Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(3.82 %)
23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1
n/a 5,478
(2.34 %)
30,482
(13.88 %)
n/a 44.27
(95.26 %)
8,735
(4.75 %)
8,115
(99.79 %)
241,805
(14.48 %)
72,702
(2.39 %)
1,434,880
(21.28 %)
25,507
(8.25 %)
6 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
7 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
23,832
(3.81 %)
8 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
9 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
10 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
11 American alligator (scaffold assembly 2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
50,852
(2.67 %)
12 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
49,792
(2.45 %)
13 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
14 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
15 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
16 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
44,261
(5.21 %)
17 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
50,987
(4.44 %)
18 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
19 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
20 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
18,108
(3.49 %)
21 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
17,048
(6.08 %)
22 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
23,814
(3.66 %)
23 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2
n/a 426
(3.03 %)
203
(12.39 %)
n/a 32.03
(100.00 %)
10
(0.00 %)
50
(100.00 %)
3,358
(1.88 %)
1,257
(0.81 %)
67,711
(20.74 %)
4
(0.02 %)
24 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1
n/a 326
(0.37 %)
1,632
(4.94 %)
n/a 51.33
(98.72 %)
8,063
(1.32 %)
12,727
(98.68 %)
127,265
(17.42 %)
148,397
(16.77 %)
326,694
(37.33 %)
12,417
(22.22 %)
25 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
25,871
(1.75 %)
26 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
27 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
28 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,279
(7.94 %)
4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
39,696
(5.22 %)
29 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
39,511
(5.22 %)
30 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1
22,417
(13.18 %)
5,290
(2.15 %)
13,925
(7.00 %)
n/a 33.81
(97.56 %)
5,205
(2.44 %)
10,777
(97.56 %)
122,491
(2.29 %)
27,169
(0.71 %)
2,130,840
(38.92 %)
11,899
(2.85 %)
31 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2
n/a 10,893
(0.53 %)
128,502
(8.33 %)
n/a 40.42
(100.00 %)
n/a 2,434
(100.00 %)
605,350
(2.88 %)
921,761
(7.40 %)
11,169,474
(57.07 %)
220,674
(10.38 %)
32 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1
n/a 10,347
(0.43 %)
138,311
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,196
(100.00 %)
691,302
(2.69 %)
1,084,185
(7.47 %)
12,619,495
(57.66 %)
250,421
(10.15 %)
33 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1
49,254
(2.57 %)
10,500
(0.44 %)
138,307
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,197
(100.00 %)
6,821,491
(69.74 %)
1,084,205
(7.47 %)
12,619,646
(57.66 %)
250,420
(10.13 %)
34 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
39,691
(1.17 %)
35 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
2,846
(42.44 %)
36 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2
n/a 1,524
(3.90 %)
5,275
(23.90 %)
n/a 50.30
(99.43 %)
158
(0.58 %)
249
(99.42 %)
5,218
(3.22 %)
2,452
(0.41 %)
51,693
(4.64 %)
1,128
(90.37 %)
37 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,608
(51.05 %)
1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
5,568
(53.86 %)
38 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
805
(44.28 %)
39 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
8,002
(10.69 %)
40 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2
n/a 1,518
(1.57 %)
5,702
(9.73 %)
n/a 35.75
(98.67 %)
1,691
(1.34 %)
1,794
(98.66 %)
42,930
(2.67 %)
27,826
(1.78 %)
328,698
(50.87 %)
7,943
(9.35 %)
41 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1
n/a 1,479
(4.26 %)
5,283
(25.22 %)
n/a 46.59
(100.00 %)
33
(0.00 %)
88
(100.00 %)
10,463
(5.97 %)
5,206
(0.91 %)
74,027
(11.89 %)
4,784
(34.49 %)
42 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2
n/a 1,503
(2.37 %)
11,741
(30.20 %)
n/a 47.63
(98.55 %)
377
(1.46 %)
545
(98.54 %)
8,453
(2.23 %)
3,560
(0.37 %)
129,150
(7.65 %)
14,398
(29.11 %)
43 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1
n/a 1,446
(3.95 %)
5,635
(25.84 %)
n/a 50.12
(92.42 %)
2,066
(7.59 %)
3,579
(92.41 %)
11,499
(5.71 %)
11,754
(2.10 %)
87,648
(13.51 %)
4,483
(54.70 %)
44 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2
n/a 1,461
(4.51 %)
5,599
(29.85 %)
n/a 48.91
(95.53 %)
516
(4.48 %)
562
(95.52 %)
3,575
(0.59 %)
2,210
(0.38 %)
66,810
(6.03 %)
7,344
(38.10 %)
45 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1
n/a 1,482
(2.32 %)
7,302
(20.85 %)
n/a 47.48
(99.41 %)
1,281
(0.60 %)
108
(100.00 %)
24,268
(1.88 %)
11,049
(1.23 %)
163,225
(20.20 %)
764
(17.56 %)
46 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1
n/a 1,550
(3.72 %)
7,756
(30.06 %)
n/a 48.96
(99.94 %)
775
(0.06 %)
49
(100.00 %)
5,678
(0.78 %)
4,560
(0.81 %)
73,645
(5.86 %)
7,807
(50.55 %)
47 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1
n/a 1,499
(4.04 %)
3,608
(17.47 %)
n/a 50.55
(99.99 %)
76
(0.00 %)
938
(100.00 %)
12,877
(1.80 %)
4,459
(0.56 %)
116,737
(10.53 %)
2,561
(81.62 %)
48 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
1,770
(49.40 %)
49 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
22
(99.61 %)
50 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1
n/a 1,532
(4.18 %)
7,679
(34.14 %)
n/a 46.67
(99.38 %)
137
(0.62 %)
589
(99.38 %)
6,404
(1.04 %)
2,594
(0.58 %)
61,594
(6.70 %)
5,746
(15.84 %)
51 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
27
(96.31 %)
52 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
53 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
54 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
55 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
56 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
105,821
(2.42 %)
57 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
58 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
59 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
60 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
61 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
62 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
63 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
64 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
65 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
16,276
(1.04 %)
66 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
5,244
(15.19 %)
67 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1
n/a 1,050
(2.04 %)
3,917
(10.89 %)
n/a 51.64
(100.00 %)
33
(0.00 %)
68
(100.00 %)
n/a 3,805
(0.81 %)
107,373
(7.81 %)
81
(99.54 %)
68 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1
n/a 957
(3.66 %)
3,784
(19.12 %)
n/a 48.54
(99.99 %)
85
(0.01 %)
99
(99.99 %)
4,944
(5.25 %)
1,808
(0.52 %)
68,717
(8.41 %)
5,128
(28.73 %)
69 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3
n/a 918
(2.66 %)
4,907
(18.38 %)
n/a 47.29
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
7,245
(1.32 %)
2,141
(0.47 %)
97,927
(9.78 %)
4,995
(11.17 %)
70 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1
9,187
(54.88 %)
867
(2.56 %)
4,441
(17.03 %)
n/a 47.25
(99.94 %)
30
(0.06 %)
42
(99.94 %)
7,231
(1.31 %)
1,919
(0.32 %)
110,288
(10.48 %)
4,972
(10.95 %)
71 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2
n/a 921
(4.16 %)
4,119
(24.79 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
2,424
(0.66 %)
1,011
(0.30 %)
56,356
(7.99 %)
1,869
(7.30 %)
72 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1
8,645
(55.47 %)
908
(2.72 %)
4,862
(19.87 %)
n/a 48.38
(99.98 %)
56
(0.02 %)
69
(99.98 %)
7,816
(1.43 %)
2,425
(0.42 %)
85,868
(7.91 %)
3,698
(15.12 %)
73 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3
n/a 910
(2.69 %)
4,861
(19.78 %)
n/a 48.39
(100.00 %)
n/a 11
(100.00 %)
7,778
(1.42 %)
2,452
(0.43 %)
86,630
(7.97 %)
3,644
(14.24 %)
74 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1
8,472
(55.96 %)
884
(2.79 %)
5,418
(21.48 %)
n/a 44.88
(99.73 %)
43
(0.27 %)
105
(99.73 %)
6,509
(1.21 %)
1,529
(0.25 %)
101,733
(9.98 %)
2,326
(4.59 %)
75 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4
n/a 886
(2.74 %)
5,392
(21.25 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
n/a 4
(100.00 %)
6,585
(1.21 %)
1,546
(0.27 %)
104,495
(10.38 %)
2,335
(5.10 %)
76 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1
7,454
(55.86 %)
893
(2.94 %)
3,348
(15.13 %)
n/a 49.82
(99.99 %)
11
(0.01 %)
132
(100.00 %)
5,510
(1.13 %)
1,598
(0.33 %)
81,983
(9.00 %)
512
(39.06 %)
77 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1
4,286
(69.39 %)
1,060
(8.79 %)
2,585
(44.95 %)
n/a 52.06
(100.00 %)
22
(0.00 %)
89
(100.00 %)
1,777
(0.93 %)
720
(0.48 %)
22,182
(4.73 %)
124
(60.74 %)
78 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
38
(40.33 %)
79 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
10,942
(2.61 %)
80 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
40,540
(3.99 %)
81 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
82 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
59,279
(1.53 %)
83 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
84 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
85 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
86 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1
n/a 3,432
(0.19 %)
108,471
(5.13 %)
n/a 45.22
(78.65 %)
201,145
(21.35 %)
570,637
(78.65 %)
656,957
(3.38 %)
365,918
(1.61 %)
8,574,437
(27.02 %)
345,141
(14.15 %)
87 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap genbank 2021)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
88 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
89 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
90 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
91 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,923
(2.41 %)
3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
178,205
(3.43 %)
92 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1
n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
93 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
94 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1
42,229
(5.95 %)
3,558
(0.29 %)
24,115
(2.96 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,921
(1.91 %)
408,322
(98.09 %)
629,362
(4.20 %)
749,383
(9.40 %)
6,932,184
(43.02 %)
16,970
(0.64 %)
95 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2
n/a 3,378
(0.29 %)
23,684
(2.94 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,903
(1.91 %)
406,924
(98.09 %)
587,583
(3.57 %)
749,212
(9.41 %)
6,921,847
(43.04 %)
16,561
(0.63 %)
96 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
67,189
(1.73 %)
97 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
98 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
99 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
100 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
37,273
(1.03 %)
101 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023)
GCA_028885525.1
n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
42,467
(1.24 %)
102 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
52,294
(2.02 %)
103 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
63,992
(1.47 %)
104 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
89,940
(1.88 %)
105 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
46,291
(1.18 %)
106 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
107 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
108 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
68,113
(2.27 %)
109 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
13,204
(0.97 %)
110 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
111 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
39,697
(1.55 %)
112 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1
36,949
(4.89 %)
4,427
(0.37 %)
22,417
(3.57 %)
37,573
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,094
(100.00 %)
597,178
(3.69 %)
564,092
(6.64 %)
6,601,918
(47.49 %)
39,697
(1.55 %)
113 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1
n/a 1,948
(12.61 %)
4,664
(59.90 %)
n/a 45.12
(98.69 %)
689
(1.33 %)
99
(100.00 %)
3,478
(1.23 %)
2,281
(0.83 %)
48,703
(8.19 %)
1,579
(6.36 %)
114 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1
n/a 2,030
(12.92 %)
4,702
(58.30 %)
n/a 45.32
(100.00 %)
3
(0.00 %)
20
(100.00 %)
3,464
(2.27 %)
2,436
(0.80 %)
28,524
(6.96 %)
1,757
(7.37 %)
115 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1
n/a 1,956
(12.86 %)
4,335
(54.85 %)
n/a 44.50
(99.71 %)
79
(0.29 %)
88
(99.71 %)
2,272
(1.18 %)
4,036
(1.77 %)
48,188
(8.66 %)
1,474
(15.82 %)
116 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1
4,892
(62.35 %)
1,845
(11.42 %)
4,476
(56.70 %)
n/a 37.84
(99.95 %)
167
(0.05 %)
148
(100.00 %)
14,118
(4.93 %)
19,713
(8.99 %)
82,014
(21.64 %)
201
(0.52 %)
117 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1
n/a 3,349
(28.79 %)
4,665
(66.28 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
n/a 9
(100.00 %)
7,406
(3.43 %)
3,781
(1.46 %)
51,732
(11.80 %)
742
(4.91 %)
118 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1
n/a 1,905
(9.82 %)
5,004
(52.37 %)
n/a 36.94
(99.45 %)
117
(0.56 %)
145
(99.44 %)
30,880
(10.91 %)
18,155
(4.10 %)
100,210
(23.18 %)
22
(0.04 %)
119 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2
n/a 3,553
(27.93 %)
4,799
(61.37 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
3
(0.00 %)
16
(100.00 %)
3,047
(1.32 %)
2,546
(1.58 %)
59,567
(11.20 %)
635
(3.11 %)
120 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1
n/a 1,755
(6.59 %)
4,802
(37.76 %)
n/a 49.05
(99.99 %)
28
(0.01 %)
34
(99.99 %)
7,553
(2.98 %)
9,578
(2.12 %)
81,595
(9.59 %)
6,216
(33.42 %)
121 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
122 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
43,150
(4.96 %)
123 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
11,070
(2.07 %)
124 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
6,783
(2.24 %)
125 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
126 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
127 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
51,989
(1.50 %)
128 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1
26,135
(1.83 %)
3,125
(0.12 %)
17,875
(1.29 %)
27,144
(1.85 %)
36.03
(84.95 %)
548,450
(15.13 %)
700,124
(84.87 %)
3,498,348
(13.19 %)
3,005,729
(6.50 %)
13,687,022
(41.09 %)
22,984
(0.34 %)
129 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,822
(2.52 %)
130 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
131 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
16,621
(0.21 %)
132 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
11,477
(0.36 %)
133 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
134 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
135 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
136 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,293
(2.98 %)
19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
44,208
(1.24 %)
137 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
173,264
(3.70 %)
138 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
139 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
31,438
(1.87 %)
140 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
32,840
(1.87 %)
141 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
142 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
12,486
(0.42 %)
143 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
144 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023)
GCA_028858805.1
n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
47,662
(1.21 %)
145 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
61,901
(2.29 %)
146 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
147 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
148 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
62,726
(1.40 %)
149 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
150 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
8,105
(0.24 %)
151 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1
8,677
(50.60 %)
1,251
(4.00 %)
7,681
(34.45 %)
n/a 39.25
(99.25 %)
383
(0.76 %)
510
(99.24 %)
2,585
(1.13 %)
3,424
(1.20 %)
81,225
(12.02 %)
161
(0.21 %)
152 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1
n/a 1,065
(1.03 %)
1,781
(1.87 %)
n/a 31.32
(99.93 %)
1,347
(0.00 %)
23,709
(100.00 %)
29,228
(1.96 %)
22,291
(1.48 %)
550,667
(25.14 %)
20
(0.01 %)
153 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
10,698
(0.86 %)
154 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
155 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,746
(13.53 %)
15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
156 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
67,831
(2.45 %)
157 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
15,663
(2.98 %)
158 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
72,061
(1.46 %)
159 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
160 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
161 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
162 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
163 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
164 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
165 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
166 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
11,998
(0.33 %)
167 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
33,411
(1.94 %)
168 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
169 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
170 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
70,700
(2.48 %)
171 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
172 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,034
(3.23 %)
18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
173 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
174 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
175 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
990,274
(4.84 %)
176 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
15,851
(2.18 %)
177 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
178 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
179 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
180 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
181 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,902
(28.68 %)
3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
6,559
(5.05 %)
182 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
8,375
(4.98 %)
183 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2
30,025
(5.21 %)
3,968
(0.39 %)
56,084
(8.02 %)
32,834
(5.48 %)
52.34
(98.93 %)
10,786
(1.08 %)
1,254
(100.00 %)
361,409
(3.23 %)
533,046
(8.92 %)
3,456,307
(19.29 %)
6,722
(54.88 %)
184 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
185 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
64,921
(2.50 %)
186 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
187 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
188 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
110,838
(2.71 %)
189 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1
6,502
(71.82 %)
251
(1.29 %)
2,079
(62.62 %)
n/a 49.25
(99.82 %)
242
(0.19 %)
306
(99.81 %)
697
(1.34 %)
335
(0.65 %)
20,634
(5.24 %)
2,275
(23.86 %)
190 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
191 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,376
(1.90 %)
192 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
193 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
44,022
(10.06 %)
194 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
732,828
(17.24 %)
195 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
196 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
197 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
1
(99.99 %)
198 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
199 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
200 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,615
(9.59 %)
15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
201 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
202 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
53,604
(6.69 %)
203 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
204 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
205 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
41,682
(1.08 %)
206 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
117,743
(2.02 %)
207 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
208 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
209 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
210 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
211 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
212 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
130,345
(8.19 %)
213 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
67,133
(2.54 %)
214 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
24,620
(4.88 %)
215 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
47,051
(4.45 %)
216 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
217 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
218 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,729
(2.65 %)
219 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
220 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
30,753
(4.27 %)
221 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
30,753
(4.27 %)
222 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
365,066
(1.20 %)
223 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1
6,744
(82.69 %)
5,085
(73.29 %)
3,403
(39.29 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4
(100.00 %)
3,336
(2.63 %)
1,034
(0.58 %)
80,458
(16.22 %)
105
(0.31 %)
224 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3
n/a 5,084
(73.46 %)
3,394
(39.28 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
6
(0.00 %)
9
(100.00 %)
3,053
(1.03 %)
1,034
(0.58 %)
79,714
(16.06 %)
105
(0.31 %)
225 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2
8,934
(5.16 %)
1,548
(0.29 %)
4,070
(2.36 %)
8,934
(5.16 %)
34.53
(99.76 %)
15,128
(0.26 %)
666
(100.00 %)
124,259
(1.58 %)
35,312
(1.17 %)
2,638,150
(34.10 %)
3,957
(0.38 %)
226 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
227 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
228 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
18,849
(8.62 %)
229 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
27,794
(16.15 %)
230 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
30,130
(16.11 %)
231 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
27,493
(12.03 %)
232 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
27,530
(17.02 %)
233 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
234 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
235 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
236 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
237 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,465
(1.34 %)
238 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
59,340
(1.50 %)
239 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
240 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
59,945
(1.50 %)
241 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,027
(10.96 %)
15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
242 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
30,200
(4.54 %)
243 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
244 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
n/a 19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
245 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
246 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
247 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
37,343
(3.12 %)
248 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
n/a 18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
249 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
250 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1
n/a 2,982
(0.90 %)
5,710
(2.77 %)
n/a 27.24
(97.73 %)
41,970
(2.29 %)
8,544
(100.00 %)
195,538
(3.32 %)
65,664
(2.79 %)
2,529,566
(54.06 %)
4,357
(1.18 %)
251 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
252 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
253 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
254 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
255 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,937
(3.26 %)
18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
256 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
32,047
(1.05 %)
257 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
258 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
259 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
260 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,340
(13.40 %)
261 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1
n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
262 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
11,043
(1.07 %)
263 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
264 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
776
(95.90 %)
265 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
106
(99.48 %)
266 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
267 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(2.57 %)
14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
268 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
269 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
80,965
(1.65 %)
270 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
271 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
46,108
(3.49 %)
272 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
33,412
(1.67 %)
41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
273 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
n/a 19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
50,379
(1.45 %)
274 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
275 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
276 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1
35,654
(12.86 %)
2,741
(0.61 %)
28,868
(8.05 %)
n/a 40.92
(99.93 %)
3,073
(0.07 %)
1,426
(100.00 %)
117,879
(1.26 %)
43,685
(1.30 %)
1,858,762
(15.09 %)
31,400
(5.04 %)
277 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
278 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
279 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
280 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
281 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1
n/a 7,825
(1.36 %)
12,819
(3.07 %)
n/a 35.11
(92.22 %)
102,610
(7.82 %)
104,053
(92.18 %)
415,874
(2.30 %)
376,409
(8.80 %)
4,931,104
(52.61 %)
7,139
(0.35 %)
282 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
283 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
284 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
285 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
286 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
287 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
288 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
289 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,667
(4.49 %)
24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
290 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
291 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
292 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
293 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39
172,809
(4.43 %)
23,121
(1.97 %)
27,697
(1.78 %)
n/a 41.04
(95.07 %)
1,268
(4.93 %)
46,029
(95.07 %)
5,859,855
(52.78 %)
1,037,733
(4.60 %)
16,933,424
(36.88 %)
56,646
(1.06 %)
294 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
57,427
(1.07 %)
295 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
53,511
(1.32 %)
296 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
52,546
(1.35 %)
297 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
53,581
(1.32 %)
298 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
52,653
(1.34 %)
299 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
300 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
52,408
(1.38 %)
301 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
302 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,746
(2.60 %)
18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
47,552
(2.89 %)
303 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,930
(1.47 %)
304 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
305 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1
28,377
(14.36 %)
4,799
(1.56 %)
15,737
(7.20 %)
n/a 35.38
(100.00 %)
26
(0.00 %)
46
(100.00 %)
136,242
(3.33 %)
48,275
(1.61 %)
2,518,372
(36.69 %)
14,106
(2.86 %)
306 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
307 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
308 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
6,204
(9.08 %)
309 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
22,279
(1.75 %)
310 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
311 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,723
(2.15 %)
17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
312 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
313 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
314 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
315 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
8,442
(2.49 %)
316 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
138,732
(1.75 %)
317 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
318 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
35,505
(1.37 %)
319 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
25,155
(1.42 %)
320 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
92
(99.40 %)
321 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
41
(99.80 %)
322 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1
n/a 619
(1.14 %)
3,882
(44.58 %)
n/a 59.85
(100.00 %)
5
(0.00 %)
42
(100.00 %)
20,726
(2.91 %)
2,267
(2.64 %)
232,973
(20.45 %)
44
(99.29 %)
323 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1
n/a 643
(1.12 %)
4,666
(45.26 %)
n/a 59.72
(99.99 %)
11
(0.00 %)
98
(100.00 %)
22,632
(2.47 %)
4,241
(2.74 %)
231,120
(20.18 %)
100
(99.82 %)
324 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
325 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
326 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
327 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
328 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1
n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
329 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
330 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
331 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
117,703
(2.02 %)
332 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,255
(11.91 %)
14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
333 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
53,323
(5.09 %)
334 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
335 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3
n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)
n/a 16
(100.00 %)
79,857
(19.18 %)
78,154
(15.50 %)
186,960
(66.90 %)
22
(0.04 %)
336 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
337 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
338 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
339 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
24,873
(3.15 %)
340 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
341 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
342 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
15,259
(2.01 %)
343 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1
n/a 238
(3.03 %)
394
(8.09 %)
n/a 33.70
(99.89 %)
437
(0.04 %)
1,743
(99.97 %)
1,511
(2.99 %)
268
(0.36 %)
31,900
(26.59 %)
373
(7.62 %)
344 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1
1,996
(85.79 %)
1,569
(68.26 %)
596
(33.73 %)
n/a 47.31
(99.97 %)
4
(0.03 %)
15
(99.97 %)
257
(0.70 %)
199
(0.40 %)
10,819
(8.68 %)
126
(3.52 %)
345 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1
n/a 348
(2.68 %)
284
(3.31 %)
n/a 25.26
(99.86 %)
n/a 5,465
(100.00 %)
3,179
(1.99 %)
1,572
(1.39 %)
85,189
(41.34 %)
4
(0.02 %)
346 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
347 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
348 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
31,479
(5.12 %)
349 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
350 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
351 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1
n/a 4,930
(0.75 %)
38,413
(8.53 %)
35,924
(4.55 %)
38.08
(99.99 %)
150
(0.01 %)
112
(100.00 %)
261,421
(1.99 %)
175,466
(5.62 %)
3,107,482
(46.30 %)
58,547
(5.75 %)
352 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
34,396
(3.66 %)
353 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
13,926
(1.48 %)
354 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
31,271
(3.60 %)
355 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,670
(3.87 %)
356 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
357 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
358 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
359 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
4,887
(1.65 %)
360 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
361 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
362 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
363 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
93,862
(1.92 %)
364 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
365 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
63,009
(9.78 %)
366 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
367 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
368 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
n/a 21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
369 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
370 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
371 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1
n/a 1,945
(0.08 %)
23,579
(1.88 %)
n/a 36.81
(99.60 %)
16,132
(0.41 %)
16,156
(99.59 %)
2,706,474
(10.11 %)
2,525,264
(12.75 %)
9,704,257
(48.31 %)
77,313
(3.01 %)
372 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
13,547
(2.72 %)
373 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,081
(4.30 %)
374 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
16,332
(2.13 %)
375 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
376 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
377 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
378 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
94,468
(9.28 %)
379 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,829
(7.91 %)
380 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
381 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
382 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
383 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
61,057
(1.17 %)
384 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
385 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
386 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
387 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
53,329
(1.37 %)
388 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
389 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
113,370
(2.46 %)
390 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
391 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
23,381
(2.80 %)
392 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
10,747
(2.25 %)
393 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
30,183
(1.07 %)
394 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
18,873
(0.62 %)
395 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
10,712
(6.90 %)
396 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
38,306
(3.37 %)
397 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
88,254
(1.06 %)
398 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
399 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
400 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
401 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
402 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
403 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,772
(6.02 %)
27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
404 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
405 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1
n/a 4,332
(0.82 %)
15,532
(3.91 %)
n/a 30.24
(99.98 %)
240
(0.02 %)
67
(100.00 %)
481,097
(4.72 %)
135,266
(7.01 %)
4,093,473
(52.65 %)
12,709
(2.68 %)
406 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
407 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
408 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
409 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
410 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
647
(0.04 %)
411 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
412 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
652,708
(8.36 %)
413 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
1
(0.73 %)
414 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
2,099
(0.38 %)
415 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
416 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
3,489
(0.51 %)
417 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
95,573
(1.75 %)
418 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2
105,360
(44.53 %)
20,433
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
1
(0.03 %)
26
(100.00 %)
5,354,441
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,483
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
419 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
420 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
421 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
422 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
423 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
80,124
(1.26 %)
424 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
39,326
(0.65 %)
425 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
38,257
(0.77 %)
426 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
39,994
(0.70 %)
427 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
456,658
(8.18 %)
428 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
429 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
430 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
60,636
(4.05 %)
431 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
64,215
(1.55 %)
432 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
433 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1
n/a 3,698
(0.12 %)
117,910
(5.00 %)
35,315
(1.88 %)
45.79
(99.99 %)
1,576
(0.01 %)
7,048
(100.00 %)
770,997
(2.03 %)
680,149
(3.55 %)
10,994,272
(39.37 %)
304,620
(17.03 %)
434 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
435 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1
n/a 5,905
(1.14 %)
41,195
(8.84 %)
n/a 37.42
(93.28 %)
45,500
(6.75 %)
48,671
(93.25 %)
738,398
(35.22 %)
171,041
(5.71 %)
3,037,349
(50.41 %)
65,784
(9.49 %)
436 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
437 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
438 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
439 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
35,897
(1.56 %)
440 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
441 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
442 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.52 %)
443 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
668
(0.62 %)
444 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1
n/a 7,737
(1.16 %)
11,972
(2.65 %)
n/a 38.85
(84.55 %)
129,113
(15.50 %)
125,702
(84.50 %)
310,342
(1.75 %)
391,619
(8.42 %)
5,616,633
(48.71 %)
38,246
(1.55 %)
445 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
60,475
(1.95 %)
446 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
447 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
6,012
(0.58 %)
448 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
449 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
450 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
55,799
(2.08 %)
451 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
452 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
453 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
454 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
455 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
54,010
(40.19 %)
26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
4,599
(1.63 %)
456 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
457 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
458 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
459 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1
36,084
(1.94 %)
4,032
(0.13 %)
128,567
(5.82 %)
43,960
(2.05 %)
46.91
(99.95 %)
13,519
(0.05 %)
1,665
(100.00 %)
1,116,542
(2.95 %)
642,860
(3.16 %)
10,429,455
(39.18 %)
37,849
(2.30 %)
460 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
15,823
(5.51 %)
461 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
61,685
(7.72 %)
462 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
463 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
27,070
(2.09 %)
464 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2
n/a 576
(1.36 %)
2,999
(35.93 %)
n/a 45.94
(99.65 %)
6,447
(0.44 %)
2,026
(100.00 %)
16,807
(2.60 %)
3,925
(0.79 %)
141,656
(16.64 %)
4,877
(34.82 %)
465 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1
n/a 742
(1.83 %)
848
(40.20 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
n/a 64
(100.00 %)
39,141
(7.68 %)
14,366
(6.71 %)
131,898
(25.19 %)
4,119
(14.82 %)
466 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
3,487
(0.58 %)
467 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
602,912
(6.66 %)
468 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
63,965
(1.04 %)
469 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
470 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
71,078
(1.08 %)
471 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
71,046
(1.10 %)
472 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
473 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
474 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
475 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1
34,675
(2.01 %)
3,329
(0.10 %)
24,015
(1.20 %)
n/a 33.26
(100.00 %)
7
(0.00 %)
16,531
(100.00 %)
1,258,301
(2.08 %)
828,332
(2.42 %)
17,994,342
(48.98 %)
63,015
(0.95 %)
476 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
16,346
(4.08 %)
477 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
478 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
479 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
480 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
481 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
482 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2
24,277
(14.78 %)
4,066
(1.46 %)
26,743
(11.40 %)
n/a 51.10
(94.72 %)
60,375
(5.31 %)
34,226
(94.71 %)
275,482
(4.88 %)
167,812
(3.67 %)
1,832,537
(24.44 %)
26,406
(36.85 %)
483 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
484 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
76,432
(1.35 %)
485 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
486 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
103,899
(1.75 %)
487 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
2,003
(54.71 %)
488 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
489 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
7,519
(2.78 %)
490 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
491 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
492 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
22,185
(2.62 %)
493 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
494 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
495 white-tufted-ear marmoset (v1.0 paternal 2020)
GCA_011100535.1
n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
35,222
(0.94 %)
496 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
37,603
(0.93 %)
497 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
498 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
499 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
500 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
501 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
502 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
503 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
14,802
(3.20 %)
504 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
505 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
506 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
36,919
(1.02 %)
507 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
508 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
509 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,063
(1.65 %)
19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
510 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
59,052
(1.48 %)
511 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
512 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
513 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1
n/a 8,814
(0.51 %)
152,909
(17.36 %)
n/a 38.16
(100.00 %)
229
(0.00 %)
6,534
(100.00 %)
2,912,289
(46.74 %)
533,475
(4.34 %)
10,210,670
(53.65 %)
132,732
(6.12 %)
514 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
28,121
(0.66 %)
515 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
15,660
(0.55 %)
516 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,168
(9.96 %)
15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
18,054
(0.96 %)
517 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1
n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
518 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
519 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
520 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
45,284
(1.67 %)
521 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
522 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
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(23.42 %)
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(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 522

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Primates 215 assemblies assembly stats track stats
Mammals 560 assemblies assembly stats track stats
Birds 377 assemblies assembly stats track stats
Fishes 401 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 239 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1042 assemblies assembly stats track stats
Plants 301 assemblies assembly stats track stats
Fungi 862 assemblies assembly stats track stats
Viruses 283 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 104 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 521 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 952 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 751 assemblies assembly stats track stats