Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1		 n/a 22,095
(0.63 %)		 44,942
(0.68 %)		 n/a 40.25
(99.86 %)		 15,429
(0.03 %)		 2,690,873
(99.97 %)		 8,755,250
(34.47 %)		 869,360
(1.26 %)		 22,002,517
(59.65 %)		 39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1		 57,514
(54.61 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1		 61,159
(3.82 %)		 23,424
(1.78 %)		 27,990
(2.23 %)		 n/a 38.98
(88.63 %)		 216,028
(11.39 %)		 324,061
(88.61 %)		 1,726,079
(12.81 %)		 680,428
(2.28 %)		 13,887,586
(35.94 %)		 85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1		 n/a 5,478
(2.34 %)		 30,482
(13.88 %)		 n/a 44.27
(95.26 %)		 8,735
(4.75 %)		 8,115
(99.79 %)		 241,805
(14.48 %)		 72,702
(2.39 %)		 1,434,880
(21.28 %)		 25,507
(8.25 %)
6 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1		 46,043
(34.84 %)		 19,181
(1.25 %)		 19,665
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,337,637
(57.82 %)		 365,796
(0.88 %)		 16,073,052
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
7 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1		 27,736
(10.71 %)		 4,020
(1.34 %)		 42,185
(10.12 %)		 n/a 40.41
(94.37 %)		 14,031
(5.59 %)		 95,883
(100.00 %)		 112,828
(2.21 %)		 95,886
(3.63 %)		 2,006,114
(27.47 %)		 23,832
(3.81 %)
8 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1		 n/a 18,513
(1.97 %)		 19,112
(1.70 %)		 31,905
(1.94 %)		 41.46
(99.38 %)		 23,458
(0.62 %)		 75,733
(99.38 %)		 3,095,742
(36.41 %)		 314,508
(1.07 %)		 12,365,152
(25.46 %)		 53,956
(1.50 %)
9 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3		 55,001
(3.56 %)		 18,437
(1.94 %)		 18,446
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,150,224
(36.21 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
10 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,139
(1.58 %)		 18,286
(1.41 %)		 n/a 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 n/a 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
11 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
12 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1		 60,799
(51.66 %)		 14,382
(0.98 %)		 18,601
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 194
(100.00 %)		 3,322,619
(43.19 %)		 478,206
(1.77 %)		 12,316,391
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
13 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1		 n/a 22,515
(1.25 %)		 34,527
(1.17 %)		 n/a 39.58
(99.92 %)		 5,769
(0.02 %)		 837,916
(99.98 %)		 5,101,904
(34.46 %)		 552,100
(1.02 %)		 15,150,706
(34.57 %)		 24,558
(0.63 %)
14 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1		 38,686
(33.79 %)		 20,215
(1.44 %)		 20,845
(1.20 %)		 n/a 41.99
(93.39 %)		 341,984
(6.63 %)		 792,165
(93.37 %)		 6,006,931
(47.67 %)		 495,106
(1.11 %)		 13,902,115
(39.01 %)		 90,767
(1.29 %)
15 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1		 26,240
(36.96 %)		 17,569
(1.60 %)		 20,092
(1.69 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,961
(87.18 %)		 2,829,934
(29.80 %)		 414,895
(1.07 %)		 10,968,663
(26.71 %)		 44,651
(1.14 %)
16 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1		 n/a 5,217
(0.97 %)		 41,736
(12.73 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 128,505
(1.65 %)		 182,123
(8.03 %)		 2,157,899
(27.45 %)		 44,261
(5.21 %)
17 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1		 24,008
(8.48 %)		 3,331
(0.47 %)		 38,201
(8.97 %)		 24,453
(8.50 %)		 38.47
(99.52 %)		 23,726
(0.48 %)		 23,426
(99.52 %)		 161,274
(1.72 %)		 432,436
(8.89 %)		 3,517,080
(28.92 %)		 50,987
(4.44 %)
18 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1		 33,668
(37.51 %)		 18,213
(1.58 %)		 15,093
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,031
(97.56 %)		 4,832,679
(42.49 %)		 831,134
(1.67 %)		 13,654,373
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
19 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
20 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1		 16,082
(8.44 %)		 4,038
(1.42 %)		 32,856
(9.80 %)		 n/a 34.73
(95.75 %)		 10,626
(4.26 %)		 26,005
(95.74 %)		 203,498
(3.41 %)		 100,483
(2.15 %)		 2,221,362
(35.19 %)		 18,108
(3.49 %)
21 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1		 28,261
(10.34 %)		 4,915
(1.27 %)		 40,257
(10.17 %)		 n/a 35.18
(99.51 %)		 1,076
(0.49 %)		 2,869
(100.00 %)		 322,753
(4.92 %)		 245,412
(6.65 %)		 1,952,946
(43.11 %)		 17,048
(6.08 %)
22 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1		 22,023
(8.25 %)		 4,211
(1.25 %)		 37,113
(9.30 %)		 n/a 35.01
(91.82 %)		 40,822
(8.21 %)		 60,583
(91.79 %)		 218,162
(3.24 %)		 139,385
(2.26 %)		 2,347,922
(34.62 %)		 23,814
(3.66 %)
23 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2		 n/a 426
(3.03 %)		 203
(12.39 %)		 n/a 32.03
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 3,358
(1.88 %)		 1,257
(0.81 %)		 67,711
(20.74 %)		 4
(0.02 %)
24 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1		 n/a 326
(0.37 %)		 1,632
(4.94 %)		 n/a 51.33
(98.72 %)		 8,063
(1.32 %)		 12,727
(98.68 %)		 127,265
(17.42 %)		 148,397
(16.77 %)		 326,694
(37.33 %)		 12,417
(22.22 %)
25 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1		 n/a 22,542
(3.52 %)		 67,060
(16.20 %)		 n/a 38.04
(88.95 %)		 7,175
(11.05 %)		 806
(100.00 %)		 692,611
(50.80 %)		 322,540
(4.42 %)		 3,033,193
(35.58 %)		 25,871
(1.75 %)
26 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1		 n/a 18,452
(1.96 %)		 16,975
(1.61 %)		 n/a 41.29
(98.88 %)		 72,775
(1.13 %)		 105,347
(98.87 %)		 3,079,920
(34.79 %)		 319,928
(0.96 %)		 12,281,845
(25.28 %)		 48,638
(1.17 %)
27 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1		 n/a 22,910
(1.42 %)		 31,985
(1.20 %)		 35,342
(1.47 %)		 41.93
(99.87 %)		 9,604
(0.04 %)		 1,272,949
(99.96 %)		 6,096,013
(44.89 %)		 1,265,350
(2.67 %)		 14,617,986
(39.29 %)		 64,716
(1.93 %)
28 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2		 10,388
(48.16 %)		 1,538
(3.76 %)		 6,155
(25.19 %)		 n/a 49.56
(99.97 %)		 90
(0.03 %)		 466
(99.97 %)		 5,026
(0.77 %)		 2,256
(0.38 %)		 68,790
(5.94 %)		 2,846
(42.44 %)
29 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2		 n/a 1,524
(3.90 %)		 5,275
(23.90 %)		 n/a 50.30
(99.43 %)		 158
(0.58 %)		 249
(99.42 %)		 5,218
(3.22 %)		 2,452
(0.41 %)		 51,693
(4.64 %)		 1,128
(90.37 %)
30 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3		 10,609
(51.05 %)		 1,481
(3.36 %)		 5,692
(22.11 %)		 n/a 50.35
(99.87 %)		 662
(0.13 %)		 469
(99.87 %)		 9,986
(1.32 %)		 2,619
(0.36 %)		 106,480
(7.71 %)		 5,568
(53.86 %)
31 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1		 11,257
(41.02 %)		 1,596
(2.91 %)		 8,283
(26.43 %)		 n/a 49.20
(100.00 %)		 n/a 34
(100.00 %)		 14,775
(2.01 %)		 16,031
(2.34 %)		 103,256
(17.19 %)		 805
(44.28 %)
32 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2		 n/a 1,516
(1.76 %)		 5,714
(11.07 %)		 n/a 37.07
(99.50 %)		 566
(0.51 %)		 593
(99.49 %)		 38,696
(2.74 %)		 27,571
(2.05 %)		 270,617
(48.64 %)		 8,002
(10.69 %)
33 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2		 n/a 1,518
(1.57 %)		 5,702
(9.73 %)		 n/a 35.75
(98.67 %)		 1,691
(1.34 %)		 1,794
(98.66 %)		 42,930
(2.67 %)		 27,826
(1.78 %)		 328,698
(50.87 %)		 7,943
(9.35 %)
34 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1		 n/a 1,479
(4.26 %)		 5,283
(25.22 %)		 n/a 46.59
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 88
(100.00 %)		 10,463
(5.97 %)		 5,206
(0.91 %)		 74,027
(11.89 %)		 4,784
(34.49 %)
35 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2		 n/a 1,503
(2.37 %)		 11,741
(30.20 %)		 n/a 47.63
(98.55 %)		 377
(1.46 %)		 545
(98.54 %)		 8,453
(2.23 %)		 3,560
(0.37 %)		 129,150
(7.65 %)		 14,398
(29.11 %)
36 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1		 n/a 1,446
(3.95 %)		 5,635
(25.84 %)		 n/a 50.12
(92.42 %)		 2,066
(7.59 %)		 3,579
(92.41 %)		 11,499
(5.71 %)		 11,754
(2.10 %)		 87,648
(13.51 %)		 4,483
(54.70 %)
37 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2		 n/a 1,461
(4.51 %)		 5,599
(29.85 %)		 n/a 48.91
(95.53 %)		 516
(4.48 %)		 562
(95.52 %)		 3,575
(0.59 %)		 2,210
(0.38 %)		 66,810
(6.03 %)		 7,344
(38.10 %)
38 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1		 n/a 1,482
(2.32 %)		 7,302
(20.85 %)		 n/a 47.48
(99.41 %)		 1,281
(0.60 %)		 108
(100.00 %)		 24,268
(1.88 %)		 11,049
(1.23 %)		 163,225
(20.20 %)		 764
(17.56 %)
39 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1		 n/a 1,550
(3.72 %)		 7,756
(30.06 %)		 n/a 48.96
(99.94 %)		 775
(0.06 %)		 49
(100.00 %)		 5,678
(0.78 %)		 4,560
(0.81 %)		 73,645
(5.86 %)		 7,807
(50.55 %)
40 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1		 n/a 1,499
(4.04 %)		 3,608
(17.47 %)		 n/a 50.55
(99.99 %)		 76
(0.00 %)		 938
(100.00 %)		 12,877
(1.80 %)		 4,459
(0.56 %)		 116,737
(10.53 %)		 2,561
(81.62 %)
41 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2		 9,903
(39.44 %)		 1,311
(2.58 %)		 4,612
(17.66 %)		 n/a 52.11
(99.64 %)		 978
(0.36 %)		 1,583
(100.00 %)		 16,540
(1.85 %)		 7,316
(0.76 %)		 171,684
(11.10 %)		 1,770
(49.40 %)
42 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1		 10,279
(51.22 %)		 1,134
(2.55 %)		 2,026
(10.60 %)		 n/a 54.96
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 15,846
(2.28 %)		 8,000
(0.94 %)		 169,678
(13.75 %)		 22
(99.61 %)
43 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1		 n/a 1,532
(4.18 %)		 7,679
(34.14 %)		 n/a 46.67
(99.38 %)		 137
(0.62 %)		 589
(99.38 %)		 6,404
(1.04 %)		 2,594
(0.58 %)		 61,594
(6.70 %)		 5,746
(15.84 %)
44 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1		 10,941
(44.32 %)		 1,451
(2.81 %)		 6,906
(25.36 %)		 n/a 52.14
(99.98 %)		 3
(0.02 %)		 24
(99.98 %)		 8,941
(1.69 %)		 8,367
(1.51 %)		 99,818
(11.14 %)		 27
(96.31 %)
45 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1		 25,266
(7.93 %)		 4,931
(1.05 %)		 28,608
(7.16 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 34,722
(0.01 %)		 7,722
(100.00 %)		 146,974
(1.35 %)		 89,987
(2.68 %)		 2,666,250
(38.74 %)		 39,696
(5.22 %)
46 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2		 25,169
(7.95 %)		 4,867
(1.05 %)		 28,255
(7.08 %)		 n/a 37.49
(100.00 %)		 34,702
(0.01 %)		 6,269
(100.00 %)		 150,783
(1.53 %)		 89,885
(2.69 %)		 2,627,296
(38.56 %)		 39,511
(5.22 %)
47 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1		 22,417
(13.18 %)		 5,290
(2.15 %)		 13,925
(7.00 %)		 n/a 33.81
(97.56 %)		 5,205
(2.44 %)		 10,777
(97.56 %)		 122,491
(2.29 %)		 27,169
(0.71 %)		 2,130,840
(38.92 %)		 11,899
(2.85 %)
48 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2		 n/a 10,893
(0.53 %)		 128,502
(8.33 %)		 n/a 40.42
(100.00 %)		 n/a 2,434
(100.00 %)		 605,350
(2.88 %)		 921,761
(7.40 %)		 11,169,474
(57.07 %)		 220,674
(10.38 %)
49 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1		 n/a 10,347
(0.43 %)		 138,311
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,196
(100.00 %)		 691,302
(2.69 %)		 1,084,185
(7.47 %)		 12,619,495
(57.66 %)		 250,421
(10.15 %)
50 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1		 49,254
(2.57 %)		 10,500
(0.44 %)		 138,307
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,197
(100.00 %)		 6,821,491
(69.74 %)		 1,084,205
(7.47 %)		 12,619,646
(57.66 %)		 250,420
(10.13 %)
51 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1		 n/a 20,854
(1.73 %)		 28,046
(1.39 %)		 n/a 40.91
(99.96 %)		 4,333
(0.02 %)		 284,468
(99.98 %)		 3,802,671
(39.88 %)		 335,521
(0.73 %)		 15,053,564
(30.25 %)		 39,691
(1.17 %)
52 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1		 48,976
(40.12 %)		 18,884
(1.76 %)		 19,296
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,166
(100.00 %)		 3,855,699
(41.69 %)		 289,735
(0.96 %)		 14,695,257
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
53 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
54 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1		 46,216
(9.88 %)		 15,249
(2.65 %)		 25,664
(6.68 %)		 n/a 44.24
(99.88 %)		 1,963
(0.12 %)		 1,990
(99.88 %)		 1,175,759
(12.03 %)		 1,231,613
(13.39 %)		 3,511,276
(32.20 %)		 33,465
(1.97 %)
55 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2		 n/a 28,077
(1.40 %)		 120,383
(3.99 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 4,501,521
(48.00 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
56 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
57 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3		 11,460
(14.87 %)		 2,843
(2.29 %)		 3,797
(4.95 %)		 n/a 30.21
(92.98 %)		 58,744
(7.04 %)		 26,881
(93.03 %)		 147,614
(11.55 %)		 54,885
(7.91 %)		 647,155
(33.62 %)		 509
(0.15 %)
58 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1		 52,178
(47.52 %)		 18,330
(1.96 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,434
(99.31 %)		 3,072,373
(34.88 %)		 306,996
(0.95 %)		 12,209,895
(25.43 %)		 49,789
(1.25 %)
59 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1		 n/a 13,319
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 453
(100.00 %)		 700,173
(13.18 %)		 457,546
(13.85 %)		 4,523,003
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
60 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1		 42,399
(57.52 %)		 15,312
(3.18 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 811,892
(18.19 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
61 barn owl (2020)
GCF_902150015.1		 37,361
(4.54 %)		 12,958
(1.72 %)		 22,922
(1.99 %)		 26,976
(3.04 %)		 41.55
(99.23 %)		 177,340
(0.79 %)		 21,504
(100.00 %)		 585,627
(5.48 %)		 367,764
(2.44 %)		 7,399,161
(19.58 %)		 47,061
(3.25 %)
62 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1		 15,006
(2.07 %)		 11,133
(1.44 %)		 21,138
(1.69 %)		 n/a 40.21
(99.24 %)		 109,223
(0.79 %)		 171,345
(99.21 %)		 413,761
(3.90 %)		 181,353
(0.91 %)		 6,776,326
(18.43 %)		 10,575
(0.29 %)
63 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
64 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
65 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
66 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1		 50,205
(13.10 %)		 16,166
(3.05 %)		 25,084
(6.20 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 3,808
(100.00 %)		 465,997
(3.11 %)		 237,955
(4.36 %)		 4,027,027
(23.91 %)		 16,276
(1.04 %)
67 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1		 10,448
(49.20 %)		 1,066
(2.53 %)		 5,238
(16.95 %)		 n/a 46.48
(99.32 %)		 225
(0.68 %)		 254
(99.32 %)		 4,921
(0.90 %)		 2,352
(0.47 %)		 62,603
(9.90 %)		 5,244
(15.19 %)
68 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1		 n/a 1,050
(2.04 %)		 3,917
(10.89 %)		 n/a 51.64
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 n/a 3,805
(0.81 %)		 107,373
(7.81 %)		 81
(99.54 %)
69 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2		 n/a 921
(4.16 %)		 4,119
(24.79 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 2,424
(0.66 %)		 1,011
(0.30 %)		 56,356
(7.99 %)		 1,869
(7.30 %)
70 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1		 n/a 957
(3.66 %)		 3,784
(19.12 %)		 n/a 48.54
(99.99 %)		 85
(0.01 %)		 99
(99.99 %)		 4,944
(5.25 %)		 1,808
(0.52 %)		 68,717
(8.41 %)		 5,128
(28.73 %)
71 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3		 n/a 918
(2.66 %)		 4,907
(18.38 %)		 n/a 47.29
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 7,245
(1.32 %)		 2,141
(0.47 %)		 97,927
(9.78 %)		 4,995
(11.17 %)
72 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1		 9,187
(54.88 %)		 867
(2.56 %)		 4,441
(17.03 %)		 n/a 47.25
(99.94 %)		 30
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 7,231
(1.31 %)		 1,919
(0.32 %)		 110,288
(10.48 %)		 4,972
(10.95 %)
73 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3		 n/a 910
(2.69 %)		 4,861
(19.78 %)		 n/a 48.39
(100.00 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 7,778
(1.42 %)		 2,452
(0.43 %)		 86,630
(7.97 %)		 3,644
(14.24 %)
74 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1		 8,645
(55.47 %)		 908
(2.72 %)		 4,862
(19.87 %)		 n/a 48.38
(99.98 %)		 56
(0.02 %)		 69
(99.98 %)		 7,816
(1.43 %)		 2,425
(0.42 %)		 85,868
(7.91 %)		 3,698
(15.12 %)
75 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1		 8,471
(55.95 %)		 884
(2.79 %)		 5,418
(21.48 %)		 n/a 44.88
(99.73 %)		 43
(0.27 %)		 105
(99.73 %)		 6,509
(1.21 %)		 1,529
(0.25 %)		 101,733
(9.98 %)		 2,326
(4.59 %)
76 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4		 n/a 886
(2.74 %)		 5,392
(21.25 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 n/a 4
(100.00 %)		 6,585
(1.21 %)		 1,546
(0.27 %)		 104,495
(10.38 %)		 2,335
(5.10 %)
77 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1		 7,854
(58.26 %)		 816
(2.92 %)		 5,392
(23.35 %)		 n/a 40.23
(99.94 %)		 24
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 6,502
(1.34 %)		 1,847
(0.36 %)		 99,393
(12.25 %)		 1,191
(2.91 %)
78 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1		 7,454
(55.86 %)		 893
(2.94 %)		 3,348
(15.13 %)		 n/a 49.82
(99.99 %)		 11
(0.01 %)		 132
(100.00 %)		 5,510
(1.13 %)		 1,598
(0.33 %)		 81,983
(9.00 %)		 512
(39.06 %)
79 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1		 4,286
(69.39 %)		 1,060
(8.79 %)		 2,585
(44.95 %)		 n/a 52.06
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 1,777
(0.93 %)		 720
(0.48 %)		 22,182
(4.73 %)		 124
(60.74 %)
80 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1		 13,192
(49.72 %)		 894
(1.60 %)		 973
(2.80 %)		 n/a 57.50
(98.57 %)		 316
(1.43 %)		 352
(98.57 %)		 7,478
(4.11 %)		 7,640
(1.13 %)		 176,404
(11.51 %)		 38
(40.33 %)
81 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1		 25,020
(17.94 %)		 4,205
(2.34 %)		 27,352
(12.83 %)		 n/a 41.09
(91.93 %)		 19,248
(8.05 %)		 50,565
(100.00 %)		 57,833
(1.39 %)		 27,440
(2.49 %)		 1,173,760
(18.39 %)		 10,942
(2.61 %)
82 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1		 16,406
(4.01 %)		 4,087
(0.75 %)		 46,846
(6.53 %)		 16,764
(4.04 %)		 40.92
(95.72 %)		 25,039
(4.23 %)		 212,650
(95.77 %)		 641,987
(7.51 %)		 360,406
(11.43 %)		 3,411,951
(46.01 %)		 40,540
(3.99 %)
83 beet (2015)
GCF_000511025.2		 37,803
(8.76 %)		 12,044
(2.14 %)		 63,283
(17.52 %)		 n/a 36.14
(91.40 %)		 30,962
(8.61 %)		 71,208
(91.39 %)		 288,084
(4.25 %)		 299,650
(4.72 %)		 3,021,571
(30.10 %)		 32,547
(2.39 %)
84 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1		 n/a 14,732
(1.14 %)		 18,988
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 1,130,950
(11.22 %)		 213,212
(1.80 %)		 11,049,280
(26.48 %)		 53,923
(2.09 %)
85 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2		 n/a 18,686
(1.78 %)		 20,378
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.66 %)		 28,398
(1.35 %)		 35,369
(98.65 %)		 4,001,688
(43.72 %)		 542,326
(1.10 %)		 12,806,249
(34.24 %)		 59,279
(1.53 %)
86 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1		 n/a n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(4.54 %)		 15
(4.33 %)		 0
(0.00 %)
87 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1		 75,387
(2.66 %)		 18,667
(1.37 %)		 20,248
(1.35 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,081,260
(20.10 %)		 796,298
(12.14 %)		 12,235,764
(46.75 %)		 50,538
(11.18 %)
88 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4		 59,636
(15.47 %)		 20,361
(4.67 %)		 44,177
(15.83 %)		 n/a 33.75
(97.43 %)		 6,871
(2.58 %)		 8,318
(97.42 %)		 402,600
(27.63 %)		 177,746
(4.65 %)		 2,639,214
(36.04 %)		 4,559
(0.56 %)
89 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
90 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
91 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1		 59,197
(39.21 %)		 21,244
(1.88 %)		 23,681
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,030
(100.00 %)		 5,600,915
(50.57 %)		 991,762
(2.45 %)		 16,353,992
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
92 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1		 59,210
(2.48 %)		 21,256
(1.89 %)		 23,679
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,031
(100.00 %)		 5,602,009
(50.58 %)		 991,745
(2.45 %)		 16,354,078
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
93 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1		 41,255
(4.77 %)		 12,955
(1.98 %)		 22,656
(2.28 %)		 31,476
(5.07 %)		 41.95
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 680,976
(7.66 %)		 296,152
(1.44 %)		 6,797,141
(21.40 %)		 31,750
(3.32 %)
94 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1		 35,910
(2.41 %)		 3,903
(0.15 %)		 39,667
(2.27 %)		 40,959
(2.59 %)		 36.64
(83.75 %)		 1,158,725
(16.44 %)		 26,876
(100.00 %)		 5,488,723
(29.98 %)		 7,028,944
(21.91 %)		 10,445,796
(49.62 %)		 178,205
(3.43 %)
95 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
96 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1		 41,018
(2.61 %)		 4,064
(0.14 %)		 135,587
(7.67 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 n/a 2,977
(100.00 %)		 1,153,773
(4.93 %)		 754,711
(7.52 %)		 10,964,182
(43.13 %)		 138,831
(8.38 %)
97 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1		 n/a 3,432
(0.19 %)		 108,471
(5.13 %)		 n/a 45.22
(78.65 %)		 201,145
(21.35 %)		 570,637
(78.65 %)		 656,957
(3.38 %)		 365,918
(1.61 %)		 8,574,437
(27.02 %)		 345,141
(14.15 %)
98 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
99 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
100 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1		 42,216
(5.95 %)		 3,558
(0.29 %)		 24,115
(2.96 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,921
(1.91 %)		 408,322
(98.09 %)		 629,362
(4.20 %)		 749,383
(9.40 %)		 6,932,184
(43.02 %)		 16,970
(0.64 %)
101 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2		 n/a 3,378
(0.29 %)		 23,684
(2.94 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,903
(1.91 %)		 406,924
(98.09 %)		 587,583
(3.57 %)		 749,212
(9.41 %)		 6,921,847
(43.04 %)		 16,561
(0.63 %)
102 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 67,189
(1.73 %)
103 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
104 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
105 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1		 53,030
(2.41 %)		 20,599
(1.98 %)		 21,182
(1.34 %)		 46,441
(1.87 %)		 40.95
(99.56 %)		 1,074
(0.44 %)		 2,790
(99.56 %)		 5,098,799
(47.87 %)		 946,231
(3.04 %)		 14,608,771
(36.99 %)		 37,273
(1.03 %)
106 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1		 39,820
(2.33 %)		 20,222
(2.04 %)		 18,404
(1.34 %)		 49,071
(2.26 %)		 40.77
(94.98 %)		 148,728
(5.04 %)		 151,414
(94.96 %)		 4,710,420
(46.30 %)		 767,602
(1.48 %)		 14,489,703
(32.96 %)		 32,474
(0.75 %)
107 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1		 n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 42,467
(1.24 %)
108 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 52,294
(2.02 %)
109 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1		 n/a 21,835
(1.38 %)		 35,087
(1.18 %)		 n/a 42.09
(99.89 %)		 5,072
(0.02 %)		 1,218,682
(99.98 %)		 5,098,108
(45.85 %)		 856,878
(2.32 %)		 13,046,921
(40.74 %)		 63,992
(1.47 %)
110 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1		 n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
111 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1		 n/a 23,562
(1.20 %)		 51,200
(1.27 %)		 n/a 42.40
(99.91 %)		 4,243
(0.02 %)		 1,071,858
(99.98 %)		 4,884,584
(32.93 %)		 777,032
(1.49 %)		 14,195,446
(36.38 %)		 89,940
(1.88 %)
112 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1		 38,099
(52.40 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,927
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 3,738
(100.00 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
113 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1		 23,611
(63.03 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,267
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 264,378
(2.90 %)		 144,255
(3.35 %)		 2,651,028
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
114 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1		 53,993
(3.19 %)		 18,811
(1.78 %)		 21,058
(1.52 %)		 39,408
(1.98 %)		 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,283,780
(41.29 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
115 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1		 60,162
(4.01 %)		 18,920
(1.66 %)		 21,641
(1.49 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 902
(100.00 %)		 4,166,472
(34.00 %)		 659,124
(5.14 %)		 13,282,996
(33.88 %)		 68,113
(2.27 %)
116 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1		 39,606
(2.36 %)		 3,965
(0.13 %)		 116,426
(5.96 %)		 45,849
(2.46 %)		 46.86
(99.96 %)		 10,359
(0.04 %)		 2,329
(100.00 %)		 1,064,424
(3.53 %)		 716,579
(3.47 %)		 10,608,171
(42.78 %)		 13,204
(0.97 %)
117 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1		 31,379
(5.19 %)		 12,572
(1.89 %)		 24,442
(2.44 %)		 26,137
(3.13 %)		 42.40
(99.99 %)		 278
(0.01 %)		 691
(99.99 %)		 504,872
(6.53 %)		 420,620
(3.73 %)		 6,496,619
(21.26 %)		 28,576
(2.39 %)
118 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1		 36,936
(60.13 %)		 4,416
(0.37 %)		 22,354
(3.57 %)		 37,534
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,093
(100.00 %)		 597,351
(3.69 %)		 564,076
(6.64 %)		 6,601,703
(47.48 %)		 39,697
(1.55 %)
119 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1		 36,949
(4.89 %)		 4,427
(0.37 %)		 22,417
(3.57 %)		 37,573
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,094
(100.00 %)		 597,178
(3.69 %)		 564,092
(6.64 %)		 6,601,918
(47.49 %)		 39,697
(1.55 %)
120 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1		 n/a 1,948
(12.61 %)		 4,664
(59.90 %)		 n/a 45.12
(98.69 %)		 689
(1.33 %)		 99
(100.00 %)		 3,478
(1.23 %)		 2,281
(0.83 %)		 48,703
(8.19 %)		 1,579
(6.36 %)
121 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1		 n/a 2,030
(12.92 %)		 4,702
(58.30 %)		 n/a 45.32
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 3,464
(2.27 %)		 2,436
(0.80 %)		 28,524
(6.96 %)		 1,757
(7.37 %)
122 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1		 n/a 1,956
(12.86 %)		 4,335
(54.85 %)		 n/a 44.50
(99.71 %)		 79
(0.29 %)		 88
(99.71 %)		 2,272
(1.18 %)		 4,036
(1.77 %)		 48,188
(8.66 %)		 1,474
(15.82 %)
123 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1		 4,917
(62.59 %)		 1,845
(11.42 %)		 4,476
(56.70 %)		 n/a 37.84
(99.95 %)		 167
(0.05 %)		 148
(100.00 %)		 14,118
(4.93 %)		 19,713
(8.99 %)		 82,014
(21.64 %)		 201
(0.52 %)
124 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1		 n/a 3,349
(28.79 %)		 4,665
(66.28 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 n/a 9
(100.00 %)		 7,406
(3.43 %)		 3,781
(1.46 %)		 51,732
(11.80 %)		 742
(4.91 %)
125 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1		 n/a 1,905
(9.82 %)		 5,004
(52.37 %)		 n/a 36.94
(99.45 %)		 117
(0.56 %)		 145
(99.44 %)		 30,880
(10.91 %)		 18,155
(4.10 %)		 100,210
(23.18 %)		 22
(0.04 %)
126 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2		 n/a 3,553
(27.93 %)		 4,799
(61.37 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 16
(100.00 %)		 3,047
(1.32 %)		 2,546
(1.58 %)		 59,567
(11.20 %)		 635
(3.11 %)
127 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1		 n/a 1,755
(6.59 %)		 4,802
(37.76 %)		 n/a 49.05
(99.99 %)		 28
(0.01 %)		 34
(99.99 %)		 7,553
(2.98 %)		 9,578
(2.12 %)		 81,595
(9.59 %)		 6,216
(33.42 %)
128 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
129 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1		 25,882
(55.17 %)		 4,722
(0.65 %)		 16,896
(3.62 %)		 47,660
(8.03 %)		 35.73
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 272,738
(1.92 %)		 98,053
(6.01 %)		 4,662,765
(51.79 %)		 43,150
(4.96 %)
130 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1		 n/a 4,588
(1.37 %)		 11,218
(5.90 %)		 42,925
(13.84 %)		 33.95
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 143,323
(2.19 %)		 45,473
(3.23 %)		 2,501,939
(42.55 %)		 11,070
(2.07 %)
131 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1		 21,844
(65.09 %)		 4,557
(1.68 %)		 9,253
(6.32 %)		 30,285
(15.57 %)		 33.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 116,781
(2.12 %)		 30,577
(1.24 %)		 2,300,336
(39.04 %)		 6,783
(2.24 %)
132 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1		 n/a 12,650
(1.75 %)		 21,946
(1.95 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 518,393
(6.41 %)		 177,329
(0.88 %)		 7,168,675
(20.31 %)		 34,926
(2.94 %)
133 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1		 n/a 23,668
(1.61 %)		 29,709
(1.32 %)		 n/a 41.56
(99.92 %)		 10,276
(0.04 %)		 582,272
(99.96 %)		 4,952,087
(44.00 %)		 651,744
(1.26 %)		 13,644,805
(35.79 %)		 62,245
(1.50 %)
134 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 51,989
(1.50 %)
135 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1		 26,135
(1.83 %)		 3,125
(0.12 %)		 17,875
(1.29 %)		 27,144
(1.85 %)		 36.03
(84.95 %)		 548,450
(15.13 %)		 700,124
(84.87 %)		 3,498,348
(13.19 %)		 3,005,729
(6.50 %)		 13,687,022
(41.09 %)		 22,984
(0.34 %)
136 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,822
(2.52 %)
137 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1		 n/a 25,543
(0.55 %)		 52,506
(0.63 %)		 n/a 40.04
(99.84 %)		 4,876
(0.01 %)		 3,432,954
(99.99 %)		 7,363,240
(21.82 %)		 876,677
(2.53 %)		 25,446,677
(58.18 %)		 25,319
(0.31 %)
138 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1		 n/a 16,133
(0.56 %)		 62,445
(2.92 %)		 n/a 34.93
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,797
(96.77 %)		 1,171,727
(3.54 %)		 948,641
(4.39 %)		 21,533,236
(46.16 %)		 16,621
(0.21 %)
139 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1		 n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
140 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1		 15,520
(2.12 %)		 11,303
(1.45 %)		 24,758
(1.84 %)		 n/a 41.67
(99.59 %)		 50,632
(0.42 %)		 104,131
(99.58 %)		 405,042
(5.66 %)		 161,525
(1.05 %)		 6,445,961
(19.27 %)		 11,477
(0.36 %)
141 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1		 48,199
(10.95 %)		 18,537
(3.62 %)		 45,536
(13.17 %)		 n/a 35.94
(85.14 %)		 37,896
(14.88 %)		 39,916
(85.12 %)		 295,656
(2.88 %)		 266,527
(3.40 %)		 2,434,269
(42.34 %)		 30,963
(1.41 %)
142 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6		 n/a 19,803
(1.54 %)		 21,001
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.57 %)		 41,517
(0.44 %)		 42,578
(99.56 %)		 5,725,274
(49.24 %)		 459,535
(1.33 %)		 12,905,109
(41.11 %)		 43,324
(1.28 %)
143 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,669
(1.56 %)		 21,999
(1.33 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,643,592
(49.67 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
144 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2		 76,306
(2.98 %)		 19,325
(1.49 %)		 21,665
(1.32 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,957
(100.00 %)		 3,550,686
(24.18 %)		 544,595
(2.90 %)		 13,050,221
(41.81 %)		 44,208
(1.24 %)
145 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1		 n/a 21,372
(1.41 %)		 34,453
(1.31 %)		 n/a 42.35
(99.87 %)		 10,534
(0.04 %)		 1,240,696
(99.96 %)		 5,244,572
(43.13 %)		 2,503,015
(4.45 %)		 12,961,004
(41.69 %)		 173,264
(3.70 %)
146 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
147 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1		 53,920
(9.58 %)		 15,712
(2.71 %)		 25,639
(5.25 %)		 n/a 39.70
(98.56 %)		 25,203
(1.45 %)		 34,544
(98.55 %)		 871,222
(5.75 %)		 585,250
(4.19 %)		 5,150,651
(33.94 %)		 31,438
(1.87 %)
148 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2		 57,087
(10.27 %)		 16,253
(2.68 %)		 44,936
(5.15 %)		 n/a 39.70
(98.57 %)		 25,285
(1.44 %)		 34,545
(98.61 %)		 900,327
(5.55 %)		 614,695
(4.28 %)		 5,348,266
(33.81 %)		 32,840
(1.87 %)
149 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1		 n/a 18,264
(1.57 %)		 14,665
(1.26 %)		 n/a 41.30
(98.26 %)		 183,260
(1.77 %)		 14,382
(100.00 %)		 4,777,041
(42.51 %)		 784,368
(1.53 %)		 13,503,827
(31.65 %)		 57,657
(1.31 %)
150 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1		 n/a 15,255
(2.94 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 465,710
(3.82 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,999
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
151 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1		 15,979
(2.53 %)		 12,065
(1.82 %)		 10,050
(2.07 %)		 n/a 41.40
(95.99 %)		 65,523
(4.03 %)		 84,595
(95.97 %)		 453,775
(7.30 %)		 194,988
(2.21 %)		 6,363,949
(19.70 %)		 12,486
(0.42 %)
152 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3		 n/a 20,378
(1.83 %)		 21,427
(1.19 %)		 n/a 40.71
(98.98 %)		 693
(1.02 %)		 5,037
(98.98 %)		 5,409,980
(53.76 %)		 984,231
(7.31 %)		 15,896,744
(39.56 %)		 45,870
(0.97 %)
153 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1		 n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 47,662
(1.21 %)
154 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 61,901
(2.29 %)
155 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1		 60,293
(11.65 %)		 15,433
(2.84 %)		 67,310
(21.70 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 273,992
(2.25 %)		 228,466
(3.97 %)		 2,261,888
(35.14 %)		 37,317
(4.18 %)
156 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1		 55,529
(3.00 %)		 19,755
(1.76 %)		 20,017
(1.50 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 4,356
(0.12 %)		 1,830
(100.00 %)		 4,544,603
(29.89 %)		 1,095,407
(2.92 %)		 12,942,232
(32.27 %)		 19,343
(0.58 %)
157 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1		 92,370
(51.48 %)		 27,141
(1.63 %)		 113,328
(4.52 %)		 157,545
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,333
(0.01 %)		 9,977
(99.99 %)		 4,892,399
(55.31 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,870
(54.55 %)		 62,726
(1.40 %)
158 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1		 34,390
(49.60 %)		 15,350
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 361
(100.00 %)		 1,669,327
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,422
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
159 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1		 17,196
(2.21 %)		 12,140
(1.50 %)		 25,641
(1.91 %)		 n/a 40.76
(99.61 %)		 56,667
(0.39 %)		 126,789
(99.61 %)		 560,317
(7.62 %)		 203,204
(1.12 %)		 6,593,712
(20.47 %)		 8,105
(0.24 %)
160 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1		 8,677
(50.60 %)		 1,251
(4.00 %)		 7,681
(34.45 %)		 n/a 39.25
(99.25 %)		 383
(0.76 %)		 510
(99.24 %)		 2,585
(1.13 %)		 3,424
(1.20 %)		 81,225
(12.02 %)		 161
(0.21 %)
161 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1		 n/a 1,065
(1.03 %)		 1,781
(1.87 %)		 n/a 31.32
(99.93 %)		 1,347
(0.00 %)		 23,709
(100.00 %)		 29,228
(1.96 %)		 22,291
(1.48 %)		 550,667
(25.14 %)		 20
(0.01 %)
162 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1		 42,930
(13.31 %)		 15,237
(3.47 %)		 22,710
(7.34 %)		 37,043
(11.25 %)		 40.40
(98.65 %)		 292
(1.35 %)		 70
(100.00 %)		 329,586
(2.67 %)		 133,519
(1.94 %)		 3,418,470
(21.84 %)		 10,698
(0.86 %)
163 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
164 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,759
(13.53 %)		 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
165 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1		 81,219
(51.66 %)		 18,516
(1.55 %)		 20,363
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 34
(100.00 %)		 4,798,634
(33.91 %)		 992,669
(2.08 %)		 13,618,933
(34.42 %)		 67,831
(2.45 %)
166 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1		 23,070
(64.23 %)		 4,767
(1.38 %)		 15,869
(7.12 %)		 34,699
(13.48 %)		 33.59
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 161,872
(2.42 %)		 73,892
(2.86 %)		 2,544,844
(42.14 %)		 15,663
(2.98 %)
167 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1		 64,032
(4.29 %)		 24,727
(1.43 %)		 46,926
(3.38 %)		 n/a 43.33
(95.39 %)		 265,291
(4.63 %)		 22,810
(99.99 %)		 1,185,308
(5.22 %)		 2,455,045
(15.99 %)		 11,710,855
(46.53 %)		 72,061
(1.46 %)
168 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
169 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1		 45,962
(43.27 %)		 17,254
(1.68 %)		 17,112
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,647
(100.00 %)		 3,845,214
(43.88 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,013
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
170 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
171 common carp (2014)
GCF_000951615.1		 75,414
(5.81 %)		 27,632
(2.17 %)		 59,950
(5.28 %)		 n/a 37.00
(97.48 %)		 57,940
(2.53 %)		 9,378
(100.00 %)		 1,460,282
(5.17 %)		 987,356
(7.88 %)		 9,900,821
(37.41 %)		 48,702
(1.38 %)
172 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 25,267
(1.71 %)
173 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1		 16,827
(2.53 %)		 12,599
(1.80 %)		 12,623
(2.28 %)		 n/a 41.52
(97.64 %)		 56,977
(2.38 %)		 71,907
(97.62 %)		 418,870
(8.06 %)		 192,437
(2.08 %)		 6,576,259
(19.85 %)		 18,002
(0.74 %)
174 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2		 30,064
(3.79 %)		 3,347
(0.23 %)		 7,571
(1.48 %)		 n/a 29.46
(81.63 %)		 247,378
(18.44 %)		 263,908
(81.56 %)		 587,943
(2.23 %)		 464,643
(2.90 %)		 10,795,253
(40.31 %)		 10,480
(0.23 %)
175 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3		 37,121
(48.05 %)		 3,276
(0.22 %)		 9,098
(1.38 %)		 38,273
(4.24 %)		 29.40
(98.45 %)		 124,228
(1.55 %)		 84,235
(98.46 %)		 637,694
(2.45 %)		 527,781
(4.43 %)		 11,553,196
(51.16 %)		 11,998
(0.33 %)
176 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1		 41,888
(9.21 %)		 3,611
(0.43 %)		 13,244
(4.58 %)		 44,721
(6.30 %)		 36.11
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 239,042
(1.40 %)		 359,961
(7.89 %)		 4,399,053
(45.69 %)		 33,411
(1.94 %)
177 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1		 55,359
(63.58 %)		 14,846
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 243
(100.00 %)		 1,149,249
(19.12 %)		 342,239
(9.71 %)		 3,906,839
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
178 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
179 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
180 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 70,700
(2.48 %)
181 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,067
(3.40 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 70,701
(2.48 %)
182 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2		 n/a 18,511
(1.87 %)		 18,170
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,108
(97.77 %)		 2,860,991
(29.93 %)		 275,245
(1.03 %)		 11,798,152
(28.19 %)		 51,833
(1.38 %)
183 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1		 51,047
(3.24 %)		 18,506
(1.88 %)		 18,166
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,861,697
(29.93 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
184 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2		 n/a 18,311
(1.71 %)		 19,456
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,767,071
(28.35 %)		 431,575
(3.90 %)		 11,286,853
(32.63 %)		 71,506
(2.50 %)
185 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1		 29,369
(33.72 %)		 19,335
(2.10 %)		 21,769
(1.63 %)		 n/a 41.24
(74.51 %)		 276,544
(25.53 %)		 299,069
(74.47 %)		 3,513,698
(39.82 %)		 304,033
(0.59 %)		 13,333,842
(21.06 %)		 56,694
(1.59 %)
186 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1		 65,969
(8.84 %)		 20,226
(1.95 %)		 89,703
(16.66 %)		 n/a 36.19
(97.99 %)		 26,139
(2.01 %)		 23,344
(100.00 %)		 865,884
(3.63 %)		 491,126
(5.95 %)		 6,119,503
(36.10 %)		 21,505
(3.50 %)
187 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 990,274
(4.84 %)
188 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1		 n/a 13,703
(1.71 %)		 26,310
(2.10 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 414
(100.00 %)		 479,045
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,298
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
189 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1		 n/a 12,750
(1.85 %)		 23,191
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.99 %)		 477
(0.01 %)		 726
(99.99 %)		 403,846
(4.59 %)		 252,125
(3.30 %)		 6,206,493
(22.07 %)		 41,821
(4.50 %)
190 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1		 21,972
(59.55 %)		 4,839
(1.54 %)		 21,045
(8.01 %)		 n/a 36.13
(89.02 %)		 26,910
(11.01 %)		 24,551
(88.99 %)		 115,046
(2.97 %)		 31,900
(0.85 %)		 2,230,382
(25.45 %)		 15,851
(2.18 %)
191 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1		 48,678
(10.56 %)		 16,927
(3.30 %)		 44,814
(13.06 %)		 54,348
(11.30 %)		 32.98
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 682
(100.00 %)		 352,238
(4.22 %)		 283,949
(8.14 %)		 3,092,021
(41.64 %)		 24,513
(2.40 %)
192 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1		 76,183
(45.03 %)		 20,283
(1.90 %)		 20,544
(1.22 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,763
(95.15 %)		 5,351,207
(51.35 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,449
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
193 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1		 76,196
(3.30 %)		 20,209
(1.91 %)		 51,427
(6.84 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,764
(95.15 %)		 5,251,819
(50.85 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,510
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
194 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1		 90,094
(55.93 %)		 29,389
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 3,481,389
(45.81 %)		 802,775
(6.54 %)		 8,190,816
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
195 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1		 22,915
(28.69 %)		 3,621
(2.94 %)		 11,430
(17.96 %)		 n/a 40.34
(99.47 %)		 2
(0.53 %)		 227
(100.00 %)		 81,008
(2.67 %)		 29,625
(4.98 %)		 609,395
(25.66 %)		 6,559
(5.05 %)
196 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1		 n/a 3,519
(2.64 %)		 12,174
(17.22 %)		 n/a 40.54
(93.29 %)		 13,228
(6.75 %)		 4,192
(100.00 %)		 63,254
(2.07 %)		 22,325
(1.44 %)		 728,942
(20.81 %)		 8,375
(4.98 %)
197 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2		 30,025
(5.21 %)		 3,968
(0.39 %)		 56,084
(8.02 %)		 32,834
(5.48 %)		 52.34
(98.93 %)		 10,786
(1.08 %)		 1,254
(100.00 %)		 361,409
(3.23 %)		 533,046
(8.92 %)		 3,456,307
(19.29 %)		 6,722
(54.88 %)
198 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2		 n/a 15,131
(1.68 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 73
(100.00 %)		 2,175,293
(47.80 %)		 176,956
(1.87 %)		 6,142,692
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
199 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1		 64,558
(45.64 %)		 19,142
(1.72 %)		 22,139
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 122
(100.00 %)		 3,040,239
(24.03 %)		 796,913
(6.38 %)		 10,478,261
(38.84 %)		 64,921
(2.50 %)
200 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1		 48,152
(35.39 %)		 22,240
(1.40 %)		 22,108
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 259,903
(84.32 %)		 4,890,270
(27.82 %)		 898,943
(1.50 %)		 14,281,942
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
201 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
202 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1		 50,318
(52.07 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,281
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
203 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1		 6,502
(71.82 %)		 251
(1.29 %)		 2,079
(62.62 %)		 n/a 49.25
(99.82 %)		 242
(0.19 %)		 306
(99.81 %)		 697
(1.34 %)		 335
(0.65 %)		 20,634
(5.24 %)		 2,275
(23.86 %)
204 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1		 n/a 22,343
(1.53 %)		 28,525
(1.27 %)		 n/a 41.66
(99.91 %)		 10,428
(0.04 %)		 667,170
(99.96 %)		 5,598,608
(45.38 %)		 1,220,686
(2.58 %)		 14,079,363
(36.37 %)		 62,881
(2.13 %)
205 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,440
(1.59 %)		 19,474
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 n/a 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,376
(1.90 %)
206 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1		 44,762
(33.07 %)		 18,297
(1.33 %)		 20,107
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,603
(97.80 %)		 4,257,412
(38.85 %)		 658,532
(1.25 %)		 14,547,631
(34.19 %)		 37,092
(0.85 %)
207 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2		 n/a 5,227
(1.28 %)		 18,795
(5.67 %)		 n/a 38.55
(99.90 %)		 30
(0.10 %)		 696
(100.00 %)		 615,428
(29.26 %)		 86,179
(1.65 %)		 2,607,325
(47.66 %)		 44,022
(10.06 %)
208 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1		 63,294
(3.74 %)		 18,050
(0.43 %)		 260,902
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 290
(100.00 %)		 1,274,894
(2.42 %)		 1,726,303
(5.40 %)		 14,010,542
(72.58 %)		 732,828
(17.24 %)
209 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1		 n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
210 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1		 n/a 1,641
(1.07 %)		 33,976
(44.50 %)		 n/a 54.16
(99.69 %)		 80
(0.31 %)		 133
(100.00 %)		 18,997
(0.80 %)		 16,094
(2.84 %)		 200,994
(27.68 %)		 232
(99.71 %)
211 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
212 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1		 15,850
(2.33 %)		 11,864
(1.67 %)		 11,795
(1.99 %)		 n/a 44.51
(96.31 %)		 96,471
(3.72 %)		 127,725
(96.28 %)		 842,281
(18.63 %)		 310,018
(2.09 %)		 5,822,687
(27.83 %)		 17,379
(0.69 %)
213 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1		 n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 90
(0.38 %)		 19,508
(7.44 %)		 1
(99.99 %)
214 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1		 39,088
(10.61 %)		 11,569
(2.49 %)		 38,114
(15.67 %)		 n/a 38.59
(99.98 %)		 627
(0.02 %)		 1,425
(99.98 %)		 230,165
(2.88 %)		 153,929
(4.02 %)		 2,160,647
(26.81 %)		 24,567
(4.41 %)
215 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1		 n/a 21,013
(2.21 %)		 18,237
(1.40 %)		 101,394
(4.09 %)		 41.76
(90.89 %)		 904,107
(9.24 %)		 30,233
(98.34 %)		 5,250,349
(40.55 %)		 1,508,787
(2.97 %)		 13,823,341
(28.09 %)		 16,695
(0.43 %)
216 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,628
(9.59 %)		 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
217 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1		 n/a 20,133
(1.87 %)		 36,361
(1.80 %)		 n/a 40.23
(99.96 %)		 4,332
(0.02 %)		 226,086
(99.98 %)		 2,985,622
(32.66 %)		 475,311
(1.11 %)		 12,612,081
(27.34 %)		 81,930
(5.75 %)
218 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1		 65,163
(51.34 %)		 17,637
(2.08 %)		 22,318
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 30
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,415
(1.02 %)		 12,031,652
(26.52 %)		 53,604
(6.69 %)
219 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1		 n/a 15,954
(3.67 %)		 48,976
(7.25 %)		 n/a 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 90
(100.00 %)		 567,621
(7.41 %)		 564,288
(10.86 %)		 2,935,361
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
220 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1		 30,695
(4.95 %)		 11,306
(1.54 %)		 18,189
(3.03 %)		 n/a 42.34
(96.16 %)		 46,232
(3.85 %)		 67,421
(96.15 %)		 1,405,480
(27.29 %)		 330,698
(2.60 %)		 5,549,534
(36.65 %)		 35,561
(2.16 %)
221 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 41,784
(5.52 %)
222 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
223 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2		 65,115
(2.96 %)		 16,271
(0.65 %)		 102,071
(6.37 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 353,389
(7.60 %)		 11,454
(99.71 %)		 1,109,875
(4.83 %)		 983,866
(3.64 %)		 12,335,790
(52.95 %)		 117,743
(2.02 %)
224 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1		 56,539
(12.93 %)		 20,844
(4.28 %)		 41,664
(12.47 %)		 n/a 32.08
(95.31 %)		 23,174
(4.71 %)		 32,789
(95.29 %)		 332,532
(5.23 %)		 246,766
(4.06 %)		 2,679,673
(43.30 %)		 2,781
(0.47 %)
225 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,151
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
226 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
227 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
228 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1		 54,631
(54.17 %)		 17,073
(1.89 %)		 34,794
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 394
(100.00 %)		 761,527
(5.99 %)		 913,328
(13.25 %)		 5,768,003
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
229 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1		 n/a 17,048
(2.22 %)		 34,271
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 53
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,520
(8.15 %)		 5,700,818
(27.40 %)		 130,345
(8.19 %)
230 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1		 69,556
(45.15 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 4,237,797
(30.90 %)		 792,898
(2.69 %)		 13,417,248
(36.59 %)		 67,133
(2.54 %)
231 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1		 22,557
(62.12 %)		 4,716
(1.16 %)		 12,599
(4.34 %)		 26,251
(7.81 %)		 33.70
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 212,528
(2.58 %)		 60,682
(1.18 %)		 3,127,157
(46.89 %)		 24,620
(4.88 %)
232 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1		 46,467
(52.27 %)		 14,820
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 356
(100.00 %)		 476,317
(3.63 %)		 520,730
(13.27 %)		 3,283,400
(33.55 %)		 47,051
(4.45 %)
233 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1		 47,025
(39.90 %)		 20,576
(1.75 %)		 21,171
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 3,580,811
(22.71 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,125
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
234 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 29,648
(2.35 %)
235 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,729
(2.65 %)
236 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
237 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1		 32,738
(63.63 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,631
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 91
(100.00 %)		 168,479
(1.60 %)		 72,876
(1.70 %)		 3,384,083
(37.35 %)		 30,753
(4.27 %)
238 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1		 32,751
(9.65 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,632
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 92
(100.00 %)		 169,122
(1.61 %)		 72,892
(1.70 %)		 3,384,365
(37.36 %)		 30,753
(4.27 %)
239 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1		 n/a 15,456
(0.21 %)		 47,501
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,468
(100.00 %)		 20,643,710
(70.75 %)		 7,150,262
(12.27 %)		 9,477
(98.01 %)		 365,066
(1.20 %)
240 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1		 12,393
(87.51 %)		 5,085
(73.29 %)		 3,403
(39.29 %)		 n/a 36.05
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4
(100.00 %)		 3,336
(2.63 %)		 1,034
(0.58 %)		 80,458
(16.22 %)		 105
(0.31 %)
241 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3		 n/a 5,084
(73.46 %)		 3,394
(39.28 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 9
(100.00 %)		 3,053
(1.03 %)		 1,034
(0.58 %)		 79,714
(16.06 %)		 105
(0.31 %)
242 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2		 8,934
(5.16 %)		 1,548
(0.29 %)		 4,070
(2.36 %)		 8,934
(5.16 %)		 34.53
(99.76 %)		 15,128
(0.26 %)		 666
(100.00 %)		 124,259
(1.58 %)		 35,312
(1.17 %)		 2,638,150
(34.10 %)		 3,957
(0.38 %)
243 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
244 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1		 39,651
(35.92 %)		 18,302
(1.36 %)		 20,592
(1.23 %)		 32,831
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,489
(89.22 %)		 5,109,822
(37.03 %)		 389,314
(0.74 %)		 14,633,007
(38.46 %)		 27,461
(0.64 %)
245 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1		 24,196
(18.66 %)		 10,065
(8.48 %)		 14,473
(13.61 %)		 n/a 38.15
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 298,709
(14.86 %)		 80,048
(3.56 %)		 1,317,733
(33.56 %)		 18,849
(8.62 %)
246 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1		 25,550
(21.64 %)		 13,354
(17.52 %)		 20,540
(17.87 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 104
(100.00 %)		 169,365
(23.08 %)		 64,316
(3.47 %)		 791,743
(23.14 %)		 27,794
(16.15 %)
247 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1		 26,658
(22.06 %)		 13,461
(17.65 %)		 21,781
(17.83 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 145,818
(25.16 %)		 34,869
(4.31 %)		 719,811
(25.74 %)		 30,130
(16.11 %)
248 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1		 21,759
(15.21 %)		 12,488
(9.92 %)		 21,269
(14.06 %)		 n/a 39.11
(100.00 %)		 n/a 1,356
(100.00 %)		 314,594
(25.90 %)		 82,446
(12.33 %)		 1,113,448
(37.00 %)		 27,493
(12.03 %)
249 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1		 28,582
(26.45 %)		 13,448
(20.44 %)		 18,989
(18.34 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 126,424
(16.72 %)		 32,595
(4.31 %)		 759,296
(23.70 %)		 27,530
(17.02 %)
250 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2		 5,431
(4.09 %)		 13,713
(15.95 %)		 22,613
(16.71 %)		 n/a 42.28
(98.12 %)		 5,400
(1.88 %)		 13,440
(98.12 %)		 180,908
(22.48 %)		 68,911
(3.75 %)		 897,353
(23.94 %)		 31,387
(14.91 %)
251 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1		 27,925
(24.59 %)		 13,343
(17.86 %)		 20,029
(17.64 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 54
(100.00 %)		 169,559
(23.47 %)		 60,591
(3.64 %)		 837,616
(23.40 %)		 28,204
(16.22 %)
252 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
253 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1		 54,726
(1.72 %)		 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,310,970
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
254 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1		 n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
255 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2		 40,432
(2.55 %)		 18,884
(1.76 %)		 18,919
(1.46 %)		 n/a 41.60
(97.66 %)		 119,126
(2.36 %)		 200,593
(97.64 %)		 4,236,423
(40.48 %)		 503,179
(1.10 %)		 13,781,487
(28.85 %)		 53,465
(1.34 %)
256 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1		 n/a 20,110
(1.71 %)		 22,288
(1.49 %)		 n/a 41.69
(98.08 %)		 186,846
(1.93 %)		 244,258
(98.07 %)		 4,464,041
(41.66 %)		 614,896
(2.00 %)		 14,294,774
(30.62 %)		 59,340
(1.50 %)
257 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2		 n/a 20,381
(1.71 %)		 21,979
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,287
(100.00 %)		 4,484,597
(41.53 %)		 618,595
(2.00 %)		 14,236,406
(30.39 %)		 59,945
(1.50 %)
258 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
259 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,040
(10.97 %)		 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
260 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1		 17,520
(43.15 %)		 4,738
(0.89 %)		 16,197
(5.05 %)		 35,235
(7.97 %)		 34.09
(100.00 %)		 80
(0.01 %)		 32
(100.00 %)		 343,193
(3.25 %)		 144,286
(3.46 %)		 3,683,956
(48.60 %)		 30,200
(4.54 %)
261 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1		 42,119
(6.72 %)		 15,804
(2.23 %)		 49,721
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,473
(9.77 %)		 13,588
(99.93 %)		 394,687
(2.79 %)		 364,361
(3.37 %)		 4,191,676
(39.48 %)		 12,198
(0.64 %)
262 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1		 0
(0.00 %)		 19,842
(1.43 %)		 22,426
(1.24 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,906
(100.00 %)		 5,669,868
(50.59 %)		 760,836
(7.07 %)		 13,024,386
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
263 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,859
(1.44 %)		 22,429
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,670,600
(50.59 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,197
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
264 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 37,343
(3.12 %)
265 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 28,919
(3.52 %)
266 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1		 0
(0.00 %)		 18,965
(1.82 %)		 19,339
(1.52 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,699
(82.88 %)		 3,724,142
(27.19 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,866
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
267 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1		 n/a 21,341
(1.86 %)		 22,492
(1.24 %)		 n/a 40.87
(98.50 %)		 61,291
(1.50 %)		 196,804
(98.50 %)		 5,673,299
(51.36 %)		 1,080,627
(3.06 %)		 16,205,827
(36.77 %)		 79,387
(1.14 %)
268 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1		 n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
269 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1		 n/a 2,982
(0.90 %)		 5,710
(2.77 %)		 n/a 27.24
(97.73 %)		 41,970
(2.29 %)		 8,544
(100.00 %)		 195,538
(3.32 %)		 65,664
(2.79 %)		 2,529,566
(54.06 %)		 4,357
(1.18 %)
270 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3		 n/a 20,031
(1.89 %)		 22,619
(1.50 %)		 n/a 40.98
(95.94 %)		 43,363
(4.06 %)		 50,982
(95.94 %)		 4,082,873
(41.60 %)		 582,430
(1.47 %)		 14,808,558
(30.05 %)		 74,772
(2.61 %)
271 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1		 73,383
(42.66 %)		 16,638
(0.72 %)		 16,171
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 5,562,366
(25.40 %)		 1,096,625
(2.60 %)		 22,322,798
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
272 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
273 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1		 50,937
(43.78 %)		 19,011
(2.00 %)		 19,882
(1.66 %)		 41,741
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,570
(100.00 %)		 3,078,210
(32.07 %)		 495,290
(1.05 %)		 11,588,202
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
274 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1		 50,950
(3.26 %)		 18,992
(2.00 %)		 19,880
(1.66 %)		 41,778
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,285,971
(33.14 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
275 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
276 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
277 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
278 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1		 n/a 23,153
(1.31 %)		 51,642
(1.43 %)		 n/a 43.16
(99.88 %)		 8,133
(0.04 %)		 1,053,330
(99.96 %)		 3,675,075
(25.48 %)		 938,700
(2.73 %)		 12,027,923
(39.01 %)		 80,955
(2.31 %)
279 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,340
(13.40 %)
280 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
281 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2		 20,814
(51.89 %)		 4,346
(0.99 %)		 12,930
(3.50 %)		 21,226
(7.60 %)		 33.06
(99.10 %)		 27,314
(0.92 %)		 13,303
(100.00 %)		 270,925
(3.18 %)		 86,050
(1.20 %)		 3,416,162
(48.29 %)		 11,043
(1.07 %)
282 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1		 14,410
(22.17 %)		 987
(0.55 %)		 11,299
(59.37 %)		 n/a 63.87
(87.58 %)		 10,425
(12.45 %)		 11,385
(87.55 %)		 167,652
(16.23 %)		 100,391
(4.60 %)		 734,057
(30.38 %)		 3,154
(63.45 %)
283 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3		 n/a 988
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 171,684
(17.03 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 106
(99.48 %)
284 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1		 9,780
(62.01 %)		 743
(1.01 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 65,787
(8.35 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 776
(95.90 %)
285 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2		 76,037
(46.89 %)		 20,079
(1.94 %)		 20,246
(1.25 %)		 n/a 40.81
(98.67 %)		 178,925
(1.35 %)		 163,017
(98.65 %)		 5,382,039
(50.20 %)		 980,479
(2.63 %)		 16,076,172
(35.62 %)		 50,033
(1.04 %)
286 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1		 31,773
(2.57 %)		 14,548
(1.02 %)		 15,297
(1.46 %)		 n/a 43.49
(95.57 %)		 134,344
(4.44 %)		 274,367
(95.56 %)		 1,615,553
(13.87 %)		 317,600
(2.08 %)		 11,732,990
(28.32 %)		 36,782
(0.70 %)
287 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,904
(3.63 %)		 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 49,035
(1.44 %)
288 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1		 n/a 21,044
(1.46 %)		 30,072
(1.23 %)		 n/a 41.83
(99.88 %)		 7,114
(0.03 %)		 1,338,272
(99.97 %)		 5,359,537
(46.83 %)		 772,736
(1.54 %)		 13,705,428
(42.29 %)		 80,965
(1.65 %)
289 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1		 51,641
(50.37 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
290 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1		 51,593
(54.67 %)		 12,737
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 187
(100.00 %)		 502,844
(6.10 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,316
(23.59 %)		 46,108
(3.49 %)
291 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1		 0
(0.00 %)		 19,385
(1.74 %)		 20,265
(1.41 %)		 33,375
(1.66 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,871
(100.00 %)		 4,629,031
(43.70 %)		 573,328
(1.09 %)		 13,374,887
(33.10 %)		 50,379
(1.45 %)
292 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,380
(1.75 %)		 20,272
(1.41 %)		 n/a 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,629,766
(43.70 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,369,616
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
293 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1		 n/a 4,944
(1.30 %)		 35,031
(15.53 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 77
(100.00 %)		 87,841
(1.67 %)		 119,697
(13.20 %)		 1,309,907
(29.40 %)		 21,623
(4.17 %)
294 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1		 n/a 4,919
(1.33 %)		 34,873
(16.02 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 56
(100.00 %)		 84,495
(1.58 %)		 118,073
(13.23 %)		 1,301,514
(28.77 %)		 20,511
(4.03 %)
295 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1		 64,153
(41.00 %)		 20,337
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 3,783,435
(35.17 %)		 567,796
(3.38 %)		 13,462,481
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
296 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
297 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1		 35,641
(12.86 %)		 2,741
(0.61 %)		 28,868
(8.05 %)		 n/a 40.92
(99.93 %)		 3,073
(0.07 %)		 1,426
(100.00 %)		 117,879
(1.26 %)		 43,685
(1.30 %)		 1,858,762
(15.09 %)		 31,400
(5.04 %)
298 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2		 35,874
(6.47 %)		 11,298
(1.84 %)		 17,627
(2.12 %)		 n/a 41.48
(97.07 %)		 27,795
(2.94 %)		 113
(100.00 %)		 392,199
(5.95 %)		 139,126
(0.76 %)		 6,141,002
(18.21 %)		 12,943
(0.48 %)
299 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5		 42,799
(6.57 %)		 11,845
(1.92 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 421,463
(6.12 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
300 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1		 n/a 18,575
(1.67 %)		 17,121
(1.34 %)		 n/a 41.50
(98.14 %)		 45,680
(1.86 %)		 55,316
(98.14 %)		 3,941,878
(45.17 %)		 381,229
(1.99 %)		 14,674,265
(29.80 %)		 45,521
(1.52 %)
301 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1		 n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
302 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
303 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1		 n/a 7,825
(1.36 %)		 12,819
(3.07 %)		 n/a 35.11
(92.22 %)		 102,610
(7.82 %)		 104,053
(92.18 %)		 415,874
(2.30 %)		 376,409
(8.80 %)		 4,931,104
(52.61 %)		 7,139
(0.35 %)
304 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1		 n/a 21,299
(2.19 %)		 18,730
(1.41 %)		 102,168
(4.09 %)		 41.70
(86.82 %)		 314,064
(13.22 %)		 40,550
(96.00 %)		 5,186,721
(40.97 %)		 1,485,719
(3.05 %)		 13,610,761
(27.42 %)		 16,745
(0.41 %)
305 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1		 n/a 21,171
(2.20 %)		 18,776
(1.40 %)		 102,254
(4.12 %)		 41.70
(89.34 %)		 365,877
(10.71 %)		 33,692
(96.01 %)		 5,186,523
(40.90 %)		 1,483,826
(3.06 %)		 13,614,266
(28.13 %)		 16,590
(0.42 %)
306 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1		 n/a 21,337
(2.21 %)		 18,682
(1.41 %)		 102,138
(4.14 %)		 41.74
(88.91 %)		 361,689
(11.14 %)		 37,453
(95.84 %)		 5,096,953
(40.72 %)		 1,407,754
(2.90 %)		 13,416,041
(27.66 %)		 16,788
(0.42 %)
307 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1		 n/a 21,177
(2.22 %)		 18,550
(1.42 %)		 101,710
(4.15 %)		 41.74
(85.90 %)		 369,499
(14.15 %)		 37,497
(95.91 %)		 5,089,496
(40.41 %)		 1,399,438
(2.72 %)		 13,485,480
(26.52 %)		 16,675
(0.41 %)
308 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1		 n/a 21,259
(2.23 %)		 18,593
(1.42 %)		 101,632
(4.14 %)		 41.78
(79.43 %)		 410,639
(20.63 %)		 42,242
(96.14 %)		 5,081,543
(40.40 %)		 1,393,763
(2.54 %)		 13,472,532
(24.46 %)		 16,809
(0.38 %)
309 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1		 n/a 21,156
(2.23 %)		 18,610
(1.43 %)		 101,908
(4.18 %)		 41.80
(88.67 %)		 409,306
(11.39 %)		 42,324
(95.14 %)		 5,028,217
(40.37 %)		 1,364,702
(2.73 %)		 13,540,805
(27.33 %)		 16,544
(0.42 %)
310 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1		 n/a 21,195
(2.22 %)		 18,615
(1.42 %)		 101,520
(4.15 %)		 41.75
(89.39 %)		 380,840
(10.66 %)		 67,805
(93.73 %)		 5,037,447
(40.28 %)		 1,381,859
(2.89 %)		 13,440,164
(27.32 %)		 16,625
(0.42 %)
311 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26		 123,654
(4.49 %)		 24,134
(2.09 %)		 22,855
(1.67 %)		 n/a 41.73
(97.18 %)		 904
(2.82 %)		 21,179
(97.18 %)		 5,554,281
(45.50 %)		 1,695,255
(3.40 %)		 13,041,229
(35.91 %)		 25,014
(0.54 %)
312 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1		 n/a 21,012
(2.23 %)		 18,555
(1.43 %)		 101,892
(4.18 %)		 41.78
(84.14 %)		 402,247
(15.91 %)		 38,542
(95.89 %)		 5,032,748
(40.03 %)		 1,373,374
(2.60 %)		 13,411,126
(25.61 %)		 16,668
(0.40 %)
313 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1		 n/a 21,291
(2.24 %)		 19,697
(1.47 %)		 101,562
(4.18 %)		 42.00
(77.13 %)		 595,433
(22.95 %)		 66,154
(95.79 %)		 5,059,815
(40.57 %)		 1,370,443
(2.51 %)		 13,251,532
(23.62 %)		 18,188
(0.42 %)
314 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1		 n/a 21,233
(2.22 %)		 18,805
(1.43 %)		 103,134
(4.18 %)		 41.74
(86.47 %)		 337,909
(13.58 %)		 57,439
(95.37 %)		 5,112,301
(40.60 %)		 1,418,629
(2.92 %)		 13,588,055
(27.01 %)		 16,857
(0.41 %)
315 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1		 n/a 20,788
(1.85 %)		 22,424
(1.25 %)		 233,427
(57.20 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 258
(100.00 %)		 5,426,471
(53.12 %)		 1,085,458
(7.66 %)		 16,023,596
(40.44 %)		 52,702
(1.17 %)
316 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1		 n/a 20,627
(1.85 %)		 22,176
(1.24 %)		 233,698
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 5,419,334
(52.97 %)		 1,071,302
(7.38 %)		 15,894,505
(40.10 %)		 52,377
(1.20 %)
317 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1		 n/a 20,611
(1.85 %)		 22,275
(1.25 %)		 233,258
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 253
(100.00 %)		 5,392,161
(53.03 %)		 1,048,372
(7.50 %)		 15,960,374
(40.31 %)		 52,502
(1.20 %)
318 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1		 n/a 19,907
(1.86 %)		 21,558
(1.26 %)		 227,172
(5.00 %)		 40.88
(100.00 %)		 n/a 287
(100.00 %)		 5,174,496
(52.83 %)		 1,030,071
(7.85 %)		 15,147,153
(40.18 %)		 50,988
(1.20 %)
319 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1		 n/a 20,805
(1.84 %)		 22,193
(1.24 %)		 233,975
(4.93 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 348
(100.00 %)		 5,408,639
(53.33 %)		 1,056,398
(8.05 %)		 16,117,475
(40.76 %)		 52,411
(1.14 %)
320 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1		 n/a 19,963
(1.85 %)		 21,514
(1.25 %)		 227,480
(4.97 %)		 40.84
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 420
(100.00 %)		 5,185,516
(53.08 %)		 1,065,657
(8.25 %)		 15,183,778
(40.61 %)		 50,883
(1.20 %)
321 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1		 n/a 20,674
(1.84 %)		 22,283
(1.25 %)		 233,363
(4.94 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 244
(100.00 %)		 5,406,821
(53.15 %)		 1,060,553
(7.74 %)		 16,051,646
(40.51 %)		 52,343
(1.14 %)
322 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1		 n/a 20,688
(1.84 %)		 22,080
(1.23 %)		 233,237
(4.95 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 299
(100.00 %)		 5,391,900
(53.13 %)		 1,050,251
(7.66 %)		 16,052,188
(40.43 %)		 52,436
(1.14 %)
323 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1		 n/a 20,654
(1.85 %)		 22,309
(1.25 %)		 233,294
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 297
(100.00 %)		 5,410,814
(53.14 %)		 1,059,472
(7.72 %)		 16,043,406
(40.45 %)		 52,535
(1.14 %)
324 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1		 n/a 20,657
(1.85 %)		 22,458
(1.25 %)		 233,356
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 5,397,570
(53.08 %)		 1,046,743
(7.55 %)		 16,021,887
(40.41 %)		 52,164
(1.20 %)
325 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1		 n/a 20,742
(1.86 %)		 22,169
(1.25 %)		 233,386
(4.98 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 236
(100.00 %)		 5,380,815
(52.80 %)		 1,031,609
(7.04 %)		 16,008,178
(39.99 %)		 52,233
(1.13 %)
326 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1		 n/a 20,694
(1.84 %)		 22,451
(1.25 %)		 232,969
(4.90 %)		 40.75
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 330
(100.00 %)		 5,420,540
(53.42 %)		 1,100,044
(8.26 %)		 15,926,032
(40.73 %)		 52,706
(1.14 %)
327 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1		 n/a 20,635
(1.85 %)		 22,311
(1.24 %)		 233,162
(4.93 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 5,394,949
(53.13 %)		 1,045,161
(7.68 %)		 15,896,292
(40.33 %)		 52,604
(1.18 %)
328 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1		 n/a 19,939
(1.84 %)		 21,482
(1.25 %)		 227,418
(4.97 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 284
(100.00 %)		 5,199,262
(53.10 %)		 1,073,766
(8.08 %)		 15,085,301
(40.44 %)		 51,050
(1.19 %)
329 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1		 n/a 20,638
(1.84 %)		 22,373
(1.25 %)		 233,201
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 399
(100.00 %)		 5,405,239
(53.13 %)		 1,058,194
(7.69 %)		 15,910,496
(40.38 %)		 53,236
(1.22 %)
330 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1		 n/a 19,870
(1.85 %)		 21,659
(1.26 %)		 227,481
(4.98 %)		 40.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 5,197,395
(52.95 %)		 1,071,566
(7.99 %)		 15,109,996
(40.28 %)		 51,315
(1.20 %)
331 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1		 n/a 20,643
(1.86 %)		 22,373
(1.25 %)		 233,154
(4.98 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 5,382,379
(52.86 %)		 1,029,500
(7.16 %)		 15,979,100
(40.07 %)		 52,346
(1.15 %)
332 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1		 n/a 20,631
(1.86 %)		 22,210
(1.24 %)		 233,273
(4.97 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 436
(100.00 %)		 5,391,322
(52.85 %)		 1,041,900
(7.14 %)		 15,985,878
(40.09 %)		 52,630
(1.16 %)
333 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1		 n/a 20,587
(1.84 %)		 22,094
(1.24 %)		 232,602
(4.93 %)		 40.81
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 5,397,845
(53.20 %)		 1,069,444
(7.79 %)		 15,978,901
(40.45 %)		 51,968
(1.14 %)
334 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1		 n/a 20,651
(1.85 %)		 22,302
(1.25 %)		 233,105
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 365
(100.00 %)		 5,401,789
(53.10 %)		 1,061,956
(7.62 %)		 16,016,635
(40.44 %)		 52,440
(1.16 %)
335 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1		 n/a 20,701
(1.85 %)		 22,327
(1.24 %)		 232,970
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 345
(100.00 %)		 5,384,218
(53.11 %)		 1,029,835
(7.61 %)		 15,997,541
(40.37 %)		 52,287
(1.16 %)
336 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1		 n/a 19,886
(1.86 %)		 21,597
(1.26 %)		 227,249
(5.00 %)		 40.90
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 436
(100.00 %)		 5,188,879
(52.80 %)		 1,041,178
(7.85 %)		 15,168,227
(40.25 %)		 51,387
(1.26 %)
337 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1		 n/a 20,652
(1.85 %)		 22,270
(1.25 %)		 233,297
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 346
(100.00 %)		 5,421,505
(53.06 %)		 1,070,796
(7.57 %)		 15,904,078
(40.29 %)		 52,952
(1.24 %)
338 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1		 n/a 19,899
(1.85 %)		 21,663
(1.25 %)		 227,048
(4.98 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 5,179,894
(52.93 %)		 1,053,273
(8.01 %)		 15,211,574
(40.34 %)		 50,868
(1.15 %)
339 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1		 n/a 20,620
(1.85 %)		 22,173
(1.24 %)		 232,988
(57.14 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 5,408,314
(53.13 %)		 1,082,369
(7.68 %)		 15,986,592
(40.42 %)		 52,497
(1.15 %)
340 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1		 n/a 19,983
(1.85 %)		 21,787
(1.25 %)		 227,373
(4.96 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 5,212,793
(53.10 %)		 1,073,348
(8.29 %)		 15,098,284
(40.47 %)		 51,706
(1.21 %)
341 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1		 n/a 20,709
(1.85 %)		 22,220
(1.24 %)		 233,019
(4.95 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 295
(100.00 %)		 5,400,880
(53.06 %)		 1,072,673
(7.57 %)		 15,970,600
(40.36 %)		 52,279
(1.19 %)
342 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1		 n/a 20,643
(1.86 %)		 22,265
(1.25 %)		 233,156
(4.98 %)		 40.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 288
(100.00 %)		 5,389,985
(52.82 %)		 1,039,540
(7.07 %)		 15,972,086
(40.01 %)		 52,246
(1.17 %)
343 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1		 n/a 20,644
(1.86 %)		 22,204
(1.24 %)		 233,342
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 331
(100.00 %)		 5,394,888
(53.00 %)		 1,057,773
(7.41 %)		 16,010,248
(40.29 %)		 52,761
(1.18 %)
344 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1		 n/a 20,737
(1.84 %)		 22,422
(1.25 %)		 233,650
(4.94 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 5,403,741
(53.18 %)		 1,044,828
(7.78 %)		 15,926,586
(40.45 %)		 52,966
(1.19 %)
345 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1		 n/a 20,608
(1.85 %)		 22,133
(1.24 %)		 232,837
(4.94 %)		 40.81
(100.00 %)		 n/a 244
(100.00 %)		 5,393,247
(53.12 %)		 1,066,426
(7.67 %)		 15,949,983
(40.40 %)		 51,940
(1.16 %)
346 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1		 n/a 19,872
(1.85 %)		 21,396
(1.24 %)		 226,741
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 5,191,849
(53.05 %)		 1,052,422
(8.21 %)		 15,216,610
(40.53 %)		 50,940
(1.18 %)
347 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1		 n/a 20,679
(1.86 %)		 22,204
(1.25 %)		 233,578
(4.98 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 307
(100.00 %)		 5,393,904
(52.87 %)		 1,041,237
(7.18 %)		 15,894,360
(39.98 %)		 52,866
(1.21 %)
348 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1		 n/a 19,863
(1.85 %)		 21,383
(1.24 %)		 226,809
(4.97 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 378
(100.00 %)		 5,181,545
(52.95 %)		 1,053,224
(8.07 %)		 15,149,369
(40.47 %)		 51,292
(1.24 %)
349 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1		 n/a 20,711
(1.84 %)		 22,195
(1.24 %)		 233,223
(4.92 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 247
(100.00 %)		 5,415,439
(53.41 %)		 1,076,389
(8.28 %)		 16,001,461
(40.83 %)		 52,688
(1.16 %)
350 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1		 n/a 20,727
(1.84 %)		 22,443
(1.25 %)		 233,592
(4.92 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 5,424,250
(53.38 %)		 1,090,520
(8.17 %)		 15,938,736
(40.68 %)		 52,674
(1.19 %)
351 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1		 n/a 20,633
(1.85 %)		 22,288
(1.24 %)		 233,237
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 422
(100.00 %)		 5,403,587
(53.12 %)		 1,056,798
(7.68 %)		 15,880,598
(40.28 %)		 52,572
(1.21 %)
352 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1		 n/a 20,645
(1.85 %)		 22,426
(1.26 %)		 233,357
(4.96 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 485
(100.00 %)		 5,400,305
(52.99 %)		 1,056,100
(7.39 %)		 15,866,266
(40.12 %)		 52,798
(1.20 %)
353 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1		 n/a 20,622
(1.85 %)		 22,230
(1.24 %)		 233,267
(4.94 %)		 40.81
(100.00 %)		 n/a 423
(100.00 %)		 5,415,368
(53.22 %)		 1,083,752
(7.85 %)		 16,009,690
(40.54 %)		 52,324
(1.14 %)
354 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1		 n/a 20,675
(1.85 %)		 22,449
(1.25 %)		 233,621
(4.96 %)		 40.87
(100.00 %)		 n/a 487
(100.00 %)		 5,408,728
(53.04 %)		 1,060,811
(7.55 %)		 15,818,402
(40.19 %)		 52,717
(1.23 %)
355 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1		 n/a 20,636
(1.85 %)		 22,298
(1.24 %)		 233,236
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 5,409,203
(53.10 %)		 1,060,311
(7.60 %)		 16,026,213
(40.43 %)		 52,647
(1.16 %)
356 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1		 n/a 20,659
(1.84 %)		 22,252
(1.23 %)		 233,332
(4.93 %)		 40.78
(100.00 %)		 n/a 306
(100.00 %)		 5,414,841
(53.29 %)		 1,077,125
(7.99 %)		 15,891,119
(40.53 %)		 52,638
(1.18 %)
357 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1		 n/a 20,626
(1.85 %)		 22,072
(1.24 %)		 232,923
(4.95 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 5,409,820
(53.15 %)		 1,075,146
(7.68 %)		 15,995,649
(40.44 %)		 52,593
(1.16 %)
358 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1		 n/a 20,047
(1.86 %)		 21,511
(1.24 %)		 227,472
(4.97 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 342
(100.00 %)		 5,191,769
(53.10 %)		 1,044,947
(8.26 %)		 15,239,696
(40.62 %)		 51,172
(1.16 %)
359 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1		 n/a 20,748
(1.85 %)		 22,425
(1.25 %)		 233,661
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 329
(100.00 %)		 5,409,998
(53.11 %)		 1,067,279
(7.64 %)		 15,944,107
(40.38 %)		 53,297
(1.22 %)
360 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1		 n/a 20,684
(1.85 %)		 22,457
(1.26 %)		 233,500
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 260
(100.00 %)		 5,394,499
(53.00 %)		 1,048,556
(7.39 %)		 16,015,449
(40.28 %)		 52,834
(1.17 %)
361 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1		 n/a 20,823
(1.84 %)		 22,634
(1.24 %)		 232,547
(4.89 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 632
(100.00 %)		 5,435,641
(53.28 %)		 1,076,981
(7.96 %)		 15,851,923
(40.45 %)		 53,410
(1.21 %)
362 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1		 n/a 20,054
(1.85 %)		 21,827
(1.25 %)		 225,951
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 641
(100.00 %)		 5,213,929
(53.30 %)		 1,082,137
(8.76 %)		 15,068,577
(40.69 %)		 51,312
(1.19 %)
363 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1		 n/a 20,669
(1.84 %)		 22,455
(1.24 %)		 233,354
(4.93 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 292
(100.00 %)		 5,446,540
(53.17 %)		 1,085,576
(7.76 %)		 15,975,207
(40.52 %)		 53,535
(1.26 %)
364 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1		 n/a 20,698
(1.84 %)		 22,536
(1.25 %)		 233,733
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 5,421,378
(53.22 %)		 1,062,842
(7.81 %)		 15,934,809
(40.46 %)		 52,975
(1.21 %)
365 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1		 n/a 20,674
(1.84 %)		 22,467
(1.25 %)		 233,172
(4.93 %)		 40.87
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 497
(100.00 %)		 5,432,857
(53.10 %)		 1,072,648
(7.64 %)		 15,990,876
(40.53 %)		 54,101
(1.32 %)
366 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1		 n/a 20,722
(1.83 %)		 22,445
(1.24 %)		 233,268
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 5,449,816
(53.34 %)		 1,108,461
(8.05 %)		 15,985,498
(40.79 %)		 53,746
(1.28 %)
367 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1		 n/a 20,621
(1.84 %)		 22,396
(1.25 %)		 233,096
(4.93 %)		 40.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 323
(100.00 %)		 5,411,829
(53.22 %)		 1,079,483
(7.87 %)		 15,854,981
(40.43 %)		 53,155
(1.21 %)
368 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1		 n/a 19,952
(1.84 %)		 21,767
(1.25 %)		 227,273
(4.93 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 399
(100.00 %)		 5,216,997
(53.34 %)		 1,089,537
(8.70 %)		 15,132,132
(40.83 %)		 51,815
(1.21 %)
369 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1		 n/a 20,697
(1.85 %)		 22,322
(1.25 %)		 233,152
(4.95 %)		 40.83
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 429
(100.00 %)		 5,403,282
(53.05 %)		 1,062,881
(7.52 %)		 15,861,495
(40.19 %)		 52,733
(1.19 %)
370 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1		 n/a 20,606
(1.84 %)		 22,627
(1.25 %)		 233,499
(4.92 %)		 40.82
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 529
(100.00 %)		 5,419,888
(53.29 %)		 1,079,052
(8.00 %)		 15,778,626
(40.44 %)		 53,133
(1.23 %)
371 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1		 n/a 20,695
(1.85 %)		 22,489
(1.25 %)		 233,161
(4.93 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 620
(100.00 %)		 5,406,404
(53.21 %)		 1,061,348
(7.77 %)		 15,879,759
(40.38 %)		 52,992
(1.18 %)
372 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1		 n/a 20,696
(1.86 %)		 22,490
(1.27 %)		 233,253
(4.97 %)		 40.87
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 566
(100.00 %)		 5,397,389
(52.88 %)		 1,044,887
(7.21 %)		 16,011,018
(40.13 %)		 52,793
(1.17 %)
373 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1		 n/a 20,740
(1.84 %)		 22,693
(1.25 %)		 233,895
(4.94 %)		 40.87
(100.00 %)		 n/a 461
(100.00 %)		 5,448,421
(53.12 %)		 1,077,973
(7.55 %)		 15,956,661
(40.38 %)		 53,701
(1.29 %)
374 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1		 n/a 20,705
(1.84 %)		 22,599
(1.26 %)		 233,328
(4.93 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 503
(100.00 %)		 5,438,367
(53.15 %)		 1,090,141
(7.70 %)		 16,016,158
(40.57 %)		 53,652
(1.26 %)
375 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1		 n/a 20,710
(1.84 %)		 22,595
(1.25 %)		 233,614
(4.93 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 439
(100.00 %)		 5,436,784
(53.21 %)		 1,094,451
(7.82 %)		 15,990,282
(40.60 %)		 53,318
(1.27 %)
376 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1		 n/a 20,661
(1.84 %)		 22,407
(1.25 %)		 233,945
(4.93 %)		 40.80
(100.00 %)		 n/a 480
(100.00 %)		 5,418,964
(53.30 %)		 1,060,724
(7.98 %)		 15,795,098
(40.40 %)		 53,149
(1.21 %)
377 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1		 n/a 20,760
(1.85 %)		 22,730
(1.26 %)		 233,655
(4.96 %)		 40.87
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 480
(100.00 %)		 5,422,116
(53.02 %)		 1,069,864
(7.46 %)		 15,951,020
(40.27 %)		 53,338
(1.19 %)
378 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1		 n/a 20,766
(1.85 %)		 22,424
(1.25 %)		 233,619
(4.96 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 320
(100.00 %)		 5,437,541
(52.96 %)		 1,084,729
(7.35 %)		 16,097,675
(40.30 %)		 52,953
(1.18 %)
379 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1		 n/a 20,820
(1.84 %)		 22,672
(1.25 %)		 234,068
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 369
(100.00 %)		 5,451,270
(53.44 %)		 1,086,645
(8.28 %)		 15,991,774
(40.84 %)		 53,435
(1.18 %)
380 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1		 n/a 20,665
(1.84 %)		 22,566
(1.26 %)		 233,386
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 435
(100.00 %)		 5,436,802
(53.34 %)		 1,105,174
(8.06 %)		 15,931,296
(40.72 %)		 53,436
(1.26 %)
381 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1		 n/a 20,724
(1.83 %)		 22,627
(1.25 %)		 233,360
(4.91 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 512
(100.00 %)		 5,449,110
(53.39 %)		 1,087,677
(8.16 %)		 15,936,844
(40.79 %)		 53,859
(1.30 %)
382 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1		 n/a 20,702
(1.85 %)		 22,327
(1.25 %)		 233,403
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 456
(100.00 %)		 5,423,189
(53.07 %)		 1,075,620
(7.56 %)		 15,928,710
(40.31 %)		 53,423
(1.24 %)
383 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1		 n/a 19,942
(1.84 %)		 21,710
(1.25 %)		 227,313
(4.94 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 499
(100.00 %)		 5,226,752
(53.28 %)		 1,092,235
(8.58 %)		 15,143,136
(40.79 %)		 51,622
(1.24 %)
384 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1		 n/a 20,739
(1.84 %)		 22,340
(1.25 %)		 233,812
(4.92 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 5,464,910
(53.26 %)		 1,101,031
(7.88 %)		 15,871,098
(40.43 %)		 53,290
(1.27 %)
385 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1		 n/a 20,765
(1.85 %)		 22,414
(1.25 %)		 234,102
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 304
(100.00 %)		 5,443,478
(53.06 %)		 1,085,707
(7.53 %)		 15,888,465
(40.19 %)		 53,328
(1.24 %)
386 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1		 n/a 20,678
(1.85 %)		 22,534
(1.26 %)		 233,508
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 387
(100.00 %)		 5,404,648
(52.98 %)		 1,047,126
(7.31 %)		 15,970,133
(40.15 %)		 52,529
(1.17 %)
387 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1		 n/a 20,772
(1.85 %)		 22,461
(1.25 %)		 233,684
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 453
(100.00 %)		 5,424,224
(53.08 %)		 1,063,925
(7.53 %)		 15,954,132
(40.32 %)		 53,106
(1.23 %)
388 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1		 n/a 20,635
(1.84 %)		 22,458
(1.25 %)		 233,555
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 508
(100.00 %)		 5,389,804
(53.21 %)		 1,045,498
(7.82 %)		 15,862,735
(40.38 %)		 52,479
(1.17 %)
389 human (NA24385 HG002 alt pat 2023)
GCA_018852605.2		 n/a 19,962
(1.84 %)		 20,471
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.74 %)		 4
(0.26 %)		 27
(99.74 %)		 5,196,926
(53.37 %)		 1,083,984
(8.63 %)		 15,221,567
(40.81 %)		 50,569
(1.11 %)
390 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2		 n/a 20,637
(1.85 %)		 21,256
(1.20 %)		 n/a 40.82
(99.23 %)		 5
(0.77 %)		 24
(100.00 %)		 5,394,439
(53.04 %)		 1,041,946
(7.44 %)		 16,039,487
(40.04 %)		 52,111
(1.11 %)
391 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1		 n/a 20,744
(1.84 %)		 21,968
(1.22 %)		 233,779
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 445
(100.00 %)		 5,435,410
(53.40 %)		 1,086,871
(8.27 %)		 15,970,867
(40.97 %)		 53,581
(1.32 %)
392 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1		 n/a 20,809
(1.82 %)		 21,369
(1.18 %)		 234,089
(4.92 %)		 40.85
(99.95 %)		 109
(0.05 %)		 355
(100.00 %)		 5,489,855
(53.93 %)		 1,085,681
(8.26 %)		 15,968,830
(40.95 %)		 53,511
(1.32 %)
393 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1		 n/a 19,919
(1.83 %)		 21,582
(1.22 %)		 227,333
(4.91 %)		 40.87
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 5,215,774
(53.54 %)		 1,094,036
(9.09 %)		 15,125,069
(41.29 %)		 52,653
(1.34 %)
394 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1		 n/a 20,014
(1.81 %)		 20,716
(1.19 %)		 227,278
(4.91 %)		 40.87
(99.97 %)		 117
(0.03 %)		 514
(100.00 %)		 5,293,356
(54.01 %)		 1,100,786
(9.09 %)		 15,122,569
(41.27 %)		 52,546
(1.35 %)
395 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2		 n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
396 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4		 108,944
(51.73 %)		 20,844
(1.79 %)		 21,287
(1.16 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 n/a 25
(100.00 %)		 5,591,082
(54.45 %)		 1,155,353
(8.89 %)		 16,163,340
(41.63 %)		 52,408
(1.38 %)
397 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
398 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2		 46,759
(2.60 %)		 18,453
(1.69 %)		 20,410
(1.59 %)		 n/a 41.90
(99.98 %)		 3,639
(0.02 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,637,156
(23.36 %)		 497,087
(1.30 %)		 10,984,260
(32.64 %)		 47,552
(2.89 %)
399 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 17,930
(1.47 %)
400 Indian medaka
GCF_002922805.1		 47,300
(9.26 %)		 14,561
(2.50 %)		 31,867
(6.43 %)		 n/a 39.04
(94.73 %)		 51,440
(5.29 %)		 8,603
(100.00 %)		 319,637
(2.20 %)		 208,749
(2.67 %)		 5,412,794
(33.26 %)		 40,721
(2.36 %)
401 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1		 28,390
(14.36 %)		 4,799
(1.56 %)		 15,737
(7.20 %)		 n/a 35.38
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 136,242
(3.33 %)		 48,275
(1.61 %)		 2,518,372
(36.69 %)		 14,106
(2.86 %)
402 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1		 n/a 21,188
(1.26 %)		 41,550
(1.34 %)		 35,477
(1.51 %)		 42.19
(99.92 %)		 4,324
(0.02 %)		 798,700
(99.98 %)		 3,297,388
(28.66 %)		 476,792
(1.23 %)		 13,144,912
(34.13 %)		 81,685
(1.86 %)
403 Japanese quail
GCF_001577835.1		 46,995
(7.38 %)		 12,864
(2.55 %)		 36,126
(11.03 %)		 n/a 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 466,141
(6.58 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
404 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1		 n/a 14,672
(0.28 %)		 30,181
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,317
(100.00 %)		 1,167,498
(3.08 %)		 2,399,496
(18.16 %)		 10,302
(99.98 %)		 503,637
(6.56 %)
405 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1		 29,097
(10.82 %)		 4,337
(1.33 %)		 43,907
(11.32 %)		 n/a 44.75
(99.72 %)		 499
(0.28 %)		 857
(100.00 %)		 439,110
(17.67 %)		 262,539
(5.69 %)		 1,834,301
(29.28 %)		 6,204
(9.08 %)
406 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1		 49,444
(5.77 %)		 13,114
(1.92 %)		 17,732
(2.50 %)		 29,004
(4.44 %)		 41.97
(97.63 %)		 362
(2.37 %)		 99
(100.00 %)		 548,758
(10.76 %)		 208,171
(1.07 %)		 6,258,082
(20.20 %)		 22,279
(1.75 %)
407 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
408 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1		 55,736
(2.16 %)		 17,500
(0.86 %)		 16,193
(0.94 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,907
(100.00 %)		 7,814,631
(41.58 %)		 1,123,545
(2.03 %)		 21,796,057
(39.25 %)		 15,957
(0.35 %)
409 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
410 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
411 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
412 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1		 24,631
(60.59 %)		 4,550
(1.47 %)		 9,197
(5.18 %)		 30,394
(12.69 %)		 34.13
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 123,352
(2.30 %)		 36,616
(6.05 %)		 2,431,238
(41.04 %)		 8,442
(2.49 %)
413 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1		 n/a 26,266
(0.71 %)		 59,868
(0.81 %)		 n/a 42.00
(99.77 %)		 6,466
(0.02 %)		 3,890,086
(99.98 %)		 7,163,973
(22.64 %)		 1,629,329
(2.64 %)		 18,970,992
(42.82 %)		 138,732
(1.75 %)
414 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 35,505
(1.37 %)
415 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
416 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
417 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2		 n/a 591
(1.09 %)		 4,193
(46.51 %)		 n/a 59.58
(99.94 %)		 454
(0.06 %)		 76
(100.00 %)		 24,390
(4.61 %)		 4,228
(1.93 %)		 243,087
(20.97 %)		 92
(99.40 %)
418 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2		 n/a 626
(1.15 %)		 4,290
(46.53 %)		 n/a 59.72
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 33,021
(5.20 %)		 8,477
(2.43 %)		 238,932
(20.91 %)		 41
(99.80 %)
419 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1		 n/a 619
(1.14 %)		 3,882
(44.58 %)		 n/a 59.85
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 20,726
(2.91 %)		 2,267
(2.64 %)		 232,973
(20.45 %)		 44
(99.29 %)
420 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1		 n/a 643
(1.12 %)		 4,666
(45.26 %)		 n/a 59.72
(99.99 %)		 11
(0.00 %)		 98
(100.00 %)		 22,632
(2.47 %)		 4,241
(2.74 %)		 231,120
(20.18 %)		 100
(99.82 %)
421 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1		 73,266
(49.50 %)		 18,874
(1.62 %)		 21,014
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,329
(96.15 %)		 5,246,283
(42.87 %)		 1,059,443
(5.13 %)		 14,265,514
(32.20 %)		 77,000
(2.45 %)
422 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1		 25,978
(33.60 %)		 19,393
(1.38 %)		 20,311
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,359
(87.13 %)		 6,205,858
(38.76 %)		 832,823
(1.53 %)		 13,661,563
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
423 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
424 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1		 n/a 18,260
(1.53 %)		 23,046
(1.60 %)		 n/a 43.05
(99.99 %)		 1,662
(0.01 %)		 1,281
(100.00 %)		 3,246,021
(21.13 %)		 1,298,965
(12.06 %)		 9,752,193
(42.90 %)		 66,137
(2.85 %)
425 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1		 n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 61,834
(2.95 %)
426 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
427 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
428 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
429 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1		 60,760
(2.83 %)		 16,272
(0.65 %)		 109,234
(6.86 %)		 n/a 37.79
(92.71 %)		 350,251
(7.33 %)		 11,453
(100.00 %)		 946,986
(1.96 %)		 983,572
(3.65 %)		 12,334,735
(53.11 %)		 117,678
(2.02 %)
430 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3		 64,818
(2.94 %)		 16,252
(0.65 %)		 101,828
(6.36 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 351,533
(7.59 %)		 9,960
(99.71 %)		 945,052
(1.95 %)		 983,641
(3.64 %)		 12,325,371
(53.00 %)		 117,703
(2.02 %)
431 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,268
(11.91 %)		 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
432 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,810
(2.84 %)		 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,821
(5.51 %)
433 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2		 n/a 18,726
(1.51 %)		 20,948
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 995
(100.00 %)		 4,125,459
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
434 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1		 n/a 12,328
(2.02 %)		 20,312
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 141
(0.37 %)		 211
(99.63 %)		 497,506
(5.06 %)		 265,815
(1.51 %)		 6,045,702
(20.10 %)		 15,922
(1.43 %)
435 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 53,323
(5.09 %)
436 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2		 55,061
(41.68 %)		 21,084
(1.92 %)		 22,287
(1.31 %)		 n/a 40.74
(94.86 %)		 83,929
(5.15 %)		 112,850
(94.85 %)		 5,109,404
(47.71 %)		 734,754
(2.02 %)		 15,854,134
(33.62 %)		 36,070
(0.90 %)
437 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3		 n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)		 n/a 16
(100.00 %)		 79,857
(19.18 %)		 78,154
(15.50 %)		 186,960
(66.90 %)		 22
(0.04 %)
438 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1		 48,578
(30.31 %)		 19,449
(1.56 %)		 24,645
(1.37 %)		 41,235
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,656
(7.81 %)		 80,669
(100.00 %)		 3,063,619
(35.20 %)		 866,306
(3.08 %)		 13,310,826
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
439 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1		 29,549
(16.44 %)		 15,120
(6.45 %)		 49,515
(30.69 %)		 n/a 40.48
(93.32 %)		 20,693
(6.71 %)		 23,184
(93.29 %)		 115,049
(2.29 %)		 51,516
(1.90 %)		 1,488,940
(24.12 %)		 42,077
(12.05 %)
440 mangrove rivulus
GCF_001649575.1		 45,293
(11.01 %)		 14,510
(2.84 %)		 29,750
(6.81 %)		 n/a 40.03
(94.35 %)		 29,388
(5.66 %)		 3,073
(100.00 %)		 345,930
(2.32 %)		 146,268
(1.33 %)		 4,717,260
(27.31 %)		 39,557
(2.69 %)
441 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1		 29,488
(69.09 %)		 4,863
(1.16 %)		 19,812
(6.60 %)		 27,763
(8.31 %)		 36.96
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 227,482
(2.41 %)		 107,773
(3.02 %)		 2,456,144
(43.97 %)		 24,873
(3.15 %)
442 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1		 n/a 19,020
(1.63 %)		 19,812
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,552,310
(40.02 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
443 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1		 n/a 21,726
(1.54 %)		 31,908
(1.39 %)		 n/a 41.89
(99.96 %)		 4,153
(0.02 %)		 354,021
(99.98 %)		 4,835,157
(40.73 %)		 693,037
(1.32 %)		 13,779,279
(33.49 %)		 76,740
(2.37 %)
444 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1		 26,008
(10.49 %)		 7,743
(3.09 %)		 12,206
(6.18 %)		 n/a 35.15
(84.42 %)		 37,430
(15.62 %)		 43,002
(84.38 %)		 237,943
(3.36 %)		 74,977
(1.26 %)		 2,410,203
(31.96 %)		 15,259
(2.01 %)
445 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1		 n/a 19,584
(1.52 %)		 20,783
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 4,643,072
(34.73 %)		 1,102,137
(4.40 %)		 13,591,414
(35.18 %)		 53,471
(2.24 %)
446 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1		 n/a 238
(3.03 %)		 394
(8.09 %)		 n/a 33.70
(99.89 %)		 437
(0.04 %)		 1,743
(99.97 %)		 1,511
(2.99 %)		 268
(0.36 %)		 31,900
(26.59 %)		 373
(7.62 %)
447 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1		 1,996
(85.79 %)		 1,569
(68.26 %)		 596
(33.73 %)		 n/a 47.31
(99.97 %)		 4
(0.03 %)		 15
(99.97 %)		 257
(0.70 %)		 199
(0.40 %)		 10,819
(8.68 %)		 126
(3.52 %)
448 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1		 n/a 348
(2.68 %)		 284
(3.31 %)		 n/a 25.26
(99.86 %)		 n/a 5,465
(100.00 %)		 3,179
(1.99 %)		 1,572
(1.39 %)		 85,189
(41.34 %)		 4
(0.02 %)
449 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1		 42,553
(41.45 %)		 19,298
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,071
(94.04 %)		 4,041,828
(42.24 %)		 573,950
(1.48 %)		 13,504,295
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
450 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1		 61,711
(41.50 %)		 19,544
(1.49 %)		 21,502
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,375
(100.00 %)		 4,006,932
(35.92 %)		 1,058,106
(12.08 %)		 12,708,154
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
451 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1		 35,332
(12.83 %)		 2,750
(0.61 %)		 29,731
(8.07 %)		 n/a 40.94
(99.89 %)		 3,360
(0.11 %)		 8,241
(99.89 %)		 115,140
(1.18 %)		 39,880
(0.71 %)		 1,832,298
(14.55 %)		 31,479
(5.12 %)
452 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1		 n/a 21,302
(1.57 %)		 27,162
(1.27 %)		 40,982
(1.78 %)		 41.88
(99.90 %)		 11,139
(0.04 %)		 796,326
(99.96 %)		 5,253,752
(39.29 %)		 1,211,658
(3.13 %)		 13,894,596
(38.35 %)		 24,829
(0.69 %)
453 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1		 47,034
(41.56 %)		 18,428
(0.81 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 18
(100.00 %)		 7,426,369
(29.77 %)		 1,249,638
(2.12 %)		 21,135,395
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
454 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1		 n/a 4,930
(0.75 %)		 38,413
(8.53 %)		 35,924
(4.55 %)		 38.08
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 112
(100.00 %)		 261,421
(1.99 %)		 175,466
(5.62 %)		 3,107,482
(46.30 %)		 58,547
(5.75 %)
455 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1		 25,114
(8.87 %)		 5,088
(1.13 %)		 22,625
(7.19 %)		 n/a 36.56
(97.52 %)		 10,662
(2.49 %)		 13,637
(97.51 %)		 154,017
(1.49 %)		 50,642
(0.97 %)		 2,919,487
(37.00 %)		 34,396
(3.66 %)
456 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2		 n/a 16,645
(3.88 %)		 43,866
(14.64 %)		 n/a 33.16
(92.79 %)		 96,870
(7.25 %)		 2,463
(100.00 %)		 265,072
(3.32 %)		 198,918
(3.34 %)		 2,840,410
(34.89 %)		 13,926
(1.48 %)
457 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 25,670
(3.87 %)
458 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 31,271
(3.60 %)
459 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1		 74,574
(44.06 %)		 21,317
(1.73 %)		 20,856
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,652
(88.41 %)		 4,162,977
(32.77 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,503
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
460 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1		 n/a 21,418
(1.52 %)		 34,189
(1.28 %)		 n/a 41.35
(99.92 %)		 8,600
(0.03 %)		 653,473
(99.97 %)		 4,512,168
(44.82 %)		 592,047
(1.17 %)		 13,009,453
(37.18 %)		 63,033
(1.47 %)
461 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1		 n/a 19,180
(1.72 %)		 22,635
(1.71 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,620
(0.02 %)		 343
(100.00 %)		 3,081,500
(24.27 %)		 797,071
(5.37 %)		 10,372,159
(38.30 %)		 64,460
(2.57 %)
462 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 61,024
(2.68 %)
463 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
464 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1		 19,404
(22.65 %)		 12,088
(12.63 %)		 7,533
(12.85 %)		 n/a 37.35
(97.22 %)		 6,713
(2.80 %)		 607
(99.95 %)		 116,909
(19.60 %)		 45,475
(4.23 %)		 820,686
(35.42 %)		 4,887
(1.65 %)
465 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2		 36,181
(5.65 %)		 10,150
(1.34 %)		 42,117
(8.90 %)		 n/a 37.47
(94.63 %)		 39,556
(5.39 %)		 45,302
(94.61 %)		 396,916
(3.25 %)		 506,716
(6.41 %)		 4,768,175
(36.07 %)		 17,009
(0.90 %)
466 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
467 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 140,990
(2.86 %)
468 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2		 n/a 21,293
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,971
(90.87 %)		 5,327,246
(49.09 %)		 651,311
(1.26 %)		 19,267,381
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
469 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1		 46,131
(1.87 %)		 21,316
(1.15 %)		 25,308
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,328,146
(49.10 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
470 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1		 n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 93,862
(1.92 %)
471 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1		 49,934
(2.73 %)		 20,106
(1.74 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,434,732
(35.01 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
472 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1		 50,662
(4.74 %)		 13,528
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 521,768
(3.86 %)		 325,987
(9.82 %)		 5,542,269
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
473 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1		 28,512
(7.14 %)		 5,830
(1.09 %)		 39,806
(8.27 %)		 n/a 36.76
(100.00 %)		 n/a 1,714
(100.00 %)		 222,294
(5.58 %)		 187,561
(9.87 %)		 3,009,613
(56.49 %)		 63,009
(9.78 %)
474 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
475 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3		 n/a 20,134
(1.89 %)		 18,568
(1.14 %)		 n/a 40.76
(93.09 %)		 180,468
(6.94 %)		 197,908
(93.06 %)		 5,169,984
(51.90 %)		 831,865
(4.16 %)		 15,243,657
(35.77 %)		 65,761
(1.00 %)
476 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2		 97,432
(43.01 %)		 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
477 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2		 n/a 20,319
(1.82 %)		 21,542
(1.19 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,810
(99.24 %)		 5,524,514
(52.78 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,031
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
478 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3		 84,433
(3.85 %)		 20,317
(1.83 %)		 21,239
(1.18 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,811
(99.24 %)		 5,525,293
(52.79 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,088
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
479 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1		 n/a 1,945
(0.08 %)		 23,579
(1.88 %)		 n/a 36.81
(99.60 %)		 16,132
(0.41 %)		 16,156
(99.59 %)		 2,706,474
(10.11 %)		 2,525,264
(12.75 %)		 9,704,257
(48.31 %)		 77,313
(3.01 %)
480 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1		 20,948
(56.23 %)		 4,705
(1.06 %)		 15,277
(5.00 %)		 29,018
(10.11 %)		 33.42
(99.99 %)		 91
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 209,233
(2.16 %)		 56,676
(1.12 %)		 3,372,591
(44.40 %)		 13,547
(2.72 %)
481 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,081
(4.30 %)
482 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1		 31,681
(7.81 %)		 4,257
(0.79 %)		 16,323
(3.39 %)		 n/a 29.76
(92.38 %)		 46,297
(7.65 %)		 21,920
(100.00 %)		 768,383
(18.87 %)		 135,468
(2.11 %)		 4,536,093
(48.39 %)		 16,332
(2.13 %)
483 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
484 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1		 n/a 20,768
(1.76 %)		 21,550
(1.18 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 5,387,919
(53.48 %)		 1,027,640
(9.31 %)		 15,407,988
(41.73 %)		 99,854
(1.52 %)
485 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1		 46,646
(9.41 %)		 17,409
(3.12 %)		 51,529
(12.74 %)		 48,654
(8.33 %)		 32.79
(94.21 %)		 36,387
(5.81 %)		 72,923
(94.19 %)		 400,327
(3.60 %)		 306,656
(4.69 %)		 3,754,630
(39.24 %)		 26,578
(2.89 %)
486 pike-perch
GCF_008315115.1		 56,221
(8.23 %)		 15,677
(2.23 %)		 29,967
(5.65 %)		 62,989
(6.22 %)		 40.92
(100.00 %)		 94
(0.00 %)		 1,313
(100.00 %)		 591,660
(5.05 %)		 569,876
(7.39 %)		 4,713,605
(36.32 %)		 39,545
(1.93 %)
487 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1		 n/a 15,042
(1.17 %)		 19,939
(1.55 %)		 n/a 46.64
(100.00 %)		 476
(0.00 %)		 4,568
(100.00 %)		 5,326,862
(52.88 %)		 879,598
(5.00 %)		 9,545,961
(50.95 %)		 94,468
(9.28 %)
488 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1		 56,695
(3.09 %)		 14,805
(1.26 %)		 18,918
(1.63 %)		 42,516
(2.60 %)		 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,099,803
(51.62 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,829
(7.91 %)
489 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
490 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1		 35,751
(39.94 %)		 18,495
(1.67 %)		 15,243
(1.37 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,161
(98.33 %)		 4,221,025
(40.96 %)		 553,193
(1.29 %)		 13,765,526
(29.91 %)		 54,906
(1.17 %)
491 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
492 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1		 n/a 24,094
(1.34 %)		 35,119
(1.27 %)		 n/a 41.97
(99.87 %)		 6,569
(0.02 %)		 1,649,700
(99.98 %)		 5,613,563
(41.47 %)		 652,408
(1.55 %)		 13,943,055
(43.64 %)		 61,057
(1.17 %)
493 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1		 45,076
(35.88 %)		 19,564
(1.68 %)		 22,124
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,059
(99.12 %)		 3,917,534
(41.44 %)		 435,606
(1.73 %)		 14,738,354
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
494 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1		 n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
495 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1		 25,575
(34.74 %)		 17,665
(1.56 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,174
(100.00 %)		 4,884,619
(42.70 %)		 833,136
(1.76 %)		 13,705,706
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
496 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2		 59,332
(37.06 %)		 19,951
(1.94 %)		 19,039
(1.18 %)		 n/a 40.74
(82.95 %)		 156,797
(17.06 %)		 121,337
(82.94 %)		 5,136,492
(50.91 %)		 775,493
(1.63 %)		 15,570,612
(30.28 %)		 43,049
(0.71 %)
497 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 88,587
(3.87 %)		 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 53,329
(1.37 %)
498 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
499 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2		 n/a 19,480
(1.31 %)		 23,335
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,159
(100.00 %)		 4,179,975
(0.00 %)		 976,271
(2.33 %)		 13,766,353
(39.76 %)		 113,370
(2.46 %)
500 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1		 n/a 19,386
(1.31 %)		 22,863
(1.35 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 222
(100.00 %)		 4,099,590
(21.20 %)		 1,062,902
(3.78 %)		 13,416,878
(41.72 %)		 116,524
(2.66 %)
501 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1		 n/a 18,676
(1.38 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,884,561
(44.65 %)		 883,943
(1.73 %)		 13,254,559
(38.27 %)		 110,338
(2.33 %)
502 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1		 69,941
(20.66 %)		 33,762
(10.20 %)		 70,765
(28.80 %)		 n/a 35.29
(87.22 %)		 28,041
(12.80 %)		 10,676
(100.00 %)		 196,483
(2.53 %)		 150,132
(3.32 %)		 2,256,858
(26.65 %)		 23,381
(2.80 %)
503 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2		 n/a 4,641
(1.20 %)		 13,258
(4.79 %)		 32,725
(10.42 %)		 32.84
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 184,094
(2.52 %)		 41,639
(1.23 %)		 3,193,736
(41.82 %)		 10,747
(2.25 %)
504 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1		 26,926
(16.13 %)		 4,185
(2.08 %)		 24,859
(11.07 %)		 n/a 39.77
(99.98 %)		 2,089
(0.02 %)		 10,222
(100.00 %)		 88,278
(1.96 %)		 74,016
(3.78 %)		 1,305,254
(28.61 %)		 10,712
(6.90 %)
505 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1		 16,151
(2.15 %)		 12,046
(1.50 %)		 25,077
(1.98 %)		 n/a 41.63
(99.43 %)		 75,085
(0.59 %)		 134,672
(99.41 %)		 401,465
(6.41 %)		 153,694
(0.86 %)		 6,705,299
(20.45 %)		 30,183
(1.07 %)
506 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1		 16,238
(2.21 %)		 12,016
(1.53 %)		 23,985
(1.93 %)		 n/a 41.20
(99.63 %)		 59,230
(0.38 %)		 112,704
(99.62 %)		 322,026
(4.02 %)		 121,725
(0.68 %)		 6,797,850
(18.25 %)		 18,873
(0.62 %)
507 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 25,173
(40.74 %)		 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
508 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
509 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3		 n/a 20,558
(1.71 %)		 22,141
(1.12 %)		 n/a 40.95
(97.08 %)		 64,538
(2.91 %)		 348,579
(97.09 %)		 5,846,699
(54.61 %)		 1,429,378
(9.24 %)		 16,512,587
(40.26 %)		 98,572
(1.29 %)
510 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 59,888
(43.60 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
511 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1		 16,166
(2.37 %)		 12,054
(1.65 %)		 23,851
(2.04 %)		 n/a 41.63
(99.55 %)		 66,437
(0.46 %)		 120,312
(99.54 %)		 392,481
(7.69 %)		 217,040
(2.27 %)		 5,855,355
(18.33 %)		 7,602
(0.24 %)
512 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1		 n/a 21,125
(1.90 %)		 29,864
(1.51 %)		 65,909
(1.91 %)		 41.13
(99.93 %)		 4,599
(0.02 %)		 580,026
(99.98 %)		 3,840,645
(39.25 %)		 675,921
(1.83 %)		 13,841,750
(31.45 %)		 59,440
(1.72 %)
513 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 58,475
(4.46 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 642,988
(3.38 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
514 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,785
(6.02 %)		 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
515 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1		 n/a 12,450
(1.75 %)		 25,274
(2.35 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
516 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1		 n/a 13,145
(1.66 %)		 28,883
(2.53 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,923
(11.76 %)		 412,678
(12.92 %)		 6,047,578
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
517 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2		 n/a 13,146
(1.66 %)		 25,463
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,969
(11.76 %)		 412,670
(12.92 %)		 6,047,584
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
518 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1		 51,619
(61.28 %)		 12,831
(2.31 %)		 n/a n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 164
(100.00 %)		 667,924
(11.59 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,274
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
519 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1		 n/a 4,332
(0.82 %)		 15,532
(3.91 %)		 n/a 30.24
(99.98 %)		 240
(0.02 %)		 67
(100.00 %)		 481,097
(4.72 %)		 135,266
(7.01 %)		 4,093,473
(52.65 %)		 12,709
(2.68 %)
520 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1		 n/a 14,592
(2.84 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 442
(100.00 %)		 1,764,545
(30.13 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,092
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
521 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1		 n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
522 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2		 53,779
(39.43 %)		 21,304
(2.26 %)		 18,211
(1.40 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,919
(92.71 %)		 4,878,260
(40.08 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,226
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
523 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 96,713
(4.05 %)		 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
524 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
525 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
526 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2		 27,164
(5.26 %)		 3,465
(0.45 %)		 3,673
(1.75 %)		 n/a 30.90
(99.99 %)		 608
(0.01 %)		 10,436
(99.99 %)		 1,394,872
(53.53 %)		 76,419
(1.13 %)		 6,311,228
(43.85 %)		 647
(0.04 %)
527 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
528 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1		 n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 42,621
(2.15 %)
529 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1		 108,406
(45.40 %)		 13,961
(0.46 %)		 36,603
(1.55 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,475
(100.00 %)		 1,903,658
(2.85 %)		 2,970,695
(16.56 %)		 15,354,615
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
530 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2		 n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.24 %)		 1
(0.11 %)		 33
(1.38 %)		 1
(0.73 %)
531 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1		 n/a 17,882
(1.96 %)		 21,291
(1.88 %)		 n/a 42.53
(99.99 %)		 1,322
(0.01 %)		 265
(100.00 %)		 2,639,522
(28.12 %)		 453,024
(5.66 %)		 10,206,715
(31.11 %)		 59,363
(2.86 %)
532 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 56,451
(2.93 %)
533 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1		 29,778
(59.32 %)		 3,020
(1.06 %)		 13,146
(12.99 %)		 30,497
(24.04 %)		 36.33
(82.34 %)		 637,478
(17.95 %)		 4,312
(100.00 %)		 74,671
(1.98 %)		 63,328
(2.24 %)		 1,417,036
(20.33 %)		 2,099
(0.38 %)
534 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1		 n/a 8,130
(0.73 %)		 36,343
(4.06 %)		 n/a 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,433
(100.00 %)		 3,309,659
(59.73 %)		 1,194,161
(21.47 %)		 5,320,564
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
535 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2		 n/a 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,142
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,588
(98.79 %)		 4,702,292
(41.42 %)		 721,749
(1.39 %)		 14,065,592
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
536 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1		 23,426
(13.46 %)		 2,741
(0.95 %)		 3,156
(4.19 %)		 n/a 32.82
(91.54 %)		 11,185
(8.47 %)		 12,292
(91.53 %)		 572,062
(30.90 %)		 474,390
(10.49 %)		 1,741,644
(44.75 %)		 3,489
(0.51 %)
537 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 95,573
(1.75 %)
538 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2		 n/a 19,572
(1.70 %)		 20,107
(1.11 %)		 n/a 40.45
(99.93 %)		 3
(0.07 %)		 40
(100.00 %)		 5,057,491
(55.54 %)		 869,279
(15.07 %)		 14,090,400
(46.04 %)		 87,907
(1.41 %)
539 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2		 105,360
(44.53 %)		 20,433
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 1
(0.03 %)		 26
(100.00 %)		 5,354,441
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,483
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
540 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
541 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
542 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
543 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1		 54,238
(2.74 %)		 17,887
(2.00 %)		 18,517
(1.25 %)		 n/a 41.17
(98.20 %)		 18,567
(1.80 %)		 18,392
(100.00 %)		 4,399,357
(50.55 %)		 711,948
(2.37 %)		 12,623,705
(36.55 %)		 67,835
(1.30 %)
544 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2		 63,475
(2.65 %)		 20,581
(1.94 %)		 21,181
(1.20 %)		 41,252
(1.46 %)		 41.02
(97.81 %)		 25,106
(2.19 %)		 18,395
(100.00 %)		 5,332,131
(51.09 %)		 857,562
(2.26 %)		 15,565,289
(36.84 %)		 80,124
(1.26 %)
545 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1		 n/a 26,771
(1.11 %)		 44,247
(1.00 %)		 n/a 40.68
(99.86 %)		 9,648
(0.03 %)		 1,946,791
(99.97 %)		 6,230,312
(41.68 %)		 688,924
(1.23 %)		 16,892,392
(43.00 %)		 39,326
(0.65 %)
546 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1		 67,213
(41.75 %)		 22,195
(1.49 %)		 21,341
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 85
(100.00 %)		 4,625,875
(39.88 %)		 579,984
(1.59 %)		 14,405,402
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
547 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1		 n/a 19,066
(1.18 %)		 19,334
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.44 %)		 269,444
(11.60 %)		 277,845
(88.40 %)		 3,789,866
(28.89 %)		 429,318
(0.87 %)		 16,950,647
(32.23 %)		 39,994
(0.70 %)
548 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,749
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
549 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1		 n/a 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
550 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
551 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1		 37,836
(4.45 %)		 10,526
(1.07 %)		 59,331
(6.34 %)		 n/a 36.53
(93.84 %)		 227,684
(6.18 %)		 139,583
(93.83 %)		 653,914
(2.87 %)		 386,956
(5.71 %)		 7,364,314
(43.00 %)		 60,636
(4.05 %)
552 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1		 76,167
(6.12 %)		 24,114
(1.71 %)		 51,371
(4.08 %)		 102,891
(5.24 %)		 43.39
(96.16 %)		 25,659
(3.84 %)		 38,027
(99.99 %)		 1,300,179
(8.96 %)		 1,465,690
(10.81 %)		 8,849,714
(48.44 %)		 64,215
(1.55 %)
553 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 61,643
(5.52 %)		 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
554 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1		 58,416
(66.24 %)		 15,695
(2.61 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 1,591,314
(33.50 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,850
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
555 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1		 n/a 3,698
(0.12 %)		 117,910
(5.00 %)		 35,315
(1.88 %)		 45.79
(99.99 %)		 1,576
(0.01 %)		 7,048
(100.00 %)		 770,997
(2.03 %)		 680,149
(3.55 %)		 10,994,272
(39.37 %)		 304,620
(17.03 %)
556 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1		 n/a 24,302
(1.12 %)		 43,055
(0.98 %)		 n/a 41.63
(99.82 %)		 10,550
(0.03 %)		 2,272,285
(99.97 %)		 5,668,964
(24.75 %)		 1,628,683
(5.38 %)		 15,658,806
(41.85 %)		 21,801
(0.44 %)
557 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1		 n/a 5,905
(1.14 %)		 41,195
(8.84 %)		 n/a 37.42
(93.28 %)		 45,500
(6.75 %)		 48,671
(93.25 %)		 738,398
(35.22 %)		 171,041
(5.71 %)		 3,037,349
(50.41 %)		 65,784
(9.49 %)
558 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1		 n/a 25,638
(0.82 %)		 49,782
(0.86 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 5,819
(0.02 %)		 2,150,023
(99.98 %)		 6,033,640
(37.10 %)		 708,890
(0.99 %)		 22,371,532
(41.88 %)		 80,897
(1.09 %)
559 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1		 n/a 25,877
(0.78 %)		 56,071
(0.82 %)		 n/a 39.82
(99.84 %)		 5,099
(0.02 %)		 2,537,432
(99.98 %)		 5,384,587
(37.86 %)		 724,925
(2.20 %)		 19,492,096
(41.12 %)		 55,674
(0.90 %)
560 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1		 37,037
(37.57 %)		 18,551
(1.79 %)		 19,747
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,823
(96.04 %)		 3,824,807
(39.33 %)		 421,693
(0.97 %)		 14,765,476
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
561 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4		 82,440
(9.65 %)		 27,682
(3.07 %)		 77,218
(11.84 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,955
(2.35 %)		 17,146
(97.65 %)		 834,646
(37.35 %)		 436,219
(5.65 %)		 5,341,660
(45.30 %)		 35,897
(1.56 %)
562 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5		 85,123
(9.72 %)		 27,647
(3.06 %)		 77,190
(11.83 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,995
(2.36 %)		 17,187
(97.64 %)		 834,651
(37.35 %)		 436,225
(5.65 %)		 5,341,721
(45.30 %)		 35,897
(1.47 %)
563 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1		 n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 25,552
(2.34 %)
564 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 28,905
(2.31 %)
565 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1		 21,720
(55.73 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,002
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 304,077
(2.97 %)		 110,835
(4.09 %)		 3,704,355
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
566 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2		 60,921
(2.59 %)		 19,527
(1.73 %)		 25,114
(1.51 %)		 n/a 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,365,057
(42.78 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.52 %)
567 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1		 31,248
(25.26 %)		 2,167
(1.08 %)		 6,648
(9.22 %)		 n/a 35.83
(86.92 %)		 14,944
(13.10 %)		 27,972
(86.90 %)		 108,973
(4.04 %)		 70,563
(4.66 %)		 881,116
(24.58 %)		 668
(0.62 %)
568 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1		 n/a 7,737
(1.16 %)		 11,972
(2.65 %)		 n/a 38.85
(84.55 %)		 129,113
(15.50 %)		 125,702
(84.50 %)		 310,342
(1.75 %)		 391,619
(8.42 %)		 5,616,633
(48.71 %)		 38,246
(1.55 %)
569 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
570 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,452
(4.10 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
571 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
572 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
573 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1		 36,135
(16.45 %)		 3,324
(0.70 %)		 20,909
(10.93 %)		 38,198
(17.00 %)		 38.54
(89.50 %)		 49,077
(10.54 %)		 5,688
(100.00 %)		 111,077
(1.70 %)		 108,732
(2.95 %)		 2,009,396
(21.40 %)		 6,012
(0.58 %)
574 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1		 53,859
(65.52 %)		 16,035
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 59
(100.00 %)		 1,870,238
(37.80 %)		 605,571
(6.82 %)		 5,059,499
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
575 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1		 n/a 1,461
(1.76 %)		 22,413
(61.13 %)		 n/a 54.37
(99.66 %)		 50
(0.34 %)		 28
(100.00 %)		 8,935
(0.72 %)		 9,528
(3.65 %)		 117,380
(14.16 %)		 34
(99.96 %)
576 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3		 n/a 20,174
(1.79 %)		 20,994
(1.15 %)		 47,806
(1.68 %)		 40.80
(99.29 %)		 553
(0.70 %)		 5,813
(99.30 %)		 5,497,148
(54.41 %)		 1,048,361
(8.01 %)		 15,948,575
(40.68 %)		 39,481
(0.87 %)
577 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 55,799
(2.08 %)
578 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
579 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
580 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
581 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1		 n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 23,629
(0.48 %)
582 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2		 n/a 17,617
(0.77 %)		 15,414
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 273
(100.00 %)		 5,866,321
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,517
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
583 Tasmanian devil
GCF_000189315.1		 32,527
(1.79 %)		 16,112
(0.84 %)		 16,152
(0.94 %)		 n/a 36.05
(92.36 %)		 201,403
(7.66 %)		 237,291
(92.34 %)		 6,766,259
(42.85 %)		 1,240,681
(2.07 %)		 20,998,733
(36.61 %)		 23,155
(0.38 %)
584 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3		 53,828
(40.09 %)		 26,552
(34.12 %)		 25,867
(35.78 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 67,353
(16.32 %)		 27,063
(2.77 %)		 749,020
(22.64 %)		 4,599
(1.63 %)
585 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,165
(1.70 %)		 18,102
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,378,557
(36.61 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
586 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
587 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
588 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1		 36,084
(1.94 %)		 4,032
(0.13 %)		 128,567
(5.82 %)		 43,960
(2.05 %)		 46.91
(99.95 %)		 13,519
(0.05 %)		 1,665
(100.00 %)		 1,116,542
(2.95 %)		 642,860
(3.16 %)		 10,429,455
(39.18 %)		 37,849
(2.30 %)
589 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1		 23,429
(54.20 %)		 3,517
(1.61 %)		 18,910
(15.71 %)		 n/a 42.18
(97.94 %)		 14,007
(2.09 %)		 459
(100.00 %)		 52,042
(1.17 %)		 27,065
(1.23 %)		 928,666
(18.11 %)		 15,823
(5.51 %)
590 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
591 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1		 47,041
(13.29 %)		 13,817
(3.76 %)		 32,943
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.04 %)		 23,101
(6.97 %)		 60,478
(93.03 %)		 359,724
(3.91 %)		 155,380
(3.35 %)		 2,811,700
(24.51 %)		 61,685
(7.72 %)
592 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1		 41,346
(1.27 %)		 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
593 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4		 46,014
(6.94 %)		 15,396
(2.15 %)		 38,462
(7.56 %)		 n/a 34.12
(90.18 %)		 19,634
(9.83 %)		 3,150
(100.00 %)		 417,162
(18.21 %)		 229,803
(3.18 %)		 5,370,478
(35.28 %)		 25,279
(1.28 %)
594 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1		 n/a 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,267
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,978
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
595 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1		 n/a 16,039
(2.06 %)		 44,287
(4.38 %)		 n/a 40.99
(92.91 %)		 867
(7.09 %)		 597
(100.00 %)		 2,228,831
(30.95 %)		 687,495
(13.85 %)		 5,309,097
(36.70 %)		 27,070
(2.09 %)
596 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
597 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1		 n/a 12,867
(1.81 %)		 26,393
(2.48 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 311
(100.00 %)		 429,011
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,716
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
598 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2		 n/a 576
(1.36 %)		 2,999
(35.93 %)		 n/a 45.94
(99.65 %)		 6,447
(0.44 %)		 2,026
(100.00 %)		 16,807
(2.60 %)		 3,925
(0.79 %)		 141,656
(16.64 %)		 4,877
(34.82 %)
599 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1		 n/a 742
(1.83 %)		 848
(40.20 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 n/a 64
(100.00 %)		 39,141
(7.68 %)		 14,366
(6.71 %)		 131,898
(25.19 %)		 4,119
(14.82 %)
600 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1		 24,334
(8.13 %)		 7,223
(2.32 %)		 6,632
(3.62 %)		 n/a 33.80
(97.46 %)		 9,688
(2.55 %)		 7,986
(100.00 %)		 418,532
(4.76 %)		 185,734
(2.26 %)		 3,090,742
(35.34 %)		 3,487
(0.58 %)
601 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1		 n/a 13,678
(0.88 %)		 29,720
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 961
(100.00 %)		 734,036
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,883
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
602 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1		 56,630
(1.50 %)		 14,448
(0.38 %)		 40,572
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,263,606
(1.94 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
603 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1		 n/a 21,053
(1.88 %)		 23,024
(1.24 %)		 n/a 40.68
(96.59 %)		 77,615
(3.42 %)		 47,644
(100.00 %)		 5,478,730
(51.13 %)		 969,126
(2.63 %)		 16,127,854
(36.40 %)		 63,965
(1.04 %)
604 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2		 66,965
(2.69 %)		 21,958
(1.85 %)		 24,388
(1.22 %)		 55,722
(1.95 %)		 40.60
(97.10 %)		 63,620
(2.91 %)		 47,449
(100.00 %)		 5,699,639
(51.61 %)		 1,066,606
(2.87 %)		 16,603,622
(37.49 %)		 71,084
(1.08 %)
605 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3		 68,173
(2.68 %)		 21,804
(1.85 %)		 23,385
(1.18 %)		 n/a 40.60
(97.10 %)		 64,415
(2.91 %)		 46,654
(100.00 %)		 5,700,226
(51.61 %)		 1,066,759
(2.88 %)		 16,603,818
(37.49 %)		 71,078
(1.08 %)
606 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4		 63,704
(2.55 %)		 21,347
(1.86 %)		 23,056
(1.19 %)		 n/a 40.84
(97.07 %)		 57,757
(2.93 %)		 34,372
(100.00 %)		 5,504,117
(51.70 %)		 961,351
(2.75 %)		 16,208,033
(37.10 %)		 71,046
(1.10 %)
607 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1		 54,667
(35.81 %)		 19,685
(1.25 %)		 21,268
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,096
(95.17 %)		 6,165,270
(34.95 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,333
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
608 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1		 63,555
(8.16 %)		 16,886
(1.90 %)		 72,876
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,674
(0.23 %)		 2,010
(100.00 %)		 800,389
(3.72 %)		 460,244
(7.41 %)		 5,439,256
(37.83 %)		 19,635
(1.10 %)
609 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1		 48,870
(21.91 %)		 19,421
(7.41 %)		 36,314
(20.76 %)		 n/a 36.49
(94.25 %)		 49,649
(5.76 %)		 25,263
(100.00 %)		 182,696
(3.35 %)		 143,269
(7.40 %)		 1,620,517
(29.12 %)		 13,323
(2.49 %)
610 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1		 34,675
(2.01 %)		 3,329
(0.10 %)		 24,015
(1.20 %)		 n/a 33.26
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 16,531
(100.00 %)		 1,258,301
(2.08 %)		 828,332
(2.42 %)		 17,994,342
(48.98 %)		 63,015
(0.95 %)
611 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1		 13,201
(7.14 %)		 3,474
(1.25 %)		 15,142
(4.89 %)		 n/a 30.36
(99.55 %)		 7,471
(0.46 %)		 9,928
(99.54 %)		 340,841
(7.52 %)		 251,386
(3.99 %)		 2,448,273
(49.27 %)		 16,346
(4.08 %)
612 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1		 n/a 20,245
(1.49 %)		 24,230
(1.29 %)		 n/a 42.11
(97.39 %)		 263,385
(2.62 %)		 630,367
(97.38 %)		 5,997,926
(47.35 %)		 466,019
(1.02 %)		 13,822,739
(40.29 %)		 93,080
(1.71 %)
613 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1		 48,251
(30.18 %)		 21,044
(1.72 %)		 22,320
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,546
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,250
(0.66 %)		 13,410,191
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
614 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1		 29,923
(35.25 %)		 18,034
(1.33 %)		 19,779
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,566
(85.91 %)		 6,527,125
(45.87 %)		 1,271,531
(2.29 %)		 12,374,069
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
615 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
616 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1		 n/a 20,870
(2.26 %)		 18,535
(1.45 %)		 100,622
(4.22 %)		 41.80
(84.36 %)		 399,976
(15.70 %)		 72,315
(94.81 %)		 4,961,700
(39.53 %)		 1,345,987
(2.51 %)		 13,324,808
(25.23 %)		 16,556
(0.40 %)
617 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2		 24,277
(14.78 %)		 4,066
(1.46 %)		 26,743
(11.40 %)		 n/a 51.10
(94.72 %)		 60,375
(5.31 %)		 34,226
(94.71 %)		 275,482
(4.88 %)		 167,812
(3.67 %)		 1,832,537
(24.44 %)		 26,406
(36.85 %)
618 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3		 n/a 20,323
(1.77 %)		 22,069
(1.15 %)		 n/a 40.71
(99.64 %)		 768
(0.36 %)		 16,065
(99.64 %)		 5,373,630
(50.30 %)		 1,025,389
(10.17 %)		 15,954,613
(41.78 %)		 53,557
(1.01 %)
619 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 76,432
(1.35 %)
620 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2		 98,415
(41.67 %)		 21,010
(1.59 %)		 50,696
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 25
(100.00 %)		 5,456,267
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,191
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
621 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3		 n/a 21,010
(1.59 %)		 50,695
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 26
(100.00 %)		 5,456,271
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,225
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
622 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3		 51,681
(3.25 %)		 15,203
(1.04 %)		 22,272
(1.67 %)		 46,230
(2.32 %)		 44.19
(91.88 %)		 183,744
(8.14 %)		 262,326
(91.86 %)		 2,767,141
(30.92 %)		 316,971
(0.98 %)		 11,856,824
(28.95 %)		 104,231
(1.84 %)
623 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
624 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1		 12,199
(13.86 %)		 2,842
(1.49 %)		 27,198
(19.18 %)		 n/a 51.58
(99.74 %)		 1,901
(0.26 %)		 3,993
(99.74 %)		 33,136
(1.10 %)		 13,115
(0.57 %)		 612,854
(9.73 %)		 2,003
(54.71 %)
625 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1		 n/a 21,211
(2.19 %)		 17,797
(1.36 %)		 100,839
(4.01 %)		 41.65
(89.10 %)		 334,091
(10.95 %)		 29,259
(98.77 %)		 5,087,807
(40.60 %)		 1,402,357
(3.14 %)		 13,522,663
(27.99 %)		 16,888
(0.42 %)
626 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1		 37,175
(25.01 %)		 4,407
(2.81 %)		 15,504
(11.96 %)		 n/a 40.34
(98.12 %)		 8,733
(1.89 %)		 10,707
(98.11 %)		 87,084
(2.38 %)		 44,673
(2.55 %)		 1,001,343
(22.18 %)		 7,519
(2.78 %)
627 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 22,185
(2.62 %)
628 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
629 white-footed mouse
GCF_004664715.1		 46,167
(2.56 %)		 20,406
(1.72 %)		 20,857
(1.46 %)		 39,081
(1.88 %)		 42.23
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 1,763
(100.00 %)		 5,064,597
(30.73 %)		 1,258,088
(2.85 %)		 14,005,845
(33.01 %)		 23,475
(0.69 %)
630 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1		 57,774
(39.81 %)		 20,653
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 40,950
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,030
(0.91 %)		 48,652
(99.10 %)		 4,799,958
(41.28 %)		 413,128
(2.59 %)		 13,296,686
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
631 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1		 n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
632 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1		 58,109
(2.92 %)		 21,699
(1.91 %)		 20,910
(1.24 %)		 n/a 40.85
(94.45 %)		 187,214
(5.57 %)		 201,523
(94.43 %)		 5,120,629
(48.95 %)		 768,432
(2.30 %)		 15,303,718
(34.75 %)		 35,805
(0.79 %)
633 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1		 n/a 21,754
(1.86 %)		 21,668
(1.22 %)		 n/a 40.77
(99.67 %)		 48,495
(0.33 %)		 88,439
(99.67 %)		 5,195,965
(48.83 %)		 825,714
(3.60 %)		 15,372,168
(38.05 %)		 34,994
(0.85 %)
634 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1		 n/a 21,729
(1.89 %)		 21,502
(1.30 %)		 n/a 40.85
(98.70 %)		 370
(1.30 %)		 1,360
(98.70 %)		 5,122,418
(49.40 %)		 818,502
(3.68 %)		 15,232,829
(38.20 %)		 36,656
(0.90 %)
635 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1		 n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 35,222
(0.94 %)
636 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2		 n/a 21,801
(1.88 %)		 21,501
(1.28 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,234
(100.00 %)		 5,036,594
(47.71 %)		 842,846
(3.25 %)		 15,161,577
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
637 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1		 55,408
(53.40 %)		 13,572
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 929
(100.00 %)		 616,295
(10.57 %)		 211,557
(2.90 %)		 6,785,134
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
638 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2		 n/a 18,785
(1.94 %)		 17,252
(1.62 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,871
(98.82 %)		 3,098,525
(34.75 %)		 353,630
(1.23 %)		 12,349,553
(25.12 %)		 45,436
(1.02 %)
639 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1		 131,302
(1.34 %)		 33,079
(0.33 %)		 567,762
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,768
(3.31 %)		 148,396
(100.00 %)		 2,762,705
(2.81 %)		 2,991,142
(3.37 %)		 493,164
(96.69 %)		 2,220,897
(25.33 %)
640 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2		 69,091
(6.81 %)		 16,823
(1.67 %)		 75,740
(11.45 %)		 n/a 35.81
(86.74 %)		 133,967
(13.30 %)		 3,189
(98.45 %)		 588,761
(3.39 %)		 493,855
(3.35 %)		 5,206,772
(45.36 %)		 48,008
(1.88 %)
641 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1		 n/a 14,001
(6.64 %)		 34,562
(26.90 %)		 n/a 38.40
(94.26 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,459
(94.24 %)		 152,427
(20.00 %)		 74,539
(2.79 %)		 1,032,592
(21.43 %)		 14,802
(3.20 %)
642 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1		 50,529
(5.75 %)		 12,950
(1.89 %)		 19,252
(2.57 %)		 24,522
(2.44 %)		 42.30
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 3,744
(100.00 %)		 500,823
(7.17 %)		 300,638
(2.31 %)		 6,414,267
(20.54 %)		 28,268
(2.21 %)
643 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1		 n/a 20,813
(1.60 %)		 23,199
(1.43 %)		 45,153
(1.99 %)		 40.00
(97.18 %)		 57,045
(2.82 %)		 105,556
(97.18 %)		 4,756,333
(33.73 %)		 836,503
(2.41 %)		 14,755,960
(31.13 %)		 34,151
(0.87 %)
644 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1		 62,044
(2.80 %)		 19,783
(1.48 %)		 21,060
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 46
(0.00 %)		 3,381
(100.00 %)		 3,884,968
(28.12 %)		 912,591
(2.73 %)		 14,538,767
(35.15 %)		 36,919
(1.02 %)
645 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1		 73,681
(3.43 %)		 25,892
(1.02 %)		 114,154
(3.30 %)		 n/a 39.45
(100.00 %)		 146
(0.00 %)		 630
(100.00 %)		 4,795,312
(24.37 %)		 2,093,730
(16.74 %)		 13,132,465
(67.32 %)		 248,526
(4.59 %)
646 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1		 n/a 13,052
(1.78 %)		 24,950
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,695
(100.00 %)		 444,866
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,498
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
647 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,639
(1.72 %)		 19,645
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 n/a 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
648 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1		 43,299
(41.33 %)		 18,726
(1.80 %)		 19,644
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,345
(99.28 %)		 3,990,044
(42.54 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,683
(32.88 %)		 59,052
(1.48 %)
649 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1		 27,063
(35.76 %)		 19,219
(1.73 %)		 27,456
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,509
(98.67 %)		 4,277,556
(44.10 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,034
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
650 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1		 27,076
(1.65 %)		 19,227
(1.75 %)		 27,468
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,193,317
(43.38 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
651 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1		 n/a 8,814
(0.51 %)		 152,909
(17.36 %)		 n/a 38.16
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 6,534
(100.00 %)		 2,912,289
(46.74 %)		 533,475
(4.34 %)		 10,210,670
(53.65 %)		 132,732
(6.12 %)
652 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1		 n/a 19,503
(1.44 %)		 20,301
(1.35 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 814
(100.00 %)		 4,038,897
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,740
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
653 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 43,878
(1.99 %)		 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
654 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1		 41,573
(2.14 %)		 19,845
(1.63 %)		 21,262
(1.39 %)		 n/a 39.88
(97.82 %)		 38,354
(2.18 %)		 69,503
(97.82 %)		 4,683,625
(34.38 %)		 799,659
(1.95 %)		 14,322,765
(32.58 %)		 34,127
(0.91 %)
655 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,184
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 487
(100.00 %)		 5,424,579
(25.40 %)		 1,269,774
(2.59 %)		 21,430,550
(42.69 %)		 28,121
(0.66 %)
656 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1		 15,990
(2.25 %)		 11,775
(1.55 %)		 23,935
(1.90 %)		 n/a 41.36
(99.67 %)		 48,553
(0.34 %)		 107,160
(99.66 %)		 384,032
(4.45 %)		 182,309
(1.03 %)		 6,529,534
(19.24 %)		 15,660
(0.55 %)
657 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1		 41,181
(9.96 %)		 15,861
(2.76 %)		 30,671
(6.00 %)		 n/a 40.75
(97.79 %)		 33,664
(2.20 %)		 99,598
(100.00 %)		 614,513
(4.16 %)		 522,349
(4.83 %)		 4,650,538
(24.98 %)		 18,054
(0.96 %)
658 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1		 n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 60,975
(2.61 %)
659 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
660 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
661 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4		 n/a 12,755
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 389,146
(3.10 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,599
(20.92 %)		 29,203
(2.49 %)
662 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
663 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2		 n/a 18,599
(1.58 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,769
(92.59 %)		 5,118,783
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,620
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
664 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1		 44,813
(12.05 %)		 15,028
(3.35 %)		 21,782
(6.89 %)		 36,982
(11.22 %)		 40.66
(97.63 %)		 235
(2.37 %)		 126
(100.00 %)		 348,517
(2.87 %)		 157,776
(2.00 %)		 3,182,742
(23.42 %)		 12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 664

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 271 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 433 assemblies assembly stats track stats
Fishes 493 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 317 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1177 assemblies assembly stats track stats
Plants 320 assemblies assembly stats track stats
Fungi 922 assemblies assembly stats track stats
Viruses 703 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 318 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 663 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1179 assemblies assembly stats track stats