Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
36,494
(1.83 %)
2 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
15,130
(2.64 %)
48,742
(6.38 %)
31,637
(9.56 %)
39.16
(95.38 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
414,078
(2.35 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
35,229
(1.82 %)
3 American shad
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
n/a 43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
4 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
14,041
(2.45 %)
46,518
(5.89 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
396,703
(2.91 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
26,364
(1.18 %)
5 Arctic char
GCF_002910315.2
67,209
(5.00 %)
23,995
(1.55 %)
99,789
(3.91 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,209,252
(5.25 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
76,282
(1.94 %)
6 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
15,489
(0.95 %)
7 Asian bonytongue (2019 VGP)
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
16,528
(2.72 %)
76,597
(7.29 %)
72,696
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
505,816
(2.98 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,514
(10.63 %)
8 Asian bonytongue (alt pseudohaplotype VGP)
GCA_900964985.2
n/a 16,056
(2.72 %)
38,888
(6.61 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,348
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,543
(10.71 %)
9 Atlantic cod (2019 VGP)
GCF_902167405.1
51,655
(11.92 %)
14,072
(2.62 %)
70,314
(9.10 %)
68,853
(9.51 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
804,201
(10.41 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
10 Atlantic cod (alt pseudohaplotype VGP)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
37,289
(8.62 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,724
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
11 Atlantic halibut (2019 refseq VGP)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
n/a 42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
12 Atlantic halibut (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819745.1
n/a 16,556
(3.00 %)
34,725
(7.12 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,005
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
13 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
35,959
(1.97 %)
14 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
15 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
27,007
(1.35 %)
327,434
(9.03 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
4,390,220
(48.67 %)
2,496,837
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
79,791
(1.60 %)
16 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
67,338
(7.00 %)
17 ballan wrasse
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
16,142
(2.44 %)
53,087
(5.90 %)
40,572
(8.04 %)
40.89
(99.98 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
507,153
(3.90 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
21,221
(1.07 %)
18 banded archerfish
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
n/a 41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
19 barramundi perch
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
16,168
(3.05 %)
44,567
(6.62 %)
59,868
(9.06 %)
40.75
(100.00 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
466,974
(3.10 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
16,276
(1.04 %)
20 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
15,200
(2.55 %)
50,756
(6.03 %)
31,970
(7.55 %)
41.66
(93.68 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
454,833
(3.02 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
46,423
(2.30 %)
21 black rockcod
GCF_000735185.1
35,189
(8.55 %)
12,614
(2.15 %)
56,067
(6.01 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
317,142
(3.01 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
31,009
(2.11 %)
22 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
15,418
(2.38 %)
50,011
(5.76 %)
60,785
(6.30 %)
40.42
(89.87 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
897,490
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
21,237
(1.00 %)
23 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
n/a 40.66
(99.97 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
32,357
(1.59 %)
24 blunt-snouted clingfish (2019 refseq VGP)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,502
(1.97 %)
51,211
(5.47 %)
60,993
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
739,980
(4.26 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
25 blunt-snouted clingfish (alt pseudohaplotype VGP)
GCA_900650505.1
n/a 12,498
(1.92 %)
29,443
(5.22 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,171
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
26 Boeseman's rainbowfish
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
27 bony fishes
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
28 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
14,986
(2.72 %)
43,922
(5.97 %)
36,423
(9.60 %)
40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
736,179
(15.19 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
17,722
(0.91 %)
29 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
22,763
(1.21 %)
30 butterfish
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
31 channel catfish (USDA103 v2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
32,840
(1.87 %)
32 channel bull blenny (2019 refseq VGP)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,477
(3.02 %)
42,362
(6.73 %)
60,811
(10.44 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
427,781
(5.47 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
33 channel bull blenny (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900634435.1
n/a 15,971
(2.79 %)
36,711
(6.53 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,653
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
34 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
28,565
(1.65 %)
35 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
24,310
(1.76 %)
36 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
27,479
(1.53 %)
119,358
(4.10 %)
113,653
(4.61 %)
43.55
(97.26 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,490,923
(5.86 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
87,959
(2.02 %)
37 Chinook salmon (v2 2021 male)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
n/a 43.55
(99.99 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
62,726
(1.40 %)
38 chum salmon
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
51,797
(1.25 %)
39 climbing perch (v1.2 2018 refseq VGP)
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
15,243
(3.53 %)
22,714
(7.45 %)
64,006
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
325,346
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
40 climbing perch (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900650485.1
n/a 14,954
(3.50 %)
24,316
(7.31 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,990
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
41 clown anemonefish
GCF_002776465.1
41,819
(7.91 %)
15,688
(2.23 %)
50,500
(5.47 %)
33,631
(6.82 %)
39.47
(99.94 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
433,963
(2.90 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
23,542
(1.13 %)
42 coho salmon
GCF_002021735.2
100,863
(6.58 %)
27,090
(1.56 %)
111,323
(4.23 %)
126,176
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,566,881
(6.79 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
65,662
(1.36 %)
43 common carp SPL01 (2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
52,638
(1.62 %)
44 copperband butterflyfish
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
n/a 42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
45 dark-edged splitfin
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
46 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
28,299
(3.33 %)
47 denticle herring (2019 VGP)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,567
(3.77 %)
58,823
(8.66 %)
72,751
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
408,046
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
48 denticle herring (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900700345.2
n/a 14,126
(3.94 %)
32,057
(8.36 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,657
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
49 eastern happy
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
15,359
(2.22 %)
52,466
(6.26 %)
42,580
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
960,962
(21.85 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
50 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
15,847
(3.84 %)
47,961
(7.39 %)
51,559
(8.50 %)
42.56
(96.95 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
524,467
(5.37 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
41,947
(3.71 %)
51 electric eel (2020 VGP)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
52 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
n/a 40.94
(99.99 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
52,191
(2.51 %)
53 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
44,049
(1.94 %)
54 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
49,361
(2.78 %)
55 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
n/a 41.90
(99.97 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
45,885
(3.03 %)
56 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq VGP)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,440
(2.15 %)
51,452
(5.98 %)
n/a 41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,049,840
(17.13 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
57 flier cichlid (alt pseudohaplotype MPI-CPG 2019 VGP)
GCA_007364235.1
n/a 17,508
(2.06 %)
36,756
(5.66 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,983
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
58 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
26,431
(0.91 %)
59 gilthead seabream (2019 VGP)
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
15,415
(2.36 %)
56,395
(6.58 %)
73,317
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
533,781
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
60 gilthead seabream (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900880695.1
n/a 13,105
(2.37 %)
31,089
(6.36 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,755
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
61 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,084
(6.71 %)
29,507
(2.77 %)
87,748
(5.07 %)
112,633
(6.58 %)
37.54
(89.58 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,228,127
(5.00 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
70,606
(1.91 %)
62 goldfish
GCF_003368295.1
116,758
(8.75 %)
35,107
(2.94 %)
100,219
(5.57 %)
144,639
(7.36 %)
37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,713,126
(5.42 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
66,585
(2.06 %)
63 great blue-spotted mudskipper
GCF_000788275.1
25,835
(5.19 %)
14,226
(1.96 %)
43,856
(4.62 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
577,238
(5.21 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
44,972
(1.97 %)
64 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,769
(9.11 %)
15,348
(2.93 %)
42,609
(6.43 %)
33,754
(9.09 %)
40.86
(99.17 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
575,505
(4.02 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
15,850
(0.98 %)
65 greater pipefish (v1.2 2020 VGP)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
66 greater pipefish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_901709685.1
n/a 10,807
(5.59 %)
23,520
(12.24 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,373
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,098
(12.19 %)
67 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
37,217
(2.39 %)
68 guppy
GCF_000633615.1
48,303
(11.25 %)
14,443
(2.72 %)
44,760
(6.24 %)
34,730
(7.44 %)
39.33
(90.86 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,847
(2.42 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
35,188
(1.91 %)
69 honeycomb rockfish
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
70 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,598
(6.94 %)
30,809
(3.11 %)
89,934
(5.34 %)
102,760
(5.91 %)
37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,259,103
(4.89 %)
708,550
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
63,217
(1.71 %)
71 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
12,252
(0.38 %)
72 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
40,721
(2.36 %)
73 Indian glassy fish (2019 VGP)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,354
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
60,337
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
349,914
(3.01 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,929
(1.44 %)
74 Indian glassy fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900651595.1
n/a 14,424
(3.70 %)
23,986
(8.00 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,771
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
75 Indo-Pacific tarpon (2020 VGP)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
n/a 43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
76 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,851
(12.25 %)
14,521
(3.39 %)
45,927
(7.71 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,732
(2.83 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
21,768
(1.42 %)
77 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,539
(10.32 %)
14,342
(2.50 %)
53,130
(7.02 %)
38,211
(9.39 %)
40.84
(99.93 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
462,541
(9.51 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
41,215
(2.89 %)
78 jewelled blenny (2019 VGP)
GCF_902148845.1
42,890
(8.61 %)
15,200
(2.40 %)
86,752
(9.03 %)
58,518
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
671,028
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,462
(9.27 %)
79 jewelled blenny (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902148835.1
n/a 15,955
(2.17 %)
48,017
(7.54 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,225
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
80 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
n/a 43.50
(99.99 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
85,419
(2.52 %)
81 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
126,142
(4.04 %)
82 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
126,485
(3.95 %)
83 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,927
(11.76 %)
15,381
(3.00 %)
46,620
(6.99 %)
66,805
(9.15 %)
41.34
(99.67 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
481,459
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
28,138
(2.09 %)
84 largemouth bass
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
28,733
(1.66 %)
85 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
86 live sharksucker (2019 VGP)
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
14,989
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
56,376
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
449,887
(3.55 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
87 live sharksucker (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900963505.1
n/a 14,633
(3.50 %)
23,105
(7.10 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,739
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
88 lumpfish (2019 refseq VGP)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,794
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
89 lumpfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769515.1
n/a 12,850
(3.32 %)
28,938
(7.88 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,695
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
90 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
32,904
(9.12 %)
14,806
(2.69 %)
43,568
(5.91 %)
32,961
(6.26 %)
40.44
(80.94 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
719,439
(14.48 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
18,098
(0.91 %)
91 mandarin fish
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
15,999
(1.17 %)
92 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
39,541
(2.69 %)
93 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
16,523
(1.68 %)
54,451
(4.05 %)
41,410
(5.66 %)
38.00
(96.73 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,136,494
(6.77 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
44,933
(1.77 %)
94 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
n/a 38.41
(99.99 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
50,533
(2.46 %)
95 milkfish (2019 VGP)
GCF_902362185.1
30,825
(7.61 %)
16,880
(3.41 %)
42,123
(6.75 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
969,140
(8.12 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
96 milkfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902362175.1
n/a 16,569
(3.37 %)
22,769
(6.61 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,389
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
97 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,100
(12.11 %)
14,683
(2.71 %)
44,219
(6.38 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
306,640
(2.08 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
33,082
(2.28 %)
98 mudskipper P.magnuspinnatus (2020 VGP)
GCA_009829125.1
n/a 14,249
(2.37 %)
25,908
(5.85 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,335
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
99 mudskipper P.magnuspinnatus (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_009829135.1
n/a 13,492
(2.34 %)
26,853
(5.82 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,411
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
100 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
54,589
(2.39 %)
101 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
81,101
(3.45 %)
102 New Zealand spotty (2019 VGP)
GCA_009762535.1
n/a 14,621
(2.22 %)
23,355
(5.18 %)
n/a 40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,321
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
18,302
(0.85 %)
103 New Zealand spotty (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009762545.1
n/a 13,586
(2.17 %)
24,175
(5.10 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,656
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
104 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,397
(10.87 %)
15,598
(1.98 %)
60,464
(6.00 %)
82,099
(7.18 %)
40.73
(99.99 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
1,080,172
(20.34 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
32,038
(1.81 %)
105 ninespine stickleback
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
72,584
(9.69 %)
106 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
16,799
(2.37 %)
57,007
(5.60 %)
79,175
(7.51 %)
42.29
(99.99 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,104,914
(31.23 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
44,793
(2.82 %)
107 northern pike (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_011004835.1
n/a 11,792
(2.41 %)
21,365
(5.51 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,815
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
108 northern pike (2020 refseq VGP)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
n/a 42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
109 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
16,003
(2.73 %)
71,307
(7.27 %)
42,977
(10.01 %)
43.93
(92.03 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
350,270
(2.24 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
76,846
(4.18 %)
110 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
26,702
(1.46 %)
111 orbiculate cardinalfish (2019 VGP)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,772
(1.50 %)
52,078
(3.82 %)
60,005
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,270,059
(5.42 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
112 orbiculate cardinalfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902148825.1
n/a 14,030
(1.51 %)
30,797
(3.85 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,390
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
113 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
14,919
(2.72 %)
43,583
(5.99 %)
32,924
(7.29 %)
40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
729,866
(15.57 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
18,455
(0.96 %)
114 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
31,508
(2.30 %)
115 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
31,782
(2.27 %)
116 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
39,666
(1.93 %)
117 pinecone soldierfish (2019 VGP)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,756
(2.42 %)
53,616
(6.20 %)
57,173
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,066,671
(5.88 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
118 pinecone soldierfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902148815.1
n/a 15,562
(2.38 %)
28,491
(5.70 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,415
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
119 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
97,805
(3.04 %)
120 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
n/a 41.52
(99.98 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
73,879
(3.55 %)
121 prehistoric monster fish (2019 refseq VGP)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
n/a 41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
122 prehistoric monster fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902500245.1
n/a 10,952
(0.64 %)
33,472
(2.20 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,333
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
123 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
56,604
(1.05 %)
124 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
n/a 43.45
(99.74 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
73,586
(2.16 %)
125 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
17,088
(1.79 %)
57,594
(3.93 %)
41,365
(5.67 %)
40.45
(97.38 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
909,082
(4.77 %)
863,001
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
34,329
(1.24 %)
126 red-bellied piranha (2020 VGP)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
n/a 40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
127 reedfish (alt pseudohaplotype VGP)
GCA_900700845.2
n/a 9,953
(0.37 %)
31,519
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,562
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
63,365
(1.11 %)
128 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
129 river trout
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
27,433
(1.62 %)
110,789
(4.44 %)
122,381
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,488,597
(5.68 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
130 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
15,055
(2.70 %)
49,372
(6.45 %)
32,168
(7.41 %)
39.18
(83.41 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
418,326
(2.47 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
34,138
(1.62 %)
131 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
26,946
(1.79 %)
132 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,892
(7.02 %)
14,761
(2.02 %)
44,836
(4.64 %)
33,363
(6.22 %)
38.19
(86.93 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
399,245
(2.03 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
18,269
(0.66 %)
133 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
15,117
(2.72 %)
49,356
(6.49 %)
35,365
(9.23 %)
39.23
(84.81 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
383,850
(2.30 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
34,271
(1.66 %)
134 Siamese fighting fish (v3 2020 VGP)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
n/a 45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
135 Siamese fighting fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_900651605.1
n/a 14,505
(4.12 %)
36,022
(9.79 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,668
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
72,474
(13.55 %)
136 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
23,875
(1.36 %)
137 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
62,850
(1.45 %)
138 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
n/a 42.07
(99.94 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
88,984
(4.31 %)
139 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,380
(11.15 %)
14,684
(2.66 %)
45,367
(6.42 %)
37,048
(9.87 %)
38.97
(99.53 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
324,377
(2.73 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
34,667
(2.13 %)
140 southern bluefin tuna
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
141 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,330
(6.97 %)
30,927
(3.18 %)
87,234
(5.37 %)
109,330
(6.70 %)
37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,254,874
(5.00 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
64,238
(1.79 %)
142 spiny chromis
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
15,644
(2.29 %)
55,797
(5.61 %)
35,487
(7.65 %)
40.01
(85.05 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
373,924
(2.31 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
25,079
(0.95 %)
143 sterlet (maternal 2020 VGP)
GCA_902713425.1
n/a 22,326
(1.80 %)
33,919
(4.12 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,735
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
51,351
(1.78 %)
144 sterlet (paternal 2020 VGP)
GCA_902713435.1
n/a 22,726
(1.81 %)
34,878
(4.20 %)
n/a 39.60
(100.00 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,500
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
52,552
(1.72 %)
145 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
15,310
(2.91 %)
37,901
(5.38 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
695,993
(4.68 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
15,076
(0.95 %)
146 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
13,730
(0.95 %)
147 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
17,264
(1.20 %)
148 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
46,339
(3.96 %)
149 swamp eel
GCF_001952655.1
43,844
(10.64 %)
14,753
(2.97 %)
40,501
(6.16 %)
33,565
(9.14 %)
40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,616
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
7,065
(0.42 %)
150 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
27,129
(2.10 %)
151 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
25,784
(0.92 %)
152 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
80,336
(11.49 %)
153 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
61,010
(7.71 %)
154 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
14,207
(3.97 %)
39,860
(8.59 %)
34,435
(13.22 %)
40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
426,532
(4.33 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
17,094
(1.42 %)
155 torafugu (2019 VGP)
GCF_901000725.2
53,492
(18.31 %)
14,548
(4.79 %)
51,180
(11.72 %)
55,740
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
290,056
(10.32 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,973
(9.53 %)
156 torafugu (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_901000745.3
n/a 13,654
(4.82 %)
28,421
(10.82 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,790
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,931
(9.34 %)
157 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
65,633
(7.08 %)
158 turquoise killifish
GCF_001465895.1
40,386
(7.85 %)
14,356
(2.08 %)
101,715
(9.24 %)
57,281
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
457,873
(3.04 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
61,105
(2.15 %)
159 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
30,624
(1.94 %)
160 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
41,820
(1.75 %)
161 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,638
(14.00 %)
14,936
(3.24 %)
47,643
(7.50 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
382,467
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
30,581
(2.04 %)
162 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
45,067
(2.52 %)
163 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
24,342
(1.72 %)
164 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
15,588
(2.85 %)
41,675
(5.49 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
899,309
(10.59 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
24,238
(1.72 %)
165 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,121
(7.78 %)
15,449
(2.26 %)
51,330
(5.61 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
631,245
(4.88 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
35,251
(1.63 %)
166 yellowfin seabream
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
167 yellowfin tuna
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
14,420
(0.88 %)
168 yellowtail amberjack
GCF_002814215.1
41,181
(9.96 %)
15,871
(2.75 %)
54,501
(6.42 %)
34,514
(8.53 %)
40.75
(97.79 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
616,664
(4.14 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
18,054
(0.96 %)
169 Zealand spotty
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
n/a 40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
170 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,025
(8.37 %)
15,904
(2.10 %)
58,127
(6.09 %)
39,681
(7.23 %)
41.16
(99.99 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
1,039,803
(22.35 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
36,688
(1.98 %)
171 zebrafish T5D
GCA_018400075.1
n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
42,482
(2.03 %)
172 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
22,227
(2.53 %)
59,767
(3.64 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
5,029,496
(60.60 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
53,471
(2.06 %)
173 zig-zag eel (alt pseudohaplotype VGP)
GCA_900700395.1
n/a 1,206
(2.88 %)
2,741
(6.48 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,316
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
174 zig-zag eel (v1.2 2019 VGP)
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
15,052
(3.35 %)
21,643
(6.89 %)
60,604
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
349,298
(2.86 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 174

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 56 assemblies assembly stats track stats
Mammals 336 assemblies assembly stats track stats
Birds 164 assemblies assembly stats track stats
Fishes 174 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 69 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 427 assemblies assembly stats track stats
Plants 159 assemblies assembly stats track stats
Fungi 445 assemblies assembly stats track stats
Viruses 252 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 257 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 221 assemblies assembly stats track stats