Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
5 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
6 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
7 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
8 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
9 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
10 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
11 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
12 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 429,691
(2.65 %)
13 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
14 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
15 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 172,876
(42.56 %)
16 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
17 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
18 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
19 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
20 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
21 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
22 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
23 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
24 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
25 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
26 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
27 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
28 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
29 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
30 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
31 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
32 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
33 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
34 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 734,430
(7.27 %)
35 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
36 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
37 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
38 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
39 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
40 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
41 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
42 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
43 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
44 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
45 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
46 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
47 central bearded dragon (2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
48 central bearded dragon (2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
49 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025)
GCA_051106095.1		 n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
50 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
51 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
52 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
53 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 142,416
(4.34 %)
54 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
55 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
56 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
57 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
58 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
59 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
60 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
61 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
62 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
63 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
64 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
65 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
66 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
67 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
68 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
69 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
70 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
71 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
72 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
73 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
74 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
75 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
76 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
77 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
78 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
79 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
80 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
81 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
82 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
83 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 606,993
(6.09 %)
84 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
85 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
86 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
87 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
88 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
89 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
90 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
91 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
92 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
93 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
94 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
95 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
96 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
97 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
98 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
99 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
100 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
101 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
102 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
103 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
104 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
105 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
106 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
107 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
108 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
109 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
110 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
111 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
112 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
113 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
114 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
115 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
116 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
117 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
118 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
119 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
120 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
121 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
122 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
123 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
124 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
125 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
126 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
127 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
128 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
129 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
130 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
131 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
132 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
133 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
134 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
135 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
136 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
137 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
138 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
139 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
140 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
141 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
142 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
143 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
144 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
145 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
146 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
147 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
148 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
149 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
150 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
151 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
152 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
153 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
154 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
155 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
156 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
157 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
158 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
159 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
160 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
161 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
162 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
163 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
164 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
165 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
166 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
167 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 131,092
(7.95 %)
168 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
169 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
170 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
171 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
172 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
173 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
174 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
175 Leopard gecko (TG4126 2023)
GCA_028583425.1		 n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
176 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
177 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
178 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
179 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
180 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
181 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
182 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
183 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
184 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
185 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
186 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
187 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
188 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
189 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
190 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
191 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
192 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
193 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
194 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
195 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
196 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
197 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
198 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
199 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
200 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
201 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 87,981
(3.16 %)
202 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
203 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
204 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
205 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 255,756
(3.08 %)
206 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
207 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
208 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
209 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
210 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
211 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
212 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
213 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
214 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
215 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
216 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
217 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
218 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
219 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
220 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
221 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
222 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
223 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
224 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
225 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
226 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
227 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
228 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
229 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
230 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
231 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
232 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
233 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
234 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
235 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
236 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
237 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
238 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
239 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
240 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
241 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
242 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
243 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
244 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
245 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
246 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
247 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
248 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
249 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
250 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
251 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
252 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
253 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
254 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
255 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
256 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
257 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
258 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
259 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
260 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
261 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
262 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
263 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
264 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
265 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
266 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
267 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
268 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
269 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
270 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
271 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
272 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
273 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
274 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
275 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
276 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
277 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
278 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
279 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
280 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
281 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
282 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
283 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
284 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
285 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
286 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
287 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 218,171
(0.23 %)
288 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
289 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
290 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
291 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
292 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
293 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
294 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
295 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
296 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
297 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
298 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
299 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
300 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
301 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
302 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
303 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
304 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
305 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
306 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
307 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
308 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
309 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
310 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
311 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
312 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
313 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
314 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
315 Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
316 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
317 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
318 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
319 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
320 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
321 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
322 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
323 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
324 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
325 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
326 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
327 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
328 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 124,359
(2.87 %)
329 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 124,000
(2.80 %)
330 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
331 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
332 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
333 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
334 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
335 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
336 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
337 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
338 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
339 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
340 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
341 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 37,965
(0.55 %)
342 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
343 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
344 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
345 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
346 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
347 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
348 Zimmermann's poison frog (aRanVar5hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
349 Zimmermann's poison frog (aRanVar5hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
TOTALS:total assembly count 349

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 604 assemblies assembly stats track stats
Mammals 724 assemblies assembly stats track stats
Birds 454 assemblies assembly stats track stats
Fishes 527 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 349 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1554 assemblies assembly stats track stats
Plants 439 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3998 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15006 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2663 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21842 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats