Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(41.31 %)
23,407
(1.77 %)
47,466
(1.76 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
3,739,339
(33.13 %)
680,419
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
3 African grass rat (paternal X 2020 VGP)
GCA_011762505.1
n/a 20,908
(1.99 %)
19,747
(1.45 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,080
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
4 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
n/a 19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
5 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
23,832
(3.81 %)
6 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
n/a 41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
7 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,451
(1.93 %)
18,474
(1.64 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,071,384
(35.75 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
8 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,533
(1.68 %)
18,293
(1.41 %)
31,319
(1.47 %)
39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
4,454,253
(32.70 %)
747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
9 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
10 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
n/a 20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
11 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
n/a 17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
12 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
n/a 38.47
(99.52 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
50,987
(4.44 %)
13 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
n/a 18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
14 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank VGP)
GCA_003957555.2
n/a 12,249
(1.95 %)
14,848
(2.40 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,312
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
15 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
17,048
(6.08 %)
16 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
23,814
(3.66 %)
17 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
18 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
n/a 41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
19 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
2,846
(42.44 %)
20 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
n/a 18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
21 Atlantic halibut (2019 genbank VGP)
GCA_009819705.1
n/a 14,962
(3.19 %)
27,576
(7.25 %)
n/a 42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,418
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
22 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,254
(2.65 %)
55,365
(7.12 %)
67,663
(8.92 %)
44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,192,612
(11.90 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
23 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
24 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
25 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
n/a 18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
26 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,130
(1.43 %)
23,939
(1.67 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
495,502
(5.00 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
27 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
n/a 41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
28 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
38
(40.33 %)
29 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
30 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
59,279
(1.53 %)
31 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
32 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
21,268
(1.88 %)
57,267
(7.27 %)
53,952
(2.06 %)
40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,516,548
(50.22 %)
991,762
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
33 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
n/a 21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
34 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
35 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020 VGP)
GCA_009873245.2
n/a 19,181
(1.80 %)
20,867
(1.44 %)
34,459
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,199
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
67,189
(1.73 %)
36 blunt-snouted clingfish (2019 genbank VGP)
GCA_900634775.1
n/a 14,502
(1.97 %)
28,865
(5.58 %)
60,993
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,727
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
37 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
38 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
n/a 40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
37,273
(1.03 %)
39 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
n/a 4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
n/a 36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
40 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,821
(1.77 %)
21,060
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,201,047
(40.86 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
41 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
n/a 46.86
(99.96 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
13,204
(0.97 %)
42 budgerigar (maternal Z 2020 genbank VGP)
GCA_012275295.1
n/a 13,243
(1.87 %)
19,393
(2.66 %)
n/a 41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,056
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
43 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
n/a 4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
n/a 35.73
(100.00 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
43,150
(4.96 %)
44 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
n/a 33.95
(100.00 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
11,070
(2.07 %)
45 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
n/a 4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
n/a 33.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
6,783
(2.24 %)
46 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
47 California sea lion (v1 2019 VGP)
GCA_009762305.1
n/a 21,009
(1.78 %)
20,758
(1.45 %)
45,454
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,946
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
51,989
(1.50 %)
48 Canada lynx (LIC74 v1 2019 VGP)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
20,245
(1.42 %)
39,235
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
4,941,326
(43.36 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,816
(2.48 %)
49 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
50 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
11,302
(1.45 %)
27,105
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
482,036
(6.53 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
11,477
(0.36 %)
51 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
52 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
53 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,655
(1.55 %)
22,253
(1.36 %)
43,984
(2.02 %)
41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,620,154
(49.32 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
54 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
173,264
(3.70 %)
55 channel bull blenny (2019 genbank VGP)
GCA_900634415.1
n/a 14,475
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,811
(10.44 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,694
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
56 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
15,714
(2.71 %)
43,065
(5.18 %)
39,017
(8.86 %)
39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
875,484
(5.70 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
31,438
(1.87 %)
57 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
58 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
12,057
(1.82 %)
18,658
(2.08 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
511,325
(8.07 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
12,486
(0.42 %)
59 chimpanzee genbank
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
60 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
61 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
20,195
(1.84 %)
20,021
(1.50 %)
46,526
(2.01 %)
41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,431,956
(32.72 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
62 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
12,137
(1.49 %)
28,865
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
571,860
(7.51 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
8,105
(0.24 %)
63 climbing perch (v1.1 2018 refseq VGP)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
15,240
(3.46 %)
39,430
(7.44 %)
37,140
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
330,437
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
10,698
(0.86 %)
64 climbing perch (v1.2 2018 genbank VGP)
GCA_900324465.2
n/a 15,241
(3.53 %)
22,713
(7.45 %)
64,006
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,476
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
65 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
n/a 4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
n/a 33.59
(100.00 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
15,663
(2.98 %)
66 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020 VGP)
GCA_011762595.1
n/a 18,784
(1.76 %)
21,417
(1.48 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,518
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
67 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
n/a 17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
68 common brushtail (genbank 2020 VGP)
GCA_011100635.1
n/a 18,662
(0.80 %)
17,576
(0.98 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,694
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
69 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
27,639
(2.17 %)
100,641
(5.02 %)
106,504
(5.94 %)
37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,476,046
(5.19 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
70 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,605
(1.80 %)
21,017
(2.12 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
484,145
(8.81 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
71 common house spider (v2 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
72 common swift (bApuApu2 2021 VGP genbank)
GCA_020740795.1
n/a 12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
73 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
74 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
32,705
(2.51 %)
18,526
(1.87 %)
18,175
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,788,883
(29.47 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
75 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
n/a 19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
76 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
n/a 32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
77 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
n/a 20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
78 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,279
(1.90 %)
53,364
(7.19 %)
54,367
(2.24 %)
40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,274,951
(51.20 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
79 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
n/a 22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
80 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
81 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,624
(1.69 %)
19,480
(1.48 %)
33,567
(2.63 %)
41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
4,309,890
(39.11 %)
606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,375
(1.90 %)
82 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
n/a 18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
83 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
44,022
(10.06 %)
84 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,863
(1.67 %)
19,887
(1.96 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
985,101
(19.79 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
85 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
1
(99.99 %)
86 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
87 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
88 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(52.05 %)
11,646
(1.60 %)
28,786
(2.60 %)
49,990
(4.61 %)
42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,926,864
(38.18 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
89 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
117,743
(2.02 %)
90 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
91 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
n/a 4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
24,620
(4.88 %)
92 European turtle dove (v1.1 2019 VGP)
GCA_901699155.1
n/a 12,398
(1.76 %)
18,558
(2.54 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,734
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,725
(2.57 %)
93 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
n/a 5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
30,753
(4.27 %)
94 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
30,753
(4.27 %)
95 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank VGP)
GCA_007364275.2
n/a 15,435
(2.15 %)
26,443
(5.90 %)
n/a 41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,138
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
96 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
n/a 18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
97 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
27,794
(16.15 %)
98 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
30,130
(16.11 %)
99 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
27,530
(17.02 %)
100 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
101 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
102 Gaboon caecilian (2019 genbank VGP)
GCA_902459505.1
n/a 14,264
(0.51 %)
30,710
(1.49 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,110
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
103 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,906
(1.75 %)
18,924
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,143,948
(40.06 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,461
(1.34 %)
104 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
59,340
(1.50 %)
105 giant panda (Jingjing v2 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,348
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
106 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
n/a 4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
30,200
(4.54 %)
107 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
108 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
109 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
41,794
(1.79 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
110 golden eagle (v1.2 2019 VGP)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
13,204
(1.86 %)
17,250
(2.40 %)
26,055
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
528,354
(5.71 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
37,343
(3.12 %)
111 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
112 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
113 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
114 great roundleaf bat (ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
n/a 19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
n/a 41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
115 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank VGP)
GCA_004115265.2
n/a 18,651
(1.96 %)
20,392
(1.68 %)
36,525
(2.28 %)
40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,017
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
116 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq VGP)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
18,648
(1.96 %)
20,392
(1.68 %)
36,525
(2.28 %)
40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,232,363
(34.57 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
117 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
118 greater pipefish (v1.1 2019 VGP)
GCA_901709675.1
n/a 13,483
(5.26 %)
28,626
(12.15 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,439
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
119 green algae C.reinhardtii CC-503 cw92 (v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
120 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
n/a 20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
121 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(42.84 %)
14,569
(1.02 %)
77,496
(2.26 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,713,239
(14.26 %)
317,642
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
122 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
123 Hawaiian crow (VGP 2021 genbank)
GCA_020740725.1
n/a 12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
46,108
(3.49 %)
124 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
125 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
50,379
(1.45 %)
126 hooded crow (2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
127 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
128 house mouse
GCF_000001635.26
124,364
(4.53 %)
23,962
(2.07 %)
23,974
(1.75 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,418,774
(44.61 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
129 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,575
(2.49 %)
52,989
(6.38 %)
36,821
(8.90 %)
39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
321,738
(2.19 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
130 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
n/a 42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
131 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
12,866
(2.54 %)
31,341
(3.50 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
573,609
(7.86 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
132 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
6,204
(9.08 %)
133 kakapo (Jane v1 2019 VGP)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
13,103
(1.92 %)
22,986
(2.28 %)
29,127
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
517,212
(7.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
22,280
(1.77 %)
134 kakapo (Jane v2 2020 genbank VGP)
GCA_004027225.2
n/a 13,101
(1.92 %)
17,782
(2.51 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,069
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
22,279
(1.79 %)
135 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
n/a 4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
n/a 34.13
(100.00 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
8,442
(2.49 %)
136 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K VGP)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
137 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K VGP)
GCA_009764565.1
n/a 14,579
(1.03 %)
16,750
(1.48 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,920
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
35,505
(1.37 %)
138 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
n/a 19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
139 lesser kestrel (v1 2021 VGP)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
140 lettuce (Salinas v1 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
141 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
n/a 18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
142 lumpfish (2019 genbank VGP)
GCA_009769545.1
n/a 14,759
(3.32 %)
31,519
(7.89 %)
52,794
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,413
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
53,323
(5.09 %)
143 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
n/a 21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
144 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
n/a 19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
145 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
146 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
14,523
(2.83 %)
47,746
(6.85 %)
30,573
(9.35 %)
40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,782
(2.29 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
147 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
n/a 4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
n/a 36.96
(100.00 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
24,873
(3.15 %)
148 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
149 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
15,259
(2.01 %)
150 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
n/a 19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
151 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
n/a 41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
152 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
34,396
(3.66 %)
153 mute swan (v1 2019 VGP)
GCA_009769625.1
n/a 12,963
(1.97 %)
16,107
(2.42 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,717
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
31,250
(3.03 %)
154 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
n/a 21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
155 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
156 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
4,887
(1.65 %)
157 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
158 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
159 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,306
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
37,723
(1.74 %)
40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,142,081
(48.89 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,550
(2.46 %)
160 northern pike (2020 genbank VGP)
GCA_011004845.1
n/a 16,628
(2.41 %)
26,450
(5.50 %)
n/a 42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,518
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
161 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
162 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
163 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,362
(1.83 %)
21,971
(1.22 %)
53,493
(1.55 %)
40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,439,424
(52.46 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
164 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
165 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
n/a 4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
n/a 33.42
(99.99 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
13,547
(2.72 %)
166 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019 VGP)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,193
(1.69 %)
20,427
(1.67 %)
n/a 42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,000,874
(29.59 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,065
(3.55 %)
167 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
16,332
(2.13 %)
168 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
n/a 32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
169 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,682
(2.23 %)
52,929
(5.62 %)
63,087
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
601,762
(5.04 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
170 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
94,468
(9.28 %)
171 platypus (Pmale09 v1 2019 VGP)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
14,785
(1.26 %)
19,402
(1.68 %)
42,892
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,069,299
(51.33 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,764
(6.47 %)
172 platypus (Pmale09 v3 2020 VGP)
GCA_004115215.3
n/a 14,790
(1.26 %)
19,367
(1.68 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,300
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
173 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
n/a 18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
174 prehistoric monster fish (2019 genbank VGP)
GCA_902500255.1
n/a 14,667
(0.76 %)
31,672
(2.47 %)
n/a 41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,128
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
175 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
61,057
(1.17 %)
176 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
n/a 19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
177 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
n/a 17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
178 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
n/a 19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
179 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
180 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
n/a 32.84
(100.00 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
10,747
(2.25 %)
181 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
12,043
(1.50 %)
26,843
(1.82 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
489,452
(7.49 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
30,183
(1.07 %)
182 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
12,013
(1.53 %)
26,109
(1.82 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
410,478
(5.25 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
18,873
(0.62 %)
183 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
10,712
(6.90 %)
184 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
185 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,048
(1.64 %)
27,305
(2.06 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
458,730
(8.48 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
186 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
n/a 41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
187 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
188 Ryukyu mouse (2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
n/a 21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
189 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
647
(0.04 %)
190 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
n/a 41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
191 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,751
(4.20 %)
56,791
(10.87 %)
62,753
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,553
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
192 silvery gibbon
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
193 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
39,994
(0.70 %)
194 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
60,636
(4.05 %)
195 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
24,136
(1.71 %)
101,121
(4.39 %)
n/a 43.39
(96.16 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,344,082
(8.82 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
64,215
(1.55 %)
196 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
197 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
198 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
n/a 18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
199 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
35,897
(1.56 %)
200 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
201 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
n/a 4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
n/a 35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
202 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
668
(0.62 %)
203 Sumatran orangutan (2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
n/a 40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
204 Swainson's thrush (v1 2019 VGP)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,005
(1.87 %)
18,005
(2.60 %)
30,197
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
493,073
(5.80 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
205 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,114
(0.84 %)
16,157
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,635,117
(42.69 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
206 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,185
(1.69 %)
18,099
(1.44 %)
33,336
(2.34 %)
39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,262,694
(35.63 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
207 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank VGP)
GCA_010909765.1
n/a 11,443
(0.60 %)
26,743
(1.75 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,595
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
208 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq VGP)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
11,443
(0.60 %)
26,742
(1.75 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
209 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
13,822
(3.75 %)
53,224
(8.82 %)
28,809
(9.18 %)
43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
358,194
(3.78 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
61,680
(7.46 %)
210 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
211 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
63,965
(1.04 %)
212 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
213 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
21,830
(1.84 %)
23,952
(1.23 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,616,687
(51.27 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
71,078
(1.08 %)
214 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
n/a 19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
215 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
216 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
217 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
n/a 21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
218 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
n/a 18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
219 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
220 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
221 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
2,003
(54.71 %)
222 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
7,519
(2.78 %)
223 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,389
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
4,919,207
(29.60 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
224 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021 VGP)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
22,185
(2.62 %)
225 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
n/a 20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
226 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
227 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,732
(1.90 %)
21,605
(1.29 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,022,252
(48.60 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
228 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,762
(1.88 %)
22,357
(1.36 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,415
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
229 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
230 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
231 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,929
(1.88 %)
24,817
(2.40 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
510,461
(7.13 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
232 woodchuck
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
n/a 40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
233 Yangtze finless porpoise (v1 2018 genbank)
GCA_003031525.1
n/a 18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
59,052
(1.48 %)
234 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,741
(1.80 %)
19,643
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
3,926,819
(42.04 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
235 Yangtze River dolphin (BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
n/a 19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
236 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,863
(1.62 %)
21,279
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,540,536
(33.43 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
237 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
238 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
11,777
(1.55 %)
26,498
(1.88 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
458,879
(5.50 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
15,660
(0.55 %)
239 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank VGP)
GCA_003957565.2
n/a 13,209
(2.01 %)
18,119
(2.76 %)
38,869
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,518
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.56 %)
240 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq VGP)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,210
(2.01 %)
25,575
(2.63 %)
38,869
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
545,004
(8.45 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.56 %)
241 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
242 zig-zag eel (v1.1 2018 VGP)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
15,046
(3.35 %)
40,301
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.63 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
349,462
(2.86 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 242

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 57 assemblies assembly stats track stats
Mammals 348 assemblies assembly stats track stats
Birds 171 assemblies assembly stats track stats
Fishes 179 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 73 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 470 assemblies assembly stats track stats
Plants 173 assemblies assembly stats track stats
Fungi 463 assemblies assembly stats track stats
Viruses 254 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 261 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 242 assemblies assembly stats track stats