Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap1.1 2024)
GCF_964194415.1		 38,942
(3.52 %)		 13,890
(1.18 %)		 20,037
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,535
(99.99 %)		 3,498,446
(50.64 %)		 792,729
(6.25 %)		 7,621,218
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
5 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
6 Adriatic sturgeon (hap1 F7M8 2026)
GCA_055691345.2		 n/a 20,098
(1.33 %)		 37,942
(3.78 %)		 n/a 40.71
(99.97 %)		 2,714
(0.03 %)		 2,382
(100.00 %)		 4,085,077
(45.81 %)		 1,195,562
(15.56 %)		 8,443,108
(46.99 %)		 78,180
(4.69 %)
7 Adriatic sturgeon (hap2 F7M8 2026)
GCA_055691285.1		 n/a 20,124
(1.49 %)		 36,410
(4.04 %)		 n/a 40.53
(99.97 %)		 3,327
(0.04 %)		 5,697
(99.96 %)		 3,667,553
(45.24 %)		 1,048,673
(13.73 %)		 7,864,141
(44.81 %)		 69,458
(4.21 %)
8 Adriatic sturgeon (hap3 F7M8 2026)
GCA_055691255.1		 n/a 19,683
(1.55 %)		 35,408
(4.15 %)		 n/a 40.38
(99.96 %)		 3,793
(0.04 %)		 5,674
(99.96 %)		 3,521,733
(44.95 %)		 947,487
(11.83 %)		 7,840,137
(43.35 %)		 65,008
(3.89 %)
9 Adriatic sturgeon (hap4 F7M8 2026)
GCA_055691465.1		 n/a 22,119
(1.53 %)		 41,296
(4.20 %)		 n/a 40.48
(99.96 %)		 4,779
(0.04 %)		 8,217
(99.96 %)		 3,962,795
(44.66 %)		 1,085,414
(12.53 %)		 8,556,153
(43.56 %)		 72,066
(4.06 %)
10 Aegean wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964252035.1		 60,400
(5.15 %)		 13,944
(1.37 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 4,972,179
(51.37 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,007,850
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
11 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
12 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
13 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
14 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
15 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
16 African softshell turtle (2025)
GCA_977009205.1		 n/a 14,887
(1.00 %)		 20,847
(1.64 %)		 n/a 45.79
(102.82 %)		 67
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 4,127,877
(47.20 %)		 461,798
(1.96 %)		 11,464,440
(36.72 %)		 110,185
(3.36 %)
17 Aldabra giant tortoise (Hermania_blood 2022)
GCA_026122505.1		 n/a 14,963
(0.99 %)		 18,852
(1.52 %)		 n/a 44.33
(101.34 %)		 321
(0.01 %)		 777
(100.00 %)		 5,237,461
(54.70 %)		 394,170
(2.15 %)		 11,669,021
(34.40 %)		 62,996
(2.39 %)
18 alligator gar (hap1 2026 genbank)
GCA_055471065.1		 n/a 13,707
(1.53 %)		 23,913
(3.61 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 1,306,252
(35.92 %)		 239,317
(13.52 %)		 5,624,757
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
19 alligator gar (hap1 2026 refseq)
GCF_055471065.1		 45,013
(6.25 %)		 13,822
(1.56 %)		 24,806
(3.66 %)		 n/a 40.64
(101.40 %)		 64
(0.00 %)		 355
(100.00 %)		 1,495,191
(40.90 %)		 239,575
(13.49 %)		 5,624,730
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
20 alligator gar (hap2 2026)
GCA_055504755.1		 n/a 13,844
(1.62 %)		 23,436
(3.73 %)		 n/a 40.48
(102.64 %)		 81
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 1,286,170
(34.39 %)		 223,198
(11.10 %)		 5,672,865
(34.23 %)		 49,009
(3.64 %)
21 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
22 American alligator (hap1 2026)
GCA_057657785.1		 n/a 14,447
(0.97 %)		 18,772
(1.45 %)		 n/a 45.07
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,387,982
(42.95 %)		 644,426
(2.34 %)		 12,507,993
(32.71 %)		 49,984
(3.01 %)
23 American alligator (hap2 2026)
GCA_057657805.1		 n/a 14,449
(0.98 %)		 18,986
(1.47 %)		 n/a 44.99
(100.00 %)		 139
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 3,389,572
(43.14 %)		 480,395
(1.63 %)		 12,514,775
(32.21 %)		 50,383
(2.34 %)
24 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
25 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 429,691
(2.65 %)
26 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
27 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
28 Amur rat snake (ZZ-2025 2025)
GCA_050231175.1		 n/a 13,403
(1.16 %)		 19,972
(2.10 %)		 n/a 40.32
(101.28 %)		 464
(0.01 %)		 602
(100.00 %)		 5,217,222
(55.62 %)		 936,557
(7.39 %)		 7,976,736
(44.95 %)		 77,945
(2.78 %)
29 Andalusian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965113315.1		 64,111
(5.17 %)		 14,387
(1.31 %)		 20,338
(2.18 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 5,139,265
(54.13 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
30 angelshark (IRGN 9GIWDBWNYT 2023)
GCA_031763465.1		 n/a 5,514
(0.36 %)		 13,241
(0.85 %)		 n/a 44.21
(86.22 %)		 226,036
(13.68 %)		 1,378,695
(86.32 %)		 204,591
(1.55 %)		 649,587
(7.45 %)		 7,948,984
(32.06 %)		 83,350
(2.20 %)
31 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 172,876
(42.56 %)
32 Argentine snake-necked turtle (alternate hap 2025)
GCA_049999975.1		 n/a 14,806
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 3,247,149
(41.23 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
33 Argentine snake-necked turtle (primary hap 2025)
GCA_049999965.1		 n/a 14,773
(1.27 %)		 19,240
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 40
(100.00 %)		 3,245,307
(41.27 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
34 Asian narrow-headed softshell turtle (alternate hap 2025)
GCA_052575425.1		 n/a 449
(0.60 %)		 896
(1.17 %)		 n/a 44.87
(100.00 %)		 n/a 940
(100.00 %)		 181,438
(48.98 %)		 15,458
(1.40 %)		 479,760
(25.10 %)		 3,011
(2.57 %)
35 Asian narrow-headed softshell turtle (primary hap 2025)
GCA_052575445.1		 n/a 14,806
(1.06 %)		 19,069
(1.59 %)		 n/a 45.16
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,923,051
(46.22 %)		 376,799
(1.35 %)		 11,484,179
(34.72 %)		 77,209
(2.05 %)
36 Asian spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_060175755.1		 n/a 13,691
(0.76 %)		 26,981
(1.84 %)		 n/a 41.25
(102.77 %)		 519
(0.00 %)		 183
(100.00 %)		 4,957,171
(42.46 %)		 1,021,404
(10.29 %)		 11,309,051
(52.32 %)		 218,366
(4.93 %)
37 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
38 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
39 Atlantic hagfish (alternate hap 2024)
GCA_964187825.1		 n/a 6,253
(0.19 %)		 56,915
(3.08 %)		 n/a 44.52
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 24,878
(100.00 %)		 1,607,558
(3.68 %)		 2,446,041
(23.93 %)		 7,370,810
(72.27 %)		 307,758
(13.12 %)
40 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
41 Atlantic hagfish (primary hap 2024 genbank)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
42 Atlantic hagfish (primary hap 2024 refseq)
GCF_964187855.1		 47,605
(1.95 %)		 6,660
(0.20 %)		 45,489
(2.63 %)		 n/a 44.25
(100.59 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,003
(100.00 %)		 1,712,039
(3.61 %)		 2,644,653
(27.70 %)		 7,619,436
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
43 Atlantic ridley (hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
44 Atlantic ridley (hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
45 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
46 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
47 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
48 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
49 axolotl (Mex_15411 2024 refseq)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
50 barred grass snake (hap1.1 2024)
GCF_964273705.1		 43,483
(3.75 %)		 13,680
(1.11 %)		 19,683
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 487
(100.00 %)		 4,187,944
(53.38 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,184
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
51 basking shark (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
52 basking shark (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964194155.1		 49,591
(1.78 %)		 13,754
(0.41 %)		 22,698
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,087
(100.00 %)		 6,782,578
(65.71 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,697,546
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
53 basking shark (hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
54 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
55 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
56 big-headed turtle (DO16091913 2018)
GCA_003942145.1		 n/a 15,845
(1.05 %)		 56,185
(2.12 %)		 n/a 44.63
(100.70 %)		 109,876
(1.58 %)		 469,569
(98.42 %)		 4,392,283
(44.70 %)		 468,071
(2.04 %)		 12,128,150
(32.03 %)		 156,196
(2.96 %)
57 big-headed turtle (hap1 2026)
GCA_057946115.1		 n/a 14,847
(1.07 %)		 19,128
(1.60 %)		 n/a 44.63
(102.82 %)		 187
(0.00 %)		 114
(100.00 %)		 4,043,109
(46.63 %)		 482,481
(2.68 %)		 10,707,787
(34.65 %)		 112,432
(2.96 %)
58 big-headed turtle (hap2 2026)
GCA_057946265.1		 n/a 14,614
(1.05 %)		 18,669
(1.58 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 81
(100.00 %)		 4,114,841
(46.68 %)		 464,722
(2.78 %)		 10,645,107
(34.66 %)		 110,978
(2.80 %)
59 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
60 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
61 blonde ray (alternate hap 2023)
GCA_963513955.1		 n/a 11,554
(0.52 %)		 31,983
(1.58 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 n/a 10,683
(100.00 %)		 8,320,120
(69.63 %)		 991,438
(7.00 %)		 11,337,728
(57.98 %)		 262,962
(6.35 %)
62 blonde ray (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
63 blonde ray (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514005.1		 40,007
(2.48 %)		 11,887
(0.54 %)		 27,557
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,646
(100.00 %)		 8,552,615
(70.14 %)		 1,061,810
(8.11 %)		 11,598,911
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
64 blue shark (ZQ-2024 2024)
GCA_037974335.1		 n/a 12,361
(0.47 %)		 16,843
(1.10 %)		 n/a 44.21
(102.82 %)		 1,665
(0.01 %)		 239
(100.00 %)		 10,050,117
(67.49 %)		 704,409
(8.57 %)		 13,466,755
(51.04 %)		 31,682
(0.79 %)
65 Bocage's wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964188305.1		 64,048
(5.17 %)		 14,155
(1.28 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 507
(100.00 %)		 5,192,766
(54.55 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,204
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
66 Boie's wart frog (hap1 2025)
GCA_054083975.1		 n/a 15,085
(0.57 %)		 28,221
(1.65 %)		 n/a 40.37
(102.96 %)		 1,684
(0.01 %)		 628
(100.00 %)		 10,732,399
(63.17 %)		 3,007,479
(16.48 %)		 16,720,184
(55.88 %)		 121,575
(2.15 %)
67 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 734,430
(7.27 %)
68 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
69 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
70 brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
71 brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
72 brown hagfish (PATA_SCHIZ_1 2024)
GCA_035128595.1		 n/a 6,299
(0.25 %)		 35,377
(2.04 %)		 n/a 43.49
(94.65 %)		 706,165
(5.46 %)		 64,533
(99.47 %)		 1,452,558
(4.27 %)		 1,950,334
(8.89 %)		 14,106,206
(47.44 %)		 224,843
(9.74 %)
73 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
74 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
75 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
76 Burmese glass lizard (XH-2025 2025)
GCA_052054735.1		 n/a 12,007
(1.18 %)		 14,792
(1.79 %)		 n/a 43.48
(102.80 %)		 197
(0.00 %)		 216
(100.00 %)		 4,976,090
(46.37 %)		 581,958
(2.32 %)		 8,298,388
(37.65 %)		 55,992
(1.89 %)
77 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
78 Burmese python (LINGU-HERP-01145 2026)
GCF_059951505.1		 48,810
(5.84 %)		 13,612
(1.41 %)		 17,903
(2.18 %)		 n/a 39.97
(102.95 %)		 n/a 99
(100.00 %)		 2,449,858
(34.22 %)		 385,031
(1.62 %)		 7,891,658
(28.18 %)		 34,600
(2.09 %)
79 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
80 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
81 Cantor's giant softshell turtle (Pc-202001 2023)
GCA_032595735.1		 n/a 14,677
(1.06 %)		 19,347
(1.63 %)		 n/a 45.29
(102.86 %)		 490
(0.00 %)		 64
(100.00 %)		 3,813,370
(46.07 %)		 429,148
(1.86 %)		 11,121,808
(34.71 %)		 88,607
(2.50 %)
82 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap1 2025)
GCA_047715975.2		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,926
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,492,668
(30.18 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
83 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap2 2025)
GCA_047715955.2		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,934
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 3,500,548
(30.07 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
84 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
85 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
86 Carpathian newt (aLisMon1.hap1.1 2026)
GCA_988324385.1		 n/a 16,438
(0.08 %)		 243,084
(1.73 %)		 n/a 45.05
(102.80 %)		 3,972
(0.00 %)		 3,355
(100.00 %)		 5,109,099
(1.64 %)		 10,970,146
(13.59 %)		 102,583,082
(47.52 %)		 2,668,298
(7.75 %)
87 Catalonian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965112155.1		 76,765
(6.15 %)		 14,333
(1.34 %)		 20,157
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 5,086,552
(52.93 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,595
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
88 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 genbank)
GCA_051106095.1		 n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
89 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 refseq)
GCF_051106095.1		 67,761
(7.72 %)		 13,968
(1.18 %)		 17,955
(1.90 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 3,462,868
(44.39 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,488
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
90 central bearded dragon (v1 2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
91 central bearded dragon (v2 2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
92 Chile mountains false toad (hap1 2026)
GCA_060712405.1		 n/a 14,336
(0.42 %)		 27,367
(1.07 %)		 n/a 43.15
(102.75 %)		 2,470
(0.01 %)		 823
(100.00 %)		 9,080,556
(47.42 %)		 3,920,854
(20.34 %)		 16,577,137
(63.23 %)		 220,660
(2.16 %)
93 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
94 Chinese brown frog (zglwZSY 2025)
GCA_052815355.1		 n/a 13,643
(0.44 %)		 39,928
(1.70 %)		 n/a 44.25
(102.81 %)		 3,210
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 13,451,071
(77.45 %)		 3,070,971
(9.70 %)		 20,121,233
(55.92 %)		 636,593
(6.80 %)
95 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
96 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
97 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 142,416
(4.34 %)
98 Chinese spiny frog (XW024 2026)
GCA_060123405.1		 n/a 13,786
(0.69 %)		 28,595
(2.10 %)		 n/a 43.64
(102.81 %)		 133
(0.00 %)		 484
(100.00 %)		 7,531,898
(59.95 %)		 1,596,340
(9.70 %)		 13,411,867
(49.25 %)		 434,135
(6.96 %)
99 Chinese sturgeon (BW-2024a 2025)
GCA_052858605.1		 n/a 21,593
(1.40 %)		 36,225
(3.72 %)		 n/a 40.75
(102.72 %)		 3,123
(0.08 %)		 324
(100.00 %)		 4,017,350
(48.28 %)		 1,172,606
(10.24 %)		 9,455,668
(44.92 %)		 88,265
(3.48 %)
100 Chuanan short-legged toad (LJT-LAB2023082_n 2026)
GCA_056747305.1		 n/a 14,111
(0.67 %)		 34,005
(1.97 %)		 n/a 42.53
(102.74 %)		 508
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 6,882,885
(44.58 %)		 2,027,522
(9.24 %)		 10,862,153
(56.66 %)		 379,664
(8.44 %)
101 cliff chirping frog (hap1 2026)
GCA_055470875.1		 n/a 14,195
(0.41 %)		 37,646
(1.41 %)		 n/a 44.76
(102.71 %)		 1,094
(0.00 %)		 1,175
(100.00 %)		 8,999,851
(42.06 %)		 2,656,367
(21.89 %)		 19,256,217
(59.70 %)		 564,413
(7.00 %)
102 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
103 Cochin Forest cane turtle (hap1 2026)
GCA_060712455.1		 n/a 14,910
(1.02 %)		 18,757
(1.53 %)		 n/a 45.04
(102.84 %)		 394
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 4,892,633
(53.58 %)		 444,811
(4.35 %)		 10,374,622
(36.24 %)		 118,141
(3.29 %)
104 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
105 coelacanth (alternate hap 2024)
GCA_037215105.1		 n/a 6,557
(0.42 %)		 33,169
(3.43 %)		 n/a 42.50
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 34,012
(100.00 %)		 3,932,420
(65.13 %)		 507,198
(3.35 %)		 6,831,314
(53.31 %)		 66,510
(2.53 %)
106 coelacanth (primary hap 2024 genbank)
GCA_037176945.1		 n/a 14,050
(0.65 %)		 28,429
(2.77 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 8,627,529
(65.90 %)		 1,047,268
(3.01 %)		 15,613,476
(54.44 %)		 140,027
(2.34 %)
107 coelacanth (primary hap 2024 refseq)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
108 collared eel (2026)
GCA_978019975.1		 n/a 16,771
(1.95 %)		 29,104
(4.65 %)		 n/a 42.54
(102.83 %)		 91
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 2,469,340
(30.58 %)		 621,719
(7.65 %)		 6,463,607
(28.25 %)		 90,015
(4.18 %)
109 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
110 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
111 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
112 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
113 common eastern froglet (primary hap 2026)
GCF_055691185.1		 75,766
(2.52 %)		 14,208
(0.61 %)		 40,998
(2.50 %)		 n/a 44.69
(99.99 %)		 1,804
(0.01 %)		 872
(100.00 %)		 4,569,042
(21.79 %)		 2,371,776
(18.54 %)		 14,121,769
(49.79 %)		 487,488
(7.45 %)
114 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
115 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
116 common garter snake (CBP01778 primary hap 2026)
GCF_051295495.1		 40,365
(3.93 %)		 13,418
(1.20 %)		 18,876
(1.98 %)		 n/a 40.95
(102.84 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,301
(99.99 %)		 4,133,759
(49.65 %)		 1,003,323
(6.06 %)		 8,348,747
(43.87 %)		 79,401
(2.49 %)
117 Common green iguana (ATCC CCL-108 2025)
GCA_051529865.1		 n/a 14,162
(1.04 %)		 17,621
(1.64 %)		 n/a 41.58
(101.52 %)		 986
(0.00 %)		 1,262
(100.00 %)		 5,634,207
(50.82 %)		 425,187
(1.11 %)		 12,007,522
(32.62 %)		 60,423
(2.35 %)
118 common lizard (alternate hap 2023)
GCA_963506595.1		 n/a 12,464
(1.37 %)		 21,834
(2.42 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 n/a 8,057
(100.00 %)		 3,484,058
(44.97 %)		 434,014
(3.31 %)		 6,610,967
(35.30 %)		 78,299
(2.87 %)
119 common lizard (primary hap 2023)
GCA_963506605.1		 n/a 14,281
(1.46 %)		 19,707
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 49
(100.00 %)		 4,263,449
(45.66 %)		 513,321
(3.73 %)		 7,172,746
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
120 common lizard (rZooViv2.hap1.1 2025)
GCF_965207765.1		 62,004
(5.68 %)		 14,208
(1.47 %)		 19,329
(2.35 %)		 n/a 43.99
(102.81 %)		 108
(0.00 %)		 168
(100.00 %)		 4,113,258
(45.15 %)		 507,231
(3.64 %)		 7,206,360
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
121 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
122 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
123 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
124 common musk turtle (alternate hap 2023)
GCA_032164215.1		 n/a 14,229
(1.29 %)		 18,555
(1.90 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,120
(99.99 %)		 3,408,527
(40.89 %)		 590,538
(3.26 %)		 8,678,744
(30.12 %)		 118,052
(4.00 %)
125 common newt (v1 alternate hap 2024)
GCA_964261385.1		 n/a 14,340
(0.07 %)		 256,786
(1.73 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
126 common newt (v1 primary hap 2024 genbank)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
127 common newt (v2 alternate hap 2026)
GCA_964261385.2		 n/a 14,340
(0.07 %)		 258,898
(1.73 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
128 common newt (v2 primary hap 2026 refseq)
GCF_964263255.1		 64,379
(0.42 %)		 16,999
(0.08 %)		 229,922
(1.61 %)		 n/a 45.02
(101.29 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,248
(100.00 %)		 4,839,266
(1.50 %)		 10,251,753
(12.52 %)		 101,183,555
(47.58 %)		 2,684,759
(7.99 %)
129 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
130 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
131 common stingray (2026)
GCA_987106705.1		 n/a 12,606
(0.38 %)		 26,958
(1.17 %)		 n/a 43.42
(102.68 %)		 1,662
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 10,190,334
(68.59 %)		 952,015
(14.78 %)		 20,089,208
(55.29 %)		 115,829
(2.54 %)
132 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
133 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
134 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
135 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
136 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
137 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
138 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
139 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
140 corn snake (Tessera 2026)
GCF_059756535.1		 66,038
(5.11 %)		 13,487
(1.17 %)		 19,751
(2.09 %)		 n/a 40.40
(102.83 %)		 17
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 4,151,293
(51.01 %)		 940,976
(5.64 %)		 8,412,021
(43.55 %)		 66,782
(2.36 %)
141 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
142 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
143 Couch's spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054954225.1		 n/a 13,528
(1.90 %)		 19,914
(3.61 %)		 n/a 39.98
(98.72 %)		 605
(1.28 %)		 578
(100.00 %)		 2,481,494
(34.56 %)		 623,950
(10.48 %)		 5,737,146
(34.46 %)		 42,554
(2.79 %)
144 Couch's spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054954145.1		 n/a 13,481
(1.82 %)		 21,941
(3.80 %)		 n/a 39.97
(99.23 %)		 620
(0.77 %)		 494
(100.00 %)		 2,625,418
(35.92 %)		 713,292
(13.02 %)		 5,588,085
(36.90 %)		 42,871
(2.71 %)
145 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
146 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
147 Cretan wall lizard (primary hap 2023 genbank)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
148 Cretan wall lizard (primary hap 2023 refseq)
GCF_951804945.1		 62,110
(5.47 %)		 14,322
(1.40 %)		 19,303
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,986,518
(46.26 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,353
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
149 cuckoo ray (2025)
GCA_965643135.1		 n/a 11,948
(0.63 %)		 26,240
(1.77 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 2,173
(0.01 %)		 1,503
(100.00 %)		 9,829,377
(67.19 %)		 1,120,890
(8.92 %)		 10,135,837
(56.08 %)		 194,688
(3.92 %)
150 Dalmatian wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964234715.1		 61,269
(4.93 %)		 14,329
(1.34 %)		 20,474
(2.25 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 386
(100.00 %)		 4,958,256
(53.05 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,837,755
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
151 dark-spotted frog (GW-2025 2026)
GCA_054643415.1		 n/a 14,566
(0.39 %)		 36,959
(1.46 %)		 n/a 43.13
(102.67 %)		 844
(0.01 %)		 180
(100.00 %)		 2,578,722
(2.62 %)		 3,612,303
(10.79 %)		 23,708,206
(55.67 %)		 351,395
(2.26 %)
152 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
153 Darwin's frog (hap2 2025)
GCA_050947465.1		 n/a 13,442
(0.54 %)		 32,134
(1.61 %)		 n/a 42.92
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 10,591,581
(59.76 %)		 2,041,017
(15.35 %)		 13,574,848
(62.16 %)		 428,658
(6.43 %)
154 Delalande's beaked blind snake (hap1 2026)
GCA_057127545.1		 n/a 13,330
(1.11 %)		 17,807
(1.86 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 642
(0.01 %)		 125
(100.00 %)		 4,372,440
(36.86 %)		 631,618
(2.38 %)		 8,665,237
(37.98 %)		 70,554
(2.23 %)
155 Delalande's beaked blind snake (hap2 2026)
GCA_057127535.1		 n/a 13,373
(1.12 %)		 17,783
(1.85 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 624
(0.01 %)		 111
(100.00 %)		 4,361,437
(36.83 %)		 631,970
(2.38 %)		 8,688,526
(38.15 %)		 70,030
(2.21 %)
156 desert lancehead (hap1 2026)
GCA_058248175.2		 n/a 15,061
(1.16 %)		 20,290
(1.86 %)		 n/a 40.66
(102.78 %)		 393
(0.00 %)		 205
(100.00 %)		 3,578,028
(54.47 %)		 933,805
(10.67 %)		 7,669,382
(47.52 %)		 91,099
(2.76 %)
157 Desirade skink (SBH274697 2026)
GCA_056883445.1		 n/a 13,792
(1.46 %)		 16,081
(2.16 %)		 n/a 43.42
(102.86 %)		 10,927,641
(0.82 %)		 21
(100.00 %)		 2,979,158
(25.91 %)		 348,872
(2.21 %)		 8,348,203
(31.66 %)		 17,700
(0.68 %)
158 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 606,993
(6.09 %)
159 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
160 diamondback terrapin (hap2 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
161 duckbill oceanic eel (2026)
GCA_987430295.1		 n/a 18,348
(0.97 %)		 58,748
(4.23 %)		 n/a 43.11
(102.85 %)		 301
(0.00 %)		 152
(100.00 %)		 6,695,343
(51.23 %)		 1,348,923
(14.73 %)		 8,982,328
(52.54 %)		 198,946
(5.68 %)
162 dusky salamander (AMNH A-194068-9 2025)
GCA_050004315.1		 n/a 18,675
(0.12 %)		 122,637
(1.35 %)		 n/a 46.83
(100.73 %)		 4,269
(0.00 %)		 15,418
(100.00 %)		 4,404,135
(1.56 %)		 5,531,798
(5.54 %)		 57,222,162
(57.82 %)		 2,045,970
(7.25 %)
163 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
164 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
165 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
166 eastern brown snake (UNSWEBS1 2025)
GCF_049901715.1		 52,863
(4.64 %)		 13,261
(1.30 %)		 17,510
(1.96 %)		 n/a 39.70
(101.39 %)		 1,177
(0.01 %)		 556
(100.00 %)		 2,901,288
(46.79 %)		 660,540
(3.18 %)		 7,879,564
(40.28 %)		 47,496
(2.07 %)
167 eastern musk turtle (MuskTurtle02 alternate hap 2026)
GCA_032164215.2		 n/a 13,592
(1.23 %)		 18,011
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 769
(99.99 %)		 3,417,560
(41.81 %)		 621,567
(3.54 %)		 8,327,641
(30.43 %)		 117,733
(4.04 %)
168 Eastern musk turtle (MuskTurtle02 primary hap 2026)
GCA_032164245.2		 n/a 14,208
(1.29 %)		 18,423
(1.89 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,079
(0.01 %)		 74
(100.00 %)		 3,408,591
(40.89 %)		 590,719
(3.26 %)		 8,678,800
(30.12 %)		 118,053
(4.00 %)
169 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
170 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
171 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
172 Eastern racer (BlueRacer01 primary hap 2024)
GCA_038048745.1		 n/a 14,465
(1.14 %)		 21,583
(2.08 %)		 n/a 40.41
(102.70 %)		 826
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 5,794,853
(55.93 %)		 1,032,854
(6.39 %)		 9,554,466
(43.47 %)		 51,856
(2.08 %)
173 Eaton's skate (JK-2026 2026)
GCA_061597785.1		 n/a 11,626
(0.67 %)		 24,078
(1.78 %)		 n/a 44.39
(100.03 %)		 3,081
(0.13 %)		 3,731
(100.00 %)		 9,594,624
(63.01 %)		 1,018,967
(4.27 %)		 8,710,360
(53.54 %)		 184,624
(4.86 %)
174 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
175 elongated tortoise (hap1 2025)
GCA_050000095.2		 n/a 14,769
(1.01 %)		 18,561
(1.53 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 169
(0.00 %)		 207
(100.00 %)		 5,015,434
(53.77 %)		 367,754
(2.17 %)		 10,980,259
(34.90 %)		 82,369
(2.28 %)
176 elongated tortoise (hap2 2025)
GCA_050000115.1		 n/a 14,858
(1.00 %)		 18,820
(1.51 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 586
(100.00 %)		 5,006,492
(53.37 %)		 397,554
(3.24 %)		 10,915,197
(35.50 %)		 82,579
(2.28 %)
177 Emei moustache toad (SX-2025 2025)
GCA_054131545.1		 n/a 13,782
(0.57 %)		 40,311
(2.03 %)		 n/a 43.92
(100.00 %)		 1,479
(0.00 %)		 1,492
(100.00 %)		 9,232,515
(76.18 %)		 2,040,137
(11.03 %)		 12,972,928
(60.26 %)		 511,382
(8.34 %)
178 epaulette shark (alternate hap 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
179 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
180 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 genbank)
GCA_964252035.2		 n/a 13,941
(1.37 %)		 19,666
(2.30 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,971,098
(51.39 %)		 526,603
(3.30 %)		 7,004,419
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
181 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 refseq)
GCF_964252035.2		 60,399
(5.16 %)		 13,941
(1.37 %)		 19,667
(2.30 %)		 n/a 43.79
(101.43 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,771,967
(51.33 %)		 526,687
(3.30 %)		 7,004,420
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
182 Erhard's wall lizard (hap2.2 2026)
GCA_964251985.2		 n/a 13,878
(1.40 %)		 20,097
(2.41 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,202
(99.99 %)		 4,873,253
(50.27 %)		 516,963
(3.38 %)		 6,833,738
(37.92 %)		 87,923
(2.92 %)
183 European brook lamprey (2025)
GCF_965212315.1		 37,400
(7.69 %)		 8,181
(0.85 %)		 37,330
(4.57 %)		 n/a 48.46
(99.98 %)		 873
(0.02 %)		 3,066
(99.98 %)		 3,708,295
(61.62 %)		 873,872
(14.29 %)		 4,763,033
(46.24 %)		 139,528
(43.10 %)
184 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
185 European conger (alternate hap 2023)
GCA_963514125.1		 n/a 16,952
(1.95 %)		 37,050
(5.24 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 n/a 3,769
(100.00 %)		 2,413,696
(36.12 %)		 866,233
(11.37 %)		 5,685,752
(33.48 %)		 112,201
(5.57 %)
186 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
187 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
188 European green toad (Lasithi_1F 2023)
GCA_033119425.1		 n/a 13,962
(0.52 %)		 37,931
(1.72 %)		 n/a 43.01
(99.70 %)		 5,177
(0.54 %)		 13,319
(100.00 %)		 11,279,683
(76.62 %)		 2,004,029
(15.42 %)		 16,764,590
(57.18 %)		 311,721
(3.22 %)
189 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
190 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
191 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
192 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
193 European pond turtle (hap2 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
194 European river lamprey (alternate hap 2024)
GCA_964198585.1		 n/a 7,082
(0.70 %)		 37,019
(4.34 %)		 n/a 49.03
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 5,726
(100.00 %)		 3,762,664
(64.70 %)		 1,005,839
(17.80 %)		 4,592,233
(49.09 %)		 153,841
(41.42 %)
195 European river lamprey (primary hap 2024 genbank)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
196 European river lamprey (primary hap 2024 refseq)
GCF_964198595.1		 36,555
(6.20 %)		 7,604
(0.70 %)		 36,803
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,496
(100.00 %)		 4,068,759
(65.84 %)		 1,165,417
(20.23 %)		 4,931,505
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
197 Far Eastern brook lamprey (v1 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
198 Far Eastern brook lamprey (v2 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.2		 37,933
(7.32 %)		 7,858
(0.72 %)		 39,278
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,945
(100.00 %)		 4,065,593
(61.75 %)		 1,192,260
(15.54 %)		 5,304,096
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
199 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
200 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
201 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964270895.1		 74,789
(6.22 %)		 14,358
(1.40 %)		 20,324
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 4,963,872
(50.70 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,009,851
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
202 Filfola wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
203 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
204 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
205 flapper skate (hap1.1 2026)
GCA_983203515.1		 n/a 12,020
(0.45 %)		 32,606
(1.57 %)		 n/a 44.80
(100.53 %)		 4,961
(0.02 %)		 3,667
(100.00 %)		 11,646,386
(74.12 %)		 2,050,507
(10.64 %)		 12,597,039
(62.58 %)		 337,808
(5.43 %)
206 flapper skate (hap2.1 2026)
GCA_983203605.1		 n/a 11,699
(0.49 %)		 29,667
(1.60 %)		 n/a 44.55
(99.99 %)		 4,331
(0.02 %)		 2,143
(100.00 %)		 10,758,595
(73.15 %)		 1,664,028
(8.60 %)		 11,722,103
(60.48 %)		 299,094
(5.16 %)
207 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
208 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
209 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
210 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
211 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
212 Florida worm lizard (hap1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
213 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
214 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
215 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
216 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
217 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
218 frog Boulenophrys sangzhiensis (2026)
GCA_056363575.1		 n/a 13,941
(0.70 %)		 42,804
(2.71 %)		 n/a 42.98
(102.85 %)		 330
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 6,689,190
(42.81 %)		 1,772,764
(10.83 %)		 11,474,724
(52.48 %)		 401,675
(10.89 %)
219 frog Ptychadena robeensis (15-139 2024)
GCA_036250615.1		 n/a 12,285
(1.02 %)		 24,703
(2.37 %)		 n/a 40.07
(100.00 %)		 212,285
(1.24 %)		 35,197
(99.94 %)		 2,477,675
(19.18 %)		 504,143
(3.43 %)		 9,642,619
(38.74 %)		 159,886
(3.90 %)
220 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
221 Gaboon caecilian (primary hap 2021)
GCF_902459505.2		 54,715
(1.72 %)		 14,269
(0.52 %)		 29,024
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 596
(99.85 %)		 11,725,554
(74.57 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,602
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
222 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
223 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
224 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
225 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
226 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
227 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
228 giant moray (Gymjav_1 2023)
GCA_029692085.1		 n/a 15,797
(0.94 %)		 41,248
(3.45 %)		 n/a 41.23
(101.36 %)		 823
(0.00 %)		 519
(100.00 %)		 5,215,352
(62.84 %)		 839,163
(6.77 %)		 10,111,295
(41.61 %)		 93,534
(1.75 %)
229 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
230 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
231 Gila monster (Gila_16-S 2026)
GCF_057233095.1		 66,395
(3.96 %)		 14,385
(0.86 %)		 17,870
(1.34 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 6,454,936
(49.83 %)		 703,981
(7.97 %)		 11,888,999
(48.87 %)		 165,685
(5.15 %)
232 gold dust stingray (hap1 2026)
GCA_055471165.1		 n/a 12,763
(0.32 %)		 26,283
(0.98 %)		 n/a 41.62
(102.78 %)		 1,114
(0.00 %)		 1,101
(100.00 %)		 10,563,952
(74.49 %)		 946,334
(14.98 %)		 22,595,289
(58.96 %)		 74,808
(0.84 %)
233 golden lancehead (SB1851 2026)
GCA_055824665.1		 n/a 14,798
(1.29 %)		 18,919
(1.98 %)		 n/a 40.44
(102.76 %)		 589
(0.01 %)		 117
(100.00 %)		 3,439,320
(49.41 %)		 811,986
(5.35 %)		 7,552,500
(42.55 %)		 84,249
(2.80 %)
234 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
235 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
236 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
237 goldentail moray (2026)
GCA_987191265.1		 n/a 15,751
(0.97 %)		 40,333
(3.49 %)		 n/a 41.72
(102.85 %)		 76
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 5,191,739
(59.75 %)		 765,480
(6.84 %)		 9,935,402
(42.21 %)		 116,467
(2.57 %)
238 goldspotted eel (2025)
GCA_975146105.1		 n/a 16,879
(1.43 %)		 38,748
(4.22 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,198,550
(33.91 %)		 741,217
(8.84 %)		 7,140,094
(39.50 %)		 136,266
(4.25 %)
239 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
240 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
241 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan lineage primary hap 2019)
GCA_007399415.1		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,597
(1.55 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,268
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
242 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
243 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
244 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
245 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
246 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
247 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
248 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
249 great white shark (primary hap 2021 genbank)
GCA_017639515.1		 n/a 13,511
(0.38 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 7,178,936
(64.10 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,189
(52.42 %)		 77,057
(2.22 %)
250 great white shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
251 greater Saint Croix skink (242174 2026)
GCA_056884235.1		 n/a 13,823
(1.46 %)		 16,298
(2.20 %)		 n/a 43.52
(102.78 %)		 4,933,696
(0.36 %)		 49
(100.00 %)		 2,996,625
(25.96 %)		 369,536
(2.25 %)		 7,783,359
(32.72 %)		 18,675
(0.71 %)
252 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
253 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
254 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
255 green sea turtle (primary hap 2021)
GCA_015237465.2		 n/a 15,016
(1.11 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 92
(100.00 %)		 3,631,238
(44.71 %)		 304,302
(1.25 %)		 11,135,013
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
256 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
257 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
258 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 genbank)
GCA_052327205.1		 n/a 13,229
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 4,461
(99.98 %)		 1,160,458
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,819
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
259 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 refseq)
GCF_052327205.1		 60,259
(1.57 %)		 13,227
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 2,111
(100.00 %)		 1,160,455
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,792
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
260 grey reef shark (hapA 2025)
GCF_965287045.1		 42,414
(2.31 %)		 13,005
(0.55 %)		 18,669
(1.27 %)		 n/a 43.98
(100.00 %)		 883
(0.00 %)		 1,521
(100.00 %)		 7,459,423
(58.87 %)		 658,213
(6.81 %)		 13,646,347
(46.40 %)		 36,259
(1.07 %)
261 grey reef shark (hapB 2025)
GCA_965295155.1		 n/a 12,988
(0.54 %)		 18,753
(1.27 %)		 n/a 44.00
(100.00 %)		 876
(0.00 %)		 2,410
(100.00 %)		 7,462,980
(58.92 %)		 660,217
(6.95 %)		 13,645,872
(46.47 %)		 36,662
(1.11 %)
262 hagfishes (Nan-Hai 2024)
GCA_041222605.1		 n/a 6,399
(0.33 %)		 35,228
(3.60 %)		 n/a 43.58
(101.45 %)		 2,308
(0.06 %)		 1,374
(100.00 %)		 1,393,396
(5.78 %)		 1,570,804
(12.54 %)		 7,379,144
(61.34 %)		 159,618
(13.48 %)
263 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
264 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
265 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
266 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
267 hellbender (hap1 2026)
GCA_060551615.1		 n/a 16,634
(0.04 %)		 215,099
(0.73 %)		 n/a 49.06
(101.33 %)		 24,119
(0.00 %)		 15,812
(100.00 %)		 42,614,233
(21.00 %)		 82,063,457
(21.73 %)		 159,296,257
(65.08 %)		 2,185,612
(3.11 %)
268 hickatee (hap1 2025)
GCA_054099655.1		 n/a 14,920
(1.21 %)		 18,649
(1.75 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 3,220,305
(41.80 %)		 325,597
(8.20 %)		 9,635,325
(31.95 %)		 49,601
(1.77 %)
269 hickatee (hap2 2025)
GCA_054099715.1		 n/a 14,893
(1.22 %)		 18,699
(1.80 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 137
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 3,212,991
(39.89 %)		 328,796
(6.89 %)		 9,501,793
(30.78 %)		 49,575
(1.79 %)
270 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
271 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
272 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
273 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
274 horseshoe snake (2026)
GCA_985781035.1		 n/a 13,810
(1.08 %)		 20,659
(1.97 %)		 n/a 41.18
(102.81 %)		 19
(0.00 %)		 56
(100.00 %)		 5,766,580
(57.35 %)		 1,131,744
(6.79 %)		 8,821,737
(46.23 %)		 122,065
(3.68 %)
275 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
276 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
277 Hubei keelback (MD-2024a 2024)
GCA_039707465.1		 n/a 13,612
(1.02 %)		 20,507
(1.76 %)		 n/a 42.16
(102.76 %)		 344
(0.00 %)		 405
(100.00 %)		 6,075,226
(57.03 %)		 1,343,329
(9.69 %)		 8,377,822
(51.25 %)		 186,520
(6.03 %)
278 Hungarian meadow viper (primary hap 2022)
GCF_947247035.1		 36,135
(3.46 %)		 13,432
(1.20 %)		 18,654
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 3,633,666
(50.97 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,427,621
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
279 Iberian parsley frog (primary hap 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
280 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
281 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
282 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 genbank)
GCA_964106645.3		 n/a 14,358
(1.39 %)		 20,037
(2.30 %)		 n/a 43.97
(99.98 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,977,258
(51.04 %)		 473,070
(2.71 %)		 7,060,127
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
283 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 refseq)
GCF_964106645.2		 68,228
(5.99 %)		 14,361
(1.39 %)		 20,038
(2.30 %)		 n/a 43.95
(101.31 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,780,857
(50.99 %)		 473,079
(2.71 %)		 7,060,124
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
284 Ibiza wall lizard (hap2.3 2026)
GCA_964106635.3		 n/a 13,838
(1.44 %)		 19,052
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,541
(99.98 %)		 4,712,744
(49.63 %)		 440,320
(2.30 %)		 6,773,549
(37.14 %)		 89,220
(3.03 %)
285 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
286 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
287 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
288 Indian short-finned eel (HC-2024 2024)
GCA_039654925.2		 n/a 17,289
(2.02 %)		 35,147
(5.16 %)		 n/a 43.49
(102.77 %)		 375
(0.00 %)		 30
(100.00 %)		 2,208,920
(36.76 %)		 851,437
(12.74 %)		 5,658,115
(32.66 %)		 127,654
(7.35 %)
289 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
290 Indo-Pacific tarpon (primary hap 2020)
GCA_013368585.1		 n/a 18,305
(2.47 %)		 29,764
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,530
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,961
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
291 inshore hagfish (2023)
GCA_900186335.3		 n/a 6,137
(0.40 %)		 23,364
(2.60 %)		 n/a 46.68
(54.88 %)		 332,729
(45.17 %)		 342,008
(54.83 %)		 1,099,633
(8.08 %)		 1,181,678
(6.90 %)		 7,860,245
(28.44 %)		 142,778
(3.95 %)
292 inshore hagfish (2026)
GCF_056783735.1		 69,177
(4.47 %)		 6,275
(0.30 %)		 31,017
(2.64 %)		 n/a 42.67
(99.92 %)		 3,288
(0.08 %)		 3,194
(100.00 %)		 1,279,433
(8.97 %)		 1,549,601
(15.25 %)		 8,247,316
(62.71 %)		 168,414
(11.99 %)
293 Italian stream frog (hap2 2026)
GCA_982398585.1		 n/a 13,531
(0.37 %)		 44,922
(1.67 %)		 n/a 44.49
(102.90 %)		 2,720
(0.01 %)		 297
(100.00 %)		 15,262,263
(79.04 %)		 3,729,151
(11.10 %)		 21,506,534
(59.26 %)		 764,694
(7.41 %)
294 Italian wall lizard (hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
295 Italian wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
296 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 131,092
(7.95 %)
297 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
298 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
299 Kaup's arrowtooth eel (Taiwan WJC10195 2023)
GCA_029718625.1		 n/a 17,009
(1.43 %)		 41,545
(4.43 %)		 n/a 42.36
(102.64 %)		 5,609
(0.18 %)		 243
(100.00 %)		 3,406,521
(51.53 %)		 928,113
(11.03 %)		 5,886,107
(43.47 %)		 122,516
(4.25 %)
300 Kemp's ridley sea turtle (hap1 2025)
GCF_965140285.1		 65,480
(3.90 %)		 14,975
(1.06 %)		 17,809
(1.52 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 4,215,923
(50.05 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
301 Kenyan clawed frog (NASCO 2022)
GCA_024363595.1		 n/a 21,451
(1.69 %)		 23,652
(2.05 %)		 n/a 38.65
(79.93 %)		 233,029
(20.10 %)		 23,435
(100.00 %)		 5,285,530
(44.53 %)		 579,815
(1.62 %)		 12,925,637
(32.47 %)		 63,201
(0.69 %)
302 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
303 Korean lamprey (ZD-2024d 2026)
GCA_056783725.1		 n/a 7,334
(0.75 %)		 33,856
(4.34 %)		 n/a 48.81
(101.62 %)		 632
(0.03 %)		 680
(99.99 %)		 3,803,524
(63.85 %)		 1,115,995
(17.45 %)		 4,790,086
(48.43 %)		 149,190
(42.84 %)
304 Kotschy's gecko (rMedKot1.hap1.1 2025)
GCA_965636955.1		 n/a 14,062
(1.16 %)		 19,832
(2.04 %)		 n/a 44.04
(102.80 %)		 96
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 5,404,758
(42.68 %)		 501,007
(3.72 %)		 9,126,850
(39.28 %)		 75,312
(2.56 %)
305 Kroombit tinker frog (2023)
GCF_031769625.1		 52,522
(1.28 %)		 14,291
(0.36 %)		 35,801
(1.15 %)		 n/a 43.56
(101.51 %)		 n/a 4,085
(100.00 %)		 11,988,581
(47.05 %)		 3,652,481
(26.73 %)		 20,577,888
(61.27 %)		 536,150
(4.98 %)
306 lampreys (CW_2021.1 2026)
GCA_062014791.1		 n/a 7,930
(0.63 %)		 38,610
(4.04 %)		 n/a 48.67
(101.20 %)		 1,293
(0.04 %)		 728
(100.00 %)		 4,241,920
(65.68 %)		 1,439,770
(31.13 %)		 5,270,445
(55.42 %)		 190,019
(33.55 %)
307 lampreys (kcIchGage1.somhap2 2026)
GCA_062039095.1		 n/a 7,696
(0.62 %)		 37,759
(3.92 %)		 n/a 48.19
(101.10 %)		 740
(0.01 %)		 792
(100.00 %)		 4,020,399
(64.74 %)		 1,166,767
(23.89 %)		 5,113,041
(54.85 %)		 197,657
(34.12 %)
308 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
309 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
310 leatherback sea turtle (primary hap 2021)
GCA_009764565.4		 n/a 14,844
(1.08 %)		 16,357
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 41
(100.00 %)		 4,070,850
(47.24 %)		 304,774
(1.14 %)		 11,121,781
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
311 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
312 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
313 Leishan spiny toad (GZLS1 2019)
GCA_009667805.1		 n/a 14,385
(0.55 %)		 44,355
(2.02 %)		 n/a 43.74
(99.99 %)		 3,282
(0.01 %)		 5,302
(100.00 %)		 1,177,889
(2.23 %)		 2,229,424
(11.42 %)		 13,846,381
(60.05 %)		 527,079
(7.98 %)
314 leopard gecko (TG4126 2023 genbank)
GCA_028583425.1		 n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
315 leopard gecko (TG4126 2023 refseq)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
316 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
317 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
318 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
319 Little striped whiptail (17121 2025)
GCA_053572275.1		 n/a 13,808
(1.33 %)		 17,983
(2.11 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 85,668
(1.09 %)		 4,989
(99.96 %)		 3,985,129
(46.12 %)		 402,709
(1.61 %)		 8,404,161
(34.23 %)		 43,932
(1.71 %)
320 lizards A.caudivolvulus (BBC_2024a 2024)
GCA_042257475.1		 n/a 14,035
(1.20 %)		 20,075
(2.10 %)		 n/a 44.31
(102.81 %)		 242
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 6,035,811
(44.39 %)		 378,348
(1.69 %)		 9,312,530
(34.07 %)		 53,546
(1.83 %)
321 lizards A.duperreyi (Individual 364 2024)
GCA_041722995.2		 n/a 13,993
(1.31 %)		 18,535
(2.29 %)		 n/a 43.09
(102.83 %)		 54
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,211,562
(22.22 %)		 918,266
(8.47 %)		 7,114,608
(40.56 %)		 31,372
(1.03 %)
322 lizards A.tigris stejnegeri (HBS 135688 alternate hap 2025)
GCA_023333555.2		 n/a 11,547
(1.21 %)		 15,609
(1.97 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 3,683,979
(51.31 %)		 480,268
(5.67 %)		 7,021,351
(38.84 %)		 45,241
(2.12 %)
323 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
324 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
325 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
326 lizards C.egeriae (BTS541 2025)
GCA_030015325.2		 n/a 14,357
(1.44 %)		 17,539
(2.36 %)		 n/a 42.46
(102.83 %)		 12
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,025,600
(21.43 %)		 882,793
(4.91 %)		 7,177,884
(37.94 %)		 22,105
(0.71 %)
327 lizards C.ocellatus (2025)
GCA_965280105.1		 n/a 13,906
(1.36 %)		 17,878
(2.32 %)		 n/a 43.37
(102.82 %)		 40
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 3,328,556
(24.09 %)		 978,523
(6.21 %)		 6,722,563
(41.08 %)		 34,603
(1.26 %)
328 lizards C.pulcher (TD-2025a 2026)
GCA_055504975.1		 n/a 13,916
(1.37 %)		 18,194
(2.48 %)		 n/a 43.08
(102.81 %)		 44
(0.00 %)		 17
(100.00 %)		 3,176,241
(22.09 %)		 998,069
(8.03 %)		 6,892,287
(39.55 %)		 50,357
(2.32 %)
329 lizards C.scabrum (Arizona 2026)
GCA_054791115.1		 n/a 16,039
(1.17 %)		 23,296
(2.10 %)		 n/a 43.45
(102.81 %)		 157
(0.00 %)		 178
(100.00 %)		 5,723,743
(41.09 %)		 611,286
(2.86 %)		 10,656,963
(36.29 %)		 67,085
(2.26 %)
330 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
331 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
332 lizards D.maculatus (Xishuangbanna Tropical Botanical Garden IS-2026a 2026)
GCA_056783515.1		 n/a 13,699
(1.14 %)		 20,557
(2.09 %)		 n/a 44.07
(102.85 %)		 948
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 5,027,683
(38.92 %)		 1,150,847
(6.84 %)		 8,064,452
(43.25 %)		 106,179
(4.57 %)
333 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 alternate hap 2024)
GCA_023053675.2		 n/a 14,236
(1.17 %)		 19,573
(1.94 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 28
(0.00 %)		 655
(100.00 %)		 6,106,640
(52.43 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,804
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
334 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
335 lizards G.kuhli (2025)
GCA_051903775.2		 n/a 15,226
(0.93 %)		 23,917
(1.83 %)		 n/a 45.79
(102.91 %)		 823
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 6,877,522
(55.62 %)		 726,688
(3.63 %)		 12,103,227
(41.72 %)		 159,475
(3.97 %)
336 lizards L.agilis (primary hap 2019)
GCA_009819535.1		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,235
(2.45 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,417
(1.76 %)		 7,135,058
(34.49 %)		 76,055
(2.68 %)
337 lizards P.bocagei (hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
338 lizards P.bocagei (hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
339 lizards P.erhardii (hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
340 lizards P.erhardii (hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
341 lizards P.guinanensis (GN01 2024)
GCA_037367245.1		 n/a 13,693
(1.11 %)		 18,704
(1.91 %)		 n/a 43.39
(102.83 %)		 1,220
(0.03 %)		 50
(100.00 %)		 4,912,309
(51.84 %)		 905,311
(3.40 %)		 8,543,101
(40.94 %)		 96,277
(3.47 %)
342 lizards P.melisellensis (hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
343 lizards P.melisellensis (hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
344 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 genbank)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
345 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 refseq)
GCF_964106645.1		 68,289
(5.99 %)		 14,362
(1.39 %)		 20,488
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 336
(100.00 %)		 4,977,407
(51.01 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,060,761
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
346 lizards P.pityusensis (hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
347 lizards P.tiliguerta (hap2.2 2025)
GCA_965153305.2		 n/a 13,808
(1.46 %)		 19,314
(2.39 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 1,003
(0.01 %)		 307
(100.00 %)		 4,685,494
(49.03 %)		 429,388
(4.28 %)		 6,635,321
(36.92 %)		 92,746
(3.04 %)
348 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
349 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
350 lizards S.anegadae (242060 2026)
GCA_056883415.1		 n/a 13,822
(1.45 %)		 16,223
(2.21 %)		 n/a 43.52
(102.83 %)		 3,908,285
(0.29 %)		 24
(100.00 %)		 2,999,489
(25.96 %)		 371,944
(2.28 %)		 7,705,335
(32.99 %)		 18,492
(0.71 %)
351 lizards S.caicosae (RGR3006 2026)
GCA_056883335.1		 n/a 13,828
(1.45 %)		 16,361
(2.21 %)		 n/a 43.53
(102.89 %)		 3,397,230
(0.25 %)		 38
(100.00 %)		 3,001,718
(25.98 %)		 369,599
(2.27 %)		 7,624,601
(33.19 %)		 18,972
(0.72 %)
352 lizards S.culebrae (Spon5 2026)
GCA_056883235.1		 n/a 13,862
(1.46 %)		 16,356
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.89 %)		 2,704,449
(0.20 %)		 32
(100.00 %)		 3,000,211
(25.96 %)		 368,625
(2.27 %)		 7,560,908
(33.32 %)		 19,199
(0.73 %)
353 lizards S.fulgidus (SBH267958 2026)
GCA_056884295.1		 n/a 13,814
(1.46 %)		 16,160
(2.17 %)		 n/a 43.58
(102.82 %)		 9,489,911
(0.71 %)		 22
(100.00 %)		 3,015,936
(26.19 %)		 355,047
(2.23 %)		 8,218,837
(32.07 %)		 18,166
(0.69 %)
354 lizards S.macleani (USNM576303 2026)
GCA_056884245.1		 n/a 13,863
(1.45 %)		 16,450
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.81 %)		 2,726,656
(0.20 %)		 21
(100.00 %)		 2,997,435
(25.95 %)		 367,687
(2.26 %)		 7,577,106
(33.31 %)		 19,150
(0.73 %)
355 lizards S.monitae (USNM576301 2026)
GCA_056884155.1		 n/a 13,830
(1.45 %)		 16,551
(2.25 %)		 n/a 43.55
(102.85 %)		 1,679,513
(0.13 %)		 52
(100.00 %)		 3,006,793
(26.00 %)		 373,331
(2.28 %)		 7,325,410
(33.35 %)		 19,537
(0.74 %)
356 lizards S.nitidus (UPRMR694 2026)
GCA_056883755.1		 n/a 13,885
(1.45 %)		 16,474
(2.23 %)		 n/a 43.54
(102.85 %)		 1,431,826
(0.11 %)		 29
(100.00 %)		 3,014,447
(26.02 %)		 384,585
(2.32 %)		 7,188,576
(33.51 %)		 19,448
(0.74 %)
357 lizards S.powelli (SBH274774 2026)
GCA_056883725.1		 n/a 13,814
(1.45 %)		 15,958
(2.17 %)		 n/a 43.52
(102.82 %)		 6,868,127
(0.52 %)		 27
(100.00 %)		 3,000,984
(26.04 %)		 356,904
(2.23 %)		 8,154,782
(32.57 %)		 17,689
(0.68 %)
358 lizards S.semitaeniatus (SBH269171 2026)
GCA_056883555.1		 n/a 13,836
(1.46 %)		 16,388
(2.21 %)		 n/a 43.53
(102.87 %)		 5,667,557
(0.42 %)		 32
(100.00 %)		 2,990,526
(25.93 %)		 366,151
(2.25 %)		 7,825,909
(32.45 %)		 18,695
(0.71 %)
359 lizards S.sloanii (USNM576305 2026)
GCA_056883505.1		 n/a 13,861
(1.46 %)		 16,550
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.81 %)		 3,572,634
(0.26 %)		 47
(100.00 %)		 2,996,789
(25.95 %)		 366,222
(2.26 %)		 7,686,824
(33.07 %)		 18,944
(0.72 %)
360 lizards T.roborowskii (PY-2025 2025)
GCA_051473905.1		 n/a 14,461
(1.02 %)		 19,850
(1.79 %)		 n/a 43.85
(102.77 %)		 14
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 5,506,953
(43.20 %)		 458,896
(4.12 %)		 9,985,831
(38.55 %)		 76,938
(2.97 %)
361 lizards T.scincoides (hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
362 lizards U.stansburiana (SF-2025a 2026)
GCA_055773955.1		 n/a 14,031
(0.99 %)		 15,603
(1.54 %)		 n/a 41.25
(102.77 %)		 113
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 6,580,975
(50.71 %)		 842,566
(4.40 %)		 11,890,298
(39.19 %)		 30,589
(0.83 %)
363 lizards V.acanthurus (MtIsa-1 2025)
GCA_050042745.1		 n/a 13,908
(1.33 %)		 19,791
(2.11 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 3,351
(0.06 %)		 2,663
(100.00 %)		 2,968,776
(37.59 %)		 315,525
(1.53 %)		 7,756,715
(26.02 %)		 60,310
(5.28 %)
364 lizards X.vigilis (SCLL12 2025)
GCA_051940855.1		 n/a 14,878
(0.92 %)		 21,870
(1.72 %)		 n/a 45.87
(102.81 %)		 112
(0.00 %)		 133
(100.00 %)		 4,316,202
(28.34 %)		 599,589
(4.12 %)		 10,853,468
(41.85 %)		 237,398
(6.23 %)
365 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
366 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
367 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
368 loggerhead turtle (v1 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
369 loggerhead turtle (v2 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.2		 61,631
(3.99 %)		 14,676
(1.05 %)		 17,408
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 744
(0.10 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,254,882
(12.49 %)		 319,728
(1.29 %)		 10,705,331
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
370 longcomb sawfish (2026)
GCA_988281235.1		 n/a 12,441
(0.65 %)		 19,960
(1.52 %)		 n/a 42.60
(102.73 %)		 759
(0.01 %)		 1,116
(99.99 %)		 5,006,729
(55.79 %)		 451,782
(4.42 %)		 11,722,101
(40.90 %)		 57,705
(1.86 %)
371 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 87,981
(3.16 %)
372 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
373 mainland tiger snake (Mainland UNSWTSFEM 2025)
GCF_049901735.1		 52,308
(4.37 %)		 13,182
(1.25 %)		 17,251
(1.86 %)		 n/a 39.76
(102.78 %)		 945
(0.01 %)		 202
(100.00 %)		 3,116,177
(48.63 %)		 765,875
(3.85 %)		 7,724,269
(42.60 %)		 64,355
(2.76 %)
374 Mandarin rat snake (2026)
GCA_057127995.1		 n/a 13,412
(1.19 %)		 20,181
(2.17 %)		 n/a 40.73
(102.83 %)		 34
(0.00 %)		 56
(100.00 %)		 5,191,102
(54.62 %)		 940,018
(5.78 %)		 8,120,107
(43.33 %)		 78,072
(2.70 %)
375 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
376 map turtle (NorthernMapTurtle01 primary hap 2025)
GCA_037349215.2		 n/a 15,014
(1.06 %)		 19,134
(1.62 %)		 n/a 44.42
(102.65 %)		 301
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,089,455
(44.48 %)		 392,176
(1.59 %)		 11,172,869
(33.37 %)		 111,339
(2.54 %)
377 marbled electric ray (2025)
GCA_977017645.1		 n/a 12,155
(0.24 %)		 25,844
(0.70 %)		 n/a 43.83
(99.99 %)		 3,402
(0.01 %)		 4,566
(100.00 %)		 10,762,422
(61.06 %)		 1,754,113
(25.79 %)		 13,259,628
(78.62 %)		 445,127
(7.22 %)
378 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
379 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 255,756
(3.08 %)
380 massasauga (EasternMassasaugaR01 primary hap 2024)
GCA_039880765.1		 n/a 13,166
(1.23 %)		 18,329
(1.95 %)		 n/a 39.94
(102.85 %)		 1,293
(0.02 %)		 265
(100.00 %)		 3,986,798
(54.49 %)		 722,734
(4.93 %)		 7,463,203
(42.71 %)		 52,744
(1.90 %)
381 McCord's box turtle (ISIS_951048 2018)
GCA_003846335.1		 n/a 16,317
(1.05 %)		 26,320
(1.64 %)		 n/a 44.69
(94.58 %)		 50,040
(5.43 %)		 141,912
(94.57 %)		 4,185,106
(47.48 %)		 331,791
(1.03 %)		 11,180,962
(31.97 %)		 126,459
(3.07 %)
382 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
383 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
384 Mediterranean moray (2026)
GCA_978019965.1		 n/a 16,427
(1.01 %)		 45,776
(4.00 %)		 n/a 41.64
(102.72 %)		 58
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,557,255
(27.83 %)		 801,510
(11.48 %)		 9,376,875
(41.09 %)		 125,556
(2.63 %)
385 Mediterranean spur-thighed tortoise (T. g. whitei from Iberian southeast TG-2024a 2024)
GCA_040782865.1		 n/a 14,964
(1.05 %)		 19,668
(1.49 %)		 n/a 39.79
(98.20 %)		 516,400
(5.40 %)		 164,422
(98.55 %)		 5,591,130
(50.11 %)		 317,117
(1.55 %)		 12,225,198
(28.87 %)		 63,003
(1.30 %)
386 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
387 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
388 Mexican gopher tortoise (maternal hap 2022)
GCA_025201925.1		 n/a 14,970
(1.00 %)		 18,525
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 622
(100.00 %)		 4,639,733
(52.18 %)		 472,502
(3.42 %)		 11,362,004
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
389 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
390 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
391 Mexican spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054668525.1		 n/a 13,828
(2.09 %)		 25,439
(4.41 %)		 n/a 40.23
(100.00 %)		 267
(0.00 %)		 504
(100.00 %)		 2,096,085
(40.85 %)		 598,367
(11.73 %)		 5,067,467
(36.37 %)		 61,483
(4.17 %)
392 Mexican spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054668515.1		 n/a 13,495
(2.09 %)		 25,018
(4.52 %)		 n/a 40.14
(100.00 %)		 264
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 2,067,301
(40.12 %)		 572,672
(10.63 %)		 4,990,706
(35.30 %)		 60,199
(4.15 %)
393 mimic poison frog (alternate hap 2023)
GCA_032442605.1		 n/a 25
(0.76 %)		 202
(6.98 %)		 n/a 51.33
(100.00 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4,414
(23.25 %)		 1,907
(64.24 %)		 6,592
(56.32 %)		 305
(4.46 %)
394 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
395 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
396 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
397 monk skink (Spon3 2026)
GCA_056884205.1		 n/a 13,876
(1.45 %)		 16,371
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.78 %)		 3,182,004
(0.24 %)		 62
(100.00 %)		 2,997,631
(25.94 %)		 368,339
(2.26 %)		 7,581,522
(33.20 %)		 19,177
(0.73 %)
398 Montpellier snake (2024)
GCA_964265115.1		 n/a 13,306
(1.10 %)		 19,276
(1.89 %)		 n/a 42.26
(102.73 %)		 80
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 6,869,152
(53.42 %)		 889,143
(4.29 %)		 8,612,740
(44.55 %)		 97,786
(4.30 %)
399 Moorish gecko (Portugal Tar1 2026)
GCA_056320045.1		 n/a 14,074
(0.98 %)		 19,789
(1.71 %)		 n/a 44.98
(102.74 %)		 120
(0.00 %)		 93
(100.00 %)		 6,882,398
(44.61 %)		 570,082
(3.97 %)		 10,552,943
(40.56 %)		 61,259
(2.09 %)
400 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
401 natterjack toad (hap1.1 2026)
GCA_978041865.1		 n/a 14,208
(0.53 %)		 29,948
(1.62 %)		 n/a 43.25
(102.85 %)		 566
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 10,491,328
(76.75 %)		 2,105,613
(18.02 %)		 15,911,863
(60.52 %)		 227,983
(2.30 %)
402 natterjack toad (hap2.1 2026)
GCA_978041805.1		 n/a 14,163
(0.53 %)		 29,749
(1.58 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 542
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 10,527,100
(76.82 %)		 2,103,391
(17.75 %)		 15,923,083
(60.50 %)		 227,482
(2.26 %)
403 nervous shark (hap1 2026)
GCA_988281195.1		 n/a 13,279
(0.53 %)		 19,375
(1.29 %)		 n/a 43.93
(101.30 %)		 2,005
(0.01 %)		 2,864
(99.99 %)		 9,687,582
(65.76 %)		 690,841
(6.77 %)		 14,011,315
(47.02 %)		 34,052
(1.10 %)
404 Nile crocodile (hap1 2026)
GCA_054954115.1		 n/a 14,644
(0.99 %)		 19,094
(1.48 %)		 n/a 45.35
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 3,197,557
(41.29 %)		 411,882
(3.33 %)		 12,292,120
(32.84 %)		 41,659
(2.72 %)
405 Nile crocodile (hap2 2026)
GCA_054825085.1		 n/a 14,603
(0.98 %)		 18,975
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,204,046
(41.22 %)		 450,353
(3.49 %)		 12,134,419
(32.77 %)		 42,362
(2.73 %)
406 northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
407 northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
408 northern wobbegong (sOreWar1 hap1 2026)
GCA_988240335.1		 n/a 12,737
(0.34 %)		 21,258
(0.94 %)		 n/a 44.79
(101.13 %)		 910
(0.00 %)		 5,369
(100.00 %)		 12,171,758
(70.72 %)		 1,348,476
(22.04 %)		 19,343,992
(55.66 %)		 91,520
(2.51 %)
409 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
410 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
411 nurse shark (FLO180531 2022)
GCA_024137785.1		 n/a 11,376
(0.58 %)		 14,375
(1.25 %)		 n/a 41.63
(56.77 %)		 68,882
(43.24 %)		 69,171
(56.76 %)		 8,181,216
(65.52 %)		 260,159
(0.44 %)		 14,324,615
(20.45 %)		 13,165
(0.13 %)
412 ocellate spot skate (KY-2023 2024)
GCA_035221665.1		 n/a 11,712
(0.53 %)		 26,077
(1.44 %)		 n/a 43.87
(102.64 %)		 4,692
(0.08 %)		 1,141
(100.00 %)		 7,883,471
(68.43 %)		 1,306,196
(3.94 %)		 12,809,543
(57.74 %)		 258,995
(4.58 %)
413 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
414 olive python (hap1 2026)
GCA_057929095.1		 n/a 13,636
(1.36 %)		 17,657
(2.07 %)		 n/a 40.20
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 2,869,112
(39.35 %)		 413,970
(3.27 %)		 7,686,808
(30.21 %)		 34,733
(2.18 %)
415 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
416 olive python (hap2 2026)
GCA_057929265.1		 n/a 13,629
(1.36 %)		 17,640
(2.07 %)		 n/a 40.19
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 2,868,493
(39.34 %)		 413,676
(3.27 %)		 7,686,615
(30.20 %)		 34,728
(2.16 %)
417 olive-headed seasnake (Western Australia SAMAR72044 2023)
GCA_033807585.1		 n/a 13,530
(0.90 %)		 18,509
(1.42 %)		 n/a 40.48
(101.31 %)		 477
(0.00 %)		 1,320
(100.00 %)		 3,955,365
(61.75 %)		 856,115
(7.07 %)		 8,301,763
(55.26 %)		 129,094
(5.58 %)
418 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
419 Pacific ridley (hap1 2025 genbank)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
420 Pacific ridley (hap1 2025 refseq)
GCF_965140295.1		 48,786
(3.33 %)		 14,876
(1.07 %)		 17,430
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 112
(99.98 %)		 4,157,740
(50.14 %)		 313,430
(2.43 %)		 10,832,284
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
421 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
422 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
423 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
424 palmate newt (alternate hap 2024)
GCA_964258895.1		 n/a 13,011
(0.06 %)		 269,650
(1.87 %)		 n/a 44.94
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 233,842
(100.00 %)		 4,147,487
(1.62 %)		 8,364,812
(13.65 %)		 78,522,792
(49.21 %)		 2,116,175
(7.96 %)
425 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
426 palmate newt (primary hap 2026)
GCA_964261635.2		 n/a 16,530
(0.09 %)		 227,377
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,696,508
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
427 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
428 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
429 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
430 Peter's clawed frog (maternal hap 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
431 Peter's clawed frog (paternal hap 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
432 pigmy rattlesnake (DRR0055 2026)
GCA_062034332.1		 n/a 13,444
(1.25 %)		 19,099
(1.98 %)		 n/a 39.62
(100.00 %)		 3,422
(0.02 %)		 3,003
(100.00 %)		 4,054,406
(53.59 %)		 722,049
(4.13 %)		 7,753,548
(41.91 %)		 50,932
(1.74 %)
433 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
434 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
435 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
436 plains spadefoot toad (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358695.2		 n/a 13,760
(2.05 %)		 25,743
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 2,153,589
(42.02 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,323
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
437 plains spadefoot toad (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
438 plateau brown frog (CW2021 2023)
GCA_029574335.1		 n/a 14,584
(0.41 %)		 46,255
(1.70 %)		 n/a 44.36
(101.35 %)		 3,572
(0.01 %)		 2,983
(100.00 %)		 15,004,906
(78.64 %)		 3,504,364
(9.27 %)		 22,310,970
(56.66 %)		 729,606
(6.73 %)
439 pool frog (hap1 2025 genbank)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
440 pool frog (hap1 2025 refseq)
GCF_965119305.1		 35,542
(0.88 %)		 14,446
(0.34 %)		 39,587
(1.24 %)		 n/a 43.74
(101.38 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,328
(100.00 %)		 2,757,940
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,848
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
441 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
442 porcupine ray (hap1 2026)
GCA_988281385.1		 n/a 12,562
(0.43 %)		 26,637
(1.32 %)		 n/a 42.29
(102.84 %)		 377
(0.00 %)		 865
(100.00 %)		 8,713,783
(67.07 %)		 602,920
(6.59 %)		 21,309,284
(45.88 %)		 120,275
(2.54 %)
443 Potamotrygon marinae (hap2 2026)
GCA_055471215.1		 n/a 11,848
(0.34 %)		 21,950
(0.94 %)		 n/a 41.36
(102.95 %)		 1,012
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 9,567,782
(73.65 %)		 740,953
(13.73 %)		 20,017,437
(57.75 %)		 52,576
(0.65 %)
444 pouched lamprey (GAM24_3 2026)
GCA_062014767.1		 n/a 8,940
(1.11 %)		 36,840
(5.37 %)		 n/a 50.41
(101.12 %)		 135
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 2,369,093
(38.41 %)		 444,777
(7.40 %)		 3,722,247
(49.17 %)		 55,869
(71.30 %)
445 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
446 prickly shark (hap1 2026)
GCA_057877045.1		 n/a 13,126
(0.23 %)		 29,347
(0.82 %)		 n/a 48.14
(101.20 %)		 5,153
(0.01 %)		 3,906
(100.00 %)		 1,289,061
(6.83 %)		 3,350,270
(36.32 %)		 16,573,834
(77.52 %)		 662,154
(10.72 %)
447 prickly shark (hap2 2026)
GCA_057876775.1		 n/a 12,978
(0.26 %)		 28,116
(0.88 %)		 n/a 48.35
(99.98 %)		 4,924
(0.02 %)		 2,205
(100.00 %)		 1,101,970
(5.16 %)		 2,769,674
(32.64 %)		 15,562,460
(75.20 %)		 617,230
(10.59 %)
448 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
449 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
450 Puget Sound dogfish (hap1 2025)
GCA_050613905.1		 n/a 13,335
(0.31 %)		 32,914
(1.25 %)		 n/a 46.84
(99.98 %)		 4,275
(0.02 %)		 3,203
(100.00 %)		 996,444
(5.35 %)		 1,697,611
(29.47 %)		 16,252,127
(70.13 %)		 372,462
(5.80 %)
451 Puget Sound dogfish (hap2 2025)
GCA_050613895.1		 n/a 13,151
(0.34 %)		 29,417
(1.19 %)		 n/a 46.65
(99.98 %)		 4,144
(0.02 %)		 1,862
(100.00 %)		 887,790
(4.65 %)		 1,380,618
(26.09 %)		 14,838,724
(67.96 %)		 333,223
(5.63 %)
452 ray-finned fishes P.merretti (hap1 2026)
GCA_057931045.1		 n/a 17,686
(1.81 %)		 37,595
(4.88 %)		 n/a 43.71
(102.76 %)		 278
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 3,118,708
(34.41 %)		 852,554
(9.08 %)		 6,259,550
(34.71 %)		 144,915
(6.52 %)
453 ray-finned fishes P.merretti (hap2 2026)
GCA_057931065.1		 n/a 16,169
(1.87 %)		 33,742
(4.94 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 236
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,757,145
(33.55 %)		 765,151
(8.12 %)		 5,640,514
(33.63 %)		 130,213
(6.47 %)
454 red coachwhip (AS-2025 2026)
GCA_060497075.1		 n/a 13,487
(1.21 %)		 18,639
(2.05 %)		 n/a 40.19
(102.85 %)		 6
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 5,052,678
(53.02 %)		 863,289
(4.17 %)		 8,794,103
(40.98 %)		 42,334
(1.94 %)
455 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
456 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
457 reedfish (primary hap 2021)
GCA_900747795.4		 n/a 13,335
(0.48 %)		 23,159
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,317,123
(62.67 %)		 1,069,641
(2.91 %)		 19,980,246
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
458 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
459 Reeve's moray (2022-ZK-DYW-LXS-MUSCLE-01 2023)
GCA_029721435.1		 n/a 15,839
(0.92 %)		 41,347
(3.51 %)		 n/a 41.65
(102.79 %)		 146
(0.00 %)		 569
(100.00 %)		 5,175,857
(64.26 %)		 713,235
(8.06 %)		 9,939,950
(43.37 %)		 100,617
(2.22 %)
460 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
461 Riggenbach's reed frog (alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
462 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 genbank)
GCA_040937935.1		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 4,172,191
(12.59 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,114
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
463 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 refseq)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
464 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
465 roundjaw bonefish (hap1 2026)
GCA_056783665.1		 n/a 17,717
(2.33 %)		 24,251
(4.97 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 1,315,104
(19.20 %)		 421,651
(7.42 %)		 5,642,373
(24.02 %)		 30,976
(1.25 %)
466 roundjaw bonefish (hap2 2026)
GCA_056776265.1		 n/a 17,768
(2.35 %)		 24,154
(4.96 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 1,309,049
(18.64 %)		 417,246
(7.24 %)		 5,611,567
(23.57 %)		 30,644
(1.20 %)
467 Roux's giant gecko (US-hobby MAAG-2026a 2026)
GCA_058969105.1		 n/a 13,997
(1.26 %)		 18,565
(2.03 %)		 n/a 44.95
(102.80 %)		 16
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 4,780,379
(37.71 %)		 397,669
(1.73 %)		 8,199,893
(34.47 %)		 81,058
(2.33 %)
468 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
469 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
470 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
471 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
472 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
473 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
474 rufous frog (hap2 2026)
GCA_031893055.2		 n/a 13,549
(0.89 %)		 24,388
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 5,738,417
(62.95 %)		 1,219,306
(21.56 %)		 7,988,200
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
475 Sabana Surinam toad (BJE4294 2021)
GCA_019650415.1		 n/a 11,460
(0.68 %)		 39,132
(1.41 %)		 n/a 37.70
(99.38 %)		 67,859
(0.60 %)		 351,451
(99.40 %)		 1,112,793
(9.46 %)		 523,672
(3.31 %)		 8,542,740
(36.81 %)		 42,115
(0.79 %)
476 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
477 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
478 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
479 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
480 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
481 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
482 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
483 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
484 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
485 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
486 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
487 sand tiger shark (hap1 2026)
GCA_055471155.1		 n/a 13,784
(0.34 %)		 21,567
(0.89 %)		 n/a 45.19
(101.28 %)		 1,643
(0.16 %)		 1,711
(100.00 %)		 7,932,159
(66.95 %)		 2,319,833
(17.54 %)		 24,061,588
(55.39 %)		 126,096
(2.69 %)
488 sand tiger shark (hap2 2026)
GCA_055471145.1		 n/a 13,439
(0.36 %)		 20,564
(0.93 %)		 n/a 45.10
(101.26 %)		 1,534
(0.23 %)		 1,171
(100.00 %)		 7,357,217
(66.76 %)		 1,982,014
(16.60 %)		 23,066,008
(54.15 %)		 113,116
(2.53 %)
489 sand viper (VAMM-2024 2025)
GCA_047301725.1		 n/a 13,318
(1.23 %)		 18,979
(2.05 %)		 n/a 40.71
(102.80 %)		 244
(0.00 %)		 24
(100.00 %)		 1,166,984
(7.70 %)		 698,784
(3.63 %)		 7,450,643
(42.34 %)		 92,145
(3.53 %)
490 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
491 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
492 Schlegel's Japanese gecko (2015)
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
493 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
494 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
495 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
496 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
497 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
498 sharks & rays (2211 2026)
GCA_060307235.1		 n/a 12,051
(0.47 %)		 21,232
(1.25 %)		 n/a 42.38
(101.36 %)		 533
(0.00 %)		 1,562
(100.00 %)		 6,312,470
(47.93 %)		 894,420
(11.22 %)		 16,405,894
(51.70 %)		 107,948
(1.61 %)
499 sharks & rays (SO-2025 2026)
GCA_054367945.1		 n/a 12,633
(0.38 %)		 27,161
(1.14 %)		 n/a 42.00
(101.33 %)		 1,288
(0.00 %)		 1,158
(100.00 %)		 9,471,920
(67.02 %)		 837,721
(14.18 %)		 20,939,378
(52.80 %)		 150,103
(2.30 %)
500 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
501 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
502 sharpnose sevengill shark (v1 hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
503 sharpnose sevengill shark (v2 hap2 2024)
GCA_035084135.2		 n/a 12,605
(0.51 %)		 23,661
(1.48 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 1,771
(0.01 %)		 1,143
(100.00 %)		 559,424
(2.10 %)		 990,550
(15.48 %)		 11,850,173
(56.04 %)		 109,272
(3.30 %)
504 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
505 shortnose gar (hap1 2026 genbank)
GCA_059453375.1		 n/a 13,777
(1.48 %)		 24,433
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.72 %)		 45
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 1,368,384
(36.80 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,116
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
506 shortnose gar (hap1 2026 refseq)
GCF_059453375.1		 69,375
(7.82 %)		 13,889
(1.51 %)		 24,432
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.79 %)		 45
(0.00 %)		 269
(100.00 %)		 1,544,945
(42.60 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,076
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
507 shortnose gar (hap2 2026)
GCA_059453405.1		 n/a 13,581
(1.54 %)		 23,444
(3.57 %)		 n/a 40.67
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 214
(100.00 %)		 1,307,157
(34.74 %)		 226,116
(11.39 %)		 5,488,729
(36.58 %)		 55,305
(3.72 %)
508 Siamese crocodile (JL-2025a 2025)
GCA_052110815.1		 n/a 14,068
(1.04 %)		 18,199
(1.50 %)		 n/a 44.88
(101.52 %)		 676
(0.00 %)		 860
(100.00 %)		 2,906,176
(41.75 %)		 289,417
(1.27 %)		 11,431,007
(31.18 %)		 36,200
(1.54 %)
509 Siberian wood frog (spRanAmu-1000001404 2026)
GCA_060496945.1		 n/a 14,403
(0.42 %)		 44,825
(1.74 %)		 n/a 44.45
(102.80 %)		 343
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 15,196,171
(77.32 %)		 3,713,759
(11.58 %)		 21,652,430
(58.15 %)		 764,860
(7.57 %)
510 silver chimaera (sChiPha1 2026)
GCA_057930315.1		 n/a 11,816
(1.51 %)		 13,743
(2.59 %)		 n/a 42.36
(100.00 %)		 850
(0.04 %)		 2,093
(100.00 %)		 3,319,760
(44.98 %)		 673,051
(4.57 %)		 6,052,480
(41.93 %)		 40,866
(2.05 %)
511 silvertip shark (SJ-STS2025 2026)
GCA_062034296.1		 n/a 11,996
(0.52 %)		 15,197
(1.20 %)		 n/a 42.90
(102.77 %)		 27,574
(4.66 %)		 27,615
(95.34 %)		 8,801,231
(65.21 %)		 383,737
(1.40 %)		 13,774,330
(41.04 %)		 17,839
(0.27 %)
512 Skyros wall lizard (hap1.2 2024)
GCF_964106915.1		 72,774
(5.99 %)		 14,298
(1.39 %)		 19,900
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 4,985,535
(51.28 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,654
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
513 Skyros wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
514 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
515 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
516 small-eyed ray (hap1.1 2026)
GCA_982319585.1		 n/a 12,092
(0.49 %)		 29,267
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.40 %)		 2,689
(0.01 %)		 4,225
(100.00 %)		 8,804,118
(72.17 %)		 1,666,575
(13.33 %)		 11,928,381
(61.47 %)		 300,552
(6.69 %)
517 small-eyed ray (hap2.1 2026)
GCA_982319545.1		 n/a 11,972
(0.50 %)		 28,154
(1.47 %)		 n/a 45.48
(99.99 %)		 2,688
(0.01 %)		 5,516
(99.99 %)		 8,685,236
(71.77 %)		 1,478,950
(12.77 %)		 11,816,313
(60.96 %)		 295,247
(6.93 %)
518 small-spotted catshark (primary hap 2021)
GCF_902713615.2		 55,748
(1.62 %)		 13,022
(0.37 %)		 23,990
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 10,880,918
(73.26 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,883,361
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
519 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
520 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
521 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
522 smalltooth sawfish (primary hap 2019)
GCA_009764475.2		 n/a 12,158
(0.69 %)		 18,625
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 4,923,143
(54.93 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,054
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
523 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
524 smooth skate (SmoothSkate02 primary hap 2024)
GCA_038087875.1		 n/a 7,998
(0.47 %)		 23,764
(1.91 %)		 n/a 44.02
(100.00 %)		 13,092
(0.13 %)		 6,182
(100.00 %)		 7,592,942
(72.49 %)		 957,387
(6.69 %)		 7,470,731
(59.29 %)		 195,339
(6.63 %)
525 snake B.irregularis (Birr_Female4 2026)
GCA_056881965.1		 n/a 12,450
(1.11 %)		 18,032
(1.87 %)		 n/a 41.15
(101.19 %)		 224
(0.00 %)		 433
(100.00 %)		 5,225,106
(56.94 %)		 954,312
(6.34 %)		 7,632,254
(46.72 %)		 72,499
(2.62 %)
526 snake C.gasperettii (CG1 2025)
GCA_046524025.1		 n/a 13,277
(1.16 %)		 17,868
(1.84 %)		 n/a 39.94
(102.83 %)		 792
(0.02 %)		 237
(100.00 %)		 1,104,071
(7.40 %)		 621,242
(4.74 %)		 7,969,137
(44.13 %)		 45,595
(1.55 %)
527 snake L.rosozonatus (Hainan Island endemic population YBU250033 2026)
GCA_061240095.1		 n/a 13,431
(1.13 %)		 20,565
(2.12 %)		 n/a 40.97
(102.80 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 5,995,609
(55.89 %)		 1,069,203
(4.88 %)		 8,343,323
(45.28 %)		 75,844
(2.59 %)
528 snake M.schweizeri (rMacScw1.hap1.1 2025)
GCA_965194845.1		 n/a 13,449
(1.19 %)		 19,267
(1.96 %)		 n/a 40.61
(101.32 %)		 1,364
(0.01 %)		 535
(100.00 %)		 3,640,611
(51.92 %)		 720,766
(7.75 %)		 7,413,566
(44.97 %)		 86,057
(3.30 %)
529 snake N.helvetica (hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
530 snake N.helvetica (hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
531 snake P.spiloides (GreyRatsnake01 primary hap 2026)
GCA_037575465.2		 n/a 14,226
(1.10 %)		 21,483
(2.05 %)		 n/a 40.40
(102.83 %)		 311
(0.00 %)		 111
(100.00 %)		 4,921,427
(55.77 %)		 1,017,940
(7.15 %)		 9,049,757
(45.25 %)		 82,928
(2.50 %)
532 snake R.lateralis (Jilin DL-2025a 2026)
GCA_062024719.1		 n/a 13,615
(0.93 %)		 20,185
(1.63 %)		 n/a 42.57
(101.39 %)		 1,025
(0.02 %)		 501
(100.00 %)		 6,445,749
(59.12 %)		 1,490,502
(11.60 %)		 8,514,446
(55.13 %)		 222,122
(6.57 %)
533 Somali helmeted turtle (alternate hap 2025)
GCA_051311595.1		 n/a 14,771
(1.19 %)		 18,963
(1.80 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 1,298
(100.00 %)		 3,524,256
(40.68 %)		 362,743
(1.52 %)		 9,689,320
(29.55 %)		 52,961
(1.73 %)
534 Somali helmeted turtle (primary hap 2025)
GCA_051311615.1		 n/a 14,695
(1.19 %)		 17,959
(1.73 %)		 n/a 43.06
(99.89 %)		 85
(0.11 %)		 67
(100.00 %)		 3,529,920
(40.73 %)		 365,058
(1.57 %)		 9,712,608
(29.62 %)		 53,463
(1.75 %)
535 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 218,171
(0.23 %)
536 southeastern chorus frog (ECM19152 2026)
GCA_058322085.1		 n/a 13,943
(0.46 %)		 48,726
(2.00 %)		 n/a 42.96
(100.00 %)		 21,585
(0.26 %)		 46,493
(100.00 %)		 14,733,533
(66.21 %)		 3,141,717
(15.77 %)		 16,088,021
(61.29 %)		 579,413
(6.33 %)
537 Southern California legless lizard (HBS135921 hap1 2026)
GCA_051312515.2		 n/a 14,187
(1.12 %)		 19,489
(1.86 %)		 n/a 43.68
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 5,909,632
(46.54 %)		 670,448
(3.31 %)		 9,944,808
(39.15 %)		 83,929
(3.91 %)
538 Southern California legless lizard (HBS135921 hap2 2026)
GCA_051312545.2		 n/a 14,225
(1.12 %)		 19,592
(1.86 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 5,913,300
(46.41 %)		 672,138
(3.61 %)		 9,957,324
(39.35 %)		 83,771
(3.97 %)
539 southern Darwin's frog (hap1 2025)
GCA_050947455.1		 n/a 13,810
(0.52 %)		 34,024
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,943
(100.00 %)		 11,010,271
(59.26 %)		 2,251,360
(18.25 %)		 13,843,971
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
540 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
541 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
542 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
543 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
544 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
545 spiny dogfish (Lynn of Lorn, Scotland, UK JT-UK-2019 2023)
GCA_030390025.1		 n/a 12,723
(0.42 %)		 26,698
(1.22 %)		 n/a 45.89
(101.24 %)		 5,471
(0.05 %)		 3,882
(100.00 %)		 749,799
(1.84 %)		 1,076,756
(12.75 %)		 13,462,662
(62.21 %)		 295,477
(4.95 %)
546 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
547 spotted gar (hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
548 spotted gar (hap2 2024 genbank)
GCA_040954835.1		 n/a 13,842
(1.51 %)		 23,963
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 1,332,243
(34.81 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,951
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
549 spotted gar (hap2 2024 refseq)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
550 spotted moray (2026)
GCA_978019835.1		 n/a 16,348
(1.04 %)		 38,313
(3.53 %)		 n/a 41.70
(102.87 %)		 71
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,160,132
(28.09 %)		 585,769
(10.39 %)		 9,925,217
(38.87 %)		 80,015
(1.64 %)
551 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
552 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
553 spotted ray (hap1.1 2026)
GCA_980250545.1		 n/a 11,917
(0.53 %)		 29,784
(1.58 %)		 n/a 44.43
(100.15 %)		 3,030
(0.02 %)		 4,542
(100.00 %)		 9,023,837
(69.78 %)		 1,317,538
(6.25 %)		 12,219,735
(58.18 %)		 278,007
(5.45 %)
554 spotted ray (hap2.1 2026)
GCA_980251185.1		 n/a 12,027
(0.53 %)		 30,226
(1.61 %)		 n/a 44.56
(99.98 %)		 2,873
(0.02 %)		 6,791
(99.98 %)		 9,053,482
(69.77 %)		 1,277,399
(6.17 %)		 12,285,515
(58.11 %)		 279,307
(5.47 %)
555 spotted thorius (hap1 2026)
GCA_060511645.1		 n/a 16,308
(0.08 %)		 281,976
(2.00 %)		 n/a 44.00
(101.39 %)		 1,347
(0.00 %)		 6,194
(100.00 %)		 7,654,632
(1.67 %)		 8,183,789
(8.39 %)		 92,968,603
(55.54 %)		 2,686,800
(7.14 %)
556 starry smooth-hound (hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
557 starry smooth-hound (hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
558 starry smooth-hound shark (hap1.1 2024)
GCF_964213995.1		 50,247
(1.97 %)		 12,752
(0.42 %)		 23,720
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,313
(100.00 %)		 1,161,214
(3.17 %)		 1,250,068
(11.36 %)		 14,206,585
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
559 Stejneger's bamboo snake (YBU240039 2025)
GCA_050613815.1		 n/a 13,474
(1.22 %)		 17,924
(1.92 %)		 n/a 40.19
(101.37 %)		 43
(0.00 %)		 617
(100.00 %)		 5,373,645
(51.79 %)		 756,052
(5.88 %)		 8,304,174
(43.59 %)		 70,655
(3.28 %)
560 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
561 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
562 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
563 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
564 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
565 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
566 tarantolino (hap1 2023)
GCA_029931775.1		 n/a 14,318
(1.18 %)		 21,784
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 592
(100.00 %)		 5,383,621
(53.79 %)		 436,945
(2.95 %)		 8,308,761
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
567 thornback ray (hap1.1 2026)
GCA_980434695.1		 n/a 12,036
(0.55 %)		 29,375
(1.65 %)		 n/a 44.43
(101.34 %)		 2,667
(0.01 %)		 1,860
(100.00 %)		 9,097,652
(68.82 %)		 1,275,313
(5.43 %)		 12,306,520
(57.27 %)		 270,118
(5.25 %)
568 thornback ray (hap2.1 2026)
GCA_980432155.1		 n/a 12,145
(0.53 %)		 30,300
(1.62 %)		 n/a 44.68
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 5,935
(99.99 %)		 9,407,764
(69.49 %)		 1,383,362
(6.40 %)		 12,478,479
(58.39 %)		 282,238
(5.47 %)
569 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
570 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.2		 n/a 11,697
(0.61 %)		 26,344
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 8,789,521
(68.75 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,963,149
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
571 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 refseq)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
572 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
573 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
574 tiger salamander (Tig_M23 2026)
GCA_061212105.1		 n/a 23,961
(0.08 %)		 186,203
(1.15 %)		 n/a 46.27
(102.78 %)		 1,920
(0.00 %)		 3,762
(100.00 %)		 28,461,502
(65.74 %)		 8,376,884
(11.27 %)		 125,465,827
(51.73 %)		 2,444,237
(5.28 %)
575 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
576 tiny cayenne caecilian (primary hap 2021)
GCF_901765095.2		 41,335
(1.27 %)		 14,580
(0.44 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 3,532
(98.99 %)		 13,578,410
(71.92 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,206,278
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
577 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
578 tope shark (hap1 2025)
GCA_977071755.1		 n/a 12,861
(0.32 %)		 25,525
(1.16 %)		 n/a 47.84
(99.98 %)		 3,659
(0.02 %)		 10,777
(99.98 %)		 1,356,606
(3.72 %)		 1,445,979
(23.88 %)		 14,153,835
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
579 tope shark (hap1 2026)
GCA_055755705.1		 n/a 12,842
(0.32 %)		 25,523
(1.16 %)		 n/a 47.73
(100.50 %)		 3,659
(0.02 %)		 8,367
(99.99 %)		 1,347,388
(3.72 %)		 1,449,325
(23.87 %)		 14,153,380
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
580 tope shark (hap2 2025)
GCA_977071745.1		 n/a 9,480
(0.44 %)		 12,818
(1.02 %)		 n/a 45.32
(99.99 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,593
(99.99 %)		 844,596
(2.20 %)		 605,996
(6.77 %)		 10,856,611
(52.57 %)		 83,694
(4.14 %)
581 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
582 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
583 Tungara frog (maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
584 Tungara frog (paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
585 Turks Islands skink (RGR3008 2026)
GCA_056884325.1		 n/a 13,827
(1.45 %)		 16,448
(2.22 %)		 n/a 43.54
(102.79 %)		 2,560,899
(0.19 %)		 34
(100.00 %)		 3,004,480
(25.98 %)		 371,562
(2.28 %)		 7,548,517
(33.44 %)		 19,370
(0.73 %)
586 turtles (Mexican musk turtle STRM 2024)
GCA_044707075.1		 n/a 14,457
(1.38 %)		 18,917
(1.85 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 171,804
(6.96 %)		 29,375
(100.00 %)		 3,199,354
(35.51 %)		 202,620
(0.71 %)		 9,383,450
(24.08 %)		 54,489
(1.56 %)
587 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
588 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
589 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 refseq)
GCF_901001135.2		 56,619
(1.50 %)		 14,447
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 4,902
(99.36 %)		 7,642,637
(30.35 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,399,636
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
590 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 genbank)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
591 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 refseq)
GCF_965153285.1		 74,360
(6.29 %)		 14,315
(1.44 %)		 20,248
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 4,922,311
(49.66 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
592 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
593 undulate ray (2026)
GCA_980436725.1		 n/a 12,010
(0.50 %)		 27,362
(1.45 %)		 n/a 45.02
(101.57 %)		 2,543
(0.01 %)		 1,253
(100.00 %)		 9,070,711
(71.40 %)		 1,216,218
(10.82 %)		 12,098,252
(61.01 %)		 281,244
(5.52 %)
594 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
595 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
596 veiled chameleon (AJP-2024a 2024)
GCA_043643385.1		 n/a 13,000
(1.03 %)		 14,947
(1.51 %)		 n/a 42.82
(101.43 %)		 546
(0.00 %)		 492
(100.00 %)		 3,475,887
(26.88 %)		 742,592
(4.05 %)		 9,688,124
(41.85 %)		 84,652
(2.86 %)
597 viperine water snake (2025)
GCA_964659585.1		 n/a 13,487
(1.13 %)		 19,333
(1.87 %)		 n/a 41.44
(102.77 %)		 75
(0.00 %)		 210
(100.00 %)		 4,142,066
(54.63 %)		 870,047
(5.04 %)		 8,557,674
(44.75 %)		 114,823
(4.54 %)
598 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
599 warty newt (alternate hap 2024)
GCA_964204665.1		 n/a 7,653
(0.05 %)		 165,170
(1.80 %)		 n/a 45.74
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 179,793
(100.00 %)		 2,367,930
(1.81 %)		 4,993,795
(17.70 %)		 40,385,667
(52.18 %)		 1,135,490
(8.29 %)
600 warty newt (primary hap 2024 genbank)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
601 warty newt (primary hap 2024 refseq)
GCF_964204655.1		 78,096
(0.50 %)		 16,122
(0.09 %)		 186,007
(1.43 %)		 n/a 45.52
(102.83 %)		 4,698
(0.00 %)		 6,001
(100.00 %)		 4,239,416
(1.37 %)		 8,725,286
(13.72 %)		 84,859,339
(50.88 %)		 2,159,664
(8.20 %)
602 wattle-necked softshell turtle (PAS_2024 2025)
GCA_054135685.1		 n/a 14,873
(1.04 %)		 20,956
(1.70 %)		 n/a 45.39
(102.91 %)		 21
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 4,053,505
(47.00 %)		 496,780
(2.80 %)		 11,190,246
(35.73 %)		 107,755
(4.04 %)
603 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a alternate hap 2024)
GCA_040939495.1		 n/a 5,770
(0.02 %)		 51,747
(0.50 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 65,665
(100.00 %)		 8,636,983
(3.97 %)		 7,822,314
(7.96 %)		 97,649,351
(57.33 %)		 262,729
(0.56 %)
604 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
605 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
606 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap1 2026)
GCA_053478255.2		 n/a 14,324
(0.49 %)		 42,410
(2.02 %)		 n/a 45.04
(100.00 %)		 1,837
(0.00 %)		 1,100
(100.00 %)		 14,993,900
(65.43 %)		 3,145,831
(17.41 %)		 15,399,943
(62.39 %)		 575,163
(6.40 %)
607 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap2 2026)
GCA_056512365.2		 n/a 13,981
(0.49 %)		 42,035
(2.07 %)		 n/a 45.01
(100.00 %)		 1,846
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 14,873,941
(65.52 %)		 3,092,457
(17.13 %)		 15,388,764
(62.36 %)		 569,249
(6.37 %)
608 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
609 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
610 Western massasauga (CLP2594 2026)
GCA_062034334.1		 n/a 13,412
(1.28 %)		 19,185
(2.02 %)		 n/a 39.50
(100.00 %)		 2,743
(0.02 %)		 3,082
(100.00 %)		 4,052,490
(52.23 %)		 714,223
(4.46 %)		 7,668,555
(40.88 %)		 47,468
(1.67 %)
611 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 124,359
(2.87 %)
612 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 124,000
(2.80 %)
613 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
614 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
615 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
616 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
617 western spadefoot toad (2023)
GCA_933207985.1		 n/a 14,211
(0.63 %)		 32,941
(1.84 %)		 n/a 40.54
(100.76 %)		 64,928
(0.21 %)		 68,502
(99.79 %)		 4,432,511
(26.34 %)		 2,612,372
(7.66 %)		 15,680,118
(46.11 %)		 151,976
(2.08 %)
618 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
619 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
620 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
621 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769535.1		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,806
(1.93 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,274,580
(7.75 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,395,695
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
622 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 refseq)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
623 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
624 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
625 white-bellied softnose skate (Sanriku21f 2025)
GCF_053455715.1		 41,159
(3.03 %)		 11,907
(0.66 %)		 24,004
(1.82 %)		 n/a 44.94
(99.88 %)		 5,336
(0.12 %)		 3,942
(100.00 %)		 9,274,458
(62.02 %)		 1,451,144
(6.73 %)		 8,696,026
(55.50 %)		 191,431
(5.50 %)
626 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
627 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 37,965
(0.55 %)
628 whitespotted bambooshark (Xiang-an2024)
GCF_037043375.1		 63,538
(1.92 %)		 12,648
(0.33 %)		 20,407
(0.93 %)		 n/a 43.84
(102.89 %)		 2,116
(0.02 %)		 247
(100.00 %)		 10,210,772
(68.41 %)		 1,553,859
(14.40 %)		 23,687,273
(50.26 %)		 67,717
(1.43 %)
629 whitespotted conger (HY 2025)
GCA_047653785.1		 n/a 17,263
(2.02 %)		 34,073
(5.20 %)		 n/a 43.81
(102.82 %)		 234
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 2,441,544
(36.20 %)		 938,430
(10.61 %)		 5,763,134
(33.42 %)		 114,088
(5.26 %)
630 wood frog (aRanSyl1 2023)
GCA_028564925.1		 n/a 14,532
(0.37 %)		 43,393
(1.52 %)		 n/a 43.63
(100.76 %)		 13,423
(0.12 %)		 4,861
(100.00 %)		 13,526,606
(71.82 %)		 4,240,726
(11.36 %)		 23,695,641
(55.29 %)		 565,695
(4.80 %)
631 Wuis rock agama (Bomi SW-2024a 2024)
GCA_040285375.1		 n/a 14,003
(1.17 %)		 18,961
(1.97 %)		 n/a 42.56
(102.85 %)		 52
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 4,423,302
(44.26 %)		 655,782
(3.52 %)		 8,674,123
(34.69 %)		 53,208
(1.89 %)
632 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
633 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
634 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2025)
GCA_050000025.1		 n/a 14,891
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 2,747,806
(34.14 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
635 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2026)
GCA_050000025.2		 n/a 14,811
(0.94 %)		 30,371
(2.41 %)		 n/a 43.83
(100.00 %)		 n/a 2,436
(100.00 %)		 4,676,532
(48.44 %)		 412,438
(1.17 %)		 12,237,450
(31.63 %)		 48,675
(1.65 %)
636 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2025)
GCA_050000005.1		 n/a 14,852
(1.27 %)		 19,245
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 73
(99.99 %)		 2,745,424
(34.17 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
637 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2026)
GCA_050000005.2		 n/a 14,683
(0.95 %)		 17,589
(1.40 %)		 n/a 43.85
(100.00 %)		 214
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,687,675
(48.54 %)		 412,242
(1.19 %)		 12,305,782
(31.82 %)		 48,972
(1.67 %)
638 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
639 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
640 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
641 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
642 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
643 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
644 Zimmermann's poison frog (hap2 2025)
GCA_051348885.1		 n/a 14,010
(0.34 %)		 42,101
(1.22 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 227
(0.00 %)		 275
(100.00 %)		 10,423,157
(48.22 %)		 3,754,386
(17.74 %)		 16,835,345
(70.24 %)		 658,843
(7.16 %)
TOTALS:total assembly count 644

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 631 assemblies assembly stats track stats
Mammals 1014 assemblies assembly stats track stats
Birds 693 assemblies assembly stats track stats
Fishes 932 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 644 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 2029 assemblies assembly stats track stats
Plants 602 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4138 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15880 assemblies assembly stats track stats
Archaea 3178 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 24177 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats