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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.
| count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Abyssinian ground-hornbill (2019 VGP) GCA_009769605.1 |
n/a | 12,918 (1.90 %) |
17,214 (2.53 %) |
n/a | 43.30 (99.29 %) |
204 (0.71 %) |
112 (100.00 %) |
401,836 (5.61 %) |
145,540 (0.78 %) |
6,556,090 (19.22 %) |
40,983 (3.62 %) |
| 2 | Abyssinian ground-hornbill (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009769595.1 |
n/a | 11,935 (1.85 %) |
17,161 (2.52 %) |
n/a | 43.51 (100.00 %) |
n/a | 3,527 (100.00 %) |
361,144 (5.36 %) |
125,372 (0.75 %) |
5,917,083 (18.51 %) |
38,782 (3.72 %) |
| 3 | Adelie penguin GCF_000699105.1 |
17,651 (3.05 %) |
11,771 (1.70 %) |
18,556 (1.84 %) |
n/a | 41.51 (95.58 %) |
95,110 (4.45 %) |
114,374 (95.55 %) |
465,562 (6.05 %) |
126,490 (0.70 %) |
6,900,013 (18.31 %) |
27,176 (0.96 %) |
| 4 | African ostrich GCF_000698965.1 |
29,026 (4.42 %) |
12,011 (1.64 %) |
17,852 (1.82 %) |
34,707 (3.37 %) |
41.05 (96.74 %) |
72,649 (3.29 %) |
79,564 (96.71 %) |
321,765 (3.17 %) |
152,444 (0.82 %) |
7,196,207 (17.79 %) |
33,542 (1.33 %) |
| 5 | American crow GCF_000691975.1 |
36,379 (6.32 %) |
12,151 (1.86 %) |
20,173 (2.17 %) |
n/a | 41.85 (96.40 %) |
79,099 (3.62 %) |
89,646 (96.38 %) |
425,989 (6.05 %) |
224,964 (1.60 %) |
6,343,680 (18.42 %) |
20,148 (0.77 %) |
| 6 | American flamingo (2019 VGP) GCA_009819775.1 |
n/a | 13,081 (1.79 %) |
22,162 (2.64 %) |
n/a | 43.27 (99.31 %) |
280 (0.69 %) |
90 (100.00 %) |
538,001 (7.73 %) |
183,346 (0.79 %) |
7,056,270 (20.92 %) |
51,972 (4.83 %) |
| 7 | American flamingo (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819805.1 |
n/a | 12,369 (1.73 %) |
22,102 (2.60 %) |
n/a | 43.35 (100.00 %) |
n/a | 3,529 (100.00 %) |
496,874 (7.22 %) |
162,522 (0.74 %) |
6,684,675 (20.14 %) |
51,873 (5.47 %) |
| 8 | Anna's hummingbird (alt pseudohaplotype BGI_N300 2018 VGP) GCA_003957575.1 |
n/a | 11,080 (1.90 %) |
14,722 (2.29 %) |
n/a | 41.32 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
3,803 (100.00 %) |
475,490 (7.41 %) |
223,791 (1.37 %) |
5,585,250 (20.30 %) |
14,903 (1.46 %) |
| 9 | Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq VGP) GCF_003957555.1 |
31,091 (4.24 %) |
12,248 (1.95 %) |
20,821 (2.30 %) |
n/a | 41.49 (98.48 %) |
429 (1.52 %) |
159 (100.00 %) |
547,346 (7.89 %) |
262,055 (1.51 %) |
6,092,276 (20.84 %) |
17,130 (1.48 %) |
| 10 | bald eagle GCF_000737465.1 |
26,869 (3.49 %) |
13,013 (1.88 %) |
21,331 (2.11 %) |
n/a | 41.68 (98.38 %) |
30,862 (1.63 %) |
31,786 (98.37 %) |
453,074 (5.29 %) |
119,526 (0.44 %) |
6,923,742 (18.48 %) |
33,353 (1.97 %) |
| 11 | bar-tailed trogon GCF_000703405.1 |
15,393 (2.18 %) |
11,432 (1.52 %) |
25,920 (1.86 %) |
n/a | 41.38 (99.58 %) |
50,921 (0.42 %) |
105,649 (99.58 %) |
447,233 (7.10 %) |
142,825 (0.82 %) |
6,474,942 (19.87 %) |
18,662 (0.63 %) |
| 12 | barn owl (U. Lausanne 2021) GCF_018691265.1 |
46,583 (5.22 %) |
13,036 (1.82 %) |
22,849 (2.14 %) |
n/a | 41.65 (95.89 %) |
259 (4.11 %) |
70 (100.00 %) |
610,994 (5.59 %) |
254,870 (1.12 %) |
7,109,716 (19.00 %) |
38,384 (2.94 %) |
| 13 | barn swallow (genbank 2021) GCA_015227805.2 |
n/a | 12,385 (1.88 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
579,928 (6.20 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,546 (2.82 %) |
| 14 | barn swallow (refseq 2021) GCF_015227805.1 |
43,374 (5.14 %) |
12,385 (1.88 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
579,928 (6.20 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,546 (2.82 %) |
| 15 | Bengalese finch GCF_005870125.1 |
32,857 (5.06 %) |
12,604 (1.98 %) |
23,707 (2.41 %) |
n/a | 41.59 (97.06 %) |
37,862 (2.95 %) |
2,015 (100.00 %) |
507,898 (7.97 %) |
424,913 (2.80 %) |
6,456,852 (20.03 %) |
29,692 (2.46 %) |
| 16 | blackcap (2019 VGP) GCA_009819655.1 |
n/a | 12,367 (1.92 %) |
17,080 (2.58 %) |
n/a | 42.00 (98.88 %) |
413 (1.12 %) |
189 (100.00 %) |
506,239 (6.14 %) |
330,354 (2.12 %) |
6,410,567 (19.76 %) |
26,837 (2.32 %) |
| 17 | blackcap (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819715.1 |
n/a | 11,575 (1.86 %) |
17,228 (2.55 %) |
n/a | 42.17 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
3,566 (100.00 %) |
473,453 (5.97 %) |
308,518 (2.29 %) |
5,987,640 (19.64 %) |
25,451 (2.38 %) |
| 18 | black swan GCF_013377495.1 |
41,255 (4.77 %) |
12,955 (1.98 %) |
22,656 (2.28 %) |
n/a | 41.95 (100.00 %) |
n/a | 396 (100.00 %) |
680,976 (7.66 %) |
296,152 (1.44 %) |
6,797,141 (21.40 %) |
31,750 (3.32 %) |
| 19 | black-throated flowerpiercer GCA_019023105.1 |
n/a | 12,249 (1.86 %) |
23,692 (2.34 %) |
n/a | 42.36 (99.99 %) |
970 (0.01 %) |
600 (100.00 %) |
491,914 (6.04 %) |
365,884 (2.89 %) |
6,453,998 (20.73 %) |
30,076 (2.44 %) |
| 20 | blue tit GCF_002901205.1 |
42,986 (5.81 %) |
12,167 (1.76 %) |
24,104 (2.22 %) |
41,815 (3.95 %) |
41.18 (92.58 %) |
24,797 (7.42 %) |
29,297 (100.00 %) |
496,094 (5.99 %) |
423,142 (2.68 %) |
6,777,615 (18.84 %) |
26,565 (0.98 %) |
| 21 | blue-crowned manakin GCF_001604755.1 |
42,586 (5.25 %) |
12,445 (1.93 %) |
22,483 (2.30 %) |
24,896 (3.01 %) |
41.74 (97.93 %) |
22,456 (2.07 %) |
23,501 (97.93 %) |
479,978 (6.88 %) |
226,975 (1.27 %) |
6,395,476 (19.17 %) |
24,084 (1.85 %) |
| 22 | brown eared-pheasant GCA_019593555.1 |
n/a | 13,027 (2.37 %) |
22,748 (2.48 %) |
n/a | 41.03 (98.67 %) |
114,232 (1.35 %) |
2,408 (100.00 %) |
523,649 (0.00 %) |
228,783 (1.17 %) |
6,134,418 (20.24 %) |
19,702 (2.00 %) |
| 23 | brown headed cowbird GCF_012460135.1 |
31,379 (5.19 %) |
12,572 (1.89 %) |
24,442 (2.44 %) |
n/a | 42.40 (99.99 %) |
278 (0.01 %) |
691 (99.99 %) |
504,872 (6.53 %) |
420,620 (3.73 %) |
6,496,619 (21.26 %) |
28,576 (2.39 %) |
| 24 | brown kiwi GCF_001039765.1 |
26,121 (3.23 %) |
12,909 (1.54 %) |
23,267 (1.91 %) |
n/a | 41.28 (86.08 %) |
368,297 (13.97 %) |
24,718 (100.00 %) |
367,446 (2.94 %) |
316,602 (7.36 %) |
7,164,456 (14.67 %) |
59,756 (2.40 %) |
| 25 | brown roatelo GCF_000695765.1 |
16,756 (2.26 %) |
12,215 (1.55 %) |
29,361 (2.00 %) |
n/a | 41.32 (99.66 %) |
51,602 (0.35 %) |
119,122 (99.65 %) |
413,378 (6.17 %) |
194,444 (1.21 %) |
6,441,258 (19.39 %) |
19,018 (0.67 %) |
| 26 | budgerigar (v6.3 2021 WashU) GCF_000238935.1 |
25,525 (4.05 %) |
12,196 (1.81 %) |
21,458 (2.10 %) |
25,737 (3.06 %) |
41.25 (97.26 %) |
51,022 (2.75 %) |
70,863 (97.25 %) |
478,340 (9.31 %) |
127,353 (0.54 %) |
5,864,264 (19.05 %) |
15,886 (0.88 %) |
| 27 | budgerigar (maternal 2020 VGP) GCA_012275265.1 |
n/a | 12,645 (1.89 %) |
18,505 (2.70 %) |
n/a | 41.89 (94.20 %) |
388 (5.80 %) |
930 (100.00 %) |
504,674 (9.95 %) |
268,616 (3.12 %) |
5,481,198 (20.78 %) |
20,278 (1.55 %) |
| 28 | budgerigar (maternal Z 2020 refseq VGP) GCF_012275295.1 |
32,026 (4.32 %) |
13,239 (1.87 %) |
23,063 (2.25 %) |
n/a | 41.80 (99.72 %) |
284 (0.28 %) |
864 (100.00 %) |
538,374 (10.19 %) |
279,504 (3.12 %) |
5,874,531 (22.08 %) |
21,155 (1.61 %) |
| 29 | budgerigar (paternal 2020 VGP) GCA_012275275.1 |
n/a | 13,131 (1.94 %) |
19,040 (2.75 %) |
n/a | 41.84 (98.98 %) |
737 (1.02 %) |
330 (100.00 %) |
505,475 (9.66 %) |
231,633 (2.15 %) |
5,778,405 (20.30 %) |
20,205 (1.61 %) |
| 30 | burrowing owl GCF_003259725.1 |
30,559 (4.30 %) |
11,739 (1.72 %) |
17,598 (1.93 %) |
23,983 (2.78 %) |
40.92 (98.92 %) |
33,737 (1.09 %) |
445 (100.00 %) |
502,022 (6.12 %) |
182,281 (0.73 %) |
6,811,984 (19.35 %) |
22,840 (1.08 %) |
| 31 | California condor GCA_018139145.1 |
n/a | 12,650 (1.75 %) |
21,946 (1.95 %) |
n/a | 42.16 (99.97 %) |
632 (0.03 %) |
542 (100.00 %) |
518,393 (6.41 %) |
177,329 (0.88 %) |
7,168,675 (20.31 %) |
34,926 (2.94 %) |
| 32 | carmine bee-eater (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819585.1 |
n/a | 12,368 (1.75 %) |
21,365 (2.81 %) |
n/a | 43.05 (100.00 %) |
n/a | 3,296 (100.00 %) |
542,762 (7.77 %) |
204,389 (1.06 %) |
6,415,832 (21.53 %) |
31,638 (2.54 %) |
| 33 | carmine bee-eater (2019 VGP) GCA_009819595.1 |
n/a | 12,724 (1.82 %) |
20,356 (2.83 %) |
n/a | 42.88 (99.47 %) |
269 (0.53 %) |
109 (100.00 %) |
556,923 (7.87 %) |
213,180 (1.09 %) |
6,641,077 (21.58 %) |
30,884 (2.47 %) |
| 34 | chicken GCF_000002315.6 |
62,183 (8.40 %) |
13,083 (2.31 %) |
23,897 (2.50 %) |
39,251 (5.00 %) |
42.23 (99.08 %) |
952 (0.92 %) |
2,380 (99.08 %) |
699,901 (12.72 %) |
307,144 (2.92 %) |
5,863,131 (21.16 %) |
24,403 (2.57 %) |
| 35 | Chilean tinamou GCF_003342845.1 |
24,894 (4.16 %) |
12,540 (2.09 %) |
23,261 (2.54 %) |
22,489 (2.50 %) |
42.04 (98.74 %) |
1,226,739 (1.39 %) |
2,217 (100.00 %) |
503,525 (5.38 %) |
290,573 (1.50 %) |
5,870,743 (19.53 %) |
44,627 (4.89 %) |
| 36 | chimney swift (M959 v1.1 2014) GCF_000747805.2 |
15,969 (2.53 %) |
12,045 (1.82 %) |
18,580 (2.07 %) |
n/a | 41.40 (96.00 %) |
65,471 (4.02 %) |
84,174 (95.98 %) |
469,979 (5.99 %) |
194,781 (2.21 %) |
6,361,618 (19.70 %) |
12,438 (0.41 %) |
| 37 | chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014) GCF_000700745.2 |
17,193 (2.21 %) |
12,092 (1.49 %) |
28,685 (1.89 %) |
n/a | 40.76 (99.62 %) |
56,333 (0.39 %) |
125,214 (99.61 %) |
516,189 (5.36 %) |
202,882 (1.12 %) |
6,588,198 (20.47 %) |
8,029 (0.24 %) |
| 38 | collared flycatcher GCF_000247815.1 |
28,373 (4.07 %) |
12,197 (1.78 %) |
21,980 (2.17 %) |
n/a | 44.22 (98.57 %) |
11,403 (1.43 %) |
30,843 (98.57 %) |
621,954 (11.73 %) |
597,207 (11.39 %) |
6,656,400 (23.61 %) |
29,879 (1.50 %) |
| 39 | common canary GCF_007115625.1 |
32,998 (4.99 %) |
12,243 (1.89 %) |
23,125 (2.34 %) |
n/a | 42.17 (98.21 %) |
47,138 (1.81 %) |
3,536 (100.00 %) |
487,201 (6.29 %) |
313,951 (2.10 %) |
6,525,604 (19.58 %) |
25,722 (1.90 %) |
| 40 | common cuckoo (VGP 2021) GCA_017976375.1 |
n/a | 13,179 (1.84 %) |
25,859 (2.41 %) |
n/a | 42.18 (99.58 %) |
296 (0.42 %) |
151 (100.00 %) |
521,043 (9.61 %) |
310,469 (2.36 %) |
6,712,849 (21.76 %) |
25,267 (1.71 %) |
| 41 | common starling GCF_001447265.1 |
28,711 (4.57 %) |
12,578 (2.01 %) |
23,288 (2.42 %) |
n/a | 41.49 (97.70 %) |
23,392 (2.31 %) |
22,666 (97.69 %) |
469,830 (5.86 %) |
310,445 (1.74 %) |
6,482,337 (19.49 %) |
23,883 (1.99 %) |
| 42 | common swift GCA_020740795.1 |
n/a | 12,277 (1.88 %) |
20,379 (2.16 %) |
n/a | 41.95 (99.84 %) |
256 (0.16 %) |
109 (100.00 %) |
533,758 (8.66 %) |
199,748 (1.12 %) |
6,353,957 (21.19 %) |
20,393 (1.74 %) |
| 43 | common tern (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819645.1 |
n/a | 12,766 (1.79 %) |
18,154 (2.47 %) |
n/a | 43.24 (100.00 %) |
n/a | 2,235 (100.00 %) |
549,457 (7.58 %) |
204,051 (1.02 %) |
6,880,566 (20.70 %) |
47,340 (3.68 %) |
| 44 | common tern (2019 VGP) GCA_009819605.1 |
n/a | 13,094 (1.80 %) |
17,911 (2.48 %) |
n/a | 43.03 (99.16 %) |
205 (0.84 %) |
123 (100.00 %) |
570,309 (7.91 %) |
216,895 (1.04 %) |
7,043,151 (20.98 %) |
45,683 (3.53 %) |
| 45 | common yellowthroat (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009764545.1 |
n/a | 10,599 (1.76 %) |
16,440 (2.36 %) |
n/a | 41.77 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
4,976 (100.00 %) |
422,886 (5.99 %) |
294,928 (2.71 %) |
5,928,421 (19.76 %) |
21,397 (1.91 %) |
| 46 | common yellowthroat (2019 VGP) GCA_009764595.1 |
n/a | 11,736 (1.82 %) |
16,696 (2.52 %) |
n/a | 42.01 (98.73 %) |
1,479 (1.27 %) |
278 (100.00 %) |
476,046 (6.38 %) |
367,108 (3.16 %) |
6,576,957 (20.43 %) |
25,004 (2.02 %) |
| 47 | crested ibis GCF_000708225.1 |
17,147 (2.52 %) |
12,801 (1.77 %) |
21,346 (1.99 %) |
n/a | 41.83 (97.20 %) |
70,475 (2.81 %) |
130,030 (97.19 %) |
517,127 (5.90 %) |
182,744 (0.97 %) |
7,244,849 (18.69 %) |
39,155 (2.05 %) |
| 48 | cuckoo roller GCF_000691785.1 |
16,484 (2.21 %) |
12,190 (1.53 %) |
27,315 (1.84 %) |
n/a | 41.82 (99.74 %) |
56,010 (0.27 %) |
113,170 (99.73 %) |
435,835 (5.75 %) |
131,678 (0.66 %) |
6,778,773 (18.46 %) |
35,090 (1.44 %) |
| 49 | Dalmatian pelican GCF_000687375.1 |
16,438 (2.13 %) |
11,926 (1.44 %) |
26,715 (1.76 %) |
n/a | 41.39 (99.65 %) |
57,580 (0.36 %) |
121,562 (99.64 %) |
502,899 (6.52 %) |
159,315 (0.83 %) |
6,832,864 (19.52 %) |
25,648 (0.91 %) |
| 50 | downy woodpecker (VGP 2020) GCA_014839835.1 |
n/a | 12,405 (1.70 %) |
23,073 (2.18 %) |
n/a | 45.31 (99.66 %) |
187 (0.34 %) |
181 (100.00 %) |
1,008,118 (21.51 %) |
378,537 (3.38 %) |
5,846,717 (32.04 %) |
26,005 (1.75 %) |
| 51 | East African grey crowned-crane GCF_000709895.1 |
16,274 (2.23 %) |
12,032 (1.55 %) |
26,131 (1.84 %) |
n/a | 41.21 (99.65 %) |
58,359 (0.36 %) |
111,850 (99.64 %) |
374,845 (4.51 %) |
130,655 (0.66 %) |
6,753,184 (18.86 %) |
26,202 (0.96 %) |
| 52 | East African grey crowned-crane (alt pseudohaplotyp 2020 VGP) GCA_011004865.1 |
n/a | 11,782 (1.88 %) |
18,687 (2.68 %) |
n/a | 42.41 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
971 (100.00 %) |
457,927 (6.40 %) |
150,544 (0.85 %) |
6,074,490 (20.16 %) |
33,314 (3.59 %) |
| 53 | East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020 VGP) GCA_011004875.1 |
n/a | 13,263 (1.84 %) |
20,787 (2.66 %) |
n/a | 42.38 (99.61 %) |
144 (0.39 %) |
105 (100.00 %) |
548,859 (7.06 %) |
187,966 (0.97 %) |
7,004,597 (21.19 %) |
36,610 (3.33 %) |
| 54 | emperor penguin GCF_000699145.1 |
20,055 (3.28 %) |
12,518 (1.77 %) |
19,763 (1.95 %) |
n/a | 41.62 (94.30 %) |
72,501 (5.72 %) |
83,173 (94.28 %) |
494,422 (5.57 %) |
200,181 (2.24 %) |
7,154,684 (17.95 %) |
31,615 (1.38 %) |
| 55 | emu (2018) GCF_003342905.1 |
36,060 (5.11 %) |
12,857 (1.77 %) |
21,489 (1.99 %) |
33,416 (3.44 %) |
41.63 (99.02 %) |
1,408,082 (1.11 %) |
2,778 (100.00 %) |
453,024 (4.18 %) |
175,539 (0.70 %) |
7,218,815 (17.59 %) |
43,742 (4.47 %) |
| 56 | emu (2020) GCA_016128335.1 |
n/a | 13,181 (1.74 %) |
24,708 (2.10 %) |
n/a | 42.41 (100.00 %) |
512 (0.00 %) |
802 (100.00 %) |
504,527 (4.38 %) |
259,276 (2.59 %) |
7,105,965 (19.15 %) |
41,784 (5.52 %) |
| 57 | Eurasian nightjar GCA_907165065.1 |
n/a | 13,040 (1.86 %) |
22,823 (2.21 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
153 (0.00 %) |
121 (100.00 %) |
595,803 (8.38 %) |
248,128 (1.78 %) |
6,744,611 (22.18 %) |
24,805 (1.90 %) |
| 58 | Eurasian tree sparrow GCF_014805655.1 |
43,477 (5.70 %) |
12,550 (1.95 %) |
24,541 (2.43 %) |
n/a | 42.02 (99.82 %) |
4,765 (0.18 %) |
18,975 (100.00 %) |
464,973 (6.08 %) |
492,684 (3.98 %) |
6,663,773 (20.49 %) |
28,741 (2.30 %) |
| 59 | European golden plover GCA_017639485.1 |
n/a | 12,984 (1.78 %) |
22,854 (2.04 %) |
n/a | 42.70 (99.01 %) |
268 (0.99 %) |
107 (100.00 %) |
558,587 (8.35 %) |
180,400 (0.83 %) |
7,132,381 (21.18 %) |
40,661 (3.41 %) |
| 60 | European robin GCA_903797595.2 |
n/a | 12,344 (1.85 %) |
23,934 (2.37 %) |
n/a | 42.10 (99.97 %) |
990 (0.03 %) |
1,119 (100.00 %) |
532,973 (5.96 %) |
401,820 (3.43 %) |
6,320,210 (21.42 %) |
30,391 (2.60 %) |
| 61 | European turtle dove (alt pseudohaplotype v1.1 2019 VGP) GCA_901699165.1 |
n/a | 11,266 (1.79 %) |
17,283 (2.48 %) |
n/a | 41.73 (100.00 %) |
n/a | 3,333 (100.00 %) |
466,564 (7.08 %) |
182,345 (0.97 %) |
6,037,183 (20.24 %) |
29,648 (2.35 %) |
| 62 | European turtle dove (v1.2 2021 VGP) GCA_901699155.2 |
n/a | 12,391 (1.76 %) |
23,333 (2.17 %) |
n/a | 41.84 (99.67 %) |
940 (0.33 %) |
311 (100.00 %) |
550,895 (7.50 %) |
227,532 (1.16 %) |
6,767,530 (21.05 %) |
34,682 (2.57 %) |
| 63 | garden warbler GCA_014839755.1 |
n/a | 12,520 (1.95 %) |
23,459 (2.46 %) |
n/a | 42.08 (99.82 %) |
134 (0.18 %) |
176 (100.00 %) |
491,810 (6.09 %) |
376,746 (2.55 %) |
6,461,292 (20.23 %) |
27,799 (2.40 %) |
| 64 | golden-collared manakin GCF_001715985.3 |
27,575 (4.33 %) |
11,800 (1.85 %) |
19,868 (2.19 %) |
n/a | 41.42 (97.44 %) |
20,874 (2.57 %) |
3,619 (100.00 %) |
455,868 (6.95 %) |
197,843 (1.19 %) |
6,198,932 (18.50 %) |
18,804 (1.03 %) |
| 65 | golden eagle (2019 VGP) GCA_902153765.1 |
n/a | 9,330 (1.81 %) |
14,414 (2.43 %) |
n/a | 42.53 (99.93 %) |
39 (0.07 %) |
3,860 (100.00 %) |
356,281 (6.03 %) |
123,430 (0.80 %) |
4,417,887 (19.25 %) |
28,919 (3.52 %) |
| 66 | golden eagle (v1.4 2021 VGP) GCF_900496995.4 |
60,920 (5.98 %) |
13,334 (1.84 %) |
23,261 (2.12 %) |
n/a | 42.16 (99.58 %) |
228 (0.42 %) |
144 (100.00 %) |
544,341 (5.93 %) |
186,461 (0.80 %) |
7,090,610 (20.01 %) |
38,495 (3.10 %) |
| 67 | golden pheasant GCA_003413605.1 |
n/a | 12,891 (2.28 %) |
21,429 (2.37 %) |
n/a | 40.87 (97.55 %) |
51,170 (2.47 %) |
65,464 (97.53 %) |
541,931 (8.01 %) |
249,405 (2.01 %) |
6,173,989 (19.98 %) |
22,227 (1.31 %) |
| 68 | great cormorant GCF_000708925.1 |
15,472 (2.07 %) |
11,539 (1.44 %) |
25,114 (1.69 %) |
n/a | 41.28 (99.25 %) |
98,475 (0.77 %) |
162,787 (99.23 %) |
403,514 (5.73 %) |
144,409 (1.43 %) |
6,724,538 (18.06 %) |
14,330 (0.42 %) |
| 69 | great potoo GCA_013368605.1 |
n/a | 13,116 (1.77 %) |
23,657 (2.10 %) |
n/a | 42.67 (99.51 %) |
243 (0.49 %) |
191 (100.00 %) |
514,142 (9.71 %) |
210,381 (1.13 %) |
6,501,989 (23.95 %) |
35,785 (2.69 %) |
| 70 | great tit GCF_001522545.3 |
46,622 (6.92 %) |
12,240 (2.00 %) |
22,301 (2.39 %) |
35,277 (4.08 %) |
41.37 (98.24 %) |
24,615 (1.76 %) |
24,044 (98.24 %) |
454,833 (5.84 %) |
249,384 (1.36 %) |
6,330,291 (19.11 %) |
23,876 (1.88 %) |
| 71 | greater prairie chicken GCA_001870855.1 |
n/a | 12,923 (2.36 %) |
24,062 (2.50 %) |
n/a | 41.23 (99.63 %) |
48,408 (0.39 %) |
60,594 (99.61 %) |
544,139 (7.50 %) |
214,682 (0.99 %) |
6,153,628 (19.86 %) |
23,154 (2.26 %) |
| 72 | greater rhea GCA_003343005.1 |
n/a | 12,895 (1.81 %) |
20,976 (2.06 %) |
n/a | 40.79 (98.79 %) |
2,075,293 (1.40 %) |
2,162 (100.00 %) |
509,589 (0.00 %) |
196,258 (0.73 %) |
6,982,184 (18.70 %) |
41,811 (3.95 %) |
| 73 | greater sage-grouse GCF_019232065.1 |
36,656 (5.50 %) |
12,419 (2.36 %) |
21,319 (2.40 %) |
n/a | 41.16 (96.34 %) |
9,894 (3.66 %) |
1,502 (100.00 %) |
574,006 (8.05 %) |
196,630 (0.72 %) |
5,996,002 (19.65 %) |
18,807 (1.81 %) |
| 74 | green peafowl GCA_016647715.1 |
n/a | 12,897 (2.25 %) |
23,427 (2.41 %) |
n/a | 41.73 (98.15 %) |
32,668 (1.85 %) |
2,446 (100.00 %) |
481,865 (6.04 %) |
188,685 (1.04 %) |
6,268,032 (20.57 %) |
22,330 (1.85 %) |
| 75 | gyrfalcon (2020 VGP) GCF_015220075.1 |
47,961 (5.90 %) |
13,016 (1.82 %) |
21,266 (2.02 %) |
n/a | 42.20 (99.55 %) |
635 (0.45 %) |
133 (100.00 %) |
484,104 (5.60 %) |
186,430 (0.85 %) |
7,162,723 (18.83 %) |
24,760 (2.03 %) |
| 76 | Hawaiian crow (VGP 2021 refseq) GCF_020740725.1 |
51,593 (6.18 %) |
12,739 (1.83 %) |
23,664 (2.30 %) |
n/a | 43.30 (99.84 %) |
294 (0.16 %) |
188 (100.00 %) |
409,129 (0.00 %) |
304,680 (5.73 %) |
5,953,375 (23.59 %) |
46,118 (3.85 %) |
| 77 | helmeted guineafowl GCF_002078875.1 |
55,448 (7.96 %) |
12,853 (2.28 %) |
23,033 (2.43 %) |
40,117 (4.15 %) |
41.73 (98.08 %) |
15,598 (1.93 %) |
2,739 (100.00 %) |
499,793 (7.93 %) |
173,056 (0.98 %) |
6,144,176 (20.18 %) |
26,577 (2.39 %) |
| 78 | hoatzin GCF_000692075.1 |
14,928 (2.31 %) |
11,457 (1.65 %) |
18,868 (1.85 %) |
n/a | 42.42 (94.92 %) |
99,371 (5.11 %) |
109,627 (94.89 %) |
444,852 (7.40 %) |
145,440 (1.01 %) |
6,679,356 (18.72 %) |
40,581 (1.42 %) |
| 79 | hooded crow (2021) GCF_000738735.5 |
42,799 (57.51 %) |
11,845 (1.92 %) |
20,738 (2.23 %) |
n/a | 42.10 (99.68 %) |
425 (0.32 %) |
47 (100.00 %) |
421,463 (6.12 %) |
164,830 (0.93 %) |
6,148,741 (19.00 %) |
25,266 (2.09 %) |
| 80 | jackdaw GCA_013407035.1 |
n/a | 12,072 (1.93 %) |
20,925 (2.08 %) |
n/a | 42.15 (99.72 %) |
511 (0.28 %) |
41 (100.00 %) |
428,760 (6.13 %) |
173,436 (1.02 %) |
6,231,317 (19.25 %) |
26,177 (2.17 %) |
| 81 | Japanese quail GCF_001577835.2 |
49,210 (7.77 %) |
12,864 (2.54 %) |
22,540 (2.69 %) |
37,604 (4.36 %) |
41.28 (98.88 %) |
11,601 (1.12 %) |
9,642 (98.88 %) |
559,601 (7.91 %) |
321,128 (2.22 %) |
5,497,911 (19.81 %) |
17,977 (1.86 %) |
| 82 | kakapo (Jane alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_004011185.1 |
n/a | 3,251 (1.65 %) |
5,389 (2.18 %) |
n/a | 41.74 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
3,728 (100.00 %) |
127,814 (7.83 %) |
53,447 (1.21 %) |
1,502,789 (18.09 %) |
5,487 (1.71 %) |
| 83 | kakapo (Jane v2 2020 refseq VGP) GCF_004027225.2 |
49,757 (5.76 %) |
13,102 (1.92 %) |
17,781 (2.51 %) |
n/a | 41.97 (99.08 %) |
373 (0.92 %) |
89 (100.00 %) |
517,233 (7.76 %) |
208,178 (1.08 %) |
6,258,087 (20.50 %) |
22,279 (1.79 %) |
| 84 | kea GCF_000696875.1 |
15,953 (2.35 %) |
11,982 (1.66 %) |
25,022 (1.97 %) |
n/a | 41.09 (99.60 %) |
51,381 (0.42 %) |
93,561 (99.58 %) |
450,515 (6.55 %) |
138,157 (0.75 %) |
5,905,331 (18.06 %) |
7,218 (0.22 %) |
| 85 | killdeer GCF_000708025.1 |
16,480 (2.43 %) |
12,353 (1.72 %) |
20,433 (1.94 %) |
n/a | 41.88 (97.24 %) |
63,995 (2.78 %) |
79,162 (97.22 %) |
528,556 (7.11 %) |
167,406 (0.94 %) |
7,070,701 (19.44 %) |
37,082 (1.57 %) |
| 86 | lance-tailed manakin (2020 VGP) GCF_009829145.1 |
46,366 (5.56 %) |
12,580 (1.91 %) |
16,669 (2.52 %) |
n/a | 41.97 (99.70 %) |
206 (0.30 %) |
93 (100.00 %) |
494,225 (7.09 %) |
247,189 (1.64 %) |
6,498,294 (20.04 %) |
25,376 (1.95 %) |
| 87 | lance-tailed manakin (alt pseudohaplotype 2020 VGP) GCA_009829205.1 |
n/a | 12,270 (1.85 %) |
18,043 (2.51 %) |
n/a | 42.20 (100.00 %) |
n/a | 4,269 (100.00 %) |
472,381 (7.01 %) |
237,680 (1.65 %) |
6,121,661 (19.48 %) |
25,589 (2.05 %) |
| 88 | lesser kestrel (v2 2021 VGP) GCF_017639655.2 |
47,420 (5.64 %) |
13,098 (1.80 %) |
22,203 (2.07 %) |
n/a | 42.30 (99.66 %) |
298 (0.34 %) |
291 (100.00 %) |
516,499 (5.58 %) |
210,234 (1.26 %) |
7,133,934 (19.19 %) |
27,558 (2.21 %) |
| 89 | lesser rhea GCA_003342835.1 |
n/a | 13,105 (1.81 %) |
25,654 (2.45 %) |
n/a | 40.86 (98.66 %) |
1,039,616 (1.43 %) |
3,019 (100.00 %) |
522,333 (5.61 %) |
208,867 (0.79 %) |
7,080,214 (19.15 %) |
42,016 (4.35 %) |
| 90 | little egret GCF_000687185.1 |
15,986 (2.42 %) |
12,165 (1.72 %) |
19,101 (1.90 %) |
n/a | 42.25 (95.99 %) |
88,871 (4.04 %) |
100,662 (95.96 %) |
502,442 (6.71 %) |
165,380 (1.23 %) |
6,955,585 (18.98 %) |
31,136 (1.15 %) |
| 91 | Macqueen's bustard GCF_000695195.1 |
15,790 (2.21 %) |
11,627 (1.51 %) |
26,301 (1.84 %) |
n/a | 41.10 (99.68 %) |
56,130 (0.33 %) |
115,823 (99.67 %) |
474,904 (5.88 %) |
148,075 (0.90 %) |
6,682,530 (20.03 %) |
27,675 (1.15 %) |
| 92 | maguari stor GCA_017639555.1 |
n/a | 12,905 (1.81 %) |
22,204 (2.01 %) |
n/a | 42.12 (98.21 %) |
232 (1.79 %) |
153 (100.00 %) |
485,318 (6.35 %) |
184,992 (0.78 %) |
7,064,965 (19.56 %) |
31,653 (3.02 %) |
| 93 | mallard CAU_Wild1.0 GCA_008746955.1 |
n/a | 13,260 (1.85 %) |
25,071 (2.17 %) |
n/a | 42.41 (99.90 %) |
318 (0.10 %) |
1,665 (100.00 %) |
849,782 (8.18 %) |
438,622 (5.10 %) |
6,729,782 (25.03 %) |
34,670 (3.03 %) |
| 94 | mallard PBH1.5 GCF_003850225.1 |
54,114 (7.47 %) |
12,188 (1.85 %) |
22,452 (2.19 %) |
n/a | 41.63 (99.77 %) |
71,703 (0.26 %) |
2,150 (100.00 %) |
781,333 (8.08 %) |
357,617 (3.09 %) |
6,587,406 (21.92 %) |
29,913 (2.33 %) |
| 95 | mallard ZJU1.0 GCF_015476345.1 |
59,854 (7.33 %) |
12,988 (1.87 %) |
23,709 (2.20 %) |
n/a | 42.27 (99.64 %) |
905 (0.36 %) |
756 (100.00 %) |
803,558 (8.04 %) |
417,575 (5.02 %) |
6,627,843 (24.59 %) |
35,030 (3.06 %) |
| 96 | Mariana crow GCF_017639235.1 |
48,460 (7.00 %) |
12,506 (1.97 %) |
22,580 (2.35 %) |
n/a | 42.14 (98.94 %) |
10,579 (1.06 %) |
1,443 (100.00 %) |
434,280 (5.91 %) |
169,629 (0.82 %) |
6,323,058 (18.94 %) |
27,390 (2.04 %) |
| 97 | medium ground-finch GCF_000277835.1 |
22,226 (4.24 %) |
11,894 (1.83 %) |
20,388 (2.17 %) |
23,200 (3.08 %) |
41.61 (97.77 %) |
68,589 (2.25 %) |
95,828 (97.75 %) |
441,359 (5.86 %) |
322,831 (2.24 %) |
6,548,136 (19.49 %) |
18,135 (0.69 %) |
| 98 | monk parakeet GCA_017639245.1 |
n/a | 13,067 (1.85 %) |
n/a | n/a | 42.29 (99.99 %) |
352 (0.01 %) |
291 (100.00 %) |
582,436 (9.49 %) |
253,709 (2.79 %) |
5,820,920 (22.52 %) |
23,101 (1.75 %) |
| 99 | mute swan (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009769485.1 |
n/a | 10,070 (1.97 %) |
14,255 (2.46 %) |
n/a | 42.22 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
5,616 (100.00 %) |
485,824 (7.06 %) |
212,892 (1.28 %) |
4,756,962 (19.95 %) |
25,662 (3.69 %) |
| 100 | mute swan (v2 2021 VGP) GCF_009769625.2 |
59,524 (6.76 %) |
12,983 (1.98 %) |
22,400 (2.22 %) |
n/a | 41.92 (99.13 %) |
451 (0.87 %) |
171 (100.00 %) |
700,051 (7.55 %) |
301,579 (1.34 %) |
6,791,838 (21.30 %) |
31,278 (3.07 %) |
| 101 | New Caledonian crow (2019 VGP) GCF_009650955.1 |
50,821 (6.95 %) |
12,735 (1.93 %) |
17,289 (2.60 %) |
n/a | 42.57 (97.41 %) |
289 (2.59 %) |
105 (100.00 %) |
460,676 (6.16 %) |
231,546 (1.70 %) |
6,265,995 (19.54 %) |
31,907 (2.46 %) |
| 102 | New Caledonian crow (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009651025.1 |
n/a | 11,089 (1.99 %) |
15,330 (2.65 %) |
n/a | 42.67 (100.00 %) |
n/a | 894 (100.00 %) |
377,047 (6.03 %) |
178,064 (1.53 %) |
5,305,126 (19.49 %) |
26,106 (2.51 %) |
| 103 | northern bobwhite GCA_008692595.2 |
n/a | 12,584 (2.37 %) |
22,327 (2.53 %) |
n/a | 41.41 (99.04 %) |
33,134 (0.97 %) |
39,169 (99.03 %) |
460,369 (4.63 %) |
213,800 (1.34 %) |
5,813,961 (19.54 %) |
22,156 (2.37 %) |
| 104 | northern fulmar GCF_000690835.1 |
16,383 (2.20 %) |
11,963 (1.50 %) |
26,299 (1.77 %) |
n/a | 41.17 (99.50 %) |
54,825 (0.51 %) |
112,214 (99.49 %) |
436,850 (5.16 %) |
146,735 (0.83 %) |
6,838,937 (18.42 %) |
24,859 (0.79 %) |
| 105 | Okarito brown kiwi GCF_003343035.1 |
43,838 (4.59 %) |
13,227 (1.76 %) |
22,482 (2.03 %) |
31,718 (2.89 %) |
41.52 (98.49 %) |
696,987 (1.57 %) |
4,120 (100.00 %) |
494,809 (4.85 %) |
178,540 (0.70 %) |
7,407,982 (18.33 %) |
43,062 (4.56 %) |
| 106 | peregrine falcon GCF_000337955.1 |
37,519 (5.42 %) |
12,666 (1.80 %) |
19,285 (1.99 %) |
n/a | 41.77 (98.44 %) |
76,069 (1.58 %) |
83,081 (98.42 %) |
447,274 (5.23 %) |
170,160 (0.93 %) |
7,157,857 (18.38 %) |
22,325 (0.89 %) |
| 107 | plumbeous ibis GCA_020745775.1 |
n/a | 13,028 (1.84 %) |
22,722 (2.10 %) |
n/a | 42.37 (99.81 %) |
104 (0.19 %) |
88 (100.00 %) |
488,030 (6.66 %) |
188,606 (1.01 %) |
6,982,793 (20.08 %) |
32,920 (3.37 %) |
| 108 | razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP) GCA_008658365.1 |
n/a | 12,776 (1.83 %) |
16,521 (2.42 %) |
n/a | 42.67 (99.70 %) |
227 (0.30 %) |
95 (100.00 %) |
543,514 (7.16 %) |
212,546 (1.12 %) |
6,930,708 (20.10 %) |
38,955 (2.90 %) |
| 109 | razorbill (alt pseudohaplotype 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019 VGP) GCA_008658355.1 |
n/a | 12,926 (1.74 %) |
18,313 (2.36 %) |
n/a | 42.61 (100.00 %) |
n/a | 3,309 (100.00 %) |
562,546 (7.14 %) |
210,852 (1.04 %) |
7,264,995 (20.26 %) |
40,925 (2.86 %) |
| 110 | red-crested turaco (2019 VGP) GCA_009769465.1 |
n/a | 12,726 (1.75 %) |
21,173 (2.64 %) |
n/a | 42.60 (97.89 %) |
344 (2.11 %) |
140 (100.00 %) |
551,882 (8.95 %) |
176,530 (0.80 %) |
6,805,042 (22.19 %) |
43,046 (3.29 %) |
| 111 | red-crested turaco (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009764505.1 |
n/a | 11,230 (1.70 %) |
19,839 (2.60 %) |
n/a | 42.64 (100.00 %) |
n/a | 3,476 (100.00 %) |
482,814 (8.51 %) |
153,169 (0.81 %) |
5,919,109 (21.87 %) |
39,761 (3.33 %) |
| 112 | red-fronted tinkerbird GCA_015220805.1 |
n/a | 12,345 (1.60 %) |
23,206 (2.02 %) |
n/a | 45.96 (99.53 %) |
307 (0.47 %) |
253 (100.00 %) |
1,082,064 (22.90 %) |
378,866 (4.28 %) |
6,003,548 (35.88 %) |
26,519 (1.76 %) |
| 113 | red-legged partridge GCA_019345075.1 |
n/a | 12,441 (2.23 %) |
20,933 (2.29 %) |
n/a | 41.44 (96.96 %) |
18,534 (3.05 %) |
29,132 (96.95 %) |
543,702 (6.02 %) |
222,583 (0.97 %) |
5,978,744 (20.17 %) |
19,970 (0.97 %) |
| 114 | red-legged seriema (2019 VGP) GCA_009819825.1 |
n/a | 13,220 (1.83 %) |
19,960 (2.64 %) |
n/a | 42.20 (99.59 %) |
194 (0.41 %) |
110 (100.00 %) |
483,781 (6.50 %) |
160,481 (0.73 %) |
6,960,060 (19.71 %) |
32,894 (2.67 %) |
| 115 | red-legged seriema (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819485.1 |
n/a | 10,125 (1.77 %) |
16,337 (2.56 %) |
n/a | 42.28 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,840 (100.00 %) |
366,588 (6.01 %) |
117,928 (0.90 %) |
5,340,048 (18.90 %) |
26,292 (2.86 %) |
| 116 | red-throated loon GCF_000690875.1 |
15,842 (2.14 %) |
11,586 (1.46 %) |
25,291 (1.71 %) |
n/a | 41.12 (99.40 %) |
64,882 (0.61 %) |
126,713 (99.39 %) |
382,153 (4.85 %) |
123,593 (0.80 %) |
6,849,573 (18.22 %) |
17,100 (0.51 %) |
| 117 | rhinoceros hornbill GCF_000710305.1 |
15,595 (2.24 %) |
11,495 (1.55 %) |
25,766 (1.88 %) |
n/a | 42.65 (98.44 %) |
118,543 (1.60 %) |
180,800 (98.40 %) |
271,331 (3.93 %) |
134,645 (1.25 %) |
6,383,631 (17.75 %) |
24,531 (0.79 %) |
| 118 | rifleman (VGP 2021) GCA_016904835.1 |
n/a | 12,620 (1.92 %) |
24,568 (2.61 %) |
n/a | 42.41 (99.61 %) |
195 (0.39 %) |
206 (100.00 %) |
495,673 (9.14 %) |
253,008 (2.04 %) |
5,936,177 (19.93 %) |
20,145 (1.83 %) |
| 119 | ring-necked pheasant GCF_004143745.1 |
33,234 (6.38 %) |
13,027 (2.34 %) |
23,759 (2.47 %) |
35,359 (4.02 %) |
41.21 (99.22 %) |
19,995 (0.78 %) |
39,678 (100.00 %) |
600,071 (8.12 %) |
291,437 (1.68 %) |
6,237,616 (20.77 %) |
22,362 (2.11 %) |
| 120 | rock pigeon GCF_000337935.1 |
52,382 (6.40 %) |
12,581 (1.87 %) |
21,539 (2.18 %) |
n/a | 41.48 (98.13 %) |
85,176 (1.90 %) |
100,099 (98.10 %) |
491,972 (6.86 %) |
268,561 (1.86 %) |
6,408,260 (19.42 %) |
29,800 (1.40 %) |
| 121 | ruddy duck GCF_011077185.1 |
50,326 (5.76 %) |
13,124 (1.98 %) |
23,592 (2.23 %) |
n/a | 41.82 (97.27 %) |
18,437 (2.73 %) |
28,026 (97.27 %) |
808,998 (7.97 %) |
389,509 (1.34 %) |
6,722,581 (21.16 %) |
34,567 (3.30 %) |
| 122 | ruff GCF_001431845.1 |
34,257 (4.61 %) |
12,986 (1.78 %) |
24,061 (2.27 %) |
35,218 (3.59 %) |
42.45 (96.26 %) |
30,404 (3.75 %) |
34,157 (96.25 %) |
598,312 (7.84 %) |
337,661 (3.70 %) |
7,220,063 (20.45 %) |
27,939 (1.42 %) |
| 123 | rufous-necked snowfinch GCF_017590135.1 |
35,381 (4.92 %) |
12,603 (1.95 %) |
24,965 (2.42 %) |
n/a | 42.00 (99.80 %) |
5,524 (0.20 %) |
24,055 (100.00 %) |
514,274 (6.32 %) |
411,146 (2.77 %) |
6,584,761 (19.85 %) |
29,372 (2.28 %) |
| 124 | saffron-crested tyrant-manakin GCF_003984885.1 |
45,898 (5.06 %) |
12,904 (1.85 %) |
26,943 (2.32 %) |
n/a | 42.28 (99.01 %) |
15,342 (0.99 %) |
38,089 (100.00 %) |
506,451 (7.11 %) |
333,391 (1.97 %) |
6,646,625 (20.87 %) |
32,671 (2.19 %) |
| 125 | Saker falcon GCF_000337975.1 |
36,497 (5.34 %) |
12,576 (1.78 %) |
18,758 (1.96 %) |
n/a | 41.71 (98.00 %) |
70,035 (2.03 %) |
75,898 (97.97 %) |
447,504 (5.26 %) |
166,251 (1.03 %) |
7,121,848 (18.23 %) |
19,927 (0.72 %) |
| 126 | small tree finch (2019) GCF_901933205.1 |
30,090 (4.91 %) |
12,639 (1.95 %) |
23,859 (2.40 %) |
24,423 (3.59 %) |
42.38 (99.99 %) |
185 (0.01 %) |
1,527 (99.99 %) |
465,333 (5.96 %) |
477,426 (4.49 %) |
6,482,932 (22.03 %) |
27,270 (2.38 %) |
| 127 | small tree finch (2020) GCA_902806625.1 |
n/a | 12,662 (1.93 %) |
23,695 (2.34 %) |
n/a | 42.49 (99.99 %) |
224 (0.01 %) |
1,951 (99.99 %) |
458,154 (6.01 %) |
482,974 (4.97 %) |
6,466,067 (22.21 %) |
27,890 (2.42 %) |
| 128 | South Island takahe (VGP alternate 2021) GCA_020801775.1 |
n/a | 12,655 (1.70 %) |
n/a | n/a | 43.63 (99.16 %) |
238 (0.84 %) |
178 (100.00 %) |
554,912 (9.42 %) |
230,808 (4.34 %) |
6,406,358 (24.83 %) |
22,941 (1.98 %) |
| 129 | South Island takahe (VGP primary 2021) GCA_020800305.1 |
n/a | 12,942 (1.69 %) |
23,221 (2.13 %) |
n/a | 43.74 (99.58 %) |
327 (0.42 %) |
174 (100.00 %) |
577,553 (9.77 %) |
259,017 (5.20 %) |
6,430,968 (25.90 %) |
23,810 (2.02 %) |
| 130 | speckled mousebird GCF_000690715.1 |
15,894 (2.09 %) |
11,557 (1.44 %) |
27,937 (1.84 %) |
n/a | 40.95 (99.65 %) |
44,462 (0.35 %) |
114,650 (99.65 %) |
425,255 (7.62 %) |
154,693 (1.27 %) |
6,152,475 (19.42 %) |
7,821 (0.23 %) |
| 131 | sunbittern GCF_000690775.1 |
15,772 (2.11 %) |
11,549 (1.45 %) |
27,111 (1.82 %) |
n/a | 42.33 (99.55 %) |
52,471 (0.46 %) |
115,170 (99.54 %) |
420,590 (6.32 %) |
117,881 (0.88 %) |
6,391,987 (18.82 %) |
32,970 (1.31 %) |
| 132 | Suruca trogon GCA_020746105.1 |
n/a | 12,884 (1.85 %) |
23,805 (2.23 %) |
n/a | 42.80 (99.12 %) |
253 (0.88 %) |
182 (100.00 %) |
539,771 (9.26 %) |
181,564 (1.14 %) |
6,538,228 (22.49 %) |
41,376 (3.37 %) |
| 133 | Swainson's thrush (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819505.1 |
n/a | 13,406 (1.85 %) |
20,402 (2.61 %) |
n/a | 42.86 (100.00 %) |
13 (0.00 %) |
3,601 (100.00 %) |
497,371 (5.78 %) |
649,859 (4.89 %) |
6,740,713 (22.65 %) |
49,076 (3.54 %) |
| 134 | Swainson's thrush (v2 2020 VGP) GCF_009819885.2 |
40,121 (5.41 %) |
13,004 (1.87 %) |
24,795 (2.41 %) |
n/a | 42.48 (98.86 %) |
429 (1.14 %) |
160 (100.00 %) |
493,071 (5.80 %) |
589,858 (4.32 %) |
6,708,638 (22.44 %) |
49,404 (3.53 %) |
| 135 | swan goose (Sichuan white goose 2017) GCF_002166845.1 |
62,728 (8.50 %) |
12,903 (1.98 %) |
21,943 (2.24 %) |
n/a | 41.68 (97.40 %) |
63,061 (2.62 %) |
64,863 (97.38 %) |
590,350 (4.68 %) |
253,525 (1.38 %) |
6,926,961 (19.71 %) |
40,011 (3.69 %) |
| 136 | swan goose (Tianfu 2020) GCA_013030995.1 |
n/a | 12,965 (1.97 %) |
25,182 (2.35 %) |
n/a | 42.15 (99.99 %) |
716 (0.01 %) |
2,119 (100.00 %) |
650,271 (7.44 %) |
270,668 (1.26 %) |
6,776,820 (21.19 %) |
35,560 (4.27 %) |
| 137 | swan goose (Zhedong 2015) GCF_000971095.1 |
43,215 (5.89 %) |
12,148 (1.89 %) |
19,386 (2.07 %) |
n/a | 41.36 (96.87 %) |
84,351 (3.16 %) |
91,944 (96.84 %) |
481,707 (5.57 %) |
230,143 (1.26 %) |
6,665,312 (19.42 %) |
38,930 (2.06 %) |
| 138 | Tibetan ground-tit GCF_000331425.1 |
28,749 (4.57 %) |
12,828 (2.02 %) |
24,003 (2.49 %) |
n/a | 41.69 (98.76 %) |
21,646 (1.24 %) |
27,052 (98.76 %) |
476,955 (6.01 %) |
346,281 (2.29 %) |
6,423,932 (19.90 %) |
27,086 (2.31 %) |
| 139 | tufted duck (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819845.1 |
n/a | 12,108 (2.02 %) |
15,241 (2.53 %) |
n/a | 41.71 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
780 (100.00 %) |
732,314 (7.82 %) |
353,660 (1.57 %) |
6,119,549 (21.70 %) |
27,919 (2.56 %) |
| 140 | tufted duck (2019 VGP) GCF_009819795.1 |
29,505 (4.02 %) |
12,959 (1.97 %) |
16,252 (2.50 %) |
n/a | 41.66 (99.16 %) |
163 (0.84 %) |
105 (100.00 %) |
836,786 (8.36 %) |
411,356 (1.71 %) |
6,691,445 (22.36 %) |
29,883 (2.48 %) |
| 141 | turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014) GCF_000146605.3 |
38,427 (6.01 %) |
13,095 (1.96 %) |
23,974 (2.27 %) |
n/a | 41.35 (96.83 %) |
65,045 (3.16 %) |
250,220 (96.84 %) |
609,750 (9.03 %) |
243,534 (1.26 %) |
6,043,889 (21.06 %) |
31,818 (1.42 %) |
| 142 | turkey (WU_HG_1 2021) GCA_905368555.1 |
n/a | 12,910 (2.37 %) |
23,038 (2.58 %) |
n/a | 41.12 (100.00 %) |
81 (0.00 %) |
151 (100.00 %) |
618,023 (8.91 %) |
227,783 (1.43 %) |
6,123,721 (21.03 %) |
20,379 (2.19 %) |
| 143 | whiskered treeswift GCA_020745705.1 |
n/a | 12,681 (1.84 %) |
21,784 (2.14 %) |
n/a | 42.12 (99.13 %) |
218 (0.87 %) |
146 (100.00 %) |
520,200 (9.32 %) |
170,778 (0.83 %) |
6,455,910 (21.44 %) |
24,061 (1.62 %) |
| 144 | white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v2 VGP 2021) GCF_016700215.2 |
83,834 (10.16 %) |
13,005 (2.32 %) |
23,329 (2.48 %) |
n/a | 42.16 (99.57 %) |
409 (0.43 %) |
685 (99.57 %) |
536,869 (6.00 %) |
268,230 (2.28 %) |
5,845,184 (20.93 %) |
24,409 (2.60 %) |
| 145 | white leghorn X broiler chicken (broiler haplotype 2021 VGP) GCF_016699485.2 |
74,716 (9.14 %) |
13,128 (2.33 %) |
23,484 (2.48 %) |
n/a | 42.20 (99.68 %) |
463 (0.32 %) |
677 (99.68 %) |
697,827 (12.53 %) |
290,892 (2.63 %) |
5,887,021 (21.30 %) |
24,469 (2.59 %) |
| 146 | white wagtail GCF_015832195.1 |
47,145 (6.80 %) |
12,127 (1.86 %) |
22,301 (2.31 %) |
n/a | 42.72 (99.92 %) |
906 (0.08 %) |
619 (100.00 %) |
479,546 (6.15 %) |
349,751 (5.62 %) |
6,384,256 (22.41 %) |
28,008 (2.68 %) |
| 147 | white-ruffed manakin GCF_003945725.1 |
45,894 (5.34 %) |
12,728 (1.91 %) |
24,667 (2.34 %) |
n/a | 41.81 (99.24 %) |
13,527 (0.76 %) |
9,068 (100.00 %) |
498,690 (7.12 %) |
246,346 (1.38 %) |
6,500,956 (19.79 %) |
25,941 (1.84 %) |
| 148 | white-rumped snowfinch GCF_017590055.1 |
34,717 (4.88 %) |
12,599 (1.97 %) |
24,083 (2.44 %) |
n/a | 42.03 (99.81 %) |
4,869 (0.19 %) |
11,576 (100.00 %) |
502,151 (6.20 %) |
449,641 (3.22 %) |
6,554,257 (20.25 %) |
28,891 (2.32 %) |
| 149 | white-tailed eagle GCF_000691405.1 |
20,744 (2.82 %) |
11,486 (1.49 %) |
24,520 (1.72 %) |
n/a | 40.90 (99.56 %) |
60,579 (0.45 %) |
111,484 (99.55 %) |
419,664 (5.08 %) |
116,707 (0.60 %) |
6,725,133 (18.14 %) |
11,615 (0.32 %) |
| 150 | white-tailed ptarmigan GCF_019238085.1 |
39,072 (5.37 %) |
12,919 (2.36 %) |
23,624 (2.48 %) |
n/a | 41.37 (97.63 %) |
10,501 (2.38 %) |
7,343 (100.00 %) |
587,593 (8.19 %) |
231,665 (1.12 %) |
6,007,601 (20.08 %) |
21,298 (2.05 %) |
| 151 | white-tailed tropicbird GCF_000687285.1 |
16,342 (2.18 %) |
12,039 (1.50 %) |
26,683 (1.79 %) |
n/a | 41.51 (99.50 %) |
65,286 (0.51 %) |
132,071 (99.49 %) |
435,221 (6.74 %) |
125,195 (0.74 %) |
6,873,137 (19.59 %) |
41,005 (1.45 %) |
| 152 | white-throated sparrow GCF_000385455.1 |
31,167 (5.71 %) |
11,245 (1.80 %) |
20,499 (2.19 %) |
30,624 (3.48 %) |
41.52 (95.61 %) |
41,460 (4.40 %) |
37,661 (95.60 %) |
437,862 (5.64 %) |
364,202 (2.52 %) |
6,300,584 (19.09 %) |
15,091 (0.85 %) |
| 153 | white-throated tinamou GCF_000705375.1 |
18,997 (2.72 %) |
12,294 (1.74 %) |
24,409 (2.18 %) |
n/a | 41.41 (97.88 %) |
59,853 (2.12 %) |
142,367 (97.88 %) |
468,176 (4.61 %) |
226,347 (1.35 %) |
6,300,683 (18.94 %) |
47,608 (2.60 %) |
| 154 | willow flycatcher GCF_003031625.1 |
37,909 (4.43 %) |
12,702 (1.90 %) |
24,710 (2.38 %) |
n/a | 42.01 (95.33 %) |
39,319 (4.68 %) |
7,791 (100.00 %) |
560,568 (7.13 %) |
242,394 (1.27 %) |
6,421,292 (18.87 %) |
27,080 (1.82 %) |
| 155 | wire-tailed manakin (2020) GCF_003945595.2 |
42,551 (5.86 %) |
12,535 (1.90 %) |
23,300 (2.38 %) |
n/a | 42.06 (99.73 %) |
758 (0.26 %) |
1,768 (100.00 %) |
480,705 (7.12 %) |
240,463 (1.87 %) |
6,316,566 (20.20 %) |
25,317 (2.02 %) |
| 156 | yellow-throated sandgrouse (2019 VGP) GCA_009769525.1 |
n/a | 12,693 (1.89 %) |
18,187 (2.69 %) |
n/a | 42.40 (99.62 %) |
242 (0.38 %) |
89 (100.00 %) |
510,630 (7.10 %) |
213,742 (1.12 %) |
6,627,716 (21.17 %) |
28,846 (2.19 %) |
| 157 | yellow-throated sandgrouse (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009769505.1 |
n/a | 11,777 (1.85 %) |
17,357 (2.58 %) |
n/a | 42.31 (100.00 %) |
n/a | 1,958 (100.00 %) |
467,957 (6.96 %) |
182,645 (0.99 %) |
6,050,545 (20.78 %) |
26,357 (2.20 %) |
| 158 | zebra finch (Blue55 v1.4 2021 VGP) GCF_003957565.2 |
49,311 (7.41 %) |
12,747 (1.97 %) |
24,009 (2.47 %) |
n/a | 41.86 (99.66 %) |
352 (0.34 %) |
199 (100.00 %) |
544,577 (9.57 %) |
458,903 (3.33 %) |
6,338,748 (20.92 %) |
29,202 (2.47 %) |
| 159 | zebra finch (Blue55 2020 VGP) GCA_009859065.2 |
n/a | 12,787 (1.92 %) |
18,164 (2.63 %) |
n/a | 41.91 (98.03 %) |
789 (1.97 %) |
541 (100.00 %) |
554,335 (9.67 %) |
339,851 (2.27 %) |
6,613,146 (20.04 %) |
28,678 (2.32 %) |
| 160 | zebra finch (alt pseudohaplotype Black17 2018 VGP) GCA_003957525.1 |
n/a | 11,327 (1.85 %) |
18,898 (2.67 %) |
n/a | 41.73 (99.98 %) |
45 (0.01 %) |
5,381 (99.99 %) |
480,644 (8.44 %) |
365,668 (2.89 %) |
5,859,698 (20.27 %) |
24,648 (2.34 %) |
| 161 | zebra finch (alt pseudohaplotype Blue55 v1 2020 VGP) GCA_009859025.1 |
n/a | 10,723 (1.83 %) |
15,206 (2.34 %) |
n/a | 41.07 (99.99 %) |
16 (0.01 %) |
4,677 (100.00 %) |
436,068 (7.44 %) |
217,580 (1.43 %) |
5,800,691 (19.24 %) |
19,512 (1.90 %) |
| 162 | zebra finch (Blue55 maternal v3 2020 VGP) GCA_008822115.3 |
n/a | 11,942 (1.99 %) |
16,368 (2.73 %) |
n/a | 42.06 (98.45 %) |
583 (1.55 %) |
206 (100.00 %) |
494,107 (9.54 %) |
347,933 (2.80 %) |
5,875,448 (20.29 %) |
27,385 (2.54 %) |
| 163 | zebra finch (Blue55 paternal 2019 VGP) GCA_008822125.1 |
n/a | 12,374 (1.97 %) |
16,560 (2.63 %) |
n/a | 41.74 (98.02 %) |
828 (1.98 %) |
202 (100.00 %) |
511,321 (8.38 %) |
351,624 (2.53 %) |
6,328,918 (19.99 %) |
25,871 (2.29 %) |
| 164 | zebra finch (Blue55 paternal W 2020 VGP) GCF_008822105.2 |
50,407 (7.20 %) |
12,465 (1.95 %) |
17,085 (2.63 %) |
n/a | 41.81 (97.98 %) |
857 (2.02 %) |
205 (100.00 %) |
540,255 (9.53 %) |
357,586 (2.56 %) |
6,359,599 (20.12 %) |
27,755 (2.36 %) |
| TOTALS: | total assembly count 164 | |||||||||||
| Additional hubs with collections of assemblies | |||
|---|---|---|---|
| Collection | Hub index pages: | Assembly statistics: | Track statistics: |
| Primates | 55 assemblies | assembly stats | track stats |
| Mammals | 329 assemblies | assembly stats | track stats |
| Birds | 164 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fishes | 142 assemblies | assembly stats | track stats |
| other vertebrates | 54 assemblies | assembly stats | track stats |
| Invertebrates | 425 assemblies | assembly stats | track stats |
| Plants | 159 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fungi | 445 assemblies | assembly stats | track stats |
| VGP - Vertebrate Genome Project | 233 assemblies | assembly stats | track stats |
| legacy/superseded | 198 assemblies | assembly stats | track stats |