Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 allis shad
GCF_017589495.1		 48,507
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
2 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
3 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
4 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
5 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
6 Arctic char
GCF_002910315.2		 67,196
(4.99 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
7 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
8 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 n/a 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
9 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
10 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
11 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
12 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,315
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
13 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
14 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
15 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
16 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
17 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
18 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
19 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
20 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
21 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,906
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 n/a 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
22 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,794
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
23 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
24 ballan wrasse
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
25 banded archerfish (fToxJac2 alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
26 banded archerfish (fToxJac2 primary hap 2021)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 n/a 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
27 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
28 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
29 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,646
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
30 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
31 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
32 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
33 black rockcod
GCF_000735185.1		 35,176
(8.54 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
34 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
35 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
36 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
37 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,916
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
38 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
39 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 n/a 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
40 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
41 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
42 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
43 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
44 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
45 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
46 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
47 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,205
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
48 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
49 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
50 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
51 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,828
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
52 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
53 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
54 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
55 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
56 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
57 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
58 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,677
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
59 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,005
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
60 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,383
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 n/a 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
61 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,340
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
62 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
63 chub mackerel (fScoJap1 primary hap 2022)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
64 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
65 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,915
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 n/a 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
66 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
67 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
68 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,567
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
69 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,912
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
70 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,850
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 n/a 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
71 common carp SPL01 (2021)
GCF_018340385.1		 91,210
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
72 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
73 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 3,092
(99.13 %)		 568,042
(10.14 %)
74 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
75 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
76 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
77 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
78 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
79 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
80 dark-edged splitfin
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
81 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
82 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
83 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
84 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,353
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
85 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
86 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
87 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
88 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
89 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
90 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 n/a 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
91 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
92 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
93 European plaice (primary hap 2022)
GCF_947347685.1		 46,468
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
94 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,457
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
95 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
96 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 n/a 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
97 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
98 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
99 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
100 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
101 giant grouper
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
102 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
103 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
104 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,071
(6.71 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
105 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
106 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,810
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
107 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,344
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
108 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,822
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
109 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,756
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
110 greater pipefish (v1.2 2020)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
111 greater pipefish (alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
112 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
113 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,587
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
114 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
115 guppy
GCF_000633615.1		 48,290
(11.24 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
116 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
117 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
118 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,585
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
119 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
120 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
121 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 n/a 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
122 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
123 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,583
(6.91 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
124 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
125 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 n/a 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
126 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 n/a 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
127 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
128 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,779
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
129 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 n/a 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
130 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
131 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,246
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
132 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,914
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
133 largemouth bass
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
134 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
135 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
136 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
137 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
138 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023)
GCA_027579695.1		 n/a 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
139 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
140 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
141 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
142 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
143 lumpfish (2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
144 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
145 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,260
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
146 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
147 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,016
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
148 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,200
(11.83 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
149 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
150 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
151 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
152 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
153 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
154 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
155 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
156 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,087
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
157 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
158 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
159 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
160 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
161 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 n/a 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
162 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
163 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,384
(10.86 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
164 ninespine stickleback
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
165 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,073
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
166 northern pike
GCF_004634155.1		 66,389
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
167 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
168 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,733
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
169 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
170 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
171 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 n/a 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
172 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
173 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,779
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
174 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
175 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
176 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,684
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
177 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
178 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
179 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
180 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
181 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
182 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 n/a 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
183 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
184 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,127
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
185 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
186 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 n/a 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
187 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
188 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,299
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
189 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,284
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 n/a 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
190 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 71,991
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
191 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
192 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
193 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 n/a 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
194 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
195 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,479
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
196 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
197 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
198 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
199 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
200 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
201 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 n/a 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
202 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,554
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
203 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
204 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
205 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,879
(7.01 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
206 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
207 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,278
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
208 Siamese fighting fish (alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
209 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,166
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
210 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,919
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
211 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,628
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
212 South Georgia icefish
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 n/a 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
213 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,367
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
214 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
215 southern bluefin tuna (primary hap 2021)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
216 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,317
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
217 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
218 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,720
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
219 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
220 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
221 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
222 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
223 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
224 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
225 striped catfish (fPanHyp1 primary hap 2022)
GCF_027358585.1		 53,860
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
226 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
227 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
228 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
229 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
230 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
231 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
232 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
233 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
234 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
235 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
236 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,024
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
237 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
238 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,479
(18.31 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
239 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
240 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
241 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,285
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
242 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,373
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 n/a 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
243 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,488
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
244 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
245 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
246 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,029
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
247 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
248 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,625
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
249 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
250 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
251 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,768
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
252 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
253 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
254 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,108
(7.77 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
255 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
256 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
257 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
258 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
259 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,935
(9.94 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
260 Zealand spotty
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 n/a 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
261 zebra mbuna
GCF_000238955.4		 51,012
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
262 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
263 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
264 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
265 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
266 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
267 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 65,219
(5.63 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
268 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
269 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 44,988
(12.00 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
270 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 270

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 159 assemblies assembly stats track stats
Mammals 407 assemblies assembly stats track stats
Birds 270 assemblies assembly stats track stats
Fishes 270 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 114 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 583 assemblies assembly stats track stats
Plants 230 assemblies assembly stats track stats
Fungi 544 assemblies assembly stats track stats
Viruses 259 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 64 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 336 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 445 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
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