Home    Genome Browser    BLAT Search    Help
  Chromosome 1 - Clone Overlaps - Single Contig
 
Description of this page Main Reports Page Main Assembly Page Main Overlap Page Whole Chromosome Single Contigs

Line color code:

  • White: overlap with immediately succeeding clone
  • Green: overlap with clone in same contig
  • Pink: overlap with clone in same chromosome, different contig
  • Red: overlap with clone on different chromosome
  • Yellow: overlap with clone not used in assembly

NT_034471 NT_037484 NT_004350 NT_004321 NT_004547 NT_034374 NT_022058 NT_021917
NT_028054 NT_032967 NT_021937 NT_004873 NT_030584 NT_029218 NT_004610 NT_004391
NT_004782 NT_037485 NT_028053 NT_004538 NT_034379 NT_037486 NT_034429 NT_004511
NT_037487 NT_004852 NT_032977 NT_029223 NT_029865 NT_004636 NT_032948 NT_004464
NT_034383 NT_004483 NT_037488 NT_004902 NT_034385 NT_026943 NT_034386 NT_029231
NT_004658 NT_004686 NT_037489 NT_021979 NT_034389 NT_037490 NT_034392 NT_028050
NT_030567 NT_021977 NT_029860 NT_037491 NT_019273 NT_004754 NT_022052 NT_022071
NT_004434 NT_037492 NT_037493 NT_037494 NT_034398 NT_034400 NT_034401 NT_034402
NT_034403 NT_037495 NT_032962 NT_037496 NT_021907 NT_037497 NT_004858 NT_037498
NT_004668 NT_037499 NT_029874 NT_004487 NT_037500 NT_021905 NT_004671 NT_029862
NT_034408 NT_034409 NT_037501 NT_034410 NT_034411 NT_021877 NT_034412 NT_004612
NT_037503 NT_021953 NT_004861 NT_004525 NT_004559 NT_031728 NT_021973 NT_004753
NT_004433 NT_030561 NT_004836 NT_004734 NT_004536 NT_032964 NT_037504 NT_037505
NT_031730 NT_029870 NT_032969 NT_032968


  NT_032977
 
LinksContig1Acc1Start1PhsChr2Contig2Acc2Start2PhsStrong OverlapMedium OverlapWeak OverlapTotal Overlap
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL135960464393203chr1NT_032977AL5133224663267830199501995
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL135960464393203  AL390073462263272743501964747082
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL135960464393203  AL45099646226327315400187433414
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL513322466326783chr1NT_032977AL6071224669872730195001950
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL607122466987273chr1NT_032977AL3564584680296630199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL607122466987273  AC0227544669872784018017977101995
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL607122466987273  AL513319468029666516875421904091750
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356458468029663chr1NT_032977AL5914154691679530199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356458468029663  AC0227544663267850817091051727
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356458468029663  AC03417246632678319582955421939132
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL591415469167953chr1NT_032977AL6914594702501530000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL591415469167953  AC034172466987275407003896793037
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL691459470250153chr1NT_032977AC0965414716290530000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL691459470250153  AC03417246802966109800882419804
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC096541471629053chr1NT_032977AC0996794731913530000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC096541471629053  AL45107946802966796670079667
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099679473191353chr1NT_032977AL3562894742060530197601976
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099679473191353  AL13942746802966376532618040271
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356289474206053chr1NT_032977AL1096594745849130199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356289474206053  AL13942747458491279202382030302
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL109659474584913chr1NT_032977AL3599594763817030000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL109659474584913  AC055887474584914722456411010962974
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL109659474584913  AL13942747458491204911581022072
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359959476381703chr1NT_032977AL3569684768301930000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359959476381703  AC05588747420605100281624115412806
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356968476830193chr1NT_032977AL3918444785439230199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356968476830193  AC055887474206051347746581301631151
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356968476830193  AL38992047420605123802773281417967
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL391844478543923chr1NT_032977AL3558094795023730015541554
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL391844478543923  AL38992047683019677178485198778189
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL355809479502373chr1NT_032977AC097062480685773347630034763
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL355809479502373  AC023341476830199940545217901111827
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC097062480685773chr1NT_032977AL6455074821944432000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC097062480685773  AC02334147854392757960075796
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL645507482194443chr1NT_032977AC0997884832018732000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL645507482194443  AL13922348320187349350034935
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL645507482194443  AL39024548320187637864890331571991
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099788483201873chr1NT_032977AC0922644846686630000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099788483201873  AC02766348320187360090036009
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099788483201873  AL13922348320187135224049017571
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099788483201873  AL3600164832018720152135461000843706
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC092264484668663chr1NT_032977AL590432485403073109130010913
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC092264484668663  AC01113048219444109130010913
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC092264484668663  AC02540848219444298480919139039
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC092264484668663  AC0276634821944410941100109411
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590432485403073chr1NT_032977AL0312944862515230000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590432485403073  AC01113048540307481640103749201
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590432485403073  AC02540848540307514880116152649
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590432485403073  AC02766348540307724020072402
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL031294486251523chr1NT_032977AL35691648707109300101101
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL031294486251523  AC01113048466866362802206105739543
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL031294486251523  AC02540848466866551101502056612
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356916487071093chr1NT_032977AL4455274882402030000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356916487071093  AC07392348707109397051946041651
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445527488240203chr1NT_032977AL3567894883214230000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356789488321423chr1NT_032977AL3900234893114430000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356789488321423  AC07392348625152379970037997
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL390023489311443chr1NT_032977AC1057664906228130000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC105766490622813chr1NT_032977AL5916024914855132207002207
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL591602491485513chr1NT_032977AL6457304929633230000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL645730492963323chr1NT_032977AL7318704944803432000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL731870494480343chr1NT_032977AL5838434945702830000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL583843494570283chr1NT_032977AL5921824951894630199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL583843494570283  AL162257492963324438501496359348
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL592182495189463chr1NT_032977AL5962754962981930199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL592182495189463  AL16225749518946591080059108
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL596275496298193chr1NT_032977AL0496374976709230192401924
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL596275496298193  AC026928496298199206684051944102415
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049637497670923chr1NT_032977AL6037464987689332000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049637497670923  AC02692849518946260372735028772
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603746498768933chr1NT_032977AC1185574993974132000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603746498768933  AC026259498768934903232281150663766
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603746498768933  AC09239149876893443340044334
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC118557499397413chr1NT_032977AC0916105010642930000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC118557499397413  AC02625949767092357416109041850
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC091610501064293chr1NT_032977AL3599775025378330199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359977502537833chr1NT_032977AL5904555032679632000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590455503267963chr1NT_032977AL1624305045282030000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL162430504528203chr1NT_032977AL6719865066261130200002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL162430504528203  AL13884850253783392500817447424
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL162430504528203  AL3563705025378320381147701751852669
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL671986506626113chr1NT_032977AC1041705077242432000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL671986506626113  AL3596985045282011307400113074
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL671986506626113  AL7318985045282011381000113810
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC104170507724243chr1NT_032977AL7722605091409430200002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC104170507724243  AL138904504528206938801596185349
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC104170507724243  AL35969850452820531640053164
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC104170507724243  AL391537504528203812201109149213
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC104170507724243  AL73189850662611506570050657
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL772260509140943chr1NT_032977AL8317675100807632000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL772260509140943  AL39153750772424612064281520770694
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL772260509140943  AL60649250772424650200955874578
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL831767510080763chr1NT_032977AL0503435105275430199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL050343510527543chr1NT_032977AL5896635118706630199801998
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL050343510527543  AL3593725091409483504786214905106271
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL589663511870663chr1NT_032977AL4456855129000732000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL589663511870663  AL35937251052754502118601058812
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL589663511870663  AL35996551052754398540039854
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445685512900073chr1NT_032977AL6067615143079730000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445685512900073  AL35567651290007258574907233933103
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445685512900073  AL359965512900075048474243333391241
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606761514307973chr1NT_032977AL1391565143745730018271827
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139156514374573chr1NT_032977AC1057545157444130000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC105754515744413chr1NT_032977AL5132185166589330200002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC105754515744413  AC026909514307972860615478646650550
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL513218516658933chr1NT_032977AL1388495177152030199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL513218516658933  AL138792515744412497826892012747794
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL138849517715203chr1NT_032977AL5911675189652730017761776
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL591167518965273chr1NT_032977AL3569765195471230199401994
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356976519547123chr1NT_032977AC0997845201703530199801998
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL356976519547123  AC02269651954712167100718423894
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099784520170353chr1NT_032977AL1392555217820232000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099784520170353  AC02078151896527140844316409722497
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099784520170353  AC02269651896527701911518135359120731
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139255521782023chr1NT_032977AC0996775219584330000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099677521958433chr1NT_032977AL4451835231007930200002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099677521958433  AC0207815201703545223132142486783304
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445183523100793chr1NT_032977AL6067605250185330198401984
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445183523100793  AC02078152310079111460011146
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445183523100793  AC0227285231007973027615321410100590
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL445183523100793  AL35823352195843991780099178
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606760525018533chr1NT_032977AL6065235262074332000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606760525018533chr1NT_032977AC093564526275501645420064542
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606760525018533  AC022728525018531762447931424036657
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606523526207433chr1NT_032977AC0935645262755018804008804
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC093564526275501chr1NT_032977AC119428526812113160511445017496
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC093564526275501chr1NT_032977AL606760525018533645420064542
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC119428526812113chr1NT_032977AL3654455274864830051725172
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL365445527486483chr1NT_032977AC1052805284972530000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC105280528497253chr1NT_032977AL6039155291552930199701997
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC105280528497253  AC06917552681211426050042605
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603915529155293chr1NT_032977AL5917205292598830018071807
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL591720529259883chr1NT_032977AL0497455308047930199601996
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049745530804793chr1NT_032977AL3910035319597230016971697
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049745530804793  AC07355452915529235460023546
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL391003531959723chr1NT_032977AL0314275320973330199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL031427532097333chr1NT_032977AL35389853359769300100100
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL353898533597693chr1NT_032977AL1619155345704430000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL161915534570443chr1NT_032977AL3576735347877030199301993
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL357673534787703chr1NT_032977AL1616445357046830199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL161644535704683chr1NT_032977AL3547785365193132000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL354778536519313chr1NT_032977AL0354155368749732016002016
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL035415536874973chr1NT_032977AC0997965382198315335012956630
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099796538219831chr1NT_032977AC036239539057351250711827395030848
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099796538219831  AC01173653651931280270260130628
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC099796538219831  AC025990536519314490653202066270888
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC036239539057351chr1NT_032977AL5900935396232832352901696940498
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC036239539057351chr1NT_032977AL1392445402481332601201584341855
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC036239539057351chr1NT_032977AL1392445402481332601201584341855
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC036239539057351  AC00496253962328259290558331512
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC036239539057351  AC011736539623286543401829983733
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590093539623283chr1NT_032977AL1392445402481330000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139244540248133chr1NT_032977AC0965365415196930199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139244540248133chr1NT_032977AC0362395390573512601201584341855
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139244540248133chr1NT_032977AC0362395390573512601201584341855
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139244540248133  AC00496253821983960950096095
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139244540248133  AC00496253821983960950096095
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC096536541519693chr1NT_032977AL5904405430589430000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC096536541519693  AC00496254151969495050049505
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC096536541519693  AC0099465415196910585800105858
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590440543058943chr1NT_032977AL5897905436880530199701997
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL590440543058943  AL59221054368805297470029747
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL589790543688053chr1NT_032977AC0916095441288030199701997
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL589790543688053  AL15884854412880121400012140
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC091609544128803chr1NT_032977AL6720615459439630000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC091609544128803  AL15884854305894654730065473
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC091609544128803  AL39086154305894578872880060767
S/G/Y/R/B/O NT_032977AC091609544128803  AL5922105436880512946500129465
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL672061545943963chr1NT_032977AL0497105468384430199701997
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL672061545943963  AC026036543688053052726872279056004
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL672061545943963  AL39182354683844861312134088265
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049710546838443chr1NT_032977AL6456985480637630016551655
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049710546838443  AC026036546838442352617381988845152
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL049710546838443  AL391823546838445980202275582557
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL645698548063763chr1NT_032977AL1097425481939930000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL109742548193993chr1NT_032977AL6914735491885230016521652
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL109742548193993  AC026289546838444891023651337064645
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL691473549188523chr1NT_032977AL6038405496297230000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL691473549188523  AL64569954819399401570040157
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603840549629723chr1NT_032977AL5128225513909230199901999
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603840549629723  AC026289548193993880818801313853826
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603840549629723  AC0558855481939990228021888112116
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603840549629723  AC0558865481939996028026126122154
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL603840549629723  AL15794954819399651432716067859
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL512822551390923chr1NT_032977AL6068275519396232000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL606827551939623chr1NT_032977AL1391455533175232000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139145553317523chr1NT_032977AL3570415536864432000002000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL139145553317523  AC00650055139092388830038883
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL357041553686443chr1NT_032977AL3536815549743830000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL357041553686443  AC0065005519396210614200106142
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL357041553686443  AC073467551939621464201377728419
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL353681554974383chr1NT_032977AL3597435561087710000
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL353681554974383  AC073467553317526208048161328480180
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359743556108771         
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359743556108771  AC07346755331752482202767446655453
S/G/Y/R/B/O NT_032977AL359743556108771  AL3594325533175264370149414966013