Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(3.82 %)
23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
3 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1
n/a 20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
4 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
5 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
23,832
(3.81 %)
6 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
n/a 41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
7 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
8 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
9 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
10 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
11 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
12 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
50,987
(4.44 %)
13 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
14 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
15 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
18,108
(3.49 %)
16 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
17,048
(6.08 %)
17 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
23,814
(3.66 %)
18 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
25,871
(1.75 %)
19 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
20 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
n/a 41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
21 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
2,846
(42.44 %)
22 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
8,002
(10.69 %)
23 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
1,770
(49.40 %)
24 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
n/a 1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
22
(99.61 %)
25 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
26 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1
n/a 14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
27 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
28 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
29 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
30 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
31 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
32 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
n/a 41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
33 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
34 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
35 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
5,244
(15.19 %)
36 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
38
(40.33 %)
37 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
n/a 1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
27
(96.31 %)
38 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
16,276
(1.04 %)
39 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
10,942
(2.61 %)
40 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
40,540
(3.99 %)
41 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
42 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
59,279
(1.53 %)
43 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
44 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
n/a 13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
45 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
46 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
47 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
48 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
49 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,923
(2.41 %)
3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
n/a 36.64
(83.75 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
178,205
(3.43 %)
50 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
67,189
(1.73 %)
51 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
n/a 14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
52 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
53 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
54 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
n/a 40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
37,273
(1.03 %)
55 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
56 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
57 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
n/a 46.86
(99.96 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
13,204
(0.97 %)
58 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
59 brown planthopper (BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
n/a 4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
n/a 34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
39,697
(1.55 %)
60 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
n/a 13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
n/a 41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
61 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
n/a 35.73
(100.00 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
43,150
(4.96 %)
62 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
n/a 33.95
(100.00 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
11,070
(2.07 %)
63 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
n/a 33.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
6,783
(2.24 %)
64 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
65 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
66 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
n/a 41.40
(99.28 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
51,989
(1.50 %)
67 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,822
(2.52 %)
68 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
69 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
16,621
(0.21 %)
70 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
11,477
(0.36 %)
71 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
72 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
73 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
74 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
173,264
(3.70 %)
75 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
n/a 14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
76 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
31,438
(1.87 %)
77 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
32,840
(1.87 %)
78 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
79 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
12,486
(0.42 %)
80 chimpanzee genbank
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
81 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
82 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
83 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
n/a 27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
n/a 43.55
(99.99 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
62,726
(1.40 %)
84 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
8,105
(0.24 %)
85 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
10,698
(0.86 %)
86 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
n/a 15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
87 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,746
(13.53 %)
15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
88 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
15,663
(2.98 %)
89 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
72,061
(1.46 %)
90 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
n/a 18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
91 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
92 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
n/a 18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
93 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
94 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
n/a 13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
95 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
96 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
97 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
n/a 3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
n/a 29.40
(98.45 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
11,998
(0.33 %)
98 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
99 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
100 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,034
(3.23 %)
18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
101 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
102 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
103 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
n/a 4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
15,851
(2.18 %)
104 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
n/a 32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
105 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
106 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
107 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
8,375
(4.98 %)
108 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
109 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
110 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
111 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,376
(1.90 %)
112 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
113 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
44,022
(10.06 %)
114 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
n/a 18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
732,828
(17.24 %)
115 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
116 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
n/a 12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
117 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
1
(99.99 %)
118 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
119 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,615
(9.59 %)
15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
120 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
121 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
122 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
123 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
117,743
(2.02 %)
124 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
125 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
126 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
24,620
(4.88 %)
127 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
128 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,729
(2.65 %)
129 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
130 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
30,753
(4.27 %)
131 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
30,753
(4.27 %)
132 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
133 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
134 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
18,849
(8.62 %)
135 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
27,794
(16.15 %)
136 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
30,130
(16.11 %)
137 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
27,493
(12.03 %)
138 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
27,530
(17.02 %)
139 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
140 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
141 Gaboon caecilian (2019 genbank)
GCA_902459505.1
n/a 14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
142 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,465
(1.34 %)
143 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
59,340
(1.50 %)
144 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
145 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
59,945
(1.50 %)
146 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,027
(10.96 %)
15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
147 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
30,200
(4.54 %)
148 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
149 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
150 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
151 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
152 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
37,343
(3.12 %)
153 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
154 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
155 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
156 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
157 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,937
(3.26 %)
18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
158 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
32,047
(1.05 %)
159 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
n/a 18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
160 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
161 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
162 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,340
(13.40 %)
163 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
n/a 4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
11,043
(1.07 %)
164 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
165 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
n/a 743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
776
(95.90 %)
166 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
106
(99.48 %)
167 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
168 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(2.57 %)
14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
169 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
170 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
46,108
(3.49 %)
171 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
172 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
50,379
(1.45 %)
173 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
174 hooded crow (2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
175 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
176 house mouse
GCF_000001635.26
123,667
(4.49 %)
24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
177 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39
172,809
(4.43 %)
23,121
(1.97 %)
27,697
(1.78 %)
n/a 41.04
(95.07 %)
1,268
(4.93 %)
46,029
(95.07 %)
5,859,855
(52.78 %)
1,037,733
(4.60 %)
16,933,424
(36.88 %)
56,646
(1.06 %)
178 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
57,427
(1.07 %)
179 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
180 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
52,408
(1.38 %)
181 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
182 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,746
(2.60 %)
18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
47,552
(2.89 %)
183 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
n/a 42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,930
(1.47 %)
184 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
185 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
186 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
187 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
6,204
(9.08 %)
188 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
n/a 41.97
(97.63 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
22,279
(1.75 %)
189 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
n/a 13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
190 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
n/a 14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
191 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
192 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
n/a 34.13
(100.00 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
8,442
(2.49 %)
193 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
194 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
35,505
(1.37 %)
195 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
92
(99.40 %)
196 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
41
(99.80 %)
197 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
198 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
199 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
200 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
201 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
117,703
(2.02 %)
202 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,255
(11.91 %)
14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
203 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1
n/a 14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
53,323
(5.09 %)
204 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
205 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
206 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
207 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
208 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
n/a 36.96
(100.00 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
24,873
(3.15 %)
209 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
210 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
211 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
15,259
(2.01 %)
212 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
213 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
31,479
(5.12 %)
214 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
n/a 41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
215 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
34,396
(3.66 %)
216 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
13,926
(1.48 %)
217 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
31,271
(3.60 %)
218 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,670
(3.87 %)
219 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
220 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
221 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
4,887
(1.65 %)
222 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
223 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
224 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
225 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
226 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
63,009
(9.78 %)
227 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1
n/a 16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
228 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
229 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
230 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
231 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
232 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
n/a 33.42
(99.99 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
13,547
(2.72 %)
233 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
n/a 42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,081
(4.30 %)
234 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
16,332
(2.13 %)
235 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
n/a 13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
236 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
237 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
238 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
94,468
(9.28 %)
239 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
n/a 46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,829
(7.91 %)
240 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
241 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
242 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
n/a 14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
n/a 41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
243 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
61,057
(1.17 %)
244 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
245 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
246 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
n/a 19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
247 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
113,370
(2.46 %)
248 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
249 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
n/a 32.84
(100.00 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
10,747
(2.25 %)
250 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
30,183
(1.07 %)
251 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
18,873
(0.62 %)
252 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
10,712
(6.90 %)
253 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
88,254
(1.06 %)
254 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
255 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
256 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
257 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
258 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,772
(6.02 %)
27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
259 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
260 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
261 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
n/a 12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
262 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
647
(0.04 %)
263 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
n/a 3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
2,099
(0.38 %)
264 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
265 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
1
(0.73 %)
266 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
3,489
(0.51 %)
267 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
268 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
269 silvery gibbon
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
270 slow loris
GCA_004027815.1
n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
39,326
(0.65 %)
271 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
39,994
(0.70 %)
272 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
273 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
60,636
(4.05 %)
274 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
n/a 43.39
(96.16 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
64,215
(1.55 %)
275 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
276 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
277 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
278 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
279 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
35,897
(1.56 %)
280 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
281 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
n/a 35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
282 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.52 %)
283 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
668
(0.62 %)
284 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
60,475
(1.95 %)
285 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
n/a 38.54
(89.50 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
6,012
(0.58 %)
286 Sumatran orangutan (2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
n/a 40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
287 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
288 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
289 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
290 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
54,010
(40.19 %)
26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
4,599
(1.63 %)
291 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
292 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
n/a 11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
293 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
294 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
61,685
(7.72 %)
295 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
296 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
3,487
(0.58 %)
297 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
63,965
(1.04 %)
298 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
299 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
71,078
(1.08 %)
300 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
71,046
(1.10 %)
301 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
302 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
303 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
304 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
16,346
(4.08 %)
305 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
306 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
307 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
308 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
309 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
310 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
103,899
(1.75 %)
311 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
2,003
(54.71 %)
312 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
7,519
(2.78 %)
313 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
314 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
22,185
(2.62 %)
315 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
316 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
317 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
318 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
319 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
320 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
321 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
322 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
14,802
(3.20 %)
323 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
324 woodchuck
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
n/a 40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
325 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
326 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
327 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,063
(1.65 %)
19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
328 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
59,052
(1.48 %)
329 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
330 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
331 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
28,121
(0.66 %)
332 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
15,660
(0.55 %)
333 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,168
(9.96 %)
15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
18,054
(0.96 %)
334 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
n/a 42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
335 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
n/a 42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
336 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
337 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
n/a 40.66
(97.63 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 337

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Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 159 assemblies assembly stats track stats
Mammals 407 assemblies assembly stats track stats
Birds 270 assemblies assembly stats track stats
Fishes 270 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 114 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 583 assemblies assembly stats track stats
Plants 230 assemblies assembly stats track stats
Fungi 544 assemblies assembly stats track stats
Viruses 259 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 64 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 336 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 445 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats