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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.
| count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | allis shad GCF_017589495.1 |
48,507 (8.47 %) |
15,371 (2.28 %) |
58,686 (5.84 %) |
n/a | 42.99 (99.91 %) |
1,541 (0.09 %) |
1,095 (100.00 %) |
1,190,406 (9.30 %) |
1,205,679 (11.28 %) |
3,960,328 (38.81 %) |
36,494 (1.83 %) |
| 2 | Amazon molly GCF_000485575.1 |
56,958 (11.69 %) |
15,117 (2.64 %) |
30,114 (6.60 %) |
n/a | 39.16 (95.38 %) |
36,429 (4.64 %) |
31,058 (95.36 %) |
346,461 (2.03 %) |
188,557 (1.44 %) |
5,139,633 (26.01 %) |
35,229 (1.82 %) |
| 3 | amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021) GCF_021018895.1 |
47,198 (13.10 %) |
15,500 (3.14 %) |
41,230 (6.67 %) |
n/a | 40.79 (99.99 %) |
150 (0.01 %) |
31 (100.00 %) |
1,230,524 (26.57 %) |
398,694 (5.41 %) |
4,106,609 (25.60 %) |
15,656 (0.99 %) |
| 4 | American shad (fAloSap1 alternate hap 2021) GCA_018492705.1 |
n/a | 15,901 (2.25 %) |
61,133 (6.37 %) |
n/a | 43.14 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
5,411 (100.00 %) |
2,043,181 (23.64 %) |
1,141,539 (11.35 %) |
3,668,314 (38.60 %) |
40,218 (2.14 %) |
| 5 | American shad (fAloSap1 primary hap 2021) GCF_018492685.1 |
70,400 (9.39 %) |
16,145 (2.29 %) |
60,087 (6.26 %) |
76,974 (8.55 %) |
43.18 (99.45 %) |
1,639 (0.55 %) |
74 (100.00 %) |
1,297,174 (9.39 %) |
1,245,221 (12.59 %) |
3,857,267 (39.43 %) |
42,699 (2.23 %) |
| 6 | annual killifish GCF_001266775.1 |
38,517 (8.87 %) |
14,027 (2.45 %) |
27,798 (5.86 %) |
n/a | 39.29 (80.23 %) |
1,025,519 (19.94 %) |
168,368 (80.17 %) |
349,927 (2.63 %) |
296,826 (3.18 %) |
5,039,517 (28.69 %) |
26,364 (1.18 %) |
| 7 | Antarctic lanternfish (alternate hap 2023) GCA_951214905.1 |
n/a | 17,318 (1.49 %) |
80,097 (5.79 %) |
n/a | 43.49 (100.00 %) |
n/a | 11,436 (100.00 %) |
5,482,467 (36.71 %) |
1,454,729 (18.84 %) |
6,756,226 (47.56 %) |
92,057 (3.50 %) |
| 8 | Antarctic lanternfish (primary hap 2023) GCA_951216825.1 |
n/a | 17,342 (1.44 %) |
78,914 (5.48 %) |
n/a | 43.57 (99.96 %) |
3,179 (0.04 %) |
1,901 (100.00 %) |
5,980,457 (37.18 %) |
1,633,782 (21.76 %) |
6,279,725 (52.83 %) |
104,688 (3.57 %) |
| 9 | Arctic char GCF_002910315.2 |
67,196 (4.99 %) |
23,967 (1.55 %) |
45,775 (3.69 %) |
n/a | 43.16 (93.25 %) |
1,718,015 (6.84 %) |
16,700 (99.99 %) |
1,011,348 (4.06 %) |
1,666,148 (10.50 %) |
10,597,529 (44.77 %) |
76,282 (1.94 %) |
| 10 | Aristotle's catfish (alternate hap 2022) GCA_946807865.1 |
n/a | 14,032 (2.44 %) |
39,770 (4.92 %) |
n/a | 38.85 (100.00 %) |
n/a | 7,617 (100.00 %) |
1,808,149 (37.98 %) |
583,449 (10.56 %) |
4,203,368 (40.67 %) |
24,867 (2.06 %) |
| 11 | Aristotle's catfish (primary hap 2022) GCA_946808225.1 |
n/a | 15,455 (2.53 %) |
40,077 (4.90 %) |
86,346 (8.45 %) |
38.90 (99.98 %) |
795 (0.02 %) |
241 (100.00 %) |
2,045,691 (38.70 %) |
669,975 (11.72 %) |
4,638,765 (42.07 %) |
28,277 (1.93 %) |
| 12 | Arkansas darter GCF_013103735.1 |
51,282 (9.79 %) |
14,588 (2.90 %) |
42,306 (6.27 %) |
n/a | 40.52 (99.50 %) |
35,052 (0.52 %) |
4,664 (100.00 %) |
418,294 (3.29 %) |
331,380 (3.74 %) |
4,153,309 (26.60 %) |
15,489 (0.95 %) |
| 13 | arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022) GCA_026230005.1 |
n/a | 17,862 (2.29 %) |
70,667 (5.50 %) |
n/a | 40.01 (100.00 %) |
327 (0.00 %) |
179 (100.00 %) |
2,876,989 (50.39 %) |
700,511 (9.88 %) |
5,977,913 (44.08 %) |
104,320 (8.02 %) |
| 14 | arroyo chub (AC-1 primary hap 2022) GCA_026230025.1 |
n/a | 18,025 (2.28 %) |
71,255 (5.50 %) |
n/a | 40.03 (100.00 %) |
318 (0.00 %) |
341 (100.00 %) |
2,884,301 (50.42 %) |
702,464 (9.98 %) |
5,989,299 (44.18 %) |
105,945 (8.03 %) |
| 15 | Asian bonytongue (2019) GCF_900964775.1 |
50,315 (9.13 %) |
16,526 (2.73 %) |
38,780 (6.64 %) |
72,662 (8.52 %) |
44.16 (99.99 %) |
145 (0.01 %) |
72 (100.00 %) |
504,673 (3.06 %) |
216,136 (1.69 %) |
4,323,242 (26.50 %) |
88,517 (10.73 %) |
| 16 | Asian bonytongue (alternate hap) GCA_900964985.2 |
n/a | 16,053 (2.73 %) |
74,777 (7.26 %) |
n/a | 44.15 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,006 (100.00 %) |
482,351 (3.03 %) |
207,018 (1.68 %) |
4,139,370 (26.26 %) |
85,546 (10.82 %) |
| 17 | Asian redtail catfish (EC202008001 2021) GCF_019097595.1 |
51,017 (10.40 %) |
15,549 (2.60 %) |
42,858 (5.39 %) |
n/a | 39.70 (100.00 %) |
107 (0.00 %) |
73 (100.00 %) |
1,718,992 (31.80 %) |
749,009 (14.09 %) |
4,206,758 (37.30 %) |
19,230 (1.16 %) |
| 18 | Atlantic cod (2019) GCF_902167405.1 |
51,642 (11.92 %) |
14,055 (2.62 %) |
36,761 (8.42 %) |
68,438 (9.50 %) |
45.64 (96.48 %) |
1,216 (3.52 %) |
227 (100.00 %) |
790,946 (10.54 %) |
855,327 (13.06 %) |
2,851,161 (33.38 %) |
97,133 (7.82 %) |
| 19 | Atlantic cod (alternate hap) GCA_902167395.1 |
n/a | 13,366 (2.68 %) |
66,599 (9.29 %) |
n/a | 45.55 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
3,592 (100.00 %) |
696,727 (10.13 %) |
749,876 (13.00 %) |
2,554,769 (33.77 %) |
87,167 (8.03 %) |
| 20 | Atlantic halibut (2019 refseq) GCF_009819705.1 |
52,130 (11.46 %) |
14,961 (3.19 %) |
45,365 (7.48 %) |
69,662 (10.94 %) |
42.21 (99.43 %) |
290 (0.57 %) |
57 (100.00 %) |
428,321 (4.16 %) |
256,153 (3.73 %) |
3,725,981 (24.13 %) |
31,325 (2.25 %) |
| 21 | Atlantic halibut (alternate hap 2019) GCA_009819745.1 |
n/a | 16,554 (3.01 %) |
54,832 (7.45 %) |
n/a | 42.29 (100.00 %) |
62 (0.00 %) |
4,053 (100.00 %) |
494,008 (4.23 %) |
299,066 (3.87 %) |
4,272,649 (24.46 %) |
36,868 (2.33 %) |
| 22 | Atlantic herring (v2) GCF_900700415.2 |
50,946 (10.35 %) |
16,394 (2.60 %) |
61,637 (7.20 %) |
n/a | 44.16 (99.89 %) |
1,990 (0.11 %) |
3,687 (99.89 %) |
1,269,688 (11.71 %) |
1,318,661 (13.43 %) |
3,732,801 (32.49 %) |
35,959 (1.97 %) |
| 23 | Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021) GCA_905171655.2 |
n/a | 15,331 (2.42 %) |
52,370 (6.91 %) |
n/a | 41.96 (100.00 %) |
74 (0.00 %) |
1,049 (100.00 %) |
1,454,631 (18.29 %) |
383,946 (4.34 %) |
4,363,016 (32.69 %) |
56,416 (3.08 %) |
| 24 | Atlantic horse mackerel (primary hap 2021) GCA_905171665.2 |
n/a | 15,262 (2.42 %) |
51,857 (6.86 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
153 (100.00 %) |
1,454,219 (18.25 %) |
384,609 (4.72 %) |
4,338,083 (32.80 %) |
56,553 (3.08 %) |
| 25 | Atlantic salmon (refseq 2021) GCF_905237065.1 |
112,906 (5.61 %) |
28,077 (1.40 %) |
115,207 (3.75 %) |
183,727 (7.26 %) |
43.42 (100.00 %) |
211 (0.00 %) |
4,222 (100.00 %) |
1,300,611 (4.84 %) |
2,247,891 (25.01 %) |
10,731,814 (59.31 %) |
77,089 (1.86 %) |
| 26 | Atlantic salmon (Sally 2015) GCF_000233375.1 |
109,794 (5.45 %) |
26,968 (1.35 %) |
202,772 (19.11 %) |
n/a | 43.10 (88.27 %) |
138,207 (11.73 %) |
241,570 (99.97 %) |
1,628,119 (9.46 %) |
2,496,917 (19.18 %) |
10,390,780 (51.80 %) |
79,791 (1.60 %) |
| 27 | Atlantic turbot (AOZZmale01 2020) GCF_013347765.1 |
60,214 (14.44 %) |
14,860 (3.40 %) |
50,921 (8.07 %) |
76,242 (9.93 %) |
43.38 (100.00 %) |
51 (0.00 %) |
127 (100.00 %) |
449,865 (5.00 %) |
299,255 (7.03 %) |
3,274,219 (25.77 %) |
67,338 (7.00 %) |
| 28 | ballan wrasse GCF_900080235.1 |
42,362 (9.30 %) |
16,129 (2.44 %) |
33,854 (5.87 %) |
n/a | 40.89 (99.98 %) |
257 (0.02 %) |
13,466 (100.00 %) |
503,078 (3.93 %) |
321,407 (5.60 %) |
4,329,412 (30.36 %) |
21,221 (1.07 %) |
| 29 | banded archerfish (alternate hap 2021) GCA_017976295.1 |
n/a | 15,211 (3.23 %) |
41,620 (7.14 %) |
n/a | 41.08 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
2,393 (100.00 %) |
785,178 (17.57 %) |
249,148 (8.36 %) |
3,391,653 (26.49 %) |
13,787 (0.93 %) |
| 30 | banded archerfish (primary hap 2021 refseq) GCF_017976425.1 |
42,399 (11.11 %) |
15,310 (3.17 %) |
41,147 (7.01 %) |
62,990 (9.37 %) |
41.11 (99.82 %) |
98 (0.18 %) |
96 (100.00 %) |
463,524 (3.35 %) |
271,913 (9.55 %) |
3,355,326 (28.08 %) |
15,089 (0.96 %) |
| 31 | barbel (alternate hap 2022) GCA_936446605.1 |
n/a | 26,794 (3.15 %) |
76,434 (5.64 %) |
n/a | 37.81 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
8,035 (100.00 %) |
4,084,361 (52.18 %) |
538,411 (4.25 %) |
7,659,980 (38.94 %) |
58,008 (2.90 %) |
| 32 | barbel (primary hap 2022) GCA_936440315.1 |
n/a | 31,876 (3.30 %) |
85,063 (5.65 %) |
n/a | 37.89 (100.00 %) |
108 (0.00 %) |
92 (100.00 %) |
4,839,533 (52.47 %) |
646,636 (4.57 %) |
8,240,279 (42.13 %) |
71,384 (3.04 %) |
| 33 | barramundi perch (ASB-BC8 2022) GCF_001640805.2 |
53,646 (13.68 %) |
16,073 (3.06 %) |
44,214 (6.63 %) |
n/a | 40.76 (98.88 %) |
674 (1.12 %) |
2,997 (100.00 %) |
986,469 (19.78 %) |
237,272 (4.32 %) |
3,983,840 (23.58 %) |
16,237 (1.03 %) |
| 34 | bicolor damselfish GCF_000690725.1 |
32,951 (8.67 %) |
15,181 (2.55 %) |
31,420 (5.94 %) |
n/a | 41.66 (93.68 %) |
44,409 (6.34 %) |
42,059 (93.66 %) |
351,453 (2.61 %) |
180,113 (1.20 %) |
5,016,154 (23.41 %) |
46,423 (2.30 %) |
| 35 | black goby (primary hap 2023) GCA_951799975.1 |
n/a | 14,455 (2.06 %) |
56,488 (6.31 %) |
n/a | 42.10 (99.99 %) |
636 (0.01 %) |
298 (100.00 %) |
n/a | 494,440 (10.43 %) |
4,359,169 (40.46 %) |
81,684 (4.81 %) |
| 36 | black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022) GCA_022578405.1 |
n/a | 31,847 (2.01 %) |
153,565 (6.53 %) |
n/a | 41.78 (99.99 %) |
639 (0.00 %) |
63,422 (100.00 %) |
2,786,840 (18.28 %) |
1,016,389 (7.50 %) |
8,844,631 (26.90 %) |
130,556 (4.42 %) |
| 37 | black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022) GCA_022577435.1 |
n/a | 14,991 (3.02 %) |
47,106 (6.98 %) |
n/a | 41.61 (100.00 %) |
234 (0.00 %) |
230 (100.00 %) |
1,017,149 (18.99 %) |
360,899 (8.75 %) |
3,761,526 (28.91 %) |
48,360 (4.43 %) |
| 38 | black rockcod GCF_000735185.1 |
35,176 (8.54 %) |
12,601 (2.15 %) |
42,589 (6.13 %) |
n/a | 40.62 (97.93 %) |
59,164 (2.09 %) |
72,571 (97.92 %) |
268,591 (2.71 %) |
238,334 (3.18 %) |
3,425,479 (29.48 %) |
31,009 (2.11 %) |
| 39 | black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023) GCF_030273125.1 |
43,392 (8.45 %) |
15,522 (2.13 %) |
48,255 (5.50 %) |
n/a | 38.69 (100.00 %) |
341 (0.00 %) |
92 (100.00 %) |
1,651,919 (22.26 %) |
782,601 (7.55 %) |
5,398,047 (38.87 %) |
24,508 (1.19 %) |
| 40 | blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023) GCA_028021495.1 |
n/a | 15,274 (2.92 %) |
51,453 (7.45 %) |
n/a | 43.07 (99.99 %) |
373 (0.01 %) |
461 (100.00 %) |
1,239,364 (29.69 %) |
354,703 (9.63 %) |
3,006,556 (30.35 %) |
53,503 (4.48 %) |
| 41 | blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023) GCA_028022725.1 |
n/a | 15,043 (2.96 %) |
50,860 (7.54 %) |
n/a | 42.98 (99.99 %) |
366 (0.01 %) |
109 (100.00 %) |
1,210,142 (29.44 %) |
340,820 (9.19 %) |
2,986,750 (29.89 %) |
52,010 (4.20 %) |
| 42 | blackstripe livebearer (line A6 2022) GCF_027474105.1 |
44,847 (11.30 %) |
15,364 (2.86 %) |
51,122 (6.88 %) |
n/a | 39.48 (99.99 %) |
89 (0.01 %) |
415 (100.00 %) |
1,160,519 (28.33 %) |
183,082 (4.75 %) |
4,354,804 (27.83 %) |
40,207 (2.97 %) |
| 43 | blue catfish (D&B 2022) GCF_023375685.1 |
48,916 (10.27 %) |
15,574 (2.62 %) |
44,035 (5.21 %) |
n/a | 39.80 (98.04 %) |
171 (1.96 %) |
43 (100.00 %) |
2,180,806 (45.14 %) |
625,260 (6.63 %) |
5,137,199 (35.52 %) |
31,164 (1.89 %) |
| 44 | blue tilapia (BGI-SZ) GCF_005870065.1 |
36,881 (7.40 %) |
15,408 (2.38 %) |
27,235 (5.59 %) |
n/a | 40.42 (89.87 %) |
53,539 (10.15 %) |
12,952 (100.00 %) |
867,639 (16.39 %) |
195,137 (1.62 %) |
5,293,484 (23.10 %) |
21,238 (1.02 %) |
| 45 | blue tilapia (Guangdong) GCF_013358895.1 |
57,860 (9.04 %) |
15,494 (1.98 %) |
57,878 (5.63 %) |
56,939 (8.11 %) |
40.66 (99.97 %) |
723 (0.03 %) |
304 (100.00 %) |
1,055,724 (20.14 %) |
324,841 (3.27 %) |
5,000,753 (32.08 %) |
32,357 (1.59 %) |
| 46 | bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023) GCF_030265055.1 |
63,345 (14.83 %) |
14,387 (3.54 %) |
43,563 (7.96 %) |
n/a | 41.68 (100.00 %) |
12 (0.00 %) |
57 (100.00 %) |
842,739 (18.67 %) |
356,558 (12.86 %) |
2,720,911 (41.08 %) |
40,187 (4.66 %) |
| 47 | blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank) GCA_900634775.2 |
n/a | 14,499 (1.97 %) |
51,213 (5.47 %) |
n/a | 38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
442 (100.00 %) |
731,731 (4.21 %) |
471,623 (4.92 %) |
5,974,055 (42.88 %) |
29,052 (1.48 %) |
| 48 | blunt-snouted clingfish (alternate hap) GCA_900650505.1 |
n/a | 12,494 (1.93 %) |
44,967 (5.14 %) |
n/a | 38.20 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
7,675 (100.00 %) |
608,174 (4.23 %) |
390,755 (4.71 %) |
4,977,071 (42.41 %) |
23,532 (1.46 %) |
| 49 | Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021) GCA_017639755.1 |
n/a | 13,882 (2.27 %) |
45,919 (5.98 %) |
n/a | 39.50 (99.99 %) |
45 (0.01 %) |
3,194 (100.00 %) |
803,073 (13.60 %) |
258,404 (4.19 %) |
4,674,614 (28.36 %) |
15,524 (1.02 %) |
| 50 | Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021) GCF_017639745.1 |
51,238 (8.77 %) |
15,174 (2.24 %) |
51,552 (6.21 %) |
n/a | 39.65 (99.63 %) |
440 (0.37 %) |
93 (100.00 %) |
542,278 (3.15 %) |
303,669 (4.77 %) |
5,189,645 (29.11 %) |
18,525 (1.10 %) |
| 51 | bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022) GCA_933228925.1 |
n/a | 12,424 (1.95 %) |
46,550 (6.00 %) |
n/a | 41.63 (100.00 %) |
n/a | 4,619 (100.00 %) |
789,207 (14.61 %) |
348,482 (20.98 %) |
3,447,241 (38.72 %) |
27,035 (4.16 %) |
| 52 | bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022) GCA_933228915.1 |
n/a | 14,929 (1.93 %) |
55,343 (5.90 %) |
n/a | 41.66 (99.97 %) |
1,329 (0.03 %) |
146 (100.00 %) |
998,246 (14.90 %) |
443,155 (22.40 %) |
4,319,947 (40.01 %) |
34,018 (4.16 %) |
| 53 | Brauer's lanternfish (alternate hap 2023) GCA_963281105.1 |
n/a | 17,999 (1.60 %) |
76,655 (5.58 %) |
n/a | 42.04 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
10,799 (100.00 %) |
5,994,257 (39.29 %) |
1,126,685 (10.35 %) |
6,996,991 (46.02 %) |
71,016 (3.36 %) |
| 54 | Brauer's lanternfish (primary hap 2023) GCA_963280865.1 |
n/a | 17,865 (1.56 %) |
76,506 (5.59 %) |
n/a | 42.15 (99.96 %) |
2,704 (0.04 %) |
676 (100.00 %) |
6,391,921 (39.62 %) |
1,227,487 (11.70 %) |
6,669,558 (49.73 %) |
76,828 (3.96 %) |
| 55 | brook trout (EN_2023a 2023) GCF_029448725.1 |
92,568 (6.87 %) |
26,875 (1.47 %) |
114,101 (4.26 %) |
n/a | 43.70 (99.83 %) |
4,299 (0.17 %) |
2,721 (100.00 %) |
5,005,012 (52.10 %) |
2,055,293 (26.66 %) |
9,701,968 (57.04 %) |
89,897 (2.49 %) |
| 56 | brown-marbled grouper (2020) GCF_011397635.1 |
49,205 (8.52 %) |
15,634 (1.92 %) |
53,710 (4.99 %) |
n/a | 41.33 (100.00 %) |
205 (0.00 %) |
26 (100.00 %) |
632,147 (3.01 %) |
371,482 (3.01 %) |
6,438,110 (31.32 %) |
26,136 (0.96 %) |
| 57 | Burton's mouthbrooder (Broad 2011) GCF_000239415.1 |
47,805 (10.97 %) |
14,997 (2.72 %) |
25,504 (5.86 %) |
n/a | 40.51 (84.10 %) |
61,073 (15.93 %) |
69,067 (84.07 %) |
311,174 (3.20 %) |
125,534 (0.72 %) |
4,461,288 (20.25 %) |
17,722 (0.91 %) |
| 58 | Burton's mouthbrooder (NCSU 2021) GCF_018398535.1 |
52,584 (12.38 %) |
15,229 (2.54 %) |
47,264 (5.92 %) |
n/a | 40.68 (89.05 %) |
32,418 (10.97 %) |
7,421 (100.00 %) |
812,382 (17.52 %) |
158,486 (1.12 %) |
4,571,794 (23.61 %) |
22,763 (1.21 %) |
| 59 | butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021) GCA_020382915.1 |
n/a | 15,228 (3.42 %) |
41,322 (7.36 %) |
n/a | 41.47 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
1,592 (100.00 %) |
972,098 (18.43 %) |
155,031 (1.41 %) |
3,452,400 (21.36 %) |
15,255 (1.12 %) |
| 60 | butterfish (fScaArg1 primary hap 2021) GCF_020382885.2 |
52,828 (14.10 %) |
15,261 (3.43 %) |
40,580 (7.38 %) |
n/a | 41.49 (99.70 %) |
77 (0.30 %) |
48 (100.00 %) |
413,775 (3.11 %) |
160,299 (1.55 %) |
3,420,994 (21.24 %) |
15,574 (1.13 %) |
| 61 | California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022) GCA_022749735.1 |
n/a | 19,842 (2.16 %) |
72,007 (6.04 %) |
n/a | 41.70 (99.97 %) |
2,679 (0.02 %) |
15,877 (99.98 %) |
1,911,945 (24.70 %) |
364,933 (8.56 %) |
6,201,042 (32.00 %) |
39,114 (1.56 %) |
| 62 | California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022) GCA_022749685.1 |
n/a | 15,277 (2.46 %) |
46,371 (5.95 %) |
n/a | 41.58 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
179 (100.00 %) |
1,369,186 (24.73 %) |
232,889 (8.56 %) |
4,426,065 (31.90 %) |
27,134 (1.64 %) |
| 63 | channel catfish (USDA103 v2.0 2022) GCF_001660625.3 |
59,187 (10.70 %) |
15,782 (2.57 %) |
45,562 (5.15 %) |
n/a | 39.82 (99.35 %) |
100 (0.65 %) |
137 (100.00 %) |
2,257,240 (46.82 %) |
671,926 (8.67 %) |
5,043,664 (36.53 %) |
34,284 (2.16 %) |
| 64 | channel bull blenny (2019 refseq) GCF_900634415.1 |
40,788 (11.04 %) |
14,472 (3.02 %) |
24,012 (6.59 %) |
60,720 (10.43 %) |
40.96 (99.58 %) |
445 (0.42 %) |
322 (100.00 %) |
420,697 (5.49 %) |
320,518 (6.91 %) |
3,394,846 (28.67 %) |
20,453 (1.39 %) |
| 65 | channel bull blenny (alternate hap 2019) GCA_900634435.1 |
n/a | 15,980 (2.79 %) |
53,680 (6.62 %) |
n/a | 40.96 (100.00 %) |
10 (0.00 %) |
11,565 (100.00 %) |
451,656 (4.76 %) |
321,158 (5.51 %) |
3,800,099 (26.83 %) |
20,338 (1.21 %) |
| 66 | chichlid (S. diagramma) GCF_900408965.1 |
61,496 (12.33 %) |
15,296 (2.30 %) |
50,818 (6.10 %) |
n/a | 40.92 (100.00 %) |
942 (0.00 %) |
823 (100.00 %) |
920,881 (19.96 %) |
193,629 (1.36 %) |
4,724,179 (28.98 %) |
28,565 (1.65 %) |
| 67 | Chinese cavefish (2022) GCF_024868665.1 |
48,058 (11.91 %) |
16,738 (3.72 %) |
46,295 (6.80 %) |
n/a | 39.61 (98.56 %) |
9,510 (1.45 %) |
1,039 (100.00 %) |
1,469,931 (44.44 %) |
188,838 (2.34 %) |
3,624,116 (35.94 %) |
44,615 (5.01 %) |
| 68 | Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020) GCF_014805685.1 |
49,677 (9.64 %) |
15,266 (2.70 %) |
40,151 (5.21 %) |
n/a | 38.75 (99.82 %) |
597 (0.18 %) |
286 (100.00 %) |
772,209 (6.45 %) |
630,039 (7.45 %) |
4,729,261 (37.48 %) |
24,310 (1.76 %) |
| 69 | Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022) GCF_019703515.2 |
89,005 (6.31 %) |
26,613 (1.64 %) |
77,184 (3.14 %) |
n/a | 39.08 (100.00 %) |
224 (0.00 %) |
353 (100.00 %) |
9,298,177 (59.91 %) |
977,119 (3.49 %) |
13,499,422 (52.38 %) |
100,309 (2.90 %) |
| 70 | Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq) GCF_018296145.1 |
92,383 (5.73 %) |
26,372 (1.57 %) |
107,059 (4.12 %) |
157,582 (6.65 %) |
43.55 (99.99 %) |
2,334 (0.01 %) |
9,978 (99.99 %) |
1,483,168 (7.79 %) |
2,306,695 (23.48 %) |
10,038,888 (54.54 %) |
62,726 (1.40 %) |
| 71 | Chinook salmon (v1 2018 female) GCF_002872995.1 |
81,340 (5.14 %) |
27,462 (1.53 %) |
54,538 (3.80 %) |
n/a | 43.55 (97.26 %) |
272,151 (2.76 %) |
15,944 (99.99 %) |
1,207,194 (4.55 %) |
2,524,408 (13.75 %) |
12,127,831 (47.56 %) |
87,959 (2.02 %) |
| 72 | chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022) GCA_027409835.1 |
n/a | 15,165 (2.44 %) |
46,105 (6.16 %) |
n/a | 39.93 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,163 (100.00 %) |
1,546,066 (27.08 %) |
537,737 (9.87 %) |
4,485,153 (30.70 %) |
14,774 (0.81 %) |
| 73 | chub mackerel (primary hap 2022 refseq) GCF_027409825.1 |
34,390 (6.95 %) |
15,348 (2.35 %) |
46,858 (6.07 %) |
n/a | 40.01 (99.92 %) |
1,572 (0.08 %) |
360 (100.00 %) |
1,669,322 (28.44 %) |
638,340 (11.55 %) |
4,613,373 (32.38 %) |
16,290 (0.85 %) |
| 74 | chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020) GCF_012931545.1 |
76,338 (6.27 %) |
23,186 (1.70 %) |
90,881 (4.14 %) |
n/a | 43.06 (95.36 %) |
242,238 (4.66 %) |
28,109 (99.98 %) |
1,143,292 (6.07 %) |
1,487,818 (12.14 %) |
8,992,314 (46.24 %) |
51,797 (1.25 %) |
| 75 | chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022) GCF_023373465.1 |
205,915 (6.68 %) |
26,582 (1.42 %) |
119,437 (4.14 %) |
120,379 (5.87 %) |
43.89 (99.99 %) |
3,433 (0.01 %) |
17,480 (99.99 %) |
1,160,500 (5.63 %) |
2,584,312 (31.72 %) |
10,621,107 (55.67 %) |
68,538 (1.53 %) |
| 76 | climbing perch (v1.3 2021) GCA_900324465.3 |
n/a | 15,241 (3.53 %) |
39,067 (7.54 %) |
67,055 (11.68 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
51 (100.00 %) |
633,883 (15.28 %) |
130,249 (1.89 %) |
3,325,008 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
| 77 | climbing perch (alternate hap 2019) GCA_900650485.1 |
n/a | 14,940 (3.51 %) |
39,688 (7.41 %) |
n/a | 40.40 (99.61 %) |
36 (0.39 %) |
2,641 (100.00 %) |
307,993 (2.63 %) |
121,935 (1.79 %) |
3,190,928 (20.98 %) |
10,131 (0.86 %) |
| 78 | clown anemonefish (DU_AmpOce 2017) GCF_002776465.1 |
53,567 (9.24 %) |
15,685 (2.23 %) |
33,477 (5.63 %) |
n/a | 39.47 (99.94 %) |
1,406 (0.06 %) |
6,405 (100.00 %) |
431,950 (2.92 %) |
381,394 (4.84 %) |
4,952,343 (31.95 %) |
23,543 (1.15 %) |
| 79 | clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022) GCF_022539595.1 |
53,912 (11.11 %) |
15,702 (2.37 %) |
47,805 (5.50 %) |
n/a | 39.59 (99.98 %) |
1,454 (0.02 %) |
354 (100.00 %) |
1,346,903 (35.25 %) |
401,782 (5.36 %) |
4,891,035 (31.59 %) |
23,489 (1.28 %) |
| 80 | coho salmon (150728-3 2019) GCF_002021735.2 |
100,850 (6.58 %) |
27,072 (1.56 %) |
50,811 (3.95 %) |
125,873 (5.26 %) |
43.55 (99.98 %) |
5,631 (0.02 %) |
4,482 (100.00 %) |
1,491,966 (6.88 %) |
2,135,217 (25.52 %) |
10,152,659 (54.74 %) |
65,662 (1.36 %) |
| 81 | common carp SPL01 (2021) GCF_018340385.1 |
91,210 (7.89 %) |
31,041 (2.89 %) |
89,244 (5.01 %) |
n/a | 37.11 (99.53 %) |
26,351 (0.48 %) |
6,701 (100.00 %) |
1,634,612 (6.00 %) |
919,239 (3.97 %) |
10,192,037 (38.56 %) |
52,638 (1.62 %) |
| 82 | common dab (primary hap 2023) GCF_963576545.1 |
36,211 (8.34 %) |
14,995 (2.62 %) |
50,844 (6.89 %) |
n/a | 42.67 (99.99 %) |
275 (0.01 %) |
338 (100.00 %) |
1,186,799 (32.17 %) |
307,864 (16.34 %) |
3,562,802 (35.00 %) |
41,657 (2.72 %) |
| 83 | common sole (alternate hap 2023) GCA_958295035.1 |
n/a | 14,904 (2.99 %) |
43,194 (7.09 %) |
n/a | 40.77 (100.00 %) |
n/a | 1,318 (100.00 %) |
1,128,080 (18.77 %) |
328,975 (8.35 %) |
3,952,898 (31.64 %) |
26,979 (2.08 %) |
| 84 | common sole (primary hap 2023 refseq) GCF_958295425.1 |
55,359 (12.02 %) |
14,844 (2.94 %) |
42,832 (6.93 %) |
n/a | 40.87 (99.99 %) |
373 (0.01 %) |
242 (100.00 %) |
1,149,243 (19.12 %) |
342,238 (9.71 %) |
3,906,753 (32.84 %) |
27,772 (2.71 %) |
| 85 | convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021) GCA_020510965.1 |
n/a | 5,231 (0.27 %) |
47,644 (1.48 %) |
n/a | 44.62 (99.99 %) |
144 (0.01 %) |
21,561 (99.99 %) |
2,803,873 (49.20 %) |
655,416 (2.69 %) |
7,558,550 (67.05 %) |
181,626 (10.52 %) |
| 86 | convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021) GCA_020510985.1 |
n/a | n/a | 134,417 (1.50 %) |
n/a | 44.52 (99.13 %) |
2,580 (0.87 %) |
512 (100.00 %) |
9,062,541 (49.33 %) |
2,097,650 (2.66 %) |
3,092 (99.13 %) |
568,042 (10.14 %) |
| 87 | copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021) GCA_017976315.1 |
n/a | 13,622 (2.81 %) |
43,285 (6.93 %) |
n/a | 42.59 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,125 (100.00 %) |
1,741,373 (32.89 %) |
182,926 (2.01 %) |
3,659,106 (21.68 %) |
27,693 (1.89 %) |
| 88 | copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021) GCF_017976325.1 |
35,291 (10.46 %) |
15,210 (3.03 %) |
44,916 (6.99 %) |
61,755 (8.99 %) |
42.57 (100.00 %) |
60 (0.00 %) |
29 (100.00 %) |
406,118 (2.95 %) |
199,450 (2.10 %) |
3,861,745 (21.57 %) |
29,106 (1.85 %) |
| 89 | crucian carp (alternate hap 2023) GCA_963082795.1 |
n/a | 4,509 (3.03 %) |
16,936 (7.22 %) |
n/a | 38.67 (100.00 %) |
n/a | 3,713 (100.00 %) |
430,197 (46.38 %) |
101,926 (7.54 %) |
1,077,239 (32.21 %) |
10,612 (4.11 %) |
| 90 | crucian carp (primary hap 2023 refseq) GCF_963082965.1 |
90,094 (6.75 %) |
29,386 (2.81 %) |
88,291 (5.37 %) |
n/a | 38.31 (99.99 %) |
832 (0.01 %) |
277 (100.00 %) |
3,481,382 (45.81 %) |
802,773 (6.54 %) |
8,190,783 (44.41 %) |
83,696 (3.82 %) |
| 91 | cuckoo wrasse (primary hap 2023) GCF_963584025.1 |
51,190 (10.37 %) |
15,144 (2.59 %) |
43,207 (5.98 %) |
n/a | 40.77 (99.98 %) |
570 (0.02 %) |
324 (100.00 %) |
1,435,625 (29.39 %) |
330,276 (12.54 %) |
4,196,830 (33.83 %) |
19,310 (1.01 %) |
| 92 | cunner (fTauAds1 alternate hap 2021) GCA_020745675.1 |
n/a | 14,861 (2.74 %) |
42,996 (6.34 %) |
n/a | 41.31 (99.99 %) |
31 (0.01 %) |
1,476 (100.00 %) |
1,373,727 (30.17 %) |
220,572 (4.38 %) |
4,176,936 (27.32 %) |
17,129 (1.04 %) |
| 93 | cunner (fRauAds1 primary hap 2021) GCA_020745685.1 |
n/a | 15,192 (2.74 %) |
43,564 (6.38 %) |
n/a | 41.31 (99.41 %) |
283 (0.59 %) |
64 (100.00 %) |
1,419,667 (30.50 %) |
243,024 (4.81 %) |
4,334,690 (27.65 %) |
17,974 (1.06 %) |
| 94 | Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020) GCF_015846415.1 |
49,108 (12.72 %) |
16,501 (4.06 %) |
40,671 (7.11 %) |
n/a | 38.77 (100.00 %) |
116 (0.00 %) |
167 (100.00 %) |
1,213,719 (40.21 %) |
134,299 (3.43 %) |
3,676,403 (30.98 %) |
29,879 (3.18 %) |
| 95 | Danionella translucida (Bolton 2019) GCA_007224835.1 |
n/a | 16,341 (3.18 %) |
41,545 (5.47 %) |
n/a | 38.57 (98.69 %) |
8,366 (1.31 %) |
36,005 (98.69 %) |
300,659 (2.50 %) |
212,357 (6.15 %) |
4,267,143 (35.05 %) |
23,311 (2.18 %) |
| 96 | Danionella translucida (fDanTra1 2020) GCA_903798025.1 |
n/a | 15,965 (3.73 %) |
37,421 (5.87 %) |
n/a | 38.52 (94.12 %) |
18,487 (5.88 %) |
29,831 (94.12 %) |
251,333 (2.28 %) |
132,120 (1.41 %) |
4,061,554 (28.83 %) |
16,871 (1.57 %) |
| 97 | dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq) GCF_021462225.1 |
56,220 (7.59 %) |
15,422 (1.71 %) |
50,084 (4.18 %) |
n/a | 40.18 (99.46 %) |
409 (0.54 %) |
72 (100.00 %) |
369,606 (1.86 %) |
176,954 (1.87 %) |
6,142,638 (38.35 %) |
32,973 (1.28 %) |
| 98 | delta smelt GCF_021917145.1 |
41,807 (14.97 %) |
14,549 (4.09 %) |
44,849 (9.74 %) |
n/a | 44.99 (99.92 %) |
1,474 (0.08 %) |
376 (100.00 %) |
387,882 (5.57 %) |
383,522 (9.22 %) |
1,814,696 (32.48 %) |
28,299 (3.33 %) |
| 99 | denticle herring (v2 2020) GCA_900700375.2 |
n/a | 16,559 (3.78 %) |
58,823 (8.66 %) |
74,128 (10.47 %) |
43.69 (99.18 %) |
464 (0.82 %) |
461 (100.00 %) |
403,512 (3.23 %) |
224,284 (4.61 %) |
2,948,738 (28.79 %) |
64,661 (9.49 %) |
| 100 | denticle herring (alternate hap 2019) GCA_900700345.2 |
n/a | 14,119 (3.95 %) |
47,988 (8.57 %) |
n/a | 43.51 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
1,972 (100.00 %) |
312,660 (2.77 %) |
160,575 (2.83 %) |
2,525,528 (27.70 %) |
50,830 (8.72 %) |
| 101 | dorado (hap1 2023) GCA_030448965.1 |
n/a | 16,788 (2.12 %) |
50,338 (4.68 %) |
n/a | 41.27 (98.12 %) |
641 (1.88 %) |
182 (100.00 %) |
2,709,759 (34.74 %) |
798,364 (14.84 %) |
5,418,190 (36.02 %) |
30,055 (1.31 %) |
| 102 | dorado (hap2 2023) GCA_030463535.1 |
n/a | 16,799 (2.11 %) |
50,411 (4.67 %) |
n/a | 41.29 (99.15 %) |
726 (0.85 %) |
104 (100.00 %) |
2,693,928 (34.60 %) |
805,807 (14.65 %) |
5,615,731 (36.69 %) |
30,083 (1.31 %) |
| 103 | dwarf seahorse (Florida 2022) GCF_025434085.1 |
51,353 (12.50 %) |
13,736 (3.19 %) |
50,537 (7.64 %) |
n/a | 44.73 (100.00 %) |
79 (0.00 %) |
213 (100.00 %) |
986,789 (36.30 %) |
235,862 (13.25 %) |
2,323,084 (41.85 %) |
68,121 (17.75 %) |
| 104 | eastern happy (v3 2021) GCA_900246225.5 |
n/a | 15,552 (2.29 %) |
52,465 (6.26 %) |
86,437 (9.40 %) |
41.07 (99.87 %) |
490 (0.13 %) |
364 (100.00 %) |
1,309,350 (35.93 %) |
217,916 (1.89 %) |
4,547,434 (30.78 %) |
33,005 (1.88 %) |
| 105 | electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020) GCA_013347915.1 |
n/a | 12,020 (3.63 %) |
38,881 (7.31 %) |
n/a | 42.77 (100.00 %) |
n/a | 2,629 (100.00 %) |
429,509 (7.66 %) |
432,260 (11.41 %) |
2,049,609 (24.32 %) |
35,597 (4.37 %) |
| 106 | electric eel (fEleEle1 primary hap 2020) GCF_013358815.1 |
48,958 (12.10 %) |
15,950 (3.66 %) |
48,976 (7.25 %) |
54,541 (8.42 %) |
42.49 (98.20 %) |
227 (1.80 %) |
89 (100.00 %) |
567,625 (7.41 %) |
564,286 (10.86 %) |
2,935,360 (24.79 %) |
44,501 (3.93 %) |
| 107 | electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin) GCF_003665695.1 |
40,618 (11.48 %) |
15,837 (3.85 %) |
23,074 (6.63 %) |
n/a | 42.56 (96.95 %) |
119,361 (3.09 %) |
8,786 (100.00 %) |
519,014 (5.41 %) |
516,718 (6.65 %) |
3,020,801 (21.49 %) |
41,947 (3.71 %) |
| 108 | elephant fish B.brachyistius (T26 2022) GCF_023856365.1 |
82,153 (9.98 %) |
16,513 (2.13 %) |
79,047 (6.37 %) |
n/a | 44.15 (99.99 %) |
234 (0.01 %) |
1,425 (100.00 %) |
923,543 (11.79 %) |
425,650 (9.45 %) |
3,525,237 (34.97 %) |
91,552 (5.39 %) |
| 109 | emerald rockcod GCF_902827165.1 |
44,179 (8.48 %) |
15,275 (2.20 %) |
57,830 (6.43 %) |
63,731 (6.65 %) |
40.94 (99.99 %) |
932 (0.01 %) |
864 (100.00 %) |
460,185 (3.64 %) |
399,729 (6.87 %) |
3,533,188 (40.09 %) |
52,191 (2.51 %) |
| 110 | Eurasian minnow (alternate hap 2023) GCA_949152275.1 |
n/a | 17,920 (3.03 %) |
59,697 (6.61 %) |
n/a | 39.13 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
4,949 (100.00 %) |
2,285,870 (44.17 %) |
480,649 (10.13 %) |
4,833,803 (39.56 %) |
57,737 (4.15 %) |
| 111 | Eurasian minnow (primary hap 2023) GCA_949152265.1 |
n/a | 17,661 (3.01 %) |
58,218 (6.54 %) |
n/a | 39.21 (99.98 %) |
881 (0.02 %) |
125 (100.00 %) |
2,346,939 (44.27 %) |
502,415 (11.23 %) |
4,890,830 (40.45 %) |
60,482 (4.22 %) |
| 112 | European chub (alternate hap 2023) GCA_949319155.1 |
n/a | 17,416 (2.74 %) |
60,936 (6.02 %) |
n/a | 38.65 (100.00 %) |
12 (0.00 %) |
7,437 (100.00 %) |
2,377,147 (47.98 %) |
578,235 (8.27 %) |
5,267,308 (40.22 %) |
50,909 (3.45 %) |
| 113 | European chub (primary hap 2023) GCA_949319135.1 |
n/a | 18,028 (2.64 %) |
64,206 (6.04 %) |
n/a | 38.73 (99.99 %) |
588 (0.01 %) |
106 (100.00 %) |
2,649,943 (48.88 %) |
666,129 (9.08 %) |
5,751,610 (41.56 %) |
58,471 (3.64 %) |
| 114 | European flounder (alternate hap 2023) GCA_949316195.1 |
n/a | 14,690 (3.17 %) |
48,422 (7.90 %) |
n/a | 42.61 (100.00 %) |
n/a | 1,915 (100.00 %) |
1,138,190 (26.31 %) |
249,865 (4.72 %) |
3,352,038 (25.55 %) |
36,828 (3.13 %) |
| 115 | European flounder (primary hap 2023) GCA_949316205.1 |
n/a | 14,753 (3.17 %) |
47,618 (7.81 %) |
n/a | 42.59 (99.98 %) |
482 (0.02 %) |
109 (100.00 %) |
1,160,784 (27.06 %) |
251,985 (5.23 %) |
3,353,121 (26.00 %) |
37,130 (2.79 %) |
| 116 | European perch GCF_010015445.1 |
55,605 (8.20 %) |
15,430 (2.07 %) |
55,499 (5.43 %) |
n/a | 40.90 (99.97 %) |
801 (0.03 %) |
303 (100.00 %) |
684,094 (5.16 %) |
634,788 (7.48 %) |
5,182,241 (37.07 %) |
44,049 (1.94 %) |
| 117 | European plaice (alternate hap 2022) GCA_947347695.1 |
n/a | 14,619 (2.94 %) |
50,389 (7.92 %) |
n/a | 42.58 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
3,222 (100.00 %) |
430,112 (3.88 %) |
299,581 (6.89 %) |
3,182,258 (27.97 %) |
40,094 (3.66 %) |
| 118 | European plaice (primary hap 2022 refseq) GCF_947347685.1 |
46,468 (10.51 %) |
14,818 (2.71 %) |
51,453 (7.41 %) |
n/a | 42.51 (99.97 %) |
1,072 (0.03 %) |
355 (100.00 %) |
476,314 (3.63 %) |
520,729 (13.27 %) |
3,283,360 (33.55 %) |
47,050 (4.45 %) |
| 119 | European seabass (2021) GCF_905237075.1 |
62,457 (13.08 %) |
15,582 (2.89 %) |
44,472 (6.56 %) |
69,435 (12.92 %) |
40.38 (99.85 %) |
272 (0.15 %) |
303 (100.00 %) |
1,210,970 (24.30 %) |
278,140 (4.02 %) |
4,343,442 (26.18 %) |
15,975 (0.93 %) |
| 120 | fathead minnow GCF_016745375.1 |
57,312 (8.34 %) |
18,039 (3.02 %) |
52,431 (6.01 %) |
n/a | 38.45 (86.78 %) |
5,594 (13.23 %) |
911 (100.00 %) |
657,027 (4.09 %) |
444,571 (6.23 %) |
4,902,960 (35.69 %) |
49,361 (2.78 %) |
| 121 | flathead mullet GCF_022458985.1 |
48,689 (12.71 %) |
14,908 (3.00 %) |
45,084 (6.96 %) |
75,582 (11.23 %) |
41.90 (99.97 %) |
445 (0.04 %) |
24 (100.00 %) |
469,841 (3.23 %) |
207,738 (2.31 %) |
3,955,233 (24.74 %) |
45,885 (3.03 %) |
| 122 | flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq) GCF_007364275.1 |
43,842 (8.12 %) |
15,434 (2.15 %) |
26,448 (5.90 %) |
64,657 (6.60 %) |
41.23 (98.19 %) |
744 (1.81 %) |
188 (100.00 %) |
1,014,141 (16.95 %) |
287,035 (2.21 %) |
5,305,890 (30.67 %) |
24,130 (1.26 %) |
| 123 | flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019) GCA_007364235.1 |
n/a | 17,494 (2.06 %) |
62,257 (5.73 %) |
n/a | 41.17 (99.98 %) |
13 (0.02 %) |
9,305 (99.98 %) |
1,140,986 (16.60 %) |
316,083 (2.17 %) |
6,036,560 (30.48 %) |
26,445 (1.22 %) |
| 124 | freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020) GCA_014839645.1 |
n/a | 13,745 (2.58 %) |
50,416 (6.72 %) |
n/a | 41.33 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
5,171 (100.00 %) |
442,646 (4.09 %) |
276,927 (5.42 %) |
3,741,267 (26.25 %) |
28,827 (2.28 %) |
| 125 | freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020) GCA_014839995.1 |
n/a | 14,625 (2.57 %) |
52,879 (6.72 %) |
n/a | 41.41 (98.98 %) |
1,373 (1.02 %) |
410 (100.00 %) |
492,828 (4.29 %) |
318,631 (5.94 %) |
3,977,536 (27.41 %) |
32,390 (2.33 %) |
| 126 | giant grouper GCF_005281545.1 |
45,328 (7.65 %) |
15,661 (1.91 %) |
53,910 (4.91 %) |
n/a | 41.26 (96.40 %) |
23,415 (3.61 %) |
4,201 (100.00 %) |
604,763 (2.71 %) |
357,944 (2.52 %) |
6,501,327 (30.28 %) |
26,431 (0.91 %) |
| 127 | gilthead seabream (v2 2021) GCA_900880675.2 |
n/a | 15,752 (2.45 %) |
56,395 (6.58 %) |
n/a | 41.94 (99.96 %) |
1,050 (0.04 %) |
176 (100.00 %) |
1,474,134 (29.50 %) |
305,809 (3.03 %) |
4,701,691 (25.69 %) |
47,327 (2.41 %) |
| 128 | gilthead seabream (alternate hap 2019) GCA_900880695.1 |
n/a | 13,090 (2.37 %) |
48,927 (6.41 %) |
n/a | 41.97 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
7,241 (100.00 %) |
422,758 (2.89 %) |
231,452 (2.54 %) |
3,818,141 (24.36 %) |
38,368 (2.40 %) |
| 129 | golden-line barbel GCF_001515645.1 |
74,071 (6.71 %) |
29,486 (2.77 %) |
55,545 (5.32 %) |
n/a | 37.54 (89.58 %) |
136,894 (10.45 %) |
168,074 (89.55 %) |
1,118,646 (5.04 %) |
718,426 (6.54 %) |
9,092,306 (37.16 %) |
70,606 (1.91 %) |
| 130 | goldfish GCF_003368295.1 |
116,745 (8.75 %) |
35,097 (2.94 %) |
68,251 (6.12 %) |
n/a | 37.48 (99.99 %) |
2,247 (0.01 %) |
8,463 (99.99 %) |
1,693,800 (5.39 %) |
916,195 (5.01 %) |
9,731,118 (40.19 %) |
66,585 (2.06 %) |
| 131 | grass carp (HZGC_01 2021) GCF_019924925.1 |
67,810 (11.16 %) |
18,195 (3.27 %) |
48,459 (5.67 %) |
n/a | 37.48 (99.98 %) |
150 (0.02 %) |
31 (100.00 %) |
654,416 (3.33 %) |
429,734 (3.77 %) |
5,501,085 (40.21 %) |
26,282 (1.58 %) |
| 132 | great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022) GCF_026225935.1 |
36,344 (7.09 %) |
14,512 (1.92 %) |
45,809 (4.61 %) |
n/a | 39.76 (99.63 %) |
3,407 (0.37 %) |
600 (100.00 %) |
2,662,894 (54.47 %) |
803,911 (10.32 %) |
5,763,692 (48.31 %) |
53,808 (2.65 %) |
| 133 | great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI) GCF_000788275.1 |
25,822 (5.19 %) |
14,212 (1.97 %) |
27,894 (4.68 %) |
n/a | 39.49 (93.15 %) |
92,327 (6.89 %) |
108,947 (93.11 %) |
552,368 (5.00 %) |
742,395 (8.07 %) |
5,901,720 (42.46 %) |
44,972 (1.97 %) |
| 134 | greater amberjack GCF_002260705.1 |
33,756 (9.11 %) |
15,336 (2.93 %) |
22,220 (6.07 %) |
n/a | 40.86 (99.17 %) |
9,742 (0.82 %) |
34,656 (100.00 %) |
573,770 (4.04 %) |
368,800 (3.72 %) |
4,449,534 (24.71 %) |
15,850 (0.98 %) |
| 135 | greater argentine (alternate hap 2023) GCA_951799415.1 |
n/a | 15,483 (3.45 %) |
47,484 (7.95 %) |
n/a | 44.71 (100.00 %) |
n/a | 4,805 (100.00 %) |
1,400,150 (23.78 %) |
738,163 (17.35 %) |
2,460,977 (35.90 %) |
20,794 (2.09 %) |
| 136 | greater argentine (primary hap 2023) GCA_951799395.1 |
n/a | 16,553 (3.15 %) |
51,766 (7.37 %) |
n/a | 44.75 (99.95 %) |
1,752 (0.05 %) |
1,085 (100.00 %) |
1,674,762 (26.07 %) |
900,455 (18.62 %) |
2,849,256 (39.22 %) |
26,022 (2.30 %) |
| 137 | greater pipefish (v1.2 2020 refseq) GCF_901709675.1 |
47,335 (18.32 %) |
13,477 (5.26 %) |
42,380 (12.01 %) |
37,563 (15.76 %) |
43.46 (100.00 %) |
43 (0.00 %) |
87 (100.00 %) |
193,407 (3.05 %) |
125,716 (4.25 %) |
1,676,004 (25.93 %) |
46,327 (10.97 %) |
| 138 | greater pipefish (v2 2023 genbank) GCA_948146105.1 |
n/a | 13,412 (4.76 %) |
45,946 (11.50 %) |
n/a | 44.34 (99.99 %) |
95 (0.01 %) |
251 (100.00 %) |
494,547 (20.10 %) |
204,804 (10.66 %) |
1,444,044 (34.08 %) |
47,904 (17.47 %) |
| 139 | greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023) GCA_948146095.1 |
n/a | 13,681 (4.93 %) |
45,034 (11.64 %) |
n/a | 43.88 (100.00 %) |
n/a | 4,533 (100.00 %) |
460,038 (18.47 %) |
163,838 (7.90 %) |
1,681,190 (29.08 %) |
47,523 (15.60 %) |
| 140 | greater pipefish (v1 alternate hap 2019) GCA_901709685.1 |
n/a | 10,795 (5.59 %) |
33,380 (12.07 %) |
n/a | 43.29 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
1,848 (100.00 %) |
140,376 (2.96 %) |
81,000 (3.32 %) |
1,318,564 (23.30 %) |
34,104 (12.82 %) |
| 141 | greater sand-eel (alternate hap 2023) GCA_949358355.1 |
n/a | 13,432 (2.10 %) |
50,930 (6.39 %) |
n/a | 41.05 (100.00 %) |
n/a | 4,952 (100.00 %) |
2,495,763 (38.80 %) |
473,105 (6.27 %) |
3,444,123 (38.56 %) |
35,298 (1.94 %) |
| 142 | greater sand-eel (primary hap 2023) GCA_949357725.1 |
n/a | 15,028 (2.35 %) |
50,436 (6.30 %) |
n/a | 41.10 (99.97 %) |
1,188 (0.03 %) |
1,568 (100.00 %) |
2,688,222 (39.74 %) |
549,362 (7.60 %) |
3,564,661 (40.05 %) |
37,043 (1.94 %) |
| 143 | green swordtail GCF_003331165.1 |
52,602 (11.81 %) |
14,955 (2.58 %) |
47,115 (6.33 %) |
n/a | 39.09 (99.71 %) |
661 (0.29 %) |
272 (100.00 %) |
328,469 (2.10 %) |
162,178 (2.35 %) |
4,801,050 (28.86 %) |
37,217 (2.39 %) |
| 144 | gudgeon (alternate hap 2023) GCA_949357705.1 |
n/a | 16,645 (1.92 %) |
62,533 (4.55 %) |
n/a | 39.69 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
7,253 (100.00 %) |
5,166,731 (67.78 %) |
750,850 (11.35 %) |
5,903,440 (54.20 %) |
90,235 (5.58 %) |
| 145 | gudgeon (primary hap 2023) GCA_949357685.1 |
n/a | 17,136 (1.90 %) |
63,611 (4.50 %) |
n/a | 39.74 (99.99 %) |
1,046 (0.01 %) |
233 (100.00 %) |
5,662,029 (68.75 %) |
825,757 (11.99 %) |
6,236,024 (55.15 %) |
99,559 (5.68 %) |
| 146 | Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq) GCF_024217435.1 |
58,587 (18.27 %) |
13,442 (4.00 %) |
41,565 (8.87 %) |
n/a | 44.92 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
496 (100.00 %) |
253,033 (3.86 %) |
180,311 (16.78 %) |
1,339,521 (43.63 %) |
51,080 (18.49 %) |
| 147 | Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank) GCA_024217435.4 |
n/a | 13,441 (4.00 %) |
41,519 (8.87 %) |
n/a | 44.92 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
496 (100.00 %) |
644,601 (20.82 %) |
180,310 (16.78 %) |
1,339,461 (43.63 %) |
51,080 (18.49 %) |
| 148 | guppy GCF_000633615.1 |
48,290 (11.24 %) |
14,436 (2.72 %) |
44,759 (6.24 %) |
n/a | 39.33 (90.86 %) |
458,354 (9.22 %) |
40,143 (90.84 %) |
340,480 (2.43 %) |
167,943 (1.50 %) |
4,695,380 (25.63 %) |
35,188 (1.91 %) |
| 149 | honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020) GCA_015220095.1 |
n/a | 15,058 (2.50 %) |
46,340 (5.85 %) |
n/a | 40.71 (100.00 %) |
21 (0.00 %) |
2,131 (100.00 %) |
1,642,351 (37.42 %) |
389,169 (5.43 %) |
4,687,710 (35.55 %) |
34,408 (1.75 %) |
| 150 | honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020) GCF_015220745.1 |
57,752 (9.94 %) |
15,244 (2.44 %) |
47,034 (5.98 %) |
63,546 (8.88 %) |
40.77 (99.83 %) |
215 (0.17 %) |
138 (100.00 %) |
524,161 (3.79 %) |
422,265 (6.20 %) |
4,827,148 (36.22 %) |
37,878 (1.84 %) |
| 151 | horned golden-line barbel GCF_001515625.1 |
74,585 (6.94 %) |
30,802 (3.11 %) |
57,655 (5.63 %) |
n/a | 37.18 (91.91 %) |
150,790 (8.11 %) |
314,962 (91.89 %) |
1,147,234 (4.93 %) |
708,513 (4.77 %) |
9,080,512 (35.95 %) |
63,217 (1.71 %) |
| 152 | humphead wrasse GCF_018320785.1 |
42,229 (6.60 %) |
15,287 (1.66 %) |
47,025 (4.13 %) |
n/a | 39.53 (100.00 %) |
284 (0.00 %) |
46 (100.00 %) |
447,458 (2.27 %) |
310,170 (4.65 %) |
8,002,463 (32.97 %) |
12,252 (0.38 %) |
| 153 | Indian medaka GCF_002922805.2 |
49,295 (10.27 %) |
14,591 (2.49 %) |
52,982 (6.37 %) |
n/a | 39.04 (94.83 %) |
51,550 (5.20 %) |
8,493 (100.00 %) |
319,151 (2.20 %) |
208,690 (2.67 %) |
5,412,546 (33.29 %) |
40,721 (2.36 %) |
| 154 | Indian glassy fish (v2 2020) GCA_900634625.2 |
n/a | 15,339 (3.60 %) |
44,099 (8.47 %) |
57,867 (10.10 %) |
42.38 (98.08 %) |
1,523 (1.92 %) |
157 (100.00 %) |
346,399 (3.02 %) |
163,524 (3.00 %) |
2,755,274 (25.07 %) |
17,931 (1.47 %) |
| 155 | Indian glassy fish (alternate hap 2019) GCA_900651595.1 |
n/a | 14,412 (3.70 %) |
41,944 (8.58 %) |
n/a | 42.27 (99.58 %) |
230 (0.42 %) |
2,242 (100.00 %) |
304,774 (2.86 %) |
140,555 (2.80 %) |
2,689,154 (24.08 %) |
15,419 (1.38 %) |
| 156 | Indo-Pacific tarpon (2020) GCF_013368585.1 |
41,583 (6.91 %) |
18,302 (2.47 %) |
29,762 (5.45 %) |
74,968 (7.01 %) |
43.02 (99.97 %) |
63 (0.03 %) |
207 (100.00 %) |
603,558 (3.71 %) |
433,446 (4.32 %) |
5,341,985 (22.07 %) |
78,561 (3.69 %) |
| 157 | Japanese flounder GCF_001970005.1 |
37,838 (12.25 %) |
14,521 (3.39 %) |
30,773 (7.34 %) |
n/a | 41.64 (81.04 %) |
40,314 (18.97 %) |
9,525 (100.00 %) |
332,322 (2.84 %) |
164,916 (1.16 %) |
3,476,344 (17.36 %) |
21,768 (1.42 %) |
| 158 | Japanese medaka GCF_002234675.1 |
50,526 (10.32 %) |
14,325 (2.50 %) |
27,912 (6.71 %) |
91,652 (11.67 %) |
40.84 (99.93 %) |
491 (0.07 %) |
25 (100.00 %) |
384,317 (4.42 %) |
163,041 (3.07 %) |
4,631,750 (34.91 %) |
41,215 (2.89 %) |
| 159 | jewelled blenny (2019) GCF_902148845.1 |
42,877 (8.61 %) |
15,188 (2.40 %) |
41,262 (7.86 %) |
58,418 (6.97 %) |
44.34 (98.69 %) |
602 (1.31 %) |
203 (100.00 %) |
667,122 (4.21 %) |
442,004 (5.09 %) |
4,388,570 (26.54 %) |
121,464 (9.36 %) |
| 160 | jewelled blenny (alternate hap 2019) GCA_902148835.1 |
n/a | 15,945 (2.17 %) |
101,825 (8.93 %) |
n/a | 44.49 (99.63 %) |
9 (0.37 %) |
4,516 (100.00 %) |
744,228 (4.25 %) |
519,896 (5.73 %) |
4,677,160 (28.52 %) |
138,484 (9.55 %) |
| 161 | John dory (alternate hap 2023) GCA_960530785.1 |
n/a | 14,960 (2.23 %) |
74,436 (6.65 %) |
n/a | 43.94 (100.00 %) |
n/a | 5,370 (100.00 %) |
1,620,688 (23.00 %) |
902,057 (13.66 %) |
4,547,953 (39.90 %) |
129,990 (12.07 %) |
| 162 | John dory (primary hap 2023) GCA_960531495.1 |
n/a | 14,906 (2.33 %) |
72,029 (6.72 %) |
n/a | 43.92 (99.98 %) |
887 (0.02 %) |
191 (100.00 %) |
1,609,654 (22.82 %) |
897,264 (13.58 %) |
4,548,467 (39.80 %) |
129,147 (11.75 %) |
| 163 | kelp grouper (mb 2019) GCF_006386435.1 |
45,779 (8.57 %) |
15,561 (1.99 %) |
53,188 (5.12 %) |
n/a | 41.32 (97.02 %) |
48,394 (2.99 %) |
4,563 (100.00 %) |
574,889 (2.73 %) |
367,135 (2.64 %) |
6,420,280 (29.10 %) |
28,979 (1.07 %) |
| 164 | lake trout GCF_016432855.1 |
65,012 (4.57 %) |
26,528 (1.53 %) |
112,119 (4.47 %) |
76,885 (3.80 %) |
43.50 (99.99 %) |
3,264 (0.01 %) |
4,121 (100.00 %) |
1,387,896 (5.81 %) |
1,797,785 (19.28 %) |
9,643,314 (54.44 %) |
85,419 (2.52 %) |
| 165 | lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U) GCF_018398675.1 |
78,867 (4.31 %) |
27,579 (1.38 %) |
113,850 (3.63 %) |
n/a | 44.18 (100.00 %) |
1,716 (0.00 %) |
6,355 (100.00 %) |
1,729,029 (6.03 %) |
1,781,307 (15.24 %) |
9,311,548 (61.16 %) |
126,142 (4.04 %) |
| 166 | lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U) GCF_020615455.1 |
87,246 (4.53 %) |
28,366 (1.38 %) |
117,266 (3.71 %) |
n/a | 44.12 (100.00 %) |
1,159 (0.00 %) |
7,334 (100.00 %) |
1,768,537 (6.02 %) |
1,793,716 (15.51 %) |
9,525,312 (61.13 %) |
126,485 (3.95 %) |
| 167 | large yellow croaker GCF_000972845.2 |
49,914 (11.76 %) |
15,365 (3.00 %) |
26,101 (6.66 %) |
n/a | 41.34 (99.67 %) |
7,424 (0.33 %) |
9,998 (100.00 %) |
478,685 (3.50 %) |
306,063 (3.37 %) |
4,199,578 (24.80 %) |
28,138 (2.09 %) |
| 168 | large-eye snaggletooth (alternate hap 2023) GCA_949987545.1 |
n/a | 15,841 (2.36 %) |
79,276 (8.51 %) |
n/a | 46.35 (100.00 %) |
n/a | 5,761 (100.00 %) |
2,935,570 (42.17 %) |
1,208,602 (21.28 %) |
3,157,730 (42.63 %) |
88,759 (6.30 %) |
| 169 | large-eye snaggletooth (primary hap 2023) GCA_949987555.1 |
n/a | 16,376 (2.19 %) |
82,947 (7.99 %) |
n/a | 46.31 (99.94 %) |
2,631 (0.06 %) |
1,522 (100.00 %) |
3,333,323 (43.58 %) |
1,553,932 (25.91 %) |
3,393,507 (46.78 %) |
99,668 (6.39 %) |
| 170 | largemouth bass GCF_014851395.1 |
55,170 (9.49 %) |
16,635 (2.18 %) |
56,707 (5.52 %) |
n/a | 40.86 (99.85 %) |
2,909 (0.15 %) |
4,753 (100.00 %) |
497,281 (2.60 %) |
269,495 (3.70 %) |
5,496,732 (29.60 %) |
28,733 (1.66 %) |
| 171 | largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020) GCA_014839705.1 |
n/a | 8,132 (2.11 %) |
25,878 (4.67 %) |
n/a | 38.55 (100.00 %) |
n/a | 5,088 (100.00 %) |
260,789 (2.73 %) |
158,564 (2.12 %) |
3,023,128 (27.39 %) |
9,678 (1.02 %) |
| 172 | largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020) GCA_014839685.1 |
n/a | 14,774 (2.18 %) |
42,858 (4.83 %) |
58,247 (6.94 %) |
38.54 (99.96 %) |
107 (0.04 %) |
33 (100.00 %) |
506,950 (2.73 %) |
305,170 (2.13 %) |
6,194,879 (29.85 %) |
17,881 (0.94 %) |
| 173 | leopard coralgrouper GCF_008729295.1 |
38,671 (7.52 %) |
15,538 (2.18 %) |
57,480 (5.26 %) |
n/a | 39.54 (98.22 %) |
3,611 (1.77 %) |
94,260 (100.00 %) |
629,451 (3.42 %) |
385,539 (3.83 %) |
6,343,655 (29.35 %) |
27,018 (1.26 %) |
| 174 | lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023) GCA_027579805.1 |
n/a | 15,487 (0.88 %) |
85,135 (3.39 %) |
n/a | 42.43 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
6,593 (100.00 %) |
5,572,163 (49.59 %) |
1,052,072 (6.02 %) |
7,246,646 (62.69 %) |
157,768 (4.38 %) |
| 175 | lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq) GCF_027579695.1 |
53,323 (3.35 %) |
15,955 (0.92 %) |
85,700 (3.30 %) |
n/a | 42.44 (99.43 %) |
334 (0.57 %) |
38 (100.00 %) |
6,041,262 (71.88 %) |
1,126,468 (6.51 %) |
7,609,180 (62.74 %) |
166,630 (4.38 %) |
| 176 | lesser sand-eel (alternate hap 2023) GCA_950004245.1 |
n/a | 13,792 (2.19 %) |
51,353 (6.60 %) |
n/a | 41.16 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
3,620 (100.00 %) |
2,536,362 (38.05 %) |
513,115 (7.50 %) |
3,542,854 (37.60 %) |
31,814 (1.79 %) |
| 177 | lesser sand-eel (primary hap 2023) GCA_949987685.1 |
n/a | 13,908 (2.19 %) |
50,634 (6.50 %) |
n/a | 41.22 (99.97 %) |
1,017 (0.03 %) |
701 (100.00 %) |
2,698,640 (39.19 %) |
577,328 (8.51 %) |
3,615,231 (39.17 %) |
33,251 (1.82 %) |
| 178 | limp eelpout (alternate hap 2023) GCA_949748265.1 |
n/a | 15,033 (2.98 %) |
51,296 (7.68 %) |
n/a | 43.01 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
2,700 (100.00 %) |
1,099,919 (28.68 %) |
314,919 (9.57 %) |
2,620,601 (30.23 %) |
49,248 (4.19 %) |
| 179 | limp eelpout (primary hap 2023) GCA_949748355.1 |
n/a | 15,060 (2.89 %) |
50,064 (7.31 %) |
n/a | 41.88 (99.98 %) |
589 (0.02 %) |
534 (100.00 %) |
1,116,427 (28.18 %) |
315,489 (13.14 %) |
2,598,812 (33.21 %) |
50,192 (3.82 %) |
| 180 | live sharksucker (v2 2021) GCA_900963305.2 |
n/a | 14,975 (3.53 %) |
40,908 (7.56 %) |
n/a | 41.43 (99.89 %) |
140 (0.11 %) |
38 (100.00 %) |
772,309 (14.49 %) |
146,353 (1.65 %) |
3,204,473 (21.79 %) |
16,807 (1.33 %) |
| 181 | live sharksucker (alternate hap 2019) GCA_900963505.1 |
n/a | 14,632 (3.51 %) |
40,441 (7.51 %) |
n/a | 41.42 (99.96 %) |
19 (0.04 %) |
1,405 (100.00 %) |
435,742 (3.57 %) |
139,003 (1.51 %) |
3,161,165 (22.06 %) |
16,302 (1.34 %) |
| 182 | longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021) GCA_910589325.1 |
n/a | 15,137 (3.09 %) |
52,499 (7.75 %) |
n/a | 42.22 (100.00 %) |
n/a | 1,778 (100.00 %) |
448,166 (4.67 %) |
416,181 (8.95 %) |
3,288,388 (27.99 %) |
55,747 (4.41 %) |
| 183 | longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021) GCA_910589615.1 |
n/a | 15,027 (3.10 %) |
51,137 (7.71 %) |
n/a | 42.22 (99.99 %) |
242 (0.01 %) |
27 (100.00 %) |
452,844 (4.81 %) |
417,308 (9.63 %) |
3,262,282 (28.51 %) |
55,527 (4.38 %) |
| 184 | lumpfish (2019 refseq) GCF_009769545.1 |
41,612 (11.11 %) |
14,752 (3.31 %) |
49,223 (8.10 %) |
52,721 (8.34 %) |
42.83 (98.22 %) |
347 (1.78 %) |
48 (100.00 %) |
478,386 (6.02 %) |
421,632 (11.07 %) |
2,928,619 (27.99 %) |
53,321 (5.09 %) |
| 185 | lumpfish (alternate hap 2019) GCA_009769515.1 |
n/a | 12,848 (3.32 %) |
43,711 (8.09 %) |
n/a | 42.84 (100.00 %) |
n/a | 1,866 (100.00 %) |
407,698 (6.03 %) |
360,501 (11.29 %) |
2,456,041 (28.07 %) |
45,916 (5.21 %) |
| 186 | lyretail cichlid GCF_000239395.1 |
38,260 (10.03 %) |
14,804 (2.69 %) |
23,751 (5.79 %) |
n/a | 40.44 (80.94 %) |
109,100 (19.10 %) |
118,181 (80.90 %) |
695,696 (14.49 %) |
119,381 (1.10 %) |
4,539,429 (19.49 %) |
18,098 (0.91 %) |
| 187 | mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021) GCF_020085105.1 |
64,831 (12.89 %) |
15,283 (2.75 %) |
43,349 (6.02 %) |
n/a | 40.35 (100.00 %) |
93 (0.00 %) |
65 (100.00 %) |
441,324 (3.38 %) |
206,420 (2.54 %) |
4,582,841 (27.41 %) |
15,999 (1.17 %) |
| 188 | mandarin fish (RoL2022-P1 2023) GCF_027744825.2 |
49,016 (12.41 %) |
14,186 (3.08 %) |
55,502 (8.05 %) |
n/a | 43.27 (100.00 %) |
19 (0.00 %) |
97 (100.00 %) |
321,832 (4.91 %) |
114,318 (16.04 %) |
2,300,636 (32.10 %) |
46,312 (5.05 %) |
| 189 | mangrove rivulus GCF_001649575.2 |
46,200 (11.83 %) |
14,522 (2.87 %) |
46,641 (6.86 %) |
n/a | 40.03 (94.31 %) |
32,278 (5.70 %) |
300 (100.00 %) |
345,678 (2.32 %) |
146,263 (1.33 %) |
4,718,292 (27.30 %) |
39,541 (2.69 %) |
| 190 | marbled rockcod (alternate hap 2023) GCA_949606865.1 |
n/a | 14,564 (1.72 %) |
71,604 (6.41 %) |
n/a | 41.49 (100.00 %) |
n/a | 8,737 (100.00 %) |
1,662,251 (42.29 %) |
439,119 (12.96 %) |
3,776,125 (45.00 %) |
56,507 (2.83 %) |
| 191 | marbled rockcod (primary hap 2023) GCA_949606895.1 |
n/a | 15,070 (1.79 %) |
71,367 (6.50 %) |
n/a | 41.46 (99.92 %) |
4,157 (0.08 %) |
943 (100.00 %) |
1,717,591 (42.63 %) |
474,348 (12.30 %) |
4,011,319 (44.93 %) |
59,531 (2.83 %) |
| 192 | Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023) GCF_029220125.1 |
44,363 (10.91 %) |
14,032 (2.80 %) |
60,400 (8.09 %) |
n/a | 43.84 (99.86 %) |
974 (0.14 %) |
200 (100.00 %) |
1,157,953 (36.57 %) |
569,832 (12.19 %) |
2,864,996 (37.65 %) |
98,423 (9.53 %) |
| 193 | Mexican tetra (2017 WashU) GCF_000372685.2 |
47,018 (6.00 %) |
16,516 (1.68 %) |
33,920 (4.24 %) |
n/a | 38.00 (96.73 %) |
621 (3.27 %) |
2,415 (100.00 %) |
1,125,511 (6.89 %) |
1,113,607 (11.76 %) |
8,546,053 (42.44 %) |
44,933 (1.77 %) |
| 194 | Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021) GCA_019721115.1 |
n/a | 16,698 (1.62 %) |
62,818 (5.14 %) |
74,339 (6.58 %) |
38.41 (99.99 %) |
334 (0.01 %) |
195 (100.00 %) |
1,194,830 (5.04 %) |
1,460,981 (11.81 %) |
7,590,179 (47.66 %) |
50,533 (2.46 %) |
| 195 | Mexican tetra (ESR-SI-001 2022) GCF_023375975.1 |
71,254 (7.50 %) |
16,674 (1.63 %) |
52,903 (4.12 %) |
101,896 (6.64 %) |
38.24 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
109 (100.00 %) |
1,155,823 (4.90 %) |
1,363,316 (12.23 %) |
7,667,721 (47.23 %) |
48,358 (1.88 %) |
| 196 | milkfish (2019) GCF_902362185.1 |
30,812 (7.61 %) |
16,869 (3.41 %) |
21,377 (6.58 %) |
n/a | 41.53 (99.36 %) |
112 (0.64 %) |
31 (100.00 %) |
958,774 (8.18 %) |
731,733 (9.10 %) |
3,702,024 (26.31 %) |
22,089 (1.27 %) |
| 197 | milkfish (alternate hap 2019) GCA_902362175.1 |
n/a | 16,565 (3.38 %) |
42,094 (6.75 %) |
n/a | 41.51 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
1,937 (100.00 %) |
930,392 (8.11 %) |
708,375 (9.04 %) |
3,612,575 (26.46 %) |
21,531 (1.27 %) |
| 198 | monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022) GCA_023349535.1 |
n/a | 15,176 (3.17 %) |
47,458 (7.48 %) |
n/a | 42.05 (99.99 %) |
927 (0.02 %) |
486 (100.00 %) |
1,167,409 (26.98 %) |
438,114 (8.08 %) |
3,351,987 (27.25 %) |
45,298 (3.39 %) |
| 199 | monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022) GCA_023349555.1 |
n/a | 14,480 (3.19 %) |
44,951 (7.47 %) |
n/a | 42.05 (99.98 %) |
936 (0.02 %) |
725 (100.00 %) |
1,101,582 (26.86 %) |
415,846 (8.16 %) |
3,162,480 (27.08 %) |
42,657 (3.44 %) |
| 200 | Monterrey platyfish GCF_001444195.1 |
53,087 (12.11 %) |
14,672 (2.71 %) |
27,552 (6.74 %) |
n/a | 39.02 (99.85 %) |
229 (0.15 %) |
68 (100.00 %) |
305,761 (2.11 %) |
134,157 (2.14 %) |
4,687,726 (28.26 %) |
33,082 (2.28 %) |
| 201 | mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023) GCF_009829125.3 |
33,236 (8.44 %) |
14,601 (2.46 %) |
44,145 (5.80 %) |
n/a | 40.22 (99.05 %) |
701 (0.95 %) |
122 (100.00 %) |
1,755,227 (42.93 %) |
551,482 (7.22 %) |
4,887,087 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
| 202 | mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank) GCA_009829135.1 |
n/a | 13,470 (2.34 %) |
42,799 (5.73 %) |
n/a | 40.16 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,799 (100.00 %) |
394,414 (4.41 %) |
509,973 (7.17 %) |
4,581,968 (38.91 %) |
34,522 (2.54 %) |
| 203 | mummichog (Maine) GCF_000826765.1 |
41,183 (7.38 %) |
14,602 (1.92 %) |
57,194 (5.03 %) |
35,597 (6.40 %) |
40.58 (91.29 %) |
123,625 (8.75 %) |
120,723 (91.25 %) |
447,158 (2.19 %) |
235,336 (1.39 %) |
6,518,990 (26.03 %) |
54,589 (2.39 %) |
| 204 | mummichog (U. Missouri) GCF_011125445.2 |
56,612 (6.89 %) |
15,361 (1.60 %) |
69,801 (5.20 %) |
n/a | 40.76 (99.88 %) |
2,820 (0.12 %) |
1,031 (100.00 %) |
636,480 (2.75 %) |
392,130 (3.32 %) |
7,023,777 (32.98 %) |
81,101 (3.45 %) |
| 205 | New Zealand spotty (2019) GCA_009762535.1 |
n/a | 14,609 (2.22 %) |
43,262 (5.33 %) |
60,241 (8.02 %) |
40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
468 (100.00 %) |
519,324 (4.65 %) |
393,329 (5.54 %) |
4,522,265 (33.34 %) |
18,302 (0.85 %) |
| 206 | New Zealand spotty (alternate hap 2019) GCA_009762545.1 |
n/a | 13,566 (2.17 %) |
40,774 (5.21 %) |
n/a | 40.81 (100.00 %) |
n/a | 3,286 (100.00 %) |
472,659 (4.46 %) |
348,429 (5.17 %) |
4,169,213 (33.57 %) |
16,368 (0.83 %) |
| 207 | Nile tilapia GCF_001858045.2 |
77,384 (10.86 %) |
15,599 (1.99 %) |
32,839 (6.04 %) |
n/a | 40.73 (99.99 %) |
551 (0.01 %) |
2,460 (100.00 %) |
600,869 (5.40 %) |
291,105 (3.17 %) |
4,958,128 (31.15 %) |
32,038 (1.81 %) |
| 208 | ninespine stickleback (alternate hap 2023) GCA_949316245.1 |
n/a | 13,050 (3.93 %) |
44,650 (10.12 %) |
n/a | 44.10 (100.00 %) |
n/a | 1,934 (100.00 %) |
512,583 (14.83 %) |
156,305 (8.46 %) |
2,005,803 (27.09 %) |
59,674 (9.19 %) |
| 209 | ninespine stickleback (primary hap 2023) GCA_949316345.1 |
n/a | 14,600 (3.83 %) |
49,927 (9.98 %) |
n/a | 44.12 (99.97 %) |
738 (0.03 %) |
175 (100.00 %) |
599,088 (14.68 %) |
186,747 (10.27 %) |
2,273,942 (28.36 %) |
70,136 (9.39 %) |
| 210 | ninespine stickleback (NSP_V7 2020) GCF_902500615.1 |
51,166 (15.31 %) |
14,765 (3.99 %) |
49,191 (9.80 %) |
n/a | 44.37 (99.99 %) |
341 (0.01 %) |
1,667 (100.00 %) |
380,357 (3.60 %) |
188,301 (6.29 %) |
2,422,266 (25.70 %) |
72,584 (9.69 %) |
| 211 | North African catfish (Netherlands MV-2021 2022) GCF_024256425.1 |
51,073 (7.42 %) |
15,809 (2.17 %) |
43,728 (4.54 %) |
n/a | 39.00 (100.00 %) |
n/a | 48 (100.00 %) |
2,472,286 (44.73 %) |
560,123 (5.68 %) |
6,203,876 (38.64 %) |
42,187 (2.72 %) |
| 212 | northern pike GCF_004634155.1 |
66,389 (9.11 %) |
16,778 (2.37 %) |
27,040 (5.41 %) |
n/a | 42.29 (99.99 %) |
584 (0.01 %) |
908 (100.00 %) |
1,065,458 (31.14 %) |
531,451 (7.80 %) |
4,677,366 (33.26 %) |
44,793 (2.82 %) |
| 213 | northern pike (alternate hap 2020) GCA_011004835.1 |
n/a | 11,782 (2.41 %) |
40,748 (5.68 %) |
n/a | 42.32 (99.93 %) |
11 (0.07 %) |
3,813 (100.00 %) |
700,818 (30.15 %) |
372,729 (7.71 %) |
3,058,655 (31.76 %) |
29,687 (2.57 %) |
| 214 | northern pike (2020 refseq) GCF_011004845.1 |
63,733 (9.28 %) |
16,618 (2.41 %) |
55,784 (5.64 %) |
82,941 (8.82 %) |
42.22 (99.89 %) |
112 (0.11 %) |
53 (100.00 %) |
984,415 (29.15 %) |
524,708 (7.32 %) |
4,691,096 (32.91 %) |
42,910 (2.52 %) |
| 215 | Old Calabar mormyrid GCF_002872115.1 |
61,915 (11.48 %) |
15,987 (2.73 %) |
33,963 (6.66 %) |
n/a | 43.93 (92.03 %) |
49,579 (7.99 %) |
4,666 (100.00 %) |
348,463 (2.27 %) |
314,129 (2.95 %) |
4,259,711 (20.83 %) |
76,846 (4.18 %) |
| 216 | orangethroat darter GCF_008692095.1 |
55,448 (8.29 %) |
15,000 (2.25 %) |
49,918 (5.41 %) |
n/a | 40.91 (99.57 %) |
101,221 (0.47 %) |
3,119 (100.00 %) |
566,915 (3.75 %) |
509,018 (6.60 %) |
5,142,090 (31.18 %) |
26,702 (1.46 %) |
| 217 | orbiculate cardinalfish (2019) GCF_902148855.1 |
46,571 (5.47 %) |
15,761 (1.50 %) |
31,563 (4.00 %) |
59,905 (3.98 %) |
37.90 (99.73 %) |
1,844 (0.27 %) |
340 (100.00 %) |
1,257,250 (5.57 %) |
979,214 (8.64 %) |
6,386,731 (48.59 %) |
29,320 (0.87 %) |
| 218 | orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019) GCA_902148825.1 |
n/a | 14,018 (1.51 %) |
45,251 (3.61 %) |
n/a | 37.73 (99.94 %) |
142 (0.06 %) |
7,038 (99.94 %) |
1,041,393 (5.09 %) |
744,623 (6.94 %) |
6,250,631 (45.53 %) |
22,522 (0.77 %) |
| 219 | oriental weatherfish (BS_2022a 2023) GCF_027580225.1 |
68,779 (8.54 %) |
17,223 (2.28 %) |
49,697 (5.11 %) |
n/a | 38.10 (99.99 %) |
614 (0.01 %) |
358 (100.00 %) |
2,925,549 (40.35 %) |
402,676 (5.35 %) |
5,933,365 (45.71 %) |
56,843 (3.18 %) |
| 220 | P.nyererei 1_Seehausen GCF_000239375.1 |
40,001 (9.36 %) |
14,904 (2.72 %) |
24,732 (5.87 %) |
n/a | 40.60 (84.20 %) |
60,817 (15.83 %) |
68,050 (84.17 %) |
306,171 (3.27 %) |
124,292 (0.75 %) |
4,414,831 (20.66 %) |
18,455 (0.96 %) |
| 221 | Pacific cod (2023) GCF_031168955.1 |
49,417 (13.66 %) |
13,542 (2.89 %) |
64,214 (9.77 %) |
n/a | 45.55 (99.92 %) |
4,826 (0.09 %) |
24 (100.00 %) |
1,117,561 (38.30 %) |
685,851 (13.38 %) |
2,330,116 (34.15 %) |
87,761 (8.68 %) |
| 222 | Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020) GCF_013339905.1 |
48,776 (12.61 %) |
14,747 (3.15 %) |
45,075 (7.30 %) |
n/a | 42.24 (100.00 %) |
219 (0.00 %) |
120 (100.00 %) |
410,917 (4.22 %) |
246,500 (4.66 %) |
3,680,698 (25.23 %) |
31,508 (2.30 %) |
| 223 | Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022) GCF_022539355.2 |
46,684 (12.50 %) |
14,862 (3.15 %) |
45,824 (7.30 %) |
n/a | 42.17 (99.95 %) |
1,131 (0.05 %) |
53 (100.00 %) |
407,699 (3.94 %) |
247,330 (3.84 %) |
3,838,896 (24.75 %) |
31,782 (2.27 %) |
| 224 | panther danio (primary hap 2020) GCF_903798145.1 |
40,657 (5.52 %) |
17,858 (2.46 %) |
42,119 (3.16 %) |
n/a | 36.32 (98.82 %) |
1,821 (1.18 %) |
342 (100.00 %) |
3,973,354 (56.67 %) |
940,639 (7.81 %) |
8,701,639 (50.54 %) |
29,684 (1.18 %) |
| 225 | pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023) GCA_027942865.1 |
n/a | 15,242 (2.07 %) |
60,994 (6.53 %) |
n/a | 41.51 (99.99 %) |
282 (0.01 %) |
189 (100.00 %) |
975,354 (15.76 %) |
315,625 (10.49 %) |
3,601,904 (35.09 %) |
49,121 (3.07 %) |
| 226 | pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023) GCA_027942885.1 |
n/a | 15,317 (2.02 %) |
61,647 (6.35 %) |
n/a | 41.37 (99.99 %) |
135 (0.01 %) |
469 (99.99 %) |
981,519 (15.40 %) |
319,637 (12.45 %) |
3,706,473 (36.77 %) |
50,353 (2.98 %) |
| 227 | peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021) GCA_017639685.1 |
n/a | 16,729 (3.56 %) |
56,451 (8.61 %) |
n/a | 45.00 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
5,701 (100.00 %) |
1,153,359 (18.94 %) |
829,887 (14.54 %) |
2,793,018 (28.79 %) |
49,469 (4.32 %) |
| 228 | peladilla (fAplTae1 primary hap 2021) GCA_017639675.1 |
n/a | 13,829 (3.83 %) |
41,932 (8.64 %) |
n/a | 45.01 (98.24 %) |
1,158 (1.77 %) |
41 (100.00 %) |
930,246 (18.49 %) |
660,569 (13.71 %) |
2,316,198 (27.66 %) |
41,023 (4.40 %) |
| 229 | pike-perch GCF_008315115.2 |
65,418 (8.54 %) |
15,731 (2.23 %) |
52,240 (5.69 %) |
n/a | 40.87 (99.98 %) |
711 (0.02 %) |
337 (100.00 %) |
629,999 (5.16 %) |
567,578 (7.41 %) |
4,697,709 (36.49 %) |
39,666 (1.93 %) |
| 230 | pinecone soldierfish (2019) GCF_902150065.1 |
40,770 (8.72 %) |
15,738 (2.42 %) |
26,691 (5.69 %) |
57,069 (6.14 %) |
41.83 (99.78 %) |
253 (0.22 %) |
87 (100.00 %) |
1,063,888 (5.90 %) |
646,820 (4.30 %) |
4,938,857 (28.11 %) |
41,636 (2.04 %) |
| 231 | pinecone soldierfish (alternate hap 2019) GCA_902148815.1 |
n/a | 15,563 (2.38 %) |
54,264 (6.19 %) |
n/a | 41.81 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
2,193 (100.00 %) |
1,040,418 (5.81 %) |
623,499 (4.08 %) |
4,888,400 (27.89 %) |
40,331 (2.02 %) |
| 232 | pink salmon GCF_021184085.1 |
91,127 (4.89 %) |
27,187 (1.37 %) |
124,120 (3.88 %) |
n/a | 44.28 (99.96 %) |
5,213 (0.04 %) |
22,556 (99.99 %) |
1,343,135 (0.00 %) |
2,906,520 (28.95 %) |
10,882,087 (57.26 %) |
97,805 (3.04 %) |
| 233 | ploughfish GCF_902827175.1 |
50,551 (7.66 %) |
14,699 (1.83 %) |
66,348 (6.06 %) |
62,492 (5.74 %) |
41.52 (99.98 %) |
1,569 (0.02 %) |
2,618 (100.00 %) |
467,937 (3.05 %) |
412,361 (6.64 %) |
3,498,382 (45.08 %) |
73,879 (3.55 %) |
| 234 | pollack (alternate hap 2023) GCA_949987605.1 |
n/a | 14,050 (2.77 %) |
63,249 (8.86 %) |
n/a | 45.41 (100.00 %) |
n/a | 4,970 (100.00 %) |
708,455 (9.71 %) |
797,241 (15.67 %) |
2,785,159 (33.18 %) |
78,151 (7.95 %) |
| 235 | pollack (primary hap 2023) GCA_949987615.1 |
n/a | 14,126 (2.81 %) |
61,907 (8.75 %) |
n/a | 45.67 (99.94 %) |
1,810 (0.06 %) |
616 (100.00 %) |
753,034 (10.17 %) |
850,189 (15.72 %) |
2,888,555 (33.70 %) |
80,883 (8.43 %) |
| 236 | prehistoric monster fish (2019 refseq) GCF_902500255.1 |
45,404 (2.55 %) |
14,664 (0.76 %) |
72,609 (2.41 %) |
57,391 (2.04 %) |
41.99 (99.49 %) |
2,554 (0.51 %) |
464 (100.00 %) |
1,310,663 (2.79 %) |
786,401 (3.65 %) |
9,901,286 (59.90 %) |
172,199 (5.45 %) |
| 237 | prehistoric monster fish (alternate hap 2019) GCA_902500245.1 |
n/a | 10,944 (0.64 %) |
59,123 (2.21 %) |
n/a | 41.96 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
19,587 (100.00 %) |
947,336 (2.69 %) |
554,284 (3.27 %) |
7,314,941 (58.56 %) |
125,285 (5.42 %) |
| 238 | rainbow trout (Swanson) GCF_002163495.1 |
79,299 (6.41 %) |
25,179 (1.70 %) |
98,339 (4.18 %) |
115,853 (5.33 %) |
42.67 (88.52 %) |
427,894 (11.54 %) |
139,800 (99.96 %) |
1,332,141 (5.52 %) |
1,604,760 (8.18 %) |
9,451,984 (44.00 %) |
56,604 (1.05 %) |
| 239 | rainbow trout (Arlee) GCF_013265735.2 |
119,284 (6.51 %) |
27,513 (1.62 %) |
109,524 (4.38 %) |
138,073 (5.21 %) |
43.45 (99.74 %) |
486 (0.26 %) |
939 (100.00 %) |
1,537,455 (7.32 %) |
2,083,211 (23.10 %) |
10,092,840 (53.71 %) |
73,586 (2.16 %) |
| 240 | razorback sucker (HMW12.3.18 2022) GCF_025860055.1 |
71,991 (5.94 %) |
27,195 (1.88 %) |
81,269 (3.63 %) |
n/a | 39.59 (99.96 %) |
1,873 (0.04 %) |
1,746 (100.00 %) |
7,035,382 (51.89 %) |
1,021,269 (5.98 %) |
12,768,853 (46.85 %) |
109,185 (4.70 %) |
| 241 | red drum (XU1910 2020) GCA_014183145.1 |
n/a | 15,655 (3.01 %) |
47,717 (6.87 %) |
n/a | 40.98 (95.57 %) |
11,577 (4.42 %) |
34,462 (100.00 %) |
470,579 (3.16 %) |
231,051 (1.91 %) |
4,345,700 (23.24 %) |
20,149 (1.25 %) |
| 242 | red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020) GCA_015220065.1 |
n/a | 4,539 (2.01 %) |
14,061 (4.35 %) |
n/a | 40.48 (100.00 %) |
n/a | 1,751 (100.00 %) |
759,605 (49.59 %) |
161,693 (7.99 %) |
1,684,737 (29.93 %) |
7,525 (1.31 %) |
| 243 | red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020) GCF_015220715.1 |
54,818 (7.05 %) |
16,817 (1.87 %) |
52,672 (4.24 %) |
76,011 (5.65 %) |
40.58 (99.17 %) |
303 (0.83 %) |
55 (100.00 %) |
817,566 (5.40 %) |
689,236 (8.30 %) |
7,296,459 (35.73 %) |
33,087 (1.38 %) |
| 244 | red-bellied piranha (Pna-1 2016) GCF_001682695.1 |
47,129 (6.06 %) |
17,089 (1.80 %) |
33,378 (4.02 %) |
n/a | 40.45 (97.38 %) |
62,964 (2.59 %) |
325,620 (97.41 %) |
898,445 (4.81 %) |
863,000 (6.48 %) |
7,757,382 (34.74 %) |
34,329 (1.24 %) |
| 245 | reedfish (2021) GCF_900747795.2 |
44,479 (2.01 %) |
13,108 (0.46 %) |
23,157 (1.29 %) |
n/a | 39.37 (99.18 %) |
1,431 (0.82 %) |
169 (100.00 %) |
8,636,520 (39.34 %) |
1,069,643 (2.91 %) |
19,980,572 (47.52 %) |
89,023 (1.13 %) |
| 246 | reedfish (alternate hap) GCA_900700845.2 |
n/a | 9,950 (0.37 %) |
31,611 (1.22 %) |
n/a | 39.44 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
38,598 (100.00 %) |
1,300,565 (2.57 %) |
685,834 (2.21 %) |
14,691,576 (45.66 %) |
63,365 (1.11 %) |
| 247 | ringed pipefish (RoL2022-P2 2023) GCF_027744805.1 |
56,261 (13.18 %) |
14,197 (2.71 %) |
45,193 (6.30 %) |
n/a | 41.67 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
157 (100.00 %) |
941,095 (17.66 %) |
238,999 (5.27 %) |
4,283,692 (41.06 %) |
43,014 (4.07 %) |
| 248 | Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021) GCF_014905685.2 |
25,353 (3.88 %) |
14,334 (1.56 %) |
137,348 (9.74 %) |
n/a | 41.06 (92.01 %) |
100,521 (8.02 %) |
18,998 (100.00 %) |
635,526 (3.14 %) |
444,158 (3.06 %) |
6,203,124 (42.81 %) |
52,308 (2.11 %) |
| 249 | river trout (v2 2021) GCA_901001165.2 |
n/a | 27,928 (1.66 %) |
110,791 (4.44 %) |
n/a | 43.36 (96.90 %) |
3,941 (3.10 %) |
1,441 (100.00 %) |
4,690,842 (57.30 %) |
1,789,507 (15.87 %) |
9,819,763 (52.37 %) |
70,821 (1.77 %) |
| 250 | roach minnow (alternate hap 2023) GCA_951802655.1 |
n/a | 18,165 (2.73 %) |
62,580 (6.00 %) |
n/a | 38.74 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
4,612 (100.00 %) |
2,483,904 (48.29 %) |
584,363 (7.55 %) |
5,582,076 (40.38 %) |
60,229 (3.53 %) |
| 251 | roach minnow (primary hap 2023) GCA_951802725.1 |
n/a | 18,132 (2.65 %) |
63,523 (6.01 %) |
n/a | 38.80 (99.99 %) |
471 (0.01 %) |
86 (100.00 %) |
2,613,900 (48.90 %) |
625,102 (8.21 %) |
5,738,444 (41.24 %) |
65,328 (3.68 %) |
| 252 | rock gunnel (alternate hap 2021) GCA_910591705.2 |
n/a | 15,291 (3.29 %) |
45,865 (7.56 %) |
n/a | 42.26 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,165 (100.00 %) |
1,131,154 (25.69 %) |
269,583 (5.08 %) |
3,371,712 (24.64 %) |
36,810 (2.68 %) |
| 253 | rock gunnel (primary hap 2021) GCA_910591455.2 |
n/a | 15,181 (3.34 %) |
44,153 (7.53 %) |
51,135 (7.40 %) |
42.31 (99.98 %) |
418 (0.02 %) |
101 (100.00 %) |
1,121,704 (25.48 %) |
269,467 (4.88 %) |
3,358,709 (24.69 %) |
36,987 (3.02 %) |
| 254 | rohu (BAU-BD-2019 2022) GCF_022985175.1 |
52,554 (8.81 %) |
17,664 (3.05 %) |
48,403 (5.24 %) |
n/a | 36.06 (83.93 %) |
5,144 (16.07 %) |
2,870 (100.00 %) |
2,600,095 (49.94 %) |
683,499 (4.34 %) |
6,000,462 (35.96 %) |
33,741 (1.62 %) |
| 255 | Rosablanca catfish (hap1 2023) GCA_030014385.1 |
n/a | 15,802 (1.97 %) |
47,186 (4.62 %) |
n/a | 40.27 (100.00 %) |
198 (0.00 %) |
349 (100.00 %) |
2,616,870 (40.73 %) |
658,784 (9.71 %) |
5,197,126 (48.95 %) |
48,344 (2.62 %) |
| 256 | Rosablanca catfish (hap2 2023) GCA_030015355.1 |
n/a | 15,434 (2.01 %) |
44,991 (4.63 %) |
n/a | 40.24 (100.00 %) |
192 (0.00 %) |
302 (100.00 %) |
2,506,810 (40.54 %) |
613,867 (8.67 %) |
5,070,851 (48.32 %) |
46,071 (2.57 %) |
| 257 | sailfin molly GCF_001443285.1 |
53,986 (11.41 %) |
15,048 (2.71 %) |
33,482 (6.71 %) |
n/a | 39.18 (83.41 %) |
41,735 (16.61 %) |
54,623 (83.39 %) |
357,919 (2.18 %) |
189,502 (1.23 %) |
4,873,063 (22.51 %) |
34,138 (1.62 %) |
| 258 | sansaifugu (HTHZ2018 2019) GCF_003711565.1 |
56,010 (20.10 %) |
13,998 (4.84 %) |
48,737 (11.56 %) |
n/a | 45.63 (99.99 %) |
250 (0.01 %) |
868 (100.00 %) |
304,980 (15.98 %) |
171,631 (4.98 %) |
1,616,965 (21.60 %) |
48,338 (9.79 %) |
| 259 | scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023) GCF_030265065.1 |
51,270 (7.00 %) |
13,854 (1.32 %) |
48,980 (3.46 %) |
n/a | 39.44 (100.00 %) |
9 (0.00 %) |
109 (100.00 %) |
1,805,346 (21.21 %) |
512,153 (12.76 %) |
6,260,589 (63.96 %) |
96,908 (3.65 %) |
| 260 | Senegalese sole GCF_019176455.1 |
46,446 (12.02 %) |
15,155 (3.15 %) |
43,828 (7.31 %) |
n/a | 40.92 (99.99 %) |
662 (0.01 %) |
1,937 (100.00 %) |
522,618 (4.22 %) |
317,280 (4.23 %) |
4,040,245 (28.25 %) |
26,946 (1.79 %) |
| 261 | shanny (alternate hap 2023) GCA_963383635.1 |
n/a | 14,728 (2.46 %) |
62,094 (7.09 %) |
n/a | 42.32 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
3,847 (100.00 %) |
939,151 (11.90 %) |
472,983 (7.68 %) |
4,326,183 (28.40 %) |
64,290 (4.16 %) |
| 262 | shanny (primary hap 2023) GCA_963383615.1 |
n/a | 15,032 (2.44 %) |
62,625 (6.97 %) |
n/a | 42.07 (99.98 %) |
598 (0.02 %) |
847 (100.00 %) |
967,197 (11.85 %) |
498,286 (8.15 %) |
4,397,828 (28.96 %) |
65,744 (4.06 %) |
| 263 | sheepshead minnow GCF_000732505.1 |
37,879 (7.01 %) |
14,749 (2.02 %) |
25,480 (4.66 %) |
n/a | 38.19 (86.93 %) |
113,210 (13.10 %) |
110,959 (86.90 %) |
363,397 (1.88 %) |
195,191 (1.43 %) |
6,444,762 (27.47 %) |
18,269 (0.66 %) |
| 264 | shortfin molly GCF_001443325.1 |
54,473 (11.42 %) |
15,104 (2.72 %) |
33,717 (6.74 %) |
n/a | 39.23 (84.81 %) |
37,507 (15.20 %) |
50,598 (84.80 %) |
328,347 (2.03 %) |
172,112 (1.18 %) |
4,876,942 (22.80 %) |
34,271 (1.66 %) |
| 265 | Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023) GCF_900634795.4 |
59,278 (19.85 %) |
14,594 (4.32 %) |
55,265 (10.96 %) |
n/a | 45.31 (99.99 %) |
321 (0.01 %) |
36 (100.00 %) |
384,203 (19.38 %) |
175,898 (4.39 %) |
1,946,630 (23.16 %) |
70,331 (13.13 %) |
| 266 | Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019) GCA_900651605.1 |
n/a | 14,510 (4.12 %) |
60,058 (10.77 %) |
n/a | 45.51 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
3,705 (100.00 %) |
249,671 (3.68 %) |
182,366 (4.87 %) |
1,939,533 (22.55 %) |
72,474 (13.55 %) |
| 267 | Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023) GCA_900651605.2 |
n/a | 14,737 (4.05 %) |
61,568 (10.70 %) |
n/a | 45.50 (100.00 %) |
108 (0.00 %) |
3,872 (100.00 %) |
392,585 (19.23 %) |
190,741 (5.09 %) |
1,994,824 (23.20 %) |
74,259 (13.49 %) |
| 268 | silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022) GCF_023724105.1 |
131,166 (9.80 %) |
29,612 (2.99 %) |
81,338 (5.43 %) |
n/a | 37.63 (99.92 %) |
2,597 (0.08 %) |
51 (100.00 %) |
3,277,259 (45.05 %) |
801,192 (7.96 %) |
7,910,205 (42.51 %) |
60,236 (2.18 %) |
| 269 | smalleye Pacific opah (hap1 2023) GCA_029633845.1 |
n/a | 13,661 (1.11 %) |
75,418 (4.21 %) |
n/a | 45.01 (99.96 %) |
3,120 (0.04 %) |
1,059 (100.00 %) |
4,634,757 (53.53 %) |
1,006,319 (17.13 %) |
5,273,732 (51.16 %) |
145,115 (7.59 %) |
| 270 | smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq) GCF_029633865.1 |
34,018 (4.17 %) |
13,617 (1.10 %) |
74,639 (4.12 %) |
n/a | 44.94 (99.96 %) |
3,115 (0.04 %) |
544 (100.00 %) |
4,603,649 (53.23 %) |
1,009,241 (18.00 %) |
5,236,063 (51.65 %) |
143,632 (7.43 %) |
| 271 | smallmouth bass GCF_021292245.1 |
55,919 (9.40 %) |
15,509 (2.37 %) |
49,387 (5.61 %) |
n/a | 40.72 (99.65 %) |
34,581 (0.36 %) |
15,020 (100.00 %) |
445,979 (2.50 %) |
249,630 (2.49 %) |
5,071,015 (28.28 %) |
23,875 (1.36 %) |
| 272 | sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019) GCF_006149115.2 |
75,628 (6.10 %) |
24,075 (1.71 %) |
98,364 (4.30 %) |
n/a | 43.37 (96.15 %) |
25,658 (3.85 %) |
36,660 (99.99 %) |
949,725 (3.53 %) |
1,465,583 (10.82 %) |
8,853,884 (48.52 %) |
62,850 (1.45 %) |
| 273 | South Georgia icefish GCF_902827115.1 |
41,307 (6.47 %) |
14,776 (1.79 %) |
68,734 (6.16 %) |
61,643 (5.52 %) |
42.07 (99.94 %) |
2,461 (0.06 %) |
1,563 (100.00 %) |
498,451 (3.42 %) |
474,032 (7.20 %) |
3,613,731 (45.83 %) |
88,984 (4.31 %) |
| 274 | southern platyfish GCF_002775205.1 |
46,367 (11.15 %) |
14,674 (2.66 %) |
28,368 (6.82 %) |
n/a | 38.97 (99.53 %) |
156 (0.47 %) |
102 (100.00 %) |
323,402 (2.76 %) |
146,477 (2.33 %) |
4,741,552 (28.27 %) |
34,667 (2.13 %) |
| 275 | southern bluefin tuna (alternate hap 2021) GCA_910596085.1 |
n/a | 15,727 (2.61 %) |
43,177 (5.74 %) |
n/a | 39.72 (100.00 %) |
n/a | 895 (100.00 %) |
1,590,386 (33.53 %) |
246,800 (2.86 %) |
5,173,834 (26.85 %) |
14,473 (0.87 %) |
| 276 | southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq) GCF_910596095.1 |
58,429 (11.06 %) |
15,626 (2.56 %) |
42,730 (5.74 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
184 (0.00 %) |
58 (100.00 %) |
554,276 (3.42 %) |
247,764 (2.94 %) |
5,176,851 (26.85 %) |
14,097 (0.88 %) |
| 277 | Southwestern China cavefish GCF_001515605.1 |
74,317 (6.97 %) |
30,906 (3.19 %) |
55,474 (5.66 %) |
n/a | 37.28 (92.69 %) |
168,741 (7.34 %) |
254,423 (92.66 %) |
1,129,104 (5.02 %) |
730,197 (4.59 %) |
8,910,005 (36.97 %) |
64,238 (1.79 %) |
| 278 | spiny chromis (Palm Islands 2017) GCF_002109545.1 |
38,931 (8.84 %) |
15,624 (2.29 %) |
35,942 (5.59 %) |
n/a | 40.01 (85.05 %) |
209,115 (15.01 %) |
30,414 (100.00 %) |
372,901 (2.33 %) |
278,854 (1.99 %) |
5,622,334 (22.61 %) |
25,079 (0.95 %) |
| 279 | spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022) GCF_021347895.1 |
57,720 (10.03 %) |
15,810 (2.14 %) |
58,218 (5.77 %) |
n/a | 40.33 (99.99 %) |
871 (0.01 %) |
81 (100.00 %) |
1,505,948 (35.31 %) |
346,542 (4.71 %) |
5,210,329 (31.65 %) |
36,529 (1.65 %) |
| 280 | sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023) GCF_027596085.1 |
34,548 (9.49 %) |
15,280 (3.00 %) |
46,259 (6.95 %) |
n/a | 40.45 (99.99 %) |
723 (0.01 %) |
8,212 (99.99 %) |
1,335,152 (28.19 %) |
415,384 (6.53 %) |
3,948,379 (27.81 %) |
22,854 (1.61 %) |
| 281 | sterlet (maternal 2020) GCA_902713425.1 |
n/a | 22,306 (1.80 %) |
33,366 (4.09 %) |
n/a | 39.56 (99.99 %) |
402 (0.01 %) |
245 (100.00 %) |
1,126,738 (3.36 %) |
889,853 (6.73 %) |
8,766,715 (39.22 %) |
51,356 (1.84 %) |
| 282 | sterlet (paternal 2020) GCA_902713435.1 |
n/a | 22,718 (1.81 %) |
34,093 (4.15 %) |
57,768 (4.88 %) |
39.60 (100.00 %) |
422 (0.01 %) |
224 (100.00 %) |
1,145,503 (3.39 %) |
912,936 (6.84 %) |
8,839,174 (39.17 %) |
52,560 (1.82 %) |
| 283 | stone loach (alternate hap 2022) GCA_947034905.1 |
n/a | 16,177 (4.18 %) |
40,160 (7.35 %) |
n/a | 39.58 (100.00 %) |
n/a | 2,237 (100.00 %) |
1,208,781 (38.02 %) |
121,854 (7.96 %) |
2,956,942 (32.61 %) |
27,787 (3.58 %) |
| 284 | stone loach (primary hap 2022) GCA_947034865.1 |
n/a | 16,419 (3.98 %) |
40,677 (7.21 %) |
n/a | 39.69 (99.97 %) |
825 (0.03 %) |
100 (100.00 %) |
1,324,513 (39.84 %) |
143,170 (9.30 %) |
3,000,881 (34.30 %) |
30,130 (3.71 %) |
| 285 | striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022) GCA_027382375.1 |
n/a | 15,871 (2.85 %) |
42,287 (5.51 %) |
n/a | 38.96 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
3,274 (100.00 %) |
1,826,752 (37.53 %) |
592,022 (6.69 %) |
4,899,884 (32.33 %) |
17,357 (1.25 %) |
| 286 | striped catfish (primary hap 2022 refseq) GCF_027358585.1 |
53,860 (11.99 %) |
16,033 (2.86 %) |
41,619 (5.48 %) |
n/a | 38.99 (99.49 %) |
236 (0.51 %) |
58 (100.00 %) |
1,870,234 (37.80 %) |
605,570 (6.82 %) |
5,059,429 (32.43 %) |
17,919 (1.29 %) |
| 287 | striped catfish Vietnam GCF_003671635.1 |
40,992 (9.44 %) |
15,295 (2.91 %) |
20,865 (5.31 %) |
n/a | 38.71 (97.32 %) |
23,755 (2.69 %) |
567 (100.00 %) |
693,498 (4.75 %) |
489,286 (3.69 %) |
4,849,313 (30.04 %) |
15,076 (0.95 %) |
| 288 | striped sea-bass GCF_004916995.1 |
32,103 (10.78 %) |
14,422 (3.07 %) |
38,188 (6.41 %) |
n/a | 40.19 (99.19 %) |
73,335 (0.86 %) |
630 (100.00 %) |
365,581 (2.59 %) |
142,967 (0.99 %) |
4,151,813 (22.73 %) |
13,730 (0.95 %) |
| 289 | striped catfish Indonesia GCF_009078355.1 |
50,044 (9.61 %) |
15,665 (2.76 %) |
41,398 (5.35 %) |
n/a | 38.86 (99.98 %) |
463 (0.02 %) |
150 (100.00 %) |
777,186 (5.69 %) |
603,962 (6.24 %) |
5,141,987 (32.41 %) |
17,264 (1.20 %) |
| 290 | Sumatra barb GCF_018831695.1 |
54,947 (11.16 %) |
18,745 (3.98 %) |
49,520 (6.36 %) |
n/a | 38.24 (99.95 %) |
5,075 (0.05 %) |
1,122 (100.00 %) |
638,783 (6.33 %) |
357,159 (7.71 %) |
4,520,846 (32.46 %) |
46,339 (3.96 %) |
| 291 | swamp eel GCF_001952655.1 |
43,831 (10.64 %) |
14,741 (2.98 %) |
20,099 (5.80 %) |
n/a | 40.90 (92.01 %) |
51,257 (8.01 %) |
71,879 (91.99 %) |
266,195 (1.84 %) |
95,726 (1.16 %) |
3,596,747 (21.95 %) |
7,065 (0.42 %) |
| 292 | swordfish GCF_016859285.1 |
47,986 (9.92 %) |
15,208 (2.84 %) |
42,556 (5.91 %) |
n/a | 40.69 (99.97 %) |
449 (0.03 %) |
1,482 (100.00 %) |
484,543 (3.59 %) |
230,762 (3.41 %) |
4,496,150 (23.94 %) |
27,129 (2.10 %) |
| 293 | tambaqui GCF_904425465.1 |
46,601 (6.55 %) |
17,150 (1.88 %) |
50,327 (4.03 %) |
n/a | 39.33 (100.00 %) |
420 (0.00 %) |
1,269 (100.00 %) |
753,112 (4.00 %) |
676,948 (5.71 %) |
8,317,676 (35.32 %) |
25,784 (0.92 %) |
| 294 | three-spined stickleback GCF_016920845.1 |
50,181 (16.09 %) |
14,935 (3.99 %) |
53,773 (9.96 %) |
n/a | 44.66 (99.24 %) |
3,125 (0.76 %) |
2,937 (100.00 %) |
368,987 (9.09 %) |
160,564 (2.89 %) |
2,308,841 (21.91 %) |
80,336 (11.49 %) |
| 295 | tidewater goby (DKJ021-1_F 2022) GCA_026437355.1 |
n/a | 13,912 (1.87 %) |
62,727 (6.28 %) |
n/a | 42.90 (99.99 %) |
894 (0.01 %) |
755 (100.00 %) |
1,981,480 (37.86 %) |
652,950 (27.50 %) |
3,680,829 (47.75 %) |
96,414 (8.01 %) |
| 296 | tidewater goby (DKJ021-1_F 2022) GCA_026437365.1 |
n/a | 14,276 (1.78 %) |
66,576 (6.32 %) |
n/a | 42.96 (99.99 %) |
794 (0.01 %) |
820 (100.00 %) |
2,127,818 (38.86 %) |
708,255 (30.28 %) |
3,809,452 (49.66 %) |
101,682 (8.04 %) |
| 297 | tiger tail seahorse (QL1 v2 2016) GCF_001891065.2 |
47,024 (13.33 %) |
13,806 (3.76 %) |
52,367 (8.81 %) |
n/a | 43.30 (93.08 %) |
22,977 (6.92 %) |
55,891 (93.08 %) |
356,857 (3.66 %) |
155,338 (3.36 %) |
2,806,278 (24.56 %) |
61,010 (7.71 %) |
| 298 | tongue sole GCF_000523025.1 |
45,186 (16.40 %) |
14,186 (3.98 %) |
20,816 (8.22 %) |
n/a | 40.82 (94.88 %) |
33,269 (5.14 %) |
62,912 (94.86 %) |
423,833 (4.34 %) |
235,739 (3.33 %) |
3,085,031 (24.78 %) |
17,094 (1.42 %) |
| 299 | torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq) GCF_901000725.2 |
53,479 (18.31 %) |
14,527 (4.79 %) |
28,597 (10.65 %) |
55,587 (14.38 %) |
45.67 (99.04 %) |
402 (0.96 %) |
128 (100.00 %) |
281,011 (10.36 %) |
178,921 (5.32 %) |
1,642,756 (20.86 %) |
49,975 (9.63 %) |
| 300 | torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank) GCA_901000725.3 |
n/a | 14,527 (4.79 %) |
51,181 (11.72 %) |
n/a | 45.67 (99.04 %) |
402 (0.96 %) |
128 (100.00 %) |
325,077 (14.03 %) |
178,921 (5.32 %) |
1,642,754 (20.86 %) |
49,975 (9.63 %) |
| 301 | torafugu (alternate hap 2019) GCA_901000745.3 |
n/a | 13,635 (4.82 %) |
48,723 (11.83 %) |
n/a | 45.60 (99.82 %) |
38 (0.18 %) |
2,012 (100.00 %) |
249,793 (9.32 %) |
151,193 (4.49 %) |
1,577,144 (20.25 %) |
46,936 (9.72 %) |
| 302 | trahira (hap1 2023) GCA_029633855.1 |
n/a | 16,039 (2.06 %) |
44,287 (4.38 %) |
n/a | 40.99 (92.91 %) |
867 (7.09 %) |
597 (100.00 %) |
2,228,831 (30.95 %) |
687,495 (13.85 %) |
5,309,097 (36.70 %) |
27,070 (2.09 %) |
| 303 | trahira (hap2 2023) GCA_029633875.1 |
n/a | 16,216 (2.00 %) |
45,209 (4.32 %) |
n/a | 41.03 (96.02 %) |
907 (3.98 %) |
452 (100.00 %) |
2,280,303 (30.80 %) |
708,327 (15.59 %) |
5,394,248 (39.01 %) |
28,386 (2.18 %) |
| 304 | turbot (ysfricsl-2021 2022) GCF_022379125.1 |
57,285 (14.93 %) |
14,887 (3.52 %) |
49,403 (8.32 %) |
87,351 (14.65 %) |
43.54 (100.00 %) |
n/a | 28 (100.00 %) |
455,017 (0.00 %) |
297,185 (5.03 %) |
3,312,612 (24.33 %) |
65,633 (7.08 %) |
| 305 | turquoise killifish (GRZ 2015) GCF_001465895.1 |
40,373 (7.85 %) |
14,339 (2.08 %) |
84,906 (20.47 %) |
57,218 (6.01 %) |
42.51 (68.98 %) |
85,562 (31.04 %) |
68,911 (68.97 %) |
392,114 (2.78 %) |
307,607 (2.09 %) |
4,777,941 (27.62 %) |
61,105 (2.15 %) |
| 306 | turquoise killifish (MZM-0403 2023) GCF_027789165.1 |
54,488 (6.75 %) |
14,227 (1.27 %) |
69,161 (4.33 %) |
n/a | 44.33 (93.22 %) |
3,093 (6.78 %) |
2,681 (100.00 %) |
2,760,581 (47.64 %) |
635,213 (25.56 %) |
4,136,925 (56.55 %) |
110,696 (10.50 %) |
| 307 | walking catfish (CIFAMagur01 2020) GCA_013621035.1 |
n/a | 15,895 (2.18 %) |
46,934 (4.73 %) |
n/a | 39.83 (99.95 %) |
605 (0.05 %) |
3,484 (100.00 %) |
1,061,538 (6.25 %) |
611,618 (5.19 %) |
5,978,835 (37.11 %) |
54,666 (3.50 %) |
| 308 | walleye pollock (NIFS_2021 2022) GCF_026213295.1 |
49,084 (12.15 %) |
14,241 (2.71 %) |
70,653 (9.29 %) |
n/a | 45.59 (99.96 %) |
2,816 (0.04 %) |
168 (100.00 %) |
1,274,742 (38.63 %) |
797,757 (14.11 %) |
2,725,416 (34.38 %) |
95,149 (8.09 %) |
| 309 | warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020) GCA_013347815.1 |
n/a | 14,197 (3.33 %) |
44,782 (7.70 %) |
n/a | 41.82 (100.00 %) |
n/a | 2,294 (100.00 %) |
396,279 (4.74 %) |
275,154 (5.76 %) |
2,933,132 (29.41 %) |
35,104 (4.08 %) |
| 310 | warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020) GCA_013358685.1 |
n/a | 14,494 (3.34 %) |
45,310 (7.77 %) |
n/a | 41.86 (99.87 %) |
219 (0.13 %) |
155 (100.00 %) |
413,753 (4.95 %) |
290,313 (6.11 %) |
3,010,996 (29.71 %) |
36,840 (4.18 %) |
| 311 | western mosquitofish GCF_019740435.1 |
54,029 (12.31 %) |
14,667 (2.80 %) |
44,358 (6.62 %) |
n/a | 38.94 (97.42 %) |
181 (2.58 %) |
37 (100.00 %) |
348,476 (2.56 %) |
158,728 (2.21 %) |
4,604,959 (26.85 %) |
30,624 (1.94 %) |
| 312 | western speckled dace (OS25496 2023) GCF_029890125.1 |
46,203 (5.36 %) |
16,945 (2.57 %) |
65,343 (6.35 %) |
n/a | 39.74 (100.00 %) |
n/a | 930 (100.00 %) |
2,528,154 (48.24 %) |
549,447 (8.24 %) |
5,157,802 (41.42 %) |
84,874 (6.05 %) |
| 313 | White Sands pupfish GCF_016077235.1 |
46,084 (6.27 %) |
14,817 (1.71 %) |
52,055 (4.88 %) |
n/a | 39.01 (100.00 %) |
n/a | 2,003 (100.00 %) |
489,894 (2.67 %) |
304,277 (3.91 %) |
6,371,712 (38.05 %) |
41,820 (1.75 %) |
| 314 | wolf-eel GCF_004355925.1 |
43,625 (14.00 %) |
14,930 (3.24 %) |
31,372 (7.30 %) |
n/a | 42.10 (92.86 %) |
23,891 (7.15 %) |
33,400 (92.85 %) |
379,343 (3.26 %) |
244,853 (2.39 %) |
3,432,622 (22.07 %) |
30,581 (2.04 %) |
| 315 | woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022) GCA_023055335.1 |
n/a | 14,847 (3.48 %) |
50,136 (8.43 %) |
n/a | 42.99 (100.00 %) |
219 (0.00 %) |
443 (100.00 %) |
461,903 (5.20 %) |
422,251 (8.03 %) |
3,180,804 (25.81 %) |
70,183 (7.15 %) |
| 316 | woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022) GCA_023055415.1 |
n/a | 14,753 (3.49 %) |
49,516 (8.47 %) |
n/a | 43.00 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
171 (100.00 %) |
458,382 (5.18 %) |
420,718 (8.01 %) |
3,146,054 (25.71 %) |
69,817 (7.20 %) |
| 317 | Wuchang bream GCF_018812025.1 |
68,768 (8.86 %) |
18,247 (2.62 %) |
57,323 (5.24 %) |
n/a | 37.64 (99.83 %) |
1,281 (0.17 %) |
243 (100.00 %) |
801,110 (0.00 %) |
559,399 (5.04 %) |
6,340,567 (43.09 %) |
45,067 (2.52 %) |
| 318 | Yangtze koukloug (SWU-2019 2020) GCF_012432095.1 |
63,925 (10.50 %) |
17,502 (3.25 %) |
52,519 (5.86 %) |
n/a | 37.23 (99.62 %) |
617 (0.38 %) |
353 (100.00 %) |
2,297,102 (50.34 %) |
368,423 (3.28 %) |
5,171,389 (38.98 %) |
32,824 (2.00 %) |
| 319 | yellow catfish (hzauxx_2018 2022) GCF_022655615.1 |
64,819 (11.15 %) |
15,680 (2.87 %) |
41,108 (5.68 %) |
n/a | 39.49 (99.94 %) |
817 (0.06 %) |
517 (100.00 %) |
839,496 (9.42 %) |
756,396 (11.12 %) |
4,051,149 (35.45 %) |
24,342 (1.72 %) |
| 320 | yellow catfish (Tf-2017 2018) GCF_003724035.1 |
54,374 (10.66 %) |
15,584 (2.85 %) |
22,598 (5.58 %) |
n/a | 39.55 (99.11 %) |
1,760 (0.89 %) |
663 (100.00 %) |
883,218 (10.65 %) |
797,020 (11.09 %) |
4,092,065 (35.46 %) |
24,238 (1.72 %) |
| 321 | yellow perch (YP-PL-M2 2019) GCF_004354835.1 |
47,108 (7.77 %) |
15,458 (2.26 %) |
28,572 (5.62 %) |
n/a | 40.84 (99.95 %) |
831 (0.05 %) |
268 (100.00 %) |
620,402 (4.92 %) |
540,302 (7.26 %) |
4,770,842 (35.92 %) |
35,251 (1.63 %) |
| 322 | yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020) GCA_904848175.1 |
n/a | 814 (1.87 %) |
3,814 (6.84 %) |
n/a | 42.36 (99.98 %) |
80 (0.02 %) |
349 (100.00 %) |
38,000 (5.03 %) |
29,516 (7.35 %) |
232,988 (20.37 %) |
2,289 (2.07 %) |
| 323 | yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020) GCF_904848185.1 |
63,974 (13.26 %) |
15,178 (2.82 %) |
46,332 (6.73 %) |
84,160 (11.62 %) |
42.09 (100.00 %) |
149 (0.00 %) |
66 (100.00 %) |
499,939 (3.43 %) |
254,361 (2.64 %) |
4,420,217 (22.81 %) |
31,005 (1.79 %) |
| 324 | yellowfin tuna (alternate hap 2021) GCA_914744365.1 |
n/a | 15,959 (2.63 %) |
43,025 (5.73 %) |
n/a | 39.71 (100.00 %) |
n/a | 640 (100.00 %) |
1,427,221 (28.44 %) |
257,108 (3.15 %) |
5,197,531 (26.91 %) |
13,909 (0.83 %) |
| 325 | yellowfin tuna (primary hap 2021) GCF_914725855.1 |
57,835 (11.36 %) |
15,616 (2.53 %) |
42,750 (5.72 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
70 (0.00 %) |
68 (100.00 %) |
569,665 (3.53 %) |
259,656 (3.34 %) |
5,175,692 (27.05 %) |
14,420 (0.88 %) |
| 326 | yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017) GCF_002814215.2 |
40,935 (9.94 %) |
15,673 (2.75 %) |
53,235 (6.33 %) |
n/a | 40.72 (97.79 %) |
33,661 (2.21 %) |
98,345 (100.00 %) |
1,337,427 (24.48 %) |
522,121 (4.83 %) |
4,649,096 (25.00 %) |
16,819 (0.86 %) |
| 327 | Zealand spotty GCF_009762535.1 |
45,555 (9.06 %) |
14,609 (2.22 %) |
43,259 (5.33 %) |
60,241 (8.02 %) |
40.86 (98.32 %) |
1,135 (1.69 %) |
467 (100.00 %) |
517,755 (4.63 %) |
393,328 (5.54 %) |
4,522,224 (33.34 %) |
18,299 (0.85 %) |
| 328 | zebra mbuna GCF_000238955.4 |
51,012 (8.37 %) |
15,901 (2.10 %) |
32,136 (6.12 %) |
n/a | 41.16 (99.99 %) |
641 (0.01 %) |
1,690 (100.00 %) |
565,771 (6.22 %) |
253,037 (2.53 %) |
4,679,743 (31.57 %) |
36,689 (2.00 %) |
| 329 | zebrafish (T5D 2021) GCA_018400075.1 |
n/a | 17,774 (2.54 %) |
44,221 (3.24 %) |
n/a | 36.52 (99.87 %) |
20,876 (0.14 %) |
20,901 (99.86 %) |
4,138,008 (61.22 %) |
894,145 (6.79 %) |
9,494,379 (47.68 %) |
42,482 (2.03 %) |
| 330 | zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020) GCA_903684865.1 |
n/a | 17,535 (2.50 %) |
44,169 (3.34 %) |
n/a | 36.57 (99.99 %) |
712 (0.01 %) |
1,252 (100.00 %) |
3,891,854 (61.07 %) |
927,173 (7.78 %) |
8,621,517 (50.27 %) |
44,554 (2.12 %) |
| 331 | zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020) GCA_903684855.2 |
n/a | 17,692 (2.51 %) |
43,578 (3.27 %) |
n/a | 36.56 (99.99 %) |
1,352 (0.01 %) |
755 (100.00 %) |
3,937,397 (60.86 %) |
936,258 (7.76 %) |
8,732,369 (50.44 %) |
44,812 (2.09 %) |
| 332 | zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022) GCA_944039255.1 |
n/a | 6,365 (2.41 %) |
16,467 (3.26 %) |
n/a | 36.72 (100.00 %) |
n/a | 4,719 (100.00 %) |
1,317,027 (59.43 %) |
323,062 (10.58 %) |
3,014,570 (45.46 %) |
14,563 (1.98 %) |
| 333 | zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022) GCA_944039275.1 |
n/a | 18,065 (2.46 %) |
44,526 (3.30 %) |
n/a | 37.08 (99.99 %) |
381 (0.01 %) |
73 (100.00 %) |
4,804,769 (44.04 %) |
954,645 (10.72 %) |
8,694,743 (51.88 %) |
44,936 (2.02 %) |
| 334 | zebrafish GRCz11 GCF_000002035.6 |
65,219 (5.63 %) |
22,246 (2.54 %) |
51,134 (7.13 %) |
n/a | 36.60 (99.72 %) |
20,258 (0.28 %) |
34,617 (99.73 %) |
4,595,932 (57.92 %) |
1,077,677 (6.47 %) |
10,772,232 (49.45 %) |
53,471 (2.06 %) |
| 335 | zig-zag eel (alternate hap) GCA_900700395.1 |
n/a | 1,204 (2.88 %) |
4,065 (7.13 %) |
n/a | 41.24 (99.99 %) |
n/a | 1,437 (100.00 %) |
26,319 (3.19 %) |
14,209 (3.21 %) |
211,357 (18.05 %) |
1,253 (1.49 %) |
| 336 | zig-zag eel (v1.2 2019 refseq) GCF_900324485.2 |
44,988 (12.00 %) |
15,037 (3.35 %) |
40,235 (7.28 %) |
60,496 (9.39 %) |
40.66 (97.76 %) |
238 (2.24 %) |
123 (100.00 %) |
348,230 (2.87 %) |
157,728 (2.01 %) |
3,180,025 (23.44 %) |
12,807 (1.08 %) |
| 337 | zig-zag eel (v1.3 2021 genbank) GCA_900324485.3 |
n/a | 15,036 (3.35 %) |
40,234 (7.28 %) |
n/a | 40.66 (97.76 %) |
238 (2.24 %) |
123 (100.00 %) |
671,614 (20.98 %) |
157,728 (2.01 %) |
3,180,040 (23.44 %) |
12,807 (1.08 %) |
| TOTALS: | total assembly count 337 | |||||||||||
| Additional hubs with collections of assemblies | |||
|---|---|---|---|
| Collection | Hub index pages: | Assembly statistics: | Track statistics: |
| Primates | 200 assemblies | assembly stats | track stats |
| Mammals | 482 assemblies | assembly stats | track stats |
| Birds | 299 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fishes | 337 assemblies | assembly stats | track stats |
| other vertebrates | 167 assemblies | assembly stats | track stats |
| Invertebrates | 628 assemblies | assembly stats | track stats |
| Plants | 249 assemblies | assembly stats | track stats |
| Fungi | 612 assemblies | assembly stats | track stats |
| Viruses | 264 assemblies | assembly stats | track stats |
| Bacteria | 73 assemblies | assembly stats | track stats |
| legacy/superseded | 401 assemblies | assembly stats | track stats |
| collections below are subsets of the assemblies above | |||
| VGP - Vertebrate Genome Project | 651 assemblies | assembly stats | track stats |
| CCGP - The California Conservation Genomics Project | 126 assemblies | assembly stats | track stats |
| HPRC - Human Pangenome Reference Consortium | 96 assemblies | assembly stats | track stats |