Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 refseq)
GCF_043250625.1
59,397
(10.47 %)
15,453
(2.37 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
472
(0.01 %)
204
(100.00 %)
529,455
(3.89 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,018
(37.01 %)
39,918
(2.01 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
67,978
(8.92 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1
48,520
(8.47 %)
15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
36,494
(1.83 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
35,229
(1.82 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
15,656
(0.99 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
40,218
(2.14 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
26,364
(1.18 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
494,595
(10.52 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
92,057
(3.50 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
104,688
(3.57 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
60,941
(3.20 %)
15 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1
101,825
(6.80 %)
26,394
(1.53 %)
107,089
(4.26 %)
n/a 43.53
(99.98 %)
3,854
(0.02 %)
939
(100.00 %)
1,090,104
(4.07 %)
1,787,017
(23.51 %)
9,220,961
(56.45 %)
78,798
(2.30 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
70,947
(2.59 %)
17 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2
72,597
(5.72 %)
23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
76,282
(1.94 %)
18 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
24,867
(2.06 %)
19 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
28,277
(1.93 %)
20 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
15,489
(0.95 %)
21 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
104,320
(8.02 %)
22 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
105,945
(8.03 %)
23 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,517
(10.73 %)
24 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,546
(10.82 %)
25 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,030
(10.40 %)
15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
19,230
(1.16 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
28 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
29 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
30 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
31 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
32 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
35,959
(1.97 %)
33 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
56,416
(3.08 %)
34 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
56,553
(3.08 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
13,309
(0.75 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
13,308
(0.75 %)
37 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,904
(5.61 %)
28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
38 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,781
(5.45 %)
26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
79,791
(1.60 %)
39 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1
n/a 14,247
(3.16 %)
47,091
(7.94 %)
n/a 42.17
(99.99 %)
867
(0.02 %)
478
(100.00 %)
352,705
(4.33 %)
432,013
(10.15 %)
2,954,922
(28.67 %)
41,876
(4.47 %)
40 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1
n/a 14,127
(3.23 %)
45,606
(7.98 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
804
(0.01 %)
567
(100.00 %)
333,253
(4.04 %)
384,132
(9.16 %)
2,977,533
(27.98 %)
40,432
(4.35 %)
41 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
67,338
(7.00 %)
42 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
9,322
(0.80 %)
43 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
9,637
(0.93 %)
44 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
21,221
(1.07 %)
45 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
46 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
47 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
13,787
(0.93 %)
48 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
49 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
94,695
(3.92 %)
50 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
93,198
(3.82 %)
51 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
58,008
(2.90 %)
52 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
71,384
(3.04 %)
53 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,657
(13.68 %)
16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
16,237
(1.03 %)
54 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
68,008
(5.51 %)
55 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
67,732
(5.27 %)
56 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1
n/a 15,950
(2.82 %)
53,175
(7.04 %)
n/a 42.97
(99.99 %)
481
(0.01 %)
846
(100.00 %)
1,017,817
(12.34 %)
764,426
(15.65 %)
3,524,564
(32.87 %)
60,800
(4.43 %)
57 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1
n/a 15,811
(2.85 %)
52,254
(7.09 %)
n/a 43.06
(99.99 %)
508
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,002,378
(12.22 %)
753,750
(14.96 %)
3,479,721
(32.11 %)
60,513
(4.18 %)
58 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
46,423
(2.30 %)
59 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1
n/a 16,025
(2.63 %)
53,351
(6.76 %)
n/a 42.47
(99.98 %)
699
(0.02 %)
322
(100.00 %)
995,401
(9.22 %)
626,617
(9.80 %)
4,302,378
(31.80 %)
38,231
(2.50 %)
60 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1
n/a 15,902
(2.63 %)
52,639
(6.71 %)
n/a 42.44
(99.98 %)
680
(0.02 %)
204
(100.00 %)
989,039
(9.11 %)
628,091
(9.80 %)
4,315,800
(31.97 %)
37,729
(2.33 %)
61 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1
34,914
(7.61 %)
16,015
(2.73 %)
54,287
(6.76 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
n/a 8,310
(100.00 %)
996,609
(9.55 %)
631,344
(6.03 %)
4,456,094
(29.17 %)
37,522
(2.03 %)
62 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
77,592
(4.86 %)
63 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
81,684
(4.81 %)
64 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
130,556
(4.42 %)
65 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
66 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1
n/a 15,257
(2.73 %)
47,477
(6.62 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
n/a 24
(100.00 %)
488,582
(3.19 %)
254,655
(4.13 %)
4,385,401
(24.08 %)
32,461
(1.90 %)
67 black rockcod
GCF_000735185.1
34,978
(8.49 %)
12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
31,009
(2.11 %)
68 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
24,508
(1.19 %)
69 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
53,503
(4.48 %)
70 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
52,010
(4.20 %)
71 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1
n/a 15,085
(2.21 %)
48,479
(5.71 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
11
(0.00 %)
43
(100.00 %)
499,447
(3.15 %)
285,392
(5.12 %)
5,443,017
(30.00 %)
23,550
(1.23 %)
72 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
40,207
(2.97 %)
73 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
41,889
(2.32 %)
74 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
42,744
(2.37 %)
75 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,929
(10.27 %)
15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
31,164
(1.89 %)
76 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
21,238
(1.02 %)
77 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
32,357
(1.59 %)
78 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
78,815
(8.25 %)
79 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
14,576
(0.85 %)
80 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
40,187
(4.66 %)
81 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
82 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
29,052
(1.48 %)
83 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
15,524
(1.02 %)
84 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
85 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
73,543
(3.28 %)
86 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
27,035
(4.16 %)
87 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
34,018
(4.16 %)
88 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
46,438
(14.87 %)
89 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
71,533
(4.06 %)
90 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1
n/a 17,715
(2.98 %)
44,183
(4.64 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
2
(0.00 %)
70
(100.00 %)
613,768
(4.88 %)
440,668
(11.76 %)
5,264,302
(45.25 %)
39,351
(3.96 %)
91 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
27,133
(1.64 %)
92 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
20,152
(1.50 %)
93 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
94 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
43,764
(2.79 %)
95 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
71,016
(3.36 %)
96 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
76,828
(3.96 %)
97 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1
n/a 13,406
(4.62 %)
41,458
(10.33 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
78
(0.00 %)
155
(100.00 %)
205,224
(2.93 %)
217,943
(13.58 %)
1,368,592
(36.56 %)
48,018
(12.44 %)
98 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1
n/a 13,414
(4.78 %)
41,481
(10.68 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
90
(0.00 %)
126
(100.00 %)
203,521
(2.96 %)
200,308
(11.44 %)
1,413,994
(34.72 %)
47,578
(12.59 %)
99 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
51,671
(14.43 %)
100 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
89,897
(2.49 %)
101 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,218
(8.52 %)
15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
26,136
(0.96 %)
102 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
17,722
(0.91 %)
103 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
22,763
(1.21 %)
104 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
15,255
(1.12 %)
105 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,841
(14.10 %)
15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
106 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
81,881
(6.68 %)
107 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1
48,842
(7.86 %)
15,030
(2.11 %)
47,569
(5.39 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
223
(0.00 %)
296
(100.00 %)
362,601
(2.31 %)
342,827
(15.91 %)
3,359,060
(39.76 %)
28,098
(1.96 %)
108 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
39,114
(1.56 %)
109 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
27,134
(1.64 %)
110 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
111 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
112 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
34,284
(2.16 %)
113 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
83,137
(1.99 %)
114 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
30,971
(2.02 %)
115 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
30,593
(1.99 %)
116 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
28,565
(1.65 %)
117 Chinaman-leatherjacket (Tasmania G7.1 2024)
GCF_046127955.1
46,411
(11.83 %)
14,102
(3.02 %)
52,239
(7.87 %)
n/a 45.59
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
809,090
(6.75 %)
459,997
(7.66 %)
2,973,747
(37.71 %)
124,869
(12.74 %)
118 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1
n/a 15,739
(1.88 %)
46,290
(4.42 %)
n/a 39.31
(100.00 %)
70
(0.00 %)
89
(100.00 %)
663,559
(2.79 %)
371,107
(3.14 %)
7,519,173
(32.84 %)
17,824
(0.70 %)
119 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1
n/a 15,611
(1.87 %)
46,283
(4.42 %)
n/a 39.32
(100.00 %)
72
(0.00 %)
61
(100.00 %)
663,907
(2.82 %)
372,676
(3.23 %)
7,551,541
(33.03 %)
17,757
(0.80 %)
120 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,071
(11.91 %)
16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
44,615
(5.01 %)
121 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,690
(9.64 %)
15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
24,310
(1.76 %)
122 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,018
(6.31 %)
26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
100,309
(2.90 %)
123 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,327
(5.14 %)
27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
87,959
(2.02 %)
124 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,370
(5.73 %)
26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
62,726
(1.40 %)
125 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
14,774
(0.81 %)
126 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
127 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
51,797
(1.25 %)
128 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,598
(6.68 %)
26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
68,538
(1.53 %)
129 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
130 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
131 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,580
(9.24 %)
15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
23,543
(1.15 %)
132 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,925
(11.11 %)
15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
23,489
(1.28 %)
133 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,863
(6.58 %)
27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
65,662
(1.36 %)
134 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
62,337
(3.61 %)
135 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
44,388
(1.60 %)
136 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,197
(7.89 %)
31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
52,638
(1.62 %)
137 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
41,657
(2.72 %)
138 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
78,182
(4.87 %)
139 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1
n/a 17,904
(2.46 %)
68,908
(5.96 %)
n/a 38.98
(99.98 %)
1,147
(0.02 %)
530
(100.00 %)
3,428,827
(55.24 %)
796,220
(8.80 %)
5,775,180
(41.93 %)
77,105
(4.67 %)
140 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1
n/a 15,435
(2.40 %)
54,036
(6.66 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
536
(0.01 %)
576
(100.00 %)
495,544
(2.96 %)
454,601
(9.69 %)
4,614,163
(29.34 %)
29,859
(1.71 %)
141 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1
n/a 15,519
(2.52 %)
53,533
(6.93 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
535
(0.01 %)
784
(99.99 %)
472,383
(2.92 %)
337,781
(6.08 %)
4,705,623
(26.82 %)
29,198
(1.68 %)
142 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
70,253
(6.29 %)
143 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
26,979
(2.08 %)
144 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
145 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
112,654
(3.84 %)
146 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
94,019
(3.82 %)
147 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
181,626
(10.52 %)
148 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
20,502,207
(74.78 %)
568,042
(10.14 %)
149 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
27,693
(1.89 %)
150 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
151 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
29,142
(2.35 %)
152 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
67,226
(8.43 %)
153 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
149,374
(4.78 %)
154 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1
n/a 17,775
(1.43 %)
100,017
(6.38 %)
n/a 44.59
(99.96 %)
2,894
(0.04 %)
4,301
(99.96 %)
5,332,080
(56.26 %)
1,737,704
(18.88 %)
6,064,583
(49.72 %)
141,258
(4.70 %)
155 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1
n/a 14,740
(2.96 %)
58,554
(8.04 %)
n/a 44.56
(99.96 %)
1,180
(0.04 %)
793
(100.00 %)
711,944
(7.44 %)
537,707
(8.17 %)
3,418,045
(29.92 %)
95,750
(8.49 %)
156 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1
n/a 13,849
(3.08 %)
53,198
(8.16 %)
n/a 44.70
(99.96 %)
1,089
(0.04 %)
513
(100.00 %)
649,032
(7.21 %)
483,451
(7.55 %)
3,155,766
(28.97 %)
88,490
(8.53 %)
157 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
10,612
(4.11 %)
158 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
159 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
19,310
(1.01 %)
160 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
17,129
(1.04 %)
161 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
17,974
(1.06 %)
162 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,121
(12.72 %)
16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
29,879
(3.18 %)
163 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
23,311
(2.18 %)
164 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
16,871
(1.57 %)
165 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
166 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
28,299
(3.33 %)
167 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
168 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
169 doctor fish G.rufa (2025)
GCF_049309525.1
56,413
(6.01 %)
18,728
(2.09 %)
57,498
(4.48 %)
n/a 37.04
(99.47 %)
14,924
(0.54 %)
1,000
(100.00 %)
928,901
(3.56 %)
923,200
(13.04 %)
6,338,918
(52.94 %)
64,694
(3.55 %)
170 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
30,055
(1.31 %)
171 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1
45,512
(7.65 %)
16,797
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
726
(0.85 %)
103
(100.00 %)
871,278
(4.83 %)
805,806
(14.65 %)
5,615,217
(36.69 %)
30,083
(1.31 %)
172 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
51,743
(9.31 %)
173 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,366
(12.50 %)
13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
68,121
(17.75 %)
174 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
175 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
34,184
(2.09 %)
176 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
35,597
(4.37 %)
177 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
41,947
(3.71 %)
178 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
179 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1
n/a 16,358
(2.62 %)
62,068
(6.39 %)
n/a 41.74
(99.75 %)
49
(0.25 %)
460
(100.00 %)
701,679
(6.15 %)
756,011
(21.53 %)
2,660,355
(42.28 %)
50,381
(3.85 %)
180 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
91,552
(5.39 %)
181 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
52,191
(2.51 %)
182 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
57,737
(4.15 %)
183 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
60,482
(4.22 %)
184 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
80,927
(2.32 %)
185 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
50,909
(3.45 %)
186 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
58,471
(3.64 %)
187 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
188 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
36,828
(3.13 %)
189 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
37,130
(2.79 %)
190 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
37,129
(2.79 %)
191 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
44,049
(1.94 %)
192 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
40,094
(3.66 %)
193 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,467
(10.51 %)
14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
47,050
(4.45 %)
194 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,470
(13.08 %)
15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
15,975
(0.93 %)
195 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
196 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
197 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
35,552
(1.87 %)
198 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
49,361
(2.78 %)
199 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
45,885
(3.03 %)
200 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1
n/a 15,528
(2.10 %)
55,124
(6.16 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
31
(0.00 %)
23
(100.00 %)
946,588
(24.66 %)
252,409
(5.14 %)
4,403,110
(33.26 %)
35,478
(2.07 %)
201 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
202 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
203 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
28,827
(2.28 %)
204 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
32,390
(2.33 %)
205 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
26,431
(0.91 %)
206 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1
n/a 15,652
(1.85 %)
56,048
(5.08 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
7
(0.00 %)
176
(100.00 %)
640,534
(2.88 %)
384,479
(4.59 %)
6,438,939
(33.27 %)
28,221
(1.10 %)
207 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
208 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
209 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,257
(6.73 %)
29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
70,606
(1.91 %)
210 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
66,585
(2.06 %)
211 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,821
(11.16 %)
18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
26,282
(1.58 %)
212 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,357
(7.09 %)
14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
53,808
(2.65 %)
213 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,835
(5.19 %)
14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
44,972
(1.97 %)
214 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,769
(9.11 %)
15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
15,850
(0.98 %)
215 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
20,794
(2.09 %)
216 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
26,022
(2.30 %)
217 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,104
(12.82 %)
218 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
219 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
47,904
(17.47 %)
220 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
47,523
(15.60 %)
221 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
35,298
(1.94 %)
222 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
37,043
(1.94 %)
223 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
37,217
(2.39 %)
224 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
66,857
(4.99 %)
225 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
90,235
(5.58 %)
226 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
99,559
(5.68 %)
227 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
228 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,583
(18.27 %)
13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
229 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
230 guppy
GCF_000633615.1
48,303
(11.25 %)
14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
35,188
(1.91 %)
231 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
34,408
(1.75 %)
232 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
233 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,598
(6.94 %)
30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
63,217
(1.71 %)
234 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
12,252
(0.38 %)
235 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
236 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
17,931
(1.47 %)
237 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
40,721
(2.36 %)
238 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,570
(6.90 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
239 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
21,768
(1.42 %)
240 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
23,373
(1.76 %)
241 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
41,215
(2.89 %)
242 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,464
(9.36 %)
243 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
244 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
129,990
(12.07 %)
245 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
129,147
(11.75 %)
246 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,790
(8.57 %)
15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
28,979
(1.07 %)
247 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
47,481
(4.63 %)
248 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
249 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
250 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
85,419
(2.52 %)
251 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
126,142
(4.04 %)
252 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,259
(4.53 %)
28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
126,485
(3.95 %)
253 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
127,942
(3.84 %)
254 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,927
(11.76 %)
15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
28,138
(2.09 %)
255 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
88,759
(6.30 %)
256 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
99,668
(6.39 %)
257 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
25,920
(1.67 %)
258 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
28,733
(1.66 %)
259 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
9,678
(1.02 %)
260 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
17,881
(0.94 %)
261 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
70,560
(7.78 %)
262 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
44,712
(2.85 %)
263 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
264 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
157,768
(4.38 %)
265 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
266 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
31,814
(1.79 %)
267 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
33,251
(1.82 %)
268 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
43,864
(3.01 %)
269 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
49,248
(4.19 %)
270 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
50,192
(3.82 %)
271 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
272 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
273 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
55,527
(4.38 %)
274 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
55,747
(4.41 %)
275 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
276 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
55,066
(5.20 %)
277 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
278 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,273
(10.03 %)
14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
18,098
(0.91 %)
279 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
35,281
(1.93 %)
280 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
15,999
(1.17 %)
281 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,029
(12.41 %)
14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
46,312
(5.05 %)
282 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,187
(11.82 %)
14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
39,541
(2.69 %)
283 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
56,507
(2.83 %)
284 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
59,531
(2.83 %)
285 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,376
(10.91 %)
14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
98,423
(9.53 %)
286 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
44,933
(1.77 %)
287 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
48,358
(1.88 %)
288 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
50,533
(2.46 %)
289 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1
n/a 15,067
(2.44 %)
45,263
(5.54 %)
n/a 40.74
(92.95 %)
617,558
(7.14 %)
624,195
(92.86 %)
867,309
(14.82 %)
199,669
(1.16 %)
5,215,762
(25.14 %)
13,920
(0.64 %)
290 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
291 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
292 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
74,954
(3.44 %)
293 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
45,298
(3.39 %)
294 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
295 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
296 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,100
(12.11 %)
14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
33,082
(2.28 %)
297 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1
77,155
(10.70 %)
16,413
(2.24 %)
85,893
(7.33 %)
n/a 43.96
(100.00 %)
249
(0.00 %)
407
(100.00 %)
447,893
(2.43 %)
464,565
(9.46 %)
3,801,201
(29.32 %)
93,225
(5.54 %)
298 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
54,589
(2.39 %)
299 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
81,101
(3.45 %)
300 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
301 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
18,302
(0.85 %)
302 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
303 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,397
(10.87 %)
15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
32,038
(1.81 %)
304 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
59,674
(9.19 %)
305 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
72,584
(9.69 %)
306 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
307 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
308 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,085
(7.42 %)
15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
42,187
(2.72 %)
309 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1
n/a 15,704
(2.16 %)
43,094
(4.57 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
115
(0.01 %)
104
(100.00 %)
1,034,605
(5.50 %)
566,093
(5.52 %)
6,229,176
(38.50 %)
41,022
(2.53 %)
310 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1
n/a 15,762
(2.12 %)
43,732
(4.51 %)
n/a 38.98
(100.00 %)
180
(0.00 %)
278
(100.00 %)
1,071,044
(5.64 %)
581,680
(6.16 %)
6,228,783
(39.01 %)
42,159
(2.70 %)
311 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
55,251
(4.79 %)
312 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
57,881
(4.66 %)
313 northern pike
GCF_004634155.1
66,376
(9.11 %)
16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
44,793
(2.82 %)
314 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
315 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,720
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
316 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
8,436
(0.70 %)
317 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
58,433
(13.25 %)
318 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
58,256
(13.22 %)
319 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
76,846
(4.18 %)
320 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
19,721
(1.34 %)
321 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
19,710
(1.32 %)
322 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
26,702
(1.46 %)
323 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
324 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
325 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,792
(8.54 %)
17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
56,843
(3.18 %)
326 oriental weatherfish (2024)
GCF_027580225.2
72,545
(8.62 %)
17,655
(2.31 %)
50,007
(4.93 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
110
(0.00 %)
61
(100.00 %)
446,769
(2.37 %)
424,953
(7.13 %)
6,268,308
(45.46 %)
53,150
(3.31 %)
327 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1
n/a 14,679
(2.30 %)
51,447
(6.15 %)
n/a 44.09
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
180
(100.00 %)
1,452,983
(14.50 %)
1,649,878
(17.81 %)
4,184,643
(38.57 %)
36,016
(2.07 %)
328 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1
n/a 15,600
(2.30 %)
54,714
(6.21 %)
n/a 43.99
(99.99 %)
1,132
(0.01 %)
184
(100.00 %)
1,505,689
(14.07 %)
1,691,834
(17.30 %)
4,407,291
(38.23 %)
38,205
(2.14 %)
329 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1
60,285
(14.61 %)
15,290
(2.96 %)
42,088
(6.53 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 150
(100.00 %)
534,470
(3.96 %)
267,099
(3.88 %)
4,094,899
(24.75 %)
14,784
(1.60 %)
330 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
18,455
(0.96 %)
331 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,430
(13.67 %)
13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
87,761
(8.68 %)
332 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
31,508
(2.30 %)
333 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,697
(12.50 %)
14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
31,782
(2.27 %)
334 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
106,026
(5.14 %)
335 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
29,684
(1.18 %)
336 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
64,543
(3.14 %)
337 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
81,193
(3.23 %)
338 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
16,570
(1.12 %)
339 pejerrey (hap1 2023 genbank)
GCA_027942865.1
n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
340 pejerrey (hap1 2023 refseq)
GCF_027942865.1
47,443
(8.28 %)
15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
440,063
(2.87 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,808
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
341 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
50,353
(2.98 %)
342 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
49,469
(4.32 %)
343 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
41,023
(4.40 %)
344 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
78,669
(4.37 %)
345 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
41,125
(5.45 %)
346 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
41,114
(5.50 %)
347 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
39,666
(1.93 %)
348 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
349 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
350 pink cusk-eel (Tasmania CSIRO-AG114 2024)
GCF_046128005.1
40,370
(14.18 %)
14,305
(3.83 %)
42,250
(9.00 %)
n/a 44.35
(100.00 %)
n/a 598
(100.00 %)
544,423
(6.21 %)
349,202
(8.94 %)
2,573,015
(26.48 %)
39,781
(3.80 %)
351 pink salmon
GCF_021184085.1
91,140
(4.89 %)
27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
97,805
(3.04 %)
352 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
73,879
(3.55 %)
353 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
78,151
(7.95 %)
354 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
80,883
(8.43 %)
355 pond loach (2024)
GCF_030506205.2
63,171
(8.66 %)
17,091
(2.42 %)
45,877
(5.02 %)
n/a 38.27
(99.98 %)
1,120
(0.02 %)
220
(100.00 %)
409,390
(2.50 %)
390,110
(8.52 %)
5,401,936
(44.65 %)
52,115
(4.00 %)
356 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
47,942
(3.56 %)
357 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
358 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
359 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
360 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
361 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,271
(6.51 %)
27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
73,586
(2.16 %)
362 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,286
(6.41 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
56,604
(1.05 %)
363 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1
n/a 15,661
(1.94 %)
54,906
(5.30 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
21
(0.00 %)
386
(100.00 %)
591,994
(2.64 %)
396,424
(6.16 %)
6,144,028
(31.24 %)
24,792
(1.05 %)
364 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1
n/a 15,830
(2.03 %)
54,183
(5.34 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
33
(0.00 %)
199
(100.00 %)
2,922,062
(42.12 %)
374,226
(5.08 %)
6,124,255
(30.17 %)
24,493
(0.98 %)
365 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
72,004
(5.94 %)
27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
109,185
(4.70 %)
366 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
20,149
(1.25 %)
367 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
7,525
(1.31 %)
368 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
34,329
(1.24 %)
369 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
370 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1
37,802
(8.56 %)
16,430
(2.60 %)
56,127
(6.62 %)
n/a 42.14
(100.00 %)
n/a 6,232
(100.00 %)
1,061,195
(9.52 %)
653,833
(5.90 %)
4,595,588
(30.15 %)
38,922
(2.20 %)
371 red seabream (2024)
GCF_040436345.1
36,326
(8.73 %)
15,416
(2.51 %)
50,764
(6.70 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
278
(0.00 %)
25
(100.00 %)
474,006
(3.07 %)
322,892
(6.05 %)
4,847,143
(26.99 %)
23,370
(1.27 %)
372 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,478
(2.01 %)
13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
89,023
(1.13 %)
373 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
63,365
(1.11 %)
374 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
43,014
(4.07 %)
375 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
376 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
377 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
60,229
(3.53 %)
378 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
65,328
(3.68 %)
379 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
36,810
(2.68 %)
380 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
36,987
(3.02 %)
381 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,514
(8.81 %)
17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
33,741
(1.62 %)
382 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
46,071
(2.57 %)
383 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
19,771
(1.39 %)
384 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
19,851
(1.40 %)
385 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
66,952
(4.46 %)
386 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
72,686
(4.52 %)
387 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
22,854
(1.61 %)
388 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
34,138
(1.62 %)
389 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1
n/a 15,661
(2.59 %)
68,929
(8.14 %)
n/a 45.02
(99.96 %)
1,365
(0.04 %)
2,987
(100.00 %)
2,234,544
(43.47 %)
1,192,255
(16.84 %)
3,383,827
(41.37 %)
108,808
(9.86 %)
390 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1
n/a 15,427
(2.54 %)
67,522
(7.97 %)
n/a 44.96
(99.96 %)
1,366
(0.04 %)
1,559
(100.00 %)
2,195,227
(44.71 %)
1,219,658
(17.45 %)
3,319,218
(42.93 %)
108,314
(9.71 %)
391 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,023
(20.10 %)
13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
48,338
(9.79 %)
392 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
68,874
(3.56 %)
393 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
68,873
(3.56 %)
394 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,267
(7.00 %)
13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
96,908
(3.65 %)
395 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
61,012
(13.03 %)
396 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1
n/a 14,237
(4.44 %)
46,701
(10.13 %)
n/a 44.75
(99.99 %)
276
(0.01 %)
52
(100.00 %)
413,494
(14.42 %)
189,429
(8.99 %)
1,996,715
(23.13 %)
60,252
(12.60 %)
397 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
26,946
(1.79 %)
398 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
64,290
(4.16 %)
399 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
65,744
(4.06 %)
400 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
21,711
(0.94 %)
401 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
21,587
(0.91 %)
402 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,892
(7.02 %)
14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
18,269
(0.66 %)
403 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
34,271
(1.66 %)
404 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
72,474
(13.55 %)
405 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,291
(19.85 %)
14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
70,331
(13.13 %)
406 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
74,259
(13.49 %)
407 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,179
(9.80 %)
29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
60,236
(2.18 %)
408 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1
n/a 16,906
(1.39 %)
115,931
(7.77 %)
n/a 44.10
(99.96 %)
3,365
(0.04 %)
5,504
(100.00 %)
4,606,608
(53.63 %)
1,428,326
(25.54 %)
4,395,832
(51.22 %)
166,807
(7.52 %)
409 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1
n/a 17,409
(1.14 %)
146,413
(8.24 %)
n/a 44.20
(99.96 %)
3,473
(0.04 %)
8,068
(99.96 %)
2,051,529
(14.72 %)
1,808,246
(28.36 %)
4,967,915
(54.93 %)
208,486
(7.83 %)
410 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
145,115
(7.59 %)
411 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
412 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,932
(9.40 %)
15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
23,875
(1.36 %)
413 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
122,765
(3.07 %)
414 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,641
(6.10 %)
24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
62,850
(1.45 %)
415 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
77,648
(1.61 %)
416 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2
42,862
(7.09 %)
14,776
(1.80 %)
68,955
(6.18 %)
n/a 42.07
(99.90 %)
2,603
(0.11 %)
1,563
(100.00 %)
512,600
(3.45 %)
473,958
(7.19 %)
3,590,436
(45.74 %)
88,970
(4.31 %)
417 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
14,473
(0.87 %)
418 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
419 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,380
(11.15 %)
14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
34,667
(2.13 %)
420 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,330
(6.97 %)
30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
64,238
(1.79 %)
421 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
37,214
(1.53 %)
422 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
36,602
(1.46 %)
423 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,656
(10.03 %)
15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
36,529
(1.65 %)
424 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
25,079
(0.95 %)
425 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
51,580
(13.42 %)
426 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1
n/a 15,425
(3.14 %)
43,414
(6.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
n/a 109
(100.00 %)
447,804
(3.49 %)
241,876
(3.25 %)
3,757,088
(26.25 %)
23,346
(2.49 %)
427 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
30,399
(1.90 %)
428 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
31,383
(1.89 %)
429 spotted wolffish (MPS153535 2025)
GCF_050575085.1
49,857
(11.48 %)
15,196
(3.01 %)
47,823
(7.37 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
5
(0.00 %)
328
(100.00 %)
430,253
(4.48 %)
288,471
(10.10 %)
3,247,212
(28.89 %)
36,945
(3.24 %)
430 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,167
(7.62 %)
25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
431 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
65,007
(2.74 %)
432 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
27,787
(3.58 %)
433 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
30,130
(3.71 %)
434 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
74,723
(4.45 %)
435 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
140,374
(3.90 %)
436 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
36,818
(4.17 %)
437 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
17,357
(1.25 %)
438 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,859
(11.99 %)
16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
439 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
17,264
(1.20 %)
440 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
15,076
(0.95 %)
441 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
13,730
(0.95 %)
442 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
46,339
(3.96 %)
443 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
7,065
(0.42 %)
444 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
27,129
(2.10 %)
445 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
25,784
(0.92 %)
446 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
51,441
(3.53 %)
447 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
38,929
(2.20 %)
448 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
80,336
(11.49 %)
449 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
84,009
(12.41 %)
450 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
75,434
(12.33 %)
451 threespot wrasse (MK-OKI-2021-1 2023)
GCF_033239565.1
40,418
(8.77 %)
15,124
(2.26 %)
46,507
(5.67 %)
n/a 40.89
(99.99 %)
117
(0.01 %)
228
(100.00 %)
539,144
(3.57 %)
361,249
(6.62 %)
5,059,734
(33.65 %)
22,689
(1.57 %)
452 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
96,414
(8.01 %)
453 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1
43,108
(6.07 %)
14,279
(1.78 %)
65,726
(6.14 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
794
(0.01 %)
821
(100.00 %)
411,442
(6.11 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,301
(49.66 %)
101,682
(8.04 %)
454 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,037
(13.33 %)
13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
61,010
(7.71 %)
455 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
17,094
(1.42 %)
456 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,936
(9.72 %)
457 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,489
(18.32 %)
14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
458 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
459 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
26,440
(2.18 %)
460 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
461 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
462 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1
n/a 14,730
(2.84 %)
50,956
(7.07 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
179
(0.00 %)
161
(100.00 %)
548,208
(5.35 %)
356,364
(7.30 %)
3,448,877
(26.01 %)
26,685
(1.80 %)
463 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1
n/a 14,680
(2.80 %)
50,753
(6.99 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
187
(0.00 %)
248
(100.00 %)
559,722
(5.35 %)
382,817
(8.57 %)
3,423,208
(26.76 %)
26,739
(1.77 %)
464 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
66,132
(6.90 %)
465 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,298
(14.93 %)
14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
65,633
(7.08 %)
466 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,386
(7.85 %)
14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
61,105
(2.15 %)
467 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1
56,976
(5.74 %)
14,604
(1.25 %)
72,207
(4.35 %)
n/a 44.51
(100.00 %)
369
(0.00 %)
304
(100.00 %)
2,858,575
(46.12 %)
660,603
(29.65 %)
4,283,242
(61.88 %)
118,966
(11.71 %)
468 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,501
(6.75 %)
14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
110,696
(10.50 %)
469 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
54,666
(3.50 %)
470 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
95,149
(8.09 %)
471 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
35,104
(4.08 %)
472 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
36,840
(4.18 %)
473 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,016
(12.31 %)
14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
30,624
(1.94 %)
474 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
84,874
(6.05 %)
475 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1
85,126
(5.62 %)
27,822
(1.58 %)
113,187
(4.31 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
1,381
(0.01 %)
4,647
(99.99 %)
1,200,605
(4.82 %)
2,237,797
(24.56 %)
10,339,252
(54.27 %)
70,550
(1.65 %)
476 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
41,820
(1.75 %)
477 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,638
(14.00 %)
14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
30,581
(2.04 %)
478 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
69,817
(7.20 %)
479 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
70,183
(7.15 %)
480 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
70,181
(7.15 %)
481 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3
47,694
(3.96 %)
14,177
(1.01 %)
59,392
(2.97 %)
n/a 39.43
(100.00 %)
40
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,246,897
(5.46 %)
1,548,619
(19.15 %)
6,596,258
(69.80 %)
148,788
(5.04 %)
482 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,781
(8.86 %)
18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
45,067
(2.52 %)
483 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,938
(10.50 %)
17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
32,824
(2.00 %)
484 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1
n/a 15,641
(1.95 %)
52,141
(5.13 %)
n/a 40.61
(100.00 %)
17
(0.00 %)
250
(100.00 %)
607,010
(2.66 %)
288,837
(3.91 %)
6,785,488
(31.37 %)
39,560
(1.65 %)
485 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1
n/a 15,666
(1.88 %)
53,049
(5.01 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
29
(0.00 %)
324
(100.00 %)
620,903
(2.64 %)
305,809
(5.18 %)
6,707,330
(33.41 %)
45,863
(1.88 %)
486 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
24,342
(1.72 %)
487 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
24,238
(1.72 %)
488 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,121
(7.78 %)
15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
35,251
(1.63 %)
489 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
2,289
(2.07 %)
490 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
491 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
13,909
(0.83 %)
492 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
14,420
(0.88 %)
493 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,948
(9.95 %)
15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
16,819
(0.86 %)
494 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,025
(8.37 %)
15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
36,689
(2.00 %)
495 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
14,563
(1.98 %)
496 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
42,482
(2.03 %)
497 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1
122,338
(8.09 %)
18,033
(2.41 %)
44,966
(3.23 %)
n/a 37.14
(100.00 %)
13,351
(0.00 %)
26
(100.00 %)
3,807,410
(60.58 %)
965,679
(12.22 %)
8,736,108
(52.67 %)
45,856
(2.03 %)
498 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
44,554
(2.12 %)
499 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
44,812
(2.09 %)
500 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
44,936
(2.02 %)
501 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
72,965
(6.43 %)
22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
53,471
(2.06 %)
502 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
503 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
504 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
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(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 504

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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 692 assemblies assembly stats track stats
Birds 442 assemblies assembly stats track stats
Fishes 504 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 324 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1365 assemblies assembly stats track stats
Plants 345 assemblies assembly stats track stats
Fungi 948 assemblies assembly stats track stats
Viruses 710 assemblies assembly stats track stats
Archaea 757 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21350 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1965 assemblies assembly stats track stats