Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,594
(1.08 %)		 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2		 n/a 19,637
(1.95 %)		 19,610
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 5,399,465
(42.90 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2		 70,837
(3.51 %)		 19,640
(1.95 %)		 19,607
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 5,625,390
(42.96 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,806
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
7 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3		 n/a 20,986
(2.01 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,532,782
(33.95 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,916
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
8 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 47,644
(1.64 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1		 n/a 18,688
(1.61 %)		 19,670
(1.44 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 4,281,139
(31.62 %)		 959,378
(2.78 %)		 12,859,760
(32.95 %)		 49,122
(2.32 %)
10 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1		 n/a 19,463
(1.58 %)		 20,378
(1.42 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 77
(100.00 %)		 4,513,580
(32.16 %)		 1,008,611
(2.91 %)		 13,570,452
(33.71 %)		 50,954
(2.21 %)
11 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
12 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1		 n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 62,315
(1.49 %)
14 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
15 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 27,301
(0.49 %)
16 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1		 n/a 22,687
(1.16 %)		 46,299
(0.94 %)		 n/a 41.37
(99.72 %)		 75,967
(0.24 %)		 659,537
(99.76 %)		 6,139,432
(45.57 %)		 1,339,550
(3.13 %)		 12,293,115
(32.34 %)		 16,575
(0.44 %)
17 alpaca (2025)
GCF_048564905.1		 80,233
(3.11 %)		 18,667
(1.53 %)		 23,043
(1.52 %)		 n/a 41.92
(99.91 %)		 681
(0.09 %)		 519
(100.00 %)		 3,387,094
(33.34 %)		 395,581
(10.22 %)		 11,510,740
(36.96 %)		 72,497
(1.98 %)
18 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 54,502
(1.38 %)
19 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 30,191
(0.63 %)
20 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
21 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
22 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
23 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1		 n/a 17,917
(1.26 %)		 20,499
(1.11 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 377
(0.00 %)		 550
(100.00 %)		 5,812,915
(56.93 %)		 431,488
(2.57 %)		 14,336,638
(47.98 %)		 33,775
(0.84 %)
24 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1		 n/a 18,949
(1.23 %)		 21,655
(1.08 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 401
(100.00 %)		 6,218,266
(57.31 %)		 470,437
(3.04 %)		 15,241,157
(48.91 %)		 37,124
(0.86 %)
25 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1		 n/a 19,828
(1.45 %)		 20,376
(1.31 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 503
(100.00 %)		 4,030,880
(35.35 %)		 566,770
(2.63 %)		 14,198,970
(35.24 %)		 24,454
(0.96 %)
26 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1		 n/a 19,144
(1.44 %)		 18,959
(1.23 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 194
(0.00 %)		 229
(100.00 %)		 3,981,637
(35.85 %)		 561,691
(2.26 %)		 14,374,940
(35.03 %)		 23,386
(0.80 %)
27 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1		 79,343
(3.55 %)		 19,759
(1.46 %)		 19,920
(1.23 %)		 n/a 39.67
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,023,733
(35.50 %)		 563,158
(2.55 %)		 14,502,226
(35.45 %)		 23,983
(0.89 %)
28 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
29 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,699
(2.34 %)		 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
30 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 78,849
(3.32 %)
31 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 68,981
(3.00 %)
32 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 62,580
(1.91 %)
33 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
34 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1		 n/a 19,203
(1.43 %)		 22,174
(1.33 %)		 n/a 42.39
(99.98 %)		 2,957
(0.02 %)		 435
(100.00 %)		 4,188,829
(30.04 %)		 802,295
(5.81 %)		 14,041,290
(37.98 %)		 65,430
(2.64 %)
35 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1		 n/a 18,890
(1.43 %)		 21,684
(1.33 %)		 n/a 42.35
(99.98 %)		 2,849
(0.02 %)		 3,200
(99.98 %)		 4,158,563
(30.22 %)		 786,430
(5.25 %)		 13,845,377
(37.58 %)		 64,307
(2.75 %)
36 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 63,307
(2.38 %)
37 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
38 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
39 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,240
(1.93 %)		 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
40 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
41 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1		 n/a 18,360
(1.57 %)		 20,615
(1.47 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 758
(100.00 %)		 4,038,995
(32.25 %)		 664,825
(1.25 %)		 13,625,080
(33.05 %)		 56,595
(2.13 %)
42 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
43 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1		 n/a 18,528
(1.65 %)		 22,359
(1.64 %)		 n/a 42.89
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 3,531,044
(35.70 %)		 555,304
(2.07 %)		 11,439,853
(36.03 %)		 102,112
(3.75 %)
44 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
45 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 56,223
(1.31 %)
46 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 65,503
(2.30 %)
47 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 48,844
(1.32 %)
48 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,532
(3.85 %)		 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
49 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
50 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1		 n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 55,428
(1.61 %)
51 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
52 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 49,997
(2.23 %)
53 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
54 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1		 n/a 20,255
(1.35 %)		 21,401
(1.44 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 694
(0.00 %)		 2,530
(100.00 %)		 4,287,108
(25.85 %)		 895,123
(5.96 %)		 15,722,314
(36.45 %)		 34,781
(0.82 %)
55 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1		 n/a 18,385
(1.31 %)		 19,099
(1.34 %)		 n/a 39.97
(100.00 %)		 590
(0.00 %)		 2,307
(100.00 %)		 4,314,945
(35.63 %)		 820,736
(6.65 %)		 14,490,422
(35.95 %)		 31,201
(0.78 %)
56 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 148,246
(5.67 %)
57 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
58 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
59 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 44,158
(1.19 %)
60 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
61 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
62 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 41,082
(1.37 %)
63 ass (Donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1		 92,510
(3.84 %)		 18,566
(1.54 %)		 21,504
(1.32 %)		 n/a 42.37
(99.94 %)		 7
(0.06 %)		 849
(100.00 %)		 3,555,052
(38.38 %)		 658,645
(5.79 %)		 14,242,715
(36.79 %)		 43,875
(3.45 %)
64 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,976
(3.12 %)		 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
65 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1		 n/a 18,773
(1.50 %)		 21,069
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,034
(0.01 %)		 900
(100.00 %)		 3,975,427
(35.64 %)		 1,054,000
(10.27 %)		 12,281,095
(41.92 %)		 79,762
(4.08 %)
66 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1		 n/a 17,961
(1.59 %)		 20,087
(1.36 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 917
(0.01 %)		 1,796
(99.99 %)		 3,626,392
(35.51 %)		 824,778
(7.32 %)		 11,499,904
(39.18 %)		 74,348
(3.46 %)
67 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
68 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
69 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,191
(3.64 %)		 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
70 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1		 76,927
(4.47 %)		 18,239
(1.57 %)		 22,111
(1.51 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 127
(0.00 %)		 158
(100.00 %)		 3,258,307
(30.21 %)		 377,352
(13.70 %)		 11,533,205
(36.22 %)		 65,887
(1.95 %)
71 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 78,648
(2.80 %)
72 bank vole
GCF_902806735.1		 56,423
(2.99 %)		 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 18,784
(0.42 %)
73 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 36,371
(1.27 %)
74 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 73,031
(1.72 %)
75 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
76 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1		 n/a 19,354
(1.74 %)		 21,367
(1.51 %)		 n/a 41.48
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 265
(100.00 %)		 3,860,506
(38.95 %)		 722,335
(7.13 %)		 11,994,816
(35.77 %)		 44,562
(1.21 %)
77 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 59,710
(1.51 %)
78 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,413
(3.09 %)		 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
79 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,720
(2.99 %)
80 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
81 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1		 n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 95,564
(1.72 %)
82 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2		 78,636
(2.63 %)		 19,459
(1.36 %)		 21,150
(1.33 %)		 n/a 43.91
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 3,963,383
(22.89 %)		 826,353
(11.67 %)		 12,918,743
(46.86 %)		 52,254
(10.67 %)
83 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1		 n/a 18,686
(0.72 %)		 17,238
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 609
(100.00 %)		 6,263,094
(27.34 %)		 2,223,995
(5.89 %)		 23,994,844
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
84 bilby (mMagLag1 2024)
GCF_037893015.1		 60,460
(3.10 %)		 18,687
(0.72 %)		 17,229
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 608
(100.00 %)		 6,299,949
(27.49 %)		 2,223,987
(5.89 %)		 23,992,536
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
85 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1		 n/a 20,713
(0.64 %)		 21,469
(0.64 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 770
(0.00 %)		 470
(100.00 %)		 3,860,121
(14.52 %)		 1,230,113
(2.81 %)		 21,600,460
(65.53 %)		 49,878
(0.73 %)
86 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1		 n/a 19,814
(0.63 %)		 20,140
(0.63 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 3,657,357
(14.24 %)		 1,158,716
(2.84 %)		 22,924,986
(64.53 %)		 46,774
(0.90 %)
87 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,991
(3.15 %)		 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,483
(3.88 %)
88 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 18,055
(0.48 %)
89 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
90 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 44,113
(0.97 %)
91 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1		 56,268
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
92 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 86,892
(2.23 %)
93 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,415
(2.78 %)		 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 54,060
(2.11 %)
94 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 63,124
(1.85 %)
95 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
96 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,553
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
97 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 56,916
(1.85 %)
98 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
99 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,737
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
100 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 100,915
(3.00 %)
101 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,417
(2.39 %)		 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 69,211
(2.68 %)
102 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 48,826
(1.07 %)
103 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 33,757
(1.35 %)
104 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
105 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
106 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
107 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
108 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
109 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
110 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
111 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
112 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 19,508
(0.31 %)
113 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 43,382
(1.17 %)
114 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,229
(2.92 %)		 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 62,125
(1.80 %)
115 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 64,814
(2.05 %)
116 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
117 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 62,325
(2.36 %)
118 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,537
(2.02 %)		 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 19,540
(0.49 %)
119 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,273
(3.80 %)		 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 19,529
(0.58 %)
120 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 44,449
(1.57 %)
121 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
122 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
123 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
124 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 19,104
(0.65 %)
125 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 20,062
(0.64 %)
126 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 39,082
(2.44 %)
127 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
128 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
129 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 41,527
(1.41 %)
130 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
131 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
132 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2		 n/a 18,455
(1.10 %)		 22,103
(1.12 %)		 n/a 41.00
(88.89 %)		 259,879
(11.14 %)		 325,568
(88.86 %)		 6,210,235
(51.92 %)		 381,915
(1.06 %)		 20,080,212
(36.28 %)		 29,690
(0.50 %)
133 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 37,158
(0.70 %)
134 capybara
GCA_004027455.1		 n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 34,558
(0.85 %)
135 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 99,752
(3.73 %)
136 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,808
(4.11 %)		 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 46,864
(1.37 %)
137 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 42,869
(1.24 %)
138 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 172,178
(3.66 %)
139 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 60,367
(2.22 %)
140 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,744
(2.17 %)
141 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,625
(2.80 %)		 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 46,689
(1.12 %)
142 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
143 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 46,006
(2.59 %)		 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
144 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 17,960
(0.54 %)
145 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 18,838
(0.40 %)
146 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
147 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
148 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
149 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 30,693
(0.58 %)
150 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 32,993
(0.98 %)
151 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1		 n/a 17,893
(1.95 %)		 19,249
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,055,304
(33.11 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,144
(29.52 %)		 30,884
(1.08 %)
152 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCF_036562045.2		 67,162
(3.87 %)		 17,890
(1.94 %)		 19,248
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,325,750
(39.02 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,028
(29.52 %)		 30,884
(1.08 %)
153 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
154 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1		 n/a 22,218
(1.55 %)		 22,364
(1.36 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 1,697
(0.01 %)		 1,645
(100.00 %)		 6,126,341
(42.08 %)		 1,035,957
(2.47 %)		 14,328,193
(41.14 %)		 90,914
(1.82 %)
155 chiru
GCA_000400835.1		 n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 43,135
(1.89 %)
156 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
157 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
158 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 65,379
(1.89 %)
159 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,220
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
160 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
161 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2		 80,385
(4.33 %)		 18,770
(1.77 %)		 20,525
(1.42 %)		 n/a 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 361
(100.00 %)		 3,981,744
(44.78 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,558
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
162 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
163 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
164 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,661
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
165 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
166 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
167 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 92,062
(3.23 %)
168 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1		 n/a 18,233
(1.77 %)		 21,445
(1.80 %)		 n/a 42.93
(99.98 %)		 1,650
(0.02 %)		 575
(100.00 %)		 3,324,262
(26.83 %)		 869,167
(7.44 %)		 10,218,519
(37.91 %)		 76,006
(3.29 %)
169 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1		 n/a 18,115
(1.81 %)		 21,233
(1.83 %)		 n/a 42.89
(99.98 %)		 1,602
(0.02 %)		 1,971
(99.98 %)		 3,303,323
(27.28 %)		 852,756
(5.65 %)		 10,047,424
(36.41 %)		 69,105
(3.25 %)
170 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2		 n/a 17,485
(1.76 %)		 18,907
(1.66 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 576
(0.01 %)		 429
(100.00 %)		 2,592,246
(28.20 %)		 352,985
(2.87 %)		 10,737,944
(31.11 %)		 61,125
(2.28 %)
171 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2		 58,786
(3.38 %)		 18,507
(1.82 %)		 19,451
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 574
(100.00 %)		 2,960,602
(36.90 %)		 431,577
(3.90 %)		 11,286,753
(32.62 %)		 71,507
(2.50 %)
172 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,044
(3.24 %)		 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 51,634
(1.37 %)
173 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,156
(2.64 %)		 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 75,592
(1.86 %)
174 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
175 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1		 n/a 19,527
(1.61 %)		 18,923
(1.35 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 4,435,406
(32.05 %)		 981,019
(1.98 %)		 13,673,245
(32.65 %)		 49,252
(2.20 %)
176 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1		 n/a 19,251
(1.60 %)		 19,585
(1.40 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 4,493,000
(32.28 %)		 982,814
(2.01 %)		 13,803,318
(33.09 %)		 50,777
(2.23 %)
177 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 23,141
(0.54 %)
178 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 57,196
(1.33 %)
179 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1		 n/a 19,467
(1.76 %)		 18,734
(1.43 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 4,718,848
(32.83 %)		 1,327,449
(6.80 %)		 12,893,458
(34.03 %)		 21,236
(0.61 %)
180 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 68,668
(1.15 %)
181 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1		 n/a 18,610
(1.67 %)		 19,098
(1.39 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,077,286
(41.85 %)		 754,689
(2.64 %)		 11,873,386
(36.16 %)		 48,137
(1.04 %)
182 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
183 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
184 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 46,569
(1.25 %)
185 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
186 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
187 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 27,955
(0.39 %)
188 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
189 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,165
(2.13 %)		 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
190 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,291
(2.11 %)		 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 17,053
(0.51 %)
191 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 54,479
(1.01 %)
192 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
193 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 51,216
(2.28 %)
194 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2		 n/a 19,889
(1.67 %)		 20,501
(1.39 %)		 n/a 41.36
(99.99 %)		 1,388
(0.01 %)		 3,630
(99.99 %)		 4,950,227
(43.32 %)		 1,059,639
(2.97 %)		 13,694,849
(33.70 %)		 51,443
(2.16 %)
195 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2		 n/a 19,310
(1.60 %)		 19,947
(1.42 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 631
(100.00 %)		 4,452,916
(32.14 %)		 960,590
(2.23 %)		 13,685,353
(33.01 %)		 50,715
(2.22 %)
196 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1		 n/a 19,211
(1.60 %)		 20,327
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 641
(0.00 %)		 175
(100.00 %)		 4,471,016
(32.18 %)		 984,776
(2.03 %)		 13,719,474
(32.88 %)		 51,050
(2.25 %)
197 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1		 n/a 19,279
(1.60 %)		 20,348
(1.44 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 1,015
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,491,081
(32.21 %)		 996,142
(2.01 %)		 13,761,195
(32.97 %)		 51,490
(2.25 %)
198 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,536
(3.63 %)		 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,269
(2.07 %)
199 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,761
(3.84 %)		 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 50,679
(2.26 %)
200 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1		 n/a 19,255
(1.61 %)		 20,479
(1.45 %)		 n/a 41.19
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 4,490,019
(32.25 %)		 989,383
(1.99 %)		 13,710,808
(32.97 %)		 50,883
(2.22 %)
201 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
202 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3		 n/a 19,757
(1.69 %)		 20,201
(1.41 %)		 n/a 41.32
(99.74 %)		 458
(0.26 %)		 410
(100.00 %)		 4,974,233
(43.03 %)		 1,048,366
(2.46 %)		 13,881,889
(33.61 %)		 51,900
(2.21 %)
203 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1		 n/a 19,256
(1.61 %)		 20,247
(1.44 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 516
(0.00 %)		 675
(100.00 %)		 4,456,220
(32.19 %)		 960,584
(1.96 %)		 13,688,006
(32.82 %)		 50,670
(2.21 %)
204 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 52,469
(2.25 %)
205 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,076
(3.30 %)		 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,701
(2.41 %)
206 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 69,725
(2.42 %)
207 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6		 n/a 18,357
(1.55 %)		 20,085
(1.38 %)		 n/a 41.76
(98.18 %)		 422
(1.82 %)		 1,254
(98.28 %)		 4,661,997
(33.78 %)		 947,221
(2.58 %)		 13,867,949
(33.67 %)		 68,011
(2.41 %)
208 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 67,329
(2.48 %)
209 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,868
(3.09 %)		 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 58,684
(2.16 %)
210 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 54,600
(1.94 %)
211 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 39,682
(0.89 %)
212 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
213 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3		 n/a 18,672
(1.39 %)		 19,408
(1.24 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 646
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 3,570,978
(23.00 %)		 583,762
(8.57 %)		 14,055,227
(40.52 %)		 43,883
(1.17 %)
214 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
215 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
216 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 70,689
(2.42 %)
217 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
218 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 22,270
(0.54 %)
219 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 55,063
(3.69 %)
220 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 24,508
(0.70 %)
221 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1		 n/a 20,397
(1.93 %)		 20,515
(1.44 %)		 n/a 42.68
(98.12 %)		 109,220
(1.90 %)		 19,837
(99.90 %)		 4,701,702
(33.98 %)		 1,304,933
(2.91 %)		 13,145,044
(31.05 %)		 19,636
(0.56 %)
222 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,244
(6.54 %)
223 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
224 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1		 n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 19,944
(0.55 %)
225 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 47,099
(1.31 %)
226 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,345
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
227 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
228 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
229 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
230 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 26,414
(0.61 %)
231 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
232 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
233 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,269
(2.96 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
234 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
235 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
236 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
237 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 98,831
(2.33 %)
238 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
239 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
240 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
241 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1		 n/a 18,085
(1.69 %)		 19,509
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 1,056
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 2,569,380
(23.32 %)		 565,465
(2.18 %)		 10,506,666
(33.68 %)		 46,367
(3.09 %)
242 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1		 n/a 18,064
(1.69 %)		 19,764
(1.59 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,396
(99.99 %)		 2,567,492
(23.34 %)		 570,250
(2.16 %)		 10,485,959
(33.56 %)		 46,213
(3.27 %)
243 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
244 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
245 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,851
(2.58 %)
246 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
247 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
248 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
249 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1		 n/a 20,075
(1.28 %)		 20,274
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 1,436
(0.01 %)		 502
(100.00 %)		 4,357,247
(31.78 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,882,486
(41.66 %)		 39,275
(0.88 %)
250 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,113
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
251 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
252 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 214,480
(2.98 %)
253 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1		 n/a 20,072
(1.51 %)		 22,668
(1.37 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 1,369
(100.00 %)		 4,623,335
(34.75 %)		 475,143
(7.51 %)		 13,000,703
(41.56 %)		 112,581
(2.00 %)
254 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1		 n/a 18,238
(1.57 %)		 20,307
(1.42 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 242
(0.00 %)		 388
(100.00 %)		 4,244,450
(35.89 %)		 405,446
(2.83 %)		 12,211,643
(38.55 %)		 52,418
(1.36 %)
255 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1		 n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
256 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1		 75,958
(3.31 %)		 18,718
(1.50 %)		 20,982
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 438
(100.00 %)		 3,958,926
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,061
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
257 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1		 n/a 17,866
(1.45 %)		 21,079
(1.46 %)		 n/a 42.37
(99.08 %)		 133
(0.92 %)		 416
(100.00 %)		 3,852,502
(34.98 %)		 1,112,185
(16.42 %)		 11,435,533
(44.17 %)		 75,215
(4.36 %)
258 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 65,521
(1.47 %)
259 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,224
(2.50 %)		 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 22,480
(0.71 %)
260 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 26,411
(0.73 %)
261 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1		 60,212
(2.43 %)		 15,763
(0.77 %)		 16,031
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 8
(100.00 %)		 5,302,378
(24.47 %)		 1,450,227
(3.79 %)		 20,870,714
(44.26 %)		 24,586
(0.65 %)
262 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1		 n/a 15,762
(0.77 %)		 16,035
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 1,915
(99.99 %)		 5,302,372
(24.47 %)		 1,450,220
(3.79 %)		 20,870,654
(44.26 %)		 24,585
(0.65 %)
263 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1		 n/a 16,012
(0.77 %)		 16,430
(0.90 %)		 n/a 36.18
(99.99 %)		 1,730
(0.01 %)		 1,737
(99.99 %)		 5,361,847
(24.48 %)		 1,474,744
(3.79 %)		 21,021,671
(44.20 %)		 25,669
(0.69 %)
264 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1		 n/a 19,491
(1.21 %)		 22,538
(1.06 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 1,516
(0.01 %)		 2,612
(100.00 %)		 4,598,236
(35.34 %)		 1,716,315
(24.14 %)		 12,260,919
(52.40 %)		 82,683
(1.47 %)
265 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1		 n/a 18,684
(1.40 %)		 21,322
(1.20 %)		 n/a 41.87
(99.99 %)		 1,258
(0.01 %)		 3,706
(99.99 %)		 4,103,716
(36.69 %)		 1,030,821
(16.12 %)		 11,633,934
(45.82 %)		 74,782
(1.60 %)
266 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,085
(2.86 %)		 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 70,402
(2.61 %)
267 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 32,563
(0.80 %)
268 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,664
(2.08 %)		 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
269 fossa
GCA_004023885.1		 n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 78,033
(2.52 %)
270 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 32,359
(0.80 %)
271 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 75,114
(1.33 %)
272 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 45,586
(0.89 %)
273 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1		 n/a 19,320
(1.74 %)		 21,940
(1.65 %)		 n/a 42.55
(99.99 %)		 1,540
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 3,707,500
(37.60 %)		 733,107
(7.78 %)		 10,515,474
(39.35 %)		 60,200
(2.41 %)
274 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1		 n/a 18,718
(1.71 %)		 20,961
(1.62 %)		 n/a 42.29
(99.98 %)		 1,597
(0.02 %)		 2,101
(99.98 %)		 3,662,405
(37.72 %)		 717,069
(7.80 %)		 10,298,372
(39.22 %)		 56,300
(2.26 %)
275 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,344
(3.53 %)		 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 65,918
(2.36 %)
276 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 57,558
(0.94 %)
277 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 82,376
(2.05 %)
278 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,481
(3.27 %)		 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 59,449
(1.50 %)
279 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,172
(2.31 %)		 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 125,662
(4.00 %)
280 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 24,314
(0.52 %)
281 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 21,268
(0.61 %)
282 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
283 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
284 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1		 n/a 20,967
(0.89 %)		 24,137
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,087
(100.00 %)		 5,547,018
(29.30 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,898
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
285 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1		 49,173
(1.30 %)		 19,845
(0.90 %)		 24,244
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,088
(100.00 %)		 8,197,827
(62.01 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,958
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
286 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1		 n/a 19,719
(1.16 %)		 22,611
(1.21 %)		 n/a 39.48
(100.00 %)		 643
(0.00 %)		 2,820
(100.00 %)		 4,725,546
(31.70 %)		 997,950
(3.53 %)		 14,753,550
(39.53 %)		 33,465
(0.69 %)
287 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1		 46,395
(1.71 %)		 18,853
(1.19 %)		 22,613
(1.21 %)		 n/a 39.48
(100.00 %)		 643
(0.00 %)		 2,821
(100.00 %)		 6,984,115
(50.68 %)		 997,950
(3.53 %)		 14,753,604
(39.53 %)		 33,465
(0.69 %)
288 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 92,729
(3.60 %)
289 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1		 n/a 19,352
(1.42 %)		 20,724
(1.33 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 898
(100.00 %)		 4,418,039
(36.90 %)		 1,050,244
(11.63 %)		 13,240,305
(39.50 %)		 89,246
(2.69 %)
290 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
291 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1		 n/a 19,291
(1.73 %)		 20,301
(1.41 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 1,130
(0.01 %)		 171
(100.00 %)		 4,245,582
(34.81 %)		 600,624
(2.16 %)		 13,240,803
(34.28 %)		 56,932
(1.78 %)
292 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1		 n/a 19,222
(1.73 %)		 20,205
(1.41 %)		 n/a 41.54
(99.99 %)		 1,110
(0.01 %)		 1,233
(99.99 %)		 4,236,942
(34.95 %)		 601,409
(1.99 %)		 13,226,667
(34.03 %)		 57,067
(1.82 %)
293 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
294 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
295 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,388
(2.34 %)		 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
296 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 59,073
(2.48 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
297 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
298 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
299 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
300 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
301 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2		 n/a 16,978
(1.61 %)		 18,544
(1.54 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 2,601,985
(26.67 %)		 331,187
(4.87 %)		 10,884,729
(33.93 %)		 63,610
(2.71 %)
302 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2		 n/a 18,051
(1.56 %)		 19,955
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 2,841,143
(26.67 %)		 379,430
(5.52 %)		 11,651,542
(35.11 %)		 72,337
(2.76 %)
303 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,908
(3.26 %)		 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 32,949
(0.96 %)
304 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 44,124
(1.99 %)
305 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 97,686
(2.61 %)
306 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
307 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
308 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
309 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1		 n/a 18,582
(1.55 %)		 20,954
(1.35 %)		 n/a 42.46
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 4,158,629
(40.30 %)		 696,150
(4.67 %)		 12,702,667
(41.11 %)		 257,446
(3.38 %)
310 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1		 55,259
(2.53 %)		 18,321
(1.40 %)		 21,048
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 256
(100.00 %)		 4,247,145
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,157
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
311 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 62,189
(5.35 %)
312 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 72,343
(1.59 %)
313 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
314 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1		 n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
315 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1		 49,276
(1.90 %)		 19,295
(1.38 %)		 21,790
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 703
(100.00 %)		 4,116,894
(35.85 %)		 966,064
(16.74 %)		 12,154,101
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
316 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 84,875
(2.37 %)
317 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1		 n/a 17,856
(1.76 %)		 20,604
(1.75 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 3,697,250
(33.21 %)		 842,827
(8.27 %)		 10,094,062
(38.40 %)		 61,715
(2.96 %)
318 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
319 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1		 33,578
(1.54 %)		 18,528
(1.58 %)		 20,582
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 1,405
(99.99 %)		 3,760,713
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,181
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
320 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,657
(2.98 %)		 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 54,592
(1.70 %)
321 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 52,067
(1.50 %)
322 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 71,478
(1.57 %)
323 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
324 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
325 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 54,753
(1.59 %)
326 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 48,380
(1.43 %)
327 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
328 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
329 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 48,312
(1.15 %)
330 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 53,444
(2.30 %)
331 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 17,558
(0.40 %)
332 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 55,943
(1.04 %)
333 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 55,567
(2.02 %)
334 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 59,066
(1.72 %)
335 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
336 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
337 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1		 124,629
(3.91 %)		 18,742
(1.47 %)		 21,901
(1.39 %)		 n/a 42.90
(99.96 %)		 5
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 3,600,073
(33.96 %)		 709,759
(8.89 %)		 14,396,691
(35.72 %)		 48,802
(5.67 %)
338 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,388
(4.03 %)		 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,825
(1.77 %)
339 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 16,957
(0.40 %)
340 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 23,211
(0.57 %)
341 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 23,309
(0.57 %)
342 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
343 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 23,203
(0.56 %)
344 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 23,196
(0.56 %)
345 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 23,262
(0.56 %)
346 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1		 n/a 21,496
(1.92 %)		 19,278
(1.25 %)		 n/a 41.31
(99.85 %)		 108
(0.15 %)		 345
(99.85 %)		 4,519,975
(46.81 %)		 1,564,206
(14.33 %)		 12,267,542
(42.16 %)		 23,119
(0.55 %)
347 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 23,232
(0.56 %)
348 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 24,140
(0.59 %)
349 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 22,696
(0.55 %)
350 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 24,374
(0.54 %)
351 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 23,253
(0.56 %)
352 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 24,187
(0.54 %)
353 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
354 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 136,224
(4.84 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
355 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1		 n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 16,877
(0.39 %)
356 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2		 n/a 21,817
(2.13 %)		 19,349
(1.37 %)		 n/a 41.79
(99.76 %)		 1,127
(0.24 %)		 214
(100.00 %)		 4,661,104
(40.76 %)		 1,552,079
(3.56 %)		 12,953,662
(35.57 %)		 23,204
(0.56 %)
357 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1		 n/a 19,463
(1.32 %)		 22,424
(1.19 %)		 n/a 42.05
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 1,355
(100.00 %)		 4,164,459
(34.02 %)		 1,281,751
(18.33 %)		 12,412,281
(48.28 %)		 82,412
(1.67 %)
358 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,986
(3.41 %)		 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 47,466
(2.89 %)
359 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 92,830
(3.12 %)
360 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 57,869
(3.73 %)
361 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1		 n/a 17,560
(2.04 %)		 21,687
(1.83 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 2,598,385
(30.48 %)		 486,921
(1.41 %)		 11,828,726
(27.28 %)		 37,476
(5.58 %)
362 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 31,453
(0.55 %)
363 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 68,257
(1.40 %)
364 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1		 n/a 19,123
(1.40 %)		 21,508
(1.26 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 31
(100.00 %)		 3,982,368
(23.76 %)		 650,129
(7.44 %)		 12,858,872
(44.33 %)		 99,144
(2.87 %)
365 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1		 n/a 18,239
(1.76 %)		 20,378
(1.53 %)		 n/a 41.40
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 2,195
(100.00 %)		 3,438,644
(42.82 %)		 584,006
(9.54 %)		 12,207,998
(35.49 %)		 34,491
(1.02 %)
366 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
367 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 71,066
(2.37 %)
368 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1		 n/a 17,882
(1.68 %)		 19,103
(1.41 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 4,622,385
(41.25 %)		 893,297
(1.89 %)		 12,851,116
(33.53 %)		 61,319
(2.55 %)
369 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1		 n/a 18,867
(1.64 %)		 20,784
(1.40 %)		 n/a 41.76
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 4,977,843
(41.75 %)		 982,064
(2.10 %)		 13,365,332
(34.16 %)		 66,000
(2.75 %)
370 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,578
(4.12 %)		 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 63,777
(2.41 %)
371 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 69,090
(2.29 %)
372 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,692
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
373 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 61,951
(1.93 %)
374 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 24,168
(0.56 %)
375 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 68,778
(2.92 %)
376 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,479
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
377 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
378 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
379 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
380 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 65,654
(3.37 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
381 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
382 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 19,817
(0.34 %)
383 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
384 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1		 n/a 19,085
(1.11 %)		 23,074
(1.09 %)		 n/a 43.54
(99.98 %)		 2,938
(0.02 %)		 3,189
(100.00 %)		 4,687,333
(25.05 %)		 908,610
(10.98 %)		 12,922,050
(49.64 %)		 68,749
(2.22 %)
385 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1		 n/a 18,255
(1.29 %)		 22,201
(1.27 %)		 n/a 42.68
(99.98 %)		 2,709
(0.02 %)		 4,948
(99.98 %)		 4,268,233
(27.47 %)		 787,850
(6.40 %)		 12,592,088
(42.54 %)		 62,416
(2.34 %)
386 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,501
(3.29 %)		 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 65,793
(2.64 %)
387 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,279
(3.20 %)		 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 77,001
(2.45 %)
388 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 67,390
(2.50 %)
389 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1		 n/a 17,815
(2.05 %)		 23,917
(1.90 %)		 n/a 40.13
(99.14 %)		 100,669
(0.88 %)		 108,810
(99.12 %)		 2,688,705
(31.20 %)		 428,968
(1.19 %)		 12,245,385
(26.51 %)		 58,118
(6.81 %)
390 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
391 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
392 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,978
(1.44 %)		 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
393 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1		 n/a 18,484
(1.87 %)		 24,356
(1.84 %)		 n/a 41.88
(97.91 %)		 866
(2.09 %)		 617
(99.68 %)		 3,419,622
(36.65 %)		 663,182
(2.53 %)		 11,508,574
(30.58 %)		 84,174
(4.85 %)
394 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1		 n/a 19,031
(1.88 %)		 21,003
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,133,745
(33.46 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,720,176
(32.32 %)		 35,414
(1.75 %)
395 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1		 n/a 18,875
(1.72 %)		 21,166
(1.58 %)		 n/a 41.18
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,727
(99.99 %)		 3,160,659
(34.00 %)		 696,130
(6.23 %)		 11,662,645
(34.26 %)		 36,176
(1.80 %)
396 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2		 n/a 18,342
(1.54 %)		 22,974
(1.62 %)		 n/a 43.04
(100.00 %)		 302
(0.00 %)		 588
(100.00 %)		 4,258,096
(37.31 %)		 1,289,911
(11.51 %)		 9,694,758
(42.52 %)		 65,974
(2.80 %)
397 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2		 n/a 17,492
(1.62 %)		 22,188
(1.72 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 247
(0.00 %)		 920
(100.00 %)		 3,886,341
(36.52 %)		 1,139,308
(10.89 %)		 9,356,457
(40.65 %)		 62,254
(3.00 %)
398 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1		 n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 64,369
(2.52 %)
399 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1		 53,210
(2.49 %)		 18,323
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 168
(100.00 %)		 4,224,344
(28.69 %)		 1,030,576
(2.60 %)		 12,591,989
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
400 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 62,675
(2.56 %)
401 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
402 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 48,101
(2.62 %)
403 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 49,636
(2.61 %)
404 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 71,530
(2.05 %)
405 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2		 61,447
(2.80 %)		 18,725
(1.51 %)		 20,946
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 2,076
(99.99 %)		 4,125,452
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,170
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
406 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,117
(3.28 %)		 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
407 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,854
(2.98 %)		 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
408 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 63,015
(4.70 %)
409 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 61,715
(0.94 %)
410 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1		 87,404
(4.24 %)		 18,382
(1.54 %)		 19,802
(1.30 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 90
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 3,146,889
(38.39 %)		 384,539
(2.15 %)		 12,642,995
(34.68 %)		 48,454
(1.30 %)
411 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
412 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
413 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1		 n/a 25,281
(0.80 %)		 18,740
(0.87 %)		 n/a 37.80
(99.99 %)		 196
(0.01 %)		 889
(99.99 %)		 6,538,990
(26.08 %)		 1,450,668
(2.40 %)		 21,374,371
(47.19 %)		 17,923
(0.30 %)
414 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 40,504
(1.02 %)
415 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 26,633
(0.68 %)
416 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
417 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1		 56,969
(2.88 %)		 19,974
(1.74 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 180
(100.00 %)		 4,116,239
(33.62 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,153
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
418 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
419 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,858
(2.22 %)
420 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 38,521
(1.60 %)
421 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
422 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1		 68,331
(2.37 %)		 21,280
(1.16 %)		 28,582
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,535
(100.00 %)		 4,378,949
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,725
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
423 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1		 n/a 18,172
(1.67 %)		 20,736
(1.60 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 2,998,913
(29.48 %)		 418,833
(1.07 %)		 11,783,716
(32.96 %)		 65,956
(4.38 %)
424 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1		 n/a 18,105
(1.68 %)		 20,751
(1.60 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,994,788
(29.48 %)		 415,375
(1.07 %)		 11,752,432
(32.88 %)		 65,597
(4.38 %)
425 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1		 112,768
(4.40 %)		 19,582
(1.52 %)		 20,911
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 4,598,813
(31.70 %)		 1,102,136
(4.40 %)		 13,591,364
(35.18 %)		 53,470
(2.24 %)
426 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1		 n/a 18,738
(1.56 %)		 19,759
(1.41 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 4,265,479
(32.40 %)		 1,030,876
(4.11 %)		 12,818,772
(34.22 %)		 50,269
(2.22 %)
427 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
428 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
429 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
430 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,359
(2.29 %)		 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
431 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 26,044
(0.71 %)
432 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 25,300
(0.76 %)
433 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
434 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
435 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 37,371
(0.76 %)
436 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1		 n/a 19,816
(1.60 %)		 22,341
(1.44 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,737
(100.00 %)		 3,099,775
(24.20 %)		 406,796
(2.52 %)		 13,117,056
(38.34 %)		 50,644
(1.33 %)
437 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2		 n/a 19,116
(1.66 %)		 21,184
(1.45 %)		 n/a 41.55
(95.50 %)		 71,769
(4.51 %)		 77,708
(95.49 %)		 3,026,678
(23.77 %)		 373,266
(0.91 %)		 13,167,376
(34.08 %)		 44,302
(1.21 %)
438 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1		 n/a 21,375
(1.65 %)		 26,769
(1.42 %)		 n/a 41.64
(92.66 %)		 83,831
(7.35 %)		 131,373
(92.65 %)		 5,022,053
(43.27 %)		 384,658
(1.22 %)		 13,422,381
(34.52 %)		 49,216
(1.18 %)
439 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 39,133
(0.76 %)
440 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 19,876
(0.50 %)
441 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1		 n/a 20,755
(1.51 %)		 20,024
(1.35 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 2,332
(0.04 %)		 264
(100.00 %)		 3,593,261
(30.76 %)		 529,045
(1.14 %)		 13,294,831
(36.07 %)		 32,235
(0.93 %)
442 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 40,717
(0.98 %)
443 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,587
(3.56 %)		 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
444 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
445 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3		 n/a 18,681
(1.79 %)		 19,816
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 101
(100.00 %)		 3,618,235
(37.24 %)		 612,229
(1.52 %)		 12,641,632
(35.02 %)		 60,518
(1.78 %)
446 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
447 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1		 n/a 18,001
(1.75 %)		 21,219
(1.77 %)		 n/a 42.26
(99.98 %)		 1,836
(0.02 %)		 1,062
(100.00 %)		 3,664,854
(32.90 %)		 906,692
(8.55 %)		 10,164,440
(37.98 %)		 56,705
(2.75 %)
448 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1		 n/a 17,899
(1.71 %)		 20,808
(1.69 %)		 n/a 42.15
(99.98 %)		 1,832
(0.02 %)		 2,485
(99.98 %)		 3,637,576
(31.92 %)		 930,013
(11.25 %)		 9,967,930
(39.61 %)		 56,237
(2.62 %)
449 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1		 n/a 17,944
(1.86 %)		 20,545
(1.83 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 154
(100.00 %)		 3,628,328
(34.57 %)		 838,723
(4.04 %)		 10,155,601
(35.22 %)		 56,332
(2.92 %)
450 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2		 n/a 19,475
(1.82 %)		 22,424
(1.68 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 212
(100.00 %)		 3,841,654
(38.99 %)		 801,041
(5.78 %)		 10,278,311
(38.66 %)		 64,639
(2.57 %)
451 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2		 n/a 18,368
(1.91 %)		 21,701
(1.80 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 136
(0.00 %)		 309
(100.00 %)		 3,509,151
(38.16 %)		 704,537
(5.21 %)		 9,806,703
(36.74 %)		 61,004
(2.65 %)
452 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 59,091
(1.70 %)
453 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 57,653
(1.29 %)
454 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
455 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2		 72,174
(2.47 %)		 21,051
(1.11 %)		 24,418
(1.07 %)		 n/a 41.00
(99.67 %)		 793
(0.33 %)		 546
(100.00 %)		 5,412,063
(53.31 %)		 738,320
(2.02 %)		 19,755,423
(43.69 %)		 142,597
(2.85 %)
456 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 139,490
(2.47 %)
457 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 23,523
(0.71 %)
458 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
459 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
460 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
461 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
462 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
463 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 74,800
(1.52 %)
464 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 53,559
(1.88 %)
465 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
466 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
467 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
468 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1		 n/a 18,933
(1.44 %)		 23,629
(1.50 %)		 n/a 42.60
(100.00 %)		 113
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 4,027,155
(30.73 %)		 712,278
(5.22 %)		 12,003,034
(41.58 %)		 96,116
(3.02 %)
469 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1		 n/a 18,305
(1.49 %)		 22,534
(1.56 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 282
(100.00 %)		 3,783,543
(30.10 %)		 656,592
(4.68 %)		 11,353,707
(40.26 %)		 92,041
(3.01 %)
470 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
471 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
472 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 57,236
(1.62 %)
473 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 69,898
(2.38 %)
474 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 69,897
(2.38 %)
475 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 74,314
(2.49 %)
476 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
477 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,953
(2.43 %)		 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
478 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2		 71,169
(3.14 %)		 21,276
(1.78 %)		 21,276
(1.42 %)		 n/a 41.44
(98.05 %)		 30,369
(1.95 %)		 43,734
(98.05 %)		 4,118,994
(34.95 %)		 578,801
(1.07 %)		 13,530,999
(33.27 %)		 51,258
(1.43 %)
479 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1		 n/a 16,996
(1.51 %)		 21,787
(1.66 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 3,293,772
(27.51 %)		 602,403
(3.02 %)		 11,827,700
(30.64 %)		 44,220
(1.55 %)
480 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1		 n/a 17,037
(1.43 %)		 21,690
(1.55 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 115
(0.00 %)		 1,031
(100.00 %)		 3,527,940
(26.81 %)		 646,620
(6.32 %)		 11,343,462
(34.09 %)		 47,125
(1.51 %)
481 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1		 n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 47,533
(1.43 %)
482 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 16,583
(0.36 %)
483 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 43,689
(2.08 %)
484 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1		 n/a 18,475
(1.82 %)		 19,990
(1.56 %)		 n/a 40.72
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 3,507,612
(39.92 %)		 711,081
(2.15 %)		 11,788,205
(32.17 %)		 35,670
(1.25 %)
485 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
486 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
487 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1		 n/a 21,764
(1.78 %)		 20,141
(1.30 %)		 n/a 41.87
(99.96 %)		 234
(0.04 %)		 120
(100.00 %)		 4,636,987
(39.98 %)		 1,579,595
(5.22 %)		 13,544,768
(38.06 %)		 20,127
(0.46 %)
488 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
489 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 97,432
(4.08 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
490 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
491 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
492 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 20,720
(0.48 %)
493 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1		 n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 21,006
(0.49 %)
494 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 21,449
(0.51 %)
495 nutria
GCA_004027025.1		 n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 59,854
(1.00 %)
496 okapi
GCA_001660835.1		 n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 47,417
(1.12 %)
497 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
498 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 59,382
(1.23 %)
499 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 74,961
(2.33 %)
500 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 49,134
(2.83 %)
501 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
502 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,970
(3.26 %)		 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
503 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 67,712
(4.23 %)
504 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
505 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
506 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
507 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
508 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 69,806
(1.89 %)
509 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 53,180
(4.61 %)
510 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
511 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 45,730
(0.84 %)
512 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 48,374
(1.14 %)
513 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
514 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
515 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
516 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
517 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,132
(1.82 %)
518 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1		 n/a 18,500
(1.46 %)		 19,718
(1.29 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 n/a 54
(100.00 %)		 4,068,783
(28.54 %)		 1,511,605
(5.52 %)		 12,867,101
(39.59 %)		 82,002
(2.44 %)
519 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 82,442
(2.62 %)
520 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1		 n/a 18,525
(1.46 %)		 19,792
(1.29 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 4,084,482
(28.40 %)		 1,424,314
(5.35 %)		 12,927,595
(39.56 %)		 81,967
(2.96 %)
521 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,794
(2.87 %)		 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 41,391
(1.27 %)
522 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
523 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,379
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
524 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,751
(2.39 %)		 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
525 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,175
(2.92 %)		 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 63,315
(1.93 %)
526 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
527 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1		 84,704
(3.63 %)		 19,312
(1.68 %)		 20,354
(1.41 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 6,577,724
(45.25 %)		 1,288,198
(5.24 %)		 13,978,540
(35.31 %)		 23,724
(0.69 %)
528 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 22,444
(0.57 %)
529 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
530 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
531 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
532 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 48,670
(1.19 %)
533 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,089
(2.76 %)		 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
534 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1		 117,131
(4.09 %)		 18,569
(1.70 %)		 20,018
(1.38 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 310
(0.00 %)		 2,146
(100.00 %)		 3,768,149
(39.86 %)		 632,308
(5.35 %)		 14,449,518
(32.71 %)		 42,166
(4.46 %)
535 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 69,437
(2.62 %)
536 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 65,437
(2.53 %)
537 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,588
(1.44 %)		 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
538 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 85,696
(1.65 %)
539 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 95,344
(2.15 %)
540 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 73,518
(2.67 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
541 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
542 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1		 n/a 17,527
(1.87 %)		 20,474
(1.83 %)		 n/a 41.67
(98.52 %)		 63,679
(1.49 %)		 75,985
(98.51 %)		 2,147,379
(23.41 %)		 327,740
(0.98 %)		 10,539,226
(28.05 %)		 44,487
(4.39 %)
543 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1		 n/a 19,881
(1.40 %)		 22,566
(1.32 %)		 n/a 44.09
(99.92 %)		 4,254
(0.08 %)		 5,157
(99.93 %)		 5,202,709
(44.78 %)		 1,059,544
(2.39 %)		 13,897,372
(40.69 %)		 119,691
(2.74 %)
544 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,033
(4.16 %)		 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 113,371
(2.46 %)
545 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1		 95,289
(4.22 %)		 19,385
(1.31 %)		 22,631
(1.31 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 221
(100.00 %)		 4,099,586
(21.20 %)		 1,062,900
(3.78 %)		 13,416,814
(41.72 %)		 116,523
(2.66 %)
546 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,642
(2.34 %)		 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
547 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,577
(2.89 %)		 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 52,450
(2.27 %)
548 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,083
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
549 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,461
(3.21 %)		 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 43,959
(1.30 %)
550 ratel
GCA_004024625.1		 n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 95,094
(1.91 %)
551 red bat
GCA_004026805.1		 n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 125,564
(3.55 %)
552 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
553 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
554 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1		 84,632
(3.45 %)		 19,565
(1.57 %)		 19,909
(1.38 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 104
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 4,480,315
(31.76 %)		 1,010,887
(2.70 %)		 13,766,344
(33.12 %)		 50,763
(2.22 %)
555 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2		 n/a 19,622
(1.57 %)		 20,371
(1.38 %)		 n/a 41.34
(99.98 %)		 1,845
(0.02 %)		 461
(100.00 %)		 4,519,485
(31.91 %)		 1,018,114
(2.59 %)		 13,810,284
(32.99 %)		 52,053
(2.31 %)
556 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2		 n/a 19,517
(1.57 %)		 20,105
(1.37 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 1,819
(0.02 %)		 350
(100.00 %)		 4,487,839
(31.79 %)		 1,010,106
(2.64 %)		 13,838,711
(33.07 %)		 51,373
(2.26 %)
557 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1		 43,508
(2.67 %)		 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,204
(1.88 %)
558 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 18,764
(0.58 %)
559 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
560 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1		 52,442
(2.57 %)		 19,577
(1.52 %)		 22,283
(1.38 %)		 n/a 41.89
(99.99 %)		 682
(0.01 %)		 267
(100.00 %)		 3,294,672
(23.89 %)		 527,436
(2.98 %)		 13,137,581
(39.89 %)		 57,436
(1.81 %)
561 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 48,931
(1.20 %)
562 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 55,319
(1.23 %)
563 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
564 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
565 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 57,318
(2.32 %)
566 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1		 n/a 18,825
(1.58 %)		 20,986
(1.29 %)		 n/a 42.25
(99.99 %)		 1,138
(0.01 %)		 1,150
(100.00 %)		 4,405,513
(43.51 %)		 1,342,544
(11.28 %)		 12,274,096
(41.76 %)		 76,936
(4.65 %)
567 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1		 n/a 18,061
(1.68 %)		 20,080
(1.36 %)		 n/a 41.97
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,135
(99.99 %)		 3,948,427
(43.52 %)		 848,222
(8.00 %)		 11,527,950
(38.76 %)		 70,117
(3.31 %)
568 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,792
(2.85 %)		 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 15,963
(0.43 %)
569 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 58,623
(2.22 %)
570 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
571 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
572 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2		 46,014
(2.36 %)		 18,616
(1.49 %)		 20,618
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 1,598
(99.99 %)		 4,020,525
(35.99 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,758
(42.64 %)		 66,188
(3.91 %)
573 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 46,883
(0.82 %)
574 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1		 n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 62,520
(2.73 %)
575 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2		 n/a 18,109
(2.10 %)		 21,263
(1.89 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 2,812,261
(34.39 %)		 457,565
(5.58 %)		 10,220,083
(31.02 %)		 59,522
(2.81 %)
576 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2		 n/a 17,286
(2.19 %)		 20,474
(1.95 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 86
(0.00 %)		 254
(100.00 %)		 2,610,773
(33.65 %)		 389,844
(4.42 %)		 9,728,138
(29.49 %)		 56,508
(2.97 %)
577 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 42,961
(1.10 %)
578 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 234,762
(1.56 %)
579 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,140
(2.17 %)		 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
580 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 118,227
(2.28 %)
581 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1		 n/a 19,292
(1.27 %)		 21,865
(1.14 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 1,179
(0.01 %)		 2,572
(100.00 %)		 4,525,289
(42.25 %)		 1,097,216
(21.14 %)		 12,203,884
(50.47 %)		 80,128
(1.58 %)
582 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1		 n/a 19,313
(1.37 %)		 21,662
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 1,066
(0.01 %)		 2,917
(99.99 %)		 4,418,625
(42.98 %)		 875,114
(15.81 %)		 12,360,254
(46.52 %)		 78,537
(1.66 %)
583 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1		 n/a 19,388
(1.42 %)		 21,612
(1.28 %)		 n/a 43.17
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 5,311,536
(44.06 %)		 653,238
(7.29 %)		 12,937,231
(44.10 %)		 63,230
(6.03 %)
584 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 44,477
(1.28 %)
585 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 43,911
(1.13 %)
586 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
587 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 15,455
(0.48 %)
588 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 49,177
(1.05 %)
589 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1		 n/a 20,087
(1.59 %)		 23,556
(1.46 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,724
(0.03 %)		 1,889
(100.00 %)		 3,925,148
(27.17 %)		 419,490
(1.24 %)		 13,364,988
(37.79 %)		 47,630
(1.31 %)
590 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
591 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 107,473
(2.80 %)
592 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,569
(3.37 %)		 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 64,690
(2.41 %)
593 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 126,152
(2.28 %)
594 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 31,883
(0.72 %)
595 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
596 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
597 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 34,141
(0.80 %)
598 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1		 n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 16,724
(0.41 %)
599 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 21,349
(0.52 %)
600 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1		 n/a 22,529
(1.85 %)		 20,409
(1.22 %)		 n/a 41.10
(99.90 %)		 78
(0.10 %)		 416
(99.90 %)		 4,880,101
(47.77 %)		 1,689,287
(15.13 %)		 12,822,147
(42.92 %)		 22,642
(0.54 %)
601 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 53,182
(1.62 %)
602 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
603 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,058
(3.04 %)		 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
604 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
605 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
606 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 71,951
(0.98 %)
607 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
608 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
609 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
610 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1		 n/a 19,471
(1.39 %)		 22,951
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 1,095
(0.01 %)		 1,604
(100.00 %)		 4,307,839
(34.31 %)		 825,475
(10.97 %)		 11,375,945
(45.31 %)		 76,527
(3.10 %)
611 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1		 n/a 18,591
(1.46 %)		 21,588
(1.27 %)		 n/a 42.00
(99.99 %)		 974
(0.01 %)		 2,126
(99.99 %)		 3,961,403
(34.20 %)		 742,897
(9.73 %)		 10,832,739
(43.68 %)		 70,803
(2.85 %)
612 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1		 n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 69,001
(1.39 %)
613 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,616
(2.83 %)		 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 86,751
(2.23 %)
614 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1		 n/a 15,188
(0.80 %)		 15,406
(0.90 %)		 n/a 36.07
(99.97 %)		 151
(0.03 %)		 157
(99.97 %)		 4,933,924
(23.65 %)		 1,239,006
(2.76 %)		 20,612,787
(41.98 %)		 21,700
(0.64 %)
615 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1		 n/a 15,441
(0.80 %)		 15,791
(0.92 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 118
(0.01 %)		 124
(99.99 %)		 4,962,547
(23.62 %)		 1,257,253
(2.87 %)		 20,652,321
(42.01 %)		 22,718
(0.69 %)
616 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,079
(2.76 %)
617 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
618 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 38,450
(1.17 %)
619 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 17,544
(0.44 %)
620 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1		 n/a 19,605
(1.80 %)		 20,075
(1.48 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 80
(100.00 %)		 4,110,913
(40.46 %)		 838,212
(2.48 %)		 11,938,168
(33.52 %)		 40,424
(1.32 %)
621 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 67,245
(2.34 %)
622 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 59,513
(1.87 %)
623 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
624 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
625 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 69,835
(2.20 %)
626 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 58,977
(2.20 %)
627 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1		 n/a 19,326
(0.81 %)		 17,560
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,895
(100.00 %)		 6,382,198
(27.07 %)		 1,058,207
(1.74 %)		 22,508,040
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
628 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1		 55,990
(2.41 %)		 19,328
(0.81 %)		 17,559
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,896
(100.00 %)		 6,382,203
(27.07 %)		 1,058,208
(1.74 %)		 22,508,106
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
629 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 45,201
(1.03 %)
630 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1		 36,400
(1.65 %)		 19,192
(1.42 %)		 22,014
(1.41 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 3,242,768
(21.18 %)		 612,565
(8.05 %)		 12,812,990
(44.37 %)		 75,177
(5.86 %)
631 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
632 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 114,955
(1.43 %)
633 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 54,528
(2.15 %)
634 tailess tenrec (hap1 2025)
GCF_050624435.1		 45,770
(1.60 %)		 21,323
(0.86 %)		 25,223
(1.02 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 2,180
(100.00 %)		 5,633,466
(38.91 %)		 1,001,072
(14.26 %)		 17,866,411
(50.04 %)		 53,320
(1.01 %)
635 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,927
(1.65 %)		 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 49,134
(7.43 %)
636 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 70,793
(1.26 %)
637 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
638 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1		 n/a 17,491
(0.79 %)		 15,701
(0.88 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 5,762,317
(26.52 %)		 1,078,692
(1.83 %)		 22,476,051
(38.99 %)		 22,756
(0.48 %)
639 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1		 n/a 17,037
(0.79 %)		 15,066
(0.87 %)		 n/a 38.62
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 24
(100.00 %)		 5,608,153
(26.57 %)		 1,050,173
(1.77 %)		 21,856,273
(38.96 %)		 21,811
(0.47 %)
640 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1		 73,219
(3.07 %)		 17,615
(0.77 %)		 15,415
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 272
(100.00 %)		 5,866,314
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,480
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
641 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1		 n/a 15,725
(0.77 %)		 16,721
(0.92 %)		 n/a 36.17
(99.49 %)		 1,514
(0.51 %)		 1,521
(99.49 %)		 5,222,976
(23.42 %)		 1,357,438
(3.95 %)		 21,705,122
(42.26 %)		 24,443
(0.70 %)
642 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1		 n/a 15,165
(0.76 %)		 15,663
(0.91 %)		 n/a 36.00
(99.11 %)		 2,578
(0.89 %)		 2,584
(99.11 %)		 5,039,957
(23.64 %)		 1,257,168
(2.97 %)		 20,893,744
(41.44 %)		 22,574
(0.67 %)
643 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1		 52,070
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
644 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 28,317
(0.64 %)
645 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1		 n/a 19,552
(1.59 %)		 19,307
(1.35 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 145
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 4,500,832
(32.18 %)		 999,068
(2.01 %)		 13,646,015
(32.98 %)		 49,402
(2.19 %)
646 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 64,312
(2.55 %)
647 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
648 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
649 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 9,596
(0.16 %)
650 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1		 n/a 18,871
(1.79 %)		 20,351
(1.55 %)		 n/a 40.66
(99.99 %)		 397
(0.01 %)		 136
(100.00 %)		 3,580,957
(40.75 %)		 683,947
(2.19 %)		 11,464,418
(33.39 %)		 37,175
(1.31 %)
651 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1		 n/a 19,530
(1.21 %)		 24,576
(1.13 %)		 n/a 42.48
(99.99 %)		 1,240
(0.01 %)		 2,757
(100.00 %)		 4,847,855
(34.88 %)		 949,927
(20.01 %)		 10,981,914
(51.51 %)		 91,880
(2.74 %)
652 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1		 n/a 19,313
(1.40 %)		 22,642
(1.25 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,457
(99.99 %)		 4,540,507
(37.61 %)		 826,104
(12.82 %)		 11,296,445
(45.25 %)		 80,840
(2.24 %)
653 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,680
(2.07 %)		 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
654 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 26,541
(0.58 %)
655 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
656 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
657 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
658 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,565
(3.26 %)		 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 40,189
(1.07 %)
659 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,264
(2.73 %)		 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
660 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
661 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
662 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
663 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 22,985
(0.56 %)
664 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1		 n/a 20,291
(1.29 %)		 23,555
(1.23 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 212
(100.00 %)		 4,204,612
(25.49 %)		 848,463
(7.79 %)		 12,687,776
(48.28 %)		 57,315
(1.25 %)
665 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 54,394
(1.54 %)
666 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 22,568
(0.53 %)
667 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2		 n/a 19,504
(1.78 %)		 22,272
(1.73 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 1,566
(0.02 %)		 533
(100.00 %)		 3,046,246
(25.06 %)		 753,151
(4.86 %)		 10,596,418
(37.62 %)		 66,785
(2.55 %)
668 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1		 n/a 18,681
(1.83 %)		 21,523
(1.79 %)		 n/a 43.13
(99.99 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,741
(99.99 %)		 2,849,223
(24.50 %)		 688,594
(4.80 %)		 9,968,980
(36.80 %)		 64,365
(2.68 %)
669 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
670 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,995
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
671 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
672 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2		 68,660
(3.60 %)		 19,951
(1.73 %)		 21,804
(1.48 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 4,512,173
(43.10 %)		 402,481
(1.14 %)		 12,813,223
(37.56 %)		 45,863
(1.30 %)
673 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,787
(2.93 %)		 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
674 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
675 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
676 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
677 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
678 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 41,935
(0.63 %)
679 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1		 52,505
(2.90 %)		 19,278
(1.60 %)		 20,813
(1.31 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 2,040
(100.00 %)		 5,706,841
(46.71 %)		 464,013
(1.82 %)		 12,973,198
(41.46 %)		 42,508
(1.32 %)
680 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1		 29,789
(1.92 %)		 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
681 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 36,914
(1.02 %)
682 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 68,562
(1.41 %)
683 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
684 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1		 n/a 19,363
(1.28 %)		 22,239
(1.28 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 112
(100.00 %)		 4,432,114
(42.23 %)		 966,165
(7.11 %)		 13,263,822
(43.77 %)		 96,755
(2.28 %)
685 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,310
(2.49 %)		 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 59,050
(1.48 %)
686 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,128
(1.61 %)		 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 62,458
(1.54 %)
687 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1		 55,299
(2.52 %)		 19,502
(1.44 %)		 20,297
(1.34 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 813
(100.00 %)		 4,038,893
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,633
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
688 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1		 n/a 18,677
(1.51 %)		 19,370
(1.40 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 307
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 3,694,109
(28.05 %)		 793,102
(2.43 %)		 13,585,913
(33.39 %)		 33,990
(1.02 %)
689 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,667
(2.16 %)		 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 34,122
(0.91 %)
690 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,618
(2.51 %)		 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 28,118
(0.66 %)
691 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 38,521
(0.68 %)
692 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
693 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
694 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1		 n/a 18,352
(1.71 %)		 20,233
(1.46 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,530
(100.00 %)		 3,466,695
(41.95 %)		 934,524
(8.81 %)		 11,690,112
(36.30 %)		 35,257
(5.20 %)
695 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 61,910
(2.52 %)
696 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1		 48,707
(3.25 %)		 18,807
(1.93 %)		 21,046
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 684
(100.00 %)		 3,552,235
(38.46 %)		 719,552
(4.26 %)		 10,089,365
(36.35 %)		 60,974
(2.61 %)
697 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1		 n/a 19,162
(1.53 %)		 20,991
(1.34 %)		 n/a 41.77
(99.99 %)		 350
(0.01 %)		 292
(100.00 %)		 3,296,209
(23.14 %)		 440,574
(1.28 %)		 12,824,144
(40.98 %)		 39,400
(1.07 %)
698 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,830
(2.52 %)		 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
699 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1		 70,745
(4.27 %)		 19,546
(1.58 %)		 21,187
(1.33 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 283
(0.00 %)		 67
(100.00 %)		 5,530,890
(46.61 %)		 459,827
(1.43 %)		 13,190,355
(41.36 %)		 42,544
(1.21 %)
TOTALS:total assembly count 699

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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
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HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats