Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1		 n/a 11,948
(1.86 %)		 22,509
(2.24 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 n/a 3,527
(100.00 %)		 361,147
(5.36 %)		 125,372
(0.75 %)		 5,917,083
(18.51 %)		 38,787
(3.82 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1		 n/a 12,926
(1.90 %)		 23,453
(2.26 %)		 n/a 43.30
(99.29 %)		 204
(0.71 %)		 112
(100.00 %)		 401,839
(5.61 %)		 145,540
(0.78 %)		 6,556,090
(19.22 %)		 40,986
(3.65 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1		 n/a 12,415
(1.42 %)		 23,266
(1.78 %)		 n/a 46.76
(99.99 %)		 1,555
(0.01 %)		 2,294
(100.00 %)		 1,077,039
(17.72 %)		 548,450
(13.79 %)		 4,965,697
(43.00 %)		 29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1		 n/a 11,832
(1.45 %)		 22,508
(1.87 %)		 n/a 46.81
(99.99 %)		 1,317
(0.01 %)		 4,491
(99.99 %)		 980,493
(17.23 %)		 496,946
(14.39 %)		 5,155,337
(42.38 %)		 28,236
(3.22 %)
5 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCF_026170545.1		 41,049
(4.47 %)		 11,830
(1.45 %)		 22,522
(1.87 %)		 n/a 46.81
(99.99 %)		 1,317
(0.01 %)		 4,489
(99.99 %)		 980,471
(17.23 %)		 496,933
(14.40 %)		 5,155,020
(42.38 %)		 28,236
(3.22 %)
6 Adelie penguin
GCF_000699105.1		 17,651
(3.05 %)		 11,763
(1.71 %)		 10,671
(1.99 %)		 n/a 41.51
(95.58 %)		 95,110
(4.45 %)		 114,374
(95.55 %)		 360,323
(4.64 %)		 126,490
(0.70 %)		 6,900,013
(18.31 %)		 27,176
(0.96 %)
7 African ostrich
GCF_000698965.1		 29,013
(4.42 %)		 12,011
(1.64 %)		 17,852
(1.82 %)		 34,707
(3.37 %)		 41.05
(96.74 %)		 72,649
(3.29 %)		 79,564
(96.71 %)		 321,765
(3.17 %)		 152,444
(0.82 %)		 7,196,207
(17.79 %)		 33,542
(1.33 %)
8 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1		 70,988
(5.69 %)		 14,024
(1.60 %)		 24,944
(1.95 %)		 n/a 44.34
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 710,321
(8.33 %)		 473,161
(7.22 %)		 5,692,215
(24.23 %)		 46,493
(8.90 %)
9 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1		 n/a 13,036
(1.56 %)		 32,740
(2.89 %)		 n/a 45.71
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 651,979
(9.34 %)		 459,653
(10.08 %)		 4,547,348
(28.27 %)		 49,261
(10.50 %)
10 American crow
GCF_000691975.1		 36,379
(6.32 %)		 12,151
(1.86 %)		 11,346
(2.24 %)		 n/a 41.85
(96.40 %)		 79,099
(3.62 %)		 89,646
(96.38 %)		 416,990
(6.08 %)		 224,964
(1.60 %)		 6,343,680
(18.42 %)		 20,148
(0.77 %)
11 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1		 n/a 12,384
(1.73 %)		 23,611
(2.05 %)		 n/a 43.35
(100.00 %)		 n/a 3,529
(100.00 %)		 496,877
(7.22 %)		 162,522
(0.74 %)		 6,684,675
(20.14 %)		 51,895
(5.89 %)
12 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1		 n/a 13,100
(1.79 %)		 23,372
(2.04 %)		 n/a 43.27
(99.31 %)		 280
(0.69 %)		 90
(100.00 %)		 538,004
(7.73 %)		 183,346
(0.79 %)		 7,056,270
(20.92 %)		 52,012
(5.96 %)
13 American kestrel (FMNH 100283 2023)
GCA_034782035.1		 n/a 12,381
(1.73 %)		 24,701
(2.09 %)		 n/a 42.11
(85.58 %)		 492,459
(14.58 %)		 507,420
(85.42 %)		 366,772
(2.72 %)		 158,507
(0.60 %)		 6,543,446
(15.57 %)		 31,184
(1.76 %)
14 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1		 n/a 11,084
(1.90 %)		 19,321
(2.14 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,803
(100.00 %)		 475,493
(7.41 %)		 223,791
(1.37 %)		 5,585,250
(20.30 %)		 14,903
(1.46 %)
15 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1		 31,091
(4.24 %)		 12,257
(1.95 %)		 14,633
(2.35 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 159
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,055
(1.51 %)		 6,092,276
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
16 bald eagle
GCF_000737465.1		 26,869
(3.49 %)		 13,007
(1.88 %)		 15,874
(2.35 %)		 n/a 41.68
(98.38 %)		 30,862
(1.63 %)		 31,786
(98.37 %)		 355,319
(3.99 %)		 119,526
(0.44 %)		 6,923,742
(18.48 %)		 33,353
(1.97 %)
17 band-tailed pigeon (hap1 2025)
GCF_037038585.1		 53,396
(5.03 %)		 13,483
(1.56 %)		 27,248
(2.08 %)		 n/a 44.11
(99.81 %)		 137
(0.19 %)		 360
(100.00 %)		 559,611
(7.44 %)		 512,210
(15.22 %)		 4,524,890
(33.96 %)		 44,009
(7.81 %)
18 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1		 36,326
(4.04 %)		 13,317
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 452
(100.00 %)		 700,166
(13.18 %)		 457,543
(13.85 %)		 4,522,973
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
19 band-tailed pigeon (v2 hap2 2025)
GCA_036971685.2		 n/a 12,277
(1.73 %)		 24,050
(2.22 %)		 n/a 43.61
(99.61 %)		 64
(0.39 %)		 441
(100.00 %)		 468,593
(5.54 %)		 342,626
(9.43 %)		 5,110,790
(27.39 %)		 38,807
(6.05 %)
20 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1		 15,393
(2.18 %)		 11,432
(1.52 %)		 23,733
(1.98 %)		 n/a 41.38
(99.58 %)		 50,921
(0.42 %)		 105,649
(99.58 %)		 386,871
(6.20 %)		 142,825
(0.82 %)		 6,474,942
(19.87 %)		 18,662
(0.63 %)
21 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1		 46,583
(5.22 %)		 13,036
(1.82 %)		 22,849
(2.14 %)		 n/a 41.65
(95.89 %)		 259
(4.11 %)		 70
(100.00 %)		 610,994
(5.59 %)		 254,870
(1.12 %)		 7,109,716
(19.00 %)		 38,384
(2.94 %)
22 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3		 n/a 11,132
(1.94 %)		 20,993
(2.40 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,476
(100.00 %)		 550,072
(10.78 %)		 282,378
(2.00 %)		 5,634,117
(20.43 %)		 30,305
(2.79 %)
23 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2		 41,925
(5.13 %)		 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
24 Bengalese finch
GCF_005870125.1		 32,857
(5.06 %)		 12,604
(1.98 %)		 23,707
(2.41 %)		 n/a 41.59
(97.06 %)		 37,862
(2.95 %)		 2,015
(100.00 %)		 507,898
(7.97 %)		 424,913
(2.80 %)		 6,456,852
(20.03 %)		 29,692
(2.46 %)
25 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1		 n/a 13,007
(1.87 %)		 23,375
(2.27 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 439
(0.01 %)		 592
(100.00 %)		 467,217
(6.83 %)		 273,604
(2.43 %)		 6,154,114
(21.83 %)		 23,203
(2.12 %)
26 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1		 n/a 12,101
(1.93 %)		 21,258
(2.30 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 344
(0.01 %)		 525
(100.00 %)		 412,944
(6.30 %)		 232,333
(2.21 %)		 5,715,517
(21.35 %)		 20,873
(2.13 %)
27 bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023)
GCF_031753505.1		 53,868
(5.67 %)		 12,992
(1.79 %)		 25,575
(2.33 %)		 n/a 43.43
(99.99 %)		 431
(0.01 %)		 1,370
(100.00 %)		 437,810
(3.71 %)		 484,607
(8.45 %)		 5,614,533
(25.04 %)		 45,374
(4.99 %)
28 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1		 n/a 12,607
(2.39 %)		 22,429
(2.59 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 425
(100.00 %)		 521,486
(5.26 %)		 266,418
(2.40 %)		 5,305,054
(20.63 %)		 19,590
(2.16 %)
29 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1		 n/a 12,731
(2.42 %)		 22,580
(2.63 %)		 n/a 41.64
(99.99 %)		 330
(0.01 %)		 191
(100.00 %)		 520,888
(5.33 %)		 274,030
(2.07 %)		 5,360,112
(20.48 %)		 19,673
(2.18 %)
30 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1		 46,130
(4.40 %)		 13,292
(1.73 %)		 24,384
(2.16 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 993
(100.00 %)		 514,287
(6.54 %)		 355,123
(8.64 %)		 5,531,059
(27.22 %)		 28,362
(1.86 %)
31 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1		 42,284
(5.19 %)		 12,694
(1.84 %)		 25,490
(2.39 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 339
(0.00 %)		 3,792
(100.00 %)		 398,368
(3.10 %)		 569,232
(5.31 %)		 6,675,899
(23.29 %)		 31,995
(2.37 %)
32 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2		 41,434
(4.72 %)		 13,027
(1.98 %)		 22,616
(2.25 %)		 n/a 41.96
(99.99 %)		 130
(0.01 %)		 568
(100.00 %)		 636,501
(5.67 %)		 297,964
(1.45 %)		 6,820,083
(21.47 %)		 31,725
(3.49 %)
33 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1		 44,401
(4.96 %)		 13,738
(1.81 %)		 26,691
(2.34 %)		 n/a 42.41
(99.92 %)		 404
(0.08 %)		 307
(100.00 %)		 730,165
(12.91 %)		 566,529
(6.51 %)		 6,499,984
(24.36 %)		 42,650
(2.59 %)
34 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1		 n/a 11,495
(1.90 %)		 22,202
(2.49 %)		 n/a 42.77
(99.94 %)		 240
(0.06 %)		 157
(100.00 %)		 560,436
(11.20 %)		 441,102
(7.11 %)		 5,126,888
(23.42 %)		 35,457
(2.90 %)
35 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1		 n/a 12,902
(1.75 %)		 23,180
(2.09 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 498,044
(5.37 %)		 199,557
(4.44 %)		 6,843,616
(23.12 %)		 42,444
(3.62 %)
36 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1		 n/a 13,244
(1.58 %)		 25,111
(1.96 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 462
(0.01 %)		 729
(100.00 %)		 516,350
(4.84 %)		 268,175
(14.83 %)		 5,880,256
(31.31 %)		 45,313
(4.92 %)
37 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1		 46,133
(4.67 %)		 13,243
(1.58 %)		 24,048
(1.89 %)		 n/a 44.66
(99.99 %)		 462
(0.01 %)		 728
(100.00 %)		 516,346
(4.84 %)		 268,169
(14.83 %)		 5,880,218
(31.31 %)		 45,313
(4.92 %)
38 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1		 51,115
(5.11 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
39 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1		 n/a 12,650
(1.68 %)		 22,959
(2.02 %)		 n/a 44.62
(99.95 %)		 223
(0.05 %)		 733
(100.00 %)		 483,413
(5.25 %)		 221,284
(9.35 %)		 6,264,499
(27.26 %)		 42,776
(4.88 %)
40 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1		 n/a 12,249
(1.86 %)		 23,692
(2.34 %)		 n/a 42.36
(99.99 %)		 970
(0.01 %)		 600
(100.00 %)		 491,914
(6.04 %)		 365,884
(2.89 %)		 6,453,998
(20.73 %)		 30,076
(2.44 %)
41 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1		 n/a 11,586
(1.87 %)		 22,618
(2.41 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,566
(100.00 %)		 473,456
(5.97 %)		 308,518
(2.29 %)		 5,987,640
(19.64 %)		 25,451
(2.38 %)
42 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1		 31,610
(4.74 %)		 12,379
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 190
(100.00 %)		 582,016
(10.36 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,626
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
43 blue tit
GCF_002901205.1		 42,986
(5.81 %)		 12,162
(1.76 %)		 16,442
(2.29 %)		 n/a 41.18
(92.58 %)		 24,797
(7.42 %)		 29,297
(100.00 %)		 486,455
(6.02 %)		 423,142
(2.68 %)		 6,777,615
(18.84 %)		 26,565
(0.98 %)
44 blue jay (hap1 2024)
GCA_046129655.1		 n/a 13,064
(1.75 %)		 25,241
(2.27 %)		 n/a 43.65
(99.99 %)		 393
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 727,985
(19.18 %)		 342,327
(5.00 %)		 5,822,377
(25.13 %)		 40,586
(3.99 %)
45 blue jay (hap2 2024)
GCA_046129645.1		 n/a 12,260
(1.70 %)		 24,683
(2.22 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 333
(0.01 %)		 309
(100.00 %)		 878,243
(23.54 %)		 375,593
(6.42 %)		 4,946,505
(29.07 %)		 43,182
(4.25 %)
46 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1		 n/a 12,919
(1.77 %)		 22,770
(2.15 %)		 n/a 42.69
(99.92 %)		 107
(0.08 %)		 246
(100.00 %)		 711,670
(17.55 %)		 242,430
(5.04 %)		 5,545,074
(24.84 %)		 25,153
(2.06 %)
47 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1		 n/a 13,216
(1.69 %)		 23,855
(2.07 %)		 n/a 43.30
(99.92 %)		 130
(0.08 %)		 274
(100.00 %)		 746,174
(21.96 %)		 291,116
(9.91 %)		 5,424,976
(28.69 %)		 26,750
(2.02 %)
48 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1		 42,586
(5.25 %)		 12,442
(1.93 %)		 16,972
(2.49 %)		 n/a 41.74
(97.93 %)		 22,456
(2.07 %)		 23,501
(97.93 %)		 470,567
(6.92 %)		 226,975
(1.27 %)		 6,395,476
(19.17 %)		 24,084
(1.85 %)
49 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1		 n/a 12,250
(1.92 %)		 19,607
(2.10 %)		 n/a 41.72
(93.42 %)		 3,560,856
(6.92 %)		 1,498
(100.00 %)		 559,187
(10.05 %)		 144,509
(0.66 %)		 5,883,053
(17.90 %)		 18,581
(1.17 %)
50 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1		 n/a 12,339
(1.91 %)		 20,350
(2.13 %)		 n/a 41.72
(93.49 %)		 3,559,082
(6.85 %)		 3,232
(100.00 %)		 501,831
(8.21 %)		 144,313
(0.66 %)		 5,882,906
(17.92 %)		 18,584
(1.17 %)
51 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1		 43,924
(4.72 %)		 13,092
(1.91 %)		 23,195
(2.31 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 1,864
(100.00 %)		 469,079
(6.31 %)		 205,954
(1.49 %)		 5,911,944
(20.89 %)		 22,555
(1.70 %)
52 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1		 n/a 13,202
(1.80 %)		 24,416
(2.14 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 569
(100.00 %)		 832,469
(7.06 %)		 531,644
(7.37 %)		 6,294,434
(28.49 %)		 34,786
(3.61 %)
53 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1		 n/a 12,578
(1.76 %)		 23,066
(2.06 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 720
(100.00 %)		 773,452
(7.75 %)		 522,491
(10.88 %)		 5,592,104
(31.80 %)		 33,981
(4.60 %)
54 bronzed cowbird (106 2024)
GCF_037042795.1		 30,276
(4.54 %)		 12,775
(1.77 %)		 24,737
(2.30 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 528
(100.00 %)		 410,661
(3.03 %)		 498,610
(9.50 %)		 6,332,690
(26.06 %)		 33,278
(2.51 %)
55 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1		 n/a 13,027
(2.37 %)		 22,748
(2.48 %)		 n/a 41.03
(98.67 %)		 114,232
(1.35 %)		 2,408
(100.00 %)		 523,649
(0.00 %)		 228,783
(1.17 %)		 6,134,418
(20.24 %)		 19,702
(2.00 %)
56 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2		 31,884
(5.31 %)		 12,561
(1.89 %)		 24,218
(2.41 %)		 n/a 42.40
(99.99 %)		 318
(0.01 %)		 692
(99.99 %)		 598,355
(12.36 %)		 420,712
(3.73 %)		 6,496,704
(21.26 %)		 28,568
(2.41 %)
57 brown kiwi
GCF_001039765.1		 26,121
(3.23 %)		 12,909
(1.54 %)		 23,267
(1.91 %)		 n/a 41.28
(86.08 %)		 368,297
(13.97 %)		 24,718
(100.00 %)		 367,446
(2.94 %)		 316,602
(7.36 %)		 7,164,456
(14.67 %)		 59,756
(2.40 %)
58 brown roatelo
GCF_000695765.1		 16,756
(2.26 %)		 12,208
(1.55 %)		 27,079
(2.12 %)		 n/a 41.32
(99.66 %)		 51,602
(0.35 %)		 119,122
(99.65 %)		 345,102
(5.17 %)		 194,444
(1.21 %)		 6,441,258
(19.39 %)		 19,018
(0.67 %)
59 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1		 n/a 12,659
(1.89 %)		 22,063
(2.28 %)		 n/a 41.89
(94.20 %)		 388
(5.80 %)		 930
(100.00 %)		 504,677
(9.95 %)		 268,616
(3.12 %)		 5,481,198
(20.78 %)		 20,278
(1.55 %)
60 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1		 32,025
(4.32 %)		 13,239
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 864
(100.00 %)		 538,374
(10.19 %)		 279,504
(3.12 %)		 5,874,531
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
61 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1		 n/a 13,127
(1.94 %)		 22,492
(2.30 %)		 n/a 41.84
(98.98 %)		 737
(1.02 %)		 330
(100.00 %)		 505,478
(9.66 %)		 231,633
(2.15 %)		 5,778,405
(20.30 %)		 20,205
(1.61 %)
62 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1		 25,525
(4.05 %)		 12,188
(1.82 %)		 15,819
(2.26 %)		 n/a 41.25
(97.26 %)		 51,022
(2.75 %)		 70,863
(97.25 %)		 465,974
(9.37 %)		 127,353
(0.54 %)		 5,864,264
(19.05 %)		 15,886
(0.88 %)
63 burrowing owl
GCF_003259725.1		 30,559
(4.30 %)		 11,741
(1.72 %)		 10,976
(2.04 %)		 n/a 40.92
(98.92 %)		 33,737
(1.09 %)		 445
(100.00 %)		 492,320
(6.21 %)		 182,281
(0.73 %)		 6,811,984
(19.35 %)		 22,840
(1.08 %)
64 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1		 n/a 11,551
(1.57 %)		 22,390
(2.09 %)		 n/a 44.21
(99.99 %)		 1,672
(0.01 %)		 3,563
(100.00 %)		 465,417
(6.39 %)		 218,050
(11.40 %)		 4,588,632
(30.42 %)		 22,622
(2.16 %)
65 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1		 n/a 12,725
(1.54 %)		 24,572
(2.13 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 319
(0.00 %)		 964
(100.00 %)		 522,782
(6.36 %)		 226,563
(14.09 %)		 5,497,483
(32.27 %)		 24,529
(1.77 %)
66 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2		 27,527
(3.38 %)		 12,653
(1.75 %)		 21,924
(1.97 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 434,141
(3.82 %)		 177,389
(0.88 %)		 7,171,770
(20.32 %)		 34,918
(3.00 %)
67 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1		 n/a 12,948
(1.71 %)		 24,838
(2.01 %)		 n/a 43.36
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,359,516
(35.69 %)		 599,039
(11.78 %)		 3,454,101
(36.94 %)		 36,496
(2.55 %)
68 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1		 n/a 12,718
(2.12 %)		 23,363
(2.40 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 287
(0.00 %)		 608
(100.00 %)		 881,563
(19.85 %)		 308,707
(5.50 %)		 5,409,060
(25.34 %)		 25,268
(2.42 %)
69 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1		 28,823
(3.21 %)		 12,791
(1.50 %)		 26,511
(2.06 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 n/a 627
(100.00 %)		 473,712
(3.18 %)		 586,987
(10.80 %)		 4,965,312
(32.86 %)		 48,369
(2.73 %)
70 Canada goose (primary hap 2025)
GCA_965231335.1		 n/a 13,367
(1.74 %)		 24,033
(2.05 %)		 n/a 44.13
(99.99 %)		 531
(0.01 %)		 614
(100.00 %)		 686,641
(5.40 %)		 437,049
(11.66 %)		 6,060,316
(29.86 %)		 41,213
(4.57 %)
71 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1		 n/a 13,061
(1.95 %)		 24,149
(2.23 %)		 n/a 42.13
(98.37 %)		 15,389
(1.64 %)		 28,876
(98.36 %)		 715,113
(7.61 %)		 319,386
(1.67 %)		 6,810,836
(21.27 %)		 40,389
(4.15 %)
72 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1		 n/a 12,381
(1.76 %)		 28,865
(2.78 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 3,296
(100.00 %)		 542,765
(7.77 %)		 204,389
(1.06 %)		 6,415,832
(21.53 %)		 31,638
(2.54 %)
73 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1		 n/a 12,740
(1.82 %)		 28,031
(2.77 %)		 n/a 42.88
(99.47 %)		 269
(0.53 %)		 109
(100.00 %)		 556,926
(7.87 %)		 213,180
(1.09 %)		 6,641,077
(21.58 %)		 30,881
(2.41 %)
74 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1		 n/a 12,708
(1.72 %)		 24,978
(2.26 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 573
(0.01 %)		 467
(100.00 %)		 495,590
(3.15 %)		 493,628
(13.34 %)		 6,163,336
(28.37 %)		 39,042
(6.25 %)
75 chestnut-breasted malkoha (KB17595 2023)
GCF_032191515.1		 36,882
(4.04 %)		 13,316
(1.67 %)		 25,480
(2.15 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 587
(100.00 %)		 486,715
(8.57 %)		 476,696
(11.88 %)		 6,153,538
(29.89 %)		 33,146
(2.23 %)
76 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1		 n/a 11,740
(2.36 %)		 21,473
(2.56 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 2,263
(100.00 %)		 551,116
(10.78 %)		 241,638
(4.43 %)		 4,973,260
(21.77 %)		 21,151
(2.71 %)
77 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1		 n/a 13,037
(2.20 %)		 23,550
(2.37 %)		 n/a 42.31
(99.81 %)		 460
(0.19 %)		 252
(100.00 %)		 681,166
(12.04 %)		 381,093
(7.09 %)		 5,610,806
(24.65 %)		 25,664
(2.75 %)
78 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6		 62,183
(8.40 %)		 13,099
(2.32 %)		 18,797
(2.76 %)		 73,407
(9.29 %)		 42.23
(99.08 %)		 952
(0.92 %)		 2,380
(99.08 %)		 684,052
(12.74 %)		 307,144
(2.92 %)		 5,863,131
(21.16 %)		 24,405
(2.72 %)
79 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2		 n/a 13,405
(2.26 %)		 24,435
(2.45 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 704,190
(12.54 %)		 502,701
(5.74 %)		 5,731,097
(23.50 %)		 27,781
(2.90 %)
80 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1		 n/a 11,339
(2.33 %)		 20,588
(2.51 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,684
(100.00 %)		 537,847
(10.84 %)		 217,964
(3.81 %)		 4,879,985
(21.43 %)		 19,653
(2.66 %)
81 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1		 n/a 12,855
(2.22 %)		 23,147
(2.37 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 566
(0.26 %)		 246
(100.00 %)		 672,973
(12.00 %)		 342,156
(6.53 %)		 5,690,712
(23.98 %)		 24,413
(2.63 %)
82 chicken (Silkie 2023)
GCA_034509865.1		 n/a 13,116
(2.18 %)		 24,675
(2.43 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 1,100
(100.00 %)		 539,764
(6.24 %)		 361,584
(6.68 %)		 5,543,095
(24.80 %)		 27,013
(3.08 %)
83 chicken (Wuding W17 2024)
GCA_030914275.2		 n/a 13,176
(2.39 %)		 23,363
(2.52 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 311
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 499,477
(5.56 %)		 293,096
(1.94 %)		 6,026,265
(20.73 %)		 23,340
(2.53 %)
84 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2		 84,120
(9.95 %)		 13,128
(2.33 %)		 23,484
(2.48 %)		 72,013
(9.34 %)		 42.20
(99.68 %)		 463
(0.32 %)		 677
(99.68 %)		 697,827
(12.53 %)		 290,892
(2.63 %)		 5,887,021
(21.30 %)		 24,469
(2.59 %)
85 Chilean tinamou
GCF_003342845.1		 24,894
(4.16 %)		 12,545
(2.09 %)		 18,167
(2.87 %)		 n/a 42.04
(98.74 %)		 1,226,739
(1.39 %)		 2,217
(100.00 %)		 496,518
(5.43 %)		 290,573
(1.50 %)		 5,870,743
(19.53 %)		 44,640
(5.21 %)
86 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2		 15,969
(2.53 %)		 12,045
(1.82 %)		 18,580
(2.07 %)		 n/a 41.40
(96.00 %)		 65,471
(4.02 %)		 84,174
(95.98 %)		 469,979
(5.99 %)		 194,781
(2.21 %)		 6,361,618
(19.70 %)		 12,438
(0.41 %)
87 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2		 17,193
(2.21 %)		 12,092
(1.49 %)		 28,685
(1.89 %)		 n/a 40.76
(99.62 %)		 56,333
(0.39 %)		 125,214
(99.61 %)		 516,189
(5.36 %)		 202,882
(1.12 %)		 6,588,198
(20.47 %)		 8,029
(0.24 %)
88 collared flycatcher
GCF_000247815.1		 28,373
(4.07 %)		 12,200
(1.78 %)		 14,028
(2.24 %)		 33,113
(3.87 %)		 44.22
(98.57 %)		 11,403
(1.43 %)		 30,843
(98.57 %)		 559,053
(7.88 %)		 597,207
(11.39 %)		 6,656,400
(23.61 %)		 29,879
(1.50 %)
89 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1		 n/a 13,512
(1.75 %)		 24,417
(2.13 %)		 n/a 43.17
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 546
(100.00 %)		 439,018
(4.62 %)		 244,865
(6.73 %)		 6,778,625
(23.94 %)		 43,400
(4.80 %)
90 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1		 n/a 13,593
(1.72 %)		 24,541
(2.09 %)		 n/a 43.49
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 929
(99.99 %)		 439,011
(4.19 %)		 247,629
(8.40 %)		 6,711,875
(25.06 %)		 49,141
(4.61 %)
91 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1		 32,998
(4.99 %)		 12,248
(1.89 %)		 15,910
(2.38 %)		 n/a 42.17
(98.21 %)		 47,138
(1.81 %)		 3,536
(100.00 %)		 477,249
(6.30 %)		 313,951
(2.10 %)		 6,525,604
(19.58 %)		 25,722
(1.90 %)
92 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1		 41,403
(5.57 %)		 12,314
(1.93 %)		 23,133
(2.37 %)		 n/a 42.36
(99.95 %)		 1,055
(0.05 %)		 685
(100.00 %)		 553,077
(10.89 %)		 322,311
(2.75 %)		 6,543,183
(20.47 %)		 26,268
(2.31 %)
93 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1		 n/a 12,464
(1.91 %)		 24,623
(2.50 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 505,582
(10.93 %)		 292,484
(2.48 %)		 6,061,828
(21.38 %)		 24,010
(1.80 %)
94 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1		 50,206
(6.30 %)		 13,190
(1.85 %)		 24,284
(2.29 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 150
(100.00 %)		 566,161
(11.56 %)		 310,430
(2.36 %)		 6,712,791
(21.76 %)		 25,268
(1.73 %)
95 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1		 n/a 13,374
(1.90 %)		 24,308
(2.28 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 544
(100.00 %)		 751,865
(6.78 %)		 400,294
(3.80 %)		 6,184,781
(24.97 %)		 35,712
(2.66 %)
96 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1		 n/a 12,976
(1.68 %)		 23,758
(2.12 %)		 n/a 44.70
(99.99 %)		 603
(0.01 %)		 845
(100.00 %)		 499,923
(5.57 %)		 250,214
(7.38 %)		 6,350,978
(25.68 %)		 27,790
(2.32 %)
97 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1		 n/a 12,745
(1.75 %)		 23,052
(2.18 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 931
(99.99 %)		 483,812
(5.59 %)		 210,131
(3.30 %)		 6,332,994
(22.33 %)		 26,285
(2.20 %)
98 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1		 n/a 10,692
(1.77 %)		 20,925
(2.29 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,221
(100.00 %)		 328,602
(4.16 %)		 604,057
(8.02 %)		 5,233,128
(25.06 %)		 25,210
(3.70 %)
99 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1		 n/a 12,560
(1.73 %)		 23,740
(2.16 %)		 n/a 42.32
(99.80 %)		 435
(0.20 %)		 455
(100.00 %)		 395,254
(5.40 %)		 937,774
(11.00 %)		 6,145,808
(28.07 %)		 32,293
(3.87 %)
100 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1		 n/a 13,505
(1.83 %)		 24,961
(2.21 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 474
(0.01 %)		 870
(100.00 %)		 833,892
(8.17 %)		 576,230
(8.04 %)		 6,149,355
(27.84 %)		 34,089
(2.69 %)
101 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1		 n/a 12,828
(1.96 %)		 23,534
(2.35 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 405
(0.01 %)		 767
(99.99 %)		 725,169
(7.34 %)		 472,156
(5.81 %)		 5,786,296
(25.35 %)		 30,917
(2.80 %)
102 common starling
GCF_001447265.1		 28,711
(4.57 %)		 12,585
(2.01 %)		 17,785
(2.59 %)		 n/a 41.49
(97.70 %)		 23,392
(2.31 %)		 22,666
(97.69 %)		 427,543
(5.30 %)		 310,445
(1.74 %)		 6,482,337
(19.49 %)		 23,883
(1.99 %)
103 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1		 n/a 11,653
(1.89 %)		 19,731
(2.20 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,697
(100.00 %)		 443,384
(6.09 %)		 185,968
(1.18 %)		 5,916,553
(20.88 %)		 18,864
(1.75 %)
104 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1		 39,999
(4.95 %)		 12,292
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 110
(100.00 %)		 499,695
(6.70 %)		 199,749
(1.12 %)		 6,354,003
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
105 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1		 n/a 12,773
(1.79 %)		 24,751
(2.23 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 n/a 2,235
(100.00 %)		 549,460
(7.58 %)		 204,051
(1.02 %)		 6,880,566
(20.70 %)		 47,352
(3.95 %)
106 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1		 n/a 13,103
(1.81 %)		 24,044
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.16 %)		 205
(0.84 %)		 123
(100.00 %)		 570,312
(7.91 %)		 216,895
(1.04 %)		 7,043,151
(20.98 %)		 45,694
(3.73 %)
107 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1		 n/a 10,611
(1.77 %)		 21,125
(2.21 %)		 n/a 41.77
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,976
(100.00 %)		 422,889
(5.99 %)		 294,928
(2.71 %)		 5,928,421
(19.76 %)		 21,397
(1.91 %)
108 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1		 n/a 11,741
(1.82 %)		 22,382
(2.29 %)		 n/a 42.01
(98.73 %)		 1,479
(1.27 %)		 278
(100.00 %)		 476,049
(6.38 %)		 367,108
(3.16 %)		 6,576,957
(20.43 %)		 25,004
(2.02 %)
109 Cory's shearwater (hap1.2 2024)
GCA_964195595.2		 n/a 13,703
(1.71 %)		 25,586
(2.06 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 362
(100.00 %)		 478,943
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,061
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
110 Cory's shearwater (hap2.2 2024)
GCA_964196065.2		 n/a 12,808
(1.80 %)		 23,455
(2.11 %)		 n/a 43.33
(99.99 %)		 478
(0.01 %)		 759
(99.99 %)		 415,430
(4.64 %)		 280,099
(4.96 %)		 6,158,105
(23.65 %)		 43,892
(4.58 %)
111 crested eagle (hap1 2024)
GCA_045345505.1		 n/a 12,782
(1.65 %)		 24,376
(2.35 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 548
(100.00 %)		 675,525
(20.31 %)		 325,345
(11.43 %)		 5,483,869
(28.16 %)		 52,371
(8.51 %)
112 crested eagle (hap2 2024)
GCA_045345515.1		 n/a 13,656
(1.49 %)		 27,669
(2.31 %)		 n/a 44.30
(100.00 %)		 164
(0.00 %)		 544
(100.00 %)		 765,672
(26.88 %)		 431,376
(14.19 %)		 5,221,201
(33.63 %)		 63,565
(10.48 %)
113 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1		 17,147
(2.52 %)		 12,801
(1.77 %)		 14,062
(2.19 %)		 n/a 41.83
(97.20 %)		 70,475
(2.81 %)		 130,030
(97.19 %)		 395,055
(4.53 %)		 182,744
(0.97 %)		 7,244,849
(18.69 %)		 39,156
(2.06 %)
114 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1		 16,484
(2.21 %)		 12,195
(1.53 %)		 24,940
(1.96 %)		 n/a 41.82
(99.74 %)		 56,010
(0.27 %)		 113,170
(99.73 %)		 349,912
(4.65 %)		 131,678
(0.66 %)		 6,778,773
(18.46 %)		 35,090
(1.44 %)
115 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1		 n/a 13,157
(1.67 %)		 30,413
(2.59 %)		 n/a 43.53
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 609,076
(8.83 %)		 331,584
(6.01 %)		 5,966,458
(23.99 %)		 45,694
(7.05 %)
116 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1		 n/a 13,044
(1.66 %)		 30,275
(2.65 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 271
(0.00 %)		 295
(100.00 %)		 603,184
(8.76 %)		 324,082
(7.37 %)		 6,147,876
(25.10 %)		 44,051
(8.95 %)
117 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1		 n/a 12,766
(1.68 %)		 26,055
(2.18 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 7,284
(100.00 %)		 607,561
(13.23 %)		 239,649
(4.41 %)		 6,086,519
(23.21 %)		 38,398
(5.49 %)
118 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1		 16,438
(2.13 %)		 11,927
(1.44 %)		 25,409
(1.84 %)		 n/a 41.39
(99.65 %)		 57,580
(0.36 %)		 121,562
(99.64 %)		 394,453
(5.19 %)		 159,315
(0.83 %)		 6,832,864
(19.52 %)		 25,648
(0.91 %)
119 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1		 n/a 13,457
(1.72 %)		 25,299
(2.10 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 390
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 660,747
(14.47 %)		 294,268
(5.22 %)		 6,840,996
(24.63 %)		 39,705
(5.14 %)
120 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1		 n/a 13,401
(1.75 %)		 24,999
(2.15 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 930
(0.01 %)		 819
(100.00 %)		 685,992
(5.59 %)		 452,303
(8.91 %)		 5,976,185
(28.48 %)		 43,672
(4.38 %)
121 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1		 n/a 12,473
(1.84 %)		 22,849
(2.21 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 1,135
(99.99 %)		 594,136
(5.06 %)		 375,813
(7.54 %)		 5,497,978
(26.76 %)		 39,164
(4.55 %)
122 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1		 n/a 11,732
(1.74 %)		 22,080
(2.25 %)		 n/a 45.44
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,342
(100.00 %)		 921,959
(20.95 %)		 334,804
(3.26 %)		 5,352,773
(31.27 %)		 24,105
(1.81 %)
123 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1		 25,483
(3.24 %)		 12,410
(1.70 %)		 22,416
(2.11 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 180
(100.00 %)		 1,259,627
(26.52 %)		 378,533
(3.38 %)		 5,846,661
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
124 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1		 16,274
(2.23 %)		 12,032
(1.55 %)		 26,131
(1.84 %)		 n/a 41.21
(99.65 %)		 58,359
(0.36 %)		 111,850
(99.64 %)		 374,845
(4.51 %)		 130,655
(0.66 %)		 6,753,184
(18.86 %)		 26,202
(0.96 %)
125 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1		 n/a 11,799
(1.88 %)		 22,122
(2.30 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 457,930
(6.40 %)		 150,544
(0.85 %)		 6,074,490
(20.16 %)		 33,323
(3.81 %)
126 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1		 n/a 13,276
(1.84 %)		 25,393
(2.30 %)		 n/a 42.38
(99.61 %)		 144
(0.39 %)		 105
(100.00 %)		 548,862
(7.06 %)		 187,966
(0.97 %)		 7,004,597
(21.19 %)		 36,626
(3.69 %)
127 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1		 38,171
(5.79 %)		 12,559
(1.96 %)		 23,642
(2.48 %)		 n/a 42.01
(99.99 %)		 582
(0.01 %)		 587
(100.00 %)		 599,051
(9.46 %)		 453,954
(3.77 %)		 6,287,657
(20.75 %)		 27,831
(2.52 %)
128 elegant crested-tinamou (YG026_01 primary hap 2025)
GCA_047922985.1		 n/a 13,193
(1.91 %)		 25,746
(2.48 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 299
(0.00 %)		 397
(100.00 %)		 486,339
(4.61 %)		 408,335
(8.96 %)		 5,589,546
(25.37 %)		 51,487
(9.83 %)
129 elegant crested-tinamou (YG026_01 alternate hap 2025)
GCA_047922975.1		 n/a 12,085
(2.00 %)		 23,151
(2.57 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 359
(100.00 %)		 416,542
(4.17 %)		 324,013
(7.62 %)		 5,021,818
(23.94 %)		 44,588
(10.08 %)
130 emperor penguin
GCF_000699145.1		 20,055
(3.28 %)		 12,513
(1.77 %)		 11,986
(2.13 %)		 n/a 41.62
(94.30 %)		 72,501
(5.72 %)		 83,173
(94.28 %)		 478,239
(5.68 %)		 200,181
(2.24 %)		 7,154,684
(17.95 %)		 31,615
(1.38 %)
131 emu (2018)
GCF_003342905.1		 36,047
(5.11 %)		 12,857
(1.77 %)		 17,727
(2.32 %)		 n/a 41.63
(99.02 %)		 1,408,082
(1.11 %)		 2,778
(100.00 %)		 440,224
(4.29 %)		 175,539
(0.70 %)		 7,218,815
(17.59 %)		 43,752
(4.64 %)
132 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1		 54,479
(5.65 %)		 13,972
(1.59 %)		 25,695
(1.97 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 271
(100.00 %)		 713,839
(12.11 %)		 418,774
(7.08 %)		 5,668,105
(24.04 %)		 51,137
(7.32 %)
133 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1		 n/a 12,839
(1.57 %)		 24,113
(1.98 %)		 n/a 44.40
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 242
(100.00 %)		 657,460
(14.23 %)		 397,600
(8.84 %)		 4,824,789
(26.94 %)		 48,081
(7.49 %)
134 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2		 n/a 13,213
(1.74 %)		 24,562
(2.10 %)		 n/a 42.41
(99.99 %)		 539
(0.01 %)		 767
(100.00 %)		 567,285
(7.79 %)		 258,030
(2.59 %)		 7,108,005
(19.16 %)		 41,752
(6.24 %)
135 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1		 n/a 13,292
(1.69 %)		 25,387
(2.13 %)		 n/a 41.80
(99.99 %)		 696
(0.01 %)		 2,451
(100.00 %)		 489,065
(4.78 %)		 331,025
(13.58 %)		 6,196,233
(29.98 %)		 37,567
(3.51 %)
136 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1		 n/a 13,051
(1.80 %)		 24,815
(2.25 %)		 n/a 42.33
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 584
(100.00 %)		 482,819
(5.02 %)		 292,761
(7.61 %)		 6,282,928
(25.46 %)		 35,630
(3.58 %)
137 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1		 n/a 13,457
(1.70 %)		 24,519
(2.05 %)		 n/a 44.24
(99.99 %)		 593
(0.01 %)		 754
(100.00 %)		 516,462
(4.57 %)		 262,941
(8.12 %)		 5,356,948
(26.79 %)		 48,488
(7.36 %)
138 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1		 n/a 13,239
(1.66 %)		 24,512
(2.02 %)		 n/a 43.98
(99.99 %)		 785
(0.01 %)		 1,834
(100.00 %)		 600,399
(6.45 %)		 616,756
(7.75 %)		 5,607,190
(28.35 %)		 39,863
(3.53 %)
139 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1		 n/a 12,728
(1.78 %)		 23,645
(2.18 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,504
(99.99 %)		 544,959
(6.24 %)		 393,773
(4.49 %)		 5,839,698
(24.52 %)		 35,759
(3.26 %)
140 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1		 n/a 12,266
(1.90 %)		 22,091
(2.30 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 2,502
(100.00 %)		 458,278
(5.64 %)		 212,205
(1.54 %)		 6,032,224
(21.16 %)		 21,942
(1.89 %)
141 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1		 n/a 13,040
(1.86 %)		 22,823
(2.21 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 121
(100.00 %)		 595,803
(8.38 %)		 248,128
(1.78 %)		 6,744,611
(22.18 %)		 24,805
(1.90 %)
142 Eurasian spoonbill (hap1.1 2025)
GCA_965183815.1		 n/a 13,660
(1.73 %)		 24,623
(2.04 %)		 n/a 43.62
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 669
(100.00 %)		 956,977
(14.04 %)		 311,174
(4.10 %)		 5,758,263
(23.26 %)		 48,161
(5.09 %)
143 Eurasian spoonbill (hap2.1 2025)
GCA_965183785.1		 n/a 12,564
(1.79 %)		 22,613
(2.13 %)		 n/a 43.52
(99.99 %)		 604
(0.01 %)		 1,012
(99.99 %)		 595,219
(12.96 %)		 265,149
(4.02 %)		 6,214,797
(22.29 %)		 41,397
(4.95 %)
144 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1		 43,477
(5.70 %)		 12,550
(1.95 %)		 24,541
(2.43 %)		 n/a 42.02
(99.82 %)		 4,765
(0.18 %)		 18,975
(100.00 %)		 464,973
(6.08 %)		 492,684
(3.98 %)		 6,663,773
(20.49 %)		 28,741
(2.30 %)
145 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1		 n/a 12,984
(1.78 %)		 22,854
(2.04 %)		 n/a 42.70
(99.01 %)		 268
(0.99 %)		 107
(100.00 %)		 558,587
(8.35 %)		 180,400
(0.83 %)		 7,132,381
(21.18 %)		 40,661
(3.41 %)
146 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2		 n/a 11,359
(1.98 %)		 21,437
(2.45 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 3,668
(100.00 %)		 346,477
(2.88 %)		 283,542
(2.49 %)		 5,597,130
(19.71 %)		 22,977
(2.32 %)
147 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2		 n/a 12,344
(1.85 %)		 23,934
(2.37 %)		 n/a 42.10
(99.97 %)		 990
(0.03 %)		 1,119
(100.00 %)		 532,973
(5.96 %)		 401,820
(3.43 %)		 6,320,210
(21.42 %)		 30,391
(2.60 %)
148 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1		 n/a 11,681
(1.64 %)		 22,195
(2.04 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,752
(100.00 %)		 363,092
(4.61 %)		 347,630
(2.63 %)		 5,664,392
(21.56 %)		 32,162
(3.60 %)
149 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1		 n/a 13,203
(1.74 %)		 22,959
(2.04 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 436,838
(4.84 %)		 471,070
(3.20 %)		 6,601,537
(22.79 %)		 37,247
(3.95 %)
150 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2		 n/a 12,391
(1.76 %)		 23,333
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 940
(0.33 %)		 311
(100.00 %)		 550,895
(7.50 %)		 227,532
(1.16 %)		 6,767,530
(21.05 %)		 34,682
(2.57 %)
151 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,210
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,334
(100.00 %)		 426,785
(4.89 %)		 182,446
(0.97 %)		 6,038,491
(20.24 %)		 29,692
(2.35 %)
152 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1		 n/a 11,836
(1.83 %)		 21,119
(2.12 %)		 n/a 42.78
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,147
(100.00 %)		 443,887
(6.00 %)		 149,233
(0.76 %)		 6,328,128
(20.72 %)		 37,413
(3.59 %)
153 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1		 n/a 12,359
(1.95 %)		 23,228
(2.46 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 n/a 775
(100.00 %)		 485,213
(6.08 %)		 333,505
(2.21 %)		 6,358,327
(19.87 %)		 26,594
(2.34 %)
154 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1		 n/a 12,520
(1.95 %)		 23,459
(2.46 %)		 n/a 42.08
(99.82 %)		 134
(0.18 %)		 176
(100.00 %)		 491,810
(6.09 %)		 376,746
(2.55 %)		 6,461,292
(20.23 %)		 27,799
(2.40 %)
155 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4		 60,920
(5.98 %)		 13,334
(1.84 %)		 23,261
(2.12 %)		 n/a 42.16
(99.58 %)		 228
(0.42 %)		 144
(100.00 %)		 544,341
(5.93 %)		 186,461
(0.80 %)		 7,090,610
(20.01 %)		 38,495
(3.10 %)
156 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2		 n/a 9,172
(1.85 %)		 16,917
(2.12 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,855
(100.00 %)		 377,153
(8.49 %)		 117,959
(0.78 %)		 4,418,970
(18.34 %)		 27,767
(3.57 %)
157 golden pheasant
GCA_003413605.1		 n/a 12,891
(2.28 %)		 21,429
(2.37 %)		 n/a 40.87
(97.55 %)		 51,170
(2.47 %)		 65,464
(97.53 %)		 541,931
(8.01 %)		 249,405
(2.01 %)		 6,173,989
(19.98 %)		 22,227
(1.31 %)
158 golden-collared manakin
GCF_001715985.3		 27,575
(4.33 %)		 11,806
(1.85 %)		 13,267
(2.32 %)		 n/a 41.42
(97.44 %)		 20,874
(2.57 %)		 3,619
(100.00 %)		 447,084
(7.00 %)		 197,843
(1.19 %)		 6,198,932
(18.50 %)		 18,804
(1.03 %)
159 golden parakeet (hap1 2024)
GCA_045345405.1		 n/a 13,156
(1.63 %)		 23,633
(1.97 %)		 n/a 43.34
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 216
(100.00 %)		 515,745
(6.36 %)		 283,125
(12.39 %)		 4,289,389
(30.87 %)		 27,612
(1.85 %)
160 golden parakeet (hap2 2024)
GCA_045519325.1		 n/a 12,035
(1.69 %)		 21,430
(2.05 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 267
(100.00 %)		 447,782
(6.26 %)		 211,075
(11.12 %)		 4,868,563
(29.39 %)		 24,821
(1.87 %)
161 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1		 15,472
(2.07 %)		 11,547
(1.44 %)		 22,727
(1.73 %)		 n/a 41.28
(99.25 %)		 98,475
(0.77 %)		 162,787
(99.23 %)		 324,530
(4.59 %)		 144,409
(1.43 %)		 6,724,538
(18.06 %)		 14,330
(0.42 %)
162 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1		 n/a 13,434
(1.76 %)		 30,619
(3.17 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 493
(0.01 %)		 351
(100.00 %)		 556,740
(10.18 %)		 303,279
(3.45 %)		 6,599,611
(22.65 %)		 38,341
(5.45 %)
163 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1		 46,253
(5.46 %)		 13,432
(1.76 %)		 23,419
(2.08 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 493
(0.01 %)		 350
(100.00 %)		 556,733
(10.18 %)		 303,277
(3.45 %)		 6,599,550
(22.65 %)		 38,340
(5.45 %)
164 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1		 n/a 11,630
(1.85 %)		 20,866
(2.20 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 1,395
(100.00 %)		 421,187
(9.08 %)		 159,172
(0.96 %)		 5,602,689
(22.75 %)		 29,548
(2.77 %)
165 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1		 n/a 13,116
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 191
(100.00 %)		 514,142
(9.71 %)		 210,381
(1.13 %)		 6,501,989
(23.95 %)		 35,785
(2.69 %)
166 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1		 33,115
(3.89 %)		 13,120
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 190
(100.00 %)		 610,506
(15.46 %)		 210,373
(1.13 %)		 6,501,918
(23.95 %)		 35,788
(2.78 %)
167 great tit
GCF_001522545.3		 46,214
(6.78 %)		 12,250
(2.00 %)		 16,577
(2.52 %)		 n/a 41.37
(98.24 %)		 24,615
(1.76 %)		 24,044
(98.24 %)		 447,566
(5.89 %)		 249,384
(1.36 %)		 6,330,291
(19.11 %)		 23,876
(1.88 %)
168 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1		 20,607
(2.63 %)		 12,184
(1.76 %)		 21,560
(2.12 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 556
(0.00 %)		 1,452
(100.00 %)		 804,583
(12.49 %)		 291,451
(3.14 %)		 5,887,349
(28.34 %)		 19,623
(1.55 %)
169 greater prairie chicken
GCA_001870855.1		 n/a 12,923
(2.36 %)		 24,062
(2.50 %)		 n/a 41.23
(99.63 %)		 48,408
(0.39 %)		 60,594
(99.61 %)		 544,139
(7.50 %)		 214,682
(0.99 %)		 6,153,628
(19.86 %)		 23,154
(2.26 %)
170 greater scaup (hap1 2025)
GCA_965140915.1		 n/a 13,410
(1.86 %)		 25,527
(2.30 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,290
(100.00 %)		 944,720
(17.84 %)		 522,593
(6.27 %)		 6,100,900
(26.44 %)		 33,827
(2.73 %)
171 greater scaup (hap2 2025)
GCA_965140925.1		 n/a 12,299
(2.00 %)		 22,405
(2.37 %)		 n/a 41.92
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 1,031
(99.99 %)		 790,499
(12.43 %)		 402,414
(3.15 %)		 5,715,255
(22.73 %)		 29,339
(2.75 %)
172 greater rhea
GCA_003343005.1		 n/a 12,895
(1.81 %)		 20,976
(2.06 %)		 n/a 40.79
(98.79 %)		 2,075,293
(1.40 %)		 2,162
(100.00 %)		 509,589
(0.00 %)		 196,258
(0.73 %)		 6,982,184
(18.70 %)		 41,811
(3.95 %)
173 greater sage-grouse
GCF_019232065.1		 36,656
(5.50 %)		 12,419
(2.36 %)		 21,319
(2.40 %)		 n/a 41.16
(96.34 %)		 9,894
(3.66 %)		 1,502
(100.00 %)		 574,006
(8.05 %)		 196,630
(0.72 %)		 5,996,002
(19.65 %)		 18,807
(1.81 %)
174 green peafowl
GCA_016647715.1		 n/a 12,897
(2.25 %)		 23,427
(2.41 %)		 n/a 41.73
(98.15 %)		 32,668
(1.85 %)		 2,446
(100.00 %)		 481,865
(6.04 %)		 188,685
(1.04 %)		 6,268,032
(20.57 %)		 22,330
(1.85 %)
175 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1		 n/a 13,159
(1.57 %)		 41,528
(2.68 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 4,777
(0.03 %)		 54,154
(99.97 %)		 525,535
(7.07 %)		 222,932
(1.16 %)		 6,301,005
(19.38 %)		 28,978
(2.14 %)
176 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1		 41,746
(4.05 %)		 13,173
(1.89 %)		 24,269
(2.31 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 n/a 8,090
(100.00 %)		 468,845
(6.23 %)		 261,918
(2.42 %)		 5,956,005
(21.98 %)		 25,573
(1.77 %)
177 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1		 n/a 6,534
(1.74 %)		 12,152
(1.97 %)		 n/a 42.70
(100.00 %)		 n/a 8,370
(100.00 %)		 179,674
(3.19 %)		 76,165
(0.79 %)		 2,908,228
(16.85 %)		 11,838
(2.15 %)
178 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1		 47,961
(5.90 %)		 13,016
(1.82 %)		 21,266
(2.02 %)		 n/a 42.20
(99.55 %)		 635
(0.45 %)		 133
(100.00 %)		 484,104
(5.60 %)		 186,430
(0.85 %)		 7,162,723
(18.83 %)		 24,760
(2.03 %)
179 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1		 n/a 11,838
(1.64 %)		 24,014
(2.16 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,969
(100.00 %)		 405,109
(3.51 %)		 220,222
(6.17 %)		 4,708,177
(25.30 %)		 58,446
(5.44 %)
180 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1		 51,641
(5.08 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
181 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1		 n/a 7,477
(1.92 %)		 14,094
(2.40 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 n/a 2,762
(100.00 %)		 296,732
(12.20 %)		 135,408
(4.08 %)		 3,123,655
(20.92 %)		 23,288
(3.74 %)
182 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1		 51,606
(6.18 %)		 12,739
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 188
(100.00 %)		 409,129
(0.00 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,375
(23.59 %)		 46,118
(3.85 %)
183 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1		 55,448
(7.96 %)		 12,866
(2.29 %)		 18,391
(2.68 %)		 n/a 41.73
(98.08 %)		 15,598
(1.93 %)		 2,739
(100.00 %)		 486,655
(7.97 %)		 173,056
(0.98 %)		 6,144,176
(20.18 %)		 26,577
(2.39 %)
184 herring gull (hap1 2024)
GCA_964417175.1		 n/a 13,382
(1.61 %)		 25,785
(2.15 %)		 n/a 44.80
(99.99 %)		 559
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 535,852
(5.32 %)		 233,906
(10.46 %)		 5,597,180
(29.50 %)		 46,309
(7.00 %)
185 herring gull (hap2 2024)
GCA_964417125.1		 n/a 12,602
(1.69 %)		 23,925
(2.13 %)		 n/a 44.52
(99.99 %)		 456
(0.01 %)		 989
(99.99 %)		 483,098
(5.09 %)		 245,440
(9.57 %)		 6,076,469
(27.75 %)		 42,842
(5.92 %)
186 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1		 14,928
(2.31 %)		 11,454
(1.65 %)		 11,717
(2.07 %)		 n/a 42.42
(94.92 %)		 99,371
(5.11 %)		 109,627
(94.89 %)		 360,821
(6.34 %)		 145,440
(1.01 %)		 6,679,356
(18.72 %)		 40,581
(1.42 %)
187 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1		 n/a 13,089
(1.50 %)		 29,621
(2.22 %)		 n/a 45.56
(100.00 %)		 268
(0.00 %)		 683
(100.00 %)		 610,333
(22.07 %)		 252,997
(12.56 %)		 5,154,598
(31.67 %)		 58,754
(5.54 %)
188 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1		 n/a 12,349
(1.54 %)		 27,206
(2.21 %)		 n/a 45.91
(100.00 %)		 212
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 529,757
(21.69 %)		 235,999
(14.32 %)		 4,845,810
(31.86 %)		 53,781
(5.77 %)
189 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6		 42,799
(6.57 %)		 11,856
(1.93 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 458,399
(8.32 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
190 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1		 n/a 12,027
(1.89 %)		 23,973
(2.49 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 385,230
(3.05 %)		 398,497
(5.70 %)		 5,772,203
(22.69 %)		 28,740
(2.98 %)
191 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1		 43,241
(5.71 %)		 12,702
(1.83 %)		 24,568
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 296
(0.98 %)		 184
(100.00 %)		 440,384
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,138
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
192 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1		 n/a 12,831
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 202
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 647,396
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,524
(30.36 %)		 36,193
(2.91 %)
193 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1		 75,216
(7.36 %)		 12,832
(1.61 %)		 26,124
(2.26 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 204
(0.00 %)		 335
(100.00 %)		 647,402
(12.37 %)		 646,615
(14.14 %)		 5,906,561
(30.36 %)		 36,193
(2.91 %)
194 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1		 n/a 12,201
(1.59 %)		 24,721
(2.19 %)		 n/a 44.46
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 629,688
(12.73 %)		 644,409
(14.12 %)		 5,103,050
(31.93 %)		 33,424
(2.42 %)
195 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1		 n/a 11,806
(1.66 %)		 21,429
(1.97 %)		 n/a 43.73
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,343
(100.00 %)		 508,803
(10.25 %)		 162,918
(5.44 %)		 6,029,969
(24.67 %)		 27,953
(3.83 %)
196 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1		 n/a 13,233
(1.67 %)		 23,010
(1.93 %)		 n/a 43.91
(99.92 %)		 253
(0.08 %)		 136
(100.00 %)		 610,144
(11.51 %)		 214,393
(5.75 %)		 6,069,916
(25.74 %)		 33,172
(3.38 %)
197 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2		 n/a 12,424
(1.21 %)		 43,440
(2.06 %)		 n/a 41.86
(99.95 %)		 1,098
(0.00 %)		 260,829
(100.00 %)		 497,886
(5.29 %)		 184,967
(0.96 %)		 6,167,538
(20.22 %)		 33,529
(1.55 %)
198 jackdaw (S_Up_J01 2020)
GCA_013407035.1		 n/a 12,072
(1.93 %)		 20,925
(2.08 %)		 n/a 42.15
(99.72 %)		 511
(0.28 %)		 41
(100.00 %)		 428,760
(6.13 %)		 173,436
(1.02 %)		 6,231,317
(19.25 %)		 26,177
(2.17 %)
199 jackdaw (hap1.1 2025)
GCA_965178545.1		 n/a 13,233
(1.72 %)		 30,094
(2.51 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 648
(0.01 %)		 733
(100.00 %)		 532,540
(3.59 %)		 553,881
(6.97 %)		 5,338,663
(26.88 %)		 54,918
(4.96 %)
200 jackdaw (hap2.1 2025)
GCA_965178535.1		 n/a 12,364
(1.84 %)		 25,990
(2.48 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 571
(0.01 %)		 1,744
(99.99 %)		 441,993
(3.39 %)		 436,100
(6.66 %)		 4,938,426
(24.63 %)		 47,080
(4.82 %)
201 Japanese quail
GCF_001577835.2		 49,197
(7.77 %)		 12,864
(2.54 %)		 22,540
(2.69 %)		 37,604
(4.36 %)		 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 559,601
(7.91 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
202 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1		 n/a 8,732
(1.74 %)		 16,473
(2.17 %)		 n/a 45.10
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,819
(100.00 %)		 314,902
(10.49 %)		 133,061
(10.84 %)		 3,656,435
(25.68 %)		 32,592
(5.25 %)
203 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1		 n/a 13,042
(1.63 %)		 24,142
(2.01 %)		 n/a 45.07
(99.96 %)		 300
(0.04 %)		 148
(100.00 %)		 563,851
(12.90 %)		 270,861
(12.36 %)		 6,191,106
(28.24 %)		 54,426
(4.92 %)
204 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1		 n/a 3,256
(1.65 %)		 6,220
(1.98 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 3,728
(100.00 %)		 127,817
(7.83 %)		 53,447
(1.21 %)		 1,502,789
(18.09 %)		 5,487
(1.71 %)
205 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2		 49,757
(5.76 %)		 13,110
(1.92 %)		 22,782
(2.26 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 89
(100.00 %)		 507,148
(7.85 %)		 208,178
(1.08 %)		 6,258,087
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
206 kea
GCF_000696875.1		 15,953
(2.35 %)		 11,985
(1.66 %)		 22,107
(2.01 %)		 n/a 41.09
(99.60 %)		 51,381
(0.42 %)		 93,561
(99.58 %)		 368,226
(5.60 %)		 138,157
(0.75 %)		 5,905,331
(18.06 %)		 7,218
(0.22 %)
207 killdeer
GCF_000708025.1		 16,480
(2.43 %)		 12,356
(1.72 %)		 12,853
(2.15 %)		 n/a 41.88
(97.24 %)		 63,995
(2.78 %)		 79,162
(97.22 %)		 424,095
(5.93 %)		 167,406
(0.94 %)		 7,070,701
(19.44 %)		 37,082
(1.57 %)
208 king quail (bCotChi1hap2 2024)
GCF_039878825.1		 38,976
(5.65 %)		 12,731
(2.42 %)		 22,580
(2.63 %)		 n/a 41.64
(99.99 %)		 330
(0.01 %)		 191
(100.00 %)		 520,844
(5.33 %)		 274,030
(2.07 %)		 5,359,922
(20.48 %)		 19,673
(2.18 %)
209 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1		 n/a 13,641
(1.52 %)		 24,293
(1.78 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 484,661
(3.34 %)		 252,569
(16.01 %)		 5,595,734
(32.51 %)		 77,942
(3.59 %)
210 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1		 n/a 12,764
(1.49 %)		 23,033
(1.77 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 128
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 432,536
(3.01 %)		 230,315
(20.91 %)		 4,960,923
(35.56 %)		 86,907
(3.76 %)
211 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1		 n/a 10,584
(1.75 %)		 19,112
(2.09 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 2,892
(100.00 %)		 363,564
(3.53 %)		 235,220
(7.22 %)		 5,072,834
(23.83 %)		 24,909
(2.64 %)
212 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1		 n/a 13,529
(1.69 %)		 23,672
(1.98 %)		 n/a 43.50
(99.85 %)		 259
(0.15 %)		 232
(100.00 %)		 491,653
(3.53 %)		 349,011
(9.83 %)		 5,955,030
(26.51 %)		 32,237
(2.61 %)
213 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1		 46,366
(5.56 %)		 12,594
(1.91 %)		 22,763
(2.31 %)		 26,057
(3.91 %)		 41.97
(99.70 %)		 206
(0.30 %)		 93
(100.00 %)		 485,121
(7.13 %)		 247,189
(1.64 %)		 6,498,294
(20.04 %)		 25,377
(1.97 %)
214 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1		 n/a 12,282
(1.85 %)		 23,867
(2.36 %)		 n/a 42.20
(100.00 %)		 n/a 4,269
(100.00 %)		 472,384
(7.01 %)		 237,680
(1.65 %)		 6,121,661
(19.48 %)		 25,589
(2.05 %)
215 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1		 n/a 12,458
(1.70 %)		 22,259
(2.05 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 n/a 3,090
(100.00 %)		 413,301
(3.46 %)		 189,449
(5.28 %)		 5,962,597
(22.07 %)		 31,611
(2.72 %)
216 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1		 48,561
(5.70 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
217 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1		 n/a 13,333
(1.68 %)		 24,731
(2.05 %)		 n/a 44.40
(99.99 %)		 537
(0.01 %)		 1,382
(100.00 %)		 509,160
(5.11 %)		 266,609
(9.64 %)		 6,827,304
(27.15 %)		 44,108
(6.34 %)
218 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1		 n/a 12,578
(1.83 %)		 22,257
(2.16 %)		 n/a 42.51
(98.97 %)		 258
(1.03 %)		 551
(100.00 %)		 431,717
(3.61 %)		 201,876
(1.38 %)		 6,620,060
(19.16 %)		 27,552
(2.26 %)
219 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2		 47,420
(5.64 %)		 13,098
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,499
(5.58 %)		 210,234
(1.26 %)		 7,133,934
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
220 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1		 51,352
(6.92 %)		 12,689
(2.35 %)		 22,377
(2.51 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 58
(0.00 %)		 206
(100.00 %)		 498,179
(5.36 %)		 218,390
(1.80 %)		 6,038,211
(20.76 %)		 20,648
(2.33 %)
221 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1		 n/a 13,105
(1.81 %)		 25,654
(2.45 %)		 n/a 40.86
(98.66 %)		 1,039,616
(1.43 %)		 3,019
(100.00 %)		 522,333
(5.61 %)		 208,867
(0.79 %)		 7,080,214
(19.15 %)		 42,016
(4.35 %)
222 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1		 n/a 10,465
(1.71 %)		 19,083
(2.16 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 910
(100.00 %)		 520,125
(6.78 %)		 251,547
(4.21 %)		 5,321,207
(21.53 %)		 34,698
(5.69 %)
223 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1		 39,024
(4.18 %)		 13,360
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 180
(100.00 %)		 674,149
(6.73 %)		 329,124
(5.34 %)		 6,820,245
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
224 little egret
GCF_000687185.1		 25,856
(3.55 %)		 12,162
(1.73 %)		 10,954
(2.03 %)		 n/a 42.25
(95.99 %)		 88,871
(4.04 %)		 100,662
(95.96 %)		 490,997
(6.84 %)		 165,380
(1.23 %)		 6,955,585
(18.98 %)		 31,136
(1.15 %)
225 little owl (hap1.1 2025)
GCA_965140245.1		 n/a 13,385
(1.67 %)		 23,822
(2.00 %)		 n/a 43.44
(99.99 %)		 572
(0.01 %)		 717
(100.00 %)		 653,518
(17.99 %)		 588,381
(7.88 %)		 5,739,624
(25.13 %)		 34,531
(9.97 %)
226 little owl (hap2.1 2025)
GCA_965140185.1		 n/a 13,316
(1.72 %)		 23,607
(2.06 %)		 n/a 42.88
(99.99 %)		 552
(0.01 %)		 1,212
(99.99 %)		 673,616
(14.62 %)		 427,083
(4.58 %)		 6,784,709
(22.52 %)		 33,432
(6.74 %)
227 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1		 n/a 13,329
(1.88 %)		 23,888
(2.25 %)		 n/a 42.30
(99.99 %)		 544
(0.01 %)		 272
(100.00 %)		 784,647
(6.78 %)		 501,860
(7.36 %)		 6,388,957
(26.13 %)		 34,028
(3.04 %)
228 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1		 n/a 12,264
(2.01 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 40.99
(100.00 %)		 n/a 230
(100.00 %)		 498,393
(5.07 %)		 266,700
(1.49 %)		 6,131,743
(20.45 %)		 15,809
(1.43 %)
229 long-tailed hermit (v2 PSU5 primary hap 2025)
GCA_023637945.2		 n/a 12,322
(2.02 %)		 20,234
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 140
(0.37 %)		 77
(100.00 %)		 497,376
(5.06 %)		 265,823
(1.51 %)		 6,044,278
(20.09 %)		 15,921
(1.43 %)
230 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1		 15,790
(2.21 %)		 11,632
(1.52 %)		 24,790
(1.96 %)		 n/a 41.10
(99.68 %)		 56,130
(0.33 %)		 115,823
(99.67 %)		 391,856
(4.80 %)		 148,075
(0.90 %)		 6,682,530
(20.03 %)		 27,675
(1.15 %)
231 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1		 n/a 13,082
(1.73 %)		 27,150
(2.44 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 669,243
(14.71 %)		 211,387
(6.69 %)		 6,514,716
(27.07 %)		 47,331
(8.09 %)
232 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1		 n/a 11,814
(1.80 %)		 23,161
(2.38 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 586,864
(13.28 %)		 184,036
(5.91 %)		 5,606,205
(25.25 %)		 42,560
(7.71 %)
233 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1		 n/a 10,658
(1.74 %)		 18,941
(1.98 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 4,278
(100.00 %)		 326,479
(4.02 %)		 141,715
(0.74 %)		 5,600,372
(19.59 %)		 27,330
(3.35 %)
234 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1		 n/a 12,905
(1.81 %)		 22,204
(2.01 %)		 n/a 42.12
(98.21 %)		 232
(1.79 %)		 153
(100.00 %)		 485,318
(6.35 %)		 184,992
(0.78 %)		 7,064,965
(19.56 %)		 31,653
(3.02 %)
235 mallard (CAU_Wild1.0 2019)
GCA_008746955.1		 n/a 13,260
(1.85 %)		 25,071
(2.17 %)		 n/a 42.41
(99.90 %)		 318
(0.10 %)		 1,665
(100.00 %)		 849,782
(8.18 %)		 438,622
(5.10 %)		 6,729,782
(25.03 %)		 34,670
(3.03 %)
236 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1		 n/a 13,680
(1.77 %)		 26,845
(2.33 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 571
(0.01 %)		 936
(100.00 %)		 941,876
(15.92 %)		 570,703
(9.50 %)		 6,169,980
(28.67 %)		 41,791
(3.18 %)
237 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1		 n/a 12,715
(1.89 %)		 24,338
(2.42 %)		 n/a 42.70
(99.99 %)		 485
(0.01 %)		 972
(99.99 %)		 795,168
(13.44 %)		 445,147
(7.71 %)		 5,728,430
(26.21 %)		 35,679
(3.13 %)
238 mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1		 n/a 12,871
(1.94 %)		 25,038
(2.26 %)		 n/a 41.42
(95.05 %)		 25,623
(4.96 %)		 21,442
(100.00 %)		 760,634
(7.52 %)		 360,866
(1.37 %)		 6,710,465
(20.25 %)		 32,823
(2.15 %)
239 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1		 59,854
(7.33 %)		 12,988
(1.87 %)		 23,709
(2.20 %)		 86,787
(8.80 %)		 42.27
(99.64 %)		 905
(0.36 %)		 756
(100.00 %)		 803,558
(8.04 %)		 417,575
(5.02 %)		 6,627,843
(24.59 %)		 35,030
(3.06 %)
240 mallard (Pekin duck ZD024472 2025)
GCF_047663525.1		 68,191
(7.26 %)		 13,389
(1.80 %)		 24,673
(2.19 %)		 n/a 42.76
(100.00 %)		 n/a 42
(100.00 %)		 785,501
(5.94 %)		 515,879
(8.26 %)		 6,238,340
(27.60 %)		 40,229
(3.05 %)
241 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1		 54,114
(7.47 %)		 12,199
(1.86 %)		 15,363
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.77 %)		 71,703
(0.26 %)		 2,150
(100.00 %)		 770,322
(8.16 %)		 357,617
(3.09 %)		 6,587,406
(21.92 %)		 29,913
(2.33 %)
242 Mariana crow
GCF_017639235.1		 48,460
(7.00 %)		 12,506
(1.97 %)		 22,580
(2.35 %)		 n/a 42.14
(98.94 %)		 10,579
(1.06 %)		 1,443
(100.00 %)		 434,280
(5.91 %)		 169,629
(0.82 %)		 6,323,058
(18.94 %)		 27,390
(2.04 %)
243 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1		 n/a 4,774
(1.89 %)		 8,695
(2.32 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 n/a 2,259
(100.00 %)		 135,092
(3.67 %)		 112,042
(8.63 %)		 1,739,144
(22.50 %)		 12,908
(3.26 %)
244 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1		 n/a 13,064
(1.72 %)		 22,269
(1.98 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 407
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 459,578
(3.87 %)		 315,686
(6.19 %)		 6,650,507
(22.84 %)		 36,076
(2.82 %)
245 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1		 n/a 8,873
(1.81 %)		 16,175
(2.24 %)		 n/a 42.92
(100.00 %)		 n/a 2,130
(100.00 %)		 331,293
(6.89 %)		 161,393
(5.94 %)		 3,516,196
(24.86 %)		 16,659
(1.74 %)
246 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1		 n/a 13,133
(1.81 %)		 23,396
(2.19 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 358
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 511,156
(7.05 %)		 238,915
(5.05 %)		 5,764,523
(25.19 %)		 24,675
(1.70 %)
247 medium ground-finch
GCF_000277835.1		 22,226
(4.24 %)		 11,887
(1.83 %)		 11,438
(2.19 %)		 n/a 41.61
(97.77 %)		 68,589
(2.25 %)		 95,828
(97.75 %)		 433,244
(5.91 %)		 322,831
(2.24 %)		 6,548,136
(19.49 %)		 18,135
(0.69 %)
248 monk parakeet
GCA_017639245.1		 n/a 13,067
(1.85 %)		 n/a n/a 42.29
(99.99 %)		 352
(0.01 %)		 291
(100.00 %)		 582,436
(9.49 %)		 253,709
(2.79 %)		 5,820,920
(22.52 %)		 23,101
(1.75 %)
249 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1		 28,327
(3.95 %)		 12,793
(2.29 %)		 22,305
(2.47 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 521
(100.00 %)		 458,084
(6.03 %)		 243,493
(3.14 %)		 5,553,010
(22.13 %)		 22,147
(2.41 %)
250 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2		 n/a 10,145
(1.98 %)		 18,617
(2.30 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 5,640
(100.00 %)		 533,330
(9.11 %)		 213,518
(1.29 %)		 4,813,886
(20.16 %)		 25,667
(3.86 %)
251 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2		 59,524
(6.76 %)		 12,983
(1.98 %)		 22,400
(2.22 %)		 33,839
(5.17 %)		 41.92
(99.13 %)		 451
(0.87 %)		 171
(100.00 %)		 700,051
(7.55 %)		 301,579
(1.34 %)		 6,791,838
(21.30 %)		 31,278
(3.07 %)
252 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1		 n/a 11,687
(1.78 %)		 24,169
(2.43 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 n/a 2,834
(100.00 %)		 414,780
(3.26 %)		 491,012
(10.03 %)		 5,570,475
(26.24 %)		 29,485
(4.55 %)
253 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1		 31,033
(4.42 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
254 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1		 n/a 11,097
(1.99 %)		 20,436
(2.45 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 n/a 894
(100.00 %)		 377,050
(6.03 %)		 178,064
(1.53 %)		 5,305,126
(19.49 %)		 26,107
(2.52 %)
255 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1		 50,821
(6.95 %)		 12,747
(1.94 %)		 23,372
(2.37 %)		 30,299
(3.60 %)		 42.57
(97.41 %)		 289
(2.59 %)		 105
(100.00 %)		 452,690
(6.21 %)		 231,546
(1.70 %)		 6,265,995
(19.54 %)		 31,909
(2.48 %)
256 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1		 n/a 13,359
(1.72 %)		 24,921
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 705,078
(18.28 %)		 342,299
(9.55 %)		 6,410,095
(28.06 %)		 38,589
(9.40 %)
257 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1		 34,506
(4.09 %)		 13,358
(1.72 %)		 24,851
(2.13 %)		 n/a 44.64
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 806
(100.00 %)		 705,074
(18.28 %)		 342,297
(9.55 %)		 6,410,054
(28.06 %)		 38,589
(9.40 %)
258 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1		 n/a 13,270
(1.84 %)		 24,753
(2.28 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 118
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 675,092
(12.72 %)		 313,111
(3.64 %)		 6,547,843
(23.22 %)		 37,728
(3.88 %)
259 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1		 48,921
(5.26 %)		 12,986
(1.89 %)		 22,892
(2.24 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,593
(100.00 %)		 487,881
(6.13 %)		 259,865
(3.37 %)		 5,961,641
(22.88 %)		 24,673
(1.77 %)
260 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1		 n/a 13,670
(1.52 %)		 33,383
(2.64 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 409
(100.00 %)		 713,271
(8.42 %)		 603,937
(6.25 %)		 5,379,113
(27.65 %)		 50,913
(9.74 %)
261 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1		 39,806
(3.75 %)		 13,668
(1.52 %)		 25,226
(1.90 %)		 n/a 44.01
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 408
(100.00 %)		 713,264
(8.42 %)		 603,930
(6.25 %)		 5,379,069
(27.65 %)		 50,913
(9.74 %)
262 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1		 n/a 13,664
(1.44 %)		 37,696
(2.80 %)		 n/a 44.42
(100.00 %)		 155
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 760,455
(8.84 %)		 626,528
(6.85 %)		 5,029,822
(30.45 %)		 54,278
(9.43 %)
263 northern bobwhite
GCA_008692595.2		 n/a 12,584
(2.37 %)		 22,327
(2.53 %)		 n/a 41.41
(99.04 %)		 33,134
(0.97 %)		 39,169
(99.03 %)		 460,369
(4.63 %)		 213,800
(1.34 %)		 5,813,961
(19.54 %)		 22,156
(2.37 %)
264 northern fulmar
GCF_000690835.1		 16,383
(2.20 %)		 11,965
(1.51 %)		 24,294
(1.87 %)		 n/a 41.17
(99.50 %)		 54,825
(0.51 %)		 112,214
(99.49 %)		 330,541
(3.74 %)		 146,735
(0.83 %)		 6,838,937
(18.42 %)		 24,859
(0.79 %)
265 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1		 n/a 13,367
(1.65 %)		 24,403
(2.00 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 829
(100.00 %)		 498,574
(4.51 %)		 273,984
(5.20 %)		 5,544,122
(27.29 %)		 34,879
(3.83 %)
266 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1		 n/a 13,477
(1.77 %)		 23,613
(2.08 %)		 n/a 42.44
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 474,930
(4.45 %)		 237,604
(2.75 %)		 5,847,260
(21.07 %)		 30,873
(3.03 %)
267 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1		 n/a 12,115
(1.73 %)		 22,764
(2.15 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,484
(100.00 %)		 417,395
(3.68 %)		 231,908
(7.24 %)		 5,424,533
(24.05 %)		 35,691
(4.26 %)
268 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2		 n/a 13,527
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 455
(100.00 %)		 511,000
(3.76 %)		 325,992
(9.82 %)		 5,542,342
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
269 northern lapwing (hap1.1 2025)
GCA_965231255.1		 n/a 13,331
(1.54 %)		 24,472
(1.83 %)		 n/a 44.53
(99.99 %)		 936
(0.01 %)		 2,408
(100.00 %)		 863,726
(25.27 %)		 320,840
(14.03 %)		 5,397,999
(32.53 %)		 69,579
(4.22 %)
270 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1		 n/a 13,218
(1.88 %)		 23,888
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 631
(0.01 %)		 395
(100.00 %)		 734,763
(5.74 %)		 422,947
(7.08 %)		 6,491,165
(25.88 %)		 34,601
(2.98 %)
271 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1		 61,479
(7.27 %)		 13,217
(1.88 %)		 23,886
(2.27 %)		 n/a 42.56
(99.99 %)		 631
(0.01 %)		 394
(100.00 %)		 734,760
(5.74 %)		 422,946
(7.08 %)		 6,491,116
(25.88 %)		 34,601
(2.98 %)
272 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1		 n/a 12,592
(1.89 %)		 24,002
(2.35 %)		 n/a 42.94
(99.48 %)		 1,602
(0.52 %)		 1,695
(100.00 %)		 466,546
(6.40 %)		 235,283
(1.98 %)		 6,371,421
(20.17 %)		 34,247
(3.02 %)
273 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1		 43,838
(4.59 %)		 13,232
(1.76 %)		 18,641
(2.35 %)		 n/a 41.52
(98.49 %)		 696,987
(1.57 %)		 4,120
(100.00 %)		 482,272
(4.98 %)		 178,540
(0.70 %)		 7,407,982
(18.33 %)		 43,081
(4.88 %)
274 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1		 n/a 12,953
(1.76 %)		 25,275
(2.07 %)		 24,636
(2.89 %)		 41.70
(98.42 %)		 42,691
(1.58 %)		 151,517
(98.42 %)		 494,677
(6.28 %)		 222,654
(1.07 %)		 7,211,171
(19.25 %)		 41,048
(2.24 %)
275 Oriental stork (2023)
GCF_034638445.1		 48,452
(4.91 %)		 13,561
(1.84 %)		 23,874
(2.12 %)		 n/a 42.45
(99.99 %)		 149
(0.01 %)		 281
(100.00 %)		 416,480
(4.26 %)		 256,558
(1.47 %)		 7,177,204
(20.57 %)		 34,358
(3.65 %)
276 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1		 n/a 12,529
(1.75 %)		 24,654
(2.25 %)		 n/a 42.72
(100.00 %)		 n/a 2,745
(100.00 %)		 517,204
(7.95 %)		 218,606
(4.15 %)		 6,216,533
(21.16 %)		 26,313
(2.41 %)
277 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1		 49,100
(5.64 %)		 13,021
(1.66 %)		 21,794
(1.95 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 241
(0.31 %)		 125
(100.00 %)		 586,320
(11.83 %)		 335,218
(8.05 %)		 7,038,851
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
278 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1		 37,506
(5.42 %)		 12,670
(1.80 %)		 11,311
(2.11 %)		 n/a 41.77
(98.44 %)		 76,069
(1.58 %)		 83,081
(98.42 %)		 437,234
(5.32 %)		 170,160
(0.93 %)		 7,157,857
(18.38 %)		 22,325
(0.89 %)
279 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1		 41,783
(4.96 %)		 12,712
(1.86 %)		 24,157
(2.37 %)		 n/a 42.69
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 484
(100.00 %)		 641,523
(14.11 %)		 414,142
(6.03 %)		 6,230,412
(23.70 %)		 49,402
(3.94 %)
280 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1		 n/a 10,425
(1.96 %)		 20,219
(2.49 %)		 n/a 42.52
(100.00 %)		 n/a 1,277
(100.00 %)		 344,711
(4.99 %)		 225,902
(3.41 %)		 4,563,425
(21.61 %)		 28,391
(3.74 %)
281 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1		 n/a 13,140
(1.85 %)		 25,111
(2.31 %)		 n/a 42.27
(99.99 %)		 509
(0.01 %)		 143
(100.00 %)		 488,313
(5.48 %)		 331,962
(3.50 %)		 6,243,204
(22.87 %)		 36,343
(3.63 %)
282 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1		 n/a 13,275
(1.76 %)		 24,103
(2.11 %)		 n/a 43.68
(99.98 %)		 1,137
(0.02 %)		 715
(100.00 %)		 792,215
(9.76 %)		 471,286
(10.34 %)		 6,448,623
(29.48 %)		 49,485
(4.41 %)
283 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1		 n/a 11,774
(1.90 %)		 20,857
(2.20 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 749
(100.00 %)		 356,053
(4.37 %)		 157,695
(0.93 %)		 5,995,637
(19.60 %)		 30,478
(4.03 %)
284 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1		 n/a 13,028
(1.84 %)		 22,722
(2.10 %)		 n/a 42.37
(99.81 %)		 104
(0.19 %)		 88
(100.00 %)		 488,030
(6.66 %)		 188,606
(1.01 %)		 6,982,793
(20.08 %)		 32,920
(3.37 %)
285 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2		 n/a 12,000
(1.69 %)		 22,393
(2.01 %)		 n/a 41.66
(74.61 %)		 137,572
(25.41 %)		 200,284
(74.59 %)		 536,198
(8.55 %)		 200,698
(0.96 %)		 5,147,882
(14.30 %)		 14,572
(0.41 %)
286 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1		 n/a 12,787
(1.83 %)		 22,839
(2.13 %)		 n/a 42.67
(99.70 %)		 227
(0.30 %)		 95
(100.00 %)		 543,517
(7.16 %)		 212,546
(1.12 %)		 6,930,708
(20.10 %)		 38,960
(3.02 %)
287 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1		 n/a 12,937
(1.75 %)		 24,253
(2.09 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 3,309
(100.00 %)		 562,549
(7.14 %)		 210,852
(1.04 %)		 7,264,995
(20.26 %)		 40,926
(2.91 %)
288 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1		 29,040
(5.08 %)		 12,371
(2.00 %)		 24,297
(2.42 %)		 n/a 41.70
(96.94 %)		 3,337,637
(3.40 %)		 10,634
(100.00 %)		 349,349
(2.76 %)		 398,866
(2.71 %)		 6,299,092
(18.40 %)		 27,078
(2.11 %)
289 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1		 n/a 13,231
(1.68 %)		 24,060
(2.00 %)		 n/a 43.15
(99.98 %)		 1,269
(0.02 %)		 660
(100.00 %)		 440,963
(5.78 %)		 187,847
(3.22 %)		 6,601,610
(24.99 %)		 54,002
(5.24 %)
290 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1		 n/a 11,989
(1.71 %)		 21,527
(2.03 %)		 n/a 43.19
(99.98 %)		 1,072
(0.02 %)		 1,572
(99.98 %)		 383,852
(5.39 %)		 164,123
(3.45 %)		 5,859,520
(24.45 %)		 48,825
(5.37 %)
291 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1		 n/a 13,234
(1.92 %)		 23,753
(2.26 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 714
(0.01 %)		 141
(100.00 %)		 772,537
(6.34 %)		 437,831
(4.05 %)		 6,488,340
(24.52 %)		 31,577
(2.49 %)
292 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1		 n/a 11,247
(1.70 %)		 23,705
(2.27 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 n/a 3,476
(100.00 %)		 482,817
(8.51 %)		 153,169
(0.81 %)		 5,919,109
(21.87 %)		 39,766
(3.41 %)
293 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1		 n/a 12,744
(1.75 %)		 25,706
(2.29 %)		 n/a 42.60
(97.89 %)		 344
(2.11 %)		 140
(100.00 %)		 551,885
(8.95 %)		 176,530
(0.80 %)		 6,805,042
(22.19 %)		 43,051
(3.40 %)
294 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1		 n/a 11,434
(1.65 %)		 21,710
(2.11 %)		 n/a 46.12
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 2,748
(100.00 %)		 859,899
(15.52 %)		 319,622
(3.85 %)		 5,367,970
(34.63 %)		 23,381
(1.81 %)
295 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1		 n/a 12,345
(1.60 %)		 23,206
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 253
(100.00 %)		 1,082,064
(22.90 %)		 378,866
(4.28 %)		 6,003,548
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
296 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1		 44,843
(4.51 %)		 12,341
(1.60 %)		 23,205
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 252
(100.00 %)		 981,758
(15.82 %)		 378,855
(4.28 %)		 6,003,474
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
297 red-legged partridge
GCA_019345075.1		 n/a 12,441
(2.23 %)		 20,933
(2.29 %)		 n/a 41.44
(96.96 %)		 18,534
(3.05 %)		 29,132
(96.95 %)		 543,702
(6.02 %)		 222,583
(0.97 %)		 5,978,744
(20.17 %)		 19,970
(0.97 %)
298 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1		 n/a 10,131
(1.78 %)		 19,775
(2.21 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,840
(100.00 %)		 366,591
(6.01 %)		 117,928
(0.90 %)		 5,340,048
(18.90 %)		 26,293
(2.86 %)
299 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1		 n/a 13,229
(1.84 %)		 25,580
(2.35 %)		 n/a 42.20
(99.59 %)		 194
(0.41 %)		 110
(100.00 %)		 483,784
(6.50 %)		 160,481
(0.73 %)		 6,960,060
(19.71 %)		 32,899
(2.77 %)
300 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1		 15,842
(2.14 %)		 11,589
(1.46 %)		 22,840
(1.76 %)		 n/a 41.12
(99.40 %)		 64,882
(0.61 %)		 126,713
(99.39 %)		 293,224
(3.50 %)		 123,593
(0.80 %)		 6,849,573
(18.22 %)		 17,100
(0.51 %)
301 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1		 n/a 13,357
(1.64 %)		 29,603
(2.35 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 3,225
(100.00 %)		 549,694
(8.44 %)		 246,171
(10.46 %)		 5,258,356
(27.36 %)		 39,810
(3.37 %)
302 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1		 25,173
(3.02 %)		 13,216
(1.71 %)		 24,050
(2.10 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,185
(100.00 %)		 544,422
(8.81 %)		 223,672
(5.77 %)		 6,669,433
(23.63 %)		 38,305
(3.37 %)
303 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1		 30,007
(3.93 %)		 12,687
(1.75 %)		 25,287
(2.30 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 516
(100.00 %)		 785,960
(17.62 %)		 522,256
(9.27 %)		 6,371,580
(25.40 %)		 32,643
(2.66 %)
304 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1		 15,595
(2.24 %)		 11,495
(1.55 %)		 25,766
(1.88 %)		 n/a 42.65
(98.44 %)		 118,543
(1.60 %)		 180,800
(98.40 %)		 271,331
(3.93 %)		 134,645
(1.25 %)		 6,383,631
(17.75 %)		 24,531
(0.79 %)
305 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1		 n/a 9,867
(1.89 %)		 19,635
(2.52 %)		 n/a 42.54
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 2,879
(100.00 %)		 394,769
(10.00 %)		 186,556
(1.91 %)		 4,428,687
(19.09 %)		 15,730
(1.88 %)
306 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1		 n/a 12,620
(1.92 %)		 24,568
(2.61 %)		 n/a 42.41
(99.61 %)		 195
(0.39 %)		 206
(100.00 %)		 495,673
(9.14 %)		 253,008
(2.04 %)		 5,936,177
(19.93 %)		 20,145
(1.83 %)
307 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1		 33,234
(6.38 %)		 13,027
(2.35 %)		 19,960
(2.74 %)		 n/a 41.21
(99.22 %)		 19,995
(0.78 %)		 39,678
(100.00 %)		 586,827
(8.20 %)		 291,437
(1.68 %)		 6,237,616
(20.77 %)		 22,365
(2.11 %)
308 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1		 52,382
(6.40 %)		 12,577
(1.87 %)		 14,272
(2.42 %)		 n/a 41.48
(98.13 %)		 85,176
(1.90 %)		 100,099
(98.10 %)		 480,221
(6.94 %)		 268,561
(1.86 %)		 6,408,260
(19.42 %)		 29,801
(1.43 %)
309 rock pigeon (Tarim TR01 2023)
GCA_032719375.1		 n/a 14,202
(1.82 %)		 26,634
(2.26 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 79
(100.00 %)		 560,932
(5.87 %)		 388,710
(3.61 %)		 6,986,404
(22.52 %)		 37,664
(3.11 %)
310 rock pigeon (v2 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.2		 n/a 12,450
(1.75 %)		 23,660
(2.21 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
311 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1		 70,874
(7.24 %)		 13,145
(1.66 %)		 25,462
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 869
(100.00 %)		 656,963
(11.76 %)		 412,665
(12.92 %)		 6,047,535
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
312 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1		 n/a 12,090
(2.36 %)		 21,910
(2.57 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,212
(100.00 %)		 585,577
(10.45 %)		 202,342
(1.61 %)		 5,390,780
(20.38 %)		 19,210
(2.23 %)
313 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1		 51,632
(7.29 %)		 12,832
(2.31 %)		 23,047
(2.56 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 165
(100.00 %)		 526,839
(5.87 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,345
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
314 ruddy duck
GCF_011077185.1		 50,326
(5.76 %)		 13,124
(1.98 %)		 23,592
(2.23 %)		 n/a 41.82
(97.27 %)		 18,437
(2.73 %)		 28,026
(97.27 %)		 808,998
(7.97 %)		 389,509
(1.34 %)		 6,722,581
(21.16 %)		 34,567
(3.30 %)
315 ruff
GCF_001431845.1		 34,257
(4.61 %)		 12,979
(1.79 %)		 15,969
(2.42 %)		 n/a 42.45
(96.26 %)		 30,404
(3.75 %)		 34,157
(96.25 %)		 308,688
(1.08 %)		 337,661
(3.70 %)		 7,220,063
(20.45 %)		 27,939
(1.42 %)
316 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1		 35,381
(4.92 %)		 12,603
(1.95 %)		 24,965
(2.42 %)		 n/a 42.00
(99.80 %)		 5,524
(0.20 %)		 24,055
(100.00 %)		 514,274
(6.32 %)		 411,146
(2.77 %)		 6,584,761
(19.85 %)		 29,372
(2.28 %)
317 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1		 40,472
(5.86 %)		 12,903
(1.96 %)		 23,477
(2.35 %)		 n/a 42.26
(99.87 %)		 181
(0.13 %)		 1,692
(100.00 %)		 439,625
(4.09 %)		 338,042
(2.23 %)		 6,366,832
(20.27 %)		 28,572
(2.11 %)
318 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1		 45,898
(5.06 %)		 12,908
(1.86 %)		 21,103
(2.48 %)		 n/a 42.28
(99.01 %)		 15,342
(0.99 %)		 38,089
(100.00 %)		 496,308
(7.14 %)		 333,391
(1.97 %)		 6,646,625
(20.87 %)		 32,671
(2.19 %)
319 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1		 n/a 16,893
(1.07 %)		 43,426
(1.70 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 43,047
(100.00 %)		 1,180,596
(3.55 %)		 1,932,696
(16.57 %)		 6,340,063
(43.85 %)		 66,996
(3.45 %)
320 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1		 n/a 12,804
(1.50 %)		 25,425
(1.97 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 1,339
(100.00 %)		 699,755
(3.36 %)		 1,030,540
(15.69 %)		 5,226,748
(36.13 %)		 36,539
(2.71 %)
321 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1		 n/a 12,258
(1.66 %)		 25,579
(2.30 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,162
(100.00 %)		 506,343
(6.77 %)		 182,589
(7.22 %)		 5,435,776
(23.60 %)		 29,420
(2.47 %)
322 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1		 36,497
(5.34 %)		 12,572
(1.79 %)		 10,629
(2.08 %)		 27,857
(3.09 %)		 41.71
(98.00 %)		 70,035
(2.03 %)		 75,898
(97.97 %)		 433,484
(5.29 %)		 166,251
(1.03 %)		 7,121,848
(18.23 %)		 19,927
(0.72 %)
323 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1		 50,303
(5.75 %)		 12,973
(1.67 %)		 21,670
(1.90 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 283
(100.00 %)		 548,090
(7.21 %)		 201,488
(8.55 %)		 7,030,877
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
324 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1		 n/a 12,826
(1.74 %)		 26,019
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 n/a 3,054
(100.00 %)		 482,850
(3.37 %)		 523,437
(10.15 %)		 6,386,315
(26.20 %)		 32,734
(4.25 %)
325 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1		 27,528
(4.03 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
326 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1		 n/a 16,954
(1.37 %)		 46,692
(2.27 %)		 n/a 43.66
(99.99 %)		 1,822
(0.01 %)		 31,565
(99.99 %)		 680,766
(3.36 %)		 930,904
(8.76 %)		 7,502,726
(27.96 %)		 56,390
(5.99 %)
327 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1		 n/a 12,665
(1.79 %)		 25,654
(2.40 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 339
(0.00 %)		 337
(100.00 %)		 428,675
(3.22 %)		 588,040
(7.38 %)		 6,466,447
(24.39 %)		 33,599
(4.75 %)
328 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1		 n/a 12,986
(1.66 %)		 27,028
(2.29 %)		 n/a 43.66
(99.78 %)		 249
(0.22 %)		 110
(100.00 %)		 464,600
(3.28 %)		 681,402
(9.28 %)		 6,314,744
(26.92 %)		 39,406
(5.26 %)
329 scrub jay (FSJ_1873_10779 2024)
GCF_041296385.1		 51,624
(5.10 %)		 13,318
(1.64 %)		 26,496
(2.22 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 660
(100.00 %)		 879,188
(16.59 %)		 506,206
(7.16 %)		 5,626,321
(29.85 %)		 44,942
(4.68 %)
330 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1		 n/a 12,858
(1.52 %)		 25,777
(2.02 %)		 n/a 44.04
(99.85 %)		 365
(0.15 %)		 501
(100.00 %)		 580,376
(4.24 %)		 636,266
(12.18 %)		 4,804,433
(34.52 %)		 48,871
(4.18 %)
331 silver-eye (hap1.1 2025)
GCA_965231275.1		 n/a 13,156
(1.86 %)		 25,666
(2.48 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 703
(0.01 %)		 427
(100.00 %)		 484,761
(3.51 %)		 588,871
(4.76 %)		 6,251,918
(22.33 %)		 33,754
(2.58 %)
332 silver-eye (hap2.1 2025)
GCA_965231245.1		 n/a 12,304
(1.89 %)		 23,352
(2.47 %)		 n/a 42.57
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 818
(100.00 %)		 440,985
(3.45 %)		 570,391
(6.24 %)		 5,725,429
(23.52 %)		 33,401
(2.67 %)
333 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1		 30,090
(4.91 %)		 12,645
(1.95 %)		 17,146
(2.49 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 185
(0.01 %)		 1,527
(99.99 %)		 457,266
(6.02 %)		 477,426
(4.49 %)		 6,482,932
(22.03 %)		 27,271
(2.40 %)
334 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1		 n/a 12,662
(1.93 %)		 23,695
(2.34 %)		 25,763
(3.61 %)		 42.49
(99.99 %)		 224
(0.01 %)		 1,951
(99.99 %)		 458,154
(6.01 %)		 482,974
(4.97 %)		 6,466,067
(22.21 %)		 27,890
(2.42 %)
335 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1		 n/a 15,672
(1.16 %)		 40,690
(1.82 %)		 n/a 45.19
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 34,693
(100.00 %)		 1,068,703
(34.46 %)		 796,004
(19.02 %)		 6,315,990
(40.22 %)		 57,647
(3.95 %)
336 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1		 n/a 12,580
(1.53 %)		 24,737
(2.00 %)		 n/a 44.45
(100.00 %)		 323
(0.00 %)		 501
(100.00 %)		 697,818
(28.44 %)		 510,301
(17.90 %)		 5,319,400
(34.64 %)		 36,632
(3.59 %)
337 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1		 n/a 12,940
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 299
(0.07 %)		 354
(100.00 %)		 515,857
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,880
(39.23 %)		 47,269
(3.90 %)
338 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1		 41,069
(3.95 %)		 12,946
(1.39 %)		 26,698
(1.87 %)		 n/a 44.96
(99.93 %)		 299
(0.07 %)		 353
(100.00 %)		 515,851
(3.07 %)		 681,436
(15.73 %)		 5,004,851
(39.23 %)		 47,268
(3.90 %)
339 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1		 n/a 12,655
(1.70 %)		 n/a n/a 43.63
(99.16 %)		 238
(0.84 %)		 178
(100.00 %)		 554,912
(9.42 %)		 230,808
(4.34 %)		 6,406,358
(24.83 %)		 22,941
(1.98 %)
340 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1		 n/a 12,942
(1.69 %)		 23,221
(2.13 %)		 n/a 43.74
(99.58 %)		 327
(0.42 %)		 174
(100.00 %)		 577,553
(9.77 %)		 259,017
(5.20 %)		 6,430,968
(25.90 %)		 23,810
(2.02 %)
341 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1		 15,894
(2.09 %)		 11,566
(1.44 %)		 25,387
(1.84 %)		 n/a 40.95
(99.65 %)		 44,462
(0.35 %)		 114,650
(99.65 %)		 345,458
(6.87 %)		 154,693
(1.27 %)		 6,152,475
(19.42 %)		 7,821
(0.23 %)
342 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1		 37,067
(4.23 %)		 12,815
(1.76 %)		 23,175
(2.17 %)		 n/a 42.29
(99.52 %)		 161
(0.48 %)		 191
(100.00 %)		 572,944
(12.88 %)		 256,368
(3.55 %)		 5,868,966
(23.42 %)		 27,158
(2.30 %)
343 speckled mousebird (v2 hap2 2023)
GCA_028858625.2		 n/a 12,332
(1.76 %)		 22,895
(2.24 %)		 n/a 42.74
(99.53 %)		 136
(0.47 %)		 242
(100.00 %)		 521,023
(11.26 %)		 304,406
(7.39 %)		 5,319,571
(25.46 %)		 27,299
(2.35 %)
344 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1		 n/a 12,217
(1.73 %)		 25,261
(2.32 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 957
(100.00 %)		 423,239
(3.30 %)		 362,061
(4.83 %)		 4,954,262
(27.09 %)		 42,188
(4.05 %)
345 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1		 n/a 12,789
(1.82 %)		 24,509
(2.35 %)		 n/a 43.18
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 352
(100.00 %)		 413,598
(3.28 %)		 318,919
(3.99 %)		 5,977,564
(23.65 %)		 33,675
(3.21 %)
346 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1		 n/a 12,871
(1.88 %)		 22,508
(2.20 %)		 n/a 42.01
(96.97 %)		 578,921
(3.08 %)		 1,570
(100.00 %)		 554,367
(10.05 %)		 180,644
(0.89 %)		 6,158,602
(21.14 %)		 21,695
(1.62 %)
347 sunbittern
GCF_000690775.1		 15,772
(2.11 %)		 11,564
(1.45 %)		 25,522
(1.98 %)		 n/a 42.33
(99.55 %)		 52,471
(0.46 %)		 115,170
(99.54 %)		 346,556
(5.38 %)		 117,881
(0.88 %)		 6,391,987
(18.82 %)		 32,970
(1.31 %)
348 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1		 n/a 11,628
(1.91 %)		 21,635
(2.31 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 1,535
(100.00 %)		 421,231
(6.57 %)		 146,070
(1.11 %)		 5,727,350
(21.91 %)		 37,752
(3.68 %)
349 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1		 n/a 12,884
(1.85 %)		 23,805
(2.23 %)		 n/a 42.80
(99.12 %)		 253
(0.88 %)		 182
(100.00 %)		 539,771
(9.26 %)		 181,564
(1.14 %)		 6,538,228
(22.49 %)		 41,376
(3.37 %)
350 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,669
(2.52 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 704,976
(13.16 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
351 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2		 40,121
(5.41 %)		 13,004
(1.87 %)		 24,795
(2.41 %)		 n/a 42.48
(98.86 %)		 429
(1.14 %)		 160
(100.00 %)		 493,071
(5.80 %)		 589,858
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
352 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1		 n/a 12,160
(1.83 %)		 24,622
(2.46 %)		 n/a 43.37
(100.00 %)		 n/a 862
(100.00 %)		 383,634
(3.06 %)		 527,550
(8.40 %)		 5,916,654
(24.97 %)		 31,261
(3.21 %)
353 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1		 29,544
(4.27 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
354 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1		 68,379
(7.95 %)		 13,715
(1.90 %)		 24,704
(2.28 %)		 n/a 43.07
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 780,603
(10.80 %)		 463,894
(5.65 %)		 6,593,404
(24.63 %)		 41,265
(4.48 %)
355 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1		 62,741
(8.50 %)		 12,903
(1.98 %)		 21,943
(2.24 %)		 n/a 41.68
(97.40 %)		 63,061
(2.62 %)		 64,863
(97.38 %)		 590,350
(4.68 %)		 253,525
(1.38 %)		 6,926,961
(19.71 %)		 40,011
(3.69 %)
356 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1		 n/a 12,965
(1.97 %)		 25,182
(2.35 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 716
(0.01 %)		 2,119
(100.00 %)		 650,271
(7.44 %)		 270,668
(1.26 %)		 6,776,820
(21.19 %)		 35,560
(4.27 %)
357 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1		 43,215
(5.89 %)		 12,148
(1.89 %)		 19,386
(2.07 %)		 29,870
(3.24 %)		 41.36
(96.87 %)		 84,351
(3.16 %)		 91,944
(96.84 %)		 481,707
(5.57 %)		 230,143
(1.26 %)		 6,665,312
(19.42 %)		 38,930
(2.06 %)
358 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1		 50,082
(5.09 %)		 12,974
(1.75 %)		 22,545
(2.07 %)		 n/a 42.67
(99.82 %)		 186
(0.18 %)		 367
(100.00 %)		 541,918
(6.97 %)		 347,387
(6.90 %)		 5,657,314
(26.08 %)		 25,816
(2.01 %)
359 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1		 n/a 11,928
(1.78 %)		 20,879
(2.12 %)		 n/a 42.78
(99.75 %)		 122
(0.25 %)		 413
(100.00 %)		 481,463
(6.65 %)		 359,572
(7.59 %)		 5,094,615
(26.27 %)		 23,296
(2.08 %)
360 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1		 n/a 11,432
(1.95 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 911
(100.00 %)		 470,125
(9.51 %)		 140,846
(3.57 %)		 5,002,695
(22.08 %)		 22,424
(2.33 %)
361 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1		 n/a 13,321
(1.76 %)		 24,102
(2.15 %)		 n/a 42.35
(99.83 %)		 203
(0.17 %)		 1,038
(100.00 %)		 593,409
(10.51 %)		 202,463
(9.29 %)		 6,160,173
(27.65 %)		 25,785
(2.35 %)
362 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1		 n/a 13,204
(1.60 %)		 23,981
(1.99 %)		 n/a 42.70
(99.70 %)		 281
(0.30 %)		 212
(99.85 %)		 443,228
(4.74 %)		 272,738
(10.86 %)		 5,812,837
(27.42 %)		 30,602
(2.52 %)
363 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1		 n/a 12,367
(1.72 %)		 21,445
(2.03 %)		 n/a 42.53
(99.88 %)		 206
(0.12 %)		 184
(100.00 %)		 392,959
(4.59 %)		 235,300
(7.72 %)		 6,437,772
(24.82 %)		 27,952
(2.71 %)
364 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1		 40,939
(5.96 %)		 12,510
(1.84 %)		 24,378
(2.37 %)		 n/a 42.64
(99.99 %)		 378
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 384,533
(3.09 %)		 345,667
(4.24 %)		 6,199,979
(21.86 %)		 33,587
(2.53 %)
365 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1		 28,749
(4.57 %)		 12,828
(2.02 %)		 17,743
(2.65 %)		 n/a 41.69
(98.76 %)		 21,646
(1.24 %)		 27,052
(98.76 %)		 443,797
(5.51 %)		 346,281
(2.29 %)		 6,423,932
(19.90 %)		 27,086
(2.31 %)
366 tourmaline sunangel (hap1 2024 refseq)
GCF_036169615.1		 50,562
(5.87 %)		 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,200
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,721
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
367 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1		 n/a 11,697
(2.00 %)		 19,544
(2.34 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 370
(0.01 %)		 200
(100.00 %)		 480,724
(5.14 %)		 292,213
(3.66 %)		 5,608,823
(21.79 %)		 17,191
(1.69 %)
368 tree swallow (Ithaca 2401-50270 2024)
GCA_007636935.2		 n/a 13,272
(1.53 %)		 31,390
(2.16 %)		 n/a 42.14
(98.29 %)		 2,123,840
(1.89 %)		 2,173,118
(98.11 %)		 581,418
(3.41 %)		 593,688
(3.21 %)		 7,518,639
(20.56 %)		 40,631
(3.03 %)
369 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1		 n/a 12,203
(1.76 %)		 25,216
(2.40 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 450
(100.00 %)		 430,792
(3.25 %)		 542,908
(5.67 %)		 5,289,916
(24.99 %)		 36,805
(3.52 %)
370 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 refseq)
GCF_023055355.1		 47,580
(6.11 %)		 12,866
(1.81 %)		 26,109
(2.43 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 428,951
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,642
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
371 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1		 29,505
(4.02 %)		 12,972
(1.98 %)		 22,757
(2.27 %)		 n/a 41.66
(99.16 %)		 163
(0.84 %)		 105
(100.00 %)		 826,451
(8.47 %)		 411,356
(1.71 %)		 6,691,445
(22.36 %)		 29,882
(2.41 %)
372 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1		 n/a 12,117
(2.03 %)		 21,464
(2.36 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 780
(100.00 %)		 732,317
(7.82 %)		 353,660
(1.57 %)		 6,119,549
(21.70 %)		 27,920
(2.56 %)
373 tundra swan (primary hap 2025)
GCA_965151615.1		 n/a 13,371
(1.77 %)		 23,897
(2.09 %)		 n/a 45.04
(99.99 %)		 540
(0.01 %)		 608
(100.00 %)		 745,129
(5.82 %)		 484,265
(9.62 %)		 6,249,520
(28.78 %)		 46,110
(11.14 %)
374 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3		 38,427
(6.01 %)		 13,095
(1.96 %)		 23,974
(2.27 %)		 30,549
(3.14 %)		 41.35
(96.83 %)		 65,045
(3.16 %)		 250,220
(96.84 %)		 609,750
(9.03 %)		 243,534
(1.26 %)		 6,043,889
(21.06 %)		 31,818
(1.42 %)
375 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1		 n/a 12,910
(2.37 %)		 23,038
(2.58 %)		 53,269
(6.57 %)		 41.12
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 618,023
(8.91 %)		 227,783
(1.43 %)		 6,123,721
(21.03 %)		 20,379
(2.19 %)
376 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1		 n/a 12,819
(1.94 %)		 24,247
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 178
(100.00 %)		 616,749
(11.96 %)		 411,917
(3.56 %)		 6,385,102
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
377 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1		 44,961
(5.49 %)		 12,817
(1.94 %)		 24,245
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 177
(100.00 %)		 616,746
(11.96 %)		 411,917
(3.57 %)		 6,385,057
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
378 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1		 n/a 2,176
(1.79 %)		 7,719
(4.37 %)		 n/a 49.74
(100.00 %)		 n/a 1,939
(100.00 %)		 136,312
(29.31 %)		 157,341
(15.03 %)		 648,725
(34.67 %)		 15,490
(8.23 %)
379 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1		 n/a 12,732
(1.51 %)		 23,395
(1.91 %)		 n/a 44.28
(99.99 %)		 668
(0.00 %)		 4,450
(100.00 %)		 526,500
(5.75 %)		 269,598
(14.29 %)		 4,825,913
(32.19 %)		 27,465
(2.18 %)
380 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1		 n/a 12,760
(1.53 %)		 23,262
(2.16 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 1,299
(100.00 %)		 497,104
(5.09 %)		 271,530
(15.72 %)		 5,291,065
(32.37 %)		 24,669
(1.78 %)
381 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1		 n/a 11,226
(2.33 %)		 20,526
(2.54 %)		 n/a 41.53
(100.00 %)		 n/a 5,463
(100.00 %)		 436,894
(5.48 %)		 209,008
(1.73 %)		 4,790,071
(20.27 %)		 17,864
(2.58 %)
382 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1		 n/a 12,775
(2.33 %)		 22,516
(2.50 %)		 n/a 41.49
(99.98 %)		 973
(0.02 %)		 318
(100.00 %)		 518,194
(5.54 %)		 276,294
(2.21 %)		 5,866,033
(21.12 %)		 21,287
(2.50 %)
383 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1		 n/a 12,480
(1.72 %)		 22,915
(2.17 %)		 n/a 44.29
(100.00 %)		 168
(0.00 %)		 1,631
(100.00 %)		 394,733
(2.99 %)		 364,498
(6.04 %)		 4,803,453
(27.52 %)		 42,022
(4.90 %)
384 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1		 n/a 13,128
(1.62 %)		 25,648
(2.11 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 272
(0.00 %)		 1,393
(100.00 %)		 449,314
(3.08 %)		 505,129
(6.52 %)		 4,634,925
(31.99 %)		 51,884
(4.81 %)
385 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1		 n/a 11,632
(1.83 %)		 20,659
(2.18 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,405
(100.00 %)		 553,633
(11.80 %)		 147,999
(0.81 %)		 5,825,472
(20.55 %)		 20,481
(1.61 %)
386 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1		 n/a 12,681
(1.84 %)		 21,784
(2.14 %)		 n/a 42.12
(99.13 %)		 218
(0.87 %)		 146
(100.00 %)		 520,200
(9.32 %)		 170,778
(0.83 %)		 6,455,910
(21.44 %)		 24,061
(1.62 %)
387 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2		 83,834
(10.16 %)		 13,005
(2.32 %)		 23,329
(2.48 %)		 72,360
(9.39 %)		 42.16
(99.57 %)		 409
(0.43 %)		 685
(99.57 %)		 536,869
(6.00 %)		 268,230
(2.28 %)		 5,845,184
(20.93 %)		 24,409
(2.60 %)
388 white wagtail
GCF_015832195.1		 47,145
(6.80 %)		 12,127
(1.86 %)		 22,301
(2.31 %)		 n/a 42.72
(99.92 %)		 906
(0.08 %)		 619
(100.00 %)		 479,546
(6.15 %)		 349,751
(5.62 %)		 6,384,256
(22.41 %)		 28,008
(2.68 %)
389 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1		 53,728
(6.26 %)		 12,981
(1.91 %)		 23,916
(2.40 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 n/a 643
(100.00 %)		 417,020
(3.98 %)		 366,209
(3.55 %)		 5,992,950
(21.48 %)		 28,964
(2.22 %)
390 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1		 n/a 12,807
(1.82 %)		 25,568
(2.46 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 697
(100.00 %)		 429,646
(4.10 %)		 293,431
(3.59 %)		 6,059,494
(21.89 %)		 29,574
(2.42 %)
391 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1		 55,558
(6.99 %)		 12,807
(1.82 %)		 23,359
(2.28 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 696
(100.00 %)		 429,643
(4.10 %)		 293,428
(3.59 %)		 6,059,402
(21.89 %)		 29,574
(2.42 %)
392 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1		 n/a 12,135
(1.94 %)		 21,591
(2.38 %)		 n/a 42.49
(99.99 %)		 307
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 375,468
(3.93 %)		 263,979
(3.93 %)		 5,786,346
(21.36 %)		 25,275
(2.50 %)
393 white-plumed antbird (INPA30051 2025)
GCF_047495875.1		 37,839
(4.99 %)		 12,030
(1.76 %)		 22,066
(2.17 %)		 n/a 42.67
(99.85 %)		 415
(0.15 %)		 53
(100.00 %)		 409,029
(4.70 %)		 301,324
(5.91 %)		 5,956,577
(23.63 %)		 22,947
(2.01 %)
394 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1		 45,894
(5.34 %)		 12,730
(1.91 %)		 19,044
(2.50 %)		 n/a 41.81
(99.24 %)		 13,527
(0.76 %)		 9,068
(100.00 %)		 489,252
(7.14 %)		 246,346
(1.38 %)		 6,500,956
(19.79 %)		 25,941
(1.84 %)
395 white-rumped munia (maternal hap 2024)
GCA_046129695.1		 n/a 12,487
(1.71 %)		 29,990
(2.73 %)		 n/a 43.26
(100.00 %)		 176
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 427,385
(3.06 %)		 507,421
(10.23 %)		 5,759,740
(27.66 %)		 36,849
(5.10 %)
396 white-rumped munia (paternal hap 2024)
GCA_046129705.1		 n/a 12,130
(1.67 %)		 29,443
(2.72 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 228
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 420,085
(3.06 %)		 494,379
(10.27 %)		 5,496,878
(27.56 %)		 36,269
(5.17 %)
397 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1		 34,717
(4.88 %)		 12,599
(1.97 %)		 24,083
(2.44 %)		 n/a 42.03
(99.81 %)		 4,869
(0.19 %)		 11,576
(100.00 %)		 502,151
(6.20 %)		 449,641
(3.22 %)		 6,554,257
(20.25 %)		 28,891
(2.32 %)
398 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1		 20,744
(2.82 %)		 11,490
(1.49 %)		 22,258
(1.77 %)		 n/a 40.90
(99.56 %)		 60,579
(0.45 %)		 111,484
(99.55 %)		 325,669
(3.74 %)		 116,707
(0.60 %)		 6,725,133
(18.14 %)		 11,615
(0.32 %)
399 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1		 n/a 7,755
(1.71 %)		 16,331
(2.39 %)		 n/a 43.66
(100.00 %)		 n/a 4,971
(100.00 %)		 304,566
(13.21 %)		 116,307
(6.64 %)		 3,407,853
(22.91 %)		 34,573
(4.56 %)
400 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1		 52,797
(5.74 %)		 13,736
(1.76 %)		 24,846
(2.12 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 585,279
(12.89 %)		 291,297
(6.10 %)		 6,474,102
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
401 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1		 39,072
(5.37 %)		 12,919
(2.36 %)		 23,624
(2.48 %)		 n/a 41.37
(97.63 %)		 10,501
(2.38 %)		 7,343
(100.00 %)		 587,593
(8.19 %)		 231,665
(1.12 %)		 6,007,601
(20.08 %)		 21,298
(2.05 %)
402 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1		 16,342
(2.18 %)		 12,040
(1.50 %)		 26,704
(1.97 %)		 n/a 41.51
(99.50 %)		 65,286
(0.51 %)		 132,071
(99.49 %)		 353,892
(5.61 %)		 125,195
(0.74 %)		 6,873,137
(19.59 %)		 41,005
(1.45 %)
403 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1		 n/a 12,856
(1.79 %)		 23,827
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 658
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 431,536
(3.38 %)		 345,533
(10.59 %)		 5,840,462
(26.59 %)		 29,711
(3.56 %)
404 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1		 29,618
(3.60 %)		 12,854
(1.79 %)		 23,825
(2.25 %)		 n/a 42.82
(99.99 %)		 658
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 431,531
(3.38 %)		 345,532
(10.59 %)		 5,840,421
(26.59 %)		 29,711
(3.56 %)
405 white-throated sparrow (hap1 2025)
GCA_047830755.1		 n/a 12,983
(1.65 %)		 33,925
(3.13 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 180
(100.00 %)		 449,053
(3.16 %)		 631,898
(8.80 %)		 6,189,242
(27.24 %)		 40,133
(2.67 %)
406 white-throated sparrow (hap2 2025)
GCA_047774235.1		 n/a 12,395
(1.71 %)		 31,476
(3.12 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 246
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 412,959
(3.07 %)		 653,654
(9.08 %)		 5,548,210
(27.13 %)		 38,640
(2.84 %)
407 white-throated sparrow (Tan morph 2013)
GCF_000385455.1		 31,167
(5.71 %)		 11,241
(1.81 %)		 13,429
(2.26 %)		 n/a 41.52
(95.61 %)		 41,460
(4.40 %)		 37,661
(95.60 %)		 439,216
(5.96 %)		 364,202
(2.52 %)		 6,300,584
(19.09 %)		 15,091
(0.85 %)
408 white-throated tinamou
GCF_000705375.1		 18,997
(2.72 %)		 12,287
(1.75 %)		 20,132
(2.48 %)		 n/a 41.41
(97.88 %)		 59,853
(2.12 %)		 142,367
(97.88 %)		 366,311
(3.62 %)		 226,347
(1.35 %)		 6,300,683
(18.94 %)		 47,608
(2.60 %)
409 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1		 55,421
(5.57 %)		 13,574
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 930
(100.00 %)		 616,300
(10.57 %)		 211,558
(2.90 %)		 6,785,192
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
410 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1		 n/a 13,284
(1.87 %)		 23,528
(2.20 %)		 n/a 42.47
(99.50 %)		 586
(0.50 %)		 395
(100.00 %)		 569,940
(8.69 %)		 162,569
(0.98 %)		 7,021,319
(20.20 %)		 38,582
(3.77 %)
411 willow flycatcher
GCF_003031625.1		 37,909
(4.43 %)		 12,708
(1.90 %)		 19,591
(2.57 %)		 n/a 42.01
(95.33 %)		 39,319
(4.68 %)		 7,791
(100.00 %)		 550,172
(7.15 %)		 242,394
(1.27 %)		 6,421,292
(18.87 %)		 27,080
(1.82 %)
412 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2		 42,551
(5.86 %)		 12,535
(1.90 %)		 23,300
(2.38 %)		 n/a 42.06
(99.73 %)		 758
(0.26 %)		 1,768
(100.00 %)		 480,705
(7.12 %)		 240,463
(1.87 %)		 6,316,566
(20.20 %)		 25,317
(2.02 %)
413 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1		 n/a 13,053
(1.78 %)		 24,963
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 342
(0.00 %)		 1,350
(100.00 %)		 444,809
(3.08 %)		 473,154
(7.96 %)		 5,336,472
(25.82 %)		 37,198
(3.14 %)
414 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq)
GCF_029207755.1		 40,944
(5.15 %)		 13,050
(1.78 %)		 24,948
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,694
(100.00 %)		 444,856
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,456
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
415 Xingu scale-backed antbird (hap1 2024)
GCA_045364795.1		 n/a 12,848
(1.71 %)		 24,293
(2.19 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 773
(0.01 %)		 1,510
(100.00 %)		 688,169
(20.12 %)		 440,901
(9.03 %)		 5,858,667
(26.62 %)		 39,419
(4.07 %)
416 Xingu scale-backed antbird (hap2 2024)
GCA_045364805.1		 n/a 12,157
(1.85 %)		 22,615
(2.35 %)		 n/a 43.36
(99.99 %)		 533
(0.01 %)		 743
(100.00 %)		 575,863
(14.81 %)		 371,492
(6.11 %)		 5,580,275
(23.05 %)		 28,593
(3.34 %)
417 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1		 n/a 12,426
(1.63 %)		 27,565
(2.37 %)		 n/a 43.59
(100.00 %)		 246
(0.00 %)		 776
(100.00 %)		 447,274
(3.06 %)		 612,008
(10.28 %)		 5,606,168
(28.79 %)		 39,449
(2.66 %)
418 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1		 n/a 12,556
(1.69 %)		 26,545
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 440,673
(3.12 %)		 581,112
(9.17 %)		 6,158,372
(26.15 %)		 35,577
(2.57 %)
419 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1		 n/a 13,169
(1.63 %)		 23,545
(1.98 %)		 n/a 43.42
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 1,679
(100.00 %)		 579,903
(8.32 %)		 295,345
(9.90 %)		 4,361,776
(30.37 %)		 28,647
(1.82 %)
420 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1		 n/a 12,079
(1.50 %)		 21,895
(1.84 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 138
(0.00 %)		 2,468
(100.00 %)		 514,155
(7.08 %)		 298,648
(19.26 %)		 3,943,979
(37.27 %)		 27,272
(1.79 %)
421 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1		 n/a 12,692
(1.61 %)		 24,720
(2.07 %)		 n/a 44.79
(100.00 %)		 n/a 4,673
(100.00 %)		 486,967
(5.03 %)		 248,816
(10.71 %)		 6,176,494
(29.58 %)		 44,101
(6.72 %)
422 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1		 n/a 13,396
(1.62 %)		 25,176
(2.03 %)		 n/a 44.64
(99.99 %)		 500
(0.01 %)		 618
(100.00 %)		 521,539
(5.15 %)		 267,365
(11.68 %)		 5,827,639
(29.76 %)		 44,532
(6.28 %)
423 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1		 n/a 11,788
(1.85 %)		 23,306
(2.45 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 1,958
(100.00 %)		 467,960
(6.96 %)		 182,645
(0.99 %)		 6,050,545
(20.78 %)		 26,357
(2.20 %)
424 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1		 n/a 12,697
(1.89 %)		 25,289
(2.53 %)		 n/a 42.40
(99.62 %)		 242
(0.38 %)		 89
(100.00 %)		 510,633
(7.10 %)		 213,742
(1.12 %)		 6,627,716
(21.17 %)		 28,848
(2.23 %)
425 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1		 n/a 11,340
(1.85 %)		 22,921
(2.37 %)		 n/a 41.73
(99.98 %)		 45
(0.01 %)		 5,381
(99.99 %)		 480,647
(8.44 %)		 365,668
(2.89 %)		 5,859,698
(20.27 %)		 24,649
(2.35 %)
426 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1		 n/a 10,734
(1.84 %)		 19,978
(2.21 %)		 n/a 41.07
(99.99 %)		 16
(0.01 %)		 4,677
(100.00 %)		 436,071
(7.44 %)		 217,580
(1.43 %)		 5,800,691
(19.24 %)		 19,512
(1.90 %)
427 zebra finch (bTaeGut7 maternal hap 2025)
GCA_048771995.1		 n/a 12,949
(1.86 %)		 26,010
(2.49 %)		 n/a 42.68
(99.97 %)		 9
(0.03 %)		 42
(100.00 %)		 411,962
(3.12 %)		 511,516
(6.75 %)		 5,958,859
(23.49 %)		 35,953
(3.51 %)
428 zebra finch (bTaeGut7 paternal hap 2025)
GCA_048772025.1		 n/a 12,239
(1.95 %)		 23,953
(2.54 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 2
(0.01 %)		 41
(99.99 %)		 369,991
(3.07 %)		 472,357
(5.84 %)		 5,622,412
(22.80 %)		 30,701
(3.48 %)
429 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2		 n/a 11,213
(2.01 %)		 21,533
(2.54 %)		 n/a 41.92
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 1,646
(100.00 %)		 470,860
(9.54 %)		 387,943
(3.32 %)		 5,428,128
(20.68 %)		 23,838
(2.47 %)
430 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2		 n/a 12,796
(1.92 %)		 24,658
(2.44 %)		 n/a 41.91
(98.03 %)		 789
(1.97 %)		 541
(100.00 %)		 554,338
(9.67 %)		 339,851
(2.27 %)		 6,613,146
(20.04 %)		 28,678
(2.32 %)
431 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1		 n/a 12,384
(1.97 %)		 23,021
(2.44 %)		 n/a 41.74
(98.02 %)		 828
(1.98 %)		 202
(100.00 %)		 511,324
(8.38 %)		 351,624
(2.53 %)		 6,328,918
(19.99 %)		 25,871
(2.29 %)
432 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2		 50,407
(7.20 %)		 12,470
(1.95 %)		 23,352
(2.42 %)		 n/a 41.81
(97.98 %)		 857
(2.02 %)		 205
(100.00 %)		 529,829
(9.55 %)		 357,586
(2.56 %)		 6,359,599
(20.12 %)		 27,755
(2.36 %)
433 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2		 49,311
(7.41 %)		 12,747
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 544,577
(9.57 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,748
(20.92 %)		 29,202
(2.47 %)
434 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3		 n/a 11,950
(2.00 %)		 22,828
(2.51 %)		 n/a 42.06
(98.45 %)		 583
(1.55 %)		 206
(100.00 %)		 494,110
(9.54 %)		 347,933
(2.80 %)		 5,875,448
(20.29 %)		 27,387
(2.57 %)
TOTALS:total assembly count 434

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Primates 393 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 434 assemblies assembly stats track stats
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