Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019 VGP)
GCA_009769605.1
n/a 12,918
(1.90 %)
17,214
(2.53 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,836
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,983
(3.62 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769595.1
n/a 11,935
(1.85 %)
17,161
(2.52 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,144
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,782
(3.72 %)
3 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,651
(3.05 %)
11,771
(1.70 %)
18,556
(1.84 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
465,562
(6.05 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
4 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
5 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
20,173
(2.17 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
425,989
(6.05 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
6 American flamingo (2019 VGP)
GCA_009819775.1
n/a 13,081
(1.79 %)
22,162
(2.64 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,001
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
51,972
(4.83 %)
7 American flamingo (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819805.1
n/a 12,369
(1.73 %)
22,102
(2.60 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,874
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,873
(5.47 %)
8 Anna's hummingbird (alt pseudohaplotype BGI_N300 2018 VGP)
GCA_003957575.1
n/a 11,080
(1.90 %)
14,722
(2.29 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,490
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
9 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq VGP)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,248
(1.95 %)
20,821
(2.30 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
547,346
(7.89 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
10 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,013
(1.88 %)
21,331
(2.11 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
453,074
(5.29 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
11 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
25,920
(1.86 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
447,233
(7.10 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
12 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
13 barn swallow (genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
14 barn swallow (refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
15 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
16 blackcap (2019 VGP)
GCA_009819655.1
n/a 12,367
(1.92 %)
17,080
(2.58 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,239
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,837
(2.32 %)
17 blackcap (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819715.1
n/a 11,575
(1.86 %)
17,228
(2.55 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,453
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
18 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
31,725
(3.49 %)
19 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
20 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,167
(1.76 %)
24,104
(2.22 %)
41,815
(3.95 %)
41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
496,094
(5.99 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
21 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,445
(1.93 %)
22,483
(2.30 %)
24,896
(3.01 %)
41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
479,978
(6.88 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
22 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
18,584
(1.17 %)
23 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
24 brown headed cowbird
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
25 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
26 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,215
(1.55 %)
29,361
(2.00 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
413,378
(6.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
27 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,196
(1.81 %)
21,458
(2.10 %)
25,737
(3.06 %)
41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
478,340
(9.31 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
28 budgerigar (maternal 2020 VGP)
GCA_012275265.1
n/a 12,645
(1.89 %)
18,505
(2.70 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,674
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
29 budgerigar (maternal Z 2020 refseq VGP)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
n/a 41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
30 budgerigar (paternal 2020 VGP)
GCA_012275275.1
n/a 13,131
(1.94 %)
19,040
(2.75 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,475
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
31 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,739
(1.72 %)
17,598
(1.93 %)
23,983
(2.78 %)
40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
502,022
(6.12 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
32 California condor
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
33 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
40,389
(4.15 %)
34 carmine bee-eater (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819585.1
n/a 12,368
(1.75 %)
21,365
(2.81 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,762
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
35 carmine bee-eater (2019 VGP)
GCA_009819595.1
n/a 12,724
(1.82 %)
20,356
(2.83 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,923
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,884
(2.47 %)
36 chicken
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,083
(2.31 %)
23,897
(2.50 %)
39,251
(5.00 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
699,901
(12.72 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,403
(2.57 %)
37 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 VGP 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
n/a 42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
38 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 VGP 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
n/a 42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
39 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,540
(2.09 %)
23,261
(2.54 %)
22,489
(2.50 %)
42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
503,525
(5.38 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,627
(4.89 %)
40 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
41 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
42 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,373
(4.07 %)
12,197
(1.78 %)
21,980
(2.17 %)
n/a 44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
621,954
(11.73 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
43 common canary
GCF_007115625.1
32,998
(4.99 %)
12,243
(1.89 %)
23,125
(2.34 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
487,201
(6.29 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
44 common cuckoo (VGP 2021)
GCA_017976375.1
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
45 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,578
(2.01 %)
23,288
(2.42 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
469,830
(5.86 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
46 common swift (bApuApu2 2021 VGP refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
47 common tern (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819645.1
n/a 12,766
(1.79 %)
18,154
(2.47 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,457
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,340
(3.68 %)
48 common tern (2019 VGP)
GCA_009819605.1
n/a 13,094
(1.80 %)
17,911
(2.48 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,309
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,683
(3.53 %)
49 common yellowthroat (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009764545.1
n/a 10,599
(1.76 %)
16,440
(2.36 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,886
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
50 common yellowthroat (2019 VGP)
GCA_009764595.1
n/a 11,736
(1.82 %)
16,696
(2.52 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,046
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
51 crested ibis
GCF_000708225.1
17,147
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
21,346
(1.99 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
517,127
(5.90 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,155
(2.05 %)
52 cuckoo roller
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,190
(1.53 %)
27,315
(1.84 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
435,835
(5.75 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
53 Dalmatian pelican
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,926
(1.44 %)
26,715
(1.76 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
502,899
(6.52 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
54 downy woodpecker (VGP 2020)
GCA_014839835.1
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
55 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
56 East African grey crowned-crane (alt pseudohaplotyp 2020 VGP)
GCA_011004865.1
n/a 11,782
(1.88 %)
18,687
(2.68 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,927
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,314
(3.59 %)
57 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020 VGP)
GCA_011004875.1
n/a 13,263
(1.84 %)
20,787
(2.66 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,859
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,610
(3.33 %)
58 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,518
(1.77 %)
19,763
(1.95 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
494,422
(5.57 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
59 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,060
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
21,489
(1.99 %)
33,416
(3.44 %)
41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
453,024
(4.18 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,742
(4.47 %)
60 emu (2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
61 Eurasian nightjar
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
62 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
63 European golden plover
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
64 European robin
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
65 European turtle dove (alt pseudohaplotype v1.1 2019 VGP)
GCA_901699165.1
n/a 11,266
(1.79 %)
17,283
(2.48 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,564
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
66 European turtle dove (v1.2 2021 VGP)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
67 garden warbler
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
68 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,800
(1.85 %)
19,868
(2.19 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
455,868
(6.95 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
69 golden eagle (2019 VGP)
GCA_902153765.1
n/a 9,330
(1.81 %)
14,414
(2.43 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,281
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
70 golden eagle (v1.4 2021 VGP)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
71 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
72 great cormorant
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,539
(1.44 %)
25,114
(1.69 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
403,514
(5.73 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
73 great potoo
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
74 great tit
GCF_001522545.3
46,622
(6.92 %)
12,240
(2.00 %)
22,301
(2.39 %)
35,277
(4.08 %)
41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
454,833
(5.84 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
75 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
76 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
77 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
78 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
79 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
28,978
(2.14 %)
80 gyrfalcon (2020 VGP)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
81 Hawaiian crow (VGP 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
82 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,448
(7.96 %)
12,853
(2.28 %)
23,033
(2.43 %)
40,117
(4.15 %)
41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
499,793
(7.93 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
83 hoatzin
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,457
(1.65 %)
18,868
(1.85 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
444,852
(7.40 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
84 hooded crow (2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
85 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
33,529
(1.55 %)
86 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
87 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
88 kakapo (Jane alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_004011185.1
n/a 3,251
(1.65 %)
5,389
(2.18 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,814
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
89 kakapo (Jane v2 2020 refseq VGP)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,102
(1.92 %)
17,781
(2.51 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
517,233
(7.76 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,279
(1.79 %)
90 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,982
(1.66 %)
25,022
(1.97 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
450,515
(6.55 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
91 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,353
(1.72 %)
20,433
(1.94 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
528,556
(7.11 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
92 lance-tailed manakin (2020 VGP)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,580
(1.91 %)
16,669
(2.52 %)
n/a 41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
494,225
(7.09 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,376
(1.95 %)
93 lance-tailed manakin (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_009829205.1
n/a 12,270
(1.85 %)
18,043
(2.51 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,381
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
94 lanner falcon (2022 VGP)
GCA_023638135.1
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
n/a 203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
95 lesser kestrel (alt pseudohaplotype 2021 VGP)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
96 lesser kestrel (v2 2021 VGP)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
97 lesser rhea
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
98 little egret
GCF_000687185.1
15,986
(2.42 %)
12,165
(1.72 %)
19,101
(1.90 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
502,442
(6.71 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
99 Macqueen's bustard
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,627
(1.51 %)
26,301
(1.84 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
474,904
(5.88 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
100 maguari stor
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
101 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
102 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,188
(1.85 %)
22,452
(2.19 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
781,333
(8.08 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
103 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
n/a 42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
104 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
105 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,894
(1.83 %)
20,388
(2.17 %)
23,200
(3.08 %)
41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
441,359
(5.86 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
106 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
107 mute swan (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769485.1
n/a 10,070
(1.97 %)
14,255
(2.46 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,824
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,662
(3.69 %)
108 mute swan (v2 2021 VGP)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
n/a 41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
109 New Caledonian crow (2019 VGP)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,735
(1.93 %)
17,289
(2.60 %)
n/a 42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
460,676
(6.16 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,907
(2.46 %)
110 New Caledonian crow (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009651025.1
n/a 11,089
(1.99 %)
15,330
(2.65 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,047
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,106
(2.51 %)
111 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
112 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,963
(1.50 %)
26,299
(1.77 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
436,850
(5.16 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
113 northern goshawk (2022 VGP)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
114 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,227
(1.76 %)
22,482
(2.03 %)
31,718
(2.89 %)
41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
494,809
(4.85 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,062
(4.56 %)
115 peregrine falcon (2022 VGP)
GCA_023634155.1
n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
n/a 335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
116 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,519
(5.42 %)
12,666
(1.80 %)
19,285
(1.99 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
447,274
(5.23 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
117 plumbeous ibis
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
118 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP)
GCA_008658365.1
n/a 12,776
(1.83 %)
16,521
(2.42 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,514
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,955
(2.90 %)
119 razorbill (alt pseudohaplotype 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP)
GCA_008658355.1
n/a 12,926
(1.74 %)
18,313
(2.36 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,546
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,925
(2.86 %)
120 red-crested turaco (2019 VGP)
GCA_009769465.1
n/a 12,726
(1.75 %)
21,173
(2.64 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,882
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,046
(3.29 %)
121 red-crested turaco (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009764505.1
n/a 11,230
(1.70 %)
19,839
(2.60 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,814
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,761
(3.33 %)
122 red-fronted tinkerbird
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
123 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
124 red-legged seriema (2019 VGP)
GCA_009819825.1
n/a 13,220
(1.83 %)
19,960
(2.64 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,781
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,894
(2.67 %)
125 red-legged seriema (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819485.1
n/a 10,125
(1.77 %)
16,337
(2.56 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,588
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,292
(2.86 %)
126 red-throated loon
GCF_000690875.1
15,842
(2.14 %)
11,586
(1.46 %)
25,291
(1.71 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
382,153
(4.85 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
127 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
128 rifleman (VGP 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
129 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,234
(6.38 %)
13,027
(2.34 %)
23,759
(2.47 %)
35,359
(4.02 %)
41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
600,071
(8.12 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,362
(2.11 %)
130 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,382
(6.40 %)
12,581
(1.87 %)
21,539
(2.18 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
491,972
(6.86 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,800
(1.40 %)
131 rock ptarmigan (2022 VGP)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
132 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
133 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,986
(1.78 %)
24,061
(2.27 %)
35,218
(3.59 %)
42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
598,312
(7.84 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
134 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
135 rusty-margined flycatcher (2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
28,572
(2.11 %)
136 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,904
(1.85 %)
26,943
(2.32 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
506,451
(7.11 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
137 Saker falcon (2022 VGP)
GCA_023634085.1
n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
n/a 201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
138 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,576
(1.78 %)
18,758
(1.96 %)
n/a 41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
447,504
(5.26 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
139 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,639
(1.95 %)
23,859
(2.40 %)
24,423
(3.59 %)
42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
465,333
(5.96 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,270
(2.38 %)
140 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
141 South Island takahe (VGP alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
142 South Island takahe (VGP primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
143 speckled mousebird
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,557
(1.44 %)
27,937
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
425,255
(7.62 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
144 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,549
(1.45 %)
27,111
(1.82 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
420,590
(6.32 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
145 Suruca trogon
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
146 Swainson's thrush (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819505.1
n/a 13,406
(1.85 %)
20,402
(2.61 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,371
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
147 Swainson's thrush (v2 2020 VGP)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
148 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
149 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
150 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
n/a 41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
151 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,749
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
24,003
(2.49 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
476,955
(6.01 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
152 tufted duck (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819845.1
n/a 12,108
(2.02 %)
15,241
(2.53 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,314
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,919
(2.56 %)
153 tufted duck (2019 VGP)
GCF_009819795.1
29,505
(4.02 %)
12,959
(1.97 %)
16,252
(2.50 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
836,786
(8.36 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,883
(2.48 %)
154 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
n/a 41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
155 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
156 whiskered treeswift
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
157 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
158 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,728
(1.91 %)
24,667
(2.34 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
498,690
(7.12 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
159 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
160 white-tailed eagle
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,486
(1.49 %)
24,520
(1.72 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
419,664
(5.08 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
161 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
162 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,039
(1.50 %)
26,683
(1.79 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
435,221
(6.74 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
163 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,245
(1.80 %)
20,499
(2.19 %)
30,624
(3.48 %)
41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
437,862
(5.64 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
164 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,294
(1.74 %)
24,409
(2.18 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
468,176
(4.61 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
165 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,702
(1.90 %)
24,710
(2.38 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
560,568
(7.13 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
166 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
167 yellow-throated sandgrouse (2019 VGP)
GCA_009769525.1
n/a 12,693
(1.89 %)
18,187
(2.69 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,630
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,846
(2.19 %)
168 yellow-throated sandgrouse (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769505.1
n/a 11,777
(1.85 %)
17,357
(2.58 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,957
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
169 zebra finch (Blue55 v1.4 2021 VGP)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
170 zebra finch (Blue55 2020 VGP)
GCA_009859065.2
n/a 12,787
(1.92 %)
18,164
(2.63 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,335
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
171 zebra finch (alt pseudohaplotype Black17 2018 VGP)
GCA_003957525.1
n/a 11,327
(1.85 %)
18,898
(2.67 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,644
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,648
(2.34 %)
172 zebra finch (alt pseudohaplotype Blue55 v1 2020 VGP)
GCA_009859025.1
n/a 10,723
(1.83 %)
15,206
(2.34 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,068
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
173 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020 VGP)
GCA_008822115.3
n/a 11,942
(1.99 %)
16,368
(2.73 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,107
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,385
(2.54 %)
174 zebra finch (Blue55 paternal 2019 VGP)
GCA_008822125.1
n/a 12,374
(1.97 %)
16,560
(2.63 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,321
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
25,871
(2.29 %)
175 zebra finch (Blue55 paternal W 2020 VGP)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,465
(1.95 %)
17,085
(2.63 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
540,255
(9.53 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
TOTALS:total assembly count 175

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 57 assemblies assembly stats track stats
Mammals 348 assemblies assembly stats track stats
Birds 175 assemblies assembly stats track stats
Fishes 195 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 73 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 470 assemblies assembly stats track stats
Plants 173 assemblies assembly stats track stats
Fungi 463 assemblies assembly stats track stats
Viruses 254 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 14 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 261 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 242 assemblies assembly stats track stats