Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,912
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 n/a 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
3 American alligator
GCF_000281125.3		 51,026
(51.68 %)		 14,436
(1.06 %)		 74,897
(2.32 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,920,573
(36.55 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,529
(1.26 %)
4 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 n/a 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
5 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(45.49 %)		 12,491
(1.05 %)		 61,366
(2.05 %)		 32,407
(1.81 %)		 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,549,472
(36.54 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,646
(0.97 %)
6 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(32.76 %)		 14,048
(1.20 %)		 51,679
(2.38 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,291,449
(8.96 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
7 Burmese python
GCF_000186305.1		 n/a 13,712
(1.31 %)		 42,039
(2.12 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 752,295
(3.27 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
8 central bearded dragon
GCF_900067755.1		 42,304
(48.88 %)		 13,858
(1.18 %)		 48,027
(2.11 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 862,124
(3.60 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
9 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,897
(44.05 %)		 14,428
(1.00 %)		 72,676
(2.16 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,998,039
(38.47 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,636
(1.17 %)
10 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,454
(49.60 %)		 13,725
(0.95 %)		 88,745
(2.61 %)		 21,808
(2.25 %)		 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,284,603
(11.20 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
11 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,776
(45.19 %)		 13,818
(0.81 %)		 37,802
(1.29 %)		 26,660
(2.15 %)		 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 4,622,378
(45.80 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
12 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(34.23 %)		 11,630
(1.25 %)		 38,102
(2.42 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 779,428
(5.61 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
13 common wall lizard
GCF_004329235.1		 56,519
(54.27 %)		 14,447
(1.36 %)		 42,702
(2.32 %)		 39,427
(3.20 %)		 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,135,168
(8.42 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
14 common toad
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 n/a 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
15 corn snake
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 n/a 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
16 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(43.57 %)		 13,629
(1.22 %)		 41,211
(1.92 %)		 28,806
(2.37 %)		 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,064,921
(5.89 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
17 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
18 epaulette shark (sHemOce1 2021 VGP)
GCA_020745735.1		 n/a 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 n/a 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
19 epaulette shark (alt pseudohaplotype sHemOce1 2021 VGP)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 n/a 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
20 European common frog
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 n/a 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
21 European eel
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
22 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
23 Gaboon caecilian (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902459495.1		 n/a 12,817
(0.47 %)		 30,608
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,592
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
24 Gaboon caecilian (2019 refseq VGP)
GCF_902459505.1		 54,726
(1.72 %)		 14,266
(0.51 %)		 30,710
(1.49 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,315,377
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
25 gharial
GCF_001723915.1		 32,297
(43.73 %)		 12,195
(1.03 %)		 55,598
(1.83 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,665,007
(36.56 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
26 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019 VGP)
GCF_007399415.2		 57,455
(51.33 %)		 14,859
(1.00 %)		 79,415
(2.33 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,699,240
(13.65 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
27 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_007399395.1		 n/a 13,364
(0.95 %)		 19,373
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,510
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
28 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,178
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
29 great white shark
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
30 green anole
GCF_000090745.1		 38,109
(47.48 %)		 13,022
(1.08 %)		 36,350
(1.68 %)		 27,172
(3.04 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 3,046,789
(35.84 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
31 green sea turtle (v2 2021)
GCF_015237465.2		 84,366
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
32 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(42.57 %)		 13,690
(0.93 %)		 62,075
(2.44 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 539,604
(1.38 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
33 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
34 Lataste's viper (rVipLat1 2022 VGP)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 n/a 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
35 leatherback sea turtle (v4 2021 refseq G10K VGP)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
36 leatherback sea turtle (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009762595.1		 n/a 10,850
(1.00 %)		 15,583
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,216
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
37 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,631
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
38 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(40.69 %)		 13,447
(1.15 %)		 41,323
(1.81 %)		 30,892
(1.93 %)		 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,129,940
(6.04 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
39 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
40 meadow viper (2022 VGP)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 n/a 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
41 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022 VGP)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
42 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022 VGP)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 n/a 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
43 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,226
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
44 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
45 reedfish
GCF_900747795.1		 40,558
(43.70 %)		 13,160
(0.46 %)		 48,082
(1.04 %)		 34,872
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,852,335
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
46 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
47 sand lizard (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009819545.1		 n/a 14,227
(1.28 %)		 25,839
(2.36 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,430
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
48 sand lizard (2019 VGP)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,356
(1.48 %)		 19,592
(2.50 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 1,019,541
(5.39 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
49 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,190
(34.88 %)		 14,559
(0.81 %)		 93,071
(2.44 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 1,628,593
(7.27 %)		 666,501
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
50 sea lamprey (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_010993595.1		 n/a 6,199
(0.70 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,742
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,398
(32.95 %)
51 sea lamprey (2020 VGP)
GCF_010993605.1		 41,254
(6.50 %)		 7,662
(0.70 %)		 36,337
(4.06 %)		 n/a 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 2,075,622
(39.58 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,447
(30.55 %)
52 smaller spotted catshark
GCF_902713615.1		 55,762
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
53 smalltooth sawfish (2019 VGP)
GCA_009764475.1		 n/a 11,845
(0.66 %)		 19,597
(1.63 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,018
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
54 smalltooth sawfish (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009764485.1		 n/a 9,081
(0.58 %)		 20,783
(1.60 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,692
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
55 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,694
(59.51 %)		 13,054
(1.95 %)		 56,879
(5.06 %)		 27,887
(6.15 %)		 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 217,619
(1.18 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
56 sterlet
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
57 thorny skate (CabotCenter1 v1.1 2020 VGP)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
58 thorny skate (alt pseudohaplotype CabotCenter1 2020 VGP)
GCA_010909745.1		 n/a 5,898
(0.35 %)		 24,499
(1.46 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,412
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
59 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
60 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
61 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1		 41,346
(53.62 %)		 14,572
(0.43 %)		 88,603
(1.29 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,847,289
(1.60 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
62 tiny Cayenne caecilian (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_901765105.1		 n/a 12,190
(0.36 %)		 33,739
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,439
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
63 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
64 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(51.54 %)		 14,675
(1.95 %)		 34,624
(2.33 %)		 n/a 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,420,417
(35.06 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
65 two-lined caecilian (2019 VGP)
GCF_901001135.1		 56,630
(53.09 %)		 14,452
(0.38 %)		 180,328
(2.13 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,273,617
(1.93 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
66 two-lined caecilian (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_901001175.1		 n/a 13,451
(0.33 %)		 47,476
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,434
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
67 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 n/a 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
68 West African lungfish
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 n/a 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
69 western painted turtle (v304 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
70 western terrestrial garter snake (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009769695.1		 n/a 13,104
(0.93 %)		 25,268
(1.76 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,209
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
71 western terrestrial garter snake (2019 VGP)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,072
(1.13 %)		 19,161
(1.98 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,326,233
(7.79 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
72 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(30.57 %)		 11,890
(0.43 %)		 41,823
(0.87 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 420,252
(1.14 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
73 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 n/a 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
74 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
75 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,526
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
76 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
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