Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019)
GCA_009769605.1		 n/a 12,926
(1.90 %)		 23,453
(2.26 %)		 n/a 43.30
(99.29 %)		 204
(0.71 %)		 112
(100.00 %)		 401,839
(5.61 %)		 145,540
(0.78 %)		 6,556,090
(19.22 %)		 40,986
(3.65 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1		 n/a 11,948
(1.86 %)		 22,509
(2.24 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 n/a 3,527
(100.00 %)		 361,147
(5.36 %)		 125,372
(0.75 %)		 5,917,083
(18.51 %)		 38,787
(3.82 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1		 n/a 12,415
(1.42 %)		 23,266
(1.78 %)		 n/a 46.76
(99.99 %)		 1,555
(0.01 %)		 2,294
(100.00 %)		 1,077,039
(17.72 %)		 548,450
(13.79 %)		 4,965,697
(43.00 %)		 29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1		 n/a 11,832
(1.45 %)		 22,508
(1.87 %)		 n/a 46.81
(99.99 %)		 1,317
(0.01 %)		 4,491
(99.99 %)		 980,493
(17.23 %)		 496,946
(14.39 %)		 5,155,337
(42.38 %)		 28,236
(3.22 %)
5 Adelie penguin
GCF_000699105.1		 17,638
(3.05 %)		 11,763
(1.71 %)		 10,671
(1.99 %)		 n/a 41.51
(95.58 %)		 95,110
(4.45 %)		 114,374
(95.55 %)		 360,323
(4.64 %)		 126,490
(0.70 %)		 6,900,013
(18.31 %)		 27,176
(0.96 %)
6 African ostrich
GCF_000698965.1		 29,026
(4.42 %)		 12,011
(1.64 %)		 17,852
(1.82 %)		 34,707
(3.37 %)		 41.05
(96.74 %)		 72,649
(3.29 %)		 79,564
(96.71 %)		 321,765
(3.17 %)		 152,444
(0.82 %)		 7,196,207
(17.79 %)		 33,542
(1.33 %)
7 American crow
GCF_000691975.1		 36,379
(6.32 %)		 12,151
(1.86 %)		 11,346
(2.24 %)		 n/a 41.85
(96.40 %)		 79,099
(3.62 %)		 89,646
(96.38 %)		 416,990
(6.08 %)		 224,964
(1.60 %)		 6,343,680
(18.42 %)		 20,148
(0.77 %)
8 American flamingo (2019)
GCA_009819775.1		 n/a 13,100
(1.79 %)		 23,372
(2.04 %)		 n/a 43.27
(99.31 %)		 280
(0.69 %)		 90
(100.00 %)		 538,004
(7.73 %)		 183,346
(0.79 %)		 7,056,270
(20.92 %)		 52,012
(5.96 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1		 n/a 12,384
(1.73 %)		 23,611
(2.05 %)		 n/a 43.35
(100.00 %)		 n/a 3,529
(100.00 %)		 496,877
(7.22 %)		 162,522
(0.74 %)		 6,684,675
(20.14 %)		 51,895
(5.89 %)
10 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1		 n/a 11,084
(1.90 %)		 19,321
(2.14 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,803
(100.00 %)		 475,493
(7.41 %)		 223,791
(1.37 %)		 5,585,250
(20.30 %)		 14,903
(1.46 %)
11 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1		 31,091
(4.24 %)		 12,257
(1.95 %)		 14,633
(2.35 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 159
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,055
(1.51 %)		 6,092,276
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
12 bald eagle
GCF_000737465.1		 26,869
(3.49 %)		 13,007
(1.88 %)		 15,874
(2.35 %)		 n/a 41.68
(98.38 %)		 30,862
(1.63 %)		 31,786
(98.37 %)		 355,319
(3.99 %)		 119,526
(0.44 %)		 6,923,742
(18.48 %)		 33,353
(1.97 %)
13 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1		 15,393
(2.18 %)		 11,432
(1.52 %)		 23,733
(1.98 %)		 n/a 41.38
(99.58 %)		 50,921
(0.42 %)		 105,649
(99.58 %)		 386,871
(6.20 %)		 142,825
(0.82 %)		 6,474,942
(19.87 %)		 18,662
(0.63 %)
14 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1		 46,583
(5.22 %)		 13,036
(1.82 %)		 22,849
(2.14 %)		 n/a 41.65
(95.89 %)		 259
(4.11 %)		 70
(100.00 %)		 610,994
(5.59 %)		 254,870
(1.12 %)		 7,109,716
(19.00 %)		 38,384
(2.94 %)
15 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3		 n/a 11,132
(1.94 %)		 20,993
(2.40 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,476
(100.00 %)		 550,072
(10.78 %)		 282,378
(2.00 %)		 5,634,117
(20.43 %)		 30,305
(2.79 %)
16 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2		 41,925
(5.13 %)		 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
17 Bengalese finch
GCF_005870125.1		 32,857
(5.06 %)		 12,604
(1.98 %)		 23,707
(2.41 %)		 n/a 41.59
(97.06 %)		 37,862
(2.95 %)		 2,015
(100.00 %)		 507,898
(7.97 %)		 424,913
(2.80 %)		 6,456,852
(20.03 %)		 29,692
(2.46 %)
18 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1		 44,388
(4.96 %)		 13,738
(1.81 %)		 26,691
(2.34 %)		 n/a 42.41
(99.92 %)		 404
(0.08 %)		 307
(100.00 %)		 730,165
(12.91 %)		 566,529
(6.51 %)		 6,499,984
(24.36 %)		 42,650
(2.59 %)
19 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1		 n/a 11,495
(1.90 %)		 22,202
(2.49 %)		 n/a 42.77
(99.94 %)		 240
(0.06 %)		 157
(100.00 %)		 560,436
(11.20 %)		 441,102
(7.11 %)		 5,126,888
(23.42 %)		 35,457
(2.90 %)
20 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1		 51,115
(5.11 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
21 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1		 n/a 12,650
(1.68 %)		 22,959
(2.02 %)		 n/a 44.62
(99.95 %)		 223
(0.05 %)		 733
(100.00 %)		 483,413
(5.25 %)		 221,284
(9.35 %)		 6,264,499
(27.26 %)		 42,776
(4.88 %)
22 blackcap (2019)
GCA_009819655.1		 n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
23 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1		 n/a 11,586
(1.87 %)		 22,618
(2.41 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,566
(100.00 %)		 473,456
(5.97 %)		 308,518
(2.29 %)		 5,987,640
(19.64 %)		 25,451
(2.38 %)
24 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2		 41,421
(4.72 %)		 13,027
(1.98 %)		 22,616
(2.25 %)		 n/a 41.96
(99.99 %)		 130
(0.01 %)		 568
(100.00 %)		 636,501
(5.67 %)		 297,964
(1.45 %)		 6,820,083
(21.47 %)		 31,725
(3.49 %)
25 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1		 n/a 12,249
(1.86 %)		 23,692
(2.34 %)		 n/a 42.36
(99.99 %)		 970
(0.01 %)		 600
(100.00 %)		 491,914
(6.04 %)		 365,884
(2.89 %)		 6,453,998
(20.73 %)		 30,076
(2.44 %)
26 blue tit
GCF_002901205.1		 42,986
(5.81 %)		 12,162
(1.76 %)		 16,442
(2.29 %)		 n/a 41.18
(92.58 %)		 24,797
(7.42 %)		 29,297
(100.00 %)		 486,455
(6.02 %)		 423,142
(2.68 %)		 6,777,615
(18.84 %)		 26,565
(0.98 %)
27 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1		 n/a 12,919
(1.77 %)		 22,770
(2.15 %)		 n/a 42.69
(99.92 %)		 107
(0.08 %)		 246
(100.00 %)		 711,670
(17.55 %)		 242,430
(5.04 %)		 5,545,074
(24.84 %)		 25,153
(2.06 %)
28 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1		 n/a 13,216
(1.69 %)		 23,855
(2.07 %)		 n/a 43.30
(99.92 %)		 130
(0.08 %)		 274
(100.00 %)		 746,174
(21.96 %)		 291,116
(9.91 %)		 5,424,976
(28.69 %)		 26,750
(2.02 %)
29 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1		 42,586
(5.25 %)		 12,442
(1.93 %)		 16,972
(2.49 %)		 n/a 41.74
(97.93 %)		 22,456
(2.07 %)		 23,501
(97.93 %)		 470,567
(6.92 %)		 226,975
(1.27 %)		 6,395,476
(19.17 %)		 24,084
(1.85 %)
30 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1		 n/a 12,250
(1.92 %)		 19,607
(2.10 %)		 n/a 41.72
(93.42 %)		 3,560,856
(6.92 %)		 1,498
(100.00 %)		 559,187
(10.05 %)		 144,509
(0.66 %)		 5,883,053
(17.90 %)		 18,581
(1.17 %)
31 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1		 n/a 12,339
(1.91 %)		 20,350
(2.13 %)		 n/a 41.72
(93.49 %)		 3,559,082
(6.85 %)		 3,232
(100.00 %)		 501,831
(8.21 %)		 144,313
(0.66 %)		 5,882,906
(17.92 %)		 18,584
(1.17 %)
32 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1		 n/a 13,027
(2.37 %)		 22,748
(2.48 %)		 n/a 41.03
(98.67 %)		 114,232
(1.35 %)		 2,408
(100.00 %)		 523,649
(0.00 %)		 228,783
(1.17 %)		 6,134,418
(20.24 %)		 19,702
(2.00 %)
33 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2		 31,871
(5.31 %)		 12,561
(1.89 %)		 24,218
(2.41 %)		 n/a 42.40
(99.99 %)		 318
(0.01 %)		 692
(99.99 %)		 598,355
(12.36 %)		 420,712
(3.73 %)		 6,496,704
(21.26 %)		 28,568
(2.41 %)
34 brown kiwi
GCF_001039765.1		 26,121
(3.23 %)		 12,909
(1.54 %)		 23,267
(1.91 %)		 n/a 41.28
(86.08 %)		 368,297
(13.97 %)		 24,718
(100.00 %)		 367,446
(2.94 %)		 316,602
(7.36 %)		 7,164,456
(14.67 %)		 59,756
(2.40 %)
35 brown roatelo
GCF_000695765.1		 16,756
(2.26 %)		 12,208
(1.55 %)		 27,079
(2.12 %)		 n/a 41.32
(99.66 %)		 51,602
(0.35 %)		 119,122
(99.65 %)		 345,102
(5.17 %)		 194,444
(1.21 %)		 6,441,258
(19.39 %)		 19,018
(0.67 %)
36 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1		 25,525
(4.05 %)		 12,188
(1.82 %)		 15,819
(2.26 %)		 n/a 41.25
(97.26 %)		 51,022
(2.75 %)		 70,863
(97.25 %)		 465,974
(9.37 %)		 127,353
(0.54 %)		 5,864,264
(19.05 %)		 15,886
(0.88 %)
37 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1		 n/a 12,659
(1.89 %)		 22,063
(2.28 %)		 n/a 41.89
(94.20 %)		 388
(5.80 %)		 930
(100.00 %)		 504,677
(9.95 %)		 268,616
(3.12 %)		 5,481,198
(20.78 %)		 20,278
(1.55 %)
38 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1		 32,026
(4.32 %)		 13,239
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 864
(100.00 %)		 538,374
(10.19 %)		 279,504
(3.12 %)		 5,874,531
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
39 budgerigar (paternal 2020)
GCA_012275275.1		 n/a 13,127
(1.94 %)		 22,492
(2.30 %)		 n/a 41.84
(98.98 %)		 737
(1.02 %)		 330
(100.00 %)		 505,478
(9.66 %)		 231,633
(2.15 %)		 5,778,405
(20.30 %)		 20,205
(1.61 %)
40 burrowing owl
GCF_003259725.1		 30,559
(4.30 %)		 11,741
(1.72 %)		 10,976
(2.04 %)		 n/a 40.92
(98.92 %)		 33,737
(1.09 %)		 445
(100.00 %)		 492,320
(6.21 %)		 182,281
(0.73 %)		 6,811,984
(19.35 %)		 22,840
(1.08 %)
41 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1		 n/a 11,551
(1.57 %)		 22,390
(2.09 %)		 n/a 44.21
(99.99 %)		 1,672
(0.01 %)		 3,563
(100.00 %)		 465,417
(6.39 %)		 218,050
(11.40 %)		 4,588,632
(30.42 %)		 22,622
(2.16 %)
42 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1		 n/a 12,725
(1.54 %)		 24,572
(2.13 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 319
(0.00 %)		 964
(100.00 %)		 522,782
(6.36 %)		 226,563
(14.09 %)		 5,497,483
(32.27 %)		 24,529
(1.77 %)
43 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2		 27,527
(3.38 %)		 12,653
(1.75 %)		 21,924
(1.97 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 434,141
(3.82 %)		 177,389
(0.88 %)		 7,171,770
(20.32 %)		 34,918
(3.00 %)
44 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1		 n/a 12,948
(1.71 %)		 24,838
(2.01 %)		 n/a 43.36
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,359,516
(35.69 %)		 599,039
(11.78 %)		 3,454,101
(36.94 %)		 36,496
(2.55 %)
45 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1		 n/a 12,718
(2.12 %)		 23,363
(2.40 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 287
(0.00 %)		 608
(100.00 %)		 881,563
(19.85 %)		 308,707
(5.50 %)		 5,409,060
(25.34 %)		 25,268
(2.42 %)
46 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1		 28,823
(3.21 %)		 12,791
(1.50 %)		 26,511
(2.06 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 n/a 627
(100.00 %)		 473,712
(3.18 %)		 586,987
(10.80 %)		 4,965,312
(32.86 %)		 48,369
(2.73 %)
47 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1		 n/a 13,061
(1.95 %)		 24,149
(2.23 %)		 n/a 42.13
(98.37 %)		 15,389
(1.64 %)		 28,876
(98.36 %)		 715,113
(7.61 %)		 319,386
(1.67 %)		 6,810,836
(21.27 %)		 40,389
(4.15 %)
48 carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019)
GCA_009819585.1		 n/a 12,381
(1.76 %)		 28,865
(2.78 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 3,296
(100.00 %)		 542,765
(7.77 %)		 204,389
(1.06 %)		 6,415,832
(21.53 %)		 31,638
(2.54 %)
49 carmine bee-eater (2019)
GCA_009819595.1		 n/a 12,740
(1.82 %)		 28,031
(2.77 %)		 n/a 42.88
(99.47 %)		 269
(0.53 %)		 109
(100.00 %)		 556,926
(7.87 %)		 213,180
(1.09 %)		 6,641,077
(21.58 %)		 30,881
(2.41 %)
50 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6		 62,183
(8.40 %)		 13,099
(2.32 %)		 18,797
(2.76 %)		 73,407
(9.29 %)		 42.23
(99.08 %)		 952
(0.92 %)		 2,380
(99.08 %)		 684,052
(12.74 %)		 307,144
(2.92 %)		 5,863,131
(21.16 %)		 24,405
(2.72 %)
51 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1		 n/a 11,740
(2.36 %)		 21,473
(2.56 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 2,263
(100.00 %)		 551,116
(10.78 %)		 241,638
(4.43 %)		 4,973,260
(21.77 %)		 21,151
(2.71 %)
52 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1		 n/a 13,037
(2.20 %)		 23,550
(2.37 %)		 n/a 42.31
(99.81 %)		 460
(0.19 %)		 252
(100.00 %)		 681,166
(12.04 %)		 381,093
(7.09 %)		 5,610,806
(24.65 %)		 25,664
(2.75 %)
53 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2		 n/a 13,405
(2.26 %)		 24,435
(2.45 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 704,190
(12.54 %)		 502,701
(5.74 %)		 5,731,097
(23.50 %)		 27,781
(2.90 %)
54 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1		 n/a 11,339
(2.33 %)		 20,588
(2.51 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,684
(100.00 %)		 537,847
(10.84 %)		 217,964
(3.81 %)		 4,879,985
(21.43 %)		 19,653
(2.66 %)
55 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1		 n/a 12,855
(2.22 %)		 23,147
(2.37 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 566
(0.26 %)		 246
(100.00 %)		 672,973
(12.00 %)		 342,156
(6.53 %)		 5,690,712
(23.98 %)		 24,413
(2.63 %)
56 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2		 83,834
(10.16 %)		 13,005
(2.32 %)		 23,329
(2.48 %)		 72,360
(9.39 %)		 42.16
(99.57 %)		 409
(0.43 %)		 685
(99.57 %)		 536,869
(6.00 %)		 268,230
(2.28 %)		 5,845,184
(20.93 %)		 24,409
(2.60 %)
57 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021)
GCF_016699485.2		 74,716
(9.14 %)		 13,128
(2.33 %)		 23,484
(2.48 %)		 72,013
(9.34 %)		 42.20
(99.68 %)		 463
(0.32 %)		 677
(99.68 %)		 697,827
(12.53 %)		 290,892
(2.63 %)		 5,887,021
(21.30 %)		 24,469
(2.59 %)
58 Chilean tinamou
GCF_003342845.1		 24,894
(4.16 %)		 12,545
(2.09 %)		 18,167
(2.87 %)		 n/a 42.04
(98.74 %)		 1,226,739
(1.39 %)		 2,217
(100.00 %)		 496,518
(5.43 %)		 290,573
(1.50 %)		 5,870,743
(19.53 %)		 44,640
(5.21 %)
59 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2		 15,969
(2.53 %)		 12,045
(1.82 %)		 18,580
(2.07 %)		 n/a 41.40
(96.00 %)		 65,471
(4.02 %)		 84,174
(95.98 %)		 469,979
(5.99 %)		 194,781
(2.21 %)		 6,361,618
(19.70 %)		 12,438
(0.41 %)
60 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2		 17,193
(2.21 %)		 12,092
(1.49 %)		 28,685
(1.89 %)		 n/a 40.76
(99.62 %)		 56,333
(0.39 %)		 125,214
(99.61 %)		 516,189
(5.36 %)		 202,882
(1.12 %)		 6,588,198
(20.47 %)		 8,029
(0.24 %)
61 collared flycatcher
GCF_000247815.1		 28,360
(4.07 %)		 12,200
(1.78 %)		 14,028
(2.24 %)		 33,113
(3.87 %)		 44.22
(98.57 %)		 11,403
(1.43 %)		 30,843
(98.57 %)		 559,053
(7.88 %)		 597,207
(11.39 %)		 6,656,400
(23.61 %)		 29,879
(1.50 %)
62 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1		 32,985
(4.99 %)		 12,248
(1.89 %)		 15,910
(2.38 %)		 n/a 42.17
(98.21 %)		 47,138
(1.81 %)		 3,536
(100.00 %)		 477,249
(6.30 %)		 313,951
(2.10 %)		 6,525,604
(19.58 %)		 25,722
(1.90 %)
63 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1		 41,390
(5.57 %)		 12,314
(1.93 %)		 23,133
(2.37 %)		 n/a 42.36
(99.95 %)		 1,055
(0.05 %)		 685
(100.00 %)		 553,077
(10.89 %)		 322,311
(2.75 %)		 6,543,183
(20.47 %)		 26,268
(2.31 %)
64 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1		 n/a 12,464
(1.91 %)		 24,623
(2.50 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 505,582
(10.93 %)		 292,484
(2.48 %)		 6,061,828
(21.38 %)		 24,010
(1.80 %)
65 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1		 50,206
(6.30 %)		 13,190
(1.85 %)		 24,284
(2.29 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 150
(100.00 %)		 566,161
(11.56 %)		 310,430
(2.36 %)		 6,712,791
(21.76 %)		 25,268
(1.73 %)
66 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1		 n/a 10,692
(1.77 %)		 20,925
(2.29 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,221
(100.00 %)		 328,602
(4.16 %)		 604,057
(8.02 %)		 5,233,128
(25.06 %)		 25,210
(3.70 %)
67 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1		 n/a 12,560
(1.73 %)		 23,740
(2.16 %)		 n/a 42.32
(99.80 %)		 435
(0.20 %)		 455
(100.00 %)		 395,254
(5.40 %)		 937,774
(11.00 %)		 6,145,808
(28.07 %)		 32,293
(3.87 %)
68 common starling
GCF_001447265.1		 28,711
(4.57 %)		 12,585
(2.01 %)		 17,785
(2.59 %)		 n/a 41.49
(97.70 %)		 23,392
(2.31 %)		 22,666
(97.69 %)		 427,543
(5.30 %)		 310,445
(1.74 %)		 6,482,337
(19.49 %)		 23,883
(1.99 %)
69 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1		 n/a 11,653
(1.89 %)		 19,731
(2.20 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,697
(100.00 %)		 443,384
(6.09 %)		 185,968
(1.18 %)		 5,916,553
(20.88 %)		 18,864
(1.75 %)
70 common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1		 39,986
(4.95 %)		 12,292
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 110
(100.00 %)		 499,695
(6.70 %)		 199,749
(1.12 %)		 6,354,003
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
71 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1		 n/a 12,773
(1.79 %)		 24,751
(2.23 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 n/a 2,235
(100.00 %)		 549,460
(7.58 %)		 204,051
(1.02 %)		 6,880,566
(20.70 %)		 47,352
(3.95 %)
72 common tern (2019)
GCA_009819605.1		 n/a 13,103
(1.81 %)		 24,044
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.16 %)		 205
(0.84 %)		 123
(100.00 %)		 570,312
(7.91 %)		 216,895
(1.04 %)		 7,043,151
(20.98 %)		 45,694
(3.73 %)
73 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1		 n/a 10,611
(1.77 %)		 21,125
(2.21 %)		 n/a 41.77
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,976
(100.00 %)		 422,889
(5.99 %)		 294,928
(2.71 %)		 5,928,421
(19.76 %)		 21,397
(1.91 %)
74 common yellowthroat (2019)
GCA_009764595.1		 n/a 11,741
(1.82 %)		 22,382
(2.29 %)		 n/a 42.01
(98.73 %)		 1,479
(1.27 %)		 278
(100.00 %)		 476,049
(6.38 %)		 367,108
(3.16 %)		 6,576,957
(20.43 %)		 25,004
(2.02 %)
75 crested ibis
GCF_000708225.1		 17,134
(2.52 %)		 12,801
(1.77 %)		 14,062
(2.19 %)		 n/a 41.83
(97.20 %)		 70,475
(2.81 %)		 130,030
(97.19 %)		 395,055
(4.53 %)		 182,744
(0.97 %)		 7,244,849
(18.69 %)		 39,156
(2.06 %)
76 cuckoo roller
GCF_000691785.1		 16,484
(2.21 %)		 12,195
(1.53 %)		 24,940
(1.96 %)		 n/a 41.82
(99.74 %)		 56,010
(0.27 %)		 113,170
(99.73 %)		 349,912
(4.65 %)		 131,678
(0.66 %)		 6,778,773
(18.46 %)		 35,090
(1.44 %)
77 Dalmatian pelican
GCF_000687375.1		 16,438
(2.13 %)		 11,927
(1.44 %)		 25,409
(1.84 %)		 n/a 41.39
(99.65 %)		 57,580
(0.36 %)		 121,562
(99.64 %)		 394,453
(5.19 %)		 159,315
(0.83 %)		 6,832,864
(19.52 %)		 25,648
(0.91 %)
78 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1		 n/a 12,766
(1.68 %)		 26,055
(2.18 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 7,284
(100.00 %)		 607,561
(13.23 %)		 239,649
(4.41 %)		 6,086,519
(23.21 %)		 38,398
(5.49 %)
79 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1		 n/a 13,457
(1.72 %)		 25,299
(2.10 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 390
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 660,747
(14.47 %)		 294,268
(5.22 %)		 6,840,996
(24.63 %)		 39,705
(5.14 %)
80 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1		 n/a 11,732
(1.74 %)		 22,080
(2.25 %)		 n/a 45.44
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,342
(100.00 %)		 921,959
(20.95 %)		 334,804
(3.26 %)		 5,352,773
(31.27 %)		 24,105
(1.81 %)
81 Downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1		 25,483
(3.24 %)		 12,410
(1.70 %)		 22,416
(2.11 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 180
(100.00 %)		 1,259,627
(26.52 %)		 378,533
(3.38 %)		 5,846,661
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
82 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1		 16,274
(2.23 %)		 12,032
(1.55 %)		 26,131
(1.84 %)		 n/a 41.21
(99.65 %)		 58,359
(0.36 %)		 111,850
(99.64 %)		 374,845
(4.51 %)		 130,655
(0.66 %)		 6,753,184
(18.86 %)		 26,202
(0.96 %)
83 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1		 n/a 11,799
(1.88 %)		 22,122
(2.30 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 457,930
(6.40 %)		 150,544
(0.85 %)		 6,074,490
(20.16 %)		 33,323
(3.81 %)
84 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020)
GCA_011004875.1		 n/a 13,276
(1.84 %)		 25,393
(2.30 %)		 n/a 42.38
(99.61 %)		 144
(0.39 %)		 105
(100.00 %)		 548,862
(7.06 %)		 187,966
(0.97 %)		 7,004,597
(21.19 %)		 36,626
(3.69 %)
85 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1		 38,171
(5.79 %)		 12,559
(1.96 %)		 23,642
(2.48 %)		 n/a 42.01
(99.99 %)		 582
(0.01 %)		 587
(100.00 %)		 599,051
(9.46 %)		 453,954
(3.77 %)		 6,287,657
(20.75 %)		 27,831
(2.52 %)
86 emperor penguin
GCF_000699145.1		 20,055
(3.28 %)		 12,513
(1.77 %)		 11,986
(2.13 %)		 n/a 41.62
(94.30 %)		 72,501
(5.72 %)		 83,173
(94.28 %)		 478,239
(5.68 %)		 200,181
(2.24 %)		 7,154,684
(17.95 %)		 31,615
(1.38 %)
87 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2		 n/a 13,213
(1.74 %)		 24,562
(2.10 %)		 n/a 42.41
(99.99 %)		 539
(0.01 %)		 767
(100.00 %)		 567,285
(7.79 %)		 258,030
(2.59 %)		 7,108,005
(19.16 %)		 41,752
(6.24 %)
88 emu (2018)
GCF_003342905.1		 36,047
(5.11 %)		 12,857
(1.77 %)		 17,727
(2.32 %)		 n/a 41.63
(99.02 %)		 1,408,082
(1.11 %)		 2,778
(100.00 %)		 440,224
(4.29 %)		 175,539
(0.70 %)		 7,218,815
(17.59 %)		 43,752
(4.64 %)
89 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1		 n/a 12,266
(1.90 %)		 22,091
(2.30 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 2,502
(100.00 %)		 458,278
(5.64 %)		 212,205
(1.54 %)		 6,032,224
(21.16 %)		 21,942
(1.89 %)
90 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1		 n/a 13,040
(1.86 %)		 22,823
(2.21 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 121
(100.00 %)		 595,803
(8.38 %)		 248,128
(1.78 %)		 6,744,611
(22.18 %)		 24,805
(1.90 %)
91 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1		 43,477
(5.70 %)		 12,550
(1.95 %)		 24,541
(2.43 %)		 n/a 42.02
(99.82 %)		 4,765
(0.18 %)		 18,975
(100.00 %)		 464,973
(6.08 %)		 492,684
(3.98 %)		 6,663,773
(20.49 %)		 28,741
(2.30 %)
92 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1		 n/a 11,836
(1.83 %)		 21,119
(2.12 %)		 n/a 42.78
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,147
(100.00 %)		 443,887
(6.00 %)		 149,233
(0.76 %)		 6,328,128
(20.72 %)		 37,413
(3.59 %)
93 European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021)
GCA_017639485.1		 n/a 12,984
(1.78 %)		 22,854
(2.04 %)		 n/a 42.70
(99.01 %)		 268
(0.99 %)		 107
(100.00 %)		 558,587
(8.35 %)		 180,400
(0.83 %)		 7,132,381
(21.18 %)		 40,661
(3.41 %)
94 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2		 n/a 11,359
(1.98 %)		 21,437
(2.45 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 3,668
(100.00 %)		 346,477
(2.88 %)		 283,542
(2.49 %)		 5,597,130
(19.71 %)		 22,977
(2.32 %)
95 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2		 n/a 12,344
(1.85 %)		 23,934
(2.37 %)		 n/a 42.10
(99.97 %)		 990
(0.03 %)		 1,119
(100.00 %)		 532,973
(5.96 %)		 401,820
(3.43 %)		 6,320,210
(21.42 %)		 30,391
(2.60 %)
96 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1		 n/a 11,681
(1.64 %)		 22,195
(2.04 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,752
(100.00 %)		 363,092
(4.61 %)		 347,630
(2.63 %)		 5,664,392
(21.56 %)		 32,162
(3.60 %)
97 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1		 n/a 13,203
(1.74 %)		 22,959
(2.04 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 436,838
(4.84 %)		 471,070
(3.20 %)		 6,601,537
(22.79 %)		 37,247
(3.95 %)
98 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,210
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,334
(100.00 %)		 426,785
(4.89 %)		 182,446
(0.97 %)		 6,038,491
(20.24 %)		 29,692
(2.35 %)
99 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2		 n/a 12,391
(1.76 %)		 23,333
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 940
(0.33 %)		 311
(100.00 %)		 550,895
(7.50 %)		 227,532
(1.16 %)		 6,767,530
(21.05 %)		 34,682
(2.57 %)
100 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1		 n/a 12,359
(1.95 %)		 23,228
(2.46 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 n/a 775
(100.00 %)		 485,213
(6.08 %)		 333,505
(2.21 %)		 6,358,327
(19.87 %)		 26,594
(2.34 %)
101 garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020)
GCA_014839755.1		 n/a 12,520
(1.95 %)		 23,459
(2.46 %)		 n/a 42.08
(99.82 %)		 134
(0.18 %)		 176
(100.00 %)		 491,810
(6.09 %)		 376,746
(2.55 %)		 6,461,292
(20.23 %)		 27,799
(2.40 %)
102 golden-collared manakin
GCF_001715985.3		 27,575
(4.33 %)		 11,806
(1.85 %)		 13,267
(2.32 %)		 n/a 41.42
(97.44 %)		 20,874
(2.57 %)		 3,619
(100.00 %)		 447,084
(7.00 %)		 197,843
(1.19 %)		 6,198,932
(18.50 %)		 18,804
(1.03 %)
103 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2		 n/a 9,172
(1.85 %)		 16,917
(2.12 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,855
(100.00 %)		 377,153
(8.49 %)		 117,959
(0.78 %)		 4,418,970
(18.34 %)		 27,767
(3.57 %)
104 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4		 60,920
(5.98 %)		 13,334
(1.84 %)		 23,261
(2.12 %)		 n/a 42.16
(99.58 %)		 228
(0.42 %)		 144
(100.00 %)		 544,341
(5.93 %)		 186,461
(0.80 %)		 7,090,610
(20.01 %)		 38,495
(3.10 %)
105 golden pheasant
GCA_003413605.1		 n/a 12,891
(2.28 %)		 21,429
(2.37 %)		 n/a 40.87
(97.55 %)		 51,170
(2.47 %)		 65,464
(97.53 %)		 541,931
(8.01 %)		 249,405
(2.01 %)		 6,173,989
(19.98 %)		 22,227
(1.31 %)
106 great cormorant
GCF_000708925.1		 15,472
(2.07 %)		 11,547
(1.44 %)		 22,727
(1.73 %)		 n/a 41.28
(99.25 %)		 98,475
(0.77 %)		 162,787
(99.23 %)		 324,530
(4.59 %)		 144,409
(1.43 %)		 6,724,538
(18.06 %)		 14,330
(0.42 %)
107 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1		 n/a 11,630
(1.85 %)		 20,866
(2.20 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 1,395
(100.00 %)		 421,187
(9.08 %)		 159,172
(0.96 %)		 5,602,689
(22.75 %)		 29,548
(2.77 %)
108 great potoo (bNycGra1 primary hap 2020)
GCA_013368605.1		 n/a 13,116
(1.77 %)		 23,657
(2.10 %)		 n/a 42.67
(99.51 %)		 243
(0.49 %)		 191
(100.00 %)		 514,142
(9.71 %)		 210,381
(1.13 %)		 6,501,989
(23.95 %)		 35,785
(2.69 %)
109 great tit
GCF_001522545.3		 46,201
(6.78 %)		 12,250
(2.00 %)		 16,577
(2.52 %)		 n/a 41.37
(98.24 %)		 24,615
(1.76 %)		 24,044
(98.24 %)		 447,566
(5.89 %)		 249,384
(1.36 %)		 6,330,291
(19.11 %)		 23,876
(1.88 %)
110 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1		 20,607
(2.63 %)		 12,184
(1.76 %)		 21,560
(2.12 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 556
(0.00 %)		 1,452
(100.00 %)		 804,583
(12.49 %)		 291,451
(3.14 %)		 5,887,349
(28.34 %)		 19,623
(1.55 %)
111 greater prairie chicken
GCA_001870855.1		 n/a 12,923
(2.36 %)		 24,062
(2.50 %)		 n/a 41.23
(99.63 %)		 48,408
(0.39 %)		 60,594
(99.61 %)		 544,139
(7.50 %)		 214,682
(0.99 %)		 6,153,628
(19.86 %)		 23,154
(2.26 %)
112 greater rhea
GCA_003343005.1		 n/a 12,895
(1.81 %)		 20,976
(2.06 %)		 n/a 40.79
(98.79 %)		 2,075,293
(1.40 %)		 2,162
(100.00 %)		 509,589
(0.00 %)		 196,258
(0.73 %)		 6,982,184
(18.70 %)		 41,811
(3.95 %)
113 greater sage-grouse
GCF_019232065.1		 36,656
(5.50 %)		 12,419
(2.36 %)		 21,319
(2.40 %)		 n/a 41.16
(96.34 %)		 9,894
(3.66 %)		 1,502
(100.00 %)		 574,006
(8.05 %)		 196,630
(0.72 %)		 5,996,002
(19.65 %)		 18,807
(1.81 %)
114 green peafowl
GCA_016647715.1		 n/a 12,897
(2.25 %)		 23,427
(2.41 %)		 n/a 41.73
(98.15 %)		 32,668
(1.85 %)		 2,446
(100.00 %)		 481,865
(6.04 %)		 188,685
(1.04 %)		 6,268,032
(20.57 %)		 22,330
(1.85 %)
115 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1		 n/a 13,159
(1.57 %)		 41,528
(2.68 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 4,777
(0.03 %)		 54,154
(99.97 %)		 525,535
(7.07 %)		 222,932
(1.16 %)		 6,301,005
(19.38 %)		 28,978
(2.14 %)
116 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1		 41,746
(4.05 %)		 13,173
(1.89 %)		 24,269
(2.31 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 n/a 8,090
(100.00 %)		 468,845
(6.23 %)		 261,918
(2.42 %)		 5,956,005
(21.98 %)		 25,573
(1.77 %)
117 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1		 n/a 6,534
(1.74 %)		 12,152
(1.97 %)		 n/a 42.70
(100.00 %)		 n/a 8,370
(100.00 %)		 179,674
(3.19 %)		 76,165
(0.79 %)		 2,908,228
(16.85 %)		 11,838
(2.15 %)
118 gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020)
GCF_015220075.1		 47,961
(5.90 %)		 13,016
(1.82 %)		 21,266
(2.02 %)		 n/a 42.20
(99.55 %)		 635
(0.45 %)		 133
(100.00 %)		 484,104
(5.60 %)		 186,430
(0.85 %)		 7,162,723
(18.83 %)		 24,760
(2.03 %)
119 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1		 n/a 11,838
(1.64 %)		 24,014
(2.16 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,969
(100.00 %)		 405,109
(3.51 %)		 220,222
(6.17 %)		 4,708,177
(25.30 %)		 58,446
(5.44 %)
120 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1		 51,641
(5.08 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
121 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1		 n/a 7,477
(1.92 %)		 14,094
(2.40 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 n/a 2,762
(100.00 %)		 296,732
(12.20 %)		 135,408
(4.08 %)		 3,123,655
(20.92 %)		 23,288
(3.74 %)
122 Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1		 51,593
(6.18 %)		 12,739
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 188
(100.00 %)		 409,129
(0.00 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,375
(23.59 %)		 46,118
(3.85 %)
123 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1		 55,435
(7.96 %)		 12,866
(2.29 %)		 18,391
(2.68 %)		 n/a 41.73
(98.08 %)		 15,598
(1.93 %)		 2,739
(100.00 %)		 486,655
(7.97 %)		 173,056
(0.98 %)		 6,144,176
(20.18 %)		 26,577
(2.39 %)
124 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1		 14,928
(2.31 %)		 11,454
(1.65 %)		 11,717
(2.07 %)		 n/a 42.42
(94.92 %)		 99,371
(5.11 %)		 109,627
(94.89 %)		 360,821
(6.34 %)		 145,440
(1.01 %)		 6,679,356
(18.72 %)		 40,581
(1.42 %)
125 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1		 n/a 13,089
(1.50 %)		 29,621
(2.22 %)		 n/a 45.56
(100.00 %)		 268
(0.00 %)		 683
(100.00 %)		 610,333
(22.07 %)		 252,997
(12.56 %)		 5,154,598
(31.67 %)		 58,754
(5.54 %)
126 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1		 n/a 12,349
(1.54 %)		 27,206
(2.21 %)		 n/a 45.91
(100.00 %)		 212
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 529,757
(21.69 %)		 235,999
(14.32 %)		 4,845,810
(31.86 %)		 53,781
(5.77 %)
127 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6		 42,787
(6.57 %)		 11,856
(1.93 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 458,399
(8.32 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
128 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1		 n/a 12,027
(1.89 %)		 23,973
(2.49 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 385,230
(3.05 %)		 398,497
(5.70 %)		 5,772,203
(22.69 %)		 28,740
(2.98 %)
129 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1		 43,228
(5.71 %)		 12,702
(1.83 %)		 24,568
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 296
(0.98 %)		 184
(100.00 %)		 440,384
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,138
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
130 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1		 n/a 11,806
(1.66 %)		 21,429
(1.97 %)		 n/a 43.73
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,343
(100.00 %)		 508,803
(10.25 %)		 162,918
(5.44 %)		 6,029,969
(24.67 %)		 27,953
(3.83 %)
131 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1		 n/a 13,233
(1.67 %)		 23,010
(1.93 %)		 n/a 43.91
(99.92 %)		 253
(0.08 %)		 136
(100.00 %)		 610,144
(11.51 %)		 214,393
(5.75 %)		 6,069,916
(25.74 %)		 33,172
(3.38 %)
132 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2		 n/a 12,424
(1.21 %)		 43,440
(2.06 %)		 n/a 41.86
(99.95 %)		 1,098
(0.00 %)		 260,829
(100.00 %)		 497,886
(5.29 %)		 184,967
(0.96 %)		 6,167,538
(20.22 %)		 33,529
(1.55 %)
133 jackdaw
GCA_013407035.1		 n/a 12,072
(1.93 %)		 20,925
(2.08 %)		 n/a 42.15
(99.72 %)		 511
(0.28 %)		 41
(100.00 %)		 428,760
(6.13 %)		 173,436
(1.02 %)		 6,231,317
(19.25 %)		 26,177
(2.17 %)
134 Japanese quail
GCF_001577835.2		 49,210
(7.77 %)		 12,864
(2.54 %)		 22,540
(2.69 %)		 37,604
(4.36 %)		 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 559,601
(7.91 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
135 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1		 n/a 8,732
(1.74 %)		 16,473
(2.17 %)		 n/a 45.10
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,819
(100.00 %)		 314,902
(10.49 %)		 133,061
(10.84 %)		 3,656,435
(25.68 %)		 32,592
(5.25 %)
136 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1		 n/a 13,042
(1.63 %)		 24,142
(2.01 %)		 n/a 45.07
(99.96 %)		 300
(0.04 %)		 148
(100.00 %)		 563,851
(12.90 %)		 270,861
(12.36 %)		 6,191,106
(28.24 %)		 54,426
(4.92 %)
137 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1		 n/a 3,256
(1.65 %)		 6,220
(1.98 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 3,728
(100.00 %)		 127,817
(7.83 %)		 53,447
(1.21 %)		 1,502,789
(18.09 %)		 5,487
(1.71 %)
138 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2		 49,757
(5.76 %)		 13,110
(1.92 %)		 22,782
(2.26 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 89
(100.00 %)		 507,148
(7.85 %)		 208,178
(1.08 %)		 6,258,087
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
139 kea
GCF_000696875.1		 15,953
(2.35 %)		 11,985
(1.66 %)		 22,107
(2.01 %)		 n/a 41.09
(99.60 %)		 51,381
(0.42 %)		 93,561
(99.58 %)		 368,226
(5.60 %)		 138,157
(0.75 %)		 5,905,331
(18.06 %)		 7,218
(0.22 %)
140 killdeer
GCF_000708025.1		 16,480
(2.43 %)		 12,356
(1.72 %)		 12,853
(2.15 %)		 n/a 41.88
(97.24 %)		 63,995
(2.78 %)		 79,162
(97.22 %)		 424,095
(5.93 %)		 167,406
(0.94 %)		 7,070,701
(19.44 %)		 37,082
(1.57 %)
141 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1		 n/a 10,584
(1.75 %)		 19,112
(2.09 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 2,892
(100.00 %)		 363,564
(3.53 %)		 235,220
(7.22 %)		 5,072,834
(23.83 %)		 24,909
(2.64 %)
142 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1		 n/a 13,529
(1.69 %)		 23,672
(1.98 %)		 n/a 43.50
(99.85 %)		 259
(0.15 %)		 232
(100.00 %)		 491,653
(3.53 %)		 349,011
(9.83 %)		 5,955,030
(26.51 %)		 32,237
(2.61 %)
143 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1		 46,366
(5.56 %)		 12,594
(1.91 %)		 22,763
(2.31 %)		 26,057
(3.91 %)		 41.97
(99.70 %)		 206
(0.30 %)		 93
(100.00 %)		 485,121
(7.13 %)		 247,189
(1.64 %)		 6,498,294
(20.04 %)		 25,377
(1.97 %)
144 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1		 n/a 12,282
(1.85 %)		 23,867
(2.36 %)		 n/a 42.20
(100.00 %)		 n/a 4,269
(100.00 %)		 472,384
(7.01 %)		 237,680
(1.65 %)		 6,121,661
(19.48 %)		 25,589
(2.05 %)
145 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1		 n/a 12,458
(1.70 %)		 22,259
(2.05 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 n/a 3,090
(100.00 %)		 413,301
(3.46 %)		 189,449
(5.28 %)		 5,962,597
(22.07 %)		 31,611
(2.72 %)
146 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1		 48,561
(5.70 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
147 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1		 n/a 12,578
(1.83 %)		 22,257
(2.16 %)		 n/a 42.51
(98.97 %)		 258
(1.03 %)		 551
(100.00 %)		 431,717
(3.61 %)		 201,876
(1.38 %)		 6,620,060
(19.16 %)		 27,552
(2.26 %)
148 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2		 47,420
(5.64 %)		 13,098
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,499
(5.58 %)		 210,234
(1.26 %)		 7,133,934
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
149 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1		 51,352
(6.92 %)		 12,689
(2.35 %)		 22,377
(2.51 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 58
(0.00 %)		 206
(100.00 %)		 498,179
(5.36 %)		 218,390
(1.80 %)		 6,038,211
(20.76 %)		 20,648
(2.33 %)
150 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1		 n/a 10,465
(1.71 %)		 19,083
(2.16 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 910
(100.00 %)		 520,125
(6.78 %)		 251,547
(4.21 %)		 5,321,207
(21.53 %)		 34,698
(5.69 %)
151 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023)
GCA_028389875.1		 n/a 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
152 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1		 n/a 13,105
(1.81 %)		 25,654
(2.45 %)		 n/a 40.86
(98.66 %)		 1,039,616
(1.43 %)		 3,019
(100.00 %)		 522,333
(5.61 %)		 208,867
(0.79 %)		 7,080,214
(19.15 %)		 42,016
(4.35 %)
153 little egret
GCF_000687185.1		 25,843
(3.55 %)		 12,162
(1.73 %)		 10,954
(2.03 %)		 n/a 42.25
(95.99 %)		 88,871
(4.04 %)		 100,662
(95.96 %)		 490,997
(6.84 %)		 165,380
(1.23 %)		 6,955,585
(18.98 %)		 31,136
(1.15 %)
154 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1		 n/a 12,264
(2.01 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 40.99
(100.00 %)		 n/a 230
(100.00 %)		 498,393
(5.07 %)		 266,700
(1.49 %)		 6,131,743
(20.45 %)		 15,809
(1.43 %)
155 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1		 n/a 12,328
(2.02 %)		 20,312
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 141
(0.37 %)		 211
(99.63 %)		 497,506
(5.06 %)		 265,815
(1.51 %)		 6,045,702
(20.10 %)		 15,922
(1.43 %)
156 Macqueen's bustard
GCF_000695195.1		 15,790
(2.21 %)		 11,632
(1.52 %)		 24,790
(1.96 %)		 n/a 41.10
(99.68 %)		 56,130
(0.33 %)		 115,823
(99.67 %)		 391,856
(4.80 %)		 148,075
(0.90 %)		 6,682,530
(20.03 %)		 27,675
(1.15 %)
157 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1		 n/a 10,658
(1.74 %)		 18,941
(1.98 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 4,278
(100.00 %)		 326,479
(4.02 %)		 141,715
(0.74 %)		 5,600,372
(19.59 %)		 27,330
(3.35 %)
158 maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021)
GCA_017639555.1		 n/a 12,905
(1.81 %)		 22,204
(2.01 %)		 n/a 42.12
(98.21 %)		 232
(1.79 %)		 153
(100.00 %)		 485,318
(6.35 %)		 184,992
(0.78 %)		 7,064,965
(19.56 %)		 31,653
(3.02 %)
159 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1		 n/a 13,260
(1.85 %)		 25,071
(2.17 %)		 n/a 42.41
(99.90 %)		 318
(0.10 %)		 1,665
(100.00 %)		 849,782
(8.18 %)		 438,622
(5.10 %)		 6,729,782
(25.03 %)		 34,670
(3.03 %)
160 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1		 54,114
(7.47 %)		 12,199
(1.86 %)		 15,363
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.77 %)		 71,703
(0.26 %)		 2,150
(100.00 %)		 770,322
(8.16 %)		 357,617
(3.09 %)		 6,587,406
(21.92 %)		 29,913
(2.33 %)
161 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1		 59,854
(7.33 %)		 12,988
(1.87 %)		 23,709
(2.20 %)		 86,787
(8.80 %)		 42.27
(99.64 %)		 905
(0.36 %)		 756
(100.00 %)		 803,558
(8.04 %)		 417,575
(5.02 %)		 6,627,843
(24.59 %)		 35,030
(3.06 %)
162 Mariana crow
GCF_017639235.1		 48,460
(7.00 %)		 12,506
(1.97 %)		 22,580
(2.35 %)		 n/a 42.14
(98.94 %)		 10,579
(1.06 %)		 1,443
(100.00 %)		 434,280
(5.91 %)		 169,629
(0.82 %)		 6,323,058
(18.94 %)		 27,390
(2.04 %)
163 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1		 n/a 4,774
(1.89 %)		 8,695
(2.32 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 n/a 2,259
(100.00 %)		 135,092
(3.67 %)		 112,042
(8.63 %)		 1,739,144
(22.50 %)		 12,908
(3.26 %)
164 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1		 n/a 13,064
(1.72 %)		 22,269
(1.98 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 407
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 459,578
(3.87 %)		 315,686
(6.19 %)		 6,650,507
(22.84 %)		 36,076
(2.82 %)
165 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1		 n/a 8,873
(1.81 %)		 16,175
(2.24 %)		 n/a 42.92
(100.00 %)		 n/a 2,130
(100.00 %)		 331,293
(6.89 %)		 161,393
(5.94 %)		 3,516,196
(24.86 %)		 16,659
(1.74 %)
166 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1		 n/a 13,133
(1.81 %)		 23,396
(2.19 %)		 n/a 42.66
(99.99 %)		 358
(0.01 %)		 172
(100.00 %)		 511,156
(7.05 %)		 238,915
(5.05 %)		 5,764,523
(25.19 %)		 24,675
(1.70 %)
167 medium ground-finch
GCF_000277835.1		 22,226
(4.24 %)		 11,887
(1.83 %)		 11,438
(2.19 %)		 n/a 41.61
(97.77 %)		 68,589
(2.25 %)		 95,828
(97.75 %)		 433,244
(5.91 %)		 322,831
(2.24 %)		 6,548,136
(19.49 %)		 18,135
(0.69 %)
168 monk parakeet
GCA_017639245.1		 n/a 13,067
(1.85 %)		 n/a n/a 42.29
(99.99 %)		 352
(0.01 %)		 291
(100.00 %)		 582,436
(9.49 %)		 253,709
(2.79 %)		 5,820,920
(22.52 %)		 23,101
(1.75 %)
169 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2		 n/a 10,145
(1.98 %)		 18,617
(2.30 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 5,640
(100.00 %)		 533,330
(9.11 %)		 213,518
(1.29 %)		 4,813,886
(20.16 %)		 25,667
(3.86 %)
170 mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2		 59,524
(6.76 %)		 12,983
(1.98 %)		 22,400
(2.22 %)		 33,839
(5.17 %)		 41.92
(99.13 %)		 451
(0.87 %)		 171
(100.00 %)		 700,051
(7.55 %)		 301,579
(1.34 %)		 6,791,838
(21.30 %)		 31,278
(3.07 %)
171 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1		 n/a 11,687
(1.78 %)		 24,169
(2.43 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 n/a 2,834
(100.00 %)		 414,780
(3.26 %)		 491,012
(10.03 %)		 5,570,475
(26.24 %)		 29,485
(4.55 %)
172 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1		 31,033
(4.42 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
173 New Caledonian crow (2019)
GCF_009650955.1		 50,821
(6.95 %)		 12,747
(1.94 %)		 23,372
(2.37 %)		 30,299
(3.60 %)		 42.57
(97.41 %)		 289
(2.59 %)		 105
(100.00 %)		 452,690
(6.21 %)		 231,546
(1.70 %)		 6,265,995
(19.54 %)		 31,909
(2.48 %)
174 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1		 n/a 11,097
(1.99 %)		 20,436
(2.45 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 n/a 894
(100.00 %)		 377,050
(6.03 %)		 178,064
(1.53 %)		 5,305,126
(19.49 %)		 26,107
(2.52 %)
175 northern bobwhite
GCA_008692595.2		 n/a 12,584
(2.37 %)		 22,327
(2.53 %)		 n/a 41.41
(99.04 %)		 33,134
(0.97 %)		 39,169
(99.03 %)		 460,369
(4.63 %)		 213,800
(1.34 %)		 5,813,961
(19.54 %)		 22,156
(2.37 %)
176 northern fulmar
GCF_000690835.1		 16,383
(2.20 %)		 11,965
(1.51 %)		 24,294
(1.87 %)		 n/a 41.17
(99.50 %)		 54,825
(0.51 %)		 112,214
(99.49 %)		 330,541
(3.74 %)		 146,735
(0.83 %)		 6,838,937
(18.42 %)		 24,859
(0.79 %)
177 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1		 n/a 13,367
(1.65 %)		 24,403
(2.00 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 829
(100.00 %)		 498,574
(4.51 %)		 273,984
(5.20 %)		 5,544,122
(27.29 %)		 34,879
(3.83 %)
178 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1		 n/a 13,477
(1.77 %)		 23,613
(2.08 %)		 n/a 42.44
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 474,930
(4.45 %)		 237,604
(2.75 %)		 5,847,260
(21.07 %)		 30,873
(3.03 %)
179 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1		 n/a 12,115
(1.73 %)		 22,764
(2.15 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,484
(100.00 %)		 417,395
(3.68 %)		 231,908
(7.24 %)		 5,424,533
(24.05 %)		 35,691
(4.26 %)
180 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2		 n/a 13,527
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 455
(100.00 %)		 511,000
(3.76 %)		 325,992
(9.82 %)		 5,542,342
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
181 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1		 50,663
(4.74 %)		 13,528
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 521,768
(3.86 %)		 325,987
(9.82 %)		 5,542,269
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
182 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1		 n/a 12,592
(1.89 %)		 24,002
(2.35 %)		 n/a 42.94
(99.48 %)		 1,602
(0.52 %)		 1,695
(100.00 %)		 466,546
(6.40 %)		 235,283
(1.98 %)		 6,371,421
(20.17 %)		 34,247
(3.02 %)
183 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1		 43,838
(4.59 %)		 13,232
(1.76 %)		 18,641
(2.35 %)		 n/a 41.52
(98.49 %)		 696,987
(1.57 %)		 4,120
(100.00 %)		 482,272
(4.98 %)		 178,540
(0.70 %)		 7,407,982
(18.33 %)		 43,081
(4.88 %)
184 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1		 n/a 12,953
(1.76 %)		 25,275
(2.07 %)		 n/a 41.70
(98.42 %)		 42,691
(1.58 %)		 151,517
(98.42 %)		 494,677
(6.28 %)		 222,654
(1.07 %)		 7,211,171
(19.25 %)		 41,048
(2.24 %)
185 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1		 n/a 12,529
(1.75 %)		 24,654
(2.25 %)		 n/a 42.72
(100.00 %)		 n/a 2,745
(100.00 %)		 517,204
(7.95 %)		 218,606
(4.15 %)		 6,216,533
(21.16 %)		 26,313
(2.41 %)
186 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1		 49,100
(5.64 %)		 13,021
(1.66 %)		 21,794
(1.95 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 241
(0.31 %)		 125
(100.00 %)		 586,320
(11.83 %)		 335,218
(8.05 %)		 7,038,851
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
187 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1		 37,506
(5.42 %)		 12,670
(1.80 %)		 11,311
(2.11 %)		 n/a 41.77
(98.44 %)		 76,069
(1.58 %)		 83,081
(98.42 %)		 437,234
(5.32 %)		 170,160
(0.93 %)		 7,157,857
(18.38 %)		 22,325
(0.89 %)
188 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1		 41,770
(4.95 %)		 12,712
(1.86 %)		 24,157
(2.37 %)		 n/a 42.69
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 484
(100.00 %)		 641,523
(14.11 %)		 414,142
(6.03 %)		 6,230,412
(23.70 %)		 49,402
(3.94 %)
189 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1		 n/a 10,425
(1.96 %)		 20,219
(2.49 %)		 n/a 42.52
(100.00 %)		 n/a 1,277
(100.00 %)		 344,711
(4.99 %)		 225,902
(3.41 %)		 4,563,425
(21.61 %)		 28,391
(3.74 %)
190 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1		 n/a 13,140
(1.85 %)		 25,111
(2.31 %)		 n/a 42.27
(99.99 %)		 509
(0.01 %)		 143
(100.00 %)		 488,313
(5.48 %)		 331,962
(3.50 %)		 6,243,204
(22.87 %)		 36,343
(3.63 %)
191 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1		 n/a 11,774
(1.90 %)		 20,857
(2.20 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 749
(100.00 %)		 356,053
(4.37 %)		 157,695
(0.93 %)		 5,995,637
(19.60 %)		 30,478
(4.03 %)
192 plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021)
GCA_020745775.1		 n/a 13,028
(1.84 %)		 22,722
(2.10 %)		 n/a 42.37
(99.81 %)		 104
(0.19 %)		 88
(100.00 %)		 488,030
(6.66 %)		 188,606
(1.01 %)		 6,982,793
(20.08 %)		 32,920
(3.37 %)
193 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2		 n/a 12,000
(1.69 %)		 22,393
(2.01 %)		 n/a 41.66
(74.61 %)		 137,572
(25.41 %)		 200,284
(74.59 %)		 536,198
(8.55 %)		 200,698
(0.96 %)		 5,147,882
(14.30 %)		 14,572
(0.41 %)
194 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1		 n/a 12,787
(1.83 %)		 22,839
(2.13 %)		 n/a 42.67
(99.70 %)		 227
(0.30 %)		 95
(100.00 %)		 543,517
(7.16 %)		 212,546
(1.12 %)		 6,930,708
(20.10 %)		 38,960
(3.02 %)
195 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1		 n/a 12,937
(1.75 %)		 24,253
(2.09 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 3,309
(100.00 %)		 562,549
(7.14 %)		 210,852
(1.04 %)		 7,264,995
(20.26 %)		 40,926
(2.91 %)
196 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1		 29,027
(5.08 %)		 12,371
(2.00 %)		 24,297
(2.42 %)		 n/a 41.70
(96.94 %)		 3,337,637
(3.40 %)		 10,634
(100.00 %)		 349,349
(2.76 %)		 398,866
(2.71 %)		 6,299,092
(18.40 %)		 27,078
(2.11 %)
197 red-crested turaco (2019)
GCA_009769465.1		 n/a 12,744
(1.75 %)		 25,706
(2.29 %)		 n/a 42.60
(97.89 %)		 344
(2.11 %)		 140
(100.00 %)		 551,885
(8.95 %)		 176,530
(0.80 %)		 6,805,042
(22.19 %)		 43,051
(3.40 %)
198 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1		 n/a 11,247
(1.70 %)		 23,705
(2.27 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 n/a 3,476
(100.00 %)		 482,817
(8.51 %)		 153,169
(0.81 %)		 5,919,109
(21.87 %)		 39,766
(3.41 %)
199 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1		 n/a 11,434
(1.65 %)		 21,710
(2.11 %)		 n/a 46.12
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 2,748
(100.00 %)		 859,899
(15.52 %)		 319,622
(3.85 %)		 5,367,970
(34.63 %)		 23,381
(1.81 %)
200 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCA_015220805.1		 n/a 12,345
(1.60 %)		 23,206
(2.02 %)		 n/a 45.96
(99.53 %)		 307
(0.47 %)		 253
(100.00 %)		 1,082,064
(22.90 %)		 378,866
(4.28 %)		 6,003,548
(35.88 %)		 26,519
(1.76 %)
201 red-legged partridge
GCA_019345075.1		 n/a 12,441
(2.23 %)		 20,933
(2.29 %)		 n/a 41.44
(96.96 %)		 18,534
(3.05 %)		 29,132
(96.95 %)		 543,702
(6.02 %)		 222,583
(0.97 %)		 5,978,744
(20.17 %)		 19,970
(0.97 %)
202 red-legged seriema (2019)
GCA_009819825.1		 n/a 13,229
(1.84 %)		 25,580
(2.35 %)		 n/a 42.20
(99.59 %)		 194
(0.41 %)		 110
(100.00 %)		 483,784
(6.50 %)		 160,481
(0.73 %)		 6,960,060
(19.71 %)		 32,899
(2.77 %)
203 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1		 n/a 10,131
(1.78 %)		 19,775
(2.21 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,840
(100.00 %)		 366,591
(6.01 %)		 117,928
(0.90 %)		 5,340,048
(18.90 %)		 26,293
(2.86 %)
204 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1		 15,829
(2.14 %)		 11,589
(1.46 %)		 22,840
(1.76 %)		 n/a 41.12
(99.40 %)		 64,882
(0.61 %)		 126,713
(99.39 %)		 293,224
(3.50 %)		 123,593
(0.80 %)		 6,849,573
(18.22 %)		 17,100
(0.51 %)
205 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1		 n/a 13,357
(1.64 %)		 29,603
(2.35 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 3,225
(100.00 %)		 549,694
(8.44 %)		 246,171
(10.46 %)		 5,258,356
(27.36 %)		 39,810
(3.37 %)
206 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1		 25,173
(3.02 %)		 13,216
(1.71 %)		 24,050
(2.10 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,185
(100.00 %)		 544,422
(8.81 %)		 223,672
(5.77 %)		 6,669,433
(23.63 %)		 38,305
(3.37 %)
207 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1		 29,994
(3.93 %)		 12,687
(1.75 %)		 25,287
(2.30 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 516
(100.00 %)		 785,960
(17.62 %)		 522,256
(9.27 %)		 6,371,580
(25.40 %)		 32,643
(2.66 %)
208 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1		 15,595
(2.24 %)		 11,495
(1.55 %)		 25,766
(1.88 %)		 n/a 42.65
(98.44 %)		 118,543
(1.60 %)		 180,800
(98.40 %)		 271,331
(3.93 %)		 134,645
(1.25 %)		 6,383,631
(17.75 %)		 24,531
(0.79 %)
209 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1		 n/a 9,867
(1.89 %)		 19,635
(2.52 %)		 n/a 42.54
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 2,879
(100.00 %)		 394,769
(10.00 %)		 186,556
(1.91 %)		 4,428,687
(19.09 %)		 15,730
(1.88 %)
210 rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021)
GCA_016904835.1		 n/a 12,620
(1.92 %)		 24,568
(2.61 %)		 n/a 42.41
(99.61 %)		 195
(0.39 %)		 206
(100.00 %)		 495,673
(9.14 %)		 253,008
(2.04 %)		 5,936,177
(19.93 %)		 20,145
(1.83 %)
211 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1		 33,221
(6.38 %)		 13,027
(2.35 %)		 19,960
(2.74 %)		 n/a 41.21
(99.22 %)		 19,995
(0.78 %)		 39,678
(100.00 %)		 586,827
(8.20 %)		 291,437
(1.68 %)		 6,237,616
(20.77 %)		 22,365
(2.11 %)
212 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1		 52,369
(6.40 %)		 12,577
(1.87 %)		 14,272
(2.42 %)		 n/a 41.48
(98.13 %)		 85,176
(1.90 %)		 100,099
(98.10 %)		 480,221
(6.94 %)		 268,561
(1.86 %)		 6,408,260
(19.42 %)		 29,801
(1.43 %)
213 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1		 n/a 12,090
(2.36 %)		 21,910
(2.57 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,212
(100.00 %)		 585,577
(10.45 %)		 202,342
(1.61 %)		 5,390,780
(20.38 %)		 19,210
(2.23 %)
214 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1		 51,619
(7.29 %)		 12,832
(2.31 %)		 23,047
(2.56 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 165
(100.00 %)		 526,839
(5.87 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,345
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
215 ruddy duck
GCF_011077185.1		 50,326
(5.76 %)		 13,124
(1.98 %)		 23,592
(2.23 %)		 n/a 41.82
(97.27 %)		 18,437
(2.73 %)		 28,026
(97.27 %)		 808,998
(7.97 %)		 389,509
(1.34 %)		 6,722,581
(21.16 %)		 34,567
(3.30 %)
216 ruff
GCF_001431845.1		 34,257
(4.61 %)		 12,979
(1.79 %)		 15,969
(2.42 %)		 n/a 42.45
(96.26 %)		 30,404
(3.75 %)		 34,157
(96.25 %)		 308,688
(1.08 %)		 337,661
(3.70 %)		 7,220,063
(20.45 %)		 27,939
(1.42 %)
217 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1		 35,381
(4.92 %)		 12,603
(1.95 %)		 24,965
(2.42 %)		 n/a 42.00
(99.80 %)		 5,524
(0.20 %)		 24,055
(100.00 %)		 514,274
(6.32 %)		 411,146
(2.77 %)		 6,584,761
(19.85 %)		 29,372
(2.28 %)
218 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1		 40,473
(5.86 %)		 12,903
(1.96 %)		 23,477
(2.35 %)		 n/a 42.26
(99.87 %)		 181
(0.13 %)		 1,692
(100.00 %)		 439,625
(4.09 %)		 338,042
(2.23 %)		 6,366,832
(20.27 %)		 28,572
(2.11 %)
219 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1		 45,898
(5.06 %)		 12,908
(1.86 %)		 21,103
(2.48 %)		 n/a 42.28
(99.01 %)		 15,342
(0.99 %)		 38,089
(100.00 %)		 496,308
(7.14 %)		 333,391
(1.97 %)		 6,646,625
(20.87 %)		 32,671
(2.19 %)
220 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1		 n/a 16,893
(1.07 %)		 43,426
(1.70 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 43,047
(100.00 %)		 1,180,596
(3.55 %)		 1,932,696
(16.57 %)		 6,340,063
(43.85 %)		 66,996
(3.45 %)
221 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1		 n/a 12,804
(1.50 %)		 25,425
(1.97 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 1,339
(100.00 %)		 699,755
(3.36 %)		 1,030,540
(15.69 %)		 5,226,748
(36.13 %)		 36,539
(2.71 %)
222 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1		 n/a 12,258
(1.66 %)		 25,579
(2.30 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,162
(100.00 %)		 506,343
(6.77 %)		 182,589
(7.22 %)		 5,435,776
(23.60 %)		 29,420
(2.47 %)
223 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1		 50,290
(5.75 %)		 12,973
(1.67 %)		 21,670
(1.90 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 283
(100.00 %)		 548,090
(7.21 %)		 201,488
(8.55 %)		 7,030,877
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
224 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1		 36,497
(5.34 %)		 12,572
(1.79 %)		 10,629
(2.08 %)		 27,857
(3.09 %)		 41.71
(98.00 %)		 70,035
(2.03 %)		 75,898
(97.97 %)		 433,484
(5.29 %)		 166,251
(1.03 %)		 7,121,848
(18.23 %)		 19,927
(0.72 %)
225 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1		 n/a 12,826
(1.74 %)		 26,019
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 n/a 3,054
(100.00 %)		 482,850
(3.37 %)		 523,437
(10.15 %)		 6,386,315
(26.20 %)		 32,734
(4.25 %)
226 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1		 27,528
(4.03 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
227 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1		 n/a 16,954
(1.37 %)		 46,692
(2.27 %)		 n/a 43.66
(99.99 %)		 1,822
(0.01 %)		 31,565
(99.99 %)		 680,766
(3.36 %)		 930,904
(8.76 %)		 7,502,726
(27.96 %)		 56,390
(5.99 %)
228 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1		 n/a 12,665
(1.79 %)		 25,654
(2.40 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 339
(0.00 %)		 337
(100.00 %)		 428,675
(3.22 %)		 588,040
(7.38 %)		 6,466,447
(24.39 %)		 33,599
(4.75 %)
229 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1		 30,090
(4.91 %)		 12,645
(1.95 %)		 17,146
(2.49 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 185
(0.01 %)		 1,527
(99.99 %)		 457,266
(6.02 %)		 477,426
(4.49 %)		 6,482,932
(22.03 %)		 27,271
(2.40 %)
230 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1		 n/a 12,662
(1.93 %)		 23,695
(2.34 %)		 25,763
(3.61 %)		 42.49
(99.99 %)		 224
(0.01 %)		 1,951
(99.99 %)		 458,154
(6.01 %)		 482,974
(4.97 %)		 6,466,067
(22.21 %)		 27,890
(2.42 %)
231 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1		 n/a 15,672
(1.16 %)		 40,690
(1.82 %)		 n/a 45.19
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 34,693
(100.00 %)		 1,068,703
(34.46 %)		 796,004
(19.02 %)		 6,315,990
(40.22 %)		 57,647
(3.95 %)
232 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1		 n/a 12,580
(1.53 %)		 24,737
(2.00 %)		 n/a 44.45
(100.00 %)		 323
(0.00 %)		 501
(100.00 %)		 697,818
(28.44 %)		 510,301
(17.90 %)		 5,319,400
(34.64 %)		 36,632
(3.59 %)
233 South Island takahe (alternate 2021)
GCA_020801775.1		 n/a 12,655
(1.70 %)		 n/a n/a 43.63
(99.16 %)		 238
(0.84 %)		 178
(100.00 %)		 554,912
(9.42 %)		 230,808
(4.34 %)		 6,406,358
(24.83 %)		 22,941
(1.98 %)
234 South Island takahe (primary 2021)
GCA_020800305.1		 n/a 12,942
(1.69 %)		 23,221
(2.13 %)		 n/a 43.74
(99.58 %)		 327
(0.42 %)		 174
(100.00 %)		 577,553
(9.77 %)		 259,017
(5.20 %)		 6,430,968
(25.90 %)		 23,810
(2.02 %)
235 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1		 15,894
(2.09 %)		 11,566
(1.44 %)		 25,387
(1.84 %)		 n/a 40.95
(99.65 %)		 44,462
(0.35 %)		 114,650
(99.65 %)		 345,458
(6.87 %)		 154,693
(1.27 %)		 6,152,475
(19.42 %)		 7,821
(0.23 %)
236 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1		 n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 25,552
(2.34 %)
237 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 28,905
(2.31 %)
238 steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1		 n/a 2,176
(1.79 %)		 7,719
(4.37 %)		 n/a 49.74
(100.00 %)		 n/a 1,939
(100.00 %)		 136,312
(29.31 %)		 157,341
(15.03 %)		 648,725
(34.67 %)		 15,490
(8.23 %)
239 steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022)
GCA_026979565.1		 n/a 12,819
(1.94 %)		 24,247
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 178
(100.00 %)		 616,749
(11.96 %)		 411,917
(3.56 %)		 6,385,102
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
240 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1		 n/a 12,217
(1.73 %)		 25,261
(2.32 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 957
(100.00 %)		 423,239
(3.30 %)		 362,061
(4.83 %)		 4,954,262
(27.09 %)		 42,188
(4.05 %)
241 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1		 n/a 12,789
(1.82 %)		 24,509
(2.35 %)		 n/a 43.18
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 352
(100.00 %)		 413,598
(3.28 %)		 318,919
(3.99 %)		 5,977,564
(23.65 %)		 33,675
(3.21 %)
242 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1		 n/a 12,871
(1.88 %)		 22,508
(2.20 %)		 n/a 42.01
(96.97 %)		 578,921
(3.08 %)		 1,570
(100.00 %)		 554,367
(10.05 %)		 180,644
(0.89 %)		 6,158,602
(21.14 %)		 21,695
(1.62 %)
243 sunbittern
GCF_000690775.1		 15,772
(2.11 %)		 11,564
(1.45 %)		 25,522
(1.98 %)		 n/a 42.33
(99.55 %)		 52,471
(0.46 %)		 115,170
(99.54 %)		 346,556
(5.38 %)		 117,881
(0.88 %)		 6,391,987
(18.82 %)		 32,970
(1.31 %)
244 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1		 n/a 11,628
(1.91 %)		 21,635
(2.31 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 1,535
(100.00 %)		 421,231
(6.57 %)		 146,070
(1.11 %)		 5,727,350
(21.91 %)		 37,752
(3.68 %)
245 Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021)
GCA_020746105.1		 n/a 12,884
(1.85 %)		 23,805
(2.23 %)		 n/a 42.80
(99.12 %)		 253
(0.88 %)		 182
(100.00 %)		 539,771
(9.26 %)		 181,564
(1.14 %)		 6,538,228
(22.49 %)		 41,376
(3.37 %)
246 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,669
(2.52 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 704,976
(13.16 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
247 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2		 40,121
(5.41 %)		 13,004
(1.87 %)		 24,795
(2.41 %)		 n/a 42.48
(98.86 %)		 429
(1.14 %)		 160
(100.00 %)		 493,071
(5.80 %)		 589,858
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
248 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1		 n/a 12,160
(1.83 %)		 24,622
(2.46 %)		 n/a 43.37
(100.00 %)		 n/a 862
(100.00 %)		 383,634
(3.06 %)		 527,550
(8.40 %)		 5,916,654
(24.97 %)		 31,261
(3.21 %)
249 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1		 29,544
(4.27 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
250 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1		 62,728
(8.50 %)		 12,903
(1.98 %)		 21,943
(2.24 %)		 n/a 41.68
(97.40 %)		 63,061
(2.62 %)		 64,863
(97.38 %)		 590,350
(4.68 %)		 253,525
(1.38 %)		 6,926,961
(19.71 %)		 40,011
(3.69 %)
251 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1		 n/a 12,965
(1.97 %)		 25,182
(2.35 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 716
(0.01 %)		 2,119
(100.00 %)		 650,271
(7.44 %)		 270,668
(1.26 %)		 6,776,820
(21.19 %)		 35,560
(4.27 %)
252 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1		 43,215
(5.89 %)		 12,148
(1.89 %)		 19,386
(2.07 %)		 29,870
(3.24 %)		 41.36
(96.87 %)		 84,351
(3.16 %)		 91,944
(96.84 %)		 481,707
(5.57 %)		 230,143
(1.26 %)		 6,665,312
(19.42 %)		 38,930
(2.06 %)
253 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1		 n/a 11,432
(1.95 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 911
(100.00 %)		 470,125
(9.51 %)		 140,846
(3.57 %)		 5,002,695
(22.08 %)		 22,424
(2.33 %)
254 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1		 n/a 13,321
(1.76 %)		 24,102
(2.15 %)		 n/a 42.35
(99.83 %)		 203
(0.17 %)		 1,038
(100.00 %)		 593,409
(10.51 %)		 202,463
(9.29 %)		 6,160,173
(27.65 %)		 25,785
(2.35 %)
255 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1		 28,736
(4.57 %)		 12,828
(2.02 %)		 17,743
(2.65 %)		 n/a 41.69
(98.76 %)		 21,646
(1.24 %)		 27,052
(98.76 %)		 443,797
(5.51 %)		 346,281
(2.29 %)		 6,423,932
(19.90 %)		 27,086
(2.31 %)
256 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1		 n/a 12,203
(1.76 %)		 25,216
(2.40 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 450
(100.00 %)		 430,792
(3.25 %)		 542,908
(5.67 %)		 5,289,916
(24.99 %)		 36,805
(3.52 %)
257 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1		 n/a 12,867
(1.81 %)		 26,393
(2.48 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 311
(100.00 %)		 429,011
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,716
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
258 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1		 n/a 12,117
(2.03 %)		 21,464
(2.36 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 780
(100.00 %)		 732,317
(7.82 %)		 353,660
(1.57 %)		 6,119,549
(21.70 %)		 27,920
(2.56 %)
259 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1		 29,492
(4.02 %)		 12,972
(1.98 %)		 22,757
(2.27 %)		 n/a 41.66
(99.16 %)		 163
(0.84 %)		 105
(100.00 %)		 826,451
(8.47 %)		 411,356
(1.71 %)		 6,691,445
(22.36 %)		 29,882
(2.41 %)
260 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3		 38,427
(6.01 %)		 13,095
(1.96 %)		 23,974
(2.27 %)		 30,549
(3.14 %)		 41.35
(96.83 %)		 65,045
(3.16 %)		 250,220
(96.84 %)		 609,750
(9.03 %)		 243,534
(1.26 %)		 6,043,889
(21.06 %)		 31,818
(1.42 %)
261 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1		 n/a 12,910
(2.37 %)		 23,038
(2.58 %)		 53,269
(6.57 %)		 41.12
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 618,023
(8.91 %)		 227,783
(1.43 %)		 6,123,721
(21.03 %)		 20,379
(2.19 %)
262 village indigobird (OUT-0048 2022)
GCF_026979565.1		 44,961
(5.49 %)		 12,817
(1.94 %)		 24,245
(2.44 %)		 n/a 42.23
(99.98 %)		 458
(0.02 %)		 177
(100.00 %)		 616,746
(11.96 %)		 411,917
(3.57 %)		 6,385,057
(20.91 %)		 37,940
(2.83 %)
263 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1		 n/a 12,732
(1.51 %)		 23,395
(1.91 %)		 n/a 44.28
(99.99 %)		 668
(0.00 %)		 4,450
(100.00 %)		 526,500
(5.75 %)		 269,598
(14.29 %)		 4,825,913
(32.19 %)		 27,465
(2.18 %)
264 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1		 n/a 12,760
(1.53 %)		 23,262
(2.16 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 1,299
(100.00 %)		 497,104
(5.09 %)		 271,530
(15.72 %)		 5,291,065
(32.37 %)		 24,669
(1.78 %)
265 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1		 n/a 11,226
(2.33 %)		 20,526
(2.54 %)		 n/a 41.53
(100.00 %)		 n/a 5,463
(100.00 %)		 436,894
(5.48 %)		 209,008
(1.73 %)		 4,790,071
(20.27 %)		 17,864
(2.58 %)
266 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1		 n/a 12,775
(2.33 %)		 22,516
(2.50 %)		 n/a 41.49
(99.98 %)		 973
(0.02 %)		 318
(100.00 %)		 518,194
(5.54 %)		 276,294
(2.21 %)		 5,866,033
(21.12 %)		 21,287
(2.50 %)
267 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1		 n/a 12,480
(1.72 %)		 22,915
(2.17 %)		 n/a 44.29
(100.00 %)		 168
(0.00 %)		 1,631
(100.00 %)		 394,733
(2.99 %)		 364,498
(6.04 %)		 4,803,453
(27.52 %)		 42,022
(4.90 %)
268 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1		 n/a 13,128
(1.62 %)		 25,648
(2.11 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 272
(0.00 %)		 1,393
(100.00 %)		 449,314
(3.08 %)		 505,129
(6.52 %)		 4,634,925
(31.99 %)		 51,884
(4.81 %)
269 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1		 n/a 11,632
(1.83 %)		 20,659
(2.18 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,405
(100.00 %)		 553,633
(11.80 %)		 147,999
(0.81 %)		 5,825,472
(20.55 %)		 20,481
(1.61 %)
270 whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021)
GCA_020745705.1		 n/a 12,681
(1.84 %)		 21,784
(2.14 %)		 n/a 42.12
(99.13 %)		 218
(0.87 %)		 146
(100.00 %)		 520,200
(9.32 %)		 170,778
(0.83 %)		 6,455,910
(21.44 %)		 24,061
(1.62 %)
271 white wagtail
GCF_015832195.1		 47,145
(6.80 %)		 12,127
(1.86 %)		 22,301
(2.31 %)		 n/a 42.72
(99.92 %)		 906
(0.08 %)		 619
(100.00 %)		 479,546
(6.15 %)		 349,751
(5.62 %)		 6,384,256
(22.41 %)		 28,008
(2.68 %)
272 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1		 53,731
(6.26 %)		 12,981
(1.91 %)		 23,916
(2.40 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 n/a 643
(100.00 %)		 417,020
(3.98 %)		 366,209
(3.55 %)		 5,992,950
(21.48 %)		 28,964
(2.22 %)
273 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1		 45,894
(5.34 %)		 12,730
(1.91 %)		 19,044
(2.50 %)		 n/a 41.81
(99.24 %)		 13,527
(0.76 %)		 9,068
(100.00 %)		 489,252
(7.14 %)		 246,346
(1.38 %)		 6,500,956
(19.79 %)		 25,941
(1.84 %)
274 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1		 34,717
(4.88 %)		 12,599
(1.97 %)		 24,083
(2.44 %)		 n/a 42.03
(99.81 %)		 4,869
(0.19 %)		 11,576
(100.00 %)		 502,151
(6.20 %)		 449,641
(3.22 %)		 6,554,257
(20.25 %)		 28,891
(2.32 %)
275 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1		 20,744
(2.82 %)		 11,490
(1.49 %)		 22,258
(1.77 %)		 n/a 40.90
(99.56 %)		 60,579
(0.45 %)		 111,484
(99.55 %)		 325,669
(3.74 %)		 116,707
(0.60 %)		 6,725,133
(18.14 %)		 11,615
(0.32 %)
276 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1		 n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
277 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1		 n/a 7,755
(1.71 %)		 16,331
(2.39 %)		 n/a 43.66
(100.00 %)		 n/a 4,971
(100.00 %)		 304,566
(13.21 %)		 116,307
(6.64 %)		 3,407,853
(22.91 %)		 34,573
(4.56 %)
278 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1		 39,072
(5.37 %)		 12,919
(2.36 %)		 23,624
(2.48 %)		 n/a 41.37
(97.63 %)		 10,501
(2.38 %)		 7,343
(100.00 %)		 587,593
(8.19 %)		 231,665
(1.12 %)		 6,007,601
(20.08 %)		 21,298
(2.05 %)
279 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1		 16,342
(2.18 %)		 12,040
(1.50 %)		 26,704
(1.97 %)		 n/a 41.51
(99.50 %)		 65,286
(0.51 %)		 132,071
(99.49 %)		 353,892
(5.61 %)		 125,195
(0.74 %)		 6,873,137
(19.59 %)		 41,005
(1.45 %)
280 white-throated sparrow
GCF_000385455.1		 31,167
(5.71 %)		 11,241
(1.81 %)		 13,429
(2.26 %)		 n/a 41.52
(95.61 %)		 41,460
(4.40 %)		 37,661
(95.60 %)		 439,216
(5.96 %)		 364,202
(2.52 %)		 6,300,584
(19.09 %)		 15,091
(0.85 %)
281 white-throated tinamou
GCF_000705375.1		 18,997
(2.72 %)		 12,287
(1.75 %)		 20,132
(2.48 %)		 n/a 41.41
(97.88 %)		 59,853
(2.12 %)		 142,367
(97.88 %)		 366,311
(3.62 %)		 226,347
(1.35 %)		 6,300,683
(18.94 %)		 47,608
(2.60 %)
282 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1		 55,408
(5.57 %)		 13,574
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 930
(100.00 %)		 616,300
(10.57 %)		 211,558
(2.90 %)		 6,785,192
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
283 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1		 n/a 13,284
(1.87 %)		 23,528
(2.20 %)		 n/a 42.47
(99.50 %)		 586
(0.50 %)		 395
(100.00 %)		 569,940
(8.69 %)		 162,569
(0.98 %)		 7,021,319
(20.20 %)		 38,582
(3.77 %)
284 willow flycatcher
GCF_003031625.1		 37,909
(4.43 %)		 12,708
(1.90 %)		 19,591
(2.57 %)		 n/a 42.01
(95.33 %)		 39,319
(4.68 %)		 7,791
(100.00 %)		 550,172
(7.15 %)		 242,394
(1.27 %)		 6,421,292
(18.87 %)		 27,080
(1.82 %)
285 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2		 42,551
(5.86 %)		 12,535
(1.90 %)		 23,300
(2.38 %)		 n/a 42.06
(99.73 %)		 758
(0.26 %)		 1,768
(100.00 %)		 480,705
(7.12 %)		 240,463
(1.87 %)		 6,316,566
(20.20 %)		 25,317
(2.02 %)
286 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1		 n/a 13,053
(1.78 %)		 24,963
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 342
(0.00 %)		 1,350
(100.00 %)		 444,809
(3.08 %)		 473,154
(7.96 %)		 5,336,472
(25.82 %)		 37,198
(3.14 %)
287 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023)
GCA_029207755.1		 n/a 13,052
(1.78 %)		 24,950
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,695
(100.00 %)		 444,866
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,498
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
288 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1		 n/a 12,426
(1.63 %)		 27,565
(2.37 %)		 n/a 43.59
(100.00 %)		 246
(0.00 %)		 776
(100.00 %)		 447,274
(3.06 %)		 612,008
(10.28 %)		 5,606,168
(28.79 %)		 39,449
(2.66 %)
289 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1		 n/a 12,556
(1.69 %)		 26,545
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 440,673
(3.12 %)		 581,112
(9.17 %)		 6,158,372
(26.15 %)		 35,577
(2.57 %)
290 yellow-throated sandgrouse (2019)
GCA_009769525.1		 n/a 12,697
(1.89 %)		 25,289
(2.53 %)		 n/a 42.40
(99.62 %)		 242
(0.38 %)		 89
(100.00 %)		 510,633
(7.10 %)		 213,742
(1.12 %)		 6,627,716
(21.17 %)		 28,848
(2.23 %)
291 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1		 n/a 11,788
(1.85 %)		 23,306
(2.45 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 1,958
(100.00 %)		 467,960
(6.96 %)		 182,645
(0.99 %)		 6,050,545
(20.78 %)		 26,357
(2.20 %)
292 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2		 n/a 11,213
(2.01 %)		 21,533
(2.54 %)		 n/a 41.92
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 1,646
(100.00 %)		 470,860
(9.54 %)		 387,943
(3.32 %)		 5,428,128
(20.68 %)		 23,838
(2.47 %)
293 zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021)
GCF_003957565.2		 49,311
(7.41 %)		 12,747
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 544,577
(9.57 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,748
(20.92 %)		 29,202
(2.47 %)
294 zebra finch (Blue55 2020)
GCA_009859065.2		 n/a 12,796
(1.92 %)		 24,658
(2.44 %)		 n/a 41.91
(98.03 %)		 789
(1.97 %)		 541
(100.00 %)		 554,338
(9.67 %)		 339,851
(2.27 %)		 6,613,146
(20.04 %)		 28,678
(2.32 %)
295 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1		 n/a 11,340
(1.85 %)		 22,921
(2.37 %)		 n/a 41.73
(99.98 %)		 45
(0.01 %)		 5,381
(99.99 %)		 480,647
(8.44 %)		 365,668
(2.89 %)		 5,859,698
(20.27 %)		 24,649
(2.35 %)
296 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1		 n/a 10,734
(1.84 %)		 19,978
(2.21 %)		 n/a 41.07
(99.99 %)		 16
(0.01 %)		 4,677
(100.00 %)		 436,071
(7.44 %)		 217,580
(1.43 %)		 5,800,691
(19.24 %)		 19,512
(1.90 %)
297 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020)
GCA_008822115.3		 n/a 11,950
(2.00 %)		 22,828
(2.51 %)		 n/a 42.06
(98.45 %)		 583
(1.55 %)		 206
(100.00 %)		 494,110
(9.54 %)		 347,933
(2.80 %)		 5,875,448
(20.29 %)		 27,387
(2.57 %)
298 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1		 n/a 12,384
(1.97 %)		 23,021
(2.44 %)		 n/a 41.74
(98.02 %)		 828
(1.98 %)		 202
(100.00 %)		 511,324
(8.38 %)		 351,624
(2.53 %)		 6,328,918
(19.99 %)		 25,871
(2.29 %)
299 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2		 50,407
(7.20 %)		 12,470
(1.95 %)		 23,352
(2.42 %)		 n/a 41.81
(97.98 %)		 857
(2.02 %)		 205
(100.00 %)		 529,829
(9.55 %)		 357,586
(2.56 %)		 6,359,599
(20.12 %)		 27,755
(2.36 %)
TOTALS:total assembly count 299

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 200 assemblies assembly stats track stats
Mammals 481 assemblies assembly stats track stats
Birds 299 assemblies assembly stats track stats
Fishes 335 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 166 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 628 assemblies assembly stats track stats
Plants 249 assemblies assembly stats track stats
Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 264 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 73 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 401 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 648 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats