Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,607 (1.08 %)	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	26,235 (0.40 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	17,712 (0.51 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	17,677 (0.50 %)
4	African grass rat (paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
6	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
7	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	47,644 (1.64 %)
8	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	49,122 (2.32 %)
9	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	50,954 (2.21 %)
10	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	33,513 (0.68 %)
11	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	68,531 (1.61 %)
12	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	62,315 (1.49 %)
13	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	62,314 (1.49 %)
14	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	27,301 (0.49 %)
15	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	54,502 (1.38 %)
16	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	30,191 (0.63 %)
17	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	75,377 (2.21 %)
18	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	76,769 (2.57 %)
19	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	76,453 (2.43 %)
20	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	33,775 (0.84 %)
21	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	37,124 (0.86 %)
22	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	23,046 (0.72 %)
23	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	24,454 (0.96 %)
24	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	23,386 (0.80 %)
25	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,686 (2.34 %)	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	60,388 (1.03 %)
26	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	78,849 (3.32 %)
27	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	68,981 (3.00 %)
28	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	62,580 (1.91 %)
29	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	54,199 (1.98 %)
30	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	65,430 (2.64 %)
31	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	64,307 (2.75 %)
32	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	63,307 (2.38 %)
33	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
34	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	54,919 (1.33 %)
35	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,253 (1.93 %)	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	44,652 (1.14 %)
36	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	44,743 (1.13 %)
37	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	65,229 (1.60 %)
38	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	102,112 (3.75 %)
39	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	56,223 (1.31 %)
40	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	65,503 (2.30 %)
41	aoudad GCA_002201775.1	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	48,844 (1.32 %)
42	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,519 (3.85 %)	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	58,872 (1.79 %)
43	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	52,135 (1.67 %)
44	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	55,428 (1.61 %)
45	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	55,427 (1.61 %)
46	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	49,997 (2.23 %)
47	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	27,575 (0.72 %)
48	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
49	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	31,201 (0.78 %)
50	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	148,246 (5.67 %)
51	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	50,264 (1.15 %)
52	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	69,120 (1.32 %)
53	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	44,158 (1.19 %)
54	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	37,174 (1.87 %)
55	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	36,699 (1.70 %)
56	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	41,082 (1.37 %)
57	ass (Donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	43,875 (3.45 %)
58	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,989 (3.12 %)	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	40,025 (1.06 %)
59	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
60	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	74,348 (3.46 %)
61	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	70,515 (2.88 %)
62	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	78,364 (2.73 %)
63	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,178 (3.64 %)	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	49,790 (1.25 %)
64	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	78,648 (2.80 %)
65	bank vole GCF_902806735.1	56,410 (2.99 %)	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	18,784 (0.42 %)
66	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	36,371 (1.27 %)
67	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	73,031 (1.72 %)
68	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	63,688 (2.22 %)
69	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	44,562 (1.21 %)
70	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	59,710 (1.51 %)
71	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,400 (3.08 %)	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	59,307 (1.53 %)
72	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	66,720 (2.99 %)
73	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	77,605 (3.68 %)
74	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	52,254 (10.67 %)
75	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	95,564 (1.72 %)
76	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
77	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	1,239 (100.00 %)	49,878 (0.73 %)
78	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	46,774 (0.90 %)
79	black flying fox GCF_000325575.1	46,978 (3.15 %)	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	62,483 (3.88 %)
80	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	18,055 (0.48 %)
81	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	44,971 (1.16 %)
82	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	44,113 (0.97 %)
83	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,255 (2.28 %)	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	43,525 (1.14 %)
84	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	86,892 (2.23 %)
85	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,402 (2.78 %)	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	54,060 (2.11 %)
86	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	63,124 (1.85 %)
87	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	62,389 (1.68 %)
88	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,540 (2.07 %)	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	70,851 (1.80 %)
89	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	56,916 (1.85 %)
90	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	55,436 (1.85 %)
91	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,750 (2.71 %)	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
92	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	100,915 (3.00 %)
93	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,362 (2.39 %)	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	69,211 (2.68 %)
94	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	48,826 (1.07 %)
95	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	33,757 (1.35 %)
96	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	31,102 (1.31 %)
97	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	27,049 (1.25 %)
98	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	26,416 (1.35 %)
99	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	63,428 (1.55 %)
100	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	60,067 (1.55 %)
101	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	66,749 (1.59 %)
102	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	68,896 (2.40 %)
103	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	19,508 (0.31 %)
104	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	43,382 (1.17 %)
105	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,242 (2.92 %)	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	62,125 (1.80 %)
106	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	64,814 (2.05 %)
107	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	60,671 (2.39 %)
108	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	62,325 (2.36 %)
109	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,524 (2.02 %)	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	19,540 (0.49 %)
110	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,274 (3.80 %)	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	19,529 (0.58 %)
111	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	44,449 (1.57 %)
112	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	50,583 (1.46 %)
113	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	44,467 (1.57 %)
114	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
115	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	19,104 (0.65 %)
116	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	20,062 (0.64 %)
117	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	39,082 (2.44 %)
118	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	39,099 (2.44 %)
119	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	66,799 (2.48 %)
120	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	41,527 (1.41 %)
121	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	25,977 (0.42 %)
122	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	21,186 (0.33 %)
123	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	29,690 (0.50 %)
124	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	37,158 (0.70 %)
125	capybara GCA_004027455.1	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	34,558 (0.85 %)
126	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	99,752 (3.73 %)
127	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,927 (4.11 %)	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	46,864 (1.37 %)
128	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	42,869 (1.24 %)
129	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	172,178 (3.66 %)
130	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	60,367 (2.22 %)
131	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	60,744 (2.17 %)
132	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,612 (2.80 %)	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	46,689 (1.12 %)
133	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	19,341 (0.58 %)
134	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	45,993 (2.59 %)	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	12,522 (0.25 %)
135	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	17,960 (0.54 %)
136	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	18,838 (0.40 %)
137	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	35,278 (1.05 %)
138	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
139	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	48,960 (1.19 %)
140	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	30,693 (0.58 %)
141	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	32,993 (0.98 %)
142	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
143	Chinese tree shrew GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	88,806 (1.44 %)
144	chiru GCA_000400835.1	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	43,135 (1.89 %)
145	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	56,375 (2.45 %)
146	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	67,830 (2.45 %)
147	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	65,379 (1.89 %)
148	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,207 (3.31 %)	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
149	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	48,030 (1.35 %)
150	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	64,630 (1.84 %)
151	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	13,303 (0.35 %)
152	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,674 (1.80 %)	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	17,762 (0.38 %)
153	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	57,295 (2.83 %)
154	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	50,430 (2.54 %)
155	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	92,062 (3.23 %)
156	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	76,006 (3.29 %)
157	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	69,105 (3.25 %)
158	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	61,125 (2.28 %)
159	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	71,507 (2.50 %)
160	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,031 (3.24 %)	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	51,634 (1.37 %)
161	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,088 (2.64 %)	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	75,592 (1.86 %)
162	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	18,752 (0.37 %)
163	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	49,252 (2.20 %)
164	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	50,777 (2.23 %)
165	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	23,141 (0.54 %)
166	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	57,196 (1.33 %)
167	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
168	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	68,668 (1.15 %)
169	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	48,137 (1.04 %)
170	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	37,008 (0.74 %)
171	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	37,008 (0.74 %)
172	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	46,569 (1.25 %)
173	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	62,910 (2.66 %)
174	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	64,920 (2.51 %)
175	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	27,955 (0.39 %)
176	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	59,615 (1.59 %)
177	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,152 (2.13 %)	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	40,135 (0.82 %)
178	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,279 (2.11 %)	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	17,053 (0.51 %)
179	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	54,479 (1.01 %)
180	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	51,835 (2.25 %)
181	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	51,216 (2.28 %)
182	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	51,443 (2.16 %)
183	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	50,715 (2.22 %)
184	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	51,050 (2.25 %)
185	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	51,490 (2.25 %)
186	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,549 (3.63 %)	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	53,269 (2.07 %)
187	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,774 (3.84 %)	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	50,679 (2.26 %)
188	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	50,883 (2.22 %)
189	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	53,518 (2.23 %)
190	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	51,900 (2.21 %)
191	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	50,670 (2.21 %)
192	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	52,469 (2.25 %)
193	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,089 (3.30 %)	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	69,701 (2.41 %)
194	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	69,725 (2.42 %)
195	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	68,011 (2.41 %)
196	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	67,329 (2.48 %)
197	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,855 (3.09 %)	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	58,684 (2.16 %)
198	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	54,600 (1.94 %)
199	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	39,682 (0.89 %)
200	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	37,093 (0.85 %)
201	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	43,883 (1.17 %)
202	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	29,863 (0.83 %)
203	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	29,828 (0.79 %)
204	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	70,689 (2.42 %)
205	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	99,224 (2.27 %)
206	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	22,270 (0.54 %)
207	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	55,063 (3.69 %)
208	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	24,508 (0.70 %)
209	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	19,636 (0.56 %)
210	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	56,244 (6.54 %)
211	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	53,573 (4.84 %)
212	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	19,944 (0.55 %)
213	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	47,099 (1.31 %)
214	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,332 (3.19 %)	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
215	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	39,139 (2.25 %)
216	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	65,806 (4.13 %)
217	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
218	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	26,414 (0.61 %)
219	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	24,268 (1.07 %)
220	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
221	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,145 (2.95 %)	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
222	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	27,057 (1.96 %)
223	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	14,146 (0.57 %)
224	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
225	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	98,831 (2.33 %)
226	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
227	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	47,810 (2.50 %)
228	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	67,132 (2.54 %)
229	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	46,367 (3.09 %)
230	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	46,213 (3.27 %)
231	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	61,481 (4.29 %)
232	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	77,009 (2.86 %)
233	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	77,851 (2.58 %)
234	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	79,785 (2.86 %)
235	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	17,629 (0.60 %)
236	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	20,725 (0.63 %)
237	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
238	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,114 (2.24 %)	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	23,961 (0.53 %)
239	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	20,865 (0.55 %)
240	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	214,480 (2.98 %)
241	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	112,581 (2.00 %)
242	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	52,418 (1.36 %)
243	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
244	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
245	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	75,215 (4.36 %)
246	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	65,521 (1.47 %)
247	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,211 (2.50 %)	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	22,480 (0.71 %)
248	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	26,411 (0.73 %)
249	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	24,585 (0.65 %)
250	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	25,669 (0.69 %)
251	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	82,683 (1.47 %)
252	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	74,782 (1.60 %)
253	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,015 (2.86 %)	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	70,402 (2.61 %)
254	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	32,563 (0.80 %)
255	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,645 (2.08 %)	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	27,462 (0.64 %)
256	fossa GCA_004023885.1	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	78,033 (2.52 %)
257	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	32,359 (0.80 %)
258	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	75,114 (1.33 %)
259	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	45,586 (0.89 %)
260	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	60,200 (2.41 %)
261	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	56,300 (2.26 %)
262	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,331 (3.53 %)	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	65,918 (2.36 %)
263	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	57,558 (0.94 %)
264	giant otter GCA_004024605.1	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	82,376 (2.05 %)
265	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,468 (3.27 %)	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	59,449 (1.50 %)
266	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,159 (2.31 %)	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	125,662 (4.00 %)
267	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	24,314 (0.52 %)
268	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	21,268 (0.61 %)
269	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	18,591 (0.51 %)
270	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025) GCA_048772815.1	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
271	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025) GCA_048772825.1	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
272	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
273	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	92,729 (3.60 %)
274	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	89,246 (2.69 %)
275	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	56,932 (1.78 %)
276	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	57,067 (1.82 %)
277	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	55,637 (1.78 %)
278	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	24,879 (0.67 %)
279	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
280	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,375 (2.34 %)	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	30,883 (0.53 %)
281	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	58,884 (2.46 %)	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
282	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	38,976 (1.13 %)
283	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	51,996 (2.15 %)
284	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	32,293 (2.35 %)
285	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	71,574 (2.28 %)
286	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
287	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
288	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,895 (3.26 %)	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	32,949 (0.96 %)
289	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	44,124 (1.99 %)
290	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	97,686 (2.61 %)
291	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	24,370 (1.08 %)
292	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
293	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	61,023 (2.69 %)
294	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	0 (0.00 %)	257,446 (3.38 %)
295	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
296	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	62,189 (5.35 %)
297	grey whale GCA_004363415.1	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	72,343 (1.59 %)
298	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	73,507 (1.72 %)
299	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
300	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
301	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	84,875 (2.37 %)
302	Hanaki's dwarf bat (2024) GCA_964339955.1	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
303	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
304	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
305	harbor seal GCF_004348235.1	50,670 (2.98 %)	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	54,592 (1.70 %)
306	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	52,067 (1.50 %)
307	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	71,478 (1.57 %)
308	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	36,143 (1.96 %)
309	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
310	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	54,753 (1.59 %)
311	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	48,380 (1.43 %)
312	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	48,164 (1.90 %)
313	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	48,365 (1.91 %)
314	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	48,312 (1.15 %)
315	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	53,444 (2.30 %)
316	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	17,558 (0.40 %)
317	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	55,943 (1.04 %)
318	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	55,567 (2.02 %)
319	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	59,066 (1.72 %)
320	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	37,293 (2.80 %)
321	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	43,527 (2.54 %)
322	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	48,802 (5.67 %)
323	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,567 (4.06 %)	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	44,825 (1.77 %)
324	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	16,957 (0.40 %)
325	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	23,211 (0.57 %)
326	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	23,309 (0.57 %)
327	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	506 (0.31 %)
328	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	23,203 (0.56 %)
329	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	23,196 (0.56 %)
330	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	23,262 (0.56 %)
331	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	23,119 (0.55 %)
332	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	23,232 (0.56 %)
333	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	24,140 (0.59 %)
334	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	22,696 (0.55 %)
335	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	24,374 (0.54 %)
336	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	23,253 (0.56 %)
337	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	24,187 (0.54 %)
338	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	23,955 (0.54 %)
339	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	130,343 (4.85 %)	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	23,794 (0.53 %)
340	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	16,877 (0.39 %)
341	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	23,204 (0.56 %)
342	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	82,412 (1.67 %)
343	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	45,850 (1.37 %)
344	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	41,359 (1.10 %)
345	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,973 (3.41 %)	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	47,466 (2.89 %)
346	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	92,830 (3.12 %)
347	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	57,869 (3.73 %)
348	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	37,476 (5.58 %)
349	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	31,453 (0.55 %)
350	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	68,257 (1.40 %)
351	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	99,144 (2.87 %)
352	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	34,491 (1.02 %)
353	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	43,736 (1.20 %)
354	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	71,066 (2.37 %)
355	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.1	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	61,319 (2.55 %)
356	jaguar (hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
357	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,565 (4.12 %)	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	63,777 (2.41 %)
358	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	69,090 (2.29 %)
359	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,705 (2.72 %)	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	61,973 (1.87 %)
360	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	61,951 (1.93 %)
361	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	24,168 (0.56 %)
362	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	68,778 (2.92 %)
363	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,470 (3.76 %)	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
364	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	57,347 (3.41 %)
365	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	61,145 (1.59 %)
366	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
367	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	63,293 (2.96 %)	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	55,965 (2.99 %)
368	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	78,404 (3.24 %)
369	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	19,817 (0.34 %)
370	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	123,453 (2.17 %)
371	least weasel (hap1.1 2025) GCA_964662115.1	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	68,749 (2.22 %)
372	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	62,416 (2.34 %)
373	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,488 (3.29 %)	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	65,793 (2.64 %)
374	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,266 (3.20 %)	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	77,001 (2.45 %)
375	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	67,390 (2.50 %)
376	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	58,118 (6.81 %)
377	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
378	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	29,872 (0.82 %)
379	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,991 (1.44 %)	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	26,669 (0.59 %)
380	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	84,174 (4.85 %)
381	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
382	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	36,176 (1.80 %)
383	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	65,974 (2.80 %)
384	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	62,254 (3.00 %)
385	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	64,369 (2.52 %)
386	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	98,189 (2.06 %)
387	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	62,675 (2.56 %)
388	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	57,630 (1.79 %)
389	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	48,101 (2.62 %)
390	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	49,636 (2.61 %)
391	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	71,530 (2.05 %)
392	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
393	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,104 (3.28 %)	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	62,905 (1.69 %)
394	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,841 (2.98 %)	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	46,931 (1.25 %)
395	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	63,015 (4.70 %)
396	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	61,715 (0.94 %)
397	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	35,558 (0.84 %)
398	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	33,486 (1.00 %)
399	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	17,923 (0.30 %)
400	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	40,504 (1.02 %)
401	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	26,633 (0.68 %)
402	meadow vole (hap1 2024) GCA_037038515.1	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
403	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	22,186 (0.75 %)
404	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	64,858 (2.22 %)
405	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	38,521 (1.60 %)
406	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
407	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
408	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	65,956 (4.38 %)
409	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	65,597 (4.38 %)
410	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	53,470 (2.24 %)
411	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	50,269 (2.22 %)
412	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	65,448 (1.38 %)
413	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	69,852 (1.62 %)
414	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	72,756 (1.59 %)
415	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,346 (2.29 %)	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	24,154 (0.74 %)
416	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	26,044 (0.71 %)
417	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	25,300 (0.76 %)
418	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	13,856 (0.35 %)
419	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	16,598 (0.36 %)
420	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	37,371 (0.76 %)
421	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	50,644 (1.33 %)
422	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	44,302 (1.21 %)
423	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	49,216 (1.18 %)
424	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	39,133 (0.76 %)
425	muskrat GCA_004026605.1	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	19,876 (0.50 %)
426	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	40,717 (0.98 %)
427	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,574 (3.56 %)	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	31,950 (0.88 %)
428	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	60,492 (1.58 %)
429	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
430	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	63,261 (2.07 %)
431	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	56,332 (2.92 %)
432	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	56,705 (2.75 %)
433	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	56,237 (2.62 %)
434	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	64,639 (2.57 %)
435	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	61,004 (2.65 %)
436	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	59,091 (1.70 %)
437	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	57,653 (1.29 %)
438	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	130,245 (2.79 %)
439	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	142,597 (2.85 %)
440	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	139,490 (2.47 %)
441	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	23,523 (0.71 %)
442	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	24,733 (0.70 %)
443	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	40,925 (1.35 %)
444	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	51,299 (1.36 %)
445	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	85,881 (1.90 %)
446	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
447	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	74,800 (1.52 %)
448	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	53,559 (1.88 %)
449	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	76,164 (3.52 %)
450	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	77,656 (3.27 %)
451	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	85,908 (2.60 %)
452	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	96,116 (3.02 %)
453	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	92,041 (3.01 %)
454	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	62,007 (1.94 %)
455	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
456	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	57,236 (1.62 %)
457	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	69,898 (2.38 %)
458	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	69,897 (2.38 %)
459	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	74,314 (2.49 %)
460	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	52,064 (1.59 %)
461	northern fur seal GCF_003265705.1	54,940 (2.43 %)	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	57,281 (1.44 %)
462	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	47,533 (1.43 %)
463	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	44,220 (1.55 %)
464	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	47,125 (1.51 %)
465	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	16,583 (0.36 %)
466	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	43,689 (2.08 %)
467	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	35,670 (1.25 %)
468	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
469	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
470	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	20,127 (0.46 %)
471	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	1,806 (0.40 %)
472	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	99,139 (4.10 %)	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	19,244 (0.46 %)
473	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	18,944 (0.42 %)
474	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	22,600 (0.47 %)
475	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	20,720 (0.48 %)
476	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	21,006 (0.49 %)
477	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	21,449 (0.51 %)
478	nutria GCA_004027025.1	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	59,854 (1.00 %)
479	okapi GCA_001660835.1	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	47,417 (1.12 %)
480	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	61,921 (3.56 %)
481	pacarana GCA_004027595.1	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	59,382 (1.23 %)
482	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	74,961 (2.33 %)
483	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	49,134 (2.83 %)
484	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	45,142 (1.29 %)
485	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,947 (3.26 %)	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	62,275 (1.67 %)
486	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	67,712 (4.23 %)
487	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	67,718 (4.23 %)
488	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	63,905 (3.75 %)
489	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	79,984 (2.45 %)
490	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	70,272 (2.89 %)
491	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	69,806 (1.89 %)
492	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	53,180 (4.61 %)
493	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	77,397 (4.55 %)
494	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	45,730 (0.84 %)
495	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	48,374 (1.14 %)
496	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	40,162 (1.31 %)
497	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
498	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
499	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	81,791 (2.82 %)
500	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	79,132 (1.82 %)
501	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	82,002 (2.44 %)
502	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	82,442 (2.62 %)
503	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	81,967 (2.96 %)
504	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,779 (2.87 %)	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	41,391 (1.27 %)
505	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	81,538 (8.24 %)
506	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,392 (3.07 %)	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	87,796 (6.47 %)
507	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,764 (2.39 %)	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	54,907 (1.17 %)
508	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,188 (2.92 %)	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	63,315 (1.93 %)
509	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	23,246 (0.56 %)
510	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	22,444 (0.57 %)
511	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	18,233 (0.52 %)
512	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	54,438 (1.38 %)
513	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	50,527 (1.37 %)
514	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	48,670 (1.19 %)
515	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,076 (2.76 %)	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	40,752 (0.94 %)
516	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	42,166 (4.46 %)
517	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	69,437 (2.62 %)
518	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	65,437 (2.53 %)
519	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,575 (1.43 %)	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	58,912 (1.65 %)
520	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	85,696 (1.65 %)
521	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	95,344 (2.15 %)
522	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	56,261 (2.22 %)	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	101,353 (2.90 %)
523	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	106,168 (2.78 %)
524	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	44,487 (4.39 %)
525	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	119,691 (2.74 %)
526	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,045 (4.16 %)	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	113,371 (2.46 %)
527	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	116,523 (2.66 %)
528	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,655 (2.34 %)	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	110,337 (2.33 %)
529	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,564 (2.89 %)	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	52,450 (2.27 %)
530	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,096 (2.48 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	51,748 (1.29 %)
531	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,474 (3.21 %)	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	43,959 (1.30 %)
532	ratel GCA_004024625.1	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	95,094 (1.91 %)
533	red bat GCA_004026805.1	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	125,564 (3.55 %)
534	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	88,756 (1.66 %)
535	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	128,858 (2.07 %)
536	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	52,053 (2.31 %)
537	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	51,373 (2.26 %)
538	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,495 (2.67 %)	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	53,204 (1.88 %)
539	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	18,764 (0.58 %)
540	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	79,357 (2.66 %)
541	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	57,436 (1.81 %)
542	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	48,931 (1.20 %)
543	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	55,319 (1.23 %)
544	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	74,971 (1.64 %)
545	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	73,126 (1.69 %)
546	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	57,318 (2.32 %)
547	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	76,936 (4.65 %)
548	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	70,117 (3.31 %)
549	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,779 (2.85 %)	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	15,963 (0.43 %)
550	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	58,623 (2.22 %)
551	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
552	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	66,179 (3.91 %)
553	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
554	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	46,883 (0.82 %)
555	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	59,522 (2.81 %)
556	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	56,508 (2.97 %)
557	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	62,520 (2.73 %)
558	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	42,961 (1.10 %)
559	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	234,762 (1.56 %)
560	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,127 (2.16 %)	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	55,388 (1.87 %)
561	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	118,227 (2.28 %)
562	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	80,128 (1.58 %)
563	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	78,537 (1.66 %)
564	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	63,230 (6.03 %)
565	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	44,477 (1.28 %)
566	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	43,911 (1.13 %)
567	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	16,787 (0.47 %)
568	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	15,455 (0.48 %)
569	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	49,177 (1.05 %)
570	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	39,993 (0.70 %)
571	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	107,473 (2.80 %)
572	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,556 (3.37 %)	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	64,690 (2.41 %)
573	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	126,152 (2.28 %)
574	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	31,883 (0.72 %)
575	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	62,524 (3.25 %)
576	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	63,256 (3.06 %)
577	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	34,141 (0.80 %)
578	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	16,724 (0.41 %)
579	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	21,349 (0.52 %)
580	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	22,642 (0.54 %)
581	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	53,182 (1.62 %)
582	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
583	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,045 (3.04 %)	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	16,715 (0.45 %)
584	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	59,907 (1.35 %)
585	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
586	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	71,951 (0.98 %)
587	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	51,339 (1.15 %)
588	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	51,430 (1.14 %)
589	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	36,281 (1.02 %)
590	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
591	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	70,803 (2.85 %)
592	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	69,001 (1.39 %)
593	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,615 (2.83 %)	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	86,751 (2.23 %)
594	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	21,700 (0.64 %)
595	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	22,718 (0.69 %)
596	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	48,079 (2.76 %)
597	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	51,355 (1.45 %)
598	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	38,450 (1.17 %)
599	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	17,544 (0.44 %)
600	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	40,424 (1.32 %)
601	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	67,245 (2.34 %)
602	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	59,513 (1.87 %)
603	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	67,537 (3.57 %)
604	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
605	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	69,835 (2.20 %)
606	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	58,977 (2.20 %)
607	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
608	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
609	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	45,201 (1.03 %)
610	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	75,177 (5.86 %)
611	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	82,988 (1.05 %)
612	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	114,955 (1.43 %)
613	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	54,528 (2.15 %)
614	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,914 (1.65 %)	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	49,134 (7.43 %)
615	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	70,793 (1.26 %)
616	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	12,393 (0.46 %)
617	tammar wallaby (v2 primary hap 2023) GCA_028372415.2	n/a	17,617 (0.77 %)	15,414 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	515 (0.19 %)	273 (100.00 %)	5,866,321 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,517 (39.53 %)	23,590 (0.47 %)
618	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	22,756 (0.48 %)
619	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	21,811 (0.47 %)
620	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	24,443 (0.70 %)
621	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	22,574 (0.67 %)
622	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,057 (2.36 %)	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	23,609 (0.65 %)
623	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	28,317 (0.64 %)
624	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	49,402 (2.19 %)
625	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	64,312 (2.55 %)
626	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	48,226 (2.42 %)
627	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	47,139 (2.58 %)
628	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	9,596 (0.16 %)
629	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	37,175 (1.31 %)
630	True's beaked whale (hap1.1 2024) GCA_964341445.1	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	91,880 (2.74 %)
631	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	80,840 (2.24 %)
632	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,667 (2.07 %)	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	22,905 (0.49 %)
633	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	26,541 (0.58 %)
634	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	29,783 (1.94 %)
635	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
636	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	43,120 (1.15 %)
637	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,552 (3.26 %)	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	40,189 (1.07 %)
638	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,251 (2.73 %)	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	48,738 (1.01 %)
639	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	28,528 (0.71 %)
640	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	23,321 (0.97 %)
641	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	32,667 (0.90 %)
642	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	22,985 (0.56 %)
643	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	57,315 (1.25 %)
644	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	54,394 (1.54 %)
645	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	22,568 (0.53 %)
646	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	66,785 (2.55 %)
647	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	64,365 (2.68 %)
648	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	56,325 (3.33 %)
649	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,982 (2.43 %)	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	68,551 (3.58 %)
650	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	23,456 (0.67 %)
651	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	45,863 (1.30 %)
652	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,774 (2.93 %)	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	44,165 (1.19 %)
653	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	15,669 (0.79 %)
654	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
655	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	55,524 (1.75 %)
656	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	45,437 (1.02 %)
657	wild goat GCA_000978405.1	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	41,935 (0.63 %)
658	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	42,508 (1.32 %)
659	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,776 (1.92 %)	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	41,147 (0.82 %)
660	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	36,914 (1.02 %)
661	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	68,562 (1.41 %)
662	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	18,232 (0.48 %)
663	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	96,755 (2.28 %)
664	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,297 (2.49 %)	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	59,050 (1.48 %)
665	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,115 (1.61 %)	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	62,458 (1.54 %)
666	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,654 (2.16 %)	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	34,122 (0.91 %)
667	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	36,674 (1.05 %)
668	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	33,990 (1.02 %)
669	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,606 (2.50 %)	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	28,118 (0.66 %)
670	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	38,521 (0.68 %)
671	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	31,831 (0.63 %)
672	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	28,674 (0.68 %)
673	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	35,257 (5.20 %)
674	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	61,910 (2.52 %)
675	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	60,974 (2.61 %)
676	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	39,400 (1.07 %)
677	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,817 (2.52 %)	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	35,241 (0.84 %)
678	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	42,544 (1.21 %)
TOTALS:	total assembly count 678

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	223 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	678 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	432 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	488 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	311 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1158 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	313 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	921 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	421 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	123 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	580 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1222 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	974 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links