Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 refseq)
GCF_043250625.1		 59,397
(10.47 %)		 15,453
(2.37 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 472
(0.01 %)		 204
(100.00 %)		 529,455
(3.89 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,018
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1		 54,226
(11.15 %)		 13,427
(2.67 %)		 46,903
(5.94 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 1,200,994
(30.62 %)		 143,062
(2.20 %)		 3,921,676
(38.03 %)		 67,978
(8.92 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1		 48,520
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1		 47,198
(13.10 %)		 15,500
(3.14 %)		 41,230
(6.67 %)		 n/a 40.79
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 31
(100.00 %)		 1,230,524
(26.57 %)		 398,694
(5.41 %)		 4,106,609
(25.60 %)		 15,656
(0.99 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1		 n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1		 n/a 16,678
(0.56 %)		 151,361
(4.03 %)		 n/a 44.57
(99.91 %)		 15,113
(0.09 %)		 5,983
(100.00 %)		 12,251,532
(51.73 %)		 3,521,157
(17.69 %)		 10,051,020
(68.37 %)		 494,595
(10.52 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1		 n/a 14,859
(1.97 %)		 60,431
(5.73 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 1,039
(0.01 %)		 1,541
(100.00 %)		 461,253
(3.08 %)		 434,124
(6.81 %)		 3,499,945
(42.99 %)		 60,941
(3.20 %)
15 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1		 101,825
(6.80 %)		 26,394
(1.53 %)		 107,089
(4.26 %)		 n/a 43.53
(99.98 %)		 3,854
(0.02 %)		 939
(100.00 %)		 1,090,104
(4.07 %)		 1,787,017
(23.51 %)		 9,220,961
(56.45 %)		 78,798
(2.30 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1		 n/a 22,376
(1.44 %)		 97,559
(4.71 %)		 n/a 43.37
(99.97 %)		 3,235
(0.03 %)		 4,404
(99.97 %)		 999,920
(4.22 %)		 1,630,911
(26.08 %)		 7,875,105
(58.08 %)		 70,947
(2.59 %)
17 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2		 72,597
(5.72 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
18 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
19 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
20 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
21 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
22 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
23 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,328
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
24 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
25 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1		 51,030
(10.40 %)		 15,549
(2.60 %)		 42,858
(5.39 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,718,992
(31.80 %)		 749,009
(14.09 %)		 4,206,758
(37.30 %)		 19,230
(1.16 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1		 n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1		 54,426
(12.09 %)		 15,720
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 119
(100.00 %)		 1,608,682
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,078
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
28 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
29 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
30 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
31 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
32 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
33 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
34 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1		 n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 13,309
(0.75 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1		 34,357
(8.10 %)		 15,289
(2.56 %)		 43,205
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 665
(100.00 %)		 1,496,240
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,726
(29.93 %)		 13,308
(0.75 %)
37 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,904
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
38 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,781
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
39 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1		 n/a 14,247
(3.16 %)		 47,091
(7.94 %)		 n/a 42.17
(99.99 %)		 867
(0.02 %)		 478
(100.00 %)		 352,705
(4.33 %)		 432,013
(10.15 %)		 2,954,922
(28.67 %)		 41,876
(4.47 %)
40 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1		 n/a 14,127
(3.23 %)		 45,606
(7.98 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 804
(0.01 %)		 567
(100.00 %)		 333,253
(4.04 %)		 384,132
(9.16 %)		 2,977,533
(27.98 %)		 40,432
(4.35 %)
41 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 76,242
(9.93 %)		 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1		 n/a 15,457
(2.72 %)		 38,472
(5.59 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 625
(100.00 %)		 476,492
(3.25 %)		 242,097
(6.02 %)		 4,286,693
(33.41 %)		 9,322
(0.80 %)
43 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1		 n/a 15,534
(2.50 %)		 39,464
(5.26 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 552
(100.00 %)		 498,493
(3.22 %)		 271,314
(7.61 %)		 4,161,752
(38.16 %)		 9,637
(0.93 %)
44 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
45 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
46 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1		 48,592
(12.09 %)		 15,140
(2.66 %)		 43,304
(6.14 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 946
(99.98 %)		 1,221,797
(30.10 %)		 290,736
(7.79 %)		 4,164,799
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
47 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
48 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
49 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1		 n/a 15,122
(1.44 %)		 65,809
(4.50 %)		 n/a 41.23
(99.74 %)		 293
(0.26 %)		 331
(100.00 %)		 2,545,429
(50.53 %)		 451,939
(5.50 %)		 5,807,705
(42.18 %)		 94,695
(3.92 %)
50 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1		 n/a 15,024
(1.45 %)		 65,141
(4.53 %)		 n/a 41.23
(99.52 %)		 373
(0.48 %)		 196
(100.00 %)		 2,509,508
(50.53 %)		 441,892
(5.11 %)		 6,245,443
(38.22 %)		 93,198
(3.82 %)
51 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
52 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
53 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,657
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
54 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1		 n/a 15,938
(3.00 %)		 52,921
(7.52 %)		 n/a 43.38
(99.98 %)		 752
(0.02 %)		 327
(100.00 %)		 993,554
(11.81 %)		 755,389
(11.75 %)		 3,469,352
(30.25 %)		 68,008
(5.51 %)
55 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1		 n/a 15,940
(3.02 %)		 51,682
(7.42 %)		 n/a 43.31
(99.98 %)		 756
(0.02 %)		 200
(100.00 %)		 986,717
(11.69 %)		 754,642
(11.91 %)		 3,459,958
(30.32 %)		 67,732
(5.27 %)
56 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1		 n/a 15,950
(2.82 %)		 53,175
(7.04 %)		 n/a 42.97
(99.99 %)		 481
(0.01 %)		 846
(100.00 %)		 1,017,817
(12.34 %)		 764,426
(15.65 %)		 3,524,564
(32.87 %)		 60,800
(4.43 %)
57 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1		 n/a 15,811
(2.85 %)		 52,254
(7.09 %)		 n/a 43.06
(99.99 %)		 508
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,002,378
(12.22 %)		 753,750
(14.96 %)		 3,479,721
(32.11 %)		 60,513
(4.18 %)
58 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
59 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1		 n/a 16,025
(2.63 %)		 53,351
(6.76 %)		 n/a 42.47
(99.98 %)		 699
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 995,401
(9.22 %)		 626,617
(9.80 %)		 4,302,378
(31.80 %)		 38,231
(2.50 %)
60 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1		 n/a 15,902
(2.63 %)		 52,639
(6.71 %)		 n/a 42.44
(99.98 %)		 680
(0.02 %)		 204
(100.00 %)		 989,039
(9.11 %)		 628,091
(9.80 %)		 4,315,800
(31.97 %)		 37,729
(2.33 %)
61 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1		 34,914
(7.61 %)		 16,015
(2.73 %)		 54,287
(6.76 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 n/a 8,310
(100.00 %)		 996,609
(9.55 %)		 631,344
(6.03 %)		 4,456,094
(29.17 %)		 37,522
(2.03 %)
62 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1		 n/a 14,534
(2.11 %)		 56,906
(6.41 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 3,523
(100.00 %)		 2,445,373
(45.07 %)		 452,878
(9.46 %)		 4,195,077
(39.49 %)		 77,592
(4.86 %)
63 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
64 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
65 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1		 42,351
(12.09 %)		 14,988
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 1,017,142
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,447
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
66 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1		 n/a 15,257
(2.73 %)		 47,477
(6.62 %)		 n/a 42.03
(100.00 %)		 n/a 24
(100.00 %)		 488,582
(3.19 %)		 254,655
(4.13 %)		 4,385,401
(24.08 %)		 32,461
(1.90 %)
67 black rockcod
GCF_000735185.1		 34,978
(8.49 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
68 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1		 43,392
(8.45 %)		 15,522
(2.13 %)		 48,255
(5.50 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 341
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 1,651,919
(22.26 %)		 782,601
(7.55 %)		 5,398,047
(38.87 %)		 24,508
(1.19 %)
69 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
70 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
71 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1		 n/a 15,085
(2.21 %)		 48,479
(5.71 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 499,447
(3.15 %)		 285,392
(5.12 %)		 5,443,017
(30.00 %)		 23,550
(1.23 %)
72 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
73 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1		 n/a 17,403
(2.99 %)		 45,903
(5.38 %)		 n/a 38.64
(99.99 %)		 709
(0.01 %)		 673
(100.00 %)		 2,141,901
(35.77 %)		 482,931
(17.18 %)		 4,297,133
(46.82 %)		 41,889
(2.32 %)
74 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1		 n/a 17,486
(2.97 %)		 46,833
(5.41 %)		 n/a 38.79
(99.99 %)		 720
(0.01 %)		 413
(100.00 %)		 2,165,269
(36.18 %)		 490,692
(17.84 %)		 4,251,333
(47.54 %)		 42,744
(2.37 %)
75 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,929
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
76 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
77 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 56,939
(8.11 %)		 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
78 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1		 n/a 13,097
(2.93 %)		 55,097
(8.76 %)		 n/a 45.82
(99.88 %)		 3,055
(0.12 %)		 3,832
(100.00 %)		 1,337,604
(32.27 %)		 749,185
(17.27 %)		 2,363,606
(35.06 %)		 78,815
(8.25 %)
79 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1		 n/a 14,996
(2.68 %)		 44,244
(6.44 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 59
(100.00 %)		 1,619,681
(30.07 %)		 337,749
(4.31 %)		 4,541,709
(29.20 %)		 14,576
(0.85 %)
80 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1		 63,345
(14.83 %)		 14,387
(3.54 %)		 43,563
(7.96 %)		 n/a 41.68
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 842,739
(18.67 %)		 356,558
(12.86 %)		 2,720,911
(41.08 %)		 40,187
(4.66 %)
81 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
82 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
83 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
84 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
85 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
86 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
87 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
88 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1		 24,050
(11.30 %)		 14,596
(4.48 %)		 52,760
(11.00 %)		 n/a 44.75
(99.96 %)		 1,486
(0.04 %)		 1,370
(100.00 %)		 471,281
(10.94 %)		 181,798
(7.38 %)		 2,008,576
(24.90 %)		 46,438
(14.87 %)
89 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1		 86,420
(8.25 %)		 22,100
(2.28 %)		 59,296
(4.66 %)		 n/a 38.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 3,555,303
(40.49 %)		 538,181
(9.64 %)		 6,137,303
(50.16 %)		 71,533
(4.06 %)
90 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1		 n/a 17,715
(2.98 %)		 44,183
(4.64 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 613,768
(4.88 %)		 440,668
(11.76 %)		 5,264,302
(45.25 %)		 39,351
(3.96 %)
91 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1		 37,003
(8.79 %)		 15,275
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 1,369,180
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,024
(31.90 %)		 27,133
(1.64 %)
92 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1		 43,278
(10.19 %)		 15,613
(2.96 %)		 39,340
(5.77 %)		 n/a 39.31
(99.98 %)		 291
(0.02 %)		 78
(100.00 %)		 1,563,305
(33.23 %)		 689,312
(9.96 %)		 3,954,578
(35.31 %)		 20,152
(1.50 %)
93 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1		 55,474
(7.85 %)		 13,848
(1.83 %)		 27,055
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 953,492
(13.69 %)		 387,699
(7.91 %)		 4,552,359
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
94 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 43,764
(2.79 %)
95 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
96 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
97 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1		 n/a 13,406
(4.62 %)		 41,458
(10.33 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 205,224
(2.93 %)		 217,943
(13.58 %)		 1,368,592
(36.56 %)		 48,018
(12.44 %)
98 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1		 n/a 13,414
(4.78 %)		 41,481
(10.68 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 90
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 203,521
(2.96 %)		 200,308
(11.44 %)		 1,413,994
(34.72 %)		 47,578
(12.59 %)
99 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1		 49,639
(15.87 %)		 13,630
(3.98 %)		 43,263
(9.12 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 727,223
(20.88 %)		 290,624
(20.53 %)		 1,369,709
(43.82 %)		 51,671
(14.43 %)
100 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
101 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,218
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
102 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
103 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
104 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
105 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,841
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
106 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
107 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1		 48,842
(7.86 %)		 15,030
(2.11 %)		 47,569
(5.39 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 362,601
(2.31 %)		 342,827
(15.91 %)		 3,359,060
(39.76 %)		 28,098
(1.96 %)
108 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
109 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
110 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
111 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
112 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
113 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1		 80,307
(5.31 %)		 27,171
(1.38 %)		 123,048
(4.00 %)		 n/a 44.12
(99.94 %)		 4,047
(0.06 %)		 18,306
(100.00 %)		 1,207,353
(5.23 %)		 2,779,869
(27.93 %)		 11,429,057
(55.56 %)		 83,137
(1.99 %)
114 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1		 38,623
(10.62 %)		 15,604
(3.07 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 1,224,649
(24.57 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,926
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
115 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1		 n/a 15,116
(2.91 %)		 47,839
(7.01 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 463,848
(3.80 %)		 254,561
(4.23 %)		 3,654,295
(24.08 %)		 30,593
(1.99 %)
116 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
117 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1		 n/a 15,739
(1.88 %)		 46,290
(4.42 %)		 n/a 39.31
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 663,559
(2.79 %)		 371,107
(3.14 %)		 7,519,173
(32.84 %)		 17,824
(0.70 %)
118 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1		 n/a 15,611
(1.87 %)		 46,283
(4.42 %)		 n/a 39.32
(100.00 %)		 72
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 663,907
(2.82 %)		 372,676
(3.23 %)		 7,551,541
(33.03 %)		 17,757
(0.80 %)
119 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1		 48,071
(11.91 %)		 16,738
(3.72 %)		 46,295
(6.80 %)		 n/a 39.61
(98.56 %)		 9,510
(1.45 %)		 1,039
(100.00 %)		 1,469,931
(44.44 %)		 188,838
(2.34 %)		 3,624,116
(35.94 %)		 44,615
(5.01 %)
120 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,690
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
121 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,018
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
122 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,327
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
123 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,370
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 157,582
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
124 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
125 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
126 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
127 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,598
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 120,379
(5.87 %)		 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
128 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
129 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
130 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,580
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
131 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,925
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
132 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,863
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 125,873
(5.26 %)		 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
133 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1		 n/a 18,114
(2.63 %)		 66,549
(6.11 %)		 n/a 38.62
(99.99 %)		 685
(0.01 %)		 215
(100.00 %)		 2,639,968
(48.46 %)		 659,243
(7.55 %)		 5,950,358
(40.47 %)		 62,337
(3.61 %)
134 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1		 n/a 30,973
(3.47 %)		 83,657
(5.95 %)		 n/a 37.06
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 674
(100.00 %)		 3,324,121
(41.45 %)		 707,134
(4.72 %)		 8,110,561
(39.08 %)		 44,388
(1.60 %)
135 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1		 91,197
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
136 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
137 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1		 n/a 18,484
(2.43 %)		 69,931
(5.95 %)		 n/a 39.03
(99.98 %)		 1,202
(0.02 %)		 876
(100.00 %)		 938,148
(4.74 %)		 828,944
(9.34 %)		 5,833,273
(42.65 %)		 78,182
(4.87 %)
138 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1		 n/a 17,904
(2.46 %)		 68,908
(5.96 %)		 n/a 38.98
(99.98 %)		 1,147
(0.02 %)		 530
(100.00 %)		 3,428,827
(55.24 %)		 796,220
(8.80 %)		 5,775,180
(41.93 %)		 77,105
(4.67 %)
139 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1		 n/a 15,435
(2.40 %)		 54,036
(6.66 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 576
(100.00 %)		 495,544
(2.96 %)		 454,601
(9.69 %)		 4,614,163
(29.34 %)		 29,859
(1.71 %)
140 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1		 n/a 15,519
(2.52 %)		 53,533
(6.93 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 535
(0.01 %)		 784
(99.99 %)		 472,383
(2.92 %)		 337,781
(6.08 %)		 4,705,623
(26.82 %)		 29,198
(1.68 %)
141 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1		 60,947
(12.28 %)		 13,706
(2.67 %)		 42,956
(5.71 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,259
(100.00 %)		 1,417,848
(37.47 %)		 173,323
(3.85 %)		 3,968,694
(40.23 %)		 70,253
(6.29 %)
142 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
143 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
144 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1		 n/a 29,103
(1.36 %)		 124,287
(3.94 %)		 n/a 43.87
(99.96 %)		 5,995
(0.04 %)		 11,150
(100.00 %)		 1,655,140
(4.68 %)		 1,843,550
(17.63 %)		 9,367,555
(61.56 %)		 112,654
(3.84 %)
145 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1		 n/a 25,968
(1.48 %)		 104,922
(4.18 %)		 n/a 43.67
(99.96 %)		 4,689
(0.04 %)		 8,669
(99.96 %)		 1,320,339
(4.08 %)		 1,364,334
(15.61 %)		 7,674,742
(61.10 %)		 94,019
(3.82 %)
146 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
147 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 20,502,207
(74.78 %)		 568,042
(10.14 %)
148 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
149 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
150 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
151 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1		 n/a 14,695
(2.68 %)		 51,799
(6.37 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 2,080
(100.00 %)		 1,969,654
(37.02 %)		 663,295
(11.19 %)		 3,764,275
(45.19 %)		 67,226
(8.43 %)
152 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1		 n/a 17,935
(1.34 %)		 104,307
(6.12 %)		 n/a 44.53
(99.96 %)		 2,975
(0.04 %)		 2,930
(100.00 %)		 5,608,839
(57.44 %)		 1,825,932
(20.35 %)		 6,375,759
(51.18 %)		 149,374
(4.78 %)
153 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1		 n/a 17,775
(1.43 %)		 100,017
(6.38 %)		 n/a 44.59
(99.96 %)		 2,894
(0.04 %)		 4,301
(99.96 %)		 5,332,080
(56.26 %)		 1,737,704
(18.88 %)		 6,064,583
(49.72 %)		 141,258
(4.70 %)
154 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1		 n/a 14,740
(2.96 %)		 58,554
(8.04 %)		 n/a 44.56
(99.96 %)		 1,180
(0.04 %)		 793
(100.00 %)		 711,944
(7.44 %)		 537,707
(8.17 %)		 3,418,045
(29.92 %)		 95,750
(8.49 %)
155 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1		 n/a 13,849
(3.08 %)		 53,198
(8.16 %)		 n/a 44.70
(99.96 %)		 1,089
(0.04 %)		 513
(100.00 %)		 649,032
(7.21 %)		 483,451
(7.55 %)		 3,155,766
(28.97 %)		 88,490
(8.53 %)
156 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
157 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
158 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
159 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
160 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
161 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1		 49,121
(12.72 %)		 16,501
(4.06 %)		 40,671
(7.11 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 1,213,719
(40.21 %)		 134,299
(3.43 %)		 3,676,403
(30.98 %)		 29,879
(3.18 %)
162 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
163 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
164 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
165 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
166 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
167 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
168 doctor fish G.rufa (2025)
GCF_049309525.1		 56,413
(6.01 %)		 18,728
(2.09 %)		 57,498
(4.48 %)		 n/a 37.04
(99.47 %)		 14,924
(0.54 %)		 1,000
(100.00 %)		 928,901
(3.56 %)		 923,200
(13.04 %)		 6,338,918
(52.94 %)		 64,694
(3.55 %)
169 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
170 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1		 45,512
(7.65 %)		 16,797
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 103
(100.00 %)		 871,278
(4.83 %)		 805,806
(14.65 %)		 5,615,217
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
171 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2		 n/a 14,760
(4.56 %)		 56,353
(11.37 %)		 n/a 45.56
(99.97 %)		 1,033
(0.03 %)		 1,158
(100.00 %)		 292,029
(9.69 %)		 192,568
(5.53 %)		 1,623,924
(22.71 %)		 51,743
(9.31 %)
172 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,366
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
173 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
174 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1		 n/a 15,554
(2.13 %)		 55,328
(6.30 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 31
(100.00 %)		 933,060
(24.43 %)		 252,509
(4.84 %)		 4,460,314
(32.70 %)		 34,184
(2.09 %)
175 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
176 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
177 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
178 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1		 n/a 16,358
(2.62 %)		 62,068
(6.39 %)		 n/a 41.74
(99.75 %)		 49
(0.25 %)		 460
(100.00 %)		 701,679
(6.15 %)		 756,011
(21.53 %)		 2,660,355
(42.28 %)		 50,381
(3.85 %)
179 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
180 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 63,731
(6.65 %)		 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
181 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
182 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
183 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1		 48,154
(5.87 %)		 15,415
(1.33 %)		 77,712
(5.08 %)		 n/a 44.45
(99.99 %)		 9,202
(0.02 %)		 1,922
(100.00 %)		 4,406,534
(31.73 %)		 2,331,293
(15.35 %)		 6,863,540
(50.47 %)		 80,927
(2.32 %)
184 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
185 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
186 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
187 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
188 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1		 n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 37,130
(2.79 %)
189 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1		 48,969
(12.45 %)		 14,751
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 108
(100.00 %)		 1,160,781
(27.06 %)		 251,983
(5.23 %)		 3,353,086
(26.00 %)		 37,129
(2.79 %)
190 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
191 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
192 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,467
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
193 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,470
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
194 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1		 n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
195 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1		 46,762
(14.07 %)		 15,639
(3.79 %)		 50,238
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,007
(100.00 %)		 1,648,428
(31.34 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,793
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
196 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
197 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
198 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 75,582
(11.23 %)		 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
199 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1		 n/a 15,528
(2.10 %)		 55,124
(6.16 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 946,588
(24.66 %)		 252,409
(5.14 %)		 4,403,110
(33.26 %)		 35,478
(2.07 %)
200 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
201 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
202 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
203 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
204 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
205 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1		 n/a 15,652
(1.85 %)		 56,048
(5.08 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 176
(100.00 %)		 640,534
(2.88 %)		 384,479
(4.59 %)		 6,438,939
(33.27 %)		 28,221
(1.10 %)
206 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
207 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
208 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,257
(6.73 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
209 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
210 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,821
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
211 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,357
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
212 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,835
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
213 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,769
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
214 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
215 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
216 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
217 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
218 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
219 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
220 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
221 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
222 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
223 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
224 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
225 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
226 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2		 53,176
(17.83 %)		 13,439
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 644,597
(20.82 %)		 180,309
(16.78 %)		 1,339,434
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
227 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,583
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
228 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
229 guppy
GCF_000633615.1		 48,303
(11.25 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
230 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
231 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
232 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,598
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
233 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
234 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
235 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
236 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
237 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,570
(6.90 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
238 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
239 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1		 60,200
(14.08 %)		 14,987
(3.26 %)		 42,919
(7.40 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 850,797
(19.88 %)		 308,390
(6.45 %)		 3,329,304
(26.55 %)		 23,373
(1.76 %)
240 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 91,652
(11.67 %)		 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
241 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
242 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
243 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
244 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
245 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,790
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
246 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1		 40,680
(11.49 %)		 14,847
(3.17 %)		 46,307
(7.10 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 n/a 1,003
(100.00 %)		 967,639
(17.54 %)		 319,567
(5.43 %)		 3,743,006
(26.82 %)		 47,481
(4.63 %)
247 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
248 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
249 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 76,885
(3.80 %)		 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
250 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
251 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,259
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
252 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
253 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,927
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
254 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
255 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
256 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1		 n/a 15,790
(2.31 %)		 50,332
(5.65 %)		 n/a 40.87
(99.96 %)		 672
(0.04 %)		 202
(100.00 %)		 464,845
(2.71 %)		 255,513
(3.69 %)		 5,124,388
(29.65 %)		 25,920
(1.67 %)
257 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
258 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
259 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
260 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1		 46,242
(10.23 %)		 13,712
(2.62 %)		 43,369
(5.56 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 1,537
(100.00 %)		 1,406,779
(35.37 %)		 202,983
(7.44 %)		 3,933,128
(41.19 %)		 70,560
(7.78 %)
261 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1		 n/a 14,961
(2.55 %)		 52,234
(6.83 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 409
(0.01 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,233,052
(39.33 %)		 366,741
(18.98 %)		 3,296,338
(36.77 %)		 44,712
(2.85 %)
262 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
263 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
264 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
265 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
266 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
267 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
268 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
269 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
270 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
271 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
272 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
273 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
274 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
275 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
276 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
277 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,273
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
278 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1		 n/a 15,501
(2.18 %)		 54,090
(6.20 %)		 n/a 41.17
(99.99 %)		 422
(0.01 %)		 82
(100.00 %)		 1,727,328
(38.16 %)		 259,351
(4.71 %)		 4,381,278
(33.25 %)		 35,281
(1.93 %)
279 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
280 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,029
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
281 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,187
(11.82 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
282 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
283 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
284 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1		 44,376
(10.91 %)		 14,032
(2.80 %)		 60,400
(8.09 %)		 n/a 43.84
(99.86 %)		 974
(0.14 %)		 200
(100.00 %)		 1,157,953
(36.57 %)		 569,832
(12.19 %)		 2,864,996
(37.65 %)		 98,423
(9.53 %)
285 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
286 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
287 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
288 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1		 n/a 15,067
(2.44 %)		 45,263
(5.54 %)		 n/a 40.74
(92.95 %)		 617,558
(7.14 %)		 624,195
(92.86 %)		 867,309
(14.82 %)		 199,669
(1.16 %)		 5,215,762
(25.14 %)		 13,920
(0.64 %)
289 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
290 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
291 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
292 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
293 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
294 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1		 40,276
(12.25 %)		 14,478
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 1,660
(99.98 %)		 1,101,578
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,428
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
295 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,100
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
296 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1		 77,155
(10.70 %)		 16,413
(2.24 %)		 85,893
(7.33 %)		 n/a 43.96
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 407
(100.00 %)		 447,893
(2.43 %)		 464,565
(9.46 %)		 3,801,201
(29.32 %)		 93,225
(5.54 %)
297 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
298 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
299 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
300 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
301 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
302 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,397
(10.87 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
303 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
304 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
305 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1		 n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
306 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1		 57,816
(15.11 %)		 14,598
(3.83 %)		 49,473
(9.87 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 174
(100.00 %)		 599,085
(14.68 %)		 186,746
(10.27 %)		 2,273,889
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
307 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,085
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
308 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1		 n/a 15,704
(2.16 %)		 43,094
(4.57 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 115
(0.01 %)		 104
(100.00 %)		 1,034,605
(5.50 %)		 566,093
(5.52 %)		 6,229,176
(38.50 %)		 41,022
(2.53 %)
309 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1		 n/a 15,762
(2.12 %)		 43,732
(4.51 %)		 n/a 38.98
(100.00 %)		 180
(0.00 %)		 278
(100.00 %)		 1,071,044
(5.64 %)		 581,680
(6.16 %)		 6,228,783
(39.01 %)		 42,159
(2.70 %)
310 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1		 n/a 14,295
(2.22 %)		 50,623
(6.07 %)		 n/a 42.09
(99.99 %)		 466
(0.01 %)		 892
(100.00 %)		 1,941,831
(49.35 %)		 650,256
(17.85 %)		 3,210,410
(44.77 %)		 55,251
(4.79 %)
311 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1		 n/a 14,542
(2.12 %)		 51,650
(5.81 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 484
(0.01 %)		 667
(100.00 %)		 2,014,967
(51.82 %)		 755,698
(19.90 %)		 3,290,098
(47.08 %)		 57,881
(4.66 %)
312 northern pike
GCF_004634155.1		 66,376
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
313 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
314 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,720
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
315 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1		 61,639
(13.32 %)		 15,131
(2.87 %)		 35,444
(5.74 %)		 n/a 39.76
(100.00 %)		 52
(0.00 %)		 291
(100.00 %)		 830,033
(26.45 %)		 152,304
(8.77 %)		 3,778,846
(29.39 %)		 8,436
(0.70 %)
316 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1		 n/a 13,787
(3.68 %)		 60,819
(10.07 %)		 n/a 45.42
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 108
(100.00 %)		 259,874
(3.38 %)		 94,885
(3.76 %)		 2,302,967
(21.04 %)		 58,433
(13.25 %)
317 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1		 n/a 13,709
(3.65 %)		 60,517
(9.98 %)		 n/a 45.43
(100.00 %)		 111
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 272,479
(3.57 %)		 101,623
(4.29 %)		 2,384,412
(21.91 %)		 58,256
(13.22 %)
318 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
319 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1		 32,231
(8.81 %)		 15,382
(3.41 %)		 41,015
(7.24 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 1,143,877
(18.90 %)		 219,801
(2.87 %)		 3,652,133
(23.09 %)		 19,721
(1.34 %)
320 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1		 n/a 15,360
(3.42 %)		 41,012
(7.26 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 94
(100.00 %)		 438,416
(3.46 %)		 219,275
(2.83 %)		 3,623,998
(22.85 %)		 19,710
(1.32 %)
321 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
322 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
323 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
324 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,792
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
325 oriental weatherfish (2024)
GCF_027580225.2		 72,545
(8.62 %)		 17,655
(2.31 %)		 50,007
(4.93 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 446,769
(2.37 %)		 424,953
(7.13 %)		 6,268,308
(45.46 %)		 53,150
(3.31 %)
326 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1		 n/a 14,679
(2.30 %)		 51,447
(6.15 %)		 n/a 44.09
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 180
(100.00 %)		 1,452,983
(14.50 %)		 1,649,878
(17.81 %)		 4,184,643
(38.57 %)		 36,016
(2.07 %)
327 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1		 n/a 15,600
(2.30 %)		 54,714
(6.21 %)		 n/a 43.99
(99.99 %)		 1,132
(0.01 %)		 184
(100.00 %)		 1,505,689
(14.07 %)		 1,691,834
(17.30 %)		 4,407,291
(38.23 %)		 38,205
(2.14 %)
328 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1		 60,285
(14.61 %)		 15,290
(2.96 %)		 42,088
(6.53 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 150
(100.00 %)		 534,470
(3.96 %)		 267,099
(3.88 %)		 4,094,899
(24.75 %)		 14,784
(1.60 %)
329 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
330 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1		 49,430
(13.67 %)		 13,542
(2.89 %)		 64,214
(9.77 %)		 n/a 45.55
(99.92 %)		 4,826
(0.09 %)		 24
(100.00 %)		 1,117,561
(38.30 %)		 685,851
(13.38 %)		 2,330,116
(34.15 %)		 87,761
(8.68 %)
331 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
332 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,697
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
333 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1		 54,344
(6.52 %)		 15,214
(1.67 %)		 74,345
(6.13 %)		 n/a 41.49
(99.96 %)		 900
(0.04 %)		 759
(100.00 %)		 805,776
(5.16 %)		 849,901
(11.48 %)		 4,645,552
(43.92 %)		 106,026
(5.14 %)
334 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1		 40,657
(5.52 %)		 17,858
(2.46 %)		 42,119
(3.16 %)		 n/a 36.32
(98.82 %)		 1,821
(1.18 %)		 342
(100.00 %)		 3,973,354
(56.67 %)		 940,639
(7.81 %)		 8,701,639
(50.54 %)		 29,684
(1.18 %)
335 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1		 n/a 15,421
(1.80 %)		 62,324
(6.15 %)		 n/a 42.79
(99.90 %)		 4,955
(0.10 %)		 4,978
(99.90 %)		 4,032,523
(34.18 %)		 982,411
(16.51 %)		 5,189,655
(46.47 %)		 64,543
(3.14 %)
336 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1		 n/a 16,917
(1.64 %)		 72,190
(5.85 %)		 n/a 42.91
(99.96 %)		 2,729
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 4,976,327
(35.08 %)		 1,258,755
(18.52 %)		 6,268,804
(48.21 %)		 81,193
(3.23 %)
337 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1		 42,701
(12.59 %)		 14,986
(3.15 %)		 46,289
(7.75 %)		 n/a 40.99
(99.97 %)		 380
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 1,031,762
(25.30 %)		 219,393
(4.63 %)		 3,436,780
(25.57 %)		 16,570
(1.12 %)
338 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
339 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
340 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
341 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
342 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1		 n/a 17,996
(2.00 %)		 89,591
(7.93 %)		 n/a 45.22
(99.94 %)		 3,299
(0.06 %)		 1,177
(100.00 %)		 2,828,457
(30.93 %)		 1,676,413
(19.87 %)		 4,137,400
(48.69 %)		 78,669
(4.37 %)
343 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1		 n/a 13,827
(3.46 %)		 53,000
(8.90 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 122
(0.00 %)		 364
(100.00 %)		 222,800
(3.83 %)		 105,428
(7.84 %)		 2,500,710
(25.24 %)		 41,125
(5.45 %)
344 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1		 n/a 13,816
(3.52 %)		 52,689
(9.01 %)		 n/a 43.48
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 300
(100.00 %)		 223,762
(3.25 %)		 105,291
(6.28 %)		 2,579,336
(24.55 %)		 41,114
(5.50 %)
345 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
346 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
347 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
348 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,140
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
349 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
350 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
351 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
352 pond loach (2024)
GCF_030506205.2		 63,171
(8.66 %)		 17,091
(2.42 %)		 45,877
(5.02 %)		 n/a 38.27
(99.98 %)		 1,120
(0.02 %)		 220
(100.00 %)		 409,390
(2.50 %)		 390,110
(8.52 %)		 5,401,936
(44.65 %)		 52,115
(4.00 %)
353 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1		 56,688
(7.63 %)		 17,670
(2.67 %)		 54,522
(5.25 %)		 n/a 37.95
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,087,358
(61.37 %)		 553,846
(7.14 %)		 6,036,124
(43.52 %)		 47,942
(3.56 %)
354 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
355 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
356 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1		 n/a 15,639
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 365
(100.00 %)		 1,655,350
(30.53 %)		 511,512
(12.09 %)		 2,015,264
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
357 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1		 39,606
(12.43 %)		 15,641
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 366
(100.00 %)		 1,655,356
(30.53 %)		 511,513
(12.09 %)		 2,015,303
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
358 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,271
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 138,073
(5.21 %)		 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
359 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,286
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
360 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1		 n/a 15,661
(1.94 %)		 54,906
(5.30 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 386
(100.00 %)		 591,994
(2.64 %)		 396,424
(6.16 %)		 6,144,028
(31.24 %)		 24,792
(1.05 %)
361 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1		 n/a 15,830
(2.03 %)		 54,183
(5.34 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 2,922,062
(42.12 %)		 374,226
(5.08 %)		 6,124,255
(30.17 %)		 24,493
(0.98 %)
362 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 72,004
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
363 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
364 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
365 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
366 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
367 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1		 37,802
(8.56 %)		 16,430
(2.60 %)		 56,127
(6.62 %)		 n/a 42.14
(100.00 %)		 n/a 6,232
(100.00 %)		 1,061,195
(9.52 %)		 653,833
(5.90 %)		 4,595,588
(30.15 %)		 38,922
(2.20 %)
368 red seabream (2024)
GCF_040436345.1		 36,326
(8.73 %)		 15,416
(2.51 %)		 50,764
(6.70 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 278
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 474,006
(3.07 %)		 322,892
(6.05 %)		 4,847,143
(26.99 %)		 23,370
(1.27 %)
369 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,478
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
370 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
371 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
372 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
373 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
374 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
375 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
376 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
377 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
378 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,514
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
379 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
380 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1		 32,256
(9.05 %)		 15,283
(3.03 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 1,115,191
(21.73 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,073
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
381 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1		 n/a 14,475
(2.89 %)		 44,413
(7.11 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 84
(100.00 %)		 1,762,151
(30.90 %)		 262,291
(5.80 %)		 3,580,461
(24.37 %)		 19,851
(1.40 %)
382 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1		 n/a 17,895
(2.55 %)		 64,448
(5.84 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 418
(0.01 %)		 110
(100.00 %)		 2,661,155
(49.83 %)		 673,071
(10.59 %)		 5,755,954
(42.48 %)		 66,952
(4.46 %)
383 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1		 n/a 18,254
(2.38 %)		 68,852
(5.71 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 759
(100.00 %)		 2,854,977
(51.13 %)		 754,287
(11.81 %)		 5,942,764
(44.17 %)		 72,686
(4.52 %)
384 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
385 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
386 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1		 n/a 15,661
(2.59 %)		 68,929
(8.14 %)		 n/a 45.02
(99.96 %)		 1,365
(0.04 %)		 2,987
(100.00 %)		 2,234,544
(43.47 %)		 1,192,255
(16.84 %)		 3,383,827
(41.37 %)		 108,808
(9.86 %)
387 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1		 n/a 15,427
(2.54 %)		 67,522
(7.97 %)		 n/a 44.96
(99.96 %)		 1,366
(0.04 %)		 1,559
(100.00 %)		 2,195,227
(44.71 %)		 1,219,658
(17.45 %)		 3,319,218
(42.93 %)		 108,314
(9.71 %)
388 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1		 56,023
(20.10 %)		 13,998
(4.84 %)		 48,737
(11.56 %)		 n/a 45.63
(99.99 %)		 250
(0.01 %)		 868
(100.00 %)		 304,980
(15.98 %)		 171,631
(4.98 %)		 1,616,965
(21.60 %)		 48,338
(9.79 %)
389 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1		 n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 68,874
(3.56 %)
390 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1		 48,146
(9.15 %)		 16,069
(2.33 %)		 64,178
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 240
(100.00 %)		 1,503,108
(11.74 %)		 1,507,022
(15.48 %)		 4,027,614
(37.52 %)		 68,873
(3.56 %)
391 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1		 51,267
(7.00 %)		 13,854
(1.32 %)		 48,980
(3.46 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,805,346
(21.21 %)		 512,153
(12.76 %)		 6,260,589
(63.96 %)		 96,908
(3.65 %)
392 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1		 n/a 14,310
(4.44 %)		 47,336
(10.19 %)		 n/a 44.83
(99.99 %)		 241
(0.01 %)		 38
(100.00 %)		 446,827
(13.86 %)		 192,599
(8.52 %)		 2,033,160
(22.85 %)		 61,012
(13.03 %)
393 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1		 n/a 14,237
(4.44 %)		 46,701
(10.13 %)		 n/a 44.75
(99.99 %)		 276
(0.01 %)		 52
(100.00 %)		 413,494
(14.42 %)		 189,429
(8.99 %)		 1,996,715
(23.13 %)		 60,252
(12.60 %)
394 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
395 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
396 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
397 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1		 n/a 15,800
(1.77 %)		 51,791
(4.52 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 777,839
(3.19 %)		 459,791
(3.90 %)		 7,958,604
(35.17 %)		 21,711
(0.94 %)
398 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1		 n/a 15,879
(1.78 %)		 51,774
(4.52 %)		 n/a 39.81
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 778,842
(3.19 %)		 462,247
(3.82 %)		 7,956,116
(35.13 %)		 21,587
(0.91 %)
399 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,892
(7.02 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
400 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
401 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
402 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,291
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
403 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
404 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,179
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
405 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1		 n/a 16,906
(1.39 %)		 115,931
(7.77 %)		 n/a 44.10
(99.96 %)		 3,365
(0.04 %)		 5,504
(100.00 %)		 4,606,608
(53.63 %)		 1,428,326
(25.54 %)		 4,395,832
(51.22 %)		 166,807
(7.52 %)
406 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1		 n/a 17,409
(1.14 %)		 146,413
(8.24 %)		 n/a 44.20
(99.96 %)		 3,473
(0.04 %)		 8,068
(99.96 %)		 2,051,529
(14.72 %)		 1,808,246
(28.36 %)		 4,967,915
(54.93 %)		 208,486
(7.83 %)
407 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
408 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
409 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,932
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
410 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1		 57,883
(4.39 %)		 15,654
(1.03 %)		 72,123
(3.58 %)		 n/a 38.64
(100.00 %)		 2,564
(0.00 %)		 424
(100.00 %)		 3,149,025
(23.73 %)		 1,621,410
(19.58 %)		 7,534,195
(67.22 %)		 122,765
(3.07 %)
411 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,641
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
412 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1		 80,798
(5.59 %)		 26,218
(1.35 %)		 116,746
(3.87 %)		 n/a 44.03
(99.93 %)		 4,351
(0.07 %)		 12,436
(100.00 %)		 6,356,046
(54.95 %)		 2,840,516
(31.41 %)		 10,575,179
(57.52 %)		 77,648
(1.61 %)
413 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2		 42,862
(7.09 %)		 14,776
(1.80 %)		 68,955
(6.18 %)		 n/a 42.07
(99.90 %)		 2,603
(0.11 %)		 1,563
(100.00 %)		 512,600
(3.45 %)		 473,958
(7.19 %)		 3,590,436
(45.74 %)		 88,970
(4.31 %)
414 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
415 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
416 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,380
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
417 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,330
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
418 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1		 n/a 15,554
(1.75 %)		 58,641
(5.19 %)		 n/a 40.59
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 682,449
(3.01 %)		 409,809
(4.43 %)		 7,114,584
(28.98 %)		 37,214
(1.53 %)
419 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1		 n/a 15,490
(1.77 %)		 57,993
(5.20 %)		 n/a 40.57
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 677,985
(3.03 %)		 408,391
(4.33 %)		 7,184,861
(29.15 %)		 36,602
(1.46 %)
420 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,656
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
421 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
422 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1		 n/a 13,641
(5.13 %)		 57,982
(13.46 %)		 n/a 46.43
(91.24 %)		 18,974
(8.76 %)		 44,686
(91.24 %)		 252,877
(4.38 %)		 159,939
(3.51 %)		 1,689,462
(18.66 %)		 51,580
(13.42 %)
423 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1		 n/a 15,425
(3.14 %)		 43,414
(6.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 n/a 109
(100.00 %)		 447,804
(3.49 %)		 241,876
(3.25 %)		 3,757,088
(26.25 %)		 23,346
(2.49 %)
424 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1		 46,818
(8.35 %)		 14,938
(2.04 %)		 55,475
(6.12 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 792
(100.00 %)		 505,488
(2.57 %)		 269,742
(4.14 %)		 4,697,020
(30.74 %)		 30,399
(1.90 %)
425 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2		 48,380
(8.37 %)		 15,470
(2.04 %)		 57,237
(6.11 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 791
(100.00 %)		 523,070
(2.57 %)		 277,554
(4.08 %)		 4,872,723
(30.67 %)		 31,383
(1.89 %)
426 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,167
(7.62 %)		 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
427 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2		 n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 65,007
(2.74 %)
428 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
429 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
430 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1		 59,497
(6.82 %)		 17,172
(2.25 %)		 57,383
(4.85 %)		 n/a 39.18
(99.99 %)		 497
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 4,750,810
(63.58 %)		 649,426
(10.14 %)		 6,511,384
(46.74 %)		 74,723
(4.45 %)
431 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1		 56,498
(4.86 %)		 14,602
(1.00 %)		 64,279
(2.96 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 1,172
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 2,984,285
(27.54 %)		 1,402,691
(20.35 %)		 7,915,062
(67.02 %)		 140,374
(3.90 %)
432 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1		 45,220
(12.66 %)		 14,509
(3.35 %)		 46,221
(7.95 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 791,570
(25.79 %)		 305,491
(6.68 %)		 3,000,938
(29.61 %)		 36,818
(4.17 %)
433 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
434 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,859
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
435 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
436 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
437 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
438 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
439 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
440 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
441 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
442 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
443 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
444 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
445 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1		 n/a 14,939
(3.72 %)		 56,284
(10.07 %)		 n/a 44.71
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 133
(100.00 %)		 573,569
(20.53 %)		 206,699
(9.01 %)		 2,335,009
(27.29 %)		 84,009
(12.41 %)
446 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1		 n/a 13,591
(3.79 %)		 50,693
(10.19 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 309
(0.01 %)		 479
(99.99 %)		 505,547
(19.86 %)		 181,092
(8.75 %)		 2,117,454
(27.02 %)		 75,434
(12.33 %)
447 threespot wrasse (MK-OKI-2021-1 2023)
GCF_033239565.1		 40,418
(8.77 %)		 15,124
(2.26 %)		 46,507
(5.67 %)		 n/a 40.89
(99.99 %)		 117
(0.01 %)		 228
(100.00 %)		 539,144
(3.57 %)		 361,249
(6.62 %)		 5,059,734
(33.65 %)		 22,689
(1.57 %)
448 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
449 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1		 43,108
(6.07 %)		 14,279
(1.78 %)		 65,726
(6.14 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 821
(100.00 %)		 411,442
(6.11 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,301
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
450 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,037
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
451 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
452 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
453 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,489
(18.32 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
454 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
455 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2		 n/a 15,041
(2.01 %)		 42,180
(4.38 %)		 n/a 41.03
(96.21 %)		 792
(3.79 %)		 594
(98.65 %)		 1,069,159
(7.06 %)		 653,554
(15.46 %)		 4,921,631
(38.75 %)		 26,440
(2.18 %)
456 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
457 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2		 n/a 17,256
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 597
(100.00 %)		 2,407,631
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,418
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
458 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1		 n/a 14,730
(2.84 %)		 50,956
(7.07 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 179
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 548,208
(5.35 %)		 356,364
(7.30 %)		 3,448,877
(26.01 %)		 26,685
(1.80 %)
459 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1		 n/a 14,680
(2.80 %)		 50,753
(6.99 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 187
(0.00 %)		 248
(100.00 %)		 559,722
(5.35 %)		 382,817
(8.57 %)		 3,423,208
(26.76 %)		 26,739
(1.77 %)
460 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
461 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,298
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 87,351
(14.65 %)		 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
462 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,386
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 57,218
(6.01 %)		 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
463 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1		 56,976
(5.74 %)		 14,604
(1.25 %)		 72,207
(4.35 %)		 n/a 44.51
(100.00 %)		 369
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 2,858,575
(46.12 %)		 660,603
(29.65 %)		 4,283,242
(61.88 %)		 118,966
(11.71 %)
464 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,501
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
465 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1		 n/a 15,895
(2.18 %)		 46,934
(4.73 %)		 n/a 39.83
(99.95 %)		 605
(0.05 %)		 3,484
(100.00 %)		 1,061,538
(6.25 %)		 611,618
(5.19 %)		 5,978,835
(37.11 %)		 54,666
(3.50 %)
466 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1		 49,084
(12.15 %)		 14,241
(2.71 %)		 70,653
(9.29 %)		 n/a 45.59
(99.96 %)		 2,816
(0.04 %)		 168
(100.00 %)		 1,274,742
(38.63 %)		 797,757
(14.11 %)		 2,725,416
(34.38 %)		 95,149
(8.09 %)
467 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
468 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
469 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,016
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
470 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1		 46,203
(5.36 %)		 16,945
(2.57 %)		 65,343
(6.35 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 n/a 930
(100.00 %)		 2,528,154
(48.24 %)		 549,447
(8.24 %)		 5,157,802
(41.42 %)		 84,874
(6.05 %)
471 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1		 85,126
(5.62 %)		 27,822
(1.58 %)		 113,187
(4.31 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 1,381
(0.01 %)		 4,647
(99.99 %)		 1,200,605
(4.82 %)		 2,237,797
(24.56 %)		 10,339,252
(54.27 %)		 70,550
(1.65 %)
472 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
473 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,638
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
474 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
475 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
476 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1		 42,410
(12.47 %)		 14,845
(3.48 %)		 50,132
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 661
(100.00 %)		 461,895
(5.20 %)		 422,249
(8.03 %)		 3,180,722
(25.81 %)		 70,181
(7.15 %)
477 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3		 47,694
(3.96 %)		 14,177
(1.01 %)		 59,392
(2.97 %)		 n/a 39.43
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,246,897
(5.46 %)		 1,548,619
(19.15 %)		 6,596,258
(69.80 %)		 148,788
(5.04 %)
478 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,781
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
479 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1		 63,938
(10.50 %)		 17,502
(3.25 %)		 52,519
(5.86 %)		 n/a 37.23
(99.62 %)		 617
(0.38 %)		 353
(100.00 %)		 2,297,102
(50.34 %)		 368,423
(3.28 %)		 5,171,389
(38.98 %)		 32,824
(2.00 %)
480 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1		 n/a 15,641
(1.95 %)		 52,141
(5.13 %)		 n/a 40.61
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 607,010
(2.66 %)		 288,837
(3.91 %)		 6,785,488
(31.37 %)		 39,560
(1.65 %)
481 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1		 n/a 15,666
(1.88 %)		 53,049
(5.01 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 620,903
(2.64 %)		 305,809
(5.18 %)		 6,707,330
(33.41 %)		 45,863
(1.88 %)
482 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
483 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
484 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,121
(7.78 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
485 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
486 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
487 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
488 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
489 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,948
(9.95 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
490 zebra mbuna
GCF_000238955.4		 51,025
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
491 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
492 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
493 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1		 122,338
(8.09 %)		 18,033
(2.41 %)		 44,966
(3.23 %)		 n/a 37.14
(100.00 %)		 13,351
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 3,807,410
(60.58 %)		 965,679
(12.22 %)		 8,736,108
(52.67 %)		 45,856
(2.03 %)
494 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
495 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
496 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
497 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 72,965
(6.43 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
498 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
499 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 45,001
(12.01 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
500 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 500

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 598 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 434 assemblies assembly stats track stats
Fishes 500 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 320 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1194 assemblies assembly stats track stats
Plants 325 assemblies assembly stats track stats
Fungi 922 assemblies assembly stats track stats
Viruses 707 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 322 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1633 assemblies assembly stats track stats