 %)		 20,132
(2.48 %)		 n/a 41.41
(97.88 %)		 59,853
(2.12 %)		 142,367
(97.88 %)		 366,311
(3.62 %)		 226,347
(1.35 %)		 6,300,683
(18.94 %)		 47,608
(2.60 %)
415 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1		 55,421
(5.57 %)		 13,574
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 930
(100.00 %)		 616,300
(10.57 %)		 211,558
(2.90 %)		 6,785,192
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
416 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1		 n/a 13,284
(1.87 %)		 23,528
(2.20 %)		 n/a 42.47
(99.50 %)		 586
(0.50 %)		 395
(100.00 %)		 569,940
(8.69 %)		 162,569
(0.98 %)		 7,021,319
(20.20 %)		 38,582
(3.77 %)
417 willow flycatcher
GCF_003031625.1		 37,909
(4.43 %)		 12,708
(1.90 %)		 19,591
(2.57 %)		 n/a 42.01
(95.33 %)		 39,319
(4.68 %)		 7,791
(100.00 %)		 550,172
(7.15 %)		 242,394
(1.27 %)		 6,421,292
(18.87 %)		 27,080
(1.82 %)
418 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2		 42,551
(5.86 %)		 12,535
(1.90 %)		 23,300
(2.38 %)		 n/a 42.06
(99.73 %)		 758
(0.26 %)		 1,768
(100.00 %)		 480,705
(7.12 %)		 240,463
(1.87 %)		 6,316,566
(20.20 %)		 25,317
(2.02 %)
419 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1		 n/a 13,053
(1.78 %)		 24,963
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 342
(0.00 %)		 1,350
(100.00 %)		 444,809
(3.08 %)		 473,154
(7.96 %)		 5,336,472
(25.82 %)		 37,198
(3.14 %)
420 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq)
GCF_029207755.1		 40,944
(5.15 %)		 13,050
(1.78 %)		 24,948
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,694
(100.00 %)		 444,856
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,456
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
421 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1		 n/a 12,848
(1.71 %)		 24,293
(2.19 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 773
(0.01 %)		 1,510
(100.00 %)		 688,169
(20.12 %)		 440,901
(9.03 %)		 5,858,667
(26.62 %)		 39,419
(4.07 %)
422 Xingu scale-backed antbird (hap2 2024)
GCA_045364805.1		 n/a 12,157
(1.85 %)		 22,615
(2.35 %)		 n/a 43.36
(99.99 %)		 533
(0.01 %)		 743
(100.00 %)		 575,863
(14.81 %)		 371,492
(6.11 %)		 5,580,275
(23.05 %)		 28,593
(3.34 %)
423 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1		 n/a 12,426
(1.63 %)		 27,565
(2.37 %)		 n/a 43.59
(100.00 %)		 246
(0.00 %)		 776
(100.00 %)		 447,274
(3.06 %)		 612,008
(10.28 %)		 5,606,168
(28.79 %)		 39,449
(2.66 %)
424 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1		 n/a 12,556
(1.69 %)		 26,545
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 440,673
(3.12 %)		 581,112
(9.17 %)		 6,158,372
(26.15 %)		 35,577
(2.57 %)
425 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1		 n/a 13,169
(1.63 %)		 23,545
(1.98 %)		 n/a 43.42
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 1,679
(100.00 %)		 579,903
(8.32 %)		 295,345
(9.90 %)		 4,361,776
(30.37 %)		 28,647
(1.82 %)
426 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1		 n/a 12,079
(1.50 %)		 21,895
(1.84 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 138
(0.00 %)		 2,468
(100.00 %)		 514,155
(7.08 %)		 298,648
(19.26 %)		 3,943,979
(37.27 %)		 27,272
(1.79 %)
427 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1		 n/a 12,692
(1.61 %)		 24,720
(2.07 %)		 n/a 44.79
(100.00 %)		 n/a 4,673
(100.00 %)		 486,967
(5.03 %)		 248,816
(10.71 %)		 6,176,494
(29.58 %)		 44,101
(6.72 %)
428 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1		 n/a 13,396
(1.62 %)		 25,176
(2.03 %)		 n/a 44.64
(99.99 %)		 500
(0.01 %)		 618
(100.00 %)		 521,539
(5.15 %)		 267,365
(11.68 %)		 5,827,639
(29.76 %)		 44,532
(6.28 %)
429 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCF_964199755.1		 55,633
(4.58 %)		 13,395
(1.62 %)		 25,176
(2.03 %)		 n/a 44.64
(99.99 %)		 500
(0.01 %)		 617
(100.00 %)		 521,442
(5.14 %)		 262,205
(11.30 %)		 5,827,388
(29.76 %)		 44,532
(6.28 %)
430 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1		 n/a 11,788
(1.85 %)		 23,306
(2.45 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 1,958
(100.00 %)		 467,960
(6.96 %)		 182,645
(0.99 %)		 6,050,545
(20.78 %)		 26,357
(2.20 %)
431 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1		 n/a 12,697
(1.89 %)		 25,289
(2.53 %)		 n/a 42.40
(99.62 %)		 242
(0.38 %)		 89
(100.00 %)		 510,633
(7.10 %)		 213,742
(1.12 %)		 6,627,716
(21.17 %)		 28,848
(2.23 %)
432 zebra finch (2025)
GCF_048771995.1		 56,858
(7.38 %)		 12,947
(1.86 %)		 25,218
(2.42 %)		 n/a 42.68
(99.97 %)		 9
(0.03 %)		 50
(99.97 %)		 411,957
(3.12 %)		 511,515
(6.75 %)		 5,958,834
(23.49 %)		 35,953
(3.51 %)
433 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1		 n/a 11,340
(1.85 %)		 22,921
(2.37 %)		 n/a 41.73
(99.98 %)		 45
(0.01 %)		 5,381
(99.99 %)		 480,647
(8.44 %)		 365,668
(2.89 %)		 5,859,698
(20.27 %)		 24,649
(2.35 %)
434 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1		 n/a 10,734
(1.84 %)		 19,978
(2.21 %)		 n/a 41.07
(99.99 %)		 16
(0.01 %)		 4,677
(100.00 %)		 436,071
(7.44 %)		 217,580
(1.43 %)		 5,800,691
(19.24 %)		 19,512
(1.90 %)
435 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2		 n/a 11,213
(2.01 %)		 21,533
(2.54 %)		 n/a 41.92
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 1,646
(100.00 %)		 470,860
(9.54 %)		 387,943
(3.32 %)		 5,428,128
(20.68 %)		 23,838
(2.47 %)
436 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2		 n/a 12,796
(1.92 %)		 24,658
(2.44 %)		 n/a 41.91
(98.03 %)		 789
(1.97 %)		 541
(100.00 %)		 554,338
(9.67 %)		 339,851
(2.27 %)		 6,613,146
(20.04 %)		 28,678
(2.32 %)
437 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1		 n/a 12,384
(1.97 %)		 23,021
(2.44 %)		 n/a 41.74
(98.02 %)		 828
(1.98 %)		 202
(100.00 %)		 511,324
(8.38 %)		 351,624
(2.53 %)		 6,328,918
(19.99 %)		 25,871
(2.29 %)
438 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2		 50,407
(7.20 %)		 12,470
(1.95 %)		 23,352
(2.42 %)		 n/a 41.81
(97.98 %)		 857
(2.02 %)		 205
(100.00 %)		 529,829
(9.55 %)		 357,586
(2.56 %)		 6,359,599
(20.12 %)		 27,755
(2.36 %)
439 zebra finch (bTaeGut7 maternal hap 2025)
GCA_048771995.1		 n/a 12,949
(1.86 %)		 26,010
(2.49 %)		 n/a 42.68
(99.97 %)		 9
(0.03 %)		 42
(100.00 %)		 411,962
(3.12 %)		 511,516
(6.75 %)		 5,958,859
(23.49 %)		 35,953
(3.51 %)
440 zebra finch (bTaeGut7 paternal hap 2025)
GCA_048772025.1		 n/a 12,239
(1.95 %)		 23,953
(2.54 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 2
(0.01 %)		 41
(99.99 %)		 369,991
(3.07 %)		 472,357
(5.84 %)		 5,622,412
(22.80 %)		 30,701
(3.48 %)
441 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2		 49,311
(7.41 %)		 12,747
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 544,577
(9.57 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,748
(20.92 %)		 29,202
(2.47 %)
442 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3		 n/a 11,950
(2.00 %)		 22,828
(2.51 %)		 n/a 42.06
(98.45 %)		 583
(1.55 %)		 206
(100.00 %)		 494,110
(9.54 %)		 347,933
(2.80 %)		 5,875,448
(20.29 %)		 27,387
(2.57 %)
TOTALS:total assembly count 442

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Primates 600 assemblies assembly stats track stats
Mammals 690 assemblies assembly stats track stats
Birds 442 assemblies assembly stats track stats
Fishes 500 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 323 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1197 assemblies assembly stats track stats
Plants 341 assemblies assembly stats track stats
Fungi 932 assemblies assembly stats track stats
Viruses 709 assemblies assembly stats track stats
Archaea 757 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21256 assemblies assembly stats track stats
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collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1633 assemblies assembly stats track stats