Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024) GCA_043250625.1	n/a	15,735 (2.44 %)	50,184 (6.16 %)	n/a	40.90 (99.99 %)	471 (0.01 %)	203 (100.00 %)	1,781,283 (37.65 %)	444,047 (7.93 %)	4,765,080 (37.01 %)	39,918 (2.01 %)
2	alligator pipefish (LvHL_M 2021) GCF_019802595.1	54,226 (11.15 %)	13,427 (2.67 %)	46,903 (5.94 %)	n/a	42.94 (100.00 %)	144 (0.00 %)	143 (100.00 %)	1,200,994 (30.62 %)	143,062 (2.20 %)	3,921,676 (38.03 %)	67,978 (8.92 %)
3	allis shad GCF_017589495.1	48,507 (8.47 %)	15,371 (2.28 %)	58,686 (5.84 %)	n/a	42.99 (99.91 %)	1,541 (0.09 %)	1,095 (100.00 %)	1,190,406 (9.30 %)	1,205,679 (11.28 %)	3,960,328 (38.81 %)	36,494 (1.83 %)
4	Amazon molly GCF_000485575.1	56,958 (11.69 %)	15,117 (2.64 %)	30,114 (6.60 %)	n/a	39.16 (95.38 %)	36,429 (4.64 %)	31,058 (95.36 %)	346,461 (2.03 %)	188,557 (1.44 %)	5,139,633 (26.01 %)	35,229 (1.82 %)
5	amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021) GCF_021018895.1	47,198 (13.10 %)	15,500 (3.14 %)	41,230 (6.67 %)	n/a	40.79 (99.99 %)	150 (0.01 %)	31 (100.00 %)	1,230,524 (26.57 %)	398,694 (5.41 %)	4,106,609 (25.60 %)	15,656 (0.99 %)
6	American shad (fAloSap1 alternate hap 2021) GCA_018492705.1	n/a	15,901 (2.25 %)	61,133 (6.37 %)	n/a	43.14 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,411 (100.00 %)	2,043,181 (23.64 %)	1,141,539 (11.35 %)	3,668,314 (38.60 %)	40,218 (2.14 %)
7	American shad (primary hap 2021) GCF_018492685.1	70,400 (9.39 %)	16,145 (2.29 %)	60,087 (6.26 %)	76,974 (8.55 %)	43.18 (99.45 %)	1,639 (0.55 %)	74 (100.00 %)	1,297,174 (9.39 %)	1,245,221 (12.59 %)	3,857,267 (39.43 %)	42,699 (2.23 %)
8	Andian cavefish (hap1 2023 genbank) GCA_030014385.1	n/a	15,802 (1.97 %)	47,186 (4.62 %)	n/a	40.27 (100.00 %)	198 (0.00 %)	349 (100.00 %)	2,616,870 (40.73 %)	658,784 (9.71 %)	5,197,126 (48.95 %)	48,344 (2.62 %)
9	Andian cavefish (hap1 2023 refseq) GCF_030014385.1	42,881 (5.97 %)	15,802 (1.97 %)	47,186 (4.62 %)	n/a	40.27 (100.00 %)	198 (0.00 %)	349 (100.00 %)	2,616,870 (40.73 %)	658,784 (9.71 %)	5,197,126 (48.95 %)	48,344 (2.62 %)
10	annual killifish GCF_001266775.1	38,517 (8.87 %)	14,027 (2.45 %)	27,798 (5.86 %)	n/a	39.29 (80.23 %)	1,025,519 (19.94 %)	168,368 (80.17 %)	349,927 (2.63 %)	296,826 (3.18 %)	5,039,517 (28.69 %)	26,364 (1.18 %)
11	Antarctic jonasfish (primary hap 2024) GCA_963971535.1	n/a	16,678 (0.56 %)	151,361 (4.03 %)	n/a	44.57 (99.91 %)	15,113 (0.09 %)	5,983 (100.00 %)	12,251,532 (51.73 %)	3,521,157 (17.69 %)	10,051,020 (68.37 %)	494,595 (10.52 %)
12	Antarctic lanternfish (alternate hap 2023) GCA_951214905.1	n/a	17,318 (1.49 %)	80,097 (5.79 %)	n/a	43.49 (100.00 %)	n/a	11,436 (100.00 %)	5,482,467 (36.71 %)	1,454,729 (18.84 %)	6,756,226 (47.56 %)	92,057 (3.50 %)
13	Antarctic lanternfish (primary hap 2023) GCA_951216825.1	n/a	17,342 (1.44 %)	78,914 (5.48 %)	n/a	43.57 (99.96 %)	3,179 (0.04 %)	1,901 (100.00 %)	5,980,457 (37.18 %)	1,633,782 (21.76 %)	6,279,725 (52.83 %)	104,688 (3.57 %)
14	Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020) GCA_902827135.1	n/a	14,859 (1.97 %)	60,431 (5.73 %)	n/a	41.82 (99.99 %)	1,039 (0.01 %)	1,541 (100.00 %)	461,253 (3.08 %)	434,124 (6.81 %)	3,499,945 (42.99 %)	60,941 (3.20 %)
15	Arctic char (2024) GCF_045679555.1	101,825 (6.80 %)	26,394 (1.53 %)	107,089 (4.26 %)	n/a	43.53 (99.98 %)	3,854 (0.02 %)	939 (100.00 %)	1,090,104 (4.07 %)	1,787,017 (23.51 %)	9,220,961 (56.45 %)	78,798 (2.30 %)
16	Arctic char (CBP00131 primary hap 2024) GCA_036784965.1	n/a	22,376 (1.44 %)	97,559 (4.71 %)	n/a	43.37 (99.97 %)	3,235 (0.03 %)	4,404 (99.97 %)	999,920 (4.22 %)	1,630,911 (26.08 %)	7,875,105 (58.08 %)	70,947 (2.59 %)
17	Arctic char (IW2-2015 2018) GCF_002910315.2	67,196 (4.99 %)	23,967 (1.55 %)	45,775 (3.69 %)	n/a	43.16 (93.25 %)	1,718,015 (6.84 %)	16,700 (99.99 %)	1,011,348 (4.06 %)	1,666,148 (10.50 %)	10,597,529 (44.77 %)	76,282 (1.94 %)
18	Aristotle's catfish (alternate hap 2022) GCA_946807865.1	n/a	14,032 (2.44 %)	39,770 (4.92 %)	n/a	38.85 (100.00 %)	n/a	7,617 (100.00 %)	1,808,149 (37.98 %)	583,449 (10.56 %)	4,203,368 (40.67 %)	24,867 (2.06 %)
19	Aristotle's catfish (primary hap 2022) GCA_946808225.1	n/a	15,455 (2.53 %)	40,077 (4.90 %)	86,346 (8.45 %)	38.90 (99.98 %)	795 (0.02 %)	241 (100.00 %)	2,045,691 (38.70 %)	669,975 (11.72 %)	4,638,765 (42.07 %)	28,277 (1.93 %)
20	Arkansas darter GCF_013103735.1	51,282 (9.79 %)	14,588 (2.90 %)	42,306 (6.27 %)	n/a	40.52 (99.50 %)	35,052 (0.52 %)	4,664 (100.00 %)	418,294 (3.29 %)	331,380 (3.74 %)	4,153,309 (26.60 %)	15,489 (0.95 %)
21	arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022) GCA_026230005.1	n/a	17,862 (2.29 %)	70,667 (5.50 %)	n/a	40.01 (100.00 %)	327 (0.00 %)	179 (100.00 %)	2,876,989 (50.39 %)	700,511 (9.88 %)	5,977,913 (44.08 %)	104,320 (8.02 %)
22	arroyo chub (AC-1 primary hap 2022) GCA_026230025.1	n/a	18,025 (2.28 %)	71,255 (5.50 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	318 (0.00 %)	341 (100.00 %)	2,884,301 (50.42 %)	702,464 (9.98 %)	5,989,299 (44.18 %)	105,945 (8.03 %)
23	Asian bonytongue (2019) GCF_900964775.1	50,315 (9.13 %)	16,526 (2.73 %)	38,780 (6.64 %)	72,662 (8.52 %)	44.16 (99.99 %)	145 (0.01 %)	72 (100.00 %)	504,673 (3.06 %)	216,136 (1.69 %)	4,323,242 (26.50 %)	88,517 (10.73 %)
24	Asian bonytongue (alternate hap) GCA_900964985.2	n/a	16,053 (2.73 %)	74,777 (7.26 %)	n/a	44.15 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,006 (100.00 %)	482,351 (3.03 %)	207,018 (1.68 %)	4,139,370 (26.26 %)	85,546 (10.82 %)
25	Asian redtail catfish (EC202008001 2021) GCF_019097595.1	51,017 (10.40 %)	15,549 (2.60 %)	42,858 (5.39 %)	n/a	39.70 (100.00 %)	107 (0.00 %)	73 (100.00 %)	1,718,992 (31.80 %)	749,009 (14.09 %)	4,206,758 (37.30 %)	19,230 (1.16 %)
26	Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank) GCA_963924715.1	n/a	15,722 (2.57 %)	43,026 (5.68 %)	n/a	39.77 (99.99 %)	468 (0.01 %)	120 (100.00 %)	1,608,686 (33.02 %)	253,749 (4.14 %)	5,181,115 (27.80 %)	14,488 (0.90 %)
27	Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq) GCF_963924715.1	54,426 (12.09 %)	15,720 (2.57 %)	43,026 (5.68 %)	n/a	39.77 (99.99 %)	468 (0.01 %)	119 (100.00 %)	1,608,682 (33.02 %)	253,749 (4.14 %)	5,181,078 (27.80 %)	14,488 (0.90 %)
28	Atlantic cod (2019) GCF_902167405.1	51,642 (11.92 %)	14,055 (2.62 %)	36,761 (8.42 %)	68,438 (9.50 %)	45.64 (96.48 %)	1,216 (3.52 %)	227 (100.00 %)	790,946 (10.54 %)	855,327 (13.06 %)	2,851,161 (33.38 %)	97,133 (7.82 %)
29	Atlantic cod (alternate hap) GCA_902167395.1	n/a	13,366 (2.68 %)	66,599 (9.29 %)	n/a	45.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3,592 (100.00 %)	696,727 (10.13 %)	749,876 (13.00 %)	2,554,769 (33.77 %)	87,167 (8.03 %)
30	Atlantic halibut (2019 refseq) GCF_009819705.1	52,130 (11.46 %)	14,961 (3.19 %)	45,365 (7.48 %)	69,662 (10.94 %)	42.21 (99.43 %)	290 (0.57 %)	57 (100.00 %)	428,321 (4.16 %)	256,153 (3.73 %)	3,725,981 (24.13 %)	31,325 (2.25 %)
31	Atlantic halibut (alternate hap 2019) GCA_009819745.1	n/a	16,554 (3.01 %)	54,832 (7.45 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	62 (0.00 %)	4,053 (100.00 %)	494,008 (4.23 %)	299,066 (3.87 %)	4,272,649 (24.46 %)	36,868 (2.33 %)
32	Atlantic herring (v2) GCF_900700415.2	50,946 (10.35 %)	16,394 (2.60 %)	61,637 (7.20 %)	n/a	44.16 (99.89 %)	1,990 (0.11 %)	3,687 (99.89 %)	1,269,688 (11.71 %)	1,318,661 (13.43 %)	3,732,801 (32.49 %)	35,959 (1.97 %)
33	Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021) GCA_905171655.2	n/a	15,331 (2.42 %)	52,370 (6.91 %)	n/a	41.96 (100.00 %)	74 (0.00 %)	1,049 (100.00 %)	1,454,631 (18.29 %)	383,946 (4.34 %)	4,363,016 (32.69 %)	56,416 (3.08 %)
34	Atlantic horse mackerel (primary hap 2021) GCA_905171665.2	n/a	15,262 (2.42 %)	51,857 (6.86 %)	n/a	41.94 (100.00 %)	222 (0.00 %)	153 (100.00 %)	1,454,219 (18.25 %)	384,609 (4.72 %)	4,338,083 (32.80 %)	56,553 (3.08 %)
35	Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank) GCA_963691925.1	n/a	15,291 (2.56 %)	43,206 (5.92 %)	n/a	39.78 (99.96 %)	1,489 (0.04 %)	666 (100.00 %)	1,496,244 (26.83 %)	395,543 (8.92 %)	4,523,761 (29.92 %)	13,309 (0.75 %)
36	Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq) GCF_963691925.1	34,357 (8.10 %)	15,289 (2.56 %)	43,205 (5.92 %)	n/a	39.78 (99.96 %)	1,489 (0.04 %)	665 (100.00 %)	1,496,240 (26.83 %)	395,543 (8.92 %)	4,523,726 (29.93 %)	13,308 (0.75 %)
37	Atlantic salmon (refseq 2021) GCF_905237065.1	112,906 (5.61 %)	28,077 (1.40 %)	115,207 (3.75 %)	183,727 (7.26 %)	43.42 (100.00 %)	211 (0.00 %)	4,222 (100.00 %)	1,300,611 (4.84 %)	2,247,891 (25.01 %)	10,731,814 (59.31 %)	77,089 (1.86 %)
38	Atlantic salmon (Sally 2015) GCF_000233375.1	109,794 (5.45 %)	26,968 (1.35 %)	202,772 (19.11 %)	n/a	43.10 (88.27 %)	138,207 (11.73 %)	241,570 (99.97 %)	1,628,119 (9.46 %)	2,496,917 (19.18 %)	10,390,780 (51.80 %)	79,791 (1.60 %)
39	Atlantic turbot (AOZZmale01 2020) GCF_013347765.1	60,214 (14.44 %)	14,860 (3.40 %)	50,921 (8.07 %)	76,242 (9.93 %)	43.38 (100.00 %)	51 (0.00 %)	127 (100.00 %)	449,865 (5.00 %)	299,255 (7.03 %)	3,274,219 (25.77 %)	67,338 (7.00 %)
40	Australian ruff (RE-2024a hap1 2024) GCA_042242115.1	n/a	15,457 (2.72 %)	38,472 (5.59 %)	n/a	39.70 (100.00 %)	91 (0.00 %)	625 (100.00 %)	476,492 (3.25 %)	242,097 (6.02 %)	4,286,693 (33.41 %)	9,322 (0.80 %)
41	Australian ruff (RE-2024a hap2 2024) GCA_042242135.1	n/a	15,534 (2.50 %)	39,464 (5.26 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	98 (0.00 %)	552 (100.00 %)	498,493 (3.22 %)	271,314 (7.61 %)	4,161,752 (38.16 %)	9,637 (0.93 %)
42	ballan wrasse (2016) GCF_900080235.1	42,362 (9.30 %)	16,129 (2.44 %)	33,854 (5.87 %)	n/a	40.89 (99.98 %)	257 (0.02 %)	13,466 (100.00 %)	503,078 (3.93 %)	321,407 (5.60 %)	4,329,412 (30.36 %)	21,221 (1.07 %)
43	ballan wrasse (primary hap 2024 genbank) GCA_963930695.1	n/a	15,142 (2.66 %)	43,601 (6.21 %)	n/a	40.59 (99.98 %)	815 (0.02 %)	133 (100.00 %)	1,221,802 (30.10 %)	290,738 (7.79 %)	4,164,845 (30.34 %)	17,126 (0.94 %)
44	ballan wrasse (primary hap 2024 refseq) GCF_963930695.1	48,592 (12.09 %)	15,140 (2.66 %)	43,304 (6.14 %)	n/a	40.59 (99.98 %)	815 (0.02 %)	946 (99.98 %)	1,221,797 (30.10 %)	290,736 (7.79 %)	4,164,799 (30.34 %)	17,126 (0.94 %)
45	banded archerfish (alternate hap 2021) GCA_017976295.1	n/a	15,211 (3.23 %)	41,620 (7.14 %)	n/a	41.08 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2,393 (100.00 %)	785,178 (17.57 %)	249,148 (8.36 %)	3,391,653 (26.49 %)	13,787 (0.93 %)
46	banded archerfish (primary hap 2021 refseq) GCF_017976425.1	42,399 (11.11 %)	15,310 (3.17 %)	41,147 (7.01 %)	62,990 (9.37 %)	41.11 (99.82 %)	98 (0.18 %)	96 (100.00 %)	463,524 (3.35 %)	271,913 (9.55 %)	3,355,326 (28.08 %)	15,089 (0.96 %)
47	banded killifish (hap1 2024) GCA_037039145.1	n/a	15,122 (1.44 %)	65,809 (4.50 %)	n/a	41.23 (99.74 %)	293 (0.26 %)	331 (100.00 %)	2,545,429 (50.53 %)	451,939 (5.50 %)	5,807,705 (42.18 %)	94,695 (3.92 %)
48	banded killifish (hap2 2024) GCA_037038625.1	n/a	15,024 (1.45 %)	65,141 (4.53 %)	n/a	41.23 (99.52 %)	373 (0.48 %)	196 (100.00 %)	2,509,508 (50.53 %)	441,892 (5.11 %)	6,245,443 (38.22 %)	93,198 (3.82 %)
49	barbel (alternate hap 2022) GCA_936446605.1	n/a	26,794 (3.15 %)	76,434 (5.64 %)	n/a	37.81 (100.00 %)	1 (0.00 %)	8,035 (100.00 %)	4,084,361 (52.18 %)	538,411 (4.25 %)	7,659,980 (38.94 %)	58,008 (2.90 %)
50	barbel (primary hap 2022) GCA_936440315.1	n/a	31,876 (3.30 %)	85,063 (5.65 %)	n/a	37.89 (100.00 %)	108 (0.00 %)	92 (100.00 %)	4,839,533 (52.47 %)	646,636 (4.57 %)	8,240,279 (42.13 %)	71,384 (3.04 %)
51	barramundi perch (ASB-BC8 2022) GCF_001640805.2	53,646 (13.68 %)	16,073 (3.06 %)	44,214 (6.63 %)	n/a	40.76 (98.88 %)	674 (1.12 %)	2,997 (100.00 %)	986,469 (19.78 %)	237,272 (4.32 %)	3,983,840 (23.58 %)	16,237 (1.03 %)
52	beardfish (hap1 2025) GCA_047511565.1	n/a	15,938 (3.00 %)	52,921 (7.52 %)	n/a	43.38 (99.98 %)	752 (0.02 %)	327 (100.00 %)	993,554 (11.81 %)	755,389 (11.75 %)	3,469,352 (30.25 %)	68,008 (5.51 %)
53	beardfish (hap2 2025) GCA_047511595.1	n/a	15,940 (3.02 %)	51,682 (7.42 %)	n/a	43.31 (99.98 %)	756 (0.02 %)	200 (100.00 %)	986,717 (11.69 %)	754,642 (11.91 %)	3,459,958 (30.32 %)	67,732 (5.27 %)
54	bicolor damselfish GCF_000690725.1	32,951 (8.67 %)	15,181 (2.55 %)	31,420 (5.94 %)	n/a	41.66 (93.68 %)	44,409 (6.34 %)	42,059 (93.66 %)	351,453 (2.61 %)	180,113 (1.20 %)	5,016,154 (23.41 %)	46,423 (2.30 %)
55	bight redfish (hap1 2025) GCA_048128805.1	n/a	16,025 (2.63 %)	53,351 (6.76 %)	n/a	42.47 (99.98 %)	699 (0.02 %)	322 (100.00 %)	995,401 (9.22 %)	626,617 (9.80 %)	4,302,378 (31.80 %)	38,231 (2.50 %)
56	bight redfish (hap2 2025) GCA_048129085.1	n/a	15,902 (2.63 %)	52,639 (6.71 %)	n/a	42.44 (99.98 %)	680 (0.02 %)	204 (100.00 %)	989,039 (9.11 %)	628,091 (9.80 %)	4,315,800 (31.97 %)	37,729 (2.33 %)
57	black goby (alternate hap 2023) GCA_951799965.1	n/a	14,534 (2.11 %)	56,906 (6.41 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	n/a	3,523 (100.00 %)	2,445,373 (45.07 %)	452,878 (9.46 %)	4,195,077 (39.49 %)	77,592 (4.86 %)
58	black goby (primary hap 2023) GCA_951799975.1	n/a	14,455 (2.06 %)	56,488 (6.31 %)	n/a	42.10 (99.99 %)	636 (0.01 %)	298 (100.00 %)	3,230,397 (55.09 %)	494,440 (10.43 %)	4,359,169 (40.46 %)	81,684 (4.81 %)
59	black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022) GCA_022578405.1	n/a	31,847 (2.01 %)	153,565 (6.53 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	639 (0.00 %)	63,422 (100.00 %)	2,786,840 (18.28 %)	1,016,389 (7.50 %)	8,844,631 (26.90 %)	130,556 (4.42 %)
60	black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq) GCF_022577435.1	42,351 (12.09 %)	14,988 (3.02 %)	47,106 (6.98 %)	n/a	41.61 (100.00 %)	234 (0.00 %)	463 (100.00 %)	1,017,142 (18.99 %)	360,899 (8.75 %)	3,761,447 (28.91 %)	48,360 (4.43 %)
61	black rockcod GCF_000735185.1	35,176 (8.54 %)	12,601 (2.15 %)	42,589 (6.13 %)	n/a	40.62 (97.93 %)	59,164 (2.09 %)	72,571 (97.92 %)	268,591 (2.71 %)	238,334 (3.18 %)	3,425,479 (29.48 %)	31,009 (2.11 %)
62	black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023) GCF_030273125.1	43,392 (8.45 %)	15,522 (2.13 %)	48,255 (5.50 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	341 (0.00 %)	92 (100.00 %)	1,651,919 (22.26 %)	782,601 (7.55 %)	5,398,047 (38.87 %)	24,508 (1.19 %)
63	blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023) GCA_028021495.1	n/a	15,274 (2.92 %)	51,453 (7.45 %)	n/a	43.07 (99.99 %)	373 (0.01 %)	461 (100.00 %)	1,239,364 (29.69 %)	354,703 (9.63 %)	3,006,556 (30.35 %)	53,503 (4.48 %)
64	blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023) GCA_028022725.1	n/a	15,043 (2.96 %)	50,860 (7.54 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	366 (0.01 %)	109 (100.00 %)	1,210,142 (29.44 %)	340,820 (9.19 %)	2,986,750 (29.89 %)	52,010 (4.20 %)
65	blackstripe livebearer (line A6 2022) GCF_027474105.1	44,847 (11.30 %)	15,364 (2.86 %)	51,122 (6.88 %)	n/a	39.48 (99.99 %)	89 (0.01 %)	415 (100.00 %)	1,160,519 (28.33 %)	183,082 (4.75 %)	4,354,804 (27.83 %)	40,207 (2.97 %)
66	blacktail shiner (hap1 2024) GCA_038021265.1	n/a	17,403 (2.99 %)	45,903 (5.38 %)	n/a	38.64 (99.99 %)	709 (0.01 %)	673 (100.00 %)	2,141,901 (35.77 %)	482,931 (17.18 %)	4,297,133 (46.82 %)	41,889 (2.32 %)
67	blacktail shiner (hap2 2024) GCA_038024135.1	n/a	17,486 (2.97 %)	46,833 (5.41 %)	n/a	38.79 (99.99 %)	720 (0.01 %)	413 (100.00 %)	2,165,269 (36.18 %)	490,692 (17.84 %)	4,251,333 (47.54 %)	42,744 (2.37 %)
68	blue catfish (D&B 2022) GCF_023375685.1	48,916 (10.27 %)	15,574 (2.62 %)	44,035 (5.21 %)	n/a	39.80 (98.04 %)	171 (1.96 %)	43 (100.00 %)	2,180,806 (45.14 %)	625,260 (6.63 %)	5,137,199 (35.52 %)	31,164 (1.89 %)
69	blue tilapia (BGI-SZ) GCF_005870065.1	36,881 (7.40 %)	15,408 (2.38 %)	27,235 (5.59 %)	n/a	40.42 (89.87 %)	53,539 (10.15 %)	12,952 (100.00 %)	867,639 (16.39 %)	195,137 (1.62 %)	5,293,484 (23.10 %)	21,238 (1.02 %)
70	blue tilapia (Guangdong) GCF_013358895.1	57,860 (9.04 %)	15,494 (1.98 %)	57,878 (5.63 %)	56,939 (8.11 %)	40.66 (99.97 %)	723 (0.03 %)	304 (100.00 %)	1,055,724 (20.14 %)	324,841 (3.27 %)	5,000,753 (32.08 %)	32,357 (1.59 %)
71	blue whiting (primary hap 2024) GCA_964030765.1	n/a	13,097 (2.93 %)	55,097 (8.76 %)	n/a	45.82 (99.88 %)	3,055 (0.12 %)	3,832 (100.00 %)	1,337,604 (32.27 %)	749,185 (17.27 %)	2,363,606 (35.06 %)	78,815 (8.25 %)
72	bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023) GCA_030710495.1	n/a	14,996 (2.68 %)	44,244 (6.44 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	211 (0.00 %)	59 (100.00 %)	1,619,681 (30.07 %)	337,749 (4.31 %)	4,541,709 (29.20 %)	14,576 (0.85 %)
73	bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023) GCF_030265055.1	63,345 (14.83 %)	14,387 (3.54 %)	43,563 (7.96 %)	n/a	41.68 (100.00 %)	12 (0.00 %)	57 (100.00 %)	842,739 (18.67 %)	356,558 (12.86 %)	2,720,911 (41.08 %)	40,187 (4.66 %)
74	blunt-snouted clingfish (alternate hap) GCA_900650505.1	n/a	12,494 (1.93 %)	44,967 (5.14 %)	n/a	38.20 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,675 (100.00 %)	608,174 (4.23 %)	390,755 (4.71 %)	4,977,071 (42.41 %)	23,532 (1.46 %)
75	blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank) GCA_900634775.2	n/a	14,499 (1.97 %)	51,213 (5.47 %)	n/a	38.27 (98.47 %)	1,160 (1.53 %)	442 (100.00 %)	731,731 (4.21 %)	471,623 (4.92 %)	5,974,055 (42.88 %)	29,052 (1.48 %)
76	Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021) GCA_017639755.1	n/a	13,882 (2.27 %)	45,919 (5.98 %)	n/a	39.50 (99.99 %)	45 (0.01 %)	3,194 (100.00 %)	803,073 (13.60 %)	258,404 (4.19 %)	4,674,614 (28.36 %)	15,524 (1.02 %)
77	Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021) GCF_017639745.1	51,238 (8.77 %)	15,174 (2.24 %)	51,552 (6.21 %)	n/a	39.65 (99.63 %)	440 (0.37 %)	93 (100.00 %)	542,278 (3.15 %)	303,669 (4.77 %)	5,189,645 (29.11 %)	18,525 (1.10 %)
78	Bolin's lanternfish (primary hap 2024) GCA_963924005.1	n/a	16,964 (1.77 %)	67,673 (5.93 %)	n/a	42.61 (99.97 %)	1,785 (0.03 %)	979 (100.00 %)	4,285,965 (30.73 %)	1,222,431 (20.69 %)	6,105,881 (46.99 %)	73,543 (3.28 %)
79	bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022) GCA_933228925.1	n/a	12,424 (1.95 %)	46,550 (6.00 %)	n/a	41.63 (100.00 %)	n/a	4,619 (100.00 %)	789,207 (14.61 %)	348,482 (20.98 %)	3,447,241 (38.72 %)	27,035 (4.16 %)
80	bonti-bonti (primary hap 2022) GCA_933228915.1	n/a	14,929 (1.93 %)	55,343 (5.90 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	1,329 (0.03 %)	146 (100.00 %)	998,246 (14.90 %)	443,155 (22.40 %)	4,319,947 (40.01 %)	34,018 (4.16 %)
81	bony fish B.hirsutus (HB-005 2024) GCF_040956055.1	24,050 (11.30 %)	14,596 (4.48 %)	52,760 (11.00 %)	n/a	44.75 (99.96 %)	1,486 (0.04 %)	1,370 (100.00 %)	471,281 (10.94 %)	181,798 (7.38 %)	2,008,576 (24.90 %)	46,438 (14.87 %)
82	bony fish P.dabryanus (BB 2023) GCF_030506205.1	86,420 (8.25 %)	22,100 (2.28 %)	59,296 (4.66 %)	n/a	38.32 (100.00 %)	1 (0.00 %)	610 (100.00 %)	3,555,303 (40.49 %)	538,181 (9.64 %)	6,137,303 (50.16 %)	71,533 (4.06 %)
83	bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022) GCF_022749685.1	37,003 (8.79 %)	15,275 (2.46 %)	46,371 (5.95 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	8 (0.00 %)	186 (100.00 %)	1,369,180 (24.73 %)	232,889 (8.56 %)	4,426,024 (31.90 %)	27,133 (1.64 %)
84	bony fish T.vachellii (PV-2020 2023) GCF_030014155.1	43,278 (10.19 %)	15,613 (2.96 %)	39,340 (5.77 %)	n/a	39.31 (99.98 %)	291 (0.02 %)	78 (100.00 %)	1,563,305 (33.23 %)	689,312 (9.96 %)	3,954,578 (35.31 %)	20,152 (1.50 %)
85	bowfin (hap1 2024 refseq) GCF_036373705.1	55,474 (7.85 %)	13,848 (1.83 %)	27,055 (4.43 %)	n/a	40.75 (100.00 %)	97 (0.00 %)	389 (100.00 %)	953,492 (13.69 %)	387,699 (7.91 %)	4,552,359 (37.72 %)	46,301 (2.99 %)
86	bowfin (hap2 2024) GCA_036365475.1	n/a	13,813 (1.89 %)	27,088 (4.55 %)	n/a	40.60 (100.00 %)	80 (0.00 %)	297 (100.00 %)	886,999 (13.24 %)	358,077 (7.37 %)	4,625,277 (36.22 %)	43,764 (2.79 %)
87	Brauer's lanternfish (alternate hap 2023) GCA_963281105.1	n/a	17,999 (1.60 %)	76,655 (5.58 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	5 (0.00 %)	10,799 (100.00 %)	5,994,257 (39.29 %)	1,126,685 (10.35 %)	6,996,991 (46.02 %)	71,016 (3.36 %)
88	Brauer's lanternfish (primary hap 2023) GCA_963280865.1	n/a	17,865 (1.56 %)	76,506 (5.59 %)	n/a	42.15 (99.96 %)	2,704 (0.04 %)	676 (100.00 %)	6,391,921 (39.62 %)	1,227,487 (11.70 %)	6,669,558 (49.73 %)	76,828 (3.96 %)
89	broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025) GCA_048301445.1	n/a	13,406 (4.62 %)	41,458 (10.33 %)	n/a	43.23 (100.00 %)	78 (0.00 %)	155 (100.00 %)	205,224 (2.93 %)	217,943 (13.58 %)	1,368,592 (36.56 %)	48,018 (12.44 %)
90	broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025) GCA_048301605.1	n/a	13,414 (4.78 %)	41,481 (10.68 %)	n/a	43.24 (100.00 %)	90 (0.00 %)	126 (100.00 %)	203,521 (2.96 %)	200,308 (11.44 %)	1,413,994 (34.72 %)	47,578 (12.59 %)
91	broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023) GCF_033458585.1	49,639 (15.87 %)	13,630 (3.98 %)	43,263 (9.12 %)	n/a	43.65 (100.00 %)	40 (0.00 %)	495 (100.00 %)	727,223 (20.88 %)	290,624 (20.53 %)	1,369,709 (43.82 %)	51,671 (14.43 %)
92	brook trout (EN_2023a 2023) GCF_029448725.1	92,568 (6.87 %)	26,875 (1.47 %)	114,101 (4.26 %)	n/a	43.70 (99.83 %)	4,299 (0.17 %)	2,721 (100.00 %)	5,005,012 (52.10 %)	2,055,293 (26.66 %)	9,701,968 (57.04 %)	89,897 (2.49 %)
93	brown-marbled grouper (2020) GCF_011397635.1	49,205 (8.52 %)	15,634 (1.92 %)	53,710 (4.99 %)	n/a	41.33 (100.00 %)	205 (0.00 %)	26 (100.00 %)	632,147 (3.01 %)	371,482 (3.01 %)	6,438,110 (31.32 %)	26,136 (0.96 %)
94	Burton's mouthbrooder (Broad 2011) GCF_000239415.1	47,805 (10.97 %)	14,997 (2.72 %)	25,504 (5.86 %)	n/a	40.51 (84.10 %)	61,073 (15.93 %)	69,067 (84.07 %)	311,174 (3.20 %)	125,534 (0.72 %)	4,461,288 (20.25 %)	17,722 (0.91 %)
95	Burton's mouthbrooder (NCSU 2021) GCF_018398535.1	52,584 (12.38 %)	15,229 (2.54 %)	47,264 (5.92 %)	n/a	40.68 (89.05 %)	32,418 (10.97 %)	7,421 (100.00 %)	812,382 (17.52 %)	158,486 (1.12 %)	4,571,794 (23.61 %)	22,763 (1.21 %)
96	butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021) GCA_020382915.1	n/a	15,228 (3.42 %)	41,322 (7.36 %)	n/a	41.47 (100.00 %)	4 (0.00 %)	1,592 (100.00 %)	972,098 (18.43 %)	155,031 (1.41 %)	3,452,400 (21.36 %)	15,255 (1.12 %)
97	butterfish (primary hap 2021) GCF_020382885.2	52,828 (14.10 %)	15,261 (3.43 %)	40,580 (7.38 %)	n/a	41.49 (99.70 %)	77 (0.30 %)	48 (100.00 %)	413,775 (3.11 %)	160,299 (1.55 %)	3,420,994 (21.24 %)	15,574 (1.13 %)
98	butterfly blenny (primary hap 2023) GCA_963422515.1	n/a	14,403 (2.47 %)	61,860 (7.37 %)	n/a	43.15 (99.96 %)	1,625 (0.04 %)	525 (100.00 %)	959,651 (12.16 %)	517,137 (13.14 %)	3,775,081 (32.47 %)	81,881 (6.68 %)
99	California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022) GCA_022749735.1	n/a	19,842 (2.16 %)	72,007 (6.04 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	2,679 (0.02 %)	15,877 (99.98 %)	1,911,945 (24.70 %)	364,933 (8.56 %)	6,201,042 (32.00 %)	39,114 (1.56 %)
100	California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022) GCA_022749685.1	n/a	15,277 (2.46 %)	46,371 (5.95 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	8 (0.00 %)	179 (100.00 %)	1,369,186 (24.73 %)	232,889 (8.56 %)	4,426,065 (31.90 %)	27,134 (1.64 %)
101	channel bull blenny (2019 refseq) GCF_900634415.1	40,788 (11.04 %)	14,472 (3.02 %)	24,012 (6.59 %)	60,720 (10.43 %)	40.96 (99.58 %)	445 (0.42 %)	322 (100.00 %)	420,697 (5.49 %)	320,518 (6.91 %)	3,394,846 (28.67 %)	20,453 (1.39 %)
102	channel bull blenny (alternate hap 2019) GCA_900634435.1	n/a	15,980 (2.79 %)	53,680 (6.62 %)	n/a	40.96 (100.00 %)	10 (0.00 %)	11,565 (100.00 %)	451,656 (4.76 %)	321,158 (5.51 %)	3,800,099 (26.83 %)	20,338 (1.21 %)
103	channel catfish (USDA103 v2.0 2022) GCF_001660625.3	59,187 (10.70 %)	15,782 (2.57 %)	45,562 (5.15 %)	n/a	39.82 (99.35 %)	100 (0.65 %)	137 (100.00 %)	2,257,240 (46.82 %)	671,926 (8.67 %)	5,043,664 (36.53 %)	34,284 (2.16 %)
104	cherry salmon (Uvic2021 2024) GCF_036934945.1	80,307 (5.31 %)	27,171 (1.38 %)	123,048 (4.00 %)	n/a	44.12 (99.94 %)	4,047 (0.06 %)	18,306 (100.00 %)	1,207,353 (5.23 %)	2,779,869 (27.93 %)	11,429,057 (55.56 %)	83,137 (1.99 %)
105	chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq) GCF_039877785.1	38,623 (10.62 %)	15,604 (3.07 %)	48,037 (7.05 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	49 (0.00 %)	36 (100.00 %)	1,224,649 (24.57 %)	254,015 (3.62 %)	3,657,926 (23.28 %)	30,971 (2.02 %)
106	chevron butterflyfish (hap2 2024) GCA_039877575.1	n/a	15,116 (2.91 %)	47,839 (7.01 %)	n/a	42.73 (100.00 %)	43 (0.00 %)	71 (100.00 %)	463,848 (3.80 %)	254,561 (4.23 %)	3,654,295 (24.08 %)	30,593 (1.99 %)
107	chichlid (S. diagramma) GCF_900408965.1	61,496 (12.33 %)	15,296 (2.30 %)	50,818 (6.10 %)	n/a	40.92 (100.00 %)	942 (0.00 %)	823 (100.00 %)	920,881 (19.96 %)	193,629 (1.36 %)	4,724,179 (28.98 %)	28,565 (1.65 %)
108	Chinamanfish (OG11 2025) GCA_048128725.1	n/a	15,739 (1.88 %)	46,290 (4.42 %)	n/a	39.31 (100.00 %)	70 (0.00 %)	89 (100.00 %)	663,559 (2.79 %)	371,107 (3.14 %)	7,519,173 (32.84 %)	17,824 (0.70 %)
109	Chinese cavefish (2022) GCF_024868665.1	48,058 (11.91 %)	16,738 (3.72 %)	46,295 (6.80 %)	n/a	39.61 (98.56 %)	9,510 (1.45 %)	1,039 (100.00 %)	1,469,931 (44.44 %)	188,838 (2.34 %)	3,624,116 (35.94 %)	44,615 (5.01 %)
110	Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020) GCF_014805685.1	49,677 (9.64 %)	15,266 (2.70 %)	40,151 (5.21 %)	n/a	38.75 (99.82 %)	597 (0.18 %)	286 (100.00 %)	772,209 (6.45 %)	630,039 (7.45 %)	4,729,261 (37.48 %)	24,310 (1.76 %)
111	Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022) GCF_019703515.2	89,005 (6.31 %)	26,613 (1.64 %)	77,184 (3.14 %)	n/a	39.08 (100.00 %)	224 (0.00 %)	353 (100.00 %)	9,298,177 (59.91 %)	977,119 (3.49 %)	13,499,422 (52.38 %)	100,309 (2.90 %)
112	Chinook salmon (v1 2018 female) GCF_002872995.1	81,340 (5.14 %)	27,462 (1.53 %)	54,538 (3.80 %)	n/a	43.55 (97.26 %)	272,151 (2.76 %)	15,944 (99.99 %)	1,207,194 (4.55 %)	2,524,408 (13.75 %)	12,127,831 (47.56 %)	87,959 (2.02 %)
113	Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq) GCF_018296145.1	92,383 (5.73 %)	26,372 (1.57 %)	107,059 (4.12 %)	157,582 (6.65 %)	43.55 (99.99 %)	2,334 (0.01 %)	9,978 (99.99 %)	1,483,168 (7.79 %)	2,306,695 (23.48 %)	10,038,888 (54.54 %)	62,726 (1.40 %)
114	chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022) GCA_027409835.1	n/a	15,165 (2.44 %)	46,105 (6.16 %)	n/a	39.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,163 (100.00 %)	1,546,066 (27.08 %)	537,737 (9.87 %)	4,485,153 (30.70 %)	14,774 (0.81 %)
115	chub mackerel (primary hap 2022 refseq) GCF_027409825.1	34,390 (6.95 %)	15,348 (2.35 %)	46,858 (6.07 %)	n/a	40.01 (99.92 %)	1,572 (0.08 %)	360 (100.00 %)	1,669,322 (28.44 %)	638,340 (11.55 %)	4,613,373 (32.38 %)	16,290 (0.85 %)
116	chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020) GCF_012931545.1	76,338 (6.27 %)	23,186 (1.70 %)	90,881 (4.14 %)	n/a	43.06 (95.36 %)	242,238 (4.66 %)	28,109 (99.98 %)	1,143,292 (6.07 %)	1,487,818 (12.14 %)	8,992,314 (46.24 %)	51,797 (1.25 %)
117	chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022) GCF_023373465.1	205,915 (6.68 %)	26,582 (1.42 %)	119,437 (4.14 %)	120,379 (5.87 %)	43.89 (99.99 %)	3,433 (0.01 %)	17,480 (99.99 %)	1,160,500 (5.63 %)	2,584,312 (31.72 %)	10,621,107 (55.67 %)	68,538 (1.53 %)
118	climbing perch (alternate hap 2019) GCA_900650485.1	n/a	14,940 (3.51 %)	39,688 (7.41 %)	n/a	40.40 (99.61 %)	36 (0.39 %)	2,641 (100.00 %)	307,993 (2.63 %)	121,935 (1.79 %)	3,190,928 (20.98 %)	10,131 (0.86 %)
119	climbing perch (v1.3 2021) GCA_900324465.3	n/a	15,241 (3.53 %)	39,067 (7.54 %)	67,055 (11.68 %)	40.40 (99.35 %)	266 (0.65 %)	51 (100.00 %)	633,883 (15.28 %)	130,249 (1.89 %)	3,325,008 (21.31 %)	10,500 (0.87 %)
120	clown anemonefish (DU_AmpOce 2017) GCF_002776465.1	53,567 (9.24 %)	15,685 (2.23 %)	33,477 (5.63 %)	n/a	39.47 (99.94 %)	1,406 (0.06 %)	6,405 (100.00 %)	431,950 (2.92 %)	381,394 (4.84 %)	4,952,343 (31.95 %)	23,543 (1.15 %)
121	clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022) GCF_022539595.1	53,912 (11.11 %)	15,702 (2.37 %)	47,805 (5.50 %)	n/a	39.59 (99.98 %)	1,454 (0.02 %)	354 (100.00 %)	1,346,903 (35.25 %)	401,782 (5.36 %)	4,891,035 (31.59 %)	23,489 (1.28 %)
122	coho salmon (150728-3 2019) GCF_002021735.2	100,850 (6.58 %)	27,072 (1.56 %)	50,811 (3.95 %)	125,873 (5.26 %)	43.55 (99.98 %)	5,631 (0.02 %)	4,482 (100.00 %)	1,491,966 (6.88 %)	2,135,217 (25.52 %)	10,152,659 (54.74 %)	65,662 (1.36 %)
123	common bream (primary hap 2024) GCA_963993115.1	n/a	18,114 (2.63 %)	66,549 (6.11 %)	n/a	38.62 (99.99 %)	685 (0.01 %)	215 (100.00 %)	2,639,968 (48.46 %)	659,243 (7.55 %)	5,950,358 (40.47 %)	62,337 (3.61 %)
124	common carp (R8XR3 2021) GCA_905221575.1	n/a	30,973 (3.47 %)	83,657 (5.95 %)	n/a	37.06 (100.00 %)	372 (0.00 %)	674 (100.00 %)	3,324,121 (41.45 %)	707,134 (4.72 %)	8,110,561 (39.08 %)	44,388 (1.60 %)
125	common carp (SPL01 2021) GCF_018340385.1	91,210 (7.89 %)	31,041 (2.89 %)	89,244 (5.01 %)	n/a	37.11 (99.53 %)	26,351 (0.48 %)	6,701 (100.00 %)	1,634,612 (6.00 %)	919,239 (3.97 %)	10,192,037 (38.56 %)	52,638 (1.62 %)
126	common dab (primary hap 2023) GCF_963576545.1	36,211 (8.34 %)	14,995 (2.62 %)	50,844 (6.89 %)	n/a	42.67 (99.99 %)	275 (0.01 %)	338 (100.00 %)	1,186,799 (32.17 %)	307,864 (16.34 %)	3,562,802 (35.00 %)	41,657 (2.72 %)
127	common dace (hap1.1 2025) GCA_965113295.1	n/a	18,484 (2.43 %)	69,931 (5.95 %)	n/a	39.03 (99.98 %)	1,202 (0.02 %)	876 (100.00 %)	938,148 (4.74 %)	828,944 (9.34 %)	5,833,273 (42.65 %)	78,182 (4.87 %)
128	common seadragon (TA_2022b 2022) GCF_024500385.1	60,947 (12.28 %)	13,706 (2.67 %)	42,956 (5.71 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	196 (0.00 %)	1,259 (100.00 %)	1,417,848 (37.47 %)	173,323 (3.85 %)	3,968,694 (40.23 %)	70,253 (6.29 %)
129	common sole (alternate hap 2023) GCA_958295035.1	n/a	14,904 (2.99 %)	43,194 (7.09 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	n/a	1,318 (100.00 %)	1,128,080 (18.77 %)	328,975 (8.35 %)	3,952,898 (31.64 %)	26,979 (2.08 %)
130	common sole (primary hap 2023 refseq) GCF_958295425.1	55,359 (12.02 %)	14,844 (2.94 %)	42,832 (6.93 %)	n/a	40.87 (99.99 %)	373 (0.01 %)	242 (100.00 %)	1,149,243 (19.12 %)	342,238 (9.71 %)	3,906,753 (32.84 %)	27,772 (2.71 %)
131	common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024) GCA_964263955.1	n/a	29,103 (1.36 %)	124,287 (3.94 %)	n/a	43.87 (99.96 %)	5,995 (0.04 %)	11,150 (100.00 %)	1,655,140 (4.68 %)	1,843,550 (17.63 %)	9,367,555 (61.56 %)	112,654 (3.84 %)
132	common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024) GCA_964263835.1	n/a	25,968 (1.48 %)	104,922 (4.18 %)	n/a	43.67 (99.96 %)	4,689 (0.04 %)	8,669 (99.96 %)	1,320,339 (4.08 %)	1,364,334 (15.61 %)	7,674,742 (61.10 %)	94,019 (3.82 %)
133	convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021) GCA_020510965.1	n/a	5,231 (0.27 %)	47,644 (1.48 %)	n/a	44.62 (99.99 %)	144 (0.01 %)	21,561 (99.99 %)	2,803,873 (49.20 %)	655,416 (2.69 %)	7,558,550 (67.05 %)	181,626 (10.52 %)
134	convict blenny (primary hap 2021) GCA_020510985.1	n/a	n/a	134,417 (1.50 %)	n/a	44.52 (99.13 %)	2,580 (0.87 %)	512 (100.00 %)	9,062,541 (49.33 %)	2,097,650 (2.66 %)	3,092 (99.13 %)	568,042 (10.14 %)
135	copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021) GCA_017976315.1	n/a	13,622 (2.81 %)	43,285 (6.93 %)	n/a	42.59 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,125 (100.00 %)	1,741,373 (32.89 %)	182,926 (2.01 %)	3,659,106 (21.68 %)	27,693 (1.89 %)
136	copperband butterflyfish (primary hap 2021) GCF_017976325.1	35,291 (10.46 %)	15,210 (3.03 %)	44,916 (6.99 %)	61,755 (8.99 %)	42.57 (100.00 %)	60 (0.00 %)	29 (100.00 %)	406,118 (2.95 %)	199,450 (2.10 %)	3,861,745 (21.57 %)	29,106 (1.85 %)
137	corkwing wrasse (primary hap 2022) GCA_947650265.1	n/a	14,740 (2.91 %)	45,483 (7.26 %)	n/a	41.82 (99.96 %)	1,379 (0.04 %)	395 (100.00 %)	936,676 (24.41 %)	306,192 (9.29 %)	3,495,456 (28.75 %)	29,142 (2.35 %)
138	Corydoras catfish unclassified (C115 2021) GCA_019802505.1	n/a	14,695 (2.68 %)	51,799 (6.37 %)	n/a	42.12 (100.00 %)	n/a	2,080 (100.00 %)	1,969,654 (37.02 %)	663,295 (11.19 %)	3,764,275 (45.19 %)	67,226 (8.43 %)
139	crested bigscale (hap1.1 2025) GCA_964638095.1	n/a	17,935 (1.34 %)	104,307 (6.12 %)	n/a	44.53 (99.96 %)	2,975 (0.04 %)	2,930 (100.00 %)	5,608,839 (57.44 %)	1,825,932 (20.35 %)	6,375,759 (51.18 %)	149,374 (4.78 %)
140	crested bigscale (hap2.1 2025) GCA_964638665.1	n/a	17,775 (1.43 %)	100,017 (6.38 %)	n/a	44.59 (99.96 %)	2,894 (0.04 %)	4,301 (99.96 %)	5,332,080 (56.26 %)	1,737,704 (18.88 %)	6,064,583 (49.72 %)	141,258 (4.70 %)
141	crucian carp (alternate hap 2023) GCA_963082795.1	n/a	4,509 (3.03 %)	16,936 (7.22 %)	n/a	38.67 (100.00 %)	n/a	3,713 (100.00 %)	430,197 (46.38 %)	101,926 (7.54 %)	1,077,239 (32.21 %)	10,612 (4.11 %)
142	crucian carp (primary hap 2023 refseq) GCF_963082965.1	90,094 (6.75 %)	29,386 (2.81 %)	88,291 (5.37 %)	n/a	38.31 (99.99 %)	832 (0.01 %)	277 (100.00 %)	3,481,382 (45.81 %)	802,773 (6.54 %)	8,190,783 (44.41 %)	83,696 (3.82 %)
143	cuckoo wrasse (primary hap 2023) GCF_963584025.1	51,190 (10.37 %)	15,144 (2.59 %)	43,207 (5.98 %)	n/a	40.77 (99.98 %)	570 (0.02 %)	324 (100.00 %)	1,435,625 (29.39 %)	330,276 (12.54 %)	4,196,830 (33.83 %)	19,310 (1.01 %)
144	cunner (fTauAds1 alternate hap 2021) GCA_020745675.1	n/a	14,861 (2.74 %)	42,996 (6.34 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	31 (0.01 %)	1,476 (100.00 %)	1,373,727 (30.17 %)	220,572 (4.38 %)	4,176,936 (27.32 %)	17,129 (1.04 %)
145	cunner (primary hap 2021) GCA_020745685.1	n/a	15,192 (2.74 %)	43,564 (6.38 %)	n/a	41.31 (99.41 %)	283 (0.59 %)	64 (100.00 %)	1,419,667 (30.50 %)	243,024 (4.81 %)	4,334,690 (27.65 %)	17,974 (1.06 %)
146	Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020) GCF_015846415.1	49,108 (12.72 %)	16,501 (4.06 %)	40,671 (7.11 %)	n/a	38.77 (100.00 %)	116 (0.00 %)	167 (100.00 %)	1,213,719 (40.21 %)	134,299 (3.43 %)	3,676,403 (30.98 %)	29,879 (3.18 %)
147	Danionella translucida (Bolton 2019) GCA_007224835.1	n/a	16,341 (3.18 %)	41,545 (5.47 %)	n/a	38.57 (98.69 %)	8,366 (1.31 %)	36,005 (98.69 %)	300,659 (2.50 %)	212,357 (6.15 %)	4,267,143 (35.05 %)	23,311 (2.18 %)
148	Danionella translucida (fDanTra1 2020) GCA_903798025.1	n/a	15,965 (3.73 %)	37,421 (5.87 %)	n/a	38.52 (94.12 %)	18,487 (5.88 %)	29,831 (94.12 %)	251,333 (2.28 %)	132,120 (1.41 %)	4,061,554 (28.83 %)	16,871 (1.57 %)
149	dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq) GCF_021462225.1	56,220 (7.59 %)	15,422 (1.71 %)	50,084 (4.18 %)	n/a	40.18 (99.46 %)	409 (0.54 %)	72 (100.00 %)	369,606 (1.86 %)	176,954 (1.87 %)	6,142,638 (38.35 %)	32,973 (1.28 %)
150	delta smelt GCF_021917145.1	41,807 (14.97 %)	14,549 (4.09 %)	44,849 (9.74 %)	n/a	44.99 (99.92 %)	1,474 (0.08 %)	376 (100.00 %)	387,882 (5.57 %)	383,522 (9.22 %)	1,814,696 (32.48 %)	28,299 (3.33 %)
151	denticle herring (alternate hap 2019) GCA_900700345.2	n/a	14,119 (3.95 %)	47,988 (8.57 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	4 (0.00 %)	1,972 (100.00 %)	312,660 (2.77 %)	160,575 (2.83 %)	2,525,528 (27.70 %)	50,830 (8.72 %)
152	denticle herring (v2 2020) GCA_900700375.2	n/a	16,559 (3.78 %)	58,823 (8.66 %)	74,128 (10.47 %)	43.69 (99.18 %)	464 (0.82 %)	461 (100.00 %)	403,512 (3.23 %)	224,284 (4.61 %)	2,948,738 (28.79 %)	64,661 (9.49 %)
153	dorado (hap1 2023) GCA_030448965.1	n/a	16,788 (2.12 %)	50,338 (4.68 %)	n/a	41.27 (98.12 %)	641 (1.88 %)	182 (100.00 %)	2,709,759 (34.74 %)	798,364 (14.84 %)	5,418,190 (36.02 %)	30,055 (1.31 %)
154	dorado (hap2 2023) GCA_030463535.1	n/a	16,799 (2.11 %)	50,411 (4.67 %)	n/a	41.29 (99.15 %)	726 (0.85 %)	104 (100.00 %)	2,693,928 (34.60 %)	805,807 (14.65 %)	5,615,731 (36.69 %)	30,083 (1.31 %)
155	double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019) GCA_004026145.2	n/a	14,760 (4.56 %)	56,353 (11.37 %)	n/a	45.56 (99.97 %)	1,033 (0.03 %)	1,158 (100.00 %)	292,029 (9.69 %)	192,568 (5.53 %)	1,623,924 (22.71 %)	51,743 (9.31 %)
156	dwarf seahorse (Florida 2022) GCF_025434085.1	51,353 (12.50 %)	13,736 (3.19 %)	50,537 (7.64 %)	n/a	44.73 (100.00 %)	79 (0.00 %)	213 (100.00 %)	986,789 (36.30 %)	235,862 (13.25 %)	2,323,084 (41.85 %)	68,121 (17.75 %)
157	eastern happy (v3 2021) GCA_900246225.5	n/a	15,552 (2.29 %)	52,465 (6.26 %)	86,437 (9.40 %)	41.07 (99.87 %)	490 (0.13 %)	364 (100.00 %)	1,309,350 (35.93 %)	217,916 (1.89 %)	4,547,434 (30.78 %)	33,005 (1.88 %)
158	eastern happy (primary hap 2024) GCA_964374335.1	n/a	15,554 (2.13 %)	55,328 (6.30 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	40 (0.00 %)	31 (100.00 %)	933,060 (24.43 %)	252,509 (4.84 %)	4,460,314 (32.70 %)	34,184 (2.09 %)
159	electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020) GCA_013347915.1	n/a	12,020 (3.63 %)	38,881 (7.31 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	n/a	2,629 (100.00 %)	429,509 (7.66 %)	432,260 (11.41 %)	2,049,609 (24.32 %)	35,597 (4.37 %)
160	electric eel (fEleEle1 primary hap 2020) GCF_013358815.1	48,958 (12.10 %)	15,950 (3.66 %)	48,976 (7.25 %)	54,541 (8.42 %)	42.49 (98.20 %)	227 (1.80 %)	89 (100.00 %)	567,625 (7.41 %)	564,286 (10.86 %)	2,935,360 (24.79 %)	44,501 (3.93 %)
161	electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin) GCF_003665695.1	40,618 (11.48 %)	15,837 (3.85 %)	23,074 (6.63 %)	n/a	42.56 (96.95 %)	119,361 (3.09 %)	8,786 (100.00 %)	519,014 (5.41 %)	516,718 (6.65 %)	3,020,801 (21.49 %)	41,947 (3.71 %)
162	elephant fish B.brachyistius (T26 2022) GCF_023856365.1	82,153 (9.98 %)	16,513 (2.13 %)	79,047 (6.37 %)	n/a	44.15 (99.99 %)	234 (0.01 %)	1,425 (100.00 %)	923,543 (11.79 %)	425,650 (9.45 %)	3,525,237 (34.97 %)	91,552 (5.39 %)
163	emerald rockcod GCF_902827165.1	44,179 (8.48 %)	15,275 (2.20 %)	57,830 (6.43 %)	63,731 (6.65 %)	40.94 (99.99 %)	932 (0.01 %)	864 (100.00 %)	460,185 (3.64 %)	399,729 (6.87 %)	3,533,188 (40.09 %)	52,191 (2.51 %)
164	Eurasian minnow (alternate hap 2023) GCA_949152275.1	n/a	17,920 (3.03 %)	59,697 (6.61 %)	n/a	39.13 (100.00 %)	8 (0.00 %)	4,949 (100.00 %)	2,285,870 (44.17 %)	480,649 (10.13 %)	4,833,803 (39.56 %)	57,737 (4.15 %)
165	Eurasian minnow (primary hap 2023) GCA_949152265.1	n/a	17,661 (3.01 %)	58,218 (6.54 %)	n/a	39.21 (99.98 %)	881 (0.02 %)	125 (100.00 %)	2,346,939 (44.27 %)	502,415 (11.23 %)	4,890,830 (40.45 %)	60,482 (4.22 %)
166	European anchovy (BLACKSEA-1 2023) GCF_034702125.1	48,154 (5.87 %)	15,415 (1.33 %)	77,712 (5.08 %)	n/a	44.45 (99.99 %)	9,202 (0.02 %)	1,922 (100.00 %)	4,406,534 (31.73 %)	2,331,293 (15.35 %)	6,863,540 (50.47 %)	80,927 (2.32 %)
167	European chub (alternate hap 2023) GCA_949319155.1	n/a	17,416 (2.74 %)	60,936 (6.02 %)	n/a	38.65 (100.00 %)	12 (0.00 %)	7,437 (100.00 %)	2,377,147 (47.98 %)	578,235 (8.27 %)	5,267,308 (40.22 %)	50,909 (3.45 %)
168	European chub (primary hap 2023) GCA_949319135.1	n/a	18,028 (2.64 %)	64,206 (6.04 %)	n/a	38.73 (99.99 %)	588 (0.01 %)	106 (100.00 %)	2,649,943 (48.88 %)	666,129 (9.08 %)	5,751,610 (41.56 %)	58,471 (3.64 %)
169	European conger (primary hap 2023 refseq) GCF_963514075.1	54,631 (7.46 %)	17,072 (1.89 %)	34,801 (5.07 %)	n/a	43.89 (99.98 %)	1,009 (0.02 %)	380 (100.00 %)	761,522 (5.99 %)	913,306 (13.25 %)	5,767,879 (35.48 %)	120,990 (6.12 %)
170	European flounder (alternate hap 2023) GCA_949316195.1	n/a	14,690 (3.17 %)	48,422 (7.90 %)	n/a	42.61 (100.00 %)	n/a	1,915 (100.00 %)	1,138,190 (26.31 %)	249,865 (4.72 %)	3,352,038 (25.55 %)	36,828 (3.13 %)
171	European flounder (primary hap 2023 genbank) GCA_949316205.1	n/a	14,753 (3.17 %)	47,618 (7.81 %)	n/a	42.59 (99.98 %)	482 (0.02 %)	109 (100.00 %)	1,160,784 (27.06 %)	251,985 (5.23 %)	3,353,121 (26.00 %)	37,130 (2.79 %)
172	European flounder (primary hap 2023 refseq) GCF_949316205.1	48,969 (12.45 %)	14,751 (3.17 %)	47,618 (7.81 %)	n/a	42.59 (99.98 %)	482 (0.02 %)	108 (100.00 %)	1,160,781 (27.06 %)	251,983 (5.23 %)	3,353,086 (26.00 %)	37,129 (2.79 %)
173	European perch GCF_010015445.1	55,605 (8.20 %)	15,430 (2.07 %)	55,499 (5.43 %)	n/a	40.90 (99.97 %)	801 (0.03 %)	303 (100.00 %)	684,094 (5.16 %)	634,788 (7.48 %)	5,182,241 (37.07 %)	44,049 (1.94 %)
174	European plaice (alternate hap 2022) GCA_947347695.1	n/a	14,619 (2.94 %)	50,389 (7.92 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3,222 (100.00 %)	430,112 (3.88 %)	299,581 (6.89 %)	3,182,258 (27.97 %)	40,094 (3.66 %)
175	European plaice (primary hap 2022 refseq) GCF_947347685.1	46,468 (10.51 %)	14,818 (2.71 %)	51,453 (7.41 %)	n/a	42.51 (99.97 %)	1,072 (0.03 %)	355 (100.00 %)	476,314 (3.63 %)	520,729 (13.27 %)	3,283,360 (33.55 %)	47,050 (4.45 %)
176	European seabass (2021) GCF_905237075.1	62,457 (13.08 %)	15,582 (2.89 %)	44,472 (6.56 %)	69,435 (12.92 %)	40.38 (99.85 %)	272 (0.15 %)	303 (100.00 %)	1,210,970 (24.30 %)	278,140 (4.02 %)	4,343,442 (26.18 %)	15,975 (0.93 %)
177	European smelt (primary hap 2023 genbank) GCA_963692335.1	n/a	15,640 (3.79 %)	50,248 (9.36 %)	n/a	45.42 (99.90 %)	2,462 (0.10 %)	1,038 (100.00 %)	1,648,435 (31.35 %)	508,368 (13.05 %)	1,992,832 (35.86 %)	33,284 (4.05 %)
178	European smelt (primary hap 2023 refseq) GCF_963692335.1	46,762 (14.07 %)	15,639 (3.79 %)	50,238 (9.36 %)	n/a	45.42 (99.90 %)	2,462 (0.10 %)	1,007 (100.00 %)	1,648,428 (31.34 %)	508,368 (13.05 %)	1,992,793 (35.86 %)	33,284 (4.05 %)
179	European sprat (primary hap 2023) GCA_963457725.1	n/a	16,181 (2.44 %)	63,544 (7.17 %)	n/a	43.83 (99.96 %)	1,501 (0.04 %)	387 (100.00 %)	2,109,362 (31.42 %)	1,300,159 (14.91 %)	3,634,744 (35.44 %)	35,552 (1.87 %)
180	fathead minnow GCF_016745375.1	57,312 (8.34 %)	18,039 (3.02 %)	52,431 (6.01 %)	n/a	38.45 (86.78 %)	5,594 (13.23 %)	911 (100.00 %)	657,027 (4.09 %)	444,571 (6.23 %)	4,902,960 (35.69 %)	49,361 (2.78 %)
181	flathead mullet GCF_022458985.1	48,689 (12.71 %)	14,908 (3.00 %)	45,084 (6.96 %)	75,582 (11.23 %)	41.90 (99.97 %)	445 (0.04 %)	24 (100.00 %)	469,841 (3.23 %)	207,738 (2.31 %)	3,955,233 (24.74 %)	45,885 (3.03 %)
182	flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019) GCA_007364235.1	n/a	17,494 (2.06 %)	62,257 (5.73 %)	n/a	41.17 (99.98 %)	13 (0.02 %)	9,305 (99.98 %)	1,140,986 (16.60 %)	316,083 (2.17 %)	6,036,560 (30.48 %)	26,445 (1.22 %)
183	flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq) GCF_007364275.1	43,842 (8.12 %)	15,434 (2.15 %)	26,448 (5.90 %)	64,657 (6.60 %)	41.23 (98.19 %)	744 (1.81 %)	188 (100.00 %)	1,014,141 (16.95 %)	287,035 (2.21 %)	5,305,890 (30.67 %)	24,130 (1.26 %)
184	freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020) GCA_014839645.1	n/a	13,745 (2.58 %)	50,416 (6.72 %)	n/a	41.33 (100.00 %)	2 (0.00 %)	5,171 (100.00 %)	442,646 (4.09 %)	276,927 (5.42 %)	3,741,267 (26.25 %)	28,827 (2.28 %)
185	freshwater garfish (primary hap 2020) GCA_014839995.1	n/a	14,625 (2.57 %)	52,879 (6.72 %)	n/a	41.41 (98.98 %)	1,373 (1.02 %)	410 (100.00 %)	492,828 (4.29 %)	318,631 (5.94 %)	3,977,536 (27.41 %)	32,390 (2.33 %)
186	giant grouper GCF_005281545.1	45,328 (7.65 %)	15,661 (1.91 %)	53,910 (4.91 %)	n/a	41.26 (96.40 %)	23,415 (3.61 %)	4,201 (100.00 %)	604,763 (2.71 %)	357,944 (2.52 %)	6,501,327 (30.28 %)	26,431 (0.91 %)
187	gilthead seabream (alternate hap 2019) GCA_900880695.1	n/a	13,090 (2.37 %)	48,927 (6.41 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	2 (0.00 %)	7,241 (100.00 %)	422,758 (2.89 %)	231,452 (2.54 %)	3,818,141 (24.36 %)	38,368 (2.40 %)
188	gilthead seabream (v2 2021) GCA_900880675.2	n/a	15,752 (2.45 %)	56,395 (6.58 %)	n/a	41.94 (99.96 %)	1,050 (0.04 %)	176 (100.00 %)	1,474,134 (29.50 %)	305,809 (3.03 %)	4,701,691 (25.69 %)	47,327 (2.41 %)
189	golden-line barbel GCF_001515645.1	74,071 (6.71 %)	29,486 (2.77 %)	55,545 (5.32 %)	n/a	37.54 (89.58 %)	136,894 (10.45 %)	168,074 (89.55 %)	1,118,646 (5.04 %)	718,426 (6.54 %)	9,092,306 (37.16 %)	70,606 (1.91 %)
190	goldfish GCF_003368295.1	116,745 (8.75 %)	35,097 (2.94 %)	68,251 (6.12 %)	n/a	37.48 (99.99 %)	2,247 (0.01 %)	8,463 (99.99 %)	1,693,800 (5.39 %)	916,195 (5.01 %)	9,731,118 (40.19 %)	66,585 (2.06 %)
191	grass carp (HZGC_01 2021) GCF_019924925.1	67,810 (11.16 %)	18,195 (3.27 %)	48,459 (5.67 %)	n/a	37.48 (99.98 %)	150 (0.02 %)	31 (100.00 %)	654,416 (3.33 %)	429,734 (3.77 %)	5,501,085 (40.21 %)	26,282 (1.58 %)
192	great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022) GCF_026225935.1	36,344 (7.09 %)	14,512 (1.92 %)	45,809 (4.61 %)	n/a	39.76 (99.63 %)	3,407 (0.37 %)	600 (100.00 %)	2,662,894 (54.47 %)	803,911 (10.32 %)	5,763,692 (48.31 %)	53,808 (2.65 %)
193	great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI) GCF_000788275.1	25,822 (5.19 %)	14,212 (1.97 %)	27,894 (4.68 %)	n/a	39.49 (93.15 %)	92,327 (6.89 %)	108,947 (93.11 %)	552,368 (5.00 %)	742,395 (8.07 %)	5,901,720 (42.46 %)	44,972 (1.97 %)
194	greater amberjack GCF_002260705.1	33,756 (9.11 %)	15,336 (2.93 %)	22,220 (6.07 %)	n/a	40.86 (99.17 %)	9,742 (0.82 %)	34,656 (100.00 %)	573,770 (4.04 %)	368,800 (3.72 %)	4,449,534 (24.71 %)	15,850 (0.98 %)
195	greater argentine (alternate hap 2023) GCA_951799415.1	n/a	15,483 (3.45 %)	47,484 (7.95 %)	n/a	44.71 (100.00 %)	n/a	4,805 (100.00 %)	1,400,150 (23.78 %)	738,163 (17.35 %)	2,460,977 (35.90 %)	20,794 (2.09 %)
196	greater argentine (primary hap 2023) GCA_951799395.1	n/a	16,553 (3.15 %)	51,766 (7.37 %)	n/a	44.75 (99.95 %)	1,752 (0.05 %)	1,085 (100.00 %)	1,674,762 (26.07 %)	900,455 (18.62 %)	2,849,256 (39.22 %)	26,022 (2.30 %)
197	greater pipefish (v1 alternate hap 2019) GCA_901709685.1	n/a	10,795 (5.59 %)	33,380 (12.07 %)	n/a	43.29 (100.00 %)	2 (0.00 %)	1,848 (100.00 %)	140,376 (2.96 %)	81,000 (3.32 %)	1,318,564 (23.30 %)	34,104 (12.82 %)
198	greater pipefish (v1.2 2020 refseq) GCF_901709675.1	47,335 (18.32 %)	13,477 (5.26 %)	42,380 (12.01 %)	37,563 (15.76 %)	43.46 (100.00 %)	43 (0.00 %)	87 (100.00 %)	193,407 (3.05 %)	125,716 (4.25 %)	1,676,004 (25.93 %)	46,327 (10.97 %)
199	greater pipefish (v2 2023 genbank) GCA_948146105.1	n/a	13,412 (4.76 %)	45,946 (11.50 %)	n/a	44.34 (99.99 %)	95 (0.01 %)	251 (100.00 %)	494,547 (20.10 %)	204,804 (10.66 %)	1,444,044 (34.08 %)	47,904 (17.47 %)
200	greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023) GCA_948146095.1	n/a	13,681 (4.93 %)	45,034 (11.64 %)	n/a	43.88 (100.00 %)	n/a	4,533 (100.00 %)	460,038 (18.47 %)	163,838 (7.90 %)	1,681,190 (29.08 %)	47,523 (15.60 %)
201	greater sand-eel (alternate hap 2023) GCA_949358355.1	n/a	13,432 (2.10 %)	50,930 (6.39 %)	n/a	41.05 (100.00 %)	n/a	4,952 (100.00 %)	2,495,763 (38.80 %)	473,105 (6.27 %)	3,444,123 (38.56 %)	35,298 (1.94 %)
202	greater sand-eel (primary hap 2023) GCA_949357725.1	n/a	15,028 (2.35 %)	50,436 (6.30 %)	n/a	41.10 (99.97 %)	1,188 (0.03 %)	1,568 (100.00 %)	2,688,222 (39.74 %)	549,362 (7.60 %)	3,564,661 (40.05 %)	37,043 (1.94 %)
203	green swordtail GCF_003331165.1	52,602 (11.81 %)	14,955 (2.58 %)	47,115 (6.33 %)	n/a	39.09 (99.71 %)	661 (0.29 %)	272 (100.00 %)	328,469 (2.10 %)	162,178 (2.35 %)	4,801,050 (28.86 %)	37,217 (2.39 %)
204	grey gurnard (primary hap 2023) GCA_963514095.1	n/a	14,752 (2.74 %)	58,725 (8.49 %)	n/a	43.13 (99.98 %)	553 (0.02 %)	322 (100.00 %)	1,860,845 (35.64 %)	378,045 (9.39 %)	3,208,482 (30.12 %)	66,857 (4.99 %)
205	gudgeon (alternate hap 2023) GCA_949357705.1	n/a	16,645 (1.92 %)	62,533 (4.55 %)	n/a	39.69 (100.00 %)	8 (0.00 %)	7,253 (100.00 %)	5,166,731 (67.78 %)	750,850 (11.35 %)	5,903,440 (54.20 %)	90,235 (5.58 %)
206	gudgeon (primary hap 2023) GCA_949357685.1	n/a	17,136 (1.90 %)	63,611 (4.50 %)	n/a	39.74 (99.99 %)	1,046 (0.01 %)	233 (100.00 %)	5,662,029 (68.75 %)	825,757 (11.99 %)	6,236,024 (55.15 %)	99,559 (5.68 %)
207	Gulf pipefish (Florida 2022) GCF_024217435.2	53,176 (17.83 %)	13,439 (4.00 %)	41,519 (8.87 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	11 (0.00 %)	495 (100.00 %)	644,597 (20.82 %)	180,309 (16.78 %)	1,339,434 (43.63 %)	51,080 (18.49 %)
208	Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq) GCF_024217435.1	58,587 (18.27 %)	13,442 (4.00 %)	41,565 (8.87 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	11 (0.00 %)	496 (100.00 %)	253,033 (3.86 %)	180,311 (16.78 %)	1,339,521 (43.63 %)	51,080 (18.49 %)
209	Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank) GCA_024217435.4	n/a	13,441 (4.00 %)	41,519 (8.87 %)	n/a	44.92 (100.00 %)	11 (0.00 %)	496 (100.00 %)	644,601 (20.82 %)	180,310 (16.78 %)	1,339,461 (43.63 %)	51,080 (18.49 %)
210	guppy GCF_000633615.1	48,290 (11.24 %)	14,436 (2.72 %)	44,759 (6.24 %)	n/a	39.33 (90.86 %)	458,354 (9.22 %)	40,143 (90.84 %)	340,480 (2.43 %)	167,943 (1.50 %)	4,695,380 (25.63 %)	35,188 (1.91 %)
211	honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020) GCA_015220095.1	n/a	15,058 (2.50 %)	46,340 (5.85 %)	n/a	40.71 (100.00 %)	21 (0.00 %)	2,131 (100.00 %)	1,642,351 (37.42 %)	389,169 (5.43 %)	4,687,710 (35.55 %)	34,408 (1.75 %)
212	honeycomb rockfish (primary hap 2020) GCF_015220745.1	57,752 (9.94 %)	15,244 (2.44 %)	47,034 (5.98 %)	63,546 (8.88 %)	40.77 (99.83 %)	215 (0.17 %)	138 (100.00 %)	524,161 (3.79 %)	422,265 (6.20 %)	4,827,148 (36.22 %)	37,878 (1.84 %)
213	horned golden-line barbel GCF_001515625.1	74,585 (6.94 %)	30,802 (3.11 %)	57,655 (5.63 %)	n/a	37.18 (91.91 %)	150,790 (8.11 %)	314,962 (91.89 %)	1,147,234 (4.93 %)	708,513 (4.77 %)	9,080,512 (35.95 %)	63,217 (1.71 %)
214	humphead wrasse GCF_018320785.1	42,229 (6.60 %)	15,287 (1.66 %)	47,025 (4.13 %)	n/a	39.53 (100.00 %)	284 (0.00 %)	46 (100.00 %)	447,458 (2.27 %)	310,170 (4.65 %)	8,002,463 (32.97 %)	12,252 (0.38 %)
215	Indian glassy fish (alternate hap 2019) GCA_900651595.1	n/a	14,412 (3.70 %)	41,944 (8.58 %)	n/a	42.27 (99.58 %)	230 (0.42 %)	2,242 (100.00 %)	304,774 (2.86 %)	140,555 (2.80 %)	2,689,154 (24.08 %)	15,419 (1.38 %)
216	Indian glassy fish (v2 2020) GCA_900634625.2	n/a	15,339 (3.60 %)	44,099 (8.47 %)	57,867 (10.10 %)	42.38 (98.08 %)	1,523 (1.92 %)	157 (100.00 %)	346,399 (3.02 %)	163,524 (3.00 %)	2,755,274 (25.07 %)	17,931 (1.47 %)
217	Indian medaka GCF_002922805.2	49,295 (10.27 %)	14,591 (2.49 %)	52,982 (6.37 %)	n/a	39.04 (94.83 %)	51,550 (5.20 %)	8,493 (100.00 %)	319,151 (2.20 %)	208,690 (2.67 %)	5,412,546 (33.29 %)	40,721 (2.36 %)
218	Indo-Pacific tarpon (2020) GCF_013368585.1	41,583 (6.91 %)	18,302 (2.47 %)	29,762 (5.45 %)	74,968 (7.01 %)	43.02 (99.97 %)	63 (0.03 %)	207 (100.00 %)	603,558 (3.71 %)	433,446 (4.32 %)	5,341,985 (22.07 %)	78,561 (3.69 %)
219	Japanese flounder GCF_001970005.1	37,838 (12.25 %)	14,521 (3.39 %)	30,773 (7.34 %)	n/a	41.64 (81.04 %)	40,314 (18.97 %)	9,525 (100.00 %)	332,322 (2.84 %)	164,916 (1.16 %)	3,476,344 (17.36 %)	21,768 (1.42 %)
220	Japanese flounder (ysfri-2021 2022) GCF_024713975.1	60,200 (14.08 %)	14,987 (3.26 %)	42,919 (7.40 %)	n/a	41.54 (100.00 %)	21 (0.00 %)	25 (100.00 %)	850,797 (19.88 %)	308,390 (6.45 %)	3,329,304 (26.55 %)	23,373 (1.76 %)
221	Japanese medaka GCF_002234675.1	50,526 (10.32 %)	14,325 (2.50 %)	27,912 (6.71 %)	91,652 (11.67 %)	40.84 (99.93 %)	491 (0.07 %)	25 (100.00 %)	384,317 (4.42 %)	163,041 (3.07 %)	4,631,750 (34.91 %)	41,215 (2.89 %)
222	jewelled blenny (2019) GCF_902148845.1	42,877 (8.61 %)	15,188 (2.40 %)	41,262 (7.86 %)	58,418 (6.97 %)	44.34 (98.69 %)	602 (1.31 %)	203 (100.00 %)	667,122 (4.21 %)	442,004 (5.09 %)	4,388,570 (26.54 %)	121,464 (9.36 %)
223	jewelled blenny (alternate hap 2019) GCA_902148835.1	n/a	15,945 (2.17 %)	101,825 (8.93 %)	n/a	44.49 (99.63 %)	9 (0.37 %)	4,516 (100.00 %)	744,228 (4.25 %)	519,896 (5.73 %)	4,677,160 (28.52 %)	138,484 (9.55 %)
224	John dory (alternate hap 2023) GCA_960530785.1	n/a	14,960 (2.23 %)	74,436 (6.65 %)	n/a	43.94 (100.00 %)	n/a	5,370 (100.00 %)	1,620,688 (23.00 %)	902,057 (13.66 %)	4,547,953 (39.90 %)	129,990 (12.07 %)
225	John dory (primary hap 2023) GCA_960531495.1	n/a	14,906 (2.33 %)	72,029 (6.72 %)	n/a	43.92 (99.98 %)	887 (0.02 %)	191 (100.00 %)	1,609,654 (22.82 %)	897,264 (13.58 %)	4,548,467 (39.80 %)	129,147 (11.75 %)
226	kelp grouper (mb 2019) GCF_006386435.1	45,779 (8.57 %)	15,561 (1.99 %)	53,188 (5.12 %)	n/a	41.32 (97.02 %)	48,394 (2.99 %)	4,563 (100.00 %)	574,889 (2.73 %)	367,135 (2.64 %)	6,420,280 (29.10 %)	28,979 (1.07 %)
227	kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023) GCF_029030835.1	40,680 (11.49 %)	14,847 (3.17 %)	46,307 (7.10 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	n/a	1,003 (100.00 %)	967,639 (17.54 %)	319,567 (5.43 %)	3,743,006 (26.82 %)	47,481 (4.63 %)
228	Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank) GCA_009829135.1	n/a	13,470 (2.34 %)	42,799 (5.73 %)	n/a	40.16 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,799 (100.00 %)	394,414 (4.41 %)	509,973 (7.17 %)	4,581,968 (38.91 %)	34,522 (2.54 %)
229	Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023) GCF_009829125.3	33,236 (8.44 %)	14,601 (2.46 %)	44,145 (5.80 %)	n/a	40.22 (99.05 %)	701 (0.95 %)	122 (100.00 %)	1,755,227 (42.93 %)	551,482 (7.22 %)	4,887,087 (38.97 %)	37,287 (2.58 %)
230	lake trout GCF_016432855.1	65,012 (4.57 %)	26,528 (1.53 %)	112,119 (4.47 %)	76,885 (3.80 %)	43.50 (99.99 %)	3,264 (0.01 %)	4,121 (100.00 %)	1,387,896 (5.81 %)	1,797,785 (19.28 %)	9,643,314 (54.44 %)	85,419 (2.52 %)
231	lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U) GCF_018398675.1	78,867 (4.31 %)	27,579 (1.38 %)	113,850 (3.63 %)	n/a	44.18 (100.00 %)	1,716 (0.00 %)	6,355 (100.00 %)	1,729,029 (6.03 %)	1,781,307 (15.24 %)	9,311,548 (61.16 %)	126,142 (4.04 %)
232	lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U) GCF_020615455.1	87,246 (4.53 %)	28,366 (1.38 %)	117,266 (3.71 %)	n/a	44.12 (100.00 %)	1,159 (0.00 %)	7,334 (100.00 %)	1,768,537 (6.02 %)	1,793,716 (15.51 %)	9,525,312 (61.13 %)	126,485 (3.95 %)
233	lantern fish (primary hap 2024) GCA_963921795.1	n/a	17,851 (1.28 %)	83,249 (5.18 %)	n/a	42.69 (99.97 %)	2,397 (0.03 %)	709 (100.00 %)	7,797,173 (37.37 %)	1,593,818 (10.64 %)	7,610,300 (54.05 %)	127,942 (3.84 %)
234	large yellow croaker GCF_000972845.2	49,914 (11.76 %)	15,365 (3.00 %)	26,101 (6.66 %)	n/a	41.34 (99.67 %)	7,424 (0.33 %)	9,998 (100.00 %)	478,685 (3.50 %)	306,063 (3.37 %)	4,199,578 (24.80 %)	28,138 (2.09 %)
235	large-eye snaggletooth (alternate hap 2023) GCA_949987545.1	n/a	15,841 (2.36 %)	79,276 (8.51 %)	n/a	46.35 (100.00 %)	n/a	5,761 (100.00 %)	2,935,570 (42.17 %)	1,208,602 (21.28 %)	3,157,730 (42.63 %)	88,759 (6.30 %)
236	large-eye snaggletooth (primary hap 2023) GCA_949987555.1	n/a	16,376 (2.19 %)	82,947 (7.99 %)	n/a	46.31 (99.94 %)	2,631 (0.06 %)	1,522 (100.00 %)	3,333,323 (43.58 %)	1,553,932 (25.91 %)	3,393,507 (46.78 %)	99,668 (6.39 %)
237	largemouth bass (2-A1 2021) GCA_019677235.1	n/a	15,790 (2.31 %)	50,332 (5.65 %)	n/a	40.87 (99.96 %)	672 (0.04 %)	202 (100.00 %)	464,845 (2.71 %)	255,513 (3.69 %)	5,124,388 (29.65 %)	25,920 (1.67 %)
238	largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020) GCF_014851395.1	55,170 (9.49 %)	16,635 (2.18 %)	56,707 (5.52 %)	n/a	40.86 (99.85 %)	2,909 (0.15 %)	4,753 (100.00 %)	497,281 (2.60 %)	269,495 (3.70 %)	5,496,732 (29.60 %)	28,733 (1.66 %)
239	largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020) GCA_014839705.1	n/a	8,132 (2.11 %)	25,878 (4.67 %)	n/a	38.55 (100.00 %)	n/a	5,088 (100.00 %)	260,789 (2.73 %)	158,564 (2.12 %)	3,023,128 (27.39 %)	9,678 (1.02 %)
240	largescale foureyes (primary hap 2020) GCA_014839685.1	n/a	14,774 (2.18 %)	42,858 (4.83 %)	58,247 (6.94 %)	38.54 (99.96 %)	107 (0.04 %)	33 (100.00 %)	506,950 (2.73 %)	305,170 (2.13 %)	6,194,879 (29.85 %)	17,881 (0.94 %)
241	leafy seadragon (BA_2022a 2022) GCF_024500275.1	46,242 (10.23 %)	13,712 (2.62 %)	43,369 (5.56 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	76 (0.00 %)	1,537 (100.00 %)	1,406,779 (35.37 %)	202,983 (7.44 %)	3,933,128 (41.19 %)	70,560 (7.78 %)
242	lemon sole (primary hap 2024) GCA_964266715.1	n/a	14,961 (2.55 %)	52,234 (6.83 %)	n/a	41.57 (99.99 %)	409 (0.01 %)	1,601 (100.00 %)	1,233,052 (39.33 %)	366,741 (18.98 %)	3,296,338 (36.77 %)	44,712 (2.85 %)
243	leopard coralgrouper GCF_008729295.1	38,671 (7.52 %)	15,538 (2.18 %)	57,480 (5.26 %)	n/a	39.54 (98.22 %)	3,611 (1.77 %)	94,260 (100.00 %)	629,451 (3.42 %)	385,539 (3.83 %)	6,343,655 (29.35 %)	27,018 (1.26 %)
244	lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023) GCA_027579805.1	n/a	15,487 (0.88 %)	85,135 (3.39 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	3 (0.00 %)	6,593 (100.00 %)	5,572,163 (49.59 %)	1,052,072 (6.02 %)	7,246,646 (62.69 %)	157,768 (4.38 %)
245	lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq) GCF_027579695.1	53,323 (3.35 %)	15,955 (0.92 %)	85,700 (3.30 %)	n/a	42.44 (99.43 %)	334 (0.57 %)	38 (100.00 %)	6,041,262 (71.88 %)	1,126,468 (6.51 %)	7,609,180 (62.74 %)	166,630 (4.38 %)
246	lesser sand-eel (alternate hap 2023) GCA_950004245.1	n/a	13,792 (2.19 %)	51,353 (6.60 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	1 (0.00 %)	3,620 (100.00 %)	2,536,362 (38.05 %)	513,115 (7.50 %)	3,542,854 (37.60 %)	31,814 (1.79 %)
247	lesser sand-eel (primary hap 2023) GCA_949987685.1	n/a	13,908 (2.19 %)	50,634 (6.50 %)	n/a	41.22 (99.97 %)	1,017 (0.03 %)	701 (100.00 %)	2,698,640 (39.19 %)	577,328 (8.51 %)	3,615,231 (39.17 %)	33,251 (1.82 %)
248	lesser weever (primary hap 2023) GCA_963691815.1	n/a	15,269 (2.44 %)	52,449 (6.28 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	606 (0.02 %)	133 (100.00 %)	1,879,201 (31.40 %)	449,901 (9.89 %)	4,248,556 (33.21 %)	43,864 (3.01 %)
249	limp eelpout (alternate hap 2023) GCA_949748265.1	n/a	15,033 (2.98 %)	51,296 (7.68 %)	n/a	43.01 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2,700 (100.00 %)	1,099,919 (28.68 %)	314,919 (9.57 %)	2,620,601 (30.23 %)	49,248 (4.19 %)
250	limp eelpout (primary hap 2023) GCA_949748355.1	n/a	15,060 (2.89 %)	50,064 (7.31 %)	n/a	41.88 (99.98 %)	589 (0.02 %)	534 (100.00 %)	1,116,427 (28.18 %)	315,489 (13.14 %)	2,598,812 (33.21 %)	50,192 (3.82 %)
251	live sharksucker (alternate hap 2019) GCA_900963505.1	n/a	14,632 (3.51 %)	40,441 (7.51 %)	n/a	41.42 (99.96 %)	19 (0.04 %)	1,405 (100.00 %)	435,742 (3.57 %)	139,003 (1.51 %)	3,161,165 (22.06 %)	16,302 (1.34 %)
252	live sharksucker (v2 2021) GCA_900963305.2	n/a	14,975 (3.53 %)	40,908 (7.56 %)	n/a	41.43 (99.89 %)	140 (0.11 %)	38 (100.00 %)	772,309 (14.49 %)	146,353 (1.65 %)	3,204,473 (21.79 %)	16,807 (1.33 %)
253	longspined bullhead (.1 primary hap 2021) GCA_910589615.1	n/a	15,027 (3.10 %)	51,137 (7.71 %)	n/a	42.22 (99.99 %)	242 (0.01 %)	27 (100.00 %)	452,844 (4.81 %)	417,308 (9.63 %)	3,262,282 (28.51 %)	55,527 (4.38 %)
254	longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021) GCA_910589325.1	n/a	15,137 (3.09 %)	52,499 (7.75 %)	n/a	42.22 (100.00 %)	n/a	1,778 (100.00 %)	448,166 (4.67 %)	416,181 (8.95 %)	3,288,388 (27.99 %)	55,747 (4.41 %)
255	lumpfish (alternate hap 2019) GCA_009769515.1	n/a	12,848 (3.32 %)	43,711 (8.09 %)	n/a	42.84 (100.00 %)	n/a	1,866 (100.00 %)	407,698 (6.03 %)	360,501 (11.29 %)	2,456,041 (28.07 %)	45,916 (5.21 %)
256	lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank) GCA_963457625.1	n/a	14,944 (3.23 %)	50,328 (8.09 %)	n/a	42.82 (99.97 %)	954 (0.03 %)	232 (100.00 %)	1,034,598 (25.93 %)	434,819 (13.21 %)	2,907,371 (30.18 %)	55,066 (5.20 %)
257	lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq) GCF_009769545.1	41,612 (11.11 %)	14,752 (3.31 %)	49,223 (8.10 %)	52,721 (8.34 %)	42.83 (98.22 %)	347 (1.78 %)	48 (100.00 %)	478,386 (6.02 %)	421,632 (11.07 %)	2,928,619 (27.99 %)	53,321 (5.09 %)
258	lyretail cichlid GCF_000239395.1	38,260 (10.03 %)	14,804 (2.69 %)	23,751 (5.79 %)	n/a	40.44 (80.94 %)	109,100 (19.10 %)	118,181 (80.90 %)	695,696 (14.49 %)	119,381 (1.10 %)	4,539,429 (19.49 %)	18,098 (0.91 %)
259	Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024) GCA_963969265.1	n/a	15,501 (2.18 %)	54,090 (6.20 %)	n/a	41.17 (99.99 %)	422 (0.01 %)	82 (100.00 %)	1,727,328 (38.16 %)	259,351 (4.71 %)	4,381,278 (33.25 %)	35,281 (1.93 %)
260	mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021) GCF_020085105.1	64,831 (12.89 %)	15,283 (2.75 %)	43,349 (6.02 %)	n/a	40.35 (100.00 %)	93 (0.00 %)	65 (100.00 %)	441,324 (3.38 %)	206,420 (2.54 %)	4,582,841 (27.41 %)	15,999 (1.17 %)
261	mandarin fish (RoL2022-P1 2023) GCF_027744825.2	49,016 (12.41 %)	14,186 (3.08 %)	55,502 (8.05 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	19 (0.00 %)	97 (100.00 %)	321,832 (4.91 %)	114,318 (16.04 %)	2,300,636 (32.10 %)	46,312 (5.05 %)
262	mangrove rivulus GCF_001649575.2	46,200 (11.83 %)	14,522 (2.87 %)	46,641 (6.86 %)	n/a	40.03 (94.31 %)	32,278 (5.70 %)	300 (100.00 %)	345,678 (2.32 %)	146,263 (1.33 %)	4,718,292 (27.30 %)	39,541 (2.69 %)
263	marbled rockcod (alternate hap 2023) GCA_949606865.1	n/a	14,564 (1.72 %)	71,604 (6.41 %)	n/a	41.49 (100.00 %)	n/a	8,737 (100.00 %)	1,662,251 (42.29 %)	439,119 (12.96 %)	3,776,125 (45.00 %)	56,507 (2.83 %)
264	marbled rockcod (primary hap 2023) GCA_949606895.1	n/a	15,070 (1.79 %)	71,367 (6.50 %)	n/a	41.46 (99.92 %)	4,157 (0.08 %)	943 (100.00 %)	1,717,591 (42.63 %)	474,348 (12.30 %)	4,011,319 (44.93 %)	59,531 (2.83 %)
265	Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023) GCF_029220125.1	44,363 (10.91 %)	14,032 (2.80 %)	60,400 (8.09 %)	n/a	43.84 (99.86 %)	974 (0.14 %)	200 (100.00 %)	1,157,953 (36.57 %)	569,832 (12.19 %)	2,864,996 (37.65 %)	98,423 (9.53 %)
266	Mexican tetra (2017 WashU) GCF_000372685.2	47,018 (6.00 %)	16,516 (1.68 %)	33,920 (4.24 %)	n/a	38.00 (96.73 %)	621 (3.27 %)	2,415 (100.00 %)	1,125,511 (6.89 %)	1,113,607 (11.76 %)	8,546,053 (42.44 %)	44,933 (1.77 %)
267	Mexican tetra (ESR-SI-001 2022) GCF_023375975.1	71,254 (7.50 %)	16,674 (1.63 %)	52,903 (4.12 %)	101,896 (6.64 %)	38.24 (100.00 %)	14 (0.00 %)	109 (100.00 %)	1,155,823 (4.90 %)	1,363,316 (12.23 %)	7,667,721 (47.23 %)	48,358 (1.88 %)
268	Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021) GCA_019721115.1	n/a	16,698 (1.62 %)	62,818 (5.14 %)	74,339 (6.58 %)	38.41 (99.99 %)	334 (0.01 %)	195 (100.00 %)	1,194,830 (5.04 %)	1,460,981 (11.81 %)	7,590,179 (47.66 %)	50,533 (2.46 %)
269	milkfish (2019) GCF_902362185.1	30,812 (7.61 %)	16,869 (3.41 %)	21,377 (6.58 %)	n/a	41.53 (99.36 %)	112 (0.64 %)	31 (100.00 %)	958,774 (8.18 %)	731,733 (9.10 %)	3,702,024 (26.31 %)	22,089 (1.27 %)
270	milkfish (alternate hap 2019) GCA_902362175.1	n/a	16,565 (3.38 %)	42,094 (6.75 %)	n/a	41.51 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1,937 (100.00 %)	930,392 (8.11 %)	708,375 (9.04 %)	3,612,575 (26.46 %)	21,531 (1.27 %)
271	minispotted lanternfish (primary hap 2023) GCA_963454915.1	n/a	17,701 (1.62 %)	73,433 (5.69 %)	n/a	42.20 (99.98 %)	1,398 (0.02 %)	388 (100.00 %)	6,438,444 (40.32 %)	1,202,669 (11.51 %)	7,055,665 (47.04 %)	74,954 (3.44 %)
272	monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022) GCA_023349535.1	n/a	15,176 (3.17 %)	47,458 (7.48 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	927 (0.02 %)	486 (100.00 %)	1,167,409 (26.98 %)	438,114 (8.08 %)	3,351,987 (27.25 %)	45,298 (3.39 %)
273	monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022) GCA_023349555.1	n/a	14,480 (3.19 %)	44,951 (7.47 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	936 (0.02 %)	725 (100.00 %)	1,101,582 (26.86 %)	415,846 (8.16 %)	3,162,480 (27.08 %)	42,657 (3.44 %)
274	monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022) GCF_023349555.1	40,276 (12.25 %)	14,478 (3.19 %)	44,951 (7.47 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	936 (0.02 %)	1,660 (99.98 %)	1,101,578 (26.86 %)	415,846 (8.16 %)	3,162,428 (27.08 %)	42,657 (3.44 %)
275	Monterrey platyfish GCF_001444195.1	53,087 (12.11 %)	14,672 (2.71 %)	27,552 (6.74 %)	n/a	39.02 (99.85 %)	229 (0.15 %)	68 (100.00 %)	305,761 (2.11 %)	134,157 (2.14 %)	4,687,726 (28.26 %)	33,082 (2.28 %)
276	mummichog (Maine) GCF_000826765.1	41,183 (7.38 %)	14,602 (1.92 %)	57,194 (5.03 %)	35,597 (6.40 %)	40.58 (91.29 %)	123,625 (8.75 %)	120,723 (91.25 %)	447,158 (2.19 %)	235,336 (1.39 %)	6,518,990 (26.03 %)	54,589 (2.39 %)
277	mummichog (U. Missouri) GCF_011125445.2	56,612 (6.89 %)	15,361 (1.60 %)	69,801 (5.20 %)	n/a	40.76 (99.88 %)	2,820 (0.12 %)	1,031 (100.00 %)	636,480 (2.75 %)	392,130 (3.32 %)	7,023,777 (32.98 %)	81,101 (3.45 %)
278	New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank) GCA_009762545.1	n/a	13,566 (2.17 %)	40,774 (5.21 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	n/a	3,286 (100.00 %)	472,659 (4.46 %)	348,429 (5.17 %)	4,169,213 (33.57 %)	16,368 (0.83 %)
279	New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank) GCA_009762535.1	n/a	14,609 (2.22 %)	43,262 (5.33 %)	60,241 (8.02 %)	40.86 (98.32 %)	1,135 (1.69 %)	468 (100.00 %)	519,324 (4.65 %)	393,329 (5.54 %)	4,522,265 (33.34 %)	18,302 (0.85 %)
280	New Zealand spotty (primary hap refseq) GCF_009762535.1	45,555 (9.06 %)	14,609 (2.22 %)	43,259 (5.33 %)	60,241 (8.02 %)	40.86 (98.32 %)	1,135 (1.69 %)	467 (100.00 %)	517,755 (4.63 %)	393,328 (5.54 %)	4,522,224 (33.34 %)	18,299 (0.85 %)
281	Nile tilapia GCF_001858045.2	77,384 (10.86 %)	15,599 (1.99 %)	32,839 (6.04 %)	n/a	40.73 (99.99 %)	551 (0.01 %)	2,460 (100.00 %)	600,869 (5.40 %)	291,105 (3.17 %)	4,958,128 (31.15 %)	32,038 (1.81 %)
282	ninespine stickleback (alternate hap 2023) GCA_949316245.1	n/a	13,050 (3.93 %)	44,650 (10.12 %)	n/a	44.10 (100.00 %)	n/a	1,934 (100.00 %)	512,583 (14.83 %)	156,305 (8.46 %)	2,005,803 (27.09 %)	59,674 (9.19 %)
283	ninespine stickleback (NSP_V7 2020) GCF_902500615.1	51,166 (15.31 %)	14,765 (3.99 %)	49,191 (9.80 %)	n/a	44.37 (99.99 %)	341 (0.01 %)	1,667 (100.00 %)	380,357 (3.60 %)	188,301 (6.29 %)	2,422,266 (25.70 %)	72,584 (9.69 %)
284	ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank) GCA_949316345.1	n/a	14,600 (3.83 %)	49,927 (9.98 %)	n/a	44.12 (99.97 %)	738 (0.03 %)	175 (100.00 %)	599,088 (14.68 %)	186,747 (10.27 %)	2,273,942 (28.36 %)	70,136 (9.39 %)
285	ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq) GCF_949316345.1	57,816 (15.11 %)	14,598 (3.83 %)	49,473 (9.87 %)	n/a	44.12 (99.97 %)	738 (0.03 %)	174 (100.00 %)	599,085 (14.68 %)	186,746 (10.27 %)	2,273,889 (28.36 %)	70,136 (9.39 %)
286	North African catfish (Netherlands MV-2021 2022) GCF_024256425.1	51,073 (7.42 %)	15,809 (2.17 %)	43,728 (4.54 %)	n/a	39.00 (100.00 %)	n/a	48 (100.00 %)	2,472,286 (44.73 %)	560,123 (5.68 %)	6,203,876 (38.64 %)	42,187 (2.72 %)
287	northern cavefish (hap1 2024) GCA_046255685.1	n/a	14,295 (2.22 %)	50,623 (6.07 %)	n/a	42.09 (99.99 %)	466 (0.01 %)	892 (100.00 %)	1,941,831 (49.35 %)	650,256 (17.85 %)	3,210,410 (44.77 %)	55,251 (4.79 %)
288	northern cavefish (hap2 2024) GCA_046255725.1	n/a	14,542 (2.12 %)	51,650 (5.81 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	484 (0.01 %)	667 (100.00 %)	2,014,967 (51.82 %)	755,698 (19.90 %)	3,290,098 (47.08 %)	57,881 (4.66 %)
289	northern pike GCF_004634155.1	66,389 (9.11 %)	16,778 (2.37 %)	27,040 (5.41 %)	n/a	42.29 (99.99 %)	584 (0.01 %)	908 (100.00 %)	1,065,458 (31.14 %)	531,451 (7.80 %)	4,677,366 (33.26 %)	44,793 (2.82 %)
290	northern pike (alternate hap 2020) GCA_011004835.1	n/a	11,782 (2.41 %)	40,748 (5.68 %)	n/a	42.32 (99.93 %)	11 (0.07 %)	3,813 (100.00 %)	700,818 (30.15 %)	372,729 (7.71 %)	3,058,655 (31.76 %)	29,687 (2.57 %)
291	northern pike (primary hap 2020 refseq) GCF_011004845.1	63,733 (9.28 %)	16,618 (2.41 %)	55,784 (5.64 %)	82,941 (8.82 %)	42.22 (99.89 %)	112 (0.11 %)	53 (100.00 %)	984,415 (29.15 %)	524,708 (7.32 %)	4,691,096 (32.91 %)	42,910 (2.52 %)
292	northern snakehead (prfri 2023) GCF_033026475.1	61,639 (13.32 %)	15,131 (2.87 %)	35,444 (5.74 %)	n/a	39.76 (100.00 %)	52 (0.00 %)	291 (100.00 %)	830,033 (26.45 %)	152,304 (8.77 %)	3,778,846 (29.39 %)	8,436 (0.70 %)
293	ocellated dragonet (captive hap1 2024) GCA_044231665.1	n/a	13,787 (3.68 %)	60,819 (10.07 %)	n/a	45.42 (100.00 %)	99 (0.00 %)	108 (100.00 %)	259,874 (3.38 %)	94,885 (3.76 %)	2,302,967 (21.04 %)	58,433 (13.25 %)
294	ocellated dragonet (captive hap2 2024) GCA_044231645.1	n/a	13,709 (3.65 %)	60,517 (9.98 %)	n/a	45.43 (100.00 %)	111 (0.00 %)	129 (100.00 %)	272,479 (3.57 %)	101,623 (4.29 %)	2,384,412 (21.91 %)	58,256 (13.22 %)
295	Old Calabar mormyrid (PKING1 2018) GCF_002872115.1	61,915 (11.48 %)	15,987 (2.73 %)	33,963 (6.66 %)	n/a	43.93 (92.03 %)	49,579 (7.99 %)	4,666 (100.00 %)	348,463 (2.27 %)	314,129 (2.95 %)	4,259,711 (20.83 %)	76,846 (4.18 %)
296	old wife E.armatus (hap1 2024) GCF_043641665.1	32,231 (8.81 %)	15,382 (3.41 %)	41,015 (7.24 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	114 (0.00 %)	136 (100.00 %)	1,143,877 (18.90 %)	219,801 (2.87 %)	3,652,133 (23.09 %)	19,721 (1.34 %)
297	old wife E.armatus (hap2 2024) GCA_043640875.1	n/a	15,360 (3.42 %)	41,012 (7.26 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	100 (0.00 %)	94 (100.00 %)	438,416 (3.46 %)	219,275 (2.83 %)	3,623,998 (22.85 %)	19,710 (1.32 %)
298	orangethroat darter GCF_008692095.1	55,448 (8.29 %)	15,000 (2.25 %)	49,918 (5.41 %)	n/a	40.91 (99.57 %)	101,221 (0.47 %)	3,119 (100.00 %)	566,915 (3.75 %)	509,018 (6.60 %)	5,142,090 (31.18 %)	26,702 (1.46 %)
299	orbiculate cardinalfish (2019) GCF_902148855.1	46,571 (5.47 %)	15,761 (1.50 %)	31,563 (4.00 %)	59,905 (3.98 %)	37.90 (99.73 %)	1,844 (0.27 %)	340 (100.00 %)	1,257,250 (5.57 %)	979,214 (8.64 %)	6,386,731 (48.59 %)	29,320 (0.87 %)
300	orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019) GCA_902148825.1	n/a	14,018 (1.51 %)	45,251 (3.61 %)	n/a	37.73 (99.94 %)	142 (0.06 %)	7,038 (99.94 %)	1,041,393 (5.09 %)	744,623 (6.94 %)	6,250,631 (45.53 %)	22,522 (0.77 %)
301	oriental weatherfish (BS_2022a 2023) GCF_027580225.1	68,779 (8.54 %)	17,223 (2.28 %)	49,697 (5.11 %)	n/a	38.10 (99.99 %)	614 (0.01 %)	358 (100.00 %)	2,925,549 (40.35 %)	402,676 (5.35 %)	5,933,365 (45.71 %)	56,843 (3.18 %)
302	oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025) GCF_046630095.1	60,285 (14.61 %)	15,290 (2.96 %)	42,088 (6.53 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	n/a	150 (100.00 %)	534,470 (3.96 %)	267,099 (3.88 %)	4,094,899 (24.75 %)	14,784 (1.60 %)
303	P.nyererei 1_Seehausen GCF_000239375.1	40,001 (9.36 %)	14,904 (2.72 %)	24,732 (5.87 %)	n/a	40.60 (84.20 %)	60,817 (15.83 %)	68,050 (84.17 %)	306,171 (3.27 %)	124,292 (0.75 %)	4,414,831 (20.66 %)	18,455 (0.96 %)
304	Pacific cod (2023) GCF_031168955.1	49,417 (13.66 %)	13,542 (2.89 %)	64,214 (9.77 %)	n/a	45.55 (99.92 %)	4,826 (0.09 %)	24 (100.00 %)	1,117,561 (38.30 %)	685,851 (13.38 %)	2,330,116 (34.15 %)	87,761 (8.68 %)
305	Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020) GCF_013339905.1	48,776 (12.61 %)	14,747 (3.15 %)	45,075 (7.30 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	219 (0.00 %)	120 (100.00 %)	410,917 (4.22 %)	246,500 (4.66 %)	3,680,698 (25.23 %)	31,508 (2.30 %)
306	Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022) GCF_022539355.2	46,684 (12.50 %)	14,862 (3.15 %)	45,824 (7.30 %)	n/a	42.17 (99.95 %)	1,131 (0.05 %)	53 (100.00 %)	407,699 (3.94 %)	247,330 (3.84 %)	3,838,896 (24.75 %)	31,782 (2.27 %)
307	Pacific saury (AMF1-May2022 2023) GCF_033807715.1	54,344 (6.52 %)	15,214 (1.67 %)	74,345 (6.13 %)	n/a	41.49 (99.96 %)	900 (0.04 %)	759 (100.00 %)	805,776 (5.16 %)	849,901 (11.48 %)	4,645,552 (43.92 %)	106,026 (5.14 %)
308	panther danio (primary hap 2020) GCF_903798145.1	40,657 (5.52 %)	17,858 (2.46 %)	42,119 (3.16 %)	n/a	36.32 (98.82 %)	1,821 (1.18 %)	342 (100.00 %)	3,973,354 (56.67 %)	940,639 (7.81 %)	8,701,639 (50.54 %)	29,684 (1.18 %)
309	parallel lanternfish (alternate hap 2024) GCA_964188415.1	n/a	15,421 (1.80 %)	62,324 (6.15 %)	n/a	42.79 (99.90 %)	4,955 (0.10 %)	4,978 (99.90 %)	4,032,523 (34.18 %)	982,411 (16.51 %)	5,189,655 (46.47 %)	64,543 (3.14 %)
310	parallel lanternfish (primary hap 2024) GCA_964188405.1	n/a	16,917 (1.64 %)	72,190 (5.85 %)	n/a	42.91 (99.96 %)	2,729 (0.04 %)	24 (100.00 %)	4,976,327 (35.08 %)	1,258,755 (18.52 %)	6,268,804 (48.21 %)	81,193 (3.23 %)
311	Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024) GCF_036324505.1	42,701 (12.59 %)	14,986 (3.15 %)	46,289 (7.75 %)	n/a	40.99 (99.97 %)	380 (0.03 %)	27 (100.00 %)	1,031,762 (25.30 %)	219,393 (4.63 %)	3,436,780 (25.57 %)	16,570 (1.12 %)
312	pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023) GCA_027942865.1	n/a	15,242 (2.07 %)	60,994 (6.53 %)	n/a	41.51 (99.99 %)	282 (0.01 %)	189 (100.00 %)	975,354 (15.76 %)	315,625 (10.49 %)	3,601,904 (35.09 %)	49,121 (3.07 %)
313	pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023) GCA_027942885.1	n/a	15,317 (2.02 %)	61,647 (6.35 %)	n/a	41.37 (99.99 %)	135 (0.01 %)	469 (99.99 %)	981,519 (15.40 %)	319,637 (12.45 %)	3,706,473 (36.77 %)	50,353 (2.98 %)
314	peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021) GCA_017639685.1	n/a	16,729 (3.56 %)	56,451 (8.61 %)	n/a	45.00 (100.00 %)	11 (0.00 %)	5,701 (100.00 %)	1,153,359 (18.94 %)	829,887 (14.54 %)	2,793,018 (28.79 %)	49,469 (4.32 %)
315	peladilla (primary hap 2021) GCA_017639675.1	n/a	13,829 (3.83 %)	41,932 (8.64 %)	n/a	45.01 (98.24 %)	1,158 (1.77 %)	41 (100.00 %)	930,246 (18.49 %)	660,569 (13.71 %)	2,316,198 (27.66 %)	41,023 (4.40 %)
316	pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024) GCA_963989245.1	n/a	17,996 (2.00 %)	89,591 (7.93 %)	n/a	45.22 (99.94 %)	3,299 (0.06 %)	1,177 (100.00 %)	2,828,457 (30.93 %)	1,676,413 (19.87 %)	4,137,400 (48.69 %)	78,669 (4.37 %)
317	picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024) GCA_044231685.1	n/a	13,827 (3.46 %)	53,000 (8.90 %)	n/a	43.38 (100.00 %)	122 (0.00 %)	364 (100.00 %)	222,800 (3.83 %)	105,428 (7.84 %)	2,500,710 (25.24 %)	41,125 (5.45 %)
318	picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024) GCA_044231675.1	n/a	13,816 (3.52 %)	52,689 (9.01 %)	n/a	43.48 (100.00 %)	100 (0.00 %)	300 (100.00 %)	223,762 (3.25 %)	105,291 (6.28 %)	2,579,336 (24.55 %)	41,114 (5.50 %)
319	pike-perch GCF_008315115.2	65,418 (8.54 %)	15,731 (2.23 %)	52,240 (5.69 %)	n/a	40.87 (99.98 %)	711 (0.02 %)	337 (100.00 %)	629,999 (5.16 %)	567,578 (7.41 %)	4,697,709 (36.49 %)	39,666 (1.93 %)
320	pinecone soldierfish (2019) GCF_902150065.1	40,770 (8.72 %)	15,738 (2.42 %)	26,691 (5.69 %)	57,069 (6.14 %)	41.83 (99.78 %)	253 (0.22 %)	87 (100.00 %)	1,063,888 (5.90 %)	646,820 (4.30 %)	4,938,857 (28.11 %)	41,636 (2.04 %)
321	pinecone soldierfish (alternate hap 2019) GCA_902148815.1	n/a	15,563 (2.38 %)	54,264 (6.19 %)	n/a	41.81 (100.00 %)	6 (0.00 %)	2,193 (100.00 %)	1,040,418 (5.81 %)	623,499 (4.08 %)	4,888,400 (27.89 %)	40,331 (2.02 %)
322	pink salmon GCF_021184085.1	91,127 (4.89 %)	27,187 (1.37 %)	124,120 (3.88 %)	n/a	44.28 (99.96 %)	5,213 (0.04 %)	22,556 (99.99 %)	1,343,135 (0.00 %)	2,906,520 (28.95 %)	10,882,087 (57.26 %)	97,805 (3.04 %)
323	ploughfish GCF_902827175.1	50,551 (7.66 %)	14,699 (1.83 %)	66,348 (6.06 %)	62,492 (5.74 %)	41.52 (99.98 %)	1,569 (0.02 %)	2,618 (100.00 %)	467,937 (3.05 %)	412,361 (6.64 %)	3,498,382 (45.08 %)	73,879 (3.55 %)
324	pollack (alternate hap 2023) GCA_949987605.1	n/a	14,050 (2.77 %)	63,249 (8.86 %)	n/a	45.41 (100.00 %)	n/a	4,970 (100.00 %)	708,455 (9.71 %)	797,241 (15.67 %)	2,785,159 (33.18 %)	78,151 (7.95 %)
325	pollack (primary hap 2023) GCA_949987615.1	n/a	14,126 (2.81 %)	61,907 (8.75 %)	n/a	45.67 (99.94 %)	1,810 (0.06 %)	616 (100.00 %)	753,034 (10.17 %)	850,189 (15.72 %)	2,888,555 (33.70 %)	80,883 (8.43 %)
326	predatory carp (Z2021 2022) GCF_024489055.1	56,688 (7.63 %)	17,670 (2.67 %)	54,522 (5.25 %)	n/a	37.95 (100.00 %)	181 (0.00 %)	51 (100.00 %)	3,087,358 (61.37 %)	553,846 (7.14 %)	6,036,124 (43.52 %)	47,942 (3.56 %)
327	prehistoric monster fish (2019 refseq) GCF_902500255.1	45,404 (2.55 %)	14,664 (0.76 %)	72,609 (2.41 %)	57,391 (2.04 %)	41.99 (99.49 %)	2,554 (0.51 %)	464 (100.00 %)	1,310,663 (2.79 %)	786,401 (3.65 %)	9,901,286 (59.90 %)	172,199 (5.45 %)
328	prehistoric monster fish (alternate hap 2019) GCA_902500245.1	n/a	10,944 (0.64 %)	59,123 (2.21 %)	n/a	41.96 (100.00 %)	8 (0.00 %)	19,587 (100.00 %)	947,336 (2.69 %)	554,284 (3.27 %)	7,314,941 (58.56 %)	125,285 (5.42 %)
329	rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024) GCA_038355195.1	n/a	15,639 (3.89 %)	49,368 (9.40 %)	n/a	45.55 (99.93 %)	1,907 (0.07 %)	365 (100.00 %)	1,655,350 (30.53 %)	511,512 (12.09 %)	2,015,264 (35.19 %)	32,410 (4.33 %)
330	rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024) GCF_038355195.1	39,606 (12.43 %)	15,641 (3.89 %)	49,368 (9.40 %)	n/a	45.55 (99.93 %)	1,907 (0.07 %)	366 (100.00 %)	1,655,356 (30.53 %)	511,513 (12.09 %)	2,015,303 (35.19 %)	32,410 (4.33 %)
331	rainbow trout (Arlee) GCF_013265735.2	119,284 (6.51 %)	27,513 (1.62 %)	109,524 (4.38 %)	138,073 (5.21 %)	43.45 (99.74 %)	486 (0.26 %)	939 (100.00 %)	1,537,455 (7.32 %)	2,083,211 (23.10 %)	10,092,840 (53.71 %)	73,586 (2.16 %)
332	rainbow trout (Swanson) GCF_002163495.1	79,299 (6.41 %)	25,179 (1.70 %)	98,339 (4.18 %)	115,853 (5.33 %)	42.67 (88.52 %)	427,894 (11.54 %)	139,800 (99.96 %)	1,332,141 (5.52 %)	1,604,760 (8.18 %)	9,451,984 (44.00 %)	56,604 (1.05 %)
333	Rankin cod (hap1 2025) GCA_048129235.1	n/a	15,661 (1.94 %)	54,906 (5.30 %)	n/a	41.36 (100.00 %)	21 (0.00 %)	386 (100.00 %)	591,994 (2.64 %)	396,424 (6.16 %)	6,144,028 (31.24 %)	24,792 (1.05 %)
334	razorback sucker (HMW12.3.18 2022) GCF_025860055.1	71,991 (5.94 %)	27,195 (1.88 %)	81,269 (3.63 %)	n/a	39.59 (99.96 %)	1,873 (0.04 %)	1,746 (100.00 %)	7,035,382 (51.89 %)	1,021,269 (5.98 %)	12,768,853 (46.85 %)	109,185 (4.70 %)
335	red drum (XU1910 2020) GCA_014183145.1	n/a	15,655 (3.01 %)	47,717 (6.87 %)	n/a	40.98 (95.57 %)	11,577 (4.42 %)	34,462 (100.00 %)	470,579 (3.16 %)	231,051 (1.91 %)	4,345,700 (23.24 %)	20,149 (1.25 %)
336	red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020) GCA_015220065.1	n/a	4,539 (2.01 %)	14,061 (4.35 %)	n/a	40.48 (100.00 %)	n/a	1,751 (100.00 %)	759,605 (49.59 %)	161,693 (7.99 %)	1,684,737 (29.93 %)	7,525 (1.31 %)
337	red-bellied piranha (Pna-1 2016) GCF_001682695.1	47,129 (6.06 %)	17,089 (1.80 %)	33,378 (4.02 %)	n/a	40.45 (97.38 %)	62,964 (2.59 %)	325,620 (97.41 %)	898,445 (4.81 %)	863,000 (6.48 %)	7,757,382 (34.74 %)	34,329 (1.24 %)
338	red-bellied piranha (primary hap 2020) GCF_015220715.1	54,818 (7.05 %)	16,817 (1.87 %)	52,672 (4.24 %)	76,011 (5.65 %)	40.58 (99.17 %)	303 (0.83 %)	55 (100.00 %)	817,566 (5.40 %)	689,236 (8.30 %)	7,296,459 (35.73 %)	33,087 (1.38 %)
339	reedfish (2021) GCF_900747795.2	44,479 (2.01 %)	13,108 (0.46 %)	23,157 (1.29 %)	n/a	39.37 (99.18 %)	1,431 (0.82 %)	169 (100.00 %)	8,636,520 (39.34 %)	1,069,643 (2.91 %)	19,980,572 (47.52 %)	89,023 (1.13 %)
340	reedfish (v1 alternate hap 2019) GCA_900700845.2	n/a	9,950 (0.37 %)	31,611 (1.22 %)	n/a	39.44 (100.00 %)	5 (0.00 %)	38,598 (100.00 %)	1,300,565 (2.57 %)	685,834 (2.21 %)	14,691,576 (45.66 %)	63,365 (1.11 %)
341	ringed pipefish (RoL2022-P2 2023) GCF_027744805.1	56,261 (13.18 %)	14,197 (2.71 %)	45,193 (6.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	14 (0.00 %)	157 (100.00 %)	941,095 (17.66 %)	238,999 (5.27 %)	4,283,692 (41.06 %)	43,014 (4.07 %)
342	Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021) GCF_014905685.2	25,353 (3.88 %)	14,334 (1.56 %)	137,348 (9.74 %)	n/a	41.06 (92.01 %)	100,521 (8.02 %)	18,998 (100.00 %)	635,526 (3.14 %)	444,158 (3.06 %)	6,203,124 (42.81 %)	52,308 (2.11 %)
343	river trout (v2 2021) GCA_901001165.2	n/a	27,928 (1.66 %)	110,791 (4.44 %)	n/a	43.36 (96.90 %)	3,941 (3.10 %)	1,441 (100.00 %)	4,690,842 (57.30 %)	1,789,507 (15.87 %)	9,819,763 (52.37 %)	70,821 (1.77 %)
344	roach minnow (alternate hap 2023) GCA_951802655.1	n/a	18,165 (2.73 %)	62,580 (6.00 %)	n/a	38.74 (100.00 %)	6 (0.00 %)	4,612 (100.00 %)	2,483,904 (48.29 %)	584,363 (7.55 %)	5,582,076 (40.38 %)	60,229 (3.53 %)
345	roach minnow (primary hap 2023) GCA_951802725.1	n/a	18,132 (2.65 %)	63,523 (6.01 %)	n/a	38.80 (99.99 %)	471 (0.01 %)	86 (100.00 %)	2,613,900 (48.90 %)	625,102 (8.21 %)	5,738,444 (41.24 %)	65,328 (3.68 %)
346	rock gunnel (alternate hap 2021) GCA_910591705.2	n/a	15,291 (3.29 %)	45,865 (7.56 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,165 (100.00 %)	1,131,154 (25.69 %)	269,583 (5.08 %)	3,371,712 (24.64 %)	36,810 (2.68 %)
347	rock gunnel (primary hap 2021) GCA_910591455.2	n/a	15,181 (3.34 %)	44,153 (7.53 %)	51,135 (7.40 %)	42.31 (99.98 %)	418 (0.02 %)	101 (100.00 %)	1,121,704 (25.48 %)	269,467 (4.88 %)	3,358,709 (24.69 %)	36,987 (3.02 %)
348	rohu (BAU-BD-2019 2022) GCF_022985175.1	52,554 (8.81 %)	17,664 (3.05 %)	48,403 (5.24 %)	n/a	36.06 (83.93 %)	5,144 (16.07 %)	2,870 (100.00 %)	2,600,095 (49.94 %)	683,499 (4.34 %)	6,000,462 (35.96 %)	33,741 (1.62 %)
349	Rosablanca catfish (hap2 2023) GCA_030015355.1	n/a	15,434 (2.01 %)	44,991 (4.63 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	192 (0.00 %)	302 (100.00 %)	2,506,810 (40.54 %)	613,867 (8.67 %)	5,070,851 (48.32 %)	46,071 (2.57 %)
350	rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq) GCF_042242105.1	32,256 (9.05 %)	15,283 (3.03 %)	44,299 (6.93 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	87 (0.00 %)	441 (100.00 %)	1,115,191 (21.73 %)	271,391 (5.93 %)	3,651,073 (24.53 %)	19,771 (1.39 %)
351	rough bullseye (RE-2024b hap2 2024) GCA_042242125.1	n/a	14,475 (2.89 %)	44,413 (7.11 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	93 (0.00 %)	84 (100.00 %)	1,762,151 (30.90 %)	262,291 (5.80 %)	3,580,461 (24.37 %)	19,851 (1.40 %)
352	rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022) GCA_024453875.1	n/a	17,895 (2.55 %)	64,448 (5.84 %)	n/a	38.93 (99.99 %)	418 (0.01 %)	110 (100.00 %)	2,661,155 (49.83 %)	673,071 (10.59 %)	5,755,954 (42.48 %)	66,952 (4.46 %)
353	rudd (fScaEry2.hap1.1 2024) GCA_964197995.1	n/a	18,254 (2.38 %)	68,852 (5.71 %)	n/a	39.02 (99.99 %)	836 (0.01 %)	759 (100.00 %)	2,854,977 (51.13 %)	754,287 (11.81 %)	5,942,764 (44.17 %)	72,686 (4.52 %)
354	sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023) GCF_027596085.1	34,548 (9.49 %)	15,280 (3.00 %)	46,259 (6.95 %)	n/a	40.45 (99.99 %)	723 (0.01 %)	8,212 (99.99 %)	1,335,152 (28.19 %)	415,384 (6.53 %)	3,948,379 (27.81 %)	22,854 (1.61 %)
355	sailfin molly GCF_001443285.1	53,986 (11.41 %)	15,048 (2.71 %)	33,482 (6.71 %)	n/a	39.18 (83.41 %)	41,735 (16.61 %)	54,623 (83.39 %)	357,919 (2.18 %)	189,502 (1.23 %)	4,873,063 (22.51 %)	34,138 (1.62 %)
356	sansaifugu (HTHZ2018 2019) GCF_003711565.1	56,010 (20.10 %)	13,998 (4.84 %)	48,737 (11.56 %)	n/a	45.63 (99.99 %)	250 (0.01 %)	868 (100.00 %)	304,980 (15.98 %)	171,631 (4.98 %)	1,616,965 (21.60 %)	48,338 (9.79 %)
357	sardine (primary hap 2023 genbank) GCA_963854185.1	n/a	16,071 (2.33 %)	64,180 (7.08 %)	n/a	44.44 (99.96 %)	1,654 (0.04 %)	241 (100.00 %)	1,503,111 (11.74 %)	1,507,024 (15.48 %)	4,027,638 (37.52 %)	68,874 (3.56 %)
358	sardine (primary hap 2023 refseq) GCF_963854185.1	48,146 (9.15 %)	16,069 (2.33 %)	64,178 (7.08 %)	n/a	44.44 (99.96 %)	1,654 (0.04 %)	240 (100.00 %)	1,503,108 (11.74 %)	1,507,022 (15.48 %)	4,027,614 (37.52 %)	68,873 (3.56 %)
359	scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023) GCF_030265065.1	51,270 (7.00 %)	13,854 (1.32 %)	48,980 (3.46 %)	n/a	39.44 (100.00 %)	9 (0.00 %)	109 (100.00 %)	1,805,346 (21.21 %)	512,153 (12.76 %)	6,260,589 (63.96 %)	96,908 (3.65 %)
360	sea stickleback (SK-2024b hap1 2025) GCA_048126635.1	n/a	14,310 (4.44 %)	47,336 (10.19 %)	n/a	44.83 (99.99 %)	241 (0.01 %)	38 (100.00 %)	446,827 (13.86 %)	192,599 (8.52 %)	2,033,160 (22.85 %)	61,012 (13.03 %)
361	sea stickleback (SK-2024b hap2 2025) GCA_048127205.1	n/a	14,237 (4.44 %)	46,701 (10.13 %)	n/a	44.75 (99.99 %)	276 (0.01 %)	52 (100.00 %)	413,494 (14.42 %)	189,429 (8.99 %)	1,996,715 (23.13 %)	60,252 (12.60 %)
362	Senegalese sole GCF_019176455.1	46,446 (12.02 %)	15,155 (3.15 %)	43,828 (7.31 %)	n/a	40.92 (99.99 %)	662 (0.01 %)	1,937 (100.00 %)	522,618 (4.22 %)	317,280 (4.23 %)	4,040,245 (28.25 %)	26,946 (1.79 %)
363	shanny (alternate hap 2023) GCA_963383635.1	n/a	14,728 (2.46 %)	62,094 (7.09 %)	n/a	42.32 (100.00 %)	1 (0.00 %)	3,847 (100.00 %)	939,151 (11.90 %)	472,983 (7.68 %)	4,326,183 (28.40 %)	64,290 (4.16 %)
364	shanny (primary hap 2023) GCA_963383615.1	n/a	15,032 (2.44 %)	62,625 (6.97 %)	n/a	42.07 (99.98 %)	598 (0.02 %)	847 (100.00 %)	967,197 (11.85 %)	498,286 (8.15 %)	4,397,828 (28.96 %)	65,744 (4.06 %)
365	sharptooth jobfish (hap1 2024) GCA_045363895.1	n/a	15,800 (1.77 %)	51,791 (4.52 %)	n/a	39.82 (100.00 %)	84 (0.00 %)	283 (100.00 %)	777,839 (3.19 %)	459,791 (3.90 %)	7,958,604 (35.17 %)	21,711 (0.94 %)
366	sharptooth jobfish (hap2 2024) GCA_045363885.1	n/a	15,879 (1.78 %)	51,774 (4.52 %)	n/a	39.81 (100.00 %)	76 (0.00 %)	172 (100.00 %)	778,842 (3.19 %)	462,247 (3.82 %)	7,956,116 (35.13 %)	21,587 (0.91 %)
367	sheepshead minnow GCF_000732505.1	37,879 (7.01 %)	14,749 (2.02 %)	25,480 (4.66 %)	n/a	38.19 (86.93 %)	113,210 (13.10 %)	110,959 (86.90 %)	363,397 (1.88 %)	195,191 (1.43 %)	6,444,762 (27.47 %)	18,269 (0.66 %)
368	shortfin molly GCF_001443325.1	54,473 (11.42 %)	15,104 (2.72 %)	33,717 (6.74 %)	n/a	39.23 (84.81 %)	37,507 (15.20 %)	50,598 (84.80 %)	328,347 (2.03 %)	172,112 (1.18 %)	4,876,942 (22.80 %)	34,271 (1.66 %)
369	Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019) GCA_900651605.1	n/a	14,510 (4.12 %)	60,058 (10.77 %)	n/a	45.51 (100.00 %)	2 (0.00 %)	3,705 (100.00 %)	249,671 (3.68 %)	182,366 (4.87 %)	1,939,533 (22.55 %)	72,474 (13.55 %)
370	Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023) GCF_900634795.4	59,278 (19.85 %)	14,594 (4.32 %)	55,265 (10.96 %)	n/a	45.31 (99.99 %)	321 (0.01 %)	36 (100.00 %)	384,203 (19.38 %)	175,898 (4.39 %)	1,946,630 (23.16 %)	70,331 (13.13 %)
371	Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023) GCA_900651605.2	n/a	14,737 (4.05 %)	61,568 (10.70 %)	n/a	45.50 (100.00 %)	108 (0.00 %)	3,872 (100.00 %)	392,585 (19.23 %)	190,741 (5.09 %)	1,994,824 (23.20 %)	74,259 (13.49 %)
372	silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022) GCF_023724105.1	131,166 (9.80 %)	29,612 (2.99 %)	81,338 (5.43 %)	n/a	37.63 (99.92 %)	2,597 (0.08 %)	51 (100.00 %)	3,277,259 (45.05 %)	801,192 (7.96 %)	7,910,205 (42.51 %)	60,236 (2.18 %)
373	smalleye Pacific opah (hap1 2023) GCA_029633845.1	n/a	13,661 (1.11 %)	75,418 (4.21 %)	n/a	45.01 (99.96 %)	3,120 (0.04 %)	1,059 (100.00 %)	4,634,757 (53.53 %)	1,006,319 (17.13 %)	5,273,732 (51.16 %)	145,115 (7.59 %)
374	smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq) GCF_029633865.1	34,018 (4.17 %)	13,617 (1.10 %)	74,639 (4.12 %)	n/a	44.94 (99.96 %)	3,115 (0.04 %)	544 (100.00 %)	4,603,649 (53.23 %)	1,009,241 (18.00 %)	5,236,063 (51.65 %)	143,632 (7.43 %)
375	smallmouth bass GCF_021292245.1	55,919 (9.40 %)	15,509 (2.37 %)	49,387 (5.61 %)	n/a	40.72 (99.65 %)	34,581 (0.36 %)	15,020 (100.00 %)	445,979 (2.50 %)	249,630 (2.49 %)	5,071,015 (28.28 %)	23,875 (1.36 %)
376	snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023) GCF_033978785.1	57,883 (4.39 %)	15,654 (1.03 %)	72,123 (3.58 %)	n/a	38.64 (100.00 %)	2,564 (0.00 %)	424 (100.00 %)	3,149,025 (23.73 %)	1,621,410 (19.58 %)	7,534,195 (67.22 %)	122,765 (3.07 %)
377	sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019) GCF_006149115.2	75,628 (6.10 %)	24,075 (1.71 %)	98,364 (4.30 %)	n/a	43.37 (96.15 %)	25,658 (3.85 %)	36,660 (99.99 %)	949,725 (3.53 %)	1,465,583 (10.82 %)	8,853,884 (48.52 %)	62,850 (1.45 %)
378	sockeye salmon (Pitt River 2024) GCF_034236695.1	80,798 (5.59 %)	26,218 (1.35 %)	116,746 (3.87 %)	n/a	44.03 (99.93 %)	4,351 (0.07 %)	12,436 (100.00 %)	6,356,046 (54.95 %)	2,840,516 (31.41 %)	10,575,179 (57.52 %)	77,648 (1.61 %)
379	South Georgia icefish (v2 primary hap 2022) GCF_902827115.2	42,862 (7.09 %)	14,776 (1.80 %)	68,955 (6.18 %)	n/a	42.07 (99.90 %)	2,603 (0.11 %)	1,563 (100.00 %)	512,600 (3.45 %)	473,958 (7.19 %)	3,590,436 (45.74 %)	88,970 (4.31 %)
380	southern bluefin tuna (alternate hap 2021) GCA_910596085.1	n/a	15,727 (2.61 %)	43,177 (5.74 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	n/a	895 (100.00 %)	1,590,386 (33.53 %)	246,800 (2.86 %)	5,173,834 (26.85 %)	14,473 (0.87 %)
381	southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq) GCF_910596095.1	58,429 (11.06 %)	15,626 (2.56 %)	42,730 (5.74 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	184 (0.00 %)	58 (100.00 %)	554,276 (3.42 %)	247,764 (2.94 %)	5,176,851 (26.85 %)	14,097 (0.88 %)
382	southern platyfish GCF_002775205.1	46,367 (11.15 %)	14,674 (2.66 %)	28,368 (6.82 %)	n/a	38.97 (99.53 %)	156 (0.47 %)	102 (100.00 %)	323,402 (2.76 %)	146,477 (2.33 %)	4,741,552 (28.27 %)	34,667 (2.13 %)
383	Southwestern China cavefish GCF_001515605.1	74,317 (6.97 %)	30,906 (3.19 %)	55,474 (5.66 %)	n/a	37.28 (92.69 %)	168,741 (7.34 %)	254,423 (92.66 %)	1,129,104 (5.02 %)	730,197 (4.59 %)	8,910,005 (36.97 %)	64,238 (1.79 %)
384	spangled emperor (hap1 2024) GCA_045362495.1	n/a	15,554 (1.75 %)	58,641 (5.19 %)	n/a	40.59 (100.00 %)	196 (0.00 %)	226 (100.00 %)	682,449 (3.01 %)	409,809 (4.43 %)	7,114,584 (28.98 %)	37,214 (1.53 %)
385	spangled emperor (hap2 2024) GCA_045362485.1	n/a	15,490 (1.77 %)	57,993 (5.20 %)	n/a	40.57 (100.00 %)	244 (0.00 %)	151 (100.00 %)	677,985 (3.03 %)	408,391 (4.33 %)	7,184,861 (29.15 %)	36,602 (1.46 %)
386	spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022) GCF_021347895.1	57,720 (10.03 %)	15,810 (2.14 %)	58,218 (5.77 %)	n/a	40.33 (99.99 %)	871 (0.01 %)	81 (100.00 %)	1,505,948 (35.31 %)	346,542 (4.71 %)	5,210,329 (31.65 %)	36,529 (1.65 %)
387	spiny chromis (Palm Islands 2017) GCF_002109545.1	38,931 (8.84 %)	15,624 (2.29 %)	35,942 (5.59 %)	n/a	40.01 (85.05 %)	209,115 (15.01 %)	30,414 (100.00 %)	372,901 (2.33 %)	278,854 (1.99 %)	5,622,334 (22.61 %)	25,079 (0.95 %)
388	spotted green pufferfish (2004) GCA_000180735.1	n/a	13,641 (5.13 %)	57,982 (13.46 %)	n/a	46.43 (91.24 %)	18,974 (8.76 %)	44,686 (91.24 %)	252,877 (4.38 %)	159,939 (3.51 %)	1,689,462 (18.66 %)	51,580 (13.42 %)
389	spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024) GCF_036321145.1	46,818 (8.35 %)	14,938 (2.04 %)	55,475 (6.12 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	23 (0.00 %)	792 (100.00 %)	505,488 (2.57 %)	269,742 (4.14 %)	4,697,020 (30.74 %)	30,399 (1.90 %)
390	spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024) GCF_036321145.2	48,380 (8.37 %)	15,470 (2.04 %)	57,237 (6.11 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	24 (0.00 %)	791 (100.00 %)	523,070 (2.57 %)	277,554 (4.08 %)	4,872,723 (30.67 %)	31,383 (1.89 %)
391	sterlet (maternal hap 2022 refseq) GCF_902713425.1	110,154 (7.62 %)	25,364 (1.76 %)	40,715 (4.06 %)	n/a	40.11 (100.00 %)	433 (0.00 %)	1,731 (100.00 %)	4,055,215 (43.14 %)	1,124,096 (10.13 %)	9,426,172 (41.81 %)	64,522 (2.85 %)
392	sterlet (v2 paternal hap 2022) GCA_902713435.2	n/a	24,717 (1.73 %)	40,151 (4.13 %)	74,807 (5.54 %)	40.09 (99.99 %)	475 (0.01 %)	1,517 (100.00 %)	1,844,596 (9.77 %)	1,119,340 (9.88 %)	9,372,934 (41.58 %)	65,007 (2.74 %)
393	stone loach (alternate hap 2022) GCA_947034905.1	n/a	16,177 (4.18 %)	40,160 (7.35 %)	n/a	39.58 (100.00 %)	n/a	2,237 (100.00 %)	1,208,781 (38.02 %)	121,854 (7.96 %)	2,956,942 (32.61 %)	27,787 (3.58 %)
394	stone loach (primary hap 2022) GCA_947034865.1	n/a	16,419 (3.98 %)	40,677 (7.21 %)	n/a	39.69 (99.97 %)	825 (0.03 %)	100 (100.00 %)	1,324,513 (39.84 %)	143,170 (9.30 %)	3,000,881 (34.30 %)	30,130 (3.71 %)
395	stone moroko (DD20220531a primary hap 2022) GCF_024679245.1	59,497 (6.82 %)	17,172 (2.25 %)	57,383 (4.85 %)	n/a	39.18 (99.99 %)	497 (0.01 %)	81 (100.00 %)	4,750,810 (63.58 %)	649,426 (10.14 %)	6,511,384 (46.74 %)	74,723 (4.45 %)
396	straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023) GCF_033978795.1	56,498 (4.86 %)	14,602 (1.00 %)	64,279 (2.96 %)	n/a	39.74 (100.00 %)	1,172 (0.00 %)	473 (100.00 %)	2,984,285 (27.54 %)	1,402,691 (20.35 %)	7,915,062 (67.02 %)	140,374 (3.90 %)
397	striated frogfish (MH-2024 2024) GCF_040054535.1	45,220 (12.66 %)	14,509 (3.35 %)	46,221 (7.95 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	18 (0.00 %)	42 (100.00 %)	791,570 (25.79 %)	305,491 (6.68 %)	3,000,938 (29.61 %)	36,818 (4.17 %)
398	striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022) GCA_027382375.1	n/a	15,871 (2.85 %)	42,287 (5.51 %)	n/a	38.96 (100.00 %)	1 (0.00 %)	3,274 (100.00 %)	1,826,752 (37.53 %)	592,022 (6.69 %)	4,899,884 (32.33 %)	17,357 (1.25 %)
399	striped catfish (primary hap 2022 refseq) GCF_027358585.1	53,860 (11.99 %)	16,033 (2.86 %)	41,619 (5.48 %)	n/a	38.99 (99.49 %)	236 (0.51 %)	58 (100.00 %)	1,870,234 (37.80 %)	605,570 (6.82 %)	5,059,429 (32.43 %)	17,919 (1.29 %)
400	striped catfish Indonesia GCF_009078355.1	50,044 (9.61 %)	15,665 (2.76 %)	41,398 (5.35 %)	n/a	38.86 (99.98 %)	463 (0.02 %)	150 (100.00 %)	777,186 (5.69 %)	603,962 (6.24 %)	5,141,987 (32.41 %)	17,264 (1.20 %)
401	striped catfish Vietnam GCF_003671635.1	40,992 (9.44 %)	15,295 (2.91 %)	20,865 (5.31 %)	n/a	38.71 (97.32 %)	23,755 (2.69 %)	567 (100.00 %)	693,498 (4.75 %)	489,286 (3.69 %)	4,849,313 (30.04 %)	15,076 (0.95 %)
402	striped sea-bass GCF_004916995.1	32,103 (10.78 %)	14,422 (3.07 %)	38,188 (6.41 %)	n/a	40.19 (99.19 %)	73,335 (0.86 %)	630 (100.00 %)	365,581 (2.59 %)	142,967 (0.99 %)	4,151,813 (22.73 %)	13,730 (0.95 %)
403	Sumatra barb GCF_018831695.1	54,947 (11.16 %)	18,745 (3.98 %)	49,520 (6.36 %)	n/a	38.24 (99.95 %)	5,075 (0.05 %)	1,122 (100.00 %)	638,783 (6.33 %)	357,159 (7.71 %)	4,520,846 (32.46 %)	46,339 (3.96 %)
404	swamp eel GCF_001952655.1	43,831 (10.64 %)	14,741 (2.98 %)	20,099 (5.80 %)	n/a	40.90 (92.01 %)	51,257 (8.01 %)	71,879 (91.99 %)	266,195 (1.84 %)	95,726 (1.16 %)	3,596,747 (21.95 %)	7,065 (0.42 %)
405	swordfish GCF_016859285.1	47,986 (9.92 %)	15,208 (2.84 %)	42,556 (5.91 %)	n/a	40.69 (99.97 %)	449 (0.03 %)	1,482 (100.00 %)	484,543 (3.59 %)	230,762 (3.41 %)	4,496,150 (23.94 %)	27,129 (2.10 %)
406	tambaqui GCF_904425465.1	46,601 (6.55 %)	17,150 (1.88 %)	50,327 (4.03 %)	n/a	39.33 (100.00 %)	420 (0.00 %)	1,269 (100.00 %)	753,112 (4.00 %)	676,948 (5.71 %)	8,317,676 (35.32 %)	25,784 (0.92 %)
407	thickback sole (primary hap 2023) GCA_963457635.1	n/a	14,720 (2.58 %)	45,918 (6.44 %)	n/a	40.37 (99.99 %)	454 (0.01 %)	188 (100.00 %)	1,242,704 (17.37 %)	518,293 (15.23 %)	3,986,694 (40.18 %)	51,441 (3.53 %)
408	thicklip grey mullet (primary hap 2023) GCA_963514085.1	n/a	15,347 (2.73 %)	50,294 (7.25 %)	n/a	42.30 (99.98 %)	610 (0.02 %)	393 (100.00 %)	1,157,324 (26.70 %)	229,196 (4.33 %)	3,694,790 (27.54 %)	38,929 (2.20 %)
409	three-spined stickleback GCF_016920845.1	50,181 (16.09 %)	14,935 (3.99 %)	53,773 (9.96 %)	n/a	44.66 (99.24 %)	3,125 (0.76 %)	2,937 (100.00 %)	368,987 (9.09 %)	160,564 (2.89 %)	2,308,841 (21.91 %)	80,336 (11.49 %)
410	three-spined stickleback (hap1 2024) GCA_964276395.1	n/a	14,939 (3.72 %)	56,284 (10.07 %)	n/a	44.71 (99.99 %)	331 (0.01 %)	133 (100.00 %)	573,569 (20.53 %)	206,699 (9.01 %)	2,335,009 (27.29 %)	84,009 (12.41 %)
411	three-spined stickleback (hap2 2024) GCA_964276385.1	n/a	13,591 (3.79 %)	50,693 (10.19 %)	n/a	44.72 (99.99 %)	309 (0.01 %)	479 (99.99 %)	505,547 (19.86 %)	181,092 (8.75 %)	2,117,454 (27.02 %)	75,434 (12.33 %)
412	tidewater goby (DKJ021-1_F 2022) GCA_026437355.1	n/a	13,912 (1.87 %)	62,727 (6.28 %)	n/a	42.90 (99.99 %)	894 (0.01 %)	755 (100.00 %)	1,981,480 (37.86 %)	652,950 (27.50 %)	3,680,829 (47.75 %)	96,414 (8.01 %)
413	tidewater goby (DKJ021-1_F 2022) GCA_026437365.1	n/a	14,276 (1.78 %)	66,576 (6.32 %)	n/a	42.96 (99.99 %)	794 (0.01 %)	820 (100.00 %)	2,127,818 (38.86 %)	708,255 (30.28 %)	3,809,452 (49.66 %)	101,682 (8.04 %)
414	tiger tail seahorse (QL1 v2 2016) GCF_001891065.2	47,024 (13.33 %)	13,806 (3.76 %)	52,367 (8.81 %)	n/a	43.30 (93.08 %)	22,977 (6.92 %)	55,891 (93.08 %)	356,857 (3.66 %)	155,338 (3.36 %)	2,806,278 (24.56 %)	61,010 (7.71 %)
415	tongue sole GCF_000523025.1	45,186 (16.40 %)	14,186 (3.98 %)	20,816 (8.22 %)	n/a	40.82 (94.88 %)	33,269 (5.14 %)	62,912 (94.86 %)	423,833 (4.34 %)	235,739 (3.33 %)	3,085,031 (24.78 %)	17,094 (1.42 %)
416	torafugu (alternate hap 2019) GCA_901000745.3	n/a	13,635 (4.82 %)	48,723 (11.83 %)	n/a	45.60 (99.82 %)	38 (0.18 %)	2,012 (100.00 %)	249,793 (9.32 %)	151,193 (4.49 %)	1,577,144 (20.25 %)	46,936 (9.72 %)
417	torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq) GCF_901000725.2	53,479 (18.31 %)	14,527 (4.79 %)	28,597 (10.65 %)	55,587 (14.38 %)	45.67 (99.04 %)	402 (0.96 %)	128 (100.00 %)	281,011 (10.36 %)	178,921 (5.32 %)	1,642,756 (20.86 %)	49,975 (9.63 %)
418	torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank) GCA_901000725.3	n/a	14,527 (4.79 %)	51,181 (11.72 %)	n/a	45.67 (99.04 %)	402 (0.96 %)	128 (100.00 %)	325,077 (14.03 %)	178,921 (5.32 %)	1,642,754 (20.86 %)	49,975 (9.63 %)
419	trahira (v2 hap2 2024) GCA_029633875.2	n/a	15,041 (2.01 %)	42,180 (4.38 %)	n/a	41.03 (96.21 %)	792 (3.79 %)	594 (98.65 %)	1,069,159 (7.06 %)	653,554 (15.46 %)	4,921,631 (38.75 %)	26,440 (2.18 %)
420	trahira (v1 hap1 2024 refseq) GCF_029633855.1	55,764 (7.71 %)	17,259 (2.05 %)	47,792 (4.36 %)	n/a	40.99 (94.51 %)	989 (5.49 %)	598 (100.00 %)	2,407,637 (30.93 %)	742,073 (14.33 %)	5,715,475 (37.52 %)	29,012 (2.12 %)
421	trahira (v2 hap1 2024 genbank) GCA_029633855.2	n/a	17,256 (2.05 %)	47,792 (4.36 %)	n/a	40.99 (94.51 %)	989 (5.49 %)	597 (100.00 %)	2,407,631 (30.93 %)	742,073 (14.33 %)	5,715,418 (37.52 %)	29,012 (2.12 %)
422	trumpetfish (SK-2024c 2025) GCA_048301465.1	n/a	14,730 (2.84 %)	50,956 (7.07 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	179 (0.00 %)	161 (100.00 %)	548,208 (5.35 %)	356,364 (7.30 %)	3,448,877 (26.01 %)	26,685 (1.80 %)
423	trumpetfish (SK-2024c 2025) GCA_048301475.1	n/a	14,680 (2.80 %)	50,753 (6.99 %)	n/a	43.14 (100.00 %)	187 (0.00 %)	248 (100.00 %)	559,722 (5.35 %)	382,817 (8.57 %)	3,423,208 (26.76 %)	26,739 (1.77 %)
424	turbot (primary hap 2023) GCA_963854745.1	n/a	14,816 (3.44 %)	49,680 (8.16 %)	n/a	43.40 (99.97 %)	805 (0.03 %)	108 (100.00 %)	808,348 (19.20 %)	301,230 (7.15 %)	3,267,772 (25.91 %)	66,132 (6.90 %)
425	turbot (ysfricsl-2021 2022) GCF_022379125.1	57,285 (14.93 %)	14,887 (3.52 %)	49,403 (8.32 %)	87,351 (14.65 %)	43.54 (100.00 %)	n/a	28 (100.00 %)	455,017 (0.00 %)	297,185 (5.03 %)	3,312,612 (24.33 %)	65,633 (7.08 %)
426	turquoise killifish (GRZ 2015) GCF_001465895.1	40,373 (7.85 %)	14,339 (2.08 %)	84,906 (20.47 %)	57,218 (6.01 %)	42.51 (68.98 %)	85,562 (31.04 %)	68,911 (68.97 %)	392,114 (2.78 %)	307,607 (2.09 %)	4,777,941 (27.62 %)	61,105 (2.15 %)
427	turquoise killifish (GRZ-AD 2024) GCF_043380555.1	56,976 (5.74 %)	14,604 (1.25 %)	72,207 (4.35 %)	n/a	44.51 (100.00 %)	369 (0.00 %)	304 (100.00 %)	2,858,575 (46.12 %)	660,603 (29.65 %)	4,283,242 (61.88 %)	118,966 (11.71 %)
428	turquoise killifish (MZM-0403 2023) GCF_027789165.1	54,488 (6.75 %)	14,227 (1.27 %)	69,161 (4.33 %)	n/a	44.33 (93.22 %)	3,093 (6.78 %)	2,681 (100.00 %)	2,760,581 (47.64 %)	635,213 (25.56 %)	4,136,925 (56.55 %)	110,696 (10.50 %)
429	walking catfish (CIFAMagur01 2020) GCA_013621035.1	n/a	15,895 (2.18 %)	46,934 (4.73 %)	n/a	39.83 (99.95 %)	605 (0.05 %)	3,484 (100.00 %)	1,061,538 (6.25 %)	611,618 (5.19 %)	5,978,835 (37.11 %)	54,666 (3.50 %)
430	walleye pollock (NIFS_2021 2022) GCF_026213295.1	49,084 (12.15 %)	14,241 (2.71 %)	70,653 (9.29 %)	n/a	45.59 (99.96 %)	2,816 (0.04 %)	168 (100.00 %)	1,274,742 (38.63 %)	797,757 (14.11 %)	2,725,416 (34.38 %)	95,149 (8.09 %)
431	warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020) GCA_013347815.1	n/a	14,197 (3.33 %)	44,782 (7.70 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	n/a	2,294 (100.00 %)	396,279 (4.74 %)	275,154 (5.76 %)	2,933,132 (29.41 %)	35,104 (4.08 %)
432	warty frogfish (primary hap 2020) GCA_013358685.1	n/a	14,494 (3.34 %)	45,310 (7.77 %)	n/a	41.86 (99.87 %)	219 (0.13 %)	155 (100.00 %)	413,753 (4.95 %)	290,313 (6.11 %)	3,010,996 (29.71 %)	36,840 (4.18 %)
433	western mosquitofish GCF_019740435.1	54,029 (12.31 %)	14,667 (2.80 %)	44,358 (6.62 %)	n/a	38.94 (97.42 %)	181 (2.58 %)	37 (100.00 %)	348,476 (2.56 %)	158,728 (2.21 %)	4,604,959 (26.85 %)	30,624 (1.94 %)
434	western speckled dace (OS25496 2023) GCF_029890125.1	46,203 (5.36 %)	16,945 (2.57 %)	65,343 (6.35 %)	n/a	39.74 (100.00 %)	n/a	930 (100.00 %)	2,528,154 (48.24 %)	549,447 (8.24 %)	5,157,802 (41.42 %)	84,874 (6.05 %)
435	westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024) GCF_045791955.1	85,126 (5.62 %)	27,822 (1.58 %)	113,187 (4.31 %)	n/a	43.47 (99.99 %)	1,381 (0.01 %)	4,647 (99.99 %)	1,200,605 (4.82 %)	2,237,797 (24.56 %)	10,339,252 (54.27 %)	70,550 (1.65 %)
436	White Sands pupfish GCF_016077235.1	46,084 (6.27 %)	14,817 (1.71 %)	52,055 (4.88 %)	n/a	39.01 (100.00 %)	n/a	2,003 (100.00 %)	489,894 (2.67 %)	304,277 (3.91 %)	6,371,712 (38.05 %)	41,820 (1.75 %)
437	wolf-eel GCF_004355925.1	43,625 (14.00 %)	14,930 (3.24 %)	31,372 (7.30 %)	n/a	42.10 (92.86 %)	23,891 (7.15 %)	33,400 (92.85 %)	379,343 (3.26 %)	244,853 (2.39 %)	3,432,622 (22.07 %)	30,581 (2.04 %)
438	woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022) GCA_023055415.1	n/a	14,753 (3.49 %)	49,516 (8.47 %)	n/a	43.00 (100.00 %)	222 (0.00 %)	171 (100.00 %)	458,382 (5.18 %)	420,718 (8.01 %)	3,146,054 (25.71 %)	69,817 (7.20 %)
439	woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022) GCA_023055335.1	n/a	14,847 (3.48 %)	50,136 (8.43 %)	n/a	42.99 (100.00 %)	219 (0.00 %)	443 (100.00 %)	461,903 (5.20 %)	422,251 (8.03 %)	3,180,804 (25.81 %)	70,183 (7.15 %)
440	woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022) GCF_023055335.1	42,410 (12.47 %)	14,845 (3.48 %)	50,132 (8.43 %)	n/a	42.99 (100.00 %)	219 (0.00 %)	661 (100.00 %)	461,895 (5.20 %)	422,249 (8.03 %)	3,180,722 (25.81 %)	70,181 (7.15 %)
441	worm pipefish (RoL_2023-P1 2023) GCF_033978685.1	73,681 (3.43 %)	25,892 (1.02 %)	114,154 (3.30 %)	n/a	39.45 (100.00 %)	146 (0.00 %)	630 (100.00 %)	4,795,312 (24.37 %)	2,093,730 (16.74 %)	13,132,465 (67.32 %)	248,526 (4.59 %)
442	Wuchang bream GCF_018812025.1	68,768 (8.86 %)	18,247 (2.62 %)	57,323 (5.24 %)	n/a	37.64 (99.83 %)	1,281 (0.17 %)	243 (100.00 %)	801,110 (0.00 %)	559,399 (5.04 %)	6,340,567 (43.09 %)	45,067 (2.52 %)
443	Yangtze koukloug (SWU-2019 2020) GCF_012432095.1	63,925 (10.50 %)	17,502 (3.25 %)	52,519 (5.86 %)	n/a	37.23 (99.62 %)	617 (0.38 %)	353 (100.00 %)	2,297,102 (50.34 %)	368,423 (3.28 %)	5,171,389 (38.98 %)	32,824 (2.00 %)
444	yellow and blueback fusilier (OG672 2025) GCA_048129025.1	n/a	15,641 (1.95 %)	52,141 (5.13 %)	n/a	40.61 (100.00 %)	17 (0.00 %)	250 (100.00 %)	607,010 (2.66 %)	288,837 (3.91 %)	6,785,488 (31.37 %)	39,560 (1.65 %)
445	yellow and blueback fusilier (OG672 2025) GCA_048129055.1	n/a	15,666 (1.88 %)	53,049 (5.01 %)	n/a	40.71 (100.00 %)	29 (0.00 %)	324 (100.00 %)	620,903 (2.64 %)	305,809 (5.18 %)	6,707,330 (33.41 %)	45,863 (1.88 %)
446	yellow catfish (hzauxx_2018 2022) GCF_022655615.1	64,819 (11.15 %)	15,680 (2.87 %)	41,108 (5.68 %)	n/a	39.49 (99.94 %)	817 (0.06 %)	517 (100.00 %)	839,496 (9.42 %)	756,396 (11.12 %)	4,051,149 (35.45 %)	24,342 (1.72 %)
447	yellow catfish (Tf-2017 2018) GCF_003724035.1	54,374 (10.66 %)	15,584 (2.85 %)	22,598 (5.58 %)	n/a	39.55 (99.11 %)	1,760 (0.89 %)	663 (100.00 %)	883,218 (10.65 %)	797,020 (11.09 %)	4,092,065 (35.46 %)	24,238 (1.72 %)
448	yellow perch (YP-PL-M2 2019) GCF_004354835.1	47,108 (7.77 %)	15,458 (2.26 %)	28,572 (5.62 %)	n/a	40.84 (99.95 %)	831 (0.05 %)	268 (100.00 %)	620,402 (4.92 %)	540,302 (7.26 %)	4,770,842 (35.92 %)	35,251 (1.63 %)
449	yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020) GCA_904848175.1	n/a	814 (1.87 %)	3,814 (6.84 %)	n/a	42.36 (99.98 %)	80 (0.02 %)	349 (100.00 %)	38,000 (5.03 %)	29,516 (7.35 %)	232,988 (20.37 %)	2,289 (2.07 %)
450	yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020) GCF_904848185.1	63,974 (13.26 %)	15,178 (2.82 %)	46,332 (6.73 %)	84,160 (11.62 %)	42.09 (100.00 %)	149 (0.00 %)	66 (100.00 %)	499,939 (3.43 %)	254,361 (2.64 %)	4,420,217 (22.81 %)	31,005 (1.79 %)
451	yellowfin tuna (alternate hap 2021) GCA_914744365.1	n/a	15,959 (2.63 %)	43,025 (5.73 %)	n/a	39.71 (100.00 %)	n/a	640 (100.00 %)	1,427,221 (28.44 %)	257,108 (3.15 %)	5,197,531 (26.91 %)	13,909 (0.83 %)
452	yellowfin tuna (primary hap 2021) GCF_914725855.1	57,835 (11.36 %)	15,616 (2.53 %)	42,750 (5.72 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	70 (0.00 %)	68 (100.00 %)	569,665 (3.53 %)	259,656 (3.34 %)	5,175,692 (27.05 %)	14,420 (0.88 %)
453	yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017) GCF_002814215.2	40,935 (9.94 %)	15,673 (2.75 %)	53,235 (6.33 %)	n/a	40.72 (97.79 %)	33,661 (2.21 %)	98,345 (100.00 %)	1,337,427 (24.48 %)	522,121 (4.83 %)	4,649,096 (25.00 %)	16,819 (0.86 %)
454	zebra mbuna GCF_000238955.4	51,012 (8.37 %)	15,901 (2.10 %)	32,136 (6.12 %)	n/a	41.16 (99.99 %)	641 (0.01 %)	1,690 (100.00 %)	565,771 (6.22 %)	253,037 (2.53 %)	4,679,743 (31.57 %)	36,689 (2.00 %)
455	zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022) GCA_944039255.1	n/a	6,365 (2.41 %)	16,467 (3.26 %)	n/a	36.72 (100.00 %)	n/a	4,719 (100.00 %)	1,317,027 (59.43 %)	323,062 (10.58 %)	3,014,570 (45.46 %)	14,563 (1.98 %)
456	zebrafish (T5D 2021) GCA_018400075.1	n/a	17,774 (2.54 %)	44,221 (3.24 %)	n/a	36.52 (99.87 %)	20,876 (0.14 %)	20,901 (99.86 %)	4,138,008 (61.22 %)	894,145 (6.79 %)	9,494,379 (47.68 %)	42,482 (2.03 %)
457	zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020) GCA_903684865.1	n/a	17,535 (2.50 %)	44,169 (3.34 %)	n/a	36.57 (99.99 %)	712 (0.01 %)	1,252 (100.00 %)	3,891,854 (61.07 %)	927,173 (7.78 %)	8,621,517 (50.27 %)	44,554 (2.12 %)
458	zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020) GCA_903684855.2	n/a	17,692 (2.51 %)	43,578 (3.27 %)	n/a	36.56 (99.99 %)	1,352 (0.01 %)	755 (100.00 %)	3,937,397 (60.86 %)	936,258 (7.76 %)	8,732,369 (50.44 %)	44,812 (2.09 %)
459	zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022) GCA_944039275.1	n/a	18,065 (2.46 %)	44,526 (3.30 %)	n/a	37.08 (99.99 %)	381 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,804,769 (44.04 %)	954,645 (10.72 %)	8,694,743 (51.88 %)	44,936 (2.02 %)
460	zebrafish GRCz11 GCF_000002035.6	65,219 (5.63 %)	22,246 (2.54 %)	51,134 (7.13 %)	n/a	36.60 (99.72 %)	20,258 (0.28 %)	34,617 (99.73 %)	4,595,932 (57.92 %)	1,077,677 (6.47 %)	10,772,232 (49.45 %)	53,471 (2.06 %)
461	zig-zag eel (alternate hap) GCA_900700395.1	n/a	1,204 (2.88 %)	4,065 (7.13 %)	n/a	41.24 (99.99 %)	n/a	1,437 (100.00 %)	26,319 (3.19 %)	14,209 (3.21 %)	211,357 (18.05 %)	1,253 (1.49 %)
462	zig-zag eel (v1.2 2019 refseq) GCF_900324485.2	44,988 (12.00 %)	15,037 (3.35 %)	40,235 (7.28 %)	60,496 (9.39 %)	40.66 (97.76 %)	238 (2.24 %)	123 (100.00 %)	348,230 (2.87 %)	157,728 (2.01 %)	3,180,025 (23.44 %)	12,807 (1.08 %)
463	zig-zag eel (v1.3 2021 genbank) GCA_900324485.3	n/a	15,036 (3.35 %)	40,234 (7.28 %)	n/a	40.66 (97.76 %)	238 (2.24 %)	123 (100.00 %)	671,614 (20.98 %)	157,728 (2.01 %)	3,180,040 (23.44 %)	12,807 (1.08 %)
TOTALS:	total assembly count 463

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	222 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	659 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	424 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	463 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	302 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1152 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	311 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	920 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	291 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	118 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	553 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1186 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	778 assemblies	assembly stats	track stats