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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.
| count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | allis shad GCF_017589495.1 |
48,507 (8.47 %) |
15,371 (2.28 %) |
58,686 (5.84 %) |
n/a | 42.99 (99.91 %) |
1,541 (0.09 %) |
1,095 (100.00 %) |
1,190,406 (9.30 %) |
1,205,679 (11.28 %) |
3,960,328 (38.81 %) |
36,494 (1.83 %) |
| 2 | Amazon molly GCF_000485575.1 |
56,958 (11.69 %) |
15,130 (2.64 %) |
48,742 (6.38 %) |
31,637 (9.56 %) |
39.16 (95.38 %) |
36,429 (4.64 %) |
31,058 (95.36 %) |
414,078 (2.35 %) |
188,557 (1.44 %) |
5,139,633 (26.01 %) |
35,229 (1.82 %) |
| 3 | American shad GCF_018492685.1 |
70,400 (9.39 %) |
16,145 (2.29 %) |
60,087 (6.26 %) |
n/a | 43.18 (99.45 %) |
1,639 (0.55 %) |
74 (100.00 %) |
1,297,174 (9.39 %) |
1,245,221 (12.59 %) |
3,857,267 (39.43 %) |
42,699 (2.23 %) |
| 4 | annual killifish GCF_001266775.1 |
38,517 (8.87 %) |
14,041 (2.45 %) |
46,518 (5.89 %) |
n/a | 39.29 (80.23 %) |
1,025,519 (19.94 %) |
168,368 (80.17 %) |
396,703 (2.91 %) |
296,826 (3.18 %) |
5,039,517 (28.69 %) |
26,364 (1.18 %) |
| 5 | Arctic char GCF_002910315.2 |
67,209 (5.00 %) |
23,995 (1.55 %) |
99,789 (3.91 %) |
n/a | 43.16 (93.25 %) |
1,718,015 (6.84 %) |
16,700 (99.99 %) |
1,209,252 (5.25 %) |
1,666,148 (10.50 %) |
10,597,529 (44.77 %) |
76,282 (1.94 %) |
| 6 | Arkansas darter GCF_013103735.1 |
51,282 (9.79 %) |
14,588 (2.90 %) |
42,306 (6.27 %) |
n/a | 40.52 (99.50 %) |
35,052 (0.52 %) |
4,664 (100.00 %) |
418,294 (3.29 %) |
331,380 (3.74 %) |
4,153,309 (26.60 %) |
15,489 (0.95 %) |
| 7 | Asian bonytongue (2019 VGP) GCF_900964775.1 |
50,328 (9.13 %) |
16,528 (2.72 %) |
76,597 (7.29 %) |
72,696 (8.52 %) |
44.16 (99.99 %) |
145 (0.01 %) |
72 (100.00 %) |
505,816 (2.98 %) |
216,136 (1.69 %) |
4,323,242 (26.50 %) |
88,514 (10.63 %) |
| 8 | Asian bonytongue (alt pseudohaplotype VGP) GCA_900964985.2 |
n/a | 16,056 (2.72 %) |
38,888 (6.61 %) |
n/a | 44.15 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,006 (100.00 %) |
482,348 (3.03 %) |
207,018 (1.68 %) |
4,139,370 (26.26 %) |
85,543 (10.71 %) |
| 9 | Atlantic cod (2019 VGP) GCF_902167405.1 |
51,655 (11.92 %) |
14,072 (2.62 %) |
70,314 (9.10 %) |
68,853 (9.51 %) |
45.64 (96.48 %) |
1,216 (3.52 %) |
227 (100.00 %) |
804,201 (10.41 %) |
855,327 (13.06 %) |
2,851,161 (33.38 %) |
97,133 (7.82 %) |
| 10 | Atlantic cod (alt pseudohaplotype VGP) GCA_902167395.1 |
n/a | 13,366 (2.68 %) |
37,289 (8.62 %) |
n/a | 45.55 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
3,592 (100.00 %) |
696,724 (10.13 %) |
749,876 (13.00 %) |
2,554,769 (33.77 %) |
87,167 (8.03 %) |
| 11 | Atlantic halibut (2019 refseq VGP) GCF_009819705.1 |
52,130 (11.46 %) |
14,961 (3.19 %) |
45,365 (7.48 %) |
n/a | 42.21 (99.43 %) |
290 (0.57 %) |
57 (100.00 %) |
428,321 (4.16 %) |
256,153 (3.73 %) |
3,725,981 (24.13 %) |
31,325 (2.25 %) |
| 12 | Atlantic halibut (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009819745.1 |
n/a | 16,556 (3.00 %) |
34,725 (7.12 %) |
n/a | 42.29 (100.00 %) |
62 (0.00 %) |
4,053 (100.00 %) |
494,005 (4.23 %) |
299,066 (3.87 %) |
4,272,649 (24.46 %) |
36,868 (2.33 %) |
| 13 | Atlantic herring (v2) GCF_900700415.2 |
50,946 (10.35 %) |
16,394 (2.60 %) |
61,637 (7.20 %) |
n/a | 44.16 (99.89 %) |
1,990 (0.11 %) |
3,687 (99.89 %) |
1,269,688 (11.71 %) |
1,318,661 (13.43 %) |
3,732,801 (32.49 %) |
35,959 (1.97 %) |
| 14 | Atlantic salmon (refseq 2021) GCF_905237065.1 |
112,906 (5.61 %) |
28,077 (1.40 %) |
115,207 (3.75 %) |
n/a | 43.42 (100.00 %) |
211 (0.00 %) |
4,222 (100.00 %) |
1,300,611 (4.84 %) |
2,247,891 (25.01 %) |
10,731,814 (59.31 %) |
77,089 (1.86 %) |
| 15 | Atlantic salmon (Sally 2015) GCF_000233375.1 |
109,794 (5.45 %) |
27,007 (1.35 %) |
327,434 (9.03 %) |
n/a | 43.10 (88.27 %) |
138,207 (11.73 %) |
241,570 (99.97 %) |
4,390,220 (48.67 %) |
2,496,837 (19.18 %) |
10,390,780 (51.80 %) |
79,791 (1.60 %) |
| 16 | Atlantic turbot (AOZZmale01 2020) GCF_013347765.1 |
60,214 (14.44 %) |
14,860 (3.40 %) |
50,921 (8.07 %) |
n/a | 43.38 (100.00 %) |
51 (0.00 %) |
127 (100.00 %) |
449,865 (5.00 %) |
299,255 (7.03 %) |
3,274,219 (25.77 %) |
67,338 (7.00 %) |
| 17 | ballan wrasse GCF_900080235.1 |
42,362 (9.30 %) |
16,142 (2.44 %) |
53,087 (5.90 %) |
40,572 (8.04 %) |
40.89 (99.98 %) |
257 (0.02 %) |
13,466 (100.00 %) |
507,153 (3.90 %) |
321,407 (5.60 %) |
4,329,412 (30.36 %) |
21,221 (1.07 %) |
| 18 | banded archerfish GCF_017976425.1 |
42,399 (11.11 %) |
15,310 (3.17 %) |
41,147 (7.01 %) |
n/a | 41.11 (99.82 %) |
98 (0.18 %) |
96 (100.00 %) |
463,524 (3.35 %) |
271,913 (9.55 %) |
3,355,326 (28.08 %) |
15,089 (0.96 %) |
| 19 | barramundi perch GCF_001640805.1 |
50,205 (13.10 %) |
16,168 (3.05 %) |
44,567 (6.62 %) |
59,868 (9.06 %) |
40.75 (100.00 %) |
110 (0.00 %) |
3,808 (100.00 %) |
466,974 (3.10 %) |
237,955 (4.36 %) |
4,027,027 (23.91 %) |
16,276 (1.04 %) |
| 20 | bicolor damselfish GCF_000690725.1 |
32,951 (8.67 %) |
15,200 (2.55 %) |
50,756 (6.03 %) |
31,970 (7.55 %) |
41.66 (93.68 %) |
44,409 (6.34 %) |
42,059 (93.66 %) |
454,833 (3.02 %) |
180,113 (1.20 %) |
5,016,154 (23.41 %) |
46,423 (2.30 %) |
| 21 | black rockcod GCF_000735185.1 |
35,189 (8.55 %) |
12,614 (2.15 %) |
56,067 (6.01 %) |
n/a | 40.62 (97.93 %) |
59,164 (2.09 %) |
72,571 (97.92 %) |
317,142 (3.01 %) |
238,334 (3.18 %) |
3,425,479 (29.48 %) |
31,009 (2.11 %) |
| 22 | blue tilapia (BGI-SZ) GCF_005870065.1 |
36,881 (7.40 %) |
15,418 (2.38 %) |
50,011 (5.76 %) |
60,785 (6.30 %) |
40.42 (89.87 %) |
53,539 (10.15 %) |
12,952 (100.00 %) |
897,490 (16.39 %) |
195,137 (1.62 %) |
5,293,484 (23.10 %) |
21,237 (1.00 %) |
| 23 | blue tilapia (Guangdong) GCF_013358895.1 |
57,860 (9.04 %) |
15,494 (1.98 %) |
57,878 (5.63 %) |
n/a | 40.66 (99.97 %) |
723 (0.03 %) |
304 (100.00 %) |
1,055,724 (20.14 %) |
324,841 (3.27 %) |
5,000,753 (32.08 %) |
32,357 (1.59 %) |
| 24 | blunt-snouted clingfish (2019 refseq VGP) GCF_900634775.1 |
47,312 (7.12 %) |
14,502 (1.97 %) |
51,211 (5.47 %) |
60,993 (6.13 %) |
38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
441 (100.00 %) |
739,980 (4.26 %) |
471,620 (4.92 %) |
5,974,002 (42.88 %) |
29,050 (1.48 %) |
| 25 | blunt-snouted clingfish (alt pseudohaplotype VGP) GCA_900650505.1 |
n/a | 12,498 (1.92 %) |
29,443 (5.22 %) |
n/a | 38.20 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
7,675 (100.00 %) |
608,171 (4.23 %) |
390,755 (4.71 %) |
4,977,071 (42.41 %) |
23,532 (1.46 %) |
| 26 | Boeseman's rainbowfish GCF_017639745.1 |
51,238 (8.77 %) |
15,174 (2.24 %) |
51,552 (6.21 %) |
n/a | 39.65 (99.63 %) |
440 (0.37 %) |
93 (100.00 %) |
542,278 (3.15 %) |
303,669 (4.77 %) |
5,189,645 (29.11 %) |
18,525 (1.10 %) |
| 27 | bony fishes GCF_009829125.1 |
29,517 (6.48 %) |
14,243 (2.37 %) |
44,144 (5.80 %) |
n/a | 40.22 (99.05 %) |
700 (0.95 %) |
124 (100.00 %) |
423,274 (4.48 %) |
551,472 (7.22 %) |
4,887,142 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
| 28 | Burton's mouthbrooder (Broad 2011) GCF_000239415.1 |
47,805 (10.97 %) |
14,986 (2.72 %) |
43,922 (5.97 %) |
36,423 (9.60 %) |
40.51 (84.10 %) |
61,073 (15.93 %) |
69,067 (84.07 %) |
736,179 (15.19 %) |
125,534 (0.72 %) |
4,461,288 (20.25 %) |
17,722 (0.91 %) |
| 29 | Burton's mouthbrooder (NCSU 2021) GCF_018398535.1 |
52,584 (12.38 %) |
15,229 (2.54 %) |
47,264 (5.92 %) |
n/a | 40.68 (89.05 %) |
32,418 (10.97 %) |
7,421 (100.00 %) |
812,382 (17.52 %) |
158,486 (1.12 %) |
4,571,794 (23.61 %) |
22,763 (1.21 %) |
| 30 | butterfish GCF_020382885.2 |
52,828 (14.10 %) |
15,261 (3.43 %) |
40,580 (7.38 %) |
n/a | 41.49 (99.70 %) |
77 (0.30 %) |
48 (100.00 %) |
413,775 (3.11 %) |
160,299 (1.55 %) |
3,420,994 (21.24 %) |
15,574 (1.13 %) |
| 31 | channel catfish (USDA103 v2 2019) GCF_001660625.2 |
57,087 (10.27 %) |
16,253 (2.68 %) |
44,936 (5.15 %) |
n/a | 39.70 (98.57 %) |
25,285 (1.44 %) |
34,545 (98.61 %) |
900,327 (5.55 %) |
614,695 (4.28 %) |
5,348,266 (33.81 %) |
32,840 (1.87 %) |
| 32 | channel bull blenny (2019 refseq VGP) GCF_900634415.1 |
40,788 (11.04 %) |
14,477 (3.02 %) |
42,362 (6.73 %) |
60,811 (10.44 %) |
40.96 (99.58 %) |
445 (0.42 %) |
322 (100.00 %) |
427,781 (5.47 %) |
320,518 (6.91 %) |
3,394,846 (28.67 %) |
20,453 (1.39 %) |
| 33 | channel bull blenny (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900634435.1 |
n/a | 15,971 (2.79 %) |
36,711 (6.53 %) |
n/a | 40.96 (100.00 %) |
10 (0.00 %) |
11,565 (100.00 %) |
451,653 (4.76 %) |
321,158 (5.51 %) |
3,800,099 (26.83 %) |
20,338 (1.21 %) |
| 34 | chichlid (S. diagramma) GCF_900408965.1 |
61,496 (12.33 %) |
15,296 (2.30 %) |
50,818 (6.10 %) |
n/a | 40.92 (100.00 %) |
942 (0.00 %) |
823 (100.00 %) |
920,881 (19.96 %) |
193,629 (1.36 %) |
4,724,179 (28.98 %) |
28,565 (1.65 %) |
| 35 | Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020) GCF_014805685.1 |
49,677 (9.64 %) |
15,266 (2.70 %) |
40,151 (5.21 %) |
n/a | 38.75 (99.82 %) |
597 (0.18 %) |
286 (100.00 %) |
772,209 (6.45 %) |
630,039 (7.45 %) |
4,729,261 (37.48 %) |
24,310 (1.76 %) |
| 36 | Chinook salmon (v1 2018 female) GCF_002872995.1 |
81,340 (5.14 %) |
27,479 (1.53 %) |
119,358 (4.10 %) |
113,653 (4.61 %) |
43.55 (97.26 %) |
272,151 (2.76 %) |
15,944 (99.99 %) |
1,490,923 (5.86 %) |
2,524,408 (13.75 %) |
12,127,831 (47.56 %) |
87,959 (2.02 %) |
| 37 | Chinook salmon (v2 2021 male) GCF_018296145.1 |
92,383 (5.73 %) |
26,372 (1.57 %) |
107,059 (4.12 %) |
n/a | 43.55 (99.99 %) |
2,334 (0.01 %) |
9,978 (99.99 %) |
1,483,168 (7.79 %) |
2,306,695 (23.48 %) |
10,038,888 (54.54 %) |
62,726 (1.40 %) |
| 38 | chum salmon GCF_012931545.1 |
76,338 (6.27 %) |
23,186 (1.70 %) |
90,881 (4.14 %) |
n/a | 43.06 (95.36 %) |
242,238 (4.66 %) |
28,109 (99.98 %) |
1,143,292 (6.07 %) |
1,487,818 (12.14 %) |
8,992,314 (46.24 %) |
51,797 (1.25 %) |
| 39 | climbing perch (v1.2 2018 refseq VGP) GCF_900324465.2 |
42,759 (13.53 %) |
15,243 (3.53 %) |
22,714 (7.45 %) |
64,006 (10.45 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
51 (100.00 %) |
325,346 (2.66 %) |
130,249 (1.89 %) |
3,325,009 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
| 40 | climbing perch (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900650485.1 |
n/a | 14,954 (3.50 %) |
24,316 (7.31 %) |
n/a | 40.40 (99.61 %) |
36 (0.39 %) |
2,641 (100.00 %) |
307,990 (2.63 %) |
121,935 (1.79 %) |
3,190,928 (20.98 %) |
10,131 (0.86 %) |
| 41 | clown anemonefish GCF_002776465.1 |
41,819 (7.91 %) |
15,688 (2.23 %) |
50,500 (5.47 %) |
33,631 (6.82 %) |
39.47 (99.94 %) |
1,406 (0.06 %) |
6,405 (100.00 %) |
433,963 (2.90 %) |
381,394 (4.84 %) |
4,952,343 (31.95 %) |
23,542 (1.13 %) |
| 42 | coho salmon GCF_002021735.2 |
100,863 (6.58 %) |
27,090 (1.56 %) |
111,323 (4.23 %) |
126,176 (5.26 %) |
43.55 (99.98 %) |
5,631 (0.02 %) |
4,482 (100.00 %) |
1,566,881 (6.79 %) |
2,135,217 (25.52 %) |
10,152,659 (54.74 %) |
65,662 (1.36 %) |
| 43 | common carp SPL01 (2021) GCF_018340385.1 |
91,210 (7.89 %) |
31,041 (2.89 %) |
89,244 (5.01 %) |
n/a | 37.11 (99.53 %) |
26,351 (0.48 %) |
6,701 (100.00 %) |
1,634,612 (6.00 %) |
919,239 (3.97 %) |
10,192,037 (38.56 %) |
52,638 (1.62 %) |
| 44 | copperband butterflyfish GCF_017976325.1 |
35,291 (10.46 %) |
15,210 (3.03 %) |
44,916 (6.99 %) |
n/a | 42.57 (100.00 %) |
60 (0.00 %) |
29 (100.00 %) |
406,118 (2.95 %) |
199,450 (2.10 %) |
3,861,745 (21.57 %) |
29,106 (1.85 %) |
| 45 | dark-edged splitfin GCF_021462225.1 |
56,220 (7.59 %) |
15,422 (1.71 %) |
50,084 (4.18 %) |
n/a | 40.18 (99.46 %) |
409 (0.54 %) |
72 (100.00 %) |
369,606 (1.86 %) |
176,954 (1.87 %) |
6,142,638 (38.35 %) |
32,973 (1.28 %) |
| 46 | delta smelt GCF_021917145.1 |
41,807 (14.97 %) |
14,549 (4.09 %) |
44,849 (9.74 %) |
n/a | 44.99 (99.92 %) |
1,474 (0.08 %) |
376 (100.00 %) |
387,882 (5.57 %) |
383,522 (9.22 %) |
1,814,696 (32.48 %) |
28,299 (3.33 %) |
| 47 | denticle herring (2019 VGP) GCF_900700375.1 |
59,645 (12.74 %) |
16,567 (3.77 %) |
58,823 (8.66 %) |
72,751 (10.66 %) |
43.69 (99.18 %) |
464 (0.82 %) |
460 (100.00 %) |
408,046 (3.23 %) |
224,282 (4.61 %) |
2,948,671 (28.79 %) |
64,661 (9.49 %) |
| 48 | denticle herring (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900700345.2 |
n/a | 14,126 (3.94 %) |
32,057 (8.36 %) |
n/a | 43.51 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
1,972 (100.00 %) |
312,657 (2.77 %) |
160,575 (2.83 %) |
2,525,528 (27.70 %) |
50,830 (8.72 %) |
| 49 | eastern happy GCF_900246225.1 |
57,628 (9.59 %) |
15,359 (2.22 %) |
52,466 (6.26 %) |
42,580 (8.31 %) |
41.07 (99.87 %) |
490 (0.13 %) |
364 (100.00 %) |
960,962 (21.85 %) |
217,915 (1.89 %) |
4,547,443 (30.78 %) |
33,005 (1.88 %) |
| 50 | electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin) GCF_003665695.1 |
40,618 (11.48 %) |
15,847 (3.84 %) |
47,961 (7.39 %) |
51,559 (8.50 %) |
42.56 (96.95 %) |
119,361 (3.09 %) |
8,786 (100.00 %) |
524,467 (5.37 %) |
516,718 (6.65 %) |
3,020,801 (21.49 %) |
41,947 (3.71 %) |
| 51 | electric eel (2020 VGP) GCF_013358815.1 |
48,958 (12.10 %) |
15,950 (3.66 %) |
48,976 (7.25 %) |
n/a | 42.49 (98.20 %) |
227 (1.80 %) |
89 (100.00 %) |
567,625 (7.41 %) |
564,286 (10.86 %) |
2,935,360 (24.79 %) |
44,501 (3.93 %) |
| 52 | emerald rockcod GCF_902827165.1 |
44,179 (8.48 %) |
15,275 (2.20 %) |
57,830 (6.43 %) |
n/a | 40.94 (99.99 %) |
932 (0.01 %) |
864 (100.00 %) |
460,185 (3.64 %) |
399,729 (6.87 %) |
3,533,188 (40.09 %) |
52,191 (2.51 %) |
| 53 | European perch GCF_010015445.1 |
55,605 (8.20 %) |
15,430 (2.07 %) |
55,499 (5.43 %) |
n/a | 40.90 (99.97 %) |
801 (0.03 %) |
303 (100.00 %) |
684,094 (5.16 %) |
634,788 (7.48 %) |
5,182,241 (37.07 %) |
44,049 (1.94 %) |
| 54 | fathead minnow GCF_016745375.1 |
57,312 (8.34 %) |
18,039 (3.02 %) |
52,431 (6.01 %) |
n/a | 38.45 (86.78 %) |
5,594 (13.23 %) |
911 (100.00 %) |
657,027 (4.09 %) |
444,571 (6.23 %) |
4,902,960 (35.69 %) |
49,361 (2.78 %) |
| 55 | flathead mullet GCF_022458985.1 |
48,689 (12.71 %) |
14,908 (3.00 %) |
45,084 (6.96 %) |
n/a | 41.90 (99.97 %) |
445 (0.04 %) |
24 (100.00 %) |
469,841 (3.23 %) |
207,738 (2.31 %) |
3,955,233 (24.74 %) |
45,885 (3.03 %) |
| 56 | flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq VGP) GCF_007364275.1 |
43,842 (8.12 %) |
15,440 (2.15 %) |
51,452 (5.98 %) |
n/a | 41.23 (98.19 %) |
744 (1.81 %) |
188 (100.00 %) |
1,049,840 (17.13 %) |
287,035 (2.21 %) |
5,305,890 (30.67 %) |
24,130 (1.26 %) |
| 57 | flier cichlid (alt pseudohaplotype MPI-CPG 2019 VGP) GCA_007364235.1 |
n/a | 17,508 (2.06 %) |
36,756 (5.66 %) |
n/a | 41.17 (99.98 %) |
13 (0.02 %) |
9,305 (99.98 %) |
1,140,983 (16.60 %) |
316,083 (2.17 %) |
6,036,560 (30.48 %) |
26,445 (1.22 %) |
| 58 | giant grouper GCF_005281545.1 |
45,328 (7.65 %) |
15,661 (1.91 %) |
53,910 (4.91 %) |
n/a | 41.26 (96.40 %) |
23,415 (3.61 %) |
4,201 (100.00 %) |
604,763 (2.71 %) |
357,944 (2.52 %) |
6,501,327 (30.28 %) |
26,431 (0.91 %) |
| 59 | gilthead seabream (2019 VGP) GCF_900880675.1 |
59,040 (10.97 %) |
15,415 (2.36 %) |
56,395 (6.58 %) |
73,317 (7.97 %) |
41.94 (99.96 %) |
1,050 (0.04 %) |
176 (100.00 %) |
533,781 (3.04 %) |
305,809 (3.03 %) |
4,701,694 (25.69 %) |
47,327 (2.41 %) |
| 60 | gilthead seabream (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900880695.1 |
n/a | 13,105 (2.37 %) |
31,089 (6.36 %) |
n/a | 41.97 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
7,241 (100.00 %) |
422,755 (2.89 %) |
231,452 (2.54 %) |
3,818,141 (24.36 %) |
38,368 (2.40 %) |
| 61 | golden-line barbel GCF_001515645.1 |
74,084 (6.71 %) |
29,507 (2.77 %) |
87,748 (5.07 %) |
112,633 (6.58 %) |
37.54 (89.58 %) |
136,894 (10.45 %) |
168,074 (89.55 %) |
1,228,127 (5.00 %) |
718,426 (6.54 %) |
9,092,306 (37.16 %) |
70,606 (1.91 %) |
| 62 | goldfish GCF_003368295.1 |
116,758 (8.75 %) |
35,107 (2.94 %) |
100,219 (5.57 %) |
144,639 (7.36 %) |
37.48 (99.99 %) |
2,247 (0.01 %) |
8,463 (99.99 %) |
1,713,126 (5.42 %) |
916,195 (5.01 %) |
9,731,118 (40.19 %) |
66,585 (2.06 %) |
| 63 | great blue-spotted mudskipper GCF_000788275.1 |
25,835 (5.19 %) |
14,226 (1.96 %) |
43,856 (4.62 %) |
n/a | 39.49 (93.15 %) |
92,327 (6.89 %) |
108,947 (93.11 %) |
577,238 (5.21 %) |
742,395 (8.07 %) |
5,901,720 (42.46 %) |
44,972 (1.97 %) |
| 64 | greater amberjack GCF_002260705.1 |
33,769 (9.11 %) |
15,348 (2.93 %) |
42,609 (6.43 %) |
33,754 (9.09 %) |
40.86 (99.17 %) |
9,742 (0.82 %) |
34,656 (100.00 %) |
575,505 (4.02 %) |
368,800 (3.72 %) |
4,449,534 (24.71 %) |
15,850 (0.98 %) |
| 65 | greater pipefish (v1.2 2020 VGP) GCF_901709675.1 |
47,335 (18.32 %) |
13,477 (5.26 %) |
42,380 (12.01 %) |
n/a | 43.46 (100.00 %) |
43 (0.00 %) |
87 (100.00 %) |
193,407 (3.05 %) |
125,716 (4.25 %) |
1,676,004 (25.93 %) |
46,327 (10.97 %) |
| 66 | greater pipefish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_901709685.1 |
n/a | 10,807 (5.59 %) |
23,520 (12.24 %) |
n/a | 43.29 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
1,848 (100.00 %) |
140,373 (2.96 %) |
81,000 (3.32 %) |
1,318,564 (23.30 %) |
34,098 (12.19 %) |
| 67 | green swordtail GCF_003331165.1 |
52,602 (11.81 %) |
14,955 (2.58 %) |
47,115 (6.33 %) |
n/a | 39.09 (99.71 %) |
661 (0.29 %) |
272 (100.00 %) |
328,469 (2.10 %) |
162,178 (2.35 %) |
4,801,050 (28.86 %) |
37,217 (2.39 %) |
| 68 | guppy GCF_000633615.1 |
48,303 (11.25 %) |
14,443 (2.72 %) |
44,760 (6.24 %) |
34,730 (7.44 %) |
39.33 (90.86 %) |
458,354 (9.22 %) |
40,143 (90.84 %) |
340,847 (2.42 %) |
167,943 (1.50 %) |
4,695,380 (25.63 %) |
35,188 (1.91 %) |
| 69 | honeycomb rockfish GCF_015220745.1 |
57,752 (9.94 %) |
15,244 (2.44 %) |
47,034 (5.98 %) |
n/a | 40.77 (99.83 %) |
215 (0.17 %) |
138 (100.00 %) |
524,161 (3.79 %) |
422,265 (6.20 %) |
4,827,148 (36.22 %) |
37,878 (1.84 %) |
| 70 | horned golden-line barbel GCF_001515625.1 |
74,598 (6.94 %) |
30,809 (3.11 %) |
89,934 (5.34 %) |
102,760 (5.91 %) |
37.18 (91.91 %) |
150,790 (8.11 %) |
314,962 (91.89 %) |
1,259,103 (4.89 %) |
708,550 (4.77 %) |
9,080,512 (35.95 %) |
63,217 (1.71 %) |
| 71 | humphead wrasse GCF_018320785.1 |
42,229 (6.60 %) |
15,287 (1.66 %) |
47,025 (4.13 %) |
n/a | 39.53 (100.00 %) |
284 (0.00 %) |
46 (100.00 %) |
447,458 (2.27 %) |
310,170 (4.65 %) |
8,002,463 (32.97 %) |
12,252 (0.38 %) |
| 72 | Indian medaka GCF_002922805.2 |
49,295 (10.27 %) |
14,591 (2.49 %) |
52,982 (6.37 %) |
n/a | 39.04 (94.83 %) |
51,550 (5.20 %) |
8,493 (100.00 %) |
319,151 (2.20 %) |
208,690 (2.67 %) |
5,412,546 (33.29 %) |
40,721 (2.36 %) |
| 73 | Indian glassy fish (2019 VGP) GCF_900634625.1 |
44,096 (12.32 %) |
15,354 (3.60 %) |
44,099 (8.47 %) |
60,337 (10.41 %) |
42.38 (98.08 %) |
1,523 (1.92 %) |
156 (100.00 %) |
349,914 (3.01 %) |
163,522 (3.00 %) |
2,755,229 (25.07 %) |
17,929 (1.44 %) |
| 74 | Indian glassy fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900651595.1 |
n/a | 14,424 (3.70 %) |
23,986 (8.00 %) |
n/a | 42.27 (99.58 %) |
230 (0.42 %) |
2,242 (100.00 %) |
304,771 (2.86 %) |
140,555 (2.80 %) |
2,689,154 (24.08 %) |
15,419 (1.38 %) |
| 75 | Indo-Pacific tarpon (2020 VGP) GCF_013368585.1 |
41,583 (6.91 %) |
18,302 (2.47 %) |
29,762 (5.45 %) |
n/a | 43.02 (99.97 %) |
63 (0.03 %) |
207 (100.00 %) |
603,558 (3.71 %) |
433,446 (4.32 %) |
5,341,985 (22.07 %) |
78,561 (3.69 %) |
| 76 | Japanese flounder GCF_001970005.1 |
37,851 (12.25 %) |
14,521 (3.39 %) |
45,927 (7.71 %) |
n/a | 41.64 (81.04 %) |
40,314 (18.97 %) |
9,525 (100.00 %) |
332,732 (2.83 %) |
164,916 (1.16 %) |
3,476,344 (17.36 %) |
21,768 (1.42 %) |
| 77 | Japanese medaka GCF_002234675.1 |
50,539 (10.32 %) |
14,342 (2.50 %) |
53,130 (7.02 %) |
38,211 (9.39 %) |
40.84 (99.93 %) |
491 (0.07 %) |
25 (100.00 %) |
462,541 (9.51 %) |
163,041 (3.07 %) |
4,631,750 (34.91 %) |
41,215 (2.89 %) |
| 78 | jewelled blenny (2019 VGP) GCF_902148845.1 |
42,890 (8.61 %) |
15,200 (2.40 %) |
86,752 (9.03 %) |
58,518 (6.97 %) |
44.34 (98.69 %) |
602 (1.31 %) |
203 (100.00 %) |
671,028 (4.21 %) |
442,004 (5.09 %) |
4,388,570 (26.54 %) |
121,462 (9.27 %) |
| 79 | jewelled blenny (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_902148835.1 |
n/a | 15,955 (2.17 %) |
48,017 (7.54 %) |
n/a | 44.49 (99.63 %) |
9 (0.37 %) |
4,516 (100.00 %) |
744,225 (4.25 %) |
519,896 (5.73 %) |
4,677,160 (28.52 %) |
138,484 (9.55 %) |
| 80 | lake trout GCF_016432855.1 |
65,012 (4.57 %) |
26,528 (1.53 %) |
112,119 (4.47 %) |
n/a | 43.50 (99.99 %) |
3,264 (0.01 %) |
4,121 (100.00 %) |
1,387,896 (5.81 %) |
1,797,785 (19.28 %) |
9,643,314 (54.44 %) |
85,419 (2.52 %) |
| 81 | lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U) GCF_018398675.1 |
78,867 (4.31 %) |
27,579 (1.38 %) |
113,850 (3.63 %) |
n/a | 44.18 (100.00 %) |
1,716 (0.00 %) |
6,355 (100.00 %) |
1,729,029 (6.03 %) |
1,781,307 (15.24 %) |
9,311,548 (61.16 %) |
126,142 (4.04 %) |
| 82 | lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U) GCF_020615455.1 |
87,246 (4.53 %) |
28,366 (1.38 %) |
117,266 (3.71 %) |
n/a | 44.12 (100.00 %) |
1,159 (0.00 %) |
7,334 (100.00 %) |
1,768,537 (6.02 %) |
1,793,716 (15.51 %) |
9,525,312 (61.13 %) |
126,485 (3.95 %) |
| 83 | large yellow croaker GCF_000972845.2 |
49,927 (11.76 %) |
15,381 (3.00 %) |
46,620 (6.99 %) |
66,805 (9.15 %) |
41.34 (99.67 %) |
7,424 (0.33 %) |
9,998 (100.00 %) |
481,459 (3.50 %) |
306,063 (3.37 %) |
4,199,578 (24.80 %) |
28,138 (2.09 %) |
| 84 | largemouth bass GCF_014851395.1 |
55,170 (9.49 %) |
16,635 (2.18 %) |
56,707 (5.52 %) |
n/a | 40.86 (99.85 %) |
2,909 (0.15 %) |
4,753 (100.00 %) |
497,281 (2.60 %) |
269,495 (3.70 %) |
5,496,732 (29.60 %) |
28,733 (1.66 %) |
| 85 | leopard coralgrouper GCF_008729295.1 |
38,671 (7.52 %) |
15,538 (2.18 %) |
57,480 (5.26 %) |
n/a | 39.54 (98.22 %) |
3,611 (1.77 %) |
94,260 (100.00 %) |
629,451 (3.42 %) |
385,539 (3.83 %) |
6,343,655 (29.35 %) |
27,018 (1.26 %) |
| 86 | live sharksucker (2019 VGP) GCF_900963305.1 |
40,268 (11.91 %) |
14,989 (3.53 %) |
40,908 (7.56 %) |
56,376 (9.51 %) |
41.43 (99.89 %) |
140 (0.11 %) |
38 (100.00 %) |
449,887 (3.55 %) |
146,353 (1.65 %) |
3,204,476 (21.79 %) |
16,807 (1.33 %) |
| 87 | live sharksucker (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900963505.1 |
n/a | 14,633 (3.50 %) |
23,105 (7.10 %) |
n/a | 41.42 (99.96 %) |
19 (0.04 %) |
1,405 (100.00 %) |
435,739 (3.57 %) |
139,003 (1.51 %) |
3,161,165 (22.06 %) |
16,302 (1.34 %) |
| 88 | lumpfish (2019 refseq VGP) GCF_009769545.1 |
41,612 (11.11 %) |
14,752 (3.31 %) |
49,223 (8.10 %) |
52,794 (8.34 %) |
42.83 (98.22 %) |
347 (1.78 %) |
48 (100.00 %) |
478,386 (6.02 %) |
421,632 (11.07 %) |
2,928,619 (27.99 %) |
53,321 (5.09 %) |
| 89 | lumpfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009769515.1 |
n/a | 12,850 (3.32 %) |
28,938 (7.88 %) |
n/a | 42.84 (100.00 %) |
n/a | 1,866 (100.00 %) |
407,695 (6.03 %) |
360,501 (11.29 %) |
2,456,041 (28.07 %) |
45,916 (5.21 %) |
| 90 | lyretail cichlid GCF_000239395.1 |
32,904 (9.12 %) |
14,806 (2.69 %) |
43,568 (5.91 %) |
32,961 (6.26 %) |
40.44 (80.94 %) |
109,100 (19.10 %) |
118,181 (80.90 %) |
719,439 (14.48 %) |
119,381 (1.10 %) |
4,539,429 (19.49 %) |
18,098 (0.91 %) |
| 91 | mandarin fish GCF_020085105.1 |
64,831 (12.89 %) |
15,283 (2.75 %) |
43,349 (6.02 %) |
n/a | 40.35 (100.00 %) |
93 (0.00 %) |
65 (100.00 %) |
441,324 (3.38 %) |
206,420 (2.54 %) |
4,582,841 (27.41 %) |
15,999 (1.17 %) |
| 92 | mangrove rivulus GCF_001649575.2 |
46,200 (11.83 %) |
14,522 (2.87 %) |
46,641 (6.86 %) |
n/a | 40.03 (94.31 %) |
32,278 (5.70 %) |
300 (100.00 %) |
345,678 (2.32 %) |
146,263 (1.33 %) |
4,718,292 (27.30 %) |
39,541 (2.69 %) |
| 93 | Mexican tetra (2017 WashU) GCF_000372685.2 |
47,018 (6.00 %) |
16,523 (1.68 %) |
54,451 (4.05 %) |
41,410 (5.66 %) |
38.00 (96.73 %) |
621 (3.27 %) |
2,415 (100.00 %) |
1,136,494 (6.77 %) |
1,113,607 (11.76 %) |
8,546,053 (42.44 %) |
44,933 (1.77 %) |
| 94 | Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021) GCA_019721115.1 |
n/a | 16,698 (1.62 %) |
62,818 (5.14 %) |
n/a | 38.41 (99.99 %) |
334 (0.01 %) |
195 (100.00 %) |
1,194,830 (5.04 %) |
1,460,981 (11.81 %) |
7,590,179 (47.66 %) |
50,533 (2.46 %) |
| 95 | milkfish (2019 VGP) GCF_902362185.1 |
30,825 (7.61 %) |
16,880 (3.41 %) |
42,123 (6.75 %) |
n/a | 41.53 (99.36 %) |
112 (0.64 %) |
31 (100.00 %) |
969,140 (8.12 %) |
731,733 (9.10 %) |
3,702,024 (26.31 %) |
22,089 (1.27 %) |
| 96 | milkfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_902362175.1 |
n/a | 16,569 (3.37 %) |
22,769 (6.61 %) |
n/a | 41.51 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
1,937 (100.00 %) |
930,389 (8.11 %) |
708,375 (9.04 %) |
3,612,575 (26.46 %) |
21,531 (1.27 %) |
| 97 | Monterrey platyfish GCF_001444195.1 |
53,100 (12.11 %) |
14,683 (2.71 %) |
44,219 (6.38 %) |
n/a | 39.02 (99.85 %) |
229 (0.15 %) |
68 (100.00 %) |
306,640 (2.08 %) |
134,157 (2.14 %) |
4,687,726 (28.26 %) |
33,082 (2.28 %) |
| 98 | mudskipper P.magnuspinnatus (2020 VGP) GCA_009829125.1 |
n/a | 14,249 (2.37 %) |
25,908 (5.85 %) |
n/a | 40.22 (99.05 %) |
700 (0.95 %) |
124 (100.00 %) |
423,335 (4.48 %) |
551,472 (7.22 %) |
4,887,148 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
| 99 | mudskipper P.magnuspinnatus (alt pseudohaplotype 2020 VGP) GCA_009829135.1 |
n/a | 13,492 (2.34 %) |
26,853 (5.82 %) |
n/a | 40.16 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,799 (100.00 %) |
394,411 (4.41 %) |
509,973 (7.17 %) |
4,581,968 (38.91 %) |
34,522 (2.54 %) |
| 100 | mummichog (Maine) GCF_000826765.1 |
41,183 (7.38 %) |
14,602 (1.92 %) |
57,194 (5.03 %) |
35,597 (6.40 %) |
40.58 (91.29 %) |
123,625 (8.75 %) |
120,723 (91.25 %) |
447,158 (2.19 %) |
235,336 (1.39 %) |
6,518,990 (26.03 %) |
54,589 (2.39 %) |
| 101 | mummichog (U. Missouri) GCF_011125445.2 |
56,612 (6.89 %) |
15,361 (1.60 %) |
69,801 (5.20 %) |
n/a | 40.76 (99.88 %) |
2,820 (0.12 %) |
1,031 (100.00 %) |
636,480 (2.75 %) |
392,130 (3.32 %) |
7,023,777 (32.98 %) |
81,101 (3.45 %) |
| 102 | New Zealand spotty (2019 VGP) GCA_009762535.1 |
n/a | 14,621 (2.22 %) |
23,355 (5.18 %) |
n/a | 40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
468 (100.00 %) |
519,321 (4.65 %) |
393,329 (5.54 %) |
4,522,265 (33.34 %) |
18,302 (0.85 %) |
| 103 | New Zealand spotty (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_009762545.1 |
n/a | 13,586 (2.17 %) |
24,175 (5.10 %) |
n/a | 40.81 (100.00 %) |
n/a | 3,286 (100.00 %) |
472,656 (4.46 %) |
348,429 (5.17 %) |
4,169,213 (33.57 %) |
16,368 (0.83 %) |
| 104 | Nile tilapia GCF_001858045.2 |
77,397 (10.87 %) |
15,598 (1.98 %) |
60,464 (6.00 %) |
82,099 (7.18 %) |
40.73 (99.99 %) |
551 (0.01 %) |
2,460 (100.00 %) |
1,080,172 (20.34 %) |
291,105 (3.17 %) |
4,958,128 (31.15 %) |
32,038 (1.81 %) |
| 105 | ninespine stickleback GCF_902500615.1 |
51,166 (15.31 %) |
14,765 (3.99 %) |
49,191 (9.80 %) |
n/a | 44.37 (99.99 %) |
341 (0.01 %) |
1,667 (100.00 %) |
380,357 (3.60 %) |
188,301 (6.29 %) |
2,422,266 (25.70 %) |
72,584 (9.69 %) |
| 106 | northern pike GCF_004634155.1 |
66,389 (9.11 %) |
16,799 (2.37 %) |
57,007 (5.60 %) |
79,175 (7.51 %) |
42.29 (99.99 %) |
584 (0.01 %) |
908 (100.00 %) |
1,104,914 (31.23 %) |
531,451 (7.80 %) |
4,677,366 (33.26 %) |
44,793 (2.82 %) |
| 107 | northern pike (alt pseudohaplotype 2020 VGP) GCA_011004835.1 |
n/a | 11,792 (2.41 %) |
21,365 (5.51 %) |
n/a | 42.32 (99.93 %) |
11 (0.07 %) |
3,813 (100.00 %) |
700,815 (30.15 %) |
372,729 (7.71 %) |
3,058,655 (31.76 %) |
29,687 (2.57 %) |
| 108 | northern pike (2020 refseq VGP) GCF_011004845.1 |
63,733 (9.28 %) |
16,618 (2.41 %) |
55,784 (5.64 %) |
n/a | 42.22 (99.89 %) |
112 (0.11 %) |
53 (100.00 %) |
984,415 (29.15 %) |
524,708 (7.32 %) |
4,691,096 (32.91 %) |
42,910 (2.52 %) |
| 109 | Old Calabar mormyrid GCF_002872115.1 |
61,915 (11.48 %) |
16,003 (2.73 %) |
71,307 (7.27 %) |
42,977 (10.01 %) |
43.93 (92.03 %) |
49,579 (7.99 %) |
4,666 (100.00 %) |
350,270 (2.24 %) |
314,129 (2.95 %) |
4,259,711 (20.83 %) |
76,846 (4.18 %) |
| 110 | orangethroat darter GCF_008692095.1 |
55,448 (8.29 %) |
15,000 (2.25 %) |
49,918 (5.41 %) |
n/a | 40.91 (99.57 %) |
101,221 (0.47 %) |
3,119 (100.00 %) |
566,915 (3.75 %) |
509,018 (6.60 %) |
5,142,090 (31.18 %) |
26,702 (1.46 %) |
| 111 | orbiculate cardinalfish (2019 VGP) GCF_902148855.1 |
46,571 (5.47 %) |
15,772 (1.50 %) |
52,078 (3.82 %) |
60,005 (3.98 %) |
37.90 (99.73 %) |
1,844 (0.27 %) |
340 (100.00 %) |
1,270,059 (5.42 %) |
979,214 (8.64 %) |
6,386,731 (48.59 %) |
29,320 (0.87 %) |
| 112 | orbiculate cardinalfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_902148825.1 |
n/a | 14,030 (1.51 %) |
30,797 (3.85 %) |
n/a | 37.73 (99.94 %) |
142 (0.06 %) |
7,038 (99.94 %) |
1,041,390 (5.09 %) |
744,623 (6.94 %) |
6,250,631 (45.53 %) |
22,522 (0.77 %) |
| 113 | P.nyererei 1_Seehausen GCF_000239375.1 |
40,001 (9.36 %) |
14,919 (2.72 %) |
43,583 (5.99 %) |
32,924 (7.29 %) |
40.60 (84.20 %) |
60,817 (15.83 %) |
68,050 (84.17 %) |
729,866 (15.57 %) |
124,292 (0.75 %) |
4,414,831 (20.66 %) |
18,455 (0.96 %) |
| 114 | Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020) GCF_013339905.1 |
48,776 (12.61 %) |
14,747 (3.15 %) |
45,075 (7.30 %) |
n/a | 42.24 (100.00 %) |
219 (0.00 %) |
120 (100.00 %) |
410,917 (4.22 %) |
246,500 (4.66 %) |
3,680,698 (25.23 %) |
31,508 (2.30 %) |
| 115 | Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022) GCF_022539355.2 |
46,684 (12.50 %) |
14,862 (3.15 %) |
45,824 (7.30 %) |
n/a | 42.17 (99.95 %) |
1,131 (0.05 %) |
53 (100.00 %) |
407,699 (3.94 %) |
247,330 (3.84 %) |
3,838,896 (24.75 %) |
31,782 (2.27 %) |
| 116 | pike-perch GCF_008315115.2 |
65,418 (8.54 %) |
15,731 (2.23 %) |
52,240 (5.69 %) |
n/a | 40.87 (99.98 %) |
711 (0.02 %) |
337 (100.00 %) |
629,999 (5.16 %) |
567,578 (7.41 %) |
4,697,709 (36.49 %) |
39,666 (1.93 %) |
| 117 | pinecone soldierfish (2019 VGP) GCF_902150065.1 |
40,770 (8.72 %) |
15,756 (2.42 %) |
53,616 (6.20 %) |
57,173 (6.14 %) |
41.83 (99.78 %) |
253 (0.22 %) |
87 (100.00 %) |
1,066,671 (5.88 %) |
646,820 (4.30 %) |
4,938,857 (28.11 %) |
41,636 (2.04 %) |
| 118 | pinecone soldierfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_902148815.1 |
n/a | 15,562 (2.38 %) |
28,491 (5.70 %) |
n/a | 41.81 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
2,193 (100.00 %) |
1,040,415 (5.81 %) |
623,499 (4.08 %) |
4,888,400 (27.89 %) |
40,331 (2.02 %) |
| 119 | pink salmon GCF_021184085.1 |
91,127 (4.89 %) |
27,187 (1.37 %) |
124,120 (3.88 %) |
n/a | 44.28 (99.96 %) |
5,213 (0.04 %) |
22,556 (99.99 %) |
1,343,135 (0.00 %) |
2,906,520 (28.95 %) |
10,882,087 (57.26 %) |
97,805 (3.04 %) |
| 120 | ploughfish GCF_902827175.1 |
50,551 (7.66 %) |
14,699 (1.83 %) |
66,348 (6.06 %) |
n/a | 41.52 (99.98 %) |
1,569 (0.02 %) |
2,618 (100.00 %) |
467,937 (3.05 %) |
412,361 (6.64 %) |
3,498,382 (45.08 %) |
73,879 (3.55 %) |
| 121 | prehistoric monster fish (2019 refseq VGP) GCF_902500255.1 |
45,404 (2.55 %) |
14,664 (0.76 %) |
72,609 (2.41 %) |
n/a | 41.99 (99.49 %) |
2,554 (0.51 %) |
464 (100.00 %) |
1,310,663 (2.79 %) |
786,401 (3.65 %) |
9,901,286 (59.90 %) |
172,199 (5.45 %) |
| 122 | prehistoric monster fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_902500245.1 |
n/a | 10,952 (0.64 %) |
33,472 (2.20 %) |
n/a | 41.96 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
19,587 (100.00 %) |
947,333 (2.69 %) |
554,284 (3.27 %) |
7,314,941 (58.56 %) |
125,285 (5.42 %) |
| 123 | rainbow trout (Swanson) GCF_002163495.1 |
79,299 (6.41 %) |
25,179 (1.70 %) |
98,339 (4.18 %) |
115,853 (5.33 %) |
42.67 (88.52 %) |
427,894 (11.54 %) |
139,800 (99.96 %) |
1,332,141 (5.52 %) |
1,604,760 (8.18 %) |
9,451,984 (44.00 %) |
56,604 (1.05 %) |
| 124 | rainbow trout (Arlee) GCF_013265735.2 |
119,284 (6.51 %) |
27,513 (1.62 %) |
109,524 (4.38 %) |
n/a | 43.45 (99.74 %) |
486 (0.26 %) |
939 (100.00 %) |
1,537,455 (7.32 %) |
2,083,211 (23.10 %) |
10,092,840 (53.71 %) |
73,586 (2.16 %) |
| 125 | red-bellied piranha (Pna-1 2016) GCF_001682695.1 |
47,129 (6.06 %) |
17,088 (1.79 %) |
57,594 (3.93 %) |
41,365 (5.67 %) |
40.45 (97.38 %) |
62,964 (2.59 %) |
325,620 (97.41 %) |
909,082 (4.77 %) |
863,001 (6.48 %) |
7,757,382 (34.74 %) |
34,329 (1.24 %) |
| 126 | red-bellied piranha (2020 VGP) GCF_015220715.1 |
54,818 (7.05 %) |
16,817 (1.87 %) |
52,672 (4.24 %) |
n/a | 40.58 (99.17 %) |
303 (0.83 %) |
55 (100.00 %) |
817,566 (5.40 %) |
689,236 (8.30 %) |
7,296,459 (35.73 %) |
33,087 (1.38 %) |
| 127 | reedfish (alt pseudohaplotype VGP) GCA_900700845.2 |
n/a | 9,953 (0.37 %) |
31,519 (1.22 %) |
n/a | 39.44 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
38,598 (100.00 %) |
1,300,562 (2.57 %) |
685,834 (2.21 %) |
14,691,576 (45.66 %) |
63,365 (1.11 %) |
| 128 | Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021) GCF_014905685.2 |
25,353 (3.88 %) |
14,334 (1.56 %) |
137,348 (9.74 %) |
n/a | 41.06 (92.01 %) |
100,521 (8.02 %) |
18,998 (100.00 %) |
635,526 (3.14 %) |
444,158 (3.06 %) |
6,203,124 (42.81 %) |
52,308 (2.11 %) |
| 129 | river trout GCF_901001165.1 |
102,785 (6.02 %) |
27,433 (1.62 %) |
110,789 (4.44 %) |
122,381 (5.28 %) |
43.36 (96.90 %) |
3,941 (3.10 %) |
1,441 (100.00 %) |
1,488,597 (5.68 %) |
1,789,507 (15.87 %) |
9,819,761 (52.37 %) |
70,821 (1.77 %) |
| 130 | sailfin molly GCF_001443285.1 |
53,986 (11.41 %) |
15,055 (2.70 %) |
49,372 (6.45 %) |
32,168 (7.41 %) |
39.18 (83.41 %) |
41,735 (16.61 %) |
54,623 (83.39 %) |
418,326 (2.47 %) |
189,502 (1.23 %) |
4,873,063 (22.51 %) |
34,138 (1.62 %) |
| 131 | Senegalese sole GCF_019176455.1 |
46,446 (12.02 %) |
15,155 (3.15 %) |
43,828 (7.31 %) |
n/a | 40.92 (99.99 %) |
662 (0.01 %) |
1,937 (100.00 %) |
522,618 (4.22 %) |
317,280 (4.23 %) |
4,040,245 (28.25 %) |
26,946 (1.79 %) |
| 132 | sheepshead minnow GCF_000732505.1 |
37,892 (7.02 %) |
14,761 (2.02 %) |
44,836 (4.64 %) |
33,363 (6.22 %) |
38.19 (86.93 %) |
113,210 (13.10 %) |
110,959 (86.90 %) |
399,245 (2.03 %) |
195,191 (1.43 %) |
6,444,762 (27.47 %) |
18,269 (0.66 %) |
| 133 | shortfin molly GCF_001443325.1 |
54,473 (11.42 %) |
15,117 (2.72 %) |
49,356 (6.49 %) |
35,365 (9.23 %) |
39.23 (84.81 %) |
37,507 (15.20 %) |
50,598 (84.80 %) |
383,850 (2.30 %) |
172,112 (1.18 %) |
4,876,942 (22.80 %) |
34,271 (1.66 %) |
| 134 | Siamese fighting fish (v3 2020 VGP) GCF_900634795.3 |
54,864 (17.78 %) |
14,745 (4.20 %) |
56,808 (10.87 %) |
n/a | 45.30 (99.99 %) |
328 (0.01 %) |
70 (100.00 %) |
255,550 (3.51 %) |
184,269 (4.62 %) |
2,010,934 (23.88 %) |
72,126 (13.08 %) |
| 135 | Siamese fighting fish (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_900651605.1 |
n/a | 14,505 (4.12 %) |
36,022 (9.79 %) |
n/a | 45.51 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
3,705 (100.00 %) |
249,668 (3.68 %) |
182,366 (4.87 %) |
1,939,533 (22.55 %) |
72,474 (13.55 %) |
| 136 | smallmouth bass GCF_021292245.1 |
55,919 (9.40 %) |
15,509 (2.37 %) |
49,387 (5.61 %) |
n/a | 40.72 (99.65 %) |
34,581 (0.36 %) |
15,020 (100.00 %) |
445,979 (2.50 %) |
249,630 (2.49 %) |
5,071,015 (28.28 %) |
23,875 (1.36 %) |
| 137 | sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019) GCF_006149115.2 |
75,628 (6.10 %) |
24,075 (1.71 %) |
98,364 (4.30 %) |
n/a | 43.37 (96.15 %) |
25,658 (3.85 %) |
36,660 (99.99 %) |
949,725 (3.53 %) |
1,465,583 (10.82 %) |
8,853,884 (48.52 %) |
62,850 (1.45 %) |
| 138 | South Georgia icefish GCF_902827115.1 |
41,307 (6.47 %) |
14,776 (1.79 %) |
68,734 (6.16 %) |
n/a | 42.07 (99.94 %) |
2,461 (0.06 %) |
1,563 (100.00 %) |
498,451 (3.42 %) |
474,032 (7.20 %) |
3,613,731 (45.83 %) |
88,984 (4.31 %) |
| 139 | southern platyfish GCF_002775205.1 |
46,380 (11.15 %) |
14,684 (2.66 %) |
45,367 (6.42 %) |
37,048 (9.87 %) |
38.97 (99.53 %) |
156 (0.47 %) |
102 (100.00 %) |
324,377 (2.73 %) |
146,477 (2.33 %) |
4,741,552 (28.27 %) |
34,667 (2.13 %) |
| 140 | southern bluefin tuna GCF_910596095.1 |
58,429 (11.06 %) |
15,626 (2.56 %) |
42,730 (5.74 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
184 (0.00 %) |
58 (100.00 %) |
554,276 (3.42 %) |
247,764 (2.94 %) |
5,176,851 (26.85 %) |
14,097 (0.88 %) |
| 141 | Southwestern China cavefish GCF_001515605.1 |
74,330 (6.97 %) |
30,927 (3.18 %) |
87,234 (5.37 %) |
109,330 (6.70 %) |
37.28 (92.69 %) |
168,741 (7.34 %) |
254,423 (92.66 %) |
1,254,874 (5.00 %) |
730,197 (4.59 %) |
8,910,005 (36.97 %) |
64,238 (1.79 %) |
| 142 | spiny chromis GCF_002109545.1 |
38,931 (8.84 %) |
15,644 (2.29 %) |
55,797 (5.61 %) |
35,487 (7.65 %) |
40.01 (85.05 %) |
209,115 (15.01 %) |
30,414 (100.00 %) |
373,924 (2.31 %) |
278,854 (1.99 %) |
5,622,334 (22.61 %) |
25,079 (0.95 %) |
| 143 | sterlet (maternal 2020 VGP) GCA_902713425.1 |
n/a | 22,326 (1.80 %) |
33,919 (4.12 %) |
n/a | 39.56 (99.99 %) |
402 (0.01 %) |
245 (100.00 %) |
1,126,735 (3.36 %) |
889,853 (6.73 %) |
8,766,715 (39.22 %) |
51,351 (1.78 %) |
| 144 | sterlet (paternal 2020 VGP) GCA_902713435.1 |
n/a | 22,726 (1.81 %) |
34,878 (4.20 %) |
n/a | 39.60 (100.00 %) |
422 (0.01 %) |
224 (100.00 %) |
1,145,500 (3.39 %) |
912,936 (6.84 %) |
8,839,174 (39.17 %) |
52,552 (1.72 %) |
| 145 | striped catfish Vietnam GCF_003671635.1 |
40,992 (9.44 %) |
15,310 (2.91 %) |
37,901 (5.38 %) |
n/a | 38.71 (97.32 %) |
23,755 (2.69 %) |
567 (100.00 %) |
695,993 (4.68 %) |
489,286 (3.69 %) |
4,849,313 (30.04 %) |
15,076 (0.95 %) |
| 146 | striped sea-bass GCF_004916995.1 |
32,103 (10.78 %) |
14,422 (3.07 %) |
38,188 (6.41 %) |
n/a | 40.19 (99.19 %) |
73,335 (0.86 %) |
630 (100.00 %) |
365,581 (2.59 %) |
142,967 (0.99 %) |
4,151,813 (22.73 %) |
13,730 (0.95 %) |
| 147 | striped catfish Indonesia GCF_009078355.1 |
50,044 (9.61 %) |
15,665 (2.76 %) |
41,398 (5.35 %) |
n/a | 38.86 (99.98 %) |
463 (0.02 %) |
150 (100.00 %) |
777,186 (5.69 %) |
603,962 (6.24 %) |
5,141,987 (32.41 %) |
17,264 (1.20 %) |
| 148 | Sumatra barb GCF_018831695.1 |
54,947 (11.16 %) |
18,745 (3.98 %) |
49,520 (6.36 %) |
n/a | 38.24 (99.95 %) |
5,075 (0.05 %) |
1,122 (100.00 %) |
638,783 (6.33 %) |
357,159 (7.71 %) |
4,520,846 (32.46 %) |
46,339 (3.96 %) |
| 149 | swamp eel GCF_001952655.1 |
43,844 (10.64 %) |
14,753 (2.97 %) |
40,501 (6.16 %) |
33,565 (9.14 %) |
40.90 (92.01 %) |
51,257 (8.01 %) |
71,879 (91.99 %) |
266,616 (1.84 %) |
95,726 (1.16 %) |
3,596,747 (21.95 %) |
7,065 (0.42 %) |
| 150 | swordfish GCF_016859285.1 |
47,986 (9.92 %) |
15,208 (2.84 %) |
42,556 (5.91 %) |
n/a | 40.69 (99.97 %) |
449 (0.03 %) |
1,482 (100.00 %) |
484,543 (3.59 %) |
230,762 (3.41 %) |
4,496,150 (23.94 %) |
27,129 (2.10 %) |
| 151 | tambaqui GCF_904425465.1 |
46,601 (6.55 %) |
17,150 (1.88 %) |
50,327 (4.03 %) |
n/a | 39.33 (100.00 %) |
420 (0.00 %) |
1,269 (100.00 %) |
753,112 (4.00 %) |
676,948 (5.71 %) |
8,317,676 (35.32 %) |
25,784 (0.92 %) |
| 152 | three-spined stickleback GCF_016920845.1 |
50,181 (16.09 %) |
14,935 (3.99 %) |
53,773 (9.96 %) |
n/a | 44.66 (99.24 %) |
3,125 (0.76 %) |
2,937 (100.00 %) |
368,987 (9.09 %) |
160,564 (2.89 %) |
2,308,841 (21.91 %) |
80,336 (11.49 %) |
| 153 | tiger tail seahorse (QL1 v2 2016) GCF_001891065.2 |
47,024 (13.33 %) |
13,806 (3.76 %) |
52,367 (8.81 %) |
n/a | 43.30 (93.08 %) |
22,977 (6.92 %) |
55,891 (93.08 %) |
356,857 (3.66 %) |
155,338 (3.36 %) |
2,806,278 (24.56 %) |
61,010 (7.71 %) |
| 154 | tongue sole GCF_000523025.1 |
45,186 (16.40 %) |
14,207 (3.97 %) |
39,860 (8.59 %) |
34,435 (13.22 %) |
40.82 (94.88 %) |
33,269 (5.14 %) |
62,912 (94.86 %) |
426,532 (4.33 %) |
235,739 (3.33 %) |
3,085,031 (24.78 %) |
17,094 (1.42 %) |
| 155 | torafugu (2019 VGP) GCF_901000725.2 |
53,492 (18.31 %) |
14,548 (4.79 %) |
51,180 (11.72 %) |
55,740 (14.38 %) |
45.67 (99.04 %) |
402 (0.96 %) |
128 (100.00 %) |
290,056 (10.32 %) |
178,921 (5.32 %) |
1,642,756 (20.86 %) |
49,973 (9.53 %) |
| 156 | torafugu (alt pseudohaplotype 2019 VGP) GCA_901000745.3 |
n/a | 13,654 (4.82 %) |
28,421 (10.82 %) |
n/a | 45.60 (99.82 %) |
38 (0.18 %) |
2,012 (100.00 %) |
249,790 (9.32 %) |
151,193 (4.49 %) |
1,577,144 (20.25 %) |
46,931 (9.34 %) |
| 157 | turbot (ysfricsl-2021 2022) GCF_022379125.1 |
57,285 (14.93 %) |
14,887 (3.52 %) |
49,403 (8.32 %) |
n/a | 43.54 (100.00 %) |
n/a | 28 (100.00 %) |
455,017 (0.00 %) |
297,185 (5.03 %) |
3,312,612 (24.33 %) |
65,633 (7.08 %) |
| 158 | turquoise killifish GCF_001465895.1 |
40,386 (7.85 %) |
14,356 (2.08 %) |
101,715 (9.24 %) |
57,281 (6.01 %) |
42.51 (68.98 %) |
85,562 (31.04 %) |
68,911 (68.97 %) |
457,873 (3.04 %) |
307,607 (2.09 %) |
4,777,941 (27.62 %) |
61,105 (2.15 %) |
| 159 | western mosquitofish GCF_019740435.1 |
54,029 (12.31 %) |
14,667 (2.80 %) |
44,358 (6.62 %) |
n/a | 38.94 (97.42 %) |
181 (2.58 %) |
37 (100.00 %) |
348,476 (2.56 %) |
158,728 (2.21 %) |
4,604,959 (26.85 %) |
30,624 (1.94 %) |
| 160 | White Sands pupfish GCF_016077235.1 |
46,084 (6.27 %) |
14,817 (1.71 %) |
52,055 (4.88 %) |
n/a | 39.01 (100.00 %) |
n/a | 2,003 (100.00 %) |
489,894 (2.67 %) |
304,277 (3.91 %) |
6,371,712 (38.05 %) |
41,820 (1.75 %) |
| 161 | wolf-eel GCF_004355925.1 |
43,638 (14.00 %) |
14,936 (3.24 %) |
47,643 (7.50 %) |
n/a | 42.10 (92.86 %) |
23,891 (7.15 %) |
33,400 (92.85 %) |
382,467 (3.26 %) |
244,853 (2.39 %) |
3,432,622 (22.07 %) |
30,581 (2.04 %) |
| 162 | Wuchang bream GCF_018812025.1 |
68,768 (8.86 %) |
18,247 (2.62 %) |
57,323 (5.24 %) |
n/a | 37.64 (99.83 %) |
1,281 (0.17 %) |
243 (100.00 %) |
801,110 (0.00 %) |
559,399 (5.04 %) |
6,340,567 (43.09 %) |
45,067 (2.52 %) |
| 163 | yellow catfish (hzauxx_2018 2022) GCF_022655615.1 |
64,819 (11.15 %) |
15,680 (2.87 %) |
41,108 (5.68 %) |
n/a | 39.49 (99.94 %) |
817 (0.06 %) |
517 (100.00 %) |
839,496 (9.42 %) |
756,396 (11.12 %) |
4,051,149 (35.45 %) |
24,342 (1.72 %) |
| 164 | yellow catfish (Tf-2017 2018) GCF_003724035.1 |
54,374 (10.66 %) |
15,588 (2.85 %) |
41,675 (5.49 %) |
n/a | 39.55 (99.11 %) |
1,760 (0.89 %) |
663 (100.00 %) |
899,309 (10.59 %) |
797,020 (11.09 %) |
4,092,065 (35.46 %) |
24,238 (1.72 %) |
| 165 | yellow perch (YP-PL-M2 2019) GCF_004354835.1 |
47,121 (7.78 %) |
15,449 (2.26 %) |
51,330 (5.61 %) |
n/a | 40.84 (99.95 %) |
831 (0.05 %) |
268 (100.00 %) |
631,245 (4.88 %) |
540,302 (7.26 %) |
4,770,842 (35.92 %) |
35,251 (1.63 %) |
| 166 | yellowfin seabream GCF_904848185.1 |
63,974 (13.26 %) |
15,178 (2.82 %) |
46,332 (6.73 %) |
n/a | 42.09 (100.00 %) |
149 (0.00 %) |
66 (100.00 %) |
499,939 (3.43 %) |
254,361 (2.64 %) |
4,420,217 (22.81 %) |
31,005 (1.79 %) |
| 167 | yellowfin tuna GCF_914725855.1 |
57,835 (11.36 %) |
15,616 (2.53 %) |
42,750 (5.72 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
70 (0.00 %) |
68 (100.00 %) |
569,665 (3.53 %) |
259,656 (3.34 %) |
5,175,692 (27.05 %) |
14,420 (0.88 %) |
| 168 | yellowtail amberjack GCF_002814215.1 |
41,181 (9.96 %) |
15,871 (2.75 %) |
54,501 (6.42 %) |
34,514 (8.53 %) |
40.75 (97.79 %) |
33,664 (2.20 %) |
99,598 (100.00 %) |
616,664 (4.14 %) |
522,349 (4.83 %) |
4,650,538 (24.98 %) |
18,054 (0.96 %) |
| 169 | Zealand spotty GCF_009762535.1 |
45,555 (9.06 %) |
14,609 (2.22 %) |
43,259 (5.33 %) |
n/a | 40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
467 (100.00 %) |
517,755 (4.63 %) |
393,328 (5.54 %) |
4,522,224 (33.34 %) |
18,299 (0.85 %) |
| 170 | zebra mbuna GCF_000238955.4 |
51,025 (8.37 %) |
15,904 (2.10 %) |
58,127 (6.09 %) |
39,681 (7.23 %) |
41.16 (99.99 %) |
641 (0.01 %) |
1,690 (100.00 %) |
1,039,803 (22.35 %) |
253,037 (2.53 %) |
4,679,743 (31.57 %) |
36,688 (1.98 %) |
| 171 | zebrafish T5D GCA_018400075.1 |
n/a | 17,774 (2.54 %) |
44,221 (3.24 %) |
n/a | 36.52 (99.87 %) |
20,876 (0.14 %) |
20,901 (99.86 %) |
4,138,008 (61.22 %) |
894,145 (6.79 %) |
9,494,379 (47.68 %) |
42,482 (2.03 %) |
| 172 | zebrafish GRCz11 GCF_000002035.6 |
65,219 (5.63 %) |
22,227 (2.53 %) |
59,767 (3.64 %) |
n/a | 36.60 (99.72 %) |
20,258 (0.28 %) |
34,617 (99.73 %) |
5,029,496 (60.60 %) |
1,077,677 (6.47 %) |
10,772,232 (49.45 %) |
53,471 (2.06 %) |
| 173 | zig-zag eel (alt pseudohaplotype VGP) GCA_900700395.1 |
n/a | 1,206 (2.88 %) |
2,741 (6.48 %) |
n/a | 41.24 (99.99 %) |
n/a | 1,437 (100.00 %) |
26,316 (3.19 %) |
14,209 (3.21 %) |
211,357 (18.05 %) |
1,253 (1.49 %) |
| 174 | zig-zag eel (v1.2 2019 VGP) GCF_900324485.2 |
45,001 (12.01 %) |
15,052 (3.35 %) |
21,643 (6.89 %) |
60,604 (9.39 %) |
40.66 (97.76 %) |
238 (2.24 %) |
123 (100.00 %) |
349,298 (2.86 %) |
157,728 (2.01 %) |
3,180,025 (23.44 %) |
12,807 (1.08 %) |
| TOTALS: | total assembly count 174 | |||||||||||
| Additional hubs with collections of assemblies | |||
|---|---|---|---|
| Collection | Hub index pages: | Assembly statistics: | Track statistics: |
| Primates | 56 assemblies | assembly stats | track stats |
| Mammals | 336 assemblies | assembly stats | track stats |
| Birds | 164 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fishes | 174 assemblies | assembly stats | track stats |
| other vertebrates | 69 assemblies | assembly stats | track stats |
| Invertebrates | 427 assemblies | assembly stats | track stats |
| Plants | 159 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fungi | 445 assemblies | assembly stats | track stats |
| Viruses | 252 assemblies | assembly stats | track stats |
| VGP - Vertebrate Genome Project | 257 assemblies | assembly stats | track stats |
| legacy/superseded | 221 assemblies | assembly stats | track stats |