Home    Genome Browser    BLAT Search    Help
  Chromosome 5 - Clone Overlaps - Single Contig
 
Description of this page Main Reports Page Main Assembly Page Main Overlap Page Whole Chromosome Single Contigs

Line color code:

  • White: overlap with immediately succeeding clone
  • Green: overlap with clone in same contig
  • Pink: overlap with clone in same chromosome, different contig
  • Red: overlap with clone on different chromosome
  • Yellow: overlap with clone not used in assembly

NT_034766 NT_037650 NT_037651 NT_023089 NT_006576 NT_023084 NT_037652 NT_037653
NT_006547 NT_023124 NT_023085 NT_034819 NT_006679 NT_023195 NT_034769 NT_023098
NT_037654 NT_023102 NT_037655 NT_037656 NT_037657 NT_033088 NT_023081 NT_006431
NT_037658 NT_037659 NT_006713 NT_030680 NT_037660 NT_029973 NT_023148 NT_006654
NT_037661 NT_034772 NT_006899 NT_030685 NT_025702 NT_016755 NT_007072 NT_034775
NT_034776 NT_037662 NT_037663 NT_037664 NT_016714 NT_029289 NT_006859 NT_034779
NT_006788 NT_030698 NT_023133 NT_037665 NT_023132 NT_037666 NT_034860 NT_037667
NT_006519 NT_037668


  NT_034769
 
LinksContig1Acc1Start1PhsChr2Contig2Acc2Start2PhsStrong OverlapMedium OverlapWeak OverlapTotal Overlap
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008964400720053chr5NT_034769AC01063340215846310893200108932
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008964400720053chr5NT_023195AC109467400075683158230015823
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008964400720053  AC01671940215846168470016847
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC010633402158463chr5NT_034769AC025471403027973202840020284
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC010633402158463  AC00791440007568170572951020008
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC010633402158463  AC01557540072005257620025762
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC025471403027973chr5NT_034769AC008846404310893205040020504
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC025471403027973  AC00791440302797101834294943097147880
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC025471403027973  AC00896840431089925260092526
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC025471403027973  AC02213540215846666495197327775123
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008846404310893chr5NT_034769AC008916405032543288210028821
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008846404310893  AC00791440215846684050068405
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008846404310893  AC06917940302797613050061305
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008916405032543chr5NT_034769AC0267084060829530148201482
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008916405032543  AC00895940431089754420075442
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008916405032543  AC06917940608295908021660108293544
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026708406082953chr5NT_034769AC091886407488603117410011741
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026708406082953  AC00895940503254244930024493
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026708406082953  AC02747540503254614263540770372669
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC091886407488603chr5NT_034769AC0932174075404030000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC091886407488603  AC02747540608295343530034353
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093217407540403chr5NT_034769AC0088204092754130035603560
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093217407540403  AC02524740927541290452666031711
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093217407540403  AC0262094092754145873208002176188434
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093217407540403  AC02747540927541571063349060455
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093217407540403  AC11432040927541343400034340
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008820409275413chr5NT_034769AC0267144098325932124002124
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008820409275413  AC025247409275413304349391567853660
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026714409832593chr5NT_034769AC116363410702883363560036356
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026714409832593  AC02524740927541320231645852042188
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026714409832593  AC02750440927541146140296817582
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC116363410702883chr5NT_034769AC0088424122562132814002814
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC116363410702883  AC01016541225621588770058877
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC116363410702883  AC02750440983259749985208299783203
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008842412256213chr5NT_034769AC1100014135085930000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008842412256213  AC02224140983259391662048336844582
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008842412256213  AC10949440983259545830054583
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC110001413508593chr5NT_034769AC108105413855533286000028600
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC110001413508593  AC01636941070288301240792838052
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC110001413508593  AC02224141070288292920029292
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC110001413508593  AC11339441385553300120030012
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108105413855533chr5NT_034769AC093277415199253251730025173
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108105413855533  AC01636941385553121302041591162893
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108105413855533  AC02224141385553425440042544
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108105413855533  AC1133944135085911591800115918
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093277415199253chr5NT_034769AC1149774155364630000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093277415199253  AC01636941350859316280031628
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114977415536463chr5NT_034769AC093264417070673281080028108
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114977415536463  AC02748841385553715310071531
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093264417070673chr5NT_034769AC0088104184317630000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC093264417070673  AC02748841707067532040053204
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008810418431763chr5NT_034769AC02673241936052306930693
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008810418431763  AC025758415536465160303736288965
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026732419360523chr5NT_034769AC114967420393983403600040360
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026732419360523  AC00892241843176435860043586
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026732419360523  AC018595418431762392308824011
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC026732419360523  AC06778441843176403190040319
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114967420393983chr5NT_034769AC0088634211808630000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114967420393983  AC0185954203939810010405863105967
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114967420393983  AC0677844193605215722471747070171468
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008863421180863chr5NT_034769AC0918714227061533242003242
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC091871422706153chr5NT_034769AC0088304235440739387009387
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008830423544073chr5NT_034769AC0940824248569930000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008830423544073  AC01633242118086926732226094899
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008830423544073  AC02160042118086221830593228115
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008830423544073  AC02214142118086685254258213974922
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC094082424856993chr5NT_034769AC020940425246081194381945201223395
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC094082424856993  AC01633242270615227920022792
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC094082424856993  AC02160042524608683762130591576421
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC094082424856993  AC02214142524608355304311101540856
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC020940425246081chr5NT_034769AC10945342600999395410462214163
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC020940425246081  AC02160042524608593833978591169272
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC020940425246081  AC025649425246083266248622481162335
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC109453426009993chr5NT_034769AC0088174266398530000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC109453426009993  AC025649425246081048101362924110
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008817426639853chr5NT_034769AC1149464284676930000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008817426639853  AC025384425246083456501938653951
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008817426639853  AC02564942524608427400042740
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114946428467693chr5NT_034769AC0342224290580834346004346
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC114946428467693  AC02538442524608584590106959528
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC034222429058083chr5NT_034769AC010408430423893401550040155
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC034222429058083  AC02297243042389213951976106924440
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC010408430423893chr5NT_034769AC0089124307404030000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC010408430423893  AC022972428467692503203099756029
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008912430740403chr5NT_034769AC108099431865703355880035588
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008912430740403  AC02297242905808785541854591886326
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC008912430740403  AC02665542905808236572146649132294
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108099431865703chr5NT_034769AC1041144332382030000
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108099431865703  AC02297243074040156120015612
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC108099431865703  AC02665543074040220160863430650
S/G/Y/R/B/O NT_034769AC104114433238203