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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.
count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | aardvark (BS58 2019 Broad) GCA_004365145.1 |
n/a | 22,095 (0.63 %) |
44,942 (0.68 %) |
n/a | 40.25 (99.86 %) |
15,429 (0.03 %) |
2,690,873 (99.97 %) |
8,755,250 (34.47 %) |
869,360 (1.26 %) |
22,002,517 (59.65 %) |
39,239 (0.49 %) |
2 | Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank) GCA_027172205.1 |
57,514 (54.61 %) |
14,340 (1.37 %) |
20,053 (2.31 %) |
n/a | 43.81 (100.00 %) |
30 (0.00 %) |
27 (100.00 %) |
832,937 (4.17 %) |
474,203 (4.04 %) |
7,020,288 (38.29 %) |
94,745 (2.70 %) |
3 | African clawed frog (2016) GCF_001663975.1 |
61,172 (3.82 %) |
23,424 (1.78 %) |
27,990 (2.23 %) |
n/a | 38.98 (88.63 %) |
216,028 (11.39 %) |
324,061 (88.61 %) |
1,726,079 (12.81 %) |
680,428 (2.28 %) |
13,887,586 (35.94 %) |
85,680 (0.94 %) |
4 | African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank) GCA_011762505.1 |
45,963 (36.56 %) |
20,933 (2.00 %) |
19,613 (1.43 %) |
37,929 (2.32 %) |
41.39 (99.19 %) |
1,624 (0.81 %) |
1,596 (100.00 %) |
4,940,083 (37.33 %) |
1,674,970 (5.40 %) |
13,613,540 (32.71 %) |
17,767 (0.51 %) |
5 | African malaria mosquito (PEST 2006) GCA_000005575.1 |
n/a | 5,478 (2.34 %) |
30,482 (13.88 %) |
n/a | 44.27 (95.26 %) |
8,735 (4.75 %) |
8,115 (99.79 %) |
241,805 (14.48 %) |
72,702 (2.39 %) |
1,434,880 (21.28 %) |
25,507 (8.25 %) |
6 | African savanna elephant (2009 genbank) GCA_000001905.1 |
46,043 (34.84 %) |
19,181 (1.25 %) |
19,665 (1.10 %) |
n/a | 40.76 (97.57 %) |
93,514 (2.45 %) |
95,866 (97.55 %) |
6,337,637 (57.82 %) |
365,796 (0.88 %) |
16,073,052 (44.89 %) |
33,513 (0.68 %) |
7 | alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018) GCF_003710045.1 |
27,736 (10.71 %) |
4,020 (1.34 %) |
42,185 (10.12 %) |
n/a | 40.41 (94.37 %) |
14,031 (5.59 %) |
95,883 (100.00 %) |
112,828 (2.21 %) |
95,886 (3.63 %) |
2,006,114 (27.47 %) |
23,832 (3.81 %) |
8 | alpaca (2015 BGI) GCA_000767525.1 |
n/a | 18,513 (1.97 %) |
19,112 (1.70 %) |
31,905 (1.94 %) |
41.46 (99.38 %) |
23,458 (0.62 %) |
75,733 (99.38 %) |
3,095,742 (36.41 %) |
314,508 (1.07 %) |
12,365,152 (25.46 %) |
53,956 (1.50 %) |
9 | alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.3 |
55,014 (3.56 %) |
18,437 (1.94 %) |
18,446 (1.63 %) |
n/a | 41.40 (95.85 %) |
166,280 (4.17 %) |
77,390 (100.00 %) |
3,150,224 (36.21 %) |
315,108 (1.36 %) |
12,461,739 (24.88 %) |
54,502 (1.38 %) |
10 | Alpine marmot (2015) GCF_001458135.1 |
35,350 (2.23 %) |
20,139 (1.58 %) |
18,286 (1.41 %) |
n/a | 39.80 (96.07 %) |
89,362 (3.94 %) |
14,543 (100.00 %) |
n/a | 747,129 (1.83 %) |
14,077,162 (30.27 %) |
30,224 (0.63 %) |
11 | American alligator (2023 genbank) GCA_030867065.1 |
n/a | 14,487 (0.97 %) |
20,444 (1.61 %) |
n/a | 45.04 (99.81 %) |
136 (0.19 %) |
806 (99.81 %) |
3,380,365 (43.12 %) |
560,127 (2.00 %) |
12,524,244 (32.47 %) |
50,852 (2.67 %) |
12 | American alligator (chrom assembly 2023 genbank) GCA_030867095.1 |
60,799 (51.66 %) |
14,382 (0.98 %) |
18,601 (1.45 %) |
n/a | 45.01 (99.30 %) |
161 (0.70 %) |
194 (100.00 %) |
3,322,619 (43.19 %) |
478,206 (1.77 %) |
12,316,391 (32.01 %) |
49,792 (2.45 %) |
13 | American beaver (US014 2019 Broad) GCA_004027675.1 |
n/a | 22,515 (1.25 %) |
34,527 (1.17 %) |
n/a | 39.58 (99.92 %) |
5,769 (0.02 %) |
837,916 (99.98 %) |
5,101,904 (34.46 %) |
552,100 (1.02 %) |
15,150,706 (34.57 %) |
24,558 (0.63 %) |
14 | American bison (2014 genbank) GCA_000754665.1 |
38,686 (33.79 %) |
20,215 (1.44 %) |
20,845 (1.20 %) |
n/a | 41.99 (93.39 %) |
341,984 (6.63 %) |
792,165 (93.37 %) |
6,006,931 (47.67 %) |
495,106 (1.11 %) |
13,902,115 (39.01 %) |
90,767 (1.29 %) |
15 | American pika 3.0 (2012 Broad genbank) GCA_000292845.1 |
26,240 (36.96 %) |
17,569 (1.60 %) |
20,092 (1.69 %) |
n/a | 43.35 (87.20 %) |
122,542 (12.82 %) |
132,961 (87.18 %) |
2,829,934 (29.80 %) |
414,895 (1.07 %) |
10,968,663 (26.71 %) |
44,651 (1.14 %) |
16 | amphioxus (hap2 2024 genbank) GCA_035083965.1 |
n/a | 5,217 (0.97 %) |
41,736 (12.73 %) |
n/a | 41.61 (100.00 %) |
103 (0.00 %) |
34 (100.00 %) |
128,505 (1.65 %) |
182,123 (8.03 %) |
2,157,899 (27.45 %) |
44,261 (5.21 %) |
17 | amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016) GCF_000764305.1 |
24,008 (8.48 %) |
3,331 (0.47 %) |
38,201 (8.97 %) |
24,453 (8.50 %) |
38.47 (99.52 %) |
23,726 (0.48 %) |
23,426 (99.52 %) |
161,274 (1.72 %) |
432,436 (8.89 %) |
3,517,080 (28.92 %) |
50,987 (4.44 %) |
18 | Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank) GCA_000464555.1 |
33,668 (37.51 %) |
18,213 (1.58 %) |
15,093 (1.29 %) |
n/a | 41.40 (97.59 %) |
155,553 (2.44 %) |
157,031 (97.56 %) |
4,832,679 (42.49 %) |
831,134 (1.67 %) |
13,654,373 (31.78 %) |
65,229 (1.60 %) |
19 | Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank) GCA_003957555.2 |
n/a | 12,258 (1.95 %) |
20,580 (2.26 %) |
n/a | 41.49 (98.48 %) |
429 (1.52 %) |
160 (100.00 %) |
535,315 (7.95 %) |
262,056 (1.51 %) |
6,092,351 (20.84 %) |
17,130 (1.48 %) |
20 | ant C.costatus (v1 MS0001 2016) GCF_001594065.1 |
16,082 (8.44 %) |
4,038 (1.42 %) |
32,856 (9.80 %) |
n/a | 34.73 (95.75 %) |
10,626 (4.26 %) |
26,005 (95.74 %) |
203,498 (3.41 %) |
100,483 (2.15 %) |
2,221,362 (35.19 %) |
18,108 (3.49 %) |
21 | ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019) GCF_005281655.1 |
28,261 (10.34 %) |
4,915 (1.27 %) |
40,257 (10.17 %) |
n/a | 35.18 (99.51 %) |
1,076 (0.49 %) |
2,869 (100.00 %) |
322,753 (4.92 %) |
245,412 (6.65 %) |
1,952,946 (43.11 %) |
17,048 (6.08 %) |
22 | ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI) GCF_001594075.1 |
22,023 (8.25 %) |
4,211 (1.25 %) |
37,113 (9.30 %) |
n/a | 35.01 (91.82 %) |
40,822 (8.21 %) |
60,583 (91.79 %) |
218,162 (3.24 %) |
139,385 (2.26 %) |
2,347,922 (34.62 %) |
23,814 (3.66 %) |
23 | apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank) GCA_004936735.2 |
n/a | 426 (3.03 %) |
203 (12.39 %) |
n/a | 32.03 (100.00 %) |
10 (0.00 %) |
50 (100.00 %) |
3,358 (1.88 %) |
1,257 (0.81 %) |
67,711 (20.74 %) |
4 (0.02 %) |
24 | apicomplexans E.tenella (Houghton 2013) GCA_000499545.1 |
n/a | 326 (0.37 %) |
1,632 (4.94 %) |
n/a | 51.33 (98.72 %) |
8,063 (1.32 %) |
12,727 (98.68 %) |
127,265 (17.42 %) |
148,397 (16.77 %) |
326,694 (37.33 %) |
12,417 (22.22 %) |
25 | apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank) GCA_002114115.1 |
n/a | 22,542 (3.52 %) |
67,060 (16.20 %) |
n/a | 38.04 (88.95 %) |
7,175 (11.05 %) |
806 (100.00 %) |
692,611 (50.80 %) |
322,540 (4.42 %) |
3,033,193 (35.58 %) |
25,871 (1.75 %) |
26 | Arabian camel (2014 genbank) GCA_000767585.1 |
n/a | 18,452 (1.96 %) |
16,975 (1.61 %) |
n/a | 41.29 (98.88 %) |
72,775 (1.13 %) |
105,347 (98.87 %) |
3,079,920 (34.79 %) |
319,928 (0.96 %) |
12,281,845 (25.28 %) |
48,638 (1.17 %) |
27 | Arctic fox (US066 2019 Broad) GCA_004023825.1 |
n/a | 22,910 (1.42 %) |
31,985 (1.20 %) |
35,342 (1.47 %) |
41.93 (99.87 %) |
9,604 (0.04 %) |
1,272,949 (99.96 %) |
6,096,013 (44.89 %) |
1,265,350 (2.67 %) |
14,617,986 (39.29 %) |
64,716 (1.93 %) |
28 | ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006) GCF_000149645.2 |
10,390 (48.16 %) |
1,538 (3.76 %) |
6,155 (25.19 %) |
n/a | 49.56 (99.97 %) |
90 (0.03 %) |
466 (99.97 %) |
5,026 (0.77 %) |
2,256 (0.38 %) |
68,790 (5.94 %) |
2,846 (42.44 %) |
29 | ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank) GCA_000149205.2 |
n/a | 1,524 (3.90 %) |
5,275 (23.90 %) |
n/a | 50.30 (99.43 %) |
158 (0.58 %) |
249 (99.42 %) |
5,218 (3.22 %) |
2,452 (0.41 %) |
51,693 (4.64 %) |
1,128 (90.37 %) |
30 | ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007) GCF_000002855.3 |
10,608 (51.05 %) |
1,481 (3.36 %) |
5,692 (22.11 %) |
n/a | 50.35 (99.87 %) |
662 (0.13 %) |
469 (99.87 %) |
9,986 (1.32 %) |
2,619 (0.36 %) |
106,480 (7.71 %) |
5,568 (53.86 %) |
31 | ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019) GCF_004011695.1 |
11,257 (41.02 %) |
1,596 (2.91 %) |
8,283 (26.43 %) |
n/a | 49.20 (100.00 %) |
n/a | 34 (100.00 %) |
14,775 (2.01 %) |
16,031 (2.34 %) |
103,256 (17.19 %) |
805 (44.28 %) |
32 | ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank) GCA_000003525.2 |
n/a | 1,516 (1.76 %) |
5,714 (11.07 %) |
n/a | 37.07 (99.50 %) |
566 (0.51 %) |
593 (99.49 %) |
38,696 (2.74 %) |
27,571 (2.05 %) |
270,617 (48.64 %) |
8,002 (10.69 %) |
33 | ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank) GCA_000003855.2 |
n/a | 1,518 (1.57 %) |
5,702 (9.73 %) |
n/a | 35.75 (98.67 %) |
1,691 (1.34 %) |
1,794 (98.66 %) |
42,930 (2.67 %) |
27,826 (1.78 %) |
328,698 (50.87 %) |
7,943 (9.35 %) |
34 | ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban) GCA_000151335.1 |
n/a | 1,479 (4.26 %) |
5,283 (25.22 %) |
n/a | 46.59 (100.00 %) |
33 (0.00 %) |
88 (100.00 %) |
10,463 (5.97 %) |
5,206 (0.91 %) |
74,027 (11.89 %) |
4,784 (34.49 %) |
35 | ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank) GCA_000271745.2 |
n/a | 1,503 (2.37 %) |
11,741 (30.20 %) |
n/a | 47.63 (98.55 %) |
377 (1.46 %) |
545 (98.54 %) |
8,453 (2.23 %) |
3,560 (0.37 %) |
129,150 (7.65 %) |
14,398 (29.11 %) |
36 | ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank) GCA_000184105.1 |
n/a | 1,446 (3.95 %) |
5,635 (25.84 %) |
n/a | 50.12 (92.42 %) |
2,066 (7.59 %) |
3,579 (92.41 %) |
11,499 (5.71 %) |
11,754 (2.10 %) |
87,648 (13.51 %) |
4,483 (54.70 %) |
37 | ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank) GCA_000315645.2 |
n/a | 1,461 (4.51 %) |
5,599 (29.85 %) |
n/a | 48.91 (95.53 %) |
516 (4.48 %) |
562 (95.52 %) |
3,575 (0.59 %) |
2,210 (0.38 %) |
66,810 (6.03 %) |
7,344 (38.10 %) |
38 | ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank) GCA_004337985.1 |
n/a | 1,482 (2.32 %) |
7,302 (20.85 %) |
n/a | 47.48 (99.41 %) |
1,281 (0.60 %) |
108 (100.00 %) |
24,268 (1.88 %) |
11,049 (1.23 %) |
163,225 (20.20 %) |
764 (17.56 %) |
39 | ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank) GCA_000226395.1 |
n/a | 1,550 (3.72 %) |
7,756 (30.06 %) |
n/a | 48.96 (99.94 %) |
775 (0.06 %) |
49 (100.00 %) |
5,678 (0.78 %) |
4,560 (0.81 %) |
73,645 (5.86 %) |
7,807 (50.55 %) |
40 | ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank) GCA_000968595.1 |
n/a | 1,499 (4.04 %) |
3,608 (17.47 %) |
n/a | 50.55 (99.99 %) |
76 (0.00 %) |
938 (100.00 %) |
12,877 (1.80 %) |
4,459 (0.56 %) |
116,737 (10.53 %) |
2,561 (81.62 %) |
41 | ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012) GCF_000182805.2 |
9,903 (39.44 %) |
1,311 (2.58 %) |
4,612 (17.66 %) |
n/a | 52.11 (99.64 %) |
978 (0.36 %) |
1,583 (100.00 %) |
16,540 (1.85 %) |
7,316 (0.76 %) |
171,684 (11.10 %) |
1,770 (49.40 %) |
42 | ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank) GCA_000961545.1 |
10,279 (51.22 %) |
1,134 (2.55 %) |
2,026 (10.60 %) |
n/a | 54.96 (100.00 %) |
57 (0.00 %) |
73 (100.00 %) |
15,846 (2.28 %) |
8,000 (0.94 %) |
169,678 (13.75 %) |
22 (99.61 %) |
43 | ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank) GCA_000001985.1 |
n/a | 1,532 (4.18 %) |
7,679 (34.14 %) |
n/a | 46.67 (99.38 %) |
137 (0.62 %) |
589 (99.38 %) |
6,404 (1.04 %) |
2,594 (0.58 %) |
61,594 (6.70 %) |
5,746 (15.84 %) |
44 | ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank) GCA_000219625.1 |
10,941 (44.32 %) |
1,451 (2.81 %) |
6,906 (25.36 %) |
n/a | 52.14 (99.98 %) |
3 (0.02 %) |
24 (99.98 %) |
8,941 (1.69 %) |
8,367 (1.51 %) |
99,818 (11.14 %) |
27 (96.31 %) |
45 | Asian corn borer (v1 ACB-3 2019) GCF_004193835.1 |
25,279 (7.94 %) |
4,931 (1.05 %) |
28,608 (7.16 %) |
n/a | 37.50 (100.00 %) |
34,722 (0.01 %) |
7,722 (100.00 %) |
146,974 (1.35 %) |
89,987 (2.68 %) |
2,666,250 (38.74 %) |
39,696 (5.22 %) |
46 | Asian corn borer (v2 ACB-3 2019) GCF_004193835.2 |
25,169 (7.95 %) |
4,867 (1.05 %) |
28,255 (7.08 %) |
n/a | 37.49 (100.00 %) |
34,702 (0.01 %) |
6,269 (100.00 %) |
150,783 (1.53 %) |
89,885 (2.69 %) |
2,627,296 (38.56 %) |
39,511 (5.22 %) |
47 | Asian swallowtail (v1 2015) GCF_000836235.1 |
22,417 (13.18 %) |
5,290 (2.15 %) |
13,925 (7.00 %) |
n/a | 33.81 (97.56 %) |
5,205 (2.44 %) |
10,777 (97.56 %) |
122,491 (2.29 %) |
27,169 (0.71 %) |
2,130,840 (38.92 %) |
11,899 (2.85 %) |
48 | Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank) GCA_001876365.2 |
n/a | 10,893 (0.53 %) |
128,502 (8.33 %) |
n/a | 40.42 (100.00 %) |
n/a | 2,434 (100.00 %) |
605,350 (2.88 %) |
921,761 (7.40 %) |
11,169,474 (57.07 %) |
220,674 (10.38 %) |
49 | Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank GCA_006496715.1 |
n/a | 10,347 (0.43 %) |
138,311 (7.69 %) |
n/a | 40.40 (99.93 %) |
3,359 (0.07 %) |
2,196 (100.00 %) |
691,302 (2.69 %) |
1,084,185 (7.47 %) |
12,619,495 (57.66 %) |
250,421 (10.15 %) |
50 | Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq) GCF_006496715.1 |
49,254 (2.57 %) |
10,500 (0.44 %) |
138,307 (7.69 %) |
n/a | 40.40 (99.93 %) |
3,359 (0.07 %) |
2,197 (100.00 %) |
6,821,491 (69.74 %) |
1,084,205 (7.47 %) |
12,619,646 (57.66 %) |
250,420 (10.13 %) |
51 | Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019) GCA_004024905.1 |
n/a | 20,854 (1.73 %) |
28,046 (1.39 %) |
n/a | 40.91 (99.96 %) |
4,333 (0.02 %) |
284,468 (99.98 %) |
3,802,671 (39.88 %) |
335,521 (0.73 %) |
15,053,564 (30.25 %) |
39,691 (1.17 %) |
52 | ass (Maral har 2015 genbank) GCA_001305755.1 |
48,976 (40.12 %) |
18,884 (1.76 %) |
19,296 (1.44 %) |
n/a | 41.28 (98.63 %) |
69,593 (1.38 %) |
2,166 (100.00 %) |
3,855,699 (41.69 %) |
289,735 (0.96 %) |
14,695,257 (28.58 %) |
40,025 (1.06 %) |
53 | Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank) GCA_009819705.1 |
52,117 (66.34 %) |
14,960 (3.20 %) |
45,365 (7.48 %) |
69,625 (10.94 %) |
42.21 (99.43 %) |
290 (0.57 %) |
57 (100.00 %) |
428,421 (4.16 %) |
256,153 (3.73 %) |
3,725,979 (24.13 %) |
31,325 (2.25 %) |
54 | Atlantic herring (v1) GCF_900700415.1 |
46,216 (9.88 %) |
15,249 (2.65 %) |
25,664 (6.68 %) |
n/a | 44.24 (99.88 %) |
1,963 (0.12 %) |
1,990 (99.88 %) |
1,175,759 (12.03 %) |
1,231,613 (13.39 %) |
3,511,276 (32.20 %) |
33,465 (1.97 %) |
55 | Atlantic salmon (genbank 2021) GCA_905237065.2 |
n/a | 28,077 (1.40 %) |
120,383 (3.99 %) |
183,727 (7.26 %) |
43.42 (100.00 %) |
211 (0.00 %) |
4,222 (100.00 %) |
4,501,521 (48.00 %) |
2,247,891 (25.01 %) |
10,731,814 (59.31 %) |
77,089 (1.86 %) |
56 | Atlantic stingray (hap1 2023 genbank) GCA_030144855.1 |
60,922 (45.62 %) |
12,545 (0.38 %) |
29,428 (1.34 %) |
n/a | 43.35 (99.99 %) |
1,648 (0.01 %) |
2,990 (100.00 %) |
8,579,105 (49.81 %) |
831,224 (15.75 %) |
21,718,213 (51.79 %) |
105,821 (2.42 %) |
57 | B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis) GCF_000002995.3 |
11,472 (14.88 %) |
2,843 (2.29 %) |
3,797 (4.95 %) |
n/a | 30.21 (92.98 %) |
58,744 (7.04 %) |
26,881 (93.03 %) |
147,614 (11.55 %) |
54,885 (7.91 %) |
647,155 (33.62 %) |
509 (0.15 %) |
58 | Bactrian camel (Alxa 2014 genbank) GCA_000767855.1 |
52,178 (47.52 %) |
18,330 (1.96 %) |
17,094 (1.64 %) |
n/a | 41.32 (99.32 %) |
31,980 (0.69 %) |
67,434 (99.31 %) |
3,072,373 (34.88 %) |
306,996 (0.95 %) |
12,209,895 (25.43 %) |
49,789 (1.25 %) |
59 | banded archerfish (primary hap 2021 genbank) GCA_017976425.1 |
42,399 (57.52 %) |
15,312 (3.18 %) |
41,147 (7.01 %) |
62,990 (9.37 %) |
41.11 (99.82 %) |
98 (0.18 %) |
96 (100.00 %) |
811,892 (18.19 %) |
271,913 (9.55 %) |
3,355,326 (28.08 %) |
15,089 (0.96 %) |
60 | barn owl (2020) GCF_902150015.1 |
37,361 (4.54 %) |
12,958 (1.72 %) |
22,922 (1.99 %) |
26,976 (3.04 %) |
41.55 (99.23 %) |
177,340 (0.79 %) |
21,504 (100.00 %) |
585,627 (5.48 %) |
367,764 (2.44 %) |
7,399,161 (19.58 %) |
47,061 (3.25 %) |
61 | barn owl BGI_N341 (2014) GCF_000687205.1 |
15,006 (2.07 %) |
11,133 (1.44 %) |
21,138 (1.69 %) |
n/a | 40.21 (99.24 %) |
109,223 (0.79 %) |
171,345 (99.21 %) |
413,761 (3.90 %) |
181,353 (0.91 %) |
6,776,326 (18.43 %) |
10,575 (0.29 %) |
62 | barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021) GCA_015227805.2 |
n/a | 12,385 (1.88 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
579,928 (6.20 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,546 (2.82 %) |
63 | barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq) GCF_015227805.1 |
43,374 (5.14 %) |
12,385 (1.88 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
579,928 (6.20 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,546 (2.82 %) |
64 | barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank) GCA_015227805.3 |
n/a | 12,395 (1.89 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
664,757 (13.92 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,548 (2.85 %) |
65 | barramundi perch (ASB-BC8 2016) GCF_001640805.1 |
50,205 (13.10 %) |
16,166 (3.05 %) |
25,084 (6.20 %) |
n/a | 40.75 (100.00 %) |
110 (0.00 %) |
3,808 (100.00 %) |
465,997 (3.11 %) |
237,955 (4.36 %) |
4,027,027 (23.91 %) |
16,276 (1.04 %) |
66 | basidiomycetes A.bisporus (H97 2012) GCF_000300575.1 |
10,448 (49.20 %) |
1,066 (2.53 %) |
5,238 (16.95 %) |
n/a | 46.48 (99.32 %) |
225 (0.68 %) |
254 (99.32 %) |
4,921 (0.90 %) |
2,352 (0.47 %) |
62,603 (9.90 %) |
5,244 (15.19 %) |
67 | basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank) GCA_000182895.1 |
n/a | 1,050 (2.04 %) |
3,917 (10.89 %) |
n/a | 51.64 (100.00 %) |
33 (0.00 %) |
68 (100.00 %) |
n/a | 3,805 (0.81 %) |
107,373 (7.81 %) |
81 (99.54 %) |
68 | basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank) GCA_001720195.2 |
n/a | 921 (4.16 %) |
4,119 (24.79 %) |
n/a | 44.80 (100.00 %) |
n/a | 8 (100.00 %) |
2,424 (0.66 %) |
1,011 (0.30 %) |
56,356 (7.99 %) |
1,869 (7.30 %) |
69 | basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank) GCA_000091045.1 |
n/a | 957 (3.66 %) |
3,784 (19.12 %) |
n/a | 48.54 (99.99 %) |
85 (0.01 %) |
99 (99.99 %) |
4,944 (5.25 %) |
1,808 (0.52 %) |
68,717 (8.41 %) |
5,128 (28.73 %) |
70 | basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank) GCA_000512585.3 |
n/a | 918 (2.66 %) |
4,907 (18.38 %) |
n/a | 47.29 (100.00 %) |
n/a | 8 (100.00 %) |
7,245 (1.32 %) |
2,141 (0.47 %) |
97,927 (9.78 %) |
4,995 (11.17 %) |
71 | basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016) GCF_000512585.1 |
9,187 (54.88 %) |
867 (2.56 %) |
4,441 (17.03 %) |
n/a | 47.25 (99.94 %) |
30 (0.06 %) |
42 (99.94 %) |
7,231 (1.31 %) |
1,919 (0.32 %) |
110,288 (10.48 %) |
4,972 (10.95 %) |
72 | basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank) GCA_000512565.3 |
n/a | 910 (2.69 %) |
4,861 (19.78 %) |
n/a | 48.39 (100.00 %) |
n/a | 11 (100.00 %) |
7,778 (1.42 %) |
2,452 (0.43 %) |
86,630 (7.97 %) |
3,644 (14.24 %) |
73 | basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016) GCF_000512565.1 |
8,645 (55.47 %) |
908 (2.72 %) |
4,862 (19.87 %) |
n/a | 48.38 (99.98 %) |
56 (0.02 %) |
69 (99.98 %) |
7,816 (1.43 %) |
2,425 (0.42 %) |
85,868 (7.91 %) |
3,698 (15.12 %) |
74 | basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq) GCF_000507465.1 |
8,472 (55.96 %) |
884 (2.79 %) |
5,418 (21.48 %) |
n/a | 44.88 (99.73 %) |
43 (0.27 %) |
105 (99.73 %) |
6,509 (1.21 %) |
1,529 (0.25 %) |
101,733 (9.98 %) |
2,326 (4.59 %) |
75 | basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank) GCA_000507465.4 |
n/a | 886 (2.74 %) |
5,392 (21.25 %) |
n/a | 44.92 (100.00 %) |
n/a | 4 (100.00 %) |
6,585 (1.21 %) |
1,546 (0.27 %) |
104,495 (10.38 %) |
2,335 (5.10 %) |
76 | basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019) GCF_008629635.1 |
7,454 (55.86 %) |
893 (2.94 %) |
3,348 (15.13 %) |
n/a | 49.82 (99.99 %) |
11 (0.01 %) |
132 (100.00 %) |
5,510 (1.13 %) |
1,598 (0.33 %) |
81,983 (9.00 %) |
512 (39.06 %) |
77 | basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007) GCF_000181695.1 |
4,286 (69.39 %) |
1,060 (8.79 %) |
2,585 (44.95 %) |
n/a | 52.06 (100.00 %) |
22 (0.00 %) |
89 (100.00 %) |
1,777 (0.93 %) |
720 (0.48 %) |
22,182 (4.73 %) |
124 (60.74 %) |
78 | basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010) GCF_000143185.1 |
13,192 (49.72 %) |
894 (1.60 %) |
973 (2.80 %) |
n/a | 57.50 (98.57 %) |
316 (1.43 %) |
352 (98.57 %) |
7,478 (4.11 %) |
7,640 (1.13 %) |
176,404 (11.51 %) |
38 (40.33 %) |
79 | bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016) GCF_001652005.1 |
25,020 (17.94 %) |
4,205 (2.34 %) |
27,352 (12.83 %) |
n/a | 41.09 (91.93 %) |
19,248 (8.05 %) |
50,565 (100.00 %) |
57,833 (1.39 %) |
27,440 (2.49 %) |
1,173,760 (18.39 %) |
10,942 (2.61 %) |
80 | bee E.mexicana (v1 0111107269 2016) GCF_001483705.1 |
16,406 (4.01 %) |
4,087 (0.75 %) |
46,846 (6.53 %) |
16,764 (4.04 %) |
40.92 (95.72 %) |
25,039 (4.23 %) |
212,650 (95.77 %) |
641,987 (7.51 %) |
360,406 (11.43 %) |
3,411,951 (46.01 %) |
40,540 (3.99 %) |
81 | beet (2015) GCF_000511025.2 |
37,939 (8.78 %) |
12,044 (2.14 %) |
63,283 (17.52 %) |
n/a | 36.14 (91.40 %) |
30,962 (8.61 %) |
71,208 (91.39 %) |
288,084 (4.25 %) |
299,650 (4.72 %) |
3,021,571 (30.10 %) |
32,547 (2.39 %) |
82 | beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017) GCA_002288925.2 |
n/a | 18,686 (1.78 %) |
20,378 (1.43 %) |
n/a | 41.24 (98.66 %) |
28,398 (1.35 %) |
35,369 (98.65 %) |
4,001,688 (43.72 %) |
542,326 (1.10 %) |
12,806,249 (34.24 %) |
59,279 (1.53 %) |
83 | black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018) GCF_000002775.4 |
59,637 (15.47 %) |
20,361 (4.67 %) |
44,177 (15.83 %) |
n/a | 33.75 (97.43 %) |
6,871 (2.58 %) |
8,318 (97.42 %) |
402,600 (27.63 %) |
177,746 (4.65 %) |
2,639,214 (36.04 %) |
4,559 (0.56 %) |
84 | black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank) GCA_022577435.1 |
n/a | 14,991 (3.02 %) |
47,106 (6.98 %) |
n/a | 41.61 (100.00 %) |
234 (0.00 %) |
230 (100.00 %) |
1,017,149 (18.99 %) |
360,899 (8.75 %) |
3,761,526 (28.91 %) |
48,360 (4.43 %) |
85 | black rhinoceros (primary hap 2021 genbank) GCA_020826845.1 |
56,255 (36.51 %) |
18,774 (1.38 %) |
22,346 (1.26 %) |
n/a | 41.59 (99.95 %) |
215 (0.05 %) |
1,075 (100.00 %) |
4,200,385 (36.22 %) |
548,030 (8.34 %) |
14,347,639 (40.14 %) |
43,525 (1.14 %) |
86 | black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016) GCA_001698545.1 |
59,197 (39.21 %) |
21,244 (1.88 %) |
23,681 (1.25 %) |
n/a | 40.94 (94.13 %) |
149,843 (5.88 %) |
105,030 (100.00 %) |
5,600,915 (50.57 %) |
991,762 (2.45 %) |
16,353,992 (34.26 %) |
81,205 (1.19 %) |
87 | black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016) GCF_001698545.1 |
59,210 (2.48 %) |
21,256 (1.89 %) |
23,679 (1.25 %) |
n/a | 40.94 (94.13 %) |
149,843 (5.88 %) |
105,031 (100.00 %) |
5,602,009 (50.58 %) |
991,745 (2.45 %) |
16,354,078 (34.26 %) |
81,205 (1.19 %) |
88 | black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020) GCF_013377495.1 |
41,255 (4.77 %) |
12,955 (1.98 %) |
22,656 (2.28 %) |
31,476 (5.07 %) |
41.95 (100.00 %) |
n/a | 396 (100.00 %) |
680,976 (7.66 %) |
296,152 (1.44 %) |
6,797,141 (21.40 %) |
31,750 (3.32 %) |
89 | black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020) GCF_015228065.1 |
35,923 (2.41 %) |
3,903 (0.15 %) |
39,667 (2.27 %) |
40,959 (2.59 %) |
36.64 (83.75 %) |
1,158,725 (16.44 %) |
26,876 (100.00 %) |
5,488,723 (29.98 %) |
7,028,944 (21.91 %) |
10,445,796 (49.62 %) |
178,205 (3.43 %) |
90 | black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank) GCA_028500815.1 |
51,115 (48.16 %) |
13,211 (1.67 %) |
24,108 (1.99 %) |
n/a | 44.40 (99.94 %) |
283 (0.06 %) |
716 (100.00 %) |
521,275 (5.36 %) |
236,727 (8.62 %) |
5,684,588 (26.70 %) |
45,318 (4.71 %) |
91 | black-legged tick (U.Maryland v1 2021) GCF_016920785.1 |
41,018 (2.61 %) |
4,064 (0.14 %) |
135,587 (7.67 %) |
n/a | 46.27 (100.00 %) |
n/a | 2,977 (100.00 %) |
1,153,773 (4.93 %) |
754,711 (7.52 %) |
10,964,182 (43.13 %) |
138,831 (8.38 %) |
92 | black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank) GCA_000208615.1 |
n/a | 3,432 (0.19 %) |
108,471 (5.13 %) |
n/a | 45.22 (78.65 %) |
201,145 (21.35 %) |
570,637 (78.65 %) |
656,957 (3.38 %) |
365,918 (1.61 %) |
8,574,437 (27.02 %) |
345,141 (14.15 %) |
93 | blackcap (primary hap 2019 genbank) GCA_009819655.1 |
n/a | 12,378 (1.92 %) |
22,970 (2.37 %) |
n/a | 42.00 (98.88 %) |
413 (1.12 %) |
189 (100.00 %) |
506,242 (6.14 %) |
330,354 (2.12 %) |
6,410,567 (19.76 %) |
26,838 (2.34 %) |
94 | Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank) GCA_025265405.1 |
47,540 (38.02 %) |
19,042 (1.52 %) |
20,766 (1.27 %) |
n/a | 41.70 (99.97 %) |
97 (0.03 %) |
73 (100.00 %) |
3,964,035 (35.29 %) |
765,957 (8.74 %) |
12,128,162 (41.78 %) |
70,851 (1.80 %) |
95 | bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq) GCF_000457365.1 |
42,229 (5.95 %) |
3,558 (0.29 %) |
24,115 (2.96 %) |
n/a | 35.99 (98.05 %) |
76,921 (1.91 %) |
408,322 (98.09 %) |
629,362 (4.20 %) |
749,383 (9.40 %) |
6,932,184 (43.02 %) |
16,970 (0.64 %) |
96 | bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank) GCA_000457365.2 |
n/a | 3,378 (0.29 %) |
23,684 (2.94 %) |
n/a | 35.99 (98.05 %) |
76,903 (1.91 %) |
406,924 (98.09 %) |
587,583 (3.57 %) |
749,212 (9.41 %) |
6,921,847 (43.04 %) |
16,561 (0.63 %) |
97 | blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020) GCA_009873245.2 |
n/a | 19,164 (1.81 %) |
20,546 (1.41 %) |
34,210 (1.86 %) |
40.88 (98.91 %) |
936 (1.09 %) |
130 (100.00 %) |
3,999,202 (44.22 %) |
581,540 (1.22 %) |
12,900,977 (34.62 %) |
67,189 (1.73 %) |
98 | blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank) GCA_900634775.1 |
47,312 (59.52 %) |
14,496 (1.97 %) |
28,873 (5.58 %) |
60,981 (6.13 %) |
38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
441 (100.00 %) |
731,730 (4.21 %) |
471,620 (4.92 %) |
5,974,002 (42.88 %) |
29,050 (1.48 %) |
99 | blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq) GCF_900634775.1 |
47,312 (7.12 %) |
14,496 (1.97 %) |
28,873 (5.58 %) |
60,981 (6.13 %) |
38.27 (98.47 %) |
1,160 (1.53 %) |
441 (100.00 %) |
731,730 (4.21 %) |
471,620 (4.92 %) |
5,974,002 (42.88 %) |
29,050 (1.48 %) |
100 | Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021) GCF_016699345.1 |
53,030 (2.41 %) |
20,599 (1.98 %) |
21,182 (1.34 %) |
46,441 (1.87 %) |
40.95 (99.56 %) |
1,074 (0.44 %) |
2,790 (99.56 %) |
5,098,799 (47.87 %) |
946,231 (3.04 %) |
14,608,771 (36.99 %) |
37,273 (1.03 %) |
101 | Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011) GCF_000235385.1 |
39,820 (2.33 %) |
20,222 (2.04 %) |
18,404 (1.34 %) |
49,071 (2.26 %) |
40.77 (94.98 %) |
148,728 (5.04 %) |
151,414 (94.96 %) |
4,710,420 (46.30 %) |
767,602 (1.48 %) |
14,489,703 (32.96 %) |
32,474 (0.75 %) |
102 | Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank) GCA_028885525.1 |
n/a | 19,820 (1.76 %) |
20,399 (1.15 %) |
n/a | 40.98 (99.88 %) |
36 (0.12 %) |
251 (99.88 %) |
5,232,617 (54.01 %) |
1,003,539 (10.19 %) |
14,858,575 (42.10 %) |
42,467 (1.24 %) |
103 | Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq) GCF_028885625.1 |
81,966 (2.93 %) |
20,794 (1.72 %) |
21,307 (1.13 %) |
n/a | 41.13 (99.86 %) |
39 (0.14 %) |
1,593 (99.86 %) |
5,651,267 (54.21 %) |
1,155,151 (9.33 %) |
16,242,823 (42.82 %) |
52,294 (2.02 %) |
104 | boutu (BS63 2019) GCA_004363515.1 |
n/a | 21,835 (1.38 %) |
35,087 (1.18 %) |
n/a | 42.09 (99.89 %) |
5,072 (0.02 %) |
1,218,682 (99.98 %) |
5,098,108 (45.85 %) |
856,878 (2.32 %) |
13,046,921 (40.74 %) |
63,992 (1.47 %) |
105 | Brazilian free-tailed bat (US034 2019) GCA_004025005.1 |
n/a | 23,562 (1.20 %) |
51,200 (1.27 %) |
n/a | 42.40 (99.91 %) |
4,243 (0.02 %) |
1,071,858 (99.98 %) |
4,884,584 (32.93 %) |
777,032 (1.49 %) |
14,195,446 (36.38 %) |
89,940 (1.88 %) |
106 | brown anole (Geneva1000 2022 genbank) GCA_025583915.1 |
38,099 (52.40 %) |
14,028 (1.05 %) |
19,927 (1.81 %) |
n/a | 41.14 (98.37 %) |
114,440 (1.64 %) |
3,738 (100.00 %) |
1,376,455 (6.78 %) |
1,094,843 (5.18 %) |
9,127,396 (44.98 %) |
46,291 (1.18 %) |
107 | brown argus (genbank 2021) GCA_905147365.1 |
23,611 (63.03 %) |
4,734 (1.03 %) |
24,267 (6.80 %) |
24,237 (6.16 %) |
36.86 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
26 (100.00 %) |
264,378 (2.90 %) |
144,255 (3.35 %) |
2,651,028 (48.44 %) |
35,431 (4.56 %) |
108 | brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018) GCF_003584765.1 |
54,006 (3.19 %) |
18,811 (1.78 %) |
21,058 (1.52 %) |
39,408 (1.98 %) |
41.84 (99.31 %) |
17,380 (0.70 %) |
21,814 (99.30 %) |
4,283,780 (41.29 %) |
567,588 (1.23 %) |
13,807,277 (30.86 %) |
62,126 (1.80 %) |
109 | brown bear (v1.0 2022 WashU) GCF_023065955.1 |
60,162 (4.01 %) |
18,920 (1.66 %) |
21,641 (1.49 %) |
n/a | 42.51 (100.00 %) |
215 (0.00 %) |
902 (100.00 %) |
4,166,472 (34.00 %) |
659,124 (5.14 %) |
13,282,996 (33.88 %) |
68,113 (2.27 %) |
110 | brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020) GCF_013339695.1 |
39,619 (2.36 %) |
3,965 (0.13 %) |
116,426 (5.96 %) |
45,849 (2.46 %) |
46.86 (99.96 %) |
10,359 (0.04 %) |
2,329 (100.00 %) |
1,064,424 (3.53 %) |
716,579 (3.47 %) |
10,608,171 (42.78 %) |
13,204 (0.97 %) |
111 | brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020) GCF_012460135.1 |
31,379 (5.19 %) |
12,572 (1.89 %) |
24,442 (2.44 %) |
26,137 (3.13 %) |
42.40 (99.99 %) |
278 (0.01 %) |
691 (99.99 %) |
504,872 (6.53 %) |
420,620 (3.73 %) |
6,496,619 (21.26 %) |
28,576 (2.39 %) |
112 | brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank) GCA_014356525.1 |
36,936 (60.13 %) |
4,416 (0.37 %) |
22,354 (3.57 %) |
37,534 (4.91 %) |
34.69 (99.96 %) |
4,529 (0.04 %) |
7,093 (100.00 %) |
597,351 (3.69 %) |
564,076 (6.64 %) |
6,601,703 (47.48 %) |
39,697 (1.55 %) |
113 | brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq) GCF_014356525.1 |
36,949 (4.89 %) |
4,427 (0.37 %) |
22,417 (3.57 %) |
37,573 (4.91 %) |
34.69 (99.96 %) |
4,529 (0.04 %) |
7,094 (100.00 %) |
597,178 (3.69 %) |
564,092 (6.64 %) |
6,601,918 (47.49 %) |
39,697 (1.55 %) |
114 | budding yeast C.auris (6684 2015 genbank) GCA_001189475.1 |
n/a | 1,948 (12.61 %) |
4,664 (59.90 %) |
n/a | 45.12 (98.69 %) |
689 (1.33 %) |
99 (100.00 %) |
3,478 (1.23 %) |
2,281 (0.83 %) |
48,703 (8.19 %) |
1,579 (6.36 %) |
115 | budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank) GCA_002775015.1 |
n/a | 2,030 (12.92 %) |
4,702 (58.30 %) |
n/a | 45.32 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
20 (100.00 %) |
3,464 (2.27 %) |
2,436 (0.80 %) |
28,524 (6.96 %) |
1,757 (7.37 %) |
116 | budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank) GCA_000003835.1 |
n/a | 1,956 (12.86 %) |
4,335 (54.85 %) |
n/a | 44.50 (99.71 %) |
79 (0.29 %) |
88 (99.71 %) |
2,272 (1.18 %) |
4,036 (1.77 %) |
48,188 (8.66 %) |
1,474 (15.82 %) |
117 | budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022) GCF_023343755.1 |
4,892 (62.35 %) |
1,845 (11.42 %) |
4,476 (56.70 %) |
n/a | 37.84 (99.95 %) |
167 (0.05 %) |
148 (100.00 %) |
14,118 (4.93 %) |
19,713 (8.99 %) |
82,014 (21.64 %) |
201 (0.52 %) |
118 | budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank) GCA_001417885.1 |
n/a | 3,349 (28.79 %) |
4,665 (66.28 %) |
n/a | 40.12 (100.00 %) |
n/a | 9 (100.00 %) |
7,406 (3.43 %) |
3,781 (1.46 %) |
51,732 (11.80 %) |
742 (4.91 %) |
119 | budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank) GCA_000149685.1 |
n/a | 1,905 (9.82 %) |
5,004 (52.37 %) |
n/a | 36.94 (99.45 %) |
117 (0.56 %) |
145 (99.44 %) |
30,880 (10.91 %) |
18,155 (4.10 %) |
100,210 (23.18 %) |
22 (0.04 %) |
120 | budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank) GCA_000002545.2 |
n/a | 3,553 (27.93 %) |
4,799 (61.37 %) |
n/a | 38.65 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
16 (100.00 %) |
3,047 (1.32 %) |
2,546 (1.58 %) |
59,567 (11.20 %) |
635 (3.11 %) |
121 | budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank) GCA_000002525.1 |
n/a | 1,755 (6.59 %) |
4,802 (37.76 %) |
n/a | 49.05 (99.99 %) |
28 (0.01 %) |
34 (99.99 %) |
7,553 (2.98 %) |
9,578 (2.12 %) |
81,595 (9.59 %) |
6,216 (33.42 %) |
122 | budgerigar (maternal Z 2020 genbank) GCA_012275295.1 |
32,026 (47.01 %) |
13,250 (1.87 %) |
23,063 (2.25 %) |
26,324 (3.11 %) |
41.80 (99.72 %) |
284 (0.28 %) |
865 (100.00 %) |
539,059 (10.20 %) |
279,511 (3.12 %) |
5,874,608 (22.08 %) |
21,155 (1.61 %) |
123 | butterfly L.sinapis (2021 genbank) GCA_905404315.1 |
25,882 (55.17 %) |
4,722 (0.65 %) |
16,896 (3.62 %) |
47,660 (8.03 %) |
35.73 (100.00 %) |
13 (0.00 %) |
50 (100.00 %) |
272,738 (1.92 %) |
98,053 (6.01 %) |
4,662,765 (51.79 %) |
43,150 (4.96 %) |
124 | butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021) GCA_905475465.1 |
n/a | 4,588 (1.37 %) |
11,218 (5.90 %) |
42,925 (13.84 %) |
33.95 (100.00 %) |
41 (0.00 %) |
43 (100.00 %) |
143,323 (2.19 %) |
45,473 (3.23 %) |
2,501,939 (42.55 %) |
11,070 (2.07 %) |
125 | cabbage white (genbank 2021) GCA_905147795.1 |
21,844 (65.09 %) |
4,557 (1.68 %) |
9,253 (6.32 %) |
30,285 (15.57 %) |
33.23 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
40 (100.00 %) |
116,781 (2.12 %) |
30,577 (1.24 %) |
2,300,336 (39.04 %) |
6,783 (2.24 %) |
126 | California condor (v1 813 2021 genbank) GCA_018139145.1 |
n/a | 12,650 (1.75 %) |
21,946 (1.95 %) |
n/a | 42.16 (99.97 %) |
632 (0.03 %) |
542 (100.00 %) |
518,393 (6.41 %) |
177,329 (0.88 %) |
7,168,675 (20.31 %) |
34,926 (2.94 %) |
127 | California sea lion (BS06 2019 Broad) GCA_004024565.1 |
n/a | 23,668 (1.61 %) |
29,709 (1.32 %) |
n/a | 41.56 (99.92 %) |
10,276 (0.04 %) |
582,272 (99.96 %) |
4,952,087 (44.00 %) |
651,744 (1.26 %) |
13,644,805 (35.79 %) |
62,245 (1.50 %) |
128 | California sea lion (v1 2019) GCA_009762305.1 |
n/a | 21,020 (1.79 %) |
20,045 (1.39 %) |
45,176 (2.15 %) |
41.40 (99.28 %) |
122 (0.72 %) |
43 (100.00 %) |
4,529,949 (43.67 %) |
589,962 (1.24 %) |
13,266,465 (33.77 %) |
51,989 (1.50 %) |
129 | California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015) GCF_001194135.1 |
26,135 (1.83 %) |
3,125 (0.12 %) |
17,875 (1.29 %) |
27,144 (1.85 %) |
36.03 (84.95 %) |
548,450 (15.13 %) |
700,124 (84.87 %) |
3,498,348 (13.19 %) |
3,005,729 (6.50 %) |
13,687,022 (41.09 %) |
22,984 (0.34 %) |
130 | Canada lynx (LIC74 v1 2019) GCF_007474595.1 |
50,094 (2.69 %) |
18,283 (1.66 %) |
19,326 (1.35 %) |
38,985 (1.96 %) |
41.70 (99.88 %) |
848 (0.12 %) |
66 (100.00 %) |
5,016,399 (43.75 %) |
904,986 (1.75 %) |
13,476,288 (34.20 %) |
66,822 (2.52 %) |
131 | Cape golden mole (BS56 2019 Broad) GCA_004027935.1 |
n/a | 25,543 (0.55 %) |
52,506 (0.63 %) |
n/a | 40.04 (99.84 %) |
4,876 (0.01 %) |
3,432,954 (99.99 %) |
7,363,240 (21.82 %) |
876,677 (2.53 %) |
25,446,677 (58.18 %) |
25,319 (0.31 %) |
132 | capsicum (Zunla-1 2015 genbank) GCA_000710875.1 |
n/a | 16,133 (0.56 %) |
62,445 (2.92 %) |
n/a | 34.93 (96.78 %) |
107,172 (3.23 %) |
108,797 (96.77 %) |
1,171,727 (3.54 %) |
948,641 (4.39 %) |
21,533,236 (46.16 %) |
16,621 (0.21 %) |
133 | Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank) GCA_036971445.1 |
n/a | 11,967 (0.44 %) |
20,851 (1.23 %) |
n/a | 43.35 (99.99 %) |
1,443 (0.01 %) |
596 (100.00 %) |
4,902,656 (34.96 %) |
1,040,893 (17.82 %) |
16,403,253 (54.79 %) |
113,936 (1.69 %) |
134 | carmine bee-eater (2014 BGI) GCF_000691845.1 |
15,520 (2.12 %) |
11,303 (1.45 %) |
24,758 (1.84 %) |
n/a | 41.67 (99.59 %) |
50,632 (0.42 %) |
104,131 (99.58 %) |
405,042 (5.66 %) |
161,525 (1.05 %) |
6,445,961 (19.27 %) |
11,477 (0.36 %) |
135 | cassava (v6 AM560-2 2016 DOE) GCF_001659605.1 |
48,199 (10.95 %) |
18,537 (3.62 %) |
45,536 (13.17 %) |
n/a | 35.94 (85.14 %) |
37,896 (14.88 %) |
39,916 (85.12 %) |
295,656 (2.88 %) |
266,527 (3.40 %) |
2,434,269 (42.34 %) |
30,963 (1.41 %) |
136 | cattle (Hereford 2015) GCA_000003205.6 |
n/a | 19,803 (1.54 %) |
21,001 (1.30 %) |
n/a | 41.83 (99.57 %) |
41,517 (0.44 %) |
42,578 (99.56 %) |
5,725,274 (49.24 %) |
459,535 (1.33 %) |
12,905,109 (41.11 %) |
43,324 (1.28 %) |
137 | cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA) GCF_002263795.1 |
76,369 (2.97 %) |
19,669 (1.56 %) |
21,999 (1.33 %) |
n/a | 41.93 (100.00 %) |
386 (0.00 %) |
2,211 (100.00 %) |
5,643,592 (49.67 %) |
545,256 (2.90 %) |
13,085,601 (41.79 %) |
44,357 (1.24 %) |
138 | cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA) GCF_002263795.2 |
76,293 (2.98 %) |
19,325 (1.49 %) |
21,665 (1.32 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
386 (0.00 %) |
1,957 (100.00 %) |
3,550,686 (24.18 %) |
544,595 (2.90 %) |
13,050,221 (41.81 %) |
44,208 (1.24 %) |
139 | Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad) GCA_004024745.1 |
n/a | 21,372 (1.41 %) |
34,453 (1.31 %) |
n/a | 42.35 (99.87 %) |
10,534 (0.04 %) |
1,240,696 (99.96 %) |
5,244,572 (43.13 %) |
2,503,015 (4.45 %) |
12,961,004 (41.69 %) |
173,264 (3.70 %) |
140 | channel bull blenny (2019 genbank) GCA_900634415.1 |
40,788 (61.50 %) |
14,472 (3.02 %) |
24,012 (6.59 %) |
60,720 (10.43 %) |
40.96 (99.58 %) |
445 (0.42 %) |
322 (100.00 %) |
420,697 (5.49 %) |
320,518 (6.91 %) |
3,394,846 (28.67 %) |
20,453 (1.39 %) |
141 | channel catfish (USDA103 v1 2016) GCF_001660625.1 |
53,933 (9.58 %) |
15,712 (2.71 %) |
25,639 (5.25 %) |
n/a | 39.70 (98.56 %) |
25,203 (1.45 %) |
34,544 (98.55 %) |
871,222 (5.75 %) |
585,250 (4.19 %) |
5,150,651 (33.94 %) |
31,438 (1.87 %) |
142 | channel catfish (USDA103 v1.2 2019) GCF_001660625.2 |
57,087 (10.27 %) |
16,253 (2.68 %) |
44,936 (5.15 %) |
n/a | 39.70 (98.57 %) |
25,285 (1.44 %) |
34,545 (98.61 %) |
900,327 (5.55 %) |
614,695 (4.28 %) |
5,348,266 (33.81 %) |
32,840 (1.87 %) |
143 | cheetah (AJU 981 2015) GCA_001443585.1 |
n/a | 18,264 (1.57 %) |
14,665 (1.26 %) |
n/a | 41.30 (98.26 %) |
183,260 (1.77 %) |
14,382 (100.00 %) |
4,777,041 (42.51 %) |
784,368 (1.53 %) |
13,503,827 (31.65 %) |
57,657 (1.31 %) |
144 | chimney swift (M959 v1.0 2014) GCF_000747805.1 |
15,979 (2.53 %) |
12,065 (1.82 %) |
10,050 (2.07 %) |
n/a | 41.40 (95.99 %) |
65,523 (4.03 %) |
84,595 (95.97 %) |
453,775 (7.30 %) |
194,988 (2.21 %) |
6,363,949 (19.70 %) |
12,486 (0.42 %) |
145 | chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank) GCA_002880755.3 |
n/a | 20,378 (1.83 %) |
21,427 (1.19 %) |
n/a | 40.71 (98.98 %) |
693 (1.02 %) |
5,037 (98.98 %) |
5,409,980 (53.76 %) |
984,231 (7.31 %) |
15,896,744 (39.56 %) |
45,870 (0.97 %) |
146 | chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank) GCA_028858805.1 |
n/a | 20,001 (1.79 %) |
21,230 (1.19 %) |
n/a | 40.62 (99.78 %) |
22 (0.22 %) |
141 (99.78 %) |
5,092,768 (48.83 %) |
946,933 (11.75 %) |
14,844,947 (42.39 %) |
47,662 (1.21 %) |
147 | chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq) GCF_028858775.1 |
111,282 (4.36 %) |
20,990 (1.75 %) |
21,705 (1.15 %) |
n/a | 40.94 (99.90 %) |
29 (0.10 %) |
1,500 (99.90 %) |
5,581,205 (50.06 %) |
1,158,792 (10.59 %) |
15,972,274 (43.09 %) |
61,901 (2.29 %) |
148 | China rose (Old Blush v1 2018) GCF_002994745.1 |
60,293 (11.65 %) |
15,433 (2.84 %) |
67,310 (21.70 %) |
n/a | 38.83 (100.00 %) |
33 (0.00 %) |
45 (100.00 %) |
273,992 (2.25 %) |
228,466 (3.97 %) |
2,261,888 (35.14 %) |
37,317 (4.18 %) |
149 | Chinese hamster (17A/GY CHO 2018) GCF_003668045.1 |
55,529 (3.00 %) |
19,755 (1.76 %) |
20,017 (1.50 %) |
n/a | 41.51 (99.88 %) |
4,356 (0.12 %) |
1,830 (100.00 %) |
4,544,603 (29.89 %) |
1,095,407 (2.92 %) |
12,942,232 (32.27 %) |
19,343 (0.58 %) |
150 | Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank) GCA_018296145.1 |
92,370 (51.48 %) |
27,141 (1.63 %) |
113,328 (4.52 %) |
157,545 (6.65 %) |
43.55 (99.99 %) |
2,333 (0.01 %) |
9,977 (99.99 %) |
4,892,399 (55.31 %) |
2,306,695 (23.48 %) |
10,038,870 (54.55 %) |
62,726 (1.40 %) |
151 | chub mackerel (primary hap 2022 genbank) GCA_027409825.1 |
34,390 (49.60 %) |
15,350 (2.35 %) |
46,858 (6.07 %) |
n/a | 40.01 (99.92 %) |
1,572 (0.08 %) |
361 (100.00 %) |
1,669,327 (28.44 %) |
638,340 (11.55 %) |
4,613,422 (32.38 %) |
16,290 (0.85 %) |
152 | chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014) GCF_000700745.1 |
17,196 (2.21 %) |
12,140 (1.50 %) |
25,641 (1.91 %) |
n/a | 40.76 (99.61 %) |
56,667 (0.39 %) |
126,789 (99.61 %) |
560,317 (7.62 %) |
203,204 (1.12 %) |
6,593,712 (20.47 %) |
8,105 (0.24 %) |
153 | chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011) GCF_000203795.1 |
8,677 (50.60 %) |
1,251 (4.00 %) |
7,681 (34.45 %) |
n/a | 39.25 (99.25 %) |
383 (0.76 %) |
510 (99.24 %) |
2,585 (1.13 %) |
3,424 (1.20 %) |
81,225 (12.02 %) |
161 (0.21 %) |
154 | ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012) GCA_000295675.1 |
n/a | 1,065 (1.03 %) |
1,781 (1.87 %) |
n/a | 31.32 (99.93 %) |
1,347 (0.00 %) |
23,709 (100.00 %) |
29,228 (1.96 %) |
22,291 (1.48 %) |
550,667 (25.14 %) |
20 (0.01 %) |
155 | climbing perch (v1.1 2018 refseq) GCF_900324465.1 |
42,930 (13.31 %) |
15,237 (3.47 %) |
22,710 (7.34 %) |
37,043 (11.25 %) |
40.40 (98.65 %) |
292 (1.35 %) |
70 (100.00 %) |
329,586 (2.67 %) |
133,519 (1.94 %) |
3,418,470 (21.84 %) |
10,698 (0.86 %) |
156 | climbing perch (v1.2 2018 genbank) GCA_900324465.2 |
42,746 (63.74 %) |
15,239 (3.53 %) |
39,067 (7.54 %) |
63,908 (10.45 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
50 (100.00 %) |
324,479 (2.66 %) |
130,248 (1.89 %) |
3,324,960 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
157 | climbing perch (v1.2 2018 refseq) GCF_900324465.2 |
42,746 (13.53 %) |
15,241 (3.53 %) |
39,067 (7.54 %) |
63,908 (10.45 %) |
40.40 (99.35 %) |
266 (0.65 %) |
51 (100.00 %) |
324,324 (2.66 %) |
130,249 (1.89 %) |
3,325,009 (21.31 %) |
10,500 (0.87 %) |
158 | clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018385.1 |
81,219 (51.66 %) |
18,516 (1.55 %) |
20,363 (1.39 %) |
n/a | 41.79 (99.94 %) |
181 (0.06 %) |
34 (100.00 %) |
4,798,634 (33.91 %) |
992,669 (2.08 %) |
13,618,933 (34.42 %) |
67,831 (2.45 %) |
159 | clouded yellow (genbank 2021) GCA_905220415.1 |
23,070 (64.23 %) |
4,767 (1.38 %) |
15,869 (7.12 %) |
34,699 (13.48 %) |
33.59 (100.00 %) |
9 (0.00 %) |
33 (100.00 %) |
161,872 (2.42 %) |
73,892 (2.86 %) |
2,544,844 (42.14 %) |
15,663 (2.98 %) |
160 | coho salmon (150728-3 2017) GCF_002021735.1 |
64,032 (4.29 %) |
24,727 (1.43 %) |
46,926 (3.38 %) |
n/a | 43.33 (95.39 %) |
265,291 (4.63 %) |
22,810 (99.99 %) |
1,185,308 (5.22 %) |
2,455,045 (15.99 %) |
11,710,855 (46.53 %) |
72,061 (1.46 %) |
161 | common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020) GCA_011762595.1 |
67,207 (45.84 %) |
18,772 (1.77 %) |
20,527 (1.42 %) |
35,815 (1.58 %) |
41.44 (99.74 %) |
674 (0.26 %) |
362 (100.00 %) |
4,067,521 (46.14 %) |
628,982 (2.12 %) |
12,490,896 (35.29 %) |
65,551 (1.90 %) |
162 | common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank) GCA_001922835.1 |
45,962 (43.27 %) |
17,254 (1.68 %) |
17,112 (1.34 %) |
n/a | 40.85 (99.45 %) |
114,003 (0.57 %) |
2,647 (100.00 %) |
3,845,214 (43.88 %) |
514,631 (1.06 %) |
12,317,013 (32.18 %) |
48,030 (1.35 %) |
163 | common brushtail (genbank 2020) GCA_011100635.1 |
37,661 (35.20 %) |
18,681 (0.81 %) |
15,375 (0.86 %) |
n/a | 39.48 (99.44 %) |
1,796 (0.56 %) |
212 (100.00 %) |
7,598,697 (38.92 %) |
1,259,434 (1.97 %) |
22,071,301 (40.56 %) |
17,762 (0.38 %) |
164 | common carp (2014) GCF_000951615.1 |
75,427 (5.81 %) |
27,632 (2.17 %) |
59,950 (5.28 %) |
n/a | 37.00 (97.48 %) |
57,940 (2.53 %) |
9,378 (100.00 %) |
1,460,282 (5.17 %) |
987,356 (7.88 %) |
9,900,821 (37.41 %) |
48,702 (1.38 %) |
165 | common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank) GCA_017976375.1 |
50,206 (57.28 %) |
13,179 (1.84 %) |
25,859 (2.41 %) |
n/a | 42.18 (99.58 %) |
296 (0.42 %) |
151 (100.00 %) |
521,043 (9.61 %) |
310,469 (2.36 %) |
6,712,849 (21.76 %) |
25,267 (1.71 %) |
166 | common cuckoo (BGI 2014) GCF_000709325.1 |
16,827 (2.53 %) |
12,599 (1.80 %) |
12,623 (2.28 %) |
n/a | 41.52 (97.64 %) |
56,977 (2.38 %) |
71,907 (97.62 %) |
418,870 (8.06 %) |
192,437 (2.08 %) |
6,576,259 (19.85 %) |
18,002 (0.74 %) |
167 | common house spider (v2 Geottingen 2017) GCF_000365465.2 |
30,064 (3.79 %) |
3,347 (0.23 %) |
7,571 (1.48 %) |
n/a | 29.46 (81.63 %) |
247,378 (18.44 %) |
263,908 (81.56 %) |
587,943 (2.23 %) |
464,643 (2.90 %) |
10,795,253 (40.31 %) |
10,480 (0.23 %) |
168 | common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank) GCA_000365465.3 |
37,121 (48.05 %) |
3,276 (0.22 %) |
9,098 (1.38 %) |
38,273 (4.24 %) |
29.40 (98.45 %) |
124,228 (1.55 %) |
84,235 (98.46 %) |
637,694 (2.45 %) |
527,781 (4.43 %) |
11,553,196 (51.16 %) |
11,998 (0.33 %) |
169 | common limpet (v1 primary hap 2022) GCF_932274485.1 |
41,888 (9.21 %) |
3,611 (0.43 %) |
13,244 (4.58 %) |
44,721 (6.30 %) |
36.11 (100.00 %) |
75 (0.00 %) |
13 (100.00 %) |
239,042 (1.40 %) |
359,961 (7.89 %) |
4,399,053 (45.69 %) |
33,411 (1.94 %) |
170 | common sole (primary hap 2023 genbank) GCA_958295425.1 |
55,359 (63.58 %) |
14,846 (2.94 %) |
42,832 (6.93 %) |
n/a | 40.87 (99.99 %) |
373 (0.01 %) |
243 (100.00 %) |
1,149,249 (19.12 %) |
342,239 (9.71 %) |
3,906,839 (32.84 %) |
27,772 (2.71 %) |
171 | common swift (bApuApu2 2021 genbank) GCA_020740795.1 |
39,986 (53.94 %) |
12,277 (1.88 %) |
20,379 (2.16 %) |
n/a | 41.95 (99.84 %) |
256 (0.16 %) |
109 (100.00 %) |
533,758 (8.66 %) |
199,748 (1.12 %) |
6,353,957 (21.19 %) |
20,393 (1.74 %) |
172 | common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank) GCA_022682495.1 |
58,054 (45.51 %) |
18,280 (1.71 %) |
19,514 (1.59 %) |
n/a | 42.98 (99.99 %) |
611 (0.01 %) |
572 (100.00 %) |
2,761,820 (28.38 %) |
427,940 (3.89 %) |
11,250,492 (32.57 %) |
70,700 (2.48 %) |
173 | common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank) GCA_002940915.2 |
n/a | 18,511 (1.87 %) |
18,170 (1.68 %) |
n/a | 42.15 (97.78 %) |
54,308 (2.23 %) |
84,108 (97.77 %) |
2,860,991 (29.93 %) |
275,245 (1.03 %) |
11,798,152 (28.19 %) |
51,833 (1.38 %) |
174 | common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq) GCF_002940915.1 |
51,034 (3.23 %) |
18,506 (1.88 %) |
18,166 (1.68 %) |
n/a | 42.15 (97.78 %) |
54,308 (2.23 %) |
84,109 (97.77 %) |
2,861,697 (29.93 %) |
275,247 (1.03 %) |
11,798,198 (28.19 %) |
51,834 (1.38 %) |
175 | Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank) GCA_000956105.1 |
29,369 (33.72 %) |
19,335 (2.10 %) |
21,769 (1.63 %) |
n/a | 41.24 (74.51 %) |
276,544 (25.53 %) |
299,069 (74.47 %) |
3,513,698 (39.82 %) |
304,033 (0.59 %) |
13,333,842 (21.06 %) |
56,694 (1.59 %) |
176 | cork oak (v1 HL8 2018) GCF_002906115.1 |
65,969 (8.84 %) |
20,226 (1.95 %) |
89,703 (16.66 %) |
n/a | 36.19 (97.99 %) |
26,139 (2.01 %) |
23,344 (100.00 %) |
865,884 (3.63 %) |
491,126 (5.95 %) |
6,119,503 (36.10 %) |
21,505 (3.50 %) |
177 | corroboree frog (hap2 2023 genbank) GCA_028390025.1 |
n/a | n/a | 54,346 (1.07 %) |
n/a | 45.66 (99.76 %) |
2,699 (0.24 %) |
3,127 (100.00 %) |
18,782,633 (75.22 %) |
5,902,115 (18.63 %) |
5,826 (99.76 %) |
990,274 (4.84 %) |
178 | cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank) GCA_002156985.1 |
21,972 (59.55 %) |
4,839 (1.54 %) |
21,045 (8.01 %) |
n/a | 36.13 (89.02 %) |
26,910 (11.01 %) |
24,551 (88.99 %) |
115,046 (2.97 %) |
31,900 (0.85 %) |
2,230,382 (25.45 %) |
15,851 (2.18 %) |
179 | cowpea (IT97K-499-35 v1 2019) GCF_004118075.1 |
48,679 (10.56 %) |
16,927 (3.30 %) |
44,814 (13.06 %) |
54,348 (11.30 %) |
32.98 (99.48 %) |
68 (0.52 %) |
682 (100.00 %) |
352,238 (4.22 %) |
283,949 (8.14 %) |
3,092,021 (41.64 %) |
24,513 (2.40 %) |
180 | crab-eating macaque WashU 2013 genbank GCA_000364345.1 |
76,183 (45.03 %) |
20,283 (1.90 %) |
20,544 (1.22 %) |
n/a | 40.90 (95.16 %) |
80,474 (4.85 %) |
87,763 (95.15 %) |
5,351,207 (51.35 %) |
941,514 (3.24 %) |
15,778,449 (35.74 %) |
76,963 (1.14 %) |
181 | crab-eating macaque WashU 2013 refseq GCF_000364345.1 |
76,196 (3.30 %) |
20,209 (1.91 %) |
51,427 (6.84 %) |
n/a | 40.90 (95.16 %) |
80,474 (4.85 %) |
87,764 (95.15 %) |
5,251,819 (50.85 %) |
941,514 (3.24 %) |
15,778,510 (35.74 %) |
76,963 (1.14 %) |
182 | crucian carp (primary hap 2023 genbank) GCA_963082965.1 |
90,094 (55.93 %) |
29,389 (2.81 %) |
88,291 (5.37 %) |
n/a | 38.31 (99.99 %) |
832 (0.01 %) |
278 (100.00 %) |
3,481,389 (45.81 %) |
802,775 (6.54 %) |
8,190,816 (44.41 %) |
83,696 (3.82 %) |
183 | crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022) GCF_022539665.1 |
22,902 (28.68 %) |
3,621 (2.94 %) |
11,430 (17.96 %) |
n/a | 40.34 (99.47 %) |
2 (0.53 %) |
227 (100.00 %) |
81,008 (2.67 %) |
29,625 (4.98 %) |
609,395 (25.66 %) |
6,559 (5.05 %) |
184 | crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank) GCA_003990815.1 |
n/a | 3,519 (2.64 %) |
12,174 (17.22 %) |
n/a | 40.54 (93.29 %) |
13,228 (6.75 %) |
4,192 (100.00 %) |
63,254 (2.07 %) |
22,325 (1.44 %) |
728,942 (20.81 %) |
8,375 (4.98 %) |
185 | crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020) GCF_011947565.2 |
30,025 (5.21 %) |
3,968 (0.39 %) |
56,084 (8.02 %) |
32,834 (5.48 %) |
52.34 (98.93 %) |
10,786 (1.08 %) |
1,254 (100.00 %) |
361,409 (3.23 %) |
533,046 (8.92 %) |
3,456,307 (19.29 %) |
6,722 (54.88 %) |
186 | dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank) GCA_021462225.2 |
n/a | 15,131 (1.68 %) |
50,084 (4.18 %) |
n/a | 40.18 (99.46 %) |
409 (0.54 %) |
73 (100.00 %) |
2,175,293 (47.80 %) |
176,956 (1.87 %) |
6,142,692 (38.35 %) |
32,973 (1.28 %) |
187 | Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank) GCA_963259705.1 |
64,558 (45.64 %) |
19,142 (1.72 %) |
22,139 (1.66 %) |
n/a | 43.18 (99.99 %) |
1,099 (0.01 %) |
122 (100.00 %) |
3,040,239 (24.03 %) |
796,913 (6.38 %) |
10,478,261 (38.84 %) |
64,921 (2.50 %) |
188 | degu (3935 2012 genbank) GCA_000260255.1 |
48,152 (35.39 %) |
22,240 (1.40 %) |
22,108 (1.46 %) |
n/a | 41.38 (84.36 %) |
252,770 (15.68 %) |
259,903 (84.32 %) |
4,890,270 (27.82 %) |
898,943 (1.50 %) |
14,281,942 (29.30 %) |
40,135 (0.82 %) |
189 | denticle herring (v1 2019) GCF_900700375.1 |
59,645 (12.74 %) |
16,556 (3.78 %) |
37,861 (8.42 %) |
72,719 (10.66 %) |
43.69 (99.18 %) |
464 (0.82 %) |
460 (100.00 %) |
403,512 (3.23 %) |
224,282 (4.61 %) |
2,948,671 (28.79 %) |
64,661 (9.49 %) |
190 | diamondback terrapin (hap1 2023 genbank) GCA_027887155.1 |
50,318 (52.07 %) |
15,109 (1.08 %) |
19,281 (1.62 %) |
n/a | 44.46 (99.92 %) |
141 (0.08 %) |
76 (100.00 %) |
4,088,064 (46.33 %) |
403,943 (1.72 %) |
11,014,504 (33.74 %) |
110,838 (2.71 %) |
191 | diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008) GCF_000002435.1 |
6,502 (71.82 %) |
251 (1.29 %) |
2,079 (62.62 %) |
n/a | 49.25 (99.82 %) |
242 (0.19 %) |
306 (99.81 %) |
697 (1.34 %) |
335 (0.65 %) |
20,634 (5.24 %) |
2,275 (23.86 %) |
192 | dog (BS72 2019 Broad) GCA_004027395.1 |
n/a | 22,343 (1.53 %) |
28,525 (1.27 %) |
n/a | 41.66 (99.91 %) |
10,428 (0.04 %) |
667,170 (99.96 %) |
5,598,608 (45.38 %) |
1,220,686 (2.58 %) |
14,079,363 (36.37 %) |
62,881 (2.13 %) |
193 | domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011) GCF_000215625.1 |
55,980 (3.39 %) |
18,440 (1.59 %) |
19,474 (1.48 %) |
n/a | 41.47 (94.51 %) |
109,700 (5.51 %) |
117,442 (94.49 %) |
n/a | 606,818 (1.04 %) |
13,503,550 (29.63 %) |
53,376 (1.90 %) |
194 | domestic guinea pig (2N 2008 genbank) GCA_000151735.1 |
44,762 (33.07 %) |
18,297 (1.33 %) |
20,107 (1.34 %) |
n/a | 39.95 (97.81 %) |
58,460 (2.20 %) |
61,603 (97.80 %) |
4,257,412 (38.85 %) |
658,532 (1.25 %) |
14,547,631 (34.19 %) |
37,092 (0.85 %) |
195 | domestic silkworm (genbank 2020) GCA_014905235.2 |
n/a | 5,227 (1.28 %) |
18,795 (5.67 %) |
n/a | 38.55 (99.90 %) |
30 (0.10 %) |
696 (100.00 %) |
615,428 (29.26 %) |
86,179 (1.65 %) |
2,607,325 (47.66 %) |
44,022 (10.06 %) |
196 | domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank) GCA_904849725.1 |
63,294 (3.74 %) |
18,050 (0.43 %) |
260,902 (9.04 %) |
n/a | 44.46 (99.97 %) |
162 (0.03 %) |
290 (100.00 %) |
1,274,894 (2.42 %) |
1,726,303 (5.40 %) |
14,010,542 (72.58 %) |
732,828 (17.24 %) |
197 | downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020) GCA_014839835.1 |
25,483 (48.39 %) |
12,405 (1.70 %) |
23,073 (2.18 %) |
n/a | 45.31 (99.66 %) |
187 (0.34 %) |
181 (100.00 %) |
1,008,118 (21.51 %) |
378,537 (3.38 %) |
5,846,717 (32.04 %) |
26,005 (1.75 %) |
198 | downy woodpecker (BGI 2014) GCF_000699005.1 |
15,850 (2.33 %) |
11,864 (1.67 %) |
11,795 (1.99 %) |
n/a | 44.51 (96.31 %) |
96,471 (3.72 %) |
127,725 (96.28 %) |
842,281 (18.63 %) |
310,018 (2.09 %) |
5,822,687 (27.83 %) |
17,379 (0.69 %) |
199 | E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank) GCA_000750555.1 |
n/a | n/a | n/a | n/a | 50.78 (100.00 %) |
n/a | 1 (100.00 %) |
n/a | 90 (0.38 %) |
19,508 (7.44 %) |
1 (99.99 %) |
200 | East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019) GCF_008831285.1 |
39,088 (10.61 %) |
11,569 (2.49 %) |
38,114 (15.67 %) |
n/a | 38.59 (99.98 %) |
627 (0.02 %) |
1,425 (99.98 %) |
230,165 (2.88 %) |
153,929 (4.02 %) |
2,160,647 (26.81 %) |
24,567 (4.41 %) |
201 | eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016) GCA_001624775.1 |
n/a | 21,013 (2.21 %) |
18,237 (1.40 %) |
101,394 (4.09 %) |
41.76 (90.89 %) |
904,107 (9.24 %) |
30,233 (98.34 %) |
5,250,349 (40.55 %) |
1,508,787 (2.97 %) |
13,823,341 (28.09 %) |
16,695 (0.43 %) |
202 | eastern happy (v2 2018) GCF_900246225.1 |
57,615 (9.59 %) |
15,348 (2.22 %) |
28,518 (6.29 %) |
42,170 (8.31 %) |
41.07 (99.87 %) |
490 (0.13 %) |
364 (100.00 %) |
527,486 (5.98 %) |
217,915 (1.89 %) |
4,547,443 (30.78 %) |
33,005 (1.88 %) |
203 | Egyptian rousette (US006 2019 Broad) GCA_004024865.1 |
n/a | 20,133 (1.87 %) |
36,361 (1.80 %) |
n/a | 40.23 (99.96 %) |
4,332 (0.02 %) |
226,086 (99.98 %) |
2,985,622 (32.66 %) |
475,311 (1.11 %) |
12,612,081 (27.34 %) |
81,930 (5.75 %) |
204 | Egyptian rousette (v1 2020 genbank) GCA_014176215.1 |
65,163 (51.34 %) |
17,637 (2.08 %) |
22,318 (1.84 %) |
n/a | 40.05 (98.59 %) |
242 (1.41 %) |
30 (100.00 %) |
2,821,248 (33.05 %) |
434,415 (1.02 %) |
12,031,652 (26.52 %) |
53,604 (6.69 %) |
205 | elephant shark (2013) GCF_000165045.1 |
30,695 (4.95 %) |
11,306 (1.54 %) |
18,189 (3.03 %) |
n/a | 42.34 (96.16 %) |
46,232 (3.85 %) |
67,421 (96.15 %) |
1,405,480 (27.29 %) |
330,698 (2.60 %) |
5,549,534 (36.65 %) |
35,561 (2.16 %) |
206 | emu (v1 ZJU1.0 2020) GCA_016128335.1 |
n/a | 13,181 (1.74 %) |
24,708 (2.10 %) |
33,433 (3.99 %) |
42.41 (100.00 %) |
512 (0.00 %) |
802 (100.00 %) |
504,527 (4.38 %) |
259,276 (2.59 %) |
7,105,965 (19.15 %) |
41,784 (5.52 %) |
207 | epaulette shark (2021 genbank) GCA_020745735.1 |
43,156 (39.58 %) |
12,439 (0.39 %) |
19,520 (1.06 %) |
n/a | 42.76 (98.05 %) |
3,716 (1.95 %) |
1,963 (100.00 %) |
9,211,963 (69.93 %) |
935,037 (6.51 %) |
20,660,613 (43.88 %) |
41,682 (1.08 %) |
208 | eudicots lettuce (Salinas v7 2020) GCF_002870075.2 |
65,115 (2.96 %) |
16,271 (0.65 %) |
102,071 (6.37 %) |
n/a | 37.79 (92.44 %) |
353,389 (7.60 %) |
11,454 (99.71 %) |
1,109,875 (4.83 %) |
983,866 (3.64 %) |
12,335,790 (52.95 %) |
117,743 (2.02 %) |
209 | Euphrates poplar (v1 2014) GCF_000495115.1 |
56,539 (12.93 %) |
20,844 (4.28 %) |
41,664 (12.47 %) |
n/a | 32.08 (95.31 %) |
23,174 (4.71 %) |
32,789 (95.29 %) |
332,532 (5.23 %) |
246,766 (4.06 %) |
2,679,673 (43.30 %) |
2,781 (0.47 %) |
210 | Eurasian badger (v3.1 2021) GCF_922984935.1 |
57,138 (2.48 %) |
19,265 (1.40 %) |
22,121 (1.36 %) |
n/a | 42.48 (100.00 %) |
101 (0.00 %) |
538 (100.00 %) |
4,487,951 (32.73 %) |
821,664 (4.02 %) |
13,814,723 (38.08 %) |
66,524 (3.95 %) |
211 | Eurasian red squirrel (v1.1 2019) GCA_902686455.1 |
n/a | 21,298 (1.58 %) |
21,024 (1.36 %) |
36,645 (1.54 %) |
40.08 (94.33 %) |
1,177 (5.67 %) |
638 (100.00 %) |
4,680,964 (35.76 %) |
704,218 (1.42 %) |
14,991,981 (31.49 %) |
48,159 (1.04 %) |
212 | Eurasian water vole (v1 2020) GCF_903992535.1 |
45,658 (2.52 %) |
19,724 (1.77 %) |
19,069 (1.47 %) |
34,561 (2.01 %) |
42.15 (99.74 %) |
872 (0.26 %) |
216 (100.00 %) |
4,098,151 (26.75 %) |
1,088,237 (2.91 %) |
12,853,776 (32.42 %) |
19,000 (0.58 %) |
213 | European conger (primary hap 2023 genbank) GCA_963514075.1 |
54,631 (54.17 %) |
17,073 (1.89 %) |
34,794 (5.07 %) |
n/a | 43.89 (99.98 %) |
1,009 (0.02 %) |
394 (100.00 %) |
761,527 (5.99 %) |
913,328 (13.25 %) |
5,768,003 (35.48 %) |
120,990 (6.12 %) |
214 | European eel (primary hap 2020 genbank) GCA_013347855.1 |
n/a | 17,048 (2.22 %) |
34,271 (5.56 %) |
n/a | 43.64 (99.61 %) |
640 (0.40 %) |
53 (100.00 %) |
831,037 (5.48 %) |
786,520 (8.15 %) |
5,700,818 (27.40 %) |
130,345 (8.19 %) |
215 | European mink (primary hap 2023 genbank) GCA_030435805.1 |
69,556 (45.15 %) |
18,706 (1.46 %) |
21,193 (1.37 %) |
n/a | 41.85 (100.00 %) |
39 (0.00 %) |
26 (100.00 %) |
4,237,797 (30.90 %) |
792,898 (2.69 %) |
13,417,248 (36.59 %) |
67,133 (2.54 %) |
216 | European peacock (2021 genbank) GCA_905147045.1 |
22,557 (62.12 %) |
4,716 (1.16 %) |
12,599 (4.34 %) |
26,251 (7.81 %) |
33.70 (100.00 %) |
10 (0.00 %) |
42 (100.00 %) |
212,528 (2.58 %) |
60,682 (1.18 %) |
3,127,157 (46.89 %) |
24,620 (4.88 %) |
217 | European plaice (primary hap 2022 genbank) GCA_947347685.1 |
46,467 (52.27 %) |
14,820 (2.71 %) |
51,453 (7.41 %) |
n/a | 42.51 (99.97 %) |
1,072 (0.03 %) |
356 (100.00 %) |
476,317 (3.63 %) |
520,730 (13.27 %) |
3,283,400 (33.55 %) |
47,051 (4.45 %) |
218 | European snow vole (primary hap 2023 genbank) GCA_950005125.1 |
47,025 (39.90 %) |
20,576 (1.75 %) |
21,171 (1.56 %) |
n/a | 41.98 (100.00 %) |
197 (0.00 %) |
161 (100.00 %) |
3,580,811 (22.71 %) |
998,537 (5.14 %) |
12,204,125 (34.97 %) |
20,725 (0.63 %) |
219 | European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019) GCA_901699165.1 |
n/a | 11,276 (1.79 %) |
21,238 (2.15 %) |
n/a | 41.73 (100.00 %) |
n/a | 3,333 (100.00 %) |
466,567 (7.08 %) |
182,345 (0.97 %) |
6,037,183 (20.24 %) |
29,648 (2.35 %) |
220 | European turtle dove (v1.1 primary hap 2019) GCA_901699155.1 |
n/a | 12,415 (1.77 %) |
23,484 (2.17 %) |
n/a | 41.84 (99.67 %) |
894 (0.33 %) |
357 (100.00 %) |
539,737 (7.60 %) |
227,500 (1.16 %) |
6,768,805 (21.05 %) |
34,729 (2.65 %) |
221 | European woodmouse (2022 genbank) GCA_947179515.1 |
54,113 (34.13 %) |
19,960 (1.65 %) |
19,954 (1.25 %) |
n/a | 41.23 (99.99 %) |
1,129 (0.01 %) |
498 (100.00 %) |
4,863,656 (37.41 %) |
1,795,997 (8.95 %) |
13,681,786 (40.58 %) |
23,961 (0.53 %) |
222 | fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank) GCA_011064685.1 |
32,738 (63.63 %) |
5,744 (1.12 %) |
26,631 (7.08 %) |
n/a | 36.43 (99.99 %) |
525 (0.01 %) |
91 (100.00 %) |
168,479 (1.60 %) |
72,876 (1.70 %) |
3,384,083 (37.35 %) |
30,753 (4.27 %) |
223 | fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020) GCF_011064685.1 |
32,751 (9.65 %) |
5,744 (1.12 %) |
26,632 (7.08 %) |
n/a | 36.43 (99.99 %) |
525 (0.01 %) |
92 (100.00 %) |
169,122 (1.61 %) |
72,892 (1.70 %) |
3,384,365 (37.36 %) |
30,753 (4.27 %) |
224 | fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank) GCA_027579735.1 |
n/a | 15,456 (0.21 %) |
47,501 (0.88 %) |
n/a | 38.98 (98.02 %) |
7,009 (1.99 %) |
2,468 (100.00 %) |
20,643,710 (70.75 %) |
7,150,262 (12.27 %) |
9,477 (98.01 %) |
365,066 (1.20 %) |
225 | fission yeast (v1 972h- 2007 refseq) GCF_000002945.1 |
6,744 (82.69 %) |
5,085 (73.29 %) |
3,403 (39.29 %) |
n/a | 36.05 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
4 (100.00 %) |
3,336 (2.63 %) |
1,034 (0.58 %) |
80,458 (16.22 %) |
105 (0.31 %) |
226 | fission yeast (v2 972h- 2019 genbank) GCA_000002945.3 |
n/a | 5,084 (73.46 %) |
3,394 (39.28 %) |
n/a | 36.06 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
9 (100.00 %) |
3,053 (1.03 %) |
1,034 (0.58 %) |
79,714 (16.06 %) |
105 (0.31 %) |
227 | flatworm S.haematobium (v2 2020) GCF_000699445.2 |
8,934 (5.16 %) |
1,548 (0.29 %) |
4,070 (2.36 %) |
8,934 (5.16 %) |
34.53 (99.76 %) |
15,128 (0.26 %) |
666 (100.00 %) |
124,259 (1.58 %) |
35,312 (1.17 %) |
2,638,150 (34.10 %) |
3,957 (0.38 %) |
228 | flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank) GCA_007364275.2 |
n/a | 15,436 (2.15 %) |
26,448 (5.90 %) |
64,657 (6.60 %) |
41.23 (98.19 %) |
744 (1.81 %) |
189 (100.00 %) |
1,014,141 (16.95 %) |
287,037 (2.21 %) |
5,305,987 (30.67 %) |
24,130 (1.26 %) |
229 | Florida manatee (Lorelei 2012 genbank) GCA_000243295.1 |
39,651 (35.92 %) |
18,302 (1.36 %) |
20,592 (1.23 %) |
32,831 (1.38 %) |
40.73 (89.24 %) |
160,167 (10.78 %) |
166,489 (89.22 %) |
5,109,822 (37.03 %) |
389,314 (0.74 %) |
14,633,007 (38.46 %) |
27,461 (0.64 %) |
230 | fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019) GCF_009650485.1 |
24,196 (18.66 %) |
10,065 (8.48 %) |
14,473 (13.61 %) |
n/a | 38.15 (100.00 %) |
7 (0.00 %) |
11 (100.00 %) |
298,709 (14.86 %) |
80,048 (3.56 %) |
1,317,733 (33.56 %) |
18,849 (8.62 %) |
231 | fly D.santomea (v1.0 2021) GCF_016746245.1 |
25,550 (21.64 %) |
13,354 (17.52 %) |
20,540 (17.87 %) |
n/a | 42.61 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
104 (100.00 %) |
169,365 (23.08 %) |
64,316 (3.47 %) |
791,743 (23.14 %) |
27,794 (16.15 %) |
232 | fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine) GCF_004382195.1 |
26,658 (22.06 %) |
13,461 (17.65 %) |
21,781 (17.83 %) |
n/a | 42.26 (100.00 %) |
38 (0.00 %) |
402 (100.00 %) |
145,818 (25.16 %) |
34,869 (4.31 %) |
719,811 (25.74 %) |
30,130 (16.11 %) |
233 | fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017) GCF_002093755.1 |
21,759 (15.21 %) |
12,488 (9.92 %) |
21,269 (14.06 %) |
n/a | 39.11 (100.00 %) |
n/a | 1,356 (100.00 %) |
314,594 (25.90 %) |
82,446 (12.33 %) |
1,113,448 (37.00 %) |
27,493 (12.03 %) |
234 | fly D.simulans (w501 v3.0 2021) GCF_016746395.1 |
28,595 (26.45 %) |
13,448 (20.44 %) |
18,989 (18.34 %) |
n/a | 42.47 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
96 (100.00 %) |
126,424 (16.72 %) |
32,595 (4.31 %) |
759,296 (23.70 %) |
27,530 (17.02 %) |
235 | fly D.yakuba (2018) GCF_000005975.2 |
5,444 (4.10 %) |
13,713 (15.95 %) |
22,613 (16.71 %) |
n/a | 42.28 (98.12 %) |
5,400 (1.88 %) |
13,440 (98.12 %) |
180,908 (22.48 %) |
68,911 (3.75 %) |
897,353 (23.94 %) |
31,387 (14.91 %) |
236 | fly D.yakuba (v1 2021) GCF_016746365.1 |
27,938 (24.60 %) |
13,343 (17.86 %) |
20,029 (17.64 %) |
n/a | 42.55 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
54 (100.00 %) |
169,559 (23.47 %) |
60,591 (3.64 %) |
837,616 (23.40 %) |
28,204 (16.22 %) |
237 | Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank) GCA_902459505.1 |
54,713 (61.19 %) |
14,267 (0.51 %) |
29,026 (1.40 %) |
n/a | 43.24 (99.85 %) |
433 (0.15 %) |
163 (100.00 %) |
1,311,113 (1.64 %) |
1,364,596 (3.83 %) |
19,589,738 (52.85 %) |
270,923 (4.52 %) |
238 | Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_902459505.1 |
54,713 (1.72 %) |
14,269 (0.51 %) |
29,026 (1.40 %) |
n/a | 43.24 (99.85 %) |
433 (0.15 %) |
164 (100.00 %) |
1,310,970 (1.64 %) |
1,364,597 (3.83 %) |
19,589,802 (52.85 %) |
270,923 (4.52 %) |
239 | giant panda (2009 BGI) GCF_000004335.2 |
40,432 (2.55 %) |
18,884 (1.76 %) |
18,919 (1.46 %) |
n/a | 41.60 (97.66 %) |
119,126 (2.36 %) |
200,593 (97.64 %) |
4,236,423 (40.48 %) |
503,179 (1.10 %) |
13,781,487 (28.85 %) |
53,465 (1.34 %) |
240 | giant panda (Jingjing v1 2017) GCA_002007445.1 |
n/a | 20,110 (1.71 %) |
22,288 (1.49 %) |
n/a | 41.69 (98.08 %) |
186,846 (1.93 %) |
244,258 (98.07 %) |
4,464,041 (41.66 %) |
614,896 (2.00 %) |
14,294,774 (30.62 %) |
59,340 (1.50 %) |
241 | giant panda (Jingjing v2 genbank 2020) GCA_002007445.2 |
n/a | 20,381 (1.71 %) |
21,979 (1.44 %) |
43,086 (2.00 %) |
41.69 (98.09 %) |
190,364 (1.92 %) |
77,287 (100.00 %) |
4,484,597 (41.53 %) |
618,595 (2.00 %) |
14,236,406 (30.39 %) |
59,945 (1.50 %) |
242 | giant panda (Jingjing v2 refseq 2020) GCF_002007445.1 |
67,162 (3.32 %) |
20,374 (1.71 %) |
21,965 (1.44 %) |
43,086 (2.00 %) |
41.69 (98.09 %) |
190,364 (1.92 %) |
77,288 (100.00 %) |
4,476,689 (41.47 %) |
618,596 (2.00 %) |
14,236,463 (30.39 %) |
59,946 (1.50 %) |
243 | gilthead seabream (v1 2019) GCF_900880675.1 |
59,027 (10.96 %) |
15,412 (2.36 %) |
31,802 (6.47 %) |
73,197 (7.97 %) |
41.94 (99.96 %) |
1,050 (0.04 %) |
176 (100.00 %) |
531,360 (3.04 %) |
305,809 (3.03 %) |
4,701,694 (25.69 %) |
47,327 (2.41 %) |
244 | Glanville fritillary (genbank 2021) GCA_905220565.1 |
17,520 (43.15 %) |
4,738 (0.89 %) |
16,197 (5.05 %) |
35,235 (7.97 %) |
34.09 (100.00 %) |
80 (0.01 %) |
32 (100.00 %) |
343,193 (3.25 %) |
144,286 (3.46 %) |
3,683,956 (48.60 %) |
30,200 (4.54 %) |
245 | globe artichoke (v1 2C 2018) GCF_001531365.1 |
42,119 (6.72 %) |
15,804 (2.23 %) |
49,721 (11.10 %) |
n/a | 35.35 (90.31 %) |
310,473 (9.77 %) |
13,588 (99.93 %) |
394,687 (2.79 %) |
364,361 (3.37 %) |
4,191,676 (39.48 %) |
12,198 (0.64 %) |
246 | goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank) GCA_001704415.1 |
n/a | 19,842 (1.43 %) |
22,426 (1.24 %) |
52,608 (1.64 %) |
43.16 (100.00 %) |
790 (0.00 %) |
29,906 (100.00 %) |
5,669,868 (50.59 %) |
760,836 (7.07 %) |
13,024,386 (44.85 %) |
125,682 (4.01 %) |
247 | goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq) GCF_001704415.1 |
47,206 (2.31 %) |
19,857 (1.43 %) |
22,880 (1.27 %) |
52,608 (1.64 %) |
43.16 (100.00 %) |
790 (0.00 %) |
29,907 (100.00 %) |
5,578,287 (50.22 %) |
760,837 (7.07 %) |
13,024,440 (44.85 %) |
125,682 (4.02 %) |
248 | golden eagle (v1.2 2019) GCF_900496995.1 |
55,164 (5.86 %) |
13,226 (1.87 %) |
23,033 (2.15 %) |
25,921 (3.22 %) |
42.11 (99.61 %) |
191 (0.39 %) |
142 (100.00 %) |
519,341 (5.86 %) |
180,990 (0.79 %) |
7,005,531 (19.25 %) |
37,343 (3.12 %) |
249 | golden eagle (v1.2 alternate hap 2019) GCA_902153765.1 |
n/a | 9,334 (1.82 %) |
17,594 (2.12 %) |
n/a | 42.53 (99.93 %) |
39 (0.07 %) |
3,860 (100.00 %) |
356,284 (6.03 %) |
123,430 (0.80 %) |
4,417,887 (19.25 %) |
28,919 (3.52 %) |
250 | golden hamster (Baylor 2013 genbank) GCA_000349665.1 |
n/a | 18,965 (1.82 %) |
19,339 (1.52 %) |
n/a | 42.01 (82.92 %) |
216,216 (17.12 %) |
237,699 (82.88 %) |
3,724,142 (27.19 %) |
790,256 (1.69 %) |
12,003,866 (24.29 %) |
18,591 (0.51 %) |
251 | golden snub-nosed monkey (2014 Novogene) GCA_000769185.1 |
n/a | 21,341 (1.86 %) |
22,492 (1.24 %) |
n/a | 40.87 (98.50 %) |
61,291 (1.50 %) |
196,804 (98.50 %) |
5,673,299 (51.36 %) |
1,080,627 (3.06 %) |
16,205,827 (36.77 %) |
79,387 (1.14 %) |
252 | grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank) GCA_025091365.1 |
n/a | 2,982 (0.90 %) |
5,710 (2.77 %) |
n/a | 27.24 (97.73 %) |
41,970 (2.29 %) |
8,544 (100.00 %) |
195,538 (3.32 %) |
65,664 (2.79 %) |
2,529,566 (54.06 %) |
4,357 (1.18 %) |
253 | gray mouse lemur genbank GCA_000165445.3 |
n/a | 20,031 (1.89 %) |
22,619 (1.50 %) |
n/a | 40.98 (95.94 %) |
43,363 (4.06 %) |
50,982 (95.94 %) |
4,082,873 (41.60 %) |
582,430 (1.47 %) |
14,808,558 (30.05 %) |
74,772 (2.61 %) |
254 | gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887165.1 |
73,383 (42.66 %) |
16,638 (0.72 %) |
16,171 (0.86 %) |
n/a | 37.92 (99.11 %) |
2,255 (0.89 %) |
14 (100.00 %) |
5,562,366 (25.40 %) |
1,096,625 (2.60 %) |
22,322,798 (43.37 %) |
28,894 (0.57 %) |
255 | great fruit-eating bat (v1 hap1 2024) GCA_038363095.1 |
n/a | 18,022 (1.56 %) |
20,018 (1.52 %) |
n/a | 42.28 (100.00 %) |
81 (0.00 %) |
419 (100.00 %) |
2,827,417 (26.82 %) |
371,479 (4.97 %) |
11,603,093 (34.64 %) |
71,574 (2.28 %) |
256 | great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank) GCA_001890085.1 |
50,937 (43.78 %) |
19,011 (2.00 %) |
19,882 (1.66 %) |
41,741 (2.41 %) |
41.11 (87.42 %) |
172,751 (12.60 %) |
7,570 (100.00 %) |
3,078,210 (32.07 %) |
495,290 (1.05 %) |
11,588,202 (25.43 %) |
33,101 (0.97 %) |
257 | great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq) GCF_001890085.1 |
50,937 (3.26 %) |
18,992 (2.00 %) |
19,880 (1.66 %) |
41,778 (2.41 %) |
41.11 (87.42 %) |
172,751 (12.60 %) |
7,571 (100.00 %) |
3,285,971 (33.14 %) |
495,292 (1.05 %) |
11,588,248 (25.43 %) |
33,101 (0.97 %) |
258 | greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020) GCA_014108255.1 |
n/a | 18,531 (1.97 %) |
20,309 (1.67 %) |
n/a | 40.52 (99.19 %) |
292 (0.81 %) |
50 (100.00 %) |
3,284,473 (35.00 %) |
559,653 (1.29 %) |
12,043,562 (29.15 %) |
32,047 (1.05 %) |
259 | greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank) GCA_004115265.2 |
53,353 (46.77 %) |
18,647 (1.97 %) |
20,359 (1.68 %) |
n/a | 40.54 (99.64 %) |
158 (0.36 %) |
135 (100.00 %) |
3,301,020 (34.99 %) |
564,790 (1.35 %) |
12,217,069 (29.39 %) |
32,445 (1.06 %) |
260 | greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq) GCF_004115265.1 |
53,352 (3.13 %) |
18,647 (1.97 %) |
20,359 (1.68 %) |
n/a | 40.54 (99.64 %) |
158 (0.36 %) |
134 (100.00 %) |
3,300,836 (34.99 %) |
564,789 (1.35 %) |
12,217,020 (29.39 %) |
32,445 (1.06 %) |
261 | greater mouse-eared bat (2019 Broad) GCA_004026985.1 |
n/a | 23,153 (1.31 %) |
51,642 (1.43 %) |
n/a | 43.16 (99.88 %) |
8,133 (0.04 %) |
1,053,330 (99.96 %) |
3,675,075 (25.48 %) |
938,700 (2.73 %) |
12,027,923 (39.01 %) |
80,955 (2.31 %) |
262 | greater pipefish (v1.1 2019) GCA_901709675.1 |
n/a | 13,467 (5.26 %) |
42,380 (12.01 %) |
n/a | 43.46 (100.00 %) |
43 (0.00 %) |
87 (100.00 %) |
193,442 (3.05 %) |
125,716 (4.25 %) |
1,676,004 (25.93 %) |
46,340 (13.40 %) |
263 | greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850765.1 |
n/a | 18,322 (1.40 %) |
21,049 (1.35 %) |
n/a | 41.71 (98.73 %) |
468 (1.27 %) |
359 (99.59 %) |
4,247,148 (29.53 %) |
1,031,385 (2.50 %) |
12,465,194 (43.30 %) |
101,620 (2.01 %) |
264 | greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank) GCA_003640425.2 |
20,814 (51.89 %) |
4,346 (0.99 %) |
12,930 (3.50 %) |
21,226 (7.60 %) |
33.06 (99.10 %) |
27,314 (0.92 %) |
13,303 (100.00 %) |
270,925 (3.18 %) |
86,050 (1.20 %) |
3,416,162 (48.29 %) |
11,043 (1.07 %) |
265 | green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007) GCF_000002595.1 |
14,484 (22.24 %) |
987 (0.55 %) |
11,299 (59.37 %) |
n/a | 63.87 (87.58 %) |
10,425 (12.45 %) |
11,385 (87.55 %) |
167,652 (16.23 %) |
100,391 (4.60 %) |
734,057 (30.38 %) |
3,154 (63.45 %) |
266 | green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank) GCA_000002595.3 |
n/a | 988 (0.56 %) |
9,689 (59.71 %) |
n/a | 64.08 (96.36 %) |
1,459 (3.65 %) |
1,512 (96.35 %) |
171,684 (17.03 %) |
110,553 (6.12 %) |
748,240 (34.06 %) |
106 (99.48 %) |
267 | green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank) GCA_000147415.1 |
9,780 (62.01 %) |
743 (1.01 %) |
4,520 (67.55 %) |
n/a | 67.14 (91.48 %) |
3,543 (8.55 %) |
3,810 (91.45 %) |
65,787 (8.35 %) |
28,736 (2.86 %) |
416,740 (37.15 %) |
776 (95.90 %) |
268 | green monkey 1994-021 (2014 genbank) GCA_000409795.2 |
76,037 (46.89 %) |
20,079 (1.94 %) |
20,246 (1.25 %) |
n/a | 40.81 (98.67 %) |
178,925 (1.35 %) |
163,017 (98.65 %) |
5,382,039 (50.20 %) |
980,479 (2.63 %) |
16,076,172 (35.62 %) |
50,033 (1.04 %) |
269 | green sea turtle (BGI 2013) GCF_000344595.1 |
31,786 (2.57 %) |
14,548 (1.02 %) |
15,297 (1.46 %) |
n/a | 43.49 (95.57 %) |
134,344 (4.44 %) |
274,367 (95.56 %) |
1,615,553 (13.87 %) |
317,600 (2.08 %) |
11,732,990 (28.32 %) |
36,782 (0.70 %) |
270 | green sea turtle (v1 2020) GCF_015237465.1 |
56,917 (3.63 %) |
14,729 (1.06 %) |
17,439 (1.56 %) |
n/a | 44.01 (99.44 %) |
294 (0.56 %) |
99 (100.00 %) |
1,641,730 (15.08 %) |
304,356 (1.25 %) |
11,136,918 (31.96 %) |
49,035 (1.44 %) |
271 | harbor porpoise (BS71 2019) GCA_004363495.1 |
n/a | 21,044 (1.46 %) |
30,072 (1.23 %) |
n/a | 41.83 (99.88 %) |
7,114 (0.03 %) |
1,338,272 (99.97 %) |
5,359,537 (46.83 %) |
772,736 (1.54 %) |
13,705,428 (42.29 %) |
80,965 (1.65 %) |
272 | Harpy eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_026419915.1 |
51,641 (50.37 %) |
13,412 (1.70 %) |
24,002 (2.05 %) |
n/a | 43.39 (99.80 %) |
342 (0.20 %) |
322 (100.00 %) |
456,476 (3.62 %) |
260,495 (7.70 %) |
5,658,773 (24.81 %) |
60,606 (5.66 %) |
273 | Hawaiian crow (2021 genbank) GCA_020740725.1 |
51,593 (54.67 %) |
12,737 (1.83 %) |
23,664 (2.30 %) |
n/a | 43.30 (99.84 %) |
294 (0.16 %) |
187 (100.00 %) |
502,844 (6.10 %) |
304,680 (5.73 %) |
5,953,316 (23.59 %) |
46,108 (3.49 %) |
274 | Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank) GCA_002201575.1 |
n/a | 19,385 (1.74 %) |
20,265 (1.41 %) |
33,375 (1.66 %) |
41.41 (97.77 %) |
38,833 (2.24 %) |
7,871 (100.00 %) |
4,629,031 (43.70 %) |
573,328 (1.09 %) |
13,374,887 (33.10 %) |
50,379 (1.45 %) |
275 | Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq) GCF_002201575.1 |
29,897 (1.95 %) |
19,404 (1.74 %) |
20,264 (1.41 %) |
33,412 (1.67 %) |
41.41 (97.77 %) |
38,833 (2.24 %) |
7,872 (100.00 %) |
4,547,865 (43.29 %) |
573,335 (1.09 %) |
13,374,928 (33.10 %) |
50,380 (1.45 %) |
276 | hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank) GCA_030028045.1 |
64,153 (41.00 %) |
20,337 (1.62 %) |
20,633 (1.37 %) |
n/a | 41.60 (100.00 %) |
226 (0.00 %) |
356 (100.00 %) |
3,783,435 (35.17 %) |
567,796 (3.38 %) |
13,462,481 (35.48 %) |
48,365 (1.91 %) |
277 | Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.1 |
49,894 (2.81 %) |
18,317 (1.66 %) |
19,991 (1.63 %) |
n/a | 42.33 (99.79 %) |
38,823 (0.21 %) |
27,486 (100.00 %) |
2,844,834 (29.10 %) |
367,443 (1.49 %) |
11,805,151 (31.26 %) |
59,262 (1.70 %) |
278 | honeybee mite (v1 2017) GCF_002443255.1 |
35,654 (12.86 %) |
2,741 (0.61 %) |
28,868 (8.05 %) |
n/a | 40.92 (99.93 %) |
3,073 (0.07 %) |
1,426 (100.00 %) |
117,879 (1.26 %) |
43,685 (1.30 %) |
1,858,762 (15.09 %) |
31,400 (5.04 %) |
279 | hooded crow (v2 S_Up_H32 2017) GCF_000738735.2 |
35,874 (6.47 %) |
11,298 (1.84 %) |
17,627 (2.12 %) |
n/a | 41.48 (97.07 %) |
27,795 (2.94 %) |
113 (100.00 %) |
392,199 (5.95 %) |
139,126 (0.76 %) |
6,141,002 (18.21 %) |
12,943 (0.48 %) |
280 | hooded crow (v5 S_Up_H32 2021) GCF_000738735.5 |
42,799 (57.51 %) |
11,845 (1.92 %) |
20,738 (2.23 %) |
n/a | 42.10 (99.68 %) |
425 (0.32 %) |
47 (100.00 %) |
421,463 (6.12 %) |
164,830 (0.93 %) |
6,148,741 (19.00 %) |
25,266 (2.09 %) |
281 | horse (Twilight 2007 genbank) GCA_000002305.1 |
n/a | 18,575 (1.67 %) |
17,121 (1.34 %) |
n/a | 41.50 (98.14 %) |
45,680 (1.86 %) |
55,316 (98.14 %) |
3,941,878 (45.17 %) |
381,229 (1.99 %) |
14,674,265 (29.80 %) |
45,521 (1.52 %) |
282 | hourglass treefrog (paternal 2023 genbank) GCA_027789765.1 |
n/a | 14,058 (0.89 %) |
31,050 (2.69 %) |
n/a | 43.97 (99.70 %) |
804 (0.30 %) |
2,200 (100.00 %) |
906,816 (2.43 %) |
1,710,859 (17.48 %) |
10,069,798 (51.41 %) |
235,277 (5.56 %) |
283 | house finch (primary hap 2022 genbank) GCA_027477595.1 |
43,228 (49.63 %) |
12,700 (1.83 %) |
24,567 (2.38 %) |
n/a | 42.91 (99.02 %) |
295 (0.98 %) |
183 (100.00 %) |
440,379 (3.17 %) |
463,164 (6.37 %) |
6,300,100 (23.47 %) |
30,897 (2.53 %) |
284 | house fly (aabys 2013 genbank) GCA_000371365.1 |
n/a | 7,825 (1.36 %) |
12,819 (3.07 %) |
n/a | 35.11 (92.22 %) |
102,610 (7.82 %) |
104,053 (92.18 %) |
415,874 (2.30 %) |
376,409 (8.80 %) |
4,931,104 (52.61 %) |
7,139 (0.35 %) |
285 | house mouse (AKR_J v1 2016) GCA_001624295.1 |
n/a | 21,299 (2.19 %) |
18,730 (1.41 %) |
102,168 (4.09 %) |
41.70 (86.82 %) |
314,064 (13.22 %) |
40,550 (96.00 %) |
5,186,721 (40.97 %) |
1,485,719 (3.05 %) |
13,610,761 (27.42 %) |
16,745 (0.41 %) |
286 | house mouse (A_J v1 2016) GCA_001624215.1 |
n/a | 21,171 (2.20 %) |
18,776 (1.40 %) |
102,254 (4.12 %) |
41.70 (89.34 %) |
365,877 (10.71 %) |
33,692 (96.01 %) |
5,186,523 (40.90 %) |
1,483,826 (3.06 %) |
13,614,266 (28.13 %) |
16,590 (0.42 %) |
287 | house mouse (BALB_cJ v1 2016) GCA_001632525.1 |
n/a | 21,337 (2.21 %) |
18,682 (1.41 %) |
102,138 (4.14 %) |
41.74 (88.91 %) |
361,689 (11.14 %) |
37,453 (95.84 %) |
5,096,953 (40.72 %) |
1,407,754 (2.90 %) |
13,416,041 (27.66 %) |
16,788 (0.42 %) |
288 | house mouse (C3H_HeJ v1 2016) GCA_001632575.1 |
n/a | 21,177 (2.22 %) |
18,550 (1.42 %) |
101,710 (4.15 %) |
41.74 (85.90 %) |
369,499 (14.15 %) |
37,497 (95.91 %) |
5,089,496 (40.41 %) |
1,399,438 (2.72 %) |
13,485,480 (26.52 %) |
16,675 (0.41 %) |
289 | house mouse (CBA_J v1 2016) GCA_001624475.1 |
n/a | 21,259 (2.23 %) |
18,593 (1.42 %) |
101,632 (4.14 %) |
41.78 (79.43 %) |
410,639 (20.63 %) |
42,242 (96.14 %) |
5,081,543 (40.40 %) |
1,393,763 (2.54 %) |
13,472,532 (24.46 %) |
16,809 (0.38 %) |
290 | house mouse (DBA_2J v1 2016) GCA_001624505.1 |
n/a | 21,156 (2.23 %) |
18,610 (1.43 %) |
101,908 (4.18 %) |
41.80 (88.67 %) |
409,306 (11.39 %) |
42,324 (95.14 %) |
5,028,217 (40.37 %) |
1,364,702 (2.73 %) |
13,540,805 (27.33 %) |
16,544 (0.42 %) |
291 | house mouse (FVB_NJ v1 2016) GCA_001624535.1 |
n/a | 21,195 (2.22 %) |
18,615 (1.42 %) |
101,520 (4.15 %) |
41.75 (89.39 %) |
380,840 (10.66 %) |
67,805 (93.73 %) |
5,037,447 (40.28 %) |
1,381,859 (2.89 %) |
13,440,164 (27.32 %) |
16,625 (0.42 %) |
292 | house mouse (GRCm38.p6 2017) GCF_000001635.26 |
123,667 (4.49 %) |
24,134 (2.09 %) |
22,855 (1.67 %) |
n/a | 41.73 (97.18 %) |
904 (2.82 %) |
21,179 (97.18 %) |
5,554,281 (45.50 %) |
1,695,255 (3.40 %) |
13,041,229 (35.91 %) |
25,014 (0.54 %) |
293 | house mouse (LP_J v1 2016) GCA_001632615.1 |
n/a | 21,012 (2.23 %) |
18,555 (1.43 %) |
101,892 (4.18 %) |
41.78 (84.14 %) |
402,247 (15.91 %) |
38,542 (95.89 %) |
5,032,748 (40.03 %) |
1,373,374 (2.60 %) |
13,411,126 (25.61 %) |
16,668 (0.40 %) |
294 | house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016) GCA_001624675.1 |
n/a | 21,291 (2.24 %) |
19,697 (1.47 %) |
101,562 (4.18 %) |
42.00 (77.13 %) |
595,433 (22.95 %) |
66,154 (95.79 %) |
5,059,815 (40.57 %) |
1,370,443 (2.51 %) |
13,251,532 (23.62 %) |
18,188 (0.42 %) |
295 | house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016) GCA_001624745.1 |
n/a | 21,233 (2.22 %) |
18,805 (1.43 %) |
103,134 (4.18 %) |
41.74 (86.47 %) |
337,909 (13.58 %) |
57,439 (95.37 %) |
5,112,301 (40.60 %) |
1,418,629 (2.92 %) |
13,588,055 (27.01 %) |
16,857 (0.41 %) |
296 | human (GRCh38.p13 2019) GCF_000001405.39 |
172,809 (4.43 %) |
23,121 (1.97 %) |
27,697 (1.78 %) |
n/a | 41.04 (95.07 %) |
1,268 (4.93 %) |
46,029 (95.07 %) |
5,859,855 (52.78 %) |
1,037,733 (4.60 %) |
16,933,424 (36.88 %) |
56,646 (1.06 %) |
297 | human (GRCh38.p14 2022) GCF_000001405.40 |
188,352 (5.12 %) |
23,474 (1.98 %) |
28,557 (1.86 %) |
n/a | 41.05 (95.10 %) |
1,270 (4.90 %) |
46,502 (95.10 %) |
5,910,293 (52.77 %) |
1,047,827 (4.59 %) |
17,068,934 (36.82 %) |
57,427 (1.07 %) |
298 | human (NA24385.mat 2021) GCA_018852615.1 |
n/a | 20,744 (1.84 %) |
21,968 (1.22 %) |
233,779 (4.92 %) |
40.85 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
445 (100.00 %) |
5,435,410 (53.40 %) |
1,086,871 (8.27 %) |
15,970,867 (40.97 %) |
53,581 (1.32 %) |
299 | human (NA24385.mat 2022) GCA_021951015.1 |
n/a | 20,809 (1.82 %) |
21,369 (1.18 %) |
234,089 (4.92 %) |
40.85 (99.95 %) |
109 (0.05 %) |
355 (100.00 %) |
5,489,855 (53.93 %) |
1,085,681 (8.26 %) |
15,968,830 (40.95 %) |
53,511 (1.32 %) |
300 | human (NA24385.pat 2021) GCA_018852605.1 |
n/a | 19,919 (1.83 %) |
21,582 (1.22 %) |
227,333 (4.91 %) |
40.87 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
610 (100.00 %) |
5,215,774 (53.54 %) |
1,094,036 (9.09 %) |
15,125,069 (41.29 %) |
52,653 (1.34 %) |
301 | human (NA24385.pat 2022) GCA_021950905.1 |
n/a | 20,014 (1.81 %) |
20,716 (1.19 %) |
227,278 (4.91 %) |
40.87 (99.97 %) |
117 (0.03 %) |
514 (100.00 %) |
5,293,356 (54.01 %) |
1,100,786 (9.09 %) |
15,122,569 (41.27 %) |
52,546 (1.35 %) |
302 | human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank) GCA_000845685.2 |
n/a | n/a | n/a | n/a | 42.44 (100.00 %) |
n/a | 1 (100.00 %) |
33 (1.67 %) |
36 (4.27 %) |
603 (9.83 %) |
3 (13.72 %) |
303 | human T2T CHM13 v2.0 GCA_009914755.4 |
108,944 (51.73 %) |
20,844 (1.79 %) |
21,287 (1.16 %) |
n/a | 40.75 (100.00 %) |
n/a | 25 (100.00 %) |
5,591,082 (54.45 %) |
1,155,353 (8.89 %) |
16,163,340 (41.63 %) |
52,408 (1.38 %) |
304 | Iberian mole (v1 TD23 2020) GCF_014898055.1 |
46,872 (2.59 %) |
18,566 (1.67 %) |
20,793 (1.59 %) |
n/a | 41.91 (99.98 %) |
3,640 (0.02 %) |
4,425 (100.00 %) |
3,269,038 (31.47 %) |
501,677 (1.32 %) |
11,176,747 (32.61 %) |
48,076 (2.80 %) |
305 | Iberian mole (v2 TD23 2020) GCF_014898055.2 |
46,746 (2.60 %) |
18,453 (1.69 %) |
20,410 (1.59 %) |
n/a | 41.90 (99.98 %) |
3,639 (0.02 %) |
3,202 (100.00 %) |
2,637,156 (23.36 %) |
497,087 (1.30 %) |
10,984,260 (32.64 %) |
47,552 (2.89 %) |
306 | Indian glassy fish (v1 2019) GCF_900634625.1 |
44,096 (12.32 %) |
15,337 (3.60 %) |
23,988 (7.92 %) |
60,224 (10.41 %) |
42.38 (98.08 %) |
1,523 (1.92 %) |
156 (100.00 %) |
346,406 (3.02 %) |
163,522 (3.00 %) |
2,755,229 (25.07 %) |
17,930 (1.47 %) |
307 | Indian medaka GCF_002922805.1 |
47,300 (9.26 %) |
14,561 (2.50 %) |
31,867 (6.43 %) |
n/a | 39.04 (94.73 %) |
51,440 (5.29 %) |
8,603 (100.00 %) |
319,637 (2.20 %) |
208,749 (2.67 %) |
5,412,794 (33.26 %) |
40,721 (2.36 %) |
308 | Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023) GCF_027563975.1 |
28,377 (14.36 %) |
4,799 (1.56 %) |
15,737 (7.20 %) |
n/a | 35.38 (100.00 %) |
26 (0.00 %) |
46 (100.00 %) |
136,242 (3.33 %) |
48,275 (1.61 %) |
2,518,372 (36.69 %) |
14,106 (2.86 %) |
309 | Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad) GCA_004027435.1 |
n/a | 21,188 (1.26 %) |
41,550 (1.34 %) |
35,477 (1.51 %) |
42.19 (99.92 %) |
4,324 (0.02 %) |
798,700 (99.98 %) |
3,297,388 (28.66 %) |
476,792 (1.23 %) |
13,144,912 (34.13 %) |
81,685 (1.86 %) |
310 | Japanese quail GCF_001577835.1 |
47,008 (7.38 %) |
12,864 (2.55 %) |
36,126 (11.03 %) |
n/a | 41.28 (98.88 %) |
11,601 (1.12 %) |
9,642 (98.88 %) |
466,141 (6.58 %) |
321,128 (2.22 %) |
5,497,911 (19.81 %) |
17,977 (1.86 %) |
311 | Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018) GCF_003227715.1 |
29,097 (10.82 %) |
4,337 (1.33 %) |
43,907 (11.32 %) |
n/a | 44.75 (99.72 %) |
499 (0.28 %) |
857 (100.00 %) |
439,110 (17.67 %) |
262,539 (5.69 %) |
1,834,301 (29.28 %) |
6,204 (9.08 %) |
312 | kakapo (Jane v1 2019) GCF_004027225.1 |
49,444 (5.77 %) |
13,114 (1.92 %) |
17,732 (2.50 %) |
29,004 (4.44 %) |
41.97 (97.63 %) |
362 (2.37 %) |
99 (100.00 %) |
548,758 (10.76 %) |
208,171 (1.07 %) |
6,258,082 (20.20 %) |
22,279 (1.75 %) |
313 | kakapo (Jane v2 2020 genbank) GCA_004027225.2 |
49,757 (54.33 %) |
13,112 (1.92 %) |
17,637 (2.48 %) |
n/a | 41.97 (99.08 %) |
373 (0.92 %) |
90 (100.00 %) |
507,072 (7.85 %) |
208,180 (1.08 %) |
6,258,178 (20.50 %) |
22,278 (1.77 %) |
314 | koala (Bilbo 61053 2017) GCF_002099425.1 |
55,723 (2.15 %) |
17,500 (0.86 %) |
16,193 (0.94 %) |
n/a | 39.05 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
1,907 (100.00 %) |
7,814,631 (41.58 %) |
1,123,545 (2.03 %) |
21,796,057 (39.25 %) |
15,957 (0.35 %) |
315 | Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank) GCA_009829125.1 |
29,504 (53.56 %) |
14,221 (2.37 %) |
44,144 (5.80 %) |
41,384 (6.20 %) |
40.22 (99.05 %) |
700 (0.95 %) |
124 (100.00 %) |
423,338 (4.48 %) |
551,472 (7.22 %) |
4,887,148 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
316 | Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq) GCF_009829125.1 |
29,517 (6.48 %) |
14,243 (2.37 %) |
44,144 (5.80 %) |
41,421 (6.20 %) |
40.22 (99.05 %) |
700 (0.95 %) |
124 (100.00 %) |
423,274 (4.48 %) |
551,472 (7.22 %) |
4,887,142 (38.97 %) |
37,287 (2.58 %) |
317 | lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank) GCA_023638135.1 |
48,561 (51.20 %) |
12,862 (1.69 %) |
21,562 (1.92 %) |
n/a | 43.03 (99.83 %) |
158 (0.17 %) |
397 (100.00 %) |
439,975 (3.77 %) |
203,640 (6.96 %) |
6,921,438 (23.57 %) |
32,398 (2.65 %) |
318 | large cabbage white (genbank 2021) GCA_905147105.1 |
24,631 (60.59 %) |
4,550 (1.47 %) |
9,197 (5.18 %) |
30,394 (12.69 %) |
34.13 (100.00 %) |
29 (0.00 %) |
402 (100.00 %) |
123,352 (2.30 %) |
36,616 (6.05 %) |
2,431,238 (41.04 %) |
8,442 (2.49 %) |
319 | large tree shrew (BS70 2019 Broad) GCA_004365275.1 |
n/a | 26,266 (0.71 %) |
59,868 (0.81 %) |
n/a | 42.00 (99.77 %) |
6,466 (0.02 %) |
3,890,086 (99.98 %) |
7,163,973 (22.64 %) |
1,629,329 (2.64 %) |
18,970,992 (42.82 %) |
138,732 (1.75 %) |
320 | leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K) GCA_009764565.1 |
n/a | 14,572 (1.03 %) |
16,165 (1.42 %) |
n/a | 43.36 (99.74 %) |
558 (0.26 %) |
55 (100.00 %) |
1,631,923 (15.09 %) |
303,440 (1.14 %) |
11,122,938 (34.12 %) |
35,505 (1.37 %) |
321 | leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019) GCA_009762595.1 |
n/a | 10,857 (1.01 %) |
15,585 (1.46 %) |
n/a | 43.54 (100.00 %) |
n/a | 8,982 (100.00 %) |
1,090,219 (15.03 %) |
206,192 (1.19 %) |
7,154,939 (33.03 %) |
25,155 (1.42 %) |
322 | leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K) GCF_009764565.2 |
62,576 (3.50 %) |
14,610 (1.03 %) |
16,359 (1.45 %) |
n/a | 43.35 (99.74 %) |
667 (0.26 %) |
40 (100.00 %) |
1,637,236 (15.13 %) |
304,730 (1.14 %) |
11,121,967 (34.21 %) |
35,485 (1.36 %) |
323 | Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002875.2 |
n/a | 591 (1.09 %) |
4,193 (46.51 %) |
n/a | 59.58 (99.94 %) |
454 (0.06 %) |
76 (100.00 %) |
24,390 (4.61 %) |
4,228 (1.93 %) |
243,087 (20.97 %) |
92 (99.40 %) |
324 | Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank) GCA_000002725.2 |
n/a | 626 (1.15 %) |
4,290 (46.53 %) |
n/a | 59.72 (100.00 %) |
7 (0.00 %) |
43 (100.00 %) |
33,021 (5.20 %) |
8,477 (2.43 %) |
238,932 (20.91 %) |
41 (99.80 %) |
325 | Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank) GCA_017916325.1 |
n/a | 619 (1.14 %) |
3,882 (44.58 %) |
n/a | 59.85 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
42 (100.00 %) |
20,726 (2.91 %) |
2,267 (2.64 %) |
232,973 (20.45 %) |
44 (99.29 %) |
326 | Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank) GCA_017916335.1 |
n/a | 643 (1.12 %) |
4,666 (45.26 %) |
n/a | 59.72 (99.99 %) |
11 (0.00 %) |
98 (100.00 %) |
22,632 (2.47 %) |
4,241 (2.74 %) |
231,120 (20.18 %) |
100 (99.82 %) |
327 | leopard (Maewha 2016 genbank) GCA_001857705.1 |
73,266 (49.50 %) |
18,874 (1.62 %) |
21,014 (1.44 %) |
n/a | 41.71 (96.17 %) |
214,953 (3.85 %) |
265,329 (96.15 %) |
5,246,283 (42.87 %) |
1,059,443 (5.13 %) |
14,265,514 (32.20 %) |
77,000 (2.45 %) |
328 | lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank) GCA_000280705.1 |
25,978 (33.60 %) |
19,393 (1.38 %) |
20,311 (1.35 %) |
n/a | 41.87 (87.17 %) |
326,464 (12.87 %) |
337,359 (87.13 %) |
6,205,858 (38.76 %) |
832,823 (1.53 %) |
13,661,563 (33.98 %) |
26,669 (0.59 %) |
329 | lesser kestrel (v1 2021) GCF_017639655.1 |
47,420 (5.64 %) |
13,097 (1.80 %) |
22,203 (2.07 %) |
n/a | 42.30 (99.66 %) |
298 (0.34 %) |
291 (100.00 %) |
516,498 (5.58 %) |
210,236 (1.26 %) |
7,133,927 (19.19 %) |
27,558 (2.21 %) |
330 | lesser rhea (primary hap 2023 genbank) GCA_028389875.1 |
39,024 (47.65 %) |
13,358 (1.72 %) |
23,870 (2.13 %) |
n/a | 42.45 (99.89 %) |
128 (0.11 %) |
179 (100.00 %) |
674,141 (6.73 %) |
329,122 (5.34 %) |
6,820,211 (22.78 %) |
45,073 (5.83 %) |
331 | lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank) GCA_036850995.1 |
n/a | 18,322 (1.42 %) |
21,350 (1.39 %) |
n/a | 41.84 (99.24 %) |
573 (0.76 %) |
345 (99.51 %) |
4,224,340 (28.69 %) |
1,030,574 (2.60 %) |
12,591,928 (42.30 %) |
98,189 (2.06 %) |
332 | lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank) GCA_027579695.1 |
53,323 (53.05 %) |
15,841 (0.90 %) |
85,700 (3.30 %) |
n/a | 42.44 (99.43 %) |
334 (0.57 %) |
38 (100.00 %) |
5,905,868 (49.76 %) |
1,126,468 (6.51 %) |
7,609,180 (62.74 %) |
166,630 (4.38 %) |
333 | lettuce (Salinas v7 2018) GCF_002870075.1 |
60,760 (2.83 %) |
16,272 (0.65 %) |
109,234 (6.86 %) |
n/a | 37.79 (92.71 %) |
350,251 (7.33 %) |
11,453 (100.00 %) |
946,986 (1.96 %) |
983,572 (3.65 %) |
12,334,735 (53.11 %) |
117,678 (2.02 %) |
334 | lettuce (Salinas v8 2020) GCF_002870075.3 |
64,708 (2.94 %) |
16,252 (0.65 %) |
101,828 (6.36 %) |
n/a | 37.79 (92.44 %) |
351,533 (7.59 %) |
9,960 (99.71 %) |
945,052 (1.95 %) |
983,641 (3.64 %) |
12,325,371 (53.00 %) |
117,703 (2.02 %) |
335 | live sharksucker (v1 2019) GCF_900963305.1 |
40,255 (11.91 %) |
14,975 (3.53 %) |
22,304 (7.09 %) |
56,266 (9.51 %) |
41.43 (99.89 %) |
140 (0.11 %) |
38 (100.00 %) |
448,828 (3.61 %) |
146,353 (1.65 %) |
3,204,476 (21.79 %) |
16,807 (1.33 %) |
336 | lumpfish (primary hap 2019 genbank) GCA_009769545.1 |
41,612 (58.17 %) |
14,748 (3.32 %) |
49,223 (8.10 %) |
52,721 (8.34 %) |
42.83 (98.22 %) |
347 (1.78 %) |
49 (100.00 %) |
478,416 (6.02 %) |
421,634 (11.07 %) |
2,928,668 (27.98 %) |
53,323 (5.09 %) |
337 | Ma's night monkey genbank GCA_000952055.2 |
55,061 (41.68 %) |
21,084 (1.92 %) |
22,287 (1.31 %) |
n/a | 40.74 (94.86 %) |
83,929 (5.15 %) |
112,850 (94.85 %) |
5,109,404 (47.71 %) |
734,754 (2.02 %) |
15,854,134 (33.62 %) |
36,070 (0.90 %) |
338 | malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank) GCA_000002765.3 |
n/a | n/a | n/a | n/a | 19.34 (100.00 %) |
n/a | 16 (100.00 %) |
79,857 (19.18 %) |
78,154 (15.50 %) |
186,960 (66.90 %) |
22 (0.04 %) |
339 | Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank) GCA_001685135.1 |
48,578 (30.31 %) |
19,449 (1.56 %) |
24,645 (1.37 %) |
41,235 (1.95 %) |
40.78 (92.27 %) |
984,656 (7.81 %) |
80,669 (100.00 %) |
3,063,619 (35.20 %) |
866,306 (3.08 %) |
13,310,826 (28.76 %) |
35,558 (0.84 %) |
340 | malo sina (v1 2012) GCF_000231095.1 |
29,549 (16.44 %) |
15,120 (6.45 %) |
49,515 (30.69 %) |
n/a | 40.48 (93.32 %) |
20,693 (6.71 %) |
23,184 (93.29 %) |
115,049 (2.29 %) |
51,516 (1.90 %) |
1,488,940 (24.12 %) |
42,077 (12.05 %) |
341 | mangrove rivulus GCF_001649575.1 |
45,306 (11.02 %) |
14,510 (2.84 %) |
29,750 (6.81 %) |
n/a | 40.03 (94.35 %) |
29,388 (5.66 %) |
3,073 (100.00 %) |
345,930 (2.32 %) |
146,268 (1.33 %) |
4,717,260 (27.31 %) |
39,557 (2.69 %) |
342 | meadow brown (genbank 2021) GCA_905333055.1 |
29,488 (69.09 %) |
4,863 (1.16 %) |
19,812 (6.60 %) |
27,763 (8.31 %) |
36.96 (100.00 %) |
21 (0.00 %) |
32 (100.00 %) |
227,482 (2.41 %) |
107,773 (3.02 %) |
2,456,144 (43.97 %) |
24,873 (3.15 %) |
343 | meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank) GCA_006229205.1 |
n/a | 19,020 (1.63 %) |
19,812 (1.43 %) |
42,441 (2.08 %) |
41.68 (99.72 %) |
65,245 (0.28 %) |
63,791 (100.00 %) |
4,552,310 (40.02 %) |
634,179 (1.21 %) |
13,631,635 (32.17 %) |
64,849 (2.13 %) |
344 | meerkat (BS45 2019 Broad) GCA_004023905.1 |
n/a | 21,726 (1.54 %) |
31,908 (1.39 %) |
n/a | 41.89 (99.96 %) |
4,153 (0.02 %) |
354,021 (99.98 %) |
4,835,157 (40.73 %) |
693,037 (1.32 %) |
13,779,279 (33.49 %) |
76,740 (2.37 %) |
345 | melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014) GCF_000806345.1 |
26,008 (10.49 %) |
7,743 (3.09 %) |
12,206 (6.18 %) |
n/a | 35.15 (84.42 %) |
37,430 (15.62 %) |
43,002 (84.38 %) |
237,943 (3.36 %) |
74,977 (1.26 %) |
2,410,203 (31.96 %) |
15,259 (2.01 %) |
346 | microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank) GCA_000209485.1 |
n/a | 238 (3.03 %) |
394 (8.09 %) |
n/a | 33.70 (99.89 %) |
437 (0.04 %) |
1,743 (99.97 %) |
1,511 (2.99 %) |
268 (0.36 %) |
31,900 (26.59 %) |
373 (7.62 %) |
347 | microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002) GCF_000091225.1 |
1,996 (85.79 %) |
1,569 (68.26 %) |
596 (33.73 %) |
n/a | 47.31 (99.97 %) |
4 (0.03 %) |
15 (99.97 %) |
257 (0.70 %) |
199 (0.40 %) |
10,819 (8.68 %) |
126 (3.52 %) |
348 | microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank) GCA_000182985.1 |
n/a | 348 (2.68 %) |
284 (3.31 %) |
n/a | 25.26 (99.86 %) |
n/a | 5,465 (100.00 %) |
3,179 (1.99 %) |
1,572 (1.39 %) |
85,189 (41.34 %) |
4 (0.02 %) |
349 | minke whale (2013 genbank) GCA_000493695.1 |
42,553 (41.45 %) |
19,298 (1.81 %) |
18,661 (1.42 %) |
n/a | 40.94 (94.06 %) |
173,296 (5.96 %) |
184,071 (94.04 %) |
4,041,828 (42.24 %) |
573,950 (1.48 %) |
13,504,295 (30.96 %) |
65,448 (1.38 %) |
350 | minke whale (primary hap 2023 genbank) GCA_949987535.1 |
61,711 (41.50 %) |
19,544 (1.49 %) |
21,502 (1.26 %) |
n/a | 41.55 (99.99 %) |
1,177 (0.01 %) |
1,375 (100.00 %) |
4,006,932 (35.92 %) |
1,058,106 (12.08 %) |
12,708,154 (42.66 %) |
72,756 (1.59 %) |
351 | mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017) GCF_002532875.1 |
35,332 (12.83 %) |
2,750 (0.61 %) |
29,731 (8.07 %) |
n/a | 40.94 (99.89 %) |
3,360 (0.11 %) |
8,241 (99.89 %) |
115,140 (1.18 %) |
39,880 (0.71 %) |
1,832,298 (14.55 %) |
31,479 (5.12 %) |
352 | Mongolian gerbil (US013 2019 Broad) GCA_004026785.1 |
n/a | 21,302 (1.57 %) |
27,162 (1.27 %) |
40,982 (1.78 %) |
41.88 (99.90 %) |
11,139 (0.04 %) |
796,326 (99.96 %) |
5,253,752 (39.29 %) |
1,211,658 (3.13 %) |
13,894,596 (38.35 %) |
24,829 (0.69 %) |
353 | monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank) GCA_019393635.1 |
47,034 (41.56 %) |
18,428 (0.81 %) |
15,519 (0.85 %) |
n/a | 39.11 (99.91 %) |
260 (0.09 %) |
18 (100.00 %) |
7,426,369 (29.77 %) |
1,249,638 (2.12 %) |
21,135,395 (42.80 %) |
16,598 (0.36 %) |
354 | moth C.splendana (v1 2021 genbank) GCA_910591565.1 |
n/a | 4,930 (0.75 %) |
38,413 (8.53 %) |
35,924 (4.55 %) |
38.08 (99.99 %) |
150 (0.01 %) |
112 (100.00 %) |
261,421 (1.99 %) |
175,466 (5.62 %) |
3,107,482 (46.30 %) |
58,547 (5.75 %) |
355 | moth S.litura (Ishihara v1 2017) GCF_002706865.1 |
25,114 (8.87 %) |
5,088 (1.13 %) |
22,625 (7.19 %) |
n/a | 36.56 (97.52 %) |
10,662 (2.49 %) |
13,637 (97.51 %) |
154,017 (1.49 %) |
50,642 (0.97 %) |
2,919,487 (37.00 %) |
34,396 (3.66 %) |
356 | mung bean (VC1973A 2015 genbank) GCA_000741045.2 |
n/a | 16,645 (3.88 %) |
43,866 (14.64 %) |
n/a | 33.16 (92.79 %) |
96,870 (7.25 %) |
2,463 (100.00 %) |
265,072 (3.32 %) |
198,918 (3.34 %) |
2,840,410 (34.89 %) |
13,926 (1.48 %) |
357 | mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019) GCA_009769485.1 |
n/a | 10,083 (1.97 %) |
18,350 (2.23 %) |
n/a | 42.22 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
5,616 (100.00 %) |
485,827 (7.06 %) |
212,892 (1.28 %) |
4,756,962 (19.95 %) |
25,670 (3.87 %) |
358 | mute swan (v1 primary hap 2019) GCA_009769625.1 |
n/a | 12,973 (1.97 %) |
22,300 (2.18 %) |
n/a | 41.92 (99.06 %) |
446 (0.94 %) |
181 (100.00 %) |
688,720 (7.65 %) |
301,358 (1.34 %) |
6,775,217 (21.21 %) |
31,271 (3.60 %) |
359 | naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank) GCA_000247695.1 |
74,574 (44.06 %) |
21,317 (1.73 %) |
20,856 (1.51 %) |
n/a | 40.21 (88.43 %) |
110,424 (11.59 %) |
114,652 (88.41 %) |
4,162,977 (32.77 %) |
484,933 (0.92 %) |
13,672,503 (27.63 %) |
31,950 (0.88 %) |
360 | narwhal (BS41 2019 Broad) GCA_004026685.1 |
n/a | 21,418 (1.52 %) |
34,189 (1.28 %) |
n/a | 41.35 (99.92 %) |
8,600 (0.03 %) |
653,473 (99.97 %) |
4,512,168 (44.82 %) |
592,047 (1.17 %) |
13,009,453 (37.18 %) |
63,033 (1.47 %) |
361 | Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank) GCA_027579445.1 |
31,033 (46.15 %) |
12,385 (1.72 %) |
24,339 (2.24 %) |
n/a | 43.01 (99.57 %) |
215 (0.43 %) |
77 (100.00 %) |
479,994 (3.33 %) |
443,098 (9.18 %) |
6,350,593 (25.82 %) |
31,693 (3.88 %) |
362 | nematode C.briggsae (AF16 v1 2008) GCF_000004555.1 |
19,404 (22.65 %) |
12,088 (12.63 %) |
7,533 (12.85 %) |
n/a | 37.35 (97.22 %) |
6,713 (2.80 %) |
607 (99.95 %) |
116,909 (19.60 %) |
45,475 (4.23 %) |
820,686 (35.42 %) |
4,887 (1.65 %) |
363 | New South Wales waratah (AGSP 2013) GCF_000471905.2 |
36,251 (5.66 %) |
10,150 (1.34 %) |
42,117 (8.90 %) |
n/a | 37.47 (94.63 %) |
39,556 (5.39 %) |
45,302 (94.61 %) |
396,916 (3.25 %) |
506,716 (6.41 %) |
4,768,175 (36.07 %) |
17,009 (0.90 %) |
364 | nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank) GCA_000208655.2 |
n/a | 21,293 (1.15 %) |
25,302 (1.09 %) |
n/a | 40.77 (90.89 %) |
268,442 (9.13 %) |
314,971 (90.87 %) |
5,327,246 (49.09 %) |
651,311 (1.26 %) |
19,267,381 (38.27 %) |
139,552 (2.47 %) |
365 | nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq) GCF_000208655.1 |
46,144 (1.87 %) |
21,316 (1.15 %) |
25,308 (1.09 %) |
n/a | 40.77 (90.89 %) |
268,442 (9.13 %) |
314,972 (90.87 %) |
5,328,146 (49.10 %) |
651,316 (1.26 %) |
19,267,438 (38.27 %) |
139,552 (2.47 %) |
366 | North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank) GCA_028564815.1 |
n/a | 19,541 (1.47 %) |
21,516 (1.25 %) |
n/a | 41.69 (99.83 %) |
363 (0.17 %) |
779 (100.00 %) |
1,361,117 (2.23 %) |
836,632 (13.12 %) |
12,597,969 (44.00 %) |
93,862 (1.92 %) |
367 | northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021) GCF_021288785.1 |
49,934 (2.73 %) |
20,106 (1.74 %) |
20,957 (1.35 %) |
n/a | 41.51 (99.35 %) |
39,936 (0.65 %) |
142,455 (100.00 %) |
4,434,732 (35.01 %) |
588,877 (1.19 %) |
13,745,426 (32.96 %) |
52,064 (1.59 %) |
368 | northern house mosquito (v1 TS 2021) GCF_016801865.1 |
28,512 (7.14 %) |
5,830 (1.09 %) |
39,806 (8.27 %) |
n/a | 36.76 (100.00 %) |
n/a | 1,714 (100.00 %) |
222,294 (5.58 %) |
187,561 (9.87 %) |
3,009,613 (56.49 %) |
63,009 (9.78 %) |
369 | northern pike (primary hap 2020 genbank) GCA_011004845.1 |
63,720 (60.35 %) |
16,616 (2.41 %) |
55,784 (5.64 %) |
82,918 (8.82 %) |
42.22 (99.89 %) |
112 (0.11 %) |
53 (100.00 %) |
1,039,521 (30.93 %) |
524,708 (7.32 %) |
4,691,094 (32.91 %) |
42,910 (2.52 %) |
370 | northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC) GCA_000146795.3 |
n/a | 20,134 (1.89 %) |
18,568 (1.14 %) |
n/a | 40.76 (93.09 %) |
180,468 (6.94 %) |
197,908 (93.06 %) |
5,169,984 (51.90 %) |
831,865 (4.16 %) |
15,243,657 (35.77 %) |
65,761 (1.00 %) |
371 | Norway rat BN7 genbank GCA_015227675.2 |
n/a | 21,523 (1.86 %) |
19,627 (1.36 %) |
54,530 (2.79 %) |
41.99 (99.19 %) |
581 (0.81 %) |
757 (99.19 %) |
4,895,563 (44.53 %) |
1,514,974 (3.57 %) |
13,450,428 (35.83 %) |
19,244 (0.46 %) |
372 | olive baboon (2017 HGSC genbank) GCA_000264685.2 |
n/a | 20,319 (1.82 %) |
21,542 (1.19 %) |
n/a | 40.99 (99.25 %) |
58,981 (0.76 %) |
118,810 (99.24 %) |
5,524,514 (52.78 %) |
1,068,912 (5.55 %) |
16,068,031 (38.71 %) |
95,595 (1.41 %) |
373 | olive baboon (2017 HGSC RefSeq) GCF_000264685.3 |
84,433 (3.85 %) |
20,317 (1.83 %) |
21,239 (1.18 %) |
n/a | 40.99 (99.25 %) |
58,981 (0.76 %) |
118,811 (99.24 %) |
5,525,293 (52.79 %) |
1,068,912 (5.55 %) |
16,068,088 (38.71 %) |
95,595 (1.41 %) |
374 | oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank) GCA_015104395.1 |
n/a | 1,945 (0.08 %) |
23,579 (1.88 %) |
n/a | 36.81 (99.60 %) |
16,132 (0.41 %) |
16,156 (99.59 %) |
2,706,474 (10.11 %) |
2,525,264 (12.75 %) |
9,704,257 (48.31 %) |
77,313 (3.01 %) |
375 | painted lady (genbank 2021) GCA_905220365.1 |
20,948 (56.23 %) |
4,705 (1.06 %) |
15,277 (5.00 %) |
29,018 (10.11 %) |
33.42 (99.99 %) |
91 (0.01 %) |
37 (100.00 %) |
209,233 (2.16 %) |
56,676 (1.12 %) |
3,372,591 (44.40 %) |
13,547 (2.72 %) |
376 | pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019) GCF_004126475.1 |
35,529 (2.39 %) |
18,185 (1.70 %) |
20,184 (1.64 %) |
41,094 (3.29 %) |
42.38 (98.92 %) |
831 (1.08 %) |
141 (100.00 %) |
3,072,951 (30.02 %) |
385,608 (0.80 %) |
12,060,365 (30.47 %) |
64,081 (4.30 %) |
377 | pea aphid (AL4f v1 2019) GCF_005508785.1 |
31,681 (7.81 %) |
4,257 (0.79 %) |
16,323 (3.39 %) |
n/a | 29.76 (92.38 %) |
46,297 (7.65 %) |
21,920 (100.00 %) |
768,383 (18.87 %) |
135,468 (2.11 %) |
4,536,093 (48.39 %) |
16,332 (2.13 %) |
378 | peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634155.1 |
49,100 (50.44 %) |
13,025 (1.67 %) |
24,167 (2.02 %) |
n/a | 42.65 (99.69 %) |
232 (0.31 %) |
124 (100.00 %) |
586,316 (11.83 %) |
335,214 (8.05 %) |
7,038,700 (24.65 %) |
26,085 (2.25 %) |
379 | pigeon pea (v1 2016 BGI) GCF_000340665.1 |
46,646 (9.41 %) |
17,409 (3.12 %) |
51,529 (12.74 %) |
48,654 (8.33 %) |
32.79 (94.21 %) |
36,387 (5.81 %) |
72,923 (94.19 %) |
400,327 (3.60 %) |
306,656 (4.69 %) |
3,754,630 (39.24 %) |
26,578 (2.89 %) |
380 | pike-perch GCF_008315115.1 |
56,221 (8.23 %) |
15,677 (2.23 %) |
29,967 (5.65 %) |
62,989 (6.22 %) |
40.92 (100.00 %) |
94 (0.00 %) |
1,313 (100.00 %) |
591,660 (5.05 %) |
569,876 (7.39 %) |
4,713,605 (36.32 %) |
39,545 (1.93 %) |
381 | platypus (Pmale09 2018 BGI) GCA_002966995.1 |
n/a | 15,042 (1.17 %) |
19,939 (1.55 %) |
n/a | 46.64 (100.00 %) |
476 (0.00 %) |
4,568 (100.00 %) |
5,326,862 (52.88 %) |
879,598 (5.00 %) |
9,545,961 (50.95 %) |
94,468 (9.28 %) |
382 | platypus (Pmale09 v1 2019) GCF_004115215.1 |
56,708 (3.09 %) |
14,805 (1.26 %) |
18,918 (1.63 %) |
42,516 (2.60 %) |
46.13 (99.18 %) |
522 (0.82 %) |
305 (100.00 %) |
5,099,803 (51.62 %) |
577,434 (2.88 %) |
9,110,403 (48.91 %) |
87,829 (7.91 %) |
383 | platypus (Pmale09 v3 2020) GCA_004115215.3 |
n/a | 14,805 (1.26 %) |
18,888 (1.63 %) |
n/a | 46.14 (99.18 %) |
515 (0.82 %) |
322 (100.00 %) |
5,101,303 (51.62 %) |
578,617 (2.89 %) |
9,113,847 (48.93 %) |
87,861 (7.92 %) |
384 | polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank) GCA_000687225.1 |
35,751 (39.94 %) |
18,495 (1.67 %) |
15,243 (1.37 %) |
n/a | 41.65 (98.35 %) |
110,343 (1.67 %) |
134,161 (98.33 %) |
4,221,025 (40.96 %) |
553,193 (1.29 %) |
13,765,526 (29.91 %) |
54,906 (1.17 %) |
385 | prehistoric monster fish (2019 genbank) GCA_902500255.1 |
45,404 (55.83 %) |
14,654 (0.76 %) |
72,609 (2.41 %) |
57,391 (2.04 %) |
41.99 (99.49 %) |
2,554 (0.51 %) |
464 (100.00 %) |
1,311,131 (2.79 %) |
786,401 (3.65 %) |
9,901,286 (59.90 %) |
172,199 (5.45 %) |
386 | pronghorn (BS35 2019 Broad) GCA_004027515.1 |
n/a | 24,094 (1.34 %) |
35,119 (1.27 %) |
n/a | 41.97 (99.87 %) |
6,569 (0.02 %) |
1,649,700 (99.98 %) |
5,613,563 (41.47 %) |
652,408 (1.55 %) |
13,943,055 (43.64 %) |
61,057 (1.17 %) |
387 | Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank) GCA_000696695.1 |
45,076 (35.88 %) |
19,564 (1.68 %) |
22,124 (1.36 %) |
n/a | 41.27 (99.13 %) |
80,963 (0.88 %) |
134,059 (99.12 %) |
3,917,534 (41.44 %) |
435,606 (1.73 %) |
14,738,354 (28.36 %) |
40,752 (0.94 %) |
388 | puma (SC36_Marlon 2018 genbank) GCA_003327715.1 |
25,575 (34.74 %) |
17,665 (1.56 %) |
16,565 (1.29 %) |
n/a | 41.36 (95.34 %) |
178,992 (4.69 %) |
2,174 (100.00 %) |
4,884,619 (42.70 %) |
833,136 (1.76 %) |
13,705,706 (31.28 %) |
58,912 (1.65 %) |
389 | pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015) GCA_000258655.2 |
59,332 (37.06 %) |
19,951 (1.94 %) |
19,039 (1.18 %) |
n/a | 40.74 (82.95 %) |
156,797 (17.06 %) |
121,337 (82.94 %) |
5,136,492 (50.91 %) |
775,493 (1.63 %) |
15,570,612 (30.28 %) |
43,049 (0.71 %) |
390 | pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023) GCF_029289425.1 |
84,858 (3.73 %) |
20,765 (1.73 %) |
22,666 (1.18 %) |
n/a | 40.49 (99.96 %) |
8 (0.04 %) |
443 (100.00 %) |
5,487,575 (50.65 %) |
1,054,555 (12.79 %) |
15,952,698 (43.80 %) |
53,329 (1.37 %) |
391 | pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank) GCA_026419965.1 |
56,261 (41.31 %) |
18,495 (1.55 %) |
20,718 (1.32 %) |
n/a | 42.05 (99.81 %) |
143 (0.19 %) |
580 (100.00 %) |
3,817,653 (34.51 %) |
758,297 (7.42 %) |
12,196,926 (39.96 %) |
101,353 (2.90 %) |
392 | rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank) GCA_009806435.2 |
n/a | 19,480 (1.31 %) |
23,335 (1.31 %) |
n/a | 43.83 (97.68 %) |
18,178 (2.32 %) |
3,159 (100.00 %) |
4,179,975 (0.00 %) |
976,271 (2.33 %) |
13,766,353 (39.76 %) |
113,370 (2.46 %) |
393 | rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank) GCA_000003625.1 |
n/a | 18,676 (1.38 %) |
20,095 (1.24 %) |
n/a | 43.75 (95.14 %) |
80,789 (4.88 %) |
84,024 (95.12 %) |
4,884,561 (44.65 %) |
883,943 (1.73 %) |
13,254,559 (38.27 %) |
110,338 (2.33 %) |
394 | radish (v1 WS10039 2015) GCF_000801105.1 |
69,943 (20.66 %) |
33,762 (10.20 %) |
70,765 (28.80 %) |
n/a | 35.29 (87.22 %) |
28,041 (12.80 %) |
10,676 (100.00 %) |
196,483 (2.53 %) |
150,132 (3.32 %) |
2,256,858 (26.65 %) |
23,381 (2.80 %) |
395 | red admiral (genbank 2021) GCA_905147765.2 |
n/a | 4,641 (1.20 %) |
13,258 (4.79 %) |
32,725 (10.42 %) |
32.84 (100.00 %) |
18 (0.00 %) |
142 (100.00 %) |
184,094 (2.52 %) |
41,639 (1.23 %) |
3,193,736 (41.82 %) |
10,747 (2.25 %) |
396 | red mason bee (LIB18336 2019) GCF_004153925.1 |
26,926 (16.13 %) |
4,185 (2.08 %) |
24,859 (11.07 %) |
n/a | 39.77 (99.98 %) |
2,089 (0.02 %) |
10,222 (100.00 %) |
88,278 (1.96 %) |
74,016 (3.78 %) |
1,305,254 (28.61 %) |
10,712 (6.90 %) |
397 | red-crested turaco (2014 BGI) GCF_000709365.1 |
16,151 (2.15 %) |
12,046 (1.50 %) |
25,077 (1.98 %) |
n/a | 41.63 (99.43 %) |
75,085 (0.59 %) |
134,672 (99.41 %) |
401,465 (6.41 %) |
153,694 (0.86 %) |
6,705,299 (20.45 %) |
30,183 (1.07 %) |
398 | red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI) GCF_000690535.1 |
16,238 (2.21 %) |
12,016 (1.53 %) |
23,985 (1.93 %) |
n/a | 41.20 (99.63 %) |
59,230 (0.38 %) |
112,704 (99.62 %) |
322,026 (4.02 %) |
121,725 (0.68 %) |
6,797,850 (18.25 %) |
18,873 (0.62 %) |
399 | red-throated loon (hap2 2023 genbank) GCA_030936135.1 |
25,173 (40.74 %) |
13,218 (1.71 %) |
28,120 (2.39 %) |
n/a | 43.11 (100.00 %) |
249 (0.00 %) |
1,195 (100.00 %) |
544,427 (8.81 %) |
223,674 (5.77 %) |
6,669,469 (23.63 %) |
38,306 (3.37 %) |
400 | reedfish (2019) GCF_900747795.1 |
40,545 (1.73 %) |
13,154 (0.46 %) |
24,028 (1.29 %) |
34,856 (1.34 %) |
39.44 (93.75 %) |
5,614 (6.25 %) |
1,885 (100.00 %) |
1,834,613 (2.79 %) |
1,018,031 (2.36 %) |
20,081,632 (44.56 %) |
88,254 (1.06 %) |
401 | Rhesus monkey (2015 Baylor) GCA_000772875.3 |
n/a | 20,558 (1.71 %) |
22,141 (1.12 %) |
n/a | 40.95 (97.08 %) |
64,538 (2.91 %) |
348,579 (97.09 %) |
5,846,699 (54.61 %) |
1,429,378 (9.24 %) |
16,512,587 (40.26 %) |
98,572 (1.29 %) |
402 | Rice's whale (hap2 2023 genbank) GCA_028023285.1 |
59,888 (43.60 %) |
19,291 (1.53 %) |
21,195 (1.30 %) |
n/a | 41.44 (99.90 %) |
334 (0.10 %) |
774 (100.00 %) |
3,917,923 (36.26 %) |
828,521 (9.28 %) |
12,518,796 (41.08 %) |
73,126 (1.69 %) |
403 | rifleman (BGI 2014) GCF_000695815.1 |
16,166 (2.37 %) |
12,054 (1.65 %) |
23,851 (2.04 %) |
n/a | 41.63 (99.55 %) |
66,437 (0.46 %) |
120,312 (99.54 %) |
392,481 (7.69 %) |
217,040 (2.27 %) |
5,855,355 (18.33 %) |
7,602 (0.24 %) |
404 | ring-tailed lemur BS26 Broad 2019 GCA_004024665.1 |
n/a | 21,125 (1.90 %) |
29,864 (1.51 %) |
65,909 (1.91 %) |
41.13 (99.93 %) |
4,599 (0.02 %) |
580,026 (99.98 %) |
3,840,645 (39.25 %) |
675,921 (1.83 %) |
13,841,750 (31.45 %) |
59,440 (1.72 %) |
405 | Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020) GCF_014905685.1 |
25,353 (3.88 %) |
14,334 (1.56 %) |
58,475 (4.46 %) |
n/a | 41.06 (92.01 %) |
100,521 (8.02 %) |
18,998 (100.00 %) |
642,988 (3.38 %) |
444,158 (3.06 %) |
6,203,124 (42.81 %) |
52,308 (2.11 %) |
406 | river trout (v1 2019) GCF_901001165.1 |
102,772 (6.02 %) |
27,413 (1.62 %) |
51,424 (4.17 %) |
121,979 (5.28 %) |
43.36 (96.90 %) |
3,941 (3.10 %) |
1,441 (100.00 %) |
1,438,988 (5.72 %) |
1,789,507 (15.87 %) |
9,819,761 (52.37 %) |
70,821 (1.77 %) |
407 | rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank) GCA_023343835.1 |
51,619 (61.28 %) |
12,831 (2.31 %) |
n/a | n/a | 41.57 (99.99 %) |
210 (0.01 %) |
164 (100.00 %) |
667,924 (11.59 %) |
268,431 (2.63 %) |
5,885,274 (21.73 %) |
21,346 (2.37 %) |
408 | rose-grain aphid (CAU 2021 genbank) GCA_019925205.1 |
n/a | 4,332 (0.82 %) |
15,532 (3.91 %) |
n/a | 30.24 (99.98 %) |
240 (0.02 %) |
67 (100.00 %) |
481,097 (4.72 %) |
135,266 (7.01 %) |
4,093,473 (52.65 %) |
12,709 (2.68 %) |
409 | Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank) GCA_900094665.2 |
53,779 (39.43 %) |
21,304 (2.26 %) |
18,211 (1.40 %) |
n/a | 41.70 (89.05 %) |
306,650 (10.98 %) |
30,919 (92.71 %) |
4,878,260 (40.08 %) |
1,351,707 (2.59 %) |
12,965,226 (27.49 %) |
16,050 (0.44 %) |
410 | Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq) GCF_900094665.1 |
53,855 (2.85 %) |
21,291 (2.26 %) |
19,256 (1.49 %) |
96,713 (4.05 %) |
41.70 (89.05 %) |
306,650 (10.98 %) |
30,920 (92.71 %) |
4,749,528 (39.06 %) |
1,351,707 (2.59 %) |
12,965,297 (27.49 %) |
16,050 (0.44 %) |
411 | saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank) GCA_949987515.1 |
46,746 (40.70 %) |
18,625 (1.49 %) |
20,451 (1.28 %) |
n/a | 42.06 (99.99 %) |
968 (0.01 %) |
631 (100.00 %) |
4,020,682 (35.99 %) |
1,259,549 (13.09 %) |
12,359,818 (42.64 %) |
66,179 (3.91 %) |
412 | Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank) GCA_023634085.1 |
50,290 (50.75 %) |
12,971 (1.67 %) |
23,351 (2.02 %) |
n/a | 43.15 (99.70 %) |
258 (0.30 %) |
282 (100.00 %) |
548,087 (7.21 %) |
201,482 (8.55 %) |
7,030,761 (24.94 %) |
31,791 (2.57 %) |
413 | salmon louse (v1.1 2020) GCF_016086655.2 |
27,164 (5.26 %) |
3,465 (0.45 %) |
3,673 (1.75 %) |
n/a | 30.90 (99.99 %) |
608 (0.01 %) |
10,436 (99.99 %) |
1,394,872 (53.53 %) |
76,419 (1.13 %) |
6,311,228 (43.85 %) |
647 (0.04 %) |
414 | saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank) GCA_027887145.1 |
27,528 (42.80 %) |
12,832 (1.69 %) |
25,514 (2.23 %) |
n/a | 43.50 (99.76 %) |
363 (0.24 %) |
282 (100.00 %) |
541,958 (3.43 %) |
566,692 (13.38 %) |
6,205,274 (28.98 %) |
35,549 (5.05 %) |
415 | Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank) GCA_029499605.1 |
108,406 (45.40 %) |
13,961 (0.46 %) |
36,603 (1.55 %) |
n/a | 43.90 (99.99 %) |
2,297 (0.01 %) |
3,475 (100.00 %) |
1,903,658 (2.85 %) |
2,970,695 (16.56 %) |
15,354,615 (64.31 %) |
652,708 (8.36 %) |
416 | SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19) GCF_009858895.2 |
n/a | n/a | n/a | n/a | 37.98 (99.99 %) |
n/a | 1 (100.00 %) |
5 (0.24 %) |
1 (0.11 %) |
33 (1.38 %) |
1 (0.73 %) |
417 | sea anemones (CC7 2015 genbank) GCA_001417965.1 |
29,778 (59.32 %) |
3,020 (1.06 %) |
13,146 (12.99 %) |
30,497 (24.04 %) |
36.33 (82.34 %) |
637,478 (17.95 %) |
4,312 (100.00 %) |
74,671 (1.98 %) |
63,328 (2.24 %) |
1,417,036 (20.33 %) |
2,099 (0.38 %) |
418 | sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020) GCA_010993605.1 |
n/a | 8,130 (0.73 %) |
36,343 (4.06 %) |
n/a | 48.31 (98.62 %) |
930 (1.38 %) |
1,433 (100.00 %) |
3,309,659 (59.73 %) |
1,194,161 (21.47 %) |
5,320,564 (50.50 %) |
178,590 (35.88 %) |
419 | sea otter (GAN:26980312 2017 genbank) GCA_002288905.2 |
n/a | 18,591 (1.64 %) |
20,913 (1.44 %) |
34,142 (1.77 %) |
41.56 (98.79 %) |
23,134 (1.21 %) |
29,588 (98.79 %) |
4,702,292 (41.42 %) |
721,749 (1.39 %) |
14,065,592 (32.89 %) |
55,388 (1.87 %) |
420 | segmented worms (v1 2012) GCF_000326865.1 |
23,426 (13.46 %) |
2,741 (0.95 %) |
3,156 (4.19 %) |
n/a | 32.82 (91.54 %) |
11,185 (8.47 %) |
12,292 (91.53 %) |
572,062 (30.90 %) |
474,390 (10.49 %) |
1,741,644 (44.75 %) |
3,489 (0.51 %) |
421 | siamang (v1 Jambi primary hap 2023) GCF_028878055.1 |
79,118 (2.62 %) |
20,139 (1.70 %) |
21,232 (1.14 %) |
n/a | 40.62 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
606 (100.00 %) |
5,278,880 (55.89 %) |
946,219 (14.68 %) |
14,395,605 (46.26 %) |
95,573 (1.75 %) |
422 | siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank) GCA_028878055.2 |
105,360 (44.53 %) |
20,433 (1.69 %) |
21,357 (1.12 %) |
n/a | 40.42 (99.97 %) |
1 (0.03 %) |
26 (100.00 %) |
5,354,441 (55.80 %) |
935,620 (14.70 %) |
14,917,483 (46.01 %) |
92,243 (1.42 %) |
423 | siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq) GCF_028878055.2 |
105,373 (3.05 %) |
20,434 (1.69 %) |
21,357 (1.12 %) |
n/a | 40.42 (99.97 %) |
2 (0.03 %) |
27 (100.00 %) |
5,354,446 (55.80 %) |
935,620 (14.70 %) |
14,917,515 (46.01 %) |
92,243 (1.42 %) |
424 | Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019) GCF_900634795.2 |
54,389 (16.95 %) |
14,745 (4.21 %) |
34,348 (10.09 %) |
62,673 (13.02 %) |
45.30 (99.99 %) |
328 (0.01 %) |
70 (100.00 %) |
252,955 (3.51 %) |
184,269 (4.62 %) |
2,010,934 (23.88 %) |
72,126 (13.08 %) |
425 | Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020) GCF_900634795.3 |
54,864 (17.78 %) |
14,745 (4.20 %) |
56,808 (10.87 %) |
69,466 (16.34 %) |
45.30 (99.99 %) |
328 (0.01 %) |
70 (100.00 %) |
255,550 (3.51 %) |
184,269 (4.62 %) |
2,010,934 (23.88 %) |
72,126 (13.08 %) |
426 | silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.1 |
54,238 (2.74 %) |
17,887 (2.00 %) |
18,517 (1.25 %) |
n/a | 41.17 (98.20 %) |
18,567 (1.80 %) |
18,392 (100.00 %) |
4,399,357 (50.55 %) |
711,948 (2.37 %) |
12,623,705 (36.55 %) |
67,835 (1.30 %) |
427 | silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz) GCF_009828535.2 |
63,475 (2.65 %) |
20,581 (1.94 %) |
21,181 (1.20 %) |
41,252 (1.46 %) |
41.02 (97.81 %) |
25,106 (2.19 %) |
18,395 (100.00 %) |
5,332,131 (51.09 %) |
857,562 (2.26 %) |
15,565,289 (36.84 %) |
80,124 (1.26 %) |
428 | slow loris (BS32 2019) GCA_004027815.1 |
n/a | 26,771 (1.11 %) |
44,247 (1.00 %) |
n/a | 40.68 (99.86 %) |
9,648 (0.03 %) |
1,946,791 (99.97 %) |
6,230,312 (41.68 %) |
688,924 (1.23 %) |
16,892,392 (43.00 %) |
39,326 (0.65 %) |
429 | slow loris (primary hap 2022 genbank) GCA_027406575.1 |
67,213 (41.75 %) |
22,195 (1.49 %) |
21,341 (1.28 %) |
n/a | 40.82 (99.86 %) |
218 (0.14 %) |
85 (100.00 %) |
4,625,875 (39.88 %) |
579,984 (1.59 %) |
14,405,402 (40.78 %) |
38,257 (0.77 %) |
430 | small Madagascar hedgehog GCA_000313985.1 |
n/a | 19,066 (1.18 %) |
19,334 (1.31 %) |
n/a | 43.01 (88.44 %) |
269,444 (11.60 %) |
277,845 (88.40 %) |
3,789,866 (28.89 %) |
429,318 (0.87 %) |
16,950,647 (32.23 %) |
39,994 (0.70 %) |
431 | smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq) GCF_902713615.1 |
55,762 (1.62 %) |
12,597 (0.36 %) |
23,987 (1.08 %) |
n/a | 47.65 (98.48 %) |
7,146 (1.52 %) |
646 (100.00 %) |
1,185,832 (1.72 %) |
1,448,620 (6.25 %) |
20,884,767 (51.41 %) |
456,658 (8.18 %) |
432 | smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank) GCA_029633865.1 |
n/a | 13,617 (1.10 %) |
74,639 (4.12 %) |
n/a | 44.94 (99.96 %) |
3,115 (0.04 %) |
544 (100.00 %) |
4,603,649 (53.23 %) |
1,009,241 (18.00 %) |
5,236,063 (51.65 %) |
143,632 (7.43 %) |
433 | smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank) GCA_009764475.1 |
n/a | 11,828 (0.66 %) |
18,627 (1.55 %) |
n/a | 42.38 (99.09 %) |
698 (0.91 %) |
173 (100.00 %) |
405,021 (1.14 %) |
391,531 (1.52 %) |
11,282,302 (38.19 %) |
45,398 (1.34 %) |
434 | snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016) GCF_001687245.1 |
37,836 (4.45 %) |
10,526 (1.07 %) |
59,331 (6.34 %) |
n/a | 36.53 (93.84 %) |
227,684 (6.18 %) |
139,583 (93.83 %) |
653,914 (2.87 %) |
386,956 (5.71 %) |
7,364,314 (43.00 %) |
60,636 (4.05 %) |
435 | sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019) GCF_006149115.1 |
76,167 (6.12 %) |
24,114 (1.71 %) |
51,371 (4.08 %) |
102,891 (5.24 %) |
43.39 (96.16 %) |
25,659 (3.84 %) |
38,027 (99.99 %) |
1,300,179 (8.96 %) |
1,465,690 (10.81 %) |
8,849,714 (48.44 %) |
64,215 (1.55 %) |
436 | southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank) GCA_910596095.1 |
58,416 (66.24 %) |
15,695 (2.61 %) |
42,730 (5.74 %) |
n/a | 39.73 (100.00 %) |
95 (0.00 %) |
58 (100.00 %) |
1,591,314 (33.50 %) |
247,764 (2.94 %) |
5,176,850 (26.85 %) |
14,097 (0.88 %) |
437 | southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank) GCA_013339725.1 |
n/a | 3,698 (0.12 %) |
117,910 (5.00 %) |
35,315 (1.88 %) |
45.79 (99.99 %) |
1,576 (0.01 %) |
7,048 (100.00 %) |
770,997 (2.03 %) |
680,149 (3.55 %) |
10,994,272 (39.37 %) |
304,620 (17.03 %) |
438 | southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad) GCA_004026725.1 |
n/a | 24,302 (1.12 %) |
43,055 (0.98 %) |
n/a | 41.63 (99.82 %) |
10,550 (0.03 %) |
2,272,285 (99.97 %) |
5,668,964 (24.75 %) |
1,628,683 (5.38 %) |
15,658,806 (41.85 %) |
21,801 (0.44 %) |
439 | southern house mosquito (JHB 2007 genbank) GCA_000209185.1 |
n/a | 5,905 (1.14 %) |
41,195 (8.84 %) |
n/a | 37.42 (93.28 %) |
45,500 (6.75 %) |
48,671 (93.25 %) |
738,398 (35.22 %) |
171,041 (5.71 %) |
3,037,349 (50.41 %) |
65,784 (9.49 %) |
440 | southern tamandua (Broad 2019) GCA_004025105.1 |
n/a | 25,638 (0.82 %) |
49,782 (0.86 %) |
n/a | 39.53 (99.88 %) |
5,819 (0.02 %) |
2,150,023 (99.98 %) |
6,033,640 (37.10 %) |
708,890 (0.99 %) |
22,371,532 (41.88 %) |
80,897 (1.09 %) |
441 | southern two-toed sloth (US054 2019 Broad) GCA_004027855.1 |
n/a | 25,877 (0.78 %) |
56,071 (0.82 %) |
n/a | 39.82 (99.84 %) |
5,099 (0.02 %) |
2,537,432 (99.98 %) |
5,384,587 (37.86 %) |
724,925 (2.20 %) |
19,492,096 (41.12 %) |
55,674 (0.90 %) |
442 | southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank) GCA_000283155.1 |
37,037 (37.57 %) |
18,551 (1.79 %) |
19,747 (1.44 %) |
n/a | 40.90 (96.05 %) |
54,737 (3.96 %) |
57,823 (96.04 %) |
3,824,807 (39.33 %) |
421,693 (0.97 %) |
14,765,476 (28.93 %) |
36,281 (1.02 %) |
443 | soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010) GCF_000004515.4 |
82,440 (9.65 %) |
27,682 (3.07 %) |
77,218 (11.84 %) |
n/a | 34.77 (97.65 %) |
15,955 (2.35 %) |
17,146 (97.65 %) |
834,646 (37.35 %) |
436,219 (5.65 %) |
5,341,660 (45.30 %) |
35,897 (1.56 %) |
444 | soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018) GCF_000004515.5 |
85,123 (9.72 %) |
27,647 (3.06 %) |
77,190 (11.83 %) |
n/a | 34.77 (97.65 %) |
15,995 (2.36 %) |
17,187 (97.64 %) |
834,651 (37.35 %) |
436,225 (5.65 %) |
5,341,721 (45.30 %) |
35,897 (1.47 %) |
445 | speckled wood butterfly (genbank 2021) GCA_905163445.1 |
21,720 (55.73 %) |
4,713 (0.87 %) |
17,002 (4.33 %) |
29,238 (7.81 %) |
35.99 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
71 (100.00 %) |
304,077 (2.97 %) |
110,835 (4.09 %) |
3,704,355 (44.42 %) |
28,108 (2.75 %) |
446 | sperm whale (SW-GA 2019) GCF_002837175.2 |
60,921 (2.59 %) |
19,527 (1.73 %) |
25,114 (1.51 %) |
n/a | 41.39 (95.90 %) |
128,928 (4.12 %) |
143,605 (95.88 %) |
4,365,057 (42.78 %) |
694,673 (2.40 %) |
13,518,590 (32.76 %) |
94,152 (2.52 %) |
447 | sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF) GCF_000090795.1 |
31,248 (25.26 %) |
2,167 (1.08 %) |
6,648 (9.22 %) |
n/a | 35.83 (86.92 %) |
14,944 (13.10 %) |
27,972 (86.90 %) |
108,973 (4.04 %) |
70,563 (4.66 %) |
881,116 (24.58 %) |
668 (0.62 %) |
448 | stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank) GCA_001015335.1 |
n/a | 7,737 (1.16 %) |
11,972 (2.65 %) |
n/a | 38.85 (84.55 %) |
129,113 (15.50 %) |
125,702 (84.50 %) |
310,342 (1.75 %) |
391,619 (8.42 %) |
5,616,633 (48.71 %) |
38,246 (1.55 %) |
449 | sterlet (maternal hap 2022 genbank) GCA_902713425.2 |
n/a | 25,364 (1.76 %) |
40,452 (4.10 %) |
n/a | 40.11 (100.00 %) |
433 (0.00 %) |
1,731 (100.00 %) |
4,055,215 (43.14 %) |
1,124,096 (10.13 %) |
9,426,172 (41.81 %) |
64,522 (2.85 %) |
450 | sterlet (v1 Gen_M01 2020) GCF_010645085.1 |
73,251 (5.76 %) |
24,411 (1.72 %) |
39,637 (3.96 %) |
n/a | 39.76 (99.93 %) |
6,283 (0.07 %) |
3,404 (100.00 %) |
1,269,345 (3.50 %) |
1,095,665 (6.81 %) |
10,007,602 (39.30 %) |
60,475 (1.95 %) |
451 | stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017) GCF_002571385.1 |
36,135 (16.45 %) |
3,324 (0.70 %) |
20,909 (10.93 %) |
38,198 (17.00 %) |
38.54 (89.50 %) |
49,077 (10.54 %) |
5,688 (100.00 %) |
111,077 (1.70 %) |
108,732 (2.95 %) |
2,009,396 (21.40 %) |
6,012 (0.58 %) |
452 | striped catfish (primary hap 2022 genbank) GCA_027358585.1 |
53,859 (65.52 %) |
16,035 (2.86 %) |
41,619 (5.48 %) |
n/a | 38.99 (99.49 %) |
236 (0.51 %) |
59 (100.00 %) |
1,870,238 (37.80 %) |
605,571 (6.82 %) |
5,059,499 (32.43 %) |
17,919 (1.29 %) |
453 | Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank) GCA_002880775.3 |
n/a | 20,174 (1.79 %) |
20,994 (1.15 %) |
47,806 (1.68 %) |
40.80 (99.29 %) |
553 (0.70 %) |
5,813 (99.30 %) |
5,497,148 (54.41 %) |
1,048,361 (8.01 %) |
15,948,575 (40.68 %) |
39,481 (0.87 %) |
454 | Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023) GCF_028885655.1 |
98,046 (3.46 %) |
21,162 (1.68 %) |
21,714 (1.13 %) |
n/a | 41.13 (99.79 %) |
59 (0.21 %) |
2,670 (99.79 %) |
5,730,768 (55.05 %) |
1,175,314 (11.19 %) |
16,323,507 (44.05 %) |
55,799 (2.08 %) |
455 | Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019) GCA_009819505.1 |
n/a | 13,403 (1.85 %) |
27,456 (2.48 %) |
n/a | 42.86 (100.00 %) |
13 (0.00 %) |
3,601 (100.00 %) |
497,374 (5.78 %) |
649,859 (4.89 %) |
6,740,713 (22.65 %) |
49,076 (3.54 %) |
456 | Swainson's thrush (v1 primary hap 2019) GCF_009819885.1 |
40,128 (5.45 %) |
13,016 (1.88 %) |
24,787 (2.41 %) |
30,064 (2.94 %) |
42.48 (98.86 %) |
428 (1.14 %) |
161 (100.00 %) |
483,978 (5.85 %) |
589,859 (4.32 %) |
6,708,638 (22.44 %) |
49,404 (3.53 %) |
457 | swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank) GCA_028018845.1 |
29,544 (46.92 %) |
12,375 (1.75 %) |
24,577 (2.31 %) |
n/a | 43.08 (99.89 %) |
236 (0.11 %) |
40 (100.00 %) |
419,473 (3.09 %) |
439,909 (7.61 %) |
6,077,743 (24.47 %) |
32,064 (3.27 %) |
458 | Tasmanian devil GCF_000189315.1 |
32,527 (1.79 %) |
16,112 (0.84 %) |
16,152 (0.94 %) |
n/a | 36.05 (92.36 %) |
201,403 (7.66 %) |
237,291 (92.34 %) |
6,766,259 (42.85 %) |
1,240,681 (2.07 %) |
20,998,733 (36.61 %) |
23,155 (0.38 %) |
459 | thale cress (tair10 Columbia 2011) GCF_000001735.3 |
54,010 (40.19 %) |
26,552 (34.12 %) |
25,867 (35.78 %) |
n/a | 36.06 (99.85 %) |
357 (0.16 %) |
7 (100.00 %) |
67,353 (16.32 %) |
27,063 (2.77 %) |
749,020 (22.64 %) |
4,599 (1.63 %) |
460 | thirteen-lined ground squirrel (2011) GCF_000236235.1 |
41,886 (2.61 %) |
19,165 (1.70 %) |
18,102 (1.44 %) |
n/a | 39.91 (93.27 %) |
141,005 (6.75 %) |
153,488 (93.25 %) |
4,378,557 (36.61 %) |
640,337 (1.64 %) |
14,116,066 (27.91 %) |
28,321 (0.64 %) |
461 | thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq) GCF_010909765.1 |
45,969 (2.40 %) |
11,433 (0.60 %) |
26,341 (1.72 %) |
32,017 (1.87 %) |
44.30 (92.54 %) |
3,753 (7.46 %) |
957 (100.00 %) |
865,711 (2.57 %) |
1,176,348 (3.79 %) |
9,964,038 (52.25 %) |
242,676 (4.73 %) |
462 | thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank) GCA_010909765.1 |
45,969 (46.35 %) |
11,434 (0.60 %) |
26,342 (1.72 %) |
32,017 (1.87 %) |
44.30 (92.54 %) |
3,753 (7.46 %) |
958 (100.00 %) |
866,598 (2.58 %) |
1,176,350 (3.79 %) |
9,964,083 (52.25 %) |
242,676 (4.73 %) |
463 | tick D.silvarum (v1 2020) GCF_013339745.1 |
36,084 (1.94 %) |
4,032 (0.13 %) |
128,567 (5.82 %) |
43,960 (2.05 %) |
46.91 (99.95 %) |
13,519 (0.05 %) |
1,665 (100.00 %) |
1,116,542 (2.95 %) |
642,860 (3.16 %) |
10,429,455 (39.18 %) |
37,849 (2.30 %) |
464 | tidepool copepod (San Diego 2019 genbank) GCA_007210705.1 |
23,429 (54.20 %) |
3,517 (1.61 %) |
18,910 (15.71 %) |
n/a | 42.18 (97.94 %) |
14,007 (2.09 %) |
459 (100.00 %) |
52,042 (1.17 %) |
27,065 (1.23 %) |
928,666 (18.11 %) |
15,823 (5.51 %) |
465 | tiger tail seahorse (QL1 v1 2016) GCF_001891065.1 |
47,041 (13.29 %) |
13,817 (3.76 %) |
32,943 (8.81 %) |
n/a | 43.30 (93.04 %) |
23,101 (6.97 %) |
60,478 (93.03 %) |
359,724 (3.91 %) |
155,380 (3.35 %) |
2,811,700 (24.51 %) |
61,685 (7.72 %) |
466 | tomato (v3.0 Heinz 1706 2018) GCF_000188115.4 |
46,015 (6.94 %) |
15,396 (2.15 %) |
38,462 (7.56 %) |
n/a | 34.12 (90.18 %) |
19,634 (9.83 %) |
3,150 (100.00 %) |
417,162 (18.21 %) |
229,803 (3.18 %) |
5,370,478 (35.28 %) |
25,279 (1.28 %) |
467 | trahira (v1 hap1 2023) GCA_029633855.1 |
n/a | 16,039 (2.06 %) |
44,287 (4.38 %) |
n/a | 40.99 (92.91 %) |
867 (7.09 %) |
597 (100.00 %) |
2,228,831 (30.95 %) |
687,495 (13.85 %) |
5,309,097 (36.70 %) |
27,070 (2.09 %) |
468 | Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank) GCA_001457755.2 |
n/a | 576 (1.36 %) |
2,999 (35.93 %) |
n/a | 45.94 (99.65 %) |
6,447 (0.44 %) |
2,026 (100.00 %) |
16,807 (2.60 %) |
3,925 (0.79 %) |
141,656 (16.64 %) |
4,877 (34.82 %) |
469 | Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank) GCA_022059095.1 |
n/a | 742 (1.83 %) |
848 (40.20 %) |
n/a | 41.23 (100.00 %) |
n/a | 64 (100.00 %) |
39,141 (7.68 %) |
14,366 (6.71 %) |
131,898 (25.19 %) |
4,119 (14.82 %) |
470 | tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020) GCF_014805625.1 |
24,334 (8.13 %) |
7,223 (2.32 %) |
6,632 (3.62 %) |
n/a | 33.80 (97.46 %) |
9,688 (2.55 %) |
7,986 (100.00 %) |
418,532 (4.76 %) |
185,734 (2.26 %) |
3,090,742 (35.34 %) |
3,487 (0.58 %) |
471 | two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq) GCF_901001135.1 |
56,617 (1.50 %) |
14,448 (0.38 %) |
40,572 (1.31 %) |
n/a | 44.40 (99.36 %) |
3,573 (0.64 %) |
1,330 (100.00 %) |
2,263,606 (1.94 %) |
2,036,108 (4.34 %) |
29,400,958 (44.09 %) |
602,912 (6.66 %) |
472 | Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017) GCA_002776525.1 |
n/a | 21,053 (1.88 %) |
23,024 (1.24 %) |
n/a | 40.68 (96.59 %) |
77,615 (3.42 %) |
47,644 (100.00 %) |
5,478,730 (51.13 %) |
969,126 (2.63 %) |
16,127,854 (36.40 %) |
63,965 (1.04 %) |
473 | Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018) GCF_002776525.2 |
66,965 (2.69 %) |
21,958 (1.85 %) |
24,388 (1.22 %) |
55,722 (1.95 %) |
40.60 (97.10 %) |
63,620 (2.91 %) |
47,449 (100.00 %) |
5,699,639 (51.61 %) |
1,066,606 (2.87 %) |
16,603,622 (37.49 %) |
71,084 (1.08 %) |
474 | Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019) GCF_002776525.3 |
68,173 (2.68 %) |
21,804 (1.85 %) |
23,385 (1.18 %) |
n/a | 40.60 (97.10 %) |
64,415 (2.91 %) |
46,654 (100.00 %) |
5,700,226 (51.61 %) |
1,066,759 (2.88 %) |
16,603,818 (37.49 %) |
71,078 (1.08 %) |
475 | Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019) GCF_002776525.4 |
63,704 (2.55 %) |
21,347 (1.86 %) |
23,056 (1.19 %) |
n/a | 40.84 (97.07 %) |
57,757 (2.93 %) |
34,372 (100.00 %) |
5,504,117 (51.70 %) |
961,351 (2.75 %) |
16,208,033 (37.10 %) |
71,046 (1.10 %) |
476 | Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank) GCA_000622305.1 |
54,667 (35.81 %) |
19,685 (1.25 %) |
21,268 (1.20 %) |
n/a | 41.26 (95.18 %) |
201,121 (4.83 %) |
356,096 (95.17 %) |
6,165,270 (34.95 %) |
1,197,778 (2.77 %) |
16,282,333 (36.21 %) |
22,905 (0.49 %) |
477 | valley oak (v3.0 2019) GCF_001633185.1 |
63,555 (8.16 %) |
16,886 (1.90 %) |
72,876 (14.48 %) |
n/a | 35.38 (99.77 %) |
1,674 (0.23 %) |
2,010 (100.00 %) |
800,389 (3.72 %) |
460,244 (7.41 %) |
5,439,256 (37.83 %) |
19,635 (1.10 %) |
478 | vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017) GCF_002806865.1 |
48,870 (21.91 %) |
19,421 (7.41 %) |
36,314 (20.76 %) |
n/a | 36.49 (94.25 %) |
49,649 (5.76 %) |
25,263 (100.00 %) |
182,696 (3.35 %) |
143,269 (7.40 %) |
1,620,517 (29.12 %) |
13,323 (2.49 %) |
479 | velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020) GCF_010614865.1 |
34,675 (2.01 %) |
3,329 (0.10 %) |
24,015 (1.20 %) |
n/a | 33.26 (100.00 %) |
7 (0.00 %) |
16,531 (100.00 %) |
1,258,301 (2.08 %) |
828,332 (2.42 %) |
17,994,342 (48.98 %) |
63,015 (0.95 %) |
480 | wasp C.solmsi marchali (v1 2013) GCF_000503995.1 |
13,201 (7.14 %) |
3,474 (1.25 %) |
15,142 (4.89 %) |
n/a | 30.36 (99.55 %) |
7,471 (0.46 %) |
9,928 (99.54 %) |
340,841 (7.52 %) |
251,386 (3.99 %) |
2,448,273 (49.27 %) |
16,346 (4.08 %) |
481 | water buffalo (Mediterranean 2013) GCA_000471725.1 |
n/a | 20,245 (1.49 %) |
24,230 (1.29 %) |
n/a | 42.11 (97.39 %) |
263,385 (2.62 %) |
630,367 (97.38 %) |
5,997,926 (47.35 %) |
466,019 (1.02 %) |
13,822,739 (40.29 %) |
93,080 (1.71 %) |
482 | Weddell seal (WS11-02 2013 genbank) GCA_000349705.1 |
48,251 (30.18 %) |
21,044 (1.72 %) |
22,320 (1.43 %) |
n/a | 41.39 (70.44 %) |
152,836 (29.58 %) |
169,546 (70.42 %) |
4,420,479 (41.72 %) |
471,250 (0.66 %) |
13,410,191 (22.09 %) |
48,738 (1.01 %) |
483 | western European hedgehog (2012 genbank) GCA_000296755.1 |
29,923 (35.25 %) |
18,034 (1.33 %) |
19,779 (1.35 %) |
n/a | 41.54 (85.94 %) |
219,764 (14.09 %) |
225,566 (85.91 %) |
6,527,125 (45.87 %) |
1,271,531 (2.29 %) |
12,374,069 (42.02 %) |
28,528 (0.71 %) |
484 | western European hedgehog (primary hap 2023 genbank) GCA_950295315.1 |
61,103 (44.10 %) |
18,126 (1.16 %) |
21,345 (1.28 %) |
n/a | 42.00 (99.97 %) |
3,760 (0.03 %) |
1,175 (100.00 %) |
4,891,344 (19.68 %) |
1,507,933 (3.81 %) |
12,571,193 (54.50 %) |
32,667 (0.90 %) |
485 | western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016) GCA_001624835.1 |
n/a | 20,870 (2.26 %) |
18,535 (1.45 %) |
100,622 (4.22 %) |
41.80 (84.36 %) |
399,976 (15.70 %) |
72,315 (94.81 %) |
4,961,700 (39.53 %) |
1,345,987 (2.51 %) |
13,324,808 (25.23 %) |
16,556 (0.40 %) |
486 | western flower thrips (v2 FOCC.00 2017) GCF_000697945.2 |
24,277 (14.78 %) |
4,066 (1.46 %) |
26,743 (11.40 %) |
n/a | 51.10 (94.72 %) |
60,375 (5.31 %) |
34,226 (94.71 %) |
275,482 (4.88 %) |
167,812 (3.67 %) |
1,832,537 (24.44 %) |
26,406 (36.85 %) |
487 | western lowland gorilla (Susie 2016) GCA_900006655.3 |
n/a | 20,323 (1.77 %) |
22,069 (1.15 %) |
n/a | 40.71 (99.64 %) |
768 (0.36 %) |
16,065 (99.64 %) |
5,373,630 (50.30 %) |
1,025,389 (10.17 %) |
15,954,613 (41.78 %) |
53,557 (1.01 %) |
488 | western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023) GCF_029281585.1 |
101,242 (3.18 %) |
20,994 (1.57 %) |
41,945 (1.53 %) |
n/a | 40.59 (99.85 %) |
38 (0.15 %) |
637 (100.00 %) |
5,526,927 (51.16 %) |
1,080,693 (20.38 %) |
15,929,020 (48.46 %) |
76,432 (1.35 %) |
489 | western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 genbank) GCA_029281585.2 |
98,415 (41.67 %) |
21,010 (1.59 %) |
50,696 (1.83 %) |
n/a | 40.49 (99.94 %) |
2 (0.06 %) |
25 (100.00 %) |
5,456,267 (50.77 %) |
1,060,267 (19.55 %) |
15,870,191 (47.77 %) |
69,745 (1.19 %) |
490 | western painted turtle (v303 2014) GCF_000241765.3 |
51,681 (3.25 %) |
15,203 (1.04 %) |
22,272 (1.67 %) |
46,230 (2.32 %) |
44.19 (91.88 %) |
183,744 (8.14 %) |
262,326 (91.86 %) |
2,767,141 (30.92 %) |
316,971 (0.98 %) |
11,856,824 (28.95 %) |
104,231 (1.84 %) |
491 | western painted turtle (v304 RCT428 2020) GCF_000241765.4 |
64,798 (3.75 %) |
15,669 (1.09 %) |
21,663 (1.64 %) |
n/a | 44.19 (87.54 %) |
184,311 (12.48 %) |
260,698 (87.52 %) |
3,780,252 (41.81 %) |
316,422 (0.93 %) |
11,852,305 (27.59 %) |
103,899 (1.75 %) |
492 | western predatory mite (v1.0 2012) GCF_000255335.1 |
12,199 (13.86 %) |
2,842 (1.49 %) |
27,198 (19.18 %) |
n/a | 51.58 (99.74 %) |
1,901 (0.26 %) |
3,993 (99.74 %) |
33,136 (1.10 %) |
13,115 (0.57 %) |
612,854 (9.73 %) |
2,003 (54.71 %) |
493 | western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016) GCA_001624865.1 |
n/a | 21,211 (2.19 %) |
17,797 (1.36 %) |
100,839 (4.01 %) |
41.65 (89.10 %) |
334,091 (10.95 %) |
29,259 (98.77 %) |
5,087,807 (40.60 %) |
1,402,357 (3.14 %) |
13,522,663 (27.99 %) |
16,888 (0.42 %) |
494 | wheat stem sawfly (v1 2014) GCF_000341935.1 |
37,175 (25.01 %) |
4,407 (2.81 %) |
15,504 (11.96 %) |
n/a | 40.34 (98.12 %) |
8,733 (1.89 %) |
10,707 (98.11 %) |
87,084 (2.38 %) |
44,673 (2.55 %) |
1,001,343 (22.18 %) |
7,519 (2.78 %) |
495 | white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021) GCF_016700215.1 |
55,865 (8.86 %) |
12,310 (2.41 %) |
22,056 (2.57 %) |
n/a | 42.20 (99.65 %) |
254 (0.35 %) |
509 (99.65 %) |
604,452 (10.76 %) |
232,416 (2.03 %) |
5,541,059 (20.23 %) |
22,185 (2.62 %) |
496 | white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_949774975.1 |
59,982 (41.87 %) |
18,737 (1.57 %) |
20,767 (1.34 %) |
n/a | 41.91 (99.99 %) |
1,070 (0.01 %) |
410 (100.00 %) |
3,820,566 (36.21 %) |
922,103 (8.43 %) |
12,304,360 (39.74 %) |
68,551 (3.58 %) |
497 | white-footed mouse GCF_004664715.1 |
46,167 (2.56 %) |
20,406 (1.72 %) |
20,857 (1.46 %) |
39,081 (1.88 %) |
42.23 (100.00 %) |
79 (0.00 %) |
1,763 (100.00 %) |
5,064,597 (30.73 %) |
1,258,088 (2.85 %) |
14,005,845 (33.01 %) |
23,475 (0.69 %) |
498 | white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank) GCA_002102435.1 |
57,774 (39.81 %) |
20,653 (1.75 %) |
23,083 (1.50 %) |
40,950 (1.94 %) |
41.55 (99.10 %) |
107,030 (0.91 %) |
48,652 (99.10 %) |
4,799,958 (41.28 %) |
413,128 (2.59 %) |
13,296,686 (34.22 %) |
44,165 (1.19 %) |
499 | white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank) GCA_947461875.1 |
n/a | 13,735 (1.76 %) |
28,993 (2.53 %) |
n/a | 43.15 (99.99 %) |
424 (0.01 %) |
188 (100.00 %) |
585,276 (12.89 %) |
291,289 (6.10 %) |
6,474,027 (23.66 %) |
54,851 (4.05 %) |
500 | white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U) GCF_000004665.1 |
58,109 (2.92 %) |
21,699 (1.91 %) |
20,910 (1.24 %) |
n/a | 40.85 (94.45 %) |
187,214 (5.57 %) |
201,523 (94.43 %) |
5,120,629 (48.95 %) |
768,432 (2.30 %) |
15,303,718 (34.75 %) |
35,805 (0.79 %) |
501 | white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017) GCA_002754865.1 |
n/a | 21,754 (1.86 %) |
21,668 (1.22 %) |
n/a | 40.77 (99.67 %) |
48,495 (0.33 %) |
88,439 (99.67 %) |
5,195,965 (48.83 %) |
825,714 (3.60 %) |
15,372,168 (38.05 %) |
34,994 (0.85 %) |
502 | white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank) GCA_009663435.1 |
n/a | 21,729 (1.89 %) |
21,502 (1.30 %) |
n/a | 40.85 (98.70 %) |
370 (1.30 %) |
1,360 (98.70 %) |
5,122,418 (49.40 %) |
818,502 (3.68 %) |
15,232,829 (38.20 %) |
36,656 (0.90 %) |
503 | white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020) GCA_011100535.1 |
n/a | 20,939 (1.94 %) |
20,416 (1.31 %) |
n/a | 41.04 (99.58 %) |
788 (0.42 %) |
336 (100.00 %) |
4,869,007 (49.39 %) |
746,577 (2.68 %) |
14,347,286 (37.59 %) |
35,222 (0.94 %) |
504 | white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank) GCA_011100555.2 |
n/a | 21,801 (1.88 %) |
21,501 (1.28 %) |
n/a | 40.92 (99.52 %) |
1,165 (0.48 %) |
1,234 (100.00 %) |
5,036,594 (47.71 %) |
842,846 (3.25 %) |
15,161,577 (38.08 %) |
37,603 (0.93 %) |
505 | whooping crane (maternal hap 2023 genbank) GCA_028858705.1 |
55,408 (53.40 %) |
13,572 (1.81 %) |
24,739 (2.19 %) |
n/a | 43.07 (99.63 %) |
262 (0.37 %) |
929 (100.00 %) |
616,295 (10.57 %) |
211,557 (2.90 %) |
6,785,134 (22.11 %) |
42,795 (4.66 %) |
506 | wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank) GCA_000311805.2 |
n/a | 18,785 (1.94 %) |
17,252 (1.62 %) |
n/a | 41.28 (98.83 %) |
60,971 (1.18 %) |
68,871 (98.82 %) |
3,098,525 (34.75 %) |
353,630 (1.23 %) |
12,349,553 (25.12 %) |
45,436 (1.02 %) |
507 | wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019) GCF_002162155.1 |
131,302 (1.34 %) |
33,079 (0.33 %) |
567,762 (8.14 %) |
n/a | 45.99 (96.70 %) |
344,768 (3.31 %) |
148,396 (100.00 %) |
2,762,705 (2.81 %) |
2,991,142 (3.37 %) |
493,164 (96.69 %) |
2,220,897 (25.33 %) |
508 | wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017) GCF_000817695.2 |
69,091 (6.81 %) |
16,823 (1.67 %) |
75,740 (11.45 %) |
n/a | 35.81 (86.74 %) |
133,967 (13.30 %) |
3,189 (98.45 %) |
588,761 (3.39 %) |
493,855 (3.35 %) |
5,206,772 (45.36 %) |
48,008 (1.88 %) |
509 | wild strawberry (2011 genbank) GCA_000184155.1 |
n/a | 14,001 (6.64 %) |
34,562 (26.90 %) |
n/a | 38.40 (94.26 %) |
16,253 (5.76 %) |
16,459 (94.24 %) |
152,427 (20.00 %) |
74,539 (2.79 %) |
1,032,592 (21.43 %) |
14,802 (3.20 %) |
510 | wire-tailed manakin (2018) GCF_003945595.1 |
50,529 (5.75 %) |
12,950 (1.89 %) |
19,252 (2.57 %) |
24,522 (2.44 %) |
42.30 (100.00 %) |
102 (0.00 %) |
3,744 (100.00 %) |
500,823 (7.17 %) |
300,638 (2.31 %) |
6,414,267 (20.54 %) |
28,268 (2.21 %) |
511 | woodchuck (CNAG 2019) GCA_901343595.1 |
n/a | 20,813 (1.60 %) |
23,199 (1.43 %) |
45,153 (1.99 %) |
40.00 (97.18 %) |
57,045 (2.82 %) |
105,556 (97.18 %) |
4,756,333 (33.73 %) |
836,503 (2.41 %) |
14,755,960 (31.13 %) |
34,151 (0.87 %) |
512 | woodchuck (v1.0 LI92 2021) GCF_021218885.1 |
62,044 (2.80 %) |
19,783 (1.48 %) |
21,060 (1.38 %) |
n/a | 39.92 (100.00 %) |
46 (0.00 %) |
3,381 (100.00 %) |
3,884,968 (28.12 %) |
912,591 (2.73 %) |
14,538,767 (35.15 %) |
36,919 (1.02 %) |
513 | wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank) GCA_029207755.1 |
n/a | 13,052 (1.78 %) |
24,950 (2.30 %) |
n/a | 43.93 (100.00 %) |
353 (0.00 %) |
1,695 (100.00 %) |
444,866 (3.08 %) |
473,471 (7.97 %) |
5,336,498 (25.82 %) |
37,210 (3.14 %) |
514 | Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq) GCF_003031525.1 |
43,312 (2.49 %) |
18,639 (1.72 %) |
19,645 (1.46 %) |
n/a | 41.28 (99.29 %) |
52,647 (0.72 %) |
66,346 (99.28 %) |
n/a | 540,765 (1.65 %) |
12,691,760 (32.87 %) |
59,052 (1.48 %) |
515 | Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank) GCA_003031525.1 |
43,299 (41.33 %) |
18,726 (1.80 %) |
19,644 (1.46 %) |
n/a | 41.28 (99.29 %) |
52,647 (0.72 %) |
66,345 (99.28 %) |
3,990,044 (42.54 %) |
540,765 (1.65 %) |
12,691,683 (32.88 %) |
59,052 (1.48 %) |
516 | Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank) GCA_000442215.1 |
27,063 (35.76 %) |
19,219 (1.73 %) |
27,456 (1.66 %) |
n/a | 41.30 (98.69 %) |
124,797 (1.33 %) |
155,509 (98.67 %) |
4,277,556 (44.10 %) |
690,534 (1.95 %) |
13,025,034 (35.19 %) |
67,035 (1.82 %) |
517 | Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.1 |
27,063 (1.65 %) |
19,227 (1.75 %) |
27,468 (1.66 %) |
n/a | 41.30 (98.69 %) |
124,797 (1.33 %) |
155,510 (98.67 %) |
4,193,317 (43.38 %) |
690,534 (1.95 %) |
13,025,097 (35.19 %) |
67,035 (1.82 %) |
518 | yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank) GCA_002204515.1 |
n/a | 8,814 (0.51 %) |
152,909 (17.36 %) |
n/a | 38.16 (100.00 %) |
229 (0.00 %) |
6,534 (100.00 %) |
2,912,289 (46.74 %) |
533,475 (4.34 %) |
10,210,670 (53.65 %) |
132,732 (6.12 %) |
519 | yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019) GCF_003676075.2 |
42,715 (2.16 %) |
19,894 (1.62 %) |
21,366 (1.40 %) |
43,878 (1.99 %) |
39.89 (97.96 %) |
35,595 (2.04 %) |
66,624 (97.96 %) |
4,646,957 (34.05 %) |
800,897 (1.96 %) |
14,340,028 (32.63 %) |
34,125 (0.91 %) |
520 | yellow-bellied marmot (v1 2018) GCF_003676075.1 |
41,573 (2.14 %) |
19,845 (1.63 %) |
21,262 (1.39 %) |
n/a | 39.88 (97.82 %) |
38,354 (2.18 %) |
69,503 (97.82 %) |
4,683,625 (34.38 %) |
799,659 (1.95 %) |
14,322,765 (32.58 %) |
34,127 (0.91 %) |
521 | yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCA_016432865.1 |
n/a | 15,703 (0.78 %) |
16,184 (0.90 %) |
n/a | 36.21 (99.99 %) |
620 (0.01 %) |
487 (100.00 %) |
5,424,579 (25.40 %) |
1,269,774 (2.59 %) |
21,430,550 (42.69 %) |
28,121 (0.66 %) |
522 | yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI) GCF_000699245.1 |
15,990 (2.25 %) |
11,775 (1.55 %) |
23,935 (1.90 %) |
n/a | 41.36 (99.67 %) |
48,553 (0.34 %) |
107,160 (99.66 %) |
384,032 (4.45 %) |
182,309 (1.03 %) |
6,529,534 (19.24 %) |
15,660 (0.55 %) |
523 | yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017) GCF_002814215.1 |
41,168 (9.96 %) |
15,861 (2.76 %) |
30,671 (6.00 %) |
n/a | 40.75 (97.79 %) |
33,664 (2.20 %) |
99,598 (100.00 %) |
614,513 (4.16 %) |
522,349 (4.83 %) |
4,650,538 (24.98 %) |
18,054 (0.96 %) |
524 | zebra finch (v1 Black17 2019 refseq) GCF_003957565.1 |
51,472 (7.16 %) |
13,211 (2.02 %) |
17,812 (2.70 %) |
38,655 (7.10 %) |
42.04 (99.78 %) |
312 (0.22 %) |
135 (100.00 %) |
535,521 (8.50 %) |
550,118 (4.01 %) |
6,519,872 (21.47 %) |
30,053 (2.58 %) |
525 | zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank) GCA_003957565.2 |
n/a | 13,212 (2.02 %) |
25,117 (2.57 %) |
38,655 (7.10 %) |
42.04 (99.78 %) |
312 (0.22 %) |
135 (100.00 %) |
535,521 (8.50 %) |
550,118 (4.01 %) |
6,519,872 (21.47 %) |
30,053 (2.58 %) |
526 | zebra shark (hap1 2023 genbank) GCA_030684315.1 |
n/a | 12,291 (0.48 %) |
16,769 (1.14 %) |
n/a | 43.41 (99.47 %) |
1,159 (0.53 %) |
835 (100.00 %) |
8,087,543 (64.92 %) |
798,373 (9.17 %) |
14,838,773 (42.39 %) |
45,284 (1.67 %) |
527 | zebu cattle (Nelore 2014 genbank) GCA_000247795.2 |
n/a | 18,599 (1.58 %) |
18,779 (1.29 %) |
n/a | 41.75 (92.62 %) |
6,941,272 (7.66 %) |
253,769 (92.59 %) |
5,118,783 (46.84 %) |
358,908 (0.88 %) |
13,431,620 (36.60 %) |
35,241 (0.84 %) |
528 | zig-zag eel (v1.1 2018) GCF_900324485.1 |
44,813 (12.05 %) |
15,028 (3.35 %) |
21,782 (6.89 %) |
36,982 (11.22 %) |
40.66 (97.63 %) |
235 (2.37 %) |
126 (100.00 %) |
348,517 (2.87 %) |
157,776 (2.00 %) |
3,182,742 (23.42 %) |
12,824 (1.08 %) |
TOTALS: | total assembly count 528 |