Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark
GCF_000298275.1
25,607
(1.08 %)
18,366
(1.06 %)
20,362
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
6,205,937
(32.04 %)
536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African savanna elephant
GCF_000001905.1
46,056
(2.30 %)
19,172
(1.25 %)
19,731
(1.11 %)
28,847
(1.03 %)
40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,188,365
(57.57 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
3 alpaca
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,451
(1.93 %)
18,474
(1.64 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,071,384
(35.75 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
4 Alpine marmot
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,533
(1.68 %)
18,293
(1.41 %)
31,319
(1.47 %)
39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
4,454,253
(32.70 %)
747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
5 American beaver
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,865
(1.52 %)
24,202
(1.33 %)
38,514
(1.52 %)
39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,332,270
(32.82 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
6 American bison
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
20,020
(1.51 %)
20,440
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
5,520,795
(46.38 %)
419,620
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
7 American mink
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
8 American pika 3.0
GCF_000292845.1
26,253
(1.93 %)
17,581
(1.61 %)
20,070
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,764,715
(29.18 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
9 American pika 4.0
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
10 Amur tiger
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
18,211
(1.58 %)
15,090
(1.29 %)
31,423
(1.68 %)
41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
4,759,850
(42.13 %)
831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
11 Arabian camel
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,506
(1.88 %)
20,721
(1.64 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,159,451
(33.63 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
12 Arctic fox
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
13 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,979
(1.74 %)
19,370
(1.45 %)
34,173
(1.85 %)
39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,271,650
(31.66 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
14 ass
GCF_001305755.1
48,989
(3.12 %)
18,881
(1.76 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,779,606
(41.38 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
15 Australian echidna
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
16 Bactrian camel
GCF_000767855.1
30,670
(2.36 %)
18,329
(1.97 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
3,001,969
(34.42 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
17 beluga whale
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,694
(1.79 %)
20,348
(1.44 %)
34,035
(1.82 %)
41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
3,941,793
(43.25 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
18 big brown bat
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,347
(1.93 %)
20,120
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,864,091
(26.79 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,714
(2.82 %)
19 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,109
(2.00 %)
20,669
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,903,289
(33.58 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,454
(3.26 %)
20 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
21 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
22 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,290
(1.75 %)
18,487
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
3,034,586
(25.67 %)
634,242
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
23 brown bear
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,821
(1.77 %)
21,060
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,201,047
(40.86 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
24 California sea lion
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,746
(1.77 %)
20,628
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,446,830
(42.87 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
25 Canada lynx
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
20,245
(1.42 %)
39,235
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
4,941,326
(43.36 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,816
(2.48 %)
26 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,291
(1.07 %)
24,277
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,691,898
(16.77 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
27 Cape golden mole
GCF_000296735.1
25,336
(1.07 %)
20,999
(1.07 %)
21,719
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
5,100,661
(20.78 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
28 cattle
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,655
(1.55 %)
22,253
(1.36 %)
43,984
(2.02 %)
41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,620,154
(49.32 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
29 cheetah
GCF_003709585.1
72,167
(3.33 %)
18,484
(1.69 %)
20,554
(1.44 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,776,210
(42.44 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,743
(2.17 %)
30 Chinese hamster
GCF_000223135.1
46,741
(2.77 %)
20,573
(1.77 %)
17,449
(1.35 %)
34,472
(2.19 %)
41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,408,864
(32.03 %)
1,072,137
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
31 Chinese hamster CHO
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
n/a 41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
32 Chinese pangolin
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
33 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,420
(1.39 %)
19,216
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
4,978,967
(22.65 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
34 common bottlenose dolphin
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,272
(1.68 %)
17,061
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,762,939
(43.50 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,029
(1.34 %)
35 common vampire bat
GCF_002940915.1
32,705
(2.51 %)
18,526
(1.87 %)
18,175
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,788,883
(29.47 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
36 common wombat
GCF_900497805.2
46,378
(1.78 %)
19,413
(0.86 %)
18,956
(0.96 %)
37,453
(1.40 %)
38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,545,522
(41.80 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
37 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
38 Damara mole-rat DMR 1.0
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,996
(1.45 %)
17,068
(1.43 %)
41,630
(2.45 %)
40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
3,917,768
(29.90 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
39 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
40 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,760
(1.77 %)
17,570
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,813,425
(24.38 %)
532,295
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
41 degu
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,273
(1.40 %)
22,101
(1.46 %)
32,968
(1.30 %)
41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,736,285
(26.59 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
42 dingo
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
43 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,549
(3.63 %)
19,773
(1.66 %)
19,610
(1.40 %)
60,994
(2.37 %)
41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,859,174
(42.88 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,267
(2.05 %)
44 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,774
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
45 dog (labrador)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
n/a 41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
46 domestic cat
GCF_000181335.3
72,089
(3.30 %)
18,675
(1.63 %)
21,699
(1.43 %)
54,456
(2.25 %)
41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,007,925
(43.13 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,699
(2.42 %)
47 domestic ferret
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,624
(1.69 %)
19,480
(1.48 %)
33,567
(2.63 %)
41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
4,309,890
(39.11 %)
606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,375
(1.90 %)
48 domestic guinea pig
GCF_000151735.1
44,775
(2.31 %)
18,304
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
34,846
(1.97 %)
39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,118,154
(37.97 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
49 Egyptian rousette
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,227
(2.03 %)
24,190
(1.88 %)
n/a 40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,793,981
(32.38 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,181
(4.55 %)
50 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
51 European shrew
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,316
(1.33 %)
22,012
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,209,276
(32.39 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,848
(2.54 %)
52 Florida manatee
GCF_000243295.1
39,658
(2.08 %)
18,311
(1.36 %)
20,590
(1.23 %)
n/a 40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
4,987,661
(36.73 %)
389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
53 giant panda
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,348
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
54 goat
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
41,794
(1.79 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
55 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
n/a 42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
56 golden hamster (Broad 2013)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
57 gray seal
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
58 gray short-tailed opossum
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,699
(0.75 %)
16,890
(0.89 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,754,700
(56.19 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
59 great roundleaf bat
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
19,032
(2.00 %)
19,878
(1.66 %)
n/a 41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,013,481
(31.67 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
60 greater mouse-eared bat
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
61 harbor seal
GCF_004348235.1
50,670
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
n/a 41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
62 Hawaiian monk seal
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
63 Honduran yellow-shouldered bat
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
64 horse
GCF_002863925.1
76,580
(4.06 %)
19,002
(1.72 %)
21,184
(1.44 %)
59,087
(2.31 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
3,990,556
(44.47 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,824
(1.74 %)
65 house mouse
GCF_000001635.27
130,343
(4.85 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
66 house mouse 129S1_SvImJ
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
n/a 41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
67 house mouse AKR_J
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
n/a 41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
68 house mouse A_J
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
69 house mouse BALB_cJ
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
n/a 41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
70 house mouse C3H_HeJ
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
n/a 41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
71 house mouse C57BL_6NJ
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
n/a 41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
72 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
n/a 41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
73 house mouse CBA_J
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
n/a 41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
74 house mouse DBA_2J
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
n/a 41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
75 house mouse FVB_NJ
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
n/a 41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
76 house mouse LP_J
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
n/a 41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
77 house mouse NOD_ShiLtJ
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
n/a 42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
78 house mouse NZO_HlLtJ
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
n/a 41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
79 house mouse PWK_PhJ
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
n/a 41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
80 house mouse WSB_EiJ
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
n/a 41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
81 Iberian mole
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
82 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
n/a 39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
83 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
84 Jamaican fruit-eating bat
GCF_014825515.1
48,705
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
n/a 41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
85 killer whale
GCF_000331955.2
28,632
(1.91 %)
18,740
(1.85 %)
20,364
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,889,071
(43.64 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
86 koala
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
17,497
(0.86 %)
16,191
(0.94 %)
45,693
(1.51 %)
39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,723,845
(41.40 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
87 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,459
(1.90 %)
23,597
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,034,715
(36.02 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
88 leopard
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,886
(1.63 %)
21,016
(1.44 %)
35,228
(1.85 %)
41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,164,376
(42.44 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
76,997
(2.42 %)
89 lesser Egyptian jerboa
GCF_000280705.1
25,991
(1.44 %)
19,411
(1.38 %)
20,314
(1.35 %)
31,768
(1.26 %)
41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,163,038
(37.73 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
90 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,327
(1.85 %)
22,706
(1.70 %)
26,840
(1.67 %)
42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,683,414
(37.00 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
91 long-finned pilot whale
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,773
(1.79 %)
21,033
(1.46 %)
n/a 41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,867,760
(45.23 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
92 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,119
(1.58 %)
19,511
(1.52 %)
39,338
(2.73 %)
41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,013,972
(30.18 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
93 Malayan pangolin ManJav 1.0
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,455
(1.56 %)
24,779
(1.38 %)
n/a 40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
2,943,168
(34.76 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
94 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
95 meerkat
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
18,993
(1.63 %)
19,805
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,490,767
(39.69 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
96 minke whale
GCF_000493695.1
42,566
(2.38 %)
19,285
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
3,965,103
(41.83 %)
573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
97 Mongolian gerbil
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,191
(1.83 %)
24,331
(1.47 %)
35,821
(1.80 %)
42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,691,924
(36.71 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
98 naked mole-rat
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,356
(1.73 %)
20,858
(1.51 %)
41,385
(2.69 %)
40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,043,531
(31.71 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
99 narwhal
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,754
(1.77 %)
20,712
(1.43 %)
33,373
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
3,955,737
(43.50 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
100 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,049
(2.15 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,648,190
(29.47 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
101 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
102 nine-banded armadillo
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,306
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
37,723
(1.74 %)
40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,142,081
(48.89 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,550
(2.46 %)
103 Northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
104 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,422
(1.77 %)
23,659
(1.43 %)
n/a 41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
4,956,409
(42.98 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
105 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
106 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
99,139
(4.10 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
n/a 41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
107 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,436
(1.94 %)
19,620
(1.43 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
4,727,554
(42.65 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
108 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,323
(1.82 %)
20,892
(1.37 %)
41,078
(2.09 %)
41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,183,432
(43.24 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
109 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,957
(1.53 %)
19,315
(1.54 %)
27,593
(1.67 %)
42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,216,757
(36.05 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
110 Pacific walrus
GCF_000321225.1
32,719
(1.92 %)
20,637
(1.82 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,370,614
(41.51 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
111 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,960
(3.26 %)
18,765
(1.79 %)
20,858
(1.45 %)
n/a 41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,877,981
(45.30 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
112 pale spear-nosed bat
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,193
(1.69 %)
20,427
(1.67 %)
n/a 42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,000,874
(29.59 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,065
(3.55 %)
113 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
114 pig (Duroc)
GCF_000003025.6
77,708
(4.05 %)
18,978
(1.64 %)
20,299
(1.39 %)
63,041
(4.47 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
4,932,009
(45.39 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,130
(1.79 %)
115 pig (USMARCv1)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
116 platypus (2020 v4)
GCF_004115215.2
51,392
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
117 polar bear (BGI 2014)
GCF_000687225.1
35,764
(2.39 %)
18,507
(1.67 %)
15,385
(1.38 %)
40,592
(1.77 %)
41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,137,454
(40.52 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
118 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,188
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
119 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,412
(1.69 %)
20,882
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
4,953,552
(29.12 %)
1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
120 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
121 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,616
(1.90 %)
19,545
(1.63 %)
31,482
(2.05 %)
42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,667,172
(24.26 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
122 Przewalski's horse
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,556
(1.68 %)
22,114
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,833,909
(41.06 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
123 puma
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,666
(1.57 %)
16,978
(1.33 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,808,774
(42.28 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
124 rabbit
GCF_000003625.3
43,655
(2.34 %)
18,672
(1.38 %)
20,766
(1.29 %)
51,845
(2.01 %)
43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,802,800
(44.34 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
125 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,096
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,656
(1.47 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
126 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,474
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
127 red fox
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,810
(1.68 %)
18,896
(1.40 %)
54,234
(2.21 %)
41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,835,239
(40.35 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,199
(1.82 %)
128 Ryukyu mouse
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
129 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
130 sea otter
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
n/a 41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,615,871
(40.95 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,389
(1.88 %)
131 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
132 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
28,376
(1.28 %)
18,986
(1.18 %)
19,329
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,633,157
(28.17 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
133 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
n/a 41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
134 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,294
(2.10 %)
18,506
(1.44 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,749,130
(37.35 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
135 southern white rhinoceros
GCF_000283155.1
37,050
(2.11 %)
18,561
(1.80 %)
19,750
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,736,665
(38.99 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
136 sperm whale
GCF_002837175.2
60,934
(2.59 %)
19,544
(1.72 %)
25,657
(1.56 %)
35,346
(1.68 %)
41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,278,719
(42.32 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.53 %)
137 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,276
(1.94 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
2,372,354
(28.64 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,078
(2.74 %)
138 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,057
(2.38 %)
21,173
(1.77 %)
21,625
(1.43 %)
n/a 41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,473,916
(43.13 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
139 striped hyena
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
140 Sunda flying lemur
GCF_000696425.1
34,747
(1.83 %)
21,445
(1.54 %)
25,827
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
5,040,804
(38.62 %)
854,442
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
141 Tasmanian devil
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,902
(0.85 %)
17,542
(0.99 %)
43,475
(2.65 %)
36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,648,718
(44.20 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
142 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
143 Upper Galilee mountains blind mole rat
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,715
(1.26 %)
21,275
(1.20 %)
32,861
(1.46 %)
41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,001,130
(33.96 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
144 water buffalo
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
145 Weddell seal
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,059
(1.72 %)
22,343
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,339,447
(41.27 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
146 western European hedgehog
GCF_000296755.1
29,936
(1.68 %)
18,057
(1.33 %)
19,768
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,405,129
(45.37 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
147 white-footed mouse
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
148 white-tailed deer
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,671
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
n/a 41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,716,909
(40.83 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
149 Wild Bactrian camel BCGSAC Cfer 1.0
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
n/a 41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
150 Wild Bactrian camel CB1
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,796
(1.94 %)
17,115
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
3,026,433
(34.28 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
151 wild mouse SPRET_EiJ
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
n/a 41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
152 wild yak
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,942
(1.61 %)
19,921
(1.32 %)
40,104
(1.69 %)
41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,326,892
(44.50 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
153 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,663
(2.12 %)
21,029
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,603,698
(36.96 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
154 Yangtze finless porpoise (v2)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,721
(1.80 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,926,818
(42.04 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
155 Yangtze River dolphin
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
19,232
(1.73 %)
27,450
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,220,655
(43.60 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
156 yellow-bellied marmot
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
157 zebu cattle
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,594
(1.58 %)
19,105
(1.32 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,037,418
(46.47 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,242
(0.85 %)
TOTALS:total assembly count 157

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Primates 31 assemblies assembly stats track stats
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