Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,594
(1.08 %)
18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2
70,837
(3.51 %)
19,640
(1.95 %)
19,607
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
5,625,390
(42.96 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,806
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
7 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
8 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
49,122
(2.32 %)
10 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
50,954
(2.21 %)
11 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
12 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
68,531
(1.61 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1
n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
62,315
(1.49 %)
14 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
62,314
(1.49 %)
15 African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022)
GCA_021653895.1
n/a 20,232
(2.08 %)
18,517
(1.32 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
n/a 7,311
(100.00 %)
5,083,017
(39.13 %)
1,337,200
(3.02 %)
13,402,561
(30.35 %)
17,841
(0.51 %)
16 African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021)
GCA_019843795.1
n/a 26,123
(1.59 %)
49,154
(1.23 %)
n/a 41.38
(99.06 %)
92,030
(0.93 %)
412,491
(99.07 %)
5,251,146
(37.28 %)
1,541,020
(3.13 %)
13,613,713
(32.35 %)
21,054
(0.58 %)
17 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
18 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1
n/a 22,687
(1.16 %)
46,299
(0.94 %)
n/a 41.37
(99.72 %)
75,967
(0.24 %)
659,537
(99.76 %)
6,139,432
(45.57 %)
1,339,550
(3.13 %)
12,293,115
(32.34 %)
16,575
(0.44 %)
19 alpaca (2025)
GCF_048564905.1
80,233
(3.11 %)
18,667
(1.53 %)
23,043
(1.52 %)
n/a 41.92
(99.91 %)
681
(0.09 %)
519
(100.00 %)
3,387,094
(33.34 %)
395,581
(10.22 %)
11,510,740
(36.96 %)
72,497
(1.98 %)
20 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
54,502
(1.38 %)
21 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
30,191
(0.63 %)
22 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
75,377
(2.21 %)
23 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
76,769
(2.57 %)
24 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
76,453
(2.43 %)
25 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
33,775
(0.84 %)
26 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a 18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
37,124
(0.86 %)
27 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
24,454
(0.96 %)
28 American beaver (hap1v2 2025)
GCA_047511655.2
n/a 19,759
(1.46 %)
19,656
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
181
(0.00 %)
182
(100.00 %)
4,077,829
(35.51 %)
563,159
(2.55 %)
14,502,350
(35.45 %)
23,983
(0.89 %)
29 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
23,386
(0.80 %)
30 American beaver (hap2v2 2025)
GCA_047511605.2
n/a 19,115
(1.44 %)
18,756
(1.21 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
194
(0.00 %)
154
(100.00 %)
4,032,632
(35.91 %)
560,508
(2.24 %)
14,349,713
(35.01 %)
23,225
(0.77 %)
31 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1
79,343
(3.55 %)
19,759
(1.46 %)
19,920
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
181
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,023,733
(35.50 %)
563,158
(2.55 %)
14,502,226
(35.45 %)
23,983
(0.89 %)
32 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
33 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
34 American black bear (L20-20 2025)
GCA_024610735.2
n/a 18,082
(1.59 %)
20,977
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
41
(0.00 %)
298
(100.00 %)
4,773,058
(45.96 %)
641,956
(5.91 %)
13,210,521
(35.54 %)
68,976
(3.00 %)
35 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
78,849
(3.32 %)
36 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1
n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
68,981
(3.00 %)
37 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
62,580
(1.91 %)
38 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
39 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
65,430
(2.64 %)
40 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
64,307
(2.75 %)
41 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
42 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
60,350
(1.67 %)
43 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
54,919
(1.33 %)
44 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,240
(1.93 %)
17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
45 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
46 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1
n/a 18,360
(1.57 %)
20,615
(1.47 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
53
(0.00 %)
758
(100.00 %)
4,038,995
(32.25 %)
664,825
(1.25 %)
13,625,080
(33.05 %)
56,595
(2.13 %)
47 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
48 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
102,112
(3.75 %)
49 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024)
GCA_043748605.1
n/a 17,996
(1.77 %)
23,084
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 1,670
(100.00 %)
4,087,571
(42.52 %)
525,056
(2.00 %)
10,779,134
(34.81 %)
100,610
(3.93 %)
50 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
51 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
52 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
53 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
54 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
55 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
52,135
(1.67 %)
56 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1
n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
55,428
(1.61 %)
57 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
55,427
(1.61 %)
58 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
59 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
60 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
34,781
(0.82 %)
61 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
31,201
(0.78 %)
62 Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024)
GCF_045843805.1
45,939
(2.00 %)
19,773
(1.41 %)
20,880
(1.28 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
694
(0.00 %)
2,529
(100.00 %)
5,291,989
(39.61 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,212
(36.45 %)
34,781
(0.82 %)
63 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
64 Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021)
GCA_016801275.1
n/a 18,688
(1.73 %)
22,642
(1.64 %)
n/a 41.26
(97.24 %)
152,126
(2.77 %)
303,244
(97.23 %)
3,431,580
(28.56 %)
667,375
(2.21 %)
13,572,972
(26.90 %)
42,853
(1.30 %)
65 Asiatic elephant (hap1 2025)
GCA_051911825.1
n/a 18,110
(1.16 %)
21,254
(1.07 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
83
(0.00 %)
106
(100.00 %)
8,688,198
(60.75 %)
617,944
(3.48 %)
16,342,943
(48.24 %)
54,726
(1.19 %)
66 Asiatic elephant (hap2 2025)
GCA_051911805.1
n/a 17,315
(1.21 %)
20,345
(1.11 %)
n/a 41.03
(99.98 %)
51
(0.02 %)
88
(100.00 %)
8,066,849
(59.94 %)
495,013
(2.47 %)
15,276,267
(46.85 %)
44,484
(1.08 %)
67 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
50,264
(1.15 %)
68 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
69,120
(1.32 %)
69 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
44,158
(1.19 %)
70 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
37,174
(1.87 %)
71 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
36,699
(1.70 %)
72 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
73 ass (Donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1
92,510
(3.84 %)
18,566
(1.54 %)
21,504
(1.32 %)
n/a 42.37
(99.94 %)
7
(0.06 %)
849
(100.00 %)
3,555,052
(38.38 %)
658,645
(5.79 %)
14,242,715
(36.79 %)
43,875
(3.45 %)
74 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,976
(3.12 %)
18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
75 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
79,762
(4.08 %)
76 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
74,348
(3.46 %)
77 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
70,515
(2.88 %)
78 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
79 Australian echidna (primary hap 2020)
GCA_015852505.1
n/a 14,558
(1.03 %)
19,716
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
311
(100.00 %)
11,576,251
(65.36 %)
1,219,765
(6.93 %)
9,488,197
(55.68 %)
78,365
(2.74 %)
80 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,191
(3.64 %)
18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
81 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1
76,927
(4.47 %)
18,239
(1.57 %)
22,111
(1.51 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
127
(0.00 %)
158
(100.00 %)
3,258,307
(30.21 %)
377,352
(13.70 %)
11,533,205
(36.22 %)
65,887
(1.95 %)
82 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
83 bank vole
GCF_902806735.1
56,423
(2.99 %)
18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
18,784
(0.42 %)
84 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
85 banteng 2023
GCF_032452875.1
71,974
(3.56 %)
19,305
(1.36 %)
21,174
(1.20 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
84
(0.00 %)
1,518
(100.00 %)
3,344,481
(20.63 %)
1,039,571
(11.74 %)
13,031,356
(47.36 %)
73,031
(1.72 %)
86 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
63,688
(2.22 %)
87 bat C.sowelli (hap1 2025)
GCA_051307085.1
n/a 18,014
(1.42 %)
20,809
(1.93 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
68
(0.00 %)
509
(100.00 %)
3,004,656
(32.84 %)
845,572
(16.12 %)
11,658,155
(41.10 %)
66,315
(3.59 %)
88 bat C.sowelli (hap2 2025)
GCA_051307135.1
n/a 17,963
(1.56 %)
20,587
(1.76 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
58
(0.00 %)
272
(100.00 %)
2,925,013
(29.51 %)
669,006
(8.09 %)
11,656,071
(35.51 %)
66,056
(3.20 %)
89 bat G.keenani (hap1 2025)
GCA_050655435.1
n/a 17,710
(1.68 %)
20,322
(1.57 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
103
(0.00 %)
188
(100.00 %)
3,982,570
(44.25 %)
413,159
(3.00 %)
12,157,326
(33.66 %)
69,493
(3.54 %)
90 bat G.keenani (hap2 2025)
GCA_050655445.1
n/a 17,129
(1.75 %)
19,351
(1.61 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
57
(0.00 %)
83
(100.00 %)
3,507,996
(42.55 %)
382,739
(1.78 %)
11,541,032
(32.12 %)
67,214
(3.68 %)
91 bat H.larvatus (alternate hap 2023)
GCA_031878685.1
n/a 19,431
(1.77 %)
23,767
(1.57 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,531
(100.00 %)
4,390,631
(44.16 %)
678,913
(4.61 %)
11,883,673
(33.41 %)
41,004
(1.20 %)
92 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
44,562
(1.21 %)
93 bat M.microtis (hap1 2025)
GCA_051107205.1
n/a 18,403
(1.68 %)
20,606
(1.62 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
68
(0.00 %)
190
(100.00 %)
3,101,865
(28.94 %)
356,434
(1.13 %)
11,717,214
(32.98 %)
78,560
(2.78 %)
94 bat M.microtis (hap2 2025)
GCA_051107335.1
n/a 17,634
(1.72 %)
19,795
(1.66 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
64
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,904,392
(28.42 %)
330,754
(1.09 %)
11,070,209
(31.88 %)
74,480
(2.76 %)
95 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
59,710
(1.51 %)
96 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
97 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,720
(2.99 %)
98 big brown bat (TK198812 2023)
GCA_027574615.1
n/a 18,420
(1.89 %)
21,275
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
49
(100.00 %)
4,895,568
(45.28 %)
904,082
(3.80 %)
10,530,742
(37.05 %)
77,606
(3.68 %)
99 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
77,605
(3.68 %)
100 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCA_042477335.2
n/a 19,021
(1.39 %)
21,154
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
5,490,141
(54.04 %)
826,352
(11.67 %)
12,918,667
(46.86 %)
52,254
(10.67 %)
101 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
102 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
52,254
(10.67 %)
103 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1
n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
104 bilby (mMagLag1 2024)
GCF_037893015.1
60,460
(3.10 %)
18,687
(0.72 %)
17,229
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
608
(100.00 %)
6,299,949
(27.49 %)
2,223,987
(5.89 %)
23,992,536
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
105 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
21,600,460
(65.53 %)
49,878
(0.73 %)
106 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
46,774
(0.90 %)
107 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,483
(3.88 %)
108 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
109 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
110 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
44,113
(0.97 %)
111 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,268
(2.28 %)
18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
112 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
113 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,415
(2.78 %)
18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
54,060
(2.11 %)
114 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
115 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
62,389
(1.68 %)
116 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,553
(2.07 %)
19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
117 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
56,916
(1.85 %)
118 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020)
GCA_009873245.3
n/a 19,151
(1.81 %)
20,574
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,871
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,081
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
119 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
55,436
(1.85 %)
120 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,737
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
121 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
100,915
(3.00 %)
122 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,417
(2.39 %)
18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
69,211
(2.68 %)
123 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
48,826
(1.07 %)
124 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
33,757
(1.35 %)
125 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
31,102
(1.31 %)
126 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
27,049
(1.25 %)
127 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
26,416
(1.35 %)
128 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
63,428
(1.55 %)
129 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
60,067
(1.55 %)
130 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
131 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
132 Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023)
GCA_030848815.1
n/a 18,921
(1.72 %)
22,946
(1.65 %)
n/a 42.50
(100.00 %)
n/a 3,728
(100.00 %)
4,021,020
(40.28 %)
637,136
(3.60 %)
11,382,826
(36.28 %)
70,547
(2.64 %)
133 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
68,896
(2.40 %)
134 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
135 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
136 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,229
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
137 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
64,814
(2.05 %)
138 brown big-eared bat (alternate hap 2023)
GCA_963455325.1
n/a 18,932
(1.77 %)
23,324
(1.64 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
n/a 5,570
(100.00 %)
4,970,484
(48.00 %)
928,854
(4.06 %)
10,332,383
(39.35 %)
59,133
(2.45 %)
139 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
60,671
(2.39 %)
140 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
62,325
(2.36 %)
141 bush duiker (CMD-5126 2019)
GCA_006408735.1
n/a 21,234
(1.49 %)
24,405
(1.37 %)
n/a 42.55
(81.82 %)
787,889
(18.24 %)
810,213
(81.76 %)
5,743,783
(45.60 %)
588,471
(5.37 %)
13,114,146
(31.74 %)
52,826
(1.05 %)
142 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,537
(2.02 %)
18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
19,540
(0.49 %)
143 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,273
(3.80 %)
18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
19,529
(0.58 %)
144 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
44,449
(1.57 %)
145 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
146 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
44,467
(1.57 %)
147 California sea lion (primary hap 2020)
GCA_009762305.2
n/a 20,939
(1.78 %)
20,184
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,530,531
(43.69 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,573
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
148 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
149 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
19,104
(0.65 %)
150 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
20,062
(0.64 %)
151 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
39,082
(2.44 %)
152 Canada lynx (LIC74 primary hap 2020)
GCA_007474595.2
n/a 18,286
(1.66 %)
19,266
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
55
(100.00 %)
5,014,416
(43.75 %)
904,528
(1.75 %)
13,467,329
(34.19 %)
66,805
(2.53 %)
153 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
39,099
(2.44 %)
154 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
155 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
156 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
157 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
158 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2
n/a 18,455
(1.10 %)
22,103
(1.12 %)
n/a 41.00
(88.89 %)
259,879
(11.14 %)
325,568
(88.86 %)
6,210,235
(51.92 %)
381,915
(1.06 %)
20,080,212
(36.28 %)
29,690
(0.50 %)
159 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
37,158
(0.70 %)
160 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
161 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
99,752
(3.73 %)
162 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,808
(4.11 %)
19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
46,864
(1.37 %)
163 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
42,869
(1.24 %)
164 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
172,178
(3.66 %)
165 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
60,367
(2.22 %)
166 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,744
(2.17 %)
167 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,625
(2.80 %)
19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
46,689
(1.12 %)
168 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
169 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,006
(2.59 %)
20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
170 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
171 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
18,838
(0.40 %)
172 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
173 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCA_030020395.1
n/a 18,675
(1.41 %)
21,838
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
662
(100.00 %)
3,516,380
(43.45 %)
618,194
(3.68 %)
12,009,657
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
174 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
175 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
48,960
(1.19 %)
176 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
177 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
178 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1
n/a 17,893
(1.95 %)
19,249
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,055,304
(33.11 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,144
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
179 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCF_036562045.2
67,162
(3.87 %)
17,890
(1.94 %)
19,248
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,325,750
(39.02 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,028
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
180 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
181 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1
n/a 22,218
(1.55 %)
22,364
(1.36 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
1,697
(0.01 %)
1,645
(100.00 %)
6,126,341
(42.08 %)
1,035,957
(2.47 %)
14,328,193
(41.14 %)
90,914
(1.82 %)
182 Chiriquinan serotine (hap1 2025)
GCA_054100705.1
n/a 17,992
(1.72 %)
21,541
(1.60 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
319
(0.00 %)
133
(100.00 %)
5,339,985
(49.93 %)
956,399
(6.53 %)
10,659,420
(39.61 %)
80,046
(3.68 %)
183 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
184 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
56,375
(2.45 %)
185 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
67,830
(2.45 %)
186 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
65,379
(1.89 %)
187 common bottlenose dolphin (maternal hap 2024)
GCA_011762595.2
n/a 18,777
(1.77 %)
20,526
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,064,487
(44.85 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,633
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
188 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
189 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
190 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2
80,385
(4.33 %)
18,770
(1.77 %)
20,525
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
361
(100.00 %)
3,981,744
(44.78 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,558
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
191 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
192 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
193 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,661
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
194 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
57,295
(2.83 %)
195 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
50,430
(2.54 %)
196 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
197 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1
n/a 18,233
(1.77 %)
21,445
(1.80 %)
n/a 42.93
(99.98 %)
1,650
(0.02 %)
575
(100.00 %)
3,324,262
(26.83 %)
869,167
(7.44 %)
10,218,519
(37.91 %)
76,006
(3.29 %)
198 common pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_965203405.2
n/a 18,176
(1.76 %)
21,285
(1.78 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
370
(0.00 %)
254
(100.00 %)
3,357,975
(26.71 %)
873,676
(8.26 %)
10,088,614
(38.25 %)
78,890
(3.25 %)
199 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1
n/a 18,115
(1.81 %)
21,233
(1.83 %)
n/a 42.89
(99.98 %)
1,602
(0.02 %)
1,971
(99.98 %)
3,303,323
(27.28 %)
852,756
(5.65 %)
10,047,424
(36.41 %)
69,105
(3.25 %)
200 common pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_965204225.2
n/a 18,092
(1.83 %)
21,286
(1.85 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
358
(0.00 %)
656
(100.00 %)
3,325,603
(27.55 %)
851,200
(4.82 %)
10,152,156
(36.08 %)
66,359
(3.22 %)
201 common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021)
GCA_019843835.1
n/a 25,148
(1.36 %)
49,594
(1.08 %)
n/a 41.11
(99.52 %)
63,300
(0.44 %)
572,372
(99.56 %)
3,806,717
(32.04 %)
1,181,694
(2.86 %)
12,272,340
(28.58 %)
16,373
(0.48 %)
202 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2
n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
61,125
(2.28 %)
203 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2
58,786
(3.38 %)
18,507
(1.82 %)
19,451
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
615
(0.01 %)
574
(100.00 %)
2,960,602
(36.90 %)
431,577
(3.90 %)
11,286,753
(32.62 %)
71,507
(2.50 %)
204 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,044
(3.24 %)
18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
51,634
(1.37 %)
205 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,156
(2.64 %)
18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
75,592
(1.86 %)
206 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
207 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1
n/a 19,527
(1.61 %)
18,923
(1.35 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
107
(0.00 %)
202
(100.00 %)
4,435,406
(32.05 %)
981,019
(1.98 %)
13,673,245
(32.65 %)
49,252
(2.20 %)
208 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1
n/a 19,251
(1.60 %)
19,585
(1.40 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
93
(0.00 %)
120
(100.00 %)
4,493,000
(32.28 %)
982,814
(2.01 %)
13,803,318
(33.09 %)
50,777
(2.23 %)
209 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
210 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
211 crested rat (2021)
GCA_907164525.1
n/a 18,829
(1.57 %)
20,084
(1.23 %)
n/a 40.89
(92.16 %)
116,236
(7.85 %)
153,441
(92.15 %)
6,937,911
(48.56 %)
1,051,397
(2.16 %)
13,178,644
(37.15 %)
22,912
(0.47 %)
212 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
21,236
(0.61 %)
213 Crete spiny mouse (2025)
GCA_964271855.5
n/a 19,050
(1.82 %)
18,719
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,310
(34.03 %)
21,236
(0.61 %)
214 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
215 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880225.1
n/a 18,335
(1.64 %)
20,207
(1.46 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
n/a 1,440
(100.00 %)
4,675,929
(43.51 %)
742,038
(2.58 %)
11,746,853
(36.11 %)
47,949
(1.04 %)
216 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
48,137
(1.04 %)
217 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
218 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
219 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
220 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
62,910
(2.66 %)
221 Daubenton's bat (hap1.2 2025)
GCA_963259705.2
n/a 19,016
(1.77 %)
22,392
(1.66 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
219
(0.00 %)
176
(100.00 %)
5,102,002
(45.10 %)
815,584
(6.94 %)
10,416,086
(39.34 %)
66,271
(2.56 %)
222 Daubenton's bat (hap2.2 2025)
GCA_963242275.2
n/a 18,127
(1.87 %)
21,346
(1.75 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
136
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,712,850
(43.86 %)
726,883
(5.33 %)
9,942,977
(37.29 %)
62,442
(2.66 %)
223 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
64,920
(2.51 %)
224 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
225 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
226 Davis's round-eared bat (hap1 2025)
GCA_051307075.1
n/a 17,736
(1.53 %)
21,703
(1.45 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
153
(0.00 %)
311
(100.00 %)
4,450,174
(45.25 %)
390,322
(7.86 %)
12,108,244
(37.90 %)
76,695
(4.57 %)
227 Davis's round-eared bat (hap2 2025)
GCA_051307065.1
n/a 16,878
(1.65 %)
20,512
(1.56 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
113
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,720,522
(43.45 %)
352,035
(4.96 %)
11,326,247
(34.44 %)
72,242
(4.65 %)
228 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
229 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,291
(2.11 %)
19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
17,053
(0.51 %)
230 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
231 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
232 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
51,216
(2.28 %)
233 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2
n/a 19,889
(1.67 %)
20,501
(1.39 %)
n/a 41.36
(99.99 %)
1,388
(0.01 %)
3,630
(99.99 %)
4,950,227
(43.32 %)
1,059,639
(2.97 %)
13,694,849
(33.70 %)
51,443
(2.16 %)
234 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2
n/a 19,310
(1.60 %)
19,947
(1.42 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
631
(100.00 %)
4,452,916
(32.14 %)
960,590
(2.23 %)
13,685,353
(33.01 %)
50,715
(2.22 %)
235 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1
n/a 19,211
(1.60 %)
20,327
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
641
(0.00 %)
175
(100.00 %)
4,471,016
(32.18 %)
984,776
(2.03 %)
13,719,474
(32.88 %)
51,050
(2.25 %)
236 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1
n/a 19,279
(1.60 %)
20,348
(1.44 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
1,015
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,491,081
(32.21 %)
996,142
(2.01 %)
13,761,195
(32.97 %)
51,490
(2.25 %)
237 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,536
(3.63 %)
19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,269
(2.07 %)
238 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,761
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
239 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1
n/a 19,255
(1.61 %)
20,479
(1.45 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
262
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,490,019
(32.25 %)
989,383
(1.99 %)
13,710,808
(32.97 %)
50,883
(2.22 %)
240 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
53,518
(2.23 %)
241 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3
n/a 19,757
(1.69 %)
20,201
(1.41 %)
n/a 41.32
(99.74 %)
458
(0.26 %)
410
(100.00 %)
4,974,233
(43.03 %)
1,048,366
(2.46 %)
13,881,889
(33.61 %)
51,900
(2.21 %)
242 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1
n/a 19,256
(1.61 %)
20,247
(1.44 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
516
(0.00 %)
675
(100.00 %)
4,456,220
(32.19 %)
960,584
(1.96 %)
13,688,006
(32.82 %)
50,670
(2.21 %)
243 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
244 dog (poodle 2003)
GCA_000181415.1
n/a 12,852
(0.53 %)
24,666
(0.57 %)
n/a 41.09
(99.86 %)
n/a 1,089,636
(100.00 %)
3,212,912
(39.08 %)
549,098
(1.63 %)
8,833,799
(29.80 %)
41,068
(1.31 %)
245 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,076
(3.30 %)
18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,701
(2.41 %)
246 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
69,725
(2.42 %)
247 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6
n/a 18,357
(1.55 %)
20,085
(1.38 %)
n/a 41.76
(98.18 %)
422
(1.82 %)
1,254
(98.28 %)
4,661,997
(33.78 %)
947,221
(2.58 %)
13,867,949
(33.67 %)
68,011
(2.41 %)
248 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
249 domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024)
GCA_040285425.1
n/a 19,454
(1.36 %)
22,081
(1.21 %)
n/a 44.04
(99.98 %)
31
(0.02 %)
878
(100.00 %)
6,506,177
(50.93 %)
1,038,848
(13.71 %)
11,547,434
(49.22 %)
84,199
(8.81 %)
250 domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024)
GCA_040286185.1
n/a 19,252
(1.32 %)
22,269
(1.20 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
17
(0.04 %)
407
(99.99 %)
6,783,665
(51.29 %)
1,072,289
(13.17 %)
12,697,022
(49.18 %)
89,666
(8.32 %)
251 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,868
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
252 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
253 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1
79,333
(3.55 %)
17,999
(1.09 %)
21,509
(1.20 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
84
(0.00 %)
672
(100.00 %)
5,037,431
(41.68 %)
886,785
(13.97 %)
14,620,284
(42.71 %)
39,682
(0.89 %)
254 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
255 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3
n/a 18,672
(1.39 %)
19,408
(1.24 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
646
(0.00 %)
343
(100.00 %)
3,570,978
(23.00 %)
583,762
(8.57 %)
14,055,227
(40.52 %)
43,883
(1.17 %)
256 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
29,863
(0.83 %)
257 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
29,828
(0.79 %)
258 dwarf fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_051107565.1
n/a 17,834
(1.67 %)
19,738
(1.55 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
77
(0.00 %)
106
(100.00 %)
3,731,962
(43.43 %)
377,985
(3.87 %)
11,915,741
(34.43 %)
72,159
(2.56 %)
259 dwarf fruit-eating bat (hap2 2025)
GCA_051107595.1
n/a 16,790
(1.71 %)
18,246
(1.55 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
43
(0.00 %)
102
(100.00 %)
3,412,455
(42.90 %)
339,875
(3.98 %)
10,947,746
(33.73 %)
65,083
(2.56 %)
260 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
261 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
99,224
(2.27 %)
262 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
22,270
(0.54 %)
263 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
264 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
24,508
(0.70 %)
265 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1
n/a 20,397
(1.93 %)
20,515
(1.44 %)
n/a 42.68
(98.12 %)
109,220
(1.90 %)
19,837
(99.90 %)
4,701,702
(33.98 %)
1,304,933
(2.91 %)
13,145,044
(31.05 %)
19,636
(0.56 %)
266 eastern woodrat (hap1 2025)
GCA_050000055.1
n/a 19,460
(1.37 %)
22,249
(1.25 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
154
(0.00 %)
1,382
(100.00 %)
7,741,791
(54.00 %)
2,194,305
(10.09 %)
13,803,906
(42.49 %)
22,114
(0.48 %)
267 eastern woodrat (hap2 2025)
GCA_050000045.1
n/a 18,460
(1.50 %)
21,237
(1.36 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
154
(0.00 %)
942
(100.00 %)
6,975,151
(51.59 %)
1,843,248
(8.41 %)
12,873,831
(39.03 %)
20,366
(0.52 %)
268 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,244
(6.54 %)
269 Egyptian rousette (primary hap 2025)
GCA_014176215.2
n/a 17,319
(2.06 %)
22,433
(1.85 %)
n/a 40.05
(98.63 %)
250
(1.37 %)
27
(100.00 %)
3,010,528
(35.56 %)
434,429
(1.02 %)
12,031,135
(26.53 %)
53,517
(6.74 %)
270 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
271 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
272 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
273 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
274 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,139
(2.25 %)
275 ermine (hap1.1 2025)
GCA_965636865.1
n/a 18,538
(1.35 %)
23,646
(1.36 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
212
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
6,455,322
(46.66 %)
881,285
(5.47 %)
13,096,768
(42.14 %)
93,973
(3.17 %)
276 ermine (hap2.1 2025)
GCA_965636855.1
n/a 17,654
(1.42 %)
22,483
(1.40 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
139
(0.00 %)
1,083
(100.00 %)
5,945,296
(44.94 %)
800,358
(4.39 %)
12,526,091
(40.11 %)
85,220
(2.90 %)
277 ermine (primary hap 2020)
GCA_009829155.1
n/a 18,855
(1.65 %)
20,668
(1.43 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,997
(41.44 %)
714,178
(1.30 %)
13,845,820
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
278 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
279 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
280 Eurasian beaver (alternate hap 2025)
GCA_977035955.1
n/a 14,184
(1.28 %)
14,518
(1.21 %)
n/a 40.16
(99.94 %)
12,413
(0.06 %)
17,640
(99.94 %)
2,894,516
(33.23 %)
469,512
(3.63 %)
8,909,825
(39.95 %)
18,772
(1.65 %)
281 Eurasian beaver (primary hap 2025)
GCA_977036005.1
n/a 20,316
(1.47 %)
20,429
(1.25 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
237
(0.00 %)
228
(100.00 %)
4,115,552
(36.09 %)
562,383
(2.69 %)
14,321,638
(36.02 %)
24,219
(0.75 %)
282 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
26,414
(0.61 %)
283 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
284 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
285 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,269
(2.96 %)
18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
286 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
27,057
(1.96 %)
287 Eurasian river otter (primary hap 2020)
GCA_902655055.2
n/a 19,133
(1.66 %)
20,177
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,736,483
(42.28 %)
713,721
(1.36 %)
13,625,976
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
288 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
14,146
(0.57 %)
289 Eurasian water vole (primary hap 2021)
GCA_903992535.2
n/a 19,126
(1.84 %)
19,054
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
5,439,454
(42.21 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,486
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
290 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
291 European free-tailed bat (hap1.1 2025)
GCA_976988885.1
n/a 19,367
(1.49 %)
21,955
(1.44 %)
n/a 42.35
(100.00 %)
174
(0.00 %)
641
(100.00 %)
4,439,364
(40.01 %)
680,470
(8.16 %)
11,487,613
(43.09 %)
73,991
(1.99 %)
292 European free-tailed bat (hap2.1 2025)
GCA_976988855.1
n/a 19,630
(1.68 %)
21,945
(1.52 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
121
(0.00 %)
370
(100.00 %)
4,242,872
(41.74 %)
637,498
(4.18 %)
11,360,772
(39.15 %)
69,324
(2.22 %)
293 European ground squirrel (alternate hap 2024)
GCA_964194095.1
n/a 15,410
(1.11 %)
21,126
(1.11 %)
n/a 39.96
(100.00 %)
n/a 28,045
(100.00 %)
3,186,054
(30.28 %)
656,568
(16.12 %)
9,975,571
(43.35 %)
28,808
(1.24 %)
294 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1
46,528
(2.09 %)
19,392
(1.25 %)
23,070
(1.29 %)
n/a 44.03
(100.00 %)
418
(0.00 %)
651
(100.00 %)
4,011,592
(19.81 %)
1,000,204
(8.44 %)
13,414,251
(44.25 %)
98,831
(2.33 %)
295 European harvest mouse (alternate hap 2024)
GCA_963924645.1
n/a 3,404
(1.16 %)
2,956
(0.83 %)
n/a 39.56
(100.00 %)
n/a 5,020
(100.00 %)
741,789
(44.38 %)
265,801
(43.28 %)
1,048,943
(61.65 %)
3,244
(3.57 %)
296 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
17,423
(0.62 %)
297 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
47,810
(2.50 %)
298 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
67,132
(2.54 %)
299 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
46,367
(3.09 %)
300 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
46,213
(3.27 %)
301 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
61,481
(4.29 %)
302 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
77,009
(2.86 %)
303 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,851
(2.58 %)
304 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
79,785
(2.86 %)
305 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
17,629
(0.60 %)
306 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
307 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
39,275
(0.88 %)
308 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,113
(2.24 %)
19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
309 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
20,865
(0.55 %)
310 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1
57,013
(2.35 %)
20,187
(1.33 %)
23,290
(1.33 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
44
(0.00 %)
284
(100.00 %)
3,308,241
(20.72 %)
513,748
(18.20 %)
12,996,819
(48.19 %)
214,480
(2.98 %)
311 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
112,581
(2.00 %)
312 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
52,418
(1.36 %)
313 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1
n/a 18,718
(1.50 %)
20,929
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
439
(100.00 %)
3,958,932
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,131
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
314 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
315 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
75,215
(4.36 %)
316 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
317 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,224
(2.50 %)
18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
22,480
(0.71 %)
318 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
26,411
(0.73 %)
319 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1
60,212
(2.43 %)
15,763
(0.77 %)
16,031
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
8
(100.00 %)
5,302,378
(24.47 %)
1,450,227
(3.79 %)
20,870,714
(44.26 %)
24,586
(0.65 %)
320 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
24,585
(0.65 %)
321 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1
n/a 16,012
(0.77 %)
16,430
(0.90 %)
n/a 36.18
(99.99 %)
1,730
(0.01 %)
1,737
(99.99 %)
5,361,847
(24.48 %)
1,474,744
(3.79 %)
21,021,671
(44.20 %)
25,669
(0.69 %)
322 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
82,683
(1.47 %)
323 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1
n/a 18,684
(1.40 %)
21,322
(1.20 %)
n/a 41.87
(99.99 %)
1,258
(0.01 %)
3,706
(99.99 %)
4,103,716
(36.69 %)
1,030,821
(16.12 %)
11,633,934
(45.82 %)
74,782
(1.60 %)
324 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,085
(2.86 %)
18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
70,402
(2.61 %)
325 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
32,563
(0.80 %)
326 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,664
(2.08 %)
18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
327 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
328 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
329 gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020)
GCA_014182915.2
n/a 19,130
(1.53 %)
21,239
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.99 %)
2,194
(0.01 %)
635
(100.00 %)
6,520,228
(50.46 %)
466,916
(1.41 %)
13,425,286
(41.25 %)
41,833
(1.15 %)
330 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
75,114
(1.33 %)
331 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
45,586
(0.89 %)
332 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
60,200
(2.41 %)
333 Geoffroy's bat (hap1.2 2025)
GCA_965115925.2
n/a 18,831
(1.81 %)
22,032
(1.67 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
226
(0.00 %)
306
(100.00 %)
4,958,159
(48.46 %)
733,004
(7.77 %)
10,528,813
(39.34 %)
59,971
(2.41 %)
334 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
56,300
(2.26 %)
335 Geoffroy's bat (hap2.2 2025)
GCA_965115945.2
n/a 18,471
(1.79 %)
21,274
(1.64 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
264
(0.00 %)
418
(100.00 %)
4,911,358
(48.79 %)
719,004
(7.65 %)
10,340,272
(39.15 %)
56,616
(2.24 %)
336 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,344
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
337 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
338 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
339 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,481
(3.27 %)
19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
59,449
(1.50 %)
340 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,172
(2.31 %)
19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
125,662
(4.00 %)
341 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
342 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
343 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
344 golden jackal (CA01 2025)
GCF_053574225.1
115,457
(4.37 %)
19,332
(1.58 %)
21,009
(1.39 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
59
(0.00 %)
306
(100.00 %)
6,089,485
(46.31 %)
1,184,044
(5.44 %)
13,574,928
(35.96 %)
54,314
(2.19 %)
345 golden spiny mouse (2020)
GCA_903995435.1
n/a 20,001
(1.90 %)
19,127
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,976,496
(36.34 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,957,738
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
346 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
347 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1
n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
40,182
(0.59 %)
348 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1
49,173
(1.30 %)
19,845
(0.90 %)
24,244
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
1,448
(0.01 %)
8,088
(100.00 %)
8,197,827
(62.01 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,958
(52.73 %)
40,182
(0.59 %)
349 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1
n/a 19,719
(1.16 %)
22,611
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,820
(100.00 %)
4,725,546
(31.70 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,550
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
350 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1
46,395
(1.71 %)
18,853
(1.19 %)
22,613
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,821
(100.00 %)
6,984,115
(50.68 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,604
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
351 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
352 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1
n/a 19,352
(1.42 %)
20,724
(1.33 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
26
(0.00 %)
898
(100.00 %)
4,418,039
(36.90 %)
1,050,244
(11.63 %)
13,240,305
(39.50 %)
89,246
(2.69 %)
353 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
354 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
56,932
(1.78 %)
355 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
57,067
(1.82 %)
356 gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025)
GCF_964656455.1
70,736
(3.27 %)
18,889
(1.71 %)
20,343
(1.40 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
1,300
(99.99 %)
5,332,627
(44.68 %)
600,622
(2.16 %)
13,240,769
(34.28 %)
56,931
(1.78 %)
357 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
24,879
(0.67 %)
358 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
359 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
360 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
59,073
(2.48 %)
20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
361 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
38,976
(1.13 %)
362 gray squirrel (primary hap 2020)
GCA_902686445.2
n/a 20,739
(1.50 %)
21,110
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
753
(100.00 %)
4,732,857
(35.28 %)
728,193
(1.65 %)
15,466,750
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
363 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
51,996
(2.15 %)
364 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
32,293
(2.35 %)
365 great fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_038363095.4
n/a 18,198
(1.65 %)
19,926
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
44
(0.00 %)
487
(100.00 %)
3,105,608
(36.84 %)
379,427
(5.52 %)
11,651,533
(35.11 %)
72,337
(2.76 %)
366 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
63,610
(2.71 %)
367 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
72,337
(2.76 %)
368 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,908
(3.26 %)
18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
32,949
(0.96 %)
369 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
370 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
371 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
372 greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019)
GCA_004115265.3
n/a 18,510
(1.96 %)
20,357
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,547,476
(40.33 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,002
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
373 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
374 greater Indian rhinoceros (Sample0755 2023)
GCA_028646465.1
n/a 19,533
(1.67 %)
23,705
(1.37 %)
n/a 41.10
(101.83 %)
33,235
(0.47 %)
275,222
(99.99 %)
5,364,142
(46.33 %)
487,256
(1.17 %)
16,182,706
(30.52 %)
42,131
(1.13 %)
375 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
376 Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880455.1
n/a 16,611
(1.60 %)
22,294
(1.43 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
n/a 8,359
(100.00 %)
4,914,747
(44.93 %)
593,619
(4.20 %)
10,708,461
(39.52 %)
222,795
(3.47 %)
377 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
12,702,667
(41.11 %)
257,446
(3.38 %)
378 greater sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036850925.1
n/a 17,838
(1.44 %)
21,425
(1.45 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
n/a 2,167
(100.00 %)
6,139,040
(42.07 %)
974,353
(2.52 %)
11,694,399
(43.03 %)
96,465
(2.06 %)
379 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
380 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
62,189
(5.35 %)
381 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
382 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
73,507
(1.72 %)
383 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1
n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
384 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
385 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
386 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1
n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
61,715
(2.96 %)
387 Hanaki's dwarf bat (2025)
GCA_964339955.5
n/a 17,654
(1.85 %)
20,599
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
61,715
(2.96 %)
388 harbor porpoise (alternate hap 2024)
GCA_963924725.1
n/a 19,112
(1.54 %)
22,516
(1.29 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
n/a 7,636
(100.00 %)
4,295,938
(43.35 %)
1,111,088
(11.90 %)
12,254,452
(42.18 %)
77,325
(3.31 %)
389 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1
n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
390 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
391 harbor seal
GCF_004348235.1
50,657
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
392 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
393 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
394 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
36,143
(1.96 %)
395 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
71,058
(1.88 %)
396 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
54,753
(1.59 %)
397 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
48,380
(1.43 %)
398 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
48,164
(1.90 %)
399 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
400 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
401 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
402 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
403 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
404 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
405 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
59,066
(1.72 %)
406 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
37,293
(2.80 %)
407 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
43,527
(2.54 %)
408 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1
124,629
(3.91 %)
18,742
(1.47 %)
21,901
(1.39 %)
n/a 42.90
(99.96 %)
5
(0.04 %)
625
(100.00 %)
3,600,073
(33.96 %)
709,759
(8.89 %)
14,396,691
(35.72 %)
48,802
(5.67 %)
409 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,388
(4.03 %)
18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,825
(1.77 %)
410 Hottentot golden mole (hap1 2026)
GCA_054824725.1
n/a 23,545
(0.65 %)
25,587
(0.69 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
397
(0.00 %)
2,994
(100.00 %)
15,378,633
(76.69 %)
1,709,398
(27.18 %)
17,909,037
(71.38 %)
48,162
(0.41 %)
411 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
412 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
23,211
(0.57 %)
413 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
23,309
(0.57 %)
414 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
506
(0.31 %)
415 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
23,203
(0.56 %)
416 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
23,196
(0.56 %)
417 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
23,262
(0.56 %)
418 house mouse (C57BL/6J 2012)
GCA_000185105.2
n/a 21,313
(2.28 %)
19,336
(1.53 %)
n/a 41.71
(91.01 %)
189,267
(9.02 %)
191,581
(90.98 %)
4,937,032
(40.05 %)
1,409,489
(2.64 %)
13,090,524
(27.69 %)
16,523
(0.40 %)
419 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1
n/a 21,496
(1.92 %)
19,278
(1.25 %)
n/a 41.31
(99.85 %)
108
(0.15 %)
345
(99.85 %)
4,519,975
(46.81 %)
1,564,206
(14.33 %)
12,267,542
(42.16 %)
23,119
(0.55 %)
420 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
23,232
(0.56 %)
421 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
24,140
(0.59 %)
422 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
22,696
(0.55 %)
423 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
24,374
(0.54 %)
424 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
23,253
(0.56 %)
425 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
24,187
(0.54 %)
426 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
23,955
(0.54 %)
427 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
136,224
(4.84 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
428 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
429 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2
n/a 21,817
(2.13 %)
19,349
(1.37 %)
n/a 41.79
(99.76 %)
1,127
(0.24 %)
214
(100.00 %)
4,661,104
(40.76 %)
1,552,079
(3.56 %)
12,953,662
(35.57 %)
23,204
(0.56 %)
430 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
82,412
(1.67 %)
431 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,986
(3.41 %)
18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
47,466
(2.89 %)
432 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
433 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
434 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1
n/a 17,560
(2.04 %)
21,687
(1.83 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
26
(0.00 %)
181
(100.00 %)
2,598,385
(30.48 %)
486,921
(1.41 %)
11,828,726
(27.28 %)
37,476
(5.58 %)
435 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
436 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
437 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
99,144
(2.87 %)
438 intermediate fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
439 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024)
GCA_043727925.1
n/a 17,564
(1.87 %)
20,064
(1.66 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 2,194
(100.00 %)
3,406,902
(41.38 %)
537,189
(4.88 %)
11,454,141
(30.99 %)
32,338
(1.09 %)
440 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
34,491
(1.02 %)
441 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
43,736
(1.20 %)
442 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
443 jaguar (hap1 2025 genbank)
GCA_046562885.1
n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
61,319
(2.55 %)
444 jaguar (hap1 2025 refseq)
GCF_046562885.1
72,531
(3.71 %)
17,886
(1.68 %)
19,296
(1.42 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,733,281
(41.33 %)
893,299
(1.89 %)
12,851,153
(33.54 %)
61,319
(2.55 %)
445 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.2
n/a 17,884
(1.68 %)
19,104
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,733,274
(41.33 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
61,319
(2.55 %)
446 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
66,000
(2.75 %)
447 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.2
n/a 18,869
(1.64 %)
20,781
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
5,097,971
(41.83 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
66,000
(2.75 %)
448 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,578
(4.12 %)
19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
63,777
(2.41 %)
449 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
450 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,692
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
451 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
61,951
(1.93 %)
452 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
24,168
(0.56 %)
453 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
68,778
(2.92 %)
454 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,479
(3.76 %)
18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
455 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
57,347
(3.41 %)
456 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
457 killer whale (primary hap 2022)
GCA_937001465.1
n/a 18,847
(1.59 %)
21,099
(1.30 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,361,647
(43.69 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,548
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
458 klipspringer (KSP-560 2019)
GCA_006410675.1
n/a 22,317
(1.37 %)
27,606
(1.31 %)
n/a 42.04
(89.74 %)
371,212
(10.28 %)
396,104
(89.72 %)
6,379,883
(45.04 %)
726,514
(5.64 %)
15,472,957
(34.77 %)
50,579
(1.00 %)
459 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
460 koala (Bilbo 61053 2022)
GCF_003287225.1
50,393
(2.58 %)
17,125
(0.85 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
10,370,789
(60.23 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,035
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
461 koala (Bilbo 61053 2025)
GCA_003287225.3
n/a 17,123
(0.85 %)
14,700
(0.86 %)
n/a 39.06
(100.00 %)
664
(0.00 %)
1,239
(100.00 %)
10,358,875
(60.22 %)
1,121,543
(2.02 %)
21,754,367
(39.21 %)
15,940
(0.35 %)
462 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
65,654
(3.37 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
463 Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025)
GCA_014108245.2
n/a 17,770
(2.01 %)
20,646
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
522
(0.69 %)
82
(100.00 %)
4,542,064
(41.94 %)
797,434
(2.76 %)
10,057,037
(34.56 %)
55,766
(2.87 %)
464 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
465 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
19,817
(0.34 %)
466 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
123,453
(2.17 %)
467 large tree shrew (BS70 2025)
GCA_026018925.2
n/a 21,760
(1.34 %)
22,479
(1.26 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,263
(0.00 %)
1,209
(100.00 %)
6,876,878
(36.82 %)
1,357,671
(10.13 %)
14,333,971
(46.09 %)
123,449
(2.17 %)
468 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1
n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
68,749
(2.22 %)
469 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
62,416
(2.34 %)
470 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,501
(3.29 %)
18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
65,793
(2.64 %)
471 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
77,001
(2.45 %)
472 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
473 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1
n/a 17,815
(2.05 %)
23,917
(1.90 %)
n/a 40.13
(99.14 %)
100,669
(0.88 %)
108,810
(99.12 %)
2,688,705
(31.20 %)
428,968
(1.19 %)
12,245,385
(26.51 %)
58,118
(6.81 %)
474 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
475 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
476 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,978
(1.44 %)
19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
477 lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021)
GCA_020740685.1
n/a 20,129
(1.24 %)
22,086
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
159
(100.00 %)
6,288,871
(38.51 %)
1,187,585
(2.92 %)
14,221,962
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
478 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024)
GCA_043880535.1
n/a 1,572
(0.57 %)
3,175
(1.45 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,678
(100.00 %)
286,260
(35.16 %)
107,917
(13.71 %)
1,232,326
(51.86 %)
5,144
(2.91 %)
479 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
84,174
(4.85 %)
480 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
35,414
(1.75 %)
481 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
36,176
(1.80 %)
482 lesser horseshoe bat (hap2.2 2025)
GCA_964194215.2
n/a 18,974
(1.81 %)
21,191
(1.58 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
56
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
3,652,081
(41.23 %)
696,117
(6.18 %)
11,690,617
(34.28 %)
36,376
(1.84 %)
483 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
65,974
(2.80 %)
484 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2
n/a 17,492
(1.62 %)
22,188
(1.72 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
247
(0.00 %)
920
(100.00 %)
3,886,341
(36.52 %)
1,139,308
(10.89 %)
9,356,457
(40.65 %)
62,254
(3.00 %)
485 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
486 lesser sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036851165.1
n/a 18,593
(1.42 %)
23,334
(1.46 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
n/a 4,715
(100.00 %)
6,471,175
(42.04 %)
1,030,472
(2.62 %)
12,509,696
(42.43 %)
96,414
(2.05 %)
487 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
488 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
489 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
490 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
48,101
(2.62 %)
491 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
49,636
(2.61 %)
492 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
493 long-finned pilot whale (alternate hap 2024)
GCA_963455345.2
n/a 17,552
(1.56 %)
25,954
(1.35 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 28,097
(100.00 %)
3,815,058
(48.74 %)
789,873
(8.23 %)
9,845,230
(38.66 %)
58,137
(3.47 %)
494 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
71,822
(5.51 %)
495 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
496 long-footed potoroo (2021)
GCA_904812075.1
n/a 278
(19.06 %)
223
(16.20 %)
n/a 51.14
(99.50 %)
n/a 1,479
(100.00 %)
194
(1.83 %)
54
(0.32 %)
2,088
(5.90 %)
51
(2.47 %)
497 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
498 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
499 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
500 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1
87,404
(4.24 %)
18,382
(1.54 %)
19,802
(1.30 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
90
(0.00 %)
63
(100.00 %)
3,146,889
(38.39 %)
384,539
(2.15 %)
12,642,995
(34.68 %)
48,454
(1.30 %)
501 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
502 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
503 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
17,923
(0.30 %)
504 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
505 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
506 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1
n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
507 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1
56,969
(2.88 %)
19,974
(1.74 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
180
(100.00 %)
4,116,239
(33.62 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,153
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
508 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
22,186
(0.75 %)
509 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,858
(2.22 %)
510 melon-headed whale (hap1 2025)
GCA_051427945.1
n/a 18,643
(1.64 %)
20,840
(1.43 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
84
(0.00 %)
204
(100.00 %)
5,100,394
(52.00 %)
1,312,199
(7.54 %)
12,322,262
(38.99 %)
69,873
(4.58 %)
511 melon-headed whale (hap2 2025)
GCA_051427955.1
n/a 17,790
(1.73 %)
19,805
(1.50 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
65
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,595,309
(50.05 %)
975,539
(5.44 %)
11,730,402
(37.10 %)
65,883
(3.79 %)
512 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
38,521
(1.60 %)
513 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1
n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
514 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1
68,331
(2.37 %)
21,280
(1.16 %)
28,582
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,535
(100.00 %)
4,378,949
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,725
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
515 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
65,956
(4.38 %)
516 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
65,597
(4.38 %)
517 mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021)
GCA_019844195.1
n/a 18,926
(2.00 %)
20,713
(1.46 %)
n/a 41.06
(99.08 %)
121,340
(0.94 %)
152,293
(99.06 %)
6,081,188
(43.08 %)
1,497,646
(3.55 %)
13,086,584
(30.02 %)
15,700
(0.46 %)
518 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
53,470
(2.24 %)
519 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1
n/a 18,738
(1.56 %)
19,759
(1.41 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
124
(0.00 %)
155
(100.00 %)
4,265,479
(32.40 %)
1,030,876
(4.11 %)
12,818,772
(34.22 %)
50,269
(2.22 %)
520 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
521 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
69,852
(1.62 %)
522 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
523 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
524 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
26,044
(0.71 %)
525 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
25,300
(0.76 %)
526 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
13,856
(0.35 %)
527 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
528 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
529 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1
n/a 19,816
(1.60 %)
22,341
(1.44 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,737
(100.00 %)
3,099,775
(24.20 %)
406,796
(2.52 %)
13,117,056
(38.34 %)
50,644
(1.33 %)
530 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2
n/a 19,116
(1.66 %)
21,184
(1.45 %)
n/a 41.55
(95.50 %)
71,769
(4.51 %)
77,708
(95.49 %)
3,026,678
(23.77 %)
373,266
(0.91 %)
13,167,376
(34.08 %)
44,302
(1.21 %)
531 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1
n/a 21,375
(1.65 %)
26,769
(1.42 %)
n/a 41.64
(92.66 %)
83,831
(7.35 %)
131,373
(92.65 %)
5,022,053
(43.27 %)
384,658
(1.22 %)
13,422,381
(34.52 %)
49,216
(1.18 %)
532 Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021)
GCA_019843965.1
n/a 18,266
(2.07 %)
18,451
(1.45 %)
n/a 41.51
(99.45 %)
47,796
(0.55 %)
61,989
(99.45 %)
5,656,524
(42.94 %)
1,120,762
(2.44 %)
12,212,163
(29.98 %)
15,204
(0.46 %)
533 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
534 mountain bongo (Barney_WCC 2024)
GCA_040438115.1
n/a 19,857
(1.47 %)
21,826
(1.20 %)
n/a 41.99
(96.15 %)
62,885
(3.86 %)
34,537
(100.00 %)
6,342,707
(52.09 %)
474,043
(1.33 %)
13,361,157
(42.94 %)
42,078
(0.91 %)
535 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
536 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1
n/a 20,755
(1.51 %)
20,024
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
2,332
(0.04 %)
264
(100.00 %)
3,593,261
(30.76 %)
529,045
(1.14 %)
13,294,831
(36.07 %)
32,235
(0.93 %)
537 naked mole-rat (maternal 2024)
GCA_964261345.1
n/a 19,980
(1.56 %)
19,365
(1.33 %)
n/a 39.96
(99.93 %)
2,238
(0.07 %)
263
(100.00 %)
5,099,610
(44.65 %)
523,459
(1.13 %)
13,036,461
(35.91 %)
31,614
(0.92 %)
538 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
40,717
(0.98 %)
539 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
540 naked mole-rat (pHap 2024)
GCA_964261355.1
n/a 19,953
(1.57 %)
19,579
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.91 %)
2,381
(0.09 %)
264
(100.00 %)
5,097,978
(44.61 %)
523,861
(1.13 %)
13,168,788
(36.09 %)
31,789
(0.93 %)
541 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
542 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
60,518
(1.78 %)
543 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
544 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
56,705
(2.75 %)
545 Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_964656225.2
n/a 17,671
(1.80 %)
21,057
(1.71 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
307
(0.00 %)
410
(100.00 %)
4,579,266
(45.39 %)
943,644
(11.48 %)
9,925,875
(39.77 %)
56,485
(2.63 %)
546 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
56,237
(2.62 %)
547 Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_964656075.2
n/a 17,650
(1.86 %)
21,005
(1.78 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
306
(0.00 %)
759
(100.00 %)
4,580,609
(44.28 %)
888,097
(8.14 %)
10,070,978
(37.75 %)
56,514
(2.79 %)
548 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
56,332
(2.92 %)
549 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
64,639
(2.57 %)
550 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2
n/a 18,368
(1.91 %)
21,701
(1.80 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
136
(0.00 %)
309
(100.00 %)
3,509,151
(38.16 %)
704,537
(5.21 %)
9,806,703
(36.74 %)
61,004
(2.65 %)
551 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
552 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
553 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCA_030445035.2
n/a 21,049
(1.11 %)
24,419
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,507,356
(53.38 %)
738,321
(2.02 %)
19,755,425
(43.69 %)
142,597
(2.85 %)
554 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
130,245
(2.79 %)
555 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2
72,174
(2.47 %)
21,051
(1.11 %)
24,418
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,412,063
(53.31 %)
738,320
(2.02 %)
19,755,423
(43.69 %)
142,597
(2.85 %)
556 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
139,490
(2.47 %)
557 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
23,523
(0.71 %)
558 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
24,733
(0.70 %)
559 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
40,925
(1.35 %)
560 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
51,299
(1.36 %)
561 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
85,881
(1.90 %)
562 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
563 North Atlantic right whale (hap2._XY 2023)
GCA_028564815.2
n/a 19,476
(1.53 %)
21,630
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
788
(100.00 %)
4,812,242
(53.57 %)
841,302
(13.08 %)
12,527,493
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
564 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
565 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
566 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
76,164
(3.52 %)
567 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
77,656
(3.27 %)
568 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
85,908
(2.60 %)
569 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
96,116
(3.02 %)
570 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
92,041
(3.01 %)
571 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
62,007
(1.94 %)
572 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
67,258
(2.00 %)
573 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
574 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1
n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
69,898
(2.38 %)
575 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1
74,106
(3.88 %)
19,277
(1.60 %)
20,000
(1.36 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
595
(100.00 %)
4,348,327
(34.40 %)
621,980
(2.21 %)
13,251,706
(35.32 %)
69,897
(2.38 %)
576 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1
n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
74,314
(2.49 %)
577 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
578 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
579 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2
71,169
(3.14 %)
21,276
(1.78 %)
21,276
(1.42 %)
n/a 41.44
(98.05 %)
30,369
(1.95 %)
43,734
(98.05 %)
4,118,994
(34.95 %)
578,801
(1.07 %)
13,530,999
(33.27 %)
51,258
(1.43 %)
580 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
44,220
(1.55 %)
581 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1
n/a 17,037
(1.43 %)
21,690
(1.55 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
115
(0.00 %)
1,031
(100.00 %)
3,527,940
(26.81 %)
646,620
(6.32 %)
11,343,462
(34.09 %)
47,125
(1.51 %)
582 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
583 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
584 northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024)
GCA_036346955.1
n/a 19,574
(1.25 %)
21,306
(1.23 %)
n/a 42.16
(99.93 %)
954
(0.07 %)
487
(100.00 %)
6,447,286
(38.11 %)
1,321,523
(3.44 %)
13,986,035
(43.83 %)
30,337
(0.84 %)
585 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
586 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024)
GCA_043748905.1
n/a 17,474
(1.85 %)
19,891
(1.65 %)
n/a 40.73
(100.00 %)
n/a 1,329
(100.00 %)
3,473,169
(40.23 %)
618,364
(2.01 %)
11,013,083
(30.75 %)
32,427
(1.26 %)
587 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
35,670
(1.25 %)
588 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
114,725
(42.69 %)
21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
589 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
590 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1
n/a 21,764
(1.78 %)
20,141
(1.30 %)
n/a 41.87
(99.96 %)
234
(0.04 %)
120
(100.00 %)
4,636,987
(39.98 %)
1,579,595
(5.22 %)
13,544,768
(38.06 %)
20,127
(0.46 %)
591 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
592 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
97,432
(4.08 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
593 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
594 Norway rat Dahl SR JrHsd (RGD_1582184 2024)
GCA_045688005.1
n/a 21,901
(1.75 %)
20,001
(1.28 %)
n/a 41.84
(99.81 %)
299
(0.19 %)
141
(100.00 %)
4,717,442
(40.25 %)
1,598,987
(5.75 %)
13,553,199
(38.60 %)
20,297
(0.46 %)
595 Norway rat Lyon Hypertensive(RGD_10755352 2024)
GCA_045687965.1
n/a 21,971
(1.75 %)
20,095
(1.28 %)
n/a 41.85
(99.93 %)
269
(0.07 %)
133
(100.00 %)
4,719,614
(40.23 %)
1,601,400
(5.83 %)
13,552,374
(38.67 %)
20,429
(0.47 %)
596 Norway rat Lyon Normot (RGD_10755354 2024)
GCA_045687995.1
n/a 21,928
(1.75 %)
20,321
(1.29 %)
n/a 41.85
(99.84 %)
302
(0.16 %)
154
(100.00 %)
4,723,406
(40.27 %)
1,602,417
(5.79 %)
13,563,546
(38.65 %)
20,456
(0.47 %)
597 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
598 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
20,720
(0.48 %)
599 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1
n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
21,006
(0.49 %)
600 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
21,449
(0.51 %)
601 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
602 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
603 Okinawa island spiny rat (P-3 2024)
GCA_047150545.1
n/a 20,516
(1.33 %)
20,222
(0.99 %)
n/a 40.89
(100.00 %)
19
(0.00 %)
53
(100.00 %)
9,452,355
(48.57 %)
2,252,101
(4.71 %)
12,808,891
(51.48 %)
20,770
(0.36 %)
604 Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023)
GCA_036184385.1
n/a 18,829
(1.78 %)
19,061
(1.29 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
250
(0.00 %)
1,778
(100.00 %)
6,918,941
(46.48 %)
1,550,409
(4.06 %)
12,787,294
(38.04 %)
19,458
(0.47 %)
605 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
606 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
607 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
608 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
49,134
(2.83 %)
609 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
610 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,970
(3.26 %)
18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
611 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
67,712
(4.23 %)
612 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020)
GCA_004126475.3
n/a 18,167
(1.70 %)
20,017
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
78
(100.00 %)
3,071,886
(30.03 %)
385,665
(0.81 %)
12,049,923
(30.57 %)
63,918
(4.33 %)
613 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
67,718
(4.23 %)
614 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
615 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
616 pallid bat (TK200870 alternate hap 2023)
GCA_027595915.1
n/a 19,085
(1.74 %)
22,770
(1.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
n/a 1,839
(100.00 %)
5,323,924
(49.33 %)
928,982
(3.65 %)
11,123,530
(39.36 %)
70,095
(2.89 %)
617 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
70,272
(2.89 %)
618 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
619 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
53,180
(4.61 %)
620 particolored bat (hap1.2 2025)
GCA_963924515.2
n/a 17,612
(1.78 %)
20,793
(1.69 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
189
(0.00 %)
273
(100.00 %)
5,418,781
(46.24 %)
903,727
(5.36 %)
10,321,898
(38.41 %)
78,516
(4.52 %)
621 particolored bat (hap2.2 2025)
GCA_963924695.2
n/a 16,887
(1.81 %)
20,042
(1.72 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
395
(100.00 %)
5,048,325
(44.60 %)
836,727
(4.41 %)
9,638,999
(37.87 %)
76,656
(4.63 %)
622 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
77,397
(4.55 %)
623 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
624 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
625 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
40,162
(1.31 %)
626 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1
n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
627 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
628 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
81,791
(2.82 %)
629 pig (Bamei 2025)
GCA_030704935.2
n/a 17,940
(1.49 %)
20,133
(1.29 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
6,650,808
(50.63 %)
1,731,111
(5.80 %)
12,817,015
(40.05 %)
81,487
(2.80 %)
630 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,132
(1.82 %)
631 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1
n/a 18,500
(1.46 %)
19,718
(1.29 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
n/a 54
(100.00 %)
4,068,783
(28.54 %)
1,511,605
(5.52 %)
12,867,101
(39.59 %)
82,002
(2.44 %)
632 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
633 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
81,967
(2.96 %)
634 plains viscacha rat (AO245 2017)
GCA_002564285.1
n/a 23,367
(0.78 %)
50,706
(0.93 %)
n/a 41.26
(99.73 %)
124,165
(0.16 %)
1,682,965
(99.84 %)
5,295,703
(27.32 %)
1,024,529
(1.81 %)
16,181,193
(35.22 %)
46,628
(0.97 %)
635 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,794
(2.87 %)
19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
41,391
(1.27 %)
636 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,538
(8.24 %)
637 platypus (Pmale09 primary hap 2020)
GCA_004115215.4
n/a 14,555
(1.24 %)
18,891
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
7,731,079
(57.03 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,668
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
638 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,379
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
639 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,751
(2.39 %)
18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
640 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,175
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
641 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
642 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1
84,704
(3.63 %)
19,312
(1.68 %)
20,354
(1.41 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
106
(0.00 %)
25
(100.00 %)
6,577,724
(45.25 %)
1,288,198
(5.24 %)
13,978,540
(35.31 %)
23,724
(0.69 %)
643 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
644 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
645 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
54,438
(1.38 %)
646 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
50,527
(1.37 %)
647 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
48,670
(1.19 %)
648 Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019)
GCA_006410515.1
n/a 19,722
(1.52 %)
21,663
(1.29 %)
n/a 42.49
(95.93 %)
557,686
(4.13 %)
831,816
(95.87 %)
5,438,181
(47.21 %)
408,156
(1.63 %)
13,068,837
(39.30 %)
67,544
(1.31 %)
649 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
650 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1
117,131
(4.09 %)
18,569
(1.70 %)
20,018
(1.38 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
310
(0.00 %)
2,146
(100.00 %)
3,768,149
(39.86 %)
632,308
(5.35 %)
14,449,518
(32.71 %)
42,166
(4.46 %)
651 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1
n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
69,437
(2.62 %)
652 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
65,437
(2.53 %)
653 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
654 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
655 Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023)
GCA_033318265.1
n/a 18,332
(1.50 %)
18,296
(1.29 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
133
(0.00 %)
437
(100.00 %)
3,825,722
(28.38 %)
915,865
(11.98 %)
13,456,122
(37.89 %)
18,577
(0.50 %)
656 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
657 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
73,518
(2.67 %)
18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
658 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
106,168
(2.78 %)
659 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1
n/a 17,527
(1.87 %)
20,474
(1.83 %)
n/a 41.67
(98.52 %)
63,679
(1.49 %)
75,985
(98.51 %)
2,147,379
(23.41 %)
327,740
(0.98 %)
10,539,226
(28.05 %)
44,487
(4.39 %)
660 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1
n/a 19,881
(1.40 %)
22,566
(1.32 %)
n/a 44.09
(99.92 %)
4,254
(0.08 %)
5,157
(99.93 %)
5,202,709
(44.78 %)
1,059,544
(2.39 %)
13,897,372
(40.69 %)
119,691
(2.74 %)
661 rabbit (alternate hap 2024)
GCA_964237575.1
n/a 12,274
(1.39 %)
16,482
(1.38 %)
n/a 44.19
(100.00 %)
n/a 10,111
(100.00 %)
3,613,446
(49.48 %)
579,915
(3.18 %)
7,084,192
(39.81 %)
65,573
(2.79 %)
662 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,033
(4.16 %)
19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
113,371
(2.46 %)
663 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
116,523
(2.66 %)
664 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,642
(2.34 %)
18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
665 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,577
(2.89 %)
19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
52,450
(2.27 %)
666 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,083
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
667 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,461
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
668 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
669 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
670 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
671 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
128,858
(2.07 %)
672 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1
84,632
(3.45 %)
19,565
(1.57 %)
19,909
(1.38 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
104
(0.00 %)
289
(100.00 %)
4,480,315
(31.76 %)
1,010,887
(2.70 %)
13,766,344
(33.12 %)
50,763
(2.22 %)
673 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
52,053
(2.31 %)
674 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
51,373
(2.26 %)
675 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,204
(1.88 %)
676 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
18,764
(0.58 %)
677 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
79,357
(2.66 %)
678 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
57,436
(1.81 %)
679 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
48,931
(1.20 %)
680 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
681 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
74,971
(1.64 %)
682 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
683 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
57,318
(2.32 %)
684 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
76,936
(4.65 %)
685 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
70,117
(3.31 %)
686 root vole (2023)
GCA_963919705.1
n/a 19,293
(1.92 %)
20,635
(1.67 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
3
(0.00 %)
268
(100.00 %)
4,396,130
(38.90 %)
891,534
(2.66 %)
12,119,692
(31.39 %)
19,542
(0.63 %)
687 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,792
(2.85 %)
21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
15,963
(0.43 %)
688 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
58,623
(2.22 %)
689 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
690 saddleback dolphin (alternate hap 2024)
GCA_949987525.2
n/a 18,426
(1.62 %)
22,420
(1.35 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
4,448,346
(50.40 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
691 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCA_949987515.2
n/a 18,542
(1.57 %)
20,620
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,890,277
(52.33 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,469
(42.64 %)
66,188
(3.91 %)
692 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
693 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
66,188
(3.91 %)
694 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
695 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
696 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
59,522
(2.81 %)
697 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2
n/a 17,286
(2.19 %)
20,474
(1.95 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
86
(0.00 %)
254
(100.00 %)
2,610,773
(33.65 %)
389,844
(4.42 %)
9,728,138
(29.49 %)
56,508
(2.97 %)
698 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
699 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
700 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
701 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
702 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
80,128
(1.58 %)
703 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1
n/a 19,313
(1.37 %)
21,662
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
1,066
(0.01 %)
2,917
(99.99 %)
4,418,625
(42.98 %)
875,114
(15.81 %)
12,360,254
(46.52 %)
78,537
(1.66 %)
704 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
63,230
(6.03 %)
705 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
44,477
(1.28 %)
706 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
707 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
708 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
15,455
(0.48 %)
709 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
49,177
(1.05 %)
710 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1
n/a 20,087
(1.59 %)
23,556
(1.46 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,724
(0.03 %)
1,889
(100.00 %)
3,925,148
(27.17 %)
419,490
(1.24 %)
13,364,988
(37.79 %)
47,630
(1.31 %)
711 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
712 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
107,473
(2.80 %)
713 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,569
(3.37 %)
18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
64,690
(2.41 %)
714 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
715 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
716 Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022)
GCA_023101885.1
n/a 20,505
(1.36 %)
25,606
(1.53 %)
n/a 42.21
(99.64 %)
3,794
(0.36 %)
1,243
(100.00 %)
5,973,279
(45.08 %)
1,551,851
(4.63 %)
13,570,249
(38.60 %)
73,762
(1.53 %)
717 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
62,524
(3.25 %)
718 soprano pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_949987585.2
n/a 17,999
(1.88 %)
21,396
(1.80 %)
n/a 42.74
(100.00 %)
122
(0.00 %)
330
(100.00 %)
4,426,108
(44.40 %)
866,819
(7.44 %)
10,132,985
(37.65 %)
64,680
(3.15 %)
719 soprano pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_949987765.2
n/a 17,269
(1.90 %)
20,534
(1.83 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
87
(0.00 %)
369
(100.00 %)
4,151,522
(43.86 %)
809,312
(8.01 %)
9,615,104
(37.56 %)
63,890
(3.24 %)
720 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
63,256
(3.06 %)
721 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
722 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
723 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
21,349
(0.52 %)
724 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1
n/a 22,529
(1.85 %)
20,409
(1.22 %)
n/a 41.10
(99.90 %)
78
(0.10 %)
416
(99.90 %)
4,880,101
(47.77 %)
1,689,287
(15.13 %)
12,822,147
(42.92 %)
22,642
(0.54 %)
725 Southern African pygmy mouse (2020)
GCA_902729485.2
n/a 21,253
(2.02 %)
24,053
(1.41 %)
n/a 41.62
(85.36 %)
63,317
(14.65 %)
92,356
(85.35 %)
5,677,434
(41.24 %)
1,683,338
(3.20 %)
13,320,768
(28.29 %)
21,132
(0.44 %)
726 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
727 southern grasshopper mouse (2020)
GCA_903995425.1
n/a 19,395
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,480
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,539,823
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
728 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
729 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
730 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
59,907
(1.35 %)
731 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
732 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCF_023851605.1
84,279
(3.04 %)
20,960
(1.28 %)
22,188
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
200
(100.00 %)
4,793,649
(47.24 %)
593,018
(1.17 %)
18,033,318
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
733 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
734 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
51,339
(1.15 %)
735 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
736 southern two-toed sloth (primary hap 2020)
GCA_015220235.1
n/a 22,250
(1.38 %)
23,180
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
1,240
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,830,544
(50.68 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,148
(40.49 %)
51,430
(1.14 %)
737 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
738 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
76,527
(3.10 %)
739 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
70,803
(2.85 %)
740 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
741 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,616
(2.83 %)
19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
86,751
(2.23 %)
742 spotted hyena (KB4526 2019)
GCF_008692635.1
n/a n/a n/a n/a 41.48
(99.10 %)
n/a 283,944
(99.08 %)
5,744,848
(42.15 %)
n/a n/a n/a
743 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
21,700
(0.64 %)
744 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1
n/a 15,441
(0.80 %)
15,791
(0.92 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
118
(0.01 %)
124
(99.99 %)
4,962,547
(23.62 %)
1,257,253
(2.87 %)
20,652,321
(42.01 %)
22,718
(0.69 %)
745 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,079
(2.76 %)
746 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
747 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
748 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
17,544
(0.44 %)
749 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024)
GCA_043727795.1
n/a 18,498
(1.82 %)
20,345
(1.58 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,228
(100.00 %)
4,403,018
(41.05 %)
809,880
(2.56 %)
11,206,839
(32.61 %)
38,354
(1.36 %)
750 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
40,424
(1.32 %)
751 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
752 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
753 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
67,537
(3.57 %)
754 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
68,498
(4.29 %)
755 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
756 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
757 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1
n/a 19,326
(0.81 %)
17,560
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,895
(100.00 %)
6,382,198
(27.07 %)
1,058,207
(1.74 %)
22,508,040
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
758 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1
55,990
(2.41 %)
19,328
(0.81 %)
17,559
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,896
(100.00 %)
6,382,203
(27.07 %)
1,058,208
(1.74 %)
22,508,106
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
759 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
45,201
(1.03 %)
760 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1
36,400
(1.65 %)
19,192
(1.42 %)
22,014
(1.41 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
6
(0.00 %)
159
(100.00 %)
3,242,768
(21.18 %)
612,565
(8.05 %)
12,812,990
(44.37 %)
75,177
(5.86 %)
761 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
762 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
114,955
(1.43 %)
763 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
764 tailess tenrec (hap1 2025)
GCA_050624435.1
n/a 21,323
(0.86 %)
25,222
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,682,996
(38.93 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
53,320
(1.01 %)
765 tailess tenrec (hap1 2025)
GCF_050624435.1
45,770
(1.60 %)
21,323
(0.86 %)
25,223
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,633,466
(38.91 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
53,320
(1.01 %)
766 tailess tenrec (hap2 2025)
GCA_050624465.1
n/a 20,180
(0.96 %)
23,467
(1.13 %)
n/a 44.21
(100.00 %)
160
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
5,074,733
(40.88 %)
791,473
(8.15 %)
16,742,233
(44.91 %)
47,409
(1.01 %)
767 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,927
(1.65 %)
19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
49,134
(7.43 %)
768 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
769 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
12,393
(0.46 %)
770 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1
n/a 17,491
(0.79 %)
15,701
(0.88 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
32
(0.00 %)
40
(100.00 %)
5,762,317
(26.52 %)
1,078,692
(1.83 %)
22,476,051
(38.99 %)
22,756
(0.48 %)
771 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1
n/a 17,037
(0.79 %)
15,066
(0.87 %)
n/a 38.62
(100.00 %)
16
(0.00 %)
24
(100.00 %)
5,608,153
(26.57 %)
1,050,173
(1.77 %)
21,856,273
(38.96 %)
21,811
(0.47 %)
772 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
23,590
(0.47 %)
773 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
24,443
(0.70 %)
774 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1
n/a 15,165
(0.76 %)
15,663
(0.91 %)
n/a 36.00
(99.11 %)
2,578
(0.89 %)
2,584
(99.11 %)
5,039,957
(23.64 %)
1,257,168
(2.97 %)
20,893,744
(41.44 %)
22,574
(0.67 %)
775 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
776 Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022)
GCA_007646695.3
n/a 15,896
(0.81 %)
37,523
(1.30 %)
n/a 36.26
(90.01 %)
295,304
(10.01 %)
149,109
(100.00 %)
9,159,284
(56.14 %)
1,604,085
(2.22 %)
21,839,162
(35.42 %)
46,604
(0.74 %)
777 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
778 thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025)
GCA_052094955.1
n/a 19,425
(1.31 %)
21,287
(1.27 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
1,444
(0.01 %)
5,280
(100.00 %)
6,062,160
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,133
(37.64 %)
34,544
(0.73 %)
779 thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025)
GCA_052094965.1
n/a 17,228
(1.41 %)
17,999
(1.30 %)
n/a 39.81
(99.99 %)
1,000
(0.01 %)
1,438
(100.00 %)
5,253,166
(38.98 %)
750,953
(4.01 %)
14,542,518
(32.77 %)
27,458
(0.71 %)
780 thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025)
GCF_052094955.1
91,025
(3.74 %)
19,425
(1.31 %)
20,977
(1.20 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
1,444
(0.01 %)
5,279
(100.00 %)
6,062,154
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,064
(37.64 %)
34,544
(0.73 %)
781 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1
n/a 19,552
(1.59 %)
19,307
(1.35 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
145
(0.00 %)
234
(100.00 %)
4,500,832
(32.18 %)
999,068
(2.01 %)
13,646,015
(32.98 %)
49,402
(2.19 %)
782 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
783 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025)
GCA_026230055.2
n/a 18,747
(1.81 %)
21,398
(1.62 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
256
(0.00 %)
381
(100.00 %)
5,017,312
(48.85 %)
779,839
(3.26 %)
10,740,034
(37.51 %)
49,071
(2.44 %)
784 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025)
GCA_026230045.2
n/a 17,913
(1.88 %)
19,986
(1.66 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
239
(0.00 %)
165
(100.00 %)
4,617,916
(47.27 %)
707,796
(3.14 %)
9,951,985
(36.27 %)
46,302
(2.55 %)
785 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
48,226
(2.42 %)
786 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
47,139
(2.58 %)
787 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
788 Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024)
GCA_043728055.1
n/a 17,828
(1.84 %)
20,454
(1.63 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
n/a 2,403
(100.00 %)
3,519,024
(41.02 %)
627,372
(2.04 %)
11,034,851
(31.87 %)
33,992
(1.29 %)
789 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
37,175
(1.31 %)
790 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
91,880
(2.74 %)
791 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
80,840
(2.24 %)
792 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
793 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
26,541
(0.58 %)
794 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
795 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
796 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
797 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,565
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
798 water vole (JQ59JK4JDI 2023)
GCA_019206885.2
n/a 18,401
(2.03 %)
18,085
(1.65 %)
n/a 42.19
(89.99 %)
161,581
(10.04 %)
2,585
(100.00 %)
4,771,963
(38.17 %)
705,400
(1.96 %)
11,410,837
(25.00 %)
16,195
(0.52 %)
799 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
800 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
801 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
23,321
(0.97 %)
802 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
803 western European house mouse (C57BL/6 2026)
GCA_056825265.1
n/a 22,725
(1.91 %)
20,127
(1.25 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
n/a 22
(100.00 %)
5,054,625
(45.46 %)
1,712,800
(10.08 %)
12,627,747
(41.14 %)
24,439
(0.56 %)
804 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
22,985
(0.56 %)
805 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1
n/a 20,291
(1.29 %)
23,555
(1.23 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 212
(100.00 %)
4,204,612
(25.49 %)
848,463
(7.79 %)
12,687,776
(48.28 %)
57,315
(1.25 %)
806 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
807 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
22,568
(0.53 %)
808 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
66,785
(2.55 %)
809 whiskered bat (hap1.2 2025)
GCA_964094495.3
n/a 19,023
(1.85 %)
22,199
(1.73 %)
n/a 43.02
(100.00 %)
267
(0.00 %)
241
(100.00 %)
5,005,820
(47.73 %)
756,354
(4.85 %)
10,602,346
(37.72 %)
67,615
(2.61 %)
810 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
64,365
(2.68 %)
811 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
56,325
(3.33 %)
812 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,995
(2.43 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
813 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
814 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2
68,660
(3.60 %)
19,951
(1.73 %)
21,804
(1.48 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
294
(0.00 %)
718
(100.00 %)
4,512,173
(43.10 %)
402,481
(1.14 %)
12,813,223
(37.56 %)
45,863
(1.30 %)
815 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
816 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
15,669
(0.79 %)
817 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
818 white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022)
GCA_024139225.1
n/a 17,350
(1.25 %)
21,890
(1.35 %)
n/a 39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
148
(100.00 %)
6,924,771
(50.26 %)
1,252,365
(3.89 %)
13,775,765
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
819 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
820 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
821 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
822 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1
52,505
(2.90 %)
19,278
(1.60 %)
20,813
(1.31 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
196
(0.00 %)
2,040
(100.00 %)
5,706,841
(46.71 %)
464,013
(1.82 %)
12,973,198
(41.46 %)
42,508
(1.32 %)
823 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
824 winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023)
GCA_030556225.1
n/a 18,177
(1.88 %)
18,942
(1.54 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
742
(100.00 %)
5,398,126
(39.36 %)
1,168,723
(3.56 %)
12,272,233
(30.38 %)
18,332
(0.60 %)
825 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
36,914
(1.02 %)
826 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
827 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
828 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1
n/a 19,363
(1.28 %)
22,239
(1.28 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
240
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,432,114
(42.23 %)
966,165
(7.11 %)
13,263,822
(43.77 %)
96,755
(2.28 %)
829 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
830 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,128
(1.61 %)
18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
62,458
(1.54 %)
831 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
330
(0.00 %)
813
(100.00 %)
4,038,893
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,633
(34.97 %)
36,674
(1.05 %)
832 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
33,990
(1.02 %)
833 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,667
(2.16 %)
19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
34,122
(0.91 %)
834 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,618
(2.51 %)
15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
28,118
(0.66 %)
835 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
836 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
31,831
(0.63 %)
837 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
28,674
(0.68 %)
838 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024)
GCA_043880365.1
n/a 18,844
(1.70 %)
23,805
(1.54 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 8,862
(100.00 %)
3,638,702
(42.22 %)
847,774
(6.68 %)
11,654,541
(34.78 %)
34,055
(3.45 %)
839 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
35,257
(5.20 %)
840 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a 19,188
(1.79 %)
21,673
(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
215
(0.00 %)
250
(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
773,853
(4.49 %)
10,648,494
(37.26 %)
61,910
(2.52 %)
841 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1
48,707
(3.25 %)
18,807
(1.93 %)
21,046
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
684
(100.00 %)
3,552,235
(38.46 %)
719,552
(4.26 %)
10,089,365
(36.35 %)
60,974
(2.61 %)
842 zebra duiker (hap1 2025)
GCA_054099735.1
n/a 19,411
(1.04 %)
23,174
(0.98 %)
n/a 46.14
(100.00 %)
185
(0.00 %)
598
(100.00 %)
6,742,800
(39.85 %)
699,303
(26.55 %)
12,357,908
(58.45 %)
605,557
(5.20 %)
843 zebra duiker (hap2 2025)
GCA_054099755.1
n/a 19,383
(1.06 %)
23,042
(0.98 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
162
(0.00 %)
677
(100.00 %)
6,681,000
(40.47 %)
636,475
(26.14 %)
12,329,686
(57.66 %)
583,195
(5.17 %)
844 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1
n/a 19,162
(1.53 %)
20,991
(1.34 %)
n/a 41.77
(99.99 %)
350
(0.01 %)
292
(100.00 %)
3,296,209
(23.14 %)
440,574
(1.28 %)
12,824,144
(40.98 %)
39,400
(1.07 %)
845 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
846 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1
70,745
(4.27 %)
19,546
(1.58 %)
21,187
(1.33 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
283
(0.00 %)
67
(100.00 %)
5,530,890
(46.61 %)
459,827
(1.43 %)
13,190,355
(41.36 %)
42,544
(1.21 %)
TOTALS:total assembly count 846

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 617 assemblies assembly stats track stats
Mammals 846 assemblies assembly stats track stats
Birds 543 assemblies assembly stats track stats
Fishes 637 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 406 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1946 assemblies assembly stats track stats
Plants 446 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15063 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22351 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats