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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.
count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | aardvark GCF_000298275.1 |
25,607 (1.08 %) |
18,366 (1.06 %) |
20,362 (0.98 %) |
n/a | 40.07 (76.89 %) |
411,144 (23.15 %) |
433,653 (76.85 %) |
6,205,937 (32.04 %) |
536,700 (0.74 %) |
18,176,790 (39.08 %) |
26,235 (0.40 %) |
2 | African savanna elephant GCF_000001905.1 |
46,056 (2.30 %) |
19,172 (1.25 %) |
19,731 (1.11 %) |
n/a | 40.76 (97.57 %) |
93,514 (2.45 %) |
95,866 (97.55 %) |
6,188,365 (57.57 %) |
365,797 (0.88 %) |
16,073,053 (44.89 %) |
33,513 (0.68 %) |
3 | alpaca GCF_000164845.3 |
55,014 (3.56 %) |
18,451 (1.93 %) |
18,474 (1.64 %) |
n/a | 41.40 (95.85 %) |
166,280 (4.17 %) |
77,390 (100.00 %) |
3,071,384 (35.75 %) |
315,108 (1.36 %) |
12,461,739 (24.88 %) |
54,502 (1.38 %) |
4 | Alpine marmot GCF_001458135.1 |
35,350 (2.23 %) |
20,533 (1.68 %) |
18,293 (1.41 %) |
31,318 (1.47 %) |
39.80 (96.07 %) |
89,362 (3.94 %) |
14,543 (100.00 %) |
4,454,253 (32.70 %) |
747,129 (1.83 %) |
14,077,162 (30.27 %) |
30,224 (0.63 %) |
5 | American beaver GCF_001984765.1 |
40,013 (2.15 %) |
20,865 (1.52 %) |
24,202 (1.33 %) |
n/a | 39.72 (99.99 %) |
3,321 (0.01 %) |
21,157 (100.00 %) |
4,332,270 (32.82 %) |
486,353 (1.30 %) |
14,347,145 (31.96 %) |
23,046 (0.72 %) |
6 | American bison GCF_000754665.1 |
38,699 (2.34 %) |
20,020 (1.51 %) |
20,440 (1.25 %) |
n/a | 41.82 (93.12 %) |
341,984 (6.92 %) |
470,415 (93.08 %) |
5,520,795 (46.38 %) |
419,620 (0.95 %) |
13,519,877 (37.66 %) |
60,388 (1.03 %) |
7 | American pika 3.0 GCF_000292845.1 |
26,253 (1.93 %) |
17,581 (1.61 %) |
20,070 (1.70 %) |
n/a | 43.35 (87.20 %) |
122,542 (12.82 %) |
132,962 (87.18 %) |
2,764,715 (29.18 %) |
414,896 (1.07 %) |
10,968,698 (26.71 %) |
44,652 (1.14 %) |
8 | American pika 4.0 GCF_014633375.1 |
31,887 (1.92 %) |
17,532 (1.60 %) |
19,609 (1.65 %) |
n/a | 43.35 (87.14 %) |
124,941 (12.88 %) |
9,351 (100.00 %) |
2,827,662 (29.77 %) |
414,980 (1.07 %) |
10,969,165 (26.69 %) |
44,743 (1.13 %) |
9 | American mink GCA_900108605.1 |
n/a | 18,686 (1.70 %) |
20,016 (1.50 %) |
n/a | 41.60 (92.95 %) |
154,172 (7.07 %) |
161,347 (92.93 %) |
4,350,343 (38.70 %) |
606,128 (1.17 %) |
13,605,797 (28.74 %) |
54,199 (1.98 %) |
10 | Amur tiger GCF_000464555.1 |
33,681 (2.23 %) |
18,211 (1.58 %) |
15,090 (1.29 %) |
n/a | 41.40 (97.59 %) |
155,553 (2.44 %) |
157,032 (97.56 %) |
4,759,850 (42.13 %) |
831,136 (1.67 %) |
13,654,437 (31.78 %) |
65,229 (1.60 %) |
11 | Arabian camel GCF_000803125.2 |
64,532 (3.85 %) |
18,506 (1.88 %) |
20,721 (1.64 %) |
n/a | 41.51 (99.22 %) |
47,342 (0.79 %) |
21,070 (100.00 %) |
3,159,451 (33.63 %) |
345,049 (1.55 %) |
13,383,050 (26.19 %) |
58,872 (1.79 %) |
12 | Arctic ground squirrel GCF_003426925.1 |
39,569 (2.25 %) |
18,979 (1.74 %) |
19,370 (1.45 %) |
n/a | 39.95 (89.51 %) |
2,429,461 (10.59 %) |
15,883 (100.00 %) |
4,271,650 (31.66 %) |
672,831 (1.50 %) |
13,913,477 (26.41 %) |
27,575 (0.72 %) |
13 | ass GCF_001305755.1 |
48,989 (3.12 %) |
18,881 (1.76 %) |
19,295 (1.44 %) |
n/a | 41.28 (98.63 %) |
69,593 (1.38 %) |
2,167 (100.00 %) |
3,779,606 (41.38 %) |
289,737 (0.96 %) |
14,695,308 (28.58 %) |
40,025 (1.06 %) |
14 | Bactrian camel GCF_000767855.1 |
30,670 (2.36 %) |
18,329 (1.97 %) |
17,094 (1.64 %) |
n/a | 41.32 (99.32 %) |
31,980 (0.69 %) |
67,435 (99.31 %) |
3,001,969 (34.42 %) |
306,997 (0.95 %) |
12,209,949 (25.43 %) |
49,790 (1.25 %) |
15 | David's myotis bat GCF_000327345.1 |
37,645 (2.70 %) |
18,760 (1.77 %) |
17,570 (1.62 %) |
n/a | 42.69 (91.23 %) |
223,511 (8.80 %) |
325,280 (91.20 %) |
2,813,425 (24.38 %) |
532,295 (1.90 %) |
11,016,028 (29.55 %) |
59,615 (1.59 %) |
16 | Natal long-fingered bat GCF_001595765.1 |
32,050 (3.03 %) |
18,049 (2.15 %) |
18,293 (1.87 %) |
n/a | 42.07 (96.24 %) |
204,616 (3.79 %) |
1,269 (100.00 %) |
2,648,190 (29.47 %) |
376,532 (1.91 %) |
10,427,823 (26.35 %) |
63,261 (2.07 %) |
17 | beluga whale GCF_002288925.2 |
59,413 (3.09 %) |
18,694 (1.79 %) |
20,348 (1.44 %) |
n/a | 41.24 (98.49 %) |
24,414 (1.52 %) |
29,444 (98.48 %) |
3,941,793 (43.25 %) |
543,276 (1.11 %) |
12,802,735 (34.18 %) |
59,307 (1.53 %) |
18 | big brown bat GCF_000308155.1 |
59,162 (3.17 %) |
18,347 (1.93 %) |
20,120 (1.78 %) |
n/a | 42.93 (89.41 %) |
160,269 (10.62 %) |
167,057 (89.38 %) |
2,864,091 (26.79 %) |
614,712 (1.89 %) |
10,407,733 (28.90 %) |
66,714 (2.82 %) |
19 | black flying fox GCF_000325575.1 |
46,991 (3.15 %) |
18,109 (2.00 %) |
20,669 (1.75 %) |
n/a | 39.74 (97.93 %) |
104,566 (2.08 %) |
170,164 (97.92 %) |
2,903,289 (33.58 %) |
481,859 (1.45 %) |
12,582,349 (26.52 %) |
62,454 (3.26 %) |
20 | Brandt's bat GCF_000412655.1 |
46,912 (2.84 %) |
19,290 (1.75 %) |
18,487 (1.62 %) |
n/a | 42.59 (94.06 %) |
155,664 (5.95 %) |
325,414 (94.05 %) |
3,034,586 (25.67 %) |
634,242 (3.20 %) |
11,323,618 (31.06 %) |
66,749 (1.59 %) |
21 | brown bear GCF_003584765.1 |
54,006 (3.19 %) |
18,821 (1.77 %) |
21,060 (1.52 %) |
n/a | 41.84 (99.31 %) |
17,380 (0.70 %) |
21,814 (99.30 %) |
4,201,047 (40.86 %) |
567,588 (1.23 %) |
13,807,277 (30.86 %) |
62,126 (1.80 %) |
22 | California sea lion GCF_900631625.1 |
69,240 (2.99 %) |
20,746 (1.77 %) |
20,628 (1.44 %) |
n/a | 41.38 (99.81 %) |
47,716 (0.20 %) |
10,423 (100.00 %) |
4,446,830 (42.87 %) |
573,086 (1.12 %) |
13,442,336 (33.58 %) |
50,583 (1.46 %) |
23 | Canada lynx GCF_007474595.1 |
50,094 (2.69 %) |
18,273 (1.65 %) |
20,245 (1.42 %) |
39,235 (1.96 %) |
41.70 (99.88 %) |
848 (0.12 %) |
66 (100.00 %) |
4,941,326 (43.36 %) |
904,986 (1.75 %) |
13,476,288 (34.20 %) |
66,816 (2.48 %) |
24 | Cape elephant shrew GCF_000299155.1 |
25,406 (1.08 %) |
23,291 (1.07 %) |
24,277 (1.16 %) |
n/a | 40.30 (86.29 %) |
279,394 (13.74 %) |
288,162 (86.26 %) |
3,691,898 (16.77 %) |
604,351 (0.89 %) |
20,072,078 (42.36 %) |
25,977 (0.42 %) |
25 | Cape golden mole GCF_000296735.1 |
25,336 (1.07 %) |
20,999 (1.07 %) |
21,719 (1.04 %) |
n/a | 40.01 (79.93 %) |
370,844 (20.11 %) |
391,344 (79.89 %) |
5,100,661 (20.78 %) |
500,830 (1.95 %) |
18,946,663 (41.18 %) |
21,186 (0.33 %) |
26 | cattle GCF_002263795.1 |
76,369 (2.97 %) |
19,655 (1.55 %) |
22,253 (1.36 %) |
n/a | 41.93 (100.00 %) |
386 (0.00 %) |
2,211 (100.00 %) |
5,620,154 (49.32 %) |
545,256 (2.90 %) |
13,085,601 (41.79 %) |
44,357 (1.24 %) |
27 | cheetah GCF_003709585.1 |
72,167 (3.33 %) |
18,484 (1.69 %) |
20,554 (1.44 %) |
n/a | 41.55 (99.55 %) |
24,173 (0.45 %) |
3,220 (100.00 %) |
4,776,210 (42.44 %) |
831,106 (1.53 %) |
13,663,571 (32.84 %) |
60,743 (2.17 %) |
28 | Chinese hamster GCF_000223135.1 |
46,741 (2.77 %) |
20,573 (1.77 %) |
17,449 (1.35 %) |
n/a | 41.37 (96.61 %) |
156,635 (3.40 %) |
265,787 (96.60 %) |
4,408,864 (32.03 %) |
1,072,137 (2.66 %) |
13,150,189 (30.04 %) |
12,522 (0.25 %) |
29 | Chinese hamster CHO GCF_003668045.3 |
55,440 (2.79 %) |
20,030 (1.84 %) |
18,721 (1.41 %) |
n/a | 41.51 (99.90 %) |
4,164 (0.10 %) |
647 (100.00 %) |
8,121,057 (33.74 %) |
1,095,058 (2.91 %) |
12,923,274 (32.25 %) |
19,341 (0.58 %) |
30 | Chinese pangolin GCF_014570555.1 |
69,694 (3.21 %) |
18,206 (1.70 %) |
20,508 (1.48 %) |
n/a | 40.79 (95.54 %) |
34,903 (4.47 %) |
4,694 (100.00 %) |
2,927,176 (35.60 %) |
269,964 (0.67 %) |
12,610,535 (29.10 %) |
35,278 (1.05 %) |
31 | Chinese tree shrew GCF_000334495.1 |
47,005 (2.07 %) |
21,420 (1.39 %) |
19,216 (1.28 %) |
n/a | 41.73 (95.10 %) |
191,695 (4.92 %) |
242,445 (95.08 %) |
4,978,967 (22.65 %) |
1,046,388 (4.15 %) |
14,978,259 (38.04 %) |
88,806 (1.44 %) |
32 | common bottlenose dolphin GCF_001922835.1 |
45,975 (2.99 %) |
17,272 (1.68 %) |
17,061 (1.34 %) |
n/a | 40.85 (99.45 %) |
114,003 (0.57 %) |
2,648 (100.00 %) |
3,762,939 (43.50 %) |
514,631 (1.06 %) |
12,317,098 (32.18 %) |
48,029 (1.34 %) |
33 | common vampire bat GCF_002940915.1 |
32,705 (2.51 %) |
18,526 (1.87 %) |
18,175 (1.68 %) |
n/a | 42.15 (97.78 %) |
54,308 (2.23 %) |
84,109 (97.77 %) |
2,788,883 (29.47 %) |
275,247 (1.03 %) |
11,798,198 (28.19 %) |
51,834 (1.38 %) |
34 | common wombat GCF_900497805.2 |
46,378 (1.78 %) |
19,413 (0.86 %) |
18,956 (0.96 %) |
n/a | 38.86 (99.68 %) |
67,461 (0.33 %) |
14,183 (100.00 %) |
8,545,522 (41.80 %) |
1,203,246 (1.61 %) |
23,878,215 (39.11 %) |
18,752 (0.37 %) |
35 | Damara mole-rat DMR 1.0 GCF_000743615.1 |
52,373 (2.57 %) |
17,996 (1.45 %) |
17,068 (1.43 %) |
n/a | 40.34 (97.96 %) |
87,815 (2.05 %) |
162,545 (97.95 %) |
3,917,768 (29.90 %) |
545,281 (1.74 %) |
13,406,483 (30.65 %) |
37,008 (0.74 %) |
36 | Damara mole-rat DMR 1.0 HiC GCF_012274545.1 |
58,091 (2.74 %) |
17,780 (1.44 %) |
16,515 (1.42 %) |
n/a | 40.34 (97.94 %) |
88,899 (2.07 %) |
73,970 (100.00 %) |
4,035,140 (30.95 %) |
544,772 (1.73 %) |
13,390,872 (30.61 %) |
37,008 (0.74 %) |
37 | degu GCF_000260255.1 |
48,165 (2.13 %) |
22,273 (1.40 %) |
22,101 (1.46 %) |
n/a | 41.38 (84.36 %) |
252,772 (15.68 %) |
259,904 (84.32 %) |
4,736,285 (26.59 %) |
898,945 (1.50 %) |
14,282,003 (29.30 %) |
40,135 (0.82 %) |
38 | dingo GCF_012295265.1 |
102,060 (4.04 %) |
19,777 (1.69 %) |
20,341 (1.41 %) |
n/a | 41.29 (99.69 %) |
325 (0.31 %) |
477 (100.00 %) |
4,950,808 (42.83 %) |
1,033,921 (2.36 %) |
13,745,703 (33.32 %) |
51,835 (2.25 %) |
39 | dog GCF_000002285.3 |
82,549 (3.63 %) |
19,773 (1.66 %) |
19,610 (1.40 %) |
60,994 (2.37 %) |
41.31 (99.25 %) |
23,876 (0.76 %) |
27,106 (99.24 %) |
4,859,174 (42.88 %) |
991,835 (2.81 %) |
13,644,959 (33.60 %) |
53,267 (2.05 %) |
40 | domestic cat GCF_000181335.3 |
72,089 (3.30 %) |
18,675 (1.63 %) |
21,699 (1.43 %) |
n/a | 41.73 (98.20 %) |
436 (1.80 %) |
5,079 (98.20 %) |
5,007,925 (43.13 %) |
964,126 (2.68 %) |
13,947,871 (33.33 %) |
69,699 (2.42 %) |
41 | domestic ferret GCF_000215625.1 |
55,980 (3.39 %) |
18,624 (1.69 %) |
19,480 (1.48 %) |
n/a | 41.47 (94.51 %) |
109,700 (5.51 %) |
117,442 (94.49 %) |
4,309,890 (39.11 %) |
606,818 (1.04 %) |
13,503,550 (29.63 %) |
53,375 (1.90 %) |
42 | domestic guinea pig GCF_000151735.1 |
44,775 (2.31 %) |
18,304 (1.33 %) |
20,111 (1.34 %) |
n/a | 39.95 (97.81 %) |
58,460 (2.20 %) |
61,604 (97.80 %) |
4,118,154 (37.97 %) |
658,533 (1.25 %) |
14,547,726 (34.19 %) |
37,093 (0.85 %) |
43 | Egyptian rousette GCF_001466805.2 |
54,791 (4.93 %) |
18,227 (2.03 %) |
24,190 (1.88 %) |
n/a | 40.02 (99.97 %) |
638 (0.03 %) |
2,490 (100.00 %) |
2,793,981 (32.38 %) |
440,119 (1.01 %) |
12,346,041 (26.86 %) |
56,181 (4.55 %) |
44 | Eurasian water vole GCF_903992535.1 |
45,658 (2.52 %) |
19,724 (1.77 %) |
19,069 (1.47 %) |
n/a | 42.15 (99.74 %) |
872 (0.26 %) |
216 (100.00 %) |
4,098,151 (26.75 %) |
1,088,237 (2.91 %) |
12,853,776 (32.42 %) |
19,000 (0.58 %) |
45 | European shrew GCF_000181275.1 |
23,525 (1.54 %) |
17,316 (1.33 %) |
22,012 (1.50 %) |
n/a | 42.90 (90.49 %) |
188,953 (9.54 %) |
201,798 (90.46 %) |
4,209,276 (32.39 %) |
946,629 (2.03 %) |
13,377,581 (35.30 %) |
77,848 (2.54 %) |
46 | Florida manatee GCF_000243295.1 |
39,658 (2.08 %) |
18,311 (1.36 %) |
20,590 (1.23 %) |
n/a | 40.73 (89.24 %) |
160,167 (10.78 %) |
166,490 (89.22 %) |
4,987,661 (36.73 %) |
389,315 (0.74 %) |
14,633,038 (38.46 %) |
27,462 (0.64 %) |
47 | giant panda GCF_002007445.1 |
67,162 (3.32 %) |
20,374 (1.71 %) |
21,965 (1.44 %) |
n/a | 41.69 (98.09 %) |
190,364 (1.92 %) |
77,288 (100.00 %) |
4,476,689 (41.47 %) |
618,596 (2.00 %) |
14,236,463 (30.39 %) |
59,946 (1.50 %) |
48 | goat GCF_001704415.1 |
47,206 (2.31 %) |
19,857 (1.43 %) |
22,880 (1.27 %) |
41,794 (1.79 %) |
43.16 (100.00 %) |
790 (0.00 %) |
29,907 (100.00 %) |
5,578,287 (50.22 %) |
760,837 (7.07 %) |
13,024,440 (44.85 %) |
125,682 (4.02 %) |
49 | golden hamster GCF_000349665.1 |
42,636 (2.91 %) |
18,976 (1.82 %) |
19,149 (1.51 %) |
n/a | 42.01 (82.92 %) |
216,216 (17.12 %) |
237,700 (82.88 %) |
3,599,795 (26.09 %) |
790,256 (1.69 %) |
12,003,956 (24.29 %) |
18,591 (0.51 %) |
50 | gray short-tailed opossum GCF_000002295.2 |
68,388 (2.34 %) |
16,699 (0.75 %) |
16,890 (0.89 %) |
n/a | 37.82 (97.26 %) |
67,660 (2.75 %) |
72,674 (97.25 %) |
7,754,700 (56.19 %) |
1,051,473 (2.34 %) |
22,274,001 (42.23 %) |
30,883 (0.53 %) |
51 | gray seal GCF_012393455.1 |
79,009 (3.73 %) |
19,882 (1.73 %) |
22,416 (1.46 %) |
n/a | 41.44 (100.00 %) |
117 (0.00 %) |
6,880 (100.00 %) |
4,448,588 (43.28 %) |
557,710 (1.32 %) |
13,340,576 (33.41 %) |
55,637 (1.78 %) |
52 | great roundleaf bat GCF_001890085.1 |
50,950 (3.26 %) |
19,032 (2.00 %) |
19,878 (1.66 %) |
n/a | 41.11 (87.42 %) |
172,751 (12.60 %) |
7,571 (100.00 %) |
3,013,481 (31.67 %) |
495,292 (1.05 %) |
11,588,248 (25.43 %) |
33,101 (0.97 %) |
53 | Hawaiian monk seal GCF_002201575.1 |
29,897 (1.95 %) |
19,404 (1.74 %) |
20,264 (1.41 %) |
n/a | 41.41 (97.77 %) |
38,833 (2.24 %) |
7,872 (100.00 %) |
4,547,865 (43.29 %) |
573,335 (1.09 %) |
13,374,928 (33.10 %) |
50,380 (1.45 %) |
54 | Honduran yellow-shouldered bat GCF_014824575.1 |
49,894 (2.81 %) |
18,317 (1.66 %) |
19,991 (1.63 %) |
n/a | 42.33 (99.79 %) |
38,823 (0.21 %) |
27,486 (100.00 %) |
2,844,834 (29.10 %) |
367,443 (1.49 %) |
11,805,151 (31.26 %) |
59,262 (1.70 %) |
55 | horse GCF_002863925.1 |
76,580 (4.06 %) |
19,002 (1.72 %) |
21,184 (1.44 %) |
n/a | 41.50 (99.62 %) |
6,294 (0.38 %) |
4,701 (100.00 %) |
3,990,556 (44.47 %) |
395,037 (1.44 %) |
15,169,517 (29.93 %) |
44,824 (1.74 %) |
56 | house mouse GCF_000001635.27 |
130,343 (4.85 %) |
22,409 (2.02 %) |
19,480 (1.31 %) |
n/a | 41.67 (97.30 %) |
334 (2.70 %) |
22,273 (97.30 %) |
5,361,085 (45.51 %) |
1,641,063 (3.41 %) |
12,722,791 (36.04 %) |
23,794 (0.53 %) |
57 | Iberian mole GCF_014898055.1 |
46,872 (2.59 %) |
18,566 (1.67 %) |
20,793 (1.59 %) |
n/a | 41.91 (99.98 %) |
3,640 (0.02 %) |
4,425 (100.00 %) |
3,269,038 (31.47 %) |
501,677 (1.32 %) |
11,176,747 (32.61 %) |
48,076 (2.80 %) |
58 | Jamaican fruit-eating bat GCF_014825515.1 |
48,705 (2.72 %) |
19,921 (1.66 %) |
23,614 (1.68 %) |
n/a | 41.95 (98.87 %) |
110,840 (1.13 %) |
56,740 (100.00 %) |
2,972,388 (28.79 %) |
405,474 (2.15 %) |
12,458,880 (30.65 %) |
61,973 (1.87 %) |
59 | killer whale GCF_000331955.2 |
28,632 (1.91 %) |
18,740 (1.85 %) |
20,364 (1.48 %) |
n/a | 41.35 (94.82 %) |
78,441 (5.20 %) |
80,100 (94.80 %) |
3,889,071 (43.64 %) |
555,737 (1.13 %) |
12,773,973 (31.51 %) |
61,145 (1.59 %) |
60 | koala GCF_002099425.1 |
55,736 (2.16 %) |
17,497 (0.86 %) |
16,191 (0.94 %) |
45,693 (1.51 %) |
39.05 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
1,907 (100.00 %) |
7,723,845 (41.40 %) |
1,123,545 (2.03 %) |
21,796,057 (39.25 %) |
15,957 (0.35 %) |
61 | large flying fox GCF_000151845.1 |
52,243 (3.10 %) |
18,459 (1.90 %) |
23,597 (1.73 %) |
n/a | 39.82 (91.80 %) |
189,340 (8.24 %) |
225,433 (91.76 %) |
3,034,715 (36.02 %) |
504,277 (3.03 %) |
13,025,556 (25.00 %) |
78,404 (3.24 %) |
62 | leopard GCF_001857705.1 |
73,279 (3.20 %) |
18,886 (1.63 %) |
21,016 (1.44 %) |
35,226 (1.85 %) |
41.71 (96.17 %) |
214,953 (3.85 %) |
265,330 (96.15 %) |
5,164,376 (42.44 %) |
1,059,446 (5.13 %) |
14,265,573 (32.20 %) |
76,997 (2.42 %) |
63 | lesser Egyptian jerboa GCF_000280705.1 |
25,991 (1.44 %) |
19,411 (1.38 %) |
20,314 (1.35 %) |
n/a | 41.87 (87.17 %) |
326,464 (12.87 %) |
337,360 (87.13 %) |
6,163,038 (37.73 %) |
832,825 (1.53 %) |
13,661,612 (33.98 %) |
26,669 (0.59 %) |
64 | little brown bat GCF_000147115.1 |
50,660 (2.76 %) |
19,327 (1.85 %) |
22,706 (1.70 %) |
n/a | 42.50 (96.66 %) |
61,131 (3.35 %) |
72,785 (96.65 %) |
3,683,414 (37.00 %) |
634,854 (2.15 %) |
10,841,759 (33.45 %) |
57,630 (1.79 %) |
65 | long-finned pilot whale GCF_006547405.1 |
66,117 (3.28 %) |
18,773 (1.79 %) |
21,033 (1.46 %) |
n/a | 41.29 (99.58 %) |
14,859 (0.42 %) |
20,999 (99.58 %) |
3,867,760 (45.23 %) |
557,247 (1.11 %) |
12,616,535 (34.70 %) |
62,905 (1.69 %) |
66 | long-tailed chinchilla GCF_000276665.1 |
54,854 (2.98 %) |
18,119 (1.58 %) |
19,511 (1.52 %) |
39,338 (2.73 %) |
41.06 (95.56 %) |
78,817 (4.46 %) |
81,656 (95.54 %) |
4,013,972 (30.18 %) |
607,082 (1.15 %) |
13,528,234 (28.15 %) |
46,931 (1.25 %) |
67 | Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1 |
68,043 (3.50 %) |
18,167 (1.72 %) |
20,453 (1.54 %) |
n/a | 40.83 (91.78 %) |
57,746 (8.23 %) |
17,969 (100.00 %) |
2,864,567 (34.23 %) |
277,996 (1.69 %) |
12,659,207 (25.72 %) |
33,486 (1.00 %) |
68 | Malayan pangolin ManJav 1.0 GCF_001685135.1 |
48,591 (2.76 %) |
19,455 (1.56 %) |
24,779 (1.38 %) |
n/a | 40.78 (92.27 %) |
984,658 (7.81 %) |
80,670 (100.00 %) |
2,943,168 (34.76 %) |
866,309 (3.08 %) |
13,310,859 (28.76 %) |
35,558 (0.84 %) |
69 | meerkat GCF_006229205.1 |
58,806 (2.67 %) |
18,993 (1.63 %) |
19,805 (1.43 %) |
42,441 (2.08 %) |
41.68 (99.72 %) |
65,245 (0.28 %) |
63,791 (100.00 %) |
4,490,767 (39.69 %) |
634,179 (1.21 %) |
13,631,635 (32.17 %) |
64,849 (2.13 %) |
70 | minke whale GCF_000493695.1 |
42,566 (2.38 %) |
19,285 (1.81 %) |
18,661 (1.42 %) |
n/a | 40.94 (94.06 %) |
173,296 (5.96 %) |
184,072 (94.04 %) |
3,965,103 (41.83 %) |
573,951 (1.48 %) |
13,504,347 (30.96 %) |
65,448 (1.38 %) |
71 | Mongolian gerbil GCF_002204375.1 |
40,359 (2.29 %) |
21,191 (1.83 %) |
24,331 (1.47 %) |
35,816 (1.80 %) |
42.09 (95.23 %) |
91,601 (4.78 %) |
68,793 (100.00 %) |
4,691,924 (36.71 %) |
940,776 (1.82 %) |
13,848,274 (31.31 %) |
24,154 (0.74 %) |
72 | naked mole-rat GCF_000247695.1 |
74,587 (3.56 %) |
21,356 (1.73 %) |
20,858 (1.51 %) |
n/a | 40.21 (88.43 %) |
110,424 (11.59 %) |
114,653 (88.41 %) |
4,043,531 (31.71 %) |
484,933 (0.92 %) |
13,672,561 (27.63 %) |
31,950 (0.88 %) |
73 | narwhal GCF_005190385.1 |
51,639 (2.71 %) |
18,754 (1.77 %) |
20,712 (1.43 %) |
n/a | 41.22 (99.52 %) |
18,323 (0.49 %) |
6,972 (100.00 %) |
3,955,737 (43.50 %) |
565,367 (1.22 %) |
12,720,018 (34.85 %) |
60,492 (1.58 %) |
74 | nine-banded armadillo GCF_000208655.1 |
46,144 (1.87 %) |
21,306 (1.15 %) |
25,302 (1.09 %) |
n/a | 40.77 (90.89 %) |
268,442 (9.13 %) |
314,972 (90.87 %) |
5,142,081 (48.89 %) |
651,316 (1.26 %) |
19,267,438 (38.27 %) |
139,550 (2.46 %) |
75 | northern fur seal GCF_003265705.1 |
54,953 (2.43 %) |
23,422 (1.77 %) |
23,659 (1.43 %) |
n/a | 41.48 (98.01 %) |
38,666 (1.99 %) |
52,469 (98.01 %) |
4,956,409 (42.98 %) |
638,130 (1.06 %) |
14,922,442 (33.12 %) |
57,281 (1.44 %) |
76 | Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5 |
69,456 (3.34 %) |
22,323 (1.82 %) |
20,892 (1.37 %) |
n/a | 41.93 (95.13 %) |
145,731 (4.89 %) |
76,195 (95.16 %) |
5,183,432 (43.24 %) |
1,620,304 (3.72 %) |
14,520,050 (33.09 %) |
22,600 (0.47 %) |
77 | Norway rat celera GCF_000002265.2 |
39,745 (2.91 %) |
21,436 (1.94 %) |
19,620 (1.43 %) |
n/a | 41.98 (95.28 %) |
111,391 (4.74 %) |
118,423 (95.26 %) |
4,727,554 (42.65 %) |
1,387,703 (3.05 %) |
13,224,921 (32.45 %) |
18,944 (0.42 %) |
78 | Norway rat BN7 GCA_015227675.2 |
n/a | 21,523 (1.86 %) |
19,627 (1.36 %) |
n/a | 41.99 (99.19 %) |
581 (0.81 %) |
757 (99.19 %) |
4,895,563 (44.53 %) |
1,514,974 (3.57 %) |
13,450,428 (35.83 %) |
19,244 (0.46 %) |
79 | Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1 |
n/a | 3,096 (1.64 %) |
2,450 (1.02 %) |
n/a | 41.23 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
3,156 (100.00 %) |
517,347 (50.76 %) |
157,701 (3.90 %) |
1,502,752 (34.14 %) |
1,806 (0.40 %) |
80 | Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1 |
30,625 (2.21 %) |
17,957 (1.53 %) |
19,315 (1.54 %) |
n/a | 42.06 (92.36 %) |
83,035 (7.65 %) |
148,226 (92.35 %) |
4,216,757 (36.05 %) |
1,140,316 (7.60 %) |
10,422,685 (36.59 %) |
61,921 (3.56 %) |
81 | Pacific walrus GCF_000321225.1 |
32,719 (1.92 %) |
20,637 (1.82 %) |
20,982 (1.48 %) |
n/a | 41.36 (95.85 %) |
66,766 (4.16 %) |
70,656 (95.84 %) |
4,370,614 (41.51 %) |
511,500 (1.05 %) |
13,507,582 (30.43 %) |
45,142 (1.29 %) |
82 | Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1 |
65,960 (3.26 %) |
18,765 (1.79 %) |
20,858 (1.45 %) |
n/a | 41.28 (99.56 %) |
16,699 (0.44 %) |
21,350 (99.56 %) |
3,877,981 (45.30 %) |
574,056 (1.14 %) |
12,602,965 (34.83 %) |
62,275 (1.67 %) |
83 | pale spear-nosed bat GCF_004126475.1 |
35,529 (2.39 %) |
18,193 (1.69 %) |
20,427 (1.67 %) |
n/a | 42.38 (98.92 %) |
831 (1.08 %) |
141 (100.00 %) |
3,000,874 (29.59 %) |
385,608 (0.80 %) |
12,060,365 (30.47 %) |
64,065 (3.55 %) |
84 | pig GCF_000003025.6 |
77,708 (4.05 %) |
18,978 (1.64 %) |
20,299 (1.39 %) |
n/a | 41.87 (98.81 %) |
544 (1.19 %) |
1,313 (98.81 %) |
4,932,009 (45.39 %) |
710,994 (1.32 %) |
13,243,289 (36.33 %) |
79,130 (1.79 %) |
85 | platypus GCF_004115215.1 |
56,708 (3.09 %) |
14,785 (1.26 %) |
19,402 (1.68 %) |
n/a | 46.13 (99.18 %) |
522 (0.82 %) |
305 (100.00 %) |
5,069,299 (51.33 %) |
577,434 (2.88 %) |
9,110,403 (48.91 %) |
87,764 (6.47 %) |
86 | polar bear GCF_000687225.1 |
35,764 (2.39 %) |
18,507 (1.67 %) |
15,385 (1.38 %) |
n/a | 41.65 (98.35 %) |
110,343 (1.67 %) |
134,162 (98.33 %) |
4,137,454 (40.52 %) |
553,196 (1.29 %) |
13,765,581 (29.91 %) |
54,907 (1.17 %) |
87 | prairie deer mouse GCF_000500345.1 |
50,187 (2.51 %) |
20,412 (1.69 %) |
20,882 (1.45 %) |
n/a | 42.34 (94.06 %) |
182,263 (5.97 %) |
212,962 (94.03 %) |
4,953,552 (29.12 %) |
1,229,123 (2.83 %) |
14,447,916 (30.09 %) |
23,246 (0.56 %) |
88 | prairie vole GCF_000317375.1 |
40,484 (2.72 %) |
19,616 (1.90 %) |
19,545 (1.63 %) |
n/a | 42.25 (92.03 %) |
180,677 (8.00 %) |
187,012 (92.00 %) |
3,667,172 (24.26 %) |
879,192 (2.11 %) |
12,360,347 (27.34 %) |
18,233 (0.52 %) |
89 | Przewalski's horse GCF_000696695.1 |
45,089 (2.76 %) |
19,556 (1.68 %) |
22,114 (1.36 %) |
n/a | 41.27 (99.13 %) |
80,963 (0.88 %) |
134,060 (99.12 %) |
3,833,909 (41.06 %) |
435,607 (1.73 %) |
14,738,418 (28.36 %) |
40,752 (0.94 %) |
90 | puma GCF_003327715.1 |
25,588 (1.44 %) |
17,666 (1.57 %) |
16,978 (1.33 %) |
n/a | 41.36 (95.34 %) |
178,992 (4.69 %) |
2,175 (100.00 %) |
4,808,774 (42.28 %) |
833,138 (1.76 %) |
13,705,778 (31.28 %) |
58,912 (1.65 %) |
91 | rabbit GCF_000003625.3 |
43,655 (2.34 %) |
18,672 (1.38 %) |
20,766 (1.29 %) |
n/a | 43.75 (95.14 %) |
80,789 (4.88 %) |
84,024 (95.12 %) |
4,802,800 (44.34 %) |
883,939 (1.73 %) |
13,254,520 (38.27 %) |
110,337 (2.33 %) |
92 | red fox GCF_003160815.1 |
43,508 (2.67 %) |
19,810 (1.68 %) |
18,896 (1.40 %) |
n/a | 41.08 (97.06 %) |
246,167 (2.96 %) |
82,424 (100.00 %) |
4,835,239 (40.35 %) |
954,461 (2.46 %) |
14,190,625 (30.86 %) |
53,199 (1.82 %) |
93 | woodland thicket rat GCF_004785775.1 |
43,129 (2.40 %) |
22,663 (2.12 %) |
21,029 (1.49 %) |
n/a | 41.17 (98.57 %) |
76,623 (1.44 %) |
23,656 (100.00 %) |
4,603,698 (36.96 %) |
1,424,025 (3.23 %) |
13,549,399 (30.42 %) |
18,232 (0.48 %) |
94 | Ryukyu mouse GCF_900094665.1 |
53,855 (2.85 %) |
21,291 (2.26 %) |
19,256 (1.49 %) |
n/a | 41.70 (89.05 %) |
306,650 (10.98 %) |
30,920 (92.71 %) |
4,749,528 (39.06 %) |
1,351,707 (2.59 %) |
12,965,297 (27.49 %) |
16,050 (0.44 %) |
95 | sea otter GCF_002288905.1 |
38,140 (2.17 %) |
18,591 (1.64 %) |
20,913 (1.44 %) |
n/a | 41.56 (98.79 %) |
23,134 (1.21 %) |
29,589 (98.79 %) |
4,615,871 (40.95 %) |
721,750 (1.39 %) |
14,065,653 (32.89 %) |
55,389 (1.88 %) |
96 | Rambouillet sheep GCF_002742125.1 |
50,096 (2.48 %) |
19,992 (1.47 %) |
22,506 (1.31 %) |
20,898 (22.48 %) |
41.91 (99.99 %) |
4,847 (0.01 %) |
7,486 (99.99 %) |
5,764,757 (47.38 %) |
507,629 (1.55 %) |
14,138,601 (41.27 %) |
51,748 (1.29 %) |
97 | shrew mouse GCF_900095145.1 |
46,279 (2.64 %) |
20,549 (2.23 %) |
18,979 (1.49 %) |
94,079 (3.98 %) |
41.89 (90.53 %) |
269,643 (9.50 %) |
17,879 (93.73 %) |
4,788,498 (38.32 %) |
1,499,714 (3.03 %) |
13,021,757 (27.83 %) |
16,787 (0.47 %) |
98 | small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2 |
28,376 (1.28 %) |
18,986 (1.18 %) |
19,329 (1.31 %) |
n/a | 43.01 (88.43 %) |
270,406 (11.60 %) |
7,490 (100.00 %) |
3,633,157 (28.17 %) |
429,226 (0.87 %) |
16,951,112 (32.23 %) |
39,993 (0.70 %) |
99 | southern multimammate mouse GCF_008632895.1 |
69,058 (3.04 %) |
20,294 (2.10 %) |
18,506 (1.44 %) |
n/a | 41.39 (91.90 %) |
146,713 (8.12 %) |
28 (100.00 %) |
4,749,130 (37.35 %) |
1,454,350 (2.93 %) |
13,104,717 (28.82 %) |
16,715 (0.45 %) |
100 | southern white rhinoceros GCF_000283155.1 |
37,050 (2.11 %) |
18,561 (1.80 %) |
19,750 (1.44 %) |
n/a | 40.90 (96.05 %) |
54,737 (3.96 %) |
57,824 (96.04 %) |
3,736,665 (38.99 %) |
421,694 (0.97 %) |
14,765,529 (28.93 %) |
36,281 (1.02 %) |
101 | sperm whale GCF_002837175.2 |
60,934 (2.59 %) |
19,544 (1.72 %) |
25,657 (1.56 %) |
35,346 (1.68 %) |
41.39 (95.90 %) |
128,928 (4.12 %) |
143,605 (95.88 %) |
4,278,719 (42.32 %) |
694,673 (2.40 %) |
13,518,590 (32.76 %) |
94,152 (2.53 %) |
102 | star-nosed mole GCF_000260355.1 |
30,444 (2.86 %) |
16,276 (1.94 %) |
17,403 (1.78 %) |
n/a | 41.55 (95.10 %) |
82,557 (4.92 %) |
84,595 (95.08 %) |
2,372,354 (28.64 %) |
308,473 (0.86 %) |
9,571,561 (26.02 %) |
48,078 (2.74 %) |
103 | Steller sea lion GCF_004028035.1 |
46,057 (2.38 %) |
21,173 (1.77 %) |
21,625 (1.43 %) |
n/a | 41.38 (99.41 %) |
18,994 (0.59 %) |
24,485 (99.41 %) |
4,473,916 (43.13 %) |
577,797 (1.09 %) |
13,545,012 (33.71 %) |
51,355 (1.45 %) |
104 | Sunda flying lemur GCF_000696425.1 |
34,747 (1.83 %) |
21,445 (1.54 %) |
25,827 (1.21 %) |
n/a | 40.21 (87.96 %) |
412,608 (12.07 %) |
511,878 (87.93 %) |
5,040,804 (38.62 %) |
854,442 (3.33 %) |
17,562,576 (28.82 %) |
82,988 (1.05 %) |
105 | Tasmanian devil GCF_902635505.1 |
52,070 (2.36 %) |
15,902 (0.85 %) |
17,542 (0.99 %) |
n/a | 36.16 (100.00 %) |
354 (0.00 %) |
106 (100.00 %) |
6,648,718 (44.20 %) |
1,246,027 (2.19 %) |
21,434,803 (41.20 %) |
23,609 (0.65 %) |
106 | thirteen-lined ground squirrel GCF_000236235.1 |
41,886 (2.61 %) |
19,185 (1.69 %) |
18,099 (1.44 %) |
n/a | 39.91 (93.27 %) |
141,005 (6.75 %) |
153,488 (93.25 %) |
4,262,694 (35.63 %) |
640,337 (1.64 %) |
14,116,066 (27.91 %) |
28,321 (0.64 %) |
107 | Upper Galilee mountains blind mole rat GCF_000622305.1 |
54,680 (2.07 %) |
19,715 (1.26 %) |
21,275 (1.20 %) |
n/a | 41.26 (95.18 %) |
201,121 (4.83 %) |
356,097 (95.17 %) |
6,001,130 (33.96 %) |
1,197,778 (2.77 %) |
16,282,383 (36.21 %) |
22,905 (0.49 %) |
108 | water buffalo GCF_003121395.1 |
69,771 (3.14 %) |
19,465 (1.58 %) |
21,849 (1.37 %) |
n/a | 41.81 (99.99 %) |
410 (0.01 %) |
509 (100.00 %) |
5,407,697 (47.11 %) |
473,976 (1.54 %) |
13,015,899 (41.23 %) |
43,120 (1.15 %) |
109 | Weddell seal GCF_000349705.1 |
48,264 (2.73 %) |
21,059 (1.72 %) |
22,343 (1.43 %) |
n/a | 41.39 (70.44 %) |
152,836 (29.58 %) |
169,547 (70.42 %) |
4,339,447 (41.27 %) |
471,256 (0.66 %) |
13,410,237 (22.09 %) |
48,738 (1.01 %) |
110 | western European hedgehog GCF_000296755.1 |
29,936 (1.68 %) |
18,057 (1.33 %) |
19,768 (1.35 %) |
n/a | 41.54 (85.94 %) |
219,764 (14.09 %) |
225,567 (85.91 %) |
6,405,129 (45.37 %) |
1,271,533 (2.29 %) |
12,374,161 (42.02 %) |
28,528 (0.71 %) |
111 | white-footed mouse GCF_004664715.2 |
54,479 (2.82 %) |
19,971 (1.69 %) |
20,132 (1.42 %) |
n/a | 42.23 (99.95 %) |
2,299 (0.05 %) |
1,857 (100.00 %) |
5,060,487 (30.71 %) |
1,258,073 (2.85 %) |
14,007,098 (32.99 %) |
23,456 (0.67 %) |
112 | white-tailed deer GCF_002102435.1 |
57,787 (2.93 %) |
20,671 (1.75 %) |
23,083 (1.50 %) |
n/a | 41.55 (99.10 %) |
107,058 (0.91 %) |
48,653 (99.10 %) |
4,716,909 (40.83 %) |
413,129 (2.59 %) |
13,296,779 (34.22 %) |
44,165 (1.19 %) |
113 | Wild Bactrian camel CB1 GCF_000311805.1 |
34,726 (2.40 %) |
18,796 (1.94 %) |
17,115 (1.61 %) |
n/a | 41.28 (98.83 %) |
60,971 (1.18 %) |
68,872 (98.82 %) |
3,026,433 (34.28 %) |
353,632 (1.23 %) |
12,349,615 (25.12 %) |
45,437 (1.02 %) |
114 | Wild Bactrian camel BCGSAC Cfer 1.0 GCF_009834535.1 |
70,235 (4.11 %) |
18,202 (1.93 %) |
20,199 (1.66 %) |
n/a | 41.66 (99.99 %) |
2,345 (0.01 %) |
2,043 (100.00 %) |
3,091,018 (33.31 %) |
332,720 (5.33 %) |
12,161,286 (28.79 %) |
55,524 (1.75 %) |
115 | wild yak GCF_000298355.1 |
29,789 (1.92 %) |
19,942 (1.61 %) |
19,921 (1.32 %) |
40,104 (1.69 %) |
41.71 (95.48 %) |
192,006 (4.54 %) |
233,198 (95.46 %) |
5,326,892 (44.50 %) |
449,880 (1.38 %) |
13,572,902 (36.62 %) |
41,147 (0.82 %) |
116 | Yangtze finless porpoise GCF_003031525.1 |
43,312 (2.49 %) |
18,741 (1.80 %) |
19,643 (1.46 %) |
n/a | 41.28 (99.29 %) |
52,647 (0.72 %) |
66,346 (99.28 %) |
3,926,819 (42.04 %) |
540,765 (1.65 %) |
12,691,760 (32.87 %) |
59,052 (1.48 %) |
117 | Yangtze River dolphin GCF_000442215.1 |
27,076 (1.65 %) |
19,232 (1.73 %) |
27,450 (1.66 %) |
n/a | 41.30 (98.69 %) |
124,797 (1.33 %) |
155,510 (98.67 %) |
4,220,655 (43.60 %) |
690,534 (1.95 %) |
13,025,097 (35.19 %) |
67,035 (1.82 %) |
118 | yellow-bellied marmot GCF_003676075.2 |
42,715 (2.16 %) |
19,894 (1.62 %) |
21,366 (1.40 %) |
n/a | 39.89 (97.96 %) |
35,595 (2.04 %) |
66,624 (97.96 %) |
4,646,957 (34.05 %) |
800,897 (1.96 %) |
14,340,028 (32.63 %) |
34,125 (0.91 %) |
119 | zebu cattle GCF_000247795.1 |
39,830 (2.52 %) |
18,594 (1.58 %) |
19,105 (1.32 %) |
n/a | 41.75 (92.62 %) |
6,941,272 (7.66 %) |
253,770 (92.59 %) |
5,037,418 (46.47 %) |
358,908 (0.88 %) |
13,431,672 (36.60 %) |
35,242 (0.85 %) |
TOTALS: | total assembly count 119 |
Additional hubs with collections of assemblies | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Assembly hubs index pages: | Primates | Mammals | Birds | Fish | other vertebrates | legacy/superseded | Plants | VGP - Vertebrate Genome Project |
Hubs assembly statistics: | Primates | Mammals | Birds | Fish | other vertebrates | legacy/superseded | Plants | VGP - Vertebrate Genome Project |
Hubs track statistics: | Primates | Mammals | Birds | Fish | other vertebrates | legacy/superseded | Plants | VGP - Vertebrate Genome Project |