Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,607
(1.08 %)
18,366
(1.06 %)
20,362
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
6,205,937
(32.04 %)
536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020 VGP)
GCA_011750645.1
n/a 20,905
(2.00 %)
19,775
(1.45 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,844
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
17,711
(0.50 %)
3 African grass rat (paternal 2020 VGP)
GCA_011762545.1
n/a 20,760
(1.99 %)
19,765
(1.45 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,240
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (paternal X 2020 VGP)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
6 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,056
(2.30 %)
19,172
(1.25 %)
19,731
(1.11 %)
28,847
(1.03 %)
40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,188,365
(57.57 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
7 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
8 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
54,502
(1.38 %)
9 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
30,191
(0.63 %)
10 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,865
(1.52 %)
24,202
(1.33 %)
38,514
(1.52 %)
39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,332,270
(32.82 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
11 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
20,020
(1.51 %)
20,440
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
5,520,795
(46.38 %)
419,620
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
12 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
62,580
(1.91 %)
13 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
14 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
15 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,253
(1.93 %)
17,581
(1.61 %)
20,070
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,764,715
(29.18 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
16 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
17 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
18,211
(1.58 %)
15,090
(1.29 %)
31,423
(1.68 %)
41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
4,759,850
(42.13 %)
831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
18 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
19 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
20 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
21 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,506
(1.88 %)
20,721
(1.64 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,159,451
(33.63 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
22 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
23 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,979
(1.74 %)
19,370
(1.45 %)
34,173
(1.85 %)
39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,271,650
(31.66 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
24 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
25 Asiatic elephant (2022 VGP)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
69,120
(1.32 %)
26 Asiatic tapir
GCA_004024905.1
n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
39,691
(1.17 %)
27 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
n/a 41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
28 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,989
(3.12 %)
18,881
(1.76 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,779,606
(41.38 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
29 Australian echidna
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
30 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
30,670
(2.36 %)
18,329
(1.97 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
3,001,969
(34.42 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
31 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
32 bank vole
GCF_902806735.1
56,410
(2.99 %)
18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
18,784
(0.42 %)
33 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
34 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
n/a 41.25
(97.57 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
59,710
(1.51 %)
35 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,694
(1.79 %)
20,348
(1.44 %)
34,035
(1.82 %)
41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
3,941,793
(43.25 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
36 big brown bat
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,347
(1.93 %)
20,120
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,864,091
(26.79 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,714
(2.82 %)
37 bighorn sheep
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
38 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,109
(2.00 %)
20,669
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,903,289
(33.58 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,454
(3.26 %)
39 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
40 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
41 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
42 black rhinoceros (2021 VGP)
GCA_020826845.1
n/a 18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
n/a 548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
43 black rhinoceros (alt pseudohaplotype 2021 VGP)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
n/a 564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
44 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
44,113
(0.97 %)
45 Blainville's beaked whale ( 2022 VGP)
GCA_025265405.1
n/a 19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
n/a 765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
46 blue whale (alt pseudohaplotype JJ_BM4_2016_0621 2019 VGP)
GCA_008658375.1
n/a 17,268
(1.79 %)
21,293
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,351
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
56,916
(1.85 %)
47 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 2020 VGP)
GCF_009873245.2
58,750
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
48 bobcat (2022 UCLA)
GCF_022079265.1
45,362
(2.39 %)
18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
69,211
(2.68 %)
49 boutu
GCA_004363515.1
n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
63,992
(1.47 %)
50 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,290
(1.75 %)
18,487
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
3,034,586
(25.67 %)
634,242
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
51 Brazilian free-tailed bat
GCA_004025005.1
n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
89,940
(1.88 %)
52 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
53 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
54 brown bear (2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
68,113
(2.27 %)
55 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,242
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
56 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
62,325
(2.36 %)
57 California sea lion (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_009762295.1
n/a 18,329
(1.80 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,616
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
44,449
(1.57 %)
58 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,746
(1.77 %)
20,628
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,446,830
(42.87 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
59 California sea lion (v2 2020 VGP)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
60 Canada lynx (alt pseudohaplotype LIC74 2019 VGP)
GCA_007474575.1
n/a 12,021
(1.41 %)
15,193
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,488
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
39,082
(2.44 %)
61 Canada lynx (LIC74 v2 2020 VGP)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
62 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
n/a 41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
63 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,291
(1.07 %)
24,277
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,691,898
(16.77 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
64 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,336
(1.07 %)
20,999
(1.07 %)
21,719
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
5,100,661
(20.78 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
65 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
37,158
(0.70 %)
66 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
67 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,293
(2.98 %)
19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
44,208
(1.24 %)
68 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
172,178
(3.66 %)
69 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,167
(3.33 %)
18,484
(1.69 %)
20,554
(1.44 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,776,210
(42.44 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,743
(2.17 %)
70 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
n/a 41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
71 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,741
(2.77 %)
20,573
(1.77 %)
17,449
(1.35 %)
34,472
(2.19 %)
41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,408,864
(32.03 %)
1,072,137
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
72 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
73 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
74 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
75 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
76 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,420
(1.39 %)
19,216
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
4,978,967
(22.65 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
77 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
78 common bottlenose dolphin (paternal 2020 VGP)
GCA_011762515.1
n/a 18,561
(1.76 %)
21,110
(1.48 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,798
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
79 common bottlenose dolphin (maternal 2020 VGP)
GCA_011762535.1
n/a 18,853
(1.76 %)
21,496
(1.48 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,890
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
65,379
(1.89 %)
80 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020 VGP)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
18,774
(1.76 %)
20,983
(1.46 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
3,974,528
(45.82 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
81 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,272
(1.68 %)
17,061
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,762,939
(43.50 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,029
(1.34 %)
82 common brushtail (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_011100645.1
n/a 14,854
(0.75 %)
15,755
(0.91 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,766
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
83 common brushtail (refseq 2020 VGP)
GCF_011100635.1
37,674
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
84 common pipistrelle (2020 VGP)
GCA_903992545.1
n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
n/a 805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
57,295
(2.83 %)
85 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
86 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,031
(3.24 %)
18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
51,634
(1.37 %)
87 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,088
(2.64 %)
18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
n/a 41.95
(99.61 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
75,592
(1.86 %)
88 common wombat
GCF_900497805.2
46,378
(1.78 %)
19,413
(0.86 %)
18,956
(0.96 %)
37,453
(1.40 %)
38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,545,522
(41.80 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
89 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
90 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
91 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
92 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,996
(1.45 %)
17,068
(1.43 %)
41,630
(2.45 %)
40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
3,917,768
(29.90 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
93 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
94 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
95 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
96 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,760
(1.77 %)
17,570
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,813,425
(24.38 %)
532,295
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
97 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,273
(1.40 %)
22,101
(1.46 %)
32,968
(1.30 %)
41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,736,285
(26.59 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
98 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
99 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
100 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
51,216
(2.28 %)
101 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,549
(3.63 %)
19,773
(1.66 %)
19,610
(1.40 %)
60,994
(2.37 %)
41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,859,174
(42.88 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,267
(2.05 %)
102 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,774
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
103 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
53,518
(2.23 %)
104 dog (labrador)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
n/a 41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
105 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,089
(3.30 %)
18,675
(1.63 %)
21,699
(1.43 %)
54,456
(2.25 %)
41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,007,925
(43.13 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,699
(2.42 %)
106 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
107 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,855
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
108 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
109 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,775
(2.31 %)
18,304
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
34,846
(1.97 %)
39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,118,154
(37.97 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
110 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
111 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
112 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
24,508
(0.70 %)
113 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,227
(2.03 %)
24,190
(1.88 %)
n/a 40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,793,981
(32.38 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,181
(4.55 %)
114 Egyptian rousette (2020 VGP)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
115 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
n/a 42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
116 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
117 ermine (alt pseudohaplotype 2020 VGP)
GCA_009829165.1
n/a 13,589
(1.64 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,032
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,138
(2.20 %)
118 ermine (2020 VGP)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
18,862
(1.65 %)
21,246
(1.48 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,560,766
(40.92 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,063
(2.27 %)
119 Eurasian badger (2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
120 Eurasian badger (2021 VGP)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
n/a 801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
121 Eurasian red squirrel (alt pseudohaplotype 2019 VGP)
GCA_902685485.1
n/a 12,427
(1.50 %)
13,159
(1.26 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,173
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
122 Eurasian red squirrel (2019 VGP)
GCA_902686455.1
n/a 21,292
(1.58 %)
21,930
(1.42 %)
36,836
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,961
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
123 Eurasian river otter
GCF_902655055.1
67,145
(2.95 %)
18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
124 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
125 European shrew
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,316
(1.33 %)
22,012
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,209,276
(32.39 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,848
(2.54 %)
126 European woodmouse (2022 VGP)
GCA_947179515.1
n/a 19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
n/a 1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
127 fat dormouse
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
128 fat sand rat
GCA_002215935.1
n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
26,411
(0.73 %)
129 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,015
(2.86 %)
18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
70,402
(2.61 %)
130 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,658
(2.08 %)
18,311
(1.36 %)
20,590
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
4,987,661
(36.73 %)
389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
131 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
132 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
133 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
75,114
(1.33 %)
134 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
45,586
(0.89 %)
135 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,331
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
136 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
137 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
138 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,468
(3.27 %)
19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
59,449
(1.50 %)
139 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,159
(2.31 %)
19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
125,662
(4.00 %)
140 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
141 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
n/a 42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
142 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
143 golden spiny mouse (2020 VGP)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
144 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
145 gray seal
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
146 gray short-tailed opossum
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,699
(0.75 %)
16,890
(0.89 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,754,700
(56.19 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
147 gray squirrel
GCF_902686445.1
58,884
(2.46 %)
20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
148 gray wolf (2021 VGP)
GCA_905319855.2
n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
n/a 1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
51,996
(2.15 %)
149 great roundleaf bat (ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
19,032
(2.00 %)
19,878
(1.66 %)
n/a 41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,013,481
(31.67 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
150 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
151 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
152 greater horseshoe bat alt pseudohaplotype (MPI-CBG 2019 VGP)
GCA_004115295.1
n/a 14,884
(1.84 %)
18,926
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,327
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
153 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019 VGP)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
154 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
155 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
62,189
(5.35 %)
156 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
157 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
158 harbor porpoise
GCA_004363495.1
n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
80,965
(1.65 %)
159 harbor seal
GCF_004348235.1
50,670
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
160 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
161 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
162 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
48,380
(1.43 %)
163 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
54,753
(1.59 %)
164 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
165 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
166 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
n/a 39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
167 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
168 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
169 Honduran yellow-shouldered bat
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
170 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,580
(4.06 %)
19,002
(1.72 %)
21,184
(1.44 %)
59,087
(2.31 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
3,990,556
(44.47 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,824
(1.74 %)
171 house mouse 129S1_SvImJ
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
n/a 41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
172 house mouse AKR_J
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
n/a 41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
173 house mouse A_J
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
174 house mouse BALB_cJ
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
n/a 41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
175 house mouse C3H_HeJ
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
n/a 41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
176 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
130,343
(4.85 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
177 house mouse C57BL_6NJ
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
n/a 41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
178 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
n/a 41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
179 house mouse CBA_J
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
n/a 41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
180 house mouse DBA_2J
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
n/a 41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
181 house mouse FVB_NJ
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
n/a 41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
182 house mouse LP_J
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
n/a 41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
183 house mouse NOD_ShiLtJ
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
n/a 42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
184 house mouse NZO_HlLtJ
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
n/a 41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
185 house mouse PWK_PhJ
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
n/a 41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
186 house mouse WSB_EiJ
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
n/a 41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
187 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 hybrid 2018 VGP)
GCA_003369685.2
n/a 19,100
(1.59 %)
21,093
(1.37 %)
52,201
(2.64 %)
41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,419
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
188 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 hybrid 2018 VGP)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,602
(1.56 %)
21,960
(1.36 %)
54,700
(2.65 %)
41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,458,622
(47.18 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
189 Iberian mole
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
190 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
n/a 40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
191 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
n/a 39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
192 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
193 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
194 jaguar
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
195 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
196 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,705
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
n/a 41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
197 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
68,778
(2.92 %)
198 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
28,632
(1.91 %)
18,740
(1.85 %)
20,364
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,889,071
(43.64 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
199 killer whale (2022 VGP)
GCF_937001465.1
78,470
(3.76 %)
18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
200 koala
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
17,497
(0.86 %)
16,191
(0.94 %)
45,693
(1.51 %)
39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,723,845
(41.40 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
201 Kuhl's pipistrelle (2020 VGP)
GCF_014108245.1
63,293
(2.96 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
202 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,459
(1.90 %)
23,597
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,034,715
(36.02 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
203 large tree shrew
GCA_004365275.1
n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
138,732
(1.75 %)
204 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,886
(1.63 %)
21,016
(1.44 %)
35,228
(1.85 %)
41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,164,376
(42.44 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
76,997
(2.42 %)
205 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
206 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,991
(1.44 %)
19,411
(1.38 %)
20,314
(1.35 %)
31,768
(1.26 %)
41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,163,038
(37.73 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
207 lesser Egyptian jerboa (alt pseudohaplotype 2021 VGP)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
208 lesser Egyptian jerboa (2021 VGP)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
209 lesser panda
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
210 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
211 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,327
(1.85 %)
22,706
(1.70 %)
26,840
(1.67 %)
42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,683,414
(37.00 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
212 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
213 long-finned pilot whale
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,773
(1.79 %)
21,033
(1.46 %)
n/a 41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,867,760
(45.23 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
214 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,119
(1.58 %)
19,511
(1.52 %)
39,338
(2.73 %)
41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,013,972
(30.18 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
215 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
216 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
217 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,455
(1.56 %)
24,779
(1.38 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
2,943,168
(34.76 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
218 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
219 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
220 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
221 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
18,993
(1.63 %)
19,805
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,490,767
(39.69 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
222 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,566
(2.38 %)
19,285
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
3,965,103
(41.83 %)
573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
223 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,191
(1.83 %)
24,331
(1.47 %)
35,821
(1.80 %)
42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,691,924
(36.71 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
224 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
26,044
(0.71 %)
225 monito del monte
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
226 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
n/a 40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
227 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
228 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
229 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,356
(1.73 %)
20,858
(1.51 %)
41,385
(2.69 %)
40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,043,531
(31.71 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
230 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
40,717
(0.98 %)
231 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,754
(1.77 %)
20,712
(1.43 %)
33,373
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
3,955,737
(43.50 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
232 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,049
(2.15 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,648,190
(29.47 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
233 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
234 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
235 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
139,490
(2.47 %)
236 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
237 Northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
238 Northern elephant seal (2021 DNA Zoo)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
239 Northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
240 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,422
(1.77 %)
23,659
(1.43 %)
n/a 41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
4,956,409
(42.98 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
241 northern gundi
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
242 Northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
243 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
244 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
245 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
246 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,436
(1.94 %)
19,620
(1.43 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
4,727,554
(42.65 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
247 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,323
(1.82 %)
20,892
(1.37 %)
41,078
(2.09 %)
41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,183,432
(43.24 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
248 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
n/a 41.85
(99.82 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
20,720
(0.48 %)
249 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1
n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
n/a 41.86
(99.94 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
21,006
(0.49 %)
250 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
n/a 41.92
(99.80 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
21,449
(0.51 %)
251 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
252 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
253 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,957
(1.53 %)
19,315
(1.54 %)
27,593
(1.67 %)
42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,216,757
(36.05 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
254 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
255 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
256 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
49,134
(2.83 %)
257 Pacific walrus
GCF_000321225.1
32,719
(1.92 %)
20,637
(1.82 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,370,614
(41.51 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
258 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,960
(3.26 %)
18,765
(1.79 %)
20,858
(1.45 %)
n/a 41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,877,981
(45.30 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
259 pale spear-nosed bat (alt pseudohaplotype MPI-MPIP 2019 VGP)
GCA_004115245.1
n/a 18,137
(1.62 %)
23,531
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,127
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
67,665
(3.67 %)
260 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 2020 VGP)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
261 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
262 Parnell's mustached bat
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
263 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
264 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
265 pig (Duroc)
GCF_000003025.6
77,708
(4.05 %)
18,978
(1.64 %)
20,299
(1.39 %)
63,041
(4.47 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
4,932,009
(45.39 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,130
(1.79 %)
266 pig (USMARCv1)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
267 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,779
(2.87 %)
19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
41,391
(1.27 %)
268 platypus (alt pseudohaplotype Pmale09 2020 VGP)
GCA_004115175.2
n/a 13,224
(1.25 %)
19,300
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,881
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,474
(7.32 %)
269 platypus (Pmale09 v4 2020 VGP)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
270 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,764
(2.39 %)
18,507
(1.67 %)
15,385
(1.38 %)
40,592
(1.77 %)
41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,137,454
(40.52 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
271 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,188
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
272 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,412
(1.69 %)
20,882
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
4,953,552
(29.12 %)
1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
273 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
274 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,616
(1.90 %)
19,545
(1.63 %)
31,482
(2.05 %)
42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,667,172
(24.26 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
275 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
48,670
(1.19 %)
276 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,556
(1.68 %)
22,114
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,833,909
(41.06 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
277 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,666
(1.57 %)
16,978
(1.33 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,808,774
(42.28 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
278 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
279 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
280 rabbit (New Zealand White 2021)
GCA_009806435.2
n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
113,370
(2.46 %)
281 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,655
(2.34 %)
18,672
(1.38 %)
20,766
(1.29 %)
51,845
(2.01 %)
43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,802,800
(44.34 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
282 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,096
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,656
(1.47 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
283 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,474
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
284 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
285 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
286 red deer
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
287 red fox
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,810
(1.68 %)
18,896
(1.40 %)
54,234
(2.21 %)
41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,835,239
(40.35 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,199
(1.82 %)
288 reed vole (2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
18,764
(0.58 %)
289 reindeer
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
290 Ryukyu mouse (2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
291 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
58,623
(2.22 %)
292 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
293 Schreibers' long-fingered bat
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
294 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
295 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
296 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
n/a 41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,615,871
(40.95 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,389
(1.88 %)
297 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
298 sheep
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
n/a 41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
299 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
300 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
49,177
(1.05 %)
301 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
28,376
(1.28 %)
18,986
(1.18 %)
19,329
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,633,157
(28.17 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
302 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,556
(3.37 %)
18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
64,690
(2.41 %)
303 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
304 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
305 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
306 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
n/a 41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
307 southern grasshopper mouse (2020 VGP)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
308 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,294
(2.10 %)
18,506
(1.44 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,749,130
(37.35 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
309 southern tamandua (2022 VGP)
GCA_023851605.1
n/a 20,639
(1.21 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
n/a 593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
310 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
311 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
312 southern two-toed sloth (2020 VGP)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
313 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,050
(2.11 %)
18,561
(1.80 %)
19,750
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,736,665
(38.99 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
314 Sowerby's beaked whale
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
315 sperm whale
GCF_002837175.2
60,934
(2.59 %)
19,544
(1.72 %)
25,657
(1.56 %)
35,346
(1.68 %)
41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,278,719
(42.32 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.53 %)
316 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,276
(1.94 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
2,372,354
(28.64 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,078
(2.74 %)
317 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,057
(2.38 %)
21,173
(1.77 %)
21,625
(1.43 %)
n/a 41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,473,916
(43.13 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
318 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
319 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a 21,630
(2.15 %)
20,895
(1.41 %)
47,114
(2.07 %)
41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
n/a 1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
17,544
(0.44 %)
320 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
321 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
322 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
323 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
324 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
45,201
(1.03 %)
325 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,747
(1.83 %)
21,445
(1.54 %)
25,827
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
5,040,804
(38.62 %)
854,442
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
326 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
114,955
(1.43 %)
327 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
328 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
329 Tasmanian devil
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,902
(0.85 %)
17,542
(0.99 %)
43,475
(2.65 %)
36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,648,718
(44.20 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
330 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
331 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
332 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
333 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,715
(1.26 %)
21,275
(1.20 %)
32,861
(1.46 %)
41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,001,130
(33.96 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
334 vaquita (alt pseudohaplotype mPhoSin1 2019 VGP)
GCA_008692045.1
n/a 9,345
(1.66 %)
11,443
(1.32 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,357
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
335 vaquita (mPhoSin1 2019 VGP)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,607
(1.76 %)
20,488
(1.43 %)
35,398
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,010,529
(43.76 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
336 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
337 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,552
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
338 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,059
(1.72 %)
22,343
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,339,447
(41.27 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
339 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,936
(1.68 %)
18,057
(1.33 %)
19,768
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,405,129
(45.37 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
340 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
341 white-footed mouse
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
342 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,671
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,716,909
(40.83 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
343 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
n/a 39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
344 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
n/a 41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
345 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,796
(1.94 %)
17,115
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
3,026,433
(34.28 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
346 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
347 wild mouse SPRET_EiJ
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
n/a 41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
348 wild yak
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,942
(1.61 %)
19,921
(1.32 %)
40,104
(1.69 %)
41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,326,892
(44.50 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
349 woodchuck (LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
36,919
(1.02 %)
350 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
351 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,663
(2.12 %)
21,029
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,603,698
(36.96 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
352 Yangtze finless porpoise (v2)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,721
(1.80 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,926,818
(42.04 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
353 Yangtze River dolphin (BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
19,232
(1.73 %)
27,450
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,220,655
(43.60 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
354 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,654
(2.16 %)
19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
34,122
(0.91 %)
355 yellow-footed antechinus
GCA_016432865.1
n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
28,121
(0.66 %)
356 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
357 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,594
(1.58 %)
19,105
(1.32 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,037,418
(46.47 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,242
(0.85 %)
TOTALS:total assembly count 357

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Primates 59 assemblies assembly stats track stats
Mammals 357 assemblies assembly stats track stats
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