Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019 VGP)
GCA_009769605.1
n/a 12,918
(1.90 %)
17,214
(2.53 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,836
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,983
(3.62 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769595.1
n/a 11,935
(1.85 %)
17,161
(2.52 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,144
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,782
(3.72 %)
3 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,651
(3.05 %)
11,771
(1.70 %)
18,556
(1.84 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
465,562
(6.05 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
4 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
5 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
20,173
(2.17 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
425,989
(6.05 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
6 American flamingo (2019 VGP)
GCA_009819775.1
n/a 13,081
(1.79 %)
22,162
(2.64 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,001
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
51,972
(4.83 %)
7 American flamingo (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819805.1
n/a 12,369
(1.73 %)
22,102
(2.60 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,874
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,873
(5.47 %)
8 Anna's hummingbird (alt pseudohaplotype BGI_N300 2018 VGP)
GCA_003957575.1
n/a 11,080
(1.90 %)
14,722
(2.29 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,490
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
9 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq VGP)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,248
(1.95 %)
20,821
(2.30 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
547,346
(7.89 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
10 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,013
(1.88 %)
21,331
(2.11 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
453,074
(5.29 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
11 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
25,920
(1.86 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
447,233
(7.10 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
12 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
13 barn swallow (genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
14 barn swallow (refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
15 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
16 blackcap (2019 VGP)
GCA_009819655.1
n/a 12,367
(1.92 %)
17,080
(2.58 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,239
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,837
(2.32 %)
17 blackcap (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819715.1
n/a 11,575
(1.86 %)
17,228
(2.55 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,453
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
18 black swan
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
19 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
20 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,167
(1.76 %)
24,104
(2.22 %)
41,815
(3.95 %)
41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
496,094
(5.99 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
21 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,445
(1.93 %)
22,483
(2.30 %)
24,896
(3.01 %)
41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
479,978
(6.88 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
22 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
23 brown headed cowbird
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
24 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
25 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,215
(1.55 %)
29,361
(2.00 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
413,378
(6.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
26 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,196
(1.81 %)
21,458
(2.10 %)
25,737
(3.06 %)
41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
478,340
(9.31 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
27 budgerigar (maternal 2020 VGP)
GCA_012275265.1
n/a 12,645
(1.89 %)
18,505
(2.70 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,674
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
28 budgerigar (maternal Z 2020 refseq VGP)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
n/a 41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
29 budgerigar (paternal 2020 VGP)
GCA_012275275.1
n/a 13,131
(1.94 %)
19,040
(2.75 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,475
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
30 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,739
(1.72 %)
17,598
(1.93 %)
23,983
(2.78 %)
40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
502,022
(6.12 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
31 California condor
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
32 carmine bee-eater (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819585.1
n/a 12,368
(1.75 %)
21,365
(2.81 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,762
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
33 carmine bee-eater (2019 VGP)
GCA_009819595.1
n/a 12,724
(1.82 %)
20,356
(2.83 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,923
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,884
(2.47 %)
34 chicken
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,083
(2.31 %)
23,897
(2.50 %)
39,251
(5.00 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
699,901
(12.72 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,403
(2.57 %)
35 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,540
(2.09 %)
23,261
(2.54 %)
22,489
(2.50 %)
42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
503,525
(5.38 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,627
(4.89 %)
36 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
37 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
38 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,373
(4.07 %)
12,197
(1.78 %)
21,980
(2.17 %)
n/a 44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
621,954
(11.73 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
39 common canary
GCF_007115625.1
32,998
(4.99 %)
12,243
(1.89 %)
23,125
(2.34 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
487,201
(6.29 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
40 common cuckoo (VGP 2021)
GCA_017976375.1
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
41 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,578
(2.01 %)
23,288
(2.42 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
469,830
(5.86 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
42 common swift
GCA_020740795.1
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
43 common tern (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819645.1
n/a 12,766
(1.79 %)
18,154
(2.47 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,457
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,340
(3.68 %)
44 common tern (2019 VGP)
GCA_009819605.1
n/a 13,094
(1.80 %)
17,911
(2.48 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,309
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,683
(3.53 %)
45 common yellowthroat (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009764545.1
n/a 10,599
(1.76 %)
16,440
(2.36 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,886
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
46 common yellowthroat (2019 VGP)
GCA_009764595.1
n/a 11,736
(1.82 %)
16,696
(2.52 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,046
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
47 crested ibis
GCF_000708225.1
17,147
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
21,346
(1.99 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
517,127
(5.90 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,155
(2.05 %)
48 cuckoo roller
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,190
(1.53 %)
27,315
(1.84 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
435,835
(5.75 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
49 Dalmatian pelican
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,926
(1.44 %)
26,715
(1.76 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
502,899
(6.52 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
50 downy woodpecker (VGP 2020)
GCA_014839835.1
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
51 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
52 East African grey crowned-crane (alt pseudohaplotyp 2020 VGP)
GCA_011004865.1
n/a 11,782
(1.88 %)
18,687
(2.68 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,927
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,314
(3.59 %)
53 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020 VGP)
GCA_011004875.1
n/a 13,263
(1.84 %)
20,787
(2.66 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,859
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,610
(3.33 %)
54 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,518
(1.77 %)
19,763
(1.95 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
494,422
(5.57 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
55 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,060
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
21,489
(1.99 %)
33,416
(3.44 %)
41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
453,024
(4.18 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,742
(4.47 %)
56 emu (2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
57 Eurasian nightjar
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
58 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
59 European golden plover
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
60 European robin
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
61 European turtle dove (alt pseudohaplotype v1.1 2019 VGP)
GCA_901699165.1
n/a 11,266
(1.79 %)
17,283
(2.48 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,564
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
62 European turtle dove (v1.2 2021 VGP)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
63 garden warbler
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
64 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,800
(1.85 %)
19,868
(2.19 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
455,868
(6.95 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
65 golden eagle (2019 VGP)
GCA_902153765.1
n/a 9,330
(1.81 %)
14,414
(2.43 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,281
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
66 golden eagle (v1.4 2021 VGP)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
67 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
68 great cormorant
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,539
(1.44 %)
25,114
(1.69 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
403,514
(5.73 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
69 great potoo
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
70 great tit
GCF_001522545.3
46,622
(6.92 %)
12,240
(2.00 %)
22,301
(2.39 %)
35,277
(4.08 %)
41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
454,833
(5.84 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
71 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
72 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
73 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
74 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
75 gyrfalcon (2020 VGP)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
76 Hawaiian crow (VGP 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
77 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,448
(7.96 %)
12,853
(2.28 %)
23,033
(2.43 %)
40,117
(4.15 %)
41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
499,793
(7.93 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
78 hoatzin
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,457
(1.65 %)
18,868
(1.85 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
444,852
(7.40 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
79 hooded crow (2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
80 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
81 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
82 kakapo (Jane alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_004011185.1
n/a 3,251
(1.65 %)
5,389
(2.18 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,814
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
83 kakapo (Jane v2 2020 refseq VGP)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,102
(1.92 %)
17,781
(2.51 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
517,233
(7.76 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,279
(1.79 %)
84 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,982
(1.66 %)
25,022
(1.97 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
450,515
(6.55 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
85 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,353
(1.72 %)
20,433
(1.94 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
528,556
(7.11 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
86 lance-tailed manakin (2020 VGP)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,580
(1.91 %)
16,669
(2.52 %)
n/a 41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
494,225
(7.09 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,376
(1.95 %)
87 lance-tailed manakin (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_009829205.1
n/a 12,270
(1.85 %)
18,043
(2.51 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,381
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
88 lesser kestrel (v2 2021 VGP)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
89 lesser rhea
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
90 little egret
GCF_000687185.1
15,986
(2.42 %)
12,165
(1.72 %)
19,101
(1.90 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
502,442
(6.71 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
91 Macqueen's bustard
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,627
(1.51 %)
26,301
(1.84 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
474,904
(5.88 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
92 maguari stor
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
93 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
94 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,188
(1.85 %)
22,452
(2.19 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
781,333
(8.08 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
95 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
n/a 42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
96 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
97 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,894
(1.83 %)
20,388
(2.17 %)
23,200
(3.08 %)
41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
441,359
(5.86 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
98 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
99 mute swan (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769485.1
n/a 10,070
(1.97 %)
14,255
(2.46 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,824
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,662
(3.69 %)
100 mute swan (v2 2021 VGP)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
n/a 41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
101 New Caledonian crow (2019 VGP)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,735
(1.93 %)
17,289
(2.60 %)
n/a 42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
460,676
(6.16 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,907
(2.46 %)
102 New Caledonian crow (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009651025.1
n/a 11,089
(1.99 %)
15,330
(2.65 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,047
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,106
(2.51 %)
103 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
104 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,963
(1.50 %)
26,299
(1.77 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
436,850
(5.16 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
105 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,227
(1.76 %)
22,482
(2.03 %)
31,718
(2.89 %)
41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
494,809
(4.85 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,062
(4.56 %)
106 peregrine falcon
GCF_000337955.1
37,519
(5.42 %)
12,666
(1.80 %)
19,285
(1.99 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
447,274
(5.23 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
107 plumbeous ibis
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
108 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP)
GCA_008658365.1
n/a 12,776
(1.83 %)
16,521
(2.42 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,514
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,955
(2.90 %)
109 razorbill (alt pseudohaplotype 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP)
GCA_008658355.1
n/a 12,926
(1.74 %)
18,313
(2.36 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,546
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,925
(2.86 %)
110 red-crested turaco (2019 VGP)
GCA_009769465.1
n/a 12,726
(1.75 %)
21,173
(2.64 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,882
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,046
(3.29 %)
111 red-crested turaco (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009764505.1
n/a 11,230
(1.70 %)
19,839
(2.60 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,814
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,761
(3.33 %)
112 red-fronted tinkerbird
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
113 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
114 red-legged seriema (2019 VGP)
GCA_009819825.1
n/a 13,220
(1.83 %)
19,960
(2.64 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,781
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,894
(2.67 %)
115 red-legged seriema (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819485.1
n/a 10,125
(1.77 %)
16,337
(2.56 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,588
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,292
(2.86 %)
116 red-throated loon
GCF_000690875.1
15,842
(2.14 %)
11,586
(1.46 %)
25,291
(1.71 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
382,153
(4.85 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
117 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
118 rifleman (VGP 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
119 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,234
(6.38 %)
13,027
(2.34 %)
23,759
(2.47 %)
35,359
(4.02 %)
41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
600,071
(8.12 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,362
(2.11 %)
120 rock pigeon
GCF_000337935.1
52,382
(6.40 %)
12,581
(1.87 %)
21,539
(2.18 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
491,972
(6.86 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,800
(1.40 %)
121 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
122 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,986
(1.78 %)
24,061
(2.27 %)
35,218
(3.59 %)
42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
598,312
(7.84 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
123 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
124 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,904
(1.85 %)
26,943
(2.32 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
506,451
(7.11 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
125 Saker falcon
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,576
(1.78 %)
18,758
(1.96 %)
n/a 41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
447,504
(5.26 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
126 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,639
(1.95 %)
23,859
(2.40 %)
24,423
(3.59 %)
42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
465,333
(5.96 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,270
(2.38 %)
127 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
128 South Island takahe (VGP alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
129 South Island takahe (VGP primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
130 speckled mousebird
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,557
(1.44 %)
27,937
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
425,255
(7.62 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
131 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,549
(1.45 %)
27,111
(1.82 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
420,590
(6.32 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
132 Suruca trogon
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
133 Swainson's thrush (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819505.1
n/a 13,406
(1.85 %)
20,402
(2.61 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,371
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
134 Swainson's thrush (v2 2020 VGP)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
135 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
136 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
137 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
n/a 41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
138 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,749
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
24,003
(2.49 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
476,955
(6.01 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
139 tufted duck (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819845.1
n/a 12,108
(2.02 %)
15,241
(2.53 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,314
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,919
(2.56 %)
140 tufted duck (2019 VGP)
GCF_009819795.1
29,505
(4.02 %)
12,959
(1.97 %)
16,252
(2.50 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
836,786
(8.36 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,883
(2.48 %)
141 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
n/a 41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
142 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
143 whiskered treeswift
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
144 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 VGP 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
n/a 42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
145 white leghorn X broiler chicken (broiler haplotype 2021 VGP)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
n/a 42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
146 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
147 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,728
(1.91 %)
24,667
(2.34 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
498,690
(7.12 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
148 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
149 white-tailed eagle
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,486
(1.49 %)
24,520
(1.72 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
419,664
(5.08 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
150 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
151 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,039
(1.50 %)
26,683
(1.79 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
435,221
(6.74 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
152 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,245
(1.80 %)
20,499
(2.19 %)
30,624
(3.48 %)
41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
437,862
(5.64 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
153 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,294
(1.74 %)
24,409
(2.18 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
468,176
(4.61 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
154 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,702
(1.90 %)
24,710
(2.38 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
560,568
(7.13 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
155 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
156 yellow-throated sandgrouse (2019 VGP)
GCA_009769525.1
n/a 12,693
(1.89 %)
18,187
(2.69 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,630
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,846
(2.19 %)
157 yellow-throated sandgrouse (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769505.1
n/a 11,777
(1.85 %)
17,357
(2.58 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,957
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
158 zebra finch (Blue55 v1.4 2021 VGP)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
159 zebra finch (Blue55 2020 VGP)
GCA_009859065.2
n/a 12,787
(1.92 %)
18,164
(2.63 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,335
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
160 zebra finch (alt pseudohaplotype Black17 2018 VGP)
GCA_003957525.1
n/a 11,327
(1.85 %)
18,898
(2.67 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,644
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,648
(2.34 %)
161 zebra finch (alt pseudohaplotype Blue55 v1 2020 VGP)
GCA_009859025.1
n/a 10,723
(1.83 %)
15,206
(2.34 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,068
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
162 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020 VGP)
GCA_008822115.3
n/a 11,942
(1.99 %)
16,368
(2.73 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,107
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,385
(2.54 %)
163 zebra finch (Blue55 paternal 2019 VGP)
GCA_008822125.1
n/a 12,374
(1.97 %)
16,560
(2.63 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,321
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
25,871
(2.29 %)
164 zebra finch (Blue55 paternal W 2020 VGP)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,465
(1.95 %)
17,085
(2.63 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
540,255
(9.53 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
TOTALS:total assembly count 164

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Primates 55 assemblies assembly stats track stats
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