Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiGene gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adeno-associated virus 2 (1993)
GCF_000838645.1
14
(89.01 %)
53.80
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(3.18 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(54.43 %)
2 Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005)
GCF_000864245.1
11
(95.04 %)
33.42
(99.83 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.20 %)
37
(2.83 %)
0
(0.00 %)
3 Aichi virus 1 (A846/88 1998)
GCF_000861885.1
1
(88.50 %)
58.90
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.09 %)
n/a 8
(2.47 %)
1
(81.27 %)
4 Alphapapillomavirus 4 (1991)
GCF_000864945.1
7
(86.62 %)
48.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.34 %)
1
(0.50 %)
7
(2.05 %)
0
(0.00 %)
5 Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003)
GCF_000856545.1
4
(95.69 %)
41.57
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.24 %)
1
(0.48 %)
2
(0.58 %)
0
(0.00 %)
6 Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012)
GCF_000895575.1
3
(99.13 %)
40.52
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(2.01 %)
0
(0.00 %)
7 Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012)
GCF_000897955.1
3
(97.62 %)
42.99
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.11 %)
0
(0.00 %)
8 Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012)
GCF_000899535.1
3
(99.15 %)
40.00
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(2.19 %)
0
(0.00 %)
9 Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012)
GCF_000901475.1
3
(98.01 %)
41.78
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.29 %)
0
(0.00 %)
10 Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999)
GCF_000850325.1
5
(91.79 %)
44.15
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.61 %)
0
(0.00 %)
11 Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000)
GCF_000858185.1
12
(86.10 %)
39.33
(99.89 %)
n/a 12
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.64 %)
0
(0.00 %)
12 Barmah Forest virus (BH2193 1997)
GCF_000847585.1
5
(95.39 %)
48.55
(99.97 %)
2
(0.02 %)
3
(99.98 %)
4
(0.59 %)
n/a 7
(2.47 %)
5
(15.26 %)
13 Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022)
GCF_008777455.1
75
(84.84 %)
72.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 116
(4.31 %)
1,304
(33.41 %)
1
(99.99 %)
14 Bunyamwera virus (1991)
GCF_000849925.1
4
(95.34 %)
35.16
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 30
(3.12 %)
0
(0.00 %)
15 Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004)
GCF_000846965.1
80
(78.07 %)
75.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
169
(6.25 %)
180
(5.92 %)
1,059
(33.71 %)
1
(100.00 %)
16 Chandipura virus (CIN 0451 2013)
GCF_000906815.1
5
(96.34 %)
42.53
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.29 %)
n/a 19
(1.75 %)
0
(0.00 %)
17 Chikungunya virus (S27-African prototype 2002)
GCF_000854045.1
2
(94.47 %)
50.04
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.87 %)
n/a 3
(1.76 %)
7
(34.06 %)
18 Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009)
GCF_000885595.1
1
(83.53 %)
43.75
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.63 %)
n/a 5
(1.90 %)
0
(0.00 %)
19 Cowpox virus (Brighton Red 2002)
GCF_000839185.1
233
(91.92 %)
33.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
41
(0.80 %)
64
(2.52 %)
1,041
(9.40 %)
0
(0.00 %)
20 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003)
GCF_000854165.1
3
(95.80 %)
42.23
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.22 %)
26
(1.53 %)
0
(0.00 %)
21 Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997)
GCF_000862125.1
1
(94.82 %)
46.67
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.68 %)
0
(0.00 %)
22 Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993)
GCF_000871845.1
5
(98.86 %)
45.82
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 2
(0.16 %)
0
(0.00 %)
23 Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2019)
GCF_000866625.1
5
(98.92 %)
46.71
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.60 %)
0
(0.00 %)
24 Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001)
GCF_000865065.1
4
(98.81 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
25 Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017)
GCF_002116195.1
6
(95.15 %)
45.84
(99.90 %)
n/a 6
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.33 %)
0
(0.00 %)
26 Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995)
GCF_000850985.1
3
(96.61 %)
40.19
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 41
(3.15 %)
0
(0.00 %)
27 Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013)
GCF_000905375.1
5
(90.59 %)
44.22
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.72 %)
0
(0.00 %)
28 Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991)
GCF_000862705.1
5
(96.00 %)
48.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.91 %)
n/a 3
(0.64 %)
5
(23.55 %)
29 Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018)
GCF_003032765.1
5
(93.39 %)
37.99
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.77 %)
n/a 8
(0.77 %)
0
(0.00 %)
30 Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993)
GCF_000862985.1
3
(87.80 %)
49.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.68 %)
1
(1.68 %)
2
(1.83 %)
0
(0.00 %)
31 Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982)
GCF_000861165.1
5
(98.35 %)
46.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(6.95 %)
32 Enterovirus D (Enterovirus 70 1993)
GCF_000861205.1
1
(89.14 %)
42.80
(100.00 %)
3
(0.04 %)
4
(99.96 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
33 Enterovirus A (1994)
GCF_000861905.1
1
(88.79 %)
47.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.09 %)
1
(3.32 %)
34 Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007)
GCF_000872045.1
114
(68.90 %)
59.54
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
34
(0.79 %)
29
(5.78 %)
498
(10.10 %)
24
(45.98 %)
35 Epstein-Barr virus (Raji 2005)
GCF_002402265.1
98
(77.44 %)
59.50
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
30
(0.66 %)
34
(5.62 %)
577
(10.56 %)
27
(45.97 %)
36 Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993)
GCA_000844025.1
81
(83.51 %)
56.66
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
23
(0.73 %)
28
(3.15 %)
306
(5.68 %)
2
(99.10 %)
37 European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007)
GCF_000870765.1
5
(90.43 %)
44.65
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.08 %)
0
(0.00 %)
38 Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999)
GCA_000847005.2
90
(80.77 %)
47.74
(99.98 %)
n/a 14
(100.00 %)
11
(0.22 %)
9
(0.61 %)
221
(1.97 %)
23
(30.48 %)
39 GB virus C (1996)
GCF_000862005.1
1
(91.81 %)
59.09
(99.98 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(1.67 %)
2
(82.30 %)
40 Hantaan orthohantavirus (76-118 2003)
GCF_000856085.1
3
(94.17 %)
38.56
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.78 %)
0
(0.00 %)
41 Hendra henipavirus (1998)
GCF_000852685.1
9
(82.12 %)
39.43
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 13
(0.75 %)
0
(0.00 %)
42 Hepatitis delta virus (1993)
GCF_000856565.1
2
(38.35 %)
58.81
(99.88 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(2.68 %)
1
(3.63 %)
1
(71.11 %)
43 Hepatitis B virus (2015)
GCF_000861825.2
4
(55.31 %)
48.46
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(12.45 %)
44 Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997)
GCF_000861845.1
3
(93.68 %)
58.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.33 %)
6
(1.40 %)
13
(2.88 %)
1
(90.43 %)
45 Hepatovirus A (1993)
GCF_000860505.1
3
(100.00 %)
37.87
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
1
(0.47 %)
1
(0.53 %)
0
(0.00 %)
46 Herpes simplex virus type 1 (17 1990)
GCF_000859985.2
81
(86.40 %)
68.30
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
81
(2.72 %)
51
(2.90 %)
932
(18.12 %)
1
(100.00 %)
47 human polyomavirus 1 (1993)
GCF_000837865.1
7
(89.15 %)
39.53
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(2.45 %)
13
(4.13 %)
0
(0.00 %)
48 human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007)
GCF_000838265.1
113
(85.53 %)
53.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.88 %)
151
(3.93 %)
9
(84.42 %)
49 human papillomavirus type 60 (1995)
GCF_000838505.1
7
(92.85 %)
36.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 12
(2.15 %)
1
(3.27 %)
50 human papillomavirus type 48 (1995)
GCF_000839365.1
7
(93.41 %)
36.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.58 %)
18
(3.61 %)
1
(4.07 %)
51 human parvovirus B19 (J35 1999)
GCF_000839645.1
6
(81.47 %)
43.81
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4
(2.93 %)
13
(4.72 %)
2
(12.12 %)
52 human papillomavirus type 50 (1995)
GCF_000841625.1
7
(92.78 %)
36.85
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.53 %)
14
(2.00 %)
0
(0.00 %)
53 human erythrovirus V9 (V9 2001)
GCF_000841965.1
6
(90.67 %)
42.09
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.75 %)
0
(0.00 %)
54 human mastadenovirus C (1993)
GCF_000845085.1
63
(97.51 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
55 human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004)
GCF_000845245.1
194
(84.91 %)
57.48
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
74
(1.33 %)
28
(0.67 %)
1,047
(7.96 %)
1
(99.99 %)
56 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq)
GCF_000845685.2
115
(79.56 %)
42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
57 human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008)
GCF_000845985.1
47
(93.93 %)
57.10
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.92 %)
1
(0.13 %)
59
(2.95 %)
3
(67.41 %)
58 human papillomavirus type 92 (2003)
GCF_000846285.1
7
(93.86 %)
39.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.48 %)
3
(1.50 %)
7
(2.92 %)
1
(4.21 %)
59 human betaherpesvirus 6B (Z29 1999)
GCF_000846365.1
128
(82.45 %)
42.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
27
(1.57 %)
20
(3.84 %)
652
(8.84 %)
6
(15.35 %)
60 human mastadenovirus F (Dugan 1993)
GCF_000846685.1
44
(94.91 %)
51.22
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.32 %)
n/a 63
(2.23 %)
1
(62.53 %)
61 human mastadenovirus A (Huie 1993)
GCF_000846805.1
43
(94.41 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
62 human T-lymphotropic virus 2 (1993)
GCF_000847505.1
9
(94.24 %)
53.82
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.11 %)
n/a 16
(2.41 %)
2
(6.46 %)
63 human betaherpesvirus 7 (RK 1995)
GCF_000848125.1
111
(79.51 %)
36.22
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
16
(1.65 %)
34
(8.04 %)
791
(15.85 %)
3
(5.14 %)
64 human respirovirus 1 (Washington 1964 2002)
GCF_000848705.1
10
(99.19 %)
37.24
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.19 %)
1
(0.25 %)
4
(1.69 %)
0
(0.00 %)
65 human respirovirus 3 (1998)
GCF_000850205.1
9
(93.58 %)
34.52
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.09 %)
n/a 11
(1.89 %)
0
(0.00 %)
66 human coronavirus 229E (2001)
GCF_000853505.1
9
(97.14 %)
38.26
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.31 %)
2
(0.29 %)
57
(2.91 %)
0
(0.00 %)
67 human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004)
GCF_000853865.1
8
(97.86 %)
34.46
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(1.09 %)
n/a 84
(5.24 %)
0
(0.00 %)
68 human orthopneumovirus (B1 1997)
GCF_000855545.1
10
(97.35 %)
33.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.61 %)
2
(0.52 %)
16
(3.21 %)
0
(0.00 %)
69 human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993)
GCF_000856385.1
12
(84.81 %)
45.66
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.98 %)
10
(1.44 %)
0
(0.00 %)
70 human mastadenovirus B (Slobitski 2008)
GCF_000857085.1
46
(93.74 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.82 %)
3
(0.30 %)
50
(2.47 %)
6
(39.41 %)
71 human adenovirus 5 (2004)
GCF_000857865.1
42
(90.68 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.95 %)
n/a 99
(4.47 %)
5
(69.88 %)
72 human adenovirus 35 (2004)
GCF_000857885.1
44
(93.67 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.68 %)
3
(0.30 %)
80
(3.56 %)
6
(39.41 %)
73 human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013)
GCF_000858385.2
86
(83.37 %)
70.38
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
124
(3.80 %)
64
(3.26 %)
1,158
(23.65 %)
1
(99.99 %)
74 human mastadenovirus D (2004)
GCF_000858625.1
21
(47.83 %)
56.58
(100.00 %)
4
(0.01 %)
5
(99.99 %)
12
(1.24 %)
n/a 61
(3.14 %)
3
(66.84 %)
75 human adenovirus 1 (2004)
GCF_000858645.1
44
(91.94 %)
55.26
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.98 %)
2
(0.11 %)
103
(4.79 %)
6
(70.17 %)
76 human coronavirus HKU1 (HKU1 2004)
GCF_000858765.1
10
(98.07 %)
32.06
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.72 %)
1
(1.60 %)
89
(5.62 %)
0
(0.00 %)
77 human picobirnavirus (Hy005102 2005)
GCF_000859285.1
3
(92.15 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
78 human adenovirus 2 (2004)
GCF_000859465.1
42
(90.84 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
79 human adenovirus 7 (2004)
GCF_000859485.1
45
(92.24 %)
51.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.56 %)
1
(1.54 %)
61
(2.28 %)
7
(43.72 %)
80 human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001)
GCF_000859665.1
40
(96.48 %)
57.67
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.65 %)
n/a 107
(4.08 %)
5
(73.25 %)
81 human parvovirus 4 G1 (2005)
GCF_000861005.1
2
(89.92 %)
44.94
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
2
(1.52 %)
4
(0.70 %)
1
(3.85 %)
82 human astrovirus (1993)
GCF_000861865.1
3
(97.58 %)
44.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.88 %)
1
(1.34 %)
9
(2.08 %)
0
(0.00 %)
83 human papillomavirus type 7 (1993)
GCF_000861925.1
6
(82.97 %)
39.53
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.73 %)
1
(0.59 %)
13
(3.49 %)
0
(0.00 %)
84 human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985)
GCF_000861945.1
9
(89.64 %)
40.87
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.39 %)
1
(0.76 %)
15
(3.21 %)
0
(0.00 %)
85 human papillomavirus type 90 (2002)
GCF_000862685.1
7
(82.73 %)
46.65
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.95 %)
n/a 10
(3.96 %)
1
(2.53 %)
86 human papillomavirus type 49 (1993)
GCF_000862825.1
6
(93.19 %)
41.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 11
(2.66 %)
0
(0.00 %)
87 human orthorubulavirus 2 (1991)
GCF_000863525.1
8
(98.61 %)
38.41
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 6
(0.27 %)
0
(0.00 %)
88 human T-cell leukemia virus type I (1998)
GCF_000863585.1
11
(81.17 %)
53.47
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 19
(2.50 %)
2
(12.06 %)
89 human papillomavirus 9 (1993)
GCF_000863685.1
7
(94.00 %)
41.00
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.14 %)
2
(0.93 %)
13
(2.45 %)
1
(4.63 %)
90 human papillomavirus type 41 (1991)
GCF_000863845.1
11
(90.82 %)
46.94
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(3.68 %)
91 human papillomavirus type 16 (1993)
GCF_000863945.3
11
(87.67 %)
36.53
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(3.26 %)
1
(0.32 %)
12
(4.50 %)
0
(0.00 %)
92 human papillomavirus type 34 (1993)
GCF_000863965.1
6
(85.10 %)
38.25
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.33 %)
3
(1.17 %)
8
(3.52 %)
0
(0.00 %)
93 human papillomavirus type 54 (1995)
GCF_000864725.1
7
(84.57 %)
41.88
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.32 %)
n/a 9
(3.05 %)
0
(0.00 %)
94 human immunodeficiency virus 1 (1998)
GCF_000864765.1
14
(93.78 %)
42.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.57 %)
1
(0.34 %)
18
(3.29 %)
1
(2.29 %)
95 human papillomavirus type 96 (2003)
GCF_000864825.1
7
(97.38 %)
40.31
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 21
(3.83 %)
1
(4.33 %)
96 human papillomavirus 4 (1993)
GCF_000864845.1
7
(92.18 %)
38.53
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.71 %)
1
(0.35 %)
23
(3.75 %)
0
(0.00 %)
97 human papillomavirus type 10 (1993)
GCF_000864905.1
7
(84.68 %)
45.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.78 %)
n/a 16
(3.86 %)
0
(0.00 %)
98 human papillomavirus type 32 (1993)
GCF_000864925.1
6
(84.42 %)
40.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 9
(1.96 %)
0
(0.00 %)
99 human papillomavirus type 63 (1993)
GCF_000865565.1
7
(91.55 %)
40.44
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.20 %)
1
(0.59 %)
5
(0.53 %)
0
(0.00 %)
100 human papillomavirus type 53 (1993)
GCF_000865685.1
7
(66.96 %)
40.14
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(2.47 %)
n/a 24
(6.16 %)
0
(0.00 %)
101 human papillomavirus type 26 (1993)
GCF_000866485.1
6
(84.85 %)
38.60
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(2.74 %)
2
(0.45 %)
14
(5.89 %)
0
(0.00 %)
102 human papillomavirus 5 (1993)
GCF_000866505.1
8
(92.64 %)
42.39
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(2.94 %)
1
(0.39 %)
13
(3.01 %)
1
(7.11 %)
103 human papillomavirus 103 (Qv33725 2006)
GCF_000868225.1
6
(88.01 %)
41.58
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 19
(3.06 %)
0
(0.00 %)
104 human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006)
GCF_000869845.1
6
(89.06 %)
43.12
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 5
(0.61 %)
0
(0.00 %)
105 human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007)
GCF_000873085.1
6
(88.17 %)
39.37
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.85 %)
26
(6.90 %)
0
(0.00 %)
106 human papillomavirus type 88 (2008)
GCF_000874925.1
7
(92.19 %)
40.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.35 %)
6
(0.71 %)
1
(4.00 %)
107 human TMEV-like cardiovirus (2008)
GCF_000875265.1
3
(86.45 %)
43.58
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.84 %)
0
(0.00 %)
108 human mastadenovirus B (GB 2008)
GCF_000880515.1
48
(93.42 %)
51.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.47 %)
1
(0.18 %)
41
(1.61 %)
7
(43.26 %)
109 human papillomavirus type 112 (2009)
GCF_000882135.1
7
(93.62 %)
37.52
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.73 %)
1
(3.81 %)
110 human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009)
GCF_000882595.1
8
(77.85 %)
56.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.51 %)
n/a 30
(5.68 %)
3
(16.69 %)
111 human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009)
GCF_000882675.1
4
(87.74 %)
41.59
(99.98 %)
1
(0.02 %)
2
(99.98 %)
5
(1.23 %)
n/a 5
(0.98 %)
0
(0.00 %)
112 human bocavirus 3 (W471 2009)
GCF_000882855.1
4
(88.44 %)
42.16
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.95 %)
1
(4.96 %)
113 human papillomavirus 108 (2009)
GCF_000883655.1
5
(88.56 %)
42.65
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.38 %)
0
(0.00 %)
114 human papillomavirus 109 (2009)
GCF_000883695.1
7
(92.87 %)
38.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.94 %)
1
(0.48 %)
19
(3.13 %)
1
(3.23 %)
115 human papillomavirus 116 (HPV116 2009)
GCF_000884175.1
7
(93.82 %)
38.50
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(4.73 %)
116 human mastadenovirus A (2004)
GCF_000884295.1
41
(94.00 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
117 human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009)
GCF_000884955.1
1
(88.49 %)
43.79
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.47 %)
n/a 6
(1.35 %)
0
(0.00 %)
118 human adenovirus 54 (Kobe-H 2009)
GCF_000885675.1
40
(91.15 %)
54.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.74 %)
n/a 65
(2.61 %)
3
(66.98 %)
119 human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009)
GCF_000886375.1
6
(92.83 %)
40.41
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.06 %)
0
(0.00 %)
120 human papillomavirus 132 (27-50 2011)
GCF_000888015.1
7
(93.36 %)
37.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.89 %)
0
(0.00 %)
121 human polyomavirus 6 (607a 2010)
GCF_000888495.1
6
(89.67 %)
42.66
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.83 %)
0
(0.00 %)
122 human papillomavirus 121 (NJ3301 2010)
GCF_000889075.1
7
(92.45 %)
37.74
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.41 %)
n/a 9
(0.98 %)
0
(0.00 %)
123 human polyomavirus 7 (713a 2010)
GCF_000889175.1
6
(89.14 %)
42.91
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(1.25 %)
0
(0.00 %)
124 human papillomavirus type 128 (2011)
GCF_000889675.1
7
(92.33 %)
35.98
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(3.18 %)
0
(0.00 %)
125 human papillomavirus 134 (39-65 2011)
GCF_000889695.1
7
(92.69 %)
38.14
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.48 %)
0
(0.00 %)
126 human papillomavirus 127 (R3a 2010)
GCF_000890115.1
8
(93.50 %)
36.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(0.79 %)
18
(2.79 %)
1
(3.20 %)
127 human papillomavirus type 131 (27-49 2011)
GCF_000890535.1
7
(93.15 %)
37.03
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.73 %)
0
(0.00 %)
128 human papillomavirus type 129 (2011)
GCF_000891495.1
7
(93.07 %)
37.31
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.82 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
129 human polyomavirus 9 (HPyV9 2011)
GCF_000891615.1
6
(88.18 %)
39.16
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(4.74 %)
0
(0.00 %)
130 human papillomavirus 126 (HPV126 2011)
GCF_000896435.1
7
(91.96 %)
38.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(2.68 %)
1
(2.92 %)
131 human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012)
GCF_000897255.1
7
(93.60 %)
37.57
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 16
(2.39 %)
0
(0.00 %)
132 human papillomavirus 135 (NJ3500 2012)
GCF_000898235.1
7
(92.24 %)
36.86
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.56 %)
1
(0.67 %)
14
(2.77 %)
0
(0.00 %)
133 human papillomavirus type 144 (CL3740 2012)
GCF_000898255.1
7
(92.09 %)
38.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.32 %)
0
(0.00 %)
134 human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012)
GCF_000898855.1
7
(91.69 %)
39.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.79 %)
n/a 4
(1.28 %)
0
(0.00 %)
135 human papillomavirus 166 (KC9 2012)
GCF_000899515.1
6
(92.72 %)
38.29
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.79 %)
0
(0.00 %)
136 human papillomavirus 136 (CL3865 2012)
GCF_000899695.1
7
(91.83 %)
38.51
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 19
(3.31 %)
0
(0.00 %)
137 human polyomavirus 12 (hu1403 2013)
GCF_000906235.1
6
(89.41 %)
39.60
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.91 %)
27
(6.74 %)
0
(0.00 %)
138 human rotavirus B (Bang373 2013)
GCF_000907835.1
13
(95.17 %)
36.97
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(1.22 %)
0
(0.00 %)
139 human papillomavirus 154 (PV77 2013)
GCF_000908695.1
7
(92.75 %)
37.93
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.37 %)
0
(0.00 %)
140 human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013)
GCF_000908835.1
3
(84.17 %)
46.45
(99.89 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.38 %)
1
(13.92 %)
141 human parainfluenza virus 4a (M-25 2013)
GCF_000910675.1
7
(83.27 %)
36.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.23 %)
1
(0.22 %)
13
(1.18 %)
0
(0.00 %)
142 human papillomavirus 179 (SIBX16 2013)
GCF_000912535.1
6
(92.78 %)
36.76
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
n/a 7
(1.67 %)
0
(0.00 %)
143 human papillomavirus 167 (KC10 2013)
GCF_000913075.1
6
(92.78 %)
35.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 23
(5.24 %)
0
(0.00 %)
144 human endogenous retrovirus K113 (2013)
GCF_000913595.1
1
(22.17 %)
41.86
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.60 %)
n/a 14
(2.49 %)
0
(0.00 %)
145 human associated cyclovirus 10 (7078A 2014)
GCF_000918035.2
2
(86.20 %)
43.41
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
146 human papillomavirus 178 (2014)
GCF_000918095.1
7
(92.49 %)
38.15
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.53 %)
2
(0.59 %)
8
(1.35 %)
0
(0.00 %)
147 human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014)
GCF_000920655.1
1
(81.59 %)
43.53
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.59 %)
0
(0.00 %)
148 human astrovirus BF34 (BF34 2014)
GCF_000923215.1
4
(97.29 %)
43.77
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.47 %)
0
(0.00 %)
149 human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014)
GCF_000924015.1
4
(85.08 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 1
(0.25 %)
2
(49.61 %)
150 human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015)
GCF_000929235.1
2
(69.15 %)
43.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
151 human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015)
GCF_000931315.1
2
(74.85 %)
48.83
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.55 %)
1
(41.76 %)
152 human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015)
GCF_000973295.1
4
(80.18 %)
54.85
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.21 %)
1
(91.86 %)
153 human papillomavirus KC5 (KC5 2015)
GCF_000989155.1
7
(92.99 %)
36.78
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.71 %)
0
(0.00 %)
154 human papillomavirus 201 (HPV201 2015)
GCF_001184845.1
7
(93.33 %)
37.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.48 %)
n/a 5
(0.95 %)
0
(0.00 %)
155 human papillomavirus (SE379 2015)
GCF_001274345.1
6
(93.54 %)
37.49
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.98 %)
1
(2.70 %)
21
(3.02 %)
0
(0.00 %)
156 human pegivirus 2 (UC0125.US 2015)
GCF_001310135.2
1
(92.98 %)
53.96
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.49 %)
2
(90.06 %)
157 human papillomavirus 163 (KC3 2015)
GCF_001430115.1
6
(93.54 %)
37.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.80 %)
0
(0.00 %)
158 human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015)
GCF_001448435.1
4
(89.04 %)
51.81
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.89 %)
1
(1.89 %)
1
(2.24 %)
1
(97.10 %)
159 human papillomavirus type 156 (GC01 2017)
GCF_002006915.1
7
(92.47 %)
36.18
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.86 %)
0
(0.00 %)
160 human papillomavirus type 85 (114B 2017)
GCF_002153865.1
8
(90.54 %)
37.76
(98.31 %)
7
(1.95 %)
8
(98.05 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(4.34 %)
0
(0.00 %)
161 human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017)
GCF_002219525.1
2
(84.04 %)
32.53
(99.90 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.60 %)
0
(0.00 %)
162 human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017)
GCF_002219705.1
2
(81.18 %)
45.77
(99.87 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.34 %)
0
(0.00 %)
163 human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017)
GCF_002219885.1
5
(72.08 %)
31.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(5.43 %)
n/a 20
(11.11 %)
0
(0.00 %)
164 human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017)
GCF_002271185.1
2
(72.89 %)
46.99
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.66 %)
1
(1.56 %)
4
(1.25 %)
0
(0.00 %)
165 human metapneumovirus (00-1 2018)
GCF_002815375.1
9
(93.36 %)
36.29
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(1.38 %)
1
(0.34 %)
27
(3.46 %)
0
(0.00 %)
166 human orthopneumovirus (2018)
GCF_002815475.1
12
(97.34 %)
33.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.24 %)
19
(3.32 %)
0
(0.00 %)
167 human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018)
GCF_002816885.1
1
(92.58 %)
43.40
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
168 human parechovirus 1 (2018)
GCF_002817305.1
1
(89.15 %)
39.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(1.29 %)
0
(0.00 %)
169 human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018)
GCF_002819605.1
2
(93.58 %)
43.54
(99.76 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.24 %)
0
(0.00 %)
170 human hepegivirus (AK-790 2018)
GCF_002821385.1
1
(96.18 %)
53.60
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.51 %)
2
(88.97 %)
171 human gemycircularvirus GeTz1 (GeTz1 2018)
GCF_002826025.1
4
(77.38 %)
49.05
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.23 %)
0
(0.00 %)
172 human papillomavirus 71 (2018)
GCF_002826825.1
1
(24.06 %)
44.38
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.47 %)
3
(1.63 %)
11
(3.93 %)
0
(0.00 %)
173 human papillomavirus type 161 (KC1 2018)
GCF_002826985.1
6
(92.39 %)
37.73
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.36 %)
0
(0.00 %)
174 human papillomavirus 172 (2018)
GCF_002827005.1
7
(95.04 %)
37.77
(99.96 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
5
(1.22 %)
n/a 4
(0.60 %)
0
(0.00 %)
175 human papillomavirus 175 (SE87 2018)
GCF_002827025.1
7
(93.05 %)
38.87
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.29 %)
n/a 8
(1.00 %)
1
(3.46 %)
176 human papillomavirus 204 (A342 2018)
GCF_002827045.1
7
(92.47 %)
37.84
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.50 %)
n/a 6
(1.44 %)
1
(2.92 %)
177 human papillomavirus 30 (2018)
GCF_002987345.1
6
(84.46 %)
40.39
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.31 %)
2
(1.03 %)
14
(4.22 %)
0
(0.00 %)
178 human papillomavirus 184 (SIBX17 2018)
GCF_002987365.1
6
(92.71 %)
36.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.98 %)
1
(0.53 %)
4
(0.40 %)
0
(0.00 %)
179 human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018)
GCF_003033475.1
2
(69.15 %)
42.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
180 human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018)
GCF_003033485.1
2
(69.81 %)
43.97
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(1.38 %)
2
(0.57 %)
0
(0.00 %)
181 human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018)
GCF_003033495.1
2
(70.27 %)
42.28
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.79 %)
0
(0.00 %)
182 human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018)
GCF_003033575.1
2
(74.86 %)
46.00
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.54 %)
1
(19.22 %)
183 human papillomavirus 187 (ACS447 2018)
GCF_003055605.1
6
(92.85 %)
38.90
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.36 %)
0
(0.00 %)
184 human feces pecovirus (PeCV-NI 2019)
GCF_003726995.1
2
(72.77 %)
50.00
(99.90 %)
1
(0.03 %)
2
(99.97 %)
5
(2.46 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(55.12 %)
185 human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019)
GCF_003727435.1
1
(6.26 %)
53.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.89 %)
n/a 3
(0.59 %)
1
(93.16 %)
186 human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019)
GCF_003972325.1
11
(97.82 %)
36.79
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.43 %)
1
(0.09 %)
90
(3.88 %)
0
(0.00 %)
187 human papillomavirus type 203 (SE369 2019)
GCF_004133345.1
7
(92.96 %)
37.54
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.43 %)
n/a 10
(1.33 %)
0
(0.00 %)
188 human lung-associated vientovirus FB (2021)
GCF_013088445.1
3
(86.49 %)
33.94
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.15 %)
1
(1.34 %)
3
(6.81 %)
0
(0.00 %)
189 Influenza A virus (A/California/07/2009 2015)
GCF_001343785.1
14
(99.84 %)
43.70
(99.90 %)
4
(0.03 %)
12
(99.97 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.83 %)
0
(0.00 %)
190 Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005)
GCF_000864105.1
15
(96.68 %)
44.12
(99.93 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
191 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003)
GCF_000851145.1
12
(97.14 %)
44.07
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.81 %)
0
(0.00 %)
192 Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005)
GCF_000866645.1
15
(97.49 %)
43.41
(99.89 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.28 %)
0
(0.00 %)
193 Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005)
GCF_000865085.1
15
(96.37 %)
42.94
(99.91 %)
n/a 8
(100.00 %)
4
(0.57 %)
n/a 6
(0.33 %)
0
(0.00 %)
194 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982)
GCF_000865725.1
15
(96.32 %)
43.40
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.68 %)
0
(0.00 %)
195 Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015)
GCF_000928555.1
15
(99.34 %)
44.36
(99.92 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.30 %)
0
(0.00 %)
196 Influenza B virus (B/Lee/1940 1993)
GCF_000820495.2
11
(92.51 %)
40.19
(99.88 %)
n/a 8
(100.00 %)
5
(0.51 %)
n/a 23
(1.85 %)
0
(0.00 %)
197 Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004)
GCF_000856665.10
11
(95.87 %)
37.28
(99.91 %)
n/a 7
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 42
(4.23 %)
0
(0.00 %)
198 Isfahan virus (2013)
GCF_000906835.1
5
(96.29 %)
41.93
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(1.82 %)
0
(0.00 %)
199 Japanese encephalitis virus (1993)
GCF_000862145.1
3
(93.83 %)
51.43
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.15 %)
0
(0.00 %)
200 JC polyomavirus (Mad1 1993)
GCF_000863805.1
9
(96.55 %)
40.45
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(3.82 %)
17
(5.52 %)
0
(0.00 %)
201 La Crosse virus (human/78 2002)
GCF_000850965.1
4
(94.68 %)
36.68
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 26
(2.75 %)
0
(0.00 %)
202 Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013)
GCF_000905975.1
5
(90.15 %)
43.48
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.41 %)
0
(0.00 %)
203 Langat virus (TP21 2000)
GCF_000860805.1
1
(93.62 %)
54.31
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.56 %)
1
(2.18 %)
204 Lassa mammarenavirus (Josiah 1998)
GCF_000851705.1
4
(94.96 %)
42.06
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.37 %)
9
(1.70 %)
0
(0.00 %)
205 Louping ill virus (369/T2 1997)
GCF_000863165.1
1
(94.24 %)
54.86
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.52 %)
3
(12.29 %)
206 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993)
GCF_000851025.1
4
(97.52 %)
42.29
(99.99 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.07 %)
0
(0.00 %)
207 Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003)
GCF_000853725.1
4
(94.98 %)
41.77
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.62 %)
0
(0.00 %)
208 Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994)
GCF_000857325.2
7
(98.72 %)
38.29
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(1.05 %)
0
(0.00 %)
209 Mayaro virus (2002)
GCF_000863385.1
5
(96.78 %)
50.37
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.76 %)
n/a 4
(1.59 %)
5
(42.02 %)
210 Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998)
GCF_000854845.1
7
(94.55 %)
47.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.91 %)
1
(3.88 %)
211 Merkel cell polyomavirus (R17b 2008)
GCF_000874865.1
5
(88.06 %)
40.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.78 %)
0
(0.00 %)
212 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012)
GCF_000901155.1
12
(97.48 %)
41.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
n/a 4
(0.14 %)
0
(0.00 %)
213 Mokola lyssavirus (2004)
GCF_000856485.1
5
(98.49 %)
44.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.73 %)
0
(0.00 %)
214 Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996)
GCF_000843325.1
163
(85.07 %)
63.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
128
(3.25 %)
92
(4.74 %)
1,361
(17.29 %)
1
(99.95 %)
215 Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021)
GCF_000857045.1
191
(87.29 %)
33.09
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
37
(0.96 %)
24
(0.57 %)
1,102
(9.51 %)
0
(0.00 %)
216 Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022)
GCF_014621545.1
179
(83.90 %)
33.03
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
38
(0.78 %)
22
(0.54 %)
1,097
(9.44 %)
0
(0.00 %)
217 Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000)
GCF_000856685.1
8
(92.81 %)
42.49
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 10
(0.59 %)
0
(0.00 %)
218 Mupapillomavirus 1 (1982)
GCF_000866405.1
7
(86.17 %)
40.28
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.47 %)
1
(0.40 %)
7
(1.87 %)
1
(2.75 %)
219 Murray Valley encephalitis virus (1999)
GCF_000863565.1
3
(93.56 %)
48.72
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.23 %)
1
(1.84 %)
220 Nipah henipavirus (2000)
GCF_000863625.1
11
(82.06 %)
38.17
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.17 %)
n/a 8
(0.37 %)
0
(0.00 %)
221 Norovirus GI (1993)
GCF_000864005.1
3
(99.09 %)
48.03
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.52 %)
1
(0.35 %)
3
(0.31 %)
0
(0.00 %)
222 Onyong-nyong virus (1993)
GCF_000863005.1
5
(100.00 %)
48.32
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(1.28 %)
7
(1.39 %)
5
(15.80 %)
223 Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004)
GCF_000844845.1
130
(89.67 %)
63.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
56
(2.03 %)
37
(1.70 %)
1,076
(16.55 %)
1
(100.00 %)
224 Oropouche virus (2004)
GCF_000853785.1
4
(97.72 %)
35.40
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 33
(3.75 %)
0
(0.00 %)
225 Orthohepevirus A (Xinjiang 1993)
GCF_000861105.1
3
(98.65 %)
57.95
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.80 %)
1
(89.53 %)
226 Parainfluenza virus 5 (W3A 2004)
GCF_000854805.1
9
(99.06 %)
42.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 3
(0.30 %)
0
(0.00 %)
227 Parechovirus A (Gregory 1998)
GCF_000861505.1
1
(89.00 %)
39.48
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 6
(0.98 %)
0
(0.00 %)
228 Pichinde virus (AN3739 2004)
GCF_000856465.1
4
(96.57 %)
41.84
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.44 %)
0
(0.00 %)
229 Powassan virus (LB 1993)
GCF_000860485.1
1
(94.55 %)
53.32
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 14
(1.20 %)
1
(3.47 %)
230 Punta Toro virus (Adames 2018)
GCF_002815115.1
4
(92.61 %)
40.36
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(1.74 %)
3
(0.77 %)
16
(3.35 %)
0
(0.00 %)
231 Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003)
GCF_000854405.1
3
(39.37 %)
36.97
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.66 %)
n/a 33
(3.47 %)
0
(0.00 %)
232 Rabies lyssavirus (1993)
GCF_000859625.1
5
(95.29 %)
45.10
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(1.15 %)
0
(0.00 %)
233 Rhinovirus A (1993)
GCF_000862245.1
1
(90.81 %)
39.05
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.15 %)
0
(0.00 %)
234 Rift Valley fever virus (ZH-548 2010)
GCF_000847345.1
4
(95.24 %)
45.11
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.49 %)
n/a 8
(1.04 %)
0
(0.00 %)
235 Rosavirus A2 (GA7403 2014)
GCF_000918175.1
1
(82.95 %)
51.41
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.67 %)
1
(4.60 %)
236 Ross River virus (NB5092 1993)
GCF_000862165.1
5
(96.96 %)
51.41
(99.90 %)
20
(0.47 %)
20
(99.53 %)
4
(0.90 %)
n/a 4
(1.54 %)
8
(48.39 %)
237 Rotavirus C (Bristol 2005)
GCF_000864225.1
11
(95.04 %)
31.63
(99.89 %)
n/a 11
(100.00 %)
7
(1.19 %)
n/a 33
(2.72 %)
0
(0.00 %)
238 Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008)
GCF_000880735.1
12
(94.00 %)
33.67
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
4
(0.19 %)
n/a 21
(1.24 %)
0
(0.00 %)
239 Rubella virus (F-Therien 1993)
GCF_000863025.1
2
(99.15 %)
69.60
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.85 %)
n/a 54
(9.70 %)
1
(98.66 %)
240 Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005)
GCF_000866785.1
1
(94.09 %)
49.75
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.35 %)
1
(3.05 %)
241 Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009)
GCF_000886535.1
1
(89.26 %)
56.70
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.15 %)
2
(48.16 %)
242 Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004)
GCF_000854285.1
4
(98.01 %)
44.60
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 13
(2.02 %)
0
(0.00 %)
243 Sapovirus C12 (C12 2004)
GCF_000855765.1
2
(98.27 %)
51.73
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
2
(7.50 %)
244 SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003)
GCF_000864885.1
16
(97.60 %)
40.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.08 %)
n/a 18
(0.74 %)
0
(0.00 %)
245 Semliki Forest virus (1987)
GCF_000860285.1
4
(96.64 %)
53.22
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.66 %)
n/a 4
(1.46 %)
1
(92.56 %)
246 Seoul orthohantavirus (80-39 2003)
GCF_000855645.1
3
(93.29 %)
39.00
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.56 %)
n/a 14
(1.15 %)
0
(0.00 %)
247 Simian foamy virus (1994)
GCF_000848485.1
6
(78.31 %)
38.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.50 %)
n/a 7
(0.57 %)
0
(0.00 %)
248 Sindbis virus (1993)
GCF_000860545.1
5
(100.00 %)
50.91
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.34 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(93.38 %)
249 smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993)
GCF_000859885.1
197
(87.60 %)
32.73
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
31
(0.69 %)
7
(0.57 %)
1,031
(9.09 %)
0
(0.00 %)
250 Snowshoe hare virus (2021)
GCF_004789895.1
4
(96.87 %)
37.25
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.83 %)
n/a 15
(1.23 %)
0
(0.00 %)
251 Torque teno virus 1 (VT416 1998)
GCF_000857545.1
5
(70.74 %)
49.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.80 %)
n/a 17
(6.93 %)
2
(35.41 %)
252 Uukuniemi virus (2003)
GCF_000851865.1
4
(96.08 %)
47.69
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.86 %)
0
(0.00 %)
253 Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005)
GCF_000860085.1
223
(88.80 %)
33.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
26
(0.57 %)
10
(3.43 %)
744
(9.15 %)
0
(0.00 %)
254 Varicella-zoster virus (Dumas 1987)
GCF_000858285.1
74
(89.36 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
14
(0.32 %)
17
(0.92 %)
421
(5.39 %)
1
(0.20 %)
255 Venezuelan equine encephalitis virus (1993)
GCF_000862105.1
6
(100.00 %)
50.12
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
1
(0.30 %)
6
(1.47 %)
4
(15.75 %)
256 Vesicular stomatitis Indiana virus (1993)
GCF_000850045.1
4
(91.34 %)
41.74
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.60 %)
0
(0.00 %)
257 West Nile virus (956 1993)
GCF_000861085.1
3
(93.90 %)
51.06
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.19 %)
3
(7.47 %)
258 Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000)
GCF_000850885.1
4
(96.79 %)
49.21
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.64 %)
3
(52.96 %)
259 WU Polyomavirus (B0 2007)
GCF_000870785.1
6
(85.79 %)
39.18
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.03 %)
1
(0.71 %)
16
(3.46 %)
0
(0.00 %)
260 Yaba monkey tumor virus (2003)
GCF_000845705.1
140
(94.29 %)
29.83
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
24
(0.67 %)
6
(0.47 %)
1,223
(18.16 %)
0
(0.00 %)
261 Yaba-like disease virus (2001)
GCF_000847185.1
152
(95.76 %)
27.00
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
39
(1.06 %)
10
(0.44 %)
1,396
(21.09 %)
0
(0.00 %)
262 Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986)
GCF_000857725.1
1
(100.00 %)
49.72
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 1
(0.28 %)
0
(0.00 %)
263 Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999)
GCF_000848505.1
11
(95.31 %)
41.07
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.18 %)
n/a 4
(0.15 %)
1
(1.12 %)
264 Zika virus (MR 766 2009)
GCF_000882815.3
1
(95.05 %)
50.95
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.26 %)
0
(0.00 %)
TOTALS:total assembly count 264

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 159 assemblies assembly stats track stats
Mammals 407 assemblies assembly stats track stats
Birds 270 assemblies assembly stats track stats
Fishes 270 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 114 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 584 assemblies assembly stats track stats
Plants 230 assemblies assembly stats track stats
Fungi 544 assemblies assembly stats track stats
Viruses 264 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 64 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 336 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 445 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats