Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019)
GCA_009769605.1
n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,986
(3.65 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,787
(3.82 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
5 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
6 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
7 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
8 American flamingo (2019)
GCA_009819775.1
n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
52,012
(5.96 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,895
(5.89 %)
10 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
11 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
12 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
13 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
14 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
15 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
30,305
(2.79 %)
16 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021)
GCA_015227805.3
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
17 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
18 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
19 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
42,776
(4.88 %)
20 blackcap (2019)
GCA_009819655.1
n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
21 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
22 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
31,725
(3.49 %)
23 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
24 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
25 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
26 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
18,581
(1.17 %)
27 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
18,584
(1.17 %)
28 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
29 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
28,568
(2.41 %)
30 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
31 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
32 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
33 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
34 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
n/a 41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
35 budgerigar (paternal 2020)
GCA_012275275.1
n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
36 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
37 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22,622
(2.16 %)
38 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
24,529
(1.77 %)
39 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
34,918
(3.00 %)
40 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
36,496
(2.55 %)
41 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
25,268
(2.42 %)
42 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
48,369
(2.73 %)
43 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
40,389
(4.15 %)
44 carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019)
GCA_009819585.1
n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
45 carmine bee-eater (2019)
GCA_009819595.1
n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,881
(2.41 %)
46 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,405
(2.72 %)
47 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
21,151
(2.71 %)
48 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
25,664
(2.75 %)
49 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
27,781
(2.90 %)
50 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
19,653
(2.66 %)
51 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
24,413
(2.63 %)
52 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
53 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
54 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,640
(5.21 %)
55 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
56 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
57 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
58 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
59 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
26,268
(2.31 %)
60 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
24,010
(1.80 %)
61 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
25,268
(1.73 %)
62 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
25,210
(3.70 %)
63 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
32,293
(3.87 %)
64 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
65 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
18,864
(1.75 %)
66 common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
67 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,352
(3.95 %)
68 common tern (2019)
GCA_009819605.1
n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,694
(3.73 %)
69 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
70 common yellowthroat (2019)
GCA_009764595.1
n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
71 crested ibis
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,156
(2.06 %)
72 cuckoo roller
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
73 Dalmatian pelican
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
74 Downy woodpecker (bDryPub1 alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
24,105
(1.81 %)
75 Downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
76 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
77 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,323
(3.81 %)
78 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020)
GCA_011004875.1
n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,626
(3.69 %)
79 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
80 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
41,752
(6.24 %)
81 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,752
(4.64 %)
82 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
21,942
(1.89 %)
83 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
84 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
85 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
37,413
(3.59 %)
86 European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
87 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
22,977
(2.32 %)
88 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
89 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
29,692
(2.35 %)
90 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
91 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
26,594
(2.34 %)
92 garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
93 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
94 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
27,767
(3.57 %)
95 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
96 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
97 great cormorant
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
98 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
29,548
(2.77 %)
99 great potoo (bNycGra1 primary hap 2020)
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
100 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
101 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
19,623
(1.55 %)
102 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
103 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
104 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
105 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
106 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
28,978
(2.14 %)
107 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
11,838
(2.15 %)
108 gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
109 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
58,446
(5.44 %)
110 Harpy eagle (bHarHar1 primary hap 2022)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
111 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
23,288
(3.74 %)
112 Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
113 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
114 hoatzin
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
115 hooded crow (2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
116 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
28,740
(2.98 %)
117 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022)
GCA_027477595.1
n/a 12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
118 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
27,953
(3.83 %)
119 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
33,172
(3.38 %)
120 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
33,529
(1.55 %)
121 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
122 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
123 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
32,592
(5.25 %)
124 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
54,426
(4.92 %)
125 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
126 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
127 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
128 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
129 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
24,909
(2.64 %)
130 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
32,237
(2.61 %)
131 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,377
(1.97 %)
132 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
133 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
31,611
(2.72 %)
134 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022)
GCA_023638135.1
n/a 12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
135 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
136 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
137 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
20,648
(2.33 %)
138 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
34,698
(5.69 %)
139 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023)
GCA_028389875.1
n/a 13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
140 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
141 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
142 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
15,809
(1.43 %)
143 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
144 Macqueen's bustard
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
145 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
27,330
(3.35 %)
146 maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
147 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
148 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
149 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
150 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
151 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
152 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
153 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
25,667
(3.86 %)
154 mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
155 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
29,485
(4.55 %)
156 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023)
GCA_027579445.1
n/a 12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
157 New Caledonian crow (2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,909
(2.48 %)
158 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,107
(2.52 %)
159 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
160 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
161 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
35,691
(4.26 %)
162 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
163 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
164 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
34,247
(3.02 %)
165 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,081
(4.88 %)
166 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
26,313
(2.41 %)
167 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
168 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
169 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
49,402
(3.94 %)
170 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
30,478
(4.03 %)
171 plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
172 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
14,572
(0.41 %)
173 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,960
(3.02 %)
174 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,926
(2.91 %)
175 red-crested turaco (2019)
GCA_009769465.1
n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,051
(3.40 %)
176 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,766
(3.41 %)
177 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
23,381
(1.81 %)
178 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
179 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
180 red-legged seriema (2019)
GCA_009819825.1
n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,899
(2.77 %)
181 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,293
(2.86 %)
182 red-throated loon
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
183 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
32,643
(2.66 %)
184 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
185 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
15,730
(1.88 %)
186 rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
187 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,365
(2.11 %)
188 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,801
(1.43 %)
189 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
19,210
(2.23 %)
190 rock ptarmigan (bLagMut1 primary hap 2022)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
191 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
192 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
193 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
194 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
28,572
(2.11 %)
195 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
196 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
66,996
(3.45 %)
197 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
36,539
(2.71 %)
198 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
29,420
(2.47 %)
199 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
200 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
201 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
32,734
(4.25 %)
202 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023)
GCA_027887145.1
n/a 12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
203 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
56,390
(5.99 %)
204 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
33,599
(4.75 %)
205 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,271
(2.40 %)
206 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
207 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
57,647
(3.95 %)
208 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
36,632
(3.59 %)
209 South Island takahe (alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
210 South Island takahe (primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
211 speckled mousebird
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
212 steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
15,490
(8.23 %)
213 steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022)
GCA_026979565.1
n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
214 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
42,188
(4.05 %)
215 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
33,675
(3.21 %)
216 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
21,695
(1.62 %)
217 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
218 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
37,752
(3.68 %)
219 Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
220 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
221 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
222 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
31,261
(3.21 %)
223 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023)
GCA_028018845.1
n/a 12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
224 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
225 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
226 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
227 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
22,424
(2.33 %)
228 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
25,785
(2.35 %)
229 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
230 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
36,805
(3.52 %)
231 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
232 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,920
(2.56 %)
233 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,882
(2.41 %)
234 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
n/a 41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
235 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
236 village indigobird (OUT-0048 2022)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
237 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
27,465
(2.18 %)
238 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
24,669
(1.78 %)
239 Western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
42,022
(4.90 %)
240 Western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
51,884
(4.81 %)
241 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
20,481
(1.61 %)
242 whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
243 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
244 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
28,964
(2.22 %)
245 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
246 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
247 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
248 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1
n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
249 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
34,573
(4.56 %)
250 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
251 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
252 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
253 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
254 whooping crane (bGruAme1 2023)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
255 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
256 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
257 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
37,198
(3.14 %)
258 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023)
GCA_029207755.1
n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
259 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
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(28.79 %)
39,449
(2.66 %)
260 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
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(3.12 %)
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(9.17 %)
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(26.15 %)
35,577
(2.57 %)
261 yellow-throated sandgrouse (2019)
GCA_009769525.1
n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,848
(2.23 %)
262 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
263 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
23,838
(2.47 %)
264 zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
265 zebra finch (Blue55 2020)
GCA_009859065.2
n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
266 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,649
(2.35 %)
267 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
268 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020)
GCA_008822115.3
n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,387
(2.57 %)
269 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a 12,384
(1.97 %)
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(2.44 %)
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(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
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(2.29 %)
270 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
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(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
TOTALS:total assembly count 270

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 159 assemblies assembly stats track stats
Mammals 407 assemblies assembly stats track stats
Birds 270 assemblies assembly stats track stats
Fishes 270 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 113 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 583 assemblies assembly stats track stats
Plants 230 assemblies assembly stats track stats
Fungi 544 assemblies assembly stats track stats
Viruses 259 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 64 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 336 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 445 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats