Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 allis shad
GCF_017589495.1		 48,507
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
2 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
3 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1		 47,198
(13.10 %)		 15,500
(3.14 %)		 41,230
(6.67 %)		 n/a 40.79
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 31
(100.00 %)		 1,230,524
(26.57 %)		 398,694
(5.41 %)		 4,106,609
(25.60 %)		 15,656
(0.99 %)
4 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
5 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
6 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
7 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
8 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
9 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
10 Arctic char
GCF_002910315.2		 67,196
(4.99 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
11 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
12 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
13 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
14 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
15 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
16 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,315
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
17 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
18 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1		 51,017
(10.40 %)		 15,549
(2.60 %)		 42,858
(5.39 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,718,992
(31.80 %)		 749,009
(14.09 %)		 4,206,758
(37.30 %)		 19,230
(1.16 %)
19 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1		 n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
20 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
21 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
22 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
23 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
24 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
25 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
26 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
27 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1		 n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 13,309
(0.75 %)
28 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,906
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
29 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,794
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
30 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 76,242
(9.93 %)		 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
31 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
32 ballan wrasse (primary hap 2024)
GCA_963930695.1		 n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
33 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
34 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
35 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
36 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
37 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,646
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
38 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
39 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
40 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
41 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
42 black rockcod
GCF_000735185.1		 35,176
(8.54 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
43 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1		 43,392
(8.45 %)		 15,522
(2.13 %)		 48,255
(5.50 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 341
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 1,651,919
(22.26 %)		 782,601
(7.55 %)		 5,398,047
(38.87 %)		 24,508
(1.19 %)
44 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
45 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
46 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
47 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,916
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
48 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
49 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 56,939
(8.11 %)		 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
50 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1		 63,345
(14.83 %)		 14,387
(3.54 %)		 43,563
(7.96 %)		 n/a 41.68
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 842,739
(18.67 %)		 356,558
(12.86 %)		 2,720,911
(41.08 %)		 40,187
(4.66 %)
51 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
52 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
53 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
54 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
55 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
56 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
57 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
58 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1		 n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
59 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
60 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
61 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
62 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,205
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
63 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
64 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
65 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
66 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,828
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
67 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
68 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
69 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
70 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
71 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
72 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
73 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
74 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1		 48,058
(11.91 %)		 16,738
(3.72 %)		 46,295
(6.80 %)		 n/a 39.61
(98.56 %)		 9,510
(1.45 %)		 1,039
(100.00 %)		 1,469,931
(44.44 %)		 188,838
(2.34 %)		 3,624,116
(35.94 %)		 44,615
(5.01 %)
75 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,677
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
76 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,005
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
77 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,383
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 157,582
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
78 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,340
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
79 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
80 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
81 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
82 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,915
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 120,379
(5.87 %)		 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
83 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
84 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
85 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,567
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
86 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,912
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
87 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,850
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 125,873
(5.26 %)		 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
88 common carp SPL01 (2021)
GCF_018340385.1		 91,210
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
89 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
90 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
91 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
92 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
93 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 3,092
(99.13 %)		 568,042
(10.14 %)
94 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
95 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
96 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
97 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1		 n/a 14,695
(2.68 %)		 51,799
(6.37 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 2,080
(100.00 %)		 1,969,654
(37.02 %)		 663,295
(11.19 %)		 3,764,275
(45.19 %)		 67,226
(8.43 %)
98 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
99 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
100 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
101 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
102 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
103 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1		 49,108
(12.72 %)		 16,501
(4.06 %)		 40,671
(7.11 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 1,213,719
(40.21 %)		 134,299
(3.43 %)		 3,676,403
(30.98 %)		 29,879
(3.18 %)
104 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
105 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
106 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
107 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
108 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
109 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
110 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
111 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1		 n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
112 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,353
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
113 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
114 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
115 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
116 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
117 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
118 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 63,731
(6.65 %)		 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
119 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
120 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
121 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
122 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
123 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
124 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1		 n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 37,130
(2.79 %)
125 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
126 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
127 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,468
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
128 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,457
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
129 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1		 n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
130 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
131 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
132 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 75,582
(11.23 %)		 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
133 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
134 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
135 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
136 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
137 giant grouper
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
138 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
139 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
140 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,071
(6.71 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
141 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
142 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,810
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
143 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,344
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
144 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,822
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
145 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,756
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
146 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
147 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
148 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
149 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
150 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
151 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
152 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
153 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
154 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
155 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
156 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
157 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
158 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,587
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
159 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
160 guppy
GCF_000633615.1		 48,290
(11.24 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
161 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
162 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
163 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,585
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
164 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
165 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
166 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
167 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
168 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,583
(6.91 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
169 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
170 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 91,652
(11.67 %)		 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
171 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
172 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
173 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
174 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
175 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,779
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
176 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 76,885
(3.80 %)		 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
177 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
178 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,246
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
179 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
180 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,914
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
181 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
182 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
183 largemouth bass
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
184 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
185 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
186 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
187 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
188 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
189 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
190 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
191 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
192 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
193 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
194 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
195 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
196 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
197 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
198 lumpfish (primary hap v1 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
199 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
200 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
201 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,260
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
202 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
203 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,016
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
204 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,200
(11.83 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
205 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
206 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
207 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1		 44,363
(10.91 %)		 14,032
(2.80 %)		 60,400
(8.09 %)		 n/a 43.84
(99.86 %)		 974
(0.14 %)		 200
(100.00 %)		 1,157,953
(36.57 %)		 569,832
(12.19 %)		 2,864,996
(37.65 %)		 98,423
(9.53 %)
208 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
209 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
210 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
211 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
212 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
213 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
214 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
215 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
216 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,087
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
217 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
218 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
219 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
220 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
221 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
222 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
223 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,384
(10.86 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
224 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
225 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1		 n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
226 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
227 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,073
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
228 northern pike
GCF_004634155.1		 66,389
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
229 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
230 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,733
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
231 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
232 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
233 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
234 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
235 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,779
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
236 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
237 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1		 49,417
(13.66 %)		 13,542
(2.89 %)		 64,214
(9.77 %)		 n/a 45.55
(99.92 %)		 4,826
(0.09 %)		 24
(100.00 %)		 1,117,561
(38.30 %)		 685,851
(13.38 %)		 2,330,116
(34.15 %)		 87,761
(8.68 %)
238 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
239 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,684
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
240 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1		 40,657
(5.52 %)		 17,858
(2.46 %)		 42,119
(3.16 %)		 n/a 36.32
(98.82 %)		 1,821
(1.18 %)		 342
(100.00 %)		 3,973,354
(56.67 %)		 940,639
(7.81 %)		 8,701,639
(50.54 %)		 29,684
(1.18 %)
241 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
242 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
243 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
244 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
245 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
246 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
247 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
248 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,127
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
249 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
250 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
251 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
252 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
253 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
254 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,299
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
255 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,284
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 138,073
(5.21 %)		 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
256 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 71,991
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
257 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
258 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
259 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
260 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
261 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,479
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
262 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
263 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
264 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
265 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
266 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
267 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
268 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
269 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
270 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,554
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
271 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1		 n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
272 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
273 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
274 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
275 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1		 56,010
(20.10 %)		 13,998
(4.84 %)		 48,737
(11.56 %)		 n/a 45.63
(99.99 %)		 250
(0.01 %)		 868
(100.00 %)		 304,980
(15.98 %)		 171,631
(4.98 %)		 1,616,965
(21.60 %)		 48,338
(9.79 %)
276 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1		 n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 68,874
(3.56 %)
277 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1		 51,270
(7.00 %)		 13,854
(1.32 %)		 48,980
(3.46 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,805,346
(21.21 %)		 512,153
(12.76 %)		 6,260,589
(63.96 %)		 96,908
(3.65 %)
278 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
279 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
280 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
281 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,879
(7.01 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
282 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
283 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,278
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
284 Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
285 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
286 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,166
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
287 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
288 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
289 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,919
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
290 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,628
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
291 South Georgia icefish
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 61,643
(5.52 %)		 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
292 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,367
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
293 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
294 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
295 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,317
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
296 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
297 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,720
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
298 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
299 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
300 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
301 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
302 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
303 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,860
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
304 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
305 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
306 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
307 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
308 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
309 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
310 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
311 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
312 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
313 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
314 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
315 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
316 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,024
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
317 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
318 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,479
(18.31 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
319 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
320 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
321 trahira (hap1 2023)
GCA_029633855.1		 n/a 16,039
(2.06 %)		 44,287
(4.38 %)		 n/a 40.99
(92.91 %)		 867
(7.09 %)		 597
(100.00 %)		 2,228,831
(30.95 %)		 687,495
(13.85 %)		 5,309,097
(36.70 %)		 27,070
(2.09 %)
322 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
323 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,285
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 87,351
(14.65 %)		 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
324 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
325 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,373
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 57,218
(6.01 %)		 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
326 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,488
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
327 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1		 n/a 15,895
(2.18 %)		 46,934
(4.73 %)		 n/a 39.83
(99.95 %)		 605
(0.05 %)		 3,484
(100.00 %)		 1,061,538
(6.25 %)		 611,618
(5.19 %)		 5,978,835
(37.11 %)		 54,666
(3.50 %)
328 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1		 49,084
(12.15 %)		 14,241
(2.71 %)		 70,653
(9.29 %)		 n/a 45.59
(99.96 %)		 2,816
(0.04 %)		 168
(100.00 %)		 1,274,742
(38.63 %)		 797,757
(14.11 %)		 2,725,416
(34.38 %)		 95,149
(8.09 %)
329 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
330 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
331 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,029
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
332 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1		 46,203
(5.36 %)		 16,945
(2.57 %)		 65,343
(6.35 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 n/a 930
(100.00 %)		 2,528,154
(48.24 %)		 549,447
(8.24 %)		 5,157,802
(41.42 %)		 84,874
(6.05 %)
333 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
334 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,625
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
335 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
336 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
337 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1		 73,681
(3.43 %)		 25,892
(1.02 %)		 114,154
(3.30 %)		 n/a 39.45
(100.00 %)		 146
(0.00 %)		 630
(100.00 %)		 4,795,312
(24.37 %)		 2,093,730
(16.74 %)		 13,132,465
(67.32 %)		 248,526
(4.59 %)
338 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,768
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
339 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1		 63,925
(10.50 %)		 17,502
(3.25 %)		 52,519
(5.86 %)		 n/a 37.23
(99.62 %)		 617
(0.38 %)		 353
(100.00 %)		 2,297,102
(50.34 %)		 368,423
(3.28 %)		 5,171,389
(38.98 %)		 32,824
(2.00 %)
340 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
341 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
342 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,108
(7.77 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
343 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
344 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
345 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
346 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
347 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,935
(9.94 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
348 Zealand spotty
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
349 zebra mbuna
GCF_000238955.4		 51,012
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
350 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
351 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
352 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
353 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
354 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
355 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 65,219
(5.63 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
356 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
357 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 44,988
(12.00 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
358 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 358

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Primates 207 assemblies assembly stats track stats
Mammals 507 assemblies assembly stats track stats
Birds 327 assemblies assembly stats track stats
Fishes 358 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 198 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 644 assemblies assembly stats track stats
Plants 252 assemblies assembly stats track stats
Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 265 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 74 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 437 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 796 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats