Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,607
(1.08 %)
18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
6 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
7 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
68,531
(1.61 %)
8 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1
n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
62,315
(1.49 %)
9 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
10 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
54,502
(1.38 %)
11 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
30,191
(0.63 %)
12 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
75,377
(2.21 %)
13 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
14 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,686
(2.34 %)
19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
15 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
78,849
(3.32 %)
16 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1
n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
68,981
(3.00 %)
17 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
62,580
(1.91 %)
18 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
19 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
20 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,253
(1.93 %)
17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
21 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
22 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
60,350
(1.67 %)
23 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
54,919
(1.33 %)
24 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
25 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
26 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
27 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
28 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,519
(3.85 %)
18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
29 Arabian camel (paternal 2024)
GCA_036321535.1
n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
55,428
(1.61 %)
30 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
52,135
(1.67 %)
31 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
32 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
33 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
34 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
50,264
(1.15 %)
35 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
69,120
(1.32 %)
36 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
44,158
(1.19 %)
37 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
37,174
(1.87 %)
38 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
36,699
(1.70 %)
39 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
40 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,989
(3.12 %)
18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
41 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
70,515
(2.88 %)
42 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
43 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,178
(3.64 %)
18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
44 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
45 bank vole
GCF_902806735.1
56,410
(2.99 %)
18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
18,784
(0.42 %)
46 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
47 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
59,710
(1.51 %)
48 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,400
(3.08 %)
18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
49 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,720
(2.99 %)
50 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
77,605
(3.68 %)
51 bighorn sheep
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
52 black flying fox
GCF_000325575.1
46,978
(3.15 %)
18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,483
(3.88 %)
53 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,402
(2.78 %)
18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
54,060
(2.11 %)
54 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
55 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
56 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
57 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021)
GCF_020826845.1
56,255
(2.28 %)
18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
58 black rhinoceros (mBicDic1 alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
59 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
44,113
(0.97 %)
60 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
62,389
(1.68 %)
61 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,540
(2.07 %)
19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
62 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
56,916
(1.85 %)
63 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
55,436
(1.85 %)
64 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
65 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
100,915
(3.00 %)
66 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,362
(2.39 %)
18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
69,211
(2.68 %)
67 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
48,826
(1.07 %)
68 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
33,757
(1.35 %)
69 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
31,102
(1.31 %)
70 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
27,049
(1.25 %)
71 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
26,416
(1.35 %)
72 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
63,428
(1.55 %)
73 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
60,067
(1.55 %)
74 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
75 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
68,896
(2.40 %)
76 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
77 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
78 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
64,814
(2.05 %)
79 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,242
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
80 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
60,671
(2.39 %)
81 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
62,325
(2.36 %)
82 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,524
(2.02 %)
18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
19,540
(0.49 %)
83 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,274
(3.80 %)
18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
19,529
(0.58 %)
84 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
44,467
(1.57 %)
85 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
44,449
(1.57 %)
86 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
87 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
88 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
20,062
(0.64 %)
89 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
19,104
(0.65 %)
90 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
39,082
(2.44 %)
91 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
39,099
(2.44 %)
92 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
93 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
94 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
95 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
96 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
37,158
(0.70 %)
97 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
98 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
99,752
(3.73 %)
99 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,927
(4.11 %)
19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
46,864
(1.37 %)
100 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
42,869
(1.24 %)
101 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
172,178
(3.66 %)
102 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
60,367
(2.22 %)
103 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,744
(2.17 %)
104 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,612
(2.80 %)
19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
46,689
(1.12 %)
105 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
106 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
45,993
(2.59 %)
20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
107 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
108 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
18,838
(0.40 %)
109 Chinese pangolin (hap1 mManPen7 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
110 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
48,960
(1.19 %)
111 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
112 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
113 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
114 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
115 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
116 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
56,375
(2.45 %)
117 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
67,830
(2.45 %)
118 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
119 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
65,379
(1.89 %)
120 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,207
(3.31 %)
18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
121 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
122 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
123 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
124 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
57,295
(2.83 %)
125 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
50,430
(2.54 %)
126 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
127 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,054
(3.40 %)
18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
70,701
(2.48 %)
128 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1
n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
61,931
(2.30 %)
129 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,031
(3.24 %)
18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
51,634
(1.37 %)
130 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,088
(2.64 %)
18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
75,592
(1.86 %)
131 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
132 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
133 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
134 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
135 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
136 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
137 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
138 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
64,920
(2.51 %)
139 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
62,910
(2.66 %)
140 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
141 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
142 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,152
(2.13 %)
22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
143 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,279
(2.11 %)
19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
17,053
(0.51 %)
144 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
145 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
146 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
51,216
(2.28 %)
147 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,549
(3.63 %)
19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,269
(2.07 %)
148 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,774
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
149 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
53,518
(2.23 %)
150 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
151 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
69,725
(2.42 %)
152 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,089
(3.30 %)
18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,701
(2.41 %)
153 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
154 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,855
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
155 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
156 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
157 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
29,863
(0.83 %)
158 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
29,828
(0.79 %)
159 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
160 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
99,224
(2.27 %)
161 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
162 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
24,508
(0.70 %)
163 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,244
(6.54 %)
164 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
165 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
166 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
167 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,139
(2.25 %)
168 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,332
(3.19 %)
18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
169 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
170 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
171 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
26,414
(0.61 %)
172 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
173 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
174 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
175 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
27,057
(1.96 %)
176 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
177 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
14,146
(0.57 %)
178 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
17,423
(0.62 %)
179 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
47,810
(2.50 %)
180 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
67,132
(2.54 %)
181 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
61,481
(4.29 %)
182 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,851
(2.58 %)
183 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
77,009
(2.86 %)
184 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
79,785
(2.86 %)
185 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
17,629
(0.60 %)
186 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
187 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,114
(2.24 %)
19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
188 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
20,865
(0.55 %)
189 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
190 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,211
(2.50 %)
18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
22,480
(0.71 %)
191 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
26,411
(0.73 %)
192 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,015
(2.86 %)
18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
70,402
(2.61 %)
193 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
32,563
(0.80 %)
194 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,645
(2.08 %)
18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
195 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
196 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
197 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
75,114
(1.33 %)
198 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
45,586
(0.89 %)
199 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,331
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
200 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
201 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
202 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,468
(3.27 %)
19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
59,449
(1.50 %)
203 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,159
(2.31 %)
19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
125,662
(4.00 %)
204 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
205 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
206 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
207 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
208 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
209 gray seal
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
210 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,375
(2.34 %)
16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
211 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
24,879
(0.67 %)
212 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
213 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
214 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
38,976
(1.13 %)
215 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
51,996
(2.15 %)
216 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
32,293
(2.35 %)
217 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,895
(3.26 %)
18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
32,949
(0.96 %)
218 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
219 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
220 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
221 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
222 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
223 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
62,189
(5.35 %)
224 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
225 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
73,507
(1.72 %)
226 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1
n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
227 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
228 harbor porpoise (primary hap 2024)
GCA_963924675.1
n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
229 harbor seal
GCF_004348235.1
50,670
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
230 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
231 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
232 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
36,143
(1.96 %)
233 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
71,058
(1.88 %)
234 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
54,753
(1.59 %)
235 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
48,380
(1.43 %)
236 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
48,164
(1.90 %)
237 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
238 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
239 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
240 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
241 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
242 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
243 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
59,066
(1.72 %)
244 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,567
(4.06 %)
18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,825
(1.77 %)
245 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
37,293
(2.80 %)
246 horse (paternal 2024)
GCA_036426135.1
n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
43,527
(2.54 %)
247 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
23,955
(0.54 %)
248 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
506
(0.31 %)
249 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
250 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
23,211
(0.57 %)
251 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
23,309
(0.57 %)
252 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
23,203
(0.56 %)
253 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
23,196
(0.56 %)
254 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
23,262
(0.56 %)
255 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
130,343
(4.85 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
256 house mouse C57BL_6NJ
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
257 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
258 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
23,232
(0.56 %)
259 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
24,140
(0.59 %)
260 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
22,696
(0.55 %)
261 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
24,374
(0.54 %)
262 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
23,253
(0.56 %)
263 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
24,187
(0.54 %)
264 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
22,270
(0.54 %)
265 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
266 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
267 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,973
(3.41 %)
18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
47,466
(2.89 %)
268 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
269 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
270 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
271 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
272 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
43,736
(1.20 %)
273 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
274 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,565
(4.12 %)
19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
63,777
(2.41 %)
275 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
276 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,705
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
277 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
61,951
(1.93 %)
278 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
24,168
(0.56 %)
279 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
68,778
(2.92 %)
280 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
281 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
282 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
57,347
(3.41 %)
283 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
284 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
285 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
286 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
19,817
(0.34 %)
287 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
123,453
(2.17 %)
288 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,266
(3.20 %)
18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
77,001
(2.45 %)
289 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,488
(3.29 %)
18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
65,793
(2.64 %)
290 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
291 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,991
(1.44 %)
19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
292 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
293 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
294 lesser panda
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
295 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
296 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
297 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
48,101
(2.62 %)
298 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
49,636
(2.61 %)
299 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
300 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,797
(2.84 %)
18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
71,821
(5.51 %)
301 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,104
(3.28 %)
18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
302 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,841
(2.98 %)
18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
303 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
304 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
305 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
306 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
307 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
38,521
(1.60 %)
308 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1
n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
309 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
310 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
311 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,858
(2.22 %)
312 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
313 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
69,852
(1.62 %)
314 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
315 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,346
(2.29 %)
21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
316 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
26,044
(0.71 %)
317 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
25,300
(0.76 %)
318 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
13,856
(0.35 %)
319 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
320 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
321 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
322 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
323 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,574
(3.56 %)
21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
324 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
40,717
(0.98 %)
325 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
326 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
327 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
328 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
329 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
139,490
(2.47 %)
330 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
131,852
(2.78 %)
331 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
140,990
(2.86 %)
332 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
23,523
(0.71 %)
333 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
24,733
(0.70 %)
334 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
40,925
(1.35 %)
335 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
51,299
(1.36 %)
336 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
85,881
(1.90 %)
337 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
338 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
339 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
340 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
76,164
(3.52 %)
341 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
77,656
(3.27 %)
342 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
85,908
(2.60 %)
343 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
62,007
(1.94 %)
344 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
67,258
(2.00 %)
345 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 alternate hap 2023)
GCA_029215635.1
n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
74,314
(2.49 %)
346 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 primary hap 2023)
GCA_029215605.1
n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
69,898
(2.38 %)
347 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
348 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
349 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,940
(2.43 %)
23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
350 northern gundi
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
351 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
352 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
353 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
n/a 21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
354 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
355 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
356 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
357 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
358 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
359 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
20,720
(0.48 %)
360 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1
n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
21,006
(0.49 %)
361 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
21,449
(0.51 %)
362 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
363 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
364 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
365 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
366 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
367 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
49,134
(2.83 %)
368 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
369 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,947
(3.26 %)
18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
370 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
67,712
(4.23 %)
371 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
67,718
(4.23 %)
372 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
373 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
374 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
70,272
(2.89 %)
375 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
376 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
53,180
(4.61 %)
377 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
77,397
(4.55 %)
378 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
379 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
380 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
40,162
(1.31 %)
381 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022)
GCA_027409185.1
n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
382 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
81,791
(2.82 %)
383 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,132
(1.82 %)
384 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
385 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,779
(2.87 %)
19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
41,391
(1.27 %)
386 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,538
(8.24 %)
387 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
388 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,764
(2.39 %)
18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
389 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,188
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
390 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
391 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
392 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
393 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
48,670
(1.19 %)
394 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,076
(2.76 %)
19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
395 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,575
(1.43 %)
17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
396 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
65,437
(2.53 %)
397 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1
n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
69,437
(2.62 %)
398 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
399 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
400 pygmy sperm whale (mKogBre1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
56,261
(2.22 %)
18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
401 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
106,168
(2.78 %)
402 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,045
(4.16 %)
19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
113,371
(2.46 %)
403 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,655
(2.34 %)
18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
404 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,564
(2.89 %)
19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
52,450
(2.27 %)
405 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,096
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
406 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,474
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
407 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
408 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
409 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
410 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
128,858
(2.07 %)
411 red fox
GCF_003160815.1
43,495
(2.67 %)
19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,204
(1.88 %)
412 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
18,764
(0.58 %)
413 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
79,357
(2.66 %)
414 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
415 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
48,931
(1.20 %)
416 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
74,971
(1.64 %)
417 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
418 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
57,318
(2.32 %)
419 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,779
(2.85 %)
21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
15,963
(0.43 %)
420 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
58,623
(2.22 %)
421 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
422 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
423 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
424 Schreibers' long-fingered bat
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
425 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
426 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
427 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,127
(2.16 %)
18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
428 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
429 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
44,477
(1.28 %)
430 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
431 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
432 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
15,455
(0.48 %)
433 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
49,177
(1.05 %)
434 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
435 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
107,473
(2.80 %)
436 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,556
(3.37 %)
18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
64,690
(2.41 %)
437 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
438 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
439 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
62,524
(3.25 %)
440 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
63,256
(3.06 %)
441 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
442 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
21,349
(0.52 %)
443 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
444 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
445 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,045
(3.04 %)
20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
446 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
59,907
(1.35 %)
447 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
448 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
449 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
51,339
(1.15 %)
450 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
451 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
452 Sowerby's beaked whale
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
453 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,615
(2.83 %)
19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
86,751
(2.23 %)
454 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,079
(2.76 %)
455 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
456 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
457 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
17,544
(0.44 %)
458 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
459 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
460 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
67,537
(3.57 %)
461 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
68,498
(4.29 %)
462 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
463 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
464 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
45,201
(1.03 %)
465 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
466 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
114,955
(1.43 %)
467 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
468 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,914
(1.65 %)
19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
49,134
(7.43 %)
469 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
470 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1
n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
23,629
(0.48 %)
471 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
12,393
(0.46 %)
472 Tasmanian devil
GCF_902635505.1
52,057
(2.36 %)
15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
473 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
474 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
475 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
48,226
(2.42 %)
476 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
47,139
(2.58 %)
477 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
478 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,667
(2.07 %)
19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
479 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
26,541
(0.58 %)
480 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
481 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
482 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
483 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,552
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
484 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,251
(2.73 %)
21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
485 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
486 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
23,321
(0.97 %)
487 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
488 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
22,985
(0.56 %)
489 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
490 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
56,325
(3.33 %)
491 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,982
(2.43 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
492 white-footed mouse
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
493 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,774
(2.93 %)
20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
494 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
15,669
(0.79 %)
495 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
496 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
497 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
498 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
499 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
22,568
(0.53 %)
500 wild yak
GCF_000298355.1
29,776
(1.92 %)
19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
501 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
36,914
(1.02 %)
502 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
503 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
504 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,297
(2.49 %)
18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
505 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,115
(1.61 %)
18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
62,458
(1.54 %)
506 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,654
(2.16 %)
19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
34,122
(0.91 %)
507 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,606
(2.50 %)
15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
28,118
(0.66 %)
508 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
509 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
28,674
(0.68 %)
510 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
31,831
(0.63 %)
511 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a 19,188
(1.79 %)
21,673
(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
215
(0.00 %)
250
(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
773,853
(4.49 %)
10,648,494
(37.26 %)
61,910
(2.52 %)
512 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023)
GCA_028538775.1
n/a 18,587
(1.82 %)
21,049
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
685
(100.00 %)
2,890,086
(24.28 %)
719,555
(4.26 %)
10,089,514
(36.35 %)
60,975
(2.61 %)
513 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,817
(2.52 %)
18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 513

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 207 assemblies assembly stats track stats
Mammals 513 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 648 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 798 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats