Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark
GCF_000298275.1		 25,607
(1.08 %)		 18,366
(1.06 %)		 20,362
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 6,205,937
(32.04 %)		 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African savanna elephant
GCF_000001905.1		 46,056
(2.30 %)		 19,172
(1.25 %)		 19,731
(1.11 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,188,365
(57.57 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
3 alpaca
GCF_000164845.3		 55,014
(3.56 %)		 18,451
(1.93 %)		 18,474
(1.64 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,071,384
(35.75 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
4 Alpine marmot
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,533
(1.68 %)		 18,293
(1.41 %)		 31,318
(1.47 %)		 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 4,454,253
(32.70 %)		 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
5 American beaver
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,865
(1.52 %)		 24,202
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,332,270
(32.82 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
6 American bison
GCF_000754665.1		 38,699
(2.34 %)		 20,020
(1.51 %)		 20,440
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 5,520,795
(46.38 %)		 419,620
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
7 American pika 3.0
GCF_000292845.1		 26,253
(1.93 %)		 17,581
(1.61 %)		 20,070
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,764,715
(29.18 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
8 American pika 4.0
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
9 American mink
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 n/a 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
10 Amur tiger
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 18,211
(1.58 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 4,759,850
(42.13 %)		 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
11 Arabian camel
GCF_000803125.2		 64,532
(3.85 %)		 18,506
(1.88 %)		 20,721
(1.64 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,159,451
(33.63 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
12 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,979
(1.74 %)		 19,370
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,271,650
(31.66 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
13 ass
GCF_001305755.1		 48,989
(3.12 %)		 18,881
(1.76 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,779,606
(41.38 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
14 Bactrian camel
GCF_000767855.1		 30,670
(2.36 %)		 18,329
(1.97 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 3,001,969
(34.42 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
15 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,760
(1.77 %)		 17,570
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,813,425
(24.38 %)		 532,295
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
16 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,049
(2.15 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,648,190
(29.47 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
17 beluga whale
GCF_002288925.2		 59,413
(3.09 %)		 18,694
(1.79 %)		 20,348
(1.44 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 3,941,793
(43.25 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
18 big brown bat
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,347
(1.93 %)		 20,120
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,864,091
(26.79 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,714
(2.82 %)
19 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,991
(3.15 %)		 18,109
(2.00 %)		 20,669
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,903,289
(33.58 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,454
(3.26 %)
20 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,290
(1.75 %)		 18,487
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 3,034,586
(25.67 %)		 634,242
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
21 brown bear
GCF_003584765.1		 54,006
(3.19 %)		 18,821
(1.77 %)		 21,060
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,201,047
(40.86 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
22 California sea lion
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,746
(1.77 %)		 20,628
(1.44 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,446,830
(42.87 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
23 Canada lynx
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 20,245
(1.42 %)		 39,235
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 4,941,326
(43.36 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,816
(2.48 %)
24 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,291
(1.07 %)		 24,277
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,691,898
(16.77 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
25 Cape golden mole
GCF_000296735.1		 25,336
(1.07 %)		 20,999
(1.07 %)		 21,719
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 5,100,661
(20.78 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
26 cattle
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,655
(1.55 %)		 22,253
(1.36 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,620,154
(49.32 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
27 cheetah
GCF_003709585.1		 72,167
(3.33 %)		 18,484
(1.69 %)		 20,554
(1.44 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,776,210
(42.44 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,743
(2.17 %)
28 Chinese hamster
GCF_000223135.1		 46,741
(2.77 %)		 20,573
(1.77 %)		 17,449
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,408,864
(32.03 %)		 1,072,137
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
29 Chinese hamster CHO
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 n/a 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
30 Chinese pangolin
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
31 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,420
(1.39 %)		 19,216
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 4,978,967
(22.65 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
32 common bottlenose dolphin
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,272
(1.68 %)		 17,061
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,762,939
(43.50 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,029
(1.34 %)
33 common vampire bat
GCF_002940915.1		 32,705
(2.51 %)		 18,526
(1.87 %)		 18,175
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,788,883
(29.47 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
34 common wombat
GCF_900497805.2		 46,378
(1.78 %)		 19,413
(0.86 %)		 18,956
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,545,522
(41.80 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
35 Damara mole-rat DMR 1.0
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,996
(1.45 %)		 17,068
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 3,917,768
(29.90 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
36 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
37 degu
GCF_000260255.1		 48,165
(2.13 %)		 22,273
(1.40 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,736,285
(26.59 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
38 dingo
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
39 dog
GCF_000002285.3		 82,549
(3.63 %)		 19,773
(1.66 %)		 19,610
(1.40 %)		 60,994
(2.37 %)		 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,859,174
(42.88 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,267
(2.05 %)
40 domestic cat
GCF_000181335.3		 72,089
(3.30 %)		 18,675
(1.63 %)		 21,699
(1.43 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,007,925
(43.13 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,699
(2.42 %)
41 domestic ferret
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,624
(1.69 %)		 19,480
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 4,309,890
(39.11 %)		 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,375
(1.90 %)
42 domestic guinea pig
GCF_000151735.1		 44,775
(2.31 %)		 18,304
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,118,154
(37.97 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
43 Egyptian rousette
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,227
(2.03 %)		 24,190
(1.88 %)		 n/a 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,793,981
(32.38 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,181
(4.55 %)
44 Eurasian water vole
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
45 European shrew
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,316
(1.33 %)		 22,012
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,209,276
(32.39 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,848
(2.54 %)
46 Florida manatee
GCF_000243295.1		 39,658
(2.08 %)		 18,311
(1.36 %)		 20,590
(1.23 %)		 n/a 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 4,987,661
(36.73 %)		 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
47 giant panda
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 n/a 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
48 goat
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,857
(1.43 %)		 22,880
(1.27 %)		 41,794
(1.79 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,578,287
(50.22 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,440
(44.85 %)		 125,682
(4.02 %)
49 golden hamster
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
50 gray short-tailed opossum
GCF_000002295.2		 68,388
(2.34 %)		 16,699
(0.75 %)		 16,890
(0.89 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,754,700
(56.19 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
51 gray seal
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
52 great roundleaf bat
GCF_001890085.1		 50,950
(3.26 %)		 19,032
(2.00 %)		 19,878
(1.66 %)		 n/a 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,013,481
(31.67 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
53 Hawaiian monk seal
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,404
(1.74 %)		 20,264
(1.41 %)		 n/a 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,547,865
(43.29 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,374,928
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
54 Honduran yellow-shouldered bat
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
55 horse
GCF_002863925.1		 76,580
(4.06 %)		 19,002
(1.72 %)		 21,184
(1.44 %)		 n/a 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 3,990,556
(44.47 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,824
(1.74 %)
56 house mouse
GCF_000001635.27		 130,343
(4.85 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 n/a 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
57 Iberian mole
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
58 Jamaican fruit-eating bat
GCF_014825515.1		 48,705
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 n/a 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
59 killer whale
GCF_000331955.2		 28,632
(1.91 %)		 18,740
(1.85 %)		 20,364
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,889,071
(43.64 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
60 koala
GCF_002099425.1		 55,736
(2.16 %)		 17,497
(0.86 %)		 16,191
(0.94 %)		 45,693
(1.51 %)		 39.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,907
(100.00 %)		 7,723,845
(41.40 %)		 1,123,545
(2.03 %)		 21,796,057
(39.25 %)		 15,957
(0.35 %)
61 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,459
(1.90 %)		 23,597
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,034,715
(36.02 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
62 leopard
GCF_001857705.1		 73,279
(3.20 %)		 18,886
(1.63 %)		 21,016
(1.44 %)		 35,226
(1.85 %)		 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,164,376
(42.44 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 76,997
(2.42 %)
63 lesser Egyptian jerboa
GCF_000280705.1		 25,991
(1.44 %)		 19,411
(1.38 %)		 20,314
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,163,038
(37.73 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
64 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,327
(1.85 %)		 22,706
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,683,414
(37.00 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
65 long-finned pilot whale
GCF_006547405.1		 66,117
(3.28 %)		 18,773
(1.79 %)		 21,033
(1.46 %)		 n/a 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,867,760
(45.23 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
66 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,854
(2.98 %)		 18,119
(1.58 %)		 19,511
(1.52 %)		 39,338
(2.73 %)		 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,013,972
(30.18 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
67 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
68 Malayan pangolin ManJav 1.0
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,455
(1.56 %)		 24,779
(1.38 %)		 n/a 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 2,943,168
(34.76 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
69 meerkat
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 18,993
(1.63 %)		 19,805
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,490,767
(39.69 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
70 minke whale
GCF_000493695.1		 42,566
(2.38 %)		 19,285
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 3,965,103
(41.83 %)		 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
71 Mongolian gerbil
GCF_002204375.1		 40,359
(2.29 %)		 21,191
(1.83 %)		 24,331
(1.47 %)		 35,816
(1.80 %)		 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,691,924
(36.71 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
72 naked mole-rat
GCF_000247695.1		 74,587
(3.56 %)		 21,356
(1.73 %)		 20,858
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,043,531
(31.71 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
73 narwhal
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,754
(1.77 %)		 20,712
(1.43 %)		 n/a 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 3,955,737
(43.50 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
74 nine-banded armadillo
GCF_000208655.1		 46,144
(1.87 %)		 21,306
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,142,081
(48.89 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,550
(2.46 %)
75 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,953
(2.43 %)		 23,422
(1.77 %)		 23,659
(1.43 %)		 n/a 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 4,956,409
(42.98 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
76 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,323
(1.82 %)		 20,892
(1.37 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,183,432
(43.24 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
77 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,436
(1.94 %)		 19,620
(1.43 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 4,727,554
(42.65 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
78 Norway rat BN7
GCA_015227675.2		 n/a 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 n/a 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
79 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
80 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,957
(1.53 %)		 19,315
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,216,757
(36.05 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
81 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 32,719
(1.92 %)		 20,637
(1.82 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,370,614
(41.51 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
82 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,960
(3.26 %)		 18,765
(1.79 %)		 20,858
(1.45 %)		 n/a 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,877,981
(45.30 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
83 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,193
(1.69 %)		 20,427
(1.67 %)		 n/a 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,000,874
(29.59 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,065
(3.55 %)
84 pig
GCF_000003025.6		 77,708
(4.05 %)		 18,978
(1.64 %)		 20,299
(1.39 %)		 n/a 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 4,932,009
(45.39 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,130
(1.79 %)
85 platypus
GCF_004115215.1		 56,708
(3.09 %)		 14,785
(1.26 %)		 19,402
(1.68 %)		 n/a 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,069,299
(51.33 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,764
(6.47 %)
86 polar bear
GCF_000687225.1		 35,764
(2.39 %)		 18,507
(1.67 %)		 15,385
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,137,454
(40.52 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
87 prairie deer mouse
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,412
(1.69 %)		 20,882
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 4,953,552
(29.12 %)		 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
88 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,616
(1.90 %)		 19,545
(1.63 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,667,172
(24.26 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
89 Przewalski's horse
GCF_000696695.1		 45,089
(2.76 %)		 19,556
(1.68 %)		 22,114
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,833,909
(41.06 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
90 puma
GCF_003327715.1		 25,588
(1.44 %)		 17,666
(1.57 %)		 16,978
(1.33 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,808,774
(42.28 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
91 rabbit
GCF_000003625.3		 43,655
(2.34 %)		 18,672
(1.38 %)		 20,766
(1.29 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,802,800
(44.34 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
92 red fox
GCF_003160815.1		 43,508
(2.67 %)		 19,810
(1.68 %)		 18,896
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,835,239
(40.35 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,199
(1.82 %)
93 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,663
(2.12 %)		 21,029
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,603,698
(36.96 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
94 Ryukyu mouse
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
95 sea otter
GCF_002288905.1		 38,140
(2.17 %)		 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 n/a 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,615,871
(40.95 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,389
(1.88 %)
96 Rambouillet sheep
GCF_002742125.1		 50,096
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 20,898
(22.48 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
97 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
98 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 28,376
(1.28 %)		 18,986
(1.18 %)		 19,329
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,633,157
(28.17 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
99 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,058
(3.04 %)		 20,294
(2.10 %)		 18,506
(1.44 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,749,130
(37.35 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
100 southern white rhinoceros
GCF_000283155.1		 37,050
(2.11 %)		 18,561
(1.80 %)		 19,750
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,736,665
(38.99 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
101 sperm whale
GCF_002837175.2		 60,934
(2.59 %)		 19,544
(1.72 %)		 25,657
(1.56 %)		 35,346
(1.68 %)		 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,278,719
(42.32 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.53 %)
102 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,276
(1.94 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 2,372,354
(28.64 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,078
(2.74 %)
103 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,057
(2.38 %)		 21,173
(1.77 %)		 21,625
(1.43 %)		 n/a 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,473,916
(43.13 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
104 Sunda flying lemur
GCF_000696425.1		 34,747
(1.83 %)		 21,445
(1.54 %)		 25,827
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 5,040,804
(38.62 %)		 854,442
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
105 Tasmanian devil
GCF_902635505.1		 52,070
(2.36 %)		 15,902
(0.85 %)		 17,542
(0.99 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,648,718
(44.20 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
106 thirteen-lined ground squirrel
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,185
(1.69 %)		 18,099
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,262,694
(35.63 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
107 Upper Galilee mountains blind mole rat
GCF_000622305.1		 54,680
(2.07 %)		 19,715
(1.26 %)		 21,275
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,001,130
(33.96 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
108 water buffalo
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
109 Weddell seal
GCF_000349705.1		 48,264
(2.73 %)		 21,059
(1.72 %)		 22,343
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,339,447
(41.27 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
110 western European hedgehog
GCF_000296755.1		 29,936
(1.68 %)		 18,057
(1.33 %)		 19,768
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,405,129
(45.37 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
111 white-footed mouse
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
112 white-tailed deer
GCF_002102435.1		 57,787
(2.93 %)		 20,671
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 n/a 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,716,909
(40.83 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
113 Wild Bactrian camel CB1
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,796
(1.94 %)		 17,115
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 3,026,433
(34.28 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
114 Wild Bactrian camel BCGSAC Cfer 1.0
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 n/a 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
115 wild yak
GCF_000298355.1		 29,789
(1.92 %)		 19,942
(1.61 %)		 19,921
(1.32 %)		 40,104
(1.69 %)		 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,326,892
(44.50 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
116 Yangtze finless porpoise
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,741
(1.80 %)		 19,643
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 3,926,819
(42.04 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
117 Yangtze River dolphin
GCF_000442215.1		 27,076
(1.65 %)		 19,232
(1.73 %)		 27,450
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,220,655
(43.60 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
118 yellow-bellied marmot
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
119 zebu cattle
GCF_000247795.1		 39,830
(2.52 %)		 18,594
(1.58 %)		 19,105
(1.32 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,037,418
(46.47 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,242
(0.85 %)
TOTALS:total assembly count 119

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