Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(41.31 %)
23,407
(1.77 %)
47,466
(1.76 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
3,739,339
(33.13 %)
680,419
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
3 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
4 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
n/a 41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
5 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,451
(1.93 %)
18,474
(1.64 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,071,384
(35.75 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
6 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
7 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
8 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
9 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
10 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
11 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
n/a 41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
12 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
13 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,254
(2.65 %)
55,365
(7.12 %)
67,663
(8.92 %)
44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,192,612
(11.90 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
14 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
15 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
16 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,130
(1.43 %)
23,939
(1.67 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
495,502
(5.00 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
17 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
n/a 41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
18 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
19 black snub-nosed monkey genbank
GCA_001698545.1
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
20 Bolivian squirrel monkey (2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
21 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,821
(1.77 %)
21,060
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,201,047
(40.86 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
22 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
23 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
24 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
25 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
26 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
27 chimpanzee genbank
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
28 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
29 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
20,195
(1.84 %)
20,021
(1.50 %)
46,526
(2.01 %)
41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,431,956
(32.72 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
30 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
31 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
32 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
27,639
(2.17 %)
100,641
(5.02 %)
106,504
(5.94 %)
37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,476,046
(5.19 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
33 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,605
(1.80 %)
21,017
(2.12 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
484,145
(8.81 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
34 common house spider (v2 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
35 common vampire bat (DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
36 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
37 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
38 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,279
(1.90 %)
53,364
(7.19 %)
54,367
(2.24 %)
40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,274,951
(51.20 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
39 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
40 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
41 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,624
(1.69 %)
19,480
(1.48 %)
33,567
(2.63 %)
41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
4,309,890
(39.11 %)
606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,375
(1.90 %)
42 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
43 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,863
(1.67 %)
19,887
(1.96 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
985,101
(19.79 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
44 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
45 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(52.05 %)
11,646
(1.60 %)
28,786
(2.60 %)
49,990
(4.61 %)
42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,926,864
(38.18 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
46 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
47 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
48 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
49 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
50 giant panda
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,906
(1.75 %)
18,924
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,143,948
(40.06 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,461
(1.34 %)
51 goat (San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
52 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
53 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
54 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
55 great roundleaf bat (ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
n/a 41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
56 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
57 green algae C.reinhardtii CC-503 cw92 (v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
58 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
59 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(42.84 %)
14,569
(1.02 %)
77,496
(2.26 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,713,239
(14.26 %)
317,642
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
60 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
61 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
62 hooded crow (2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
63 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
64 house mouse
GCF_000001635.26
124,364
(4.53 %)
23,962
(2.07 %)
23,974
(1.75 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,418,774
(44.61 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
65 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,575
(2.49 %)
52,989
(6.38 %)
36,821
(8.90 %)
39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
321,738
(2.19 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
66 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
n/a 42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
67 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
12,866
(2.54 %)
31,341
(3.50 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
573,609
(7.86 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
68 leatherback sea turtle (v3 2020)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
69 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
70 lettuce (Salinas v1 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
71 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
72 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
73 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
74 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
75 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
14,523
(2.83 %)
47,746
(6.85 %)
30,573
(9.35 %)
40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,782
(2.29 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
76 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
77 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
78 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
n/a 41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
79 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
80 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
81 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
82 nine-banded armadillo (3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
83 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
84 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
85 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,362
(1.83 %)
21,971
(1.22 %)
53,493
(1.55 %)
40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,439,424
(52.46 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
86 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
87 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,682
(2.23 %)
52,929
(5.62 %)
63,087
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
601,762
(5.04 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
88 platypus (v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
14,785
(1.26 %)
19,402
(1.68 %)
42,892
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,069,299
(51.33 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,764
(6.47 %)
89 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
90 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
91 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
92 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
n/a 19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
93 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
94 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
95 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,048
(1.64 %)
27,305
(2.06 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
458,730
(8.48 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
96 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
n/a 41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
97 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
98 Ryukyu mouse (2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
99 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
n/a 41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
100 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,751
(4.20 %)
56,791
(10.87 %)
62,753
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,553
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
101 silvery gibbon
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
102 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
103 soybean (US DOE JGI-PGF v1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
104 Sumatran orangutan (2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
n/a 40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
105 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,114
(0.84 %)
16,157
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,635,117
(42.69 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
106 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,185
(1.69 %)
18,099
(1.44 %)
33,336
(2.34 %)
39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,262,694
(35.63 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
107 Ugandan red Colobus
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
108 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
109 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
110 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
111 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
112 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
113 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
114 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
115 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,389
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
4,919,207
(29.60 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
116 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
117 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
118 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,732
(1.90 %)
21,605
(1.29 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,022,252
(48.60 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
119 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,762
(1.88 %)
22,357
(1.36 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,415
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
120 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
121 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,929
(1.88 %)
24,817
(2.40 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
510,461
(7.13 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
122 woodchuck
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
n/a 40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
123 Yangtze finless porpoise (v1 2018)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,741
(1.80 %)
19,643
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
3,926,819
(42.04 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
124 Yangtze River dolphin (BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
125 yellow-bellied marmot
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,863
(1.62 %)
21,279
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,540,536
(33.43 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
126 zebra finch (v1 2019)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,210
(2.01 %)
25,575
(2.63 %)
38,869
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
545,004
(8.45 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.56 %)
127 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 127

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Primates 52 assemblies assembly stats track stats
Mammals 291 assemblies assembly stats track stats
Birds 113 assemblies assembly stats track stats
Fishes 130 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 48 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 399 assemblies assembly stats track stats
Plants 146 assemblies assembly stats track stats
Fungi 416 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 233 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 127 assemblies assembly stats track stats