Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,607
(1.08 %)
18,366
(1.06 %)
20,362
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
6,205,937
(32.04 %)
536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
3 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,056
(2.30 %)
19,172
(1.25 %)
19,731
(1.11 %)
28,847
(1.03 %)
40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,188,365
(57.57 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
4 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
5 alpaca (2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,451
(1.93 %)
18,474
(1.64 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,071,384
(35.75 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
6 Alpine marmot
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,533
(1.68 %)
18,293
(1.41 %)
31,319
(1.47 %)
39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
4,454,253
(32.70 %)
747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
7 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,865
(1.52 %)
24,202
(1.33 %)
38,514
(1.52 %)
39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,332,270
(32.82 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
8 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
20,020
(1.51 %)
20,440
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
5,520,795
(46.38 %)
419,620
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
9 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
10 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
11 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,253
(1.93 %)
17,581
(1.61 %)
20,070
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,764,715
(29.18 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
12 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
13 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
18,211
(1.58 %)
15,090
(1.29 %)
31,423
(1.68 %)
41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
4,759,850
(42.13 %)
831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
14 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
15 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
16 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
17 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,506
(1.88 %)
20,721
(1.64 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,159,451
(33.63 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
18 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
19 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,979
(1.74 %)
19,370
(1.45 %)
34,173
(1.85 %)
39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,271,650
(31.66 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
20 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
21 Asiatic tapir
GCA_004024905.1
n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
39,691
(1.17 %)
22 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,989
(3.12 %)
18,881
(1.76 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,779,606
(41.38 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
23 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
n/a 41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
24 Australian echidna
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
25 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
30,670
(2.36 %)
18,329
(1.97 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
3,001,969
(34.42 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
26 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
27 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
28 beluga whale
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,694
(1.79 %)
20,348
(1.44 %)
34,035
(1.82 %)
41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
3,941,793
(43.25 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
29 big brown bat
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,347
(1.93 %)
20,120
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,864,091
(26.79 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,714
(2.82 %)
30 bighorn sheep
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
31 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,109
(2.00 %)
20,669
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,903,289
(33.58 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,454
(3.26 %)
32 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
33 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
34 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
35 boutu
GCA_004363515.1
n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
63,992
(1.47 %)
36 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,290
(1.75 %)
18,487
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
3,034,586
(25.67 %)
634,242
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
37 Brazilian free-tailed bat
GCA_004025005.1
n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
89,940
(1.88 %)
38 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
39 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
40 brown bear (v2 2018)
GCF_003584765.2
50,242
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
41 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,746
(1.77 %)
20,628
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,446,830
(42.87 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
42 Canada lynx
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
20,245
(1.42 %)
39,235
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
4,941,326
(43.36 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,816
(2.48 %)
43 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
n/a 41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
44 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,291
(1.07 %)
24,277
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,691,898
(16.77 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
45 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,336
(1.07 %)
20,999
(1.07 %)
21,719
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
5,100,661
(20.78 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
46 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
47 cattle (Hereford 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,655
(1.55 %)
22,253
(1.36 %)
43,984
(2.02 %)
41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,620,154
(49.32 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
48 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,167
(3.33 %)
18,484
(1.69 %)
20,554
(1.44 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,776,210
(42.44 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,743
(2.17 %)
49 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
50 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,741
(2.77 %)
20,573
(1.77 %)
17,449
(1.35 %)
34,472
(2.19 %)
41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,408,864
(32.03 %)
1,072,137
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
51 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
n/a 41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
52 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
53 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
54 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
55 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,420
(1.39 %)
19,216
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
4,978,967
(22.65 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
56 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
57 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,272
(1.68 %)
17,061
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,762,939
(43.50 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,029
(1.34 %)
58 common pipistrelle
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
59 common vampire bat (DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
32,705
(2.51 %)
18,526
(1.87 %)
18,175
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,788,883
(29.47 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
60 common wombat
GCF_900497805.2
46,378
(1.78 %)
19,413
(0.86 %)
18,956
(0.96 %)
37,453
(1.40 %)
38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,545,522
(41.80 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
61 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
62 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
63 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
64 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,996
(1.45 %)
17,068
(1.43 %)
41,630
(2.45 %)
40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
3,917,768
(29.90 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
65 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
66 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
67 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
68 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,760
(1.77 %)
17,570
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,813,425
(24.38 %)
532,295
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
69 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,273
(1.40 %)
22,101
(1.46 %)
32,968
(1.30 %)
41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,736,285
(26.59 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
70 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
71 dingo
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
72 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,549
(3.63 %)
19,773
(1.66 %)
19,610
(1.40 %)
60,994
(2.37 %)
41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,859,174
(42.88 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,267
(2.05 %)
73 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,774
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
74 dog (labrador)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
n/a 41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
75 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,089
(3.30 %)
18,675
(1.63 %)
21,699
(1.43 %)
54,456
(2.25 %)
41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,007,925
(43.13 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,699
(2.42 %)
76 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
77 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
78 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,855
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
79 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,775
(2.31 %)
18,304
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
34,846
(1.97 %)
39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,118,154
(37.97 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
80 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
81 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
82 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,227
(2.03 %)
24,190
(1.88 %)
n/a 40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,793,981
(32.38 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,181
(4.55 %)
83 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
n/a 42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
84 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
85 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
86 European shrew
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,316
(1.33 %)
22,012
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,209,276
(32.39 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,848
(2.54 %)
87 Fat dormouse
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
88 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,658
(2.08 %)
18,311
(1.36 %)
20,590
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
4,987,661
(36.73 %)
389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
89 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
90 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
91 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,331
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
92 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
93 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
94 giant panda
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,348
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
95 goat (San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
41,794
(1.79 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
96 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
97 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
n/a 42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
98 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
99 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
100 gray seal
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
101 gray short-tailed opossum
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,699
(0.75 %)
16,890
(0.89 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,754,700
(56.19 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
102 great roundleaf bat (ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
19,032
(2.00 %)
19,878
(1.66 %)
n/a 41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,013,481
(31.67 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
103 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
104 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
105 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
106 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
107 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
108 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
109 harbor porpoise
GCA_004363495.1
n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
80,965
(1.65 %)
110 harbor seal
GCF_004348235.1
50,670
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
111 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
112 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
113 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
114 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
115 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
n/a 39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
116 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
117 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
118 Honduran yellow-shouldered bat
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
119 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,580
(4.06 %)
19,002
(1.72 %)
21,184
(1.44 %)
59,087
(2.31 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
3,990,556
(44.47 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,824
(1.74 %)
120 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
130,343
(4.85 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
121 house mouse 129S1_SvImJ
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
n/a 41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
122 house mouse AKR_J
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
n/a 41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
123 house mouse A_J
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
124 house mouse BALB_cJ
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
n/a 41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
125 house mouse C3H_HeJ
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
n/a 41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
126 house mouse C57BL_6NJ
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
n/a 41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
127 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
n/a 41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
128 house mouse CBA_J
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
n/a 41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
129 house mouse DBA_2J
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
n/a 41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
130 house mouse FVB_NJ
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
n/a 41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
131 house mouse LP_J
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
n/a 41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
132 house mouse NOD_ShiLtJ
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
n/a 42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
133 house mouse NZO_HlLtJ
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
n/a 41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
134 house mouse PWK_PhJ
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
n/a 41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
135 house mouse WSB_EiJ
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
n/a 41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
136 Iberian mole
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
137 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
n/a 40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
138 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
n/a 39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
139 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
140 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
141 jaguar
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
142 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
143 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,705
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
n/a 41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
144 killer whale
GCF_000331955.2
28,632
(1.91 %)
18,740
(1.85 %)
20,364
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,889,071
(43.64 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
145 koala
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
17,497
(0.86 %)
16,191
(0.94 %)
45,693
(1.51 %)
39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,723,845
(41.40 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
146 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,459
(1.90 %)
23,597
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,034,715
(36.02 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
147 large tree shrew
GCA_004365275.1
n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
138,732
(1.75 %)
148 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,886
(1.63 %)
21,016
(1.44 %)
35,228
(1.85 %)
41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,164,376
(42.44 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
76,997
(2.42 %)
149 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
150 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,991
(1.44 %)
19,411
(1.38 %)
20,314
(1.35 %)
31,768
(1.26 %)
41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,163,038
(37.73 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
151 lesser Egyptian jerboa (VGP 2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
152 lesser panda
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
153 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
154 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,327
(1.85 %)
22,706
(1.70 %)
26,840
(1.67 %)
42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,683,414
(37.00 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
155 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
156 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
157 long-finned pilot whale
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,773
(1.79 %)
21,033
(1.46 %)
n/a 41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,867,760
(45.23 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
158 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,119
(1.58 %)
19,511
(1.52 %)
39,338
(2.73 %)
41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,013,972
(30.18 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
159 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
160 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,455
(1.56 %)
24,779
(1.38 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
2,943,168
(34.76 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
161 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
162 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
163 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
164 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
18,993
(1.63 %)
19,805
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,490,767
(39.69 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
165 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,566
(2.38 %)
19,285
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
3,965,103
(41.83 %)
573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
166 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,191
(1.83 %)
24,331
(1.47 %)
35,821
(1.80 %)
42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,691,924
(36.71 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
167 monito del monte
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
168 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
n/a 40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
169 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
170 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
171 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,356
(1.73 %)
20,858
(1.51 %)
41,385
(2.69 %)
40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,043,531
(31.71 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
172 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,754
(1.77 %)
20,712
(1.43 %)
33,373
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
3,955,737
(43.50 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
173 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,049
(2.15 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,648,190
(29.47 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
174 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
175 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
176 nine-banded armadillo (3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,306
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
37,723
(1.74 %)
40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,142,081
(48.89 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,550
(2.46 %)
177 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
178 Northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
179 Northern elephant seal
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
180 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,422
(1.77 %)
23,659
(1.43 %)
n/a 41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
4,956,409
(42.98 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
181 northern gundi
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
182 Northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
183 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
184 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
185 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
186 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,436
(1.94 %)
19,620
(1.43 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
4,727,554
(42.65 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
187 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,323
(1.82 %)
20,892
(1.37 %)
41,078
(2.09 %)
41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,183,432
(43.24 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
188 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
189 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
190 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,957
(1.53 %)
19,315
(1.54 %)
27,593
(1.67 %)
42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,216,757
(36.05 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
191 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
192 Pacific pocket mouse
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
193 Pacific walrus
GCF_000321225.1
32,719
(1.92 %)
20,637
(1.82 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,370,614
(41.51 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
194 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,960
(3.26 %)
18,765
(1.79 %)
20,858
(1.45 %)
n/a 41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,877,981
(45.30 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
195 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,193
(1.69 %)
20,427
(1.67 %)
n/a 42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,000,874
(29.59 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,065
(3.55 %)
196 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
197 Parnell's mustached bat
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
198 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
199 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
200 pig (Duroc)
GCF_000003025.6
77,708
(4.05 %)
18,978
(1.64 %)
20,299
(1.39 %)
63,041
(4.47 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
4,932,009
(45.39 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,130
(1.79 %)
201 pig (USMARCv1)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
202 platypus (2020 v4)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
203 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,764
(2.39 %)
18,507
(1.67 %)
15,385
(1.38 %)
40,592
(1.77 %)
41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,137,454
(40.52 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
204 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,188
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
205 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,412
(1.69 %)
20,882
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
4,953,552
(29.12 %)
1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
206 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
207 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,616
(1.90 %)
19,545
(1.63 %)
31,482
(2.05 %)
42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,667,172
(24.26 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
208 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,556
(1.68 %)
22,114
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,833,909
(41.06 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
209 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,666
(1.57 %)
16,978
(1.33 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,808,774
(42.28 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
210 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
211 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
212 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,655
(2.34 %)
18,672
(1.38 %)
20,766
(1.29 %)
51,845
(2.01 %)
43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,802,800
(44.34 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
213 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,096
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,656
(1.47 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
214 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,474
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
215 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
216 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
217 red deer
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
218 red fox
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,810
(1.68 %)
18,896
(1.40 %)
54,234
(2.21 %)
41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,835,239
(40.35 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,199
(1.82 %)
219 reindeer
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
220 Ryukyu mouse (2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
221 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
222 Schreibers' long-fingered bat
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
223 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
224 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
225 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
n/a 41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,615,871
(40.95 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,389
(1.88 %)
226 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
227 sheep
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
n/a 41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
228 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
229 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
28,376
(1.28 %)
18,986
(1.18 %)
19,329
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,633,157
(28.17 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
230 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
231 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
232 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
233 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
n/a 41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
234 southern grasshopper mouse
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
235 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,294
(2.10 %)
18,506
(1.44 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,749,130
(37.35 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
236 southern tamandua
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
237 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
238 southern two-toed sloth
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
239 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,050
(2.11 %)
18,561
(1.80 %)
19,750
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,736,665
(38.99 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
240 Sowerby's beaked whale
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
241 sperm whale
GCF_002837175.2
60,934
(2.59 %)
19,544
(1.72 %)
25,657
(1.56 %)
35,346
(1.68 %)
41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,278,719
(42.32 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.53 %)
242 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,276
(1.94 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
2,372,354
(28.64 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,078
(2.74 %)
243 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,057
(2.38 %)
21,173
(1.77 %)
21,625
(1.43 %)
n/a 41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,473,916
(43.13 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
244 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
245 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
246 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
247 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
248 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
249 Sunda flying lemur
GCF_000696425.1
34,747
(1.83 %)
21,445
(1.54 %)
25,827
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
5,040,804
(38.62 %)
854,442
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
250 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
251 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
252 Tasmanian devil
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,902
(0.85 %)
17,542
(0.99 %)
43,475
(2.65 %)
36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,648,718
(44.20 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
253 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
254 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
255 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
256 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,715
(1.26 %)
21,275
(1.20 %)
32,861
(1.46 %)
41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,001,130
(33.96 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
257 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
258 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,552
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
259 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,059
(1.72 %)
22,343
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,339,447
(41.27 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
260 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,936
(1.68 %)
18,057
(1.33 %)
19,768
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,405,129
(45.37 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
261 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
262 white-footed mouse
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
263 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,671
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,716,909
(40.83 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
264 Wild Bactrian camel
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
265 Wild Bactrian camel BCGSAC Cfer 1.0
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
n/a 41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
266 Wild Bactrian camel CB1
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,796
(1.94 %)
17,115
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
3,026,433
(34.28 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
267 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
268 wild mouse SPRET_EiJ
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
n/a 41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
269 wild yak
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,942
(1.61 %)
19,921
(1.32 %)
40,104
(1.69 %)
41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,326,892
(44.50 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
270 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
271 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,663
(2.12 %)
21,029
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,603,698
(36.96 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
272 Yangtze finless porpoise (v2)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,721
(1.80 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,926,818
(42.04 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
273 Yangtze River dolphin (BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
19,232
(1.73 %)
27,450
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,220,655
(43.60 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
274 yellow-bellied marmot
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
275 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
276 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,594
(1.58 %)
19,105
(1.32 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,037,418
(46.47 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,242
(0.85 %)
TOTALS:total assembly count 276

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 49 assemblies assembly stats track stats
Mammals 276 assemblies assembly stats track stats
Birds 112 assemblies assembly stats track stats
Fishes 128 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 46 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 375 assemblies assembly stats track stats
Plants 142 assemblies assembly stats track stats
Fungi 415 assemblies assembly stats track stats
VGP - Vertebrate Genome Project 233 assemblies assembly stats track stats
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