Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap1.1 2024)
GCF_964194415.1		 38,942
(3.52 %)		 13,890
(1.18 %)		 20,037
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,535
(99.99 %)		 3,498,446
(50.64 %)		 792,729
(6.25 %)		 7,621,218
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
5 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
6 Aegean wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964252035.1		 60,400
(5.15 %)		 13,944
(1.37 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 4,972,179
(51.37 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,007,850
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
7 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
8 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
9 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
10 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
11 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
12 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
13 American alligator (hap1 2026)
GCA_057657785.1		 n/a 14,447
(0.97 %)		 18,772
(1.45 %)		 n/a 45.07
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,387,982
(42.95 %)		 644,426
(2.34 %)		 12,507,993
(32.71 %)		 49,984
(3.01 %)
14 American alligator (hap2 2026)
GCA_057657805.1		 n/a 14,449
(0.98 %)		 18,986
(1.47 %)		 n/a 44.99
(100.00 %)		 139
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 3,389,572
(43.14 %)		 480,395
(1.63 %)		 12,514,775
(32.21 %)		 50,383
(2.34 %)
15 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
16 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 429,691
(2.65 %)
17 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
18 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
19 Andalusian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965113315.1		 64,111
(5.17 %)		 14,387
(1.31 %)		 20,338
(2.18 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 5,139,265
(54.13 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
20 angelshark (IRGN 9GIWDBWNYT 2023)
GCA_031763465.1		 n/a 5,514
(0.36 %)		 13,241
(0.85 %)		 n/a 44.21
(86.22 %)		 226,036
(13.68 %)		 1,378,695
(86.32 %)		 204,591
(1.55 %)		 649,587
(7.45 %)		 7,948,984
(32.06 %)		 83,350
(2.20 %)
21 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 172,876
(42.56 %)
22 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
23 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
24 Atlantic hagfish (alternate hap 2024)
GCA_964187825.1		 n/a 6,253
(0.19 %)		 56,915
(3.08 %)		 n/a 44.52
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 24,878
(100.00 %)		 1,607,558
(3.68 %)		 2,446,041
(23.93 %)		 7,370,810
(72.27 %)		 307,758
(13.12 %)
25 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
26 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
27 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
28 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
29 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
30 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
31 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
32 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
33 axolotl (Mex_15411 2024 refseq)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
34 barred grass snake (hap1.1 2024)
GCF_964273705.1		 43,483
(3.75 %)		 13,680
(1.11 %)		 19,683
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 487
(100.00 %)		 4,187,944
(53.38 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,184
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
35 basking shark (hap1.1 2024)
GCF_964194155.1		 49,591
(1.78 %)		 13,754
(0.41 %)		 22,698
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,087
(100.00 %)		 6,782,578
(65.71 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,697,546
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
36 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
37 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
38 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
39 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
40 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
41 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
42 blonde ray (alternate hap 2023)
GCA_963513955.1		 n/a 11,554
(0.52 %)		 31,983
(1.58 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 n/a 10,683
(100.00 %)		 8,320,120
(69.63 %)		 991,438
(7.00 %)		 11,337,728
(57.98 %)		 262,962
(6.35 %)
43 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
44 blonde ray (primary hap 2023)
GCF_963514005.1		 40,007
(2.48 %)		 11,887
(0.54 %)		 27,557
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,646
(100.00 %)		 8,552,615
(70.14 %)		 1,061,810
(8.11 %)		 11,598,911
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
45 Bocage's wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964188305.1		 64,048
(5.17 %)		 14,155
(1.28 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 507
(100.00 %)		 5,192,766
(54.55 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,204
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
46 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 734,430
(7.27 %)
47 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
48 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
49 brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
50 brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
51 brown hagfish (PATA_SCHIZ_1 2024)
GCA_035128595.1		 n/a 6,299
(0.25 %)		 35,377
(2.04 %)		 n/a 43.49
(94.65 %)		 706,165
(5.46 %)		 64,533
(99.47 %)		 1,452,558
(4.27 %)		 1,950,334
(8.89 %)		 14,106,206
(47.44 %)		 224,843
(9.74 %)
52 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
53 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
54 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
55 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
56 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
57 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
58 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap1 2025)
GCA_047715975.2		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,926
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,492,668
(30.18 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
59 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap2 2025)
GCA_047715955.2		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,934
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 3,500,548
(30.07 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
60 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
61 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
62 Catalonian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965112155.1		 76,765
(6.15 %)		 14,333
(1.34 %)		 20,157
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 5,086,552
(52.93 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,595
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
63 central bearded dragon (2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
64 central bearded dragon (2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
65 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025)
GCA_051106095.1		 n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
66 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025)
GCF_051106095.1		 67,761
(7.72 %)		 13,968
(1.18 %)		 17,955
(1.90 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 3,462,868
(44.39 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,488
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
67 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
68 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
69 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
70 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 142,416
(4.34 %)
71 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
72 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
73 coelacanth (alternate hap 2024)
GCA_037215105.1		 n/a 6,557
(0.42 %)		 33,169
(3.43 %)		 n/a 42.50
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 34,012
(100.00 %)		 3,932,420
(65.13 %)		 507,198
(3.35 %)		 6,831,314
(53.31 %)		 66,510
(2.53 %)
74 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
75 coelacanth (primary hap 2024)
GCA_037176945.1		 n/a 14,050
(0.65 %)		 28,429
(2.77 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 8,627,529
(65.90 %)		 1,047,268
(3.01 %)		 15,613,476
(54.44 %)		 140,027
(2.34 %)
76 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
77 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
78 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
79 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
80 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
81 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
82 common lizard (primary hap 2023)
GCA_963506605.1		 n/a 14,281
(1.46 %)		 19,707
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 49
(100.00 %)		 4,263,449
(45.66 %)		 513,321
(3.73 %)		 7,172,746
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
83 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
84 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
85 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
86 common newt (alternate hap 2024)
GCA_964261385.1		 n/a 14,340
(0.07 %)		 256,786
(1.73 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
87 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
88 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
89 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
90 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
91 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
92 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
93 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
94 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
95 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
96 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
97 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
98 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
99 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
100 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
101 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
102 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
103 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCF_951804945.1		 62,110
(5.47 %)		 14,322
(1.40 %)		 19,303
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,986,518
(46.26 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,353
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
104 cuckoo ray (2025)
GCA_965643135.1		 n/a 11,948
(0.63 %)		 26,240
(1.77 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 2,173
(0.01 %)		 1,503
(100.00 %)		 9,829,377
(67.19 %)		 1,120,890
(8.92 %)		 10,135,837
(56.08 %)		 194,688
(3.92 %)
105 Dalmatian wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964234715.1		 61,269
(4.93 %)		 14,329
(1.34 %)		 20,474
(2.25 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 386
(100.00 %)		 4,958,256
(53.05 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,837,755
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
106 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
107 Darwin's frog (hap2 2025)
GCA_050947465.1		 n/a 13,442
(0.54 %)		 32,134
(1.61 %)		 n/a 42.92
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 10,591,581
(59.76 %)		 2,041,017
(15.35 %)		 13,574,848
(62.16 %)		 428,658
(6.43 %)
108 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 606,993
(6.09 %)
109 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
110 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
111 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
112 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
113 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
114 Eastern musk turtle (MuskTurtle02 primary hap 2026)
GCA_032164245.2		 n/a 14,208
(1.29 %)		 18,423
(1.89 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,079
(0.01 %)		 74
(100.00 %)		 3,408,591
(40.89 %)		 590,719
(3.26 %)		 8,678,800
(30.12 %)		 118,053
(4.00 %)
115 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
116 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
117 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
118 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
119 elongated tortoise (hap1 2025)
GCA_050000095.2		 n/a 14,769
(1.01 %)		 18,561
(1.53 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 169
(0.00 %)		 207
(100.00 %)		 5,015,434
(53.77 %)		 367,754
(2.17 %)		 10,980,259
(34.90 %)		 82,369
(2.28 %)
120 elongated tortoise (hap2 2025)
GCA_050000115.1		 n/a 14,858
(1.00 %)		 18,820
(1.51 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 586
(100.00 %)		 5,006,492
(53.37 %)		 397,554
(3.24 %)		 10,915,197
(35.50 %)		 82,579
(2.28 %)
121 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
122 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
123 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
124 European conger (alternate hap 2023)
GCA_963514125.1		 n/a 16,952
(1.95 %)		 37,050
(5.24 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 n/a 3,769
(100.00 %)		 2,413,696
(36.12 %)		 866,233
(11.37 %)		 5,685,752
(33.48 %)		 112,201
(5.57 %)
125 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
126 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
127 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
128 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
129 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
130 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
131 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
132 European river lamprey (alternate hap 2024)
GCA_964198585.1		 n/a 7,082
(0.70 %)		 37,019
(4.34 %)		 n/a 49.03
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 5,726
(100.00 %)		 3,762,664
(64.70 %)		 1,005,839
(17.80 %)		 4,592,233
(49.09 %)		 153,841
(41.42 %)
133 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
134 European river lamprey (primary hap 2024)
GCF_964198595.1		 36,555
(6.20 %)		 7,604
(0.70 %)		 36,803
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,496
(100.00 %)		 4,068,759
(65.84 %)		 1,165,417
(20.23 %)		 4,931,505
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
135 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
136 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
137 Filfola wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964270895.1		 74,789
(6.22 %)		 14,358
(1.40 %)		 20,324
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 4,963,872
(50.70 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,009,851
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
138 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
139 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
140 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
141 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
142 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
143 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
144 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
145 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
146 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
147 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
148 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
149 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
150 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
151 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
152 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
153 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
154 Gaboon caecilian (primary hap 2021)
GCF_902459505.2		 54,715
(1.72 %)		 14,269
(0.52 %)		 29,024
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 596
(99.85 %)		 11,725,554
(74.57 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,602
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
155 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
156 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
157 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
158 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
159 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
160 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
161 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
162 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
163 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
164 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
165 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
166 goldspotted eel (2025)
GCA_975146105.1		 n/a 16,879
(1.43 %)		 38,748
(4.22 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,198,550
(33.91 %)		 741,217
(8.84 %)		 7,140,094
(39.50 %)		 136,266
(4.25 %)
167 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
168 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
169 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
170 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
171 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
172 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
173 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
174 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
175 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
176 great white shark (primary hap 2021)
GCA_017639515.1		 n/a 13,511
(0.38 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 7,178,936
(64.10 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,189
(52.42 %)		 77,057
(2.22 %)
177 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
178 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
179 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
180 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
181 green sea turtle (primary hap 2021)
GCA_015237465.2		 n/a 15,016
(1.11 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 92
(100.00 %)		 3,631,238
(44.71 %)		 304,302
(1.25 %)		 11,135,013
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
182 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
183 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
184 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025)
GCA_052327205.1		 n/a 13,229
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 4,461
(99.98 %)		 1,160,458
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,819
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
185 grey reef shark (2025)
GCA_965295155.1		 n/a 12,988
(0.54 %)		 18,753
(1.27 %)		 n/a 44.00
(100.00 %)		 876
(0.00 %)		 2,410
(100.00 %)		 7,462,980
(58.92 %)		 660,217
(6.95 %)		 13,645,872
(46.47 %)		 36,662
(1.11 %)
186 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
187 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
188 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
189 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
190 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
191 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
192 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
193 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
194 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
195 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
196 Hungarian meadow viper (primary hap 2022)
GCF_947247035.1		 36,135
(3.46 %)		 13,432
(1.20 %)		 18,654
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 3,633,666
(50.97 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,427,621
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
197 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
198 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
199 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
200 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
201 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
202 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
203 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
204 Indo-Pacific tarpon (primary hap 2020)
GCA_013368585.1		 n/a 18,305
(2.47 %)		 29,764
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,530
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,961
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
205 inshore hagfish (2023)
GCA_900186335.3		 n/a 6,137
(0.40 %)		 23,364
(2.60 %)		 n/a 46.68
(54.88 %)		 332,729
(45.17 %)		 342,008
(54.83 %)		 1,099,633
(8.08 %)		 1,181,678
(6.90 %)		 7,860,245
(28.44 %)		 142,778
(3.95 %)
206 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
207 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
208 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 131,092
(7.95 %)
209 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
210 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
211 Kemp's ridley sea turtle (hap1 2025)
GCF_965140285.1		 65,480
(3.90 %)		 14,975
(1.06 %)		 17,809
(1.52 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 4,215,923
(50.05 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
212 Kenyan clawed frog (NASCO 2022)
GCA_024363595.1		 n/a 21,451
(1.69 %)		 23,652
(2.05 %)		 n/a 38.65
(79.93 %)		 233,029
(20.10 %)		 23,435
(100.00 %)		 5,285,530
(44.53 %)		 579,815
(1.62 %)		 12,925,637
(32.47 %)		 63,201
(0.69 %)
213 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
214 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
215 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
216 leatherback sea turtle (primary hap 2021)
GCA_009764565.4		 n/a 14,844
(1.08 %)		 16,357
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 41
(100.00 %)		 4,070,850
(47.24 %)		 304,774
(1.14 %)		 11,121,781
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
217 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
218 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
219 Leopard gecko (TG4126 2023)
GCA_028583425.1		 n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
220 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
221 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
222 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
223 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
224 lizards A.tigris stejnegeri (HBS 135688 alternate hap 2025)
GCA_023333555.2		 n/a 11,547
(1.21 %)		 15,609
(1.97 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 3,683,979
(51.31 %)		 480,268
(5.67 %)		 7,021,351
(38.84 %)		 45,241
(2.12 %)
225 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
226 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
227 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
228 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
229 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
230 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 alternate hap 2024)
GCA_023053675.2		 n/a 14,236
(1.17 %)		 19,573
(1.94 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 28
(0.00 %)		 655
(100.00 %)		 6,106,640
(52.43 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,804
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
231 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
232 lizards L.agilis (primary hap 2019)
GCA_009819535.1		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,235
(2.45 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,417
(1.76 %)		 7,135,058
(34.49 %)		 76,055
(2.68 %)
233 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
234 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
235 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
236 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
237 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
238 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
239 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024)
GCF_964106645.1		 68,289
(5.99 %)		 14,362
(1.39 %)		 20,488
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 336
(100.00 %)		 4,977,407
(51.01 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,060,761
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
240 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
241 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
242 lizards P.tiliguerta (hap2.2 2025)
GCA_965153305.2		 n/a 13,808
(1.46 %)		 19,314
(2.39 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 1,003
(0.01 %)		 307
(100.00 %)		 4,685,494
(49.03 %)		 429,388
(4.28 %)		 6,635,321
(36.92 %)		 92,746
(3.04 %)
243 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
244 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
245 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
246 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
247 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
248 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
249 loggerhead turtle (v1 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
250 loggerhead turtle (v2 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.2		 61,631
(3.99 %)		 14,676
(1.05 %)		 17,408
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 744
(0.10 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,254,882
(12.49 %)		 319,728
(1.29 %)		 10,705,331
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
251 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 87,981
(3.16 %)
252 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
253 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
254 marbled electric ray (2025)
GCA_977017645.1		 n/a 12,155
(0.24 %)		 25,844
(0.70 %)		 n/a 43.83
(99.99 %)		 3,402
(0.01 %)		 4,566
(100.00 %)		 10,762,422
(61.06 %)		 1,754,113
(25.79 %)		 13,259,628
(78.62 %)		 445,127
(7.22 %)
255 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
256 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 255,756
(3.08 %)
257 McCord's box turtle (ISIS_951048 2018)
GCA_003846335.1		 n/a 16,317
(1.05 %)		 26,320
(1.64 %)		 n/a 44.69
(94.58 %)		 50,040
(5.43 %)		 141,912
(94.57 %)		 4,185,106
(47.48 %)		 331,791
(1.03 %)		 11,180,962
(31.97 %)		 126,459
(3.07 %)
258 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
259 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
260 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
261 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
262 Mexican gopher tortoise (maternal hap 2022)
GCA_025201925.1		 n/a 14,970
(1.00 %)		 18,525
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 622
(100.00 %)		 4,639,733
(52.18 %)		 472,502
(3.42 %)		 11,362,004
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
263 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
264 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
265 mimic poison frog (alternate hap 2023)
GCA_032442605.1		 n/a 25
(0.76 %)		 202
(6.98 %)		 n/a 51.33
(100.00 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4,414
(23.25 %)		 1,907
(64.24 %)		 6,592
(56.32 %)		 305
(4.46 %)
266 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
267 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
268 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
269 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
270 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
271 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
272 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
273 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
274 nurse shark (FLO180531 2022)
GCA_024137785.1		 n/a 11,376
(0.58 %)		 14,375
(1.25 %)		 n/a 41.63
(56.77 %)		 68,882
(43.24 %)		 69,171
(56.76 %)		 8,181,216
(65.52 %)		 260,159
(0.44 %)		 14,324,615
(20.45 %)		 13,165
(0.13 %)
275 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
276 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
277 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
278 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
279 Pacific ridley (hap1 2025)
GCF_965140295.1		 48,786
(3.33 %)		 14,876
(1.07 %)		 17,430
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 112
(99.98 %)		 4,157,740
(50.14 %)		 313,430
(2.43 %)		 10,832,284
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
280 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
281 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
282 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
283 palmate newt (alternate hap 2024)
GCA_964258895.1		 n/a 13,011
(0.06 %)		 269,650
(1.87 %)		 n/a 44.94
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 233,842
(100.00 %)		 4,147,487
(1.62 %)		 8,364,812
(13.65 %)		 78,522,792
(49.21 %)		 2,116,175
(7.96 %)
284 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
285 palmate newt (primary hap 2026)
GCA_964261635.2		 n/a 16,530
(0.09 %)		 227,377
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,696,508
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
286 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
287 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
288 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
289 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
290 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
291 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
292 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
293 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
294 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCA_027358695.2		 n/a 13,760
(2.05 %)		 25,743
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 2,153,589
(42.02 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,323
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
295 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
296 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
297 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
298 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
299 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
300 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
301 Puget Sound dogfish (hap1 2025)
GCA_050613905.1		 n/a 13,335
(0.31 %)		 32,914
(1.25 %)		 n/a 46.84
(99.98 %)		 4,275
(0.02 %)		 3,203
(100.00 %)		 996,444
(5.35 %)		 1,697,611
(29.47 %)		 16,252,127
(70.13 %)		 372,462
(5.80 %)
302 Puget Sound dogfish (sSquSuc3hap2 2025)
GCA_050613895.1		 n/a 13,151
(0.34 %)		 29,417
(1.19 %)		 n/a 46.65
(99.98 %)		 4,144
(0.02 %)		 1,862
(100.00 %)		 887,790
(4.65 %)		 1,380,618
(26.09 %)		 14,838,724
(67.96 %)		 333,223
(5.63 %)
303 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
304 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
305 reedfish (primary hap 2021)
GCA_900747795.4		 n/a 13,335
(0.48 %)		 23,159
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,317,123
(62.67 %)		 1,069,641
(2.91 %)		 19,980,246
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
306 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
307 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
308 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
309 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
310 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
311 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
312 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
313 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
314 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
315 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
316 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
317 rufous frog (hap2 2026)
GCA_031893055.2		 n/a 13,549
(0.89 %)		 24,388
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 5,738,417
(62.95 %)		 1,219,306
(21.56 %)		 7,988,200
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
318 Sabana Surinam toad (BJE4294 2021)
GCA_019650415.1		 n/a 11,460
(0.68 %)		 39,132
(1.41 %)		 n/a 37.70
(99.38 %)		 67,859
(0.60 %)		 351,451
(99.40 %)		 1,112,793
(9.46 %)		 523,672
(3.31 %)		 8,542,740
(36.81 %)		 42,115
(0.79 %)
319 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
320 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
321 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
322 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
323 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
324 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
325 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
326 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
327 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
328 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
329 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
330 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
331 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
332 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
333 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
334 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
335 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
336 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
337 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
338 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
339 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
340 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
341 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.2		 n/a 12,605
(0.51 %)		 23,661
(1.48 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 1,771
(0.01 %)		 1,143
(100.00 %)		 559,424
(2.10 %)		 990,550
(15.48 %)		 11,850,173
(56.04 %)		 109,272
(3.30 %)
342 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
343 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap1.2 2024)
GCF_964106915.1		 72,774
(5.99 %)		 14,298
(1.39 %)		 19,900
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 4,985,535
(51.28 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,654
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
344 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
345 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
346 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
347 small-spotted catshark (primary hap 2021)
GCF_902713615.2		 55,748
(1.62 %)		 13,022
(0.37 %)		 23,990
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 10,880,918
(73.26 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,883,361
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
348 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
349 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
350 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
351 smalltooth sawfish (primary hap 2019)
GCA_009764475.2		 n/a 12,158
(0.69 %)		 18,625
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 4,923,143
(54.93 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,054
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
352 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
353 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
354 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
355 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 218,171
(0.23 %)
356 Southern California legless lizard (HBS135921 hap1 2026)
GCA_051312515.2		 n/a 14,187
(1.12 %)		 19,489
(1.86 %)		 n/a 43.68
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 5,909,632
(46.54 %)		 670,448
(3.31 %)		 9,944,808
(39.15 %)		 83,929
(3.91 %)
357 Southern California legless lizard (HBS135921 hap2 2026)
GCA_051312545.2		 n/a 14,225
(1.12 %)		 19,592
(1.86 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 5,913,300
(46.41 %)		 672,138
(3.61 %)		 9,957,324
(39.35 %)		 83,771
(3.97 %)
358 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
359 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
360 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
361 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
362 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
363 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
364 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
365 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
366 spotted gar (hap2 2024)
GCA_040954835.1		 n/a 13,842
(1.51 %)		 23,963
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 1,332,243
(34.81 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,951
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
367 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
368 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
369 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
370 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
371 starry smooth-hound shark (hap1.1 2024)
GCF_964213995.1		 50,247
(1.97 %)		 12,752
(0.42 %)		 23,720
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,313
(100.00 %)		 1,161,214
(3.17 %)		 1,250,068
(11.36 %)		 14,206,585
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
372 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
373 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
374 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
375 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
376 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
377 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
378 tarantolino (hap1 2023)
GCA_029931775.1		 n/a 14,318
(1.18 %)		 21,784
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 592
(100.00 %)		 5,383,621
(53.79 %)		 436,945
(2.95 %)		 8,308,761
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
379 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
380 thorny skate (CabotCenter1 primary hap 2020)
GCA_010909765.2		 n/a 11,697
(0.61 %)		 26,344
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 8,789,521
(68.75 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,963,149
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
381 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
382 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
383 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
384 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
385 tiny cayenne caecilian (primary hap 2021)
GCF_901765095.2		 41,335
(1.27 %)		 14,580
(0.44 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 3,532
(98.99 %)		 13,578,410
(71.92 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,206,278
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
386 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
387 tope shark (hap1 2025)
GCA_977071755.1		 n/a 12,861
(0.32 %)		 25,525
(1.16 %)		 n/a 47.84
(99.98 %)		 3,659
(0.02 %)		 10,777
(99.98 %)		 1,356,606
(3.72 %)		 1,445,979
(23.88 %)		 14,153,835
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
388 tope shark (hap2 2025)
GCA_977071745.1		 n/a 9,480
(0.44 %)		 12,818
(1.02 %)		 n/a 45.32
(99.99 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,593
(99.99 %)		 844,596
(2.20 %)		 605,996
(6.77 %)		 10,856,611
(52.57 %)		 83,694
(4.14 %)
389 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
390 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
391 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
392 Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
393 turtles (alternate hap 2025)
GCA_049999975.1		 n/a 14,806
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 3,247,149
(41.23 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
394 turtles (alternate hap 2025)
GCA_051311595.1		 n/a 14,771
(1.19 %)		 18,963
(1.80 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 1,298
(100.00 %)		 3,524,256
(40.68 %)		 362,743
(1.52 %)		 9,689,320
(29.55 %)		 52,961
(1.73 %)
395 turtles (alternate hap 2025)
GCA_052575425.1		 n/a 449
(0.60 %)		 896
(1.17 %)		 n/a 44.87
(100.00 %)		 n/a 940
(100.00 %)		 181,438
(48.98 %)		 15,458
(1.40 %)		 479,760
(25.10 %)		 3,011
(2.57 %)
396 turtles (hap1 2025)
GCA_054099655.1		 n/a 14,920
(1.21 %)		 18,649
(1.75 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 3,220,305
(41.80 %)		 325,597
(8.20 %)		 9,635,325
(31.95 %)		 49,601
(1.77 %)
397 turtles (hap2 2025)
GCA_054099715.1		 n/a 14,893
(1.22 %)		 18,699
(1.80 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 137
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 3,212,991
(39.89 %)		 328,796
(6.89 %)		 9,501,793
(30.78 %)		 49,575
(1.79 %)
398 turtles (MuskTurtle02 alternate hap 2023)
GCA_032164215.1		 n/a 14,229
(1.29 %)		 18,555
(1.90 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,120
(99.99 %)		 3,408,527
(40.89 %)		 590,538
(3.26 %)		 8,678,744
(30.12 %)		 118,052
(4.00 %)
399 turtles (primary hap 2025)
GCA_049999965.1		 n/a 14,773
(1.27 %)		 19,240
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 40
(100.00 %)		 3,245,307
(41.27 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
400 turtles (primary hap 2025)
GCA_051311615.1		 n/a 14,695
(1.19 %)		 17,959
(1.73 %)		 n/a 43.06
(99.89 %)		 85
(0.11 %)		 67
(100.00 %)		 3,529,920
(40.73 %)		 365,058
(1.57 %)		 9,712,608
(29.62 %)		 53,463
(1.75 %)
401 turtles (primary hap 2025)
GCA_052575445.1		 n/a 14,806
(1.06 %)		 19,069
(1.59 %)		 n/a 45.16
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,923,051
(46.22 %)		 376,799
(1.35 %)		 11,484,179
(34.72 %)		 77,209
(2.05 %)
402 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
403 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
404 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 refseq)
GCF_901001135.2		 56,619
(1.50 %)		 14,447
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 4,902
(99.36 %)		 7,642,637
(30.35 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,399,636
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
405 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
406 Tyrrhenian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965153285.1		 74,360
(6.29 %)		 14,315
(1.44 %)		 20,248
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 4,922,311
(49.66 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
407 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
408 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
409 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
410 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
411 warty newt (alternate hap 2024)
GCA_964204665.1		 n/a 7,653
(0.05 %)		 165,170
(1.80 %)		 n/a 45.74
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 179,793
(100.00 %)		 2,367,930
(1.81 %)		 4,993,795
(17.70 %)		 40,385,667
(52.18 %)		 1,135,490
(8.29 %)
412 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
413 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a alternate hap 2024)
GCA_040939495.1		 n/a 5,770
(0.02 %)		 51,747
(0.50 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 65,665
(100.00 %)		 8,636,983
(3.97 %)		 7,822,314
(7.96 %)		 97,649,351
(57.33 %)		 262,729
(0.56 %)
414 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
415 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
416 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
417 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
418 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 124,359
(2.87 %)
419 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 124,000
(2.80 %)
420 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
421 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
422 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
423 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
424 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
425 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
426 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
427 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCA_009769535.1		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,806
(1.93 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,274,580
(7.75 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,395,695
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
428 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
429 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
430 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
431 white-bellied softnose skate (Sanriku21f 2025)
GCF_053455715.1		 41,159
(3.03 %)		 11,907
(0.66 %)		 24,004
(1.82 %)		 n/a 44.94
(99.88 %)		 5,336
(0.12 %)		 3,942
(100.00 %)		 9,274,458
(62.02 %)		 1,451,144
(6.73 %)		 8,696,026
(55.50 %)		 191,431
(5.50 %)
432 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
433 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 37,965
(0.55 %)
434 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
435 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
436 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2025)
GCA_050000025.1		 n/a 14,891
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 2,747,806
(34.14 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
437 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2025)
GCA_050000005.1		 n/a 14,852
(1.27 %)		 19,245
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 73
(99.99 %)		 2,745,424
(34.17 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
438 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
439 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
440 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
441 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
442 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
443 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
TOTALS:total assembly count 443

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 619 assemblies assembly stats track stats
Mammals 879 assemblies assembly stats track stats
Birds 569 assemblies assembly stats track stats
Fishes 691 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 443 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1957 assemblies assembly stats track stats
Plants 448 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4129 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15067 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2732 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22466 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats