Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiGene gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adeno-associated virus 2 (1993)
GCF_000838645.1
14
(89.01 %)
53.80
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(3.18 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(54.43 %)
2 Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005)
GCF_000864245.1
11
(95.04 %)
33.42
(99.83 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.20 %)
37
(2.83 %)
0
(0.00 %)
3 Aichi virus 1 (A846/88 1998)
GCF_000861885.1
1
(88.50 %)
58.90
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.09 %)
n/a 8
(2.47 %)
1
(81.27 %)
4 Alphapapillomavirus 4 (1991)
GCF_000864945.1
7
(86.62 %)
48.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.34 %)
1
(0.50 %)
7
(2.05 %)
0
(0.00 %)
5 Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023)
GCA_008791745.1
78
(79.40 %)
44.93
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(0.18 %)
13
(1.23 %)
226
(2.34 %)
5
(4.61 %)
6 Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003)
GCF_000856545.1
4
(95.69 %)
41.57
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.24 %)
1
(0.48 %)
2
(0.58 %)
0
(0.00 %)
7 Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012)
GCF_000895575.1
3
(99.13 %)
40.52
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(2.01 %)
0
(0.00 %)
8 Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012)
GCF_000899535.1
3
(99.15 %)
40.00
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(2.19 %)
0
(0.00 %)
9 Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012)
GCF_000901475.1
3
(98.01 %)
41.78
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.29 %)
0
(0.00 %)
10 Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012)
GCF_000897955.1
3
(97.62 %)
42.99
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.11 %)
0
(0.00 %)
11 Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999)
GCF_000850325.1
5
(91.79 %)
44.15
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.61 %)
0
(0.00 %)
12 Bacillus phage PfNC7401 (2016)
GCA_002611025.1
79
(85.50 %)
36.55
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
4
(0.31 %)
121
(3.62 %)
0
(0.00 %)
13 Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000)
GCF_000858185.1
12
(86.10 %)
39.33
(99.89 %)
n/a 12
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.64 %)
0
(0.00 %)
14 Barmah Forest virus (BH2193 1997)
GCF_000847585.1
5
(95.39 %)
48.55
(99.97 %)
2
(0.02 %)
3
(99.98 %)
4
(0.59 %)
n/a 7
(2.47 %)
5
(15.26 %)
15 Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022)
GCF_008777455.1
75
(84.84 %)
72.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 116
(4.31 %)
1,304
(33.41 %)
1
(99.99 %)
16 Bunyamwera virus (1991)
GCF_000849925.1
4
(95.34 %)
35.16
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 30
(3.12 %)
0
(0.00 %)
17 Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004)
GCF_000846965.1
80
(78.07 %)
75.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
169
(6.25 %)
180
(5.92 %)
1,059
(33.71 %)
1
(100.00 %)
18 Chandipura virus (CIN 0451 2013)
GCF_000906815.1
5
(96.34 %)
42.53
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.29 %)
n/a 19
(1.75 %)
0
(0.00 %)
19 Chikungunya virus (S27-African prototype 2002)
GCF_000854045.1
2
(94.47 %)
50.04
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.87 %)
n/a 3
(1.76 %)
7
(34.06 %)
20 Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009)
GCF_000885595.1
1
(83.53 %)
43.75
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.63 %)
n/a 5
(1.90 %)
0
(0.00 %)
21 Cowpox virus (Brighton Red 2002)
GCF_000839185.1
233
(91.92 %)
33.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
41
(0.80 %)
64
(2.52 %)
1,041
(9.40 %)
0
(0.00 %)
22 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003)
GCF_000854165.1
3
(95.80 %)
42.23
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.22 %)
26
(1.53 %)
0
(0.00 %)
23 Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997)
GCF_000862125.1
1
(94.82 %)
46.67
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.68 %)
0
(0.00 %)
24 Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993)
GCF_000871845.1
5
(98.86 %)
45.82
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 2
(0.16 %)
0
(0.00 %)
25 Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007)
GCF_000866625.1
5
(98.92 %)
46.71
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.60 %)
0
(0.00 %)
26 Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001)
GCF_000865065.1
4
(98.81 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
27 Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017)
GCF_002116195.1
6
(95.15 %)
45.84
(99.90 %)
n/a 6
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.33 %)
0
(0.00 %)
28 Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995)
GCF_000850985.1
3
(96.61 %)
40.19
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 41
(3.15 %)
0
(0.00 %)
29 Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013)
GCF_000905375.1
5
(90.59 %)
44.22
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.72 %)
0
(0.00 %)
30 Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018)
GCF_003032765.1
5
(93.39 %)
37.99
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.77 %)
n/a 8
(0.77 %)
0
(0.00 %)
31 Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991)
GCF_000862705.1
5
(96.00 %)
48.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.91 %)
n/a 3
(0.64 %)
5
(23.55 %)
32 Ectromelia virus (Moscow 2002)
GCF_000841905.1
173
(80.43 %)
33.18
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
45
(0.96 %)
22
(1.55 %)
1,122
(9.40 %)
0
(0.00 %)
33 Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993)
GCF_000862985.1
3
(87.80 %)
49.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.68 %)
1
(1.68 %)
2
(1.83 %)
0
(0.00 %)
34 Enterovirus A (1994)
GCF_000861905.1
1
(88.79 %)
47.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.09 %)
1
(3.32 %)
35 Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982)
GCF_000861165.1
5
(98.35 %)
46.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(6.95 %)
36 Enterovirus D (Enterovirus 70 1993)
GCF_000861205.1
1
(89.14 %)
42.80
(100.00 %)
3
(0.04 %)
4
(99.96 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
37 Epstein-Barr virus (Raji 2005)
GCF_002402265.1
98
(77.44 %)
59.50
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
30
(0.66 %)
34
(5.62 %)
577
(10.56 %)
27
(45.97 %)
38 Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007)
GCF_000872045.1
114
(68.90 %)
59.54
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
34
(0.79 %)
29
(5.78 %)
498
(10.10 %)
24
(45.98 %)
39 Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993)
GCA_000844025.1
81
(83.51 %)
56.66
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
23
(0.73 %)
28
(3.15 %)
306
(5.68 %)
2
(99.10 %)
40 Escherichia phage Lambda (2000)
GCF_000840245.1
92
(95.32 %)
49.86
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.20 %)
n/a 36
(0.81 %)
4
(51.36 %)
41 European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007)
GCF_000870765.1
5
(90.43 %)
44.65
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.08 %)
0
(0.00 %)
42 Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999)
GCA_000847005.2
90
(80.77 %)
47.74
(99.98 %)
n/a 14
(100.00 %)
11
(0.22 %)
9
(0.61 %)
221
(1.97 %)
23
(30.48 %)
43 Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000)
GCF_000838845.1
78
(74.47 %)
53.61
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
47
(1.57 %)
60
(2.83 %)
387
(6.28 %)
1
(99.49 %)
44 GB virus C (1996)
GCF_000862005.1
1
(91.81 %)
59.09
(99.98 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(1.67 %)
2
(82.30 %)
45 Goatpox virus (Pellor 2002)
GCF_000840165.1
150
(93.15 %)
25.31
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
51
(1.59 %)
8
(0.24 %)
1,548
(24.38 %)
0
(0.00 %)
46 Hantaan orthohantavirus (76-118 2003)
GCF_000856085.1
3
(94.17 %)
38.56
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.78 %)
0
(0.00 %)
47 Hendra henipavirus (1998)
GCF_000852685.1
9
(82.12 %)
39.43
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 13
(0.75 %)
0
(0.00 %)
48 Hepatitis B virus (2015)
GCF_000861825.2
4
(55.31 %)
48.46
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(12.45 %)
49 Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997)
GCF_000861845.1
3
(93.68 %)
58.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.33 %)
6
(1.40 %)
13
(2.88 %)
1
(90.43 %)
50 Hepatitis delta virus (1993)
GCF_000856565.1
2
(38.35 %)
58.81
(99.88 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(2.68 %)
1
(3.63 %)
1
(71.11 %)
51 Hepatovirus A (1993)
GCF_000860505.1
3
(100.00 %)
37.87
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
1
(0.47 %)
1
(0.53 %)
0
(0.00 %)
52 Herpes simplex virus type 1 (17 1990)
GCF_000859985.2
81
(86.40 %)
68.30
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
81
(2.72 %)
51
(2.90 %)
932
(18.12 %)
1
(100.00 %)
53 human adenovirus 1 (2004)
GCF_000858645.1
44
(91.94 %)
55.26
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.98 %)
2
(0.11 %)
103
(4.79 %)
6
(70.17 %)
54 human adenovirus 2 (2004)
GCF_000859465.1
42
(90.84 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
55 human adenovirus 35 (2004)
GCF_000857885.1
44
(93.67 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.68 %)
3
(0.30 %)
80
(3.56 %)
6
(39.41 %)
56 human adenovirus 5 (2004)
GCF_000857865.1
42
(90.68 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.95 %)
n/a 99
(4.47 %)
5
(69.88 %)
57 human adenovirus 54 (Kobe-H 2009)
GCF_000885675.1
40
(91.15 %)
54.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.74 %)
n/a 65
(2.61 %)
3
(66.98 %)
58 human adenovirus 7 (2004)
GCF_000859485.1
45
(92.24 %)
51.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.56 %)
1
(1.54 %)
61
(2.28 %)
7
(43.72 %)
59 human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013)
GCF_000858385.2
86
(83.37 %)
70.38
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
124
(3.80 %)
64
(3.26 %)
1,158
(23.65 %)
1
(99.99 %)
60 human associated cyclovirus 10 (7078A 2014)
GCF_000918035.2
2
(86.20 %)
43.41
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
61 human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015)
GCF_001448435.1
4
(89.04 %)
51.81
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.89 %)
1
(1.89 %)
1
(2.24 %)
1
(97.10 %)
62 human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018)
GCF_003033475.1
2
(69.15 %)
42.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
63 human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018)
GCF_003033485.1
2
(69.81 %)
43.97
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(1.38 %)
2
(0.57 %)
0
(0.00 %)
64 human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018)
GCF_003033495.1
2
(70.27 %)
42.28
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.79 %)
0
(0.00 %)
65 human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015)
GCF_000931315.1
2
(74.85 %)
48.83
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.55 %)
1
(41.76 %)
66 human astrovirus (1993)
GCF_000861865.1
3
(97.58 %)
44.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.88 %)
1
(1.34 %)
9
(2.08 %)
0
(0.00 %)
67 human astrovirus BF34 (BF34 2014)
GCF_000923215.1
4
(97.29 %)
43.77
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.47 %)
0
(0.00 %)
68 human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004)
GCF_000845245.1
194
(84.91 %)
57.48
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
74
(1.33 %)
28
(0.67 %)
1,047
(7.96 %)
1
(99.99 %)
69 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq)
GCF_000845685.2
115
(79.56 %)
42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
70 human betaherpesvirus 6B (Z29 1999)
GCF_000846365.1
128
(82.45 %)
42.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
27
(1.57 %)
20
(3.84 %)
652
(8.84 %)
6
(15.35 %)
71 human betaherpesvirus 7 (RK 1995)
GCF_000848125.1
111
(79.51 %)
36.22
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
16
(1.65 %)
34
(8.04 %)
791
(15.85 %)
3
(5.14 %)
72 human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009)
GCF_000882675.1
4
(87.74 %)
41.59
(99.98 %)
1
(0.02 %)
2
(99.98 %)
5
(1.23 %)
n/a 5
(0.98 %)
0
(0.00 %)
73 human bocavirus 3 (W471 2009)
GCF_000882855.1
4
(88.44 %)
42.16
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.95 %)
1
(4.96 %)
74 human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009)
GCF_000886375.1
6
(92.83 %)
40.41
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.06 %)
0
(0.00 %)
75 human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014)
GCF_000924015.1
4
(85.08 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 1
(0.25 %)
2
(49.61 %)
76 human coronavirus 229E (2001)
GCF_000853505.1
9
(97.14 %)
38.26
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.31 %)
2
(0.29 %)
57
(2.91 %)
0
(0.00 %)
77 human coronavirus HKU1 (HKU1 2004)
GCF_000858765.1
10
(98.07 %)
32.06
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.72 %)
1
(1.60 %)
89
(5.62 %)
0
(0.00 %)
78 human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004)
GCF_000853865.1
8
(97.86 %)
34.46
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(1.09 %)
n/a 84
(5.24 %)
0
(0.00 %)
79 human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019)
GCF_003972325.1
11
(97.82 %)
36.79
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.43 %)
1
(0.09 %)
90
(3.88 %)
0
(0.00 %)
80 human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014)
GCF_000920655.1
1
(81.59 %)
43.53
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.59 %)
0
(0.00 %)
81 human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009)
GCF_000884955.1
1
(88.49 %)
43.79
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.47 %)
n/a 6
(1.35 %)
0
(0.00 %)
82 human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013)
GCF_000908835.1
3
(84.17 %)
46.45
(99.89 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.38 %)
1
(13.92 %)
83 human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019)
GCF_003727435.1
1
(6.26 %)
53.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.89 %)
n/a 3
(0.59 %)
1
(93.16 %)
84 human endogenous retrovirus K113 (2013)
GCF_000913595.1
1
(22.17 %)
41.86
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.60 %)
n/a 14
(2.49 %)
0
(0.00 %)
85 human erythrovirus V9 (V9 2001)
GCF_000841965.1
6
(90.67 %)
42.09
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.75 %)
0
(0.00 %)
86 human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017)
GCF_002219885.1
5
(72.08 %)
31.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(5.43 %)
n/a 20
(11.11 %)
0
(0.00 %)
87 human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017)
GCF_002219525.1
2
(84.04 %)
32.53
(99.90 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.60 %)
0
(0.00 %)
88 human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017)
GCF_002219705.1
2
(81.18 %)
45.77
(99.87 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.34 %)
0
(0.00 %)
89 human feces pecovirus (PeCV-NI 2019)
GCF_003726995.1
2
(72.77 %)
50.00
(99.90 %)
1
(0.03 %)
2
(99.97 %)
5
(2.46 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(55.12 %)
90 human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018)
GCF_003033575.1
2
(74.86 %)
46.00
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.54 %)
1
(19.22 %)
91 human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017)
GCF_002271185.1
2
(72.89 %)
46.99
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.66 %)
1
(1.56 %)
4
(1.25 %)
0
(0.00 %)
92 Human gammaherpesvirus 8 (BCBL-1 2019)
GCA_027939675.1
n/a 53.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.10 %)
29
(2.97 %)
135
(3.68 %)
8
(83.99 %)
93 human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007)
GCF_000838265.1
113
(85.53 %)
53.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.88 %)
151
(3.93 %)
9
(84.42 %)
94 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009)
GCA_027939395.1
102
(83.23 %)
53.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
95 Human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2019)
GCA_027939375.1
102
(83.23 %)
53.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
96 Human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2021)
GCA_027939385.1
102
(83.23 %)
53.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
97 Human gammaherpesvirus 8 (UNC_BCBL-1 2022)
GCA_027939455.1
114
(84.22 %)
53.75
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.87 %)
145
(3.86 %)
9
(84.42 %)
98 Human gemycircularvirus (GeTz1 2018)
GCF_002826025.1
4
(77.38 %)
49.05
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.23 %)
0
(0.00 %)
99 human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015)
GCF_000973295.1
4
(80.18 %)
54.85
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.21 %)
1
(91.86 %)
100 human hepegivirus (AK-790 2018)
GCF_002821385.1
1
(96.18 %)
53.60
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.51 %)
2
(88.97 %)
101 human immunodeficiency virus 1 (1998)
GCF_000864765.1
14
(93.78 %)
42.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.57 %)
1
(0.34 %)
18
(3.29 %)
1
(2.29 %)
102 human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993)
GCF_000856385.1
12
(84.81 %)
45.66
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.98 %)
10
(1.44 %)
0
(0.00 %)
103 human lung-associated vientovirus FB (2021)
GCF_013088445.1
3
(86.49 %)
33.94
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.15 %)
1
(1.34 %)
3
(6.81 %)
0
(0.00 %)
104 human mastadenovirus A (2004)
GCF_000884295.1
41
(94.00 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
105 human mastadenovirus A (Huie 1993)
GCF_000846805.1
43
(94.41 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
106 human mastadenovirus B (GB 2008)
GCF_000880515.1
48
(93.42 %)
51.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.47 %)
1
(0.18 %)
41
(1.61 %)
7
(43.26 %)
107 human mastadenovirus B (Slobitski 2008)
GCF_000857085.1
46
(93.74 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.82 %)
3
(0.30 %)
50
(2.47 %)
6
(39.41 %)
108 human mastadenovirus C (1993)
GCF_000845085.1
63
(97.51 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
109 human mastadenovirus D (2004)
GCF_000858625.1
21
(47.83 %)
56.58
(100.00 %)
4
(0.01 %)
5
(99.99 %)
12
(1.24 %)
n/a 61
(3.14 %)
3
(66.84 %)
110 human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008)
GCF_000845985.1
47
(93.93 %)
57.10
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.92 %)
1
(0.13 %)
59
(2.95 %)
3
(67.41 %)
111 human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001)
GCF_000859665.1
40
(96.48 %)
57.67
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.65 %)
n/a 107
(4.08 %)
5
(73.25 %)
112 human mastadenovirus F (Dugan 1993)
GCF_000846685.1
44
(94.91 %)
51.22
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.32 %)
n/a 63
(2.23 %)
1
(62.53 %)
113 human metapneumovirus (00-1 2018)
GCF_002815375.1
9
(93.36 %)
36.29
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(1.38 %)
1
(0.34 %)
27
(3.46 %)
0
(0.00 %)
114 human orthopneumovirus (2018)
GCF_002815475.1
12
(97.34 %)
33.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.24 %)
19
(3.32 %)
0
(0.00 %)
115 human orthopneumovirus (B1 1997)
GCF_000855545.1
10
(97.35 %)
33.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.61 %)
2
(0.52 %)
16
(3.21 %)
0
(0.00 %)
116 human orthorubulavirus 2 (1991)
GCF_000863525.1
8
(98.61 %)
38.41
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 6
(0.27 %)
0
(0.00 %)
117 human papillomavirus (SE379 2015)
GCF_001274345.1
6
(93.54 %)
37.49
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.98 %)
1
(2.70 %)
21
(3.02 %)
0
(0.00 %)
118 human papillomavirus 103 (Qv33725 2006)
GCF_000868225.1
6
(88.01 %)
41.58
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 19
(3.06 %)
0
(0.00 %)
119 human papillomavirus 108 (2009)
GCF_000883655.1
5
(88.56 %)
42.65
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.38 %)
0
(0.00 %)
120 human papillomavirus 109 (2009)
GCF_000883695.1
7
(92.87 %)
38.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.94 %)
1
(0.48 %)
19
(3.13 %)
1
(3.23 %)
121 human papillomavirus 116 (HPV116 2009)
GCF_000884175.1
7
(93.82 %)
38.50
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(4.73 %)
122 human papillomavirus 121 (NJ3301 2010)
GCF_000889075.1
7
(92.45 %)
37.74
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.41 %)
n/a 9
(0.98 %)
0
(0.00 %)
123 human papillomavirus 126 (HPV126 2011)
GCF_000896435.1
7
(91.96 %)
38.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(2.68 %)
1
(2.92 %)
124 human papillomavirus 127 (R3a 2010)
GCF_000890115.1
8
(93.50 %)
36.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(0.79 %)
18
(2.79 %)
1
(3.20 %)
125 human papillomavirus 132 (27-50 2011)
GCF_000888015.1
7
(93.36 %)
37.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.89 %)
0
(0.00 %)
126 human papillomavirus 134 (39-65 2011)
GCF_000889695.1
7
(92.69 %)
38.14
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.48 %)
0
(0.00 %)
127 human papillomavirus 135 (NJ3500 2012)
GCF_000898235.1
7
(92.24 %)
36.86
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.56 %)
1
(0.67 %)
14
(2.77 %)
0
(0.00 %)
128 human papillomavirus 136 (CL3865 2012)
GCF_000899695.1
7
(91.83 %)
38.51
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 19
(3.31 %)
0
(0.00 %)
129 human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012)
GCF_000898855.1
7
(91.69 %)
39.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.79 %)
n/a 4
(1.28 %)
0
(0.00 %)
130 human papillomavirus 154 (PV77 2013)
GCF_000908695.1
7
(92.75 %)
37.93
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.37 %)
0
(0.00 %)
131 human papillomavirus 161 (KC1 2018)
GCF_002826985.1
6
(92.39 %)
37.73
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.36 %)
0
(0.00 %)
132 human papillomavirus 163 (KC3 2015)
GCF_001430115.1
6
(93.54 %)
37.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.80 %)
0
(0.00 %)
133 human papillomavirus 166 (KC9 2012)
GCF_000899515.1
6
(92.72 %)
38.29
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.79 %)
0
(0.00 %)
134 human papillomavirus 167 (KC10 2013)
GCF_000913075.1
6
(92.78 %)
35.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 23
(5.24 %)
0
(0.00 %)
135 human papillomavirus 172 (2018)
GCF_002827005.1
7
(95.04 %)
37.77
(99.96 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
5
(1.22 %)
n/a 4
(0.60 %)
0
(0.00 %)
136 human papillomavirus 175 (SE87 2018)
GCF_002827025.1
7
(93.05 %)
38.87
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.29 %)
n/a 8
(1.00 %)
1
(3.46 %)
137 human papillomavirus 178 (2014)
GCF_000918095.1
7
(92.49 %)
38.15
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.53 %)
2
(0.59 %)
8
(1.35 %)
0
(0.00 %)
138 human papillomavirus 179 (SIBX16 2013)
GCF_000912535.1
6
(92.78 %)
36.76
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
n/a 7
(1.67 %)
0
(0.00 %)
139 human papillomavirus 18 (2000)
GCF_000865665.1
8
(87.96 %)
40.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.70 %)
n/a 12
(3.67 %)
0
(0.00 %)
140 human papillomavirus 184 (SIBX17 2018)
GCF_002987365.1
6
(92.71 %)
36.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.98 %)
1
(0.53 %)
4
(0.40 %)
0
(0.00 %)
141 human papillomavirus 187 (ACS447 2018)
GCF_003055605.1
6
(92.85 %)
38.90
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.36 %)
0
(0.00 %)
142 human papillomavirus 201 (HPV201 2015)
GCF_001184845.1
7
(93.33 %)
37.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.48 %)
n/a 5
(0.95 %)
0
(0.00 %)
143 human papillomavirus 203 (SE369 2019)
GCF_004133345.1
7
(92.96 %)
37.54
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.43 %)
n/a 10
(1.33 %)
0
(0.00 %)
144 human papillomavirus 204 (A342 2018)
GCF_002827045.1
7
(92.47 %)
37.84
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.50 %)
n/a 6
(1.44 %)
1
(2.92 %)
145 human papillomavirus 30 (2018)
GCF_002987345.1
6
(84.46 %)
40.39
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.31 %)
2
(1.03 %)
14
(4.22 %)
0
(0.00 %)
146 human papillomavirus 4 (1993)
GCF_000864845.1
7
(92.18 %)
38.53
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.71 %)
1
(0.35 %)
23
(3.75 %)
0
(0.00 %)
147 human papillomavirus 5 (1993)
GCF_000866505.1
8
(92.64 %)
42.39
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(2.94 %)
1
(0.39 %)
13
(3.01 %)
1
(7.11 %)
148 human papillomavirus 71 (2018)
GCF_002826825.1
1
(24.06 %)
44.38
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.47 %)
3
(1.63 %)
11
(3.93 %)
0
(0.00 %)
149 human papillomavirus 9 (1993)
GCF_000863685.1
7
(94.00 %)
41.00
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.14 %)
2
(0.93 %)
13
(2.45 %)
1
(4.63 %)
150 human papillomavirus KC5 (KC5 2015)
GCF_000989155.1
7
(92.99 %)
36.78
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.71 %)
0
(0.00 %)
151 human papillomavirus type 10 (1993)
GCF_000864905.1
7
(84.68 %)
45.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.78 %)
n/a 16
(3.86 %)
0
(0.00 %)
152 human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006)
GCF_000869845.1
6
(89.06 %)
43.12
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 5
(0.61 %)
0
(0.00 %)
153 human papillomavirus type 112 (2009)
GCF_000882135.1
7
(93.62 %)
37.52
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.73 %)
1
(3.81 %)
154 human papillomavirus type 128 (2011)
GCF_000889675.1
7
(92.33 %)
35.98
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(3.18 %)
0
(0.00 %)
155 human papillomavirus type 129 (2011)
GCF_000891495.1
7
(93.07 %)
37.31
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.82 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
156 human papillomavirus type 131 (27-49 2011)
GCF_000890535.1
7
(93.15 %)
37.03
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.73 %)
0
(0.00 %)
157 human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012)
GCF_000897255.1
7
(93.60 %)
37.57
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 16
(2.39 %)
0
(0.00 %)
158 human papillomavirus type 144 (CL3740 2012)
GCF_000898255.1
7
(92.09 %)
38.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.32 %)
0
(0.00 %)
159 human papillomavirus type 156 (GC01 2017)
GCF_002006915.1
7
(92.47 %)
36.18
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.86 %)
0
(0.00 %)
160 human papillomavirus type 16 (1993)
GCF_000863945.3
11
(87.67 %)
36.53
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(3.26 %)
1
(0.32 %)
12
(4.50 %)
0
(0.00 %)
161 human papillomavirus type 26 (1993)
GCF_000866485.1
6
(84.85 %)
38.60
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(2.74 %)
2
(0.45 %)
14
(5.89 %)
0
(0.00 %)
162 human papillomavirus type 32 (1993)
GCF_000864925.1
6
(84.42 %)
40.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 9
(1.96 %)
0
(0.00 %)
163 human papillomavirus type 34 (1993)
GCF_000863965.1
6
(85.10 %)
38.25
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.33 %)
3
(1.17 %)
8
(3.52 %)
0
(0.00 %)
164 human papillomavirus type 41 (1991)
GCF_000863845.1
11
(90.82 %)
46.94
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(3.68 %)
165 human papillomavirus type 48 (1995)
GCF_000839365.1
7
(93.41 %)
36.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.58 %)
18
(3.61 %)
1
(4.07 %)
166 human papillomavirus type 49 (1993)
GCF_000862825.1
6
(93.19 %)
41.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 11
(2.66 %)
0
(0.00 %)
167 human papillomavirus type 50 (1995)
GCF_000841625.1
7
(92.78 %)
36.85
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.53 %)
14
(2.00 %)
0
(0.00 %)
168 human papillomavirus type 53 (1993)
GCF_000865685.1
7
(66.96 %)
40.14
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(2.47 %)
n/a 24
(6.16 %)
0
(0.00 %)
169 human papillomavirus type 54 (1995)
GCF_000864725.1
7
(84.57 %)
41.88
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.32 %)
n/a 9
(3.05 %)
0
(0.00 %)
170 human papillomavirus type 60 (1995)
GCF_000838505.1
7
(92.85 %)
36.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 12
(2.15 %)
1
(3.27 %)
171 human papillomavirus type 63 (1993)
GCF_000865565.1
7
(91.55 %)
40.44
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.20 %)
1
(0.59 %)
5
(0.53 %)
0
(0.00 %)
172 human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985)
GCF_000861945.1
9
(89.64 %)
40.87
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.39 %)
1
(0.76 %)
15
(3.21 %)
0
(0.00 %)
173 human papillomavirus type 7 (1993)
GCF_000861925.1
6
(82.97 %)
39.53
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.73 %)
1
(0.59 %)
13
(3.49 %)
0
(0.00 %)
174 human papillomavirus type 85 (114B 2017)
GCF_002153865.1
8
(90.54 %)
37.76
(98.31 %)
7
(1.95 %)
8
(98.05 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(4.34 %)
0
(0.00 %)
175 human papillomavirus type 88 (2008)
GCF_000874925.1
7
(92.19 %)
40.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.35 %)
6
(0.71 %)
1
(4.00 %)
176 human papillomavirus type 90 (2002)
GCF_000862685.1
7
(82.73 %)
46.65
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.95 %)
n/a 10
(3.96 %)
1
(2.53 %)
177 human papillomavirus type 92 (2003)
GCF_000846285.1
7
(93.86 %)
39.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.48 %)
3
(1.50 %)
7
(2.92 %)
1
(4.21 %)
178 human papillomavirus type 96 (2003)
GCF_000864825.1
7
(97.38 %)
40.31
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 21
(3.83 %)
1
(4.33 %)
179 human parainfluenza virus 4a (M-25 2013)
GCF_000910675.1
7
(83.27 %)
36.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.23 %)
1
(0.22 %)
13
(1.18 %)
0
(0.00 %)
180 human parechovirus 1 (2018)
GCF_002817305.1
1
(89.15 %)
39.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(1.29 %)
0
(0.00 %)
181 human parvovirus 4 G1 (2005)
GCF_000861005.1
2
(89.92 %)
44.94
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
2
(1.52 %)
4
(0.70 %)
1
(3.85 %)
182 human parvovirus B19 (J35 1999)
GCF_000839645.1
6
(81.47 %)
43.81
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4
(2.93 %)
13
(4.72 %)
2
(12.12 %)
183 human pegivirus 2 (UC0125.US 2015)
GCF_001310135.2
1
(92.98 %)
53.96
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.49 %)
2
(90.06 %)
184 human picobirnavirus (Hy005102 2005)
GCF_000859285.1
3
(92.15 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
185 human polyomavirus 1 (1993)
GCF_000837865.1
7
(89.15 %)
39.53
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(2.45 %)
13
(4.13 %)
0
(0.00 %)
186 human polyomavirus 12 (hu1403 2013)
GCF_000906235.1
6
(89.41 %)
39.60
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.91 %)
27
(6.74 %)
0
(0.00 %)
187 human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007)
GCF_000873085.1
6
(88.17 %)
39.37
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.85 %)
26
(6.90 %)
0
(0.00 %)
188 human polyomavirus 6 (607a 2010)
GCF_000888495.1
6
(89.67 %)
42.66
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.83 %)
0
(0.00 %)
189 human polyomavirus 7 (713a 2010)
GCF_000889175.1
6
(89.14 %)
42.91
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(1.25 %)
0
(0.00 %)
190 human polyomavirus 9 (HPyV9 2011)
GCF_000891615.1
6
(88.18 %)
39.16
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(4.74 %)
0
(0.00 %)
191 Human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000)
GCF_000856445.1
13
(98.68 %)
33.21
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.89 %)
1
(0.26 %)
23
(3.73 %)
0
(0.00 %)
192 human respirovirus 1 (Washington 1964 2002)
GCF_000848705.1
10
(99.19 %)
37.24
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.19 %)
1
(0.25 %)
4
(1.69 %)
0
(0.00 %)
193 human respirovirus 3 (1998)
GCF_000850205.1
9
(93.58 %)
34.52
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.09 %)
n/a 11
(1.89 %)
0
(0.00 %)
194 human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018)
GCF_002816885.1
1
(92.58 %)
43.40
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
195 human rotavirus B (Bang373 2013)
GCF_000907835.1
13
(95.17 %)
36.97
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(1.22 %)
0
(0.00 %)
196 human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015)
GCF_000929235.1
2
(69.15 %)
43.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
197 human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018)
GCF_002819605.1
2
(93.58 %)
43.54
(99.76 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.24 %)
0
(0.00 %)
198 Human T-cell leukemia virus type I (1993)
GCA_003102335.1
3
(59.99 %)
53.88
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(2.55 %)
3
(15.21 %)
199 human T-cell leukemia virus type I (1998)
GCF_000863585.1
11
(81.17 %)
53.47
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 19
(2.50 %)
2
(12.06 %)
200 human T-lymphotropic virus 2 (1993)
GCF_000847505.1
9
(94.24 %)
53.82
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.11 %)
n/a 16
(2.41 %)
2
(6.46 %)
201 human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009)
GCF_000882595.1
8
(77.85 %)
56.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.51 %)
n/a 30
(5.68 %)
3
(16.69 %)
202 human TMEV-like cardiovirus (2008)
GCF_000875265.1
3
(86.45 %)
43.58
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.84 %)
0
(0.00 %)
203 Influenza A virus (A/California/07/2009 2015)
GCF_001343785.1
14
(99.84 %)
43.70
(99.90 %)
4
(0.03 %)
12
(99.97 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.83 %)
0
(0.00 %)
204 Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005)
GCF_000864105.1
15
(96.68 %)
44.12
(99.93 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
205 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003)
GCF_000851145.1
12
(97.14 %)
44.07
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.81 %)
0
(0.00 %)
206 Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005)
GCF_000866645.1
15
(97.49 %)
43.41
(99.89 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.28 %)
0
(0.00 %)
207 Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005)
GCF_000865085.1
15
(96.37 %)
42.94
(99.91 %)
n/a 8
(100.00 %)
4
(0.57 %)
n/a 6
(0.33 %)
0
(0.00 %)
208 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982)
GCF_000865725.1
15
(96.32 %)
43.40
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.68 %)
0
(0.00 %)
209 Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015)
GCF_000928555.1
15
(99.34 %)
44.36
(99.92 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.30 %)
0
(0.00 %)
210 Influenza B virus (B/Lee/1940 1993)
GCF_000820495.2
11
(92.51 %)
40.19
(99.88 %)
n/a 8
(100.00 %)
5
(0.51 %)
n/a 23
(1.85 %)
0
(0.00 %)
211 Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004)
GCF_000856665.10
11
(95.87 %)
37.28
(99.91 %)
n/a 7
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 42
(4.23 %)
0
(0.00 %)
212 Isfahan virus (2013)
GCF_000906835.1
5
(96.29 %)
41.93
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(1.82 %)
0
(0.00 %)
213 Japanese encephalitis virus (1993)
GCF_000862145.1
3
(93.83 %)
51.43
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.15 %)
0
(0.00 %)
214 JC polyomavirus (Mad1 1993)
GCF_000863805.1
9
(96.55 %)
40.45
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(3.82 %)
17
(5.52 %)
0
(0.00 %)
215 La Crosse virus (human/78 2002)
GCF_000850965.1
4
(94.68 %)
36.68
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 26
(2.75 %)
0
(0.00 %)
216 Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013)
GCF_000905975.1
5
(90.15 %)
43.48
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.41 %)
0
(0.00 %)
217 Langat virus (TP21 2000)
GCF_000860805.1
1
(93.62 %)
54.31
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.56 %)
1
(2.18 %)
218 Lassa mammarenavirus (Josiah 1998)
GCF_000851705.1
4
(94.96 %)
42.06
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.37 %)
9
(1.70 %)
0
(0.00 %)
219 Louping ill virus (369/T2 1997)
GCF_000863165.1
1
(94.24 %)
54.86
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.52 %)
3
(12.29 %)
220 Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001)
GCF_000839805.1
156
(95.76 %)
25.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
55
(1.76 %)
20
(0.65 %)
1,542
(23.51 %)
0
(0.00 %)
221 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993)
GCF_000851025.1
4
(97.52 %)
42.29
(99.99 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.07 %)
0
(0.00 %)
222 Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003)
GCF_000853725.1
4
(94.98 %)
41.77
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.62 %)
0
(0.00 %)
223 Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994)
GCF_000857325.2
7
(98.72 %)
38.29
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(1.05 %)
0
(0.00 %)
224 Mayaro virus (2002)
GCF_000863385.1
5
(96.78 %)
50.37
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.76 %)
n/a 4
(1.59 %)
5
(42.02 %)
225 Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998)
GCF_000854845.1
7
(94.55 %)
47.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.91 %)
1
(3.88 %)
226 Merkel cell polyomavirus (R17b 2008)
GCF_000874865.1
5
(88.06 %)
40.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.78 %)
0
(0.00 %)
227 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012)
GCF_000901155.1
12
(97.48 %)
41.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
n/a 4
(0.14 %)
0
(0.00 %)
228 Mokola lyssavirus (2004)
GCF_000856485.1
5
(98.49 %)
44.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.73 %)
0
(0.00 %)
229 Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996)
GCF_000843325.1
163
(85.07 %)
63.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
128
(3.25 %)
92
(4.74 %)
1,361
(17.29 %)
1
(99.95 %)
230 Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022)
GCF_014621545.1
179
(83.90 %)
33.03
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
38
(0.78 %)
22
(0.54 %)
1,097
(9.44 %)
0
(0.00 %)
231 Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021)
GCF_000857045.1
191
(87.29 %)
33.09
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
37
(0.96 %)
24
(0.57 %)
1,102
(9.51 %)
0
(0.00 %)
232 Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000)
GCF_000856685.1
8
(92.81 %)
42.49
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 10
(0.59 %)
0
(0.00 %)
233 Mupapillomavirus 1 (1982)
GCF_000866405.1
7
(86.17 %)
40.28
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.47 %)
1
(0.40 %)
7
(1.87 %)
1
(2.75 %)
234 Murine herpesvirus 68 (WUMS 2007)
GCA_000845665.1
80
(90.74 %)
47.23
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.12 %)
31
(3.40 %)
69
(4.25 %)
4
(4.97 %)
235 Murray Valley encephalitis virus (1999)
GCF_000863565.1
3
(93.56 %)
48.72
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.23 %)
1
(1.84 %)
236 Myxoma virus (Lausanne 2002)
GCF_000843685.1
170
(95.89 %)
43.56
(100.00 %)
7
(0.00 %)
8
(100.00 %)
11
(0.16 %)
15
(0.33 %)
578
(5.25 %)
0
(0.00 %)
237 Nipah henipavirus (2000)
GCF_000863625.1
11
(82.06 %)
38.17
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.17 %)
n/a 8
(0.37 %)
0
(0.00 %)
238 Norovirus GI (1993)
GCF_000864005.1
3
(99.09 %)
48.03
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.52 %)
1
(0.35 %)
3
(0.31 %)
0
(0.00 %)
239 Onyong-nyong virus (1993)
GCF_000863005.1
5
(100.00 %)
48.32
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(1.28 %)
7
(1.39 %)
5
(15.80 %)
240 Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004)
GCF_000844845.1
130
(89.67 %)
63.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
56
(2.03 %)
37
(1.70 %)
1,076
(16.55 %)
1
(100.00 %)
241 Oropouche virus (2004)
GCF_000853785.1
4
(97.72 %)
35.40
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 33
(3.75 %)
0
(0.00 %)
242 Orthohepevirus A (Xinjiang 1993)
GCF_000861105.1
3
(98.65 %)
57.95
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.80 %)
1
(89.53 %)
243 Parainfluenza virus 5 (W3A 2004)
GCF_000854805.1
9
(99.06 %)
42.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 3
(0.30 %)
0
(0.00 %)
244 Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011)
GCF_000847045.1
814
(95.11 %)
39.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
75
(0.98 %)
146
(4.42 %)
1,227
(8.76 %)
23
(3.04 %)
245 Parechovirus A (Gregory 1998)
GCF_000861505.1
1
(89.00 %)
39.48
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 6
(0.98 %)
0
(0.00 %)
246 Pichinde virus (AN3739 2004)
GCF_000856465.1
4
(96.57 %)
41.84
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.44 %)
0
(0.00 %)
247 Powassan virus (LB 1993)
GCF_000860485.1
1
(94.55 %)
53.32
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 14
(1.20 %)
1
(3.47 %)
248 Punta Toro virus (Adames 2018)
GCF_002815115.1
4
(92.61 %)
40.36
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(1.74 %)
3
(0.77 %)
16
(3.35 %)
0
(0.00 %)
249 Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003)
GCF_000854405.1
3
(39.37 %)
36.97
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.66 %)
n/a 33
(3.47 %)
0
(0.00 %)
250 Rabies lyssavirus (1993)
GCF_000859625.1
5
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n/a 1
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3
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n/a 11
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(0.00 %)
251 Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005)
GCF_000858025.1
3
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(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
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2
(1.01 %)
9
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3
(8.85 %)
252 Rhinovirus A (1993)
GCF_000862245.1
1
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39.05
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n/a 1
(100.00 %)
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253 Rift Valley fever virus (ZH-548 2010)
GCF_000847345.1
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(1.04 %)
0
(0.00 %)
254 Rosavirus A2 (GA7403 2014)
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1
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1
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2
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3
(0.00 %)
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(0.67 %)
1
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255 Ross River virus (NB5092 1993)
GCF_000862165.1
5
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(0.47 %)
20
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n/a 4
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8
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256 Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008)
GCF_000880735.1
12
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n/a 11
(100.00 %)
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(0.00 %)
257 Rotavirus C (Bristol 2005)
GCF_000864225.1
11
(95.04 %)
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n/a 11
(100.00 %)
7
(1.19 %)
n/a 33
(2.72 %)
0
(0.00 %)
258 Rubella virus (F-Therien 1993)
GCF_000863025.1
2
(99.15 %)
69.60
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
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n/a 54
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1
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259 Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005)
GCF_000866785.1
1
(94.09 %)
49.75
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.35 %)
1
(3.05 %)
260 Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009)
GCF_000886535.1
1
(89.26 %)
56.70
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.15 %)
2
(48.16 %)
261 Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004)
GCF_000854285.1
4
(98.01 %)
44.60
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 13
(2.02 %)
0
(0.00 %)
262 Sapovirus C12 (C12 2004)
GCF_000855765.1
2
(98.27 %)
51.73
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
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n/a 1
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263 SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003)
GCF_000864885.1
16
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40.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
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n/a 18
(0.74 %)
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(0.00 %)
264 Semliki Forest virus (1987)
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53.22
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n/a 1
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n/a 4
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265 Seoul orthohantavirus (80-39 2003)
GCF_000855645.1
3
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(99.96 %)
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5
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(1.15 %)
0
(0.00 %)
266 Sheeppox virus (TU-V02127 2002)
GCF_000840205.1
148
(93.28 %)
25.01
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
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267 Simian foamy virus (1994)
GCF_000848485.1
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268 Sindbis virus (1993)
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(100.00 %)
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n/a 1
(100.00 %)
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269 Singapore grouper iridovirus (2004)
GCF_000846905.1
162
(89.23 %)
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(100.00 %)
n/a 1
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285
(4.52 %)
1
(0.16 %)
270 smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993)
GCF_000859885.1
197
(87.60 %)
32.73
(100.00 %)
n/a 1
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31
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271 Snowshoe hare virus (2021)
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272 Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017)
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1
(0.00 %)
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273 Torque teno virus 1 (VT416 1998)
GCF_000857545.1
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n/a 1
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274 Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001)
GCF_000839725.1
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275 Uukuniemi virus (2003)
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276 Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005)
GCF_000860085.1
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(100.00 %)
n/a 1
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277 Varicella-zoster virus (Dumas 1987)
GCF_000858285.1
74
(89.36 %)
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(100.00 %)
n/a 1
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278 Venezuelan equine encephalitis virus (1993)
GCF_000862105.1
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279 Vesicular stomatitis Indiana virus (1993)
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280 West Nile virus (956 1993)
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281 Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000)
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282 WU Polyomavirus (B0 2007)
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283 Yaba monkey tumor virus (2003)
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284 Yaba-like disease virus (2001)
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285 Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986)
GCF_000857725.1
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286 Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999)
GCF_000848505.1
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287 Zika virus (MR 766 2009)
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TOTALS:total assembly count 287

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 217 assemblies assembly stats track stats
Mammals 564 assemblies assembly stats track stats
Birds 383 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1099 assemblies assembly stats track stats
Plants 303 assemblies assembly stats track stats
Fungi 899 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 107 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 522 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 952 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 769 assemblies assembly stats track stats