Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1		 n/a 22,095
(0.63 %)		 44,942
(0.68 %)		 n/a 40.25
(99.86 %)		 15,429
(0.03 %)		 2,690,873
(99.97 %)		 8,755,250
(34.47 %)		 869,360
(1.26 %)		 22,002,517
(59.65 %)		 39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1		 n/a 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1		 61,172
(3.82 %)		 23,424
(1.78 %)		 27,990
(2.23 %)		 n/a 38.98
(88.63 %)		 216,028
(11.39 %)		 324,061
(88.61 %)		 1,726,079
(12.81 %)		 680,428
(2.28 %)		 13,887,586
(35.94 %)		 85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1		 n/a 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1		 n/a 19,181
(1.25 %)		 19,665
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,337,637
(57.82 %)		 365,796
(0.88 %)		 16,073,052
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
6 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1		 27,736
(10.71 %)		 4,020
(1.34 %)		 42,185
(10.12 %)		 n/a 40.41
(94.37 %)		 14,031
(5.59 %)		 95,883
(100.00 %)		 112,828
(2.21 %)		 95,886
(3.63 %)		 2,006,114
(27.47 %)		 23,832
(3.81 %)
7 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1		 n/a 18,513
(1.97 %)		 19,112
(1.70 %)		 31,905
(1.94 %)		 41.46
(99.38 %)		 23,458
(0.62 %)		 75,733
(99.38 %)		 3,095,742
(36.41 %)		 314,508
(1.07 %)		 12,365,152
(25.46 %)		 53,956
(1.50 %)
8 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3		 55,014
(3.56 %)		 18,437
(1.94 %)		 18,446
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,150,224
(36.21 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
9 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,139
(1.58 %)		 18,286
(1.41 %)		 n/a 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 n/a 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
10 American alligator (scaffold assembly 2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
11 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1		 n/a 14,382
(0.98 %)		 18,601
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 194
(100.00 %)		 3,322,619
(43.19 %)		 478,206
(1.77 %)		 12,316,391
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
12 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1		 n/a 22,515
(1.25 %)		 34,527
(1.17 %)		 n/a 39.58
(99.92 %)		 5,769
(0.02 %)		 837,916
(99.98 %)		 5,101,904
(34.46 %)		 552,100
(1.02 %)		 15,150,706
(34.57 %)		 24,558
(0.63 %)
13 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1		 n/a 20,215
(1.44 %)		 20,845
(1.20 %)		 n/a 41.99
(93.39 %)		 341,984
(6.63 %)		 792,165
(93.37 %)		 6,006,931
(47.67 %)		 495,106
(1.11 %)		 13,902,115
(39.01 %)		 90,767
(1.29 %)
14 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1		 n/a 17,569
(1.60 %)		 20,092
(1.69 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,961
(87.18 %)		 2,829,934
(29.80 %)		 414,895
(1.07 %)		 10,968,663
(26.71 %)		 44,651
(1.14 %)
15 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1		 24,008
(8.48 %)		 3,331
(0.47 %)		 38,201
(8.97 %)		 24,453
(8.50 %)		 38.47
(99.52 %)		 23,726
(0.48 %)		 23,426
(99.52 %)		 161,274
(1.72 %)		 432,436
(8.89 %)		 3,517,080
(28.92 %)		 50,987
(4.44 %)
16 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1		 n/a 18,213
(1.58 %)		 15,093
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,031
(97.56 %)		 4,832,679
(42.49 %)		 831,134
(1.67 %)		 13,654,373
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
17 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
18 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1		 16,082
(8.44 %)		 4,038
(1.42 %)		 32,856
(9.80 %)		 n/a 34.73
(95.75 %)		 10,626
(4.26 %)		 26,005
(95.74 %)		 203,498
(3.41 %)		 100,483
(2.15 %)		 2,221,362
(35.19 %)		 18,108
(3.49 %)
19 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1		 28,261
(10.34 %)		 4,915
(1.27 %)		 40,257
(10.17 %)		 n/a 35.18
(99.51 %)		 1,076
(0.49 %)		 2,869
(100.00 %)		 322,753
(4.92 %)		 245,412
(6.65 %)		 1,952,946
(43.11 %)		 17,048
(6.08 %)
20 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1		 22,023
(8.25 %)		 4,211
(1.25 %)		 37,113
(9.30 %)		 n/a 35.01
(91.82 %)		 40,822
(8.21 %)		 60,583
(91.79 %)		 218,162
(3.24 %)		 139,385
(2.26 %)		 2,347,922
(34.62 %)		 23,814
(3.66 %)
21 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1		 n/a 22,542
(3.52 %)		 67,060
(16.20 %)		 n/a 38.04
(88.95 %)		 7,175
(11.05 %)		 806
(100.00 %)		 692,611
(50.80 %)		 322,540
(4.42 %)		 3,033,193
(35.58 %)		 25,871
(1.75 %)
22 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1		 n/a 18,452
(1.96 %)		 16,975
(1.61 %)		 n/a 41.29
(98.88 %)		 72,775
(1.13 %)		 105,347
(98.87 %)		 3,079,920
(34.79 %)		 319,928
(0.96 %)		 12,281,845
(25.28 %)		 48,638
(1.17 %)
23 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1		 n/a 22,910
(1.42 %)		 31,985
(1.20 %)		 35,342
(1.47 %)		 41.93
(99.87 %)		 9,604
(0.04 %)		 1,272,949
(99.96 %)		 6,096,013
(44.89 %)		 1,265,350
(2.67 %)		 14,617,986
(39.29 %)		 64,716
(1.93 %)
24 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1		 25,279
(7.94 %)		 4,931
(1.05 %)		 28,608
(7.16 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 34,722
(0.01 %)		 7,722
(100.00 %)		 146,974
(1.35 %)		 89,987
(2.68 %)		 2,666,250
(38.74 %)		 39,696
(5.22 %)
25 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2		 25,169
(7.95 %)		 4,867
(1.05 %)		 28,255
(7.08 %)		 n/a 37.49
(100.00 %)		 34,702
(0.01 %)		 6,269
(100.00 %)		 150,783
(1.53 %)		 89,885
(2.69 %)		 2,627,296
(38.56 %)		 39,511
(5.22 %)
26 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2		 10,390
(48.16 %)		 1,538
(3.76 %)		 6,155
(25.19 %)		 n/a 49.56
(99.97 %)		 90
(0.03 %)		 466
(99.97 %)		 5,026
(0.77 %)		 2,256
(0.38 %)		 68,790
(5.94 %)		 2,846
(42.44 %)
27 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3		 10,608
(51.05 %)		 1,481
(3.36 %)		 5,692
(22.11 %)		 n/a 50.35
(99.87 %)		 662
(0.13 %)		 469
(99.87 %)		 9,986
(1.32 %)		 2,619
(0.36 %)		 106,480
(7.71 %)		 5,568
(53.86 %)
28 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1		 11,257
(41.02 %)		 1,596
(2.91 %)		 8,283
(26.43 %)		 n/a 49.20
(100.00 %)		 n/a 34
(100.00 %)		 14,775
(2.01 %)		 16,031
(2.34 %)		 103,256
(17.19 %)		 805
(44.28 %)
29 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2		 n/a 1,516
(1.76 %)		 5,714
(11.07 %)		 n/a 37.07
(99.50 %)		 566
(0.51 %)		 593
(99.49 %)		 38,696
(2.74 %)		 27,571
(2.05 %)		 270,617
(48.64 %)		 8,002
(10.69 %)
30 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2		 9,903
(39.44 %)		 1,311
(2.58 %)		 4,612
(17.66 %)		 n/a 52.11
(99.64 %)		 978
(0.36 %)		 1,583
(100.00 %)		 16,540
(1.85 %)		 7,316
(0.76 %)		 171,684
(11.10 %)		 1,770
(49.40 %)
31 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1		 n/a 1,134
(2.55 %)		 2,026
(10.60 %)		 n/a 54.96
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 15,846
(2.28 %)		 8,000
(0.94 %)		 169,678
(13.75 %)		 22
(99.61 %)
32 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1		 n/a 18,884
(1.76 %)		 19,296
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,166
(100.00 %)		 3,855,699
(41.69 %)		 289,735
(0.96 %)		 14,695,257
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
33 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1		 n/a 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
34 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1		 46,216
(9.88 %)		 15,249
(2.65 %)		 25,664
(6.68 %)		 n/a 44.24
(99.88 %)		 1,963
(0.12 %)		 1,990
(99.88 %)		 1,175,759
(12.03 %)		 1,231,613
(13.39 %)		 3,511,276
(32.20 %)		 33,465
(1.97 %)
35 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2		 n/a 28,077
(1.40 %)		 120,383
(3.99 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 4,501,521
(48.00 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
36 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 n/a 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
37 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3		 11,472
(14.88 %)		 2,843
(2.29 %)		 3,797
(4.95 %)		 n/a 30.21
(92.98 %)		 58,744
(7.04 %)		 26,881
(93.03 %)		 147,614
(11.55 %)		 54,885
(7.91 %)		 647,155
(33.62 %)		 509
(0.15 %)
38 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1		 n/a 18,330
(1.96 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,434
(99.31 %)		 3,072,373
(34.88 %)		 306,996
(0.95 %)		 12,209,895
(25.43 %)		 49,789
(1.25 %)
39 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1		 n/a 15,312
(3.18 %)		 41,147
(7.01 %)		 n/a 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 811,892
(18.19 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
40 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1		 15,006
(2.07 %)		 11,133
(1.44 %)		 21,138
(1.69 %)		 n/a 40.21
(99.24 %)		 109,223
(0.79 %)		 171,345
(99.21 %)		 413,761
(3.90 %)		 181,353
(0.91 %)		 6,776,326
(18.43 %)		 10,575
(0.29 %)
41 barn owl (2020)
GCF_902150015.1		 37,361
(4.54 %)		 12,958
(1.72 %)		 22,922
(1.99 %)		 26,976
(3.04 %)		 41.55
(99.23 %)		 177,340
(0.79 %)		 21,504
(100.00 %)		 585,627
(5.48 %)		 367,764
(2.44 %)		 7,399,161
(19.58 %)		 47,061
(3.25 %)
42 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
43 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
44 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
45 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1		 10,448
(49.20 %)		 1,066
(2.53 %)		 5,238
(16.95 %)		 n/a 46.48
(99.32 %)		 225
(0.68 %)		 254
(99.32 %)		 4,921
(0.90 %)		 2,352
(0.47 %)		 62,603
(9.90 %)		 5,244
(15.19 %)
46 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1		 13,192
(49.72 %)		 894
(1.60 %)		 973
(2.80 %)		 n/a 57.50
(98.57 %)		 316
(1.43 %)		 352
(98.57 %)		 7,478
(4.11 %)		 7,640
(1.13 %)		 176,404
(11.51 %)		 38
(40.33 %)
47 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1		 n/a 1,451
(2.81 %)		 6,906
(25.36 %)		 n/a 52.14
(99.98 %)		 3
(0.02 %)		 24
(99.98 %)		 8,941
(1.69 %)		 8,367
(1.51 %)		 99,818
(11.14 %)		 27
(96.31 %)
48 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1		 50,205
(13.10 %)		 16,166
(3.05 %)		 25,084
(6.20 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 3,808
(100.00 %)		 465,997
(3.11 %)		 237,955
(4.36 %)		 4,027,027
(23.91 %)		 16,276
(1.04 %)
49 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1		 25,020
(17.94 %)		 4,205
(2.34 %)		 27,352
(12.83 %)		 n/a 41.09
(91.93 %)		 19,248
(8.05 %)		 50,565
(100.00 %)		 57,833
(1.39 %)		 27,440
(2.49 %)		 1,173,760
(18.39 %)		 10,942
(2.61 %)
50 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1		 16,406
(4.01 %)		 4,087
(0.75 %)		 46,846
(6.53 %)		 16,764
(4.04 %)		 40.92
(95.72 %)		 25,039
(4.23 %)		 212,650
(95.77 %)		 641,987
(7.51 %)		 360,406
(11.43 %)		 3,411,951
(46.01 %)		 40,540
(3.99 %)
51 beet (2015)
GCF_000511025.2		 37,939
(8.78 %)		 12,044
(2.14 %)		 63,283
(17.52 %)		 n/a 36.14
(91.40 %)		 30,962
(8.61 %)		 71,208
(91.39 %)		 288,084
(4.25 %)		 299,650
(4.72 %)		 3,021,571
(30.10 %)		 32,547
(2.39 %)
52 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2		 n/a 18,686
(1.78 %)		 20,378
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.66 %)		 28,398
(1.35 %)		 35,369
(98.65 %)		 4,001,688
(43.72 %)		 542,326
(1.10 %)		 12,806,249
(34.24 %)		 59,279
(1.53 %)
53 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4		 59,637
(15.47 %)		 20,361
(4.67 %)		 44,177
(15.83 %)		 n/a 33.75
(97.43 %)		 6,871
(2.58 %)		 8,318
(97.42 %)		 402,600
(27.63 %)		 177,746
(4.65 %)		 2,639,214
(36.04 %)		 4,559
(0.56 %)
54 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 n/a 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
55 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1		 41,018
(2.61 %)		 4,064
(0.14 %)		 135,587
(7.67 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 n/a 2,977
(100.00 %)		 1,153,773
(4.93 %)		 754,711
(7.52 %)		 10,964,182
(43.13 %)		 138,831
(8.38 %)
56 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap genbank 2021)
GCA_020826845.1		 n/a 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
57 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1		 59,210
(2.48 %)		 21,256
(1.89 %)		 23,679
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,031
(100.00 %)		 5,602,009
(50.58 %)		 991,745
(2.45 %)		 16,354,078
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
58 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1		 n/a 21,244
(1.88 %)		 23,681
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,030
(100.00 %)		 5,600,915
(50.57 %)		 991,762
(2.45 %)		 16,353,992
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
59 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1		 41,255
(4.77 %)		 12,955
(1.98 %)		 22,656
(2.28 %)		 31,476
(5.07 %)		 41.95
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 680,976
(7.66 %)		 296,152
(1.44 %)		 6,797,141
(21.40 %)		 31,750
(3.32 %)
60 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1		 35,923
(2.41 %)		 3,903
(0.15 %)		 39,667
(2.27 %)		 40,959
(2.59 %)		 36.64
(83.75 %)		 1,158,725
(16.44 %)		 26,876
(100.00 %)		 5,488,723
(29.98 %)		 7,028,944
(21.91 %)		 10,445,796
(49.62 %)		 178,205
(3.43 %)
61 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 n/a 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
62 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 67,189
(1.73 %)
63 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 n/a 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
64 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
65 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1		 39,820
(2.33 %)		 20,222
(2.04 %)		 18,404
(1.34 %)		 49,071
(2.26 %)		 40.77
(94.98 %)		 148,728
(5.04 %)		 151,414
(94.96 %)		 4,710,420
(46.30 %)		 767,602
(1.48 %)		 14,489,703
(32.96 %)		 32,474
(0.75 %)
66 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1		 53,030
(2.41 %)		 20,599
(1.98 %)		 21,182
(1.34 %)		 46,441
(1.87 %)		 40.95
(99.56 %)		 1,074
(0.44 %)		 2,790
(99.56 %)		 5,098,799
(47.87 %)		 946,231
(3.04 %)		 14,608,771
(36.99 %)		 37,273
(1.03 %)
67 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1		 n/a 4,734
(1.03 %)		 24,267
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 264,378
(2.90 %)		 144,255
(3.35 %)		 2,651,028
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
68 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1		 54,006
(3.19 %)		 18,811
(1.78 %)		 21,058
(1.52 %)		 39,408
(1.98 %)		 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,283,780
(41.29 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
69 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1		 60,162
(4.01 %)		 18,920
(1.66 %)		 21,641
(1.49 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 902
(100.00 %)		 4,166,472
(34.00 %)		 659,124
(5.14 %)		 13,282,996
(33.88 %)		 68,113
(2.27 %)
70 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1		 39,619
(2.36 %)		 3,965
(0.13 %)		 116,426
(5.96 %)		 45,849
(2.46 %)		 46.86
(99.96 %)		 10,359
(0.04 %)		 2,329
(100.00 %)		 1,064,424
(3.53 %)		 716,579
(3.47 %)		 10,608,171
(42.78 %)		 13,204
(0.97 %)
71 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1		 31,379
(5.19 %)		 12,572
(1.89 %)		 24,442
(2.44 %)		 26,137
(3.13 %)		 42.40
(99.99 %)		 278
(0.01 %)		 691
(99.99 %)		 504,872
(6.53 %)		 420,620
(3.73 %)		 6,496,619
(21.26 %)		 28,576
(2.39 %)
72 brown planthopper (BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1		 n/a 4,416
(0.37 %)		 22,354
(3.57 %)		 37,534
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,093
(100.00 %)		 597,351
(3.69 %)		 564,076
(6.64 %)		 6,601,703
(47.48 %)		 39,697
(1.55 %)
73 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 n/a 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
74 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1		 n/a 4,722
(0.65 %)		 16,896
(3.62 %)		 47,660
(8.03 %)		 35.73
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 272,738
(1.92 %)		 98,053
(6.01 %)		 4,662,765
(51.79 %)		 43,150
(4.96 %)
75 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1		 n/a 4,588
(1.37 %)		 11,218
(5.90 %)		 42,925
(13.84 %)		 33.95
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 143,323
(2.19 %)		 45,473
(3.23 %)		 2,501,939
(42.55 %)		 11,070
(2.07 %)
76 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1		 n/a 4,557
(1.68 %)		 9,253
(6.32 %)		 30,285
(15.57 %)		 33.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 116,781
(2.12 %)		 30,577
(1.24 %)		 2,300,336
(39.04 %)		 6,783
(2.24 %)
77 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1		 n/a 12,650
(1.75 %)		 21,946
(1.95 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 518,393
(6.41 %)		 177,329
(0.88 %)		 7,168,675
(20.31 %)		 34,926
(2.94 %)
78 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1		 n/a 23,668
(1.61 %)		 29,709
(1.32 %)		 n/a 41.56
(99.92 %)		 10,276
(0.04 %)		 582,272
(99.96 %)		 4,952,087
(44.00 %)		 651,744
(1.26 %)		 13,644,805
(35.79 %)		 62,245
(1.50 %)
79 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 51,989
(1.50 %)
80 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,822
(2.52 %)
81 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1		 n/a 25,543
(0.55 %)		 52,506
(0.63 %)		 n/a 40.04
(99.84 %)		 4,876
(0.01 %)		 3,432,954
(99.99 %)		 7,363,240
(21.82 %)		 876,677
(2.53 %)		 25,446,677
(58.18 %)		 25,319
(0.31 %)
82 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1		 n/a 16,133
(0.56 %)		 62,445
(2.92 %)		 n/a 34.93
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,797
(96.77 %)		 1,171,727
(3.54 %)		 948,641
(4.39 %)		 21,533,236
(46.16 %)		 16,621
(0.21 %)
83 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1		 15,520
(2.12 %)		 11,303
(1.45 %)		 24,758
(1.84 %)		 n/a 41.67
(99.59 %)		 50,632
(0.42 %)		 104,131
(99.58 %)		 405,042
(5.66 %)		 161,525
(1.05 %)		 6,445,961
(19.27 %)		 11,477
(0.36 %)
84 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1		 48,199
(10.95 %)		 18,537
(3.62 %)		 45,536
(13.17 %)		 n/a 35.94
(85.14 %)		 37,896
(14.88 %)		 39,916
(85.12 %)		 295,656
(2.88 %)		 266,527
(3.40 %)		 2,434,269
(42.34 %)		 30,963
(1.41 %)
85 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6		 n/a 19,803
(1.54 %)		 21,001
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.57 %)		 41,517
(0.44 %)		 42,578
(99.56 %)		 5,725,274
(49.24 %)		 459,535
(1.33 %)		 12,905,109
(41.11 %)		 43,324
(1.28 %)
86 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,669
(1.56 %)		 21,999
(1.33 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,643,592
(49.67 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
87 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2		 76,293
(2.98 %)		 19,325
(1.49 %)		 21,665
(1.32 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,957
(100.00 %)		 3,550,686
(24.18 %)		 544,595
(2.90 %)		 13,050,221
(41.81 %)		 44,208
(1.24 %)
88 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1		 n/a 21,372
(1.41 %)		 34,453
(1.31 %)		 n/a 42.35
(99.87 %)		 10,534
(0.04 %)		 1,240,696
(99.96 %)		 5,244,572
(43.13 %)		 2,503,015
(4.45 %)		 12,961,004
(41.69 %)		 173,264
(3.70 %)
89 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 n/a 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
90 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1		 53,933
(9.58 %)		 15,712
(2.71 %)		 25,639
(5.25 %)		 n/a 39.70
(98.56 %)		 25,203
(1.45 %)		 34,544
(98.55 %)		 871,222
(5.75 %)		 585,250
(4.19 %)		 5,150,651
(33.94 %)		 31,438
(1.87 %)
91 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2		 57,087
(10.27 %)		 16,253
(2.68 %)		 44,936
(5.15 %)		 n/a 39.70
(98.57 %)		 25,285
(1.44 %)		 34,545
(98.61 %)		 900,327
(5.55 %)		 614,695
(4.28 %)		 5,348,266
(33.81 %)		 32,840
(1.87 %)
92 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1		 n/a 18,264
(1.57 %)		 14,665
(1.26 %)		 n/a 41.30
(98.26 %)		 183,260
(1.77 %)		 14,382
(100.00 %)		 4,777,041
(42.51 %)		 784,368
(1.53 %)		 13,503,827
(31.65 %)		 57,657
(1.31 %)
93 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1		 15,979
(2.53 %)		 12,065
(1.82 %)		 10,050
(2.07 %)		 n/a 41.40
(95.99 %)		 65,523
(4.03 %)		 84,595
(95.97 %)		 453,775
(7.30 %)		 194,988
(2.21 %)		 6,363,949
(19.70 %)		 12,486
(0.42 %)
94 chimpanzee genbank
GCA_002880755.3		 n/a 20,378
(1.83 %)		 21,427
(1.19 %)		 n/a 40.71
(98.98 %)		 693
(1.02 %)		 5,037
(98.98 %)		 5,409,980
(53.76 %)		 984,231
(7.31 %)		 15,896,744
(39.56 %)		 45,870
(0.97 %)
95 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1		 60,293
(11.65 %)		 15,433
(2.84 %)		 67,310
(21.70 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 273,992
(2.25 %)		 228,466
(3.97 %)		 2,261,888
(35.14 %)		 37,317
(4.18 %)
96 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1		 55,529
(3.00 %)		 19,755
(1.76 %)		 20,017
(1.50 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 4,356
(0.12 %)		 1,830
(100.00 %)		 4,544,603
(29.89 %)		 1,095,407
(2.92 %)		 12,942,232
(32.27 %)		 19,343
(0.58 %)
97 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1		 n/a 27,141
(1.63 %)		 113,328
(4.52 %)		 157,545
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,333
(0.01 %)		 9,977
(99.99 %)		 4,892,399
(55.31 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,870
(54.55 %)		 62,726
(1.40 %)
98 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1		 n/a 15,350
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 361
(100.00 %)		 1,669,327
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,422
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
99 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1		 17,196
(2.21 %)		 12,140
(1.50 %)		 25,641
(1.91 %)		 n/a 40.76
(99.61 %)		 56,667
(0.39 %)		 126,789
(99.61 %)		 560,317
(7.62 %)		 203,204
(1.12 %)		 6,593,712
(20.47 %)		 8,105
(0.24 %)
100 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1		 42,930
(13.31 %)		 15,237
(3.47 %)		 22,710
(7.34 %)		 37,043
(11.25 %)		 40.40
(98.65 %)		 292
(1.35 %)		 70
(100.00 %)		 329,586
(2.67 %)		 133,519
(1.94 %)		 3,418,470
(21.84 %)		 10,698
(0.86 %)
101 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 n/a 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
102 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,746
(13.53 %)		 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
103 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1		 n/a 18,516
(1.55 %)		 20,363
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 34
(100.00 %)		 4,798,634
(33.91 %)		 992,669
(2.08 %)		 13,618,933
(34.42 %)		 67,831
(2.45 %)
104 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1		 n/a 4,767
(1.38 %)		 15,869
(7.12 %)		 34,699
(13.48 %)		 33.59
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 161,872
(2.42 %)		 73,892
(2.86 %)		 2,544,844
(42.14 %)		 15,663
(2.98 %)
105 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1		 64,032
(4.29 %)		 24,727
(1.43 %)		 46,926
(3.38 %)		 n/a 43.33
(95.39 %)		 265,291
(4.63 %)		 22,810
(99.99 %)		 1,185,308
(5.22 %)		 2,455,045
(15.99 %)		 11,710,855
(46.53 %)		 72,061
(1.46 %)
106 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 n/a 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
107 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1		 n/a 17,254
(1.68 %)		 17,112
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,647
(100.00 %)		 3,845,214
(43.88 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,013
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
108 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 n/a 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
109 common carp (2014)
GCF_000951615.1		 75,427
(5.81 %)		 27,632
(2.17 %)		 59,950
(5.28 %)		 n/a 37.00
(97.48 %)		 57,940
(2.53 %)		 9,378
(100.00 %)		 1,460,282
(5.17 %)		 987,356
(7.88 %)		 9,900,821
(37.41 %)		 48,702
(1.38 %)
110 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 n/a 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 25,267
(1.71 %)
111 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1		 16,827
(2.53 %)		 12,599
(1.80 %)		 12,623
(2.28 %)		 n/a 41.52
(97.64 %)		 56,977
(2.38 %)		 71,907
(97.62 %)		 418,870
(8.06 %)		 192,437
(2.08 %)		 6,576,259
(19.85 %)		 18,002
(0.74 %)
112 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2		 30,064
(3.79 %)		 3,347
(0.23 %)		 7,571
(1.48 %)		 n/a 29.46
(81.63 %)		 247,378
(18.44 %)		 263,908
(81.56 %)		 587,943
(2.23 %)		 464,643
(2.90 %)		 10,795,253
(40.31 %)		 10,480
(0.23 %)
113 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3		 n/a 3,276
(0.22 %)		 9,098
(1.38 %)		 38,273
(4.24 %)		 29.40
(98.45 %)		 124,228
(1.55 %)		 84,235
(98.46 %)		 637,694
(2.45 %)		 527,781
(4.43 %)		 11,553,196
(51.16 %)		 11,998
(0.33 %)
114 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1		 41,888
(9.21 %)		 3,611
(0.43 %)		 13,244
(4.58 %)		 44,721
(6.30 %)		 36.11
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 239,042
(1.40 %)		 359,961
(7.89 %)		 4,399,053
(45.69 %)		 33,411
(1.94 %)
115 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1		 n/a 14,846
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 243
(100.00 %)		 1,149,249
(19.12 %)		 342,239
(9.71 %)		 3,906,839
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
116 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 n/a 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
117 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2		 n/a 18,511
(1.87 %)		 18,170
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,108
(97.77 %)		 2,860,991
(29.93 %)		 275,245
(1.03 %)		 11,798,152
(28.19 %)		 51,833
(1.38 %)
118 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1		 51,034
(3.23 %)		 18,506
(1.88 %)		 18,166
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,861,697
(29.93 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
119 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1		 n/a 19,335
(2.10 %)		 21,769
(1.63 %)		 n/a 41.24
(74.51 %)		 276,544
(25.53 %)		 299,069
(74.47 %)		 3,513,698
(39.82 %)		 304,033
(0.59 %)		 13,333,842
(21.06 %)		 56,694
(1.59 %)
120 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1		 65,969
(8.84 %)		 20,226
(1.95 %)		 89,703
(16.66 %)		 n/a 36.19
(97.99 %)		 26,139
(2.01 %)		 23,344
(100.00 %)		 865,884
(3.63 %)		 491,126
(5.95 %)		 6,119,503
(36.10 %)		 21,505
(3.50 %)
121 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1		 n/a 4,839
(1.54 %)		 21,045
(8.01 %)		 n/a 36.13
(89.02 %)		 26,910
(11.01 %)		 24,551
(88.99 %)		 115,046
(2.97 %)		 31,900
(0.85 %)		 2,230,382
(25.45 %)		 15,851
(2.18 %)
122 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1		 48,679
(10.56 %)		 16,927
(3.30 %)		 44,814
(13.06 %)		 54,348
(11.30 %)		 32.98
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 682
(100.00 %)		 352,238
(4.22 %)		 283,949
(8.14 %)		 3,092,021
(41.64 %)		 24,513
(2.40 %)
123 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1		 n/a 20,283
(1.90 %)		 20,544
(1.22 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,763
(95.15 %)		 5,351,207
(51.35 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,449
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
124 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1		 76,196
(3.30 %)		 20,209
(1.91 %)		 51,427
(6.84 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,764
(95.15 %)		 5,251,819
(50.85 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,510
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
125 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1		 n/a 29,389
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 3,481,389
(45.81 %)		 802,775
(6.54 %)		 8,190,816
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
126 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1		 22,902
(28.68 %)		 3,621
(2.94 %)		 11,430
(17.96 %)		 n/a 40.34
(99.47 %)		 2
(0.53 %)		 227
(100.00 %)		 81,008
(2.67 %)		 29,625
(4.98 %)		 609,395
(25.66 %)		 6,559
(5.05 %)
127 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1		 n/a 3,519
(2.64 %)		 12,174
(17.22 %)		 n/a 40.54
(93.29 %)		 13,228
(6.75 %)		 4,192
(100.00 %)		 63,254
(2.07 %)		 22,325
(1.44 %)		 728,942
(20.81 %)		 8,375
(4.98 %)
128 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2		 n/a 15,131
(1.68 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 73
(100.00 %)		 2,175,293
(47.80 %)		 176,956
(1.87 %)		 6,142,692
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
129 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1		 n/a 19,142
(1.72 %)		 22,139
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 122
(100.00 %)		 3,040,239
(24.03 %)		 796,913
(6.38 %)		 10,478,261
(38.84 %)		 64,921
(2.50 %)
130 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1		 n/a 22,240
(1.40 %)		 22,108
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 259,903
(84.32 %)		 4,890,270
(27.82 %)		 898,943
(1.50 %)		 14,281,942
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
131 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
132 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1		 n/a 15,109
(1.08 %)		 19,281
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
133 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1		 n/a 22,343
(1.53 %)		 28,525
(1.27 %)		 n/a 41.66
(99.91 %)		 10,428
(0.04 %)		 667,170
(99.96 %)		 5,598,608
(45.38 %)		 1,220,686
(2.58 %)		 14,079,363
(36.37 %)		 62,881
(2.13 %)
134 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,440
(1.59 %)		 19,474
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 n/a 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,376
(1.90 %)
135 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1		 n/a 18,297
(1.33 %)		 20,107
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,603
(97.80 %)		 4,257,412
(38.85 %)		 658,532
(1.25 %)		 14,547,631
(34.19 %)		 37,092
(0.85 %)
136 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2		 n/a 5,227
(1.28 %)		 18,795
(5.67 %)		 n/a 38.55
(99.90 %)		 30
(0.10 %)		 696
(100.00 %)		 615,428
(29.26 %)		 86,179
(1.65 %)		 2,607,325
(47.66 %)		 44,022
(10.06 %)
137 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1		 n/a 18,050
(0.43 %)		 260,902
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 290
(100.00 %)		 1,274,894
(2.42 %)		 1,726,303
(5.40 %)		 14,010,542
(72.58 %)		 732,828
(17.24 %)
138 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1		 15,850
(2.33 %)		 11,864
(1.67 %)		 11,795
(1.99 %)		 n/a 44.51
(96.31 %)		 96,471
(3.72 %)		 127,725
(96.28 %)		 842,281
(18.63 %)		 310,018
(2.09 %)		 5,822,687
(27.83 %)		 17,379
(0.69 %)
139 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 n/a 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
140 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1		 n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 90
(0.38 %)		 19,508
(7.44 %)		 1
(99.99 %)
141 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1		 39,088
(10.61 %)		 11,569
(2.49 %)		 38,114
(15.67 %)		 n/a 38.59
(99.98 %)		 627
(0.02 %)		 1,425
(99.98 %)		 230,165
(2.88 %)		 153,929
(4.02 %)		 2,160,647
(26.81 %)		 24,567
(4.41 %)
142 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,615
(9.59 %)		 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
143 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1		 n/a 20,133
(1.87 %)		 36,361
(1.80 %)		 n/a 40.23
(99.96 %)		 4,332
(0.02 %)		 226,086
(99.98 %)		 2,985,622
(32.66 %)		 475,311
(1.11 %)		 12,612,081
(27.34 %)		 81,930
(5.75 %)
144 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1		 n/a 17,637
(2.08 %)		 22,318
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 30
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,415
(1.02 %)		 12,031,652
(26.52 %)		 53,604
(6.69 %)
145 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1		 30,695
(4.95 %)		 11,306
(1.54 %)		 18,189
(3.03 %)		 n/a 42.34
(96.16 %)		 46,232
(3.85 %)		 67,421
(96.15 %)		 1,405,480
(27.29 %)		 330,698
(2.60 %)		 5,549,534
(36.65 %)		 35,561
(2.16 %)
146 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 41,784
(5.52 %)
147 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2		 65,115
(2.96 %)		 16,271
(0.65 %)		 102,071
(6.37 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 353,389
(7.60 %)		 11,454
(99.71 %)		 1,109,875
(4.83 %)		 983,866
(3.64 %)		 12,335,790
(52.95 %)		 117,743
(2.02 %)
148 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1		 56,539
(12.93 %)		 20,844
(4.28 %)		 41,664
(12.47 %)		 n/a 32.08
(95.31 %)		 23,174
(4.71 %)		 32,789
(95.29 %)		 332,532
(5.23 %)		 246,766
(4.06 %)		 2,679,673
(43.30 %)		 2,781
(0.47 %)
149 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,138
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
150 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
151 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
152 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1		 n/a 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 4,237,797
(30.90 %)		 792,898
(2.69 %)		 13,417,248
(36.59 %)		 67,133
(2.54 %)
153 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1		 n/a 4,716
(1.16 %)		 12,599
(4.34 %)		 26,251
(7.81 %)		 33.70
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 212,528
(2.58 %)		 60,682
(1.18 %)		 3,127,157
(46.89 %)		 24,620
(4.88 %)
154 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1		 n/a 14,820
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 356
(100.00 %)		 476,317
(3.63 %)		 520,730
(13.27 %)		 3,283,400
(33.55 %)		 47,051
(4.45 %)
155 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1		 n/a 20,576
(1.75 %)		 21,171
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 3,580,811
(22.71 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,125
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
156 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 29,648
(2.35 %)
157 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,729
(2.65 %)
158 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 n/a 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
159 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1		 n/a 5,744
(1.12 %)		 26,631
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 91
(100.00 %)		 168,479
(1.60 %)		 72,876
(1.70 %)		 3,384,083
(37.35 %)		 30,753
(4.27 %)
160 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1		 32,751
(9.65 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,632
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 92
(100.00 %)		 169,122
(1.61 %)		 72,892
(1.70 %)		 3,384,365
(37.36 %)		 30,753
(4.27 %)
161 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
162 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1		 n/a 18,302
(1.36 %)		 20,592
(1.23 %)		 32,831
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,489
(89.22 %)		 5,109,822
(37.03 %)		 389,314
(0.74 %)		 14,633,007
(38.46 %)		 27,461
(0.64 %)
163 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1		 24,196
(18.66 %)		 10,065
(8.48 %)		 14,473
(13.61 %)		 n/a 38.15
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 298,709
(14.86 %)		 80,048
(3.56 %)		 1,317,733
(33.56 %)		 18,849
(8.62 %)
164 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1		 25,550
(21.64 %)		 13,354
(17.52 %)		 20,540
(17.87 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 104
(100.00 %)		 169,365
(23.08 %)		 64,316
(3.47 %)		 791,743
(23.14 %)		 27,794
(16.15 %)
165 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1		 26,658
(22.06 %)		 13,461
(17.65 %)		 21,781
(17.83 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 145,818
(25.16 %)		 34,869
(4.31 %)		 719,811
(25.74 %)		 30,130
(16.11 %)
166 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1		 21,759
(15.21 %)		 12,488
(9.92 %)		 21,269
(14.06 %)		 n/a 39.11
(100.00 %)		 n/a 1,356
(100.00 %)		 314,594
(25.90 %)		 82,446
(12.33 %)		 1,113,448
(37.00 %)		 27,493
(12.03 %)
167 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1		 28,595
(26.45 %)		 13,448
(20.44 %)		 18,989
(18.34 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 126,424
(16.72 %)		 32,595
(4.31 %)		 759,296
(23.70 %)		 27,530
(17.02 %)
168 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2		 5,444
(4.10 %)		 13,713
(15.95 %)		 22,613
(16.71 %)		 n/a 42.28
(98.12 %)		 5,400
(1.88 %)		 13,440
(98.12 %)		 180,908
(22.48 %)		 68,911
(3.75 %)		 897,353
(23.94 %)		 31,387
(14.91 %)
169 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1		 27,938
(24.60 %)		 13,343
(17.86 %)		 20,029
(17.64 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 54
(100.00 %)		 169,559
(23.47 %)		 60,591
(3.64 %)		 837,616
(23.40 %)		 28,204
(16.22 %)
170 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 n/a 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
171 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1		 54,713
(1.72 %)		 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,310,970
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
172 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2		 40,432
(2.55 %)		 18,884
(1.76 %)		 18,919
(1.46 %)		 n/a 41.60
(97.66 %)		 119,126
(2.36 %)		 200,593
(97.64 %)		 4,236,423
(40.48 %)		 503,179
(1.10 %)		 13,781,487
(28.85 %)		 53,465
(1.34 %)
173 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1		 n/a 20,110
(1.71 %)		 22,288
(1.49 %)		 n/a 41.69
(98.08 %)		 186,846
(1.93 %)		 244,258
(98.07 %)		 4,464,041
(41.66 %)		 614,896
(2.00 %)		 14,294,774
(30.62 %)		 59,340
(1.50 %)
174 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
175 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2		 n/a 20,381
(1.71 %)		 21,979
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,287
(100.00 %)		 4,484,597
(41.53 %)		 618,595
(2.00 %)		 14,236,406
(30.39 %)		 59,945
(1.50 %)
176 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,027
(10.96 %)		 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
177 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1		 n/a 4,738
(0.89 %)		 16,197
(5.05 %)		 35,235
(7.97 %)		 34.09
(100.00 %)		 80
(0.01 %)		 32
(100.00 %)		 343,193
(3.25 %)		 144,286
(3.46 %)		 3,683,956
(48.60 %)		 30,200
(4.54 %)
178 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1		 42,119
(6.72 %)		 15,804
(2.23 %)		 49,721
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,473
(9.77 %)		 13,588
(99.93 %)		 394,687
(2.79 %)		 364,361
(3.37 %)		 4,191,676
(39.48 %)		 12,198
(0.64 %)
179 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1		 n/a 19,842
(1.43 %)		 22,426
(1.24 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,906
(100.00 %)		 5,669,868
(50.59 %)		 760,836
(7.07 %)		 13,024,386
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
180 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,857
(1.43 %)		 22,880
(1.27 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,578,287
(50.22 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,440
(44.85 %)		 125,682
(4.02 %)
181 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 28,919
(3.52 %)
182 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 37,343
(3.12 %)
183 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1		 n/a 18,965
(1.82 %)		 19,339
(1.52 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,699
(82.88 %)		 3,724,142
(27.19 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,866
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
184 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1		 n/a 21,341
(1.86 %)		 22,492
(1.24 %)		 n/a 40.87
(98.50 %)		 61,291
(1.50 %)		 196,804
(98.50 %)		 5,673,299
(51.36 %)		 1,080,627
(3.06 %)		 16,205,827
(36.77 %)		 79,387
(1.14 %)
185 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3		 n/a 20,031
(1.89 %)		 22,619
(1.50 %)		 n/a 40.98
(95.94 %)		 43,363
(4.06 %)		 50,982
(95.94 %)		 4,082,873
(41.60 %)		 582,430
(1.47 %)		 14,808,558
(30.05 %)		 74,772
(2.61 %)
186 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1		 n/a 16,638
(0.72 %)		 16,171
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 5,562,366
(25.40 %)		 1,096,625
(2.60 %)		 22,322,798
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
187 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1		 n/a 19,011
(2.00 %)		 19,882
(1.66 %)		 41,741
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,570
(100.00 %)		 3,078,210
(32.07 %)		 495,290
(1.05 %)		 11,588,202
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
188 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1		 50,937
(3.26 %)		 18,992
(2.00 %)		 19,880
(1.66 %)		 41,778
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,285,971
(33.14 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
189 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
190 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 n/a 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
191 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
192 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1		 n/a 23,153
(1.31 %)		 51,642
(1.43 %)		 n/a 43.16
(99.88 %)		 8,133
(0.04 %)		 1,053,330
(99.96 %)		 3,675,075
(25.48 %)		 938,700
(2.73 %)		 12,027,923
(39.01 %)		 80,955
(2.31 %)
193 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,340
(13.40 %)
194 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2		 n/a 4,346
(0.99 %)		 12,930
(3.50 %)		 21,226
(7.60 %)		 33.06
(99.10 %)		 27,314
(0.92 %)		 13,303
(100.00 %)		 270,925
(3.18 %)		 86,050
(1.20 %)		 3,416,162
(48.29 %)		 11,043
(1.07 %)
195 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1		 14,484
(22.24 %)		 987
(0.55 %)		 11,299
(59.37 %)		 n/a 63.87
(87.58 %)		 10,425
(12.45 %)		 11,385
(87.55 %)		 167,652
(16.23 %)		 100,391
(4.60 %)		 734,057
(30.38 %)		 3,154
(63.45 %)
196 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1		 n/a 743
(1.01 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 65,787
(8.35 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 776
(95.90 %)
197 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3		 n/a 988
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 171,684
(17.03 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 106
(99.48 %)
198 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2		 n/a 20,079
(1.94 %)		 20,246
(1.25 %)		 n/a 40.81
(98.67 %)		 178,925
(1.35 %)		 163,017
(98.65 %)		 5,382,039
(50.20 %)		 980,479
(2.63 %)		 16,076,172
(35.62 %)		 50,033
(1.04 %)
199 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1		 31,786
(2.57 %)		 14,548
(1.02 %)		 15,297
(1.46 %)		 n/a 43.49
(95.57 %)		 134,344
(4.44 %)		 274,367
(95.56 %)		 1,615,553
(13.87 %)		 317,600
(2.08 %)		 11,732,990
(28.32 %)		 36,782
(0.70 %)
200 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,917
(3.63 %)		 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 49,035
(1.44 %)
201 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1		 n/a 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
202 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1		 n/a 12,737
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 187
(100.00 %)		 502,844
(6.10 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,316
(23.59 %)		 46,108
(3.49 %)
203 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,404
(1.74 %)		 20,264
(1.41 %)		 33,412
(1.67 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,547,865
(43.29 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,374,928
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
204 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1		 n/a 19,385
(1.74 %)		 20,265
(1.41 %)		 33,375
(1.66 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,871
(100.00 %)		 4,629,031
(43.70 %)		 573,328
(1.09 %)		 13,374,887
(33.10 %)		 50,379
(1.45 %)
205 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1		 n/a 20,337
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 3,783,435
(35.17 %)		 567,796
(3.38 %)		 13,462,481
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
206 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
207 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2		 35,874
(6.47 %)		 11,298
(1.84 %)		 17,627
(2.12 %)		 n/a 41.48
(97.07 %)		 27,795
(2.94 %)		 113
(100.00 %)		 392,199
(5.95 %)		 139,126
(0.76 %)		 6,141,002
(18.21 %)		 12,943
(0.48 %)
208 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5		 42,799
(57.51 %)		 11,845
(1.92 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 421,463
(6.12 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
209 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1		 n/a 18,575
(1.67 %)		 17,121
(1.34 %)		 n/a 41.50
(98.14 %)		 45,680
(1.86 %)		 55,316
(98.14 %)		 3,941,878
(45.17 %)		 381,229
(1.99 %)		 14,674,265
(29.80 %)		 45,521
(1.52 %)
210 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 n/a 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
211 house mouse
GCF_000001635.26		 123,667
(4.49 %)		 24,134
(2.09 %)		 22,855
(1.67 %)		 n/a 41.73
(97.18 %)		 904
(2.82 %)		 21,179
(97.18 %)		 5,554,281
(45.50 %)		 1,695,255
(3.40 %)		 13,041,229
(35.91 %)		 25,014
(0.54 %)
212 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39		 172,809
(4.43 %)		 23,121
(1.97 %)		 27,697
(1.78 %)		 n/a 41.04
(95.07 %)		 1,268
(4.93 %)		 46,029
(95.07 %)		 5,859,855
(52.78 %)		 1,037,733
(4.60 %)		 16,933,424
(36.88 %)		 56,646
(1.06 %)
213 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40		 188,352
(5.12 %)		 23,474
(1.98 %)		 28,557
(1.86 %)		 n/a 41.05
(95.10 %)		 1,270
(4.90 %)		 46,502
(95.10 %)		 5,910,293
(52.77 %)		 1,047,827
(4.59 %)		 17,068,934
(36.82 %)		 57,427
(1.07 %)
214 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2		 n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
215 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4		 108,944
(51.73 %)		 20,844
(1.79 %)		 21,287
(1.16 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 n/a 25
(100.00 %)		 5,591,082
(54.45 %)		 1,155,353
(8.89 %)		 16,163,340
(41.63 %)		 52,408
(1.38 %)
216 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
217 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2		 46,746
(2.60 %)		 18,453
(1.69 %)		 20,410
(1.59 %)		 n/a 41.90
(99.98 %)		 3,639
(0.02 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,637,156
(23.36 %)		 497,087
(1.30 %)		 10,984,260
(32.64 %)		 47,552
(2.89 %)
218 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 17,930
(1.47 %)
219 Indian medaka
GCF_002922805.1		 47,300
(9.26 %)		 14,561
(2.50 %)		 31,867
(6.43 %)		 n/a 39.04
(94.73 %)		 51,440
(5.29 %)		 8,603
(100.00 %)		 319,637
(2.20 %)		 208,749
(2.67 %)		 5,412,794
(33.26 %)		 40,721
(2.36 %)
220 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1		 n/a 21,188
(1.26 %)		 41,550
(1.34 %)		 35,477
(1.51 %)		 42.19
(99.92 %)		 4,324
(0.02 %)		 798,700
(99.98 %)		 3,297,388
(28.66 %)		 476,792
(1.23 %)		 13,144,912
(34.13 %)		 81,685
(1.86 %)
221 Japanese quail
GCF_001577835.1		 47,008
(7.38 %)		 12,864
(2.55 %)		 36,126
(11.03 %)		 n/a 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 466,141
(6.58 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
222 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1		 29,097
(10.82 %)		 4,337
(1.33 %)		 43,907
(11.32 %)		 n/a 44.75
(99.72 %)		 499
(0.28 %)		 857
(100.00 %)		 439,110
(17.67 %)		 262,539
(5.69 %)		 1,834,301
(29.28 %)		 6,204
(9.08 %)
223 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1		 49,444
(5.77 %)		 13,114
(1.92 %)		 17,732
(2.50 %)		 29,004
(4.44 %)		 41.97
(97.63 %)		 362
(2.37 %)		 99
(100.00 %)		 548,758
(10.76 %)		 208,171
(1.07 %)		 6,258,082
(20.20 %)		 22,279
(1.75 %)
224 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 n/a 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
225 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 n/a 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
226 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
227 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 n/a 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
228 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1		 n/a 4,550
(1.47 %)		 9,197
(5.18 %)		 30,394
(12.69 %)		 34.13
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 123,352
(2.30 %)		 36,616
(6.05 %)		 2,431,238
(41.04 %)		 8,442
(2.49 %)
229 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
230 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 35,505
(1.37 %)
231 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
232 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2		 n/a 591
(1.09 %)		 4,193
(46.51 %)		 n/a 59.58
(99.94 %)		 454
(0.06 %)		 76
(100.00 %)		 24,390
(4.61 %)		 4,228
(1.93 %)		 243,087
(20.97 %)		 92
(99.40 %)
233 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2		 n/a 626
(1.15 %)		 4,290
(46.53 %)		 n/a 59.72
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 33,021
(5.20 %)		 8,477
(2.43 %)		 238,932
(20.91 %)		 41
(99.80 %)
234 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1		 n/a 18,874
(1.62 %)		 21,014
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,329
(96.15 %)		 5,246,283
(42.87 %)		 1,059,443
(5.13 %)		 14,265,514
(32.20 %)		 77,000
(2.45 %)
235 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1		 n/a 19,393
(1.38 %)		 20,311
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,359
(87.13 %)		 6,205,858
(38.76 %)		 832,823
(1.53 %)		 13,661,563
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
236 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
237 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 n/a 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
238 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1		 60,760
(2.83 %)		 16,272
(0.65 %)		 109,234
(6.86 %)		 n/a 37.79
(92.71 %)		 350,251
(7.33 %)		 11,453
(100.00 %)		 946,986
(1.96 %)		 983,572
(3.65 %)		 12,334,735
(53.11 %)		 117,678
(2.02 %)
239 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3		 64,708
(2.94 %)		 16,252
(0.65 %)		 101,828
(6.36 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 351,533
(7.59 %)		 9,960
(99.71 %)		 945,052
(1.95 %)		 983,641
(3.64 %)		 12,325,371
(53.00 %)		 117,703
(2.02 %)
240 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,255
(11.91 %)		 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
241 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1		 n/a 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 53,323
(5.09 %)
242 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2		 n/a 21,084
(1.92 %)		 22,287
(1.31 %)		 n/a 40.74
(94.86 %)		 83,929
(5.15 %)		 112,850
(94.85 %)		 5,109,404
(47.71 %)		 734,754
(2.02 %)		 15,854,134
(33.62 %)		 36,070
(0.90 %)
243 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1		 n/a 19,449
(1.56 %)		 24,645
(1.37 %)		 41,235
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,656
(7.81 %)		 80,669
(100.00 %)		 3,063,619
(35.20 %)		 866,306
(3.08 %)		 13,310,826
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
244 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1		 29,549
(16.44 %)		 15,120
(6.45 %)		 49,515
(30.69 %)		 n/a 40.48
(93.32 %)		 20,693
(6.71 %)		 23,184
(93.29 %)		 115,049
(2.29 %)		 51,516
(1.90 %)		 1,488,940
(24.12 %)		 42,077
(12.05 %)
245 mangrove rivulus
GCF_001649575.1		 45,306
(11.02 %)		 14,510
(2.84 %)		 29,750
(6.81 %)		 n/a 40.03
(94.35 %)		 29,388
(5.66 %)		 3,073
(100.00 %)		 345,930
(2.32 %)		 146,268
(1.33 %)		 4,717,260
(27.31 %)		 39,557
(2.69 %)
246 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1		 n/a 4,863
(1.16 %)		 19,812
(6.60 %)		 27,763
(8.31 %)		 36.96
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 227,482
(2.41 %)		 107,773
(3.02 %)		 2,456,144
(43.97 %)		 24,873
(3.15 %)
247 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1		 n/a 21,726
(1.54 %)		 31,908
(1.39 %)		 n/a 41.89
(99.96 %)		 4,153
(0.02 %)		 354,021
(99.98 %)		 4,835,157
(40.73 %)		 693,037
(1.32 %)		 13,779,279
(33.49 %)		 76,740
(2.37 %)
248 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1		 n/a 19,020
(1.63 %)		 19,812
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,552,310
(40.02 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
249 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1		 26,008
(10.49 %)		 7,743
(3.09 %)		 12,206
(6.18 %)		 n/a 35.15
(84.42 %)		 37,430
(15.62 %)		 43,002
(84.38 %)		 237,943
(3.36 %)		 74,977
(1.26 %)		 2,410,203
(31.96 %)		 15,259
(2.01 %)
250 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1		 n/a 19,298
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,071
(94.04 %)		 4,041,828
(42.24 %)		 573,950
(1.48 %)		 13,504,295
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
251 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1		 n/a 19,544
(1.49 %)		 21,502
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,375
(100.00 %)		 4,006,932
(35.92 %)		 1,058,106
(12.08 %)		 12,708,154
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
252 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1		 35,332
(12.83 %)		 2,750
(0.61 %)		 29,731
(8.07 %)		 n/a 40.94
(99.89 %)		 3,360
(0.11 %)		 8,241
(99.89 %)		 115,140
(1.18 %)		 39,880
(0.71 %)		 1,832,298
(14.55 %)		 31,479
(5.12 %)
253 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1		 n/a 21,302
(1.57 %)		 27,162
(1.27 %)		 40,982
(1.78 %)		 41.88
(99.90 %)		 11,139
(0.04 %)		 796,326
(99.96 %)		 5,253,752
(39.29 %)		 1,211,658
(3.13 %)		 13,894,596
(38.35 %)		 24,829
(0.69 %)
254 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1		 n/a 18,428
(0.81 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 18
(100.00 %)		 7,426,369
(29.77 %)		 1,249,638
(2.12 %)		 21,135,395
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
255 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1		 25,114
(8.87 %)		 5,088
(1.13 %)		 22,625
(7.19 %)		 n/a 36.56
(97.52 %)		 10,662
(2.49 %)		 13,637
(97.51 %)		 154,017
(1.49 %)		 50,642
(0.97 %)		 2,919,487
(37.00 %)		 34,396
(3.66 %)
256 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2		 n/a 16,645
(3.88 %)		 43,866
(14.64 %)		 n/a 33.16
(92.79 %)		 96,870
(7.25 %)		 2,463
(100.00 %)		 265,072
(3.32 %)		 198,918
(3.34 %)		 2,840,410
(34.89 %)		 13,926
(1.48 %)
257 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 31,271
(3.60 %)
258 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 25,670
(3.87 %)
259 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1		 n/a 21,317
(1.73 %)		 20,856
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,652
(88.41 %)		 4,162,977
(32.77 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,503
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
260 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1		 n/a 21,418
(1.52 %)		 34,189
(1.28 %)		 n/a 41.35
(99.92 %)		 8,600
(0.03 %)		 653,473
(99.97 %)		 4,512,168
(44.82 %)		 592,047
(1.17 %)		 13,009,453
(37.18 %)		 63,033
(1.47 %)
261 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 n/a 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
262 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1		 19,404
(22.65 %)		 12,088
(12.63 %)		 7,533
(12.85 %)		 n/a 37.35
(97.22 %)		 6,713
(2.80 %)		 607
(99.95 %)		 116,909
(19.60 %)		 45,475
(4.23 %)		 820,686
(35.42 %)		 4,887
(1.65 %)
263 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2		 36,251
(5.66 %)		 10,150
(1.34 %)		 42,117
(8.90 %)		 n/a 37.47
(94.63 %)		 39,556
(5.39 %)		 45,302
(94.61 %)		 396,916
(3.25 %)		 506,716
(6.41 %)		 4,768,175
(36.07 %)		 17,009
(0.90 %)
264 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2		 n/a 21,293
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,971
(90.87 %)		 5,327,246
(49.09 %)		 651,311
(1.26 %)		 19,267,381
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
265 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1		 46,144
(1.87 %)		 21,316
(1.15 %)		 25,308
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,328,146
(49.10 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
266 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1		 49,934
(2.73 %)		 20,106
(1.74 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,434,732
(35.01 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
267 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1		 28,512
(7.14 %)		 5,830
(1.09 %)		 39,806
(8.27 %)		 n/a 36.76
(100.00 %)		 n/a 1,714
(100.00 %)		 222,294
(5.58 %)		 187,561
(9.87 %)		 3,009,613
(56.49 %)		 63,009
(9.78 %)
268 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1		 n/a 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
269 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3		 n/a 20,134
(1.89 %)		 18,568
(1.14 %)		 n/a 40.76
(93.09 %)		 180,468
(6.94 %)		 197,908
(93.06 %)		 5,169,984
(51.90 %)		 831,865
(4.16 %)		 15,243,657
(35.77 %)		 65,761
(1.00 %)
270 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2		 n/a 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
271 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3		 84,433
(3.85 %)		 20,317
(1.83 %)		 21,239
(1.18 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,811
(99.24 %)		 5,525,293
(52.79 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,088
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
272 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2		 n/a 20,319
(1.82 %)		 21,542
(1.19 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,810
(99.24 %)		 5,524,514
(52.78 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,031
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
273 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1		 n/a 4,705
(1.06 %)		 15,277
(5.00 %)		 29,018
(10.11 %)		 33.42
(99.99 %)		 91
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 209,233
(2.16 %)		 56,676
(1.12 %)		 3,372,591
(44.40 %)		 13,547
(2.72 %)
274 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,081
(4.30 %)
275 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1		 31,681
(7.81 %)		 4,257
(0.79 %)		 16,323
(3.39 %)		 n/a 29.76
(92.38 %)		 46,297
(7.65 %)		 21,920
(100.00 %)		 768,383
(18.87 %)		 135,468
(2.11 %)		 4,536,093
(48.39 %)		 16,332
(2.13 %)
276 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 n/a 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
277 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1		 46,646
(9.41 %)		 17,409
(3.12 %)		 51,529
(12.74 %)		 48,654
(8.33 %)		 32.79
(94.21 %)		 36,387
(5.81 %)		 72,923
(94.19 %)		 400,327
(3.60 %)		 306,656
(4.69 %)		 3,754,630
(39.24 %)		 26,578
(2.89 %)
278 pike-perch
GCF_008315115.1		 56,221
(8.23 %)		 15,677
(2.23 %)		 29,967
(5.65 %)		 62,989
(6.22 %)		 40.92
(100.00 %)		 94
(0.00 %)		 1,313
(100.00 %)		 591,660
(5.05 %)		 569,876
(7.39 %)		 4,713,605
(36.32 %)		 39,545
(1.93 %)
279 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1		 n/a 15,042
(1.17 %)		 19,939
(1.55 %)		 n/a 46.64
(100.00 %)		 476
(0.00 %)		 4,568
(100.00 %)		 5,326,862
(52.88 %)		 879,598
(5.00 %)		 9,545,961
(50.95 %)		 94,468
(9.28 %)
280 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1		 56,708
(3.09 %)		 14,805
(1.26 %)		 18,918
(1.63 %)		 42,516
(2.60 %)		 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,099,803
(51.62 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,829
(7.91 %)
281 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
282 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1		 n/a 18,495
(1.67 %)		 15,243
(1.37 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,161
(98.33 %)		 4,221,025
(40.96 %)		 553,193
(1.29 %)		 13,765,526
(29.91 %)		 54,906
(1.17 %)
283 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 n/a 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
284 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1		 n/a 24,094
(1.34 %)		 35,119
(1.27 %)		 n/a 41.97
(99.87 %)		 6,569
(0.02 %)		 1,649,700
(99.98 %)		 5,613,563
(41.47 %)		 652,408
(1.55 %)		 13,943,055
(43.64 %)		 61,057
(1.17 %)
285 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1		 n/a 19,564
(1.68 %)		 22,124
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,059
(99.12 %)		 3,917,534
(41.44 %)		 435,606
(1.73 %)		 14,738,354
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
286 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1		 n/a 17,665
(1.56 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,174
(100.00 %)		 4,884,619
(42.70 %)		 833,136
(1.76 %)		 13,705,706
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
287 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2		 n/a 19,951
(1.94 %)		 19,039
(1.18 %)		 n/a 40.74
(82.95 %)		 156,797
(17.06 %)		 121,337
(82.94 %)		 5,136,492
(50.91 %)		 775,493
(1.63 %)		 15,570,612
(30.28 %)		 43,049
(0.71 %)
288 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 n/a 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
289 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2		 n/a 19,480
(1.31 %)		 23,335
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,159
(100.00 %)		 4,179,975
(0.00 %)		 976,271
(2.33 %)		 13,766,353
(39.76 %)		 113,370
(2.46 %)
290 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1		 n/a 18,676
(1.38 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,884,561
(44.65 %)		 883,943
(1.73 %)		 13,254,559
(38.27 %)		 110,338
(2.33 %)
291 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1		 69,943
(20.66 %)		 33,762
(10.20 %)		 70,765
(28.80 %)		 n/a 35.29
(87.22 %)		 28,041
(12.80 %)		 10,676
(100.00 %)		 196,483
(2.53 %)		 150,132
(3.32 %)		 2,256,858
(26.65 %)		 23,381
(2.80 %)
292 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2		 n/a 4,641
(1.20 %)		 13,258
(4.79 %)		 32,725
(10.42 %)		 32.84
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 184,094
(2.52 %)		 41,639
(1.23 %)		 3,193,736
(41.82 %)		 10,747
(2.25 %)
293 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1		 16,151
(2.15 %)		 12,046
(1.50 %)		 25,077
(1.98 %)		 n/a 41.63
(99.43 %)		 75,085
(0.59 %)		 134,672
(99.41 %)		 401,465
(6.41 %)		 153,694
(0.86 %)		 6,705,299
(20.45 %)		 30,183
(1.07 %)
294 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1		 16,238
(2.21 %)		 12,016
(1.53 %)		 23,985
(1.93 %)		 n/a 41.20
(99.63 %)		 59,230
(0.38 %)		 112,704
(99.62 %)		 322,026
(4.02 %)		 121,725
(0.68 %)		 6,797,850
(18.25 %)		 18,873
(0.62 %)
295 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1		 26,926
(16.13 %)		 4,185
(2.08 %)		 24,859
(11.07 %)		 n/a 39.77
(99.98 %)		 2,089
(0.02 %)		 10,222
(100.00 %)		 88,278
(1.96 %)		 74,016
(3.78 %)		 1,305,254
(28.61 %)		 10,712
(6.90 %)
296 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 n/a 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
297 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
298 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3		 n/a 20,558
(1.71 %)		 22,141
(1.12 %)		 n/a 40.95
(97.08 %)		 64,538
(2.91 %)		 348,579
(97.09 %)		 5,846,699
(54.61 %)		 1,429,378
(9.24 %)		 16,512,587
(40.26 %)		 98,572
(1.29 %)
299 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 n/a 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
300 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1		 16,166
(2.37 %)		 12,054
(1.65 %)		 23,851
(2.04 %)		 n/a 41.63
(99.55 %)		 66,437
(0.46 %)		 120,312
(99.54 %)		 392,481
(7.69 %)		 217,040
(2.27 %)		 5,855,355
(18.33 %)		 7,602
(0.24 %)
301 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1		 n/a 21,125
(1.90 %)		 29,864
(1.51 %)		 65,909
(1.91 %)		 41.13
(99.93 %)		 4,599
(0.02 %)		 580,026
(99.98 %)		 3,840,645
(39.25 %)		 675,921
(1.83 %)		 13,841,750
(31.45 %)		 59,440
(1.72 %)
302 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 58,475
(4.46 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 642,988
(3.38 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
303 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,772
(6.02 %)		 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
304 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1		 n/a 12,831
(2.31 %)		 n/a n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 164
(100.00 %)		 667,924
(11.59 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,274
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
305 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2		 n/a 21,304
(2.26 %)		 18,211
(1.40 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,919
(92.71 %)		 4,878,260
(40.08 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,226
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
306 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 96,713
(4.05 %)		 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
307 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 n/a 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
308 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 n/a 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
309 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2		 27,164
(5.26 %)		 3,465
(0.45 %)		 3,673
(1.75 %)		 n/a 30.90
(99.99 %)		 608
(0.01 %)		 10,436
(99.99 %)		 1,394,872
(53.53 %)		 76,419
(1.13 %)		 6,311,228
(43.85 %)		 647
(0.04 %)
310 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 n/a 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
311 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1		 n/a 13,961
(0.46 %)		 36,603
(1.55 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,475
(100.00 %)		 1,903,658
(2.85 %)		 2,970,695
(16.56 %)		 15,354,615
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
312 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2		 n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.24 %)		 1
(0.11 %)		 33
(1.38 %)		 1
(0.73 %)
313 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1		 n/a 3,020
(1.06 %)		 13,146
(12.99 %)		 30,497
(24.04 %)		 36.33
(82.34 %)		 637,478
(17.95 %)		 4,312
(100.00 %)		 74,671
(1.98 %)		 63,328
(2.24 %)		 1,417,036
(20.33 %)		 2,099
(0.38 %)
314 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2		 n/a 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,142
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,588
(98.79 %)		 4,702,292
(41.42 %)		 721,749
(1.39 %)		 14,065,592
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
315 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1		 23,426
(13.46 %)		 2,741
(0.95 %)		 3,156
(4.19 %)		 n/a 32.82
(91.54 %)		 11,185
(8.47 %)		 12,292
(91.53 %)		 572,062
(30.90 %)		 474,390
(10.49 %)		 1,741,644
(44.75 %)		 3,489
(0.51 %)
316 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
317 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
318 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1		 54,238
(2.74 %)		 17,887
(2.00 %)		 18,517
(1.25 %)		 n/a 41.17
(98.20 %)		 18,567
(1.80 %)		 18,392
(100.00 %)		 4,399,357
(50.55 %)		 711,948
(2.37 %)		 12,623,705
(36.55 %)		 67,835
(1.30 %)
319 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2		 63,475
(2.65 %)		 20,581
(1.94 %)		 21,181
(1.20 %)		 41,252
(1.46 %)		 41.02
(97.81 %)		 25,106
(2.19 %)		 18,395
(100.00 %)		 5,332,131
(51.09 %)		 857,562
(2.26 %)		 15,565,289
(36.84 %)		 80,124
(1.26 %)
320 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1		 n/a 26,771
(1.11 %)		 44,247
(1.00 %)		 n/a 40.68
(99.86 %)		 9,648
(0.03 %)		 1,946,791
(99.97 %)		 6,230,312
(41.68 %)		 688,924
(1.23 %)		 16,892,392
(43.00 %)		 39,326
(0.65 %)
321 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1		 n/a 22,195
(1.49 %)		 21,341
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 85
(100.00 %)		 4,625,875
(39.88 %)		 579,984
(1.59 %)		 14,405,402
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
322 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1		 n/a 19,066
(1.18 %)		 19,334
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.44 %)		 269,444
(11.60 %)		 277,845
(88.40 %)		 3,789,866
(28.89 %)		 429,318
(0.87 %)		 16,950,647
(32.23 %)		 39,994
(0.70 %)
323 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,762
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
324 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
325 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1		 37,836
(4.45 %)		 10,526
(1.07 %)		 59,331
(6.34 %)		 n/a 36.53
(93.84 %)		 227,684
(6.18 %)		 139,583
(93.83 %)		 653,914
(2.87 %)		 386,956
(5.71 %)		 7,364,314
(43.00 %)		 60,636
(4.05 %)
326 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1		 76,167
(6.12 %)		 24,114
(1.71 %)		 51,371
(4.08 %)		 102,891
(5.24 %)		 43.39
(96.16 %)		 25,659
(3.84 %)		 38,027
(99.99 %)		 1,300,179
(8.96 %)		 1,465,690
(10.81 %)		 8,849,714
(48.44 %)		 64,215
(1.55 %)
327 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1		 n/a 15,695
(2.61 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 1,591,314
(33.50 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,850
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
328 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1		 n/a 24,302
(1.12 %)		 43,055
(0.98 %)		 n/a 41.63
(99.82 %)		 10,550
(0.03 %)		 2,272,285
(99.97 %)		 5,668,964
(24.75 %)		 1,628,683
(5.38 %)		 15,658,806
(41.85 %)		 21,801
(0.44 %)
329 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1		 n/a 25,638
(0.82 %)		 49,782
(0.86 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 5,819
(0.02 %)		 2,150,023
(99.98 %)		 6,033,640
(37.10 %)		 708,890
(0.99 %)		 22,371,532
(41.88 %)		 80,897
(1.09 %)
330 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1		 n/a 25,877
(0.78 %)		 56,071
(0.82 %)		 n/a 39.82
(99.84 %)		 5,099
(0.02 %)		 2,537,432
(99.98 %)		 5,384,587
(37.86 %)		 724,925
(2.20 %)		 19,492,096
(41.12 %)		 55,674
(0.90 %)
331 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1		 n/a 18,551
(1.79 %)		 19,747
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,823
(96.04 %)		 3,824,807
(39.33 %)		 421,693
(0.97 %)		 14,765,476
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
332 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4		 82,440
(9.65 %)		 27,682
(3.07 %)		 77,218
(11.84 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,955
(2.35 %)		 17,146
(97.65 %)		 834,646
(37.35 %)		 436,219
(5.65 %)		 5,341,660
(45.30 %)		 35,897
(1.56 %)
333 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5		 85,123
(9.72 %)		 27,647
(3.06 %)		 77,190
(11.83 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,995
(2.36 %)		 17,187
(97.64 %)		 834,651
(37.35 %)		 436,225
(5.65 %)		 5,341,721
(45.30 %)		 35,897
(1.47 %)
334 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1		 n/a 4,713
(0.87 %)		 17,002
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 304,077
(2.97 %)		 110,835
(4.09 %)		 3,704,355
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
335 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2		 60,921
(2.59 %)		 19,527
(1.73 %)		 25,114
(1.51 %)		 n/a 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,365,057
(42.78 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.52 %)
336 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1		 31,248
(25.26 %)		 2,167
(1.08 %)		 6,648
(9.22 %)		 n/a 35.83
(86.92 %)		 14,944
(13.10 %)		 27,972
(86.90 %)		 108,973
(4.04 %)		 70,563
(4.66 %)		 881,116
(24.58 %)		 668
(0.62 %)
337 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
338 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,452
(4.10 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
339 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1		 36,135
(16.45 %)		 3,324
(0.70 %)		 20,909
(10.93 %)		 38,198
(17.00 %)		 38.54
(89.50 %)		 49,077
(10.54 %)		 5,688
(100.00 %)		 111,077
(1.70 %)		 108,732
(2.95 %)		 2,009,396
(21.40 %)		 6,012
(0.58 %)
340 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1		 n/a 16,035
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 59
(100.00 %)		 1,870,238
(37.80 %)		 605,571
(6.82 %)		 5,059,499
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
341 Sumatran orangutan (2018 genbank)
GCA_002880775.3		 n/a 20,174
(1.79 %)		 20,994
(1.15 %)		 47,806
(1.68 %)		 40.80
(99.29 %)		 553
(0.70 %)		 5,813
(99.30 %)		 5,497,148
(54.41 %)		 1,048,361
(8.01 %)		 15,948,575
(40.68 %)		 39,481
(0.87 %)
342 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
343 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
344 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 n/a 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
345 Tasmanian devil
GCF_000189315.1		 32,527
(1.79 %)		 16,112
(0.84 %)		 16,152
(0.94 %)		 n/a 36.05
(92.36 %)		 201,403
(7.66 %)		 237,291
(92.34 %)		 6,766,259
(42.85 %)		 1,240,681
(2.07 %)		 20,998,733
(36.61 %)		 23,155
(0.38 %)
346 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3		 54,010
(40.19 %)		 26,552
(34.12 %)		 25,867
(35.78 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 67,353
(16.32 %)		 27,063
(2.77 %)		 749,020
(22.64 %)		 4,599
(1.63 %)
347 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,165
(1.70 %)		 18,102
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,378,557
(36.61 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
348 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 n/a 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
349 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
350 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1		 n/a 3,517
(1.61 %)		 18,910
(15.71 %)		 n/a 42.18
(97.94 %)		 14,007
(2.09 %)		 459
(100.00 %)		 52,042
(1.17 %)		 27,065
(1.23 %)		 928,666
(18.11 %)		 15,823
(5.51 %)
351 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1		 47,041
(13.29 %)		 13,817
(3.76 %)		 32,943
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.04 %)		 23,101
(6.97 %)		 60,478
(93.03 %)		 359,724
(3.91 %)		 155,380
(3.35 %)		 2,811,700
(24.51 %)		 61,685
(7.72 %)
352 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4		 46,015
(6.94 %)		 15,396
(2.15 %)		 38,462
(7.56 %)		 n/a 34.12
(90.18 %)		 19,634
(9.83 %)		 3,150
(100.00 %)		 417,162
(18.21 %)		 229,803
(3.18 %)		 5,370,478
(35.28 %)		 25,279
(1.28 %)
353 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1		 24,334
(8.13 %)		 7,223
(2.32 %)		 6,632
(3.62 %)		 n/a 33.80
(97.46 %)		 9,688
(2.55 %)		 7,986
(100.00 %)		 418,532
(4.76 %)		 185,734
(2.26 %)		 3,090,742
(35.34 %)		 3,487
(0.58 %)
354 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1		 56,617
(1.50 %)		 14,448
(0.38 %)		 40,572
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,263,606
(1.94 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
355 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1		 n/a 21,053
(1.88 %)		 23,024
(1.24 %)		 n/a 40.68
(96.59 %)		 77,615
(3.42 %)		 47,644
(100.00 %)		 5,478,730
(51.13 %)		 969,126
(2.63 %)		 16,127,854
(36.40 %)		 63,965
(1.04 %)
356 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2		 66,965
(2.69 %)		 21,958
(1.85 %)		 24,388
(1.22 %)		 55,722
(1.95 %)		 40.60
(97.10 %)		 63,620
(2.91 %)		 47,449
(100.00 %)		 5,699,639
(51.61 %)		 1,066,606
(2.87 %)		 16,603,622
(37.49 %)		 71,084
(1.08 %)
357 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3		 68,173
(2.68 %)		 21,804
(1.85 %)		 23,385
(1.18 %)		 n/a 40.60
(97.10 %)		 64,415
(2.91 %)		 46,654
(100.00 %)		 5,700,226
(51.61 %)		 1,066,759
(2.88 %)		 16,603,818
(37.49 %)		 71,078
(1.08 %)
358 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4		 63,704
(2.55 %)		 21,347
(1.86 %)		 23,056
(1.19 %)		 n/a 40.84
(97.07 %)		 57,757
(2.93 %)		 34,372
(100.00 %)		 5,504,117
(51.70 %)		 961,351
(2.75 %)		 16,208,033
(37.10 %)		 71,046
(1.10 %)
359 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1		 n/a 19,685
(1.25 %)		 21,268
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,096
(95.17 %)		 6,165,270
(34.95 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,333
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
360 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1		 63,555
(8.16 %)		 16,886
(1.90 %)		 72,876
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,674
(0.23 %)		 2,010
(100.00 %)		 800,389
(3.72 %)		 460,244
(7.41 %)		 5,439,256
(37.83 %)		 19,635
(1.10 %)
361 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1		 48,870
(21.91 %)		 19,421
(7.41 %)		 36,314
(20.76 %)		 n/a 36.49
(94.25 %)		 49,649
(5.76 %)		 25,263
(100.00 %)		 182,696
(3.35 %)		 143,269
(7.40 %)		 1,620,517
(29.12 %)		 13,323
(2.49 %)
362 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1		 13,201
(7.14 %)		 3,474
(1.25 %)		 15,142
(4.89 %)		 n/a 30.36
(99.55 %)		 7,471
(0.46 %)		 9,928
(99.54 %)		 340,841
(7.52 %)		 251,386
(3.99 %)		 2,448,273
(49.27 %)		 16,346
(4.08 %)
363 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1		 n/a 20,245
(1.49 %)		 24,230
(1.29 %)		 n/a 42.11
(97.39 %)		 263,385
(2.62 %)		 630,367
(97.38 %)		 5,997,926
(47.35 %)		 466,019
(1.02 %)		 13,822,739
(40.29 %)		 93,080
(1.71 %)
364 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1		 n/a 21,044
(1.72 %)		 22,320
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,546
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,250
(0.66 %)		 13,410,191
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
365 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1		 n/a 18,034
(1.33 %)		 19,779
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,566
(85.91 %)		 6,527,125
(45.87 %)		 1,271,531
(2.29 %)		 12,374,069
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
366 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 n/a 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
367 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3		 n/a 20,323
(1.77 %)		 22,069
(1.15 %)		 n/a 40.71
(99.64 %)		 768
(0.36 %)		 16,065
(99.64 %)		 5,373,630
(50.30 %)		 1,025,389
(10.17 %)		 15,954,613
(41.78 %)		 53,557
(1.01 %)
368 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3		 51,681
(3.25 %)		 15,203
(1.04 %)		 22,272
(1.67 %)		 46,230
(2.32 %)		 44.19
(91.88 %)		 183,744
(8.14 %)		 262,326
(91.86 %)		 2,767,141
(30.92 %)		 316,971
(0.98 %)		 11,856,824
(28.95 %)		 104,231
(1.84 %)
369 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
370 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1		 12,199
(13.86 %)		 2,842
(1.49 %)		 27,198
(19.18 %)		 n/a 51.58
(99.74 %)		 1,901
(0.26 %)		 3,993
(99.74 %)		 33,136
(1.10 %)		 13,115
(0.57 %)		 612,854
(9.73 %)		 2,003
(54.71 %)
371 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1		 37,175
(25.01 %)		 4,407
(2.81 %)		 15,504
(11.96 %)		 n/a 40.34
(98.12 %)		 8,733
(1.89 %)		 10,707
(98.11 %)		 87,084
(2.38 %)		 44,673
(2.55 %)		 1,001,343
(22.18 %)		 7,519
(2.78 %)
372 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 n/a 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
373 white-footed mouse
GCF_004664715.1		 46,167
(2.56 %)		 20,406
(1.72 %)		 20,857
(1.46 %)		 39,081
(1.88 %)		 42.23
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 1,763
(100.00 %)		 5,064,597
(30.73 %)		 1,258,088
(2.85 %)		 14,005,845
(33.01 %)		 23,475
(0.69 %)
374 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 22,185
(2.62 %)
375 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1		 n/a 20,653
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 40,950
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,030
(0.91 %)		 48,652
(99.10 %)		 4,799,958
(41.28 %)		 413,128
(2.59 %)		 13,296,686
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
376 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1		 n/a 21,754
(1.86 %)		 21,668
(1.22 %)		 n/a 40.77
(99.67 %)		 48,495
(0.33 %)		 88,439
(99.67 %)		 5,195,965
(48.83 %)		 825,714
(3.60 %)		 15,372,168
(38.05 %)		 34,994
(0.85 %)
377 white-tufted-ear marmoset (v1.0 paternal 2020)
GCA_011100535.1		 n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 35,222
(0.94 %)
378 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2		 n/a 21,801
(1.88 %)		 21,501
(1.28 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,234
(100.00 %)		 5,036,594
(47.71 %)		 842,846
(3.25 %)		 15,161,577
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
379 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1		 58,109
(2.92 %)		 21,699
(1.91 %)		 20,910
(1.24 %)		 n/a 40.85
(94.45 %)		 187,214
(5.57 %)		 201,523
(94.43 %)		 5,120,629
(48.95 %)		 768,432
(2.30 %)		 15,303,718
(34.75 %)		 35,805
(0.79 %)
380 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1		 n/a 21,729
(1.89 %)		 21,502
(1.30 %)		 n/a 40.85
(98.70 %)		 370
(1.30 %)		 1,360
(98.70 %)		 5,122,418
(49.40 %)		 818,502
(3.68 %)		 15,232,829
(38.20 %)		 36,656
(0.90 %)
381 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1		 n/a 13,572
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 929
(100.00 %)		 616,295
(10.57 %)		 211,557
(2.90 %)		 6,785,134
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
382 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2		 n/a 18,785
(1.94 %)		 17,252
(1.62 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,871
(98.82 %)		 3,098,525
(34.75 %)		 353,630
(1.23 %)		 12,349,553
(25.12 %)		 45,436
(1.02 %)
383 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1		 131,302
(1.34 %)		 33,079
(0.33 %)		 567,762
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,768
(3.31 %)		 148,396
(100.00 %)		 2,762,705
(2.81 %)		 2,991,142
(3.37 %)		 493,164
(96.69 %)		 2,220,897
(25.33 %)
384 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2		 69,091
(6.81 %)		 16,823
(1.67 %)		 75,740
(11.45 %)		 n/a 35.81
(86.74 %)		 133,967
(13.30 %)		 3,189
(98.45 %)		 588,761
(3.39 %)		 493,855
(3.35 %)		 5,206,772
(45.36 %)		 48,008
(1.88 %)
385 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1		 n/a 14,001
(6.64 %)		 34,562
(26.90 %)		 n/a 38.40
(94.26 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,459
(94.24 %)		 152,427
(20.00 %)		 74,539
(2.79 %)		 1,032,592
(21.43 %)		 14,802
(3.20 %)
386 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1		 50,529
(5.75 %)		 12,950
(1.89 %)		 19,252
(2.57 %)		 24,522
(2.44 %)		 42.30
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 3,744
(100.00 %)		 500,823
(7.17 %)		 300,638
(2.31 %)		 6,414,267
(20.54 %)		 28,268
(2.21 %)
387 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1		 n/a 20,813
(1.60 %)		 23,199
(1.43 %)		 45,153
(1.99 %)		 40.00
(97.18 %)		 57,045
(2.82 %)		 105,556
(97.18 %)		 4,756,333
(33.73 %)		 836,503
(2.41 %)		 14,755,960
(31.13 %)		 34,151
(0.87 %)
388 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1		 62,044
(2.80 %)		 19,783
(1.48 %)		 21,060
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 46
(0.00 %)		 3,381
(100.00 %)		 3,884,968
(28.12 %)		 912,591
(2.73 %)		 14,538,767
(35.15 %)		 36,919
(1.02 %)
389 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,639
(1.72 %)		 19,645
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 n/a 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
390 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1		 n/a 19,219
(1.73 %)		 27,456
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,509
(98.67 %)		 4,277,556
(44.10 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,034
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
391 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1		 27,063
(1.65 %)		 19,227
(1.75 %)		 27,468
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,193,317
(43.38 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
392 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1		 n/a 18,726
(1.80 %)		 19,644
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,345
(99.28 %)		 3,990,044
(42.54 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,683
(32.88 %)		 59,052
(1.48 %)
393 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1		 41,573
(2.14 %)		 19,845
(1.63 %)		 21,262
(1.39 %)		 n/a 39.88
(97.82 %)		 38,354
(2.18 %)		 69,503
(97.82 %)		 4,683,625
(34.38 %)		 799,659
(1.95 %)		 14,322,765
(32.58 %)		 34,127
(0.91 %)
394 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 43,878
(1.99 %)		 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
395 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,184
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 487
(100.00 %)		 5,424,579
(25.40 %)		 1,269,774
(2.59 %)		 21,430,550
(42.69 %)		 28,121
(0.66 %)
396 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1		 15,990
(2.25 %)		 11,775
(1.55 %)		 23,935
(1.90 %)		 n/a 41.36
(99.67 %)		 48,553
(0.34 %)		 107,160
(99.66 %)		 384,032
(4.45 %)		 182,309
(1.03 %)		 6,529,534
(19.24 %)		 15,660
(0.55 %)
397 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1		 41,168
(9.96 %)		 15,861
(2.76 %)		 30,671
(6.00 %)		 n/a 40.75
(97.79 %)		 33,664
(2.20 %)		 99,598
(100.00 %)		 614,513
(4.16 %)		 522,349
(4.83 %)		 4,650,538
(24.98 %)		 18,054
(0.96 %)
398 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
399 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
400 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2		 n/a 18,599
(1.58 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,769
(92.59 %)		 5,118,783
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,620
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
401 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1		 44,813
(12.05 %)		 15,028
(3.35 %)		 21,782
(6.89 %)		 36,982
(11.22 %)		 40.66
(97.63 %)		 235
(2.37 %)		 126
(100.00 %)		 348,517
(2.87 %)		 157,776
(2.00 %)		 3,182,742
(23.42 %)		 12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 401

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 200 assemblies assembly stats track stats
Mammals 481 assemblies assembly stats track stats
Birds 299 assemblies assembly stats track stats
Fishes 336 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 167 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 628 assemblies assembly stats track stats
Plants 249 assemblies assembly stats track stats
Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 264 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 73 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 400 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 651 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats