Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1		 n/a 15,735
(2.44 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 203
(100.00 %)		 1,781,283
(37.65 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,080
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1		 54,226
(11.15 %)		 13,427
(2.67 %)		 46,903
(5.94 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 1,200,994
(30.62 %)		 143,062
(2.20 %)		 3,921,676
(38.03 %)		 67,978
(8.92 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1		 48,520
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1		 47,198
(13.10 %)		 15,500
(3.14 %)		 41,230
(6.67 %)		 n/a 40.79
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 31
(100.00 %)		 1,230,524
(26.57 %)		 398,694
(5.41 %)		 4,106,609
(25.60 %)		 15,656
(0.99 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1		 n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1		 n/a 16,678
(0.56 %)		 151,361
(4.03 %)		 n/a 44.57
(99.91 %)		 15,113
(0.09 %)		 5,983
(100.00 %)		 12,251,532
(51.73 %)		 3,521,157
(17.69 %)		 10,051,020
(68.37 %)		 494,595
(10.52 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1		 n/a 14,859
(1.97 %)		 60,431
(5.73 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 1,039
(0.01 %)		 1,541
(100.00 %)		 461,253
(3.08 %)		 434,124
(6.81 %)		 3,499,945
(42.99 %)		 60,941
(3.20 %)
15 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1		 101,825
(6.80 %)		 26,394
(1.53 %)		 107,089
(4.26 %)		 n/a 43.53
(99.98 %)		 3,854
(0.02 %)		 939
(100.00 %)		 1,090,104
(4.07 %)		 1,787,017
(23.51 %)		 9,220,961
(56.45 %)		 78,798
(2.30 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1		 n/a 22,376
(1.44 %)		 97,559
(4.71 %)		 n/a 43.37
(99.97 %)		 3,235
(0.03 %)		 4,404
(99.97 %)		 999,920
(4.22 %)		 1,630,911
(26.08 %)		 7,875,105
(58.08 %)		 70,947
(2.59 %)
17 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2		 72,597
(5.72 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
18 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
19 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
20 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
21 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
22 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
23 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,328
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
24 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
25 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1		 51,030
(10.40 %)		 15,549
(2.60 %)		 42,858
(5.39 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,718,992
(31.80 %)		 749,009
(14.09 %)		 4,206,758
(37.30 %)		 19,230
(1.16 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1		 n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1		 54,426
(12.09 %)		 15,720
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 119
(100.00 %)		 1,608,682
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,078
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
28 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
29 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
30 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
31 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
32 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
33 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
34 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1		 n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 13,309
(0.75 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1		 34,357
(8.10 %)		 15,289
(2.56 %)		 43,205
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 665
(100.00 %)		 1,496,240
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,726
(29.93 %)		 13,308
(0.75 %)
37 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,904
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
38 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,781
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
39 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1		 n/a 14,247
(3.16 %)		 47,091
(7.94 %)		 n/a 42.17
(99.99 %)		 867
(0.02 %)		 478
(100.00 %)		 352,705
(4.33 %)		 432,013
(10.15 %)		 2,954,922
(28.67 %)		 41,876
(4.47 %)
40 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1		 n/a 14,127
(3.23 %)		 45,606
(7.98 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 804
(0.01 %)		 567
(100.00 %)		 333,253
(4.04 %)		 384,132
(9.16 %)		 2,977,533
(27.98 %)		 40,432
(4.35 %)
41 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 76,242
(9.93 %)		 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1		 n/a 15,457
(2.72 %)		 38,472
(5.59 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 625
(100.00 %)		 476,492
(3.25 %)		 242,097
(6.02 %)		 4,286,693
(33.41 %)		 9,322
(0.80 %)
43 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1		 n/a 15,534
(2.50 %)		 39,464
(5.26 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 552
(100.00 %)		 498,493
(3.22 %)		 271,314
(7.61 %)		 4,161,752
(38.16 %)		 9,637
(0.93 %)
44 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
45 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
46 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1		 48,592
(12.09 %)		 15,140
(2.66 %)		 43,304
(6.14 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 946
(99.98 %)		 1,221,797
(30.10 %)		 290,736
(7.79 %)		 4,164,799
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
47 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
48 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
49 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1		 n/a 15,122
(1.44 %)		 65,809
(4.50 %)		 n/a 41.23
(99.74 %)		 293
(0.26 %)		 331
(100.00 %)		 2,545,429
(50.53 %)		 451,939
(5.50 %)		 5,807,705
(42.18 %)		 94,695
(3.92 %)
50 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1		 n/a 15,024
(1.45 %)		 65,141
(4.53 %)		 n/a 41.23
(99.52 %)		 373
(0.48 %)		 196
(100.00 %)		 2,509,508
(50.53 %)		 441,892
(5.11 %)		 6,245,443
(38.22 %)		 93,198
(3.82 %)
51 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
52 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
53 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,657
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
54 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1		 n/a 15,938
(3.00 %)		 52,921
(7.52 %)		 n/a 43.38
(99.98 %)		 752
(0.02 %)		 327
(100.00 %)		 993,554
(11.81 %)		 755,389
(11.75 %)		 3,469,352
(30.25 %)		 68,008
(5.51 %)
55 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1		 n/a 15,940
(3.02 %)		 51,682
(7.42 %)		 n/a 43.31
(99.98 %)		 756
(0.02 %)		 200
(100.00 %)		 986,717
(11.69 %)		 754,642
(11.91 %)		 3,459,958
(30.32 %)		 67,732
(5.27 %)
56 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1		 n/a 15,950
(2.82 %)		 53,175
(7.04 %)		 n/a 42.97
(99.99 %)		 481
(0.01 %)		 846
(100.00 %)		 1,017,817
(12.34 %)		 764,426
(15.65 %)		 3,524,564
(32.87 %)		 60,800
(4.43 %)
57 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1		 n/a 15,811
(2.85 %)		 52,254
(7.09 %)		 n/a 43.06
(99.99 %)		 508
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,002,378
(12.22 %)		 753,750
(14.96 %)		 3,479,721
(32.11 %)		 60,513
(4.18 %)
58 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
59 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1		 n/a 16,025
(2.63 %)		 53,351
(6.76 %)		 n/a 42.47
(99.98 %)		 699
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 995,401
(9.22 %)		 626,617
(9.80 %)		 4,302,378
(31.80 %)		 38,231
(2.50 %)
60 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1		 n/a 15,902
(2.63 %)		 52,639
(6.71 %)		 n/a 42.44
(99.98 %)		 680
(0.02 %)		 204
(100.00 %)		 989,039
(9.11 %)		 628,091
(9.80 %)		 4,315,800
(31.97 %)		 37,729
(2.33 %)
61 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1		 34,914
(7.61 %)		 16,015
(2.73 %)		 54,287
(6.76 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 n/a 8,310
(100.00 %)		 996,609
(9.55 %)		 631,344
(6.03 %)		 4,456,094
(29.17 %)		 37,522
(2.03 %)
62 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1		 n/a 14,534
(2.11 %)		 56,906
(6.41 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 3,523
(100.00 %)		 2,445,373
(45.07 %)		 452,878
(9.46 %)		 4,195,077
(39.49 %)		 77,592
(4.86 %)
63 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
64 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
65 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1		 42,351
(12.09 %)		 14,988
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 1,017,142
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,447
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
66 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1		 n/a 15,257
(2.73 %)		 47,477
(6.62 %)		 n/a 42.03
(100.00 %)		 n/a 24
(100.00 %)		 488,582
(3.19 %)		 254,655
(4.13 %)		 4,385,401
(24.08 %)		 32,461
(1.90 %)
67 black rockcod
GCF_000735185.1		 34,978
(8.49 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
68 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1		 43,392
(8.45 %)		 15,522
(2.13 %)		 48,255
(5.50 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 341
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 1,651,919
(22.26 %)		 782,601
(7.55 %)		 5,398,047
(38.87 %)		 24,508
(1.19 %)
69 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
70 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
71 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1		 n/a 15,085
(2.21 %)		 48,479
(5.71 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 499,447
(3.15 %)		 285,392
(5.12 %)		 5,443,017
(30.00 %)		 23,550
(1.23 %)
72 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
73 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1		 n/a 17,403
(2.99 %)		 45,903
(5.38 %)		 n/a 38.64
(99.99 %)		 709
(0.01 %)		 673
(100.00 %)		 2,141,901
(35.77 %)		 482,931
(17.18 %)		 4,297,133
(46.82 %)		 41,889
(2.32 %)
74 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1		 n/a 17,486
(2.97 %)		 46,833
(5.41 %)		 n/a 38.79
(99.99 %)		 720
(0.01 %)		 413
(100.00 %)		 2,165,269
(36.18 %)		 490,692
(17.84 %)		 4,251,333
(47.54 %)		 42,744
(2.37 %)
75 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,929
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
76 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
77 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 56,939
(8.11 %)		 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
78 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1		 n/a 13,097
(2.93 %)		 55,097
(8.76 %)		 n/a 45.82
(99.88 %)		 3,055
(0.12 %)		 3,832
(100.00 %)		 1,337,604
(32.27 %)		 749,185
(17.27 %)		 2,363,606
(35.06 %)		 78,815
(8.25 %)
79 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1		 n/a 14,996
(2.68 %)		 44,244
(6.44 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 59
(100.00 %)		 1,619,681
(30.07 %)		 337,749
(4.31 %)		 4,541,709
(29.20 %)		 14,576
(0.85 %)
80 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1		 63,345
(14.83 %)		 14,387
(3.54 %)		 43,563
(7.96 %)		 n/a 41.68
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 842,739
(18.67 %)		 356,558
(12.86 %)		 2,720,911
(41.08 %)		 40,187
(4.66 %)
81 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
82 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
83 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
84 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
85 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
86 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
87 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
88 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1		 24,050
(11.30 %)		 14,596
(4.48 %)		 52,760
(11.00 %)		 n/a 44.75
(99.96 %)		 1,486
(0.04 %)		 1,370
(100.00 %)		 471,281
(10.94 %)		 181,798
(7.38 %)		 2,008,576
(24.90 %)		 46,438
(14.87 %)
89 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1		 86,420
(8.25 %)		 22,100
(2.28 %)		 59,296
(4.66 %)		 n/a 38.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 3,555,303
(40.49 %)		 538,181
(9.64 %)		 6,137,303
(50.16 %)		 71,533
(4.06 %)
90 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1		 n/a 17,715
(2.98 %)		 44,183
(4.64 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 613,768
(4.88 %)		 440,668
(11.76 %)		 5,264,302
(45.25 %)		 39,351
(3.96 %)
91 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1		 37,003
(8.79 %)		 15,275
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 1,369,180
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,024
(31.90 %)		 27,133
(1.64 %)
92 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1		 43,278
(10.19 %)		 15,613
(2.96 %)		 39,340
(5.77 %)		 n/a 39.31
(99.98 %)		 291
(0.02 %)		 78
(100.00 %)		 1,563,305
(33.23 %)		 689,312
(9.96 %)		 3,954,578
(35.31 %)		 20,152
(1.50 %)
93 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1		 55,474
(7.85 %)		 13,848
(1.83 %)		 27,055
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 953,492
(13.69 %)		 387,699
(7.91 %)		 4,552,359
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
94 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 43,764
(2.79 %)
95 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
96 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
97 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1		 n/a 13,406
(4.62 %)		 41,458
(10.33 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 205,224
(2.93 %)		 217,943
(13.58 %)		 1,368,592
(36.56 %)		 48,018
(12.44 %)
98 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1		 n/a 13,414
(4.78 %)		 41,481
(10.68 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 90
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 203,521
(2.96 %)		 200,308
(11.44 %)		 1,413,994
(34.72 %)		 47,578
(12.59 %)
99 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1		 49,639
(15.87 %)		 13,630
(3.98 %)		 43,263
(9.12 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 727,223
(20.88 %)		 290,624
(20.53 %)		 1,369,709
(43.82 %)		 51,671
(14.43 %)
100 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
101 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,218
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
102 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
103 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
104 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
105 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,841
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
106 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
107 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1		 48,842
(7.86 %)		 15,030
(2.11 %)		 47,569
(5.39 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 362,601
(2.31 %)		 342,827
(15.91 %)		 3,359,060
(39.76 %)		 28,098
(1.96 %)
108 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
109 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
110 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
111 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
112 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
113 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1		 80,307
(5.31 %)		 27,171
(1.38 %)		 123,048
(4.00 %)		 n/a 44.12
(99.94 %)		 4,047
(0.06 %)		 18,306
(100.00 %)		 1,207,353
(5.23 %)		 2,779,869
(27.93 %)		 11,429,057
(55.56 %)		 83,137
(1.99 %)
114 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1		 38,623
(10.62 %)		 15,604
(3.07 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 1,224,649
(24.57 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,926
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
115 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1		 n/a 15,116
(2.91 %)		 47,839
(7.01 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 463,848
(3.80 %)		 254,561
(4.23 %)		 3,654,295
(24.08 %)		 30,593
(1.99 %)
116 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
117 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1		 n/a 15,739
(1.88 %)		 46,290
(4.42 %)		 n/a 39.31
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 663,559
(2.79 %)		 371,107
(3.14 %)		 7,519,173
(32.84 %)		 17,824
(0.70 %)
118 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1		 n/a 15,611
(1.87 %)		 46,283
(4.42 %)		 n/a 39.32
(100.00 %)		 72
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 663,907
(2.82 %)		 372,676
(3.23 %)		 7,551,541
(33.03 %)		 17,757
(0.80 %)
119 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1		 48,071
(11.91 %)		 16,738
(3.72 %)		 46,295
(6.80 %)		 n/a 39.61
(98.56 %)		 9,510
(1.45 %)		 1,039
(100.00 %)		 1,469,931
(44.44 %)		 188,838
(2.34 %)		 3,624,116
(35.94 %)		 44,615
(5.01 %)
120 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,690
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
121 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,018
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
122 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,327
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
123 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,370
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 157,582
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
124 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
125 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
126 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
127 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,598
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 120,379
(5.87 %)		 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
128 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
129 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
130 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,580
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
131 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,925
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
132 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,863
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 125,873
(5.26 %)		 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
133 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1		 n/a 18,114
(2.63 %)		 66,549
(6.11 %)		 n/a 38.62
(99.99 %)		 685
(0.01 %)		 215
(100.00 %)		 2,639,968
(48.46 %)		 659,243
(7.55 %)		 5,950,358
(40.47 %)		 62,337
(3.61 %)
134 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1		 n/a 30,973
(3.47 %)		 83,657
(5.95 %)		 n/a 37.06
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 674
(100.00 %)		 3,324,121
(41.45 %)		 707,134
(4.72 %)		 8,110,561
(39.08 %)		 44,388
(1.60 %)
135 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1		 91,197
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
136 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
137 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1		 n/a 18,484
(2.43 %)		 69,931
(5.95 %)		 n/a 39.03
(99.98 %)		 1,202
(0.02 %)		 876
(100.00 %)		 938,148
(4.74 %)		 828,944
(9.34 %)		 5,833,273
(42.65 %)		 78,182
(4.87 %)
138 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1		 n/a 17,904
(2.46 %)		 68,908
(5.96 %)		 n/a 38.98
(99.98 %)		 1,147
(0.02 %)		 530
(100.00 %)		 3,428,827
(55.24 %)		 796,220
(8.80 %)		 5,775,180
(41.93 %)		 77,105
(4.67 %)
139 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1		 n/a 15,435
(2.40 %)		 54,036
(6.66 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 576
(100.00 %)		 495,544
(2.96 %)		 454,601
(9.69 %)		 4,614,163
(29.34 %)		 29,859
(1.71 %)
140 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1		 n/a 15,519
(2.52 %)		 53,533
(6.93 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 535
(0.01 %)		 784
(99.99 %)		 472,383
(2.92 %)		 337,781
(6.08 %)		 4,705,623
(26.82 %)		 29,198
(1.68 %)
141 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1		 60,947
(12.28 %)		 13,706
(2.67 %)		 42,956
(5.71 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,259
(100.00 %)		 1,417,848
(37.47 %)		 173,323
(3.85 %)		 3,968,694
(40.23 %)		 70,253
(6.29 %)
142 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
143 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
144 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1		 n/a 29,103
(1.36 %)		 124,287
(3.94 %)		 n/a 43.87
(99.96 %)		 5,995
(0.04 %)		 11,150
(100.00 %)		 1,655,140
(4.68 %)		 1,843,550
(17.63 %)		 9,367,555
(61.56 %)		 112,654
(3.84 %)
145 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1		 n/a 25,968
(1.48 %)		 104,922
(4.18 %)		 n/a 43.67
(99.96 %)		 4,689
(0.04 %)		 8,669
(99.96 %)		 1,320,339
(4.08 %)		 1,364,334
(15.61 %)		 7,674,742
(61.10 %)		 94,019
(3.82 %)
146 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
147 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 20,502,207
(74.78 %)		 568,042
(10.14 %)
148 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
149 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
150 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
151 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1		 n/a 14,695
(2.68 %)		 51,799
(6.37 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 2,080
(100.00 %)		 1,969,654
(37.02 %)		 663,295
(11.19 %)		 3,764,275
(45.19 %)		 67,226
(8.43 %)
152 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1		 n/a 17,935
(1.34 %)		 104,307
(6.12 %)		 n/a 44.53
(99.96 %)		 2,975
(0.04 %)		 2,930
(100.00 %)		 5,608,839
(57.44 %)		 1,825,932
(20.35 %)		 6,375,759
(51.18 %)		 149,374
(4.78 %)
153 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1		 n/a 17,775
(1.43 %)		 100,017
(6.38 %)		 n/a 44.59
(99.96 %)		 2,894
(0.04 %)		 4,301
(99.96 %)		 5,332,080
(56.26 %)		 1,737,704
(18.88 %)		 6,064,583
(49.72 %)		 141,258
(4.70 %)
154 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1		 n/a 14,740
(2.96 %)		 58,554
(8.04 %)		 n/a 44.56
(99.96 %)		 1,180
(0.04 %)		 793
(100.00 %)		 711,944
(7.44 %)		 537,707
(8.17 %)		 3,418,045
(29.92 %)		 95,750
(8.49 %)
155 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1		 n/a 13,849
(3.08 %)		 53,198
(8.16 %)		 n/a 44.70
(99.96 %)		 1,089
(0.04 %)		 513
(100.00 %)		 649,032
(7.21 %)		 483,451
(7.55 %)		 3,155,766
(28.97 %)		 88,490
(8.53 %)
156 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
157 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
158 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
159 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
160 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
161 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1		 49,121
(12.72 %)		 16,501
(4.06 %)		 40,671
(7.11 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 1,213,719
(40.21 %)		 134,299
(3.43 %)		 3,676,403
(30.98 %)		 29,879
(3.18 %)
162 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
163 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
164 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
165 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
166 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
167 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
168 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
169 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1		 45,512
(7.65 %)		 16,797
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 103
(100.00 %)		 871,278
(4.83 %)		 805,806
(14.65 %)		 5,615,217
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
170 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2		 n/a 14,760
(4.56 %)		 56,353
(11.37 %)		 n/a 45.56
(99.97 %)		 1,033
(0.03 %)		 1,158
(100.00 %)		 292,029
(9.69 %)		 192,568
(5.53 %)		 1,623,924
(22.71 %)		 51,743
(9.31 %)
171 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,366
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
172 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
173 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1		 n/a 15,554
(2.13 %)		 55,328
(6.30 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 31
(100.00 %)		 933,060
(24.43 %)		 252,509
(4.84 %)		 4,460,314
(32.70 %)		 34,184
(2.09 %)
174 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
175 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
176 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
177 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1		 n/a 16,358
(2.62 %)		 62,068
(6.39 %)		 n/a 41.74
(99.75 %)		 49
(0.25 %)		 460
(100.00 %)		 701,679
(6.15 %)		 756,011
(21.53 %)		 2,660,355
(42.28 %)		 50,381
(3.85 %)
178 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
179 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 63,731
(6.65 %)		 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
180 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
181 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
182 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1		 48,154
(5.87 %)		 15,415
(1.33 %)		 77,712
(5.08 %)		 n/a 44.45
(99.99 %)		 9,202
(0.02 %)		 1,922
(100.00 %)		 4,406,534
(31.73 %)		 2,331,293
(15.35 %)		 6,863,540
(50.47 %)		 80,927
(2.32 %)
183 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
184 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
185 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
186 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
187 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1		 n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 37,130
(2.79 %)
188 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1		 48,969
(12.45 %)		 14,751
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 108
(100.00 %)		 1,160,781
(27.06 %)		 251,983
(5.23 %)		 3,353,086
(26.00 %)		 37,129
(2.79 %)
189 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
190 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
191 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,467
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
192 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,470
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
193 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1		 n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
194 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1		 46,762
(14.07 %)		 15,639
(3.79 %)		 50,238
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,007
(100.00 %)		 1,648,428
(31.34 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,793
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
195 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
196 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
197 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 75,582
(11.23 %)		 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
198 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1		 n/a 15,528
(2.10 %)		 55,124
(6.16 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 946,588
(24.66 %)		 252,409
(5.14 %)		 4,403,110
(33.26 %)		 35,478
(2.07 %)
199 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
200 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
201 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
202 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
203 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
204 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1		 n/a 15,652
(1.85 %)		 56,048
(5.08 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 176
(100.00 %)		 640,534
(2.88 %)		 384,479
(4.59 %)		 6,438,939
(33.27 %)		 28,221
(1.10 %)
205 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
206 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
207 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,257
(6.73 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
208 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
209 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,821
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
210 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,357
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
211 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,835
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
212 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,769
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
213 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
214 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
215 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
216 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
217 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
218 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
219 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
220 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
221 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
222 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
223 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
224 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
225 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2		 53,176
(17.83 %)		 13,439
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 644,597
(20.82 %)		 180,309
(16.78 %)		 1,339,434
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
226 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,583
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
227 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
228 guppy
GCF_000633615.1		 48,303
(11.25 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
229 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
230 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
231 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,598
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
232 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
233 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
234 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
235 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
236 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,570
(6.90 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
237 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
238 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1		 60,200
(14.08 %)		 14,987
(3.26 %)		 42,919
(7.40 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 850,797
(19.88 %)		 308,390
(6.45 %)		 3,329,304
(26.55 %)		 23,373
(1.76 %)
239 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 91,652
(11.67 %)		 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
240 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
241 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
242 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
243 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
244 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,790
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
245 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1		 40,680
(11.49 %)		 14,847
(3.17 %)		 46,307
(7.10 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 n/a 1,003
(100.00 %)		 967,639
(17.54 %)		 319,567
(5.43 %)		 3,743,006
(26.82 %)		 47,481
(4.63 %)
246 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
247 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
248 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 76,885
(3.80 %)		 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
249 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
250 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,259
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
251 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
252 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,927
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
253 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
254 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
255 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1		 n/a 15,790
(2.31 %)		 50,332
(5.65 %)		 n/a 40.87
(99.96 %)		 672
(0.04 %)		 202
(100.00 %)		 464,845
(2.71 %)		 255,513
(3.69 %)		 5,124,388
(29.65 %)		 25,920
(1.67 %)
256 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
257 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
258 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
259 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1		 46,242
(10.23 %)		 13,712
(2.62 %)		 43,369
(5.56 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 1,537
(100.00 %)		 1,406,779
(35.37 %)		 202,983
(7.44 %)		 3,933,128
(41.19 %)		 70,560
(7.78 %)
260 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1		 n/a 14,961
(2.55 %)		 52,234
(6.83 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 409
(0.01 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,233,052
(39.33 %)		 366,741
(18.98 %)		 3,296,338
(36.77 %)		 44,712
(2.85 %)
261 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
262 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
263 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
264 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
265 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
266 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
267 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
268 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
269 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
270 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
271 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
272 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
273 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
274 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
275 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
276 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,273
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
277 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1		 n/a 15,501
(2.18 %)		 54,090
(6.20 %)		 n/a 41.17
(99.99 %)		 422
(0.01 %)		 82
(100.00 %)		 1,727,328
(38.16 %)		 259,351
(4.71 %)		 4,381,278
(33.25 %)		 35,281
(1.93 %)
278 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
279 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,029
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
280 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,187
(11.82 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
281 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
282 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
283 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1		 44,376
(10.91 %)		 14,032
(2.80 %)		 60,400
(8.09 %)		 n/a 43.84
(99.86 %)		 974
(0.14 %)		 200
(100.00 %)		 1,157,953
(36.57 %)		 569,832
(12.19 %)		 2,864,996
(37.65 %)		 98,423
(9.53 %)
284 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
285 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
286 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
287 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1		 n/a 15,067
(2.44 %)		 45,263
(5.54 %)		 n/a 40.74
(92.95 %)		 617,558
(7.14 %)		 624,195
(92.86 %)		 867,309
(14.82 %)		 199,669
(1.16 %)		 5,215,762
(25.14 %)		 13,920
(0.64 %)
288 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
289 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
290 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
291 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
292 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
293 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1		 40,276
(12.25 %)		 14,478
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 1,660
(99.98 %)		 1,101,578
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,428
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
294 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,100
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
295 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1		 77,155
(10.70 %)		 16,413
(2.24 %)		 85,893
(7.33 %)		 n/a 43.96
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 407
(100.00 %)		 447,893
(2.43 %)		 464,565
(9.46 %)		 3,801,201
(29.32 %)		 93,225
(5.54 %)
296 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
297 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
298 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
299 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
300 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
301 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,397
(10.87 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
302 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
303 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
304 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1		 n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
305 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1		 57,816
(15.11 %)		 14,598
(3.83 %)		 49,473
(9.87 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 174
(100.00 %)		 599,085
(14.68 %)		 186,746
(10.27 %)		 2,273,889
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
306 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,085
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
307 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1		 n/a 15,704
(2.16 %)		 43,094
(4.57 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 115
(0.01 %)		 104
(100.00 %)		 1,034,605
(5.50 %)		 566,093
(5.52 %)		 6,229,176
(38.50 %)		 41,022
(2.53 %)
308 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1		 n/a 15,762
(2.12 %)		 43,732
(4.51 %)		 n/a 38.98
(100.00 %)		 180
(0.00 %)		 278
(100.00 %)		 1,071,044
(5.64 %)		 581,680
(6.16 %)		 6,228,783
(39.01 %)		 42,159
(2.70 %)
309 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1		 n/a 14,295
(2.22 %)		 50,623
(6.07 %)		 n/a 42.09
(99.99 %)		 466
(0.01 %)		 892
(100.00 %)		 1,941,831
(49.35 %)		 650,256
(17.85 %)		 3,210,410
(44.77 %)		 55,251
(4.79 %)
310 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1		 n/a 14,542
(2.12 %)		 51,650
(5.81 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 484
(0.01 %)		 667
(100.00 %)		 2,014,967
(51.82 %)		 755,698
(19.90 %)		 3,290,098
(47.08 %)		 57,881
(4.66 %)
311 northern pike
GCF_004634155.1		 66,376
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
312 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
313 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,720
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
314 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1		 61,639
(13.32 %)		 15,131
(2.87 %)		 35,444
(5.74 %)		 n/a 39.76
(100.00 %)		 52
(0.00 %)		 291
(100.00 %)		 830,033
(26.45 %)		 152,304
(8.77 %)		 3,778,846
(29.39 %)		 8,436
(0.70 %)
315 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1		 n/a 13,787
(3.68 %)		 60,819
(10.07 %)		 n/a 45.42
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 108
(100.00 %)		 259,874
(3.38 %)		 94,885
(3.76 %)		 2,302,967
(21.04 %)		 58,433
(13.25 %)
316 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1		 n/a 13,709
(3.65 %)		 60,517
(9.98 %)		 n/a 45.43
(100.00 %)		 111
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 272,479
(3.57 %)		 101,623
(4.29 %)		 2,384,412
(21.91 %)		 58,256
(13.22 %)
317 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
318 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1		 32,231
(8.81 %)		 15,382
(3.41 %)		 41,015
(7.24 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 1,143,877
(18.90 %)		 219,801
(2.87 %)		 3,652,133
(23.09 %)		 19,721
(1.34 %)
319 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1		 n/a 15,360
(3.42 %)		 41,012
(7.26 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 94
(100.00 %)		 438,416
(3.46 %)		 219,275
(2.83 %)		 3,623,998
(22.85 %)		 19,710
(1.32 %)
320 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
321 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
322 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
323 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,792
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
324 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1		 n/a 14,679
(2.30 %)		 51,447
(6.15 %)		 n/a 44.09
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 180
(100.00 %)		 1,452,983
(14.50 %)		 1,649,878
(17.81 %)		 4,184,643
(38.57 %)		 36,016
(2.07 %)
325 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1		 n/a 15,600
(2.30 %)		 54,714
(6.21 %)		 n/a 43.99
(99.99 %)		 1,132
(0.01 %)		 184
(100.00 %)		 1,505,689
(14.07 %)		 1,691,834
(17.30 %)		 4,407,291
(38.23 %)		 38,205
(2.14 %)
326 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1		 60,285
(14.61 %)		 15,290
(2.96 %)		 42,088
(6.53 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 150
(100.00 %)		 534,470
(3.96 %)		 267,099
(3.88 %)		 4,094,899
(24.75 %)		 14,784
(1.60 %)
327 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
328 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1		 49,430
(13.67 %)		 13,542
(2.89 %)		 64,214
(9.77 %)		 n/a 45.55
(99.92 %)		 4,826
(0.09 %)		 24
(100.00 %)		 1,117,561
(38.30 %)		 685,851
(13.38 %)		 2,330,116
(34.15 %)		 87,761
(8.68 %)
329 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
330 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,697
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
331 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1		 54,344
(6.52 %)		 15,214
(1.67 %)		 74,345
(6.13 %)		 n/a 41.49
(99.96 %)		 900
(0.04 %)		 759
(100.00 %)		 805,776
(5.16 %)		 849,901
(11.48 %)		 4,645,552
(43.92 %)		 106,026
(5.14 %)
332 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1		 40,657
(5.52 %)		 17,858
(2.46 %)		 42,119
(3.16 %)		 n/a 36.32
(98.82 %)		 1,821
(1.18 %)		 342
(100.00 %)		 3,973,354
(56.67 %)		 940,639
(7.81 %)		 8,701,639
(50.54 %)		 29,684
(1.18 %)
333 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1		 n/a 15,421
(1.80 %)		 62,324
(6.15 %)		 n/a 42.79
(99.90 %)		 4,955
(0.10 %)		 4,978
(99.90 %)		 4,032,523
(34.18 %)		 982,411
(16.51 %)		 5,189,655
(46.47 %)		 64,543
(3.14 %)
334 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1		 n/a 16,917
(1.64 %)		 72,190
(5.85 %)		 n/a 42.91
(99.96 %)		 2,729
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 4,976,327
(35.08 %)		 1,258,755
(18.52 %)		 6,268,804
(48.21 %)		 81,193
(3.23 %)
335 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1		 42,701
(12.59 %)		 14,986
(3.15 %)		 46,289
(7.75 %)		 n/a 40.99
(99.97 %)		 380
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 1,031,762
(25.30 %)		 219,393
(4.63 %)		 3,436,780
(25.57 %)		 16,570
(1.12 %)
336 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
337 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
338 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
339 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
340 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1		 n/a 17,996
(2.00 %)		 89,591
(7.93 %)		 n/a 45.22
(99.94 %)		 3,299
(0.06 %)		 1,177
(100.00 %)		 2,828,457
(30.93 %)		 1,676,413
(19.87 %)		 4,137,400
(48.69 %)		 78,669
(4.37 %)
341 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1		 n/a 13,827
(3.46 %)		 53,000
(8.90 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 122
(0.00 %)		 364
(100.00 %)		 222,800
(3.83 %)		 105,428
(7.84 %)		 2,500,710
(25.24 %)		 41,125
(5.45 %)
342 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1		 n/a 13,816
(3.52 %)		 52,689
(9.01 %)		 n/a 43.48
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 300
(100.00 %)		 223,762
(3.25 %)		 105,291
(6.28 %)		 2,579,336
(24.55 %)		 41,114
(5.50 %)
343 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
344 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
345 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
346 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,140
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
347 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
348 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
349 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
350 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1		 56,688
(7.63 %)		 17,670
(2.67 %)		 54,522
(5.25 %)		 n/a 37.95
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,087,358
(61.37 %)		 553,846
(7.14 %)		 6,036,124
(43.52 %)		 47,942
(3.56 %)
351 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
352 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
353 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1		 n/a 15,639
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 365
(100.00 %)		 1,655,350
(30.53 %)		 511,512
(12.09 %)		 2,015,264
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
354 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1		 39,606
(12.43 %)		 15,641
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 366
(100.00 %)		 1,655,356
(30.53 %)		 511,513
(12.09 %)		 2,015,303
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
355 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,271
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 138,073
(5.21 %)		 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
356 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,286
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
357 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1		 n/a 15,661
(1.94 %)		 54,906
(5.30 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 386
(100.00 %)		 591,994
(2.64 %)		 396,424
(6.16 %)		 6,144,028
(31.24 %)		 24,792
(1.05 %)
358 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1		 n/a 15,830
(2.03 %)		 54,183
(5.34 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 2,922,062
(42.12 %)		 374,226
(5.08 %)		 6,124,255
(30.17 %)		 24,493
(0.98 %)
359 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 72,004
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
360 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
361 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
362 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
363 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
364 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1		 37,802
(8.56 %)		 16,430
(2.60 %)		 56,127
(6.62 %)		 n/a 42.14
(100.00 %)		 n/a 6,232
(100.00 %)		 1,061,195
(9.52 %)		 653,833
(5.90 %)		 4,595,588
(30.15 %)		 38,922
(2.20 %)
365 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,478
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
366 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
367 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
368 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
369 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
370 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
371 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
372 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
373 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
374 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,514
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
375 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
376 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1		 32,256
(9.05 %)		 15,283
(3.03 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 1,115,191
(21.73 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,073
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
377 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1		 n/a 14,475
(2.89 %)		 44,413
(7.11 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 84
(100.00 %)		 1,762,151
(30.90 %)		 262,291
(5.80 %)		 3,580,461
(24.37 %)		 19,851
(1.40 %)
378 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1		 n/a 17,895
(2.55 %)		 64,448
(5.84 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 418
(0.01 %)		 110
(100.00 %)		 2,661,155
(49.83 %)		 673,071
(10.59 %)		 5,755,954
(42.48 %)		 66,952
(4.46 %)
379 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1		 n/a 18,254
(2.38 %)		 68,852
(5.71 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 759
(100.00 %)		 2,854,977
(51.13 %)		 754,287
(11.81 %)		 5,942,764
(44.17 %)		 72,686
(4.52 %)
380 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
381 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
382 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1		 n/a 15,661
(2.59 %)		 68,929
(8.14 %)		 n/a 45.02
(99.96 %)		 1,365
(0.04 %)		 2,987
(100.00 %)		 2,234,544
(43.47 %)		 1,192,255
(16.84 %)		 3,383,827
(41.37 %)		 108,808
(9.86 %)
383 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1		 n/a 15,427
(2.54 %)		 67,522
(7.97 %)		 n/a 44.96
(99.96 %)		 1,366
(0.04 %)		 1,559
(100.00 %)		 2,195,227
(44.71 %)		 1,219,658
(17.45 %)		 3,319,218
(42.93 %)		 108,314
(9.71 %)
384 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1		 56,023
(20.10 %)		 13,998
(4.84 %)		 48,737
(11.56 %)		 n/a 45.63
(99.99 %)		 250
(0.01 %)		 868
(100.00 %)		 304,980
(15.98 %)		 171,631
(4.98 %)		 1,616,965
(21.60 %)		 48,338
(9.79 %)
385 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1		 n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 68,874
(3.56 %)
386 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1		 48,146
(9.15 %)		 16,069
(2.33 %)		 64,178
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 240
(100.00 %)		 1,503,108
(11.74 %)		 1,507,022
(15.48 %)		 4,027,614
(37.52 %)		 68,873
(3.56 %)
387 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1		 51,267
(7.00 %)		 13,854
(1.32 %)		 48,980
(3.46 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,805,346
(21.21 %)		 512,153
(12.76 %)		 6,260,589
(63.96 %)		 96,908
(3.65 %)
388 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1		 n/a 14,310
(4.44 %)		 47,336
(10.19 %)		 n/a 44.83
(99.99 %)		 241
(0.01 %)		 38
(100.00 %)		 446,827
(13.86 %)		 192,599
(8.52 %)		 2,033,160
(22.85 %)		 61,012
(13.03 %)
389 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1		 n/a 14,237
(4.44 %)		 46,701
(10.13 %)		 n/a 44.75
(99.99 %)		 276
(0.01 %)		 52
(100.00 %)		 413,494
(14.42 %)		 189,429
(8.99 %)		 1,996,715
(23.13 %)		 60,252
(12.60 %)
390 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
391 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
392 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
393 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1		 n/a 15,800
(1.77 %)		 51,791
(4.52 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 777,839
(3.19 %)		 459,791
(3.90 %)		 7,958,604
(35.17 %)		 21,711
(0.94 %)
394 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1		 n/a 15,879
(1.78 %)		 51,774
(4.52 %)		 n/a 39.81
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 778,842
(3.19 %)		 462,247
(3.82 %)		 7,956,116
(35.13 %)		 21,587
(0.91 %)
395 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,892
(7.02 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
396 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
397 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
398 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,291
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
399 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
400 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,179
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
401 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1		 n/a 16,906
(1.39 %)		 115,931
(7.77 %)		 n/a 44.10
(99.96 %)		 3,365
(0.04 %)		 5,504
(100.00 %)		 4,606,608
(53.63 %)		 1,428,326
(25.54 %)		 4,395,832
(51.22 %)		 166,807
(7.52 %)
402 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1		 n/a 17,409
(1.14 %)		 146,413
(8.24 %)		 n/a 44.20
(99.96 %)		 3,473
(0.04 %)		 8,068
(99.96 %)		 2,051,529
(14.72 %)		 1,808,246
(28.36 %)		 4,967,915
(54.93 %)		 208,486
(7.83 %)
403 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
404 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
405 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,932
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
406 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1		 57,883
(4.39 %)		 15,654
(1.03 %)		 72,123
(3.58 %)		 n/a 38.64
(100.00 %)		 2,564
(0.00 %)		 424
(100.00 %)		 3,149,025
(23.73 %)		 1,621,410
(19.58 %)		 7,534,195
(67.22 %)		 122,765
(3.07 %)
407 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,641
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
408 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1		 80,798
(5.59 %)		 26,218
(1.35 %)		 116,746
(3.87 %)		 n/a 44.03
(99.93 %)		 4,351
(0.07 %)		 12,436
(100.00 %)		 6,356,046
(54.95 %)		 2,840,516
(31.41 %)		 10,575,179
(57.52 %)		 77,648
(1.61 %)
409 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2		 42,862
(7.09 %)		 14,776
(1.80 %)		 68,955
(6.18 %)		 n/a 42.07
(99.90 %)		 2,603
(0.11 %)		 1,563
(100.00 %)		 512,600
(3.45 %)		 473,958
(7.19 %)		 3,590,436
(45.74 %)		 88,970
(4.31 %)
410 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
411 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
412 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,380
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
413 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,330
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
414 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1		 n/a 15,554
(1.75 %)		 58,641
(5.19 %)		 n/a 40.59
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 682,449
(3.01 %)		 409,809
(4.43 %)		 7,114,584
(28.98 %)		 37,214
(1.53 %)
415 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1		 n/a 15,490
(1.77 %)		 57,993
(5.20 %)		 n/a 40.57
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 677,985
(3.03 %)		 408,391
(4.33 %)		 7,184,861
(29.15 %)		 36,602
(1.46 %)
416 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,656
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
417 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
418 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1		 n/a 13,641
(5.13 %)		 57,982
(13.46 %)		 n/a 46.43
(91.24 %)		 18,974
(8.76 %)		 44,686
(91.24 %)		 252,877
(4.38 %)		 159,939
(3.51 %)		 1,689,462
(18.66 %)		 51,580
(13.42 %)
419 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1		 n/a 15,425
(3.14 %)		 43,414
(6.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 n/a 109
(100.00 %)		 447,804
(3.49 %)		 241,876
(3.25 %)		 3,757,088
(26.25 %)		 23,346
(2.49 %)
420 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1		 46,818
(8.35 %)		 14,938
(2.04 %)		 55,475
(6.12 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 792
(100.00 %)		 505,488
(2.57 %)		 269,742
(4.14 %)		 4,697,020
(30.74 %)		 30,399
(1.90 %)
421 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2		 48,380
(8.37 %)		 15,470
(2.04 %)		 57,237
(6.11 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 791
(100.00 %)		 523,070
(2.57 %)		 277,554
(4.08 %)		 4,872,723
(30.67 %)		 31,383
(1.89 %)
422 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,167
(7.62 %)		 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
423 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2		 n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 65,007
(2.74 %)
424 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
425 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
426 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1		 59,497
(6.82 %)		 17,172
(2.25 %)		 57,383
(4.85 %)		 n/a 39.18
(99.99 %)		 497
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 4,750,810
(63.58 %)		 649,426
(10.14 %)		 6,511,384
(46.74 %)		 74,723
(4.45 %)
427 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1		 56,498
(4.86 %)		 14,602
(1.00 %)		 64,279
(2.96 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 1,172
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 2,984,285
(27.54 %)		 1,402,691
(20.35 %)		 7,915,062
(67.02 %)		 140,374
(3.90 %)
428 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1		 45,220
(12.66 %)		 14,509
(3.35 %)		 46,221
(7.95 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 791,570
(25.79 %)		 305,491
(6.68 %)		 3,000,938
(29.61 %)		 36,818
(4.17 %)
429 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
430 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,859
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
431 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
432 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
433 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
434 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
435 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
436 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
437 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
438 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
439 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
440 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
441 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1		 n/a 14,939
(3.72 %)		 56,284
(10.07 %)		 n/a 44.71
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 133
(100.00 %)		 573,569
(20.53 %)		 206,699
(9.01 %)		 2,335,009
(27.29 %)		 84,009
(12.41 %)
442 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1		 n/a 13,591
(3.79 %)		 50,693
(10.19 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 309
(0.01 %)		 479
(99.99 %)		 505,547
(19.86 %)		 181,092
(8.75 %)		 2,117,454
(27.02 %)		 75,434
(12.33 %)
443 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
444 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1		 43,108
(6.07 %)		 14,279
(1.78 %)		 65,726
(6.14 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 821
(100.00 %)		 411,442
(6.11 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,301
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
445 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,037
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
446 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
447 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
448 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,489
(18.32 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
449 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
450 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2		 n/a 15,041
(2.01 %)		 42,180
(4.38 %)		 n/a 41.03
(96.21 %)		 792
(3.79 %)		 594
(98.65 %)		 1,069,159
(7.06 %)		 653,554
(15.46 %)		 4,921,631
(38.75 %)		 26,440
(2.18 %)
451 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
452 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2		 n/a 17,256
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 597
(100.00 %)		 2,407,631
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,418
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
453 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1		 n/a 14,730
(2.84 %)		 50,956
(7.07 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 179
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 548,208
(5.35 %)		 356,364
(7.30 %)		 3,448,877
(26.01 %)		 26,685
(1.80 %)
454 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1		 n/a 14,680
(2.80 %)		 50,753
(6.99 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 187
(0.00 %)		 248
(100.00 %)		 559,722
(5.35 %)		 382,817
(8.57 %)		 3,423,208
(26.76 %)		 26,739
(1.77 %)
455 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
456 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,298
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 87,351
(14.65 %)		 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
457 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,386
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 57,218
(6.01 %)		 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
458 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1		 56,976
(5.74 %)		 14,604
(1.25 %)		 72,207
(4.35 %)		 n/a 44.51
(100.00 %)		 369
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 2,858,575
(46.12 %)		 660,603
(29.65 %)		 4,283,242
(61.88 %)		 118,966
(11.71 %)
459 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,501
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
460 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1		 n/a 15,895
(2.18 %)		 46,934
(4.73 %)		 n/a 39.83
(99.95 %)		 605
(0.05 %)		 3,484
(100.00 %)		 1,061,538
(6.25 %)		 611,618
(5.19 %)		 5,978,835
(37.11 %)		 54,666
(3.50 %)
461 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1		 49,084
(12.15 %)		 14,241
(2.71 %)		 70,653
(9.29 %)		 n/a 45.59
(99.96 %)		 2,816
(0.04 %)		 168
(100.00 %)		 1,274,742
(38.63 %)		 797,757
(14.11 %)		 2,725,416
(34.38 %)		 95,149
(8.09 %)
462 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
463 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
464 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,016
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
465 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1		 46,203
(5.36 %)		 16,945
(2.57 %)		 65,343
(6.35 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 n/a 930
(100.00 %)		 2,528,154
(48.24 %)		 549,447
(8.24 %)		 5,157,802
(41.42 %)		 84,874
(6.05 %)
466 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1		 85,126
(5.62 %)		 27,822
(1.58 %)		 113,187
(4.31 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 1,381
(0.01 %)		 4,647
(99.99 %)		 1,200,605
(4.82 %)		 2,237,797
(24.56 %)		 10,339,252
(54.27 %)		 70,550
(1.65 %)
467 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
468 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,638
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
469 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
470 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
471 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1		 42,410
(12.47 %)		 14,845
(3.48 %)		 50,132
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 661
(100.00 %)		 461,895
(5.20 %)		 422,249
(8.03 %)		 3,180,722
(25.81 %)		 70,181
(7.15 %)
472 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3		 47,694
(3.96 %)		 14,177
(1.01 %)		 59,392
(2.97 %)		 n/a 39.43
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,246,897
(5.46 %)		 1,548,619
(19.15 %)		 6,596,258
(69.80 %)		 148,788
(5.04 %)
473 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,781
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
474 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1		 63,938
(10.50 %)		 17,502
(3.25 %)		 52,519
(5.86 %)		 n/a 37.23
(99.62 %)		 617
(0.38 %)		 353
(100.00 %)		 2,297,102
(50.34 %)		 368,423
(3.28 %)		 5,171,389
(38.98 %)		 32,824
(2.00 %)
475 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1		 n/a 15,641
(1.95 %)		 52,141
(5.13 %)		 n/a 40.61
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 607,010
(2.66 %)		 288,837
(3.91 %)		 6,785,488
(31.37 %)		 39,560
(1.65 %)
476 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1		 n/a 15,666
(1.88 %)		 53,049
(5.01 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 620,903
(2.64 %)		 305,809
(5.18 %)		 6,707,330
(33.41 %)		 45,863
(1.88 %)
477 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
478 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
479 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,121
(7.78 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
480 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
481 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
482 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
483 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
484 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,948
(9.95 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
485 zebra mbuna
GCF_000238955.4		 51,025
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
486 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
487 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
488 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1		 122,338
(8.09 %)		 18,033
(2.41 %)		 44,966
(3.23 %)		 n/a 37.14
(100.00 %)		 13,351
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 3,807,410
(60.58 %)		 965,679
(12.22 %)		 8,736,108
(52.67 %)		 45,856
(2.03 %)
489 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
490 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
491 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
492 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 72,965
(6.43 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
493 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
494 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 45,001
(12.01 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
495 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 495

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 598 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 434 assemblies assembly stats track stats
Fishes 495 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 317 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1183 assemblies assembly stats track stats
Plants 325 assemblies assembly stats track stats
Fungi 922 assemblies assembly stats track stats
Viruses 707 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 322 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 680 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1633 assemblies assembly stats track stats